JPWO2020072996A5 - - Google Patents

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Claims (91)

  1. 対象における重症複合免疫不全症（ＳＣＩＤ）、ウィスコット・アルドリッチ症候群（ＷＡＳ）、及び／またはＸ連鎖無ガンマグロブリン血症（ＸＬＡ）をスクリーニングする方法であって、
    前記対象に由来する乾燥血液スポット（ＤＢＳ）試料の血液由来のタンパク質を酵素で消化して１つ以上のペプチドを生成することと；
    以下の工程によりペプチドを濃縮することであって、
    配列番号１のＳＣＩＤのＣＤ３εシグネチャーペプチドを、前記ＣＤ３εシグネチャーペプチドに結合し、かつ配列番号２２のＣＤＲ１、配列番号２３のＣＤＲ２、及び配列番号２４のＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号２５のＣＤＲ１、配列番号２６のＣＤＲ２、及び配列番号２７のＣＤＲを含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む、抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて；
    配列番号２のＷＡＳの第１のＷＡＳｐシグネチャーペプチドを、前記第１のＷＡＳｐシグネチャーペプチドに結合し、かつ配列番号２８のＣＤＲ１、配列番号２９のＣＤＲ２、及び配列番号３０のＣＤＲ３を含む重鎖可変ドメイン（ＶＨ）、ならびに配列番号３１のＣＤＲ１、配列番号３２のＣＤＲ２、及び配列番号３３のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む、抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて；
    配列番号３のＷＡＳの第２のＷＡＳｐシグネチャーペプチドを、前記第２のＷＡＳｐシグネチャーペプチドに結合する、抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて；
    配列番号４のＸＬＡの第１のＢＴＫシグネチャーペプチドを、前記第１のＢＴＫシグネチャーペプチドに結合し、かつ配列番号３４のＣＤＲ１、配列番号３５のＣＤＲ２、及び配列ＧＤＩのＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号３６のＣＤＲ１、配列番号３７のＣＤＲ２、及び配列番号３８のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む、抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて；
    ならびに／あるいは
    配列番号５のＸＬＡの第２のＢＴＫシグネチャーペプチドを、前記第２のＢＴＫシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて、
    前記濃縮することと；
    前記濃縮ペプチドに対して液体クロマトグラフィー－多重反応モニタリング質量分析（ＬＣ－ＭＲＭ－ＭＳ）を実行して、前記ペプチドの濃度を決定することと；
    前記対象が、以下：
    前記ＣＤ３εシグネチャーペプチドの前記濃度が所定の閾値濃度よりも低い場合、または前記ＣＤ３εシグネチャーペプチドが存在しない場合は、ＳＣＩＤ；
    前記第１及び／もしくは第２のＷＡＳｐシグネチャーペプチドの前記濃度が対応する所定の閾値濃度よりも低い場合、または前記第１及び／もしくは第２のＷＡＳｐシグネチャーペプチドが存在しない場合は、ＷＡＳ；ならびに
    前記第１及び／もしくは第２のＢＴＫシグネチャーペプチドの前記濃度が対応する所定の閾値濃度よりも低い場合、または前記第１及び／もしくは第２のＢＴＫシグネチャーペプチドが存在しない場合は、ＸＬＡ；
    を有すると決定することと：
    を含む、前記方法。
  2. 前記方法が、フェニルケトン尿症、原発性先天性甲状腺機能低下症、嚢胞性線維症、及び鎌状赤血球症のうちの１つ以上について前記対象をさらにスクリーニングする、新生児スクリーニング（ＮＢＳ）の一部として実施される、及び／又は
    前記対象においてＳＣＩＤ、ＷＡＳ、及び／またはＸＬＡの臨床症状がない状態で実施される、
    請求項１に記載の方法。
  3. 前記酵素がトリプシンである、請求項１に記載の方法。
  4. 各シグネチャーペプチドについて前記対応する所定の閾値濃度が、正常な対照対象の集団由来のＤＢＳ中の各シグネチャーペプチドの前記平均濃度の標準偏差から計算される、請求項１に記載の方法。
  5. 正常な対照対象の集団由来のＤＢＳにおける配列番号１のＳＣＩＤの前記ＣＤ３εシグネチャーペプチドの前記平均濃度が、７０ｐｍｏｌ／Ｌ～４００ｐｍｏｌ／Ｌの範囲の濃度を含む、及び／又は
    正常な対照対象の集団由来のＤＢＳ中における配列番号２のＷＡＳの前記第１のＷＡＳｐシグネチャーペプチドの前記平均濃度が、６００ｐｍｏｌ／Ｌ～５０００ｐｍｏｌ／Ｌの範囲の濃度を含む、及び／又は
    正常な対照対象の集団由来のＤＢＳにおける配列番号３のＷＡＳの前記第２のＷＡＳｐシグネチャーペプチドの前記平均濃度が、５５００ｐｍｏｌ／Ｌ～１５０００ｐｍｏｌ／Ｌの範囲の濃度を含む、及び／又は
    正常な対照対象の集団由来のＤＢＳにおける配列番号４のＸＬＡの前記第１のＢＴＫシグネチャーペプチドの前記平均濃度が、３５０ｐｍｏｌ／Ｌ～２５００ｐｍｏｌ／Ｌの範囲の濃度を含む、及び／又は
    正常な対照対象の集団由来のＤＢＳにおける配列番号５のＸＬＡの前記第２のＢＴＫシグネチャーペプチドの前記平均濃度が５５０ｐｍｏｌ／Ｌ～１６００ｐｍｏｌ／Ｌの範囲の濃度を含む、請求項４に記載の方法。
  6. 配列番号１のＳＣＩＤの前記ＣＤ３εシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号６３のＶＨドメインを含む、及び／又は
    配列番号１のＳＣＩＤの前記ＣＤ３εシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号６４のＶＬドメインを含む、請求項１に記載の方法。
  7. 配列番号２のＷＡＳの前記第１のＷＡＳｐシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号６５のＶＨドメインを含む、及び／又は
    配列番号２のＷＡＳの前記第１のＷＡＳｐシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号６６のＶＬドメインを含む、及び／又は
    配列番号２のＷＡＳの前記第１のＷＡＳｐシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号８６の重鎖を含む、及び／又は
    配列番号２のＷＡＳの前記第１のＷＡＳｐシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号９１の軽鎖を含む、請求項１に記載の方法。
  8. 配列番号４のＸＬＡの前記第１のＢＴＫシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号６７のＶＨドメインを含む、及び／又は
    配列番号４のＸＬＡの前記第１のＢＴＫシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号６８のＶＬドメインを含む、及び／又は
    配列番号４のＸＬＡの前記第１のＢＴＫシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号９６の重鎖を含む、及び／又は
    配列番号４のＸＬＡの前記第１のＢＴＫシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号１０１の軽鎖を含む、請求項１に記載の方法。
  9. ペプチドの濃縮によりシスチン症をスクリーニングするステップをさらに含む、請求項１に記載の方法であって、
    第１のＣＴＮＳシグネチャーペプチドに結合し、かつ配列番号３９のＣＤＲ１、配列番号４０のＣＤＲ２、及び配列番号４１のＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号４２のＣＤＲ１、配列番号４３のＣＤＲ２、及び配列番号４４のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む、抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて、配列番号６のシスチン症の第１のＣＴＮＳシグネチャーペプチドを；
    第２のＣＴＮＳシグネチャーペプチドに結合し、かつ配列番号４５のＣＤＲ１、配列番号４６のＣＤＲ２、及び配列番号４７のＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号４８のＣＤＲ１、配列番号４９のＣＤＲ２、及び配列番号５０のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む、抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて、配列番号７または８のシスチン症の第２のＣＴＮＳシグネチャーペプチドを；
    第３のＣＴＮＳシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて、配列番号１２のシスチン症の第３のＣＴＮＳシグネチャーペプチドを；
    第４のＣＴＮＳシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて、配列番号１３のシスチン症の第４のＣＴＮＳシグネチャーペプチドを；
    第１のＳＨＰＫシグネチャーペプチドに結合し、かつ配列番号５１のＣＤＲ１、配列番号５２のＣＤＲ２、及び配列番号５３のＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号５４のＣＤＲ１、配列番号５５のＣＤＲ２、及び配列番号５６のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む、抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて、配列番号９のシスチン症の第１のＳＨＰＫシグネチャーペプチドを；
    第２のＳＨＰＫシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて、配列番号１４のシスチン症の第２のＳＨＰＫシグネチャーペプチドを；
    第３のＳＨＰＫシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて、配列番号１５のシスチン症の第３のＳＨＰＫシグネチャーペプチドを、
    前記濃縮することにより、シスチン症をスクリーニングすることと；
    前記対象を、前記第１のＣＴＮＳ、前記第２のＣＴＮＳ、前記第３のＣＴＮＳ、前記第４のＣＴＮＳ、前記第１のＳＨＰＫ、前記第２のＳＨＰＫ、及び／もしくは前記第３のＳＨＰＫシグネチャーペプチドの濃度が対応する所定の閾値濃度よりも低い場合、または前記第１のＣＴＮＳ、前記第２のＣＴＮＳ、前記第３のＣＴＮＳ、前記第４のＣＴＮＳ、前記第１のＳＨＰＫ、前記第２のＳＨＰＫ、及び／または前記第３のＳＨＰＫシグネチャーペプチドが存在しない場合、シスチン症を有すると決定することと、
    をさらに含む、前記方法。
  10. 各シグネチャーペプチドの前記対応する所定の閾値濃度が、正常な対照対象の集団由来のＤＢＳ中の各シグネチャーペプチドの平均濃度の標準偏差から計算され、及び
    正常な対照対象の集団由来のＤＢＳにおける配列番号６のシスチン症の前記第１のＣＴＮＳシグネチャーペプチドの前記平均濃度が、４０ｐｍｏｌ／Ｌ～２５０ｐｍｏｌ／Ｌの範囲の濃度を含む、及び／又は正常な対照対象の集団由来のＤＢＳにおける配列番号９のシスチン症の第１のＳＨＰＫシグネチャーペプチドの平均濃度が、１００ｐｍｏｌ／Ｌ～８０００ｐｍｏｌ／Ｌの範囲の濃度を含む、
    請求項９に記載の方法。
  11. 配列番号６のシスチン症の前記第１のＣＴＮＳシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号６９のＶＨドメインを含む、及び／又は
