JPH09507388A - 抗微生物性タンパク質 - Google Patents

抗微生物性タンパク質

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Abstract

(57)【要約】Heuchera またはAesculusの種子から単離しうる抗微生物性タンパク質は広範な抗真菌活性およびグラム陽性細菌に対する若干の活性を示す。これらのタンパク質をコードするDNAを単離し、ベクターに取り込ませることができる。このDNAで形質転換された植物を形成することができる。これらのタンパク質を抗真菌薬または抗菌薬として商業的に利用することができ;形質転換された植物は病害に対する抵抗性の増大を示すであろう。

Description

【発明の詳細な説明】 抗微生物性タンパク質 本発明は、抗微生物性タンパク質、それらの製造および使用方法、ならびにそ れらをコードするDNA配列に関するものである。特に本発明は、Heuche ra またはAesculusの種子から単離しうる抗微生物性タンパク質に関す るものである。 これに関して抗微生物性タンパク質は、以下の活性のうち少なくとも1つを備 えたタンパク質であると定義される:抗真菌(antifungal)活性(抗酵母活性を 含む)、抗菌(antibacterial)活性。活性には、広範な拮抗作用、たとえば部 分的阻害または死が含まれる。それらのタンパク質はオリゴマーであってもよく 、または単一ペプチドサブユニットであってもよい。 Heuchera属はユキノシタ科(Saxifragaceae)植物の一 部である。ユキノシタ科は主として多年生の草本および潅木を含む大きな広範な 科であり、アカスグリ(currants)およびスグリ(gooseberr ies)ならびに多くの一般的な庭園の花がこれに含まれる。 Aesculus属はトチノキ科(Hippocastanaceae)植物 の一部である。トチノキ科は2属を含む樹木の小さな科である。Aesculu 属はその観賞用樹木、特にその褐色の種子が子供たちの好む“トチの実”であ るセイヨウトチノキ(Aesculus hippocastanum)によっ て最も良く知られている。 植物は予想される侵入体と戦うために広範な一連の抗真菌性化合物を産生して おり、ここ10年にわたって、抗真菌活性をもつタンパク質がこれらの防御の重 要な部分を構成することが明らかになった。チオニン類、β−1,3−グルカナ ーゼ類、リボソーム不活性化タンパク質、ゼーマチン類、キチン結合性レクチン 類、およびキチナーゼ類を含めた幾つかの群のこのようなタンパク質が記載され ている。これらのタンパク質は生物制御物質として利用しうる可能性があるので 、かなりの関心がもたれている。 国際特許出願番号PCT/GB92/01570号明細書(1993年3月1 8日に公開番号WO93/05153号として公開、その記載内容を参考として 本明細書に引用する)には、抗真菌性タンパク質(AFP)および抗微生物性タ ンパク質(AMP)を含むタンパク質群が記載されている。この群には以下のタ ンパク質が含まれる:ダイコン(Raphanus sativus)から単離 しうるRs−AFP1およびRs−AFP2(Terras FRGら,199 2,J Biol Chem,267:15301−13309)、ハクサイ(Brassica napus)から単離しうるBn−AFP1およびBn−A FP2、カブ(Brassica rapa)から単離しうるBr−AFP1お よびBr−AFP2、Sinapsis albaから単離しうるSa−AFP 1およびSa−AFP2、シロイヌナズナ(Arabidopsis thal iana )から単離しうるAt−AFP1、Dahlia merckiiから 単離しうるDm−AMP1およびDm−AMP2、Cnicus benedi ctus から単離しうるCb−AMP1およびCb−AMP2、Lathyru ciceraから単離しうるLc−AFP、Clitoria terna tea から単離しうるCt−AMP1およびCt−AMP2。このタンパク質群 を以下において“Rs−AFP−タイプタンパク質”とよぶ。これら、および他 の、植物由来の抗微生物性タンパク質は、特に農業目的用の殺真菌薬または抗生 物質として有用である。これらのタンパク質を植物もしくはその周囲に適用する か、または植物内において発現させることができる。 本発明者らは今回2種類の新規かつ有効な抗微生物性タンパク質を精製した。 本発明者らはHeuchera sanguineaの種子から新規な抗微生 物性タンパク質を精製した。以下、これをHs−AFP1(Heuchera sanguinea −抗真菌性タンパク質1)とよぶ。Hs−AFP1は5kD aのポリペプチドであり;それらのポリペプチドは二量体として結合する場合が ある。Hs−AFP1は広範な抗真菌活性を示す。 本発明者らは、セイヨウトチノキ(Aesculus hippocasta num )の種子から新規な抗微生物性タンパク質を精製した。以下、これをAh −AMP1(Aesculus hippocastanum−抗微生物性タン パク質1)とよぶ。Hs−AFP1と同様にAh−AMP1も5kDaのポリペ プチドである。Ah−AMP1は広範な抗真菌活性を示す。 本発明によれば、配列番号:1もしくは配列番号:2に示すアミノ酸配列をも つ抗微生物性タンパク質、または配列番号:1もしくは配列番号:2に示すアミ ノ酸配列と実質的に相同(好ましくは少なくとも60%の配列同一性をもつ)で あって、そのタンパク質が抗微生物活性をもつものが提供される。 