KR20180131024A - 재조합 벡터, 형질전환체 및 이를 이용한 테로스틸벤의 생산 방법 - Google Patents
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Abstract
본 발명은 형질전환된 대장균(E. coli) 및 방선균(Actinomyces)을 공배양하는 새로운 생합성 시스템을 통하여 테로스틸벤(pterostilbene)을 고수율로 생산하는 방법에 관한 것이다.
본 발명은 4-쿠마레이트 조효소 A 리가아제(4-Coumarate CoA Ligase; 4CL)를 코딩하는 유전자 및 스틸벤 합성효소(Stilbene synthase; STS)를 코딩하는 유전자를 포함하는 재조합 벡터로 형질전환된 대장균과 O-메틸트랜스퍼라제(O-methyltransferase; ROMT)를 코딩하는 유전자를 포함하는 재조합 벡터로 형질전환된 스트렙토마이세스 베네주엘래(Streptomyces venezuelae) DHS2001 균주를 이용하여 이들 균주를 공배양함으로써, 테로스틸벤을 생합성적 방법으로 고수율로 수득할 수 있는 이점이 있다.
또한, 본 발명은 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001 균주를 형질전환함에 있어서, O-메틸트랜스퍼라제 코딩 유전자를 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001 균주에 최적화되도록 변이하여 형질전환에 이용함으로써, 테로스틸벤 생산율을 현저히 증가시키는 효과를 나타낸다.
본 발명은 4-쿠마레이트 조효소 A 리가아제(4-Coumarate CoA Ligase; 4CL)를 코딩하는 유전자 및 스틸벤 합성효소(Stilbene synthase; STS)를 코딩하는 유전자를 포함하는 재조합 벡터로 형질전환된 대장균과 O-메틸트랜스퍼라제(O-methyltransferase; ROMT)를 코딩하는 유전자를 포함하는 재조합 벡터로 형질전환된 스트렙토마이세스 베네주엘래(Streptomyces venezuelae) DHS2001 균주를 이용하여 이들 균주를 공배양함으로써, 테로스틸벤을 생합성적 방법으로 고수율로 수득할 수 있는 이점이 있다.
또한, 본 발명은 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001 균주를 형질전환함에 있어서, O-메틸트랜스퍼라제 코딩 유전자를 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001 균주에 최적화되도록 변이하여 형질전환에 이용함으로써, 테로스틸벤 생산율을 현저히 증가시키는 효과를 나타낸다.
Description
본 발명은 대장균(E. coli) 및 방선균(Actinomyces)을 공배양하는 새로운 생합성 시스템을 통하여 테로스틸벤(pterostilbene)을 고수율로 생산하는 방법에 관한 것이다.
구체적으로 본 발명은 4-쿠마레이트 조효소 A 리가아제(4-Coumarate CoA Ligase; 4CL)를 코딩하는 유전자 및 스틸벤 합성효소(Stilbene synthase; STS)를 코딩하는 유전자를 포함하는 재조합 벡터로 형질전환된 대장균과 O-메틸트랜스퍼라제(O-methyltransferase; ROMT)를 코딩하는 유전자를 포함하는 재조합 벡터로 형질전환된 스트렙토마이세스 베네주엘래(Streptomyces venezuelae) DHS2001 균주를 공배양하여 테로스틸벤을 생산하는 방법에 관한 것이며, 상기 재조합 벡터, 그리고 상기 형질전환체에 관한 것이다.
스틸벤(stilbene)은 식물 유래의 유용 생리 활성 물질로서 항암, 항산화, 함염, 항균 등 효능을 갖고 있는 것으로 알려져 있다. 이러한 스틸벤 계열 화합물 중, 레스베라트롤(resveratrol)의 유도체인 테로스틸벤(pterostilbene)은 화학구조에 추가적으로 두 개의 메틸기를 더 가지고 있으며, 활성적으로는 수배 내지는 수십 배 향상된 생리 활성 기능을 갖고 있는 것으로 알려져 있다.
테로스틸벤의 생합성은 페닐프로파노이드 경로(phenylpropanoid pathway)를 거쳐 이루어진다. 구체적으로 p-쿠마릭산(p-coumaric acid)이 p-쿠마레이트 조효소 A 리가아제(p-Coumarate CoA Ligase; 4CL)에 의해 p-쿠마릭 조효소 A (p-coumaric CoA)로 전환된 후, 스틸벤 합성효소(stilbene synthase; STS)에 의해 세 개의 말로닐 조효소 A (malonyl-CoA)와 결합하여 레스베라트롤을 형성한다. 그 후 3,5-O-메틸트랜스퍼라제(3,5-O-methyltranferase; 3,5-OMT)의 연속적 효소작용에 의해, 메틸기가 한 개인 피노스틸벤(pinostilbene)을 거쳐, 최종 목표물질인 테로스틸벤으로 생합성 된다.
테로스틸벤은 항암, 항산화, 항염, 항균 효능 등이 탁월하여 여러 의약품 원료로 활용되고 있으나, 자연에서 얻을 수 있는 양이 매우 제한적이고 화학적 합성도 용이하지 않아, 테로스틸벤을 안정적이고 고수율로 수득할 수 있는 방법에 대한 요구가 지속되고 있다(CN103102254(출원공개공보A), CN104672066(출원공개공보A)). 그러나 아직까지 생합성 루트를 통해 안정적으로 높은 수율의 테로스틸벤을 생산할 수 있는 방법에 대한 개발이 미비한 상태이며, 형질전환된 서로 다른 종류의 균주를 공배양하여 테로스틸벤의 수율을 극대화한 생합성 시스템에 대하여는 전혀 연구된 바가 없다.
본 발명은 형질전환된 대장균(E. coli) 및 방선균(Actinomyces)을 공배양하는 새로운 생합성 시스템을 통하여 테로스틸벤(pterostilbene)을 고수율로 생산하는 방법을 제공하는 것을 목적으로 한다.
구체적으로 본 발명은 4-쿠마레이트 조효소 A 리가아제(4-Coumarate CoA Ligase; 4CL)를 코딩하는 유전자 및 스틸벤 합성효소(Stilbene synthase; STS)를 코딩하는 유전자를 포함하는 재조합 벡터로 형질전환된 대장균과 O-메틸트랜스퍼라제(O-methyltransferase; ROMT)를 코딩하는 유전자를 포함하는 재조합 벡터로 형질전환된 스트렙토마이세스 베네주엘래(Streptomyces venezuelae) DHS2001 균주를 공배양하여 테로스틸벤을 생산하는 방법을 제공하는 것을 목적으로 한다.
또한, 본 발명은 상기 공배양에 이용되는 재조합 벡터 및 형질전환체를 제공하는 것을 목적으로 한다.
본 발명은 형질전환된 대장균(E. coli) 및 방선균(Actinomyces)을 공배양하는 새로운 생합성 시스템을 통하여 테로스틸벤(pterostilbene)을 고수율로 생산하는 방법을 제공한다.
본 발명은 4-쿠마레이트 조효소 A 리가아제(4-Coumarate CoA Ligase; 4CL) 및 스틸벤 합성효소(Stilbene synthase; STS) 발현능을 갖는 대장균; 및 O-메틸트랜스퍼라제(O-methyltransferase; ROMT) 발현능을 갖는 스트렙토마이세스 베네주엘래(Streptomyces venezuelae) DHS2001 균주를 공배양하여 테로스틸벤을 생산하는 방법을 제공한다.
본 발명에서 상기 4-쿠마레이트 조효소 A 리가아제 및 스틸벤 합성효소 발현능을 갖는 대장균은 바람직하게는 4-쿠마레이트 조효소 A 리가아제를 코딩하는 유전자 및 스틸벤 합성효소를 코딩하는 유전자를 포함하는 재조합 벡터로 형질전환된 대장균일 수 있다.
