KR101105189B1 - 중증급성호흡기증후군 바이러스의 뉴클레오캡시드와 세포막단백질간의 상호작용 측정방법 및 항-사스 바이러스활성을 갖는 물질의 검색방법 - Google Patents
중증급성호흡기증후군 바이러스의 뉴클레오캡시드와 세포막단백질간의 상호작용 측정방법 및 항-사스 바이러스활성을 갖는 물질의 검색방법 Download PDFInfo
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Abstract
본 발명은 중증급성호흡기증후군(SARS, Severe Acute Respiratory Syndrome, 사스) 바이러스의 뉴클레오캡시드(Nucleocapsid) 단독 또는 이것과 세포막(Membrane) 단백질간의 상호작용 측정방법과 항-사스 바이러스 활성을 갖는 물질의 검색방법에 관한 것으로서, 보다 상세하게는 사스 바이러스의 뉴클레오캡시드 단백질을 코딩하는 유전자 또는 뉴클레오캡시드 단백질 및 세포막 단백질을 코딩하는 유전자에 조각난 노랑형광단백질을 코딩하는 유전자를 삽입하고, 상기 유전자를 발현시켜 사스 바이러스 뉴클레오캡시드 단백질간의 자가정렬(Self-assembly)을 측정하는 방법 또는 사스 바이러스의 뉴클레오캡시드 단백질과 세포막 단백질의 상호작용을 측정하는 방법, 및 상기 방법을 이용한 항-사스 바이러스 활성을 갖는 물질의 검색방법에 관한 것이다. 본 발명은 사스 바이러스 생성과 증식에 필요한 바이러스 단백질들간의 상호작용을 세포 수준에서 검색할 수 있는 방법을 제시함으로써, 사스 바이러스의 증식을 효과적으로 억제할 수 있는 신약 후보 물질들을 세포 수준에서 간편하게 검색할 수 있다.
사스, 저해제, 형광 현미경, 단백질 상호작용, 검색방법
Description
본 발명은 본 발명은 중증급성호흡기증후군(SARS, Severe Acute Respiratory Syndrome, 사스) 바이러스의 뉴클레오캡시드(Nucleocapsid) 단독 또는 이것과 세포막(Membrane) 단백질간의 상호작용 측정방법과 항-사스 바이러스 활성을 갖는 물질의 검색방법에 관한 것이다.
중증급성호흡기증후군(重症急性呼吸器症候群)은 2001년 11월경에 중국 광동지역에서 첫 환자가 발생하였으며, 그 이후로 전 세계로 확산되었다. 이 전염병은 코로나 바이러스의 변종으로 알려진 사스(SARS, Severe Acute Respiratory Syndrome) 바이러스에 의해서 발병이 되며, 고열, 기침, 호흡곤란 등의 호흡기 증상을 보인다(Lo AW et al., J Pathol. 208, 142-151, 2006; Lai MM et al., Adv Virus Res. 48, 1-100, 1997).
사스 뉴클레오캡시드 단백질은 422개의 아미노산으로 이루어져있으며, 바이러스의 구조적 구성물들 중에서 가장 중요한 단백질로서, 바이러스의 게놈을 둘러싸서 바이러스 구조를 형성하는데 중요한 역할을 하며, 인체의 다양한 단백질과 상호작용하여 다양한 세포 작용을 방해하여 바이러스 증식과 복제에 유리하게끔 작용한다고 알려져 있다. 사스 뉴클레오캡시드 단백질의 N-말단은 DNA 및 RNA와 결합할 수 있으며(Huang Q et al., Biochemistry. 43, 6059-6063, 2004), 중간 부위는 인체의 다양한 단백질들과 상호작용을 통해 여러 세포내 반응에 관여하며(Surjit M et al., J Virol. 79, 11476-11486, 2005; Fan Z et al., J Med Virol. 78, 1365-1373, 2006), 뉴클레오캡시드 단백질의 자가정렬에도 매우 중요한 역할을 한다(Luo H et al., Biochemistry,. 44, 15351-15358, 2005). C-말단 부위는 뉴클레오캡시드 단백질의 자가정렬(Yu IM et al., J Biol Chem. 280, 23280-23286, 2005; Luo H et al., Biochemistry. 45, 11827-11835, 2006)과 사스 세포막 단백질의 C-말단 부위와의 상호결합작용에 중요한 역할을 한다(Fang X et al., J Biochem Mol Biol. 38, 381-385, 2005; Luo H et al., Int J Biochem Cell Biol. 38, 589-599, 2006). 사스 뉴클레오캡시드는 사스 단백질들 중에서 유일하게 인산화되는 단백질로서 인산화는 DNA의 결합에 영향을 미치며, 세포내 여러 단백질과의 상호작용에도 영향을 미치지만 인산화 부위와 정확한 조절기작은 알려져 있지 않다(Surjit M et al., J Virol. 79, 11476-11486, 2005).
사스 세포막(Membrane) 단백질은 221개의 아미노산으로 구성되어 있으며, 3 개의 세포막 투과 지역을 가지고 있다. C-말단 부위는 사스 뉴클레오캡시드 단백질과 상호결합작용을 함으로써 사스 바이러스의 구조를 형성하는 요소로서 중요한 역할을 한다(Fang X et al., J Biochem Mol Biol. 38, 381-385, 2005; Luo H et al., Int J Biochem Cell Biol. 38, 589-599, 2006; He R et al., Virus Res. 105, 121-125, 2004). 사스 세포막 단백질의 발현은 세포의 NF-kappaB를 활성화하며, 세포사멸을 유도한다(Fang X et al., J Med Virol. 79, 1431-1439, 2007).
사스 바이러스에 대한 신약 개발의 연구가 활발히 진행되고 있다. 방대한 항체 목록으로부터 사스 뉴클레오캡시드 단백질을 인지하는 항체 스크리닝에 관한 연구를 통해 항-사스 바이러스 항체를 찾아내는 연구가 진행되고 있으며, 강력한 살균력을 갖고 있는 천연 물질과 나노 크기 입자로 합성된 복합 나노 물질에 관한 연구가 진행되고 있다. 리노바이러스 치료제로 알려진 Ruprintrivir는 바이러스 3C프로테아제(3C Protease)의 활성을 차단하여 바이러스의 증식을 억제한다고 보고되어 있으며, 만성 C형 간염 환자 치료에 사용되고 있는 인터페론 알파콘1(Interferon alfacon1)도 사스 바이러스에 대해 증식 저해 효과를 보인다고 보고되고 있다(Paragas J et al., Antiviral Res. 66, 99-102, 2005). 그러나, 이러한 치료제들은 사스 바이러스 증식을 효과적으로 차단하지 못하고 있다. 이러한 사스 바이러스에 대한 많은 연구에도 불구하고, 현재까지 사스 바이러스에 대한 근본적인 예방책과 효과적인 치료방법이 개발되지 않은 상태이다.
신약 개발에서 동물 세포를 대상으로 화합물의 생리활성을 측정하는 방법은 정제된 단백질의 활성을 측정하는 방법보다 화합물의 활성, 화합물의 세포 투과성, 독성을 동시에 검증할 수 있는 장점이 있어 보다 효과적인 검색방법으로 인식되고 있다. 사스 바이러스의 신약 개발에 있어서 뉴클레오캡시드와 세포막 단백질은 바이러스 구조 형성에 중요한 단백질로서 신약 개발의 좋은 후보물로 여겨지고 있다.
이에, 본 발명자들은 사스 바이러스의 뉴클레오캡시드 단백질의 자가정렬과 세포막 단백질과의 상호작용을 동물 세포에서 측정할 수 있는 방법을 개발하고, 세포에서 발현된 뉴클레오캡시드와 세포막 단백질들은 인산화, DNA 결합 등의 고유의 성질을 가지고 있기 때문에, 다양한 화합물 라이브러리로부터 효과적인 항-사스 바이러스의 효력을 갖는 신약 물질 스크리닝에 매우 유용하게 이용될 수 있음을 확인함으로써 본 발명을 완성하였다.
본 발명의 목적은 동물 세포에서 사스 바이러스의 뉴클레오캡시드와 세포막 단백질을 발현함으로써, 세포 수준에서 사스 바이러스의 뉴클레오캡시드 단백질의 자가정렬과 세포막 단백질과 뉴클레오캡시드 단백질의 상호결합작용을 측정할 수 있는 방법을 개발하여, 다양한 화합물 라이브러리로부터 효과적으로 사스 바이러스의 복제와 증식을 저해할 수 있는 물질을 탐색하는 방법을 제공하는 것이다.
상기 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 ⅰ) 사스(SARS, Severe Acute Respiratory Syndrome, 중증급성호흡기증후군) 바이러스의 뉴클레오캡시드 단백질을 코딩하는 유전자에 노랑형광단백질(Yellow Fluorescence Protein, YFP) N-말단 부위를 코딩하는 유전자를 삽입하고, 또 다른 뉴클레오캡시드 단백질을 코딩하는 유전자에 노랑형광단백질 C-말단 부위를 코딩하는 유전자를 삽입하는 단계; ⅱ) 상기 유전자를 이용하여 동물세포를 형질전환시키는 단계; ⅲ) 상기 형질전환된 동물세포에서 상기 유전자를 발현시키는 단계; 및 ⅳ) 상기 발현된 뉴클레오캡시드 단백질을 형광현미경 또는 형광분석법을 통해 형광 단백질의 분포 및 형광 세기를 측정하는 단계;를 포함하는 사스 바이러스의 뉴클레오캡시드 단백질의 자가정렬 측정방법을 제공한다.
또한, 본 발명은 ⅰ) 사스 바이러스의 뉴클레오캡시드 단백질을 코딩하는 유전자에 노랑형광단백질 N-말단 부위를 코딩하는 유전자를 삽입하고, 또 다른 뉴클레오캡시드 단백질을 코딩하는 유전자에 노랑형광단백질 C-말단 부위를 코딩하는 유전자를 삽입하는 단계; ⅱ) 상기 유전자를 이용하여 동물세포를 형질전환시키는 단계; ⅲ) 상기 형질전환된 동물세포에서 상기 유전자를 발현시키고, 상기 형질전환된 동물세포에 항-사스 바이러스 활성을 가질 수 있는 시험물질을 처리하는 단계; 및 ⅳ) 형광현미경 또는 형광분석법을 통해 형광 단백질의 분포 및 형광 세기를 측정하는 단계;를 포함하는 상기 방법을 이용한 항-사스 바이러스 활성을 갖는 물질의 검색방법을 제공한다.