本発明による抗微生物性タンパク質はHeucheraもしくはAescul us の種子から単離することができ、関連種もしくは非関連種両方の種子から単 離することもでき、またはいずれか適切な方法で製造もしくは合成することがで きる。 本発明の抗微生物性タンパク質は植物材料から抽出および精製するか、その既 知のアミノ酸配列から標準的なペプチド合成装置を用いる化学合成により製造す るか、または適切な生物(たとえば微生物または植物)内で組換えDNAの発現 により産生させることができる。本発明の抗微生物性タンパク質は殺真菌薬また は抗生物質として有用であり、農業用または薬剤用として用いられる。 Hs−AFP1およびAh−AMP1のアミノ酸配列決定によれば、それらは Rs−AFPタイプのタンパク質と相同である(国際特許出願公開WO93/0 5153号明細書)ことが示される。Hs−AFP1のアミノ酸配列を配列番号 :1として示す;Ah−AMP1のアミノ酸配列を配列番号:2として示す。 図5はHs−AFP1(配列番号:1)およびAh−AMP1(配列番号:2 )と、Rs−AFPタイプ抗真菌性/抗微生物性タンパク質であるRs−AFP 1(配列番号:3)、Rs−AFP2(配列番号:4)、Dm−AMP1(配列 番号:5)、Cb−AMP1(配列番号:6)、Ct−AMP1(配列番号:7 )、Lc−AFP(配列番号:8)(国際特許出願公開WO93/05153号 明細書に記載)との配列並列(alignment)を示す。Sorghumからのタン パク質Siα2(配列番号:9)およびTriticumからのg1−P(配列 番号:10)、ならびにpSAS10(Vigna)(配列番号:11)、pI 230(Pisum)(配列番号:12)およびp322(Solanum)( 配列番号:13)の推定遺伝子産物の配列の一部をも示す(後に議論する)。点 線は最適な並列を得るために配列に挿入された。 Rs−AFPタンパク質は共通の構造モチーフをもち、これがHs−AFP1 およびAh−AMP1の配列中にも見られる。Hs−AFP1およびAh−AM P1とRs−AFP1タイプのタンパク質との配列並列により、それらが図5に 示すコンセンサス−システイン−グリシン−モチーフを共有することが示される 。図5から、保存されたシステインとグリシン間のアミノ酸残基の数は示した異 なる配列および部分配列においてわずかに異なることが明らかである:最適並列 を得るために配列に点線を導入した。Hs−AFP1の配列に対比して残基に番 号を付けると、8個すべてのシステイン残基は残基番号6、17、23、27、 39、48、50および54の保存位置をもち、位置番号15および37に2個 の保存グリシンがある。さらに保存芳香族残基が位置13に、保存グルタミン酸 残基が位置31にある。 Hs−AFP1配列はRs−AFP1と48%の配列同一性を示す。Ah−A MP1配列はRs−AFP1と54%の配列同一性を示す。Hs−AFP1はア ミノ酸配列水準でAh−AMP1と52%の配列同一性を示す。Heucher タンパク質(Hs−AFP1)、Aesculusタンパク質(Ah−AMP 1)およびRs−AFPタイプタンパク質間には類似性があるにもかかわらず、 全体的なアミノ酸の含量および配列において相異がある。 Hs−AFP1の抗真菌活性は、特定の種の真菌菌糸を著しく分枝させる(高 次分枝、hyper−branching)。この形態学的作用はRs−AFP 1またはRs−AFP2により生じるものと類似する。タンパク質Ah−AMP 1は真菌増殖を阻害するが、菌糸の高次分枝は生じない。この活性はタンパク質 Dm−AMP1、Cb−AMP1、Ct−AMP1、およびLc−AFPの活性 の方により類似する。 Hs−AFP1、Ah−AMP1およびRs−AFPタイプのタンパク質は、 ChiangおよびHadwiger(1991,Mol Plant Mic robe Interact,4:324−331)が記載する、エンドウマメ (Pisum sativum−マメ科(Fabaceae)の一員)のFus arium 誘導遺伝子pI39およびpI230の推定タンパク質産物と部分的 に相同である。この相同性は、Ishibashiら(1990,Plant Mol Biol,15:59−64)が記載するササゲ(Vigna ung uiculata −他のマメ科)由来のpSAS10遺伝子の推定タンパク質産 物とも共有される。これらのタンパク質はStiekemaら(1988,Pl ant Mol Biol,11:255−269)が記載するバレイショ( olanum tuberosum−ナス科(Solanaceae)の一員) の遺伝子p322の推定タンパク質産物とも部分的に相同である。最近、アミノ 末端アミノ酸配列がp322によりコードされる成熟タンパク質のものとほとん ど同一であるタンパク質がバレイショ塊茎から精製され、抗微生物活性をもつこ とが示された(Morenoら,1994,Eur J Biochem,23 3:135−139)。cDNAが研究されたにすぎないので、遺伝子pI39 、pI230、pSAS10またはp322によりコードされるタンパク質の生 物学的特性については、全く知られていない。しかしpI39とpI230遺伝 子は、病害その他のストレスによる植物への攻撃の後にスイッチがオンになる。 pSAS10遺伝子は発芽に関与するタンパク質をコードすることが提唱されて いる。 Hs−AFP1、Ah−AMP1およびRs−AFPタイプのタンパク質配列 はイネ科(Gramineae)の下記メンバーに見られる一群の小型のα−ア ミラーゼ阻害物質の配列とは、より低度の部分的相同性を示す:モロコシ(Bl ochおよびRichardson,1991,FEBS Lett,279: 101−104)、コムギ(Colittaら,1990,FEBS Lett ,270:191−194)、およびオオムギ(Mendezら,1990,E ur J Biochem,194:533−539)。