KR20040077910A

KR20040077910A - 프리프로타키키닌 유전자의 유전자 다형성

Info

Publication number: KR20040077910A
Application number: KR10-2004-7011752A
Authority: KR
Inventors: 포에른즈레어도로시; 하쉬모토라라; 리지아; 루에딘에릭; 슬레이즈트앙드레; 반칸피에르
Original assignee: 에프. 호프만-라 로슈 아게
Priority date: 2002-01-31
Filing date: 2003-01-23
Publication date: 2004-09-07
Also published as: CA2473128A1; PE20030816A1; US20060228752A1; HRP20040669A2; JP2005515788A; US20030158187A1; BR0307257A; PA8564401A1; MXPA04007353A; UY27634A1; CN1625603A; RU2004126440A; NO20043613L; GT200300020A; WO2003064685A3; AR038334A1; PL371731A1; ZA200405516B; EP1472377A2; WO2003064685A2

Abstract

본 발명은 프리프로타키키닌(NKNA) 유전자에서의 단일 뉴클레오타이드 다형성을 인간에게 투여되는 약학 활성 화합물의 효능 및 상용성과 연관시키는 방법에 관한 것이다. 본 발명은 또한 NKNA 유전자에서 하나 이상의 단일 뉴클레오타이드 다형성을 측정함을 포함하는, 인간에게 투여되는 약학 활성 화합물의 효능 및 상용성을 측정하는 방법에 관한 것이다. 상기 방법은 NKNA 유전자에서 특정한 단일 뉴클레오타이드 다형성을 측정하는 단계, 및 NKNA에서의 다형성을 기준으로 인간에서 약학 활성 화합물의 효능과 상용성을 측정하는 단계에 근거한다. 본 발명은 또한 이들의 서열 이내에 본원에 정의된 바와 같은 다형성을 포함하는 단리된 핵산; 이런 핵산에 하이브리드를 형성할 수 있는 핵산 프라이머 및 올리고뉴클레오타이드 프로브; NKNA 유전자에서 다형성을 측정하기 위한 이런 프로브 및 프라이머 중 하나 이상을 포함하는 진단 키트; NK-1 수용체 길항제 및 다형성에 대해 시험되는 인간에게 약물을 투여하기 위한 사용 설명서를 포함하는 약학 팩(pack); 및 NKNA 유전자의 다형성에 대한 서열 정보가 저장되어 있는 컴퓨터 판독형 매체에 관한 것이다.

Description

프리프로타키키닌 유전자의 유전자 다형성{GENETIC POLYMORPHISMS IN THE PREPROTACHYKININ GENE}

약물유전학은 약물 반응의 변동에서 개인사이의 유전학적 변동의 역할을 연구하기 위해 다형성에 대한 지식을 이용하는 접근법이고, 변동은 종종 약물 대사에서의 개인의 차이에서 유발된다. 약물유전학은 특정한 약학적 제제를 이용한 치료에 가장 적합한 환자를 확인하기 위해 사용된다. 이 접근법은 약물 선택 과정을 돕기 위해 약학적 조사에 이용될 수 있다. 약물유전학에 대한 세부 사항 및 다형성 검출의 다른 용도는 린더(Linder) 등의 문헌[(1997), Clinical Chemistry, 43, 254], 마샬(Marshall)의 문헌[1997, Nature Biotechnology, 15, 1249], 국제 특허 출원 제 WO97/40462 호, 문헌[Spectra Biomedical] 및 샤퍼(Schafer) 등의 문헌[1998, Nature Biotechnology, 16, 33]에서 발견될 수 있다.

더욱이, 다형성은 DNA 삽입, 결실, 복제 및 뉴클레오타이드 치환으로부터 발생되는 2000가지 이상의 인간의 병리학적 신드롬과 관련되어 있다. 개인에게서 유전적 다형성을 발견하고, 가족 내에서 이들 변동을 추적하면 임상적 진단을 확인하고, 전임상 및 준임상적으로 질병에 걸린 개인뿐만 아니라 운반체에서의 질병에 대한 소인 및 질병 상태 둘 모두를 진단하기 위한 수단을 제공한다. 정확한 진단에 기초한 카운슬링은 환자가 가능한 아이의 육아, 진행중인 임신 및 질병에 걸린 개인에 대한 초기의 조치에 대해 정보를 갖고 결정할 수 있게 해준다.

병리학적인 신드롬과 연관된 다형성은 매우 다양하고, 결론적으로 확인하기 어려울 수 있다. 유전자 내부의 여러 개의 대립 유전자는 흔한 일이기 때문에, 질병과 연관된 대립 유전자를 (질병과 연관되지 않은) 중립적인 대립 유전자와 구별해야만 한다. 대부분의 대립 유전자는 식별할 수 없는, 정상적으로는 활성인 유전자 생성물을 만들어 내거나, 눈 색깔과 같은 일반적으로 다양한 특징을 발현하는 중립적인 다형성이다. 이와는 대조적으로, 일부 다형성 대립 유전자는 겸상 적혈구성 빈혈과 같은 임상적 질병과 연관되어 있다. 더욱이, 질병과 연관된 다형성의 구조는 매우 다양하고, 겸상 적혈구성 빈혈에서 일어날 수 있는 것과 같은 단일 지점 돌연변이에서 발생되거나, 또는 부셔지기 쉬운 X 증후군 및 헌팅톤 무도병에서 나타나는 것처럼 뉴클레오타이드 반복의 확장으로부터 기인할 수 있다.

뉴로키닌-1(NK-1) 또는 물질 P는 타키키닌 계열의 펩타이드에 속하는, 자연적으로 발생하는 운데카펩타이드이고, 타키키닌 계열은 혈관외 평활근 조직에 대한 이들의 즉각적인 수축 활성 때문에 이러한 이름을 얻었다. 인간에서의 3가지의 공지된 타키키닌은 2가지 유전자인 NKNA 및 NKNB에 의해 암호화된다. NKNA 유전자는 물질 P 및 뉴로키닌 A 둘모두를 함유하는 전구체를 암호화하고, 반면 NKNB 유전자는 뉴로키닌 B만을 함유하는 전구체를 암호화한다(뉴로키닌 A는 이전에는 물질 K로서 알려졌다). 클로닝된 인간의 유전자 및 설치류-인간의 체세포 하이브리드 패널에서 유래된 프로브를 이용하여, 보너(Bonner) 등은 문헌[Cytogenet. Cell Genet., 1987, 46, 584]에서 NKNA 유전자를 7q21-q22에, NKNB 유전자를 12q13-q21에 할당하였다. 타키키닌 분자의 특성을 규명하면 이들이 단백질분해 과정에 의해 프리프로타키키닌으로 알려진 공통의 전구체 분자에서 나옴을 보여준다. 메시지의 3가지 형태(알파, 베타 및 감마)는 서로 다른 스플라이싱에 의해 발생한다(문헌[Proc. Nat. Acad. Sci., 1987, 84, 881-885]. 프리프로타키키닌의 베타와 감마 형태는물질 P 및 뉴로키닌 A 둘모두를 암호화하는 반면, 알파 형태는 물질 P 서열만을 함유한다.

물질 P에 대한 뉴로펩타이드 수용체(NK-1 수용체)는 G 단백질-커플링된 수용체의 슈퍼패밀리의 일종이다. 이는 포유동물의 신경계(특히, 뇌와 척수 신경절), 순환계 및 말초 조직(특히 십이지장과 공장) 전체에 광범위하게 분포되어 있고, 다수의 다양한 생물학적 과정의 제어에 관여한다.

포유동물의 타키키닌 물질 P의 중추적 및 말초적 작용은 편두통, 류마티스성 관절염, 천식 및 염증성 대장 질환을 포함하는 다양한 염증성 질환, 또한 구토 반사의 중재 및 중추 신경계(CNS) 질환(예를 들면, 파킨슨 병(Neurosci. Res., 1996, 7, 187-214), 불안증(Can. J. Phys., 1997, 75, 612-621) 및 우울증(Science, 1998, 281, 1640-1645))의 조절과 연관되어 있다.

통증, 두통, 특히 편두통, 알츠하이머 병, 다발성 경화증, 모르핀 금단 현상의 약화, 심혈관 변화, 부종, 예를 들면 열 손상으로 인한 부종, 만성 염증성 질병, 예를 들면 류마티스성 관절염, 천식/기관지 과반응성 및 다른 호흡기 질환(알레르기성 비염), 장의 염증성 질환(궤양성 대장염 및 크론 병 포함), 눈 손상 및 눈의 염증성 질병에 NK-1 수용체 길항물질이 유용하다는 증거는 문헌["Tachykinin Receptor and Tachykinin Receptor Antagonist", J. Auton. Pharmacol., 1993, 13, 23-93]에 개시되어 있다.

또한, NK-1 수용체 길항제는 타키키닌, 특히 물질 P의 과다 또는 불균형과 연관된 다수의 생리학적 질병의 치료를 위해 개발되고 있다. 물질 P가 연관된 질병의 예는 불안증, 우울증 및 정신병과 같은 중추 신경계 질병을 포함한다(WO 95/16679, WO95/18124 및 WO95/23798).

NK-1 수용체 길항제는 또한 멀미의 치료와 치료로 인한 구토의 치료에 유용하다.

또한, 문헌[The New England Journal of Medicine, 1999, 340(3), 190-195]에서는 시스플라틴에 의해 유도되는 구토가 선택적 NK-1 수용체 길항제에 의해 감소됨을 개시하고 있다.

특정한 형태의 요실금의 치료를 위한 NK-1 수용체 길항제의 유용성은 또한 문헌[Neuropeptides, 1998, 32(1), 1-49] 및 문헌[Eur. J. Pharmacol., 1999, 383(3), 297-303]에 개시되어 있다.

또한, 미국 특허 제 5,972,938 호는 타키키닌 수용체 길항제, 예를 들면 NK-1 수용체 길항제를 투여함으로써 정신면역학적 또는 정신신체적 질환을 치료하는 방법을 개시한다.

문헌[Life Sci., 2000, 67(9), 985-1001]은 성상세포가 물질 P(이는 CNS 전개, 감염 및 상처에서 반응성 성상세포를 위한 중요한 자극이다)를 포함하는 다양한 신경전달물질에 대한 작용성 수용체를 발현함을 개시하고 있다. 뇌 종양에서, 성상 세포에서 기원한 악성 신경교 세포는 NK-1 수용체를 통해 타키키닌에 의해 유발되어 가용성 매개체들을 분비하고, 이들의 증식 속도를 증가시킨다. 따라서, 선택적인 NK-1 수용체 길항제들은 암의 치료에서 악성 신경교종을 치료하기 위한 치료학적 접근법으로서 유용할 수 있다.

문헌[Nature(London), 2000, 405(6783), 180-183]에서는 NK-1 수용체가 유전적으로 파괴된 마우스의 경우 모르핀의 보상 성질이 없어진다는 것을 개시하고 있다. 결론적으로, NK-1 수용체 길항제는 오피에이트 및 니코틴과 같은 중독성 약물의 금단 현상의 치료와 이들의 남용/갈망을 감소시키는데 유용할 수 있다.

NK-1 수용체 길항제는 또한 외상성 뇌 손상의 치료에 유리한 효과를 갖는다(2000년 10월 17-20일에 프랑스 라 그랑 모뜨에서 개최된 International Tachykinin Conference 2000에서 님모 교수의 "Neurokinin 1(NK-1) Receptor Antagonists Improve the Neurological Outcome Following Traumatic Brain Injury"(저자: A. J. Nimmo, C.J. Bennett, X. Hu, I. Cernak, R. Vink)라는 제목의 구두 발표).

NK-1 길항제를 이용한 치료에 대한 다른 증후는 양성 전립선 과형성(BPH)이며, BPH는 진행성일 수 있고, 뇨 잔류, 감염, 방광 결석 및 신장 기능부진을 야기하고, 제 EP 01109853.0 호에 보고되어왔다.

임상 실험은 약제, 예를 들면 NK-1 수용체 길항제를 이용한 치료에 대한 환자 반응이 종종 불균일함을 보여준다. 따라서, 약제 디자인 및 치료에 대한 개선된 접근법이 필요하다.

놀랍게도, NKNA 유전자의 단일 뉴클레오타이드 다형성이 인간에게 투여되는 약학 활성 화합물, 예를 들면 NK-1 수용체 길항제의 효능 및 상용성을 측정하는데 사용될 수 있음이 발견되었다.

