JP2000508894A - 細胞外/上皮増殖因子hcaba58x - Google Patents

細胞外/上皮増殖因子hcaba58x

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JP2000508894A JP09536141A JP53614197A JP2000508894A JP 2000508894 A JP2000508894 A JP 2000508894A JP 09536141 A JP09536141 A JP 09536141A JP 53614197 A JP53614197 A JP 53614197A JP 2000508894 A JP2000508894 A JP 2000508894A
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Abstract

(57)【要約】 本発明は、細胞外/上皮増殖因子ポリペプチドおよびこのようなポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを開示する。組換え技術によりこのようなポリペプチドを産生するための手順、ならびに細胞増殖および細胞分化の誘導、創傷治癒の刺激、神経障害の処置、眼球障害の処置、腎臓障害および肝臓障害、マルファン症候群の処置、および胚形成および血管形成の刺激を含むポリペプチドの治療的使用もまた、提供される。このようなポリペプチドに対するアンタゴニストもまた、開示され、そして新生物形成の処置をするための治療薬としてのそれらの使用が開示される。さらに、本発明のポリペプチドの変化レベル、および本発明のポリペプチドをコードする核酸配列における変異を検出するための診断アッセイが開示される。

Description

【発明の詳細な説明】 細胞外/上皮増殖因子HCABA58X 本発明は、新たに同定されたポリヌクレオチド、このようなポリヌクレオチド によりコードされるポリペプチド、このようなポリヌクレオチドおよびポリペプ チドの使用、ならびにこのようなポリヌクレオチドおよびポリペプチドの産生に 関する。本発明のポリペプチドは、ヒト細胞外タンパク質様/上皮増殖因子様タ ンパク質として推定的に同定されており、このタンパク質は本明細書中以下で「 HCABA58X」と呼ばれる。本発明はまた、このようなポリペプチドの作用を阻害す ることに関する。 細胞増殖および分化は、様々な刺激性、阻害性、ならびに相乗性の因子および ホルモンにより、開始、促進、維持および調節されるようである。細胞の恒常性 機構の変化および/または破壊は、新生物形成を含む増殖関連疾患の基礎的な原 因と考えられる。増殖調節因子は、シグナル伝達、細胞連絡、細胞増殖および細 胞発生、胚発生、免疫応答、造血細胞の生存および分化、炎症、組織修復、およ び再構築、アテローム性動脈硬化症ならびにガンを含む、広く多様な病理学的お よび生理学的な過程に関連する。他の因子の中でもとりわけ、上皮増殖因子(EGF )、トランスフォーミング増殖因子α(TGFα)、βセルリン(betacellulin)、 アンフィレギュリン(amphiregulin)、およびワクシニア増殖因子は、正常な生 理学的条件下または外因性刺激への応答のいずれかにおいて、多様な細胞型によ って産生される、増殖および分化調節性タンパク質であり、そしてこれらはEGF ファミリーのメンバーである。 これらのペプチド増殖因子は、自己分泌機構およびパラ分泌機構を通して上皮 および表皮の細胞に影響を及ぼす。これらはまた、皮膚、角膜および胃腸管のよ うな組織における正常な創傷治癒において重要な役割を担い、そしてこれらは全 て、3つの鎖内ジスルフィド結合の保存された配置を含む、実質的なアミノ酸配 列相同性を共有する。さらに、このファミリーの全ての因子は、分子量170,000 の膜貫通糖タンパク質レセプターに結合し、そしてレセプターの細胞質ドメイン におけるチロシンキナーゼ活性を活性化する(Buhrow,S.A.ら,J.Bio.Chem., 258:7824-7826(1983))。 レセプターは、皮膚ケラチノサイト、線維芽細胞、血管内皮細胞、および胃腸 管(GI)の上皮細胞を含む多くの型の細胞により発現される。これらのペプチド増 殖因子は、血小板、ケラチノサイト、および活性化マクロファージを含む、創傷 治癒に関与する幾つかの細胞によって合成される。これらの増殖因子はまた、特 定の細胞の増殖および分化の刺激(例えば、新生物形成)ならびに他の型の細胞 の阻害の両方に関与している。 βセルリンは、32キロダルトンの糖タンパク質であり、より大きな膜貫通前駆 体からタンパク質分解切断によりプロセシングされるようである。βセルリンの カルボキシル末端ドメインは、ラットのトランスフォーミング増殖因子αのカル ボキシル末端ドメインと50%配列類似性を有する。βセルリンは、網膜色素上皮 細胞および血管平滑筋細胞についての強力な分裂促進因子である。 アンフィレギュリンは、新生物形成細胞におけるDNA合成に強力な阻害活性を 示すが、それにもかかわらず特定の正常細胞の増殖を促進する、二機能性細胞増 殖調節因子である。アンフィレギュリンの広く多様な使用が挙げられており、こ れは創傷およびガンの処置を含む。例えば、アンフィレギュリンは、インビトロ において上皮起源のいくつかのヒトガン細胞株に強力な抗増殖効果を有する。ア ンフィレギュリンはまた、米国特許出願第5,115,096号に示されるように、ヒト 包皮線維芽細胞の増殖を誘導する。 TGFαは多面的な生物学的効果を有する。TGFαの特定のメンバーの産物は、多 数の腫瘍形成性に形質転換された線維芽細胞(Ciardielloら、J .Cell.Biochem. ,42:45-57(1990))によって、ならびに腎臓ガン、乳ガン、および扁平上皮ガン 、メラノーマ、およびグリア芽細胞腫を含む種々の腫瘍(Derynck,R.ら、Cancer Res. ,47:707-712(1987))によって合成される。トランスジェニックマウス(腫 瘍細胞が高レベルのTGFαを発現する)の分析により、TGFαの発現が、正常細胞 のその腫瘍形成性対応物への転換における寄与因子であり得るという、直接的な 証拠がある。マウスの系統およびTGFα発現を調節するプロモーターの選択に依 存して、TGFαのトランスジェニック動物は多様な新生物形成障害を示す(Sandgr enら、Cell,61:1121-1135(1990))。 TGFαはまた、正常な胚発生および成体生理機能において役割を果たす(Derync k,R.Adv .Cancer Res.,58:27-5(1992))。TGFαは皮膚、脳、胃腸粘膜、およ び活性化マクロファージを含む多くの組織において発現されている。従って、TG Fαは上皮細胞の増殖の制御において重要な因子であり、創傷治癒において役割 を有する。TGFαはまた、血管形成性であることが判明している(Schreiberら、Science ,232:1250-1253(1986))。 本発明のポリペプチドは、細胞外/上皮増殖因子として推定的に同定されてい る。この同定は、心臓組織に豊富であり、そしてLecka-Czernikら,Molecular a nd Cellular Biology,15(1):120-128(1995)に開示されるEGF様ドメインを伴っ た分泌タンパク質であるヒト細胞外タンパク質とのアミノ酸配列相同性の結果と して得られている。 本発明の1つの局面によれば、新規の成熟ポリペプチド、ならびに生物学的に 活性な、および診断的または治療的に有用なそのフラグメント、アナログおよび 誘導体が提供される。本発明のポリペプチドはヒト起源である。 本発明の別の局面によれば、本発明のポリペプチドをコードする単離された核 酸分子が提供され、この核酸分子は、mRNA、cDNA、ゲノムDNA、ならびにそのア ナログ、および生物学的に活性な、および診断的または治療的に有用なフラグメ ントを含む。 本発明の別の局面によれば、ATCC受託番号第97376号に含まれるヒトcDNAによ り発現される成熟ポリペプチドをコードする単離された核酸分子が提供される。 本発明のなおさらなる局面によれば、本発明のポリペプチドをコードする核酸 配列を含む組換え原核生物宿主細胞および/または真核生物宿主細胞を培養する 工程を含む組換え技術により、このようなポリペプチドを産生するためのプロセ スが提供される。 本発明のなおさらなる局面によれば、このようなポリペプチド、またはこのよ うなポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを、治療目的(例えば、血管平 滑筋細胞増殖の調節、Marfan症候群の処置、創傷治癒の刺激、外傷またはAIDS痴 呆後の正常な神経機能の修復、眼の障害の処置、腎臓および肝臓の障害の処置、 毛包発達の促進、インビボおよびインビトロでの多様な表皮細胞および上皮細胞 の増殖および分化の刺激、ならびに火傷、潰瘍、および角膜切開の処置、胚形成 の刺激)のために利用するためのプロセスが提供される。 本発明のなおさらなる局面によれば、本発明の核酸配列に特異的にハイブリダ イズするのに充分な長さの核酸分子を含む核酸プローブもまた提供される。 本発明のなおさらなる局面によれば、このようなポリペプチドに対する抗体が 提供される。 本発明のなおさらなる局面によれば、本発明のポリペプチドに対するアゴニス トが提供される。 本発明のなお別の局面によれば、このようなポリペプチドに対するアンタゴニ ストが提供され、これは、例えば、角膜炎症、新生物形成(例えば、腫瘍および ガン)ならびに乾癬および糖尿病に対する処置において、このようなポリペプチ ドの作用を阻害するために使用され得る。 本発明のさらに別の局面によれば、本発明のポリペプチドの過剰発現およびこ のようなポリペプチドをコードする核酸配列における変異に関連した疾患を検出 するための診断アッセイが提供される。 本発明のなおさちなる局面によれば、科学的研究、DNAの合成、およびDNAベク ターの製造に関連するインビトロ目的のため、このようなポリペプチド、または このようなポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを利用するためのプロセ スが提供される。 本発明のこれらおよび他の局面は、本明細書中の教示から当業者に明らかであ るはずである。 以下の図面は、本発明の実施態様の例示であり、そして請求の範囲に含まれる 本発明の範囲を限定することを意味しない。 図1は、HCABA58XのcDNA配列および対応する推定アミノ酸配列を示す。アミノ 酸の標準的な1文字略語および3文字略語の両方が使用される。 図2は、本発明のポリペプチド(下列)とヒト細胞外タンパク質(上列)(配 列番号9)との間のアミノ酸配列相同性の比較の例示である。 本発明の1つの局面によれば、図1(配列番号2)の推定アミノ酸配列を有す る成熟ポリペプチドをコードする単離された核酸(ポリヌクレオチド)が提供さ れる。 本発明のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、ヒト脳および初期の 脳組織から得られ得る。本発明のポリヌクレオチドは、ヒト破骨細胞腫cDNAライ ブラリーにおいて発見された。これは特徴的なEGFドメインに相同性を有する。 これは、24アミノ酸の推定のリーダー配列を有する443アミノ酸のポリペプチド をコードするオープンリーディングフレームを含む。HCABA58Xはアミノ酸レベル でヒト細胞外タンパク質に最も高い程度の相同性を示し、387アミノ酸の範囲で5 1%の同一性および30%の類似性を有する。このタンパク質のノーザンブロット 分析は、約2kbである転写産物を伴って、心臓および腎臓の組織において高レベ ルの発現を示す。 本発明の別の局面によれば、ATCC受託番号第97376号(アメリカンタイプカル チャーコレクション、12301 Park Lawn Drive,Rockville,Maryland 20852,US A 1995年12月8日に「PF258」として寄託)に含まれるDNAにより発現される成熟 ポリペプチドをコードする単離されたポリヌクレオチドが提供される。