KR20180057637A - 개의 암을 치료하기 위한 키메라 aav-항-vegf - Google Patents

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크리스티안 힌더러
제임스 엠. 윌슨
매튜 윌슨
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더 트러스티스 오브 더 유니버시티 오브 펜실바니아
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Abstract

대상의 혈관육종 치료를 위한 조성물 및 방법이 제시된다. 캡시드 및 핵산 발현 카세트를 포함하는 벡터 게놈을 포함하는 재조합 AAV가 제시된다. 상기 발현 카세트는 프로모터, 항-VEGF 항체 중쇄 면역글로불린에 작동가능하도록 연계된 제 1 신호 펩티드, 링커 서열, 그리고 항-VEGF 경쇄 면역글로불린에 작동가능하도록 연계된 제 2 신호 펩티드를 인코드하는 서열을 포함하며, 이때 전술한 발현 카세트는 면역글로불린 쇄들이 기능성 키메라 항-VEGF 항체로 어셈블리되는 것을 허용하는 조건하에서 숙주 세포 안에서 상기 쇄들을 공동-발현시킨다. 한 구체예에서, 상기 항-VEGF 항체는 키메라 항체다.

Description

개의 암을 치료하기 위한 키메라 AAV-항-VEGF
전자형태로 제출된 편입된 참고 자료들
출원인은 여기에 전자 형식으로 제출된 서열 목록 자료를 참조서류에 편입시킨다. 이 화일은 "15-7473_SEQ_LISTING_ST25"로 명명한다.
발명의 배경
혈관육종 (HSA)은 미국에서 년간 25 만 마리 이상의 개에서 발병된다. HSA는 대개 비장이나 간장에 위치한 혈관 종양이다. 현재 HSA는 완치될 수 없으며, 표준 요법은 일반적으로 수술 후 독소루비신(doxorubicin)의 화학 치료 요법을 후속적으로 하는 것이다. 이 요법은 일반적으로 6,000 달러이상이 소요되며, 생존을 추가로 3-4 개월 연장할 수 있다. 비록 임의의 연령 및 품종의 개가 혈관육종에 걸리기 쉽긴 하지만, 중년(6살 이상)에서 더 흔하게 발행되며, 골든 리트리버(Golden Retrievers), 독일 셰퍼드 개(German Shepherd Dogs), 포르투갈 워터 도그(Portuguese Water Dogs), 베르네 산 마운틴 도그(Bernese Mountain Dogs), 플랫 코팅 리트리버(Flat Coated Retrievers), 복서 및 스카이 테리어(Boxers and Skye Terriers)와 같은 품종에서 보다 일반적으로 발생한다. 2000 년에 발표된 골든 리트리버 건강 연구 (Golden Retriever Health Study)에 따르면, 일상동안의 이 품종에서 혈관 육종의 예상된 위험은 5 마리중 1마리로써, 이 문제의 심각성을 보여준다.
개에서 혈관육종의 가장 흔한 부위는 비장, 심장의 우심방, 피부 아래의 조직인 피하 조직이다. 이러한 종양의 성장 패턴은 전이 뿐만 아니라, 종양을 둘러싼 정상 조직으로의 침윤을 포함한다.
HSA 종양은 혈관신생 성장을 통하여 혈관을 형성하고, 증식하는 것을 돕는 혈관 내피 성장 인자 (VEGF) 및 VEGF 수용체를 또한 발현시킨다. 현재 개나 다른 반려 동물에게 이용할 수 있는 VEGF 표적 치료법은 없다.
아데노 연합된 바이러스 (AAV)는 안전성 프로파일과 생체 내에서 장기적인 유전자 발현 능력으로 인하여, 치료 유전자를 전달하는데 있어서 바람직한 벡터이다. 재조합 AAV 벡터 (rAAV)는 생체 내에서 단일 사슬 및 전장 항체를 발현하는데 이미 사용되어 왔다. AAV의 제한된 이식유전자(transgene) 패키징(packaging) 용량으로 인하여, 전장의 항체를 생성하기 위해 단일 AAV 벡터를 사용하여 항체의 중쇄 및 경쇄를 발현하도록 엄격하게 조절된 시스템을 갖는 것이 기술적인 과제였다.
따라서, 대상, 특히 반려 동물에서 VEGF를 표적화하는데 유용한 조성물이 필요하다.
발명의 요약
새롭게 조작된 개의 키메라 항-VEGF 항체 구조체(constructs)가 제시된다. 이러한 구조체들은 다수의 경로를 통해, 특히 재조합 아데노-관련 바이러스 (rAAV) 벡터와 같은 재조합 벡터에 의해 매개되는 생체 내 발현에 의해 이를 필요로 하는 대상에게 전달될 수 있다. 한 구체예에서, 상기 대상은 반려 동물, 가령, 개 또는 고양이다.
한 측면에서, 바이러스 벡터가 제시된다. 한 구체예에서, 상기 바이러스 벡터는 숙주 세포에서 VEGF 항체 발현을 지시하는 발현 제어 서열에 작동가능하도록 연계된, 개의 키메라 혈관 내피 성장 인자 (VEGF) 항체를 인코드하는 서열이 포함된 최소한 하나의 핵산 발현 카세트를 포함한다.
또 다른 구체예에서, 상기 바이러스 벡터는 다음을 인코드하는 서열이 포함된 최소한 하나의 핵산 발현 카세트를 포함한다: 프로모터, 개의 키메라 항-VEGF 항체 중쇄 면역글로불린에 작동가능하도록 연계된 제1 신호 펩티드, 링커 서열, 그리고 개의 키메라 항-VEGF 경쇄 면역글로불린에 작동가능하도록 연계된 제2 신호 펩티드, 이때 전술한 발현 카세트는 상기 면역글로불린 쇄들이 기능을 하는 개의 키메라 항-VEGF 항체로 어셈블리되는 것을 허용하는 조건하에서 숙주 세포 안에서 상기 쇄들을 공동-발현시킨다.
또 다른 측면에서, 바이러스 벡터는 서열 번호: 15의 항-VEGF 항체 중쇄 면역글로불린 및/또는 서열 번호: 14의 항-VEGF 항체 경쇄 면역글로불린이 포함된 개의 VEGF에 결합하는 기능을 하는 항-VEGF 항체, 그리고 면역글로불린 쇄들이 기능을 하는 항체로 어셈블리되는 것을 허용하는 조건하에서 숙주 세포 안에서 상기 쇄들의 발현을 지시하는 발현 제어 서열을 포함하는 핵산 서열이 포함된 최소한 하나의 핵산 발현 카세트를 포함한다.
또 다른 구체예에서, 상기 바이러스 벡터는 다음을 인코드하는 서열이 포함된 최소한 하나의 핵산 발현 카세트를 포함한다: 5' AAV 역전된 말단 반복 서열 (ITR), 임의선택적 인헨서와 함께 프로모터, 개의 키메라 항-VEGF 항체 중쇄 면역글로불린에 작동가능하도록 연계된 제 1 신호 펩티드, 링커 서열, 항-VEGF 경쇄 면역글로불린에 작동가능하도록 연계된 제2 신호 펩티드, 그리고 3' AAV ITR, 이때 전술한 발현 카세트는 상기 면역글로불린 쇄들이 기능을 하는 개의 키메라 항-VEGF 항체로 어셈블리되는 것을 허용하는 조건하에서 숙주 세포 안에서 상기 쇄들을 공동-발현시킨다. 상기 바이러스 벡터로부터 생산된 키메라 항-VEGF 항체가 또한 제시된다. 한 구체예에서, 상기 항-VEGF 항체는 키메라 항체이며, 여기에서 뮤린 가변 쇄들은 개의 불변 도메인에 연계된다. 한 구체예에서, 상기 바이러스 벡터는 아데노-연합된 바이러스 벡터다. 또 다른 구체예에서, 상기 벡터는 AAV8, rh64R1, AAV9, AAVhu.37, 또는 rh10 및 이의 변이체들로부터 선택된 캡시드(capsid)를 갖는 rAAV다. 한 구체예에서, 상기 캡시드는 AAV8 캡시드 또는 이의 변이체다.
또 다른 구체예에서, 상기 바이러스 벡터는 또 다른 바이러스 벡터로부터 선택된다. 다른 적합한 벡터로는 아데노바이러스, RNA 벡터 (가령, 레트로바이러스 이를 테면, 예로써, 몰로니(Moloney) 뮤린 육종바이러스 (MoMSV), 하르베이(Harvey) 뮤린 육종바이러스 (HaMuSV), 뮤린 유선 종양 바이러스 (MuMTV), 긴팔원숭이(gibbon ape) 백혈병 바이러스 (GaLV), 고양이 백혈병 바이러스 (FLV), 스푸마바이러스, 프렌드(Friend), 뮤린 줄기 세포 바이러스 (MSCV) 및 라우스(Rous) 육종바이러스 (RSV))를 포함하나, 이에 국한되지 않는다. 본 발명에서 이용되는 "레트로바이러스 벡터(retroviral vectors)"는 인간 T 세포 백혈병 바이러스, HTLV-1 및 HTLV-2, 그리고 레트로바이러스의 렌티바이러스 패밀리, 이를 테면 인간 면역결핍 바이러스, HIV-1, HIV-2, 유인원의 면역결핍 바이러스 (SIV), 고양이 면역결핍 바이러스 (FIV), 말의 면역결핍 바이러스 (EIV), 그리고 다른 부류의 레트로바이러스, 리포좀, 양이온 지질, 렌티바이러스 벡터, 및 트랜스포존으로부터 유래된 벡터를 또한 포함한다. 또 다른 구체예에서, 상기 바이러스 벡터는 수포성 구내염 바이러스다.
또 다른 측면에서, 약학적으로 수용가능한 운반체와 본원에서 기술된 바이러스 벡터를 포함하는 약학 조성물이 제공된다. 또 다른 구체예에서, 상기 약학 조성물은 바이러스 벡터 및 운반체, 희석제, 부형제 및/또는 어쥬번트를 포함하는 현탁액이다.
또 다른 측면에서, 암, 가령, 혈관육종을 치료하는 방법이 제시된다. 한 구체예에서, 상기 방법은 본 발명에서 기술된 바이러스 벡터-함유 조성물을 투여하는 것을 포함한다.
또 다른 측면에서, 키메라 항-VEGF 항체가 제시된다. 한 구체예에서, 상기 키메라 항체는 뮤린 및 개의 면역글로불린 도메인을 포함한다. 또 다른 측면에서, 약학적으로 수용가능한 운반체와 복합된, 키메라 항-VEGF 항체를 포함하는 약학 조성물이 제공된다. 또 다른 구체예에서, 상기 약학 조성물은 개의 키메라 항-VEGF 항체 그리고 운반체, 희석제, 부형제 및/또는 어쥬번트를 포함한다.
본 발명의 다른 측면들 및 이점은 이하의 본 발명의 상세한 설명으로부터 바로 명백해질 것이다.
도 1은 정제된 키메라 뮤린-개의 항-VEGF 항체를 보여주는 SDS-PAGE 사진이다. 상기 래더(ladder)는 Pageruler Prestained (Thermo Scientific)이다.
도 2는 AAV8 벡터로 처리된 3마리 개에서 혈청 항-VEGF 항체 농도를 보여주는 그래프다.
도 3은 실시예 1에 이용된 발현 구조체의 카툰 맵(cartoon map)이다.
도 4 는 도 3 및 실시예 1의 발현 카세트의 레이아웃을 보여주는 카툰 맵이다.
도 5는 본 발명의 한 구체예의 키메라 항-VEGF 항체 경쇄 (상부; 서열 번호: 14) 및 중쇄 (하부; 서열 번호: 15)를 보여준다. 상보성 결정 영역 (CDRs)은 밑줄로 표시된다.
발명의 상세한 설명
키메라 항-VEGF 혈관 내피 성장 인자 (VEGF) 항체를 인코드하는 서열과 숙주 세포에서 이 VEGF 항체의 발현을 지시하는 발현 제어 서열에 작동가능하도록 연계된, 서열이 포함된 최소한 하나의 핵산 발현 카세트를 포함하는 바이러스 벡터가 본 명세서에서 기술된다. 또한, 본원에 기재된 구조체를 사용하여 생산된 개과 뮤린 영역 모두를 함유하는 키메라 항-VEGF 항체가 제공된다. AAV8 벡터에 의해 발현되는 예시적인 구조체를 사용하여, 발명자는 생체 내 연구에서 110 일 이상의 지속적인 항체 발현을 입증하였다.
한 구체예에서, 상기 바이러스 벡터는 다음을 인코드하는 핵산 서열이 포함된 최소한 하나의 핵산 발현 카세트를 포함한다: 프로모터, 개의 키메라 항-VEGF 항체 중쇄 면역글로불린에 작동가능하도록 연계된 제1 신호 펩티드, 링커 서열, 그리고 개의 키메라 항-VEGF 경쇄 면역글로불린에 작동가능하도록 연계된 제2 신호 펩티드, 이때 전술한 발현 카세트는 상기 면역글로불린 쇄들이 기능을 하는 키메라 항-VEGF 항체로 어셈블리되는 것을 허용하는 조건하에서 숙주 세포 안에서 상기 쇄들을 공동-발현시킨다 (도 4). 또 다른 구체예에서, 상기 바이러스 벡터는 다음을 인코드하는 핵산 서열이 포함된 최소한 하나의 핵산 발현 카세트를 포함한다: 5' AAV 역전된 말단 반복 서열 (ITR), 임의선택적 인헨서와 함께 프로모터, 개의 키메라 항-VEGF 항체 중쇄 면역글로불린에 작동가능하도록 연계된 제 1 신호 펩티드, 링커 서열, 개의 키매라 항-VEGF 경쇄 면역글로불린에 작동가능하도록 연계된 제2 신호 펩티드, 그리고 3' AAV ITR, 이때 전술한 발현 카세트는 상기 면역글로불린 쇄들이 기능을 하는 개의 키메라 항-VEGF 항체로 어셈블리되는 것을 허용하는 조건하에서 숙주 세포 안에서 상기 쇄들을 공동-발현시킨다. 본 명세서에서 사용된 바와 같이, "기능을 하는 항체(functional antibody)"는 원하는 생리학적 결과에 영향을 주는 충분한 결합 친화력을 갖고 선택된 표적(가령, VEGF)에 결합하는 항체 또는 면역글로불린일 수 있으며, 이때 상기 결과는 보호를 위한 (가령, 수동 면역화) 또는 치료 (가령, VEGF 중화)일 수 있다.
한 구체예에서, 상기 항-VEGF 항체는 키메라다. 본 명세서에서 사용된 바와 같이, "키메라(chimera)"는 각각의 "부모 (parent)" 단백질로부터 유래된 성질을 키메라 항체에 부여하기 위해, 둘 이상의 종으로부터 유래된 단백질의 영역을 통합한 항체를 말한다. 한 구체예에서, 상기 항체는 뮤린 면역글로불린 도메인을 함유한다. 한 구체예에서, 상기 항체는 개의 면역글로불린 도메인을 함유한다. 한 구체예에서, 상기 항체는 뮤린 가변 영역을 함유한다. 또 다른 구체예에서, 상기 항체는 또 다른 종으로부터 유래된 가변 쇄 영역을 함유한다. 한 구체예에서, 상기 항체는 뮤린 항체의 가변 영역과 개의 불변 쇄 영역을 함유하고, 이렇게 생성된 항체를 "키메라"라고 한다. 또 다른 구체예에서, 상기 항체는 이 항체가 궁극적으로 투여되기로 예정된 대상과 동일한 종으로부터 유래된 불변 쇄 영역을 함유한다. 한 구체예에서, 상기 Fc 영역은 개의 서열이다. 또 다른 구체예에서, 상기 항-VEGF 항체는 뮤린 항-VEGF 항체의 가변 영역과 개의 VEGF IgGA/카파 불변 영역을 포함한다. 한 구체예에서, 상기 뮤린 가변 영역은 뮤린 단일클론 항체 a4.6.1로부터 유래된다 (Gerber et al, Mice expressing a humanized form of VEGF-A may provide insights into safety and efficacy of anti-VEGF antibodies, PNAS, 104(9):3478-83 2007 참고, 이것은 참고자료에 편입된다). 한 구체예에서, 상기 항체는 서열 번호: 14 및 서열 번호: 15의 서열을 포함한다. 또 다른 구체예에서, 상기 항체는 도 5에 나타낸 바와 같은 뮤린 CDRs이 포함된 개의 키메라 항체다. 이 구체예에서, 나머지 항체 서열은 개로부터 유래된다.
