KR101238196B1 - 대장암의 간 전이 진단용 조성물 및 그 용도 - Google Patents

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Abstract

본 발명은 대장암의 간 전이 진단용 조성물 및 그 용도에 관한 것으로, 더욱 자세하게는 CCL7 (Chemokine (C-C motif) ligand 7) 유전자의 mRNA 수준을 측정하는 물질 또는 상기 유전자가 코딩하는 단백질 수준을 측정하는 물질을 포함하는 대장암의 간 전이 진단용 조성물에 관한 것이다. 본 발명은 대장암의 간 전이를 진단하는 데 있어서, CCL7 유전자의 mRNA 또는 CCL7 단백질의 발현 수준 측정을 통해, 대장암의 간 전이가 일어났는지를 진단할 수 있으며, CCL7 유전자에 대한 억제제를 포함하는 조성물을 이용하여 대장암의 치료 또는 대장암의 간 전이를 억제할 수 있다.

Description

 대장암의 간 전이 진단용 조성물 및 그 용도 {Composition for Diagnosis of Liver Metastasis of Colorectal Cancer and the Use Thereof}
본 발명은 대장암의 간 전이 진단용 조성물 및 그 용도에 관한 것으로, 더욱 자세하게는 CCL7 (Chemokine (C-C motif) ligand 7) 유전자의 mRNA 수준을 측정하는 물질 또는 상기 유전자가 코딩하는 단백질 수준을 측정하는 물질을 포함하는 대장암의 간 전이 진단용 조성물에 관한 것이다.
대장암은 전세계적으로 3번째로 흔한 암으로 우리나라에서는 남자의 경우 위암, 폐암, 간암에 이어, 여자의 경우는 유방암, 위암에 이어 각각 4번째와 3번째로 흔히 발생하는 암으로 근래에 식생활의 양상이 서구화되어 가면서 그 발생 빈도가 가파르게 증가하고 있고, 최근 10년 사이 대장암에 의한 사망률은 약 80%정도 증가하여 그 상승속도가 계속 높아지고 있는 추세이다 (2002년 한국중앙암등록 보고서). 대장암 환자의 약 50%는 진단 후 5년 내에 사망하며 15-25%의 환자는 대장암 진단 당시 간 전이가 발견되며 20-30%에서는 원발성 대장암 수술후 추적관찰하던 중 간전이가 발견된다. 실제 대장암을 비롯한 악성 종양 환자의 사망 원인은 악성 종양 자체가 아니라 악성 종양의 전이 때문이다.
현재까지 진행되고 있는 암과 관련된 연구는 대부분 발암과정 및 기전에 관한 것이 대부분이다. 대장암 환자들의 치료 성적 및 생존율을 향상시키기 위해서는 가장 주된 사망원인인 전이에 대한 연구가 필요하며 그 중 가장 흔한 전이 장소인 간전이에 대한 연구가 필수적이라 할 수 있다.
지금까지 많은 연구에서 악성 종양의 발생 또는 전이에 관련된 바이오마커를 발굴하기 위해 Microarray gene expression profiling 기법을 사용하였다. 이는 전체 유전자의 발현을 총체적으로 알아볼 수 있는 방법이지만 분석이 어려울 뿐 아니라 분석비용도 많이 들고 또한 위양성 (false-positive)이 많다. 또한 실험 후 northern blot, RT-PCR 등을 통해 유전자 발현 정도를 다시 확인하는 과정이 필요하다. RT2 Profiler PCR Array 기법은 96 well plate에 pathway(예: Apoptosis, Cell cycle, Cancer, Signal pathway) 또는 disease 별로 구분된 유전자에 맞는 SYBR Green-optimized primer sets가 들어있는 것으로 real time PCR-based technique을 이용하여 한 번에 특정 signal pathway에 들어있는 유전자군들의 발현을 분석할 수 있는 기법이다.
이에, 본 발명자들은 대장암의 간 전이를 진단할 수 있는 바이오마커를 개발하고자 예의 노력한 결과, CCL7 유전자의 mRNA 발현량 및 CCL7 단백질양을 대장암의 간 전이 부위와 원발성 대장암 부위에서 비교하여, 간 전이 부위에서 CCL7 유전자가 더욱 강하게 발현하고, CCL7 단백질 수준 또한 더 높아, CCL7 유전자가 대장암의 간 전이에 특이적인 바이오마커로서 사용될 수 있다는 것을 확인하고 본 발명을 완성하게 되었다.
