JPH0387185A - ヒト免疫グロブリン遺伝子関連dna断片及び該dna断片を用いる診断方法 - Google Patents
ヒト免疫グロブリン遺伝子関連dna断片及び該dna断片を用いる診断方法Info
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Landscapes
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Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。
め要約のデータは記録されません。
Description
【発明の詳細な説明】
[産業上の利用分野]
本発明は、免疫学、遺伝学、全生学、血液学、癌研究等
の分野で、f等動物より哨乳動物などの高等動物までの
免疫グロブリンあるいはT細胞レセプターを生産する動
物類における、なかでもヒトにおける免疫グロブリンあ
るいはTiWII胞レセプターの産生に関与する新たな
りNA断片に関する。
の分野で、f等動物より哨乳動物などの高等動物までの
免疫グロブリンあるいはT細胞レセプターを生産する動
物類における、なかでもヒトにおける免疫グロブリンあ
るいはTiWII胞レセプターの産生に関与する新たな
りNA断片に関する。
本発明のこれらDNA断片の、各種細胞からのクローニ
ング及び構造決定による免疫グロブリンあるいはT細胞
レセプターの多様な反応性の遺伝子レベルでの解析・実
証を行なうことにより、これらDNA断片に含まれる遺
伝子の発現過程を利用して、多様な抗原特異性を持つ免
疫グロブリンを各種生産する技術の確立に必要な情報が
提供され得る。
ング及び構造決定による免疫グロブリンあるいはT細胞
レセプターの多様な反応性の遺伝子レベルでの解析・実
証を行なうことにより、これらDNA断片に含まれる遺
伝子の発現過程を利用して、多様な抗原特異性を持つ免
疫グロブリンを各種生産する技術の確立に必要な情報が
提供され得る。
更に、本発明は、前記のこれら特定のDNA断片を含む
固有のDNA断片を腫瘍マーカーとして用いるB細胞系
あるいはT細胞系腫瘍細胞の検出法、ずなわちリンパ系
II!T!瘍、白血病πφの診断方法も提供する。
固有のDNA断片を腫瘍マーカーとして用いるB細胞系
あるいはT細胞系腫瘍細胞の検出法、ずなわちリンパ系
II!T!瘍、白血病πφの診断方法も提供する。
[従来の技術及び発明が解決しようとする課題]免疫化
学、細胞免疫学、免疫遺伝学の進展により、動物の生産
する抗体分子(免疫グロブリン)については、以下のよ
うな事実が明らかとされている(参考文献1:後述の参
考文献リストにその詳細を示す)。
学、細胞免疫学、免疫遺伝学の進展により、動物の生産
する抗体分子(免疫グロブリン)については、以下のよ
うな事実が明らかとされている(参考文献1:後述の参
考文献リストにその詳細を示す)。
免疫グロブリン(Ig)は、2本の同一な重鎮(H3n
)および軽釦(L釦)からできている。H釦、L鎖は
構造および機能上、2つの領域に分かれており、定常(
不変)領域(C領域)と呼ばれる一定した一次構造を持
つC末端側に位置する領域と、可変領域(V領域)と呼
ばれるN末端より約110アミノ酸残基の領域とがあり
、■領域が抗原結合領域に相当する。
)および軽釦(L釦)からできている。H釦、L鎖は
構造および機能上、2つの領域に分かれており、定常(
不変)領域(C領域)と呼ばれる一定した一次構造を持
つC末端側に位置する領域と、可変領域(V領域)と呼
ばれるN末端より約110アミノ酸残基の領域とがあり
、■領域が抗原結合領域に相当する。
抗体の抗原結合能力の多様性は、■領域のアミノ酸−次
配列の相違で説明され、即ち対応する遺伝子のDNA塩
基配列の相違に起因する。
配列の相違で説明され、即ち対応する遺伝子のDNA塩
基配列の相違に起因する。
H鎖及びL鎖のV領域のアミノ酸の多様性について、N
末端からの距離とアミノ酸の変異度との相関からみると
、■領域全体として高い変異度があるが、その中でもと
りわけ多様性に富んでいる場所が、それぞれ3個所に集
中している。それは、rgのV領域の立体構造に43い
てβシート構造を形作るポリペプチドIIと■の間、■
と■の間及び■と■の間の3個所であり、H,L両頭で
計6個所となる。これらの個所が抗原結合部位をポケッ
ト状に形成するので、相補性決定部位(complom
Cnl、aril、y dCl、crmingrCgi
on ;CD R)と呼ばれている。
末端からの距離とアミノ酸の変異度との相関からみると
、■領域全体として高い変異度があるが、その中でもと
りわけ多様性に富んでいる場所が、それぞれ3個所に集
中している。それは、rgのV領域の立体構造に43い
てβシート構造を形作るポリペプチドIIと■の間、■
と■の間及び■と■の間の3個所であり、H,L両頭で
計6個所となる。これらの個所が抗原結合部位をポケッ
ト状に形成するので、相補性決定部位(complom
Cnl、aril、y dCl、crmingrCgi
on ;CD R)と呼ばれている。
そして、これら3個所はそれぞれCDRI、CDRIl
、、CDRmと呼ばれる。
、、CDRmと呼ばれる。
この中でHmlのCDRmはとりわけ多様性に富んでお
り、このV領域部分が、多種類の抗原結合能を有するこ
とと密接に関連している。
り、このV領域部分が、多種類の抗原結合能を有するこ
とと密接に関連している。
20種類のアミノ酸のうち、比較的βシート構造をつく
りやすいアミノ酸は、システィン、フェニルアラニン、
インロイシン、ロイシン、メチオニン、クルクミン、ス
レオニン、バリン、トリプトファン、チロシンの10種
類である。
りやすいアミノ酸は、システィン、フェニルアラニン、
インロイシン、ロイシン、メチオニン、クルクミン、ス
レオニン、バリン、トリプトファン、チロシンの10種
類である。
他方1gH鎖遺伝子の全構成はH鎖V (variab
le)領域(VO)遣イ云子、H釦D (divcrs
il、y、分岐)領@(D++)遺伝子、H釦J (j
oiningMl’i合)領域(JH)遺伝子及びC領
域遺伝子のj噴で成り立っている。
le)領域(VO)遣イ云子、H釦D (divcrs
il、y、分岐)領@(D++)遺伝子、H釦J (j
oiningMl’i合)領域(JH)遺伝子及びC領
域遺伝子のj噴で成り立っている。
Ig遺伝子は、Bリンパ球系細棒に特異的に発現する遺
伝子で、その発現はBwI胞の分化・成熟の過程にとも
なって調節・制御される。
伝子で、その発現はBwI胞の分化・成熟の過程にとも
なって調節・制御される。
すなわち、これら遺伝子は2種類のDNA再配列を行な
い、1つはVHDot JH結合で、これにより完全
な活姓型V遺イム子が形成される。いまtつは、H鎖り
ラススイツヂのためのD N A 41f編成である。
い、1つはVHDot JH結合で、これにより完全
な活姓型V遺イム子が形成される。いまtつは、H鎖り
ラススイツヂのためのD N A 41f編成である。
胎児型遺伝子配列の中で分散していたH 61遺伝子は
、幹細胞からB細胞へ分化する過程で、まず1つのDH
遺伝子断片と1つのJ、遺伝子断片が、その間のシグナ
ルへブタマー、シグナルノナマー、スペーサーを含むイ
ントロン部分の欠失をともなって結合し、次にこのDJ
i!i合断片が1つのV11断片と結合し、VDJとい
う遺伝子配列をもつ活性型の■遺伝子が形成される。
、幹細胞からB細胞へ分化する過程で、まず1つのDH
遺伝子断片と1つのJ、遺伝子断片が、その間のシグナ
ルへブタマー、シグナルノナマー、スペーサーを含むイ
ントロン部分の欠失をともなって結合し、次にこのDJ
i!i合断片が1つのV11断片と結合し、VDJとい
う遺伝子配列をもつ活性型の■遺伝子が形成される。
このIgH&JI遺伝子り領域に存在するDH遺伝子が
、H釦CDRI[Iをコートする遺伝子てあり、同一の
ファミリーに属する胎児型り、遺伝子は、規則的な間隔
て、マウスでは5キロ塩基対(kb)(参考文献2)、
ヒトでは9kb(参考文献3)ととに繰り返しコードさ
れている。
、H釦CDRI[Iをコートする遺伝子てあり、同一の
ファミリーに属する胎児型り、遺伝子は、規則的な間隔
て、マウスでは5キロ塩基対(kb)(参考文献2)、
ヒトでは9kb(参考文献3)ととに繰り返しコードさ
れている。
しかしながら、ヒトD領域におけるDoift伝子の分
布、存在様式については、十分で詳細にわたる検討は未
だ行なわれていなかったのが現状であり、わずか5ic
bcnlislらが−に記の報告(参考文i13 )
−C2ツ(7)D++ J(云’/)7 ミ’) (
D目or、2、DI、。)を同定していたにすぎない。
布、存在様式については、十分で詳細にわたる検討は未
だ行なわれていなかったのが現状であり、わずか5ic
bcnlislらが−に記の報告(参考文i13 )
−C2ツ(7)D++ J(云’/)7 ミ’) (
D目or、2、DI、。)を同定していたにすぎない。
そこで、本発明者らの一人は、既にマウスの胎児型I)
u遺伝子を12個同定し、3つのファミリーに分類した
(参考文献2)が、引き続き本発明者らはヒトD Hf
a域ゲノムについても詳細に検討し、9kb単位の中に
、5つの異なるDH遺伝子(DM+遺伝子、DLR1、
遺伝子、D XPI遺伝子、DXll・1遺伝子及びD
NI遺伝子)を同定したく参考文献4)。
u遺伝子を12個同定し、3つのファミリーに分類した
(参考文献2)が、引き続き本発明者らはヒトD Hf
a域ゲノムについても詳細に検討し、9kb単位の中に
、5つの異なるDH遺伝子(DM+遺伝子、DLR1、
遺伝子、D XPI遺伝子、DXll・1遺伝子及びD
NI遺伝子)を同定したく参考文献4)。
Dl、遺伝子領域は、抗体分子の各種抗原に対する多様
な反応性を、V 11遺伝子領域、J++遺伝子領域と
ともに規定しており、これら3つの遺伝子の結合の組み
合せから、1個の生体は106〜108種類の抗体分子
をつくり得るとされてる。
な反応性を、V 11遺伝子領域、J++遺伝子領域と
ともに規定しており、これら3つの遺伝子の結合の組み
合せから、1個の生体は106〜108種類の抗体分子
をつくり得るとされてる。
他方、T細胞レセプター、特にβ鎖、δ鎖の遺伝子のV
DJ結合の多様な組合せ、そして抗原に対する多様な反
応性も免疫グンロブリンと同様に解明されてきている。
DJ結合の多様な組合せ、そして抗原に対する多様な反
応性も免疫グンロブリンと同様に解明されてきている。
このように多様な抗原に対して、B細胞系細胞あるいは
T細胞系細胞が分化し、その分化過程で抗体あるいはT
細胞レセプターの各遺伝子間で再編成が起き、多様な抗
体あるいはT細胞レセプターを泥土するメカニズムの大
筋は明らかにされたが、その実体については未解決の問
題も多く、そのメカニズムを利用した多様な抗体等の人
為的な生産の研究は未だ行なわれていなかった。
T細胞系細胞が分化し、その分化過程で抗体あるいはT
細胞レセプターの各遺伝子間で再編成が起き、多様な抗
体あるいはT細胞レセプターを泥土するメカニズムの大
筋は明らかにされたが、その実体については未解決の問
題も多く、そのメカニズムを利用した多様な抗体等の人
為的な生産の研究は未だ行なわれていなかった。
本発明者らは、CRDmの抗原結合能の多様性の決定に
特別深く関与しているDH遺伝子領域の全貌を明らかに
し、多種多様な抗体を作製する手段を開発する道を切り
開くことにつなげたいと考えた。
特別深く関与しているDH遺伝子領域の全貌を明らかに
し、多種多様な抗体を作製する手段を開発する道を切り
開くことにつなげたいと考えた。
すなわち、更により多くのり。遺伝子をクロー 0
ニングし、そのヌクレオチド配列を明らかにし、特定の
部位のアミノ酸を種々変えたIgを人工的に調製するた
めに、それらDI4遺伝子を使用することを企画した。
部位のアミノ酸を種々変えたIgを人工的に調製するた
めに、それらDI4遺伝子を使用することを企画した。
従来における抗体生産の研究は、特定の抗原に対するポ
リクローナル抗体、モノクローナル抗体を必要にせまら
れ調製している場合がほとんどすべてであったが、本発
明者らの方法は、従来における研究とは逆に、あらかし
め様々な抗体を人二[的に作製しておき、しかる後に、
これまで未検討の抗原あるいは新たに出現してきた抗原
に対応する抗体を、それらの中から探索・スクリーニン
グしていくという方法である。
リクローナル抗体、モノクローナル抗体を必要にせまら
れ調製している場合がほとんどすべてであったが、本発
明者らの方法は、従来における研究とは逆に、あらかし
め様々な抗体を人二[的に作製しておき、しかる後に、
これまで未検討の抗原あるいは新たに出現してきた抗原
に対応する抗体を、それらの中から探索・スクリーニン
グしていくという方法である。
本発明の目的は、Igの産生調節機構の解明及び新たに
人工的なIgの生産に有用な細胞生物学上、また医学的
に、更に医療産業上の応用に極めて有用な技術を提供す
ることにある。
人工的なIgの生産に有用な細胞生物学上、また医学的
に、更に医療産業上の応用に極めて有用な技術を提供す
ることにある。
例えば、各種DH遺伝子の詳細なヌクレオチド配列と各
種り、□遺伝子のスクリーニングや同定に有用なプロー
ブを提供することにある。
種り、□遺伝子のスクリーニングや同定に有用なプロー
ブを提供することにある。
1を
更に、本発明は、前記の各種Dll遺伝子DNA断片を
含む固有のDNA断片を腫瘍マーカーとして用いるB細
胞系あるいはT細胞系腫瘍細胞の検出法、すなわちリン
パ系腫瘍、白血病等の診断方法も提供する。
含む固有のDNA断片を腫瘍マーカーとして用いるB細
胞系あるいはT細胞系腫瘍細胞の検出法、すなわちリン
パ系腫瘍、白血病等の診断方法も提供する。
[課題を解決するための手段]
本発明のDNA断片は、DI+遺伝子ファミリーDA、
DK及びDI+(に属するDI4遺伝子の1以上を少な
くとも含むことを特徴とする。
DK及びDI+(に属するDI4遺伝子の1以上を少な
くとも含むことを特徴とする。
このDNA断片は、各種り。遺伝子のスクリーニングや
同定などのプローブとして、あるいは特定の部位のアミ
ノ酸を種々変えたIgを人工的に調製するための各種遺
伝子工学的操作に用いる遺伝子配列として有用である。
同定などのプローブとして、あるいは特定の部位のアミ
ノ酸を種々変えたIgを人工的に調製するための各種遺
伝子工学的操作に用いる遺伝子配列として有用である。
以下、本発明のDNA断片について、DXP4XP+遺
伝子4遺伝子、DK4遺伝子、DN4遺伝子、D IR
,遺伝子、D、遺伝子、DLRI遺伝子、D XP+遺
伝子、DXP1遺伝子、DA+遺伝子、DK+遺伝子、
DN1遺伝子、DIR2遺伝子及びDM2遺伝子を含む
15kbからなるDNA断片を代表例として 2 詳細に説明する。
伝子4遺伝子、DK4遺伝子、DN4遺伝子、D IR
,遺伝子、D、遺伝子、DLRI遺伝子、D XP+遺
伝子、DXP1遺伝子、DA+遺伝子、DK+遺伝子、
DN1遺伝子、DIR2遺伝子及びDM2遺伝子を含む
15kbからなるDNA断片を代表例として 2 詳細に説明する。
なお、15kbD N A断片中に見い出される遺伝子
ファミリーDA、DK及びDIRに属するD +1遺伝
子、すなわち、DAに属するDA4遺伝子、DA1遺伝
子;Dにに属するDK4遺伝子、DK+遣イ云子:DI
Hに属するD IR+ 、 D IR2は、その存在及
び具体的なりNA配列か本発明者らによって初めて特定
されたものである。
ファミリーDA、DK及びDIRに属するD +1遺伝
子、すなわち、DAに属するDA4遺伝子、DA1遺伝
子;Dにに属するDK4遺伝子、DK+遣イ云子:DI
Hに属するD IR+ 、 D IR2は、その存在及
び具体的なりNA配列か本発明者らによって初めて特定
されたものである。
先に述べたようにDl、遺伝子領域(多数のD11遺伝
子が配列された領域)には、同一ファミリーに属するり
。遺伝子か9kb間隔で繰り返されていることが知られ
ており、本発明者らにより同定された上記のD H遺伝