본 명세서에서 제시된 AAV 벡터는 하나 또는 그 이상의 면역글로불린 도메인을 발현시키는 1 또는 2개의 개방 해독 틀(ORF)를 함유할 수 있다. 본 명세서에서 사용된 바와 같이, "면역글로불린 도메인(immunoglobulin domain)"이란 통상의 전장(full-length) 항체와 관련하여 정의된 바와 같은 항체 중쇄 또는 경쇄의 도메인을 지칭한다. 더욱 구체적으로, 전장 항체는 하나의 N-말단 가변 (VH) 영역과 세 개의 C-말단 불변 (CH1, CH2 및 CH3) 영역으로된 4개의 주요 도메인을 함유하는 중쇄 (H) 폴리펩티드 그리고 하나의 N-말단 가변 (VL) 영역과 하나의 C-말단 불변 (CL) 영역을 함유하는 경쇄 (L) 폴리펩티드를 함유한다. Fab 영역은 각각의 중쇄 및 경쇄에 대해 하나의 불변 도메인 및 하나의 가변 도메인을 포함할 수 있다.
용어 "면역글로불린(immunoglobulin)"은 본원에서 기술한 바와 같이, 면역글로불린 도메인을 포함하는 항체 및 이의 기능적 단편을 포함하는데 사용된다. 본원에서 기술된 바와 같이, 항-VEGF 항체는 다양한 형태로 존재할 수 있는데, 예로써, 다중클론 항체, 단일클론 항체, 카멜화된(camelized) 단일 도메인 항체, 세포내 항체 ("안트라바디"), 재조합 항체, 다중특이적 항체 (이중특이적), 항체 단편, 이를 테면, Fv, Fab, F(ab)2, F(ab)3, Fab', Fab'-SH, F(ab')2, 면역흡착, 단일 쇄 가변 단편 항체 (scFv), 덴덤(tandem)/bis-scFv, Fc, pFc', scFvFc (또는 scFv-Fc), 이황화물 Fv (dsfv), 이중특이적 항체 (bc-scFv) 이를 테면 BiTE 항체; 카멜리드(camelid) 항체, 표면재처리된(resurfaced) 항체, 인간화 항체, 온전한 인간 항체, 캐니니즈화된(caninized) 항체, 온전한 개의 항체, 단일-도메인 항체 (sdAb, NANOBODY®로도 공지된), 키메라 항체, 최소한 하나의 개의 불변 영역을 포함하는 키메라 항체, 그리고 이와 유사한 것들이 포함된다. "항체 단편(antibody fragment)"이란 그의 표적에 결합하는 면역글로불린, 예를 들어 VEGF의 가변 영역의 적어도 일부를 지칭한다. 한 구체예에서, 상기 면역글로불린은 IgG이다. 그러나, 다른 유형의 면역글로불린이 선택될 수 있다.
한 구체예에서, 상기 항-VEGF 항체는 키메라 단일클론 항체다. 한 구체예에서, 상기 항-VEGF 항체 중쇄 면역글로불린은 가변 쇄 서열 (VH)를 함유한다. 한 구체예에서, 상기 항-VEGF 항체 중쇄 면역글로불린은 가변 쇄 서열 (VH)과 최소한 하나의 개의 불변 쇄 서열 (CH)를 함유한다. 추가 구체예에서, 상기 항-VEGF 항체 중쇄 면역글로불린은 가변 쇄 서열 (VH)과 3개의 모든 불변 쇄 서열 (CH1, CH2 및 CH3)을 함유한다. 한 구체예에서, 상기 항-VEGF 항체 가변 중쇄 면역글로불린 아미노산 서열은 서열 번호: 1이다. 한 구체예에서, 상기 불변 중쇄 아미노산 서열은 서열 번호: 2이다. 한 구체예에서, 상기 항-VEGF 경쇄 면역글로불린은 가변 쇄 서열 (VL)을 함유한다. 한 구체예에서, 상기 항-VEGF 경쇄 면역글로불린은 가변 쇄 서열(VL)과 최소한 하나의 개의 불변 쇄 서열 (CL)을 함유한다. 한 구체예에서, 상기 항-VEGF 경쇄 가변 면역글로불린 아미노산 서열은 서열 번호: 3이다. 한 구체예에서, 상기 항-VEGF 경쇄 불변 면역글로불린 아미노산 서열은 서열 번호: 4이다. 한 구체예에서, 상기 키메라 항-VEGF 경쇄 서열은 서열 번호: 14이다. 한 구체예에서, 상기 키메라 항-VEGF 중쇄 서열은 서열 번호: 15이다.
단백질 또는 핵산과 관련하여 사용되는 경우 "이종성(heterologous)"이라는 용어는 단백질 또는 핵산이 본질상 서로 동일한 관계에 있지 않는 2 개 또는 그 이상의 서열 또는 하위서열을 포함한다는 것을 나타낸다. 예를 들어, 발현 카세트는 전형적으로 새로운 기능성 핵산을 만들도록 배열된 비-관련 유전자로부터의 2 개 또는 그 이상의 서열을 갖도록 재조합적으로 생산된다. 예로써, 한 구체예에서, 상기 핵산은 상이한 유전자로부터 코딩 서열의 발현을 지시하도록 배열된 하나의 유전자로부터 유래된 프로모터를 갖는다. 따라서, 면역글로불린 코딩 서열에 있어서, 상기 프로모터는 이종성이다. 유사하게, AAV 캡시드에 있어서, 상기 면역글로불린 코딩 서열은 이종성이다.
벡터 내에 패키징된 핵산 분자에 의해 운반되는 하나 또는 이상의 ORF (들)는 2 종의 발현 카세트로부터 발현될 수 있으며, 이들중 하나 또는 둘 모두 다 바이시스트로닉 (bicistronic)일 수 있다. 따라서, 발현 카세트, 또는 발현 카세트를 포함하는 벡터의 경우에 있어서, 하나 이상의 발현 카세트가 원하는 항-VEGF 항체 서열을 발현하는데 사용되는 또 다른 구체예가 고려된다.
또 다른 측면에서, 본원에서 기술된 항체 영역 아미노산 서열을 인코드하는 핵산 서열이 또한 제시된다. 선택된 면역글로불린 도메인 (가령, 중쇄 및/또는 경쇄(들))의 코딩 서열은 수득되거나 및/또는 합성될 수 있거나 또는 본원에서 기술된다. 아미노산을 시퀀싱하는 방법은 당업자에게 공지되어 있다. 일단 아미노산 서열이 알려지면, 웹-기반 및 상업적으로 이용 가능한 컴퓨터 프로그램 뿐만 아니라, 아미노산 서열을 핵산 코딩 서열로 역-해독하는 서비스-기반 회사도 있다. 가령, backtranseq by EMBOSS, http://www.ebi.ac.uk/Tools/st/ ; Gene Infinity (http://www.geneinfinity.org/sms/sms_backtranslation.html); ExPasy (http://www.expasy.org/tools/) 참고.
한 구체예에서, RNA 및/또는 cDNA 코딩 서열은 개의 세포에서 최적 발현되도록 기획된다. 핵산을 합성하는 방법은 당업자에게 공지되어 있으며, 본원에 기재된 핵산 구조체의 전부 또는 일부에 대해 이용될 수 있다. 한 구체예에서, 항-VEGF 항체 중쇄 가변 영역을 인코딩하는 핵산 서열은 서열 번호: 6 또는 코돈 최적화된 이의 변이체를 포함한다. 한 구체예에서, 항-VEGF 항체 경쇄 가변 영역을 인코딩하는 핵산 서열은 서열 번호: 7 또는 코돈 최적화된 이의 변이체를 포함한다. 한 구체예에서, 상기 항-VEGF 항체 중쇄 불변 영역을 인코딩하는 핵산 서열은 서열 번호: 8 또는 코돈 최적화된 이의 변이체를 포함한다. 한 구체예에서, 상기 항-VEGF 항체 경쇄 불변 영역을 인코딩하는 핵산 서열은 서열 번호: 9 또는 코돈 최적화된 이의 변이체를 포함한다.
또 다른 구체예에서, 기술된 임의의 면역글로불린 도메인을 인코딩하는 핵산 서열은 본원에서 기술된 서열 (가령, 서열 번호: 6, 7, 8, 또는 9)와 최소한 50% 동일성을 공유한다. 또 다른 구체예에서, 기술된 임의의 면역글로불린 도메인을 인코딩하는 핵산 서열은 본원에서 기술된 서열 (가령, 서열 번호: 6, 7, 8, 또는 9)와 최소한 60% 동일성을 공유한다. 또 다른 구체예에서, 기술된 임의의 면역글로불린 도메인을 인코딩하는 핵산 서열은 본원에서 기술된 서열 (가령, 서열 번호: 6, 7, 8, 또는 9)와 최소한 70% 동일성을 공유한다. 또 다른 구체예에서, 기술된 임의의 면역글로불린 도메인을 인코딩하는 핵산 서열은 본원에서 기술된 서열 (가령, 서열 번호: 6, 7, 8, 또는 9)와 최소한 80% 동일성을 공유한다. 또 다른 구체예에서, 기술된 임의의 면역글로불린 도메인을 인코딩하는 핵산 서열은 본원에서 기술된 서열 (가령, 서열 번호: 6, 7, 8, 또는 9)와 최소한 90% 동일성을 공유한다.
또 다른 구체예에서, 서열 번호: 1의 상기 항-VEGF 항체 중쇄 가변 영역을 인코드하는 핵산 서열이 제시된다. 또 다른 구체예에서, 서열 번호: 2의 상기 항-VEGF 항체 중쇄 불변 영역을 인코드하는 핵산 서열이 제시된다. 또 다른 구체예에서, 서열 번호: 3의 상기 항-VEGF 항체 경쇄 가변 영역을 인코드하는 핵산 서열이 제시된다. 또 다른 구체예에서, 서열 번호: 4의 상기 항-VEGF 항체 경쇄 불변 영역을 인코드하는 핵산 서열이 제시된다. 원하는 목표 대상에서의 발현이 최적화된(가령, 코돈 최적화에 의해) 핵산 서열을 포함하여, 기술된 폴리펩티드 서열을 인코딩하는 모든 핵산이 포함되는 것으로 의도된다.
상이한 다양한 방법에 의해 코돈-최적화된 코딩 영역이 기획될 수 있다. 이러한 최적화는 온라인에서 이용가능한 방법 (예를 들어, GeneArt), 공개된 방법, 또는 코돈 최적화 서비스를 제공하는 회사, 예를 들어, DNA2.0 (Menlo Park, CA)에서 이용가능한 방법을 사용하여 수행될 수 있다. 하나의 코돈 최적화 알고리즘은 예를 들어, 본 명세서에 참고자료에 편입된 국제 특허 공개 번호 WO 2015/012924에 기술되어 있다. 가령 , 미국 특허 공개 번호 2014/0032186 및 미국 특허 공개 번호 2006/0136184를 또한 참고. 적합하게는, 생성물의 개방 해독 틀 (ORF)의 전체 길이가 변경된다. 그러나, 일부 구체예에서, 상기 ORF의 오직 한 단편(가령, 하나 또는 그 이상의 개별 면역글로불린 도메인)만이 변경될 수 있다 . 이들 방법 중 하나를 사용함으로써, 주어진 폴리펩티드 서열에 빈도를 적용하고, 이 폴리펩티드를 인코딩하는 코돈-최적화된 코딩 영역의 핵산 단편을 생성할 수 있다.
코돈에 대한 실제 변화를 수행하거나 또는 본원에 기술된 바와 같이 설계된 코돈-최적화된 코딩 영역을 합성하기 위해 다수의 옵션이 이용가능하다. 이러한 변형 또는 합성은 당업자에게 공지된 표준 및 일상적인 분자 생물학적 조작을 사용하여 수행될 수 있다. 하나의 접근법에서, 길이가 각각 80-90개 뉴클레오티드이고, 원하는 서열의 길이에 걸쳐있는 일련의 상보적 올리고 뉴클레오티드 쌍을 표준 방법에 의해 합성한다. 이들 올리고뉴클레오티드 쌍은 어닐링될 때, 코헤시드(cohesive) 단부를 함유하는 80-90개의 염기 쌍의 이중 가닥 단편을 형성하도록 합성되는데, 가령, 한 쌍의 각 올리고뉴클레오티드는 한 쌍의 다른 올리고뉴클레오티드에 상보적인 영역을 넘어서 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10개 또는 그 이상의 염기로 확장되도록 합성된다. 올리고뉴클레오티드의 각 쌍의 단일 가닥 말단은 올리고뉴클레오티드의 또 다른 쌍의 단일 가닥 말단과 어닐링하도록 기획된다. 올리고뉴클레오티드 쌍을 어닐링시키고, 대략적으로 5 내지 6 개의 이들 이중 가닥 단편을 코헤시브 단일 가닥 단부를 통해 함께 어닐링시킨 다음, 같이 결찰시키고, 표준 박테리아 클로닝 벡터, 예를 들어, Invitrogen Corporation, Carlsbad, CA로부터 입수 가능한 TOPO® 벡터로 클로닝한다. 다음에, 이 구조체는 표준 방법에 의해 서열화된다. 함께 결찰된 80 내지 90개 염기쌍 단편중 5 내지 6개의 단편, 가령, 약 500개 염기쌍의 단편으로 이루어진 이들 구조체 중 몇 개가 제조되어, 원하는 전체 서열은 일련의 플라스미드 구조체에 나타낸다. 그런 다음, 이들 플라스미드의 삽입물을 적절한 제한 효소로 절단하고, 함께 결찰시켜 최종 구조체가 형성된다. 최종 구조체는 표준 박테리아 클로닝 벡터에 클로닝되고, 서열화한다. 추가적인 방법은 당업자에게 즉시 명백할 것이다. 또한, 유전자 합성은 상업적으로 쉽게 이용 가능하다.
임의선택적으로, 발현, 표적화 또는 다른 이유를 향상시키기 위해 본원에 제공된 천연 서열 또는 서열로부터 면역글로불린 도메인 핵산 또는 아미노산 서열에 대한 치환이 만들어질 수 있다. 이러한 배열을 만들기 위한 방법 및 컴퓨터 프로그램이 이용 가능하고, 당업자에게 잘 알려져 있다. 치환은 (일문자 코드로 식별되는 아미노산)-위치 #-(일문자 코드로 식별되는 아미노산)으로 또한 표현될 수 있고, 이때 첫 아미노산은 치환된 아미노산이고, 두번째 아미노산은 명시된 위치에서 치환되는 아미노산이다. 본원에 사용된 바와 같이, 용어 "치환(substitution)" 및 "아미노산의 치환" 및 "아미노산 치환"은 아미노산 서열의 아미노산을 다른 아미노산으로 치환하는 것을 말하며, 이때 후자 아미노산은 치환된 아미노산과 상이하다. 아미노산을 치환하는 방법은 당해 기술 분야의 숙련자에게 잘 알려져 있으며, 아미노산 서열을 코딩하는 뉴클레오티드 서열의 돌연변이를 포함하나, 이에 한정되는 것은 아니다. IgG에서 아미노산 치환을 만드는 방법은 예를 들어, 아미노산 개질 기술에 대한 논의를 위해 참고 자료에 편입된 WO 2013/046704에 기재되어 있다.
또 다른 측면에서, 키메라 항-VEGF 항체 및 이의 도메인이 제시된다. 한 구체예에서, 상기 키메라 항-VEGF 항체는 뮤린 가변 영역과 개의 불변 영역을 함유한다. 한 구체예에서, 상기 항-VEGF 항체 중쇄 면역글로불린 도메인은 가변 쇄 서열과 최소한 하나의 불변 쇄 서열을 포함한다. 또 다른 구체예에서, 상기 항-VEGF 항체 중쇄 가변 단편 면역글로불린 아미노산 서열은 서열 번호: 1 (밑줄친 CDRs)이다: E I Q L V Q S G P E L K Q P G E T V R I S C K A S G Y T F T N Y G M N W V K Q A P G K G L K W M G W I N T Y T G E P T Y A A D F K R R F T F S L E T S A S T A Y L Q I S N L K N D D T A T Y F C A K Y P H Y Y G S S H W Y F D V W G A G T T V T V S S A. 또 다른 구체예에서, 상기 항-VEGF 항체 중쇄 가변 단편 면역글로불린은 서열 번호: 1과 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 그 이상의 동일성을 공유하는 서열을 갖는다. 또 다른 구체예에서, 상기 항-VEGF 항체 중쇄 면역글로불린을 인코딩하는 핵산 서열이 제시된다. 또 다른 구체예에서, 상기 항-VEGF 항체는 상기 밑줄친 CDRs을 포함한다.
