KR100886937B1 - 유방암 및 난소암의 예측 또는 진단에 유용한 ｂｒｃａ1,ｂｒｃａ2 유전자 돌연변이 - Google Patents
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Abstract
본 발명은 유방암 및 난소암의 소인 및 감수성을 판단하기 위해 이용될 수 있는 한국인 특이적인 BRCA1 및 BRCA2 유전자 돌연변이에 관한 것이다.
유방암, 난소암, BRCA1, BRCA2, 유전자 돌연변이
Description
도 1은 BRCA1 유전자의 구조 및 돌연변이 분포를 개략적으로 도시한다. 번호는 엑손을 나타내며 화살표 머리는 돌연변이가 존재하는 위치를 개략적으로 표시한다.
도 2는 BRCA2 유전자의 구조 및 돌연변이 분포를 개략적으로 도시한다. 번호는 엑손을 나타내며 화살표 머리는 돌연변이가 존재하는 위치를 개략적으로 표시한다.
도 3은 BRCA1 유전자 돌연변이 중 하나인, BRCA1 유전자(서열번호 1)의 5339번째 뉴클레오티드(엑손 22에 위치함)가 T에서 C로 치환된 돌연변이의 F-CSGE 분석 그래프를 도시한다.
도 4는 BRCA2 유전자 돌연변이 중 하나인, BRCA2 유전자(서열번호 9)의 8827번째와 8828번째 뉴클레오티드(엑손 22에 위치함) 사이에 G가 삽입된 돌연변이의 F-CSGE 분석 그래프를 도시한다.
본 발명은 유방암 및 난소암의 발병 유전자로 알려진 BRCA1 및 BRCA2 유전자에 관한 것이다. 보다 구체적으로는, 유방암 및 난소암의 감수성 예측이나 진단시 이용될 수 있는 한국인 특이적인 생식세포 돌연변이 및 이들을 BRCA1 및 BRCA2 유전자로부터 검출하는 방법에 관한 것이다.
BRCA1 유전자는 염색체 17번에 위치하며 22개의 엑손으로 구성되며, 최초로 유방암 및 난소암의 발병 위험성을 증가시키는 유전자로 검증된 유전자이다. BRCA2 유전자는 염색체 13번에 위치하며, 26개의 엑손으로 구성되고 BRCA1에 이어 유방암 및 난소암의 발병 위험성을 증가시키는 유전자로 검증되었다. 부모 중 한쪽으로부터 BRCA1, BRCA2 유전자 돌연변이를 유전받은 사람은 70세가 될 때까지 유방암 발병 확률이 87%에 이르며, 폐경기 이전의 40 내지 50세에 유방암이 발병할 확률은 59%이다.
BRCA1은 유방암뿐 아니라 난소암의 발병에도 관련이 있어, BRCA1 유전자 돌연변이를 가진 사람의 난소암 발병률은 70세 이전에 44%에 이른다(Ford, et al., 1994). 돌연변이가 일어난 BRCA 유전자는 모계뿐 아니라 부계로부터 유전될 수도 있으며, 여성뿐 아니라 남성도 유전자 돌연변이를 가진 경우, 유방암의 발병율은 높아진다.
대략 유방암의 7%, 난소암의 10%가 BRCA1 및 BRCA2 유전자의 돌연변이와 관련이 있는 것으로 알려지고 있다. 이들 두 유전자 중에 돌연변이가 있을 경우, 유방암 발생률이 56~87% 까지 상승되며, 난소암의 발생률도 정상인의 10배 이상으로 상승된다. 또한 유방암, 난소암의 재발율을 증가시키며, 전립선암, 대장암 등 기타 암들에 대한 질병민감도를 증가시키는 것으로 알려져 있다.
BRCA1 및 BRCA2 유전자의 돌연변이 발생빈도는 민족별로 차이가 있으며, 현재까지 3400 여종의 생식세포 BRCA1 및 BRCA2 돌연변이, 다형성 및 서열 변이가 확인되었다(Breast Cancer Information Core(BIC), National Center for Human Genome Research, National Institute of Health: http://research.nhgri.nih.gov/projects/bic/). BRCA1 및 BRCA2 유전자 돌연변이의 분석은 유방암의 유전에 관한 이해를 크게 심화시켰으나, 한국인을 대상으로 한 BRCA1 및 BRCA2 유전자 돌연변이의 발생 빈도 및 특이적인 돌연변이 유형에 대해서는 밝혀진 바와 많지 않다. 특히, 유방암은 국내에서 연간 7,600 여명의 신규 환자가 발생하고 있으며, 여성의 경우 위암에 이어 두 번째로 높은 발병률을 기록하고 있다(한국 중앙 암 등록사업 연례보고서).
따라서, 한국인을 대상으로 한 BRCA1 및 BRCA2 유전자의 돌연변이 및 단일염기다형성을 포함하는 뉴클레오티드 변이 양상을 연구하여 한국인 특이적인 BRCA1 및 BRCA2 유전자 돌연변이를 파악하는 것이 요구된다. BRCA1 및 BRCA2 유전자의 돌연변이 유무를 분석하는 것은 유방암 및 난소암의 발병 위험성을 조기에 진단함으로써, 보다 적극적인 예방 프로그램을 수행하여 발병위험성을 최소화하는데 기여할 수 있을 것이다. 이에 본 발명자들은 다수의 한국인 유방암 환자들 및 정상인들로부터 수득된 시료를 분석하여, BRCA1 및 BRCA2 유전자 상에 존재하는 돌연변이 유형 및 빈도를 조사하여 유방암 및 난소암 예측 및 진단에 활용할 수 있는 유전자 돌연변이를 확인하였다.
본 발명의 목적은 유방암 및 난소암의 진단에 활용될 수 있는 한국인 특이적인 BRCA1 및 BRCA2 유전자 돌연변이를 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 목적은 유방암 또는 난소암의 진단을 위해 프라이머 또는 프로브로 활용될 수 있는 한국인 특이적인 BRCA1 또는 BRCA2 유전자 돌연변이를 포함하는 20 내지 100개의 연속된 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드를 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 목적은 한국인 특이적인 BRCA1 또는 BRCA2 유전자 돌연변이를 포함하는 20개 내지 100개의 연속된 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드 또는 이의 상보적인 서열을 프로브로 포함하는 유방암 및 난소암 진단용 마이크로어레이를 제공하는 것이다.
본 발명에서 사용되는 유전자 돌연변이는 다음과 같이 정의된다:
서열번호 1 및 서열번호 9는 각각 BRCA1(Gen Bank Accession No. NM_007294.1) 및 BRCA2(Gen Bank Accession No. NM_000059.1)의 코딩 서열(CDS)을 나타내며, 번역 개시 코돈인 ATG의 A를 뉴클레오티드 +1로 표시한다. BRCA1 및 BRCA2 유전자의 엑손 내의 돌연변이는 각각 서열번호 1 및 서열번호 9를 기준으로 표시된다. 삽입(insertion) 돌연변이는 'ins'로 표시하고, 결실(deletion) 돌연변이는 'del'로 표시하며, 'ins'와 'del' 다음의 문자는 실제 삽입 또는 결실된 뉴클 레오티드를 의미한다. 치환(substitution) 돌연변이는 기호'>'를 표시하여 기재하며, '>'앞의 문자는 정상인 BRCA1, BRCA2 유전자의 뉴클레오티드이며, '>' 뒤의 문자는 돌연변이 BRCA1, BRCA2 유전자의 뉴클레오티드를 의미한다.
서열번호 2 내지 8은 GenBank 게놈 기준 서열 NT_010755.15를 참조하고 서열번호 10 내지 12는 GenBank 게놈 기준 서열 NT_024524.13을 참조한다. 서열번호 2 내지 8 및 서열번호 10 내지 12는 각각 BRCA1 및 BRCA2의 인트론(intron) 부위 또는 스플라이싱(splicing) 부위의 돌연변이를 표시하기 위해 이용되며, 해당되는 코돈과 인트론의 접경 부위의 서열, 즉, 코돈과 인트론의 일부를 포함하는 서열을 나타낸다. 인트론의 시작 부위에 존재하는 돌연변이는 선행하는 엑손의 마지막 뉴클레오티드의 번호(코딩 서열 기준) 다음에 '+' 및 이에 뒤이어 상기 뉴클레오티드로부터 돌연변이 부위까지의 뉴클레오티드의 수를 기재하고 그 다음에 돌연변이의 유형을 기재한다. 예를 들면, 'c.548+13delG'는 코딩서열상의 548번째 뉴클레오티드로부터 13번째에 위치한 뉴클레오티드 G가 결실된 돌연변이를 의미한다. 한편, 인트론의 종결 부위에 존재하는 돌연변이는 후행하는 엑손의 첫번째 뉴클레오티드 번호(코딩 서열 기준) 다음에 '-' 부호 및 뒤이어 상기 엑손 상의 뉴클레오티드로부터 상향(upstream)으로 인트론 내의 해당하는 위치까지의 뉴클레오티드의 수를 기재하고 그 다음에 돌연변이의 유형을 기재한다. 예를 들면, 'c.5194-10G>T'는 코딩 서열상의 5194번째 뉴클레오티드로부터 상향으로 10번째에 위치한 뉴클레오티드 G가 T로 치환된 돌연변이를 의미한다.
도 1 및 도 2는 BRCA1 및 BRCA2 유전자의 구조 및 본 발명에서 확인된 유전 자 돌연변이의 개략적인 분포를 도시한다.
