JPH11507809A - ヒト肝ガン由来増殖因子−2 - Google Patents

ヒト肝ガン由来増殖因子−2

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JPH11507809A
JPH11507809A JP9500351A JP50035197A JPH11507809A JP H11507809 A JPH11507809 A JP H11507809A JP 9500351 A JP9500351 A JP 9500351A JP 50035197 A JP50035197 A JP 50035197A JP H11507809 A JPH11507809 A JP H11507809A
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エイ. クンシュ,チャールズ
エイ. ローゼン,クレイグ
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ヒューマン ジノーム サイエンシーズ,インコーポレイテッド
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Abstract

(57)【要約】 ヒト肝ガン由来の増殖因子ポリペプチドおよびこのようなポリペプチドをコードするDNA(RNA)ならびに組換え技術によるこのようなポリペプチドを産生するための手順が開示される。組織の修復および組織の増殖の刺激のためにこのようなポリペプチドを利用するための方法がまた開示される。このようなポリペプチドに対するアンタゴニストおよび腫瘍増殖および瘢痕を遅延させるための治療としてのそれらの使用もまた開示される。宿主由来のサンプル中のこのポリペプチドのコード配列における変異およびこのポリペプチドの濃度変化を検出するための診断方法がまた開示される。

Description

【発明の詳細な説明】 ヒト肝ガン由来増殖因子-2 本発明は、新たに同定されたポリヌクレオチド、このようなポリヌクレオチド によりコードされるポリペプチド、このようなポリヌクレオチドおよびポリペプ チドの使用、ならびにこのようなポリヌクレオチドおよびポリペプチドの産生に 関する。より詳細には、本発明のポリペプチドは、肝ガン由来の増殖因子(時々 、本明細書中で以降「HDGF-2」という)として推定的に同定された。本発明はま た、このようなポリペプチドの作用を阻害することに関する。 細胞増殖は、種々の成長因子およびサイトカインによって調節される。これら は、転写因子の活性化に対する細胞内の生化学的シグナルのカスケードを誘発す るための特異的膜レセプターに結合し、それにより種々のサブセットの遺伝子の 種々の活性化および抑制をもたらす(Aaroson,S.A、Science,254:1146-1153(199 1))。 肝ガン由来の増殖因子(HDGF)は、最近クローン化されている(Nakamura,H. ら、J.Bio.Chem.,269(40):25143-25149(1994))。HDGFは、線維芽細胞に対して 分裂促進的な(mitogenic)ヘパリン結合タンパク質である。HDGFは、ヒト肝ガ ン由来の細胞株HuH-7の馴化培地よりSwiss 3T3細胞中へのトリチウム化チミジン の組み込みによって精製された。HDGFは、シグナルペプチドを有しないが、cDNA クローンのトランスフェクション後、COS-7細胞の培地中に分泌される。これは 、ヘパリン結合タンパク質であり、そしていくつかの腫瘍由来の細胞株および組 織中に遍在的に発現する。これは、肝ガン細胞の細胞質中に局在し、そして強い 成長刺激活性を有する。 本発明のポリペプチドは、HDGF-2ポリペプチドとして推定的に同定された。こ の同定は、ヒトHDGFに相同なアミノ酸配列の結果として作製されている。 本発明の1つの局面によれば、新規の成熟ポリペプチド、ならびに生物学的に 活性で、かつ診断または治療に有用なそのフラグメント、アナログ、およびそれ らの誘導体が提供される。本発明のポリペプチドはヒト起源である。 本発明の別の局面によれば、単離された核酸分子が提供され、それには、mRNA 、DNA,cDNA、ゲノムDNA、ならびにそのアナログ、および生物学的に活性で、か つ診断または治療に有用なそのフラグメントが含まれる。 本発明のなおさらに別の局面によれば、組換え技術によりこのようなポリペプ チドを産生するためのプロセスが提供される。組換え技術は、本発明のポリペプ チドをコードする核酸配列を含む組換え原核生物宿主細胞および/または組換え 真核生物宿主細胞を、このタンパク質の発現を促進する条件下で培養し、その後 このタンパク質を回収する工程を包含する。 本発明のさらなる局面によれば、このようなポリペプチド、またはこのような ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを、それに対するアゴニストおよび アンタゴニスト化合物をスクリーニングする目的、および治療目的(例えば、火 傷、組織修復、および潰瘍の結果としての傷害の治癒の促進、血栓症および動脈 硬化症を処置すること、神経障害による神経損傷を防止し、そして神経増殖を促 進すること、骨および歯周の再生を促進すること、日焼けを処置すること、骨髄 細胞および角膜に内皮の成長および/または分化を刺激すること、肌の老化およ び抜け毛を防止すること、器官形成を刺激すること)に利用するプロセスが提供 される。 本発明のさらなる局面によれば、本発明のポリペプチドをコードする核酸配列 に特異的にハイブリダイズするために十分な長さの核酸分子を含む核酸プローブ がまた提供される。 本発明のなおさらなる局面によれば、このようなポリペプチドに対する抗体が 提供される。 本発明の別の局面によれば、それらに対するレセプターに結合および活性化す ることによって本発明のポリペプチドを模倣するアゴニストが提供される。 本発明のさらに別の局面によれば、このようなポリペプチドに対するアンタゴ ニストが提供される。これは、このようなポリペプチドの作用を阻害する(例え ば、血管形成、腫瘍新脈管形成後の再狭窄の処置において、瘢痕形成(scarring )を防止し、そして血管過多症(hyper-vascular disease)を処置すること)た めに使用される。 本発明のなお別の局面によれば、疾患および本発明の核酸配列内の変異に関連 する疾患に対する感受性を検出するための、およびこのような配列によりコード されるポリペプチドの過剰発現を検出するための診断アッセイが提供される。 本発明の別の局面によれば、このようなポリペプチド、またはこのようなポリ ペプチドをコードするポリヌクレオチドを、科学的研究、DNA合成およびDNAベク ターの製造に関連するインビトロにおける目的のために利用するためのプロセス が提供される。 本発明のこれらおよび他の局面は、本明細書中の教示から当業者に明らかであ るはずである。 以下の図面は、本発明の実施態様を例示するものであり、請求の範囲により包 含される本発明の範囲を制限することを意味しない。 図1は、HDGF-2のcDNA配列、および対応するHDGF-2の推定アミノ酸配列を示す 。アミノ酸の標準的な1文字表記を使用する。配列決定は、373自動化DNAシーケ ンサー(Applied Biosystems,Inc.)を用いて行った。 図2は、本発明のポリペプチド(上列)とヒトHDGF-1(下列)との間のアミノ 酸組成である。 本発明の1つの局面によれば、図1(配列番号2)の推定のアミノ酸配列を有 する成熟ポリペプチドまたは1995年5月24日にATCC受託番号第 号として寄託 されたクローンのcDNAによりコードされる成熟ポリペプチドをコードする単離さ れた核酸(ポリヌクレオチド)が提供される。 本発明のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、心臓、脳、および骨 格筋から得られ得る。本発明のポリヌクレオチドは、ヒト臍静脈内皮組織由来の cDNAライブラリー中で発見された。これは、HDGFファミリーに構造的に関連する 。これは、249アミノ酸残基のタンパク質をコードするオープンレーディングフ レームを含む。このタンパク質は、201アミノ酸長にわたり、ヒトHDGFに対して 最も高い程度の相同性(23%の同一性および61%の類似性)を示す。 本発明のポリヌクレオチドは、RNAの形態またはDNA(このDNAはcDNA、ゲノムD NA、および合成DNAを包含する)の形態であり得る。一本鎖がコード鎖または非 コード(アンチセンス)鎖であり得る場合、DNAは二本鎖または一本鎖であり得 る。成熟ポリペプチドをコードするコード配列は、図1(配列番号1)に示すコ ード配列または寄託したクローンのコード配列と同一であり得、あるいはそのコ ード配列が、遺伝コードの重複または縮重の結果として、図1(配列番号1)の DNAまたは寄託したcDNAと同じ成熟ポリペプチドをコードする異なるコード配列 であり得る。 図1(配列番号2)の成熟ポリペプチドまたは寄託したcDNAによりコードされ る成熟ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、以下を含み得るがこれら に限定されない:成熟ポリペプチドのコード配列のみ;成熟ポリペプチドのコー ド配列およびさらなるコード配列;成熟ポリペプチドのコード配列(および必要 に応じてさらなるコード配列)ならびに非コード配列(例えば、イントロンある いは成熟ポリペプチドのコード配列の5'および/または3'非コード配列)。 従って、用語「ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド」は、ポリペプチ ドのコード配列のみを含むポリヌクレオチド、ならびにさらなるコード配列およ び/または非コード配列を含むポリヌクレオチドを含む。 本発明はさらに、図1(配列番号2)の推定のアミノ酸配列を有するポリペプ チド、または寄託したクローンのcDNAによりコードされるポリペプチドのフラグ メント、アナログ、および誘導体をコードする本明細書中上記のポリヌクレオチ ドの変異体に関する。ポリヌクレオチドの変異体は、ポリヌクレオチドの天然に 存在する対立遺伝子変異体またはポリヌクレオチドの天然に存在しない変異体で あり得る。 従って、本発明は、図1(配列番号2)に示すものと同じ成熟ポリペプチド、 または寄託したクローンのcDNAによりコードされる同じ成熟ポリペプチドをコー ドするポリヌクレオチド、およびそのようなポリヌクレオチドの変異体を包含す る。この変異体は、図1のポリペプチドまたは寄託したクローンのcDNAによりコ ードされるポリペプチドのフラグメント、誘導体またはアナログをコードする。 このようなヌクレオチド変異体は、欠失変異体、置換変異体、および付加または 挿入変異体を含む。 