본 발명은 프리프로타키키닌(NKNA) 유전자의 단일 뉴클레오타이드 다형성을 인간에게 투여되는 약학 활성 화합물의 효능 및 상용성과 연관시키는 방법에 관한 것이다. 본 발명은 또한 NKNA 유전자의 하나 이상의 단일 뉴클레오타이드 다형성을 측정함을 포함하는, 인간에게 투여되는 약학 활성 화합물의 효능 및 상용성을 측정하는 방법에 관한 것이다. 상기 방법은 NKNA 유전자에서 특정한 단일 뉴클레오타이드 다형성을 측정하는 단계, 및 NKNA에서의 다형성을 기준으로 인간에서 약학 활성 화합물의 효능과 상용성을 측정하는 단계에 근거한다. 본 발명은 또한 이들의 서열 이내에 본원에 정의된 바와 같은 다형성을 포함하는 단리된 핵산; 이런 핵산에 하이브리드를 형성할 수 있는 핵산 프라이머 및 올리고뉴클레오타이드 프로브; NKNA 유전자의 다형성을 측정하기 위한 이런 프라이머 및 프로브중 하나 이상을 포함하는 진단 키트; NK-1 수용체 길항제 및 다형성에 대해 시험되는 인간에게 약물을 투여하기 위한 사용 설명서를 포함하는 약학 팩(pack); 및 NKNA 유전자의 다형성에 대한 서열 정보가 저장되어 있는 컴퓨터 판독형 매체에 관한 것이다.

도 1은 NKNA 유전자의 게놈 구조와 유전자에서 발견되는 다형성에 대한 것이다.

도 2a 내지 2c는 프리프로타키키닌 유전자를 포함하고 있는 수탁 번호 EM＿HUM1:AC004140.1에 의해 한정되는 PAC 클론 DJ0841B21의 게놈 서열의 일부이다.

도 3은 도 2에 정의된 바와 같은 위치를 갖는 NKNA 유전자에서의 확인된 단일 뉴클레오타이드 다형성이다.

도 4는 구토 시험 전 농도가 20ng/ml 초과인 2-(3,5-비스-트라이플루오로메틸-페닐)-N-메틸-N-(6-모폴린-4-일-4-o-톨릴-피리딘-3-일)-아이소부티르아마이드를 이용한 29개의 위치 41172 유전자형 시험 결과에 대한 2x2 분할표이다.

본 발명은 NKNA 유전자의 단일 뉴클레오타이드 다형성을 인간에게 투여되는 약학 활성 화합물의 효능 및 상용성과 연관시키는 방법에 관한 것이다. 본 발명은 또한, NKNA 유전자의 하나 이상의 단일 뉴클레오타이드 다형성을 측정함을 포함하는, 인간에게 투여되는 약학 활성 화합물의 효능 및 상용성을 측정하는 방법에 관한 것이다. 상기 방법은 인간 샘플에서 NKNA 유전자의 하나 이상의 단일 뉴클레오타이드 다형성의 측정에 근거하고, 도 2의 위치로 한정된 바와 같은 NKNA 유전자의 인트론(intron) 1의 위치 41172의 뉴클레오타이드를 측정하는 단계, 및 NKNA 유전자에서의 다형성에 의해 인간의 상태를 결정하는 단계를 포함한다. 다르게는 또는이에 추가하여, 이 방법은 도 2에 의해 한정된 바와 같은 NKNA 유전자의 인트론 1의 위치 41112, NKNA 유전자의 인트론 5의 위치 37434, NKNA 유전자의 인트론 6의 위치 37114, 37025, 33949 및 NKNA 유전자의 3' UTR의 위치 33612에서 인간의 핵산의 서열을 측정하는 단계를 포함한다. 본 발명은 또한, 서열 내부에 이전에 정의된 위치에서의 다형성을 포함하는 단리된 핵산; 이런 핵산에 하이브리드를 형성할 수 있는 핵산 프라이머 및 올리고뉴클레오타이드 프로브; NKNA 유전자에서의 다형성을 검출하기 위한 이런 프라이머 및 프로브중 하나 이상을 포함하는 진단 키트; NK-1 수용체 길항제 및 다형성에 대해 시험되는 인간에게 약물을 투여하기 위한 사용 설명서를 포함하는 약학 팩(pack); 및 NKNA 유전자에서의 다형성에 대한 서열 정보가 저장되어 있는 컴퓨터 판독형 매체에 관한 것이다.

본 발명은 NKNA 유전자에서의 단일 뉴클레오타이드 다형성의 발견에 기초한다.

용어 "다형성"은 삽입, 결실, 치환, 및 복제를 포함하는 반복 서열을 포함하는 핵산 서열에서 발생하는 것으로 알려진 모든 변체를 포함하는 것으로 널리 정의된다.

"폴리뉴클레오타이드" 및 "핵산"은 뉴클레오타이드 염기인 A, T, C 및 G로 구성되는 DNA, 또는 염기, A, U(T 대신), C 및 G로 구성되는 RNA일 수 있는 단일 또는 이중 나선 분자를 의미한다. 폴리뉴클레오타이드는 암호화 나선 또는 그의 상보체를 나타낼 수 있다. 폴리뉴클레오타이드 분자는 자연적으로 발생하는 서열과 동일한 서열일 수도 있거나, 또는 자연적으로 발생하는 서열에서 발견되는 것과동일한 아미노산을 암호화하는 다른 코돈을 포함할 수도 있다(르윈(Lewin)의 문헌["Gene V", Oxford University Press, Chapter 7, 1994, 171-174] 참고). 또한, 폴리뉴클레오타이드 분자는 개시된 바와 같은 아미노산의 보전성 치환을 나타내는 코돈을 포함할 수 있다. 폴리뉴클레오타이드는 게놈 DNA 또는 cDNA를 나타낼 수 있다.

본원에서 정의된 바와 같은 "NKNA 유전자"는 인간의 염색체 7q21.1-q31.1에 위치하고 서열 번호 1과 도 2에 나타난 서열을 핵산 내부에 나타낸다. NKNA 유전자는 도 1에 예시된 NKNA 유전자의 프로모터 요소를 포함하며, 7개의 엑손(exon) 영역, 엑손 서열들 사이의 6개의 인트론 서열, 및 3' 및 5'의 번역되지 않은 영역(3' UTR 및 5'UTR)을 포함한다. 추정되는 129개의 아미노산 단백질에 대해 첫 번째의 인 프레임(in frame) ATG는 엑손 2에 있고(또는 도 2에서 위치 41031), TAG 중단 코돈은 엑손 7에 존재한다.

본 발명은 NKNA 유전자중의 단일 뉴클레오타이드 다형성을 인간에게 투여되는 약학 활성 화합물의 효능 및 상용성과 연관시키기 위한 방법에 관한 것으로서, 이 방법은 인간의 NKNA 유전자에서 단일 뉴클레오타이드 다형성을 측정하는 단계, 및 NKNA 유전자의 다형성에 의해 약학 활성 화합물이 투여되는 인간의 상태를 측정하는 단계를 포함한다.

본 발명의 또다른 양태에 따르면, NKNA 유전자의 단일 뉴클레오타이드 다형성을 인간에게 투여되는 약학 활성 화합물의 효능 및 상용성과 연관시키는 방법이 제공되고, 이 방법은 인간의 NKNA 유전자의 단일 뉴클레오타이드 다형성을 측정하는 단계, 및 약학 활성 화합물이 투여되는 인간의 상태를 위치 33612, 33949, 37025, 37114, 37474, 41112 및/또는 41172를 포함하는 NKNA 유전자를 포함하는 도 2의 하나 이상의 위치에서의 다형성을 참고하여 측정하는 단계를 포함한다.

인간의 상태는 1, 2, 3, 4, 5, 6 또는 7개 모두의 위치에서의 대립 유전자 변체를 참고하여 측정될 수 있다. 인간의 상태는 또한 본원에 정의된 특정한 다형성 하나 이상을 하나 이상의 다른 단일 뉴클레오타이드 다형성과 조합하여 측정될 수 있다.

인간의 상태는 생리학적 및 심리학적 반응을 포함하여, 약물 치료에 대한 인간의 임의의 반응을 포함한다.

용어 인간은 NK-1 수용체 리간드에 의해 매개되는 질병을 갖고 있거나, 갖고 있는 것으로 의심되는 인간을 포함한다. 각각의 위치에서, 인간은 대립 유전자에 대해 동형접합이거나 이형접합일 수 있다.

대립 유전자 변체는 약물 치료에 대한 개인의 반응에 대해 직접적인 효과를 가질 수 있다. 따라서, 본 발명의 방법은 이런 약물에 대한 임상적 반응의 예측과, 치료 투여량의 측정 둘 모두에 유용할 수 있다.

약학 활성 화합물은 NK-1 수용체 길항제의 군에 속할 수 있다. 뉴로키닌 수용체 길항제는 문헌[Exp. Opin. Ther. Patents, 1996, 6, 367-378] 및 문헌[Exp. Opin. Ther. Patents, 1997, 7, 43-54]에 개론되어 있다. 본원에서 사용되는 용어 "NK-1 수용체 길항제"는 물질 P의 NK-1 수용체에 대한 결합을 억제하는 임의의 천연 또는 합성 화학적 화합물을 의미한다. 많은 수의 이런 수용체 길항제가 공지되어 있고, 개시되어 왔다. NK-1 수용체 길항제는 제 EP 1035115 호, 제 WO0050401 호, 제 WO 0050398 호, 제 WO0053572 호, 제 WO0073279 호, 제 WO0073278 호, 제 EP1103546 호, 제 EP 1103545 호 및 제 WO 0206236 호에 개시되어 있는 바와 같이, 4-페닐-피리딘 유도체, 3-페닐-피리딘 유도체, 2-페닐-치환된 벤젠 유도체, 바이페닐 유도체, 4-페닐-피리미딘 유도체, 5-페닐-피리미딘 유도체, 1,4-다이아제판-2,5-다이온 유도체, 1,3,8-트라이아자-스피로[4.5]데칸-4-온 유도체 및 피페리딘 유도체로 구성된 군에서 선택될 수 있다. 이들 문헌 및 하기 언급되어 있는 모든 문헌은 본원에 전체가 참고로 인용되어 있다.

본 발명에 유용한 추가로 바람직한 NK-1 수용체 길항제는 현재 약물 개발되고 있는 하기의 NK-1 수용체 길항제이다.

GR205171: 3-피페리딘아민, N-[[2-메톡시-5-[5-(트라이플루오로메틸)-1H-테트라졸-1-일]페닐]메틸]-2-페닐-, (2S-시스)- (가드너(Gardner) 등의 문헌[Regul. Pep. 65:45, 1996)

HSP-117: 3-피페리딘아민, N-[[2,3-다이하이드로-5-(1-메틸에틸)-7-벤조푸라닐]메틸]-2-페닐-, 다이하이드로클로라이드, (2S-시스)-

L 703,606: 1-아자바이사이클로[2.2.2]옥탄-3-아민, 2-(다이페닐메틸)-N-[(2-요오도페닐)메틸]-, (2S-시스)-, 옥살레이트(카시에리(Cascieri) 등의 문헌[Mol. Pharmacol. 42, 458, 1992)

L 668,169: L-페닐알라닌, N-[2-[3-[[N-[2-(3-아미노-2-옥소-1-피롤리디닐)-4-메틸-1-옥소펜틸]-L-메티오닐-L-글루타미닐-D-트립토필-N-메틸-L-페닐알라닐]아미노]-2-옥소-1-피롤리디닐]-4-메틸-1-옥소펜틸]-L-메티오닐-L-글루타미닐-D-트립토필-N-메틸-, 사이클릭(8->1)-펩타이드, [3R-[1[S^*[R^*(S^*)]],3R^*]]-

LY 303241: 1-피페라진아세트아마이드, N-[2-[아세틸[(2-메톡시페닐)메틸]아미노]-1-(1H-인돌-3-일-메틸)에틸]-4-페닐, (R)-

LY 306740: 1-피페라진아세트아마이드, N-[2-[아세틸[(2-메톡시페닐)메틸]아미노]-1-(1H-인돌-3-일-메틸)에틸]-4-사이클로헥실, (R)-

MK-869: 3H-1,2,4-트라이아졸-3-온, 5-[[2-[1-[3,5-비스(트라이플루오로메틸)페닐]에톡시]-3-(4-플루오로페닐)-4-모폴리닐]메틸]-1,2-다이하이드로, -[2R-[2α(R^*),3α]]-

R-544: Ac-Thr-D-Trp(FOR)-Phe-Z-MeBzl

스판타이드(Spantide) III: L-노르루신아마이드, N6-(3-피리디닐카보닐)-D-리실-L-프롤릴-3-(3-피리디닐)-L-알라닐-L-프롤릴-3,4-다이클로로-D-페닐알라닐-L-아스파라기닐-D-트립토필-L-페닐알라닐-3-(3-피리디닐)-D-알라닐-L-루실-

WIN-62,577: 1H-벤즈이미다조[2,1-b]사이클로펜타[5,6]나프토[1,2-g]퀴나졸린-1-올, 1-에티닐-2,3,3a,3b,4,5,15,15a,15b,16,17,17a-도데카하이드로-15a,17a-다이메틸-, (1R,3aS,3bR,15aR,15bS,17aS)-