寄託物は 、全長HCABA58X cDNAを含むpBluescript SK(+)プラスミド(Stratagene,La Jol la,CA)である。 寄託は、特許手続上の微生物の寄託の国際的承認に関するブダペスト条約の約 定の下になされている。この株は、特許の発行の際には、改変されず、かつ制約 または条件を伴わずに公衆に譲渡される。これらの寄託物は、当業者に対する便 宜として提供されるに過ぎず、そして米国特許法第112条の下で寄託が必要とさ れることを認めたわけではない。寄託物に含まれるポリヌクレオチドの配列、な らびにそれによりコードされるポリペプチドのアミノ酸配列は、本明細書中に参 考として援用され、そして本明細書中の配列のいかなる記載とのいかなる矛盾も 抑えている。寄託物を製造し、使用し、または販売するためには実施許諾が必要 とされ得、そしてそのような実施許諾はこれによって与えられるわけではない。 本明細書を通しての「ポリヌクレオチド」に対する参考は、上記に言及されてい る寄託物のDNAを含む。 本発明のポリヌクレオチドは、RNAの形態またはDNAの形態(このDNAは、cDNA 、 ゲノムDNA、および合成DNAを含む)であり得る。DNAは二本鎖または一本鎖であ り得、そして一本鎖の場合には、コード鎖または非コード(アンチセンス)鎖で あり得る。成熟ポリペプチドをコードするコード配列は、図1(配列番号1)に 示すコード配列と同一であり得、または異なったコード配列であり得、そのコー ド配列は、遺伝コードの重複性または縮重の結果として、図1(配列番号1)の DNAと同じ成熟ポリペプチドをコードする。 図1(配列番号2)の成熟ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、以 下を含み得るが、これらに限定されない:成熟ポリペプチドのコード配列のみ; 成熟ポリペプチドのコード配列およびさらなるコード配列(例えば、リーダー配 列または分泌配列もしくはプロタンパク質配列);成熟ポリペプチドのコード配 列(および必要に応じてさらなるコード配列)および非コード配列(例えば、イ ントロンまたは成熟ポリペプチドのコード配列の5'および/もしくは3'側の非コ ード配列)。 従って、用語「ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド」は、ポリペプチ ドのコード配列のみを含むポリヌクレオチド、ならびにさらなるコード配列およ び/または非コード配列を含むポリヌクレオチドを含む。 本発明はさらに、図1の推定アミノ酸配列(配列番号2)を有するポリペプチ ドのフラグメント、アナログ、および誘導体をコードする、本明細書中上記のポ リヌクレオチドの変異体に関する。ポリヌクレオチドの変異体は、このポリヌク レオチドの天然に存在する対立遺伝子変異体、またはこのポリヌクレオチドの天 然に存在しない変異体であり得る。 従って、本発明は、図1(配列番号2)に示されるのと同じ成熟ポリペプチド をコードするポリヌクレオチド、ならびにこのようなポリヌクレオチドの変異体 を含み、この変異体は、図1のポリペプチド(配列番号2)のフラグメント、誘 導体、またはアナログをコードする。このようなヌクレオチド変異体は、欠失変 異体、置換変異体、および付加または挿入変異体を含む。 本明細書中上記に示されるように、ポリヌクレオチドは、図1に示されるコー ド配列(配列番号1)の天然に存在する対立遺伝子変異体であるコード配列を有 し得る。当該分野に公知のように、対立遺伝子変異体は、コードされるポリペプ チドの機能を実質的に変化させない1つ以上のヌクレオチドの置換、欠失、また は付加を有し得る、代替形態のポリヌクレオチド配列である。 本発明はまた、ポリヌクレオチドを含む。ここで、成熟ポリペプチドのコード 配列は、宿主細胞からのポリペプチドの発現および分泌を助けるポリヌクレオチ ド配列(例えば、細胞からのポリペプチドの輸送を制御するための分泌配列とし て機能するリーダー配列)と同じリーディングフレームで融合され得る。リーダ ー配列を有するポリペプチドはプレタンパク質であり、そして、宿主細胞によっ て切断されて成熟形態のポリペプチドを形成するリーダー配列を有し得る。ポリ ヌクレオチドはまた、さらなる5'アミノ酸残基を加えた成熟タンパク質であるプ ロタンパク質をコードし得る。プロ配列を有する成熟タンパク質はプロタンパク 質であり、そしてこれはそのタンパク質の不活性形態である。一旦プロ配列が切 断されると、活性な成熟タンパク質が残存する。従って、例えば、本発明のポリ ヌクレオチドは、成熟タンパク質、またはプロ配列を有するタンパク質、または プロ配列およびプレ配列(リーダー配列)の両方を有するタンパク質をコードし 得る。 本発明のポリヌクレオチドはまた、本発明のポリペプチドの精製を可能にする マーカー配列と、インフレームで融合したコード配列を有し得る。細菌宿主の場 合、マーカー配列は、pQE-9ベクターによって供給されるヘキサ-ヒスチジンタグ であり得、これはマーカーに融合した成熟ポリペプチドの精製を提供し、または 、例えば、哺乳動物宿主(例えばCOS-7細胞)が使用される場合、マーカー配列 は赤血球凝集素(HA)タグであり得る。HAタグは、インフルエンザ赤血球凝集素タ ンパク質由来のエビトープに対応する(Wilson,I.ら、Cell,37:767(1984))。 用語「遺伝子」は、ポリペプチド鎖を産生することに関連したDNAのセグメン トを意味し;これは、コード領域の前後の領域(リーダーおよびトレーラー(tra iler))ならびに個々のコードセグメント(エキソン)の間の介在配列(イント ロン)を含む。 本発明の全長のHCABA58X遺伝子のフラグメントは、cDNAライブラリーのための ハイブリダイゼーションプローブとして使用されて、全長遺伝子を単離し得、そ してこの遺伝子への高い配列類似性または類似の生物学的活性を有する他の遺伝 子を単離し得る。この型のプローブは、少なくとも15塩基を、好ましくは少なく とも30塩基を有し、そして、例えば、50塩基以上を含み得る。このプローブはま た、全長転写産物、および完全なHCABA58X遺伝子(調節領域およびプロモーター 領域、エキソン、ならびにイントロンを含む)を含むゲノムクローン(単数また は複数)に対応するcDNAクローンを同定するために使用され得る。スクリーニン グの例は、オリゴヌクレオチドプローブを合成するために公知のDNA配列を使用 することにより、この遺伝子のコード領域を単離することを含む。本発明の遺伝 子の配列に相補的な配列を有する標識オリゴヌクレオチドは、ヒトcDNA、ゲノム DNA、またはmRNAのライブラリーをスクリーニングして、プローブがハイブリダ イズするライブラリーのメンバーを決定するために使用される。 本発明はさらに、配列間に少なくとも70%、好ましくは少なくとも90%、そし てより好ましくは少なくとも95%の同一性が存在する場合、本明細書中上記の配 列にハイブリダイズするポリヌクレオチドに関する。本発明は特に、本明細書中 上記のポリヌクレオチドにストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリ ヌクレオチドに関する。本明細書中で用いられる用語「ストリンジェントな条件 」は、ハイブリダイゼーションが、配列間に少なくとも95%、そして好ましくは 少なくとも97%の同一性が存在する場合のみに生じることを意味する。好ましい 実施態様において、本明細書中上記のポリヌクレオチドにハイブリダイズするポ リヌクレオチドは、図1(配列番号1)のcDNAによりコードされる成熟ポリペブ チドと実質的に同じ生物学的機能または活性のいずれかを保持するポリペプチド をコードする。 あるいは、このポリヌクレオチドは、本発明のポリヌクレオチドにハイブリダ イズする、少なくとも15塩基、好ましくは少なくとも30塩基、そしてより好まし くは少なくとも50塩基を有し得、そしてこれは、本明細書中上記のように、それ に同一性を有し、そしてこれは活性を保持していても保持していなくともよい。 例えば、このようなポリヌクレオチドは配列番号1のポリヌクレオチドに対する プローブ(例えば、ポリヌクレオチドの回収のため)として、または診断プロー ブもしくはPCRプライマーとして使用され得る。 従って、本発明は、配列番号2のポリペプチドをコードするポリヌクレオチド およびそれに相補的なポリヌクレオチドに少なくとも70%の同一性、好ましくは 少なくとも90%の同一性、そしてより好ましくは少なくとも95%の同一性を有す るポリヌクレオチドならびにその部分(その部分は、少なくとも15の隣接塩基、 好ましくは少なくとも30の隣接塩基、そしてより好ましくは50の隣接塩基を有す る)ならびにそのようなポリペプチドによってコードされるポリヌクレオチドに 関する。 本発明はさらに、図1の推定のアミノ酸配列(配列番号2)を有するポリペプ チド、ならびにそのようなポリペプチドのフラグメント、アナログおよび誘導体 に関する。 用語「フラグメント」、「誘導体」、および「アナログ」は、図1のポリペプ チド(配列番号2)をいう場合、そのようなポリペプチドと実質的に同じ生物学 的機能または活性を保持するポリペプチドを意味する。従って、アナログは、プ ロタンパク質部分の切断により活性化されて活性な成熟ポリペプチドを生成し得 るプロタンパク質を含む。 本発明のポリペプチドは、組換えポリペプチド、天然のポリペプチドまたは合 成ポリペプチドであり得、好ましくは組換えポリペプチドであり得る。 図1のポリペプチド(配列番号2)のフラグメント、誘導体、またはアナログ は、(i)1つ以上のアミノ酸残基が保存アミノ酸残基または非保存アミノ酸残基 (好ましくは保存アミノ酸残基)で置換され、そしてこのような置換されるアミ ノ酸残基は遺伝的コードによりコードされ得るアミノ酸残基であってもよく、ま たはそうでなくてもよいもの、あるいは(ii)1つ以上のアミノ酸残基が置換基を 含有するもの、あるいは(iii)成熟ポリペプチドが、ポリペプチドの半減期を増 加させる化合物(例えば、ポリエチレングリコール)のような別の化合物と融合 されているもの、あるいは(iv)さらなるアミノ酸が、成熟ポリペプチド(例えば 、リーダーならびに分泌配列、または成熟ポリペプチドならびにプロタンパク質 配列の精製のために使用される配列)に融合しているもの、であり得る。このよ うなフラグメント、誘導体およびアナログは、本明細書中の教示から、当業者の 範囲内にあると考えられる。 本発明のポリペプチドおよびポリヌクレオチドは、好ましくは、単離された形 態で提供され、そして好ましくは均質に精製される。 用語「単離された」は、物質がその本来の環境(例えば、天然に存在する場合 は、天然の環境)から取り出されていることを意味する。例えば、生きている動 物の中に存在する天然に存在するポリヌクレオチドまたはポリペプチドは、単離 されていないが、天然の系において共存する物質の幾らかまたは全てから分離さ れている同一のポリヌクレオチドまたはポリペプチドは、単離されている。この ようなポリヌクレオチドはベクターの一部であり得、そして/またはこのような ポリヌクレオチドまたはポリペプチドは、組成物の一部であり得、そしてそのよ うなベクターまたは組成物はその天然の環境の一部ではないため、なお単離され 得る。 本発明のポリペプチドは、配列番号2のポリペプチド(特に成熟ポリペプチド において)、ならびに配列番号2のポリペプチドに対して少なくとも70%の類似 性(好ましくは少なくとも70%の同一性)を有するポリペプチド、およびより好 ましくは配列番号2のポリペプチドに対して少なくとも90%の類似性(より好ま しくは少なくとも90%の同一性)、およびさらにより好ましくは配列番号2のポ リペプチドに対して少なくとも95%の類似性(さらにより好ましくは少なくとも 95%の同一性)を有し、またポリペプチドが一般に少なくとも30アミノ酸、およ びより好ましくは少なくとも50アミノ酸を含むポリペプチドのこのような部分を 有するようなポリペプチドの部分を含む。 