KR20150065709A - 마크로시클릭 뎁시펩티드의 제조를 위한 용액 상 공정 및 신규 중간체 - Google Patents
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Abstract
Description
본 발명은 용액 상 펩티드 합성을 포함하는 마크로시클릭 뎁시펩티드의 제조를 위한 방법 또는 공정, 신규 중간체 및 그의 제조, 뿐만 아니라 관련된 발명 실시양태에 관한 것이다.
시클릭 뎁시펩티드의 다수 유용성 및 용도는 약리학에 공지되어 있다. 예로서, WO 2009/024527에 개시된 뎁시펩티드는 다양한 질환의 치료에 유용하다.
예를 들어, WO 2009/024527에 언급된 하기 화학식 A의 화합물은
염증성 및/또는 과다증식성 및 소양성 피부 질환, 예컨대 아토피성 피부염, 건선, 농포성 건선, 장미증, 켈로이드, 비후성 반흔, 여드름, 네더톤 증후군 또는 다른 소양성 피부병, 예컨대 결절성 양진, 노인의 상세불명의 가려움증, 뿐만 아니라 상피 장벽 기능장애를 동반한 다른 질환, 예컨대 노화 피부의 치료 및/또는 예방에 유용하다.
이 화합물은 또한 이하 "화합물 A"로 명명된다.
이전에 시아노박테리움 노스톡(Nostoc)으로부터 단리된 다른 시클릭 뎁시펩티드, 예컨대 BN920이 또한 마이크로시스티스(Microcystis)로부터 단리되었다. 노스토펩틴(Nostopeptin) (BN920)은 31 nM의 IC50 값으로 키모트립신을 억제하였다 (문헌 [J. Nat. Prod. 68(9), 1324-7 (2005)] 참조). 이는 하기 화학식 B를 갖는다.
이들 화합물은, 각각 소위 ahp-하위구조 (ahp: 3-아미노-6-히드록시-피페리딘-2-온) 및 상응하는 데히드로-ahp 하위구조 (데히드로-ahp: 3-아미노-3,4-디히드로-1H-피리딘-2-온) (또한 본원에서 "탈수화물"이라 함)를 포함하는 다른 뎁시펩티드와 함께 발효 (콘드로미세스 크로악투스(Chondromyces croactus), 믹소박테리아 사용)에 의해 생산될 수 있다. 따라서, 이들 화합물 중 임의의 단일의 것에 관한 발효의 수율은 현재까지 다소 낮고, 산업적 또는 심지어 파일럿 규모에 대해 충분한 양의 제조도 허용할 수 없다.
유사한 화합물은 용액 상 합성에 의해 합성되나, 불량한 수율 및 낮은 효율을 갖는다.
본 발명은 따라서 언급된 단점을 최소화하거나 제거하도록 하는 새로운 제조 방법을 제공하는 것을 목표로 한다.
본 발명은 임의의 고체 상 합성 단계를 필요로 하지 않는 순수한 용액 상 펩티드 합성에 의해 화학식 I의 뎁시펩티드를 제조하는 공정 또는 방법에 관한 것이다.
본 발명은 이러한 시클릭 뎁시펩티드를 증가된 수율 및/또는 우수한 순도로, 또한 산업적 제조에 적합한 양, 예를 들어 수 킬로그램 및 심지어 수 톤까지 수득하도록 하는 공정 또는 방법에 관한 것이다.
다수의 가능한 이성질체와의 복합 분자의 합성에 있어서, 다수의 합성 위험, 예컨대 라세미화, 호변이성질체화, 중간체의 탈보호 동안의 절단 또는 다른 부반응 및 기타에도 불구하고, 화학식 I의 시클릭 뎁시펩티드를 우수한 수율 및/또는 필요한 입체이성질적 순도, 특히 둘 다로 제조하도록 하는, 용액 중 반응을 포함하고 임의의 고체 상 물질의 사용을 필요로 하지 않는 제조 방법을 발견하는 것이 본 발명에 이르러 가능하였다. 다량의 합성은 이러한 새로운 합성 방법을 기준으로 하여 가능한 것으로 합리적으로 예상되며, 이는 산업적 규모의 생성물 제조를 허용한다. 부산물의 양을 감소시키고, 심지어 이러한 부산물, 특히 데히드로-ahp 하위구조 및/또는 ahp 대신에 5원 고리를 갖는 목적하는 ahp-포함 생성물의 유사체를 목적하는 최종 생성물로 전환시킴으로써 수율을 개선하는 것이 가능하다. 이는 수율을 추가로 증가시키도록 한다. 특히, 합성은, 예를 들어 실리카 겔 및 역상 물질 상의 크로마토그래피, 예컨대 흡수 크로마토그래피에 의한 중간체의 단순 분리 공정을 가능하게 한다.
반응은, 다른 합성 방식, 예를 들어 고체 상 펩티드 합성과 비교시, 보다 낮은 과량의 시약 (통상적으로 고체 상 물질 상의 기 상에 결합될 과량의 물질을 필요로 하는 고체 상 합성에 반해, 거의 화학량론적 양 또는 화학량론적 양이 가능함) 및 반응물을 사용하여 다목적 반응기에서 수행될 수 있다. 이것 뿐만 아니라, 상기 나타낸 크로마토그래피 단계에 의해 중간체를 정제하는 가능성은 제조에 대한 융통성을 제공하고, 수 톤 양의 시클로펩티드의 제조를 위한 규모-확대를 가능하게 한다.
특히, 적절한 보호기 전략을 사용하는 것이 가능하였다.
본 발명은 따라서, 제1 실시양태에서, 용액 상 합성 단독에 의해 하기 화학식 I의 시클릭 뎁시펩티드 화합물, 특히 하기 화학식 IA의 화합물 또는 그의 염을 제조하기 위한 방법 또는 공정이며,
<화학식 I>
<화학식 IA>
(상기 식에서,
A1은 말단 카르복시 또는 카르바모일 기를 갖는 아미노산, 특히 아스파라긴 또는 글루타민의 (2가) 모이어티이고, 카르보닐을 통해 분자의 나머지 부분에 결합되거나; 또는 C1-8-알카노일 또는 인산화 히드록시-C1-8-알카노일이고;
X는 A1의 N을 통해 결합되고 아실이거나, 또는 A1이 C1-8-알카노일 또는 인산화 히드록시-C1-8-알카노일인 경우에는 부재하고;
R2는 C1-8-알킬, 특히 메틸이고;
R3은 아미노산, 특히 류신, 이소류신 또는 발린의 측쇄이고;
R5는 아미노산, 바람직하게는 페닐알라닌, 류신, 이소류신 또는 발린의 측쇄이고;
R6은 히드록시 아미노산, 특히 티로신의 측쇄이고;
R7은 아미노산, 바람직하게는 아미노산 류신, 이소류신 또는 발린의 측쇄이고;
Y는 수소 또는 C1-8-알킬임)
상기 방법은
제1 변형법 (A)에서
하기 화학식 II, 특히 하기 화학식 IIA의 화합물의 유리 히드록실 기를
<화학식 II>
<화학식 IIA>
(상기 식에서, Y는 화학식 I의 화합물에 대해 정의된 바와 같고, X*, A1*, R2*, R3*, R5*, R6* 및 R7*는 각각 화학식 I에서의 X, A1, R2, R3, R5, R6 및 R7에 상응하나, 단 이들 모이어티 상의 반응성 관능기는 적어도 이들이 목적하지 않은 부반응에 참여할 수 있는 경우에는 보호 형태로 존재함)
산화 조건 하에 반응시켜 하기 화학식 III, 특히 하기 화학식 IIIA의 화합물을 형성하고,
<화학식 III>
<화학식 IIIA>
잔류하는 보호기를 제거하여 (예를 들어, 화학식 II, 특히 IIA의 화합물에서의 일부 또는 모든 보호기를 여전히 보유하는, 화학식 XXIII-1 (특히 XXIII-1A), XXIII-2 (특히 XXIII-2A) 및/또는 XXIII-3 (특히 XXIII-3A)의 중간체 또는 유사체를 통해) 화학식 I의 화합물 또는 그의 염을 수득하고,
원하는 경우에, 화학식 I의 유리 화합물을 염으로, 화학식 I의 화합물의 염을 화학식 I의 화합물의 상이한 염으로 또는 화학식 I의 유리 화합물로 전환시키고/거나 화학식 I의 화합물의 탈수화물 유사체를 화학식 I의 상응하는 화합물로 전환시키는 것을 포함하며,
여기서 화학식 III의 화합물은 (바람직하게는) 하기 화학식 IV, 특히 화학식 IVA의 화합물의 거대락탐화에 의해 제조되는 것
<화학식 IV>
<화학식 IVA>
(상기 식에서, Y, R2*, R3*, R7*, R6* 및 R5*, X* 및 A1*는 화학식 II의 화합물에 대해 정의된 바와 같음)
인 방법 또는 공정에 관한 것이다.
화학식 III, 특히 화학식 IIIA의 화합물을 화학식 II, 특히 화학식 IIA의 화합물로부터 제조하기 위한 산화 조건은 바람직하게는 히드록실 기가 알데히드 기로 직접 산화되도록 선택된다 (및/또는 하기 주어진 화학식 XXXIII-3의 화합물의 헤미아미날 이성질체가 형성됨). 산화를 위한 적합한 산화 조건은 통상적으로 DMSO 중 IBX (J. Org. Chem. 1995, 60, 7272-7276); 피리디늄 디크로메이트 또는 피리디늄 클로로크로메이트 (Tetrahedron Lett. 1979, 5, 399-402); 옥살릴 클로라이드, 디메틸 술폭시드 및 3급 아민 (J. Peptide Sci. 2006, 12, 140-146), 옥소암모늄 염 (J. Org. Chem. 1985, 50, 1332-1334); 옥소암모늄 염에 의해 촉매화되는 알칼리 하이포클로라이트 (J Org. Chem. 1989, 54, 2970-2972); 옥소아미늄 염 (Tetrahedron Lett. 1988, 29, 5671-5672), RuCl2(PPh3)3 (Tetrahedron Lett. 1981, 22, 1605-1608); 차아염소산나트륨의 존재 하에 TEMPO (1 mol%) (Tetrahedron Lett. 1990, 31, 2177-2180); NaIO4, TEMPO, NaBr (Tetrahedron 2006, 62, 8928-8932); SiO2 지지된 산화바나듐 (IV) 및 t-BuOOH (Advanced Synthesis & Catalysis 2007, 349, 846-848)를 사용하고 있다. 가능한 산화제 중에서 1-히드록시-1,2-벤즈아이오독솔-3(1H)-온-1-옥시드 (IBX)가 특히 바람직하다. 반응은 바람직하게는 적절한 용매, 예컨대 시클릭 에테르, 예를 들어 테트라히드로푸란 또는 디옥신, 디-(C1-C8-알킬)술폭시드, 예를 들어 디메틸술폭시드 또는 그의 혼합물 중에서, 예를 들어 0-50℃, 바람직하게는 20-25℃에서 수행한다.
용액 중 거대락탐화는 통상적으로 올리고머화 및 중합을 피하기 위해 매우 낮은 농도의 기질로 수행된다. 이는 반응을 수행하기 위해 막대한 양의 용매 및 매우 큰 반응기를 필요로 한다. 예를 들어, 올리고펩티드의 거대락탐화는 2 mMol/리터의 농도에서 수행된다 (문헌 [Yokokawa et al., Tetrahedron 2005, 61, 1459-1480] 참조). 이러한 난점은, 3급 염기 및 커플링 시약을 용해시키고, 제어된 방식으로 올리고펩티드의 용액을 이 용액에 첨가함으로써 회피될 수 있다. 제어된, 특히 느린 올리고펩티드-용액의 첨가는 영구적으로 용액 중 낮은 농도의 활성화된 올리고펩티드를 생성하고, 따라서 올리고머화 및 중합을 방지한다. 올리고펩티드 용액의 첨가 비율은 거대고리화를 위한 반응 속도에 따라 조정될 수 있다: 거대고리화가 빠른 반응인 경우에는, 올리고펩티드의 용액은 빠르게 첨가될 수 있다. 거대고리화가 느린 경우에, 용액의 첨가는 활성화된 올리고펩티드의 영구적인 저농도를 보장하도록 느려야만 한다. 따라서, 올리고펩티드의 제어된 첨가는 훨씬 적은 용매량으로, 또한 여전히 활성화된 올리고펩티드의 농도를 10-3 mM 미만으로, 예를 들어 10-4 내지 10-6 mM의 범위로 또는 훨씬 더 낮게 유지하면서 작업하는 것을 가능하게 한다. 커플링 시약 용액에의 올리고펩티드의 제어된 첨가의 변형법은 본 발명의 바람직한 실시양태의 일부이며;
여기서 바람직하게는
추가 실시양태에서, 상기 기재된 방법 또는 공정은 보호기 ProtA, 보호된 아미노 기 Z의 보호기(들) 및 보호기 Prot를 하기 화학식 V, 특히 화학식 VA의 화합물로부터 동시에 또는 순차적으로 제거함으로써 용액 상에서 화학식 IV의 화합물을 제조하는 것을 추가로 포함한다.
<화학식 V>
<화학식 VA>
(상기 식에서, ProtA는 카르복시 보호기이고, Prot는 히드록실 보호기이고, Z는 화학식 NHProt** (여기서 Prot**는 적어도 거의 pH 중성 조건 하에 바람직하게 제거될 수 있는 아미노 보호기임)의 보호된 아미노 기이거나; 또는 Z는 화학식 N(Prot*)2 (여기서 각 Prot*는, 예를 들어 촉매 수소화에 의해 제거될 수 있는 아미노 보호기이고, 특히 각각은 아릴알킬 아미노 보호기임)의 보호된 아미노 기이고; Y, R2*, R3*, R7*, R6* 및 R5*, X* 및 A1*는 화학식 II의 화합물에 대해 정의된 바와 같음)
추가 실시양태에서, 본 발명은 하기 화학식 VI, 특히 화학식 VIA의 화합물을
<화학식 VI>
<화학식 VIA>
(상기 식에서, ProtA는 화학식 V의 화합물에 대해 상기 정의된 바와 같고, Y, R2*, R3*, R7*, R6* 및 R5*, X* 및 A1*는 화학식 II의 화합물에 대해 상기 정의된 바와 같음)
하기 화학식 VII, 특히 화학식 VIIA의 아미노산,
<화학식 VII>
<화학식 VIIA>
(상기 식에서, ProtA, 및 바람직하게는 NHProt**인 Z는 화학식 V의 화합물에 대해 상기 정의된 바와 같음)
또는 그의 활성화된 유도체와 커플링시킴으로써 용액 상에서 화학식 V의 화합물을 제조하는 것 (변형법 A의 마지막)을 추가로 포함하는 것인
상기 언급된 방법 또는 공정;
및/또는 (병행으로 또는 바람직하게는 대안적으로) 변형법 (B)에서,
하기 화학식 II*, 특히 하기 화학식 IIA*의 화합물을 탈보호시켜
<화학식 II*>
<화학식 IIA*>
(상기 식에서, 알데히드 보호기(들) Rk 및 Rl은 서로 독립적으로 비치환 또는 치환된 알킬이거나, 또는 2개의 결합 O 원자, 및 2개의 O 원자가 결합되어 있는 탄소 원자와 함께 비치환 또는 치환된 고리를 형성하고 (Rk 및 Rl은 이어서 바람직하게는 비치환 또는 치환된 알킬렌 가교, 특히 비치환 또는 치환된 에틸렌, 예컨대 -CH2-CH2- 또는 -CH2-CH2-CH2-를 형성함), Y는 화학식 I의 화합물에 정의된 바와 같고, X*, A1*, R2*, R3*, R5*, R6* 및 R7*는 각각 화학식 I에서의 X, A1, R2, R3, R5, R6 및 R7에 상응하나, 단 이들 모이어티 상의 반응성 관능기 (예컨대 아미노, 이미노, 히드록시, 카르복시, 술프히드릴, 아미디노, 구아니디노, O-포스포노 (-O-P(=O)(OH)2))는 적어도 이들이 목적하지 않은 부반응에 참여할 수 있는 경우에는 보호된 형태로 존재함)
(예를 들어, 화학식 II*, 특히 IIA*의 화합물에서의 일부 또는 모든 보호기를 여전히 보유하는, 화학식 XXIII-1 (특히 XXIII-1A), XXIII-2 (특히 XXIII-2A) 및/또는 XXIII-3 (특히 XXIII-3A)의 중간체 또는 유사체를 통해) 화학식 I, 특히 IA의 화합물을 생성하고,
원하는 경우에, 화학식 I, 또는 특히 IA의 유리 화합물을 염으로, 화학식 I의 화합물의 염을 화학식 I, 또는 특히 IA의 화합물의 상이한 염으로 또는 화학식 I, 또는 특히 IA의 유리 화합물로 전환시키고/거나, 탈수화물 유사체 (예를 들어 상기 주어진 화학식 XXIII-2 또는 특히 XXIII-2A의 부산물) 및/또는 화학식 I, 또는 특히 IA의 화합물의 5원 고리 유사체 (예를 들어 상기 주어진 화학식 XXIII-3 또는 특히 XXIII-3A의 부산물)를 화학식 I, 또는 특히 IA의 상응하는 화합물로 전환시키는 것을 포함하는, 상기 언급된 방법 또는 공정에 관한 것이다.