본 발명에서 상기 4-쿠마레이트 조효소 A 리가아제를 코딩하는 유전자는 바람직하게는 아라비돕시스 탈리아나(Arabidopsis thaliana) 유래의 4CL (At4CL; Genbank accession no. U18675; 서열번호 1) 유전자일 수 있고, 상기 스틸벤 합성효소를 코딩하는 유전자는 바람직하게는 비티스 비니훼라(Vitis vinifera) 유래의 STS (VvSTS; Genbank accession no. DQ459351; 서열번호 2) 유전자일 수 있다.
본 발명에서 사용되는 용어, "재조합 벡터"는 적당한 숙주세포에서 목적 단백질을 발현할 수 있도록 제조된 벡터로서, 유전자 삽입물이 발현되도록 작동 가능하게 연결된 필수적인 조절 요소를 포함하는 유전자 작제물을 말한다.
본 발명에서 사용되는 용어, "작동 가능하게 연결된(operably linked)"은 일반적 기능을 수행하도록 핵산 발현 조절 서열과 목적하는 단백질을 코딩하는 핵산 서열이 기능적으로 연결(functional linkage)되어 있는 것을 말한다. 예를 들어, 프로모터와 단백질을 코딩하는 핵산 서열이 작동 가능하게 연결되어 코딩하는 핵산 서열의 발현에 영향을 미칠 수 있다. 재조합 벡터와의 작동적 연결은 당해 기술 분야에서 공지된 유전자 재조합 기술을 이용하여 제조할 수 있으며, 부위-특이적 DNA 절단 및 연결은 당해 기술 분야에서 일반적으로 알려진 효소 등을 사용할 수 있다.
본 발명에서 사용될 수 있는 벡터는 플라스미드 벡터, 코즈미드 벡터, 박테리오파아지 벡터 및 아데노바이러스 벡터, 레트로바이러스 벡터, 아데노-연관 바이러스 벡터 같은 바이러스 벡터 등을 포함한다. 적합한 발현벡터는 프로모터, 개시코돈, 종결코돈, 폴리아데닐화 시그널 및 인핸서 등과 같은 발현 조절 요소 외에도 막 표적화 또는 분비를 위한 신호서열 또는 리더 서열을 포함할 수 있으며 목적에 따라 다양하게 제조될 수 있다.
본 발명에서 상기 4-쿠마레이트 조효소 A 리가아제를 코딩하는 유전자 및 스틸벤 합성효소를 코딩하는 유전자를 포함하는 재조합 벡터는 이를 대장균에 도입하여 발현될 수 있도록 제조된 것이라면 그 제조 방법, 형태 등이 특별히 제한되지 않는다.
본 발명의 실시예에서, 상기 4-쿠마레이트 조효소 A 리가아제를 코딩하는 유전자 및 스틸벤 합성효소를 코딩하는 유전자를 포함하는 재조합 벡터를 구축하기 위하여, 유전자 발현벡터로 암피실린(ampicillin) 저항성 마커를 가지는 pET32를 사용하였으며, 아라비돕시스 탈리아나(Arabidopsis thaliana) 유래의 At4CL과 비티스 비니훼라(Vitis vinifera) 유래의 VvSTS 두 개의 유전자를 합성하여 실험을 진행하였다(Koffas et al. High-yield resveratrol production in engineered Escherichia coli. Appl Environ Microbiol. 2001 May25, 3451-3460). 구체적으로, pET32에 NotI, XbaI 제한효소를 처리하고, 상기 두 개 식물 유래의 At4CL과 VvSTS 생합성 유전자에 각각 NotI, HindIII 와 HindIII, XbaI 제한효소를 처리한 다음, 라이게이션(ligation)을 통해 pET32-PT7-At4CL-VvSTS 발현벡터 pYJ1869를 구축하였다(도 3).
본 발명의 실시예에서, 상기 대장균은 대장균 BL21 (DE3) (NEB사의 제품)을 사용하였다.
본 발명에서 사용되는 용어, "형질전환(transformation)"은 DNA를 숙주로 도입하여 DNA가 염색체의 인자로서 또는 염색체 통합완성에 의해 복제 가능하게 되는 것으로, 외부의 DNA를 세포 내로 도입하여 인위적으로 유전적인 변화를 일으키는 현상을 의미한다.
본 발명에서 상기 4-쿠마레이트 조효소 A 리가아제를 코딩하는 유전자 및 스틸벤 합성효소를 코딩하는 유전자를 포함하는 재조합 벡터를 이용하여 대장균을 형질전환시키는 방법은 특별히 제한되지 않으며, 상기 재조합 벡터가 대장균에 도입되어 발현될 수 있도록 처리하는 방법이라면 당해 기술 분야에서 사용될 수 있는 모든 형질전환 방법을 포함한다.
구체적으로 형질전환 방법에는 CaCl2 침전법, CaCl2 방법에 환원물질인 DMSO (dimethyl sulfoxide)를 사용함으로써 효율을 높인 Hanahan 방법, 전기 천공법(electroporation), 전기 충격 유전자 전달법, 인산칼슘 침전법, 원형질 융합법, 실리콘 카바이드 섬유를 이용한 교반법, 아그로 박테리아 매개된 형질전환법, PEG를 이용한 형질전환법, 덱스트란 설페이트, 리포펙타민 및 건조/억제 매개된 형질전환 방법 등이 있으나 이에 제한되지 않는다.
본 발명의 실시예에서, 상기 재조합 벡터 pYJ1869를 대장균 BL21 (DE3)에 형질전환하기 위하여 전기 충격 유전자 전달법을 사용하였고, 콜로니 선별은 암피실린(50 μg/ml)이 포함된 LB (Luria Bertani) 한천배지를 사용하였으며 생산용 배지로 YM9 (Koffas et al. High-yield resveratrol production in engineered Escherichia coli. Appl Environ Microbiol. 2001 May25, 3451-3460) 혹은 R2YE 액체 배지를 사용하였다.
본 발명에서 상기 O-메틸트랜스퍼라제 발현능을 갖는 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001 균주는 바람직하게는 O-메틸트랜스퍼라제를 코딩하는 유전자를 포함하는 재조합 벡터로 형질전환된 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001 균주일 수 있다.
본 발명에서 상기 O-메틸트랜스퍼라제를 코딩하는 유전자는 바람직하게는 비티스 비니훼라(Vitis vinifera) 유래의 ROMT (VvROMT; Genbank accession no. FM178870; 서열번호 3) 유전자를 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001 균주의 코돈에 맞추어 최적화되도록 변이시킨 VvROMTop (서열번호 4) 유전자일 수 있다. 이와 같이 VvROMT 유전자를 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001 균주에 최적화되도록 변이하여 이용함으로써, 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001 균주에서의 O-메틸트랜스퍼라제 발현을 극대화하여 테로스틸벤 생산율을 현저히 증가시키는 이점이 있다.
본 발명에서 상기 O-메틸트랜스퍼라제를 코딩하는 유전자를 포함하는 재조합 벡터는 이를 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001 균주에 도입하여 발현될 수 있도록 제조된 것이라면 그 제조 방법, 형태 등이 특별히 제한되지 않는다.
본 발명의 실시예에서, 상기 O-메틸트랜스퍼라제를 코딩하는 유전자를 포함하는 재조합 벡터를 구축하기 위하여, 유전자 발현벡터로 티오스트렙톤(thiostrepton) 저항성 마커를 가지는 pSE34를 사용하였으며, 비티스 비니훼라(Vitis vinifera) 유래의 VvROMT 유전자를 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001 균주의 코돈에 맞추어 최적화되도록 변이시킨 VvROMTop (서열번호 4) 유전자를 이용해 실험을 진행하였다. 구체적으로, 이종숙주에서의 pYJ1852 발현벡터를 구축하기 위하여 단계별 서브클로닝을 진행하였다. 먼저 리트머스 28 벡터를 이용하여 pstS 프로모터(서열번호 5), VvROMTop와 터미네이터 (terminator)를 다단계 라이게이션을 통해 이어준 다음(pLitmus28-PpstS-VvROMTop-Tdes), MfeI 과 XbaI 제한효소를 처리하여, 최종 pSE34 발현벡터에 삽입해 넣었다(도 6).
