KR102040364B1 - 알츠하이머병 관련 ３０개 유전자를 이용한 유전적 진단방법 - Google Patents

Abstract

본 발명은 알츠하이머 진단을 위한 정보제공방법 및 이를 이용한 진단키트에 관한 것이다. 본 발명의 방법을 이용한 유전자 돌연변이 분석결과에 따라 알츠하이머병 환자에게 개인적 맞춤 진단 및 치료가 가능할 것으로 기대된다. 본 발명의 방법을 이용하여 알츠하이머와 연관된 30개의 유전자를 스크리닝하여 환자가 가지고 있는 유전적 문제점을 확인한 후 개별 맞춤 치료를 적용할 수 있다.

Description

알츠하이머병 관련 ３０개 유전자를 이용한 유전적 진단방법{Genetic diagnostic method using 30 genes associated with Alzheimer's disease}

본 발명은 알츠하이머병의 유전적 진단방법 관한 것이다. 보다 상세하게는, 본 발명은 알츠하이머 환자에서 나타나는 30개 유전자의 돌연변이를 검사하여 치매를 진단할 수 있는 유전자 분석 진단방법에 관한 것이다.

알츠하이머병 (AD), 전두측두엽성 치매 (FTD), 근위축성측삭경화증 (ALS), 프리온 질환 (CJD) 및 파킨슨병 (PD)을 비롯한 많은 신경 퇴행성 질환 (neurodegenerative diseases, ND)은 여러 임상적, 병리적 및 분자적 특징이 공통적으로 나타나는 것으로 보고되었다(Bertram L, et al. The genetic epidemiology of neurodegenerative disease. J Clin Invest 2005;115(6):1449-1457). 신경 퇴행성 질환은 신경 세포의 선택적 손실 및 임상 증상으로 기능적 장애를 갖는 질환으로 정의된다. 의료기술이 발달하면서 평균 수명이 길어짐에 따라 질환은 세계에서 주요 건강 문제가 되고 있다. 이러한 문제를 해결하기 위해 전 임상 단계에서 성공적인 치료를 위한 새로운 진단 방법이 필요하다.

Next generation sequencing (NGS)은 인 비트로(in vitro) 및 인 비보(in vivo) 상에서 쉽게 유전적 서열을 확인할 수 있는 기술로서, 최근 몇 년 동안 유전학 연구는 sequencing 기술의 출현으로 인해 상당한 진보를 보였다. NGS 기술을 통하여 점점 더 많은 수의 유전자를 조사할 수 있게 되었고, 이러한 기술의 발달로 질병 진단과 치료를 위해 유전적 돌연변이 발견이 용이해졌다. 최근 확인된 치매와 연관된 대다수의 유전자는 Aβ42 생성 및 제거에 영향을 주거나 ND 병인에 있어서 중요한 경로에 영향을 주는 것으로 알려졌다(Karch CM, et al. Alzheimer's disease risk genes and mechanisms of disease pathogenesis. Biological psychiatry. 2015;77(1):43-51; Lambert JC, et al. Meta-analysis of 74,046 individuals identifies 11 new susceptibility loci for Alzheimer's disease. Nat Genet. 2013; Zhang B, et al. Integrated systems approach identifies genetic nodes and networks in late-onset Alzheimer's disease. Cell. 2013;153:707-720). 하지만 어떠한 돌연변이 유전자가 어떤 질병과 연관성이 있는지 규명되지 않은 부분이 상당히 많다. 특히 다양한 퇴행성 뇌질환의 경우 복잡한 상호연관성을 가지고 있기 때문에(Bertram L, et al. The genetic epidemiology of neurodegenerative disease. J Clin Invest 2005;115(6):1449-1457) 한 가지 유전자로 해당 질병을 진단하거나 치료에 적용하기에 문제점이 있다.

본 명세서 전체에 걸쳐 다수의 논문 및 특허문헌이 참조되고 그 인용이 표시되어 있다. 인용된 논문 및 특허문헌의 개시 내용은 그 전체로서 본 명세서에 참조로 삽입되어 본 발명이 속하는 기술 분야의 수준 및 본 발명의 내용이 보다 명확하게 설명된다.

본 발명자들은 치매 중 가장 높은 비중을 차지하고 하고 있는 알츠하이머를 진단할 수 있는 방법을 찾고자 예의 연구 노력하였다. 그 결과 본 발명자들은 알츠하이머 환자에게서 발견된 알츠하이머 관련 돌연변이 유전자30개를 선별하여 이에 대한 NGS 분석용 프라이머를 디자인 하였고, 이 프라이머를 이용하여 뇌질환 의심 환자들의 대한 돌연변이를 분석함으로써 알츠하이머를 진단할 수 있음을 확인하였다.

따라서, 본 발명의 목적은 알츠하이머 진단을 위한 정보제공방법을 제공하는데 있다.

본 발명의 다른 목적은 알츠하이머 진단 또는 예후 분석용 키트를 제공하는데 있다.

본 발명의 또 목적은 퇴행성 뇌질환 진단을 위한 정보제공방법을 제공하는데 있다.

본 발명의 또 목적은 퇴행성 뇌질환 진단 또는 예후 분석용 키트를 제공하는데 있다.

본 발명의 다른 목적 및 이점은 하기의 발명의 상세한 설명, 청구범위 및 도면에 의해 보다 명확하게 된다.

본 발명의 일 양태에 따르면, 본 발명은 진단하고자 하는 개체로부터 분리된 생물학적 시료의 유전자 돌연변이를 분석하는 단계를 포함하며, 상기 유전자 돌연변이는 APP (amyloid precursor protein), PSEN1 (presenilin), PSEN2 (presenilin 2), CR1 (complement receptor 1), BIN1 (Bridging integrator 1), TREM2 (triggering receptor expressed on myeloid cells 2), CLU (clusterin), CTNNA3 (Cadherin-associated protein alpha 3), DNMBP (Dynamin binding protein), SORL1 (sortilin-related receptor 1), BACE1 (Beta-secretase 1), PICALM (Phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein), LPR6 (low-density lipoprotein receptor-related protein 6), ADAM10 (Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 10), ABCA7 (ATP-binding cassette transporter A7), CD33 (sialic acid binding Ig-like lectin 3), TDP43 (TAR-DNA binding protein-43), SIGMAR1 (sigma non-opioid intracellular receptor 1), FUS (Fused-in-Sarcoma), GRN(PGRN) (progranulin), MAPT (microtubule associated Tau protein), ALS2 (amyotrophic lateral sclerosis), PINK1 (PTEN-induced putative kinase 1), PARK7 (Colony Stimulating Factor 1 Receptor), PARK9 (ATPase 13A2 or PTEN Induced Putative Kinase 1), SNCA (Alpha synuclein), LRRK2 (Leucine-rich repeat kinase 2), CSF1R (colony stimulating factor 1 receptor), NOCTH3 (Neurogenic locus notch homolog protein 3), PRNP (prion protein gene) 및 이의 조합으로 구성된 군에서 선택되는 유전자의 엑손(exon) 부위 돌연변이인, 알츠하이머 진단을 위한 정보제공방법을 제공한다.

본 발명자들은 치매 중 가장 높은 비중을 차지하고 하고 있는 알츠하이머를 진단할 수 있는 방법을 찾고자 예의 연구 노력한 결과, 알츠하이머 환자에게서 발견된 알츠하이머 관련 돌연변이 유전자 30개를 선별하여 이에 대한 NGS 분석용 프라이머를 디자인 하였고, 이 프라이머를 이용하여 여러 뇌질환 의심 환자들의 대한 돌연변이를 분석함으로써 알츠하이머를 진단할 수 있음을 확인하였다.

본 발명에서는 EOAD 환자에서 APP, PSEN1, PSEN2, CR1, BIN1, CLU, CTNNA3, DNMBP, SORL1, BACE1, PICALM, LPR6, ADAM10, ABCA7, CD33, SIGMAR1, FUS, GRN, MAPT, ALS2, PINK1, PARK7, PARK9, SNCA, LRRK2, CSF1R, NOTCH3 및 PRNP 유전자의 돌연변이를 발견하였으며, 특히, PSEN1, CLU, CTNNA3, SORL1, LRP6, ABCA7, PINK1, ATP13A2 (PARK9), LRRK2, FUS, GRN (PGRN), ALS2, CSF1R, NOTCH3 및 PRNP 유전자에서 신규한(novel) 돌연변이가 발견되었다.

또한, LOAD 환자에서도 APP, CR1, BIN1, CLU, CTNNA3, DNMBP, SORL1, BACE1, PICALM, LPR6, ADAM10, ABCA7, CD33, SIGMAR1, MAPT, ALS2, PINK1, PARK9, LRRK2, CSF1R, NOTCH3 및 PRNP 유전자의 돌연변이를 발견하였고, 특히 APP, CLU, ADAM10, ATP13A2 (PARK9), LRRK 및 NOTCH3 유전자의 신규한 돌연변이를 발견하였다.

본 발명의 일 구현예에 따르면, 상기 유전자는 APP, PSEN1, PSEN2, CR1, BIN1, CLU, CTNNA3, DNMBP, SORL1, BACE1, PICALM, LPR6, ADAM10, ABCA7, CD33, SIGMAR1, FUS, GRN, MAPT, ALS2, PINK1, PARK7, PARK9, SNCA, LRRK2, CSF1R, NOTCH3 및 PRNP 및 이의 조합으로 구성된 군에서 선택될 수 있다. 본 발명의 다른 구현예에 따르면, 상기 유전자는 APP, CR1, BIN1, CLU, CTNNA3, DNMBP, SORL1, BACE1, PICALM, LPR6, ADAM10, ABCA7, CD33, SIGMAR1, MAPT, ALS2, PINK1, PARK9, LRRK2, CSF1R, NOTCH3 및 PRNP 및 이의 조합으로 구성된 군에서 선택될 수 있다.

본 발명의 특정 구현예에 따르면, 알츠하이머의 진단에 있어서 상기 30개의 유전자의 돌연변이를 분석하되, 각 유전자에서 1 이상의 돌연변이를 검출할 수 있고, 각 유전자의 돌연변이 검출에 있어서는 1개 이상의 프라이머 세트를 사용할 수 있다. 상기 돌연변이는 하기 실시예의 표 2 및 표 3에 기재되어 있다.

본 발명에서 상기 생물학적 시료는 혈액, 정액, 질 세포, 모발, 타액, 소변, 구강세포, 태반세포 또는 태아세포를 포함하는 양수 및 이의 혼합물로 구성된 군에서 선택되는 시료로부터 분리된 DNA 시료이다. 본 발명의 일 구현예에 따르면, 상기 생물학적 시료는 혈액으로부터 분리된 DNA 시료이다.

상기 DNA 시료는 당업계에 공지된 통상적인 방법을 통해 수득할 수 있다. 예컨대, 상기 조직에 DNA 용해 완충액(예컨대, tris-HCl, EDTA, EGTA, SDS, 디옥시콜레이트(deoxycholate), 및 트리톤X (tritonX) 및/또는 NP-40을 포함)을 처리하여 DNA를 분리한다.

본 발명의 일 구현예에 따르면, DNA 시료는 DNA를 포함하는 생물학적 시료(biological sample)이다.

본 명세서에 기술된 용어 “증폭”은 핵산 분자를 증폭하는 반응을 의미한다. 다양한 증폭 반응들이 당업계에 보고 되어 있으며, 이는 중합효소 연쇄반응(이하 PCR이라 한다)(미국 특허 제4,683,195, 4,683,202, 및 4,800,159호), 역전사-중합효소 연쇄반응(이하 RT-PCR로 표기한다)(Sambrook 등, Molecular Cloning. A Laboratory Manual, 3rd ed. Cold Spring Harbor Press(2001)), Miller, H. I.(WO 89/06700) 및 Davey, C. 등(EP 329,822)의 방법, 리가아제 연쇄 반응(ligase chain reaction; LCR)(17, 18), Gap-LCR(WO 90/01069), 복구 연쇄 반응(repair chain reaction; EP 439,182), 전사-중재 증폭(transcription-mediated amplification; TMA)(19) (WO 88/10315), 자가 유지 염기서열 복제(self sustained sequence replication)(20)(WO 90/06995), 타깃 폴리뉴클레오티드 염기서열의 선택적 증폭(selective amplification of target polynucleotide sequences)(미국 특허 제6,410,276호), 컨센서스 서열 프라이밍 중합효소 연쇄 반응(consensus sequence primed polymerase chain reaction; CP-PCR)(미국 특허 제4,437,975호), 임의적 프라이밍 중합효소 연쇄 반응(arbitrarily primed polymerase chain reaction; AP-PCR)(미국 특허 제5,413,909호 및 제5,861,245호), 핵산 염기서열 기반 증폭(nucleic acid sequence based amplification; NASBA)(미국 특허 제5,130,238호, 제5,409,818호, 제5,554,517호, 및 제6,063,603호), 가닥 치환 증폭(strand displacement amplification) 및 고리-중재 항온성 증폭(loop-mediated isothermal amplification; LAMP)을 포함하나, 이에 한정되지는 않는다. 사용 가능한 다른 증폭 방법들은 미국특허 제5,242,794, 5,494,810, 4,988,617호 및 미국 특허 제09/854,317호에 기술되어 있다.

PCR은 가장 잘 알려진 핵산 증폭 방법으로, 그의 많은 변형과 응용들이 개발되어 있다. 예를 들어, PCR의 특이성 또는 민감성을 증진시키기 위해 전통적인 PCR 절차를 변형시켜 터치다운(touchdown) PCR, 핫 스타트(hot start) PCR, 네스티드(nested) PCR 및 부스터(booster) PCR이 개발되었다. 또한, Emulsion PCR, Polony PCR, 멀티플렉스(multiplex) PCR, 실시간(real-time) PCR, 분별 디스플레이 PCR(differential display PCR, D-PCR), cDNA 말단의 신속 증폭(rapid amplification of cDNA ends, RACE), 인버스 PCR (inverse polymerase chain reaction: IPCR), 벡토레트(vectorette) PCR, 및 TAIL-PCR(thermal asymmetric interlaced PCR)이 특정한 응용을 위해 개발되었다. PCR에 대한 자세한 내용은 McPherson, M.J., 및 Moller, S.G. PCR. BIOS Scientific Publishers, Springer-Verlag New York Berlin Heidelberg, N.Y. (2000)에 기재되어 있으며, 그의 교시사항은 본 명세서에 참조로 삽입된다.

본 발명에서 상기 돌연변이 분석은 상기 유전자에 상보적으로 결합하는 각각의 프라이머를 이용하여 유전자를 증폭하고, 상기 증폭산물의 시퀀싱(sequencing) 데이터를 이용하여 유전자 돌연변이를 분석함으로써 실시할 수 있다. 또는 상기 돌연변이 분석은 RFLP (Restriction frangment length polymorphism) 또는 Allele specific PCR 의 방법을 이용하여 분석할 수도 있다.

본 발명의 일 구현예에 따르면, 상기 시퀀싱은 NGS (next generation sequencing) 방법을 이용하여 실시할 수 있다. 본 발명에서 NGS 데이터세트는 Torrent Suite Software v.4.4.3 (Life Technologies)으로 분석하였으며, 돌연변이 분석은 Integrative Genome Viewer (IGV) software (software.broadinstitute.org/igv/)로 진행하였다.

본 발명에서는 각 유전자에 대한 프라이머를 이용하여 돌연변이 분석을 실시할 수 있으며, 각 유전자별로 한 쌍(pair) 이상의 프라이머 세트를 이용할 수 있다. 본 발명에서 이용한 프라이머는 표 4 내지 표 33에 개시되어 있다.

본 발명의 특정 구현예에 따르면, 본 발명의 방법에서 APP 유전자의 엑손(exon)에 상보적으로 결합하는 프라이머 세트를 1세트 내지 18세트 사용할 수 있고; 상기 PSEN1 유전자에 상보적으로 결합하는 프라이머 세트를 1세트 내지 12세트 사용할 수 있고; 상기 PSEN2 유전자에 상보적으로 결합하는 프라이머 세트를 1세트 내지 13세트 사용할 수 있고; 상기 CR1 유전자에 상보적으로 결합하는 프라이머 세트를 1세트 내지 52세트 사용할 수 있고; 상기 BIN1 유전자에 상보적으로 결합하는 프라이머 세트를 1세트 내지 16세트 사용할 수 있고; 상기 TREM2 유전자에 상보적으로 결합하는 프라이머 세트를 1세트 내지 4세트 사용할 수 있고; 상기 CLU 유전자에 상보적으로 결합하는 프라이머 세트를 1세트 내지 10세트 사용할 수 있고; 상기 CTNNA3 유전자에 상보적으로 결합하는 프라이머 세트를 1세트 내지 19세트 사용할 수 있고; 상기 DNMBP 유전자에 상보적으로 결합하는 프라이머 세트를 1세트 내지 23세트 사용할 수 있고; 상기 SORL1 유전자에 상보적으로 결합하는 프라이머 세트를 1세트 내지 48세트 사용할 수 있고; 상기 BACE1 유전자에 상보적으로 결합하는 프라이머 세트를 1세트 내지 9세트 사용할 수 있고, 상기 PICALM 유전자에 상보적으로 결합하는 프라이머 세트를 1세트 내지 19세트 사용할 수 있고; 상기 LPR6 유전자에 상보적으로 결합하는 프라이머 세트를 1세트 내지 25세트 사용할 수 있고; 상기 ADAM10 유전자에 상보적으로 결합하는 프라이머 세트를 1세트 내지 16세트 사용할 수 있고; 상기 ABCA7 유전자에 상보적으로 결합하는 프라이머 세트를 1세트 내지 47세트 사용할 수 있고; 상기 CD33 유전자에 상보적으로 결합하는 프라이머 세트를 1세트 내지 8세트 사용할 수 있고; 상기 TDP43 유전자에 상보적으로 결합하는 프라이머 세트를 1세트 내지 11세트 사용할 수 있고; 상기 SIGMAR1 유전자에 상보적으로 결합하는 프라이머 세트를 1세트 내지 6세트 사용할 수 있고; 상기 FUS 유전자에 상보적으로 결합하는 프라이머 세트를 1세트 내지 15세트 사용할 수 있고; 상기 GRN 유전자에 상보적으로 결합하는 프라이머 세트를 1세트 내지 13세트 사용할 수 있고; 상기 MAPT 유전자에 상보적으로 결합하는 프라이머 세트를 1세트 내지 15세트 사용할 수 있고; 상기 ALS2 유전자에 상보적으로 결합하는 프라이머 세트를 1세트 내지 39세트 사용할 수 있고; 상기 PINK1 유전자에 상보적으로 결합하는 프라이머 세트를 1세트 내지 9세트 사용할 수 있고; 상기 PARK7 유전자에 상보적으로 결합하는 프라이머 세트를 1세트 내지 7세트 사용할 수 있고; 상기 PARK9 유전자에 상보적으로 결합하는 프라이머 세트를 1세트 내지 28세트 사용할 수 있고; 상기 SNCA 유전자에 상보적으로 프라이머 세트를 1세트 내지 6세트 사용할 수 있고; 상기 LRRK2 유전자에 상보적으로 결합하는 프라이머 세트를 1세트 내지 54세트 사용할 수 있고; 상기 CSF1R 유전자에 상보적으로 결합하는 프라이머 세트를 1세트 내지 22세트 사용할 수 있고; 상기 NOTCH3 유전자에 상보적으로 결합하는 프라이머 세트를 1세트 내지 35세트 사용할 수 있고; 상기 PRNP 유전자에 상보적으로 결합하는 프라이머 세트를 1세트 내지 4세트 사용할 수 있다.

본 발명에서는 유전자 당 1 세트 이상의 프라이머를 사용하여 돌연변이를 검출하는데 사용할 수 있다.

본 발명의 일 구현예에 따르면, 상기 프라이머를 이용한 유전자 증폭을 위하여, 멀티플렉스 PCR(Polymerase Chain Reaction) 증폭방법을 사용할 수 있다. 본 발명의 다른 구현예에 따르면, 상기 멀티플렉스 증폭은 에멀젼(emulsion) 멀티플렉스 PCR 증폭이다.

본 발명의 또 다른 구현예에 따르면, 상기 프라이머를 이용한 유전자 증폭을 위하여, Emulsion PCR, Polony PCR 또는 Bridge PCR 방법을 사용할 수 있다.