当該分野で公知のように、2ポリペプチド間の「類似性」は、ポリペプチドの アミノ酸配列およびそれらの保存されたアミノ酸置換物と第2のポリペプチドの 配列とを比較することにより決定される。 本発明のポリペプチドのフラグメントまたは部分は、ペプチド合成によって相 当する全長ポリペプチドを生成するために使用され得、それゆえ、このフラグメ ントは、全長ポリペプチドを生成するための中間体として使用され得る。本発明 のポリヌクレオチドのフラグメントまたは部分は、本発明の全長ポリヌクレオチ ドを合成するために使用され得る。 本発明はまた、本発明のポリヌクレオチドを含むベクター、本発明のベクター を用いて遺伝子操作される宿主細胞、および組換え技術による本発明のポリペプ チドの産生に関する。 宿主細胞は、本発明のベクター(これは、例えば、クローニングベクターまた は発現ベクターであり得る)を用いて遺伝子操作される(形質導入されるか、ま たは形質転換されるか、またはトランスフェクトされる)。ベクターは、例えば 、プラスミド、ウイルス粒子、ファージなどの形態であり得る。操作された宿主 細胞は、プロモーターを活性化するか、形質転換体を選択するか、または本発明 の遺伝子を増幅するために適切に改変した従来の栄養培地中において培養され得 る。培養条件(例えば、温度、pHなど)は、発現のために選択される宿主細胞に 以前使用された条件であり、そして当業者には明らかである。 本発明のポリヌクレオチドは、組換え技術によりポリペプチドを産生するため に用いられ得る。従って、例えば、ポリヌクレオチドは、ポリペプチドを発現す るための種々の発現ベクターのいずれかに含まれ得る。このようなベクターは、 染色体DNA配列、非染色体DNA配列、および合成DNA配列を包含する。このような ベクターは、例えば、SV40の誘導体;細菌性プラスミド;ファージDNA;バキュ ロウイルス;酵母プラスミド;プラスミドおよびファージDNAの組み合わせに由 来するベクター、ウイルスDNA(例えば、ワクシニア、アデノウイルス、鶏痘ウ イルス、および仮性狂犬病)である。しかし、宿主において複製可能で、かつ存 続可能である限り、他の任意のベクターも使用され得る。 適切なDNA配列は、種々の手順によりベクターに挿入され得る。一般に、DNA配 列は、当該分野で公知の手順により適切な制限エンドヌクレアーゼ部位に挿入さ れる。このような手順および他の手順は、当業者の範囲内であると考えられる。 発現ベクター中のDNA配列は、適切な発現制御配列(プロモーター)に作動可 能に連結され、mRNAの合成を指示する。このようなプロモーターの代表的な例と しては、以下が挙げられ得る:LTRまたはSV40プロモーター、E .coli lacまたはtrp 、λファージPLプロモーター、および原核生物細胞または真核生物細胞ある いはそのウイルス内で遺伝子の発現を制御することが知られている他のプロモー ター。発現ベクターはまた、翻訳開始のためのリボソーム結合部位および転写タ ーミネーターを含有する。ベクターはまた、発現を増幅するための適切な配列を 含有し得る。 さらに、発現ベクターは、好ましくは、形質転換された宿主細胞の選択のため の表現型特性(例えば、真核細胞培養物についてはジヒドロ葉酸レダクターゼま たはネオマイシン耐性、あるいは例えばE .coliにおけるテトラサイクリン耐性 またはアンピシリン耐性)を提供する1つ以上の選択マーカー遺伝子を含有する 。 本明細書中上記のような適切なDNA配列ならびに適切なプロモーター配列また は制御配列を含有するベクターは、適切な宿主を形質転換して宿主にタンパク質 を発現させるために用いられ得る。 適切な宿主の代表的な例としては、以下が挙げられ得る:細菌細胞(例えば、E .coliStreptomycesSalmonella typhimurium);真菌細胞(例えば酵母) ;昆虫細胞(例えば、Drosophila S2およびSpodoptera Sf9);動物細胞(例え ば、CHO、COSまたはBowes黒色腫);アデノウイルス;植物細胞など。適切な宿 主の選択は、本明細書中の教示から当業者の範囲内であると考えられる。 さらに詳細には、本発明はまた、上記で広範に記載した1つ以上の配列を含む 組換え構築物を包含する。構築物は、ベクター(例えば、ブラスミドベクターま たはウイルスベクター)を包含し、このベクターの中に、本発明の配列が正方向 または逆方向に挿入されている。この実施態様の好ましい局面において、構築物 はさらに、配列に作動可能に連結された調節配列(例えば、プロモーターを包含 する)を含む。非常に多数の適切なベクターおよびプロモーターが当業者には公 知であり、そして購入可能である。以下のベクターが例として提供される;細菌 性:pQE70、pQE60、pQE-9(Qiagen)、pBS、pD10、phagescript、psiX174、pblues cript SK、pbsks、pNH8A、pNH16a、pNH18A、pNH46A(Stratagene);ptrc99a、pKK 223-3、pKK233-3、pDR540、pRIT5(Pharmacia);真核性:pWLNEO、pSV2CAT、pOG4 4、pXT1、pSG(Stratagene)、pSVK3、pBPV、pMSG、pSVL(Pharmacia)。しかし、他 の任意のプラスミドまたはベクターも、それらが宿主において複製可能で、かつ 存続可能である限り、使用され得る。 プロモーター領域は、CAT(クロラムフェニコールトランスフェラーゼ)ベク ターまたは選択マーカーを有する他のベクターを使用して、任意の所望の遺伝子 から選択され得る。2つの適切なベクターは、pKK232-8およびpCM7である。特に よく知られた細菌プロモーターは、lacI、lacZ、T3、T7、gpt、λPR、PLおよびt r pを包含する。真核生物プロモーターは、CMV即時型、HSVチミジンキナーゼ、初 期SV40および後期SV40、レトロウイルス由来のLTR、およびマウスメタロチオネ インIを包含する。適切なベクターおよびプロモーターの選択は、十分に当業者 のレベル内である。 さらなる実施態様では、本発明は上記の構築物を含有する宿主細胞に関する。 宿主細胞は、高等真核生物細胞(例えば、哺乳動物細胞)または下等真核生物細 胞(例えば、酵母細胞)であり得るか、あるいは宿主細胞は原核生物細胞(例え ば、細菌細胞)であり得る。構築物の宿主細胞への導入は、リン酸カルシウムト ランスフェクション、DEAE-デキストラン媒介トランスフェクション、またはエ レクトロポレーションにより達成され得る(Davis,L.,Dibner,M.,Battey,I.,B asic Methods in Molecular Biology,(1986))。 宿主細胞中の構築物を用いて、従来の方法で組換え配列によりコードされる遺 伝子産物を産生し得る。あるいは、本発明のポリペプチドは、従来のペプチド合 成機により合成的に産生され得る。 成熟タンパク質は、哺乳動物細胞、酵母、細菌、または他の細胞中で適切なプ ロモーターの制御下で発現され得る。無細胞翻訳系もまた、本発明のDNA構築物 に由来するRNAを使用して、このようなタンパク質を産生するために用いられ得 る。原核生物宿主および真核生物宿主で使用される適切なクローニングベクター および発現ベクターは、Sambrookら,Molecular Cloning:A Laboratory Manual ,第2版,Cold Spring Harbor,N.Y.,(1989)(この開示は、本明細書中に参考 として援用される)に記載されている。 本発明のポリペプチドをコードするDNAの高等真核生物による転写は、ベクタ ーにエンハンサー配列を挿入することにより増大される。エンハンサーはDNAの シス作用エレメントであり、通常は約10〜約300bpであり、これはプロモーター に作用してその転写を増大させる。例として、複製起点のbp100〜270の後期側の SV40エンハンサー、サイトメガロウイルスの初期プロモーターエンハンサー、複 製起点の後期側のポリオーマエンハンサー、およびアデノウイルスエンハンサー が挙げられる。 一般に、組換え発現ベクターは、宿主細胞の形質転換を可能とする複製起点お よび選択マーカー(例えば、E .coliのアンピシリン耐性遺伝子およびS.cerevis iae のTRP1遺伝子)、ならびに下流の構造配列の転写を指示する高発現遺伝子由 来のプロモーターを含有する。このようなプロモーターは、とりわけ、解糖酵素 (例えば、3-ホスホグリセリン酸キナーゼ(PGK))、α因子、酸性ホスファター ゼ、または熱ショックタンパク質をコードするオペロンに由来し得る。異種構造 配列は、翻訳開始配列および翻訳終止配列、および好ましくは翻訳されたタンパ ク質のペリプラズム空間または細胞外の培地への分泌を指示し得るリーダー配列 と適切な相内で組立てられる。必要に応じて、異種配列は、所望の特徴(例えば 、発現された組換え産物の安定化または簡略化された精製)を与えるN末端同定 ペプチドを含む融合タンパク質をコードし得る。 細菌の使用に有用な発現ベクターは、機能的なプロモーターと作動可能な読み 取り相で、適切な翻訳開始シグナルおよび翻訳終止シグナルと共に所望のタンパ ク質をコードする構造DNA配列を挿入することにより構築される。ベクターは、 1つ以上の表現型選択マーカー、およびベクターの維持を確実にし、かつ所望に より宿主内での増幅を提供するための複製起点を含有する。形質転換のために適 切な原核生物宿主は、E .coliBacillus subtilisSalmonella typhimurium、 ならびにPseudomonas属、Streptomyces属、およびStaphylococcus属内の種々の 種を包含するが、他の種もまた選択対象として用いられ得る。 代表的な、しかし限定しない例として、細菌の使用に有用な発現ベクターは、 周知のクローニングベクターpBR322(ATCC 37017)の遺伝的エレメントを含む市販 のプラスミドに由来する選択マーカーおよび細菌性の複製起点を含有し得る。こ のような市販のベクターは、例えば、pKK223-3(Pharmacia Fine Chemicals,Upp sala,Sweden)およびGEM1(Promega Biotec,Madison,WI,USA)を含む。これら のpBR322「骨格」部分は、適切なプロモーターおよび発現されるべき構造配列と 組み合わされる。 適切な宿主株の形質転換および適切な細胞密度までの宿主株の増殖に続いて、 選択されたプロモーターは適切な手段(例えば、温度シフトまたは化学的誘導) により誘導され、そして細胞はさらなる期間培養される。 細胞は、代表的には遠心分離により収集され、物理的手段または化学的手段に より破砕され、そして得られた粗抽出物はさらなる精製のために保持される。 タンパク質の発現において用いられる微生物細胞は、凍結融解サイクル、超音 波処理、機械的破砕、または細胞溶解剤の使用を包含する任意の簡便な方法によ り破砕され得る。このような方法は当業者に周知である。 種々の哺乳動物細胞の培養系もまた、組換えタンパク質を発現するために用い られ得る。哺乳動物発現系の例には、Gluzman,Cell,23:175(1981)に記載され るサル腎臓線維芽細胞のCOS-7株、および適合性のベクターを発現し得る他の細 胞株(例えば、C127、3T3、CHO、HeLa、およびBHK細胞株)が含まれる。哺乳動 物発現ベクターは、複製起点、適切なプロモーターおよびエンハンサー、ならび に任意の必要なリボソーム結合部位、ポリアデニル化部位、スプライスドナー部 位およびスプライスアクセプター部位、転写終結配列、および5'フランキング非 転写配列をまた含有する。SV40スプライス部位、およびポリアデニル化部位に由 来するDNA配列は、必要な非転写遺伝的エレメントを提供するために使用され得 る。 