JPWO2009081446A1 - 質量分析システム - Google Patents
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Abstract
Description
a)被検試料について、MSm分析(m=2以上の整数)と、該分析の結果得られるマススペクトルピークの少なくとも1つをプリカーサイオンとして選んだMSm+1分析と、を実行してマススペクトルデータを取得する質量分析手段と、
b)前記質量分析手段により得られるMSmスペクトルに現れるピークと、MSm+1スペクトルに現れるピークとをそれぞれ抽出するとともに、必要に応じてプリカーサイオンの質量差だけMSm+1スペクトルをシフトさせて得られるピークも抽出し、それらピークに対応するイオンの質量情報を収集し、それら収集した質量情報をプリカーサイオンの末端系列と同じであると判断できるもの、プリカーサイオンの末端系列と異なると判断できるもの、及びアミノ酸配列末端系列の判断ができないもの、のいずれかに区分して集約したピークリストを作成するピーク情報収集手段と、
c)前記ピーク情報収集手段により集約された質量情報を用い、MSmスペクトル、MSm+1スペクトルそれぞれにおける質量の相補性や、MSmスペクトルとMSm+1スペクトルとの間での質量の共通性及び相補性、に基づいた基準によりピークを選別して分類するとともに、その分類毎のピークの出現頻度を求めるピーク抽出手段と、
d)前記各分類毎に予め算出された、該分類に含まれるピークに対応したイオンがプロダクトイオンであることの確からしさを示す信頼度、及び該イオンの末端系列に関する信頼度とを含む信頼度情報と、前記ピーク抽出手段により得られた各分類毎のピークの出現頻度情報とに基づき、選別された各ピークに対応するイオンがプロダクトイオンであることの確からしさを示す評価指標値及び該イオンの末端系列に関する評価指標値をそれぞれ算出する評価値算出手段と、
e)前記ピーク抽出手段により選別されたピークの質量情報と前記評価値算出手段により得られた各ピークの評価指標値とを用いて被検試料のアミノ酸配列を推定する配列推定手段と、
を備えることを特徴としている。
11…イオン化部
12…イオントラップ部
13…質量分離部
14…イオン検出器
20…制御/処理部
21…制御部
22…スペクトルデータ処理部
23…ピーク抽出部
24…信頼度情報記憶部
25…評価指標値算出部
26…同定用データベース(DB)
27…配列推定処理部
[by0]:1465.827+175.1195=PCms2+H
[by00]:1238.663+175.1195=PCms3+H
いずれもプリカーサイオンと同じ末端系列のイオンであるかプリカーサイオンと相違する系列のイオンであるのかは不明である。
[com1]:262.1515=262.1515
[com2]:1279.726=(1052.563+PCdiff)
com1はMS2、MS3いずれでもプリカーサイオンと同じ末端系列を持つイオンであり、他方、com2はMS2、MS3いずれでもプリカーサイオンと異なる末端系列を持つイオンである。
[by2+]:589.3309+(824.4518+PCdiff)=PCms2+H
[by2-]:1150.684+490.2625=PCms2+H
[by3+]:(702.415-PCdiff)+(711.3677+PCdiff)=PCms3+H
[by3-]:(1051.605-PCdiff)+589.3309=PCms3+H
fk =Σwk(i)・nk(i)、但し、Σはi=1から16までの総和
においてk=1である。
Claims (4)
- MSn分析(nは3以上の任意の整数)により得られるデータを利用してアミノ酸配列を推定するための質量分析システムであって、
a)被検試料について、MSm分析(m=2以上の整数)と、該分析の結果得られるマススペクトルピークの少なくとも1つをプリカーサイオンとして選んだMSm+1分析と、を実行してマススペクトルデータを取得する質量分析手段と、
b)前記質量分析手段により得られるMSmスペクトルに現れるピークと、MSm+1スペクトルに現れるピークとをそれぞれ抽出するとともに、必要に応じてプリカーサイオンの質量差だけMSm+1スペクトルをシフトさせて得られるピークも抽出し、それらピークに対応するイオンの質量情報を収集し、それら収集した質量情報をプリカーサイオンの末端系列と同じであると判断できるもの、プリカーサイオンの末端系列と異なると判断できるもの、及びアミノ酸配列末端系列の判断ができないもの、のいずれかに区分して集約したピークリストを作成するピーク情報収集手段と、
c)前記ピーク情報収集手段により集約された質量情報を用い、MSmスペクトル、MSm+1スペクトルそれぞれにおける質量の相補性や、MSmスペクトルとMSm+1スペクトルとの間での質量の共通性及び相補性、に基づいた基準によりピークを選別して分類するとともに、その分類毎のピークの出現頻度を求めるピーク抽出手段と、
d)前記各分類毎に予め算出された、該分類に含まれるピークに対応したイオンがプロダクトイオンであることの確からしさを示す信頼度、及び該イオンの末端系列に関する信頼度とを含む信頼度情報と、前記ピーク抽出手段により得られた各分類毎のピークの出現頻度情報とに基づき、選別された各ピークに対応するイオンがプロダクトイオンであることの確からしさを示す評価指標値及び該イオンの末端系列に関する評価指標値をそれぞれ算出する評価値算出手段と、
e)前記ピーク抽出手段により選別されたピークの質量情報と前記評価値算出手段により得られた各ピークの評価指標値とを用いて被検試料のアミノ酸配列を推定する配列推定手段と、
を備えることを特徴とする質量分析システム。 - 請求項1に記載の質量分析システムであって、mは3以上であって、m=2、3、…と順に前記各手段による処理を実行することを特徴とする質量分析システム。
- 請求項1に記載の質量分析システムであって、前記ピーク情報収集手段は、或る1つのプリカーサイオンに対し複数の異なる開裂条件の下でMSm+1分析を行ってそれぞれ得られたMSm+1スペクトルに現れるピークを収集することを特徴とする質量分析システム。
- 請求項1に記載の質量分析システムであって、前記ピーク抽出手段は、さらにMSm+1スペクトルをMSm分析とMSm+1分析とのプリカーサイオンの質量差の分だけ高質量側にシフトさせたマススペクトルに現れるピーク情報も得て、これを元のMSm+1スペクトルで得たピーク情報に合わせて、MSmスペクトルとのピークの共通性や相補性を判断することを特徴とする質量分析システム。
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