モロコシ由来のSiα 2およびコムギ由来のg−1−ピューロチオニン(g−1P)を含めて、これら のタンパク質は昆虫α−アミラーゼを阻害することが知られており、また昆虫幼 生に対しても有毒である可能性があるが、ただしこれは示されていない。これら のα−アミラーゼの阻害物質が抗真菌活性または他の抗微生物活性を示すか否か は知られていない:それらの生物学的活性については他のデータは報告されてい ない。 抗微生物性タンパク質またはその一部の一次構造を知ることにより、標準的な ペプチド合成装置を用いてそれを化学合成により製造することが可能となる。こ れにより、その抗微生物性タンパク質をコードするDNA構築物を製造すること も可能である。 本発明はさらに、本発明による抗微生物性タンパク質をコードするDNA配列 を提供する。DNA配列はcDNA配列またはゲノム配列であってもよく、また cDNAクローン、ゲノムDNAクローン、または標準的な核酸合成装置を用い て製造されたDNAに由来するものであってもよい。 DNA配列は既知のアミノ酸配列から推定することができ、そのタンパク質を コードするDNAは標準的な核酸合成装置を用いて製造することができる。ある いはDNA配列は植物由来のDNAライブラリーから単離することができる。適 切なオリゴヌクレオチドプローブを既知のアミノ酸配列から誘導し、そのタンパ ク質の一部または全部をコードするcDNAクローンにつきcDNAライブラリ ーをスクリーニングするために用いることができる。これらの同じオリゴヌクレ オチドプローブまたはcDNAクローンを用いて、ゲノムDNAライブラリーの スクリーニングによって実際の抗微生物性タンパク質遺伝子(単数または複数) を単離することができる。それらのゲノムクローンは、植物ゲノムにおいて作動 する調節配列を含みうる。たとえば抗微生物性(その他の)タンパク質の発現を 駆動するために用いうるプロモーター配列を単離することも可能である。これら のプロモーターは環境条件(たとえば真菌性病原体の存在)に対して特に応答性 であり、任意の標的遺伝子の発現を駆動するために使用しうる。 抗微生物性タンパク質をコードするcDNA配列を適切な調節配列(プロモー ター、ターミネーターなど)と組み合わせて、DNA構築物またはベクター中へ 取り込ませることができる。DNAを構成性または誘導性のプロモーター(たと えば環境条件、病原体の存在、化学物質の存在により刺激される)の制御下に置 くことができる。このようなDNA構築物を、コードされたタンパク質またはそ のタンパク質の活性部分の発現を可能にする生物系内へクローン化または形質転 換することができる。適切な生物系には微生物(たとえば細菌、たとえば大腸菌 (Escherichia coli)、シュードモナス属菌(Pseudom onas)、および内部寄生性生物(endophytes)、たとえばクラビ バクター・キシリ亜種サイノドンチス(Clavibacter xyli s ubsp.cynodontis)(Cxc);酵母;ウイルス;バクテリオフ ァ ージ;など)、培養細胞(たとえば昆虫細胞、哺乳動物細胞)、ならびに植物が 含まれる。場合によっては、発現したタンパク質を使用するために、次いで抽出 し、単離することができる。 本発明による抗微生物性タンパク質(たとえばHs−AFP1またはAh−A MP1)は殺真菌薬または抗生物質として有用である。本発明はさらに、本発明 による抗微生物性タンパク質に暴露することにより真菌または細菌を攻撃する方 法を提供する。 薬剤としての用途に関しては、本発明の抗微生物性タンパク質を哺乳動物感染 症の治療のための(たとえばカンジダ(Candida)などの酵母を攻撃する ための)殺真菌薬または抗菌薬として使用しうる。 本発明による抗微生物性タンパク質は、防腐薬として(たとえば食品添加物と して)も使用しうる。 農業用としては、本発明の抗微生物性タンパク質を、植物生育中の作物の病害 抵抗性もしくは病害耐性を改良するために、または収穫後の作物の保護のために 使用しうる。タンパク質に暴露された病原体は阻害される。本発明の抗微生物性 タンパク質は植物において既に確立している病原体を根絶することができ、また は将来の病原体の攻撃から植物を保護することができる。タンパク質の根絶作用 は特に有利である。 抗微生物性タンパク質への植物病原体の暴露は、以下のような種々の方法で行 うことができる:例えば、 (a)単離されたタンパク質を含む組成物を標準的な農業手法(たとえば噴霧 )により植物の部分または周囲の土壌に付与することができる;タンパク質は植 物組織から抽出したり、または化学的に合成したり、またはそのタンパク質を発 現するように遺伝的に修飾された微生物から抽出することができる; (b)抗微生物性タンパク質を発現するように遺伝的に修飾された微生物を含 む組成物を植物に、または植物が生育している土壌に付与することができる; (c)抗微生物性タンパク質を発現するように遺伝的に修飾された内部寄生性 生物を植物組織に導入することができる(たとえば種子処理法により); [内部寄生性生物とは、植物宿主との非病原性内部共生関係に入ることができる 微生物であると定義される。内部寄生性生物による増強された植物保護の方法は クロップ・ジェネティックス・インターナショナル・コーポレーションにより一 連の特許出願明細書に記載されている(たとえば国際特許出願公開WO90/1 3224号、欧州特許公告EP−125468−B1号、国際特許出願公開WO 91/10363号、国際特許出願公開WO87/03303号)。