본 발명에서 상기 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001 균주는 스트렙토마이세스 베네주엘래 ATCC15439 균주로부터 피크로마이신(pikromycin) 생합성 관련 유전자를 제거하여 본 발명자들의 선행연구에서 제조한 균주를 의미한다.
상기 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001 균주를 제조하는 방법은 다음과 같다. 스트렙토마이세스 베네주엘래 ATCC15439 균주에서 이차대사산물인 피크로마이신 생합성 유전자를 제거하기 위하여 pikAI 생합성 유전자의 왼쪽(left arm; LA) 영역, pikV 생합성 유전자의 오른쪽(right arm; RA) 영역 및 하그로마이신 B류(Hygromycin B) 저항성 유전자를 유전자 결실용 온도 민감성 대장균-스트렙토마이세스 셔틀벡터 pKC1139 (Bierman M, et al. Plasmids cloning vectors for the conjugal transfer of DNA from Escherichia coli to Streptomyces spp. Gene 1992 July1, 43-49)에 클로닝하여 최종 유전자 제거 벡터인 pKC1139-LA-HyB-RA를 제작하였다. 다음 벡터를 스트렙토마이세스 베네주엘래에 도입하여 이중교차 재조합에 의해 생합성 유전자 집단이 제거되었다(Yoon et al. Heterologous expression of tylosin polyketide synthase and production of a hybrid bioactive macrolide in Streptomyces venezuelae. Appl Microbiol Biotechnol. 2006 Feb22, 763-769).
본 발명에서 사용된 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001 균주는 특히 이차대사산물을 생산하기에 매우 적합한 이종숙주라는 이점이 있다(Yoon et al. Engineering of plant-specific phenylpropanoids biosynthesis in Streptomyces venezuelae. 2009 March 20, 181-188).
본 발명에서 상기 O-메틸트랜스퍼라제를 코딩하는 유전자를 포함하는 재조합 벡터를 이용하여 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001 균주를 형질전환시키는 방법은 특별히 제한되지 않으며, 상기 재조합 벡터가 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001 균주에 도입되어 발현될 수 있도록 처리하는 방법이라면 당해 기술 분야에서 사용될 수 있는 모든 형질전환 방법을 포함한다.
본 발명의 실시예에서, 상기 재조합 벡터 pYJ1852를 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001에 형질전환하기 위하여 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001 균주를 SGGP 액체배지에 배양하여 원형질체(protoplast)를 제조한 다음 (Kieser et al. Practical Streptomyces Genetics. John Innes Centre. 2000), 콜로니 선별을 위해 R2YE 한천배지를 사용하여 형질전환체를 24 시간 배양 후, 티오스트렙톤(50 μg/ml)을 도포하였다. 포자회수는 ISP4 (50 μg/ml 티오스트렙톤) 한천배지를 사용하였고 생산용으로는 R2YE 액체 배지를 사용하였다.
본 발명에서 상기 대장균과 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001 균주를 공배양하는 방법은 특별히 제한되지 않으며, 상기 두 가지 상이한 균주가 함께 생존할 수 있도록 배양하는 방법이라면 당해 기술 분야에서 사용될 수 있는 모든 배양 방법을 포함한다.
본 발명의 실시예에서, 상기 재조합 벡터 pYJ1869로 형질전환시킨 대장균 BL21 (DE3)/pYJ1869 및 상기 재조합 벡터 pYJ1852로 형질전환시킨 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001/pYJ1852 두 가지 균주를 각각 배양하여 세포를 회수한 다음, 공배양을 진행하였다.
구체적으로, 대장균 BL21 (DE3)/pYJ1869의 경우, 2 ml LB 배지에서 230 RPM, 37℃ 조건에서 12 시간 동안 종균 배양(seed culture) 후, 50 ml의 LB 배지에서 OD600가 0.1이 되도록 재접종을 진행하였다. 이어지는 본 배양(mian culture)에서는, 배양액의 OD600 값이 0.8이 되었을 때, 1 mM의 IPTG (isopropyl-1-thio-β-D-galactopyranoside)를 첨가하였고, 3 시간 배양 후 배양액을 원심분리하여 상등액을 제거하고 세포를 회수하였다.
스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001/pYJ1852의 경우, 포자 현탁액을 5 ml R2YE 액체 배지를 사용하여 230 RPM, 30℃ 조건에서 36 시간 동안 종균 배양하였다. 이어 본 배양에서는 종균 배양액 500 μl를 50 ml의 R2YE에 재접종 하였고, 48 시간 배양 후 세포를 회수하였다.
그 다음, 상기와 같이 각각 회수된 균주 중 0.025 g의 대장균 BL21 (DE3)/pYJ1869과 0.25 g의 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001/pYJ1852를 취하여, 50 μg/l 암피실린, 50 μg/l 티오스트렙톤, 1 mM IPTG, 2 mM p-쿠마릭산을 함유한 25 ml의 R2YE 액체 배지에서 230 RPM, 30℃ 조건에서 48 시간 동안 공배양하였다.
본 발명은 상기 형질전환된 대장균과 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001 균주를 공배양함으로써, 그 배양액으로부터 테로스틸벤을 높을 수율로 수득할 수 있다.
본 발명에서 사용되는 용어, "배양액"은 액체 배지에 균주를 접종하여 배양한 것을 의미한다. 상기 배양액은 균주를 포함한 것, 또는 균주를 접종하여 배양한 후, 제균 즉 균주를 제거한 배양여액일 수 있다. 본 발명에서 배양액은 배양액 자체, 배양액을 농축한 농축액 또는 배양액을 건조시킨 건조물 형태일 수 있다.
본 발명에서 상기 형질전환된 대장균과 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001 균주를 공배양한 배양액으로부터 테로스틸벤을 분리하는 방법은 특별히 제한되지 않으며, 당해 기술 분야에서 알려진 통상적인 방법에 의하여 수행될 수 있다. 이러한 분리 방법에는, 원심분리, 여과, 이온교환 크로마토그래피 및 결정화 등의 방법이 이용될 수 있다. 예를 들면, 배양액을 저속 원심분리하여 바이오매스를 제거하고 얻어진 상등액을 이온교환 크로마토그래피를 통하여 분리할 수 있다.
본 발명의 실시예에서, 상기 형질전환된 대장균과 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001 균주를 공배양한 후, 그 배양액으로부터 화합물을 추출하고 분리하기 위하여, 우선 배양액 내의 화합물을 에틸아세테이트로 추출 및 분리하였다. 그 다음, 추출 농축액을 메탄올에 용해시켰고, ES positive (+) 이온모드에서 Phenomenex Synergi Polar-RP 컬럼(150ㅧ4.6 mm, 4 um)을 사용하여 LC-ESI-MS/MS (liquid chromatography-electrospray ionization-mass spectrometry, Waters/Micromass-Quattro microTMAPI) 분석을 수행하였다. 분석 용매로는 0.1% (v/v) 포름산(formic acid) 수용액을 용출 용매 A로 하고, 0.1% (v/v) 포름산 수용액과 아세토나이트릴(acetonitrile)이 20:80으로 섞인 수용액을 용출 용매 B로 하여, 분석 과정에서 유속 400 μl/min으로 용매를 흘려주었다.
분석을 위한 용매 기울기 조건은 다음과 같이 수행하였다. 구체적으로 초기 40% 용출 용매 B를 0.3 분간 유지 후, 7 분까지 75% 용출 용매 B가 되도록 상승시키고, 이어 15 분까지 85% 용출 용매 B가 되도록 상승시킨 후, 22 분까지 100% 용출 용매 B가 되도록 상승시킨다. 이후 3 분간 100% 용출 용매 B 농도를 유지한 후, 초기 조건 40% 용출 용매 B가 되도록 10 분간 유지하였다.
