JPWO2003097877A1 - 遺伝子多型の検出方法 - Google Patents
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Abstract
受容体をコードする遺伝子若しくはその相補配列中に存在する多型部位を含むように、又は受容体をコードする遺伝子及びその相補配列の少なくとも一方を増幅したときの増幅断片中に前記多型部位が含まれるように、オリゴヌクレオチドプローブ及び／又はオリゴヌクレオチドプライマーを作製し、得られるオリゴヌクレオチドプローブ及び／又はオリゴヌクレオチドプライマーを用いて、目的の受容体をコードする遺伝子中の少なくとも１個の遺伝子多型を検出することを特徴とする遺伝子多型の検出方法。
Description
技術分野
本発明は、遺伝子多型情報、遺伝子多型情報の検出方法、遺伝子多型を用いた薬物の評価方法、及び薬物のスクリーニング方法に関する。
背景技術
ヒトの姿形が千差万別であるように、３０億からなる遺伝暗号も個人間で比較するとかなり多くの部位で異なっている。この遺伝暗号の違いを遺伝子多型（ポリモルフィズム）と呼んでおり、代表的な遺伝子多型として一塩基多型が知られている。
一塩基多型（ＳＮＰ：ｓｉｎｇｌｅ ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ）とは、個人間における１遺伝暗号の違いを意味する。ヒトの顔貌や体型が千差万別であるように、遺伝暗号である塩基配列も一人ひとりかなり多くの部位で異なっている。ＳＮＰは、その存在する位置によってｃＳＮＰ（ｃｏｄｉｎｇ ＳＮＰ）とｇＳＮＰ（ｇｅｎｏｍｅ ＳＮＰ）に分類され、ｃＳＮＰには、さらにｓＳＮＰ（ｓｉｌｅｎｔ ＳＮＰ）、ｒＳＮＰ（ｒｅｇｕｌａｔｏｒｙ ＳＮＰ）及びｉＳＮＰ（ｉｎｔｒｏｎ ＳＮＰ）が含まれる。
上記ＳＮＰは、多型マーカーとしての疾患の発症や増悪に関連する遺伝子を見つけるために有用であり、最終的に臨床分野において疾患のリスク診断や薬剤の使い分けなどに直接関係する。また、疾患の原因となっている物質を標的分子とした証拠に基づく薬剤開発は、世界的趨勢となっている。ある疾患に対して薬剤を投与した場合、患者の応答性は様々であり、著効を示すもの、有効性の低いもの、全く効果を示さないもののように、薬剤に対する応答性には大きな違いがある。これは、症状が同じで同じ診断名であっても、その背景となっている疾患を起こしている経路が異なっていたり、あるいは薬剤の受容体への結合能やその受容体の情報伝達能、受容体そのものの発現量などが大きく異なっている可能性があるからである。従って、ＳＮＰなど遺伝子多型を参考にしながら、目的の疾患に応じた薬物の選択、治療法の開発（いわゆるオーダーメイド医療）が望まれる。
薬剤に対する応答性に加えて、時には致死的となるような強い副作用の問題も、医療従事者が対処していかなければならない大きな問題の一つである。これは、処方ミスなどによる過剰投与がなくても、時には思わぬ致死的な副作用に遭遇することがある。従って、薬剤の応答性に対しては、薬剤の代謝、薬剤の輸送のみならず、薬剤のレセプターの薬剤応答性や副作用に関連する受容体の感受性における個体差を、ＳＮＰなどの遺伝子多型を参考にしながら決定することが望まれる。
発明の開示
本発明は、遺伝子多型情報の検出方法とその情報に基づく薬物の有効性並びに安全性を評価するための方法、及び薬物のスクリーニング方法を提供することを目的とする。
本発明者は、上記課題を解決するため鋭意研究を行った結果、受容体をコードする遺伝子中の遺伝子多型を見出し、これを用いて薬物の感受性とその薬物が標的としないであろうと思われていた受容体を介した副作用の発現を評価する方法の確立に成功し、本発明を完成するに至った。
すなわち、本発明は以下の通りである。
（１）受容体をコードする遺伝子若しくはその相補配列中に存在する多型部位を含むように、又は受容体をコードする遺伝子及びその相補配列の少なくとも一方を増幅したときの増幅断片中に前記多型部位が含まれるように、オリゴヌクレオチドプローブ及び／又はオリゴヌクレオチドプライマーを作製し、得られるオリゴヌクレオチドプローブ及び／又はオリゴヌクレオチドプライマーを用いて、目的の受容体をコードする遺伝子中の少なくとも１個の遺伝子多型を検出することを特徴とする遺伝子多型の検出方法。
（２）受容体をコードする遺伝子若しくはその相補配列中に存在する多型部位を含むように、又は受容体をコードする遺伝子及びその相補配列の少なくとも一方を増幅したときの増幅断片中に前記多型部位が含まれるように、オリゴヌクレオチドプローブ及び／又はオリゴヌクレオチドプライマーを作製し、得られるオリゴヌクレオチドプローブ及び／又はオリゴヌクレオチドプライマーを用いて、目的の受容体をコードする遺伝子中の少なくとも１個の遺伝子多型を検出することを特徴とする遺伝子多型の検出方法であって、前記多型部位が、配列番号１〜１１６８に示す塩基配列又はその相補配列中に存在する少なくとも一つであることを特徴とする、前記方法。
（３）受容体をコードする遺伝子若しくはその相補配列中に存在する多型部位を含むように、又は受容体をコードする遺伝子及びその相補配列の少なくとも一方を増幅したときの増幅断片中に前記多型部位が含まれるように、オリゴヌクレオチドプローブ及び／又はオリゴヌクレオチドプライマーを作製し、得られるオリゴヌクレオチドプローブ及び／又はオリゴヌクレオチドプライマーを用いて、目的の受容体をコードする遺伝子中の少なくとも１個の遺伝子多型を検出することを特徴とする遺伝子多型の検出方法であって、前記オリゴヌクレオチドプローブ及び／又はオリゴヌクレオチドプライマーが、配列番号１〜１１６８に示す塩基配列のうち多型部位を含む少なくとも１３塩基の配列又はこれに相補的な配列を有するものからなる群から選択される少なくとも１つである前記方法。
この場合のオリゴヌクレオチドプローブ及び／又はオリゴヌクレオチドプライマーの長さとしては、１３〜６０塩基のものが挙げられる。
（４）上記（１）〜（３）の方法において、多型部位の情報としては表１に示すもの（例えば表１に示す配列番号１〜１１６８の配列情報）を使用することができる。また、多型部位を含むオリゴヌクレオチドプローブ及び／又はオリゴヌクレオチドプライマーとしては、その５’末端若しくは３’末端又は中央の塩基が当該多型部位となるように作製されたものが挙げられる。受容体をコードする遺伝子又はその相補配列とハイブリダイズし得る断片とハイブリダイズしない断片とが結合したものであって、前記多型部位が、当該ハイブリダイズし得る断片の５’末端又は３’末端となるようなオリゴヌクレオチドプローブも、多型部位を含むオリゴヌクレオチドプローブとして本発明に含まれる。
本発明の方法において、多型の種類は限定されるものではなく、例えば、一塩基多型、複数個の塩基の欠失、置換若しくは挿入による多型、又はＶＮＴＲ若しくはマイクロサテライトによる多型が挙げられる。
（５）上記（１）〜（４）のいずれかの方法により得られた検出結果から、当該受容体を介する薬物の有効性及び安全性を評価することを特徴とする薬物の評価方法。
（６）上記（１）〜（４）のいずれかの方法により得られた検出結果から、当該受容体を介する薬物の感受性の程度を評価することを特徴とする薬物の評価方法。
（７）上記（５）又は（６）の評価方法により得られた評価を指標として、使用すべき薬物を選択することを特徴とする薬物の選択方法。
（８）受容体をコードする遺伝子又はその相補配列中の多型情報と、被験者から採取した当該受容体をコードする遺伝子又はその相補配列中の多型情報とを比較して、当該受容体を介して起こる薬物の有効性及び／又は安全性に関する個体差を解析し、得られる解析結果から使用すべき薬物及び／又はその用量を選択することを特徴とする薬物の選択方法。
（９）上記（１）〜（４）の検出方法、（５）〜（６）の評価方法又は（７）〜（８）の選択方法において、受容体としては、ＣＤ２０、ＣＤ３３、ＣＳＦ３Ｒ、ＩＬ１Ｒ１、ＩＬ１Ｒ２、ＩＬ２Ｒ、ＨＥＲ２、ＩＦＮＡＲ１、ＰＧＲ、ＡＣＴＨ、ＩＣＡＭ１、ＶＣＡＭ１、ＩＴＧＢ２、ＰＴＧＤＲ、ＰＴＧＥＲ１、ＰＴＧＥＲ２、ＰＴＧＥＲ３、ＰＴＧＦＲ、ＧＮＡ１２、ＴＢＸＡ２Ｒ、ＢＬＴＲ２、ＣＹＳＬＴ１、ＣＹＳＬＴ２、ＰＴＡＦＲ、ＢＤＫＲＢ１、ＢＤＫＲＢ２、ＡＤＲＢ１、ＡＤＲＢ２、ＨＲＨ１、ＨＲＨ２、ＨＲＨ３、ＨＴＲ３Ａ、ＡＧＴＲ１、ＡＧＴＲＬ１、ＡＧＴＲ２、ＡＶＰＲ１Ａ、ＡＶＰＲ２、ＰＴＧＩＲ、ＤＲＤ１、ＩＴＧＡ２Ｂ、ＦＯＬＲ１、ＴＮＦＲ１、ＡＤＯＲＡ１、ＡＤＯＲＡ２Ａ、ＡＤＯＲＡ２Ｂ、ＡＤＯＲＡ３、ＡＶＰＲ１Ｂ、ＡＤＲＡ１Ａ、ＡＤＲＡ２Ａ、ＡＤＲＡ２Ｂ、ＥＤＧ１、ＥＤＧ４、ＥＤＧ５、ＧＰＲ１、ＧＰＲ２、ＧＰＲ３、ＧＰＲ４、ＧＰＲ１０、ＭＣ１Ｒ、ＭＣ２Ｒ、ＭＣ３Ｒ、ＭＣ４Ｒ、ＯＸＴＲ、ＳＳＴＲ１及びＳＳＴＲ３からなる群から選択される少なくとも１つが挙げられる。
（１０）受容体をコードする遺伝子又はその相補配列中に存在する多型部位を含むように作製されたオリゴヌクレオチド。
（１１）ＣＤ２０、ＣＤ３３、ＣＳＦ３Ｒ、ＩＬ１Ｒ１、ＩＬ１Ｒ２、ＩＬ２Ｒ、ＨＥＲ２、ＩＦＮＡＲ１、ＰＧＲ、ＡＣＴＨ、ＩＣＡＭ１、ＶＣＡＭ１、ＩＴＧＢ２、ＰＴＧＤＲ、ＰＴＧＥＲ１、ＰＴＧＥＲ２、ＰＴＧＥＲ３、ＰＴＧＦＲ、ＧＮＡ１２、ＴＢＸＡ２Ｒ、ＢＬＴＲ２、ＣＹＳＬＴ１、ＣＹＳＬＴ２、ＰＴＡＦＲ、ＢＤＫＲＢ１、ＢＤＫＲＢ２、ＡＤＲＢ１、ＡＤＲＢ２、ＨＲＨ１、ＨＲＨ２、ＨＲＨ３、ＨＴＲ３Ａ、ＡＧＴＲ１、ＡＧＴＲＬ１、ＡＧＴＲ２、ＡＶＰＲ１Ａ、ＡＶＰＲ２、ＰＴＧＩＲ、ＤＲＤ１、ＩＴＧＡ２Ｂ、ＦＯＬＲ１、ＴＮＦＲ１、ＡＤＯＲＡ１、ＡＤＯＲＡ２Ａ、ＡＤＯＲＡ２Ｂ、ＡＤＯＲＡ３、ＡＶＰＲ１Ｂ、ＡＤＲＡ１Ａ、ＡＤＲＡ２Ａ、ＡＤＲＡ２Ｂ、ＥＤＧ１、ＥＤＧ４、ＥＤＧ５、ＧＰＲ１、ＧＰＲ２、ＧＰＲ３、ＧＰＲ４、ＧＰＲ１０、ＭＣ１Ｒ、ＭＣ２Ｒ、ＭＣ３Ｒ、ＭＣ４Ｒ、ＯＸＴＲ、ＳＳＴＲ１及びＳＳＴＲ３からなる群から選択されるいずれかの受容体をコードする遺伝子又はその相補配列中に存在する多型部位を含むように作製されたオリゴヌクレオチド。
（１２）上記（１０）〜（１１）のオリゴヌクレオチドは、例えば、その５’末端若しくは３’末端又は中央の塩基が、当該多型部位となるように作製される。また、多型部位を含む上記オリゴヌクレオチドは、受容体をコードする遺伝子又はその相補配列とハイブリダイズし得る断片とハイブリダイズしない断片とが結合したものであって、前記多型部位が、当該ハイブリダイズし得る断片の５’末端又は３’末端となるように作製することもできる。
本発明のさらに具体的なオリゴヌクレオチドとしては、配列番号１〜１１６８に示す塩基配列又はその相補配列中に存在する少なくとも一つの多型部位を含むオリゴヌクレオチドが挙げられる。これらのオリゴヌクレオチドは、１３〜３５塩基の長さを有するものであってもよく、配列番号１〜１１６８に示すいずれかの塩基配列のうち第２１番目の塩基を含む少なくとも１３塩基の配列又はこれに相補的な配列からなるオリゴヌクレオチドであってもよい。また、配列番号１〜１１６８に示される塩基配列又はこれに相補的な塩基配列からなる群から選択されるオリゴヌクレオチドも本発明に含まれる。
（１３）配列番号１〜１１６８に示すいずれかの塩基配列又はその相補配列中の多型部位が含まれるゲノムＤＮＡ領域において、当該多型部位から５’及び／又は３’側に向かってそれぞれ１０００ｂｐ以内に設計され、かつ、１３〜６０塩基の長さを有するオリゴヌクレオチド。
（１４）上記（１２）〜（１３）に示すオリゴヌクレオチドが支持体に固定されたマイクロアレイ。
（１５）上記（１２）〜（１３）に示すオリゴヌクレオチド及び／又は（１４）に示すマイクロアレイを含む遺伝子多型検出用キット。
以下、本発明を詳細に説明する。
本発明は、受容体に関する遺伝子多型情報を用いて、被検対象の遺伝子多型を検出する方法に関する。また、本発明は、当該受容体を介して起こる薬物の有効性及び安全性の有無又は強弱を解析することを特徴とし、この解析結果により、疾患と薬物との関係を評価するものである。複数人が同じ疾患に罹患している場合であっても、受容体の遺伝子多型情報は個々の患者ごとに異なることが多い。従って、その異なる遺伝子多型情報から薬物に対する受容体感受性の違いを導き、どのような遺伝子多型情報を有する場合に特定の薬物の有効性が認められるのか又は認められないのか、また、どのような遺伝子多型情報を有する場合に副作用が出やすいのか又は出にくいのか、その薬物の有効性及び／又は安全性を評価する。その結果、ある疾患に対してどのような薬物を使用すべきなのか、遺伝子多型情報からそれぞれの患者ごとに適した投薬（オーダーメイド医療）が可能となる。
１．遺伝子多型
遺伝子多型には、一塩基多型、インサーション／デリーション型多型、及び塩基配列の繰り返し数が異なっていることにより生じる多型が含まれる。一塩基多型（ＳＮＰ）とは、一般にはある遺伝子又はその相補鎖（相補配列）領域における特定の１個の塩基が他の塩基に置換することによる多型を意味するが、本発明においては、上記置換による多型のほか、当該１個の塩基が欠失したことによる多型、当該１個の塩基にさらに１個の塩基が挿入したことによる多型も含めることとする。
また、インサーション／デリーション型多型とは、複数の塩基（例えば２個〜数十塩基）が欠失や挿入をしていることによる多型をいい、数百塩基〜数千塩基が欠失や挿入されているものも存在する。さらに、塩基配列の繰り返し数が異なっていることにより生じる多型は２〜数十塩基の配列が繰り返されており、その繰り返し回数が個人間で異なっているものをいう。繰り返しの単位が数塩基から数十塩基のものをＶＮＴＲ（ｖａｒｉａｂｌｅ ｎｕｍｂｅｒ ｏｆ ｔａｎｄｅｍ ｒｅｐｅａｔ）といい、２〜４塩基単位程度のものをマイクロサテライト多型という。ＶＮＴＲやマイクロサテライト多型においては、この繰り返し回数の違いが個々人のアレル（対立遺伝子）で異なることにより、バリエーションを獲得している。
ここで、遺伝子多型情報は、遺伝子中の多型情報と、その相補配列中の多型情報との双方を含むものである。また、「相補鎖」又は「相補配列」とは、塩基対合則の関係を有するポリヌクレオチドである。例えば、「５’−Ａ−Ｇ−Ｔ−３’」配列は「３’−Ｔ−Ｃ−Ａ−５’」配列に対し相補的である。相補性は、部分的に、すなわちポリヌクレオチド中においてある程度の数の塩基のみが塩基対合則により一致しているようなものであってもよく、全体が完全に相補的であってもよい。このような相補性の程度は、ハイブリダイゼーションの効率及び強度に有意に影響を及ぼす。これは、増幅反応、及びポリヌクレオチド間の結合による検出方法において特に重要である。
ヌクレオチド配列の相補性は、１つの配列の５’末端が他の配列の３’末端と対合するようにヌクレオチド配列を並べた場合に、オリゴヌクレオチドの配列が「逆並行の関係」にあることを意味する。相補性が完全である必要はなく、二重らせんはミスマッチ塩基対又は一致していない塩基を含んでいても安定である。当業者であれば、例えばオリゴヌクレオチドの長さ、オリゴヌクレオチドの塩基組成及び配列、イオン強度、並びにミスマッチ塩基対の存在などを考慮して経験的に二重らせんの安定性を決定することが可能である。
２．受容体
「受容体」とは、ホルモン、オータコイド、神経伝達物質などの特異的なリガンドに応答する受容器の総称である。代表的なものとしては細胞膜や核内受容体が知られている。医薬品の一部はこの受容体へのリガンドの結合を阻害又は拮抗するか、あるいは、リガンドと同様に受容体に結合し、その受容体が司る情報伝達を刺激するものである。そのため、受容体へのリガンドの結合能、その情報伝達能、あるいは受容体そのものの発現量が遺伝子多型によって影響を受ける場合には、薬物の効果又は副作用に個体差が生じる。
本発明において、遺伝子多型解析の対象となる遺伝子により発現される受容体としては、以下のものが挙げられる。
ＣＤ２０、ＣＤ３３、ＣＳＦ３Ｒ、ＩＬ１Ｒ１、ＩＬ１Ｒ２、ＩＬ２Ｒ、ＨＥＲ２、ＩＦＮＡＲ１、ＰＧＲ、ＡＣＴＨ、ＩＣＡＭ１、ＶＣＡＭ１、ＩＴＧＢ２、ＰＴＧＤＲ、ＰＴＧＥＲ１、ＰＴＧＥＲ２、ＰＴＧＥＲ３、ＰＴＧＦＲ、ＧＮＡ１２、ＴＢＸＡ２Ｒ、ＢＬＴＲ２、ＣＹＳＬＴ１、ＣＹＳＬＴ２、ＰＴＡＦＲ、ＢＤＫＲＢ１、ＢＤＫＲＢ２、ＡＤＲＢ１、ＡＤＲＢ２、ＨＲＨ１、ＨＲＨ２、ＨＲＨ３、ＨＴＲ３Ａ、ＡＧＴＲ１、ＡＧＴＲＬ１、ＡＧＴＲ２、ＡＶＰＲ１Ａ、ＡＶＰＲ２、ＰＴＧＩＲ、ＤＲＤ１、ＩＴＧＡ２Ｂ、ＦＯＬＲ１、ＴＮＦＲ１、ＡＤＯＲＡ１、ＡＤＯＲＡ２Ａ、ＡＤＯＲＡ２Ｂ、ＡＤＯＲＡ３、ＡＶＰＲ１Ｂ、ＡＤＲＡ１Ａ、ＡＤＲＡ２Ａ、ＡＤＲＡ２Ｂ、ＥＤＧ１、ＥＤＧ４、ＥＤＧ５、ＧＰＲ１、ＧＰＲ２、ＧＰＲ３、ＧＰＲ４、ＧＰＲ１０、ＭＣ１Ｒ、ＭＣ２Ｒ、ＭＣ３Ｒ、ＭＣ４Ｒ、ＯＸＴＲ、ＳＳＴＲ１及びＳＳＴＲ３
受容体は、各々特異的なリガンドによる情報伝達のみを制御する受容器である。
（１） ＣＤ２０はＣＤ２０抗原の受容体である。
（２） ＣＤ３３はＣＤ３３抗原の受容体である。
（３） ＣＳＦ３Ｒはコロニー刺激因子３（Ｃｏｌｏｎｙ ｓｔｉｍｕｌａｔｉｎｇ ｆａｃｔｏｒ ３）の受容体である。
（４） ＩＬ１Ｒ１はインターロイキン１（Ｉｎｔｅｒｌｅｕｋｉｎ １の受容体である。
（５） ＩＬ１Ｒ２はインターロイキン１（Ｉｎｔｅｒｌｅｕｋｉｎ １）の受容体である。
（６） ＩＬ２Ｒはインターロイキン２（Ｉｎｔｅｒｌｅｕｋｉｎ ２）の受容体である。
（７） ＨＥＲ２はｃ−ｅｒｂ−Ｂ−２の受容体である。
（８） ＩＦＮＡＲ１はインターフェロンα、β又はω（Ｉｎｔｅｒｆｅｒｏｎ（ａｌｐｈａ，ｂｅｔａ ａｎｄ ｏｍｅｇａ））の受容体である。
（９） ＰＧＲはプロゲステロン（Ｐｒｏｇｅｓｔｅｒｏｎｅ）の受容体である。
（１０） ＡＣＴＨはメラノコルチン２（Ｍｅｌａｎｏｃｏｒｔｉｎ ２）の受容体である。
（１１） ＩＣＡＭ１はヒト細胞内接着分子１（Ｉｎｔｅｒｃｅｌｌｕｌａｒ ａｄｈｅｓｉｏｎ ｍｏｌｅｃｕｌｅ １（ＣＤ５４），ｈｕｍａｎ）の受容体である。
（１２） ＶＣＡＭ１は血管細胞接着分子１（Ｖａｓｃｕｌａｒ ｃｅｌｌ ａｄｈｅｓｉｏｎ ｍｏｌｅｃｕｌｅ １）の受容体である。
（１３） ＩＴＧＢ２はインテグリンβ２（抗原ＣＤ１８（ｐ９５），リンパ球機能関連抗原１；マクロファージ抗原１（Ｍａｃ−１）βサブユニット）（Ｉｎｔｅｇｒｉｎ，ｂｅｔａ ２（ａｎｔｉｇｅｎ ＣＤ１８（ｐ９５），ｌｙｍｐｈｏｃｙｔｅ ｆｕｎｃｔｉｏｎ−ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ ａｎｔｉｇｅｎ １；ｍａｃｒｏｐｈａｇｅ ａｎｔｉｇｅｎ １（ｍａｃ−１）ｂｅｔａ ｓｕｂｕｎｉｔ））の受容体である。
（１４） ＰＴＧＤＲはプロスタグランジンＤ２（Ｐｒｏｓｔａｇｌａｎｄｉｎ Ｄ２）の受容体である。
（１５） ＰＴＧＥＲ１はプロスタグランジンＥ１（Ｐｒｏｓｔａｇｌａｎｄｉｎ Ｅ１）の受容体である。
（１６） ＰＴＧＥＲ２はプロスタグランジンＥ２（Ｐｒｏｓｔａｇｌａｎｄｉｎ Ｅ２）の受容体である。
（１７） ＰＴＧＥＲ３はプロスタグランジンＥ３（Ｐｒｏｓｔａｇｌａｎｄｉｎ Ｅ３）の受容体である。
（１８） ＰＴＧＦＲはプロスタグランジンＦ（Ｐｒｏｓｔａｇｌａｎｄｉｎ Ｆ）の受容体である。
（１９） ＧＮＡ１２はトロンボキサンＡ２（Ｔｈｒｏｍｂｏｘａｎｅ Ａ２）の受容体である。
（２０） ＴＢＸＡ２ＲはトロンボキサンＡ２（Ｔｈｒｏｍｂｏｘａｎｅ Ａ２）の受容体である。
（２１） ＢＬＴＲ２はロイコトリエンＢ４（ｌｅｕｋｏｔｒｉｅｎｅ Ｂ４）の受容体である。
（２２） ＣＹＳＬＴ１はシステイニルロイコトリエン（Ｃｙｓｔｅｉｎｙｌ ｌｅｕｋｏｔｒｉｅｎｅ）の受容体である。
（２３） ＣＹＳＬＴ２は、システイニルロイコトリエンの受容体である。
（２４） ＰＴＡＦＲは血小板活性化因子（Ｐｌａｔｅｌｅｔ−ａｃｔｉｖａｔｉｎｇ ｆａｃｔｏｒ）受容体である。
（２５） ＢＤＫＲＢ１はブラジキニン（Ｂｒａｄｙｋｉｎｉｎ）の受容体である。
（２６） ＢＤＫＲＢ２はブラジキニン（Ｂｒａｄｙｋｉｎｉｎ）の受容体である。
（２７） ＡＤＲＢ１はカテコールアミンβ−１（Ｃａｔｅｃｈｏｌａｍｉｎｅ ｂｅｔａ−１）の受容体である。
（２８） ＡＤＲＢ２はカテコールアミンβ−２（Ｃａｔｅｃｈｏｌａｍｉｎｅ ｂｅｔａ−２）の受容体である。
（２９） ＨＲＨ１はヒスタミンＨ１（ｈｉｓｔａｍｉｎｅ Ｈ１）受容体である。
（３０） ＨＲＨ２はヒスタミンＨ２（ｈｉｓｔａｍｉｎｅ Ｈ２）受容体である。
（３１） ＨＲＨ３はヒスタミンＨ３（ｈｉｓｔａｍｉｎｅ Ｈ３）受容体である。
（３２） ＨＴＲ３Ａは５−ヒドロキシトリプタミン（セロトニン）（５−ｈｙｄｒｏｘｙｔｒｙｐｔａｍｉｎｅ（ｓｅｒｏｔｏｎｉｎ））の受容体である。
（３３） ＡＧＴＲ１はアンジオテンシン受容体１（Ａｎｇｉｏｔｅｎｓｉｎ ｒｅｃｅｐｔｏｒ １）である。
（３４） ＡＧＴＲＬ１はアンジオテンシン（Ａｎｇｉｏｔｅｎｓｉｎ）様の受容体である。
（３５） ＡＧＴＲ２はアンジオテンシン（Ａｎｇｉｏｔｅｎｓｉｎ）の受容体である。
（３６） ＡＶＰＲ１Ａはアルギニンバソプレッシン（Ａｒｇｉｎｉｎｅ ｖａｓｏｐｒｅｓｓｉｎ）の受容体である。
（３７） ＡＶＰＲ２はアルギニンバソプレッシン（Ａｒｇｉｎｉｎｅ ｖａｓｏｐｒｅｓｓｉｎ）の受容体である。
（３８） ＰＴＧＩＲはプロスタグランジンＩ２（プロスタサイクリン）（Ｐｒｏｓｔａｇｌａｎｄｉｎ Ｉ２）（ｐｒｏｓｔａｃｙｃｌｉｎ）の受容体である。
（３９） ＤＲＤ１はドーパミン（Ｄｏｐａｍｉｎｅ）の受容体である。
（４０） ＩＴＧＡ２Ｂはインテグリンα２ｂ（血小板糖タンパク質ＩＩｂ／ＩＩＩａ複合体のＩＩｂ，抗原ＣＤ４１Ｂ）（（Ｉｎｔｅｇｒｉｎ，ａｌｐｈａ ２ｂ）（ｐｌａｔｅｌｅｔ ｇｌｙｃｏｐｒｏｔｅｉｎ ＩＩｂ ｏｆ ＩＩｂ／ＩＩＩａ ｃｏｍｐｌｅｘ，ａｎｔｉｇｅｎ ＣＤ４１Ｂ））である。
（４１） ＦＯＬＲ１は葉酸受容体１（Ｆｏｌａｔｅ ｒｅｃｅｐｔｏｒ １）である。
（４２） ＴＮＦＲ１は腫瘍壊死因子受容体１（Ｔｕｍｏｒ ｎｅｃｒｏｓｉｓ ｆａｃｔｏｒ ｒｅｃｅｐｔｏｒ １）である。アクセッション番号：ＡＣ００６０５７．５
（４３） ＡＤＯＲＡ１はアデノシンＡ１受容体（Ａｄｅｎｏｓｉｎｅ Ａ１ ｒｅｃｅｐｔｏｒ）である。
（４４） ＡＤＯＲＡ２ＡはアデノシンＡ２受容体（Ａｄｅｎｏｓｉｎｅ Ａ２ ｒｅｃｅｐｔｏｒ）である。
（４５） ＡＤＯＲＡ２ＢはアデノシンＡ２Ｂ受容体（Ａｄｅｎｏｓｉｎｅ Ａ２Ｂ ｒｅｃｅｐｔｏｒ）である。
（４６） ＡＤＯＲＡ３はアデノシンＡ３受容体（Ａｄｅｎｏｓｉｎｅ Ａ３ ｒｅｃｅｐｔｏｒ）である。
（４７） ＡＶＰＲ１Ｂはアルギニンバソプレッシン受容体１Ｂ（Ａｒｇｉｎｉｎｅ Ｖａｓｏｐｒｅｓｓｉｎ ｒｅｃｅｐｔｏｒ １Ｂ）である。
（４８） ＡＤＲＡ１Ａはアドレナリンα１Ａ受容体（Ａｄｒｅｎｅｒｇｉｃ ａｌｐｈａ−１Ａ ｒｅｃｅｐｔｏｒ）である。
（４９） ＡＤＲＡ２Ａはアドレナリンα２Ａ受容体（Ａｄｒｅｎｅｒｇｉｃ ａｌｐｈａ−２Ａ ｒｅｃｅｐｔｏｒ）である。
（５０） ＡＤＲＡ２Ｂはアドレナリンα２Ｂ受容体（Ａｄｒｅｎｅｒｇｉｃ ａｌｐｈａ−２Ｂ ｒｅｃｅｐｔｏｒ）である。
（５１） ＥＤＧ１は内皮分化スフィンゴリピドＧタンパク質共役受容体１（Ｅｎｄｏｔｈｅｌｉａｌ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｔｉｏｎ，ｓｐｈｉｎｇｏｌｉｐｉｄ Ｇ−ｐｒｏｔｅｉｎ−ｃｏｕｐｌｅｄ ｒｅｃｅｐｔｏｒ，１）である。
（５２） ＥＤＧ４は内皮分化スフィンゴリピドＧタンパク質共役受容体４（Ｅｎｄｏｔｈｅｌｉａｌ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｔｉｏｎ，ｓｐｈｉｎｇｏｌｉｐｉｄ Ｇ−ｐｒｏｔｅｉｎ−ｃｏｕｐｌｅｄ ｒｅｃｅｐｔｏｒ，４）である。
（５３） ＥＤＧ５は内皮分化スフィンゴリピドＧタンパク質共役受容体５（Ｅｎｄｏｔｈｅｌｉａｌ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｔｉｏｎ，ｓｐｈｉｎｇｏｌｉｐｉｄ Ｇ−ｐｒｏｔｅｉｎ−ｃｏｕｐｌｅｄ ｒｅｃｅｐｔｏｒ，５）である。
（５４） ＧＰＲ１はＧタンパク質共役受容体１（Ｇ ｐｒｏｔｅｉｎ−ｃｏｕｐｌｅｄ ｒｅｃｅｐｔｏｒ １）である。
（５５） ＧＰＲ２はＧタンパク質共役受容体２（Ｇ ｐｒｏｔｅｉｎ−ｃｏｕｐｌｅｄ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ２）である。
（５６） ＧＰＲ３はＧタンパク質共役受容体３（Ｇ ｐｒｏｔｅｉｎ−ｃｏｕｐｌｅｄ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ３）である。
（５７） ＧＰＲ４はＧタンパク質共役受容体４（Ｇ ｐｒｏｔｅｉｎ−ｃｏｕｐｌｅｄ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ４）である。
（５８） ＧＰＲ１０はＧタンパク質共役受容体１０（Ｇ ｐｒｏｔｅｉｎ−ｃｏｕｐｌｅｄ ｒｅｃｅｐｔｏｒ １０）である。
（５９） ＭＣ１Ｒはメラノコルチン１受容体（Ｍｅｌａｎｏｃｏｒｔｉｎ １ ｒｅｃｅｐｔｏｒ）である。
（６０） ＭＣ２Ｒはメラノコルチン２受容体（Ｍｅｌａｎｏｃｏｒｔｉｎ ２ ｒｅｃｅｐｔｏｒ）である。
（６１） ＭＣ３Ｒはメラノコルチン３受容体（Ｍｅｌａｎｏｃｏｒｔｉｎ ３ ｒｅｃｅｐｔｏｒ）である。
（６２） ＭＣ４Ｒはメラノコルチン４受容体（Ｍｅｌａｎｏｃｏｒｔｉｎ ４ ｒｅｃｅｐｔｏｒ）である。
（６３） ＯＸＴＲはオキシトシン受容体（Ｏｘｙｔｏｃｉｎ ｒｅｃｅｐｔｏｒ）である。
（６４） ＳＳＴＲ１はソマトスタチン受容体１（Ｓｏｍａｔｏｓｔａｔｉｎ ｒｅｃｅｐｔｏｒ １）である。
（６５） ＳＳＴＲ３はソマトスタチン受容体３（Ｓｏｍａｔｏｓｔａｔｉｎ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ３）である。
３．遺伝子多型情報
遺伝子多型情報は、一般的遺伝子多型検出法を利用して得ることができる。例えば、シークエンス法、ＰＣＲによる方法、断片長多型アッセイ、アレル特異的オリゴヌクレオチドを鋳型としてハイブリダイゼーションを行う方法（例えばＴａｑＭａｎ ＰＣＲ法、インベーダー法、ＤＮＡチップ法）、プライマー伸長反応を利用する方法、シークエンス法、ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ／ＭＳ法、ＤＮＡチップ法等が採用される。ＰＣＲ法やシークエンス法はいずれの遺伝子多型の検出法にも使用することができ、他の方法は、主としてＳＮＰの検出法に使用することができる。
ＴａｑＭａｎ ＰＣＲ法とは、蛍光標識したアレル特異的オリゴとＴａｑ ＤＮＡポリメラーゼによるＰＣＲ反応とを利用した方法である（Ｌｉｖａｋ，Ｋ．Ｊ．Ｇｅｎｅｔ．Ａｎａｌ．１４，１４３（１９９９）；Ｍｏｒｒｉｓ Ｔ．ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｃｌｉｎ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．３４，２９３３（１９９６））。インベーダー法とは、ＳＮＰのそれぞれのアレルに特異的な２種類のレポータープローブ及び１種類のインベーダープローブの鋳型ＤＮＡへのハイブリダイゼーションと、ＤＮＡの構造を認識して切断するという特殊なエンドヌクレアーゼ活性を有する酵素によるＤＮＡの切断を組み合わせた方法である（Ｌｉｖａｋ，Ｋ．Ｊ．Ｂｉｏｍｏｌ．Ｅｎｇ．１４，１４３−１４９（１９９９）；Ｍｏｒｒｉｓ Ｔ．ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｃｌｉｎ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．３４，２９３３（１９９６）；Ｌｙａｍｉｃｈｅｖ，Ｖ．ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２６０，７７８−７８３（１９９３）等）。
また、プライマー伸長反応を利用する方法として、例えばＳｎｉＰｅｒ法を採用することもできる。ＳｎｉＰｅｒ法とは、ＲＣＡ（ｒｏｌｌｉｎｇ ｃｉｒｃｌｅ ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ）法と呼ばれる手法を基本原理とするものであり、環状の一本鎖ＤＮＡを鋳型としてＤＮＡポリメラーゼがその上を移動しながら相補鎖ＤＮＡを連続して合成していくものである。この方法によれば、ＤＮＡ増幅が起こった場合に生じる発色反応の有無を測定することによってＳＮＰを判定する（Ｌｉｚａｒｄｉ，Ｐ．Ｍ．ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ Ｇｅｎｅｔ．，１９，２２５−２３２（１９９８）；Ｐｉａｔｅｄ，Ａ．Ｓ．ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈ．，１６，３５９−３６３（１９９８））。
シークエンス法とは、遺伝子多型を含む領域をＰＣＲにて増幅させ、Ｄｙｅ Ｔｅｒｍｉｎａｔｏｒなどを用いてＤＮＡ配列をシークエンスすることで遺伝子多型（特に一塩基多型）の頻度を解析する方法である。
ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ／ＭＳ法とは、質量分析機（ｍａｓｓ ｓｐｅｃｔｒｍｅｔｅｒ）を用いた方法で、基本的には異なる一塩基の質量の違いを利用してＳＮＰジェノタイピングする方法である。ＰＣＲ増幅を利用した方法とｍｕｌｔｉｐｌｅｘを利用した方法がある（Ｈａｆｆ，Ｌ．Ａ．，Ｓｍｉｒｎｏｖ，Ｉ．Ｐ．，Ｇｅｎｏｍｅ Ｒｅｓ．，７，３７８−（１９９７）；Ｌｉｔｔｌｅ，Ｄ．Ｐ．ｅｔ ａｌ．Ｅｕｒ．Ｊ．Ｃｌｉｎｉｃａ．Ｃｈｅｍ．Ｃｌｉｎ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．，３５，５４５−（１９９７）；Ｒｏｓｓ，Ｐ．，ｅｔ ａｌ．Ｎａｔ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．，１６，１３４７−（１９９８））。
ＤＮＡチップ法とは、ガラスなどの基盤上に多種類のＤＮＡプローブを整列化し、固定し、その上で標識ＤＮＡのハイブリダイゼーションを行い、プローブ上の標識（蛍光など）シグナルを検出する方法を利用して、ハイブリダイゼーションで完全マッチと一塩基ミスマッチを分別検出する方法である。
本発明の方法において使用することができる遺伝子多型情報、特にＳＮＰ情報は表１の通りである。
表１において、「遺伝子名」の欄には受容体をコードする遺伝子名を記載した。「配列」の欄においてアルファベット大文字で示した塩基、つまり「配列」の欄の第２１番目の塩基が多型情報である。表中の配列は、基本的にＳＮＰの前後２０塩基を示している。但し、第２１番目の多型部位からみて前後２０塩基中にも多型が存在するものもある。例えば、ＣＤ２０のＮｏ．９（配列番号９）の第１６番目の「Ｔ／Ｃ」、あるいはＩＬ１ＲのＮｏ．１０（配列番号５７）の第５番目の「Ｔ／Ｃ」なども、多型である。「／」を付した２つの塩基は、その塩基のホモ又はヘテロのＳＮＰを示す。例えば、「Ａ／Ｇ」と表示した場合は、アレルがＡ／Ａ若しくはＧ／Ｇのホモ、又はＡ／Ｇのヘテロであることを意味する。但し、括弧を付した塩基（例えばＣＳＦ３ＲのＮｏ．１２の（Ａ）：配列番号４６）はインサートによる多型を、Δ（例えばＩＬ１Ｒ２のＮｏ．３７：配列番号１３３）は１又は複数塩基の欠失による多型を意味する。また、括弧に数字を付した塩基は、その括弧内の塩基がその数字の数だけ繰り返されていることを意味する。例えば、配列番号４３の配列（表１、ＣＳＦ３ＲのＮｏ．９）において「（Ｃ）８−１０」とあるのは、Ｃが８〜１０個の繰り返し配列であることを意味する。ここで、表１の「配列」に示す塩基配列の位置関係を説明する場合に使用するときの「第２１番目」は、遺伝子多型部位の位置を意味するものである。したがって、欠失のＳＮＰ（Δ）の場合は、その欠失した架空の塩基が「第２１番目」であり、複数の塩基が存在する場合は、複数の塩基のひとかたまりが「第２１番目」の塩基となる。例えば、ＶＣＡＭ１のＮｏ．１８（配列番号２４９）の場合は多型部位「ＧＣＡＧ」又は欠失部が、ＩＬ１ＲのＮｏ．４１（配列番号８９）の場合は多型部位「（Ａ）９−１２」が第２１番目の塩基となる。