본 발명의 일 양태는 하기로 구성된 군으로부터 선택되는 BRCA1 유전자 돌연변이를 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열, 예를 들면, 20-80개, 20-60개, 20-50개, 또는 20-40개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드를 제공한다:
(1) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 38번째 염기와 39번째 염기에서 AT의 결실 및 GGG의 삽입;
(2) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 154번째 염기의 C에서 T로의 치환;
(3) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 390번째 염기의 C에서 A로의 치환;
(4) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 527번째 염기의 C에서 T로의 치환;
(5) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 720번째와 721번째 사이에 A의 삽입;
(6) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 811번째 염기의 G에서 A로의 치환;
(7) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 928번째 염기의 C에서 T로의 치환;
(8) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 1293번째 염기에서 1295번째 염기까지 ACT의 결실 및 GA의 삽입;
(9) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 1516번째 염기에서 1520번째 염기까지 5개의 염기의 결실;
(10) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 1612번째 염기의 C에서 T로의 치환;
(11) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 1716번째 염기 A의 결실;
(12) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 1823번째 염기 A의 결실;
(13) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 1831번째 염기 C의 결실;
(14) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 1840번째 염기의 A에서 G로의 치환;
(15) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 1865번째 염기의 C에서 T로의 치환;
(16) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 1961번째 염기 A의 결실;
(17) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 2048번째 염기 A의 결실;
(18) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 2359번째 염기 G의 결실;
(19) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 2433번째 염기 C의 결실;
(20) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 2481번째 염기의 A에서 C로의 치환;
(21) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 2726번째 염기의 A에서 T로의 치환;
(22) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 2934번째 염기 T의 결실;
(23) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 2968번째 염기의 G에서 A로의 치환;
(24) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3296번째 염기 C의 결실;
(25) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3329번째 염기 A의 결실;
(26) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3340번째 염기의 G에서 T로의 치환;
(27) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3409번째 염기의 A에서 G로의 치환;
(28) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3436번째에서 3439 번째까지 4개의 염기의 결실;
(29) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3442번째 염기 G의 결실;
(30) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3448번째 염기의 C에서 T로의 치환;
(31) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3472번째 염기의 G에서 T로의 치환;
(32) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3593번째 염기의 T에서 A로의 치환;
(33) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3627번째와 3628번째 사이에 A의 삽입;
(34) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3722번째 염기의 C에서 G로의 치환;
(35) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3756번째에서 3759번째까지 4개의 염기의 결실;
(36) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3812번째와 3813번째 사이에 T의 삽입;
(37) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3895번째 염기의 C에서 T로의 치환;
(38) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 4041번째에서 4142 번째까지 2개의 염기의 결실;
(39) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 4065번째에서 4068번째까지 4개의 염기의 결실;
(40) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 4338번째 염기와 4339번째 염기 사이에 4개의 염기 AGAA의 삽입;
(41) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 4729번째 염기의 T에서 C로의 치환;
(42) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 4743번째 염기의 A에서 C로의 치환;
(43) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 4981번째 염기의 G에서 T로의 치환;
(44) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 5030번째에서 5033번째까지 4개의 염기의 결실;
(45) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 5102번째에서 5103번째까지 2개의 염기의 결실;
(46) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 5323번째에서 5324번째까지 2개의 염기의 결실;
(47) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 5339번째 염기의 T에서 C로의 치환;
(48) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 5444번째 염기의 G 에서 A로의 치환;
(49) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 5470번째로부터 5477번째까지 8개의 염기의 결실;
(50) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 5483번째 염기 G의 결실;
(51) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 5497번째로부터 5506번째까지 10개의 염기의 결실; 및
(52) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 5532번째와 5533번째 사이에 G의 삽입; 및
(53) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 5553번째와 5554번째 사이에 C의 삽입;
(54) 서열번호 2의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 210번째에 존재하는 G가 결실된 것인 돌연변이 c.547+13delG;
(55) 서열번호 3의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 218번째에 존재하는 염기 A가 G로 치환된 것인 돌연변이 c.4484+14A>G;
(56) 서열번호 4의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 167번째에 존재하는 염기 G가 T로 치환된 것인 돌연변이 c.5194-10G>T;
(57) 서열번호 5의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 171번째에 존재하는 염기 G가 A로 치환된 것인 돌연변이 c.441+1G>A;
(58) 서열번호 6의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 149번째에 존재하는 염기 A가 C로 치환된 것인 돌연변이 c.302-2A>C;
(59) 서열번호 7의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 124번째에 존재하는 염기 A가 G로 치환된 것인 돌연변이 c.671-8A>G; 및
(60) 서열번호 8의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 205번째에 존재하는 염기 G가 T로 치환된 것인 돌연변이 c.5074+1G>T.
상기에서, 돌연변이 (1) 내지 (53)은 BRCA1 유전자의 코딩 서열상에 존재하는 돌연변이로서 서열번호 1을 기준으로 표시된다. 이들은 각각 서열번호 1의 해당하는 위치에서 뉴클레오티드의 결실, 삽입 또는 치환 돌연변이에 해당되며, 이에 의해 정상인 BRCA1과 다른 아미노산 서열이 생성되고, 이는 BRCA1 단백질의 생체 내 기능을 변화시킬 수 있다.
또한, 상기에서 돌연변이 (54) 내지 (60)은 BRCA1 유전자의 코딩 서열이 아닌 인트론 또는 스플라이싱 부위에서의 돌연변이이다:
돌연변이 (54)는 코딩 서열 상(서열번호 1)의 547번 위치에 존재하는 뉴클레오티드로부터 13번째 위치(서열번호 2의 210번)에 존재하는 뉴클레오티드 G가 결실된 것인 인트론 상의 돌연변이이다. 인트론은 아미노산을 코딩하는 부위가 아니므로, 아미노산 서열에는 변화가 없으나, 스플라이싱의 변화로 인한 RNA 생성의 차이 때문에 BRCA1 발현 양상의 변화를 초래할 수 있다.
돌연변이 (55)는 코딩 서열 상(서열번호 1)의 4487번 위치에 존재하는 뉴클레오티드로부터 14번째 위치(서열번호 3의 218번)에 존재하는 뉴클레오티드 A가 G로 치환된 것인 인트론 상의 돌연변이이다. 인트론은 아미노산을 코딩하는 부위가 아니므로, 아미노산 서열에는 변화가 없으나, 스플라이싱의 변화로 인한 RNA 생성의 차이 때문에 BRCA1 발현 양상의 변화를 초래할 수 있다.
돌연변이 (56)은 코딩 서열 상(서열번호 1)의 5194번 위치에 존재하는 뉴클레오티드로부터 상향으로 10번째 위치(서열번호 4의 167번)에 존재하는 뉴클레오티드 G가 T로 치환된 것인 인트론 상의 돌연변이이다. 인트론은 아미노산을 코딩하는 부위가 아니므로, 아미노산 서열에는 변화가 없으나, 스플라이싱의 변화로 인한 RNA 생성의 차이 때문에 BRCA1 발현 양상의 변화를 초래할 수 있다.
돌연변이 (57)은 코딩 서열 상(서열번호 1)의 441번 위치에 존재하는 뉴클레오티드 바로 다음(서열번호 5의 171번)에 존재하는 뉴클레오티드 G가 A로 치환된 것인 스플라이싱 부위의 돌연변이이다. 스플라이싱 부위는 아미노산을 코딩하는 부위가 아니므로, 아미노산 서열에는 변화가 없으나, 스플라이싱의 변화로 인한 RNA 생성의 차이 때문에 BRCA1 발현 양상의 변화를 초래할 수 있다.
돌연변이 (58)은 코딩 서열 상(서열번호 1)의 302번 위치에 존재하는 뉴클레오티드로부터 상향으로 2번째 위치(서열번호 6의 149번)에 존재하는 뉴클레오티드 A가 C로 치환된 것인 스플라이싱 부위의 돌연변이이다. 스플라이싱 부위는 아미노산을 코딩하는 부위가 아니므로, 아미노산 서열에는 변화가 없으나, 스플라이싱의 변화로 인한 RNA 생성의 차이 때문에 BRCA1 발현 양상의 변화를 초래할 수 있다.
돌연변이 (59)는 코딩 서열 상(서열번호 1)의 671번 위치에 존재하는 뉴클레오티드로부터 상향으로 8번째 위치(서열번호 7의 124번)에 존재하는 뉴클레오티드 A가 G로 치환된 것인 인트론 상의 돌연변이이다. 인트론은 아미노산을 코딩하는 부 위가 아니므로, 아미노산 서열에는 변화가 없으나, 스플라이싱의 변화로 인한 RNA 생성의 차이 때문에 BRCA1 발현 양상의 변화를 초래할 수 있다.
돌연변이 (60)은 코딩 서열 상(서열번호 1)의 5074번 위치에 존재하는 뉴클레오티드의 바로 다음(서열번호 8의 205번)에 존재하는 뉴클레오티드 G가 T로 치환된 것인 인트론 상의 돌연변이이다. 인트론은 아미노산을 코딩하는 부위가 아니므로, 아미노산 서열에는 변화가 없으나, 스플라이싱의 변화로 인한 RNA 생성의 차이 때문에 BRCA1 발현 양상의 변화를 초래할 수 있다.
본 발명의 폴리뉴클레오티드는 프로브 또는 프라이머로 사용될 수 있다.
본 발명의 또 다른 양태는 또한 하기로 구성된 군으로부터 선택되는 BRCA2 돌연변이를 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열, 예를 들면, 20-80개, 20-60개, 20-50개, 또는 20-40개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드를 제공한다:
(1) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 53번째 염기의 G에서 A로의 치환;
(2) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 97번째 염기의 G에서 T로의 치환;
(3) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 125번째 염기의 A에서 G로의 치환;
(4) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 276번째와 277번째 사이에 A의 삽입;
(5) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 475번째 염기의 G에서 A로의 치환;
(6) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 623번째 염기의 T에서 G로의 치환;
(7) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 658번째 염기에서 659번째 염기까지 2개의 염기의 결실;
(8) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 943번째 염기의 T에서 A로의 치환;
(9) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 964번째 염기의 A에서 C로의 치환;
(10) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 994번째 염기 A의 결실;
(11) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 1310번째 염기에서 1313번째 염기까지 4개의 염기의 결실;
(12) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 1399번째 염기의 A에서 T로의 치환;
(13) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 1547번째 염기 T의 결실;
(14) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 1744번째 염기의 A에서 C로의 치환;
(15) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 1847번째 염기의 G에서 A로의 치환;
(16) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 1889번째 염기의 C에서 T로의 치환;
(17) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 2465번째 염기의 G에서 A로의 치환;
(18) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 2798번째 염기에서 2799번째 염기까지 2개의 염기의 결실;
(19) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 2808번째 염기에서 2811번째 염기까지 4개의 염기의 결실;
(20) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 2912번째 염기의 T에서 G로의 치환;
(21) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3096번째 염기에서 3110번째 염기까지 15개의 염기의 결실 및 T의 삽입;
(22) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3195번째 염기에서 3198번째 염기까지 4개의 염기의 결실;
(23) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3220번째 염기의 A에서 T로의 치환;
(24) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3341번째 염기의 T에서 G로의 치환;
(25) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3352번째 염기에서 3356번째 염기까지 5개의 염기의 결실;
(26) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3744번째 염기에서 3747번째 염기까지 4개의 염기의 결실;
(27) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3814번째 염기의 A에서 G로의 치환;
(28) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3814번째 염기의 A에서 T로의 치환;
(29) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 4376번째 염기의 A에서 G로의 치환;
(30) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 4766번째 염기 C의 결실;
(31) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 4829번째 염기에서 4830번째 염기까지 2개의 염기의 결실;
(32) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 4854번째 염기의 T에서 A로의 치환;
(33) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 5207번째 염기에서 5208번째 염기까지 2개의 염기의 결실;
(34) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 5250번째 염기 C의 결실;
(35) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 5576번째 염기에서 5579번째 염기까지 4개의 염기의 결실;
(36) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 5656번째 염기의 C에서 T로의 치환;
(37) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 5744번째 염기의 C에서 T로의 치환;
(38) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 5946번째 염기에서 5949번째 염기까지 4개의 염기의 결실;
(39) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 5969번째 염기의 A에서 C로의 치환;
(40) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 6029번째 염기의 T에서 G로의 치환;
(41) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 6082번째 염기의 G에서 T로의 치환;
(42) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 6086번째 염기의 A에서 G로의 치환;
(43) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 6131번째 염기의 G에서 T로의 치환;
(44) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 6239번째 염기의 T에서 G로의 치환;
(45) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 6325번째 염기의 G에서 A로의 치환;
(46) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 6448번째 염기의 A에서 C로의 치환;
(47) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 6496번째 염기의 G에서 T로의 치환;
(48) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 6553번째 염기 G의 결실;
(49) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 6724번째 염기에서 6725번째 염기까지 2개의 염기의 결실;
(50) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 6839번째 염기의 T에서 G로의 치환;
(51) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 6875번째 염기의 A에서 C로의 치환;
(52) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 7052번째 염기의 C에서 G로의 치환;
(53) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 7088번째 염기의 A에서 G로의 치환;
(54) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 7218번째 염기의 T에서 G로의 치환;
(55) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 7411번째 염기의 A에서 G로의 치환;
(56) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 7469번째 염기의 T에서 C로의 치환;
(57) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 7480번째 염기의 C에서 T로의 치환;
(58) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 7522번째 염기의 G에서 A로의 치환;
(59) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 7625번째 염기의 C에서 A로의 치환;
(60) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 7814번째 염기의 G에서 A로의 치환;
(61) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 7876번째 염기의 T에서 C로의 치환;
(62) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 8063번째 염기의 T에서 A로의 치환;
(63) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 8299번째 염기와 8300번째 염기 사이에 AC의 삽입;
(64) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 8437번째 염기에서 8439번째 염기까지 3개의 염기의 결실;
(65) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 8717번째 염기에서 8718번째 염기까지 2개의 염기의 결실;
(66) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 8827번째 염기와 8828번째 염기 사이에 G의 삽입;
(67) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 8932번째 염기의 T에서 G로의 치환;
(68) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 8951번째 염기의 C에서 G로의 치환;
(69) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 8991번째 염기의 T에서 G로의 치환;
(70) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 9076번째 염기의 C에서 T로의 치환;
(71) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 9253번째와 9254번째 사이에 A의 삽입;
(72) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 9309번째 염기의 A에서 C로의 치환;
(73) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 10150번째 염기의 C에서 T로의 치환.