또 다른 구체예에서, 상기 항-VEGF 항체 중쇄 불변 단편 면역글로불린 아미노산 서열은 서열 번호: 2이다: S T T A P S V F P L A P S C G S T S G S T V A L A C L V S G Y F P E P V T V S W N S G S L T S G V H T F P S V L Q S S G L H S L S S M V T V P S S R W P S E T F T C N V V H P A S N T K V D K P V F N E C R C T D T P P C P V P E P L G G P S V L I F P P K P K D I L R I T R T P E V T C V V L D L G R E D P E V Q I S W F V D G K E V H T A K T Q S R E Q Q F N G T Y R V V S V L P I E H Q D W L T G K E F K C R V N H I D L P S P I E R T I S K A R G R A H K P S V Y V L P P S P K E L S S S D T V S I T C L I K D F Y P P D I D V E W Q S N G Q Q E P E R K H R M T P P Q L D E D G S Y F L Y S K L S V D K S R W Q Q G D P F T C A V M H E T L Q N H Y T D L S L S H S P G K. 또 다른 구체예에서, 상기 항-VEGF 항체 중쇄 개의 불변 영역 면역글로불린은 서열 번호: 2와 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 그 이상의 동일성을 공유하는 서열을 갖는다. 또 다른 구체예에서, 상기 항-VEGF 항체 개의 중쇄 불변 영역 면역글로불린이 인코딩된 핵산 서열이 제시된다.
한 구체예에서, 상기 항-VEGF 항체 경쇄 면역글로불린 도메인은 가변 쇄 서열과 최소한 하나의 개의 불변 쇄 서열을 포함한다. 한 구체예에서, 상기 항-VEGF 항체 경쇄 가변 단편 면역글로불린 아미노산 서열은 서열 번호: 3 (밑줄친 CDRs): D I Q M T Q T T S S L S A S L G D R V I I S C S A S Q D I S N Y L N W Y Q Q K P D G T V K V L I Y F T S S L H S G V P S R F S G S G S G T D Y S L T I S N L E P E D I A T Y Y C Q Q Y S T V P W T F G G G T K L E I K R. 또 다른 구체예에서, 상기 항-VEGF 항체 경쇄 가변 영역은 서열 번호: 3과 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 그 이상의 동일성을 공유하는 서열을 갖는다. 또 다른 구체예에서, 상기 항-VEGF 항체 경쇄 가변 영역이 인코딩된 핵산 서열이 제시된다. 또 다른 구체예에서, 상기 항-VEGF 항체는 상기 밑줄친 CDRs을 포함한다.
한 구체예에서, 상기 항-VEGF 항체 경쇄 개의 불변 영역 면역글로불린 아미노산 서열은 서열 번호: 4이다: N D A Q P A V Y L F Q P S P D Q L H T G S A S V V C L L N S F Y P K D I N V K W K V D G V I Q D T G I Q E S V T E Q D K D S T Y S L S S T L T M S S T E Y L S H E L Y S C E I T H K S L P S T L I K S F Q R S E C. 또 다른 구체예에서, 상기 항-VEGF 항체 경쇄 불변 영역은 서열 번호: 4와 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 그 이상의 동일성을 공유하는 서열을 갖는다. 또 다른 구체예에서, 상기 항-VEGF 항체 경쇄 불변 영역을 인코딩하는 핵산 서열이 제시된다.
한 구체예에서, 상기 키메라 항-VEGF 항체는 서열 번호: 1, 서열 번호: 2, 서열 번호: 3, 또는 서열 번호: 4중 하나 또는 그 이상을 포함한다. 또 다른 구체예에서, 상기 키메라 항-VEGF 항체는 서열 번호: 1, 서열 번호: 2, 서열 번호: 3, 또는 서열 번호: 4중 하나 또는 그 이상과 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 그 이상의 동일성을 공유하는 하나 또는 그 이상의 서열을 포함한다.
상기 "아미노산 치환" 및 그 동의어는 아미노산을 또 다른 치환 아미노산으로 대체함으로써 아미노산 서열을 변형시키는 것을 포함한다. 상기 치환은 원하는 결과에 따라 보존적 또는 비-보존적 치환일 수 있다. 2 개의 아미노산을 언급 할 때, 보존적이라는 용어는 아미노산이 당업자에 의해 인식되는 공통적인 특성을 공유함을 의미한다. 용어 "비-보존적 (non-conservative)"이란 2 개의 아미노산을 언급 할 때, 당업자에 의해 인식되는 적어도 하나의 특성에 차이가 있는 아미노산을 의미하는 것으로 의도된다. 예로써, 이러한 성질은 소수성 비산성 측쇄들을 갖는 아미노산, 소수성 측쇄들을 갖는 아미노산 (이들은 산성 또는 비산성으로 더 분화될 수 있다), 지방족 소수성 측쇄들을 갖는 아미노산, 방향족 소수성 측쇄들을 갖는 아미노산, 극성 중성 측쇄들을 갖는 아미노산, 전기적으로 하전된 측쇄들을 갖는 아미노산, 전기적으로 하전된 산성 측쇄들을 갖는 아미노산, 그리고 전기적으로 하전된 염기성 측쇄들을 갖는 아미노산을 포함할 수 있다. 자연 발생적, 그리고 비-자연 발생적 아미노산은 당업계에 공지되어 있고, 구체예에서 아미노산을 대체하는데 사용될 수 있다. 따라서, 보존적 아미노산 치환은 소수성 측쇄를 갖는 제 1 아미노산을 소수성 측쇄를 갖는 상이한 아미노산으로 변경하는 것을 포함할 수 있고; 한편 비-보존성 아미노산 치환은 산성 소수성 측쇄를 갖는 제 1 아미노산을 상이한 측쇄, 가령, 염기성 소수성 측쇄 또는 친수성 측쇄를 갖는 상이한 아미노산으로 변경시키는 것을 포함할 수 있다. 여전히 다른 보존적 또는 비-보존인 변화는 당업자에 의해 결정될 수 있다. 여전히 다른 구체예에서, 주어진 위치에서의 치환은 본원에서 확인된 목적을 달성하기 위해 당업자에게 자명한 아미노산 또는 아미노산 군 중 하나에 관한 것이다. 본 명세서에서 사용된 바와 같이, 본원에서 사용된 용어 "동일성 %"는 아미노산 치환의 특정 수를 지칭할 수 있다. 예로써, 124개의 아미노산을 갖는 서열 번호: 1의 경우, "최소한 90% 동일성"을 공유하는 서열은 상기 고유한 서열과 비교하였을 때, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 또는 12개의 아미노산 치환을 가질 것이다. 이러한 정의가 본 명세서에서 고려된다.
선택된 면역글로불린 도메인을 발현시키기 위해, 선택된 포유류 종, 예를 들어, 개의 면역글로불린 도메인 폴리펩티드의 최적 발현을 위해 선택된 코돈을 함유하는 핵산 분자가 기획될 수 있다. 또한, 핵산 분자는 선택된 항체의 각 중쇄 및 경쇄에 대한 이종 리더 서열을 포함할 수 있다. 한 구체예에서, 리더 서열은 가변 및 불변 영역으로 구성된 중쇄 폴리펩티드의 상류에 융합된 IL-2 리더 펩티드, 그리고 가변 영역 및 불변 영역으로 구성된 경쇄 폴리펩티드의 상류에 융합된 제 2 리더 IL-2 리더 펩티드를 인코드한다. 한 구체예에서, 제 1 및 제 2 리더 서열은 동일하다. 또 다른 구체예에서, 제 1 및 제 2 리더 서열은 상이하다. 한 구체예에서, 상기 리더 서열은 서열 번호: 5: M Y R M Q L L S C I A L S L A L V T N S이다. 그러나, 또 다른 이종성 리더 서열은 IL-2 신호/리더 펩티드중 하나 또는 둘 모두에서 치환될 수 있다. 신호/리더 펩티드는 중쇄 및 경쇄 면역글로불린 도메인 구조체 각각에 있어서 동일하거나 또는 상이할 수 있다. 이들은 면역글로불린 (예:IgG)에서 본래 발견되는 신호 서열일 수도 있고, 이종성 원천으로부터 유래된 것일 수도 있다. 이러한 이종 원천은 그중에서도 사이토킨 (예:IL-2, IL12, IL18 등), 인슐린, 알부민, β-글루쿠로니다아제, 알칼리성 프로테아제 또는 피브로넥틴 분비 신호 펩티드 또는 조직 특이적 분비 단백질의 서열일 수 있다 .
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "발현 카세트(expression cassette)"란 면역글로불린 유전자(들) (가령, 면역글로불린 가변 영역, 면역글로불린 불변 영역, 면역글로불린 구조체의 전장 경쇄, 전장 중쇄 또는 또 다른 단편), 프로모터가 포함된 핵산 분자를 지칭하며, 그리고 여기에는 이들에 대한 다른 조정 서열을 함유할 수 있고, 이때 상기 카세트는 패키징 숙주 세포로 유전적 요소(가령, 플라스미드)를 통하여 전달되거나, 외피 바이러스의 외피 또는 바이러스 벡터의 캡시드(가령, AAV 또는 다른 파르보바이러스 입자)로 패키지될 수 있다. 전형적으로, 바이러스 벡터를 생성하기 위한 이러한 발현 카세트는 바이러스 게놈의 서열 및 다른 발현 제어 서열의 패키징에 의해 측면에 위치하는 본원에 기술된 면역글로불린 서열을 함유한다. 이러한 서열들은 함께, 본원에서 벡터 게놈으로 지칭될 수 있다. 그러나, 용어 "발현 카세트" 및 "벡터 게놈(vector genome)"은 상호호환적으로 사용될 수 있다. 한 구체예에서, 상기 발현 카세트는 최소한 제 1 개방 해독 틀 (ORF)과 임의선택적으로 제 2 ORF를 포함한다. ORF는 1, 2, 3, 또는 4개의 항체 도메인을 함유할 수 있다. 예로써, ORF는 전장 중쇄를 함유할 수 있다. 대안으로, ORF는 하나 또는 두개의 항체 도메인을 함유할 수 있다. 예로써, ORF는 중쇄 가변 도메인과 단일 중쇄 불변 도메인을 함유할 수 있다. 또 다른 예시에서, ORF는 중쇄 가변 도메인과 3개의 중쇄 불변 도메인을 함유할 수 있다. 또 다른 예시에서, ORF는 경쇄 가변과 경쇄 불변 영역을 함유할 수 있다. 따라서, 발현 카세트는 바이시스트로닉 (bicistronic)으로써, 즉 공유된 조절 서열로부터 ORF의 발현을 지시하는 조절 서열을 포함하도록 기획될 수 있다. 이 경우에서, 상기 2개의 ORFs는 전형적으로 링커에 의해 구별되어 있다. 적합한 링커, 이를 테면 내부 리보자임 결합 부위 (IRES) 및/또는 퓨린-2a 자가-절단 펩티드 링커 (F2a), [가령, Radcliffe and Mitrophanous, Gene Therapy (2004), 11, 1673-1674 참고]가 당분야에 공지되어 있다. 한 구체예에서, 상기 링커는 IRES이다. 또 다른 구체예에서, 상기 링커는 F2a이다. 또 다른 구체예에서, 각 ORF는 별도 발현 카세트 안에 함유되어 있다.
적합하게는, ORF는 표적 세포에서 발현을 지시하는 조절 조절 서열에 작동 가능하게 연결된다. 이러한 조절 제어 서열은 polyA, 프로모터, 및 인헨서를 함유할 수 있다. AAV 벡터로부터 공동-발현을 실행하기 위하여, 제 1 및 제 2 ORF는 최소한 하나의 인헨서 및/또는 polyA 서열을 공유할 수 있다.
최소한 하나의 항-VEGF 면역글로불린 도메인 (또는 전체 항-VEGF 항체)을 인코딩하는 서열에 추가하여, 상기 발현 카세트는 숙주 세포 안에서 VEGF 도메인/항체의 발현을 지시하는 서열을 함유한다. 적합한 조절 제어 서열은 다양한 원천으로부터 선택되고, 그리고 수득될 수 있다. 한 구체예에서, 상기 벡터는 프로모터를 포함한다. 한 구체예에서, 상기 프로모터는 구성 프로모터다. 상기 항체 도메인의 발현 제어에 적합한 구성 프로모터는 병아리 b-액틴 (CB) 또는 다른 종의 베타 액틴, 인간 사이토메갈로바이러스 (CMV) 프로모터, 유인원의 바이러스 40 (SV40)의 조기 및 후기 프로모터, U6 프로모터, 메탈로티오넨 프로모터, EF1α 프로모터, 유비퀴틴 프로모터, 하이포산틴 포스포리보실 전이효소 (HPRT) 프로모터, 디하이드로폴레이트 환원효소 (DHFR) 프로모터 (Scharfmann et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 88:4626-4630 (1991), 아데노신 데아미나제 프로모터, 포스포글리세롤 키나제 (PGK) 프로모터, 피루베이트 키나제 프로모터 포스포글리세롤 무타제 프로모터, β-액틴 프로모터 (Lai et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86: 10006-10010 (1989), UbB, UbC, 몰로니(Moloney) 백혈병 바이러스 및 기타 레트로바이러스의 긴 말단 반복(LTR), 헤르페스 심플렉스 바이러스의 티미딘 키나제 프로모터 그리고 당분야의 당업자에게 공지된 기타 구성 프로모터를 포함하나, 이에 국한되지 않는다. 본 발명에 사용하기에 적합한 조직- 또는 세포-특이적 프로모터의 예로는 내피 세포에 특이적인 엔도텔린-I (ET-I) 및 Flt-I, FoxJ1 (섬모 세포를 표적으로 하는 FoxJ1을 포함하나, 이에 국한되지 않는다).
덜 바람직하기는 하지만, 외생성 제제 (예:약리학적 제제) 또는 생리학적 신호에 반응하는 프로모터를 포함하는, 항체 도메인의 발현을 제어하기에 적합한 유도성 프로모터가 이용될 수 있다. 이들 반응 요소들은 HIF-Iα 및 β에 결합하는 저산소증 반응 요소(HRE), 금속-이온 반응 요소, 이를 테면 Mayo et al. (1982, Cell 29:99-108); Brinster et al. (1982, Nature 296:39-42) 및 Searle et al. (1985, Mol. Cell. Biol. 5:1480-1489)에서 기술된 것들; 또는 열 쇼크 반응 요소, 이를 테면 Nouer et al. (in: Heat Shock Response, ed. Nouer, L., CRC, Boca Raton, Fla., ppI67-220, 1991)에서 기술된 것들을 포함하나, 이에 국한되지 않는다.
한 구체예에서, 개방 해독 틀의 발현은 ORF (유전자)의 전사, 예를 들어 약리학적 제제 또는 약리학적 제제에 의해 활성화된 전사 인자 또는 대안적인 구체예에서 생리적 단서를 엄격하게 제어하는 조절 가능한 프로모터에 의해 조절된다. 사용될 수 있는 리간드-의존성 전사 인자 복합체인 조절가능한 프로모터의 예로는 이들의 각각의 리간드 (예를 들어, 글루코 코르티코이드, 에스트로겐, 프로게스틴, 레티노이드, 엑디손 및 이들의 유사체 및 모방체)에 의해 활성화된 핵 수용체 슈퍼 패밀리의 구성원과 테트라 사이클린에 의해 활성화된 rTTA를 포함하나, 이에 국한되지 않는다. 이러한 시스템의 ARGENT™ Transcriptional Technology (ARIAD Pharmaceuticals, Cambridge, Mass.)를 포함하나, 이에 국한되지 않는다. 이러한 프로모터 시스템의 예는 가령, WO 2012/145572에 기술되며, 이것은 본원의 참고자료에 편입된다. 다른 구체예들에서, 작은 RNA 기반의 스위치는 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25605380에 기술된다.