「存在位置」は、ＳＮＰのゲノム上の位置を示す。５’フランキング（ｆｌａｎｋｉｎｇ）領域、イントロン（ｉｎｔｒｏｎ）領域、３’フランキング（ｆｌａｎｋｉｎｇ）領域のＳＮＰｓの存在位置は、第１エキソンの最も５’側の塩基より１塩基５’側を−１番とし、以下５’側に向かって−２、−３、−４、・・・となる。イントロン（ｉｎｔｒｏｎ）領域は、あるエキソンの３’側端から１塩基３’側から、次のエキソンまでの間を意味し、また、その番号は５’側のエキソン番号で表す。例えば、エキソン３とエキソン４との間に存在するイントロン（すなわち、エキソン３の３’側に存在するイントロン）をイントロン３という。イントロン領域のＳＮＰｓの存在位置は、そのイントロンの５’側に位置するエキソン／イントロン接合点（ｅｘｏｎ／ｉｎｔｒｏｎ ｊｕｎｃｔｉｏｎ）からみて３’側の最初の塩基をそのイントロンの塩基配列１番として数えた。そして、（＋）表示又は無表示は３’下流方向に、（−）表示は５’上流方向に向かって数えた数字を示した。例えば、エキソン３／イントロン３接合点から３’側に向かって３塩基目の塩基が多型であれば、「ｉｎｔｒｏｎ ３，＋３」と表示する。同様に、イントロン３／エキソン４接合点から５’側に向かって５塩基目の塩基が多型であれば、「ｉｎｔｒｏｎ ３，−５」と表示する。また、最終エキソンの３’側を３’フランキング（ｆｌａｎｋｉｎｇ）といい、ＳＮＰｓの存在位置は、その遺伝子の最終エキソンの最も３’側の塩基より更に１塩基３’側の塩基を１番として数えた。なお、表１のＭＣ２Ｒ１７〜ＭＣ２Ｒ２０（配列番号９６７〜９７０）の「存在位置」に記載の数字はデータベース上のものであり、本発明の解析により得られた数字をカッコ内に示した。「Ｎｏ．」の欄に記載された数字は、各遺伝子の遺伝子地図（図９〜７３）上におけるＳＮＰの位置を示す番号と対応する。また、図９〜７３には、公のゲノムデータベースにおける多型のアクセッション番号が示されている。表１、図面及びデータベースの情報を利用することにより、多型に隣接する領域の配列を特定することができる。例えば、このような情報は、多型に隣接するＰＣＲプライマーを作成する際に有用である。
上記ゲノムデータベースとしては、限定されるものではないが、ＮＣＢＩ（米国バイオテクノロジー情報センター：Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｃｅｎｔｅｒ ｆｏｒ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ）のサービス一覧、ＩＭＳ−ＪＳＴ ＪＳＮＰデータベースウエブサイト（理化学研究所、遺伝子多型研究センター、遺伝子多型タイピング研究・支援チーム）が挙げられる。
４．オリゴヌクレオチドプローブ又はオリゴヌクレオチドプライマーの作製
本発明の検出方法においてプライマー及び／又はプローブとして使用されるオリゴヌクレオチドは、例えばＳＮＰを検出するときは表１に示す塩基配列（配列番号１〜１１６８）を基本とし、これらの配列自体を合成してもよく、これらの配列の一部を含むように設計し合成してもよい。但し、その塩基配列中には必ずＳＮＰ（表１の「配列」の欄にアルファベット大文字で表示した部分）が含まれるようにする。また、本発明においてはこれらの配列の相補鎖も含まれる。
ＳＮＰを例に説明すると、ＳＮＰ部位は、プライマー又はプローブの塩基配列の３’若しくは５’端に存在するように設計し、あるいは、相補的な配列の３’若しくは５’端に存在するように設計し、又は前２者の３’若しくは５’端から４塩基内、好ましくは２塩基内に存在するように設計する。あるいは、オリゴヌクレオチドの塩基配列全長の中央にＳＮＰが存在するように設計する。「中央」とは、ＳＮＰの塩基よりも５’端に向かう塩基の数と、３’端に向かう塩基の数とがほぼ同数となる中心部の領域をいい、オリゴヌクレオチドの塩基数が奇数の場合は、中心部の５塩基、好ましくは中心部の３塩基、さらに好ましくは最も中心部の１塩基をいう。例えば、４１個の塩基数の場合は、第１９番目〜第２３番目、好ましくは第２０番目〜第２２番目、さらに好ましくは第２１番目の塩基が「中央」となる。また、オリゴヌクレオチドの塩基数が偶数の場合は、中心部の４塩基、好ましくは中心部の２塩基をいう。例えば、４０個の塩基数の場合は、第１９番目〜第２２番目、好ましくは第２０番目の塩基が「中央」となる。表１の「配列」に示す塩基配列において、欠失の多型の場合は、実際の配列の長さは４０個で偶数となる。したがって、この配列に基づいて４０個の塩基数のオリゴヌクレオチドを設計した場合は、第１９番目〜第２２番目、好ましくは第２０番目の塩基が「中央」となる。
多型部位が複数の塩基で構成される場合は、多型部位の全部又は一部の塩基配列又はその相補配列が含まれるようにプローブ又はプライマーを設計及び作製する。作製されたオリゴヌクレオチドをプローブとして用いると、ハイブリダイズの有無又は差を利用してアレルを決定することができる。プローブ又はプライマーのＤＮＡのうち、多型部位又はその周辺領域と相補鎖を形成する塩基を「対応塩基」とすると、プローブ又はプライマーは、多型を構成する配列のうちいずれかの配列上に対応塩基が位置するように設計することができる。「周辺領域」とは、多型を構成する配列の最も５’側端からさらに１〜３塩基外側（５’側）、又は多型を構成する配列の最も３’側端からさらに１〜３塩基外側（３’側）の領域を意味する。特に、プローブ又はプライマー中の対応塩基は、相補鎖を形成するときの５’又は３’末端の塩基が、多型を構成する配列中の５’末端側、３’末端側又は中央に位置するように設計することができる。本発明では、中央に位置することが好ましい。さらに、対応塩基は、多型を構成する配列の周辺領域上に位置するように設計することもできる。
例えば、後述のインベーダー法において表１のＰＴＧＤＲの第１３番（配列番号３１３）に示す遺伝子多型（ＴＣＣ）を検出するためにインベーダープローブ及びアレルプローブを作製する場合は、アレルプローブについては、多型部位ＴＣＣに相当する塩基、すなわち５’側から３’側に向かって「Ｇ」、「Ｇ」又は「Ａ」がアレルプローブの対応塩基となってハイブリダイズするように設計する（図４Ｂのａ〜ｃ）。例えば、図４Ｂ（ａ）は、相補鎖を形成する最も５’側の対応塩基「Ｇ」が、多型を構成する塩基（ＴＣＣ）の中央に位置し、図４Ｂ（ｂ）は、相補鎖を形成する最も５’側の対応塩基「Ａ」が、多型を構成する塩基（ＴＣＣ）の「Ｔ」上に位置するという位置関係を示している。また、図４Ｂ（ｄ）には、アレルプローブの対応塩基が、多型部位（下線部）の周辺領域（３塩基）に位置するように設計したものが示されている。
インベーダープローブについては、３’端の塩基「Ｎ」（Ａ、Ｔ、Ｃ又はＧのいずれか）の位置が、ハイブリダイズした場合に多型部位の塩基（ＴＣＣ）のいずれかと対応する位置になるように設計する。但し、アレルプローブと１塩基重複するように設計するのが最も効果的である（図４Ｃ）。一方、もう１つの遺伝子多型であるＴＣＣ欠失の場合には、その１〜３塩基分５’側又は３’側の位置に相当する塩基をインベーダープローブ及びアレルプローブの重複塩基としてＴＣＣ欠失を考慮して（配列から欠失させて）設計すればよい。図４Ｂ（ｅ）には、欠失部位の両側２塩基がアレルプローブとハイブリダイズするようにしたものを示す。なお、ＴａｑＭａｎプローブでは、このＴＣＣのいずれかの塩基又はその欠失位置が、ＴａｑＭａｎプローブの中央となるように設計すればよい。
塩基配列の長さは、少なくとも１３塩基、好ましくは１３塩基〜６０塩基、さらに好ましくは１５〜４０塩基、最も好ましくは１８〜３０塩基となるように設計する。このオリゴヌクレオチド配列は、被検遺伝子を検出するためのプローブとして使用することができ、また、フォワード（センス）プライマー及びリバース（アンチセンス）プライマーのどちらに使用してもよい。
また、オリゴヌクレオチドは、ゲノムＤＮＡとハイブリダイズする領域とハイブリダイズしない領域とがタンデムに連結したものであってもよい。連結の順序はどちらが上流でも下流でもよい。このオリゴヌクレオチドのうちハイブリダイズする領域は、表１に記載のＳＮＰを含む配列情報から設計し、ゲノムＤＮＡとハイブリダイズする領域の最も５’側又は３’側の配列がＳＮＰとなるように作製する。上記オリゴヌクレオチドのうちハイブリダイズしない領域は、表１に記載のＳＮＰを含む配列とハイブリダイズしないように、ランダムに配列を設計する。このオリゴヌクレオチドは、主としてインベーダー法によるＳＮＰの検出に、プローブとして使用することができる。
さらに、本発明において使用されるプライマーは、表１に示す塩基配列のうち、そのＳＮＰに起因する機能変化、有効／無効の判断、副作用の有無を調べる目的で、ＰＣＲにて増幅される配列の中にＳＮＰを含むよう設計される。この場合の、プライマーの長さは、少なくとも１５塩基、好ましくは１５〜３０塩基、さらに好ましくは１８〜２４塩基の長さを有するように設計する。このときのプライマー配列は、増幅断片が１０００ｂｐ以下、好ましくは５００ｂｐ以内（例えば１２０〜５００ｂｐ）、さらに好ましくは２００ｂｐ以内（１２０〜２００）ｂｐとなるように鋳型ＤＮＡの領域から適宜選択する。
例えば、ＳＮＰの５’側又は３’側に隣接する塩基から起算して、センス又はアンチセンスのプライマーの少なくともどちらか一方が、それぞれ５’又は３’側方向に１０００ｂｐ以内、好ましくは２００ｂｐ以内、さらに好ましくは１００ｂｐ以内の領域に含まれるように設計する。
以上のように設計されたオリゴヌクレオチドプライマー又はオリゴヌクレオチドプローブは、公知の手法により化学合成することができるが、通常は、市販の化学合成装置を使用して合成される。
なお、プローブには、予め蛍光標識（例えばＦＡＭ，ＶＩＣ，Ｒｅｄｍｏｎｄ Ｄｙｅ等）を付加して作業の自動化を図ることも可能である。
５．キット
上記オリゴヌクレオチドは、遺伝子多型検出用キットに含めることができる。
本発明の遺伝子多型検出用キットは、本発明を実施するために必要な１種以上の成分を含むものである。例えば、本発明のキットは、酵素を保存若しくは供給するためのもの、及び／又は切断アッセイ（例えばインベーダーアッセイ）を実施するために必要な反応成分を含むものである。本発明のキットは、酵素、又はアッセイに必要な（好適な）成分のうち、任意の全ての成分を含むものである。そのような成分としては、限定されるものではないが、オリゴヌクレオチド、ポリメラーゼ（例えばＴａｑポリメラーゼ）、バッファー（例えばＴｒｉｓ緩衝液）、ｄＮＴＰ、コントロール用試薬（例えば、組織サンプル、ポジティブ及びネガティブコントロール用標的オリゴヌクレオチドなど）、標識用及び／又は検出用試薬（ＶＩＣ、ＦＡＭ等の蛍光色素）、固相支持体、説明書、説明図及び／又は製品情報、阻害剤、包装環境調節剤（例えば、氷、乾燥剤）などが挙げられる。また本発明のキットは、必要な成分のうちの一部のみを含む部分的キットであってもよく、その場合には、ユーザーが他の成分を用意することができる。また、本発明のキットは、各容器が使用対象の成分のうちの一部を含む、２つ以上の別個の容器を含むものであってもよい。例えば、第１の容器が酵素を含有し、第２の容器がオリゴヌクレオチドを含有するものが挙げられる。ここで、酵素は、例えば適切な保存用バッファー中又は容器内に入れられた構造特異的切断酵素などであり、オリゴヌクレオチドは、例えばインベーダーオリゴヌクレオチド、プローブオリゴヌクレオチド、コントロール用標的オリゴヌクレオチドなどである。あるいは、１種以上の反応成分を予め分配した形で提供してもよい。この場合には、本発明の方法の１ステップで使用するために予め定量して分配されているため、再度計量したり、再度分配する必要がない。また、選択した反応成分を混合して一緒に分配しておいてもよい。反応成分は、予め分配され、反応容器中に入れられていることが好ましい。反応容器としては、限定されるものではないが、反応チューブ又はウエル、あるいはマイクロタイタープレートなどが挙げられる。予め分配される反応成分は、例えば脱水又は凍結乾燥などにより、反応容器中で乾燥させておくことが特に好ましい。
６．検出
上記のようにして調製されたオリゴヌクレオチドをプライマーとし、ＤＮＡポリメラーゼを用いて受容体をコードする遺伝子（鋳型ＤＮＡ）を増幅する。あるいは、上記のようにして調製されたプローブを鋳型ＤＮＡとハイブリダイズさせて、目的の遺伝子多型を有するＤＮＡを検出する。鋳型となるＤＮＡの調製は、公知の手法、例えば塩化セシウム密度勾配超遠心法、ＳＤＳ溶解法又はフェノール・クロロホルム抽出法等により行うことができる。
（１）ＰＣＲによる検出
増幅は、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）により行うことができる。ＤＮＡポリメラーゼとしてはＬＡ Ｔａｑ ＤＮＡポリメラーゼ（Ｔａｋａｒａ）、Ｅｘ Ｔａｑポリメラーゼ（Ｔａｋａｒａ社）、Ｇｏｌｄ Ｔａｑポリメラーゼ（Ｐｅｒｋｉｎ Ｅｌｍｅｒ），ＡｍｐｌｉＴａｑ（Ｐｅｒｋｉｎ Ｅｌｍｅｒ）、Ｐｆｕ ＤＮＡポリメラーゼ（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ社）等が挙げられる。
増幅の条件は、８５℃〜１０５℃で１０秒〜４０秒、好ましくは９４℃で２０秒〜３０秒の変性工程、５０℃〜７２℃で２０秒〜１分、好ましくは６０℃で２０秒〜１分のアニーリング工程、及び６５℃〜７５℃で１分〜４分、好ましくは７２℃で２分〜３分の伸長工程を１サイクルとしてこれを３０〜４０サイクル行う。但し、鋳型ＤＮＡ及びプライマーを十分変性させるために、上記増幅サイクルの前に９５℃で１分〜５分〔但し、Ｇｏｌｄ Ｔａｑポリメラーゼ（Ｐｅｒｋｉｎ Ｅｌｍｅｒ）を使用の際は、最低８分〜１５分、好ましくは１０分から１２分〕の変性工程を加えてもよく、また、増幅されたＤＮＡを完全に伸長するために、増幅サイクルの後に７２℃で１分〜１０分の伸長工程を加えてもよい。さらに、増幅産物の検出を直ちに行わない場合は、非特異的な増幅が起こらないようにするために、増幅産物を４℃で保存する工程を加えることが好ましい。このようにして、受容体をコードする遺伝子を増幅することができる。
その後は、増幅産物についてアガロースゲル電気泳動を行い、臭化エチジウム、ＳＹＢＲ Ｇｒｅｅｎ液等により染色し、そして増幅産物を１本又は２〜３本のバンド（ＤＮＡフラグメント）として検出することにより、受容体をコードする遺伝子中の遺伝子多型を含む受容体の一部分をＤＮＡフラグメントとして検出することができる。アガロースゲル電気泳動の代わりにポリアクリルアミドゲル電気泳動、あるいはキャピラリー電気泳動を実施してもよい。また、予め蛍光色素等により標識したプライマーを用いてＰＣＲを行い、増幅産物を検出することもできる。また、マイクロプレート等の固相に増幅産物を結合させ、蛍光又は酵素反応等により検出する等、電気泳動を必要としない検出方法も採用することができる。
（２）ＴａｑＭａｎ ＰＣＲ法による検出
ＴａｑＭａｎ ＰＣＲ法は、蛍光標識したアレル特異的オリゴとＴａｑ ＤＮＡポリメラーゼによるＰＣＲ反応とを利用した方法である。ＴａｑＭａｎ ＰＣＲ法で用いるアレル特異的オリゴ（ＴａｑＭａｎプローブという）は、前記ＳＮＰ情報に基づいて設計することができる。ＴａｑＭａｎプローブの５’末端はＦＡＭやＶＩＣなどの蛍光レポーター色素Ｒによって標識されており、同時に３’末端がクエンチャーＱ（消光物質）によって標識されている。（図１）。従って、この状態ではクエンチャーが蛍光エネルギーを吸収するため蛍光は検出できない。ＴａｑＭａｎプローブの３’末端はリン酸化されているため、ＰＣＲ反応中にＴａｑＭａｎプローブからの伸長反応は起こらない（図１）。しかし、このＴａｑＭａｎプローブを、ＳＮＰを含む領域を増幅するように設計したプライマーとＴａｑ ＤＮＡポリメラーゼとともにＰＣＲ反応を行うと、次の反応が起こる。
まず、ＴａｑＭａｎプローブが鋳型ＤＮＡの特異的な配列にハイブリダイゼーションし（図２ａ）、同時にＰＣＲプライマーから伸長反応が起こる（図２ｂ）。この際、Ｔａｑ ＤＮＡポリメラーゼは５’ヌクレアーゼ活性を有しているため、ＰＣＲプライマーの伸長反応が進む際にハイブリダイゼーションしたＴａｑＭａｎプローブを切断する。ＴａｑＭａｎプローブが切断されると、蛍光色素がクエンチャーの影響を受けなくなり、蛍光を検出することができる（図２ｃ）。
例えば、図３に示すように、ＳＮＰ部位がＡのアレル（アレル１とする）と、Ｇのアレル（アレル２とする）が存在すると仮定する。アレル１に特異的なＴａｑＭａｎプローブはＦＡＭで、アレル２に特異的なＴａｑＭａｎプローブはＶＩＣで標識する（図３）。２種類のアレル特異的オリゴをＰＣＲ試薬に添加し、検出の対象となる鋳型とＴａｑＭａｎ ＰＣＲを行う。その後、蛍光検出器にてＦＡＭ及びＶＩＣの蛍光強度を測定する。その結果、アレルのＳＮＰ部位と、ＴａｑＭａｎプローブのＳＮＰに対応する部位とが相補的である場合は、プローブがアレルとハイブリダイズし、Ｔａｑポリメラーゼによりプローブの蛍光色素が切断されて、クエンチャーの影響を受けなくなり、蛍光強度が検出される。
なお、鋳型がアレル１のホモ接合体である場合はＦＡＭの強い蛍光強度を認め、ＶＩＣの蛍光はほとんど認められない。鋳型がアレル１とアレル２のヘテロ接合体である場合は、ＦＡＭとＶＩＣの両者の蛍光を検出することができる。
（３）インベーダー法によるＳＮＰの検出
インベーダー法は、アレル特異的オリゴと鋳型とをハイブリダイゼーションすることによりＳＮＰを検出する方法である。インベーダー法では、２種類の非標識オリゴと１種類の蛍光標識オリゴを用いる。２種類の非標識オリゴのうちのひとつは、アレルプローブと呼ばれるものである。アレルプローブは、ゲノムＤＮＡ（鋳型ＤＮＡ）とハイブリダイズして相補二本鎖を形成する領域と、鋳型ＤＮＡの配列とは無関係な配列であってゲノムＤＮＡとハイブリダイズしない配列の領域（フラップという）とから構成されており、ハイブリダイズする領域のうち最も５’側又は３’側の位置が、ＳＮＰに対応する塩基となっている（図４Ａ（ａ））。上記フラップ配列は、後述するフレットプローブと相補的な配列を有するオリゴヌクレオチドである。もうひとつのオリゴは、インベーダープローブと呼ばれている。このオリゴは、ＳＮＰ部位からゲノムＤＮＡの３’側方向に向かって相補的にハイブリダイズするように設計されている（図４Ａ（ｂ））。但し、ＳＮＰ部位に対応する配列（図４Ａ（ｂ）中、「Ｎ」）は任意の塩基でよい。従って、鋳型であるゲノムＤＮＡと上記２つのプローブをハイブリダイゼーションさせると、ＳＮＰ部位にインベーダープローブの１塩基（Ｎ）が割り込むように侵入し（図４Ａ（ｃ））、ＳＮＰ部位が３重鎖を形成する。
一方、蛍光標識オリゴはアレルと全く無関係な配列であり、ＳＮＰの種類によらず配列は共通である。このプローブをフレット（ＦＲＥＴ）プローブ（ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｃｅ ｒｅｓｏｎａｎｃｅ ｅｎｅｒｇｙ ｔｒａｎｓｆｅｒ ｐｒｏｂｅ）という（図５）。ＦＲＥＴプローブの５’末端の塩基（レポーター）には蛍光色素Ｒが標識されており、その上流にはクエンチャーＱが結合している。従って、この状態ではクエンチャーが蛍光色素を吸収してしまうため蛍光を検出できない。また、ＦＲＥＴプローブの５’末端（レポーター塩基）から一定領域（領域１とする）は、その領域１よりも３’側の領域と向き合って相補的な配列となるように設計されている（これを領域２という）。従って、領域１は領域２と自分自身で相補鎖を形成する（図５）。また、この相補鎖形成領域よりもさらに３’方向の領域は、アレルプローブのフラップとハイブリダイズして相補鎖を形成できるように設計されている（図５）。
インベーダー法では、ＤＮＡの特殊な構造を認識して切断する特殊なエンドヌクレアーゼ活性を有する酵素（５’ヌクレオチダーゼ）の１つであるクリーバーゼ（ｃｌｅａｖａｓｅ）を用いる。クリーバーゼは、ゲノムＤＮＡ、アレルプローブ及びインベーダープローブがＳＮＰ位置で３重になった時に、アレルプローブのＳＮＰ位置の３’側を切断する酵素である。従って、図４Ａ（ｃ）のように３つの塩基が並び、５’末端がフラップ状になっている部分を認識して、そのフラップ部分を切断する。これによって、このＳＮＰ部位の構造がクリーバーゼにより認識され（図６ａ）、フラップの部位でアレルプローブが切断されフラップ部分が遊離する（図６ｂ）。次に、アレルプローブから遊離したフラップ部分は、ＦＲＥＴプローブと相補的な配列をもつため相補結合する（図６ｃ）。このとき、フラップのＳＮＰ部位がＦＲＥＴ自身の相補結合部位に割り込んで侵入する。クリーバーゼは再びこの構造を認識して蛍光色素部分を切断する。切断された蛍光色素は、クエンチャーの影響を受けなくなり、蛍光を発する（図６ｄ）。ＳＮＰ部位がアレルプローブのＳＮＰに対応する配列とマッチしない場合は、図７のように、クリーバーゼが認識する特異的なＤＮＡ構造をとらないため、プローブは切断されず、蛍光は検出されない。
例えば、あるＳＮＰがＴ／Ｃのときに、Ｔ用のインベーダープローブ、アレルプローブ、及びＳＮＰに対応するレポーターにＦＡＭを結合させたフレットプローブ、並びにこれとは別にＣ用のインベーダープローブ、アレルプローブ、及びＳＮＰに対応するレポーターにＶＩＣを結合させたフレットプローブとを準備し、全て混合してＳＮＰ検出を行う。その結果、ＳＮＰがＴ／Ｔのホモの場合にはＦＡＭの蛍光を発し、Ｃ／Ｃのホモの場合にはＶＩＣの蛍光を発し、Ｔ／Ｃヘテロの場合にはＦＡＭとＶＩＣ両者の蛍光を発する。ＦＡＭとＶＩＣは蛍光波長が異なるため、両者を分別できることになる。蛍光色素で標識された産物は、蛍光プレートリーダー、又は反応過程で生じた蛍光データを採集するよう設定した装置（リアルタイム蛍光検出器）を用いて検出することができる。リアルタイム蛍光検出器としては、例えばＡＢＩ ７７００配列検出システム（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ社）が挙げられる。
（４）ＳｎｉＰｅｒ法による検出
ＳｎｉＰｅｒ法でＳＮＰを検出するためには、アレルの識別をＲＣＡによる増幅の有無で行うことができる。すなわち、鋳型になるべきゲノムＤＮＡを直鎖状にしておいて、このゲノムＤＮＡにプローブをハイブリダイズさせる。プローブの配列と鋳型であるゲノムＤＮＡの配列とが相補的にマッチして相補鎖を形成すると、ゲノムＤＮＡはライゲーション反応が起こって環状になることができる。その結果、環状ＤＮＡのＲＣＡが進行する。これに対し、プローブの端がゲノムＤＮＡとマッチしなければ、ライゲーションされず環状にならないため、ＲＣＡの反応は進まない。従ってＳｎｉＰｅｒ法では、ゲノムＤＮＡとアニールし、しかも環状になり得る一本鎖プローブを設計する。この一本鎖プローブをパドロックプローブという。このパドロックプローブの断端を検出目的となるＳＮＰに対応する配列にしておいて、このパドロックプローブとゲノムＤＮＡとを混ぜ、ライゲーション反応を行う。パドロックプローブの断端とゲノムＤＮＡのＳＮＰ部分が相補的であれば、ライゲーション反応によってパドロックプローブは断端がつながり環状となるが、相補的でなければ環状にならない。従って、対象となるＳＮＰに相当するパドロックプローブのみが環状となり、ＤＮＡポリメラーゼによって増幅する。ＳＮＰは、この増幅の有無を検出すればよい。検出は、両端に蛍光色素とクエンチャーをもち、ヘアピン構造を有する合成オリゴヌクレオチドを使用する。
（５）ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ／ＭＳ法による検出
ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ／ＭＳ（Ｍａｔｒｉｘ Ａｓｓｉｓｔｅｄ Ｌａｓｅｒ Ｄｅｓｏｒｐｔｉｏｎ−Ｔｉｍｅ ｏｆ Ｆｌｉｇｈｔ／Ｍａｓｓ Ｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙ）法は、質量分析計をＳＮＰタイピングに応用した方法である。この方法は、以下のステップから構成される。
（ｉ）ＳＮＰを含むＤＮＡ断片のＰＣＲ増幅及び精製
ＳＮＰ部位の塩基とＰＣＲプライマーは重複しないように設計した後ＤＮＡ断片を増幅し、増幅反応産物からエキソヌクレアーゼやアルカリホスファターゼ処理によりプライマー、ｄＮＴＰ等を除去して増幅断片を精製する。
（ｉｉ）プライマー伸長反応（サーマルサイクル）及び精製
ＰＣＲ産物である標的領域の鋳型に対して１０倍以上のプライマーを加え、サーマルサイクル反応させてプライマー伸長反応を行う。ここで使用するプライマーは、その３’末端がＳＮＰ部位の塩基に隣接するように設計する。プライマーの長さは、１５〜３０塩基、好ましくは２０〜２５塩基である。マルチプレックス反応を行う場合には、鋳型と相補的でない配列を５’末端に付加する。また、サーマルサイクルは、８５〜１０５℃（好ましくは９４℃）と３５〜４０℃（好ましくは３７℃）の２温度間で２０〜３０サイクル（好ましくは２５サイクル）行う。
得られた反応産物を、質量分析機に適した状態にするため精製キット等を用いて精製する。
（ｉｉｉ）質量分析計によるＤＮＡの質量分析
精製された伸長反応産物を質量分析機にアプライして、目的産物の質量を測定する。すなわち、精製産物をマトリックスと混合し、ＭＡＬＤＩプレートに０．５〜１．０μＬスポットする。プレートを乾燥後、試料にレーザー光を照射し、スペクトログラムを作成する。
（６）塩基配列決定法による検出
本発明においては、１塩基の伸長反応を利用した多型の検出を行うことができる。つまり、異なる蛍光化合物で標識された４種類のジデオキシヌクレオチドを、検出の対象となる遺伝子が含まれる反応系に添加し、１塩基の伸長反応を行う。この場合、伸長する塩基を多型部位としておき、また、ＤＮＡ合成の停止とＤＮＡ分子の３’末端の蛍光標識という２つの反応を操作する。４種類の反応液をシークエンシング用ゲルの同一レーンやキャピラリー上で電気泳動を行ない、ＤＮＡバンドを標識した蛍光色素の違いを蛍光検出器により検出して配列決定を行う、あるいは１塩基伸長したオリゴヌクレオチドを蛍光検出装置や質量分析装置などを用いてどの塩基が伸長したかを蛍光色素の種類の違いを利用して調べる方法である。蛍光標識ジデオキシヌクレオチドの代わりにプライマーを蛍光標識し、非標識ジデオキシヌクレオチドと共に用いることもできる。
（７）ＤＮＡマイクロアレイによる検出
ＤＮＡマイクロアレイは、支持体上にヌクレオチドプローブが固定されたものであり、ＤＮＡチップ、Ｇｅｎｅチップ、マイクロチップ、ビーズアレイなどを含む。
ＤＮＡチップなどのＤＮＡマイクロアレイアッセイとしてはＧｅｎｅＣｈｉｐアッセイが挙げられる（Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ社；米国特許第６，０４５，９９６号、同第５，９２５，５２５号、及び同第５，８５８，６５９号参照）。ＧｅｎｅＣｈｉｐ技術は、チップに貼り付けたオリゴヌクレオチドプローブの小型化高密度マイクロアレイを利用するものである。プローブアレイは、例えば固相化学合成法と半導体産業において用いられているフォトリソグラフィー製造技術とを組み合わせた光照射化学合成法（Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ社）により製造される。チップの化学反応部位の境界を明確するためにフォトリソグラフィーマスクを利用し、特定の化学合成工程を行うことによって、アレイの所定の位置にオリゴヌクレオチドプローブが貼り付けられた高密度アレイを構築することができる。マルチプルプローブアレイは、大きなガラス基板上で同時に合成する。続いてこの基板を乾燥し、個々のプローブアレイを射出成形プラスチックカートリッジに充填する。このカートリッジは、外部環境からアレイを保護し、またハイブリダイゼーションチャンバーとしても機能する。
まず、分析対象のポリヌクレオチドを単離し、ＰＣＲにより増幅し、蛍光レポーター基により標識する。続いて、流体ステーションを用いて、標識化ＤＮＡをアレイと共にインキュベートする。次にこのアレイをスキャナーに差し込み、ハイブリダイゼーションパターンを検出する。ハイブリダイゼーションのデータは、プローブアレイに結合した（すなわち標的配列に取り込まれた）蛍光レポーター基からの発光として採集する。標的配列と完全に一致したプローブは、一般的には、標的配列と一致していない部分を有するものよりも強いシグナルを生じる。アレイ上の各プローブの配列及び位置は分かっているため、相補性によって、プローブアレイと反応させた標的ポリヌクレオチドの配列を決定することができる。
また本発明においては、電子工学的に捕捉されたプローブを有するＤＮＡマイクロチップを利用することもできる（Ｎａｎｏｇｅｎ社；例えば、米国特許第６，０１７，６９６号、同第６，０６８，８１８号、及び同第６，０５１，３８０号参照）。Ｎａｎｏｇｅｎ社の技術は、マイクロエレクトロニクスを利用することによって、半導体マイクロチップ上の所定の試験部位に及びその部位から荷電分子を移動したり、濃縮したりできる。所定のＳＮＰ又は変異に特有なＤＮＡ捕捉型プローブは、マイクロチップ上の特定の部位に電子工学的に配置されるか、又はアドレス指定される。ＤＮＡは強く負に荷電しているため、正電荷領域へ電子的に移動することが可能である。
最初に、マイクロチップ上の試験部位又は試験部位の列を正電荷により電子的に活性化する。続いて、ＤＮＡプローブ含有溶液をマイクロチップ上に導入する。負に荷電したプローブは、正に荷電した部位に迅速に移動するため、マイクロチップ上のその部位にプローブが濃縮され、化学的に結合する。続いてマイクロチップを洗浄し、さらに別の異なるＤＮＡプローブ溶液を添加してＤＮＡプローブとの特異的結合を行う。
次に、被検サンプル中に標的ＤＮＡ分子が存在するか否かを分析する。この分析は、被検サンプル中の相補的ＤＮＡとハイブリダイズしたＤＮＡ捕捉型プローブの種類を判定することにより行う。ここで被検サンプルとしては、例えばＰＣＲにより増幅した検出対象の遺伝子が挙げられる。また、電荷を利用することにより、マイクロチップ上の１以上の試験部位に標的分子を移動させ、濃縮することができる。各試験部位におけるサンプルＤＮＡの電気的濃縮によって、サンプルＤＮＡとそれに対し相補的な捕捉型プローブとのハイブリダイゼーションが迅速に行われる。例えば、このような操作によりハイブリダイゼーションが数分で起こるようになる。未結合ＤＮＡ又は非特異的結合ＤＮＡを各試験部位から除去するために、その部位の極性又は電荷を陰性に逆転し、それにより未結合ＤＮＡ又は非特異的結合ＤＮＡを溶液中に戻すことができる。この方法においては、例えばレーザーを利用した蛍光スキャナーを用いて特異的結合を検出することができる。
さらに、本発明においては、表面張力の違いによる平面（チップ）上での流体の分離現象を利用したアレイ技術も利用可能である（ＰｒｏｔｏＧｅｎｅ社；例えば、米国特許第６，００１，３１１号、同第５，９８５，５５１号、及び同第５，４７４，７９６号参照）。Ｐｒｏｔｏｇｅｎｅ社の技術は、化学的被膜により付与される表面張力の違いによって、流体が平面上で分離するという事実に基づいている。オリゴヌクレオチドプローブは、上述のような原理に基づいて分離させることができるため、プローブを含む試薬をインクジェットプリントすることによりチップ上で直接合成することができる。表面張力により規定される反応部位を有するアレイを、１セット（４つ）の圧電性ノズル下に配置されたＸ／Ｙ移動ステージ上に載せる。各圧電性ノズルには、それぞれ４種の標準的なＤＮＡ塩基が含有されている。この移動ステージはアレイの各列に沿って移動し、適切な試薬（例えばアミダイト）を各反応部位に供給する。アレイの表面全体を、アレイの反応部位に共通の試薬及び洗浄液に浸漬し、その後回転させることによりこれらの溶液を除去する。