(74) 서열번호 10의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서, 171번째 염기 T가 결실된 것인 돌연변이 c.68-7delT;
(75) 서열번호 11의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서, 208번째 염기 T가 C로 치환된 것인 돌연변이 c.425+13T>C; 및
(76) 서열번호 12의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서, 118번째 염기 C가 A로 치환된 것인 돌연변이 c.517-12C>T.
상기에서, 돌연변이 (1) 내지 (73)은 BRCA2 유전자의 코딩 서열상에 존재하는 돌연변이로서 서열번호 9를 기준으로 표시된다. 이들은 각각 서열번호 9의 해당하는 위치에서 뉴클레오티드의 결실, 삽입 또는 치환 돌연변이에 해당되며, 이에 의해 정상인 BRCA2와 다른 아미노산 서열이 생성되고, 이는 BRCA2 단백질의 생체 내 기능을 변화시킬 수 있다.
또한, 상기에서 돌연변이 (74) 내지 (76)은 BRCA2 유전자의 코딩 서열이 아닌 인트론에서의 돌연변이이다:
돌연변이 (74)는 코딩 서열 상(서열번호 9)의 68번 위치에 존재하는 뉴클레오티드로부터 상향으로 7번째 위치(서열번호 10의 171번)에 존재하는 뉴클레오티드 T가 결실된 것인 인트론 상의 돌연변이이다. 인트론은 아미노산을 코딩하는 부위가 아니므로, 아미노산 서열에는 변화가 없으나, 스플라이싱의 변화로 인한 RNA 생성의 차이 때문에 BRCA2 발현 양상의 변화를 초래할 수 있다.
돌연변이 (75)는 코딩 서열 상(서열번호 9)의 425번 위치에 존재하는 뉴클레오티드로부터 13번째 위치(서열번호 11의 208번)에 존재하는 뉴클레오티드 T가 C로 치환된 것인 인트론 상의 돌연변이이다. 인트론은 아미노산을 코딩하는 부위가 아니므로, 아미노산 서열에는 변화가 없으나, 스플라이싱의 변화로 인한 RNA 생성의 차이 때문에 BRCA2 발현 양상의 변화를 초래할 수 있다.
돌연변이 (76)은 코딩 서열 상(서열번호 9)의 517번 위치에 존재하는 뉴클레오티드로부터 상향으로 12번째 위치(서열번호 12의 118번)에 존재하는 뉴클레오티드 C가 T로 치환된 것인 인트론 상의 돌연변이이다. 인트론은 아미노산을 코딩하는 부위가 아니므로, 아미노산 서열에는 변화가 없으나, 스플라이싱의 변화로 인한 RNA 생성의 차이 때문에 BRCA1 발현 양상의 변화를 초래할 수 있다.
본 발명에 따르면, BRCA1 및/또는 BRCA2 유전자에 상기와 같은 돌연변이를 갖는 사람은 정상인에 비해 유방암 및/또는 난소암의 발생 가능성이 높다.
본 발명의 또 다른 양태는 상기와 같은 BRCA1 또는 BRCA2 유전자에 존재하는 돌연변이를 포함하는 20 내지 100개의 연속된 뉴클레오티드 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 서열의 폴리뉴클레오티드로 구성된 프라이머 또는 프로브를 제공한다. 상기 프라이머 또는 프로브는 전술된 BRCA1 및/또는 BRCA2 유전자 돌연변이의 존재 유무를 확인하여 유방암 및/또는 난소암의 소인 또는 감수성을 확인하기 위해 이용될 수 있다. 이를 위해 이하의 실시예에 상세히 기재된 F-CSGE를 수행한 후 DNA 서열분석(sequencing)을 통해 확인하는 기술 외에 하기와 같이 여러 방법들이 이용될 수 있다:
(가) 엑손 및 인트론 경계 부분을 포함하는 표적 절편들을 각각 돌연변이 유무를 확인할 수 있는 한 쌍의 프라이머로 증폭하여 F-CSGE를 수행하지 않고, 바로 디데옥시(dideoxy) 반응을 통한 서열분석으로 돌연변이의 존재 유무를 확인할 수 있다. 이 경우, 본 발명의 상기 돌연변이가 일어난 부위 및 이를 포함하는 염기서 열로 구성된 올리고뉴클레오티드 프로브를 쓰지 않고, 바로 돌연변이의 존재 유무를 확인할 수 있다. 또는, BRCA1, BRCA2를 클로닝하여 벡터에 삽입한 후 서열분석을 수행할 수도 있다. 이 경우, 정상 BRCA1, BRCA2 유전자의 염기서열과 서열분석 결과를 서로 비교하여 돌연변이의 존재 유무를 확인할 수 있다.
(나) 유전자 돌연변이의 존재 유무는 또한 제한효소절단법을 이용하여 확인할 수 있다. 이는 BRCA1, BRCA2 유전자의 정상 유전자와 돌연변이 유전자의 염기서열이 서로 다르다는 점에 착안하여, 적당한 제한효소 또는 제한효소와 동일한 결과를 도출하는 화합물을 이용하여 정상 유전자는 절단되고 돌연변이 유전자는 절단되지 않거나 또는 역으로 정상 유전자는 절단되지 않고, 돌연변이 유전자는 절단되는 원리를 이용하는 방법이다. 이와 유사한 방법으로는 돌연변이 위치 부근에 결합한 프라이머를 절단하는 엔도뉴클레아제(endonuclease) 효소가 돌연변이에 의한 부정합 부위는 절단할 수 없는 원리를 이용한 인베이더 등이 있으며, 이들은 모두 본 발명의 돌연변이의 존재 유무를 확인하기 위해 이용될 수 있다.
(다) 돌연변이가 일어날 수 있는 유전자 상의 염기 위치 전후에 결합하는 프라이머가 돌연변이 위치의 염기에 따라서 결합하는 정도가 다른 것을 이용하여 돌연변이 양상을 확인하는 방법이 있다. 리버스 도트 블롯(reverse dot blot) 등이 있으며, 형광표지자, 비드 등을 사용한 다양한 방법들을 통해 상기 원리를 이용하여 본 발명의 돌연변이를 포함한 돌연변이의 존재 유무 및 그 양상을 확인할 수 있다.
(라) 대립형질-특이적 PCR(Allele-specific PCR)은 돌연변이가 일어날 수 있 는 유전자 상의 염기 위치 부위에 결합하는 프라이머를 이용한 PCR을 수행함으로써, 돌연변이 위치의 염기에 따라 선택적으로 PCR 반응이 일어나는 원리를 이용하여 돌연변이 양상을 확인하는 방법이다. FRET와 AlphaScan 등이 있으며, 이는 모두 본 발명의 돌연변이의 존재 유무를 확인하기 위해 이용될 수 있다.
(마) 또 다른 방법으로서, SSCP(Single Strand Conformation Polymorphism)는 유전자의 절편 중에서 단쇄(single strand)를 분석하여 돌연변이 유무를 분석할 수 있다. 이는 돌연변이의 유무에 따라 단쇄의 이중구조가 다르다는 점에 착안하여 전기영동 또는 이와 유사한 결과를 도출할 수 있는 시스템을 이용하여 진단에 이용할 수 있다.
(바) 또 다른 방법으로서, 이형이중가닥(Heteroduplex) 분석법은 이형이중가닥을 생성시켜 이를 염기서열분석기(예를 들면, ABI377)와 같은 장비를 이용하여 분석하는 방법이다. 이와 유사한 방법으로는 생성된 이형이중가닥을 2-D로 분리하는 TDGS(Two-Dimensional Gene Scanning)와 D-HPLC, DGGE 등이 있으며, 이는 모두 본 발명의 돌연변이의 존재 유무를 확인하기 위해 이용될 수 있다.
(사) 또 다른 방법으로서, 프라이머 연장(primer extension) 분석법은 돌연변이의 유무를 확인하고자 할 때, 돌연변이가 일어날 수 있는 유전자 상의 염기 위치의 5' 방향에 선택적으로 결합하는 프라이머를 제작하여 부착시킨 후, 중합효소를 이용하여 프라이머를 연장시켜 돌연변이의 유무를 확인하는 방법이다.
(아) 또 다른 방법으로서, 실시간 PCR(real time PCR) 분석법은 돌연변이의 유무를 확인하고자 할 때, 돌연변이가 일어날 수 있는 유전자 상의 염기 위치 부근 에 상보적으로 결합하는 프라이머를 제작하고, 프라이머의 양 말단에 형광표지자와 퀀처(quencher)를 표지하여 PCR의 진행과 함께 유리되는 형광표지자의 양을 측정하여 돌연변이 양상을 확인하는 방법이다. Taqman 등의 방법이 이에 해당되며 이와 유사한 방법으로는 Molecualr beacon 등이 있다. 이는 모두 본 발명의 돌연변이의 존재 유무를 확인하기 위해 이용될 수 있다.
(자) 또 다른 방법으로서, 올리고뉴클레오티드의 결합을 이용한 분석법(OLA: Oligonucleotide ligation assay)은 돌연변이의 유무를 확인하고자 할 때, 돌연변이가 일어날 수 있는 유전자 상의 염기 위치 전후에 결합하는 프라이머를 제작하여, 돌연변이 위치에 정확히 상보결합한 프라이머끼리만 결합효소(ligase)에 의한 결합이 이루어지는 원리를 이용하여 돌연변이 양상을 확인하는 방법이다. OLA와 Colorimetric OLA, OLA에 기반한 DNA 칩 등이 있다. 이는 모두 본 발명의 돌연변이의 존재 유무를 확인하기 위해 이용될 수 있다.