본 발명의 목적은 CCL7 (Chemokine (C-C motif) ligand 7) 유전자의 mRNA 수준을 측정하는 물질 또는 상기 유전자가 코딩하는 단백질 수준을 측정하는 물질을 포함하는 대장암의 간 전이 진단용 조성물 및 이를 포함하는 대장암의 간 전이 진단용 키트를 제공하는 데 있다.
본 발명의 다른 목적은 CCL7 (Chemokine (C-C motif) ligand 7) 유전자에 대한 억제제를 포함하는 대장암의 간 전이 억제용 조성물을 제공하는 데 있다.
본 발명의 또 다른 목적은 CCL7 (Chemokine (C-C motif) ligand 7) 유전자의 mRNA 또는 CCL7 단백질의 발현량을 측정함으로써, 대장암의 간 전이 진단을 위한 정보 제공 방법을 제공하는 데 있다.
상기 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 CCL7 (Chemokine (C-C motif) ligand 7) 유전자의 mRNA 수준을 측정하는 물질 또는 상기 유전자가 코딩하는 단백질 수준을 측정하는 물질을 포함하는 대장암의 간 전이 진단용 조성물을 제공한다.
본 발명은 또한, 상기 대장암의 간 전이 진단용 조성물을 포함하는 대장암의 간 전이 진단용 키트를 제공한다.
본 발명은 또한, CCL7 (Chemokine (C-C motif) ligand 7) 유전자에 대한 억제제를 포함하는 대장암의 간 전이 억제용 조성물을 제공한다.
본 발명은 또한, (a) 대장암의 간 전이 의심 환자로부터 분리된 생물학적 시료로부터 CCL7 유전자의 mRNA 수준을 측정하는 단계; 및 (b) 상기 CCL7 유전자의 mRNA 수준을 원발성 대장암 대조군 시료의 CCL7 유전자의 mRNA 수준과 비교하는 단계를 포함하는 대장암의 간 전이의 진단을 위한 정보 제공 방법을 제공한다.
본 발명은 또한, (a) 대장암의 간 전이 의심 환자로부터 분리된 생물학적 시료로부터 CCL7 단백질 수준을 측정하는 단계; 및 (b) 상기 단백질 수준을 원발성 대장암 대조군 시료의 CCL7 단백질 수준과 비교하는 단계를 포함하는 대장암의 간 전이의 진단을 위한 정보 제공 방법을 제공한다.
본 발명은 대장암의 간 전이를 진단하는 데 있어서, CCL7 유전자의 mRNA 또는 CCL7 단백질의 발현 수준 측정을 통해, 대장암의 간 전이가 일어났는지를 진단할 수 있으며, CCL7 유전자에 대한 억제제를 포함하는 조성물을 이용하여 대장암의 치료 또는 대장암의 간 전이를 억제할 수 있다.
도 1은 원발성 대장암 및 간 전이 대장암 간의 유의미한 유전자 발현 차이를 나타내는 타겟 유전자들의 분석 결과를 나타낸 것이다.
도 2(A)는 대장암 환자의 원발 부위와 간 전이 조직에서의 CCL7 발현을 비교한 그림이다. 도 2(B)는 대장암 환자의 원발 부위와 간 전이 조직에서 CCL7의 수용체인 CCR1, CCR2, CCR3 발현을 비교한 그림이다.
도 3(A)는 정상 대장 조직에서 CCL7의 면역조직화학염색 사진이다 (H&E, x200). 도 3(B)는 원발성 대장암 조직에서 CCL7의 면역조직화학염색 사진이다 (H&E, x200). 도 3(C)는 대장암 간 전이 조직에서 CCL7의 면역조직화학염색 사진이다 (H&E, x200).
다른 식으로 정의되지 않는 한, 본 명세서에서 사용된 모든 기술적 및 과학적 용어들은 본 발명이 속하는 기술분야에서 숙련된 전문가에 의해서 통상적으로 이해되는 것과 동일한 의미를 갖는다. 일반적으로 본 명세서에서 사용된 명명법은 본 기술분야에서 잘 알려져 있고 통상적으로 사용되는 것이다.