検出対象のＳＮＰ又は変異に特有なＤＮＡプローブをＰｒｏｔｏｇｅｎｅ社の技術を利用してチップに貼り付ける。続いて、チップを、ＰＣＲで増幅した検出対象遺伝子と接触させる。ハイブリダイゼーション後、未結合ＤＮＡを除去し、任意の適切な方法を利用してハイブリダイゼーションを検出する。
さらに、「ビーズアレイ」を利用して多型を検出することができる（Ｉｌｌｕｍｉｎａ社；例えば、ＰＣＴ国際公開ＷＯ ９９／６７６４１号及び同ＷＯ ００／３９５８７号参照）。Ｉｌｌｕｍｉｎａ社は、光ファイバー束と、アレイに自己会合するビーズとを組み合わせたビーズアレイ技術を利用している。各光ファイバー束は、その束の直径に応じて数百万のファイバーを含有する。ビーズは、所定のＳＮＰ又は変異の検出に特異的なオリゴヌクレオチドにより被覆する。各種所定量のビーズを混ぜて、アレイに特異的なプールを形成させる。アッセイを行うために、ビーズアレイと調製済みの被験者サンプルとを接触させる。そして、ハイブリダイゼーションを任意の適切な方法により検出する。
７．薬物の評価
本発明においては、前記のようにして得られる一塩基多型等の検出結果から、当該受容体を介した薬物の有効性及び安全性を評価することができる。
薬物の評価は、タイピングシステムにより行うことができる。すなわち、上記いずれかの検出手法に従って、毒性（副作用）発現群と非発現群のアレル頻度を比較する。両者を比較した際、アレル頻度に差が生じるものを毒性発現認識のためのマーカーとして選出する。統計学的検定は、通常χ２検定によるが、例えばＦｉｓｈｅｒ検定などの他の統計処理を行うこともできる。なお、この結果を、リガンドと受容体との結合活性やその結合活性に対する薬物の阻害作用の強さ、当該受容体を有する細胞などをリガンドで刺激した際の細胞応答およびその作用に対する薬物の詐害活性、当該受容体の発現量をリガンド結合量や該当する抗受容体抗体などの結合量などに反映させることも可能である。当該全ての遺伝子多型に関して、作用あるいは毒性との因果関係を調べ、相関のあった遺伝子多型部位のみを選出する。その全ての遺伝子多型解析用プローブ又はプライマーと各手法に応じた試薬を、反応プレート、カード又はガラス基盤等に予め用意し、そこに予測したいヒトのゲノムＤＮＡを添加し、反応させることで、アレルパターンを調べることができる。作用又は毒性と相関する遺伝子多型を有する場合には、そのヒトの作用発現又は副作用発現予測が可能となる。薬物の有効性についても同様である。また、薬物の違いにより、副作用又は有効性と相関する遺伝子多型も異なるので、それぞれに関して、当該遺伝子多型を用いてタイピング操作を行えば、有効性や副作用の予測をすることが可能となる。
このことを利用して、その遺伝子多型頻度と有効／無効又は副作用の有／無を比較し、アレル頻度に差がある時に判定することが可能となる。
例えば、薬物Ａの投与によってある毒性（副作用）を示した者のＳＮＰを解析した結果、統計的に全体の９０％がＴ／Ｔを持つ者（例えばＦＡＭの蛍光強度を検出）であることが判明し、毒性（副作用）を示さなかった者のＳＮＰを解析した結果、Ｔ／Ｔを持つ者は全体の１０％にすぎず、Ｃ／Ｃを持つものが９０％を占めたことが判明したとすると、ＳＮＰ解析の結果、Ｔ／Ｔを持つ者は薬物Ａの投与はできないと評価することができる。
８．薬物のスクリーニング
本発明において前記の通り得られた遺伝子多型情報は、被験者から採取した当該受容体をコードする遺伝子又はその相補配列の遺伝子多型情報と比較することにより、当該受容体に作用する薬物、すなわち受容体を介した薬物の有効性及び安全性を解析するための指標として利用される。上記多型情報を用いて、薬物の有効性、安全性に関する個体差を解析することも可能である。従って、本発明において得られた遺伝子多型情報は、どの薬物が治療に最も有効であるか、その使用すべき薬物及び／又はその用量を選択するための情報源となる。
手法としては「７．薬物の評価」に記載の評価方法を利用すればよい。つまり、前項で副作用又は有効性と相関が認められた遺伝子多型は、その受容体へのリガンド結合能、受容体の情報伝達能、転写・翻訳に由来する受容体発現量に影響を与えるものであるといえる。また、副作用又は有効性の発現機構と間接的であっても何らかの因果関係があるといえる。ある薬物の感受性は、製薬会社などにおいて前臨床又は臨床試験にて調査・確認される。よって、それらの酵素遺伝子中に存在する遺伝子多型の中に重篤な副作用と相関する多型がある場合にはこれを削除すること、あるいは条件付きで使用することが可能となる。また、有効性についても同様である。この副作用と有効性の情報から薬物のスクリーニングが可能となる。
さらに、臨床試験（第Ｉ〜ＩＩＩ相試験）において副作用発現症例のボランティアと副作用非発現症例の遺伝子多型頻度解析を行うことで、前記した以外に副作用や有効性と相関する新たな遺伝子多型を検出することが可能となる。これを、上記と同様に調べることで薬物のスクリーニングが可能となる。
発明を実施するための最良の形態
以下、実施例により本発明をさらに具体的に説明する。但し、本発明はこれら実施例にその技術的範囲が限定されるものではない。
〔実施例１〕ＳＮＰ情報の取得
（１）ＤＮＡ抽出
血縁関係のない４８人からＥＤＴＡ存在下に採血を行った。ＤＮＡの抽出は、ゲノム解析ラボマニュアル（中村祐輔編 シュプリンガー・フェアラーク東京）の方法に従って以下の通り行った。
血液１０ｍｌを５０ｍｌのファルコンチューブに移し、室温で３０００ｒｐｍ、５分間遠心を行った。ピペットにて上清（血清）を採取した後、ＲＢＣ溶解バッファー（１０ｍＭ ＮＨ４ＨＣＯ３，１４４ｍＭ ＮＨ３Ｃｌ）を３０ｍｌ加えた。沈殿がほぐれるまで混和した後、室温で２０分放置した。室温で３０００ｒｐｍ、５分間遠心を行った後、ピペットにて上清（血清）を捨て、白血球のペレットを得た。ＲＢＣ溶解バッファーを３０ｍｌ加え、同様の操作をさらに２回行った。白血球のペレットにＰｒｏｔｅｉｎａｓｅ Ｋバッファー（５０ｍＭ Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ（ｐＨ７．４），１００ｍＭ ＮａＣｌ，１ｍＭ ＥＤＴＡ（ｐＨ８．０））を４ｍｌ、１０％ ＳＤＳを２００μｌ、１０ｍｇ／ｍｌ Ｐｒｏｔｅｉｎａｓｅ Ｋを２００μｌ加え、転倒混和した後、３７℃で一晩静置した。フェノールを４ｍｌ加え、ローテーター（Ｒｏｔａｔｏｒ Ｔ−５０，Ｔａｉｔｅｃ）にて４時間ゆっくりと転倒混和した。室温で３０００ｒｐｍ、１０分間遠心を行い、上層を新しいチューブに回収した。４ｍｌのフェノール−クロロホルム−イソアミルアルコール（容積比２５：２４：１）を加え、同様に２時間転倒混和した後、遠心した。上層を新しいチューブに回収し、４ｍｌのクロロホルム−イソアミルアルコール（容積比２４：１）を加え、同様に３０分転倒混和した後、遠心した。上層を新しいチューブに回収し、８Ｍ酢酸アンモニウム４００μｌ、イソプロパノール４ｍｌを加え、転倒混和した。糸状の白色析出物（ＤＮＡ）を２ｍｌ容のチューブに回収し、７０％エタノールを１ｍｌ加え、転倒混和した。新しい２ｍｌ容のチューブにＤＮＡを回収し風乾した後、ＴＥ溶液（１０ｍＭ Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ（ｐＨ７．４），１ｍＭ ＥＤＴＡ（ｐＨ７．４））を５００μｌ加え、溶解後、ゲノムＤＮＡサンプルとした。
（２）ＰＣＲ
ゲノムシークエンスは、ＧｅｎＢａｎｋ ＤＮＡデータベースから得た。ＲｅｐＭａｓｋコンピュータプログラムを用い、リピート配列を除いた後、ＰＣＲ産物が１ｋｂ前後になるようにＰＣＲプライマーを設計した。ゲノムＤＮＡは、同濃度に調製した血縁関係のない４８人のＤＮＡを使用した。それぞれ３人分のＤＮＡを１本のチューブに同量混ぜ、このうち６０ｎｇをＰＣＲに使用した。ＰＣＲは、Ｅｘ−Ｔａｑ（２．５Ｕ；ＴａＫａＲａ）を使用し、ＧｅｎｅＡｍｐ ＰＣＲ Ｓｙｓｔｅｍ ９７００（ＰＥ Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）を用いて行った。９４℃で２分間反応後、９４℃で３０秒の変性、６０℃又は５５℃で３０秒のアニーリング、７２℃で１分の伸長を行い、これを１サイクルとして３５サイクル行った。
（３）シークエンス
ＰＣＲ産物は、Ａｒｒａｙｌｔ（Ｔｅｌｅｃｈｅｍ）を使用し精製を行った後、ＢｉｇＤｙｅ Ｔｅｒｍｉｎａｔｏｒ ＲＲ Ｍｉｘ（ＰＥ Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）を用い、シークエンス反応を行った。ＧｅｎｅＡｍｐ ＰＣＲ Ｓｙｓｔｅｍ ９７００（ＰＥ Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）を用い、９６℃で２分間反応後、９６℃で２０秒の変性、５０℃で３０秒のアニーリング、６０℃で４分の伸長を行い、これを１サイクルとして２５サイクル行った。シークエンス反応後、ＡＢＩ ＰＲＩＳＭ ３７００ ＤＮＡ Ａｎａｌｙｚｅｒにてシークエンス解析を行った。
（４）ＳＮＰの検出
ＳＮＰの検出には、ＰｏｌｙＰｈｒｅｄコンピュータープログラム（Ｎｉｃｋｅｒｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，１９９７，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．，２５，２７４５−２７５１）を使用し、解析を行った。
（５）結果
表１に示すＳＮＰの結果が得られた。また、解析を行った受容体名とその略号、データベース（ＧｅｎＢａｎｋ）のＡＣＣＥＳＳＩＯＮ番号、受容体の遺伝子の構造とＳＮＰｓの存在位置を図９〜７３に示した。図９〜７３において、エキソンは水平線で表示した遺伝子上に白抜きのボックス又は黒の線で示した。ＳＮＰｓの存在位置は、遺伝子の上側に実線で示し、番号を付した。また、図９〜４０及び図４９〜７３において、ＳＮＰ以外の他の多型の存在位置は、遺伝子の下側に実線で示し、番号を付した。
産業上の利用可能性
本発明により、ＳＮＰの解析方法が提供される。本発明の方法により、目的の疾患に応じた薬物の選択をすることが可能となるため、本発明の方法は極めて有用である。
配列表フリーテキスト
配列番号２１：ｎはｔの１０〜１２回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号２２：ｎはｇ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号２３：ｎはａ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号２４：ｎはｃａの８〜１０回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号２５：ｎはｇａｃｔの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号２７：ｎはａの８〜９回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号４３：ｎはｃの８〜１０回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号４４：ｎはｃ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号４５：ｎはａ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号４６：ｎはａの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号８５：ｎはａ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号８６：ｎはｇの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号８８：ｎはａａａｃの６〜１１回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号８９：ｎはａの９〜１２回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号９０：ｎはｔの１１〜１３回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号９１：ｎはｔの１０〜１４回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号９２：ｎはｔの２０〜２６回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号９３：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号９４：ｎはｃｔの４〜６回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号９５：ｎはａの１０〜１２回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号９６：ｎはｇの７〜１１回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号１２９：ｎはｔｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１３０：ｎはｇａの１０〜１１回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号１３１：ｎはｔｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１３２：ｎはｔの１９〜２２回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号１３３：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１３４：ｎはａの１５〜１８回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号１３５：ｎはａの７〜８回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号１６９：ｎはｇ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１７０：ｎはｇ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１７１：ｎはａの１２〜１４回の繰り返し又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１７２：ｎはｔの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号１７４：ｎはｔの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号１７６：ｎはａ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１７７：ｎはｇ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１７８：ｎはｇ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１９０：ｎはｇｔの５〜１４回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号１９１：ｎはａの９〜１１回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号１９６：ｎはｔｇの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号１９８：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１９９：ｎはａｃの７〜８回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号２１９：ｎはｃ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号２２０：ｎはｔｔの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号２２２：ｎはｇａの３〜３０及びｇｔの３〜３０の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号２３１：ｎはｔの１２〜１４回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号２４９：ｎはｇｃａｇ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号２５０：ｎはｃａ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号２５１：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号２５２：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号２５３：ｎはａの１２〜１５回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号２５４：ｎはｔの１０〜１２回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号２５５：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号２５６：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号２９５：ｎはｃ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号２９６：ｎはａｇ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号２９７：ｎはｃの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号２９９：ｎはｔｔｃｃ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号３００：ｎはｃ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号３１３：ｎはｔｃｃ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号３１４：ｎはａの１０〜１１回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号３１５：ｎはｔｃａｇｇ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号３１６：ｎはｔの１１〜１２回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号３３０：ｎはｇｇ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号３３１：ｎはｔｇの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号３３３：ｎはｔの７〜８の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号３４４：ｎはｃの６〜９の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号３４５：ｎはａ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号３４６：ｎはｔの９〜１０の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号３４７：ｎはａ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号３４８：ｎはｃ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号３４９：ｎはｔｔｔａ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号３５０：ｎはａの１２〜１４の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号４７８：ｎはａｃｔｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号４７９：ｎはｃａの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号４８１：ｎはｔの７〜８の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号４８２：ｎはｃ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号４８３：ｎはｔの１１〜１３の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号４８４：ｎはｔの１０〜１２の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号４８５：ｎはａ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号４８６：ｎはｔの１０〜１２の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号４８７：ｎはｔの８〜９の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号４８８：ｎはａａｔｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号４８９：ｎはｔの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号４９１：ｎはａｔの９〜１１の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号４９２：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号４９３：ｎはｃａｃｔの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号４９５：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号４９６：ｎはｇａａ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号４９７：ｎはｔの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号４９９：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号５００：ｎはａ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号５０１：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号５０２：ｎはａの１０〜１５の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号５０３：ｎはａ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号５０４：ｎはａの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号５０６：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号５３６：ｎはｔの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号５３８：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号５３９：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号５４０：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号５４１：ｎはｔの２１〜３７の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号５４２：ｎはａの２１〜２８の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号５４３：ｎはｔの８〜１０の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号５４４：ｎはａの９〜１３の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号５４５：ｎはｔの９〜１１の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号５７９：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号５８０：ｎはｃａ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号５８１：ｎはａの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号５８３：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号５８４：ｎはａｇ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号５８５：ｎはｔの１２〜１５の繰り返し又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号５８６：ｎはｔの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号５８８：ｎはａａａの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号５９０：ｎはｃの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号５９２：ｎはｃｃｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号５９３：ｎはｇの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号５９５：ｎはａａｔｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号６２８：ｎはｇａｔの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号６３０：ｎはｔの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号６３５：ｎはｔの１２〜１５の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号６３６：ｎはａの２２〜２６の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号６５７：ｎはｔの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号６５９：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号６６０：ｎはｇｔｃｃａｃｔａａａの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号６６２：ｎはｇｔｃｃａｃｔａａａｔｇａｔｔｇａｔａａｔｔｇの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号６６３：ｎはｔｇａｔｔｇａｔａａｔｔｇの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号６６４：ｎはａ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号６６５：ｎはｔの１６〜１８の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号６６６：ｎはｇ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号６７０：ｎはａ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号６７９：ｎはａの１１〜１３の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号６８０：ｎはｔの１０〜１２の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号６８１：ｎはａの１９〜２４の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号６８２：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号６８３：ｎはｔの１５〜２２の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号６８４：ｎはａの７〜９の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号６８５：ｎはａの２０〜２８の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号６９３：ｎはａの１１〜１４の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号６９４：ｎはｃの１０〜１３の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号６９６：ｎはａの１８〜２１の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号６９７：ｎはａの１０〜１２の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号６９８：ｎはａａａａｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号６９９：ｎはｇａａａｔの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号７０６：ｎはａの１８〜２４の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号７１２：ｎはｇ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号７２５：ｎはａの１５〜１７の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号７２６：ｎはｇｔの１５〜２１の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号７２７：ｎはｇ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号７２８：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号７２９：ｎはａの９〜１１の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号７３１：ｎはｔの２〜４の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号７３３：ｎはｔａａｇ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号７３９：ｎはｃｔｔｔの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号７４２：ｎはｔの８〜９の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号７４６：ｎはｔａｇａｃａｔｔｔｃｔｔａ又はｇｔａｇｃを表す（存在位置２１）。