본 발명의 다른 양태에 따르면, 본 발명은 APP (amyloid precursor protein), PSEN1 (presenilin), PSEN2 (presenilin 2), CR1 (complement receptor 1), BIN1 (Bridging integrator 1), TREM2 (triggering receptor expressed on myeloid cells 2), CLU (clusterin), CTNNA3 (Cadherin-associated protein alpha 3), DNMBP (Dynamin binding protein), SORL1 (sortilin-related receptor 1), BACE1 (Beta-secretase 1), PICALM (Phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein), LPR6 (low-density lipoprotein receptor-related protein 6), ADAM10 (Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 10), ABCA7 (ATP-binding cassette transporter A7), CD33 (sialic acid binding Ig-like lectin 3), TDP43 (TAR-DNA binding protein-43), SIGMAR1 (sigma non-opioid intracellular receptor 1), FUS (Fused-in-Sarcoma), GRN(PGRN) (progranulin), MAPT (microtubule associated Tau protein), ALS2 (amyotrophic lateral sclerosis), PINK1 (PTEN-induced putative kinase 1), PARK7 (Colony Stimulating Factor 1 Receptor), PARK9 (ATPase 13A2 or PTEN Induced Putative Kinase 1), SNCA (Alpha synuclein), LRRK2 (Leucine-rich repeat kinase 2), CSF1R (colony stimulating factor 1 receptor), NOCTH3 (Neurogenic locus notch homolog protein 3), PRNP (prion protein gene) 및 이의 조합으로 구성된 군에서 선택되는 유전자의 엑손(exon) 부위에 상보적으로 결합하는 각각의 프라이머를 이용하여 유전자 돌연변이를 분석하는 알츠하이머 진단 또는 예후 분석 키트를 제공한다.

본 발명의 알츠하이머 진단 또는 예후 분석 키트는 상술한 “알츠하이머 진단을 위한 정보제공방법”을 이용하기 때문에, 공통된 사항은 본 명세서의 과도한 중복성을 피하기 위해 그 기재를 생략한다.

본 발명의 또 다른 양태에 따르면, 본 발명은 진단하고자 하는 개체로부터 분리된 생물학적 시료의 유전자 돌연변이를 분석하는 단계를 포함하며, 상기 유전자 돌연변이는 APP (amyloid precursor protein), PSEN1 (presenilin), PSEN2 (presenilin 2), CR1 (complement receptor 1), BIN1 (Bridging integrator 1), TREM2 (triggering receptor expressed on myeloid cells 2), CLU (clusterin), CTNNA3 (Cadherin-associated protein alpha 3), DNMBP (Dynamin binding protein), SORL1 (sortilin-related receptor 1), BACE1 (Beta-secretase 1), PICALM (Phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein), LPR6 (low-density lipoprotein receptor-related protein 6), ADAM10 (Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 10), ABCA7 (ATP-binding cassette transporter A7), CD33 (sialic acid binding Ig-like lectin 3), TDP43 (TAR-DNA binding protein-43), SIGMAR1 (sigma non-opioid intracellular receptor 1), FUS (Fused-in-Sarcoma), GRN(PGRN) (progranulin), MAPT (microtubule associated Tau protein), ALS2 (amyotrophic lateral sclerosis), PINK1 (PTEN-induced putative kinase 1), PARK7 (Colony Stimulating Factor 1 Receptor), PARK9 (ATPase 13A2 or PTEN Induced Putative Kinase 1), SNCA (Alpha synuclein), LRRK2 (Leucine-rich repeat kinase 2), CSF1R (colony stimulating factor 1 receptor), NOCTH3 (Neurogenic locus notch homolog protein 3), PRNP (prion protein gene) 및 이의 조합으로 구성된 군에서 선택되는 유전자의 엑손(exon) 부위 돌연변이인, 신경 퇴행성 질환(neurodegenerative disease) 진단을 위한 정보제공방법을 제공한다.

본 발명의 또 다른 양태에 따르면, 본 발명은 APP (amyloid precursor protein), PSEN1 (presenilin), PSEN2 (presenilin 2), CR1 (complement receptor 1), BIN1 (Bridging integrator 1), TREM2 (triggering receptor expressed on myeloid cells 2), CLU (clusterin), CTNNA3 (Cadherin-associated protein alpha 3), DNMBP (Dynamin binding protein), SORL1 (sortilin-related receptor 1), BACE1 (Beta-secretase 1), PICALM (Phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein), LPR6 (low-density lipoprotein receptor-related protein 6), ADAM10 (Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 10), ABCA7 (ATP-binding cassette transporter A7), CD33 (sialic acid binding Ig-like lectin 3), TDP43 (TAR-DNA binding protein-43), SIGMAR1 (sigma non-opioid intracellular receptor 1), FUS (Fused-in-Sarcoma), GRN(PGRN) (progranulin), MAPT (microtubule associated Tau protein), ALS2 (amyotrophic lateral sclerosis), PINK1 (PTEN-induced putative kinase 1), PARK7 (Colony Stimulating Factor 1 Receptor), PARK9 (ATPase 13A2 or PTEN Induced Putative Kinase 1), SNCA (Alpha synuclein), LRRK2 (Leucine-rich repeat kinase 2), CSF1R (colony stimulating factor 1 receptor), NOCTH3 (Neurogenic locus notch homolog protein 3), PRNP (prion protein gene) 및 이의 조합으로 구성된 군에서 선택되는 유전자의 엑손(exon) 부위에 상보적으로 결합하는 각각의 프라이머를 이용하여 유전자 돌연변이를 분석하는 신경 퇴행성 질환(neurodegenerative disease) 진단 또는 예후 분석 키트를 제공한다.

본 발명에서 신경 퇴행성 질환은 알츠하이머병(Alzheimer's disease), 루게릭병(Amyotrophic Lateral Sclerosis), 전두측두엽성 치매(Frontotemporal dementia), 루이소체 치매(Dementia with Lewy Bodies), 크루츠펠트 야콥병 (Creutzfeldt Jakob Disease), 파킨슨병(Parkinson’s disease), 뇌졸중(stroke), 근위축성측색경화증(amyotrophic lateral sclerosis), 빈스완거병(Binswanger’s disease), 헌팅톤 무도병(Huntington’s chorea), 다발성 경화증(multiple sclerosis), 중증 근무력증(myasthenia gravis) 및 피크병(Pick’s disease)을 포함하며 이에 한정되는 것은 아니다.

상기 신경 퇴행성 질환과 관련된 유전자는 하기 실시예 표 1에 개시되어 있다.

본 발명의 특징 및 이점을 요약하면 다음과 같다:

(a) 본 발명은 알츠하이머 진단을 위한 정보제공방법 및 이를 이용한 진단키트에 관한 것이다.

(b) 본 발명의 방법을 이용한 유전자 돌연변이 분석결과에 따라 알츠하이머병 환자에게 개인적 맞춤 진단 및 치료가 가능할 것으로 기대된다.

(c) 본 발명의 방법을 이용하여 알츠하이머와 연관된 30개의 유전자를 스크리닝하여 환자가 가지고 있는 유전적 문제점을 확인 후 개별 맞춤 치료를 적용할 수 있다. 국내에서 알츠하이머 환자에게 다양한 유전자 검사를 적용하여 치료에 활용하는 경우는 없으므로 본 발병은 알츠하이머 진단에 있어 충분한 경쟁력이 있을 것으로 예상된다.

도 1은 염색체 상의 30개 후보 유전자 위치를 나타낸다.
도 2는 PCR 매개 유전자 스플라이싱 전략을 나타내는 모식도이다.

이하, 실시예를 통하여 본 발명을 더욱 상세히 설명하고자 한다. 이들 실시예는 오로지 본 발명을 보다 구체적으로 설명하기 위한 것으로, 본 발명의 요지에 따라 본 발명의 범위가 이들 실시예에 의해 제한되지 않는다는 것은 당업계에서 통상의 지식을 가진 자에 있어서 자명할 것이다.

실시예

실험 방법

1. 프라이머 디자인

Primer3Plus (www.primer3plus.com) 소프트웨어를 활용하여 해당 유전자에 가장 적합한 프라이머를 디자인하였다(하기 표 4 내지 표 33 참조). 유전자의 full-length를 전부 PCR로 증폭하여 샘플을 준비하는 과정이 어렵기 때문에 각 엑손(exon)마다 프라이머를 만들어 진행하였다. 그리고 겹치는 부분이 있기 때문에 최종적으로 full-length DNA를 만들 수 있다(도 2 참조). 도 3은 실험의 전반적인 흐름을 도식화하여 나타낸 것이다.

2. 차세대 염기서열분석 (next generation sequencing, NGS)

Ion Torrent PGM system을 이용하여 NGS를 실행하였다. 20 ng DNA를 이용하여 멀티플렉스 PCR 을 수행하였다(Ion AmpliSeq Customized Panel, Life Technologies, Grand Island, NY, USA). 단편 라이브러리는 DNA 단편화, 바코드 및 어댑터 결합 및 Ion DNA Barcoding 키트 (Life Technologies, Grand Island, NY, USA)를 이용한 라이브러리 증폭에 의해 구축되었다. DNA 단편의 크기 분포를 High Sensitivity Kit (Agilent, Santa Clara, CA, USA)를 사용하여 Agilent Bioanalyzer로 분석하였다. 주형 제작, 에멀젼(emulsion) PCR 및 이온 구형 입자 (ISP) 농축은 제조사의 지침에 따라 Ion Xpress Template kit (Life Technologies, Grand Island, NY, USA)를 사용하여 수행하였다. ISP를 P1 칩에 로딩하고 이온 P1 시퀀싱 200 키트 (Life Technologies, Grand Island, NY, USA)를 사용하여 시퀀싱하였다. NGS에서 나온 결과는 Torrent Suite Software v.4.4.3 (Life Technologies)으로 분석하였으며, 돌연변이 분석은 Integrative Genome Viewer (IGV) software (software.broadinstitute.org/igv/)로 진행하였다.

선행 연구결과나 다른 논문에서 보고된 결과, 또는 Alzforum에 있는 정보를 토대로 30개 유전자를 선정하였다(하기 표 1 참조). 선정된 30개의 유전자에 대해 디자인된 프라이머를 사용하여 NGS 데이터를 얻었다. 선정된 30개의 유전자는 퇴행성 뇌질환을 분석 및 치료 목적으로 활용하였다. 표 2 및 표 3은 디자인된 프라이머로 66명의 EOAD (Early Onset Alzheimer's Disease) 환자와 26명의 LOAD (Late Onset Alzheimer's Disease) 포함 치매환자에게서 30개 유전자에 대한 돌연변이를 분석한 결과이다. 이와 같이 본 발명의 프라이머를 이용하여 여러 뇌질환 의심 환자들의 대한 돌연변이를 분석할 수 있다. 본 발명의 방법에 의한 돌연변이 분석 결과를 다른 진단 기술과 접목하여 진단의 정확도를 높일 수 있으며, 해당 돌연변이에 의한 생물학적 문제가 생길 것으로 예측하여, 이와 관련된 치료에 접근할 수 있다.

실험결과

디자인된 프라이머를 사용하여 초기 발병 알츠하이머 환자 (EOAD, Early onset Alzheimer’s disease)와 후발성 알츠하이머 환자 (LOAD, late onset Alzheimer’s disease)의 혈액에서 DNA를 추출하여 돌연변이를 분석하였다. 66명의 EOAD 환자와 26명의 LOAD포함 치매환자에게서 30개 유전자에 대한 돌연변이를 분석한 결과를 정리하여 표 2에 나타내었다. 도 1은 선별된 유전자들이 위치한 염색체를 보여주며, 선별된 유전자와 유전자들이 연관된 질병을 표 1에 나타내었다. 표 1에 기대된 30개의 유전자는 기존 선행연구와 다른 선행문헌을 통해 선별된 유전자이다.

30 개 후보유전자 및 관련 질병

관련 질병	유전자수	후보 유전자 선정
Alzheimer's disease (AD)	16	APP, PSEN1 , PSEN2 , CR1, BIN1 , TREM2 , CLU , CTNNA3, DNMBP , SORL1 , BACE1 , PICALM , LPR6 , ADAM10, ABCA7 , CD33.
ALS (Amyotrophic Lateral Sclerosis) & FTD (Frontotemporal dementia)	6	TDP43 , SIGMAR1 , FUS , GRN , MAPT , ALS2
PD (Dementia with Lewy Bodies)	5	PINK1 , PARK7 , PARK9 , SNCA , LRRK2
기타 퇴행성 질환	3	CSF1R , NOTCH3 , PRNP

Ion AmpliSeq™ NGS Panel 을 이용하여 66 명 EOAD 환자를 분석한 결과 (T means tolerated, D means damaging)

Genes	DNA change	Protein change	Mutation frequency	rs ID	PolyPhen2 HumDiv	Sift score	Clinical features
PSEN1	c.356C>T (Exon 5)	p.T119I	1/66	Novel	0.9 (D)	0.06 (T)	Novel mutation
	c.626G>C (Exon 7)	p.G209A	1/66	Novel	1 (D)	0 (D)	Novel mutation
	c.695T>C (Exon 7)	p.L232P	1/66	Novel	1 (D)	0 (D)	Novel mutation
	c.1250G>C (Exon 12)	p.G417A	1/66	Novel	0.99 (D)	0 (D)	Novel mutation
PSEN2	c.505C>A (Exon 6)	p.H169N	1/66	0.0001648	0.925 (D)	0.04 (D)	Known mutation, pathogenic nature unclear
TREM2	No mutation
CR1	c.394A>C	p.T132P	1/66	rs55906048	0.07 (B)	0.345 (T)	Probable benign variant
	c.4973A>G	p.H1658R	16/66	rs2274567	0.98 (D)	0.89 (T)	Possible risk factor for AD
	c.5573C>T	p.T1858M	32/100	rs3737002	0.995 (D)	0.019 (D)	Common variant, possible AD risk factor
	c.6178A>T	p.T2060S	66/66	rs4844609	0.95 (D)	0.019 (D)	Common variant, possible AD risk factor
	c.6193A>G	p.I2065V	18/66	rs6691117	0.005 (B)	1 (T)	Common variant, possible AD risk factor
	c.6653T>C	p.V2218A	1/66	rs191751915	0.85 (D)	0.19 (T)	Possible AD risk factor
	c.6830C>G	p.P2277R	18/66	rs3811381	0.032 (B)	0.44 (T)	Probable benign variant
	c.7255A>G	p.T2419A	29/66	rs2296160	0.001 (B)	0.98 (T)	Common variant
BIN1	c.1292C>T	p.P431L	4/66	rs141119288	0.99 (D)	0.07 (T)	Probably AD risk factor
CLU	c.380G>A	p.R127H	1/66	Novel	0.56 (D)	0.003 (D)	Probably AD risk factor
CTNNA3	c.1787G>A	p.S596N	14/66	rs4548513	0.001 (B)	1 (T)	Possible risk factor for LOAD and autism
	c.1850T>C	p.I617T	2/66	Novel	0.928 (D)	0.001 (D)	Unknown significance
	c.2404G>T	p.D802Y	1/66	Novel	0.99 (D)	0.001 (D)	Unknown significance
DNMBP	c.2633C>T	p.A878V	1/66	rs116707029	0.67 (D)	0.035 (D)	Unknown significance
	c.3154C>T	p.R1052W	1/66	rs115117818	1 (D)	0.001 (D)	Unknown significance
	c.3410G>A	p.R1137Q	1/66	rs116296676	0.99 (D)	0.006 (T)	Unknown significance
	c.4239T>G	p.C1413W	28/66	rs11190305	0.094 (B)	0.18 (T)	Common variant
SORL1	c.829G>C	p.V277L	1/66	Novel	0.173 (B)	0.01 (D)	Unknown significance
	c.1528G>C	p.G511R	1/66	Novel	0.99 (D)	0 (D)	Unknown significance
	c.1582G>A	p.A528T	22/66	rs2298813	0.59 (D)	0.3 (T)	AD risk factor
	c.2586T>G	p.D862E	1/66	Novel	0.178 (B)	0.05 (D)	Unknown
	:c.3220C>G	p.E1074Q	66/66	rs1699107	0 (B)	0.16 (T)	Common variant
	c.3476G>A	p.R1159Q	1/66	rs527617199	0.62 (D)	0.45 (T)	Unknown
	:c.4447A>G	p.T1483A	1/66	rs143286467	0.002 (D)	0.3 (T)	Unknown
	c.4570G>A	p.G1524R	2/66	rs201415809	0.99 (D)	0.005 (D)	Unknown
	c.5899A>G	p.V1967I	66/66	rs1792120	0.003 (B)	1 (T)	Common, unknown
	c.6289G>A	p.V2097I	1/66	rs74642146	0.9 (D)	0.16 (T)	Unknown
BACE1	c.1141C>T	p.C481R	66/66	rs539765	0 (B)	0.4 (T)	Common mutation
LRP6	c.379T>A	p.S127T	2/66	rs17848270	0.001 (B)	0.8 (T)	Unknown
	c.427A>G	p.I143V	1/66	Novel	0.93 (D)	0.13 (T)	Unknown
	c.2902C>T	p.R968W	1/66	Novel	0.99 (D)	0.001 (D)	Unknown
	c.3184G>A	p.V1062I	59/66	rs2302685	0 (B)	1 (T)	Common mutation, possible AD risk factor
ADAM10	c.763A>G	p.T255A	2/66	rs147572059	0.004 (B	0.88 (T)	Unknown
ABCA7	c.563A>G	p.E188G	9/66	rs3764645	0.06 (B)	0.67 (T)	Unknown
	c.955A>G	p.T319A	11/66	rs3752232	0.142 (B)	0.446 (T)	Possible AD risk factor
	c.1184A>G	p.H395R	11/66	rs3764647	0.02 (B	1 (T)	Possible AD risk factor
	c.1384G>C	p.V462L	1/66	Novel	0.08 (B)	0.086 (T)	Unknown
	c.1388G>A	p.R463H	3/66	rs3752233	0.8 (D)	0.25 (T)	Unknown
	c.2153A>C	p.N718T	3/66	rs3752239	0.58 (D)	0.24 (T)	Unknown
	c.1620delC	p.D540fs	1/66	Novel	-	-	Unknown
	c.1832T>G	p.V611G	1/66	Novel	0.97 (D)	0.004 (D)	Unknown
	c.2892C>G	p.D964E	2/66	rs117390715	1 (D)	0 (D)	Unknown
	c.2923C>T	p.R975C	1/66	Novel	1 (D)	0 (D)	Unknown
	c.3629G>A	p.R1210Q	1/66	Novel	0.006 (B)	1 (T)	Unknown
	c.3641G>A	p.W1214*	1/66	Known	-	-	AD risk factor, stop codon
	c.4046G>A	p.R1349Q	6/66	rs3745842	0.004 (B)	0.54 (T)	Common variant, unknown
	c.4211A>G	p.K1404R	1/66	Novel	0.03 (B)	0.002 (D)	Unknown
	c.4580G>C	p.G1527A	29/66	rs3752246	0 (B)	0.87 (T)	Common variant, unknown
	c.5057A>G	p.Q1686R	3/66	rs4147918	0.004 (B)	0.23 (T)	Common variant, unknown
	c.5069T>C	p.I1690T	2/66	rs184218896	0.911 (D)	0.001 (T)	Unknown
	c.5666C>T	p.P1898S	1/66	Novel	0.9 (D)	0.08 (T)	Unknown
	c.5789A>G	p.N1930S	1/66	Novel	0.98 (D)	0.002 (D)	Unknown
	c.5963G>T	p.C1988F	1/66	rs142573667	1 (D)	0 (D)	Unknown
	c.6133G>T	p.A2045S	11/66	rs4147934	0.051 (B)	0.96 (T)	Common mutation, unknown
	c.6633G>T	p.F2071C	2/66	Novel	0.5 (B)	0.46 (T)	Common mutation, unknown
CD33	c.41C>T	p.A14V	1/66	rs12459419	0.023 (B)	0.08 (T)	AD risk factor
	c.205A>G	p.R69G	3/66	rs2455069	0.009 (B)	0.33 (T)	Unknown
	c.594A>G	p.I198M	1/66	rs200827254	0.105 (B)	0.006 (T)	Unknown
	c.880G>T	p.V294L	1/66	rs2271652	0.001 (B)	0.16 (T)	Unknown
PINK1	c.755A>T	p.E252V	1/66	Novel	0.605 (D)	0.05 (D)	unknown
	c.1018G>A	p.A340T	35/66	rs3738136	0.001 (B)	1 (T)	Unknown
	c.1562A>C	p.N521T	33/66	rs1043424	0.005 (B)	0.24 (T)	Unknown
PARK7	c.535G>A	p.A179T	1/66	rs71653622	0. 001 (B)	0.56 (T)	Unknown
ATP13A2 (PARK9)	c.317A>G	p.Q106R	1/66	Novel	0.008 (B)	0.47 (T)	Unknown
	c.1817C>G	p.P606R	1/66	Novel	0.93 (D)	0.025 (D)	Unknown
	c.3175C>T	p.L1059F	1/66	Novel	0.74 (D)	0.005 (D)	Unknown
SNCA	c.381G>A	p.M127I	1/66	rs191055637	0.77 (D)	0.16 (T)	Unknown
PARK2	c.500G>A	p.S167N	16/66	rs1801474	0.03 (B)	0.31 (T)	Benign variant
	c.799T>C	p.Y267H	1/66	rs114696251	0.99 (D)	0 (D)	Unknown
	c.1138G>C	p.V380L	4/66	rs1801582	0 (B)	0.37 (T)	Benign variant
LRRK2	c.149A>G	p.R50H	66/66	rs2256408	0 (B)	1 (T)	Common variant, PD risk factor
	c.691T>C	p.S231P	1/66	rs201332859	0.004 (B)	0.3 (T)	Unknown
	c.1256C>T	p.A419V	2/66	rs34594498	0.49 (D)	0.03 (D)	PD risk factor
	c.1598T>C	p.V533A	1/66	Novel	0.5 (T)	0.004 (D)	Unknown
	c.1653C>G	p.N551K	16/66	rs7308720	0.005 (D)	0.972 (D)	Possible PD risk factor
	c.2167A>G	p.I723V	2/66	rs10878307	0.001 (B)	0.68 (T)	Possible PD risk factor
	c.4193G>A	p.R1398H	13/66	rs7133914	0.58 (D)	0.1 (T)	Possible PD risk factor
	c.4337C>T	p.P1446L	1/66	rs74681492	1 (D)	0.008 (T)	Possible risk factor
	c.4939T>A,	p.S1647T	30/66	rs11564148	0 (B)	0.95 (T)	Possible risk factor
	c.7153G>A	p.G2385R	5/66	rs34778348	0.013(B)	0.4 (T)	Possible PD risk factor
	c.7190T>C	p.M2397T	43/66	rs3761863	0 (B)	0.466 (T)	Possible PD risk factor
SIGMAR1	c.5A>C	p.Q2P	11/66	rs1800866	0 (B)	0.343 (T)	Possible risk factor
	c.622C>T	p.R208W	6/66	rs11559048	0.94 (D)	0.01 (D)	Unknown
	c.632G>A	p.R211Q	1/66	rs192644838	0.57 (D)	0.29 (T)	Unknown
FUS	c.451C>T	p.P151S	1/66	Novel	0.007 (B)	0.03 (D)	Unknown
GRN (PGRN)	c.119G>A	p.S40N	1/66	Novel	0.75 (D)	0.015 (D)	Probable novel mutation
	c.1690C>T	p.R564C	1/66	Novel	0.87 (D)	0.04 (D)	AD risk factor mutation
MAPT	c.418C>T	p.P140S	3/66	rs151115928	0.846 (D)	0.04 (D)	Unknown
	c.1321T>C	p.Y441H	59/66	rs112757188	0 (B)	0.97 (T)	Common mutation, unknown
TDP43	No mutation-
ALS2	c.475G>A	p.E159K	2/66	Novel	0.156 (B)	0.15 (T)	Unknown
	c.1102G>A	p.V368M	66/66	Novel	0.009 (B)	0.191 (T)	Common mutation, unknown
	c.2278C>G	p.L760V	1/66	Novel	0.99 (D)	0.14 (T)	Unknown
	c.2953C>T	p.L985F	1/66	rs41308836	0.0953 (D)	0.005 (D)	Unknown
	c.3517G>A	p.E1173K	3/66	rs41309046	0.8 (D)	0.003 (D)	Unknown
	c.4892A>G	p.Y1631C	1/66	Novel	0.003 (D)	0.18 (T)	Unknown
CSF1R	c.544G>T	p.G182C	1/66	Novel	0.782 (D)	0.01 (D)	Unknown
	c.635T>A	p.L212Q	1/66	Novel	0.2 (D)	0.14 (T)	Possible novel variant
	c.637G>A	p.V213M	1/66	Novel	0.93 (D)	0.001 (D)	Unknown
	c.835G>A	p.V279M	3/66	rs3829986	0.19 (B)	0.11 (T)	Unknown
	c.1085A>G	p.H362R	40/66	rs10079250	0.15 (B)	0.06 (T)	Common mutation, possible cancer risk factor
	c.2806G>A	p.G936S	1/66	Novel	0.78 (D)	0.01 (D)	Possible novel variant
NOTCH3	c.709G>A	p.V237M	1/66	rs2285981	0.25 (B)	0.001 (D)	Unknown
	c.2320C>G	p.P774A	1/66	Novel	0.99 (D)	0.004 (T)	Unknown
	c.2519G>A	p.G840E	1/66	Novel	1 (D)	0.001 (D)	Unknown
	c.3523C>T	p.R1175W	1/66	rs200504060	0.91 (D)	0.004 (D)	Unknown
	c.3620A>G	p.N1207S	2/66	rs141418355	0.99 (D)	0.002 (D)	Unknown
	c.4348G>A	p.A1450T	3/66	Novel	0.61 (D)	0.11 (T)	Unknown
	c.6668C>T	p.A2223V	18/66	rs1044009	0.003 (B)	0.14 (T)	Common mutation
PRNP	c.385A>G	p.M129V	1/66	rs1799990	0.012 (B)	0.024 (D)	Pathogenic nature complicated
	c.655G>A	p.E219K	7/66	rs1800014	0.003 (B)	0.035 (D)	Pathogenic nature complicated
	c.674A>G	p.Y225C	1/66	Novel	0.98 (D)	0.001 (D)	May be involved in CJD, novel
	c.695T>G	p.M232R	1/66	rs74315409	0.707 (D)	0.001 (D)	CJD or AD involvement

