JPH08205867A - ヒトリンパ球抗原複合体のDRβ−鎖座位の免疫学的もしくは生物学的活性を示すポリペプチドをコードするDNAおよびそれを使用する診断型別方法および型別用製造物 - Google Patents

ヒトリンパ球抗原複合体のDRβ−鎖座位の免疫学的もしくは生物学的活性を示すポリペプチドをコードするDNAおよびそれを使用する診断型別方法および型別用製造物

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JPH08205867A
JPH08205867A JP7290485A JP29048595A JPH08205867A JP H08205867 A JPH08205867 A JP H08205867A JP 7290485 A JP7290485 A JP 7290485A JP 29048595 A JP29048595 A JP 29048595A JP H08205867 A JPH08205867 A JP H08205867A
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    • C07K14/70503Immunoglobulin superfamily
    • C07K14/70539MHC-molecules, e.g. HLA-molecules

Abstract

(57)【要約】 【目的】 ひとリンパ球抗原複合体のDRβ−鎖座位を
コ−ドするDNA配列に関し、診断型別方法および型別
用製造物にこれらDNA配列を使用するものであって、
広範囲の病気に対する個体の感受性および組織もしくは
器官移植物の供与体もしくは受容体としての個体の特性
を決定する際に有用な方法および製造物を得る。 【構成】 ひとリンパ球抗原複合体のDRβ−鎖、すな
わちDR座位の主要な多形質領域をコードするDNA配
列から成る。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】
【発明の属する技術分野】本発明は、ヒトリンパ球抗原
複合体のDRβ−鎖座位をコードするDNA配列に関す
るものである。さらに詳細には、本発明は、診断型別方
法および診断型別用製造物におけるこれらのDNA配列
の使用に関するものである。これらの診断型別および製
造物は、多種多様な病気に対する個体の感受性、および
組織もしくは器官移植物の供与体もしくは受容体として
の個体の特性を決定する際に有用である。本発明のDN
A配列は、さらにそれらによりコードされるポリペプチ
ドの発現においても有用である。
【0002】ヒトリンパ球抗原(「HLA」)系は、ヒ
トにおける主要な組織適合性複合体である。従って、こ
れは個体間の組織および器官移植物に対する最も強いバ
リヤを構成し、明確に自己と非自己とを区別する。さら
に、HLA因子は、様々な病気に対する感受性の増強に
関連していることが示されている。従って、HLA系の
抗原は、様々な病気に対する個人の感受性を決定するた
めの診断型別方法および診断型別用製造物に使用され、
かつ組織もしくは器官移植物の供与体もしくは受容体と
してのその特性を決定するのに使用される[エフ・エッ
チ・バッハおよびジエー・ジエー・バンルード、N.E
ngl.J.Med.、第295巻、第806〜813
頁(1976)]。
【0003】遺伝学的観点から、HLA系はかなり良く
その特性が明らかにされている。たとえば、エル・ピー
・ライダー等「HLA病関連の遺伝学」、Ann.Re
v.Genet.、第15巻、第169〜187頁(1
981);ジエー・エル・ストローミンガー等、「免疫
学における主要組織適合性複合体の役割」、エル・ドル
フ編集、ガーランド SPTM プレス社、第115〜
172頁(1981);テイー・ササズキ等、「主要組
織適合性複合体における遺伝子と疾病感受性との間の関
係」、Ann.Rev.Med.、第28巻、第425
〜452頁(1977)を参照することができる。これ
は、第6染色体の短腕における約2センチモルガン(c
M)の間隔内に位置する多かれ少なかれ高度に多形性の
一連の座位から成っている。この系における3つの座位
(HLA−A,BおよびC)は、共優性的に発現される
アロ抗原の1クラスをコードする(クラスI)。他の座
位(HLA−D/DR)は、高度に識別された多形性を
有する共優性アロ抗原の第2のクラスをコードする(ク
ラスII)。補体カスケードの初期成分(C2,C4およ
びBf因子)の幾つかを制御する他の3つの座位もHL
A系に属する(種類3)。最後に、HLA複合体におけ
るIaと呼ばれる非特異的領域が存在する。この領域I
aはDR座位に関係すると思われるが、これとは異なる
ものである。
【0004】HLA系の生物学は、まだ充分に理解され
ていない。クラスIの因子は、赤血球以外の全ゆる組織
に分布している。クラスIIの因子は、実質的にβ−リン
パ球および単核食細胞に限定され、そしてクラスIII の
補体因子はC3因子、すなわち補体系における重要成分
の活性化に直接関係する。HLA−DR抗原は免疫学的
現象、すなわち免疫反応性、T−細胞抑制、T−細胞お
よびβ−細胞の共働ならびにT−細胞と大食細胞の相互
作用に関係するものと思われる[ビー・ベナセラフ、
「免疫生物学における主要組織適合性複合体の役割」、
エム・イー・ドルフ編、ガーランド SPTM プレス
社、第255〜269頁(1981)]。
【0005】HLA−DR抗原は2種の非共有結合グリ
コシル化ペプチド鎖、すなわち分子量約35000の重
鎖すなわちα−鎖と分子量約29000の軽鎖すなわち
β−鎖とから構成され、これらは細胞膜を画成する[ス
トロミンガー等、上記;およびライダー等、上記]。細
胞内において、分子量約32000の第3のペプチド鎖
がα−鎖およびβ−鎖に関連する[デー・ジエー・シャ
ロンおよびエッチ・オー・マックデビット、J.Ex
p.Med.、第152巻、第18s〜36s頁(19
80);ストロミンガー、上記]。軽鎖すなわちβ−鎖
はHLA−DR抗原の多形性を担う一方、α−鎖および
第3の鎖は種々異なる個体において同一であると思われ
る[ジー・コルテ等、Proc.Natl.Acad.
Sci.USA、第78巻、第534〜538頁(19
81);シャロンおよびマックデビット、上記]。数種
の血清学的に異なるHLA−DR抗原が同定されており
(HLA−DR1乃至HLA−DR8)、さらにモノク
ローン抗体によって、同型接合細胞系内におけるDR抗
原の従属部分が決定されている[ヴイ・クワランタ等、
ジャーナル・イミュノロジー、第125巻、第1421
〜1425頁(1980);エス・カレル等、モレキユ
ラ・イミュノロジー、第18巻、第403〜411頁
(1981)]。さらに、少なくとも2種のDRβ−鎖
を、ペプチド分析により数種の同型接合細胞系において
区別することができる[アール・エス・アコラ等、Pr
oc.Natl.Acad.Sci.USA、第78
巻、第4549〜4551頁(1981)]。
【0006】さらに、HLA−DRに近縁であるが同一
でない多形性Ia様抗原をコードする種類の他の座位も
存在する[ジー・コルテ等、ネイチヤー誌、第292
巻、第357〜360頁(1981);ナドラー等、ネ
イチヤー誌、第290巻、第591〜593頁(198
1)]。これらの明確なサブ領域はDCと呼ばれ[アー
ル・トシ等、J.Exp.Med.、第148巻、第1
592〜1611頁(1978);デー・エー・シャッ
ケルフオード等、Proc.Natl.Acad.Sc
i.USA,第78巻、第4566〜4570頁(19
81)]、およびSBと呼ばれる[エス・ジヨー等、
J.Exp.Med.、第156巻、第731〜743
頁(1982)]。DC抗原は、DR抗原との強い結合
不均衡にある。SB抗原は、二次的リンパ球反応を制御
しかつDR座位に対し動原体性の領域でコードされる。
【0007】
【従来の技術】現在、HLA−DR抗原は、抗血清での
沈殿により血清学的に単離される。従って、HLA−D
R抗原決定基の正確な性質は未確定である。しかしなが
ら、これらの抗原は、組織もしくは器官移植物に対する
供与体および受容体の適合性を決定するための、或いは
広範囲の病気に対する個体の感受性を決定するための型
別方法および型別用製造物に使用されている。たとえ
ば、ライダー等(上記)は、DR1乃至DR8型別に基
づく次の病気の感受性を報告している:
【0008】
【表1】
【0009】これらの型別からわかるように、D/DR
4につき陽性と型別された個体は、D/DR4につき陰
性と型別された個体よりも6.4倍高くインシュリン依
存性糖尿病を発生する危険がある。
【0010】ある場合には、ある疾病が、疾病関連性の
抗原を有する患者において、この抗原を持たない患者に
おけるよりもさらに重度に現れることも示されている。
たとえば、多発性硬化症の経過は、D/DR2陰性の患
者におけるよりもD/DR2陽性の患者においてより急
速である。さらに、ある種の疾病の再発は、疾病関連性
抗原につき陽性の患者においてより一般的である。要す
るに、HLA−DR型別は、大きな診断的および予後判
断的価値を有する。
【0011】
【発明が解決しようとする課題】しかしながら、この様
な型別方法および型別用製造物の使用、ならびに許容し
うる移植供与体および受容体と病気感受性の個体とを同
定する際にこれらがもたらす重要な利点は著しく制約さ
れている。何故なら、現在の型別方法は複雑かつ時間の
かかるものであり、またこの様な型別方法および型別用
製造物に対する有用かつ経済的な原料を供給するために
入手しうるHLA−DR抗原が不充分であるからであ
る。
【0012】
【課題を解決するための手段】本発明は、DR−β−鎖
をコードするDNA配列、すなわちヒトリンパ球抗原複
合体のDR座位の主要な多形性領域、およびこれらに関
連する診断型別方法ならびに型別用製造物を提供するこ
とにより上記の問題を解決する。
【0013】
【発明の効果】本発明により、HLA−DR軽鎖すなわ
ちβ−鎖をコードするDNA配列がHLA−DR型別方
法および型別用製造物に使用するため初めて入手しうる
ようになった。本発明のDNA配列は経済的かつ多量に
生産され得るだけでなく、型別方法および型別用製造物
におけるその使用は前記HLA−DR抗原に基づく型別
方法および型別用製造物を相当に単純化させかつそのコ
ストを低減させる。たとえば、本発明のDNA型別方法
は簡単であり、10〜20ml程度の少ない血液で行う
ことができ、かつ数千回の型別まで容易に規模拡大する
ことができる。
【0014】最後に、本発明のDNA配列は、適当な宿
主におけるこれら配列の発現ならびにそれらによりコー
ドされる特異的DRβ−鎖抗原の生産を他のHLA−D
R因子により汚染されることなく可能にし、これらを診
断剤、予防剤または治療剤として使用することを可能に
する。
【0015】
【発明の実施の形態】本発明を一層充分に理解し得るよ
う、以下詳細に説明する。本発明において次の用語を使
用する。
【0016】ヌクレオチド:糖成分(ペントース)と燐
酸と含窒素複素環式塩基とより成るDNAもしくはRN
Aのモノマ単位。この塩基はグリコシド炭素(ペントー
スの1´炭素)を介して糖成分に結合され、塩基と糖と
のこの結合をヌクレオチドと呼ぶ。塩基はヌクレオチド
を特性化する。4種のDNA塩基はアデニン
(「A」),グアニン(「G」),シトシン(「C」)
およびチミン(「T」)である。4種のRNA塩基は
A,G,Cおよびウラシル(「U」)である。
【0017】DNA配列:隣接するペントースの3´炭
素と5´炭素との間のホスホジエステル結合により互い
に結合されたヌクレオチドの線状列。
【0018】コドン:mRNAを介してアミノ酸、翻訳
開始信号または翻訳停止信号をコードする3個のヌクレ
オチド(トリプレット)のDNA配列。たとえば、ヌク
レオチドトリプレットTTA,TTG,CTT,CT
C,CTAおよびCTGはアミノ酸ロイシン(「Le
u」)をコードし、TAG,TAAおよびTGAは翻訳