配列番号７４７：ｎはａの４〜５の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号７５３：ｎはｔｇ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号７６２：ｎはａｔの８〜９の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号７７７：ｎはｔの８〜１０の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号７７９：ｎはｃａの６〜７の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号７８１：ｎはｇｔｔａｃ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号７９８：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号８０８：ｎはａｔの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号８１０：ｎはａｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号８１２：ｎはｔの１１〜１８の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号８１７：ｎはａの８〜９の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号８１８：ｎはｇｔｇｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号８２１：ｎはａの８〜９の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号８２３：ｎはｔの１０〜１２の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号８２４：ｎはｔの８〜９の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号８３３：ｎはｔの６〜７の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号８３５：ｎはｇｔの１３〜１５の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号８４５：ｎはｔの１１〜１３の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号８４６：ｎはａ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号８５１：ｎはａの６〜７の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号８５９：ｎはｃｃｔの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号８７０：ｎはｔの８〜９の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号８７６：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号８７７：ｎはｃａｇｇｇｇｃｔｃの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号８７９：ｎはａの１０〜１１の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号８８６：ｎはｃ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号８９７：ｎはｃｔｃｃｃｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号８９８：ｎはｔの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号９００：ｎはｔｔｔｔｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号９０１：ｎはｃｃの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号９０３：ｎはａｇａａａｔｔｔｃｔａｇｃｔｇｃｃｔｇｃａｔｔｔｃｔａｇｃａｇｃｃｃａの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号９１３：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号９４９：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号９５０：ｎはｇｔｔの８〜９の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号９５２：ｎはｃ又は欠失を表す（存在位置２５）。
配列番号９６４：ｎはｔｔ又は欠失を表す（存在位置３４）
配列番号９７１：ｎはｃ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号９７２：ｎはｔｔの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号９７４：ｎはｇａの３〜３０の繰り返し並びにｇｔの３〜３０の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号９７５：ｎはｇ又は欠失を表す（存在位置２１）
配列番号９８２：ｎはａの７〜８の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号１００５：ｎはｇ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１００６：ｎはｇ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１００７：ｎはａの１２〜１４の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号１００８：ｎはｔの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号１０１０：ｎはａｃの７〜８の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号１０２８：ｎはｔの１２〜１５の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号１０３１：ｎはａの１１〜１３の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号１０３２：ｎはｔの１０〜１２の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号１０３３：ｎはａの１９〜２４の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号１０３５：ｎはａの１１〜１４の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号１０３６：ｎはａの１８〜２１の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号１０４３：ｎはａの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号１０５９：ｎはｃａの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号１０６７：ｎはａａｃ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１０６８：ｎはａａｃ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１０７９：ｎはｔの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号１０８１：ｎ（存在位置２１）はａｃｃｔｇｔａｇｃｇｃｔｇｃｇｃｔａｃｃｃａａを、ｎ（存在位置２２）はｇａｔｇの挿入又は欠失を表す。
配列番号１０８２：ｎはｇａｔｇの挿入又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１０８３：ｎ（存在位置２０）はａｃｃｔｇｔａｇｃｇｃｔｇｃｇｃｔａｃｃｃａａの挿入を、ｎ（存在位置２１）はｇａｔｇの挿入又は欠失を表す。
配列番号１０８４：ｎはａｃｃｔｇｔａｇｃｇｃｔｇｃｇｃｔａｃｃｃａａの挿入を表す（存在位置２０）。
配列番号１０８９：ｎはｔｔｔｔｃａａｔｔａｇｇｃａａ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１０９０：ｎはａ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１０９１：ｎはｔｔｔｃｔｔｔｔｃａｃａａ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１０９３：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１０９４：ｎはｇ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１１０１：ｎはｔの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号１１０５：ｎはｇの挿入又は欠失を表す（存在位置２３）。
配列番号１１０７：ｎはｔの挿入を表す（存在位置３２）。
配列番号１１１０：ｎ（存在位置１９）はｃ又はｇの挿入を、ｎ（存在位置２１）はｇ又は欠失を表す。
配列番号１１１１：ｎ（存在位置１０）はｔ又はｇの挿入を、ｎ（存在位置２１）はｔの挿入を表す。
配列番号１１１２：ｎはｔ又はｇの挿入を表す（存在位置１０）。
配列番号１１１３：ｎはａ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１１１７：ｎはｃ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１１２３：ｎはｇｃｃｃａｇｃｔｇｇ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１１４３：ｎはａの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号１１６１：ｎはａ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１１６２：ｎはｔｔｃｃｔｔｃｃａｃ又は欠失を表す（存在位置２１）。
【図面の簡単な説明】
図１は、ＴａｑＭａｎプローブを示す図である。
図２は、ＴａｑＭａｎ ＰＣＲ法の概要を示す図である。
図３は、蛍光色素を付したプローブを示す図である。
図４Ａは、インベーダー法の概要を示す図である。
図４Ｂは、インベーダープローブとアレルプローブとの位置関係を示す図である。
図４Ｃは、インベーダープローブとアレルプローブとの位置関係を示す図である。
図５は、フレットプローブを示す図である。
図６は、インベーダー法の概要を示す図である。
図７は、アレルとマッチしないプローブを示す図である。
図８は、ライゲーション反応によるアレルの識別の概要を示す図である。
図９は、ＣＤ２０：ＣＤ２０ａｎｔｉｇｅｎ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＰ００１０３４．４
図１０は、ＣＤ３３：ＣＤ３３ ａｎｔｉｇｅｎ（ｇｐ６７）遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０６３９７７．５
図１１は、ＣＳＦ３Ｒ：Ｃｏｌｏｎｙ ｓｔｉｍｕｌａｔｉｎｇ ｆａｃｔｏｒ ３ ｒｅｃｅｐｔｏｒ（ｇｒａｎｕｌｏｃｙｔｅ）遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＬ４４５２４５．３
図１２は、ＩＬ１Ｒ１：Ｉｎｔｅｒｌｅｕｋｉｎ １ ｒｅｃｅｐｔｏｒ，ｔｙｐｅ Ｉ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ００７２７１．３
図１３は、ＩＬ１Ｒ２：Ｉｎｔｅｒｌｅｕｋｉｎ １ ｒｅｃｅｐｔｏｒ，ｔｙｐｅ ＩＩ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ００５０３５．１，ＡＣ００７１６５．３
図１４は、ＩＬ２Ｒ：Ｉｎｔｅｒｌｅｕｋｉｎ ２ ｒｅｃｅｐｔｏｒ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＬ１５７３９５．１６，ＡＬ１３７１８６．１８
図１５は、ＨＥＲ２：ｃ−ｅｒｂ−Ｂ−２遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０７９１９９．３
図１６は、ＩＦＮＡＲ１：Ｉｎｔｅｒｆｅｒｏｎ（ａｌｐｈａ，ｂｅｔａ ａｎｄ ｏｍｅｇａ）ｒｅｃｅｐｔｏｒ １ 遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＰ００１７１６．１
図１７は、ＰＧＲ：Ｐｒｏｇｅｓｔｅｒｏｎｅ ｒｅｃｅｐｔｏｒ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０２０７３５．５
図１８は、ＡＣＴＨ：Ｍｅｌａｎｏｃｏｒｔｉｎ ２ ｒｅｃｅｐｔｏｒ（ＭＣ２Ｒ）遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＰ００１０８６．４とＹ１０２５９．１
図１９は、ＩＣＡＭ１：Ｉｎｔｅｒｃｅｌｌｕｌａｒ ａｄｈｅｓｉｏｎ ｍｏｌｅｃｕｌｅ １（ＣＤ５４），ｈｕｍａｎ ｒｈｉｎｏｖｉｒｕｓ ｒｅｃｅｐｔｏｒ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０１１５１１．９
図２０は、ＶＣＡＭ１：Ｖａｓｃｕｌａｒ ｃｅｌｌ ａｄｈｅｓｉｏｎ ｍｏｌｅｃｕｌｅ １遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＬ１５７７１５．５
図２１は、ＩＴＧＢ２：Ｌｅｕｋｏｃｙｔｅ Ｉｎｔｅｇｒｉｎ，ｂｅｔａ ２（ａｎｔｉｇｅｎ ＣＤ１８（ｐ９５），ｌｙｍｐｈｏｃｙｔｅ ｆｕｎｃｔｉｏｎ−ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ ａｎｔｉｇｅｎ １；ｍａｃｒｏｐｈａｇｅ ａｎｔｉｇｅｎ １（ｍａｃ−１）ｂｅｔａ ｓｕｂｕｎｉｔ）遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＬ１６３３００．２
図２２は、ＰＴＧＤＲ：Ｐｒｏｓｔａｇｌａｎｄｉｎ Ｄ２ ｒｅｃｅｐｔｏｒ（ＤＰ）遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＬ３５５８３３．４
図２３は、ＰＴＧＥＲ１：Ｐｒｏｓｔａｇｌａｎｄｉｎ Ｅ ｒｅｃｅｐｔｏｒ １（ｓｕｂｔｙｐｅ ＥＰ１），４２ｋＤ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ００８５６９．６
図２４は、ＰＴＧＥＲ２：Ｐｒｏｓｔａｇｌａｎｄｉｎ Ｅ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ２（ｓｕｂｔｙｐｅ ＥＰ２），５３ｋＤ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＬ３６５４７５．１
図２５は、ＰＴＧＥＲ３：ｐｒｏｓｔａｇｌａｎｄｉｎ Ｅ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ３遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＬ０３１４２９．１１，ＡＬ１５８０８７．１１
図２６は、ＰＴＧＦＲ：Ｐｒｏｓｔａｇｌａｎｄｉｎ Ｆ ｒｅｃｅｐｔｏｒ（ＦＰ）遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＬ１３６３２４．６
図２７は、ＧＮＡ１２：Ｔｈｒｏｍｂｏｘａｎｅ Ａ２ ｒｅｃｅｐｔｏｒ／Ｇ ｐｒｏｔｅｉｎ ａｌｐｈａ １２遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ００６０２８．３
図２８は、ＴＢＸＡ２Ｒ：Ｔｈｒｏｍｂｏｘａｎｅ Ａ２ ｒｅｃｅｐｔｏｒ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ００５１７５．１
図２９は、ＢＬＴＲ２：Ｓｅｖｅｎ ｔｒａｎｓｍｅｍｂｒａｎｅ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ＢＬＴＲ２；ｌｅｕｋｏｔｒｉｅｎｅ Ｂ４ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ＢＬＴ２遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＬ０９６８７０．５
図３０は、ＣＹＳＬＴ１：Ｃｙｓｔｅｉｎｙｌ ｌｅｕｋｏｔｒｉｅｎｅ ｒｅｃｅｐｔｏｒ １遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＬ４４５２０２．２
１
図３１は、ＣＹＳＬＴ２：Ｃｙｓｔｅｉｎｙｌ ｌｅｕｋｏｔｒｉｅｎｅ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ２遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＬ１３７１１８．２０
図３２は、ＰＴＡＦＲ：Ｐｌａｔｅｌｅｔ−ａｃｔｉｖａｔｉｎｇ ｆａｃｔｏｒ ｒｅｃｅｐｔｏｒ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０２７４２１．３
図３３は、ＢＤＫＲＢ１：Ｂｒａｄｙｋｉｎｉｎ ｒｅｃｅｐｔｏｒ Ｂ１遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＬ３５５１０２．５
図３４は、ＢＤＫＲＢ２：Ｂｒａｄｙｋｉｎｉｎ ｒｅｃｅｐｔｏｒ Ｂ２遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＦ３７８５４２．２
図３５は、ＡＤＲＢ１：Ａｄｒｅｎｅｒｇｉｃ，ｂｅｔａ−１−，ｒｅｃｅｐｔｏｒ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ００５８８６．２
図３６は、ＡＤＲＢ２：Ａｄｒｅｎｅｒｇｉｃ，ｂｅｔａ−２−，ｒｅｃｅｐｔｏｒ，ｓｕｒｆａｃｅ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０１１３３４．４
図３７は、ＨＲＨ１：ｈｉｓｔａｍｉｎｅ Ｈ１ ｒｅｃｅｐｔｏｒ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０２０７５０．３
図３８は、ＨＲＨ２：ｈｉｓｔａｍｉｎｅ Ｈ２ ｒｅｃｅｐｔｏｒ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＢ０２３４８６．１
図３９は、ＨＲＨ３：ｈｉｓｔａｍｉｎｅ Ｈ３ ｒｅｃｅｐｔｏｒ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＬ０７８６３３．３
２
図４０は、ＨＴＲ３Ａ：５−ｈｙｄｒｏｘｙｔｒｙｐｔａｍｉｎｅ（ｓｅｒｏｔｏｎｉｎ）ｒｅｃｅｐｔｏｒ ３Ａ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＰ００１８７４．３
図４１は、ＡＧＴＲ１：Ａｎｇｉｏｔｅｎｓｉｎ ｒｅｃｅｐｔｏｒ １遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０２４８９７．２３
図４２は、ＡＧＴＲＬ１：Ａｎｇｉｏｔｅｎｓｉｎ ｒｅｃｅｐｔｏｒ−ｌｉｋｅ １遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＰ００１７８６．４
図４３は、ＡＧＴＲ２：Ａｎｇｉｏｔｅｎｓｉｎ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ２遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０６９４８０．２
図４４は、ＡＶＰＲ１Ａ：Ａｒｇｉｎｉｎｅ ｖａｓｏｐｒｅｓｓｉｎ ｒｅｃｅｐｔｏｒ １Ａ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０２５５２５．３
図４５は、ＡＶＰＲ２：ａｒｇｉｎｉｎｅ ｖａｓｏｐｒｅｓｓｉｎ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ２遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：Ｕ５２１１２．１
図４６は、ＰＴＧＩＲ：Ｐｒｏｓｔａｇｌａｎｄｉｎ Ｉ２（ｐｒｏｓｔａｃｙｃｌｉｎ）ｒｅｃｅｐｔｏｒ（ＩＰ）遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０２５９８３．３
図４７は、ＤＲＤ１：Ｄｏｐａｍｉｎｅ ｒｅｃｅｐｔｏｒ Ｄ１遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０９１３９３．１
図４８は、ＩＴＧＡ２Ｂ：Ｉｎｔｅｇｒｉｎ，ａｌｐｈａ ２ｂ（ｐｌａｔｅｌｅｔ ｇｌｙｃｏｐｒｏｔｅｉｎ ＩＩｂ ｏｆ ＩＩｂ／ＩＩＩａ ｃｏｍｐｌｅｘ，ａｎｔｉｇｅｎ ＣＤ４１Ｂ）遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０１９１５２．５
図４９は、ＦＯＬＲ１：Ｆｏｌａｔｅ Ｒｅｃｅｐｔｏｒ １遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：Ｕ２０３９１．１
図５０は、ＴＮＦＲ１：Ｔｕｍｏｒ ｎｅｃｒｏｓｉｓ ｆａｃｔｏｒ ｒｅｃｅｐｔｏｒ １遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ００６０５７．５
図５１は、ＡＤＯＲＡ２Ａ：Ａｄｅｎｏｓｉｎｅ Ａ２ Ｒｅｃｅｐｔｏｒ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＰ０００３５５．１
図５２は、ＡＶＰＲ１Ｂ：アルギニンバソプレッシン受容体１Ｂ（Ａｒｇｉｎｉｎｅ Ｖａｓｏｐｒｅｓｓｉｎ Ｒｅｃｅｐｔｏｒ １Ｂ）の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＦ１５２２３８．１
図５３は、ＭＣ２Ｒ：Ｍｅｌａｎｏｃｏｒｔｉｎ ２ Ｒｅｃｅｐｔｏｒ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＰ００１０８６．４とＹ１０２５９．１
図５４は、ＡＤＯＲＡ１：Ａｄｅｎｏｓｉｎｅ Ａ１ ｒｅｃｅｐｔｏｒ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ１０５９４０．２
図５５は、ＡＤＯＲＡ２Ｂ：Ａｄｅｎｏｓｉｎｅ Ａ２ｂ ｒｅｃｅｐｔｏｒ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ００６２５１．３
図５６は、ＡＤＯＲＡ３：Ａｄｅｎｏｓｉｎｅ Ａ３ ｒｅｃｅｐｔｏｒ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＬ３９０１９５．１０
図５７は、ＡＤＲＡ１Ａ：Ａｄｒｅｎｅｒｇｉｃ，ａｌｐｈａ−１Ａ−，ｒｅｃｅｐｔｏｒ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０２５７１２．４
図５８は、ＡＤＲＡ２Ａ：Ａｄｒｅｎｅｒｇｉｃ，ａｌｐｈａ−２Ａ−，ｒｅｃｅｐｔｏｒ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＬ１５８１６３．１１
図５９は、ＡＤＲＡ２Ｂ：Ａｄｒｅｎｅｒｇｉｃ，ａｌｐｈａ−２Ｂ−，ｒｅｃｅｐｔｏｒ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０９２６０３．２
図６０は、ＥＤＧ１：Ｅｎｄｏｔｈｅｌｉａｌ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｔｉｏｎ，ｓｐｈｉｎｇｏｌｉｐｉｄ Ｇ−ｐｒｏｔｅｉｎ−ｃｏｕｐｌｅｄ ｒｅｃｅｐｔｏｒ，１遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＬ１０９７４１．１９
図６１は、ＥＤＧ４：Ｅｎｄｏｔｈｅｌｉａｌ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｔｉｏｎ，ｌｙｓｏｐｈｏｓｐｈａｔｉｄｉｃ ａｃｉｄ Ｇ−ｐｒｏｔｅｉｎ−ｃｏｕｐｌｅｄ ｒｅｃｅｐｔｏｒ，４遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０１１４５８．７
図６２は、ＥＤＧ５：Ｅｎｄｏｔｈｅｌｉａｌ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｔｉｏｎ，ｓｐｈｉｎｇｏｌｉｐｉｄ Ｇ−ｐｒｏｔｅｉｎ−ｃｏｕｐｌｅｄ ｒｅｃｅｐｔｏｒ，５遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０１１５１１．１２
図６３は、ＧＰＲ１：Ｇ ｐｒｏｔｅｉｎ−ｃｏｕｐｌｅｄ ｒｅｃｅｐｔｏｒ １遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ００７３８３．４
図６４は、ＧＰＲ２：Ｇ ｐｒｏｔｅｉｎ−ｃｏｕｐｌｅｄ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ２遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０２７１４６．１
図６５は、ＧＰＲ３：Ｇ ｐｒｏｔｅｉｎ−ｃｏｕｐｌｅｄ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ３遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＬ０９６７７４．９
図６６は、ＧＰＲ４：Ｇ ｐｒｏｔｅｉｎ−ｃｏｕｐｌｅｄ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ４遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０１１４８０．３
図６７は、ＭＣ１Ｒ：Ｍｅｌａｎｏｃｏｒｔｉｎ １ ｒｅｃｅｐｔｏｒ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０９２１４３．３
図６８は、ＭＣ３Ｒ：Ｍｅｌａｎｏｃｏｒｔｉｎ ３ ｒｅｃｅｐｔｏｒ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＬ１３９８２４．２２
図６９は、ＭＣ４Ｒ：Ｍｅｌａｎｏｃｏｒｔｉｎ ４ ｒｅｃｅｐｔｏｒ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０９１５７６．１１
図７０は、ＯＸＴＲ：Ｏｘｙｔｏｃｉｎ ｒｅｃｅｐｔｏｒ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＦ１７６３１５．２
図７１は、ＳＳＴＲ１：Ｓｏｍａｔｏｓｔａｔｉｎ ｒｅｃｅｐｔｏｒ １遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＬ４５０１０９．３
図７２は、ＳＳＴＲ３：Ｓｏｍａｔｏｓｔａｔｉｎ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ３ 遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：Ｚ８２１８８．２
図７３は、ＧＰＲ１０：Ｇ ｐｒｏｔｅｉｎ−ｃｏｕｐｌｅｄ ｒｅｃｅｐｔｏｒ １０遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０６７８９５．２
本発明は、遺伝子多型情報、遺伝子多型情報の検出方法、遺伝子多型を用いた薬物の評価方法、及び薬物のスクリーニング方法に関する。
背景技術
ヒトの姿形が千差万別であるように、３０億からなる遺伝暗号も個人間で比較するとかなり多くの部位で異なっている。この遺伝暗号の違いを遺伝子多型（ポリモルフィズム）と呼んでおり、代表的な遺伝子多型として一塩基多型が知られている。
一塩基多型（ＳＮＰ：ｓｉｎｇｌｅ ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ）とは、個人間における１遺伝暗号の違いを意味する。ヒトの顔貌や体型が千差万別であるように、遺伝暗号である塩基配列も一人ひとりかなり多くの部位で異なっている。ＳＮＰは、その存在する位置によってｃＳＮＰ（ｃｏｄｉｎｇ ＳＮＰ）とｇＳＮＰ（ｇｅｎｏｍｅ ＳＮＰ）に分類され、ｃＳＮＰには、さらにｓＳＮＰ（ｓｉｌｅｎｔ ＳＮＰ）、ｒＳＮＰ（ｒｅｇｕｌａｔｏｒｙ ＳＮＰ）及びｉＳＮＰ（ｉｎｔｒｏｎ ＳＮＰ）が含まれる。
上記ＳＮＰは、多型マーカーとしての疾患の発症や増悪に関連する遺伝子を見つけるために有用であり、最終的に臨床分野において疾患のリスク診断や薬剤の使い分けなどに直接関係する。また、疾患の原因となっている物質を標的分子とした証拠に基づく薬剤開発は、世界的趨勢となっている。ある疾患に対して薬剤を投与した場合、患者の応答性は様々であり、著効を示すもの、有効性の低いもの、全く効果を示さないもののように、薬剤に対する応答性には大きな違いがある。これは、症状が同じで同じ診断名であっても、その背景となっている疾患を起こしている経路が異なっていたり、あるいは薬剤の受容体への結合能やその受容体の情報伝達能、受容体そのものの発現量などが大きく異なっている可能性があるからである。従って、ＳＮＰなど遺伝子多型を参考にしながら、目的の疾患に応じた薬物の選択、治療法の開発（いわゆるオーダーメイド医療）が望まれる。
薬剤に対する応答性に加えて、時には致死的となるような強い副作用の問題も、医療従事者が対処していかなければならない大きな問題の一つである。これは、処方ミスなどによる過剰投与がなくても、時には思わぬ致死的な副作用に遭遇することがある。従って、薬剤の応答性に対しては、薬剤の代謝、薬剤の輸送のみならず、薬剤のレセプターの薬剤応答性や副作用に関連する受容体の感受性における個体差を、ＳＮＰなどの遺伝子多型を参考にしながら決定することが望まれる。
発明の開示