農業用化学 物質を産生するように内部寄生性生物を遺伝的に修飾することができる。国際特 許出願公開WO94/16076号明細書(ゼネカ・リミテッド)には、植物由 来の抗微生物性タンパク質を発現するように遺伝的に修飾された内部寄生性生物 の使用が記載されている。] (d)抗微生物性タンパク質をコードするDNAを植物ゲノムに導入し、これ により植物体内でそのタンパク質を発現させることができる(DNAはcDNA 、ゲノムDNA、または標準的な核酸合成装置により製造されたDNAのいずれ であってもよい)。 植物細胞を既知の種々の方法(アグロバクテリウム(Agrobacteri um )Tiプラスミド、エレクトロポレーション、マイクロインジェクション、 マイクロプロジェクタイルガンなど)に従って組換えDNA構築体により形質転 換することができる。次いで適切な場合、形質転換細胞を新たな核物質がゲノム 内へ安定に取り込まれた全植物体に再生することができる。形質転換した単子葉 植物および双子葉植物の両方をこの方法で得ることができるが、通常は後者の方 が再生しやすい。これらの一次形質転換体の子孫のうちあるものは抗微生物性タ ンパク質(単数または複数)をコードする組換えDNAを受け継ぐであろう。 本発明はさらに、本発明による抗微生物性タンパク質を発現する組換えDNA を含む、真菌性または細菌性病原体に対する改良された抵抗性を有する植物を提 供する。それらの植物を標準的な植物育種交配における親として用いて、改良さ れた真菌または細菌抵抗性を備えた雑種または系統を開発することができる。 組換えDNAは、植物またはその祖先に形質転換により導入された異種DNA である。組換えDNAは病原体攻撃部位(たとえば葉)へ付与するために発現さ れる抗微生物性タンパク質をコードする。このDNAは抗微生物性タンパク質の 活性サブユニットをコードするものであってもよい。 病原体は植物上、植物内またはその付近で増殖しているいかなる真菌または細 菌であってもよい。これに関して改良された抵抗性は、野生型植物と比較して真 菌性または細菌性病原体に対して増強された耐性であると定義される。抵抗性は 、病原体の作用に対する耐性のわずかな増大(この場合は病原体が部分的に阻害 される)から、植物が病原体の存在により影響されないほどの全体的な抵抗性( この場合は病原体は著しく阻害されるか、または死滅する)にまで及ぶものであ ってもよい。特定の病原体に対する抵抗性またはより広域スペクトルの病原体に 対する抵抗性双方の水準の増大が抵抗性改良を構成しうる。改良された抵抗性を 示すトランスジェニック植物(またはそれに由来する植物)は、植物形質転換法 またはその後の交配により選択される。 抗微生物性タンパク質がトランスジェニック植物またはその子孫において発現 すると、真菌または細菌は植物に病原体が攻撃した部位においてそのタンパク質 に暴露される。特に、適宜な遺伝子調節配列の採用により、タンパク質をインビ ボで、最も効果的な時点および部位において産生させることができる。たとえば タンパク質を、それが普通は多量に発現されない植物部分であるが、病害抵抗性 が重要である部位(たとえば葉)内で産生させることができる。 形成しうる遺伝的に修飾された植物の例には、栽培作物、穀物、果実および野 菜、たとえばカノラ(canola)、ヒマワリ、タバコ、テンサイ、ワタ、ダ イズ、トウモロコシ、コムギ、オオムギ、コメ、モロコシ、トマト、マンゴー、 モモ、リンゴ、ナシ、イチゴ、バナナ、メロン、バレイショ、ニンジン、レタス 、キャベツ、タマネギが含まれる。 例示にすぎないが、本発明を以下に図面を参照して説明する: 図1は、Hs−AFP1の精製に関するカチオン交換クロマトグラムおよびそ れに付随する真菌増殖阻害のグラフを示す; 図2は、精製Hs−AFP1の逆相クロマトグラムを示す; 図3は、Ah−AMP1の精製に関するカチオン交換クロマトグラムおよびそ れに付随する真菌増殖阻害のグラフを示す; 図4は、精製Ah−AMP1の逆相クロマトグラムを示す; 図5は、Hs−AFP1、Ah−AMP1その他のタンパク質のアミノ酸配列 並列を示す; また配列表を参照する: 配列番号:1はHs−AFP1のアミノ酸配列である; 配列番号:2はAh−AMP1のアミノ酸配列である; 配列番号:3はRs−AFP1のアミノ酸配列である; 配列番号:4はRs−AFP2のアミノ酸配列である; 配列番号:5はDm−AMP1のアミノ酸配列である; 配列番号:6はCb−AMP1のアミノ酸配列である; 配列番号:7はCt−AMP1のアミノ酸配列である; 配列番号:8はLc−AFPのアミノ酸配列である; 配列番号:9はSiα2のアミノ酸配列の一部である; 配列番号:10はg1−Pのアミノ酸配列の一部である; 配列番号:11はpSAS10遺伝子産物の推定アミノ酸配列の一部である; 配列番号:12はpI230遺伝子産物の推定アミノ酸配列の一部である; 配列番号:13はp322遺伝子産物の推定アミノ酸配列の一部である。 実施例1 抗真菌活性および抗菌活性のアッセイ 抗真菌活性は、先に記載された顕微分光測光法により測定された(Broek aert,1990,FEMS Microbiol Lett,69:55− 60)。通常通り、20μlの(フィルター滅菌した)被験溶液、および80μ lの真菌胞子の半濃度バレイショーデキストロースブロス(1/2 PDB)中 の懸濁液(2×104胞子/ml)を用いて試験を実施した。合成増殖培地(S MF)は以下のものからなっていた:K2HPO4(2.5mM)、MgSO4( 50μM)、CaCl2(50μM)、FeSO4(5μM)、CoCl2(0. 