    配列番号６のシスチン症の前記第１のＣＴＮＳシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号７０のＶＬドメインを含む、及び／又は
    配列番号６のシスチン症の前記第１のＣＴＮＳシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号１０６の重鎖を含む、及び／又は
    配列番号６のシスチン症の前記第１のＣＴＮＳシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号１１１の軽鎖を含む、請求項９に記載の方法。
  12. 配列番号７または８のシスチン症の前記第２のＣＴＮＳシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号７１のＶＨドメインを含む、及び／又は
    配列番号７または８のシスチン症の前記第２のＣＴＮＳシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号７２のＶＬドメインを含む、及び／又は
    配列番号７または８のシスチン症の前記第２のＣＴＮＳシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号１１６の重鎖を含む、及び／又は
    配列番号７または８のシスチン症の前記第２のＣＴＮＳシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号１２１の軽鎖を含む、請求項９に記載の方法。
  13. 配列番号９のシスチン症の前記第１のＳＨＰＫシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号７３のＶＨドメインを含む、及び／又は
    配列番号９のシスチン症の前記第１のＳＨＰＫシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号７４のＶＬドメインを含む、及び／又は
    配列番号９のシスチン症の前記第１のＳＨＰＫシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号１２６の重鎖を含む、及び／又は
    配列番号９のシスチン症の前記第１のＳＨＰＫシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号１３１の軽鎖を含む、請求項９に記載の方法。
  14. ペプチドの濃縮によりウィルソン病（ＷＤ）をスクリーニングするステップをさらに含む、請求項１に記載の方法であって、
    第１のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて、配列番号１０のＷＤの前記第１のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドを；及び／または
    第２のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドに結合し、かつ配列番号５７のＣＤＲ１、配列番号５８のＣＤＲ２、及び配列番号５９のＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号６０のＣＤＲ１、配列番号６１のＣＤＲ２、及び配列番号６２のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む、抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて、配列番号１１または２１のＷＤの前記第２のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドを；
    第３のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて、配列番号１６のＷＤの前記第３のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドを；
    第４のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて、配列番号１７のＷＤの前記第４のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドを；
    第５のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて、配列番号１８のＷＤの前記第５のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドを；
    第６のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて、配列番号１９のＷＤの前記第６のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドを；
    第７のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて、配列番号２０のＷＤの前記第７のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドを、前記濃縮することよってウィルソン病（ＷＤ）をスクリーニングすることと；及び
    前記第１のＡＴＰ７Ｂ、前記第２のＡＴＰ７Ｂ、前記第３のＡＴＰ７Ｂ、前記第４のＡＴＰ７Ｂ、前記第５のＡＴＰ７Ｂ、前記第６のＡＴＰ７Ｂ、及び／もしくは前記第７のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドの濃度が対応する所定の閾値濃度よりも低い場合、または前記第１のＡＴＰ７Ｂ、前記第２のＡＴＰ７Ｂ、前記第３のＡＴＰ７Ｂ、前記第４のＡＴＰ７Ｂ、前記第５のＡＴＰ７Ｂ、前記第６のＡＴＰ７Ｂ、及び／もしくは前記第７のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドが存在しない場合、前記対象がＷＤを有すると決定することと；
    をさらに含む、前記方法。
  15. 各シグネチャーペプチドの前記対応する所定の閾値濃度が、正常な対照対象の集団由来のＤＢＳ中の各シグネチャーペプチドの前記平均濃度の標準偏差から計算される、請求項１４に記載の方法。
  16. 正常な対照対象の集団由来のＤＢＳにおける配列番号１１または２１のＷＤの前記第２のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドの前記平均濃度が、９０ｐｍｏｌ／Ｌ～４００ｐｍｏｌ／Ｌの範囲の濃度を含む、及び／又は
    正常な対照対象の集団由来のＤＢＳにおける配列番号１６のＷＤの前記第３のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドの前記平均濃度が、３０ｐｍｏｌ／Ｌ～１００ｐｍｏｌ／Ｌの範囲の濃度を含む、及び／又は
    正常な対照対象の集団由来のＤＢＳにおける配列番号２０のＷＤの前記第７のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドの前記平均濃度が、２００ｐｍｏｌ／Ｌ～５００ｐｍｏｌ／Ｌの範囲の濃度を含む、請求項１５に記載の方法。
  17. 配列番号１１または２１のＷＤの前記第２のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号７５のＶＨドメインを含む、及び／又は
    配列番号１１または２１のＷＤの前記第２のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号７６のＶＬドメインを含む、及び／又は
    配列番号１１または２１のＷＤの前記第２のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号１３６の重鎖を含む、及び／又は
    配列番号１１または２１のＷＤの前記第２のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号１４１の軽鎖を含む、請求項１４に記載の方法。
  18. 対象における重症複合免疫不全症（ＳＣＩＤ）、ウィスコット・アルドリッチ症候群（ＷＡＳ）、及び／またはＸ連鎖無ガンマグロブリン血症（ＸＬＡ）をスクリーニングする方法であって、
    前記対象に由来する乾燥血液スポット（ＤＢＳ）サンプルの血液由来のタンパク質を酵素で消化して１つ以上のペプチドを生成することと；
    以下のステップによりペプチドを濃縮することであって、
    配列番号１のＳＣＩＤのＣＤ３εシグネチャーペプチドを、前記ＣＤ３εシグネチャーペプチドに結合し、かつ配列番号２２のＣＤＲ１、配列番号２３のＣＤＲ２、及び配列番号２４のＣＤＲ３を含む、重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号２５のＣＤＲ１、配列番号２６のＣＤＲ２、及び配列番号２７のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む、抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて；
    配列番号２のＷＡＳの第１のＷＡＳｐシグネチャーペプチドを、前記第１のＷＡＳｐシグネチャーペプチドに結合し、かつ配列番号２８のＣＤＲ１、配列番号２９のＣＤＲ２、及び配列番号３０のＣＤＲ３を含む、重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号３１のＣＤＲ１、配列番号３２のＣＤＲ２、及び配列番号３３のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む、抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて；
    配列番号３のＷＡＳの第２のＷＡＳｐシグネチャーペプチドを、前記第２のＷＡＳｐシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて；
    配列番号４のＸＬＡの第１のＢＴＫシグネチャーペプチドを、前記第１のＢＴＫシグネチャーペプチドに結合し、かつ配列番号３４のＣＤＲ１、配列番号３５のＣＤＲ２、及び配列ＧＤＩのＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号３６のＣＤＲ１、配列番号３７のＣＤＲ２、及び配列番号３８のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む、抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて、及び／又は
    配列番号５のＸＬＡの第２のＢＴＫシグネチャーペプチドを、前記第２のＢＴＫシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて、
    前記濃縮することと；
    以下の内因性ＡＴＰ７Ｂペプチドを濃縮することであって、：
    前記配列番号１０の内因性ＡＴＰ７Ｂペプチドを、配列番号１０の内因性ＡＴＰ７Ｂペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて；
    配列番号１１または２１の内因性ＡＴＰ７Ｂペプチドを、前記配列番号１１または２１の内因性ＡＴＰ７Ｂペプチドに結合し、かつ配列番号５７のＣＤＲ１、配列番号５８のＣＤＲ２、及び配列番号５９のＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号６０のＣＤＲ１、配列番号６１のＣＤＲ２、及び配列番号６２のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む、抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて；
    配列番号１６の内因性ＡＴＰ７Ｂペプチドを、前記配列番号１６の内因性ＡＴＰ７Ｂペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて；
