KR20140147982A - 레티노이드 생산에 관여하는 효소를 코딩하는 유전자를 포함하는 미생물 및 이를 이용한 레티노이드의 생산 방법 - Google Patents
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Abstract
본 발명은 레티노이드 생산에 관여하는 효소를 코딩하는 유전자를 포함하는 미생물 및 이를 이용한 레티노이드의 생산 방법에 관한 것으로, 보다 상세하게는 레티노이드 생산에 관여하는 효소를 코딩하는 유전자를 포함함으로써, 안전하면서 우수한 효율로 레티노이드를 대량 생산할 수 있는 미생물 및 이를 이용한 레티노이드의 생산 방법에 관한 것이다.
Description
본 발명은 레티노이드 생산에 관여하는 효소를 코딩하는 유전자를 포함하는 미생물 및 이를 이용한 레티노이드의 생산 방법에 관한 것이다.
레티노이드는 비타민 A와 화학적으로 관련된 친지질성 이소프레노이드 분자의 클래스이다. 레티노이드는 알코올(예를 들면, 레티놀), 알데히드 (예를 들면, 레티날), 카르복실산 (예를 들면, 레티노산), 또는 에스테르 (예를 들면, 레티닐 아세테이트) 기능기와 함께, β-이논 고리 및 다불포화(polyunsaturated) 곁사슬로 구성된다. 이들은 시력보호, 골 발달 및 재생, 항산화 효과와 더불어 피부 노화 방지와 같은 인체 건강에 있어 필수적인 역할을 하고 특정 암의 위험을 감소시킨다고 알려져 있다.
레티노이드는 최근 수년간 주름개선 및 피부 질환 치료를 위한 효과적인 화장품 및 의약품 원료로서 큰 관심을 받아 왔다. 레티노이드 시장 규모는 세계적으로 약 160억불 정도로 추정된다. 화학적으로 합성된 레티노이드는 대표적인 상업적 원료이다. 레티놀은 펜타디엔 유도체의 환원에 의해 화학적으로 합성된 레티날의 산성화 또는 가수분해로부터 생산된다. 그러나 이러한 화학적 과정은 복잡한 정제 단계 및 원하지 않는 부산물 형성과 같은 단점을 갖는다. 동물은 과일 및 야채로부터 얻은 카로티노이드로부터 레티노이드를 생산하는 반면, 식물은 레티노이드를 합성할 수 없다. 레티노이드 합성의 전체 경로는 보조기(prosthetic group)로서 레티날을 갖는 박테리오로돕신 또는 프로테오로돕신을 포함하는 미생물에서만 가능하다. 그러나, 미생물은 레티날의 단백질 결합 형태를 생산하므로 자유 레티노이드의 대량 생산에는 적합하지 않다. 지금까지 생물학적 생산을 위해서 효소를 이용한 일부 제한적인 시도가 있었지만 성공적인 결과는 없었다. 따라서, 대사적으로 형질전환된 미생물을 사용하는, 레티노이드 생산을 위한 생명공학적 방법의 개발이 필요하다.
레티노이드는 그의 반응성 있는 콘쥬게이트된 이중 결합으로 인해 화학적으로 매우 불안정하고, 열, 산소 및 빛에 의해 쉽게 산화되고 이성체화된다. 또한 레티노이드는 생물학적으로 레티노산을 통해 쉽게 분해된다. 따라서, 레티노이드를 보다 효율적으로 생산하는 방법이 요구되고 있다.
한국공개특허 제2008-42387호에는 이소프레노이드와 카로티노이드 생합성 유전자로 형질전환된 대장균 및 이를 이용한 아스타잔틴의 대량 생산방법이 개시되어 있다.
본 발명은 안전하면서 우수한 효율로 레티노이드를 생산할 수 있는 미생물을 제공하는 것을 목적으로 한다.
본 발명은 이러한 미생물을 이용하여 레티노이드를 생산하는 방법을 을 제공하는 것을 목적으로 한다.
1. 레티노이드 생산에 관여하는 효소를 코딩하는 유전자를 포함하는 사카로마이세스 속 미생물.
2. 위 1에 있어서, 상기 유전자는 서열번호 2 내지 9로 이루어진 군에서 선택되는 적어도 하나의 아미노산 서열을 코딩하는 것인, 미생물.
3, 위 1에 있어서, 상기 유전자는 서열번호 2, 3 및 10 중 적어도 하나; 서열번호 4 및 11 중 적어도 하나; 서열번호 5, 6 및 12 중 적어도 하나; 서열번호 7; 서열번호 8; 및 서열번호 9, 13 및 21 중 적어도 하나;의 아미노산 서열을 코딩하는 것인, 미생물.
4. 위 3에 있어서, 서열번호 1의 아미노산 서열을 코딩하는 유전자를 더 포함하는, 미생물.
5. 위 1에 있어서, 사카로마이세스 세레비지에인, 미생물.
6. 위 1에 있어서, 사카로마이세스 세레비지에 Y2805인, 미생물.
7. 레티노이드 생산에 관여하는 효소를 코딩하는 유전자를 포함하는 코리네박테리움 속 미생물.
8. 위 7에 있어서, 상기 유전자는 서열번호 2 내지 9로 이루어진 군에서 선택되는 적어도 하나의 아미노산 서열을 코딩하는 것인, 미생물.
9. 위 7에 있어서, 상기 유전자는 서열번호 2, 3 및 10 중 적어도 하나; 서열번호 4 및 11 중 적어도 하나; 서열번호 5, 6 및 12 중 적어도 하나; 서열번호 7; 서열번호 8; 및 서열번호 9, 13 및 21 중 적어도 하나;의 아미노산 서열을 코딩하는 것인, 미생물.
10. 위 9에 있어서, 서열번호 14 및 15 중 적어도 하나의 아미노산 서열을 코딩하는 유전자를 더 포함하는, 미생물.
11. 위 9에 있어서, 서열번호 16 내지 20의 아미노산 서열을 코딩하는 유전자를 더 포함하는, 미생물.
12. 위 7에 있어서, 서열번호 22 내지 24로 이루어진 군에서 선택된 적어도 하나의 아미노산 서열을 코딩하는 유전자를 불활성화 또는 결손화한, 미생물.
13. 위 7에 있어서, 코리네박테리움 글루타미쿰인, 미생물.
14. 위 7에 있어서, 코리네박테리움 글루타미쿰 ATCC13032인, 미생물.
15. 위 1 내지 14 중 어느 한 항에 있어서, 유전자는 벡터에 의해 도입된 것인, 미생물.
16. 위 1 내지 15 중 어느 한 항의 미생물을 배양하는 단계; 및 상기 미생물의 배양물로부터 레티노이드를 분리하는 단계를 포함하는 레티노이드의 생산 방법.
17. 위 16에 있어서, 상기 미생물의 배양은 친유성 물질을 포함하는 배지 중에서 수행되는 것인, 방법.
18. 위 17에 있어서, 상기 분리는 친유성 물질 상으로부터 되는 것인, 방법.
19. 위 17에 있어서, 상기 친유성 물질은 옥탄, 데칸, 도데칸, 테트라데칸, 피토스쿠알란, 미네랄 오일, 이소프로필 미리스테이트, 세틸 에틸헥사노에이트, 디옥타노일 데카노일 글리세롤, 스쿠알란, 또는 이들의 조합인, 방법.
본 발명의 레티노이드 생산에 관여하는 효소를 코딩하는 유전자를 포함하는 미생물은 안전하면서도 우수한 효율로 레티노이드를 대량생산할 수 있다.
본 발명의 미생물을 이용한 레티노이드 생산 방법을 통해 얻어진 레티노이드는 화장품, 식품, 의약품 등의 소재로 널리 활용될 수 있고, 화장품, 식품, 의약품 등의 제조를 위해 특정 레티노이드의 효과적인 생산이 필요할 경우 본 발명의 레티노이드 생산 방법을 활용하기 적합하다.
도 1은 β-카로틴의 레티날, 레티놀, 레티노산, 및 레티닐 에스테르를 포함하는 레티노이드로의 변환을 나타낸 도면이다.
도 2는 레티날 생합성의 MEP 경로 및 외래의 MVA 경로를 도식적으로 나타낸 도면이다.
도 3은 레티노이드 표준화합물(A)과 사카로마이세스(B)를 통해 생산된 레티노이드의 HPLC 피크를 나타낸 것이다.
도 4는 레티노이드 표준화합물(A, C)과 사카로마이세스에서 생산된 레티노이드(B, D)의 LC-MS 피크를 나타낸 것이다.
도 5는 레티노이드 표준화합물(A)과 코리네박테리움(B)를 통해 생산된 레티노이드의 HPLC 피크를 나타낸 것이다.
도 2는 레티날 생합성의 MEP 경로 및 외래의 MVA 경로를 도식적으로 나타낸 도면이다.
도 3은 레티노이드 표준화합물(A)과 사카로마이세스(B)를 통해 생산된 레티노이드의 HPLC 피크를 나타낸 것이다.
도 4는 레티노이드 표준화합물(A, C)과 사카로마이세스에서 생산된 레티노이드(B, D)의 LC-MS 피크를 나타낸 것이다.
도 5는 레티노이드 표준화합물(A)과 코리네박테리움(B)를 통해 생산된 레티노이드의 HPLC 피크를 나타낸 것이다.
본 발명은 레티노이드 생산에 관여하는 효소를 코딩하는 유전자를 포함함으로써, 안전하면서 우수한 효율로 레티노이드를 대량 생산할 수 있는 미생물 및 이를 이용한 레티노이드의 생산 방법에 관한 것이다.
이하, 본 발명을 보다 상세히 설명한다.
본 발명은 레티노이드 생산능을 갖는 미생물을 제공한다.
용어 "레티노이드 (retinoids)"는 비타민 A에 화학적으로 관련된 화학물질의 부류를 나타낸다. 레티노이드의 구조는 시클릭 말단기, 폴리엔 측쇄 및 극성 말단기로 구성된다. 상기 폴리엔 측쇄의 C=C 이중결합이 교대로 되어 형성된 공액 시스템 (conjugated system)은 레티노이드의 색 (보통 노란색, 오렌지 또는 적색)을 띄게 한다. 많은 레티노이드는 발색소(chromophore)이다. 측쇄 및 말단기를 변화시킴으로써 다양한 레티노이드가 생성될 수 있다. 상기 레티노이드는 레티날, 레티놀, 레티노산, 레티닐 아세테이트, 또는 이들의 조합일 수 있다. 또한, 상기 레티노이드는 레티날, 레티놀, 레티노산, 레티닐 아세테이트, 또는 이들의 조합의 생체 내 분해 산물일 수 있다.
상기 미생물은 사카로마이세스 속 또는 코리네박테리움 속 일 수 있다.
사카로마이세스 속 미생물은 특별히 한정되지 않고 레티노이드 생산능에 따라 적절히 선택될 수 있으며, 예를 들면 사카로마이세스 세레비지에일 수 있고, 바람직하게는 사카로마이세스 세레비지에 Y2805일 수 있다.
코리네박테리움 속 미생물은 특별히 한정되지 않고 레티노이드 생산능에 따라 적절히 선택될 수 있으며, 예를 들면 코리네박테리움 글루타미쿰일 수 있고, 바람직하게는 코리네박테리움 글루타미쿰 ATCC13032(Corynebacterium glutamcium ATCC13032, taxid: 196627; GenBank NID: NC_003450, ATCC13032)일 수 있다.
본 발명의 레티노이드 생산능을 갖는 미생물은 레티노이드 생산에 관여하는 효소를 코딩하는 유전자를 포함한다.
본 발명에서 레티노이드 생산에 관여하는 효소는 레티노이드의 생산에 필요한 효소, 레티노이드의 생산량을 증가시키는 효소 또는 이들의 조합을 총칭한다.
상기 유전자는 서열번호 2의 판토에아 아글로메란스(Pantoea agglomerans) 유래의 제라닐제라닐 피로포스페이트(GGPP) 신타제의 아미노산 서열, 서열번호 3의 시네코시스티스 종 PCC6803(Synechocystis sp. PCC6803) 유래의 제라닐제라닐 피로포스페이트(GGPP) 신타제의 아미노산 서열, 서열번호 4의 판토에아 아글로메란스 유래의 피토엔 신타제의 아미노산 서열, 서열번호 5의 판토에아 아글로메란스 유래의 피토엔 디히드로게나제의 아미노산 서열, 서열번호 6의 로도수도모나스 팔러스트리스(Rhodopseudomonas palustris) 유래의 피토엔 데히드로게나제의 아미노산 서열, 서열번호 7의 판토에아 아나나티스(Pantoea ananatis) 유래의 라이코펜-베타-시클라제의 아미노산 서열, 서열번호 8의 배양되지 않는 해양 세균 66A03(uncultured marine bacterium 66A03) 유래의 베타-카로틴 모노옥시게나제의 아미노산 서열 및 서열번호 9의 크로노박터 사카자키(Cronobacter sakazakii) 유래의 IPP 이소머라제의 아미노산 서열 등을 코딩하는 것일 수 있다. 이들은 단독 또는 2종 이상 조합하여 사용할 수 있다.
본 발명의 레티노이드 생산능을 갖는 미생물이 사카로마이세스 속인 경우에는, 바람직하게는 상기 유전자는 서열번호 2, 3 및 10 중 적어도 하나; 서열번호 4 및 11 중 적어도 하나; 서열번호 5, 6 및 12 중 적어도 하나; 서열번호 7; 서열번호 8; 및 서열번호 9, 13 및 21 중 적어도 하나;의 아미노산 서열을 코딩하는 것일 수 있다. 그러한 경우에, 보다 효율적으로 레티노이드를 생산하여 생산량을 극대화할 수 있다.
서열번호 10은 내재적인 GGPP 신타제의 아미노산 서열, 서열번호 11은 내재적인 피토엔 신타제의 아미노산 서열, 서열번호 12는 내재적인 피토엔 디히드로게나제의 아미노산 서열, 서열번호 13은 코리네박테리움 글루타미쿰 유래의 이소펜테닐 디포스페이트 (IPP) 이소머라제의 아미노산 서열, 서열번호 21은 대장균 유래의 이소펜테닐 디포스페이트 (IPP) 이소머라제의 아미노산 서열이다.
또한, 사카로마이세스 속 미생물은 서열번호 1의 사카로마이세스 세레비지에 (Saccharomyces cerevisiae) 유래의 하이드록시메틸글루타릴(HMG)-CoA 리덕타제의 아미노산 서열을 코딩하는 유전자를 더 포함할 수 있다. 이는 레티노이드 생산량을 더욱 촉진하는 역할을 한다.
본 발명의 레티노이드 생산능을 갖는 미생물이 코리네박테리움 속인 경우에는, 바람직하게는 상기 유전자는 서열번호 2, 3 및 10 중 적어도 하나; 서열번호 4 및 11 중 적어도 하나; 서열번호 5, 6 및 12 중 적어도 하나; 서열번호 7; 서열번호 8; 및 서열번호 9, 13 및 21 중 적어도 하나;의 아미노산 서열을 코딩하는 것일 수 있다. 그러한 경우에, 보다 효율적으로 레티노이드를 생산하여 생산량을 극대화할 수 있다.
또한, 코리네박테리움 속 미생물은 서열번호 14의 대장균 유래 1-데옥시자일룰로즈-5-포스페이트 (DXP) 신타제의 아미노산 서열, 서열번호 15의 내재적인 1-데옥시자일룰로즈-5-포스페이트 (DXP) 신타제의 아미노산 서열 등을 코딩하는 유전자를 더 포함할 수 있다. 이들은 단독 또는 2종 이상 조합하여 사용할 수 있다. 이는 레티노이드 생산량을 더욱 촉진하는 역할을 한다.
DXP는 내재적 MEP 경로에서 속도 결정 단계에 해당하는 효소이므로, 본 발명의 미생물은 DXP 신타제의 아미노산 서열을 코딩하는 유전자를 더 포함함으로써 베타-카로틴을 고농도로 생산할 수 있다. 도 1은 β-카로틴의 레티날, 레티놀, 레티노산, 및 레티닐 에스테르를 포함하는 레티노이드로의 변환을 나타낸다.
또한, 코리네박테리움 속 미생물은 내재적으로 MEP 경로를 가지고 있는 것이나, 아세틸-CoA로부터 IPP를 생산하는데 관여하는 외래 메발로네이트 경로의 효소를 코딩하는 유전자를 더 포함할 수 있다. 도 2는 레티날 생합성의 MEP 경로 및 외래의 MVA 경로를 도식적으로 나타낸 도면이다.
상기 외래 메발로네이트 경로의 효소를 코딩하는 유전자는 예를 들면, 서열번호 16의 엔테로코커스 패칼리스 (Enterococcus faecalis) 유래의 아세틸-CoA 아세틸트란스퍼라제/하이드록시메틸글루타릴 (HMG)-CoA 리덕타제의 아미노산 서열, 서열번호 17의 엔테로코커스 패칼리스 유래의 HMG-CoA 신타제의 아미노산 서열, 서열번호 18의 스트렙토코커스 뉴모니애 (Streptococcus pneumoniae) 유래의 메발로네이트 키나제의 아미노산 서열, 서열번호 19의 스트렙토코커스 뉴모니애 유래의 포스포메발로네이트 키나제의 아미노산 서열, 서열번호 20의 스트렙토코커스 뉴모니애 유래의 메발로네이트 디포스페이트 데카르복실라제의 아미노산 서열 등을 코딩하는 것일 수 있다. 이들은 단독 또는 2종 이상 조합하여 사용할 수 있다
IPP 이소머라제는 카로테노이드 또는 이소프레노이드 생합성 과정에서 이소프렌 단위의 조합 비율, 즉, 각각의 이소프렌 단위에 대하여 IPP와 DMAPP의 비율을 조절하는 결정적인 역할을 한다.
또한, 본 발명의 미생물은 상기 IPP로부터 베타-카로틴을 합성하는데 관여하는 효소를 코딩하는 유전자가 추가적으로 도입된 것일 수 있고, 두 카피의 IPP 이소머라제가 도입되어 IPP로부터 DMAPP로의 전환이 촉진된 것일 수 있다. 따라서, 상기 미생물은 베타-카로틴을 고농도로 생산할 수 있다.
상기 유전자는 당업계에 알려진 임의의 방법에 의하여 도입되는 것일 수 있다. 상기 유전자는 예를 들면, 벡터에 의하여 도입되는 것일 수 있다.
용어 "벡터"란 연결되어 있는 다른 핵산을 전달할 수 있는 핵산 분자를 의미한다. 특정한 유전자의 도입을 매개하는 핵산 서열이라는 관점에서, 본 발명에서 벡터는, 핵산 구조체, 및 카세트와 상호 교환 가능하게 사용될 수 있는 것으로 해석된다.
벡터에는 예를 들면 플라스미드 또는 바이러스 유래 벡터 등이 포함된다. 플라스미드란 추가의 DNA가 연결될 수 있는 원형의 이중가닥 DNA 고리를 말한다. 본 발명에서 사용되는 벡터에는 예를 들면, 플라스미드 발현벡터, 플라스미드 셔틀벡터, 바이러스 발현벡터(예, 복제결함 레트로바이러스 벡터, 레트로바이러스 벡터, 아데노바이러스 벡터, 헤르페스 심플렉스 바이러스 벡터, 폭스바이러스 벡터, 렌티바이러스 벡터, 아데노 연관 바이러스 벡터 등) 및 이들과 동등한 기능을 수행할 수 있는 바이러스 벡터가 포함되나 이들에 한정되는 것은 아니다.
본 발명은 미생물은 레티노이드의 생산능을 촉진하기 위해 특정 유전자를 활성화시키거나, 불활성화 또는 결손한 것일 수 있다. 예를 들어, 코리네박테리움 속 미생물은 서열번호 22 내지 24로 이루어진 군에서 선택된 적어도 하나의 아미노산 서열을 코딩하는 유전자를 불활성화 또는 결손한 것일 수 있다.
코리네박테리움 속 미생물은 내재적인 crtEb 유전자가 코딩하는 서열번호 24의 아미노산 서열을 갖는 프레닐 트랜스퍼라제에 의해 라이코펜으로부터 플라부크산틴(flavuxanthin)을 합성하고, 합성된 플라부크산틴은 내재적인 crtYe 및 crtYf 유전자가 각각 코딩하는 서열번호 23 및 24의 서열을 갖는 카로티노이드-엡실론-시클라아제(carotenoid-ε-cyclase) 에 의해 데카프레노크산틴으로 전환된다.
본 발명은 서열번호 22 내지 24로 이루어진 군에서 선택된 적어도 하나의 아미노산 서열을 코딩하는 유전자를 불활성화 또는 결손시킴으로써, 데카프레노크산틴 생산을 억제하고 라이코펜을 축적시켜, 이를 최종 산물인 레티노이드의 전구체로 이용할 수 있다.
용어 "결손" 또는 "불활성화"란 상기 유전자의 발현이 감소되거나 발현이 이루어지지 않는 것을 의미한다. 상기 "불활성화"는 당업계에 알려진 방법에 의하여 이루어질 수 있다. 예를 들면, 상동 재조합 (homologuous recombination)에 의하여 불활성화된 것일 수 있다. 상기 상동 재조합은 예를 들면, 전이인자 돌연변이 (transposon mutagenesis) 또는 P1 형질도입 (P1 transduction)에 의하여 매개된 것일 수 있다.
서열번호 1의 아미노산 서열을 코딩하는 유전자(HMG1)는 서열번호 25의 뉴클레오티드 서열을 갖고, 서열번호 2의 아미노산 서열을 코딩하는 유전자(crtE)는 서열번호 26의 뉴클레오티드 서열을 갖고, 서열번호 3의 아미노산 서열을 코딩하는 유전자(crtE)는 서열번호 27의 뉴클레오티드 서열을 갖고, 서열번호 4의 아미노산 서열을 코딩하는 유전자(crtB)는 서열번호 28의 뉴클레오티드 서열을 갖고, 서열번호 5의 아미노산 서열을 코딩하는 유전자(crtI)는 서열번호 29의 뉴클레오티드 서열을 갖고, 서열번호 6의 아미노산 서열을 코딩하는 유전자(crtI)는 서열번호 30의 뉴클레오티드 서열을 갖고, 서열번호 7의 아미노산 서열을 코딩하는 유전자(crtY)는 서열번호 31의 뉴클레오티드 서열을 갖고, 서열번호 8의 아미노산 서열을 코딩하는 유전자(SR)는 서열번호 32의 뉴클레오티드 서열을 갖고, 서열번호 9의 아미노산 서열을 코딩하는 유전자(idi)는 서열번호 33의 뉴클레오티드 서열을 갖고, 서열번호 10의 아미노산 서열을 코딩하는 유전자(crtE)는 서열번호 34의 뉴클레오티드 서열을 갖는다.
서열번호 11의 아미노산 서열을 코딩하는 유전자(crtB)는 서열번호 35의 뉴클레오티드 서열을 갖고, 서열번호 12의 아미노산 서열을 코딩하는 유전자(crtI)는 서열번호 36의 뉴클레오티드 서열을 갖고, 서열번호 13의 아미노산 서열을 코딩하는 유전자(idi)는 서열번호 37의 뉴클레오티드 서열을 갖고, 서열번호 14의 아미노산 서열을 코딩하는 유전자(dxs)는 서열번호 38의 뉴클레오티드 서열을 갖고, 서열번호 15의 아미노산 서열을 코딩하는 유전자(dxs)는 서열번호 39의 뉴클레오티드 서열을 갖고, 서열번호 16의 아미노산 서열을 코딩하는 유전자(mvaE)는 서열번호 40의 뉴클레오티드 서열을 갖고, 서열번호 17의 아미노산 서열을 코딩하는 유전자(mvaS)는 서열번호 41의 뉴클레오티드 서열을 갖고, 서열번호 18의 아미노산 서열을 코딩하는 유전자(mvaK1)는 서열번호 42의 뉴클레오티드 서열을 갖고, 서열번호 19의 아미노산 서열을 코딩하는 유전자(mvaK2)는 서열번호 43의 뉴클레오티드 서열을 갖고, 서열번호 20의 아미노산 서열을 코딩하는 유전자(mvaD)는 서열번호 44의 뉴클레오티드 서열을 갖는다.
서열번호 21의 아미노산 서열을 코딩하는 유전자(idi)는 서열번호 45의 뉴클레오티드 서열을 갖고, 서열번호 22의 아미노산 서열을 코딩하는 유전자(crtYe)는 서열번호 46의 뉴클레오티드 서열을 갖고, 서열번호 23의 아미노산 서열을 코딩하는 유전자(crtYf)는 서열번호 47의 뉴클레오티드 서열을 갖고, 서열번호 24의 아미노산 서열을 코딩하는 유전자(crtEb)는 서열번호 48의 뉴클레오티드 서열을 갖는다.
또한, 본 발명은 레티노이드의 생산능을 갖는 미생물을 이용하여 레티노이드를 생산하는 방법을 제공한다.
본 발명의 일 구현예에 따라 본 발명의 레티노이드의 생산 방법을 단계별로 상세히 설명한다.
먼저, 상기 레티노이드 생산능을 갖는 미생물을 배양한다.
배양은 합성, 반합성, 또는 복합 배양 배지에서 수행될 수 있다.
배양 배지는 특별히 한정되지 않으며, 탄소원, 질소원, 비타민 및 미네랄로 구성된 배지를 사용할 수 있다. 예를 들어, MRS (Man-Rogosa-Sharp) 액체 배지, 우유가 첨가된 액체 배지 등을 사용할 수 있다.