Ion AmpliSeq™ NGS Panel을 이용하여 26 명 환자 (LOAD + Unknown + dementia)에서 30개 유전자를 분석한 결과 (T means tolerated, D means damaging)

Genes	DNA change	Protein change	Mutation frequency	ExAC frequency	PolyPhen2 HumDiv	Sift score	Clinical features
APP	c.674T>C	p.V225A	1/26	Novel	0.577 (D)	0.496 (T)	Unknown significance
PSEN1	No mutation
PSEN2	No mutation
TREM2	No mutation
CR1	c.5573C>T	p.1858M	17/26	0.2750	0.995(D)	0.019 (D)	Common variant, possible AD risk factor
	c.6193A>G	p.I2065V	5/26	0.3341	0.005(B)	1 (T)	Common variant, possible AD risk factor
	c.6178A>T	p.T2060S	26/26	0.9853	0.95(D)	0.019(D)	Common variant, possible AD risk factor
	c.7255A>G	p.T2419A	24/26	0.8159	0.001(B)	0.98(T)	Common variant
	c.6830C>G	p.P2277R	4/26	0.2403	0.032(B)	0.44(T)	Probable benign variant
BIN1	c.1292C>T	p.P431L	1/26	0.003413	0.99(D)	0.07(T)	Probably AD risk factor
CLU	c.545G>A	p.R182H	1/26	Novel	0.87(D)	0.1(T)	Probably AD risk factor
	c.1283C>G	p.P428R	1/26	Novel	1(D)	0.001(D)	Probably AD risk factor
CTNNA3	c.1787G>A	p.S596N	17/26	0.4120	0.001 (B)	1.0 (T)	Common variant
DNMBP	c.1119C>G	p.N373K	1/26	0.04518	0.016 (B)	0.195 (T)	Unknown significance
	c.4138G>A	p.G1380S	1/26	0.0006599	0.002 (B)	0.94 (T)	Unknown significance
	c.4239T>G	p.C1413W	4/26	0.3442	0.094 (B)	0.18 (T)	Common variant
SORL1	c.1582G>A	p.A528T	10/26	0.07219	0.59 (D)	0.3 (T)	AD risk factor
	c.3220C>G	p.E1074Q	26/26	0.9949	0 (B)	0.16 (T)	Common variant
	c.4570G>A	p.G1524R	1/26	0.0001813	0.99(D)	0.005(D)	Unknown
	c.5899A>G	p.V1967I	26/26	0.9953	0.003(B)	1(T)	Common, unknown
BACE1	c.1141C>T	p.C481R	26/26	0.9997	0(B)	0.4 (T)	Common mutation
LRP6	c.379T>A	p.S127T	1/26	0.001980	0.001(B)	0.8(T)	Unknown
	c.3184G>A	p.V1062I	26/26	0.8474	0(B)	1(T)	Common mutation, possible AD risk factor
ADAM10	c.1661A>G	p.D554G	1/26	Novel	0.02 (B)	0.377 (T)	Unknown
ABCA7	c.563A>G	p.E188G	21/26	0.4838	0.06 (B)	0.67 (T)	Unknown
	c.955A>G	p.T319A	4/26	0.06039	0.142 (B)	0.446 (T)	Possible AD risk factor
	c.1184A>G	p.H395R	4/26	0.06298	0.02 (B	1 (T)	Possible AD risk factor
	c.1388G>A	p.R463H	8/26	0.04775	0.8 (D)	0.25 (T)	Unknown
	c.1570C>T	p.R524W	2/26	0.0002259	0.75 (D)	0.01 (D)	Unknown
	c.2153A>C	p.N718T	9/26	0.07028	0.58 (D)	0.24 (T)	Unknown
	c.4046G>A	p.R1349Q	17/26	0.4433	0.004 (B)	0.54 (T)	Common variant, unknown
	c.4580G>C	p.G1527A	24/26	0.8405	0 (B)	0.87(T)	Common variant, unknown
	c.5057A>G	p.Q1686R	8/26	0.04785	0.004(B)	0.23 (T)	Common variant, unknown
	c.5609G>T	p.G1870V	1/26	0.000008395	0.99 (D)	0 (D)	Unknown
	c.6133G>T	p.A2045S	24/26	0.7317	0.051 (B)	0.96 (T)	Common mutation, unknown
CD33	c.41C>T	p.A14V	11/26	0.2939	0.023 (B)	0.08 (T)	AD risk factor
	c.205A>G	p.R69G	3/26	0.3577	0.009 (B)	0.33 (T)	Unknown
PINK1	c.1018G>A	p.A340T	10/26	0.09211	0.001(B)	1 (T)	Unknown
	c.1562A>C	p.N521T	14/26	0.09211	0.005 (B)	0.24 (T)	Unknown
PARK7	No mutation
ATP13A2 (PARK9)	c.1499G>T	p.R500L	1/26	Novel	1 (D)	0 (D)	Unknown
	c.745G>A	p.A249T	1/26	0.0001173	0.006(B)	0.25 (T)	Unknown
SNCA	No mutation
PARK2	c.500G>A	p.S167N	20/26	0.06758	0.03(B)	0.31	Benign variant
	c.1138G>C	p.V380L	4/26	0.1646	0 (B)	0.37 (T)	Benign variant
LRRK2	c.149A>G	p.R50H	26/26	0.9911	0 (B)	1 (T)	Common variant, PD risk factor
	c.1653C>G	p.N551K	7/26	0.08607	0.005(D)	0.972 (D)	Possible PD risk factor
	c.2264C>T	p.P755L	1/66	Novel	0.2 (B)	0.3 (T)	PD risk factor
	c.4193G>A	p.R1398H	7/26	0.08412	0.58 (D)	0.1(T)	Possible PD risk factor
	c.4337C>T	p.P1446L	1/26	0.0002473	1 (D)	0.008 (T)	Possible risk factor
	c.4939T>A	p.S1647T	14/26	0.2983	0 (B)	0.95 (T)	Possible risk factor
	c.7153G>A	p.G2385R	3/26	0.1129	0.013(B)	0.4 (T)	Possible PD risk factor
	c.7190T>C	p.M2397T	19/26	0.6240	0 (B)	0.466(T)	Possible PD risk factor
SIGMAR1	c.5A>C	p.Q2P	16/26	0.1840	0 (B)	0.343(T)	Possible risk factor
	c.632G>A	p.R211Q	1/26	0.00009934	0.57 (D)	0.29 (T)	Unknown
	c.622C>T	p.R208W	3/26	0.007782	0.94 (D)	0.01(D)	Unknown
FUS	No mutation
GRN	No mutation
MAPT	c.530A>T	p.D177V	2/26	0.0007273	0.846 (D)	0.04 (D)	Possible involvement with FTD
	c.1321T>C	p.Y441H	18/26	0.0001799	0.92 (D)	0 (D)	Unknown
TDP43	No mutation
ALS2	c.1102G>A	p.V368M	26/26	0.9106	0.009(B)	0.191(T)	Common mutation, unknown
	c.3517G>A	p.E1173K	1/26	0.002211	0.8 (D)	0.003(D)	Unknown
CSF1R	c.835G>A	p.V279M	3/26	0.002537	0.19(B)	0.11(T)	Unknown
	c.1085A>G	p.H362R	16/26	0.00009984	0.15 (B)	0.06 (T)	Common mutation, possible cancer risk factor
	c.733G>T	p.A245T	1/26	0.00005022	0.008(B)	0.6(T)	Unknown
NOTCH3	c.224G>A	p.R75Q	1/26	0.0004639	0.6(D)	0.25(T)	Unknown
	c.709G>A	p.V237M	1/26	0.000008449	0.25(B)	0.001(D)	Unknown
	c.2208C>A	p.D736E	1/26	Novel	0.97(D)	0.004(T)	Unknown
	c.2966T>G	p.L989R	1/26	Novel	0.001(B)	0.06 (T)	Unknown
	c.6668C>T	p.A2223V	23/26	0.7591	0.003(B)	0.14(T)	Common mutation
PRNP	c.385A>G	p.M129V	1/26	0.3078	0.012 (B)	0.024 (D)	Pathogenic nature complicated
	c.655G>A	p.E219K	2/26	0.008728	0.003 (B)	0.035 (D)	Pathogenic nature complicated

본 발명에서 디자인된 프라이머 (PSEN2)

Primer ID	서열	Tm (oC)	GC (%)	길이 (bp)
XM_005273198.1_ex1F	cccagtggacgagggaac	61	66	122
XM_005273198.1_ex1R	gctccagcggagtttacg	59	61	122
XM_005273198.1_ex2F	tctgttagcagcggtgtttg	60	50	265
XM_005273198.1_ex2R	taaacaggggtgaggtctgc	60	55	265
XM_005273198.1_ex3F	cagggggaggaaggtgag	61	67	366
XM_005273198.1_ex3R	aaaatgccacagcaaactcc	60	45	366
XM_005273198.1_ex4F	tgtgtccaagtctccaggtc	59	55	350
XM_005273198.1_ex4R	atcagggaatgaatgtctgg	60	48	350
XM_005273198.1_ex5F	caaacttctcatttctggttcc	58	41	395
XM_005273198.1_ex5R	agtgaccaacacaggctgct	61	55	395
XM_005273198.1_ex6F	ccctagcaggtccagaatca	60	55	316
XM_005273198.1_ex6R	tctaaaggcggctgtttcac	60	50	316
XM_005273198.1_ex7F	gacaccttgtgatcgtgcaa	60	50	213
XM_005273198.1_ex7R	gaagactggagctcgatggt	59	55	213
XM_005273198.1_ex8F	ttgggactgaatggtggtaa	59	45	398
XM_005273198.1_ex8R	caagcccttcagcacctg	61	61	398
XM_005273198.1_ex9F	cggggatagtttgacaagga	60	50	173
XM_005273198.1_ex9R	accccgagtcaggcagag	61	66	173
XM_005273198.1_ex10F	ttctgggacgcagactgg	61	61	272
XM_005273198.1_ex10R	actcatgcctctcagggaag	59	55	272
XM_005273198.1_ex11F	cactctgaccagctgttgtttc	60	50	282
XM_005273198.1_ex11R	cctcatgccctcctccac	62	67	282
XM_005273198.1_ex12F	attctgtgcacgcctcttca	62	50	203
XM_005273198.1_ex12R	accacgaggcagctggac	62	66	203
XM_005273198.1_ex13F	ctcacagctcctgtccacac	59	60	236
XM_005273198.1_ex13R	cctgtggcacaccatgtc	59	61	236

본 발명에서 디자인된 프라이머 (CR1)

