JPH05506989A - 新規T細胞リンパ腫cDNAクローン - Google Patents

新規T細胞リンパ腫cDNAクローン

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JPH05506989A
JPH05506989A JP91508037A JP50803791A JPH05506989A JP H05506989 A JPH05506989 A JP H05506989A JP 91508037 A JP91508037 A JP 91508037A JP 50803791 A JP50803791 A JP 50803791A JP H05506989 A JPH05506989 A JP H05506989A
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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるため要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 発明の名称 新規T細胞リンパ1lcDNAクローン発明の分野 本発明は新しいDNA配列、遺伝子組換えDNA分子、T細胞の発生に表現され る新規膜横断蛋白質をつくりだすプロセス、および実質的に純粋な形態での新規 膜横断蛋白質に関するものである。より詳しくは、本発明は適切な宿主と、これ ら宿主内でつくりだされた組み込み膜蛋白質の2つの新しい蛋白質で表現される 新しいDNA配列に関するものである。本発明によるこれらDNA配列および遺 伝子組換えDNA分子は、各々が以下の特徴のうちの少なくとも2つを有する新 規蛋白質を遺伝コードで指定している点に特徴がある:(1,)Tリンパ腫細胞 で表現されている、(2)通常の胸腺、活性化肺臓細胞、あるいは腸関連リンパ 系組織により表現されている、(3)卵巣組織、通常の肝臓、あるいは不死化ま たはガン性細胞株で表現されている、(4)胚発生に表現されている、そして/ または(5)複数の膜にまたがった領域を有している。以下の開示から理解され るであろうように、これらDNA配列、遺伝子組換えDNA分子、およびT細胞 の発生に表現される新規蛋白質および実質的に純粋な形での新規T細胞蛋白質を つくりだすためのプロセスはT細胞発生の調整の操作において有益であり、腫瘍 の転移病巣の局所化においても有益である。本発明はまた、本発明による蛋白質 上でのエピトープに結合する新規の抗体を提供し、これらの抗体を、この新規蛋 白質を表現する特殊な細胞タイプに対する薬品あるいはその他の試薬を確認、特 定するために使用することを提供するものである。
技術の背景 免疫システムの開発においては、Tリンパ球は胸腺に入って分化および成熟する 前駆体幹細胞から誘導される。多くの遺伝子はT細胞がその胸腺内部で発生の異 なった段階を通過する時に活性化されるか、あるいは抑制される。例えば、それ らの細胞はこの期間中にその表面にIL−2受容体、CD4、および/またはC D8を獲得する。これらの分化標識はT細胞の発生および/または機能にとって 重要である。多くの遺伝子生成物は発生中のTリンパ球における表現のレベルに おいて増大される。これらには抗原に対するT細胞受容体と同様標111iCD 4およびCD8を含んでいる。他の多くの抗原は、リンパ球におけるその正確な 機能が知られる前にT細胞標識としての役割を果してきた。ごく最近、T細胞抗 原pgp1が胸腺リンパ球が胸腺に入るのを助け、そのためT2O0(CD45 )は細胞内標識するための成分としての役割を果すことが見出された。別のT細 胞標識で、rhy 1はなおそれに関連した機能は知られていない。
5L12.4細胞はCD4 CDB二重ネガティブ表現型を示し、従って、発生 の比較的初期の段階では胸腺リンパ球に類似している。さらに、それらはT細胞 受容体アルファサブユニットは表現しない。しかしながら、5L12.4細胞は 、胸腺上皮単層上で共生培養を行った後、その表面上にCD4およびCD8を安 定−して表現させることができる。 TCR−アルファmRNAもまたこうした 処理後に表現される。このように5L12.4細胞は分化および成熟を受ける能 力を有していることは明らかである。こうした独特なイン・ビトロ生物学的系は ある程度、胸腺の微環境に擬態される。
遺伝子の数は発生中の胸腺リンパ球に先ず表現されることが確認されている。こ れらの遺伝子の多くは、例えば以下のような、免疫システムでの機能を果すT細 胞前駆体として表現されねばならない蛋白質でコード化する=1)抗原識別に必 要な抗原に対するTCR; 2)それらの細胞がサイトカインIL2に対応する 細胞より表現されねばならないCD25 (IL2受容体) ; 3) CD3  、 CD4 、 CDS、 CD45などの抗原識別中にシグナル導入のため に重要な遺伝子生成物、4)遺伝子生成物のあるものは目標器官への胸腺リンパ 球移入に関与する、モして5) T細胞活性化に関与する遺伝子生成物(フォー ルケスおよびパードール、文長生立盈歩旦:207−264 (1989) ; フード等、(1985)鳳1.赳、 225=229 ;ローテンベルブおよび ルゴ、Develo 、 Biol 月2.1−17 (1985) ;アドキ ンス等、Ann Rev Immunol、5 :325−365 (1987 ) 、クラブツリー、並工王之ス困:343−355 (1989) ;クオン およびワイスマン、扛匹工Σ痣I Acaム」≧L1鎧赳: 1963−196 7(1989) )。表現された遺伝子の異なった組み合わせを表現する胸腺リ ンパ球サブセットには著しい異質性がある。いろいろなタイプの胸腺リンパ球の すべてにおいてではないが、その多くにおいて、遺伝子表現が詳しく分析されて おり、そして、T細胞の発生および移入において機能を果すコード化生成物、特 に数値的にはあまり現れない、一時的プロジェニター胸腺リンパ球において表現 されるものをコード表現する遺伝子の確認が未だなされていないようである。
胸腺リンパ球の広範な異質性のために、発生中に起きる遺伝子表現のカスケード を特徴づけるのに十分な数と純度で分画されたプロジェニター胸腺リンパ球を得 るのは実際的には不可能である。こうした理由から、リンパ腫および白血病細胞 がリンパ系の発生における遺伝子表現の研究において広範に利用されていた(グ リーブス、サイエンス234 : 697−704(1986) ;ハンリーー ハイドおよびリンチ、Ann Rev Immuno14 : 621−649  (1986) ) 、がなりの量の文献が数値的にあまり現れない一時的プロ ジェニター細胞が悪性腫瘍への形質変換の対象となっていること、そしてさらに 、形質変換された目標細胞の特性の一部が腫瘍細胞内に保持されていることを示 唆している。腫瘍細胞における予期されない遺伝子表現は過去においては往々に して形質変換における異常として簡単に片づけられた。しかしながら、造血組織 腫瘍細胞における「異常な」遺伝子表現を注意深く分析した結果、こうした遺伝 子を表現する通常のプロジェニター細胞の稀なサブセットが明らかになった(グ リーブス、サイエンス234 : 697−704(1986) ; ハンリー ーハイドおよびリンチ、Ann Rev、 Tmmunolジ挫工旦: 1.9 96−2004 (1988) ) 。
ひとつの個体から取り出されたマウスおよびヒトのリンパ腫細胞株の異質性は個 々の細胞が到達している成熟の程度の違いの結果であると考えることができる。
確立されたTリンパ腫細胞株の異質性は限定された数の特性だけが異なっている 密接に関連した細胞クローンを得るために利用された。ヘントリック等(ヘント リック等、工木イ」−1:308 : 149−153(1984) )は減法 クローニング法を用いて、TおよびB細胞はほば100の遺伝子の表現が異なっ ているという推定を行った。密接に関連したTリンパ腫細胞がそれよりもっと少 ない遺伝子の表現において異なっているだけかもしれない可能性がある。こうし た細胞クローンは、限られた数の特性だけが異なっている明確に定義されそして 安定した表現型を有する細胞の純粋な集団を操作する可能性を提供した。本願に おいてはこうした密接に関連した細胞集団を提供するために5L12Tリンパ腫 モデル・システムが開発され、使われる(ヘイズ等、江旦」2ハ匹肛亜:597 −601 (1986) ;マツクリート等、Cancer Re5earch 旦: 1784−1790 (1984) ;マツクリート等、L」里工旦匪二 り江旺74 : 875−882 (1985) ;マツクリート等、Proc 、 Natl、Acad Sci USA 83 : 6989−6993(1 986) ;之二j及!、ム」江り1恒d、 166 : 1702−1715 (+987) )。
発明の詳細な説明 本発明は新規DNA配列、遺伝子組換えDNA (rDNA)分子、T細胞の発 生において表現される新規T細胞蛋白質をつくるためのプロセス、実質的に純粋 な形態での新規T細胞蛋白質およびそれら新規蛋白質に結合する抗原を提供する ものである。
より詳細には、本発明は適切な宿主とそれら宿主でつくられる新規T細胞蛋白質 で表現される新規DNA配列に関するものである。本発明はまた、実質的純粋な 形態での新規膜横断蛋白質、こうした膜横断蛋白質をコード化するrDNA分子 、そしてそれら新規膜横断蛋白質をつくるためのプロセスを提供する。本発明の DNA配列および遺伝子組換えDNA分子は、それらがTリンパ腫細胞により表 現され、少なくとも以下の特性のひとつを有しているという特徴を有している= (1)正常の胸腺、活性化肺臓細胞、あるいは腸関連リンパ系組織において表現 されている、(2)卵巣組織、正常の肝臓において、および/または胚発生の段 階固有の方法で表現されている、(3)複数の膜横断領域を有する新規膜横断蛋 白質をコード表現している。
別の側面として、本発明は胸腺上皮単層上での共生培養後にSLl、2.4細胞 で誘導できる、本明細書ではLovとも称せられる新規遺伝子、19.5を提供 する。本発明はまた、Lov cDNA配列に基づくオリゴペプチドに対するポ リクローナル抗体も提供する。共生培養後の5L12.4細胞集団から分離され た細胞クローンは表面蛋白質レベルと同様mRNAで高いレベルのLov表現を 示すので、Lovの誘発は安定していると思われる。、Lov遺伝子はマウス染 色体16にマツプされている。Lov遺伝子生成、物は発生段階的に調整され、 T細胞の発生において一定の役割を演じる。
5L12.4cDNAライブラリーは、関連する姉妹リンパ腫細胞株、5L12 .3に対する減法ハイブリダイゼイションを経て分離される6つの新規cDNA から構成されている。5L12.3細胞はSLl2.4より未成熟段階で胸腺リ ンパ球の特性を有している。cDNAクローンの1つである19.5は5L12 .4において表現されるが、5L12.3細胞においては表現されない、この配 列はLov(μymphoid[リンパ系]およびovarian [:卵巣コ 細胞表現)と名づけられている)。これにより目標の蛋白質は高度に親水性のよ うであり、コンピュータ分析によると、4つの膜横断領域を含んでいる。Lov  cDNAあるいは目標の蛋白質配列と他の知られている配列の間に有意の相同 は認められていない。Lovは、例えば、ヒト、噛歯類、ウサギ、アシ力などの は乳類、および鳥類に保持されており、転写は卵巣および腸関連リンパ系組織( GALT) 、および胸腺において高度に表現されるようである。Lov表現と その生物系における誘導可能性、およびこの遺伝子のマウス染色体による局所化 を本明細書中に開示する。
こうしたDNA配列および遺伝子組換えDNA分子を提供することにより、本発 明はまた、これらの配列を含んでいたり、あるいは欠いている細胞を確認するた めのプローブおよび方法と、これらの配列を欠いている細胞にその配列を提供す る手段とを提供する。さらに、本発明は、細胞に投与された場合、あるいはアン チセンスRNAをコード表現しているDNAを該DNA配列を含んでいる細胞に 投与した場合、本発明による新規蛋白質をコード表現しているRNAと結合して 、その合成を妨げるアンチセンスRNAをつくりだすアンチセンスRNA配列を 提供することによってそれら新規配列の表現を抑制する手段を提供する。本発明 による蛋白質のいずれかに対する抗原がリガンドのそれら蛋白質への結合を阻止 し、これら蛋白質を表現している細胞の標的薬品あるいはその他の試薬(ラベル など)に利用できることは、本開示から当業者には明らかであろう。
限られた数の組織でだけ見いだされる転写を確認する、本明細書中ではTeaと も表現されるcDNAクローン、20.5も提供される。Tea転写はT細胞ミ トゲンConAを使って活性化された肺臓リンパ球内で誘導される。活性化T細 胞で表現される他の知られた遺伝子とは違って、Tea遺伝子は膜を何回も通過 する蛋白質をコード表現するように思われ、一方、T細胞の活性化において誘導 される多数の既知の組み込まれた膜蛋白質は単一膜にひろがった蛋白質である( クラブツリー、(1989)サイエンス243 : 355−361)である。
本発明はまた、新規膜横断蛋白質およびT細胞の発生、腫瘍形成表現型の調整に おいて利用でき、また、自己免疫疾患におけるT細胞の活性化の阻止においても 有益である実質的に純粋な形態での新規膜横断蛋白質をつくりだすプロセスを提 供する。
2つの関連Tリンパ腫細胞クローン間で異なって表現される新規のcDNAクロ ーンは減法−栄養強化分画スクリーニングを用いて分離された。それからcDN Aが分離された5L12゜4細胞は発生の中間段階において胸腺リンパ球の特性 を有しており、同系動物において顕著な結節外卵巣腫瘍を引き起こす、同じ腫瘍 から取り出された姉妹細胞である5L12.3は別の表現型を有しており、より 進行性のつよい、拡散性リンパ腫をつくりだす。これら5つの新規遺伝子のうち の4つは正常胸腺、活性化肺臓細胞、あるいは腸関連リンパ系組織において表現 される。新規cDNA配列及び新規cDN^クローンに関する目標蛋白質配列を 第3,13図および20−23に示す。新規19.5cDNAクローンは正常な 胸腺、腸関連リンパ系組織および卵巣組織におけるmRNAを検出する。目標蛋 白質は推定4つの膜横断領域を有している。転写の表現は新規cDNAクローン に対する検出可能なmRNA相補を欠いている3つの異なったTリンパ腫細胞株 と融合した5L12.4細胞から形成される体細胞ハイブリッドで抑制される。
このトランス−ネガティブ調整はその遺伝子の表現が抑制メカニズムによって調 整されることを示唆している。
図面の簡単な説明 第1図はノーザン・プロットによる5つの異なった5L12.4−固有−cDN Aクローンを示している。
第2図は4つの異なった5L12.4固有cDNAクローンのサザーンプロット ・ハイブリダイゼイションを示している。
第3図はDNA及び19.5cDNAクローンの目標蛋白質配列を示している。
A、DNA配列および目標アミノ酸配列は二重ストランド化シーケンシングを用 いて得られたものである。遺伝子配列を組み立てるため、および目標アミノ酸配 列を調製するためにミクロジェニー(ベックマン)が用いられた。B、サブクロ ーニングのためのcDNA内の拘束箇所とシーケンシング手法が示されている。
オーブン・リーディング・フレームは点線の水平線で示しである。両方のスタン ドとも、完全なインサートとプライマーを用いた4つのサブクローンからプラズ ミドpT7T3のT3およびT7領域および1つの合成オリゴヌクレオチド・プ ライマーまでで配列されている。目標の蛋白質の物理的属性を調べ、Cに示され ているスケッチを作成するために、PCジーン・ソフトウェア・プログラム5O AP。
