JPWO2016103312A1 - 分析データ処理方法及び装置 - Google Patents
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Abstract
Description
a)一つのスペクトルデータ集合毎に、各測定点のスペクトルデータ中の全て又は一部のパラメータ値に対する強度値を基準値に基づいて規格化する際に、その規格化後の強度値が所定の許容値を超えないような最大の基準値を求める個別基準値取得ステップと、
b)全てのスペクトルデータ集合に対し前記個別基準値取得ステップにより得られた複数の基準値の中から最小のものを共通の基準値として選出する、又はその最小のものよりもさらに小さい値を共通の基準値として設定する共通基準値選出ステップと、
c)各スペクトルデータ集合に含まれるスペクトルデータ中の全て又は一部のパラメータ値に対する強度値を、前記共通基準値選出ステップにより選出された共通の基準値に基づいて規格化する規格化実行ステップと、
を有することを特徴としている。
a)一つのスペクトルデータ集合毎に、一つの測定点におけるスペクトルデータ中の全て又は一部のパラメータ値に対する強度値の積算値と最大強度値との比が全ての測定点の中で最大であるものを規格化のための基準値として求める個別基準値取得ステップと、
b)全てのスペクトルデータ集合に対し前記個別基準値取得ステップにより得られた複数の基準値の中から最小のものを共通の基準値として選出する、又はその最小のものよりもさらに小さい値を共通の基準値として設定する共通基準値選出ステップと、
c)各スペクトルデータ集合に含まれるスペクトルデータ中の全て又は一部のパラメータ値に対する強度値を、前記共通基準値選出ステップにより選出された共通の基準値に基づいて、規格化後の強度値が所定の許容値を超えないように規格化する規格化実行ステップと、
を有することを特徴としている。
a)一つのスペクトルデータ集合毎に、各測定点のスペクトルデータ中の全て又は一部のパラメータ値に対する強度値を基準値に基づいて規格化する際に、その規格化後の強度値が所定の許容値を超えないような最大の基準値を求める個別基準値取得部と、
b)全てのスペクトルデータ集合に対し前記個別基準値取得部により得られた複数の基準値の中から最小のものを共通の基準値として選出する、又はその最小のものよりもさらに小さい値を共通の基準値として設定する共通基準値選出部と、
c)各スペクトルデータ集合に含まれるスペクトルデータ中の全て又は一部のパラメータ値に対する強度値を、前記共通基準値選出部により選出された共通の基準値に基づいて規格化する規格化実行部と、
を備えることを特徴としている。
a)一つのスペクトルデータ集合毎に、一つの測定点におけるスペクトルデータ中の全て又は一部のパラメータ値に対する強度値の積算値と最大強度値との比が全ての測定点の中で最大であるものを規格化のための基準値として求める個別基準値取得部と、
b)全てのスペクトルデータ集合に対し前記個別基準値取得部により得られた複数の基準値の中から最小のものを共通の基準値として選出する、又はその最小のものよりもさらに小さい値を共通の基準値として設定する共通基準値選出部と、
c)各スペクトルデータ集合に含まれるスペクトルデータ中の全て又は一部のパラメータ値に対する強度値を、前記共通基準値選出部により選出された共通の基準値に基づいて、規格化後の強度値が所定の許容値を超えないように規格化する規格化実行部と、
を備えることを特徴としている。
まず、本発明の特徴の一つである、複数の質量分析イメージングデータに対する規格化処理方法について、図4を参照して説明する。
この場合、一つ質量分析イメージングデータ内の全ての測定点について、次の(1)式を満たせば、規格化の演算の際にオーバーフローは生じない。
Ii×(Psj/Pi)<long_Max …(1)
この(1)式を変形すると、
Psj<long_Max×(Pi/Ii) …(2)
となる。
図4(a)では、i=8、i=16の二つの測定点に対するマススペクトルを例示しており、前者からI8、P8が求まり、後者からI16、P16が求まる。
G=Pmin/Pi …(3)
この場合、分析者は操作部4により比較したい複数の質量分析イメージングデータを指定する(ステップS21)。すでに述べた図4は、三つの試料A、B、Cに対する質量分析イメージングデータが指定された例である。それらの比較解析を行うに先立って、共通基準値決定部22は外部記憶装置3に保存されている、それら複数の質量分析イメージングデータに対応するデータファイルから未スケーリング個別基準値Fjを読み出す(ステップS22)。そして、読み出された複数の未スケーリング個別基準値Fj中で最小の値を見つけ未スケーリング共通基準値Fminとして内部に記憶する(ステップS23)。