GR 103,537

L 758,298: 포스폰산, [3-[[2-[1-[3,5-비스(트라이플루오로메틸)페닐]에톡시]-3-(4-플루오로페닐)-4-모폴리닐]메틸]-2,5-다이하이드로-5-옥소-1H-1,2,4-트라이아졸-1-일]-, [2R-[2α(R^*),3α]]-

NKP608: (2R,4S)-N-[1-{3,5-비스(트라이플루오로메틸)-벤조일}-2-(4-클로로-벤질)-4-피페리디닐]-퀴놀린-4-카복스아마이드

CGP49823: (2R,4S)-2-벤질-1-(3,5-다이메틸벤조일)-N-[(4-퀴놀리닐)메틸]-4-피페린아민)다이하이드로클로라이드

CP-96,345: (2S,3S)-시스-(2-(다이페닐메틸)-N-[(2-메톡시페닐)메틸]-1-아자바이사이클로[2.2.2]옥탄-3-아민(스라이더(Srider) 등의 문헌[Science, 251:435, 1991])

CP-99,994: ((2S,3S)-시스-3-(2-메톡시벤질아미노)-2-페닐-피페리딘)다이하이드로클로라이드(데사이(Desai) 등의 문헌[J. Med. Chem. 35:4911, 1992])

CP-122,721: (+)-(2S,3S)-3-(2-메톡시-5-트라이플루오로메톡시벤질)아미노-2-페닐피페리딘

FK 888: (N2-[(4R)-4-하이드록시-1-(1-메틸-1H-인돌-3-일)카보닐-L-프로필-N-메틸-N-페닐메틸-L-3-(2-나프틸)-알라닌아마이드(후지(Fujii) 등의 문헌[Br. J. Pharm. 107:785, 1992])

GR203040: (2S,3S 및 2R,3R)-2-메톡시-5-테트라졸-1-일-벤질-(2-페닐-피페리딘-3-일)-아민

GR 82334: [D-Pro9,]스피로-감마-락탐]Lei10,Trp11]피살라에민-(1-11)

GR 94800: PhCO-Ala-Ala-DTrp-Phe-DPe-DPro-Pro-Nle-NH2

L 732,138: N-아세틸-L-트립토판

L 733,060: ((2S,S)-3-((3,5-비스(트라이플루오로메틸)페닐)메틸옥시)-2-페닐 피페리딘

L 742,694: (2-(S)-(3,5-비스(트라이플루오로메틸)벤질옥시)-3-(S)-페닐-4-(5-(3-옥소-1,2,4-트라이아졸로)메틸모폴린

L 754,030: 2-(R)-(1-(R)-3,5-비스(트라이플루오로메틸)페닐에톡시)-3-(S)-(4-플루오로)페닐-4-(3-옥소-1,2,4-트라이아졸-5-일)메틸모폴린

LY 303870: (R)-1[N-(2-메톡시벤질)아세틸아미노]-3-(1H-인돌-3-일)-2-[N-(2-(4-(피페리디닐)피페리딘-1-일)아세틸)아미노]프로판

MEN 11149: 2-(2-나프닐)-1-N-[(1R,2S)-2-N-[2(H)인돌-3-일카보닐]아미노사이클로헥산카보닐]-1-[N'-에틸-N'-(4-메틸페닐아세틸)]다이아미노에탄(시릴로(Cirillo) 등의 문헌[Eur. J. Pharm. 341: 201, 1998)

PD 154075: (2-벤조푸란)-CH₂OCO]-(R)-알파-MeTrp-(S)-NHCH(CH₃)Ph

RP-67580: (3aR,7aR)-7,7-다이페닐-2-[1-이미도-2(2-메톡시페닐)-에틸]+++퍼하이드로아이소인돌-4-온 하이드로클로라이드(가렛(Garret) 등의 문헌[PNAS, 88:10208, 1991])

RPR 100893: (3aS,4S,7aS)-7,7-다이페닐-4-(2-메톡시페닐)-2-[(S)-2-(2-메톡시페닐)프로피오닐]퍼하이드로아이소인돌-4-올

스펜다이드(Spendide): Tyr-D-Phe-Phe-D-His-Leu-Met-NH2

스판타이드(Spantide) II: D-NicLys1,3-PaI3,D-Cl2Phe5,Asn6,D-Trp7.0, NIe11-물질P

SR140333: (S)-1-[2-[3-(3,4-다이클로로페닐)-1-(3-아이소프로폭시페닐아세틸)피페리딘-3-일]에틸]-4-페닐-1-아자니아바이사이클로[2.2.2]옥탄(에드몬츠(Edmonts) 등의 문헌[Eur. J. Pharm. 250:403, 1993])

WIN-41,708: (17베타-하이드록시-17알파-에티닐-5알파-안드로스타노[3.2-b]피리미도[1,2-a]벤즈이미다졸

SR-48,968: (S)-N-메틸-N[4-(4-아세틸아미노-4-[페닐피페리디노)-2-(3,4-다이클로로페닐)-부틸]벤즈아마이드

L-659,877: 사이클로[Gln,Trp,Phe,Gly,Leu,Met]

MEN 10627: 사이클로(Met-Asp-Trp-Phe-Dap-Leu)사이클로(2베타-5-베타)

SR 144190: (R)-3(1-[2-(4-벤조일-2-(3,4-다이플루오로페닐)-모폴린-2-일)에틸]-4-페닐피페리딘-4-일)-1-다이메틸우레아

GR 94800: PhCO-Ala-Ala-D-Trp-Phe-D-Pro-Pro-NIe-NH2

SR-142,801: (S)-(N)-(1-(3-(1-벤조일-3-(3,4-다이클로로페닐)피페리딘-3-일)프로필)-4-페닐피페리딘-4-일)-N-메틸 아세트아마이드

R820: 3-인돌릴카보닐-Hyp-Phg-N(Me)-Bzl

R486: H-Asp-Ser-Phe-Trp-베타-Ala-Leu-Met-NH2

SB 222200: (S)-(-)-N-(a-에틸벤질)-3-메틸-2-페닐퀴놀린-4-카복스이미드

L 758,298: 포스폰산, [3-[[2-[1-[3,5-비스(트라이플루오로메틸)페닐]에톡시]-3-(4-플루오로페닐)-4-모폴리닐]-2,5-다이하이드로-5-옥소-1H-1,2,4-트라이아졸-1-일]-, [2R-[2a(R^*),3a]]-

NK-608: (2R,4S)-N-[1-{3,5-비스(트라이플루오로메틸)-벤조일}-2-(4-클로로-벤질)-4-피페리디닐]-퀴놀린-4-카복스아마이드

CGP 47899: 실링(Shilling) 등의 문헌[Pers. Med. Chem. 207, 1993]

MEN 11467: 에반젤리스타(Evangelista) 등의 문헌[XXIX, Nat. Congr. of the Ital. Pharmacological Soc., Florence 20-23. 06. 1999]

상기에서 특정하게 명명된 화합물에 대한 임의의 언급은 또한 이의 약학적으로 허용가능한 산 부가 염을 포함한다.

약물 개발되고 있는 이들 NK-1 수용체 길항제에 대한 추가의 정보는 발표된 문헌에서 발견될 수 있다.

추가의 적합한 NK-1 수용체 길항제는 하기 공개된 특허 및 특허 출원에 설명되어 있다.

미국 특허 제 5,990,125 호는 컬럼 33에서 특히 화학식 Ia 내지 Ie, XVI 내지 XXI의 화합물 및 퀴누클리딘, 피페리딘 에틸렌 다이아민, 피롤리딘 및 아자보난 유도체와 물질 P 수용체 길항제로서 활성을 나타내는 연관된 화합물을 포함하는 다른 길항제를 개시하고 있다. 이들 길항제는 바람직하게는 미국 특허 제 5,990,125호의 컬럼 34에서 특정된 투여량으로 사용된다.

추가로 적합한 NK-1 수용체 길항제는 다음과 같은 문헌에 개시되어 있다.

미국 특허(USP): 5,977,104, 5,162,339, 4,481,139, 5,232,929, 5,998,444, 5,242,930, 5,373,003, 5,981,744, 5,387,595, 5,459,270, 5,494,926, 5,496,833, 5,637,699.

유럽 특허 출원 공보 번호(EP-A-): 0360390, 0394989, 0428434, 0429366, 0430771, 0436334, 0433132, 0482539, 0498069, 0499313, 0512901, 0512902, 0514273, 0514274, 0514275, 0514276, 0515681, 0517589, 0520555, 0522808, 0528495, 0532456, 0533280, 0536817, 0545478, 0558156, 0577394, 0585913, 0590152, 0599538, 0610793, 0634402, 0686629, 0639489, 0694535, 0699655, 0699674, 0707006, 0708101, 0709375, 0709376, 0714891, 0723959, 0733632, 0776893.

PCT 국제 특허 공개 공보(WO): 90/05525, 90/05729, 91/09844, 91/18899, 92/01688, 92/06079, 92/12151, 92/15585, 92/17449, 92/20661, 92/20676, 92/21677, 92/22569, 93/00330, 93/00331, 93/01159, 93/01165, 93/01169, 93/01170, 93/06099, 93/09116, 93/10073, 93/14084, 93/14113, 93/18023, 93/19064, 93/21155, 93/21181, 93/23380, 93/24465, 94/00440, 94/01402, 94/02461, 94/02595, 94/03429, 94/03445, 94/04494, 94/04496, 94/05625, 94/07843, 94/08997, 94/10165, 94/10167, 94/10168, 94/10170, 94/11368, 94/13639, 94/13663, 94/14767, 94/15903, 94/19320, 94/19323, 94/20500,94/26735, 94/26740, 94/29309, 95/02595, 95/04040, 95/04042, 95/06645, 95/07886, 95/08908, 95/08549, 95/11880, 95/14017, 95/15311, 95/16679, 95/17382, 95/18124, 95/18129, 95/19344, 95/20575, 95/21819, 95/22525, 95/23798, 95/26338, 95/28418, 95/30674, 95/30687, 95/33744, 96/05181, 96/05193, 96/05203, 96/06094, 96/07649, 96/10562, 96/16939, 96/18643, 96/20197, 96/21661, 69/29304, 96/29317, 96/29326, 96/29328, 96/31214, 96/32385, 96/37489, 97/01553, 97/01554, 97/03066, 97/08144, 97/14671, 97/17362, 97/18206, 97/19084, 97/19942, 97/21702, 97/49710.

영국 특허 공개 공보(GB): 2266529, 2268931, 2269170, 2269590, 2271774, 2292144, 2293168, 2293169, 2302689.

상기 개시된 바와 같은 NK-1 수용체 길항제에 대한 증후는 통증, 두통, 특히 편두통, 알츠하이머 병, 중추 신경계 질환(예를 들면 일부 우울증 질환, 불안증 및 구토), 정신병, 다발성 경화증, 모르핀 금단 현상의 약화, 심혈관 변화, 부종, 예를 들면 열 손상으로 인한 부종, 만성 염증성 질병, 예를 들면 류마티스성 관절염, 천식/기관지 과반응성 및 다른 호흡기 질환(알레르기성 비염), 장의 염증성 질환(궤양성 대장염 및 크론 병 포함), 눈 손상 및 눈의 염증성 질병, 양성 전립성 과형성, 멀미, 치료로 인한 구토, 암(예를 들면 악성 신경교종), 외상성 뇌 손상의 치료이다.

바람직하게는, NK-1 수용체 길항제는 제 EP 1035115 호에 개시된 바와 같은2-(3,5-비스-트라이플루오로메틸-페닐)-N-[6-(1,1-다이옥소-1λ⁶-티오모폴린-4-일)-4-o-톨릴-피리딘-3-일]-N-메틸-아이소부티르아마이드 또는 2-(3,5-비스-트라이플루오로메틸-페닐)-N-[6-(1,1-다이옥소-1λ⁶-티오모폴린-4-일)-4-(4-플루오로-2-메틸-페닐)-피리딘-3-일]-N-메틸-아이소부티르아마이드이다.

가장 바람직하게는, NK-1 수용체 길항제는 제 EP 1035115 호에 개시된 바와 같은 2-(3,5-비스-트라이플루오로메틸-페닐)-N-메틸-N-(6-모폴린-4-일-4-o-톨릴-피리딘-3-일)-아이소부티르아마이드이다.

이들 NK-1 수용체 길항제를 위한 바람직한 증후는 중추 신경계 질환, 예를 들면 일부 우울증 질병, 초조 또는 구토의 치료 또는 예방을 포함하는 것들이다. 주요 우울증 에피소드는 최소한 2주동안, 거의 매일, 하루의 대부분의 기간동안 우울한 기분이거나 또는 모든 또는 거의 모든 활동에 대해 흥미나 즐거움이 전혀 없는 상태로 정의된다.

다른 양태에서 본 발명은 인간을 위한 약학 활성 화합물의 효능 및 상용성을 측정하는 방법을 제공하고, 이 방법은 약학 활성 화합물의 효능 및 상용성과 연관되어 있는 단일 뉴클레오타이드 다형성의 존재를 인간에서 수득된 NKNA 게놈 서열에서 측정하는 단계 및 이에 의해 인간을 위한 약학 활성 화합물의 효능 및 상용성을 측정하는 단계를 포함한다.