HELIXMEM、 MONOTNYオヨびRAOARGO5が用いられた。
第4図は体細胞ハイブリッド内の19.5および20.2cDNAおよび正常な マウスの組織における19.5の表現パターンを示している。
第5図は19.5cDNAに対して相補型の配列がヒトの卵巣悪性腫瘍細胞株に 含まれていることをノーザン・プロットで示している。
第6図は19゜5に対する相補型の配列が種々の曙乳物種に存在しており、した がって、進化の過程で保持されることを、サザーン・プロットで示している。
第7図はLovの両方の転写が共生培養によって誘発されることをノーザン・プ ロットで示している。
第8図は5L12.4のLovの表面表現に関する蛍光抗体分析を示している。
第9図は19.5抗体の免疫抗原に関する特殊性を示している。
第1O図は胸腺上皮細胞によるLov蛋白質の誘発可能性を示している。
第11図はLov表現の安定性をノーザン・プロットおよびFAC5分析で示し ている。
第12図はLovの染色体16への局所化を示している。
第13図はDNAとクローン20.5cDNAの目標の蛋白質配列を示している 。
第14図はTea遺伝子表現を示している。
第15図は活性化肺臓リンパ球におけるTea遺伝子誘発の動力学的原理を示し ている。
第16図は20.5およびERRcDNA配列の配列を示している。
第17図はTea目標蛋白質配列とマウス自己指向性レトロウィルス受容体配列 との配列を示している。
第18図はTeaおよびRec−1遺伝子の目標蛋白質生成物の物理的属性を示 している。
第19図は種々の種から取り出したDNAのサザーン分析と染色体8上でのTe a遺伝子を位置を特定するための遺伝子組換え近交型DNAの分析を示している 。
第20図はクローン19.1cDNAのDNAと目標蛋白質配列を示している。
第21図はクローン19.2cDNAのDNAと目標蛋白質配列を示している。
第22図はクローン19,4cDNAのDNAと目標蛋白質配列を示している。
第23図はpNEo/TfR−NCの系統図を示している。
第24図はpMAMneo−Blueの系統図を示している。
発明の詳細な説明 本明細書中に述べられている発明をもっと良く理解できるように、以下に詳しく 説明する。
説明においては、以下の用語が用いられる。
ここで用いられるr宿主Jという用語は、原核生物ばかりでなく、イーストや糸 状菌、および植物および動物細胞などの真核生物なども意味している。
「原核生物」という用語は本発明による膜横断あるいは遺伝子組換えT細胞蛋白 質(rtTCP)を表現するためにDNAで形質転換され得るすべてのバクテリ アを意味している。
「真核生物」という用語は、本発明による膜横断あるいは遺伝子組換え膜横断T 細胞蛋白質を表現するためにDNAで形質転換することが可能なすべてのイース ト菌、菌類、動物および植物細胞を意味している。
本発明によるT細胞蛋白質のためのDNAはいかなる哨乳類種からでも取り出す ことができる。必要なのは、T細胞蛋白質のための遺伝子配列がその原核生物あ るいは真核生物の有機体組織内で表現されることだけである。好ましいのはマウ スからのTCP蛋白質を表現するT細胞DNAである。特に好ましいのは複数の 動物種(例えば、マウス、ウサギ、アシ力、あるいはヒトなど)の間で免疫学的 交雑が可能なT細胞DNAの配列である。
本発明のT細胞蛋白質のいずれかをコード遺伝子組換えDNA分子は、この分野 における通常の技術を知っている人々に広く知られている手法のいずれかを用い て、宿主の形質転換を行うために用いることができる。特に好ましいのは、原核 生物の形質転換を目的として、本発明によるT細胞蛋白質に関するコーディング 配列を含んだベクターの使用である。
本発明のT細胞遺伝子組換え蛋白質(TCP)は先天T細胞蛋白質のアミノ酸と 比較して、その両側面端に多いかあるいは少ないアミノ酸を含むことができる。
「実質的純粋jという言葉は、本発明の膜横断T細胞蛋白質に対して使った場合 、ポリペプチドは、通常はその自然の状態でT細胞蛋白質と結合していて、定常 的および再現可能な電気泳動あるいはグロマトグラフイー的応答、溶出特性、そ して抗原活性を抑制してしまう他の蛋白質とは基本的に無関係であることを意味 している。「実質的純粋」という意味には、T細胞蛋白質とその他の化合物の人 為的、あるいは合成混合物を排除することは含まれていない。
融合された、操作可能に結合された遺伝子を調製し、それらをバクテリア内で表 現するための方法は知られており、例えば、本願に引例として採用されている米 国特許&4..366、246に示されている。ここに示されている遺伝子構成 および方法は原核生物あるいは真核生物宿主内で膜横断細胞蛋白質を表現するた めに用いることができる。
原核生物宿主には太II1.主ノーよm、セラチア・マルセッセ之ス、および1 LiLなどの、グラム陰性菌およびダラム陽性菌を含む。
真核生物宿主はMfヱ・パストリスなどのイースト菌あるいは哺乳動物の細胞を 含んでいる。
一般的に、挿入されたDNA断片の効率的な転写を容易に行わせるようにするプ ロモーター配列を含んだ表現ベクターはその宿主との関連で用いられる。表現ベ クターは典型的に、複製開始点、プロモーター、ターミネータ−1および形質転 換される細胞に表現型選択を行うことができる特殊な遺伝子を含んでいる。形質 転換される宿主は、最善の細胞培養を行うために公知の手段に従って発酵、培養 させることができる。
本発明で用いることができるプロモーターの例としては、rec A 、 tr c、 lac、 tac1バクテリオファージ・ラムダpRあるいはpL+ M MTV、 SV40などを含むが、これだけには限られない。本発明で用いるこ とができるプラスミドあるいはバクテリオファージのいくつかの例は「マニアテ イス等、jLテ2Lp−−ニング、コールド・スプリング・ハーバ−・ラボラト リーズ、1982 Jに紹介されており、その他のものも当業者には知られてお り、簡単に確かめることができる。
本発明は、例えば、溶原性ファージを用いた遺伝子素材の転写など、この分野で 公知のいずれかの他の方法で述べられた、あるいは変更された方法で行う、そし て膜横断T細胞蛋白質の遺伝子を表現している原核生物あるいは真核生物を生み 出すどの宿主に対しても適用できる。
遺伝子はその鋳型あるいはメツセンジャーRNAを通じてひとつのペプチドの特 性を有するアミノ酸の配列をコード表現するDNA配列である。cDNAという 用語は、介在配列が取り除かれた遺伝子を含んでいる。rDNAという用語は、 イン・ビト旦でcDNAあるいはゲノム性DNA配列をスプライシングすること により遺伝子組換えされた分子を意味する。
クローニング伝播体は、プラスミドかファージDNA、あるいは、その個所でD NAの基本的な生物学的機能を損なわずに確定可能な方法でDNA配列が切断さ れるエンドヌクレアーゼを1つ、あるいは少数含んでいることで特徴づけられ、 形質転換された細胞の確認のために使用するのに適した標識を含んでいる宿主細 胞内で複製できるその他のDNA配列である。
標識は、例えば、テトラサイクリン抵抗、ネオマイシン抵抗、あるいはアムビシ リン抵抗である。「ベクター」という用語はクローニング伝播体の意味で使用さ れることが時々ある。
伝播体の表現は、クローニング伝播体に似ているが、通常、ある種のコントロー ル配列によるコントロール下で、宿主内に一定の構造遺伝子を表現することがで きる伝播体である。
膜横断T細胞蛋白質のために膜横断T細胞ゲノムで形質転換された宿主は膜横断 T細胞ポリペプチドおよび蛋白質をつくりだすために特に有用である。
遺伝子組換えT細胞蛋白質はT細胞蛋白質のアミノ酸配列全体で構成される場合 もあるし、特定の決定子だけで構成される場合もある。T細胞遺伝子組換え蛋白 質で免疫化された動物はその遺伝子組換え、あるいは自然由来のポリペプチド上 にあるエピトープと結合する抗体をつくりだす。従って、T細胞を含有した遺伝 子組換え蛋白質の商業的な生産は実行可能である。
「固体」という用語は、すべての動物、好ましくは哺乳類そして、噛歯類、ネコ 、イヌ、ウシ、あるいはヒトが特に好ましい。
探知可能なラベルは検出できるものであればどんな分子であっても差し支えない 。通常用いられている探知可能ラベルは°゛P、”C1゛“I、”Hおよび°S などの放射性ラベルが含まれるが、これらだけに限られるものではない。ビオチ ンでラベルしたヌクレオチドはニック翻訳、酵素あるいは化学的な手段でDNA あるいはRNAに組み込むことができる。ビオチン化されたプローブはアビジン /ストレプトアビジン、蛍光、酵素あるいはコロイド性金共役を用いてハイブリ ッド化した後に検出される。核酸も他の蛍光化合物、免疫検出性蛍光誘導体、あ るいはビオチン類似物を使ってラベルすることができる。核酸は蛋白質を取りつ ける手段でラベルすることもできる。放射性あるいは蛍光性ヒソトンHに結合し た核酸、酵素(アルカリフォスファターゼおよびパーオキシダーゼ)、あるいは −木繊結合(ssB)蛋白質も使用することができる。
従って、本発明は本発明による膜横断蛋白質に関するプローブ、および本発明に よるT細胞蛋白質の天然リガンドの結合に対する抑制子として、および1つの薬 品あるいはラベルを目標とした伝達システムとして、反膜横断T細胞蛋白質抗体 を使えるようにする。
5L12Tリンパ腫細胞株から誘導された2つの細胞クローンが遺伝子表現にお いて知られている差と、同系宿主動物における腫瘍を発生させる上でのその異な った能力に基づいて、新規のそれぞれ違って表現された遺伝子の分離のために選 ばれた(ヘイズ等、加Lエム」工旦匹皿:597−601 (1986) ;マ ツクリート等、Cancer Re5earch 44 : 1784−179 0 (1984) ;マツクリート等、J、Nat Cancer In5t、 74 : 875−882(1985):マツクリート等、ヒ四二上蛙1. A C5蛙工陣シ」以層競: 6989−6993 (+986) ;シーゲル等、 J、 Ex Med 166 : 1702−1715 (1987) 、ウニ インロス等、Cancer R,esearch 4Eし4804−4809  (1985) ;ウィルキンソン等、EMBOJ、7−二101−109(19 88)および表現型の要約に関しては表1参照)。5L12,3細胞株はT細胞 機能に必要な遺伝子はほとんど表現しない。
そして、それは同系動物においては非常に悪性であり、拡散。
進行性腫瘍を形成する。それとは対照的に、5L12,4細胞はTCR−アルフ ァの除< TCR/CD 3複合体のすべての成分に対してmRNA5を表現し 、いくつかの観点で、この細胞は胸腺リンパ球の発生の中間段階での胸腺リンパ 球に似ている。5L12.4細胞は腫瘍発生性がはるかに低く、顕著な結節外腫 瘍を誘発する。雌の宿主動物においては、腫瘍が形成される第1の箇所は卵巣で ある。新規の膜横断蛋白質は腫瘍細胞を卵巣に向かわせることに関与している。
新規cDNAクローンが腫瘍発生性、ホーミング特性、および成熟状態において 異なっている2つの細胞株から分離される。
これらのcDNAは腫瘍を発生させる2つの細胞株の異なった能力に関係する生 成物をコード表現する、モして/またはT細胞において機能を果たす遺伝子を示 す。本発明は5L12.4T細胞クローンで優先的に表現され、姉妹細胞クロー ンである5L12.3では検出できない程のレベルで、あるいは非常に弱くしか 表現されない遺伝子を示す5つの新規cDNAクローンの分離およびその特性に ついて開示している。cDNAクローンは減法ハイブリダイズプローブと古典的 な差別化スクリーニングとの組み合わせで得られた。2つの細胞クローン間で異 なって表現される遺伝子を示す新規cDNAクローンが開示されている。
関係する遺伝子のすべては組織の限定的なサブセットで表現される。一部の転写 はリンパ系細胞でも見いだされるが、一連の異なった表現を示すacDNAのう ちの2つの配列(19,5および20.5)は遺伝子生成物が正常のマウス卵巣 組織、胸腺、腸関連リンパ系組織、膵臓、および肝臓に表現される新規の複数の 膜にまたがっている蛋白質であることを示唆している。
1つの配列はヒトの卵巣悪性腫瘍および正常組織ともハイブリダイズされた。
上に本発明を一般的に述べたが、以下の具体例を参照すれば、さらによく理解で きるであろう。これらの事例は説明のためだけで提供されるのであって、特に他 の指定がない限りそれらに限定することは意図されていない。
例1 細胞の分離、特徴付け、および培養 A、 リンパ腫細胞株 Tリンパ腫細胞株5L12.1.5L12,3.5L12.4およびそれらの間 でつくられた体細胞ハイブリッドの分離、特徴付け、および培養についてはヘイ ズ等、nム」工Cancer 38 : 597−601 (1986) ;マ ツクリート等、Cancer Re5earch 44 :1784−1790  (1984) ;マツクリート等、J Nat、Cancer In5t亙: 875−882 (1985) ;マツクリート等、2二と一一に源JよAca d ’Sci USA 83:6989−6993およびワインロス等、Can cer Re5earch 45 : 4805−4809 (1985)に詳 しく述べられており、これらのすべては本願に引例として組み込まれている。
5L12.3および5L12.4細胞クローンの表現型を表1に要約して示す。
転写表現、表面蛋白質表現、腫瘍原性、および腫瘍のタイプはノーザン分析、フ ロー・サイトメトリー、およびクローン化細胞の同系動物への一イ>二I:!f 注入によってそれぞれ判定された。TCR−β1.0および1.3kb転写は( D)−J−CおよびV−D−J−C配列をそれぞれコード表現する。
グルココルチコイド応答は1mMデキサメタシン中でのその細胞の成長によって 判定された。
表1 SL12.4および5L12.3細胞クローンの表現型特性5L12.4 5L 12,3 rhy−1+ + + + + TCR−アルファ −+ TCR−β1.Okb+− IIRNA 1.3kb −− CD3−イプシロン + 十/− 表 面 ThB + − 表 現 TL 十+ Mel−14+NT グルココルチコイド SR 感 性 腫瘍原性 低 高 腫瘍タイプ 結節外 拡散 R=細胞溶解に抵抗性のある細胞 S=細胞溶解の影響を受けやすい SAK 8細胞(ガッソンおよびプールジェオイス、J Ce1lBiol 9 6409−415 (1953)はガツソン博士から入手した。
リンパ腫細胞はlO%仔仔ウシ血清、グルタミン、ペニシリン、およびペニシリ ンおよびストレプトマイシンを加えたダルベツコの修正イーグルス培養液で培養 された。ヒト卵巣悪性腫瘍細胞株200B (ディサエア等、Am工J 0bs tet工ユ胆坦且月、4 : 979−989 (1972) )およびC0L O316(ウツズ等、Cancer Res、 39 : 4449−4459 ))が5%子ウシ血清、グルタミン、および1%ファンギーバクト(アーヴイン ・サイエンティフィック社、カリフォルニア州すンタ・CA、)でを加えたPR MI 316で培養された。これらの細胞がRNAを作成するために用いられた 場合、1m12あたり5−8X1.O。
個の細胞数程度の密度で指数関数的に成長している時期に取り出された(ウィル キンソン、およびマツクリート、EMBOJ、7 : 1ot−109,(19 88))。BALB/ cマウスから取り出された膵臓リンパ球が3XIO°個 の細胞/mQの条件下でシードされ、RNAを取り出す前に2日間10ug/+ Q ConAで刺激を与えられた。