Primer ID	서열	Tm (oC)	GC (%)	길이 (bp)
NM_000573.3_ex1F	atgtgcttggggagaatggg	61	55	212
NM_000573.3_ex1R	gctgcacgcgagttctct	60	61	212
NM_000573.3_ex2F	tggtcttgatctccaggtca	60	50	221
NM_000573.3_ex2R	gggttcccactccagagttac	60	57	221
NM_000573.3_ex3F	accatcagaactgcgtgtgt	60	50	234
NM_000573.3_ex3R	tcaagagatgccaactcaccc	60	52	234
NM_000573.3_ex4F	ggtagttgacctgtgtct	59	50	254
NM_000573.3_ex4R	tcttcagccgtgtgaaggac	60	55	254
NM_000573.3_ex5_1F	cctgctcttcctttttccagg	58	52	260
NM_000573.3_ex5_1R	catttggaggcgtgcatttg	61	50	260
NM_000573.3_ex5_2F	ccgcccctcagtgcattata	61	55	262
NM_000573.3_ex5_2R	tgatccaacagcaacgcatg	61	50	260
NM_000573.3_ex6F	gctgtactttgtttctctctcccc	60	50	262
NM_000573.3_ex6R	ggcatgtggagaataaagacgc	59	50	262
NM_000573.3_ex7F	gcgtctttattctccacatgcc	60	50	182
NM_000573.3_ex7R	gcaggtcaggcaagctcata	59	55	182
NM_000573.3_ex8F	gggttctcttggctgaaacag	60	52	182
NM_000573.3_ex8R	atgaagggagagactggcct	59	55	182
NM_000573.3_ex9F	acctctggtgaaactcctga	60	50	330
NM_000573.3_ex9R	atggagggcctgggttagat	60	55	330
NM_000573.3_ex10F	gaggaaacacactgggtatc	56	50	277
NM_000573.3_ex10R	tgcagacatgggaaagatcc	59	50	277
NM_000573.3_ex11F	ctctacctggctccaaaaca	57	50	161
NM_000573.3_ex11R	accaagagatgttgctgcca	60	50	161
NM_000573.3_ex12F	gctgtcaggaagttgatgaggt	60	50	185
NM_000573.3_ex12R	taaacggtggggtgaatggg	60	55	185
NM_000573.3_ex13_1F	gcaagactctgtcccaaggt	60	55	269
NM_000573.3_ex13_1R	tataatgcactgaggggccg	60	55	269
NM_000573.3_ex13_2F	cggcccctcagtgcattata	60	55	255
NM_000573.3_ex13_2R	acagcaacgcatgtcacttg	60	50	255
NM_000573.3_ex14F	gctgtactttgtttctctctcccc	60	50	262
NM_000573.3_ex14R	ggcatgtggagaataaagacgc	60	50	262
NM_000573.3_ex15F	gcgtctttattctccacatgcc	60	50	214
NM_000573.3_ex15R	agactgattcccaaccccaa	59	50	214
NM_000573.3_ex16F	gggttctcttggctgaaacag	60	52	182
NM_000573.3_ex16R	atgaagggagagactggcct	60	55	182
NM_000573.3_ex17F	acctctggtgaaactcctga	60	50	330
NM_000573.3_ex17R	atggagggcctgggttagat	60	55	330
NM_000573.3_ex18F	gaggaaacacactgggtatc	56	50	277
NM_000573.3_ex18R	tgcagacatgggaaagatcc	58	50	277
NM_000573.3_ex19F	tcagattactctacctggctcc	60	50	200
NM_000573.3_ex19R	gaaagtactatcgctgtgctgg	60	50	200
NM_000573.3_ex20F	gctgtcaggaagttgatgaggt	60	50	185
NM_000573.3_ex20R	taaacggtggggtgaatggg	60	55	185
NM_000573.3_ex21_1F	gcaagactctgtcccaaggt	60	55	296
NM_000573.3_ex21_1R	cacatttggaggcgtgcatt	60	60	296
NM_000573.3_ex21_2F	cggcccctcagtgcattata	61	55	255
NM_000573.3_ex21_2R	acagcaacgcatgtcacttg	60	50	255
NM_000573.3_ex22F	gctgtactttgtttctctctcccc	61	50	262
NM_000573.3_ex22R	ggcatgtggagaataaagacgc	60	50	262
NM_000573.3_ex23F	gcgtctttattctccacatgcc	60	50	182
NM_000573.3_ex23R	gcaggtcaggcaagctcata	60	55	182
NM_000573.3_ex24F	gtgtcctcttggctgaaacag	60	53	180
NM_000573.3_ex24R	tgaaggggagagattggcct	60	55	180
NM_000573.3_ex25F	acctctggtgaaactcctga	59	50	330
NM_000573.3_ex25R	atggaggggctgggttagat	60	56	330
NM_000573.3_ex26F	gaggaaacacactgggtatc	56	50	277
NM_000573.3_ex26R	tgcagacatgggaaagatcc	56	55	277
NM_000573.3_ex27F	ctctacctggctccaaaaca	60	50	183
NM_000573.3_ex27R	atcgctgtgctggaactctt	61	50	183
NM_000573.3_ex28F	tgctgtcaggaagttgatgagg	60	50	185
NM_000573.3_ex28R	tcaatggtggggtgaatggg	60	55	185
NM_000573.3_ex29_1F	gcaagactctgtcccaaggt	59	55	268
NM_000573.3_ex29_1R	tataatgcactgaggggcgg	60	55	268
NM_000573.3_ex29_2F	ccgcccctcagtgcattata	60	55	264
NM_000573.3_ex29_2R	cctgatccaacagcaacaca	60	50	264
NM_000573.3_ex30	ggaagcataggaaattccccca	60	50	294
NM_000573.3_ex30	agtaagacctccatgtgtggg	59	52	294
NM_000573.3_ex31	cacacatggaggtcttactc	60	50	198
NM_000573.3_ex31	gcagtgctgagtccctgatc	59	60	198
NM_000573.3_ex32	atggtgcattcatccagcca	60	50	234
NM_000573.3_ex32	tcaaaagcgggcacaaacag	60	50	234
NM_000573.3_ex33	ggcaacacagtcacagtatg	57	50	370
NM_000573.3_ex33	gggtccacatattctgaaccca	60	50	370
NM_000573.3_ex34	gaggaggtagggtggaagtct	59	72	300
NM_000573.3_ex34	agcccggtcccacctatg	60	66	300
NM_000573.3_ex35	cccaaattctgcttcttcccc	60	52	183
NM_000573.3_ex35	tcagaagttggctctgctgt	60	55	183
NM_000573.3_ex36F	ctgccatggtgtaatctgtcct	60	50	255
NM_000573.3_ex36R	gggcaagtcaggatcacaca	60	55	255
NM_000573.3_ex37_1F	ctcttccttctctcagtc	50	50	316
NM_000573.3_ex37_1R	tgatgatctcagtgaggg	52	50	316
NM_000573.3_ex37_2F	gagtaccaggaaacaggagt	56	50	181
NM_000573.3_ex37_2R	cctcacacccagcaaagtct	59	55	181
NM_000573.3_ex38F	caagtgctctggaactgtcct	60	52	262
NM_000573.3_ex38R	agtcctccatgtgaagggga	60	55	262
NM_000573.3_ex39F	tccccttcacatggaggact	60	55	186
NM_000573.3_ex39R	tgagtccttggtctcaacgc	60	55	186
NM_000573.3_ex40F	gggagagatgggaattgctca	60	52	222
NM_000573.3_ex40R	gacaacaggtgatgccatgc	60	55	222
NM_000573.3_ex41F	ttaagcgcacagtcacaggt	59	50	337
NM_000573.3_ex41R	ggatatgtggaagcaggtac	56	50	337
NM_000573.3_ex42F	gtgtgggaacttgttcttagcc	61	50	253
NM_000573.3_ex42R	gcctcatgcattccatacaacc	60	50	253
NM_000573.3_ex43F	tgcttcctcttagccaaggg	60	55	326
NM_000573.3_ex43R	cccacattccttgcacttgc	61	55	326
NM_000573.3_ex44F	tgttgcatgccagagtgatg	59	50	109
NM_000573.3_ex44R	gatgccagaattcctcagca	59	50	109
NM_000573.3_ex45F	ccttgttttactgcctaggc	59	50	154
NM_000573.3_ex45R	tgacttccaagagggggtaag	59	52	154
NM_000573.3_ex46F	tcctttcagacgtcttgcaa	57	45	348
NM_000573.3_ex46R	ggtatcaatgacctacctagtgca	59	46	348
NM_000573.3_ex47F	ctgggtagttcagttgtctacc	58	50	102
NM_000573.3_ex47R	cgagatgttcttcagctg	53	50	102

본 발명에서 디자인된 프라이머 (BIN1)

Primer ID	서열	Tm (oC)	GC (%)	길이 (bp)
NM_004305.3_ex1_1F	ctccctcctcgcggacct	60	72	364
NM_004305.3_ex1_1R	acccctttactgcccatctc	60	55	364
NM_004305.3_ex1_2F	aagatctccccgcgcgag	60	66	212
NM_004305.3_ex1_2R	gaggatagggggacaggtgg	60	65	212
NM_004305.3_ex2F	tctccccttctctcttggct	60	55	172
NM_004305.3_ex2R	ccatttttcacctggcagcc	60	55	172
NM_004305.3_ex3F	tccctgacctggtccttgtc	60	60	138
NM_004305.3_ex3R	ctgcacccaccagctctac	60	63	138
NM_004305.3_ex4F	ggaggcccacatacttcctt	60	55	188
NM_004305.3_ex4R	ggacaggagctgagaccaga	60	60	188
NM_004305.3_ex5F	gtgctcttgcctgtctcaga	60	55	170
NM_004305.3_ex5R	tctctccagttccctccagg	60	60	170
NM_004305.3_ex6F	gcttagtgccctcctctgtc	60	60	183
NM_004305.3_ex6R	ctctcagccccctgcaga	61	66	183
NM_004305.3_ex7F	ccaacagaggggaatgacc	57	58	132
NM_004305.3_ex7R	gctgggcctcacctgttc	60	66	132
NM_004305.3_ex8F	ccatccttccgcccttctg	60	63	132
NM_004305.3_ex8R	ggtgtggcccctcagagg	61	72	132
NM_004305.3_ex9F	cactgtctctcctgcagctc	60	60	176
NM_004305.3_ex9R	ccaacagggtcacaggaagg	60	60	176
NM_004305.3_ex10F	gaatgaaggcctccacctcc	60	60	141
NM_004305.3_ex10R	atgcacagggccagccag	62	67	141
NM_004305.3_ex11F	gctccctttcttgtcctccc	60	60	200
NM_004305.3_ex11R	gggacctgctaccaagacat	61	55	200
NM_004305.3_ex12F	gtcctgtgtctgaccccaag	61	60	162
NM_004305.3_ex12R	aggaaaaggcagggctttgt	60	50	162
NM_004305.3_ex13F	ctgctcagctgacccgtac	60	63	171
NM_004305.3_ex13R	actgcagcagtcagaggct	60	58	171
NM_004305.3_ex14F	gggacggaaggtctgacttg	61	60	191
NM_004305.3_ex14R	caggatgcctgtggtccc	60	66	191
NM_004305.3_ex15F	ctctgcccctcaggatgaag	59	60	371
NM_004305.3_ex15R	gggcgccagaaactcaacta	60	55	371

본 발명에서 디자인된 프라이머 (TREM2)

Primer ID	서열	Tm (oC)	GC (%)	길이 (bp)
NM_001271821.1_ex1F	ccccagtcctgactattgct	60	55	229
NM_001271821.1_ex1R	gagggagagaaggcatcaca	60	55	229
NM_001271821.1_ex2F	tgaatgtctcctccccagag	60	55	384
NM_001271821.1_ex2R	ccactgcccactcacctg	59	66	384
NM_001271821.1_ex3F	aggaggaaggggctggag	61	66	185
NM_001271821.1_ex3R	ctctgcagggtggaagtctg	61	60	185
NM_001271821.1_ex4F	cccatctgccttcttgtctc	61	55	247
NM_001271821.1_ex4R	cttgatggctgtgctctcc	60	57	247

본 발명에서 디자인된 프라이머 (CLU)

Primer ID	서열	Tm (oC)	GC (%)	길이 (bp)
NM_001831.3_ex1F	agcacagctattcgtggtga	59	50	356
NM_001831.3_ex1R	gtgactgcgagctgtgtcat	60	55	356
NM_001831.3_ex2F	gtgtccatggcaagtctggt	61	55	396
NM_001831.3_ex2R	ggcctgatagagaggcactg	60	60	396
NM_001831.3_ex3F	tgacagcccctgaactgaac	61	55	399
NM_001831.3_ex3R	taattgcagcctcagcatca	61	45	399
NM_001831.3_ex4F	ggagcaagggtaggcactt	59	58	396
NM_001831.3_ex4R	gcatgcggaatgaagcata	61	47	396
NM_001831.3_ex5_1F	gtggccttggtgagcttct	62	55	258
NM_001831.3_ex5_1R	gaagggcaggtagtggtagg	64	55	285
NM_001831.3_ex5_2F	tccaggacaggttcttcacc	60	55	308
NM_001831.3_ex5_2R	cagcatctaacgagttgctca	60	45	308
NM_001831.3_ex6F	agagtcacctgagcctggaa	60	55	376
NM_001831.3_ex6R	cataaaggcagcaccagtga	60	50	376
NM_001831.3_ex7F	catgtgctaacttccattca	55	40	400
NM_001831.3_ex7R	tcagtcaaaagcacacatgc	58	45	400
NM_001831.3_ex8F	tttccttggagaagcaggag	60	50	392
NM_001831.3_ex8R	agtcgttcccaccaggctat	61	55	392
NM_001831.3_ex9F	ccaagaacaaagccaggaag	60	50	197
NM_001831.3_ex9R	tacttggtgacgtgcagagc	61	55	197

본 발명에서 디자인된 프라이머 (CTNNA3)

Primer ID	서열	Tm (oC)	GC (%)	길이 (bp)
XM_005269717.1_ex1F	gtgaggtcagtgactagcgg	60	60	309
XM_005269717.1_ex1R	gcagaaatgagaattcgctg	56	45	309
XM_005269717.1_ex2F	tggagcctttcttgaagcgt	60	50	138
XM_005269717.1_ex2R	gccctacaatttagccctgt	59	50	138
XM_005269717.1_ex3F	agcatccttttgtgtttgtgca	60	41	134
XM_005269717.1_ex3R	aatacctggattatgagaggctcc	61	46	134
XM_005269717.1_ex4F	tcccaggactgtgttctcct	60	55	291
XM_005269717.1_ex4R	atgcagtttgctcctgacca	61	50	291
XM_005269717.1_ex5F	ggggttgtatttttcaggtgaagc	60	46	227
XM_005269717.1_ex5R	agtgaagacaatgccaaggt	60	45	227
XM_005269717.1_ex6F	tcgactcttcgtgttagcaagt	60	46	228
XM_005269717.1_ex6R	tccaccaaggagagctctga	60	55	228
XM_005269717.1_ex7F	cccattgtaagataccactc	53	45	329
XM_005269717.1_ex7R	cacactttatctttctcccgac	57	46	329
XM_005269717.1_ex8F	gccatggagctctaaccataca	60	50	263
XM_005269717.1_ex8R	aggcaaaccagtcacctacg	59	55	263
XM_005269717.1_ex9F	ttcttctttgcaggctgg	60	50	135
XM_005269717.1_ex9R	agcccctatgtttctgactcc	60	52	135
XM_005269717.1_ex10F	catttcttctcagctccgca	60	50	216
XM_005269717.1_ex10R	ggagcctcattctcctggac	60	60	216
XM_005269717.1_ex11F	agtgttgctgcatttccttgc	60	48	165
XM_005269717.1_ex11R	agttgtcatacctgtggacaca	60	46	165
XM_005269717.1_ex12F	attgcatagtggtgaagtgtgg	59	46	260
XM_005269717.1_ex12R	acataccagatacagcaagg	55	45	260
XM_005269717.1_ex13F	acacagacacacgcaaaaac	57	45	273
XM_005269717.1_ex13R	tgtgcagctgttattggcaac	60	47	273
XM_005269717.1_ex14F	caaagaggacaatcttctcc	53	45	249
XM_005269717.1_ex14R	ggcattccagatggtgaagaac	60	50	249
XM_005269717.1_ex15F	taaggtactgccgcgttgtt	60	50	225
XM_005269717.1_ex15R	gcacagccttcagtgacaca	60	55	225
XM_005269717.1_ex16F	cacatgttttaggctaagatgactc	58	40	272
XM_005269717.1_ex16R	gagaatcttgaggtttcact	53	40	272
XM_005269717.1_ex17F	tagccgttctttgggatgcg	60	55	266
XM_005269717.1_ex17R	gtccacttgtaagtaactcacctg	60	46	266
XM_005269717.1_ex18F	atttagtgcccagatccatc	55	45	210
XM_005269717.1_ex18R	acaagggtgtagttactctg	55	45	210
XM_005269717.1_ex19F	ttccctacagttggacagtgtc	60	50	355
XM_005269717.1_ex19R	aagcagtgtggttaggcagg	60	55	355

본 발명에서 디자인된 프라이머 (DNMBP)

Primer ID	서열	Tm (oC)	GC (%)	길이 (bp)
NM_015221.2_ex1F	cgctgactcacacgggatc	62	63	130
NM_015221.2_ex1R	cggcctctgacctgctttc	62	63	130
NM_015221.2_ex2F	caggttataaaacatggaggctgg	60	46	205
NM_015221.2_ex2R	atggaaagaagtcagggcctg	60	52	205
NM_015221.2_ex3F	tgtccttgtacacagacggg	60	55	256
NM_015221.2_ex3R	ttgtcgaaacgggcagactc	60	55	256
NM_015221.2_ex4_1F	aggtcaccatctctgctcct	60	55	392
NM_015221.2_ex4_1R	tcatccacagtcctcagggg	60	60	392
NM_015221.2_ex4_2F	tttgtagagctgttggggcc	60	55	380
NM_015221.2_ex4_2R	gaagtttccgggatcctggc	59	60	380
NM_015221.2_ex4_3F	gccaggatcccggaaacttc	58	55	398
NM_015221.2_ex4_3R	tctaggggaagaaggtcggg	57	60	398
NM_015221.2_ex4_4F	cacccgcactcagaacagta	60	55	387
NM_015221.2_ex4_4R	ccctgccaagctcttctcaa	60	55	387
NM_015221.2_ex4_5F	ttgagaagagcttggcaggg	60	55	396
NM_015221.2_ex4_5R	atggggaggtctggtccag	60	63	396
NM_015221.2_ex4_6F	ggccctggtcatatgggaag	60	60	300
NM_015221.2_ex4_6R	ctgggtaggctgtttctggg	60	60	300
NM_015221.2_ex5F	tacacccagagctgctaacc	60	55	300
NM_015221.2_ex5R	atcctaatgcttctggcctgg	60	52	300
NM_015221.2_ex6F	ccattaagctcatttccgtgca	60	46	181
NM_015221.2_ex6R	agctgcttctgaaacaacacag	60	46	181
NM_015221.2_ex7F	gtgtgtattccaaaggacctgtg	59	47	180
NM_015221.2_ex7R	gtggtcaaaactcctacttcag	58	47	180
NM_015221.2_ex8F	tcttttcatgcccactgcct	60	50	75
NM_015221.2_ex8R	gagcgcatacatcaagcagc	60	55	75
NM_015221.2_ex9F	ccttctcttacaggggatgca	60	52	250
NM_015221.2_ex9R	gggcatacctccttttcagca	60	52	250
NM_015221.2_ex10F	gcccatgctgaggaaagtgc	60	60	200
NM_015221.2_ex10R	cgctaagccttccaggatgg	60	60	200
NM_015221.2_ex11F	tgtccagatttgctaacagc	60	45	199
NM_015221.2_ex11R	aggggacagaattacatcgt	60	45	199
NM_015221.2_ex12F	gtgtctgtcctaactggctcc	60	55	183
NM_015221.2_ex12R	ggggccaacttttgaagaaa	57	55	183
NM_015221.2_ex13F	gcaatgtgcctttctcgtcc	59	55	391
NM_015221.2_ex13R	tgaccatcccactgaacagg	61	55	391
NM_015221.2_ex14F	ctctgctcttcccatggacc	60	60	219
NM_015221.2_ex14R	cagttccctactcaccaggc	60	60	219
NM_015221.2_ex15F	acgtcttacctttcagccaagt	60	46	248
NM_015221.2_ex15R	cagttacagtcctctgctgct	55	52	248
NM_015221.2_ex16_1F	tcctttgtagtcaccaaaggct	60	46	397
NM_015221.2_ex16_1R	tggcagtgggttgctttaca	60	50	397
NM_015221.2_ex16_2F	ggggactctgcagatgtagc	60	60	274
NM_015221.2_ex16_2R	cgctggtacccacaacacat	60	55	274
NM_015221.2_ex17F	tctctccctcacacaggtct	60	55	369
NM_015221.2_ex17R	acaacccaatcgaggagaaca	60	48	369

본 발명에서 디자인된 프라이머 (SORL1)