停止信号であり、かつATGは翻訳開始信号である。
【0019】読枠:mRNAをアミノ酸配列に翻訳する
際のコドンのグループ。翻訳する際、適切な読枠を維持
しなければならない。たとえば、配列GCTGGTTG
TAAGは3つの読枠もしくは相に翻訳することがで
き、そのおのおのは次の異なるアミノ酸配列を与える: GCT GGT TGT AAG −− Ala−Gly−Cys−Lys G CTG GTT GTA AG −− Leu−Val−Val GC TGG TTG TAA G −− Trp−Leu−(停止)ポリペプチド :隣接するアミノ酸のαアミノ基とカルボ
キシ基との間のペプチド結合により互いに結合されたア
ミノ酸の線状列。
【0020】ゲノム:細胞もしくはウイルスの全DN
A。これは特に細胞もしくはウイルスのポリペプチドを
コードする遺伝子、ならびにそのオペレータ、プロモー
タおよびたとえばシャイン−ダルガルノ配列のような配
列を含むリボソーム結合および相互作用配列を包含す
る。
【0021】遺伝子:雛型もしくはメッセンジャRNA
(「mRNA」)を介して特異的ポリペプチドに特性的
なアミノ酸の配列をコードするDNA配列。
【0022】転写:遺伝子もしくはDNA配列からmR
NAを生成する過程。
【0023】翻訳:mRNAからポリペプチドを生成す
る過程。
【0024】発現:ポリペプチドを生成するためDNA
配列もしくは遺伝子により行なわれる過程。これは転写
と翻訳との組合せである。
【0025】プラスミド:完全「レプリコン」からなる
非染色体二重鎖DNA配列であって、このプラスミドは
宿主細胞において複製される。プラスミドを単細胞生物
内に挿入すると、この生物の特性をプラスミドのDNA
の結果として変化もしくは形質転換させることができ
る。たとえば、テトラサイクリン耐性(TetR )に対
する遺伝子を有するプラスミドは、初めテトラサイクリ
ンに対し感受性の細胞をこれに耐性である細胞に形質転
換させる。プラスミドにより形質転換された細胞を「形
質転換体」と呼ぶ。
【0026】ファージもしくはバクテリオファージ:細
菌性ウイルスであって、その多くは蛋白質エンベロプも
しくはコートにカプセル化されたDNA配列より成って
いる(「カプシド蛋白質」)。
【0027】クローン化ベヒクル:プラスミド、ファー
ジDNAまたはその他のDNA配列であって、これは宿
主細胞中に複製することができコート蛋白質の複製およ
び生産のようなDNAの本質的生物機能の喪失を伴なう
ことなくまたはプロモータもしくは結合部位の喪失を伴
なうことなくDNA配列を決定可能に切断しうる1個も
しくは少数のエンドヌクレアーゼ識別部位により特性化
され、かつ形質転換細胞の同定に使用するのに適した標
識、たとえばテトラサイクリン耐性もしくはアンピシリ
ン耐性を有する。クローン化ベヒクルはしばしばベクタ
ーと呼ばれる。クローン化 :生物の集落またはこの種の生物もしくは配
列から無性増殖により生成されるDNA配列を得るため
の過程。
【0028】組換DNA分子もしくはヒブリドDNA
異なるゲノムからのDNAの断片よりなる分子であっ
て、前記ゲノムは生細胞の外部で末端結合され、そして
ある宿主細胞に感染してその中に維持される能力を有す
る。
【0029】発現制御配列:DNA配列もしくは遺伝子
に作用結合された際、これらの配列もしくは遺伝子の発
現を制御および調整するヌクレオチドの配列。これらは
lac系,trp系、ファージλの主オペレータおよび
プロモータ領域、fdコート蛋白質の制御領域ならびに
原核もしくは真核細胞またはそのウイルスの遺伝子の発
現を制御することが知られたその他の配列を包含する。
【0030】図1は、第6染色体ならびにこの染色体の
短腕におけるHLA座位の位置の略図である。HLA系
の複雑性に鑑み、種々のIa様抗原と種々のHLA−D
R抗原自身とを区別し得るmRNA翻訳検定法を開発す
ることが重要であった。
【0031】例えば、ウサギ網状赤血球溶解物系のよう
な無細胞翻訳系は重合蛋白質を構成しない。他方、アフ
リカツメガエル(Xenopus laevis)の卵
細胞が各種蛋白質に対する翻訳系として使用されてい
る。従って、この系を選択してDR抗原をコードするm
RNAにつき検定した。この系を用いてHLA−DR抗
原の3つのポリペプチド鎖を卵細胞で組立てられるこ
と、および卵細胞から抗−DRモノクローン抗体により
免疫沈降させ得ることを示した。従って、この卵細胞系
は、DR抗原をコードするmRNAを選択する方法を与
えた。
【0032】上記検定で同定されたDR抗原をコードす
るmRNAの豊富な分画を使用して、mRNAからcD
NAを調製し、これをクローン化させかつ選択し、そし
て本発明のDRβ−鎖抗原をコードするDNA配列を含
むクローンを単離した。次いで、これらDNA配列を本
発明の型別方法および型別用製造物に使用して、組織お
よび器官移植物に対する適合性を決定すると共に各種の
病気に対する個体の増強した感受性を決定した。さら
に、これらDNA配列は、それらのコードする抗原を適
当な宿主において他のHLA−DR因子により実質的に
汚染されることなく製造させるのに有用であり、病気の
診断、治療および予防に使用することができる。
【0033】
【実施例】ポリA+ RNAを含有するHLA−DRの調製 10%牛胎仔血清とグルタミンとゲンタマイシンとを補
充したRPMI1640培地において、ヒトβリンパ芽
球細胞系、すなわちラジ細胞(2種のDR遺伝子、DR
3およびDR6を有する異型接合細胞系)を増殖させた
(これについてはエス・カレル等によりモレキュラ・イ
ミュノロジー、第18巻、第403〜411頁(198
1)に実質的に記載されている)。細胞の生成物を追跡
するための標識を与えるため、50×106 個の細胞当
り1mCiのS35−メチオニンを補充した完成メチオニ
ン非含有培地において、2×106 個の細胞1mlの濃
度にて37℃で16時間培養することにより細胞を代謝
標識した。検定用として非グリコシル化DR分子を得る
ため、S35−メチオニンを添加する2時間前に2μg/
mlのツニカマイシンを添加した。
【0034】凍結細胞ペレットを、氷冷した溶解緩衝液
(10mMトリス−HCl(pH7.6)、0.1M
NaCl、1%ノニデットP40)(1ml緩衝液/1
8個細胞)において1分間隔で15秒間4回乱流させ
ることにより溶解させ、そしてこの溶解した細胞をベッ
クマンJ−6型遠心分離器(4500×g)にて遠心分
離した(4℃、4min、4000rpm)。次いで、
4mlの細胞質上澄液を次の濃度勾配にてSW41ポリ
アロマー管に加えた:10mMトリス−HCl(pH
7.4)、1mM EDTAにおける2ml CsCl
(5.7M);20mMトリス−HCl(pH7.
4)、2mM EDTAにおける40%〜20%(W/
V)の直線濃度におけるCsCl4.2ml;および2
0mMトリス−HCl(pH7.4),0.1M Na
Cl,4mM EDTAにおける5%(W/V)蔗糖溶
液0.8ml。14℃にて濃度勾配を均衡化させた後、
RNAをペレット化させた(14℃、14時間、370
00rpm)。大型RNA調製物につき、SW27チユ
ーブを14℃にて26000rpmで16時間使用し
た。
【0035】チユーブからRNAを回収するため、チユ
ーブを転倒させそして底部を切除した。次いで、RNA
を10mMトリス−HCl(pH7.4)、1mM E
DTAに溶解させ、混合物を0.3M酢酸ナトリウム
(pH5.0)に調整しそしてRNAを2容量のエタノ
ールで沈殿させた。再びRNAを10mMトリス−HC
l(pH7.4)、1mM EDTAおよび1%SDS
に溶解させ、これを100℃にて2分間加熱し、そして
混合物を室温まで冷却した。1容量の10mMトリス−
HCl(pH7.4)、1mM EDTA、1M Na
Clを加えた後、RNAをオリゴ(dT)セルロースカ
ラム(コラポラテイブ・リサーチ社)に加え、そしてポ
リA+ RNA分画をH2 Oで溶出させそしてこれをED
TAの不存在下にエタノールで2回沈殿させた(図
2)。
【0036】緩衝液系(25mMクエン酸ナトリウムに
おける6M尿素(pH3.8)を用いてポリA+ RNA
をアルガロース−尿素ゲルにおいてサイズ分画した(こ
れについてはローゼン等により、バイオケミストリー
(ワシントン)、第14巻、第69〜78頁(197
5)に実質的に記載されている)(図2)。この緩衝液
系は高能力および高分解能の分画化によく適している。
さらに、これは充分に変性する[エッチ・レーラッハ
等、バイオケミストリー、第16巻、第4743〜47
51頁(1977)]。
【0037】ポリA+ RNAの分画化を行なうため、5
00μgのポリA+ RNAを100μlの10mMトリ
ス−HCl(pH7.4)、1mM EDTA、0.5
%SDSに溶解させ、200μlのDMSO(99%)
を加え、そしてこの溶液を1mM EDTAおよびpH
8.0に調整した。次いで、この溶液を45℃にて5分
間加熱し、4×0.5cmのスロットに加えた(2.5
%アガロースゲル)。このゲルをブロムフェノールブル
ーがゲルの底部に達するまで冷所中で36時間電気泳動
にかけた。種々のサイズの分画(700×1600ヌク
レオチド長)を得るため、2mmの切片をゲルに沿って
切断し、これら分画を4mlの10mMトリス−HCl
(pH7.4)、10mM EDTA、0.5%NaC
l,0.1mg/mlイー・コリtRNAにおいてウル
トラ−ツラックスで分散させた。分散懸濁物を0.5%
SDSまで調整した後、これを1晩震盪し、次いでポリ
+ RNAを上澄液からオリゴ(dT)−セルロース小
カラムにおけるクロマトグラフィーにより単離し、そし
てこれをEDTAの不存在下にエタノールで2回沈殿さ
せた。調製ゲル電気泳動の前に、試料中に3´末端標識
されたラジmRNAを含ませることにより回収を監視し
た。
【0038】種々のポリA+ RNA分画のHLA−DR
活性(もしあれば)を検定するため、このRNAを卵細
胞中に移殖し、そして生成物を3種のモノクローン抗体
D1−12,D4 −22およびBT2.2 で免疫沈降させ
た。この検定において、段階6の卵細胞をアフリカツメ
ガエルの卵巣から、CA++を含有しないOR2培地にお
ける0.2%粗製コラゲナーゼ(シグマー社C−013
0)中で攪拌しながら室温にて90〜120分間培養し
た後単離した[ワラック等、J.Exp.Zool.、
第184巻、第321〜334頁(1973)]。次い
でこれら卵細胞に20ngのポリA+ RNAの50nl
を注入し(これについてはヴイ・エー・モア、ジャーナ
ル・モレキユラー・バイオロジー、第61巻、第63〜
103頁(1971)に実質的に記載されている)、そ
してこれを0.5mCi/mlのS35−メチオニンと5
0単位/mlペニシリンとストレブトマイシンとを含有
するOR2培地において24時間培養した。培養後、卵
細胞をホモゲナイズした(これについてはランジャーお
よびツアラーによりProc.Natl.Acad.S
ci.USA、第75巻、第6073〜6077頁(1
978)に実質的に記載されている)。ただし1mlの
緩衝液を50個の卵細胞当りに使用した**
【0039】 これらのモノクローン抗体およびその
活性は既に報告されている[エス・カレル等、モレキユ
ラ・イミュノロジー、第18巻、第403〜411頁
(1981)(D1 −12,D4 −22);アール・エス・
アコラ等、ヨーロピアン・ジャーナル・イミュノロジ
ー、第12巻、第166〜169頁(1982)(BT
2.2)]。** 検定用として非グリコシル化生成物を調製するた
め、卵細胞を50μg/mlのツニカマイシンの存在下
で培養し、これらに40μg/mlのツニカマイシンを
含有するRNA(50nl)を注入し、そして5μg/
mlのツニカマイシンを含有するDR培地において24
時間培養した。これについてはコールマン等により、ヨ
ーロピアン・ジャーナル・バイオケミストリー、第11
3巻、第339〜348頁(1981)に実質的に記載
されている。
【0040】卵細胞ホモゲナイズ物からの上澄液を0.