B、5L12.4細胞および胸腺上皮単層の共生培養SL]、2.4細胞および 胸腺上皮単層の共生培養条件。要約すると、5L12.4細胞は3日間の共生培 養後の最終的な濃度が1×10°細胞/mlとなるような密度でシードされた。
 置あるいはTEP Iは3日目までには溶融状態になった。この細胞はlO% 胎仔性仔ウシ血清を含み、グルタミンおよびペニシリン/ストレプトマイシンを 加えたダルベツコの修正イーグル培養液で37℃の温度下で培養された。
C,20,5表現検討のための細胞株 20.5表現検討においては、以下の供給源からの細胞株が用いられた。胎仔性 悪性腫瘍F9およびPCC4(バーンスタイン等、力■且工N担ユ、」旦回工」 逗り一回襲−測: 3899−3903(1973) 、脳下垂体腫瘍Artz o (ブアナッシーシ等、2二によ凰葺工紅封、鋭肚」鎧、旦: 1184−1 192 (1962) ) 、胸腺上皮TEPI (ビアズリ−等、肚X二上蛙 h]−史籾工」≧L−以述ユよびMEFがフレッシュニー(フレッシュニー、( 1983) In工Cu1ture of Animal Ce1ls、アラン 、R,リス社、pp99−110)に従って調製された。これらの細胞は10% の胎仔性仔ウシ血清、グルタミン、ペニシリン、およびストレプトマイシンを加 えたダルベツコの修正イーグル培養液で培養された。
RNAを調製するために用いられた細胞は1m12あたり5−8×10゛個の細 胞を含んでいる培養基から指数関数的成長期に取り出された。BALB/ cマ ウスから取り出された膵臓リンパ球が上に述べたのと同様のR,PMII640 内で3XIO“でシードされ、RNAを取り出す前に、10ug/d ConA を使って6゜24、48あるいは72時間刺激を与えられた。
例2 クローニングおよびスクリーニングの手法二本鎖(ds) cDNA (Gub ler and Hoffman、 Gene 25 : 263−269 ( 1,983) )を調製するために、5L12.4細胞からのポリ(A)” m RNAが用いられた。 EcoRIリンカ−が前もってメチル化されたds D NAに加えられた。脱リン化うムダgtloアーム(ストラタジーン)がcDN Aに結合されて、メーカーの指示に従って、ストラタジーン・パッケージング抽 出液を用いて、ラムダ・ファージにパッケージ化された(フイヌ等、In D、  Glober(ed)、DNA C1onin Techni ues :  A Practical A roach。
IRL Press、オックスフォード、英国(1984) )。
減法ハイブリダイゼーションが、基本的にはへラドリック等(Nature 3 08 : 1.49−153 (1984) ) 、ティンバーレイク、Dev 、Biol、 78 : 497−503 (1980) )が述べた方法に従 って行われた。一本領cDNAは1100u/dのアクチノマイシンDの存在下 で250二〇〇″’PdCTP(アマ−ジャム)を用いて10mgポリ(A)”  5L124 RNAから調製され、5L12.3細胞からの25mgポリ(A )十を使って、8−の体積で、68℃の温度下、18時間、1260のロット( 1リツトルあたリモル×秒)にハイブリダイズされた。ハイブリダイゼーション 後、ss cDNAはヒドロキシアパタイト・カラムを通じてグロマトグラフイ ーによって集められた。出発時の5L12.4.cDNAのlugから、約12 0ng(3×10“cpmを含んでいるインプットcDNAの12%)が回収さ れ、lフィルターあたり20.000のラムダgtloファージを含んでいる2 つの150mmニトロセルロース・フィルターをプローブするために用いられた 。この5L12,4ラムダgtloライブラリーからの2つの二重フィルター・ リフトの内の第一のものは5L12.3mRNAからのすべてのcDNAを使っ てプローブされ、第二のものは前に述べたような5L12.4減法強化cDNA でプローブされた。用いられた手法はフィルムス等が用いたのと同様であった。
 (別個に調製したサブトラクトされたプローブを用いて)、この悪疫純化ラム ダ・ファージ・クローンは5L12.4固有のものと確認され、その後、5L1 2.3細胞からではなく5L12.4細胞からのmRNAに対してだけ、ハイブ リダイズされることを確認するために、ノーザン分析が行われた。cDNAイン サートは低融点アガロース(Ken参照)で分離された制限酵素Hindlll およびBglnで消化することによってラムダDNAから取り除かれ、Hing mおよびBam旧によって消化されたブラズミド・ベクターpT7/T3 (ベ テスダ・リサーチ・インスティテユート)にサブコローンされた。Eco旧部位 はすべての分離株で損傷されるので、EcoRIを持ったファージからのインサ ートについては、実験を行うことはできなかった。 (クジエル等、Nucl、  Ac1d Res、 15 : 3181 (1987)参照。)例3 ノーザン・プロット分析 A、 一般的手順 総細胞性RNAが上に述べた様に修正された(ウィルキンソン等、EMBOJ  7 : 1ot−109(1988) )グアニジン・イソシアネート法(マニ アチス等、 Mo1ecular C1onin : A撫堕コ上り山恒匣旦、 コールド・ハーバ−・ラボラトリ−・プレス、コールド・スプリング・ハーバ− 、ニューヨーク州(1983)参照)によって細胞株および組織から分離された 。ノーザン分析のために、10ugのRNAがホルムアルデヒドを含んでいる1 %アガロース・ゲル内で電気泳動され、ニトロセルロース膜に移された(メイン コス、ワール、Anal、Bj、ochem、13 : 267−284 (1 984) )。
アクリジン・オレンジ染色(マニアティス等、Mo1ecularC1onin  : A Laborator Manual、コールド−ハーバ−・ラボラト リ−・プレス、コールド・スプリング・ハーバ−、ニューヨーク州(1983)  )および、アクチン、CHO−Aおよび/またはシクロフィリンcDNAとの ハイブリダイゼーションによって、RNAのまったく同じ負荷および移動につい ての評価が行われた。10%硫酸デキストランおよび50%ホルムアミドの存在 下で、42℃の温度下、12−18時間、ランダム・プライムされたくアマ−ジ ャム)”Pラベル化cDNAインサートとハイブリダイズされ、段階的に洗浄さ れ、最後に、42−50℃の温度下で、0.IX 5SPE、 0.1%SDS 内で30分間洗浄された。ラベル化されたプローブを除去するために、0、IX  5SPEおよび0.1%SDSを用いて90℃の温度下で洗浄され、室温まで 温度が下がったら、空気乾燥して、再度ハイブリダイズされるまで、真空下で保 存された。
B、Lov (19,5) RNAのノーザン分析5L12.4細胞は共生培養 後取り出され、4Mグアニジンイソチオシアネート、1M2−メルカプトエタノ ール、および24關酢酸ナトリウム(pH5,2)で溶解された。その後、溶解 物は5.7M塩化セシウム/2mM EDTAの層上に置かれ、4℃の温度下で 、18時間、38000RPMで遠心分離された。次にRNAペレットをTE緩 衝液内に再び懸濁させ、クロロボルム/ブタノールで2度抽出した。10ugの RNAが1%ホルムアルデヒド・アガロース・ゲルの各レーン内で電気泳動され 、ニトロセルロース膜上に移された。このノーザン・プロットを、アマ−ジャム 類のランダム・プライム・ラベリング・キットを用いて0Pでラベルされていた Lov遺伝子のcDNA遺伝子のcDNAインサートとハイブリダイズされた。
ハイブリダイゼーションは、10%硫酸デキストランおよび50%ホルムアルデ ヒドの存在下で、42℃の温度下、12−18時間行う様にされた。その結果で きるオートラジオグラムを、走査レーザー密度計測によって、Lovの変化に関 する分析が行われた。共生培養後、アクチンと誘発されていないCHO−Aで再 度のハイブリダイゼーションを行って、見掛けの誘発をRNA負荷に関して正常 化した(マツクリート等、Proc、 Natl、 Acad、 Sci、 U SA 83 : 6989−6993 (1986) ) 。
それにより、報告された数値は、未処理の5L12.4細胞と比較して、共生培 養内のLov表現が修正倍率だけ増大された数値となっている。
C,20,5(Tea) RNAのノーザン・ブ0’/ト分析総細胞性RNAが 5L12,4.5L12.3およびBa1b/ c マウスからの新鮮な組織標 本から、上に述べたグアニジンイソチオシアネート法で分離された。細胞質ある いは核RNAが上に述べた方法で調製された。ノーザン分析を行うため、10u gのRNAが1%ホルムアルデヒド・アガロース・ゲル内で電気泳動され、ニト ロセルロース膜に移された(マニアテイス等、Mo1ecular C1oni n :A Laborator Manual、 :I−ルド・スプリング・ハ ーバ−・ラボラトリ−・ブス、コールド・スプリング・ハーバ−、ニューヨーク 州および、メインコスおよびワール(1984) Anal Biochem、  13 : 267−284)。
例4 サザーン・プロット分析 A、 一般的手順 総細胞性DNAが細胞、Tリンパ腫およびマウス−ハムスタ一体細胞ハイブリッ ドから分離され、他の種から取り出した組織は提供業者の指定する条件に従って 、図に示されている制限酵素を使って消化された。消化されたDNAの10マイ クログラムを0.7%アガロース・ゲルの各レーンに入れて、電気泳動させ、基 本的には上述(メインコスおよびワールAnal Biochem、’ 13  : 267−28484 (1984) )されているようなナイトラン・サポ ートのプロットされ、ノーザン・プロット分析の場合に述べたのと同様にハイブ リダイズされ、洗浄された。
B、20.5のサザーン・プロット分析20.5のサザーン・プロット分析が、 以下に記す点を除いては上に述べたのと同様に行われた。
総細胞性DNAが5L12.4細胞、マウスおよびハムスターの肝臓および体細 胞ハイブリッドから分離された。ヒヨコおよびヒトの肝臓からのDNAはカリフ ォルニア州バロ・アルドのグロネテック社から入手した。このDNAは提供業者 の指示に従って事例に記載されている制限酵素を使って消化された。消化された DNAの10ugが0.8%アガロース・ゲルの各レーンに与えられ酢酸トリス 緩衝液内で最低48時間電気泳動され。ナイトラン・サポートに移されて、ノー ザン・プロット分析に関して述べられたのと同様にハイブリダイズされ、洗浄さ れた。他の種からのDNAを含んでいるプロットは最初軽く洗い、最後に2XS SPEを用いて室温で洗浄された。
例5 減法強化分画スクリーニングを用いての新規cDNAの分離5L12.4細胞に よって、あるいは5L12.3におけるよりもより多く表現される新規cDNA クローンが特定され、例1−4に述べられているのと同様の方法で分離された。
40,000個の遺伝子組換えggtloファージの最初のスクリーニングでは わずか11の候補が得られただけで、そのうちの8つはサブトラクトされたプロ ーブを用いて再スクリーニングを行った後に回収されたもので、6つの異なった 遺伝子生成物を示しているようである。5つのcDNAクローンの特徴付けが行 われた。 5L12.4および5L12.3細胞からのノーザン・プロットは分 離されたcDNAが第1図に示されているように、5L12.3および5L12 .4細胞において異なって表現されることを示した。対応する5L12.47細 胞に固有のcDNAクローンからの精製されたインサートがラベルされ、ノーザ ン・プロットをプローブするために用いられた。上に述べたように、各レーンは 5L12.4および5L12.3からの総細胞性RNAをl Oug含んでいた 。このプロットはその後、上に述べた放射性物質でラベルしたcDNAインサー トでプローブされた。矢印は18sおよび28 S rRNA転写のそれぞれの 移動度を示している。各レーンに負荷された5L12.3および5L12.4の 量は、例3の場合と同様、CHO−A cDNAでハイブリダイゼイションで判 定して、同じであった。
cDNAクローンの一部は5L12.4細胞(19,5および20.5)だけで 表現されたのに対して、他のもの(19,1,19,2および19.4)は5L 12.4でより多く表現された。cDNAのいくつかはいろいろな転写サイズを 示したが、これはそれらの転写が異なった部位で開始されたり、終了したり、切 断されたりする可能性のあること、あるいはそれらの転写が密接に関連した遺伝 子から誘発される可能性のあることを示唆している。
cDNAクローンは両方の5L12細胞株に存在している低コピー数あるいは単 一コピー遺伝子に対応している。 5L12.3細胞株は12.5および20. 5転写の検出可能な表現を欠いているので、その転写不在を説明するために、我 々はその遺伝子が消去されたのか、あるいは再構成されたのかを調べてみた。5 L12.4および5L12.3細胞、そして正常な肝臓DNAからのゲノム性D NAがEcoRI、 HindIIIあるいはPstlで消化され、cDNAク ローンに対する精製インサート・プローブを用いて分析された。第2図は5L1 2,4固有cDNAクローンのサザーン・プロット・ハイブリダイゼイションを 示している。 AKRマウス肝臓、SLl、2.3゜5L124およびSAKク ローン化Tリンパ腫細胞株、および5L12,3xsL124.5AKXSL1 2,4.5AKXSI、12.3ハイブリツド細胞からのゲノム性DNA(ル− ンあたりloug)がEcoRIを用いて消化され、例4で述べたcDNAクロ ーンでハイブリダイズされたサザーン・プロットにより分析された。(ラムダH indm消化DNAの共生培養により判定された)キロベース・ペアでのフラグ メント・サイズを欄外に示す。1つ、あるいは複数の制限フラグメントがそれら プローブで確認されたが、これは対応する遺伝子がマウス・ゲノムの低コピー数 で両方の細胞株に存在していることを示している。ハイブリダイゼイションの強 度はすべてのレーンでほぼ同じであったが、これは、それらの遺伝子が5L12 ,3細胞DNAに同じ量、そして、4つの異なった酵素(第2図)を用いての検 出可能な配列変更なしに存在していることを示している。したがって、S L  12細胞クローンにおける遺伝子の表現における違いは細胞固有の調整機能に関 係しており、特定の遺伝子の喪失や、検品可能な程度の配列変更とは関係がない 可能性がある。しかしながら、5L12.3細胞における小規模な配列変更ある いは点変異の可能性を完全に否定することはできない。
5L12.4固有cDNAクローンは新規遺伝子を示している。1.9.1゜1 9.2.19.5および20.5cDNAクローンの配列は完全に確認されてい る。公表されている配列との有意の類似性は存在していない。これらの配列は第 3.13.20.21図および第22図に示されている。
19.4配列は部分的に判定されているだけであるが(3,6kbの約2.8K b”) 、DNAデータ・バンクにおいて、転写サイズ、表現レベル、および組 織パターンなどで、配列上の重要な類似性は確認されていない。さらに、cDN Aクローンのいずれも知られているT細胞遺伝子、ARK細胞株で表現されるこ とが知られている腫瘍遺伝子、あるいはレトロウィルス(retroviral )遺伝子と、転写サイズ、あるいは表現の頻度などにおいて対応していない。( 萩原等、J、 Tmmunol、 138 : 2514−2517゜(198 7) ;ヘラクツオード等、Jl遣工徂劇よ工: 3652−3663(198 6) ;レッグレア等、EMBOJ 5 : 3227−3234 (+986 ) ;ムシンスキ等、サイエンス220 : 795−798 (1983)  ;ヤグー等、Ce1l 42 : 81−87 (1985) ;クイント等、 J、Vjrol。
