JPWO2020158687A5

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Publication number: JPWO2020158687A5
Application number: JP2020569625A
Authority: JP
Filing date: 2020-01-27
Publication date: 2023-01-25
Anticipated expiration: 2040-01-27

Claims

次の式Ｉの化合物からなる、光反応性架橋剤：
［化８］

（ただし、式Ｉにおいて、
Ｒは、メチル基であり、
Ｘは、酸素原子であり、
Ｒ１及びＲ２は、それぞれ独立して、水素原子、ハロゲン原子、－ＯＨ基、アミノ基、ニトロ基、メチル基、フッ化メチル基、エチル基、フッ化エチル基、及びＣ１～Ｃ３のアルキルスルファニル基からなる群から選択された基であり、
Ｙは、糖（糖は、リボース、及びデオキシリボースを含む）、多糖類（多糖類は、核酸のポリリボース鎖、及びポリデオキシリボース鎖を含む）、ポリエーテル、ポリオール、アルカノールアミン、アミノ酸、ポリペプチド鎖（ポリペプチド鎖は、ペプチド核酸のポリペプチド鎖を含む）、又は水溶性合成高分子である）。
式ＩにおけるＹ基が、以下の（ｉ）～（ｉｉｉ）に示される原子及び基からなる群から選択された基である、請求項１に記載の光反応性架橋剤：
（ｉ）次の式Ｙａで表される基：
［化９］

（ただし、式Ｙａにおいて、
Ｒ１１は、水素原子又は水酸基であり、
Ｒ１２は、水酸基、又は－Ｏ－Ｑ₁基であり、
Ｒ１３は、水酸基、又は－Ｏ－Ｑ₂基であり、
Ｑ₁は、
Ｑ₁に結合するＯと一体となって形成されるリン酸基；
Ｑ₁に結合するＯと一体となって形成されるリン酸基によって形成されるリン酸ジエステル結合を介して連結されるヌクレオチド、核酸又はペプチド核酸；及び
以下から選択される保護基：
トリチル基、モノメトキシトリチル基、ジメトキシトリチル基、トリメトキシトリチル基、トリメチルシリル基、トリエチルシリル基、ｔ－ブチルジメチルシリル基、アセチル基、ベンゾイル基；
からなる群から選択される基であり、
Ｑ₂は、
Ｑ₂に結合するＯと一体となって形成されるリン酸基；
Ｑ₂に結合するＯと一体となって形成されるリン酸基によって形成されるリン酸ジエステル結合を介して連結されるヌクレオチド、核酸又はペプチド核酸；及び
以下から選択される保護基：
２－シアノエチル－Ｎ，Ｎ－ジアルキル（Ｃ１～Ｃ４）ホスホロアミダイト基、メチルホスホンアミダイト基、エチルホスホンアミダイト基、オキサザホスホリジン基、チオホスファイト基、－ＰＨ（＝Ｏ）ＯＨのＴＥＡ塩、－ＰＨ（＝Ｏ）ＯＨのＤＢＵ塩、－ＰＨ（＝Ｓ）ＯＨのＴＥＡ塩、－ＰＨ（＝Ｓ）ＯＨのＤＢＵ塩；
からなる群から選択される基である）；
（ｉｉ）次の式Ｙｂで表される基：
［化１０］

（ただし、式Ｙｂにおいて、
Ｒ２１は、水素原子、メチル基、又はエチル基を表し、
Ｑ₁は、式ＹａのＱ₁として記載された基であり、
Ｑ₂は、式ＹａのＱ₂として記載された基である）；及び
（ｉｉｉ）次の式Ｙｃで表される基：
［化１１］

（ただし、式Ｙｃにおいて、
Ｒ３１は、アミノ基の保護基、水素原子、又は、Ｒ３１に結合するＮＨと一体となって形成されたペプチド結合によって結合されたポリペプチドを表し、
Ｒ３２は、水酸基、又は、Ｒ３２に結合するＣＯと一体となって形成されたペプチド結合によって結合されたポリペプチドを表し、
Ｌは、リンカー部、又は単結合である）。
式ＩにおけるＹ基が、以下の条件を満たす式Ｙａで表される基である、請求項２に記載の光反応性架橋剤：
式Ｙａで表される基において、
Ｒ１１は、水素原子又は水酸基であり、
Ｒ１２は、水酸基、又は－Ｏ－Ｑ₁基であり、
Ｒ１３は、水酸基、又は－Ｏ－Ｑ₂基であり、
Ｑ₁は、
Ｑ₁に結合するＯと一体となって形成されるリン酸基；
Ｑ₁に結合するＯと一体となって形成されるリン酸基によって形成されるリン酸ジエステル結合を介して連結されるヌクレオチド、又は核酸であり、
Ｑ₂は、
Ｑ₂に結合するＯと一体となって形成されるリン酸基；
Ｑ₂に結合するＯと一体となって形成されるリン酸基によって形成されるリン酸ジエステル結合を介して連結されるヌクレオチド、又は核酸であり、
ただし、Ｒ１２とＲ１３が同時に水酸基である場合を除く。
請求項１～３のいずれかに記載の光反応性架橋剤を使用して、ピリミジン環を有する核酸塩基との間に光架橋を形成する方法。