ポリペプチドは、以下を含む方法により組換え細胞培養物から回収され、そし て精製され得る:硫安沈澱またはエタノール沈澱、酸抽出、陰イオンまたは陽イ オン交換クロマトグラフィー、ホスホセルロースクロマトグラフィー、疎水的相 互作用クロマトグラフィー、アフィニティークロマトグラフィー、ヒドロキシル アパタイトクロマトグラフィー、およびレクチンクロマトグラフィー。必要に応 じて、タンパク質の再折りたたみ(refolding)工程が、成熟タンパク質の配置 を完全にするために使用され得る。最終的に、高速液体クロマトグラフィー(HPL C)が、最終的な精製工程に用いられ得る。 本発明のポリペプチドは、天然の精製された産物、または化学合成手順の産物 であり得るか、あるいは原核生物宿主または真核生物宿主(例えば、培養物中の 細菌、酵母、高等植物、昆虫、および哺乳動物細胞)から組換え技術により産生 され得る。組換え産生手順に用いられる宿主に依存して、本発明のポリペプチド は、グリコシル化され得るか、またはグリコシル化され得ない。本発明のポリペ プチドはまた、最初のメチオニンアミノ酸残基を含み得る。 本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、ヒト疾患の処置および診断 薬の発見のための研究用試薬および物質として使用され得る。 本発明のポリペプチドは、血管平滑筋増殖を調節するために使用され得る。 本発明のポリペプチドはまた、レセプターの特徴付けのために使用され得る。 EGFファミリーのレセプターは現在、EGFR1、EGFR2、EGFR3、およびGFR4と称され る4つのEGFレセプターを含む。EGFR2レセプターはまた、ERB-2と称され、そし てこの分子は種々の診断および治療的適応のために利用される(Prigent,S.A. ,およびLemoine,N.R.,Prog Growth Factor Res.,4:1-24(1992))。HCABA58X ポリペプチドは、1つ以上のこれらのレセプター、ならびに未同定の新規なEGF 型レセプターに対するリガンドであるようである。HCABA58Xの使用は、このよう なレセプターの同定、特徴付け、およびクローニングを補助し得る。例えば、EG Fレセプター遺伝子は、トリ赤芽球症ウイルスのv-erb-Bガン遺伝子の細胞性ホモ ログを示す。EGFレセプターの過剰発現またはそのタンパク質のキナーゼ調節セ グメントの欠損は、細胞の腫瘍化の形質転換を引き起こし得る(Manjusri,Dら 、Human Cytokines,364および382(1991))。 本発明のポリペプチドはまた、外傷もしくは他の損傷病理(例えば、AIDS、痴 呆、老人性痴呆など)の結果として減少した神経の機能の修復または増強のため に使用され得る。TGFαおよびそのホモログは、脳のほとんどの部分におけるEGF /TGFαレセプターに対する最も豊富なリガンドであることが見出されている(Ka serら、Mol Brain Res:16:316-322(1992))。HCABA58Xまたはその可溶性形態は また、眼球障害(例えば、角膜炎症)の治療に使用され得る。種々の実験は、こ のような病理学におけるTGFα遺伝子ファミリーのメンバーを関連づけた。ある 最近の文献は、これらの増殖因子が眼の疾患で果たす役割に関連したいくつかの データを要約している(Mannら、Cell,73:249-261(1993))。最近の実験は、TG Fα遺伝子を欠如したマウスの多数が、眼の固有質への白血球および他の細胞の 浸潤により角膜炎症を起こすことを示した。 さらに、それらの標的細胞に対する特定の増殖因子の特異性は、標的細胞を破 壊するための機構として利用され得る。例えば、HCABA58Xまたはその可溶性形態 は、当該分野に公知の広範な種々の方法により、毒性分子:例えば、標的細胞を 不活性化する放射性医薬品に結合され得る。これらの増殖因子-毒物融合体は、 標的細胞(および特定の場合では種々の「バイスタンダー」効果により隣接した 細胞)を死滅させる。このような毒物融合遺伝子の最近の例は、Mesriら,J.Bio l.Chem.268:4853-62(1993)によって刊行されている。HCABA58Xおよび関連した 分子はまた、リポソーム中にカプセル化され得、そして腫瘍または細胞特異的抗 原を認識し結合する抗体に結合し、それによって細胞を「標的化する」手段を提 供し得る。 HCABA58Xポリペプチドはまた、腎臓でこれらの増殖因子が発現していることが 見出されているので特定の腎臓障害の処置に使用され得る。従って、これらの因 子はこの器官の適切な生理学的維持に必要であり得る。処置はまた、肝臓の再生 、または肝機能障害に関連し得る。 HCABA58Xを含む有意な処置は、創傷治癒に関連する。本発明の組成物は、生体 の実質的に全ての皮膚創傷、角膜創傷、および上皮で覆われた(epithelial-lin ed)中空器官への障害を含む広範な種々の創傷を処置するために用いられ得る。 処置に適する創傷は、火傷、擦傷、および切り傷のような外傷、ならびに外科的 切開および皮膚移植術のような外科的手順から生じるものを含む。本発明のポリ ペプチドを用いた処置に適切な他の症状は、慢性潰瘍、糖尿病性潰瘍、他の非治 癒(栄養に関する)症状(マルファン症候群を処置するべき症状、毛包発達を促 進するべき症状、インビボおよびインビトロの種々の表皮および上皮細胞の増殖 ならびに分化を刺激するべき症状、および胚形成を刺激するべき症状)のような 慢性症状を含む。 HCABA58Xまたはその可溶性フラグメントは、発症領域に適用するために生理学 的に受容可能なキャリアに取り込まれ得る。キャリアの性質は、広く変化し得、 そして意図される適用の場所に依存する。皮膚への適用のために、クリームまた は軟膏基剤が通常好まれる;適切な基剤は、ラノリン、Silvadene(Marion)( 特に火傷の処置のため)、Aquaphor(Duke Laboratories,South Norwalk,Conn .)などを含む。所望であれば、創傷のペプチドへの連続的な曝露のために、絆 創膏および他の創傷包帯中にHCABA58X含有組成物を取り込ませることが可能であ る。エアロゾール適用もまた使用を見出し得る。 処置組成物におけるHCABA58Xの濃度は重要ではないが、上皮細胞増殖を誘導す るのに充分であるべきである。組成物は局所的に発症領域に適用され、代表的に は眼には点眼薬として、または皮膚にはクリーム剤、軟膏剤またはローション剤 として適用され得る。眼の場合、頻回の処置が望ましく、通常4時間以内の間隔 で適用される。皮膚では、1日に2回〜4回またはより頻繁な処置組成物の適用 により、治癒の間、発症領域に処置組成物を継続的に維持することが望ましい。 本発明のポリペプチドの使用量は、投与の様式、他の活性化合物の使用などと 共に変化し、一般に約1μg〜100μgの範囲にある。本発明のポリペプチドは生 理食塩水、リン酸緩衝化生理食塩水などのような生理学的に受容可能なキャリア と共に使用され得る。使用される化合物の量は、本発明のポリペプチドまたは本 発明のポリペプチドを含む処方物へのインビトロでの細胞応答および実験動物の 応答に基づいて経験的に決定され得る。 HCABA58Xまたはその可溶性フラグメントは、血管形成、骨吸収、免疫応答、な らびにシナプスおよび神経細胞のエフェクター機能の調節に使用され得る。HCAB A58Xはまた、アラキドン酸カスケードの調節に使用され得る。 適用はまた、脱毛症、失毛(hair loss)に関連し、そして毛包発達に影響する 他の皮膚の症状に関連する。いくつかの系統の証拠は、このような症状の増殖因 子の関与を結びつける。上記で記載されたように、TGFα遺伝子に無発現変異を 含むように操作された「ノックアウト」マウスは、量的または質的な毛合成に関 連した異常性を表す。さらに、マウスにおけるマッピング研究は、毛発育に影響 するいくつかの変異がTGFα遺伝子座に位置することを示した(Mannら、Cell,7 3:249-261(1993))。HCABA58Xまたはその誘導体の局所的または全身的適用は、 脱毛症、失毛の処置のために使用され得、そしてこれらの請求項は本発明の範囲 内にある。 特定の疾患病態は、HCABA58X増殖因子の全身性臨床的投与により部分的に、ま たは完全に回復され得る。この投与は、遺伝子治療の形態(下記参照)であるか :あるいはHCABA58X DNAの組換え構築物から、またはペプチド化学合成から合成 されるペプチドもしくはタンパク質の投与を介し得る(Wooら、Protein Enginee ring 3:29-37(1989))。 本発明はHCABA58Xレセプターを同定するための方法を提供する。レセプターを コードする遺伝子は、当該分野に公知の多数の方法、例えば、リガンドパニング およびFACS選別により、同定され得る(Coliganら、Current Protocols in Immu n.,1(2),第5章、(1991))。好ましくは、発現クローニングが使用され、ここ でポリアデニル化RNAがHCABA58X応答性の細胞から調製される。そして、このRNA から作製されたcDNAライブラリーはプールに分けられ、そしてこのRNAを使用し て、COS細胞またはHCABA58X応答性でない他の細胞をトランスフェクトする。ガ ラススライド上で増殖したトランスフェクトされた細胞は、標識されたHCABA58X に曝される。これは、ヨウ素化または部位特異的タンパク質キナーゼに対する認 識部位の封入を含む種々の方法、によって標識され得る。固定化およびインキュ ベーションに続いて、スライドはオートラジオグラフィー分析に供される。ポジ ティブなプールは同定され、そしてサブプールが調製され、そしてサブプールお よび再スクリーニングプロセスを繰り返して再トランスフェクトされ、最終的に 推定レセプターをコードする単一のクローンを得る。レセプター同定のための別 のアプローチの場合、標識されたリガンドは、レセプター分子を発現する細胞膜 または細胞抽出調製物に光親和性結合し得る。架橋物質はPAGEによって分離され 、そしてX線フィルムに曝される。リガンドレセプターを含む標識された複合体 は、切除され得、ペプチドフラグメントに分解され得、そしてタンパク質ミクロ シークエンスに供され得る。ミクロシークエンスから得られたアミノ酸配列は、 推定レセプターをコードする遺伝子を同定するための、cDNAライブラリーをスク リーニングするための縮合オリゴヌクレオチドプローブ対を設計するために使用 され得る。 本発明はまた、本発明のポリペプチドに対するアゴニスト化合物を同定するた めの、化合物をスクリーニングする方法を提供する。例として、HCABA58Xレセプ ターを発現している哺乳動物細胞または膜調製物が、HCABA58Xおよび潜在的なア ンタゴニスト化合物とインキュベートされ、そしてレセプターからの2次シグナ ルを生じるこの化合物の能力が、それが有効なアンタゴニストであるかどうかを 決定するために測定される。このような2次メッセンジャー系はcAMPグアニル酸 シクラーゼ、イオンチャンネルまたはホスホイノシチド加水分解を含むが、これ らに限定されない。 本発明のポリペプチドに対するレセプターに特異的な、潜在的なアンタゴニス トを同定するための別のアッセイは、競合アッセイである。このアッセイは本発 明のポリペプチドに対するレセプターを過剰発現する原形質膜(例えばヒトA431 ガン細胞)を単離する工程を含む。培地(容量はおよそ10マイクロリットル)中 の連続的に希釈された10nM 125I-HCABA58Xを含む試験試料が、潜在的なアンタゴ ニスト化合物の存在下で5マイクログラムの原形質膜に添加され、そして4℃に て4時間インキュベートされる。反応溶液は希釈され、直ちにミリポア(millipo re)フィルターに通される。次いで、フィルターを迅速に洗浄し、そして結合放 射活性をガンマカウンターにおいて測定する。次いで、結合HCABA58Xの量を測定 する。コントロールアッセイもまた化合物の非存在下で行われ、アンタゴニスト が結合HCABA58Xの量を減少させるかどうか決定する。 