本発明は、遺伝子多型情報の検出方法とその情報に基づく薬物の有効性並びに安全性を評価するための方法、及び薬物のスクリーニング方法を提供することを目的とする。
本発明者は、上記課題を解決するため鋭意研究を行った結果、受容体をコードする遺伝子中の遺伝子多型を見出し、これを用いて薬物の感受性とその薬物が標的としないであろうと思われていた受容体を介した副作用の発現を評価する方法の確立に成功し、本発明を完成するに至った。
すなわち、本発明は以下の通りである。
（１）受容体をコードする遺伝子若しくはその相補配列中に存在する多型部位を含むように、又は受容体をコードする遺伝子及びその相補配列の少なくとも一方を増幅したときの増幅断片中に前記多型部位が含まれるように、オリゴヌクレオチドプローブ及び／又はオリゴヌクレオチドプライマーを作製し、得られるオリゴヌクレオチドプローブ及び／又はオリゴヌクレオチドプライマーを用いて、目的の受容体をコードする遺伝子中の少なくとも１個の遺伝子多型を検出することを特徴とする遺伝子多型の検出方法。
（２）受容体をコードする遺伝子若しくはその相補配列中に存在する多型部位を含むように、又は受容体をコードする遺伝子及びその相補配列の少なくとも一方を増幅したときの増幅断片中に前記多型部位が含まれるように、オリゴヌクレオチドプローブ及び／又はオリゴヌクレオチドプライマーを作製し、得られるオリゴヌクレオチドプローブ及び／又はオリゴヌクレオチドプライマーを用いて、目的の受容体をコードする遺伝子中の少なくとも１個の遺伝子多型を検出することを特徴とする遺伝子多型の検出方法であって、前記多型部位が、配列番号１〜１１６８に示す塩基配列又はその相補配列中に存在する少なくとも一つであることを特徴とする、前記方法。
（３）受容体をコードする遺伝子若しくはその相補配列中に存在する多型部位を含むように、又は受容体をコードする遺伝子及びその相補配列の少なくとも一方を増幅したときの増幅断片中に前記多型部位が含まれるように、オリゴヌクレオチドプローブ及び／又はオリゴヌクレオチドプライマーを作製し、得られるオリゴヌクレオチドプローブ及び／又はオリゴヌクレオチドプライマーを用いて、目的の受容体をコードする遺伝子中の少なくとも１個の遺伝子多型を検出することを特徴とする遺伝子多型の検出方法であって、前記オリゴヌクレオチドプローブ及び／又はオリゴヌクレオチドプライマーが、配列番号１〜１１６８に示す塩基配列のうち多型部位を含む少なくとも１３塩基の配列又はこれに相補的な配列を有するものからなる群から選択される少なくとも１つである前記方法。
この場合のオリゴヌクレオチドプローブ及び／又はオリゴヌクレオチドプライマーの長さとしては、１３〜６０塩基のものが挙げられる。
（４）上記（１）〜（３）の方法において、多型部位の情報としては表１に示すもの（例えば表１に示す配列番号１〜１１６８の配列情報）を使用することができる。また、多型部位を含むオリゴヌクレオチドプローブ及び／又はオリゴヌクレオチドプライマーとしては、その５’末端若しくは３’末端又は中央の塩基が当該多型部位となるように作製されたものが挙げられる。受容体をコードする遺伝子又はその相補配列とハイブリダイズし得る断片とハイブリダイズしない断片とが結合したものであって、前記多型部位が、当該ハイブリダイズし得る断片の５’末端又は３’末端となるようなオリゴヌクレオチドプローブも、多型部位を含むオリゴヌクレオチドプローブとして本発明に含まれる。
本発明の方法において、多型の種類は限定されるものではなく、例えば、一塩基多型、複数個の塩基の欠失、置換若しくは挿入による多型、又はＶＮＴＲ若しくはマイクロサテライトによる多型が挙げられる。
（５）上記（１）〜（４）のいずれかの方法により得られた検出結果から、当該受容体を介する薬物の有効性及び安全性を評価することを特徴とする薬物の評価方法。
（６）上記（１）〜（４）のいずれかの方法により得られた検出結果から、当該受容体を介する薬物の感受性の程度を評価することを特徴とする薬物の評価方法。
（７）上記（５）又は（６）の評価方法により得られた評価を指標として、使用すべき薬物を選択することを特徴とする薬物の選択方法。
（８）受容体をコードする遺伝子又はその相補配列中の多型情報と、被験者から採取した当該受容体をコードする遺伝子又はその相補配列中の多型情報とを比較して、当該受容体を介して起こる薬物の有効性及び／又は安全性に関する個体差を解析し、得られる解析結果から使用すべき薬物及び／又はその用量を選択することを特徴とする薬物の選択方法。
（９）上記（１）〜（４）の検出方法、（５）〜（６）の評価方法又は（７）〜（８）の選択方法において、受容体としては、ＣＤ２０、ＣＤ３３、ＣＳＦ３Ｒ、ＩＬ１Ｒ１、ＩＬ１Ｒ２、ＩＬ２Ｒ、ＨＥＲ２、ＩＦＮＡＲ１、ＰＧＲ、ＡＣＴＨ、ＩＣＡＭ１、ＶＣＡＭ１、ＩＴＧＢ２、ＰＴＧＤＲ、ＰＴＧＥＲ１、ＰＴＧＥＲ２、ＰＴＧＥＲ３、ＰＴＧＦＲ、ＧＮＡ１２、ＴＢＸＡ２Ｒ、ＢＬＴＲ２、ＣＹＳＬＴ１、ＣＹＳＬＴ２、ＰＴＡＦＲ、ＢＤＫＲＢ１、ＢＤＫＲＢ２、ＡＤＲＢ１、ＡＤＲＢ２、ＨＲＨ１、ＨＲＨ２、ＨＲＨ３、ＨＴＲ３Ａ、ＡＧＴＲ１、ＡＧＴＲＬ１、ＡＧＴＲ２、ＡＶＰＲ１Ａ、ＡＶＰＲ２、ＰＴＧＩＲ、ＤＲＤ１、ＩＴＧＡ２Ｂ、ＦＯＬＲ１、ＴＮＦＲ１、ＡＤＯＲＡ１、ＡＤＯＲＡ２Ａ、ＡＤＯＲＡ２Ｂ、ＡＤＯＲＡ３、ＡＶＰＲ１Ｂ、ＡＤＲＡ１Ａ、ＡＤＲＡ２Ａ、ＡＤＲＡ２Ｂ、ＥＤＧ１、ＥＤＧ４、ＥＤＧ５、ＧＰＲ１、ＧＰＲ２、ＧＰＲ３、ＧＰＲ４、ＧＰＲ１０、ＭＣ１Ｒ、ＭＣ２Ｒ、ＭＣ３Ｒ、ＭＣ４Ｒ、ＯＸＴＲ、ＳＳＴＲ１及びＳＳＴＲ３からなる群から選択される少なくとも１つが挙げられる。
（１０）受容体をコードする遺伝子又はその相補配列中に存在する多型部位を含むように作製されたオリゴヌクレオチド。
（１１）ＣＤ２０、ＣＤ３３、ＣＳＦ３Ｒ、ＩＬ１Ｒ１、ＩＬ１Ｒ２、ＩＬ２Ｒ、ＨＥＲ２、ＩＦＮＡＲ１、ＰＧＲ、ＡＣＴＨ、ＩＣＡＭ１、ＶＣＡＭ１、ＩＴＧＢ２、ＰＴＧＤＲ、ＰＴＧＥＲ１、ＰＴＧＥＲ２、ＰＴＧＥＲ３、ＰＴＧＦＲ、ＧＮＡ１２、ＴＢＸＡ２Ｒ、ＢＬＴＲ２、ＣＹＳＬＴ１、ＣＹＳＬＴ２、ＰＴＡＦＲ、ＢＤＫＲＢ１、ＢＤＫＲＢ２、ＡＤＲＢ１、ＡＤＲＢ２、ＨＲＨ１、ＨＲＨ２、ＨＲＨ３、ＨＴＲ３Ａ、ＡＧＴＲ１、ＡＧＴＲＬ１、ＡＧＴＲ２、ＡＶＰＲ１Ａ、ＡＶＰＲ２、ＰＴＧＩＲ、ＤＲＤ１、ＩＴＧＡ２Ｂ、ＦＯＬＲ１、ＴＮＦＲ１、ＡＤＯＲＡ１、ＡＤＯＲＡ２Ａ、ＡＤＯＲＡ２Ｂ、ＡＤＯＲＡ３、ＡＶＰＲ１Ｂ、ＡＤＲＡ１Ａ、ＡＤＲＡ２Ａ、ＡＤＲＡ２Ｂ、ＥＤＧ１、ＥＤＧ４、ＥＤＧ５、ＧＰＲ１、ＧＰＲ２、ＧＰＲ３、ＧＰＲ４、ＧＰＲ１０、ＭＣ１Ｒ、ＭＣ２Ｒ、ＭＣ３Ｒ、ＭＣ４Ｒ、ＯＸＴＲ、ＳＳＴＲ１及びＳＳＴＲ３からなる群から選択されるいずれかの受容体をコードする遺伝子又はその相補配列中に存在する多型部位を含むように作製されたオリゴヌクレオチド。
（１２）上記（１０）〜（１１）のオリゴヌクレオチドは、例えば、その５’末端若しくは３’末端又は中央の塩基が、当該多型部位となるように作製される。また、多型部位を含む上記オリゴヌクレオチドは、受容体をコードする遺伝子又はその相補配列とハイブリダイズし得る断片とハイブリダイズしない断片とが結合したものであって、前記多型部位が、当該ハイブリダイズし得る断片の５’末端又は３’末端となるように作製することもできる。
本発明のさらに具体的なオリゴヌクレオチドとしては、配列番号１〜１１６８に示す塩基配列又はその相補配列中に存在する少なくとも一つの多型部位を含むオリゴヌクレオチドが挙げられる。これらのオリゴヌクレオチドは、１３〜３５塩基の長さを有するものであってもよく、配列番号１〜１１６８に示すいずれかの塩基配列のうち第２１番目の塩基を含む少なくとも１３塩基の配列又はこれに相補的な配列からなるオリゴヌクレオチドであってもよい。また、配列番号１〜１１６８に示される塩基配列又はこれに相補的な塩基配列からなる群から選択されるオリゴヌクレオチドも本発明に含まれる。
（１３）配列番号１〜１１６８に示すいずれかの塩基配列又はその相補配列中の多型部位が含まれるゲノムＤＮＡ領域において、当該多型部位から５’及び／又は３’側に向かってそれぞれ１０００ｂｐ以内に設計され、かつ、１３〜６０塩基の長さを有するオリゴヌクレオチド。
（１４）上記（１２）〜（１３）に示すオリゴヌクレオチドが支持体に固定されたマイクロアレイ。
（１５）上記（１２）〜（１３）に示すオリゴヌクレオチド及び／又は（１４）に示すマイクロアレイを含む遺伝子多型検出用キット。
以下、本発明を詳細に説明する。
本発明は、受容体に関する遺伝子多型情報を用いて、被検対象の遺伝子多型を検出する方法に関する。また、本発明は、当該受容体を介して起こる薬物の有効性及び安全性の有無又は強弱を解析することを特徴とし、この解析結果により、疾患と薬物との関係を評価するものである。複数人が同じ疾患に罹患している場合であっても、受容体の遺伝子多型情報は個々の患者ごとに異なることが多い。従って、その異なる遺伝子多型情報から薬物に対する受容体感受性の違いを導き、どのような遺伝子多型情報を有する場合に特定の薬物の有効性が認められるのか又は認められないのか、また、どのような遺伝子多型情報を有する場合に副作用が出やすいのか又は出にくいのか、その薬物の有効性及び／又は安全性を評価する。その結果、ある疾患に対してどのような薬物を使用すべきなのか、遺伝子多型情報からそれぞれの患者ごとに適した投薬（オーダーメイド医療）が可能となる。
１．遺伝子多型
遺伝子多型には、一塩基多型、インサーション／デリーション型多型、及び塩基配列の繰り返し数が異なっていることにより生じる多型が含まれる。一塩基多型（ＳＮＰ）とは、一般にはある遺伝子又はその相補鎖（相補配列）領域における特定の１個の塩基が他の塩基に置換することによる多型を意味するが、本発明においては、上記置換による多型のほか、当該１個の塩基が欠失したことによる多型、当該１個の塩基にさらに１個の塩基が挿入したことによる多型も含めることとする。
また、インサーション／デリーション型多型とは、複数の塩基（例えば２個〜数十塩基）が欠失や挿入をしていることによる多型をいい、数百塩基〜数千塩基が欠失や挿入されているものも存在する。さらに、塩基配列の繰り返し数が異なっていることにより生じる多型は２〜数十塩基の配列が繰り返されており、その繰り返し回数が個人間で異なっているものをいう。繰り返しの単位が数塩基から数十塩基のものをＶＮＴＲ（ｖａｒｉａｂｌｅ ｎｕｍｂｅｒ ｏｆ ｔａｎｄｅｍ ｒｅｐｅａｔ）といい、２〜４塩基単位程度のものをマイクロサテライト多型という。ＶＮＴＲやマイクロサテライト多型においては、この繰り返し回数の違いが個々人のアレル（対立遺伝子）で異なることにより、バリエーションを獲得している。
ここで、遺伝子多型情報は、遺伝子中の多型情報と、その相補配列中の多型情報との双方を含むものである。また、「相補鎖」又は「相補配列」とは、塩基対合則の関係を有するポリヌクレオチドである。例えば、「５’−Ａ−Ｇ−Ｔ−３’」配列は「３’−Ｔ−Ｃ−Ａ−５’」配列に対し相補的である。相補性は、部分的に、すなわちポリヌクレオチド中においてある程度の数の塩基のみが塩基対合則により一致しているようなものであってもよく、全体が完全に相補的であってもよい。このような相補性の程度は、ハイブリダイゼーションの効率及び強度に有意に影響を及ぼす。これは、増幅反応、及びポリヌクレオチド間の結合による検出方法において特に重要である。
ヌクレオチド配列の相補性は、１つの配列の５’末端が他の配列の３’末端と対合するようにヌクレオチド配列を並べた場合に、オリゴヌクレオチドの配列が「逆並行の関係」にあることを意味する。相補性が完全である必要はなく、二重らせんはミスマッチ塩基対又は一致していない塩基を含んでいても安定である。当業者であれば、例えばオリゴヌクレオチドの長さ、オリゴヌクレオチドの塩基組成及び配列、イオン強度、並びにミスマッチ塩基対の存在などを考慮して経験的に二重らせんの安定性を決定することが可能である。
２．受容体
「受容体」とは、ホルモン、オータコイド、神経伝達物質などの特異的なリガンドに応答する受容器の総称である。代表的なものとしては細胞膜や核内受容体が知られている。医薬品の一部はこの受容体へのリガンドの結合を阻害又は拮抗するか、あるいは、リガンドと同様に受容体に結合し、その受容体が司る情報伝達を刺激するものである。そのため、受容体へのリガンドの結合能、その情報伝達能、あるいは受容体そのものの発現量が遺伝子多型によって影響を受ける場合には、薬物の効果又は副作用に個体差が生じる。
本発明において、遺伝子多型解析の対象となる遺伝子により発現される受容体としては、以下のものが挙げられる。
ＣＤ２０、ＣＤ３３、ＣＳＦ３Ｒ、ＩＬ１Ｒ１、ＩＬ１Ｒ２、ＩＬ２Ｒ、ＨＥＲ２、ＩＦＮＡＲ１、ＰＧＲ、ＡＣＴＨ、ＩＣＡＭ１、ＶＣＡＭ１、ＩＴＧＢ２、ＰＴＧＤＲ、ＰＴＧＥＲ１、ＰＴＧＥＲ２、ＰＴＧＥＲ３、ＰＴＧＦＲ、ＧＮＡ１２、ＴＢＸＡ２Ｒ、ＢＬＴＲ２、ＣＹＳＬＴ１、ＣＹＳＬＴ２、ＰＴＡＦＲ、ＢＤＫＲＢ１、ＢＤＫＲＢ２、ＡＤＲＢ１、ＡＤＲＢ２、ＨＲＨ１、ＨＲＨ２、ＨＲＨ３、ＨＴＲ３Ａ、ＡＧＴＲ１、ＡＧＴＲＬ１、ＡＧＴＲ２、ＡＶＰＲ１Ａ、ＡＶＰＲ２、ＰＴＧＩＲ、ＤＲＤ１、ＩＴＧＡ２Ｂ、ＦＯＬＲ１、ＴＮＦＲ１、ＡＤＯＲＡ１、ＡＤＯＲＡ２Ａ、ＡＤＯＲＡ２Ｂ、ＡＤＯＲＡ３、ＡＶＰＲ１Ｂ、ＡＤＲＡ１Ａ、ＡＤＲＡ２Ａ、ＡＤＲＡ２Ｂ、ＥＤＧ１、ＥＤＧ４、ＥＤＧ５、ＧＰＲ１、ＧＰＲ２、ＧＰＲ３、ＧＰＲ４、ＧＰＲ１０、ＭＣ１Ｒ、ＭＣ２Ｒ、ＭＣ３Ｒ、ＭＣ４Ｒ、ＯＸＴＲ、ＳＳＴＲ１及びＳＳＴＲ３
受容体は、各々特異的なリガンドによる情報伝達のみを制御する受容器である。
（１） ＣＤ２０はＣＤ２０抗原の受容体である。
（２） ＣＤ３３はＣＤ３３抗原の受容体である。
（３） ＣＳＦ３Ｒはコロニー刺激因子３（Ｃｏｌｏｎｙ ｓｔｉｍｕｌａｔｉｎｇ ｆａｃｔｏｒ ３）の受容体である。
（４） ＩＬ１Ｒ１はインターロイキン１（Ｉｎｔｅｒｌｅｕｋｉｎ １の受容体である。
（５） ＩＬ１Ｒ２はインターロイキン１（Ｉｎｔｅｒｌｅｕｋｉｎ １）の受容体である。
（６） ＩＬ２Ｒはインターロイキン２（Ｉｎｔｅｒｌｅｕｋｉｎ ２）の受容体である。
（７） ＨＥＲ２はｃ−ｅｒｂ−Ｂ−２の受容体である。
（８） ＩＦＮＡＲ１はインターフェロンα、β又はω（Ｉｎｔｅｒｆｅｒｏｎ（ａｌｐｈａ，ｂｅｔａ ａｎｄ ｏｍｅｇａ））の受容体である。
（９） ＰＧＲはプロゲステロン（Ｐｒｏｇｅｓｔｅｒｏｎｅ）の受容体である。
（１０） ＡＣＴＨはメラノコルチン２（Ｍｅｌａｎｏｃｏｒｔｉｎ ２）の受容体である。
（１１） ＩＣＡＭ１はヒト細胞内接着分子１（Ｉｎｔｅｒｃｅｌｌｕｌａｒ ａｄｈｅｓｉｏｎ ｍｏｌｅｃｕｌｅ １（ＣＤ５４），ｈｕｍａｎ）の受容体である。
（１２） ＶＣＡＭ１は血管細胞接着分子１（Ｖａｓｃｕｌａｒ ｃｅｌｌ ａｄｈｅｓｉｏｎ ｍｏｌｅｃｕｌｅ １）の受容体である。
（１３） ＩＴＧＢ２はインテグリンβ２（抗原ＣＤ１８（ｐ９５），リンパ球機能関連抗原１；マクロファージ抗原１（Ｍａｃ−１）βサブユニット）（Ｉｎｔｅｇｒｉｎ，ｂｅｔａ ２（ａｎｔｉｇｅｎ ＣＤ１８（ｐ９５），ｌｙｍｐｈｏｃｙｔｅ ｆｕｎｃｔｉｏｎ−ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ ａｎｔｉｇｅｎ １；ｍａｃｒｏｐｈａｇｅ ａｎｔｉｇｅｎ １（ｍａｃ−１）ｂｅｔａ ｓｕｂｕｎｉｔ））の受容体である。
（１４） ＰＴＧＤＲはプロスタグランジンＤ２（Ｐｒｏｓｔａｇｌａｎｄｉｎ Ｄ２）の受容体である。
（１５） ＰＴＧＥＲ１はプロスタグランジンＥ１（Ｐｒｏｓｔａｇｌａｎｄｉｎ Ｅ１）の受容体である。
（１６） ＰＴＧＥＲ２はプロスタグランジンＥ２（Ｐｒｏｓｔａｇｌａｎｄｉｎ Ｅ２）の受容体である。
（１７） ＰＴＧＥＲ３はプロスタグランジンＥ３（Ｐｒｏｓｔａｇｌａｎｄｉｎ Ｅ３）の受容体である。
（１８） ＰＴＧＦＲはプロスタグランジンＦ（Ｐｒｏｓｔａｇｌａｎｄｉｎ Ｆ）の受容体である。
（１９） ＧＮＡ１２はトロンボキサンＡ２（Ｔｈｒｏｍｂｏｘａｎｅ Ａ２）の受容体である。
（２０） ＴＢＸＡ２ＲはトロンボキサンＡ２（Ｔｈｒｏｍｂｏｘａｎｅ Ａ２）の受容体である。
（２１） ＢＬＴＲ２はロイコトリエンＢ４（ｌｅｕｋｏｔｒｉｅｎｅ Ｂ４）の受容体である。
（２２） ＣＹＳＬＴ１はシステイニルロイコトリエン（Ｃｙｓｔｅｉｎｙｌ ｌｅｕｋｏｔｒｉｅｎｅ）の受容体である。
（２３） ＣＹＳＬＴ２は、システイニルロイコトリエンの受容体である。
（２４） ＰＴＡＦＲは血小板活性化因子（Ｐｌａｔｅｌｅｔ−ａｃｔｉｖａｔｉｎｇ ｆａｃｔｏｒ）受容体である。
（２５） ＢＤＫＲＢ１はブラジキニン（Ｂｒａｄｙｋｉｎｉｎ）の受容体である。
（２６） ＢＤＫＲＢ２はブラジキニン（Ｂｒａｄｙｋｉｎｉｎ）の受容体である。
（２７） ＡＤＲＢ１はカテコールアミンβ−１（Ｃａｔｅｃｈｏｌａｍｉｎｅ ｂｅｔａ−１）の受容体である。
（２８） ＡＤＲＢ２はカテコールアミンβ−２（Ｃａｔｅｃｈｏｌａｍｉｎｅ ｂｅｔａ−２）の受容体である。
（２９） ＨＲＨ１はヒスタミンＨ１（ｈｉｓｔａｍｉｎｅ Ｈ１）受容体である。
（３０） ＨＲＨ２はヒスタミンＨ２（ｈｉｓｔａｍｉｎｅ Ｈ２）受容体である。
（３１） ＨＲＨ３はヒスタミンＨ３（ｈｉｓｔａｍｉｎｅ Ｈ３）受容体である。
（３２） ＨＴＲ３Ａは５−ヒドロキシトリプタミン（セロトニン）（５−ｈｙｄｒｏｘｙｔｒｙｐｔａｍｉｎｅ（ｓｅｒｏｔｏｎｉｎ））の受容体である。
（３３） ＡＧＴＲ１はアンジオテンシン受容体１（Ａｎｇｉｏｔｅｎｓｉｎ ｒｅｃｅｐｔｏｒ １）である。
（３４） ＡＧＴＲＬ１はアンジオテンシン（Ａｎｇｉｏｔｅｎｓｉｎ）様の受容体である。
（３５） ＡＧＴＲ２はアンジオテンシン（Ａｎｇｉｏｔｅｎｓｉｎ）の受容体である。
（３６） ＡＶＰＲ１Ａはアルギニンバソプレッシン（Ａｒｇｉｎｉｎｅ ｖａｓｏｐｒｅｓｓｉｎ）の受容体である。
（３７） ＡＶＰＲ２はアルギニンバソプレッシン（Ａｒｇｉｎｉｎｅ ｖａｓｏｐｒｅｓｓｉｎ）の受容体である。
（３８） ＰＴＧＩＲはプロスタグランジンＩ２（プロスタサイクリン）（Ｐｒｏｓｔａｇｌａｎｄｉｎ Ｉ２）（ｐｒｏｓｔａｃｙｃｌｉｎ）の受容体である。
（３９） ＤＲＤ１はドーパミン（Ｄｏｐａｍｉｎｅ）の受容体である。
（４０） ＩＴＧＡ２Ｂはインテグリンα２ｂ（血小板糖タンパク質ＩＩｂ／ＩＩＩａ複合体のＩＩｂ，抗原ＣＤ４１Ｂ）（（Ｉｎｔｅｇｒｉｎ，ａｌｐｈａ ２ｂ）（ｐｌａｔｅｌｅｔ ｇｌｙｃｏｐｒｏｔｅｉｎ ＩＩｂ ｏｆ ＩＩｂ／ＩＩＩａ ｃｏｍｐｌｅｘ，ａｎｔｉｇｅｎ ＣＤ４１Ｂ））である。
（４１） ＦＯＬＲ１は葉酸受容体１（Ｆｏｌａｔｅ ｒｅｃｅｐｔｏｒ １）である。
（４２） ＴＮＦＲ１は腫瘍壊死因子受容体１（Ｔｕｍｏｒ ｎｅｃｒｏｓｉｓ ｆａｃｔｏｒ ｒｅｃｅｐｔｏｒ １）である。アクセッション番号：ＡＣ００６０５７．５
（４３） ＡＤＯＲＡ１はアデノシンＡ１受容体（Ａｄｅｎｏｓｉｎｅ Ａ１ ｒｅｃｅｐｔｏｒ）である。
（４４） ＡＤＯＲＡ２ＡはアデノシンＡ２受容体（Ａｄｅｎｏｓｉｎｅ Ａ２ ｒｅｃｅｐｔｏｒ）である。
（４５） ＡＤＯＲＡ２ＢはアデノシンＡ２Ｂ受容体（Ａｄｅｎｏｓｉｎｅ Ａ２Ｂ ｒｅｃｅｐｔｏｒ）である。
（４６） ＡＤＯＲＡ３はアデノシンＡ３受容体（Ａｄｅｎｏｓｉｎｅ Ａ３ ｒｅｃｅｐｔｏｒ）である。
（４７） ＡＶＰＲ１Ｂはアルギニンバソプレッシン受容体１Ｂ（Ａｒｇｉｎｉｎｅ Ｖａｓｏｐｒｅｓｓｉｎ ｒｅｃｅｐｔｏｒ １Ｂ）である。
（４８） ＡＤＲＡ１Ａはアドレナリンα１Ａ受容体（Ａｄｒｅｎｅｒｇｉｃ ａｌｐｈａ−１Ａ ｒｅｃｅｐｔｏｒ）である。
（４９） ＡＤＲＡ２Ａはアドレナリンα２Ａ受容体（Ａｄｒｅｎｅｒｇｉｃ ａｌｐｈａ−２Ａ ｒｅｃｅｐｔｏｒ）である。
（５０） ＡＤＲＡ２Ｂはアドレナリンα２Ｂ受容体（Ａｄｒｅｎｅｒｇｉｃ ａｌｐｈａ−２Ｂ ｒｅｃｅｐｔｏｒ）である。
（５１） ＥＤＧ１は内皮分化スフィンゴリピドＧタンパク質共役受容体１（Ｅｎｄｏｔｈｅｌｉａｌ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｔｉｏｎ，ｓｐｈｉｎｇｏｌｉｐｉｄ Ｇ−ｐｒｏｔｅｉｎ−ｃｏｕｐｌｅｄ ｒｅｃｅｐｔｏｒ，１）である。
（５２） ＥＤＧ４は内皮分化スフィンゴリピドＧタンパク質共役受容体４（Ｅｎｄｏｔｈｅｌｉａｌ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｔｉｏｎ，ｓｐｈｉｎｇｏｌｉｐｉｄ Ｇ−ｐｒｏｔｅｉｎ−ｃｏｕｐｌｅｄ ｒｅｃｅｐｔｏｒ，４）である。
（５３） ＥＤＧ５は内皮分化スフィンゴリピドＧタンパク質共役受容体５（Ｅｎｄｏｔｈｅｌｉａｌ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｔｉｏｎ，ｓｐｈｉｎｇｏｌｉｐｉｄ Ｇ−ｐｒｏｔｅｉｎ−ｃｏｕｐｌｅｄ ｒｅｃｅｐｔｏｒ，５）である。
（５４） ＧＰＲ１はＧタンパク質共役受容体１（Ｇ ｐｒｏｔｅｉｎ−ｃｏｕｐｌｅｄ ｒｅｃｅｐｔｏｒ １）である。
（５５） ＧＰＲ２はＧタンパク質共役受容体２（Ｇ ｐｒｏｔｅｉｎ−ｃｏｕｐｌｅｄ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ２）である。
（５６） ＧＰＲ３はＧタンパク質共役受容体３（Ｇ ｐｒｏｔｅｉｎ−ｃｏｕｐｌｅｄ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ３）である。
（５７） ＧＰＲ４はＧタンパク質共役受容体４（Ｇ ｐｒｏｔｅｉｎ−ｃｏｕｐｌｅｄ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ４）である。
（５８） ＧＰＲ１０はＧタンパク質共役受容体１０（Ｇ ｐｒｏｔｅｉｎ−ｃｏｕｐｌｅｄ ｒｅｃｅｐｔｏｒ １０）である。
（５９） ＭＣ１Ｒはメラノコルチン１受容体（Ｍｅｌａｎｏｃｏｒｔｉｎ １ ｒｅｃｅｐｔｏｒ）である。
（６０） ＭＣ２Ｒはメラノコルチン２受容体（Ｍｅｌａｎｏｃｏｒｔｉｎ ２ ｒｅｃｅｐｔｏｒ）である。
（６１） ＭＣ３Ｒはメラノコルチン３受容体（Ｍｅｌａｎｏｃｏｒｔｉｎ ３ ｒｅｃｅｐｔｏｒ）である。
（６２） ＭＣ４Ｒはメラノコルチン４受容体（Ｍｅｌａｎｏｃｏｒｔｉｎ ４ ｒｅｃｅｐｔｏｒ）である。
（６３） ＯＸＴＲはオキシトシン受容体（Ｏｘｙｔｏｃｉｎ ｒｅｃｅｐｔｏｒ）である。
（６４） ＳＳＴＲ１はソマトスタチン受容体１（Ｓｏｍａｔｏｓｔａｔｉｎ ｒｅｃｅｐｔｏｒ １）である。
（６５） ＳＳＴＲ３はソマトスタチン受容体３（Ｓｏｍａｔｏｓｔａｔｉｎ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ３）である。
３．遺伝子多型情報
遺伝子多型情報は、一般的遺伝子多型検出法を利用して得ることができる。例えば、シークエンス法、ＰＣＲによる方法、断片長多型アッセイ、アレル特異的オリゴヌクレオチドを鋳型としてハイブリダイゼーションを行う方法（例えばＴａｑＭａｎ ＰＣＲ法、インベーダー法、ＤＮＡチップ法）、プライマー伸長反応を利用する方法、シークエンス法、ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ／ＭＳ法、ＤＮＡチップ法等が採用される。ＰＣＲ法やシークエンス法はいずれの遺伝子多型の検出法にも使用することができ、他の方法は、主としてＳＮＰの検出法に使用することができる。
ＴａｑＭａｎ ＰＣＲ法とは、蛍光標識したアレル特異的オリゴとＴａｑ ＤＮＡポリメラーゼによるＰＣＲ反応とを利用した方法である（Ｌｉｖａｋ，Ｋ．Ｊ．Ｇｅｎｅｔ．Ａｎａｌ．１４，１４３（１９９９）；Ｍｏｒｒｉｓ Ｔ．ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｃｌｉｎ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．３４，２９３３（１９９６））。インベーダー法とは、ＳＮＰのそれぞれのアレルに特異的な２種類のレポータープローブ及び１種類のインベーダープローブの鋳型ＤＮＡへのハイブリダイゼーションと、ＤＮＡの構造を認識して切断するという特殊なエンドヌクレアーゼ活性を有する酵素によるＤＮＡの切断を組み合わせた方法である（Ｌｉｖａｋ，Ｋ．Ｊ．Ｂｉｏｍｏｌ．Ｅｎｇ．１４，１４３−１４９（１９９９）；Ｍｏｒｒｉｓ Ｔ．ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｃｌｉｎ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．３４，２９３３（１９９６）；Ｌｙａｍｉｃｈｅｖ，Ｖ．ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２６０，７７８−７８３（１９９３）等）。
また、プライマー伸長反応を利用する方法として、例えばＳｎｉＰｅｒ法を採用することもできる。ＳｎｉＰｅｒ法とは、ＲＣＡ（ｒｏｌｌｉｎｇ ｃｉｒｃｌｅ ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ）法と呼ばれる手法を基本原理とするものであり、環状の一本鎖ＤＮＡを鋳型としてＤＮＡポリメラーゼがその上を移動しながら相補鎖ＤＮＡを連続して合成していくものである。この方法によれば、ＤＮＡ増幅が起こった場合に生じる発色反応の有無を測定することによってＳＮＰを判定する（Ｌｉｚａｒｄｉ，Ｐ．Ｍ．ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ Ｇｅｎｅｔ．，１９，２２５−２３２（１９９８）；Ｐｉａｔｅｄ，Ａ．Ｓ．ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈ．，１６，３５９−３６３（１９９８））。
シークエンス法とは、遺伝子多型を含む領域をＰＣＲにて増幅させ、Ｄｙｅ Ｔｅｒｍｉｎａｔｏｒなどを用いてＤＮＡ配列をシークエンスすることで遺伝子多型（特に一塩基多型）の頻度を解析する方法である。
ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ／ＭＳ法とは、質量分析機（ｍａｓｓ ｓｐｅｃｔｒｍｅｔｅｒ）を用いた方法で、基本的には異なる一塩基の質量の違いを利用してＳＮＰジェノタイピングする方法である。ＰＣＲ増幅を利用した方法とｍｕｌｔｉｐｌｅｘを利用した方法がある（Ｈａｆｆ，Ｌ．Ａ．，Ｓｍｉｒｎｏｖ，Ｉ．Ｐ．，Ｇｅｎｏｍｅ Ｒｅｓ．，７，３７８−（１９９７）；Ｌｉｔｔｌｅ，Ｄ．Ｐ．ｅｔ ａｌ．Ｅｕｒ．Ｊ．Ｃｌｉｎｉｃａ．Ｃｈｅｍ．Ｃｌｉｎ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．，３５，５４５−（１９９７）；Ｒｏｓｓ，Ｐ．，ｅｔ ａｌ．Ｎａｔ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．，１６，１３４７−（１９９８））。
ＤＮＡチップ法とは、ガラスなどの基盤上に多種類のＤＮＡプローブを整列化し、固定し、その上で標識ＤＮＡのハイブリダイゼーションを行い、プローブ上の標識（蛍光など）シグナルを検出する方法を利用して、ハイブリダイゼーションで完全マッチと一塩基ミスマッチを分別検出する方法である。
本発明の方法において使用することができる遺伝子多型情報、特にＳＮＰ情報は表１の通りである。
「存在位置」は、ＳＮＰのゲノム上の位置を示す。５’フランキング（ｆｌａｎｋｉｎｇ）領域、イントロン（ｉｎｔｒｏｎ）領域、３’フランキング（ｆｌａｎｋｉｎｇ）領域のＳＮＰｓの存在位置は、第１エキソンの最も５’側の塩基より１塩基５’側を−１番とし、以下５’側に向かって−２、−３、−４、・・・となる。イントロン（ｉｎｔｒｏｎ）領域は、あるエキソンの３’側端から１塩基３’側から、次のエキソンまでの間を意味し、また、その番号は５’側のエキソン番号で表す。例えば、エキソン３とエキソン４との間に存在するイントロン（すなわち、エキソン３の３’側に存在するイントロン）をイントロン３という。イントロン領域のＳＮＰｓの存在位置は、そのイントロンの５’側に位置するエキソン／イントロン接合点（ｅｘｏｎ／ｉｎｔｒｏｎ ｊｕｎｃｔｉｏｎ）からみて３’側の最初の塩基をそのイントロンの塩基配列１番として数えた。そして、（＋）表示又は無表示は３’下流方向に、（−）表示は５’上流方向に向かって数えた数字を示した。例えば、エキソン３／イントロン３接合点から３’側に向かって３塩基目の塩基が多型であれば、「ｉｎｔｒｏｎ ３，＋３」と表示する。同様に、イントロン３／エキソン４接合点から５’側に向かって５塩基目の塩基が多型であれば、「ｉｎｔｒｏｎ ３，−５」と表示する。また、最終エキソンの３’側を３’フランキング（ｆｌａｎｋｉｎｇ）といい、ＳＮＰｓの存在位置は、その遺伝子の最終エキソンの最も３’側の塩基より更に１塩基３’側の塩基を１番として数えた。なお、表１のＭＣ２Ｒ１７〜ＭＣ２Ｒ２０（配列番号９６７〜９７０）の「存在位置」に記載の数字はデータベース上のものであり、本発明の解析により得られた数字をカッコ内に示した。「Ｎｏ．」の欄に記載された数字は、各遺伝子の遺伝子地図（図９〜７３）上におけるＳＮＰの位置を示す番号と対応する。また、図９〜７３には、公のゲノムデータベースにおける多型のアクセッション番号が示されている。表１、図面及びデータベースの情報を利用することにより、多型に隣接する領域の配列を特定することができる。例えば、このような情報は、多型に隣接するＰＣＲプライマーを作成する際に有用である。
上記ゲノムデータベースとしては、限定されるものではないが、ＮＣＢＩ（米国バイオテクノロジー情報センター：Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｃｅｎｔｅｒ ｆｏｒ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ）のサービス一覧、ＩＭＳ−ＪＳＴ ＪＳＮＰデータベースウエブサイト（理化学研究所、遺伝子多型研究センター、遺伝子多型タイピング研究・支援チーム）が挙げられる。
４．オリゴヌクレオチドプローブ又はオリゴヌクレオチドプライマーの作製
本発明の検出方法においてプライマー及び／又はプローブとして使用されるオリゴヌクレオチドは、例えばＳＮＰを検出するときは表１に示す塩基配列（配列番号１〜１１６８）を基本とし、これらの配列自体を合成してもよく、これらの配列の一部を含むように設計し合成してもよい。但し、その塩基配列中には必ずＳＮＰ（表１の「配列」の欄にアルファベット大文字で表示した部分）が含まれるようにする。また、本発明においてはこれらの配列の相補鎖も含まれる。
ＳＮＰを例に説明すると、ＳＮＰ部位は、プライマー又はプローブの塩基配列の３’若しくは５’端に存在するように設計し、あるいは、相補的な配列の３’若しくは５’端に存在するように設計し、又は前２者の３’若しくは５’端から４塩基内、好ましくは２塩基内に存在するように設計する。あるいは、オリゴヌクレオチドの塩基配列全長の中央にＳＮＰが存在するように設計する。「中央」とは、ＳＮＰの塩基よりも５’端に向かう塩基の数と、３’端に向かう塩基の数とがほぼ同数となる中心部の領域をいい、オリゴヌクレオチドの塩基数が奇数の場合は、中心部の５塩基、好ましくは中心部の３塩基、さらに好ましくは最も中心部の１塩基をいう。例えば、４１個の塩基数の場合は、第１９番目〜第２３番目、好ましくは第２０番目〜第２２番目、さらに好ましくは第２１番目の塩基が「中央」となる。また、オリゴヌクレオチドの塩基数が偶数の場合は、中心部の４塩基、好ましくは中心部の２塩基をいう。例えば、４０個の塩基数の場合は、第１９番目〜第２２番目、好ましくは第２０番目の塩基が「中央」となる。表１の「配列」に示す塩基配列において、欠失の多型の場合は、実際の配列の長さは４０個で偶数となる。したがって、この配列に基づいて４０個の塩基数のオリゴヌクレオチドを設計した場合は、第１９番目〜第２２番目、好ましくは第２０番目の塩基が「中央」となる。