15M NaCl、0.25%ノニデットP40により
2mlに調整し、そしてこれをレンチルレクチン−セフ
ァローズ(ファルマシア社)の1mlカラムに加えた。
このカラムを同じ緩衝液で激しく洗浄した後、0.1M
α−メチルマノシドを含有する同じ緩衝液でグリコシル
化物質を溶出させた(1.3%S35−メチオニン含有物
を合併分画中に溶出させた)。その後のクローン化実験
においてはレンチルカラムを省略した。
【0041】次いで、レンチルレクチンカラムからのグ
リコシル化物質をトリス−HCl(pH7.0)および
1%アブロテニン(シグマ社)にpH8.0に調整し、
そして1ml当り20μlのPX63腹水液を加えた。
冷所中で2時間以上培養しかつ過剰の蛋白質A−セファ
ロース(ファルマシア社)の存在下でさらに2時間培養
した後、1ml当り20μlの抗−DRモノクローン抗
体(D1 −12,D4−22,BT2.2 )の混合物を腹水液
として加えた。これは注入した卵細胞当り1μlの腹水
液に相当する。4℃にて1晩培養した後、試料を3分間
遠心分離し(エッペンドルフマイクロ分離器)、そして
ペレットを捨てた。この遠心分離は、検定における凝集
物質に基づく大きいバックグランドを避けるために重要
である。
【0042】次いで、蛋白質A−セファロースを上澄液
に加え、そして培養を4時間続けた。遠心分離により免
疫沈降物を集め(マイクロ分離)、約400μlの50
mMトリス−HCl(pH7.4)、5mM EDT
A、0.15M NaCl、1%ノニデットP40、1
0mMメチオニン、1%アブロテニンで2回洗浄し、約
400μlの同じ緩衝液(ただしアブロテニンと0.1
5M NaClとを含有せず、0.5MのNaClを含
有する)で3回、さらに約400μlの10mMトリス
−HCl(pH7.4)、1mM EDTA、0.15
M NaCl、0.5%ノニデットP40で2回洗浄し
た。
【0043】次いで、免疫沈降物を25μlの0.5M
トリス−HCl(pH8.8)、1M蔗糖、5mM E
DTA、0.01%ブロムフェノールブルー、3%SD
Sおよび8.3mMジチオスレイトールの中に100℃
にて3分間加熱することにより溶解させ、そしてこの溶
液を12%ポリアクリルアミドSDSゲルに加えた。こ
のゲルを二次元で電気泳動にかけ、第一次元においては
非平衡pH濃度勾配の電気泳動にかけた(これについて
はピー・ゼット・オーファレル等、セル誌、第12巻、
第1133〜1142頁(1977)に実質的に記載さ
れている)。これらゲルを10%トリクロル酢酸中で固
定し、エンハンス(ニュー・イングランド・ヌクレア
社)で処理し、20%メタノールおよび3%グリセリン
中で洗浄し、そして乾燥させた。乾燥ゲルを予備フラッ
シュされたコダックX−ARフィルムに強化スクリーン
(Cawo社)を用いて−70℃で露出させた。
【0044】この検定により、HLA−DRのα−鎖、
中間鎖およびβ−鎖をコードするRNAを含有する分画
として、mRNA1200−1300ヌクレオチド長を
有する分画31を同定した。この分画のRNAを全ポリ
+ RNAにつき約20倍濃縮させた。
【0045】サイズ分画したRNAの検定は、ラジ細胞
からの翻訳RNAおよびDR抗原の多数回の事前検定に
基づく。これらの検定から、卵細胞はHLA−DRのα
−鎖、中間鎖およびβ−鎖をコードするRNAを翻訳
し、これら抗原をグリコシル化させ、かつこれらを組立
てることを確認した。さらに、組立物はモノクローン抗
体D1 −12,D4 −22およびBT2.2 により免疫沈降さ
れたが、β−鎖のみがBT2.2 により抗原組立物が変性
された後に免疫沈降されたことを確認した。また、α−
鎖は35000〜36000の明確な分子量を有し、中
間鎖は約33000の明確な分子量を有し、かつβ−鎖
はSDS−ポリアクリルアミドゲルにおいて31000
および29000の明確な分子量を有することを確認し
た。さらに、非グリコシル化物質は次の通りである:3
0000および29000(α−鎖)、2700(中間
鎖)並びに27000および26000(β−鎖)。
【0046】cDNAクローンの作成 1.HLA−DR cDNAの調製 分画31のポリA+ RNAの単一鎖cDNAコピーを調
製するため、CH3 Hgを5mMまで加えることにより
RNAを変性させ、そしてこの混合物を室温で1分間静
置した。次いで、この変性RNAに1ml/40μgR
NAの緩衝液(50mMトリス−HCl(pH8.
3)、10mM MgCl2 、70mMKCl、30m
M β−メルカプトエタノール、4mMピロ燐酸ナトリ
ウム)と0.5mM dGTP、dATPおよびdTT
Pと0.3mM α−P32−dCTP(〜0.5μCi
/nモル)と40μg/mlのオリゴ(dT)12−1
8(コラボラティブ・リサーチ社)と300単位/ml
の逆転写酵素(ライフ・サイエンス社)とを加え、この
混合物を37℃にて10分間および42℃にて60分間
加熱した[ワーリ等、Dev.Biol.、第67巻、
第371〜383頁(1978)](図2)。〔燐酸ナ
トリウムの添加は沈殿を生ぜしめ、この沈殿は反応を停
止させると消失する。〕 この混合物へEDTAを10
mMまで加えかつSDSを0.1%まで加えることによ
り反応を停止させ、そして混合物をフェノール/クロロ
ホルム/イソアミルアルコール(100:99:1)で
抽出した。水相をセファデックスG−50超微粒カラム
により10mMトリス−HCl(pH7.6)、1mM
EDTAで洗浄した。次いで、溶出された混合物をN
aOHにて0.5Nとなし、これを37℃で30分間培
養し、それぞれ5MのHOAcおよび1Mのトリス−H
Cl(pH7.6)の0.1容量で中和し、そして単一
鎖cDNAをエタノール沈殿させた。遠心分離によりc
DNAを回収した後、これを50μlの0.5N Na
OH中に再懸濁させ、37℃にて30分間培養し、そし
てこれを0.9M NaCl、0.1M NaOH、2
mM EDTA中で4mlの5〜20%アルカリ性蔗糖
濃度勾配にて層状化させた。この層状化されたcDNA
をSW60ロータ(50000rpm、1℃、7.5時
間)にてサイズ分画し、そして1000ヌクレオチド以
上の長さを有するcDNAを含有する分画を集めた。集
めたDNAを中和し、そして上記と同様に沈殿させた
(図2)。
【0047】上記の集めた分画からcDNAを68℃で
90秒間加熱しかつ氷中で急冷させて変性させることに
より二重鎖cDNAを調製した。次いで、次の反応混合
物を調整した:単一鎖cDNA(40μg/ml)、5
0mMトリス−HCl(pH8.3)、10mM Mg
Cl2 、70mM KCl、30mMβ−メルカプトエ
タノール、0.5mMのそれぞれdNTPおよび300
単位/mlの逆転写酵素。この混合物を37℃で10分
間および42℃で90分間加熱した。EDTAを10m
Mまで加えることにより再び反応を停止させ、そしてこ
れをフェノール/クロロホルム/イソアミルアルコール
(100:99:1)で抽出し、そしてセファデックス
G−50カラムにて10mMトリス−HCl(pH7.
6)、1mM EDTAでクロマトグラフにかけた。
【0048】二重鎖cDNA調製物におけるヘヤピンル
ープを60mM NaCl、6mMNaOAc(pH
4.8)、0.5mM ZnCl2 、〜30μg/ml
二重鎖cDNA、100単位/mlS1 ヌクレアーゼ
(P−Lバイオケミカルス社)を含有する反応混合物に
おいて混合物を37℃で30分間加熱することによりS
1 ヌクレアーゼで切断した。EDTAを10mMまで加
えかつトリス−HCl(pH7.6)を100mMまで
加えることにより反応を停止させ、混合物をフェノール
/クロロホルム/イソアミルアルコール(100:9
9:1)で抽出し、そしてこれをセファロースCL−G
Bカラムにより10mMトリス−HCl(pH7.