목표물질에 대한 MS/MS (mass spectrum) 검출방법 및 정량은 MRM (multiple reactions monitoring) 모드로 수행하였다. 양이온화된 분자 이온이 선택된 분석물질에 특이적인 해당조각(산물) 이온으로 전환되는 것을 탐지하기 위하여 두 개의 질량이온 [모이온(parent mass ion) > 딸이온(daughter mass ion)]을 선택하여 수행하였다: 레스베라트롤 229>135, 피노스틸벤 243>121, 테로스틸벤 257>133. 표준물질은 시그마-알드리치(Sigma-Aldrich)에서 구입하였다.
본 발명은 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001 균주에서 발현이 증가되도록 변이시킨 서열번호 4의 O-메틸트랜스퍼라제 코딩 유전자를 제공한다.
본 발명에서 상기 서열번호 4의 O-메틸트랜스퍼라제 코딩 유전자는 바람직하게는 비티스 비니훼라(Vitis vinifera) 유래의 ROMT (VvROMT; Genbank accession no. FM178870; 서열번호 3) 유전자를 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001 균주의 코돈에 맞추어 최적화되도록 변이시킨 VvROMTop 유전자일 수 있다. 이와 같이 VvROMT 유전자를 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001 균주에 최적화되도록 변이하여 이용함으로써, 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001 균주에서의 O-메틸트랜스퍼라제 발현을 극대화하여 테로스틸벤 생산율을 현저히 증가시키는 이점이 있다.
본 발명은 상기 서열번호 4의 유전자를 포함하는 재조합 벡터를 제공한다. 상기 재조합 벡터는 이를 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001 균주에 도입하여 발현될 수 있도록 제조된 것이라면 그 제조 방법, 형태 등이 특별히 제한되지 않는다. 본 발명의 실시예에서, 상기 재조합 벡터는 도 6의 개열지도와 같이 제조되었다. 상기 재조합 벡터의 정의, 사용 가능한 벡터 등에 대한 구체적인 설명은 상기에서 설명한 바와 같다.
본 발명은 상기 서열번호 4의 유전자를 포함하는 재조합 벡터를 이용하여 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001 균주를 형질전환시키는 방법 및 그 형질전환된 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001 균주를 제공한다.
본 발명에서 상기 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001 균주를 형질전환시키는 방법은 특별히 제한되지 않으며, 상기 재조합 벡터가 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001 균주에 도입되어 발현될 수 있도록 처리하는 방법이라면 당해 기술 분야에서 사용될 수 있는 모든 형질전환 방법을 포함한다. 상기 형질전환의 정의, 구첵저인 형질전환 방법의 예시 등은 상기에서 설명한 바와 같다.
본 발명은 형질전환된 대장균(E.coli) 및 방선균(Actinomyces)을 공배양하는 새로운 생합성 시스템을 제공함으로써 테로스틸벤(pterostilbene)을 고수율로 생산하는 방법을 제공한다.
구체적으로 본 발명은 4-쿠마레이트 조효소 A 리가아제(4-Coumarate CoA Ligase; 4CL)를 코딩하는 유전자 및 스틸벤 합성효소(Stilbene synthase; STS)를 코딩하는 유전자를 포함하는 재조합 벡터로 형질전환된 대장균과 O-메틸트랜스퍼라제(O-methyltransferase; ROMT)를 코딩하는 유전자를 포함하는 재조합 벡터로 형질전환된 스트렙토마이세스 베네주엘래(Streptomyces venezuelae) DHS2001 균주를 이용하여 이들 균주를 공배양함으로써, 충분한 양의 자연적 수득이 어렵고 화학적 합성도 용이하지 않은 테로스틸벤을 생합성적 방법으로 고수율로 수득할 수 있는 이점이 있다.
또한, 본 발명은 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001 균주를 형질전환함에 있어서, O-메틸트랜스퍼라제 코딩 유전자를 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001 균주에 최적화되도록 변이하여 형질전환에 이용함으로써, O-메틸트랜스퍼라제의 발현을 극대화하여 테로스틸벤 생산율을 현저히 증가시키는 효과를 나타낸다.
도 1은 테로스틸벤의 생합성 경로를 나타낸 것이다(도면에서, 4CL은 4-쿠마레이트 조효소 A 리가아제; STS는 스틸벤 합성효소; 3,5-OMT는 3,5-O-메틸트랜스퍼라제를 나타냄).
도 2는 대장균 BL21 (DE3)/pYJ1869와 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001/pYJ1852의 공배양을 통한 테로스틸벤 생합성 경로를 나타낸 것이다.
도 3은 pET32 벡터에 아라비돕시스 탈리아나 유래 4CL 코딩 유전자 At4CL과 비티스 비니훼라 유래 STS 코딩 유전자 VvSTS를 포함하는 pYJ1869 발현벡터의 개열지도를 나타낸 것이다.
도 4는 대장균 BL21 (DE3)/pYJ1869에서의 레스베라트롤 생합성 과정을 나타낸 것으로, 대장균 BL21 (DE3)/pYJ1869를 이종숙주로 사용하고 이에 p-쿠마린산을 첨가하는 경우, At4CL과 VvSTS 유전자에 의해 레스테라트롤이 생합성 된다.
도 5는 LC-ESI MS 장비를 이용한 레스베라트롤의 MRM (multiple-reaction-monitoring) 크로마토그램 및 MS/MS (mass spectrum) 분석 결과를 나타낸 그래프로, (A)는 레스베라트롤 표준물질 MRM TIC, (B)는 레스베라트롤 m/z 299 MS/MS, (C)는 대장균 BL21 (DE3)/pYJ1869 발현을 통한 레스베라트롤 생산 추출물 MRM TIC, (D)는 대장균 BL21 (DE3)/pYJ1869로 생산된 레스베라트롤 MS/MS를 나타낸다.
도 6은 대장균-방선균 셔틀벡터(E.coli-Streptomyces shuttle vector)인 pSE34에 비티스 비니훼라 유래의 O-메틸트랜스퍼라제 유전자인 VvROMT를 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001에 적합하도록 코돈 최적화한 VvROMTop를 포함하는 pYJ1852 발현 벡터의 개열지도를 나타낸 것이다.
도 7은 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001/pYJ1852에서의 테로스틸벤 생합성 과정을 나타낸 것으로, 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001/pYJ1852를 이종숙주로 사용하고 이에 레스베라트롤을 첨가하는 경우, VvROMTop 유전자에 의해 테로스틸벤이 생합성된다.
도 8은 LC-ESI MS 장비를 이용한 테로스틸벤의 MRM 크로마토그램 및 MS/MS 분석 결과를 나타낸 그래프로, (A)는 피노스틸벤 표준물질 MRM TIC, (B)는 피노스틸벤 m/z 243 MS/MS, (C)는 테로스틸벤 표준물질 MRM TIC, (D)는 테로스틸벤 m/z 257 MS/MS, (E)는 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001/pYJ1869의 발현을 통한 테로스틸벤 생산 추출물 MRM TIC, (F)는 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001/pYJ1869로부터 생산된 테로스틸벤 MS/MS를 나타낸다.
도 9는 대장균 BL21(DE3)/pYJ1869와 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001/pYJ1852의 공배양시, p-쿠마릭산 첨가 후의 배양시간에 따른 레스베라트롤, 피노스틸벤 및 테로스틸벤의 생산량에 관한 결과를 나타낸 그래프이다.
도 2는 대장균 BL21 (DE3)/pYJ1869와 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001/pYJ1852의 공배양을 통한 테로스틸벤 생합성 경로를 나타낸 것이다.