본 연구자들은 대장암의 간 전이와 관련된 바이오마커를 발굴하기 위하여 RT2 Profiler PCR 어레이를 사용하였다. 이는 96well plate에 pathway (예: Apoptosis, Cell cycle, Cancer, Signal pathway) 또는 질병별로 구분된 유전자에 맞는 SYBR Green-optimized 프라이머 셋트가 들어있는 것으로, real time PCR-based technique을 이용하여 한 번에 특정 신호경로(signal pathway)에 들어있는 유전자군들의 발현을 분석할 수 있는 기법이다.
본 발명에서 대장암의 간 전이 마커로 발굴한 CCL7은 Chemokine (C-C motif) ligand 7으로 이전에는 monocyte-specific chemokine 3 (MCP-3)로 불리었던 작은 케모카인이다. CCL7은 두 개의 인접한 N-말단 시스테인 잔기를 갖고 있으며 단핵구를 유인하며 마크로파아지의 기능을 조절한다. 이러한 CCL7은 단핵백혈구(monocytes), 섬유아세포(fibroblasts), 혈소판(platelets), colonic epithelial cells과 일부 malignant tumor cells에서 분비된다고 알려져 있으며, 3개의 chemokine 수용체 (CCR1, CCR2, and CCR3)와 결합하여 lymphocyte chemoattractant로 작용한다.
본 발명은 일 관점에서, CCL7 (Chemokine (C-C motif) ligand 7) 유전자의 mRNA 수준을 측정하는 물질 또는 상기 유전자가 코딩하는 단백질 수준을 측정하는 물질을 포함하는 대장암의 간 전이 진단용 조성물에 관한 것이다.
본 발명에서 CCL7 유전자의 mRNA의 수준을 측정하는 물질은 상기 CCL7 유전자에 특이적인 상보적 서열을 갖는 프로브인 것을 특징으로 할 수 있고, 상기 유전자에 특이적인 프로브를 이용하여 상기 유전자의 발현을 mRNA 수준에서 효과적으로 검출할 수 있다.
본 발명에서, "프로브"란 mRNA와 특이적 결합을 이룰 수 있는 짧게는 수 염기 내지 길게는 수백 염기에 해당하는 RNA 또는 DNA 등의 핵산 단편을 의미하며, 라벨링되어 있어서 특정 mRNA의 존재 유무를 확인할 수 있다. 프로브는 올리고뉴클레오티드 프로브, 단쇄 DNA(single straned DNA) 프로브, 이중쇄 DNA(double stranded DNA) 프로브, RNA 프로브 등의 형태로 제작될 수 있다.
본 발명에서 상기 CCL7 유전자의 단백질 발현 수준을 측정할 수 있는 물질은 CCL7 단백질에 특이적으로 결합하는 항체 또는 그 단편인 것을 특징으로 할 수 있다. 이때, 항체는 다클론 항체, 단클론 항체 및 재조합 항체 등의 "항체"를 모두 포함하며 항체란 항원성 부위에 대해서 지시되는 특이적인 단백질 분자를 의미한다.
다클론 항체는 상기한 간 질환 마커 단백질로써, TM4SF5 항원을 동물에 주사하고 동물로부터 채혈하여 항체를 포함하는 혈청을 수득하는 당업계에 널리 공지된 방법에 의해 생산할 수 있다. 이러한 다클론 항체는 염소, 토끼, 양, 원숭이, 말, 돼지, 쥐, 랫트(rat), 소, 개 등의 임의의 동물 종 숙주로부터 제조 가능하다. 단클론 항체는 당업계에 널리 공지된 하이브리도마 방법(hybridoma method)(Kohler 및 Milstein (1976) European Jounral of Immunology 6:511-519 참조), 또는 파지 항체 라이브러리(Clackson et al, Nature, 352:624-628, 1991; Marks et al, J. Mol. Biol., 222:58, 1-597, 1991) 기술을 이용하여 제조될 수 있다. 상기 방법으로 제조된 항체는 겔 전기영동, 투석, 염 침전, 이온교환 크로마토그래피, 친화성 크로마토그래피 등의 방법을 이용하여 분리, 정제할 수 있다. 또한 본 발명의 항체는 2개의 전체 길이의 경쇄 및 2개의 전체 길이의 중쇄를 가지는 완전한 형태뿐만 아니라, 항체 분자의 기능적인 단편을 포함한다. 항체 분자의 기능적인 단편이란 적어도 항원 결합 기능을 보유하고 있는 단편을 뜻하며, Fab, F(ab'), F(ab') 2 및 Fv 등이 있다.