6)、1mM EDTAで洗浄して精製した。次いで、
cDNAを上記と同様にEtOHにて沈殿させた。
【0049】2.HLA−DR cDNAのクローン化 広範囲の宿主/クローン化ベヒクル組合せ物を使用し
て、二重鎖cDNAをクローン化させることができる。
さらに、それぞれ特異的クローン化ベヒクルにおいて、
種々の部位を選択することにより二重鎖cDNAを挿入
することができる。当業者が本発明の範囲を逸脱するこ
となく、本発明のDNA配列をクローン化するために、
これらの様々な選択肢の中から特定して選択することが
できることは理解されるであろう。
【0050】初期のクローン化研究において、細菌性プ
ラスミドpBR322(エフ・ポリバール等、「新規な
クローン化ベヒクルの作成および特性化II. 多目的クロ
ーン化方式」、ジーン誌、第2(2) 巻、第95〜114
頁(1977);ジエー・ジー・サットクリフ、「DN
A配列から得られるpBR322制限地図;4361ヌ
クレオチド対長さまでの正確なDNAサイズ標識」、ヌ
クレイック・アシッド・リサーチ、第5巻、第2721
〜2728(1978))。さらに、PstI部位[エ
ル・ピラ・コマロフ等、「プロインシュリンを合成する
細菌性クローン」、Proc.Natl.Acad.S
ci.USA、第75巻、第3727〜3731頁(1
978)]、dC/dG切断[エル・ピラ・コマロフ
等、上記]およびイー・コリHB101を選択した。
【0051】a.PstI−開裂されたdG−切断pB
R322の調製 標準条件を用いてPstIによりpBR322を切断し
た。次いで、20mMK−カコジル酸塩、50mMトリ
ス−HCl(pH6.9)、10mM MgCl2 、1
mM dGTP、200μg/ml線状化pBR322
および25単位/ml末端トランスフェラーゼの反応混
合物を調製した。この混合物を37℃にて45分間加熱
した後、EDTAを10mMまで加えかつSDSを0.
5%まで加えて反応を停止させ、そしてこの混合物を氷
中で15分間急冷し、遠心分離(マイクロ遠心分離器、
2分間、4℃)によりdC切断されたHLA−DR c
DNAにアニールさせるため上澄液を調製した(図
2)。
【0052】b.dC切断HLA−DR cDNAの調
dC切断物を、200mM K−カコジル酸塩,50m
Mトリス−HCl(pH6.9)、1mM dCTP、
100μg/ml BSA(ペンテックス社)、〜2μ
g/ml cDNAおよび125単位/ml末端デオキ
ヌクレオチジルトランスフェラーゼ(P−Lバイオケミ
カルス社)を含有する反応混合物において37℃でこの
混合物を1〜6分間加熱することにより上記と同様に調
製されたcDNAへ加えた。少量部を用いることによ
り、最適な反応時間を選択した(通常約4分間)。次い
で、この時間を使用してcDNAを切断した。再びED
TAを10mMまで加えかつSDSを0.5%まで加
え、さらに混合物を氷中で15分間急冷することにより
反応を停止させた。dC切断されたcDNAを単離して
これを遠心分離によりdG切断されたPst−開裂pB
R322へアニールさせた(マイクロ遠心分離器、2分
間、4℃)。
【0053】c.dC切断cDNAおよびdG切断pB
R322のアニール化 上記のように調製した40ngのdC切断cDNAと、
上記のように調製した250ngのdG切断されたPs
t開裂pBR322とをアニール化用緩衝液(10mM
トリス−HCl(pH7.6)、1mM EDTA、
0.2M NaCl)において68℃で2時間混合し、
次いで徐々に冷却した(図2)。
【0054】上記のように調製された組換DNA分子の
僅かのものが、実際にHLA−DRのβ−鎖、すなわち
軽鎖、すなわちHLA−DR座の主たる多形性領域をコ
ードするDNA配列を含有することが了解されよう。事
実、大部分のクローン化された種類は、HLA−DRに
対し或いはそのβ−鎖に対し無関係である。
【0055】3.ヒブリドによるイー・コリHB101
のトランスフェクション 競合イー・コリHB101(recA- )を上記のヒブ
リドにより形質転換させた(これについては、ディー・
モリソンによりジャーナル・バクテリオロジー、第13
2巻、第349〜351頁(1977)に記載されてい
る)。
【0056】プラスミドpBR322はアンピシリン耐
性とテトラサイクリン耐性とをコードする遺伝子を含
み、かつ前者の遺伝子はPstI部位におけるcDNA
挿入により失活されるので、PstI部位にcDNA挿
入物を有する組換DNA分子で形質転換された集落を、
そのように形質転換されていない集落から選択すること
ができる。従って、上記のように形質転換されたイー・
コリ菌体を10μg/mlのテトラサイクリンを含有す
る洗浄かつオートクレープ処理されたシュライヒャーお
よびシュエルのニトロセルロースフィルターに塗沫した
[ディー・ハナハンおよびエム・メセルソン、ジーン
誌、第10巻、第63〜67頁(1980)]。この方
法を用いて550種のcDNAクローンを作成した(図
2)。
【0057】HLA−DR cDNAを含有するクロー
ンの選別 特定の組換DNA分子を含有するクローン、すなわちH
LA−DR−β−鎖関連のDNA挿入物を含有するクロ
ーンにつき、クローンの保存物を選別するには幾つかの
方法がある。これらの方法は当業界で充分周知されてい
る。初期のクローン選別において、ポリA+ RNAに対
する高基準の陽性ヒブリド化選択をジアゾベンジルオキ
シメチル紙(シュライヒャーおよびシュエル)において
使用するよう選択した。本発明の方法はゴールドベルク
等、メソッド・エンチモロジー、第68巻、第206〜
220頁(1979)の方法から改変させた。ヒブリド
化に対する実験基準としては、50個の集落の保存物に
おいて1個のDR−β−cDNA−関連クローンを検出
しうると予想した。
【0058】550個の選別したクローンをそれぞれ5
0個のクローンの11群に分け、これらを10μg/m
lのテトラサイクリンを補充したL−培地で増殖させ
た。次いで、クロラムフェニコール(50μg/ml)
によりプラスミドを1晩処理し、そして慣用の清澄溶菌
物CsCl濃度勾配法を使用してこれら保存物からプラ
スミドDNAを調製した。次いで、プラスミドDNAを
0.5%ジエチルピロ炭酸エステルで処理し、これをセ
ファロースBカラム(10mMトリス−HCl(pH
7.6),1mM EDTA)に通して、小さい汚染性
RNA分子を除去した。プラスミドDNAを0.25N
HCl中で室温にて10分間部分的に処理し、混合物
を0.5NのNaOH、0.5M NaClまで調製
し、20分間培養し、HClで中和し、そしてDNAを
EtOHにより2回沈殿させた。次いで、調製されたジ
アゾベンジルオキシメチル紙(シュライヒャーおよびシ
ュエル)を調製し、これに上記で調製されたDNAを共
融結合させた(これについてはゴールドベルク等、上記
により実質的に記載されている)。P32−標識DNAト
レーサを混合物中に含ませることによりDNAの滞留に
つき監視した。平均して15μgのDNAがそれぞれ1
cm2 のフィルタに結合された。
【0059】これらフィルタを50%ホルムアミド(2
回再結晶化させかつ脱イオン化したもの)、20mM
PIPES(pH6.4)、0.75M NaCl、2
mMEDTA、0.4%SDS、1%グリシン、0.3
mg/mlイー・コリtRNA、0.1mg/mlポリ
Aにおいて37℃で2〜4時間予備ヒブリド化させた。
ヒブリド化するため、11枚のフィルタを〜200ml
の同じ緩衝液(グリシン,tRNAおよびポリAを含ま
ない)において37℃で20時間にわたり300μgの
全ポリA+ RNA(上記のように調製)で処理した。次
いで、これらフィルタをヒブリド化緩衝液で37℃にて
30分間3回洗浄し、22℃で10mMトリス−HCl
(pH7.4)、1mM EDTA、0.1M NaC
l、0.1%SDSにて30分間3回洗浄し、次いで5
0℃にて10mMトリス−HCl(pH7.4)、1m
M EDTAにより10分間3回洗浄した。
【0060】ヒブリド化RNAを150μlの5mMト
リス−HCl(pH7.4)、0.5mM EDTA、
6μg/mlウサギtRNAにより2つの部分に溶出
し、その際フィルタを含む溶液を98℃にて75秒間加
熱した。次いで、混合物を0.3M NaOAc(pH
5.0)まで調整し、そしてRNAをEtOHにより2
回沈殿させた。
【0061】上記からのRNAにHLA−DR α−鎖
および中間鎖(cDNA過剰の条件下で25μgのポリ
+ RNAから選択し、かつ卵細胞分析により確認)に
対するmRNAを補充し、そして補充されたRNAを卵
細胞に注入して上記と同様に分析した。RNAをこのよ
うに処理して免疫沈降のレベルを増大させると共に、可
能なクローンを検出する機会を増大させた。卵細胞によ
り合成されたα−鎖および中間鎖抗原の存在を監視する
ため、各卵細胞抽出物の1/4を、遊離α−鎖および中
間鎖を結合する抗−DR−ウサギ血清133[カレル
等、モレキュラ・イミュノロジー、第18巻、第403
〜411頁(1981)]で免疫沈降させた。各卵細胞
抽出物の残部3/4を抗−DR−モノクローン抗体(D
1 −12,D4 −22,BT2.2 )によって免疫沈降させ
た。11個の保存物のうち2個において、少量のDR−
抗原(β)が注入卵細胞で合成された
【0062】 幾つかの保存物においてはさらに37
000ダルトンのバンドも免疫沈降された。この蛋白質
は同定しなかった。
【0063】2種の陽性のものの各々を10個のクロー
ンからなる5群に分け、かつヒブリド化させて、これら
を上記と同様に分析した。元の2種の陽性のものの各々
から誘導された5群のうちの1群は、再び陽性であっ
た。次いで、2つの陽性の群の各々を、それぞれ1個の
クローンよりなる10群に分け、かつヒブリド化させて
これらを上記と同様に分析した。2つの陽性クローンを
選択した:クローン68およびクローン83−7。
【0064】クローン83−7はヒブリド化の条件下で
DR−β鎖mRNAを極めて効率的に選択した。このm
RNAは卵細胞において抗原を生成し、この抗原をαお
よび中間鎖RNAによる補充なしに抗−DRモノクロー
ン抗体(D1 −12,D4 −22,BT2.2 )により免疫沈
降させた。逆に、クローン68−6はDR−β鎖mRN
Aの選択において遥かに効率が低かった。クローン83
−7は180bpの挿入物を有し、かつクローン68−
6は470bpの挿入物を有した。これら挿入物はクロ
スヒブリド化しなかった。
【0065】図3はDR領域におけるクローン83−7
のcDNA挿入物の位置およびIa様領域におけるクロ
ーン68−6のcDNA挿入物の位置を示している。I
a様領域をHLA座位の領域と呼び(図1)。クローン
68−6はIaと名付けられる。何故なら、これはHL
A/DRに関連するがそれと同一でない領域を示すから
である。
【0066】さらに、ゲル移動ヒブリド化によりこれら
2種のcDNAクローンに相同であるRNAを分析し
た。両cDNAクローンは長さ約1300ヌクレオチド
のポリA+ RNAとヒブリド化し、2種のβ−細胞系お
よび慢性リンパ白血病を有する患者からのβ−細胞で発
現されたが、3種のT細胞系、膵臓および肝臓には存在
しなかった。また、68−6cDNA挿入物は長さ16
50ヌクレオチドの他のRNAバンドにヒブリド化した
が、83−7cDNA挿入物は長さ1900ヌクレオチ
ドの他のRNAバンドにヒブリド化した。
【0067】クローン83−7および68−6にヒブリ
ド化するラジ由来のクローンの選別 クローン83−7および68−6のDNA挿入物を試料
として使用し、上記と同様に調製された全ポリA+ RN