배지의 탄소원으로는 예를 들면 전분, 포도당, 자당, 갈락토스, 과당, 글리세롤 및 이들의 혼합물로 이루어진 군으로부터 선택된 것을 사용할 수 있으며, 바람직하게는 포도당 또는 갈락토스를 사용할 수 있다.
배지의 질소원으로는 예를 들면 황산암모늄, 질산암모늄, 질산나트륨, 글루탐산, 카사미노산, 사카로마이세스추출물, 펩톤, 트립톤, 대두박 및 이들의 혼합물로 이루어진 군으로부터 선택된 것을 사용할 수 있으며, 미네랄은 예를 들면 염화나트륨, 인산제이칼륨, 황산마그네슘 및 이들의 혼합물로 이루어진 군으로부터 선택된 것을 사용할 수 있다.
배지 내에서 탄소원, 질소원 및 미네랄의 함량은 특별히 한정되지 않으며, 예를 들면 리터당 10 내지 100g, 5 내지 40g 및 0.5 내지 4 g일 수 있다.
비타민은 예를 들면, 비타민 B, 비타민 C, 비타민 D, 비타민 E 및 이들의 혼합물로 이루어진 군으로부터 선택될 수 있다. 비타민은 탄소원, 질소원, 미네랄 등의 배지와 동시에 첨가하거나, 멸균하여 준비된 배지에 첨가할 수 있다.
배양은 통상의 사카로마이세스 속 또는 코리네박테리움 속의 배양 조건 하에 수행될 수 있으며, 예를 들면 15 내지 45℃에서 24 내지 96시간 동안 수행될 수 있다.
배양액 중의 배양 배지를 제거하고 농축된 균체만을 분리하거나 제거하기 위해 원심분리 또는 여과과정을 거칠 수 있으며 이러한 단계는 당업자의 필요에 따라 수행할 수 있다. 농축된 균체는 통상적인 방법에 따라 냉동하거나 냉동건조하여 그 활성을 잃지 않도록 보존할 수 있다.
레티노이드 생산능을 갖는 미생물이 사카로마이세스 속인 경우, 배양은 탄소원으로서 포도당과 갈락토스를 포함하는 배지에서 수행될 수 있다. 갈락토스는 도입된 유전자의 프로모터 발현을 촉진하므로, 갈락토스를 포함하는 배지에서 배양시 레티노이드의 생산이 더욱 촉진된다.
갈락토스를 포함하는 배지의 갈락토스 함량은 특별히 한정되지 않고 프로모터의 발현을 충분히 촉진하면서 최적의 생육을 나타낼 수 있도록 적절히 선택될 수 있으며, 예를 들면 0.5 내지 2부피%로 포함될 수 있고, 바람직하게는 0.5 내지 1.5부피%로 포함될 수 있다.
상기 배지는 예를 들면, 펩톤 0.5 내지 4중량%, 사카로마이세스 추출물 0.5 내지 2중량%, 포도당 0.5 내지 2부피%, 갈락토스 0.5 내지 2부피%를 포함하는 것일 수 있다.
레티노이드 생산능을 갖는 미생물이 코리네박테리움 속인 경우, 배양은 탄소원으로서 포도당을 포함하는 배지에서 수행될 수 있다.
포도당을 포함하는 배지의 포도당 함량은 특별히 한정되지 않고 최적의 생육을 나타낼 수 있도록 적절히 선택될 수 있으며, 예를 들면 0.5 내지 2부피%로 포함될 수 있고, 바람직하게는 0.5 내지 1.5부피%로 포함될 수 있다.
상기 배지는 예를 들면, 리터 당 K2HPO4 0.5 내지 2g, (NH4)2SO4 5 내지 20g, MgSO47H2O 0.1 내지 1g, FeSO47H2O 5 내지 40mg, MnSO4H2O 5 내지 40mg, NaCl 20 내지 80mg, 요소 0.5 내지 4g, 비오틴 0.05 내지 0.5mg 및 티아민 0.05 내지 0.5mg을 포함하는 것일 수 있다.
본 발명에 따른 레티노이드 생산능을 갖는 미생물의 배양은 친유성 물질 존재하의 배양 배지에서 수행될 수 있다. 그러한 경우에 상기 미생물을 배지 표면의 친유성 물질 상(phase)에 위치시켜 배양한다.
레티노이드 생산능을 갖는 미생물로부터의 레티노이드의 생산량은 일정 시점에서 최고치를 나타내고 그 이후에는 점차 감소한다. 이는 미생물 성장의 정체 상태 동안 추가적인 레티노이드의 합성은 중단되고, 세포 내에서 레티노이드의 산화적 분해가 일어나기 때문이다.
그러나 친유성 물질은 생성된 레티노이드가 세포 내에서 분해되기 전에 흡수함으로써, 레티노이드 생산 효율을 개선할 수 있다.
친유성 물질은 상기 기능을 할 수 있으면서 미생물의 성장에 영향을 미치지 않는 것이라면 특별히 한정되지 않으며, 예를 들면 옥탄, 데칸, 도데칸, 테트라데칸, 피토스쿠알란, 미네랄 오일, 이소프로필 미리스테이트, 세틸에틸헥사노에이트, 디옥타노일 데카노일 글리세롤, 스쿠알란, 또는 이들의 조합일 수 있고, 바람직하게는 데칸, 도데칸, 중량 미네랄 오일, 또는 이들의 조합일 수 있다.
상기 친유성 물질은 미생물의 성장에 영향을 미치지 않으면서, 소수성 레티노이드 추출을 위해 소수성이고 낮은 휘발성을 갖는 것일 수 있다.
본 발명의 미생물이 사카로마이세스 속인 경우 도데칸 또는 데칸을 포함하는 배지, 코리네박테리움 속인 경우 중량 미네랄 오일을 포함하는 배지에서 배양하는 것이 보다 바람직하다.
친유성 물질의 배지 내에서의 함량은 상기 기능을 다 할 수 있는 범위 내라면 특별히 한정되지 않으며, 예를 들면 배지 대 친유성 물질의 부피비가 1:0.1-3.0, 1:0.2-3.0, 1:0.5-3.0, 1:1.0-3.0, 1:1.5-3.0, 1:2.0-3.0, 1:2.5-3.0, 1:0.2-2.5, 1:0.2-2.0, 1:0.2-1.5, 1:0.2-1.0, 1:0.2-0.5, 1:0.5-2.5, 1:0.5-2.0, 1:0.5-1.5, 1:0.5-1.0, 1:0.8-2.5, 1:0.8-2.0, 1:0.8-1.5, 1:0.8-1.2, 1:0.8-1.0 등이 가능하다.
배양은 교반되는 상태로 수행될 수 있다.
교반되는 경우, 100 내지 300rpm, 예를 들면, 100 내지 280rpm, 100 내지 260rpm, 100 내지 240rpm, 100 내지 220rpm, 100 내지 200rpm, 100 내지 180rpm, 100 내지 160rpm, 100 내지 140rpm, 100 내지 120rpm, 120 내지 300rpm, 120 내지 280rpm, 120 내지 260rpm, 120 내지 240rpm, 120 내지 220rpm, 120 내지 200rpm, 120 내지 180rpm, 120 내지 160rpm, 120 내지 140rpm, 150 내지 300rpm, 150 내지 280rpm, 150 내지 260rpm, 150 내지 240rpm, 150 내지 220rpm, 150 내지 200rpm, 150 내지 180rpm, 140 내지 160rpm, 200 내지 300rpm, 200 내지 280rpm, 200 내지 260rpm, 200 내지 240rpm, 200 내지 220rpm 또는 100 내지 150 rpm으로 교반될 수 있다.
배양이 친유성 물질을 포함하는 배지에서 수행되는 경우, 교반 시에 상기 친유성 물질은 배지 중에서 분산되어 세포와 접촉된다. 친유성 물질은 배지 중에 분산됨으로써 미생물과 접촉하는 면적이 넓어져 배양 중 레티노이드를 효율적으로 세포로부터 분리되게 하여 안정화 및/또는 용해시킬 수 있다.
이후, 상기 미생물의 배양물로부터 레티노이드를 분리한다.
미생물의 배양이 친유성 물질 존재하의 배양 배지에서 수행된 경우에는, 분리는 친유성 물질 상으로부터 수행된다.
레티노이드를 분리하는 방법은 특별히 한정되지 않고 당 분야에 공지된 방법에 의할 수 있으며, 예를 들면 원심분리, 여과, 결정화, 이온교환 크로마토그래피, 고성능 액체크로마토그래피(HPLC 등의 방법을 들 수 있다. 구체적으로, 균체를 분리한 후에 아세톤 등의 용매를 이용한 추출 후에 고순도의 제품을 얻기 위해서는 HPLC 또는 결정화 작업등을 통한 분리정제가 진행될 수 있다.
레티노이드는 화장품, 식품 또는 의약품의 소재로 널리 활용된다.
이하, 본 발명을 구체적으로 설명하기 위해 실시예를 들어 상세하게 설명하기로 한다.
실시예
1-1.
사카로마이세스
세레비지에
형질전환체의 제조
사카로마이세스 세레비지에를 레티노이드를 생산하도록 형질전환하기 위하여 우선 레티노이드 생산 유전자 6 종을 프로모터와 종결자(terminator)를 갖는 벡터의 프로모터와 종결자 사이에 도입하여 생산유전자가 각각 프로모터와 종결자를 갖도록 한 벡터 6종을 제조하였다.
상기 재조합 벡터로부터 중합효소연쇄반응(PCR)을 이용하여 GAL10 프로모터와 GAL7 종결자를 갖는 각각의 유전자를 증폭하고 이를 대장균-사카로마이세스 셔틀벡터에 순차적으로 도입하여 최종적으로 레티노이드 생산용 재조합 셔틀벡터를 제조하였다.
상기 재조합 셔틀벡터를 사카로마이세스 세레비지에에 형질전환하여 레티노이드 생산능을 갖는 사카로마이세스 형질전환체를 제조하였다. 상기 내용을 아래의 항목에서 상세히 설명하도록 한다.
(1)
레티노이드
생산에 관여하는 유전자를 포함하는 재조합 셔틀 벡터의 제조
사카로마이세스 세레비지에를 레티노이드를 생산능을 갖도록 형질전환하기 위하여 우선 레티노이드 생산 유전자 6 종을 프로모터와 종결자(terminator)를 갖는 벡터의 프로모터와 종결자 사이에 도입하여 이들 유전자가 각각 프로모터와 종결자를 갖도록 한 벡터 6종을 제조하였다.
레티노이드 생산에 관여하는 유전자 6종의 정보는 하기 표 1에 나타내었고, 해당 유전자를 증폭하기 위한 프라이머는 하기 표 2에 나타내었다.
프라이머 1과 2를 이용하여 사카로마이세스 세레비지에의 게놈으로부터 HMG1 유전자를 증폭한 후 제한 효소 EcoRI과 SalI으로 절단 하고 이를 동일 제한효소로 처리한 YEGα-HIR525(KCTC 8519P, Choi et al., Appl. Microbial. biotechnol., 1994, 42, 587)에 도입하여 재조합 벡터 pGAL-HMG1를 제조하였다.
프라이머 3과 4를 이용하여 판토에아 아글로메란스의 게놈으로부터 crtE를 증폭한 후 제한 효소 EcoRI과 SalI으로 절단하고 이를 동일한 제한효소로 처리한 YEGα-HIR525 벡터에 도입하여 pGAL-YEPAcrtE를 제조하였다.
프라이머 5와 6을 이용하여 판토에아 아글로메란스의 게놈으로부터 crtB를 증폭한 후 제한 효소 EcoRI과 SalI으로 절단하고 이를 동일한 제한효소로 처리한 YEGα-HIR525 벡터에 도입하여 pGAL-YEPAcrtB를 제조하였다.
프라이머 7과 8을 이용하여 판토에아 아글로메란스의 게놈으로부터 crtI를 증폭한 후 제한 효소 EcoRI과 SalI으로 절단하고 이를 동일한 제한효소로 처리한 YEGα-HIR525 벡터에 도입하여 pGAL-YEPAcrtI를 제조하였다.
프라이머 9와 10을 이용하여 판토에아 아나나티스의 게놈으로부터 crtY를 증폭한 후 제한 효소 EcoRI과 SalI으로 절단하고 이를 동일한 제한효소로 처리한 YEGα-HIR525 벡터에 도입하여 pGAL-YEPAUcrtY를 제조하였다.
프라이머 11과 12를 이용하여 pT-DHBSR 재조합 플라스미드 벡터 (HJ Jang et al, 2011, Microbial Cell Factories, 10:59)로부터 SR을 증폭한 후 제한 효소 EcoRI과 SalI으로 절단하고 이를 동일한 제한효소로 처리한 YEGα-HIR525 벡터에 도입하여 pGAL-YESYNSR을 제조하였다.
서열번호 | 유전자명 | 효소명 | 참고문헌 또는 Genbank 허가번호 |
1 | HMG1 | HMG-CoA 리덕타제 | 10-2009-0104505 |
2 | crtE | 제라닐제라닐 피로포스페이트 신타제 | M87280 |
4 | crtB | 피토엔 신타제 | M87280 |
5 | crtI | 피토엔 데히드로게나제 | M87280 |
7 | crtY | 라이코펜 베타-시클라제 | D90087 |
8 | SR | 베타-카로틴 모노옥시게나제 | HJ Jang et al, 2011, Microbial Cell Factories, 10:59 |
프라이머 번호 | 염기서열 (5'-3') | 서열번호 |
1 | GCGCGAATTCATGGACCAATTGGTGAAAACTGAAGTC | 49 |
2 | GCGCGTCGACTTTTAGGATTTAATGCAGGTGACGGAC | 50 |
3 | GCGCGAATTCAAAAATGGTGAGTGGCAGTAAAGCGG | 51 |
4 | GCGCGTCGACTTAGGCGATTTTCATGACCGGTG | 52 |
5 | GCGCGAATTCAAAAATGAGCCAACCGCCGCTG | 53 |
6 | GCGCGTCGACTTAAACGGGACGCTGCCAAAG | 54 |
7 | GCGCGAATTCAAAAATGAAAAAAACCGTTGTGATTGG | 55 |
8 | GCGCGTCGACTTATTGCAGATCCTCAATCATCAGG | 56 |
9 | GCGCGAATTCAAAAATGCAACCGCATTATGATCTGATTC | 57 |
10 | GCGCGTCGACTTAACGATGAGTCGTCATAATGGCTTG | 58 |
11 | GCGCGAATTCAAAAATGGGTCTGATGCTGATTGATTGG | 59 |
12 | GCGCGTCGACTTAGTTTTTGATTTTGATACGGGAAGAG | 60 |
상기 제조한 재조합 플라스미드 벡터 pGAL-YEPAcrtE, pGAL-HMG1, pGAL-YEPAcrtI, pGAL-YEPAcrtB, pGAL-YEPAUcrtY, pGAL-YESYNSR로부터 하기 표 3의 프라이머를 이용하여 각각 6종의 GAL10 프로모터와 GAL7 종결자를 가진 유전자를 증폭하였으며, 이를 상기에서 사용한 YEGα-HIR525 셔틀벡터에 순차적으로 도입하였다.
상세히 설명하면 우선 프라이머 13과 14를 이용하여 pGAL-YEPAcrtE 으로부터 GAL10 프로모터와 GAL7 종결자를 가진 crtE를 증폭하여 제한효소 KpnI과 NotI으로 절단한 후 동일 효소로 절단한 YEGα-HIR525 셔틀벡터에 삽입하였다.
프라이머 15와 16을 이용하여 pGAL-HMG1으로부터 GAL10 프로모터와 GAL7 종결자를 가진 HMG1을 증폭하여 제한효소 NotI과 SpeI으로 절단한 후 상기 제조한 재조합 벡터의 동일 제한부위에 삽입하였다.
프라이머 17과 18을 이용하여 pGAL-YEPAcrtI로부터 GAL10 프로모터와 GAL7 종결자를 가진 crtI를 증폭하여 제한효소 EcoRV와 NheI으로 절단한 후 상기 제조한 재조합 벡터의 동일 제한부위에 삽입하였다.
프라이머 19와 20을 이용하여 pGAL-YEPAcrtB로부터 GAL10 프로모터와 GAL7 종결자를 가진 crtB를 증폭하여 제한효소 NheI과 BglII로 절단한 후 상기 제조한 재조합 벡터의 동일 제한부위에 삽입하였다.
프라이머 21과 22를 이용하여 pGAL-YEPAUcrtY로부터 GAL10 프로모터와 GAL7 종결자를 가진 crtY를 증폭하여 제한효소 BamHI과 PacI으로 절단한 후 상기 제조한 재조합 벡터의 동일 제한부위에 삽입하였다.
프라이머 23과 24를 이용하여 pGAL-YESYNSR로부터 GAL10 프로모터와 GAL7 종결자를 가진 SR을 증폭하여 제한효소 PacI과 XbaI으로 절단한 후 상기 제조한 재조합 벡터의 동일 제한부위에 최종적으로 삽입하여 사카로마이세스에서 레티노이드를 생합성 하도록 제조된 재조합 셔틀벡터 pGAL-EHIBYSR을 제조하였다.
프라이머 번호 | 염기서열 (5'-3') | 서열번호 |
13 | GCGCGCGGCCGCATCGCTTCGCTGATTAATTACCCC | 61 |
14 | GCGCACTAGTACAATGAGCCTTGCTGCAACATC | 62 |
15 | GCGCGGTACCATCGCTTCGCTGATTAATTACCCC | 63 |
16 | GCGCGCGGCCGCACAATGAGCCTTGCTGCAACATC | 64 |
17 | GCGCGATATCACTAGTATCGCTTCGCTGATTAATTACCCC | 65 |
18 | GCGCGCTAGCACAATGAGCCTTGCTGCAACATC | 66 |
19 | GCGCGCTAGCATCGCTTCGCTGATTAATTACCCC | 67 |
20 | GCGCAGATCTACAATGAGCCTTGCTGCAACATC | 68 |
21 | GCGCGGATCCATCGCTTCGCTGATTAATTAC | 69 |
22 | GCGCTTAATTAAACAATGAGCCTTGCTGCAACATC | 70 |
23 | GCGCTTAATTAAATCGCTTCGCTGATTAATTACCCC | 71 |
24 | GCGCTCTAGAGGGGAAACTTAAAGAAATTCTATTCTTG | 72 |
(2) 제조된 재조합 셔틀벡터를 이용한 형질전환체의 제조
사카로마이세스 세레비지에 Y2805 균주를 3 mL YPD(리터당 펩톤 20g, 사카로마이세스 추출물 10g, 포도당 20g)배지에 30℃에서 250rpm으로 교반하며 종배양(seed)을 한 뒤, 다음 날 50mL YPD 배지에 종배양액 0.5 mL을 접종하여 30℃에서 180rpm으로 교반하며 3시간 동안 본배양(main)을 하였다.
배양액을 3,000rpm, 4℃ 조건으로 5분간 원심분리하여 상층액은 제거하고, 균체를 25 mL의 1X TE/ 0.1M LiAC 버퍼(10mM Tris-HCl, 1mM EDTA, 100mM LiAC, pH 7.5)로 1회 세척한 후, 0.5mL의 1X TE/ 0.1M LiAC 버퍼에 재현탁하여 수용성 세포(competent cell)를 얻었다.
제조된 수용성 세포 100㎕, 벡터 5㎕, salmon sperm DNA (carrier DNA, Sigma D9156, USA) 5㎕와 0.6mL PEG/LiAC(40% PEG3350 (Quiagen NeXtal Stock PEG3350 (200), Cat. No. 133083), 10mM Tris-HCl, 1mM EDTA, 100mM LiAC, pH 7.5)를 섞은 뒤 혼합액을 30℃에서 30분간 방치 후, 100㎕의 DMSO를 넣고 다시 혼합하였다. 제조된 세포 혼합액을 42℃에서 15분간 열충격 처리 후, 얼음에서 5분을 식히고 4℃에서 1분간 원심분리 후 상층액을 제거하였다. 얻어진 펠렛을 200㎕의 TE 버퍼(10mM Tris-HCl, 1mM EDTA, pH 7.5)에 재현탁하여 선택배지인 UD 고체배지(리터 당 Yeast nitrogen base without Amino Acids (DifcoTM, Cat. No. 291940) 6.7 g, -Ura DO Supplement(Clontech Cat. No. 630416) 0.77g, 덱스트로즈 20g, 한천 20g, pH 5.8)에 도말 한 뒤, 30℃에서 2일간 배양하여 형질전환체를 제조하였다.
실시예
1-2.
사카로마이세스
형질전환체로부터
레티노이드의
생산
(1)
사카로마이세스
형질전환체의 배양
UD 배지 3mL에 단일 집락을 접종하고, 30℃에서 250rpm으로 교반하며 종배양하였다.
본배양은 실험군으로서 갈락토스를 함유하는 YPDG 배지(리터 당 펩톤 20g, 사카로마이세스 추출물 10g, 포도당 10g 및 갈락토스 10g)를 사용하였으며, 그에 대한 대조군으로 갈락토스를 함유하지 않은 YPD 배지 (리터 당 펩톤 20g, 사카로마이세스 추출물 10g, 포도당 20g)를 이용하였다. 배양은 YPDG 배지와 YPD 배지를 300mL 홈이 파인 플라스크(baffled flask)에 25mL씩 분주한 뒤, 레티노이드 생산의 2-상(two-phase) 배양에서, 5mL의 도데칸(Cat. No. 297879, Sigma, USA)을 배양 배지 25 mL 위에 위치시켰다.
초기 배양한 균주를 균체 농도를 OD600nm가 0.1이 되도록 접종하였고, 30℃에서 180rpm으로 교반하면서 96시간 동안 배양하였다. 세포 성장은 배양 72시간 후에 600nm(OD600nm)에서 광학 밀도를 측정함으로써 평가하였다.
(2)
레티노이드의
고성능 액체크로마토그래피(
HPLC
) 분석
도데칸 씌움을 갖는 2-상 배양에서, 레티노이드를 포함하는 도데칸 상을 수집하여 14,000rpm에서 10분 동안 원심분리시켜 모든 세포 파편들을 제거한 후에 HPLC 분석에 사용하였다. 도데칸 상을 검출 파장 370nm(레티날) 및 340nm(레티놀 및 레티닐 아세테이트)에서 HPLC(LC-20A, Shimadzu, Kyoto,Japan)로 분석하였다. 분석은 Sentry Guard C18(15mm×4.6mm, 5m)을 갖는 Symmetry C18(250mm×4.6mm, 5m)의 HPLC 컬럼을 사용하여 수행하였다. 이동상으로 부피비 95:5의 메탄올 및 아세토니트릴을 사용하였다. HPLC 분석은 이동상의 유동 속도는 1.0ml/분, 컬럼 온도는 40℃ 조건하에서 수행하였다.
레티날(Cat. No. R2500), 레티놀(Cat. No. R7632) 및 레티닐 아세테이트(Cat. No. R4632)를(Sigma사) 아세톤에 용해시켜 표준 화합물로서 사용하였다(도 3 (A)).
도 3을 참조하면, 상기 형질전환체에서 생산된 레티노이드(도 3 (B))의 피크가 표준화합물로 사용한 레티놀, 레티날 및 레티날 아세테이트 (도 3 (A))와 동일한 머무름 시간에 주요하게 나타나는 것을 확인할 수 있다. 이에 따라, 상기 형질전환체에서 생산된 레티노이드는 표준화합물로서의 레티노이드와 같은 성분으로 판명되었다.
(3)
레티노이드의
액페크로마토그래피
-질량(
LC
-
MS
/
MS
) 분석
상기의 사카로마이세스 형질전환체로부터 생산된 레티노이드를 분석하기 위하여 액체크로마토그래피-질량분석(LC-MS/MS)을 실시하였다.
상기 형질전환체의 배양액 중의 도데칸 상을 취하여 이를 진공 증발시키고, 증발 전 도데칸 상과 동일 중량의 메탄올에 용해하여 이온포획 질량 분석기(Ion Trap Mass Spectrometer)를 이용하여 생산된 레티노이드의 성분을 분석하였다.
LC-MS 분석에는 Sentry Guard C18(15mm×4.6mm, 5m)을 갖는 Symmetry C18(250mm×4.6mm, 5m) 칼럼과 분석 기기로 AB SCIEX Qtrap 3200(AB SCIEX사)을 사용하였다. 이동상으로 부피비 95:5의 메탄올 및 아세토니트릴을 사용하였다.
HPLC 분석은 이동상의 유동 속도는 1.0ml/분, 컬럼 온도는 30℃ 조건하에서 수행하였다.
레티놀 (Cat. No. R7632) 및 레티닐 아세테이트 (Cat. No. R4632)(Sigma사)를 메탄올에 용해시켜 이를 표준 화합물로서 사용하였다.
분석 결과는 도 4에 나타내었다.
도 4을 참조하면, 상기 형질전환체에서 생산된 레티노이드(도 4 (B), (D))의 피크가 표준화합물로 사용한 레티놀(도 4 (A))과 레티닐 아세테이트(도 4 (C))와 동일한 머무름 시간에 주요하게 나타나는 것을 확인할 수 있다.
이에 따라, 상기 형질전환체에서 생산된 레티노이드는 표준화합물로서의 레티노이드와 같은 성분으로 판명되어, 본 발명의 미생물이 레티노이드를 유효하게 생산해 낼 수 있음을 확인하였다.
(4) 배양 결과
배양 결과는 하기 표 4에 나타내었다.