子と同一ファミリーに屈するD H遺伝子か該15kb
D N A断片領域以外のり、遺伝子領域にも存在する
(このことは後述の実施例の結果によっても支持されて
いる)。
子が配列された領域)には、同一ファミリーに属するり
。遺伝子か9kb間隔で繰り返されていることが知られ
ており、本発明者らにより同定された上記のD H遺伝
子と同一ファミリーに屈するD H遺伝子か該15kb
D N A断片領域以外のり、遺伝子領域にも存在する
(このことは後述の実施例の結果によっても支持されて
いる)。
従って、上記15kbD N A断片以外のDl、遺伝
子領域中にある遺伝子ファミリーDA 、DK、DIR
に属するDll遺伝子もまた本発明に含まれるものであ
る。
子領域中にある遺伝子ファミリーDA 、DK、DIR
に属するDll遺伝子もまた本発明に含まれるものであ
る。
話15kbD N A断片領域のヒト胎児型DNAでの
存在位置を第1図に模式的に示す。
存在位置を第1図に模式的に示す。
該15kbD N A断片領域は、前述の5ieben
l istらの報告(参考文献3)にあるDlに対応す
るり、、R□の上流及び下流部分に相当し、9kbから
なるDl、8.を含むその上流部分な■とし、下流部分
を■とし、同一ファミリーのDH遺伝子が対応するよう
分割して示した。即ち、■のD N A 鎖の3′末端
に、■のDNA鎖の5′末端が連結している。
l istらの報告(参考文献3)にあるDlに対応す
るり、、R□の上流及び下流部分に相当し、9kbから
なるDl、8.を含むその上流部分な■とし、下流部分
を■とし、同一ファミリーのDH遺伝子が対応するよう
分割して示した。即ち、■のD N A 鎖の3′末端
に、■のDNA鎖の5′末端が連結している。
■のDNA鎖と■のDNA鎖の間に引いた線は、両頭を
比較して挿入あるいは欠失がある部分を示す。
比較して挿入あるいは欠失がある部分を示す。
なお、RE’及びRE2で示された領域は16bpの繰
り返しを示す。また、EはEcoRI切断部位、BはB
amHI切断部位、Hは旧ndm切断部位をそれぞれ示
す。E9は、クローニングのために人工的にマニアチス
らにより導入されたEcoRI切断部位である。
り返しを示す。また、EはEcoRI切断部位、BはB
amHI切断部位、Hは旧ndm切断部位をそれぞれ示
す。E9は、クローニングのために人工的にマニアチス
らにより導入されたEcoRI切断部位である。
従って、該15kbD N A断片から所望の部位を含
4 む小断片を得るには、これらの制限酵素切断部(+′L
が好適に利用できる。
4 む小断片を得るには、これらの制限酵素切断部(+′L
が好適に利用できる。
上述の本発明の15kbD N A断片および各D 1
+遺伝子は、遺伝子工学を利用した人工的な各種抗体の
調製等、これらDNA断片の機能な柿々の用途に使用す
る際の原料として、また後に説明する本発明者らによる
新たな知見を確認するための、あるいは免疫グロブリン
生産調節機構の更なる解明のために利用する試薬として
有用である。
+遺伝子は、遺伝子工学を利用した人工的な各種抗体の
調製等、これらDNA断片の機能な柿々の用途に使用す
る際の原料として、また後に説明する本発明者らによる
新たな知見を確認するための、あるいは免疫グロブリン
生産調節機構の更なる解明のために利用する試薬として
有用である。
これら本発明の15kbD N A断片および各D H
遺伝子は、例えばヒト免疫グロブリン重鎮遺伝子を適当
な制限酵素で処理して断片化し、これを適当なベクター
に結合して、DNAライブラリーを作製し、その中から
所望の遺伝子を含むクローンを選択する方法により作製
できる。また、I)u遺伝子は、15kbD N A断
片からの再クローニングや化学的合成法で調製できる。
遺伝子は、例えばヒト免疫グロブリン重鎮遺伝子を適当
な制限酵素で処理して断片化し、これを適当なベクター
に結合して、DNAライブラリーを作製し、その中から
所望の遺伝子を含むクローンを選択する方法により作製
できる。また、I)u遺伝子は、15kbD N A断
片からの再クローニングや化学的合成法で調製できる。
このDNAライブラリーの作製には、クローニングに広
く用いられている各種のプラスミドやフファージからな
るベクターを用いることができ5 る。
く用いられている各種のプラスミドやフファージからな
るベクターを用いることができ5 る。
以下、ベクターとして入−ファージ由来のベクターを用
いる場合について述べる。
いる場合について述べる。
まず、ヒト免疫グロブリン重鎮遺伝子を有する適当な造
血細胞のDNAを常法により調製し、これを適当な制限
酵素で処理し、得られたDNA断片をGharon 4
へベクター等のλ−ファージ由来のベクターに結合さ
せて、DNAファージライブラリーを作製する。
血細胞のDNAを常法により調製し、これを適当な制限
酵素で処理し、得られたDNA断片をGharon 4
へベクター等のλ−ファージ由来のベクターに結合さ
せて、DNAファージライブラリーを作製する。
次に、このDNAファージライブラリーから適当なり
H遺伝子スクリーニング用のプローブとハイブリダイズ
する組換え体を、プラークハイビリダイゼーション等の
方法により選別する。
H遺伝子スクリーニング用のプローブとハイブリダイズ
する組換え体を、プラークハイビリダイゼーション等の
方法により選別する。
選別された、クローンが所望の遺伝子を含んでいるかど
うかは、その制限酵素地図を作製したり、ヌクレオチド
配列を分析することにより確認できる。
うかは、その制限酵素地図を作製したり、ヌクレオチド
配列を分析することにより確認できる。
なお、」二連のDNAファージライブラリーとしては、
例えばマニアチス(T、Maniat、is)のヒトD
NAファージライブラリー(参考文献5)が利 6 用できる。
例えばマニアチス(T、Maniat、is)のヒトD
NAファージライブラリー(参考文献5)が利 6 用できる。
なお、このスクリーニングには、例えば、11cnLo
n−Davis法(参老文献6)などが利用できる。
n−Davis法(参老文献6)などが利用できる。
なお、λ−ファージ由来のベクターに所望の遺伝子を組
み込んで作製したクローンは、適当な細菌を宿主として
増殖させて、種々の用途に用いることができる。
み込んで作製したクローンは、適当な細菌を宿主として
増殖させて、種々の用途に用いることができる。
マニアチスのヒトDNAファージライブラリーのように
、Charon 4 Aベクターを用いた場合は、宿主
として、大腸菌(Escherichia coli)
DP 50、E、coli 803 [例えば、 K
、Murray (Universityof Ed
inburgh)等から人手できるコ、 E、coli
K12 X 1778 (八T1’C3]2
44) 、 E、coli K 802 (
八’I’ T C33526)、E、coli LE
392 (ATTに 33572)、E、coliMM
29d (ATTo 33625) 、 fi、
coli MM21 (ATT(:33678)など
が利用できる。これらの中では、旦、coli 803
が好ましい。
、Charon 4 Aベクターを用いた場合は、宿主
として、大腸菌(Escherichia coli)
DP 50、E、coli 803 [例えば、 K
、Murray (Universityof Ed
inburgh)等から人手できるコ、 E、coli
K12 X 1778 (八T1’C3]2
44) 、 E、coli K 802 (
八’I’ T C33526)、E、coli LE
392 (ATTに 33572)、E、coliMM
29d (ATTo 33625) 、 fi、
coli MM21 (ATT(:33678)など
が利用できる。これらの中では、旦、coli 803
が好ましい。
上記15kbD N A断片を含むクローンは、例えば
、上記マニアチスのヒトDNAファージライブ 7 ラリ−から、Ravetchらが取り出したDIl−J
Hプローブ(参考文献10)を用いて、前述のBent
on−Davis法(参考文献6)によって単離するこ
とができる。
、上記マニアチスのヒトDNAファージライブ 7 ラリ−から、Ravetchらが取り出したDIl−J
Hプローブ(参考文献10)を用いて、前述のBent
on−Davis法(参考文献6)によって単離するこ
とができる。
なお、後述の実施例1でマニアチスのヒトDNAファー
ジライブラリーから分離された第1図の15kbD N
A断片を含むりO−ン(Bacterio−phag
e、 [,1one HID−3)は、NGIMB (
NationalCollection of Ind
ustrial and Marine Bacter
ia; POBox 3]、 135 Abb
eyoad、 Aberdeen八B9 8Dへ。
ジライブラリーから分離された第1図の15kbD N
A断片を含むりO−ン(Bacterio−phag
e、 [,1one HID−3)は、NGIMB (
NationalCollection of Ind
ustrial and Marine Bacter
ia; POBox 3]、 135 Abb
eyoad、 Aberdeen八B9 8Dへ。
5cotland、UK )にブタベスト条約に基づい
て寄託されており、その寄託口及び寄託番号は以下のと
おりである。
て寄託されており、その寄託口及び寄託番号は以下のと
おりである。
寄託口:昭和63年(1989) 2月27日寄託番号
: NCIB 40122 また、該15kb断片中の各D 11遺伝子を個々に、
適当なベクター中に組み込んだクローンは、常法に従っ
て各り。遺伝子の上流及び下流にある適当な制限酵素切
断部位を利用して、これらを切り出 8 してクローン化することによって得ることもできる。
: NCIB 40122 また、該15kb断片中の各D 11遺伝子を個々に、
適当なベクター中に組み込んだクローンは、常法に従っ
て各り。遺伝子の上流及び下流にある適当な制限酵素切
断部位を利用して、これらを切り出 8 してクローン化することによって得ることもできる。
該クローン化に、Charon 4 へベクターを用い
た場合は、宿主として−1−記の大腸菌が利用てきる。
た場合は、宿主として−1−記の大腸菌が利用てきる。
また、プラスミドヘクターを用いたクローンとしては、
例えば、後述の実施例2で得られたプラスミドpPDX
P (D xp+遺伝子を含む)、プラスミドpDA
(D A4遺伝子を含む)、プラスミドpDK(D
KI遺伝子を含む)、プラスミドpDN (D N4
遺伝子を含む)、プラスミドpDM(DM2遺伝子を含
む〉、プラスミドpDLR(D +、n+遺伝子を含む
)等を辛げろことかてきる。
例えば、後述の実施例2で得られたプラスミドpPDX
P (D xp+遺伝子を含む)、プラスミドpDA
(D A4遺伝子を含む)、プラスミドpDK(D
KI遺伝子を含む)、プラスミドpDN (D N4
遺伝子を含む)、プラスミドpDM(DM2遺伝子を含
む〉、プラスミドpDLR(D +、n+遺伝子を含む
)等を辛げろことかてきる。
なお、これらプラスミドpPDXPを有する大腸菌MV
]]84は昭和63年12月15日付で、ブタベスト条
約にj、(ついて工業技術院微生物工業技術研究所[茨
城県つくば車乗1 ”−J−[11番3号(郵便番号3
05 ) ]に寄託され、各寄託番号は次のとおりであ
る。
]]84は昭和63年12月15日付で、ブタベスト条
約にj、(ついて工業技術院微生物工業技術研究所[茨
城県つくば車乗1 ”−J−[11番3号(郵便番号3
05 ) ]に寄託され、各寄託番号は次のとおりであ
る。
大腸菌pPDXP (プラスミドppoxpを有すル
)= 9 FERM BP−2193 大腸菌pDA (プラスミドpDAを有する):FE
RM BP−2188 大腸菌pDK (プラスミドpDKを有する):FE
RM BP−2189 大腸菌pDM (プラスミドpDMを有する):FE
RM BP−2191 大腸菌pDN (プラスミドpDNを有する):FA
RM HP−2192 大腸菌pDLR(プラスミドpDLRを有する):FE
RM HP−2190 この15kbD N A断片の塩基配列は第2図に示す
とおりである。
)= 9 FERM BP−2193 大腸菌pDA (プラスミドpDAを有する):FE
RM BP−2188 大腸菌pDK (プラスミドpDKを有する):FE
RM BP−2189 大腸菌pDM (プラスミドpDMを有する):FE
RM BP−2191 大腸菌pDN (プラスミドpDNを有する):FA
RM HP−2192 大腸菌pDLR(プラスミドpDLRを有する):FE
RM HP−2190 この15kbD N A断片の塩基配列は第2図に示す
とおりである。
第2図において、シグナルヘプタマー、シグナルノナマ
一部分に下線が引かれ、オーブンリープ′イングフレー
ム(D11コード領域)には太い下線が引かれている。
一部分に下線が引かれ、オーブンリープ′イングフレー
ム(D11コード領域)には太い下線が引かれている。
また、典型的なりHコード領域の隣接領域のなか以外の
領域にも15個のCへG (八/T) GTG領域が存
在し、そこにも下線が引いである。
領域にも15個のCへG (八/T) GTG領域が存
在し、そこにも下線が引いである。
0
それらのうちの1つで、DM遺伝子の上流に位置するヘ
プタマーはシグナルノナマーにより取り囲まれている。
プタマーはシグナルノナマーにより取り囲まれている。
第1図の初めの9kb領域■には、6個の異なるD H
遺伝子が同定された。すなわち、 5′Dxp4−(]
061bp)−DA4−(889bp)−Dk<−(1
773bp)D H4−(1:1Obp)−D M+−
(2610bp)−D LR+−:]’である。
遺伝子が同定された。すなわち、 5′Dxp4−(]
061bp)−DA4−(889bp)−Dk<−(1
773bp)D H4−(1:1Obp)−D M+−
(2610bp)−D LR+−:]’である。
DxpとDl、11の間には特徴的な+6bpの繰り返
し配列が存在し、これらは21回繰り返され、該繰り返
し部分の共通配列は、(I:’「GG(G/八) C(
C/下) T (C/八)AC(C/下) TG (A
/G)である(なお、「/」は「または」を意味する)
。また、DXI+4の上流には同し1libp配列が1
7回繰り返されている。
し配列が存在し、これらは21回繰り返され、該繰り返
し部分の共通配列は、(I:’「GG(G/八) C(
C/下) T (C/八)AC(C/下) TG (A
/G)である(なお、「/」は「または」を意味する)
。また、DXI+4の上流には同し1libp配列が1
7回繰り返されている。
軍1図の■領域の次の!] k b領域の前゛r部分■
には、I)xr’遺伝子を含むDNA断片が重複化して
おり、D xp+ とDxp・1が存在する。
には、I)xr’遺伝子を含むDNA断片が重複化して
おり、D xp+ とDxp・1が存在する。
この■領域でのD H遺伝子の配列順序は、 5′D
xp+ −(97bI’)−D xp・+−(804b
p)−D A+−(884bp)Dk、−(1426b
p)−DN+−(430bp)−DM□−3′であ2す る。
xp+ −(97bI’)−D xp・+−(804b
p)−D A+−(884bp)Dk、−(1426b
p)−DN+−(430bp)−DM□−3′であ2す る。
なお、DLR2は、まだ本発明者らの配列決定はそこま
で到達していないが、前に挙げた5iebenlist
らの報告(参考文献3)のとおりに存在しているはずで
ある。
で到達していないが、前に挙げた5iebenlist
らの報告(参考文献3)のとおりに存在しているはずで
ある。
また、第1図■部分と■部分での繰り返し配列を対比す
ると、4つの大きな欠失及び押入部分が存在し、それら
は■(256bp) 、■(859bp) 、[相](
499bp) 、■(16bp)で表示された部分(四
角で囲んだり、塗りつぶした3角の印がついている)で
ある(第1図にも対応する部分を示しである)。