本明細書中上記で示したように、ポリヌクレオチドは、図1(配列番号1)に 示すコード配列または寄託したクローンのコード配列の天然に存在する対立遺伝 子変異体であるコード配列を有し得る。当該分野で公知なように、対立遺伝子変 異体は、1つ以上のヌクレオチドの置換、欠失または付加を有し得るポリヌクレ オチド配列の別の形態であり、これはコードされるポリペプチドの機能を実質的 に変化させない。 本発明はまたポリヌクレオチドを包含し、ここで成熟ポリペプチドのコード配 列は、宿主細胞からのポリペプチドの発現および分泌を援助するポリヌクレオチ ド配列(例えば、細胞からのポリペプチドの輸送を制御する分泌配列として機能 するリーダー配列)に対する同じリーディングフレームで融合され得る。リーダ ー配列を有するポリペプチドはプレプロテインであり、そしてポリペプチドの成 熟形態を形成するために宿主細胞により切断されたリーダー配列を有し得る。ポ リヌクレオチドはまた、成熟タンパク質およびさらなる5’アミノ酸残基である プロプロテインをコードし得る。プロ配列を有する成熟タンパク質はプロプロテ インであり、およびタンパク質の不活性形態である。プロ配列が一旦切断されれ ば、活性な成熟タンパク質が残る。 従って、例えば、本発明のポリヌクレオチドは成熟タンパク質をコードし得る か、あるいはプロ配列を有するタンパク質またはプロ配列およびプレ配列(リー ダー配列)の両方を有するタンパク質をコードし得る。 本発明のポリヌクレオチドはまた、本発明のポリペプチドの精製を可能にする マーカー配列にインフレームで融合されたコード配列を有し得る。マーカー配列 は、細菌宿主の場合には、マーカーに融合された成熟ポリペプチドの精製を提供 する、pQE-9ベクターにより供給されるヘキサヒスチジンタグであり得る。ある いは、例えばマーカー配列は、哺乳動物宿主(例えば、COS-7細胞)が使用され る場合は、血球凝集素(HA)タグであり得る。HAタグは、インフルエンザ血球凝 集素タンパク質に由来するエピトープと一致する(Wilson,I.ら、Cell,37:767 (1984))。 用語「遺伝子」は、ポリペプチド鎖の産生に関与するDNAセグメントを意味す る;これは、コード領域に先行する領域および後に続く領域(リーダーおよびト レイラー)ならびに個々のコードセグメント(エクソン)の間に介在する配列( イントロン)を含む。 全長のHDGF-2遺伝子のフラグメントは、全長のHDGF-2遺伝子を単離するための 、およびこの遺伝子と高い配列類似性を有するか、または類似の生物学的活性を 有する他の遺伝子を単離するためのcDNAライブラリーのハイブリダイゼーション プローブとして使用され得る。このタイプのプローブは、好ましくは少なくとも 30塩基を有し、そして例えば、50またはそれ以上の塩基を含み得る。このプロー ブはまた、全長の転写産物に対応するcDNAクローン、ならびに調節領域およびプ ロモーター領域、エクソン、およびイントロンを含む完全な遺伝子を含むゲノム クローン(単数または複数)を同定するために使用され得る。スクリーニングの 例として、オリゴヌクレオチドプローブを合成するための既知のDNA配列を使用 することにより、遺伝子のコード領域を単離することを含む。本発明の遺伝子の 配列に相補的な配列を有する標識オリゴヌクレオチドは、このプローブがライブ ラリーのどのメンバーとハイブリダイズするかを決定するために、ヒトcDNA、ゲ ノムDNA、またはmRNAのライブラリーをスクリーニングするために使用される。 本発明はさらに、配列間に少なくとも70%、好ましくは少なくとも90%、およ びより好ましくは少なくとも95%の同一性が存在する場合、本明細書中上記の配 列にハイブリダイズするポリヌクレオチドに関する。本発明は特に、本明細書中 上記のポリヌクレオチドにストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリ ヌクレオチドに関する。本明細書中で用いられる用語「ストリンジェントな条件 」は、ハイブリダイゼーションが、配列間に少なくとも95%および好ましくは少 なくとも97%の同一性が存在する場合のみに生じることを意味する。好ましい実 施態様において本明細書中上記のポリヌクレオチドにハイブリダイズするポリヌ クレオチドは、図1(配列番号1)のcDNAまたは寄託したcDNAによりコードされ る成熟ポリペプチドと実質的に同じ生物学的機能または活性のいずれかを保持す るポリペプチドをコードする。 あるいは、このポリヌクレオチドは、少なくとも20塩基、好ましくは30塩基、 そしてより好ましくは50塩基を有し得る。これらは、本発明のポリヌクレオチド にハイブリダイズし、そして、本明細書上記のように、それに対する同一性を有 し、そして活性を保持してもよいし、または保持しなくてもよい。例えば、この ようなポリヌクレオチドは、例えば、このポリヌクレオチドの回収のために配列 番号1のポリヌクレオチドのためのプローブとして、あるいは診断プローブまた はPCRプライマーとして使用され得る。 従って、本発明は、配列番号2のポリペプチドをコードするポリヌクレオチド に対して、ならびに少なくとも30塩基、そして好ましくは少なくとも50塩基を有 するそのフラグメントに対して、そしてそのようなポリヌクレオチドによりコー ドされるポリペプチドに対して少なくとも70%の同一性、好ましくは少なくとも 90%、そしてより好ましくは少なくとも95%の同一性を有するポリヌクレオチド ならびに、このようなポリヌクレオチドによりコードされるポリヌクレオチドに 関する。 本明細書中でいう寄託物は、特許手続き上の微生物の寄託の国際的承認に関す るブダペスト条約の存続期間の下に維持される。これらの寄託物は、単に当業者 の便宜上提供されるのみであり、そして米国特許法第112条の下で寄託が必要と されることを認めたわけではない。寄託物に含まれるポリヌクレオチドの配列、 ならびにそれによりコードされるポリペプチドのアミノ酸配列は、本明細書中に 参考として援用されており、そして本明細書中の配列の記載とのいかなる矛盾も 抑えている。寄託物を製造し、使用し、または販売するためには実施許諾が必要 とされ得、そしてそのような実施許諾はこれによって与えられるわけではない。 本発明はさらに、図1(配列番号2)の推定のアミノ酸配列を有するか、また は寄託したcDNAによりコードされるアミノ酸配列を有するHDGF-2ポリペプチド、 ならびにそのようなポリペプチドのフラグメント、アナログおよび誘導体に関す る。 用語「フラグメント」、「誘導体」および「アナログ」は、図1(配列番号2 )のポリペプチドまたは寄託したcDNAにコードされるポリペプチドをいう場合は 、そのようなポリペプチドと本質的に同じ生物学的機能または活性を保持するポ リペプチドを意味する。従ってアナログは、プロタンパク質部分の切断により活 性化されて活性な成熟ポリペプチドを生じ得るプロタンパク質を包含する。 本発明のポリペプチドは、組換えポリペプチド、天然のポリペプチドまたは合 成ポリペプチドであり得、好ましくは組換えポリペプチドであり得る。 図1(配列番号2)のポリペプチドまたは寄託したcDNAによりコードされるポ リペプチドのフラグメント、誘導体またはアナログは、(i)1つ以上のアミノ酸 残基が保存アミノ酸残基または非保存アミノ酸残基(好ましくは保存アミノ酸残 基)で置換され、そしてこのような置換アミノ酸残基がその遺伝コードによりコ ードされるアミノ酸残基であるかもしれないし、またはそうではないかもしれな いもの、あるいは(ii)1つ以上のアミノ酸残基が置換基を含有するもの、あるい は(iii)成熟ポリペプチドがポリペプチドの半減期を増加させる化合物(例えば 、ポリエチレングリコール)のような別の化合物と融合されているもの、あるい は(iv)さらなるアミノ酸が、成熟ポリペプチドに融合され、そして成熟ポリペプ チドの精製に使用されるものであり得る。このようなフラグメント、誘導体、お よびアナログは、本明細書中の教示から当業者の範囲内にあると考えられる。 本発明のポリペプチドおよびポリヌクレオチドは、好ましくは単離された形態 で提供され、そして好ましくは均質に精製される。 用語「単離された」は、物質がその本来の環境(例えば、天然に存在する場合 は、天然の環境)から取り出されていることを意味する。例えば、生きている動 物の中に存在する天然に存在するポリヌクレオチドまたはポリペプチドは、単離 されていないが、天然の系において共存する物質の幾らかまたは全てから分離さ れている同一のポリヌクレオチドまたはポリペプチドは、単離されている。この ようなポリヌクレオチドはベクターの一部であり得、および/またはこのような ポリヌクレオチドまたはポリペプチドは、組成物の一部であり得、そしてそのよ うなベクターまたは組成物がその天然の環境の一部ではない点で、なお単離され 得る。 本発明のポリペプチドは、配列番号2のポリペプチド(特に成熟ポリペプチド )ならびに配列番号2のポリペプチドと少なくとも70%の類似性(好ましくは少 なくとも70%の同一性)、そしてより好ましくは配列番号2のポリペプチドと少 なくとも90%の類似性(より好ましくは少なくとも90%の同一性)、そしてさら により好ましくは配列番号2のポリペプチドと少なくとも95%の類似性(さらに より好ましくは少なくとも95%の同一性)を有するポリペプチドを含み、そして 、また一般的に少なくとも30アミノ酸そしてより好ましくは少なくとも50アミノ 酸を含むポリペプチドのこのような一部分を有するこのようなポリペプチドの 部分を含む。 当該分野に公知であるように、2つのポリペプチドの間の「類似性」は、第2 のポリペプチドの配列に対して、1つのポリペプチドのアミノ酸配列およびその 保存されたアミノ酸置換を比較することにより決定される。 本発明のポリペプチドのフラグメントまたは部分は、ペプチド合成による対応 する全長ポリペプチドを産生するために使用され得る。従って、このフラグメン トは全長ポリペプチドを産生するための中間体として使用され得る。本発明のポ リヌクレオチドのフラグメントまたは部分は、本発明の全長ポリヌクレオチドを 合成するために使用され得る。 本発明はまた、本発明のポリヌクレオチドを含むベクター、本発明のベクター を用いて遺伝子操作される宿主細胞、および組換え技術による本発明のポリペプ チドの産生に関する。 宿主細胞は、本発明のベクター(これは例えば、クローニングベクターまたは 発現ベクターであり得る)を用いて遺伝子操作(形質導入、または形質転換、ま たはトランスフェクト)される。ベクターは、例えば、プラスミド、ウイルス粒 子、ファージなどの形態であり得る。操作された宿主細胞は、プロモーターを活 性化するか、形質転換体を選択するか、または本発明の遺伝子を増幅するために 適切に改変した従来の栄養培地において培養され得る。