JPH02131576A - Hiv―2ウイルス変異株 - Google Patents
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Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。
め要約のデータは記録されません。
Description
【発明の詳細な説明】
[産業上の利用分野]
本発明は、HIV−2ウイルス変異株、即ち、対応する
ウイルス分離体HIV D194(ECACC V
87122303)から、又は、感染シタ細胞系H
UT 194 (ECACC V87122306
)から、及び、ウイルス分離体HIV D205 (
ECACC V 87122304)から、それぞ
れ、リポ核酸(RNA)又はRNA断片及びそれから誘
導されたデオキシリボ核酸(DNA)及びDNA断片及
び/又は蛋白質にクローンを発生できる、ウイルスHI
V D194及びHIV D205、並びに、診断
及び治療のためのその用法に関する。
ウイルス分離体HIV D194(ECACC V
87122303)から、又は、感染シタ細胞系H
UT 194 (ECACC V87122306
)から、及び、ウイルス分離体HIV D205 (
ECACC V 87122304)から、それぞ
れ、リポ核酸(RNA)又はRNA断片及びそれから誘
導されたデオキシリボ核酸(DNA)及びDNA断片及
び/又は蛋白質にクローンを発生できる、ウイルスHI
V D194及びHIV D205、並びに、診断
及び治療のためのその用法に関する。
[発明の背景]
「大食細胞へよく複製する二つの西アフリカヒト免疫不
全ウイルス型2分離体の分子クローニング:神経性後天
性免疫不全症候群の症例からのガンビア分離体及び高開
散ガーネシア分離体」(Molecular clo
ning of two West Afri
can humanimmunodeficienc
y virus type 2 isolat
es whichreplicate well o
n macrophages:a Gamianiso
late from a case of neuro
logic aquiredimmunodefici
ency syndrome, and a
highlydivergent Ghanesian
isolate) [キューネル,エッチ、ヴイ拳ブ
リーセン.エッチ、ディートリッヒ,ユー、アダムスキ
ー,エム、ミックス,ディ、ビーゼルト.エル、クロイ
ツ,アール、インメルマン.エー、ヘンコ,ケー、メイ
チュナー,シーエッチ,アンドレーセン,アール、ゲル
デルブロム,エッチ、及びリューブザメンーワイグマン
,エッチ、(Kuhel, H.,v.Briesem
l.,Dietrich,U. ,Adamski,M
. .Mix,D. ,Biesert,L. ,Kr
eutz,R. , Ima+elmann,A. ,
Henco,K. ,Meichsner,Ch.,A
ndreesen,R.,Gelderblom,H.
,& Rubsa+*en−Waigmann,H.
,) 1 9 8 9年、Proc. Natl. A
cad.Sci. 86, 4. 2383−2387
]診断において、二つの診断基準、即ち、検出される
抗原についての特異性と感度とが要求される.エイズ(
A I D S)の診断において、他の感染からのHI
V感染を特定し、そうして、rHIV−2関係感染」又
はrHIV−1関係感染」の分類におおまかに帰属させ
るために、特異性についての要求が分離体HTLV−I
IIs及びLAV−2を使用することにより確かに応え
られている(ガイヤダー,エム他(Guyader,M
. et al.)” Nature″326,198
7年、662 〜669頁).シかしながら,診断の感
度による問題がある。所謂血清変換、即ち、感染した人
の抗体の最初の発生の範囲において、感度の減少は「間
違った陰性」の試験結果の数の増加を意味する.従って
、試験感度を改良することによって、感染とこの感染の
検出との間の期間をできるだけ短縮することが一つの主
な目的である. 広範囲に使用されるELISA診断の実施において,減
少した交差反応性は、例えば減少した感度において示さ
れる.そうして、上記HIV−1分離体を使用すること
は、HIV−2血清に対する試験感度を100−100
0の係数だけ平均的に減少することを意味し、一方分離
体HTLVIII8は、もはや殆ど検出できない.HI
Vにより生じる疾病の悲惨な本質は、HIV−1及びH
IV−2ウイルス表現型及び遺伝子型のそれぞれの一つ
の型のみ存在するのではないという事実に存在する.前
提とすべきものは,むしろ大きな群の関連するウイルス
であり、お互いから厳密に分離する手段がないが互いに
M8!的に浸透し更に更に増加する開散への進化する展
開を受ける集団(Population)でさえ可渣で
あり、他方、同時にそれらは再組合せ現象によりゲノム
の互いの部分の間で交換することを始める.そうして,
存在するHIV種は、一つのウィルス変異株の狭く範囲
を定めた小集団が存在しない広い連続集団レベルを形成
する.時間と共に永久的な変動を受ける連続体が存在す
ることがむしろ推定される. 分類されたウイルス変異株HIV−1及びHIV−2は
、部分的交差反応性によってのみ示される比較的低い程
度の関係を有する広く限定された小集団の代表例である
.他方、HIV−1群の変異株があり(リュープザメン
ーワイグマン,エッチ他、” AIDS−Forsch
ung 1 0 , 1 9 8 7年、572〜5
7 5頁.リューブザメンーワイグマン.エッチ他、
J. Wed. Virol. 1 9 , 1 9
8 6年、335〜344頁:ヴイ●ブリーセン,エッ
チ他、J. Med. Virol.2 3 . 1
9 8 7年、51〜66頁)、これは、最初に特徴付
けたHIV−1分離体自身よりもHIV−2と著しく強
い交差反応をする[ハーン,ビー他( Hahn,B.