ると、4つの大きな欠失及び押入部分が存在し、それら
は■(256bp) 、■(859bp) 、[相](
499bp) 、■(16bp)で表示された部分(四
角で囲んだり、塗りつぶした3角の印がついている)で
ある(第1図にも対応する部分を示しである)。
更に、0部分と0部分では、点変異や1〜3ヌクレオチ
ドの欠失、挿入のような僅かの相違の存在も認められた
(後述の表1)。
ドの欠失、挿入のような僅かの相違の存在も認められた
(後述の表1)。
DLRIの上流領域のDXP4遺伝子は、DLRIの下
流領域において局所的に重複化されD XPI遺伝子及
びI)xp・1遺伝子となっている。
流領域において局所的に重複化されD XPI遺伝子及
びI)xp・1遺伝子となっている。
先に挙げた参考文献4の報告で、相同的配列の(11:
ACAG (Ch) CGTC,CG (C/下)にお
ける不平等交差(乗り換えcross ing−ove
r)が生じるであろうという仮 2 説は、上記の事実によって確証された。
ACAG (Ch) CGTC,CG (C/下)にお
ける不平等交差(乗り換えcross ing−ove
r)が生じるであろうという仮 2 説は、上記の事実によって確証された。
以−1=第1図および第2図で説明したように、本発明
者らがクローン化した15kb断片中に新たに3つのD
H遺伝子ファミリーが見い出されたことから、D11遺
伝子領域中に存在するD1□遺伝子の総数は約30と見
積ることができる。
者らがクローン化した15kb断片中に新たに3つのD
H遺伝子ファミリーが見い出されたことから、D11遺
伝子領域中に存在するD1□遺伝子の総数は約30と見
積ることができる。
すなわち、5icbenlistら(参考文献3)は、
4個り5、R遺伝子ファミリーに属するDl−+a伝子
がヒトのゲノム」−で9kbの間隔で直列にコードされ
ていると報告している。最近、Matsudaら(参考
文献7)は、V、遺伝子領域の中に更に1つのDLR遺
伝子(Dl、ns)を同定した。Buluwelら(参
考文献8)もまた、D H遺伝子の犬及び小クラスター
の構成の特性を記述した。
4個り5、R遺伝子ファミリーに属するDl−+a伝子
がヒトのゲノム」−で9kbの間隔で直列にコードされ
ていると報告している。最近、Matsudaら(参考
文献7)は、V、遺伝子領域の中に更に1つのDLR遺
伝子(Dl、ns)を同定した。Buluwelら(参
考文献8)もまた、D H遺伝子の犬及び小クラスター
の構成の特性を記述した。
なお、本発明の15kbD N A断片は、これら公表
論文のDLR4の3′側よりDLR2の5′側までの部
分に相当するものである。
論文のDLR4の3′側よりDLR2の5′側までの部
分に相当するものである。
木発明者らは、実施例3においてDI+遺伝子の総数を
見積るために、第1図に示すような異なるファミリーに
属するDl+遺伝子を個々にそれぞれ 3 含む6つのプローブ(第1図中の−で示された部分のD
NA断片をそれぞれ含むクローン)を調製し、これらの
プローブをイ吏用した、BamHI、EcoR■及びH
i n d mでそれぞれ消化処理したヒト胎盤DNA
のササーンハイブリダイゼーションを行なった。
見積るために、第1図に示すような異なるファミリーに
属するDl+遺伝子を個々にそれぞれ 3 含む6つのプローブ(第1図中の−で示された部分のD
NA断片をそれぞれ含むクローン)を調製し、これらの
プローブをイ吏用した、BamHI、EcoR■及びH
i n d mでそれぞれ消化処理したヒト胎盤DNA
のササーンハイブリダイゼーションを行なった。
DLRプローブは、BamHI消化物では18.7,2
.6.5.2.2及び1.9kbに相当する位置に5つ
のバンドを同定したが、これは上述の参考文献3での報
告とほぼ同じであった。D xpプローブは、BamH
I消化物では20.7,2.6.5.4.4及び3.7
kbに相当する位置に5つのハンドを同定した。回様に
、DA、DK及びDMプローブは上記3種の異なる制限
酵素の1種で5つのバンドを同定した。
.6.5.2.2及び1.9kbに相当する位置に5つ
のバンドを同定したが、これは上述の参考文献3での報
告とほぼ同じであった。D xpプローブは、BamH
I消化物では20.7,2.6.5.4.4及び3.7
kbに相当する位置に5つのハンドを同定した。回様に
、DA、DK及びDMプローブは上記3種の異なる制限
酵素の1種で5つのバンドを同定した。
このことは、これら5つのD I4遺伝子ファミリー(
DLR,D、p、DA 、DK及びDM)はすべて5つ
のメンバーより構成されていることを示す。
DLR,D、p、DA 、DK及びDM)はすべて5つ
のメンバーより構成されていることを示す。
なお、DNプローブでは、上記3種全ての制限酵素にお
ける消化物で3つのバンドしか同定され 4 ていないが、これは9kbの繰り返しのヌクレオチド配
列が繰り返し領域間で良く似ているので、1つのバンド
が2つ以上のり、遺伝子を含んでいたために生じた可能
性がある。また、これに加えて、大きなりNA断片もま
た、2つ以上のDI1m伝子を含んでいる可能性もある
かもしれない。
ける消化物で3つのバンドしか同定され 4 ていないが、これは9kbの繰り返しのヌクレオチド配
列が繰り返し領域間で良く似ているので、1つのバンド
が2つ以上のり、遺伝子を含んでいたために生じた可能
性がある。また、これに加えて、大きなりNA断片もま
た、2つ以上のDI1m伝子を含んでいる可能性もある
かもしれない。
これらプローブのそれぞれの大きさは、はぼ500ヌク
レオチド長であるが、プローブでカバーされる領域中に
制限酵素切断部位があるため、あるプローブが1個のD
u遺伝子に対し2個のバンドを同定する可能性もある。
レオチド長であるが、プローブでカバーされる領域中に
制限酵素切断部位があるため、あるプローブが1個のD
u遺伝子に対し2個のバンドを同定する可能性もある。
すなわち、これらの要因によりサザーンハイプリダイゼ
ーションによるDH遺伝子の数の見積りは妨害を受る可
能セI:がある。
ーションによるDH遺伝子の数の見積りは妨害を受る可
能セI:がある。
しかしながら、それぞれのプローブはDNプローブを除
き3種の制限酵素に3〜5のバンドを同定したので、5
つの9kb間隔を置いた繰り返しがそれぞれ6種のD
H遺伝子ファミリーを含んでおり、D H遺伝子の総数
がほぼ30であるということはほぼ間違いない。
き3種の制限酵素に3〜5のバンドを同定したので、5
つの9kb間隔を置いた繰り返しがそれぞれ6種のD
H遺伝子ファミリーを含んでおり、D H遺伝子の総数
がほぼ30であるということはほぼ間違いない。
5
一方、第4図に示すように、L記15kbD N A断
片中の各D□遺伝子は7つのDH遺伝子のファミリーに
分類された。
片中の各D□遺伝子は7つのDH遺伝子のファミリーに
分類された。
各D H遺伝子は図示するように12ヌクレオチドスペ
ーサーで分離されたシグナル ヘプタマーとノナマー(
下線が引かれている)にその両側が取り囲まれている。
ーサーで分離されたシグナル ヘプタマーとノナマー(
下線が引かれている)にその両側が取り囲まれている。
D 1.lll −D ’1.11.Iは1)f1°述
の5icbCnlislらの報1z(参考文献3)で公
表されたものである。
の5icbCnlislらの報1z(参考文献3)で公
表されたものである。
ところが、本発明者らの分析では、D LR+のほぼ中
央部は、AAではなくGGであった。これは本発明者ら
による新たな知見である。
央部は、AAではなくGGであった。これは本発明者ら
による新たな知見である。
また、DLR5は参考文献9に、D、イ。52は参考文
献10)に報告されたものである。
献10)に報告されたものである。
第4図の比較結果かられかるように、同一り。
遺伝子ファミリーに属するD H遺伝子間でシグナルヘ
プタマーは良く保存されている。ただし、DM2の5′
側でCAC八GへGの代りにCへCへGCGが見つかり
、DA+の5′側でTGCTGTGが見つかった。
プタマーは良く保存されている。ただし、DM2の5′
側でCAC八GへGの代りにCへCへGCGが見つかり
、DA+の5′側でTGCTGTGが見つかった。
これに対し、シフナルノナマーは比較的に共通 6
ノナマー(GGTTTTTGTまたは八(:へへへへへ
[;[: )から分岐していた。
[;[: )から分岐していた。
この現象は、rgおよびT細胞レセプター(Tile)
遺伝子(#考文献11)の別のシグナル領域の中に船釣
に見られる。
遺伝子(#考文献11)の別のシグナル領域の中に船釣
に見られる。
なお、マウスの12個のり、□遺伝子は3つのファミリ
ー(DS+’2 、DFLIli及びDor、2)に分
類された(参考文献2)。
ー(DS+’2 、DFLIli及びDor、2)に分
類された(参考文献2)。
最大のファミリーのDsp□はTへCTへTGGT配列
を中心領域に含んでいる。また、一番頻繁に使用される
DI+遺伝子のDFLIfi、IはTへCTへCGGT
配列を含んでいる。DsP2ファミリーはTyr−Ty
r−Gly 。
を中心領域に含んでいる。また、一番頻繁に使用される
DI+遺伝子のDFLIfi、IはTへCTへCGGT
配列を含んでいる。DsP2ファミリーはTyr−Ty
r−Gly 。
Thr−Met 、 Leu−Trpをコードし得るも
のであり、またD FLIfi、 +はTyr−Tyr
−Gay 、 Thr−Thr 、Leu八rへをコー
ドシ得るものである。
のであり、またD FLIfi、 +はTyr−Tyr
−Gay 、 Thr−Thr 、Leu八rへをコー
ドシ得るものである。
ところで、マウス体細胞D H配列の大多数はTyr−
Tyr−Glyを含んでいる(参考文献12)。
Tyr−Glyを含んでいる(参考文献12)。
このことは、マウスでは3通りのオーブンリーディング
フレームの中の1つが主に使用されていることを示唆し
ている。
フレームの中の1つが主に使用されていることを示唆し
ている。
7
これに反して、ヒトでは第5図に示すように、3通りの
オーブンリーディングフレームがすべて等しく使われて
いる。
オーブンリーディングフレームがすべて等しく使われて
いる。
なお、第5図の15個の体細胞型DH遺伝子の配列は参
考文献4に公表されたものである。また、第5図に要約
されているヌクレオチド配列の他にも、多数のヒト体細
胞型DH領域のアミノ酸配列が報告されている(参考文
献12)。
考文献4に公表されたものである。また、第5図に要約
されているヌクレオチド配列の他にも、多数のヒト体細
胞型DH領域のアミノ酸配列が報告されている(参考文
献12)。
これらは第6図に示すように2つの組み合せ、すなわち
同一アミノ酸からなるROMとLAY、及び同一アミノ
酸配列[RPPWRFT(八rg−Pro−Pro−T
rp−八rg−Phe−Thr ]を含むMCEとNZ
Uを除いては完全に分岐している。
同一アミノ酸からなるROMとLAY、及び同一アミノ
酸配列[RPPWRFT(八rg−Pro−Pro−T
rp−八rg−Phe−Thr ]を含むMCEとNZ
Uを除いては完全に分岐している。
その他のアミノ酸配列は、3アミノ酸以上の長さの配列
相同性を有していない。
相同性を有していない。
次に、体細胞型DI4のアミノ酸配列と、第4図のヌク
レオチド配列から決めた胎児型DHのアミノ酸配列とが
以下のように比較された。
レオチド配列から決めた胎児型DHのアミノ酸配列とが
以下のように比較された。
3通りのオーブンリーディングフレームはすべて読み出
されことができると仮定して、4つの78 ミノ酸の内で3つのアミノ酸が一致する例、あるいは4
つのより多いアミノ酸が一致する例が探された。
されことができると仮定して、4つの78 ミノ酸の内で3つのアミノ酸が一致する例、あるいは4
つのより多いアミノ酸が一致する例が探された。
これらの判断基準を体細胞型D□の胎児型D11への帰
属に採用した理由は、偶然の一致のために3つのアミノ
酸が一致することはほぼ起こり得ないといえるからであ
る。見かけ上のアミノ酸配列はこれらの間で非常に異な
っているが、第6図に示すように19個の体細胞型D
H配列は胎児型り。
属に採用した理由は、偶然の一致のために3つのアミノ
酸が一致することはほぼ起こり得ないといえるからであ
る。見かけ上のアミノ酸配列はこれらの間で非常に異な
っているが、第6図に示すように19個の体細胞型D
H配列は胎児型り。
遺伝子のどれか1つに帰属された。
なお第6図において、体細胞型DH遺伝子配列は参考文
献12に報告されているものであり、胎児型DH遺伝子
配列は第2図のヌクレオチド配列から決定されたもので
ある。なお、共通のアミノ酸部分には下線が引かれてい
る。第6図において各アルファベットは以下に示1−ア
ミノ酸を表す。
献12に報告されているものであり、胎児型DH遺伝子
配列は第2図のヌクレオチド配列から決定されたもので
ある。なお、共通のアミノ酸部分には下線が引かれてい
る。第6図において各アルファベットは以下に示1−ア
ミノ酸を表す。
A : 八Ia C: Cys D
: Asp E : GluF:Phe
G:GIy H:t(is I :IIeK :
Lys L : Leu M
: Met、 N : 八snP :
Pro Q : Gln R:
八rg S : Ser9 T : Thr V : Val W :
Trp Y : TyrMCEとNZUで見ら
れた異なる体細胞型り。
: Asp E : GluF:Phe
G:GIy H:t(is I :IIeK :
Lys L : Leu M
: Met、 N : 八snP :
Pro Q : Gln R:
八rg S : Ser9 T : Thr V : Val W :
Trp Y : TyrMCEとNZUで見ら
れた異なる体細胞型り。
配列中の同一配列の存在は、これらがTdTによる無秩
序なヌクレオチド挿入の産物ではなくて、胎児型配列の
中にコードされていることを示している。
序なヌクレオチド挿入の産物ではなくて、胎児型配列の
中にコードされていることを示している。
RPPWRをコードしていると予測されるヌクレオチド
配列はGCに富んでいる。これらはDIR領域にコード
されているようである。
配列はGCに富んでいる。これらはDIR領域にコード
されているようである。
15個の公表された体細胞型D□配列は、すべてDNA
配列レベルでは胎児型DII遺伝子またはDIR遺伝子
のどれかに帰属されているので(第5図)、本発明の1
5kbD N A断片に含まれる7種のD H遺伝子フ
ァミリーとは異なる多くの他のDH遺伝子が残っている
可能性は少ないと考えられる。
配列レベルでは胎児型DII遺伝子またはDIR遺伝子
のどれかに帰属されているので(第5図)、本発明の1
5kbD N A断片に含まれる7種のD H遺伝子フ
ァミリーとは異なる多くの他のDH遺伝子が残っている
可能性は少ないと考えられる。
第6図中でこれまでに決めた胎ylR型DIl逍イ云子
に帰属できない体細胞型DH遺伝子は、6種のDI+遺
伝子ファミリーに属する別のDI+遺伝子に 0 由来するのかもしれないし、また配列の分岐は体細胞突
然変異により更に拡大しているのかもしれない。
に帰属できない体細胞型DH遺伝子は、6種のDI+遺
伝子ファミリーに属する別のDI+遺伝子に 0 由来するのかもしれないし、また配列の分岐は体細胞突
然変異により更に拡大しているのかもしれない。
従って、ヒトIgH釦のCDRm領域中の大きな多様性
は、限られた数の胎児型I)++逍遺伝北よび体細胞突
然変異により作られたということはもっとなことである
。
は、限られた数の胎児型I)++逍遺伝北よび体細胞突
然変異により作られたということはもっとなことである
。
これらの結果は、IgH鎖の体細胞D I+配列が、マ
ウスとヒトでは木質的に同じ機構で作られており、V
o−D o−J□槽構造中体細胞D□領域の中心部が各
々唯一のD H遺伝子から山未していることを示してい
る。
ウスとヒトでは木質的に同じ機構で作られており、V
o−D o−J□槽構造中体細胞D□領域の中心部が各