본 발명은 다른 관점에서, 상기 대장암의 간 전이 진단용 조성물을 포함하는 대장암의 간 전이 진단용 키트에 관한 것이다.
본 발명의 진단용 키트는 분석 방법에 적합한 한 종류 또는 그 이상의 다른 구성 성분 조성물, 용액 또는 장치로 구성되고, RT-PCR 키트, DNA 칩 키트 또는 단백질 칩 키트일 수 있다. RT-PCR 키트는 마커 유전자에 대한 특이적인 각각의 프라이머 쌍 외에도 테스트 튜브 또는 다른 적절한 컨테이너, 반응 완충액, 데옥시뉴클레오타이드(dNTPs), Taq-폴리머라아제 및 역전사 효소와 같은 효소, DNase, RNase 억제제, DEPC-수, 멸균수 등을 포함할 수 있다. 또한, 정량 대조구로 사용되는 유전자에 특이적인 프라이머 쌍을 포함할 수 있다. DNA 칩 키트는 유전자 또는 그의 단편에 해당하는 cDNA가 프로브로 부착되어 있는 기판을 포함하고, 기판은 정량구조 유전자 또는 그의 단편에 해당하는 cDNA를 포함할 수 있다.
또한, 본 발명에 따른 진단용 키트는 CCL7 단백질 수준을 측정하는 제재를 포함하는 진단 키트일 수 있으며, 이때 상기 단백질 수준을 측정하는 제제는 바람직하게는 상기 단백질에 특이적인 항체이다. 따라서, 상기 단백질 수준을 측정하는 제제를 포함하는 진단 키트는, 예컨대, ELISA를 수행하기 위해 필요한 필수요소를 포함하는 진단 마커 검출용 키트일 수 있으며, 이러한 키트는 "항원-항체 복합체"를 형성한 항체를 검출할 수 있는 시약, 예컨대, 표지된 2차 항체, 발색단 (chromophores), 효소(예: 항체와 접합) 및 그의 기질 등을 포함할 수도 있다. 또한, 정량 대조구 단백질에 특이적인 항체를 포함할 수 있다.
아울러, 상기 항원-항체 복합체의 형성량은 검출 라벨(detection label)의 시그널의 크기를 통해서 정량적으로 측정할 수 있다. 이러한 검출 라벨은 효소, 형광물, 리간드, 발광물, 미소입자(microparticle), 레독스 분자 및 방사선 동위원소로 이루어진 그룹 중에서 선택할 수 있으며, 반드시 이로 제한되는 것은 아니다. 단백질 수준을 측정하기 위한 분석방법으로는 웨스턴 블롯, ELISA, 방사선면역분석, 방사선 면역 확산법, 오우크테로니 면역확산법, 로케트 면역전기영동, 조직면역 염색, 면역침전 분석법, 보체 고정분석법, FACS, 단백질 칩 등이 있으나, 이들로 제한되는 것은 아니다.
본 발명은 또 다른 관점에서, CCL7 (Chemokine (C-C motif) ligand 7) 유전자에 대한 억제제를 포함하는 대장암의 간 전이 억제용 조성물에 관한 것으로, 상기 CCL7 (Chemokine (C-C motif) ligand 7) 유전자에 대한 억제제는 CCL7 유전자의 mRNA에 대한 안티센스 올리고뉴클레오티드인 것을 특징으로 할 수 있고, 또는 CCL7 유전자의 siRNA인 것을 특징으로 할 수 있다.
본 발명에서 siRNA(small interfering RNA)는 서열 특이적으로 효율적인 유전자 발현억제를 매개하는 짧은 이중 가닥의 RNA(dsRNA)를 의미한다. siRNA는 세포 배양 및 생체 내에서 오래 지속되는 효과, 생체 내에서 세포를 트랜스펙션시키는 능력 및 혈청 내 분해에 대한 저항력의 측면에서, 생체 내 특정 유전자의 발현 저해에 대해 매우 강한 약물이 되는 잠재력을 지닌다. siRNA는 상대적으로 낮은 농도로도 안티센스 올리고뉴클레오티드에 의해 얻을 수 있는 효과와 동등하거나 높은 효과를 얻을 수 있기 때문에 안티센스 올리고뉴클레오티드의 대안으로 제시되고 있다. 당업자는 당해 기술분야에서 공지된 방법을 이용하여 원하는 방식대로 상기 안티센스 올리고뉴클레오티드 및 siRNA를 합성하고 변형시킬 수 있다.