G’=long_Max×(Fmin/Pi) …(4)
そして、この規格化係数G’を質量分析イメージングデータに含まれる各測定点におけるマススペクトルの強度値に乗じることで、該強度値を修正してメインメモリ28に格納する(ステップS25)。この場合には、上述した規格化処理方法の説明とは異なり、未スケーリング個別基準値Fjにlong_Maxの要素が織り込まれておらず、当然、未スケーリング共通基準値Fminにもlong_Maxの要素が織り込まれていないが、(4)式で求める規格化係数G’にはlong_Maxの要素が織り込まれるため、規格化演算の際にオーバーフローが生じないようにスケーリングが同時に実施される。したがって、上述した規格化方法と同様の規格化が達成されることになる。
2…データ処理部
20…データ収集部
21…個別基準値算出部
22…共通基準値決定部
23…規格化演算処理部
24…ピーク行列作成部
25…イメージング画像作成部
26…統計解析演算部
27…データファイル作成部
28…メインメモリ
29…表示処理部
3…外部記憶装置
4…操作部
5…表示部
100…サンプル
101…測定対象領域
102…測定点
a)一つのスペクトルデータ集合毎に、各測定点のスペクトルデータ中の全て又は一部のパラメータ値に対する強度値を基準値に基づいて規格化する際に、その規格化後の強度値が所定の許容値を超えない基準値を求める個別基準値取得ステップと、
b)全てのスペクトルデータ集合に対し前記個別基準値取得ステップにより得られた複数の基準値の中から最小のものを共通の基準値として選出する、又はその最小のものよりもさらに小さい値を共通の基準値として設定する共通基準値選出ステップと、
c)各スペクトルデータ集合に含まれるスペクトルデータ中の全て又は一部のパラメータ値に対する強度値を、前記共通基準値選出ステップにより選出された共通の基準値に基づいて規格化する規格化実行ステップと、
を有することを特徴としている。
a)一つのスペクトルデータ集合毎に、各測定点のスペクトルデータ中の全て又は一部のパラメータ値に対する強度値を基準値に基づいて規格化する際に、その規格化後の強度値が所定の許容値を超えない基準値を求める個別基準値取得部と、
b)全てのスペクトルデータ集合に対し前記個別基準値取得部により得られた複数の基準値の中から最小のものを共通の基準値として選出する、又はその最小のものよりもさらに小さい値を共通の基準値として設定する共通基準値選出部と、
c)各スペクトルデータ集合に含まれるスペクトルデータ中の全て又は一部のパラメータ値に対する強度値を、前記共通基準値選出部により選出された共通の基準値に基づいて規格化する規格化実行部と、
を備えることを特徴としている。
また、本発明に係る第1、第2の態様による分析データ処理方法及び装置では、複数の試料についてそれぞれ得られた質量分析イメージングデータなどの複数のスペクトルデータ集合を対象としたデータ処理を行うが、一つの試料について得られた質量分析イメージングデータ、つまりは試料上の複数の測定点におけるスペクトルデータを対象として同様の処理を実施してもよい。
即ち、本発明に係る分析データ処理方法の第3の態様は、試料上に設定された所定の測定対象領域内の複数の測定点に対しそれぞれ所定の分析を実行することで収集された、所定のパラメータと信号強度値との関係を示すスペクトルデータが前記測定点の空間位置情報に関連付けられてなるデータを扱う分析データ処理方法であって、
a)測定点毎に、一つの測定点のスペクトルデータ中の全て又は一部のパラメータ値に対する強度値を基準値に基づいて規格化する際に、その規格化後の強度値が所定の許容値を超えない基準値を求める個別基準値取得ステップと、
b)前記個別基準値取得ステップにより得られた各測定点のスペクトルデータに対する複数の基準値の中から最小のものを共通の基準値として選出する、又はその最小のものよりもさらに小さい値を共通の基準値として設定する共通基準値選出ステップと、
c)各スペクトルデータ中の全て又は一部のパラメータ値に対する強度値を、前記共通基準値選出ステップにより選出された共通の基準値に基づいて規格化する規格化実行ステップと、
を有することを特徴としている。
また本発明に係る分析データ処理装置の第3の態様は、本発明に係る分析データ処理方法の第3の態様を実施するための装置であり、試料上に設定された所定の測定対象領域内の複数の測定点に対しそれぞれ所定の分析を実行することで収集された、所定のパラメータと信号強度値との関係を示すスペクトルデータが前記測定点の空間位置情報に関連付けられてなるデータを扱う分析データ処理装置において、