et al.)” Nature”312.1984
年、166 〜169頁].このような分離体からなる
商品は、上記標準分離体HTLV−IIIsよりも、H
IV−2陽性であるとして明瞭に血清を診断する.理想
的な診断又は治療製品は、互いに著しく生物学的に区別
されるような、集団からの少なくとも一種の代表を含有
すべきである. 多くの高度に多形遺伝子突然変異株中のHIV一1ウイ
ルスは、ARC,LAS.AIDS及び脳障害(ARC
:AIDS関連鎖体、LAS:リンパ節症候群、AID
S:後天性免疫不全症候群)のような異なった疾病を起
し得る。クローン化ウイルス変異株は、それらが若し同
時に、同じ場所で、同じ患者からでさえも分離されたと
きでさえも、連鎖及び制限パターンにおいて区別される
(リューブザメン,エッチ他、1986年)。
全ウイルス型2分離体の分子クローニング:神経性後天
性免疫不全症候群の症例からのガンビア分離体及び高開
散ガーネシア分離体」(Molecular clo
ning of two West Afri
can humanimmunodeficienc
y virus type 2 isolat
es whichreplicate well o
n macrophages:a Gamianiso
late from a case of neuro
logic aquiredimmunodefici
ency syndrome, and a
highlydivergent Ghanesian
isolate) [キューネル,エッチ、ヴイ拳ブ
リーセン.エッチ、ディートリッヒ,ユー、アダムスキ
ー,エム、ミックス,ディ、ビーゼルト.エル、クロイ
ツ,アール、インメルマン.エー、ヘンコ,ケー、メイ
チュナー,シーエッチ,アンドレーセン,アール、ゲル
デルブロム,エッチ、及びリューブザメンーワイグマン
,エッチ、(Kuhel, H.,v.Briesem
l.,Dietrich,U. ,Adamski,M
. .Mix,D. ,Biesert,L. ,Kr
eutz,R. , Ima+elmann,A. ,
Henco,K. ,Meichsner,Ch.,A
ndreesen,R.,Gelderblom,H.
,& Rubsa+*en−Waigmann,H.