본 발명의 추가 실시양태는, 상기 화학식 II*, 특히 상기 화학식 IIA*의 화합물의 합성을 위해, N-말단 아미노 기 및 C-말단 카르복시 기를 보유하는 화학식 II* 또는 특히 화학식 IIA*의 화합물의 선형 전구체 펩티드의 락탐화 (거대락탐화) 하에서, 상기 아미노 및 상기 카르복시 기로부터 아미드 결합의 형성을 허용하는 반응 조건 하에, 용액 상 화학을 사용하는 고리화를 추가로 포함하는, 상기 기재된 바와 같은 방법 또는 공정에 관한 것이다.
본 발명의 추가 실시양태는 선형 전구체 펩티드가 하기 화학식 IV*, 특히 하기 IVA*를 갖고,
<화학식 IV*>
<화학식 IVA*>
(상기 식에서, Rk, Rl, X*, A1*, R2*, R3*, R5*, R6* 및 R7*는 상기 화학식 II*의 화합물에 대해 정의된 바와 같음)
이는 하기 화학식 V*, 특히 하기 VA*의 상응하는 화합물로부터
<화학식 V*>
<화학식 VA*>
(상기 식에서, Rk, Rl, X*, A1*, R2*, R3*, R5*, R6* 및 R7*는 상기 화학식 II*의 화합물에 대해 정의된 바와 같고, Z는 상기 화학식 V의 화합물에 대해 정의된 바와 같음)
보호된 아미노 기 Z를 탈보호시킴으로써 탈보호에 의해 수득될 수 있는 것인, 이전 단락에 따른 방법 또는 공정에 관한 것이다.
또 다른 실시양태는, 화학식 V* 또는 특히 VA*의 화합물의 합성을 위해, 하기 화학식 VI, 특히 하기 VIA의 화합물을
<화학식 VI>
<화학식 VIA>
(상기 식에서, Rk, Rl, X*, A1*, R2*, R3*, R5*, R6* 및 R7*는 상기 화학식 II*의 화합물에 대해 정의된 바와 같고, Prot-A는 카르복시 보호기임)
하기 화학식 VII*, 특히 하기 VIIA*의 아미노산,
<화학식 VII*>
<화학식 VIIA*>
(상기 식에서, Rk 및 Rl은 상기 화학식 II*의 화합물에 대해 정의된 바와 같고, Z는 화학식 V의 화합물에 대해 상기 정의된 바와 같음)
또는 상기 아미노산의 활성화된 유도체를 화학식 VI* 또는 VIA*의 상기 화합물에 커플링시킴으로써 반응시키는 것 (변형법 (B)의 마지막)을 추가로 포함하는 것인,
이전 단락에 따른 방법 또는 공정에 관한 것이다.
본 발명의 추가 실시양태는 하기 화학식 VIII, 특히 하기 화학식 VIIIA의 화합물을
<화학식 VIII>
<화학식 VIIIA>
(상기 식에서, ProtA는 화학식 V의 화합물에 대해 상기 정의된 바와 같고, Y, R2*, R3*, R7*, R6* 및 X* 및 A1*는 화학식 II의 화합물에 대해 상기 정의된 바와 같음)
하기 화학식 IX, 특히 하기 화학식 IXA의 아미노산,
<화학식 IX>
<화학식 IXA>
(상기 식에서, Prot**는 Z의 정의에서 화학식 V의 화합물에 대해 정의된 바와 같고, R5*는 화학식 V의 화합물에 대해 상기 정의된 바와 같음)
또는 상기 아미노산의 반응성 유도체와 커플링시킴으로써 용액 상에서 변형법 둘 다에서 사용되는 화학식 VI의 화합물을 제조하는 것을 추가로 포함하는, 상기 기재된 바와 같은 방법 또는 공정에 관한 것이다 (변형법 (A) 또는 변형법 (B)를 포함하나 둘 다가, 예를 들어 병행으로 사용되는 것을 제외하지는 않음).
또 다른 실시양태에서, 본 발명은 하기 화학식 X, 특히 하기 화학식 XA의 화합물을
<화학식 X>
<화학식 XA>
(상기 식에서, ProtA는 화학식 V의 화합물에 대해 상기 정의된 바와 같고, R2*, R3*, R7*, X* 및 A1*는 화학식 II의 화합물에 대해 상기 정의된 바와 같음)
하기 화학식 XI, 특히 하기 화학식 XIA의 아미노산,
<화학식 XI>
<화학식 XIA>
(상기 식에서, Prot** 및 R6*는 화학식 V의 화합물에 대해 상기 정의된 바와 같고, Y는 화학식 I의 화합물에 대해 상기 정의된 바와 같음)
또는 상기 아미노산의 반응성 유도체와 커플링시킴으로써 용액 상에서 화학식 VIII의 화합물을 제조하는 것을 추가로 포함하는, 상기 언급된 방법 또는 공정에 관한 것이다.
본 발명의 추가 실시양태는 하기 화학식 XII, 특히 하기 화학식 XIIA의 화합물을
<화학식 XII>
<화학식 XIIA>
(상기 식에서, ProtA는 화학식 V의 화합물에 대해 상기 정의된 바와 같고, R2*, R3* X* 및 A1*는 화학식 II의 화합물에 대해 상기 정의된 바와 같음)
하기 화학식 XIII, 특히 하기 화학식 XIIIA의 아미노산,
<화학식 XIII>
<화학식 XIIIA>
(상기 식에서, Prot** 및 R7*는 화학식 V의 화합물에 대해 상기 정의된 바와 같음)
또는 상기 아미노산의 반응성 유도체를 사용하여 에스테르화시킴으로써 용액 상에서 화학식 X의 화합물을 제조하는 것을 추가로 포함하는, 상기 방법 또는 공정에 관한 것이다.
추가 실시양태에서, 본 발명은 하기 화학식 XIV, 특히 하기 화학식 XIVA의 화합물을
<화학식 XIV>
<화학식 XIVA>
(상기 식에서, ProtA는 화학식 V의 화합물에 대해 상기 정의된 바와 같고, R2* 및 R3*는 화학식 II의 화합물에 대해 상기 정의된 바와 같음)
하기 화학식 XV의 산,
<화학식 XV>
또는 그의 반응성 유도체와 커플링시키고,
(상기 식에서, X**는 아미노 보호기이거나 또는 X*이고, X* 및 A1*는 화학식 II의 화합물에 대해 상기 정의된 바와 같음)
X**가 아미노 보호기인 경우에는, 상기 아미노 보호기 X**를 제거하여 X* 대신에 H를 수득하고, 생성된 아미노 기를 상응하는 산 X*-OH (여기서 X*는 화학식 II의 화합물에 대해 상기 정의된 바와 같음) 또는 그의 반응성 유도체를 사용하여 아실 기 X*와 커플링시킴으로써 용액 상에서 화학식 XII의 화합물을 제조하는 것을 추가로 포함하는, 상기 언급된 방법 또는 공정에 관한 것이다.
본 발명의 한 실시양태는 또한 하기 화학식 XVI, 특히 하기 화학식 XVIA의 아미노산을
<화학식 XVI>
<화학식 XVIA>
(상기 식에서, ProtA는 화학식 V의 화합물에 대해 상기 정의된 바와 같고, R3*는 화학식 II의 화합물에 대해 상기 정의된 바와 같음)
하기 XVII, 특히 하기 화학식 XVIIA의 아미노산,
<화학식 XVII>
<화학식 XVIIA>
(상기 식에서, Prot***는 보호기 ProtA의 제거 없이 절단될 수 있는 아미노 보호기이고, R2*는 화학식 II의 화합물에 대해 상기 정의된 바와 같음)
또는 상기 아미노산의 반응성 유도체와 커플링시키고,
아미노 보호기 Prot***를 제거함으로써 화학식 XV의 화합물을 제조하는 것을 추가로 포함하는, 상기 언급된 방법 또는 공정에 관한 것이다.
추가 실시양태에서, 본 발명은 하기 화학식 XVIII, 특히 하기 화학식 XVIIIA의 화합물에서의 유리 카르복실 기를
<화학식 XVIII>
<화학식 XVIIIA>
(상기 식에서, ProtC는 카르복실 보호기이고, Prot**는 화학식 V의 화합물에 대해 정의된 바와 같음)
하기 화학식 XIX, 특히 하기 화학식 XIXA의 상응하는 알콜로 환원시키고,
<화학식 XIX>
<화학식 XIXA>
(상기 식에서, Prot** 및 ProtC는 상기 정의된 바와 같음)
유리 히드록실 기를 히드록실 보호기 Prot를 도입하는 시약으로 보호하여 하기 화학식 XX, 특히 하기 화학식 XXA의 화합물을 수득하고,
<화학식 XX>
<화학식 XXA>
(상기 식에서, Prot**, ProtC 및 Prot는 상기 정의된 바와 같음)
보호기 ProtC를 제거하여 화학식 VII을 수득함으로써
화학식 VII의 화합물을 제조하는 것을 포함하는, 상기 기재된 바와 같은 방법에 관한 것이다.
본 발명의 추가 실시양태는 상기 정의된 바와 같은 치환기를 갖는 화학식 I의 화합물의 탈수화물을 화학식 I의 상응하는 화합물로 전환시키는 것을 포함하며, 여기서 탈수화물은 하기 화학식 XXI, 특히 하기 화학식 XXIA,
<화학식 XXI>
<화학식 XXIA>
(상기 식에서, Y, X, A1, R2, R3, R5, R6 및 R7은 화학식 I의 화합물에 대해 상기 정의된 바와 같음)
및/또는 또한 부산물로서 형성될 수 있고 하기 화학식 XXII*, 특히 화학식 XXIIA*를 갖는, 화학식 I에서 ahp 구조 대신에 5원 고리를 갖는 그의 상응하는 헤미아미날 유사체를 갖고,
<화학식 XXII*>
<화학식 XXIIA*>
(상기 식에서, Y, X, A1, R2, R3, R5, R6 및 R7은 각각 화학식 I의 화합물에 대해 상기 정의된 바와 같음)
수성 산을 반응성 용매로 사용하여 반응을 구동하는 것을 포함하는, 화학식 I의 화합물의 제조 방법에 관한 것이다.
화학식 II, 특히 IIA, 또는 II*, 특히 IIA*의 화합물의 반응은, 예를 들어 화학식 XXIII-1 (단지 일시적으로 존재하는 알데히드 화합물), XXIII-2 (탈수화물) 및 XXIII-3 (5원 고리 헤미-아미날)에 의해 나타내어진 하나 이상의 화합물을 비롯한 화합물 혼합물을 통해 일어날 수 있다.
<화학식 XXIII-1>
특히 XXIII-1A
<화학식 XXIII-1A>
<화학식 XXIII-2>
특히 XXIII-2A
<화학식 XXIII-2A>
및/또는
<화학식 XXIII-3>
특히 XXIII-3A
<화학식 XXIII-3A>
상기 식에서, 각각의 언급된 화합물 XXIII-1-, -2- 또는 -3- 또는 언급된 바람직한 변형체에서의 모이어티는 하기 의미를 갖는다:
상기 식에서,
A1은 말단 카르복시 또는 카르바모일 기를 갖는 아미노산, 특히 아스파라긴 또는 글루타민의 2가 모이어티이고, 카르보닐을 통해 분자의 나머지 부분에 결합되거나; 또는 C1-8-알카노일 또는 인산화 히드록시-C1-8-알카노일이고;
X는 A1의 N을 통해 결합되고 아실이거나, 또는 A1이 C1-8-알카노일 또는 인산화 히드록시-C1-8-알카노일인 경우에는 부재하고;
R2는 C1-8-알킬, 특히 메틸이고;
R3은 아미노산, 특히 류신, 이소류신 또는 발린의 측쇄이고;
R5는 아미노산, 바람직하게는 페닐알라닌, 류신, 이소류신 또는 발린의 측쇄이고;
R6은 히드록시 아미노산, 특히 티로신의 측쇄이고;
R7은 아미노산, 바람직하게는 아미노산 류신, 이소류신 또는 발린의 측쇄이고;
Y는 수소 또는 C1-8-알킬이고;
여기서 화합물은 또한 각각 염 형태로 존재할 수 있다.
추가 실시양태에서, 본 발명은 실시예에 주어진 하기 각각의 화합물로 이루어진 군으로부터 선택된 신규 화합물에 관한 것이다:
화합물 3, 화합물 4, 화합물 5, 화합물 6, 화합물 7, 화합물 8, 화합물 9, 화합물 10, 화합물 12, 화합물 13, 화합물 14, 화합물 18, 화합물 21, 또는 염-형성 기가 존재하는 경우에 그의 염.
본 발명의 구체적 실시양태는 상기 및 하기 언급된 반응 단계에서 각 치환기를 보유하는 출발 물질을 사용하는 것을 특징으로 하는, 화합물 B 또는 특히 화합물 B의 제조에 관한 것이다.
하기 정의 (또는 또한 상기 이미 포함된 정의)는, 본 발명의 추가의 실시양태를 정의하기 위해 상기 및 하기 발명 실시양태에서 사용되는 보다 일반적 용어로 대체될 수 있으며, 여기서 이러한 발명 실시양태를 정의하기 위해 1개, 2개 또는 그 초과 또는 모든 일반적 용어는 보다 구체적인 용어로 대체될 수 있다:
말단 카르복시 또는 카르바모일 기를 갖는 아미노산의 2가 모이어티는 바람직하게는 알파-카르바모일 또는 카르복실-C1-8-치환된 아미노산, 특히 아스파라긴 또는 글루타민의 2가 모이어티이고, 그의 우측에서 카르보닐 (바람직하게는 그의 α-카르복실 기의 카르보닐)을 통해 화학식 I에서 분자의 나머지 부분에 결합된다.