또한, 본 발명은 ⅰ) 사스 바이러스의 뉴클레오캡시드 단백질을 코딩하는 유전자에 노랑형광단백질 N-말단 부위 및 사스 바이러스의 세포막 단백질을 코딩하는 유전자에 노랑형광단백질 C-말단 부위를 코딩하는 유전자를 삽입하거나 사스 바이러스의 뉴클레오캡시드 단백질을 코딩하는 유전자에 노랑형광단백질 C-말단 부위 및 사스 바이러스의 세포막 단백질을 코딩하는 유전자에 노랑형광단백질 N-말단 부위를 코딩하는 유전자를 삽입하는 단계; ⅱ) 상기 유전자를 이용하여 동물세포를 형질전환시키는 단계; ⅲ) 상기 형질전환된 동물세포에서 상기 유전자를 발현시키는 단계; 및 ⅳ) 형광현미경 또는 형광분석법을 통해 측정하는 형광 단백질의 분포 및 형광 세기를 측정하는 단계;를 포함하는 사스 바이러스의 뉴클레오캡시드 단백질과 세포막 단백질의 상호작용 측정방법을 제공한다.
또한, 본 발명은 ⅰ) 사스 바이러스의 뉴클레오캡시드 단백질을 코딩하는 유전자에 노랑형광단백질 N-말단 부위 및 사스 바이러스의 세포막 단백질을 코딩하는 유전자에 노랑형광단백질 C-말단 부위를 코딩하는 유전자를 삽입하거나 사스 바이러스의 뉴클레오캡시드 단백질을 코딩하는 유전자에 노랑형광단백질 C-말단 부위 및 사스 바이러스의 세포막 단백질을 코딩하는 유전자에 노랑형광단백질 N-말단 부위를 코딩하는 유전자를 삽입하는 단계; ⅱ) 상기 유전자를 이용하여 동물세포를 형질전환시키는 단계; ⅲ) 상기 형질전환된 동물세포에서 상기 유전자를 발현시키고, 상기 형질전환된 동물세포에 항-사스 바이러스 활성을 가질 수 있는 시험물질을 처리하는 단계; 및 ⅳ) 형광현미경 또는 형광분석법을 통해 형광 단백질의 분포 및 형광 세기를 측정하는 단계;를 포함하는 상기 방법을 이용한 항-사스 바이러스 활성을 갖는 물질의 검색방법을 제공한다.
또한, 본 발명은 서열번호 1, 서열번호 2, 서열번호 5, 서열번호 6, 서열번호 9 및 서열번호 10으로 기재되는 군중에서 선택된 전체 사스 뉴클레오캡시드(1-422 아미노산 서열)와 노랑형광단백질의 N-말단 또는 C-말단 부위를 포함하는 융합단백질, 사스 세포막 단백질과 노랑형광단백질의 N-말단 또는 C-말단 부위, 및 사스 뉴클레오캡시드의 C-말단(168-422 아미노산 서열) 부위와 노랑형광단백질의 N-말단 또는 C-말단 부위를 포함하는 융합단백질을 코딩하는 유전자 및 상기 유전자로부터 코딩되는 서열번호 3, 서열번호 4, 서열번호 7, 서열번호 8, 서열번호 11 및 서열번호 12로 기재되는 군중에서 선택된 아미노산 서열을 갖는 융합단백질을 제공한다.
이하, 본 발명을 상세히 설명한다.
ⅰ) 사스(SARS, Severe Acute Respiratory Syndrome, 중증급성호흡기증후군) 바이러스의 뉴클레오캡시드 단백질을 코딩하는 유전자에 노랑형광단백질(Yellow Fluorescence Protein, YFP) N-말단 부위를 코딩하는 유전자를 삽입하고, 또 다른 뉴클레오캡시드 단백질을 코딩하는 유전자에 노랑형광단백질 C-말단 부위를 코딩하는 유전자를 삽입하는 단계; ⅱ) 상기 유전자를 이용하여 동물세포를 형질전환시키는 단계; ⅲ) 상기 형질전환된 동물세포에서 상기 유전자를 발현시키는 단계; 및 ⅳ) 상기 발현된 뉴클레오캡시드 단백질을 형광현미경 또는 형광분석법을 통해 형광 단백질의 분포 및 형광 세기를 측정하는 단계;를 포함하는 사스 바이러스의 뉴클레오캡시드 단백질의 자가정렬 측정방법을 제공한다.
본 발명의 사스 바이러스의 뉴클레오캡시드 단백질의 자가정렬 측정방법에 있어서, 상기 ⅰ) 단계의 유전자는 플라스미드를 이용하는 것이 바람직하고, 이때 상기 플라스미드는 pDONR221, pFPIA-YN 및/또는 pFPIA-YC 벡터인 것이 보다 바람직하고, 상기 ⅰ) 단계의 유전자는 서열번호 13과 14 또는 서열번호 15와 14로 기재되는 프라이머를 이용하여 DNA 중합연쇄 반응법(PCR)으로 증폭되는 것이 바람직하다.
또한, 본 발명의 사스 바이러스의 뉴클레오캡시드 단백질의 자가정렬 측정방법에 있어서, 상기 뉴클레오캡시드 단백질은 단백질 전체(1-422) 또는 C-말단 부위(168-422 아미노산 서열)인 것이 바람직하고, 상기 ⅱ) 단계의 동물세포는 HEK293T 세포인 것이 바람직하며, 상기 ⅳ) 단계의 형광현미경 또는 형광분석법은 500 ㎚에서 여기 및 535 ㎚에서 방출파장을 이용하는 것이 바람직하다.
또한, 본 발명은 ⅰ) 사스 바이러스의 뉴클레오캡시드 단백질을 코딩하는 유전자에 노랑형광단백질 N-말단 부위를 코딩하는 유전자를 삽입하고, 또 다른 뉴클레오캡시드 단백질을 코딩하는 유전자에 노랑형광단백질 C-말단 부위를 코딩하는 유전자를 삽입하는 단계; ⅱ) 상기 유전자를 이용하여 동물세포를 형질전환시키는 단계; ⅲ) 상기 형질전환된 동물세포에서 상기 유전자를 발현시키고, 상기 형질전환된 동물세포에 항-사스 바이러스 활성을 가질 수 있는 시험물질을 처리하는 단계; 및 ⅳ) 형광현미경 또는 형광분석법을 통해 형광 단백질의 분포 및 형광 세기를 측정하는 단계;를 포함하는 상기 방법을 이용한 항-사스 바이러스 활성을 갖는 물질의 검색방법을 제공한다.
또한, 본 발명은 ⅰ) 사스 바이러스의 뉴클레오캡시드 단백질을 코딩하는 유전자에 노랑형광단백질 N-말단 부위 및 사스 바이러스의 세포막 단백질을 코딩하는 유전자에 노랑형광단백질 C-말단 부위를 코딩하는 유전자를 삽입하거나 사스 바이러스의 뉴클레오캡시드 단백질을 코딩하는 유전자에 노랑형광단백질 C-말단 부위 및 사스 바이러스의 세포막 단백질을 코딩하는 유전자에 노랑형광단백질 N-말단 부위를 코딩하는 유전자를 삽입하는 단계; ⅱ) 상기 유전자를 이용하여 동물세포를 형질전환시키는 단계; ⅲ) 상기 형질전환된 동물세포에서 상기 유전자를 발현시키는 단계; 및 ⅳ) 형광현미경 또는 형광분석법을 통해 측정하는 형광 단백질의 분포 및 형광 세기를 측정하는 단계;를 포함하는 사스 바이러스의 뉴클레오캡시드 단백질과 세포막 단백질의 상호작용 측정방법을 제공한다.
본 발명의 사스 바이러스의 뉴클레오캡시드 단백질과 세포막 단백질의 상호작용 측정방법에 있어서, 상기 사스 뉴클레오캡시드 세포막 단백질은 C-말단 꼬리 부위(96-221)인 것이 바람직하고, 상기 ⅰ) 단계의 사스 뉴클레오캡시드 세포막 단백질을 코딩하는 유전자는 서열번호 16과 서열번호 17로 기재되는 프라이머를 이용하여 DNA 중합연쇄 반응법(PCR)으로 증폭되는 것이 바람직하다.
또한, 본 발명은 ⅰ) 사스 바이러스의 뉴클레오캡시드 단백질을 코딩하는 유전자에 노랑형광단백질 N-말단 부위 및 사스 바이러스의 세포막 단백질을 코딩하는 유전자에 노랑형광단백질 C-말단 부위를 코딩하는 유전자를 삽입하거나 사스 바이러스의 뉴클레오캡시드 단백질을 코딩하는 유전자에 노랑형광단백질 C-말단 부위 및 사스 바이러스의 세포막 단백질을 코딩하는 유전자에 노랑형광단백질 N-말단 부위를 코딩하는 유전자를 삽입하는 단계; ⅱ) 상기 유전자를 이용하여 동물세포를 형질전환시키는 단계; ⅲ) 상기 형질전환된 동물세포에서 상기 유전자를 발현시키고, 상기 형질전환된 동물세포에 항-사스 바이러스 활성을 가질 수 있는 시험물질을 처리하는 단계; 및 ⅳ) 형광현미경 또는 형광분석법을 통해 형광 단백질의 분포 및 형광 세기를 측정하는 단계;를 포함하는 상기 방법을 이용한 항-사스 바이러스 활성을 갖는 물질의 검색방법을 제공한다.