々唯一のD H遺伝子から山未していることを示してい
る。
(以下余白)
方、D、遺伝子の進化については以下のような仮説が立
てられている。
てられている。
5akanoらにより■及びCドメインをコードするD
NA断片は、おそらく原始的遺伝子の多重化により牛じ
たものであろうとの推論がなされ(参考文献10、更に
、5akano (参考文献13)らは先祖のVコート
DNA断片は連続していたが、抑大断片(IS)様DN
A要素かこの先祖V遺伝子の中に挿入されVとJ遺伝子
という2つの部分に分けられたと提唱した。
NA断片は、おそらく原始的遺伝子の多重化により牛じ
たものであろうとの推論がなされ(参考文献10、更に
、5akano (参考文献13)らは先祖のVコート
DNA断片は連続していたが、抑大断片(IS)様DN
A要素かこの先祖V遺伝子の中に挿入されVとJ遺伝子
という2つの部分に分けられたと提唱した。
そこで推定−ヒのIs様D N A 鰻素の両端には、
12汝び23ヌクレオチドスペーサーシグナルの存在を
仮定し、また同様のIs様断片がさらにもう一度J遺伝
子の5′端の近くに挿入され、DとJJ伝子に分けられ
たのではないかと考えられる。
12汝び23ヌクレオチドスペーサーシグナルの存在を
仮定し、また同様のIs様断片がさらにもう一度J遺伝
子の5′端の近くに挿入され、DとJJ伝子に分けられ
たのではないかと考えられる。
IgやTCR遺伝子部位におけるスペーサーの長さの規
則性はこの仮説により説明される。
則性はこの仮説により説明される。
更にこのIs様DNA断片はどちら向きにも挿入された
であろう。
であろう。
2
実際、ツノザメのIgH鎖遺伝子部位で見られるD H
遺伝子は5′側に12ヌクレオチドスペーサーシグナル
を、また3′側に23ヌクレオチドスベーサーシクナル
を含んでいる(参考文献]5) このIs仮説が正しいならば、J H遺伝子領域の近く
に位置するD I(。52が最初に進化したり、遺伝子
であるは1′である。
遺伝子は5′側に12ヌクレオチドスペーサーシグナル
を、また3′側に23ヌクレオチドスベーサーシクナル
を含んでいる(参考文献]5) このIs仮説が正しいならば、J H遺伝子領域の近く
に位置するD I(。52が最初に進化したり、遺伝子
であるは1′である。
そこで、他のD H遺伝子はDll 0 li 2遺伝
子から由来しているのだろうかという疑問が出てくる。
子から由来しているのだろうかという疑問が出てくる。
しかしながら、シフナル領域における突然変異頻度の程
度が介在領域におけるよりもわずかに低いにも拘らず、
これら6つの異なるDH遺伝子が四−の原始DH遺伝子
より由来しているというのはありそうもないことである
。DH遺伝子の本質的機能は分岐性を創造することなの
で、通常の蛋白質をコードする遺イ五子のようにDu遺
伝子のヌクレオチド配列を保持するような進化−Lの選
択圧力が秤イFするのは理屈にあわない。機能を持たな
いI)u遺伝子の創造は生存能力にはなんの影響も及
3 さないのかもしれない。
度が介在領域におけるよりもわずかに低いにも拘らず、
これら6つの異なるDH遺伝子が四−の原始DH遺伝子
より由来しているというのはありそうもないことである
。DH遺伝子の本質的機能は分岐性を創造することなの
で、通常の蛋白質をコードする遺イ五子のようにDu遺
伝子のヌクレオチド配列を保持するような進化−Lの選
択圧力が秤イFするのは理屈にあわない。機能を持たな
いI)u遺伝子の創造は生存能力にはなんの影響も及
3 さないのかもしれない。
Akiraら(参考文献11)は、スペーサーの長さと
同じヘプタマーやノナマー配列が組み換えに木質的であ
り、スペーサー領域におけるヌクレオチド配列は重要で
はないということを示した。
同じヘプタマーやノナマー配列が組み換えに木質的であ
り、スペーサー領域におけるヌクレオチド配列は重要で
はないということを示した。
しかしなから、Ichiharaらが指摘しいているよ
うに(参考文献4)、シグナルノナマーやヘプタマー配
列ばかりではなくスペーサー領域もまた一般的に回分式
(パリンドローム的)である。
うに(参考文献4)、シグナルノナマーやヘプタマー配
列ばかりではなくスペーサー領域もまた一般的に回分式
(パリンドローム的)である。
この特徴は突然変異の結果ではありえず、DI+遺伝子
の起源の反映であると考え得る。
の起源の反映であると考え得る。
以−ヒの推論や仮説に対して、本発明において得られた
新たな知見は、次のような新たな実証への手かがりを提
供する。
新たな知見は、次のような新たな実証への手かがりを提
供する。
第7図は、本発明の15kbD N A断片中にある新
規なりIR遺遺伝ソファミリ−属する不規則スペーサー
シグナルを含むDH遺伝子の概要である。
規なりIR遺遺伝ソファミリ−属する不規則スペーサー
シグナルを含むDH遺伝子の概要である。
第7図(a)に示されるように、DM遺(i子のL流に
CA[;へGTG配列が在している。このヘプタマーは
シグナルノナマー様配列により両側を取り 4 囲まれている。]゛と八は、それぞれG G i”I下
1”I’ G ’I’−及びACAAAAA(1ニ一様
配列を示している。上側の配列(D +++、−DM+
)は第1図の触初の9kb鎮域■のIに、また下側の配
列(D IR2−D M2)は第1図の■に続< 9k
b領域の前半領域■中に存在する。
CA[;へGTG配列が在している。このヘプタマーは
シグナルノナマー様配列により両側を取り 4 囲まれている。]゛と八は、それぞれG G i”I下
1”I’ G ’I’−及びACAAAAA(1ニ一様
配列を示している。上側の配列(D +++、−DM+
)は第1図の触初の9kb鎮域■のIに、また下側の配
列(D IR2−D M2)は第1図の■に続< 9k
b領域の前半領域■中に存在する。
これらのDIR遺伝子間で相違しているヌクレオチドに
は点が付されている。胎児型D□配列のどれにも帰属で
きなかった2つの体細胞型D I4配列(HIGIと3
33)は、これら領域と配列相同性を有している。この
HIGIの体細胞型り、1配列は相補性配列を有してお
り、また333の体細胞型DH配列はDIR遺伝子領域
と同じ方向で相同性を示している。コロン(=)は体細
胞型DH遺伝子と胎児型DIR遺伝子の間で一致してい
る、あるいは相補性のあるヌクレオチドを示している。
は点が付されている。胎児型D□配列のどれにも帰属で
きなかった2つの体細胞型D I4配列(HIGIと3
33)は、これら領域と配列相同性を有している。この
HIGIの体細胞型り、1配列は相補性配列を有してお
り、また333の体細胞型DH配列はDIR遺伝子領域
と同じ方向で相同性を示している。コロン(=)は体細
胞型DH遺伝子と胎児型DIR遺伝子の間で一致してい
る、あるいは相補性のあるヌクレオチドを示している。
この体細胞DH配列データは、HIGIについては参考
文献16カら、333については参考文献17より引用
した。
文献16カら、333については参考文献17より引用
した。
更に第7図(b)に示すようにDIR領域は、両 5
側を12及び32メクレオチドスベーサーで隔てられた
シグナルヘプタマー及びノナマーにより挟まれている。
シグナルヘプタマー及びノナマーにより挟まれている。
白抜き四角はGGTTTTTGT−およびへCAAAA
ACC−様配列を示す。黒塗り四角はシグナルヘプタマ
ー配列を示す。推定上のD H遺伝子はシグナルヘプタ
マー(黒塗り三角)及びノナマー(白抜き二角)ではさ
まれた白抜き粋で示した。ヘプタマーとノナマーの間の
数字はスペーサーの長さを示す。
ACC−様配列を示す。黒塗り四角はシグナルヘプタマ
ー配列を示す。推定上のD H遺伝子はシグナルヘプタ
マー(黒塗り三角)及びノナマー(白抜き二角)ではさ
まれた白抜き粋で示した。ヘプタマーとノナマーの間の
数字はスペーサーの長さを示す。
このDIlt逍伝了ファミリーか新たに固定されたこと
で、以下のような事項が示唆され得る。
で、以下のような事項が示唆され得る。
参考文献4には、GとC残基に富むHIGIおよび33
3細胞の体細胞D□配列に対応するもうつの胎児型DI
4遺伝子が予言されている。
3細胞の体細胞D□配列に対応するもうつの胎児型DI
4遺伝子が予言されている。
しかし、をでに同定されていた17個の胎児型り、遺伝
子は、これと配列相同性を示さず、更にマウスにおいて
さえ、GとC残基に富む体細胞型り、配列のいくつかは
12個の胎児型D H断片のどれとも相同性を示さない
(参考文献2)。
子は、これと配列相同性を示さず、更にマウスにおいて
さえ、GとC残基に富む体細胞型り、配列のいくつかは
12個の胎児型D H断片のどれとも相同性を示さない
(参考文献2)。
AltとBaltimore (参考文献18)は、
N領域の 6 分岐に末端転移酵素の関与を提案した際に、N領域には
GCに富む配列が高頻度で現れることと末端転移酵素が
dGC残基選択しやすいことを強調した。
N領域の 6 分岐に末端転移酵素の関与を提案した際に、N領域には
GCに富む配列が高頻度で現れることと末端転移酵素が
dGC残基選択しやすいことを強調した。
このような胎児型り。遺伝子のどれにも帰属されなかっ
たGCに富む体細胞型DI、配列において、胎児型り、
1遺伝子によりコードされている領域はおそらくエクソ
ヌクレアーゼ活性により除かれているのであろうと考え
られる。
たGCに富む体細胞型DI、配列において、胎児型り、
1遺伝子によりコードされている領域はおそらくエクソ
ヌクレアーゼ活性により除かれているのであろうと考え
られる。
これに対し、本発明者らは第7図(a)に示すように、
DM遺伝子の上流に、配列がHIGID□配列に相補的
(18/2]ヌクレオチド)で、かつ333細胞のDH
配列と相同的な(16723ヌクレオチド)DNA領域
を発見した。このDNA9A域を取り囲む領域は上述の
ようにいくつかのシグナルヘプタマーとノナマーを含ん
でいる。第7図(b)にはその位置とスペーサー長が図
解的に示されている。
DM遺伝子の上流に、配列がHIGID□配列に相補的
(18/2]ヌクレオチド)で、かつ333細胞のDH
配列と相同的な(16723ヌクレオチド)DNA領域
を発見した。このDNA9A域を取り囲む領域は上述の
ようにいくつかのシグナルヘプタマーとノナマーを含ん
でいる。第7図(b)にはその位置とスペーサー長が図
解的に示されている。
このDTl+遺伝子ファミリーにおける5′端のヘプタ
マーとDM遺伝子のヘプタマーとの間の距離7 ばかなり長い(127または151)にも拘らず、これ
ら領域は両端を12及び23ヌクレオチドスベサーシグ
ナルの両者により取り囲まれているこことがわかる。
マーとDM遺伝子のヘプタマーとの間の距離7 ばかなり長い(127または151)にも拘らず、これ
ら領域は両端を12及び23ヌクレオチドスベサーシグ
ナルの両者により取り囲まれているこことがわかる。
このDI+?領域は欠失または逆位によりD IR−D
、結合に関与している可能性がある。
、結合に関与している可能性がある。
興味あることに、相同な配列をならべてみると、HIG
Iのり、とDIRの極性は逆で333とDIRの極性は
同じである。推定上のDIR−DI4結合は5′側に1
2及び23ヌクレオチドスペーサーシグナルを、また3
′側に12ヌクレオチドスペーサーシグナルを持つはず
なので、V o−D IR−D u−JH、VH−DH
−DIR−JH及びV +<−D u−D I R−D
H−JHの構造のどれかを形成するための基質であるか
もしれない。
Iのり、とDIRの極性は逆で333とDIRの極性は
同じである。推定上のDIR−DI4結合は5′側に1
2及び23ヌクレオチドスペーサーシグナルを、また3
′側に12ヌクレオチドスペーサーシグナルを持つはず
なので、V o−D IR−D u−JH、VH−DH
−DIR−JH及びV +<−D u−D I R−D
H−JHの構造のどれかを形成するための基質であるか
もしれない。
次に本発明者らによって得られた知見を基にり、遺伝子
および介在領域での突然変異の頻度を計算するために、
第1図の■と■の部分が比較検討された。
および介在領域での突然変異の頻度を計算するために、
第1図の■と■の部分が比較検討された。
DH遺伝子が機能を有する断片であるために 8
は、両側の21ヌクレオチドスペーサーシグナルの存在
が本質的であると思われる。
が本質的であると思われる。
表1に第1図の■と■の部分における突然変異の頻度を
要約した。
要約した。
(ユフ= −j” z=l’ j4j>なお、この比較
から4つの長い挿入または欠失領域(第1図及び第2図
に示した■〜Oで示された部分)はのぞかれている。
から4つの長い挿入または欠失領域(第1図及び第2図
に示した■〜Oで示された部分)はのぞかれている。
表1のグループ■は16bp繰り返し領域とI)xp遺
飯r−の間の領域に、グループIIはDX11遺伝子と
DA遺遺伝の間の領域にそれぞれ対応する。
飯r−の間の領域に、グループIIはDX11遺伝子と
DA遺遺伝の間の領域にそれぞれ対応する。
また、1574から1829までの挿入領域、1268
6から]3184まて、 13232から13247ま
で、及び3536から4394までの部分は表1の比較
から除かれている。
6から]3184まて、 13232から13247ま
で、及び3536から4394までの部分は表1の比較
から除かれている。
更に、グループ■はDA遺伝子とDK遺伝子の間のi域
に、クループ■はDK遺伝子とDN遺イ五子の間の領域
にそれぞれ対応している。
に、クループ■はDK遺伝子とDN遺イ五子の間の領域
にそれぞれ対応している。
方、グループVはDN遺伝子とDM遺伝子の間の領域に
、グループ■はDM遺伝子の下流にそれぞれ対応してい
る。。
、グループ■はDM遺伝子の下流にそれぞれ対応してい
る。。
不−・致の(1)と(2)は(塩X)転移(GφAおよ
びTφC)と(塩基)転移(プリンφピリミジン)をそ
れぞれ示す。なお、数字は塩基対数を示している。
びTφC)と(塩基)転移(プリンφピリミジン)をそ
れぞれ示す。なお、数字は塩基対数を示している。
1
表1に示すように、転移:塩基転換の頻度比率は、約3
:2であった。
:2であった。
また、短いヌクレオチドの欠失(または挿入)の総数は
Ibpのものが45同、2bpのものが8圓、:lbp
のものが3回であった。
Ibpのものが45同、2bpのものが8圓、:lbp
のものが3回であった。
介在領域での2つの重複単位間の配列の違いの全体は、
約12木である。
約12木である。
シグナル領域においては、2つの同一遺伝子間でのヌク
レオチドの違いがノナマーでは7bp(8%)、ヘプタ
マーでは4bp(6%)、スペーサー領域では]0bp
(8%)見られた。
レオチドの違いがノナマーでは7bp(8%)、ヘプタ
マーでは4bp(6%)、スペーサー領域では]0bp
(8%)見られた。
シグナル領域及び介在領域における突然変異の大う数は
DNA複製の間違いに起因するものと考えられる。
DNA複製の間違いに起因するものと考えられる。
要約すると 1個のヌクレオチドの不一致は236回、
連続する2個のヌクレオチドの不一致は52回、連続す
る3個のヌクレオチドの不一致は7回、連続する4個の
ヌクレオチドの不一致は1目、連続する8個のヌクレオ
チドの不一致は11す1であった。
連続する2個のヌクレオチドの不一致は52回、連続す
る3個のヌクレオチドの不一致は7回、連続する4個の
ヌクレオチドの不一致は1目、連続する8個のヌクレオ
チドの不一致は11す1であった。
2
1〜3個のヌクレオチドの欠失または挿入の大多数はG
eeにからGCCまたはGCCCCへのようなりNAポ
リメラーゼのすべり(slippage)反応(参考文
献21)により起こっている。
eeにからGCCまたはGCCCCへのようなりNAポ
リメラーゼのすべり(slippage)反応(参考文
献21)により起こっている。
DI+コード領域に見られる突然変異のいくつかは上記
と同様である。
と同様である。
D□コード領域とDA1コード領域の間には差異はなく
、DMIコード領域とDM2コード領域では2個所に1