본 발명은 또 다른 관점에서, 대장암의 간 전이 의심 환자로부터 분리된 생물학적 시료로부터 CCL7 유전자의 mRNA 수준을 측정하는 단계; 및 상기 CCL7 유전자의 mRNA 수준을 원발성 대장암 대조군 시료의 CCL7 유전자의 mRNA 수준과 비교하는 단계를 포함하는 대장암의 간 전이의 진단을 위한 정보 제공 방법에 관한 것이다.
또한, 본 발명은 대장암의 간 전이 의심 환자로부터 분리된 생물학적 시료로부터 CCL7 단백질 수준을 측정하는 단계; 및 상기 단백질 수준을 원발성 대장암 대조군 시료의 CCL7 단백질 수준과 비교하는 단계를 포함하는 대장암의 간 전이의 진단을 위한 정보 제공 방법에 관한 것이다.
본 발명에 있어서, 상기 대장암의 간 전이 의심 환자로부터 분리된 생물학적 시료로부터 CCL7 단백질 수준을 측정하는 단계는 상기 대장암의 간 전이 진단용 조성물을 생물학적 시료와 접촉시키는 단계를 통하여 이루어질 수 있고, 상기 단백질 수준을 원발성 대장암 대조군 시료의 CCL7 단백질 수준과 비교하는 단계는 상기 시료 내 CCL7 단백질의 수준이 대조군에 비해 높은 것을 확인하는 단계를 이용함으로써, 대장암의 간 전이 진단의 정보를 제공하기 위한, CCL7의 검출 방법을 포함한 것이다.
이러한 방법들을 통해, 원발성 대장암 대조군에서의 CCL7 단백질 발현 수준과 대장암의 간 전이 의심 환자에서의 단백질 발현수준을 비교함으로써, 대장암이 간으로 전이된 실제 환자 여부를 진단할 수 있고, 나아가서는, 대장암의 진행단계 또는 예후를 예측할 수 있을 것이다.
본 발명에 있어서, 상기 CCL7 단백질 수준을 측정하는 단계는 CCL7을 특이적으로 인식하는 항체를 이용하여 상기 CCL7 단백질 수준을 측정할 수 있으며, 구체적으로, 웨스턴 블랏, ELISA, 방사선면역분석, 방사 면역확산법, 오우크테로니 면역 확산법, 로케트 면역전기영동, 조직면역 염색, 면역침전 분석법, 보체 고정 분석법, FACS 또는 단백질 칩 방법 등의 앞서 언급한 다양한 단백질 수준 측정방법을 이용하여 수행할 수 있다.
본 발명에 있어서, 상기 생물학적 시료는 조직, 세포, 전혈, 혈청,또는 혈장일 수 있다.
이하, 실시예를 통하여 본 발명을 더욱 상세히 설명하고자 한다. 이들 실시예는 오로지 본 발명을 예시하기 위한 것으로서, 본 발명의 범위가 이들 실시예에 의해 제한되는 것으로 해석되지 않는 것은 당업계에서 통상의 지식을 가진 자에게 있어서 자명할 것이다.
대장암의 간 전이 특이적 유전자의 발굴
원발성 대장암 및 간 전이 대장암 간의 유의미한 유전자 발현 차이를 나타내는 타겟 유전자들을 분석하기 위하여, 간 전이를 동반한 대장암으로 수술 (대장 및 간 절제)을 시행한 6명 환자(삼성의료센터)의 대장암 및 간 전이 조직 (fresh frozen tissue)으로부터 Nucleospin RNA kit를 사용하여 RNA를 추출한 후 RT2 Profiler PCR Array를 시행하였다.
즉, 6명 환자의 대장암 및 간 전이 조직은 사용되기 전까지 -80℃로 냉동되었다. 냉동된 조직을 H&E로 염색하고, 괴사성 종양 조직(necrotic tumor tissues) 및 intervening normal tissues를 제거한 후, 전체 RNA를 Nucleospin RNA kit를 이용하여 냉동된 조직으로부터 추출하였다. cDNA는 RT2 First Strand Synthesis Kit(Super Array Bioscience, Frederick, MD)를 이용하여 합성하였고, Human tumor metastasis PCR array 및 the RT2 SYBR Green/Rox PCR mastermix [APMM012C and PA-012-24, (Super Array Bioscience, Frederick, MD)]를 이용하여 분석하였다.