여전히 다른 프로모터는 가령, 인간 사이토메갈로바이러스 (CMV) 바로-초기 인헨서/프로모터, SV40 초기 인헨서/프로모터, JC 폴리모바이러스 프로모터, 미엘린 염기성 단백질 (MBP) 또는 신경교 섬유 산성 단백질 (GFAP) 프로모터, 헤르페스 심플렉스 바이러스 (HSV-1) 잠복성 연합된 프로모터 (LAP), 라우스 육종바이러스 (RSV) 긴 말단 반복 (LTR) 프로모터, 뉴런-특이적 프로모터 (NSE), 혈소판 유도된 성장 인자 (PDGF) 프로모터, hSYN, 멜라닌-농축 호르몬 (MCH) 프로모터, CBA, 신경교 섬유성(fibriallary) 산성 단백질 (GFAP) 프로모터, 매트릭스 메탈로단백질 프로모터 (MPP) 및 병아리 베타-액틴 프로모터를 포함할 수 있다. 상기 프로모터는 각 발현 카세트에서 동일하거나 또는 상이할 수 있다.
한 구체예에서, 동일한 프로모터에 의해 하나 또는 그 이상의 ORFs 발현이 제어된다(가령, 링커, 이를 테면 IRES를 이용할 때). 또 다른 구체예에서, 상기 각 ORF의 발현은 별도 프로모터에 의해 제어된다. 각 프로모터는 본원의 설명을 기반으로 별도 선택될 수 있다.
한 구체예에서, 최소 프로모터 및/또는 최소 polyA를 이용하여 크기를 보존할 수 있다. 본 명세서에서 사용된 바와 같이, 용어 "최소 프로모터(minimal promoter)"란 TATA-박스와 발현의 제어를 위하여 조절 요소들이 추가되는 전사 개시 부위를 특정화하는 다른 서열로 구성된 짧은 DNA 서열을 의미한다. 한 구체예에서, 프로모터는 코딩 서열 또는 기능성 RNA의 발현을 제어할 수 있는 조절 요소와 최소 프로모터를 함유하는 뉴클레오티드 서열을 지칭한다.　　 이러한 타입의 프로모터 서열은 근위 및 더 멀리 있는 말단 상류의 요소들로 구성되는데, 후자의 요소는 종종 인헨서 (enhancers)라고 불린다.　 한 구체예에서, 상기 최소 프로모터는 사이토메갈로바이러스 (CMV)　최소 프로모터이다. 또 다른 구체예에서, 상기 최소 프로모터는 인간 CMV (hCMV) 이를 테면 최소 프로모터로부터 유래된 hCMV 바로-초기 프로모터다 (미국 20140127749, 및 Gossen and Bujard (Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1992, 89: 5547-5551 참고), 이들은 본원의 참고자료에 편입된다). 또 다른 구체예에서, 상기 최소 프로모터는 바이러스 원천, 이를 테면, 예로써: SV40 초기 또는 후기 프로모터, 사이토메갈로바이러스 (CMV) 바로-초기 프로모터, 또는 라우스 육종바이러스 (RSV) 초기 프로모터; 또는 진핵 세포 프로모터, 예로써, 베타 액틴 프로모터 (Ng, Nuc. Acid Res. 17:601-615, 1989; Quitsche et al., J. Biol. Chem. 264:9539-9545, 1989), GADPH 프로모터 (Alexander, M. C. et al., Proc. Nat. Acad. Sci. USA 85:5092-5096, 1988, Ercolani, L. et al., J. Biol. Chem. 263:15335-15341, 1988), TK-1 (티미딘 키나제) 프로모터, HSP (열 쇼크 단백질) 프로모터, UbB 또는 UbC 프로모터, PGK, Ef1-알파 프로모터 또는 TATA 박스를 함유하는 임의의 진핵 프로모터(미국 공개 출원 번호 2014/0094392)로부터 유래된다. 또 다른 구체예에서, 상기 최소 프로모터는 미니-프로모터, 이를 테면 미국 공개 출원 번호. 2014/0065666에 기술된 CLDN5 미니-프로모터를 함유한다. 　또 다른 구체예에서, 상기 최소 프로모터는 티미딘 키나제 (TK) 프로모터이다. 한 구체예에서, 상기 최소 프로모터는 조직 특이적, 이를 테면 근육-세포 특이적 프로모터 최소 TnISlow 프로모터, 최소 TnIFast 프로모터 또는 근육 크레아틴 키나제 프로모터 (미국 공개 출원 번호. 2012/0282695)중 하나다. 이들 각 문헌은 본 명에서의 참고자료에 편입된다.
한 구체예에서, 폴리아데닐화(polyadenylation) 신호가 함유된다. 한 구체예에서, 야생형 또는 합성 polyA가 선택될 수 있다. 또 다른 구체예에서, 상기 폴리아데닐화 (poly(A)) 신호는 최소 poly(A) 신호, 즉, 효과적인 폴리아데닐화에 필요한 최소 서열이다. 한 구체예에서, 상기 최소 poly(A)는 합성 poly(A), 이를 테면 Levitt et al, Genes Dev., 1989 Jul, 3(7):1019-25; 및 Xia et al, Nat Biotechnol. 2002 Oct; 20(10):1006-10. Epub 2002 Sep 16에서 기술된 것이다. 또 다른 구체예에서, 상기 poly(A)는 토끼 베타-글로빈 poly(A)로부터 유래된다. 한 구체예에서, 상기 polyA는 양방향성으로 작용한다(An et al, 2006, PNAS, 103(49): 18662-18667. 한 구체예에서, 상기 poly(A)는 SV40 초기 polyA 신호 서열로부터 유래된다. 한 구체예에서, 상기 poly(A)는 SV40 후기 polyA 신호 서열로부터 유래된다. 이들 각 문헌은 본 명에서의 참고자료에 편입된다.
임의선택적으로, 단일 인헨서, 또는 동일한 인헨서는 플라스미드 구조체에서 다중 이종성 유전자의 전사(가령, 중쇄 면역글로불린 및 경쇄 면역글로불린)를 조절할 수 있다. 본 발명에서 사용하기에 적합한 다양한 인헨서들은 당분야에 공지되어 있고, 예로써, CMV 초기 인헨서, Hoxc8 인헨서, nPE1 및 nPE2를 포함한다. 본 발명에 유용한 추가 인헨서들은 Andersson et al, Nature, 2014 March, 507(7493):455-61에 기술되며, 이들은 본원의 참고자료에 편입된다. 여전히 다른 인헨서 요소들은 가령, 아포리포단백질 인헨서, 제브라피쉬(zebrafish) 인헨서, GFAP 인헨서 요소, 및 조직 특이적 인헨서, 이를 테면 WO 2013/1555222에서 기술된 것들, 우드척(woodchuck) 간염 후 전사-후 조절 요소를 포함할 수 있다. 추가적으로, 또는 대안으로, 기타, 가령, 하이브리드 인간 사이토메갈로바이러스 (HCMV)-바로 초기 (IE)-PDGR 프로모터 또는 다른 프로모터-인헨서 요소들이 선택될 수 있다. 발현을 강화시키기 위하여, 다른 요소들은 인트론 (프로메가 인트론 또는 키메라 병아리 글로빈-인간 면역글로불린 인트론과 같은)일 수 있다. 본원에서 유용한 기타 인헨서들은 http://promoter.cdb.riken.jp/에서 볼 수 있는 Mammalian Promoter/Enhancer Database에서 찾아볼 수 있다.
본 발명에서 기술된 구조체는 다른 발현 제어 또는 조절 서열 이를 테면, 가령, 적합한 전사 개시, 종료, 인헨서 서열; 인트론; 효과적인 RNA 프로세싱 신호, 이를 테면, 스플라이싱 및 폴리아데닐화(polyA) 신호; 세포질 mRNA를 안정화시키는 서열; 해독 효과를 강화시키는 서열(가령, Kozak 콘센수스 서열); 단백질 안정성을 강화시키는 서열; 그리고 바람직한 경우, 인코드된 산물의 분비를 강화시키는 서열을 더 포함할 수 있다.
이들 제어 서열은 상기 면역글로불린 구조체 유전자 서열에 "작동가능하도록 연계된다(operably linked)". 본 명세서에서 이용된 바와 같이, 용어 "작동가능하도록 연계된(operably linked)"이란 관심대상 유전자와 연접하는 발현 조절 서열과 관심대상 유전자를 조절하기 위해 trans 또는 먼 거리에서 작용하는 발현 제어 서열 모두를 지칭한다.
한 구체예에서, 각각의 프로모터는 인헨서 서열에 인접한 (좌 또는 우 (또는 5 '또는 3')) 중 어느 하나에 위치하고, polyA 서열은 그 사이의 ORF와 함께, ITR에 인접하여 위치한다. 한 구체예에서, 중쇄 서열이 먼저 발현되지만, ORF의 순서는 인코드된 면역 글로불린 도메인과 같이 다양할 수 있다. 예로써, 경쇄 불변 및 가변 서열은 상기 링커의 좌측에 위치할 수 있고, 중쇄는 상기 링커의 우측에 위치한 ORFs에 의해 인코드될 수 있다. 대안으로, 중쇄는 상기 링커의 좌측에 위치할 수 있고, 링커의 우측 ORFs는 경쇄를 인코드할 수 있다. 대안으로, 반대의 배위도 가능하다. 한 구체예에서, 상기 발현 카세트는 프로모터를 인코딩하는 서열, 이에 이어서 중쇄를 인코딩하는 서열, 이에 이어서 F2A 서열, 이에 이어서 경쇄를 인코딩하는 서열을 함유한다. 이러한 배위의 예시적인 예는 서열 번호: 11 및 서열 번호: 12에서 제시된 플라스미드 서열에서 찾아볼 수 있다. 한 구체예에서, 상기 발현 카세트는 프로모터를 인코딩하는 서열, 이에 이어서 경쇄를 인코딩하는 서열, 이에 이어서 IRES 서열, 이에 이어서 중쇄를 인코딩하는 서열을 함유한다. 이러한 배위의 예시적인 예는 서열 번호: 13에서 제시된 플라스미드 서열에서 찾아볼 수 있다. 또 다른 구체예에서, rAAV는 선택된 AAV 캡시드 안에 다음을 포함하는 핵산 분자를 패키지한다: 5' AAV 역전된 말단 반복 서열 (ITR), 프로모터, 뮤린 VEGF 면역글로불린 가변 중쇄 및 개의 VEGF 불변 중쇄에 작용가능하도록 연계된 신호 펩티드, IRES, 뮤린 VEGF 가변 경쇄에 작동가능하도록 연계된 신호 펩티드, 그리고 3' AAV ITR. 한 구체예에서, AAV 캡시드는 AAV8이다. 추가 구체예에서, ITRs는 AAV2로부터 유래되거나, 또는 AAV 캡시드 원천과는 상이한 원천으로부터 유래된다.
한 구체예에서, 상기 벡터는 아데노 연합된 바이러스 벡터이다. 재조합 AAV 벡터 (AAV 바이러스 입자)는 본 명세서에서 기술된 바와 같이, AAV 캡시드 안에 패키지된 기능을 하는 항체를 발현시키는 핵산 분자를 포함할 수 있다. 발현 카세트는 각각의 발현 카세트 내의 개방 해독 틀(들)에 대한 조절 요소를 함유할 수 있고, 상기 핵산 분자는 선택적으로 추가 조절 요소를 함유할 수 있다.
상기 AAV 벡터는 전장 AAV 5' 역전된 말단 반복 (ITR) 및 전장 3' ITR을 함유할 수 있다. D-서열 및 말단 해리 부위 (trs)이 결손된 단축된 형태의 5' ITR(△ITR로 명명)이 기술되었다. 약어 "sc"는 자가-상보성을 나타낸다. "자가-상보성(self-complementary) AAV"는 재조합 AAV 핵산 서열에 의해 운반되는 코딩 영역이 분자내 이중-가닥 DNA 주형을 형성하도록 기획된, 발현 카세트를 갖는 구조체를 말한다. 감염시, 제2 가닥의 세포 매개된 합성을 기다리기보다는, scAAV의 두 개의 상보적인 절반은 연관되어 즉시 복제 및 전사가 가능한 한 개의 이중 가닥 DNA (dsDNA) 유닛을 형성할 것이다. 가령 , D M McCarty et al, "Self-complementary recombinant adeno-associated virus (scAAV) vectors promote efficient transduction independently of DNA synthesis", Gene Therapy, (August 2001), Vol 8, Number 16, Pages 1248-1254 참고. 자가-상보성 AAVs는 가령, 미국 특허 번호 6,596,535; 7,125,717; 및 7,456,683에 기술되어 있으며, 이들 각각은 모두 전문이 본 명세서의 참고자료에 편입된다. 또 다른 구체예에서, 자가-상보성 AAV가 이용된다.
위형의(pseudotyped) AAV가 만들어질 때, ITRs는 상기 AAV 캡시드의 원천과는 상이한 원천으로부터 선택된다. 예로써, AAV2 ITR은 선택된 세포 수용체, 표적 조직 또는 바이러스 표적에 대해 특정한 효율을 갖는 AAV 캡시드와 함께 사용하도록 선택될 수 있다. 한 구체예에서, AAV2의 ITR 서열, 또는 이의 결손된 형태(ΔITR)는 조정 승인을 가속화시키기 위하여 편리하게 이용된다. 그러나, 다른 AAV 원천의 ITRs이 선택될 수 있다. ITRs의 원천이 AAV2이고, 그리고 AAV 캡시드는 또 다른 AAV 원천인 경우, 생성된 벡터는 위형(pseudotype)이라고 부를 수 있다. 그러나, 다른 원천의 AAV ITRs가 이용될 수 있다.
다양한 AAV 캡시드들이 기술되어 있다. AAV 벡터를 만드는 방법들은 가령, WO 2003/042397; WO 2005/033321, WO 2006/110689; 미국 7588772 B2를 비롯한 문헌 및 특허 서류에서 광범위하게 기술되어 있다. AAV 캡시드의 원천은 원하는 조직을 표적으로 하는 AAV로부터 선택될 수 있다. 예로써, 적합한 AAV는 가령, AAV9 [미국 7,906,111; 미국 2011-0236353-A1], rh10 [WO 2003/042397] 및/또는 hu37 [ 가령, 미국 7,906,111; 미국 2011-0236353-A1 참고]를 포함할 수 있다. 그러나, 다른 AAV는 가령, AAV1, AAV2, AAV3, AAV4, AAV5, AAV6, AAV7, AAV8, [미국 특허 7790449; 미국 특허 7282199] 및 이의 변이체들을 비롯한 다른 것들을 포함한다. 한 구체예에서, AAV 캡시드는 AAV8 캡시드 또는 이의 변이체다. 한 구체예에서, AAV 캡시드를 언급할 때, 용어 "변이체"는 명시된 AAV 캡시드와 최소한 약 90% 동일성, 95% 동일성, 97% 동일성, 98% 동일성, 99% 동일성 또는 그 이상의 동일성을 공유하는 캡시드를 지칭한다. 예로써, 한 구체예에서, AAV 캡시드는 NCBI 참조 서열: YP_077180.1 또는 이와 최소한 95% 동일성을 공유하는 서열로 식별되는 AAV8 캡시드다. 그러나, 다른 면역글로불린 구조체 및 벡터 요소들과 마찬가지로, 다른 원천의 AAV 캡시드 및 다른 바이러스 요소들이 선택될 수 있다.