A由来のクローン(ラジ細胞)の保存物を鋭意選別し
て、HLA−DR βコード領域から他の好ましいより
長くかつより完全なDNA配列を位置決定した。
【0068】PstIでの処理により2種のクローンの
プラスミドDNAから挿入物を切除し、これらを中性蔗
糖勾配遠心分離およびアクリルアミドゲル電気泳動によ
り精製した。溶出された断片をDEAEカラムに通し、
精製された挿入物を標識した(これについてはエム・グ
ルンシュタインおよびディー・ホグネスにより「コロニ
ーヒブリド化:特異的遺伝子を含有するクローン化DN
Aの単離方法」、Proc.Natl.Acad.Sc
i.USA、第72巻、第3961〜3965頁(19
75);リグビー等、ジャーナル・モレキュラ・バイオ
ロジー、第113巻、第237〜251頁(1977)
に実質的に記載されている)。そして(α−P32)ヌク
レオチドおよびDNAポリメラーゼI(ベ−リンガーマ
ンハイム社)によってニック翻訳により2×108 cp
m/μg、まで精製した[リグビー等、上記]。次い
で、この試料を使用して、高基準条件(下記)を用いて
より長いヒブリド化関連cDNAクローンにつき保存物
を選別した。
【0069】この選別から、より長いcDNA挿入物を
含有する多数のクローンを単離した。これらクローンの
挿入物をDR−β1 、DR−β2 およびIa−β1 と名
付けた。これら挿入物により画成される領域を第3図に
示す。第3図に示したように、DNA挿入物DR−β1
およびDR−β2 はDR座位に関連する一方、Ia−β
1 はIa領域に関連する。
【0070】さらに、これらクローンの種々の断片を用
いて幾つかのヒブリド化基準でクロスヒブリド化実験を
行ない、選択された種々異なるcDNAクローン間の類
似性の程度を決定した。cDNAクローンの3´未翻訳
部分からのDNA配列は高基準(Tmより5℃低い)、
中間基準(Tmより24℃低い)または低基準(Tmよ
り43℃低い)においてクロスヒブリド化しなかった。
【0071】逆に、DRβ−鎖座位ではなくIa様領域
の第1領域をコードするクローンの5´末端におけるD
NA配列は、中間基準でクロスヒブリド化した。従っ
て、DR関連DNA配列はIa関連配列にクロスヒブリ
ド化しないが、Ia関連配列は他のIa関連配列にクロ
スヒブリド化する。
【0072】cDNA挿入物の制限地図 各種の制限エンドヌクレアーゼによる単一および二重処
理を用いた制限分析により、各種のcDNAクローンの
HLA関連挿入物を地図化した。エンドヌクレアーゼの
供給業者(ニユー・イングランド・バイオラブ社、ベセ
スダ・リサーチ・ラボラトリー社、ベーリンガー社)に
より推奨される条件および緩衝液を使用し、そして得ら
れた断片をアガロースゲル上で分析した。
【0073】さらに図3は、選別工程において位置決定
された各種のcDNA挿入物の部分制限地図を示してい
る。勿論、図3に示された制限部位の実際の位置は不正
確である。慣用方法を用いるヌクレオチド配列は、他の
予測部位と同様に特定部位に適切に位置決定するであろ
う。
【0074】上記したように、ラジ細胞は異型接合性、
すなわちDR3/6である。従って、2種の異なる配列
DR−β1 およびDR−β2 がこれら細胞から生成され
るcDNAに存在するという事実は、これらクローンを
特性化する2種のDNA配列がβ−鎖コード配列の異な
る種類から生ずるということを明確に示していない。寧
ろ、これら2種は異型接合細胞系の2種のDR型の対立
型種類である。
【0075】クローンDR−β1 にヒブリド化するIB
W9由来のクローンの選別 ヒブリド化試料としてDNA挿入物DR−β1 を使用し
て、ヒトβ細胞系、IBW9から得られた全ポリA+
NAの20000個のクローンの保存物を選別した。こ
の保存物は、ラジ細胞保存物について前記したと同様に
調製した。IBW9は、血族関係によりHLAに対し元
来同型接合性であると思われた細胞系である。しかしな
がら、これはその後、2つの研究室によりDR4,W6
異型接合系として個々に分類された。
【0076】同型接合細胞系と思われるものを使用し
て、ラジ細胞のような異型接合細胞系に存在しうる対立
多形性を検出するのが困難な上記の可能性を回避した。
異型接合系に対比して、同型接合細胞系からのクローン
に検出されるβ−鎖クローンは、定義において異なるβ
−鎖遺伝子族を示すであろう。しかしながら、上記した
ように、本発明に使用した系統は実際には異型接合系で
あった。
【0077】この異型接合細胞系由来の保存物を選別し
た結果、HLA−DR−関連DNA配列の4つの種類を
位置決定した。これら種類のコード配列を制限地図化
に基づきDR−β−A,DR−β−B,DR−β−Cお
よびDR−β−Dと名付けた。勿論、他のβ−鎖種類も
存在しうることを了解すべきである。たとえば、アコラ
(上記)は7種のこの種のものを予測している。このよ
うな種類は、本発明のDR−β1 ,DR−β2 ,DR−
β−A,DR−β−B,DR−β−CまたはDR−β−
D配列またはその断片を用いて高基準のヒブリド化にて
(実質的に上記したと同様)または他の同様な方法を用
いて選別しうるので本発明の1部である。
【0078】 これら挿入物を含むクローンをイー・
コリHB101(pBR322(Pst)/HLA−D
R−β−A乃至D)と命名し、これはそのPstI制限
部位に特定のHLA−DR−β関連DNA挿入物を有す
るpBR322からなる組換DNA分子により形質転換
されたイー・コリHB101菌体であることを意味す
る。
【0079】4種のDR−βクローンにおけるクローン
はそのコード領域および非コード領域全体にわたり充分
にクロスヒブリド化する。これらは、極めて厳密に制限
地図およびクロスヒブリド化によって区別することがで
きる(図4)。従って、これらは恐らく4種の異なるD
R−遺伝子から得られた4種のmRNAを示している。
これらはDR(4,W6)に対し異型接合細胞系から得
られるので、これら4種のDR−β遺伝子はDR−鎖を
コードする少なくとも2つの非対立座位を示すと思われ
る。この結論は、さらにβ1 試料を用いて同じβ細胞系
から単離したゲノムDNAクローンの分析により裏付け
らる。
【0080】cDNA挿入物のヌクレオチド配列 ヌクレオチド配列を決定するため、上記のように、DN
A挿入物DR−β−A,DR−β−B,DR−β−Cお
よびDR−β−Dからの制限断片を調製し、これらをア
クリルアミドゲルから抽出し、そしてDEAEセルロー
スカラムで精製した。これら断片を(α−P32)コルジ
アピン−5´−トリホスフェート(アメルシャム社)お
よび末端デオキシヌクレオチジルトランスフェラーゼ
(P−Lバイオケミカルス社)により3´標識し、或い
はこれらを牛の腸ホスファターゼ(エス・クラークソン
による寄贈)およびポリヌクレオチドキナーゼ(P−L
バイオケミカルス社)により5´標識した。これら標識
された断片につき、マキサムおよびギルバートにより
「DNAの新規な配列決定方法」、Proc.Nat
l.Sci.USA、第74巻、第520〜564頁
(1977)に実質的記載されているように配列決定し
た。殆んどのcDNAについては両ストランドから配列
決定し、かつ標識末端として作用する殆んどの制限部位
についてはそれらを画成する断片を用いて配列決定し
た。
【0081】図5、図6、図7、図8および図9は、配
列決定方法およびcDNAクローンHLA−DR−β−
のコードストランドのヌクレオチドおよびアミノ酸
配列を示している。クローンHLA−DR−β−Aにお
いて、35個のヌクレオチドが最初のATGトリプレッ
トに先行する。このATGは長さ266個のアミノ酸の
開放読枠における最初のコドンである。11個の連続し
た疎水性残基のコアを有する最初の29個のアミノ酸
は、ヒトIa抗原のβ−鎖につき決定された部分アミノ
酸配列と高度の類似性を有する配列に先行する[ディー
・エー・シャッケルフオード等、イミュノロジー・レビ
ユー、第66巻、第133〜187頁(1982)]。
従って、最初の29個のアミノ酸(図6においてNo−
1〜−29)は恐らく信号配列を示し、残部237個の
アミノ酸(図6、図7、図8および図9においてNo1
〜237)は成熟蛋白質(199個のアミノ酸)とトラ
ンスメンブラン領域(22個のアミノ酸)と細胞質末端
(16個のアミノ酸)とを示す。図6、図7および図8
に示したように、コード配列の細胞外部分には4個のシ
ステインが存在する(位置15,79,117および1
73)。
【0082】 このクローンに対する部分ヌクレオチ
ドおよびアミノ酸配列(AA79−95)は英国特許出
願第8222066号および第8230441号明細書
に示された。
【0083】図10、図11、図12および図13は、
クローンHLA−DR−β−Aから推定したアミノ酸配
列と、DR2同型接合系[エッチ・クラッチン等、ホッ
ペ・セイラース・ツァイトシュリフト・フィジオロジッ
シエ・ケミー、第362巻、第1665〜1699頁
(1981)]から単離されたIa抗原β−鎖につきク
ラッチンにより決定された配列と、DR3,W6細胞系
[ディー・ラルハンマー等、Proc.Natl.Ac
ad.Sci.USA、第79巻、第3687〜369
1頁(1982)]から単離されたcDNAクローンに
より推定される配列とのアミノ酸配列比較を示してい
る。最後の配列は、DCβ−鎖クローンであると思われ
る。何故なら、その推定配列はDSβ−鎖[エス・エム
・ゴイエルト等、J.Exp.Med.、第156巻、
第550〜566頁(1982)]につき決定された
部分N−末端配列に匹敵するからである。
【0084】 DSおよびDC抗原は同一であり、か
つマウスI−A Ia抗原に対し極めて良好な類似性を
示すことがエス・エム・ゴイエルト等により、J.Ex
p.Med.、第156巻、第550〜566頁(19
82);アール・ボノおよびジエー・エル・ストロミン
ガー、ネイチヤー誌、第299巻、第836〜838頁
(1982)に記載されている。
【0085】図14および図15は、他のHLA−DR
−βクローン[HLA−DE−β−B]のヌクレオチド
およびアミノ酸配列を示している。さらに、このクロー
ンから推定されるアミノ酸配列は29個のアミノ酸より
なる推定信号配列と、237個の他のアミノ酸とをコー
ド領域に有する。
【0086】HLA−DR型別における本発明のcDN
A挿入物の使用 HLA−DR−β−鎖抗原またはその断片の種類をコー
ドするcDNA挿入物を、DR型別法およびキットに使
用することができる。一般に、この種の型別方法は、
(1)慣用のエンドヌクレアーゼと条件とを用いて個体
のDNAを制限し、(2)制限DNAをたとえば慣用の
ゲルにおいてサイズ分画し、(3)サイズ分画されたD
NAを本発明のHLA−DR−β−鎖関連試料またはそ
の断片にヒブリド化し、かつ(4)ヒブリド化の領域を
検出する工程からなっている。
【0087】たとえば、この種の方法の1例として、確
立された細胞系からの4種の異なる個体[HLA−DR
につき3種の同型接合体(1/1,6/6,7/7)お
よび1種の異型接合体(3/6)]から高分子量DNA
を得た。このDNAを37℃にてEcoRI(ベーリン
ガー・マンハイム社)とHindIII (ベセスダ・リサ
ーチ・ラボラトリース社)またはBam HIにより、
標準緩衝液条件および1単位酵素/μg DNAを用い
て1晩処理した。EDTAにより反応を停止させ、制限
DNAをクロロホルムイソアミルアルコール(24:
1)により1回抽出し、そしてETOHで沈殿させた。
遠心分離の後、ペレットを10mMトリス−HCl(p
H7.6)、1mM EDTA、0.1%SDS、0.