,) 1 9 8 9年、Proc. Natl. A
cad.Sci. 86, 4. 2383−2387
]診断において、二つの診断基準、即ち、検出される
抗原についての特異性と感度とが要求される.エイズ(
A I D S)の診断において、他の感染からのHI
V感染を特定し、そうして、rHIV−2関係感染」又
はrHIV−1関係感染」の分類におおまかに帰属させ
るために、特異性についての要求が分離体HTLV−I
IIs及びLAV−2を使用することにより確かに応え
られている(ガイヤダー,エム他(Guyader,M
. et al.)” Nature″326,198
7年、662 〜669頁).シかしながら,診断の感
度による問題がある。所謂血清変換、即ち、感染した人
の抗体の最初の発生の範囲において、感度の減少は「間
違った陰性」の試験結果の数の増加を意味する.従って
、試験感度を改良することによって、感染とこの感染の
検出との間の期間をできるだけ短縮することが一つの主
な目的である. 広範囲に使用されるELISA診断の実施において,減
少した交差反応性は、例えば減少した感度において示さ
れる.そうして、上記HIV−1分離体を使用すること
は、HIV−2血清に対する試験感度を100−100
0の係数だけ平均的に減少することを意味し、一方分離
体HTLVIII8は、もはや殆ど検出できない.HI
Vにより生じる疾病の悲惨な本質は、HIV−1及びH
IV−2ウイルス表現型及び遺伝子型のそれぞれの一つ
の型のみ存在するのではないという事実に存在する.前
提とすべきものは,むしろ大きな群の関連するウイルス
であり、お互いから厳密に分離する手段がないが互いに
M8!的に浸透し更に更に増加する開散への進化する展
開を受ける集団(Population)でさえ可渣で
あり、他方、同時にそれらは再組合せ現象によりゲノム
の互いの部分の間で交換することを始める.そうして,
存在するHIV種は、一つのウィルス変異株の狭く範囲
を定めた小集団が存在しない広い連続集団レベルを形成
する.時間と共に永久的な変動を受ける連続体が存在す
ることがむしろ推定される. 分類されたウイルス変異株HIV−1及びHIV−2は
、部分的交差反応性によってのみ示される比較的低い程
度の関係を有する広く限定された小集団の代表例である
.他方、HIV−1群の変異株があり(リュープザメン
ーワイグマン,エッチ他、” AIDS−Forsch
ung 1 0 , 1 9 8 7年、572〜5
7 5頁.リューブザメンーワイグマン.エッチ他、
J. Wed. Virol. 1 9 , 1 9
8 6年、335〜344頁:ヴイ●ブリーセン,エッ
チ他、J. Med. Virol.2 3 . 1
9 8 7年、51〜66頁)、これは、最初に特徴付
けたHIV−1分離体自身よりもHIV−2と著しく強
い交差反応をする[ハーン,ビー他( Hahn,B.
et al.)” Nature”312.1984
年、166 〜169頁].このような分離体からなる
商品は、上記標準分離体HTLV−IIIsよりも、H
IV−2陽性であるとして明瞭に血清を診断する.理想
的な診断又は治療製品は、互いに著しく生物学的に区別
されるような、集団からの少なくとも一種の代表を含有
すべきである. 多くの高度に多形遺伝子突然変異株中のHIV一1ウイ
ルスは、ARC,LAS.AIDS及び脳障害(ARC
:AIDS関連鎖体、LAS:リンパ節症候群、AID
S:後天性免疫不全症候群)のような異なった疾病を起
し得る。クローン化ウイルス変異株は、それらが若し同
時に、同じ場所で、同じ患者からでさえも分離されたと
きでさえも、連鎖及び制限パターンにおいて区別される
(リューブザメン,エッチ他、1986年)。
HIV−1型のウイルス変異株は、約15%までのある
種のウイルス抗原中で区別されることが示される,HI
V−2は、置換、挿入、及び削除を考慮して、ある種の
抗原のアミノ酸の40%以上で異なっている(ガイヤダ
ー.エム他1987年;ラブソン,二一.ビー.及びマ
ーチン,エム.x−,”(:611”40.1985年
、477〜480頁). [発明の詳細な記述] 本発明は、HI■−2ウイルスの二個の変異株を提供す
る.一つの変異株は無症候患者から分離され、そして一
つの変異株は末端エイズ所謂神経エイズを患った患者か
ら分離された。このウイルス分離体はウイルス抗原に関
すると同様にDNA/RNAに関し、前エイズ及びエイ
ズ段階で型HIV−2による感染を血清学的に直接同定
するための診断剤であることが証明された. 本発明によるウイルス分離体は、ウイルス及びプロウイ
ルスからなり、その特性はクローン化した部分領域の開
示された制限マップ及び連鎖のもの(第2図〜第8図)
と同一である.更に、ウイルス分離体は、そのヌクレオ
チド連鎖が上記ウイルスとは5%まで、好ましくは2%
まで、特に好ましくは1%まで異なっている、上記ウイ
ルス及びプロウイルスから区別される変異株から成る.