培養条件(例えば、温度 、pHなど)は、発現のために選択される宿主細胞に以前使用された条件であり、 そして当業者には明らかである。 本発明のポリヌクレオチドは、組換え技術によりポリペプチドを産生するため に用いられ得る。従って、例えば、ポリヌクレオチドは、ポリペプチドを発現す るための種々の発現ベクターのいずれか1つに含まれ得る。このようなベクター は、染色体DNA配列、非染色体DNA配列、および合成DNA配列を含む。このような ベクターは、例えば、SV40の誘導体;細菌性プラスミド;ファージDNA;バキュ ロウイルス;酵母プラスミド;プラスミドとファージDNAとの組み合わせ由来の ベクター;ウイルスDNA(例えば、ワクシニア、アデノウイルス、鶏痘ウイルス 、および仮性狂犬病)である。しかし、宿主において複製可能で、かつ存続可能 である限り、他の任意のベクターも使用され得る。 適切なDNA配列は、種々の手順によりベクターに挿入され得る。一般に、DNA配 列は当該分野で公知の手順により適切な制限エンドヌクレアーゼ部位に挿入され る。このような手順および他の手順は、当業者の範囲内であると考えられる。 発現ベクター中のDNA配列は、適切な発現制御配列(プロモーター)に作動可 能に連結され、mRNAの合成を指示する。このようなプロモーターの代表的な例と しては、以下が挙げられ得る:LTRまたはSV40プロモーター、E.coll. lacまたはtrp 、λファージPLプロモーター、および原核細胞または真核細胞あるいはその ウイルス内で遺伝子の発現を制御することが知られている他のプロモーター。発 現ベクターはまた、翻訳開始のためのリボソーム結合部位および転写ターミネー ターを含有する。ベクターはまた、発現を増幅するための適切な配列を含有し得 る。 さらに、発現ベクターは、好ましくは、形質転換された宿主細胞の選択のため の表現型特性(例えば、真核細胞培養物についてはジヒドロ葉酸レダクターゼま たはネオマイシン耐性、あるいは例えば、E.coliにおけるテトラサイクリン耐性 またはアンピシリン耐性)を提供する1つ以上のマーカー遺伝子を含有する。 本明細書中上記のような適切なDNA配列ならびに適切なプロモーター配列また は制御配列を含有するベクターは、適切な宿主を形質転換して宿主にタンパク質 を発現させるために用いられ得る。 適切な宿主の代表的な例としては、以下が挙げられ得る:細菌細胞(例えば、E.coli StreptomycesSalmonella typhimurium);真菌細胞(例えば酵母) ;昆虫細胞(例えば、Drosophila S2およびSpodoptera Sf9);動物細胞(例え ば、CHO、COSまたはBowes黒色腫);アデノウイルス;植物細胞など。適切な宿 主の選択は、本明細書中の教示から当業者の範囲内であると考えられる。 より詳細には、本発明はまた、上記で広範に記載した1つ以上の配列を含む組 換え構築物を包含する。この構築物は、ベクター(例えば、プラスミドベクター またはウイルスベクター)を含み、このベクターの中には本発明の配列が正方向 または逆方向に挿入されている。この実施態様の好ましい局面において、構築物 はさらに、配列に作動可能に連結された調節配列(例えば、プロモーターを含む )を含む。多数の適切なベクターおよびプロモーターが当業者には公知であり、 そして購入可能である。以下のベクターが例として提供される。細菌性:pQE70 、pQE60、pQE-9(Qiagen)、pBS、pD10、phagescript.psiX174、pbluescript SK 、pbsks,pNH8a、pNH16a,pNH18A、pNH46A(Stratagene);ptrc99a、pKK223-3、p KK233-3、pDR540、pRIT5(Pharmacia);真核生物性:pWLNEO、pSV2CAT、pOG44、p XT1、pSG(Stratagene)pSVK3、pBPV、pMSG、pSVL(Pharmacia)。しかし、他の任意 のプラスミドまたはベクターが、それらが宿主において複製可能で、かつ存続可 能である限り、使用され得る。 プロモーター領域は、CAT(クロラムフェニコールトランスフェラーゼ)ベク ターまたは選択マーカーを有する他のベクターを使用して、任意の所望の遺伝子 から選択され得る。2つの適切なベクターは、PKK232-8およびpCM7である。特に よく知られた細菌プロモーターは、lacI、lacZ、T3、T7、gpt,λPR、PLおよびt rpを含む。真核生物プロモーターは、CMV即時初期型、HSVチミジンキナーゼ、初 期SV40および後期SV40、レトロウイルス由来のLTR、およびマウスメタロチオネ インIを含む。適切なベクターおよびプロモーターの選択は、十分に当業者のレ ベルの範囲内である。 さらなる実施態様では、本発明は上記の構築物を含有する宿主細胞に関する。 宿主細胞は、高等真核生物細胞(例えば、哺乳動物細胞)あるいは下等真核生物 細胞(例えば、酵母細胞)であり得るか、または宿主細胞は原核生物細胞(例え ば、細菌細胞)であり得る。構築物の宿主細胞への導入は、リン酸カルシウムト ランスフェクション、DEAE-デキストラン媒介トランスフェクション、またはエ レクトロポレーションにより達成され得る(Davis,L.,Dibner,M.,Battey,I.,Basi c Methods in Molecular Biology,(1986))。 宿主細胞中の構築物は、組換え配列によりコードされる遺伝子産物を産生する ために、従来の方法において使用され得る。あるいは、本発明のポリペプチドは 、従来のペプチド合成機により合成的に産生され得る。 成熟タンパク質は、哺乳動物細胞、酵母、細菌、または他の細胞中で適切なプ ロモーターの制御下で発現され得る。無細胞翻訳系もまた、本発明のDNA構築物 に由来するRNAを使用して、このようなタンパク質を産生するために用いられ得 る。原核生物宿主および真核生物宿主で使用される適切なクローニングベクター および発現ベクターは、Sambrookら、Molecular Cloning: A Laboratory Manual 、第2版、Cold Spring Harbor,N.Y.,(1989)(この開示は、本明細書中に参考と して援用される)に記載されている。 本発明のポリペプチドをコードするDNAの高等真核生物による転写は、ベクタ ーにエンハンサー配列を挿入することにより増大される。エンハンサーはDNAの シス作用エレメントであり、通常は約10〜約300bpであり、これはプロモーター に作用してその転写を増大させる。例として、複製起点の後期側bp100〜270のSV 40エンハンサー、サイトメガロウイルスの初期プロモーターエンハンサー、複製 起点の後期側のポリオーマエンハンサー、およびアデノウイルスエンハンサーが 挙げられる。 一般に、組換え発現ベクターは、宿主細胞の形質転換を可能とする複製起点お よび選択マーカー(例えば、E.coliのアンピシリン耐性遺伝子およびS.cerevisi ae のTRPI遺伝子)、ならびに下流の構造配列の転写を指示する高発現遺伝子由来 のプロモーターを含有する。このようなプロモーターは、中でも、解糖酵素(例 えば、3-ホスホグリセリン酸キナーゼ(PGK))、α因子、酸性ホスファターゼ、 または熱ショックタンパク質をコードするオペロンに由来し得る。異種構造配列 は、翻訳開始配列および翻訳終止配列と適切な相で組立てられる。必要に応じて 、異種配列は、所望の特徴(例えば、発現された組換え産物の安定化または簡略 化された精製)を与えるN末端同定ペプチドを含む融合タンパク質をコードし得 る。 細菌での使用に有用な発現ベクターは、機能的なプロモーターを有する作動可 能な読み取り相で、所望のタンパク質をコードする構造DNA配列を、適切な翻訳 開始シグナルおよび翻訳終止シグナルと共に挿入することにより構築される。ベ クターは、1つ以上の表現型選択マーカー、およびベクターの維持を確実にし、 かつ所望により宿主内での増幅を提供するための複製起点を含有する。形質転換 のために適切な原核生物宿主は、E.coliBacillus subtilisSalmonella typh imurium 、ならびにPseudomonas属、Streptomyces属、およびStaphylococcus属内 の種々の種を包含するが、他の種もまた選択対象として用いられ得る。 代表的な、しかし限定しない例として、細菌での使用に有用な発現ベクターは 、周知のクローニングベクターpBR322(ATCC 37017)の遺伝子エレメントを含む市 販 のプラスミドに由来する選択マーカーおよび細菌性の複製起点を含有し得る。こ のような市販のベクターは、例えば、pKK223-3(Pharmacia Fine Chemicals,Upp sala,Sweden)およびGEM1(Promega Biotec,Madison,WI,USA)を含む。これら のpBR322「骨格」部分は、適切なプロモーターおよび発現されるべき構造配列と 組み合わされる。 適切な宿主株の形質転換および適切な細胞密度への宿主株の増殖に続いて、選 択されたプロモーターは、適切な手段(例えば、温度シフトまたは化学的誘導) により誘導され、そして細胞はさらなる期間培養される。 細胞は、代表的には遠心分離により収集され、物理的手段または化学的手段に より破砕され、そして得られた粗抽出物はさらなる精製のために保持される。 タンパク質の発現において用いられる微生物細胞は、凍結融解サイクル、超音 波処理、機械的破砕、または細胞溶解剤の使用を包含する任意の便利な方法(こ のような方法は、当業者に周知である)により破砕され得る。 種々の哺乳動物細胞の培養系もまた、組換えタンパク質を発現するために用い られ得る。哺乳動物発現系の例には、Gluzman,Cell,23: 175(1981)により記載 されるサル腎臓線維芽細胞のCOS-7株、および適合性のベクターを発現し得る他 の細胞株(例えば、C127、3T3、CHO、HeLa、およびBHK細胞株)が含まれる。哺 乳動物発現ベクターは、複製起点、適切なプロモーターおよびエンハンサー、を 含有し、そしてまた任意の必要なリボソーム結合部位、ポリアデニル化部位、ス プライスドナー部位およびスプライスアクセプター部位、転写終結配列、および 5'フランキング非転写配列を含有する。SV40スプライスに由来するDNA配列、お よびポリアデニル化部位は、必要な非転写遺伝子エレメントを提供するために使 用され得る。 HDGF-2ポリペプチドは、以下で使用される方法により組換え細胞培養物から回 収され、そして精製され得る:硫安沈殿またはエタノール沈殿、酸抽出、陰イオ ンまたは陽イオン交換クロマトグラフィー、ホスホセルロースクロマトグラフィ ー、疎水的相互作用クロマトグラフィー、アフィニティークロマトグラフィー、 ヒドロキシアパタイトクロマトグラフィー、およびレクチンクロマトグラフィー 。