a)測定点毎に、一つの測定点のスペクトルデータ中の全て又は一部のパラメータ値に対する強度値を基準値に基づいて規格化する際に、その規格化後の強度値が所定の許容値を超えない基準値を求める個別基準値取得部と、
b)前記個別基準値取得部により得られた各測定点のスペクトルデータに対する複数の基準値の中から最小のものを共通の基準値として選出する、又はその最小のものよりもさらに小さい値を共通の基準値として設定する共通基準値選出部と、
c)各スペクトルデータ中の全て又は一部のパラメータ値に対する強度値を、前記共通基準値選出部により選出された共通の基準値に基づいて規格化する規格化実行部と、
を備えることを特徴としている。
また本発明に係る分析データ処理方法の第4の態様は、試料上に設定された所定の測定対象領域内の複数の測定点に対しそれぞれ所定の分析を実行することで収集された、所定のパラメータと信号強度値との関係を示すスペクトルデータが前記測定点の空間位置情報に関連付けられてなるデータを扱う分析データ処理方法であって、
a)測定点毎に、一つの測定点におけるスペクトルデータ中の全て又は一部のパラメータ値に対する強度値の積算値と最大強度値との比が全ての測定点の中で最大であるものを規格化のための基準値として求める個別基準値取得ステップと、
b)前記個別基準値取得ステップにより得られた各測定点のスペクトルデータに対する複数の基準値の中から最小のものを共通の基準値として選出する、又はその最小のものよりもさらに小さい値を共通の基準値として設定する共通基準値選出ステップと、
c)各スペクトルデータ中の全て又は一部のパラメータ値に対する強度値を、前記共通基準値選出ステップにより選出された共通の基準値に基づいて、規格化後の強度値が所定の許容値を超えないように規格化する規格化実行ステップと、
を有することを特徴としている。
また本発明に係る分析データ処理装置の第4の態様は、本発明に係る分析データ処理方法の第4の態様を実施するための装置であり、試料上に設定された所定の測定対象領域内の複数の測定点に対しそれぞれ所定の分析を実行することで収集された、所定のパラメータと信号強度値との関係を示すスペクトルデータが前記測定点の空間位置情報に関連付けられてなるデータを扱う分析データ処理装置であって、
a)測定点毎に、一つの測定点におけるスペクトルデータ中の全て又は一部のパラメータ値に対する強度値の積算値と最大強度値との比が全ての測定点の中で最大であるものを規格化のための基準値として求める個別基準値取得部と、
b)前記個別基準値取得部により得られた各測定点のスペクトルデータに対する複数の基準値の中から最小のものを共通の基準値として選出する、又はその最小のものよりもさらに小さい値を共通の基準値として設定する共通基準値選出部と、
c)各スペクトルデータ中の全て又は一部のパラメータ値に対する強度値を、前記共通基準値選出部により選出された共通の基準値に基づいて、規格化後の強度値が所定の許容値を超えないように規格化する規格化実行部と、
を備えることを特徴としている。
この場合、一つ質量分析イメージングデータ内の全ての測定点について、次の(1)式を満たせば、規格化の演算の際にオーバーフローは生じない。
Ii×(Psj/Pi)≦long_Max …(1)
この(1)式を変形すると、
Psj ≦long_Max×(Pi/Ii) …(2)
となる。
図4(a)では、i=8、i=16の二つの測定点に対するマススペクトルを例示しており、前者からI8、P8が求まり、後者からI16、P16が求まる。
Claims (8)
- 試料上に設定された所定の測定対象領域内の複数の測定点に対しそれぞれ所定の分析を実行することで収集された、所定のパラメータと信号強度値との関係を示すスペクトルデータが前記測定点の空間位置情報に関連付けられてなるスペクトルデータ集合を扱う分析データ処理方法であって、互いに異なる複数のスペクトルデータ集合について、
a)一つのスペクトルデータ集合毎に、各測定点のスペクトルデータ中の全て又は一部のパラメータ値に対する強度値を基準値に基づいて規格化する際に、その規格化後の強度値が所定の許容値を超えないような最大の基準値を求める個別基準値取得ステップと、
b)全てのスペクトルデータ集合に対し前記個別基準値取得ステップにより得られた複数の基準値の中から最小のものを共通の基準値として選出する、又はその最小のものよりもさらに小さい値を共通の基準値として設定する共通基準値選出ステップと、
c)各スペクトルデータ集合に含まれるスペクトルデータ中の全て又は一部のパラメータ値に対する強度値を、前記共通基準値選出ステップにより選出された共通の基準値に基づいて規格化する規格化実行ステップと、