1μM)、CuSO4(0.1μM)、Na2MoO4(2μM)、H3BO3(0 .5μM)、KI(0.1μM)、ZnSO4(0.5μM)、MnSO4(0. 1μM)、グルコース(10g/l)、アスパラギン(1g/l)、メチオニン (20mg/l)、ミオイノシトール(2mg/l)、ビオチン(0.2mg/ l)、チアミン−HCl(1mg/l)、およびピリドキシン−HCl(0.2 mg/l)。対照ミクロ培養物は20μlの無菌蒸留水および80μlの真菌胞 子懸濁液を含有していた。 別途指示しない限り被験生物はフザリウム・カルモラム(Fusarium culmorum )(株IMI 180420)であり、インキュベーションを 25℃で48時間行った。増殖阻止率%は、595nmにおける対照ミクロ培養 物の補正済み吸収値に対する、対照ミクロ培養物の補正済み吸収値マイナス被験 ミクロ培養物の補正済み吸収値の比の、100倍として定義される。補正済み吸 収値は、48時間後に測定した595nmにおける培養物の吸収値マイナス30 分後に測定した595nmにおける吸収値である。 抗微生物活性は以下の記載に従って顕微分光測光法により測定された。軟栄養 アガロース(トリプトン,10g/l;シープラーク(Seaplaque)ア ガロース(FMC),5g/l)に接種することにより細菌懸濁液を調製した。 アリコート(80μl)の細菌懸濁液(105コロニー形成単位/ml)を平底 96ウェルミクロプレート中でフィルター滅菌試料(20μl)に添加した。5 95nmにおける培養物の吸収値を、ミクロプレート読み取り装置により、28 ℃で30分および24時間のインキュベーション後に測定した。抗真菌活性アッ セイにつき先に記載したものに従って増殖阻止率を計算した。 実施例2 Heuchera sanguinea種子 からの抗真菌性タンパク質の精製 20gの sanguinea種子(Okkerse,ベルギー、Mech elenから入手)をコーヒーミルで粉砕し、得られた粉を4℃で2時間、10 mMのNaH2PO4,15mMのNa2HPO4,100mMのKCl,2mMの EDTA,2mMのチオ尿素および1mMのPMSFを含有する氷冷した抽出用 緩衝液100mlで抽出した。ホモジネートをガーゼで絞り、遠心分離(7,0 00×gで30分)により清澄化した。分画分子量2,000Daのベンゾイル 化セルロースチューブ(シグマ)を用いて、上清を蒸留水に対して十分に透析し た。透析後に溶液を10倍濃度の緩衝液の添加により50mM(NH4)Ac( pH9)に調整し、次いで50mMのNH4Ac(pH9)で平衡化したQ− セファロース・ファスト・フロー(Q−Sepharose Fast Flo w)(スウェーデン、ウプサラ、ファルマシア)カラム(12×5cm)に導通 した。カラムを通過したタンパク質画分を凍結乾燥し、最後に50mlの20m MのNH4Ac(酢酸アンモニウム)pH6、に再溶解した。 この画分を、予め20mMのNH4Ac緩衝液で平衡化したS−セファロース 高性能(ファルマシア)カラム(10×1.6cm)に付与した。カラムを1m l/分で120mlの20から500mMのNH4Ac(pH6)直線濃度勾配 により溶離した。溶出液を280nmにおける吸収のオンライン測定によりタン パク質につき監視し(結果を図1の下側パネルに示す)、7.5mlの画分で採 取した。 画分を凍結乾燥し、蒸留水に再溶解した。これらの画分のうち5μlを、実施 例1に記載した顕微分光測光−抗真菌活性アッセイ法によって、1mMのCaC l2および50mMのKClを補充した合成増殖培地を用いて試験した(結果を 図1の上側パネルにヒストグラムとして示す)。すべての抗真菌活性が、約30 0mMのNH4Acで溶離した主ピーク(図1に矢印で示す)に含まれていた。 最高の抗真菌活性を示す画分をさらに逆相クロマトグラフィーにより精製した 。この画分を、0.1%TFAを含有する10%アセトニトリルで平衡化したP ep−S(多孔質シリカC2/C18、ファルマシア)カラム(25×0.93c m)に装填した。カラムを4ml/分で200mlの10%アセトニトリル/0 .1%トリフルオロ酢酸(TFA)から95%アセトニトリル/0.1%TFA までの直線濃度勾配により溶離した。溶出液を280nmにおける吸収のオンラ イン測定によりタンパク質につき監視した。2ml画分の溶出液を採取し、真空 乾燥し、最後に0.5mlの蒸留水に溶解し、そのうち10μlを、実施例1に 記載した1mMのCaCl2および50mMのKClを補充した合成増殖培地を 用いる顕微分光測光−抗真菌活性アッセイに使用した。 図2は、カチオン交換クロマトグラフィーにより精製した活性画分の逆相クロ マトグラムを示す。下側パネルは溶出液を280nmにおける吸収の測定により タンパク質につき監視したものを示す。上側パネルは顕微分光測光アッセイによ り試験した抗真菌活性を示す。このクロマトグラムは3ピークを示し、それらの うち25%アセトニトリルで溶出する第1のものがすべての抗真菌活性を含む。 このピーク(図2に矢印で指示する)から単離した活性因子をHs−AFP1(Heuchera sanguinea−抗真菌性タンパク質1)とよぶ。 実施例3 Aesculus hippocastanum種子 からの抗真菌性タンパク質の精製 セイヨウトチノキ(Aesculus hippocastanum)の種子 をセイヨウトチノキの樹木から採取した。種子の皮をむき、皮をむいた種子10 0gを凍結乾燥した。凍結乾燥した種子をコーヒーミルで粉砕し、得られた粉を 氷冷した抽出用緩衝液(実施例1参照)100mlで抽出した。