단일-가닥의 AAV 바이러스 벡터가 제시된다. 대상에게 전달하기에 적합한 AAV 바이러스 벡터를 생성하고 단리하는 방법은 당업계에 공지되어 있다. 가령 , 미국 특허 7790449; 미국 특허 7282199; WO 2003/042397; WO 2005/033321, WO 2006/110689; 미국 7588772 B2 참고]. 한 시스템에서, 생산자 세포주는 ITR에 의해 측면에 위치하는 이식유전자(transgene) 및 rep와 cap을 인코딩하는 구조체 (들)에 의해 일시적으로 형질감염된다. 제 2 시스템에서, rep 및 cap을 안정적으로 공급하는 패키징 세포계통은 ITRs의 측면에 있는 이식유전자를 인코딩하는 구조체로 일시적으로 형질감염된다. 이들 각 시스템에서, AAV 비리온은 헬퍼(helper) 아데노바이러스 또는 헤르페스바이러스의 감염에 반응하여 생성되는데, 오염 바이러스로부터 상기 rAAVs의 분리가 필요하다. 더욱 최근에, AAV를 회수시키기 위하여, 헬퍼 바이러스를 이용한 감염이 요구되지 않는 시스템이 개발되었는데, 요구되는 헬퍼 기능 (가령, 아데노바이러스 E1, E2a, VA, 및 E4 또는 헤르페스바이러스 UL5, UL8, UL52, 및 UL29, 그리고 헤르페스바이러스 중합효소)이 이 시스템에 의해 trans로 또한 공급된다. 이들 신규 시스템에서, 헬퍼 기능은 요구되는 헬퍼 기능을 인코드하는 구조체로 이 세포의 일시적 형질감염에 의해 공급될 수 있거나, 또는 이 세포들은 헬퍼 기능을 인코드하는 유전자를 안정적으로 함유하도록 조작될 수 있고, 이의 발현은 전사 또는 전사후 수준에서 제어될 수 있다. 또 다른 시스템에서, ITRs의 측면에 있는 이식유전자와 rep/cap 유전자는 베큘로바이러스-기반 벡터을 이용한 감염에 의해 곤충 세포로 도입된다. 이들 생산 시스템에 대한 검토는 일반적으로 가령, Zhang et al., 2009 "Adenovirus- adeno-associated virus hybrid for large-scale recombinant adeno-associated virus production," Human Gene Therapy 20:922-929를 참고하며, 이의 각 내용은 본 명세서의 참고자료에 전문이 편입된다. 이들 및 기타 AAV 생산 시스템을 만들고 이용하는 방법은 다음의 미국 특허에서 또한 설명되어 있으며, 이의 내용은 본 명세서의 참고자료에 전문이 편입된다: 5,139,941; 5,741,683; 6,057,152; 6,204,059; 6,268,213; 6,491,907; 6,660,514; 6,951,753; 7,094,604; 7,172,893; 7,201,898; 7,229,823; 및 7,439,065.
AAV 바이러스 벡터(가령, 재조합 (r) AAV))를 생산하는데 사용하기 위하여, 상기 발현 카세트는 임의의 적합한 벡터, 가령, 플라스미드에서 전달되며, 이것은 패키징 숙주 세포로 운반된다. 본 발명에서 유용한 플라스미드는 원핵 세포, 포유 동물 세포 또는 둘 모두에서 복제 및 패키징에 적합하도록 조작될 수 있다. 적합한 형질 감염 기술 및 패키징 숙주 세포는 공지되어 있고, 및/또는 당업자에 의해 용이하게 기획될 수 있다. 실시 예에서 이용된 바이러스 벡터를 생산하는데 사용된 플라스미드의 예를 도 3 및 서열 번호: 10에 나타낸다.
벡터로 사용하기에 적합한 AAV를 생성하고 단리하는 방법은 당업계에 공지되어 있다. 가령, Grieger & Samulski, 2005, "Adeno-associated virus as a gene therapy vector: Vector development, production and clinical applications," Adv. Biochem. Engin/Biotechnol. 99: 119-145; Buning et al., 2008, "Recent developments in adeno-associated virus vector technology," J. Gene Med. 10:717-733; 그리고 하기에서 언급된 문헌들을 참고하며, 이의 각 내용은 본 명세서의 참고자료에 전문이 편입된다: 이식유전자를 비리온(virions)으로 패키징하기 위하여, 상기 ITRs는 동일한 구조체 안에서 발현 카세트를 함유하는 핵산과 cis 형태로 요구되는 유일한 AAV 성분들이다. cap 및 rep 유전자는 trans로 공급될 수 있다.
위에서 언급 한 바와 같이, "약(about)"이라는 용어는 수치를 수정하는 데 사용되는 경우 달리 명시되지 않는 한 ± 10 %의 변동을 의미한다.
2개 또는 그 이상의 핵산 또는 폴리펩티드 서열의 내용에서 "동일(identical)" 또는 "동일성(identity)" 비율이란 하기에서 기술된 디폴트 매개변수와 함께 BLAST 또는 BLAST 2.0 서열 비교 알고리즘을 이용하여 측정하였을 때, 또는 수작업 정렬 및 시각적 점검에 의해(가령, NCBI 웹 사이트 또는 이와 유사한 것들), 동일한, 또는 아미노산 잔기 또는 뉴클레오티드의 병시된 백분율을 갖는 2개 또는 그 이상의 서열 또는 하위 서열을 지칭한다(가령, 비교 창 또는 지정 영역에 걸쳐 최대 대응을 위하여 비교 및 정렬되는 경우, 본원에서 제시되는 임의의 하나의 ORFs에서 약 70% 동일성, 바람직하게는 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 더 높은 동일성). 다른 예로서, 폴리뉴클레오티드 서열은 GCG 버젼 6.1의 프로그램인 Fasta를 사용하여 비교될 수 있다. Fasta는 문의(query) 서열과 검색 서열 사이의 가장 잘 겹쳐지는 영역의 정렬 및 서열 동일성 백분율을 제공한다. 예를 들어, 핵산 서열 간의 서열 동일성 백분율은 참조로 포함된 GCG 버전 6.1에 제공된 바와 같이, 그의 디폴트 매개변수 (워드 크기 6 및 스코어링 매트릭스에 대한 NOPAM 인자)를 갖는 Fasta 사용하여 결정될 수 있다. 일반적으로, 이들 프로그램은 디폴트 설정에서 사용되지만, 당업자는 필요에 따라 이들 설정을 변경할 수 있다. 대안 적으로, 당업자는 적어도 참조된 알고리즘 및 프로그램에 의해 제공되는 것과 동일성 수준 또는 정렬 수준을 제공하는 다른 알고리즘 또는 컴퓨터 프로그램을 이용할 수 있다. 이 정의는 서열의 컴플리먼트(compliment)를 또한 지칭하거나, 또는 이에 적용될 수 있다. 이 정의는 결손 및/또는 추가를 갖는 서열, 뿐만 아니라 치환체를 갖는 서열을 또한 포함한다. 하기에서 기술된 바와 같이, 바람직한 알고리즘은 갭(gaps) 및 이와 유사한 것들을 설명할 수 있다. 바람직하게는, 동일성은 길이가 최소한 약 25, 50, 75, 100, 150, 200개 아미노산 또는 뉴클레오티드에 걸쳐 존재하고, 그리고 가끔은 길이가 225, 250, 300, 350, 400, 450, 500개 아미노산 또는 뉴클레오티드 또는 전장의 아미노산 또는 뉴클레오티드 영역에 걸쳐 존재한다.
전형적으로, 정렬이 아미노산 서열에 기초하여 준비되는 경우, 정렬은 기준 AAV 서열에 대해 식별되는 삽입 및 결실을 포함하고, 아미노산 잔기의 번호는 정렬에 제공된 기준 구조(scale)에 기초한다. 그러나, 임의의 주어진 AAV 서열은 기준 구조보다 적은 아미노산 잔기를 가질 수 있다. 본 발명에서, 부모(parental) 서열을 논의 할 때, "동일한 위치(the same position)" 또는 "대응하는 위치(corresponding position)"라는 용어는 정렬된 서열에 대한 기준 구조에 대해 각각의 서열에서 동일한 잔기 번호에 위치하는 아미노산을 지칭한다. 그러나, 정렬로부터 각각의 단백질은 상이한 잔기 번호에 위치한 이들 아미노산을 가질 수 있다. 정렬은 공개적으로 또는 상업적으로 이용가능한 다양한 다중 서열 정렬 프로그램 중 임의의 것을 사용하여 수행된다. 서열 정렬 프로그램은 가령, "Clustal X", "MAP", "PIMA", "MSA", "BLOCKMAKER", "MEME" 및 "Match-Box" 프로그램과 같은 아미노산 서열에 사용할 수 있다. 일반적으로, 이들 프로그램 중 임의의 것은 디폴트 설정에서 사용되지만, 당업자는 필요에 따라 이들 설정을 변경할 수 있다. 대안 적으로, 당업자는 적어도 참조된 알고리즘 및 프로그램에 의해 제공되는 것과 동일성 수준 또는 정렬 수준을 제공하는 다른 알고리즘 또는 컴퓨터 프로그램을 이용할 수 있다. 가령 , J. D. Thomson et al, Nucl. Acids. Res., "A comprehensive comparison of multiple sequence alignments", 27(13):2682-2690 (1999) 참고.
한 구체예에서, 본원에 기술된 발현 카세트는 바이러스 벡터를 생산하기 위한 패키징 숙주 세포 내로 운반되는 면역 글로불린 구조체 서열을 전달하는 유전자 요소 (예: 셔틀(shuttle) 플라스미드)로 조작된다. 한 구체예에서, 선택된 유전 요소는 형질 감염, 전기천공, 리포좀 전달, 막 융합 기술, 고속 DNA-코팅된 펠렛, 바이러스 감염 및 원형질체 융합을 포함하는 임의의 적합한 방법에 의해 AAV 패키징 세포로 전달될 수 있다. 안정적 AAV 패키징 세포를 또한 만들 수 있다. 대안으로, 발현 카세트는 AAV 이외의 바이러스 벡터를 생성 시키는데, 또는 시험관 내에서 항체 혼합물의 생산을 위해 사용될 수 있다. 이러한 구조체를 제조하는 데 사용되는 방법은 유전 공학, 재조합 공학 및 합성 기술을 포함하는 핵산 조작 기술이 있는 사람들에게 공지되어 있다. 가령 , Molecular Cloning: A Laboratory Manual, ed. Green and Sambrook, Cold Spring Harbor Press, Cold Spring Harbor, NY (2012). 참고.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 벡터는 숙주 세포를 형질감염, 형질도입, 또는 감염시키고, 기능성 항체로 조립하는 면역 글로불린을 발현하는 임의의 적합한 유전적 요소일 수 있다. 이러한 벡터는 렌티바이러스 벡터, 베큘로바이러스 벡터, 파르보바이러스 벡터, 플라스미드, 변형된 RNA, 그리고 DNA 분자로부터 선택될 수 있는데, 이때, mRNA 및 DNA는 나노입자 형태일 수 있다.
상기 벡터는 인간 또는 비-인간 포유류 환자에게 투여하기 위하여, 생리학적으로 양립가능한 운반체에 현탁되는 것이 바람직하다. 적합한 운반체는 전달 바이러스에 의해 지시되는 관점을 고려하여, 당업자에 의해 용이하게 선택될 수 있다. 예를 들면, 한 가지 적합한 운반체는 염수를 포함하는데, 이는 다양한 완충 용액 (가령, 인산염 완충된 염수)로 제형화될 수 있다. 다른 예시적인 운반체는 멸균 염수, 락토즈, 슈크로즈, 말토즈, 및 물이다. 임의선택적으로, 본 발명의 조성물은 상기 rAAV 및 운반체(들)에 추가하여, 다른 통상적인 약학 성분들, 이를 테면, 보존제 또는 화학적 안정제를 포함한다.
본원에서 기술된 바이러스 벡터 구조체를 포함하는 조성물이 또한 제시된다. 본원에서 기술된 약학 조성물은 임의의 적합한 경로 또는 상이한 경로의 조합에 의해 이를 필요로 하는 대상에게 전달되도록 기획된다. 임의의 적합한 방법 또는 경로를 사용하여 본원에 기재된 바와 같은 AAV-함유 조성물을 투여하고, 선택적으로, 본원에 기재된 AAV-매개 항체와 함께, 다른 활성 약물 또는 치료제를 공동-투여할 수 있다. 투여 경로는 예로써, 전신, 경구, 흡입, 비강내, 기관내(intratracheal), 동맥내, 안구내, 정맥내, 근육내, 피하, 피내, 그리고 다른 비경구 투여를 포함한다. 본원에서 기술된 바이러스 벡터는 단일 조성물 또는 다중 조성물로 전달될 수 있다. 임의선택적으로, 2개 또는 그 이상의 상이한 AAV가 전달될 수 있거나, 또는 다중 바이러스[가령, WO 2011/126808 및 WO 2013/049493 참고]. 또 다른 구체예에서, 다중 바이러스는 상이한 복제-결함성 바이러스(가령, AAV 및 아데노바이러스)를 함유할 수 있다.
AAV 바이러스 벡터의 경우, 게놈 복사체 ( "GC")의 정량화는 제형에 포함된 용량(dose)의 척도로 사용될 수 있다. 당업계에 공지된 임의의 방법을 사용하여 본 발명의 복제-결함성 바이러스 조성물의 게놈 복사체 (GC) 수를 결정할 수 있다. AAV GC 수 적정을 실행하는 한 가지 방법은 다음과 같다: 정제된 AAV 벡터 시료를 우선 DNase로 처리하여, 캡슐화되지 않은 AAV 게놈 DNA 또는 생산 과정에서 오염된 플라스미드 DNA를 제거한다. 그런 다음 DNase 저항성 입자는 열처리하여, 캡시드에서 게놈을 방출시킨다. 그런 다음 방출된 게놈은 바이러스 게놈의 특정 영역(통상적으로 polyA 신호)을 표적으로하는 프라이머/프로브 세트를 사용하여 실시간 PCR로 정량된다. 다른 적합한 방법은 디지털 PCT, 디지털 비말 PCR 및 최적화된 qPCR을 포함한다.
또한, 복제-결함성 바이러스 조성물은 약 1.0 × 109 GC 내지 약 1.0 × 1015 GC의 범위에 있는 복제-결함성 바이러스의 양을 함유하는 투약 단위로 제형화될 수 있다. 또 다른 구체예에서, 이 양의 바이러스 게놈은 분할된 용량으로 전달될 수 있다. 한 구체예에서, 상기 투여량(dosage)은 평균 5kg의 작은 개를 대상으로 하는 경우, 약 1.0 x 1010 GC 내지 약 1.0 x 1012 GC이다. 한 구체예에서, 평균 약 20 kg의 중간 개의 대상을 대상으로 하는 경우, 상기 투여량은 약 1.0 x 1011 GC 내지 약 5.0 x 1013 GC이다. 한 구체예에서, 평균 약 50 kg의 큰 개의 대상을 대상으로 하는 경우, 상기 투여량은 약 1.0 x 1012 GC 내지 약 1.0 x 1014 GC이다. 평균적으로 개는 체중이 약 5 내지 약 50 kg이다. 한 구체예에서, 투약량은 약 1x1012 GC/kg이다. 한 구체예에서, 대상의 투약량은 약 1.0 x 1011 GC 내지 1.0 x 1014 GC이다. 또 다른 구체예에서, 용량 약 1 x 1013 GC. 예로써, AAV 바이러스의 용량은 약 1 x 1012 GC, 약 5 X 1012 GC, 약 1 X 1013 GC, 약 5 X 1013 GC, 또는 약 1 X 1014 GC이다. 또 다른 실시예에서, 상기 구조체는 mL당 약 0.001 mg 내지 약 10 mg의 양으로 전달될 수 있다. 한 구체예에서, 상기 구조체는 수의과 동물 대상의 경우 1 μL 내지 약 100 mL 용적으로 전달될 수 있다. 가령, 다양한 수의과 동물에 물질을 투여하기 위한 양호한 실행에 대한 논의는 Diehl et al, J. Applied Toxicology, 21:15-23 (2001) 참고. 이 문헌은 본 명에서의 참고자료에 편입된다. 본 명세서에서 이용된 바와 같이, 용어 "투여량(dosage)"이란 용어는 치료 과정에서 대상에게 전달되는 총 투여 량 또는 단일 투여 (다중 투여)로 전달되는 양을 지칭할 수 있다.
상기 기술된 재조합 벡터는 공지된 방법에 따라 숙주 세포에 전달될 수 있다. 바람직하게는 생리학적으로 양립가능한 운반체, 운반체, 희석제, 부형제 및/또는 어쥬번트에 현탁된 rAAV는 고양이, 개, 또는 비-인간 포유동물 대상을 포함하나, 이에 국한되지 않는 원하는 대상에게 투여될 수 있다. 적합한 운반체는 전달 바이러스에 의해 지시되는 관점을 고려하여, 당업자에 의해 용이하게 선택될 수 있다. 예를 들면, 한 가지 적합한 운반체는 염수를 포함하는데, 이는 다양한 완충 용액 (가령, 인산염 완충된 염수)로 제형화될 수 있다. 다른 예시적인 운반체는 염수, 락토스, 슈크로스, 인산 칼슘, 젤라틴, 덱스트린, 한천, 펙틴, 땅콩유, 참깨유, 및 물을 포함한다. 운반체의 선택은 본 발명에서 제한되지 않는다.