個のヌクレオチドの不一致が見られた。
、DMIコード領域とDM2コード領域では2個所に1
個のヌクレオチドの不一致が見られた。
DNIコード領域とDN4コード領域の間での連続する
3個のヌクレオチドの欠失(または挿入)はDNAポリ
メラーゼのすべり反応に起因するかもしれない。という
のは、へGC配列の3回繰り返しの中の1個の八GGが
欠失していたからである。
3個のヌクレオチドの欠失(または挿入)はDNAポリ
メラーゼのすべり反応に起因するかもしれない。という
のは、へGC配列の3回繰り返しの中の1個の八GGが
欠失していたからである。
例えば、D XPI とDXP1との間、DK4とDK
+との間、DLRファミリー等の、その他のDHコード
領域で見られる差異は、異なる特徴を持っている。
+との間、DLRファミリー等の、その他のDHコード
領域で見られる差異は、異なる特徴を持っている。
突然変異したヌクレオチドは限られた領域に密 3
集しており、分岐したヌクレオチドは他のD Hコード
領域と相同++1°を示している。
領域と相同++1°を示している。
参考文献4では、D11遺伝子のコード配列が短いオリ
ゴヌクレオチドから組み立てられているように見え、D
XPI中のG 八’I’ A ’I”rやD xp・
1の中のGGGGAのような分岐した配列がそれぞれD
LRIやD I+。52の中にも范い出されることが指
摘された。
ゴヌクレオチドから組み立てられているように見え、D
XPI中のG 八’I’ A ’I”rやD xp・
1の中のGGGGAのような分岐した配列がそれぞれD
LRIやD I+。52の中にも范い出されることが指
摘された。
そこで、遺伝子変換(参考文献19)は、D Hコード
領域における分岐性を高めている主軒路の1つであるか
もしれないといえる。
領域における分岐性を高めている主軒路の1つであるか
もしれないといえる。
更に、ヒ述の本発明における新たな知見を用いてマウス
とヒトのDH配列が比較された。
とヒトのDH配列が比較された。
その結果、第8図(a)に示すように。1つのヒトD。
遺伝子のD)Iコードおよびシグナル配列はマウスのD
sp□のものと8]!j; (59/73)の相同性
を有しており、そのLにDK4の場合にはD11遺伝子
領域だけでなく5′側及び3′側隣接配列もD SF3
のものと57本(135/2:16)の相同性を有して
いることが判明した[第8図(b)]。
sp□のものと8]!j; (59/73)の相同性
を有しており、そのLにDK4の場合にはD11遺伝子
領域だけでなく5′側及び3′側隣接配列もD SF3
のものと57本(135/2:16)の相同性を有して
いることが判明した[第8図(b)]。
4
このことは、−度り、か進化した後は、D、□遺伝子部
位には広範囲な突然変異が起こらなかったことを示唆す
る。
位には広範囲な突然変異が起こらなかったことを示唆す
る。
6つの異るDI+遺伝遺伝子離、この隣接配列は大いに
分岐しているようにみえるが、ある組み合せでは5′隣
接配列の100ヌクレオチド以上にわたり56〜61%
の類似性が見つかった。
分岐しているようにみえるが、ある組み合せでは5′隣
接配列の100ヌクレオチド以上にわたり56〜61%
の類似性が見つかった。
同程度(52〜61%)の相補性が5′と3′隣接配列
の間に見い出された[第9図(a)]。
の間に見い出された[第9図(a)]。
興味深いことには、相補性を示す隣接領域の配列の組み
合せは第9図(b)に示すように異なる遺伝子ファミリ
ーに属している。
合せは第9図(b)に示すように異なる遺伝子ファミリ
ーに属している。
以上の事項を要約すると、
a2重複化してできてきた2つの単位間での介在配列の
相違は約1八であるが、シグナル領域では6〜8%の相
違があり、 b、5′隣接領域配列の間におけるある組み合せては約
60亀の類似性が見い出されており、0.5′ と3′
隣接領域配列の間にもまた約60*の相補性が見い出さ
れており、 5 d、更に、D11コード領域の大多数には、CAC(八
/゛r)GTG−様の配列が見い出された(1’:4図
)。
相違は約1八であるが、シグナル領域では6〜8%の相
違があり、 b、5′隣接領域配列の間におけるある組み合せては約
60亀の類似性が見い出されており、0.5′ と3′
隣接領域配列の間にもまた約60*の相補性が見い出さ
れており、 5 d、更に、D11コード領域の大多数には、CAC(八
/゛r)GTG−様の配列が見い出された(1’:4図
)。
これらの結果に基き、本発明者らはDH遺伝子の起源に
つき以下の仮説を提咄することがてきる。
つき以下の仮説を提咄することがてきる。
第10図に示す構造の原始釣手り遺伝子(prih−D
)のクラスターが存在していた。
)のクラスターが存在していた。
prih−D遺伝子とそれを取り巻く領域のヌクレオチ
ド配列は初めから既に分岐していた。
ド配列は初めから既に分岐していた。
V−(D)−J結合のリコンビナーゼは2つのp r
i h −D遺伝子を認識した。
i h −D遺伝子を認識した。
これらDNA断片のi +1:は同じなので、欠失の代
りに逆位が起こった。
りに逆位が起こった。
N断片は2つのシグナルヘプタマーの間に入れられたの
であろう。
であろう。
この結果得られた断片は、I)oコード領域が二組の1
2ヌクレオチドスペーサーシグナルにより取り囲まれて
いるので、D I4遺伝子としての機能を有している。
2ヌクレオチドスペーサーシグナルにより取り囲まれて
いるので、D I4遺伝子としての機能を有している。
この仮定がこの限定された領域で数回生じ 6
た。
このprih−D遺伝子の起源として推定される遺伝子
は、シグナルを含み、多遺伝子ファミリーからなってお
り、既に分岐しており、クラスターを形成しているはず
である。
は、シグナルを含み、多遺伝子ファミリーからなってお
り、既に分岐しており、クラスターを形成しているはず
である。
このprih−D遺伝子は■遺伝子の3′端であるだろ
う。というのは、D、遺伝子の隣接領域配列とV、遺伝
子の3′隣接領域配列の間に配列類似性が本発明者らに
よって見い出されたからである(第11図〉。
う。というのは、D、遺伝子の隣接領域配列とV、遺伝
子の3′隣接領域配列の間に配列類似性が本発明者らに
よって見い出されたからである(第11図〉。
相同性または相補性の程度(57〜63%)は、D H
遺伝子の隣接領域同士の間で見られるのと非常に似てい
る。
遺伝子の隣接領域同士の間で見られるのと非常に似てい
る。
VH遺伝子がprih−D遺伝子になるためには、23
ヌクレオチドスペーサー領域中にCAC(八/T) G
TG配列が創造されたはずである。
ヌクレオチドスペーサー領域中にCAC(八/T) G
TG配列が創造されたはずである。
このことは起こり得たと考えられる。すなわち、現在の
■。遺伝子の3′側にスペーサーの中にもCAC(八/
T) GTG様の配列が見つかるからである(参考文献
20)。
■。遺伝子の3′側にスペーサーの中にもCAC(八/
T) GTG様の配列が見つかるからである(参考文献
20)。
7
このモデルの有利な点は、逆位で得られたものが機能を
持った分岐D I−1遺伝子であること、及び多種多様
なりI(遺伝子を得るためにはこの他に更に突然変異が
起こったことを仮定する必要がないことである。
持った分岐D I−1遺伝子であること、及び多種多様
なりI(遺伝子を得るためにはこの他に更に突然変異が
起こったことを仮定する必要がないことである。
上記した種々の知見から、ヒト免疫クロプリン重鎖およ
びTCRβ鎖、δ鎖遺伝子におけるVDJ結合の近傍領
域の塩基配列、ずなわちV(−N−D−N)Jは、事実
」二、無限大の今様性を示すことが明らかとなった。
びTCRβ鎖、δ鎖遺伝子におけるVDJ結合の近傍領
域の塩基配列、ずなわちV(−N−D−N)Jは、事実
」二、無限大の今様性を示すことが明らかとなった。
なお、Nは胎児型のV、DあるいはJ遺伝子にコードさ
れていないヌクレオチド断片の略号で、V−D−Jの再
配列の過程で、DNA配列内にターミナルトランスフェ
ラーゼの作用により入るヌクレオチド断片である。
れていないヌクレオチド断片の略号で、V−D−Jの再
配列の過程で、DNA配列内にターミナルトランスフェ
ラーゼの作用により入るヌクレオチド断片である。
例えば、後記の患者骨髄由来のI、D−分泌ミエローマ
細胞のDNAをBam1lIて氷解し、JHプローブで
検出、分離した20kbのDNAをファージにパッケー
ジしたDNAクローンλIGD−1(参考文献26に記
載〉のVll Dll J11再配列系、!7合部拉を
8 第12図に示す。
細胞のDNAをBam1lIて氷解し、JHプローブで
検出、分離した20kbのDNAをファージにパッケー
ジしたDNAクローンλIGD−1(参考文献26に記
載〉のVll Dll J11再配列系、!7合部拉を
8 第12図に示す。
D11部分にはDk+およびD xp・1のみ含まれる
ことが明らかとなった(第1:1図)。
ことが明らかとなった(第1:1図)。
すなわち、他の例を含めて各体細胞型D IIには、本
発明でクローン化された1 5kbのDNA断片等の中
の多数の胎児型D11′J!!、伝子のうちごく一部の
ものが、VHDll JH再配列の際に無作九に使用さ
れており、体細胞4(II l) 、、の塙JJ:配列
はjHH<眼大の多様P1を示し得る。
発明でクローン化された1 5kbのDNA断片等の中
の多数の胎児型D11′J!!、伝子のうちごく一部の
ものが、VHDll JH再配列の際に無作九に使用さ
れており、体細胞4(II l) 、、の塙JJ:配列
はjHH<眼大の多様P1を示し得る。
この無限大の多様性のあるDNA断片に対応する抗体の
ペプチド部付かCDRIII領域である。。
ペプチド部付かCDRIII領域である。。
他方、リンパ球系腫瘍細胞は各個人、それぞれモノクロ
ーナルであることが知られており、腫瘍ごとにD H及
びD I4近傍領域(Nl+’)で固有のDNA断片を
有すると考えられる。
ーナルであることが知られており、腫瘍ごとにD H及
びD I4近傍領域(Nl+’)で固有のDNA断片を
有すると考えられる。
このことから、リンパ系腫瘍に羅患した各患者のり、及
びり、近傍領域(Nl+)の、その患者に固有のDNA
断片の塩基配列を腫瘍マーカーとして決定しておけば、
その配列を有するDANプローブなどを用いて、患者の
全リンパ球(DNA 9 量)における腫瘍細胞(DNA量)の割合を算出するこ
とができる。
びり、近傍領域(Nl+)の、その患者に固有のDNA
断片の塩基配列を腫瘍マーカーとして決定しておけば、
その配列を有するDANプローブなどを用いて、患者の
全リンパ球(DNA 9 量)における腫瘍細胞(DNA量)の割合を算出するこ
とができる。
すなわち、Bリンパ球系腫瘍あるいはTリンパ球系腫瘍
、白血病、骨髄腫等において、種々の抗がん剤やステロ
イド剤による骨髄形成の抑制のための化学療法が行なわ
れている。しかしながら、腫瘍細胞を完全に消滅させる
ことは、副作用などを警戒して、化学療法剤を充分に、
徹底的に投与することができないため、不可能に近い現
状である。
、白血病、骨髄腫等において、種々の抗がん剤やステロ
イド剤による骨髄形成の抑制のための化学療法が行なわ
れている。しかしながら、腫瘍細胞を完全に消滅させる
ことは、副作用などを警戒して、化学療法剤を充分に、
徹底的に投与することができないため、不可能に近い現
状である。
従って、白血病の活動を一時的に抑え込むことができた
、いわゆるリンパ種、白血病の緩解期においても、再生
した正常骨髄細胞中に混入している腫瘍細胞の動態を定
期的に検査・診断し、白血病等の再発を、早期に診断、
予防、治療することが望まれ、行なわれているが、診断
法は、細胞診、骨髄穿刺による骨髄検査などの形態学的
分析にたよらざるをえない状況にある。
、いわゆるリンパ種、白血病の緩解期においても、再生
した正常骨髄細胞中に混入している腫瘍細胞の動態を定
期的に検査・診断し、白血病等の再発を、早期に診断、
予防、治療することが望まれ、行なわれているが、診断
法は、細胞診、骨髄穿刺による骨髄検査などの形態学的
分析にたよらざるをえない状況にある。
骨髄検査においては、白血病性幼若細胞が5〜15%を
超えた時はじめて、再発の診断が可能で 0 あり、早期の的確な診断は困難であり、またリンパ球に
特異的なモノクロナール抗体を用いた細胞蛍光分析法に
よる診断も近年行なわれているが、検出限界はそう改善
されてはいない。
超えた時はじめて、再発の診断が可能で 0 あり、早期の的確な診断は困難であり、またリンパ球に
特異的なモノクロナール抗体を用いた細胞蛍光分析法に
よる診断も近年行なわれているが、検出限界はそう改善
されてはいない。
そこで本発明者らは、前記の知見に基き、リンパ球系細
胞が生産する免疫グロブリン、TCRに対応する再配列
逍イ云子中のVu (N11’ DllN142)
JHのDNA断片、特にり、□領域及びDI+II近傍
領域(No’、N N2) (7) CD RIII
ニ対応する塩基配列が無限の多様性を示すことを利用し
て、腫瘍細胞に固有のDNA断片の配列を同定した上で
、正常リンパ球系細胞のDNA1lに対する割合を算出
するというDNA診断法を完成するに至った。
胞が生産する免疫グロブリン、TCRに対応する再配列
逍イ云子中のVu (N11’ DllN142)
JHのDNA断片、特にり、□領域及びDI+II近傍
領域(No’、N N2) (7) CD RIII
ニ対応する塩基配列が無限の多様性を示すことを利用し
て、腫瘍細胞に固有のDNA断片の配列を同定した上で
、正常リンパ球系細胞のDNA1lに対する割合を算出
するというDNA診断法を完成するに至った。
このDNA診断法は以下の過程を含む。
まず、個々の患者のリンパ球系細胞固有のDNA配列を
決定し、リンパ系腫瘍細胞の量を定量するに当って、は
とんど全ての細胞の■。およびJ H遺伝子に保存され
、共通にみられるDNA断片、すなわちVH中のオリゴ
ヌクレオチドを第1 1のプライマーとし、またJll中のオリゴヌクレオチ
ドと相補的なオリゴヌクレオチドを第2のプライマーと
して合成し、これらを患者リンパ系腫瘍細胞から分取し
たDNAと混合し、PCR,法[5aiki等のpol
ymerase chain reaction法:参
考文献24コ等によってDNAポリメラーゼの存在ドで
う量のDNAを増l111.♂生産させ、個々の思名の
リンパ球系細胞固有のD I+領域近傍の遺伝子(N□
1、N□2)の塩1Jみ配列を決定し、I−記V If
i’から選択したDNANA断片11 ”ゝと、決定
したN中から選択したDNA断片N1□I fal か
らなるV H′a’ N o’ La’ D N A
断片を、また場合ニヨッてはDHにまで入り込んだDN
A断片を、患者固有の第3のプライマーとして合成する
。また、」−記J l(中から選択したDNA断片と相
補的なりNAA断片、(゛)と、決定したNl+”から
選択したDNA断片と相補的なりNAA断片、12fa
l とからなるN、(2fa)J u (”’DNA断
片を、また場合によってはJH領領域他の部位のDNA
断片と相補的なりNA断片を、患者固有の第4のプライ
マー 2 として合成する。
決定し、リンパ系腫瘍細胞の量を定量するに当って、は
とんど全ての細胞の■。およびJ H遺伝子に保存され
、共通にみられるDNA断片、すなわちVH中のオリゴ
ヌクレオチドを第1 1のプライマーとし、またJll中のオリゴヌクレオチ
ドと相補的なオリゴヌクレオチドを第2のプライマーと
して合成し、これらを患者リンパ系腫瘍細胞から分取し
たDNAと混合し、PCR,法[5aiki等のpol
ymerase chain reaction法:参
考文献24コ等によってDNAポリメラーゼの存在ドで
う量のDNAを増l111.♂生産させ、個々の思名の
リンパ球系細胞固有のD I+領域近傍の遺伝子(N□
1、N□2)の塩1Jみ配列を決定し、I−記V If
i’から選択したDNANA断片11 ”ゝと、決定
したN中から選択したDNA断片N1□I fal か
らなるV H′a’ N o’ La’ D N A