본 발명의 폴리뉴클레오티드는 프로브 또는 폴리뉴클레오티드로 사용될 수 있다.
본 발명의 또 다른 양태는 BRCA1 또는 BRCA2 유전자에 존재하는 돌연변이를 포함하는 20 내지 100개의 연속된 뉴클레오티드 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 서열의 폴리뉴클레오티드를 프로브로 포함하는 유방암 및/또는 난소암 진단용 마이크로어레이를 제공한다.
본 발명의 일 양태에 따른 마이크로어레이에서, 프로브인 폴리뉴클레오티드는 바람직하게는 20 내지 80개, 20 내지 60개, 또는 20 내지 50개의 연속된 뉴클레 오티드 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드이다.
본 발명의 일 양태에 따른 마이크로어레이에서, 프로브인 폴리뉴클레오티드는 방사선 표지, 형광 표지, 효소 표지, 서열 택(sequence tag), 또는 바이오틴에 의해 표지될 수 있다.
본 발명의 일 양태에서, 마이크로어레이는 표면개질 유리, 실리콘, 또는 나일론 등의 재질로 된 작은 고형의 기판 표면에 BRCA1 또는 BRCA2 유전자 돌연변이를 포함하는 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 서열의 폴리뉴클레오티드인 프로브를 고밀도로 부착시킨 마이크로 칩일 수 있다. 마이크로어레이 상의 프로브와 시료 내의 표적 물질과의 혼성화(hybridization) 여부를 검출하여 시료의 BRCA1 또는 BRCA2 유전자의 돌연변이 존재 여부를 확인하고 이를 통해 대상자의 유방암 및/또는 난소암의 소인 또는 감수성을 예측할 수 있다.
본 발명의 또 다른 양태는 상기 BRCA1 및/또는 BRCA2 유전자 돌연변이에 기인한 유방암 및/또는 난소암 진단용 키트에 관한 것이다. 상기 키트는 하나 이상의 컨테이너 수단(container means)과 상기 하나 이상의 컨테이너 수단을 밀폐된 공간 내에 수용하도록 구획(compartment)되어 있는 캐리어 수단(carrier means)으로 구성되며, 상기 하나 이상의 컨테이너 수단은 상기 BRCA1 및/또는 BRCA2 유전자 돌연변이를 포함하는 폴리뉴클레오티드를 내포한다.
이하에서 실시예를 통하여 본 발명을 보다 상세하게 설명한다. 그러나, 이들 실시예는 본 발명을 예시적으로 설명하기 위한 것으로 본 발명의 범위가 이들 실시예에 한정되는 것은 아니다.
실시예
실시예
1.
BRCA1
및/또는
BRCA2
유전자의 돌연변이 검출 및 확인
1. 게놈 DNA의 분리
유방암 및 난소암 환자의 게놈 DNA는 200 ㎕ EDTA-말초혈액으로부터 QIAmp DNA Mini Kit(Catalog No. 13323, Quiagen, USA)을 이용하여 분리하였다.
2. 중합효소 연쇄 반응(PCR)을 통한 BRCA1, BRCA2 유전자의 증폭
중합효소 연쇄 반응은 다중(multiplex) 방법으로 수행하였다. 이는 각 PCR 단위 튜브에 동일한 주형을 넣고, 프라이머 쌍을 한 가지가 아닌 이중(duplex), 삼중(triplex) 또는 사중(quadraplex)의 조합으로 첨가하여 수행하는 방법이다. 다중 중합효소연쇄반응법은 전체 중합효소연쇄반응에 소요되는 비용을 1/3 수준으로 절감한다. BRCA1 및 BRCA2는 도 1 및 도 2에 도시된 바와 같이, 각각 22개 및 26개의 엑손을 포함하는 거대 유전자이다. 특히, BRCA1의 엑손 11은 그 크기가 매우 커서 한 쌍의 프라이머에 의해서는 중합효소연쇄반응을 수행할 수 없어서 총 10개의 중복 절편으로 나누어 열 쌍의 프라이머를 이용하여 증폭하였다. 이 엑손 11의 10개의 절편은 11-1, 11-2, 11-3, 11-4, 11-5, 11-6, 11-7, 11-8, 11-9, 및 11-10으로 명명하였다. BRCA2는 26개의 엑손 중에서 엑손 10, 엑손 11 및 엑손 27의 크기가 크기 때문에, 엑손 10은 10-1, 10-2, 10-3, 및 10-4로 나누고, 엑손 11은 11-1, 11-2, 11-3, 11-4, 11-5, 11-6, 11-7, 11-8, 11-9, 11-10, 11-11, 11-12, 11-13, 11-14 및 11-15로 나누었고, 엑손 27은 27-1 및 27-2로 나누어 중합효소연쇄반응을 수행하였다. 그 결과, BRCA1 및 BRCA2는 표 1에 표시된 바와 같이 25개의 다중 중합효소연쇄반응을 통해 총 75개의 절편으로 증폭되었다. 각 중합효소연쇄반응의 산물은 20 bp의 전방향 및 역방향 프라이머 염기서열 및 최소 40 bp의 5'- 및 3'-인접(flanknig) 영역을 포함하도록 설계하였다.
표 1A. BRCA1 유전자의 증폭
표 1B. BRCA2 유전자의 증폭
다중 PCR 반응의 구성 및 반응 조건은 각각 표2 및 표 3에 표시된 바와 같다.
표 2. PCR 반응액
| 성분 | 부피(㎕) |
| 10X Taq-완충액(MgCl2 불포함) | 1 |
| MgCl2(25 mM) | 1 |
| 프라이머 믹스 | 4 |
| dNTPs(각각 25 mM씩) | 1.4 |
| Taq 폴리머라아제 | 0.14 |
| DNA(게놈 DNA) | 1.45 |
| 5X Band Doctor | 1 |
| 총 부피 | 10 |
표 3. PCR 반응 조건
| 순서 | 온도 | 시간 | 사이클 수 |
| 1 | 95℃ | 10분 | 1 |
| 2 | 95℃ | 30초 | 35 |
| 57℃ | 1분 | ||
| 72℃ | 45초 | ||
| 3 | 72℃ | 7분 | 1 |
| 4 | 95℃ | 5분 | 1 |
| 5 | 68℃ | 30분 | 1 |
| 6 | 4℃ | ∞ | - |
3. F-CSGE(Fluorescence Conformation Senstitive Gel Electrophoresis)
F-CSGE는 유전자 염기 서열상에 존재하는 유전자 변이를 검색하기 위해 이용되는 방법이다. 유전자상에 돌연변이가 존재할 경우, 돌연변이 대립형질과 정상 대립형질 간에 이형이중가닥(heteroduplex)이 형성될 수 있다. 그 결과, DNA 이중쇄(double strand)의 3차 구조 모양이 상이해져서 전기영동 시 이동속도의 차이가 생기는 점을 이용하여, 돌연변이를 검출할 수 있다.
상기에서 수득된 중합효소연쇄반응 산물을 0.2 mm 두께의 12% 폴리아크릴아미드 겔(아크릴아미드(BioRad):1,4-비스(아크릴로일)피페라진(BAP, Fluka, Deisenhofen, Germany)=99:1) , 15% 포름아미드(v/v)에서 1 X TBE 버퍼로 전기영동시켰다. 전기영동은 40℃, 2000V에서 5시간 동안 실시하였으며, 각 레인마다 한 종류의 다중 중합효소연쇄반응 산물을 적재하였다(적재 혼합물(loading mixture)의 성분: TAMRA가 부착된 size standard 0.5 ㎕, 탈이온 포름아미드 0.5 ㎕). 데이터 분석은 GeneScan 및 Genotyper(PE Biosystems) 소프르웨어를 이용하였다. 도 3 및 도 4에 개시된 바와 같이, 돌연변이가 있는 유전자와 돌연변이가 없는 정상 유전자 는 F-CSGE를 통해 나타난 분석결과가 상이한 양상을 보이므로, F-CSGE 상에서의 분석결과가 다른 DNA는 염기서열 분석을 통해 그 변이 유무를 최종 분석하였다.
4. DNA 염기서열분석
F-CSGE 분석을 통해 나타난 돌연변이 및 SNP(Single Nucleotide Polymorphism)의 존재가 예상되는 중합효소연쇄반응 산물은 F-CSGE 분석에 사용된 것과 동일한 올리고뉴클레오티드 프라이머를 이용하여 다시 증폭하여, ABI3700 시퀀서(Applied Biosystems)에서 POP6 겔을 이용하여 분석하였다. 그 결과, F-CSGE를 통해 돌연변이가 존재하는 것으로 파악된 DNA 절편 상의 구체적인 돌연변이 양상을 분석하였다.
도 3은 BRCA1 유전자의 엑손 22를 분석한 결과를 도시하는 도면이다. 이에 따르면, F-CSGE 결과 정상 유전자와 돌연변이 유전자 간에는 그래프의 모양이 확연하게 달랐고, 염기서열 분석을 통해 BRCA1 유전자(서열번호 1)의 5339번째 뉴클레오티드인 T가 C로 치환되었음을 확인하였다. 도 4는 BRCA2 유전자의 엑손 22를 분석한 결과를 도시하는 도면이다. 이에 따르면, F-CSGE 결과 정상 유전자와 돌연변이 유전자 간에는 그래프의 모양이 확연하게 달랐고, 염기서열 분석을 통해 BRCA2 유전자(서열번호 9)의 8827번째와 8828번째 뉴클레오티드 사이에 G가 삽입되었음을 확인하였다.
본 발명의 폴리뉴클레오티드는 유방암 및/또는 난소암 유발 유전자인 BRCA1, BRCA2의 뉴클레오티드 서열상에 존재하는 한국인 특이적인 돌연변이의 유형을 제공하여, 유방암 및 난소암의 소인을 저비용, 고효율로 진단할 수 있게 한다.