또한, 본 발명은 서열번호 1, 서열번호 2, 서열번호 5, 서열번호 6, 서열번호 9 및 서열번호 10으로 기재되는 군중에서 선택된 전체 사스 뉴클레오캡시드(1-422 아미노산 서열)와 노랑형광단백질의 N-말단 또는 C-말단 부위를 포함하는 융합단백질, 사스 세포막 단백질과 노랑형광단백질의 N-말단 또는 C-말단 부위, 및 사스 뉴클레오캡시드의 C-말단(168-422 아미노산 서열) 부위와 노랑형광단백질의 N-말단 또는 C-말단 부위를 포함하는 융합단백질을 코딩하는 유전자를 제공한다.
또한, 본 발명은 상기 유전자로부터 코딩되는 서열번호 3, 서열번호 4, 서열번호 7, 서열번호 8, 서열번호 11 및 서열번호 12로 기재되는 군중에서 선택된 아미노산 서열을 갖는 융합단백질을 제공한다.
본 발명은 중증급성호흡기증후군(重症急性呼吸器症候群, Severe Acute Respiratory Syndrome, SARS)을 유발하는 바이러스의 뉴클레오캡시드의 자가정렬(self-assembly)과 세포막 단백질과의 상호결합작용을 형광현미경으로 측정하며, 형광분석법을 이용하여 정량화함으로서 다양한 화합물 라이브러리로부터 사스 바이러스의 증식과 복제를 억제하는 항-사스 바이러스 약물을 편리하고 빠르게 검색할 수 있는 시스템을 제시한다. 구체적으로, 본 발명은 N-말단과 C-말단 부위를 포함하도록 각각 절편화된 노랑형광단백질(Yellow Fluorescence Protein, YFP)의 N-말단 부분에 뉴클레오캡시드 단백질의 전체(1-422) 혹은 C-말단(168-422) 부위를 삽입한 재조합단백질과, 혹은 사스 세포막 단백질의 C-말단(96-221) 부위를 절편화된 노랑형광단백질의 N-말단에 삽입하여 만들어진 재조합단백질을 인간 동물세포(HEK293T)에서 발현시킨 후, 세포 내에서 발현된 재조합 단백질들의 상호 작용에 의해 절편화된 노랑형광단백질이 재결합하여 원래의 활성화 상태의 노랑형광단백질로 3차원 구조가 재조합 되었을 때 발생하는 형광을 형광현미경과 형광분석법을 이용하여 결정한다.
사스 바이러스가 감염된 세포에서 사스 뉴클레오캡시드 단백질은 사스 캡시드를 구성하는 중요한 단백질로서 자가정렬을 통해서 밀집된 캡시드를 형성한다. 또한 뉴클레오캡시드의 C-말단 부위는 사스 세포막 단백질의 C-말단과 선택적인 결합을 형성하여 완성된 사스 바이러스 입자를 만들어 낸다. 따라서 사스 뉴클레오캡시드 단백질간의 자가정렬과, 뉴클레오캡시드와 세포막 단백질 간의 특이적 결합을 세포 수준에서 측정할 수 있다면 이들 단백질의 상호 작용을 억제하는 화합물들 을 효과적으로 검색할 수 있을 것이다. 이러한 검색방법을 통해 검색된 화합물들은 사스 바이러스의 복제와 증식을 효과적으로 억제할 수 있는 기능을 가질 것이며, 사스 바이러스에 의해서 유발되는 중증급성호흡기증후군의 치료제로서 개발될 수 있다.
전체 사스 뉴클레오캡시드(1-422 아미노산 서열)와 노랑형광단백질의 N-혹은 C-말단 부위를 포함하는 융합단백질은 서열번호 1과 2로 기재되는 염기서열에 의해 코딩되는 서열번호 3과 4의 아미노산 서열을 갖는다. 사스 세포막 단백질과 노랑형광단백질의 N-혹은 C-말단 부위를 포함하는 융합단백질은 서열번호 5와 6으로 기재되는 염기서열에 의해 코딩되는 서열번호 7과 8의 아미노산 서열을 갖는다. C-말단 사스 뉴클레오캡시드(168-422 아미노산 서열)와 노랑형광단백질의 N-혹은 C-말단 부위를 포함하는 융합단백질은 서열번호 9와 10으로 기재되는 염기서열에 의해 코딩되는 서열번호 11과 12의 아미노산 서열을 갖는다.
상기의 융합단백질을 코딩하는 DNA를 pFPIA-YN 혹은 pFPIA-YC 벡터에 삽입하여 뉴클레오캡시드와 세포막 단백질을 동시에 동물세포에서 발현될 수 있는 발현 벡터들을 제조하였다. 구체적으로, NCL-YN는 노랑형광단백질(YFP)의 N-말단의 부위의 서열을 포함하는 절편화된 노랑형광단백질(YFP-N)의 N-말단에 사스 뉴클레오캡시드의 전체 서열(1~422)이 삽입되어있고, YFP-N의 C-말단에 FLAG 꼬리가 삽입된 형태이다(도 1 참조). NCL-Yc는 노랑형광단백질의 C-말단 부위의 서열을 포함하는 절편화된 노랑형광단백질(YFP-C)의 N-말단에 뉴클레오캡시드 전체 서열(1~422)이 삽입되어 있고, YFP-C의 C-말단에 HA 꼬리가 삽입된 형태이다(도 1 참조). 또한, 뉴클레오캡시드의 C-말단 부위(168-422)는 단백질의 자가정렬에 매우 중요한 부위이므로 이 부분만 발현되는 재조합단백질을 제조하였다. 구체적으로, YFP-N 혹은 YFP-C의 N-말단에 168-422 부위의 뉴클레오캡시드(NCC)를 삽입하여 NCC-YN 혹은 NCC-YC의 재조합 단백질을 제조하였다(도 1 참조). 또한, 사스 세포막 단백질의 96-221의 C-말단을 포함하는 부위(M)를 각각 YFP-N 혹은 YFP-C의 N-말단에 삽입함으로써 M-YN 혹은 M-YC의 재조합 단백질을 제조하였다(도 1 참조).
상기 발현벡터에 의해 동물세포에서 발현되는 재조합 융합단백질들이 세포내에서 상호작용을 통해서 결합하게 되면 N-말단과 C-말단으로 서로 조각난 노랑형광단백질 부위가 서로 근접하게 되어 원형의 노랑형광단백질 형태를 갖추게 되면 각각 조각난 노랑형광단백질은 형광을 내지 않지만(도 2 (가) 참조) 재결합된 노랑형광단백질은 형광을 띄게 된다(도 2 (나) 참조). 이때, 사스 뉴클레오캡시드 자가정렬이나, 뉴클레오캡시드와 세포막 단백질간의 상호 작용을 억제하는 화합물이 처리되면 조각난 노랑형광단백질들이 상호 결합을 못하게 되어 형광을 띄지 못하게 된다(도 2 (다) 참조).
조각난 노랑형광단백질이 융합된 사스 뉴클레오캡시드 전체(1-422 아미노산 서열) 혹은 C-말단 부위(168-422 아미노산 서열)를 발현하는 재조합 벡터가 동물세포에 형질 전환되어 발현되었을 때, 뉴클레오캡시드 단백질의 자가정렬에 의한 상호작용으로 인해 조각난 노랑형광단백질이 원형을 갖춤으로서 형광을 발산하는 결과를 형광 현미경을 통해 분석되었다(도 3 (가) 및 (나) 참조). 뉴클레오캡시드와 세포막 단백질 간의 상호 작용도 형광 현미경을 통해 분석되었다(도 4 (가) 및 (나) 참조).
재조합 벡터가 발현된 세포를 용해하여 형광 측정기에서 형광 세기를 측정하면 세포막 단백질간은 상호작용을 하지 않아 형광을 띄지 않았으며, 뉴클레오캡시드 단백질은 형광을 띄었다. 또한, 세포막 단백질은 전체 혹은 C-말단 부위 뉴클레오캡시드 모두에서 형광을 나타내었다(도 5 참조).
본 발명의 사스 바이러스 뉴클레오캡시드 단백질의 자가정렬의 측정방법은 가) 사스 뉴클레오캡시드+노랑형광단백질 발현 재조합 발현 벡터를 동물세포 (HEK293T)에 형질전환하는 단계; 나) 형광현미경과 형광분석법을 이용하여 세포내 형광 단백질의 분포 및 형광 세기를 측정하는 단계로 구성된다.
본 발명의 사스 바이러스 뉴클레오캡시드 단백질과 세포막 단백질간의 특이적 상호결합작용의 측정 방법은 가) 사스 뉴클레오캡시드+노랑형광단백질 혹은 세포막단백질+노랑형광단백질 발현 재조합 발현 벡터를 동물세포(HEK293T)에 형질전환하는 단계; 나) 형광 현미경과 형광 분석법을 이용하여 세포내 형광 단백질의 분포 및 형광 세기를 측정하는 단계로 구성된다.
본 발명은 사스 뉴클레오캡시드의 자가정렬과 뉴클레오캡시드와 세포막 단백질 간의 상호작용을 형광분석법을 이용하여 측정함으로써 사스 바이러스 증식 억제 물질의 검색에 이용될 수 있으며, 정제된 단백질을 이용한 상호작용 측정법과는 달리 세포에서 단백질 합성 후 발생하는 다양한 변형이 보존된 원형 그대로의 형태로 단백질 활성을 측정할 수 있는 장점이 있다. 또한, 본 발명의 검색방법이 96-웰 플레이트 등을 이용하여 수행되면 다수 화합물의 활성을 동시에 측정할 수 있으므로 사스 바이러스의 증식 억제활성 물질을 검색하는 방법으로 활용할 수 있다.
이하, 본 발명을 하기 실시예에 의거하여 보다 상세하게 설명하고자 한다. 단, 하기 실시예는 본 발명을 예시하기 위한 것일 뿐, 본 발명은 하기 실시예에 의해 한정되는 것이 아니고, 본 발명의 기술적 사상을 벗어나지 않는 범위 내에서 치환 및 균등한 타 실시예로 변경할 수 있음은 본 발명이 속하는 기술분야에서 통상의 지식을 가진 자에게 있어서 명백할 것이다.