도 3은 pET32 벡터에 아라비돕시스 탈리아나 유래 4CL 코딩 유전자 At4CL과 비티스 비니훼라 유래 STS 코딩 유전자 VvSTS를 포함하는 pYJ1869 발현벡터의 개열지도를 나타낸 것이다.
도 4는 대장균 BL21 (DE3)/pYJ1869에서의 레스베라트롤 생합성 과정을 나타낸 것으로, 대장균 BL21 (DE3)/pYJ1869를 이종숙주로 사용하고 이에 p-쿠마린산을 첨가하는 경우, At4CL과 VvSTS 유전자에 의해 레스테라트롤이 생합성 된다.
도 5는 LC-ESI MS 장비를 이용한 레스베라트롤의 MRM (multiple-reaction-monitoring) 크로마토그램 및 MS/MS (mass spectrum) 분석 결과를 나타낸 그래프로, (A)는 레스베라트롤 표준물질 MRM TIC, (B)는 레스베라트롤 m/z 299 MS/MS, (C)는 대장균 BL21 (DE3)/pYJ1869 발현을 통한 레스베라트롤 생산 추출물 MRM TIC, (D)는 대장균 BL21 (DE3)/pYJ1869로 생산된 레스베라트롤 MS/MS를 나타낸다.
도 6은 대장균-방선균 셔틀벡터(E.coli-Streptomyces shuttle vector)인 pSE34에 비티스 비니훼라 유래의 O-메틸트랜스퍼라제 유전자인 VvROMT를 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001에 적합하도록 코돈 최적화한 VvROMTop를 포함하는 pYJ1852 발현 벡터의 개열지도를 나타낸 것이다.
도 7은 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001/pYJ1852에서의 테로스틸벤 생합성 과정을 나타낸 것으로, 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001/pYJ1852를 이종숙주로 사용하고 이에 레스베라트롤을 첨가하는 경우, VvROMTop 유전자에 의해 테로스틸벤이 생합성된다.
도 8은 LC-ESI MS 장비를 이용한 테로스틸벤의 MRM 크로마토그램 및 MS/MS 분석 결과를 나타낸 그래프로, (A)는 피노스틸벤 표준물질 MRM TIC, (B)는 피노스틸벤 m/z 243 MS/MS, (C)는 테로스틸벤 표준물질 MRM TIC, (D)는 테로스틸벤 m/z 257 MS/MS, (E)는 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001/pYJ1869의 발현을 통한 테로스틸벤 생산 추출물 MRM TIC, (F)는 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001/pYJ1869로부터 생산된 테로스틸벤 MS/MS를 나타낸다.
도 9는 대장균 BL21(DE3)/pYJ1869와 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001/pYJ1852의 공배양시, p-쿠마릭산 첨가 후의 배양시간에 따른 레스베라트롤, 피노스틸벤 및 테로스틸벤의 생산량에 관한 결과를 나타낸 그래프이다.
이하, 본 발명을 실시예를 통하여 보다 상세하게 설명한다. 그러나 이들 실시예는 본 발명을 예시적으로 설명하기 위한 것으로 본 발명의 범위가 이들 실시예에 한정되는 것은 아니다.
실시예 1: 균주, 플라스미드 및 배양 조건
서브클로닝(subcloning)을 위하여 대장균 DH5α (Escherichia coli DH5 α)와 플라스미드 리트머스 28 (Litmus 28, New England Biolabs 제품)을 이용하였다. 레스베라트롤(resveratrol) 생산을 위한 생합성 유전자 발현벡터로 암피실린(ampicillin) 저항성 마커를 가지는 pET32를 사용하였고, 이종숙주로 대장균 BL21 (DE3) (NEB사의 제품)를 사용하였다.
O-메틸트랜스퍼라제의 기능 확인을 위한 생합성 유전자 발현벡터로 티오스트렙톤(thiostrepton) 저항성 마커를 가지는 pSE34를 사용하였다(Yoon et al. Generationof multiple bioactive macrolides by hybrid modular polyketide synthasesin Streptomyces venezuelae. Chem Biol. 2002 Feb9, 203-14). 이종숙주로 피크로마이신(picromycin) 생합성 관련 유전자가 삭제된 돌연변이 균주인 스트렙토마이세스 베네주엘래(Streptomyces venezuelae) DHS2001 (Yoon et al. Heterologous expression of tylosin polyketide synthase and production of a hybrid bioactive macrolide in Streptomyces venezuelae. Appl Microbiol Biotechnol. 2006 Feb22, 763-769)을 사용하였고, SGGP 액체 배지에 배양하여 원형질체(protoplast)를 제조하였다(Kieser et al. Streptomyces Genetics. 2000 John Innes Centre, Norwich).
실시예
2: 발현벡터 구축 및 돌연변이체 확보
실시예 2-1: pET32-P
T7
-
At4CL
-
VvSTS
발현벡터 pYJ1869
레스베라트롤 생합성 시스템을 위하여, 아라비돕시스 탈리아나(Arabidopsis thaliana) 유래의 4CL (At4CL; Genbank accession no. U18675; 서열번호 1)과 비티스 비니훼라(Vitis vinifera) 유래의 STS (VvSTS; Genbank accession no. DQ459351; 서열번호 2) 두 개의 유전자를 합성하여 실험을 진행하였다(Koffas et al. High-yield resveratrol production in engineered Escherichia coli. Appl Environ Microbiol. 2001 May25, 3451-3460). 구체적으로, pET32에 NotI, XbaI 제한효소를 처리하고, 상기 두 개 식물 유래의 At4CL과 VvSTS 생합성 유전자에 각각 NotI, HindIII 와 HindIII, XbaI 제한효소를 처리한 다음, 라이게이션(ligation)을 통해 pET32-PT7-At4CL-VvSTS 발현벡터 pYJ1869를 구축하였다(도 3).
실시예 2-2: pSE34-P
pstS-VvROMT
op-T
des
발현벡터 pYJ1852
스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001 돌연변이주 내에서 비티스 비니훼라(Vitis vinifera) 유래의 ROMT (VvROMT; Genbank accession no. FM178870; 서열번호 3) (Hugueney P et al. A stress-inducible resveratrol O-methyltransferase involved in the biosynthesis of pterostilbene in grapevine. Plant Physiol. 2008 Sep17, 1630-1639)를 발현시키고자, 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001 코돈에 맞추어 최적화하였으며, 상기 최적화한 유전자 VvROMTop (서열번호 4)를 이용해 실험을 진행하였다. 구체적으로, 이종숙주에서의 pYJ1852 발현벡터를 구축하기 위하여 단계별 서브클로닝을 진행하였다. 먼저 리트머스 28 벡터를 이용하여 pstS 프로모터(서열번호 5), VvROMTop와 터미네이터 (terminator)를 다단계 라이게이션을 통해 이어준 다음(pLitmus28-PpstS-VvROMTop-Tdes), MfeI 과 XbaI 제한효소를 처리하여, 최종 pSE34 발현벡터에 삽입해 넣었다(도 6).
테로스틸벤 생산 시스템을 구축하기 위한 상기 pYJ1869와 pYJ1852 발현벡터는 모두 유전자 염기서열 분석을 통해 확인하였고, 각각 대장균 BL21 (DE3)과 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001로 형질전환하였다.
실시예
3: 균주 배양조건
실시예 3-1: 대장균 BL21 (DE3) 배양조건
pYJ1869를 대장균 BL21 (DE3)에 형질전환하기 위하여 암피실린(50 μg/ml)이 포함된 LB (Luria Bertani) 한천배지에서 콜로니를 선별하였고, 생산용 배지로 YM9 (Koffas et al. 2011) 혹은 R2YE 액체 배지를 사용하였다.