<110> Lab Genomics
<120> BRCA1 and BRCA2 Germline Mutations useful for predicting or
detecting Breast and/or Ovarian Cancer
<160> 12
<170> KopatentIn 1.71
<210> 1
<211> 5589
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 1
atggatttat ctgctcttcg cgttgaagaa gtacaaaatg tcattaatgc tatgcagaaa 60
atcttagagt gtcccatctg tctggagttg atcaaggaac ctgtctccac aaagtgtgac 120
cacatatttt gcaaattttg catgctgaaa cttctcaacc agaagaaagg gccttcacag 180
tgtcctttat gtaagaatga tataaccaaa aggagcctac aagaaagtac gagatttagt 240
caacttgttg aagagctatt gaaaatcatt tgtgcttttc agcttgacac aggtttggag 300
tatgcaaaca gctataattt tgcaaaaaag gaaaataact ctcctgaaca tctaaaagat 360
gaagtttcta tcatccaaag tatgggctac agaaaccgtg ccaaaagact tctacagagt 420
gaacccgaaa atccttcctt gcaggaaacc agtctcagtg tccaactctc taaccttgga 480
actgtgagaa ctctgaggac aaagcagcgg atacaacctc aaaagacgtc tgtctacatt 540
gaattgggat ctgattcttc tgaagatacc gttaataagg caacttattg cagtgtggga 600
gatcaagaat tgttacaaat cacccctcaa ggaaccaggg atgaaatcag tttggattct 660
gcaaaaaagg ctgcttgtga attttctgag acggatgtaa caaatactga acatcatcaa 720
cccagtaata atgatttgaa caccactgag aagcgtgcag ctgagaggca tccagaaaag 780
tatcagggta gttctgtttc aaacttgcat gtggagccat gtggcacaaa tactcatgcc 840
agctcattac agcatgagaa cagcagttta ttactcacta aagacagaat gaatgtagaa 900
aaggctgaat tctgtaataa aagcaaacag cctggcttag caaggagcca acataacaga 960
tgggctggaa gtaaggaaac atgtaatgat aggcggactc ccagcacaga aaaaaaggta 1020
gatctgaatg ctgatcccct gtgtgagaga aaagaatgga ataagcagaa actgccatgc 1080
tcagagaatc ctagagatac tgaagatgtt ccttggataa cactaaatag cagcattcag 1140
aaagttaatg agtggttttc cagaagtgat gaactgttag gttctgatga ctcacatgat 1200
ggggagtctg aatcaaatgc caaagtagct gatgtattgg acgttctaaa tgaggtagat 1260
gaatattctg gttcttcaga gaaaatagac ttactggcca gtgatcctca tgaggcttta 1320
atatgtaaaa gtgaaagagt tcactccaaa tcagtagaga gtaatattga agacaaaata 1380
tttgggaaaa cctatcggaa gaaggcaagc ctccccaact taagccatgt aactgaaaat 1440
ctaattatag gagcatttgt tactgagcca cagataatac aagagcgtcc cctcacaaat 1500
aaattaaagc gtaaaaggag acctacatca ggccttcatc ctgaggattt tatcaagaaa 1560
gcagatttgg cagttcaaaa gactcctgaa atgataaatc agggaactaa ccaaacggag 1620
cagaatggtc aagtgatgaa tattactaat agtggtcatg agaataaaac aaaaggtgat 1680
tctattcaga atgagaaaaa tcctaaccca atagaatcac tcgaaaaaga atctgctttc 1740
aaaacgaaag ctgaacctat aagcagcagt ataagcaata tggaactcga attaaatatc 1800
cacaattcaa aagcacctaa aaagaatagg ctgaggagga agtcttctac caggcatatt 1860
catgcgcttg aactagtagt cagtagaaat ctaagcccac ctaattgtac tgaattgcaa 1920
attgatagtt gttctagcag tgaagagata aagaaaaaaa agtacaacca aatgccagtc 1980
aggcacagca gaaacctaca actcatggaa ggtaaagaac ctgcaactgg agccaagaag 2040
agtaacaagc caaatgaaca gacaagtaaa agacatgaca gcgatacttt cccagagctg 2100
aagttaacaa atgcacctgg ttcttttact aagtgttcaa ataccagtga acttaaagaa 2160
tttgtcaatc ctagccttcc aagagaagaa aaagaagaga aactagaaac agttaaagtg 2220
tctaataatg ctgaagaccc caaagatctc atgttaagtg gagaaagggt tttgcaaact 2280
gaaagatctg tagagagtag cagtatttca ttggtacctg gtactgatta tggcactcag 2340
gaaagtatct cgttactgga agttagcact ctagggaagg caaaaacaga accaaataaa 2400
tgtgtgagtc agtgtgcagc atttgaaaac cccaagggac taattcatgg ttgttccaaa 2460
gataatagaa atgacacaga aggctttaag tatccattgg gacatgaagt taaccacagt 2520
cgggaaacaa gcatagaaat ggaagaaagt gaacttgatg ctcagtattt gcagaataca 2580
ttcaaggttt caaagcgcca gtcatttgct ccgttttcaa atccaggaaa tgcagaagag 2640
gaatgtgcaa cattctctgc ccactctggg tccttaaaga aacaaagtcc aaaagtcact 2700
tttgaatgtg aacaaaagga agaaaatcaa ggaaagaatg agtctaatat caagcctgta 2760
cagacagtta atatcactgc aggctttcct gtggttggtc agaaagataa gccagttgat 2820
aatgccaaat gtagtatcaa aggaggctct aggttttgtc tatcatctca gttcagaggc 2880
aacgaaactg gactcattac tccaaataaa catggacttt tacaaaaccc atatcgtata 2940
ccaccacttt ttcccatcaa gtcatttgtt aaaactaaat gtaagaaaaa tctgctagag 3000
gaaaactttg aggaacattc aatgtcacct gaaagagaaa tgggaaatga gaacattcca 3060
agtacagtga gcacaattag ccgtaataac attagagaaa atgtttttaa agaagccagc 3120
tcaagcaata ttaatgaagt aggttccagt actaatgaag tgggctccag tattaatgaa 3180
ataggttcca gtgatgaaaa cattcaagca gaactaggta gaaacagagg gccaaaattg 3240
aatgctatgc ttagattagg ggttttgcaa cctgaggtct ataaacaaag tcttcctgga 3300
agtaattgta agcatcctga aataaaaaag caagaatatg aagaagtagt tcagactgtt 3360
aatacagatt tctctccata tctgatttca gataacttag aacagcctat gggaagtagt 3420
catgcatctc aggtttgttc tgagacacct gatgacctgt tagatgatgg tgaaataaag 3480
gaagatacta gttttgctga aaatgacatt aaggaaagtt ctgctgtttt tagcaaaagc 3540
gtccagaaag gagagcttag caggagtcct agccctttca cccatacaca tttggctcag 3600
ggttaccgaa gaggggccaa gaaattagag tcctcagaag agaacttatc tagtgaggat 3660
gaagagcttc cctgcttcca acacttgtta tttggtaaag taaacaatat accttctcag 3720
tctactaggc atagcaccgt tgctaccgag tgtctgtcta agaacacaga ggagaattta 3780
ttatcattga agaatagctt aaatgactgc agtaaccagg taatattggc aaaggcatct 3840
caggaacatc accttagtga ggaaacaaaa tgttctgcta gcttgttttc ttcacagtgc 3900
agtgaattgg aagacttgac tgcaaataca aacacccagg atcctttctt gattggttct 3960
tccaaacaaa tgaggcatca gtctgaaagc cagggagttg gtctgagtga caaggaattg 4020
gtttcagatg atgaagaaag aggaacgggc ttggaagaaa ataatcaaga agagcaaagc 4080
atggattcaa acttaggtga agcagcatct gggtgtgaga gtgaaacaag cgtctctgaa 4140
gactgctcag ggctatcctc tcagagtgac attttaacca ctcagcagag ggataccatg 4200
caacataacc tgataaagct ccagcaggaa atggctgaac tagaagctgt gttagaacag 4260
catgggagcc agccttctaa cagctaccct tccatcataa gtgactcttc tgcccttgag 4320
gacctgcgaa atccagaaca aagcacatca gaaaaagcag tattaacttc acagaaaagt 4380
agtgaatacc ctataagcca gaatccagaa ggcctttctg ctgacaagtt tgaggtgtct 4440
gcagatagtt ctaccagtaa aaataaagaa ccaggagtgg aaaggtcatc cccttctaaa 4500
tgcccatcat tagatgatag gtggtacatg cacagttgct ctgggagtct tcagaataga 4560
aactacccat ctcaagagga gctcattaag gttgttgatg tggaggagca acagctggaa 4620
gagtctgggc cacacgattt gacggaaaca tcttacttgc caaggcaaga tctagaggga 4680
accccttacc tggaatctgg aatcagcctc ttctctgatg accctgaatc tgatccttct 4740
gaagacagag ccccagagtc agctcgtgtt ggcaacatac catcttcaac ctctgcattg 4800
aaagttcccc aattgaaagt tgcagaatct gcccagagtc cagctgctgc tcatactact 4860
gatactgctg ggtataatgc aatggaagaa agtgtgagca gggagaagcc agaattgaca 4920
gcttcaacag aaagggtcaa caaaagaatg tccatggtgg tgtctggcct gaccccagaa 4980
gaatttatgc tcgtgtacaa gtttgccaga aaacaccaca tcactttaac taatctaatt 5040
actgaagaga ctactcatgt tgttatgaaa acagatgctg agtttgtgtg tgaacggaca 5100
ctgaaatatt ttctaggaat tgcgggagga aaatgggtag ttagctattt ctgggtgacc 5160
cagtctatta aagaaagaaa aatgctgaat gagcatgatt ttgaagtcag aggagatgtg 5220
gtcaatggaa gaaaccacca aggtccaaag cgagcaagag aatcccagga cagaaagatc 5280
ttcagggggc tagaaatctg ttgctatggg cccttcacca acatgcccac agatcaactg 5340
gaatggatgg tacagctgtg tggtgcttct gtggtgaagg agctttcatc attcaccctt 5400
ggcacaggtg tccacccaat tgtggttgtg cagccagatg cctggacaga ggacaatggc 5460
ttccatgcaa ttgggcagat gtgtgaggca cctgtggtga cccgagagtg ggtgttggac 5520
agtgtagcac tctaccagtg ccaggagctg gacacctacc tgatacccca gatcccccac 5580
agccactac 5589
<210> 2
<211> 360
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 2
ttattttgtc catggtgtca agtttctctt caggaggaaa agcacagaac tggccaacaa 60
ttgcttgact gttctttacc atactgttta gcaggaaacc agtctcagtg tccaactctc 120
taaccttgga actgtgagaa ctctgaggac aaagcagcgg atacaacctc aaaagacgtc 180
tgtctacatt gaattgggta agggtctcag gttttttaag tatttaataa taattgctgg 240
attccttatc ttatagtttt gccaaaaatc ttggtcataa tttgtatttg tggtaggcag 300
ctttgggaag tgaattttat gagccctatg gtgagttata aaaaatgtaa aagacgcagt 360
360
<210> 3
<211> 360
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 3
aaatcagtat tctaacctga attatcacta tcagaacaaa gcagtaaagt agatttgttt 60
tctcattcca tttaaagcag tattaacttc acagaaaagt agtgaatacc ctataagcca 120
gaatccagaa ggcctttctg ctgacaagtt tgaggtgtct gcagatagtt ctaccagtaa 180
aaataaagaa ccaggagtgg aaaggtaaga aacatcaatg taaagatgct gtggtatctg 240
acatctttat ttatattgaa ctctgattgt taattttttt caccatactt tctccagttt 300
tttgcataca ggcatttata cacttttatt gctctaggat acttcttttg tttaatccta 360
360
<210> 4
<211> 360
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 4
tgtcgaactc ctgacctcaa gtgatctgcc tgcctcagtc tcccaaagtg ctaggattac 60
aggggtgagc cactgcgcct ggcctgaatg ccttaaatat gacgtgtctg ctccacttcc 120
attgaaggaa gcttctcttt ctcttatcct gatgggttgt gtttgggttc tttcagcatg 180
attttgaagt cagaggagat gtggtcaatg gaagaaacca ccaaggtcca aagcgagcaa 240
gagaatccca ggacagaaag gtaaagctcc ctccctcaag ttgacaaaaa tctcacccca 300
ccactctgta ttccactccc ctttgcagag atgggccgct tcattttgta agacttatta 360
360
<210> 5
<211> 360
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 5
aaacataatg ttttcccttg tattttacag atgcaaacag ctataatttt gcaaaaaagg 60
aaaataactc tcctgaacat ctaaaagatg aagtttctat catccaaagt atgggctaca 120
gaaaccgtgc caaaagactt ctacagagtg aacccgaaaa tccttccttg gtaaaaccat 180
ttgttttctt cttcttcttc ttcttctttt cttttttttt tctttttttt ttttgagatg 240
gagtcttgct ctgtggccca ggctagaagc agtcctcctg ccttagcccc cttagtagct 300
gggattacag gcacgcgcca ccatgccagg ctaatttttg tatttttagt agagacgggg 360
360
<210> 6
<211> 360
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 6
aatttgattt ttaaaaaaaa tcacaggtaa ccttaatgca ttgtcttaac acaacaaaga 60
gcatacatag ggtttctctt ggtttctttg attataattc atacattttt ctctaactgc 120
aaacataatg ttttcccttg tattttacag atgcaaacag ctataatttt gcaaaaaagg 180
aaaataactc tcctgaacat ctaaaagatg aagtttctat catccaaagt atgggctaca 240
gaaaccgtgc caaaagactt ctacagagtg aacccgaaaa tccttccttg gtaaaaccat 300
ttgttttctt cttcttcttc ttcttctttt cttttttttt tctttttttt ttttgagatg 360
360
<210> 7
<211> 360
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 7
ttggtagttt atgaggttag tttctctaat atagccagtt ggttgatttc cacctccaag 60
gtgtatgaag tatgtatttt tttaatgaca attcagtttt tgagtacctt gttatttttg 120
tatattttca gctgcttgtg aattttctga gacggatgta acaaatactg aacatcatca 180
acccagtaat aatgatttga acaccactga gaagcgtgca gctgagaggc atccagaaaa 240
gtatcagggt agttctgttt caaacttgca tgtggagcca tgtggcacaa atactcatgc 300
cagctcatta cagcatgaga acagcagttt attactcact aaagacagaa tgaatgtaga 360
360
<210> 8
<211> 360
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 8
gtgtagaacg tgcaggattg ctacataggt aaacatatgc catggtggaa taactagtat 60
tctgagctgt gtgctagagg taactcatga taatggaata tttgatttaa tttcagatgc 120
tcgtgtacaa gtttgccaga aaacaccaca tcactttaac taatctaatt actgaagaga 180
ctactcatgt tgttatgaaa acaggtatac caagaacctt tacagaatac cttgcatctg 240
ctgcataaaa ccacatgagg cgaggcacgg tggcgcatgc ctgtaatcgc agcactttgg 300
gaggccgagg cgggcagatc acgagattag gagatcgaga ccatcctggc cagcatggtg 360
360
<210> 9
<211> 10254
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 9
atgcctattg gatccaaaga gaggccaaca ttttttgaaa tttttaagac acgctgcaac 60
aaagcagatt taggaccaat aagtcttaat tggtttgaag aactttcttc agaagctcca 120
ccctataatt ctgaacctgc agaagaatct gaacataaaa acaacaatta cgaaccaaac 180
ctatttaaaa ctccacaaag gaaaccatct tataatcagc tggcttcaac tccaataata 240
ttcaaagagc aagggctgac tctgccgctg taccaatctc ctgtaaaaga attagataaa 300
ttcaaattag acttaggaag gaatgttccc aatagtagac ataaaagtct tcgcacagtg 360
aaaactaaaa tggatcaagc agatgatgtt tcctgtccac ttctaaattc ttgtcttagt 420