39: 1−10(1981) ;セルトン等、EMBOJ 4 : 1793 −1798(1985) )。
これらによって確認されたcDNAおよび転写のサイズとオープン・リーディン グ・フレーム(ORF4)の長さを表2に示す。
表2 cDNAおよびmRNA転写のサイズ 井J 旦J 皿、j 195 cDNAインサート サ イ ズ” 1.6 3.2 3.9 1.2転 写 8.4 * cDNAインサート・サイズはキロベース(kb)ベアで示されており、D NA配列の分析で判定された。
#kbで示されている転写サイズは、資料および方法に述べられているホルムア ルデヒド・アガロース・ゲル内での183および28SリボゾームRNAへのそ れぞれの遊走によって概略判定された。
の略。そのDNA配列はPRFの位置を特定するためのマイクロジェニー社製ソ フトウェアを用いて調べられた。表中の−は長いORFが発見されなかったこと を示している。19.4の場合のLORF2400bpのデータは、配列情報が 不完全なので、予備的なものである。
++ 19.2のcDNAは450bpより長いORFを2つ含んでいる、再検 査してみれば、実際にはつながっていて、従って920bpである可能性もある 。
転写およびcDNAインサート・サイズの比較に基づいて、我々は、いずれのc DNAも十分な長さではないと判断している。
19.1cDNAの1.6kb DNA配列は長いORFはまったく含んでおら ず、polyA索を有しており、3つの未翻訳配列を示しているらし−い、 1 9.2DNAは長さが3.5kbであるが、比較的短い0RF(471bp’  。
表2)である。19.4cDNAの部分的な配列は2.4kbのORFを示して いる。19.4の場合と同様、19.5cDNAクローンはコード配列を含んで いるようであり、はとんど゛全長にひとしい。
例6 19.5cDNAの分析 19.5cDNAクローンは複数の膜にひろがった蛋白質をコード表現するよう である。 19.5cDNAおよび目標アミノ酸配列を第3A図に示す。配列化 の基本方針を第3b図の示す。cDNA配列は19.5クローンにコーディング 領域全体が存在していることの以下のようないくつかの証拠を提供している。l )目標開始位置の前、そして目標とされる3つの未翻訳領域内部のすべての3つ のリーディング・フレームに停止信号がある;2)目標メチオニン開始部位が最 善の翻訳開始部位(30)のためのCXCAUG G (XはA、C,Gあるい はUのいずれでもあり得る)コザック・コンセンサス配列により取り囲まれてい る;3)終止コードンの3つにポテンシャル・ポリアデニル化信号、ATTAA A (31)に存在している。
誘導されたアミノ酸配列は32,981ドルトンという目el(未修正)蛋白質 サイズを示し、第3A図に星印で示されている2つのポテンシャル・グリコジル 化部位を示している。目標アミノ酸配列はグリコジル化あるいはホスホリル化の いずれか、あるいは両方で変更できる分子量の正確な予測値を提供する。インテ リジエニテイツクス社製ソフトウェア・プログラムを用いて、4つの疎水性で膜 を越えて広がっている可能性のある領域が確認されている(第3A図で下線を付 している)。信号配列は確認されなかった。目標蛋白質の物理的な属性に基づい て考えられる膜関連構造のスケッチを第3C図に示す。目標とされる構造はニコ チン酸アセチルコリン受容体aのなごりであり、蛋白質あるいはDNA配列の類 似性は認められなかった。第3図は19.5cDNAクローンのDNAおよび目 標蛋白質配列を示している。パネルAは二本鎖シーケンシングを用いて得られた cDNA配列および目標アミノ酸配列を示している。DNA配列を組み立て、目 標アミノ酸配列を調製するためにマイクロジェニー(ベックマン)が使用された 。パネルBはサブクローニングのために用いられたcDNA内部の制限部位を示 している。オープン・リーディング・フレームは垂直の点線で示されている。両 方の鎖とも完全なインサートと4つのサブクローンからプラズミドpT7T3の T3およびT7に対するプライマーと1つの合成オリゴヌクレオチド・プライマ ーを用いて配列が決められた。目標蛋白質の物理的な特性を調べ、パネルCに示 されているスケッチを作成するために、pcジーンノソフトウエア・プログラム : 5OAP、 HELIXMEM。
N0VOTNY、 RAOARGO5が用イラれた。
例7 体細胞ハイブリッドにおける19.5遺伝子表現のネガティブ調節 5L12.3および5L12゜4細胞株における19.5に関連した転写の異な った表現について、5L12.3および5L12.4細胞の融合によっでつくら れた体細胞ハイブリッド(SL12,3 X 5L12.4)を用いて調べられ た。これらのハイブリッドは、それらが通常安定した、そしてほぼ四倍体に近い 染色体数を有しているので特に有益である。この5L12.3 X5L12.4 ハイブリツド細胞は79個の染色体を有しており、数年間の期間にわたってどの 染色体も失われていない。第4A図は19.5転写の表現が5L12,3 xS L12,3ハイブリツド細胞で強く抑制されていることを示している。さらに、 5L12.4細胞および他の2つのTリンパ腫細胞株、19.5mRNA (第 4A図)の表現を欠いている5AK8あるいは5L12.1の間の融合も、第4 A図に示すような検出可能な19.5転写を欠いたハイブリッド細胞をもたらす 。
3つの体細胞ハイブリッドのすべてにおける19.5遺伝子表現の量が少ないこ とは、第2S図に示されているようにL12゜3および5L12.4細胞株から のDNAを比較するサザーン・プロットがバンド・サイズや強度において検出可 能な相違を示すことができなかったからであって、遺伝子の喪失や重要な遺伝子 配列変更によるものではない。さらに、5L12.4の親が寄与した遺伝子を含 んでいる染色体がそれらの細胞のほぼ四倍体の染色体と細胞核タイプの安定性を 与えられた3つの独立したハイブリッドにおいて失われた。 19.5cDNA によって示される遺伝子は5L12.4細胞と19.5遺伝子表現を欠いている 3つの異なったT細胞細胞株の間の体細胞融合体においてネガティブに調節され る。これらの結果は、5L12.3によってつくられされた遺伝子の異なった表 現に関与している可能性があることを示唆している。同様に、TCR−ベータお よびCD3−デルタ転写が5L12.3細胞内に存在するネガティブ因子によっ て調節されることが示された。5L12.4細胞との融合パートナ−として3つ の異なったTリンパ腫細胞が用いられ、そして3つの融合のすべてで検出可能な 19.5mRNAを表現することができないので、ネガティブ因子が19.5遺 伝子表現に関与している可能性がある。19.5対立遺伝子の変異、あるいは5 L12.4親細胞からの多少の消失が異なった細胞供給源から誘導されたこれら 3つの融合体において起きる可能性がある。
異なった直線配列の細胞間の体細胞ハイブリッドの研究において、分画に固有な メツセージがもはや蓄積されない表現型消滅という現象が観察されている(ダビ ッドソン、Ann。
Rev、団狙酊ユ亙: 195−218 (1,974) ;ハイマンおよびス トーリングズ、Immuno enet、ics 6 : 447−458 ( 1978) ) 、同じ直線配列の密接に関連した細胞間で形成されたハイブリ ッドにおいて、表現型消滅は頻繁に起きる現象ではない。直線配列状の体細胞ハ イブリッドにおいて抑制が起きる場合、それは通常、特定の、その親細胞株の1 つで表現されるトランスアクトする抑制因子にその原因がめられる。成長ホルモ ン遺伝子の場合、体細胞ハイブリッドにおける抑制は特定のポジティブ・アクチ ベーター、GHF ]上に間接的に行われる例8 SL12.4クロ一ン固有配列の組織分布19.5に対応する遺伝子が普遍的に 表現されるのか、組織に固有な形態で表現されるのかを調べるために、種々のマ ウス組織から取り出されたRNAが調べられた。第4図は体細胞ハイブリッドに おける19.5および20.2cDNAおよび正常マウス組織における19.5 の表現パターンを示している。第1図および例3に述べられたようにノーザン・ プロットが作成された。
パネルAは19.5および20.2の表現に関しての評価が行われた5L12. 3.5L12.4.5AK8および5L12.1親細胞株およびハイブリッド細 胞からのRNAを示している。パネルBは正常組織およびBa1b/ cマウス から取り出された器官からのRNAを示している。転写サイズはアクチン、サイ クロフィリン、18および28SリボゾームRNAによるそれぞれの遊走に基づ いて予測された。1.9.5cDNAは1.7および1.5kbの2つの転写に ハイブリダイズされた。これらのプロットはランダム・プライムした19.5c DNAインサートによりプローブされ、その後、すべてのレーンがほぼ同量のR NAを含んでいることを再確認するためにCHO−A、アクチンおよび/または サイクロフィリン(cp)によってプローブされた。このCPコントロールは、 正常の細胞からのRNAを評価する際、正常の組織に対してはアクチンより信頼 性の高いRNA負荷の測定方法であるように思われた。
プロッティング前のゲルのアクリジン・オレンジ染色により同じように負荷され るように思われた。
少量の19.5mRNAがGALT (バイエル板細胞を含む腸関連リンパ系組 織)、脳、心臓および肺に存在しており、卵巣においては転写は非常に豊富であ る(第4B図)。19.5転写は肝臓や腸では検出できなかったしく第4B図) 、膵臓、來丸、骨髄、休止肺臓リンパ球、あるいはT細胞ミトゲンCon Aに より活性化された肺臓リンパ球においては検出できなかった。
19.5に関連する転写は非分画胸腺リンパ球において検出されないしく第4B 図)、精製CD4 CD8二重陰性胸腺リンパ球においても検出されないが、m RNAは胸腺全体と(第4B図)、ひとつの胸腺上皮細胞株(置)に存在してい る。したがって、胸腺基質細胞が転写を表現する可能性がある。
新規cDNAクローンのいくつがはその表現においてリンパ系直接配列だけに限 定されないmRNAを示している。この知見は正常の脳細胞でも表現されるrh y−1およびCD4などの知られたT細胞機能を有している他の遺伝子(ロンバ ーブ等、Mo1Cell Biol、8 : 2224−2228 (1988 ) 、および、胸腺の皮質上皮細胞にも見いだされるプレB細胞ネオプラズムの ためのマーカーである抗原6C3(アドキンス等、Ann、RevImmuno l、5 : 325−365 (1987) )と類似している。5L12.4 細胞株は受容者である雌の動物(14)の95%の卵巣において顕著な結節外腫 瘍を誘発するので、正常の卵巣および卵巣性悪性腫瘍細胞株における19.5転 写の表現はまぎられしい。対照的に、5L12,3Tリンパ腫細胞は卵巣におい ては定着しない拡散性腫瘍を形成しくマクリード等1.L」(互、工引匹旦しユ 几匹コ5875−882 (1985) ) 、それらは19.5転写を表現し ない。ひとつの知られたヒトB−リンパ腫(バーキッツ)はしばしば卵巣に転移 する(ハリソン、Pr1nci les of Internal Medic ine第11版、ブラウンワルド等による編集、マグロウヒル社、ニューヨーク 州、(1987) ) 、 19.5cDNAは2つの異なったヒト卵巣悪性腫 瘍細胞株にハイブリダイズするので、19.5遺伝子生成物が卵巣に定着して成 長していくことを可能にするその遺伝子を認知したり、あるいはそれを特定の場 所に導く機能がある。19,5mRNAが完全な胸腺リンパ球あるいは分画二重 ネガティブ胸腺リンパ球において見つからないとしても、その遺伝子が胸腺リン パ球の稀なサブセットに表現されたり、あるいは胎仔または成人のリンパ造成中 に一時的にだけ表現される可能性がある。インーサイツ・ハイブリダイゼイショ ン研究で、19.5に関連した転写を表現する胸腺、卵巣および心臓内の細胞の タイプが明らかになるであろう。
表3は5つのcDNAクローンのすべてについて行われた表現研究の結果を要約 して示しである。
以下余白 表3 マウス組織における新規cDNAクローンに間するmRNAの表現SL12.4  ++ +++ + + 胸 腺 + +++ +++ + 肺臓リンパ球 −十−− ConA” + ++ ++ − ノーザン分析で評価された新規cDNAに対して相補性のある転写の対応表現。
+はプローブが示された組織からの転写を検出したことを意味する。すべての場 合で、マウス組織からの転写は5L12−4細胞株からのRNAと共に共遊走し た。−は5L12.4細胞におけるより少なくとも10−20倍以下であること を示している。
5つのCDNAクローンのうちの4つはリンパ系組織で転写を検出する: 19 .1.19.2.19.4および19.5は胸腺で検出可能なレベルに表現され る。 +9.1.19.2および19.5の表現はCon Aで刺激を与えた膵 臓リンパ球内で誘発されている:および19、l、 19.2および19.5は GALTにおいて表現される。いくつかの非リンパ系組織は19.2および19 .5cDNAプローブ(第4B図および表3)にハイブリダイズする転写を含ん でいる。
ヒト卵巣悪性腫瘍細胞株は19,5cDNAに相補性のある配列を表現する。マ ウス卵巣組織では高いレベルの19.5遺伝子の表現が見られたので、卵巣悪性 腫瘍細胞株について、19.5配列が存在するかどうかが調べられた。第2図に 示しであるように、5L12.4細胞と2つの卵巣悪性腫瘍細胞株からの完全な RNAlougのノーザン・プロットがプローブされた。左側のプロットの最終 的な洗浄は、室温で2XSSPEを使って行われ、右側に示されている同じプロ ットがその後で0.2 X 5SPEを用いて室温で行われ、その結果、ヒトの RNAを含んでいるレーンからシグナルが喪失されたが、マウスから取り出され た5L12.4RNAを含んでいるレーンからの喪失は認められなかった。
2つの確立されたヒト細胞株2008およびC0LO316からのRNAがノー ザン分析で評価され、19.5cDNAプローブ(第5図)にハイブリダイズす る1、7kb転写を含んでいることが認められた。中胚葉由来の細胞がその転写 を表現するという知見は、これらの細胞が正常な卵巣の重量の少ないパーセント しか構成していないので、多少、意外な結果である(それらは卵巣の外部表面上 の1つの細胞の厚みの層で見出される)。卵巣基質細胞もこの遺伝子を表現する 。19.5cDNAにハイブリダイズする転写の存在は、19.5mRNAをコ ード表現するものに関連した遺伝子はヒト・ゲノム内で見出されることを示唆し ている。
いるかどうかをアシ力、ハムスター、マウス、およびヒトからのDNAのサザー ン・プロットをプローブすることによって判定するために、PstIで消化され た上に述べた供給源からのDNAlougのサザーン・プロットがランダム・プ ライムされた°゛Pでラベルした19.5cDNAインサートでプローブされた 。これらのプロットは室温でlX5SPHの最終的な厳格さで洗浄された。ヒト DNAを含んでいるレーンは比較的高いバックグランドを有している。レーンの 右側への点はマウス・プローブとグロス−ハイブリダイズする再現可能な程度に 検出できるDNAフラグメントを示している。これらのDNAのすべては単純な パターンのハイブリダイゼイションを示し、このことはこの遺伝子が哺乳動物種 に保持されていることを示唆している(第6図)。第6図に示されているように 、ラット、ウサギ、キツネザル、およびオラヌータンDNAでも検出されている 。
このように、19,5cDNAクローンで示される遺伝子は哺乳動物の間に保持 されているようである。この遺伝子が保持されていることは、それが重要である が、まだ確認されていない機能を有しているかもしれないことを示唆している。