必要に応じて、タンパク質の再折りたたみ(refolding)工程が、成熟タンパ ク 質の配置を完了するために使用され得る。最終的に、高速液体クロマトグラフィ ー(HPLC)が、最終的な精製工程のために用いられ得る。 本発明のポリペプチドは、天然の精製された産物であり得るか、または化学合 成手順の産物であり得るか、あるいは原核生物宿主または真核生物宿主(例えば 、培養物中の細菌、酵母、高等植物、昆虫、および哺乳動物細胞による)から組 換え技術により産生され得る。組換え産生手順に用いられる宿主に依存して、本 発明のポリペプチドは、グリコシル化され得るか、またはグリコシル化され得な い。本発明のポリペプチドはまた、最初のメチオニンアミノ酸残基を含み得る。 本発明のポリペプチドは、血管形成能力の結果として、血管内皮細胞増殖を刺 激し、そして種々の疾患病状(例えば、血栓症、動脈硬化症、および他の心血管 病状)による虚血組織の再血管形成を刺激するための処置に使用され得る。 これらのポリペプチドはまた、血管形成能力の結果として、中胚葉の誘導およ び初期胚における四肢の再生を刺激するために使用され得る。 ポリペプチドはまた、損傷、火傷、手術、および潰瘍による傷の治癒を促進す るために使用され得る。なぜならこれらのポリペプチドが、異なる起源の種々の 細胞(例えば、線維芽細胞および骨格筋細胞)に対して細胞分裂促進性であり、 そしてそれゆえ、損傷を受けた組織または疾病組織の修復または置換を促進する からである。 本発明のポリペプチドはまた、神経の成長を刺激するために、そして特定の神 経損傷またはアルツハイマー病、パーキンソン病、およびAIDS関連コンプレック スのような神経変性状態に生じる神経損傷を処置および予防するために使用され 得る。 このポリペプチドは、軟骨細胞増殖を刺激するために使用され、従ってこのポ リペプチドは骨の再生および歯周の再生を増大するために、そして組織移植また は骨の移植片を支援するために使用され得る。 本発明のポリペプチドは、ケラチン生成細胞の増殖を刺激することにより、日 焼けによる皮膚老化を妨げるために使用され得る。 このポリペプチドはまた、毛髪形成細胞を活性化し、そしてメラニン細胞増殖 を促進することにより、脱毛を防止するために使用され得る。 本発明のポリペプチドはまた、造血細胞および骨髄細胞の増殖および分化を刺 激するために使用され得る。 ポリペプチドはまた、移植前の器官を維持するために、または初代組織の細胞 培養を支持するために使用され得る。 本発明のポリペプチドはまた、中胚葉起源の組織を誘導して初期胚を分化させ るために使用され得る。 本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、ヒトの疾患に対する処置お よび診断の発見のための研究試薬および研究材料として使用され得る。 本発明は、本発明のポリペプチドのレセプターの同定のための方法を提供する 。このレセプターをコードする遺伝子は、例えば、リガンドパニングおよびFACS 探索(Coliganら、Current Protocols in Immun.,1(2),第5章、(1991))のような 、当該業者に公知の多数の方法により同定され得る。好ましくは、発現クローニ ングは、ポリアデニル化RNAがHDGF-2ポリペプチドに応答性の細胞から調製され る場合に使用される。そしてこのRNAから作製されたcDNAライブラリーをプール に分割し、そして応答しないCOS細胞または他の細胞にトランスフェクトするた めに使用される。スライドガラス上で増殖したトランスフェクトした細胞を、標 識されたHDGF-2に曝露する。HDGF-2ポリペプチドは、ヨウ素化または部位特異的 プロテインキナーゼに対する認識部位の含有を含む種々の手段により標識され得 る。固定およびインキュベーションの後、スライドをオートラジオグラフィー分 析に供する。陽性プールを同定しそしてサブプールを調製しそして反復性のサブ プールおよび再スクリーニングプロセスを用いて再トランスフェクトし、推定の レセプターをコードする単一クローンを最終的に得る。レセプター同定のための 1つの別のアプローチとして、標識されたリガンドは、レセプター分子を発現す る細胞膜または抽出調製物と光学親和結合(photoaffinity linked)され得る。 架橋物質はPAGE分析により分離され、そしてX線フィルムに曝露される。リガン ドーレセプターを含有する標識された複合体は、切り出され、ペプチドフラグメ ントに分解され、そしてタンパク質微小配列決定に供され得る。微小配列決定か ら得られたアミノ酸配列は、一連の縮重オリゴヌクレオチドプローブを設計して 推定のレセプターをコードする遺伝子を同定するためのcDNAライブラリーをスク リー ニングするために使用される。 本発明は、化合物をスクリーニングして、HDGF-2レセプター(アゴニスト)に 結合し、かつ活性化するか、またはHDGF-1レセプター(アンタゴニスト)に結合 し、かつ阻害する化合物を同定する。例えば、競合アッセイが使用され得、ここ で、HDGF-2レセプターを発現する哺乳動物細胞または膜調製物を標識されたHDGF -2および試験されるべき化合物と共にインキュベートする。HDGF-2レセプターに 競合するための化合物の能力は、化合物の存在および非存在における結合HDGF-2 ポリペプチドの量を同定するために、液体シンチレーションカウンティングによ って同定され得る。 あるいは、アゴニスト化合物は、試験されるべき化合物の相互作用の後、公知 のセカンドメッセンジャー系の応答を検出することによって同定され得、そして HDGF-2レセプターは、放射能を有する化合物を標識すること、およびHDGF-2レセ プターを発現する細胞と接触することにより測定される。このようなセカンドメ ッセンジャー系は、cAMPグアニル酸シクラーゼ、イオンチャンネル、またはホス ホイノシチド加水分解を含むが、これらに限定されない。アンタゴニスト化合物 は、このアッセイを用いて同定され得、ここで、アンタゴニストは、レセプター に結合するがセカンドメッセンジャー応答を誘発せず、その結果そのレセプター 由来のHDGF-2ポリペプチドを効率よく阻止する。 上記のアッセイについて細胞を調製する方法は、細胞集団(レセプターを含ま ないと仮定される)をHDGF-2レセプターをコードするDNAを含む適切なベクター でトランスフェクトする工程を包含し、それにより細胞はレセプターを発現する 。適切な応答系は、所望のセカンドメッセンジャー経路(cAMP、イオンチャンネ ル、ホスホイノシチドキナーゼ、またはカルシウム応答を含む)を含む適切な宿 主へのDNAのトランスフェクションによって得られる。このようなトランスフェ クション系は、種々の化合物および細胞に曝露されたポリペプチドの活性を分析 するための応答系を提供する。 特異性アッセイにおいて、HDGF-2の増殖刺激活性は、Nakamura,H.ら、Clin.Ch im.Acta,183:273-284(1989)(これは、本明細書によりその全体が参考として援 用される)によるWeissアルビノマウス3T3細胞への[3H]チミジンの取り込みを測 定することによる潜在的な化合物の存在下でアッセイされ得る。 アンタゴニスト化合物の例としては、HDGF-2レセプター上の種々の重要な位置 を有する、免疫反応性であり、そしてレセプターに結合し、そしてHDGF-2ポリペ プチド由来のレセプターをブロックする抗体が挙げられる。抗体には、一般に、 抗体の抗原結合部位に結合した独特の決定基を認識する抗イディオタイプの抗体 が含まれる。このタイプの抗体は、HDGF-2ポリペプチド自身に対して調製されて 抗体に結合し、そして抗体のそのレセプターとの相互作用を防止する。 HDGF-2自身との競合においてHDGF-2レセプターに結合するがセカンドメッセン ジャー応答を惹起しないオリゴペプチドはまた、アンタゴニスト化合物として使 用され得る。オリゴペプチドの例としては、例えば、小ペプチドまたはペプチド 様分子が挙げられる。オリゴペプチドはまた、HDGF-2の活性部位に結合して、HD GF-2のそのレセプターとの相互作用をブロックし得る。 アンチセンス技術を用いて調製されたアンチセンス構築物はまた、HDGF-2ポリ ペプチドの産生を防止するためのアンタゴニスト化合物として使用され得る。ア ンチセンス技術は、三重らせん形成またはアンチセンスDNAもしくはRNAを介した 遺伝子発現を制御するために用いられ得、これらの方法の両方は、ポリヌクレオ チドがDNAまたはRNAに結合することに基づいている。例えば、本発明の成熟ポリ ペプチドをコードするポリヌクレオチド配列の5'コード部分は、長さが約10〜40 塩基対のアンチセンスRNAオリゴヌクレオチドを設計するために用いられる。DNA オリゴヌクレオチドは、転写に関与する遺伝子の領域に相補的であるように設計 され(三重らせん-Leeら、Nucl.Acids Res.,6:3073(1979); Cooneyら、Scienc e,241:456(1988);およびDervanら、Science,251: 1360(1991)を参照のこと) 、それにより、転写およびHDGF-2の産生を阻害する。アンチセンスRNAオリゴヌ クレオチドはインビボでmRNAにハイブリダイズし、そしてmRNA分子のHDGF-2ポリ ペプチドへの翻訳をブロックする(アンチセンス-Okano、J.Neurochem.,56:56 0(1991); 遺伝子発現のアンチセンスインヒビターとしてのオリゴヌクレオチド ,CRC Press,Boca Raton,FL(1988))。上記のオリゴヌクレオチドはまた、細 胞に送達され得、それによって、アンチセンスRNAまたはDNAが、HDGF-2の産生を 阻害するためにインビボで発現され得る。 アンタゴニストは、新生物細胞および組織上での本発明のポリペプチドの細胞 成長および増殖効果を(すなわち、腫瘍の血管形成の刺激)を阻害するために使 用され得る。そしてそれゆえ、異常な細胞成長および増殖(例えば、腫瘍形成ま たは増殖において)を遅延するかまたは妨げる。 アンタゴニストはまた、血管過多疾患の予防に使用され得、そしてカプセル外 の白内障手術後の上皮レンズ細胞の増殖を妨げる。 本発明のポリペプチドの細胞分裂促進性活性の予防はまた、血管形成術バルー ン後の再狭窄のような場合に所望される。 アンタゴニストはまた創傷治癒の間の瘢痕組織の炎症および増殖を妨ぐために 使用され得る。 アンタゴニストはまた薬学的に受容可能なキャリア(例えば、以下に記載のよ うな)を有する化合物において使用され得る。 本発明のポリペプチドおよびアゴニストならびにアンタゴニスト化合物は、適 切な薬学的キャリアと組み合わせて使用され得る。