C1-8-알카노일 또는 인산화 히드록시-C1-8-알카노일 (히드록실 및 포스포노 (-O-P(=O)(OH)2) 기 둘 다를 보유하는 C1-8-알카노일) A1은, 예를 들어 2,3-디히드록시-프로파노일 (바람직하게는 S-형태) 또는 2-히드록시-3-포스포노-프로파노일 (바람직하게는 S-형태)이다.
R2 및 R2*는 언급되는 경우에 C1-8-알킬, 특히 메틸이다.
R3은 아미노산, 특히 천연 아미노산의 측쇄이다. 바람직하게는, 이는 분지형 또는 선형일 수 있는 C1- 8알킬이다. 가장 특히, C1-8-알킬은 n-(2-메틸)프로필 (이소부틸), n-(1-메틸프로필 (sec-부틸) 또는 메틸이고, 즉, 모이어티를 보유하는 아미노산은 류신 (바람직함), 이소류신 또는 발린이다.
R3*는, 반응에 참여하기 위해 가려져야 하는 관능기가 존재하는 경우에 보호된 형태의 상응하는 측쇄이다. 바람직하게는, 이는, 특히 이전 단락에 정의된 바와 같은 분지형 또는 선형일 수 있는 C1-8-알킬이다.
"아미노산의 측쇄"는 임의의 모이어티, 예를 들어 모노- 또는 폴리시클릭, 선형, 포화, 불포화 (예를 들어 공액 이중 결합을 가짐) 또는 부분 포화 유기 모이어티 (예를 들어 기본 구조 내에 최대 20개의 탄소 원자 및 상응하는 수의 탄소 원자를 대체하는 N, O 및 S로부터 독립적으로 선택된 0 내지 5개의 헤테로원자를 가짐)로부터 선택될 수 있고, 아미노, 이미노, 히드록시, 카르복시, 카르바모일, 술프히드릴, 아미디노, 구아니디노, O-포스포노 (-O-P(=O)(OH)2)로부터 선택된 최대 3개의 모이어티에 의해 치환될 수 있다. 바람직하게는, 측쇄는 20종의 표준 알파-아미노산 아르기닌, 히스티딘, 리신, 아스파르트산, 글루탐산, 세린, 트레오닌, 아스파라긴, 글루타민, 시스테인, 글리신, 알라닌, 류신, 이소류신, 메티오닌, 페닐알라닌, 트립토판, 티로신, 발린 및 추가로 프롤린 (이어서 알파-아미노 기를 포함하는 내부 고리화를 가짐)의 것들로부터 선택된다.
아미노산에 대해, 이들의 명칭 또는 통상적인 3 문자 코드가 하기 표에 따라 본 개시내용에서 사용된다:
R5는 아미노산, 바람직하게는 표준 아미노산의 측쇄이다. 바람직하게는, 이는 분지형 또는 선형일 수 있고 비치환되거나 또는 페닐에 의해 치환된 C1-8-알킬이다. 가장 특히 이는 벤질, n-(2-메틸)프로필, 이소부틸 또는 메틸이고, 즉 상기 모이어티를 보유하는 아미노산은 페닐알라닌, 류신, 이소류신 (바람직함) 또는 발린이다.
R6은 히드록시 아미노산, 특히 티로신의 측쇄이다.
R7은 아미노산, 특히 천연 아미노산의 측쇄이다. 바람직하게는, 이는 분지형 또는 선형일 수 있는 C1- 8알킬이다. 가장 특히 이는 n-(2-메틸)프로필 (이소부틸), n-(1-메틸)프로필 (sec-부틸) 또는 메틸이고, 즉 상기 모이어티를 보유하는 아미노산은 류신, 이소류신 (바람직함) 또는 발린이다.
C1-8-알킬은 선형이거나 1회 이상 분지화될 수 있고; 예를 들어, 이는 n-(2-메틸)프로필, n-(1-메틸)프로필 또는 메틸일 수 있다.
모든 화합물은, 염-형성 기, 예컨대 염기성 기, 예를 들어 아미노 또는 이미노, 또는 산성 기, 예를 들어 카르복실 또는 페놀계 히드록실이 존재하는 경우에, 유리 형태로 또는 염으로서 또는 염 및 유리 형태의 혼합물로서 사용될 수 있다. 따라서 화합물이 언급된 경우에, 이는 모든 이들 변형물을 포함한다. 예를 들어, 염기성 기는 산, 예컨대 할로겐화수소산, 예를 들어 HCl, 황산 또는 유기 산, 예컨대 아세트산과의 염을 형성할 수 있고, 산성 기는 양성 이온, 예를 들어 암모늄, 알킬암모늄, 알칼리 또는 알칼리-토금속 염 양이온, 예를 들어 Ca, Mg, Na, K 또는 Li 양이온 등과의 염을 형성할 수 있다.
본 개시내용에서 사용되는 경우에 "또는 기타" 또는 "및 기타"는, 이러한 표현 앞에 언급된 것들에 대한 다른 대안이 통상의 기술자에게 공지되어 있으며 구체적으로 언급된 그러한 표현에 추가될 수 있다는 사실을 나타내며; 다른 실시양태에서, "또는 기타" 또는 "및 기타"는 하나 이상 또는 모든 발명 실시양태에서 삭제될 수 있다.
보호기 Prot, Prot*, Prot**, Prot***, ProtA 및 ProtC, 및 모이어티 A*, R2*, R3*, R5*, R6*, R7*, X* 상에 존재하는 임의의 추가의 보호기는, 본 명세서 및 특허청구범위 전반에 걸쳐 언급되는 경우에, 이들은 직교 보호를 허용하도록 선택된다.
용매가, 예를 들어 N,N-디메틸포름아미드, 아세토니트릴, 클로로포름 및 테트라히드로푸란으로 이루어진 군으로부터 선택된 경우에, 보호기 Prot는 바람직하게는 플루오라이드 이온 (특히 무수 조건 하에), 예를 들어 Bu4N+F- (또한 계내, 예를 들어 Bu4N+Cl-와 KF·H2O, KF와 18-크라운-6, LiBr과 18-크라운-6, BF3·디에틸에테르, 피리딘-HF, 우레아 중 HF, Et3N(HF)3 (여기서 Et는 에틸임) 등)을 사용하여 제거가능하도록 선택된다.
바람직하게는, Prot는 에테르 보호기이며, 특히 tert-부틸디페닐실릴, 트리메틸실릴, 트리이소프로필실릴, tert-부틸디메틸실릴, 트리페닐실릴, 디페닐메틸실릴, ti-tert-부틸디메틸실릴, tert-부틸메톡시페닐실릴, 트리스(트리메틸실릴)실릴 등과 같은, 실릴 모이어티가 탄소를 통해 (임의로 추가의 Si 원자를 통해) 결합된 최대 3개의 유기 모이어티를 갖는 실릴 보호기로 이루어진 군으로부터 선택된다.
Prot* 및 Prot**는 각각 존재하는 다른 보호기에 영향을 미치지 않으면서 선택적으로 절단될 수 있는 보호기이다. 용매가, 예를 들어 N,N-디메틸포름아미드, 아세토니트릴, 클로로포름 및 테트라히드로푸란으로 이루어진 군으로부터 선택된 경우에, 이들은 바람직하게는 플루오라이드 이온 (특히 무수 조건 하에), 예를 들어 Bu4N+F- (또한 계내, 예를 들어 Bu4N+Cl-와 KF·H2O, KF와 18-크라운-6, LiBr과 18-크라운-6, BF3·디에틸에테르, 피리딘-HF, 우레아 중 HF, Et3N(HF)3 (여기서 Et는 에틸임) 등)을 사용하여 제거가능한 보호기, 및/또는 금속 히드라이드 또는 다른 환원제, 예를 들어 (PH3P)4Pd 또는 그의 이할로겐화물 (예를 들어 PdCl2(PPH3)2)의 존재 하에, 바람직하게는 디-n-부틸 주석 히드라이드 또는 트리-n-부틸 주석 히드라이드, 페닐실란, 수소화붕소나트륨 또는 디메돈과 조합하여, 적절한 용매, 예를 들어 테트라히드로푸란 중에서 특정의 트리페닐포스핀 착물에 의해 제거가능한 보호기이고, 바람직하게는 보호기 Prot**의 제거를 허용하는 조건 하에 절단가능하지 않고; 예를 들어, Prot** 및 Prot*는 C3-C8알크-2-에닐옥시카르보닐 모이어티, 예를 들어 알릴옥시카르보닐 (Alloc) (바람직함; 예를 들어 팔라듐 촉매의 존재 하에 촉매 수소화에 의해 제거될 수 있음), 1-이소프로필알릴옥시카르보닐, 4-니트로신나밀옥시카르보닐 및 3-(3'-피리딜)프로프-2-에닐옥시카르보닐; 또는 플루오렌-9-일메톡시카르보닐 (Fmoc) (바람직함), 2-(2' 또는 4'-피리딜)에톡시카르보닐 또는 2,2-비스(4'니트로페닐)에톡시카르보닐로 이루어진 군으로부터 선택된다. Prot*는 바람직하게는 1-아릴-알킬 기, 예컨대 벤질, 9-플루오레닐메틸 또는 1-(p-메톡시페닐)-에틸)이다.
Prot***는 바람직하게는 산, 예를 들어 트리플루오로아세트산의 첨가에 의해 제거가능하고, 예를 들어 트리-(1-(C1-C6)-알킬)-알콕시카르보닐, 특히 tert-부톡시카르보닐이다.
카르복실 (-COOH) 보호기 ProtA는 바람직하게는 보호기 Prot** 뿐만 아니라 Prot를 제거하는데 사용되는 탈보호 시약에 대해 안정하다. 카르복시 보호기는 바람직하게는 유사하게 제거가능하다.
카르복실 보호기 ProtA 및 ProtC는 바람직하게는 촉매 수소화, 예를 들어 고체 담체 물질, 예컨대 탄소 또는 불용성 염, 예컨대 황산바륨 (BaSO4) 상의 귀금속 촉매, 예컨대 팔라듐 또는 백금의 존재 하에, 적절한 용매, 예컨대 알콜, 예를 들어 메탄올, 에탄올, 이소프로필알콜 등, 또는 그의 2종 이상의 혼합물 중 물의 부재 또는 존재 하의, 예를 들어 수소화에 의해 제거가능하다.
카르복실 보호기 ProtA 및 ProtC는 바람직하게는 [1-(C1-C8-알킬 또는 C6-C12-아릴)-(C1-C8-알킬)]옥시메틸 기, 예컨대 메톡시메틸, 벤질옥시메틸 또는 특히 1-아릴-알킬 기, 예컨대 벤질 (특히 바람직함), 9-플루오레닐메틸 또는 p-메톡시페닐-에틸로 이루어진 군으로부터 선택된다.
존재하는 다른 보호기는 바람직하게는 Prot* 및 Prot**가 제거될 수 있는 조건 하에 제거가능하지 않으며, 예를 들어 A*에서, 카르바모일은, 예를 들어 트리틸 (트리페닐메틸)로 N-보호될 수 있고 (산, 예를 들어 트리플루오로 아세트산 (TFA)을 사용하여 절단); R6*에서 티로신 히드록시는 tert-부틸 보호되거나 (tert-부톡시로서) 또는 tert-부틸디메틸실릴, 메톡시메틸 또는 아릴아세테이트에 의해 보호될 수 있다 (산, 예를 들어 TFA를 사용하여 절단).
Rk 및 Rl은 바람직하게는 아세탈 형성 알데히드 보호기이고, 예를 들어 각각은 비치환 또는 치환된 알킬 또는 두 형태 모두이고, 2개의 결합 O 원자, 및 2개의 O 원자가 결합되어 있는 탄소 원자와 함께 비치환 또는 치환된 고리를 형성한다.
Rk 및 Rl이 각각 서로 독립적으로 비치환 또는 치환된 알킬인 경우에, 이는 특히 C1-C7-알킬 또는 특히 1-아르알킬, 예컨대 1-(C6-C12아릴)-C1-C7알킬, 보다 특히 벤질을 지칭한다.
Rk 및 Rl이 2개의 결합 O 원자, 및 2개의 O 원자가 결합되어 있는 탄소 원자와 함께 비치환 또는 치환된 고리를 형성하는 경우에, Rk 및 Rl은 바람직하게는 비치환 또는 치환된 알킬렌 가교, 특히 비치환 또는 치환된 예틸렌, 예컨대 -CH2-CH2-를 형성하고, 여기서 치환기(들)는 바람직하게는 C1-C7-알킬, 특히 2개의 이러한 치환기, 예컨대 메틸, 에틸, n-프로필 또는 이소프로필로부터 선택될 수 있다.
알데히드 보호기(들) Rk 및 Rl (결합 O 원자 및 이들을 결합시키는 탄소와 함께 보호된 알데히드 기 (아세탈)를 형성함)은 산 촉매작용, 특히 알파-할로 치환된 알칸산, 예컨대 트리플루오로아세트산 또는 트리클로로아세트산에 의해, 물의 존재 하에 제거될 수 있다.
따라서, 보호기 Prot, Prot*, Prot**, ProtA, ProtC 및 다른 보호기는 상기 언급된 것들로 제한되지는 않고 - 오히려 이들은, 예를 들어 상기 또는 하기 기재된 바와 같이 이들이 직교 보호에 적절하게 되도록 하는 조건을 충족시켜야 한다.
적절한 보호기, 또한 이들의 도입 및 제거를 위한 방법은 관련 기술분야에 공지되어 있다. 예를 들어, 보호기, 이들의 도입 및 제거 방법은 표준 교본, 예컨대 문헌 ["Protective Groups in Organic Synthesis", 3rd ed., T.W. Green and P.G.M. Wuts (Eds.). J. Wiley & Sons, Inc., New York etc. 1999]에 기재된 것들로부터 선택될 수 있다.
산의 반응성 유도체, 특히 아미노산, 또는 펩티드, 예를 들어 디펩티드가 언급되는 경우에, 이들은 계내 형성될 수 있거나 또는 그대로 사용될 수 있다.
사용되는 반응성 (또는 활성) 유도체는 할로겐화물, 예를 들어 클로라이드, 또는 니트로페닐 에스테르, 예를 들어 2,4-디니트로페닐 에스테르, 또는 반응시킬 산의 카르복시 기의 산 무수물 (대칭성 또는 예를 들어, 아세트산과 함께)을 포함한다.