ホモジネートを ガーゼで絞り、遠心分離(7,000×gで30分)により清澄化した。ベンゾ イル化セルロースチューブ(シグマ、ミズーリ州セントルイス)を用いて、上清 を蒸留水に対して十分に透析した。透析後に溶液を10倍濃度の緩衝液の添加に より50mMのNH4Ac(pH9)に調整し、50mMのNH4Ac(pH9) で平衡化したQ−セファロース・ファスト・フロー(スウェーデン、ウプサラ、 ファルマシア)カラム(12×5cm)に導通した。カラムを通過したタンパク 質画分を凍結乾燥し、最後に50mlの20mMのNH4Ac(pH6)に再溶 解した。この画分を、50mMのNH4Ac、pH6.0、で平衡化したS−セ ファロース高性能(ファルマシア)カラム(10×1.6cm)に付与した。カ ラムを1ml/分で20から500mMのNH4Ac、pH6、直線濃度勾配に より210分間にわたって溶離した。溶出液を280nmにおける吸収のオンラ イン測定によりタンパク質につき監視し(結果を図3の下側パネルに示す)、7 .5mlの画分で採取した。それぞれの画分からの試料を凍結乾燥し、7.5m lの蒸留水に再溶解した。これらの画分のうち5μlを、顕微分光測光−抗真菌 活性アッセイ法により、1mMのCaCl2および50mMのKClを補充した 合成増殖培地を用いて試験した(結果を図3の上側パネルに示す)。クロマトグ ラフィーにより、抗真菌活性は約300mMのNH4Acで溶離した主ピーク( 図3に矢印で示す)と共に溶出した。最高の抗真菌活性を示す画分をさらに逆相 クロマトグラフィーにより精製した。この画分を、0.1%TFA(トリフルオ ロ 酢酸)で平衡化したPEP−S(多孔質シリカC2/C18、ファルマシア)カラ ム(25×0.4cm)に装填した。カラムを1ml/分で0.1%TFAから 50%アセトニトリル/0.1%TFAまでの直線濃度勾配により50分間にわ たって展開した。溶出液を280nmにおける吸収のオンライン測定によりタン パク質につき監視した(結果を図4の下側パネルに示す)。1ml画分を採取し 、真空乾燥し、0.5mlの蒸留水に溶解した。それぞれの画分からの5μlを 抗真菌活性につきアッセイした(結果を図4の上側パネルに示す)。この物質は 25%アセトニトリルで溶出する単一の活性ピークを与えた。これは精製タンパ ク質Ah−AMP1(Aesculus hippocastanum−抗真菌 性タンパク質1)を表す。 実施例4 精製した真菌性タンパク質 Hs−AFP1およびAh−AMP1の分子構造 精製した抗真菌性タンパク質の分子構造をさらにドデシル硫酸ナトリウムポリ アクリルアミドゲル電気泳動(SDS−PAGE)により分析した。SDS−P AGEは市販のプレキャストゲル(ファルマシアからのファストゲル・ハイデン シティー(PhastGel High Density))上でファストシス テム(PhastSystem)(ファルマシア)電気泳動装置を用いて実施さ れた。試料緩衝液は200mMのトリス−HCl(pH8.3)、1%(w/v )のSDS、1mMのEDTA、0.005%のブロモフェノールブルー、およ び別途指示しない限り1%(w/v)のジチオエリトリトール(DTE)を含有 していた。200ngのタンパク質をゲル上で分離した。以下の大きさのミオグ ロビンフラグメントを分子量マーカーとして用いた(ファルマシア):17kD a、14.5kDa、8kDa、6kDa、および2.5kDa。12.5%グ ルタルアルデヒド中での電気泳動後にタンパク質を固定し、銀染色した:Heu keshovenおよびDernick(1985,Electrophore sis,6,103−112)に従う。 システイン残基をDTEで還元したのち、Hs−AFP1は見掛け分子質量約 5kDaの単一バンドを示す。非還元Hs−AFP1は約10kDaの単一バン ドとして泳動する。これらの結果は、天然Hs−AFP1がオリゴマータンパク 質である可能性があり、5kDaのポリペプチドの二量体からなる可能性が極め て高いことを示す。オリゴマー構造はジスルフィド結合によって安定化されると 思われる。 実施例5 抗真菌性および抗菌性効力 精製タンパク質の抗真菌効力を、実施例1に記載したアッセイ法により、種々 の植物病原体につき評価した。真菌の増殖、真菌胞子の採集および収穫、ならび に菌糸フラグメントの調製は先の記載に従って行われた(Broekaertら ,1990,FEMS Microbiol Lett,69:55−60)。 抗真菌性タンパク質の系列希釈液を、増殖培地SMF−(実施例1の合成増殖培 地)、培地SMF+(1mMのCaCl2および50mMのKClを補充した培 地SMF−)、増殖培地1/2 PDB−(実施例1に記載した半濃度バレイシ ョ−デキストロースブロス)、または増殖培地1/2 PDB+(1mMのCa Cl2および50mMのKClを補充した培地1/2 PDB−)を用いて真菌 に適用した。増殖阻止率%を顕微分光測光法により測定した。48時間のインキ ュベーション後に50%の増殖阻止を得るために必要な濃度(IC50値)を用量 応答曲線から計算した。 Hs−AFP1およびAh−AMP1に関する結果を表1に示す。用いた略号 は以下のとおりである:IC50=実施例1の記載に従って測定した、50%の増 殖阻止を得るために必要な濃度;ND=測定しなかった;Sp=胞子;PrSp =培地中で予め24時間発芽させた胞子;MF=タンパク質の添加前に培地中で 48時間プレインキュベートした菌糸フラグメント;BHR=広い宿主範囲;S F=腐生真菌;SMF−=実施例1に記載した合成増殖培地;SMF+=1mM のCaCl2および50mMのKClを補充した培地SMF−;1/2 PDB −=実施例1に記載した半濃度バレイショ−デキストロースブロス;1/2 P DB+=1mMのCaCl2および50mMのKClを補充した培地1/2 P DB−。 