<실시예 1> 발현벡터 제조
<1-1> 사스 뉴클레오캡시드 발현 유전자의 제조
사스 뉴클레오캡시드 단백질을 코딩하는 유전자는 연세대학교 생명공학과 오종원 교수로부터 제공 받았다. 사스 단백질을 동물세포에서 발현시키는 플라스미드인 pFPIA-YN와 pFPIA-YC, 그리고 Entry vector로 사용된 pDONR221(Invitrogen Inc, USA) 벡터는 연세대학교 의과대학 허만욱 교수로부터 제공 받았다. 사스 뉴클레오캡시드 단백질 전체(1-422) 혹은 C-말단 부위(168-422 아미노산 서열)에 대 한 유전자를 주형으로 하고, 서열번호 13과 14 혹은 서열번호 15와 14로 기재되는 프라이머를 이용하여 DNA 중합연쇄 반응법(PCR)으로 95℃, 30초; 56℃, 30초; 72℃, 1분의 주기로 30회 반복하여 합성한 후, 아가로스겔에서 원하는 밴드를 분리 정제하였다. 정제된 PCR 산물은 BP 클로나제(BP clonase)에 의해 25℃에서 12시간 반응하여 pDONR221 벡터로 삽입되어 pDONR N1-1266 혹은 pDONR502-1266의 벡터를 제조하였다. 상기 정제된 벡터를 pFPIA-YN 혹은 pFPIA-YC 벡터와 섞은 후, LR 클로나제(LR clonase)로 25℃에서 12시간 반응하여 각각 pFPIA-YN-N1-1266, pFPIA-YC-N1-1266, pFPIA-YN-N502-1266, pFPIA-YC-N502-1266의 벡터를 제조하였다. 상기 제조된 벡터들은 정제된 후, 염기서열분석기를 통해 서열을 확인하였다(도 1).
사스 뉴클레오캡시드 단백질 유전자의 전체(1-1266 유전자 서열) 혹은 C-말단(502-1266 유전자 서열)의 유전자 서열이 entry vector로 사용된 pDONR221 벡터에 삽입된 형태인 pDONR N1-1266 혹은 pDONR502-1266은 pDONR221(Invitrogen Inc.) 벡터 내부의 attP1와 attP2의 사이에 재조합을 통해 각각 삽입되어있다. 사스 뉴클레오캡시드 유전자의 전체(1-1266 유전자 서열) 혹은 C-말단 502-1266 유전자 서열)의 유전자 서열은 동물세포 발현 벡터로 사용된 pFPIA-YN 혹은 pFPIA-YC 벡터에 삽입되어 pFPIA-YN-N1-1266(도 1 NCL-YN, 서열번호 1), pFPIA-YC-N1-1266(도 1 NCL-YC, 서열번호 2), pFPIA-YN-N502-1266(도 1 NCC-YN, 서열번호 9), pFPIA-YC-N502-1266(도 1 NCC-YC, 서열번호 10)의 형태로 제조되었다. pFPIA-YN-N1-1266(도 1 NCL-YN)은 사스 뉴클레오캡시드 전체 서열과 그것의 C-말단에 노랑형광단백질 N-말 단(1-154 아미노산 서열)과 Flag 태그가 삽입되어 있으며, pFPIA-YC-N1-1266(도 1 NCL-YC)은 사스 뉴클레오캡시드 전체 서열과 그것의 C-말단에 노랑형광단백질 C-말단(155-238 아미노산 서열)과 HA 태그가 삽입되어 있는 형태이다. pFPIA-YN-N502-1266(도 1 NCC-YN)은 사스 뉴클레오캡시드 C-말단 서열과 그것의 C-말단에 노랑형광단백질 N-말단(1-154 아미노산 서열)과 Flag 태그가 삽입되어 있으며, pFPIA-YC-N502-1266(도 1 NCC-YC) 사스 뉴클레오캡시드 C-말단 서열과 그것의 C-말단에 노랑형광단백질 C-말단(155-238 아미노산 서열)과 HA 태그가 삽입되어 있다.
<1-2> 사스 세포막 발현 유전자의 제조
사스 뉴클레오캡시드 단백질을 코딩하는 유전자는 연세대학교 생명공학과 오종원 교수로부터 제공 받았다. 사스 세포막 단백질의 C-말단 꼬리 부위(96-221)의 유전자를 주형으로 하고, 서열번호 16과 서열번호 17로 기재되는 프라이머를 이용하여 DNA 중합연쇄 반응법(PCR)으로 95℃, 30초; 56℃, 30초; 72℃, 1분의 주기로 30회 반복하여 합성한 후 아가로스겔에서 원하는 밴드를 분리 정제하였다. 정제된 PCR 산물은 BP 클로나제(BP clonase)에 의해 25℃에서 12시간 반응하여 pDONR221 벡터로 삽입되어 pDONR M96-221의 벡터를 제조하였다. 정제된 벡터를 pFPIA-YN 혹은 pFPIA-YC 벡터와 섞은 후, LR 클로나제(LR clonase)로 25℃에서 12시간 반응하여 각각 pFPIA-YN-M96-221, pFPIA-YC-N96-221의 벡터를 제조하였다. 상기 제조된 벡터들은 정제된 후, 염기서열분석기를 통해 서열을 확인하였다(도 1).
사스 세포막 유전자의 C-말단(96-221 유전자 서열)의 유전자 서열이 entry vector로 사용된 pDONR221 벡터에 삽입된 형태인 pDONR M96-221은 pDONR221 (Invitrogen Inc.) 벡터 내부의 attP1와 attP2의 사이에 재조합을 통해 각각 삽입되어 있다. 사스 세포막 단백질 유전자의 C-말단(96-221 유전자 서열)의 유전자 서열은 동물세포 발현 벡터로 사용된 pFPIA-YN 혹은 pFPIA-YC 벡터에 삽입되어 pFPIA-YN-M96-221(도 1 M-YN, 서열번호 5)과 pFPIA-YC-M96-221(도 1 M-YC, 서열번호 6)의 형태로 제조되었다. pFPIA-YN-M96-221(도 1 M-YN)은 사스 세포막 단백질의 C-말단 서열과 그것의 C-말단에 노랑형광단백질 N-말단(1-154 아미노산 서열)과 Flag 태그가 삽입되어 있으며, pFPIA-YC-M96-221(도 1 M-YC)은 사스 뉴클레오캡시드 전체 서열과 그것의 C-말단에 노랑형광단백질 C-말단(155-238 아미노산 서열)과 HA 태그가 삽입되어 있는 형태이다.
<실시예 2> 동물세포에서의 형질전환
<2-1> 동물세포의 배양
HEK293T(Human Embryonic Kidney) 동물세포는 ATCC로 구입되었다. 인간동물 세포인 HEK293T 세포는 5% CO2와 37℃ 조건하에서 10% FBS(우태아 혈청, fetal bovine serum)이 포함된 Dulbecco's modified Eagle's medium(Gibco)에서 배양하였다. 세포는 90%의 밀도에서 25%가 되도록 나누어 주면서 계대배양을 유지하면서형질전환을 위하여 준비하였다.
<2-2> 동물세포의 형질전환
상기 실시예 2-1에서 배양된 HEK293T 세포를 형질전환 하루 전날 6-웰 플레이트에 90% 밀도조건이 되도록 배양하였다. 사스 뉴클레오캡시드 단백질의 자가정렬을 측정하기 위하여, Lipofectamine 2000(Invitrogen)을 이용하여 상기 실시예 1-1에서 제조한 pFPIA-YN-N1-1266과 pFPIA-YC-N1-1266을 1:1(1.6 ㎍: 1.6 ㎍)의 비율로 그리고, pFPIA-YC-N502-1266과 pFPIA-YC-N502-1266을 1:1(1.6 ㎍: 1.6 ㎍)의 비율로 섞어서 상기 HEK293T 세포에 감염시켰다.
사스 뉴클레오캡시드와 세포막 단백질간의 상호작용을 측정하기 위하여 실시예 1-2에서 제조한 pFPIA-YC-M96-221을 각각 pFPIA-YN-N1-1266 혹은 pFPIA-YN-N502-1266과 1:1(1.6 ㎍: 1.6 ㎍)의 비율로 섞어준 후 상기 HEK293T 세포에 감염시켰다. 이렇게 형질 전환된 세포를 5% CO2와 37℃ 조건하에서 48시간 동안 배양하였다.
<실시예 3> 형광현미경을 이용한 세포영상 측정
상기 실시예 2-2에서 형질전환된 HEK293T 세포가 자라는 플레이트를 실온의 인산완충용액으로 2회 세척한 후 노랑형광단백질 형광을 관찰할 수 있는 파장(excitation=500 ㎚, emission=535 ㎚)의 필터가 장착된 형광현미경을 이용하여 세포를 관찰하였다.