このような組成物は、治療有 効量のポリペプチドまたは化合物、および薬学的に受容可能なキャリアまたは賦 形剤を含む。このようなキャリアとしては、生理食塩水、緩衝化生理食塩水、デ キストロース、水、グリセロール、エタノール、およびそれらの組み合わせが挙 げられるが、これらに限定されない。処方は、投与の態様に合わせるべきである 。 本発明はまた、本発明の薬学的組成物の1以上の成分で満たされた1以上の容 器を含む薬学的パックまたはキットを提供する。このような容器に関して、薬剤 または生物学的製品の製造、使用、または販売を統制する政府機関により規定さ れた形式の製品表示をし得、この製品表示はヒトへの投与についての製造、使用 、または販売における機関による認可を表す。さらに、本発明のポリペプチドお よび化合物は、他の治療化合物と共に用いられ得る。 これらの薬学的組成物は、局所、静脈内、腹腔内、筋肉内、皮下、または皮内 経路によるような簡便な様式で投与され得る。薬学的組成物は、特定の徴候の処 置および/または予防に効果的な量で投与される。一般に、薬学的組成物は少な くとも約10μg/kg体重の量で投与され、そして多くの場合、それらは1日あたり 約8mg/kg体重を超えない量で投与される。多くの場合、投薬量は、1日あたり 約10μg/kg体重から約1mg/kg体重であり、投与経路、症状などが考慮される。 HDGF-2ポリペプチドおよびポリペプチドであるアゴニストおよびアンタゴニス トはまた、インビボでのこのようなポリペプチドの発現により本発明に従って用 いられ得、これはしばしば、「遺伝子治療」といわれる。 従って、例えば、患者由来の細胞は、ポリペプチドをコードするポリヌクレオ チド(DNAまたはRNA)を用いてエクソビボで操作され得、次いで、この操作された 細胞はポリペプチドで処置されるべき患者に提供される。このような方法は当該 分野で周知であり、そして本明細書中の教示から明らかである。例えば、細胞は 、本発明のポリペプチドをコードするRNAを含むレトロウイルスプラスミドベク ターの使用により操作され得る。 同様に、細胞は、インビボでのポリペプチドの発現のために、例えば、当該分 野で公知の手順によりインビボで操作され得る。例えば、パッケージング細胞は 、本発明のポリペプチドをコードするRNAを含むレトロウイルスプラスミドベク ターで形質導入される。その結果、ここでパッケージング細胞は、目的の遺伝子 を含有する感染性ウイルス粒子を産生する。これらのプロデューサー細胞は、イ ンビボにおける細胞を操作するために、およびインビボでのポリペプチドの発現 を操作するために患者に投与され得る。このような方法による本発明のポリペプ チドを投与するためのこれらの方法および他の方法は、本発明の教示により当業 者には明らかであるはずである。 本明細書中上記の、誘導され得るレトロウイルスプラスミドベクター由来のレ トロウイルスは、モロニーマウス白血病ウイルス、脾壊死ウイルス、レトロウイ ルス(例えばラウス肉腫ウイルス)、ハーベイ肉腫ウイルス、ニワトリ白血病ウ イルス、テナガザル白血病ウイルス、ヒト免疫不全ウイルス、アデノウイルス、 骨髄増殖性肉腫ウイルス、および哺乳動物腫瘍ウイルスを包含するが、これらに 限定されない。1つの実施態様において、レトロウイルスプラスミドベクターは 、モロニーマウス白血病ウイルスより誘導される。 ベクターは、1以上のプロモーターを含有する。使用され得る適切なプロモー ターは、レトロウイルスLTR;SV40プロモーター;およびMillerら、Biotechniqu es 、第7巻、第9号、980-990(1989)に記載されるヒトサイトメガロウイルス (CMV) プロモーター、または任意の他のプロモーター(例えば、これらに限定し ないが、ヒストン、pol III,およびβ−アクチンプロモーターを包含する、真 核生物細胞性プロモーターのような細胞プロモーター)を包含するが、これらに 限定されない。使用され得る他のウイルスプロモーターは、アデノウイルスプロ モーター、チミジンキナーゼ(TK)プロモーター、およびB19パルボウイルスプ ロモーターを包含するが、これらに限定されない。適切なプロモーターの選択は 、本明細書中に含まれる技術より当業者に明らかである。 本発明のポリペプチドをコードする核酸配列は、適切なプロモーターの制御下 にある。使用され得る適切なプロモーターは、以下を包含するが、これらに限定 されない:アデノウイルス主要後期プロモーターのようなアデノウイルスプロモ ーター;またはサイトメガロウイルス(CMV)プロモーターのような異種プロモ ーター;RSウイルス(respiratory syncytial virus)(RSV)プロモーター;MMT プロモーターのような誘導プロモーター;メタロチオネインプロモーター;熱シ ョックプロモーター;アルブミンプロモーター;ApoAIプロモーター;ヒトグロ ブリンプロモーター;ヘルペス単純チミジンキナーゼプロモーターのようなウイ ルスチミジンキナーゼプロモーター;レトロウイルスLTR(本明細書中上記の改 変されたレトロウイルスLTRを包含する);β−アクチンプロモーター;および ヒト増殖ホルモンプロモーター。プロモーターはまた、ポリペプチドをコードす る遺伝子を制御する天然のプロモーターであり得る。 レトロウイルスプラスミドベクターは、パッケージング細胞株を形質導入する ために使用され、プロデューサー細胞株を形成する。トランスフェクトされ得る パッケージング細胞の例は、PE501、PA317、ψ-2、ψ-AM、PA12、T19-14X、VT-1 9-17-H2、ψCRE、ψCRIP、GP+E-86、GP+envAm12、および本明細書中でその全体 が参考として援用される、Miller、Human Gene Therapy,第1巻、5-14頁(1990 )に記載されるDAN細胞株を含むが、これらに限定されない。ベクターは、当該 分野で公知の任意の手法を通じてパッケージング細胞を形質導入し得る。このよ うな手法は、エレクトロポレーション、リポソームの使用、およびCaPO4沈澱を 包含するが、これらに限定されない。1つの改変においては、レトロウイルスプ ラスミドベクターは、リポソーム中へカプセル化され得るか、または脂質と結合 し、次いで宿主に投与され得る。 プロデューサー細胞株は、ポリペプチドをコードする核酸配列(単数または複 数)を含む感染性レトロウイルスベクター粒子を生成する。次いで、このような レトロウイルスベクター粒子は、インビトロ、またはインビボのいずれかにおい て、真核生物細胞を形質導入するために使用され得る。形質導入された真核生物 細胞は、ポリペプチドをコードする核酸配列(単数または複数)を発現する。形 質導入され得る真核生物細胞は、胚幹細胞、胚癌腫細胞、ならびに造血幹細胞、 肝細胞、線維芽細胞、筋芽細胞、ケラチン生成細胞、内皮細胞、および気管支の 上皮細胞を包含するが、これらに限定されない。 本発明はまた、診断としてのHDGF-2遺伝子の使用に関する。HDGF-2をコードす る核酸配列における変異の検出は、疾患またはHDGF-2の過小発現を生じる疾患に 対する感受性の診断を可能にする。 ヒトHDGF-2遺伝子における変異を有する個体は、種々の技術によりDNAレベル で検出され得る。診断のための核酸は、患者の細胞(例えば、血液、尿、唾液、 組織バイオプシー、および剖検材料)より得られ得る。ゲノムDNAは、検出のた めに直接使用され得るか、または分析前にPCRを用いることにより酵素的に増幅 され得る(Saikiら、Nature、324:163-166(1986))。RNAまたはcDNAもまた同じ 目的のために使用され得る。一例として、本発明のポリペプチドをコードする核 酸に相補的なPCRプライマーが、HDGF-2変異を同定および分析するために使用さ れ得る。例えば、欠失および挿入は、正常な遺伝子型との比較における増幅され た産物のサイズの変化により検出され得る。点突然変異は、放射標識されたHDGF -2 RNAまたは、あるいは、放射標識されたHDGF-2アンチセンスDNA配列に、増幅 したDNAをハイブリダイズさせることにより同定され得る。完全に対合した配列 は、RNase A消化または融解温度の差により、ミスマッチした二本鎖と区別され 得る。 参照遺伝子と変異を有する遺伝子との間の配列の相違は、直接配列決定法によ って明らかにされ得る。さらに、クローン化DNAセグメントは、特異的なDNAセグ メントを検出するためのプローブとして使用され得る。本方法の感度は、PCRと 組み合わせた場合、大いに増強される。例えば、配列決定プライマーは、二本鎖 PCR産物または改変PCRによって生成された一本鎖鋳型分子と共に使用される。配 列決定は、放射性標識ヌクレオチドを用いる従来の手順によって、または蛍光タ グを用いる自動配列決定手順によって行われる。 DNA配列の相違に基づいた遺伝子試験は、変性剤を含むかまたは含まないゲル 中のDNAフラグメントの電気泳動の移動度における変化の検出により達成され得 る。小さな配列の欠損および挿入は、高分離ゲル電気泳動により視覚化され得る 。異なる配列のDNAフラグメントは、変性ホルムアミドグラジエントゲル上で区 別され得る。このゲル中で、異なるDNAフラグメントの移動度は、それらの特異 的な融解温度または部分的融解温度に従い、異なる位置に、ゲル中で、遅滞され る(例えば、Myersら、Science、230:1242(1985))。 特定の位置での配列の変化はまた、ヌクレアーゼ保護アッセイ(例えば、RNas e保護およびS1保護または化学的切断法(例えば、cottonら、PNAS、USA、85:439 7-4401(1985)))により明らかにされ得る。 従って、特定のDNA配列の検出は、例えば、ハイブリダイゼーション、RNase保 護、化学的切断、直接DNA配列決定または制限酵素の使用(例えば、制限フラグ メント長多形(RFLP))、およびゲノムDNAのサザンブロッティングのような方法 により達成され得る。 より慣習的なゲル電気泳動およびDNA配列決定に加えて、変異はまた、インサ イチュ分析により検出され得る。 本発明はまた、種々の組織におけるHDGF-2タンパク質のレベルの変化を検出す るための診断アッセイに関する。なぜなら、正常コントロール組織サンプルと比 較したこのタンパク質の過剰発現は、例えば、新生物において生じる異常な細胞 の分化および増殖の存在を検出し得るからである。宿主に由来するサンプル中の HDGF-2タンパク質のレベルを検出するために使用されるアッセイは、当業者には 周知であり、そしてラジオイムノアッセイ、競合的結合アッセイ、ウエスタンブ ロット分析、および好ましくは、ELISAアッセイを含む。ELISAアッセイは、最初 にHDGF-2抗原に特異的な抗体、好ましくはモノクローナル抗体を調製する工程を 包含する。さらに、レポーター抗体がこのモノクローナル抗体に対して調製され る。