바람직하게는, 본 발명은 인간을 위한 약학 활성 화합물의 효능 및 상용성을 측정하는 방법을 제공하고, 이 방법은 인간에서 수득된 NKNA 게놈 서열에서 NKNA유전자를 포함하는 도 2의 뉴클레오타이드 서열의 위치 33612, 33949, 37025, 37114, 37434, 41112 및/또는 41172중 하나 이상에서 약학 활성 화합물의 효능 및 상용성과 연관되어 있는 단일 뉴클레오타이드 다형성의 존재를 측정하는 단계 및 이에 의해 인간을 위한 약학 활성 화합물의 효능 및 상용성을 측정하는 단계를 포함한다.

바람직하게는, 본 발명은 인간을 위한 약학 활성 화합물의 효능 및 상용성을 측정하는 방법에 관한 것이고, 이 방법은 인간에서 수득된 NKNA 게놈 서열에서 NKNA 유전자를 포함하는 도 2의 뉴클레오타이드 서열의 위치 33612에서 C 또는 T, 도 2의 위치 33949에서 T 또는 C, 도 2의 위치 37025에서 C 또는 T, 도 2의 위치 37114에서 G 또는 A, 도 2의 위치 37434에서 A 또는 C, 도 2의 위치 41112에서 T 또는 G, 도 2의 위치 41172에서 G 또는 A, 및 이들의 조합, 및 이들의 역방향 상보체로 구성된 군에서 선택된 단일 뉴클레오타이드 다형성(이 단일 뉴클레오타이드 다형성은 약학 활성 화합물의 효능 및 상용성과 연관되어 있다)의 존재를 측정하는 단계, 및 이에 의해 인간을 위한 약학 활성 화합물의 효능 및 상용성을 측정하는 단계를 포함한다.

이 방법에서, 약학 활성 화합물은 NK-1 수용체 길항제일 수 있다. NK-1 수용체 길항제는 이전에 개시된 바와 같은 임의의 NK-1 수용체 길항제일 수 있다.

본 발명에 따른 방법은 단일 뉴클레오타이드 변형을 검출하기 위한 임의의 적합한 방법, 예를 들면, 질량 분광학을 사용한 PCR 생성물의 직접적인 질량 분석, 침해적 분해 생성물의 직접적인 분석, 직접적인 서열 분석, 대립 유전자 특이적 증폭(즉, ARMS^TM-대립 유전자 특이적 증폭; ARMS는 증폭 저항성 돌연변이 시스템을 의미한다), ALEX^TM(증폭 저항성 돌연변이 시스템의 선형 확장) 및 COPS(경쟁성 올리고뉴클레오타이드 프라이밍 시스템), 대립 유전자 특이적 하이브리드 형성(ASH), 올리고뉴클레오타이드 라이게이션 분석(OLA), 인베이더(Invader) 분석, DNA 칩 분석 및 제한 단편 길이 다형성(RFLP)을 사용하여 수행될 수 있다(리뷰를 위해서는 문헌[Genome Research, 1998, 8, 769-776]; [Pharmacogenomics, 2000, 1, 95-100]; [Human Mutation, 2001, 17, 475-492]를 참고할 수 있다).

상기 다형성을 운반하는 핵산의 시험 샘플은 통상적으로는 개인으로부터 수득한 혈액, 기관지폐포 세척 유체, 가래, 뇨 또는 다른 신체 유체 또는 조직이다. 시험 시료는 시험 시료의 서열에 상응하는 핵산 서열과 동일할 수 있고, 즉, 대립 유전자 변체를 분석하기 전에 시료 영역의 전부 또는 일부의 핵산이 먼저 임의의 통상적인 기법, 예를 들면, 중합효소 쇄 반응(PCR) 또는 리가제 쇄 반응(LCR)을 사용하여 증폭될 수 있음을 인식할 것이다.

NKNA 유전자의 다형성은 환자의 핵산 시료의 서열을 밝히는 단계 및 서열을 대조군과 비교하는 단계, 또는 서로 다른 민족 기원의 무관한 개인의 DNA에서 (NKNA 유전자의 암호화 및 조절 영역을 포함하는) 400 내지 600개의 염기쌍 단편을 PCR 증폭하는 단계에 의해 확인될 수 있다. 진행방향 및 역방향 프라이머를 사용하여 이들 시료에서 단편의 서열을 밝힐 수 있고, 다형성은 폴리프레드(PolyPhred) 소프트웨어(워싱톤 대학교에서 인가)를 사용하여 검출될 수 있고, 변체에 대한 대립 유전자 빈도수가 확립될 수 있다(문헌[Human Mutation, 2001, 17, 243-254]).

본 발명의 하나 이상의 다형성 위치에서 변체 뉴클레오타이드의 존재 또는 부재를 검출하기 위해 사용될 수 있는 많은 수의 분석 과정이 있다는 것은 당분야의 숙련된 이들에게 명확할 것이다. 일반적으로, 대립 유전자 변체의 검출에는 돌연변이 식별 기법, 선택적으로 증폭 반응 및 선택적으로 신호 발생 시스템이 요구된다. 국제 특허 출원 제 WO00/06768 호는 다수의 증폭 기법 및 돌연변이 검출 기법을 열거하고 있고, 일부는 PCR에 기반한다. 이들은 다수의 신호 발생 시스템과 조합되어 사용될 수 있고, 이러한 신호 발생 시스템의 선택 또한 제 WO 00/06768 호에 열거되어 있다. 대립 유전자 변체의 검출을 위한 많은 현재의 방법들이 놀라우(Nollau) 등의 문헌[Clin. Chem., 1997, 43, 1114-1120] 및 표준 교과서, 예를 들면 ["Laboratory Protocols for Mutation Detection", U. Landegren 편집, Oxford University Press, 1996] 및 ["PCR", 2판, Newton & Graham 편집, BIOS Scientific Publishers Limited, 1997]에 개론되어 있다.

추가로 본 발명은 다음의 서열을 함유하는 다형성에서 선택된 단리된 핵산 분자를 제공한다:

도 2에서의 위치로 한정된 바와 같은 위치 33612에서 T를 갖는 도 2의 핵산 서열;

도 2에서의 위치로 한정된 바와 같은 위치 33945에서 C를 갖는 도 2의 핵산 서열;

도 2에서의 위치로 한정된 바와 같은 위치 37025에서 T를 갖는 도 2의 핵산 서열;

도 2에서의 위치로 한정된 바와 같은 위치 37114에서 A를 갖는 도 2의 핵산 서열;

도 2에서의 위치로 한정된 바와 같은 위치 37434에서 C를 갖는 도 2의 핵산 서열;

도 2에서의 위치로 한정된 바와 같은 위치 41112에서 G를 갖는 도 2의 핵산 서열;

도 2에서의 위치로 한정된 바와 같은 위치 41172에서 G를 갖는 도 2의 핵산 서열;

또는 이들의 상보 서열 또는 다형성중 하나 이상을 포함하는 20개 이상의 염기인 이의 단편.

"단리된" NKNA 핵산 분자는 NKNA 핵산의 자연적인 공급원에서 원래 연관되어 있던 하나 이상의 오염물 핵산 분자로부터 확인되고 분리되는 핵산 분자이다. 단리된 NKNA 핵산 분자는 자연에서 발견되는 형태 또는 세팅이 아니다. 따라서, 단리된 NKNA 핵산 분자는 천연 세포에서 존재하는 NKNA 핵산 분자와 구별된다. 그러나, 단리된 NKNA 핵산 분자는 원래 NKNA를 발현하는 세포에 함유되어 있는 NKNA 핵산 분자를 포함하고, 여기서는 예를 들면 핵산 분자가 천연 세포와는 다른 염색체 위치에 있다.

또한, 본 발명은 서열 내부에서 도 2의 위치 33612, 도 2의 위치 33949, 도 2의 37025, 도 2의 37114, 도 2의 37434, 도 2의 41112 및 도 2의 41172에서 다형성을 포함하는 핵산에 하이브리드를 형성할 수 있는 NKNA 유전자 내에서의 다형성을 검출하기 위한 진단 프라이머로서 사용될 수 있는 대립 유전자-특이적 핵산 프라이머에 관한 것이다.

본 발명의 다른 양태는 하기 군에서 선택되는 다음과 같은 서열을 포함하는 핵산 프라이머이다:

서열 번호 8로 정의된 바와 같은 핵산 서열;

서열 번호 9로 정의된 바와 같은 핵산 서열;

서열 번호 10로 정의된 바와 같은 핵산 서열;

서열 번호 11로 정의된 바와 같은 핵산 서열;

서열 번호 12로 정의된 바와 같은 핵산 서열;

서열 번호 13로 정의된 바와 같은 핵산 서열;

서열 번호 14로 정의된 바와 같은 핵산 서열;

서열 번호 15로 정의된 바와 같은 핵산 서열; 또는

서열 번호 16로 정의된 바와 같은 핵산 서열; 및

이의 역방향 상보체.

대립 유전자 특이적 프라이머는 일반적으로 PCR 반응과 같은 증폭 반응에서 일정한 프라이머와 함께 사용되고, 이는 예를 들면 ARMS^TM분석을 위해 사용되는 바와 같이, 특정한 서열 위치에서의 하나의 대립 유전자의 선택적인 증폭을 통해 대립 유전자들 사이를 식별할 수 있게 해 준다. 대립 유전자 특이적 프라이머의 길이는 바람직하게는 17 내지 50 뉴클레오타이드, 보다 바람직하게는 약 17 내지 35 뉴클레오타이드, 가장 바람직하게는 17 내지 30 뉴클레오타이드이다.

바람직하게는, 대립 유전자 특이적 프라이머는 검출되어야하는 대립 유전자와 정확하게 상응해야하지만, 3' 말단의 약 6 내지 8개의 뉴클레오타이드가 검출하고자 하는 대립 유전자와 상응하고 나머지 뉴클레오타이드 중 10개 이하, 예를 들면 8, 6, 4, 2 또는 1 이하가 프라이머의 성질에 유의한 영향을 미치지 않고 변이될 수 있는 이의 유도체 또한 예상된다. 종종 서로 다른 프라이머 결합과 정확한대립 유전자 식별용 프라이머만으로부터의 우선적인 연장을 최대화하기 위해서 -2 및/또는 - 3 위치(3' 말단에 대해)의 뉴클레오타이드가 부적당하게 짝지워진다.

본 발명은 또한, 서열 이내에 도 2의 위치 33612, 도 2의 33949, 도 2의 37025, 도 2의 37114, 도 2의 37434, 도 2의 41112 및 도 2의 41172에서의 다형성을 포함하는 핵산에 특이적으로 하이브리드를 형성할 수 있는 NKNA 유전자에서의 다형성을 검출하기위한 올리고뉴클레오타이드 프로브에 관한 것이다.

용어 "올리고뉴클레오타이드 프로브"는 다형성을 발현하는 인간의 NKNA 유전자의 일부 또는 전부, 바람직하게는 인간의 NKNA 유전자의 일부에 상응하는, 길이가 17개 이상인 뉴클레오타이드의 뉴클레오타이드 서열을 의미한다. 17 내지 50개의 뉴클레오타이드 길이가 바람직하다. 일반적으로, 이런 프로브는 유전자에서 상응하는 야생형 또는 변체 좌위에 완전히 상보적인 염기 서열을 포함할 것이다. 그러나, 필요한 경우, 올리고뉴클레오타이드 프로브의 식별력이 부당하게 영향을 받지 않는 한, 하나 이상의 부적합한 짝지움이 도입될 수 있다. 본 발명의 프로브는 예를 들면 몰레큘라 비콘스(Molecular Beacons)에서처럼, 검출을 용이하게 하는 하나 이상의 표지를 가질 수 있다.

본 발명은 또한 도 2의 위치 33612에서 C 또는 T, 도 2의 위치 33949에서 T 또는 C, 도 2의 위치 37025에서 C 또는 T, 도 2의 위치 37114에서 G 또는 A, 도 2의 위치 37434에서 A 또는 C, 도 2의 위치 41112에서 T 또는 G, 도 2의 위치 41172에서 G 또는 A, 및 이들의 조합, 및 이들의 역방향 상보체로 구성된 군에서 선택된 NKNA 유전자의 단일 뉴클레오타이드 다형성을 갖는 하나 이상의 올리고뉴클레오타이드 프로브 및/또는 하나 이상의 핵산 프라이머를 포함하는 진단 키트를 포함한다.

본 발명은 또한 NK-1 수용체 길항제, 및 NKNA 유전자의 하나 이상의 위치에서 단일 뉴클레오타이드 다형성에 대해 시험되는 인간에게 약물을 투여하기 위한 사용 설명서를 포함하는 약학 팩을 제공한다.