新規cDNAプローブで認められる転写の豊富さは直接には確認されていない。
しかし、ノーザン・プロットでの比較で、19.2と19.5は比較的豊富では なく、コピー数はTCR−ベータmRNAの場合より少ない。5L12.4細胞 からクローンされた遺伝子のうちの4つは胸腺で検出可能な程度に表現され、活 性は正常のリンパ系組織および恐らくT細胞個体発生において調節される遺伝子 の分離にとって有益である。
本レポートで述べられている新規DNAクローンのいずれもこれまでに明らかに されている遺伝子配列に対応するものではない。PCジーン社のプログラムであ るプロサイト(インテリジェニティック)が、ポテンシャル・ヌクレオチドある いはDNA結合部位、亜鉛フィンガー、リューシン・ジッパ−1酵素活性部位、 細胞標的部位、あるいは構造蛋白質、の受容体、サイトカイン、および成長因子 の特徴について、19.2゜19.4.19.5および20,5cDNAで示さ れる目標蛋白質を調べるために用いられた。現在の時点で、我々はこれらが潜在 的にどのような機能を果たす可能性があるかについての何の手掛かりももってい ない。
以下の理由から、これらの遺伝子が分画という事態に関与する生成物をコード表 現している可能性がある。l)これらの遺伝子が胸腺リンパ腫変異の別の段階を 示しているらしい5L12.3および5L12.4細胞クローンに異なって表現 される;2)これらの遺伝子はそれらの表現において繊維特異性を示す;3)  19.1.19.2および19.4遺伝子表現はT細胞ミトゲンCon−Aによ り活性化された牌臓T細胞に誘発される。 4) 20.5および19.5関連 遺伝子が初期の胚で段階に固有な方法で表現される。
それら一連の新規cDNAクローンが興味深い表現パターンおよび調節を示す遺 伝子によりコード表現される。これらは細胞分画、Tリンパ腫の特定の場所への 誘導、そして形質転換されたT細胞プロジェニターの腫瘍原性特性を規制する分 子メカニズムを調べる上で有益であろう。これらのcDNAクローンはまた、こ れら新規T細胞遺伝子を持っている細胞の場所を特定するためのプローブとして 、そして、かなり純粋な新規T細胞蛋白質の供給源としても有益である。
例9 Lovに対するポリクローナル抗体の生産UC5Dコア社で、14アミノ酸オリ ゴペプチドが合成された。
構成されたペプチドの配列はに−G*−H−A−D−R−E−Q−E−8−E− E−E−Vである。この配列はLovの目標とされるC−終止末端の最後の13 のアミノ酸を示しており、それに担体への接合の指標として使用するための“C グリシンが追加されている。このペプチド2mgが30分をかけてグルタルアル デヒドをゆっくり加えて、4mgの担体蛋白質キーホール・リンプツト・ヘモチ アニン(KLH)にリンクされた。次に1品夜、PBSに対して透析された。免 疫化の前に2匹の雌ニューシーラント・ホワイト・ウサギ(ホルバーツー年齢6 カ月)から10−の血清が得られた。次に、この動物に対してフロイント・コン プリート・アジュバントの存在下で接合ペプチドが注射された。フロイント・イ ンコンプリート・アジュバントでの0.2+ngペプチドの次のブースター注射 は4週間後に行われたELISAによる抗Lov抗体を生産するするために血清 のウィークリー・テスト・ブリードの評価が行われた。
例1O Lov抗血清の分析 Lovを認識する抗体の存在がFLISAアッセイによってモニターされた。オ リゴペプチドおよびKLHがウェル内のELISA板上で間接乾燥された。次に 、その抗血清の種々の希釈液が加えられ、2時間、反応のために放置された。プ ロット内に洗浄した後、サンプルは二次抗体(西洋ワサビパーオキシダーゼにリ ンクされたヤギ抗−ウサギIgG (Fc) )の1 : 1000希釈液内で 2時間培養された。西洋ワサビパーオキシダーゼは基質としてのHlolおよび OPDを利用して比色反応の触媒としての役割を果す。その結果は自動ELIS Aリーダーで分析された。抗体の力価が定常状態に達した時、これらのウサギは 貧血状態を呈した。細胞成分を用いたELISAアッセイで、細胞は音波処理に よって溶解させた。45000gで30分、溶解物を遠心分離することによって 膜分画が分離された。次に、膜とシトソリツク分画はELISAウェルで一晶夜 乾燥された。
例11 蛍光抗体分析 10“共生培養あるいは未処理SL]、2.4細胞を20ulの緩衝液A(5% 胎児性仔ウシ血清および0.02%アジ化ナトリウムを含むPBS )内に懸濁 させた。次にLovに対する抗血清を1 : 100希釈液50u1を加えて、 氷上で30分間培養させた。緩衝液A中で3回洗浄した後、それらの細胞を氷上 で、ヤギ抗ウサギIgG(1:1OOOに希釈)でさらに30分間培養した。相 互作用の特殊性についてのテストが行われた実験においては、その抗血清をそれ らの細胞に加える前に、等しい体積の1mh/mQオリゴペプチド溶液がその抗 血清に加えられた。これらの細胞は488nmの間隔でレーザー光を発している サイトフルオグラフ50H蛍光活性化細胞ポーター上で分析された。死んだ細胞 はヨウ化プロビジウムで染色して排除した。5000個の細胞を分析して、結果 をヒストグラムで表した。
例12 Lov蛋白質の免疫沈澱反応 バーロウおよびレインがIn Antibodies : A Laborat or Manualコールド・スプリング・ハーバ−・プレス、ニューヨーク州 (+988)で述べた手順に従って、免疫沈降反応に関する研究が行われた。細 胞はメチオニンを含んでいない媒体内で4時間、”Sメチオニンでラベルされた 。次にこれらの細胞はRIPAあるいはNP40溶解緩衝液内で溶解された。溶 解物は予め免疫された血清50ulを追加して氷上で1時間培養し、交差反応性 蛋白質がブドウ球菌アウレアス(カルバイオケム社提供)を用いて免疫沈降され た。次に、5ulの免疫血清が加えられ、1時間の培養後、免疫沈降された。次 に、素材を洗浄して、5DS−FAGEゲル上で電気泳動させた。エンハンスメ ント後、当業者には公知の方法でオートラジオグラフィックのためにフィルムに 露出させた。
例13 Lovの遺伝子マツピング 中国ハムスタースフ92体細胞ハイブリッドの作成および特徴付けについてはこ れまでにも述べられている(コザック、(1983) J Vi工劇よ弧: 3 00−303)。これらのハイブリッドが1.0kb19.5cDNAインサー トでプローブされた時に各種に特有のパターンを与える酵素であるPstlで完 全に消化された。消化されたDNAは25ボルトで72時間、0.8%ガロース ・ゲル上で電気泳動させ、ナイトラン膜上に移した。次に、上の操作で得られた プロットがSapラベル化Lov cDNAでプローブされ、コダックXARフ ィルムに露出された。Lovにハイブリダイズしているマウス染色体成分の証拠 がいくつかの細胞株で観察され、その結果をコンピュータで分析して、Lovマ ウス染色体局在化のための最善の候補が判定された。
例14 胸腺上皮単層上での共生培養後、Lov表現が5L12.4細胞で誘発される。
置 (グリムチャー等、ジ眠」旦 J−ハ1旦ルIユ、二:1.−1.1(19 83) )およびTEPI (ビアズリ−およびヘイズNat1.Acad。
Sci、 USA 80 : 6005−6009 (+983) )は5L1 2.4細胞で安定したCD4およびCD8遺伝子を誘発できる2つの不死性胸腺 上皮細胞株である。置あるいはTEPI単層のいずれかの上で3日間、5L12 .4細胞が共生培養された後、LovmのmRNAが評価された。第7図のノー ザン・プロットは、両方のLovの転写(1,7゜1.5kb)が共生培養に対 応して誘発されることを示している。
両方の胸腺上皮細胞株はこの誘発を導き出すことができるが、置共生培養後のL ovの表現はTEPIと比較して、その強度が高い(表4)。示されている数値 は密度計測による分析後の5つの個別の実験の平均値および標準誤差を示してい る。さらに、5L12.4細胞におけるLov mRNAのレベルの増大は刺激 を与える胸腺単層後にも継続している。非胸腺付着細胞(MME :乳房上皮細 胞株およびAKRI−2B:線維芽細胞株)は5L12.4細胞におけるLov 表現には誘発的影響を及ぼさない。LovcDNAの5′および3′領域に対応 する100bpフラグメントがノーザンをプローブするために用いられた。両方 のプローブともLovの両方の転写を認識する。
表4 置およびTEPI共生培養後の遺伝子表現の比較1丞工CC置 ’ cc TE PI CD4 1.1±0.1 1.9±0.3CD8 1.5±0.1 2.8±0 .5TcR−cc 2.0±0.1 1.5±0.2Lov 3.7±0.3  2.9±0.2CD4 、 CD8 、 TCR−cc、 19.5 (Lov )で次々にハイブリダイズされ、最後にアクチン/CHO−Aでハイブリダイズ されたノーザン・プロットから得られたオートラジオグラムがレーザー密度計測 でスキャンされた。この密度計測シグナルが負荷されたRNAの量のコントロー ルとしてアクチン/CHO−Aを用いて正常化された。報告された数値は誘発さ れたmRNAのハイブリダイゼイション強度を誘発されていないmR,NAで割 った比率を示している(したがって、それらの数値は未処理5L12.4細胞で 検出されたものの平均倍増加士mRN^蓄積の平均値の標準誤差を示している) 。
胸腺上皮単層上でこれらの細胞を共生培養すると、5L12.4細胞の変異が引 き起こされるようである。本明細書においては、新規遺伝子、 Lovもこの措 置後に5L12.4内で誘発されるらしいことを示した。Lovの配列はコード 表現された目標蛋白質が複数の膜にまたがった領域を複数含んでいる表層分子で ある可能性を示唆している。メツセージ(3−4倍の誘発)とLovの表面表現 における両方の増大が胸腺上皮上での共生培養後に観察された。 Lov表現の これらの誘発も、共生培養後に分離されたクローンが組織培養の数か月後にも高 いLov表現を維持したという点で、安定しているように思われる。
この誘発の規模は比較的小さいので、その誘発が転写によるものか、転写後のメ カニズムによるものかを判定するための核ランーオン実験を行うことはできない 。
Lov mRNAは1.7kbおよび1.5kbの2つの転写サイズで構成され ている。これらの転写の両方とも5L12.4細胞の共生培養胸腺上皮単層上に 同じように誘発される。さらに、両方の転写はLov cDNAからの5′およ び3′プローブによって認識される。
これらの転写が別の開始部位、切断、ポリアデニル化シグナル、あるいはその他 のメカニズムから発生するのかどうかは分かっていない。しかしながら、Lov を表現するテストされた別の成人組織(例えば、卵巣、心臓)においては大きな 方の転写だけが観察される。さらに、発達中のマウスの胚の内部には、15日目 までに両方の転写の表現から大きな方の転写だけを表現する傾向へのずれが存在 しているようである。
1.7kb転写だけが成長した動物における機能性蛋白質に関するコード表現を 行っている可能性がある。
例15 SL12.4細胞膜上でLov蛋白質が検出可能Lovに対する抗体は5L12 .4細胞の細胞質膜に見出されるエピトープを認識する。Lovの最後の13の アミノ酸に対するポリクローナル抗体がウサギで、抗原としての合成ペプチドに 対して形成された。これらの抗体は5L12.4細胞の細胞質膜にむすびついて いる抗原を認識する。第8図はLovの表面表現に関する5L12.4細胞の蛍 光抗体分析を示している。これらのヒストグラムは免疫血清で染色された5L1 2.4細胞の蛍光と免疫前血清で染色した5L12.4細胞との対比を示してい る。透析可能にされた細胞を顕微鏡で調べることにより、抗体の結合が細胞質膜 上でだけ観察され、細胞質は染色しなかった。また、姉妹リンパ腫細胞クローン 、5L12.3の蛍光性データも示されている。5L12.3細胞はLovに対 してmRNAは表現せず、その細胞表面でLov表現はまったく示さなかった。
この抗原に対する免疫血清抗体の結合も免疫性オリゴペプチドを適量加えること で阻止された(第9図)が、不適切なオリゴペプチドでは阻止されなかった。5 L12.4細胞の、サイトソリツク(cytosolic)分画ではなく膜調製 もELISAで評価した場合、Lov蛋白質を示した。
Lovのカルボキシ端末に対応する合成オリゴペプチドに対して形成される抗体 は、5L12.4細胞の表面に見出されるエピトープをI8識する。関連した細 胞株でLov mRN、Aを表現しない5L12.3は蛍光で評価した場合、蛋 白質も表現しない。Lov蛋白質の免疫沈降に関する研究が行われたが、免疫前 血清との異常な量の特定されない相互作用が行われるようである。
Lov蛋白質が恐らくそれほど豊富でない(これらの細胞におけるmRNAの基 準表現に対比した場合)という事実は、これらの実験をさらに複雑にした。それ にも拘らず、5L12.4およびF6(高いLovレベルを表現している細胞ク ローン)内の”35S−メチオニン・ラベリング上に3つの固有の帯が存在して いるが、5L12.3細胞においては存在していないようである。これら3つの 帯もその特殊なオリゴペプチドを競合的に追加した後に消失する。32kdb帯 はLovバックボーンの目標分子量と関係している。22kd帯は切断による生 成物である可能性があり、一方、50kd帯はLovの解糖形態を示している可 能性がある。
例16 Lovの表面表現の誘発 Lovの表面レベルでの表現も胸腺上皮単層上での3日間の共生培養後に誘発さ れた。FAC5分析が5L12.4細胞上で3日間の共生培養後に行われた。第 1O図は胸腺上皮の処理後、5L12.4上での検出可能な量のLov蛋白質が 誘発されることと示している。このヒストグラムは刺激を与えた5L12.4と 刺激を与えていない5L12.4での抗血清とブレブリードとの対比を示してい る。置上で共生培養された5L12.4細胞を未処理の5L12.4細胞を比較 した場合の結果も示されている(下側のグラフ)。これらのグラフは対数スケー ルを用いて表示されている。TEP I細胞もLov誘発に関して同様の反応を 示した。
胸腺上皮単層上で予め共生培養された細胞クローンはより高いレベルの19.5 の基底表現を示した。ある種の細胞においては、共生培養はより高いレベルのL ovをもたらした。置あるいはTEP r上での共生培養後、多数の細胞クロー ンが5L12.4から分離された。クローニングは限界希釈法で行われた。例え ば、F6は置単層上で3日間共生培養された後の5L12,4細胞集団から誘導 クローニングされた細胞である。これらの細胞クローンは数か月間、刺激性の胸 腺上皮を含まない正常の媒体で培養された。F6上の表面蛋白質に関するRNA およびFACS分析の両方のノーザン分析とも、この細胞クローンが親の5L1 2.4細胞におけるより、安定的により高いレベルのLov表現を有しているこ とを示している。分離、テストされた他の細胞クローンはいろいろな量のLov 表現を示した。胸腺上皮単層上でのこれらの細胞クローンをさらに共生培養して もLov表現は有意に増大しない。
例17 染色体の局在 ゲノム性DNAが特定のセットのマウス染色体を含んでいるハムスター−マウス 体細胞性ハイブリッド細胞から調製された。PstI制限酵素消化の制限パター ンはハムスターとマウスとの間では違っていた(第12図、レーン1,2)。L ovでプローブしたこれらのハイブリッド細胞のサザーン・プロットは少数のハ イブリッドだけがマウス・パターンのハイブリダイゼーションを含んでいること を示した(第12図)。多数のこうしたハイブリッド細胞株に関するサザーン分 析に基づいて、最良の相関関係が得られたのはマウス染色体16に関してであっ た。サンプル番号77はそのマウス由来成分が染色体16であるハイブリッド細 胞である。表5は染色体I6がテストされたハイブリッド細胞中でLovに関す る不一致度が一番受ないことを示している。Lov遺伝子はさらに染色体16の 特定の領域にマツプされた。