このレポーター抗体に対して、検出可能な試薬、例えば、放射能、蛍光、ま たはこの実施例においては、西洋ワサビペルオキシダーゼ酵素を結合させる。こ こで、サンプルは宿主から取り出され、そしてサンプル中のタンパク質と結合す る固体支持体(例えば、ポリスチレンディッシュ)上でインキュベートされる。 次いで、ディッシュ上の任意の遊離のタンパク質結合部位は、ウシ血清アルブミ ンのような非特異的タンパク質を用いてインキュベートすることにより覆われる 。次に、モノクローナル抗体は、ディッシュ中でインキュベートされる。この間 に、モノクローナル抗体は、ポリスチレンディッシュに結合した任意のHDGF-2タ ンパク質に結合する。全ての非結合モノクローナル抗体は、緩衝液で洗い出され る。西洋ワサビペルオキシダーゼと結合したレポーター抗体はここで、ディッシ ュ中に置かれ、HDGF-2と結合した任意のモノクローナル抗体に対するレポーター 抗体の結合を生じる。次いで、非結合レポーター抗体は、洗い出される。次いで 、ペルオキシダーゼ基質がディッシュに加えられ、そして所定の時間内の発色量 は、標準曲線と比較した場合、患者サンプルの所定の容量中に存在するHDGF-2タ ンパク質の測定値である。 競合アッセイが使用され得る。ここで、HDGF-2に特異的な抗体は、固体支持体 に結合し、そして標識HDGF-2および宿主由来のサンプルは、固体支持体上を通過 し、そして、固体支持体に結合した検出された標識の量は、サンプル中のHDGF-2 の量と相関し得る。 本発明の配列はまた、染色体の同定に有益である。この配列は、個々のヒト染 色体の特定の位置を特異的に標的化し、そしてハイブリダイズし得る。さらに、 現在は染色体上の特定の部位を同定する必要がある。現在、染色体位置の標識に 利用可能な実際の配列データ(反復多形)に基づく染色体標識試薬はほとんどな い。本発明に従うDNAの染色体へのマッピングは、これらの配列と疾患に関する 遺伝子とを相関させる重要な第1段階である。 簡潔に述べれば、配列は、cDNAからPCRプライマー(好ましくは15〜25 bp)を 調製することにより染色体にマップされ得る。この遺伝子の3’非翻訳領域のコ ンピューター解析が、ゲノムDNA内で1より多いエキソンにまたがらない、従っ て増幅プロセスを複雑化しないプライマーを迅速に選択するために使用される。 次いで、これらのプライマーは、個々のヒト染色体を含む体細胞ハイブリッドの PCRスクリーニングに使用される。プライマーに対応するヒト遺伝子を含むこれ らのハイブリッドのみが、増幅フラグメントを生じる。 体細胞ハイブリッドのPCRマッピングは、特定の染色体に特定のDNAを割り当て るための迅速な手順である。同じオリゴヌクレオチドプライマーを用いる本発明 を使用して、特定の染色体由来のフラグメントのパネルまたは類似の様式の大き なゲノムクローンのプールを用いて部分的局在性(sublocalization)が達成され 得る。その染色体に対してマップするために同様に使用され得る他のマッピング ストラテジーは、インサイチュハイブリダイゼーション、標識化フロー選別(flo w-sorted)染色体でのプレスクリーニング、および染色体特異的cDNAライブラリ ーを構築するためのハイブリダイゼーションによる予備選択を含む。 cDNAクローンの中期染色体スプレッドへの蛍光インサイチュハイブリダイゼー ション(FISH)は、1工程で正確な染色体位置を提供するために使用され得る。こ の技術は、少なくとも50または60塩基を有するcDNAを用いて使用され得る。この 技術の総説としては、Vermaら,Human Chromosomes: a Manual of Basic Techni ques,Pergamon Press,New York(1988)を参照のこと。 一旦配列が正確な染色体位置にマップされると、染色体上での配列の物理的な 位置を遺伝的地図のデータと相関し得る。このようなデータは、例えば、V.McK usick,Mendelian Inheritance in Man(Johns Hopkins University Welch Medic al Libraryからオンラインで入手可能である)に見出される。次いで、同一の染 色体領域にマップされる遺伝子と疾患との間の関係が、連結解析(物理的に隣接 した遺伝子の同時遺伝)により同定される。 次に、罹患個体と非罹患個体との間のcDNAまたはゲノム配列の差異を決定する 必要がある。変異がいくつかまたはすべての罹患個体に観察されるが正常な個体 には観察されない場合、この変異は疾患の原因因子でありそうである。 物理的マッピング技術および遺伝子マッピング技術の現在の解像度では、疾患 に関する染色体領域に正確に位置決めされたcDNAは、50と500との間の潜在的原 因遺伝子の1つであり得る。(これは、1メガベースのマッピング解像度で、そ して20kbあたり1遺伝子と仮定する。) このポリペプチド、それらのフラグメントまたは他の誘導体、またはそれらの アナログ、あるいはそれらを発現する細胞は、それらに対する抗体を産生するた めの免疫原として使用され得る。これらの抗体は、例えば、ポリクローナル抗体 、またはモノクローナル抗体であり得る。本発明はまた、キメラ抗体、単鎖抗体 およびヒト化抗体、ならびにFabフラグメント、またはFab発現ライブラリーの産 物を含む。当該分野で公知の種々の手順が、このような抗体およびフラグメント の産生のために使用され得る。 本発明の配列に対応するポリペプチドに対して生成される抗体は、動物へのポ リペプチドの直接注射により、または動物へのポリペプチドの投与により得られ 得る。この動物は、好ましくは非ヒトである。次いで、このようにして得られた 抗体は、ポリペプチド自体に結合する。このようにして、ポリペプチドのフラグ メントのみをコードする配列でさえも、天然のポリペプチド全体に結合する抗体 を生成するために使用され得る。次いで、このような抗体は、そのポリペプチド を発現する組織からポリペプチドを単離するために使用され得る。 モノクローナル抗体の調製のために、連続的な細胞株の培養により産生される 抗体を提供する任意の技術が使用され得る。例としては、ハイブリドーマ技術(K ohlerおよびMilstein,1975,Nature,256: 495-497)、トリオーマ技術、ヒトB 細胞ハイブリドーマ技術(Kozborら,1983,Immunology Today4: 72)、およびヒ トモノクローナル抗体を産生するためのEBVハイブリドーマ技術(Coleら,1985, Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy,Alan R.Liss,Inc.,77-96頁)が挙 げられる。 単鎖抗体を産生するために記載された技術(米国特許第4,946,778号)を、本発 明の免疫原性ポリペプチド産物に対する単鎖抗体を生成するために適合し得る。 また、トランスジェニックマウスが、本発明の免疫原性ポリペプチド産物に対す るヒト化抗体の発現に使用され得る。 本発明を以下の実施例を参照にしてさらに記載する;しかし、本発明はこのよ うな実施例に限定されないことが理解されるべきである。すべての部または量は 、他に明記しない限り重量基準である。 以下の実施例の理解を容易にするために、出現頻度の高い所定の方法および/ または用語を記載する。 「プラスミド」は、先行する小文字のpおよび/またはそれに続く大文字およ び/または数字により命名される。本明細書中の出発プラスミドは、市販されて いるか、制限無く公的に入手可能であるか、または公開された手順に従って入手 可能なプラスミドから構築され得るかのいずれかである。さらに、記載されるプ ラスミドと等価のプラスミドが当該分野で公知であり、そして当業者には通常明 らかである。 DNAの「消化」は、DNA中の特定の配列でのみ作用する制限酵素でそのDNAを触 媒反応的に切断することをいう。本明細書中で使用される種々の制限酵素は、市 販されており、そしてそれらの反応条件、補因子、および他の必要条件は当業者 に公知のものが使用された。分析目的のために、代表的には1μgのプラスミド またはDNAフラグメントには、約2単位の酵素が約20μlの緩衝溶液中で使用され る。プラスミド構築のためのDNAフラグメントを単離する目的のために、代表的 には5〜50μgのDNAが20〜250単位の酵素で、より大きな容量中で消化される。 特定の制限酵素のための適切な緩衝液および基質量は、製造者により特定される 。37℃にての約1時間のインキュベーション時間が通常使用されるが、しかしこ れは供給者の説明書に従って変わり得る。消化後、反応物をポリアクリルアミド ゲルで直接電気泳動して所望のフラグメントを単離する。 切断フラグメントのサイズ分離は、Goeddel,D.ら,Nucleic Acids Res.,8: 4 057(1980)により記載された8%ポリアクリルアミドゲルを使用して行われる。 「オリゴヌクレオチド」は、1本鎖ポリデオキシヌクレオチドまたは2つの相 補的なポリデオキシヌクレオチド鎖のいずれかをいい、これらは化学的に合成さ れ得る。このような合成オリゴヌクレオチドは、5'リン酸を有さず、従ってキ ナーゼの存在下でリン酸とATPとを添加しなければ別のオリゴヌクレオチドと連 結しない。合成オリゴヌクレオチドは、脱リン酸化されていないフラグメントに 連結する。 「連結」は、2つの2本鎖核酸フラグメントの間でリン酸ジエステル結合を形 成するプロセスをいう(Maniatis,Tら、同上、146頁)。他に提供されていなけれ ば、連結は公知の緩衝液および条件で、ほぼ等モル量の連結されるべきDNAフラ グメント0.5μgあたり10単位のT4 DNAリガーゼ(「リガーゼ」)を用いて達成さ れ得る。 記載しない限り、形質転換はGraham,F.およびVan der Eb,A.,Virology,52: 456-457(1973)の方法に記載のように実施された。 実施例1 HDGF-2 タンパク質の細菌発現および精製 HDGF-2をコードするDNA配列(ATCC受託番号第 号)を、タンパク質の5’ 配列および遺伝子に対する3’ベクター配列に対応するPCRオリゴヌクレオチド プライマーを用いて最初に増幅する。この遺伝子に対応するさらなるヌクレオチ ドを、5'および3'配列にそれぞれ添加した。HDGF-2の5'オリゴヌクレオチド TGFα-HIIコード配列が続く。 制限酵素部位は、細菌性発現ベクターpQE-9(Qiagen、 Inc.、Chatsworth、C A 91311)上の制限酵素部位に対応する。pQE-9は、抗生物質耐性(Ampr)、細菌 の複製起点(ori)、IPTG調節可能プロモーターオペレーター(P/O)、リボソー ム結合部位(RBS)、6-Hisタグ、および制限酵素部位をコードする。次いで、pQ E-9をBamHIおよびHindIIIで消化する。