구분 | 균체 농도(OD600nm) | 레티날 (㎍/L) | 레티놀 (㎍/L) | 레티닐 아세테이트(㎍/L) |
실험군 | 22.76 ± 0.5 | 36 ± 0.67 | 2.8 ± 0.52 | 32.1 ± 2.6 |
대조군 | 18.6 ± 1.2 | 19.6 ± 0.96 | 1.49 ± 0.1 | 30.6 ± 0.98 |
상기 표 4를 참조하면, 배양 72시간 후의 균체 농도(OD600nm)는 갈락토스를 포함하는 배지에서 배양한 실험군이 22.8로서 갈락토스를 포함하지 않은 배지에서 배양한 대조군의 18.6보다 높은 것을 확인할 수 있다.
실험군은 레티날 36㎍/L, 레티놀 2.8㎍/L, 레티닐 아세테이트 32.1㎍/L를 생산하여 총 레티노이드를 약 71㎍/L를 생산하였으나, 대조군은 레티날 19.6㎍/L, 레티놀 1.49㎍/L, 레티닐 아세테이트 30.6㎍/L를 생산하여 총 레티노이드를 약 51.7㎍/L 생산하였다.
형질전환체의 총 레티노이드 생산량을 균체농도로 나누었을 때 실험군은 3.11, 대조군은 2.78로 실험군이 더 높게 나타나, 갈락토스를 첨가한 배지에서 배양한 실험군에서 레티노이드 생산에 관여하는 효소의 발현이 유도된 것을 확인하였다.
실시예
2-1.
코리네박테리움
형질전환체의 제조
또한 상기와 같이 라이코펜이 축적되는 형질전환체를 제조한 후 이종적으로(heterologous) 선별된 레티노이드 생합성 유전자인 crtE, crtB, crtI, idi, crtY, BCMO를 포함하는 셔틀벡터를 도입하여 레티노이드를 생산할 수 있는 코리네박테리움 형질전환체를 제조하였다. 이에 대하여 하기 항목을 통하여 상세히 설명하도록 한다.
(1)
코리네박테리움
글루타미쿰의
카로티노이드-엡실론-
시클라아제를
코딩하는 유전자
crtYe
/f의 불활성화
데카프레노크산틴 생산을 억제하고 라이코펜을 축적시키기 위하여 서열번호 22와 서열번호 23의 아미노산 서열을 코딩하는 crtYe/f 유전자(군)를 불활성화 하였다.
crtYe/f 유전자를 불활성하기 위해 자살 벡터(suicide vector) pK19mobsacB를 사용하였다("Handbook of Corynebacterium glutamicum", Lothar Eggeling 등, ISBN 0-8493-1821-1, 2005 by CRC press).
프라이머 25와 26을 이용하여 crtYe/f 유전자의 업스트림(upstream) 부분인 1036bp를 증폭하였고, 프라이머 27과 28을 이용하여 crtYe/f 유전자의 다운스트림(downstream) 부분인 1057bp를 증폭하였다.
증폭된 두 가지 PCR 산물을 주형으로 사용하고 프라이머 25과 28을 이용하여 PCR 증폭하여 crtYe/f 유전자를 결손시키고, 21bp 링커 서열을 가진 2102bp 길이의 PCR 산물을 얻었다. 얻어진 2102bp 산물을 HindIII와 SbfI으로 절단하여 벡터 pK19mobsacB의 동일 부위에 삽입하여 재조합 자살벡터 pK19mobsacB-KOY를 제조하였다.
제조된 재조합 벡터를 Handbook of Corynebacterium glutamicum에 기재된 방법으로 코리네박테리움 글루타미쿰 ATCC13032에 형질전환시켰다.
2 단계의 상동성 재조합(homologous recombination)을 통해 특정한 유전자 부위를 결손하는 방법은 "Handbook of Corynebacterium glutamicum"(published in 2005 by CRC press)에 보고되어 있다.
첫 번째 재조합은 결손을 위해 상기에서 제조한 pK19mobsacB-KOY 플라스미드를 코리네박테리움에 형질전환 할 경우 일어난다. 이때 벡터 서열이 게놈에 삽입(integration)되는데 이는 카나마이신 저항성을 통해 선별할 수 있으며, 재조합 벡터가 삽입된 게놈을 가진 균주는 sacB 유전자에 의해 레반수크레아제(levansurase)를 생성하기 때문에 10% 수크로스(sucrose)가 있는 경우 민감성을 보인다. 또한 첫 번째 재조합체는 하기 표 5의 프라이머 29와 30을 이용하여 PCR 증폭을 할 경우, 169bp와 987bp 크기의 PCR 산물을 얻는 것으로 재조합을 한번 더 확인 할 수 있다.
두 번째 재조합에 의해 유전자 결손을 위한 재조합 벡터는 제거되며 이는 수크로스에 저항성이 있는 것으로 선별하였다. 상세히 설명하면, 두 번째 재조합을 위하여 5㎖ BHI 배지(리터 당 calf brains(송아지 뇌) 12.5g, beef heart(소 심장) 5g, 펩톤 10g, 염화나트륨 5g, 글루코스 2g, 인산수소이나트륨 2.5g)에 첫 번째 재조합체를 접종하여 30℃에서 250rpm으로 교반하여 12시간 배양하였다.
BHI 배지를 이용하여 10-3, 10-4, 10-5배로 배양액을 희석한 뒤 100㎕씩 10% sucrose를 포함하는 LB(리터 당 트립톤 10g, 사카로마이세스 추추물 5g 및 염화나트륨 10g) 한천 플레이트에 도말하여 30℃에서 3일간 배양하여 콜로니를 얻었다. 이러한 두 번째 재조합체는 프라이머 29와 30을 이용하여 PCR 증폭을 할 경우, 169bp의 PCR 산물을 얻는 것으로 재조합을 한번 더 확인할 수 있으며 이 클론은 20㎍/㎖ 카나마이신에 민감하여 자라지 못하게 되며, 최종적으로 코리네박테리움 글루타미쿰 ATCC 13032의 crtYe/f 유전자가 불활성화된 ΔcrtYe/f 균주를 제조하였다.
프라이머 번호 | 염기서열 (5'-3') | 서열번호 |
25 | ATAAAGCTTCTTCCTGTCTTCCCGACCCACTAC | 73 |
26 | CCCATCCACTAAACTTAAACAAATTTAATGATCGTATGAGGTCTTTTGAGATG | 74 |
27 | TGTTTAAGTTTAGTGGATGGGTCATGATGGAAAAAATAAGACTAATTCTATTGTC | 75 |
28 | AAACCTGCAGGTGATTCTGTTTTGGTTACTCATCCCG | 76 |
29 | ACTGCCCGAACCATTGCCG | 77 |
30 | AGGCCAGACCAAAGGGGTAGGC | 78 |
(2)
레티노이드
생산에 관여하는 유전자를 포함하는 재조합 셔틀벡터의 제조
코리네박테리움 글루타미쿰에서 레티노이드 생산 유전자군을 발현하기 위하여 대장균-코리네박테리움 셔틀벡터인 pCES208 (J. Microbiol. Biotechnol., 18:639-647, 2008)을 바탕으로 종결자(terminator)와 프로모터가 삽입되어 있는 pSGT208 셔틀벡터를 제조하였다.
상세히 설명하면, 종결자의 삽입을 위하여 pTrc99A 벡터로부터 프라이머 31과 32를 이용하여 유전자를 증폭한 후 제한효소 HindIII와 ClaI으로 절단하고 동일 제한효소로 절단한 pSTV28 (Takara biotech)벡터에 삽입하였다. 상기 재조합 플라스미드에 프로모터 선별과정을 용이하게 하기 위하여 제한부위 및 lacZ 알파 절편을 함유하는 lac 프로모터를 삽입하였다. 이때, lacZ 알파 절편은 프로모터를 대체할 경우 X-gal을 도입하여 식별자로서 기능할 수 있도록 고안된 것이다.
프라이머 33과 34를 이용하여 대장균의 게놈으로부터 lac 프로모터 및 lacZ 알파 절편을 증폭한 후 제한효소 NgoMIV와 EcoRI으로 절단한 후 상기 구축한 재조합 플라스미드의 동일제한효소 부위에 삽입하였다. 이상에서 구축한 재조합 플라스미드로부터 ScaI과 ClaI으로 절단한 후 Klenow 절편효소를 처리하여 blunt 말단을 만든 후 제한효소 NotI과 KpnI으로 절단한 후 blunt 말단을 만든 pCES208 셔틀벡터에 삽입하여 pSGT208 셔틀벡터를 제조하였다.
상기 pSGT208 셔틀벡터는 대장균과 코리네박테리움의 복제원점을 지니며, 카나마이신(kanamycin) 저항성 유전자, 다중제한부위 (multi-cloning site)를 갖고, 프로모터 대체를 용이하게 하기위한 lacZ 알파절편 식별자 및 종결자를 갖도록 구성되었다. 사용된 프라이머의 정보는 표 6 에 나타내었다.
프라이머 번호 | 염기서열 (5'-3') | 서열번호 |
31 | GCTAAGCTTGGCTGTTTTGGCGGATGAGAG | 79 |
32 | CGAATCGATAGAGTTTGTAGAAACGCAAAAAGGCC | 80 |
33 | GCTGCCGGCAGATCTCATATGCCAATACGCAAACCGCCTCTC | 81 |
34 | GCTGAATTCACTAGTGCGGCCGCTTATTCGCCATTCAGGCTGCGC | 82 |
(3) 제조된 재조합 셔틀벡터를 이용한 형질전환체의 제조
상기 제조된 대장균-코리네박테리움 셔틀벡터 pSGT208에 하기 표 7에 나타낸 레티노이드의 합성에 관여하는 6종의 유전자를 표 8에 나타낸 프라이머를 이용하여 순차적으로 도입하였다.
상세히 설명하면 시네코시스티스 종 PCC6803의 게놈으로부터 프라이머 35와 36을 이용하여 crtE를 증폭하여 제한효소 SpeI과 XhoI으로 절단한 후 pSGT208 셔틀벡터의 동일 부위에 삽입하였다.
다음으로 로도수도모나스의 게놈으로부터 프라이머 37과 38을 이용하여 crtI를 증폭하여 XhoI과 NheI으로 절단한 후 상기 제조한 재조합 벡터의 동일 제한부위로 순차적으로 삽입하였다.
다음으로 팔러스트리스판토에아 아글로메란스의 게놈으로부터 프라이머 39와 40을 이용하여 crtB를 증폭하여 NheI과 XbaI으로 절단하고 이를 상기 제조한 재조합 벡터의 동일 부위로 순차적으로 삽입하였다.
다음으로 크로노박터 사카자키의 게놈으로부터 프라이머 41과 42를 이용하여 idi를 증폭한 후 XbaI과 NotI으로 절단 후 상기 제조한 재조합 벡터의 동일 부위로 순차적으로 삽입하였다.
다음으로 판토에아 아나나티스의 게놈으로부터 프라이머 43과 44를 이용하여 crtY를 증폭한 후 SalI과 StuI으로 절단하고 상기 제조한 재조합 벡터의 동일 부위로 순차적으로 삽입하였다.
마지막으로 pT-DHBSR로부터 프라이머 45와 46을 이용하여 SR을 증폭한 후 StuI과 SbfI로 절단한 후 상기 제조한 재조합 벡터의 동일 부위로 삽입하여 레티노이드 생산 유전자가 순차적으로 모두 포함된 재조합 셔틀벡터 pS208-RET를 완성하였다.
서열번호 | 유전자명 | 효소명 | 참고문헌 또는 Ggenbank 허가번호 |
3 | crtE | 제라닐제라닐 피로포스페이트 (GGPP) 신타제 | slr0739, GI:16329282 |
4 | crtB | 피토엔 신타제 | M87280 |
6 | crtI | 피토엔 디히드로게나제 | RPA1512, GI:39934584 |
9 | idi | IPP 이소머라제 | ESA_00346, GI:156932565 |
7 | crtY | 라이코펜-베타-시클라제 | D90087 |
8 | SR | 베타-카로틴 모노옥시게나제 | HJ Jang et al, 2011, Microbial Cell Factories, 10:59 |
프라이머 번호 | 염기서열 (5'-3') | 서열번호 |
35 | CATACTAGTAGGAGGTAATAAATATGGTTGCCCAACAAACACGA | 83 |
36 | CGGCTCGAGTTAATATTTTCTGGCAACAATATATTCGGCG | 84 |
37 | GCTCTCGAGGAGGTAATAAATATGCTCGATCCTGGCCCCAATC | 85 |
38 | GCAGCTAGCTTATGATGTCACCAGACTGTCGGCCTC | 86 |
39 | GCAGCTAGCAGGAGGTAATAAATATGAGCCAACCGCCGCTGC | 87 |
40 | CTCCTCTAGATTACTAAACGGGACGCTGC | 88 |
41 | CCATCTAGAGGAGGTAATAAAATATGAAGGACAAGGAACTGAGC | 89 |
42 | CGTGCGGCCGCTTATTCCTCATCCCCGACGCGC | 90 |
43 | CGGTCGACAGGAGGTAATAAATATGCAACCGCATTATGATCTGATTCTC | 91 |
44 | CGCCTGCAGGAGGCCTTTAACGATGAGTCGTCATAATGGCTTG | 92 |
45 | CGAGGCCTAGGAGGTAATAAATATGGGTCTGATGCTGATTGATTGGTG | 93 |
46 | CGCCTGCAGGTTAGTTTTTGATTTTGATACGGGAAGAGTG | 94 |
상기 제조한 재조합 셔틀 벡터 pS208-RET를 제조한 카로테노이드 엡실론-시클라제를 코딩하는 crtYe와 crtYf가 불활성화된 재조합 코리네박테리움 글루타미쿰인 코리네박테리움 글루타미쿰 ATCC13032ΔcrtYe/f에 Handbook of Corynebacterium glutamicum에 기재된 방법으로 형질전환시켰다.
실시예
2-2.
코리네박테리움
형질전환체로부터
레티노이드의
생산
(1)
코리네박테리움
형질전환체의 배양
2YT 배지 3mL에 단일 집락을 접종하였고, 30℃에서 250rpm으로 교반하며 종배양하였다.
본배양은 구명 최소배지(리터 당 K2HPO4 1g, (NH4)2SO4 10g, MgSO47H2O 0.4g, FeSO47H2O 20mg, MnSO4H2O 20mg, 염화나트륨 50mg, 요소 2g, 비오틴 0.1mg 및 티아민 0.1mg)에 항생제 카나마이신을 20㎍/mL로 사용하였다. 배양은 25mL 배지를 포함하는 홈이 파인 플라스크(baffled flask) 중에서 30℃에서 180rpm으로 교반하며 수행하였다.
레티노이드 생산의 2-상 배양에서, 10mL의 중량 미네랄 오일(Cat. No. 5658-4400, 대정화금, 한국)을 배양 배지 25mL 위에 위치시켰다.
세포 성장은 600nm(OD600)에서 광학 밀도를 측정하였다.
(2)
레티노이드의
고성능 액체크로마토그래피(
HPLC
) 분석
중량 미네랄 오일층을 갖는 2-상 배양에서, 레티노이드를 포함하는 중량 미네랄 오일을 수집하여 14,000rpm에서 10분 동안 원심분리시켜 모든 잔류 세포 파편 및 수용성 물질들을 제거하였다. 그 후 분리된 중량 미네랄 오일 층의 레티노이드를 상온에서 15분간 아세톤 추출하여 14,000rpm에서 10분 동안 원심분리시켜 모든 중량 미네랄 오일 상은 제거한 후 아세톤 추출물을 분석에 사용하였다.
레티노이드를 함유한 아세톤 추출물을 검출 파장 370nm(레티날) 및 340nm(레티놀 및 레티닐 아세테이트)에서 HPLC(LC-20A, Shimadzu, Kyoto,Japan)로 분석하였다.
분석은 Sentry Guard C18(15mm×4.6mm, 5m)을 갖는 Symmetry C18 (250mm×4.6mm, 5m)의 HPLC 컬럼을 사용하여 수행하였다. 이동상으로 부피비 95:5의 메탄올 및 아세토니트릴을 사용하였다. HPLC 분석은 이동상의 유동 속도는 1.5ml/분, 컬럼 온도는 40℃ 조건하에서 수행하였다.
레티날(Cat. No. R2500), 레티놀(Cat. No. R7632) 및 레티닐 아세테이트(Cat. No. R4632)(Sigma사)를 아세톤에 용해시켜 표준 화합물로서 사용하였다(도 5 (A)).
도 5를 참조하면, 상기 형질전환체에서 생산된 레티노이드(도 5 (B))의 피크가 표준화합물로 사용한 레티날(도 3 (A))과 동일한 머무름 시간에 주요하게 나타나는 것을 확인할 수 있다. 이에 따라, 상기 형질전환체에서 생산된 레티노이드는 표준화합물로서의 레티날과 같은 성분으로 판명되었다.
(3) 배양 결과
배양 결과는 하기 표 9에 나타내었다.
구분 | 벡터 | 균체 농도 (OD600nm) | 레티날 (㎍/L) | 레티놀 (㎍/L) | 레티닐 아세테이트(㎍/L) |
실시예 | pS208-RET | 14.9 ± 2.9 | 3277.87 ± 134.79 | - | - |
비교예 | pSGT208 | 9.5 ± 0.5 | - | - | - |
상기 표 9를 참조하면, 48시간 배양한 후의 균체 농도(OD600nm)는 실시예의 레티노이드 생산에 관여하는 효소를 코딩하는 유전자를 포함하는 형질전환체의 경우 15로서, 레티노이드 생산에 관여하는 효소를 코딩하는 유전자를 포함하지 않는 셔틀벡터만이 도입된 비교예의 9.5보다 높은 것을 확인할 수 있다.
실시예는 레티날이 약 3,278㎍/L가 생산되었으나, 비교예는 전혀 생산되지 않았다.
<110> INDUSTRY-ACADEMIC COOPERATION FOUNDATION GYEONGSANG NATIONAL UNIVERSITY
<120> Microorganism including genes coding enzymes involved in the
production of retinoid and preparing method for retinoid using
the same
<130> P2013-189
<160> 94
<170> KopatentIn 2.0
<210> 1
<211> 525
<212> PRT
<213> saccharomyces cerevisiae
<400> 1
Met Asp Gln Leu Val Lys Thr Glu Val Thr Lys Lys Ser Phe Thr Ala
1 5 10 15
Pro Val Gln Lys Ala Ser Thr Pro Val Leu Thr Asn Lys Thr Val Ile
20 25 30
Ser Gly Ser Lys Val Lys Ser Leu Ser Ser Ala Gln Ser Ser Ser Ser
35 40 45
Gly Pro Ser Ser Ser Ser Glu Glu Asp Asp Ser Arg Asp Ile Glu Ser
50 55 60
Leu Asp Lys Lys Ile Arg Pro Leu Glu Glu Leu Glu Ala Leu Leu Ser
65 70 75 80
Ser Gly Asn Thr Lys Gln Leu Lys Asn Lys Glu Val Ala Ala Leu Val
85 90 95
Ile His Gly Lys Leu Pro Leu Tyr Ala Leu Glu Lys Lys Leu Gly Asp
100 105 110
Thr Thr Arg Ala Val Ala Val Arg Arg Lys Ala Leu Ser Ile Leu Ala
115 120 125
Glu Ala Pro Val Leu Ala Ser Asp Arg Leu Pro Tyr Lys Asn Tyr Asp
130 135 140
Tyr Asp Arg Val Phe Gly Ala Cys Cys Glu Asn Val Ile Gly Tyr Met
145 150 155 160
Pro Leu Pro Val Gly Val Ile Gly Pro Leu Val Ile Asp Gly Thr Ser
165 170 175
Tyr His Ile Pro Met Ala Thr Thr Glu Gly Cys Leu Val Ala Ser Ala
180 185 190
Met Arg Gly Cys Lys Ala Ile Asn Ala Gly Gly Gly Ala Thr Thr Val
195 200 205
Leu Thr Lys Asp Gly Met Thr Arg Gly Pro Val Val Arg Phe Pro Thr
210 215 220
Leu Lys Arg Ser Gly Ala Cys Lys Ile Trp Leu Asp Ser Glu Glu Gly
225 230 235 240
Gln Asn Ala Ile Lys Lys Ala Phe Asn Ser Thr Ser Arg Phe Ala Arg
245 250 255
Leu Gln His Ile Gln Thr Cys Leu Ala Gly Asp Leu Leu Phe Met Arg
260 265 270
Phe Arg Thr Thr Thr Gly Asp Ala Met Gly Met Asn Met Ile Ser Lys
275 280 285
Gly Val Glu Tyr Ser Leu Lys Gln Met Val Glu Glu Tyr Gly Trp Glu
290 295 300
Asp Met Glu Val Val Ser Val Ser Gly Asn Tyr Cys Thr Asp Lys Lys
305 310 315 320
Pro Ala Ala Ile Asn Trp Ile Glu Gly Arg Gly Lys Ser Val Val Ala
325 330 335
Glu Ala Thr Ile Pro Gly Asp Val Val Arg Lys Val Leu Lys Ser Asp
340 345 350
Val Ser Ala Leu Val Glu Leu Asn Ile Ala Lys Asn Leu Val Gly Ser
355 360 365
Ala Met Ala Gly Ser Val Gly Gly Phe Asn Ala His Ala Ala Asn Leu
370 375 380
Val Thr Ala Val Phe Leu Ala Leu Gly Gln Asp Pro Ala Gln Asn Val
385 390 395 400
Glu Ser Ser Asn Cys Ile Thr Leu Met Lys Glu Val Asp Gly Asp Leu
405 410 415
Arg Ile Ser Val Ser Met Pro Ser Ile Glu Val Gly Thr Ile Gly Gly
420 425 430
Gly Thr Val Leu Glu Pro Gln Gly Ala Met Leu Asp Leu Leu Gly Val
435 440 445
Arg Gly Pro His Ala Thr Ala Pro Gly Thr Asn Ala Arg Gln Leu Ala
450 455 460
Arg Ile Val Ala Cys Ala Val Leu Ala Gly Glu Leu Ser Leu Cys Ala
465 470 475 480
Ala Leu Ala Ala Gly His Leu Val Gln Ser His Met Thr His Asn Arg
485 490 495
Lys Pro Ala Glu Pro Thr Lys Pro Asn Asn Leu Asp Ala Thr Asp Ile
500 505 510
Asn Arg Leu Lys Asp Gly Ser Val Thr Cys Ile Lys Ser
515 520 525
<210> 2
<211> 307
<212> PRT
<213> Pantoea agglomerans
<400> 2
Met Val Ser Gly Ser Lys Ala Gly Val Ser Pro His Arg Glu Ile Glu
1 5 10 15
Val Met Arg Gln Ser Ile Asp Asp His Leu Ala Gly Leu Leu Pro Glu
20 25 30
Thr Asp Ser Gln Asp Ile Val Ser Leu Ala Met Arg Glu Gly Val Met
35 40 45
Ala Pro Gly Lys Arg Ile Arg Pro Leu Leu Met Leu Leu Ala Ala Arg
50 55 60
Asp Leu Arg Tyr Gln Gly Ser Met Pro Thr Leu Leu Asp Leu Ala Cys
65 70 75 80
Ala Val Glu Leu Thr His Thr Ala Ser Leu Met Leu Asp Asp Met Pro
85 90 95
Cys Met Asp Asn Ala Glu Leu Arg Arg Gly Gln Pro Thr Thr His Lys
100 105 110
Lys Phe Gly Glu Ser Val Ala Ile Leu Ala Ser Val Gly Leu Leu Ser
115 120 125
Lys Ala Phe Gly Leu Ile Ala Ala Thr Gly Asp Leu Pro Gly Glu Arg
130 135 140
Arg Ala Gln Ala Val Asn Glu Leu Ser Thr Ala Val Gly Val Gln Gly
145 150 155 160
Leu Val Leu Gly Gln Phe Arg Asp Leu Asn Asp Ala Ala Leu Asp Arg
165 170 175
Thr Pro Asp Ala Ile Leu Ser Thr Asn His Leu Lys Thr Gly Ile Leu
180 185 190
Phe Ser Ala Met Leu Gln Ile Val Ala Ile Ala Ser Ala Ser Ser Pro
195 200 205
Ser Thr Arg Glu Thr Leu His Ala Phe Ala Leu Asp Phe Gly Gln Ala
210 215 220
Phe Gln Leu Leu Asp Asp Leu Arg Asp Asp His Pro Glu Thr Gly Lys
225 230 235 240
Asp Arg Asn Lys Asp Ala Gly Lys Ser Thr Leu Val Asn Arg Leu Gly
245 250 255
Ala Asp Ala Ala Arg Gln Lys Leu Arg Glu His Ile Asp Ser Ala Asp
260 265 270
Lys His Leu Thr Phe Ala Cys Pro Gln Gly Gly Ala Ile Arg Gln Phe
275 280 285
Met His Leu Trp Phe Gly His His Leu Ala Asp Trp Ser Pro Val Met
290 295 300
Lys Ile Ala
305
<210> 3
<211> 302
<212> PRT
<213> Synechocystis sp. PCC6803
<400> 3
Met Val Ala Gln Gln Thr Arg Thr Asp Phe Asp Leu Ala Gln Tyr Leu
1 5 10 15
Gln Val Lys Lys Gly Val Val Glu Ala Ala Leu Asp Ser Ser Leu Ala
20 25 30
Ile Ala Arg Pro Glu Lys Ile Tyr Glu Ala Met Arg Tyr Ser Leu Leu
35 40 45
Ala Gly Gly Lys Arg Leu Arg Pro Ile Leu Cys Ile Thr Ala Cys Glu
50 55 60
Leu Cys Gly Gly Asp Glu Ala Leu Ala Leu Pro Thr Ala Cys Ala Leu
65 70 75 80
Glu Met Ile His Thr Met Ser Leu Ile His Asp Asp Leu Pro Ser Met
85 90 95
Asp Asn Asp Asp Phe Arg Arg Gly Lys Pro Thr Asn His Lys Val Tyr
100 105 110
Gly Glu Asp Ile Ala Ile Leu Ala Gly Asp Gly Leu Leu Ala Tyr Ala
115 120 125
Phe Glu Tyr Val Val Thr His Thr Pro Gln Ala Asp Pro Gln Ala Leu
130 135 140
Leu Gln Val Ile Ala Arg Leu Gly Arg Thr Val Gly Ala Ala Gly Leu
145 150 155 160
Val Gly Gly Gln Val Leu Asp Leu Glu Ser Glu Gly Arg Thr Asp Ile
165 170 175
Thr Pro Glu Thr Leu Thr Phe Ile His Thr His Lys Thr Gly Ala Leu
180 185 190
Leu Glu Ala Ser Val Leu Thr Gly Ala Ile Leu Ala Gly Ala Thr Gly
195 200 205
Glu Gln Gln Gln Arg Leu Ala Arg Tyr Ala Gln Asn Ile Gly Leu Ala
210 215 220
Phe Gln Val Val Asp Asp Ile Leu Asp Ile Thr Ala Thr Gln Glu Glu
225 230 235 240
Leu Gly Lys Thr Ala Gly Lys Asp Val Lys Ala Gln Lys Ala Thr Tyr
245 250 255
Pro Ser Leu Leu Gly Leu Glu Ala Ser Arg Ala Gln Ala Gln Ser Leu
260 265 270
Ile Asp Gln Ala Ile Val Ala Leu Glu Pro Phe Gly Pro Ser Ala Glu
275 280 285
Pro Leu Gln Ala Ile Ala Glu Tyr Ile Val Ala Arg Lys Tyr
290 295 300
<210> 4
<211> 309
<212> PRT
<213> Pantoea agglomerans
<400> 4
Met Ser Gln Pro Pro Leu Leu Asp His Ala Thr Gln Thr Met Ala Asn
1 5 10 15
Gly Ser Lys Ser Phe Ala Thr Ala Ala Lys Leu Phe Asp Pro Ala Thr
20 25 30
Arg Arg Ser Val Leu Met Leu Tyr Thr Trp Cys Arg His Cys Asp Asp
35 40 45
Val Ile Asp Asp Gln Thr His Gly Phe Ala Ser Glu Ala Ala Ala Glu
50 55 60
Glu Glu Ala Thr Gln Arg Leu Ala Arg Leu Arg Thr Leu Thr Leu Ala
65 70 75 80
Ala Phe Glu Gly Ala Glu Met Gln Asp Pro Ala Phe Ala Ala Phe Gln
85 90 95
Glu Val Ala Leu Thr His Gly Ile Thr Pro Arg Met Ala Leu Asp His
100 105 110
Leu Asp Gly Phe Ala Met Asp Val Ala Gln Thr Arg Tyr Val Thr Phe
115 120 125
Glu Asp Thr Leu Arg Tyr Cys Tyr His Val Ala Gly Val Val Gly Leu
130 135 140
Met Met Ala Arg Val Met Gly Val Arg Asp Glu Arg Val Leu Asp Arg
145 150 155 160
Ala Cys Asp Leu Gly Leu Ala Phe Gln Leu Thr Asn Ile Ala Arg Asp
165 170 175
Ile Ile Asp Asp Ala Ala Ile Asp Arg Cys Tyr Leu Pro Ala Glu Trp
180 185 190
Leu Gln Asp Ala Gly Leu Thr Pro Glu Asn Tyr Ala Ala Arg Glu Asn
195 200 205
Arg Ala Ala Leu Ala Arg Val Ala Glu Arg Leu Ile Asp Ala Ala Glu
210 215 220
Pro Tyr Tyr Ile Ser Ser Gln Ala Gly Leu His Asp Leu Pro Pro Arg
225 230 235 240
Cys Ala Trp Ala Ile Ala Thr Ala Arg Ser Val Tyr Arg Glu Ile Gly
245 250 255
Ile Lys Val Lys Ala Ala Gly Gly Ser Ala Trp Asp Arg Arg Gln His
260 265 270
Thr Ser Lys Gly Glu Lys Ile Ala Met Leu Met Ala Ala Pro Gly Gln
275 280 285
Val Ile Arg Ala Lys Thr Thr Arg Val Thr Pro Arg Pro Ala Gly Leu
290 295 300
Trp Gln Arg Pro Val
305
<210> 5
<211> 492
<212> PRT
<213> Pantoea agglomerans
<400> 5
Met Lys Lys Thr Val Val Ile Gly Ala Gly Phe Gly Gly Leu Ala Leu
1 5 10 15
Ala Ile Arg Leu Gln Ala Ala Gly Ile Pro Thr Val Leu Leu Glu Gln
20 25 30