계내 형성의 경우에, 통상적인 커플링제가 적용될 수 있다. 이러한 시약은 통상의 기술자에게 공지되어 있고, 많은 공급원, 예를 들어 문헌 [Aldrich ChemFiles - Peptide Synthesis (Aldrich Chemical Co., Inc., Sigma-Aldrich Corporation, Milwaukee, WI, USA) Vol. 7 No. 2, 2007] (http://www.sigmaaldrich.com/etc/medialib/docs/Aldrich/Brochure/al_chemfile_v7_n2.Par.0001.File.tmp/al_chemfile_v7_n2.pdf 참조)로부터 편리하게 구입할 수 있다. 아미드 및 에스테르 결합 합성을 위한 가능한 커플링제 중에는 하기가 언급될 수 있다:
트리아졸, 우로늄 또는 헥사플루오로포스포늄 유도체, 예를 들어 1-히드록시-벤조트리아졸 (HOBt), 1-히드록시-7-아자-벤조트리아졸 (HOAt), 에틸 2-시아노-2-(히드록시이미노)아세테이트, 2-(1H-7-아자벤조트리아졸-1-일)-1,1,3,3-테트라메틸우로늄 헥사플루오로포스페이트 메탄아미늄 (HATU; 특히 바람직함), 벤조트리아졸-1-일-옥시트리피롤리디노포스포늄 헥사플루오로-포스페이트 (PyBOP), 1-(메시틸렌-2-술포닐)-3-니트로-1,2,4-트리아졸 (MSNT), 2-(1H-벤조트리아졸-1-일)-1,1,3,3-테트라메틸우로늄-헥사플루오로포스페이트 (HBTU), 2-(1H-벤조트리아졸-1-일)-1,1,3,3-테트라메틸우로늄-헥사플루오로보레이트 (TBTU), 2-숙신이미도-1,1,3,3-테트라메틸우로늄-테트라플루오로보레이트 (TSTU), 2-(5-노르보르넨-2,3-디카르복스이미도)-1,1,3,3-테트라메틸우로늄-테트라플루오로보레이트 (TNTU), O-[(시아노(에톡시카르보닐)-메틸리덴)아미노]-1,1,3,3-테트라메틸우로늄-테트라플루오로보레이트 (TOTU), O-(벤조트리아졸-1-일)-1,3-디메틸-1,3-디메틸렌 우로늄 헥사플루오로포스페이트 (HBMDU), O-(벤조트리아졸-1-일)-1,1,3,3-비스(테트라메틸렌)우로늄 헥사플루오로포스페이트 (HBPyU), O-(벤조트리아졸-1-일)-1,1,3,3-비스(펜타메틸렌)우로늄 헥사플루오로포스페이트 (HBPipU), 3-히드록시-4-옥소-3,4-디히드로-1,2,3-벤조트리아진 (HODhbt), 1-히드록시-7-아자-벤조트리아졸 및 그의 상응하는 우로늄 또는 포스포늄 염, 지정된 HAPyU 및 AOP, 1-시아노-2-에톡시-2-옥소에틸리덴아미노옥시-디메틸아미노-모르폴리노-카르베늄 헥사플루오로포스페이트 (COMU), 클로로트리피롤리디노포스포늄 헥사플루오로포스페이트 (PyCloP) 또는 기타;
카르보디이미드, 예를 들어 디시클로헥실카르보디이미드, N-(3-디메틸아미노프로필)-N'-에틸카르보디이미드 (=1-에틸-3-(3-디메틸아미노프로필)카르보디이미드 = EDC; 특히 바람직함), 1-tert-부틸-3-에틸카르보디이미드, N-시클로헥실-N'-2-모르폴리노에틸)카르보디이미드 또는 디이소프로필카르보디이미드 (특히 에스테르 형성의 경우에 카르복실 기의 O-아실 우레아 형성을 통해); 또는
활성 에스테르 형성제, 예를 들어 2-메르캅토벤조티아졸 (2-MBT),
아지드 형성제, 예를 들어 디페닐 포스포릴 아지드,
산 무수물, 예컨대 프로판 포스폰산 무수물,
산 할로겐화제, 예를 들어 1-클로로-N,N,2-트리메틸-1-프로페닐아민, 클로로-N,N, N',N'-비스(테트라메틸렌)포름아미디늄 테트라플루오로보레이트 또는 헥사플루오로포스페이트, 클로로-N,N,N',N'-테트라메틸포름아미디늄 헥사플루오로포스페이트, 플루오로-N,N,N',N'-테트라메틸포름아미디늄 헥사플루오로포스페이트, 플루오로-N,N,N',N'-비스(테트라메틸렌)포름아미디늄 헥사플루오로포스페이트
또는 기타, 또는 2종 이상의 상기 작용제의 혼합물.
반응은, 적절한 경우에, 온화한 염기, 예를 들어 N-메틸모르폴린, 트리알킬아민, 예를 들어 에틸디이소프로필아민, 디-(알킬)아미노피리딘, 예컨대 N,N-디메틸아미노피리딘 또는 기타의 존재 하에 (조건이 화학식 I의 화합물의 전구체 내에 존재하는 에스테르 기, 예를 들어 뎁시펩티드 에스테르 기의 가수분해를 허용할 만큼 지나치게 염기성이 되지 않도록 주의함), 적절한 또는 필요한 경우에, 적절한 용매 또는 용매 혼합물, 예를 들어 N,N-디알킬-포름아미드, 예컨대 디메틸포름아미드, 할로겐화 탄화수소, 예를 들어 디클로로메탄, N-알킬피롤리돈, 예컨대 N-메틸피롤리돈, 니트릴, 예를 들어 아세토니트릴, 또는 추가의 방향족 탄화수소, 예를 들어 톨루엔, 또는 2종 이상의 혼합물의 존재 하에 수행될 수 있으며, 단 과량의 커플링제가 존재하는 경우에는 또한 물이 존재할 수 있다. 온도는 보다 낮거나 보다 높은 주위 온도, 예를 들어 -20℃ 내지 50℃의 범위일 수 있다.
화학식 IX, IXA, XI, XIA, XIII, XIIIA, XVI, XVIA, XVII, XVIIA의 아미노산은 공지되어 있거나, 또는 이들은 관련 기술분야에 공지된 방법에 따라 합성될 수 있고/거나, 이들은 상업적으로 입수가능하고/거나, 이들은 관련 기술분야에 공지된 방법과 유사하게 합성될 수 있다.
또한 나머지 출발 물질, 예를 들어 화학식 XV 또는 XVIII 또는 XVIIIA의 산은 공지되어 있거나, 또는 이들은 관련 기술분야에 공지된 방법에 따라 합성될 수 있고/거나, 이들은 상업적으로 입수가능하고/거나, 이들은 실시예에 기재된 방법과 유사하게 합성될 수 있다.
예를 들어, 화학식 VII의 합성단위체는 실시예 1 (이는 본 발명의 특정 실시양태임)에 기재된 바와 같이 또는 이와 유사하게, 또는 문헌 [Tetrahedron 61, 1459-1480 (2005)]에 기재된 바와 같이 제조될 수 있다.
디펩티드에 대한 커플링 반응은 본 발명자들이 유리 형태 또는 활성화된 형태의 아미노산의 상응하는 카르복실 기를 활용하게 한다.
특정의 온도 범위가 상기 및 특허청구범위에 제시된 반응에 대해 주어지지 않은 경우에, 온도는 통상의 기술자에게 통상적으로, 예를 들어 -20 내지 +50℃의 범위, 예컨대 약 실온 (예를 들어 23 ± 2℃)으로 사용된다.
용매가 상기 및 하기에 주어진 반응에 대해 언급되지 않은 경우에, 유용한 용매 또는 용매 혼합물 (크로마토그래피 등을 위한 용리액 포함)은 관련 기술분야에서 통상적인 것으로부터 선택되며, 예를 들어 실시예에 사용된 것들로부터 선택된다.
본 발명의 방법의 장점은 상기 및 하기 단계에서 제시된 출발 물질이 종종 화학량론적 또는 거의 화학량론적 (사용된 화합물 중 하나에 대한 화학량론적 양으로부터의 ± 20% 편차) 양으로 사용될 수 있다는 점이다.
통상의 기술자에게 적절하고 공지된 바와 같이, 중간체는 정제될 수 있거나 또는 이들은 후속 단계에서 직접적으로 사용될 수 있다. 중간체 및 최종 생성물의 정제는 특히 크로마토그래피 방법 (예를 들어 실리카 겔 및/또는 역상 물질, 예를 들어 실리카 기재 역상 물질을 사용함), 용매 분배 방법 및 침전 (결정화 포함) 방법 등을 사용할 수 있고, 상응하는 방법은 통상의 기술자에게 공지되어 있고, 예를 들어, 방법은 실시예에 기재된 것과 유사하다.
실시예
하기 실시예는 본 발명의 범위를 제한하지 않으면서 본 발명을 예시한다. 달리 언급되지 않는 한, 반응은 바람직하게는 실온 (약 23℃)에서 일어난다.
약어
aq. 수성
Alloc 알릴옥시카르보닐
Boc/BOC tert-부톡시카르보닐
염수 물 중 염화나트륨 용액 (RT에서 포화)
Bu 부틸
Bzl 또는 Bz. 벤질
COMU 1-시아노-2-에톡시-2-옥소에틸리덴아미노옥시-디메틸아미노-모르폴리노-카르베늄 헥사플루오로포스페이트
DCM 디클로로메탄
DIPEA N,N-디이소프로필에틸아민
DMAP 4-디메틸아미노피리딘
DMF N,N-디메틸포름아미드
DMSO 디메틸 술폭시드
EDC 1-에틸-3-(3-디메틸아미노프로필)카르보디이미드
EDIPA 에틸디이소프로필아민
Et 에틸
Fmoc/FMOC 9-플루오레닐메톡시카르보닐
HATU 2-(1H-7-아자벤조트리아졸-1-일)--1,1,3,3-테트라메틸우로늄 헥사플루오로포스페이트 메탄아미늄
HPLC 고성능 액체 크로마토그래피
HR-MS 고해상도 질량 분광분석법
IBX 1-히드록시-1,2-벤즈아이오독솔-3(1H)-온 1-옥시드
IPC 공정 중 제어
IR 적외선 분광분석법
IT 내부 온도
카이저(Kaiser) 시험 SPPS에서의 탈보호를 모니터링하기 위한 닌히드린-기반 검사 (문헌 [E. Kaiser, R. L. Colescott, C. D. Bossinger, P. I. Cook, Analytical Biochemistry 34 595 (1970)] 참조); OK인 것으로 언급된 경우에, 이는 성공적 탈보호를 의미한다.
Me, Me 메틸
MS 질량 분광분석법
MSNT 1-(메시틸렌-2-술포닐)-3-니트로-1,2,4-트리아졸
NMR 핵 자기 공명 분광분석법
PPH3 트리페닐포스핀
PyBOP 벤조트리아졸-1-일-옥시트리피롤리디노포스포늄 헥사플루오로포스페이트
RP 역상
RT/rt 실온
TBAF 테트라부틸암모늄플루오라이드
TBDPS tert-부틸-디페닐-실릴
TFA 트리플루오로아세트산
트리틸 트리페닐메틸
하기 실시예는 바람직한 변형법을 기재하고 있었지만, 이는 본 발명의 범위에 영향을 미치지 않으면서 본 발명을 예시한다:
하기에서, 본 발명에 따른 화합물 A의 제조는 먼저 반응식 및 짧은 설명에 대하여 기재되어 있다. 세부사항은 이어서 실험 파트에 추가된다.
<반응식 1>
<반응식 1 계속>
<반응식 1 (계속)>
대안적으로, 상기 합성단위체 화합물 11을 사용하는 대신에, 아세탈-합성단위체 (하기 반응식에서의 화합물 17)를 사용할 수 있다:
<반응식 2>
<반응식 2 (계속)>
보호된 알데히드 합성단위체 (아세탈-합성단위체, 화합물 17)를 표준 커플링 조건 (HATU/EDIPA)을 사용하여 화합물 10 (반응식 2)과 커플링시켜 화합물 18을 91% 수율로 수득하였다. 화합물 18의 목탄상 팔라듐과의 수소화는 한 단계에서 모든 벤질 보호기를 제거하였고, 화합물 19를 94% 조 수율로 제공하였다. 활성화 시약으로서의 HATU 및 3급 염기로서의 DMAP를 사용하는 조 화합물 19의 거대락탐화는 실리카 겔 상의 플래쉬 크로마토그래피에 의한 정제 후에 마크로시클릭 화합물 20을 64% 수율 및 약 98 a% 순도로 제공하였다 (반응식 3). 최종적으로, 화합물 20의 탈보호/평형 및 실리카 겔 크로마토그래피에 의한 생성물의 정제는 목적 화합물 A를 75% 수율 및 97 a% 순도로 산출하였다. 생성물을 NMR, HR-MS 및 IR에 의해 특성화하였다. 스펙트럼은 구조를 확인하였고, 천연 생성물, 및 TBDPS-합성단위체 (화합물 11)를 사용하는 종래 용액 합성으로부터의 생성물의 스펙트럼과 동일하였다.
본원에 기재된 반응이 최적화되지 않은 것으로 언급하는 것은 주목할 만하다. 예를 들어, 거대고리화는 SPPS로부터의 화합물 19을 사용하여 다소 개선되었고, 생성물, 화합물 20을 81% 수율로 수득하였다. 따라서, 이러한 접근법에서는 개선에 대한 높은 잠재력이 있다.
Fmoc-보호기가 화합물 A의 용액 상 합성에 효율적인 것으로 입증되었지만, 다른 보호기가 또한 적절하게 사용될 수 있었다. 예를 들어, 화합물 4를 Alloc-Ile-OH를 사용하여 에스테르화시켜 화합물 21을 수득하였다 (반응식 3). alloc-보호기의 팔라듐 촉매화 절단 및 Fmoc-N-메틸-티로신과의 후속적 커플링은 화합물 7을 2 단계에 걸쳐 85% 수율로 제공하였다.
<반응식 3>
TBDPS-합성단위체 (화합물 11)를 상업적으로 입수가능한 Fmoc-Glu-OBzl로부터 출발하여 3 단계로 제조하였다 (반응식 4).
<반응식 4>
아세탈-합성단위체 (화합물 17)를 화합물 24로부터 출발하여 합성하였으며 (반응식 5), 이는 문헌 [M. Rodriguez, M. Taddei, Synthesis 2005, 3, 493-495]에 기재된 문헌 절차에 따라 L-글루타민산으로부터 제조될 수 있다.
<반응식 5>
실험
BOC-Thr-Leu-OBzl (화합물 1)의 합성
N-Boc-Thr-OH (15.0g, 68.4 mmol)를 아세토니트릴 (90 mL) 중에 용해시켰다. HATU (26.0g, 68.4 mmol)를 몇 부분으로 첨가하고, 반응 혼합물을 실온에서 10분 동안 교반하였다. 이 혼합물에, 아세토니트릴 (90 mL) 중 H-Leu-OBz.HCl (17.6g, 68.4 mmol) 및 N,N-디이소프로필-에틸아민 (17.7g에, 136.8 mmol)의 용액을 15분 내에 첨가하였다. 생성된 반응 혼합물을 실온에서 90분 동안 교반하고, 그 시간 후 탁한 용액을 투명하게 여과하였다. 용매를 부분 증발시켜 고점성 조 생성물 78.5g을 수득하였다. 조 생성물을 실리카 겔 상에서 플래쉬-크로마토그래피에 의해 이동상로서 에틸 아세테이트/헥산 (1:1 v/v)을 사용하여 정제하여 생성물 (화합물 1) 78.53g을 수득하였다. 수율: 96.1%
1H-NMR 및 IR은 제안된 구조를 확인하였다.
Thr-Leu-OBzl (화합물 2)의 합성
이전 단계로부터의 화합물 1 (27.5g, 65.084 mmol)을 디클로로메탄 (215mL) 중에 용해시키고, 용액을 트리플루오로아세트산 (149.9g)으로 처리하였으며, 이를 5분 내에 첨가하였다. 반응 혼합물을 추가로 25분 동안 실온에서 반응 완결시까지 교반하였다. 후처리를 위해, 용액을 디클로로메탄 (300 mL)으로 희석하고, 반포화 수성 Na2CO3-용액 (660 mL)으로 천천히 처리하였다. 2상 혼합물을 15분 동안 집중적으로 교반하고, 상을 분리하였다. 수성 상을 디클로로메탄 (300 mL)으로 추출하고, 유기 상을 합하였다. 합한 유기 상을 물 (300 mL)로 세척하고, 용매를 감압 하에 40-45℃에서 증발시켜 21.72g 조 생성물, Thr-Leu-OBzl (100% 조 수율)을 발포체로서 수득하였다. 조 생성물 (화합물 2)은 후속 단계에 추가 정제 없이 사용하기에 충분히 순수하였다.
