KR102464502B1 - 리소좀 표지를 위한 형광 프로브 - Google Patents

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Abstract

본 발명은 리소좀을 특이적으로 표지하는 형광 프로브에 대한 것이다.

Description

리소좀 표지를 위한 형광 프로브{Fluorescent probe for imaging of lysosome}
본 발명은 리소좀 표지를 위한 형광 프로브에 대한 것이다.
세포 소기관을 기반으로 한 단백체학은 표적 소기관에 상주하는 단백질의 기작 및 자극에 따른 세포 내 농도의 증감을 밝히고 제어함으로써 질병 진단 및 치료를 가능케 한다. 특히, 리소좀은 대부분의 원핵 및 진핵세포에 존재하여 세포 대사에 직접적인 영향을 끼치는 필수적인 소기관으로, 세포 내 소화 및 세포 사멸에 중요한 역할을 하여 다양한 대사 및 질병 치료를 위해 널리 연구되고 있다. 세포 내 소기관의 표지, 특정 단백질(독성물질)의 표지 등을 위해 보편적으로 사용되고 있는 방법은 하기의 특허문헌처럼 바이러스 활용한 녹색형광단백질(GFP)의 형질 주입 방법이다.
<특허문헌>
특허공개공보 제10-2009-0119283호(2009. 11. 19. 공개) "녹색형광단밸질 이용한 단백질 과발현 시스템의 향상"
하지만, 종래의 형질 주입 방법은 단백질의 크기가 크고, 유전정보가 알려진 단백질의 주변에만 처리를 할 수 있다는 한계점을 가지고 있다. 이에 따라, 외부에서 주입된 형광염료를 목표한 단백질에 표지하는 방법이 널리 연구되고 있다. 하지만, 종래의 리소좀을 표지하기 위한 형광염료는 세포 투과성이 낮아 형광 효율이 떨어지는 문제가 있다.
본 발명은 상기와 같은 문제점을 해결하기 위해 안출된 것으로,
본 발명은 리소좀을 특이적으로 표지하는 형광 프로브를 제공하는데 그 목적이 있다.
또한, 본 발명은 적은 농도의 화합물을 적은 시간 동안 처리하고서도, 높은 형광 효율을 가지는 형광 프로브를 제공하는데 그 목적이 있다.
본 발명은 앞서 본 목적을 달성하기 위하여 다음과 같은 구성을 가진 실시예에 의해 구현된다.
본 발명의 일 실시예에 따르면, 본 발명에 따른 화합물은 하기 화학식 1 또는 2로 표시되는 것을 특징으로 한다.
Figure 112020109223272-pat00001
Figure 112020109223272-pat00002
[화학식 1] [화학식 2]
상기 화학식 1에서 n은 10이다.
본 발명의 다른 실시예에 따르면, 본 발명에 따른 화합물은 리소좀을 표지하기 위한 용도로 사용되는 것을 특징으로 한다.
본 발명의 또 다른 실시예에 따르면, 본 발명에 따른 리소좀을 표지하는 방법은 제1항의 화학식 1 또는 2로 표시되는 화합물을 이용하는 것을 특징으로 한다.
본 발명의 또 다른 실시예에 따르면, 본 발명에 따른 리소좀을 표지하는 방법은 화학식 1 또는 2로 표시되는 화합물을 용매에 혼합해 용액을 제조하는 단계와, 상기 용액을 세포를 포함하는 시료에 첨가하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 한다.
본 발명의 또 다른 실시예에 따르면, 본 발명에 따른 리소좀을 표지하는 방법은 화학식 1 또는 2로 표시되는 화합물이 첨가된 시료에 일정 파장의 빛을 가하는 단계와, 상기 시료에서 방출되는 형광을 측정하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 한다.
본 발명은 앞서 본 실시예에 의해 다음과 같은 효과를 얻을 수 있다.
본 발명은 새롭게 합성된 화합물을 이용하여 리소좀을 특이적으로 표지할 수 있는 효과가 있다.
또한, 본 발명은 적은 농도의 화합물을 적은 시간 동안 처리하고서도, 높은 형광 효율을 제공할 수 있는 효과가 있다.
도 1은 본 발명의 일 실시예에 따른 화합물이 리소좀을 표지하는 것을 확인하기 위한 형광현미경 사진.
도 2는 본 발명의 다른 실시예에 따른 화합물이 리소좀을 표지하는 것을 확인하기 위한 형광현미경 사진.