多型部位が複数の塩基で構成される場合は、多型部位の全部又は一部の塩基配列又はその相補配列が含まれるようにプローブ又はプライマーを設計及び作製する。作製されたオリゴヌクレオチドをプローブとして用いると、ハイブリダイズの有無又は差を利用してアレルを決定することができる。プローブ又はプライマーのＤＮＡのうち、多型部位又はその周辺領域と相補鎖を形成する塩基を「対応塩基」とすると、プローブ又はプライマーは、多型を構成する配列のうちいずれかの配列上に対応塩基が位置するように設計することができる。「周辺領域」とは、多型を構成する配列の最も５’側端からさらに１〜３塩基外側（５’側）、又は多型を構成する配列の最も３’側端からさらに１〜３塩基外側（３’側）の領域を意味する。特に、プローブ又はプライマー中の対応塩基は、相補鎖を形成するときの５’又は３’末端の塩基が、多型を構成する配列中の５’末端側、３’末端側又は中央に位置するように設計することができる。本発明では、中央に位置することが好ましい。さらに、対応塩基は、多型を構成する配列の周辺領域上に位置するように設計することもできる。
例えば、後述のインベーダー法において表１のＰＴＧＤＲの第１３番（配列番号３１３）に示す遺伝子多型（ＴＣＣ）を検出するためにインベーダープローブ及びアレルプローブを作製する場合は、アレルプローブについては、多型部位ＴＣＣに相当する塩基、すなわち５’側から３’側に向かって「Ｇ」、「Ｇ」又は「Ａ」がアレルプローブの対応塩基となってハイブリダイズするように設計する（図４Ｂのａ〜ｃ）。例えば、図４Ｂ（ａ）は、相補鎖を形成する最も５’側の対応塩基「Ｇ」が、多型を構成する塩基（ＴＣＣ）の中央に位置し、図４Ｂ（ｂ）は、相補鎖を形成する最も５’側の対応塩基「Ａ」が、多型を構成する塩基（ＴＣＣ）の「Ｔ」上に位置するという位置関係を示している。また、図４Ｂ（ｄ）には、アレルプローブの対応塩基が、多型部位（下線部）の周辺領域（３塩基）に位置するように設計したものが示されている。
インベーダープローブについては、３’端の塩基「Ｎ」（Ａ、Ｔ、Ｃ又はＧのいずれか）の位置が、ハイブリダイズした場合に多型部位の塩基（ＴＣＣ）のいずれかと対応する位置になるように設計する。但し、アレルプローブと１塩基重複するように設計するのが最も効果的である（図４Ｃ）。一方、もう１つの遺伝子多型であるＴＣＣ欠失の場合には、その１〜３塩基分５’側又は３’側の位置に相当する塩基をインベーダープローブ及びアレルプローブの重複塩基としてＴＣＣ欠失を考慮して（配列から欠失させて）設計すればよい。図４Ｂ（ｅ）には、欠失部位の両側２塩基がアレルプローブとハイブリダイズするようにしたものを示す。なお、ＴａｑＭａｎプローブでは、このＴＣＣのいずれかの塩基又はその欠失位置が、ＴａｑＭａｎプローブの中央となるように設計すればよい。
塩基配列の長さは、少なくとも１３塩基、好ましくは１３塩基〜６０塩基、さらに好ましくは１５〜４０塩基、最も好ましくは１８〜３０塩基となるように設計する。このオリゴヌクレオチド配列は、被検遺伝子を検出するためのプローブとして使用することができ、また、フォワード（センス）プライマー及びリバース（アンチセンス）プライマーのどちらに使用してもよい。
また、オリゴヌクレオチドは、ゲノムＤＮＡとハイブリダイズする領域とハイブリダイズしない領域とがタンデムに連結したものであってもよい。連結の順序はどちらが上流でも下流でもよい。このオリゴヌクレオチドのうちハイブリダイズする領域は、表１に記載のＳＮＰを含む配列情報から設計し、ゲノムＤＮＡとハイブリダイズする領域の最も５’側又は３’側の配列がＳＮＰとなるように作製する。上記オリゴヌクレオチドのうちハイブリダイズしない領域は、表１に記載のＳＮＰを含む配列とハイブリダイズしないように、ランダムに配列を設計する。このオリゴヌクレオチドは、主としてインベーダー法によるＳＮＰの検出に、プローブとして使用することができる。
さらに、本発明において使用されるプライマーは、表１に示す塩基配列のうち、そのＳＮＰに起因する機能変化、有効／無効の判断、副作用の有無を調べる目的で、ＰＣＲにて増幅される配列の中にＳＮＰを含むよう設計される。この場合の、プライマーの長さは、少なくとも１５塩基、好ましくは１５〜３０塩基、さらに好ましくは１８〜２４塩基の長さを有するように設計する。このときのプライマー配列は、増幅断片が１０００ｂｐ以下、好ましくは５００ｂｐ以内（例えば１２０〜５００ｂｐ）、さらに好ましくは２００ｂｐ以内（１２０〜２００）ｂｐとなるように鋳型ＤＮＡの領域から適宜選択する。
例えば、ＳＮＰの５’側又は３’側に隣接する塩基から起算して、センス又はアンチセンスのプライマーの少なくともどちらか一方が、それぞれ５’又は３’側方向に１０００ｂｐ以内、好ましくは２００ｂｐ以内、さらに好ましくは１００ｂｐ以内の領域に含まれるように設計する。
以上のように設計されたオリゴヌクレオチドプライマー又はオリゴヌクレオチドプローブは、公知の手法により化学合成することができるが、通常は、市販の化学合成装置を使用して合成される。
なお、プローブには、予め蛍光標識（例えばＦＡＭ，ＶＩＣ，Ｒｅｄｍｏｎｄ Ｄｙｅ等）を付加して作業の自動化を図ることも可能である。
５．キット
上記オリゴヌクレオチドは、遺伝子多型検出用キットに含めることができる。
本発明の遺伝子多型検出用キットは、本発明を実施するために必要な１種以上の成分を含むものである。例えば、本発明のキットは、酵素を保存若しくは供給するためのもの、及び／又は切断アッセイ（例えばインベーダーアッセイ）を実施するために必要な反応成分を含むものである。本発明のキットは、酵素、又はアッセイに必要な（好適な）成分のうち、任意の全ての成分を含むものである。そのような成分としては、限定されるものではないが、オリゴヌクレオチド、ポリメラーゼ（例えばＴａｑポリメラーゼ）、バッファー（例えばＴｒｉｓ緩衝液）、ｄＮＴＰ、コントロール用試薬（例えば、組織サンプル、ポジティブ及びネガティブコントロール用標的オリゴヌクレオチドなど）、標識用及び／又は検出用試薬（ＶＩＣ、ＦＡＭ等の蛍光色素）、固相支持体、説明書、説明図及び／又は製品情報、阻害剤、包装環境調節剤（例えば、氷、乾燥剤）などが挙げられる。また本発明のキットは、必要な成分のうちの一部のみを含む部分的キットであってもよく、その場合には、ユーザーが他の成分を用意することができる。また、本発明のキットは、各容器が使用対象の成分のうちの一部を含む、２つ以上の別個の容器を含むものであってもよい。例えば、第１の容器が酵素を含有し、第２の容器がオリゴヌクレオチドを含有するものが挙げられる。ここで、酵素は、例えば適切な保存用バッファー中又は容器内に入れられた構造特異的切断酵素などであり、オリゴヌクレオチドは、例えばインベーダーオリゴヌクレオチド、プローブオリゴヌクレオチド、コントロール用標的オリゴヌクレオチドなどである。あるいは、１種以上の反応成分を予め分配した形で提供してもよい。この場合には、本発明の方法の１ステップで使用するために予め定量して分配されているため、再度計量したり、再度分配する必要がない。また、選択した反応成分を混合して一緒に分配しておいてもよい。反応成分は、予め分配され、反応容器中に入れられていることが好ましい。反応容器としては、限定されるものではないが、反応チューブ又はウエル、あるいはマイクロタイタープレートなどが挙げられる。予め分配される反応成分は、例えば脱水又は凍結乾燥などにより、反応容器中で乾燥させておくことが特に好ましい。
６．検出
上記のようにして調製されたオリゴヌクレオチドをプライマーとし、ＤＮＡポリメラーゼを用いて受容体をコードする遺伝子（鋳型ＤＮＡ）を増幅する。あるいは、上記のようにして調製されたプローブを鋳型ＤＮＡとハイブリダイズさせて、目的の遺伝子多型を有するＤＮＡを検出する。鋳型となるＤＮＡの調製は、公知の手法、例えば塩化セシウム密度勾配超遠心法、ＳＤＳ溶解法又はフェノール・クロロホルム抽出法等により行うことができる。
（１）ＰＣＲによる検出
増幅は、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）により行うことができる。ＤＮＡポリメラーゼとしてはＬＡ Ｔａｑ ＤＮＡポリメラーゼ（Ｔａｋａｒａ）、Ｅｘ Ｔａｑポリメラーゼ（Ｔａｋａｒａ社）、Ｇｏｌｄ Ｔａｑポリメラーゼ（Ｐｅｒｋｉｎ Ｅｌｍｅｒ），ＡｍｐｌｉＴａｑ（Ｐｅｒｋｉｎ Ｅｌｍｅｒ）、Ｐｆｕ ＤＮＡポリメラーゼ（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ社）等が挙げられる。
増幅の条件は、８５℃〜１０５℃で１０秒〜４０秒、好ましくは９４℃で２０秒〜３０秒の変性工程、５０℃〜７２℃で２０秒〜１分、好ましくは６０℃で２０秒〜１分のアニーリング工程、及び６５℃〜７５℃で１分〜４分、好ましくは７２℃で２分〜３分の伸長工程を１サイクルとしてこれを３０〜４０サイクル行う。但し、鋳型ＤＮＡ及びプライマーを十分変性させるために、上記増幅サイクルの前に９５℃で１分〜５分〔但し、Ｇｏｌｄ Ｔａｑポリメラーゼ（Ｐｅｒｋｉｎ Ｅｌｍｅｒ）を使用の際は、最低８分〜１５分、好ましくは１０分から１２分〕の変性工程を加えてもよく、また、増幅されたＤＮＡを完全に伸長するために、増幅サイクルの後に７２℃で１分〜１０分の伸長工程を加えてもよい。さらに、増幅産物の検出を直ちに行わない場合は、非特異的な増幅が起こらないようにするために、増幅産物を４℃で保存する工程を加えることが好ましい。このようにして、受容体をコードする遺伝子を増幅することができる。
その後は、増幅産物についてアガロースゲル電気泳動を行い、臭化エチジウム、ＳＹＢＲ Ｇｒｅｅｎ液等により染色し、そして増幅産物を１本又は２〜３本のバンド（ＤＮＡフラグメント）として検出することにより、受容体をコードする遺伝子中の遺伝子多型を含む受容体の一部分をＤＮＡフラグメントとして検出することができる。アガロースゲル電気泳動の代わりにポリアクリルアミドゲル電気泳動、あるいはキャピラリー電気泳動を実施してもよい。また、予め蛍光色素等により標識したプライマーを用いてＰＣＲを行い、増幅産物を検出することもできる。また、マイクロプレート等の固相に増幅産物を結合させ、蛍光又は酵素反応等により検出する等、電気泳動を必要としない検出方法も採用することができる。
（２）ＴａｑＭａｎ ＰＣＲ法による検出
ＴａｑＭａｎ ＰＣＲ法は、蛍光標識したアレル特異的オリゴとＴａｑ ＤＮＡポリメラーゼによるＰＣＲ反応とを利用した方法である。ＴａｑＭａｎ ＰＣＲ法で用いるアレル特異的オリゴ（ＴａｑＭａｎプローブという）は、前記ＳＮＰ情報に基づいて設計することができる。ＴａｑＭａｎプローブの５’末端はＦＡＭやＶＩＣなどの蛍光レポーター色素Ｒによって標識されており、同時に３’末端がクエンチャーＱ（消光物質）によって標識されている。（図１）。従って、この状態ではクエンチャーが蛍光エネルギーを吸収するため蛍光は検出できない。ＴａｑＭａｎプローブの３’末端はリン酸化されているため、ＰＣＲ反応中にＴａｑＭａｎプローブからの伸長反応は起こらない（図１）。しかし、このＴａｑＭａｎプローブを、ＳＮＰを含む領域を増幅するように設計したプライマーとＴａｑ ＤＮＡポリメラーゼとともにＰＣＲ反応を行うと、次の反応が起こる。
まず、ＴａｑＭａｎプローブが鋳型ＤＮＡの特異的な配列にハイブリダイゼーションし（図２ａ）、同時にＰＣＲプライマーから伸長反応が起こる（図２ｂ）。この際、Ｔａｑ ＤＮＡポリメラーゼは５’ヌクレアーゼ活性を有しているため、ＰＣＲプライマーの伸長反応が進む際にハイブリダイゼーションしたＴａｑＭａｎプローブを切断する。ＴａｑＭａｎプローブが切断されると、蛍光色素がクエンチャーの影響を受けなくなり、蛍光を検出することができる（図２ｃ）。
例えば、図３に示すように、ＳＮＰ部位がＡのアレル（アレル１とする）と、Ｇのアレル（アレル２とする）が存在すると仮定する。アレル１に特異的なＴａｑＭａｎプローブはＦＡＭで、アレル２に特異的なＴａｑＭａｎプローブはＶＩＣで標識する（図３）。２種類のアレル特異的オリゴをＰＣＲ試薬に添加し、検出の対象となる鋳型とＴａｑＭａｎ ＰＣＲを行う。その後、蛍光検出器にてＦＡＭ及びＶＩＣの蛍光強度を測定する。その結果、アレルのＳＮＰ部位と、ＴａｑＭａｎプローブのＳＮＰに対応する部位とが相補的である場合は、プローブがアレルとハイブリダイズし、Ｔａｑポリメラーゼによりプローブの蛍光色素が切断されて、クエンチャーの影響を受けなくなり、蛍光強度が検出される。
なお、鋳型がアレル１のホモ接合体である場合はＦＡＭの強い蛍光強度を認め、ＶＩＣの蛍光はほとんど認められない。鋳型がアレル１とアレル２のヘテロ接合体である場合は、ＦＡＭとＶＩＣの両者の蛍光を検出することができる。
（３）インベーダー法によるＳＮＰの検出
インベーダー法は、アレル特異的オリゴと鋳型とをハイブリダイゼーションすることによりＳＮＰを検出する方法である。インベーダー法では、２種類の非標識オリゴと１種類の蛍光標識オリゴを用いる。２種類の非標識オリゴのうちのひとつは、アレルプローブと呼ばれるものである。アレルプローブは、ゲノムＤＮＡ（鋳型ＤＮＡ）とハイブリダイズして相補二本鎖を形成する領域と、鋳型ＤＮＡの配列とは無関係な配列であってゲノムＤＮＡとハイブリダイズしない配列の領域（フラップという）とから構成されており、ハイブリダイズする領域のうち最も５’側又は３’側の位置が、ＳＮＰに対応する塩基となっている（図４Ａ（ａ））。上記フラップ配列は、後述するフレットプローブと相補的な配列を有するオリゴヌクレオチドである。もうひとつのオリゴは、インベーダープローブと呼ばれている。このオリゴは、ＳＮＰ部位からゲノムＤＮＡの３’側方向に向かって相補的にハイブリダイズするように設計されている（図４Ａ（ｂ））。但し、ＳＮＰ部位に対応する配列（図４Ａ（ｂ）中、「Ｎ」）は任意の塩基でよい。従って、鋳型であるゲノムＤＮＡと上記２つのプローブをハイブリダイゼーションさせると、ＳＮＰ部位にインベーダープローブの１塩基（Ｎ）が割り込むように侵入し（図４Ａ（ｃ））、ＳＮＰ部位が３重鎖を形成する。
一方、蛍光標識オリゴはアレルと全く無関係な配列であり、ＳＮＰの種類によらず配列は共通である。このプローブをフレット（ＦＲＥＴ）プローブ（ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｃｅ ｒｅｓｏｎａｎｃｅ ｅｎｅｒｇｙ ｔｒａｎｓｆｅｒ ｐｒｏｂｅ）という（図５）。ＦＲＥＴプローブの５’末端の塩基（レポーター）には蛍光色素Ｒが標識されており、その上流にはクエンチャーＱが結合している。従って、この状態ではクエンチャーが蛍光色素を吸収してしまうため蛍光を検出できない。また、ＦＲＥＴプローブの５’末端（レポーター塩基）から一定領域（領域１とする）は、その領域１よりも３’側の領域と向き合って相補的な配列となるように設計されている（これを領域２という）。従って、領域１は領域２と自分自身で相補鎖を形成する（図５）。また、この相補鎖形成領域よりもさらに３’方向の領域は、アレルプローブのフラップとハイブリダイズして相補鎖を形成できるように設計されている（図５）。
インベーダー法では、ＤＮＡの特殊な構造を認識して切断する特殊なエンドヌクレアーゼ活性を有する酵素（５’ヌクレオチダーゼ）の１つであるクリーバーゼ（ｃｌｅａｖａｓｅ）を用いる。クリーバーゼは、ゲノムＤＮＡ、アレルプローブ及びインベーダープローブがＳＮＰ位置で３重になった時に、アレルプローブのＳＮＰ位置の３’側を切断する酵素である。従って、図４Ａ（ｃ）のように３つの塩基が並び、５’末端がフラップ状になっている部分を認識して、そのフラップ部分を切断する。これによって、このＳＮＰ部位の構造がクリーバーゼにより認識され（図６ａ）、フラップの部位でアレルプローブが切断されフラップ部分が遊離する（図６ｂ）。次に、アレルプローブから遊離したフラップ部分は、ＦＲＥＴプローブと相補的な配列をもつため相補結合する（図６ｃ）。このとき、フラップのＳＮＰ部位がＦＲＥＴ自身の相補結合部位に割り込んで侵入する。クリーバーゼは再びこの構造を認識して蛍光色素部分を切断する。切断された蛍光色素は、クエンチャーの影響を受けなくなり、蛍光を発する（図６ｄ）。ＳＮＰ部位がアレルプローブのＳＮＰに対応する配列とマッチしない場合は、図７のように、クリーバーゼが認識する特異的なＤＮＡ構造をとらないため、プローブは切断されず、蛍光は検出されない。
例えば、あるＳＮＰがＴ／Ｃのときに、Ｔ用のインベーダープローブ、アレルプローブ、及びＳＮＰに対応するレポーターにＦＡＭを結合させたフレットプローブ、並びにこれとは別にＣ用のインベーダープローブ、アレルプローブ、及びＳＮＰに対応するレポーターにＶＩＣを結合させたフレットプローブとを準備し、全て混合してＳＮＰ検出を行う。その結果、ＳＮＰがＴ／Ｔのホモの場合にはＦＡＭの蛍光を発し、Ｃ／Ｃのホモの場合にはＶＩＣの蛍光を発し、Ｔ／Ｃヘテロの場合にはＦＡＭとＶＩＣ両者の蛍光を発する。ＦＡＭとＶＩＣは蛍光波長が異なるため、両者を分別できることになる。蛍光色素で標識された産物は、蛍光プレートリーダー、又は反応過程で生じた蛍光データを採集するよう設定した装置（リアルタイム蛍光検出器）を用いて検出することができる。リアルタイム蛍光検出器としては、例えばＡＢＩ ７７００配列検出システム（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ社）が挙げられる。
（４）ＳｎｉＰｅｒ法による検出
ＳｎｉＰｅｒ法でＳＮＰを検出するためには、アレルの識別をＲＣＡによる増幅の有無で行うことができる。すなわち、鋳型になるべきゲノムＤＮＡを直鎖状にしておいて、このゲノムＤＮＡにプローブをハイブリダイズさせる。プローブの配列と鋳型であるゲノムＤＮＡの配列とが相補的にマッチして相補鎖を形成すると、ゲノムＤＮＡはライゲーション反応が起こって環状になることができる。その結果、環状ＤＮＡのＲＣＡが進行する。これに対し、プローブの端がゲノムＤＮＡとマッチしなければ、ライゲーションされず環状にならないため、ＲＣＡの反応は進まない。従ってＳｎｉＰｅｒ法では、ゲノムＤＮＡとアニールし、しかも環状になり得る一本鎖プローブを設計する。この一本鎖プローブをパドロックプローブという。このパドロックプローブの断端を検出目的となるＳＮＰに対応する配列にしておいて、このパドロックプローブとゲノムＤＮＡとを混ぜ、ライゲーション反応を行う。パドロックプローブの断端とゲノムＤＮＡのＳＮＰ部分が相補的であれば、ライゲーション反応によってパドロックプローブは断端がつながり環状となるが、相補的でなければ環状にならない。従って、対象となるＳＮＰに相当するパドロックプローブのみが環状となり、ＤＮＡポリメラーゼによって増幅する。ＳＮＰは、この増幅の有無を検出すればよい。検出は、両端に蛍光色素とクエンチャーをもち、ヘアピン構造を有する合成オリゴヌクレオチドを使用する。
（５）ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ／ＭＳ法による検出
ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ／ＭＳ（Ｍａｔｒｉｘ Ａｓｓｉｓｔｅｄ Ｌａｓｅｒ Ｄｅｓｏｒｐｔｉｏｎ−Ｔｉｍｅ ｏｆ Ｆｌｉｇｈｔ／Ｍａｓｓ Ｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙ）法は、質量分析計をＳＮＰタイピングに応用した方法である。この方法は、以下のステップから構成される。
（ｉ）ＳＮＰを含むＤＮＡ断片のＰＣＲ増幅及び精製
ＳＮＰ部位の塩基とＰＣＲプライマーは重複しないように設計した後ＤＮＡ断片を増幅し、増幅反応産物からエキソヌクレアーゼやアルカリホスファターゼ処理によりプライマー、ｄＮＴＰ等を除去して増幅断片を精製する。
（ｉｉ）プライマー伸長反応（サーマルサイクル）及び精製
ＰＣＲ産物である標的領域の鋳型に対して１０倍以上のプライマーを加え、サーマルサイクル反応させてプライマー伸長反応を行う。ここで使用するプライマーは、その３’末端がＳＮＰ部位の塩基に隣接するように設計する。プライマーの長さは、１５〜３０塩基、好ましくは２０〜２５塩基である。マルチプレックス反応を行う場合には、鋳型と相補的でない配列を５’末端に付加する。また、サーマルサイクルは、８５〜１０５℃（好ましくは９４℃）と３５〜４０℃（好ましくは３７℃）の２温度間で２０〜３０サイクル（好ましくは２５サイクル）行う。
得られた反応産物を、質量分析機に適した状態にするため精製キット等を用いて精製する。
（ｉｉｉ）質量分析計によるＤＮＡの質量分析
精製された伸長反応産物を質量分析機にアプライして、目的産物の質量を測定する。すなわち、精製産物をマトリックスと混合し、ＭＡＬＤＩプレートに０．５〜１．０μＬスポットする。プレートを乾燥後、試料にレーザー光を照射し、スペクトログラムを作成する。
（６）塩基配列決定法による検出
本発明においては、１塩基の伸長反応を利用した多型の検出を行うことができる。つまり、異なる蛍光化合物で標識された４種類のジデオキシヌクレオチドを、検出の対象となる遺伝子が含まれる反応系に添加し、１塩基の伸長反応を行う。この場合、伸長する塩基を多型部位としておき、また、ＤＮＡ合成の停止とＤＮＡ分子の３’末端の蛍光標識という２つの反応を操作する。４種類の反応液をシークエンシング用ゲルの同一レーンやキャピラリー上で電気泳動を行ない、ＤＮＡバンドを標識した蛍光色素の違いを蛍光検出器により検出して配列決定を行う、あるいは１塩基伸長したオリゴヌクレオチドを蛍光検出装置や質量分析装置などを用いてどの塩基が伸長したかを蛍光色素の種類の違いを利用して調べる方法である。蛍光標識ジデオキシヌクレオチドの代わりにプライマーを蛍光標識し、非標識ジデオキシヌクレオチドと共に用いることもできる。
（７）ＤＮＡマイクロアレイによる検出
ＤＮＡマイクロアレイは、支持体上にヌクレオチドプローブが固定されたものであり、ＤＮＡチップ、Ｇｅｎｅチップ、マイクロチップ、ビーズアレイなどを含む。
ＤＮＡチップなどのＤＮＡマイクロアレイアッセイとしてはＧｅｎｅＣｈｉｐアッセイが挙げられる（Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ社；米国特許第６，０４５，９９６号、同第５，９２５，５２５号、及び同第５，８５８，６５９号参照）。ＧｅｎｅＣｈｉｐ技術は、チップに貼り付けたオリゴヌクレオチドプローブの小型化高密度マイクロアレイを利用するものである。プローブアレイは、例えば固相化学合成法と半導体産業において用いられているフォトリソグラフィー製造技術とを組み合わせた光照射化学合成法（Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ社）により製造される。チップの化学反応部位の境界を明確するためにフォトリソグラフィーマスクを利用し、特定の化学合成工程を行うことによって、アレイの所定の位置にオリゴヌクレオチドプローブが貼り付けられた高密度アレイを構築することができる。マルチプルプローブアレイは、大きなガラス基板上で同時に合成する。続いてこの基板を乾燥し、個々のプローブアレイを射出成形プラスチックカートリッジに充填する。このカートリッジは、外部環境からアレイを保護し、またハイブリダイゼーションチャンバーとしても機能する。
まず、分析対象のポリヌクレオチドを単離し、ＰＣＲにより増幅し、蛍光レポーター基により標識する。続いて、流体ステーションを用いて、標識化ＤＮＡをアレイと共にインキュベートする。次にこのアレイをスキャナーに差し込み、ハイブリダイゼーションパターンを検出する。ハイブリダイゼーションのデータは、プローブアレイに結合した（すなわち標的配列に取り込まれた）蛍光レポーター基からの発光として採集する。標的配列と完全に一致したプローブは、一般的には、標的配列と一致していない部分を有するものよりも強いシグナルを生じる。アレイ上の各プローブの配列及び位置は分かっているため、相補性によって、プローブアレイと反応させた標的ポリヌクレオチドの配列を決定することができる。
また本発明においては、電子工学的に捕捉されたプローブを有するＤＮＡマイクロチップを利用することもできる（Ｎａｎｏｇｅｎ社；例えば、米国特許第６，０１７，６９６号、同第６，０６８，８１８号、及び同第６，０５１，３８０号参照）。Ｎａｎｏｇｅｎ社の技術は、マイクロエレクトロニクスを利用することによって、半導体マイクロチップ上の所定の試験部位に及びその部位から荷電分子を移動したり、濃縮したりできる。所定のＳＮＰ又は変異に特有なＤＮＡ捕捉型プローブは、マイクロチップ上の特定の部位に電子工学的に配置されるか、又はアドレス指定される。ＤＮＡは強く負に荷電しているため、正電荷領域へ電子的に移動することが可能である。
最初に、マイクロチップ上の試験部位又は試験部位の列を正電荷により電子的に活性化する。続いて、ＤＮＡプローブ含有溶液をマイクロチップ上に導入する。負に荷電したプローブは、正に荷電した部位に迅速に移動するため、マイクロチップ上のその部位にプローブが濃縮され、化学的に結合する。続いてマイクロチップを洗浄し、さらに別の異なるＤＮＡプローブ溶液を添加してＤＮＡプローブとの特異的結合を行う。
次に、被検サンプル中に標的ＤＮＡ分子が存在するか否かを分析する。この分析は、被検サンプル中の相補的ＤＮＡとハイブリダイズしたＤＮＡ捕捉型プローブの種類を判定することにより行う。ここで被検サンプルとしては、例えばＰＣＲにより増幅した検出対象の遺伝子が挙げられる。また、電荷を利用することにより、マイクロチップ上の１以上の試験部位に標的分子を移動させ、濃縮することができる。各試験部位におけるサンプルＤＮＡの電気的濃縮によって、サンプルＤＮＡとそれに対し相補的な捕捉型プローブとのハイブリダイゼーションが迅速に行われる。例えば、このような操作によりハイブリダイゼーションが数分で起こるようになる。未結合ＤＮＡ又は非特異的結合ＤＮＡを各試験部位から除去するために、その部位の極性又は電荷を陰性に逆転し、それにより未結合ＤＮＡ又は非特異的結合ＤＮＡを溶液中に戻すことができる。この方法においては、例えばレーザーを利用した蛍光スキャナーを用いて特異的結合を検出することができる。
さらに、本発明においては、表面張力の違いによる平面（チップ）上での流体の分離現象を利用したアレイ技術も利用可能である（ＰｒｏｔｏＧｅｎｅ社；例えば、米国特許第６，００１，３１１号、同第５，９８５，５５１号、及び同第５，４７４，７９６号参照）。Ｐｒｏｔｏｇｅｎｅ社の技術は、化学的被膜により付与される表面張力の違いによって、流体が平面上で分離するという事実に基づいている。オリゴヌクレオチドプローブは、上述のような原理に基づいて分離させることができるため、プローブを含む試薬をインクジェットプリントすることによりチップ上で直接合成することができる。表面張力により規定される反応部位を有するアレイを、１セット（４つ）の圧電性ノズル下に配置されたＸ／Ｙ移動ステージ上に載せる。各圧電性ノズルには、それぞれ４種の標準的なＤＮＡ塩基が含有されている。この移動ステージはアレイの各列に沿って移動し、適切な試薬（例えばアミダイト）を各反応部位に供給する。アレイの表面全体を、アレイの反応部位に共通の試薬及び洗浄液に浸漬し、その後回転させることによりこれらの溶液を除去する。
検出対象のＳＮＰ又は変異に特有なＤＮＡプローブをＰｒｏｔｏｇｅｎｅ社の技術を利用してチップに貼り付ける。続いて、チップを、ＰＣＲで増幅した検出対象遺伝子と接触させる。ハイブリダイゼーション後、未結合ＤＮＡを除去し、任意の適切な方法を利用してハイブリダイゼーションを検出する。
さらに、「ビーズアレイ」を利用して多型を検出することができる（Ｉｌｌｕｍｉｎａ社；例えば、ＰＣＴ国際公開ＷＯ ９９／６７６４１号及び同ＷＯ ００／３９５８７号参照）。Ｉｌｌｕｍｉｎａ社は、光ファイバー束と、アレイに自己会合するビーズとを組み合わせたビーズアレイ技術を利用している。各光ファイバー束は、その束の直径に応じて数百万のファイバーを含有する。ビーズは、所定のＳＮＰ又は変異の検出に特異的なオリゴヌクレオチドにより被覆する。各種所定量のビーズを混ぜて、アレイに特異的なプールを形成させる。アッセイを行うために、ビーズアレイと調製済みの被験者サンプルとを接触させる。そして、ハイブリダイゼーションを任意の適切な方法により検出する。
７．薬物の評価
本発明においては、前記のようにして得られる一塩基多型等の検出結果から、当該受容体を介した薬物の有効性及び安全性を評価することができる。
薬物の評価は、タイピングシステムにより行うことができる。すなわち、上記いずれかの検出手法に従って、毒性（副作用）発現群と非発現群のアレル頻度を比較する。両者を比較した際、アレル頻度に差が生じるものを毒性発現認識のためのマーカーとして選出する。統計学的検定は、通常χ２検定によるが、例えばＦｉｓｈｅｒ検定などの他の統計処理を行うこともできる。なお、この結果を、リガンドと受容体との結合活性やその結合活性に対する薬物の阻害作用の強さ、当該受容体を有する細胞などをリガンドで刺激した際の細胞応答およびその作用に対する薬物の詐害活性、当該受容体の発現量をリガンド結合量や該当する抗受容体抗体などの結合量などに反映させることも可能である。当該全ての遺伝子多型に関して、作用あるいは毒性との因果関係を調べ、相関のあった遺伝子多型部位のみを選出する。その全ての遺伝子多型解析用プローブ又はプライマーと各手法に応じた試薬を、反応プレート、カード又はガラス基盤等に予め用意し、そこに予測したいヒトのゲノムＤＮＡを添加し、反応させることで、アレルパターンを調べることができる。作用又は毒性と相関する遺伝子多型を有する場合には、そのヒトの作用発現又は副作用発現予測が可能となる。薬物の有効性についても同様である。また、薬物の違いにより、副作用又は有効性と相関する遺伝子多型も異なるので、それぞれに関して、当該遺伝子多型を用いてタイピング操作を行えば、有効性や副作用の予測をすることが可能となる。
このことを利用して、その遺伝子多型頻度と有効／無効又は副作用の有／無を比較し、アレル頻度に差がある時に判定することが可能となる。
例えば、薬物Ａの投与によってある毒性（副作用）を示した者のＳＮＰを解析した結果、統計的に全体の９０％がＴ／Ｔを持つ者（例えばＦＡＭの蛍光強度を検出）であることが判明し、毒性（副作用）を示さなかった者のＳＮＰを解析した結果、Ｔ／Ｔを持つ者は全体の１０％にすぎず、Ｃ／Ｃを持つものが９０％を占めたことが判明したとすると、ＳＮＰ解析の結果、Ｔ／Ｔを持つ者は薬物Ａの投与はできないと評価することができる。
８．薬物のスクリーニング
本発明において前記の通り得られた遺伝子多型情報は、被験者から採取した当該受容体をコードする遺伝子又はその相補配列の遺伝子多型情報と比較することにより、当該受容体に作用する薬物、すなわち受容体を介した薬物の有効性及び安全性を解析するための指標として利用される。上記多型情報を用いて、薬物の有効性、安全性に関する個体差を解析することも可能である。従って、本発明において得られた遺伝子多型情報は、どの薬物が治療に最も有効であるか、その使用すべき薬物及び／又はその用量を選択するための情報源となる。
手法としては「７．薬物の評価」に記載の評価方法を利用すればよい。つまり、前項で副作用又は有効性と相関が認められた遺伝子多型は、その受容体へのリガンド結合能、受容体の情報伝達能、転写・翻訳に由来する受容体発現量に影響を与えるものであるといえる。また、副作用又は有効性の発現機構と間接的であっても何らかの因果関係があるといえる。ある薬物の感受性は、製薬会社などにおいて前臨床又は臨床試験にて調査・確認される。よって、それらの酵素遺伝子中に存在する遺伝子多型の中に重篤な副作用と相関する多型がある場合にはこれを削除すること、あるいは条件付きで使用することが可能となる。また、有効性についても同様である。この副作用と有効性の情報から薬物のスクリーニングが可能となる。
さらに、臨床試験（第Ｉ〜ＩＩＩ相試験）において副作用発現症例のボランティアと副作用非発現症例の遺伝子多型頻度解析を行うことで、前記した以外に副作用や有効性と相関する新たな遺伝子多型を検出することが可能となる。これを、上記と同様に調べることで薬物のスクリーニングが可能となる。
発明を実施するための最良の形態
以下、実施例により本発明をさらに具体的に説明する。但し、本発明はこれら実施例にその技術的範囲が限定されるものではない。
〔実施例１〕ＳＮＰ情報の取得
（１）ＤＮＡ抽出