본 발명은 또한 NK-1 수용체 길항제, 바람직하게는 2-(3,5-비스-트라이플루오로메틸-페닐)-N-메틸-N-(6-모폴린-4-일-4-o-톨릴-피리딘-3-일)-아이소부티르아마이드, 및 본 발명의 방법에 따라 NKNA 유전자의 하나 이상의 위치에서 단일 뉴클레오타이드 다형성에 대해 시험되는 인간에 약물을 투여하기 위한 사용 설명서를 포함하는 약학 팩을 제공한다.

본 발명은 또한, NKNA 유전자를 포함하는 도 2의 위치 33612, 33949, 37025, 37114, 37434, 41112 및 41172중 하나 이상에서 단일 폴리뉴클레오타이드 다형성을 갖는 것으로 진단되는 인간에서 NK-1 수용체 리간드-매개되는 질병을 치료하기 위한 약제의 제조를 위한 NK-1 수용체 길항제의 용도를 제공한다.

본 발명은 또한 도 2의 위치 33612, 도 2의 33949, 도 2의 37025, 도 2의 37114, 도 2의 37434, 도 2의 41112 및 도 2의 41172에서의 다형성을 포함하는 NKNA 유전자의 다형성에 대한 서열 정보가 저장되어 있는 컴퓨터 판독형 매체를 포함한다.

서열 확인을 수행하는 방법 또한 본 발명에 제공되어 있고, 상기 방법은 위치 33612에서 T를 갖는 도 2의 핵산 서열; 위치 33949에서 C를 갖는 도 2의 핵산서열; 위치 37025에서 T를 갖는 도 2의 핵산 서열; 위치 37114에서 A를 갖는 도 2의 핵산 서열; 위치 37434에서 C를 갖는 도 2의 핵산 서열; 위치 41112에서 G를 갖는 도 2의 핵산 서열; 위치 41172에서 G를 갖는 도 2의 핵산 서열; 또는 이의 상보적인 나선 또는 다형성중 하나 이상을 포함하는 20개 이상의 염기인 이의 단편으로 구성된 군에서 선택된 핵산 서열을 제공하는 단계; 및 상기 핵산 서열을 하나 이상의 다른 핵산 또는 폴리펩타이드 서열과 비교하여 정체를 결정하는 단계를 포함한다.

본 발명은 일반적으로 설명되어 있고, 하기의 도면과 함께 구체적인 실시예에 의해 더욱 잘 이해될 것이며, 실시예는 단지 예시 목적으로 본원에 포함되어 있으며, 달리 규정되어 있지 않은 한 한정하고자 함이 아니다.

도 1은 NKNA 유전자의 게놈 구조와 유전자에서 발견되는 다형성에 대한 것이다. 엑손-인트론의 경계는 도 2에 표시된 서열(수탁 번호 EM＿HUM1:AC004140.1의 DNA 서열의 일부에 상응한다)에 대해 표시되어 있다. 다형성의 위치는 화살표로 표기되어 있다.

도 2a 내지 2c는 프리프로타키키닌 유전자를 포함하고 있는 수탁 번호 EM＿HUM1:AC004140.1에 의해 한정되는 PAC 클론 DJ0841B21의 게놈 서열의 일부이다. 엑손-인트론 경계는 도 1에 나타나 있다. 이 서열은 서열 번호 1에 상응하고, 위치 33301이 서열 번호 1의 위치 1에 상응하며, 위치 41800이 서열 번호 1의 위치 8500에 상응한다.

도 4는 구토 시험전 농도가 20ng/ml 초과인 2-(3,5-비스-트라이플루오로메틸-페닐)-N-메틸-N-(6-모폴린-4-일-4-o-톨릴-피리딘-3-일)-아이소부티르아마이드를 사용한 29개의 위치 41172 유전형 시험 결과에 대한 2x2 분할표이다. 효과=있음: 구토 + 헛구역질의 회수가 3회 이상인 경우. 피셔(Fisher)의 정확성 시험(양면): p=0.033. 대상의 유전자형을 다음과 같은 카테고리에 따라 분류하였다: 0-2는 대립 유전자 2(뉴클레오타이드 G) 동종접합(대립 유전자 2가 2부이고, 대립 유전자 1은 없다); 0 내지 2가 아님은 대립 유전자 1(뉴클레오타이드 A) 동종 접합 2-0(대립 유전자 1 2부와 대립 유전자 2는 없음) 및 이형접합 1-1(대립 유전자 1 1부와 대립 유전자 2 1부).

본 실시예에서 언급되고 있는 상업적으로 사용가능한 시약은 달리 지시되지 않는 한 제조자의 지시에 따라 사용하였다.

실시예 1: 다형성의 검출

모든 단일 뉴클레오타이드 다형성 발견은 ABI 모세관 서열화기 및 빅 다이 케미스트리(Big Dye chemistry)(ABI)를 사용한 이중 나선 DNA 서열 규명에 의해 수행되었다. 먼저, NKNA 유전자의 게놈 구성은 NKNA mRNA(EMBL 데이터베이스에서 수탁 번호 U37529.1)을 사용한 BLAST 조사에 의해 EMBL 데이터베이스에서 수탁 번호 EM＿HUM:AC004140.1로 발견된 PAC 클론으로부터 유래하였다. 엑손-인트론 경계는도 1에 나타나 있는 대로 유래하였고, 프라이머는 유전자의 모든 암호화 및 조절 영역을 증폭시키도록 고안되었다. 모든 엑손을 증폭시키는데 사용되는 프라이머가 하기에 나타나 있고, 또한 서열규명 프라이머로서 사용되었다. 모든 다형성은 이들 프라이머 세트의 쌍을 사용하여 목표로 설정되었다:

다형성을 검출하기 위해서, NKNA 유전자는 5개의 서로 다른 민족 기원을 갖는 47명의 무관한 개인으로부터 PCR 증폭되었다. 단편-특이적 프라이머 쌍(길이 18-27bp)을 사용하여 200 내지 700bp 단편을 증폭하였다. 예를 들면 프라이머 쌍 5 및 6을 사용하여 519bp의 PCR 생성물을 생성하였다. 단편은 NKNA 유전자의 암호화 및 조절 영역을 포함하도록 고안되었다. PCR 생성물을 컬럼 정제한 후, ABI 다이 종결자 화학(형광에 근거한 서열화)을 사용하여 ABI 모세관 서열화기 상에서 DNA의 서열을 밝혔다. DNA 서열의 다형성은 폴리프레드 소프트웨어(니커슨(Nickerson, D.)의 문헌[1997; NAR 25(14): 2745-2751]를 사용하여 검출되었고, 이는 프레드(Phred), 프랩(Phrap) 및 콘세드(Consed)에 근거하여 작동된다(이들 프로그램은 모두 미국 와싱턴 대학교에서 라이센스를 갖고 있다). 이 프로그램은 형광에 근거한 서열화에 의해 이형접합 단일 뉴클레오타이드 치환체의 존재를 자동으로 검출할 수 있다. 이 실시예에서는 다음과 같은 2개의 다형성이 519bp 단편에서 검출되었다:

*: 수탁 번호 EM＿HUM1:AC004140.1에서의 위치에 의해 한정됨

전체적으로, 도 3에 도시된 바와 같이 NKNA에서 7개의 단일 뉴클레오타이드 다형성이 검출되었다.

실시예 2: 유전자형

a) 대상의 선택

지방 윤리 위원회의 승인을 받기 위해서 연구 프로토콜 및 실험 대상자들의 동의서가 제출되었다. 모든 대상자들은 자신의 혈액 시료를 유전자형 분류를 위해 사용할 것이라는 점에 대해 문서로 된 동의서를 제출하였다. 대상자들이 변심할 경우, 동의서는 한 달 뒤에 철회할 수 있다.

모든 시료에 새로운 독립적인 코드를 할당하였고, 임상 데이터베이스를 폐쇄한 지 후 6개월 이내에 새로운 코드와 원래 코드사이의 연결부를 삭제하였다. 이는 환자의 비밀을 보장하기 위한 추가적인 조치이지만, 그 결과, 원래 임상 실험에 사용되었던 환자의 이름이나 번호에 근거하여 유전자형 정보를 복구하는 것은 불가능하다. 약 15년 이내에 모든 혈액 및 DNA 시료를 파괴할 것이다.

b) 유전자형 분석법

단일 혈액 시료(9ml)를 EDTA 튜브에 수집하였다. 이들을 냉동시키고, -20 내지 -70℃에 저장한 후, 스위스 바젤에 위치한 로슈 센트랄 샘플 오피스(Roche Central Sample Office; CSO)로 보내었고, 여기서, 3개의 튜브로 분취하고, 환자의 익명성을 보장하기 위해서, 바 코드 라벨에 새로운 독립적인 코드를 할당하였다. 2가지 혈액 시료(1ml 및 4ml)를 캘리포니아주 알라메다 소재의 로슈 몰레큘라 시스템스(Roche Molecular Systems; RMS)의 로슈 샘플 리파지토리(Roche Sample Repository; RSR)에 보내었고, -80℃에서 보관하였다. 나머지 4ml 분취액을 스위스 바젤 소재의 CSO에서 -80℃에서 저장하였다. GCP 지침을 지키면서 확립된 표준 조작 과정에 따라 RSR에서 시료에 대한 모든 과정을 수행하였다.

실리카 멤브레인계 추출 방법(퀴아앰프(QiaAmp 96 DNA 혈액 키트, 캘리포니아주 발렌시아 소재)을 사용하여 전혈 400㎕으로부터 DNA를 추출하였다. 대조군에는 10mM의 Tris pH 8.0, 0.1mM의 EDTA(TE) 완충액 및 공지된 수율의 DNA를 갖는 혈액 유니트에서 얻은 전혈이 포함되어 있다.

NKNA 유전자에서의 다형성 발견 결과에 기초하여 3가지의 유전자 표식을 선택하였다. 시료를 거머(Germer) 등의 문헌[Genome Res. (2000), 10, 258-266]에 개시된 역학적 PCR 방법을 사용하여(시료를 수집하는 대신 각각의 반응에 대해 단일한 시료를 사용하는 변형을 가하였다) 이들 단일 뉴클레오타이드 다형성에 대해 유전자형을 분류하였다. 이 방법으로 형광 프로브를 사용하지 않고 단일 뉴클레오타이드 다형성을 식별할 수 있게 되었다.

역학적 가열식 순환기(KTC) 형식에서는, 이중 나선을 갖는 증폭 생성물의 생성을 DNA 삽입 염료, 및 형광-검출 CCD 카메라(PE-바이오시스템스 제네앰프(PE-Biosystems GeneAmp) 5700 서열 검출 시스템)가 부착되어 있는 가열식 순환기를 사용하여 모니터링한다. PCR 증폭 플레이트의 각 웰에서의 형광을 어닐링(annealing) 및 변성의 각 주기에서 측정한다. PE-바이오시스템스의 SDS 소프트웨어를 사용하여 상대적인 형광이 0.5의 문턱값에 도달하는 주기를 C_t로 정의하였다.

대립 유전자가 존재하는 경우 증폭 반응이 양성이 되고, 대립 유전자가 없는 경우 음성이 되도록 증폭 반응은 대립 유전자-특이적으로 고안되었다. 각각의 바이(bi)-대립 유전자 다형성의 경우, 증폭 플레이트의 하나의 웰은 대립 유전자 1에 대해 특이적이도록 설정되었고, 제 2 웰은 대립 유전자 2에 대해 특이적이도록 설정되었다. 검출된 각각의 다형성의 경우, 3개의 프라이머(2개의 대립 유전자 특이적 프라이머와 하나의 공통 프라이머)를 고안하였다(표 2). 대립 유전자 1을 위한 반응은 대립 유전자 1-특이적 프라이머 및 공통 프라이머를 함유하고, 대립 유전자 2를 위한 반응은 대립 유전자 2-특이적 프라이머와 공통 프라이머를 함유한다. 웰의 각 쌍에 대한 C_t값을 사용하여 △C_t를 계산하고, 이를 대립 유전자 콜(call)을 측정하는데 사용한다.

증폭 조건은 다음과 같다: 각 웰에 대해 85㎕ 부피중의 10mM 트리스, pH 8.0, 40mM KCl, 2mM MgCl₂, 각각 50μM의 dATP, dCTP 및 dGTP, 25μM의 dTTP 및 75μM의 dUTP, 4% DMSO, 0.2X SYBR Green I(오레건주 유진 소재의 몰레큘라 프로브(Molecular Probes)), 2% 글리세롤, 2 유니트의 우라실 N-글리코실라제(UNG), 15 유니트의 스토펠 골드(Stoffel Gold) DNA 중합효소(문헌[Nature(1996), 381, 445-6] 참고) 및 프라이머. 각각의 분석에 사용되는 프라이머의 농도는 표 2에 열거되어 있다. 그런 다음, 15㎕의 부피 중의 30ng의 DNA를 각 웰에 첨가한다.