断片を、また場合ニヨッてはDHにまで入り込んだDN
A断片を、患者固有の第3のプライマーとして合成する
。また、」−記J l(中から選択したDNA断片と相
補的なりNAA断片、(゛)と、決定したNl+”から
選択したDNA断片と相補的なりNAA断片、12fa
l とからなるN、(2fa)J u (”’DNA断
片を、また場合によってはJH領領域他の部位のDNA
断片と相補的なりNA断片を、患者固有の第4のプライ
マー 2 として合成する。
次に、更に患者の治療過程において経時的に患名リンパ
球DNAと第3のプライマーと第2のプライマー(また
は第4のプライマー)の組と、あるいは第1のプライマ
ーと第4のプライマーの組と混合してPCR法等によっ
てDNAポリメラーゼの存在下で多量のDNAを増幅生
産させ、その生産されたDNA量からリンパ系腫瘍細胞
の割合を測定する。
球DNAと第3のプライマーと第2のプライマー(また
は第4のプライマー)の組と、あるいは第1のプライマ
ーと第4のプライマーの組と混合してPCR法等によっ
てDNAポリメラーゼの存在下で多量のDNAを増幅生
産させ、その生産されたDNA量からリンパ系腫瘍細胞
の割合を測定する。
この方法を用いることにより、白血病等の患者の制癌剤
等による治療効果、奏功度の診断、および再発の診断を
早期に、迅速に行なうことができる。
等による治療効果、奏功度の診断、および再発の診断を
早期に、迅速に行なうことができる。
この診断法は、Bリンパ種、Tリンパ種、急性白血病、
骨髄腫等の診断に特に好適に利用できる。
骨髄腫等の診断に特に好適に利用できる。
IgD−分泌ミエローマ患者における本発明の診断法の
一例を以ドに説明する。
一例を以ドに説明する。
まず、患者固有のV (N’ −D−N2 )Jの再配
列結合部位のDNA断片の塩基配列を決定す 3 る。
列結合部位のDNA断片の塩基配列を決定す 3 る。
IgD−分泌ミエローマ患者の骨髄細胞あるいは末梢血
リンパ細胞より1;9法(参考文献22)に従いDNA
を分取し、モしてV。中に高い頻度で保存されたDNA
断片オリゴヌクレオチドを第1のプライマーとし、また
J 14中に高い頻度で保存されたDNA断片オリゴヌ
クレオチドに相補的な配列を有するDNA断片オリゴヌ
クレオチドを第2のプライマーとして選択し、選択した
配列を、例えば固相トリエステル法(参考文献2:1)
によって、Applied Biosystems M
odel 380八DNA合成器を用いて合成する。
リンパ細胞より1;9法(参考文献22)に従いDNA
を分取し、モしてV。中に高い頻度で保存されたDNA
断片オリゴヌクレオチドを第1のプライマーとし、また
J 14中に高い頻度で保存されたDNA断片オリゴヌ
クレオチドに相補的な配列を有するDNA断片オリゴヌ
クレオチドを第2のプライマーとして選択し、選択した
配列を、例えば固相トリエステル法(参考文献2:1)
によって、Applied Biosystems M
odel 380八DNA合成器を用いて合成する。
次に、合成されたオリゴヌクレオチドをHPLCで精製
した。
した。
第1及び第2のプライマーとしては、以下のものが用い
得る。
得る。
第1のプライマー
5 −CへCGGCCG’rGTA’rTへCTGTG
−:15 −C八(:GGCC八TCへ八’rへTTT
GTG−34 第2のプライマー 5−へCCTGAGGAGACGCTGへG−3次に、
検査診断対象としてのIgD−分泌ミエローマ患者より
常法(参考文献22)により分取したリンパ球系細胞D
NAと、第1および第2のプライマーを用い、PCR法
を利用して、これらプライマー間に形成されるDNA配
列[V (N’ −DN2)Jをコートする配列: V
H(NH’ DH−N o’) J u lを多量に
増幅生産させる。
−:15 −C八(:GGCC八TCへ八’rへTTT
GTG−34 第2のプライマー 5−へCCTGAGGAGACGCTGへG−3次に、
検査診断対象としてのIgD−分泌ミエローマ患者より
常法(参考文献22)により分取したリンパ球系細胞D
NAと、第1および第2のプライマーを用い、PCR法
を利用して、これらプライマー間に形成されるDNA配
列[V (N’ −DN2)Jをコートする配列: V
H(NH’ DH−N o’) J u lを多量に
増幅生産させる。
増幅されたDNA配列は、そのメクレオチド配列をサン
ガーらのジデオキシ法(参考文献25)によって決定し
てから、その患者固有の腫瘍マーカーとして登録してお
く。
ガーらのジデオキシ法(参考文献25)によって決定し
てから、その患者固有の腫瘍マーカーとして登録してお
く。
次に、この患者のリンパ球系細胞固有のり。領 5
域近傍の遺伝子(N’u、N2o)の塩基配列を選択し
、上記V。中の任意のDNA断片■H″′〉と、決定し
たN。1の中の任意のDNA断片N□I f″l から
なるVu′a’ Nl11(” D NA断片を、マ
タ場合ニよってはD□にまで入り込んだDNA断片を、
患者固有の第3のプライマーとして合成する。
、上記V。中の任意のDNA断片■H″′〉と、決定し
たN。1の中の任意のDNA断片N□I f″l から
なるVu′a’ Nl11(” D NA断片を、マ
タ場合ニよってはD□にまで入り込んだDNA断片を、
患者固有の第3のプライマーとして合成する。
また、−に記JH中の任意のDNA断片と相補的なりN
A断片、IH1a+と、決定したN□′の中の任意のD
NA断片と相補的なりNA断片N、、2(“)とからな
るN、21al −JHf″lDN A断片を、マタ場
合によってはJ H領域の他の部位のDNA断片と相補
的なりNA断片を、患者固有の第4のプライマーとして
合成する。
A断片、IH1a+と、決定したN□′の中の任意のD
NA断片と相補的なりNA断片N、、2(“)とからな
るN、21al −JHf″lDN A断片を、マタ場
合によってはJ H領域の他の部位のDNA断片と相補
的なりNA断片を、患者固有の第4のプライマーとして
合成する。
この第3及び第4のプライマーとしては例えば以下のも
のが利用できる。
のが利用できる。
第3のプライマー
5 −TGTGにへAGへGGGCCTTTGへA−3
第4のプライマー 5 −CへGGCCCAAGへGTGGGCへTT−3
次に、第3及び第4のプライマーと、検査診断 6 対象としてのIgD=分泌ミエローマ患者より、たとえ
ば治療経過を追って経時的に常法(参考文献22)によ
り分取したリンパ球系細胞DNAとをPCR法によって
処理し、これらプライマーの作用によって増幅したDN
A配列があるかどうか、また増幅したDNAの量から腫
瘍細胞の割合を測定する。
第4のプライマー 5 −CへGGCCCAAGへGTGGGCへTT−3
次に、第3及び第4のプライマーと、検査診断 6 対象としてのIgD=分泌ミエローマ患者より、たとえ
ば治療経過を追って経時的に常法(参考文献22)によ
り分取したリンパ球系細胞DNAとをPCR法によって
処理し、これらプライマーの作用によって増幅したDN
A配列があるかどうか、また増幅したDNAの量から腫
瘍細胞の割合を測定する。
なお、この増幅操作には、第1のプライマーと笛4のプ
ライマーとを組合せて、第3のプライマーと第2のプラ
イマーとを組合せて用いることもできる。
ライマーとを組合せて、第3のプライマーと第2のプラ
イマーとを組合せて用いることもできる。
また、増幅したDNA配列の検出は、電気泳動法によっ
て反応混合物を展開し、発色反応等によって可視化した
バンドと、先に患者固有の腫瘍マーカーとして登録した
DNA配列の同様の操作の結果とを比較して、1IJ−
の位置にバンドが表れるかどうかによって行なうことが
できる。
て反応混合物を展開し、発色反応等によって可視化した
バンドと、先に患者固有の腫瘍マーカーとして登録した
DNA配列の同様の操作の結果とを比較して、1IJ−
の位置にバンドが表れるかどうかによって行なうことが
できる。
また、プライマーとして用いたDNA断片をプローブ類
として用いサザーンハイプリダイゼーションを行ない、
バンドを分析することもでき7 る。
として用いサザーンハイプリダイゼーションを行ない、
バンドを分析することもでき7 る。
なお、第3及び第4のプライマーは、DNA配列を患者
固有の腫瘍マーカーとして登録したDNA配列から任意
に選択し、選択された配列ごとに上述と同様の操作を繰
り返して、その有効性を確認することで決定でき、上記
の配列に限定されない。
固有の腫瘍マーカーとして登録したDNA配列から任意
に選択し、選択された配列ごとに上述と同様の操作を繰
り返して、その有効性を確認することで決定でき、上記
の配列に限定されない。
[実施例]
実施例I
Ichihara、 Y、、 Kurosawa、 Y
、 et al ; l1ur、 JImmunol、
、 18.649−652(1988)に記載の方法に
従って、T、 Maniatis (バーバード大学
)から供給されたヒトDNAファージライブラリー(参
考文献5)からヒト胎児型DNAのクローンIIUD−
3を単離した。
、 et al ; l1ur、 JImmunol、
、 18.649−652(1988)に記載の方法に
従って、T、 Maniatis (バーバード大学
)から供給されたヒトDNAファージライブラリー(参
考文献5)からヒト胎児型DNAのクローンIIUD−
3を単離した。
すなわち、上記マニアチスのヒトDNAファージライブ
ラリーから、Ravetchらか取り出したD H”’
J Hプローブ(参考文献10)を用イー(、Ben
ton−Davis法(参考文献6)によって、該D「
J、プローブにハイブリダイズする15kbD N A
断 8 片を含むクローン)IUD−3を単離した。
ラリーから、Ravetchらか取り出したD H”’
J Hプローブ(参考文献10)を用イー(、Ben
ton−Davis法(参考文献6)によって、該D「
J、プローブにハイブリダイズする15kbD N A
断 8 片を含むクローン)IUD−3を単離した。
次に得られたクローンHID−3中の15kb断片の常
法に従って制限酵素地図を作製し、またそのヌクレオチ
ド配列を、Messingら[Messing 、 J
、 etal; Nucleic 八cids
Res、、 9. 309−321(1981)]の
方法に従ったM13mplOまたはMI:lmpHをク
ローニングベクターとして用いたジデオキシ法[San
ger、 F、ct、 at; Proc、
Natl、 八cad、 Sci、。
法に従って制限酵素地図を作製し、またそのヌクレオチ
ド配列を、Messingら[Messing 、 J
、 etal; Nucleic 八cids
Res、、 9. 309−321(1981)]の
方法に従ったM13mplOまたはMI:lmpHをク
ローニングベクターとして用いたジデオキシ法[San
ger、 F、ct、 at; Proc、
Natl、 八cad、 Sci、。
U、S、八、、 74.5463−5467 (197
7)]により決定し、第1図に示す制限酵素地図及び第
2図に示すヌクレオチド配列か得られた。
7)]により決定し、第1図に示す制限酵素地図及び第
2図に示すヌクレオチド配列か得られた。
第1図及び第2図に示した結果から、該クローンHID
−3の15kb断片は、参考文献3中におけるり、に対
応するDLRIを断片が含むことが確認され、該15k
b断片は胎児型DH遺伝子領域を含むものであることが
判明した。
−3の15kb断片は、参考文献3中におけるり、に対
応するDLRIを断片が含むことが確認され、該15k
b断片は胎児型DH遺伝子領域を含むものであることが
判明した。
実施例2
実施例1で得たクローンHID−3中の15kb断片か
ら以下に示す制限酵素切断部位を利用して各DNA断片
を調製し、それらをそれぞれ個々に、 9 BLUESCRIPT KS plus ベクター(
StratageneSan Diego、 GA、
USA)中に常法に従って、クローン化し、第1図のH
で示される部位を有する組み換えDNA、すなわち、プ
ラスミドpPDXP(D xp+遺伝子を含む)、プラ
スミドルDへ(D□遺伝子を含む)、プラスミドpDK
(DKu!伝子を含む)、プラスミド9I11N(
D NA遺伝子を含む)、プラスミドpDM(DM□遺
伝子を含む)、プラスミドpDLR(D bn+遺伝子
を含む)を得た。
ら以下に示す制限酵素切断部位を利用して各DNA断片
を調製し、それらをそれぞれ個々に、 9 BLUESCRIPT KS plus ベクター(
StratageneSan Diego、 GA、
USA)中に常法に従って、クローン化し、第1図のH
で示される部位を有する組み換えDNA、すなわち、プ
ラスミドpPDXP(D xp+遺伝子を含む)、プラ
スミドルDへ(D□遺伝子を含む)、プラスミドpDK
(DKu!伝子を含む)、プラスミド9I11N(
D NA遺伝子を含む)、プラスミドpDM(DM□遺
伝子を含む)、プラスミドpDLR(D bn+遺伝子
を含む)を得た。
D XP+遺伝子を含む断片(Dxp・1遺伝子を含む
);BamHI −Bal I ”(10232)−P
stI (10749)DA4遺伝子を含む断片; BamHI −EcoRV ’(15fi+)−八c
c I (2287)−XhoIDに1遺伝子を含
む断片: Sac I (+2241)−Sma I (1287
5)DN4遺伝子を含む断片; BamHI (4260)−NcoI ”(4901)
−5a1. IDM2遺伝子を含む断片(DI++、、
を含む):Xba I −5LuI ”(14339)
−EcoI (14923)D LR+RI子を含む断
片; 0 Xba I −NcoI (7577)−11ind
m (8]74)なお、上記の「7」は構築過程で破
壊された部位を示し、また括弧内の数字は第2図におけ
る塩基番号に相当する。
);BamHI −Bal I ”(10232)−P
stI (10749)DA4遺伝子を含む断片; BamHI −EcoRV ’(15fi+)−八c
c I (2287)−XhoIDに1遺伝子を含
む断片: Sac I (+2241)−Sma I (1287
5)DN4遺伝子を含む断片; BamHI (4260)−NcoI ”(4901)
−5a1. IDM2遺伝子を含む断片(DI++、、
を含む):Xba I −5LuI ”(14339)
−EcoI (14923)D LR+RI子を含む断
片; 0 Xba I −NcoI (7577)−11ind
m (8]74)なお、上記の「7」は構築過程で破
壊された部位を示し、また括弧内の数字は第2図におけ
る塩基番号に相当する。
なお、各り9.遺伝子を含むプラスミドの単離には、ベ
クターの存するポリリンカ一部位か利用された。
クターの存するポリリンカ一部位か利用された。
得られた各組み換えDNAはそれぞれ個々に大腸菌MV
1184に常法によって導入された。
1184に常法によって導入された。
実施例3
実施例2で得た15kbから得られた各断片をそれぞれ
個々にプローブとして用いて、ヒト胎盤DNAのサザン
ハイプリダイゼーションを行なった。
個々にプローブとして用いて、ヒト胎盤DNAのサザン
ハイプリダイゼーションを行なった。
Gross−ロel 1ardらの方法[Gross−
Beljard、 M。
Beljard、 M。
et al、; Eur、 J、 Biochem、、
36.32−38 (1973)]に従ってヒト胎盤
DNAを抽出した。
36.32−38 (1973)]に従ってヒト胎盤
DNAを抽出した。
抽出しなヒト胎盤DNAは、制限酵素BamHI。
EcoRI及びl1indIIIてそれぞれ個々に消化
処理された。
処理された。
1
得られた3種のDNA混合物(各々5μ)は、それぞれ
0.綿アガロースゲルを用いた電気泳動処理された。
0.綿アガロースゲルを用いた電気泳動処理された。
各ゲルは、まず0.25M HCIで15分間、次に
0.5M Na011 、]、55MNaClで30分
間、更に1.0M1’rjs−11cI (pH7,5
)緩衝液(1,5M Na1lを含む)で30分間処理