Primer ID	서열	Tm (oC)	GC (%)	길이 (bp)
NM_003105.5_ex1F	cccgttcctattcaccctgg	59	60	395
NM_003105.5_ex1R	aggaagtgcagggagaggaa	60	55	395
NM_003105.5_ex2F	cgtgggtcctaattcctaca	46	50	194
NM_003105.5_ex2R	gttgatggcaccaaggtgtg	61	55	194
NM_003105.5_ex3F	ctctgtattccaggtgtacgtg	60	50	173
NM_003105.5_ex3R	gaagtcgggacaggagggat	60	60	173
NM_003105.5_ex4F	gggcctgctctcaacttacc	60	60	201
NM_003105.5_ex4R	ttacctgcttgttggggtgg	60	55	201
NM_003105.5_ex5F	agcgggtgtttgatggtgat	60	50	235
NM_003105.5_ex5R	tttcaggggagggcagtttg	61	55	235
NM_003105.5_ex6F	tgcaaaacttccatgcctct	60	45	315
NM_003105.5_ex6R	cacagaatgccaaacttcac	60	45	315
NM_003105.5_ex7F	tttctcctcttccttggcagc	60	52	180
NM_003105.5_ex7R	ctgacctctgcataaagaca	55	45	180
NM_003105.5_ex8F	cccacagggcacatttgttt	60	50	254
NM_003105.5_ex8R	aggcaggagaaggactcaca	60	55	254
NM_003105.5_ex9F	gtgaatgtgcttaatgccac	57	45	374
NM_003105.5_ex9R	aaactaccacagagcagggc	60	55	374
NM_003105.5_ex10F	tgctgacactgcctgaaact	60	50	181
NM_003105.5_ex10R	accccttttgagaacaggca	60	50	181
NM_003105.5_ex11F	cttgcattttaggctcagtggg	60	50	120
NM_003105.5_ex11R	ggtggaggggacgggatt	60	67	120
NM_003105.5_ex12F	cacagcagtggtgtcacc	60	61	150
NM_003105.5_ex12R	aaaggcctcatcagagacac	60	50	150
NM_003105.5_ex13F	gcatttgggcagatacagtacc	60	50	218
NM_003105.5_ex13R	aaaaggtccaaggaggcagc	60	55	218
NM_003105.5_ex14F	tgcctctaatgcttcgtgct	60	50	263
NM_003105.5_ex14R	aacacaactcagtccccagc	60	55	263
NM_003105.5_ex15F	aaccgtggccttaacaaagc	55	50	185
NM_003105.5_ex15R	gcaacctctgtgatacataccc	60	50	185
NM_003105.5_ex16F	ctgacctcttgctcttgggg	60	60	191
NM_003105.5_ex16R	cggacttgggtgagatcgtg	59	60	191
NM_003105.5_ex17F	aacctcccacgtgtcttgtg	60	55	238
NM_003105.5_ex17R	cacagctcccacagtcagac	61	60	238
NM_003105.5_ex18F	cagggggtcgtttgaacagt	60	55	229
NM_003105.5_ex18R	cccgcctgctcccttaatta	60	55	229
NM_003105.5_ex19F	ctcagcctcttttccccctg	60	60	165
NM_003105.5_ex19R	agcattggacgcaagactga	60	60	165
NM_003105.5_ex20F	ccccattttcgctagggtga	61	55	314
NM_003105.5_ex20R	tatgctcctcacccgctcta	63	55	314
NM_003105.5_ex21F	gctggactaatgggcaaagg	61	55	228
NM_003105.5_ex21R	cgcagcccctttcttgagat	60	55	228
NM_003105.5_ex22F	tgctgctgtttgtcttccct	60	50	234
NM_003105.5_ex22R	aggaggatgacaggcaaa	60	50	234
NM_003105.5_ex23F	ggtttcatttcctcccctgc	60	50	180
NM_003105.5_ex23R	gtgcttaacgtccaatccag	60	55	180
NM_003105.5_ex24F	ccagtaggatgtttacatttgtggg	61	44	232
NM_003105.5_ex24R	ctccagagcagggtttcagg	60	60	232
NM_003105.5_ex25F	gcttttgtcctcacctctctgt	60	50	200
NM_003105.5_ex25R	aacggatgagtgctgtcaact	60	48	200
NM_003105.5_ex26F	gtgtgcgactgtgtctctct	60	55	229
NM_003105.5_ex26R	tctgtggcctctcttcctga	60	55	229
NM_003105.5_ex27F	cctcctcgtcattcttctgtgt	61	50	190
NM_003105.5_ex27R	cactaggcctgagtgcttcc	60	60	190
NM_003105.5_ex28F	cagtgctcatggcctcttcc	60	60	190
NM_003105.5_ex28R	ctgcctgccccaactcac	60	66	190
NM_003105.5_ex29F	ggaagttcctggacttcatgga	60	50	195
NM_003105.5_ex29R	aggaggcagactggacatct	60	55	195
NM_003105.5_ex30F	atgcagggaaagcaactg	60	50	192
NM_003105.5_ex30R	ccccaggggcctcttacc	61	72	192
NM_003105.5_ex31F	ttttgggtttccgtgcttgg	61	50	222
NM_003105.5_ex31R	ggtaccacaggagaggacct	60	60	222
NM_003105.5_ex32F	gttattggccagctccctca	60	55	224
NM_003105.5_ex32R	gctctctgactactcacggc	60	60	224
NM_003105.5_ex33F	ccctccccgtggacttaaga	60	60	185
NM_003105.5_ex33R	tggaccggcactcaccac	61	66	185
NM_003105.5_ex34F	cgcccagccaagatgtaact	60	55	240
NM_003105.5_ex34R	acagaacatcctggggcaat	60	50	240
NM_003105.5_ex35F	acggagtcagacatctcagc	60	55	250
NM_003105.5_ex35R	gaaacacttacatccctctggg	60	50	250
NM_003105.5_ex36F	ctctggttggctgctatgca	60	55	214
NM_003105.5_ex36R	ctagcacccccaacacacat	60	55	214
NM_003105.5_ex37F	atgccctggacctttggttc	60	55	183
NM_003105.5_ex37R	ggctggaatggatgacgaca	60	55	183
NM_003105.5_ex38F	ctcacccctttagctcattcag	60	50	186
NM_003105.5_ex38R	ctgcaaatgctgggatca	61	50	186
NM_003105.5_ex39F	agtcctgccttcctcacttt	60	50	187
NM_003105.5_ex39R	ataaagccccatccagctgc	60	55	187
NM_003105.5_ex40F	cttcttggttctcggcaggt	60	55	173
NM_003105.5_ex40R	agcattggtccagccttacc	60	55	173
NM_003105.5_ex41F	cacagttggcaatctgacagc	60	52	244
NM_003105.5_ex41R	agcattaggggacagtccac	60	55	244
NM_003105.5_ex42F	catgagctgatgtcctcttcca	60	50	176
NM_003105.5_ex42R	cggtatgggaaacttacc	52	50	176
NM_003105.5_ex43F	ttcctacgtgtgtgcttggg	61	55	212
NM_003105.5_ex43R	ctggaagcccaacccactc	60	63	212
NM_003105.5_ex44F	ggtcctagttgtatgcagttgc	60	50	217
NM_003105.5_ex44R	gtgtgagaagacctctaacctctc	60	50	217
NM_003105.5_ex45F	tccactaaccgcatcccatc	62	55	227
NM_003105.5_ex45R	ccagcatgctgtcaacaagc	61	55	227
NM_003105.5_ex46F	cgacttcctgagcaatctcttg	61	50	257
NM_003105.5_ex46R	gacagaaacgggcagcaatc	58	55	257
NM_003105.5_ex47F	ggtgggcttattggtgggaa	60	55	276
NM_003105.5_ex47R	gaagaaccgactctccctgc	60	60	276
NM_003105.5_ex48F	ttggaactcaccaaggcctg	60	55	382
NM_003105.5_ex48R	gacgtaaaagcatgcccagc	60	55	382

본 발명에서 디자인된 프라이머 (BACE1)

Primer ID	서열	Tm (oC)	GC (%)	길이 (bp)
NM_012104.4_ex1_1F	cacaagtctttccgcctccc	61	60	372
NM_012104.4_ex1_1R	tctcaggagagggagcttgg	60	60	372
NM_012104.4_ex1_2F	ccaagctccctctcctgaga	60	60	397
NM_012104.4_ex1_2R	gctaagggctggcctgac	59	60	397
NM_012104.4_ex2F	ctctcccctttctctgacagc	60	57	180
NM_012104.4_ex2R	ccctcccctgacccttctta	60	60	180
NM_012104.4_ex3F	gccttctttccacaggtcca	60	55	240
NM_012104.4_ex3R	cctctcaccctggcaatctc	60	60	240
NM_012104.4_ex4F	ccaacctcttctccctgcag	60	60	129
NM_012104.4_ex4R	tctctccctcaatgccagga	60	55	129
NM_012104.4_ex5F	gtgccaggacacgggtac	60	66	192
NM_012104.4_ex5R	tctcccttggttttcttacctcc	60	48	192
NM_012104.4_ex6F	taaccccctactgcccagag	60	60	185
NM_012104.4_ex6R	tagtccactcacggaggagg	60	60	185
NM_012104.4_ex7F	ccccttcttgccaacacaga	60	55	202
NM_012104.4_ex7R	agagagatccccctgactcag	60	57	202
NM_012104.4_ex8F	catttgccctctccccagtg	60	60	400
NM_012104.4_ex8R	tcaaggcagaggcatttggt	60	60	400

본 발명에서 디자인된 프라이머 (PICALM)

Primer ID	서열	Tm (oC)	GC (%)	길이 (bp)
NM_001206947.1_ex1F	taatcaccacagcagtcagc	60	50	298
NM_001206947.1_ex1R	aggcctctctctaccatgga	60	55	298
NM_001206947.1_ex2F	tcttttgcctgtttgtatgcag	60	41	321
NM_001206947.1_ex2R	cctgggagctgtttctgaag	60	55	321
NM_001206947.1_ex3F	tcgaattagagttggtgagatggc	59	46	200
NM_001206947.1_ex3R	actctggagtaatcatcatgtggg	61	46	200
NM_001206947.1_ex4F	gccattggatgcaatgagttgt	58	46	322
NM_001206947.1_ex4R	tgaggctcatcttttaaaactggc	61	42	322
NM_001206947.1_ex5F	tttcataacagggctgatggag	58	46	192
NM_001206947.1_ex5R	gagtctgtgaaaacttgagg	53	45	192
NM_001206947.1_ex6F	ttcactaacatgcctaatgc	54	40	245
NM_001206947.1_ex6R	aggctacagcagtatttaccca	59	46	245
NM_001206947.1_ex7F	tgctcctttagagacctatttgg	59	43	356
NM_001206947.1_ex7R	ttgccacagaattcaatacagc	60	41	356
NM_001206947.1_ex8F	ctggtactagccgtgatgtca	59	52	169
NM_001206947.1_ex8R	cacaacagatagtggattgg	53	45	169
NM_001206947.1_ex9F	tacaattgcaggcccctagc	59	55	162
NM_001206947.1_ex9R	agctggtttcatctactgcct	59	47	162
NM_001206947.1_ex10F	gccagaccatttcatgacctg	61	52	274
NM_001206947.1_ex10R	ctgtgcagaggccccattta	60	55	274
NM_001206947.1_ex11F	tctggaatccttatggtagttccc	60	46	191
NM_001206947.1_ex11R	ccttaacttctactcctacctg	55	46	191
NM_001206947.1_ex12F	atctgtggtgggtggagaag	60	55	336
NM_001206947.1_ex12R	ccttcaagggataaaattgc	56	40	336
NM_001206947.1_ex13F	gtgtggggaatttagtgc	54	50	345
NM_001206947.1_ex13R	gggggatgggacaatttct	61	53	345
NM_001206947.1_ex14F	ggagaaaaggcaaagacctc	58	50	339
NM_001206947.1_ex14R	agtggttccatttccgatgc	62	50	339
NM_001206947.1_ex15F	agtggcctctcagaaccaga	60	55	384
NM_001206947.1_ex15R	aacagagcgagactccgtgt	60	55	384
NM_001206947.1_ex16F	ctcccaaagtgctgggatta	60	50	397
NM_001206947.1_ex16R	taggcaaccagcttcctttg	60	50	397
NM_001206947.1_ex17F	ctcacagctgtcttagca	50	50	284
NM_001206947.1_ex17R	gggctaggagtatgaggagca	61	57	284
NM_001206947.1_ex18F	ggacctgtcatccctgttgt	60	55	222
NM_001206947.1_ex18R	accacagttacatgtagtgtgt	57	41	222
NM_001206947.1_ex19F	ggtaaagaccacaaagcatt	54	40	370
NM_001206947.1_ex19R	acaggagttgaaagaattgaaggg	59	42	370

본 발명에서 디자인된 프라이머 (LRP6)

Primer ID	서열	Tm (oC)	GC (%)	길이 (bp)
NM_002336.2_ex1F	ctcgcctcccccacttct	60	66	152
NM_002336.2_ex1R	accccaccaactttccagtg	61	55	152
NM_002336.2_ex2_1F	tttttgttctagcggcccct	59	50	250
NM_002336.2_ex2_1R	tcgggggacaataatccaga	60	50	250
NM_002336.2_ex2_2F	ctgagagtgtgcagaatg	53	50	262
NM_002336.2_ex2_2R	gtcagtggagaaaaaccg	53	50	262
NM_002336.2_ex2F	tctagcggcccctttgttg	60	57	400
NM_002336.2_ex2R	cccacttgaaggatctaaggca	60	50	400
NM_002336.2_ex3F	tgatatctgctctgtcatggct	59	46	300
NM_002336.2_ex3R	tgtatcaaggcttcatcgag	55	45	300
NM_002336.2_ex4F	tgttaataggcaggcagtggt	60	48	322
NM_002336.2_ex4R	attcccgccaactatctttg	56	45	322
NM_002336.2_ex5F	tgacagccacaaatccatgt	58	45	250
NM_002336.2_ex5R	aagtgactggtctcccaaagc	60	52	250
NM_002336.2_ex6_1F	cactttgttgttctaggtgcca	59	45	256
NM_002336.2_ex6_1R	caggatgggcaatttgagcag	59	52	256
NM_002336.2_ex6_2F	tggatctggcagtcagtttgt	59	48	220
NM_002336.2_ex6_2R	cagtagagcttcttacccaacca	59	48	220
NM_002336.2_ex7F	ctaggtacatgtattggactgactgg	60	46	235
NM_002336.2_ex7R	actgtcgactcaaaacccat	57	45	235
NM_002336.2_ex8F	gcataattcatccccttctc	54	46	296
NM_002336.2_ex8R	cctggttcccatttctaagaaagc	60	46	296
NM_002336.2_ex9F	gtgtccttctgtgccccttt	60	55	375
NM_002336.2_ex9R	gttctcccttttagtccctagct	59	48	375
NM_002336.2_ex10F	ctggatagggtttagacttatgcc	60	46	342
NM_002336.2_ex10R	tgccatgttccccgaaatgt	59	50	342
NM_002336.2_ex11F	gactctttcccccagataat	54	45	305
NM_002336.2_ex11R	cagccactgatatttgcatgga	59	46	305
NM_002336.2_ex12F	actctgcttctcccctgtct	60	55	390
NM_002336.2_ex12R	gctttggagggaaatgcagc	60	55	390
NM_002336.2_ex13F	tggatgatagaggatgtagggt	58	46	318
NM_002336.2_ex13R	tggtgagtccagttattagtcagg	59	46	318
NM_002336.2_ex14F	ttgcctcagggttatctgcc	60	55	307
NM_002336.2_ex14R	agccacagtatctgaacgcc	59	55	307
NM_002336.2_ex15F	ttcctcctttccctctaggt	59	50	312
NM_002336.2_ex15R	actgccaagaaatgtgccaa	61	45	312
NM_002336.2_ex16F	aacttgacccacatgagtca	56	45	290
NM_002336.2_ex16R	cctccaattagctttatccc	53	45	290
NM_002336.2_ex17F	acttctctccccctccactc	59	60	222
NM_002336.2_ex17R	tgcatttagggttgcacaag	60	45	222
NM_002336.2_ex18F	tgtcactccccttctccttg	59	55	307
NM_002336.2_ex18R	aaaggattgcatgctgaggc	59	50	307
NM_002336.2_ex19F	gccagagtttgactttacatga	60	41	190
NM_002336.2_ex19R	agatctcagtcctacttacaacaatcc	60	41	190
NM_002336.2_ex20F	actgcattcttcattgtagatccg	59	41	300
NM_002336.2_ex20R	agtcttgcaggaccaaagact	59	47	300
NM_002336.2_ex21F	attttaggaatgtctcgagg	52	40	180
NM_002336.2_ex21R	atgtatgtcgcattcaaagg	54	40	180
NM_002336.2_ex22F	tgaggaagccatagtcccaa	59	50	302
NM_002336.2_ex22R	gcaccttattttagagaaggatgtg	61	40	302
NM_002336.2_ex23F	ctgcttctctttattttctccc	55	41	355
NM_002336.2_ex23R	gttggaggcagtcagaggag	60	60	355

본 발명에서 디자인된 프라이머 (PSEN1)

Primer ID	서열	Tm (oC)	GC (%)	길이 (bp)
NM_007318.2_ex1F	gaaatgacgacaacggtgag	60	50	166
NM_007318.2_ex1R	actccccatcacgcacatac	60	50	166
NM_007318.2_ex2F	tggatgacctggtgaaatcc	61	60	214
NM_007318.2_ex2R	agcctcttgaggttctga	53	50	214
NM_007318.2_ex3F	ttggcctggaggagaacac	61	58	300
NM_007318.2_ex3R	tccagtctggcaaaggcagt	63	55	300
NM_007318.2_ex4F	ccgttaccttgattctgctg	60	50	354
NM_007318.2_ex4R	gccacactggctttgagaat	60	55	354
NM_007318.2_ex5F	cactgacctagggcttttgtg	60	52	220
NM_007318.2_ex5R	gaagaacagggtggaaagca	60	50	220
NM_007318.2_ex6F	tttaagggttgtgggacctg	60	50	176
NM_007318.2_ex6R	gctacacagcacaaaggtagtt	56	45	176
NM_007318.2_ex7F	tgtttgggagccatcaca	60	50	348
NM_007318.2_ex7R	gggcattcctgtgacaaaca	59	50	348
NM_007318.2_ex8F	attcctccctaccacccatt	59	50	239
NM_007318.2_ex8R	catgtgcttcagttccgata	57	45	239
NM_007318.2_ex9F	ggagaaatgatggcttgttg	58	45	219
NM_007318.2_ex9R	gcttataacagtgaccctga	53	45	219
M_007318.2_ex10F	gagctgtaacttccactttctc	55	46	250
M_007318.2_ex10R	gctacctaaaggaatccatgac	56	46	250
M_007318.2_ex11F	cattgtggggttgagtaggg	60	55	309
M_007318.2_ex11R	ccacctggggttaaaacaga	60	50	309
M_007318.2_ex12F	gtgtgtctttcccatcttctcc	60	50	241
M_007318.2_ex12R	acctttgtcctccccagatt	60	50	241

본 발명에서 디자인된 프라이머 (ADAM10)

Primer ID	서열	Tm (oC)	GC (%)	길이 (bp)
NM_001110.2_ex1F	agccccttcagcttctccc	61	63	152
NM_001110.2_ex1R	gcagtcgtgcctcacctc	60	60	152
NM_001110.2_ex2F	gaaggggtcttcaagatgat	55	45	238
NM_001110.2_ex2R	ggaacttcagacacagtcagc	58	53	238
NM_001110.2_ex3F	gttgttcccccttcccatcc	60	60	173
NM_001110.2_ex3R	gggttctgttaaggtccaac	56	50	173
NM_001110.2_ex4F	aggtgaagaaggaagttttagcca	60	42	280
NM_001110.2_ex4R	tgttctagcctgattagtaactcag	58	40	280
NM_001110.2_ex5F	tgccttttccataggtgctt	57	45	275
NM_001110.2_ex5R	ccatttcctaaatgcaagctagtgt	60	40	275
NM_001110.2_ex6F	tggcagcagaaatacctatggt	59	46	313
NM_001110.2_ex6R	tgggaactactaaaatagcgca	57	41	313
NM_001110.2_ex7F	aatctcccttcccagcgcag	62	60	328
NM_001110.2_ex7R	acatagtctggactgtttcact	58	41	328
NM_001110.2_ex8F	cattcacactaaagctctgc	55	45	296
NM_001110.2_ex8R	ctcccctttgtttcaagtag	54	45	296
NM_001110.2_ex9F	acctttttgggggtaagggg	60	55	236
NM_001110.2_ex9R	gacaatacttactggggatcca	60	46	236
NM_001110.2_ex10F	ggagagtccacaagcttcca	60	55	395
NM_001110.2_ex10R	atgcaggtggtgggtatgtc	60	55	395
NM_001110.2_ex11F	attttcctcagaatctggcc	56	45	182
NM_001110.2_ex11R	cactgaaattagcaaggtacctgc	60	46	182
NM_001110.2_ex12F	ttcctctagtccaagtcaaggtc	58	47	200
NM_001110.2_ex12R	tgcttaccccattaatgcacac	58	45	200
NM_001110.2_ex13F	ggaagctcatacttgcctgtc	59	52	293
NM_001110.2_ex13R	tctggccaaactgtaggtca	59	50	293
NM_001110.2_ex14F	gcatttcttttccagtggaccc	60	50	310
NM_001110.2_ex14R	ttgatgacttctggccaagt	57	47	310
NM_001110.2_ex15F	tttctaggctcattggtggg	55	50	252
NM_001110.2_ex15R	cccattcttacggagaaagtactg	60	46	252
NM_001110.2_ex16F	ggcccatattattggacagcac	60	50	246
NM_001110.2_ex16R	gcactaggaagaaccaaggca	60	52	246

본 발명에서 디자인된 프라이머 (ABCA7)