以下余白 表5 特定のマウス染色体と一連のマウス−ハムスタ一体細胞ハイブリッドにおける■ 、ov遺伝子の存在との間の一致度の分析 1 5 6 4 3 38.9 2 6 6 1 4 29.4 3 2 7 4 1 35.7 4 5 9 3 1 22.2 5 2 9 7 0 38.9 6 6 5 1 5 35゜3 7 5 4 2 5 43.8 8 4 8 5 2 36.8 9 5 9 4 1 26.3 10 1 9 8 .0 44,4 11 0 10 8 0 44.4 +2 2 4 2 4 50.0 13 6 7 .3 3 31,6 14 3 9 4 1 29.4 +、7 5 4 1 4 35゜7 18 5 6 2 3 31.2 19 4 5 3 5 47、I X 6 8 3 2 26.3 マウス−ハムスタ一体細胞ハイブリッドを用いての19.5(Lov)遺伝子の マツピング。記号は20.5cDNAプローブによるハイブリダイゼーションで 検出された左側のカラムの番号で示される特定のマウス染色体の存在(/+)あ るいは不在(/−)に関連してのマウスLov制限フラグメントの存在(+/) あるいは不在(−/)を示している。不一致観察の回数は十/−および−/十の 観察回数の合計である。*これらのいずれのハイブリッドも核型化されていなか った。それらは別の標識に関連してタイプ分けされたもので、したがって、例外 が染色体の間違った配列であるということはあり得る。
例18 Lov蛋白質の免疫沈降反応 Lov蛋白質のサイズを決定するために、免疫沈降反応に関する研究が行われた 。新しく合成された総蛋白質をラベルするための°°Sと表面蛋白質を合成する ための“1°■の両方が用いられた。両方のウサギからの前免疫血清は特定され ない横縞を有していた。溶解物には多数の横縞が存在しているが、少数の特定の 横縞が確認されている。分子量が22および32kdに対応する2つの横縞は− Sメチオニンにラベルされた5L12.4細胞に固有のようである。前免疫血清 、あるいは5L12.3細胞からつくられた溶解物のいずれにも、両方の横縞共 存在しなかった。しかしながらこれら2つの横縞は”181でラベルされた細胞 においては認められないが、その代わりに、50kdの横縞が5L12.4に認 められるが、5L12.3細胞では認められなかった。バックグランドの横縞の 量を減らすことが試みられた(例えば、IgG分画の硫酸アンモニウム沈降、合 成オリゴペプチドと結合したセファロース・カラム上での抗体の親和性純化、L ovを高度に表現する因子としてのクローンF6の使用)が、観察された非特定 相互作用を減らすことには成功しなかった。
したがって、Lov遺伝子はその細胞表面上で表現される蛋白質をコード表現す る。さらに、LovのレベルはこれらTリンパ腫細胞株の成熟段階と関係してい るように思われる。胸腺上皮での共生培養後、5L12.4細胞が二重ポジティ ブ(:D + CDs十表現型にシフトされるばかりでなく、これらの細胞にお けるLov表現もかなり増大する。Lovはいずれの既知の配列とも類似性を持 たない新規のcDNAおよび蛋白質である。Thy−1およびT−200などの 多くの他のT細胞標識は、それらの機能が確認される前に開示されている。Lo vはTリンパ腫細胞株から分離されたのであるが、他の細胞タイプもこの遺伝子 を表現することができる。Lovの表現パターンが考えられる機能を理解するた めの手掛かりを与えてくれるかもしれない。
最も高いレベルのLov mRNAを表現している組織は胸腺、腸関連リンパ系 組織(GALT) 、および卵巣である。最初の2つの座はリンパ球が見出され る正常の部位である。5L12.4が同系マウスに注入された際、卵巣が腫瘍が 形成される最初の場所であることは興味深い。さらに、卵巣°は広範なリンパ組 織を含んでいる。バイエル板とも呼ばれるGALT細胞は高内皮管(endot helial vessel)に制限されており、それらを通過するためには抗 原Mel−14が必要である。5L12.4細胞はその細胞表面にMal−14 を表現し、したがって、小腸のこれら特殊化された場所に存在する可能性がある 。Lovは細胞の表面に表現されるので、それはリンパ球を特定の場所に向かわ せる上で一定の役割を果す可能性がある。Lovはリンパ球および胸腺リンパ球 群全体で検昌されなかった。おそらく、それはT細胞の少数の特定サブセットで は表現されず、主要な特性ではないのである。5L12.4は数値的にはあまり 頻繁には現れない正常胸膀リンパ球を示しているのかもしれない。
例】9 cDNAライブラリーの構成と20.5遺伝子のスクリーニング他のクローンと 同様、cDNAライブライ−の構成と20.5遺伝子のためのスクリーニング、 例1−4までの場合と同様に行われた。cDNAインサートは制限酵素Hind IIlおよびBgIIIで消化することによってラムダDNAから取り除かれ、 プラグミド・ベクターpT7/T3 (ベテスダ・リサーチ・ラボラトリーズ社 )にサブクローンされた。
例20 20.5あるいはTeaのDNA配列分析制限エンドヌクレアーゼ・マツプが判 定され、フラグメントがpT7T3にサブクローンされ、そのプラグミドを塩化 セシウム上で精製して、シーケナーゼ試薬(U、 S、バイオケミカル社、オハ イオ州クリーブランド)を用いて二本鎖ジデオキシ配列法によって直接、配列決 定された。この配列の一部は宿主プラグミドに対するプライマーを用いて判定さ れ、cDNAに対してのUC5Dキャンサー・センター・コア・モルキュラー・ バイオロジーの施設で作成された。両方のDNA鎖ともその全体の配列が決定さ れ、すべての配列は繰り返し行われた少なくとも2つの相互作用において判定さ れた。重複配列情報を集めてそのDNA配列の最初の分析を行うためにマイクロ ジェニー社のコンピュータ・プログラムが用いられた。
例21 20.5の遺伝子マツピング チャイニーズ・ハムスター×マウス体細胞ハイブリッドの作成と特徴付けはこれ までにもホーガン等によって、J Virol且: 1055−1056 (1 988)に述べられている。NFS/N系マウスがミツドランド州ベテスダのN IH1天然資源部から入手された。Mus musculus musculu sマウスは最初、デンマーク、スキーヴエで捕らえられた、に、ポーター博士( NCI、 NIH1契約番号No、 l −CB 2−5584 )がミツドラ ンド州ロックビルのへイゼルトン・ラボラトリーズで飼育していたマウスから取 り出された実験コロニーから入手された。実験動物をつくりだすために、ハイブ リッドNFS/N XX、tx、成長雌個体(複数)は阿8m、成長雄成長上戻 し交配された。DNAはマウスの肝臓から抽出され、Sac IおよびBam旧 で消化され、0.4%アガロース・ゲル内で、48時間、24ボルトで電気泳動 され、ナイロン膜(ハイボンドN+、アマージャム社)に移された。膜はじ°P ]ラベルした20.5cDANおよび染色体8上に存在しているDNAポリメラ ーゼB遺伝子を示している438bl)プローブでハーイブリダイズされた(マ ツダブライド等、イン・プレス)。
膜は上に述べたのと同様に洗浄、プローブされた。同じマウスからの腎臓サンプ ルが澱粉ゲルでの電気泳動後、組織化学的染色によって標RGr−1とEs−1 の遺伝に関してタイプ分けされた(リソンおよびホプキンス、”Handboo k of EnzymeElectrophoresis in Human  Genetics、” 、ノース・ホーランド・パブリッシング社、アムステル ダム(1976) )。
例22 20、5cDNAクローンの分離とDNA配列ggtlO(16,24) テ( 7)40.OOO+7)メンバー 1’構成され6SL12.4cDNAライブ ラリーを5L12.3mRNAに対して減法処理した5L12.4cDNAを使 って、そして、同時に上に述べたような総5L12.3cDNAを使って複製フ ィルター(duplicate filters)でスクリーニングした。この スクリーニング法は20.5遺伝子の特徴付けを行うために用いられた。下に述 べるような表現特性に基づいて、このcDNAクローンはTea (ICell  earlyactivation gene : T細胞早期活性化遺伝子) と命名された。
このクローンからのインサートが両方の鎖で二本鎖法によって配列決定され、そ の配列が第13図に示されている。 cDNAインサートは長さが2397塩基 対で、塩基対409から始まって1769まで伸びている単−長オープン・リー ディング・フレームを含んでいる。cDNAはポリアデニル化シグナル配列、あ るいはポリAトラクトを含んでいない。20.5cDNA配列は複数の膜に広が った蛋白質を予報する。第13図は49.57キロドルトン(未修正)を有する 目標とされる蛋白質の目標453アミノ酸配列を示している。このcDNA配列 は、目標N端末メチオニン・コードンが最善の翻訳開始部位であるコザック・コ ンセンサス配列(GXCAUG G :ここでXはA、U、GあるいはCのいず れか)に取り巻かれており、目標とされる5′および3′未翻訳領域は3つのリ ーディング・フレームのすべてに複数のストップ・コードンを含んでいるので、 コーディング領域全体を含んでいるようである。目標蛋白質の物理的属性はマイ クロジェニー社およびPC遺伝子プログラムを用いて分析された。第13図に3 つのN−グリコシレージョンの可能性がある部位を星印で示しである。この目標 蛋白質は9つの高度の親水性を有する領域(第13図の下線部分)を持っており ;そのうちの7つはインテリジェネティックス社のソフトウェア・プログラム5 OAP、 HELIXMEM、 N0VOTNYおよびRAOARGOSを用い た分析に基づいて、膜を横断してひろがっている領域の特性を有していることが 分かっている。
このTea遺伝子はTリンパ腫細胞と正常の膵臓から採取したTリンパ系細胞と では異なって表現される。20.5cDNAクローンで認識される転写の表現に ついての評価が行われた。第14図はTea遺伝子表現を示す。コーディング領 域全体を含んでいる精製インサートはランダム・プライミングで°゛Pを使って ラベルされ、内部で各レーンが5L12.4細胞、5L12.3細胞、上に述べ た細胞株あるいは正常Ba1b/ cマウスからの組織からの総細胞性RNA  (あるいは、パネルBの場合、細胞質あるいは核RNA )を10ug含んでい るノーザン・プロットをプローブするために用いられた。ノーザン・プロットの オートラジオグラムをパネルA−Dに示す。パネルAは5L12.3細胞株内の Tea mRNAと5L12.4細胞株内でのそれとの比較を示している。
パネルBは5L12.4細胞からの総細胞性、細胞質性および核RNAにおける Tea mRNA表現を示している。パネルCは文中に述べられている一連の細 胞株におけるTea m、RNA表現を示しており、パネルDはBa1b/ c マウスからの上に述べた正常組織から採取したRNAを含んでいる(GALTは 腸に関連したリンパ系組織である)、各パネルに示されているキロベース(kb )での転写のサイズはBRL標識および18および28S内因性リボゾームRN Aに対するそれぞれの遊走によって推定された。アクリジン・オレンジ染色およ び°゛PPサイクロフイリンyc)および/または°” P−Cho−Aラベル cDNAとのハイブリダイゼーションによって、すべてのレーンにおけるRNA の負荷と転写に関する評価が行われた。
20.5cDNAプローブは5L12.4細胞内には存在しているが、Tリンパ 腫細胞には存在していない4kbおよび7kb程度の2つの転写を認識した(第 14A図)。それらが両方とも細胞質内で見出される成熟した転写であるかどう か、あるいはその大きな方のRNAが核前駆体であるかどうかを調べるために、 これらの2つの転写の細胞内での位置について調べられた。両方の転写とも細胞 質内に見出されるので、それらはいずれも十分に処理されたRNAであるように 思われる(第14B図)。
別の転写過程、転写の別の切断、あるいは別のポリアデニル化シグナルなどから 発生するのかもしれない。成長した細胞質性転写(7およびkb)はcDNAク ローンより大きい。したがって、cDNAは、それはコーディング領域全体を含 んでいるように思われるが、十分な長さではない。両方の転写とも、cDNAク ローンの5′(ヌクレオチド1から380)および3′(ヌクレオチド2005 から2394 )領域につくられたプローブで検出され、これはcDNAが2つ の異なった転写を結びつけたクローニング・アーチアクトではないことを示して いる。2つの成熟したRNAに加えて、いくつかのより大きな、それ程たくさん はない転写が、切断されていない、あるいは部分的に切断された核前駆体である 可能性がある核および総細胞性RNA標本に存在している(第14B図)。胚( F9およびPC4)、乳腺上皮(MME)および神経(ATt20)由来のいく つかのマウス細胞株が、Tea RNAに関して調べられた。これらの細胞株の いずれも検出可能なレベルのTea RNAを表現しない。それとは対照的に、 胸腺上皮(TEPI)および腺維芽細胞(3T3゜MEF)由来の細胞株はTe a mRNAを含んでいるが、それは5L12.4Tリンパ腫細胞における方が はるかに豊富である(第14C図)。
正常の組織およびリンパ系直線配列の細胞がTea遺伝子を表現するかどうかを 調べるために、マウス組織mRNAからつくられたノーザン・プロットが調べら れた。胸腺、休止膵臓、できるレベルのTea mRNAを含んでいない(第1 4D図)。しかしながら、Tea転写はT細胞ミトゲン・コンカナバリンA(C onA、第14D図)で活性化された正常の膵臓細胞では誘発された。ConA は通常外来性抗原を適切に与えると、通常、細胞クローンに特有の方法で肺臓T 細胞の活性化を模擬的に行うために用いられる。肝臓はテストされたうちではか なりの量のTea mRNAを表現した唯一の非リンパ系組織である。Tea転 写は腸、胃、卵巣(第14D図)、脳、心臓、肺、腎臓、膵臓、あるいは事大で は誘発された。したがって、Tea遺伝子表現は活性化膵臓細胞、胸腺上皮細胞 、Tリンパ腫細胞および肝臓など、少数の細胞タイプに限定されている。
例23 Tea mRNAの誘発 Tea mRNAの誘発をさらに調べるために、ConAが膵臓リンパ球に加え られてから6,24.48および72時間後に作成された。
第15図は活性化膵臓リンパ球内におけるTea遺伝子の作用メカニズムを示し ている。T細胞ミトゲンCon Aによる活性化後の上に述べた時間に取り出さ れた休止および活性化膵臓細胞からのRNAのノーザン分析が行われた。第15 図、パネルAは72時間の時、パネルBはRNAと、各レーンで負荷されたn+ RN^の対応する量のを示すためにコントロール・プロブ・サイクロフィリン( Cyc)と共に示している。Cyc飄RNAの場合と違って、rRNAはアクリ ジン・オレンジ染色で評価した場合と同様、各レインにおいて同様であった。こ れらTea転写は休止膵臓リンパ腫においては検出されないが、6時間後には検 出可能になり、約48時間後にピークに達する。アクリジン染色で評価を行った 場合、各レーンにおけるRANの総量は同じであったが(10ug) 、それぞ れにおけるリボゾーム対mRNAの比率は、総転写10ugあたりのアクチン、 CHO−Aおよびサイクロフィリン転写が増加するので、T細胞活性化の過程で 変化するらしい(第15図)。しかしながら、T細胞活性化中にこれらのコント ロールに対するTea遺伝子表現が誘発されることは明らかである。