本発明によるウイルス変異株は、リンパ節症(更に、L
AS/AIDSと言う)又は重い神経障害(脳障害)を
起すかも知れない.また、該ウイルス変異株の表出生成
物、及び更に特に抗原を好ましくは集積した又は純粋な
形で本願の特許請求の範囲に入れ、そして該表出生成物
の製造方法を全部又は部分的に又は部分の組合せで本願
の特許請求の範囲に入れる.表出生成物には,クローン
化RNA又はD NA(7)ボジ鎖(strand)又
はネガ鎖にコード化した、グリコシル化及び/又はメリ
スチル化(厘eristylated)形で全てのポリ
ペブチドを含めることを意図する. 更に好ましい態様は、ウイルス変異株のゲノムのRNA
及びDNAとハイブリド化できるクローン化したDNA
M@から成る.試験される試料、特に生物学的又は半合
成試料中の上記ゲノムのRNA及びDNA、及び他のH
IV変異株又は関連ウイルス又はDNAプロウイルスの
ハイブリダイゼーションの検出のために有用であるよう
なDNA連鎖を含む安定な遺伝子(ゲン)プロープを木
願の特許請求の範囲に入れる. 本発明の更に好ましい態様は、厳しい条件下でRNA/
DNA又はそれぞれの断片が、本発明によるウイルス変
異株、特にc−DNA、ゲノムDNA、組換えDNA、
合成DNA又はそれらの断片にハイブリド化するウイル
ス変異株RNA/DNAからなる.これらは、本発明の
ウイルス変異株に比較して削除及び挿入を示す変異株又
は断片を含むものと理解される。
種のウイルス抗原中で区別されることが示される,HI
V−2は、置換、挿入、及び削除を考慮して、ある種の
抗原のアミノ酸の40%以上で異なっている(ガイヤダ
ー.エム他1987年;ラブソン,二一.ビー.及びマ
ーチン,エム.x−,”(:611”40.1985年
、477〜480頁). [発明の詳細な記述] 本発明は、HI■−2ウイルスの二個の変異株を提供す
る.一つの変異株は無症候患者から分離され、そして一
つの変異株は末端エイズ所謂神経エイズを患った患者か
ら分離された。このウイルス分離体はウイルス抗原に関
すると同様にDNA/RNAに関し、前エイズ及びエイ
ズ段階で型HIV−2による感染を血清学的に直接同定
するための診断剤であることが証明された. 本発明によるウイルス分離体は、ウイルス及びプロウイ
ルスからなり、その特性はクローン化した部分領域の開
示された制限マップ及び連鎖のもの(第2図〜第8図)
と同一である.更に、ウイルス分離体は、そのヌクレオ
チド連鎖が上記ウイルスとは5%まで、好ましくは2%
まで、特に好ましくは1%まで異なっている、上記ウイ
ルス及びプロウイルスから区別される変異株から成る.
本発明によるウイルス変異株は、リンパ節症(更に、L
AS/AIDSと言う)又は重い神経障害(脳障害)を
起すかも知れない.また、該ウイルス変異株の表出生成
物、及び更に特に抗原を好ましくは集積した又は純粋な
形で本願の特許請求の範囲に入れ、そして該表出生成物
の製造方法を全部又は部分的に又は部分の組合せで本願
の特許請求の範囲に入れる.表出生成物には,クローン
化RNA又はD NA(7)ボジ鎖(strand)又
はネガ鎖にコード化した、グリコシル化及び/又はメリ
スチル化(厘eristylated)形で全てのポリ
ペブチドを含めることを意図する. 更に好ましい態様は、ウイルス変異株のゲノムのRNA
及びDNAとハイブリド化できるクローン化したDNA
M@から成る.試験される試料、特に生物学的又は半合
成試料中の上記ゲノムのRNA及びDNA、及び他のH
IV変異株又は関連ウイルス又はDNAプロウイルスの
ハイブリダイゼーションの検出のために有用であるよう
なDNA連鎖を含む安定な遺伝子(ゲン)プロープを木
願の特許請求の範囲に入れる. 本発明の更に好ましい態様は、厳しい条件下でRNA/
DNA又はそれぞれの断片が、本発明によるウイルス変
異株、特にc−DNA、ゲノムDNA、組換えDNA、
合成DNA又はそれらの断片にハイブリド化するウイル
ス変異株RNA/DNAからなる.これらは、本発明の
ウイルス変異株に比較して削除及び挿入を示す変異株又
は断片を含むものと理解される。
ハイブリタイゼーション及び洗浄の厳しい条件は、若し
、ハイブリダイゼーション及び洗浄条件下の100%相
同核酸錯体の融点が、使用される緩衝剤条件下で5℃以
下に入るならば、実験又は計算の方法により起こる条件