潜在的なアンタゴニスト化合物は、ポリペプチドに結合する、抗体または場合 によってはオリゴペプチドを含む。あるいは、潜在的なアンタゴニストはレセプ ター(ポリペプチドの非活性型であり、それにより本発明のポリペプチドの作用 を阻害する)に結合するタンパク質に密接に関連し得る。 別のアンタゴニスト化合物は、アンチセンス技術を用いて調製したアンチセン ス構築物である。アンチセンス技術は、三重らせん体またはアンチセンスDNAも しくはRNAを介して遺伝子発現をコントロールするために使用される。両方法はD NAまたはRNAへのポリヌクレオチド結合に基づく。例えば、本発明の成熟ポリペ プチドをコードするポリヌクレオチド配列の5'コード部分は、約10〜40塩基対の 長さのアンチセンスRNAオリゴヌクレオチドを設計するために使用される。DNAオ リゴヌクレオチドは転写に関与する遺伝子の領域に相補的であるように設計され (三重らせん:Leeら,Nucl.Acids Res.,6:3073(1979);Cooneyら,Science,2 41:456(1988);およびDervanら,Science,251:1360(1991)を参照のこと)、それ によって本発明のポリペプチドの転写および産生を妨げる。アンチセンスRNAオ リゴヌクレオチドはインビボでmRNAにハイブリダイズし、本発明のポリペプチド へのmRNA分子の翻訳をブロックする(Antisense‐Okano,J.Neurochem.,56:560 (1991);Oligodeoxynucleotides as Antisense Inhibitors of Gene Expression ,CRC Press,Boca Raton,FL(1988))。上記のオリゴヌクレオチドもま た、アンチセンスRNAまたはDNAは、インビボで発現されて、本発明のポリペプチ ドの産生を阻害し得るように、細胞に送達される。 アンタゴニスト化合物は、本発明のポリペプチドに結合する小分子を含み、そ してレセプターでその作用をブロックし、その結果正常な生物学的活性が妨げら れる。小分子はまた、結合を妨げるためにポリペプチドに結合し得る。小分子の 例は小ペプチドまたはペプチド様分子を含むが、これらに限定されない。 アンタゴニストは、新生物形成(例えば、ガンおよび腫瘍)の処置に使用され 得る。マウスの腫瘍細胞によるEGFファミリーのメンバーの分泌または生成の阻 害は、腫瘍の後退を起こす。なぜなら、これらのタンパク質は、新生物形成細胞 を含むすべての細胞でDNA合成の誘導を刺激するからである。 本発明のポリペプチドに対するアンタゴニストはまた、特定の皮膚障害、例え ば乾癬の処置のために、治療的に使用され得る。乾癬障害のような疾患から得ら れた皮膚組織診において、増殖因子のこのファミリーのメンバーの発現の上昇レ ベルが上昇することが見出されている(Cookら、Cancer Research,52:3224-3227 (1992))。アンタゴニストは、例えば、本明細書中以下で記載されるように、薬 学的に許容可能なキャリアと共に組成物において使用され得る。 本発明のポリペプチドに対するアンタゴニストはまた、糖尿病の処置のために 治療的に使用され得る。 本発明のポリペプチドまたはアンタゴニスト化合物は、適切な薬学的キャリア と組み合わせて使用され得る。このような組成物は、ポリペプチドまたは化合物 の治療的有効量および薬学的に受容可能なキャリアまたは賦形剤を含む。このよ うなキャリアは、生理食塩水、緩衝化生理食塩水、ブドウ糖、水、グリセロール 、エタノール、およびそれらの組み合わせを含むが、これらに限定されない。処 方物は、投与の方法に適するべきである。 本発明はまた、本発明の薬学的組成物の1つ以上の成分で満たされた1つ以上 の容器を含む薬学的なパックまたはキットを提供する。このような容器(単数ま たは複数)に付随するものは、医薬品または生物学的製品の製造、使用、または 販売を統制する政府機関により規定された形態の表示であり得、この表示は、ヒ トの投与のための製造、使用、または販売のその機関による認可を表す。さらに 、 本発明のポリペプチドまたは化合物は、他の治療的化合物と併用して用いられ得 る。 この薬学的組成物は、例えば、経口、局所、静脈内、腹腔内、筋肉内、皮下、 鼻腔内、または皮内経路による簡便な様式で投与され得る。薬学的組成物は、特 定の症状の処置および/または予防に効果的な量で投与される。一般に、それら は少なくとも約10μg/kg体重の量で投与され、そして多くの場合、それらは1日 に約8mg/kg体重を超えない量で投与される。多くの場合、投薬量は、1日に約1 0μg/kg体重から約1mg/kg体重であり、投与経路、症状などが考慮される。 ポリペプチドおよびポリペプチドであるアンタゴニストはまた、インビボでの このようなポリペプチドの発現により本発明に従って使用され得、これはしばし ば「遺伝子治療」といわれる。 従って、例えば、患者由来の細胞は、ポリペプチドをコードするポリヌクレオ チド(DNAまたはRNA)を用いてエキソビボで操作され得、次いで、操作された細胞 はこのポリペプチドで処置されるべき患者に提供される。このような方法は当該 分野で周知であり、本明細書中の教示から明らかである。例えば、細胞は、本発 明のポリペプチドをコードするRNAを含有するレトロウイルスプラスミドベクタ ーの使用により操作され得る。 同様に、細胞は、インビボでのポリペプチドの発現のために、例えば、当該分 野で公知の手順によりインビボで操作され得る。例えば、パッケージング細胞は 、本発明のポリペプチドをコードするRNAを含むレトロウイルスプラスミドベク ターで形質転換され、このようにパッケージング細胞は今や目的の遺伝子を含む 感染性のウイルス粒子を産生する。これらのプロデューサー細胞は、インビボで 細胞を操作するためおよびインビボでのポリペプチドの発現のために、患者に投 与され得る。このような方法により本発明のポリペプチドを投与するためのこれ らの方法および他の方法は、本発明の教示から当業者には明らかなはずである。 レトロウイルス(これ由来のレトロウイルスプラスミドベクターを本明細書中 で先に言及した)は、モロニーマウス白血病ウイルス、脾臓懐死ウイルス、ラウ ス肉腫ウイルス、ハーベイ肉腫ウイルス、鳥類白血病ウイルス、ギボンサル白血 病ウイルス、ヒト免疫不全ウイルス、アデノウイルス、骨髄増殖肉腫ウイルス、 および乳ガンウイルスのようなレトロウイルスに由来し得るが、これらに限定さ れない。一つの実施態様において、このレトロウイルスプラスミドベクターはモ ロニーマウス白血病ウイルス由来である。 このベクターは1つ以上のプロモーターを含む。使用され得る適切なプロモー ターは、レトロウイルスLTR; SV40プロモーター;およびMillerら、Biotechniqu es 7巻、第9号、980-990(1989)に記載されるヒトサイトメガロウイルス(CMV )プロモーターまたは任意の他のプロモーター(例えば、ヒストン、pol IIIお よびβアクチンプロモーターを含む(これらに限定されない)、真核生物細胞性 プロモーターのような細胞性プロモーター)を含むが、これらに限定されない。 使用され得る他のウイルス性プロモーターは、アデノウイルスプロモーター、チ ミジンキナーゼ(TK)プロモーター、およびB19パルボウイルスプロモーターを 含むが、これらに限定されない。適切なプロモーターの選択は、本明細書中に含 まれる教示により、当業者にとって明らかである。 本発明のポリペプチドをコードする核酸配列は、適切なプロモーターの制御下 にある。使用され得る適切なプロモーターは、アデノウイルス主要後期プロモー ターのようなアデノウイルスプロモーター;またはサイトメガロウイルス(CMV )プロモーターのような異種プロモーター;RSウイルス(RSV)プロモーター;M MTプロモーター、メタロチオネインプロモーターのような誘導性プロモーター; 熱ショックプロモーター;アルブミンプロモーター;ApoAIプロモーター;ヒト グロビンプロモーター;単純ヘルペスチミジンキナーゼプロモーターのようなウ イルスチミジンキナーゼプロモーター;レトロウイルスLTR(本明細書中上記の 修飾型レトロウイルスLTRを含む);βアクチンプロモーター;ならびにヒト成 長ホルモンプロモーターを含むが、これらに限定されない。プロモーターはまた 、ポリペプチドをコードする遺伝子を制御する天然のプロモーターあり得る。 レトロウイルスプラスミドベクターは、パッケージング細胞株を形質導入して プロデューサー細胞株を形成するために使用される。トランスフェクトされ得る パッケージング細胞の例は、PE501、PA317、ψ-2、ψ-AM、PA12、T19-14X、VT-1 9-17-H2、ψCRE、ψCRIP、GP+E-86、GP+envAm12、およびDAN宙細胞株(これらは 、Miller,Human Gene Therapy,1巻、5〜14頁(1990)(これは、本明細書中 で 全文が参照として援用される)に記載される)を含むが、これらに限定されない 。このベクターは、パッケージング細胞を当業者にとって公知の任意の手段で形 質導入し得る。そのような手段は、エレクトロポレーション、リポソームの使用 、およびCaPO4沈降を含むが、これらに限定されない。一つの代替手段において 、レトロウイルスプラスミドベクターは、リポソームにカプセル化され得るか、 または脂質に結合されて、そして次いで宿主に投与され得る。 プロデューサー細胞株は、このポリペプチドをコードする核酸配列を含む感染 性レトロウイルスベクター粒子を生成する。次いで、このようなレトロウイルス ベクター粒子は、真核生物細胞をインビトロまたはインビボのいずれかで形質導 入するのに、使用され得る。形質導入された真核生物細胞は、ポリペプチドをコ ードする核酸配列を発現する。形質導入され得る真核生物細胞は、胚幹細胞、胚 ガン細胞、ならびに造血幹細胞、肝細胞、線維芽細胞、筋芽細胞、ケラチノサイ ト、内皮細胞および気管支上皮細胞を含むが、これらに限定されない。 本発明はまた、診断の場合の本発明の遺伝子の使用に関連している。本発明の 遺伝子の変異型の検出は、本発明のポリペプチドの過小発現により起こる疾患( 例えば、不適切な創傷の治癒、不適切な神経学的機能、眼球障害、腎臓障害およ び肝臓障害、毛包発達、血管形成、および胚形成)または感受性の診断を可能に する。 本発明のヒト遺伝子における変異を有する個体は、種々の技術によりDNAレベ ルで検出され得る。診断のための核酸は、患者の細胞(例えば、血液、尿、唾液 、組織生検、および剖検物質由来)より得られ得る。ゲノムDNAは、検出のため に直接使用され得るか、または分析前にPCR(Saikiら、Nature、324:163-166(19 86))を用いることにより酵素的に増幅され得る。RNAあるいはcDNAもまた、また 同じ目的のために使用され得る。例として、本発明のポリペプチドをコードする 核酸に相補的なPCRプライマーが、その変異を同定および分析するために使用さ れ得る。例えば、欠失および挿入は、正常な遺伝子型との比較における増幅され た産物のサイズの変化により検出され得る。点変異は、放射性標識されたRNAま たは、あるいは放射性標識されたアンチセンスDNA配列に、増幅されたDNAをハイ ブリダイズさせることにより同定され得る。完全にマッチした配列は、RNaseA 消化または融解温度の差により、ミスマッチした二重鎖と区別され得る。 参照遺伝子と変異を有する遺伝子との間の配列の差異は、直接DNA配列決定法 により明らかにされ得る。さらに、クローン化されたDNAセグメントは、特定のD NAセグメントを検出するためのプローブとして使用され得る。この方法の感度は 、PCRと組み合わされた場合に、非常に増強される。例えば、配列プライマーは 、二重鎖のPCR産物または改変PCRにより生成された一重鎖テンプレート分子とと もに使用される。この配列決定は、放射標識されたヌクレオチドを用いる従来の 手順によるか、または蛍光タグを用いる自動配列決定手順により実行される。 