    配列番号１７の内因性ＡＴＰ７Ｂペプチドを、前記配列番号１７の内因性ＡＴＰ７Ｂペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて；
    配列番号１８の内因性ＡＴＰ７Ｂペプチドを、前記配列番号１８の内因性ＡＴＰ７Ｂペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて；
    配列番号１９の内因性ＡＴＰ７Ｂペプチドを、前記配列番号１９の内因性ＡＴＰ７Ｂペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて；
    配列番号２０の内因性ＡＴＰ７Ｂペプチドを、前記配列番号２０の内因性ＡＴＰ７Ｂペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて；あるいは
    配列番号２１の内因性ＡＴＰ７Ｂペプチドを、前記配列番号２１の内因性ＡＴＰ７Ｂペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて；
    前記濃縮することと；
    前記濃縮ペプチドに対して液体クロマトグラフィー－多重反応モニタリング質量分析（ＬＣ－ＭＲＭ－ＭＳ）を実行して、前記ペプチドの濃度を決定することと；
    シグネチャーペプチド濃度：内因性ＡＴＰ７Ｂペプチド濃度の比率を、各シグネチャーペプチドについて計算することと；
    ＣＤ３εシグネチャーペプチド濃度：内因性ＡＴＰ７Ｂペプチド濃度の比率が対応する所定の閾値比よりも低い場合、またはＣＤ３εシグネチャーペプチドが存在しない場合は、ＳＣＩＤ；
    前記第１及び／もしくは第２のＷＡＳｐシグネチャーペプチド濃度：内因性ＡＴＰ７Ｂペプチド濃度の比率が対応する所定の閾値比よりも低い場合、または前記第１及び／もしくは第２のＷＡＳｐシグネチャーペプチドが存在しない場合は、ＷＡＳ；ならびに
    前記第１及び／もしくは第２のＢＴＫシグネチャーペプチド濃度：内因性ＡＴＰ７Ｂペプチド濃度の比率が対応する所定の閾値比よりも低い場合、または前記第１及び／もしくは第２のＢＴＫシグネチャーペプチドが存在しない場合は、ＸＬＡ
    を対象が有すると、決定することと、
    を含む、前記方法。
  19. 各所定の閾値比率が、サンプルの集団における各ペプチド濃度：内因性ＡＴＰ７Ｂペプチド濃度の平均比率の標準偏差から計算される、請求項１８に記載の方法。
  20. 前記方法が、フェニルケトン尿症、原発性先天性甲状腺機能低下症、嚢胞性線維症、及び鎌状赤血球症のうちの１つ以上について前記対象をさらにスクリーニングする新生児スクリーニング（ＮＢＳ）の一部として実施される、及び／又は
    前記対象においてＳＣＩＤ、ＷＡＳ、及び／またはＸＬＡの臨床症状がない状態で実施される、請求項１８に記載の方法。
  21. 前記酵素がトリプシンである、請求項１８に記載の方法。
  22. 配列番号１のＳＣＩＤの前記ＣＤ３εシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号６３のＶＨドメインを含む、及び／又は
    配列番号１のＳＣＩＤの前記ＣＤ３εシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号６４のＶＬドメインを含む、請求項１８に記載の方法。
  23. 配列番号２のＷＡＳの前記第１のＷＡＳｐシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号６５のＶＨドメインを含む、及び／又は
    配列番号２のＷＡＳの前記第１のＷＡＳｐシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号６６のＶＬドメインを含む、及び／又は
    配列番号２のＷＡＳの前記第１のＷＡＳｐシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号８６の重鎖を含む、及び／又は
    配列番号２のＷＡＳの前記第１のＷＡＳｐシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号９１の軽鎖を含む、請求項１８に記載の方法。
  24. 配列番号４のＸＬＡの前記第１のＢＴＫシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号６７のＶＨドメインを含む、及び／又は
    配列番号４のＸＬＡの前記第１のＢＴＫシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号６８のＶＬドメインを含む、及び／又は
    配列番号４のＸＬＡの前記第１のＢＴＫシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号９６の重鎖を含む、及び／又は
    配列番号４のＸＬＡの前記第１のＢＴＫシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号１０１の軽鎖を含む、請求項１８に記載の方法。
  25. ペプチドの濃縮によりシスチン症をスクリーニングするステップを含む、請求項１８に記載の方法であって、
    配列番号６のシスチン症の第１のＣＴＮＳシグネチャーペプチドを、前記第１のＣＴＮＳシグネチャーペプチドに結合し、かつ配列番号３９のＣＤＲ１、配列番号４０のＣＤＲ２、配列番号４１のＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号４２のＣＤＲ１、配列番号４３のＣＤＲ２、及び配列番号４４のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて濃縮すること；
    配列番号７または８のシスチン症の第２のＣＴＮＳシグネチャーペプチドを、前記第２のＣＴＮＳシグネチャーペプチドに結合し、かつ配列番号４５のＣＤＲ１、配列番号４６のＣＤＲ２、及び配列番号４７のＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号４８のＣＤＲ１、配列番号４９のＣＤＲ２、及び配列番号５０のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む、抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて濃縮すること；
    配列番号１２のシスチン症の第３のＣＴＮＳシグネチャーペプチドを、前記第３のＣＴＮＳシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて濃縮すること；
    配列番号１３のシスチン症の第４のＣＴＮＳシグネチャーペプチドを、前記第４のＣＴＮＳシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて濃縮すること；
    配列番号９のシスチン症の第１のＳＨＰＫシグネチャーペプチドを、第１のＳＨＰＫシグネチャーペプチドに結合し、かつ配列番号５１のＣＤＲ１、配列番号５２のＣＤＲ２、及び配列番号５３のＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号５４のＣＤＲ１、配列番号５５のＣＤＲ２、及び配列番号５６のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む、抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて濃縮すること；
    配列番号１４のシスチン症の第２のＳＨＰＫシグネチャーペプチドを、前記第２のＳＨＰＫシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて；ならびに／あるいは
    配列番号１５のシスチン症の第３のＳＨＰＫシグネチャーペプチドを、前記第３のＳＨＰＫシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて濃縮すること；
    シグネチャーペプチド濃度：内因性ＡＴＰ７Ｂペプチド濃度の比率を、各シグネチャーペプチドについて計算することと；
    前記第１のＣＴＮＳペプチド濃度：内因性ＡＴＰ７Ｂペプチド濃度、前記第２のＣＴＮＳペプチド濃度：内因性ＡＴＰ７Ｂペプチド濃度、前記第３のＣＴＮＳペプチド濃度：内因性ＡＴＰ７Ｂペプチド濃度、前記第４のＣＴＮＳペプチド濃度：内因性ＡＴＰ７Ｂペプチド濃度、前記第１のＳＨＰＫペプチド濃度：内因性ＡＴＰ７Ｂペプチド濃度、前記第２のＳＨＰＫペプチド濃度：内因性ＡＴＰ７Ｂペプチド濃度、及び／もしくは前記第３のＳＨＰＫシグネチャーペプチド濃度：内因性ＡＴＰ７Ｂペプチド濃度の比率が、対応する所定の閾値比よりも低い場合、または前記第１のＣＴＮＳ、前記第２のＣＴＮＳ、前記第３のＣＴＮＳ、前記第４のＣＴＮＳ、前記第１のＳＨＰＫ、前記第２のＳＨＰＫ、及び／もしくは第３のＳＨＰＫシグネチャーペプチドが存在しない場合、前記対象がシスチン症を有すると決定することと、
    をさらに含む、前記方法。
  26. 配列番号６のシスチン症の前記第１のＣＴＮＳシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号６９のＶＨドメインを含む、及び／又は
    配列番号６のシスチン症の前記第１のＣＴＮＳシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号７０のＶＬドメインを含む、及び／又は
    配列番号６のシスチン症の前記第１のＣＴＮＳシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号１０６の重鎖を含む、及び／又は
    配列番号６のシスチン症の前記第１のＣＴＮＳシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号１１１の軽鎖を含む、請求項２５に記載の方法。
  27. 配列番号７または８のシスチン症の前記第２のＣＴＮＳシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号７１のＶＨドメインを含む、及び／又は
    配列番号７または８のシスチン症の前記第２のＣＴＮＳシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号７２のＶＬドメインを含む、及び／又は
    配列番号７または８のシスチン症の前記第２のＣＴＮＳシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号１１６の重鎖を含む、及び／又は
    配列番号７または８のシスチン症の前記第２のＣＴＮＳシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号１２１の軽鎖を含む、請求項２５に記載の方法。
  28. 配列番号９のシスチン症の前記第１のＳＨＰＫシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号７３のＶＨドメインを含む、及び／又は
    配列番号９のシスチン症の前記第１のＳＨＰＫシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号７４のＶＬドメインを含む、及び／又は
    配列番号９のシスチン症の前記第１のＳＨＰＫシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号１２６の重鎖を含む、及び／又は
    配列番号９のシスチン症の前記第１のＳＨＰＫシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号１３１の軽鎖を含む、請求項２５に記載の方法。
  29. 配列番号１１または２１の前記内因性ＡＴＰ７Ｂペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号７５のＶＨドメインを含む、及び／又は
    配列番号１１または２１の前記内因性ＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号７６のＶＬドメインを含む、及び／又は
    配列番号１１または２１の前記内因性ＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号１３６の重鎖を含む、及び／又は