임의선택적으로, 본 발명의 조성물은 상기 rAAV 및/또는 변이체 및 운반체(들)에 추가하여, 다른 통상적인 약학 성분들, 이를 테면, 보존제 또는 화학적 안정제를 포함한다. 적절한 예시적인 보존제는 클로로부탄올, 소르빈산 칼륨, 소르 브산, 이산화황, 프로필 갈레이트, 파라벤, 에틸 바닐린, 글리세린, 페놀 및 파라클로로페놀을 포함한다. 적합한 화학적 안정제는 젤라틴 및 알부민을 포함한다.
한 측면에서, 본 발명에서 제시된 벡터는 약 3 mL 또는 그 미만, 1 mL 또는 그 미만, 0.5 mL, 또는 그 미만, 가령, 약 100 μL 내지 250 μL 범위의 용량으로 전달될 때, 효과적인 수준의 기능성 항체를 발현시킨다. 따라서, 본원에 제공된 벡터는 계량 투여에 편리한 용량, 또는 미리 계량된 용량을 함유하는 생성물 또는 키트에서 치료 수준의 항체를 제공하는데 매우 효율적이다.
본원에서 기술된 바이러스 벡터 및 다른 구조체는 키메라 항-VEGF 항체 구조체를 이를 필요로 하는 대상에게 전달하기 위하여 및/또는 대상의 혈관육종을 치료하기 위한 약물 제조에 이용될 수 있다. 따라서, 또 다른 측면에서, 혈관육종을 치료하는 방법이 제시된다. 상기 방법은 이를 필요로 하는 대상에게 본원에서 기술된 바와 같은 조성물을 투여하는 것을 포함한다. 한 구체예에서, 상기 조성물은 본원에서 기술된 바와 같이, 항-VEGF 항체 발현 카세트가 함유된 바이러스 벡터를 포함한다. 한 구체예에서, 상기 대상은 포유류다. 또 다른 구체예에서, 상기 대상은 개이다.
또 다른 구체예에서, 개의 혈관육종을 치료하는 방법이 제시된다. 상기 방법은 키메라 항-VEGF 항체를 인코드하는 핵산 분자가 포함된 바이러스 벡터를 상기 대상에게 투여하는 것을 포함한다.
또 다른 구체예에서, 대상의 암을 치료하는 방법이 제시된다. 상기 방법은 항-VEGF 항체를 인코드하는 핵산 분자가 포함된 바이러스 벡터를 상기 대상에게 투여하는 것을 포함한다. 한 구체예에서, 상기 암은 VEGF이 연루된, 가령, 상향조절된 암이다. 예로써, VEGF는 혈관신생, 혈관 투과성 및 종양 형성에 관여한다고 보고있다. 가령, Goel and Mercurio, VEGF targets the tumor cell, Nature Reviews Cancer, 13:871-82 (2013) 참고, 이는 본원의 참고자료에 편입된다. 또 다른 구체예에서, 상기 암은 VEGF에 의해 유도된 비정상적인 수준의 혈관신생이 일어난 암이다. 본 발명에서 기술된 상기 방법 및 조성물의 다양한 구체예에서, 상기 암은 유방암, 폐암, 전립선암, 결장직장암, 뇌암, 식도암, 위암, 방광암, 췌장암, 자궁경부암, 두경부암, 난소암, 흑색종, 만성 림프구성 백혈병 및 골수성 백혈병, 골수종, 호지킨(Hodgkin's) 림프종 및 비-호지킨(non-Hodgkin's) 림프종 및 다약제 내성(multidrug resistant) 암을 포함한다. 한 구체예에서, 상기 암은 약물 저항성 암이다. 한 구체예에서, 상기 대상은 개이다.
또 다른 구체예에서, 대상에서 황반 변성을 치료하는 방법이 제공된다. 상기 방법은 항-VEGF 항체를 인코드하는 핵산 분자가 포함된 바이러스 벡터를 상기 대상에게 투여하는 것을 포함한다. 한 구체예에서, 상기 대상은 개이다. 한 구체예에서, 황반변 성은 X-연계된 황반 변성이다. 또 다른 구체예에서, 황반 변성은 노화 관련 황반 변성이다.
치료 과정은 임의선택적으로 본원에서 기술된 항-VEGF 항체를 발현시키는 동일한 바이러스 벡터 (가령, AAV8 벡터) 또는 상이한 바이러스 벡터 (가령, AAV8 및 AAVrh10)의 반복 투여를 포함할 수 있다. 또 다른 조합은 본원에 기재된 바이러스 벡터를 사용하여 선택될 수 있다. 임의선택적으로, 본원에서 기술된 조성물은 혈관육종을 가진 개에서 다음중 하나 또는 그 이상의 관련 요법과 조합될 수 있다: 암 약물(가령, 독소루비신, 빈크리스틴 + 독소루비신 + 사이클로포스파미드 (VAC), 또는 다른 화학요법제), 종양을 제거 또는 감소시키는 수술, 방사선, 카르프로펜, 데라콕시브, 독시사이클린을 포함하는 약물 (가령, Hammer AS, Couto CG, Filppi J, et.al. Efficacy and toxicity of VAC chemotherapy (vincristine, doxorubicin, and cyclophosphamide) in dogs with hemangiosarcoma. J Vet Intern Med ;1991;5:160-166 참고; Sorenmo KU, Jeglum KA, Helfand SC. Chemotherapy of canine hemangiosarcoma with doxorubicin and cyclophosphamide. J Vet Intern Med 1993;7:370-376.; 그리고 Ogilvie GK, Powers BE, Mallinckrodt CH, et.al. Surgery and doxorubicin in dogs with hemangiosarcoma. J Vet Intern Med 1996;10:379-384 참고, 이들은 본원의 참고자료에 편입된다) 그리고 폴리사카로펩티드 (PSP). 임의선택적으로, 본원에 기재된 조성물은 식이 요법 및 운동 요법을 포함하는 생활 습관 변화를 포함하는 요법과 조합될 수 있다.
용어 하나("a" 또는 "an")은 하나 이상을 지칭한다는 것을 유의해야 한다. 이와 같이, 용어 "하나"("a" (또는 "an")), "하나 이상" 및 "적어도 하나"는 여기서 상호 교환 적으로 사용된다.
단어 "포함한다", "포함한다" 및 "포함하는"이란 배타적이지 않고 포괄적으로 해석되어야 한다. 단어 "구성하다", "구성하는" 및 그 변형은 포괄적인 것이 아니라 배타으로 해석되어야 한다. 본 명세서의 다양한 구체예가 "포함하는(comprising)" 언어를 사용하여 제공되는 동안, 다른 상황 하에서, 관련된 구체예는 또한 "구성된(consisting of)" 또는 "본질적으로 구성된(consisting essentially of)"의 언어를 사용하는 것으로 해석되고, 설명되도록 의도된다.　
본 명세서에서 이용된 바와 같이, 용어 "약(about)"은 달리 언급하지 않는 한, 주어진 기준으로부터 10 %의 변동성을 의미한다.
본원에서 사용된 용어 "조절(regulation)" 또는 이의 변형은 생물학적 경로의 하나 또는 그 이상의 성분을 저해하는 조성물의 능력을 지칭한다.
"대상(subject)"은 인간, 마우스, 렛, 기니아 피그, 개, 고양이, 말, 소, 돼지 또는 비-인간 영장류, 가령, 원숭이, 침팬지, 비비 또는 고릴라와 같은 포유 동물이다. 한 구체예에서, 상기 대상은 개이다. 본 명세서에서 이용된 바와 같이, 용어 "대상"은 "환자"와 호환사용된다.
본 명세서에서 이용된 바와 같이, "질병", "장애" 및 "상태"는 상호 호환적으로 사용되어, 대상의 비정상 상태를 나타낸다.
본 명세서에서 다르게 정의되지 않는 한, 본 명세서에서 사용되는 기술적 및 과학적 용어는 당업자가 일반적으로 이해하는 것과 동일한 의미를 가지며, 그리고 본 출원에서 이용된 많은 용어들에 대한 일반적인 지침을 당업자에게 제공하는 출판된 텍스트를 참조한다.
다음의 실시예들은 오직 설명을 위한 것이며, 본 명세서의 범위를 제한하려는 의도는 아니다.
실시예 1 - VEGF 벡터의 구축
개의 IgG 아강(subclass) A 및 카파 경쇄의 아미노산 서열은 Genbank에서 구하였다. 뮤린 항체 A.4.6.1의 가변 영역의 아미노산 서열은 개의 IgGA/카파 불변 영역과 복합되어, VEGF를 표적으로 하는 개의 키메라 항체의 아미노산 서열을 만들었다. 상기 아미노산 서열은 역-해독되고, 코돈 최적화되고, kozak 콘센수스 서열, 정지 코돈, 및 클로닝 부위가 추가된다. 상기 서열은 GeneArt에 의해 생성되고, CMV 또는 CB 프로모터를 함유하는 다양한 발현 벡터에 클로닝되고, 중쇄 및 경쇄 모두의 발현은 2A 펩티드 서열과 이 폴리펩티드 쇄 사이에 퓨린 (furin) 절단 부위의 포함을 통해 달성되거나, 또는 EMCV 내부 리보솜 진입 부위를 사용하여 3 '폴리펩티드의 발현에 의해 이루어진다. 는한다. 상기 발현 구조체는 AAV2 ITRs 측면에 있다. CMV 프로모터-함유 발현 벡터의 예를 도 3 및 서열 번호: 10에 나타낸다. 상기 구조체는 삼중 형질감염 및 이딕사놀(iodixanol) 구배 정제에 의해, 그리고 Taqman 정량적 PCR에 의해 적정되어, AAV 혈청형 8 캡시드 안에 패키지되었다.
실시예 2 - 시험관 발현 및 항원 결합
CMV 프로모터, 이어서 상기 항체 중쇄, EMCV IRES, 항체 경쇄를 함유하는 구조체는 리포펙타민 2000을 이용하여 HEK 293 세포의 일시적 형질감염에 의해 시험관에서 평가되었다. 발현된 항체를 제조사의 지시에 따라 단백질 G 컬럼 (GE)을 사용하여 상청액으로부터 정제하였다. 상기 정제된 항체는 Sypro 루비 착색과 환원 SDS-PAGE에 의해 특징화되었다(도 1). 상기 항체는 ELISA를 통하여 개의 VEGF에 결합하는 것을 평가하였고, 여기에서 표적 항원은 개의 재조합 VEGF (Kingfisher Bio)이며, 결합된 항체는 HRP-콘쥬게이트된 염소 항-개 2차 항체 (Peirce)다. 정제된 항체 및 형질 감염 상청액은 모두 ELISA를 통하여, 개 VEGF에 대한 결합을 나타내었다.
실시예 3 - 개에서 개의 키메라 항-VEGF의 AAV-매개된 발현
3 마리의 정상적인 개에게 상기 키메라 항체를 발현하는 AAV8를 체중 킬로그램 당 1012 게놈 복사체 (GC/kg)를 단일 근육 주사하였다. 표시된 시간에 혈청을 수집하고, VEGF-결합 ELISA에 의해 항체 발현을 평가하였고, 정제된 항체는 정량화의 표준으로 사용되었다 (도 2).
본 명세서에 인용된 모든 출판물 뿐만 아니라, 2015년 8월 31일자로 제출된 미국 가출원 62/212,170은 본원에 참고자료에 편입되어 있다. 유사하게, 본원에서 언급되고, 첨부된 서열 목록에 나타나는 서열 번호는 참고 문헌에 편입되어 있다. 본 발명은 특정 구체예를 참조하여 설명되었지만, 본 발명의 사상을 벗어나지 않고 수정이 이루어질 수 있음을 알 수 있을 것이다. 이러한 변형은 첨부된 청구범위의 범위 안에 속하는 것으로 의도된다.