gaaagtcctg ttgttctaca atgtacacat gtaacaccac aaagagataa gtcagtggta 480
tgtgggagtt tgtttcatac accaaagttt gtgaagggtc gtcagacacc aaaacatatt 540
tctgaaagtc taggagctga ggtggatcct gatatgtctt ggtcaagttc tttagctaca 600
ccacccaccc ttagttctac tgtgctcata gtcagaaatg aagaagcatc tgaaactgta 660
tttcctcatg atactactgc taatgtgaaa agctattttt ccaatcatga tgaaagtctg 720
aagaaaaatg atagatttat cgcttctgtg acagacagtg aaaacacaaa tcaaagagaa 780
gctgcaagtc atggatttgg aaaaacatca gggaattcat ttaaagtaaa tagctgcaaa 840
gaccacattg gaaagtcaat gccaaatgtc ctagaagatg aagtatatga aacagttgta 900
gatacctctg aagaagatag tttttcatta tgtttttcta aatgtagaac aaaaaatcta 960
caaaaagtaa gaactagcaa gactaggaaa aaaattttcc atgaagcaaa cgctgatgaa 1020
tgtgaaaaat ctaaaaacca agtgaaagaa aaatactcat ttgtatctga agtggaacca 1080
aatgatactg atccattaga ttcaaatgta gcacatcaga agccctttga gagtggaagt 1140
gacaaaatct ccaaggaagt tgtaccgtct ttggcctgtg aatggtctca actaaccctt 1200
tcaggtctaa atggagccca gatggagaaa atacccctat tgcatatttc ttcatgtgac 1260
caaaatattt cagaaaaaga cctattagac acagagaaca aaagaaagaa agattttctt 1320
acttcagaga attctttgcc acgtatttct agcctaccaa aatcagagaa gccattaaat 1380
gaggaaacag tggtaaataa gagagatgaa gagcagcatc ttgaatctca tacagactgc 1440
attcttgcag taaagcaggc aatatctgga acttctccag tggcttcttc atttcagggt 1500
atcaaaaagt ctatattcag aataagagaa tcacctaaag agactttcaa tgcaagtttt 1560
tcaggtcata tgactgatcc aaactttaaa aaagaaactg aagcctctga aagtggactg 1620
gaaatacata ctgtttgctc acagaaggag gactccttat gtccaaattt aattgataat 1680
ggaagctggc cagccaccac cacacagaat tctgtagctt tgaagaatgc aggtttaata 1740
tccactttga aaaagaaaac aaataagttt atttatgcta tacatgatga aacattttat 1800
aaaggaaaaa aaataccgaa agaccaaaaa tcagaactaa ttaactgttc agcccagttt 1860
gaagcaaatg cttttgaagc accacttaca tttgcaaatg ctgattcagg tttattgcat 1920
tcttctgtga aaagaagctg ttcacagaat gattctgaag aaccaacttt gtccttaact 1980
agctcttttg ggacaattct gaggaaatgt tctagaaatg aaacatgttc taataataca 2040
gtaatctctc aggatcttga ttataaagaa gcaaaatgta ataaggaaaa actacagtta 2100
tttattaccc cagaagctga ttctctgtca tgcctgcagg aaggacagtg tgaaaatgat 2160
ccaaaaagca aaaaagtttc agatataaaa gaagaggtct tggctgcagc atgtcaccca 2220
gtacaacatt caaaagtgga atacagtgat actgactttc aatcccagaa aagtctttta 2280
tatgatcatg aaaatgccag cactcttatt ttaactccta cttccaagga tgttctgtca 2340
aacctagtca tgatttctag aggcaaagaa tcatacaaaa tgtcagacaa gctcaaaggt 2400
aacaattatg aatctgatgt tgaattaacc aaaaatattc ccatggaaaa gaatcaagat 2460
gtatgtgctt taaatgaaaa ttataaaaac gttgagctgt tgccacctga aaaatacatg 2520
agagtagcat caccttcaag aaaggtacaa ttcaaccaaa acacaaatct aagagtaatc 2580
caaaaaaatc aagaagaaac tacttcaatt tcaaaaataa ctgtcaatcc agactctgaa 2640
gaacttttct cagacaatga gaataatttt gtcttccaag tagctaatga aaggaataat 2700
cttgctttag gaaatactaa ggaacttcat gaaacagact tgacttgtgt aaacgaaccc 2760
attttcaaga actctaccat ggttttatat ggagacacag gtgataaaca agcaacccaa 2820
gtgtcaatta aaaaagattt ggtttatgtt cttgcagagg agaacaaaaa tagtgtaaag 2880
cagcatataa aaatgactct aggtcaagat ttaaaatcgg acatctcctt gaatatagat 2940
aaaataccag aaaaaaataa tgattacatg aacaaatggg caggactctt aggtccaatt 3000
tcaaatcaca gttttggagg tagcttcaga acagcttcaa ataaggaaat caagctctct 3060
gaacataaca ttaagaagag caaaatgttc ttcaaagata ttgaagaaca atatcctact 3120
agtttagctt gtgttgaaat tgtaaatacc ttggcattag ataatcaaaa gaaactgagc 3180
aagcctcagt caattaatac tgtatctgca catttacaga gtagtgtagt tgtttctgat 3240
tgtaaaaata gtcatataac ccctcagatg ttattttcca agcaggattt taattcaaac 3300
cataatttaa cacctagcca aaaggcagaa attacagaac tttctactat attagaagaa 3360
tcaggaagtc agtttgaatt tactcagttt agaaaaccaa gctacatatt gcagaagagt 3420
acatttgaag tgcctgaaaa ccagatgact atcttaaaga ccacttctga ggaatgcaga 3480
gatgctgatc ttcatgtcat aatgaatgcc ccatcgattg gtcaggtaga cagcagcaag 3540
caatttgaag gtacagttga aattaaacgg aagtttgctg gcctgttgaa aaatgactgt 3600
aacaaaagtg cttctggtta tttaacagat gaaaatgaag tggggtttag gggcttttat 3660
tctgctcatg gcacaaaact gaatgtttct actgaagctc tgcaaaaagc tgtgaaactg 3720
tttagtgata ttgagaatat tagtgaggaa acttctgcag aggtacatcc aataagttta 3780
tcttcaagta aatgtcatga ttctgttgtt tcaatgttta agatagaaaa tcataatgat 3840
aaaactgtaa gtgaaaaaaa taataaatgc caactgatat tacaaaataa tattgaaatg 3900
actactggca cttttgttga agaaattact gaaaattaca agagaaatac tgaaaatgaa 3960
gataacaaat atactgctgc cagtagaaat tctcataact tagaatttga tggcagtgat 4020
tcaagtaaaa atgatactgt ttgtattcat aaagatgaaa cggacttgct atttactgat 4080
cagcacaaca tatgtcttaa attatctggc cagtttatga aggagggaaa cactcagatt 4140
aaagaagatt tgtcagattt aacttttttg gaagttgcga aagctcaaga agcatgtcat 4200
ggtaatactt caaataaaga acagttaact gctactaaaa cggagcaaaa tataaaagat 4260
tttgagactt ctgatacatt ttttcagact gcaagtggga aaaatattag tgtcgccaaa 4320
gagtcattta ataaaattgt aaatttcttt gatcagaaac cagaagaatt gcataacttt 4380
tccttaaatt ctgaattaca ttctgacata agaaagaaca aaatggacat tctaagttat 4440
gaggaaacag acatagttaa acacaaaata ctgaaagaaa gtgtcccagt tggtactgga 4500
aatcaactag tgaccttcca gggacaaccc gaacgtgatg aaaagatcaa agaacctact 4560
ctgttgggtt ttcatacagc tagcgggaaa aaagttaaaa ttgcaaagga atctttggac 4620
aaagtgaaaa acctttttga tgaaaaagag caaggtacta gtgaaatcac cagttttagc 4680
catcaatggg caaagaccct aaagtacaga gaggcctgta aagaccttga attagcatgt 4740
gagaccattg agatcacagc tgccccaaag tgtaaagaaa tgcagaattc tctcaataat 4800
gataaaaacc ttgtttctat tgagactgtg gtgccaccta agctcttaag tgataattta 4860
tgtagacaaa ctgaaaatct caaaacatca aaaagtatct ttttgaaagt taaagtacat 4920
gaaaatgtag aaaaagaaac agcaaaaagt cctgcaactt gttacacaaa tcagtcccct 4980
tattcagtca ttgaaaattc agccttagct ttttacacaa gttgtagtag aaaaacttct 5040
gtgagtcaga cttcattact tgaagcaaaa aaatggctta gagaaggaat atttgatggt 5100
caaccagaaa gaataaatac tgcagattat gtaggaaatt atttgtatga aaataattca 5160
aacagtacta tagctgaaaa tgacaaaaat catctctccg aaaaacaaga tacttattta 5220
agtaacagta gcatgtctaa cagctattcc taccattctg atgaggtata taatgattca 5280
ggatatctct caaaaaataa acttgattct ggtattgagc cagtattgaa gaatgttgaa 5340
gatcaaaaaa acactagttt ttccaaagta atatccaatg taaaagatgc aaatgcatac 5400
ccacaaactg taaatgaaga tatttgcgtt gaggaacttg tgactagctc ttcaccctgc 5460
aaaaataaaa atgcagccat taaattgtcc atatctaata gtaataattt tgaggtaggg 5520
ccacctgcat ttaggatagc cagtggtaaa atcgtttgtg tttcacatga aacaattaaa 5580
aaagtgaaag acatatttac agacagtttc agtaaagtaa ttaaggaaaa caacgagaat 5640
aaatcaaaaa tttgccaaac gaaaattatg gcaggttgtt acgaggcatt ggatgattca 5700
gaggatattc ttcataactc tctagataat gatgaatgta gcacgcattc acataaggtt 5760
tttgctgaca ttcagagtga agaaatttta caacataacc aaaatatgtc tggattggag 5820
aaagtttcta aaatatcacc ttgtgatgtt agtttggaaa cttcagatat atgtaaatgt 5880
agtataggga agcttcataa gtcagtctca tctgcaaata cttgtgggat ttttagcaca 5940
gcaagtggaa aatctgtcca ggtatcagat gcttcattac aaaacgcaag acaagtgttt 6000
tctgaaatag aagatagtac caagcaagtc ttttccaaag tattgtttaa aagtaacgaa 6060
cattcagacc agctcacaag agaagaaaat actgctatac gtactccaga acatttaata 6120
tcccaaaaag gcttttcata taatgtggta aattcatctg ctttctctgg atttagtaca 6180
gcaagtggaa agcaagtttc cattttagaa agttccttac acaaagttaa gggagtgtta 6240
gaggaatttg atttaatcag aactgagcat agtcttcact attcacctac gtctagacaa 6300
aatgtatcaa aaatacttcc tcgtgttgat aagagaaacc cagagcactg tgtaaactca 6360
gaaatggaaa aaacctgcag taaagaattt aaattatcaa ataacttaaa tgttgaaggt 6420
ggttcttcag aaaataatca ctctattaaa gtttctccat atctctctca atttcaacaa 6480
gacaaacaac agttggtatt aggaaccaaa gtctcacttg ttgagaacat tcatgttttg 6540
ggaaaagaac aggcttcacc taaaaacgta aaaatggaaa ttggtaaaac tgaaactttt 6600
tctgatgttc ctgtgaaaac aaatatagaa gtttgttcta cttactccaa agattcagaa 6660
aactactttg aaacagaagc agtagaaatt gctaaagctt ttatggaaga tgatgaactg 6720
acagattcta aactgccaag tcatgccaca cattctcttt ttacatgtcc cgaaaatgag 6780
gaaatggttt tgtcaaattc aagaattgga aaaagaagag gagagcccct tatcttagtg 6840
ggagaaccct caatcaaaag aaacttatta aatgaatttg acaggataat agaaaatcaa 6900
gaaaaatcct taaaggcttc aaaaagcact ccagatggca caataaaaga tcgaagattg 6960
tttatgcatc atgtttcttt agagccgatt acctgtgtac cctttcgcac aactaaggaa 7020
cgtcaagaga tacagaatcc aaattttacc gcacctggtc aagaatttct gtctaaatct 7080
catttgtatg aacatctgac tttggaaaaa tcttcaagca atttagcagt ttcaggacat 7140
ccattttatc aagtttctgc tacaagaaat gaaaaaatga gacacttgat tactacaggc 7200
agaccaacca aagtctttgt tccacctttt aaaactaaat cacattttca cagagttgaa 7260
cagtgtgtta ggaatattaa cttggaggaa aacagacaaa agcaaaacat tgatggacat 7320
ggctctgatg atagtaaaaa taagattaat gacaatgaga ttcatcagtt taacaaaaac 7380
aactccaatc aagcagcagc tgtaactttc acaaagtgtg aagaagaacc tttagattta 7440
attacaagtc ttcagaatgc cagagatata caggatatgc gaattaagaa gaaacaaagg 7500
caacgcgtct ttccacagcc aggcagtctg tatcttgcaa aaacatccac tctgcctcga 7560
atctctctga aagcagcagt aggaggccaa gttccctctg cgtgttctca taaacagctg 7620
tatacgtatg gcgtttctaa acattgcata aaaattaaca gcaaaaatgc agagtctttt 7680
cagtttcaca ctgaagatta ttttggtaag gaaagtttat ggactggaaa aggaatacag 7740
ttggctgatg gtggatggct cataccctcc aatgatggaa aggctggaaa agaagaattt 7800
tatagggctc tgtgtgacac tccaggtgtg gatccaaagc ttatttctag aatttgggtt 7860
tataatcact atagatggat catatggaaa ctggcagcta tggaatgtgc ctttcctaag 7920
gaatttgcta atagatgcct aagcccagaa agggtgcttc ttcaactaaa atacagatat 7980
gatacggaaa ttgatagaag cagaagatcg gctataaaaa agataatgga aagggatgac 8040
acagctgcaa aaacacttgt tctctgtgtt tctgacataa tttcattgag cgcaaatata 8100
tctgaaactt ctagcaataa aactagtagt gcagataccc aaaaagtggc cattattgaa 8160
cttacagatg ggtggtatgc tgttaaggcc cagttagatc ctcccctctt agctgtctta 8220
aagaatggca gactgacagt tggtcagaag attattcttc atggagcaga actggtgggc 8280
tctcctgatg cctgtacacc tcttgaagcc ccagaatctc ttatgttaaa gatttctgct 8340
aacagtactc ggcctgctcg ctggtatacc aaacttggat tctttcctga ccctagacct 8400
tttcctctgc ccttatcatc gcttttcagt gatggaggaa atgttggttg tgttgatgta 8460
attattcaaa gagcataccc tatacagtgg atggagaaga catcatctgg attatacata 8520
tttcgcaatg aaagagagga agaaaaggaa gcagcaaaat atgtggaggc ccaacaaaag 8580
agactagaag ccttattcac taaaattcag gaggaatttg aagaacatga agaaaacaca 8640
acaaaaccat atttaccatc acgtgcacta acaagacagc aagttcgtgc tttgcaagat 8700
ggtgcagagc tttatgaagc agtgaagaat gcagcagacc cagcttacct tgagggttat 8760
ttcagtgaag agcagttaag agccttgaat aatcacaggc aaatgttgaa tgataagaaa 8820
caagctcaga tccagttgga aattaggaag gccatggaat ctgctgaaca aaaggaacaa 8880
ggtttatcaa gggatgtcac aaccgtgtgg aagttgcgta ttgtaagcta ttcaaaaaaa 8940
gaaaaagatt cagttatact gagtatttgg cgtccatcat cagatttata ttctctgtta 9000
acagaaggaa agagatacag aatttatcat cttgcaactt caaaatctaa aagtaaatct 9060
gaaagagcta acatacagtt agcagcgaca aaaaaaactc agtatcaaca actaccggtt 9120
tcagatgaaa ttttatttca gatttaccag ccacgggagc cccttcactt cagcaaattt 9180
ttagatccag actttcagcc atcttgttct gaggtggacc taataggatt tgtcgtttct 9240
gttgtgaaaa aaacaggact tgcccctttc gtctatttgt cagacgaatg ttacaattta 9300
ctggcaataa agttttggat agaccttaat gaggacatta ttaagcctca tatgttaatt 9360
gctgcaagca acctccagtg gcgaccagaa tccaaatcag gccttcttac tttatttgct 9420
ggagattttt ctgtgttttc tgctagtcca aaagagggcc actttcaaga gacattcaac 9480
aaaatgaaaa atactgttga gaatattgac atactttgca atgaagcaga aaacaagctt 9540