    配列番号１１または２１の前記内因性ＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号１４１の軽鎖を含む、請求項２５に記載の方法。
  30. 重症複合免疫不全症（ＳＣＩＤ）、ウィスコット・アルドリッチ症候群（ＷＡＳ）、及び／またはＸ連鎖無ガンマグロブリン血症（ＸＬＡ）の１つ以上のシグネチャーペプチドを１つ以上の乾燥血液スポット（ＤＢＳ）サンプル中で検出する方法であって、以下：
    １つ以上の乾燥血液スポット（ＤＢＳ）サンプルの各ＤＢＳの血液からタンパク質を酵素で消化して、１つ以上のペプチドを生成することと；
    以下の工程によりペプチドを濃縮することであって、：
    配列番号１のＳＣＩＤのＣＤ３εシグネチャーペプチドを、前記ＣＤ３εシグネチャーペプチドに結合し、かつ配列番号２２のＣＤＲ１、配列番号２３のＣＤＲ２、及び配列番号２４のＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号２５のＣＤＲ１、配列番号２６のＣＤＲ２、及び配列番号２７のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む、抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて；
    配列番号２のＷＡＳの第１のＷＡＳｐシグネチャーペプチドを、前記第１のＷＡＳｐシグネチャーペプチドに結合し、かつ配列番号２８のＣＤＲ１、配列番号２９のＣＤＲ２、及び配列番号３０のＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号３１のＣＤＲ１、配列番号３２のＣＤＲ２、及び配列番号３３のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む、抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて；
    配列番号３のＷＡＳの第２のＷＡＳｐシグネチャーペプチドを、前記第２のＷＡＳｐシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて；
    配列番号４のＸＬＡの第１のＢＴＫシグネチャーペプチドを、前記第１のＢＴＫシグネチャーペプチドに結合し、かつ配列番号３４のＣＤＲ１、配列番号３５のＣＤＲ２、及び配列ＧＤＩのＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号３６のＣＤＲ１、配列番号３７のＣＤＲ２、及び配列番号３８のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む、抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて；ならびに／あるいは
    配列番号５のＸＬＡの第２のＢＴＫシグネチャーペプチドを、前記第２のＢＴＫシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて；
    前記濃縮することと；
    前記濃縮ペプチドに対して液体クロマトグラフィー－多重反応モニタリング質量分析（ＬＣ－ＭＲＭ－ＭＳ）を実行し、１つ以上のＤＢＳサンプル中でＳＣＩＤ、ＷＡＳ、及びＸＬＡの１つ以上のシグネチャーペプチドを検出することと；
    を含む、前記方法。
  31. 前記酵素がトリプシンである、請求項３０に記載の方法。
  32. 配列番号１のＳＣＩＤの前記ＣＤ３εシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号６３のＶＨドメインを含む、及び／又は
    配列番号１のＳＣＩＤの前記ＣＤ３εシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号６４のＶＬドメインを含む、請求項３０に記載の方法。
  33. 配列番号２のＷＡＳの前記第１のＷＡＳｐシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号６５のＶＨドメインを含む、及び／又は
    配列番号２のＷＡＳの前記第１のＷＡＳｐシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号６６のＶＬドメインを含む、及び／又は
    配列番号２のＷＡＳの前記第１のＷＡＳｐシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号８６の重鎖を含む、及び／又は
    配列番号２のＷＡＳの前記第１のＷＡＳｐシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号９１の軽鎖を含む、請求項３０に記載の方法。
  34. 配列番号４のＸＬＡの前記第１のＢＴＫシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号６７のＶＨドメインを含む、及び／又は
    配列番号４のＸＬＡの前記第１のＢＴＫシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号６８のＶＬドメインを含む、及び／又は
    配列番号４のＸＬＡの前記第１のＢＴＫシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号９６の重鎖を含む、及び／又は
    配列番号４のＸＬＡの前記第１のＢＴＫシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号１０１の軽鎖を含む、請求項３０に記載の方法。
  35. ペプチドの濃縮によりシスチン症の１つ以上のシグネチャーペプチドを検出するステップをさらに含む、請求項３０に記載の方法であって、
    配列番号６のシスチン症の第１のＣＴＮＳシグネチャーペプチドを、前記第１のＣＴＮＳシグネチャーペプチドに結合し、かつ配列番号３９のＣＤＲ１、配列番号４０のＣＤＲ２、及び配列番号４１のＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメインならびに配列番号４２のＣＤＲ１、配列番号４３のＣＤＲ２、及び配列番号４４のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて；
    配列番号７または８のシスチン症の第２のＣＴＮＳシグネチャーペプチドを、前記第２のＣＴＮＳシグネチャーペプチドに結合し、かつ配列番号４５のＣＤＲ１、配列番号４６のＣＤＲ２、及び配列番号４７のＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号４８のＣＤＲ１、配列番号４９のＣＤＲ２、及び配列番号５０のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて；
    配列番号１２のシスチン症の第３のＣＴＮＳシグネチャーペプチドを、前記第３のＣＴＮＳシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて；
    配列番号１３のシスチン症の第４のＣＴＮＳシグネチャーペプチドを、前記第４のＣＴＮＳシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて；
    配列番号９のシスチン症の第１のＳＨＰＫシグネチャーペプチドを、前記第１のＳＨＰＫシグネチャーペプチドに結合し、かつ配列番号５１のＣＤＲ１、配列番号５２のＣＤＲ２、及び配列番号５３のＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号５４のＣＤＲ１、配列番号５５のＣＤＲ２、及び配列番号５６のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて；
    配列番号１４のシスチン症の第２のＳＨＰＫシグネチャーペプチドを、前記第２のＳＨＰＫシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて；ならびに／あるいは
    配列番号１５のシスチン症の第３のＳＨＰＫシグネチャーペプチドを、前記第３のＳＨＰＫシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて；
    前記濃縮することにより、シスチン症の１つ以上のシグネチャーペプチドを検出することと；
    前記濃縮されたペプチドに対して液体クロマトグラフィー－多重反応モニタリング質量分析（ＬＣ－ＭＲＭ－ＭＳ）を実行し、これによって１つ以上のＤＢＳサンプルでシスチン症の１つ以上のシグネチャーペプチドを検出することと；
    をさらに含む、前記方法。
  36. 配列番号６のシスチン症の前記第１のＣＴＮＳシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号６９のＶＨドメインを含む、及び／又は
    配列番号６のシスチン症の前記第１のＣＴＮＳシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号７０のＶＬドメインを含む、及び／又は
    配列番号６のシスチン症の前記第１のＣＴＮＳシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号１０６の重鎖を含む、及び／又は
    配列番号６のシスチン症の前記第１のＣＴＮＳシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号１１１の軽鎖を含む、請求項３５に記載の方法。
  37. 配列番号７または８のシスチン症の前記第２のＣＴＮＳシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号７１のＶＨドメインを含む、及び／又は
    配列番号７または８のシスチン症の前記第２のＣＴＮＳシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号７２のＶＬドメインを含む、及び／又は
    配列番号７または８のシスチン症の前記第２のＣＴＮＳシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号１１６の重鎖を含む、及び／又は
    配列番号７または８のシスチン症の前記第２のＣＴＮＳシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号１２１の軽鎖を含む、請求項３５に記載の方法。
  38. 配列番号９のシスチン症の前記第１のＳＨＰＫシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号７３のＶＨドメインを含む、及び／又は
    配列番号９のシスチン症の前記第１のＳＨＰＫシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号７４のＶＬドメインを含む、及び／又は
    配列番号９のシスチン症の前記第１のＳＨＰＫシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号１２６の重鎖を含む、及び／又は
    配列番号９のシスチン症の前記第１のＳＨＰＫシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号１３１の軽鎖を含む、請求項３５に記載の方法。
  39. ペプチドの濃縮によりウィルソン病（ＷＤ）の１つ以上のシグネチャーペプチドを検出するステップをさらに含む、請求項３０に記載の方法であって、
    配列番号１０のＷＤの第１のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドを、前記第１のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて；及び／または
    配列番号１１または２１のＷＤの第２のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドを、前記第２のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドに結合し、かつ配列番号５７のＣＤＲ１、配列番号５８のＣＤＲ２、及び配列番号５９のＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号６０のＣＤＲ１、配列番号６１のＣＤＲ２、及び配列番号６２のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて；