Arg Asp Lys Pro Gly Gly Arg Ala Tyr Val Trp His Asp Gln Gly Phe
35 40 45
Thr Phe Asp Ala Gly Pro Thr Val Ile Thr Asp Pro Thr Ala Leu Glu
50 55 60
Ala Leu Phe Thr Leu Ala Gly Arg Arg Met Glu Asp Tyr Val Arg Leu
65 70 75 80
Leu Pro Val Lys Pro Phe Tyr Arg Leu Cys Trp Glu Ser Gly Lys Thr
85 90 95
Leu Asp Tyr Ala Asn Asp Ser Ala Glu Leu Glu Ala Gln Ile Thr Gln
100 105 110
Phe Asn Pro Arg Asp Val Glu Gly Tyr Arg Arg Phe Leu Ala Tyr Ser
115 120 125
Gln Ala Val Phe Gln Glu Gly Tyr Leu Arg Leu Gly Ser Val Pro Phe
130 135 140
Leu Ser Phe Arg Asp Met Leu Arg Ala Gly Pro Gln Leu Leu Lys Leu
145 150 155 160
Gln Ala Trp Gln Ser Val Tyr Gln Ser Val Ser Arg Phe Ile Glu Asp
165 170 175
Glu His Leu Arg Gln Ala Phe Ser Phe His Ser Leu Leu Val Gly Gly
180 185 190
Asn Pro Phe Thr Thr Ser Ser Ile Tyr Thr Leu Ile His Ala Leu Glu
195 200 205
Arg Glu Trp Gly Val Trp Phe Pro Glu Gly Gly Thr Gly Ala Leu Val
210 215 220
Asn Gly Met Val Lys Leu Phe Thr Asp Leu Gly Gly Glu Ile Glu Leu
225 230 235 240
Asn Ala Arg Val Glu Glu Leu Val Val Ala Asp Asn Arg Val Ser Gln
245 250 255
Val Arg Leu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Asp Thr Asp Ala Val Ala Ser
260 265 270
Asn Ala Asp Val Val Asn Thr Tyr Lys Lys Leu Leu Gly His His Pro
275 280 285
Val Gly Gln Lys Arg Ala Ala Ala Leu Glu Arg Lys Ser Met Ser Asn
290 295 300
Ser Leu Phe Val Leu Tyr Phe Gly Leu Asn Gln Pro His Ser Gln Leu
305 310 315 320
Ala His His Thr Ile Cys Phe Gly Pro Arg Tyr Arg Glu Leu Ile Asp
325 330 335
Glu Ile Phe Thr Gly Ser Ala Leu Ala Asp Asp Phe Ser Leu Tyr Leu
340 345 350
His Ser Pro Cys Val Thr Asp Pro Ser Leu Ala Pro Pro Gly Cys Ala
355 360 365
Ser Phe Tyr Val Leu Ala Pro Val Pro His Leu Gly Asn Ala Pro Leu
370 375 380
Asp Trp Ala Gln Glu Gly Pro Lys Leu Arg Asp Arg Ile Phe Asp Tyr
385 390 395 400
Leu Glu Glu Arg Tyr Met Pro Gly Leu Arg Ser Gln Leu Val Thr Gln
405 410 415
Arg Ile Phe Thr Pro Ala Asp Phe His Asp Thr Leu Asp Ala His Leu
420 425 430
Gly Ser Ala Phe Ser Ile Glu Pro Leu Leu Thr Gln Ser Ala Trp Phe
435 440 445
Arg Pro His Asn Arg Asp Ser Asp Ile Ala Asn Leu Tyr Leu Val Gly
450 455 460
Ala Gly Thr His Pro Gly Ala Gly Ile Pro Gly Val Val Ala Ser Ala
465 470 475 480
Lys Ala Thr Ala Ser Leu Met Ile Glu Asp Leu Gln
485 490
<210> 6
<211> 511
<212> PRT
<213> Rhodopseudomonas palustris
<400> 6
Met Leu Asp Pro Gly Pro Asn Pro Ala Pro Arg Pro Ser Arg Asp Arg
1 5 10 15
Ala Pro His Ala Val Val Ile Gly Ser Gly Phe Gly Gly Leu Ala Ala
20 25 30
Ala Val Arg Leu Gly Ala Lys Gly Tyr Arg Val Thr Val Leu Glu Lys
35 40 45
Leu Asp Lys Ala Gly Gly Arg Ala Tyr Val His Lys Gln Asp Gly Phe
50 55 60
Ser Phe Asp Ala Gly Pro Thr Ile Val Thr Ala Pro Tyr Leu Phe Glu
65 70 75 80
Glu Leu Trp Lys Leu Cys Gly Lys Arg Met Ser Asp Asp Ile Thr Leu
85 90 95
Lys Pro Met Ser Pro Phe Tyr Arg Ile Arg Phe Asp Asp Gly Thr His
100 105 110
Phe Asp Tyr Ser Asp Asp Arg Asp Ala Val Leu Asp Gln Ile Ala Lys
115 120 125
Phe Cys Pro Asp Asp Val Pro Ala Tyr Asp Arg Phe Met Ala Ala Ser
130 135 140
His Glu Ile Phe Lys Val Gly Phe Glu Gln Leu Gly Asp Gln Pro Phe
145 150 155 160
Ser His Phe Thr Asp Met Leu Lys Ile Ala Pro Ala Met Ile Lys Leu
165 170 175
Glu Ser Tyr Arg Ser Val Tyr Gly Leu Val Ala Lys His Phe Lys Asp
180 185 190
Pro Lys Leu Arg Gln Val Phe Ser Phe His Pro Leu Leu Ile Gly Gly
195 200 205
Asn Pro Phe Met Ser Ser Ser Val Tyr Cys Leu Ile Thr Tyr Leu Glu
210 215 220
Lys Gln Trp Gly Val His Ser Ala Met Gly Gly Thr Gly Ala Leu Val
225 230 235 240
Thr Gly Leu Val Asn Leu Ile Glu Gly Gln Gly Asn Thr Ile Arg Tyr
245 250 255
Asn Gln Asp Val Arg Gln Ile Val Val Glu Asn Gly Thr Ala Cys Gly
260 265 270
Val Lys Leu Ala Asp Gly Glu Val Ile Lys Ala Asp Ile Val Val Ser
275 280 285
Asn Ala Asp Ser Ala Ser Thr Tyr Arg Tyr Leu Leu Pro Pro Glu Thr
290 295 300
Arg Lys Arg Trp Thr Asp Ala Lys Ile Glu Lys Ser Arg Tyr Ser Met
305 310 315 320
Ser Leu Phe Val Trp Tyr Phe Gly Thr Lys Arg Arg Tyr Glu Asp Val
325 330 335
Lys His His Thr Ile Leu Leu Gly Pro Arg Tyr Lys Glu Leu Ile Ser
340 345 350
Asp Ile Phe Ser Arg Lys Val Val Ala Glu Asp Phe Ser Leu Tyr Leu
355 360 365
His Arg Pro Thr Ala Thr Asp Pro Ser Leu Ala Pro Gln Gly Cys Asp
370 375 380
Thr Phe Tyr Val Leu Ser Pro Val Pro Asn Leu Leu Gly Asp Thr Asp
385 390 395 400
Trp His Thr Lys Ala Glu Thr Tyr Arg Ala Ser Ile Ala Lys Met Leu
405 410 415
Gly Ala Thr Val Leu Pro Asp Leu Glu Asn Gln Ile Ala Thr Ser Lys
420 425 430
Ile Thr Thr Pro Ile Asp Phe Gln Asp Arg Leu Ser Ser Phe Arg Gly
435 440 445
Ala Ala Phe Gly Leu Glu Pro Val Leu Trp Gln Ser Ala Trp Phe Arg
450 455 460
Pro His Asn Gln Ser Glu Asp Val Lys Arg Leu Tyr Leu Val Gly Ala
465 470 475 480
Gly Thr His Pro Gly Ala Gly Leu Pro Gly Val Leu Ser Ser Ala Arg
485 490 495
Val Leu Asp Ala Leu Val Pro Glu Ala Asp Ser Leu Val Thr Ser
500 505 510
<210> 7
<211> 382
<212> PRT
<213> Pantoea ananatis
<400> 7
Met Gln Pro His Tyr Asp Leu Ile Leu Val Gly Ala Gly Leu Ala Asn
1 5 10 15
Gly Leu Ile Ala Leu Arg Leu Gln Gln Gln Gln Pro Asp Met Arg Ile
20 25 30
Leu Leu Ile Asp Ala Ala Pro Gln Ala Gly Gly Asn His Thr Trp Ser
35 40 45
Phe His His Asp Asp Leu Thr Glu Ser Gln His Arg Trp Ile Ala Pro
50 55 60
Leu Val Val His His Trp Pro Asp Tyr Gln Val Arg Phe Pro Thr Arg
65 70 75 80
Arg Arg Lys Leu Asn Ser Gly Tyr Phe Cys Ile Thr Ser Gln Arg Phe
85 90 95
Ala Glu Val Leu Gln Arg Gln Phe Gly Pro His Leu Trp Met Asp Thr
100 105 110
Ala Val Ala Glu Val Asn Ala Glu Ser Val Arg Leu Lys Lys Gly Gln
115 120 125
Val Ile Gly Ala Arg Ala Val Ile Asp Gly Arg Gly Tyr Ala Ala Asn
130 135 140
Ser Ala Leu Ser Val Gly Phe Gln Ala Phe Ile Gly Gln Glu Trp Arg
145 150 155 160
Leu Ser His Pro His Gly Leu Ser Ser Pro Ile Ile Met Asp Ala Thr
165 170 175
Val Asp Gln Gln Asn Gly Tyr Arg Phe Val Tyr Ser Leu Pro Leu Ser
180 185 190
Pro Thr Arg Leu Leu Ile Glu Asp Thr His Tyr Ile Asp Asn Ala Thr
195 200 205
Leu Asp Pro Glu Cys Ala Arg Gln Asn Ile Cys Asp Tyr Ala Ala Gln
210 215 220
Gln Gly Trp Gln Leu Gln Thr Leu Leu Arg Glu Glu Gln Gly Ala Leu
225 230 235 240
Pro Ile Thr Leu Ser Gly Asn Ala Asp Ala Phe Trp Gln Gln Arg Pro
245 250 255
Leu Ala Cys Ser Gly Leu Arg Ala Gly Leu Phe His Pro Thr Thr Gly
260 265 270
Tyr Ser Leu Pro Leu Ala Val Ala Val Ala Asp Arg Leu Ser Ala Leu
275 280 285
Asp Val Phe Thr Ser Ala Ser Ile His His Ala Ile Thr His Phe Ala
290 295 300
Arg Glu Arg Trp Gln Gln Gln Gly Phe Phe Arg Met Leu Asn Arg Met
305 310 315 320
Leu Phe Leu Ala Gly Pro Ala Asp Ser Arg Trp Arg Val Met Gln Arg
325 330 335
Phe Tyr Gly Leu Pro Glu Asp Leu Ile Ala Arg Phe Tyr Ala Gly Lys
340 345 350
Leu Thr Leu Thr Asp Arg Leu Arg Ile Leu Ser Gly Lys Pro Pro Val
355 360 365
Pro Val Leu Ala Ala Leu Gln Ala Ile Met Thr Thr His Arg
370 375 380
<210> 8
<211> 275
<212> PRT
<213> uncultured marine bacterium 66A03
<400> 8
Met Gly Leu Met Leu Ile Asp Trp Cys Ala Leu Ala Leu Val Val Phe
1 5 10 15
Ile Gly Leu Pro His Gly Ala Leu Asp Ala Ala Ile Ser Phe Ser Met
20 25 30
Ile Ser Ser Ala Lys Arg Ile Ala Arg Leu Ala Gly Ile Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Leu Leu Leu Ala Thr Ala Phe Phe Leu Ile Trp Tyr Gln Leu Pro
50 55 60
Ala Phe Ser Leu Leu Ile Phe Leu Leu Ile Ser Ile Ile His Phe Gly
65 70 75 80
Met Ala Asp Phe Asn Ala Ser Pro Ser Lys Leu Lys Trp Pro His Ile
85 90 95
Ile Ala His Gly Gly Val Val Thr Val Trp Leu Pro Leu Ile Gln Lys
100 105 110
Asn Glu Val Thr Lys Leu Phe Ser Ile Leu Thr Asn Gly Pro Thr Pro
115 120 125
Ile Leu Trp Asp Ile Leu Leu Ile Phe Phe Leu Cys Trp Ser Ile Gly
130 135 140
Val Cys Leu His Thr Tyr Glu Thr Leu Arg Ser Lys His Tyr Asn Ile
145 150 155 160
Ala Phe Glu Leu Ile Gly Leu Ile Phe Leu Ala Trp Tyr Ala Pro Pro
165 170 175
Leu Val Thr Phe Ala Thr Tyr Phe Cys Phe Ile His Ser Arg Arg His
180 185 190
Phe Ser Phe Val Trp Lys Gln Leu Gln His Met Ser Ser Lys Lys Met
195 200 205
Met Ile Gly Ser Ala Ile Ile Leu Ser Cys Thr Ser Trp Leu Ile Gly
210 215 220
Gly Gly Ile Tyr Phe Phe Leu Asn Ser Lys Met Ile Ala Ser Glu Ala
225 230 235 240
Ala Leu Gln Thr Val Phe Ile Gly Leu Ala Ala Leu Thr Val Pro His
245 250 255
Met Ile Leu Ile Asp Phe Ile Phe Arg Pro His Ser Ser Arg Ile Lys
260 265 270
Ile Lys Asn
275
<210> 9
<211> 347
<212> PRT
<213> Cronobacter sakazakii
<400> 9
Met Lys Asp Lys Glu Leu Ser Gln Arg Lys Asn Asp His Leu Asp Ile
1 5 10 15
Val Leu His Pro Glu Arg Ala Lys Gln Thr Ile Arg Thr Gly Phe Glu
20 25 30
Gln Trp Arg Phe Glu His Cys Ala Leu Pro Glu Leu Ala Leu Asp Asp
35 40 45
Ile Asp Leu Ser Thr Arg Leu Phe Gly Arg Val Met Lys Ala Pro Leu
50 55 60
Leu Ile Ser Ser Met Thr Gly Gly Ala Arg Arg Ala Ser Asp Ile Asn
65 70 75 80
Arg His Leu Ala Glu Ala Ala Gln Thr Leu Gly Leu Ala Met Gly Val
85 90 95
Gly Ser Gln Arg Val Ala Leu Glu Ser Glu Asp Asn Trp Gly Leu Thr
100 105 110
Gly Glu Leu Arg Arg Tyr Ala Pro Asp Ile Pro Leu Leu Ala Asn Leu
115 120 125
Gly Ala Ala Gln Ile Gly Ser Leu Gln Gly Leu Asp Tyr Ala Arg Arg
130 135 140
Ala Val Glu Met Val Glu Ala Asp Ala Leu Ile Ile His Leu Asn Pro
145 150 155 160
Leu Gln Glu Ala Leu Gln Thr Gly Gly Asp Arg Asp Trp Arg Gly Val
165 170 175
Leu Ala Ala Ile Lys Arg Val Val Asn Ala Leu Ser Val Pro Val Val
180 185 190
Val Lys Glu Val Gly Ala Gly Leu Ser Val Pro Val Ala Arg Gln Leu
195 200 205
Ala Glu Ala Gly Val Thr Met Leu Asp Val Ala Gly Ala Gly Gly Thr
210 215 220
Ser Trp Ala Ala Val Glu Gly Glu Arg Ala Ala Ser Asp His Ala Arg
225 230 235 240
Ser Val Ala Met Ala Phe Ala Asp Trp Gly Ile Pro Thr Ala Gln Ala
245 250 255
Leu Arg Gln Ile His Gln Ala Phe Pro Ser Met Pro Leu Ile Ala Ser
260 265 270
Gly Gly Ile Arg Asp Gly Ile Asp Thr Ala Lys Ala Leu Ala Met Gly
275 280 285
Ala Ser Leu Val Gly Gln Ala Ala Ala Val Leu Gly Ser Ala Thr Thr
290 295 300
Ser Thr Ser Ala Val Leu Asp His Phe Ala Val Val Ile Glu Gln Leu
305 310 315 320
Arg Val Ala Cys Phe Cys Thr Gly Ser Ala Ser Leu Ser Ala Leu Arg
325 330 335
Glu Ala Arg Leu Ala Arg Val Gly Asp Glu Glu
340 345
<210> 10
<211> 382
<212> PRT
<213> Corynebacterium glutamicum
<400> 10
Leu Arg Asp Asn Trp Pro Cys Asp Thr Arg Met Asp Asn Gly Met Thr
1 5 10 15
Ile Thr Thr Glu His Ser Thr His Pro Asp Leu Asp Phe Asn Asp Glu
20 25 30
Ile Tyr Arg Glu Leu Asn Arg Ile Cys Ala Ser Leu Ser Gln Gln Cys
35 40 45
Ser Thr Tyr Gln Pro Glu Phe Arg Thr Cys Leu Asp Ala Ala Phe Gln
50 55 60
Ala Leu Arg Gly Gly Lys Leu Ile Arg Pro Arg Met Leu Leu Gly Leu
65 70 75 80
Tyr Asn Thr Leu Val Asp Asp Asp Ile Glu Val Lys Leu Asn Thr Val
85 90 95
Leu Gln Val Ala Val Ala Leu Glu Leu Leu His Phe Ser Leu Leu Val
100 105 110
His Asp Asp Val Ile Asp Gly Asp Leu Tyr Arg Arg Gly Lys Leu Asn
115 120 125
Phe Ile Gly Gln Ile Leu Met His Arg Thr Pro Glu Ser Phe Ala Gln
130 135 140
Ile Gln Arg Asp Pro Glu His Leu Asp Trp Ala Gln Ser Asn Gly Leu
145 150 155 160
Leu Met Gly Asn Leu Phe Leu Ala Ala Thr His Gln Ile Phe Ala Arg
165 170 175
Leu Asp Leu Pro His His Gln Arg Val Arg Leu Leu Asp Leu Leu Asn
180 185 190
His Thr Ile Asn Asp Thr Ile Val Gly Glu Phe Leu Asp Val Gly Leu
195 200 205
Ser Ser Lys Ala Ile Ser Pro Asn Met Asp Ile Ala Leu Glu Met Ser
210 215 220
Arg Leu Lys Thr Ala Thr Tyr Thr Phe Glu Leu Pro Met Arg Ala Ala
225 230 235 240
Ala Ile Leu Ala Glu Leu Pro Gln Glu Ile Glu Thr Lys Ile Gly Glu
245 250 255
Ile Gly Thr Asn Leu Gly Ile Ala Tyr Gln Leu Gln Asp Asp Tyr Leu
260 265 270
Ser Thr Phe Gly Asp Ala Ala Glu His Gly Lys Asp Ala Phe Ser Asp
275 280 285
Leu Arg Glu Gly Lys Glu Thr Thr Ile Ile Ala Phe Ala Arg Asp Thr
290 295 300
Ala Lys Trp Thr Asp Ile Gln Asp Asn Phe Gly Ser Ala Asp Leu Ser
305 310 315 320
Thr Ser Gln Ala Glu Arg Ile Gln His Leu Leu Ile Gln Cys Gly Ala
325 330 335
Lys Asn His Ser Leu Asn Ala Ile Ser Asp His Leu Asn Ile Cys Arg
340 345 350
Ser Met Ile Lys Thr Leu Ser Pro Gln Val Asp Pro Lys Ala Gln Asn
355 360 365
Leu Leu Leu Lys Gln Val Glu Gln Leu Ala Ser Arg Lys Ser
370 375 380
<210> 11
<211> 304
<212> PRT
<213> Corynebacterium glutamicum
<400> 11
Met Thr His Gln Asn Ser Pro Leu Phe Leu Lys Ser Ala Leu Arg Leu
1 5 10 15
Tyr Asn Arg Ala Ser Phe Lys Ala Ser His Lys Val Ile Glu Glu Tyr
20 25 30
Ser Thr Ser Phe Ser Leu Ser Thr Trp Leu Leu Ser Pro Arg Ile Arg
35 40 45
Asn Asp Ile Arg Asn Leu Tyr Ala Val Val Arg Ile Ala Asp Glu Ile
50 55 60
Val Asp Gly Thr Ala His Ala Ala Gly Cys Ser Thr Ala Lys Ile Glu
65 70 75 80
Glu Ile Leu Asp Ala Tyr Glu Ile Ala Val Leu Ala Ala Pro Gln Gln
85 90 95
Arg Phe Asn Thr Asp Leu Val Leu Gln Ala Tyr Gly Glu Thr Ala Arg
100 105 110
Arg Cys Asp Phe Glu Gln Glu His Val Ile Ala Phe Phe Ala Ser Met
115 120 125
Arg Lys Asp Leu Lys Ala Asn Thr His Asp Pro Asp Ser Phe Thr Thr
130 135 140
Tyr Val Tyr Gly Ser Ala Glu Val Ile Gly Leu Leu Cys Leu Ser Val
145 150 155 160
Phe Asn Gln Gly Arg Thr Ile Ser Lys Lys Arg Leu Glu Ile Met Gln
165 170 175
Asn Gly Ala Arg Ser Leu Gly Ala Ala Phe Gln Lys Ile Asn Phe Leu
180 185 190
Arg Asp Leu Ala Glu Asp Gln Gln Asn Leu Gly Arg Phe Tyr Phe Pro
195 200 205
Lys Thr Ser Gln Gly Thr Leu Thr Lys Glu Gln Lys Glu Asp Leu Ile
210 215 220
Ala Asp Ile Arg Gln Asp Leu Ala Ile Ala His Asp Ala Phe Pro Glu
225 230 235 240
Ile Pro Val Gln Ala Arg Ile Gly Val Ile Ser Ala Tyr Leu Leu Phe
245 250 255
Gln Lys Leu Thr Asp Arg Ile Glu Ala Thr Pro Thr Ala Asp Leu Leu
260 265 270
Arg Glu Arg Ile Arg Val Pro Leu His Ile Lys Leu Ser Thr Leu Ala
275 280 285
Arg Ala Thr Met Lys Gly Leu Ser Met Ser Ile Tyr Arg Lys Asn Ser
290 295 300
<210> 12
<211> 548
<212> PRT
<213> Corynebacterium glutamicum
<400> 12
Met Lys Val Ser Thr Lys Thr Pro Arg Ser Ser Gly Thr Ala Val Val
1 5 10 15
Ile Gly Ala Gly Val Ala Gly Leu Ala Thr Ser Ala Leu Leu Ala Arg
20 25 30
Asp Gly Trp Gln Val Thr Val Leu Glu Lys Asn Thr Asp Val Gly Gly
35 40 45
Arg Ala Gly Ser Leu Glu Ile Ser Gly Phe Pro Gly Phe Arg Trp Asp
50 55 60
Thr Gly Pro Ser Trp Tyr Leu Met Pro Glu Ala Phe Asp His Phe Phe
65 70 75 80
Ala Leu Phe Gly Ala Cys Thr Ser Asp Tyr Leu Asp Leu Val Glu Leu
85 90 95
Thr Pro Gly Tyr Arg Val Phe Ser Gly Thr His Asp Ala Val Asp Val
100 105 110
Pro Thr Gly Arg Glu Glu Ala Ile Ala Leu Phe Glu Ser Ile Glu Pro
115 120 125
Gly Ala Gly Ala Lys Leu Gly Asn Tyr Leu Asp Ser Ala Ala Asp Ala
130 135 140
Tyr Asp Ile Ala Ile Asp Arg Phe Leu Tyr Asn Asn Phe Ser Thr Leu
145 150 155 160
Gly Pro Leu Leu His Arg Asp Val Leu Thr Arg Ala Gly Arg Leu Phe
165 170 175
Ser Leu Leu Thr Arg Ser Leu Gln Lys Tyr Val Asn Ser Gln Phe Ser
180 185 190
Ser Pro Val Leu Arg Gln Ile Leu Thr Tyr Pro Ala Val Phe Leu Ser
195 200 205
Ser Arg Pro Thr Thr Thr Pro Ser Met Tyr His Leu Met Ser His Thr
210 215 220
Asp Leu Val Gln Gly Val Lys Tyr Pro Ile Gly Gly Phe Thr Ala Val
225 230 235 240
Val Asn Ala Leu His Gln Leu Ala Leu Glu Asn Gly Val Glu Phe Gln
245 250 255
Leu Asp Ser Glu Val Ile Ser Ile Asn Thr Ala Ser Ser Arg Gly Asn
260 265 270
Thr Ser Ala Thr Gly Val Ser Leu Leu His Asn Arg Lys Val Gln Asn
275 280 285
Leu Asp Ala Asp Leu Val Val Ser Ala Gly Asp Leu His His Thr Glu
290 295 300
Asn Asn Leu Leu Pro Arg Glu Leu Arg Thr Tyr Pro Glu Arg Tyr Trp
305 310 315 320
Ser Asn Arg Asn Pro Gly Ile Gly Ala Val Leu Ile Leu Leu Gly Val
325 330 335
Lys Gly Glu Leu Pro Gln Leu Asp His His Asn Leu Phe Phe Ser Glu
340 345 350
Asp Trp Thr Asp Asp Phe Ala Val Val Phe Asp Gly Pro Gln Leu Thr
355 360 365
Arg Pro His Asn Ala Ser Asn Ser Ile Tyr Val Ser Lys Pro Ser Thr
370 375 380
Ser Glu Asp Gly Val Ala Pro Ala Gly Tyr Glu Asn Leu Phe Val Leu
385 390 395 400
Ile Pro Thr Lys Ala Ser Ser Ser Ile Gly His Gly Asp Ala Tyr Met
405 410 415
Gln Ser Ala Ser Ala Ser Val Glu Thr Ile Ala Ser His Ala Ile Asn
420 425 430
Gln Ile Ala Thr Gln Ala Gly Ile Pro Asp Leu Thr Asp Arg Ile Val
435 440 445
Val Lys Arg Thr Ile Gly Pro Ala Asp Phe Glu His Arg Tyr His Ser
450 455 460
Trp Val Gly Ser Ala Leu Gly Pro Ala His Thr Leu Arg Gln Ser Ala
465 470 475 480
Phe Leu Arg Gly Arg Asn Ser Ser Arg Lys Val Asn Asn Leu Phe Tyr