された。
0.5M Na011 、]、55MNaClで30分
間、更に1.0M1’rjs−11cI (pH7,5
)緩衝液(1,5M Na1lを含む)で30分間処理
された。
この処理によって得られたDNAは、Olszcwsk
aら[OIszewska、 S、 et al、;T
rends in Genet、ics。
aら[OIszewska、 S、 et al、;T
rends in Genet、ics。
4、92−94 (1988)]によるサザーンの方法
[5outhern、 E、 M、; 、1. Mo1
. Biol、、98,503−517(1975)
]の変法に従って、LKB 2016 VacuGcn
cvaccum blotting system (
ファルマシア社製)を用いて、20X SS(:を利用
してナイロン膜(HybondN、アマ−ジャム)に移
された。
[5outhern、 E、 M、; 、1. Mo1
. Biol、、98,503−517(1975)
]の変法に従って、LKB 2016 VacuGcn
cvaccum blotting system (
ファルマシア社製)を用いて、20X SS(:を利用
してナイロン膜(HybondN、アマ−ジャム)に移
された。
膜に移されたDNAは5分間の紫外線照射処理及び80
℃、2時間の処理で固定された。
℃、2時間の処理で固定された。
上記の操作で調製された冬服は、煮沸洗浄溶液(0,1
×SS(: 、0.1!ti 5DS)中に15分間浸
消された後、プレハイブリダイゼーション(5x 5S
Pli 2 (20x 5SPE: 0.2M Na112P04緩
衝液(pH7,4、3,6MNaC] 、20mM E
DTAを含む) 、 O,Img/ml 熱変性サケ
粒子DNA、50!jiホルムアミド[メルク社(ダル
ムシュタット、西独)製]、5%Irishcream
1jqueur [Balleys社(ダブリン、
アイルラント)製]および0.14k SDSに42℃
で一晩処理)を行なった。
×SS(: 、0.1!ti 5DS)中に15分間浸
消された後、プレハイブリダイゼーション(5x 5S
Pli 2 (20x 5SPE: 0.2M Na112P04緩
衝液(pH7,4、3,6MNaC] 、20mM E
DTAを含む) 、 O,Img/ml 熱変性サケ
粒子DNA、50!jiホルムアミド[メルク社(ダル
ムシュタット、西独)製]、5%Irishcream
1jqueur [Balleys社(ダブリン、
アイルラント)製]および0.14k SDSに42℃
で一晩処理)を行なった。
この、プレハイブリダイゼーション処理が終了した後、
実施例2で得た各DNA断片をランダムオリゴヌクレオ
チド′ラベリング法[Feinberg、八。
実施例2で得た各DNA断片をランダムオリゴヌクレオ
チド′ラベリング法[Feinberg、八。
P、 et al、: 八na1. Bio
chern、、 132. 6−13(1983)]
によって32pで標識する過程を含む方法により、熱変
性32p標識化DNAとし、それらを個々にプローブと
して加えることを除いては、上記プレハイブリダイゼー
ションと同様の処理条件のハイブリダイゼーションを行
なった。
chern、、 132. 6−13(1983)]
によって32pで標識する過程を含む方法により、熱変
性32p標識化DNAとし、それらを個々にプローブと
して加えることを除いては、上記プレハイブリダイゼー
ションと同様の処理条件のハイブリダイゼーションを行
なった。
4xSSCで42℃、30分の洗浄および2回の0.5
x sscの洗浄処理を行ない、−80℃の条件でのオ
ートラジオグラフを行なった。
x sscの洗浄処理を行ない、−80℃の条件でのオ
ートラジオグラフを行なった。
結果を第3図に示す。
3
実施例4
[第1及び第2のプライマー川の配列の選択]実施例1
及び2で得られた各DNA断片及びこれらDNA断片の
クローニングに用いた各種プローブを用い、TgD−分
泌ミエローマ患者から常法(参考文献22)に従い骨髄
細胞あるいは末梢血リンパ細胞より分取したDNAを、
実施例3と同様の手法を用いたサザーンハイブリダイゼ
ーシジンにかけ、その結果からVH(NIP’ DI
4 NH2)JHの再配列結合を有するDNA断片を
特定してそれを実施例1で用いたl1en1.on−D
avis法によりクローニングし、それらのヌクレオヂ
ド配列をSangerらのジデオキシ法(参考文献25
)によって分析した。
及び2で得られた各DNA断片及びこれらDNA断片の
クローニングに用いた各種プローブを用い、TgD−分
泌ミエローマ患者から常法(参考文献22)に従い骨髄
細胞あるいは末梢血リンパ細胞より分取したDNAを、
実施例3と同様の手法を用いたサザーンハイブリダイゼ
ーシジンにかけ、その結果からVH(NIP’ DI
4 NH2)JHの再配列結合を有するDNA断片を
特定してそれを実施例1で用いたl1en1.on−D
avis法によりクローニングし、それらのヌクレオヂ
ド配列をSangerらのジデオキシ法(参考文献25
)によって分析した。
次に、上述のようにして得られたV (N’ −Du2
)Jの再配列結合部の配列をコートする領域[Vu
(No”Du N、2)Ju ]におけるV□遺伝子
領域及びJ 11遺伝子領域のそれぞれにおいて高い頻
度て保存されたDNA配列を特定した。
)Jの再配列結合部の配列をコートする領域[Vu
(No”Du N、2)Ju ]におけるV□遺伝子
領域及びJ 11遺伝子領域のそれぞれにおいて高い頻
度て保存されたDNA配列を特定した。
4
その結果、■、1遺伝子領域中に高い頻度で保存された
DNA配列として以下の配列(なお括弧内はどれを選択
しても良く、括弧内部分の異なるものを混合して用いて
も良い)を見い出し、第1のプライマー用配列とした。
DNA配列として以下の配列(なお括弧内はどれを選択
しても良く、括弧内部分の異なるものを混合して用いて
も良い)を見い出し、第1のプライマー用配列とした。
■5 ’−GACGG[;[;GTGT八’IへI’八
[; TG TG−3■5°−CへCGGCCへTCT
ATTTTTGTG−3また、J、遺伝子領域に高い頻
度で保存されたDNA配列と相補的な配列として、以下
の配列を見い出し、第2のプライマー用配列とした。
[; TG TG−3■5°−CへCGGCCへTCT
ATTTTTGTG−3また、J、遺伝子領域に高い頻
度で保存されたDNA配列と相補的な配列として、以下
の配列を見い出し、第2のプライマー用配列とした。
5−へCCTGAGGへGAC:GGTGAC−35−
ACCTGAGGAGACGCTGAC−3なお、参考
に、第2のプライマー用配列の選択に利用した上記の分
析の結果得られたJH遺伝子 5 領域における配列の−・部を第14図に示す。
ACCTGAGGAGACGCTGAC−3なお、参考
に、第2のプライマー用配列の選択に利用した上記の分
析の結果得られたJH遺伝子 5 領域における配列の−・部を第14図に示す。
実施例5
実施例4で選択した第1のプライマー用配列のうちの1
つを選択し、その配列を有するオリゴヌクレオチドを同
相トリエステル法(参考文献23)によって、八ppl
icd Biosysl、emSModcl 111O
A DNA合成器によって合成し、HPLC(高速液体
クロマトグラフィー)によって精製した。
つを選択し、その配列を有するオリゴヌクレオチドを同
相トリエステル法(参考文献23)によって、八ppl
icd Biosysl、emSModcl 111O
A DNA合成器によって合成し、HPLC(高速液体
クロマトグラフィー)によって精製した。
これとは別に、実施例4で選択した第2のプライマー用
配列を有するオリゴヌクレオチドをlid相トジトリエ
ステル法老°文献23)によって、八pplied B
io−systems Model 380八DN八合
成器によって合成し、HPLC(高速液体クロマトクラ
フィー)によって精製した。
配列を有するオリゴヌクレオチドをlid相トジトリエ
ステル法老°文献23)によって、八pplied B
io−systems Model 380八DN八合
成器によって合成し、HPLC(高速液体クロマトクラ
フィー)によって精製した。
次に、実施例4と同様の方法で、診断対象としてのIg
D−分泌ミエローマ患者(女性、45才)の骨髄細胞あ
るいは末梢血リンパ細胞から分取した腫瘍細胞DNAと
上記の2種の精製オリゴヌクレオチドとを、5ajki
らのPCR法(参考文献24)によって反応させた。
D−分泌ミエローマ患者(女性、45才)の骨髄細胞あ
るいは末梢血リンパ細胞から分取した腫瘍細胞DNAと
上記の2種の精製オリゴヌクレオチドとを、5ajki
らのPCR法(参考文献24)によって反応させた。
6
反応液の組成は以下のとおりであり、反応条件は5ai
kiらに従い、アニーリング温度は55℃とした。また
、DNA増幅のための反応は25回繰り返えされた。
kiらに従い、アニーリング温度は55℃とした。また
、DNA増幅のための反応は25回繰り返えされた。
反応液組成;
細胞D N A (100μg/ml) 1
0 μm第1のプライマー (20μg/ml)
3 μm第2のプライマー(20、czg/ml)、
1 μmdNTP (150μM)
18μ1Taqポリメラーゼ(10u/μl)1
μm10X P CR用緩衝液 10μl蒸
留水 59μm合計100μm (PCR用緩衝液ニドリス塩酸(p’H8,o)、Na
1150 mM、 MgCl210mM、メルカプトエ
タノール10mM ) 増幅反応終了後、反応混合液をアガロースゲルを用いた
電気泳動法によって展開した後、エチジウムブロマイド
でDNA断片を染色した。
0 μm第1のプライマー (20μg/ml)
3 μm第2のプライマー(20、czg/ml)、
1 μmdNTP (150μM)
18μ1Taqポリメラーゼ(10u/μl)1
μm10X P CR用緩衝液 10μl蒸
留水 59μm合計100μm (PCR用緩衝液ニドリス塩酸(p’H8,o)、Na
1150 mM、 MgCl210mM、メルカプトエ
タノール10mM ) 増幅反応終了後、反応混合液をアガロースゲルを用いた
電気泳動法によって展開した後、エチジウムブロマイド
でDNA断片を染色した。
その結果、282bpに相当する位置にバンドが検 7
出された。
なお、実施例4で選択した第1のプライマー用配列のう
ちOあるいは■を用いた場合に、282bpの位置に単
一のバンドが検出され、配列■あるいは■が、このIg
D−分泌患者の場合には、■及び■より優れていた。
ちOあるいは■を用いた場合に、282bpの位置に単
一のバンドが検出され、配列■あるいは■が、このIg
D−分泌患者の場合には、■及び■より優れていた。
次に、この282bpのDNA断片を必要に応して適当
な制限酵素で処理し、実施例1で用いたジデオキシ法に
よって、そのヌクレオチド配列を求めた。
な制限酵素で処理し、実施例1で用いたジデオキシ法に
よって、そのヌクレオチド配列を求めた。
得られたヌクレオチド配列を解析したところ、第12図
と同様の配列が含まれていることが確認された。
と同様の配列が含まれていることが確認された。
このヌクレオチド配列を前記診断対象患者に固有のDN
A断片マーカーとして登録した。
A断片マーカーとして登録した。
実施例6
[第3及び第4のプライマーの調製]
第12図に示された配列のV H(N H’ D I
4領域から、以下の配列を選択し、該配列を有するオリ
ゴヌクレオチドを第3のプライマー用配列とし 8 て実施例4と同様の方法により合成し、精製した。
4領域から、以下の配列を選択し、該配列を有するオリ
ゴヌクレオチドを第3のプライマー用配列とし 8 て実施例4と同様の方法により合成し、精製した。
5 −TGTGCAAGAGGGCCTTTGAA−3
更に、第12図に示された配列のD H−N H’)J
H領域より下流の、第2のプライマー用配列と相補的
な配列より更に下流の配列を選択し、該配列と相補的な
以下の配列を有するオリグヌクレオチドを第4のプライ
マーとして実施例4と同様の方法により合成し、精製し
た。
更に、第12図に示された配列のD H−N H’)J
H領域より下流の、第2のプライマー用配列と相補的
な配列より更に下流の配列を選択し、該配列と相補的な
以下の配列を有するオリグヌクレオチドを第4のプライ
マーとして実施例4と同様の方法により合成し、精製し
た。
5−CへGGにl;[;AAGAGTGGGIGATT
−3’実施例7 [本発明の診断法の感度の検定コ 実施例5で診断対象患者から分取した腫瘍細胞DNAの
細胞1個当りの量を測定した。
−3’実施例7 [本発明の診断法の感度の検定コ 実施例5で診断対象患者から分取した腫瘍細胞DNAの
細胞1個当りの量を測定した。
次に、正常胎盤細胞及び正常リンパ球細胞から実施例4
で用いた方法によって分取したDNAから、102個、
104個、106個の細胞弁に相当するDNA量をそれ
ぞれ調製した。
で用いた方法によって分取したDNAから、102個、
104個、106個の細胞弁に相当するDNA量をそれ
ぞれ調製した。
次に、腫瘍細胞DNAと、正常胎盤細胞DNAまたは正
常リンパ球細胞DNAとを混合し、細胞 9 の個数[腫瘍細胞DNA (X):正常胎盤細胞DNA
または正常リンパ球細胞DNA (Y)]で以下の比率
となる試料A−Iをそれぞれ調製した。なお各試料の(
合計)DNA量は、PCRを実施する前で一定とした。
常リンパ球細胞DNAとを混合し、細胞 9 の個数[腫瘍細胞DNA (X):正常胎盤細胞DNA
または正常リンパ球細胞DNA (Y)]で以下の比率
となる試料A−Iをそれぞれ調製した。なお各試料の(
合計)DNA量は、PCRを実施する前で一定とした。
試料A 腫瘍細胞DNAのみ
試料B 正常胎盤細胞DNAのみ
試料C正常胎盤細胞DNA使用、
X : Y=10−2: 1 (X=2ng )試料D
正常胎盤細胞DNA使用、 X : Y=10−’: 1 (X=20pg)試
料E 正常胎盤細胞DNA使用、 X : Y=]0−6: 1 (X=0.2pg )試
料F 正常リンパ球細J泡D N Aのみ試料G
正常リンパ球細胞DNA使用、X : Y=IO−2:
1 (X=2ng )試料H正XQ’+ J冶盤細胞
DNA使用、X : Y=]0−’: 1 (X=20
pg)試料I 正常胎盤細胞DNA使用、 x : Y=IO−6: t (X=0.2pg )
0 次に、各試料を個々に用い、実施例5で調製した第3及
び第4のプライマーとのPCR法によるDNAの増幅生
産を行なった。
正常胎盤細胞DNA使用、 X : Y=10−’: 1 (X=20pg)試
料E 正常胎盤細胞DNA使用、 X : Y=]0−6: 1 (X=0.2pg )試
料F 正常リンパ球細J泡D N Aのみ試料G
正常リンパ球細胞DNA使用、X : Y=IO−2:
1 (X=2ng )試料H正XQ’+ J冶盤細胞
DNA使用、X : Y=]0−’: 1 (X=20
pg)試料I 正常胎盤細胞DNA使用、 x : Y=IO−6: t (X=0.2pg )
0 次に、各試料を個々に用い、実施例5で調製した第3及
び第4のプライマーとのPCR法によるDNAの増幅生
産を行なった。
PCR用の反応液組成は以下のとおりである。
なお、試料の容量は、試料A−Eで11.5μI、F〜
Iで16.2μmとした。また、各成分の濃度は実施例
5と同様とした。
Iで16.2μmとした。また、各成分の濃度は実施例
5と同様とした。
PCR用の反応液組成
試料 11.5μmまたは16.2μm第
1のプライマー 3 μl第2のプラ
イマー 3.5μmdNTP
16 μ1Taqポリメラー
ゼ 0.5μ11OX P CR用緩
衝液 10μm蒸留水 55.
5μmまたは50.8μI合計100μI 反応条件は5aikiらに従い、アニーリング温度は6
5℃とした。また、DNA増幅のための反応は50回繰
り返えされた。
1のプライマー 3 μl第2のプラ
イマー 3.5μmdNTP
16 μ1Taqポリメラー
ゼ 0.5μ11OX P CR用緩
衝液 10μm蒸留水 55.