SEQUENCE LISTING <110> The Trustees of the University of Pennsylvania <120> AAV-Anti-VEGF For Treating Cancer in Companion Animals <130> UPN-15-7473 <150> US 62/212,170 <151> 2015-08-31 <160> 15 <170> PatentIn version 3.5 <210> 1 <211> 124 <212> PRT <213> Canis familiaris <400> 1 Glu Ile Gln Leu Val Gln Ser Gly Pro Glu Leu Lys Gln Pro Gly Glu 1 5 10 15 Thr Val Arg Ile Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Asn Tyr 20 25 30 Gly Met Asn Trp Val Lys Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Lys Trp Met 35 40 45 Gly Trp Ile Asn Thr Tyr Thr Gly Glu Pro Thr Tyr Ala Ala Asp Phe 50 55 60 Lys Arg Arg Phe Thr Phe Ser Leu Glu Thr Ser Ala Ser Thr Ala Tyr 65 70 75 80 Leu Gln Ile Ser Asn Leu Lys Asn Asp Asp Thr Ala Thr Tyr Phe Cys 85 90 95 Ala Lys Tyr Pro His Tyr Tyr Gly Ser Ser His Trp Tyr Phe Asp Val 100 105 110 Trp Gly Ala Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser Ala 115 120 <210> 2 <211> 330 <212> PRT <213> Mus musculus <400> 2 Ser Thr Thr Ala Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Cys Gly Ser 1 5 10 15 Thr Ser Gly Ser Thr Val Ala Leu Ala Cys Leu Val Ser Gly Tyr Phe 20 25 30 Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ser Leu Thr Ser Gly 35 40 45 Val His Thr Phe Pro Ser Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu His Ser Leu 50 55 60 Ser Ser Met Val Thr Val Pro Ser Ser Arg Trp Pro Ser Glu Thr Phe 65 70 75 80 Thr Cys Asn Val Val His Pro Ala Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Pro 85 90 95 Val Phe Asn Glu Cys Arg Cys Thr Asp Thr Pro Pro Cys Pro Val Pro 100 105 110 Glu Pro Leu Gly Gly Pro Ser Val Leu Ile Phe Pro Pro Lys Pro Lys 115 120 125 Asp Ile Leu Arg Ile Thr Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Leu 130 135 140 Asp Leu Gly Arg Glu Asp Pro Glu Val Gln Ile Ser Trp Phe Val Asp 145 150 155 160 Gly Lys Glu Val His Thr Ala Lys Thr Gln Ser Arg Glu Gln Gln Phe 165 170 175 Asn Gly Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Pro Ile Glu His Gln Asp 180 185 190 Trp Leu Thr Gly Lys Glu Phe Lys Cys Arg Val Asn His Ile Asp Leu 195 200 205 Pro Ser Pro Ile Glu Arg Thr Ile Ser Lys Ala Arg Gly Arg Ala His 210 215 220 Lys Pro Ser Val Tyr Val Leu Pro Pro 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acaccggcga gcctacctac 180 gccgccgact tcaagcggcg gttcaccttc agcctggaaa ccagcgccag caccgcctac 240 ctgcagatca gcaacctgaa gaacgacgac accgccacct acttttgcgc caagtacccc 300 cactactacg gcagcagcca ctggtacttc gacgtgtggg gagccggcac caccgtgaca 360 gtgtcatctg cg 372 <210> 7 <211> 324 <212> DNA <213> Canis familiaris <400> 7 gacatccaga tgacccagac caccagcagc ctgagcgcca gcctgggcga cagagtgatc 60 atcagctgta gcgcctccca ggacatcagc aactacctga actggtatca gcagaaaccc 120 gacggcaccg tgaaggtgct gatctacttc accagctccc tgcacagcgg cgtgcccagc 180 agattttctg gcagcggctc cggcaccgac tacagcctga ccatctccaa cctggaaccc 240 gaggatatcg ccacctacta ctgccagcag tacagcaccg tgccctggac ctttggcgga 300 ggcaccaagc tggaaatcaa gcgg 324 <210> 8 <211> 639 <212> DNA <213> Mus musculus <400> 8 gacatccaga tgacccagac caccagcagc ctgagcgcca gcctgggcga cagagtgatc 60 atcagctgta gcgcctccca ggacatcagc aactacctga actggtatca gcagaaaccc 120 gacggcaccg tgaaggtgct gatctacttc accagctccc tgcacagcgg cgtgcccagc 180 agattttctg gcagcggctc cggcaccgac tacagcctga ccatctccaa cctggaaccc 240 gaggatatcg ccacctacta ctgccagcag tacagcaccg tgccctggac ctttggcgga 300 ggcaccaagc tggaaatcaa gcggaatgat gctcagcctg ctgtgtacct ttttcaacca 360 agccctgacc aactgcatac cggcagtgcc tctgtggtct gcctgcttaa tagcttctat 420 cccaaggaca ttaatgtgaa gtggaaggtt gacggcgtga tacaggatac cggaattcag 480 gaaagtgtga cagaacaaga taaggatagc acctatagcc tgtctagcac cctcaccatg 540 agcagcacag agtacttgag tcatgagctg tatagctgtg agattaccca caagagtctg 600 ccaagcaccc ttataaaaag tttccagcga tctgagtgt 639 <210> 9 <211> 315 <212> DNA <213> Mus musculus <400> 9 aatgatgctc agcctgctgt gtaccttttt caaccaagcc ctgaccaact gcataccggc 60 agtgcctctg tggtctgcct gcttaatagc ttctatccca aggacattaa tgtgaagtgg 120 aaggttgacg gcgtgataca ggataccgga attcaggaaa gtgtgacaga acaagataag 180 gatagcacct atagcctgtc tagcaccctc accatgagca gcacagagta cttgagtcat 240 gagctgtata gctgtgagat tacccacaag agtctgccaa gcacccttat aaaaagtttc 300 cagcgatctg agtgt 315 <210> 10 <211> 7293 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> constructed sequence <220> <221> misc_feature <222> (12)..(71) <220> <221> misc_feature <222> (72)..(443) <220> <221> misc_feature <222> (444)..(1433) <220> <221> enhancer <222> (1445)..(2032) <223> IRES <220> <221> misc_feature <222> (2033)..(2092) <220> <221> misc_feature <222> (2093)..(2365) <220> <221> misc_feature <222> (2366)..(2731) <220> <221> polyA_signal <222> (2754)..(2985) <223> SV40\late\polyadenylation\signal <220> <221> promoter <222> (2754)..(2985) <223> human\CMV\I.E.\enhancer\&\promoter <220> <221> misc_feature <222> (3050)..(3179) <223> 3' ITR (complement) <220> <221> misc_feature <222> (6001)..(6130) <223> 5' ITR <220> <221> TATA_signal <222> (6897)..(6901) <220> <221> Intron <222> (7047)..(7179) <223> Promega\chimeric\intron <400> 10 ctagacccac catgtacagg atgcaactcc tgtcttgcat tgcactaagt cttgcacttg 60 tcacaaacag tgagatccag ctggtgcagt ctggccccga gctgaagcag cctggcgaga 120 cagtgcggat cagctgcaag gccagcggct acaccttcac caactacggc atgaactggg 180 tcaagcaggc ccctggcaag ggcctgaagt ggatgggctg gatcaacacc tacaccggcg 240 agcctaccta cgccgccgac ttcaagcggc ggttcacctt cagcctggaa accagcgcca 300 gcaccgccta cctgcagatc agcaacctga agaacgacga caccgccacc tacttttgcg 360 ccaagtaccc ccactactac ggcagcagcc actggtactt cgacgtgtgg ggagccggca 420 ccaccgtgac agtgtcatct gcgtcgacca cagccccctc tgtgttcccc ctggcccctt 480 cctgtgggtc aacctctggc agcacagtgg ccctggcgtg tcttgtgtct ggctacttcc 540 ctgaacctgt gacagtcagc tggaacagcg gaagcctgac ctctggagtg cacaccttcc 600 ccagtgtcct gcaaagctca ggcctgcaca gcctgtcaag tatggtgaca gtgcccagta 660 gcaggtggcc ttctgaaacc tttacctgca acgtggtgca ccctgcatcc aacaccaaag 720 tggataagcc tgttttcaat gagtgcagat gcacagatac acctccctgc cctgtgcctg 780 agcctctggg aggaccatca gtcctgatct tccctccaaa gcctaaggat atcctgcgga 840 tcaccagaac ccccgaggtc acctgtgtcg tcctggatct gggccgggaa gatcctgaag 900 tgcagattag ctggtttgtg gacggcaagg aagtgcacac agctaagacc caatcccggg 960 agcagcagtt caatggcacc taccgggtgg tctctgtcct gcccatcgag caccaagatt 1020 ggctgacagg caaagagttt aagtgccgag tcaaccacat agatcttccc tcccctattg 1080 agcggaccat ctccaaggca cgggggcgag cgcacaaacc ctctgtctat gtgctgcctc 1140 cctctcccaa agaattgagc tctagcgata cagtgtcaat cacctgcctg atcaaggact 1200 tctacccccc tgacattgat gttgaatggc aatcaaatgg gcagcaagaa ccagagagaa 1260 aacacagaat gacccctcca cagctggatg aggacgggtc ctactttctg tactctaaac 1320 tttccgtgga caagagcaga tggcagcagg gagacccttt cacctgtgcg gtcatgcacg 1380 agacactgca aaaccactac acagatctgt ccttgagcca ctcacctggc aagtgataag 1440 gccggcccct ctccctcccc cccccctaac gttactggcc gaagccgctt ggaataaggc 1500 cggtgtgcgt ttgtctatat gttattttcc accatattgc cgtcttttgg caatgtgagg 1560 gcccggaaac ctggccctgt cttcttgacg agcattccta ggggtctttc ccctctcgcc 1620 aaaggaatgc aaggtctgtt gaatgtcgtg aaggaagcag ttcctctgga agcttcttga 1680 agacaaacaa cgtctgtagc gaccctttgc aggcagcgga accccccacc tggcgacagg 1740 tgcctctgcg gccaaaagcc acgtgtataa gatacacctg caaaggcggc acaaccccag 1800 tgccacgttg tgagttggat agttgtggaa agagtcaaat ggctctcctc aagcgtattc 1860 aacaaggggc tgaaggatgc ccagaaggta ccccattgta tgggatctga tctggggcct 1920 cggtacacat gctttacatg tgtttagtcg aggttaaaaa aacgtctagg ccccccgaac 1980 cacggggacg tggttttcct ttgaaaaaca cgatgataat atggccacaa ccatgtaccg 2040 catgcaactc ctgtcttgca ttgcactaag tcttgcactt gtcacaaaca gtgacatcca 2100 gatgacccag accaccagca gcctgagcgc cagcctgggc gacagagtga tcatcagctg 2160 tagcgcctcc caggacatca gcaactacct gaactggtat cagcagaaac ccgacggcac 2220 cgtgaaggtg ctgatctact tcaccagctc cctgcacagc ggcgtgccca gcagattttc 2280 tggcagcggc tccggcaccg actacagcct gaccatctcc aacctggaac ccgaggatat 2340 cgccacctac tactgccagc agtacagcac cgtgccctgg acctttggcg gaggcaccaa 2400 gctggaaatc aagcggaatg atgctcagcc tgctgtgtac ctttttcaac caagccctga 2460 ccaactgcat accggcagtg cctctgtggt ctgcctgctt aatagcttct atcccaagga 2520 cattaatgtg aagtggaagg ttgacggcgt gatacaggat accggaattc aggaaagtgt 2580 gacagaacaa gataaggata gcacctatag cctgtctagc accctcacca tgagcagcac 2640 agagtacttg agtcatgagc tgtatagctg tgagattacc cacaagagtc tgccaagcac 2700 ccttataaaa agtttccagc gatctgagtg ttgatgaaag cttgcggccg cttcgagcag 2760 acatgataag atacattgat gagtttggac aaaccacaac tagaatgcag tgaaaaaaat 2820 gctttatttg tgaaatttgt gatgctattg ctttatttgt aaccattata agctgcaata 2880 aacaagttaa caacaacaat tgcattcatt ttatgtttca ggttcagggg gagatgtggg 2940 aggtttttta aagcaagtaa aacctctaca aatgtggtaa aatcgataag gatcttccta 3000 gagcatggct acgtagataa gtagcatggc gggttaatca ttaactacaa ggaaccccta 3060 gtgatggagt tggccactcc ctctctgcgc gctcgctcgc tcactgaggc cgggcgacca 3120 aaggtcgccc gacgcccggg ctttgcccgg gcggcctcag tgagcgagcg agcgcgcagc 3180 cttaattaac ctaattcact ggccgtcgtt ttacaacgtc gtgactggga aaaccctggc 3240 gttacccaac ttaatcgcct tgcagcacat ccccctttcg ccagctggcg taatagcgaa 3300 gaggcccgca ccgatcgccc ttcccaacag ttgcgcagcc tgaatggcga atgggacgcg 3360 ccctgtagcg gcgcattaag cgcggcgggt gtggtggtta cgcgcagcgt gaccgctaca 3420 cttgccagcg ccctagcgcc cgctcctttc gctttcttcc cttcctttct cgccacgttc 3480 gccggctttc cccgtcaagc tctaaatcgg gggctccctt tagggttccg atttagtgct 3540 ttacggcacc tcgaccccaa aaaacttgat tagggtgatg gttcacgtag tgggccatcg 3600 ccctgataga cggtttttcg ccctttgacg ttggagtcca cgttctttaa tagtggactc 3660 ttgttccaaa ctggaacaac actcaaccct atctcggtct attcttttga tttataaggg 3720 attttgccga tttcggccta ttggttaaaa aatgagctga tttaacaaaa atttaacgcg 3780 aattttaaca aaatattaac gcttacaatt taggtggcac ttttcgggga aatgtgcgcg 3840 gaacccctat ttgtttattt ttctaaatac attcaaatat gtatccgctc atgagacaat 3900 aaccctgata aatgcttcaa taatattgaa aaaggaagag tatgagtatt caacatttcc 3960 gtgtcgccct tattcccttt tttgcggcat tttgccttcc tgtttttgct cacccagaaa 4020 cgctggtgaa agtaaaagat gctgaagatc agttgggtgc acgagtgggt tacatcgaac 4080 tggatctcaa cagcggtaag atccttgaga gttttcgccc cgaagaacgt tttccaatga 4140 tgagcacttt taaagttctg ctatgtggcg cggtattatc ccgtattgac gccgggcaag 4200 agcaactcgg tcgccgcata cactattctc agaatgactt ggttgagtac tcaccagtca 4260 cagaaaagca tcttacggat ggcatgacag taagagaatt atgcagtgct gccataacca 4320 tgagtgataa cactgcggcc aacttacttc tgacaacgat cggaggaccg aaggagctaa 4380 ccgctttttt gcacaacatg ggggatcatg taactcgcct tgatcgttgg gaaccggagc 4440 tgaatgaagc cataccaaac gacgagcgtg acaccacgat gcctgtagca atggcaacaa 4500 cgttgcgcaa actattaact ggcgaactac ttactctagc ttcccggcaa caattaatag 4560 actggatgga ggcggataaa gttgcaggac cacttctgcg ctcggccctt ccggctggct 4620 ggtttattgc tgataaatct ggagccggtg agcgtgggtc tcgcggtatc attgcagcac 4680 tggggccaga tggtaagccc tcccgtatcg tagttatcta cacgacgggg agtcaggcaa 4740 ctatggatga acgaaataga cagatcgctg agataggtgc ctcactgatt aagcattggt 4800 aactgtcaga ccaagtttac tcatatatac tttagattga tttaaaactt catttttaat 4860 ttaaaaggat ctaggtgaag atcctttttg ataatctcat gaccaaaatc ccttaacgtg 4920 agttttcgtt ccactgagcg tcagaccccg tagaaaagat caaaggatct tcttgagatc 4980 ctttttttct gcgcgtaatc tgctgcttgc aaacaaaaaa accaccgcta ccagcggtgg 5040 tttgtttgcc ggatcaagag ctaccaactc tttttccgaa ggtaactggc ttcagcagag 5100 cgcagatacc aaatactgtt cttctagtgt agccgtagtt aggccaccac ttcaagaact 5160 ctgtagcacc gcctacatac ctcgctctgc taatcctgtt accagtggct gctgccagtg 5220 gcgataagtc gtgtcttacc gggttggact caagacgata 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gatttaatta aggccttaat taggctgcgc gctcgctcgc 4080 tcactgaggc cgcccgggca aagcccgggc gtcgggcgac ctttggtcgc ccggcctcag 4140 tgagcgagcg agcgcgcaga gagggagtgg ccaactccat cactaggggt tccttgtagt 4200 taatgattaa cccgccatgc tacttatcta cgtagccatg ctctaggaag atcttcaata 4260 ttggccatta gccatattat tcattggtta tatagcataa atcaatattg gctattggcc 4320 attgcatacg ttgtatctat atcataatat gtacatttat attggctcat gtccaatatg 4380 accgccatgt tggcattgat tattgactag ttattaatag taatcaatta cggggtcatt 4440 agttcatagc ccatatatgg agttccgcgt tacataactt acggtaaatg gcccgcctgg 4500 ctgaccgccc aacgaccccc gcccattgac gtcaataatg acgtatgttc ccatagtaac 4560 gccaataggg actttccatt gacgtcaatg ggtggagtat ttacggtaaa ctgcccactt 4620 ggcagtacat caagtgtatc atatgccaag tacgccccct attgacgtca