として理解されることをd味する. また、上記ウイルス変異株から誘導され、真核生物又は
原核生物のベクター系で増量されることができるクロー
ン化合成遺伝子プローブも本願の特許請求の範囲に入れ
る.上記クローン化DNA断片は,ウイルス変異株の診
断的検出の目的のための相補的核酸(DNA/RNA)
とのハイブリダイゼーションのために適している.本発
明による診断的検査は、DNA又はRNAプローブを使
用して行なわれる.ブローブは放射性であるか、又は蛍
光生物若しくは化学ルミネセンス基又は酵素でラベル付
けされているか、又は特に結合した反応系を介して酵素
で検出できる.ハイブリダイゼーションは、溶液の均一
相又は固体固定化核酸で不均一相で行なうことができ、
その固体は膜、粒子、細胞又は組織であってよく、ハイ
ブリダイゼーションはin situで行なうこともで
きる.本発明のウイルス分離体から、対応するDNA連
鎖(第2図)は、ウイルス分離体で感染されたリンパ球
のDNAから出発するゲノムラムダゲンパンクを確立す
ることによりE.co 1 iバクテリア中でクローン
化できる.所望のクローンは、gag−pal範囲(7
)STLV−I I I連鎖でプラークスクリーニング
を行なうことによって得られる.更に特定の方法におい
て、プローブとして、公表された連mHIV−2 R
ODから誘導されたDNA (ガイヤダー,エム他、”
Nature326,1987午、662〜669頁)
、又は未発IJJ ノ分離体HIV−2 D194及
びHIV2 D205の部分連鎖から誘導されたDN
Aプローブを使用することができる。そうして第3図か
ら、厳しい条件下で型HIV−2 0194の変異株
とのみハイブリド化するが、型HIV−2 RODの
変異株とはハイブリド化しないブローブが誘導される。
、ハイブリダイゼーション及び洗浄条件下の100%相
同核酸錯体の融点が、使用される緩衝剤条件下で5℃以
下に入るならば、実験又は計算の方法により起こる条件
として理解されることをd味する. また、上記ウイルス変異株から誘導され、真核生物又は
原核生物のベクター系で増量されることができるクロー
ン化合成遺伝子プローブも本願の特許請求の範囲に入れ
る.上記クローン化DNA断片は,ウイルス変異株の診
断的検出の目的のための相補的核酸(DNA/RNA)
とのハイブリダイゼーションのために適している.本発
明による診断的検査は、DNA又はRNAプローブを使
用して行なわれる.ブローブは放射性であるか、又は蛍
光生物若しくは化学ルミネセンス基又は酵素でラベル付
けされているか、又は特に結合した反応系を介して酵素
で検出できる.ハイブリダイゼーションは、溶液の均一
相又は固体固定化核酸で不均一相で行なうことができ、
その固体は膜、粒子、細胞又は組織であってよく、ハイ
ブリダイゼーションはin situで行なうこともで
きる.本発明のウイルス分離体から、対応するDNA連
鎖(第2図)は、ウイルス分離体で感染されたリンパ球
のDNAから出発するゲノムラムダゲンパンクを確立す
ることによりE.co 1 iバクテリア中でクローン
化できる.所望のクローンは、gag−pal範囲(7
)STLV−I I I連鎖でプラークスクリーニング
を行なうことによって得られる.更に特定の方法におい
て、プローブとして、公表された連mHIV−2 R
ODから誘導されたDNA (ガイヤダー,エム他、”
Nature326,1987午、662〜669頁)
、又は未発IJJ ノ分離体HIV−2 D194及
びHIV2 D205の部分連鎖から誘導されたDN
Aプローブを使用することができる。そうして第3図か
ら、厳しい条件下で型HIV−2 0194の変異株
とのみハイブリド化するが、型HIV−2 RODの
変異株とはハイブリド化しないブローブが誘導される。
本允明のウィルスの使用に基づく診断方法は、下記の王
程からなる。生物学的試料からのRNA又はDNAの抽
出、可能な限り制限酵素による酵素処理、核酸結合キャ
リャのためのゲル電気泳動及び/又は直接プロット法(
direct blot method)による分離、
及び、本発明のウイルスのクローン化断片の一部での継
続ハイブリタイゼーション。
程からなる。生物学的試料からのRNA又はDNAの抽
出、可能な限り制限酵素による酵素処理、核酸結合キャ
リャのためのゲル電気泳動及び/又は直接プロット法(
direct blot method)による分離、