DNA配列の差異に基づいた遺伝子試験は、変性剤を含むかまたは含まないゲル におけるDNAフラグメントの電気泳動的移動度の変化の検出により達成され得る 。高分解能ゲル電気泳動により微小配列の欠如または挿入が明らかになり得る。 異なった配列のDNAフラグメントは、変性ホルムアミド勾配ゲルにより識別され 得、そこでは異なったDNAフラグメントの移動が、それらの特定の融解温度また は部分的な融解温度に依存してゲルの異なった位置で、遅延する(例えば、Myers ら,Science,230:1242(1985)を参照のこと)。 特定の位置での配列変化もまた、核酸分解酵素保護アッセイ(例えば、RNase およびS1保護)または化学的開裂方法によって明らかになり得る(例えば、Cotto nら,PNAS,USA,85:4397-4401(1985))。 従って、特定のDNA配列の検出は、ハイブリダイゼーション、RNase保護、化学 的開裂、直接DNA配列決定、または制限酵素の使用(例えば、制限酵素断片長多型 (RFLP))、およびゲノムDNAのサザンブロッティングのような方法によって達成さ れ得る。 より従来型のゲル-電気泳動およびDNA配列決定に加えて、インサイチュ分析に より変異が検出され得る。 本発明はまた、種々の組織において本発明のポリペプチドの変化したレベルを 検出するための診断的アッセイに関連する。なぜなら、正常のコントロール組織 と比較されるタンパク質の過剰発現が、新生物形成、皮膚障害、眼球障害および 炎症などの特定の疾患症状の存在を検出し得るからである。宿主由来の試料にお ける本発明のポリペプチドのレベルを検出するために使用されるアッセイは、当 業者に周知であり、そしてラジオイムノアッセイ、競合結合アッセイ、ウエスタ ンブロット分析、そして好ましくは、ELISAアッセイを含む。ELISAアッセイは、 最初に本発明のポリペプチドの抗原に特異的な抗体(好ましくは、モノクローナ ル抗体)を調製する工程を含む。さらに、レポーター抗体がモノクローナル抗体 に対して調製される。レポーター抗体に対して、放射活性、蛍光、または本実施 例においては西洋ワサビペルオキシダーゼ酵素のような検出試薬を結合させる。 ここで、試料を宿主から取り出し、固体支持体(例えば、試料中のタンパク質に 結合するポリスチレンディッシュ)上でインキュベートする。次いで、ディッシ ュ上の任意の遊離タンパク質結合部位を、ウシ血清アルブミンのような非特異的 タンパク質とともにインキュベートすることにより覆う。次に、モノクローナル 抗体をディッシュ中でインキュベートし、その間にモノクローナル抗体がポリス チレンディッシュに結合している任意の本発明のポリペプチドに対して結合する 。全ての未結合のモノクローナル抗体は緩衝液で洗浄除去する。西洋ワサビペル オキシダーゼに連結したレポーター抗体を、ここで、ディッシュ中に入れ、本発 明のポリペプチドに結合した任意のモノクローナル抗体に対してレポーター抗体 の結合を生じさせる。次いで、未結合のレポーター抗体を洗浄除去する。次いで 、ペルオキシダーゼ基質をディッシュに加え、そして所定の時間に発色した量を 、標準曲線と比較した場合の患者試料の所定の容量中に存在するタンパク質の量 の尺度とする。 競合アッセイもまた、宿主由来の試料において本発明のポリペプチドのレベル を決定するために使用され得る。このようなアッセイは、本発明のポリペプチド のレセプターを過剰発現する原形質膜を単離する工程を含む。次いで、標識され た本発明のポリペプチドを含む試験試料を原形質膜に加え、次いで、一定時間ま でインキュベートする。また、本発明のペプチドを含むと考えられる宿主由来の 試料を反応混合物に加える。次いで、反応混合物をフィルターを通し、迅速に洗 浄し、次いでレセプターの競合量(従って、試料中の本発明のポリペプチド量) を決定するために結合放射活性を測定する。 HCABA58Xに特異的な抗体は、ガンの診断および治療に使用され得る。なぜなら 、多くのガン細胞の型が、新生物形成または過形成のプロセスの間、このTGFα フ ァミリーの種々のメンバーをアップレギュレートするためである。これらの抗体 はHCABA58Xに結合し、そして不活性化する。HCABA58X(および/またはそのファ ミリーメンバー)に対するモノクローナル抗体は、過形成増殖異常および新生物 形成増殖異常を含む(しかし、これらに限定されない)特定の障害の診断および 治療の両方について、臨床で使用され得る。新生物形成組織による増殖因子発現 のアップレギュレーションは、罹患した患者の血液中の増殖因子の増加を検出す る種々の血清アッセイのための基礎を形成する。これらのアッセイは、代表的に 診断的状況で使用されるだけでなく、予後の状況でも同様に(手術、化学療法の 後の潜在性の腫瘍細胞の存在を検出するために)使用される。 さらに、HCABA58Xレセプターを発現している悪性細胞は、レセプター結合アッ セイにおける標識されたHCABA58Xの使用により、またはHCABA58Xレセプター自体 に対する抗体の使用により、検出され得る。細胞は、HCABA58Xのレセプターの存 在および密度に基づいて識別され得、それによって、このような細胞の、HCABA5 8Xの生物学的活性に対する感受性を予想する手段を提供する。 本発明の配列はまた、染色体の同定に有益である。この配列は、個々のヒト染 色体の特定の位置に特異的に標的化され、そしてその位置にハイブリダイズし得 る。さらに、現在、染色体上の特定の部位を同定する必要がある。現在、染色体 位置のマーキング(marking)に利用可能な、実際の配列データ(反復多型)に 基づく染色体マーキング試薬はほとんどない。本発明に従うDNAの染色体へのマ ッピングは、これらの配列と疾患に関連する遺伝子とを相関させることにおける 重要な第1段階である。 簡潔に述べれば、配列は、cDNAからPCRプライマー(好ましくは15〜25bp)を 調製することにより染色体にマップされ得る。遺伝子の3'非翻訳領域のコンピュ ーター解析が、ゲノムDNA内で1より多いエキソンにまたがらず、従って増幅プ ロセスを複雑化することのないプライマーを迅速に選択するために使用される。 次いで、これらのプライマーは、個々のヒト染色体を含む体細胞ハイブリッドの PCRスクリーニングに使用される。プライマーに対応するヒト遺伝子を含むハイ ブリッドのみが増幅フラグメントを生じる。 体細胞ハイブリッドのPCRマッピングは、特定の染色体に特定のDNAを割り当て るための迅速な手順である。同じオリゴヌクレオチドプライマーを用いる本発明 を使用して、特定の染色体由来のフラグメントのパネルまたは大きなゲノムクロ ーンのプールを類似の様式で用いて、下位の位置決め(sublocalization)が達成 され得る。染色体にマップするために同様に使用され得る他のマッピングストラ テジーは、インサイチュハイブリダイゼーション、フロー選別した(flow-sorted )標識染色体でのプレスクリーニング、および染色体特異的cDNAライブラリーを 構築するためのハイブリダイゼーションによる前選択を包含する。 cDNAクローンの中期染色体スプレッドへの蛍光インサイチュハイブリダイゼー ション(FISH)は、1工程で正確な染色体位置を提供するために使用され得る。こ の技術は、50または60塩基程度の短いcDNAを用いて使用され得る。この技術の総 説としては、Vermaら,Human Chromosomes:a Manual of Basic Techniques,Per gamon Press,New York(1988)を参照のこと。 一旦配列が正確な染色体位置にマップされると、配列の染色体上での物理的な 位置を遺伝地図のデータと相関させ得る。このようなデータは、例えば、V.McK usick,Mendelian Inheritance in Manに見出される(Johns Hopkins University Welch Medical Libraryからオンラインで入手可能である)。次いで、同一の染 色体領域にマップされた遺伝子と疾患との関係が、連鎖解析(物理的に隣接した 遺伝子の同時遺伝)により同定される。 次に、罹患個体と非罹患個体との間のcDNAまたはゲノム配列の差異を決定する 必要がある。変異がいくつかまたはすべての罹患個体に観察されるが正常な個体 には全く観察されない場合、この変異はおそらく疾患の原因因子である。 物理的マッピング技術および遺伝的マッピング技術の現在の分解能では、疾患 に関連する染色体領域に正確に位置決めされたcDNAは、50〜500の可能性のある 原因遺伝子の1つであり得る。(これは、1メガベースのマッピング分解能で、 そして20kbあたり1遺伝子と仮定する。) このポリペプチド、そのフラグメントもしくは他の誘導体、またはそれらのア ナログ、あるいはそれらを発現する細胞は、それらに対する抗体を産生させるた めの免疫原として使用され得る。これらの抗体は、例えば、ポリクローナル抗体 またはモノクローナル抗体であり得る。本発明はまた、キメラ抗体、単鎖抗体お よびヒト化抗体、ならびにFabフラグメント、またはFab発現ライブラリーの産物 を包含する。当該分野で公知の種々の手順が、このような抗体およびフラグメン トの産生のために使用され得る。 本発明の配列に対応するポリペプチドに対して生成される抗体は、動物へのポ リペプチドの直接注射により、または動物へのポリペプチドの投与により得られ 得る。この動物は、好ましくは非ヒトである。次いで、このようにして得られた 抗体は、ポリペプチド自体に結合する。このようにして、ポリペプチドのフラグ メントのみをコードする配列でさえも、ネイティブなポリペプチド全体に結合す る抗体を生成するために使用され得る。次いで、このような抗体は、そのポリペ プチドを発現する組織からポリペプチドを単離するために使用され得る。 モノクローナル抗体の調製のために、細胞株の連続培養により産生される抗体 を提供する任意の技術が使用され得る。例としては、ハイブリドーマ技術(Kohle rおよびMilstein,1975,Nature,256:495-497)、トリオーマ技術、ヒトB細胞 ハイブリドーマ技術(Kozborら,1983,Immunology Today 4:72)、およびヒトモ ノクローナル抗体を産生するためのEBVハイブリドーマ技術(Coleら,1985,Mono clonal Antibodies and Cancer Therapy,Alan R.Liss,Inc.,77〜96頁)が挙げら れる。 単鎖抗体を産生するために記載された技術(米国特許第4,946,778号)は、本発 明の免疫原性ポリペプチド産物に対する単鎖抗体を生成するために適用され得る 。また、トランスジェニックマウスが、本発明の免疫原性ポリペプチド産物に対 するヒト化抗体を発現するために使用され得る。 本発明を以下の実施例を参照にしてさらに記載する;しかし、本発明はこのよ うな実施例に限定されないことが理解されるべきである。すべての部または量は 、他に明記しない限り重量基準である。 以下の実施例の理解を容易にするために、頻繁に現れる特定の方法および/ま たは用語が記載される。 「プラスミド」は、小文字のpの前および/または後の大文字および/または 数字により明示される。本明細書中の出発プラスミドは、市販であり、制限無く 公然と入手可能であるか、または公開された手順に従って入手可能なプラスミド から構築され得る。さらに、記載されるプラスミドと等価のプラスミドが当該分 野で公知であり、そして当業者には明らかである。 DNAの「消化」は、DNA中の特定の配列でのみ作用する制限酵素でそのDNAを触 媒反応的に切断することをいう。本明細書中で使用される種々の制限酵素は、市 販されており、そしてそれらの反応条件、補因子、および他の必要条件は当業者 に公知のものが使用された。分析目的には、代表的には1μgのプラスミドまた はDNAフラグメントが、約2単位の酵素とともに約20μlの緩衝溶液中で使用され る。プラスミド構築のためのDNAフラグメントを単離する目的のために、代表的 には5〜50μgのDNAが、20〜250単位の酵素で、より大きな容量中で消化される 。