485 490 495
Ser Gly Ala Thr Thr Val Pro Gly Val Gly Ile Pro Met Cys Leu Ile
500 505 510
Ser Ala Glu Asn Ile Ile Lys Arg Leu His Ala Asp Thr Ser Ala Gly
515 520 525
Pro Leu Pro Glu Pro Leu Pro Pro Lys Thr Thr Pro Ser Gln Lys Thr
530 535 540
Ser Tyr Asp His
545
<210> 13
<211> 195
<212> PRT
<213> Corynebacterium glutamicum
<400> 13
Met Ser Lys Leu Arg Gly Met Thr Thr Glu Val Glu Leu Val Val Leu
1 5 10 15
Ala Asp Ser Glu Gly Asn Pro Ile Gly Thr Ala Pro Lys Ala Thr Val
20 25 30
His Thr Lys Asp Thr Pro Leu His Phe Ala Phe Ser Thr Tyr Ile Leu
35 40 45
Asn Pro Arg Gly Glu Leu Leu Val Thr Arg Arg Ala Leu Ser Lys Lys
50 55 60
Thr Trp Pro Gly Val Trp Thr Asn Ser Met Cys Gly His Pro Gly Pro
65 70 75 80
Asp Glu Thr Asn Ala Asp Ala Ile Arg Arg Arg Gly Val Asp Glu Leu
85 90 95
Gly Leu Glu Val Asp Ser Phe Leu Asp Ile Gln Glu Ile Leu Pro Asp
100 105 110
Tyr Gln Tyr Arg Ala Val Asp Ala Ser Gly Ile Val Glu Trp Glu Leu
115 120 125
Cys Pro Val His Leu Val Arg Leu Ala Val Gly Glu Phe Val Glu Pro
130 135 140
Leu Asp Asp Glu Val Glu Glu Phe Glu Trp Ala Glu Pro Gln Lys Leu
145 150 155 160
Phe Asp Ala Val Asp Ala Thr Pro Phe Val Phe Ser Pro Trp Leu Val
165 170 175
Asp Gln Leu Ser Ala Pro Glu Leu Arg Gln Ala Ile Leu Glu Ala Phe
180 185 190
Asp Ala Glu
195
<210> 14
<211> 627
<212> PRT
<213> escherichia coli
<400> 14
Met Glu Phe Arg Arg Pro Leu Met Ser Phe Asp Ile Ala Lys Tyr Pro
1 5 10 15
Thr Leu Ala Leu Val Asp Ser Thr Gln Glu Leu Arg Leu Leu Pro Lys
20 25 30
Glu Ser Leu Pro Lys Leu Cys Asp Glu Leu Arg Arg Tyr Leu Leu Asp
35 40 45
Ser Val Ser Arg Ser Ser Gly His Phe Ala Ser Gly Leu Gly Thr Val
50 55 60
Glu Leu Thr Val Ala Leu His Tyr Val Tyr Asn Thr Pro Phe Asp Gln
65 70 75 80
Leu Ile Trp Asp Val Gly His Gln Ala Tyr Pro His Lys Ile Leu Thr
85 90 95
Gly Arg Arg Asp Lys Ile Gly Thr Ile Arg Gln Lys Gly Gly Leu His
100 105 110
Pro Phe Pro Trp Arg Gly Glu Ser Glu Tyr Asp Val Leu Ser Val Gly
115 120 125
His Ser Ser Thr Ser Ile Ser Ala Gly Ile Gly Ile Ala Val Ala Ala
130 135 140
Glu Lys Glu Gly Lys Asn Arg Arg Thr Val Cys Val Ile Gly Asp Gly
145 150 155 160
Ala Ile Thr Ala Gly Met Ala Phe Glu Ala Met Asn His Ala Gly Asp
165 170 175
Ile Arg Pro Asp Met Leu Val Ile Leu Asn Asp Asn Glu Met Ser Ile
180 185 190
Ser Glu Asn Val Gly Ala Leu Asn Asn His Leu Ala Gln Leu Leu Ser
195 200 205
Gly Lys Leu Tyr Ser Ser Leu Arg Glu Gly Gly Lys Lys Val Phe Ser
210 215 220
Gly Val Pro Pro Ile Lys Glu Leu Leu Lys Arg Thr Glu Glu His Ile
225 230 235 240
Lys Gly Met Val Val Pro Gly Thr Leu Phe Glu Glu Leu Gly Phe Asn
245 250 255
Tyr Ile Gly Pro Val Asp Gly His Asp Val Leu Gly Leu Ile Thr Thr
260 265 270
Leu Lys Asn Met Arg Asp Leu Lys Gly Pro Gln Phe Leu His Ile Met
275 280 285
Thr Lys Lys Gly Arg Gly Tyr Glu Pro Ala Glu Lys Asp Pro Ile Thr
290 295 300
Phe His Ala Val Pro Lys Phe Asp Pro Ser Ser Gly Cys Leu Pro Lys
305 310 315 320
Ser Ser Gly Gly Leu Pro Ser Tyr Ser Lys Ile Phe Gly Asp Trp Leu
325 330 335
Cys Glu Thr Ala Ala Lys Asp Asn Lys Leu Met Ala Ile Thr Pro Ala
340 345 350
Met Arg Glu Gly Ser Gly Met Val Glu Phe Ser Arg Lys Phe Pro Asp
355 360 365
Arg Tyr Phe Asp Val Ala Ile Ala Glu Gln His Ala Val Thr Phe Ala
370 375 380
Ala Gly Leu Ala Ile Gly Gly Tyr Lys Pro Ile Val Ala Ile Tyr Ser
385 390 395 400
Thr Phe Leu Gln Arg Ala Tyr Asp Gln Val Leu His Asp Val Ala Ile
405 410 415
Gln Lys Leu Pro Val Leu Phe Ala Ile Asp Arg Ala Gly Ile Val Gly
420 425 430
Ala Asp Gly Gln Thr His Gln Gly Ala Phe Asp Leu Ser Tyr Leu Arg
435 440 445
Cys Ile Pro Glu Met Val Ile Met Thr Pro Ser Asp Glu Asn Glu Cys
450 455 460
Arg Gln Met Leu Tyr Thr Gly Tyr His Tyr Asn Asp Gly Pro Ser Ala
465 470 475 480
Val Arg Tyr Pro Arg Gly Asn Ala Val Gly Val Glu Leu Thr Pro Leu
485 490 495
Glu Lys Leu Pro Ile Gly Lys Gly Ile Val Lys Arg Arg Gly Glu Lys
500 505 510
Leu Ala Ile Leu Asn Phe Gly Thr Leu Met Pro Glu Ala Ala Lys Val
515 520 525
Ala Glu Ser Leu Asn Ala Thr Leu Val Asp Met Arg Phe Val Lys Pro
530 535 540
Leu Asp Glu Ala Leu Ile Leu Glu Met Ala Ala Ser His Glu Ala Leu
545 550 555 560
Val Thr Val Glu Glu Asn Ala Ile Met Gly Gly Ala Gly Ser Gly Val
565 570 575
Asn Glu Val Leu Met Ala His Arg Lys Pro Val Pro Val Leu Asn Ile
580 585 590
Gly Leu Pro Asp Phe Phe Ile Pro Gln Gly Thr Gln Glu Glu Met Arg
595 600 605
Ala Glu Leu Gly Leu Asp Ala Ala Gly Met Glu Ala Lys Ile Lys Ala
610 615 620
Trp Leu Ala
625
<210> 15
<211> 636
<212> PRT
<213> Corynebacterium glutamicum
<400> 15
Met Gly Ile Leu Asn Ser Ile Ser Thr Pro Ala Asp Leu Lys Ala Leu
1 5 10 15
Asn Asp Glu Asp Leu Asp Ala Leu Ala Lys Glu Ile Arg Thr Phe Leu
20 25 30
Val Asp Lys Val Ala Ala Thr Gly Gly His Leu Gly Pro Asn Leu Gly
35 40 45
Val Val Glu Leu Thr Ile Gly Leu His Arg Val Phe Asp Ser Pro Gln
50 55 60
Asp Pro Ile Ile Phe Asp Thr Ser His Gln Ser Tyr Val His Lys Ile
65 70 75 80
Leu Thr Gly Arg Ala Lys Asp Phe Asp Ser Leu Arg Gln Lys Asp Gly
85 90 95
Leu Ser Gly Tyr Thr Cys Arg Ala Glu Ser Glu His Asp Trp Thr Glu
100 105 110
Ser Ser His Ala Ser Ala Ala Leu Ser Tyr Ala Asp Gly Leu Ser Lys
115 120 125
Ala Lys Gln Leu Asp Gly Asp Thr Thr His Ser Val Val Ala Val Val
130 135 140
Gly Asp Gly Ala Leu Thr Gly Gly Met Cys Trp Glu Ala Leu Asn Asn
145 150 155 160
Ile Ala Ala Gly Lys Asp Arg Lys Val Val Val Val Val Asn Asp Asn
165 170 175
Gly Arg Ser Tyr Ser Pro Thr Ile Gly Gly Phe Ala Glu Asn Leu Ala
180 185 190
Gly Leu Arg Met Gln Pro Phe Tyr Asp Arg Phe Met Glu Lys Gly Lys
195 200 205
Thr Ser Leu Lys Ser Met Gly Trp Val Gly Glu Arg Thr Phe Glu Ala
210 215 220
Leu His Ala Phe Lys Glu Gly Val Lys Ser Thr Val Ile Pro Thr Glu
225 230 235 240
Met Phe Pro Glu Leu Gly Met Lys Tyr Val Gly Pro Val Asp Gly His
245 250 255
Asn Gln Lys Ala Val Asp Asn Ala Leu Lys Tyr Ala His Asp Tyr Asp
260 265 270
Gly Pro Ile Ile Val His Met Val Thr Glu Lys Gly Arg Gly Tyr Ala
275 280 285
Pro Ala Glu Gln Asp Leu Asp Glu Leu Met His Ser Thr Gly Val Ile
290 295 300
Asp Pro Leu Thr Gly Ala Pro Lys Ser Ala Ser Lys Pro Gly Trp Thr
305 310 315 320
Ser Val Phe Ser Asp Glu Leu Val Lys Ile Gly Ala Gln Asn Glu Asn
325 330 335
Val Val Ala Ile Thr Ala Ala Met Ala Gly Pro Thr Gly Leu Ser Lys
340 345 350
Phe Glu Ala Asn Phe Pro Asn Arg Phe Phe Asp Val Gly Ile Ala Glu
355 360 365
Gln His Ala Val Thr Ser Ala Ala Gly Leu Ala Leu Gly Gly Lys His
370 375 380
Pro Val Val Ala Ile Tyr Ser Thr Phe Leu Asn Arg Ala Phe Asp Gln
385 390 395 400
Leu Leu Met Asp Val Gly Met Leu Asn Gln Pro Val Thr Leu Val Leu
405 410 415
Asp Arg Ser Gly Val Thr Gly Ser Asp Gly Ala Ser His Asn Gly Val
420 425 430
Trp Asp Met Ala Leu Thr Ser Ile Val Pro Gly Val Gln Val Ala Ala
435 440 445
Pro Arg Asp Glu Asp Ser Leu Arg Glu Leu Leu Asn Glu Ala Ile Ser
450 455 460
Ile Asp Asp Gly Pro Thr Val Val Arg Phe Pro Lys Gly Asp Leu Pro
465 470 475 480
Thr Pro Ile Val Ala Ile Asp Thr Leu Glu Asp Gly Val Asp Val Leu
485 490 495
Ala Tyr Glu Asp Ala Thr Asp Val Glu Ser Thr Asp Asp Ala Pro Ser
500 505 510
Val Leu Ile Ile Ala Val Gly Glu Arg Ala Thr Val Ala Leu Asp Val
515 520 525
Ala Ser Arg Ile Lys Gln His Gly Val Asn Val Thr Val Val Asp Pro
530 535 540
Arg Trp Ile Val Pro Ile Pro Gln Ser Leu Val Ala Leu Ser Asp Asp
545 550 555 560
His Asp Leu Val Ile Thr Ile Glu Asp Gly Val Ile His Gly Gly Val
565 570 575
Gly Ser Leu Leu Ser Asp Ala Leu Asn Ala Ser Glu Val Asp Thr Pro
580 585 590
Arg Arg Gln Ile Ala Val Pro Gln Lys Tyr Leu Asp His Ala Ser Arg
595 600 605
Asn Glu Val Leu Ala Asp Tyr Gly Leu Asp Ala Asp Gly Ile Glu Thr
610 615 620
Thr Val Val Gly Trp Leu Asp Ser Leu Phe Gly Glu
625 630 635
<210> 16
<211> 803
<212> PRT
<213> Enterococcus faecalis
<400> 16
Leu Lys Thr Val Val Ile Ile Asp Ala Leu Arg Thr Pro Ile Gly Lys
1 5 10 15
Tyr Lys Gly Ser Leu Ser Gln Val Ser Ala Val Asp Leu Gly Thr His
20 25 30
Val Thr Thr Gln Leu Leu Lys Arg His Ser Thr Ile Ser Glu Glu Ile
35 40 45
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50 55 60
Pro Ala Arg Gln Ile Ala Ile Asn Ser Gly Leu Ser His Glu Ile Pro
65 70 75 80
Ala Met Thr Val Asn Glu Val Cys Gly Ser Gly Met Lys Ala Val Ile
85 90 95
Leu Ala Lys Gln Leu Ile Gln Leu Gly Glu Ala Glu Val Leu Ile Ala
100 105 110
Gly Gly Ile Glu Asn Met Ser Gln Ala Pro Lys Leu Gln Arg Phe Asn
115 120 125
Tyr Glu Thr Glu Ser Tyr Asp Ala Pro Phe Ser Ser Met Met Tyr Asp
130 135 140
Gly Leu Thr Asp Ala Phe Ser Gly Gln Ala Met Gly Leu Thr Ala Glu
145 150 155 160
Asn Val Ala Glu Lys Tyr His Val Thr Arg Glu Glu Gln Asp Gln Phe
165 170 175
Ser Val His Ser Gln Leu Lys Ala Ala Gln Ala Gln Ala Glu Gly Ile
180 185 190
Phe Ala Asp Glu Ile Ala Pro Leu Glu Val Ser Gly Thr Leu Val Glu
195 200 205
Lys Asp Glu Gly Ile Arg Pro Asn Ser Ser Val Glu Lys Leu Gly Thr
210 215 220
Leu Lys Thr Val Phe Lys Glu Asp Gly Thr Val Thr Ala Gly Asn Ala
225 230 235 240
Ser Thr Ile Asn Asp Gly Ala Ser Ala Leu Ile Ile Ala Ser Gln Glu
245 250 255
Tyr Ala Glu Ala His Gly Leu Pro Tyr Leu Ala Ile Ile Arg Asp Ser
260 265 270
Val Glu Val Gly Ile Asp Pro Ala Tyr Met Gly Ile Ser Pro Ile Lys
275 280 285
Ala Ile Gln Lys Leu Leu Ala Arg Asn Gln Leu Thr Thr Glu Glu Ile
290 295 300
Asp Leu Tyr Glu Ile Asn Glu Ala Phe Ala Ala Thr Ser Ile Val Val
305 310 315 320
Gln Arg Glu Leu Ala Leu Pro Glu Glu Lys Val Asn Ile Tyr Gly Gly
325 330 335
Gly Ile Ser Leu Gly His Ala Ile Gly Ala Thr Gly Ala Arg Leu Leu
340 345 350
Thr Ser Leu Ser Tyr Gln Leu Asn Gln Lys Glu Lys Lys Tyr Gly Val
355 360 365
Ala Ser Leu Cys Ile Gly Gly Gly Leu Gly Leu Ala Met Leu Leu Glu
370 375 380
Arg Pro Gln Gln Lys Lys Asn Ser Arg Phe Tyr Gln Met Ser Pro Glu
385 390 395 400
Glu Arg Leu Ala Ser Leu Leu Asn Glu Gly Gln Ile Ser Ala Asp Thr
405 410 415
Lys Lys Glu Phe Glu Asn Thr Ala Leu Ser Ser Gln Ile Ala Asn His
420 425 430
Met Ile Glu Asn Gln Ile Ser Glu Thr Glu Val Pro Met Gly Val Gly
435 440 445
Leu His Leu Thr Val Asp Glu Thr Asp Tyr Leu Val Pro Met Ala Thr
450 455 460
Glu Glu Pro Ser Val Ile Ala Ala Leu Ser Asn Gly Ala Lys Ile Ala
465 470 475 480
Gln Gly Phe Lys Thr Val Asn Gln Gln Arg Leu Met Arg Gly Gln Ile
485 490 495
Val Phe Tyr Asp Val Ala Asp Ala Glu Ser Leu Ile Asp Glu Leu Gln
500 505 510
Val Arg Glu Thr Glu Ile Phe Gln Gln Ala Glu Leu Ser Tyr Pro Ser
515 520 525
Ile Val Lys Arg Gly Gly Gly Leu Arg Asp Leu Gln Tyr Arg Ala Phe
530 535 540
Asp Glu Ser Phe Val Ser Val Asp Phe Leu Val Asp Val Lys Asp Ala
545 550 555 560
Met Gly Ala Asn Ile Val Asn Ala Met Leu Glu Gly Val Ala Glu Leu
565 570 575
Phe Arg Glu Trp Phe Ala Glu Gln Lys Ile Leu Phe Ser Ile Leu Ser
580 585 590
Asn Tyr Ala Thr Glu Ser Val Val Thr Met Lys Thr Ala Ile Pro Val
595 600 605
Ser Arg Leu Ser Lys Gly Ser Asn Gly Arg Glu Ile Ala Glu Lys Ile
610 615 620
Val Leu Ala Ser Arg Tyr Ala Ser Leu Asp Pro Tyr Arg Ala Val Thr
625 630 635 640
His Asn Lys Gly Ile Met Asn Gly Ile Glu Ala Val Val Leu Ala Thr
645 650 655
Gly Asn Asp Thr Arg Ala Val Ser Ala Ser Cys His Ala Phe Ala Val
660 665 670
Lys Glu Gly Arg Tyr Gln Gly Leu Thr Ser Trp Thr Leu Asp Gly Glu
675 680 685
Gln Leu Ile Gly Glu Ile Ser Val Pro Leu Ala Leu Ala Thr Val Gly
690 695 700
Gly Ala Thr Lys Val Leu Pro Lys Ser Gln Ala Ala Ala Asp Leu Leu
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Ala Val Thr Asp Ala Lys Glu Leu Ser Arg Val Val Ala Ala Val Gly
725 730 735
Leu Ala Gln Asn Leu Ala Ala Leu Arg Ala Leu Val Ser Glu Gly Ile
740 745 750
Gln Lys Gly His Met Ala Leu Gln Ala Arg Ser Leu Ala Met Thr Val
755 760 765
Gly Ala Thr Gly Lys Glu Val Glu Ala Val Ala Gln Gln Leu Lys Arg
770 775 780
Gln Lys Thr Met Asn Gln Asp Arg Ala Leu Ala Ile Leu Asn Asp Leu
785 790 795 800
Arg Lys Gln
<210> 17
<211> 383
<212> PRT
<213> Enterococcus faecalis
<400> 17
Met Thr Ile Gly Ile Asp Lys Ile Ser Phe Phe Val Pro Pro Tyr Tyr
1 5 10 15
Ile Asp Met Thr Ala Leu Ala Glu Ala Arg Asn Val Asp Pro Gly Lys
20 25 30
Phe His Ile Gly Ile Gly Gln Asp Gln Met Ala Val Asn Pro Ile Ser
35 40 45
Gln Asp Ile Val Thr Phe Ala Ala Asn Ala Ala Glu Ala Ile Leu Thr
50 55 60
Lys Glu Asp Lys Glu Ala Ile Asp Met Val Ile Val Gly Thr Glu Ser
65 70 75 80
Ser Ile Asp Glu Ser Lys Ala Ala Ala Val Val Leu His Arg Leu Met
85 90 95
Gly Ile Gln Pro Phe Ala Arg Ser Phe Glu Ile Lys Glu Ala Cys Tyr
100 105 110
Gly Ala Thr Ala Gly Leu Gln Leu Ala Lys Asn His Val Ala Leu His
115 120 125
Pro Asp Lys Lys Val Leu Val Val Ala Ala Asp Ile Ala Lys Tyr Gly
130 135 140
Leu Asn Ser Gly Gly Glu Pro Thr Gln Gly Ala Gly Ala Val Ala Met
145 150 155 160
Leu Val Ala Ser Glu Pro Arg Ile Leu Ala Leu Lys Glu Asp Asn Val
165 170 175
Met Leu Thr Gln Asp Ile Tyr Asp Phe Trp Arg Pro Thr Gly His Pro
180 185 190
Tyr Pro Met Val Asp Gly Pro Leu Ser Asn Glu Thr Tyr Ile Gln Ser
195 200 205
Phe Ala Gln Val Trp Asp Glu His Lys Lys Arg Thr Gly Leu Asp Phe
210 215 220
Ala Asp Tyr Asp Ala Leu Ala Phe His Ile Pro Tyr Thr Lys Met Gly
225 230 235 240
Lys Lys Ala Leu Leu Ala Lys Ile Ser Asp Gln Thr Glu Ala Glu Gln
245 250 255
Glu Arg Ile Leu Ala Arg Tyr Glu Glu Ser Ile Ile Tyr Ser Arg Arg
260 265 270
Val Gly Asn Leu Tyr Thr Gly Ser Leu Tyr Leu Gly Leu Ile Ser Leu
275 280 285
Leu Glu Asn Ala Thr Thr Leu Thr Ala Gly Asn Gln Ile Gly Leu Phe
290 295 300
Ser Tyr Gly Ser Gly Ala Val Ala Glu Phe Phe Thr Gly Glu Leu Val
305 310 315 320
Ala Gly Tyr Gln Asn His Leu Gln Lys Glu Thr His Leu Ala Leu Leu
325 330 335
Asp Asn Arg Thr Glu Leu Ser Ile Ala Glu Tyr Glu Ala Met Phe Ala
340 345 350
Glu Thr Leu Asp Thr Asp Ile Asp Gln Thr Leu Glu Asp Glu Leu Lys
355 360 365
Tyr Ser Ile Ser Ala Ile Asn Asn Thr Val Arg Ser Tyr Arg Asn
370 375 380
<210> 18
<211> 292
<212> PRT
<213> Streptococcus pneumoniae
<400> 18
Met Thr Lys Lys Val Gly Val Gly Gln Ala His Ser Lys Ile Ile Leu
1 5 10 15
Ile Gly Glu His Ala Val Val Tyr Gly Tyr Pro Ala Ile Ser Leu Pro
20 25 30
Leu Leu Glu Val Glu Val Thr Cys Lys Val Val Pro Ala Glu Ser Pro
35 40 45
Trp Arg Leu Tyr Glu Glu Asp Thr Leu Ser Met Ala Val Tyr Ala Ser
50 55 60
Leu Glu Tyr Leu Asn Ile Thr Glu Ala Cys Ile Arg Cys Glu Ile Asp
65 70 75 80
Ser Ala Ile Pro Glu Lys Arg Gly Met Gly Ser Ser Ala Ala Ile Ser
85 90 95
Ile Ala Ala Ile Arg Ala Val Phe Asp Tyr Tyr Gln Ala Asp Leu Pro
100 105 110
His Asp Val Leu Glu Ile Leu Val Asn Arg Ala Glu Met Ile Ala His
115 120 125
Met Asn Pro Ser Gly Leu Asp Ala Lys Thr Cys Leu Ser Asp Gln Pro
130 135 140
Ile Arg Phe Ile Lys Asn Val Gly Phe Thr Glu Leu Glu Met Asp Leu
145 150 155 160
Ser Ala Tyr Leu Val Ile Ala Asp Thr Gly Val Tyr Gly His Thr Arg
165 170 175
Glu Ala Ile Gln Val Val Gln Asn Lys Gly Lys Asp Ala Leu Pro Phe
180 185 190
Leu His Ala Leu Gly Glu Leu Thr Gln Gln Ala Glu Val Ala Ile Ser
195 200 205
Gln Lys Asp Ala Glu Gly Leu Gly Gln Ile Leu Ser Gln Ala His Leu
210 215 220
His Leu Lys Glu Ile Gly Val Ser Ser Pro Glu Ala Asp Phe Leu Val
225 230 235 240
Glu Thr Thr Leu Ser His Gly Ala Leu Gly Ala Lys Met Ser Gly Gly
245 250 255
Gly Leu Gly Gly Cys Ile Ile Ala Leu Val Thr Asn Leu Thr His Ala
260 265 270
Gln Glu Leu Ala Glu Arg Leu Glu Glu Lys Gly Ala Val Gln Thr Trp
275 280 285
Ile Glu Ser Leu
290
<210> 19
<211> 336
<212> PRT
<213> Streptococcus pneumoniae
<400> 19
Met Ile Ala Val Lys Thr Cys Gly Lys Leu Tyr Trp Ala Gly Glu Tyr
1 5 10 15
Ala Ile Leu Glu Pro Gly Gln Leu Ala Leu Ile Lys Asp Ile Pro Ile
20 25 30
Tyr Met Arg Ala Glu Ile Ala Phe Ser Asp Ser Tyr Arg Ile Tyr Ser
35 40 45
Asp Met Phe Asp Phe Ala Val Asp Leu Arg Pro Asn Pro Asp Tyr Ser
50 55 60
Leu Ile Gln Glu Thr Ile Ala Leu Met Gly Asp Phe Leu Ala Val Arg
65 70 75 80
Gly Gln Asn Leu Arg Pro Phe Ser Leu Lys Ile Cys Gly Lys Met Glu
85 90 95
Arg Glu Gly Lys Lys Phe Gly Leu Gly Ser Ser Gly Ser Val Val Val
100 105 110
Leu Val Val Lys Ala Leu Leu Ala Leu Tyr Asn Leu Ser Val Asp Gln
115 120 125
Asn Leu Leu Phe Lys Leu Thr Ser Ala Val Leu Leu Lys Arg Gly Asp
130 135 140
Asn Gly Ser Met Gly Asp Leu Ala Cys Ile Val Ala Glu Asp Leu Val
145 150 155 160