    配列番号１６のＷＤの第３のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドを、前記第３のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて；
    配列番号１７のＷＤの第４のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドを、前記第４のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて；
    配列番号１８のＷＤの第５のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドを、前記第５のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて；
    配列番号１９のＷＤの第６のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドを、前記第６のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて；ならびに／あるいは
    配列番号２０のＷＤの第７のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドを、前記第７のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて；
    前記濃縮することにより、ウィルソン病（ＷＤ）の１つ以上のシグネチャーペプチドを検出することと；
    前記濃縮されたペプチドに対して液体クロマトグラフィー－多重反応モニタリング質量分析（ＬＣ－ＭＲＭ－ＭＳ）を実行し、これによって１つ以上のＤＢＳサンプルでＷＤの１つ以上のシグネチャーペプチドを検出することと；
    をさらに含む、前記方法。
  40. 配列番号１１または２１のＷＤの前記第２のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号７５のＶＨドメインを含む、及び／又は
    配列番号１１または２１のＷＤの前記第２のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号７６のＶＬドメインを含む、及び／又は
    配列番号１１または２１のＷＤの前記第２のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号１３６の重鎖を含む、及び／又は
    配列番号１１または２１のＷＤの前記第２のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドの濃縮に使用される前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号１４１の軽鎖を含む、請求項３９に記載の方法。
  41. 重症複合免疫不全症（ＳＣＩＤ）、ウィスコット・アルドリッチ症候群（ＷＡＳ）、対象のＸ連鎖無ガンマグロブリン血症（ＸＬＡ）、及び／またはウィルソン病（ＷＤ）のスクリーニングのためのアッセイであって：
    （ｉ）以下の抗体またはその抗原結合フラグメント：
    配列番号２２のＣＤＲ１、配列番号２３のＣＤＲ２、及び配列番号２４のＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号２５のＣＤＲ１、配列番号２６のＣＤＲ２、及び配列番号２７のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む、配列番号１のＳＣＩＤのＣＤ３εシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントと；
    配列番号２８のＣＤＲ１、配列番号２９のＣＤＲ２、及び配列番号３０のＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号３１のＣＤＲ１、配列番号３２のＣＤＲ２、及び配列番号３３のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む、配列番号２のＷＡＳのＷＡＳｐシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントと；
    配列番号３４のＣＤＲ１、配列番号３５のＣＤＲ２、及び配列ＧＤＩのＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号３６のＣＤＲ１、配列番号３７のＣＤＲ２、及び配列番号３８のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む、配列番号４のＸＬＡのＢＴＫシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントと；ならびに／あるいは
    配列番号５７のＣＤＲ１、配列番号５８のＣＤＲ２、及び配列番号５９のＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号６０のＣＤＲ１、配列番号６１のＣＤＲ２、及び配列番号６２のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む、配列番号１１もしくは２１のＡＴＰ７Ｂペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントと；
    ならびに／または
    （ｉｉ）配列番号３のＷＡＳのＷＡＳｐシグネチャーペプチドに結合する抗体もしくはその抗原結合フラグメント；
    配列番号５のＸＬＡのＢＴＫシグネチャーペプチドに結合する抗体もしくはその抗原結合フラグメント；
    配列番号１０のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドに結合する抗体もしくはその抗原結合フラグメント；
    配列番号１６のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドに結合する抗体もしくはその抗原結合フラグメント；
    配列番号１７のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドに結合する抗体もしくはその抗原結合フラグメント；
    配列番号１８のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドに結合する抗体もしくはその抗原結合フラグメント；
    配列番号１９のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドに結合する抗体もしくはその抗原結合フラグメント；
    配列番号２０のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドに結合する抗体もしくはその抗原結合フラグメント；及び／または
    配列番号２１のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドに結合する抗体もしくはその抗原結合フラグメント；
    ならびに／あるいは
    （ｉｉｉ）以下を含む参照シグネチャーペプチド：
    配列番号１のＳＣＩＤのＣＤ３εペプチド；
    配列番号２のＷＡＳのＷＡＳｐペプチド；
    配列番号３のＷＡＳのＷＡＳｐペプチド；
    配列番号４のＸＬＡのＢＴＫペプチド；
    配列番号５のＸＬＡのＢＴＫペプチド；
    配列番号１０のＷＤのＡＴＰ７Ｂペプチド；
    配列番号１１のＷＤのＡＴＰ７Ｂペプチド；
    配列番号１６のＷＤのＡＴＰ７Ｂペプチド；
    配列番号１７のＷＤのＡＴＰ７Ｂペプチド；
    配列番号１８のＷＤのＡＴＰ７Ｂペプチド；
    配列番号１９のＷＤのＡＴＰ７Ｂペプチド；
    配列番号２０のＷＤのＡＴＰ７Ｂペプチド；及び／または
    配列番号２１のＷＤのＡＴＰ７Ｂペプチド、
    を含む、前記アッセイ。
  42. 配列番号１のＳＣＩＤの前記ＣＤ３εシグネチャーペプチドに結合する前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号６３のＶＨドメインを含む、及び／又は
    配列番号１のＳＣＩＤの前記ＣＤ３εシグネチャーペプチドに結合する前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号６４のＶＬドメインを含む、請求項４１に記載のアッセイ。
  43. 配列番号２のＷＡＳの前記ＷＡＳｐシグネチャーペプチドに結合する前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号６５のＶＨドメインを含む、及び／又は
    配列番号２のＷＡＳの前記ＷＡＳｐシグネチャーペプチドに結合する前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号６６のＶＬドメインを含む、及び／又は
    配列番号２のＷＡＳの前記ＷＡＳｐシグネチャーペプチドに結合する前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号８６の重鎖を含む、及び／又は
    配列番号２のＷＡＳの前記ＷＡＳｐシグネチャーペプチドに結合する前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号９１の軽鎖を含む、請求項４１に記載のアッセイ。
  44. 配列番号４のＸＬＡの前記ＢＴＫシグネチャーペプチドに結合する前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号６７のＶＨドメインを含む、及び／又は
    配列番号４のＸＬＡの前記ＢＴＫシグネチャーペプチドに結合する前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号６８のＶＬドメインを含む、及び／又は
    配列番号４のＸＬＡの前記ＢＴＫシグネチャーペプチドに結合する前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号９６の重鎖を含む、及び／又は
    配列番号４のＸＬＡの前記ＢＴＫシグネチャーペプチドに結合する前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号１０１の軽鎖を含む、請求項４１に記載のアッセイ。
  45. シスチン症をさらにスクリーニングするための請求項４１に記載のアッセイであって、以下：
    （ｉｉｉ）以下の抗体またはその抗原結合フラグメント：
    配列番号３９のＣＤＲ１、配列番号４０のＣＤＲ２、及び配列番号４１のＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号４２のＣＤＲ１、配列番号４３のＣＤＲ２、及び配列番号４４のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む、配列番号６のシスチン症のＣＴＮＳシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメント；
    配列番号４５のＣＤＲ１、配列番号４６のＣＤＲ２、及び配列番号４７のＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号４８のＣＤＲ１、配列番号４９のＣＤＲ２、及び配列番号５０のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む、配列番号７または８のシスチン症のＣＴＮＳシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメント；