Primer ID	서열	Tm (oC)	GC (%)	길이 (bp)
NM_019112.3_ex1F	ttctgtgatcccgtctcctc	60	55	354
NM_019112.3_ex1R	attcagccgtcgtcaacatt	61	45	354
NM_019112.3_ex2F	gcgctcccattggtttact	60	53	400
NM_019112.3_ex2R	aagagaggccacagcaattc	59	50	400
NM_019112.3_ex3F	gtaacgccccagtgtgagac	61	60	376
NM_019112.3_ex3R	cctgtggactctgcctgact	60	60	376
NM_019112.3_ex4F	ccaatacatggcatgggagt	61	50	359
NM_019112.3_ex4R	gaccctggggacagagaga	60	63	359
NM_019112.3_ex5F	gcctgagcaacttcaacgac	61	55	397
NM_019112.3_ex5R	gtggagactgcttggttggt	60	55	397
NM_019112.3_ex6F	agctctgagcctcaacttgc	60	55	380
NM_019112.3_ex6R	cagacgagtcttcctcactgg	60	57	380
NM_019112.3_ex7F	gacccagtgaggaagactcg	60	60	395
NM_019112.3_ex7R	cctctccctctcgctgtcta	60	60	395
NM_019112.3_ex8F	gatcattgccagctccgtct	60	55	261
NM_019112.3_ex8R	ggtcagtcactcactcaggc	60	60	261
NM_019112.3_ex9F	cagacagcagcctgagtgag	60	60	370
NM_019112.3_ex9R	cctccatcggctaactccta	59	55	370
NM_019112.3_ex10F	cttgtgcggaggatcagag	60	58	360
NM_019112.3_ex10R	cagagcgagactccatctca	59	55	360
NM_019112.3_ex11F	ctcctgacctcaggtgatcc	60	60	393
NM_019112.3_ex11R	aaatcccaggctcttactaggg	60	50	393
NM_019112.3_ex12F	gaggtccagggggaggag	62	72	398
NM_019112.3_ex12R	tctccaataggctgaatgctg	60	48	398
NM_019112.3_ex13F	gattgcagctcttcactcca	59	50	392
NM_019112.3_ex13R	caggaaggttcccaacagag	60	55	392
NM_019112.3_ex14F	gtctccagcctccacccc	61	72	295
NM_019112.3_ex14R	acccattctgcagccggg	62	66	295
NM_019112.3_ex15F	gctggagggtgacagacag	59	63	397
NM_019112.3_ex15R	agcaggctctgcggaaaa	62	56	397
NM_019112.3_ex16F	actgaccgcccgcttttc	60	61	278
NM_019112.3_ex16R	cctcccgcaaagcaggtg	61	67	278
NM_019112.3_ex17F	agcttgcagcgagtcaaaat	60	45	390
NM_019112.3_ex17R	agtgtcttcagggcaggtgt	60	55	390
NM_019112.3_ex18F	catgacctccatggctgagt	60	55	227
NM_019112.3_ex18R	gagtggttgggggctcac	60	67	227
NM_019112.3_ex19F	gggcaacagagtgaaactcc	60	55	391
NM_019112.3_ex19R	gtgcacagagcagagtgacc	60	60	391
NM_019112.3_ex20F	gctgtttgacatgtgcgtct	60	50	351
NM_019112.3_ex20R	ctacccacgtggacctcagt	60	60	351
NM_019112.3_ex21F	gaagccgggtactgaggtc	60	63	331
NM_019112.3_ex21R	ggggtccacatgtagcaaac	60	55	331
NM_019112.3_ex22F	cttcatggggcagacaactc	61	55	388
NM_019112.3_ex22R	actgccctccatgtcagtgt	61	55	388
NM_019112.3_ex23F	tgaccaccaatgagaaggtg	60	50	349
NM_019112.3_ex23R	ccccttccacctcttactcc	60	60	349
NM_019112.3_ex24F	acagtcccctcacaggtcac	60	60	395
NM_019112.3_ex24R	ccttgctgctcataaacacg	59	50	395
NM_019112.3_ex25F	agctctggtggctcagatgt	60	55	319
NM_019112.3_ex25R	aagttgagggtcacggattg	60	50	319
NM_019112.3_ex26F	ccaaggcatagcctttaccc	61	55	387
NM_019112.3_ex26R	agaaagcgcttgagaagcag	60	50	387
NM_019112.3_ex27F	gacgtaaccctacggctcaa	60	55	376
NM_019112.3_ex27R	ggtttggattaggccactga	60	50	376
NM_019112.3_ex28F	agccatgggtggttgtagag	60	55	304
NM_019112.3_ex28R	tcactgtgtgtgaggggaga	60	55	304
NM_019112.3_ex29F	gtacggtgctcaggtgtcct	60	60	392
NM_019112.3_ex29R	agggtcaaggtgaaggtctg	59	55	392
NM_019112.3_ex30F	ttgagtgtgcacagcccatt	60	50	330
NM_019112.3_ex30R	ggacccatgctatagccagg	60	60	330
NM_019112.3_ex31F	ttgactctgtgctcccctct	60	55	259
NM_019112.3_ex31R	agcgagaagcctccgtatct	61	55	259
NM_019112.3_ex32F	ggtgaggaggggtctagctt	60	60	388
NM_019112.3_ex32R	ggtgggggtcaaggtcatag	62	60	388
NM_019112.3_ex33F	agtctcaaggtgggaactgg	59	55	365
NM_019112.3_ex33R	tgtgtcagggttcaaatcca	60	45	365
NM_019112.3_ex34F	tgactgccccatagaccttt	60	50	383
NM_019112.3_ex34R	actttacccaggccatcttg	59	50	383
NM_019112.3_ex35F	caaaaagcaaggaggtcagg	60	50	362
NM_019112.3_ex35R	cttggcacaccactgaattg	60	50	362
NM_019112.3_ex36F	gcagagaagatgggaatgga	60	50	380
NM_019112.3_ex36R	aagcagaagtgggggaagat	60	50	380
NM_019112.3_ex37F	atgtggtgctcacctgcata	60	50	387
NM_019112.3_ex37R	ggggctgtttttctccactc	61	55	387
NM_019112.3_ex38F	gactccagctgagtggccta	61	60	354
NM_019112.3_ex38R	aggagtggcagagacctcac	59	60	354
NM_019112.3_ex39F	acctcttggccatggtgata	60	50	360
NM_019112.3_ex39R	tacctgggagagtgcaggtc	60	60	360
NM_019112.3_ex40F	tgttggtgctgaggaacttg	60	50	287
NM_019112.3_ex40R	gtgcccaataaaaggtggtg	60	50	287
NM_019112.3_ex41F	aaggcaggagaattgcttga	60	45	380
NM_019112.3_ex41R	ccagtccattcactggaggt	60	55	380
NM_019112.3_ex42F	agacccctgcacctctacct	60	60	384
NM_019112.3_ex42R	gattgggccaggctttaga	60	53	384
NM_019112.3_ex43F	ctgctccacactcaatgctg	61	55	370
NM_019112.3_ex43R	caaaaggctgttccaaagga	60	45	370
NM_019112.3_ex44F	ctacagcggagggaacaaac	60	55	339
NM_019112.3_ex44R	cctgtggccttgtgcttt	60	56	339
NM_019112.3_ex45F	agaacggtctggggaagagt	60	55	367
NM_019112.3_ex45R	cccctgcaggacaatctaaa	60	50	367
NM_019112.3_ex46F	gaaaggcccgatccggtag	60	63	290
NM_019112.3_ex46R	cgtgatcacctcctccagc	60	63	290
NM_019112.3_ex47F	tccctcttgtcccctctgg	60	63	365
NM_019112.3_ex47R	cctggctcaaggacacacat	60	55	365

본 발명에서 디자인된 프라이머 (CD33)

Primer ID	서열	Tm (oC)	GC (%)	길이 (bp)
NM_001772.3_ex1F	ttctgctcacacaggaagcc	60	55	138
NM_001772.3_ex1R	gtggggaaacgagggtcag	60	63	138
NM_001772.3_ex2_1F	gaccctcgtttccccacag	60	63	246
NM_001772.3_ex2_1R	gccctgagtctcctcctgta	60	60	246
NM_001772.3_ex2_2F	ggccacaaacaagctagatc	56	50	245
NM_001772.3_ex2_2R	acccatgaacttcccttgcg	60	55	245
NM_001772.3_ex3F	ggaccctccctcctgattct	60	55	376
NM_001772.3_ex3R	atcctgtctcccctacaccc	60	55	376
NM_001772.3_ex4F	acccccaactgaaggaaatcc	60	52	124
NM_001772.3_ex4R	atgtcagtaacagccccagg	61	55	124
NM_001772.3_ex5F	acccctctctacatgctgga	59	55	223
NM_001772.3_ex5R	ctcttcacctctggcccatg	60	60	223
NM_001772.3_ex6F	cccacagcctgagaaaacca	60	55	190
NM_001772.3_ex6R	ccacattgggaggaggtgtc	60	60	190
NM_001772.3_ex7F	ctcactgccctgctctaacc	60	60	271
NM_001772.3_ex7R	gtccccgacctgtagaggat	60	60	271

본 발명에서 디자인된 프라이머 (APP)

Primer ID	서열	Tm (oC)	GC (%)	길이 (bp)
NM_001136131.2_ex1F	gggctccgtcagtttcct	60	61	311
NM_001136131.2_ex1R	cccggcttctctgcatta	60	55	311
NM_001136131.2_ex2F	ctctgccttggagctatgga	61	55	240
NM_001136131.2_ex2R	tagccaccggacaggactta	61	55	240
NM_001136131.2_ex3F	cacttctggtcccaagcatt	60	50	375
NM_001136131.2_ex3R	gagtggcaatgtgctgaaga	60	50	375
NM_001136131.2_ex4F	tagggtcttgattgggttgc	60	50	339
NM_001136131.2_ex4R	gctgttgcctcaaaataccc	60	50	339
NM_001136131.2_ex5F	cactttgtagacatgcagtgag	56	46	221
NM_001136131.2_ex5R	cacaaaggccaccttacctc	60	56	221
NM_001136131.2_ex6F	ggacgacttttcttttccttcc	58	46	363
NM_001136131.2_ex6R	cagtggtgctagggtggata	58	55	363
NM_001136131.2_ex7F	aatgtggttccccacatctc	59	50	257
NM_001136131.2_ex7R	agcagagtcagtggcgagag	60	60	257
NM_001136131.2_ex8F	gtggactcgtgcatttcagc	61	55	192
NM_001136131.2_ex8R	gtgaaccaagcagcatcctc	60	55	192
NM_001136131.2_ex9F	tctcaaacctccttctcttc	53	45	205
NM_001136131.2_ex9R	cccaatatcgtagggctgaa	59	50	205
NM_001136131.2_ex10F	tcctagtgggaggtcaaa	54	50	331
NM_001136131.2_ex10R	ggtaggaaatgggttcaggt	58	50	331
NM_001136131.2_ex11F	tcagtccccatggacata	55	50	306
NM_001136131.2_ex11R	gtgctcaaggcatttctcct	59	50	306
NM_001136131.2_ex12F	tacgttcacatgaccggatg	60	50	355
NM_001136131.2_ex12R	cttgccatagggaaaacacc	59	50	355
NM_001136131.2_ex13F	aaccattcctacccccagac	60	55	205
NM_001136131.2_ex13R	ctgggggaaaatacatgtcc	60	50	205
NM_001136131.2_ex14F	tgctgctgctgctgttgt	60	55	359
NM_001136131.2_ex14R	ctctctctcttgcacacacg	59	55	359
NM_001136131.2_ex15F	ttctgtgtcccttgcttcct	60	50	105
NM_001136131.2_ex15R	cacaagtcaagcggttctga	60	50	105
NM_001136131.2_ex16F	gggtaggctttgtcttacagtg	58	50	228
NM_001136131.2_ex16R	ggcaagacaaacagtagtgg	56	55	228
NM_001136131.2_ex17F	caaccagttgggcagagaat	60	50	334
NM_001136131.2_ex17R	ccacttggaaacatgcagtc	60	50	334
NM_001136131.2_ex18F	agctctcctcttgtttttcagg	59	45	220
NM_001136131.2_ex18R	gggtttgtttcttcccacat	58	45	220

본 발명에서 디자인된 프라이머 (PINK1)

Primer ID	서열	Tm (oC)	GC (%)	길이 (bp)
NM_032409.2_ex1_1F	gctgctgctgcgcttcac	62	67	350
NM_032409.2_ex1_1R	ccccgctcacctggatct	60	67	350
NM_032409.2_ex1_2F	cagcggcagttcgtggtg	61	66	187
NM_032409.2_ex1_2R	ttagctccgtcctccgct	60	61	187
NM_032409.2_ex2F	tcccttttcttgggccttcc	61	55	367
NM_032409.2_ex2R	tgaaaggcctggtgcttacc	60	55	367
NM_032409.2_ex3F	cctgtgtaaccctgggttcc	60	60	164
NM_032409.2_ex3R	gtcagtctggcaggcagag	61	63	164
NM_032409.2_ex4F	tgtatctgatgctggcctca	58	50	270
NM_032409.2_ex4R	gatgtatcagctccaggccc	60	60	270
NM_032409.2_ex5F	agtcgtcgatgtgtggtagc	60	55	230
NM_032409.2_ex5R	atggtgcagcaggttcctac	60	55	230
NM_032409.2_ex6F	tggtcactttgcttgctcct	50	55	209
NM_032409.2_ex6R	cagtggacatgtgggggaag	60	50	209
NM_032409.2_ex7F	gtgatgtctcacccactgct	60	55	309
NM_032409.2_ex7R	gtttctacccacaccgtccc	59	60	309
NM_032409.2_ex8F	gcttcccttcctgttgcaga	60	55	384
NM_032409.2_ex8R	tctctgcgctgtcttgtctc	60	55	384

본 발명에서 디자인된 프라이머 (PARK7)

Primer ID	서열	Tm (oC)	GC (%)	길이 (bp)
NM_007262.4_ex1F	gggctgtccagctagaaact	59	55	316
NM_007262.4_ex1R	gtccagcacagggacacc	60	67	316
NM_007262.4_ex2F	ctctgcttgaaaatgctcct	57	45	375
NM_007262.4_ex2R	gcgttaaatgtgagcagtgg	59	50	375
NM_007262.4_ex3F	gagctggaggctgcagtaag	60	60	376
NM_007262.4_ex3R	ggggaagacattcaagcaaa	60	45	376
NM_007262.4_ex4F	acaccattccgtcatgtgg	60	53	348
NM_007262.4_ex4R	cctcctcccgaaatatttgaa	60	43	348
NM_007262.4_ex5F	atgagaaatgccttgcttgg	60	45	386
NM_007262.4_ex5R	agatgccctgcatgctttat	60	45	386
NM_007262.4_ex6F	tctacctaggcctccccaat	60	55	311
NM_007262.4_ex6R	tgcagtaagccaagatcacg	60	50	311
NM_007262.4_ex7F	tgcaggtcattacacctactctg	60	48	381
NM_007262.4_ex7R	gccctgtttattctgcaaac	57	45	381

본 발명에서 디자인된 프라이머 (PARK9 ( atp13a2 ))

Primer ID	서열	Tm (oC)	GC (%)	길이 (bp)
XM_005245809.1_ex1F	ggtgtgtgcggaggagca	62	64	333
XM_005245809.1_ex1R	gacccggactccgcactc	62	65	333
XM_005245809.1_ex2F	ctcccaaagtgctgggatta	60	50	372
XM_005245809.1_ex2R	tccatggactgccacagtag	60	55	372
XM_005245809.1_ex3F	aaagctgcagggggtgaat	62	53	388
XM_005245809.1_ex3R	gtcccatggaaagtcagtgg	60	55	388
XM_005245809.1_ex4F	ctcagctttcccatctgagc	60	55	325
XM_005245809.1_ex4R	gccagagtcagcctttatgg	60	55	325
XM_005245809.1_ex5F	tagggagggaagatggctct	60	55	332
XM_005245809.1_ex5R	tggatgtttgggacaacaga	60	45	332
XM_005245809.1_ex6F	tctgttgtcccaaacatcca	60	45	398
XM_005245809.1_ex6R	gtaacctgcccaaggtttca	60	50	398
XM_005245809.1_ex7F	ggaacccagtgagaggaaca	60	55	359
XM_005245809.1_ex7R	agagaaggcaggtgactgga	60	55	359
XM_005245809.1_ex8F	tccagtcacctgccttctct	60	55	316
XM_005245809.1_ex8R	ccactatggagaaggggaca	60	55	316
XM_005245809.1_ex9F	gatgggattgaccaggagaa	60	50	380
XM_005245809.1_ex9R	agagtctggctttgctgtgg	61	55	380
XM_005245809.1_ex10F	cctcatttcctccatctcca	60	50	330
XM_005245809.1_ex10R	cactggagtccacccactct	60	60	330
XM_005245809.1_ex11F	gggaggtgaggagctaggg	61	68	381
XM_005245809.1_ex11R	cagcctggacaacagagtga	60	55	381
XM_005245809.1_EX12F	aactcctggtttgctggtgg	60	55	253
XM_005245809.1_EX12R	gatctctctcaagcccagcc	59	50	253
XM_005245809.1_ex13F	ctccacactgctgatggcta	60	55	377
XM_005245809.1_ex13R	cggtttcggtagaggatgaa	60	50	377
XM_005245809.1_ex14F	cctctctgtcctgggtgagt	59	60	266
XM_005245809.1_ex14R	gagcccggattacaatctca	60	50	266
XM_005245809.1_ex15F	cctctaccgaaaccgggta	60	58	390
XM_005245809.1_ex15R	gtgggtgctgctgagagaat	60	55	390
XM_005245809.1_ex16F	agttcctggggttcccatag	60	55	398
XM_005245809.1_ex16R	aagatggagagggaagacagg	60	52	398
XM_005245809.1_ex17F	gctgggagatttggagtgac	60	55	390
XM_005245809.1_ex17R	ctcctgcagggttggagag	61	63	390
XM_005245809.1_ex18F	cagtgatgagacccccactt	60	55	390
XM_005245809.1_ex18R	gaggcaggtgtcacaaggag	61	60	390
XM_005245809.1_ex19F	ctctgcaaccccgagacag	62	63	388
XM_005245809.1_ex19R	acctggatcagaggtcatgc	60	55	388
XM_005245809.1_ex20F	cccacccactctgaggacta	60	60	353
XM_005245809.1_ex20R	aagatgccccaaaaaggaat	60	40	353
XM_005245809.1_ex21F	cagcctgttttcccatctgt	60	50	396
XM_005245809.1_ex21R	gtgtagcttgcagcctggtc	61	60	396
XM_005245809.1_ex22F	ccagctgtacctcacccagt	60	60	395
XM_005245809.1_ex22R	ccagctctgtcttctgctca	59	55	395
XM_005245809.1_ex23F	cccctgctctgtctccttc	60	63	321
XM_005245809.1_ex23R	catgaaagacctgggagagc	60	55	321
XM_005245809.1_ex24F	ggcccagctgtcatcatatt	60	50	363
XM_005245809.1_ex24R	gacgctgaacgaagtgtcaa	60	50	363
XM_005245809.1_ex25F	gcagaagcctcagtggtctc	60	60	358
XM_005245809.1_ex25R	gcccacgtcatctattctgg	60	55	358
XM_005245809.1_ex26F	tatcagactaggggctgcca	59	55	307
XM_005245809.1_ex26R	agtcagctccctactcacca	59	55	307
XM_005245809.1_ex27F	agctagggggctacttcctg	60	60	364
XM_005245809.1_ex27R	ggcacctctctcccatctg	61	63	364
XM_005245809.1_ex28F	gactacaagtcccggcagc	60	63	362
XM_005245809.1_ex28R	ctccaaggggtgacgacaac	60	60	362

본 발명에서 디자인된 프라이머 (SNCA)

Primer ID	서열	Tm (oC)	GC (%)	길이 (bp)
NM_001146055.1_ex1F	cctcacgccttgccttcaa	59	58	100
NM_001146055.1_ex1R	ggagtgggaggcaaaccc	60	67	100
NM_001146055.1_ex2F	tccccgaaagttctcattca	57	45	235
NM_001146055.1_ex2R	ccatcactcatgaacaagcacc	60	50	235
NM_001146055.1_ex3F	aggctagcttgagacttatg	52	45	150
NM_001146055.1_ex3R	atactgggccacactaatcac	57	48	150
NM_001146055.1_ex4F	agtcactgttattctaccaccc	57	46	210
NM_001146055.1_ex4R	tacacagccataccttgccc	60	55	210
NM_001146055.1_ex5F	ttcaagatccgtggccaaca	60	50	221
NM_001146055.1_ex5R	tcagcttggactcctacctca	60	52	221
NM_001146055.1_ex6F	cagtgtgtgctgtctttttg	56	45	101
NM_001146055.1_ex6R	agatctcaagaaactgggagca	59	45	101