増幅された配列をpQE-9に連結し、そして ヒスチジンタグおよびRBSをコードする配列とインフレームで挿入する。次いで 、連結混合物を用いて、E .coli M15/rep4株(Qiagen,Inc)を、Sambrook,J.ら、 Molecular Cloning: A Laboratory Manual,Cold Spring Laboratory Press,(1 989)に記載の手順により形質転換する。M15/rep4は、 lacIリプレッサーを発現 し、そしてカナマイシン耐性(Kanr)をもまた付与するプラスミドpREP4のマル チコピーを含有する。形質転換体をLBプレート上で増殖する能力により同定し、 そしてアンピシリン/カナマイシン耐性コロニーを選択する。プラスミドDNAを 単離して、制限酵素分析により確認する。所望の構築物を含有するクローンを、 Amp(100μg/ml)およびKan(25μg/ml)の両方を補充したLB培地における液体 培養で一晩(O/N)増殖させる。O/N培養物を用いて、1:100〜1:250の比で大規模 培養物に接種する。細胞を、600の光学密度(O.D.600)が0.4と0.6との間になる まで増殖させる。次いで、IPTG(「イソプロピル-B-D-チオガラクトピラノシド 」)を加えて1mMの最終濃度にする。IPTGはlacIリプレッサーを不活性化し、P/ Oリーディングを解読して遺伝子発現を増加することにより誘導する。細胞を3 〜4時間増殖させる。次いで、細胞を遠心分離により収集する。この細胞ペレッ トをカオトロピック薬剤6MグアニジンHCl中で可溶化する。明澄化の後、6-Hisタ グを含有するタンパク質による緊密な結合を可能にする条件下でのニッケル−キ レートカラムにおけるクロマトグラフィーによって、この溶液から可溶化HDGF-2 を精製する(Hochuli,Eら、J.Chromatography 411:177-184(1984))。このタンパ ク質を6MグアニジンHCl pH5.0でカラムから溶出し、そして復元のために3Mグア ニジンHCl、100mMリン酸ナトリウム、10mMグルタチオン(還元型)、および2mM グルタチオン(酸化型)に調整した。この溶液中での12時間のインキュベーショ ンの後、タンパク質を10mMリン酸ナトリウムに対して透析した。 実施例2 バキュロウイルス発現系を用いるケモカインHDGF-2の発現および精製 全長のHDGF-2タンパク質をコードするDNA配列(ATCC受託番号第 号)を、 遺伝子の5'および3'配列に対応するPCRオリゴヌクレオチドプライマーを用い て増幅した。 (配列番号5)を有し、そしてBamHI制限酵素部位(太字)、それに続く真核生 物細胞における翻訳の開始に有効なシグナルに類似する6ヌクレオチド(Kozak ,M、J.Mol.Biol.,196,947-950,(1987))を含み、HDGF-2遺伝子の25ヌクレ オチドが続く(翻訳開始コドン「ATG」は下線を付される)。 3’プライマーは、配列5’ GCATGGTACCTCACCTAGGAAGAAGGAGGTCTTCAC 3’( 配列番号6)を有し、そして制限エンドヌクレアーゼAsp718の切断部位およびHD GF-2遺伝子の3'非翻訳配列に相補的な26ヌクレオチドを含む。増幅配列を、市 販のキット(「Geneclean」BIO 101 Inc.,La Jolla,Ca.)を用いて、1%アガ ロースゲルより単離した。次いで、フラグメントをエンドヌクレアーゼBamH IおよびAsp718で消化し、そして次いで再び1%アガロースゲルで精製した。こ のフラグメントをF2と称する。 ベーターpA2(pVL941ベクターの改変体、下記)をバキュロウイルス発現系を 用いるHDGF-2タンパク質の発現のために用いる(総説について、Summers,M.D. およびSmith,G.E.1987,A manual of methods for bacul ovirus vectors and insect cell culture procedures,Texas Agricultural Experimental Station Bulletin No.1555を参照のこと)。この発現ベクターは、Autographa californ ica核多角体病ウイルス(AcMNPV)の強力なポリヘドリンプロモーター、それに 続く制限エンドヌクレアーゼの認識部位を含む。シミアンウイルス(SV)40のポ リアデニル化部位を、効率的なポリアデニル化のために用いる。組換えウイルス を容易に選択するために、E.coli由来のβガラクトシダーゼ遺伝子をポリヘド リン遺伝子のポリアデニル化シグナルが続くポリヘドリンプロモーターと同方向 に挿入する。ポリヘドリン配列を、コトランスフェクト野生型ウイルスDNAの細 胞媒介性相同組換えのためのウイルス配列により両端で隣接させる。多くの他の バキュロウイルスベクターが、pA2の代わり(例えば、pRG1,pAc373、pVL941、 およびpAcIM1)に用いられ得る(Luckow,V.A.およびSummers,M.D.、Virology ,170:31-39)。 プラスミドを制限酵素で消化し、そして次いで当該分野で公知の手順により仔 ウシ腸ホスファターゼを用いて脱リン酸化した。次いで、DNAを市販のキット( 「Geneclean」BIO 101 Inc.,La Jolla,Ca.)を用いて、1%アガロースゲルよ り単離した。このベクターDNAをV2と称する。 フラグメントF2および脱リン酸化プラスミドV2を、T4 DNAリガーゼを用いて連 結した。次いで、E.coli XL-1 Blue細胞を形質転換し、そして酵素BamHIおよび Asp718を用いて、HDGF-2遺伝子を有するプラスミド(pBac-HDGF-2)を含む細菌 を同定した。クローン化フラグメントの配列を、DNA配列決定により確認した。 5μgのプラスミドpBac-HDGF-2を、リポフェクション法(Felgnerら Proc.Na tl.Acad.Sci.USA,84:7413-7417(1987))を用いて、1.0μgの市販の線状化バ キュロウイルス(「BaculoGoldTMbaculovirus DNA」,Pharmingen,San Diego, CA.)とともにコトランスフェクトした。 1μgのBaculoGoldTMウイルスDNAおよび5μgのプラスミドpBac-HDGF-2を、50 μlの無血清グレース培地(Life Technologies Inc.,Gaithersburg,MD)を含 むマイクロタイタープレートの滅菌ウェル中で混合した。その後、10μlのリポ フェクチンおよび90μlのグレース培地を添加し、混合し、そして室温にて15分 間インキュベートした。次いで、そのトランスフェション混合物を、無血清グレ ース培地1mlを有する35mm組織培養プレート内に播種されたSf9昆虫細胞(ATCC CRL 1711)に滴下した。プレートを、新たに加えられた溶液を混合するために、 前後に振とうした。次いでプレートを、27℃で5時間インキュベートした。5時 間後、トランスフェクション溶液をプレートから除去し、そして10%ウシ胎児血 清を補充した1mlのグレース昆虫培地を添加した。プレートをインキュベーター に戻し、そして27℃で4日間培養を続けた。 4日後、上清を回収し、そしてSummersおよびSmith(前出)による記載と同様 にプラークアッセイを行った。改変法として、青く染色されたプラークの容易な 単離を可能にする、「Blue Gal」(Life Technologies Inc.,Gaithersburg)を 有するアガロースゲルを用いた。(「プラークアッセイ」の詳細な記述はまた、 Life Technologies Inc.、Gaithersburg、で配布される昆虫細胞培養法およびバ キュロウイルス学のための使用者ガイド(9〜10頁)においても見い出され得る )。 連続希釈物の4日後、ウィルスを細胞に加え、そして青く染色されたプラーク をエッペンドルフピペットのチップで拾った。次いで、組換えウイルスを含む寒 天を、200μlのグレース培地を含むエッペンドルフチューブ中で再懸濁した。寒 天を、短時間の遠心分離により除去し、そして組換えバキュロウイルスを含む上 清を、35mmディッシュに播種されたSf9細胞を感染するために用いた。4日後、 これらの培養ディッシュの上清を回収し、次いで4℃で保存した。 Sf9細胞を、10%熱失活化FBSを補充したグレース培地中で増殖した。細胞を、 感染多重度(MOI)2で、組換えバキュロウイルスV-HDGF-2で感染させた。6時 間後、その培地を除去し、そしてメチオニンおよびシステインを除いたSF900 II 培地(Life Technologies Inc.,Gaithersburg)に置き換えた。42時間後、5μ Ciの35S−メチオニンおよび5μCiの35Sシステイン(Amersham)を添加した。 細 胞を、さらに16時間インキュベートし、その後細胞を遠心分離により採集し、そ して標識されたタンパク質をSDS-PAGEおよびオートラジオグラフィーにより可視 化した。 実施例3 COS 細胞における組換えHDGF-2の発現 プラスミドCMV-HDGF-2 HAの発現は、以下を含むベクターpcDNAI/Amp(Invltro gen)に由来する:1)SV40複製起点、2)アンピシリン耐性遺伝子、3)E.co li複製起点、4)ポリリンカー領域、SV40イントロン、およびポリアデニル化部 位が続くCMVプロモーター。完全なHDGF-2前駆体およびその3'末端にインフレー ムで融合されたHAタグをコードするDNAフラグメントを、ベクターのポリリンカ ー領域にクローン化する。それゆえ、組換えタンパク質発現は、CMVプロモータ ー下で支配される。HAタグは、以前に記載されたようなインフルエンザ赤血球凝 集素タンパク質由来のエピトープに対応する(I.Wllsonら、Cell 37,767(1984 ))。標的タンパク質に対するHAタグの融合は、HAエピトープを認識する抗体で の組換えタンパク質の容易な検出を可能にする。 プラスミド構築ストラテジーを以下に記載する: プラスミドベクターpBluescript中に含まれるHDGF-2をコードするDNA配列(AT CC受託番号第 号)は、5’末端においてpBluescriptベクタープライマー(T 3)およびXhoI制限部位を含むHDGF-2コード配列の3’末端におけるHDGF-2特異 的プライマーを用いるPCRによって増幅される。PCRを介した増幅後、得られたPC R産物を、BamHIおよびXhoIを用いて消化し、そしてXhoI制限部位の後ろにインフ レームでHAタグを含む改変pcDNA-1ベクターに連結した。得られたプラスミドは 、C末端でHAタグにインフレームで融合した全コード配列が続くHDGF-2の5’非 翻訳領域を含む。 