레스베라트롤 생산을 위하여, 먼저 2 ml LB 배지에서 230 RPM, 37℃ 조건에서 12 시간 동안 종균 배양(seed culture) 후, 50 ml의 LB 배지에서 OD600가 0.1이 되도록 재접종을 진행하였다. 이어지는 본 배양(mian culture)에서는, 배양액의 OD600 값이 0.8이 되었을 때, 1 mM의 IPTG (isopropyl-1-thio-β-D-galactopyranoside)를 첨가하였고, 3 시간 배양 후 배양액을 원심분리하여 상등액을 제거하고 세포를 회수하였다. 회수된 세포는 25 ml YM9 혹은 R2YE 배지에 옮긴 후, 50 μg/ml 암피실린, 1 mM IPTG, 2 mM p-쿠마릭산을 첨가하여 230 RPM, 30℃ 조건에서 12 시간 동안 배양 하였다.
실시예 3-2: 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001 배양조건
pYJ1852를 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001에 형질전환하기 위하여 R2YE 한천배지를 사용하였고, 콜로니 선별을 위해 형질전환체를 24 시간 배양 후, 티오스트렙톤(50 μg/ml)을 도포하였다. 포자회수는 ISP4 (50 μg/ml 티오스트렙톤) 한천배지를 사용하였고 생산용으로는 R2YE 액체 배지를 사용하였다.
VvROMT 유전자 기능 확인을 위하여 포자 현탁액을 5 ml R2YE 액체 배지를 사용하여 230 RPM, 30℃ 조건에서 36 시간 동안 종균 배양하였다. 이어 본 배양에서는 종균 배양액 500 μl를 50 ml의 R2YE에 재접종 하였고, 48 시간 배양 후 70 μM의 레스베라트롤을 첨가하여 48 시간 동안 추가 배양하였다.
실시예 3-3: 형질전환된 대장균 BL21 (DE3)과 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001의 공배양 조건
테로스틸벤 생산을 위하여 상기 두 가지 균주를 각각 배양하여 세포를 회수한 다음 공배양을 진행하였다. 대장균 BL21 (DE3)/pYJ1869는 위와 같이 본 배양과정에서 1 mM의 IPTG를 첨가하여 3 시간 배양한 다음 세포를 회수하였고, 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001/pYJ1852는 본 배양에서 48 시간 배양 후 세포를 회수하였다. 이어 0.025 g의 대장균 BL21 (DE3)/pYJ1869과 0.25 g의 DHS2001/pYJ1852를 취하여 50 μg/l 암피실린, 50 μg/l 티오스트렙톤, 1 mM IPTG, 2 mM p-쿠마릭산을 함유한 25 ml의 R2YE 액체 배지에서 230 RPM, 30℃ 조건에서 48 시간 동안 공배양하였다.
실시예 4: 생합성 화합물의 추출 및 분석
배양액에서의 화합물은 에틸아세테이트로 추출 및 분리하였다. 추출 농축액은 메탄올에 용해시켰고, ES positive (+) 이온모드에서 Phenomenex Synergi Polar-RP 컬럼(150ㅧ4.6 mm, 4 μm)을 사용하여 LC-ESI-MS/MS (liquid chromatography-electrospray ionization-mass spectrometry, Waters/Micromass-Quattro microTMAPI) 분석을 수행하였다. 분석 용매로는 0.1% (v/v) 포름산(formic acid) 수용액을 용출 용매 A로 하고, 0.1% (v/v) 포름산 수용액과 아세토나이트릴(acetonitrile)이 20:80으로 섞인 수용액을 용출 용매 B로 하여, 분석 과정에서 유속 400 μl/min으로 용매를 흘려주었다.
분석을 위한 용매 기울기 조건은 다음과 같이 수행하였다. 구체적으로 초기 40% 용출 용매 B를 0.3 분간 유지 후, 7 분까지 75% 용출 용매 B가 되도록 상승시키고, 이어 15 분까지 85% 용출 용매 B가 되도록 상승시킨 후, 22 분까지 100% 용출 용매 B가 되도록 상승시킨다. 이후 3 분간 100% 용출 용매 B 농도를 유지한 후, 초기 조건 40% 용출 용매 B가 되도록 10 분간 유지하였다.
목표물질에 대한 MS/MS (mass spectrum) 검출방법 및 정량은 MRM (multiple reactions monitoring) 모드로 수행하였다. 양이온화된 분자 이온이 선택된 분석물질에 특이적인 해당조각(산물) 이온으로 전환되는 것을 탐지하기 위하여 두 개의 질량이온 [모이온(parent mass ion) > 딸이온(daughter mass ion)]을 선택하여 수행하였다: 레스베라트롤 229>135, 피노스틸벤 243>121, 테로스틸벤 257>133. 표준물질은 시그마-알드리치(Sigma-Aldrich)에서 구입하였다.
실시예 5: 대장균 BL21 (DE3)/pYJ1869 내 레스베라트롤의 생산 확인
실시예 3-1의 방법으로 형질전환 및 배양한 대장균 BL21 (DE3)/pYJ1869로부터 레스베라트롤의 생산을 확인하기 위하여 실시예 4와 같은 방법으로 생합성 화합물을 추출하고 분석하였다. 간략하게, 이종 숙주에서 레스베라트롤의 생산을 확인하기 위하여 실시예 2에서 제조한 발현벡터 pYJ1869를 대장균 BL21 (DE3)에 형질전환하여 대장균 BL21 (DE3)/pYJ1869 균주를 제작하였다(도 4). 그 다음, 본 배양과정에서 1 mM IPTG 를 넣어 3 시간 발현한 뒤 원심분리하여 세포를 회수하였다. 확보한 세포는 대조군(control)으로, 대장균 이차대사산물 생산배지 YM9, 그리고 실험군으로 방선균 이차대사산물 생산배지, 즉, 공배양을 위한 R2YE 액체 배지를 사용하여 추가배양을 진행하였으며, 각각에 대해 생산성을 비교분석 하였다.
LC-ESI-MS/MS 분석 조건에서, 10 분에 용출되는 레스베라트롤은 분자이온 [M+H]+이 229 값을 나타내며, 이로부터 절단된 이온은 m/z 135의 값을 나타낸다. 레스베타트롤 표준물질의 정체 시간과 MS/MS 스펙트럼을 비교하여 대장균 BL21 (DE3)/pYJ1869 형질전환체에서 생산된 물질이 레스베라트롤 임을 확인하였다. 그 결과, 레스베라트롤은 YM9 배지에서 200 mg/l, R2YE 배지에서 60 mg/l를 얻어 방선균 생산배지 R2YE에서도 레스베라트롤이 생산됨을 확인하였다(도 5).
실시예 6: 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001/pYJ1852 내 생물전환방법을 이용한
VvROMT
op의 기능 확인
실시예 3-2의 방법으로 형질전환 및 배양한 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001/pYJ1852로부터 VvROMTop 유전자의 기능을 확인하기 위하여 실시예 4와 같은 방법으로 생합성 화합물을 추출하고 분석하였다. 간략하게, 이종숙주 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001에서 VvROMTop 유전자의 기능을 확인하기 위하여, 실시예 2에서 제조한 발현벡터 pYJ1852를 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001에 형질전환 시켜 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001/pYJ1852 돌연변이주를 제작하였다. 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001/pYJ1852는 레스베라트롤을 전구체로 사용하여 테로스틸벤을 만들었으며(도 7) 이는 LC-ESI-MS/MS로 확인하였다(도 8).
실시예 7: 공배양을 통한 테로스틸벤의 생산 확인
실시예 3-3의 방법으로 대장균 BL21 (DE3)/pYJ1869와 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001/pYJ1852를 공배양하고 실시예 4의 방법으로 생합성 화합물의 추출 및 분석을 수행하였다. 상기 두 균주의 공배양을 통한 테로스틸벤의 생산을 시간별로 확인한 결과, 48 시간 배양하였을 때 최대 7.8 mg/l의 테로스틸벤이 생산되었으며(도 9), 이는 LC-ESI-MS/MS로 확인하였다.