이미 존재하는 증폭 생성물에 의한 오염 가능성을 감소시키기 위해서, 분석 과정은 dUTP의 증폭 생성물로의 혼입 및 이미 존재하는 dU-함유 생성물의 UNG 분해를 위한 항온처리 단계를 포함한다(롱고(Longo) 등의 문헌[Gene, 1990, 93, 125-128]).

증폭 반응은 실험 관리 데이터베이스가 만들어내는 바코드 라벨에 의해 확인되는 96웰 증폭 플레이트에서 분취 로봇(코넥티컷주 메리덴 소재의 팩카드 멀티프로브 II(Packard Multiprobe II))를 사용하여 준비되었다. 로봇에 의해 수행되는 과정을 위한 변수는 교차 감염 가능성을 최소화하도록 설정되었다. 81개의 시료의 각각의 플레이트의 경우, 5개의 시료를 2회씩 수행하고, 2회의 결과를 분석하여 이들이 일치하는지를 결정하였다.

가열식 순환 조건은 다음과 같다: 임의의 이전에 오염된 PCR 생성물의 UNG 분석을 위해 50℃에서 2분, 스토펠 골드 중합효소 활성화를 위해 95℃에서 12분, 변성을 위해 20초동안 95℃에서의 55회 주기 및 20초동안 58℃에서의 어닐링, 및 이어서 60℃에서 95℃까지 1℃씩 증가하는 0.57분의 분리 단계. 증폭 반응은 PE 바이오시스템스 진앰프 5700 서열 검출 시스템(SDS) 장치(캘리포니아주 포스터 시 소재)를 사용하였다. 분리 곡선의 첫 번째 도함수는 SDS 소프트웨어에 의해 생성되고, 필요에 따라, 조사되어 주어진 반응에서의 형광이 비-특이적인 프라이머-이량체라기 보다는 잘 한정된 분리 피크를 갖는 특정한 생성물의 증폭에 의한 것인지를 확인하였다. 리리에(K. M. Ririe) 등의 문헌[Anal. Biochem. 1997, 254, 154-160]의 방법에 따라 PCR 동안 DNA 용융 곡선의 분석에 의해 생성물이 차별화되었다.

각 증폭 생성물의 C_t를 측정하고, 대립 유전자 1과 대립유전자 2의 C_t차이(△C_t)를 분석 결과로서 사용하였다. △C_t가 -3.0 내지 3.0인 시료를 이종접합(A1/A2)으로 간주하였다. △C_t가 -3.0 미만인 시료는 A1에 대해 동종접합(A1/A1)인 것으로 간주되었고, △C_t가 3.0 초과인 시료는 A2에 대해 동종접합(A2/A2)인 것으로 간주되었다. 대부분의 경우, 3가지 군의 유전자형사이의 △C_t차는 잘 한정되어 있고, 3.0에 가까운 △C_t값을 갖는 시료는 모순으로서 재시험하였다.

각각의 분석을 20개의 세포주 DNA 패널 상에서 수행하여 각 분석 플레이트 상에서 대조군으로서 사용하기 위한 적절한 유전자형을 갖는 세포주를 확인하였다(A1/A1, A1/A2 및 A2/A2). 세포주 DNA를 캘리포니아주 알라메다 소재의 로슈 몰레큘라 시스템스(RMS)의 R&D 서비스의 컬쳐 컬렉션(Culture Collection)에서 수득하고, 퀴아겐 추출 키트(캘리포니아주 발렌시아 소재의 퀴아앰프(QiaAmp) DNA 혈액 키트)를 사용하여 추출하였다. 세포주 DNA의 유전자형을 DNA 서열분석에 의해 확인하였다. 3가지 세포주 DNA(A1/A1, A1/A2 및 A2/A2)를 임상 시험 시료의 각 플레이트 상에서 대조군으로 수행하였고, 플레이트간의 변수를 측정하기 위해 사용하였다. 대조군 세포주에 대해 수득된 C_t값을 분석하여 임상 시험 시료를 위해 수득된 △C_t값을 위한 컷오프를 결정하였다.

각 웰에 대한 C_t값을 포함하는 데이터 파일을 각 플레이트에 대한 SDS 소프트웨어에 의해 생성하고, 실험 운영 데이터베이스에 넣었다. 임상 시험을 위해 수행되는 모든 SNP 분석을 위해, 독립적인 코드에 의해 확인되는 모든 시료를 위한 C_t값을 갖는 데이터 파일을 데이터베이스로부터 추출하여 사내에서 개발된 프로그램에 의해 최종 유전자형으로 해석하였다. 유전자형 결과를 통계학자에게 보내고 통계학적 분석을 위해 독립적인 코드로 또한 확인된 임상 자료와 일치시켰다.

실시예 3: 구토 시험

설명된 구토 시험을 다음과 같은 2가지 연구에서 수행하였다: 단일 상승 투여량 연구(Single Ascendign Dose; SAD) 및 다중 상승 투여량 연구(MAD). SAD에서, 2-(3,5-비스-트라이플루오로메틸-페닐)-N-메틸-N-(6-모폴린-4-일-4-o-톨릴-피리딘-3-일)-아이소부티르아마이드를 섭취한 후 6시간 및/또는 24시간에 구토 시험을 수행하였다. MAD에서는 14일동안 매일 1회 투여하고, 최종 투여한 지 6 또는 24시간 후에 구토 시험하였다.

SAD

SAD에서는, 연구 제 1일에 5, 10, 20, 40, 80, 160, 230 및 400mg 의 2-(3,5-비스-트라이플루오로메틸-페닐)-N-메틸-N-(6-모폴린-4-일-4-o-톨릴-피리딘-3-일)-아이소부티르아마이드를 개인에게 마시는 현탁액으로 경구 투여하였다. 약물을 투여한 지 6 또는 24시간 후에, 개인의 하복부에 50㎍/kg의 아포몰핀을 피하 주사하였다. 아포몰핀 투여 시간을 기록하였다. 주사 직후에 개인이 똑바로 앉은자세를 취하게 하였다. 이들은 구토할 때까지, 또는 아포몰핀 주사후 1시간 이상동안 이 자세를 유지하였다. 구토는 약 25ml 이상의 장 내용물을 게우는 것으로 정의하였다. 헛구역질은 게워낸 장 내용물의 양이 더 적거나, 장 내용물을 게우지는 않는 것으로 정의하였다.

미식거림 및/또는 구토는 평균 주사 10분 이내에 일어날 것으로 예상되었다. 50㎍/kg의 아포몰핀의 피하 투여 후 미식거림 및/또는 구토의 경과 시간은 약 5 내지 30분이었다. 구토와 헛구역질의 회수를 기록하였다.

"구토 시험 시기의 혈장 농도"의 순서에 따라 시험 군의 등급을 매겼다. 장애가 있는 것으로 도달한 정체기는 평균 3회의 헛구역질 및 구토였다. 이를 효능이 도달한 시점으로 간주한다면, 시험은 유효 수준이 20 ng/ml의 혈장 수준의 농도에서 도달됨을 예측한다.

혈장 농도와 헛구역질 및 구토의 횟수와의 상관성에 대한 스피어맨(Spearman) 상관성 시험은 높은 통계학적으로 유의한 상관성을 제안한다(p<0.01).

MAD

대상자들에게 14일동안 2-(3,5-비스-트라이플루오로메틸-페닐)-N-메틸-N-(6-모폴린-4-일-4-o-톨릴-피리딘-3-일)-아이소부티르아마이드를 투여하였다. 14일째에, SAD에 개시된 바와 같이 시험을 수행하였다.

MAD는 SAD와 일치하는 결과를 나타내었다.

유전자형 분류

SAD와 MAD의 모든 참가자들을 도 2의 위치로 한정된 바와 같은 NKNA 유전자의 위치 41172에서의 단일 뉴클레오타이드 다형성에 대해 시험하였다.

효과를 달성하는 최소 농도가 20ng/ml 혈장 농도로 발견됨에 따라, 단일 뉴클레오타이드 다형성이 바람직하게는 혈장 농도가 20ng/ml 초과인 사람들에게서 발견되는지, 그리고 누가 치료에 반응하였는지(3회 이하의 헛구역질 및 구토)를 시험하였다. 이 결과를 도 4에 나타낸다.

게놈에서 도 2의 위치에 의해 한정된 바와 같은 NKNA 유전자의 위치 41172에서 단일 뉴클레오타이드 다형성 G를 함유하는 대상은 단일 뉴클레오타이드 다형성을 함유하지 않거나, 단지 이종접합만을 함유하는 이들보다 치료에 더욱 높은 효능을 나타낸다.