형질전환된 HEK293T 세포가 형광을 나타낸 것은 사스 바이러스의 뉴클레오캡시드 자가정렬 측정과, 뉴클레오캡시드와 세포막 단백질의 상호결합작용의 측정 방법에 관한 원리를 도 2에 기재된 모식도와 같이 나타낼 수 있다. 그 결과, 조각난 노랑형광단백질이 융합된 사스 뉴클레오캡시드 전체(1-422 아미노산 서열) 혹은 C-말단 부위(168-422 아미노산 서열)를 발현하는 재조합 벡터가 동물세포에 형질전환되어 발현되었을 때, 뉴클레오캡시드 단백질의 자가정렬에 의한 상호작용으로 인해 조각난 노랑형광단백질이 원형을 갖춤으로서 형광을 발산하는 결과를 형광 현미경을 통해 분석되었다(도 3 (가) 및 (나)). 사스 뉴클레오캡시드 전체 서열과 그것의 C-말단에 노랑형광단백질의 N-말단 혹은 C-말단이 결합된 형태의 재조합 단백질인 NCL-YN 과 NCL-YC가 동물세포에서 동시에 발현되었을 때, 사스 뉴클레오캡시드는 서로 강한 결합 작용을 통해 조각난 노랑형광단백질이 서로 인접하게 됨으로서 상호 결합을 통해 완전한 노랑형광단백질의 모습을 갖춤으로서 세포 영상에서 형광을 나타내었다(도 3 (가)). 사스 뉴클레오캡시드 C-말단 서열과 그것의 C-말단에 노랑형광단백질의 N-말단 혹은 C-말단이 결합된 형태의 재조합 단백질인 NCC-YN 과 NCC-YC가 동물세포에서 동시에 발현되었을 때, 사스 뉴클레오캡시드 C-말단은 서로 강한 결합 작용을 통해 조각난 노랑형광단백질이 서로 인접하게 됨으로서 상호 결합을 통해 완전한 노랑형광단백질의 모습을 갖춤으로서 세포 영상에서 형광을 나타내었다(도 3 (나)). 노랑형광단백질의 N-말단과 C-말단을 포함하는 뉴클레오캡시드와 세포막 단백질 간의 상호 작용도 형광 현미경을 통해 분석되었다(도 4 (가) 및 (나)). 사스 뉴클레오캡시드 전체 서열과 그것의 C-말단에 노랑형광단백질의 N-말단이 결합된 형태의 재조합 단백질인 NCL-YN과 사스 세포막 단백질의 C-말단과 그것의 C-말단에 노랑형광단백질의 C-말단이 삽입된 형태의 재조합 단백질인 M-YC가 동물세포에서 동시에 발현되었을 때, 사스 뉴클레오캡시드와 세포막 단백질은 서로 강한 결합 작용을 통해 조각난 노랑형광단백질이 서로 인접하게 됨으로서 상호 결합을 통해 완전한 노랑형광단백질의 모습을 갖춤으로서 세포 영상에서 형광을 나타내었다(도 4 (가)). 사스 뉴클레오캡시드 C-말단 서열과 그것의 C-말단에 노랑형광단백질의 C-말단이 결합된 형태의 재조합 단백질인 NCS-YC과 사스 세포막 단백질의 C-말단과 그것의 C-말단에 노랑형광단백질의 N-말단이 삽입된 형태의 재조합 단백질인 M-YN가 동물세포에서 동시에 발현되었을 때, 사스 뉴클레오캡시드와 세포막 단백질은 서로 강한 결합 작용을 통해 조각난 노랑형광단백질이 서로 인접하게 됨으로서 상호 결합을 통해 완전한 노랑형광단백질의 모습을 갖춤으로서 세포 영상에서 형광을 나타내었다(도 4 (나)).
<실시예 4> 형광분석법을 이용한 형광 세기 측정
상기 실시예 2-2에서 형질전환된 HEK293T 세포가 자라는 플레이트를 실온의 인산완충용액으로 2회 세척한 후, 각각의 웰에 1% NP-40가 포함된 인산완충액에 4ㅀC에서 1시간 동안 세포를 분해시킨 후, 용액을 모아 13,000 rpm에서 20분간 원심분리하여 상층액을 분리하였다. 분리된 상층액을 96-웰 플레이트에 넣어, 형광 분석기를 통해 500 ㎚ excitation, 535 ㎚ emission으로 형광의 세기를 측정하였다.
이와 같이, 상기 형질전환된 HEK293T 세포에서 사스 뉴클레오캡시드 재조합 융합단백질의 자가정렬과, 뉴클레오캡시드와 세포막 재조합 융합단백질간의 상호결합작용을 형광분석법으로 측정할 수 있었다. 그 결과, 재조합 벡터가 발현된 세포를 용해하여 형광 측정기에서 형광 세기를 측정하면 세포막 단백질간은 상호작용을 하지 않아 형광을 띄지 않았으며, 뉴클레오캡시드 단백질은 형광을 띄었다. 또한, 세포막 단백질은 전체 혹은 C-말단 부위 뉴클레오캡시드 모두에서 형광을 나타내었다(도 5). 대조 실험으로 사용된 Jun과 Fos는 연세대학교 의과대학 허만욱 교수로부터 제공받았다. Jun 과 Fos는 상호작용을 통해 형광을 나타낸다고 알려져 있으며, 형광 측정시 50,000 정도의 형광 세기를 나타내었다(도 5, 첫 번째 막대). 사스 뉴클레오캡시드의 전체 서열 단백질(NL+NL)은 서로 강한 상호 작용을 통해 20,000 정도의 형광 세기를 나타내었다(도 5, 두 번째 막대). 사스 뉴클레오캡시드의 C-말단 서열 단백질들(NS+NS)은 서로 강한 상호 작용을 통해 18,000 정도의 형광 세기를 나타내었다(도 5, 세 번째 막대). 세포막 단백질은 사스 뉴클레오캡시드 전체(도 5, 네 번째 막대), 혹은 C-말단(도 5, 다섯 번째 막대) 단백질과 상호 작용을 통해 각각 22,000 혹은 23,000 정도의 형광 세기를 나타내었다. 반면, 세포막 단백질 간에는 상호 작용을 하지 않았고, 형광의 세기를 전혀 나타내지 않았다(도 5, 여섯 번째 막대).
도 1은 절편화된 노랑형광단백질의 N-말단에 사스 바이러스 뉴클레오캡시드와 세포막 단백질의 아미노산 서열이 연결되어 만들어지는 재조합 융합단백질의 구조를 나타낸 모식도이다.
도 2는 사스 바이러스의 뉴클레오캡시드 자가정렬 측정과, 뉴클레오캡시드와 세포막 단백질의 상호결합작용의 측정 방법에 관한 원리를 나타낸 모식도이다.
도 3은 동물세포에서 발현된 사스 뉴클레오캡시드 재조합 융합단백질의 자가정렬을 형광 현미경으로 측정한 결과이다.
도 4는 동물세포에서 발현된 사스 뉴클레오캡시드와 세포막 재조합 융합단백질의 상호결합작용을 형광 현미경으로 측정한 결과이다.
도 5는 사스 뉴클레오캡시드 재조합 융합단백질의 자가정렬과, 뉴클레오캡시드와 세포막 재조합 융합단백질간의 상호결합작용을 형광분석법으로 측정한 결과이다
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<210> 1
<211> 1887
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Gene Coding SARS Nucleocapsid and Yellow Fluorescence Protein
N-terminus
<400> 1
atggtacttg cggccgcgaa ttcatcgatc acaagtttgt acaaaaaagc aggcttcatg 60
tctgataatg gaccccaatc aaaccaacgt agtgcccccc gcattacatt tggtggaccc 120
acagattcaa ctgacaataa ccagaatgga ggacgcaatg gggcaaggcc aaaacagcgc 180
cgaccccaag gtttacccaa taatactgcg tcttggttca cagctctcac tcagcatggc 240
aaggaggaac ttagattccc tcgaggccag ggcgttccaa tcaacaccaa tagtggtcca 300
gatgaccaaa ttggctacta ccgaagagct acccgacgag ttcgtggtgg tgacggcaaa 360
atgaaagagc tcagccccag atggtacttc tattacctag gaactggccc agaagcttca 420
cttccctacg gcgctaacaa agaaggcatc gtatgggttg caactgaggg agccttgaat 480
acacccaaag accacattgg cacccgcaat cctaataaca atgctgccac cgtgctacaa 540
cttcctcaag gaacaacatt gccaaaaggc ttctacgcag agggaagcag aggcggcagt 600
caagcctctt ctcgctcctc atcacgtagt cgcggtaatt caagaaattc aactcctggc 660
agcagtaggg gaaattctcc tgctcgaatg gctagcggag gtggtgaaac tgccctcgcg 720
ctattgctgc tagacagatt gaaccagctt gagagcaaag tttctggtaa aggccaacaa 780
caacaaggcc aaactgtcac taagaaatct gctgctgagg catctaaaaa gcctcgccaa 840
aaacgtactg ccacaaaaca gtacaacgtc actcaagcat ttgggagacg tggtccagaa 900
caaacccaag gaaatttcgg ggaccaagac ctaatcagac aaggaactga ttacaaacat 960
tggccgcaaa ttgcacaatt tgctccaagt gcctctgcat tctttggaat gtcacgcatt 1020
ggcatggaag tcacaccttc gggaacatgg ctgacttatc atggagccat taaattggat 1080
gacaaagatc cacaattcaa agacaacgtc atactgctga acaagcacat tgacgcatac 1140
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cctttgccgc agagacaaaa gaagcagccc actgtgactc ttcttcctgc ggctgacatg 1260
gatgatttct ccagacaact tcaaaattcc atgagtggag cttctgctga ttcaactcag 1320
gcacacccag ctttcttgta caaagtggtg atatcggtac cagtcgactc tagaggatcc 1380
agatccatcg ccaccatggt gagcaagggc gaggagctgt tcaccggggt ggtgcccatc 1440
ctggtcgagc tggacggcga cgtaaacggc cacaagttca gcgtgtccgg cgagggcgag 1500
ggcgatgcca cctacggcaa gctgaccctg aagttcatct gcaccaccgg caagctgccc 1560
gtgccctggc ccaccctcgt gaccaccttc ggctacggcc tgaagtgctt cgcccgctac 1620
cccgaccaca tgaagcagca cgacttcttc aagtccgcca tgcccgaagg ctacgtccag 1680
gagcgcacca tcttcttcaa ggacgacggc aactacaaga cccgcgccga ggtgaagttc 1740
gagggcgaca ccctggtgaa ccgcatcgag ctgaagggca tcgacttcaa ggaggacggc 1800
aacatcctgg ggcacaagct ggagtacaac tacaacagcc acaacgtcta tatcatggcc 1860
gactacaaag acgatgacga caagtga 1887
<210> 2
<211> 1704
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Gene Coding SARS Nucleocapsid and Yellow Fluorescence Protein
C-termins
<400> 2
atggccatgg aggcccgaat tatcacaagt ttgtacaaaa aagcaggctt catgtctgat 60
aatggacccc aatcaaacca acgtagtgcc ccccgcatta catttggtgg acccacagat 120
tcaactgaca ataaccagaa tggaggacgc aatggggcaa ggccaaaaca gcgccgaccc 180
caaggtttac ccaataatac tgcgtcttgg ttcacagctc tcactcagca tggcaaggag 240
gaacttagat tccctcgagg ccagggcgtt ccaatcaaca ccaatagtgg tccagatgac 300
caaattggct actaccgaag agctacccga cgagttcgtg gtggtgacgg caaaatgaaa 360
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tacggcgcta acaaagaagg catcgtatgg gttgcaactg agggagcctt gaatacaccc 480
aaagaccaca ttggcacccg caatcctaat aacaatgctg ccaccgtgct acaacttcct 540
caaggaacaa cattgccaaa aggcttctac gcagagggaa gcagaggcgg cagtcaagcc 600
tcttctcgct cctcatcacg tagtcgcggt aattcaagaa attcaactcc tggcagcagt 660
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ctgctagaca gattgaacca gcttgagagc aaagtttctg gtaaaggcca acaacaacaa 780
ggccaaactg tcactaagaa atctgctgct gaggcatcta aaaagcctcg ccaaaaacgt 840
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caaggaaatt tcggggacca agacctaatc agacaaggaa ctgattacaa acattggccg 960