이하에서는 본 발명에 따른 리소좀 표지를 위한 형광 프로브를 도면을 참조하여 상세히 설명한다. 특별한 정의가 없는 한 본 명세서의 모든 용어는 본 발명이 속하는 기술분야의 통상의 지식을 가진 기술자가 이해하는 당해 용어의 일반적 의미와 동일하고 만약 본 명세서에 사용된 용어의 의미와 충돌하는 경우에는 본 명세서에 사용된 정의에 따른다. 또한, 본 발명의 요지를 불필요하게 흐릴 수 있는 공지 기능 및 구성에 대해 상세한 설명은 생략한다. 명세서 전체에서, 어떤 부분이 어떤 구성요소를 "포함"한다고 할 때 이는 특별히 반대되는 기재가 없는 한 다른 구성요소를 제외하는 것이 아니라 다른 구성요소를 더 포함할 수 있는 것을 의미한다.
본 발명의 일 실시예는 리소좀을 표지(Imaging)하기 위한 화합물에 대한 것으로, 상기 화합물은 화학식 1 또는 2로 표시되며, 상기 화학식 1에서 n은 10이다.
Figure 112020109223272-pat00003
Figure 112020109223272-pat00004
[화학식 1] [화학식 2]
본 발명의 다른 실시예는 리소좀 검출용 형광 프로브에 대한 것으로, 상기 리소좀 검출용 형광 프로브는 상기 화학식 1 또는 화학식 2로 표시되는 화합물을 포함한다.
본 발명의 또 다른 실시예는 화학식 1 또는 2로 표시되는 화합물을 이용하여 리소좀을 표지하는 방법에 대한 것이다. 상기 리소좀을 표지하는 방법은 상기 화학식 1 또는 2로 표시되는 화합물을 용매에 혼합해 용액을 제조하는 단계, 상기 용액을 세포를 포함하는 시료에 첨가하는 단계, 상기 화학식 1 또는 2로 표시되는 화합물이 첨가된 시료에 일정 파장의 빛을 가하는 단계, 상기 시료에서 방출되는 형광을 측정하는 단계를 포함한다.
본 발명의 또 다른 실시예는 화학식 1로 표시되는 리소좀 표지를 위한 화합물의 제조방법에 대한 것으로, 화학식 1-1로 표시되는 화합물 수득단계, 화학식 1-2로 표시되는 화합물 수득단계, 화학식 1-3으로 표시되는 화합물 수득단계 및 화학식 1로 표시되는 화합물 수득단계를 포함한다.
상기 화학식 1-1로 표시되는 화합물 수득단계는 하기 반응식 1-1에 따라, 아세토페논(acetophenone)과 브로모알콕시벤즈알데하이드((bromoalkoxy)benzaldehyde)를 에탄올에 녹이고, 수산화리튬일수화물(lithium hydroxide monohydrate)을 첨가하여 반응시키고, 수산화리튬일수화물과 토실메틸이소시아나이드(tosylmethyl isocyanide)을 넣고 침전이 발생할 때까지 교반하여 하기의 화학식 1-1로 표시되는 화합물을 생성하고, 침전물을 얼음물과 에탄올 혼합액으로 세척하고 건조하여 수득한다.
[반응식 1-1]
Figure 112020109223272-pat00005
상기 화학식 1-2로 표시되는 화합물 수득단계는 하기 반응식 1-2에 따라, 화학식 1-1로 표시되는 화합물을 과량의 모르폴린(morpholine)에 넣고, 반응 혼합물을 환류시키고, 과량의 모르폴린을 감압 하에서 제거하여, 화학식 1-2로 표시되는 화합물을 수득한다.
[반응식 1-2]
Figure 112020109223272-pat00006
상기 화학식 1-3으로 표시되는 화합물 수득단계는 하기 반응식 1-3에 따라, 디메틸포름아미드(dimethylformamide) 및 염화포스포릴(phosphoryl chloride)의 혼합물에 1,2-디클로로에탄(1,2-dichloroethane)을 첨가한 다음, 화학식 1-2로 표시되는 화합물을 천천히 첨가한 후 환류시키고, 수성 아세트산 나트륨(aqueous sodium acetate)을 넣고 반응시켜 화학식 1-3(major) 및 1-4(minor)로 표시되는 화합물을 수득한다.
[반응식 1-3]
Figure 112020109223272-pat00007
상기 화학식 1로 표시되는 화합물 수득단계는 하기 반응식 1-4에 따라, 화학식 1-3으로 표시되는 화합물을 무수 메틸렌 클로라이드(anhydrous methylene chloride)에 넣고 2,4- 디메틸 피롤(2, 4-dimethyl pyrrole)을 첨가한 후, 염화포스포릴을 천천히 첨가하여 반응시키고, N,N-디이소프로필에틸아민(N, N-diisopropylethylamine)을 첨가한 다음 보론트리플루오라이드에터레이트(Boron trifluoride etherate)를 넣고 반응시켜 화학식 1로 표시되는 화합물을 수득한다.