例24 20.5DNAおよびアミノ酸配列のマウスのエコトロピックレトロウィルス( ecotropic retroviral)受容体との類似性バイオネット社 のデータ・ベースを用いての類似性に関する研究の結果、20.5cDNAと前 に述べた他のDNA配列との間に有意の配列類似性は認められなかった。しかし ながら、この配列をマウスエコトロビッグ レトロウィルスcDNAクローン( ERR) の最近の報告(アルブリットン等、Ce1l 57.659−666  (1989) )と比較して、配列上のかなりの同一性が認められた。エコト ロピック レトロウィルス受容体をコード表現する遺伝子はRec−1と命名さ れた。第16図は20.5cDNA配列のERRcDNA配列との比較を示して いる。第16図は20.5およびERRcDNA配列の列を示している。第16 図、パネルAで、配列分析の対象に含まれているERRおよび20.ccDNA 配列の領域は垂直線で示しである。各cDNAのオープン・リーディング・フレ ームが示されている。パネルBに、20.5のcDNA配列全体が各線の対の上 側の直線に示されており、ERR(bp2425)のcDNA配列は最初の40 0の塩基対を欠いており、多対の底部に示されている。水平線は配列の同一性の 位置を示している。
マイクロジェニー社のソフトウェアを用いて、最も類似性の高い配列の直線配列 ができたgapsとの比較が行われた。明らかに重複しているcDNAの領域に ついてだけ、同一性がその%で示されている。なお、20.5cDNAは3′端 末でずっと長く、ERRcDNAは5′端末でずっと長い。
2つのcDNAのスケッチ(第16図)はERRcDNAが5′端末でより長く 、20.5cDNA配列は3′端末でずっと長いこと、そして2つのcDNAの 全体的な長さはほぼ同じであることを示している。それぞれのコーディング領域 は各cDNAクローンのクロスハツチされた部分で示されている。このDNA直 線配列は20゜5の重複した領域(bp 1から2047)間の全体的なりNA 配列特性を示しており、ERRcDNA (bp400から2425)は59% 、そして20.5cDNAのひとつの領域(bploll−1088)の同一性 が80%である。20.5cDNA配列の5′−兆≦L二rlユ仁久領域(bP  1がら410まで)はERRcDNA配列の重複する5′コーデイング領域と 68%の配列同一性を有しており、このことはこれ2つの遺伝子が共通の配列か ら誘導されたことを示している。
目標されたTea蛋白質は形質導入された蛋白質、イオン・チャンネル、および 糖トランスポーターはどの複数の膜にまたがった領域を有する他の蛋白質との構 造的類似性を有している。しかしながら、ERRcDNAから誘導されたERR 目標蛋白質を例外として、これらの遺伝子群との有意な配列類似性、あるいは他 の知られている蛋白質配列との有意の類似性は認められなかった。ERR蛋白質 を有するTea目標蛋白質のひとつの直列配列はアミノ酸配列がかなり同一の2 つの領域を示す(第17図)。第17図はマウスエコトロピック レトロウィル ス受容体を有するTea目標配列の直線配列を示している。パネルAで、ライン ・スケッチは比較された2つの蛋白質生成物の領域を示しており; Tea蛋白 質はアミノ酸1−404の範囲で広がっており、ERR蛋白質はアミノ酸204 −603の範囲で存在している。パネルBで、2つの目標蛋白質の直線配列が、 上側は20,5 cDNA、下側はERRcDNAによって予報されるアミノ酸 配列を示している。括弧はかなりのアミノ酸同一性を示す2つの領域の境界線を 示しており、領域1は192アミノ酸に関して81.3%の同一性があり、領域 2は79アミノ酸に対して51.95の同一性を示す。括弧で示される領域lは 81%の配列同一性および193アミノ酸に対して91%の類似性を有している 。アミノ酸の保存性に関する違い(トリトル・R,Of Urハ」耐愈りユエエ 」咀り四」匣」L工凪Lll工血匹蝋1吐凹acid se uencesエユ ニバーシティ・サイエンス・ブック、カリフォルニア州ミル・バーレイ1986 )は2つの点で示されており、アミノ酸の同一性はそれら2つの間の長めの点線 で示されている。
Tea予報遺伝子生成物とは対照的に、このERR蛋白質はより大きく、13− 14目標膜横断拡大領域を有している。さらに、それはより短い親水性カルボキ シ−末端および同様の長さのアミノ−末端を有している。これらの蛋白質の予報 カルボキシ−およびアミノ−末端が配列上で最も相違を示している。
ERRおよび他の複数膜横断蛋白質と同様、Tea遺伝子生成物はシグナル配列 を含んでいない。こうした比較はかなりの程度のアミノ酸類似性を示すが、それ でも、これら2つの蛋白質は明きらかに別の遺伝子生成物である。
第18図は図の説明に書かれているような物理的属性を調べるためにPC遺伝子 プログラムを用いてつくられた目標蛋白質構造のスケッチを示している。第18 図はTeaおよびRec−4遺伝子の目標蛋白質生成物の物理的な属性を示して いる。パネルAはTea目標蛋白質のモデルを示している。太い線はERRとの かなりの類似性を有している2つの領域を示している。インテリジェニティック ス社からのPCジーン・ソフトウェア・プログラム: 5OAP、 HELIX MEM、 N0VOTNY、 RAOARGO5を用いて、示されたモデルをつ くるために@種蛋白質の物理的属性が調べられた。パネルBは疎水性比較のため に分析された2つの目標(predicted)蛋白質(Tea蛋白質について はアミノ酸l−4,03,ERRについてはERR蛋白質)のその領域を示して いる。
パネルCはTea目標蛋白質(上)およびERR目標蛋白質(下)の疎水性を示 している。
概略図示されているモデルはERR蛋白質とのかなりの類似性を示す領域を強調 して示している。ERRは細胞表面蛋白質をコード表現するので、我々は重複領 域における2つの目標蛋白質のアミノ酸1−401. ERR蛋白質のアミノ酸 204−600)の疎水性を比較した。第18図の上部の線画はこの疎水性プロ ットで比較された2つの蛋白質の領域を示している。これらの比較は401の隣 接アミノ酸をその対象として含んでおり、いちじるしい類似性を示す。したがっ て、Tea遺伝子の生成物が細胞表面蛋白質である可能性はある。
このTea遺伝子は高級を椎動物で保持されているようである。これらTea遺 伝子配列が進化の過程で保持されているかどうかについて判断するために、ヒト 、ハムスター、マウス、およびヒヨコからのDNAが、20.5cDNAプロー ブとのクロス・ハイブリダイゼイションに関してテストされた。サザーン・プロ ットをプローブするために十分な長さのcDNAクローンが用いられた際、テス トされたすべてのゲノム性DNAに関して検出可能なハイブリダイゼイションが 起きた(第19図)。第19図は異なった種のDNAのサザーン分析および染色 体8のTea遺伝子の場所を特定するための遺伝子組換え近親交配DNAの分析 を示している。両方のパネルの°1PでラベルされたcDNAプローブは20, 5cDNAオゾンのほとんど全長に近い長さのBa1Iフラグメントであった。
パネルAは「素材および方法Jに述べられているBa1lフラグメントでプロー ブされたヒト、ハムスター、マウスおよびヒヨコからのPstl消火DNAのハ イブリダイゼイション・パターンを示すオートラジオグラムを示している。パネ ルBは遺伝子組換え近親交配動物から取り出された肝11DNAのオートラジオ グラムを示している。第19図は上に述べたいくつかの遺伝子組換え動物、およ びSac Iで消化されたNFS/ N 15!DNAから得られたハイブリダ イゼイションのパターンの例を示している。
検出されたDNAフラグメントのいずれかがRec−1遺伝子から誘導されたか どうかをテストで確認するために、20,5cDNAクローン(ERRcDNA 配列とは非常に異なっている)の3′領域に対するプローブは同じ大きさのDN Aフラグメントにハイブリダイズすることが認められた。これらの結果は異なっ た3′末端により検出された配列も進化の過程で保持されること、そして他の種 のDNAに対するクロス−ハイブリダイゼーションが2つのcDNAクローンの 間で最も違った配列をもたらすことを示している。前のセクションのデータと一 緒に得られた二のデータは、これらのTea遺伝子が他の種で見出されるER, Rとは異なった蛋白質をコード表現することを示している。カルボキシルおよび アミノ末端のアミノ酸配列の相違はこれら2つの蛋白質が別の機能を持っている 可能性を示唆している。
例25 染色体8に対するTea遺伝子のマツピングERR遺伝子生成物はウィルス性受 容体として機能するので、他の知られている後傾受容体(コザツク、(1983 )ユムニ!工o148 : 300−303)のひとつをコード表現することが 分かつている染色体上にあるかどうかについて判断するために、Tea遺伝子が マツプされた。チャイニーズ・ハムスターおよびマウス細胞間の間につくられる いくつかの異なった体細胞ハイブリッドはそれぞれ限られた数の異なったマウス 染色体を保持している。Tea遺伝子をマツプするためにこれらの遺伝子が用い られた(ホーガン等、(1988)よムーX上ロ象工匹: 1055−1056 )。
ハイブリッド細胞からの0stl消化されたDNAのサザーン分析は21のハイ ブリッドのうち、7のハイブリッドがマウスに固有のDNAフラグメントを含ん でいた。オイジテイブ・ハイブリダイゼイションを有している知られているマウ ス染色体成分とマウス固有DNAフラグメントの比較は最も大きな相関関係はマ ウス染色体8どのものであることを示している(表8)。
以下余白 表6 ハイブリッドの数 マウス 染色体1個あたりの 、S≧二亡Lし←−DNA八イへリダイゼイション +f二=二歪に一印【−x 二21ツー」二2二辷 :Lどニニ 」二/〉二 −二141 5 9 2 4  30.0 4 4 3 2 3 25.0 5 2 11 5 2 35.0 6 6 6 1 6 36.8 9 4 10 3 4 33.3 10 0 11 7 2 45.0 14 1 10 5 2 38.9 15 4 0 0 8 66.1 16 3 9 2 4 33.3 17 6 4 0 7 41.2 18 6 6 1 4 29.4 19 5 7 2 5 36.8 X 5 8 2 6 38.1 マウス−ハムスタ一体細胞ハイブリッドを用いてのTea遺伝子のマツピング。
符号は20.5cDN^プローブによるハイブリダイゼイションで検出された左 欄の番号で示される特定のマウス染色体の存在(l十)あるいは不在(/−)に 関連するマウスTea拘束フラグメントの存在(十/)あるいは不存在(−7) を示す、不一致観察回数は;/−と−/+との合計である。
本これらのハイブリッドはいずれも抜型ではない。それらはsl!識別にタイプ 分けされているので、+/−ハイブリッド細胞が染色体8のフラグメントを含ん でいたり、あるいは少ない割合の細胞がその染色体を含んでいることはあり得る 。
−/+の例外は染色体8の一部を含んでいるが、Tea遺伝子を含んでいる領域 を欠いている可能性がある。
こうした観察を確認し、さらに認識を広げるために、種間戻し交配によって、染 色体8上にTeaが位置付けられた。
5stIで消化されたDNAは、NFS/ N マウスが10.0.7.4およ び5.5kbのクロス反応性横縞を形成することを示した。Mlm。
成熟DNAは10.6.4および5.5kb、フラグメントをつくる。第19B 図はNFS/NXM、 rn、成熟F1マウスとM、 m、成熟個体との戻し交 配における20,5cDNAプローブのハイブリダイゼイションのパターンを示 している。染色体8を用いてのこの拘束フラグメント長多形性の分離パターンは 、この遺伝子がcentromere−Polb−1−Tea−Es−1(表7 および8)という遺伝子配列でGr−1およびEs−1に結合されていることを 示した。
表7 種間戻し交配の57プロジエニーにおけるPo1b Gr−1およびEs−1と いう対立形質によるTeaハイブリダイジング・フラグメントの分離。
NFS N ・立 ノ の 本 ヱ皇区 ! Gr−I T旦」 辷ユヱlス例1親 + 十+ + 22 組換え −m−+9 遺伝子 十 十−一〇 *+=対立形質を継承;−=対立形質を継承せず。
以下余白 表8 遺伝子組換え 1旦丞1亙 nl cM土q PoJ、b、 Gr−1615710,5+/−4,1Po1.b、 Tea  8157 14.O+/−4,6Gr−1、Es−11615728,0+/− 5,9Polb、 Es−12215738,6非有意a、centimorg an(cM)の距離と各遺伝子座の標準誤差はサンプル・サイズnにおける組換 え遺伝子の数がらのグリーン(19)によって計算。
b、103の戻し交配マウス(22,3cM+/−4,2)で総数24の組換え 遺伝子に関して、さらに46のマウスがTeaおよびEs−1に関してタイプ分 けされた。
染色体8上でのTea遺伝子の位置はこの遺伝子がERRをコード表現し、染色 体5に局在化されているRec−1遺伝子とは別のものであることの証拠を提供 している。それはまた、それがまだ染色体にマツプされていないA/10ウィル スに対する受容体に関連しているかどうかを判定する十分なデータがないにせよ 、染色体lに局在化されているMCFレトロウィルス受容体である可能性を完全 に否定する。
70種類の遺伝子あるいは遺伝子生成物は、抗原提供細胞の表面の抗原と自己− 組織適否性の組み合せに反応してT細胞が活性化されると、表現が増えることが 知られている。レクチン、カルチウム、カルシウム1onophoreあるいは T#胞受容体に対する抗体など抗原に対するポリクローナル活性化因子は抗原に より誘発される反応に似た反応を引き起こす。これらの「活性化」遺伝子の一部 は細胞サイクルのG、とG1の間の推移に関与している。一部のものはシトキン をコード表現およびその受容体、核調節蛋白質をコード表現し、別のものはイオ ンと栄養を細胞に運んでそれらを成長させる働きに関与している。少なくとも、 26通りのT細胞「活性化J遺伝子生成物は細胞膜に存在していることが確認さ れている。
20.5はT細胞活性化の過程で複数膜横断蛋白質をコード表現する可能性を有 しているクローン化遺伝子あるいはcDNAの最初の例である。
Con、Aあるいは抗原によって開始される肺臓子細胞活性化はペクチンあるい は抗原を与えてから数分以内に始まり、約7−14日間続く。遺伝子表現の変化 はこの活性化の全期間・を通じて起きる。クラブツリーは遺伝子表現におけるこ うした変化をウィルス遺伝子活性化との類似性を手がかりに分類した(即時、早 い、遅い、および非常に遅い)。クラブツリーの基準から、Tea mRNAが 通常の休止T細胞では検出できるレベルではほとんど見当たらず、6時間以内に 検出可能なレベルに増大し、約24時間でピークに達するので、Teaは早い遺 伝子である。Tea遺伝子の機能はまだ分がっていない;それはシグランル、あ るいはシグナル形質導入因子である小型の分子を形質導入するのがもしれないし 、あるいは未確認のりガンドに対する受容体として機能しているのかもしれない 、このTea蛋白質の比較的長いカルボキシ末端はシグナル形質導入因子として 機能しているのかもしれないが、こうした推測を支える証拠は存在していない。
5L12.4Tリンパ腫細胞および多数の他のTおよびB腫瘍細胞はこの遺伝子 を表現せず、Tea遺伝子表現は細胞の成長に必要ではない。しかしながら、我 々の研究は正常なT細胞がT細胞の活性化を伴う正常な細胞の増殖を受ける上で Tea遺伝子表現を必要としている可能性を完全には否定しなかった。この遺伝 子の表現との相互作用が、リウマチ病やその他のT細胞を媒介とする免疫性疾患 など自己免疫疾患におけるT細胞の活性化を阻止する可能性はある。