본 발명에서 디자인된 프라이머 (LRRK2)

Primer ID	서열	Tm (oC)	GC (%)	길이 (bp)
NM_198578.3_ex1F	ttcctcataaacaggcgggc	60	55	311
NM_198578.3_ex1R	ggagtacgtgaacaccagca	60	55	311
NM_198578.3_ex2F	tccccacccacttgttttcc	60	55	172
NM_198578.3_ex2R	gccagtaaaacgtctccttcc	58	52	172
NM_198578.3_ex3F	cttgttttcaggtgggttggtc	60	50	201
NM_198578.3_ex3R	acacagtgtatcaagggaaggt	55	45	201
NM_198578.3_ex4F	acacatgagcttcactacaggg	60	50	340
NM_198578.3_ex4R	gctaccctaatcctgatcttca	56	46	340
NM_198578.3_ex5F	aaccatgggtctacaaacca	55	45	325
NM_198578.3_ex5R	ctgtgttctacttttcccag	54	45	325
NM_198578.3_ex6F	ttaagtctcagaggagcaactgac	60	49	255
NM_198578.3_ex6R	gggttgagcatccacaagtt	58	50	255
NM_198578.3_ex7F	gaaatgcagtcattatgctgcc	59	46	251
NM_198578.3_ex7R	tcacctaatgtaagcctatggagc	60	46	251
NM_198578.3_ex8F	cttccatggatgagaattcagc	58	46	180
NM_198578.3_ex8R	tagtgaagttacttactgaggagggc	61	46	180
NM_198578.3_ex9F	agcacacctcattctgttggt	60	48	264
NM_198578.3_ex9R	gagagtcctacctgcacgtg	59	60	264
NM_198578.3_ex10F	cgtggcatagaaagaacaagca	60	46	205
NM_198578.3_ex10R	actaactggccatcttcatctcc	60	47	205
NM_198578.3_ex11F	ctcttgtaagtggaggtggca	60	52	259
NM_198578.3_ex11R	tggcccactgcttaccattt	60	50	259
NM_198578.3_ex12F	gctttcctgtaaatttggac	53	40	283
NM_198578.3_ex12R	ttctacctggcccaatatga	56	45	283
NM_198578.3_ex13F	atattggttctgccctcctg	57	50	234
NM_198578.3_ex13R	ctatgtaacttaccaggcac	53	45	234
NM_198578.3_ex14F	gcatttaggcatgccagaaga	60	48	200
NM_198578.3_ex14R	actgaaaaagcgcccctagt	60	50	200
NM_198578.3_ex15F	agttcattggaaatcctggg	60	45	210
NM_198578.3_ex15R	tccagtcaccagctaatgcc	60	55	210
NM_198578.3_ex16F	ggcattagctggtgactgga	60	55	271
NM_198578.3_ex16R	gtgaaattcgcacaagttccca	60	46	271
NM_198578.3_ex17F	actttaaagcaccaaccca	56	42	280
NM_198578.3_ex17R	acactgtacctgttgatcct	56	45	280
NM_198578.3_ex18F	aggatcaacaggtacagtgt	60	45	325
NM_198578.3_ex18R	acaatggcagggctcttaca	59	50	325
NM_198578.3_ex19_1F	ttgccagtctcctaaaagga	56	45	209
NM_198578.3_ex19_1R	gccagcctccttaagagcaa	60	55	209
NM_198578.3_ex19_2F	gcgttgacgataagcattggg	60	52	280
NM_198578.3_ex19_2R	ggtccctcaaactggcatga	60	55	280
NM_198578.3_ex20F	tctccagaagcatagcaatacg	60	45	375
NM_198578.3_ex20R	ttaggtcaggtttttgtcttgg	58	41	375
NM_198578.3_ex21F	caaagggaatggactgtgaaa	60	43	364
NM_198578.3_ex21R	catcagggaaatccctacca	60	50	364
NM_198578.3_ex22F	tcatttgagcactgaactggag	60	45	362
NM_198578.3_ex22R	agatgaaactggcaccaagaa	60	43	362
NM_198578.3_ex23F	gggtcatcaaaacttcaatccc	58	46	395
NM_198578.3_ex23R	tgctcctgaacatcacacaga	60	48	395
NM_198578.3_ex24F	agttaccagaggtgtgtaaggc	59	50	390
NM_198578.3_ex24R	catcagcatatttaggcaaccc	61	46	390
NM_198578.3_ex25F	cctctttgatgctgttctttga	59	41	337
NM_198578.3_ex25R	aaatccacaactaaagggtcca	60	41	337
NM_198578.3_ex26F	gtgacacactattggtagctgt	52	46	237
NM_198578.3_ex26R	ggttctgttccagctaatgtgc	52	50	237
NM_198578.3_ex27F	acactttattctcaccctgggg	59	50	304
NM_198578.3_ex27R	gtggcaataatcgtcttacctc	59	46	304
NM_198578.3_ex28F	cttccttcccaccaacaggt	59	55	300
NM_198578.3_ex28R	tgtccatcaaagtcacagagag	59	46	300
NM_198578.3_ex29F	actaggtttcttcaacagcg	58	45	290
NM_198578.3_ex29R	ccctgttccaaacaaatggt	57	45	290
NM_198578.3_ex30F	ggctgtgccttataaccgaa	60	50	240
NM_198578.3_ex30R	acacgcacacagacacatga	60	50	240
NM_198578.3_ex31F	gtgaatgtcacggaaagcaa	59	45	325
NM_198578.3_ex31R	cagcctaccatgttaccttgaa	59	45	325
NM_198578.3_ex32F	actgttagcactgaatttgc	53	40	397
NM_198578.3_ex32R	gaaccgtatggatattctctca	56	41	397
NM_198578.3_ex33F	gaccataggatgcacagcttc	59	52	306
NM_198578.3_ex33R	gcgccatctgttctatgctt	60	60	306
NM_198578.3_ex34F	ggtactgtgttgcacttgaa	55	45	333
NM_198578.3_ex34R	ggttttctttacctgcttgg	57	45	333
NM_198578.3_ex35F	gctcaacaaggttgggtgtt	61	50	298
NM_198578.3_ex35R	tgccatctccctaatttctc	60	45	298
NM_198578.3_ex36F	caatcacttgtgttgtgtgcag	60	46	327
NM_198578.3_ex36R	aacctcatactgtcgcaaagc	59	48	327
NM_198578.3_ex37F	aagctttgcgacagtatgagg	59	48	261
NM_198578.3_ex37R	caaaacataccttcctctgc	59	45	261
NM_198578.3_ex38F	tggttagaaagggagggatt	58	45	275
NM_198578.3_ex38R	ttacctaggagaaactctgg	52	45	275
NM_198578.3_ex39F	attcaatgaaacaagtaggtcagg	60	40	380
NM_198578.3_ex39R	ccacaacgaaaagacaaactagg	60	43	380
NM_198578.3_ex40F	catgttcagcctgttgatgc	60	50	385
NM_198578.3_ex40R	tgttactggggcacagtgtt	59	50	385
NM_198578.3_ex41F	tgcattttctggcagatacc	60	45	233
NM_198578.3_ex41R	gaggtcagtggttatccatcct	59	50	233
NM_198578.3_ex42F	gagccctgatgttggtcata	58	50	239
NM_198578.3_ex42R	tgtagagaaaacagaacttaccag	55	38	239
NM_198578.3_ex43F	ctttgcaatgtctggacctttt	59	41	200
NM_198578.3_ex43R	aatacctgggcagaagtaggc	60	52	200
NM_198578.3_ex44F	tggtgatctagttgggttcca	60	48	349
NM_198578.3_ex44R	gagcatttggatttacctcaga	60	41	349
NM_198578.3_ex45F	caggaagttgctgatagtagaa	54	49	236
NM_198578.3_ex45R	gatctgtaatttccccattg	54	40	236
NM_198578.3_ex46F	gggaagagtctgggaaaagg	60	55	351
NM_198578.3_ex46R	atcccataagaggggtgtga	59	50	351
NM_198578.3_ex47F	ggcaaagcttaaaggagctg	59	50	372
NM_198578.3_ex47R	acccttctgctttctggaat	57	45	372
NM_198578.3_ex48F	ctctgtaggttttcttatgcagctt	60	40	256
NM_198578.3_ex48R	ttcagaggcagaaaggaagaa	60	43	256
NM_198578.3_ex49F	tttatggttctagggaggtaatgg	60	42	241
NM_198578.3_ex49R	ctaaaggaaagaaacttgcctagc	60	42	241
NM_198578.3_ex50_1F	tctagagatacaatcttgcttgacc	59	40	255
NM_198578.3_ex50_1R	aacattccttcatacacacgag	60	41	255
NM_198578.3_ex50_2F	agctcgtgtgtatgaaggaatg	56	46	282
NM_198578.3_ex50_2R	tcgacaagcaatagtcctgtctt	60	44	282
NM_198578.3_ex51_1F	tctagagatacaatcttgcttgacc	59	40	255
NM_198578.3_ex51_1R	aacattccttcatacacacgag	58	40	255
NM_198578.3_ex51_2F	tagctcgtgtgtatgaaggaatg	59	43	370
NM_198578.3_ex51_2R	gtgcatttcgatgcaatct	57	42	370

본 발명에서 디자인된 프라이머 (TDP-43)

Primer ID	서열	Tm (oC)	GC (%)	길이 (bp)
XM_005263435.1_ex1F	ccgaaaccatctgctacgtt	60	50	329
XM_005263435.1_ex1R	gaagcccgacagggacac	61	67	329
XM_005263435.1_ex2F	tcagaactctgacatggtttgg	60	46	389
XM_005263435.1_ex2R	cacctgaacacacttcagca	59	50	389
XM_005263435.1_ex3F	tttgggaatggagtgtgtga	61	45	223
XM_005263435.1_ex3R	ccaaagcacagacgcaagta	61	55	223
XM_005263435.1_ex4F	cagcaaagccaagatgagc	59	52	251
XM_005263435.1_ex4R	ctcggcctccaaagtgct	60	61	251
XM_005263435.1_ex5_1F	gattgcgcagtctctttgtg	59	50	383
XM_005263435.1_ex5_1R	cctggtttggctccctct	60	61	383
XM_005263435.1_ex5_2F	ggccttcggttctggaaata	61	52	397
XM_005263435.1_ex5_2R	caggcaaacagcagttca	57	55	397
XM_005263435.1_ex5_3F	ggtaaaccaacacactacaa	51	40	389
XM_005263435.1_ex5_3R	cttgaatgagaaagcatgtagacag	59	40	389
XM_005263435.1_ex5_4F	atcacaggccgcgtcttt	61	57	350
XM_005263435.1_ex5_4R	tccaacagatgtggatgtcct	60	48	350
XM_005263435.1_ex5_5F	cccctacccctttgtcaact	60	55	392
XM_005263435.1_ex5_5R	gttccatctcaaaagggtca	57	45	392
XM_005263435.1_ex5_6F	tgacccttttgagatggaac	57	45	371
XM_005263435.1_ex5_6R	atcaacattttgcccactcc	59	45	371
XM_005263435.1_ex5_7F	aagggaatatcagcaccttcc	59	47	203
XM_005263435.1_ex5_7R	gttaccacattcccccacct	60	55	203

본 발명에서 디자인된 프라이머 (SIGMAR1)

Primer ID	서열	Tm (oC)	GC (%)	길이 (bp)
XM_005251339.1_ex1F	ccgattggtcagggcgag	59	68	264
XM_005251339.1_ex1R	atctcttcgcgctggaagac	59	55	264
XM_005251339.1_ex2F	ggtgccagccctgactcc	62	72	286
XM_005251339.1_ex2R	ctttacaaccccagcctccc	60	60	286
XM_005251339.1_ex3F	tgtgcgattgtcactcaggg	59	55	152
XM_005251339.1_ex3R	cgtgaagggacccacttctc	60	60	152
XM_005251339.1_ex4_1F	aggggagacggtagtacacg	60	60	400
XM_005251339.1_ex4_1R	ccatgggtctctgtgtttgga	61	53	400
XM_005251339.1_ex4_2F	tgcagatcctgagttcctgc	60	55	399
XM_005251339.1_ex4_2R	aagggcatcatagctgcagg	60	55	399
XM_005251339.1_ex4_3F	cctgcagctatgatgccctt	60	55	373
XM_005251339.1_ex4_3R	aggggctgtgtgaaaactgt	60	50	373

본 발명에서 디자인된 프라이머 (FUS)

Primer ID	서열	Tm (oC)	GC (%)	길이 (bp)
NM_004960.3_ex1F	acttaagcttcgacgcagga	60	50	200
NM_004960.3_ex1R	cccggtcccactgaaaac	61	61	200
NM_004960.3_ex2F	ggcctacgtggtccttttta	60	50	200
NM_004960.3_ex2R	cagaaaacatggcgtgacc	60	52	200
NM_004960.3_ex3F	ctgatcacgctggttttcct	60	50	200
NM_004960.3_ex3R	cccgctgagaaagactcact	60	55	200
NM_004960.3_ex4F	ctctttcctggtggcttttg	61	55	233
NM_004960.3_ex4R	acccctcttttcaagccttc	60	55	233
NM_004960.3_ex5F	ggctatgctgggattgtgat	60	50	261
NM_004960.3_ex5R	gctgcagacaaagctgaaga	60	50	261
NM_004960.3_ex6F	cctggcacttgtcaaacctt	60	50	344
NM_004960.3_ex6R	atgagacacctaccccatgc	60	55	344
NM_004960.3_ex7F	ctacccatgtttggggaatg	60	50	179
NM_004960.3_ex7R	gacaaagcattgctgggagt	60	45	179
NM_004960.3_ex8F	cggctcatcttttccttg	56	50	151
NM_004960.3_ex8R	tccaggcagtcttgataccac	60	52	151
NM_004960.3_ex9F	ctgttcaacaagcagaacagga	60	46	170
NM_004960.3_ex9R	tccacaagcctacaacactga	59	47	170
NM_004960.3_ex10F	tggaaagggagtactgtagcc	60	52	210
NM_004960.3_ex10R	tctgccagccttctcataca	60	50	210
NM_004960.3_ex11F	agaaaggcacgcttctcttg	60	50	218
NM_004960.3_ex11R	cattacccctctgcaccact	60	55	218
NM_004960.3_ex12F	caaacttggagagggagcag	60	55	214
NM_004960.3_ex12R	gcacgcatgcaagagaacta	60	50	214
NM_004960.3_ex13F	aggtcttgcctattccccatc	60	52	200
NM_004960.3_ex13R	ggattctttggtcccagctc	60	55	200
NM_004960.3_ex14F	ctcggggaacataggggaat	62	55	252
NM_004960.3_ex14R	atggcctctgttcaactgct	60	50	252
NM_004960.3_ex15F	cttggagaggctggtaactca	60	52	159
NM_004960.3_ex15R	cgagggtaacactgggtacag	62	57	`159

본 발명에서 디자인된 프라이머 (GRN)

Primer ID	서열	Tm (oC)	GC (%)	길이 (bp)
NM_002087.2_ex1F	ggccaatggaaactgaggta	60	50	133
NM_002087.2_ex1R	gagcaggcgagaggtctg	60	67	133
NM_002087.2_ex2F	ggcttaagcagttgccagac	60	55	242
NM_002087.2_ex2R	gatgaccctttgggaaaacc	60	50	242
NM_002087.2_ex3F	ccaggcacaagtctgtggtt	61	55	208
NM_002087.2_ex3R	cagacctaagcccctccact	60	60	208
NM_002087.2_ex4F	gccaatgcaggtttctctgt	60	50	172
NM_002087.2_ex4R	ggttccagactccacatgct	60	55	172
NM_002087.2_ex5F	ggagtcaccttccctgagtg	60	60	200
NM_002087.2_ex5R	cctccacatacccccatct	60	57	200
NM_002087.2_ex6F	ggggtgaagacggagtcag	60	63	201
NM_002087.2_ex6R	ccctggcctgatgctctc	60	67	201
NM_002087.2_ex7F	ctcacgtttgctcctcttcc	60	55	150
NM_002087.2_ex7R	ctccagcccctcactcac	60	67	150
NM_002087.2_ex8F	gcctggaagtgacaaagacc	60	55	225
NM_002087.2_ex8R	caggcctaaaagggaggaaa	60	50	225
NM_002087.2_ex9F	cctctctgcttccctcacag	60	60	160
NM_002087.2_ex9R	gcctgccacactgtgctc	61	67	160
NM_002087.2_ex10F	cacctgcccttcttcatctg	60	55	292
NM_002087.2_ex10R	tgctgtcccctcccatatac	60	55	292
NM_002087.2_ex11F	ggctacctacaacgcccttt	60	55	315
NM_002087.2_ex11R	ctgggcttagctcccctatc	60	60	315
NM_002087.2_ex12F	cagtgaggggacaggaacat	60	55	318
NM_002087.2_ex12R	catacccagccccaggat	60	61	318
NM_002087.2_ex13F	cacctcgtccaaccctctc	61	63	279
NM_002087.2_ex13R	ggtccagggagaatttggtt	60	50	279

본 발명에서 디자인된 프라이머 (MAPT)

Primer ID	서열	Tm (oC)	GC (%)	길이 (bp)
NM_001203251.1_ex1F	actagtggccggaggagaag	61	60	306
NM_001203251.1_ex1R	gacggcgaggcagatttc	61	61	306
NM_001203251.1_ex2F	ccccaacactcctcagaact	60	55	212
NM_001203251.1_ex2R	gcatggctgtccactaacct	60	55	212
NM_001203251.1_ex3F	cgttctgagggctcactgta	60	55	177
NM_001203251.1_ex3R	ctcaaagcacggctaagcac	61	55	177
NM_001203251.1_ex4F	ggtgaggggctgggtatg	61	66	180
NM_001203251.1_ex4R	gactgcctgggggtctct	60	66	180
NM_001203251.1_ex5F	ccccttcatttgctgacac	60	52	126
NM_001203251.1_ex5R	caagtcatggcaggcaattc	55	50	126
NM_001203251.1_ex6F_1	acagagcctgaaagtggtaagg	60	50	400
NM_001203251.1_ex6R_1	ggatgctggtggcttctct	60	57	400
NM_001203251.1_ex6F_2	cagagaagccaccagcatc	60	57	400
NM_001203251.1_ex6R_2	gcgaagaagctcaagacaca	59	50	400
NM_001203251.1_ex7F	caaacatggacctatcccagag	60	50	200
NM_001203251.1_ex7R	aacttgaccagctgcagagc	60	55	200
NM_001203251.1_ex8F	cagtttgtttccctcctcca	60	50	300
NM_001203251.1_ex8R	gcagagcagcctggttctt	60	57	300
NM_001203251.1_ex9F	ggtggcagtaacttttcc	53	50	231
NM_001203251.1_ex9R	tctgagagcttcagcttcctct	60	50	231
NM_001203251.1_ex10F	ctcgagtcctggcttcactc	60	60	363
NM_001203251.1_ex10R	acagccctacccctccag	60	67	363
NM_001203251.1_ex11F	cgcatgtcactcatcgaaag	60	50	253
NM_001203251.1_ex11R	cgcactcacaccacttccta	60	55	253
NM_001203251.1_ex12F	ttcctctctctctgcctttcc	60	52	161
NM_001203251.1_ex12R	gtcccaaccctcaccttcc	60	53	161
NM_001203251.1_ex13F	ccacagaagatgatggcaag	60	50	202
NM_001203251.1_ex13R	catatacccaagggcagcat	60	50	202
NM_001203251.1_ex14F	ctcaccctccctcccttc	60	66	300
NM_001203251.1_ex14R	ccacactctctcattctctcctc	60	55	300

본 발명에서 디자인된 프라이머 (ALS2)