[반응식 1-4]
Figure 112020109223272-pat00008
본 발명의 또 다른 실시예는 화학식 2로 표시되는 리소좀 표지를 위한 화합물의 제조방법에 대한 것으로, 화학식 2-1로 표시되는 화합물 수득단계, 화학식 2-2로 표시되는 화합물 수득단계, 화학식 2-3으로 표시되는 화합물 수득단계 및 화학식 2로 표시되는 화합물 수득단계를 포함한다.
상기 화학식 2-1로 표시되는 화합물 수득단계는 하기 반응식 2-1에 따라, 2,4-디메틸피롤(2,4-dimethylpyrrole) 및 4-니트로벤즈알데히드(4-nitrobenzaldehyde)를 건조 디클로로메탄(dichloromethane)에 녹인 후, 한 방울의 트리플루오로아세트산(trifluoroacetic acid)을 첨가하고 반응시키고, 디클로로디시아노벤조퀴논(Dichlorodicyanobenzoquinone)을 건조 디클로로메탄에 녹여 주입한 뒤 반응시키고, 디이소프로필에틸아민(diisopropylethylamine)로 추가로 처리하여 반응시킨 후, 삼불화 붕소 에테르(Boron trifluoride etherate)를 추가하여 반응시켜, 화학식 2-1로 표시되는 화합물을 수득한다.
[반응식 2-1]
Figure 112020109223272-pat00009
상기 화학식 2-2로 표시되는 화합물 수득단계는 하기 반응식 2-2에 따라, 화학식 2-1로 표시되는 화합물, 히드라진(hydrazine) 및 Pd/C를 에탄올에 용해시키고 환류시킨 후, 반응 혼합물을 여과하여 Pd/C 및 고체 불순물을 제거하고 정제하여 오렌지색 파우더를 얻고, 상기 파우더를 염산과 메탄올이 혼합된 용액에 녹인 후, 아질산나트륨(Sodium nitrite) 및 아지드화나트륨(Sodium azide)을 차례로 첨가하여 반응시켜 화학식 2-2로 표시되는 화합물을 수득한다.
[반응식 2-2]
Figure 112020109223272-pat00010
상기 화학식 2-3으로 표시되는 화합물 수득단계는 하기 반응식 2-3에 따라, 디메틸포름아미드 및 염화포스포릴의 혼합물에 화학식 2-2로 표시되는 화합물이 혼합된 1,2-디클로로에탄을 첨가하여 반응시켜 화학식 2-3으로 표시되는 화합물을 얻었다.
[반응식 2-3]
Figure 112020109223272-pat00011
상기 화학식 2로 표시되는 화합물 수득단계는 하기 반응식 2-4에 따라, 1,2-디클로로에탄에 화학식 2-3으로 표시되는 화합물 및 모르폴린을 혼합하여 반응시켜 화학식 2로 표시되는 화합물을 수득하였다.
[반응식 2-4]
Figure 112020109223272-pat00012
이하, 실시예를 통해서 본 발명을 보다 상세히 설명하기로 한다. 하지만, 이들은 본 발명을 보다 상세하게 설명하기 위한 것일 뿐, 본 발명의 권리범위가 이에 한정되는 것은 아니다.
<실시예 1> 리소좀 이미징을 위한 화합물 1의 제조
1. 아세토페논(1.0mmol)과 브로모알콕시벤즈알데하이드(1.0mmol, n은 10임)를 에탄올(3ml)에 녹이고, 수산화리튬일수화물(0.1mmol)을 첨가한 후, 실온에서 밤새 교반한다. 이후, 수산화리튬일수화물(1.1mmol) 및 토실메틸 이소시아나이드(1.2mmol)를 추가로 첨가하고 침전이 발생할 때까지 교반하고, 침전물을 여과하고 물과 차가운 에탄올로 세척하고, 건조하여 백색 분말 형태인 상기 화학식 1-1로 표시되는 화합물을 얻었다.
2. 둥근 바닥 플라스크에서 화학식 1-1로 표시되는 화합물을 5mL의 모르폴린(과량)에 넣고, 반응 혼합물을 N2 하에서 4시간 동안 환류시키고, 과량의 모르폴린을 감압 하에서 제거하고, 상기 화학식 1-2로 표시되는 화합물을 얻었다.