SEQUENCE LISTING <110> F. Hoffmann - La Roche AG <120> Genetic polymorphisms in the preprotachykinin gene <130> Case 21067 <160> 16 <170> PatentIn version 3.1 <210> 1 <211> 8500 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 1 tcagagatac aaatacagtg taataccaaa atctcagtac attttcacca tgaaaacaaa 60 taggaaaagc acaagactgt caggagtttc cttccttttc cgcagtagct gacacaactg 120 cttcaaagca atgatttttt ttctttaggg actgtatcat tgacaggttt tacaatttca 180 tttaacactg tgctttgttg agaaataacc acttatttct attttaaggg agtcatcata 240 ttggaattaa aacacatgtt tacaatacat attggcacaa tatgaaaaat aaacactttt 300 tgaattttca accccaaaca attgttatta aataaataat tattcctcat agtgcatgtc 360 ttaatttacc tgtcattgcc cattgacaca aatgaagctg aataaataat gttaggtagt 420 ttattaacgt cttctttcat aattctgcat tgcactcctt tcataagcca ctgaaaacaa 480 agaagagata aagtgttttt taagtgaatt cactgaggga gttacacaac taaagttcag 540 ggcatatagt aatttatttt aaactcataa tgacattttc cctctacaga agtatttcta 600 agaatgttat ctgcacatct tccaatcctg cctcagtctc tattctgatt ggaaatgatc 660 taaccacaga actcggtttc attcatcatt 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gaaagatctg tgaaggatct 1560 gtaggaataa taagtgctac tctaaacagt ttcctcagtg agaagatttg ctgacagaga 1620 agacaggtaa aggcaccagt attatcactt ccctctttta atactggtct taaacaccca 1680 gctatccttt aagtgcggtt aacaataagc tgcatatttt acatcaatta agtatgcact 1740 tgtgaggcag aacagtctga gccaacactg gacaggcgtg agggaaggaa acagtttatt 1800 tctcattctg gtttgattat attaggaaca ggatgaatgg cccaagttca gtctctgaca 1860 agctttaggt aacatgactc tattcctcag agaaattaga tgaaagctaa tgtaaaccaa 1920 ctaaagacag acagtgattt agctggaaca taatgtcctc ttacatggaa gcagagtttc 1980 ttacctggtc tttgaaccct ctgaagcctg atataaattt ttgagtgtat gagctgatga 2040 gggtttctct gggaaagggc atctatctag atttatcaga ttgtcaaagg ggtccctgac 2100 catgagtggg taaagatcag agggctatag attaaggcta tgataacctt gcctcaatga 2160 ggtacataaa aagatccctg attgactgtg gatcatatca catttttttc cacatttcac 2220 ctatttatat ttccttaact aaaatggagg aacaaagatt tagttataaa ttgatcctga 2280 ttcactacag tgatttttat cactacttaa aattatgtta ttattttaag tacatttaat 2340 tgtatttaat ctgttctaac ttgtacaata tctacatttg taaagttaag catgttctga 2400 aacctatatc aattctggaa atggaaagtt gatgactaat atgattatca agaaaactac 2460 aattaagtga ggactagtat gtattggtac aaataaaagc cattgtggtt taaatttata 2520 tttcatttcc aaaagtggga agataataca tattaataaa acaattacaa gtttttcatt 2580 aaggcacatt gataatttct tacactttta cacttcggca gcccaaaatg actggtgaga 2640 agatgcaaag gtagtgtcta aatagaaagt ggggacccaa taagaacact aggaagtcct 2700 gtggacttca ccaagaactt caaattccag atttattgga aattttgtat caaaaggtca 2760 attatgaaac acttagaact tttcaattat atgaatatat tctctggctt ctgccgtagc 2820 ccagattgtg ttaacttttt ttttctattg cgcgttttga tttttgcccc acagaaagtg 2880 gttttattta atgtacccaa gtcttacatt tcacaataaa gaaaaaaatc tccattaaaa 2940 aacactagga taattatttt tcctaggatc cagataatta aggattaagc cagcacatct 3000 tatagattgt ctagaaactg gaaatattct aaatgggtaa gacagctgct gattacttta 3060 taattaataa cgtatttagt attttaattc tattttcact gaaggcaaaa tagaatttga 3120 atagcttttc caagaagccc tagaggtaag agctataagg tcttaacaaa aagtgagctt 3180 ctattaaaat gatctagggg ttatttacat tgaaatcagt gtgatgaatg agttaactaa 3240 taatggtttt cagatatatg tacgtggtat ttacaaagaa gatggaaatt gaagagaagg 3300 aaacctgcag cctttatatc atacgaaaaa gttgttcaga attaaaatga gaattgtggc 3360 atcctttctc tctaaggagt ttatagccag aaccaattta taacactcaa ggatatttaa 3420 ttgtgttcct ttttgaaagt actggaataa accgtatcac ttttgtcctc tccaacatcc 3480 atcaggatgt ttagattttg aatttctaca acttcataaa aagtgattaa tttgcataaa 3540 gaatttgttt tgtgaattta tttttgtatt ggaagatcgc caaatgtaat gtcttgtaaa 3600 actttcaaat tactttgata acaagtgaaa atcaccctca ttcttccctg cactccccac 3660 tcccccttag ttcagtaagg ttaaacacgg cttatttaac agatctatag gaaagaatat 3720 agcactaacc caaagattca ggttggtaat gattaaatgg ggcagacact ggtaagaatg 3780 gtgattggag agaaatagac agatactgtg gtagtattag cttaaccagc tataaatcca 3840 tttgtggtta caagtacaac aattaaattt ttccaccata atactcattt ttatatctac 3900 cactcctttt taatatttta aaactatgtc ttagaaaaaa tagaaataga tttgagatac 3960 tgtctatttt cagtcataat ttcatacata ccagaattta aagctctttt gcccattagt 4020 ccaacaaagg aatctgtttt atgtcctgga aaaatacatt taggggtatt ttaatatgta 4080 tatctttgag gaaacaaact attataacca gaacaaagca agcttctgaa tatatgtctg 4140 tataataaat atctatctac ttcaagtttt ggtgagactg aagaaataaa gattccttaa 4200 aagttttata aattacacta aaacaataca atgaaaccac ttttcttaat tctatattta 4260 atattagcaa gcactctcta ttcatatatt ttatctgtta tgtaagggtc taaaatattt 4320 tatataaaat attgttattt gagctaggtt tgatttttta ggaagtcaat ttcacatttg 4380 tgtgagagtg aaatatccaa gcataattcc ttgtgttatt aataagttgt acttctcagc 4440 aagtagacct taattaaacc agattccttt ccttgatgat tataatcttc taaaaggtca 4500 ctgtttttat tttattggat attaaaagat actcctttca gaaaagttta ttagttttca 4560 catgaacaga gtacattttt tattacatag aatttttata tataattctc ttcaaagtca 4620 aatccttaga aagtaaatat gaatactatt tatttttcaa agatgaactc tttggaaagg 4680 ttactatttt aatgctagtg agagaatttc tcttggtttt tattttaata gttgagaata 4740 gagctgctac gttaatgtgg cctgctctgc cacccaatga accaaatcca tgacagggta 4800 caataggtga gtggacaata cgatgaagat agaccctttc cacttcttgt caactccggt 4860 tccattaact gagaaacaaa tttaatgacc ttcacatacc acaattttgc catctttgct 4920 gccctaagaa atgttttact gatcgagttt tcccattcaa ttaggggatt aaaaaactgc 4980 atctctaccg tcttcatttt tagtatggat tctctactca tgttcactca ctcattccat 5040 ttaattggct gctggatgac cctaataaat gacatcatta ttggaccaag catactaaaa 5100 tgagttagga gatgcctata aatgcttgtg ggggtttcgt gtttgtttgt ttgtttgttt 5160 acagtgaaag taagcttagg gggtgggtgg ctgggaagaa atatgtatgg tagatttcta 5220 atcctaggat tgaaattctt ctctaaaact aacaattgaa gggacttaaa agacattttt 5280 ttctttttta atataatgca tctctttgct aagtacaata tgtctaaaca accatattct 5340 ggatgtaata tgaatctccc ccattcttat attgtcttca ttaaacatat taagccctag 5400 agtcatgaca gaaaataagg taagataaat aaagtgaaat tcaatataat tttacattta 5460 aatttgataa atgtcaaaat aattttgaac ttacttttgt gagagatctg gccatgtcct 5520 agaagaaaga taaaattagc aaacacatat agatttgttt ttaaagatgc tacattatat 5580 cttttataaa ataatttgat tctcaaaata tgtaacattt tctatctata tattatcctg 5640 aggaataaag cagaaccata aatgctaaac aaattattaa tcataaaaac taaatattta 5700 aacaaacaaa tggaattttt attaagtgcc ttctatggga ttcaaaccta ggactatgag 5760 acttctgagg cctcttatta actataagac tgtaacacat cccaccttca aggctggcca 5820 cccactgaga gagagagaga aagagagaga gagagactga gagagagtga cagagagaga 5880 gagacagaga gagtgacaga gagagagaga aaccgagaga gagtgcgcaa atccatctct 5940 ttattaaaca ggcatgaccc agatcttgta tttcagccca taaaagattt tatttcactt 6000 tcctacatgt gctttcacaa tagtaaaata aagatttata ggaatgttta ccataaagag 6060 cctttaacag ggccacttgt ttttcaattg aggaatctga caagagacga attgtcatta 6120 actacatgtt ccactgaccg tgcgatgaat tcaaggaaac gatatttcta tcccaagaca 6180 aatgtactct cacctcaggg aatgctataa aatcctcttc cacatgcact tggatcatcc 6240 gcagtactac ccctggaggc ccgtgccttc cctttgtcag tttggatctt tagtcaaggg 6300 agcgcttcac tcgaatacag tgaggcatgc gaaccagatc tttccctccc cccgcgggcc 6360 cgtgcgtgcc ttagtgcggt gtgggccaat gtcgcgcctg gggaattaca cccctcttgg 6420 agtggaaatc tctattcaga gcgagagacc ctggggtact ccaggaagga gtgagcagac 6480 agggcgggct gcccaagaca cctagggacg gtcgcctatc tcaccagcat cccgtttgcc 6540 cattaatcca aagaactgct gaggcttggg tctccgggcg attctctgca gaagatgctc 6600 aaagggctcc ggcagttcct cctgggagac aaaagcacgg acaaagggcg tgtaaggcaa 6660 ccagagcgag gcacccagca acccgagccc ttccccccgc tgtactccgg ccccgaggcg 6720 tggggaggcg gccttcccca cgctcgggct gagcggggtc cctcccgagg cgctgcctct 6780 ctgcgcccct ccccgccgaa ctcgcgtccc gccccccgca agcctgccag ggcgagttag 6840 cagctggctc ggcgtcttca agcttcgagc gctttccgct ctttcctccc agcccgggga 6900 ccttccctca tctgctgcgc cgccacctga ctttgtcttg tctcggtgcc ggctttgtag 6960 agtcctcacc gccctaaatg cacacaggtg tgtgggatct ggggctgggg ctccggtggg 7020 gaagggtgac aacgctttac agacgacttt caccgttttt ccgaggcgcg ctccccagcg 7080 cctgtagcct acgagtttct aaagggagac ttcaagctac atcctcaggt ccgcaaaaca 7140 aacgtgaagg caggaaatta acttccctcc agcctccggc cctccaatcc ccctgcagct 7200 cgcgcgtgtg cccgctgctg cccgcgaccc aggcgccctc ctctgcccgt gcccagacgc 7260 tagggcagtg cagctggacc ggagcccccg aaatcccagg tcctggggga tgaaatctta 7320 cgagatttcc cgccttgtga ggatctcggg ctcatccggg agggcatccc tactgcaggg 7380 agttcctggg ccggacggtg cagccctcgg gaagaaactt gaatcgtggg cacaaaatcc 7440 cgtggggaac ccgggaaata gtgccccttt ccatcctctc gcacgcaacc gctgcctctt 7500 tccgtggtgg cggtgcgtgc cacgttaact agggtgctgt tgcgtgggaa ggtgacagct 7560 cccgagccca ggaagaaggg tgcgggccgt cctgggaagg ggcctcacct tgatctggtc 7620 gctgtcgtac cagtcggacc agtaattcag atcatcattg gctcctattt cttctgcaaa 7680 cagctgagtg gagacaagaa aaaagactgc caaggccacg aggattttca tgttggattt 7740 ctgggaaggg gtaggaggag aagacaccaa agagagaaat aatgtatcta ttaggggtgg 7800 ttatccaaga gttaaagcaa cagaattttc tgccccacaa cggatgaacc aagatcaaaa 7860 acataaggac tgaagtctca cctgtaccgg ttaggcgaga gaatcgcgtc ccaaagattc 7920 tccaaccctc ttctccctga atcccaactc ccccagcccc ctaacccacc aacccacacc 7980 ttcaaaccag gaaactctgc aggtggaaga caaagagggg cgttggcgtt tgggaagcca 8040 gtctccccac tgtccctcgc cgcagcggcg cccccagcgc ggccacctcg gacagatgcg 8100 gggcggggtg acccgggcag ccgcggccag caccgcgcgg gcacttactg cgacggacag 8160 tcccgcgggg tgctgagttt ctctggttcc tccgagcgca cgctggtcgc tccgcactct 8220 cggtagctgc cgccgggaag gaggtccgag cgcgctcttt cgcctgctca gtgccttgcg 8280 gtatttatcc cagcctcctt gagcctccag acccacgtga cattctcccc acgcgacttt 8340 ctgctcaata tttaattagc cgcctcctct cctttcgctt gcgtgattga gagtttccga 8400 gacggtaact cgtcgatgcc cataacatct ggacccaatt gggttctaaa tgacgcaatt 8460 ttaggaaaat cgaggtctcg ccatccaatc cggagcggcc 8500 <210> 2 <211> 24 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 2 catgtttaca atacatattg gcac 24 <210> 3 <211> 17 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 3 gtatatgatg aatgatg 17 <210> 4 <211> 19 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 4 caccctcatt cttccctgc 19 <210> 5 <211> 21 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 5 cttcagtctc accaaaactt g 21 <210> 6 <211> 20 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 6 gtgccccttt ccatcctctc 20 <210> 7 <211> 20 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 7 ggtgtgggtt ggtgggttag 20 <210> 8 <211> 19 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 8 ccggtacagg tgagacttt 19 <210> 9 <211> 19 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 9 ccggtacagg tgagacttc 19 <210> 10 <211> 19 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 10 caacggatga accaagatc 19 <210> 11 <211> 26 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 11 agagaaatag acagatactg tggtag 26 <210> 12 <211> 26 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 12 agagaaatag acagatactg tggtaa 26 <210> 13 <211> 22 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 13 atggatttat agctggttaa gc 22 <210> 14 <211> 26 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 14 cagatctata ggaaagaata tagcac 26 <210> 15 <211> 26 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 15 cagatctata ggaaagaata tagcat 26 <210> 16 <211> 26 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 16 ccatttaatc attaccaacc tgaatc 26

Claims

인간의 NKNA 유전자의 단일 뉴클레오타이드 다형성을 측정하는 단계, 및 NKNA 유전자의 다형성에 의해 약학 활성 화합물이 투여되는 인간의 상태를 측정하는 단계를 포함하는, 인간에게 투여되는 약학 활성 화합물의 효능 및 상용성을 NKNA 유전자의 단일 뉴클레오타이드 다형성과 연관시키는 방법.
제 1 항에 있어서,

NKNA 유전자를 포함하는 도 2의 뉴클레오타이드 서열의 위치 33612, 33949, 37025, 37114, 37434, 41112 및 41172의 위치 중 하나 이상에서 뉴클레오타이드를 측정하는 방법.
제 1 항에 있어서,

도 2에서 뉴클레오타이드의 위치에 의해 한정되는 NKNA 유전자의 위치 41172의 뉴클레오타이드를 측정하는 방법.
제 1 항 내지 제 3 항중 어느 한 항에 있어서,

NKNA 유전자의 단일 뉴클레오타이드 다형성이 도 2의 위치 33612에서 C 또는 T, 도 2의 위치 33949에서 T 또는 C, 도 2의 위치 37025에서 C 또는 T, 도 2의 위치 37114에서 G 또는 A, 도 2의 위치 37434에서 A 또는 C, 도 2의 위치 41112에서 T또는 G, 도 2의 위치 41172에서 G 또는 A, 및 이들의 조합, 및 이들의 역방향 상보체로 구성된 군에서 선택되는 방법.
제 1 항 내지 제 4 항중 어느 한 항에 있어서,

약학 활성 화합물이 NK-1 수용체 길항제인 방법.
제 5 항에 있어서,

NK-1 수용체 길항제가 2-(3,5-비스-트라이플루오로메틸-페닐)-N-메틸-N-(6-모폴린-4-일-4-o-톨릴-피리딘-3-일)-아이소부티르아마이드, 2-(3,5-비스-트라이플루오로메틸-페닐)-N-[6-(1,1-다이옥소-1λ⁶-티오모폴린-4-일)-4-o-톨릴-피리딘-3-일]-N-메틸-아이소부티르아마이드, 2-(3,5-비스-트라이플루오로메틸-페닐)-N-[6-(1,1-다이옥소-1λ⁶-티오모폴린-4-일)-4-(4-플루오로-2-메틸-페닐)-피리딘-3-일]-N-메틸-아이소부티르아마이드 및 이의 약학적으로 허용가능한 산 부가염으로 구성된 군에서 선택되는 방법.
제 5 항에 있어서,