Leu Tyr Gln Ser Phe Asp Arg Gln Lys Ala Ala Ala Trp Leu Glu Glu
165 170 175
Glu Asn Leu Ala Thr Val Leu Glu Arg Asp Trp Gly Phe Phe Ile Ser
180 185 190
Gln Val Lys Pro Thr Leu Glu Cys Asp Phe Leu Val Gly Trp Thr Lys
195 200 205
Glu Val Ala Val Ser Ser His Met Val Gln Gln Ile Lys Gln Asn Ile
210 215 220
Asn Gln Asn Phe Leu Ser Ser Ser Lys Glu Thr Val Val Ser Leu Val
225 230 235 240
Glu Ala Leu Glu Gln Gly Lys Ala Glu Lys Val Ile Glu Gln Val Glu
245 250 255
Val Ala Ser Lys Leu Leu Glu Gly Leu Ser Thr Asp Ile Tyr Thr Pro
260 265 270
Leu Leu Arg Gln Leu Lys Glu Ala Ser Gln Asp Leu Gln Ala Val Ala
275 280 285
Lys Ser Ser Gly Ala Gly Gly Gly Asp Cys Gly Ile Ala Leu Ser Phe
290 295 300
Asp Ala Gln Ser Ser Arg Asn Thr Leu Lys Asn Arg Trp Ala Asp Leu
305 310 315 320
Gly Ile Glu Leu Leu Tyr Gln Glu Arg Ile Gly His Asp Asp Lys Ser
325 330 335
<210> 20
<211> 317
<212> PRT
<213> Streptococcus pneumoniae
<400> 20
Met Asp Arg Glu Pro Val Thr Val Arg Ser Tyr Ala Asn Ile Ala Ile
1 5 10 15
Ile Lys Tyr Trp Gly Lys Lys Lys Glu Lys Glu Met Val Pro Ala Thr
20 25 30
Ser Ser Ile Ser Leu Thr Leu Glu Asn Met Tyr Thr Glu Thr Thr Leu
35 40 45
Ser Pro Leu Pro Ala Asn Val Thr Ala Asp Glu Phe Tyr Ile Asn Gly
50 55 60
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65 70 75 80
Arg Tyr Arg Pro Ala Gly Glu Gly Phe Val Arg Ile Asp Thr Gln Asn
85 90 95
Asn Met Pro Thr Ala Ala Gly Leu Ser Ser Ser Ser Ser Gly Leu Ser
100 105 110
Ala Leu Val Lys Ala Cys Asn Ala Tyr Phe Lys Leu Gly Leu Asp Arg
115 120 125
Ser Gln Leu Ala Gln Glu Ala Lys Phe Ala Ser Gly Ser Ser Ser Arg
130 135 140
Ser Phe Tyr Gly Pro Leu Gly Ala Trp Asp Lys Asp Ser Gly Glu Ile
145 150 155 160
Tyr Pro Val Glu Thr Asp Leu Lys Leu Ala Met Ile Met Leu Val Leu
165 170 175
Glu Asp Lys Lys Lys Pro Ile Ser Ser Arg Asp Gly Met Lys Leu Cys
180 185 190
Val Glu Thr Ser Thr Thr Phe Asp Asp Trp Val Arg Gln Ser Glu Lys
195 200 205
Asp Tyr Gln Asp Met Leu Ile Tyr Leu Lys Glu Asn Asp Phe Ala Lys
210 215 220
Ile Gly Glu Leu Thr Glu Lys Asn Ala Leu Ala Met His Ala Thr Thr
225 230 235 240
Lys Thr Ala Ser Pro Ala Phe Ser Tyr Leu Thr Asp Ala Ser Tyr Glu
245 250 255
Ala Met Ala Phe Val Arg Gln Leu Arg Glu Lys Gly Glu Ala Cys Tyr
260 265 270
Phe Thr Met Asp Ala Gly Pro Asn Val Lys Val Phe Cys Gln Glu Lys
275 280 285
Asp Leu Glu His Leu Ser Glu Ile Phe Gly Gln Arg Tyr Arg Leu Ile
290 295 300
Val Ser Lys Thr Lys Asp Leu Ser Gln Asp Asp Cys Cys
305 310 315
<210> 21
<211> 182
<212> PRT
<213> escherichia coli
<400> 21
Met Gln Thr Glu His Val Ile Leu Leu Asn Ala Gln Gly Val Pro Thr
1 5 10 15
Gly Thr Leu Glu Lys Tyr Ala Ala His Thr Ala Asp Thr Arg Leu His
20 25 30
Leu Ala Phe Ser Ser Trp Leu Phe Asn Ala Lys Gly Gln Leu Leu Val
35 40 45
Thr Arg Arg Ala Leu Ser Lys Lys Ala Trp Pro Gly Val Trp Thr Asn
50 55 60
Ser Val Cys Gly His Pro Gln Leu Gly Glu Ser Asn Glu Asp Ala Val
65 70 75 80
Ile Arg Arg Cys Arg Tyr Glu Leu Gly Val Glu Ile Thr Pro Pro Glu
85 90 95
Ser Ile Tyr Pro Asp Phe Arg Tyr Arg Ala Thr Asp Pro Ser Gly Ile
100 105 110
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115 120 125
Leu Gln Ile Asn Asp Asp Glu Val Met Asp Tyr Gln Trp Cys Asp Leu
130 135 140
Ala Asp Val Leu His Gly Ile Asp Ala Thr Pro Trp Ala Phe Ser Pro
145 150 155 160
Trp Met Val Met Gln Ala Thr Asn Arg Glu Ala Arg Lys Arg Leu Ser
165 170 175
Ala Phe Thr Gln Leu Lys
180
<210> 22
<211> 149
<212> PRT
<213> Corynebacterium glutamicum
<400> 22
Met Ile Pro Ile Ile Asp Ile Ser Gln Asn Glu Gln Asp Ser Asp Ile
1 5 10 15
Phe Met Ala Phe Ile Tyr Leu Gly Thr Leu Leu Val Leu Ile Gly Cys
20 25 30
Met Ala Leu Cys Asp His Arg Trp Lys Leu Ala Phe Phe Arg His Pro
35 40 45
Leu Arg Ala Ile Leu Ser Val Gly Ala Ala Tyr Ile Gly Phe Leu Leu
50 55 60
Trp Asp Ile Phe Gly Ile Ile Thr Gly Thr Phe Tyr Arg Gly Asp Ser
65 70 75 80
Ala Phe Met Ser Gly Ile Asn Leu Ala Pro His Met Pro Ile Glu Glu
85 90 95
Leu Phe Phe Leu Phe Phe Leu Cys Tyr Ile Thr Leu Asn Leu Thr Ser
100 105 110
Ala Ala Ala Leu Trp Leu Lys Ala Pro Leu Pro Lys Lys Pro Gly Lys
115 120 125
Lys Ser Pro Leu Thr Pro Gln Arg Asp Thr Phe Gln Pro Thr Thr Thr
130 135 140
Pro Glu Val Glu Pro
145
<210> 23
<211> 130
<212> PRT
<213> Corynebacterium glutamicum
<400> 23
Met Thr Tyr Ile Phe Ile Ser Ile Pro Phe Leu Ala Ile Ala Met Val
1 5 10 15
Leu Phe Val Leu Lys Leu Gln Ser Gly Thr Pro Lys Leu Leu Pro Ile
20 25 30
Thr Ala Val Ser Ala Leu Thr Leu Cys Ser Leu Thr Ile Ile Phe Asp
35 40 45
Asn Leu Met Val Trp Ala Asp Leu Phe Gly Tyr Gly Asp Thr Gln His
50 55 60
Leu Gly Ile Trp Leu Gly Leu Ile Pro Leu Glu Asp Leu Phe Tyr Pro
65 70 75 80
Leu Phe Ala Val Leu Leu Ile Pro Ala Leu Trp Leu Pro Gly Asn Met
85 90 95
Phe Lys Arg Arg Lys Lys Arg Pro His His Ser Leu Pro Thr Ile Ala
100 105 110
Asn Gly Ser Ile Thr Thr Arg Ser Thr Thr Thr Gln Ser Glu Pro Glu
115 120 125
Lys Pro
130
<210> 24
<211> 287
<212> PRT
<213> Corynebacterium glutamicum
<400> 24
Met Met Glu Lys Ile Arg Leu Ile Leu Leu Ser Ser Arg Pro Ile Ser
1 5 10 15
Trp Ile Asn Thr Ala Tyr Pro Phe Gly Leu Ala Tyr Leu Leu Asn Ala
20 25 30
Gly Glu Ile Asp Trp Leu Phe Trp Leu Gly Ile Val Phe Phe Leu Ile
35 40 45
Pro Tyr Asn Ile Ala Met Tyr Gly Ile Asn Asp Val Phe Asp Tyr Glu
50 55 60
Ser Asp Met Arg Asn Pro Arg Lys Gly Gly Val Glu Gly Ala Val Leu
65 70 75 80
Pro Lys Ser Ser His Ser Thr Leu Leu Trp Ala Ser Ala Ile Ser Thr
85 90 95
Ile Pro Phe Leu Val Ile Leu Phe Ile Phe Gly Thr Trp Met Ser Ser
100 105 110
Leu Trp Leu Thr Leu Ser Val Leu Ala Val Ile Ala Tyr Ser Ala Pro
115 120 125
Lys Leu Arg Phe Lys Glu Arg Pro Phe Ile Asp Ala Leu Thr Ser Ser
130 135 140
Thr His Phe Thr Ser Pro Ala Leu Ile Gly Ala Thr Ile Thr Gly Thr
145 150 155 160
Ser Pro Ser Ala Ala Met Trp Ile Ala Leu Gly Ser Phe Phe Leu Trp
165 170 175
Gly Met Ala Ser Gln Ile Leu Gly Ala Val Gln Asp Val Asn Ala Asp
180 185 190
Arg Glu Ala Asn Leu Ser Ser Ile Ala Thr Val Ile Gly Ala Arg Gly
195 200 205
Ala Ile Arg Leu Ser Val Val Leu Tyr Leu Leu Ala Ala Val Leu Val
210 215 220
Thr Thr Leu Pro Asn Pro Ala Trp Ile Ile Gly Ile Ala Ile Leu Thr
225 230 235 240
Tyr Val Phe Asn Ala Ala Arg Phe Trp Asn Ile Thr Asp Ala Ser Cys
245 250 255
Glu Gln Ala Asn Arg Ser Trp Lys Val Phe Leu Trp Leu Asn Tyr Phe
260 265 270
Val Gly Ala Val Ile Thr Ile Leu Leu Ile Ala Ile His Gln Ile
275 280 285
<210> 25
<211> 1578
<212> DNA
<213> saccharomyces cerevisiae
<400> 25
atggaccaat tggtgaaaac tgaagtcacc aagaagtctt ttactgctcc tgtacaaaag 60
gcttctacac cagttttaac caataaaaca gtcatttctg gatcgaaagt caaaagttta 120
tcatctgcgc aatcgagctc atcaggacct tcatcatcta gtgaggaaga tgattcccgc 180
gatattgaaa gcttggataa gaaaatacgt cctttagaag aattagaagc attattaagt 240
agtggaaata caaaacaatt gaagaacaaa gaggtcgctg ccttggttat tcacggtaag 300
ttacctttgt acgctttgga gaaaaaatta ggtgatacta cgagagcggt tgcggtacgt 360
aggaaggctc tttcaatttt ggcagaagct cctgtattag catctgatcg tttaccatat 420
aaaaattatg actacgaccg cgtatttggc gcttgttgtg aaaatgttat aggttacatg 480
cctttgcccg ttggtgttat aggccccttg gttatcgatg gtacatctta tcatatacca 540
atggcaacta cagagggttg tttggtagct tctgccatgc gtggctgtaa ggcaatcaat 600
gctggcggtg gtgcaacaac tgttttaact aaggatggta tgacaagagg cccagtagtc 660
cgtttcccaa ctttgaaaag atctggtgcc tgtaagatat ggttagactc agaagaggga 720
caaaacgcaa ttaaaaaagc ttttaactct acatcaagat ttgcacgtct gcaacatatt 780
caaacttgtc tagcaggaga tttactcttc atgagattta gaacaactac tggtgacgca 840
atgggtatga atatgatttc taaaggtgtc gaatactcat taaagcaaat ggtagaagag 900
tatggctggg aagatatgga ggttgtctcc gtttctggta actactgtac cgacaaaaaa 960
ccagctgcca tcaactggat cgaaggtcgt ggtaagagtg tcgtcgcaga agctactatt 1020
cctggtgatg ttgtcagaaa agtgttaaaa agtgatgttt ccgcattggt tgagttgaac 1080
attgctaaga atttggttgg atctgcaatg gctgggtctg ttggtggatt taacgcacat 1140
gcagctaatt tagtgacagc tgttttcttg gcattaggac aagatcctgc acaaaatgtt 1200
gaaagttcca actgtataac attgatgaaa gaagtggacg gtgatttgag aatttccgta 1260
tccatgccat ccatcgaagt aggtaccatc ggtggtggta ctgttctaga accacaaggt 1320
gccatgttgg acttattagg tgtaagaggc ccgcatgcta ccgctcctgg taccaacgca 1380
cgtcaattag caagaatagt tgcctgtgcc gtcttggcag gtgaattatc cttatgtgct 1440
gccctagcag ccggccattt ggttcaaagt catatgaccc acaacaggaa acctgctgaa 1500
ccaacaaaac ctaacaattt ggacgccact gatataaatc gtttgaaaga tgggtccgtc 1560
acctgcatta aatcctaa 1578
<210> 26
<211> 924
<212> DNA
<213> Pantoea agglomerans
<400> 26
atggtgagtg gcagtaaagc gggcgtttcg cctcatcgcg aaatagaagt aatgagacaa 60
tccattgacg atcacctggc tggcctgtta cctgaaaccg acagccagga tatcgtcagc 120
cttgcgatgc gtgaaggcgt catggcaccc ggtaaacgga tccgtccgct gctgatgctg 180
ctggccgccc gcgacctccg ctaccagggc agtatgccta cgctgctcga tctcgcctgc 240
gccgttgaac tgacccatac cgcgtcgctg atgctcgacg acatgccctg catggacaac 300
gccgagctgc gccgcggtca gcccactacc cacaaaaaat ttggtgagag cgtggcgatc 360
cttgcctccg ttgggctgct ctctaaagcc tttggtctga tcgccgccac cggcgatctg 420
ccgggggaga ggcgtgccca ggcggtcaac gagctctcta ccgccgtggg cgtgcagggc 480
ctggtactgg ggcagtttcg cgatcttaac gatgccgccc tcgaccgtac ccctgacgct 540
atcctcagca ccaaccacct caagaccggc attctgttca gcgcgatgct gcagatcgtc 600
gccattgctt ccgcctcgtc gccgagcacg cgagagacgc tgcacgcctt cgccctcgac 660
ttcggccagg cgtttcaact gctggacgat ctgcgtgacg atcacccgga aaccggtaaa 720
gatcgcaata aggacgcggg aaaatcgacg ctggtcaacc ggctgggcgc agacgcggcc 780
cggcaaaagc tgcgcgagca tattgattcc gccgacaaac acctcacttt tgcctgtccg 840
cagggcggcg ccatccgaca gtttatgcat ctgtggtttg gccatcacct tgccgactgg 900
tcaccggtca tgaaaatcgc ctga 924
<210> 27
<211> 906
<212> DNA
<213> Synechocystis sp. PCC6803
<400> 27
atggttgccc aacaaacacg aaccgacttt gatttagccc aatacttaca agttaaaaaa 60
ggtgtggtcg aggcagccct ggatagttcc ctggcgatcg cccggccgga aaagatttac 120
gaagccatgc gttattctct gttggcgggg ggcaaacgat tgcgaccgat tttatgcatt 180
acggcctgcg aactgtgtgg cggtgatgaa gccctggcct tgcccacggc ctgtgccctg 240
gaaatgatcc acaccatgtc cctcatccat gatgatttgc cctccatgga taatgacgat 300
ttccgccggg gtaaacccac taaccacaaa gtgtacgggg aagacattgc cattttggcc 360
ggggatggac tgctagccta tgcgtttgag tatgtagtta cccacacccc ccaggctgat 420
ccccaagctt tactccaagt tattgcccgt ttgggtcgca cggtgggggc cgccggttta 480
gtggggggac aagttctaga cctggaatcg gaggggcgca ctgacatcac cccggaaacc 540
ctaactttta tccataccca taaaaccggg gcattgctgg aagcttccgt gctcacaggc 600
gcaattttgg ccggggccac tggggaacaa caacagagac tggcccgcta tgcccagaat 660
attggcttag cttttcaagt ggtggatgac atcctcgaca tcaccgccac ccaggaagag 720
ttgggtaaaa ccgctggtaa agatgtcaaa gcccaaaaag ccacctatcc cagtctcctc 780
ggtttggaag cttcccgggc ccaggcccaa agtttgattg accaggccat tgtcgccctg 840
gaaccctttg gcccctccgc cgagcccctc caggcgatcg ccgaatatat tgttgccaga 900
aaatat 906
<210> 28
<211> 930
<212> DNA
<213> Pantoea agglomerans
<400> 28
atgagccaac cgccgctgct tgaccacgcc acgcagacca tggccaacgg ctcgaaaagt 60
tttgccaccg ctgcgaagct gttcgacccg gccacccgcc gtagcgtgct gatgctctac 120
acctggtgcc gccactgcga tgacgtcatt gacgaccaga cccacggctt cgccagcgag 180
gccgcggcgg aggaggaggc cacccagcgc ctggcccggc tgcgcacgct gaccctggcg 240
gcgtttgaag gggccgagat gcaggatccg gccttcgctg cctttcagga ggtggcgctg 300
acccacggta ttacgccccg catggcgctc gatcacctcg acggctttgc gatggacgtg 360
gctcagaccc gctatgtcac ctttgaggat acgctgcgct actgctatca cgtggcgggc 420
gtggtgggtc tgatgatggc cagggtgatg ggcgtgcggg atgagcgggt gctggatcgc 480
gcctgcgatc tggggctggc cttccagctg acgaatatcg cccgggatat tattgacgat 540
gcggctattg accgctgcta tctgcccgcc gagtggctgc aggatgccgg gctgaccccg 600
gagaactatg ccgcgcggga gaatcgggcc gcgctggcgc gggtggcgga gcggcttatt 660
gatgccgcag agccgtacta catctcctcc caggccgggc tacacgatct gccgccgcgc 720
tgcgcctggg cgatcgccac cgcccgcagc gtctaccggg agatcggtat taaggtaaaa 780
gcggcgggag gcagcgcctg ggatcgccgc cagcacacca gcaaaggtga aaaaattgcc 840
atgctgatgg cggcaccggg gcaggttatt cgggcgaaga cgacgagggt gacgccgcgt 900
ccggccggtc tttggcagcg tcccgtttag 930
<210> 29
<211> 1479
<212> DNA
<213> Pantoea agglomerans
<400> 29
atgaaaaaaa ccgttgtgat tggcgcaggc tttggtggcc tggcgctggc gattcgcctg 60
caggcggcag ggatcccaac cgtactgctg gagcagcggg acaagcccgg cggtcgggcc 120
tacgtctggc atgaccaggg ctttaccttt gacgccgggc cgacggtgat caccgatcct 180
accgcgcttg aggcgctgtt caccctggcc ggcaggcgca tggaggatta cgtcaggctg 240
ctgccggtaa aacccttcta ccgactctgc tgggagtccg ggaagaccct cgactatgct 300
aacgacagcg ccgagcttga ggcgcagatt acccagttca acccccgcga cgtcgagggc 360
taccggcgct ttctggctta ctcccaggcg gtattccagg agggatattt gcgcctcggc 420
agcgtgccgt tcctctcttt tcgcgacatg ctgcgcgccg ggccgcagct gcttaagctc 480
caggcgtggc agagcgtcta ccagtcggtt tcgcgcttta ttgaggatga gcatctgcgg 540
caggccttct cgttccactc cctgctggta ggcggcaacc ccttcaccac ctcgtccatc 600
tacaccctga tccacgccct tgagcgggag tggggggtct ggttccctga gggcggcacc 660
ggggcgctgg tgaacggcat ggtgaagctg tttaccgatc tgggcgggga gatcgaactc 720
aacgcccggg tcgaagagct ggtggtggcc gataaccgcg taagccaggt ccggctggcg 780
gatggtcgga tctttgacac cgacgccgta gcctcgaacg ctgacgtggt gaacacctat 840
aaaaagctgc tcggccacca tccggtgggg cagaagcggg cggcagcgct ggagcgcaag 900
agcatgagca actcgctgtt tgtgctctac ttcggcctga accagcctca ttcccagctg 960
gcgcaccata ccatctgttt tggtccccgc taccgggagc tgatcgacga gatctttacc 1020
ggcagcgcgc tggcggatga cttctcgctc tacctgcact cgccctgcgt gaccgatccc 1080
tcgctcgcgc ctcccggctg cgccagcttc tacgtgctgg ccccggtgcc gcatcttggc 1140
aacgcgccgc tggactgggc gcaggagggg ccgaagctgc gcgaccgcat ctttgactac 1200
cttgaagagc gctatatgcc cggcctgcgt agccagctgg tgacccagcg gatctttacc 1260
ccggcagact tccacgacac gctggatgcg catctgggat cggccttctc catcgagccg 1320
ctgctgaccc aaagcgcctg gttccgcccg cacaaccgcg acagcgacat tgccaacctc 1380
tacctggtgg gcgcaggtac tcaccctggg gcgggcattc ctggcgtagt ggcctcggcg 1440
aaagccaccg ccagcctgat gattgaggat ctgcaatga 1479
<210> 30
<211> 1533
<212> DNA
<213> Rhodopseudomonas palustris
<400> 30
atgctcgatc ctggccccaa tcctgctccc cgtccttctc gcgatcgtgc cccgcatgcg 60
gtggtgatcg gctctggttt cggcggcttg gccgcagcgg tgcgtcttgg cgccaagggg 120
tatcgagtaa ccgttcttga aaagctcgat aaggccggcg gccgcgctta cgtccacaag 180
caggacggct tctcattcga cgccggtccg accatcgtca ccgcgccgta tctgttcgaa 240
gagctgtgga agctgtgcgg caagcggatg tcggacgaca tcaccttgaa gccgatgtcg 300
ccgttctatc gcatccgctt cgacgacggc acgcacttcg attactccga cgaccgcgac 360
gcggtgctcg accagatcgc caagttctgc ccggacgacg tgccggccta tgaccgcttc 420
atggcggcct cgcacgagat tttcaaagtc ggtttcgagc agctcggcga tcagccattc 480
agtcacttca ccgacatgct gaagatcgcg ccggcgatga tcaagctgga gagctatcgc 540
agcgtttacg gcctcgtcgc caagcacttc aaggatccga agctgcgcca ggtgttcagc 600
ttccatccgc tgctgatcgg cggcaacccg ttcatgtcca gctcggtgta ctgcctgatc 660
acctatctgg aaaagcagtg gggcgtgcat tcagcgatgg gcggcaccgg cgcgctcgtc 720
accggtctgg tcaacctgat cgagggccag ggcaatacga tccgctacaa tcaggatgtc 780
cgccagatcg tcgtggaaaa cggcaccgcg tgcggcgtca agctcgccga tggcgaggtg 840
attaaggccg atatcgtggt gtccaacgcc gattcggcct cgacttatcg ctatctgctg 900
ccgccggaga cgcgcaagcg ttggaccgac gccaagatcg agaagtcgcg ctattcgatg 960
agcctattcg tctggtactt cggcacgaag cgtcgctacg aagacgtcaa gcaccacacc 1020
attctgctcg gaccgcgcta caaggaactg atcagcgaca tcttcagccg gaaggtggtc 1080
gccgaggatt tcagcctgta tctgcatcgc ccgactgcga ccgacccgtc gctcgcgccg 1140
cagggctgcg acactttcta cgtcctgtcg ccggtgccga atctgctcgg tgatactgat 1200
tggcacacca aggccgagac ttatcgcgcc tcgatcgcca agatgctcgg tgcgaccgtt 1260
ctgcccgatc tggaaaacca gatcgcgacc tccaagatca ccacgccgat cgatttccag 1320
gaccggctgt cgtcgttccg cggcgcggcg ttcggtctgg agccggtgtt gtggcagagc 1380
gcctggttca ggccgcacaa tcagagcgaa gacgtcaaac gcctttatct cgtcggcgcc 1440
ggaacgcatc ccggcgctgg cctgcccggg gtactgtcct cggcgcgggt actcgatgcg 1500
ctggtccccg aggccgacag tctggtgaca tca 1533
<210> 31
<211> 1146
<212> DNA
<213> Pantoea ananatis
<400> 31
atgcaaccgc attatgatct gattctcgtg ggggctggac tcgcgaatgg ccttatcgcc 60
ctgcgtcttc agcagcagca acctgatatg cgtattttgc ttatcgacgc cgcaccccag 120
gcgggcggga atcatacgtg gtcatttcac cacgatgatt tgactgagag ccaacatcgt 180
tggatagctc cgctggtggt tcatcactgg cccgactatc aggtacgctt tcccacacgc 240