3. 0℃의 온도 조건에서, 2구 플라스크에 디메틸포름아미드(1.2mmol) 및 염화포스포릴(1.2mmol)을 주입하고, Ice bath를 제거하고 반응 혼합물을 실온에서 15분 동안 교반한 후, 0℃를 유지하기 위해 Ice bath를 교체하고, 1,2-디클로로에탄 15mL를 첨가한 다음, 화학식 1-2로 표시되는 화합물(1.0mmol)을 천천히 첨가한다. 이후, 반응 혼합물을 30분 동안 환류시키고, 실온으로 냉각 시 수성 아세트산 나트륨(5.5mmol)을 첨가하고 다시 30분 동안 환류시킨다. 이후, 차가운 반응 혼합물에 물을 첨가한 다음 포화 탄산나트륨 및 염수로 2회 세척하고, 유기 층을 황산 나트륨으로 건조시키고, 용매를 감압 하에 제거하고 생성물을 플래시 컬럼 크로마토그래피로 정제하여 상기 화학식 1-3(major) 및 1-4(minor)로 표시되는 화합물을 얻었다.
4. 화학식 1-3으로 표시되는 화합물인 벤조일 피롤 카브알데히드(1.0mmol)를 무수 메틸렌 클로라이드(4mL)에 넣고 -5℃로 냉각시키고, 3분 후 냉각 용액에 2,4- 디메틸 피롤(1.0mmol)을 첨가한 후, 염화포스포릴(1.0mmol)을 천천히 첨가하고, 반응 혼합물을 동일한 온도에서 3시간 동안 교반하고 실온에서 3시간 동안 교한다. 이 후, N,N- 디이소프로필에틸아민(3mmol)을 첨가한 다음 보론트리플루오라이드에터레이트(3mmol)을 첨가하고, 3시간 후 플래시 컬럼 크로마토그래피(flash column chromatography)에 적용하여 상기 화학식 1로 표시되는 화합물 얻었다(최종 화합물이 화학식 1로 표기되는 것을 proton NMR 분광기 및 carbon NMR 분광기 결과를 통해 확인함).
<실시예 2> 리소좀 이미징을 위한 화합물 2의 제조
1. 2,4-디메틸피롤(2mmol) 및 4-니트로벤즈알데히드(1mmol)를 질소 하에 건조 디클로로 메탄(50mL)에 녹인 후, 한 방울의 트리플루오로아세트산을 첨가하고 상온의 암실에서 밤새 반응시키고, 디클로로디시아노벤조퀴논(1 mmol)을 건조 디클로로메탄(20mL)에 녹여 주입한 뒤 추가로 30분 동안 반응시켰다. 디이소프로필에틸아민(3mL)로 추가로 처리하고 5분가 반응시킨 후, 삼불화 붕소 에테르(3mL)를 첨가하고 추가로 3시간 동안 반응시켰다. 이후, 용매를 감압 하에서 제거하고, 헥산-디클로로메탄(2:1)을 용리액으로 사용하여 잔류물을 실리카 상의 플래시 컬럼 크로마토그래피를 통해 정제하여 화학식 2-1로 표시되는 화합물을 얻었다.
2. 화학식 2-1로 표시되는 화합물(1mmol), 히드라진(0.2mL) 및 10% Pd/C (1.3mmol)를 에탄올(4mL)에 용해시키고 30분 동안 환류시킨 후, 반응 혼합물을 25 ℃로 냉각하고 셀라이트를 통해 여과하여 Pd/C 및 고체 불순물을 제거하고, 수득된 여액을 감압 하에 증발시키고 1/1 EtOAc/헥산을 용리액으로 사용하는 플래쉬 컬럼 크로마토그래피로 정제한다. 수득된 황색을 띠는 주황색 고체를 1/1 HCl(1.0 M)/MeOH(3mL)에 용해시키고 0℃로 냉각한 후 10분 반응시키고, 물(0.5 mL)에 녹인 아질산나트륨(1.5mmol)을 5분에 걸쳐 첨가하고 0℃에서 1시간 동안 반응시키고, 물(1mL)에 녹인 아지드화나트륨(3mmol)을 첨가하고 반응 혼합물을 25℃에서 추가로 1시간 동안 교반한 후, 용매를 증발시키고 조 생성물을 30% EtOAc/헥산을 용리액으로 사용하는 플래쉬 크로마토그래피를 사용하여 정제하여 화학식 2-2로 표시되는 화합물을 얻었다.