atgacggtaa 4680 atggcccgcc tggcattatg cccagtacat gaccttatgg gactttccta cttggcagta 4740 catctacgta ttagtcatcg ctattaccat ggtcgaggtg agccccacgt tctgcttcac 4800 tctccccatc tcccccccct ccccaccccc aattttgtat ttatttattt tttaattatt 4860 ttgtgcagcg atgggggcgg gggggggggg ggggcgcgcg ccaggcgggg cggggcgggg 4920 cgaggggcgg ggcggggcga ggcggagagg tgcggcggca gccaatcaga gcggcgcgct 4980 ccgaaagttt ccttttatgg cgaggcggcg gcggcggcgg ccctataaaa agcgaagcgc 5040 gcggcgggcg ggagtcgctg cgcgctgcct tcgccccgtg ccccgctccg ccgccgcctc 5100 gcgccgcccg ccccggctct gactgaccgc gttactccca caggtgagcg ggcgggacgg 5160 cccttctcct ccgggctgta attagcgctt ggtttaatga cggcttgttt cttttctgtg 5220 gctgcgtgaa agccttgagg ggctccggga gggccctttg tgcgggggga gcggctcggg 5280 gggtgcgtgc gtgtgtgtgt gcgtggggag cgccgcgtgc ggctccgcgc tgcccggcgg 5340 ctgtgagcgc tgcgggcgcg gcgcggggct ttgtgcgctc cgcagtgtgc gcgaggggag 5400 cgcggccggg ggcggtgccc cgcggtgcgg ggggggctgc gaggggaaca aaggctgcgt 5460 gcggggtgtg tgcgtggggg ggtgagcagg gggtgtgggc gcgtcggtcg ggctgcaacc 5520 ccccctgcac ccccctcccc gagttgctga gcacggcccg gcttcgggtg cggggctccg 5580 tacggggcgt ggcgcggggc tcgccgtgcc gggcgggggg tggcggcagg tgggggtgcc 5640 gggcggggcg gggccgcctc gggccgggga gggctcgggg gaggggcgcg gcggcccccg 5700 gagcgccggc ggctgtcgag 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gacgtgtggg gagccggcac caccgtgaca gtgtcatctg 6600 cgtcgaccac agccccctct gtgttccccc tggccccttc ctgtgggtca acctctggca 6660 gcacagtggc cctggcgtgt cttgtgtctg gctacttccc tgaacctgtg acagtcagct 6720 ggaacagcgg aagcctgacc tctggagtgc acaccttccc cagtgtcctg caaagctcag 6780 gcctgcacag cctgtcaagt atggtgacag tgcccagtag caggtggcct tctgaaacct 6840 ttacctgcaa cgtggtgcac cctgcatcca acaccaaagt ggataagcct gttttcaatg 6900 agtgcagatg cacagataca cctccctgcc ctgtgcctga gcctctggga ggaccatcag 6960 tcctgatctt ccctccaaag cctaaggata tcctgcggat caccagaacc cccgaggtca 7020 cctgtgtcgt cctggatctg ggccgggaag atcctgaagt gcagattagc tggtttgtgg 7080 acggcaagga agtgcacaca gctaagaccc aatcccggga gcagcagttc aatggcacct 7140 accgggtggt ctctgtcctg cccatcgagc accaagattg gctgacaggc aaagagttta 7200 agtgccgagt caaccacata gatcttccct cccctattga gcggaccatc tccaaggcac 7260 gggggcgagc gcacaaaccc tctgtctatg tgctgcctcc ctctcccaaa gaattgagct 7320 ctagcgatac agtgtcaatc acctgcctga tcaaggactt ctacccccct gacattgatg 7380 ttgaatggca atcaaatggg cagcaagaac cagagagaaa acacagaatg acccctccac 7440 agctggatga ggacgggtcc tactttctgt actctaaact ttccgtggac aagagcagat 7500 ggcagcaggg agaccctttc acctgtgcgg tcatgcacga gacactgcaa aaccactaca 7560 cagatctgtc cttgagccac tcac 7584 <210> 13 <211> 7241 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Constructed sequence <400> 13 ccccgcggcc gcttcgagca gacatgataa gatacattga tgagtttgga caaaccacaa 60 ctagaatgca gtgaaaaaaa tgctttattt gtgaaatttg tgatgctatt gctttatttg 120 taaccattat aagctgcaat aaacaagtta acaacaacaa ttgcattcat tttatgtttc 180 aggttcaggg ggagatgtgg gaggtttttt aaagcaagta aaacctctac aaatgtggta 240 aaatcgataa ggatcttcct agagcatggc tacgtagata agtagcatgg cgggttaatc 300 attaactaca aggaacccct agtgatggag ttggccactc cctctctgcg cgctcgctcg 360 ctcactgagg ccgggcgacc aaaggtcgcc cgacgcccgg gctttgcccg ggcggcctca 420 gtgagcgagc gagcgcgcag ccttaattaa cctaattcac tggccgtcgt tttacaacgt 480 cgtgactggg aaaaccctgg cgttacccaa cttaatcgcc ttgcagcaca tccccctttc 540 gccagctggc gtaatagcga agaggcccgc accgatcgcc cttcccaaca gttgcgcagc 600 ctgaatggcg aatgggacgc gccctgtagc ggcgcattaa gcgcggcggg tgtggtggtt 660 acgcgcagcg tgaccgctac acttgccagc gccctagcgc ccgctccttt cgctttcttc 720 ccttcctttc tcgccacgtt cgccggcttt ccccgtcaag ctctaaatcg ggggctccct 780 ttagggttcc gatttagtgc tttacggcac ctcgacccca aaaaacttga ttagggtgat 840 ggttcacgta gtgggccatc gccctgatag acggtttttc gccctttgac gttggagtcc 900 acgttcttta atagtggact cttgttccaa actggaacaa cactcaaccc tatctcggtc 960 tattcttttg atttataagg gattttgccg atttcggcct attggttaaa aaatgagctg 1020 atttaacaaa aatttaacgc gaattttaac aaaatattaa cgcttacaat ttaggtggca 1080 cttttcgggg aaatgtgcgc ggaaccccta tttgtttatt tttctaaata cattcaaata 1140 tgtatccgct catgagacaa taaccctgat aaatgcttca ataatattga aaaaggaaga 1200 gtatgagtat tcaacatttc cgtgtcgccc ttattccctt ttttgcggca ttttgccttc 1260 ctgtttttgc tcacccagaa acgctggtga aagtaaaaga tgctgaagat cagttgggtg 1320 cacgagtggg ttacatcgaa ctggatctca acagcggtaa gatccttgag agttttcgcc 1380 ccgaagaacg ttttccaatg atgagcactt ttaaagttct gctatgtggc 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caaacaaaaa 2280 aaccaccgct accagcggtg gtttgtttgc cggatcaaga gctaccaact ctttttccga 2340 aggtaactgg cttcagcaga gcgcagatac caaatactgt tcttctagtg tagccgtagt 2400 taggccacca cttcaagaac tctgtagcac cgcctacata cctcgctctg ctaatcctgt 2460 taccagtggc tgctgccagt ggcgataagt cgtgtcttac cgggttggac tcaagacgat 2520 agttaccgga taaggcgcag cggtcgggct gaacgggggg ttcgtgcaca cagcccagct 2580 tggagcgaac gacctacacc gaactgagat acctacagcg tgagctatga gaaagcgcca 2640 cgcttcccga agggagaaag gcggacaggt atccggtaag cggcagggtc ggaacaggag 2700 agcgcacgag ggagcttcca gggggaaacg cctggtatct ttatagtcct gtcgggtttc 2760 gccacctctg acttgagcgt cgatttttgt gatgctcgtc aggggggcgg agcctatgga 2820 aaaacgccag caacgcggcc tttttacggt tcctggcctt ttgctggcct tttgctcaca 2880 tgttctttcc tgcgttatcc cctgattctg tggataaccg tattaccgcc tttgagtgag 2940 ctgataccgc tcgccgcagc cgaacgaccg agcgcagcga gtcagtgagc gaggaagcgg 3000 aagagcgccc aatacgcaaa ccgcctctcc ccgcgcgttg gccgattcat taatgcagct 3060 ggcacgacag gtttcccgac tggaaagcgg gcagtgagcg caacgcaatt aatgtgagtt 3120 agctcactca ttaggcaccc caggctttac actttatgct tccggctcgt atgttgtgtg 3180 gaattgtgag cggataacaa tttcacacag gaaacagcta tgaccatgat tacgccagat 3240 ttaattaagg ccttaattag gctgcgcgct cgctcgctca ctgaggccgc ccgggcaaag 3300 cccgggcgtc gggcgacctt tggtcgcccg gcctcagtga gcgagcgagc gcgcagagag 3360 ggagtggcca actccatcac taggggttcc ttgtagttaa tgattaaccc gccatgctac 3420 ttatctacgt agccatgctc taggaagatc ttcaatattg gccattagcc atattattca 3480 ttggttatat agcataaatc aatattggct attggccatt gcatacgttg tatctatatc 3540 ataatatgta catttatatt ggctcatgtc caatatgacc gccatgttgg cattgattat 3600 tgactagtta ttaatagtaa tcaattacgg ggtcattagt tcatagccca tatatggagt 3660 tccgcgttac ataacttacg gtaaatggcc cgcctggctg accgcccaac gacccccgcc 3720 cattgacgtc aataatgacg tatgttccca tagtaacgcc aatagggact ttccattgac 3780 gtcaatgggt ggagtattta cggtaaactg cccacttggc agtacatcaa gtgtatcata 3840 tgccaagtcc gccccctatt gacgtcaatg acggtaaatg gcccgcctgg cattatgccc 3900 agtacatgac cttacgggac tttcctactt ggcagtacat ctacgtatta gtcatcgcta 3960 ttaccatggt gatgcggttt tggcagtaca ccaatgggcg tggatagcgg tttgactcac 4020 ggggatttcc aagtctccac cccattgacg tcaatgggag tttgttttgg caccaaaatc 4080 aacgggactt tccaaaatgt cgtaataacc ccgccccgtt gacgcaaatg ggcggtaggc 4140 gtgtacggtg ggaggtctat ataagcagag ctcgtttagt gaaccgtcag atcactagaa 4200 gctttattgc ggtagtttat cacagttaaa ttgctaacgc agtcagtgct tctgacacaa 4260 cagtctcgaa cttaagctgc agaagttggt cgtgaggcac tgggcaggta agtatcaagg 4320 ttacaagaca ggtttaagga gaccaataga aactgggctt gtcgagacag agaagactct 4380 tgcgtttctg ataggcacct attggtctta ctgacatcca ctttgccttt ctctccacag 4440 gtgtccactc ccagttcaat tacagctctt aaggctagag tacttaatac gactcactat 4500 aggctagcgc caccatgtac aagatgcaac tcctgtcttg cattgcacta actcttgtcc 4560 ttgtcgcaaa cagtgacatc cagatgaccc agaccaccag cagcctgagc gccagcctgg 4620 gcgacagagt gatcatcagc tgtagcgcct cccaggacat cagcaactac ctgaactggt 4680 atcagcagaa acccgacggc accgtgaagg tgctgatcta cttcaccagc tccctgcaca 4740 gcggcgtgcc cagcagattt tctggcagcg gctccggcac cgactacagc 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tattcaacaa 5640 ggggctgaag gatgcccaga aggtacccca ttgtatggga tctgatctgg ggcctcggta 5700 cacatgcttt acatgtgttt agtcgaggtt aaaaaaacgt ctaggccccc cgaaccacgg 5760 ggacgtggtt ttcctttgaa aaacacgatg ataatatggc cacaaccatg tacaagatgc 5820 aactcctgtc ttgcattgca ctaactcttg tccttgtcgc aaacagtgag atccagctgg 5880 tgcagtctgg ccccgagctg aagcagcctg gcgagacagt gcggatcagc tgcaaggcca 5940 gcggctacac cttcaccaac tacggcatga actgggtcaa gcaggcccct ggcaagggcc 6000 tgaagtggat gggctggatc aacacctaca ccggcgagcc tacctacgcc gccgacttca 6060 agcggcggtt caccttcagc ctggaaacca gcgccagcac cgcctacctg cagatcagca 6120 acctgaagaa cgacgacacc gccacctact tttgcgccaa gtacccccac tactacggca 6180 gcagccactg gtacttcgac gtgtggggag ccggcaccac cgtgacagtg tcatctgcgt 6240 cgaccacagc cccctctgtg ttccccctgg ccccttcctg tgggtcaacc tctggcagca 6300 cagtggccct ggcgtgtctt gtgtctggct acttccctga acctgtgaca gtcagctgga 6360 acagcggaag cctgacctct ggagtgcaca ccttccccag tgtcctgcaa agctcaggcc 6420 tgcacagcct gtcaagtatg gtgacagtgc ccagtagcag gtggccttct gaaaccttta 6480 cctgcaacgt ggtgcaccct gcatccaaca ccaaagtgga taagcctgtt ttcaatgagt 6540 gcagatgcac agatacacct ccctgccctg tgcctgagcc tctgggagga ccatcagtcc 6600 tgatcttccc tccaaagcct aaggatatcc tgcggatcac cagaaccccc gaggtcacct 6660 gtgtcgtcct ggatctgggc cgggaagatc ctgaagtgca gattagctgg tttgtggacg 6720 gcaaggaagt gcacacagct aagacccaat cccgggagca gcagttcaat ggcacctacc 6780 gggtggtctc tgtcctgccc atcgagcacc aagattggct gacaggcaaa gagtttaagt 6840 gccgagtcaa ccacatagat cttccctccc ctattgagcg gaccatctcc aaggcacggg 6900 ggcgagcgca caaaccctct gtctatgtgc tgcctccctc tcccaaagaa ttgagctcta 6960 gcgatacagt gtcaatcacc tgcctgatca aggacttcta cccccctgac attgatgttg 7020 aatggcaatc aaatgggcag caagaaccag agagaaaaca cagaatgacc cctccacagc 7080 tggatgagga cgggtcctac tttctgtact ctaaactttc cgtggacaag agcagatggc 7140 agcagggaga ccctttcacc tgtgcggtca tgcacgagac actgcaaaac cactacacag 7200 atctgtcctt gagccactca cctggcaagt gataaggccg g 7241 <210> 14 <211> 213 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> chimeric 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385 390 395 400 Thr Pro Pro Gln Leu Asp Glu Asp Gly Ser Tyr Phe Leu Tyr Ser Lys 405 410 415 Leu Ser Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asp Pro Phe Thr Cys 420 425 430 Ala Val Met His Glu Thr Leu Gln Asn His Tyr Thr Asp Leu Ser Leu 435 440 445 Ser His Ser Pro Gly Lys 450

Claims (22)

  1. 다음을 포함하는 바이러스 벡터: 서열 번호: 15의 항-VEGF 항체 중쇄 면역글로불린 및/또는 서열 번호: 14의 항-VEGF 항체 경쇄 면역글로불린이 포함된 개의 VEGF에 결합하는 기능을 하는 항-VEGF 항체를 인코딩하는 핵산 서열, 그리고 면역글로불린 쇄들이 기능을 하는 항체로 어셈블리되는 것을 허용하는 조건하에서 숙주 세포 안에서 상기 쇄들의 발현을 지시하는 발현 제어 서열을 포함하는 최소한 하나의 핵산 발현 카세트.
  2. 다음을 인코딩하는 핵산 서열이 포함된 최소한 하나의 핵산 발현 카세트를 포함하는 바이러스 벡터: 프로모터, 항-VEGF 항체 중쇄 면역글로불린에 작동가능하도록 연계된 제 1 신호 펩티드, 링커 서열, 그리고 항-VEGF 경쇄 면역글로불린에 작동가능하도록 연계된 제 2 신호 펩티드, 이때 전술한 발현 카세트는 면역글로불린 쇄들이 서열 번호: 14 및/또는 서열 번호: 15를 포함하는 기능성 키메라 항-VEGF 항체로 어셈블리되는 것을 허용하는 조건하에서 숙주 세포 안에서 상기 쇄들을 공동-발현시킨다.
  3. 청구항 1 또는 청구항 2에 있어서, 이때 상기 바이러스 벡터는 아데노-연합된 바이러스 벡터인, 바이러스 벡터.
  4. 청구항 3에 있어서, 이때 상기 벡터는 AAV8 캡시드를 갖는 바이러스 벡터.
  5. 청구항 2에 있어서, 이때 전술한 링커 서열은 하나 또는 그 이상의 IRES 서열, 2A 펩티드 서열 및 퓨린 부위를 포함하는, 바이러스 벡터.
  6. 청구항 1 내지 4 중 임의의 한 항에 있어서, 이때 상기 키메라 항-VEGF 항체는 단일클론 항체, Fv, Fab, F(ab)2, F(ab)3, Fab', Fab'-SH, F(ab')2, 면역접합체(immunoadhesin), 또는 단일 쇄 가변 단편 항체로부터 선택되는, 바이러스 벡터.
  7. 청구항 5에 있어서, 이때 상기 항체는 키메라 단일클론 항체인, 바이러스 벡터.
  8. 청구항 1 내지 4 중 임의의 한 항에 있어서, 이때 항-VEGF 항체 중쇄 가변 영역을 인코드하는 핵산 서열은 서열 번호: 6 또는 코돈 최적화된 이의 변이체를 포함하는, 바이러스 벡터.
  9. 청구항 1 내지 4 중 임의의 한 항에 있어서, 이때 항-VEGF 항체 중쇄 불변 영역을 인코드하는 핵산 서열은 서열 번호: 8 또는 코돈 최적화된 이의 변이체를 포함하는, 바이러스 벡터.
  10. 청구항 1 내지 4 중 임의의 한 항에 있어서, 이때 항-VEGF 항체 경쇄 가변 영역을 인코드하는 핵산 서열은 서열 번호: 7 또는 코돈 최적화된 이의 변이체를 포함하는, 바이러스 벡터.
  11. 청구항 1 내지 4 중 임의의 한 항에 있어서, 이때 항-VEGF 항체 경쇄 불변 영역을 인코드하는 핵산 서열은 서열 번호: 9 또는 코돈 최적화된 이의 변이체를 포함하는, 바이러스 벡터.
  12. 청구항 1 내지 4 중 임의의 한 항에 있어서, 이때 상기 프로모터는 CMV 프로모터인, 바이러스 벡터.
  13. 청구항 1에 있어서, 이때 상기 발현 제어 서열은 구성 프로모터를 포함하는, 바이러스 벡터.
  14. 청구항 1 내지 4 중 임의의 한 항에 있어서, 인트론, Kozak 서열, polyA, 및 전사-후 조정 요소들중 하나 또는 그 이상을 더 포함하는, 바이러스 벡터.
  15. 청구항 1에 있어서, 이때 AAV 캡시드는 AAV8, rh64R1, AAV9, AAVhu.37, 또는 rh10 및 이의 변이체로부터 선택되는, 바이러스 벡터.
  16. 약학적으로 수용가능한 운반체 및 청구항 1 내지 15중 임의의 한 항에 따른 rAAV를 포함하는 약학 조성물.
  17. 청구항 16의 조성물을 이를 필요로 하는 대상에게 투여하는 것을 포함하는, 암 치료 방법.
  18. 청구항 17에 있어서, 여기에서 전술한 조성물은 약 1x1012 GC/kg의 투여량으로 투여되는, 방법.
  19. 서열 번호: 14 및 서열 번호: 15를 포함하는, 키메라 항-VEGF 항체.
  20. 청구항 19에 있어서, 이때 전술한 항체를 인코드하는 핵산 서열은 서열 번호: 6, 서열 번호: 7, 서열 번호: 8 또는 서열 번호: 9 중 하나 또는 그 이상, 또는 코돈 최적화된 이의 변이체를 포함하는, 키메라 항체.
  21. 대상의 암 치료에 청구항 1 내지 15 중 임의의 한 항에 따른 바이러스 벡터의 사용.
  22. 대상의 암 치료에 사용되는, 청구항 1 내지 15 중 임의의 한 항에 따른 바이러스 벡터.
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