cgtcgtaagc tgaacagcgg ctacttttgt attacttctc agcgtttcgc tgaggtttta 300
cagcgacagt ttggcccgca cttgtggatg gataccgcgg tcgcagaggt taatgcggaa 360
tctgttcggt tgaaaaaggg tcaggttatc ggtgcccgcg cggtgattga cgggcggggt 420
tatgcggcaa attcagcact gagcgtgggc ttccaggcgt ttattggcca ggaatggcga 480
ttgagccacc cgcatggttt atcgtctccc attatcatgg atgccacggt cgatcagcaa 540
aatggttatc gcttcgtgta cagcctgccg ctctcgccga ccagattgtt aattgaagac 600
acgcactata ttgataatgc gacattagat cctgaatgcg cgcggcaaaa tatttgcgac 660
tatgccgcgc aacagggttg gcagcttcag acactgctgc gagaagaaca gggcgcctta 720
cccattactc tgtcgggcaa tgccgacgca ttctggcagc agcgccccct ggcctgtagt 780
ggattacgtg ccggtctgtt ccatcctacc accggctatt cactgccgct ggcggttgcc 840
gtggccgacc gcctgagtgc acttgatgtc tttacgtcgg cctcaattca ccatgccatt 900
acgcattttg cccgcgagcg ctggcagcag cagggctttt tccgcatgct gaatcgcatg 960
ctgtttttag ccggacccgc cgattcacgc tggcgggtta tgcagcgttt ttatggttta 1020
cctgaagatt taattgcccg tttttatgcg ggaaaactca cgctgaccga tcggctacgt 1080
attctgagcg gcaagccgcc tgttccggta ttagcagcat tgcaagccat tatgacgact 1140
catcgt 1146
<210> 32
<211> 828
<212> DNA
<213> uncultured marine bacterium 66A03
<400> 32
atgggtctga tgctgattga ttggtgtgca ctggctctgg ttgttttcat tggcctgccg 60
cacggcgcgc tggatgctgc catttctttt tctatgatct cttctgcaaa acgcattgct 120
cgtctggctg gtattctgct gatctatctg ctgctggcga ccgcgttctt cctgatctgg 180
tatcagctgc cagcgtttag cctgctgatc ttcctgctga tctccattat ccactttggt 240
atggcagact tcaacgcgtc cccaagcaaa ctgaaatggc cgcatatcat cgcccacggc 300
ggtgttgtta ctgtttggct gccgctgatc cagaaaaacg aagtaactaa actgtttagc 360
atcctgacta acggtccgac tccgatcctg tgggacatcc tgctgatttt cttcctgtgt 420
tggtctattg gcgtgtgtct gcacacgtac gaaaccctgc gctctaaaca ttacaacatc 480
gcctttgaac tgatcggtct gattttcctg gcgtggtatg cgccgcctct ggttacgttt 540
gccacttact tctgcttcat tcattcccgt cgccacttct cctttgtgtg gaagcagctg 600
caacacatgt cttccaaaaa gatgatgatt ggcagcgcga ttatcctgtc ctgtacctct 660
tggctgatcg gcggtggtat ctatttcttc ctgaactcca aaatgatcgc ctctgaggct 720
gcgctgcaga ctgtgttcat cggtctggcg gcactgaccg tgccgcacat gattctgatc 780
gacttcatct tccgtccgca ctcttcccgt atcaaaatca aaaactaa 828
<210> 33
<211> 1041
<212> DNA
<213> Cronobacter sakazakii
<400> 33
atgaaggaca aggaactgag ccaacgcaag aacgatcatc tggatatcgt tctgcacccg 60
gagcgggcta aacaaacgat tcgcaccggc tttgagcagt ggcgttttga gcactgcgcc 120
ctgccggaac tcgcgcttga cgacatcgat ctcagcaccc gcctgtttgg ccgcgtgatg 180
aaagcgccgc ttctgattag ctccatgacc ggcggtgcgc ggcgcgcgag cgatatcaac 240
cgtcacctcg ccgaagccgc gcagacgctg gggctggcga tgggcgtcgg ctcgcagcgt 300
gtggcgctgg agagcgaaga caactggggg ctgacgggcg aactgcgccg gtacgcgccg 360
gatattccgc tgctggcgaa tctcggggcc gcgcagatag gcagcctcca ggggctcgat 420
tacgcccgac gcgccgtcga gatggtggaa gccgacgcgc tcattattca tcttaatccg 480
ttgcaggaag cgctccagac tggcggcgat cgcgactggc gcggcgtgtt ggcagccatc 540
aagcgcgtcg taaacgcact gtccgtgccg gtggtggtga aagaagtcgg cgccgggctc 600
tcggtgccgg tggcgcgcca gcttgcggag gcaggcgtca cgatgctgga tgtggcaggc 660
gcaggcggca ccagctgggc ggccgtggaa ggtgaacgcg cggcgagcga ccatgcccgt 720
agcgtggcga tggccttcgc cgactggggc atacccaccg cgcaggcgct gcgccagata 780
catcaggcat tcccgtcgat gccgcttatc gcctctggcg gcattcgcga cggtatcgac 840
accgccaaag ccctggcgat gggcgcaagt ctcgtcgggc aggccgcggc ggtgctcggc 900
agcgcgacca cctccaccag cgcggtgctg gaccatttcg cagtcgtgat tgaacagttg 960
cgggtcgcct gtttttgcac cggcagcgcc agcctcagcg cgctgcgtga ggcccggctg 1020
gcgcgcgtcg gggatgagga a 1041
<210> 34
<211> 1149
<212> DNA
<213> Corynebacterium glutamicum
<400> 34
ttgcgagata actggccgtg tgatactcga atggacaatg gcatgacaat caccacagaa 60
cattcaactc atcctgatct tgatttcaat gatgagattt atcgggaact aaaccgcatc 120
tgcgcttcgc tatctcaaca gtgcagcaca tatcaaccag agttccgtac ctgcctagat 180
gctgctttcc aagctttgcg aggtggcaag ttaatccgcc ctcgaatgct actggggcta 240
tacaacacgc ttgtagacga tgacattgag gtcaaactca acaccgtttt acaggtagca 300
gtggctttag aactactgca tttttccctt ttggttcatg acgatgttat tgacggagac 360
ctctatcgcc gaggcaaact taattttatt gggcagattc tcatgcatcg cacacctgaa 420
agttttgcac aaatccagcg cgatccagag catctagatt gggcacaatc taatggactg 480
cttatgggaa atctttttct tgctgccacc catcaaatct tcgcgcgcct tgaccttcca 540
catcaccaac gggttcgact tttagattta ctcaaccaca cgataaatga cactattgtg 600
ggtgagtttc ttgatgtggg attaagcagc aaagccatca gccccaatat ggacattgct 660
ctagaaatga gtcggctaaa aacagccaca tacacttttg aacttccaat gagagcagcg 720
gcaattctcg cggaactacc tcaggagatt gaaacaaaga taggtgagat aggcacaaac 780
ttgggcatcg cttatcaatt gcaggacgat tacttatcta cttttggtga cgcagccgaa 840
cacggcaaag atgccttttc tgaccttcga gaaggaaaag aaactacaat tatcgccttc 900
gctcgagata ctgctaaatg gactgatatt caagacaact tcggctccgc agatctgagc 960
acctctcagg cagagcgaat tcaacatctt ctcatacagt gtggagcaaa gaatcactcc 1020
ttgaatgcca tctccgacca cttaaatatc tgccgttcga tgatcaaaac actaagcccc 1080
caggtagatc ccaaggctca aaatttatta cttaaacaag ttgagcaact agccagccgc 1140
aaatcttag 1149
<210> 35
<211> 915
<212> DNA
<213> Corynebacterium glutamicum
<400> 35
atgacacacc aaaattcgcc tctcttcctt aaaagtgcac tgagacttta caatcgggcc 60
tcattcaagg cttcacataa agtgatcgaa gaatattcga cgagcttcag tctgtctacg 120
tggttgctat ccccacgcat acgaaatgac atacgaaatc tctatgcagt agttcgtatc 180
gccgatgaga ttgtcgacgg cactgcacat gccgctggtt gctcaactgc caaaatcgaa 240
gagattctcg atgcctatga aattgcggtt cttgcagcac cacaacaacg cttcaacaca 300
gatcttgttt tacaagctta tggtgaaact gcccgacgct gtgatttcga acaagagcat 360
gtaatagcct tctttgcatc aatgcgtaag gacctcaaag ctaatacaca cgacccagat 420
agcttcacaa cgtatgtcta tggctccgcg gaagttatag gcctgctttg tctcagcgtt 480
ttcaaccaag gtagaacgat tagcaaaaaa cggctagaga ttatgcaaaa cggagcccgc 540
tcattgggag cggcattcca gaaaattaac tttctccgtg acttggcaga agatcagcaa 600
aatttgggcc gattttattt ccccaaaacc agccaaggaa ctcttactaa agaacaaaaa 660
gaagatctca tcgctgatat ccgtcaagac ctagcaattg cccacgatgc atttccagaa 720
ataccagtgc aggctcgcat cggagtgatc tctgcttatt tgctctttca aaaactcact 780
gaccgaattg aggctactcc taccgccgat ttattgcggg agcgaatcag agttccactt 840
catatcaaac tctctacact cgctagagcc acgatgaaag gtctatctat gagcatctac 900
agaaagaatt cgtga 915
<210> 36
<211> 1647
<212> DNA
<213> Corynebacterium glutamicum
<400> 36
atgaaggtct cgactaaaac tccacgctcc tcaggtaccg ccgtagtcat aggcgcaggt 60
gttgctggtt tagccacttc tgcactttta gcacgtgatg gctggcaagt aactgttttg 120
gaaaaaaata ctgatgtcgg tggccgagct ggatcgcttg aaatatcagg ctttcctggc 180
tttcgatggg ataccggacc ttcttggtac ctcatgcccg aggcctttga ccatttcttc 240
gcactttttg gtgcatgtac ttctgattat ctcgatttgg tagaattaac gcctggttat 300
cgagtttttt ctggcacaca tgacgctgtc gatgtcccca ctgggcgtga agaagcaatt 360
gcgctattcg aatccatcga acccggcgcg ggtgcaaaac taggaaatta tcttgatagc 420
gcggcagacg cctatgacat tgccattgat agattccttt ataataattt ctccacgtta 480
ggcccgctgc ttcaccggga tgtactgacc cgagctggcc gactgttttc tctactgacc 540
cgttctttac aaaagtacgt aaatagtcaa ttcagtagcc cggtgttgcg ccagatccta 600
acctatccag cagtcttcct gtcttcccga cccactacta ccccatcgat gtaccacttg 660
atgagtcata ccgatttggt gcagggagtg aaatacccta taggtggttt tactgcagtg 720
gttaacgctc tgcatcagtt agcgctggaa aacggggttg agtttcaact cgattctgag 780
gtcatttcca tcaacactgc ttcatcgagg ggcaacacaa gcgccacagg tgtgagcttg 840
cttcacaaca gaaaagtgca aaatctagat gcggatcttg tggtttcagc aggcgaccta 900
caccatacag aaaataatct gcttccccgg gaacttcgaa cctatcccga acgatattgg 960
tccaatcgca atcctggaat tggagcggta ttaatcctcc tgggcgtaaa aggagagtta 1020
ccccagctcg accatcacaa ccttttcttc agtgaagatt ggacagatga ttttgctgta 1080
gttttcgacg ggcctcaact tacccgcccc cacaatgcat caaattccat ttatgtctcc 1140
aagccttcaa cgtccgaaga cggcgttgca cctgctggat acgaaaacct ttttgtttta 1200
attccgacca aggcctctag cagcatcggc cacggtgatg cgtatatgca gtcggcttca 1260
gcatccgtgg aaacaatcgc gtcacatgca atcaatcaaa ttgctacgca agccggcatc 1320
cctgacctca ctgaccgaat tgtggtcaaa cgcaccattg gccctgcgga ttttgagcac 1380
cgctaccatt catgggtagg cagtgcgctg ggtccagcac ataccctcag acagtccgct 1440
ttcttaagag ggcgcaatag ctcccgcaag gtcaataacc tcttctattc cggtgccacc 1500
accgtcccgg gtgtaggaat acccatgtgt ttaatttctg ccgagaatat tattaagcgt 1560
ttacatgccg ataccagtgc aggaccactg cccgaaccat tgccgcctaa aacgacacca 1620
tctcaaaaga cctcatacga tcattaa 1647
<210> 37
<211> 588
<212> DNA
<213> Corynebacterium glutamicum
<400> 37
ttactctgcg tcaaacgctt ccaggatggc ttggcgcagc tcaggggcgc taagctgatc 60
cactagccat ggagaaaaca caaatggtgt ggcatcaaca gcgtcgaaaa gcttctgcgg 120
ttccgcccac tcgaactcct ccacctcatc atccagtggc tccacaaatt cccccaccgc 180
taaacgcacg aggtggaccg ggcacaactc ccactccaca atgccggacg cgtcgacagc 240
acggtactgg taatcaggca gaatctcttg aatatccaag aaagaatcta cctccagccc 300
caactcatcg acacccctgc gacgaatcgc atccgcgttt gtctcatccg gaccagggtg 360
cccacacata gagttcgtcc acacaccagg ccatgtcttc ttcgacaatg cacgacgcgt 420
caccaacagc tccccacgcg ggttcaaaat ataggtggaa aacgcgaaat gcagaggcgt 480
gtccttagtg tgcaccgtag ctttcggcgc agtaccaata ggattgccct cggaatcagc 540
taaaacaacc agttcaacct cagtagtcat gcccctaagc ttagacac 588
<210> 38
<211> 1881
<212> DNA
<213> escherichia coli
<400> 38
atggaattca ggaggcccct gatgagtttt gatattgcca aatacccgac cctggcactg 60
gtcgactcca cccaggagtt acgactgttg ccgaaagaga gtttaccgaa actctgcgac 120
gaactgcgcc gctatttact cgacagcgtg agccgttcca gcgggcactt cgcctccggg 180
ctgggcacgg tcgaactgac cgtggcgctg cactatgtct acaacacccc gtttgaccaa 240
ttgatttggg atgtggggca tcaggcttat ccgcataaaa ttttgaccgg acgccgcgac 300
aaaatcggca ccatccgtca gaaaggcggt ctgcacccgt tcccgtggcg cggcgaaagc 360
gaatatgacg tattaagcgt cgggcattca tcaacctcca tcagtgccgg aattggtatt 420
gcggttgctg ccgaaaaaga aggcaaaaat cgccgcaccg tctgtgtcat tggcgatggc 480
gcgattaccg caggcatggc gtttgaagcg atgaatcacg cgggcgatat ccgtcctgat 540
atgctggtga ttctcaacga caatgaaatg tcgatttccg aaaatgtcgg cgcgctcaac 600
aaccatctgg cacagctgct ttccggtaag ctttactctt cactgcgcga aggcgggaaa 660
aaagttttct ctggcgtgcc gccaattaaa gagctgctca aacgcaccga agaacatatt 720
aaaggcatgg tagtgcctgg cacgttgttt gaagagctgg gctttaacta catcggcccg 780
gtggacggtc acgatgtgct ggggcttatc accacgctaa agaacatgcg cgacctgaaa 840
ggcccgcagt tcctgcatat catgaccaaa aaaggtcgtg gttatgaacc ggcagaaaaa 900
gacccgatca ctttccacgc cgtgcctaaa tttgatccct ccagcggttg tttgccgaaa 960
agtagcggcg gtttgccgag ctattcaaaa atctttggcg actggttgtg cgaaacggca 1020
gcgaaagaca acaagctgat ggcgattact ccggcgatgc gtgaaggttc cggcatggtc 1080
gagttttcac gtaaattccc ggatcgctac ttcgacgtgg caattgccga gcaacacgcg 1140
gtgacctttg ctgcgggtct ggcgattggt gggtacaaac ccattgtcgc gatttactcc 1200
actttcctgc aacgcgccta tgatcaggtg ctgcatgacg tggcgattca aaagcttccg 1260
gtcctgttcg ccatcgaccg cgcgggcatt gttggtgctg acggtcaaac ccatcagggt 1320
gcttttgatc tctcttacct gcgctgcata ccggaaatgg tcattatgac cccgagcgat 1380
gaaaacgaat gtcgccagat gctctatacc ggctatcact ataacgatgg cccgtcagcg 1440
gtgcgctacc cgcgtggcaa cgcggtcggc gtggaactga cgccgctgga aaaactacca 1500
attggcaaag gcattgtgaa gcgtcgtggc gagaaactgg cgatccttaa ctttggtacg 1560
ctgatgccag aagcggcgaa agtcgccgaa tcgctgaacg ccacgctggt cgatatgcgt 1620
tttgtgaaac cgcttgatga agcgttaatt ctggaaatgg ccgccagcca tgaagcgctg 1680
gtcaccgtag aagaaaacgc cattatgggc ggcgcaggca gcggcgtgaa cgaagtgctg 1740
atggcccatc gtaaaccagt acccgtgctg aacattggcc tgccggactt ctttattccg 1800
caaggaactc aggaagaaat gcgcgccgaa ctcggcctcg atgccgctgg tatggaagcc 1860
aaaatcaagg cctggctggc a 1881
<210> 39
<211> 1911
<212> DNA
<213> Corynebacterium glutamicum
<400> 39
ttattccccg aacagggaat ccagccatcc aacaacagtg gtttcaatgc cgtcggcgtc 60
gaggccataa tcggcgagca cttcattgcg ggacgcgtga tccaggtact tctggggcac 120
ggcgatttgt cggcgagggg tatccacctc agaggcgtta agcgcatcag agagcaagga 180
tcccacgccg ccgtggatga cgccgtcttc gatggtgatc acgaggtcat gatcatcaga 240
cagcgcgacc aaggactgcg ggatggggac aatccagcgg gggtcaacaa ccgtgacgtt 300
cacgccgtgc tgtttaatcc tggaagcaac gtcaagtgca acagttgcgc gctcgcctac 360
cgcaatgatg agaactgatg gcgcatcgtc ggttgattca acgtcagtgg cgtcttcata 420
tgcgaggaca tccacgccgt cttccaaggt gtcgatagca acaattggag ttggcaagtc 480
gcccttgggg aaacgcacaa ctgtggggcc atcatcgatg gaaatagcct cattgagcag 540
ctcacgcaag gaatcctcat cacgtggtgc cgccacctgc acgcctggaa cgatcgaggt 600
cagcgccata tcccagacgc cattgtggct cgctccatcc gaacccgtga cacctgagcg 660
atcaagcacc aaagtaacag gctggttgag catgcccaca tccatgagca gctgatcaaa 720
agcgcggttc aagaacgtgg agtaaatagc caccacaggg tgttttccac ccaatgcgag 780
gcctgcggca gaagttaccg cgtgctgctc agcaatgccg acatcaaaga atcggttggg 840
gaaattggct tcgaacttgg acagaccggt aggacctgcc atcgcggcgg tgatggcaac 900
aacgttttca ttctgcgcac caatcttgac cagctcatcg ctgaacacag aggtccaacc 960
gggctttgat gcagatttag gagctcctgt gagcggatcg atgacgcccg tggagtgcat 1020
caattcgtcc aaatcctgct cagcaggcgc gtaaccacga cccttttcgg tgaccatgtg 1080
cacgatgatg gggccatcat aatcatgagc gtatttcagc gcattgtcga cagctttttg 1140
gttatgtcca tcaaccggac ccacgtattt catgcccagt tcagggaaca tttcggtggg 1200
aatgacggtg ctcttcacac cttctttaaa tgcatggagc gcttcaaaag tacgctcccc 1260
tacccacccc atggatttca gggacgtctt gcccttttcc atgaagcgat catagaaagg 1320
ctgcatgcga aggcccgcaa ggttttccgc aaatccgcca atggttggag aataactccg 1380
gccattgtca ttgactacga caacaacttt gcggtcttta ccagcagcaa tattgttcag 1440
tgcttcccaa cacatgccgc cagttagagc gccatcacca acgacagcaa ccacactatg 1500
cgtggtatcg ccatccaact gcttggcttt agacaaacca tccgcataag acaaggccgc 1560
cgaagcatgc gaagactcag tccaatcgtg ctcactttca gcacggcagg tgtaaccaga 1620
aaggccatct ttttgacgca aagaatcaaa atctttagcg cgacccgtca ggatcttatg 1680
cacataggac tggtgagaag tatcaaagat gatcgggtct tgaggcgaat cgaaaactcg 1740
atgaagaccg atggttaatt ccactacgcc caaatttgga cctaagtggc caccagttgc 1800
tgcgacttta tcgaccagga aagttcggat ttctttggca agagcgtcca aatcctcatc 1860
attaagggcc tttaagtcag caggtgttga aatactgttc agaattccca t 1911
<210> 40
<211> 2412
<212> DNA
<213> Enterococcus faecalis
<400> 40
ttgaaaacag tagttattat tgatgcatta cgaacaccaa ttggaaaata taaaggcagc 60
ttaagtcaag taagtgccgt agacttagga acacatgtta caacacaact tttaaaaaga 120
cattccacta tttctgaaga aattgatcaa gtaatctttg gaaatgtttt acaagctgga 180
aatggccaaa atcccgcacg acaaatagca ataaacagcg gtttatctca tgaaattccc 240
gcaatgacag ttaatgaggt ctgcggatca ggaatgaagg ccgttatttt ggcgaaacaa 300
ttgattcaat taggagaagc ggaagtttta attgctggcg ggattgagaa tatgtcccaa 360
gcacctaaat tacaacgatt taattacgaa acagaaagct atgatgcgcc tttttctagt 420
atgatgtacg atgggttaac ggatgccttt agtggtcaag caatgggctt aactgctgaa 480
aatgtggccg aaaagtatca tgtaactaga gaagagcaag atcaattttc tgtacattca 540
caattaaaag cagctcaagc acaagcagaa gggatattcg ctgacgaaat agccccatta 600
gaagtatcag gaacgcttgt ggagaaagat gaagggattc gccctaattc gagcgttgag 660
aagctaggaa cgcttaaaac agtttttaaa gaagacggta ctgtaacagc agggaatgca 720
tcaaccatta atgatggggc ttctgctttg attattgctt cacaagaata tgccgaagca 780
cacggtcttc cttatttagc tattattcga gacagtgtgg aagtcggtat tgatccagcc 840
tatatgggaa tttcgccgat taaagccatt caaaaactgt tagcgcgcaa tcaacttact 900
acggaagaaa ttgatctgta tgaaatcaac gaagcatttg cagcaacttc aatcgtggtc 960
caaagagaac tggctttacc agaggaaaag gtcaacattt atggtggcgg tatttcatta 1020
ggtcatgcga ttggtgccac aggtgctcgt ttattaacga gtttaagtta tcaattaaat 1080
caaaaagaaa agaaatatgg agtggcttct ttatgtatcg gcggtggctt aggactcgct 1140
atgctactag agagacctca gcaaaaaaaa aacagccgat tttatcaaat gagtcctgag 1200
gaacgcctgg cttctcttct taatgaaggc cagatttctg ctgatacaaa aaaagaattt 1260
gaaaatacgg ctttatcttc gcagattgcc aatcatatga ttgaaaatca aatcagtgaa 1320
acagaagtgc cgatgggcgt tggcttacat ttaacagtgg acgaaactga ttatttggta 1380
ccaatggcga cagaagagcc ctcagtgatt gcggctttga gtaatggtgc aaaaatagca 1440
caaggattta aaacagtgaa tcaacaacgt ttaatgcgtg gacaaatcgt tttttacgat 1500
gttgcagacg ccgagtcatt gattgatgaa ctacaagtaa gagaaacgga aatttttcaa 1560
caagcagagt taagttatcc atctatcgtt aaacgcggcg gcggcttaag agatttgcaa 1620
tatcgtgctt ttgatgaatc atttgtatct gtcgactttt tagtagatgt taaggatgca 1680
atgggggcaa atatcgttaa cgctatgttg gaaggtgtgg ccgagttgtt ccgtgaatgg 1740
tttgcggagc aaaagatttt attcagtatt ttaagtaatt atgccacgga gtcggttgtt 1800