Tea蛋白質とERR蛋白質の驚くべき類似性は、少なくとも、4つの種類のマ ウス・レトロウィルス受容体が一般的に定義され、ただ1つだけが分子的にクロ ーンされているので、Tea遺伝子生成物がマウス・レトロウィルス性受容体を して機能している可能性を示唆している。染色体8にTea遺伝子を局在化する と、Teaが遺伝子組換え自己指向性MCFウィルス受容体をコード表現すると いう可能性は排除し、それが染色体8に局在化されていたアムホトロビック(a mphotropic)なレトロウィルス受容体をコード表現するという可能性 を提起する。マウス組織において漠然と表現されるRec−1遺伝子(ERRを コード表現する)とは対照的に、Tea遺伝子はより限定的な組織分布を有して いる。Tea遺伝子がレトロウィルス受容体として機能する蛋白質をコード表現 すると、限定的組織分布はリンパ系連鎖に拘束されているレトロウィルスの特性 を提供する可能性がある。受容体が媒介する拘束の前例はCD4をその主要受容 体をして用いるヒトのレトロウィルスHIVである。しかしながら、細胞固有受 容体はマウス・レトロウィルスの組織特性に全体的に関与してはいないらしい。
レトロウィルスにより示される組織指向性はLTRの組織特性、gp7o en V蛋白質のバリエーション、細胞因子および/または何らかの細胞表面受容体の 表現など、一連の複雑な要因によりもたらされる可能性がある。ウィルスに関す るER,R結合部位が確認されると、その部位がTea蛋白質との高度の類似性 を有する領域の内部かどうかを判定することが可能になる。
Tea蛋白質がウィルス受容体として機能しているかどうかを判定するためには ウィルス性結合および感染研究が必要である。
ERR遺伝子生成物への高度の類似性にも拘らず、TeaおよびERR予報(p redicted)蛋白質の物理的属性にはかなりの違いがある。それらは異な った染色体にマツプし、その組織表現パターンも異なっている。これら両方の遺 伝子の自然な細胞性機能は分かっていないので、これら2つの蛋白質問に存在し ているかもしれない機能的類似性について判定するためには、一層の研究が必要 である。保持されるアミノ酸と保持されないアミノ酸の分析はERR蛋白質とT ea遺伝子生成物の類似した機能や異なった機能についての一層の洞察をもたら してくれるであろう。特に、この新しい遺伝子群およびそれら2つの分子間で高 度に保持されるDNAの領域を確認するにより、この遺伝子群の新しいメンバー についての研究も可能になるであろう。
pT7T3−19.1 (寄託光68298) 、pT7T3−19.2(寄託 光68299 )、pT7T3−19.4 (寄託光68300.68301. 68302) 、pT7T3−19.5(寄託光68303) 、およびpT7 T3−20.5 (寄託風68305)は、1990年4月13日に、米国マリ −ランド州ロッグビル、アメリカン・タイプ・カルチャー・コレクション(AT CC)に寄託された。この寄託は米国、および本願に対応する出願が申請される 米国外の国々の特許法およびそのほかの規制に基づいて利用できる。この寄託が 利用できることは、本願、この出願の部分や継続に基づいて発行させるいずれか の特許を損なって、本願の発明を実施する権利を提供することは意味しない。
以上に、本願を十分に述べたので、この分野の通常の技術に通じているひとには 、ここに述べた発明の製品および反意から逸脱することなしに、多くの変化およ び修正を行うことができることは明らかであろう。
FIG、 I FIG、 2 19.1 19.2 19.5 20.2FIG、 3A−1 TTAGTCAAGTCTAGGCTGAGGAAGGGCTGCACCTCA GAAGnGGACTCCTGAAGCAT 840LeuValLysSer ArgLeuArc+LysGlyCysThrSerG1uValGlyLe uLeuLysHis (263j TATCTTACTnCAGCTCTGAAAGAACCATGAGTGATA AATTCACTTTTTACACTGTG 1080工AAAAATATTT TTTTTTAT丁TTCCGGGTAGATACC丁TCAA 、 1184 オーブンづ−ディング・フレーム FIG、 4a FIG、 4b FIG、 7 FIG、 8 FIG、 12 cDNA及び20.5 (TEA)の目標蛋白質配列c+c+c+tc+ tc  tttcc tca tcc+c t9ccc tgc+ cc tc 99 t ta tc+qc C(1(hcc tttc+c ta tqc tc+ aa tttaqc t9tgc+9cc ttc atc ac t9c+c  tc+c+aa tc tca tcctc+ tca ta tc+狽モ= @ta9qta cc+tccac+tttttcaaaac (ltac t tCaaaa tQaa ttaCa C t(1(l tC tQ(ICa( la(lta tCba(lacttc ttt9cc CICICl t(laa taa a t tt t taCa IIJc  ta t taa ta tC C t(1(JtCC t狽b tC ttt Q tcATGGTGG CTGGGT門 VAG A GCAA GTG CTA G A GA A CCA C CTTCTG  A GA A CGGAA CAA GCATCTA Cf GGG CTG GCG GCTTTAASAREPPSENGTSIYGAGGF一G GGC TTTGA CTGCATTGCA ACAA CCGGTGAA GAGGT TCGGAATC CA CAAAA GGCG`TCCCCA GFDCIATTG E EVRNPQKA IlTnAA CGCTTATG ATGC CTTA CTA C CTCCTGG A TGA G A AA  A GTCCA CTCCC`GTC G CGTTTG LTLMMPYYLLDEKSPLPVAFATCAACAAGTCTTCTT GGATCCATTTTCCCAATGCCTCGTGTAATCTATGCT ATGGCGGAGGSTSLLGSIFPMPRVIYAMAETG CTA  CTTTG TCA TC GGGTG CAGTGG CA G CTGT G A TGG CCTTTCTTTTTGA@C CTG A A GG C C C ATLSSGAVAAVMAF F KAGCTTATTCTCA GGTA  CCAA CCTGG CTTGTGTTA C GAGCA G CCCA  AATA CA CCbCTGAG A AA G 一上−ILRYQPGLCYEQP κ YTPEKG CA A GGA C AG G GTTTCA GCCTA CGAA CCCTCTTCA GCC CCTCTGCC CTGCC bACA CGA CAGT FIG. 13A 99(19ccc(la9tacccaa(]aCtQ9atC119Cgta tCtataCaCttaC9tCaCQ9tC(1ga(P 120 QtC(lcaa(la9catg(la(it(19caccttt9ac( laacttcttaataaaca(latt(J(lcモ=iit 240 gt9t(lcctt9tattactcct(](lCaCICItCttt tatCtttt!;l(Ia9taaaa(la(ltc煤ilctt 36 0 T丁GTGAAAGGAAATGTGGCTAACTGGAAGATCAGTG AAGAGTTTCTCAAAAATATATC 480FVKGNVANWK ISEEFLKNISTGCCCTATGGCnTACAGGGACGTTGG CTGGTGCTGCAACGTGCTTTTATGCCTTTGT 600M PY FT T A AAT(:FYAFVTCGGAATAGTGACGTC CTTACTTGTCTGCTTTATGGCTTACTTTGGGGnTCT GCAGC 720TGIVT LLV FMA F V AAAGTATGT CAGATGGGGCCCCGCCAAATACGnGTCGCAGCAGGC TCCCTCTGCGCCTT 840EYVRWGPAKYVVAAGSLC ALATGGGTTGCTTTTCAAATGTCTAGCTCAAATCAA TTCCAAAACGAAGACACCAGTAAT 960DGLLFKCL ’AQ INSKTK″TPV.ITCGTGGACATGATGTCTATT GGCACCCTCATGGCCTACTCTCTGGTGGCAGCCTGT GT 1080LVDMMS TGTLMAYSLVAAC,VAAACTCT GGAATCATGTACCAATGCGACTTTGAAGAGCGAGTC CCAGGTCACCATGCT 1200ETLESCTNATLKSESQ NTMLCGGCTTCCCTTGTGAGCTTTCTGGTGGGATTC CTGGCTTTCCTCATCCTGGGCTTGAG 1320FIG.  13B QGQGFSLRTLFSPSALPTRQTATTCTAACCACGTAT GGCGTCCAGGCCATTGCCAGACTGGAAGCCTGGAGC CTGGCTCTTCILTTYGVQAIARLEAWS A一一一L一一一 GA A T CA GCA A A AAGTA GCCTTC A TGG TCCC GTTCTTA CCGmCTG CC G GbCTTCA G  CATC C NQQKVAFMVPFLPFLPAFS ICTGGATGGCGCTTGG C丁丁TCTGATCTATTTCGCCTATGGCATTAGACACAG CTTGGAGGGTAWMALGF IYFA.YGIRHSLEGAGA  A GAA A AGTCCGTCATGCAA GCAAATGA C CA TCA CCA AAGAAA CCTCAGCTsA CCTTTCA EEKSVMQANDHHQRNLSLPFttaaC aa tcla (]  taCaC t(it(19c C 99a t9C CaC Ca tC9  t9c tQ(]!;hC t(I tc9tQ9Q tC t(IC t( I ta t tCt9t9 tC tcJa9(AagaC tqcc t! 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本発明はまた、かなり純粋な形態での新規膜横断蛋白質、該膜横断蛋白質をコー ド表現するrDNA分子および、その新規膜横断蛋白質をつくるためのプロセス を提供する。本発明によるDNA配列および遺伝子組換えDNA分子は、それら がTリンパ腫細胞により表現され、少なくとも、以下の特性のひとつを有する点 において、特徴づけられる=(1)正常な胸腺、活性化肺臓細胞、あるいは腸関 連リンパ系組織において表現される、(°2)卵巣組織、正常な肝臓および/ま たは段階固有な方法で、胚発達の段階において表現される、そして(3)複数の 膜にわたって広がっている新規膜横断蛋白質をコード表現する。
国際調査報告 PCT/US911025181+l?+’+al−11alA eml!II@AIFCrAE91ノ’0251BSerial Ho、PCT /LIS91/162518 ^ttach+ment 5heet 1^rt unit185Cantinuatiロr+ofSectionV工Ill C 1ai+s 5. drswn to the distinct polyp eptidpspecies of figur■@13゜ IV、 C1ai+m 6. drawn to the distinct  polypeptide 5pecies of figu窒■@2の。
V、 Claim フ、drawn to the distinct pol ypeptide 5pecies ol figure Q1゜ Vl、Claim &、 drawn to th++ distinct p olypeptide 5pecies of figur■@22゜ 5erial No、PCT us91/の2518

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1.19.5,20.5,19.1,19.2,19.3および19.4からな る群から選択される遺伝子でコード表現されるT細胞蛋白質のアミノ酸配列でか らなる遺伝子組換えポリペプチド。 2.実質的に純粋な形態の、特許請求の範囲第1項のポリペプチド。 3.該T細胞蛋白質がTリンパ腫のDMでコード表現される、特許請求の範囲第 1項あるいは第2項のポリペプチド。 4.該アミノ酸配列が第3図に示されている核酸配列によりコード表現される、 特許請求の範囲第1項のポリペプチド。 5.該アミノ酸配列が第13図に示されている核酸配列でコード表現される、特 許請求の範囲第1項のポリペプチド。 6.該アミノ酸配列が第20図に示されている核酸配列によりコード表現される 、特許請求の範囲第1項のポリペプチド。 7.該アミノ酸配列が第21図に示されている核酸配列によりコード表現される 、特許請求の範囲第1項のポリペプタイド。 8.該アミノ酸配列が第22図に示されている核酸配列でコード表現される、特 許請求の範囲第1項のポリペプタイド。 9.特許請求の範囲第4項から第8項のT細胞蛋白質のいずれかをコード表現す るDNA配列からなる表現伝播体。 10.該表現伝播体が、操作可能な連鎖において、以下の要素で構成される宿主 で複製能力を有するプラスミドである、特許請求の範囲第9項の表現伝播体。 a)複製の発生源 b)プロモーター、および c)T細胞蛋白質に関するコード表現を行うDNA配列11.該表現伝播体が、 操作可能な連鎖で、以下のもので構成されている、特許請求の範囲第10項の表 現伝播体;a)複製の原核生物性発生源、 b)原核生物性プロモーター、 c)膜横断T細胞蛋白質をコード表現するDNA配列12.該表現伝播体がpM AMneo,pNEO/Tfr−NCおよびpMAM/neo/Tfr−NCか らなる群から選択される、特許請求の範囲第10項の表現伝播体。 13.T細胞蛋白質をコード表現するDNA配列からなるベクター。 14.該ベクターがプラスミド、ファージおよびコスミッドでからなる群から選 択される、特許請求の範囲第13項のベクター。 15.該ベクターがATCC寄託間No.68298を有するpT7T7−19 .1である、特許請求の範囲第14項のベクター。 16.該ベクターがATCC寄託No.68290を有するpT7T7−19. 2である、特許請求の範囲第14項のベクター。 17.該ベクターがATCC寄託No.68300−68302を有するpT7 T7−19.4である、特許請求の範囲第14項のベクター。 18.該ベクターがATCC寄託No.68303を有するpT7T7−19. 5である、特許請求の範囲第14項のベクター。 19.該ベクターがATCC寄託No.68305を有するpT7T7−20. 5である、特許請求の範囲第14項のベクター。 20.該遺伝子組換えDNA分子が特許請求の範囲第4−8項のT細胞蛋白質の いずれかをコード表現するDNA配列からなる、遺伝子組換えDNA分子で形質 転換される宿主。 21.大腸菌である、特許請求の範囲第20項の宿主。 22.以下のステップからなるT細胞をつくるための方法:a)T細胞蛋白質を コード表現するDNA配列で宿主を形質転換する; b)該DNA配列を表現する;そして c)該T細胞蛋白質を回収する。 23.免疫学的に有効な量の特許請求の範囲第22項の方法で生産される膜横断 T細胞蛋白質からなる、個々の抗体で膜横断T細胞蛋白質を誘発するのに有益な 医薬品組成物。 24.該抗原が遺伝子組換えT細胞蛋白質である、特許請求の範囲第23項の医 薬品組成物。
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