血縁関係のない４８人からＥＤＴＡ存在下に採血を行った。ＤＮＡの抽出は、ゲノム解析ラボマニュアル（中村祐輔編 シュプリンガー・フェアラーク東京）の方法に従って以下の通り行った。
血液１０ｍｌを５０ｍｌのファルコンチューブに移し、室温で３０００ｒｐｍ、５分間遠心を行った。ピペットにて上清（血清）を採取した後、ＲＢＣ溶解バッファー（１０ｍＭ ＮＨ４ＨＣＯ３，１４４ｍＭ ＮＨ３Ｃｌ）を３０ｍｌ加えた。沈殿がほぐれるまで混和した後、室温で２０分放置した。室温で３０００ｒｐｍ、５分間遠心を行った後、ピペットにて上清（血清）を捨て、白血球のペレットを得た。ＲＢＣ溶解バッファーを３０ｍｌ加え、同様の操作をさらに２回行った。白血球のペレットにＰｒｏｔｅｉｎａｓｅ Ｋバッファー（５０ｍＭ Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ（ｐＨ７．４），１００ｍＭ ＮａＣｌ，１ｍＭ ＥＤＴＡ（ｐＨ８．０））を４ｍｌ、１０％ ＳＤＳを２００μｌ、１０ｍｇ／ｍｌ Ｐｒｏｔｅｉｎａｓｅ Ｋを２００μｌ加え、転倒混和した後、３７℃で一晩静置した。フェノールを４ｍｌ加え、ローテーター（Ｒｏｔａｔｏｒ Ｔ−５０，Ｔａｉｔｅｃ）にて４時間ゆっくりと転倒混和した。室温で３０００ｒｐｍ、１０分間遠心を行い、上層を新しいチューブに回収した。４ｍｌのフェノール−クロロホルム−イソアミルアルコール（容積比２５：２４：１）を加え、同様に２時間転倒混和した後、遠心した。上層を新しいチューブに回収し、４ｍｌのクロロホルム−イソアミルアルコール（容積比２４：１）を加え、同様に３０分転倒混和した後、遠心した。上層を新しいチューブに回収し、８Ｍ酢酸アンモニウム４００μｌ、イソプロパノール４ｍｌを加え、転倒混和した。糸状の白色析出物（ＤＮＡ）を２ｍｌ容のチューブに回収し、７０％エタノールを１ｍｌ加え、転倒混和した。新しい２ｍｌ容のチューブにＤＮＡを回収し風乾した後、ＴＥ溶液（１０ｍＭ Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ（ｐＨ７．４），１ｍＭ ＥＤＴＡ（ｐＨ７．４））を５００μｌ加え、溶解後、ゲノムＤＮＡサンプルとした。
（２）ＰＣＲ
ゲノムシークエンスは、ＧｅｎＢａｎｋ ＤＮＡデータベースから得た。ＲｅｐＭａｓｋコンピュータプログラムを用い、リピート配列を除いた後、ＰＣＲ産物が１ｋｂ前後になるようにＰＣＲプライマーを設計した。ゲノムＤＮＡは、同濃度に調製した血縁関係のない４８人のＤＮＡを使用した。それぞれ３人分のＤＮＡを１本のチューブに同量混ぜ、このうち６０ｎｇをＰＣＲに使用した。ＰＣＲは、Ｅｘ−Ｔａｑ（２．５Ｕ；ＴａＫａＲａ）を使用し、ＧｅｎｅＡｍｐ ＰＣＲ Ｓｙｓｔｅｍ ９７００（ＰＥ Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）を用いて行った。９４℃で２分間反応後、９４℃で３０秒の変性、６０℃又は５５℃で３０秒のアニーリング、７２℃で１分の伸長を行い、これを１サイクルとして３５サイクル行った。
（３）シークエンス
ＰＣＲ産物は、Ａｒｒａｙｌｔ（Ｔｅｌｅｃｈｅｍ）を使用し精製を行った後、ＢｉｇＤｙｅ Ｔｅｒｍｉｎａｔｏｒ ＲＲ Ｍｉｘ（ＰＥ Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）を用い、シークエンス反応を行った。ＧｅｎｅＡｍｐ ＰＣＲ Ｓｙｓｔｅｍ ９７００（ＰＥ Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）を用い、９６℃で２分間反応後、９６℃で２０秒の変性、５０℃で３０秒のアニーリング、６０℃で４分の伸長を行い、これを１サイクルとして２５サイクル行った。シークエンス反応後、ＡＢＩ ＰＲＩＳＭ ３７００ ＤＮＡ Ａｎａｌｙｚｅｒにてシークエンス解析を行った。
（４）ＳＮＰの検出
ＳＮＰの検出には、ＰｏｌｙＰｈｒｅｄコンピュータープログラム（Ｎｉｃｋｅｒｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，１９９７，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．，２５，２７４５−２７５１）を使用し、解析を行った。
（５）結果
表１に示すＳＮＰの結果が得られた。また、解析を行った受容体名とその略号、データベース（ＧｅｎＢａｎｋ）のＡＣＣＥＳＳＩＯＮ番号、受容体の遺伝子の構造とＳＮＰｓの存在位置を図９〜７３に示した。図９〜７３において、エキソンは水平線で表示した遺伝子上に白抜きのボックス又は黒の線で示した。ＳＮＰｓの存在位置は、遺伝子の上側に実線で示し、番号を付した。また、図９〜４０及び図４９〜７３において、ＳＮＰ以外の他の多型の存在位置は、遺伝子の下側に実線で示し、番号を付した。
産業上の利用可能性
本発明により、ＳＮＰの解析方法が提供される。本発明の方法により、目的の疾患に応じた薬物の選択をすることが可能となるため、本発明の方法は極めて有用である。
配列表フリーテキスト
配列番号２１：ｎはｔの１０〜１２回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号２２：ｎはｇ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号２３：ｎはａ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号２４：ｎはｃａの８〜１０回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号２５：ｎはｇａｃｔの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号２７：ｎはａの８〜９回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号４３：ｎはｃの８〜１０回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号４４：ｎはｃ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号４５：ｎはａ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号４６：ｎはａの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号８５：ｎはａ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号８６：ｎはｇの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号８８：ｎはａａａｃの６〜１１回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号８９：ｎはａの９〜１２回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号９０：ｎはｔの１１〜１３回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号９１：ｎはｔの１０〜１４回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号９２：ｎはｔの２０〜２６回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号９３：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号９４：ｎはｃｔの４〜６回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号９５：ｎはａの１０〜１２回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号９６：ｎはｇの７〜１１回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号１２９：ｎはｔｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１３０：ｎはｇａの１０〜１１回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号１３１：ｎはｔｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１３２：ｎはｔの１９〜２２回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号１３３：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１３４：ｎはａの１５〜１８回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号１３５：ｎはａの７〜８回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号１６９：ｎはｇ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１７０：ｎはｇ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１７１：ｎはａの１２〜１４回の繰り返し又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１７２：ｎはｔの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号１７４：ｎはｔの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号１７６：ｎはａ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１７７：ｎはｇ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１７８：ｎはｇ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１９０：ｎはｇｔの５〜１４回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号１９１：ｎはａの９〜１１回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号１９６：ｎはｔｇの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号１９８：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１９９：ｎはａｃの７〜８回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号２１９：ｎはｃ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号２２０：ｎはｔｔの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号２２２：ｎはｇａの３〜３０及びｇｔの３〜３０の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号２３１：ｎはｔの１２〜１４回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号２４９：ｎはｇｃａｇ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号２５０：ｎはｃａ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号２５１：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号２５２：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号２５３：ｎはａの１２〜１５回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号２５４：ｎはｔの１０〜１２回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号２５５：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号２５６：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号２９５：ｎはｃ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号２９６：ｎはａｇ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号２９７：ｎはｃの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号２９９：ｎはｔｔｃｃ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号３００：ｎはｃ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号３１３：ｎはｔｃｃ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号３１４：ｎはａの１０〜１１回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号３１５：ｎはｔｃａｇｇ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号３１６：ｎはｔの１１〜１２回の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号３３０：ｎはｇｇ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号３３１：ｎはｔｇの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号３３３：ｎはｔの７〜８の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号３４４：ｎはｃの６〜９の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号３４５：ｎはａ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号３４６：ｎはｔの９〜１０の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号３４７：ｎはａ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号３４８：ｎはｃ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号３４９：ｎはｔｔｔａ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号３５０：ｎはａの１２〜１４の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号４７８：ｎはａｃｔｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号４７９：ｎはｃａの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号４８１：ｎはｔの７〜８の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号４８２：ｎはｃ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号４８３：ｎはｔの１１〜１３の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号４８４：ｎはｔの１０〜１２の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号４８５：ｎはａ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号４８６：ｎはｔの１０〜１２の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号４８７：ｎはｔの８〜９の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号４８８：ｎはａａｔｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号４８９：ｎはｔの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号４９１：ｎはａｔの９〜１１の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号４９２：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号４９３：ｎはｃａｃｔの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号４９５：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号４９６：ｎはｇａａ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号４９７：ｎはｔの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号４９９：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号５００：ｎはａ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号５０１：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号５０２：ｎはａの１０〜１５の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号５０３：ｎはａ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号５０４：ｎはａの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号５０６：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号５３６：ｎはｔの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号５３８：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号５３９：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号５４０：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号５４１：ｎはｔの２１〜３７の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号５４２：ｎはａの２１〜２８の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号５４３：ｎはｔの８〜１０の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号５４４：ｎはａの９〜１３の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号５４５：ｎはｔの９〜１１の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号５７９：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号５８０：ｎはｃａ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号５８１：ｎはａの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号５８３：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号５８４：ｎはａｇ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号５８５：ｎはｔの１２〜１５の繰り返し又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号５８６：ｎはｔの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号５８８：ｎはａａａの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号５９０：ｎはｃの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号５９２：ｎはｃｃｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号５９３：ｎはｇの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号５９５：ｎはａａｔｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号６２８：ｎはｇａｔの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号６３０：ｎはｔの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号６３５：ｎはｔの１２〜１５の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号６３６：ｎはａの２２〜２６の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号６５７：ｎはｔの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号６５９：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号６６０：ｎはｇｔｃｃａｃｔａａａの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号６６２：ｎはｇｔｃｃａｃｔａａａｔｇａｔｔｇａｔａａｔｔｇの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号６６３：ｎはｔｇａｔｔｇａｔａａｔｔｇの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号６６４：ｎはａ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号６６５：ｎはｔの１６〜１８の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号６６６：ｎはｇ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号６７０：ｎはａ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号６７９：ｎはａの１１〜１３の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号６８０：ｎはｔの１０〜１２の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号６８１：ｎはａの１９〜２４の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号６８２：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号６８３：ｎはｔの１５〜２２の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号６８４：ｎはａの７〜９の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号６８５：ｎはａの２０〜２８の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号６９３：ｎはａの１１〜１４の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号６９４：ｎはｃの１０〜１３の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号６９６：ｎはａの１８〜２１の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号６９７：ｎはａの１０〜１２の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号６９８：ｎはａａａａｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号６９９：ｎはｇａａａｔの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号７０６：ｎはａの１８〜２４の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号７１２：ｎはｇ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号７２５：ｎはａの１５〜１７の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号７２６：ｎはｇｔの１５〜２１の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号７２７：ｎはｇ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号７２８：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号７２９：ｎはａの９〜１１の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号７３１：ｎはｔの２〜４の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号７３３：ｎはｔａａｇ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号７３９：ｎはｃｔｔｔの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号７４２：ｎはｔの８〜９の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号７４６：ｎはｔａｇａｃａｔｔｔｃｔｔａ又はｇｔａｇｃを表す（存在位置２１）。
配列番号７４７：ｎはａの４〜５の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号７５３：ｎはｔｇ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号７６２：ｎはａｔの８〜９の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号７７７：ｎはｔの８〜１０の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号７７９：ｎはｃａの６〜７の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号７８１：ｎはｇｔｔａｃ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号７９８：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号８０８：ｎはａｔの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号８１０：ｎはａｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号８１２：ｎはｔの１１〜１８の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号８１７：ｎはａの８〜９の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号８１８：ｎはｇｔｇｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号８２１：ｎはａの８〜９の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号８２３：ｎはｔの１０〜１２の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号８２４：ｎはｔの８〜９の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号８３３：ｎはｔの６〜７の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号８３５：ｎはｇｔの１３〜１５の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号８４５：ｎはｔの１１〜１３の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号８４６：ｎはａ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号８５１：ｎはａの６〜７の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号８５９：ｎはｃｃｔの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号８７０：ｎはｔの８〜９の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号８７６：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号８７７：ｎはｃａｇｇｇｇｃｔｃの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号８７９：ｎはａの１０〜１１の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号８８６：ｎはｃ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号８９７：ｎはｃｔｃｃｃｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号８９８：ｎはｔの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号９００：ｎはｔｔｔｔｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号９０１：ｎはｃｃの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号９０３：ｎはａｇａａａｔｔｔｃｔａｇｃｔｇｃｃｔｇｃａｔｔｔｃｔａｇｃａｇｃｃｃａの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号９１３：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号９４９：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号９５０：ｎはｇｔｔの８〜９の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号９５２：ｎはｃ又は欠失を表す（存在位置２５）。