1H-NMR 및 IR은 제안된 구조를 확인하였다.
이소부티릴-Gln(Trt)-OH (화합물 3)의 합성
트리틸-링커-수지 (78g, 1% 디비닐 벤젠 및 4-(디페닐히드록시메틸)벤조산과 가교된 아미노메틸-폴리스티렌 수지로부터 제조됨)를 톨루엔 (300 mL)으로 팽윤시키고, 아세틸클로라이드 (34mL)를 첨가하였다. 실온에서 3시간 동안 교반한 후, 혼합물을 흡인시키고, 절차를 반복하였다. 이어서, 링커-수지를 톨루엔 및 디클로로메탄으로 순차적으로 5회 세척하였다. 디클로로메탄 (200 mL) 중 Fmoc-Gln(Trt)-OH (97.6g) 및 N-메틸모르폴린 (15 mL)의 혼합물을 링커-수지에 첨가하고, 혼합물을 밤새 교반하였다. 이어서, 용매를 여과에 의해 제거하고, 수지를 디클로로메탄 및 디메틸포름아미드으로 수회 세척하였다. Fmoc-보호기의 절단을 위해, 피페리딘의 용액 (디메틸포름아미드 중 20% 용액 300 mL)을 첨가하고, 혼합물을 실온에서 10분 동안 교반하였다. 수지를 여과에 의해 단리하고, 피페리딘으로의 처리를 반복하였다. 수지를 디메틸포름아미드 및 이소프로판올 및 최종적으로 디메틸포름아미드로 세척하여 이소부티릴화를 위해 준비하였다.
PyBop (99.0g)를 디메틸포름아미드 (300 mL) 중에 용해시키고, 이소부티르산 (17.6 mL)을 첨가하고, 이어서 EDIPA (67 mL)를 첨가하였다. 혼합물을 5분 동안 교반하고, 수지에 첨가하였다. 혼합물을 실온에서 밤새 교반하였다. 수지를 여과에 의해 단리시키고, 디메틸포름아미드 및 디클로로메탄으로 순차적으로 세척하고, 진공 하에 3시간 동안 건조시켰다. 건조 수지를 아세트산 (475 mL) 및 물 (25 mL)의 혼합물 중에 현탁시키고, 혼합물을 실온에서 4시간 동안 교반하였다. 수지를 여과에 의해 단리시키고, 여과물을 함유하는 생성물을 저장하였다. 수지를 아세트산 (475 mL) 및 물 (25 mL)의 혼합물에 다시 첨가하고, 혼합물을 실온에서 밤새 교반하였다. 여과한 후, 합한 여과물을 약 200 mL의 최종 부피로 부분 증발시키고, 물 (600 mL)을 천천히 첨가하였다. 생성물이 침전되었다. 혼합물을 실온에서 추가로 20분 동안 교반하고, 생성물을 여과에 의해 단리시켰다. 필터케이크를 물 (100 mL)로 수회 세척하고, 밤새 10 mbar 및 실온에서 건조시켜 화합물 3 26.82g을 수득하였다. 화합물은 또한 순수한 용액 상 합성을 포함하는 대안적 방식을 사용하여 제조할 수 있음을 주목한다.
아미노-산 분석은 0.2% 미만의 D-거울상이성질체의 존재를 나타내었다.
이소부티릴-Gln(Trt)-Thr-Leu-OBzl (화합물 4)의 합성
이전 단계로부터의 Thr-Leu-OBzl (화합물 2) (13.36g, 41.44 mmol)을 디클로로메탄 (380 mL) 중에 용해시키고, 용액을 0℃로 냉각시켰다. 제2 4구 둥근 바닥 플라스크에서, N-이소부티릴-Gln(Trt)-OH (화합물 3); 19.0g, 41.43 mmol)를 디클로로메탄 (380 mL) 중에 용해시키고, 용액을 0℃로 냉각시켰다. EDIPA (5.06g, 41.43 mmol) 및 HATU (15.91g, 41.425 mmol)를 0℃에서 철저한 교반 하에 첨가하고, 형성된 탁한 현탁액을 0℃의 온도를 유지하면서 Thr-Leu-OBzl의 냉각된 용액에 첨가하였다. 반응 혼합물을 추가로 90분 동안 0℃에서 교반하여 전환을 완료하였다. 후처리를 위해, 반응 혼합물을 반포화 수성 NaHCO3-용액 (650 mL), 1N HCl (650 mL), 반포화 수성 NaHCO3-용액 (650 mL) 및 반포화 NaCl-용액 (650 mL)으로 순차적으로 추출하였다. 수성 상을 디클로로메탄 (250 mL)으로 추출하고, 디클로로메탄-상을 합하였다. 디클로로메탄 용액을 무수 황산마그네슘 상에서 건조시키고, 용매를 감압 하에 증발시켜 29.2g 조 생성물을 수득하였다. 조 생성물을 실리카 겔 상에서 플래쉬 크로마토그래피에 의해 정제하고, 디클로로메탄/헥산으로부터 결정화하여 이소부티릴-Gln(Trt)-Thr-Leu-OBzl (화합물 4) 23.44g을 수득하였다. 수율: 74.1%.
1H-NMR은 제안된 구조를 확인하였다.
이소부티릴-Gln(Trt)-Thr(Ile-Fmoc)-Leu-OBzl (화합물 5)의 합성
이소부티릴-Gln(Trt)-Thr-Leu-OBzl (화합물 4) (10.0g, 13.107 mmol), Fmoc-Ile-OH (6.95g, 19.66 mmol) 및 DMAP (0.24g, 1.97 mmol)를 디클로로메탄 (300 mL) 중에 용해시키고, 용액을 0℃로 냉각시켰다. EDC.HCl (3.85g t.q, 3.769g 100%, 19.66 mmol)을 용액에 0℃에서 첨가하고, 온도가 실온으로 상승하도록 하였다. 반응 혼합물을 실온에서 4.5시간 동안 교반하고, 그 시간 후 반응 혼합물을 물 (300 mL)에 부었다. 혼합물을 철저하게 교반하고, 상을 분리하였다. 유기 상을 1N HCl (300 mL), 수성 포화 NaHCO3 (300 mL) 및 염수 (300 mL)로 순차적으로 추출하였다. 수성 상을 디클로로메탄 (100 mL)으로 추출하고, 유기 층을 합하였다. 유기 상을 무수 황산마그네슘 상에 건조시키고, 용매를 감압 하에 증발시켜 21.65g 조 생성물을 수득하였다. 실리카 겔 상에서 플래쉬 크로마토그래피에 의해 정제하여 이소부티릴-Gln(Trt)-Thr(Ile-Fmoc)-Leu-OBzl (화합물 5) 11.22g을 수득하였다. 수율: 77.7%. 추가의 2.76g 생성물 (19.2% 수율; 89.3 면적% HPLC-순도)을 부 분획으로부터 단리시켰다.
1H-NMR은 제안된 구조를 확인하였다.
이소부티릴-Gln(Trt)-Thr(Ile-H)-Leu-OBzl (화합물 6)의 합성
이소부티릴-Gln(Trt)-Thr(Ile-Fmoc)-Leu-OBzl (화합물 5; 10.0g, 9.11 mmol)을 DMF (100 mL) 중에 용해시키고, 용액을 TBAFx3H2O (5.93g t.q., 5.75g 100%, 18.22 mmol)로 처리하였다. 반응 혼합물을 실온에서 1시간 동안 교반하고, 물 (300 mL)을 첨가하였다. 생성물을 이소프로필 아세테이트 (800 mL)로 추출하고, 이소프로필 아세테이트 상을 수성 포화 NaHCO3 (2x400 mL) 및 물 (400 mL)로 순차적으로 세척하였다. 수성 상을 이소프로필 아세테이트 (400 mL)로 추출하고, 유기 상을 합하였다. 유기 상을 무수 황산마그네슘 상에서 건조시키고, 용매를 감압 하에 증발시켜 9.31g 조 생성물을 수득하였다. 조 생성물을 실리카 겔 상에서 플래쉬 크로마토그래피에 의해 정제하여 이소부티릴-Gln(Trt)-Thr(Ile-H)-Leu-OBzl (화합물 6) 7.45g을 수득하였다. 수율: 93.4%.
1H-NMR은 제안된 구조를 확인하였다.
이소부티릴-Gln(Trt)-Thr(Ile-Tyr(tBu)Me-Fmoc)-Leu-OBzl (화합물 7)의 합성
N-Fmoc-N-메틸-티로신-t-부틸에테르 (4.03g, 8.51 mmol)를 디클로로메탄 (100 mL) 중에 용해시키고, 용액을 0℃로 냉각시켰다. EDIPA (2.2g, 17.02 mmol)를 첨가하고, 이어서 HATU (3.268g t.q., 3.236g 100%, 8.51 mmol)를 첨가하였다. 이 용액에, 디클로로메탄 (200mL) 중 이소부티릴-Gln(Trt)-Thr(Ile-H)-Leu-OBzl (화합물 6; 7.45g에, 8.51 mmol)의 사전 냉각된 용액을 첨가하고, 반응 혼합물을 0℃에서 2시간 15분 동안 교반하고, 그 시간 후 IPC는 전환이 완결되었음을 나타내었다. 이어서, 반응 혼합물을 디클로로메탄 (200 mL)으로 희석하고, 디클로로메탄 용액을 반포화 수성 NaHCO3 (400 mL), 1N HCl (400 mL), 반포화 수성 NaHCO3 및 반포화 수성 NaCl 용액으로 순차적으로 추출하였다. 수상을 디클로로메탄 (200 mL)으로 추출하고, 유기 상을 합하였다. 무수 황산마그네슘 상에서 건조시키고, 용매의 증발은 12.29g 조 이소부티릴-Gln(Trt)-Thr(Ile-Tyr(tBu)Me-Fmoc)-Leu-OBzl (화합물 7)을 무색 발포체로서 수득하였으며, 후속 단계에 정제 없이 사용하여 정량적 수율을 추정하였다.
정제된 분석 샘플의 1H-NMR은 제안된 구조를 확인하였다.
이소부티릴-Gln(Trt)-Thr(Ile-Tyr(tBu)Me-H)-Leu-OBzl (화합물 8)의 합성
이소부티릴-Gln(Trt)-Thr(Ile-Tyr(tBu)Me-Fmoc)-Leu-Obzl (이전 단계로부터의 12.29g 조 화합물 7; 8.51 mmol)을 DMF (113 mL) 중에 용해시키고, 용액을 TBAFx3H2O (5.53g, 17.01 mmol)로 처리하였다. 반응 혼합물을 2시간 동안 실온에서 교반하여 전환을 완결하였다. 이어서, 반응 혼합물을 물 (400 mL)로 희석하고, 생성물을 이소프로필아세테이트 (800 mL)로 추출하였다. 이소프로필아세테이트-상을 반포화 수성 NaHCO3 (2x400 mL) 및 물 (400 mL)로 순차적으로 세척하였다. 수성 상을 이소프로필아세테이트 (400 mL)로 추출하고, 유기 상을 합하였다. 유기 상을 무수 황산마그네슘 상에서 건조시키고, 용매를 감압 하에 증발시켜 11.19g 조 생성물을 수득하였다. 조 생성물을 실리카 겔 상에서 플래쉬-크로마토그래피에 의해 정제하여 이소부티릴-Gln(Trt)-Thr(Ile-Tyr(tBu)Me-H)-Leu-OBzl (화합물 8) 9.74g을 무색 발포체로서 수득하였다. 생성물은 소량의 용매를 포함하였다. 정량적 수율은 또한 이 단계 동안 추정된다.
생성물의 1H-NMR은 제안된 구조를 확인하였다.
이소부티릴-Gln(Trt)-Thr(Ile-Tyr(tBu)Me-Ile-Fmoc)-Leu-Obzl (화합물 9)의 합성
이전 단계로부터의 이소부티릴-Gln(Trt)-Thr(Ile-Tyr(tBu)Me-H)-Leu-OBzl (9.73g, 96.8 a% HPLC 순도, 9.42g 순수한 화합물 8에 상응함; 8.49 mmol)을 디클로로메탄 (118 mL) 중에 용해시켰다. Fmoc-Ile-OH (6.01g, 17.0 mmol)를 첨가하고, 이어서 EDIPA (4.394g, 34 mmol)를 첨가하였다. 용액을 HATU (6.53g, 17 mmol)로 처리하고, 18.5시간 동안 교반하고, 그 시간 후 HATU (1.63g, 4.2 mmol)의 두번째 부분을 첨가하였다. 반응 혼합물을 추가로 2시간 동안 교반하고, 디클로로메탄 (120 mL)으로 희석하였다. 묽은 용액을 포화 수성 NaHCO3 (240 mL), 1M HCl (240 mL), 포화 수성 NaHCO3 (240 mL) 및 염수 (240 mL)로 순차적으로 추출하였다. 수성 상을 디클로로메탄 (100 mL)으로 추출하고, 디클로로메탄 상을 합하였다. 합한 유기 상을 무수 황산마그네슘 상에서 건조시키고, 용매를 감압 하에 증발시켜 조 생성물 19.6g을 발포체로서 수득하였다. 조 생성물을 실리카 겔 상에서 크로마토그래피에 의해 에틸 아세테이트/헥산 (6:4)을 용리액으로서 사용하여 정제하여 이소부티릴-Gln(Trt)-Thr(Ile-Tyr(tBu)Me-Ile-Fmoc)-Leu-OBzl (화합물 9)을 발포체로서 수득하였다. 수율: 11.01g (89.6%).
1H-NMR은 제안된 구조를 확인하였다.
이소부티릴-Gln(Trt)-Thr(Ile-Tyr(tBu)Me-Ile-H)-Leu-OBzl (화합물 10)의 합성
이전 단계로부터의 이소부티릴-Gln(Trt)-Thr(Ile-Tyr(tBu)Me-Ile-Fmoc)-Leu-OBzl (화합물 9) (11.01g, 7.626 mmol)을 DMF (110 mL) 중에 용해시키고, TBAFx3H2O (4.81g, 15.25 mmol)를 첨가하였다. 혼합물을 1.5시간 동안 교반하고, 탈염수 (300 mL)를 첨가하고, 이어서 이소프로필아세테이트 (600 mL)를 첨가하였다. 혼합물을 10분 동안 교반하고, 상을 분리하였다. 유기 상을 반포화 수성 NaHCO3-용액 (2x300 mL) 및 탈염수 (300 mL)로 순차적으로 세척하였다. 수성 상을 이소프로필아세테이트 (300 mL)로 추출하고, 유기 층을 합하였다. 합한 유기 상을 무수 황산마그네슘 상에서 건조시키고, 용매를 감압 하에 증발시켜 고체 15.15g을 수득하였으며, 이를 실리카 겔 상의 여과에 의해 디클로로메탄/메탄올 (100/0에서 95/5)을 용리액으로서 사용하여 정제하였다. 수율: 이소부티릴-Gln(Trt)-Thr(Ile-Tyr(tBu)Me-Ile-H)-Leu-OBzl (화합물 10) 8.55g (91.8%).
생성물의 1H-NMR은 제안된 구조를 확인하였다.