05%ブロムフェノールブルー、0.05%キシレンシ
アノールおよび5%グリセリン中に再懸濁させた。DN
Aを37℃にて4時間培養した後、これを65℃にて5
分間処理し、20mMグリシン,15mM NaOH
(pH8.3)における0.6%アガロースゲルに加え
た。これらゲルを60−100Vにて12時間処理し、
次いで0.2μのニトロセルロースフィルタ(シュライ
ヒヤーおよびシュエル)に移した(これについてはジー
・エム・バール等によりProc.Natl.Aca
d.Sci.USA、第76巻、第3683〜3687
頁(1979)に実質的に記載されている。)。
【0088】移動させた後、これらフィルタを4×SS
C(SSCは150mM NaCl、15mM クエン
酸ナトリウムである)において洗浄し、次いでこれらを
減圧オーブン内で80℃にて2時間処理した。次いで、
フィルタを5×SSC、5×デンハルツ試薬で65℃に
てゆっくりと震盪しながら1〜2時間、および1×デン
ハルツ試薬、0.75M NaCl、5mM EDT
A、50mM燐酸ナトリウム緩衝液(pH7)、10%
デキストラン硫酸塩、0.1%SDS、50μg/ml
ポリGおよび250μg/ml超音波変性されたDNA
にて65℃で2時間、順次に培養した。次いで、濾紙に
結合したDNAを1×デンハルツ試薬、0.75M N
aCl、5mM EDTA、50mM燐酸ナトリウム緩
衝液(pH7)および1×106 cpm/mlの本発明
のP32−標識cDNA試料において65℃で8〜12時
間ヒブリド化させた。
【0089】ヒブリド化の後、フィルタをそれぞれ5×
SSC、1×デンハルト試薬、0.1%SDS、0.1
%ピロ燐酸ナトリウムと、2×SSC、0.1%SDS
と、0.5×SSCと、0.1×SSCとにより2回洗
浄した(65℃、30分間)。次いで、乾燥したフィル
タを予備フラッシュしたコダックX−ARフィルムに強
化スクリーン(Cawo社)を用いて−70℃にて48
時間露出させた。
【0090】図16はヒブリド化の結果を示している。
図16に見られるように、それぞれ異なるヒトDNA
(DR7/7(レーン1)、DR6/6(レーン2)、
DR3/6(レーン3)およびDR11/1(レーン
4))は各制限エンドヌクレアーゼにつき異なる電気泳
動パターンを示す。従って、本発明の試料を用いる種
々のHLA/DR型別された個体からのDNAのサザン
ブロットは、異なるHLA−DR特異性を有する個体か
ら簡単かつ経済的に区別することができる**。さら
に、この型別方法および型別用製造物で得られた簡単な
ブロットパターンは従来の型別方法では可能でなかった
ような型別を可能にし、従って従来のHLA−DR群に
おける各種のサブ群を同定しかつ区別することができ、
しかも種々の病気に対するこれらサブ群の感受性をより
良好に決定することができる。
【0091】 図16のレーン5はマウスDNAであ
る。** 上記の「型別」手法は10〜20mlの血液を用
いて行うことができ、100回または1000回の試験
まで容易に規模拡大される。
【0092】勿論、特定の制限DNAのヒブリド化部分
の検出はP32−標識試料により行なう必要がないことを
了解すべきである。寧ろ、他のヒブリド化検出方法を同
等に使用することができる。この種の方法は、試料を染
色活性化剤、検出酵素、アビジンまたは他の検出手段に
結合させることを含む。
【0093】本発明のcDNA挿入物の合成試料を使用
する改良HLA−DR型別 短かい(19塩基)のオリゴヌクレオチドDNA断片を
用いるサザンブロットの条件下におけるヒブリド化は、
完全に適合する配列(同一もしくは対立)を非適合配列
(異なる配列または対立)から区別しうることを示して
いる。たとえば、ビー・ジエー・コナー等、Proc.
Natl.Acad.Sci.USA、第80巻、第2
78〜282頁(1983)。
【0094】本発明のHLA−DR−β−cDNAのヌ
クレオチド配列を分析し、そしてこれら配列内に配列の
相違(多形性的相違を含む)を示す少なくとも3つの領
域を確認した。これらの3つの領域は次の通りである:
(1)アミノ酸8〜14をコードする配列;(2)アミ
ノ酸26〜32をコードする配列;および(3)アミノ
酸72〜78をコードする配列(図17)。さらに、異
なるDR−β鎖遺伝子ならびにDCおよびSBβ−鎖遺
伝子のうち同一である領域(アミノ酸39〜45をコー
ドする配列)も確認した。
【0095】不整合の3つの領域(図17における黒
丸)を画成する合成オリゴヌクレオチド(19−化合
体)の試料を調製した。第9図の指示した領域は、2種
のHLA−DR−β cDNAクローンの3つの領域の
それぞれにつき調製した特定の19−化合体を示してい
る。これら19−化合体のそれぞれは2個以上の不整合
部分を有するので、各試料につきHLA−DR配列の明
確な区別を行なうことができる。さらに、19−化合体
を上記のように同族領域から調製して、陽性ヒブリド化
比較として使用することができる。
【0096】同様にして、他のHLA−DR−β鎖遺伝
子のうち不整合および同一の領域から19−化合体DN
A試料のコレクションを作成することができる。かくし
て、それぞれの試料は所定のDR特異性にみあう特異性
を示す。従って、試料コレクションおよび比較のヒブリ
ド化は、多数の個体の迅速かつ正確なDR型別を可能に
する。
【0097】本発明のDNA配列の発現 蛋白質の生産レベルは2つの主たる因子により支配され
る:すなわち細胞内のその遺伝子のコピー数およびこれ
ら遺伝子コピーが転写しかつ翻訳する効率である。転写
および翻訳の効率(これらは一緒になって発現を構成す
る)は、通常、所望のコード配列の前方に位置するヌク
レオチド配列に依存する。これらのヌクレオチド配列ま
たは発現制御配列は、特にRNAポリメラーゼが反応し
て転写を開始する位置(プロモータ配列)およびリボソ
ームがmRNAと結合して相互反応し(転写生産物)翻
訳を開始する位置を規定する。この種の発現制御配列
は、必らずしも同等な効率で機能しない。従って、所望
の蛋白質に関する特異的コード配列を隣接するヌクレオ
チド配列から分離し、そしてこれを他の発現制御配列に
融合させて高レベルの発現を得ることが有利である。こ
れが達成されると、新たに作成されたDNA断片をマチ
ルコピーのプラスミドまたはバクテリオフアージ誘導体
に挿入して、細胞内における遺伝子コピー数を増大さ
せ、かくして発現蛋白質の収率をさらに向上させること
ができる。
【0098】従って、広範囲の宿主−発現制御配列のベ
クター組合せを使用して、本発明の方法により適当なコ
ード配列を挿入することによってHLA−DR−β鎖と
同様なポリペプチドを生産することができる。たとえ
ば、有用なベクターは染色体、非染色体および合成のD
NA配列の断片からなり、たとえば col El,p
CRI,pBR322およびその誘導体を含めイー・コ
リからの各種公知の細菌プラスミド、広範囲の宿主プラ
スミド、たとえばRP4、フアージDNA、たとえば多
くのフアージλの誘導体ならびに上記の組合せから得ら
れるベクター、たとえばpBR322、フアージλの一
部および合成部分を含むベクターが包含される。有用な
宿主はたとえばイー・コリの菌株、たとえばイー・コリ
K12 MC1061、イー・コリHB101、イー・
コリ×1776、イー・コリ×2282、イー・コリM
RCIのような細菌性宿主ならびにシュードモナス、枯
草菌、高熱細菌およびその他細菌類、酵母およびその他
の真菌類の菌株、動物もしくは植物宿主、たとえば動物
(ヒトを含む)もしくは植物の培養細胞またはその他の
宿主を包含することができる。有用な発現制御配列はイ
ー・コリのラクトースオペロンのオペレータ、プロモー
タならびにリボゾーム結合および相互作用配列(「la
c系」)、イー・コリのトリプトフアンシンセターゼ系
の対応する配列(「trp系」)、フアージλの主オペ
レータおよびプロモータ領域(OL LおよびOR I
R )、フアージfdコート蛋白質の制御領域、または原
始核細胞もしくは成熟核細胞およびそのウイルスの遺伝
子の発現を制御かつ促進するその他の配列、或いは各種
のこれらの組合せを包含することができる。
【0099】勿論、必ずしも全ての宿主−発現制御配列
−ベクター組合せ物が、特定のHLA/DRコード配列
につき同等の効果を有するとは限らない。しかしなが
ら、上記したように、生物安全性の観点から特定の構造
につき本発明のHLA−DR−βコード配列に使用しう
る部位、発現すべきHLA−DR−β鎖ポリペプチドの
サイズ、宿主細胞酵素による蛋白質分解に対するポリペ
プチドの感受性、精製の際除去するのが困難な宿主細胞
蛋白質によるポリペプチドの汚染、HLA−DR−βコ
ード配列の発現特性、たとえばDNAコード配列の構造
および発現制御配列に関する開始および停止コドンの位
置、ならびに当業者に認識されたその他の因子を考慮し
て、本発明のHLA/DR−β−鎖コード配列をベクタ
ーにおける発現制御配列へ作用結合させる適当な組合せ
を選択し、これを使用して宿主を形質転換させ、その宿
主を培養して挿入コード配列によりコードされるポリペ
プチドを生産することができる。
【0100】DNA配列および発現制御配列をベクター
中に挿入するための種々の方法が当業界で知られてい
る。たとえば、これらは直接的結合、合成リンカ、エキ
ソヌクレアーゼおよびポリメラーゼ結合した修復反応に
続く結合、或いはDNAポリメラーゼによるDNA鎖の
延長および適当な単一鎖雛型の作成に続く結合を包含す
る。さらに、当業者はこれら方法の1種もしくはそれ以
上を選択して、本発明の範囲を逸脱することなく本発明
のDNA配列を発現させることができる。
【0101】さらに、本発明の選択宿主−発現制御配列
−ベクター組合せにおいて発現された実際のHLA/D
R−β−鎖コード配列は、標準のHLA−DR−β−鎖
抗原とは同一でない生産物を生成しうることを了解すべ
きである。たとえば、発現されたコード配列は、HLA
−DR−β−鎖とは無関係なHLA−DR−β鎖プラス
メチオニンもしくはその他アミノ酸をコードしうるであ
ろう。或いは、発現されたDNA配列は、HLA−DR
−β鎖の1部のみを、或いはメチオニンもしくはその他
のアミノ酸を共にコードしうるであろう。これらの作成