본 명세서는 본 발명의 기술 분야에서 통상의 지식을 가진 자이면 충분히 인식하고 유추할 수 있는 내용은 그 상세한 기재를 생략하였으며, 본 명세서에 기재된 구체적인 예시들 이외에 본 발명의 기술적 사상이나 필수적 구성을 변경하지 않는 범위 내에서 보다 다양한 변형이 가능하다. 따라서 본 발명은 본 명세서에서 구체적으로 설명하고 예시한 것과 다른 방식으로도 실시될 수 있으며, 이는 본 발명의 기술 분야에 통상의 지식을 가진 자이면 이해할 수 있는 사항이다.
<110> EWHA UNIVERSITY - INDUSTRY COLLABORATION FOUNDATION
<120> Recombinant vector, transforman and method for producing
pterostilbene using the same
<130> P17-064-EWHA
<160> 5
<170> KoPatentIn 3.0
<210> 1
<211> 1869
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> At4CL
<400> 1
ttacaatggc gccacaagaa caagcagttt ctcaggtgat ggagaaacag agcaacaaca 60
acaacagtga cgtcattttc cgatcaaagt taccggatat ttacatcccg aaccacctat 120
ctctccacga ctacatcttc caaaacatct ccgaattcgc cactaagcct tgcctaatca 180
acggaccaac cggccacgtg tacacttact ccgacgtcca cgtcatctcc cgccaaatcg 240
ccgccaattt tcacaaactc ggcgttaacc aaaacgacgt cgtcatgctc ctcctcccaa 300
actgtcccga attcgtcctc tctttcctcg ccgcctcctt ccgcggcgca accgccaccg 360
ccgcaaaccc tttcttcact ccggcggaga tagctaaaca agccaaagcc tccaacacca 420
aactcataat caccgaagct cgttacgtcg acaaaatcaa accacttcaa aacgacgacg 480
gagtagtcat cgtctgcatc gacgacaacg aatccgtgcc aatccctgaa ggctgcctcc 540
gcttcaccga gttgactcag tcgacaaccg aggcatcaga agtcatcgac tcggtggaga 600
tttcaccgga cgacgtggtg gcactacctt actcctctgg cacgacggga ttaccaaaag 660
gagtgatgct gactcacaag ggactagtca cgagcgttgc tcagcaagtc gacggcgaga 720
acccgaatct ttatttccac agcgatgacg tcatactctg tgttttgccc atgtttcata 780
tctacgcttt gaactcgatc atgttgtgtg gtcttagagt tggtgcggcg attctgataa 840
tgccgaagtt tgagatcaat ctgctattgg agctgatcca gaggtgtaaa gtgacggtgg 900
ctccgatggt tccgccgatt gtgttggcca ttgcgaagtc ttcggagacg gagaagtatg 960
atttgagctc gataagagtg gtgaaatctg gtgctgctcc tcttggtaaa gaacttgaag 1020
atgccgttaa tgccaagttt cctaatgcca aactcggtca gggatacgga atgacggaag 1080
caggtccagt gctagcaatg tcgttaggtt ttgcaaagga accttttccg gttaagtcag 1140
gagcttgtgg tactgttgta agaaatgctg agatgaaaat agttgatcca gacaccggag 1200
attctctttc gaggaatcaa cccggtgaga tttgtattcg tggtcaccag atcatgaaag 1260
gttacctcaa caatccggca gctacagcag agaccattga taaagacggt tggcttcata 1320
ctggagatat tggattgatc gatgacgatg acgagctttt catcgttgat cgattgaaag 1380
aacttatcaa gtataaaggt tttcaggtag ctccggctga gctagaggct ttgctcatcg 1440
gtcatcctga cattactgat gttgctgttg tcgcaatgaa agaagaagca gctggtgaag 1500
ttcctgttgc atttgtggtg aaatcgaagg attcggagtt atcagaagat gatgtgaagc 1560
aattcgtgtc gaaacaggtt gtgttttaca agagaatcaa caaagtgttc ttcactgaat 1620
ccattcctaa agctccatca gggaagatat tgaggaaaga tctgagggca aaactagcaa 1680
atggattgtg atggatgatt tcaaccaaaa agcaaagatg atttcaatgt gtatatacat 1740
acaactgttt gacccaacca aggaaacaaa ctcatacgaa ccattgtctt ttgttgttgt 1800
tgttgttgtt gttgttgctg ttcttgcttg attcatgtaa tgagcctttg tgatgaaggt 1860
ggtttcttt 1869
<210> 2
<211> 1182
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> VvSTS
<400> 2
atggcttcag tcgaggaatt tagaaacgct caacgtgcca agggtccggc caccatccta 60
gccattggca cagctacccc cgaccactgt gtctaccagt ctgattatgc tgatttctat 120
ttcagggtca ctaagagcga gcacatgact gcgttgaaga agaagttcaa tcgcatatgt 180
gacaaatcca tgatcaagaa gcgttacatt catttgaccg aagaaatgct tgaggagcac 240
ccaaacattg gtgcttatat ggctccatct cttaacatac gccaagagat tatcactgcc 300
gaggtaccca agctcggtaa ggaagcagcg ttgaaggctc ttaaagagtg gggtcagcct 360
aaatcgaaga tcacccacct tgtattttgt accacctcag gtgtagaaat gcctggtgca 420
gattataaac tcgctaatct cttaggcctc gaaccatctg tcagaagagt gatgttgtac 480
catcaagggt gctatgcagg tggaactgtc cttcgaactg ctaaggatct tgcagagaat 540
aatgcaggag cacgagttct tgtggtgtgc tctgagatca cagttgttac atttcgcggc 600
ccttccgaag atgctttgga ctctttagtt ggccaagccc tttttggtga tgggtctgca 660
gctgtaatcg taggatcaga tccggatatc tcaattgaac gaccactctt ccagcttgtc 720
tcagcagccc aaacatttat tcctaattct gcaggtgcca ttgcaggaaa cttacgtgag 780
gtgggactca cctttcattt gtggcccaat gtgcccactt taatttctga gaacatagag 840
aaatgtttga ctcaggcttt tgacccactt ggtattagcg attggaactc gttattttgg 900
attgctcacc caggtggccc tgcaattctt gatgcagttg aagcaaaact caatttagat 960
aaaaagaaac tcgaagcaac gaggcatgtg ctaagtgagt atggaaacat gtcaagtgca 1020
tgtgtgttgt ttattttgga tgagatgaga aagaaatccc ttaaggggga gagggccacc 1080
acgggtgaag gattggattg gggagtatta ttcggttttg gaccaggctt gactattgaa 1140
actgttgtgt tacatagcat tcctatggtt acaaattaag cc 1182
<210> 3
<211> 1074
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> VvROMT
<400> 3
atggatttgg caaacggtgt gatatcagct gagctgcttc atgctcaagc tcatgtctgg 60
aatcatatat tcaacttcat aaagtctatg tcactaaaat gtgctattca actaggcatc 120
ccagacatca tccacaacca tggcaagccc atgactcttc ctgagctagt cgctaagctc 180
ccagtccacc ctaaaaggag tcagtgcgtg taccgtctca tgcgcattct tgttcattct 240
ggcttccttg ctgcgcaaag agtccaacaa ggtaaggaag aggaggggta tgtgcttaca 300
gatgcctcta ggctccttct aatggatgac tccttgagca taaggccctt ggtgcttgcc 360
atgctcgacc caattttaac taaaccatgg cattatctga gtgcttggtt tcaaaatgat 420
gatcccactc cgttccacac tgctcatgag cggtcatttt gggattatgc cggccatgaa 480
ccccagctca acaattcctt caatgaagcc atggctagcg atgctcgctt actcaccagc 540