    配列番号５１のＣＤＲ１、配列番号５２のＣＤＲ２、及び配列番号５３のＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号５４のＣＤＲ１、配列番号５５のＣＤＲ２、及び配列番号５６のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む、配列番号９のシスチン症のＳＨＰＫシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメント；
    ならびに／あるいは
    （ｉｖ）配列番号１２のＣＴＮＳシグネチャーペプチドに結合する抗体もしくはその抗原結合フラグメント；
    配列番号１３のＣＴＮＳシグネチャーペプチドに結合する抗体もしくはその抗原結合フラグメント；
    配列番号１４のＳＨＰＫシグネチャーペプチドに結合する抗体もしくはその抗原結合フラグメント；及び／または
    配列番号１５のＳＨＰＫシグネチャーペプチドに結合する抗体もしくはその抗原結合フラグメント；
    ならびに／あるいは
    （ｖ）以下を含む参照シグネチャーペプチド：
    配列番号６のシスチン症のＣＴＮＳペプチド；
    配列番号７もしくは８のシスチン症のＣＴＮＳペプチド；
    配列番号１２のシスチン症のＣＴＮＳペプチド；
    配列番号１３のシスチン症のＣＴＮＳペプチド；
    配列番号９のシスチン症のＳＨＰＫペプチド；
    配列番号１４のシスチン症のＳＨＰＫペプチド；及び／または
    配列番号１５のシスチン症のＳＨＰＫペプチド、
    を含む、前記アッセイ。
  46. 配列番号６のシスチン症の前記ＣＴＮＳシグネチャーペプチドに結合する前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号６９のＶＨドメインを含む、及び／又は
    配列番号６のシスチン症の前記ＣＴＮＳシグネチャーペプチドに結合する前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号７０のＶＬドメインを含む、及び／又は
    配列番号６のシスチン症の前記ＣＴＮＳシグネチャーペプチドに結合する前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号１０６の重鎖を含む、及び／又は
    配列番号６のシスチン症の前記ＣＴＮＳシグネチャーペプチドに結合する前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号１１１の軽鎖を含む、請求項４５に記載のアッセイ。
  47. 配列番号７または８のシスチン症の前記ＣＴＮＳシグネチャーペプチドに結合する前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号７１のＶＨドメインを含む、及び／又は
    配列番号７または８のシスチン症の前記ＣＴＮＳシグネチャーペプチドに結合する前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号７２のＶＬドメインを含む、及び／又は
    配列番号７または８のシスチン症の前記ＣＴＮＳシグネチャーペプチドに結合する前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号１１６の重鎖を含む、及び／又は
    配列番号７または８のシスチン症の前記ＣＴＮＳシグネチャーペプチドに結合する前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号１２１の軽鎖を含む、請求項４５に記載のアッセイ。
  48. 配列番号９のシスチン症の前記ＳＨＰＫシグネチャーペプチドに結合する前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号７３のＶＨドメインを含む、及び／又は
    配列番号９のシスチン症の前記ＳＨＰＫシグネチャーペプチドに結合する前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号７４のＶＬドメインを含む、及び／又は
    配列番号９のシスチン症の前記ＳＨＰＫシグネチャーペプチドに結合する前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号１２６の重鎖を含む、及び／又は
    配列番号９のシスチン症の前記ＳＨＰＫシグネチャーペプチドに結合する前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号１３１の軽鎖を含む、請求項４５に記載のアッセイ。
  49. 配列番号１１または２１のＷＤの前記ＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドに結合する前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号７５のＶＨドメインを含む、及び／又は
    配列番号１１または２１のＷＤの前記ＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドに結合する前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号７６のＶＬドメインを含む、及び／又は
    配列番号１１または２１のＷＤの前記ＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドに結合する前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号１３６の重鎖を含む、及び／又は
    配列番号１１または２１のＷＤの前記ＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドに結合する前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、配列番号１４１の軽鎖を含む、請求項４５に記載のアッセイ。
  50. 前記参照シグネチャーペプチドが同位体標識されている、請求項４５に記載のアッセイ。
  51. 前記抗体またはその抗原結合フラグメントが磁気ビーズに付着されている、請求項４５に記載のアッセイ。
  52. 配列番号２２のＣＤＲ１、配列番号２３のＣＤＲ２、及び配列番号２４のＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号２５のＣＤＲ１、配列番号２６のＣＤＲ２、及び配列番号２７のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む、単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
  53. 前記ＶＨドメインが配列番号６３を含む、請求項５２に記載の単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
  54. 前記ＶＬドメインが配列番号６４を含む、請求項５２に記載の単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
  55. 配列番号２８のＣＤＲ１、配列番号２９のＣＤＲ２、及び配列番号３０のＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号３１のＣＤＲ１、配列番号３２のＣＤＲ２、及び配列番号３３のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む、単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
  56. 前記ＶＨドメインが配列番号６５を含む、請求項５５に記載の単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
  57. 前記ＶＬドメインが配列番号６６を含む、請求項５５に記載の単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
  58. 前記重鎖が配列番号８６を含む、請求項５５に記載の単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
  59. 前記軽鎖が配列番号９１を含む、請求項５５に記載の単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
  60. 配列番号３４のＣＤＲ１、配列番号３５のＣＤＲ２、及び配列ＧＤＩのＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号３６のＣＤＲ１、配列番号３７のＣＤＲ２、及び配列番号３８のＣＤＲ３を含む、軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
  61. 前記ＶＨドメインが配列番号６７を含む、請求項６０に記載の単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
  62. 前記ＶＬドメインが配列番号６８を含む、請求項６０に記載の単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
  63. 前記重鎖が配列番号９６を含む、請求項６０に記載の単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
  64. 前記軽鎖が配列番号１０１を含む、請求項６０に記載の単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
  65. 配列番号３９のＣＤＲ１、配列番号４０のＣＤＲ２、及び配列番号４１のＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号４２のＣＤＲ１、配列番号４３のＣＤＲ２、及び配列番号４４のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
  66. 前記ＶＨドメインが配列番号６９を含む、請求項６５に記載の前記単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
  67. 前記ＶＬドメインが配列番号７０を含む、請求項６５に記載の前記単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
  68. 前記重鎖が配列番号１０６を含む、請求項６５に記載の前記単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
  69. 前記軽鎖が配列番号１１１を含む、請求項６５に記載の前記単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
  70. 配列番号４５のＣＤＲ１、配列番号４６のＣＤＲ２、及び配列番号４７のＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号４８のＣＤＲ１、配列番号４９のＣＤＲ２、及び配列番号５０のＣＤＲ３を含む、軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む、単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
  71. 前記ＶＨドメインが配列番号７１を含む、請求項７０に記載の前記単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
  72. 前記ＶＬドメインが配列番号７２を含む、請求項７０に記載の前記単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
  73. 前記重鎖が配列番号１１６を含む、請求項７０に記載の前記単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
  74. 前記軽鎖が配列番号１２１を含む、請求項７０に記載の前記単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