および生産物も本発明に包含される。たとえば、HLA
−DR−β−鎖状のポリペプチドをコードするヌクレオ
チド配列により形質転換された宿主は、その化合物のみ
を生産しうるか、または他のアミノ酸と融合させうる
か、或いはその生産物を分泌することができる。発酵培
養物から単離した後、または慣用の処理方法、たとえば
開裂、合成結合またはその他周知の方法による処理の
後、生産物がHLA−DR−β−鎖抗原の免疫学的もし
くは生物学的活性を示すことのみが必要とされる。
【0102】精製後の上記HLA−DR−ポリペプチド
またはそれに対して生成される抗体を使用して、慣用の
HLA−DR型別法もしくはキットにおいて個体を型別
するのに使用することができ、或いはその他の診断、予
防もしくは治療剤もしくは方法に使用することができ
る。
【0103】本発明の方法により作成される微生物およ
び組換DNA分子は、メリーランド州・ロックビル在の
アメリカン・タイプ・カルチヤー・コレクションに19
82年7月28日付けで寄託され、かつ次のDR−β−
A、DR−β−BおよびDR−β−C: DR−β−A:E.coli HB101(pBR322(Pst)/HL
A−DR−β−A) DR−β−B:E.coli HB101(pBR322(Pst)/HL
A−DR−β−B) DR−β−C:E.coli HB101(pBR322(Pst)/HL
A−DR−β−C) として同定された培養物によって例証される。
【0104】これら培養物は、それぞれ寄託番号ATC
C39164、39163および39165を得てい
る。
【0105】以上、本発明の多くの具体例につき説明し
たが、この基本構成を改変して本発明の方法および組成
物を使用する他の具体例を与え得ることが明らかであ
る。従って、本発明の範囲は上記実施例のみに限定され
ることなく、種々の改変をなしうることが了解されよ
う。
【図面の簡単な説明】
【図1】第6染色体および短腕上のHLA座位の位置を
示す略図である。
【図2】本発明のクローン化法における一具体例の略図
である。
【図3】本発明のクローン83−7,68−6,DR−
β1 ,DR−β2 およびIa−βの部位制限地図であ
る。この地図に示された制限部位は正確でないが、慣用
的なヌクレオチド配列決定法によりこれらの部位の正確
な位置を決定することは可能である。
【図4】HLA−DR−β−A,HLA−DR−β−
B,HLA−DR−β−CおよびHLA−DR−β−D
のcDNA配列の部位制限地図である。
【図5】cDNA配列HLA−DR−β−Aの配列決定
方法を示す説明図である。
【図6】cDNA配列HLA−DR−β−Aのヌクレオ
チドおよびアミノ酸配列を示す説明図である。
【図7】図6と同じcDNA配列HLA−DR−β−A
のヌクレオチドおよびアミノ酸配列を示す説明図であ
る。
【図8】図6と同じcDNA配列HLA−DR−β−A
のヌクレオチドおよびアミノ酸配列を示す説明図であ
る。
【図9】図6と同じcDNA配列HLA−DR−β−A
のヌクレオチドおよびアミノ酸配列を示す説明図であ
る。
【図10】cDNA配列HLA−DR−β−Aから推測
されるアミノ酸配列と、DR2の同型接合系から単離さ
れたIa抗原β−鎖につきクラッチンにより決定された
アミノ酸配列と、DR3,W6細胞系からラールハンマ
ーにより単離されたcDNAクローンから推測されるア
ミノ酸配列との比較図である。
【図11】図10と同じcDNA配列HLA−DR−β
−Aから推測されるアミノ酸配列と、DR2の同型接合
系から単離されたIa抗原β−鎖につきクラッチンによ
り決定されたアミノ酸配列と、DR3,W6細胞系から
ラールハンマーにより単離されたcDNAクローンから
推測されるアミノ酸配列との比較図である。
【図12】図10と同じcDNA配列HLA−DR−β
−Aから推測されるアミノ酸配列と、DR2の同型接合
系から単離されたIa抗原β−鎖につきクラッチンによ
り決定されたアミノ酸配列と、DR3,W6細胞系から
ラールハンマーにより単離されたcDNAクローンから
推測されるアミノ酸配列との比較図である。
【図13】図10と同じcDNA配列HLA−DR−β
−Aから推測されるアミノ酸配列と、DR2の同型接合
系から単離されたIa抗原β−鎖につきクラッチンによ
り決定されたアミノ酸配列と、DR3,W6細胞系から
ラールハンマーにより単離されたcDNAクローンから
推測されるアミノ酸配列との比較図である。
【図14】cDNA配列HLA−DR−β−Bのヌクレ
オチドおよびアミノ酸配列を示す説明図である。
【図15】図14と同じcDNA配列HLA−DR−β
−Bのヌクレオチドおよびアミノ酸配列を示す説明図で
ある。
【図16】本発明の型別方法の一具体例を使用して型別
された4種の個体(DR7/7,6/6,3/6および
1/1)からのDNAのサザンブロット図である。
【図17】cDNAクローンHLA−DR−β−Aおよ
びHLA−DR−β−Bのコード領域間におけるヌクレ
オチド配列不整合の3つの領域を示す説明図であり、黒
丸はヌクレオチド不整合を示し、かつ枠はこれら配列か
ら調製された19−化合体を示す。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (72)発明者 クライア テレス ウエイク アメリカ合衆国、マサチューセッツ 02145、ソマービル、キッダー ストリー ト 33番

Claims (26)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 ヒトリンパ球抗原複合体のHLA−DR
    座位のβ−鎖抗原の免疫学的もしくは生物学的活性を示
    すポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を特徴と
    するDNAであって、 (a) DNA挿入物DR−β−A; 【化1】 (b) DNA挿入物DR−β−B; 【化2】 (c) 前記DNA挿入物のいずれかに、1Xデンハルツ試
    薬、0.75M NaCl、5mM EDTAおよび5
    0mMリン酸ナトリウム緩衝液(pH7)で65℃にて
    ヒブリド化するDNA;および (d) 前記DNAのいずれかによりコードされたポリペプ
    チドを発現に際しコードするヌクレオチド配列を特徴と
    するDNAよりなる群から選択されることを特徴とする
    DNA。
  2. 【請求項2】 前記ヌクレオチド配列が、 【化3】 を有することを特徴とする請求項1に記載のDNA。
  3. 【請求項3】 前記ヌクレオチド配列が、 【化4】 を有することを特徴とする請求項1に記載のDNA。
  4. 【請求項4】 ヒトリンパ球抗原複合体のHLA−DR
    座位のβ−鎖抗原の免疫学的もしくは生物学的活性を示
    すポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を特徴と
    するDNAから成る組換DNA分子であって、前記DN
    Aが、 (a) DNA挿入物DR−β−A; 【化5】 (b) DNA挿入物DR−β−B; 【化6】 (c) 前記DNA挿入物のいずれかに、1Xデンハルツ試
    薬、0.75M NaCl、5mM EDTAおよび5
    0mMリン酸ナトリウム緩衝液(pH7)で65℃にて
    ヒブリド化するDNA;および (d) 前記DNAのいずれかによりコードされたポリペプ
    チドを発現に際しコードするヌクレオチド配列を特徴と
    するDNAよりなる群から選択されることを特徴とする
    組換DNA分子。
  5. 【請求項5】 前記DNAが、ヌクレオチド配列: 【化7】 を有することを特徴とする、請求項4に記載の組換DN
    A分子。
  6. 【請求項6】 前記DNAが、ヌクレオチド配列: 【化8】 を有することを特徴とする、請求項4に記載の組換DN
    A分子。
  7. 【請求項7】 DNA挿入物が、前記組換DNA分子の
    発現制御配列に作用的に結合していることを特徴とする
    請求項4〜請求項6のいずれかに記載の組換DNA分
    子。
  8. 【請求項8】 ヒトリンパ球抗原複合体のHLA−DR
    座位のβ−鎖抗原の免疫学的もしくは生物学的活性を示
    すポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有する
    DNAよりなる組換DNA分子で形質転換した宿主を培
    養する工程、および前記DNAを単離する工程よりなる
    ヒトリンパ球抗原複合体のHLA−DR座位のβ−鎖抗
    原の少なくとも1つをコードするヌクレオチド配列を有
    するDNAの製造方法であって、前記DNAが、 (a) DNA挿入物DR−β−A; 【化9】 (b) DNA挿入物DR−β−B; 【化10】 (c) 前記DNA挿入物のいずれかに、1Xデンハルツ試
    薬、0.75M NaCl、5mM EDTAおよび5
    0mMリン酸ナトリウム緩衝液(pH7)で65℃にて
    ヒブリド化するDNA;および (d) 前記DNAのいずれかによりコードされたポリペプ
    チドを発現に際しコードするヌクレオチド配列を有する
    DNA;よりなる群から選択されることを特徴とする、
    DNAの製造方法。
  9. 【請求項9】 前記DNAが、ヌクレオチド配列: 【化11】 を有することを特徴とする請求項8に記載の方法。
  10. 【請求項10】 前記DNAが、ヌクレオチド配列: 【化12】 を有することを特徴とする請求項8に記載の方法。
  11. 【請求項11】 型別すべき個体から単離したDNAを
    少なくとも1種の制限エンドヌクレアーゼによって切断
    し、切断されたDNAをサイズ分画し、サイズ分画され
    たDNAを、ヒトリンパ球抗原複合体のHLA−DR座
    位のβ−鎖抗原の免疫学的もしくは生物学的活性を示す
    ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するD
    NAにヒブリド化し、かつヒブリド化した領域を検出す
    る工程から成るHLA−DR型別方法であって、前記D
    NAが、 (a) DNA挿入物DR−β−A; 【化13】 (b) DNA挿入物DR−β−B; 【化14】 (c) 前記DNA挿入物のいずれかに、1Xデンハルツ試