atgcatatac tgcatgcaaa tgatcccaag tggtccaccc caactaaaga ctgtacttca 9600
gggccgtaca ctgctcaaat cattcctggt acaggaaaca agcttctgat gtcttctcct 9660
aattgtgaga tatattatca aagtccttta tcactttgta tggccaaaag gaagtctgtt 9720
tccacacctg tctcagccca gatgacttca aagtcttgta aaggggagaa agagattgat 9780
gaccaaaaga actgcaaaaa gagaagagcc ttggatttct tgagtagact gcctttacct 9840
ccacctgtta gtcccatttg tacatttgtt tctccggctg cacagaaggc atttcagcca 9900
ccaaggagtt gtggcaccaa atacgaaaca cccataaaga aaaaagaact gaattctcct 9960
cagatgactc catttaaaaa attcaatgaa atttctcttt tggaaagtaa ttcaatagct 10020
gacgaagaac ttgcattgat aaatacccaa gctcttttgt ctggttcaac aggagaaaaa 10080
caatttatat ctgtcagtga atccactagg actgctccca ccagttcaga agattatctc 10140
agactgaaac gacgttgtac tacatctctg atcaaagaac aggagagttc ccaggccagt 10200
acggaagaat gtgagaaaaa taagcaggac acaattacaa ctaaaaaata tatc 10254
<210> 10
<211> 360
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 10
cctttctata gattcgcaag agaatggatt aatgatcttg tttaattaat atgccttaac 60
aaaagtaatc catagtcaag atcttaagca tttttttcct tatgatcttt aactgttctg 120
ggtcacaaat ttgtctgtca ctggttaaaa ctaaggtggg attttttttt taaatagatt 180
taggaccaat aagtcttaat tggtttgaag aactttcttc agaagctcca ccctataatt 240
ctgaacctgc agaagaatct gaacataaaa acaacaatta cgaaccaaac ctatttaaaa 300
ctccacaaag gaaaccatct tataatcagc tggcttcaac tccaataata ttcaaagagc 360
360
<210> 11
<211> 360
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 11
gactttttgt ttttaaacac ttccaaagaa tgcaaattta taatccagag tatatacatt 60
ctcactgaat tattgtactg tttcaggaag gaatgttccc aatagtagac ataaaagtct 120
tcgcacagtg aaaactaaaa tggatcaagc agatgatgtt tcctgtccac ttctaaattc 180
ttgtcttagt gaaaggtatg atgaagctat tatattaaaa tatttaaatg aaacattttc 240
ctacatatat ttgttctata aagatgaatc tgatttttat gctaatattt tggctaagag 300
cctggtagaa gatcttacat ttttaaataa tcttttaggt tgagtccttt aatagaatag 360
360
<210> 12
<211> 360
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 12
tgtacctagc attctgcctc atacaggcaa ttcagtaaac gttaagtgaa ataaagagtg 60
aatgaaaaaa taatatcctt aatgatcagg gcatttctat aaaaaataaa ctattttctt 120
tcctcccagg gtcgtcagac accaaaacat atttctgaaa gtctaggagc tgaggtggat 180
cctgatatgt cttggtcaag ttctttagct acaccaccca cccttagttc tactgtgctc 240
ataggtaata atagcaaatg tgtatttaca agaaagagca gatgaggttg ataattgtca 300
tctctaatac ttctgttaaa aggaaatatg aaaagaaaat attagataat gtctttgata 360
360
Claims (6)
- 하기로 구성된 군으로부터 선택되는, 유방암 또는 난소암의 진단을 위한 BRCA1 유전자 돌연변이 폴리뉴클레오티드:(1) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 38번째 염기와 39번째 염기에서 AT의 결실 및 GGG의 삽입을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(2) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 154번째 염기의 C에서 T로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(3) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 390번째 염기의 C에서 A로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(4) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 527번째 염기의 C에서 T로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(5) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 720번째와 721번째 사이에 A의 삽입을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(6) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 811번째 염기의 G에서 A로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(7) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 928번째 염기의 C에서 T로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(8) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 1293번째 염기에서 1295번째 염기까지 ACT의 결실 및 GA의 삽입을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(9) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 1516번째 염기에서 1520번째 염기까지 5개의 염기의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(10) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 1612번째 염기의 C에서 T로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(11) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 1716번째 염기 A의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(12) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 1823번째 염기 A의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(13) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 1831번째 염기 C의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(14) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 1840번째 염기의 A에서 G로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(15) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 1865번째 염기의 C에서 T로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(16) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 1961번째 염기 A의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(17) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 2048번째 염기 A의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(18) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 2359번째 염기 G의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(19) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 2433번째 염기 C의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(20) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 2481번째 염기의 A에서 C로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(21) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 2726번째 염기의 A에서 T로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(22) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 2934번째 염기 T의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(23) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 2968번째 염기의 G에서 A로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(24) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3296번째 염기 C의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(25) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3329번째 염기 A의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(26) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3340번째 염기의 G에서 T로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(27) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3409번째 염기의 A에서 G로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(28) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3436번째에서 3439번째까지 4개의 염기의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(29) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3442번째 염기 G의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(30) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3448번째 염기의 C에서 T로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(31) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3472번째 염기의 G에서 T로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(32) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3593번째 염기의 T에서 A로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(33) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3627번째와 3628번째 사이에 A의 삽입을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(34) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3722번째 염기의 C에서 G로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(35) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3756번째에서 3759번째까지 4개의 염기의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(36) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3812번째와 3813번째 사이에 T의 삽입을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(37) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3895번째 염기의 C에서 T로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(38) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 4041번째에서 4142번째까지 2개의 염기의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(39) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 4065번째에서 4068번째까지 4개의 염기의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(40) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 4338번째 염기와 4339번째 염기 사이에 4개의 염기 AGAA의 삽입을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(41) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 4729번째 염기의 T에서 C로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(42) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 4743번째 염기의 A에서 C로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(43) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 4981번째 염기의 G에서 T로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(44) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 5030번째에서 5033번째까지 4개의 염기의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(45) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 5102번째에서 5103번째까지 2개의 염기의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(46) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 5323번째에서 5324번째까지 2개의 염기의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(47) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 5339번째 염기의 T에서 C로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(48) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 5444번째 염기의 G에서 A로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(49) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 5470번째로부터 5477번째까지 8개의 염기의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(50) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 5483번째 염기 G의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(51) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 5497번째로부터 5506번째까지 10개의 염기의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(52) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 5532번째와 5533번째 사이에 G의 삽입을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(53) 서열번호 1의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 5553번째와 5554번째 사이에 C의 삽입을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(54) 서열번호 2의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 210번째 염기 G의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(55) 서열번호 3의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 218번째 염기의 A에서 G로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(56) 서열번호 4의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 167번 염기의 G에서 T로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(57) 서열번호 5의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 171번 염기의 G에서 A로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(58) 서열번호 6의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 149번째 염기의 A에서 C로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(59) 서열번호 7의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 124번째 염기의 A에서 G로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드; 및(60) 서열번호 8의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 205번째 염기의 G에서 T로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드.
- 제1항의 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드를 프로브로 포함하는 BRCA1 유전자 돌연변이 검출용 마이크로어레이.
- 제2항에 있어서, 상기 폴리뉴클레오티드는 방사선 표지, 형광 표지, 효소 표지, 서열 택(sequence tag), 또는 바이오틴에 의해 표지되는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이.