配列番号９６４：ｎはｔｔ又は欠失を表す（存在位置３４）
配列番号９７１：ｎはｃ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号９７２：ｎはｔｔの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号９７４：ｎはｇａの３〜３０の繰り返し並びにｇｔの３〜３０の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号９７５：ｎはｇ又は欠失を表す（存在位置２１）
配列番号９８２：ｎはａの７〜８の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号１００５：ｎはｇ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１００６：ｎはｇ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１００７：ｎはａの１２〜１４の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号１００８：ｎはｔの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号１０１０：ｎはａｃの７〜８の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号１０２８：ｎはｔの１２〜１５の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号１０３１：ｎはａの１１〜１３の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号１０３２：ｎはｔの１０〜１２の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号１０３３：ｎはａの１９〜２４の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号１０３５：ｎはａの１１〜１４の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号１０３６：ｎはａの１８〜２１の繰り返しを表す（存在位置２１）。
配列番号１０４３：ｎはａの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号１０５９：ｎはｃａの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号１０６７：ｎはａａｃ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１０６８：ｎはａａｃ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１０７９：ｎはｔの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号１０８１：ｎ（存在位置２１）はａｃｃｔｇｔａｇｃｇｃｔｇｃｇｃｔａｃｃｃａａを、ｎ（存在位置２２）はｇａｔｇの挿入又は欠失を表す。
配列番号１０８２：ｎはｇａｔｇの挿入又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１０８３：ｎ（存在位置２０）はａｃｃｔｇｔａｇｃｇｃｔｇｃｇｃｔａｃｃｃａａの挿入を、ｎ（存在位置２１）はｇａｔｇの挿入又は欠失を表す。
配列番号１０８４：ｎはａｃｃｔｇｔａｇｃｇｃｔｇｃｇｃｔａｃｃｃａａの挿入を表す（存在位置２０）。
配列番号１０８９：ｎはｔｔｔｔｃａａｔｔａｇｇｃａａ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１０９０：ｎはａ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１０９１：ｎはｔｔｔｃｔｔｔｔｃａｃａａ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１０９３：ｎはｔ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１０９４：ｎはｇ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１１０１：ｎはｔの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号１１０５：ｎはｇの挿入又は欠失を表す（存在位置２３）。
配列番号１１０７：ｎはｔの挿入を表す（存在位置３２）。
配列番号１１１０：ｎ（存在位置１９）はｃ又はｇの挿入を、ｎ（存在位置２１）はｇ又は欠失を表す。
配列番号１１１１：ｎ（存在位置１０）はｔ又はｇの挿入を、ｎ（存在位置２１）はｔの挿入を表す。
配列番号１１１２：ｎはｔ又はｇの挿入を表す（存在位置１０）。
配列番号１１１３：ｎはａ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１１１７：ｎはｃ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１１２３：ｎはｇｃｃｃａｇｃｔｇｇ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１１４３：ｎはａの挿入を表す（存在位置２１）。
配列番号１１６１：ｎはａ又は欠失を表す（存在位置２１）。
配列番号１１６２：ｎはｔｔｃｃｔｔｃｃａｃ又は欠失を表す（存在位置２１）。
【図面の簡単な説明】
図１は、ＴａｑＭａｎプローブを示す図である。
図２は、ＴａｑＭａｎ ＰＣＲ法の概要を示す図である。
図３は、蛍光色素を付したプローブを示す図である。
図４Ａは、インベーダー法の概要を示す図である。
図４Ｂは、インベーダープローブとアレルプローブとの位置関係を示す図である。
図４Ｃは、インベーダープローブとアレルプローブとの位置関係を示す図である。
図５は、フレットプローブを示す図である。
図６は、インベーダー法の概要を示す図である。
図７は、アレルとマッチしないプローブを示す図である。
図８は、ライゲーション反応によるアレルの識別の概要を示す図である。
図９は、ＣＤ２０：ＣＤ２０ａｎｔｉｇｅｎ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＰ００１０３４．４
図１０は、ＣＤ３３：ＣＤ３３ ａｎｔｉｇｅｎ（ｇｐ６７）遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０６３９７７．５
図１１は、ＣＳＦ３Ｒ：Ｃｏｌｏｎｙ ｓｔｉｍｕｌａｔｉｎｇ ｆａｃｔｏｒ ３ ｒｅｃｅｐｔｏｒ（ｇｒａｎｕｌｏｃｙｔｅ）遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＬ４４５２４５．３
図１２は、ＩＬ１Ｒ１：Ｉｎｔｅｒｌｅｕｋｉｎ １ ｒｅｃｅｐｔｏｒ，ｔｙｐｅ Ｉ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ００７２７１．３
図１３は、ＩＬ１Ｒ２：Ｉｎｔｅｒｌｅｕｋｉｎ １ ｒｅｃｅｐｔｏｒ，ｔｙｐｅ ＩＩ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ００５０３５．１，ＡＣ００７１６５．３
図１４は、ＩＬ２Ｒ：Ｉｎｔｅｒｌｅｕｋｉｎ ２ ｒｅｃｅｐｔｏｒ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＬ１５７３９５．１６，ＡＬ１３７１８６．１８
図１５は、ＨＥＲ２：ｃ−ｅｒｂ−Ｂ−２遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０７９１９９．３
図１６は、ＩＦＮＡＲ１：Ｉｎｔｅｒｆｅｒｏｎ（ａｌｐｈａ，ｂｅｔａ ａｎｄ ｏｍｅｇａ）ｒｅｃｅｐｔｏｒ １ 遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＰ００１７１６．１
図１７は、ＰＧＲ：Ｐｒｏｇｅｓｔｅｒｏｎｅ ｒｅｃｅｐｔｏｒ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０２０７３５．５
図１８は、ＡＣＴＨ：Ｍｅｌａｎｏｃｏｒｔｉｎ ２ ｒｅｃｅｐｔｏｒ（ＭＣ２Ｒ）遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＰ００１０８６．４とＹ１０２５９．１
図１９は、ＩＣＡＭ１：Ｉｎｔｅｒｃｅｌｌｕｌａｒ ａｄｈｅｓｉｏｎ ｍｏｌｅｃｕｌｅ １（ＣＤ５４），ｈｕｍａｎ ｒｈｉｎｏｖｉｒｕｓ ｒｅｃｅｐｔｏｒ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０１１５１１．９
図２０は、ＶＣＡＭ１：Ｖａｓｃｕｌａｒ ｃｅｌｌ ａｄｈｅｓｉｏｎ ｍｏｌｅｃｕｌｅ １遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＬ１５７７１５．５
図２１は、ＩＴＧＢ２：Ｌｅｕｋｏｃｙｔｅ Ｉｎｔｅｇｒｉｎ，ｂｅｔａ ２（ａｎｔｉｇｅｎ ＣＤ１８（ｐ９５），ｌｙｍｐｈｏｃｙｔｅ ｆｕｎｃｔｉｏｎ−ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ ａｎｔｉｇｅｎ １；ｍａｃｒｏｐｈａｇｅ ａｎｔｉｇｅｎ １（ｍａｃ−１）ｂｅｔａ ｓｕｂｕｎｉｔ）遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＬ１６３３００．２
図２２は、ＰＴＧＤＲ：Ｐｒｏｓｔａｇｌａｎｄｉｎ Ｄ２ ｒｅｃｅｐｔｏｒ（ＤＰ）遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＬ３５５８３３．４
図２３は、ＰＴＧＥＲ１：Ｐｒｏｓｔａｇｌａｎｄｉｎ Ｅ ｒｅｃｅｐｔｏｒ １（ｓｕｂｔｙｐｅ ＥＰ１），４２ｋＤ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ００８５６９．６
図２４は、ＰＴＧＥＲ２：Ｐｒｏｓｔａｇｌａｎｄｉｎ Ｅ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ２（ｓｕｂｔｙｐｅ ＥＰ２），５３ｋＤ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＬ３６５４７５．１
図２５は、ＰＴＧＥＲ３：ｐｒｏｓｔａｇｌａｎｄｉｎ Ｅ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ３遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＬ０３１４２９．１１，ＡＬ１５８０８７．１１
図２６は、ＰＴＧＦＲ：Ｐｒｏｓｔａｇｌａｎｄｉｎ Ｆ ｒｅｃｅｐｔｏｒ（ＦＰ）遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＬ１３６３２４．６
図２７は、ＧＮＡ１２：Ｔｈｒｏｍｂｏｘａｎｅ Ａ２ ｒｅｃｅｐｔｏｒ／Ｇ ｐｒｏｔｅｉｎ ａｌｐｈａ １２遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ００６０２８．３
図２８は、ＴＢＸＡ２Ｒ：Ｔｈｒｏｍｂｏｘａｎｅ Ａ２ ｒｅｃｅｐｔｏｒ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ００５１７５．１
図２９は、ＢＬＴＲ２：Ｓｅｖｅｎ ｔｒａｎｓｍｅｍｂｒａｎｅ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ＢＬＴＲ２；ｌｅｕｋｏｔｒｉｅｎｅ Ｂ４ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ＢＬＴ２遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＬ０９６８７０．５
図３０は、ＣＹＳＬＴ１：Ｃｙｓｔｅｉｎｙｌ ｌｅｕｋｏｔｒｉｅｎｅ ｒｅｃｅｐｔｏｒ １遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＬ４４５２０２．２
１
図３１は、ＣＹＳＬＴ２：Ｃｙｓｔｅｉｎｙｌ ｌｅｕｋｏｔｒｉｅｎｅ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ２遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＬ１３７１１８．２０
図３２は、ＰＴＡＦＲ：Ｐｌａｔｅｌｅｔ−ａｃｔｉｖａｔｉｎｇ ｆａｃｔｏｒ ｒｅｃｅｐｔｏｒ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０２７４２１．３
図３３は、ＢＤＫＲＢ１：Ｂｒａｄｙｋｉｎｉｎ ｒｅｃｅｐｔｏｒ Ｂ１遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＬ３５５１０２．５
図３４は、ＢＤＫＲＢ２：Ｂｒａｄｙｋｉｎｉｎ ｒｅｃｅｐｔｏｒ Ｂ２遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＦ３７８５４２．２
図３５は、ＡＤＲＢ１：Ａｄｒｅｎｅｒｇｉｃ，ｂｅｔａ−１−，ｒｅｃｅｐｔｏｒ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ００５８８６．２
図３６は、ＡＤＲＢ２：Ａｄｒｅｎｅｒｇｉｃ，ｂｅｔａ−２−，ｒｅｃｅｐｔｏｒ，ｓｕｒｆａｃｅ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０１１３３４．４
図３７は、ＨＲＨ１：ｈｉｓｔａｍｉｎｅ Ｈ１ ｒｅｃｅｐｔｏｒ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０２０７５０．３
図３８は、ＨＲＨ２：ｈｉｓｔａｍｉｎｅ Ｈ２ ｒｅｃｅｐｔｏｒ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＢ０２３４８６．１
図３９は、ＨＲＨ３：ｈｉｓｔａｍｉｎｅ Ｈ３ ｒｅｃｅｐｔｏｒ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＬ０７８６３３．３
２
図４０は、ＨＴＲ３Ａ：５−ｈｙｄｒｏｘｙｔｒｙｐｔａｍｉｎｅ（ｓｅｒｏｔｏｎｉｎ）ｒｅｃｅｐｔｏｒ ３Ａ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＰ００１８７４．３
図４１は、ＡＧＴＲ１：Ａｎｇｉｏｔｅｎｓｉｎ ｒｅｃｅｐｔｏｒ １遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０２４８９７．２３
図４２は、ＡＧＴＲＬ１：Ａｎｇｉｏｔｅｎｓｉｎ ｒｅｃｅｐｔｏｒ−ｌｉｋｅ １遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＰ００１７８６．４
図４３は、ＡＧＴＲ２：Ａｎｇｉｏｔｅｎｓｉｎ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ２遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０６９４８０．２
図４４は、ＡＶＰＲ１Ａ：Ａｒｇｉｎｉｎｅ ｖａｓｏｐｒｅｓｓｉｎ ｒｅｃｅｐｔｏｒ １Ａ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０２５５２５．３
図４５は、ＡＶＰＲ２：ａｒｇｉｎｉｎｅ ｖａｓｏｐｒｅｓｓｉｎ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ２遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：Ｕ５２１１２．１
図４６は、ＰＴＧＩＲ：Ｐｒｏｓｔａｇｌａｎｄｉｎ Ｉ２（ｐｒｏｓｔａｃｙｃｌｉｎ）ｒｅｃｅｐｔｏｒ（ＩＰ）遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０２５９８３．３
図４７は、ＤＲＤ１：Ｄｏｐａｍｉｎｅ ｒｅｃｅｐｔｏｒ Ｄ１遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０９１３９３．１
図４８は、ＩＴＧＡ２Ｂ：Ｉｎｔｅｇｒｉｎ，ａｌｐｈａ ２ｂ（ｐｌａｔｅｌｅｔ ｇｌｙｃｏｐｒｏｔｅｉｎ ＩＩｂ ｏｆ ＩＩｂ／ＩＩＩａ ｃｏｍｐｌｅｘ，ａｎｔｉｇｅｎ ＣＤ４１Ｂ）遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０１９１５２．５
図４９は、ＦＯＬＲ１：Ｆｏｌａｔｅ Ｒｅｃｅｐｔｏｒ １遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：Ｕ２０３９１．１
図５０は、ＴＮＦＲ１：Ｔｕｍｏｒ ｎｅｃｒｏｓｉｓ ｆａｃｔｏｒ ｒｅｃｅｐｔｏｒ １遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ００６０５７．５
図５１は、ＡＤＯＲＡ２Ａ：Ａｄｅｎｏｓｉｎｅ Ａ２ Ｒｅｃｅｐｔｏｒ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＰ０００３５５．１
図５２は、ＡＶＰＲ１Ｂ：アルギニンバソプレッシン受容体１Ｂ（Ａｒｇｉｎｉｎｅ Ｖａｓｏｐｒｅｓｓｉｎ Ｒｅｃｅｐｔｏｒ １Ｂ）の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＦ１５２２３８．１
図５３は、ＭＣ２Ｒ：Ｍｅｌａｎｏｃｏｒｔｉｎ ２ Ｒｅｃｅｐｔｏｒ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＰ００１０８６．４とＹ１０２５９．１
図５４は、ＡＤＯＲＡ１：Ａｄｅｎｏｓｉｎｅ Ａ１ ｒｅｃｅｐｔｏｒ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ１０５９４０．２
図５５は、ＡＤＯＲＡ２Ｂ：Ａｄｅｎｏｓｉｎｅ Ａ２ｂ ｒｅｃｅｐｔｏｒ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ００６２５１．３
図５６は、ＡＤＯＲＡ３：Ａｄｅｎｏｓｉｎｅ Ａ３ ｒｅｃｅｐｔｏｒ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＬ３９０１９５．１０
図５７は、ＡＤＲＡ１Ａ：Ａｄｒｅｎｅｒｇｉｃ，ａｌｐｈａ−１Ａ−，ｒｅｃｅｐｔｏｒ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０２５７１２．４
図５８は、ＡＤＲＡ２Ａ：Ａｄｒｅｎｅｒｇｉｃ，ａｌｐｈａ−２Ａ−，ｒｅｃｅｐｔｏｒ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＬ１５８１６３．１１
図５９は、ＡＤＲＡ２Ｂ：Ａｄｒｅｎｅｒｇｉｃ，ａｌｐｈａ−２Ｂ−，ｒｅｃｅｐｔｏｒ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０９２６０３．２
図６０は、ＥＤＧ１：Ｅｎｄｏｔｈｅｌｉａｌ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｔｉｏｎ，ｓｐｈｉｎｇｏｌｉｐｉｄ Ｇ−ｐｒｏｔｅｉｎ−ｃｏｕｐｌｅｄ ｒｅｃｅｐｔｏｒ，１遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＬ１０９７４１．１９
図６１は、ＥＤＧ４：Ｅｎｄｏｔｈｅｌｉａｌ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｔｉｏｎ，ｌｙｓｏｐｈｏｓｐｈａｔｉｄｉｃ ａｃｉｄ Ｇ−ｐｒｏｔｅｉｎ−ｃｏｕｐｌｅｄ ｒｅｃｅｐｔｏｒ，４遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０１１４５８．７
図６２は、ＥＤＧ５：Ｅｎｄｏｔｈｅｌｉａｌ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｔｉｏｎ，ｓｐｈｉｎｇｏｌｉｐｉｄ Ｇ−ｐｒｏｔｅｉｎ−ｃｏｕｐｌｅｄ ｒｅｃｅｐｔｏｒ，５遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０１１５１１．１２
図６３は、ＧＰＲ１：Ｇ ｐｒｏｔｅｉｎ−ｃｏｕｐｌｅｄ ｒｅｃｅｐｔｏｒ １遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ００７３８３．４
図６４は、ＧＰＲ２：Ｇ ｐｒｏｔｅｉｎ−ｃｏｕｐｌｅｄ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ２遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０２７１４６．１
図６５は、ＧＰＲ３：Ｇ ｐｒｏｔｅｉｎ−ｃｏｕｐｌｅｄ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ３遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＬ０９６７７４．９
図６６は、ＧＰＲ４：Ｇ ｐｒｏｔｅｉｎ−ｃｏｕｐｌｅｄ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ４遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０１１４８０．３
図６７は、ＭＣ１Ｒ：Ｍｅｌａｎｏｃｏｒｔｉｎ １ ｒｅｃｅｐｔｏｒ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０９２１４３．３
図６８は、ＭＣ３Ｒ：Ｍｅｌａｎｏｃｏｒｔｉｎ ３ ｒｅｃｅｐｔｏｒ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＬ１３９８２４．２２
図６９は、ＭＣ４Ｒ：Ｍｅｌａｎｏｃｏｒｔｉｎ ４ ｒｅｃｅｐｔｏｒ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０９１５７６．１１
図７０は、ＯＸＴＲ：Ｏｘｙｔｏｃｉｎ ｒｅｃｅｐｔｏｒ遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＦ１７６３１５．２
図７１は、ＳＳＴＲ１：Ｓｏｍａｔｏｓｔａｔｉｎ ｒｅｃｅｐｔｏｒ １遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＬ４５０１０９．３
図７２は、ＳＳＴＲ３：Ｓｏｍａｔｏｓｔａｔｉｎ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ３ 遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：Ｚ８２１８８．２
図７３は、ＧＰＲ１０：Ｇ ｐｒｏｔｅｉｎ−ｃｏｕｐｌｅｄ ｒｅｃｅｐｔｏｒ １０遺伝子の構造とＳＮＰの存在位置を示す図である。
アクセッション番号（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．）：ＡＣ０６７８９５．２
Claims (24)
- 受容体をコードする遺伝子若しくはその相補配列中に存在する多型部位を含むように、又は受容体をコードする遺伝子及びその相補配列の少なくとも一方を増幅したときの増幅断片中に前記多型部位が含まれるように、オリゴヌクレオチドプローブ及び／又はオリゴヌクレオチドプライマーを作製し、得られるオリゴヌクレオチドプローブ及び／又はオリゴヌクレオチドプライマーを用いて、目的の受容体をコードする遺伝子中の少なくとも１個の遺伝子多型を検出することを特徴とする遺伝子多型の検出方法。
- 受容体をコードする遺伝子若しくはその相補配列中に存在する多型部位を含むように、又は受容体をコードする遺伝子及びその相補配列の少なくとも一方を増幅したときの増幅断片中に前記多型部位が含まれるように、オリゴヌクレオチドプローブ及び／又はオリゴヌクレオチドプライマーを作製し、得られるオリゴヌクレオチドプローブ及び／又はオリゴヌクレオチドプライマーを用いて、目的の受容体をコードする遺伝子中の少なくとも１個の遺伝子多型を検出することを特徴とする遺伝子多型の検出方法であって、前記多型部位が、配列番号１〜１１６８に示す塩基配列又はその相補配列中に存在する少なくとも一つであることを特徴とする、前記方法。
- 受容体をコードする遺伝子若しくはその相補配列中に存在する多型部位を含むように、又は受容体をコードする遺伝子及びその相補配列の少なくとも一方を増幅したときの増幅断片中に前記多型部位が含まれるように、オリゴヌクレオチドプローブ及び／又はオリゴヌクレオチドプライマーを作製し、得られるオリゴヌクレオチドプローブ及び／又はオリゴヌクレオチドプライマーを用いて、目的の受容体をコードする遺伝子中の少なくとも１個の遺伝子多型を検出することを特徴とする遺伝子多型の検出方法であって、前記オリゴヌクレオチドプローブ及び／又はオリゴヌクレオチドプライマーが、配列番号１〜１１６８に示す塩基配列のうち多型部位を含む少なくとも１３塩基の配列又はこれに相補的な配列を有するものからなる群から選択される少なくとも１つである前記方法。
- オリゴヌクレオチドプローブ及び／又はオリゴヌクレオチドプライマーの長さが１３〜６０塩基である請求項３記載の方法。
- 多型部位の情報が表１に示すものである請求項１〜４のいずれかに記載の方法。
- 多型部位を含むオリゴヌクレオチドプローブ及び／又はオリゴヌクレオチドプライマーが、その５’末端若しくは３’末端又は中央の塩基が当該多型部位となるように作製されたものである請求項１〜５のいずれかに記載の方法。
- 多型部位を含むオリゴヌクレオチドプローブが、受容体をコードする遺伝子又はその相補配列とハイブリダイズし得る断片とハイブリダイズしない断片とが結合したものであって、前記多型部位が、当該ハイブリダイズし得る断片の５’末端又は３’末端である請求項１〜５のいずれかに記載の方法。
- 多型が、一塩基多型、複数個の塩基の欠失、置換若しくは挿入による多型、又はＶＮＴＲ若しくはマイクロサテライトによる多型である請求項１〜７のいずれかに記載の検出方法。
- 請求項１〜８のいずれかの方法により得られた検出結果から、当該受容体を介する薬物の有効性及び安全性を評価することを特徴とする薬物の評価方法。
- 請求項１〜８のいずれかの方法により得られた検出結果から、当該受容体を介する薬物の感受性の程度を評価することを特徴とする薬物の評価方法。
- 請求項９又は１０記載の評価方法により得られた評価を指標として、使用すべき薬物を選択することを特徴とする薬物の選択方法。
- 受容体をコードする遺伝子又はその相補配列中の多型情報と、被験者から採取した当該受容体をコードする遺伝子又はその相補配列中の多型情報とを比較して、当該受容体を介して起こる薬物の有効性及び／又は安全性に関する個体差を解析し、得られる解析結果から使用すべき薬物及び／又はその用量を選択することを特徴とする薬物の選択方法。
- 受容体が、ＣＤ２０、ＣＤ３３、ＣＳＦ３Ｒ、ＩＬ１Ｒ１、ＩＬ１Ｒ２、ＩＬ２Ｒ、ＨＥＲ２、ＩＦＮＡＲ１、ＰＧＲ、ＡＣＴＨ、ＩＣＡＭ１、ＶＣＡＭ１、ＩＴＧＢ２、ＰＴＧＤＲ、ＰＴＧＥＲ１、ＰＴＧＥＲ２、ＰＴＧＥＲ３、ＰＴＧＦＲ、ＧＮＡ１２、ＴＢＸＡ２Ｒ、ＢＬＴＲ２、ＣＹＳＬＴ１、ＣＹＳＬＴ２、ＰＴＡＦＲ、ＢＤＫＲＢ１、ＢＤＫＲＢ２、ＡＤＲＢ１、ＡＤＲＢ２、ＨＲＨ１、ＨＲＨ２、ＨＲＨ３、ＨＴＲ３Ａ、ＡＧＴＲ１、ＡＧＴＲＬ１、ＡＧＴＲ２、ＡＶＰＲ１Ａ、ＡＶＰＲ２、ＰＴＧＩＲ、ＤＲＤ１、ＩＴＧＡ２Ｂ、ＦＯＬＲ１、ＴＮＦＲ１、ＡＤＯＲＡ１、ＡＤＯＲＡ２Ａ、ＡＤＯＲＡ２Ｂ、ＡＤＯＲＡ３、ＡＶＰＲ１Ｂ、ＡＤＲＡ１Ａ、ＡＤＲＡ２Ａ、ＡＤＲＡ２Ｂ、ＥＤＧ１、ＥＤＧ４、ＥＤＧ５、ＧＰＲ１、ＧＰＲ２、ＧＰＲ３、ＧＰＲ４、ＧＰＲ１０、ＭＣ１Ｒ、ＭＣ２Ｒ、ＭＣ３Ｒ、ＭＣ４Ｒ、ＯＸＴＲ、ＳＳＴＲ１及びＳＳＴＲ３からなる群から選択される少なくとも１つである請求項１〜１２のいずれかに記載の方法。
- 受容体をコードする遺伝子又はその相補配列中に存在する多型部位を含むように作製されたオリゴヌクレオチド。
- ＣＤ２０、ＣＤ３３、ＣＳＦ３Ｒ、ＩＬ１Ｒ１、ＩＬ１Ｒ２、ＩＬ２Ｒ、ＨＥＲ２、ＩＦＮＡＲ１、ＰＧＲ、ＡＣＴＨ、ＩＣＡＭ１、ＶＣＡＭ１、ＩＴＧＢ２、ＰＴＧＤＲ、ＰＴＧＥＲ１、ＰＴＧＥＲ２、ＰＴＧＥＲ３、ＰＴＧＦＲ、ＧＮＡ１２、ＴＢＸＡ２Ｒ、ＢＬＴＲ２、ＣＹＳＬＴ１、ＣＹＳＬＴ２、ＰＴＡＦＲ、ＢＤＫＲＢ１、ＢＤＫＲＢ２、ＡＤＲＢ１、ＡＤＲＢ２、ＨＲＨ１、ＨＲＨ２、ＨＲＨ３、ＨＴＲ３Ａ、ＡＧＴＲ１、ＡＧＴＲＬ１、ＡＧＴＲ２、ＡＶＰＲ１Ａ、ＡＶＰＲ２、ＰＴＧＩＲ、ＤＲＤ１、ＩＴＧＡ２Ｂ、ＦＯＬＲ１、ＴＮＦＲ１、ＡＤＯＲＡ１、ＡＤＯＲＡ２Ａ、ＡＤＯＲＡ２Ｂ、ＡＤＯＲＡ３、ＡＶＰＲ１Ｂ、ＡＤＲＡ１Ａ、ＡＤＲＡ２Ａ、ＡＤＲＡ２Ｂ、ＥＤＧ１、ＥＤＧ４、ＥＤＧ５、ＧＰＲ１、ＧＰＲ２、ＧＰＲ３、ＧＰＲ４、ＧＰＲ１０、ＭＣ１Ｒ、ＭＣ２Ｒ、ＭＣ３Ｒ、ＭＣ４Ｒ、ＯＸＴＲ、ＳＳＴＲ１及びＳＳＴＲ３からなる群から選択されるいずれかの受容体をコードする遺伝子又はその相補配列中に存在する多型部位を含むように作製されたオリゴヌクレオチド。
- オリゴヌクレオチドの５’末端若しくは３’末端又は中央の塩基が、当該多型部位となるように作製されたものである請求項１４又は１５記載のオリゴヌクレオチド。
- 多型部位を含むオリゴヌクレオチドが、受容体をコードする遺伝子又はその相補配列とハイブリダイズし得る断片とハイブリダイズしない断片とが結合したものであって、前記多型部位が、当該ハイブリダイズし得る断片の５’末端又は３’末端である請求項１４又は１５記載のオリゴヌクレオチド。
- 配列番号１〜１１６８に示す塩基配列又はその相補配列中に存在する少なくとも一つの多型部位を含むオリゴヌクレオチド。
- 配列番号１〜１１６８に示すいずれかの塩基配列のうち第２１番目の塩基を含む少なくとも１３塩基の配列又はこれに相補的な配列からなるオリゴヌクレオチド。
- １３〜３５塩基の長さを有する請求項１９記載のオリゴヌクレオチド。
- 配列番号１〜１１６８に示される塩基配列又はこれに相補的な塩基配列からなる群から選択されるオリゴヌクレオチド。
- 配列番号１〜１１６８に示すいずれかの塩基配列又はその相補配列中の多型部位が含まれるゲノムＤＮＡ領域において、当該多型部位から５’及び／又は３’側に向かってそれぞれ１０００ｂｐ以内に設計され、かつ、１３〜６０塩基の長さを有するオリゴヌクレオチド。
- 請求項１４〜２２のいずれかに記載のオリゴヌクレオチドが支持体に固定されたマイクロアレイ。
- 請求項１４〜２２のいずれかに記載のオリゴヌクレオチド及び／又は請求項２３記載のマイクロアレイを含む遺伝子多型検出用キット。
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