を有することを特徴とする分析データ処理方法。 - 試料上に設定された所定の測定対象領域内の複数の測定点に対しそれぞれ所定の分析を実行することで収集された、所定のパラメータと信号強度値との関係を示すスペクトルデータが前記測定点の空間位置情報に関連付けられてなるスペクトルデータ集合を扱う分析データ処理方法であって、互いに異なる複数のスペクトルデータ集合について、
a)一つのスペクトルデータ集合毎に、一つの測定点におけるスペクトルデータ中の全て又は一部のパラメータ値に対する強度値の積算値と最大強度値との比が全ての測定点の中で最大であるものを規格化のための基準値として求める個別基準値取得ステップと、
b)全てのスペクトルデータ集合に対し前記個別基準値取得ステップにより得られた複数の基準値の中から最小のものを共通の基準値として選出する、又はその最小のものよりもさらに小さい値を共通の基準値として設定する共通基準値選出ステップと、
c)各スペクトルデータ集合に含まれるスペクトルデータ中の全て又は一部のパラメータ値に対する強度値を、前記共通基準値選出ステップにより選出された共通の基準値に基づいて、規格化後の強度値が所定の許容値を超えないように規格化する規格化実行ステップと、
を有することを特徴とする分析データ処理方法。 - 請求項1又は2に記載の分析データ処理方法であって、
前記所定の許容値は、前記規格化実行ステップによる規格化演算を実行する際に強度値が格納される変数が採り得る最大値であることを特徴とする分析データ処理方法。 - 請求項1〜3のいずれか1項に記載の分析データ処理方法であって、
前記個別基準値取得ステップによる一つのスペクトルデータ集合毎の基準値の取得は、所定の測定対象領域内の複数の測定点に対しそれぞれ所定の分析を実行することでそのスペクトルデータ集合に含まれるスペクトルデータが収集されるときに行われることを特徴とする分析データ処理方法。 - 請求項1〜4のいずれか1項に記載の分析データ処理方法であって、
前記共通基準値選出ステップでは、全てのスペクトルデータ集合に対し前記個別基準値取得ステップにより得られた複数の基準値をユーザに提示し、その提示された情報に基づくユーザの指示に応じた値を共通の基準値として設定することを特徴とする分析データ処理方法。 - 請求項1〜5のいずれか1項に記載の分析データ処理方法であって、
前記スペクトルデータは質量電荷比とイオン強度値との関係を示すマススペクトルデータであることを特徴とする質量分析データ処理方法。 - 試料上に設定された所定の測定対象領域内の複数の測定点に対しそれぞれ所定の分析を実行することで収集された、所定のパラメータと信号強度値との関係を示すスペクトルデータが前記測定点の空間位置情報に関連付けられてなるスペクトルデータ集合を扱う分析データ処理装置において、互いに異なる複数のスペクトルデータ集合について、
a)一つのスペクトルデータ集合毎に、各測定点のスペクトルデータ中の全て又は一部のパラメータ値に対する強度値を基準値に基づいて規格化する際に、その規格化後の強度値が所定の許容値を超えないような最大の基準値を求める個別基準値取得部と、
b)全てのスペクトルデータ集合に対し前記個別基準値取得部により得られた複数の基準値の中から最小のものを共通の基準値として選出する、又はその最小のものよりもさらに小さい値を共通の基準値として設定する共通基準値選出部と、
c)各スペクトルデータ集合に含まれるスペクトルデータ中の全て又は一部のパラメータ値に対する強度値を、前記共通基準値選出部により選出された共通の基準値に基づいて規格化する規格化実行部と、
を備えることを特徴とする分析データ処理装置。 - 試料上に設定された所定の測定対象領域内の複数の測定点に対しそれぞれ所定の分析を実行することで収集された、所定のパラメータと信号強度値との関係を示すスペクトルデータが前記測定点の空間位置情報に関連付けられてなるスペクトルデータ集合を扱う分析データ処理装置であって、互いに異なる複数のスペクトルデータ集合について、
a)一つのスペクトルデータ集合毎に、一つの測定点におけるスペクトルデータ中の全て又は一部のパラメータ値に対する強度値の積算値と最大強度値との比が全ての測定点の中で最大であるものを規格化のための基準値として求める個別基準値取得部と、
b)全てのスペクトルデータ集合に対し前記個別基準値取得部により得られた複数の基準値の中から最小のものを共通の基準値として選出する、又はその最小のものよりもさらに小さい値を共通の基準値として設定する共通基準値選出部と、
c)各スペクトルデータ集合に含まれるスペクトルデータ中の全て又は一部のパラメータ値に対する強度値を、前記共通基準値選出部により選出された共通の基準値に基づいて、規格化後の強度値が所定の許容値を超えないように規格化する規格化実行部と、
を備えることを特徴とする分析データ処理装置。
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