(2S)-5-{[tert-부틸(디페닐)실릴]옥시}-2-{[(9H-플루오렌-9-일메톡시)카르보닐]아미노}펜탄산 (= 화합물 11 = TBDPS-합성단위체)의 합성
화합물 23 (합성을 위해 하기를 추가로 참조) (66g, 96.6 mmol)을 에탄올/이소프로필알콜/물 (89:5:6; 3000 mL) 중에 현탁시키고, 현탁액을 IT 45℃로 가열하여 용액을 얻었다. 용액을 IT 30℃로 냉각시켰다. 아르곤으로 불활성화시킨 후, 팔라듐-촉매 (황산바륨상 10%; 6.6g)를 아르곤 스트림 하에 용액에 첨가하였다. 이어서, 생성물을 대기압 약간 초과의 수소압 하에 30-35℃에서 수소화시켰다. 수소화를 HPLC에 따라 1.5시간 후에 완결하였다. 반응 혼합물을 셀룰로스 기재의 필터 보조제 (셀플록(Cellflock) 40; 셀룰로스 기재의 여과 보조제) 상에서 여과하고, 필터 보조제를 에탄올/이소프로판올/물 (89:5:6; 600 mL)로 세척하였다. 45-50℃에서 용매를 감압 하에 증발시켜 59.58g 발포체를 조 생성물로서 수득하였다. 조 생성물을 2 부분의 실리카 겔 상의 크로마토그래피 (2x1 kg 실리카 겔 60)에 의해 디클로로메탄/메탄올 95:5에서 80:20을 이동상로서 사용하여 정제하였다. 수율: 52g (90.6%) TBDPS-합성단위체 (화합물 11).
생성물의 1H-NMR은 제안된 구조를 확인하였다.
이소부티릴-Gln(Trt)-Thr(Ile-Tyr(tBu)Me-Ile-합성단위체(TBDPS)-fmoc)-Leu-OBzl (화합물 12) = 벤질 N2-(2-메틸프로파노일)-N5-(트리페닐메틸)-L-글루타미닐-O-{N-[(2S)-5-[(tert-부틸디페닐실릴)옥시]-2-{[(9H-플루오렌-9-일메톡시)카르보닐]아미노}펜타노일]-L-이소류실-O-(tert-부틸)-N-메틸-L-티로실-L-이소류실}-L-트레오닐-L-류시네이트의 합성
이전 단계로부터의 이소부티릴-Gln(Trt)-Thr(Ile-Tyr(tBu)Me-Ile-H)-Leu-OBzl (화합물 10) (8.55g, 6.99 mmol)을 디클로로메탄 (170 mL) 중에 용해시키고, TBDPS-합성단위체 (화합물 11; 4.98g, 8.39 mmol)를 실온에서 첨가하였다. EDIPA (2.17g, 16.78 mmol) 및 HATU (3.19g, 8.39 mmol)를 첨가하고, 반응 혼합물을 실온에서 1.5시간 동안 교반하였다. 후처리를 위해, 반응 혼합물을 디클로로메탄 (200 mL)으로 희석하고, 묽은 용액을 수성 NaHCO3 (400 mL), 1M HCl (400 mL), 수성 NaHCO3 (400 mL) 및 NaCl-용액 (400 mL)으로 순차적으로 추출하였다. 수성 상을 디클로로메탄 (200 mL)으로 추출하고, 디클로로메탄 상을 합하였다. 디클로로메탄 용액을 황산마그네슘 상에서 건조시키고, 용매를 감압 하에 증발시켜 발포체 14.76g을 조 생성물로서 수득하였다. 조 생성물을 실리카 겔 상의 플래쉬 크로마토그래피에 의해 에틸 아세테이트/헥산을 용리액으로서 사용하여 정제하여 목적 이소부티릴-Gln(Trt)-Thr(Ile-Tyr(tBu)Me-Ile-합성단위체(TBDPS)-fmoc)-Leu-OBzl (화합물 12)을 수득하였다. 수율: 12.46g (99%).
생성물의 1H-NMR은 제안된 구조를 확인하였다.
벤질 N2-(2-메틸프로파노일)-N5-(트리페닐메틸)-L-글루타미닐-O-{N-[(2S)-2-아미노-5-히드록시펜타노일]-L-이소류실-O-(tert-부틸)-N-메틸-L-티로실-L-이소류실}-L-트레오닐-L-류시네이트 (화합물 13)의 합성
상기 기재된 단계로부터의 이소부티릴-Gln(Trt)-Thr(Ile-Tyr(tBu)Me-Ile-합성단위체(TBDPS)-fmoc)-Leu-OBzl (화합물 12) (12.46g, 6.93 mmol)을 DMF (125 mL) 중에 용해시키고, TBAFx3H2O (6.56g, 20.79 mmol)를 첨가하였다. 반응 혼합물을 실온에서 3시간 동안 교반하고, 탈염수 (350 mL)로 희석하였다. 수성 혼합물을 이소프로필 아세테이트 (700 mL)로 추출하고, 유기 상을 수성 NaHCO3 (2x350 mL) 및 탈염수 (350 mL)로 순차적으로 세척하였다. 수성 상을 이소프로필 아세테이트 (350 mL)로 추출하고, 유기 상을 합하였다. 유기 상을 무수 황산마그네슘 상에서 건조시키고, 용매를 감압 하에 증발시켰다. 조 생성물 (12.65g)을 실리카 겔 상의 칼럼 크로마토그래피에 의해 디클로로메탄/메탄올 (95:5에서 90:10)을 용리액으로서 사용하여 정제하여 화합물 13을 수득하였다. 수율: 8.34g (90%).
생성물의 1H-NMR은 제안된 구조를 확인하였다.
N2-(2-메틸프로파노일)-N5-(트리페닐메틸)-L-글루타미닐-O-{N-[(2S)-2-아미노-5-히드록시펜타노일]-L-이소류실-O-(tert-부틸)-N-메틸-L-티로실-L-이소류실}-L-트레오닐-L-류신 (화합물 14)의 합성
이전 단계로부터의 화합물 13 (8.34g, 6.23 mmol)을 에탄올/물 (95:5; 85mL) 중에 용해시키고, 황산바륨상 10% 팔라듐 (1.67g)을 첨가하였다. 현탁액을 수소 분위기 하에 실온에서 75분 동안 교반하였다. 후처리를 위해, 반응 플라스크를 질소로 퍼징하고, 현탁액을 셀플록-층 상에서 여과하였다. 여과 잔류물을 에탄올/물 (95:5; 400 mL)로 수회 세척하였다. 여과물을 감압 하에 농축시키고, 조 생성물 (8.6g)을 실리카 겔 상에서 플래쉬-크로마토그래피에 의해 디클로로메탄/메탄올 (9:1에서 8:2)을 용리액으로서 사용하여 정제하여 화합물 14를 수득하였다. 수율: 7.6g (97.7%).
생성물의 1H-NMR은 제안된 구조를 확인하였다.
(2S)-N-[(3S,6S,9S,12S,15S,18S,19R)-3,9-디[(2S)-부탄-2-일]-6-{[4-(tert-부톡시)페닐]메틸}-12-(3-히드록시프로필)-7,19-디메틸-15(2-메틸프로필)-2,5,8,11,14,17-헥사옥소-1-옥사-4,7,10,13,16-펜타아자시클로노나데칸-18-일]-2-(2-메틸프로판아미도)-N'-(트리페닐메틸)펜탄디아미드 (화합물 15)의 합성
이전 단계로부터의 화합물 14 (7.0g, 5.61 mmol)를 아세토니트릴 (350 mL) 중에 용해시키고, EDIPA (0.87g)를 첨가하였다. 용액이 형성되었다. 이 용액을 15분 내에 아세토니트릴 (350 mL) 중 HATU (2.56g, 6.73 mmol) 및 EDIPA (0.87g)의 용액에 첨가하였다. 반응 혼합물을 추가로 15분 동안 실온에서 교반하여 반응을 완결시켰다. 이어서, 반응 혼합물을 염수 (1.4L) 및 이소프로필 아세테이트 (1.4L)로 처리하였다. 상을 분리하고, 유기 상을 염수 (1.4L)로 다시 세척하였다. 층을 분리하고, 유기 상을 무수 황산마그네슘 상에서 건조시키고, 용매를 감압 하에 증발시켰다. 조 생성물 (8.95g)을 실리카 겔 상의 플래쉬-크로마토그래피에 의해 에틸 아세테이트/메탄올 (95:5)을 용리액으로서 사용하여 정제하여 화합물 15를 수득하였다. 수율: 6.58g (95.4%).
생성물의 1H-NMR은 제안된 구조를 확인하였다.
(2S)-N-[(3S,6S,9S,12S,15S,18S,19R)-3,9-디[(2S)-부탄-2-일]-6-{[4-(tert-부톡시)페닐]메틸}-7,19-디메틸-15-(2-메틸프로필)-2,5,8,11,14,17-헥사옥소-12-(3-옥소프로필)-1-옥사-4,7,10,13,16-펜타아자시클로노나데칸-18-일]-2-(2-메틸프로판아미도)-N'-(트리페닐메틸)펜탄디아미드 (화합물 16)의 합성
이전 단계로부터의 화합물 15 (5.5g, 4.47 mmol)를 테트라히드로푸란 (600 mL) 중에 용해시키고, DMSO (200 mL)를 첨가하였다. 이 용액을 IBX (45%g/g 샘플의 11.13g, 5.01g 100% IBX에 상응함, 17.89 mmol)로 처리하였다. 반응 혼합물을 실온에서 4시간 동안 교반하고, 수성 NaHCO3 (1250 mL)을 첨가하고, 이어서 디클로로메탄 (650 mL)을 첨가하였다. 층을 분리하고, 수성 층을 디클로로메탄 (650 mL)으로 다시 추출하였다. 디클로로메탄 상을 합하고, 탈염수 (2x650 mL)로 세척하였다. 디클로로메탄 상을 무수 황산마그네슘 상에서 건조시키고, 용매를 감압 하에 증발시켰다. 조 생성물 (7.2g)을 실리카 겔 상에서 플래쉬-크로마토그래피에 의해 에틸 아세테이트/이소프로판올 (95:5)을 용리액으로서 사용하여 정제하여 화합물 16을 수득하였다. 수율: 5.136g (93.5%).
정제된 화합물 16은 목적 알데히드 및 상응하는 5원 고리 및 6-고리 헤미-아미날의 혼합물이다.
(2S)-4-(1,3-디옥솔란-2-일)-2-{[(9H-플루오렌-9-일메톡시)카르보닐]아미노}부탄산 (= 아세탈-합성단위체 = 화합물 17)의 합성
화합물 25 (26.8g; 60.15 mmol)를 디옥산 (250 mL) 중에 용해시켰다. LiOH (10.1g; 241.05 mmol) 및 물 (150 mL)을 첨가하고, 혼합물을 실온에서 72시간 동안 교반하였다. 형성된 현탁액을 물 (200 mL) 및 아세트산 (32g)으로 처리하여 2개의 투명한 상을 수득하였다. 2상 혼합물을 에틸 아세테이트 (500 mL)로 희석하고, 상을 분리하였다. 수성 상을 분리하고, 에틸 아세테이트 (300 mL)로 추출하였다. 유기 상을 합하고, 물 (300 mL)로 세척하였다. 용매를 감압 하에 증발시켜 29g 조 생성물을 점성 액체로서 수득하였다. 조 생성물을 실리카 겔 상의 플래쉬 크로마토그래피에 의해 디클로로메탄/이소프로판올 (9:1)을 용리액으로서 사용하여 정제하여 1H-NMR에 따라 약 10 mol% 이소프로판올을 포함하는 17.3g 생성물을 수득하였다. 잔류 이소프로판올을, 이소프로필 아세테이트 (200 mL) 중에 용해시키고 이소프로필 아세테이트 용액을 물 (3x50 mL)로 추출함으로써 생성물로부터 제거하였다. 최종적으로, 용매를 감압 하에 제거하고, 생성물을 진공 하에 70℃에서 건조시켜 화합물 17 (16g; 74.8% 수율)을 수득하였다.
생성물의 1H- 및 13C-NMR 스펙트럼은 제안된 구조를 확인하였다.
벤질 N2-(2-메틸프로파노일)-N5-(트리페닐메틸)-L-글루타미닐-O-{N-[(2S)-2-(디벤질아미노)-4-(1,3-디옥솔란-2-일)부타노일]-L-이소류실-O-(tert-부틸)-N-메틸-L-티로실-L-이소류실}-L-트레오닐-L-류시네이트(화합물 18)의 합성
화합물 10 (1.83g, 1.497 mmol)을 디클로로메탄 (35 mL) 중에 용해시켰다. 용액에 아세탈-합성단위체 (화합물 11) (0.638g, 1.795 mmol), EDIPA (0.464g, 3.590 mmol) 및 HATU (0.683g, 1.796 mmol)를 첨가하고, 반응 혼합물을 실온에서 75분 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 디클로로메탄 (40 mL)으로 희석하고, 수성 NaHCO3 (80 mL), 1M HCl (80 mL), 수성 NaHCO3 (80 mL) 및 반포화 염수 (80 mL)를 사용하여 순차적으로 추출하였다. 수성 상을 디클로로메탄 (40 mL)으로 추출하고, 디클로로메탄 상을 합하였다. 디클로로메탄 상을 무수 황산마그네슘 상에서 건조시키고, 용매를 감압 하에 증발시켰다. 조 생성물 (3.23g)을 실리카 겔 상의플래쉬-크로마토그래피에 의해 에틸 아세테이트/헥산 (6:4에서 7:3)을 사용하여 정제하여 화합물 18을 수득하였다. 수율: 2.13g (91.2%).
생성물의 1H-NMR 스펙트럼은 제안된 구조를 확인하였다.
N2-(2-메틸프로파노일)-N5-(트리페닐메틸)-L-글루타미닐-O-{N-[(2S)-2-아미노-4-(1,3-디옥솔란-2-일)부타노일]-L-이소류실-O-(tert-부틸)-N-메틸-L-티로시닐-L-이소류실}-L-트레오닐-L-류신 (화합물 19)의 합성
화합물 18 (2.10g, 1.282 mmol)을 이소프로판올/물 (95:5; 60 mL) 중에 용해시키고, 용액이 들은 플라스크를 아르곤의 스트림으로 불활성화시켰다. 용액을 목탄상 10% 팔라듐/물 (1:1) (2.0g)로 처리하였다. 반응기를 아르곤으로 다시 불활성화시키고, 수소로 퍼징하였다. 용액을 40℃에서 대기 수소압 하에 7시간 40분 동안 교반하였다. 이어서, 현탁액을 여과하고, 여과 잔류물을 이소프로판올로 세척하였다. 용매를 45℃에서 감압 하에 증발시켜 조 화합물 19를 수득하였다. 조 수율: 1.55g (93.8%).
조 화합물 19를 추가 정제 없이 화합물 20으로 전환시켰다.
정제된 분석 샘플의 1H-NMR 스펙트럼은 제안된 구조를 확인하였다.