特定の制限酵素のための適切な緩衝液および基質量は、製造者により特定され る。37℃での約1時間のインキュベーション時間が通常使用されるが、しかしこ れは供給者の指示に従って変わり得る。消化後、反応物をポリアクリルアミドゲ ル上で直接電気泳動して所望のフラグメントを単離する。 切断フラグメントのサイズ分離は、Goeddel,D.ら,Nucleic Acids Res.,8:40 57(1980)により記載された8%ポリアクリルアミドゲルを使用して行われる。 「オリゴヌクレオチド」は、一本鎖ポリデオキシヌクレオチドまたは2つの相 補的なポリデオキシヌクレオチド鎖のいずれかをいい、これらは化学的に合成さ れ得る。このような合成オリゴヌクレオチドは、5'リン酸を有さず、従ってキナ ーゼの存在下でリン酸とATPとを添加しなければ別のオリゴヌクレオチドと連結 しない。合成オリゴヌクレオチドは、脱リン酸化されていないフラグメントに連 結する。 「連結」は、2つの二本鎖核酸フラグメントの間でリン酸ジエステル結合を形 成するプロセスをいう(Maniatis,Tら、前出、146頁)。他に提供されていなけれ ば、連結は公知の緩衝液および条件で、ほぼ等モル量の連結されるべきDNAフラ グメント0.5μgあたり10単位のT4 DNAリガーゼ(「リガーゼ」)を用いて達成さ れ得る。 他に記載しない限り、形質転換は、Graham,F.およびVan der Eb,A.,Virolog y,52:456-457(1973)の方法に記載のように実施された。実施例1 HCABA58X の細菌発現および精製 HCABA58XをコードするDNA配列(ATCC第97376号)を、プロセス化タンパク質の 5'配列およびHCABA58X遺伝子の3'側の配列に対応するPCRオリゴヌクレオチドプ ライマーを用いて最初に増幅する。5'オリゴヌクレオチドプライマーは、配列5' GATCGCATGCTCCCCTGCGCCTCCTG 3'(配列番号3)を有し、これはSphI制限酵素部 位、続くHCABA58Xコード配列の17のヌクレオチドを含む。3'配列、5' GACTGGATC CGAAGGTGTAGGCCCCTAC 3'(配列番号4)は、BamHI部位に相補的な配列を含み、 そして続いてHCABA58Xの18ヌクレオチドを含む。制限酵素部位は、細菌発現ベク ターpQE-70(Qiagen,Inc.,Chatsworth,CA)上の制限酵素部位に対応する。pQ E-70は、抗生物質耐性(Ampr)、細菌の複製起点(ori)、IPTG調節可能プロモ ーターオペレーター(P/O)、リボソーム結合部位(RBS)、6-Hisタグ、および 制限酵素部位をコードする。次いで、pQE-70をSphIおよびBamHIで消化する。増 幅配列をpQE-70に連結し、そしてヒスチジンタグおよびRBSをコードする配列と インフレームで挿入する。次いで、連結混合物を用いて、E.coli M15/rep5株( Qiagen,Inc.)をSambrook,J.ら、Molecular Cloning:A Laboratory Manual,C old Spring Laboratory Press,(1989)に記載の手順により形質転換する。M15/r ep5は、lacIレセプターを発現し、そしてまたカナマイシン耐性(Kanr)を与え るプラスミドpREP4の複数コピーを含む。形質転換体をLBプレート上で増殖する それらの能力により同定し、そしてアンピシリン/カナマイシン耐性コロニーを 選択する。ブラスミドDNAを単離し、制限分析により確認する。所望の構築物を 含むクローンを、Amp(100μg/ml)およびKan(25μg/ml)の両方を補充したLB 培地における液体培養で一晩(O/N)増殖させる。O/N培養物を用いて1:100〜1:2 50の比で大規模な培養物に接種する。細胞を、光学密度600(O.D.600)が0.4と0 .6との間になるまで増殖させる。次いで、IPTG(「イソプロピル-B-D-チオガラ クトピラノシド」)を加えて1mMの最終濃度にする。IPTGは、lacIリプレッサー を不活化することにより、P/Oを解放(clear)し遺伝子発現の増加を誘導する。 細胞をさらに3〜4時間増殖させる。次いで、細胞を遠心分離により収集する。 細胞ペレットをカオトロピック薬剤6MグアニジンHCl中で可溶化する。明澄化 後、 可溶化HCABA58Xを、6-Hisタグを含有するタンパク質が強固に結合することを可 能とする条件下で、ニッケル−キレートカラム上でのクロマトグラフィーにより この溶液から精製する(Hochuli,Eら、J.Chromatography 411:177-184(1984) )。HCABA58Xを6MグアニジンHCl(pH5.0)中でカラムから溶出し、そして再生の目 的で、3MグアニジンHCl、100mMリン酸ナトリウム、10mMグルタチオン(還元型) 、および2mMグルタチオン(酸化型)に調整した。この溶液中での12時間のイン キュベーションの後、タンパク質を10mMリン酸ナトリウムに対して透析する。 実施例2 バキュロウイルス発現系を用いるHCABA58Xのクローニングおよび発現 HCABA58Xタンパク質をコードするDNA配列(ATCC第97376号)を、この遺伝子の 5'および3'配列に対応するPCRオリゴヌクレオチドプライマーを用いて増幅する 。 使用されたプライマー配列は以下の通り: 5' GAGCGGATCCGCCATCATGCTCCCCTGCGCCTCCTG 3'(配列番号5)であり、これは BamHI制限酵素部位(太字)、続いて真核生物細胞における翻訳の開始に効率的 なシグナルに類似の6ヌクレオチド(Kozak,M.,J.Mol.Biol.,196:947-950 (1987)(翻訳の開始コドンは「ATG」である))、それに続くHCABA58Xコード配 列の5'末端に対応する20ヌクレオチドを有する 3'プライマー、5' GACTGGTACCCTGCCCCTCACAACAGGCTC 3'(配列番号6)は、制 限エンドヌクレアーゼAsn718の切断部位(太字)およびHCABA58X遺伝子の3'末端 に相補的な20ヌクレオチドを含む。増幅配列を、市販のキット(「Geneclean」B IO 101 Inc.,La Jolla,Ca.)を用いて、1%アガロースゲルより単離する。次 いで、このフラグメントをエンドヌクレアーゼBamHIおよびAsp718で消化し、次 いで再度1%アガロースにおいて精製する。このフラグメントを、F2と命名する 。 ベクターpA2(pVL941ベクターの改変体、下記)をバキュロウイルス発現系を 用いるHCABA58Xタンパク質の発現のために用いる(総説について、Summers,M.D .およびSmith,G.E.1987,A manual of methods for baculovirus vectors an d insect cell culture procedures,Texas Agricultural Experimental Station Bulletin No.1555を参照のこと)。この発現ベクターは、オートグラファ(Aut ographa californica)核多角体ウイルス(AcMNPV)の強力なポリヘドリンプロ モーター、それに続く制限エンドヌクレアーゼの認識部位を含む。シミアンウイ ルス(SV)40のポリアデニル化部位を、効率的なポリアデニル化のために用いる。 組換えウイルスを容易に選択するために、E.coli由来のβガラクトシダーゼ遺 伝子をポリヘドリンプロモーターと同方向に挿入し、その後ポリヘドリン遺伝子 のポリアデニル化シグナルが続く。ポリヘドリン配列には、同時トランスフェク トした野生型ウイルスDNAの細胞媒介性相同組換えのためのウイルス配列が両端 で隣接する。多くの他のバキュロウイルスベクターが、用いられ得る。例えば、 pAc373、pRG1、pVL941、およびpAcIM1である(Luckow,V.A.およびSummers,M. D.、Virology,170:31-39)。 プラスミドを制限酵素BamHIおよびAsp718で消化し、次いで当該分野で公知の 手順によりウシ小腸ホスファターゼを用いて脱リン酸化した。次いで、市販のキ ット(「Geneclean」BIO 101 Inc.,La Jolla,Ca.)を用いてDNAを1%アガロ ースゲルより単離した。このベクターDNAをV2と命名する。 フラグメントF2および脱リン酸化プラスミドV2を、T4 DNAリガーゼを用いて連 結する。次いで、E.coli HB101細胞を形質転換し、そして制限酵素BamHIおよび Asp718を用いて、HCABA58X遺伝子を有するプラスミド(pBacHCABA58X)を含んだ 細菌を同定する。クローン化フラグメントの配列を、DNA配列決定により確認し た。 5μgのプラスミドpBacHCABA58Xを、リポフェクション法(Felgnerら、Proc. Natl.Acad.Sci.USA,84:7413-7417(1987))を用いて、1.0μgの市販の線状化 したバキュロウイルス(「BaculoGoldTM baculovirus DNA」,Pharmingen,San Diego,CA.)とともに同時トランスフェクトする。 1μgのBaculoGoldTMウイルスDNAおよび5μgのプラスミドpBacHCABA58Xを、5 0μlの無血清グレース培地(Life Technologies Inc.,Gaithersburg,MD)を含 むマイクロタイタープレートの無菌ウェル中で混合する。その後、10μlのリポ フェクチンおよび90μlのグレース培地を添加し、混合し、そして室温にて15分 間インキュベートする。次いで、そのトランスフェクション混合物を、無血清グ レース培地1mlを有する35mm組織培養プレート内に播種されたSf9昆虫細胞(ATC C CRL 1711)に滴下する。プレートを、新たに加えられた溶液を混合するために 、煎後に振盪する。次いでプレートを、27℃で5時間インキュベートする。5時 間後、トランスフェクション溶液をプレートから除去し、そして10%ウシ胎児血 清を補充した1mlのグレース昆虫培地を添加する。プレートをインキュベーター に戻し、そして27℃で4日間培養を続ける。 4日後、上清を回収し、そしてSummersおよびSmith(前出)による記載と同様 にプラークアッセイを行った。改変法として、青く染色されたプラークの容易な 単離を可能にする、「Blue Gal」(Life Technologies Inc.,Gaithersburg)を 有するアガロースゲルを用いる。(「プラークアッセイ」の詳細な記述はまた、 Life Technologies Inc.(Gaithersburg)により配布される昆虫細胞培養法お よびバキュロウイルス学の使用者ガイド(9〜10頁)においても見い出され得る )。 連続希釈の4日後、ウイルスを細胞に加え、そして青く染色されたプラークを エッペンドルフピペットのチップで拾う。次いで、組換えウイルスを含む寒天を 、200μlのグレース培地を含むエッペンドルフチューブに再懸濁する。寒天を、 手短な遠心分離により除去し、そして組換えバキュロウイルスを含む上清を、35 mmディッシュに播種されたSf9細胞に感染させるために用いる。4日後、これら の培養ディッシュの上清を回収し、次いで4℃で保存する。 Sf9細胞を、10%熱不活化FBSを補充したグレース培地中で増殖させる。細胞を 、感染多重度(MOI)2で組換えバキュロウイルスV-HCABA58Xに感染させる。6 時間後、その培地を除去し、そしてメチオニンおよびシステインを除いたSF900 II培地(Life Technologies Inc.,Gaithersburg)に置き換える。42時間後、5 μCiの35S-メチオニンおよび5μCiの35Sシステイン(Amersham)を添加する 。細胞をさらに16時間インキュベートし、その後細胞を遠心分離により収集し、 そして標識されたタンパク質をSDS-PAGEおよびオートラジオグラフィーにより可 視化する。