그 결과, CCL7 (p=0.0006), FN1 (p=0.0039), CXCR4 (p=0.0420), CST7 (p=0.0491), MGAT5 (p=0.0407)의 발현이 원발성 대장암 조직보다 간 전이 조직에서 증가되었음을 확인하였고, 그 중에서도 CCL7 (p=0.0006)이 가장 큰 발현의 증가를 나타내었다(도 1).
2-1: 간 전이 조직에서 CCL7의 RNA 발현 정도
상기 실시예 1에서 원발성 대장암 조직보다 간 전이 조직에서 증가된 발현을 나타내는 것을 확인한 CCL7이 대장암의 간 전이 마커로서 기능하는지를 확인하였다.
전체 RNA는 MasterPureTM Complete DNA 및 RNA Rurification Kit (Epicentre Biotechnologies)를 이용하여 파라핀 블럭(paraffin blocks)으로부터 추출되었다. mRNA의 증폭 후, SuperScriptTM III Reverse transciptase (Invitrogen)를 이용하여 double-stranded cDNA로부터 전사되었다. Quantitative real-time RT PCR은 384 well-plate에서 세 번 수행되었다. 각각의 반응은 Power SYBRGreen PCR Master Mix (Applied Biosystems, Inc., Foster City, CA): 5 μL , 10 μM 농도의 Primer: 0.25 μL, CCL7 (Bioneer Oligo Synthesis Report), CCR1 (Bioneer Oligo Synthesis Report), CCR2 (Bioneer Oligo Synthesis Report), CCR3 (Bioneer Oligo Synthesis Report) 및 GAPDH (Bioneer Oligo Synthesis Report)의 프로브 세트로 이루어졌다. 사용된 프라이머는 다음과 같다.
마커 서열 서열번호
CCL7 sense 5'-TGCTCAGCCAGTTGGGATTA-3' 1
antisense 5'-GGACAGTGGCTACTGGTGGT'3' 2
CCR1 sense 5'-CTGGTTGGAAACATCCTGGT-3' 3
antisense 5'-GGAAGCGTGAACAGGAAGAG-3' 4
CCR2 sense 5'-CCCCAGTCACCTGCTGTTAT-3' 5
antisense 5'-GCTTCTTTGGGACACTTGCT-3' 6
CCR3 sense 5'-GTGTTCACTGTGGGCCTCTT-3' 7
antisense 5'-GTGACGAGGAAGAGCAGGTC-3' 8
GAPDH sense 5'-ACCGTCAAGGCTGAGAA-3◎ 9
antisense 5'-CATCGCCCCACTTGATT-3 10
원발성 대장암 조직과 간 전이 조직을 대상으로 RT2 Profiler PCR Array와 real time PCR을 실시한 결과, 원발성 대장암 조직에서보다 간 전이 조직에서 높은 CCL7의 RNA 발현을 보였다 (도 2(A)). 또한, CCL7의 수용체로 알려진 CCR1, CCR2, CCR3도 원발성 대장암 조직에서보다 간 전이 조직에서 높은 RNA 발현을 보였다 (도 2(B)).
2-2: 간 전이 조직에서 CCL7 단백질의 발현 정도
CCL7에 대한 항체(rabbot anti-human polyclonal CCL7 (dilution 1:1000, GenWay Biotech, Inc., USA))를 이용하여 면역조직화학염색을 실시하였을 때, CCL7은 정상 대장 조직에서도 발현되나, 대장암 부위(도 3(B))에서는 정상 조직(도 3(A))에서보다 강한 발현을 나타내었고 간 전이 부위(도 3(C))에서는 원발성 대장암 부위에서보다 더욱 강한 발현을 보였다 (도 3). 이와 같은 실험결과들을 통해 CCL7은 대장암의 간 전이에 특이적인 마커로서의 가치가 높음을 확인할 수 있었다. 간 전이 특이적인 마커로 작용한다면 이를 타겟으로하는 항체를 개발하여 표적치료제로 활용할 수 있다.