caaattgcac aatttgctcc aagtgcctct gcattctttg gaatgtcacg cattggcatg 1020
gaagtcacac cttcgggaac atggctgact tatcatggag ccattaaatt ggatgacaaa 1080
gatccacaat tcaaagacaa cgtcatactg ctgaacaagc acattgacgc atacaaaaca 1140
ttcccaccaa cagagcctaa aaaggacaaa aagaaaaaga ctgatgaagc tcagcctttg 1200
ccgcagagac aaaagaagca gcccactgtg actcttcttc ctgcggctga catggatgat 1260
ttctccagac aacttcaaaa ttccatgagt ggagcttctg ctgattcaac tcaggcacac 1320
ccagctttct tgtacaaagt ggtgatgatc tctcgaggta ccgcggccgc acgtccggcg 1380
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atcaaggtga acttcaagat ccgccacaac atcgaggacg gcagcgtgca gctcgccgac 1500
cactaccagc agaacacccc catcggcgac ggccccgtgc tgctgcccga caaccactac 1560
ctgagctacc agtccaagct gagcaaagac cccaacgaga agcgcgatca catggtcctg 1620
ctggagttcg tgaccgccgc cgggatcact ctcggcatgg acgagctgta caagtaccca 1680
tacgatgttc cagattacgc ttga 1704
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<211> 628
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SARS Nucleocapsid and Yellow Fluorescence Protein N-terminus
<400> 3
Met Val Leu Ala Ala Ala Asn Ser Ser Ile Thr Ser Leu Tyr Lys Lys
1 5 10 15
Ala Gly Phe Met Ser Asp Asn Gly Pro Gln Ser Asn Gln Arg Ser Ala
20 25 30
Pro Arg Ile Thr Phe Gly Gly Pro Thr Asp Ser Thr Asp Asn Asn Gln
35 40 45
Asn Gly Gly Arg Asn Gly Ala Arg Pro Lys Gln Arg Arg Pro Gln Gly
50 55 60
Leu Pro Asn Asn Thr Ala Ser Trp Phe Thr Ala Leu Thr Gln His Gly
65 70 75 80
Lys Glu Glu Leu Arg Phe Pro Arg Gly Gln Gly Val Pro Ile Asn Thr
85 90 95
Asn Ser Gly Pro Asp Asp Gln Ile Gly Tyr Tyr Arg Arg Ala Thr Arg
100 105 110
Arg Val Arg Gly Gly Asp Gly Lys Met Lys Glu Leu Ser Pro Arg Trp
115 120 125
Tyr Phe Tyr Tyr Leu Gly Thr Gly Pro Glu Ala Ser Leu Pro Tyr Gly
130 135 140
Ala Asn Lys Glu Gly Ile Val Trp Val Ala Thr Glu Gly Ala Leu Asn
145 150 155 160
Thr Pro Lys Asp His Ile Gly Thr Arg Asn Pro Asn Asn Asn Ala Ala
165 170 175
Thr Val Leu Gln Leu Pro Gln Gly Thr Thr Leu Pro Lys Gly Phe Tyr
180 185 190
Ala Glu Gly Ser Arg Gly Gly Ser Gln Ala Ser Ser Arg Ser Ser Ser
195 200 205
Arg Ser Arg Gly Asn Ser Arg Asn Ser Thr Pro Gly Ser Ser Arg Gly
210 215 220
Asn Ser Pro Ala Arg Met Ala Ser Gly Gly Gly Glu Thr Ala Leu Ala
225 230 235 240
Leu Leu Leu Leu Asp Arg Leu Asn Gln Leu Glu Ser Lys Val Ser Gly
245 250 255
Lys Gly Gln Gln Gln Gln Gly Gln Thr Val Thr Lys Lys Ser Ala Ala
260 265 270
Glu Ala Ser Lys Lys Pro Arg Gln Lys Arg Thr Ala Thr Lys Gln Tyr
275 280 285
Asn Val Thr Gln Ala Phe Gly Arg Arg Gly Pro Glu Gln Thr Gln Gly
290 295 300
Asn Phe Gly Asp Gln Asp Leu Ile Arg Gln Gly Thr Asp Tyr Lys His
305 310 315 320
Trp Pro Gln Ile Ala Gln Phe Ala Pro Ser Ala Ser Ala Phe Phe Gly
325 330 335
Met Ser Arg Ile Gly Met Glu Val Thr Pro Ser Gly Thr Trp Leu Thr
340 345 350
Tyr His Gly Ala Ile Lys Leu Asp Asp Lys Asp Pro Gln Phe Lys Asp
355 360 365
Asn Val Ile Leu Leu Asn Lys His Ile Asp Ala Tyr Lys Thr Phe Pro
370 375 380
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385 390 395 400
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405 410 415
Ala Ala Asp Met Asp Asp Phe Ser Arg Gln Leu Gln Asn Ser Met Ser
420 425 430
Gly Ala Ser Ala Asp Ser Thr Gln Ala His Pro Ala Phe Leu Tyr Lys
435 440 445
Val Val Ile Ser Val Pro Val Asp Ser Arg Gly Ser Arg Ser Ile Ala
450 455 460
Thr Met Val Ser Lys Gly Glu Glu Leu Phe Thr Gly Val Val Pro Ile
465 470 475 480
Leu Val Glu Leu Asp Gly Asp Val Asn Gly His Lys Phe Ser Val Ser
485 490 495
Gly Glu Gly Glu Gly Asp Ala Thr Tyr Gly Lys Leu Thr Leu Lys Phe
500 505 510
Ile Cys Thr Thr Gly Lys Leu Pro Val Pro Trp Pro Thr Leu Val Thr
515 520 525
Thr Phe Gly Tyr Gly Leu Lys Cys Phe Ala Arg Tyr Pro Asp His Met
530 535 540
Lys Gln His Asp Phe Phe Lys Ser Ala Met Pro Glu Gly Tyr Val Gln
545 550 555 560
Glu Arg Thr Ile Phe Phe Lys Asp Asp Gly Asn Tyr Lys Thr Arg Ala
565 570 575
Glu Val Lys Phe Glu Gly Asp Thr Leu Val Asn Arg Ile Glu Leu Lys
580 585 590
Gly Ile Asp Phe Lys Glu Asp Gly Asn Ile Leu Gly His Lys Leu Glu
595 600 605
Tyr Asn Tyr Asn Ser His Asn Val Tyr Ile Met Ala Asp Tyr Lys Asp
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Asp Asp Asp Lys
625
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<211> 567
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SARS Nucleocapsid and Yellow Fluorescence Protein C-terminus
<400> 4
Met Ala Met Glu Ala Arg Ile Ile Thr Ser Leu Tyr Lys Lys Ala Gly
1 5 10 15
Phe Met Ser Asp Asn Gly Pro Gln Ser Asn Gln Arg Ser Ala Pro Arg
20 25 30
Ile Thr Phe Gly Gly Pro Thr Asp Ser Thr Asp Asn Asn Gln Asn Gly
35 40 45
Gly Arg Asn Gly Ala Arg Pro Lys Gln Arg Arg Pro Gln Gly Leu Pro
50 55 60
Asn Asn Thr Ala Ser Trp Phe Thr Ala Leu Thr Gln His Gly Lys Glu
65 70 75 80
Glu Leu Arg Phe Pro Arg Gly Gln Gly Val Pro Ile Asn Thr Asn Ser
85 90 95
Gly Pro Asp Asp Gln Ile Gly Tyr Tyr Arg Arg Ala Thr Arg Arg Val
100 105 110
Arg Gly Gly Asp Gly Lys Met Lys Glu Leu Ser Pro Arg Trp Tyr Phe
115 120 125
Tyr Tyr Leu Gly Thr Gly Pro Glu Ala Ser Leu Pro Tyr Gly Ala Asn
130 135 140
Lys Glu Gly Ile Val Trp Val Ala Thr Glu Gly Ala Leu Asn Thr Pro
145 150 155 160
Lys Asp His Ile Gly Thr Arg Asn Pro Asn Asn Asn Ala Ala Thr Val
165 170 175
Leu Gln Leu Pro Gln Gly Thr Thr Leu Pro Lys Gly Phe Tyr Ala Glu
180 185 190
Gly Ser Arg Gly Gly Ser Gln Ala Ser Ser Arg Ser Ser Ser Arg Ser
195 200 205
Arg Gly Asn Ser Arg Asn Ser Thr Pro Gly Ser Ser Arg Gly Asn Ser
210 215 220
Pro Ala Arg Met Ala Ser Gly Gly Gly Glu Thr Ala Leu Ala Leu Leu
225 230 235 240
Leu Leu Asp Arg Leu Asn Gln Leu Glu Ser Lys Val Ser Gly Lys Gly
245 250 255
Gln Gln Gln Gln Gly Gln Thr Val Thr Lys Lys Ser Ala Ala Glu Ala
260 265 270
Ser Lys Lys Pro Arg Gln Lys Arg Thr Ala Thr Lys Gln Tyr Asn Val
275 280 285
Thr Gln Ala Phe Gly Arg Arg Gly Pro Glu Gln Thr Gln Gly Asn Phe
290 295 300
Gly Asp Gln Asp Leu Ile Arg Gln Gly Thr Asp Tyr Lys His Trp Pro
305 310 315 320
Gln Ile Ala Gln Phe Ala Pro Ser Ala Ser Ala Phe Phe Gly Met Ser
325 330 335
Arg Ile Gly Met Glu Val Thr Pro Ser Gly Thr Trp Leu Thr Tyr His
340 345 350
Gly Ala Ile Lys Leu Asp Asp Lys Asp Pro Gln Phe Lys Asp Asn Val
355 360 365
Ile Leu Leu Asn Lys His Ile Asp Ala Tyr Lys Thr Phe Pro Pro Thr
370 375 380
Glu Pro Lys Lys Asp Lys Lys Lys Lys Thr Asp Glu Ala Gln Pro Leu
385 390 395 400
Pro Gln Arg Gln Lys Lys Gln Pro Thr Val Thr Leu Leu Pro Ala Ala
405 410 415
Asp Met Asp Asp Phe Ser Arg Gln Leu Gln Asn Ser Met Ser Gly Ala
420 425 430
Ser Ala Asp Ser Thr Gln Ala His Pro Ala Phe Leu Tyr Lys Val Val
435 440 445
Met Ile Ser Arg Gly Thr Ala Ala Ala Arg Pro Ala Cys Lys Ile Pro
450 455 460
Asn Asp Leu Lys Gln Lys Val Met Asn His Asp Lys Gln Lys Asn Gly