  75. 配列番号５１のＣＤＲ１、配列番号５２のＣＤＲ２、及び配列番号５３のＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号５４のＣＤＲ１、配列番号５５のＣＤＲ２、及び配列番号５６のＣＤＲ３を含む、軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む、単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
  76. 前記ＶＨドメインが配列番号７３を含む、請求項７５に記載の前記単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
  77. 前記ＶＬドメインが配列番号７４を含む、請求項７５に記載の前記単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
  78. 前記重鎖が配列番号１２６を含む、請求項７５に記載の前記単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
  79. 前記軽鎖が配列番号１３１を含む、請求項７５に記載の前記単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
  80. 配列番号５７のＣＤＲ１、配列番号５８のＣＤＲ２、及び配列番号５９のＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号６０のＣＤＲ１、配列番号６１のＣＤＲ２、及び配列番号６２のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む、単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
  81. 前記ＶＨドメインが配列番号７５を含む、請求項８０に記載の前記単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
  82. 前記ＶＬドメインが配列番号７６を含む、請求項８０に記載の前記単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
  83. 前記重鎖が配列番号１３６を含む、請求項８０に記載の前記単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
  84. 前記軽鎖が配列番号１４１を含む、請求項８０に記載の前記単離された抗体またはその抗原結合フラグメント。
  85. キットであって、以下：
    （ｉ）抗体またはその抗原結合フラグメントであって、以下：
    配列番号２２のＣＤＲ１、配列番号２３のＣＤＲ２、及び配列番号２４のＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号２５のＣＤＲ１、配列番号２６のＣＤＲ２、及び配列番号２７のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む、配列番号１のＳＣＩＤのＣＤ３εシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメント；
    配列番号２８のＣＤＲ１、配列番号２９のＣＤＲ２、及び配列番号３０のＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号３１のＣＤＲ１、配列番号３２のＣＤＲ２、及び配列番号３３のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む、配列番号２のＷＡＳのＷＡＳｐシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメント；
    配列番号３４のＣＤＲ１、配列番号３５のＣＤＲ２、及び配列ＧＤＩのＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号３６のＣＤＲ１、配列番号３７のＣＤＲ２、及び配列番号３８のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む、配列番号４のＸＬＡのＢＴＫシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメント；
    配列番号３９のＣＤＲ１、配列番号４０のＣＤＲ２、及び配列番号４１のＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号４２のＣＤＲ１、配列番号４３のＣＤＲ２、及び配列番号４４のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む、配列番号６のシスチン症のＣＴＮＳシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメント；
    配列番号４５のＣＤＲ１、配列番号４６のＣＤＲ２、及び配列番号４７のＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号４８のＣＤＲ１、配列番号４９のＣＤＲ２、及び配列番号５０のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む、配列番号７または８のシスチン症のＣＴＮＳシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメント；
    配列番号５１のＣＤＲ１、配列番号５２のＣＤＲ２、及び配列番号５３のＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号５４のＣＤＲ１、配列番号５５のＣＤＲ２、及び配列番号５６のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む、配列番号９のシスチン症のＳＨＰＫシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメント；ならびに／あるいは
    配列番号５７のＣＤＲ１、配列番号５８のＣＤＲ２、及び配列番号５９のＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号６０のＣＤＲ１、配列番号６１のＣＤＲ２、及び配列番号６２のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む、配列番号１１または２１のＡＴＰ７Ｂペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメント、
    ならびに／あるいは
    （ｉｉ）配列番号３のＷＡＳのＷＡＳｐシグネチャーペプチドに結合する抗体もしくはその抗原結合フラグメント；
    配列番号５のＸＬＡのＢＴＫシグネチャーペプチドに結合する抗体もしくはその抗原結合フラグメント；
    配列番号１２のＣＴＮＳシグネチャーペプチドに結合する抗体もしくはその抗原結合フラグメント；
    配列番号１３のＣＴＮＳシグネチャーペプチドに結合する抗体もしくはその抗原結合フラグメント；
    配列番号１４のＳＨＰＫシグネチャーペプチドに結合する抗体もしくはその抗原結合フラグメント；
    配列番号１５のＳＨＰＫシグネチャーペプチドに結合する抗体もしくはその抗原結合フラグメント；
    配列番号１０のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドに結合する抗体もしくはその抗原結合フラグメント；
    配列番号１６のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドに結合する抗体もしくはその抗原結合フラグメント；
    配列番号１７のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドに結合する抗体もしくはその抗原結合フラグメント；
    配列番号１８のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドに結合する抗体もしくはその抗原結合フラグメント；
    配列番号１９のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドに結合する抗体もしくはその抗原結合フラグメント；
    配列番号２０のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドに結合する抗体もしくはその抗原結合フラグメント；及び／または
    配列番号２１のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドに結合する抗体もしくはその抗原結合フラグメント；
    ならびに／あるいは
    （ｉｉｉ）参照シグネチャーペプチドであって、以下：
    配列番号１のＳＣＩＤのＣＤ３εペプチド；
    配列番号２のＷＡＳのＷＡＳｐペプチド；
    配列番号３のＷＡＳのＷＡＳｐペプチド；
    配列番号４のＸＬＡのＢＴＫペプチド；
    配列番号５のＸＬＡのＢＴＫペプチド；
    配列番号６のシスチン症のＣＴＮＳペプチド；
    配列番号７または８のシスチン症のＣＴＮＳペプチド；
    配列番号１２のシスチン症のＣＴＮＳペプチド；
    配列番号１３のシスチン症のＣＴＮＳペプチド；
    配列番号９のシスチン症のＳＨＰＫペプチド；
    配列番号１４のシスチン症のＳＨＰＫペプチド；
    配列番号１５のシスチン症のＳＨＰＫペプチド；
    配列番号１０のＷＤのＡＴＰ７Ｂペプチド；
    配列番号１１のＷＤのＡＴＰ７Ｂペプチド；
    配列番号１６のＷＤのＡＴＰ７Ｂペプチド；
    配列番号１７のＷＤのＡＴＰ７Ｂペプチド；
    配列番号１８のＷＤのＡＴＰ７Ｂペプチド；
    配列番号１９のＷＤのＡＴＰ７Ｂペプチド；
    配列番号２０のＷＤのＡＴＰ７Ｂペプチド；及び／または
    配列番号２１のＷＤのＡＴＰ７Ｂペプチド、
    を含む前記参照シグネチャーペプチド、
    を備える前記キット。
  86. 濾紙カード、パンチツール、消化酵素、消化緩衝液、抗体またはその抗原結合フラグメントの固体支持体、及び溶出緩衝液のうちの１つ以上をさらに含む、請求項８５に記載のキット。
  87. 前記参照シグネチャーペプチドが同位体標識されている、請求項８５に記載のキット。
  88. 前記抗体またはその抗原結合フラグメントが磁気ビーズに付着している、請求項８５に記載のキット。
  89. 対象における、重症複合免疫不全症（ＳＣＩＤ）、ウィスコット・アルドリッチ症候群（ＷＡＳ）、Ｘ連鎖無ガンマグロブリン血症（ＸＬＡ）、シスチン症、及び／またはウィルソン病（ＷＤ）をスクリーニングする方法であって、以下：
    前記対象に由来する乾燥血液スポット（ＤＢＳ）サンプルの血液からタンパク質を酵素で消化して１つ以上のペプチドを生成することと；
    濃縮することであって、以下：
    ＳＣＩＤのＣＤ３εシグネチャーペプチドを、前記ＣＤ３εシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて濃縮すること；
    ＷＡＳの第１のＷＡＳｐシグネチャーペプチドを、前記第１のＷＡＳｐシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて濃縮すること；
    ＷＡＳの第２のＷＡＳｐシグネチャーペプチドを、前記第２のＷＡＳｐシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて濃縮すること；
    ＸＬＡの第１のＢＴＫシグネチャーペプチドを、前記第１のＢＴＫシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて濃縮すること；
    第２のＢＴＫシグネチャーペプチドを、前記第２のＢＴＫシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて濃縮すること；
    シスチン症の第１のＣＴＮＳシグネチャーペプチドを、前記第１のＣＴＮＳシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて濃縮すること；
    シスチン症の第２のＣＴＮＳシグネチャーペプチドを、前記第２のＣＴＮＳシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて濃縮すること；