表1の結果は、Ah−AMP1およびHs−AFP1タンパク質が保有する広 範な抗真菌活性を表す。表1の結果は、Hs−AFP1とAh−AMP1が若干 異なる活性スペクトルをもつことも示す。たとえばAh−AMP1は1/2 P DB+中でレプトスペリア・マキュランス(Leptospaeria mac ulans )に対して活性が高いが、Hs−AFP1はそうでなく、一方Hs− AFP1は1/2 PDB+中でフザリウム・カルモラム(Fusarium culmorum )に対して活性が高いが、Ah−AMP1はそうでない。した がってこれら2タンパク質は互いに補足するために組み合わせ抗微生物薬として 使用することができ、これによってより広範な病害をより効果的に撲滅すること ができる。 培地SMF+および1/2 PDB+(植物組織中における生理学的条件のイ オン濃度を反映するために塩類添加物を含有する)においては、両タンパク質の 活性とも培地SMF−および1/2 PDB−におけるそれらの活性と比較して 低下する。塩類依存性の活性の低下は、明らかに被験生物により左右される。た とえばAh−AMP1に関して、培地SMF+に対比した培地SMF−における 活性低下はアルテルナリア・ブラシカ(Alternaria brassic ae )については2倍、グレオスポリウム・ムザラム(Gloeosporiu musarum)については10倍以上である。 Hs−AFP1およびAh−AMP1は両方とも、菌糸の長さの低下により示 されるように真菌の増殖過程を阻害する。Hs−AFP1はフザリウム・カルモ ラムの菌糸の高次分枝をも生じる。同様な作用がダイコン(Raphanus sativus )種子由来の抗真菌性タンパク質Rs−AFP1およびRs−A FP2によっても生じる(Terras FRGら,1992,J Biol Chem,267:15301−15309)。Ah−AMP1はフザリウム・ カルモラムの菌糸の高次分枝を生じない;それの菌糸成長阻害様式は、それぞれDahliaCnicusClitoreaおよびLathyrus由来の 抗真菌性タンパク質Dm−AMP1、Cb−AMP1、Ct−AMP1、および Lc−AFPのものに極めて類似する(国際特許出願公開WO93/05153 号明細書)。 Ah−AMP1およびHs−AFP1の抗菌活性を、4種類のグラム陽性細菌 (枯草菌(Bacillus subtilis)JHCC 553331;マ イクロコッカス・ルテウス(Micrococcus luteus)ATCC 93411;黄色ブドウ球菌(Staphylococcus aureus )ATCC 25923;大便連鎖球菌(Streptococcus fea colis )ATCC 29212)、および2種類のグラム陰性細菌(大腸菌 HB101および尋常変形菌(Proteus vulgaris)JHCC 558711)につき測定した。Hs−AFP1はこれらの被験細菌の増殖を2 00μg/mlの割合で阻害しなかったが、Ah−AMP1は枯草菌の増殖を1 00μg/mlで阻害した。 実施例8 α−アミラーゼの阻害 ゴキブリ(Blatta orientalis)成体の切断した腸から、2 0mMトリス/HCl、pH7.5、10mM CaCl2中でホモジナイズし 、細胞屑を遠心分離により除去することによって、粗製α−アミラーゼ抽出物を 調製した。ヒトおよびブタのα−アミラーゼはシグマから購入された。コムギ由 来のタイプ1−α−アミラーゼ阻害物質(シグマから購入)を陽性対照として用 いた。アミラーゼ抽出物をペプチドと共に30℃で20分間インキュベートした のち、デンプンを添加し、酵素活性をBernfeld法(1955,Meth ods Enzymol,ColwickおよびKaplan編,vol 1: 149−158)により検出した。 Hs−AFP1およびAh−AMP1のα−アミラーゼ阻害活性を、これら3 種類の供給源から得たα−アミラーゼにつき、昆虫の腸α−アミラーゼを阻害す ることが以前に報告されたモロコシ(Sorgum bicolor)相同体S Iα3(BlochおよびRichardson,1991,FEBS Let t,279:101−104)のものと比較した。SIα3は昆虫の腸およびヒ トの唾液由来の酵素の活性を5μg/ml程度の低い割合で70%以上阻害した 。コムギ由来のタイプ1−α−アミラーゼ阻害物質の市販製品10U/mlを用 いて、匹敵する阻害が得られた。SIα3は、BlochおよびRichard s on(1991)が先に報告したようにブタ膵臓由来の酵素に対しては本質的に 不活性であった。 これに対し、前記3種類の酵素に関して試験したHs−AFP1またはAh− AMP1については、200μg/mlという高い割合で含有された場合ですら 、α−アミラーゼ活性阻害は観察されなかった。 実施例7 Hs−AFP1およびAh−AMP1のアミノ酸配列決定 抗真菌性タンパク質のシステイン残基をFullmer法(1984,Ana l Biochem,142,336−341)でS−ピリジルエチル化するこ とにより修飾した。試薬をPep−S(多孔質シリカC2/C18、ファルマシア )カラム(25×0.4cm)上でのHPLCにより除去した。カラムを0.1 %トリフルオロ酢酸(TFA)から0.1%TFAを含有するアセトニトリルま での直線濃度勾配で溶離することにより、S−ピリジルエチル化タンパク質が回 収された。