465 470 475 480
Ile Lys Val Asn Phe Lys Ile Arg His Asn Ile Glu Asp Gly Ser Val
485 490 495
Gln Leu Ala Asp His Tyr Gln Gln Asn Thr Pro Ile Gly Asp Gly Pro
500 505 510
Val Leu Leu Pro Asp Asn His Tyr Leu Ser Tyr Gln Ser Lys Leu Ser
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Lys Asp Pro Asn Glu Lys Arg Asp His Met Val Leu Leu Glu Phe Val
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Thr Ala Ala Gly Ile Thr Leu Gly Met Asp Glu Leu Tyr Lys Tyr Pro
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Tyr Asp Val Pro Asp Tyr Ala
565
<210> 5
<211> 996
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Gene coding SARS Membrane Protein and Yellow Fluorescence Protein
N-terminus
<400> 5
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<210> 6
<211> 816
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Gene coding SARS Membrane Protein and Yellow Fluorescence Protein
C-terminus
<400> 6
atggccatgg aggcccgaat tatcacaagt ttgtacaaaa aagcaggctt cgttgcttcc 60
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<210> 7
<211> 332
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SARS Membrane Protein and Yellow Fluorescence Protein N-terminus
<400> 7
Met Val Leu Ala Ala Ala Asn Ser Ser Ile Thr Ser Leu Tyr Lys Lys
1 5 10 15
Ala Gly Phe Val Ala Ser Phe Arg Leu Phe Ala Arg Thr Arg Ser Met
20 25 30
Trp Ser Phe Asn Pro Glu Thr Asn Ile Leu Leu Asn Val Pro Leu Arg
35 40 45
Gly Thr Ile Val Thr Arg Pro Leu Met Glu Ser Glu Leu Val Ile Gly
50 55 60
Ala Val Ile Ile Arg Gly His Leu Arg Met Ala Gly His Pro Leu Gly
65 70 75 80
Arg Cys Asp Ile Lys Asp Leu Pro Lys Glu Ile Thr Val Ala Thr Ser
85 90 95
Arg Thr Leu Ser Tyr Tyr Lys Leu Gly Ala Ser Gln Arg Val Gly Thr
100 105 110
Asp Ser Gly Phe Ala Ala Tyr Asn Arg Tyr Arg Ile Gly Asn Tyr Lys
115 120 125
Leu Asn Thr Asp His Ala Gly Ser Asn Asp Asn Ile Ala Leu Leu Val
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Gln His Pro Ala Phe Leu Tyr Lys Val Val Ile Ser Val Pro Val Asp
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Ser Arg Gly Ser Arg Ser Ile Ala Thr Met Val Ser Lys Gly Glu Glu
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Leu Phe Thr Gly Val Val Pro Ile Leu Val Glu Leu Asp Gly Asp Val
180 185 190
Asn Gly His Lys Phe Ser Val Ser Gly Glu Gly Glu Gly Asp Ala Thr
195 200 205
Tyr Gly Lys Leu Thr Leu Lys Phe Ile Cys Thr Thr Gly Lys Leu Pro
210 215 220
Val Pro Trp Pro Thr Leu Val Thr Thr Phe Gly Tyr Gly Leu Lys Cys
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Phe Ala Arg Tyr Pro Asp His Met Lys Gln His Asp Phe Phe Lys Ser
245 250 255
Ala Met Pro Glu Gly Tyr Val Gln Glu Arg Thr Ile Phe Phe Lys Asp
260 265 270
Asp Gly Asn Tyr Lys Thr Arg Ala Glu Val Lys Phe Glu Gly Asp Thr
275 280 285
Leu Val Asn Arg Ile Glu Leu Lys Gly Ile Asp Phe Lys Glu Asp Gly
290 295 300
Asn Ile Leu Gly His Lys Leu Glu Tyr Asn Tyr Asn Ser His Asn Val
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Tyr Ile Met Ala Asp Tyr Lys Asp Asp Asp Asp Lys
325 330
<210> 8
<211> 271
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SARS Membrane Protein and Yellow Fluorescence Protein C-terminus
<400> 8
Met Ala Met Glu Ala Arg Ile Ile Thr Ser Leu Tyr Lys Lys Ala Gly
1 5 10 15
Phe Val Ala Ser Phe Arg Leu Phe Ala Arg Thr Arg Ser Met Trp Ser
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Ile Ile Arg Gly His Leu Arg Met Ala Gly His Pro Leu Gly Arg Cys
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Asp Ile Lys Asp Leu Pro Lys Glu Ile Thr Val Ala Thr Ser Arg Thr
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Leu Ser Tyr Tyr Lys Leu Gly Ala Ser Gln Arg Val Gly Thr Asp Ser
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Gly Phe Ala Ala Tyr Asn Arg Tyr Arg Ile Gly Asn Tyr Lys Leu Asn
115 120 125
Thr Asp His Ala Gly Ser Asn Asp Asn Ile Ala Leu Leu Val Gln His
130 135 140
Pro Ala Phe Leu Tyr Lys Val Val Met Ile Ser Arg Gly Thr Ala Ala
145 150 155 160
Ala Arg Pro Ala Cys Lys Ile Pro Asn Asp Leu Lys Gln Lys Val Met
165 170 175
Asn His Asp Lys Gln Lys Asn Gly Ile Lys Val Asn Phe Lys Ile Arg
180 185 190
His Asn Ile Glu Asp Gly Ser Val Gln Leu Ala Asp His Tyr Gln Gln
195 200 205
Asn Thr Pro Ile Gly Asp Gly Pro Val Leu Leu Pro Asp Asn His Tyr
210 215 220
Leu Ser Tyr Gln Ser Lys Leu Ser Lys Asp Pro Asn Glu Lys Arg Asp
225 230 235 240
His Met Val Leu Leu Glu Phe Val Thr Ala Ala Gly Ile Thr Leu Gly
245 250 255
Met Asp Glu Leu Tyr Lys Tyr Pro Tyr Asp Val Pro Asp Tyr Ala
260 265 270
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<211> 1383
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Gene Coding SARS Nucleocapsid C-terminus and Yellow Fluorescence
Protein N-terminus
<400> 9
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<211> 1203
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Gene Coding SARS Nucleocapsid C-terminus and Yellow Fluorescence
Protein C-terminus
<400> 10
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atggctagcg gaggtggtga aactgccctc gcgctattgc tgctagacag attgaaccag 240
cttgagagca aagtttctgg taaaggccaa caacaacaag gccaaactgt cactaagaaa 300
tctgctgctg aggcatctaa aaagcctcgc caaaaacgta ctgccacaaa acagtacaac 360
gtcactcaag catttgggag acgtggtcca gaacaaaccc aaggaaattt cggggaccaa 420
gacctaatca gacaaggaac tgattacaaa cattggccgc aaattgcaca atttgctcca 480
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tccatgagtg gagcttctgc tgattcaact caggcacacc cagctttctt gtacaaagtg 840
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aaacagaaag tcatgaacca cgacaagcag aagaacggca tcaaggtgaa cttcaagatc 960
cgccacaaca tcgaggacgg cagcgtgcag ctcgccgacc actaccagca gaacaccccc 1020
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tga 1203
<210> 11
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SARS Nucleocapsid C-terminus and Yellow Fluorescence Protein
N-terminus
<400> 11
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Asn Ser Thr Pro Gly Ser Ser Arg Gly Asn Ser Pro Ala Arg Met Ala
50 55 60
Ser Gly Gly Gly Glu Thr Ala Leu Ala Leu Leu Leu Leu Asp Arg Leu
65 70 75 80
Asn Gln Leu Glu Ser Lys Val Ser Gly Lys Gly Gln Gln Gln Gln Gly
85 90 95
Gln Thr Val Thr Lys Lys Ser Ala Ala Glu Ala Ser Lys Lys Pro Arg
100 105 110
Gln Lys Arg Thr Ala Thr Lys Gln Tyr Asn Val Thr Gln Ala Phe Gly
115 120 125
Arg Arg Gly Pro Glu Gln Thr Gln Gly Asn Phe Gly Asp Gln Asp Leu
130 135 140
Ile Arg Gln Gly Thr Asp Tyr Lys His Trp Pro Gln Ile Ala Gln Phe
145 150 155 160
Ala Pro Ser Ala Ser Ala Phe Phe Gly Met Ser Arg Ile Gly Met Glu
165 170 175
Val Thr Pro Ser Gly Thr Trp Leu Thr Tyr His Gly Ala Ile Lys Leu