NK-1 수용체 길항제가 GR205171, HSP-117, L 703,606, L 668,169, LY303241, LY 306740, MK-869, R-544, 스판타이드(Spantide) III, WIN-62,577, GR 103,537, L 758,298, NKP608, CGP49823, CP-96,345, CP-99,994, CP-122,721, FK 888,GR203040, GR 82334, GR 94800, L 732,138, L 733,060, L 742,694, L 754,030, LY 303870, MEN 11149, PD 154075, RP-67580, RPR100893, 스펜다이드(Spendide), 스판타이드 II, SR140333, WIN-41,708, WIN-62,577, SR-48,968, L-659,877, MEN 10627, SR 144190, GR 94800, SR-142,801, R820, R486, SB 222200, L 758,298, NK-608, CGP 47899 및 MEN 11467로 명명된 약물 개발중인 NK-1 수용체 길항제중에서 선택된 화합물이거나 이의 약학적으로 허용가능한 산 부가염인 방법.
제 5 항 내지 제 7 항중 어느 한 항에 있어서,

NK-1 수용체 길항제가 통증, 두통, 특히 편두통, 알츠하이머 병, 중추 신경계 질환, 예를 들면 일부 우울증 질환, 불안증 및 구토, 정신병, 다발성 경화증, 모르핀 금단 현상의 약화, 심혈관 변화, 부종, 예를 들면 열 손상으로 인한 부종, 만성 염증성 질병, 예를 들면 류마티스성 관절염, 천식/기관지 과반응성 및 알레르기성 비염을 포함한 다른 호흡기 질환, 궤양성 대장염 및 크론 병을 포함하는 장의 염증성 질환, 눈 손상 및 눈의 염증성 질병, 양성 전립성 과형성, 멀미, 치료로 인한 구토, 암, 예를 들면 악성 신경교종 및 외상성 뇌 손상으로 구성된 군에서 선택되는 질병 또는 질환의 치료에 사용되는 방법.
제 5 항 내지 제 7 항중 어느 한 항에 있어서,

NK-1 수용체 길항제가 중추 신경계 질환, 예를 들면 일부 우울증 질환, 불안증 및 구토의 예방 또는 치료에 사용되는 방법.
제 1 항 내지 제 9 항중 어느 한 항에 있어서,

질량 분광학을 사용한 PCR 생성물의 직접적인 질량 분석, 침해적 분해 생성물의 직접적인 분석, 직접적인 서열 분석, 대립 유전자 특이적 증폭, 대립 유전자 특이적 하이브리드 형성, 올리고뉴클레오타이드 라이게이션 분석, 인베이더(Invader) 분석, DNA 칩 분석 및 제한 단편 길이 다형성으로 구성된 군에서 선택된 서로 다른 핵산 분석 기법을 포함하는 분석법을 사용하는 방법.
약학 활성 화합물의 효능 및 상용성과 연관되어 있는 단일 뉴클레오타이드 다형성의 존재를 인간에서 수득된 NKNA 게놈 서열에서 측정하는 단계, 및 이에 의해 인간을 위한 약학 활성 화합물의 효능 및 상용성을 측정하는 단계를 포함하는, 인간을 위한 약학 활성 화합물의 효능 및 상용성을 측정하는 방법.
제 11 항에 있어서,

NKNA 유전자를 포함하는 도 2의 뉴클레오타이드 서열의 위치 33612, 33949, 37025, 37114, 37434, 41112 및 41172의 위치 중 하나 이상에서 뉴클레오타이드를 측정하는 방법.
제 11 항에 있어서,

도 2의 뉴클레오타이드의 위치에 의해 한정되는 NKNA 유전자의 위치 41172의 뉴클레오타이드를 측정하는 방법.
제 11 항 내지 제 13 항중 어느 한 항에 있어서,

NKNA 유전자의 단일 뉴클레오타이드 다형성이 도 2의 위치 33612에서 C 또는 T, 도 2의 위치 33949에서 T 또는 C, 도 2의 위치 37025에서 C 또는 T, 도 2의 위치 37114에서 G 또는 A, 도 2의 위치 37434에서 A 또는 C, 도 2의 위치 41112에서 T 또는 G, 도 2의 위치 41172에서 G 또는 A, 및 이들의 조합, 및 이들의 역방향 상보체로 구성된 군에서 선택되는 방법.
제 11 항 내지 제 14 항중 어느 한 항에 있어서,

약학 활성 화합물이 NK-1 수용체 길항제인 방법.
제 15 항에 있어서,

NK-1 수용체 길항제가 2-(3,5-비스-트라이플루오로메틸-페닐)-N-메틸-N-(6-모폴린-4-일-4-o-톨릴-피리딘-3-일)-아이소부티르아마이드, 2-(3,5-비스-트라이플루오로메틸-페닐)-N-[6-(1,1-다이옥소-1λ⁶-티오모폴린-4-일)-4-o-톨릴-피리딘-3-일]-N-메틸-아이소부티르아마이드, 2-(3,5-비스-트라이플루오로메틸-페닐)-N-[6-(1,1-다이옥소-1λ⁶-티오모폴린-4-일)-4-(4-플루오로-2-메틸-페닐)-피리딘-3-일]-N-메틸-아이소부티르아마이드로 구성된 군에서 선택되는 화합물 또는 이의 약학적으로 허용가능한 산 부가 염인 방법.
제 15 항에 있어서,

NK-1 수용체 길항제가 GR205171, HSP-117, L 703,606, L 668,169, LY303241, LY 306740, MK-869, R-544, 스판타이드 III, WIN-62,577, GR 103,537, L 758,298, NKP608, CGP49823, CP-96,345, CP-99,994, CP-122,721, FK 888, GR203040, GR 82334, GR 94800, L 732,138, L 733,060, L 742,694, L 754,030, LY 303870, MEN 11149, PD 154075, RP-67580, RPR100893, 스펜다이드, 스판타이드 II, SR140333, WIN-41,708, WIN-62,577, SR-48,968, L-659,877, MEN 10627, SR 144190, GR 94800, SR-142,801, R820, R486, SB 222200, L 758,298, NK-608, CGP 47899 및 MEN 11467로 명명된 약물 개발중인 NK-1 수용체 길항제의 군에서 선택되는 화합물 또는 이의 약학적으로 허용가능한 산 부가염인 방법.
제 15 항 내지 제 17 항중 어느 한 항에 있어서,

NK-1 수용체 길항제가 통증, 두통, 특히 편두통, 알츠하이머 병, 중추 신경계 질환, 예를 들면 일부 우울증 질병, 불안증 및 구토, 정신병, 다발성 경화증, 모르핀 금단 현상의 약화, 심혈관 변화, 부종, 예를 들면 열 손상으로 인한 부종, 만성 염증성 질병, 예를 들면 류마티스성 관절염, 천식/기관지 과반응성 및 알레르기성 비염을 포함하는 다른 호흡기 질환, 궤양성 대장염 및 크론 병을 포함하는 장의 염증성 질환, 눈 손상 및 눈의 염증성 질병, 양성 전립성 과형성, 멀미, 치료로 인한구토, 암, 예를 들면 악성 신경교종 및 외상성 뇌 손상으로 구성된 군에서 선택되는 질병 또는 질환의 치료에 사용되는 방법.
제 15 항 내지 제 17 항중 어느 한 항에 있어서,

NK-1 수용체 길항제가 중추 신경계 질환, 예를 들면 일부 우울증 질환, 불안증 및 구토의 예방 또는 치료에 사용되는 방법.
제 11 항 내지 제 19 항중 어느 한 항에 있어서,

질량 분광학을 사용한 PCR 생성물의 직접적인 질량 분석, 침해적 분해 생성물의 직접적인 분석, 직접적인 서열 분석, 대립 유전자 특이적 증폭, 대립 유전자 특이적 하이브리드 형성, 올리고뉴클레오타이드 라이게이션 분석, 인베이더(Invader) 분석, DNA 칩 분석 및 제한효소 단편 길이 다형성으로 구성된 군에서 선택된 상이한 핵산 분석 기법을 포함하는 분석법을 사용하는 방법.
도 2에서의 위치로 한정된 바와 같은 위치 33612에서 T를 갖는 도 2의 핵산 서열;

도 2에서의 위치로 한정된 바와 같은 위치 33949에서 C를 갖는 도 2의 핵산 서열;

도 2에서의 위치로 한정된 바와 같은 위치 37025에서 T를 갖는 도 2의 핵산 서열;

도 2에서의 위치로 한정된 바와 같은 위치 37114에서 A를 갖는 도 2의 핵산 서열;

도 2에서의 위치로 한정된 바와 같은 위치 37434에서 C를 갖는 도 2의 핵산 서열;

도 2에서의 위치로 한정된 바와 같은 위치 41112에서 G를 갖는 도 2의 핵산 서열;

도 2에서의 위치로 한정된 바와 같은 위치 41172에서 G를 갖는 도 2의 핵산 서열;

또는 이들의 상보적인 나선, 또는 단일 뉴클레오타이드 다형성중 하나 이상을 포함하는 20개 이상의 염기인 이의 단편으로 구성된 군에서 선택된 단리된 핵산 분자.
제 12 항에 정의된 바와 같은 도 2의 뉴클레오타이드 서열중 하나 이상의 위치에서 NKNA 유전자의 다형성을 검출할 수 있는 대립 유전자-특이적 핵산 프라이머.
제 22 항에 있어서,

프라이머가 서열 번호 8, 서열 번호 9, 서열 번호 10, 서열 번호 11, 서열 번호 12, 서열 번호 13, 서열 번호 14, 서열 번호 15 및 서열 번호 16으로 구성된 군에서 선택되는 핵산 프라이머.
제 14 항에 정의된 바와 같은 다형성을 갖는 핵산에 특이적으로 하이브리드를 형성할 수 있는 NKNA 유전자의 다형성을 검출하기 위한 올리고뉴클레오타이드 프로브.
제 24 항에 있어서,

올리고뉴클레오타이드 프로브가 17 내지 50 뉴클레오타이드의 길이를 갖는 올리고뉴클레오타이드 프로브.
제 22 항 또는 제 23 항에 정의된 바와 같은 하나 이상의 핵산 프라이머, 및/또는제 24 항 또는 제 25 항에 정의된 바와 같은 하나 이상의 올리고뉴클레오타이드 프로브를 포함하는 진단 키트.
NKNA 유전자의 하나 이상의 위치에서 단일 뉴클레오타이드 다형성에 대해 시험되는 인간에게 약물을 투여하기 위한 사용 설명서 및 NK-1 수용체 길항제를 포함하는 약학 팩(pack).
제 12 항에 정의된 바와 같은 NKNA 유전자의 하나 이상의 위치에서 단일 뉴클레오타이드 다형성에 대해 시험되는 인간에게 약물을 투여하기 위한 사용 설명서 및 NK-1 수용체 길항제를 포함하는 약학 팩.
제 11 항 내지 제 20 항중 어느 한 항의 방법에 따라 단일 뉴클레오타이드 다형성에 대해 시험되는 인간에게 약물을 투여하기 위한 사용 설명서 및 NK-1 수용체 길항제를 포함하는 약학 팩.
NKNA 유전자를 포함하는 도 2의 뉴클레오타이드 서열의 위치 33612, 33949, 37025, 37114, 37434, 41112 및 41172의 위치 중 하나 이상에서 단일 뉴클레오타이드 다형성을 갖는 것으로 진단되는 인간의 NK-1 수용체 리간드-매개되는 질환을 치료하기 위한 약제를 제조하기 위한 NK-1 수용체 길항제의 용도.
도 2에서의 위치로 한정된 바와 같은 위치 33612에서, 및/또는

도 2에서의 위치로 한정된 바와 같은 위치 33949에서, 및/또는

도 2에서의 위치로 한정된 바와 같은 위치 37025에서, 및/또는

도 2에서의 위치로 한정된 바와 같은 위치 37114에서, 및/또는

도 2에서의 위치로 한정된 바와 같은 위치 37434에서, 및/또는

도 2에서의 위치로 한정된 바와 같은 위치 41112에서, 및/또는

도 2에서의 위치로 한정된 바와 같은 위치 41172에서의 다형성을 포함하는 NKNA 유전자의 다형성에 대한 서열 정보가 저장되어 있는 컴퓨터 판독형 매체.
제 21 항의 핵산 서열을 제공하는 단계; 및

상기 핵산 서열을 하나 이상의 다른 핵산 서열과 비교하여 동일성을 측정하는 단계를 포함하는, 서열을 확인하는 방밥.
특히 전술된 실시예를 참고하여 본원에서 실질적으로 설명된 바와 같은 방법, 핵산 분자, 핵산 프라이머, 올리고뉴클레오타이드 프로브, 진단 키트 및 약학 팩, 용도 및 컴퓨터 판독형 매체.