- 하기로 구성된 군으로부터 선택되는, 난소암 또는 유방암의 진단을 위한 BRCA2 유전자 돌연변이 폴리뉴클레오티드:(1) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 53번째 염기의 G에서 A로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(2) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 97번째 염기의 G에서 T로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(3) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 125번째 염기의 A에서 G로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(4) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 276번째와 277번째 사이에 A의 삽입을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(5) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 475번째 염기의 G에서 A로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(6) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 623번째 염기의 T에서 G로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(7) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 658번째 염기에서 659번째 염기까지 2개의 염기의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(8) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 943번째 염기의 T에서 A로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(9) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 964번째 염기의 A에서 C로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(10) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 994번째 염기 A의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(11) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 1310번째 염기에서 1313번째 염기까지 4개의 염기의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(12) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 1399번째 염기의 A에서 T로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(13) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 1547번째 염기 T의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(14) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 1744번째 염기의 A에서 C로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(15) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 1847번째 염기의 G에서 A로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(16) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 1889번째 염기의 C에서 T로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(17) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 2465번째 염기의 G에서 A로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(18) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 2798번째 염기에서 2799번째 염기까지 2개의 염기의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(19) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 2808번째 염기에서 2811번째 염기까지 4개의 염기의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(20) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 2912번째 염기의 T에서 G로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(21) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3096번째 염기에서 3110번째 염기까지 15개의 염기의 결실 및 T의 삽입을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(22) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3195번째 염기에서 3198번째 염기까지 4개의 염기의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(23) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3220번째 염기의 A에서 T로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(24) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3341번째 염기의 T에서 G로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(25) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3352번째 염기에서 3356번째 염기까지 5개의 염기의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(26) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3744번째 염기에서 3747번째 염기까지 4개의 염기의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(27) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3814번째 염기의 A에서 G로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(28) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 3814번째 염기의 A에서 T로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(29) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 4376번째 염기의 A에서 G로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(30) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 4766번째 염기 C의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(31) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 4829번째 염기에서 4830번째 염기까지 2개의 염기의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(32) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 4854번째 염기의 T에서 A로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(33) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 5207번째 염기에서 5208번째 염기까지 2개의 염기의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(34) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 5250번째 염기 C의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(35) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 5576번째 염기에서 5579번째 염기까지 4개의 염기의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(36) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 5656번째 염기의 C에서 T로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(37) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 5744번째 염기의 C에서 T로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(38) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 5946번째 염기에서 5949번째 염기까지 4개의 염기의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(39) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 5969번째 염기의 A에서 C로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(40) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 6029번째 염기의 T에서 G로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(41) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 6082번째 염기의 G에서 T로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(42) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 6086번째 염기의 A에서 G로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(43) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 6131번째 염기의 G에서 T로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(44) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 6239번째 염기의 T에서 G로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(45) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 6325번째 염기의 G에서 A로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(46) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 6448번째 염기의 A에서 C로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(47) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 6496번째 염기의 G에서 T로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(48) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 6553번째 염기 G의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(49) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 6724번째 염기에서 6725번째 염기까지 2개의 염기의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(50) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 6839번째 염기의 T에서 G로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(51) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 6875번째 염기의 A에서 C로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(52) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 7052번째 염기의 C에서 G로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(53) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 7088번째 염기의 A에서 G로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(54) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 7218번째 염기의 T에서 G로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(55) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 7411번째 염기의 A에서 G로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(56) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 7469번째 염기의 T에서 C로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(57) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 7480번째 염기의 C에서 T로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(58) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 7522번째 염기의 G에서 A로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(59) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 7625번째 염기의 C에서 A로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(60) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 7814번째 염기의 G에서 A로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(61) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 7876번째 염기의 T에서 C로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(62) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 8063번째 염기의 T에서 A로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(63) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 8299번째 염기와 8300번째 염기 사이에 AC의 삽입을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(64) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 8437번째 염기에서 8439번째 염기까지 3개의 염기의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(65) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 8717번째 염기에서 8718번째 염기까지 2개의 염기의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(66) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 8827번째 염기와 8828번째 염기 사이에 G의 삽입을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(67) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 8932번째 염기의 T에서 G로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(68) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 8951번째 염기의 C에서 G로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(69) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 8991번째 염기의 T에서 G로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(70) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 9076번째 염기의 C에서 T로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(71) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 9253번째와 9254번째 사이에 A의 삽입을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(72) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 9309번째 염기의 A에서 C로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(73) 서열번호 9의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서 10150번째 염기의 C에서 T로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(74) 서열번호 10의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서, 171번째 염기 T의 결실을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드;(75) 서열번호 11의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서, 208번째 염기의 T에서 C로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드; 및(76) 서열번호 12의 서열로 구성된 폴리뉴클레오티드에서, 118번째 염기의 C에서 A로의 치환을 포함하는 20-100개의 연속 뉴클레오티드 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드.
- 제4항의 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드를 프로브로 포함하는 BRCA2 유전자 돌연변이 검출용 마이크로어레이.
- 제5항에 있어서, 상기 폴리뉴클레오티드는 방사선 표지, 형광 표지, 효소 표지, 서열 택, 또는 바이오틴에 의해 표지되는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이.
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Citations (3)
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|---|---|---|---|---|
| KR20020068305A (ko) * | 2001-02-20 | 2002-08-27 | 정용우 | Ｂｒｃａ1 돌연변이 진단방법 및 그 방법을 활용한 진단 칩 |
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Patent Citations (3)
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|---|---|---|---|---|
| KR20020068305A (ko) * | 2001-02-20 | 2002-08-27 | 정용우 | Ｂｒｃａ1 돌연변이 진단방법 및 그 방법을 활용한 진단 칩 |
| US20030224374A1 (en) | 2001-06-18 | 2003-12-04 | Hongyue Dai | Diagnosis and prognosis of breast cancer patients |
| US20050095592A1 (en) | 2002-02-13 | 2005-05-05 | Jazaeri Amir A. | Identification of ovarian cancer tumor markers and therapeutic targets |
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| KR20210138368A (ko) | 2020-05-12 | 2021-11-19 | 가톨릭대학교 산학협력단 | Brca1 유전자 메틸화를 이용한 난소암 발병 위험도 예측 방법 |
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