(2S)-N-[(3S,6S,9S,12S,15S,18S,19R)-3,9-디[(2S)-부탄-2-일]-6-{[4-(tert-부톡시)페닐]메틸}-12-[2-(1,3-디옥솔란-2-일)에틸]-7,19-디메틸-15-(2-메틸프로필)-2,5,8,11,14,17-헥사옥소-1-옥사-4,7,10,13,16-펜타아자시클로노나데칸-18-일]-2-(2-메틸프로판아미도)-N'-(트리페닐메틸)펜탄디아미드 (화합물 20)의 합성
4-DMAP (0.284g, 2.325 mmol)를 디클로로메탄 (100 mL) 중에 용해시키고, HATU (0.590g, 1.552 mmol)를 첨가하였다. 탁한 현탁액을 0℃로 냉각시켰다. 이 현탁액에, 디클로로메탄 (100 mL) 중 조 화합물 19 (1.0g에, 0.775 mmol)의 용액을, 온도를 0-4℃에서 유지하면서 30분에 걸쳐 첨가하였다. 반응 혼합물을 0-4℃에서 추가로 30분 동안 교반하였다. 반응물을 용액/물 (1:1, 200 mL) 상의 첨가에 의해 켄칭하고, 상을 분리하였다. 유기 상을 용액/물 (1:1, 200 mL)로 다시 세척하고, 상을 분리하였다. 유기 상을 무수 황산마그네슘 상에서 건조시키고, 용매를 감압 하에 증발시켜 조 화합물 20 (1.31g)을 수득하였다. 조 생성물을 실리카 겔 상의 칼럼 크로마토그래피에 의해 에틸 아세테이트를 용리액으로서 사용하여 정제하여 화합물 20을 HPLC에 따라 97.7 a% 순도로 수득하였다. 수율: 0.634g (2 단계에 걸쳐 64.3%).
생성물의 1H- 및 13C-NMR 스펙트럼은 제안된 구조를 확인하였다.
이소부티릴-Gln(Trt)-Thr(Ile-alloc)-Leu-OBzl (화합물 21)의 합성
디클로로메탄 (300 mL) 중 Alloc-Ile-OH (6.2g, 28.8 mmol)의 용액에 화합물 4 (10g, 13.11 mmol) 및 DMAP (0.16g, 1.3 mmol)를 첨가하였다. 혼합물을 실온에서 용액이 형성될 때까지 교반하였다. EDC.HCl (5.53g, 28.8 mmol)을 교반 용액에 조금씩 첨가하고, 반응 혼합물을 실온에서 24시간 동안 교반하였다. 후처리를 위해, 디클로로메탄 중 반응 혼합물을 탈염수 (300 mL), 1M HCl (300 mL), 수성 NaHCO3 (300 mL) 및 염수 (300 mL)로 순차적으로 추출하였다. 디클로로메탄 상을 무수 황산마그네슘 상에서 건조시키고, 용매를 감압 하에 증발시켜 조 화합물 21을 수득하였다. 조 생성물 (17.24g)을 실리카 겔 상의플래쉬 크로마토그래피에 의해 디클로로메탄/메탄올을 용리액으로서 사용하여 정제하여 화합물 21을 수득하였다. 수율: 11.23g (89.2%).
생성물의 1H-NMR은 제안된 구조를 확인하였다. 스펙트럼은 또한 에스테르화 동안 Alloc-Ile-OH에 대해 약 10% 라세미화를 나타내었다.
이소부티릴-Gln(Trt)-Thr(Ile-H)-Leu-OBzl (화합물 6)의 합성
화합물 21 (2.0g, 2.083 mmol)을 디클로로메탄 중에 용해시키고, 용액을 0℃로 냉각시켰다. PdCl2(PPh3)2 (0.073g, 0.104 mmol)를 용액에 첨가하고, 이어서 아세트산 (0.188 g, 2.083 mmol)을 첨가하였다. 최종적으로, Bu3SnH (1.213g, 4.166 mmol)를 첨가하고, 용액을 0℃에서 추가로 75분 동안 교반하였다. 디클로로메탄 용액을 탈염수 (2x200 mL), 수성 NaHCO3 (2x100 mL) 및 탈염수 (100 mL)로 순차적으로 세척하였다. 유기 상을 무수 황산마그네슘 상에서 건조시키고, 용매를 감압 하에 증발시켜 조 화합물 6 2.37g을 수득하였다. 분석 샘플을 에틸 아세테이트/헥산 (1:9) 중 현탁화 및 여과에 의한 침전물의 단리에 의해 정제하였다.
정제된 생성물의 1H-NMR은 제안된 구조를 확인하였다.
이 실험으로부터의 조 화합물 6을, 화합물 6의 화합물 7로의 전환에 대해 상기 기재된 절차를 사용하여 두 단계 모두에 걸쳐 85% 총 수율의 화합물 7로 성공적으로 전환시켰다.
벤질 (2S)-5-{[tert-부틸(디페닐)실릴]옥시}-2-{[(9H-플루오렌-9-일메톡시)카르보닐]아미노}펜타노에이트 (화합물 23)의 원-포트 합성
Fmoc-Glu-OBzl (60g, 130.579 mmol)을 테트라히드로푸란 (550 mL) 중에 용해시키고, 트리에틸아민 (40.8g, 403.202 mmol)을 첨가하였다. 탁한 용액을 약간의 침전물을 사용하여 수득하였다. 이 탁한 용액/현탁액을 적하 깔때기로 옮기고, 4.5L 반응기 내 테트라히드로푸란 (300 mL) 중 이소부틸-클로로포르메이트 (54.96g, 402.41 mmol)의 사전 냉각된 용액에 -35 내지 -30℃에서 첨가하였고, 첨가 동안 이 온도를 유지하였다. 적하 깔때기 중 잔류물을 추가의 테트라히드로푸란 (50mL)으로 세척하고, 반응 혼합물을 -35 내지 -30℃에서 추가로 2시간 동안 교반하였다. 물 (960 mL)을 반응 혼합물에 45분 내에 첨가하면서, 온도가 0℃까지 상승하도록 하였다. 현탁액이 형성되었다. 수소화붕소나트륨 (14.4g, 380.625 mmol)을 1시간 내에 0℃에서 20 부분으로 첨가하고, 반응 혼합물을 0℃에서 추가로 1시간 동안 교반하였다. 수소 기체가 발생하기 때문에 주의를 기울였다.
현탁액을 t-부틸-메틸에테르 (600 mL)에 붓고, 반응 플라스크를 물 (600 mL)로 세척하고, 이를 생성 혼합물에 첨가하였다 (2-상). 상을 분리하고, 수상을 t-부틸-메틸에테르 (600 mL)로 추출하고, 유기 상을 합하였다. 유기 상을 물 (2x600 mL)로 세척하고, 무수 황산마그네슘 (200g) 상에서 건조시키고, 용매를 1L의 최종 부피가 달성될 때까지 감압 하에 제거하였다. 용액을 디메틸-포름아미드 (600g)로 희석하고, 용매를 400 mL의 최종 부피가 달성될 때까지 감압 하에 증발시켰다. 이와 같이 하여 수득한 화합물 22의 용액을 둥근 바닥 플라스크로 옮겼다. 이미다졸 (14.4g, 211.524 mmol)을 화합물 22 (벤질 (2S)-2-{[(9H-플루오렌-9-일메톡시)카르보닐]아미노}-5-히드록시펜타노에이트)의 생성된 DMF 용액에 첨가하고, 혼합물을 실온에서 5분 동안 교반하였다. 최종적으로, TBDPS-Cl (39.6g, 144.07 mmol)을 20분 동안 20-25℃에서 적가하고, 반응 혼합물을 이 온도에서 추가로 1시간 동안 교반하였다.
이어서, 반응 혼합물을 에틸 아세테이트 (1200 mL)에 붓고, 혼합물을 물 (700 mL)로 추출하였다. 층을 분리하고, 유기 층을 물 (3x300 mL)로 세척하였다. 용매를 감압 하에 증발시켜 106g 조 생성물을 수득하였다.
조 생성물 (106g)을 40-50℃에서 에탄올/이소프로판올/물 (89:5:6; 1200 mL) 중에 용해시키고, 종자 결정 (0.5g 화합물 23)을 첨가하였다 (종자 결정은, 화합물 23 (점성 오일)의 정제된 샘플을 냉장고 내에 저장하여 결정을 생성하고 이를 이어서 종자 결정으로서 사용하여 헥산/이소프로필아세테이트 9:1로부터 화합물 23을 결정화시킴으로써 수득되었으며, 이는 결정화를 위해 종자로서 여기서 사용되어 결정을 생성함). 혼합물을 실온으로 냉각되도록 하고, 실온에서 17시간 동안 교반하였다. 현탁액을 -20℃로 냉각시키고, -20℃에서 2시간 동안 교반하였다. 생성물을 여과에 의해 단리하고, 필터 케이크를 용매 혼합물 에탄올/이소프로판올/물 (89:5:6; 3x200 mL)로 세척하고, 감압 하에 40℃에서 건조시켜 화합물 23 66.5g (74.6% 수율, 2 단계에 걸침)을 수득하였다. HPLC은 생성물에 대해 >99 a% 순도를 나타내었다.
추가의 생성물을 모액으로부터 단리시킬 수 있으며 (용매의 증발 후 34g), 이는 HPLC에 따라 약 30 a% 화합물 23을 함유한다.
벤질 (2S)-2-(디벤질아미노)-4-(1,3-디옥솔란-2-일)부타노에이트 (화합물 25)의 합성
디클로로메탄 (700 mL) 중 화합물 24 (29g; 72.23 mmol)의 용액에, 에틸렌 글리콜 (133g, 2.14 mol), p-톨루엔-술폰산 1수화물 (15g; 78.86 mmol) 및 분자체 (3옹스트룀, 40g)를 순차적으로 첨가하였다. 반응 혼합물을 실온에서 18시간 동안 교반하였다. 분자체를 여과에 의해 제거하고, 필터 케이크를 에틸 아세테이트로 세척하고, 여과물을 감압 하에 증발시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트 (1L) 중에 용해시키고, 물 (3x300mL)로 추출하고, 유기 상을 감압 하에 증발시켜 33.3g 조 생성물을 수득하였다. 조 생성물을 실리카 겔 상에서 크로마토그래피에 의해 에틸 아세테이트/헥산 (4:6)을 사용하여 정제하여 순수한 화합물 25 (87% 수율) 28.0g을 수득하였다.
생성물의 1H-NMR은 제안된 구조를 확인하였다.
화합물 16으로부터의 화합물 A의 합성
화합물 A= (2S)-N-[(2S,5S,8S,11R,12S,15S,18S,21R)-2,8-디[(2S)-부탄-2-일]-21-히드록시-5-[(4-히드록시페닐)메틸]-4,11-디메틸-15-(2-메틸프로필)-3,6,9,13,16,22-헥사옥소-10-옥사-1,4,7,14,17-펜타아자비시클로[16.3.1]도코산-12-일]-2-(2-메틸프로판아미도)펜탄디아미드 (대안적으로 명칭: (S)-N1-((2S,5S,8S,11R,12S,15S,18S,21R)-2,8-디-(S)-sec-부틸-21-히드록시-5-(4-히드록시벤질)-15-이소부틸-4,11-디메틸-3,6,9,13,16,22-헥사옥소-10-옥사-1,4,7,14,17-펜다아자비시클로[16.3.1]도코산-12-일)-2-이소부티르아미도펜탄디아미드):
화합물 16 (2.0g, 1.63 mmol)을 디클로로메탄 (400 mL) 중에 용해시키고, 용액을 0℃로 냉각시켰다. TFA (115.9g)를 용액에 0-4℃에서 첨가하고, 반응 혼합물을 이 온도에서 4시간 동안 교반하였다. 디클로로메탄 (400 mL)을 반응 혼합물에 첨가하고, 이어서 탈염수 (20 mL)를 첨가하였다. 반응 혼합물을 실온으로 가열하고, 이 온도에서 추가로 5시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 탈염수 (800 mL) 중 NaOAc (165.1g)의 용액에 부었다. 에틸 아세테이트 (400 mL)를 혼합물에 첨가하고, 층을 분리하였다. 유기 상을 탈염수 (2x200 mL)로 세척하고, 수성 상을 에틸 아세테이트 (200 mL)로 추출하였다. 유기 상을 합하고, 생성된 용액을 무수 황산마그네슘 상에서 건조시켰다. 용매를 감압 하에 증발시키고, 조 생성물 (2.183g)을 RP 실리카 크로마실(Kromasil) 100-10-C8 칼럼 상의 RP-크로마토그래피 (에카 케미칼스 AB(Eka Chemicals AB), 스웨덴 보후스)에 의해 아세토니트릴/물의 구배를 사용하여 정제하였다. 주요 생성물을 함유하는 분획을 수집하고, 유기 용매 (아세토니트릴)을 감압 하에 증발시키고, 에틸 아세테이트를 형성된 현탁액에 첨가하였다. 층을 분리하고, 유기 층의 용매를 감압 하에 증발시켜 정제된 화합물 A를 수득하였다. 수율: 0.895g (59.1%).
생성물의 13C- 및 1H-NMR은 제안된 구조를 확인하였고, 화합물 20으로부터 제조된 화합물 A의 스펙트럼에 필적하였으며, 하기를 참조한다.
화합물 20으로부터의 화합물 A의 합성
화합물 A= (2S)-N-[(2S,5S,8S,11R,12S,15S,18S,21R)-2,8-디[(2S)-부탄-2-일]-21-히드록시-5-[(4-히드록시페닐)메틸]-4,11-디메틸-15-(2-메틸프로필)-3,6,9,13,16,22-헥사옥소-10-옥사-1,4,7,14,17-펜타아자비시클로[16.3.1]도코산-12-일]-2-(2-메틸프로판아미도)펜탄디아미드
화합물 20 (0.400g, 0.315 mmol)을 디클로로메탄 (80 mL) 중에 용해시키고, 용액을 0-5℃로 냉각시켰다. 트리플루오로아세트산 (23.06g)을 철저한 교반 하에 첨가하고, 반응 혼합물을 이 온도에서 추가로 3.5시간 동안 교반하였다. 이어서, 용액을 디클로로메탄 (80 mL)으로 희석하고, 탈염수 (4.0g)로 처리하였다. 반응 혼합물을 실온으로 가온되도록 하고, 실온에서 추가로 19.5시간 동안 교반하였다. 후처리를 위해, 반응 혼합물을 탈염수 (160 mL) 중 아세트산나트륨 (32.6g)의 용액에 붓고, 에틸 아세테이트 (80 mL)를 첨가하였다. 상을 분리하고, 보다 하위의 유기 상을 탈염수 (2x40 mL)로 세척하였다. 수성 상을 에틸 아세테이트 (80 mL)로 추출하고, 유기 상을 합하였다. 합한 유기 상을 무수 황산마그네슘 상에서 건조시키고, 용매를 감압 하에 증발시켜 조 화합물 A를 수득하였다. 조 생성물을 실리카 겔 상의 칼럼 크로마토그래피에 의해 에틸 아세테이트/이소프로판올 (9:1)을 이동상로서 사용하여 정제하였다. 생성물 분획의 수집 및 감압 하에 용매의 증발은 화합물 A를 제공하였다. 수율: 0.22g (75.3%).
생성물의 1H- 및 13C-NMR 스펙트럼은 제안된 구조를 확인하였고, 화합물 16으로부터 수득된 화합물 A의 스펙트럼에 필적하였다.