    シスチン症の第３のＣＴＮＳシグネチャーペプチドを、前記第３のＣＴＮＳシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて濃縮すること；
    シスチン症の第４のＣＴＮＳシグネチャーペプチドを、前記第４のＣＴＮＳシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて濃縮すること；
    シスチン症の第１のＳＨＰＫシグネチャーペプチドを、前記第１のＳＨＰＫシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて濃縮すること；
    シスチン症の第２のＳＨＰＫシグネチャーペプチドを、前記第２のＳＨＰＫシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて濃縮すること；ならびに／あるいは
    シスチン症の第３のＳＨＰＫシグネチャーペプチドを、前記第３のＳＨＰＫシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて濃縮すること；
    第１のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドを、前記第１のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて濃縮すること；
    第２のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドを、前記第２のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて濃縮すること；
    第３のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドを、前記第３のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドに結合する抗体または抗原結合フラグメントを用いて濃縮すること；
    第４のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドを、前記第４のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて濃縮すること；
    第５のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドを、前記第５のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて濃縮すること；
    第６のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドを、前記第６のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて濃縮すること；ならびに／あるいは
    第７のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドを、抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて；
    前記濃縮することと濃縮すること；
    前記濃縮されたペプチドに対して液体クロマトグラフィー－多重反応モニタリング質量分析（ＬＣ－ＭＲＭ－ＭＳ）を実行して、前記ペプチドの濃度を決定することと；
    前記ＣＤ３εシグネチャーペプチドの前記濃度が所定の閾値濃度よりも低い場合、または前記ＣＤ３εシグネチャーペプチドが存在しない場合、ＳＣＩＤ；
    前記第１及び／または第２のＷＡＳｐシグネチャーペプチドの前記濃度が対応する所定の閾値濃度よりも低い場合、または前記第１及び／または第２のＷＡＳｐシグネチャーペプチドが存在しない場合、ＷＡＳ；
    前記第１及び／または第２のＢＴＫシグネチャーペプチドの前記濃度が対応する所定の閾値濃度よりも低い場合、または前記第１及び／または第２のＢＴＫシグネチャーペプチドが存在しない場合、ＸＬＡ；
    前記第１のＣＴＮＳ、前記第２のＣＴＮＳ、前記第３のＣＴＮＳ、前記第４のＣＴＮＳ、前記第１のＳＨＰＫ、前記第２のＳＨＰＫ、及び／もしくは前記第３のＳＨＰＫシグネチャーペプチドの濃度が対応する所定の閾値濃度よりも低い場合、または前記第１のＣＴＮＳ、前記第２のＣＴＮＳ、前記第３のＣＴＮＳ、前記第４のＣＴＮＳ、前記第１のＳＨＰＫ、前記第２のＳＨＰＫ、及び／もしくは前記第３のＳＨＰＫシグネチャーペプチドが存在しない場合、シスチン症；ならびに／または
    前記第１のＡＴＰ７Ｂ、前記第２のＡＴＰ７Ｂ、前記第３のＡＴＰ７Ｂ、前記第４のＡＴＰ７Ｂ、前記第５のＡＴＰ７Ｂ、前記第６のＡＴＰ７Ｂ、及び／もしくは前記第７のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドの濃度が対応する所定の閾値濃度よりも低い場合、または前記第１のＡＴＰ７Ｂ、前記第２のＡＴＰ７Ｂ、前記第３のＡＴＰ７Ｂ、前記第４のＡＴＰ７Ｂ、前記第５のＡＴＰ７Ｂ、前記第６のＡＴＰ７Ｂ、及び／もしくは前記第７のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドが存在しない場合、ＷＤ
    を有すると決定することと、
    を含む、前記方法。
  90. 請求項８９に記載の方法であって、ここで、
    ＳＣＩＤの前記ＣＤ３εシグネチャーペプチドが、配列番号１に記載のアミノ酸配列によってコードされており；
    ＷＡＳの前記第１のＷＡＳｐシグネチャーペプチドが、配列番号２に記載のアミノ酸配列によってコードされており；
    ＷＡＳの前記第２のＷＡＳｐシグネチャーペプチドが、配列番号３に記載のアミノ酸配列によってコードされており；
    ＸＬＡの第１のＢＴＫシグネチャーペプチドが、配列番号４に記載のアミノ酸配列によってコードされており；及び／または
    ＸＬＡの前記第２のＢＴＫシグネチャーペプチドが、配列番号５に記載のアミノ酸配列によってコードされており；
    シスチン症の前記第１のＣＴＮＳシグネチャーペプチドが、配列番号６に記載のアミノ酸配列によってコードされており；
    シスチン症の前記第２のＣＴＮＳシグネチャーペプチドが、配列番号７または８に記載のアミノ酸配列によってコードされており；
    シスチン症の前記第３のＣＴＮＳシグネチャーペプチドが、配列番号１２に記載のアミノ酸配列によってコードされており；
    シスチン症の前記第４のＣＴＮＳシグネチャーペプチドが、配列番号１３に記載のアミノ酸配列によってコードされており；
    シスチン症の前記第１のＳＨＰＫシグネチャーペプチドが、配列番号９に記載のアミノ酸配列によってコードされており；
    シスチン症の前記第２のＳＨＰＫシグネチャーペプチドが、配列番号１４に記載のアミノ酸配列によってコードされており；
    シスチン症の前記第３のＳＨＰＫシグネチャーペプチドが、配列番号１５に記載のアミノ酸配列によってコードされており；
    ＷＤの前記第１のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドが、配列番号１０に記載のアミノ酸配列によってコードされており；
    ＷＤの前記第２のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドが、配列番号１１または２１に記載のアミノ酸配列によってコードされており；
    ＷＤの前記第３のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドが、配列番号１６に記載のアミノ酸配列によってコードされており；
    ＷＤの前記第４のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドが、配列番号１７に記載のアミノ酸配列によってコードされており；
    ＷＤの前記第５のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドが、配列番号１８に記載のアミノ酸配列によってコードされており；
    ＷＤの前記第６のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドが、配列番号１９に記載のアミノ酸配列によってコードされており；及び／または
    ＷＤの前記第７のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドが、配列番号２０に記載のアミノ酸配列によってコードされている；
    前記方法。
  91. 請求項８９に記載の方法であって、ここで、
    前記ＣＤ３εシグネチャーペプチドに結合する前記抗体またはその抗原結合フラグメントは、配列番号２２のＣＤＲ１、配列番号２３のＣＤＲ２、及び配列番号２４のＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号２５のＣＤＲ１、配列番号２６のＣＤＲ２、及び配列番号２７のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含み；
    前記第１のＷＡＳｐシグネチャーペプチドに結合する前記抗体またはその抗原結合フラグメントは、配列番号２８のＣＤＲ１、配列番号２９のＣＤＲ２、及び配列番号３０のＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号３１のＣＤＲ１、配列番号３２のＣＤＲ２、及び配列番号３３のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメイン；ならびに／あるいは
    前記第１のＢＴＫシグネチャーペプチドに結合する前記抗体またはその抗原結合フラグメントには、配列番号３４のＣＤＲ１、配列番号３５のＣＤＲ２、及び配列ＧＤＩのＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号３６のＣＤＲ１、配列番号３７のＣＤＲ２、及び配列番号３８のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含み；
    シスチン症の前記第１のＣＴＮＳシグネチャーペプチドに結合する前記抗体またはその抗原結合フラグメントは、配列番号３９のＣＤＲ１、配列番号４０のＣＤＲ２、及び配列番号４１のＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号４２のＣＤＲ１、配列番号４３のＣＤＲ２、及び配列番号４４のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含み；
    前記第２のＣＴＮＳシグネチャーペプチドに結合する前記抗体またはその抗原結合フラグメントは、配列番号４５のＣＤＲ１、配列番号４６のＣＤＲ２、及び配列番号４７のＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号４８のＣＤＲ１、配列番号４９のＣＤＲ２、及び配列番号５０のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含み、
    前記第１のＳＨＰＫシグネチャーペプチドに結合する前記抗体またはその抗原結合フラグメントは、配列番号５１のＣＤＲ１、配列番号５２のＣＤＲ２、及び配列番号５３のＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号５４のＣＤＲ１、配列番号５５のＣＤＲ２、及び配列番号５６のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含み、ならびに／あるいは
    前記第２のＡＴＰ７Ｂシグネチャーペプチドに結合する前記抗体またはその抗原結合フラグメントは、配列番号５７のＣＤＲ１、配列番号５８のＣＤＲ２、及び配列番号５９のＣＤＲ３を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、ならびに配列番号６０のＣＤＲ１、配列番号６１のＣＤＲ２、及び配列番号６２のＣＤＲ３を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む、前記方法。
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