이상으로 본 발명의 내용의 특정한 부분을 상세히 기술하였는바, 당업계의 통상의 지식을 가진 자에게 있어서, 이러한 구체적 기술은 단지 바람직한 실시양태일 뿐이며, 이에 의해 본 발명의 범위가 제한되는 것이 아닌 점은 명백할 것이다. 따라서, 본 발명의 실질적인 범위는 첨부된 청구항들과 그것들의 등가물에 의하여 정의된다고 할 것이다.
<110> Samsung Life Public Welfare Foundation <120> Composition for Diagnosis of Liver Metastasis of Colorectal Cancer and the Use Thereof <130> P10-B263 <160> 10 <170> KopatentIn 1.71 <210> 1 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 1 tgctcagcca gttgggatta 20 <210> 2 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 2 ggacagtggc tactggtggt 20 <210> 3 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 3 ctggttggaa acatcctggt 20 <210> 4 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 4 ggaagcgtga acaggaagag 20 <210> 5 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 5 ccccagtcac ctgctgttat 20 <210> 6 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 6 gcttctttgg gacacttgct 20 <210> 7 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 7 gtgttcactg tgggcctctt 20 <210> 8 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 8 gtgacgagga agagcaggtc 20 <210> 9 <211> 17 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 9 accgtcaagg ctgagaa 17 <210> 10 <211> 17 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 10 catcgcccca cttgatt 17

Claims (9)

  1. CCL7 (Chemokine (C-C motif) ligand 7) 유전자의 mRNA 수준을 측정하는 물질 또는 상기 유전자가 코딩하는 단백질 수준을 측정하는 물질을 포함하는 대장암의 간 전이 진단용 조성물.
  2. 제1항에 있어서, 상기 CCL7 유전자의 mRNA의 수준을 측정하는 물질은 상기 CCL7 유전자에 특이적인 상보적 서열을 갖는 프로브인 것을 특징으로 하는 대장암의 간 전이 진단용 조성물.
  3. 제1항에 있어서, 상기 CCL7 유전자가 코딩하는 단백질의 수준을 측정하는 물질은 상기 유전자가 코딩하는 단백질에 특이적으로 결합하는 항체인 것을 특징으로 하는 대장암의 간 전이 진단용 조성물.
  4. 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 따른 조성물을 포함하는 대장암의 간 전이 진단용 키트.
  5. 삭제
  6. 삭제
  7. 삭제
  8. (a) 대장암의 간 전이 의심 환자로부터 분리된 생물학적 시료로부터 CCL7 유전자의 mRNA 수준을 측정하는 단계; 및
    (b) 상기 CCL7 유전자의 mRNA 수준을 원발성 대장암 대조군 시료의 CCL7 유전자의 mRNA 수준과 비교하여 CCL7 유전자의 mRNA 수준이 증가한 시료를 대장암 전이가 진행된 것으로 판단하는 단계를 포함하는 대장암의 간 전이의 진단을 위한 정보 제공 방법.
  9. (a) 대장암의 간 전이 의심 환자로부터 분리된 생물학적 시료로부터 CCL7 단백질 수준을 측정하는 단계; 및
    (b) 상기 단백질 수준을 원발성 대장암 대조군 시료의 CCL7 단백질 수준과 비교하여 CCL7 단백질 수준이 증가한 시료를 대장암 전이가 진행된 것으로 판단하는 단계를 포함하는 대장암의 간 전이의 진단을 위한 정보 제공 방법.


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Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
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Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
KR20040101426A (ko) * 2002-04-10 2004-12-02 어플라이드 리서치 시스템스 에이알에스 홀딩 엔.브이. 신규한 mcp 단백질의 길항제

Non-Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
Ai Zheng. 2002, vol. 21, no, 5, pp. 504-508. *
Int J Cancer. online 24 Nov. 2009, vol. 127, no. 2, pp. 332-344. *
Int J Cancer. online 24 Nov. 2009, vol. 127, no. 2, pp. 332-344.*
World J Gastroenterol. 2002, vol. 8, no. 6, pp. 1067-1072. *
World J Gastroenterol. 2002, vol. 8, no. 6, pp. 1067-1072.*

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
KR20190080217A (ko) 2017-12-28 2019-07-08 한양대학교 산학협력단 Chi3l1 억제제를 유효성분으로 하는 암의 폐 전이 예방 또는 치료용 약학 조성물

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