gtgctgctta aggagggcca gggcgtattt gcggggttga actcattagt tgatgtaggg 600
ggtggcaccg gaaaagtggc caaggccatt gctaacgctt tcccacattt gaactgcacc 660
gtgttagatc tcccccacgt ggttgctggc ttgcaaggga gcaagaactt gaactacttt 720
gcaggtgata tgtttgaggc aattcctcct gcagacgcaa ttttactcaa gtggatactg 780
cacgactgga gcgatgaaga atgcgtgaag atactaaagc gatgcaggga agcaattccg 840
agcaaggaaa acggaggaaa ggtgattatc atagacatga tcatgatgaa gaatcaagga 900
gactacaagt ccacagaaac acagctgttc tttgatatga cgatgatgat tttcgccccg 960
ggtagagaga gggacgagaa cgaatgggag aagctattct tggatgctgg tttcagtcac 1020
tacaagataa ctcccatttt gggtttgagg tccctcattg aggtttatcc ttga 1074
<210> 4
<211> 1074
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> VvROMTop
<400> 4
atggatttgg cgaacggtgt tatcagcgct gagttgttac acgctcaggc gcacgtttgg 60
aaccacattt tcaacttcat caagtccatg tccctgaagt gcgctattca gctcggcatt 120
ccagacatca tccacaacca cggcaagccc atgacgcttc cggagctcgt cgccaagctg 180
ccagtccacc caaagaggtc ccagtgcgtt taccgtctca tgcgcattct ggttcactct 240
ggctttcttg ctgcccagcg ggttcagcag ggaaaggagg aggaggggta tgtgctgaca 300
gacgcttcta ggctcctttt aatggatgac tccttgtcca tcaggccctt ggtgctggcc 360
atgctcgacc caatactcac caagccctgg cactatctgt cggcttggtt ccagaacgat 420
gaccccacgc cgtttcatac ggctcacgag cggtcttttt gggattatgc cggtcacgaa 480
ccgcagctca acaacagctt taatgaagca atggcgtcgg atgcgcgctt gctcaccagc 540
gtgctgctga aggaggggca gggcgtattt gcgggactca actcgttagt tgatgtcggg 600
ggcggcacgg gaaaggtggc caaggctatt gctaacgcct tcccgcacct taactgcacc 660
gtgttagatc tcccccacgt ggttgcgggc ctgcaaggga gcaagaactt gaactacttt 720
gcaggtgaca tgtttgaggc tatcccgccg gcagacgcaa tattactcaa gtggatactc 780
cacgactggt cggacgagga atgcgtgaag atcctcaagc ggtgccggga ggcaattcca 840
agcaaggaaa acggaggcaa ggtgataatc attgacatga tcatgatgaa gaaccaggga 900
gactacaagt ccacggaaac acagcttttc tttgatatga cgatgatgat tttcgccccg 960
ggacgggaga gggacgaaaa cgagtgggag aagctcttct tggatgctgg tttctcccac 1020
tacaagatca cccccatttt gggcctgagg tccctcattg aggtttatcc gtga 1074
<210> 5
<211> 220
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pstS promoter
<400> 5
cctcctcgtc tggctgccgc cgggcgaggc ccgcgcacgc ctcacccagc cgcgcgaccg 60
cgagctgctt gacgccgccg tggcgacctc acgccactga cgccttccgg agcgaccgca 120
cccgggcttc cggcacggtt cacttcccgt tcactctcct ccgtcgaccg cttcacctgt 180
tctgcctaat ttcggactca cacggtgcac ggagcactgc 220
Claims (13)
- 4-쿠마레이트 조효소 A 리가아제 및 스틸벤 합성효소 발현능을 갖는 대장균(E.coli); 및
O-메틸트랜스퍼라제 발현능을 갖는 스트렙토마이세스 베네주엘래(Streptomyces venezuelae) DHS2001 균주를 공배양하여 테로스틸벤을 생산하는 방법. - 제1항에 있어서, 상기 대장균은 4-쿠마레이트 조효소 A 리가아제를 코딩하는 유전자 및 스틸벤 합성효소를 코딩하는 유전자를 포함하는 재조합 벡터로 형질전환된 것인, 방법.
- 제2항에 있어서, 상기 4-쿠마레이트 조효소 A 리가아제를 코딩하는 유전자는 아라비돕시스 탈리아나(Arabidopsis thaliana)로부터 클로닝된 서열번호 1의 At4CL 유전자이고, 상기 스틸벤 합성효소를 코딩하는 유전자는 비티스 비니훼라(Vitis vinifera)로부터 클로닝된 서열번호 2의 VvSTS 유전자인 것인, 방법.
- 제2항에 있어서, 상기 재조합 벡터는 도 3의 개열지도를 갖는 것인, 방법.
- 제1항에 있어서, 상기 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001 균주는 O-메틸트랜스퍼라제를 코딩하는 유전자를 포함하는 재조합 벡터로 형질전환된 것인, 방법.
- 제5항에 있어서, 상기 O-메틸트랜스퍼라제를 코딩하는 유전자는 비티스 비니훼라(Vitis vinifera)로부터 클로닝된 서열번호 3의 VvROMT 유전자를 상기 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001 균주에서 발현이 증가되도록 변이시킨 것인, 방법.
- 제6항에 있어서, 상기 O-메틸트랜스퍼라제를 코딩하는 유전자는 서열번호 4의 유전자인 것인, 방법.
- 제5항에 있어서, 상기 재조합 벡터는 도 6의 개열지도를 갖는 것인, 방법.
- 스트렙토마이세스 베네주엘래(Streptomyces venezuelae) DHS2001 균주에서 발현이 증가되도록 변이시킨 서열번호 4의 O-메틸트랜스퍼라제 코딩 유전자.
- 서열번호 4의 유전자를 포함하는 재조합 벡터.
- 제10항에 있어서, 상기 재조합 벡터는 도 6의 개열지도를 갖는 것인 벡터.
- 제10항 또는 제11항의 재조합 벡터로 형질전환된 스트렙토마이세스 베네주엘래(Streptomyces venezuelae) DHS2001 균주.
- 제10항 또는 제11항의 재조합 벡터를 제조하여 스트렙토마이세스 베네주엘래(Streptomyces venezuelae) DHS2001 균주에 형질전환시키는 단계를 포함하는, O-메틸트랜스퍼라제 발현능을 갖도록 형질전환된 스트렙토마이세스 베네주엘래 DHS2001 균주의 제조 방법.
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Cited By (2)
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---|---|---|---|---|
KR20210066471A (ko) | 2019-11-28 | 2021-06-07 | 광주과학기술원 | 식별력이 향상된 스마트부이 |
KR20210066458A (ko) | 2019-11-28 | 2021-06-07 | 광주과학기술원 | 친환경 소재가 코팅된 스마트부이 |
Citations (2)
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---|---|---|---|---|
KR101617126B1 (ko) * | 2015-05-15 | 2016-05-02 | 이화여자대학교 산학협력단 | 신규 pstS 프로모터 및 이를 이용한 페닐프로파노이드의 제조방법 |
KR20160079865A (ko) * | 2013-11-01 | 2016-07-06 | 코나겐 인크. | 프테로스틸벤의 생합성 제조를 위한 o-메틸트랜스퍼라제의 사용 방법 |
-
2017
- 2017-05-31 KR KR1020170067492A patent/KR102018422B1/ko active IP Right Grant
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---|---|---|---|---|
KR20160079865A (ko) * | 2013-11-01 | 2016-07-06 | 코나겐 인크. | 프테로스틸벤의 생합성 제조를 위한 o-메틸트랜스퍼라제의 사용 방법 |
KR101617126B1 (ko) * | 2015-05-15 | 2016-05-02 | 이화여자대학교 산학협력단 | 신규 pstS 프로모터 및 이를 이용한 페닐프로파노이드의 제조방법 |
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Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
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KR20210066458A (ko) | 2019-11-28 | 2021-06-07 | 광주과학기술원 | 친환경 소재가 코팅된 스마트부이 |
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