180 185 190
Asp Asp Lys Asp Pro Gln Phe Lys Asp Asn Val Ile Leu Leu Asn Lys
195 200 205
His Ile Asp Ala Tyr Lys Thr Phe Pro Pro Thr Glu Pro Lys Lys Asp
210 215 220
Lys Lys Lys Lys Thr Asp Glu Ala Gln Pro Leu Pro Gln Arg Gln Lys
225 230 235 240
Lys Gln Pro Thr Val Thr Leu Leu Pro Ala Ala Asp Met Asp Asp Phe
245 250 255
Ser Arg Gln Leu Gln Asn Ser Met Ser Gly Ala Ser Ala Asp Ser Thr
260 265 270
Gln Ala His Pro Ala Phe Leu Tyr Lys Val Val Ile Ser Val Pro Val
275 280 285
Asp Ser Arg Gly Ser Arg Ser Ile Ala Thr Met Val Ser Lys Gly Glu
290 295 300
Glu Leu Phe Thr Gly Val Val Pro Ile Leu Val Glu Leu Asp Gly Asp
305 310 315 320
Val Asn Gly His Lys Phe Ser Val Ser Gly Glu Gly Glu Gly Asp Ala
325 330 335
Thr Tyr Gly Lys Leu Thr Leu Lys Phe Ile Cys Thr Thr Gly Lys Leu
340 345 350
Pro Val Pro Trp Pro Thr Leu Val Thr Thr Phe Gly Tyr Gly Leu Lys
355 360 365
Cys Phe Ala Arg Tyr Pro Asp His Met Lys Gln His Asp Phe Phe Lys
370 375 380
Ser Ala Met Pro Glu Gly Tyr Val Gln Glu Arg Thr Ile Phe Phe Lys
385 390 395 400
Asp Asp Gly Asn Tyr Lys Thr Arg Ala Glu Val Lys Phe Glu Gly Asp
405 410 415
Thr Leu Val Asn Arg Ile Glu Leu Lys Gly Ile Asp Phe Lys Glu Asp
420 425 430
Gly Asn Ile Leu Gly His Lys Leu Glu Tyr Asn Tyr Asn Ser His Asn
435 440 445
Val Tyr Ile Met Ala Asp Tyr Lys Asp Asp Asp Asp Lys
450 455 460
<210> 12
<211> 400
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Gene Coding SARS Nucleocapsid C-terminus and Yellow Fluorescence
Protein C-terminus
<400> 12
Met Ala Met Glu Ala Arg Ile Ile Thr Ser Leu Tyr Lys Lys Ala Gly
1 5 10 15
Phe Leu Pro Lys Gly Phe Tyr Ala Glu Gly Ser Arg Gly Gly Ser Gln
20 25 30
Ala Ser Ser Arg Ser Ser Ser Arg Ser Arg Gly Asn Ser Arg Asn Ser
35 40 45
Thr Pro Gly Ser Ser Arg Gly Asn Ser Pro Ala Arg Met Ala Ser Gly
50 55 60
Gly Gly Glu Thr Ala Leu Ala Leu Leu Leu Leu Asp Arg Leu Asn Gln
65 70 75 80
Leu Glu Ser Lys Val Ser Gly Lys Gly Gln Gln Gln Gln Gly Gln Thr
85 90 95
Val Thr Lys Lys Ser Ala Ala Glu Ala Ser Lys Lys Pro Arg Gln Lys
100 105 110
Arg Thr Ala Thr Lys Gln Tyr Asn Val Thr Gln Ala Phe Gly Arg Arg
115 120 125
Gly Pro Glu Gln Thr Gln Gly Asn Phe Gly Asp Gln Asp Leu Ile Arg
130 135 140
Gln Gly Thr Asp Tyr Lys His Trp Pro Gln Ile Ala Gln Phe Ala Pro
145 150 155 160
Ser Ala Ser Ala Phe Phe Gly Met Ser Arg Ile Gly Met Glu Val Thr
165 170 175
Pro Ser Gly Thr Trp Leu Thr Tyr His Gly Ala Ile Lys Leu Asp Asp
180 185 190
Lys Asp Pro Gln Phe Lys Asp Asn Val Ile Leu Leu Asn Lys His Ile
195 200 205
Asp Ala Tyr Lys Thr Phe Pro Pro Thr Glu Pro Lys Lys Asp Lys Lys
210 215 220
Lys Lys Thr Asp Glu Ala Gln Pro Leu Pro Gln Arg Gln Lys Lys Gln
225 230 235 240
Pro Thr Val Thr Leu Leu Pro Ala Ala Asp Met Asp Asp Phe Ser Arg
245 250 255
Gln Leu Gln Asn Ser Met Ser Gly Ala Ser Ala Asp Ser Thr Gln Ala
260 265 270
His Pro Ala Phe Leu Tyr Lys Val Val Met Ile Ser Arg Gly Thr Ala
275 280 285
Ala Ala Arg Pro Ala Cys Lys Ile Pro Asn Asp Leu Lys Gln Lys Val
290 295 300
Met Asn His Asp Lys Gln Lys Asn Gly Ile Lys Val Asn Phe Lys Ile
305 310 315 320
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325 330 335
Gln Asn Thr Pro Ile Gly Asp Gly Pro Val Leu Leu Pro Asp Asn His
340 345 350
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355 360 365
Asp His Met Val Leu Leu Glu Phe Val Thr Ala Ala Gly Ile Thr Leu
370 375 380
Gly Met Asp Glu Leu Tyr Lys Tyr Pro Tyr Asp Val Pro Asp Tyr Ala
385 390 395 400
<210> 13
<211> 59
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 13
ggggacaagt ttgtacaaaa aagcaggctt catgtctgat aatggacccc aatcaaacc 59
<210> 14
<211> 56
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 14
ggggaccact ttgtacaaga aagctgggtg tgcctgagtt gaatcagcag aagctc 56
<210> 15
<211> 55
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 15
ggggacaagt ttgtacaaaa aagcaggctt cttgccaaaa ggcttctacg cagag 55
<210> 16
<211> 56
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 16
ggggacaagt ttgtacaaaa aagcaggctt cgttgcttcc ttcaggctgt ttgctc 56
<210> 17
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 17
ggggaccact ttgtacaaga aagctgggtg ctgtactagc aaagcaatat tgtcgttgct 60
60
Claims (14)
- ⅰ) 사스(SARS, Severe Acute Respiratory Syndrome, 중증급성호흡기증후군) 바이러스의 뉴클레오캡시드 단백질의 1-422 아미노산 서열을 갖는 단백질 전체 또는 168-422 아미노산 서열을 갖는 C-말단 부위를 코딩하는 유전자에 노랑형광단백질(Yellow Fluorescence Protein, YFP) N-말단 부위를 코딩하는 유전자를 pDONR221, pFPIA-YN 또는 pFPIA-YC 벡터에 삽입하고, 또 다른 뉴클레오캡시드 단백질을 코딩하는 유전자에 노랑형광단백질 C-말단 부위를 코딩하는 유전자를 삽입하는 단계;ⅱ) 상기 유전자를 이용하여 HEK293T 동물세포를 형질전환시키는 단계;ⅲ) 상기 형질전환된 동물세포에서 상기 유전자를 발현시키는 단계; 및ⅳ) 상기 발현된 뉴클레오캡시드 단백질을 500 ㎚에서 여기 및 535 ㎚에서 방출파장을 이용한 형광현미경 또는 형광분석법을 통해 형광 단백질의 분포 및 형광 세기를 측정하는 단계;를 포함하는 사스 바이러스의 뉴클레오캡시드 단백질의 자가정렬 측정방법.
- 삭제
- 삭제
- 삭제
- 제 1항에 있어서, 상기 ⅰ) 단계의 유전자는 서열번호 13과 14 또는 서열번호 15와 14로 기재되는 프라이머를 이용하여 DNA 중합연쇄 반응법(PCR)으로 증폭되는 것을 특징으로 하는 사스 바이러스의 뉴클레오캡시드 단백질의 자가정렬 측정방법.
- 삭제
- 삭제
- ⅰ) 사스 바이러스의 뉴클레오캡시드 단백질을 코딩하는 유전자에 노랑형광단백질 N-말단 부위를 코딩하는 유전자를 삽입하고, 또 다른 뉴클레오캡시드 단백질을 코딩하는 유전자에 노랑형광단백질 C-말단 부위를 코딩하는 유전자를 삽입하는 단계;ⅱ) 상기 유전자를 이용하여 동물세포를 형질전환시키는 단계;ⅲ) 상기 형질전환된 동물세포에서 상기 유전자를 발현시키고, 상기 형질전환된 동물세포에 항-사스 바이러스 활성을 가질 수 있는 시험물질을 처리하는 단계; 및ⅳ) 형광현미경 또는 형광분석법을 통해 형광 단백질의 분포 및 형광 세기를 측정하는 단계;를 포함하는 제1항의 방법을 이용한 항-사스 바이러스 활성을 갖는 물질의 검색방법.
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- 삭제
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
KR1020080053761A KR101105189B1 (ko) | 2008-06-09 | 2008-06-09 | 중증급성호흡기증후군 바이러스의 뉴클레오캡시드와 세포막단백질간의 상호작용 측정방법 및 항-사스 바이러스활성을 갖는 물질의 검색방법 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
KR1020080053761A KR101105189B1 (ko) | 2008-06-09 | 2008-06-09 | 중증급성호흡기증후군 바이러스의 뉴클레오캡시드와 세포막단백질간의 상호작용 측정방법 및 항-사스 바이러스활성을 갖는 물질의 검색방법 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
KR20090127671A KR20090127671A (ko) | 2009-12-14 |
KR101105189B1 true KR101105189B1 (ko) | 2012-01-13 |
Family
ID=41688309
Family Applications (1)
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KR1020080053761A KR101105189B1 (ko) | 2008-06-09 | 2008-06-09 | 중증급성호흡기증후군 바이러스의 뉴클레오캡시드와 세포막단백질간의 상호작용 측정방법 및 항-사스 바이러스활성을 갖는 물질의 검색방법 |
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Country | Link |
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KR (1) | KR101105189B1 (ko) |
-
2008
- 2008-06-09 KR KR1020080053761A patent/KR101105189B1/ko not_active IP Right Cessation
Non-Patent Citations (3)
Title |
---|
The Journal of Molecular Biology* |
논문2;Biochem Biophys Res Commun* |
논문3;The International Journal of Biochemistry Cell Biology* |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
KR20090127671A (ko) | 2009-12-14 |
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