実施例3 COS 細胞における組換えHCABA58Xの発現 プラスミドHCABA58XHAの発現を、ベクターpcDNA3/Alnp(Invitrogen)から誘 導する。ベクターpcDNA3/Ampは以下を含有する:1)SV40複製起点、2)アンピ シリン耐性遺伝子、3)E.coli複製起点、4)ポリリンカー領域、SV40イント ロンおよびポリアデニル化部位が続くCMVプロモーター。完全なHCABA58X前駆体 、およびその3'末端にインフレームで融合されたHAタグをコードするDNAフラグ メントを、ベクターのポリリンカー領域にクローン化する。それゆえ、組換えタ ンパク質発現はCMVプロモーター下に指向される。HAタグは、先に記載されたよ うなインフルエンザ赤血球凝集素タンパク質由来のエピトープに対応する(I.W ilson、H.Niman、R.Heighten、A Cherenson、M.Connolly、およびR.Lerner 、1984,Cell 37:767,(1984))。標的タンパク質へのHAタグの融合により、HA エピトープを認識する抗体を用いる組換えタンパク質の容易な検出が可能になる 。 プラスミド構築ストラテジーを以下に記載する: HCABA58XをコードするDNA配列(ATCC第97376号)を、2つのプライマーを用い るPCRにより構築する;5'プライマー5'GACT GGATCC GCC ACC ATG CTCCCCTGCGCCT CCTG3'(配列番号7)は、BamHI部位(太字)、それに続く真核動物細胞の翻訳 開始に有効なシグナルに類似した6ヌクレオチドおよび開始コドンから始まるHC ABA58Xコード配列である20ヌクレオチドを含む;3'配列5'GACT TCTAGA TTA AGC GTA GTC TGG GAC GTC GTA TGG GTA GTT CTC CTT CAT GTC CTT GAA GGT GTA GGC CCC TAC 3'(配列番号8)は、HAタグ配列に相補的な配列、HCABA58Xドメインの 最後の18ヌクレオチド、およびXbaI部位を含む。それゆえ、PCR産物は、BamHI部 位、1374塩基対コード配列およびXbal部位を含む。PCR増幅DNAフラグメントおよ びベクター(pcDNA3/Amp)を、BamHIおよびXbaI制限酵素により消化し、そして 連結する。連結混合物を、E.coli SURE株(Stratagene Cloning Systems,La J olla,CA 92037より入手可能)に形質転換し、形質転換培養物をアンピシリン培 地プレートに播種し、そして耐性コロニーを選択する。プラスミドDNAを形質転 換体から単離し、そして正しいフラグメントの存在について制限分析により試験 した。組換えHCABA58Xの発現のために、COS細胞をDEAE-DEXTRAN法により 発現ベクターでトランスフェクトする(J.Sambrook、E.Fritsch、T.Maniatis 、Molecular Cloning:A Laboratory Manual,Cold Spring Laboratory Press,( 1989))。HCABA58X HAタンパク質の発現を、放射性標識および免疫沈降法により 検出する(E.Harlow,D.Lane,Antibodies:A Laboratory Manual,Cold Sprin g Harbor Laboratory Press,(1988))。細胞を、トランスフェクションの2日 後、35S-システインで8時間標識する。次いで培養培地を回収し、そして細胞を 界面活性剤(RIPM暖衝液(150mM NaCl、1% NP-40、0.1% SDS、1% NP-40、0. 5% DOC、50mM Tris(pH7.5))で溶解する(Wilson,I.ら、同上37:767(1984))。細 胞溶解物および培養培地の両方を、氾特異的モノクローナル抗体により沈降させ る。沈降したタンパク質を15% SDS-PAGEゲル上で分析する。 実施例4 遺伝子治療を介した発現 線維芽細胞を皮膚生検により被験体から得る。得られた組織を組織培養培地に おき、そして小片に分離する。組織の小さな塊を、組織培養フラスコの湿った表 面におき、それぞれのフラスコには約10片をおく。フラスコを逆さまにし、きつ く閉め、そして室温に一晩放置する。室温で24時間後、フラスコを逆さまにし、 組織の塊をフラスコの底に固定したまま、そして新鮮な培地(例えば、10%FBS 、ペニシリン、およびストレプトマイシンを含むHamのF12培地)を加える。次に 、これを37℃で約一週間インキュベートする。この時、新鮮な培地を添加し、続 いて数日おきに交換する。さらに約2週間の培養後、線維芽細胞の単層が出現す る。単層をトリプシン処理し、より大きなフラスコに入れる。 モロニーマウス肉腫ウイルスの長末端反復によって隣接されているpMV-7(Kir schmeier,P,T,ら、DNA、7:219-25(1988))を、EcoRIおよびHindIIIで消化し、 次いでウシ小腸ホスファターゼで処理する。線形ベクターをアガロースで分画化 し、そしてガラスビーズを用いて精製する。 本発明のポリペプチドをコードするcDNAを、それぞれ5'末端配列および3'末端 配列に対応するPCRプライマーを用いて増幅する。5'プライマーはEcoRI部位を含 み、そして3'プライマーはHindIII部位をさらに含む。等量のモロニーマウス肉 腫ウイルス線形骨格および増幅したEcoRIおよびHindIIIフラグメントを、T4 DNA リガーゼの存在下一緒に加える。得られた混合物を、2つのフラグメントの連結 に適切な条件下で維持する。連結混合物は、細菌HB 101を形質転換するために使 用される。この細菌は、次にベクターに目的の遺伝子を適切に挿入されたことを 確認する目的で、カナマイシン含有寒天にプレートされる。 両種向性pA317またはGP+am12パッケージング細胞を、組織培養で、10%ウシ血 清(CS)、ペニシリン、およびストレプトマイシン添加のDulbecco改変Eagle培 地(DMEM)中、コンフルエントな密度にまで増殖させる。次に、この遺伝子を含 むMSVベクターを培地に加え、パッケージング細胞をこのベクターで形質転換す る。パッケージング細胞は、ここで、この遺伝子を含む感染性ウイルス粒子を産 生する(パッケージング細胞をここでブロデューサー細胞という)。 新鮮な培地を形質転換プロデューサー細胞に加え、続いて、培地をコンフルエ ントプロデューサー細胞の10cmプレートから回収する。感染性ウイルス粒子を含 む消費培地を、ミリポアフィルターを通じて濾過し、剥離したプロデューサー細 胞を除去し、そして、次にこの培地を、線維芽細胞を感染させるために使用する 。培地を線維芽細胞のサブコンフルエントなプレートから除去し、そして即座に プロデューサー細胞由来の培地と交換する。この培地を除去し新鮮な培地と交換 する。ウイルスカ価が高い場合、実質的にすべての線維芽細胞が感染し、選択は 必要ない。力価が非常に低い場合は、neohisのような選択マーカーを有するレ トロウイルスベクターを使用する必要がある。 次いで、操作された線維芽細胞を、単独またはcytodex 3 microcarrier beads 上でコンフルエンスに増殖された後、宿主に注入する。ここで、線維芽細胞はタ ンパク質産物を産生する。 本発明の多くの改変および変形が上記の教示を考慮すれば可能であり、従って 、特に記載された以外にも、添付の請求の範囲の範囲内で本発明は実施され得る 。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) A61K 48/00 C07K 14/47 C07K 14/47 16/18 16/18 C12N 1/15 C12N 1/15 1/19 1/19 1/21 1/21 C12P 21/02 H 5/10 C12Q 1/02 C12P 21/02 1/68 A C12Q 1/02 G01N 33/53 D 1/68 C12N 5/00 A G01N 33/53 A61K 37/24

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1.以下からなる群から選択されるメンバーと少なくとも70%の同一性を有する ポリヌクレオチドを含む単離されたポリヌクレオチド: (a)配列番号2のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオ チド; (b)配列番号2に示されるアミノ酸1〜419を含むポリペプチドをコードするポ リヌクレオチド; (c)(a)または(b)のポリヌクレオチドに相補的であるポリヌクレオチド; および (D)(a)または(b)のポリヌクレオチドの少なくども15の連続した塩基を含 むポリヌクレオチド。 2.前記ポリヌクレオチドがDNAである、請求項1に記載のポリヌクレオチド。 3.前記ポリヌクレオチドがRNAである、請求項1に記載のポリヌクレオチド。 4.配列番号1のヌクレオチド配列を含む、請求項1に記載のポリヌクレオチド 。 5.配列番号1のヌクレオチド194〜ヌクレオチド1525を含む、請求項1に記載 のポリヌクレオチド。 6.以下からなる群から選択されるメンバーと少なくとも70%の同一性を有する ポリヌクレオチドを含む単離されたポリヌクレオチド: (a)ATCC寄託番号97376号に含まれるヒトcDNAにより発現された成熟ポリペプチ ドをコードするポリヌクレオチド; (b)(a)のポリヌクレオチドに相補的であるポリヌクレオチド;および (c)(a)または(b)のポリヌクレオチドの少なくとも15の連続した塩基を含 むポリヌクレオチド。 7.請求項2に記載のDNAを含むベクター。 8.請求項7に記載のベクターを含む宿主細胞。 9.前記宿主細胞から前記ベクターに含まれるヒトcDNAによりコードされるポリ ペプチドを発現させる工程を包含する、請求項8に記載の宿主細胞を使用するた めのプロセス。 10.請求項7に記載のベクターで前記細胞を形質転換またはトランスフェクト することにより該ベクターに含まれるヒトcDNAによりコードされるポリペプチド を発現させる工程を包含する、細胞を使用するためのプロセス。 11.配列番号2のアミノ酸配列に少なくとも70%相同性であるアミノ酸配列を 含むポリペプチド。 12.配列番号2のアミノ酸1〜アミノ酸419を含むポリペプチド。 13.前記ポリペプチドがその可溶性部分を含む、請求項11に記載のポリペプ チド。 14.請求項12に記載のポリペプチドに対する抗体。 15.請求項12に記載のポリペプチドに対するアンタゴニスト。 16.請求項12に記載のポリペプチドの治療的有効量を該患者に投与する工程 を包含する、HCABA58Xの必要性を有する患者の処置のための方法。 17.前記ポリペプチドの治療的有効量が、前記患者に前記ポリペプチドをコー ドするDNAを提供し、そしてインビボで該ポリペプチドを発現させることにより 投与される、請求項16に記載の方法。 18.請求項15に記載のアンタゴニストの治療的有効量を該患者に投与する工 程を包含する、HCABA58Xを阻害する必要性を有する患者の処置のための方法。 19.請求項12に記載のポリペプチドに対するアンタゴニストとして作用する 化合物を同定するための方法であって、以下: HCABA58Xレセプターを発現する細胞タイプを含む反応混合物とスクリーニング される化合物とを接触させる工程;および 前記化合物が有効なアンタゴニストである場合、同定するために該化合物が結 合した後の前記レセプターから、シグナル発生が起こらないことを検出する工程 、を包含する、方法。 20.請求項1に記載の前記ポリヌクレオチドでの変異を検出する工程を包含す る、疾患または疾患に対する感受性を診断するための方法。 21.宿主由来の試料中の請求項12に記載のポリペプチドの存在を分析する工 程を包含する、診断方法。
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