    薬、0.75M NaCl、5mM EDTAおよび5
    0mMリン酸ナトリウム緩衝液(pH7)で65℃にて
    ヒブリド化するDNA;および (d) 前記DNAのいずれかによりコードされたポリペプ
    チドを発現に際しコードするヌクレオチド配列を有する
    DNA;よりなる群から選択されることを特徴とする、
    HLA−DR型別方法。
  12. 【請求項12】 前記DNAが、ヌクレオチド配列: 【化15】 を有することを特徴とする請求項11に記載のHLA−
    DR型別方法。
  13. 【請求項13】 前記DNAが、ヌクレオチド配列: 【化16】 を有することを特徴とする請求項11に記載のHLA−
    DR型別方法。
  14. 【請求項14】 被検試料中のDNAを、ヒトリンパ球
    抗原複合体のHLA−DR座位のβ−鎖抗原の免疫学的
    もしくは生物学的活性を示すポリペプチドをコードする
    ヌクレオチド配列を有するDNAにヒブリド化し、かつ
    ヒブリド化を検出する工程から成るHLA−DR型別方
    法であって、前記DNAが、 (a) DNA挿入物DR−β−A; 【化17】 (b) DNA挿入物DR−β−B; 【化18】 (c) 前記DNA挿入物のいずれかに、1Xデンハルツ試
    薬、0.75M NaCl、5mM EDTAおよび5
    0mMリン酸ナトリウム緩衝液(pH7)で65℃にて
    ヒブリド化するDNA;および (d) 前記DNAのいずれかによりコードされたポリペプ
    チドを発現に際しコードするヌクレオチド配列を有する
    DNA;よりなる群から選択されることを特徴とする、
    HLA−DR型別方法。
  15. 【請求項15】 32P−標識DNAをヒブリド化のため
    に使用し、かつその放射線標識をヒブリド化した領域あ
    るいはヒブリド化を検出するために使用することを特徴
    とする許請求項11〜請求項14のいずれかに記載のH
    LA−DR型別方法。
  16. 【請求項16】 ヒトリンパ球抗原複合体のHLA−D
    R座位のβ−鎖抗原の免疫学的もしくは生物学的活性を
    示すポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有す
    るDNAを特徴とするHLA−DR型別キットであっ
    て、前記DNAが、 (a) DNA挿入物DR−β−A; 【化19】 (b) DNA挿入物DR−β−B; 【化20】 (c) 前記DNA挿入物のいずれかに、1Xデンハルツ試
    薬、0.75M NaCl、5mM EDTAおよび5
    0mMリン酸ナトリウム緩衝液(pH7)で65℃にて
    ヒブリド化するDNA;および (d) 前記DNAのいずれかによりコードされたポリペプ
    チドを発現に際しコードするヌクレオチド配列を有する
    DNA;よりなる群から選択されることを特徴とするH
    LA−DR型別キット。
  17. 【請求項17】 前記DNAが、ヌクレオチド配列: 【化21】 を有することを特徴とする請求項16に記載のHLA−
    DR型別キット。
  18. 【請求項18】 前記DNAが、ヌクレオチド配列: 【化22】 を有することを特徴とする請求項16に記載のHLA−
    DR型別キット。
  19. 【請求項19】 ヒトリンパ球抗原複合体のHLA−D
    R座位のβ−鎖抗原の免疫学的もしくは生物学的活性を
    示すポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を特徴
    とするDNAであって、前記DNAは、 (a) 5Xデンハルツ試薬、10%硫酸デキストラン、
    0.9M NaCl、0.18M トリス・HCl(p
    H8.0)、6mM EDTAおよび0.5%ノニデッ
    トP−40で、約45〜55℃にて次のDNA挿入物 (i) DNA挿入物DR−β−A; 【化23】 (ii)DNA挿入物DR−β−B; 【化24】 のいずれか一つにヒブリド化するDNAおよび (b) 前記DNAのいずれかによりコードされたポリペプ
    チドを発現に際しコードするヌクレオチド配列を有する
    DNA;よりなる群から選択されることを特徴とするD
    NA。
  20. 【請求項20】 ヒトリンパ球抗原複合体のHLA−D
    R座位のβ−鎖抗原の免疫学的もしくは生物学的活性を
    示すポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を特徴
    とするDNAから成るHLA−DR型別キットであっ
    て、前記DNAが、 (a) 5Xデンハルツ試薬、10%硫酸デキストラン、
    0.9M NaCl、0.18M トリス・HCl(p
    H8.0)、6mM EDTAおよび0.5%ノニデッ
    トP−40で、約45〜55℃にて次のDNA挿入物 (i) DNA挿入物DR−β−A; 【化25】 (ii)DNA挿入物DR−β−B; 【化26】 のいずれか一つにヒブリド化するDNAおよび (b) 前記DNAのいずれかによりコードされたポリペプ
    チドを発現に際しコードするヌクレオチド配列を有する
    DNA;よりなる群から選択されることを特徴とする、
    HLA−DR型別キット。
  21. 【請求項21】 ヒトリンパ球抗原複合体のHLA−D
    R座位のβ−鎖抗原の免疫学的もしくは生物学的活性を
    示すポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を特徴
    とするDNAから成る組換DNA分子であって、前記D
    NAが、 (a) 5Xデンハルツ試薬、10%硫酸デキストラン、
    0.9M NaCl、0.18M トリス・HCl(p
    H8.0)、6mM EDTAおよび0.5%ノニデッ
    トP−40で、約45〜55℃にて次のDNA挿入物 (i) DNA挿入物DR−β−A; 【化27】 (ii)DNA挿入物DR−β−B; 【化28】 のいずれか一つにヒブリド化するDNAおよび (b) 前記DNAのいずれかによりコードされたポリペプ
    チドを発現に際しコードするヌクレオチド配列を有する
    DNA;よりなる群から選択されることを特徴とする、
    組換DNA分子。
  22. 【請求項22】 型別すべき個体から単離したDNAを
    少なくとも1種の制限エンドヌクレアーゼによって切断
    し、切断されたDNAをサイズ分画し、サイズ分画され
    たDNAを、ヒトリンパ球抗原複合体のHLA−DR座
    位のβ−鎖抗原の免疫学的もしくは生物学的活性を示す
    ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するD
    NAにヒブリド化し、かつヒブリド化した領域を検出す
    る工程から成るHLA−DR型別方法であって、前記D
    NAが、 (a) 5Xデンハルツ試薬、10%硫酸デキストラン、
    0.9M NaCl、0.18M トリス・HCl(p
    H8.0)、6mM EDTAおよび0.5%ノニデッ
    トP−40で、約45〜55℃にて次のDNA挿入物 (i) DNA挿入物DR−β−A; 【化29】 (ii)DNA挿入物DR−β−B; 【化30】 のいずれか一つにヒブリド化するDNAおよび (b) 前記DNAのいずれかによりコードされたポリペプ
    チドを発現に際しコードするヌクレオチド配列を有する
    DNA;より成る群から選択されることを特徴とする、
    HLA−DR型別方法。
  23. 【請求項23】 被検試料中のDNAを、ヒトリンパ球
    抗原複合体のHLA−DR座位のβ−鎖抗原の免疫学的
    もしくは生物学的活性を示すポリペプチドをコードする
    ヌクレオチド配列を有するDNAにヒブリド化し、かつ
    ヒブリド化を検出する工程から成るHLA−DR型別方
    法であって、前記DNAが、 (a) 5Xデンハルツ試薬、10%硫酸デキストラン、
    0.9M NaCl、0.18M トリス・HCl(p
    H8.0)、6mM EDTAおよび0.5%ノニデッ
    トP−40で、約45〜55℃にて次のDNA挿入物 (i) DNA挿入物DR−β−A; 【化31】 (ii)DNA挿入物DR−β−B; 【化32】 のいずれか一つにヒブリド化するDNAおよび (b) 前記DNAのいずれかによりコードされたポリペプ
    チドを発現に際しコードするヌクレオチド配列を有する
    DNA;より成る群から選択されることを特徴とするH
    LA−DR型別方法。
  24. 【請求項24】 HLA−DR型別に使用され得るDN
    Aであって、 (a) DNA挿入物DR−β−A; 【化33】 および (b) DNA挿入物DR−β−B; 【化34】 によりコードされたポリペプチドの間の1つ以上のアミ
    ノ酸不整合領域の過半数をコードするヌクレオチド配列
    を特徴とするDNA。
  25. 【請求項25】 HLA−DR型別キットであって、 (a) DNA挿入物DR−β−A; 【化35】 および (b) DNA挿入物DR−β−B; 【化36】 によりコードされたポリペプチドの間の1つ以上のアミ
    ノ酸不整合領域の過半数をコードするヌクレオチド配列
    を特徴とするDNAから成る、HLA−DR型別キッ
    ト。
  26. 【請求項26】 被検試料中のDNAをもう1つのDN
    Aにヒブリド化し、かつヒブリド化を検出する工程から
    成るHLA−DR型別方法であって、前記もう1つのD
    NAが、 (a) DNA挿入物DR−β−A; 【化37】 および (b) DNA挿入物DR−β−B; 【化38】 によりコードされたポリペプチドの間の1つ以上のアミ
    ノ酸不整合領域の過半数をコードするヌクレオチド配列
    を特徴とする、HLA−DR型別方法。
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