連結混合物を、E.coli SURE株(Stratagene Cloning Systems,La Jolla,CA )に形質転換し、形質転換された培養物をアンピシリン培地プレートに播種し、 そして耐性コロニーを選択する。プラスミドDNAを形質転換体から単離し、そし て正しいフラグメントの存在について制限分析により試験する。組換えHDGF-2の 発現のために、COS細胞を、DEAE-DEXTRAN法(J.Sambrook、E.Fritsch、T.Man iatis、Molecular Cloning: A Laboratory Manual,Cold Spring Laboratory Pre ss,(1989))により発現ベクターでトランスフェクトする。HDGF-2-HAタンパク 質の発現を、放射標識および免疫沈降法(E.Harlow,D.Lane,Antibodies: A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory Press,(1988))により検 出する。細胞を、トランスフェクションの2日後、35S-システインで8時間標識 する。次いで培養培地を回収し、そして細胞を界面活性剤(RIPA緩衝液(150mM N aCl、1% NP-40、0.1% SDS、1% NP-40、0.5% DOC、50mM Tris(pH7.5))(Wil son,I.ら、同上 37:767(1984))で溶解する。細胞溶解物および培養培地の両方 を、HA特異的モノクローナル抗体を用いて沈降させる。沈降したタンパク質を、 15%SDS-PAGEゲルで分析する。 実施例4 遺伝子治療を介した発現 線維芽細胞を皮膚バイオプシーにより被験体から得る。生じた組織を組織培養 培地に置き、そして小片に分離する。組織の小片を、各フラスコに約10片ずつ、 組織培養フラスコの湿った表面上に置く。このフラスコを上下逆さに回し、堅く 密封して室温で一晩放置する。室温で24時間後、このフラスコを逆さにし、そし て組織の小片をフラスコの底に固定し、そして新鮮な培地(例えば10%FBS、ペ ニシリンおよびストレプトマイシン含有Ham's F12培地、)を添加する。次いで 、これを37℃で約1週間インキュベートする。このとき、新鮮な培地を添加し、 そして続いて、2、3日毎に培地を交換する。さらなる2週間の培養後、線維芽 細胞の単層が出現する。この単層をトリプシン処理し、そしてより大きなフラス コヘスケールアップする。 Moloneyマウス肉腫ウイルスのロングターミナルリピートの側面に配置されるp MV-7(Kirschmeler,P.T.ら、DNA,7:219-25(1988)を、EcoRIおよびHindIIIで消化 し、そして続いて仔ウシ腸ホスファターゼで処理する。線状化ベクターをアガロ ースゲル上で分画し、そしてガラスビーズを用いて精製する。 本発明のポリペプチドをコードするcDNAを、それぞれ各5’および3’末端配 列に対応するPCRプライマーを用いて増幅する。5’プライマーはEcoRI部位を含 有し、そして3’プライマーはさらにHindIII部位を含有する。等量のMoloneyマ ウス肉腫ウイルス線状化骨格と増殖したEcoRIおよびHidIIIフラグメントとを、T 4 DNAリガーゼの存在下に共に加える。生じた混合物を2つのフラグメントの連 結のために適切な条件下に維持する。この連結混合物を用いて細菌HB101を形質 転換し、次いで、ベクターが適切に挿入された目的の遺伝子を有することを確認 する目的のために、これをカナマイシン含有アガー上にプレートする。 アンフォトロピックpA317またはGP+am12パッケージング細胞を、10%仔ウシ血 清(CS)、ペニシリンおよびストレプトマイシン含有ダルベッコ改変イーグル培地 (DMEM)中でコンフルエントな密度まで組織培養で増殖する。次いで、遺伝子を含 有するMSVベクターを培地に添加し、そしてパッケージング細胞をベクターで形 質導入する。このパッケージング細胞は、遺伝子を含有する感染ウイルス粒子を 産生する(このパッケージング細胞はプロデューサー細胞といわれる)。 形質導入されたプロデューサー細胞に新鮮な培地を添加し、そして続いて、こ の培地をコンフルエントなプロデューサー細胞の10cmプレートから回収する。感 染ウイルス粒子を含有する使用した培地を、ミリポアフィルターを通して濾過し て未接着のプロデューサー細胞を取り除き、そして次いでこの培地を線維芽細胞 の感染に使用する。培地を線維芽細胞のサブコンフルエントなプレートから取り 除き、プロデューサー細胞由来培地に素早く置き換える。この培地を除去し、そ して新鮮な培地に置き換える。ウイルスの力価が高い場合、次いで、実質的にす べての線維芽細胞が感染され、そして選択の必要はない。ウイルス力価が非常に 低い場合、次いでneoまたはhisのような選択マーカーを有するレトロウイルスベ クターを使用することが必要である。 次いで、単独でまたはサイトデックス(cytodex)3マイクロキャリアビーズ上 でコンフルエントに増殖した後のいずれかで、操作された線維芽細胞を宿主に注 入する。この線維芽細胞はタンパク質産物を産生する。 本発明の多数の改変および種々の変化が上記の教示に照らして可能であり、そ してそれゆえ、添付の請求の範囲の範囲内で、特に記載のない限りは本発明は実 施され得る。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.6 識別記号 FI C12N 5/10 C12Q 1/68 A C12P 21/02 G01N 33/53 D C12Q 1/68 C12N 5/00 B G01N 33/53 A61K 37/02 ADU //(C12P 21/02 C12R 1:91) (81)指定国 EP(AT,BE,CH,DE, DK,ES,FR,GB,GR,IE,IT,LU,M C,NL,PT,SE),OA(BF,BJ,CF,CG ,CI,CM,GA,GN,ML,MR,NE,SN, TD,TG),AP(KE,MW,SD,SZ,UG), AM,AT,AU,BB,BG,BR,BY,CA,C H,CN,CZ,DE,DK,ES,FI,GB,GE ,HU,JP,KE,KG,KP,KR,KZ,LK, LT,LU,LV,MD,MG,MN,MW,MX,N O,NZ,PL,PT,RO,RU,SD,SE,SI ,SK,TJ,TT,UA,US,UZ,VN

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1.単離されたポリヌクレオチドであって、以下: (a)図1に記載のポリペプチドをコードするポリヌクレオチド; (b)ATCC受託番号第 号に含まれるDNaによって発現するアミノ酸配列を有す る成熟ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド; (c)(a)または(b)の該ポリヌクレオチドにハイブリダイズし得、そして該ポリ ヌクレオチドと少なくとも70%同一であるポリヌクレオチド;および (d)(a)もしくは(b)または(c)の該ポリヌクレオチドのポリヌクレオチドフラグ メント、 からなる群から選択されるメンバーを含む、単離されたポリヌクレオチド。 2.配列番号2のアミノ酸1〜249を含むポリペプチドをコードする、請求項2 に記載のポリヌクレオチド。 3.請求項1に記載のポリヌクレオチドを含むベクター。 4.請求項3に記載の前記ベクターを用いて遺伝子操作される宿主細胞。 5.ポリペプチドを生成するプロセスであって、以下の工程:請求項4に記載の 宿主細胞から該ポリペプチドによってコードされるポリペプチドを発現する工程 、を包含する、プロセス。 6.請求項3に記載のベクターを用いて、細胞を遺伝子操作する工程を包含する 、ポリペプチドの発現が可能な細胞を生成するためのプロセス。 7.(i)配列番号2の推定アミノ酸配列、ならびにそのフラグメント、アナログ 、および誘導体を有するポリペプチド;および(ii)ATCC受託番号第 号のcDNA によってコードされるポリペプチドならびに該ポリペプチドのフラグメント、ア ナログおよび誘導体、からなる群から選択される、ポリペプチド。 8.前記ポリペプチドが、図1のアミノ酸を含む、請求項13に記載のポリペプチ ド。 9.請求項7に記載のポリペプチドに対する抗体。 10.請求項7に記載の前記ポリペプチドの活性化を阻害する化合物。 11.HDGF-2の必要性を有する患者の処置のための方法であって、以下:請求項 7に記載の治療有効量のポリペプチドを該患者に投与する工程、 を包含する、方法。 12.請求項11に記載の方法であって、ここで、前記治療有効量のポリペプチ ドを、該ポリペプチドをコードする患者のDNAに提供する工程、および該ポリペ プチドをインビボで発現させる工程により投与する、方法。 13.HDGF-2ポリペプチドを阻害する必要性を有する患者の処置のための方法で あって、以下:請求項10に記載の治療有効量の化合物を患者に投与する工程; を包含する、方法。 14.患者において請求項7に記載のポリペプチドの過少発現に関する疾患また は疾患に対する感受性を診断するためのプロセスであって、以下: 患者由来のサンプルにおいて該ポリペプチドをコードする核酸配列中の変異を 同定する工程、 を包含する、プロセス。 15.診断プロセスであって、以下: 宿主由来のサンプルにおいて請求項7に記載の前記ポリペプチドの存在を分析 する工程、 を包含する、診断プロセス。 16.請求項7に記載のポリペプチドのアゴニストである化合物を同定する方法 であって、以下の工程: 該ポリペプチドのレセプターをその表面上で発現する細胞と化合物とを該レセ プターへの結合を許容する条件下で接触させる工程であって、該レセプターは、 該化合物の該レセプターへの結合に応答して検出可能なシグナルを提供し得る第 2の成分と会合される、工程;および 該化合物の該レセプターとの相互作用により生じるシグナルの存在を検出する ことによって、該化合物が該レセプターに結合し、そして活性化するかどうかを 同定する工程、 を包含する、方法。 17.請求項13に記載のポリペプチドに結合し、そして活性化を阻害する化合 物を同定する方法であって、以下の工程: HDGF-2ポリペプチドおよびスクリーニングされるべき化合物と、HDGF-2レセプ ターポリペプチドをその表面上で発現する細胞をと該レセプターポリペプチドへ の結合を許容する条件下で接触させる工程であって、該レセプターは、化合物の 該レセプターポリペプチドへの結合に応答して検出可能なシグナルを提供し得る 第2の成分と会合される、工程;および シグナルの非存在を検出することによって、該化合物がHDGF-2ポリペプチドを 阻害するかどうかを同定する工程、 を包含する、方法。
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