acgatgaaaa cggctattcc agtttcacgt ttaagtaagg ggagcaatgg ccgggaaatt 1860
gctgaaaaaa ttgttttagc ttcacgctat gcttcattag atccttatcg ggcagtcacg 1920
cataacaaag ggatcatgaa tggcattgaa gctgtcgttt tagctacagg aaatgataca 1980
cgcgctgtta gcgcttcttg tcatgctttt gcggtgaagg aaggtcgcta ccaaggtttg 2040
actagttgga cgctggatgg cgaacaacta attggtgaaa tttcagttcc gcttgcgtta 2100
gccacggttg gcggtgccac aaaagtctta cctaaatctc aagcagctgc tgatttgtta 2160
gcagtgacgg atgcaaaaga actaagtcga gtagtagcgg ctgttggttt ggcacaaaat 2220
ttagcggcgt tacgggcctt agtctctgaa ggaattcaaa aaggacacat ggctctacaa 2280
gcacgttctt tagcgatgac ggtcggagct actggtaaag aagttgaggc agtcgctcaa 2340
caattaaaac gtcaaaaaac gatgaaccaa gaccgagcct tggctatttt aaatgattta 2400
agaaaacaat aa 2412
<210> 41
<211> 1149
<212> DNA
<213> Enterococcus faecalis
<400> 41
atgacaattg ggattgataa aattagtttt tttgtgcccc cttattatat tgatatgacg 60
gcactggctg aagccagaaa tgtagaccct ggaaaatttc atattggtat tgggcaagac 120
caaatggcgg tgaacccaat cagccaagat attgtgacat ttgcagccaa tgccgcagaa 180
gcgatcttga ccaaagaaga taaagaggcc attgatatgg tgattgtcgg gactgagtcc 240
agtatcgatg agtcaaaagc ggccgcagtt gtcttacatc gtttaatggg gattcaacct 300
ttcgctcgct ctttcgaaat caaggaagct tgttacggag caacagcagg cttacagtta 360
gctaagaatc acgtagcctt acatccagat aaaaaagtct tggttgtagc agcagatatt 420
gcaaaatatg gattaaattc tggcggtgag cctacacaag gagctggggc ggttgcaatg 480
ttagttgcta gtgaaccgcg catcttggct ttaaaagagg ataatgtgat gctgacgcaa 540
gatatctatg acttttggcg tccaacaggc catccgtatc ctatggtcga tggtcctttg 600
tcaaacgaaa cctacatcca atcttttgcc caagtctggg atgaacataa aaaaagaacc 660
ggtcttgatt ttgcagatta tgatgcttta gcgttccata ttccttacac aaaaatgggc 720
aaaaaagcct tattagcaaa aatctccgac caaactgaag cagaacagga acgaatttta 780
gcccgttatg aagaaagcat catctatagt cgtcgcgtag gaaacttgta tacgggttca 840
ctttatctgg gactcatttc ccttttagaa aatgcaacga ctttaaccgc aggcaatcaa 900
attgggttat tcagttatgg ttctggtgct gtcgctgaat ttttcactgg tgaattagta 960
gctggttatc aaaatcattt acaaaaagaa actcatttag cactgctaga taatcggaca 1020
gaactttcta tcgctgaata tgaagccatg tttgcagaaa ctttagacac agatattgat 1080
caaacgttag aagatgaatt aaaatatagt atttctgcta ttaataatac cgttcgctct 1140
tatcgaaac 1149
<210> 42
<211> 879
<212> DNA
<213> Streptococcus pneumoniae
<400> 42
atgacaaaaa aagttggtgt cggtcaggca catagtaaga taattttaat aggggaacat 60
gcggtcgttt acggttatcc tgccatttcc ctgcctcttt tggaggtgga ggtgacctgt 120
aaggtagttc ctgcagagag tccttggcgc ctttatgagg aggatacctt gtccatggcg 180
gtttatgcct cactggagta tttgaatatc acagaagcct gcattcgttg tgagattgac 240
tcggctatcc ctgagaaacg ggggatgggt tcgtcagcgg ctatcagcat agcggccatt 300
cgtgcagtat ttgactacta tcaggctgat ctgcctcatg atgtactaga aatcttggtc 360
aatcgagctg aaatgattgc ccatatgaat cctagtggtt tggatgctaa gacctgtctt 420
agtgaccaac ctattcgctt tatcaagaac gtaggattta cagaacttga gatggattta 480
tccgcctatt tggtgattgc cgatacgggt gtttatggtc atactcgtga agccatccaa 540
gtggttcaaa ataagggcaa ggatgcccta ccgtttttgc atgccttggg agaattaacc 600
cagcaagcag aagttgcgat ttcacaaaaa gatgctgaag gactgggaca aatcctcagt 660
caagcgcatt tacatttaaa agaaattgga gtcagtagcc ctgaggcaga ctttttggtt 720
gaaacgactc ttagccatgg tgctctgggt gccaagatga gcggtggtgg gctaggaggt 780
tgtatcatag ccttggtaac caatttgaca cacgcacaag aactagcaga aagattagaa 840
gagaaaggag ctgttcagac atggatagag agcctgtaa 879
<210> 43
<211> 1011
<212> DNA
<213> Streptococcus pneumoniae
<400> 43
atgattgctg ttaaaacttg cggaaaactc tattgggcag gtgaatatgc tattttagag 60
ccagggcagt tagctttgat aaaggatatt cccatctata tgagggctga gattgctttt 120
tctgacagct accgtatcta ttcagatatg tttgatttcg cagtggactt aaggcccaat 180
cctgactaca gcttgattca agaaacgatt gctttgatgg gagacttcct cgctgttcgc 240
ggtcagaatt taagaccttt ttccctaaaa atctgtggca aaatggaacg agaagggaaa 300
aagtttggtc taggttctag tggcagcgtc gttgtcttgg ttgtcaaggc tttactggct 360
ctctataatc tttcggttga tcagaatctc ttgttcaagc tgactagcgc tgtcttgctc 420
aagcgaggag acaatggttc catgggcgac cttgcctgta ttgtggcaga ggatttggtt 480
ctttaccagt catttgatcg ccagaaggcg gctgcttggt tagaagaaga aaacttggcg 540
acagttctgg agcgtgattg gggatttttt atctcacaag tgaaaccaac tttagaatgt 600
gatttcttag tgggatggac caaggaagtg gctgtatcga gtcacatggt ccagcaaatc 660
aagcaaaata tcaatcaaaa ttttttaagt tcctcaaaag aaacggtggt ttctttggtc 720
gaagccttgg agcaggggaa agccgaaaaa gttatcgagc aagtagaagt agccagcaag 780
cttttagaag gcttgagtac agatatttac acgcctttgc ttagacagtt gaaagaagcc 840
agtcaagatt tgcaggccgt tgccaagagt agtggtgctg gtggtggtga ctgtggcatc 900
gccctgagtt ttgatgcgca atcttctcga aacactttaa aaaatcgttg ggccgatctg 960
gggattgagc tcttatatca agaaaggata ggacatgacg acaaatcgta a 1011
<210> 44
<211> 954
<212> DNA
<213> Streptococcus pneumoniae
<400> 44
atggatagag agcctgtaac agtacgttcc tacgcaaata ttgctattat caaatattgg 60
ggaaagaaaa aagaaaaaga gatggtgcct gctactagca gtatttctct aactttggaa 120
aatatgtata cagagacgac cttgtcgcct ttaccagcca atgtaacagc tgacgaattt 180
tacatcaatg gtcagctaca aaatgaggtc gagcatgcca agatgagtaa gattattgac 240
cgttatcgtc cagctggtga gggctttgtc cgtatcgata ctcaaaacaa tatgcctacg 300
gcagcgggcc tgtcctcaag ttctagtggt ttgtccgccc tggtcaaggc ttgtaatgct 360
tatttcaagc ttggattgga tagaagtcag ttggcacagg aagccaaatt tgcctcaggc 420
tcttcttctc ggagttttta tggaccacta ggagcctggg ataaggatag tggagaaatt 480
taccctgtag agacagactt gaaactagct atgattatgt tggtgctaga ggacaagaaa 540
aaaccaatct ctagccgtga cgggatgaaa ctttgtgtgg aaacctcgac gacttttgac 600
gactgggttc gtcagtctga gaaggactat caggatatgc tgatttatct caaggaaaat 660
gattttgcca agattggaga attaacggag aaaaatgctc tggctatgca tgctacgaca 720
aagactgcta gtccagcctt ttcttatctg acggatgcct cttatgaggc tatggccttt 780
gttcgccagc ttcgtgagaa aggagaggcc tgctacttta ccatggatgc tggtcccaat 840
gttaaggtct tctgtcagga gaaagacttg gagcatttgt cagaaatttt cggtcagcgt 900
tatcgcttga ttgtgtcaaa aacaaaggat ttgagtcaag atgattgctg ttaa 954
<210> 45
<211> 549
<212> DNA
<213> escherichia coli
<400> 45
atgcaaacgg aacacgtcat tttattgaat gcacagggag ttcccacggg tacgctggaa 60
aagtatgccg cacacacggc agacacccgc ttacatctcg cgttctccag ttggctgttt 120
aatgccaaag gacaattatt agttacccgc cgcgcactga gcaaaaaagc atggcctggc 180
gtgtggacta actcggtttg tgggcaccca caactgggag aaagcaacga agacgcagtg 240
atccgccgtt gccgttatga gcttggcgtg gaaattacgc ctcctgaatc tatctatcct 300
gactttcgct accgcgccac cgatccgagt ggcattgtgg aaaatgaagt gtgtccggta 360
tttgccgcac gcaccactag tgcgttacag atcaatgatg atgaagtgat ggattatcaa 420
tggtgtgatt tagcagatgt attacacggt attgatgcca cgccgtgggc gttcagtccg 480
tggatggtga tgcaggcgac aaatcgcgaa gccagaaaac gattatctgc atttacccag 540
cttaaataa 549
<210> 46
<211> 450
<212> DNA
<213> Corynebacterium glutamicum
<400> 46
ttgatcccta tcatcgatat ttcacaaaat gagcaagata gcgatatttt tatggccttt 60
atttatctag gtactctcct agttctcatt gggtgcatgg ctttgtgcga ccaccgttgg 120
aagctagcgt tcttccgcca tccgttacga gcaattcttt cggtaggtgc tgcatatatt 180
ggatttcttt tatgggatat atttggcatt attactggca ctttttatcg cggagactca 240
gcgtttatgt ccggtattaa ccttgcaccc catatgccca ttgaagaact ttttttctta 300
ttcttcctct gctacatcac cctcaacctt acctcggcag cagcattatg gcttaaagca 360
ccactgccta aaaaacccgg taaaaagtct cccctcacac cacagcgcga tactttccaa 420
ccaactacca ctcccgaggt tgaaccatga 450
<210> 47
<211> 393
<212> DNA
<213> Corynebacterium glutamicum
<400> 47
atgacttata tttttataag cattcctttt ttagcaatag ccatggtcct atttgtctta 60
aagctgcagt ctggaacacc taaactttta ccaatcaccg ctgtcagtgc ccttacccta 120
tgttccctaa ctatcatatt tgataacctc atggtttggg ctgatctctt tggatatggc 180
gatacccagc accttggcat ttggctcggt ttaatccccc tagaggatct tttctatccg 240
ctcttcgcag tacttctgat tcctgcccta tggttgcctg gaaatatgtt taaacgcagg 300
aaaaaacgtc cacaccattc cttacccacc atcgccaatg gaagcatcac tactagatcc 360
accaccacgc aatctgagcc agaaaagccg tag 393
<210> 48
<211> 864
<212> DNA
<213> Corynebacterium glutamicum
<400> 48
atgatggaaa aaataagact aattctattg tcatctcgcc ccattagctg gatcaatacc 60
gcctacccct ttggtctggc ctacctatta aatgcaggag agattgactg gctgttttgg 120
ctaggcatcg tattttttct tatcccgtat aacatcgcca tgtatggtat caacgatgtt 180
tttgattacg aatctgatat gcgtaatccc cgcaaaggcg gcgtcgaggg ggccgtgcta 240
ccgaaaagtt cccacagcac actgttatgg gcctcggcta tctcaacaat tcctttccta 300
gttattcttt tcatatttgg cacctggatg tcgtctttat ggctgacact ctcagtgcta 360
gcagtgattg cttattcagc accgaaattg cgttttaaag aacgcccctt tatcgatgct 420
ctaacatctt ctactcactt cacttcacct gcattaatcg gtgcaacgat cactggaaca 480
tctccttcag cagcgatgtg gatagcactg ggatcctttt tcttgtgggg catggccagt 540
cagatccttg gagcagtaca ggatgttaat gcagaccggg aagctaatct gagctcaatt 600
gccactgtaa ttggggcgcg tggagccatt cggctttcag tagtacttta tttactagct 660
gctgtgttag tcactacttt gcctaatccg gcgtggatca tcgggattgc gattctaact 720
tacgtattta atgccgcacg attttggaac attacagatg ccagttgtga acaggctaat 780
cgcagttgga aagttttcct gtggctgaac tactttgttg gtgctgtgat aacgatactg 840
ctaatagcaa ttcatcagat ataa 864
<210> 49
<211> 37
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 49
gcgcgaattc atggaccaat tggtgaaaac tgaagtc 37
<210> 50
<211> 37
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 50
gcgcgtcgac ttttaggatt taatgcaggt gacggac 37
<210> 51
<211> 36
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 51
gcgcgaattc aaaaatggtg agtggcagta aagcgg 36
<210> 52
<211> 33
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 52
gcgcgtcgac ttaggcgatt ttcatgaccg gtg 33
<210> 53
<211> 32
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 53
gcgcgaattc aaaaatgagc caaccgccgc tg 32
<210> 54
<211> 31
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 54
gcgcgtcgac ttaaacggga cgctgccaaa g 31
<210> 55
<211> 37
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 55
gcgcgaattc aaaaatgaaa aaaaccgttg tgattgg 37
<210> 56
<211> 35
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 56
gcgcgtcgac ttattgcaga tcctcaatca tcagg 35
<210> 57
<211> 39
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 57
gcgcgaattc aaaaatgcaa ccgcattatg atctgattc 39
<210> 58
<211> 37
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 58
gcgcgtcgac ttaacgatga gtcgtcataa tggcttg 37
<210> 59
<211> 38
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 59
gcgcgaattc aaaaatgggt ctgatgctga ttgattgg 38
<210> 60
<211> 38
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 60
gcgcgtcgac ttagtttttg attttgatac gggaagag 38
<210> 61
<211> 36
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 61
gcgcgcggcc gcatcgcttc gctgattaat tacccc 36
<210> 62
<211> 33
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 62
gcgcactagt acaatgagcc ttgctgcaac atc 33
<210> 63
<211> 34
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 63
gcgcggtacc atcgcttcgc tgattaatta cccc 34
<210> 64
<211> 35
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 64
gcgcgcggcc gcacaatgag ccttgctgca acatc 35
<210> 65
<211> 40
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 65
gcgcgatatc actagtatcg cttcgctgat taattacccc 40
<210> 66
<211> 33
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 66
gcgcgctagc acaatgagcc ttgctgcaac atc 33
<210> 67
<211> 34
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 67
gcgcgctagc atcgcttcgc tgattaatta cccc 34
<210> 68
<211> 33
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 68
gcgcagatct acaatgagcc ttgctgcaac atc 33
<210> 69
<211> 31
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 69
gcgcggatcc atcgcttcgc tgattaatta c 31
<210> 70
<211> 35
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 70
gcgcttaatt aaacaatgag ccttgctgca acatc 35
<210> 71
<211> 36
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 71
gcgcttaatt aaatcgcttc gctgattaat tacccc 36
<210> 72
<211> 38
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 72
gcgctctaga ggggaaactt aaagaaattc tattcttg 38
<210> 73
<211> 33
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 73
ataaagcttc ttcctgtctt cccgacccac tac 33
<210> 74
<211> 53
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 74
cccatccact aaacttaaac aaatttaatg atcgtatgag gtcttttgag atg 53
<210> 75
<211> 55
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 75
tgtttaagtt tagtggatgg gtcatgatgg aaaaaataag actaattcta ttgtc 55
<210> 76
<211> 37
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 76
aaacctgcag gtgattctgt tttggttact catcccg 37
<210> 77
<211> 19
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 77
actgcccgaa ccattgccg 19
<210> 78
<211> 22
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 78
aggccagacc aaaggggtag gc 22
<210> 79
<211> 30
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 79
gctaagcttg gctgttttgg cggatgagag 30
<210> 80
<211> 35
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 80
cgaatcgata gagtttgtag aaacgcaaaa aggcc 35
<210> 81
<211> 42
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 81
gctgccggca gatctcatat gccaatacgc aaaccgcctc tc 42
<210> 82
<211> 45
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 82
gctgaattca ctagtgcggc cgcttattcg ccattcaggc tgcgc 45
<210> 83
<211> 44
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 83
catactagta ggaggtaata aatatggttg cccaacaaac acga 44
<210> 84
<211> 40
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 84
cggctcgagt taatattttc tggcaacaat atattcggcg 40
<210> 85
<211> 43
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 85
gctctcgagg aggtaataaa tatgctcgat cctggcccca atc 43
<210> 86
<211> 36
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 86
gcagctagct tatgatgtca ccagactgtc ggcctc 36
<210> 87
<211> 42
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 87
gcagctagca ggaggtaata aatatgagcc aaccgccgct gc 42
<210> 88
<211> 29
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 88
ctcctctaga ttactaaacg ggacgctgc 29
<210> 89
<211> 44
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 89
ccatctagag gaggtaataa aatatgaagg acaaggaact gagc 44
<210> 90
<211> 33
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 90
cgtgcggccg cttattcctc atccccgacg cgc 33
<210> 91
<211> 49
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 91
cggtcgacag gaggtaataa atatgcaacc gcattatgat ctgattctc 49
<210> 92
<211> 43
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 92
cgcctgcagg aggcctttaa cgatgagtcg tcataatggc ttg 43
<210> 93
<211> 48
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 93
cgaggcctag gaggtaataa atatgggtct gatgctgatt gattggtg 48
<210> 94
<211> 40
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 94
cgcctgcagg ttagtttttg attttgatac gggaagagtg 40
Claims (19)
- 레티노이드 생산에 관여하는 효소를 코딩하는 유전자를 포함하는 사카로마이세스 속 미생물.
- 청구항 1에 있어서, 상기 유전자는 서열번호 1 내지 9로 이루어진 군에서 선택되는 적어도 하나의 아미노산 서열을 코딩하는 것인, 미생물.
- 청구항 1에 있어서, 상기 유전자는 서열번호 2, 3 및 10 중 적어도 하나; 서열번호 4 및 11 중 적어도 하나; 서열번호 5, 6 및 12 중 적어도 하나; 서열번호 7; 서열번호 8; 및 서열번호 9, 13 및 21 중 적어도 하나;의 아미노산 서열을 코딩하는 것인, 미생물.
- 청구항 3에 있어서, 서열번호 1의 아미노산 서열을 코딩하는 유전자를 더 포함하는, 미생물.
- 청구항 1에 있어서, 사카로마이세스 세레비지에인, 미생물.
- 청구항 1에 있어서, 사카로마이세스 세레비지에 Y2805인, 미생물.
- 레티노이드 생산에 관여하는 효소를 코딩하는 유전자를 포함하는 코리네박테리움 속 미생물.
- 청구항 7에 있어서, 상기 유전자는 서열번호 2 내지 9로 이루어진 군에서 선택되는 적어도 하나의 아미노산 서열을 코딩하는 것인, 미생물.
- 청구항 7에 있어서, 상기 유전자는 서열번호 2, 3 및 10 중 적어도 하나; 서열번호 4 및 11 중 적어도 하나; 서열번호 5, 6 및 12 중 적어도 하나; 서열번호 7; 서열번호 8; 및 서열번호 9, 13 및 21 중 적어도 하나;의 아미노산 서열을 코딩하는 것인, 미생물.
- 청구항 9에 있어서, 서열번호 14 및 15 중 적어도 하나의 아미노산 서열을 코딩하는 유전자를 더 포함하는, 미생물.
- 청구항 9에 있어서, 서열번호 16 내지 20의 아미노산 서열을 코딩하는 유전자를 더 포함하는, 미생물.
- 청구항 7에 있어서, 서열번호 22 내지 24로 이루어진 군에서 선택된 적어도 하나의 아미노산 서열을 코딩하는 유전자를 불활성화 또는 결손화한, 미생물.
- 청구항 6에 있어서, 코리네박테리움 글루타미쿰인, 미생물.
- 청구항 6에 있어서, 코리네박테리움 글루타미쿰 ATCC13032인, 미생물.
- 청구항 1 내지 14 중 어느 한 항에 있어서, 유전자는 벡터에 의해 도입된 것인, 미생물.
- 청구항 1 내지 15 중 어느 한 항의 미생물을 배양하는 단계; 및
상기 미생물의 배양물로부터 레티노이드를 분리하는 단계
를 포함하는 레티노이드의 생산 방법.
- 청구항 16에 있어서, 상기 미생물의 배양은 친유성 물질을 포함하는 배지 중에서 수행되는 것인, 방법.
- 청구항 17에 있어서, 상기 분리는 친유성 물질 상으로부터 되는 것인, 방법.
- 청구항 17에 있어서, 상기 친유성 물질은 옥탄, 데칸, 도데칸, 테트라데칸, 피토스쿠알란, 미네랄 오일, 이소프로필 미리스테이트, 세틸 에틸헥사노에이트, 디옥타노일 데카노일 글리세롤, 스쿠알란, 또는 이들의 조합인, 방법.
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