Primer ID	서열	Tm (oC)	GC (%)	길이 (bp)
NM_020919.3_ex1F	ggtagctaggcttggacgac	60	60	390
NM_020919.3_ex1R	ttagccaatagccaacccgg	61	55	390
NM_020919.3_ex2F	gcacttgttagagggctgct	59	55	217
NM_020919.3_ex2R	tgctatgttttcctaggagg	60	45	217
NM_020919.3_ex3F	gatgttttagctcaacagaggcag	60	46	220
NM_020919.3_ex3R	ctcaggcatttgttagcattgc	60	46	220
NM_020919.3_ex4_1F	accttcagatggtgaggtct	60	50	397
NM_020919.3_ex4_1R	tgggaaggcagtggtaatgag	59	52	397
NM_020919.3_ex4_2F	cattaccactgccttcccagt	60	52	400
NM_020919.3_ex4_2R	gctgcttgtgatctgagcac	60	55	400
NM_020919.3_ex4_3F	gtgctcagatcacaagcagc	60	55	281
NM_020919.3_ex4_3R	gctaccaagccttactca	54	50	281
NM_020919.3_ex5_1F	gcgatggatattagcctttc	54	45	284
NM_020919.3_ex5_1R	ctgcctgagctccagtttca	60	55	284
NM_020919.3_ex5_2F	atgaagctggtgccttgtca	60	50	305
NM_020919.3_ex5_2R	atgcgatgtcaggagcatcc	60	55	305
NM_020919.3_ex6F	cttcaccccacgtctggttg	60	60	221
NM_020919.3_ex6R	tcggtaaatgttggtagcgct	60	48	221
NM_020919.3_ex7F	tgactttgtgtgcctgtgtg	59	50	180
NM_020919.3_ex7R	tgttggccttccatgaaaat	60	40	180
NM_020919.3_ex8F	cgcttagctacttttctgtg	55	46	220
NM_020919.3_ex8R	taggttgtacgtatgaaattcccccg	62	46	220
NM_020919.3_ex9F	ctgtcgttgcagataagcagtg	60	50	228
NM_020919.3_ex9R	gaatgtgggccttaggatcca	60	52	228
NM_020919.3_ex10F	gccagcttcagtatacca	54	50	276
NM_020919.3_ex10R	taatggtgggagagaggggg	60	50	276
NM_020919.3_ex11F	ccttagttgagagcacatggc	60	53	333
NM_020919.3_ex11R	tgaacatgacacgggactgg	60	55	333
NM_020919.3_ex12F	ccaggtatgtgtttggaaactg	60	46	182
NM_020919.3_ex12R	tggcggagagaatgataactgg	60	50	182
NM_020919.3_ex13F	tcctctgcctctagtgatttcc	60	50	203
NM_020919.3_ex13R	ccaaagaggtatacatgggagc	60	50	203
NM_020919.3_ex14F	aggcagactgaggctacaga	60	55	257
NM_020919.3_ex14R	tggttgctgtttgctagggt	60	50	257
NM_020919.3_ex15F	tccaggattccttgagga	60	50	154
NM_020919.3_ex15R	aggttaggaatccagcctacct	59	50	154
NM_020919.3_ex16F	aagtgcctccgtgttctctg	60	55	135
NM_020919.3_ex16R	cttggacggggtggggtg	60	72	135
NM_020919.3_ex17F	gcccaaaaccaagcaagcat	60	50	245
NM_020919.3_ex17R	ccagggcgaagattgaagga	59	55	245
NM_020919.3_ex18F	tgctcctagacaaagtggct	60	50	250
NM_020919.3_ex18R	tcatcctcaccccaggcata	60	55	250
NM_020919.3_ex19F	tggggtgaggatgatcatca	60	50	207
NM_020919.3_ex19R	acgaccttaccgaacttg	60	50	207
NM_020919.3_ex20F	tcatggcaggtatggaga	54	50	140
NM_020919.3_ex20R	aaacaccagtccaacagcct	60	50	140
NM_020919.3_ex21F	ccattctttccaaccacagc	57	50	212
NM_020919.3_ex21R	ctgtgggaatagaaggag	51	50	212
NM_020919.3_ex22F	ttatttctgtgcaggggg	54	50	274
NM_020919.3_ex22R	cgcagtcatatccccaaagc	60	55	274
NM_020919.3_ex23F	cttcttgtagggaaatgggg	55	50	203
NM_020919.3_ex23R	aacgtgcacttgaaaggggt	60	50	203
NM_020919.3_ex24F	ctctgactttacctaggg	50	50	324
NM_020919.3_ex24R	gcactccagcctggtgac	60	57	324
NM_020919.3_ex25F	gcaggaagctaggaaacctgg	60	57	252
NM_020919.3_ex25R	tgtggtgagccttgactact	57	50	252
NM_020919.3_ex26F	ggatgctccactttgactgga	60	52	307
NM_020919.3_ex26R	gctgtgagtctatctgaatg	53	45	307
NM_020919.3_ex27F	tcctactcaggcctgtgaca	60	55	206
NM_020919.3_ex27R	ttccatagcccgcagacttt	60	50	206
NM_020919.3_ex28F	ccccctagaggtataattgt	53	45	171
NM_020919.3_ex28R	ccctggctctggtgattcag	60	60	171
NM_020919.3_ex29F	gctccttttctcccactcca	60	55	241
NM_020919.3_ex29R	ccatttggttgcgcttgt	59	50	241
NM_020919.3_ex30F	tctctggggcaggattagga	59	55	300
NM_020919.3_ex30R	tgaggaacaactggcttatcct	60	46	300
NM_020919.3_ex31F	tcctccttgaccttcactctct	59	50	197
NM_020919.3_ex31R	tggggatgcttaaggcttagg	60	52	197
NM_020919.3_ex32F	agtgtccgggttaaggcatg	60	55	275
NM_020919.3_ex32R	aaaacagttacctggcccgt	60	50	275
NM_020919.3_ex33F	tctctggggcaggattagga	60	55	300
NM_020919.3_ex33R	tgaggaacaactggcttatcct	59	46	300
NM_020919.3_ex34_1F	gaacttttcttccaggcatg	60	45	373
NM_020919.3_ex34_1R	gctgacataccctttactgtagga	59	46	373
NM_020919.3_ex34_2F	atcccttcctacagtaaagggt	60	46	370
NM_020919.3_ex34_2R	gaggcagaagactcctatttgga	60	48	370
NM_020919.3_ex34_3F	aggagtcttctgcctcttaact	58	46	390
NM_020919.3_ex34_3R	ccaacaacttacaatagggc	54	45	390

본 발명에서 디자인된 프라이머 (CSF1R)

Primer ID	서열	Tm (oC)	GC (%)	길이 (bp)
NM_005211.3_ex1F	cagctgctagagcccagatt	60	55	192
NM_005211.3_ex1R	ctattccctcccctgtcctt	60	55	192
NM_005211.3_ex2F	aaactctgtggttgccttgc	60	50	313
NM_005211.3_ex2R	tcacaggggtcttctccatc	60	55	313
NM_005211.3_ex3F	gcgcatcctagacctcactt	61	55	331
NM_005211.3_ex3R	cttgggaggaggctcagac	60	63	331
NM_005211.3_ex4F	agggcagttgtaaccctgtg	59	55	371
NM_005211.3_ex4R	ctctgtccccactcttcagg	60	60	371
NM_005211.3_ex5F	ctgggtgttcaggggtctct	61	60	190
NM_005211.3_ex5R	tgtgatctgcagggactgac	60	55	190
NM_005211.3_ex6F	ctcgcaatccctcaacaatc	60	50	200
NM_005211.3_ex6R	aggatccctaccgactgtcc	60	60	200
NM_005211.3_ex7F	cccactaatgccagatgctt	60	50	283
NM_005211.3_ex7R	gcataccccatctggttgtc	60	55	283
NM_005211.3_ex8F	catactaggctggggctcac	60	60	222
NM_005211.3_ex8R	ccatccctccaggcagtc	60	66	222
NM_005211.3_ex9F	ctgggagattgggaggtg	60	61	199
NM_005211.3_ex9R	tgagtggagcccacttacct	60	55	199
NM_005211.3_ex10F	ctgaagctctgagccacattc	60	52	240
NM_005211.3_ex10R	gaaggctccctctcacctg	60	63	240
NM_005211.3_ex11F	ctcactgctttgcttcatgc	60	50	199
NM_005211.3_ex11R	accatccaaatctggctcac	60	50	199
NM_005211.3_ex12F	acgtgctcccttcctcttct	60	55	194
NM_005211.3_ex12R	gccctgtgataggaagctgt	61	55	194
NM_005211.3_ex13F	gggacttaagggacctgtgtg	60	57	189
NM_005211.3_ex13R	cacccccagcatctaccac	60	63	189
NM_005211.3_ex14F	cctgtctttgggactgtggt	60	55	200
NM_005211.3_ex14R	ccctgagattccccagagg	61	63	200
NM_005211.3_ex15F	cacacccttggctgctcta	60	57	221
NM_005211.3_ex15R	cagacctggcctttttcttg	60	50	221
NM_005211.3_ex16F	tgagcagtgcagtgatgatg	60	50	203
NM_005211.3_ex16R	cccttctccttttcccttgt	60	50	203
NM_005211.3_ex17F	gtgaggggtggggagtgt	60	66	170
NM_005211.3_ex17R	agggccaggttcctactcac	60	60	170
NM_005211.3_ex18F	ggtaggagaaggcccaagac	60	60	183
NM_005211.3_ex18R	ccctcccagcacttacattg	60	55	183
NM_005211.3_ex19F	gcccaaaataactggggact	60	50	201
NM_005211.3_ex19R	agtggggcaaccagaggag	62	63	201
NM_005211.3_ex20F	gggaatggggagaagacaat	60	50	172
NM_005211.3_ex20R	gggatcccttcgcttacata	60	50	172
NM_005211.3_ex21F	tgggcatcctctgtcctatc	60	55	185
NM_005211.3_ex21R	cagcccaacgtgctttacc	61	58	185
NM_005211.3_ex22F	gcctgatggatctggactga	59	55	244
NM_005211.3_ex22R	agtttgtgggaggggagagt	60	55	244

본 발명에서 디자인된 프라이머 (NOTCH3)

Primer ID	서열	Tm (oC)	GC (%)	길이 (bp)
NM_000435.2_ex1F	cagggaaggagggaggag	59	66	222
NM_000435.2_ex1R	cttgggggttcttgcactc	60	57	222
NM_000435.2_ex2F	tccttcacccccacacag	60	61	116
NM_000435.2_ex2R	ctctgagccaggcactcac	60	63	116
NM_000435.2_ex3F	cccaaccaagccatctctg	60	57	203
NM_000435.2_ex3R	cgactacctcccctccagac	60	65	203
NM_000435.2_ex4F	tcctaaactcaccctgtcctg	60	52	381
NM_000435.2_ex4R	ggctcactcaccaggaagac	59	60	381
NM_000435.2_ex5F	agccctactcaggagagtcaga	60	55	288
NM_000435.2_ex5R	acacagatgcagcagtccag	60	55	288
NM_000435.2_ex6F	ctggactgctgcatctgtgt	61	55	281
NM_000435.2_ex6R	cagagaaaacggccactcac	60	55	281
NM_000435.2_ex7F	ctgcctatgacttctgcttacc	58	50	239
NM_000435.2_ex7R	cctcctctcccctctttcc	60	63	239
NM_000435.2_ex8F	acaccgatcgcactccat	60	56	220
NM_000435.2_ex8R	accacccacctgccatac	60	61	220
NM_000435.2_ex9F	gtagcccccgctttccta	60	61	185
NM_000435.2_ex9R	gtcttttcgggctccctct	59	57	185
NM_000435.2_ex10F	ctttctgggcctctgctcat	60	55	181
NM_000435.2_ex10R	tcttgtcggactgtcattgg	60	60	181
NM_000435.2_ex11F	gagctgaaccaggattggtc	60	55	358
NM_000435.2_ex11R	cctccaggtgtgctgtttct	60	55	358
NM_000435.2_ex12F	gccactccatgccatgtt	60	56	180
NM_000435.2_ex12R	cgatctaaggaccccctctc	60	60	180
NM_000435.2_ex13F	ccagggcccctttgtaac	60	61	234
NM_000435.2_ex13R	agagggggcagtgtctgag	60	63	234
NM_000435.2_ex14F	acctccctggcctgactac	61	63	209
NM_000435.2_ex14R	tgcagagggaaggtgaggta	60	55	209
NM_000435.2_ex15F	ctctcttccacccccaacag	60	60	170
NM_000435.2_ex15R	atggagaggaggagggaaga	60	55	170
NM_000435.2_ex16F	tgtaaccttgctccctaccc	60	55	229
NM_000435.2_ex16R	atgactgtgttccccagagc	60	55	229
NM_000435.2_ex17F	ggcaaggtaggtgaccagac	60	60	300
NM_000435.2_ex17R	gagtccctgctctccaagc	60	63	300
NM_000435.2_ex18F	ctccagctcctgcttcaatg	60	55	225
NM_000435.2_ex18R	ccagtaactccacccacctg	60	60	225
NM_000435.2_ex19F	cccaccccacagtactgact	60	60	201
NM_000435.2_ex19R	atgctcccactcaccgatct	62	55	201
NM_000435.2_ex20F	tcctgtgccactctcctctt	60	55	220
NM_000435.2_ex20R	gcccccttacctcacacat	60	59	220
NM_000435.2_ex21F	agtgggtccctctcttaccc	60	60	170
NM_000435.2_ex21R	ctggcatacccagcgttc	60	61	170
NM_000435.2_ex22F	ctcttgaccacccctcgtt	60	58	300
NM_000435.2_ex22R	gccaacgcttacctgagaag	61	55	300
NM_000435.2_ex23F	ccccattgtggctgatctac	60	55	195
NM_000435.2_ex23R	cccctactcctcctccaaag	60	60	195
NM_000435.2_ex24_1F	cttctcctccttccctccac	60	60	200
NM_000435.2_ex24_1R	caggagggtcccgacaac	61	66	200
NM_000435.2_ex24_2F	gttgtcgggaccctcctg	61	66	371
NM_000435.2_ex24_2R	agcggctgttgttgaagag	59	53	371
NM_000435.2_ex25F	agcccggtgtacgagaagta	60	55	344
NM_000435.2_ex25R	gtcactcacccgatcacctc	60	60	344
NM_000435.2_ex26F	gagacctgtgggtggagatg	61	60	396
NM_000435.2_ex26R	ccctaagagcaggaagcaga	60	55	396
NM_000435.2_ex27F	ccctctgcttcctgctctta	61	55	257
NM_000435.2_ex27R	gcagggttctcacttcatgc	60	55	257
NM_000435.2_ex28F	acatcccctcttcccattgt	60	55	150
NM_000435.2_ex28R	gtcagaggagggggcaaag	60	63	150
NM_000435.2_ex29F	cctgcccctccaggtaga	61	66	195
NM_000435.2_ex29R	gaggggcactgtcactaacc	60	60	195
NM_000435.2_ex30F	ttcctgctgacacactcctg	60	55	369
NM_000435.2_ex30R	ccagctctgaggtccaaagt	59	55	369
NM_000435.2_ex31F	tgctgcatccactctctgtc	60	55	214
NM_000435.2_ex31R	tgacaccaacccagcttaga	60	50	214
NM_000435.2_ex32F	gacctctctccccttcatcc	60	60	160
NM_000435.2_ex32R	actgctgacacccagtggac	60	60	160
NM_000435.2_ex33_1F	ctgacctctgtgggttctgg	60	60	311
NM_000435.2_ex33_1R	gcctcctgctcttcttggac	61	60	311
NM_000435.2_ex33_2F	gggtccaagaagagcaggag	59	60	327
NM_000435.2_ex33_2R	agccacagggttcagcag	61	60	327

본 발명에서 디자인된 프라이머 (PRNP)

Primer ID	서열	Tm (oC)	GC (%)	길이 (bp)
NM_001271561.1_ex1F	cctgtcctccgagccagt	61	67	75
NM_001271561.1_ex1R	gtttacctgcctcggtcgtg	62	60	75
NM_001080121.1_ex2_1F	agcagtcattatggcgaacc	60	50	300
NM_001080121.1_ex2_1R	ctgtgggtgccacctcct	62	67	300
NM_001080121.1_ex2_2F	gaggtggcacccacagtc	61	67	352
NM_001080121.1_ex2_2R	acgcgctccatcatcttaac	60	50	352
NM_001080121.1_ex2_3F	ccgagaccgacgttaagatg	60	55	221
NM_001080121.1_ex2_3R	cctccctcaagctggaaaa	60	52	221

이상으로 본 발명의 특정한 부분을 상세히 기술하였는바, 당업계의 통상의 지식을 가진 자에게 있어서 이러한 구체적인 기술은 단지 바람직한 구현 예일 뿐이며, 이에 본 발명의 범위가 제한되는 것이 아닌 점은 명백하다. 따라서, 본 발명의 실질적인 범위는 첨부된 청구항과 그의 등가물에 의하여 정의된다고 할 것이다.

Claims (12)

1. 진단하고자 하는 개체로부터 분리된 생물학적 시료의 유전자 엑손(exon) 부위 돌연변이를 분석하는 단계를 포함하며, 상기 유전자 돌연변이는 하기 표 34의 돌연변이이고 각 유전자 당 적어도 하나의 돌연변이를 분석하는 것인 알츠하이머 진단을 위한 정보제공방법:
   [표 34]
   

   

   
   
2. 제 1 항에 있어서, 상기 정보제공방법은 하기 표 35의 돌연변이 중 선택되는 1 이상의 유전자 돌연변이를 추가적으로 분석하는 단계를 포함하는 것인 정보제공방법:
   [표 35]
   

   

   
   
3. 제 1 항에 있어서, 상기 생물학적 시료는 혈액, 정액, 질 세포, 모발, 타액, 소변, 구강세포, 태반세포 또는 태아세포를 포함하는 양수 및 이의 혼합물로 구성된 군에서 선택되는 시료로부터 분리된 DNA 시료인 것을 특징으로 하는 정보제공방법.
   
4. 제 1 항에 있어서, 상기 돌연변이 분석은 상기 유전자에 상보적으로 결합하는 각각의 프라이머를 이용하여 유전자를 증폭하고, 상기 증폭산물의 시퀀싱(sequencing) 데이터를 이용하여 유전자 돌연변이를 분석하는 것을 특징으로 하는 정보제공방법.
   
5. 제 4 항에 있어서, 상기 시퀀싱은 NGS (next generation sequencing) 방법인 것을 특징으로 하는 정보제공방법.
   
6. 제 4 항에 있어서, 상기 유전자 증폭은 각 유전자에 대한 프라이머 세트를 1세트 이상 사용하는 것을 특징으로 하는 정보제공방법.
   
7. 제 4 항에 있어서, 상기 유전자 증폭은 Emulsion PCR, Polony PCR, Bridge PCR 증폭 또는 멀티플렉스 PCR(Polymerase Chain Reaction) 증폭인 것을 특징으로 하는 정보제공방법.
   
8. 제 1 항 또는 제 2 항에 있어서, 상기 정보제공방법은 PSEN2 (presenilin 2), CR1 (complement receptor 1), DNMBP (Dynamin binding protein), CD33 (sialic acid binding Ig-like lectin 3), MAPT (microtubule associated Tau protein), PARK7 (Parkinson disease protein 7), SNCA (Alpha synuclein), BIN1 (Bridging integrator 1), TREM2 (triggering receptor expressed on myeloid cells 2), BACE1 (Beta-secretase 1), PICALM (Phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein), TDP43 (TAR-DNA binding protein-43), 및 SIGMAR1 (sigma non-opioid intracellular receptor 1)으로 구성된 군에서 선택되는 1 이상 유전자의 엑손(exon) 부위 돌연변이를 추가적으로 분석하는 단계를 포함하는 정보제공방법.
   
9. APP (amyloid precursor protein), PSEN1 (presenilin 1), CLU (clusterin), SORL1 (sortilin-related receptor 1), LRP6 (low-density lipoprotein receptor-related protein 6), ADAM10 (Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 10), ABCA7 (ATP-binding cassette transporter A7), LRRK2 (Leucine-rich repeat kinase 2), GRN(PGRN) (progranulin), 및 PRNP (prion protein gene) 유전자의 엑손(exon) 부위에 상보적으로 결합하는 각각의 프라이머를 이용하여, 하기 표 36의 유전자 돌연변이 중에서 각 유전자 당 적어도 하나의 돌연변이를 분석하는 것인 알츠하이머 진단 또는 예후 분석용 키트:
   [표 36]
   

   

   
   
10. 삭제
11. 삭제
12. 삭제

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