5μmまたは50.8μI合計100μI 反応条件は5aikiらに従い、アニーリング温度は6
5℃とした。また、DNA増幅のための反応は50回繰
り返えされた。
増幅反応終了後、反応混合液をアガロースゲル1
を用いた電気泳動法によって展開した後、エチジウムブ
ロマイドでDNA断片を染色した。
ロマイドでDNA断片を染色した。
試料A、C〜E、G−Hにおいていずれも+31bpに
相当する位置に単一バンドが検出された。
相当する位置に単一バンドが検出された。
また、試料B、Fではバンドは検出されなかった。
次に、131 bpのDNA断片を常法により単離し、
必要に応じて制限酵素によって処理して、実施例1で用
いたジデオキシ法によって、そのヌクレオチド配列を求
めた。
必要に応じて制限酵素によって処理して、実施例1で用
いたジデオキシ法によって、そのヌクレオチド配列を求
めた。
得られたヌクレオチド配列を解析したところ、この13
] bpのDNA断片は第12図に示す配列中に含まれ
るものであることが確認された。
] bpのDNA断片は第12図に示す配列中に含まれ
るものであることが確認された。
以上の結果から、1/106の肺癌細胞濃度まで検出で
きることが確認できた。
きることが確認できた。
実施例8
実施例5と同一の診断対象患者の治療過程において、経
時的にリンパ系細胞を分取し、得られた細胞からDNA
を分離して、実施例7のプf法でリンパ系細胞中に含ま
れる腫瘍細胞の割合を検定し 2 た。
時的にリンパ系細胞を分取し、得られた細胞からDNA
を分離して、実施例7のプf法でリンパ系細胞中に含ま
れる腫瘍細胞の割合を検定し 2 た。
その結果、治療後、時間経過すると、増加する腫瘍細胞
も、抗癌剤の投与により、再び減少過程に入ることが確
認された。
も、抗癌剤の投与により、再び減少過程に入ることが確
認された。
(以下余白)
文献リスト
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!t)cnlisl、、 If、 C1,al、; N
a1.urC22!14. li:1l−635(19
8+) 4 : Ichihara、 Y、、 Kurosaw
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D、; Ce1l、 33. 592−593
(198])20: Kodaira、M、et a
l、; J、Mo1.Biol、、190゜529−
541 (+986) 5 2]: Ghosal、 D、 et al、;
Nature、(London)、 275゜6
]1−617 (19711) 22:Maniatis T、et al、;
Mo1ecular Cloning:八 ]、a
bora1.ory Manual ((:
old Spring 1larbarLab、
、N、Y、)、1982 23:Selinger、J、 Ct al; C
hem、Scr、、2[i、569577(1986) 24:5aiki、R,に、et al; 5ci
ence、230. 13501354 (+985) 25:Sanger、 F、 et al;
Proc、 Na11. 八にad、 Sci、
。
(1982)+9: Baltimore、
D、; Ce1l、 33. 592−593
(198])20: Kodaira、M、et a
l、; J、Mo1.Biol、、190゜529−
541 (+986) 5 2]: Ghosal、 D、 et al、;
Nature、(London)、 275゜6
]1−617 (19711) 22:Maniatis T、et al、;
Mo1ecular Cloning:八 ]、a
bora1.ory Manual ((:
old Spring 1larbarLab、
、N、Y、)、1982 23:Selinger、J、 Ct al; C
hem、Scr、、2[i、569577(1986) 24:5aiki、R,に、et al; 5ci
ence、230. 13501354 (+985) 25:Sanger、 F、 et al;
Proc、 Na11. 八にad、 Sci、
。
USA、74. 5463−5467(1977)26
:Hsashi、 Y、 et al; Eur、 J
、 Immunol、、 19゜1399−1403
(1989) [発明の効果] 従来の抗体生産の研究、実用においては、ある特定の抗
原に対応した抗体を、動物においてポリクローナル抗体
、マウス、ヒト等の抗体産生ハイブリドーマにおいてモ
ノクローナル抗体として生産することが行なわれてきた
。
:Hsashi、 Y、 et al; Eur、 J
、 Immunol、、 19゜1399−1403
(1989) [発明の効果] 従来の抗体生産の研究、実用においては、ある特定の抗
原に対応した抗体を、動物においてポリクローナル抗体
、マウス、ヒト等の抗体産生ハイブリドーマにおいてモ
ノクローナル抗体として生産することが行なわれてきた
。
本発明により得られたD1□遺伝子等30種を利用 6
し、また3通りのオープンリーディングフレームを使用
して、D H領域だけでも少なくとも90種類の抗体を
生産できる可能性がある。VHH領域J H領域と組み
合せれば、膨大な種類の抗体が生産できるのであるか、
本発明により得られた知見をもとにして、細胞工学的、
遺伝子工学的手法により予め様々な抗体を人工的に作製
しておき、しかる後に、これまで未検討の抗原あるいは
新たにj]1現してきた抗原に対応する所望の抗体をそ
れらの中から探索、スクリーニングするという方法が考
案される。この方法が一般化すれば、緊急を要し、量的
に必要とされる特定の抗体を、所望通り、医療用、ある
いは研究用に提供することが可能となる。
して、D H領域だけでも少なくとも90種類の抗体を
生産できる可能性がある。VHH領域J H領域と組み
合せれば、膨大な種類の抗体が生産できるのであるか、
本発明により得られた知見をもとにして、細胞工学的、
遺伝子工学的手法により予め様々な抗体を人工的に作製
しておき、しかる後に、これまで未検討の抗原あるいは
新たにj]1現してきた抗原に対応する所望の抗体をそ
れらの中から探索、スクリーニングするという方法が考
案される。この方法が一般化すれば、緊急を要し、量的
に必要とされる特定の抗体を、所望通り、医療用、ある
いは研究用に提供することが可能となる。
また、本発明において、種々のDH遺伝子を含むV、、
D、、J、、再配列結合部分のDNA配列がほぼ無限大
の多様性を持つという知見が明らかとされ、現実の患者
の腫瘍細胞のDH領域に、本発明により同定された、D
H遺伝子も含まれていることも示された。更に、これら
の知見に基づいて、 7 一人の腫瘍患者の腫瘍細胞はモノクローナルであること
に基づいて、V (N−D−N)J領域は個々の患者の
腫瘍細胞に固有のDNA配列からなりたっており、それ
をメルクマールとして患者固有のDNA断片マーカーを
、PCR1去による増巾品を行なうためにプライマーと
して合成し、患者の腫瘍細胞に固有のDNA配列を増幅
生産し、腫瘍細胞の他のリンパ系細胞に対する割合を算
出てきることが実訝され、本発明の診断法が確ぎfされ
た。
D、、J、、再配列結合部分のDNA配列がほぼ無限大
の多様性を持つという知見が明らかとされ、現実の患者
の腫瘍細胞のDH領域に、本発明により同定された、D
H遺伝子も含まれていることも示された。更に、これら
の知見に基づいて、 7 一人の腫瘍患者の腫瘍細胞はモノクローナルであること
に基づいて、V (N−D−N)J領域は個々の患者の
腫瘍細胞に固有のDNA配列からなりたっており、それ
をメルクマールとして患者固有のDNA断片マーカーを
、PCR1去による増巾品を行なうためにプライマーと
して合成し、患者の腫瘍細胞に固有のDNA配列を増幅
生産し、腫瘍細胞の他のリンパ系細胞に対する割合を算
出てきることが実訝され、本発明の診断法が確ぎfされ
た。
この診断法は、従来の形態学的、細胞遺伝学的診断法に
比べ、はるかに感度か良く、精度良い検査法であり、リ
ンパ系腫瘍、白血病等の早期診断および化学的療法の奏
功度のチエツクに有用である。
比べ、はるかに感度か良く、精度良い検査法であり、リ
ンパ系腫瘍、白血病等の早期診断および化学的療法の奏
功度のチエツクに有用である。
更に、本発明により得られた各種のD□プローブは様々
な患者に対応する患者リンパ球の細胞タイピングに使用
される診断薬として有用である。
な患者に対応する患者リンパ球の細胞タイピングに使用
される診断薬として有用である。
また、免疫グロブリン遺伝子及び関連遺伝子の 8
調製も本発明のD□プローブを用いることによりより簡
便に行なえる。
便に行なえる。
第1図は本発明の15kbD N A断片における12
個のDIl遺伝子の配列付置を模式的に示した円、第2
図(a)〜(c)は第1図に示した12個のDH遺伝子
を含む15kbD N A断片のヌクレオチド配列、第
3図は実施例3で行なったサザーンハイプリダイゼーシ
ョンの結果を示す図、第4図は第1図の15kbD N
A断片中に見い出されたDH遺伝子を含む17個のヒ
ト胎児型遺伝子のヌクレオチド配列、第5図は胎児型D
I4遺伝子と体細胞型DH遺伝子のヌクレオチド配列
の比較図、第6図はアミノ酸レベルでの体細胞型D H
配列と胎児型り、配列の比較図、第7図(a)及び(b
)はDIR遺伝子ファミリーの構成を示す図、第8図(
a)及び(b)はマウスとヒトDH配列の比較図、第9
図(a)及び(b)はり、遺伝子の隣接する配列間での
ヌクレオチド配列の比較図、第10図はD□遺伝子誕生
のモデルを模式的に示す図(四角枠内の 9 数字はメクレオチド数を示す)、第11図はDI+遺伝
子の両隣接領域の配列と胎児型V、遺伝子の3′側隣接
領域との比較図、第12図はIgD−分泌ミエローマ患
者のVll DIl JH領域のDNA配列を示1−図
(■〜■はプライマーの選択に用いた配列を示し、ヌク
レオチド配列直上のアルファベットはその直下のコドン
に対応するアミノ酸を示し、第6図におけるのと同様に
定義される)、第13図は第12図のDH領域のDNA
配列のみを示す図(■はDoに相当する部分、■はDX
P1に相当する配列)、第14図は同定された各種J、
+領域の結果の一部を示す図である。
個のDIl遺伝子の配列付置を模式的に示した円、第2
図(a)〜(c)は第1図に示した12個のDH遺伝子
を含む15kbD N A断片のヌクレオチド配列、第
3図は実施例3で行なったサザーンハイプリダイゼーシ
ョンの結果を示す図、第4図は第1図の15kbD N
A断片中に見い出されたDH遺伝子を含む17個のヒ
ト胎児型遺伝子のヌクレオチド配列、第5図は胎児型D
I4遺伝子と体細胞型DH遺伝子のヌクレオチド配列
の比較図、第6図はアミノ酸レベルでの体細胞型D H
配列と胎児型り、配列の比較図、第7図(a)及び(b
)はDIR遺伝子ファミリーの構成を示す図、第8図(
a)及び(b)はマウスとヒトDH配列の比較図、第9
図(a)及び(b)はり、遺伝子の隣接する配列間での
ヌクレオチド配列の比較図、第10図はD□遺伝子誕生
のモデルを模式的に示す図(四角枠内の 9 数字はメクレオチド数を示す)、第11図はDI+遺伝
子の両隣接領域の配列と胎児型V、遺伝子の3′側隣接
領域との比較図、第12図はIgD−分泌ミエローマ患
者のVll DIl JH領域のDNA配列を示1−図
(■〜■はプライマーの選択に用いた配列を示し、ヌク
レオチド配列直上のアルファベットはその直下のコドン
に対応するアミノ酸を示し、第6図におけるのと同様に
定義される)、第13図は第12図のDH領域のDNA
配列のみを示す図(■はDoに相当する部分、■はDX
P1に相当する配列)、第14図は同定された各種J、
+領域の結果の一部を示す図である。
Claims (1)
- 【特許請求の範囲】 1)ヒト免疫グロブリンD_H遺伝子ファミリーD_A
、D_K及びDIRに属するD_H遺伝子の1以上を少
なくとも含むことを特徴とするDNA断片。 2)D_X_P_4遺伝子、D_A_4遺伝子、D_K
_4遺伝子、D_N_4遺伝子、DIR_1遺伝子、D
_M_1遺伝子、D_L_R_1遺伝子、D_X_P_
1遺伝子、D_X_P_1遺伝子、D_A_1遺伝子、
D_K_1遺伝子、D_N_1遺伝子、DIR_2遺伝
子及びD_M_2遺伝子を含む15kbからなるDNA
断片。 3)請求項2記載のDNA断片を含むλファージクロー
ン。 4)D_A、D_N、D_L_R、D_X_P、D_K
またはD_M遺伝子ファミリーを含む組み換え体DNA
。 5)前記遺伝子ファミリーに属するD_H遺伝子がプラ
スミド中にクローン化されている請求項4記載の組み換
え体DNA。 6)請求項5記載の組み換え体DNAを有する大腸菌。 7)前記DH遺伝子がD_A_4、D_N_4、D_L
_R_1、D_X_P_1、D_K_1またはD_M_
2遺伝子である請求項5記載の組み換え体DNA。 8)前記DH遺伝子がD_A_4、D_N_4、D_L
_R_1、D_X_P_1、D_K_1またはD_M_
2遺伝子である請求項6記載の大腸菌。 9)リンパ系腫瘍細胞を検出する過程を含むリンパ系腫
瘍の診断方法において、診断対象患者特有のV_HD_
HJ_H結合部に含まれるDNA配列をマカーとして前
記リンパ系腫瘍細胞を検出することを特徴とするリンパ
系腫瘍の診断方法。 10)リンパ系腫瘍がB細胞系である請求項9に記載の
リンパ系腫瘍の診断方法。 11)リンパ系腫瘍がT細胞系である請求項9に記載の
リンパ系腫瘍の診断方法。 12)以下の過程a〜h: a)リンパ系腫瘍細胞のDNAにおけるV_HD_HJ
_H結合部からV_Hに頻度の高いDNA配列を選択し
、該配列を有するオリグヌクレオチドを調製する過程と
、 b)前記V_HD_HJ_H結合部からJ_Hに頻度の
高いDNA配列を選択し、該配列に相補的な配列を有す
るオリグヌクレオチドを調製する過程と、c)前記過程
aで得られたオリグヌクレオチドを第1のプライマーと
し、前記過程をで得られたオリグヌクレオチドを第2の
プライマーとし、これらプライマーと診断対象患者から
分離したDNAとを反応させて、DNA増幅を行なう過
程と、d)過程cで増幅されたDNA断片のDNA配列
を同定し、該診断対象患者固有の診断用マーカーとする
過程と、 e)過程cで増幅されたDNA断片のDNA配列のV_
HD_H結合領域から選択されたDNA配列を有するオ
リゴヌクレオチドを調製する過程と、f)過程cで増幅
されたDNA断片のDNA配列のD_HJ_H結合領域
から選択されたDNA配列に相補的な配列を有するオリ
ゴヌクレオチドを調製する過程と、 g)前記過程eで得られたオリグヌクレオチドを第3の
プライマーとし、前記過程fで得られたオリグヌクレオ
チドを第4のプライマーとし、これらプライマーと治療
処置後の診断対象患者から分離したDNAとを反応させ
て、DNA増幅を行なう過程と、 h)過程gで増幅されるDNA断片の有無を検出して、
過程gにおいて診断対象患者から分離したDNA中での
腫瘍細胞由来のDNAの有無を判定する過程と を含む請求項9〜11のいずれかに記載のリンパ系腫瘍
の診断方法。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP1329005A JP3065628B2 (ja) | 1988-12-19 | 1989-12-19 | ヒト免疫グロブリン遺伝子関連dna断片及び該dna断片を用いる診断方法 |
Applications Claiming Priority (5)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP31980988 | 1988-12-19 | ||
JP63-319809 | 1989-06-19 | ||
JP15462389 | 1989-06-19 | ||
JP1-154623 | 1989-06-19 | ||
JP1329005A JP3065628B2 (ja) | 1988-12-19 | 1989-12-19 | ヒト免疫グロブリン遺伝子関連dna断片及び該dna断片を用いる診断方法 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JPH0387185A true JPH0387185A (ja) | 1991-04-11 |
JP3065628B2 JP3065628B2 (ja) | 2000-07-17 |
Family
ID=27320695
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP1329005A Expired - Lifetime JP3065628B2 (ja) | 1988-12-19 | 1989-12-19 | ヒト免疫グロブリン遺伝子関連dna断片及び該dna断片を用いる診断方法 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
JP (1) | JP3065628B2 (ja) |
Cited By (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5866360A (en) * | 1988-07-15 | 1999-02-02 | Central Sydney Area Health Service | Acid-labile subunit (ALS) of insulin-like growth factor binding protein complex |
WO2007141533A3 (en) * | 2006-06-09 | 2008-07-31 | Almac Sciences Ltd | Fkbp-l and uses thereof |
WO2008142820A1 (ja) * | 2007-05-21 | 2008-11-27 | Panasonic Corporation | データ処理装置 |
-
1989
- 1989-12-19 JP JP1329005A patent/JP3065628B2/ja not_active Expired - Lifetime
Cited By (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5866360A (en) * | 1988-07-15 | 1999-02-02 | Central Sydney Area Health Service | Acid-labile subunit (ALS) of insulin-like growth factor binding protein complex |
WO2007141533A3 (en) * | 2006-06-09 | 2008-07-31 | Almac Sciences Ltd | Fkbp-l and uses thereof |
WO2008142820A1 (ja) * | 2007-05-21 | 2008-11-27 | Panasonic Corporation | データ処理装置 |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
JP3065628B2 (ja) | 2000-07-17 |
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