得られたタンパク質画分を、120Aアナライザー(アプライド・バ イオシステムズ)によるフェニルチオヒダントインアミノ酸のオンライン検出を 用いて、477Aプロテイン・シーケンス(477A Protein Seq uence)(アプライド・バイオシステムズ)によりアミノ酸配列分析した。 Hs−AFP1およびAh−AMP1のアミノ酸配列をN−末端自動エドマン 分解により決定した。Hs−AFP1に関する完全アミノ酸配列を配列番号:1 として、Ah−AMP1に関する完全アミノ酸配列を配列番号:2として提示す る。 Hs−AFP1は長さ54のアミノ酸であり、Ah−AMP1は長さ50のア ミノ酸である。両タンパク質とも8個のシステインを含有し、塩基性アミノ酸残 基が比較的豊富である。 Hs−AFP1は位置41にチロシン残基、位置43にフェニルアラニン残基 、および位置44にプロリン残基を含む。Rs−AFP1とRs−AFP2の対 応する位置に同一アミノ酸が見られる(Yが位置38、Fが位置40、Pが位置 41に)が、Ah−AMP1および他のRs−AFPタイプタンパク質において は非相同アミノ酸残基で置換されている。コムギ種子由来の関連タンパク質の三 次 元折りたたみの研究(Bruixら,1993,Biochemistry,3 2:715−724)は、これらの保存アミノ酸が2つの逆平行β−シートを連 結するタンパク質ループ上に位置することを示した。このループは真菌菌糸上の 推定受容体との相互作用に関与する活性部位の一部である可能性がある。 Rs−AFP1、Rs−AFP2およびHs−AFP1がすべて真菌の高次分 枝を生じるのに対し、Ah−AMP1、Dm−AMP1、Dm−AMP2、Cb −AMP1、およびCb−AMP2は生じないことは注目すべきである。これは 各群のタンパク質が真菌内の異なる標的と、または同一標的と異なる様式で相互 作用する可能性があることを示す。
【手続補正書】特許法第184条の8 【提出日】1995年12月18日 【補正内容】 請求の範囲の全文を以下のとおり差し替える。 請求の範囲 1.配列番号:1に示したアミノ酸配列と少なくとも60%の同一性をもつア ミノ酸配列を有する抗微生物性タンパク質。 2.配列番号:2に示したアミノ酸配列を有する抗微生物性タンパク質。 3.請求項1または2に記載する少なくとも2種類の抗微生物性タンパク質を 含む抗微生物剤。 4.請求項1に記載のタンパク質および請求項2に記載のタンパク質を含む、 請求項3に記載の抗微生物剤。 5.請求項1または2に記載の抗微生物性タンパク質をコードするDNA。 6.請求項5に記載のDNAを含有する生物学的系。 7.微生物である、請求項6に記載の生物学的系。 8.植物である、請求項6に記載の生物学的系。 9.請求項1または2に記載の抗微生物性タンパク質を発現する組換えDNA を含有する、真菌性または細菌性病原体に対する改良された抵抗性を有する植物 。 10.真菌または細菌を請求項1または2に記載の抗微生物性タンバク質に暴 露することを含む、真菌または細菌の攻撃方法。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.6 識別記号 庁内整理番号 FI C12N 1/21 9282−4B C12N 1/21 // C12P 21/02 9637−4B C12P 21/02 C (81)指定国 EP(AT,BE,CH,DE, DK,ES,FR,GB,GR,IE,IT,LU,M C,NL,PT,SE),OA(BF,BJ,CF,CG ,CI,CM,GA,GN,ML,MR,NE,SN, TD,TG),AP(KE,MW,SD,SZ),AU, BB,BG,BR,BY,CA,CN,CZ,FI,G E,HU,JP,KG,KP,KR,KZ,LK,LT ,LV,MD,MG,MN,NO,NZ,PL,RO, RU,SI,SK,TJ,TT,UA,US,UZ,V N (72)発明者 オズボーン,ルパート・ウィリアム イギリス国ミドルセックス ティーダブリ ュー2 6エスダブリュー,トゥイッケン ハム,ウォーリック・ロード 36 (72)発明者 リーズ,サラ・ブロンウェン イギリス国バークシャー アールジー12 3エックスエックス,ブラックネル,フォ レスト・パーク,マイケルデヴァー・ウェ イ 32

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1.配列番号:1および配列番号:2よりなる群から選ばれる配列と実質的に 相同であるアミノ酸配列を有する抗微生物性タンパク質。 2.配列番号:1に示したアミノ酸配列を有する、請求項1に記載の抗微生物 性タンパク質。 3.配列番号:2に示したアミノ酸配列を有する、請求項1に記載の抗微生物 性タンパク質。 4.請求項1に記載する少なくとも2種類の抗微生物性タンパク質を含む抗微 生物剤。 5.請求項2に記載のタンパク質および請求項3に記載のタンパク質を含む、 請求項4に記載の抗微生物剤。 6.請求項1に記載の抗微生物性タンパク質をコードするDNA。 7.請求項6に記載のDNAを含有する生物学的系。 8.微生物である、請求項7に記載の生物学的系。 9.植物である、請求項7に記載の生物学的系。 10.請求項1に記載の抗微生物性タンパク質を発現する組換えDNAを含有 する、真菌性または細菌性病原体に対する改良された抵抗性を有する植物。 11.真菌または細菌を請求項1に記載の抗微生物性タンパク質に暴露するこ とを含む、真菌または細菌の攻撃方法。
JP51784395A 1993-12-24 1994-12-19 抗微生物性タンパク質 Expired - Fee Related JP3631492B2 (ja)

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