3. 디메틸포름아미드(4mL)와 염화포스포릴(4mL)을 아르곤 하에서 5분 동안 ice-bath에서 교반한 후, 실온으로 가온한 후 추가로 30분 동안 교반하고, 화학식 2-2로 표시되는 화합물이 혼합된 1,2-디클로로에탄(60mL)을 첨가하고, 50℃로 가열하고 2시간 동안 교반하고, 실온으로 냉각하여 혼합물을 얻었다. ice bath에서 포화 수성 탄산수소나트륨(200mL)에 상기 혼합물을 천천히 붓고, 실온으로 가온하고 30분 동안 추가로 교반하고 물로 세척하여 얻은 유기층을 합하고, 무수 황산마그네슘으로 건조하고 진공에서 증발시킨 후, 컬럼 크로마토그래피를 사용하여 추가로 정제하여 화학식 2-3으로 표시되는 화합물을 얻었다.
4. 1,2-디클로로에탄에 화학식 2-3으로 표시되는 화합물(1당량) 및 모르폴린(6당량)을 혼합하고 50℃에서 4시간 동안 교반하고, 수소화붕소나트륨(4당량) 및 아세트산(1방울)을 추가로 첨가하고, 밤새 반응시키고 물과 염수 용액으로 세척한 후, 유기층을 모아 황산마그네슘으로 건조하고 감압 농축한 다음, 컬럼 크로마토그래피를 이용하여 추가로 정제하여 화학식 2로 표시되는 화합물 얻었다(최종 화합물이 화학식 2로 표기되는 것을 proton NMR 분광기 및 carbon NMR 분광기 결과를 통해 확인함).
<실시예 3> 실시예 1 및 2에서 제조된 화합물들이 리소좀을 이미징하는 것에 대한 확인
1. 하루 배양한 HeLa 세포의 미디엄을 제거하고, DMEM에 포함된 2uM의 화학식 1로 표시되는 화합물과, 50nM의 리소좀을 트래킹하는 Red DND-99(Invitrogen)을 처리한 후, 30분 동안 37℃에서 배양하고, 처리된 세포를 PBS로 3번 워싱하고, 형광 현미경을 활용하여 bright field, RHOD 및 514_RHO6 채널에서 세포를 촬영하여 그 결과를 도 1에 나타내었다. 도 1의 (a)는 Bright field, (b)는 화학식 1로 표시되는 화합물 처리 이미지, (c)는 Red DND-99 처리 이미지, (d)는 overlay 결과를 나타낸다.
2. 화학식 1로 표시되는 화합물 대신에 200nM의 화학식 2로 표시되는 화합물을 사용한 것을 제외하고는 다른 조건을 실시예 3의 1과 동일하게 하여 실험하고, 세포 촬영 결과를 도 2에 나타내었다.
3. 도 1 및 2를 보면, 화학식 1 또는 2로 표시되는 화합물을 사용하여 실험한 결과는 리소좀을 트래킹하는 lysotracker Red DND-99를 이용한 실험결과와 일치함을 확인할 수 있어, 본원발명의 화합물들은 리소좀을 이미징하기 위한 용도로 사용될 수 있음을 알 수 있다.
이상에서, 출원인은 본 발명의 바람직한 실시예들을 설명하였지만, 이와 같은 실시예들은 본 발명의 기술적 사상을 구현하는 일 실시예일 뿐이며 본 발명의 기술적 사상을 구현하는 한 어떠한 변경예 또는 수정예도 본 발명의 범위에 속하는 것으로 해석되어야 한다.

Claims (5)

  1. 하기 화학식 1 또는 2로 표시되는 화합물.
    Figure 112020109223272-pat00013
    Figure 112020109223272-pat00014

    [화학식 1] [화학식 2]
    상기 화학식 1에서 n은 10이다.
  2. 제1항에 있어서,
    상기 화합물은 리소좀을 표지하기 위한 용도로 사용되는 것을 특징으로 하는 화합물.
  3. 제1항의 화학식 1 또는 2로 표시되는 화합물을 이용하여 리소좀을 표지하는 방법.
  4. 제3항에 있어서,
    상기 리소좀을 표지하는 방법은 화학식 1 또는 2로 표시되는 화합물을 용매에 혼합해 용액을 제조하는 단계와, 상기 용액을 세포를 포함하는 시료에 첨가하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 리소좀을 표지하는 방법.
  5. 제4항에 있어서,
    상기 리소좀을 표지하는 방법은 화학식 1 또는 2로 표시되는 화합물이 첨가된 시료에 일정 파장의 빛을 가하는 단계와, 상기 시료에서 방출되는 형광을 측정하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 리소좀을 표지하는 방법.
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