Claims (14)
- 용액 상 합성 단독에 의해 하기 화학식 I의 시클릭 뎁시펩티드 화합물 또는 그의 염을 제조하기 위한 방법 또는 공정이며,
<화학식 I>
(상기 식에서,
A1은 말단 카르복시 또는 카르바모일 기를 갖는 아미노산, 특히 아스파라긴 또는 글루타민의 2가 모이어티이고, 카르보닐을 통해 화학식 I에서 분자의 나머지 부분에 결합되거나; 또는 C1-8-알카노일 또는 인산화 히드록시-C1-8-알카노일이고;
X는 A1의 N을 통해 결합되고 아실이거나, 또는 A1이 C1-8-알카노일 또는 인산화 히드록시-C1-8-알카노일인 경우에는 부재하고;
R2는 C1-8-알킬, 특히 메틸이고;
R3은 아미노산, 특히 류신, 이소류신 또는 발린의 측쇄이고;
R5는 아미노산, 바람직하게는 페닐알라닌, 류신, 이소류신 또는 발린의 측쇄이고;
R6은 히드록시 아미노산, 특히 티로신의 측쇄이고;
R7은 아미노산, 바람직하게는 아미노산 류신, 이소류신 또는 발린의 측쇄이고;
Y는 수소 또는 C1-8-알킬임)
상기 방법은
제1 변형법 (A)에서
하기 화학식 II의 화합물의 유리 히드록실 기를
<화학식 II>
(상기 식에서, Y는 화학식 I의 화합물에 대해 정의된 바와 같고, X*, A1*, R2*, R3*, R5*, R6* 및 R7*는 각각 화학식 I에서의 X, A1, R2, R3, R5, R6 및 R7에 상응하나, 단 이들 모이어티 상의 반응성 관능기는 적어도 이들이 목적하지 않은 부반응에 참여할 수 있는 경우에는 보호 형태로 존재함)
산화 조건 하에 반응시켜 하기 화학식 III의 화합물을 형성하고,
<화학식 III>
잔류하는 보호기를 제거하여 화학식 I의 화합물 또는 그의 염을 수득하고,
원하는 경우에, 화학식 I의 유리 화합물을 염으로, 화학식 I의 화합물의 염을 화학식 I의 화합물의 상이한 염으로 또는 화학식 I의 유리 화합물로 전환시키고/거나 부산물로서 형성된 화학식 I의 화합물의 탈수화물 유사체 및/또는 5원 고리 유사체를 화학식 I의 상응하는 화합물로 전환시키는 것
을 포함하며,
여기서 화학식 III의 화합물은 하기 화학식 IV의 화합물의 거대락탐화에 의해 제조되고,
<화학식 IV>
(상기 식에서, Y, R2*, R3*, R7*, R6* 및 R5*, X* 및 A1*는 화학식 II의 화합물에 대해 정의된 바와 같음)
여기서, 추가 실시양태에서, 상기 기재된 방법 또는 공정은 보호기 ProtA, 보호된 아미노 기 Z의 보호기(들) 및 보호기 Prot를 하기 화학식 V의 화합물로부터 동시에 또는 순차적으로 제거함으로써 용액 상에서 화학식 IV의 화합물을 제조하는 것을 추가로 포함하고,
<화학식 V>
(상기 식에서, ProtA는 카르복시 보호기이고, Prot는 히드록실 보호기이고, Z는 화학식 NHProt** (여기서 Prot**는 아미노 보호기임)의 보호된 아미노 기이거나; 또는 Z는 화학식 N(Prot*)2 (여기서 각 Prot*는 아미노 보호기임)의 보호된 아미노 기이고; Y, R2*, R3*, R7*, R6* 및 R5*, X* 및 A1*는 화학식 II의 화합물에 대해 정의된 바와 같음)
상기 언급된 방법 또는 공정은 바람직하게는 하기 화학식 VI의 화합물을
<화학식 VI>
(상기 식에서, ProtA는 화학식 V의 화합물에 대해 상기 정의된 바와 같고, Y, R2*, R3*, R7*, R6* 및 R5*, X* 및 A1*는 화학식 II의 화합물에 대해 상기 정의된 바와 같음)
하기 화학식 VII의 아미노산,
<화학식 VII>
(상기 식에서, ProtA 및 Z (바람직하게는 NHProt**임)는 화학식 V의 화합물에 대해 상기 정의된 바와 같음)
또는 그의 활성화된 유도체와 커플링시킴으로써 용액 상에서 화학식 V의 화합물을 제조하는 것 (변형법 A의 마지막)을 추가로 포함하는 것인
방법 또는 공정;
및/또는 병행으로 또는 대안적으로, 변형법 (B)에서,
하기 화학식 II*의 화합물을 탈보호시켜
<화학식 II*>
(상기 식에서, 알데히드 보호기(들) Rk 및 Rl은 서로 독립적으로 비치환 또는 치환된 알킬이거나, 또는 2개의 결합 O 원자, 및 2개의 O 원자가 결합되어 있는 탄소 원자와 함께 비치환 또는 치환된 고리를 형성하고, Y는 화학식 I의 화합물에 정의된 바와 같고, X*, A1*, R2*, R3*, R5*, R6* 및 R7*는 각각 화학식 I에서의 X, A1, R2, R3, R5, R6 및 R7에 상응하나, 단 이들 모이어티 상의 반응성 관능기는 적어도 이들이 목적하지 않은 부반응에 참여할 수 있는 경우에는 보호된 형태로 존재함)
화학식 I, 특히 IA의 화합물을 생성하고,
원하는 경우에, 화학식 I, 또는 특히 IA의 유리 화합물을 염으로, 화학식 I의 화합물의 염을 화학식 I, 또는 특히 IA의 화합물의 상이한 염으로 또는 화학식 I, 또는 특히 IA의 유리 화합물로 전환시키고/거나 부산물로서 형성된 화학식 I의 화합물의 탈수화물 유사체 및/또는 5원 고리 유사체를 화학식 I, 또는 특히 IA의 상응하는 화합물로 전환시키는 것을 포함하는 방법 또는 공정. - 제1항에 있어서, 화학식 II*의 화합물의 합성을 위해, N-말단 아미노 기 및 C-말단 카르복시 기를 보유하는 화학식 II*의 화합물의 선형 전구체 펩티드의 락탐화 하에서, 상기 아미노 및 상기 카르복시 기로부터 아미드 결합의 형성을 허용하는 반응 조건 하에, 용액 상 화학을 사용하는 고리화를 추가로 포함하는, 변형법 (B) 하에서의 방법 또는 공정이며,
여기서 선형 전구체 펩티드는 하기 화학식 IV*를 갖고,
<화학식 IV*>
(상기 식에서, Rk, Rl, X*, A1*, R2*, R3*, R5*, R6* 및 R7*는 상기 화학식 II*의 화합물에 대해 정의된 바와 같음)
이는 하기 화학식 V*의 상응하는 화합물로부터
<화학식 V*>
(상기 식에서, Rk, Rl, X*, A1*, R2*, R3*, R5*, R6* 및 R7*는 상기 화학식 II*의 화합물에 대해 정의된 바와 같고, Z는 제1항에서 화학식 V의 화합물에 대해 정의된 바와 같음)
보호된 아미노 기 Z를 탈보호시킴으로써 탈보호에 의해 수득될 수 있고,
상기 방법 또는 공정은 바람직하게는, 화학식 V*의 화합물의 합성을 위해, 하기 화학식 VI의 화합물을
<화학식 VI>
(상기 식에서, Rk, Rl, X*, A1*, R2*, R3*, R5*, R6* 및 R7*는 화학식 II*의 화합물에 대해 정의된 바와 같고, Prot-A는 카르복시 보호기임)
하기 화학식 VII*의 아미노산,
<화학식 VII*>
(상기 식에서, Rk 및 Rl은 화학식 II*의 화합물에 대해 정의된 바와 같고, Z는 화학식 V*의 화합물에 대해 제1항에 정의된 바와 같음)
또는 상기 아미노산의 활성화된 유도체를 화학식 VI* 또는 VIA*의 상기 화합물에 커플링시킴으로써 반응시키는 것 (변형법 (B)의 마지막)을 추가로 포함하는 것인
방법 또는 공정. - 제1항 또는 제2항에 있어서, 하기 화학식 VIII의 화합물을
<화학식 VIII>
(상기 식에서, ProtA는 제1항에서 화학식 V의 화합물에 대해 상기 정의된 바와 같고, Y, R2*, R3*, R7*, R6* 및 X* 및 A1*는 제1항에서 화학식 II의 화합물에 대해 상기 정의된 바와 같음)
하기 화학식 IX의 아미노산,
<화학식 IX>
(상기 식에서, Prot**는 제1항에서의 Z의 정의에서 화학식 V의 화합물에 대해 정의된 바와 같고, R5*는 제1항에서 화학식 V의 화합물에 대해 정의된 바와 같음)
또는 상기 아미노산의 반응성 유도체와 커플링시킴으로써 용액 상에서 변형법 둘 다에서 사용되는 화학식 VI의 화합물을 제조하는 것을 추가로 포함하는, 변형법 (A) 또는 변형법 (B)를 포함하나 둘 다가 사용되는 것을 제외하지는 않는 방법 또는 공정. - 제3항에 있어서, 하기 화학식 X의 화합물을
<화학식 X>
(상기 식에서, ProtA는 화학식 V의 화합물에 대해 제1항에 정의된 바와 같고, R2*, R3*, R7*, X* 및 A1*는 화학식 II의 화합물에 대해 제1항에 정의된 바와 같음)
하기 화학식 XI의 아미노산,
<화학식 XI>
(상기 식에서, Prot** 및 R6* 화학식 V의 화합물에 대해 제1항에 정의된 바와 같고, Y는 화학식 I의 화합물에 대해 제1항에 정의된 바와 같음)
또는 상기 아미노산의 반응성 유도체와 커플링시킴으로써 용액 상에서 화학식 VIII의 화합물을 제조하는 것을 추가로 포함하는 방법 또는 공정. - 제5항에 있어서, 하기 화학식 XIV의 화합물을
<화학식 XIV>
(상기 식에서, ProtA는 화학식 V의 화합물에 대해 상기 정의된 바와 같고, R2* 및 R3*는 화학식 II의 화합물에 대해 제1항에 정의된 바와 같음)
하기 화학식 XV의 산,
<화학식 XV>
또는 그의 반응성 유도체와 커플링시키고,
(상기 식에서, X**는 아미노산 보호기이거나 또는 X*이고, X* 및 A1*는 화학식 II의 화합물에 대해 상기 정의된 바와 같음)
X**가 아미노 보호기인 경우에는, 상기 아미노 보호기 X**를 제거하여 X* 대신에 H를 수득하고, 생성된 아미노 기를 상응하는 산 X*-OH (여기서 X*는 제1항에서 화학식 II의 화합물에 대해 상기 정의된 바와 같음) 또는 그의 반응성 유도체를 사용하여 아실 기 X*와 커플링시킴으로써 용액 상에서 화학식 XII의 화합물을 제조하는 것을 추가로 포함하는 방법 또는 공정. - 제6항에 있어서, 하기 화학식 XVI의 아미노산을
<화학식 XVI>
(상기 식에서, ProtA는 화학식 V의 화합물에 대해 상기 정의된 바와 같고, R3*는 화학식 II의 화합물에 대해 상기 정의된 바와 같음)
하기 화학식 XVII의 아미노산,
<화학식 XVII>
(상기 식에서, Prot***는 보호기 ProtA의 제거 없이 절단될 수 있는 아미노 보호기이고, R2*는 화학식 II의 화합물에 대해 상기 정의된 바와 같음)
또는 상기 아미노산의 반응성 유도체와 커플링시키고,
아미노 보호기 Prot***를 제거함으로써 화학식 XV의 화합물을 제조하는 것을 추가로 포함하는 방법 또는 공정. - 제7항에 있어서, 하기 화학식 XVIII의 화합물에서의 유리 카르복실 기를
<화학식 XVIII>
(상기 식에서, ProtC는 카르복실 보호기이고, Prot**는 화학식 V의 화합물에 대해 제1항에 정의된 바와 같음)
하기 화학식 XIX의 상응하는 알콜로 환원시키고,
<화학식 XIX>
(상기 식에서, Prot** 및 ProtC는 상기 정의된 바와 같음)
유리 히드록실 기를 히드록실 보호기 Prot를 도입하는 시약으로 보호하여 하기 화학식 XX의 화합물을 수득하고,
<화학식 XX>
(상기 식에서, Prot**, ProtC 및 Prot는 상기 정의된 바와 같음)
보호기 ProtC를 제거하여 화학식 VII의 화합물을 수득함으로써 화학식 VII의 화합물을 제조하는 것을 추가로 포함하는 방법. - 화학식 I (특히 제1항에서 제공된 것 또는 제10항에 정의된 바와 같은 치환기를 갖는 것)의 화합물의 탈수화물을 화학식 I의 상응하는 화합물로 전환시키는 것을 포함하며, 여기서 탈수화물은 하기 화학식 XXI,
<화학식 XXI>
(상기 식에서, Y, X, A1, R2, R3, R5, R6 및 R7은 화학식 I의 화합물에 대해 제1항에 정의된 바와 같음)
및/또는 또한 부산물로서 형성될 수 있고 하기 화학식 XXII*를 갖는, 화학식 I에서 ahp 구조 대신에 5원 고리를 갖는 그의 상응하는 헤미아미날 유사체를 갖고,
<화학식 XXII*>
(상기 식에서, Y, X, A1, R2, R3, R5, R6 및 R7은 각각 화학식 I의 화합물에 대해 제1항에 정의된 바와 같음)
수성 산을 반응성 용매로서 사용하여 반응을 구동하는 것을 포함하는, 화학식 I의 화합물을 제조하는 공정 또는 방법. - 제1항 내지 제9항 중 어느 한 항에 있어서, 존재하는 경우에,
기호 A1, R2, R3, R5, R6, R7, X 및 Y 또는 상응하는 비보호 또는 보호된 모이어티 R2*, R3*, R5*, R6*, R7*, X* 및 Y*가, 화학식 I의 생성된 화합물 또는 그의 염에서,
A1이 그의 α-카르복실 기의 카르보닐을 통해 아미노 기에 및 그의 α-아미노 기를 통해 화학식 I에서의 X에 결합된 L-글루타민의 2가 모이어티이거나, 또는 2S-(2-히드록시-3-포스포노옥시)-프로피오닐이고;
R2가 메틸이고;
R3이 이소프로필, 이소부틸 또는 벤질이고;
R5가 sec-부틸 또는 벤질이고;
R6이 4-히드록시벤질이고;
R7이 이소프로필 또는 sec-부틸이고;
X가 아세틸 또는 이소부티릴이거나, 또는 A1이 2S-(2-히드록시-3-포스포노옥시)-프로피오닐인 경우에는 부재하고;
Y가 메틸이도록
선택되는 것인 방법. - 제1항 내지 제10항 중 어느 한 항에 있어서, 존재하는 경우에
기호 A1, R2, R3, R5, R6, R7, X 및 Y 또는 상응하는 비보호 또는 보호된 모이어티 R2*, R3*, R5*, R6*, R7*, X* 및 Y*가, 화학식 I의 생성된 화합물 또는 그의 염에서,
A1이 그의 α-카르복실 기의 카르보닐을 통해 화학식 I에서의 A1의 우측에서 아미노 기에 및 그의 α-아미노 기를 통해 X에 결합된 L-글루타민의 모이어티이고;
R2가 메틸이고;
R3이 이소부틸이고;
R5가 sec-부틸이고;
R6이 4-히드록시벤질이고;
R7이 sec-부틸이고;
X가 이소부티릴이고;
Y가 메틸이도록
선택되는 것인 방법 또는 공정. - 제1항 내지 제12항 중 어느 한 항에 있어서, 각 중간체가 서로 독립적으로 유리 또는 염 형태로 사용되거나 또는 존재하는 것인 방법 또는 공정.
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