及び、本発明のウイルスのクローン化断片の一部での継
続ハイブリタイゼーション。
ハイブリダイゼーションはまた、化学的に処理された細
胞又は組織中で直接行なうことができる。
胞又は組織中で直接行なうことができる。
そこで組織又は液体の起源は重要ではない.特に、本発
明のウィルスの表出生成物に対する抗原のin vit
ro検出のための方法は,そのウイルス表出生成物又は
その一部を免疫学的方法の手段により検出することに特
徴を有する.この方法は、表出生成物が、特許請求の範
囲第1項記載の特徴を有するプロウイルス部分連鎖のD
NAの読み取り枠(open reading fra
me)の意味の範囲内でコード化された蛋白質、ポリペ
プチド又はその一部であり、合成法又はバイオ合成法に
より製造されることに特徴がある. この方法は更に、表出生成物又はその部分の一定量又は
組合せを前もって微量滴定板上に固定し、次いで生物学
的試料(希釈又は非希釈)を被覆した微量滴定板と接触
させ、インキュベーション及び続く洗浄工程の後で、検
出試薬又はラベル化抗一HIV抗体の手段で同定できる
ことに特徴を有する. また、濾紙片及びプラスチック片又は棒が微量滴定板の
代わりに使用され、その場合ウイルスの表出生成物は、
異なった抗原の分離された適用によりそれぞれの特定の
位置に固定される.表出生成物又はその部分は、また、
ゲル電気泳動により分離でき、次いで、プロットにより
移動され抗−HIV抗体と共にインキユベーションしそ
の検出を行なう.検出は、抗原決定基が結合ぎれており
、粒子からなる固体相キャリャ上で行なわれる. 表出生成物はin vitro−感染細胞から誘導され
たウイルス抗原であってよく、該抗原は固定された細胞
に結合した抗原として生物学的検査物質と接触され、続
く抗体結合は、例えば細胞蛍光光度計付きの装置の手段
か又は目視により、免疫学的検出試薬で決定できる. 抗原は競争ELISAで決定できる,HIV関係核酸(
DNA及びRNA)は、本発明の核酸を使用することに
より生物学的試料、細胞及び分離ざれた形態中で検出で
jる. 表出生成物は、他のHIV変異株に関連するが本発明の
分離体の物質とは生物学的性質において区別される物質
により補足される. 診断及び治療目的のために、上記DNAセグメントは、
表出コード化抗原、その部分又は異質の抗原との組合せ
のためにも使用できる.調節連鎖の狙った制御の下にD
NAセグメントを、それによりコード化yれた抗原、そ
の部分又は異質の抗原との組合せを生成するために刺激
するために原核若しくは真核標的細胞、組織又は複細胞
有機体に導入する.抗原は、特にそれぞれの患者の血清
からの抗一HIV−2抗体との反宅を介して検出できる
。より長い読み取り枠(〉50アミノ酸)を有する抗原
は、それ自身を、RNAレヘル上でスプライシング工程
を受けそしてより長い読み取り枠を形成するためにのみ
構成されるもやと同様にさせる. 本願の特許請求の範囲には、更に、同様の抗原決定基を
含有する検査物質中の抗原を検出し、それにより免疫学
的交差反応をきせるだめの、本発明によるクローン化ウ
イルス変異株から生じるポリペブチドが入る.これは、
血液から誘導ごれるそれぞれウイルスキャリャ又は無症
候ウイルスキャリャ又はウイルス生成物のエイズ及び1
′6jエイズの診断のために特に適当である.また、本
発明のウイルスの表出生成物としてこれらの抗原性ポリ
ペプチドに指向する抗体の血清学的検出が、ELISA
のような従来の系を使用することにより可能になる。免
疫抗原性のポリベプチドは、エイズ感染に対し保護を与
えるためのワクチンとしての保護ポリペプチドとして使
用できる.本発明のポリペプチドは、産出菌株中の蛋白
質分解酵素により、又はプロテアーゼの使用によるin
vitroで得られるものと同様に、長い読み取り枠
から出発する、遺伝子工学方法の手段により意図的に得
られるフラグメントを含むと理解される. 本発明のウイルス分離体及びそれから誘導される生成物
は、検査系における部分集合体HIV−2の他の分離体
、即ち、例えば、分離体HIV−2ROD(ガイヤダー
,エム他1987年)のような,上記集合体レベルでで
きるだけ遠くに離れているものと組み合わせることがで
きる.それにより、それは一つの検査で薄れた関係の集
合体を検出するための感度も可能になる。
明のウィルスの表出生成物に対する抗原のin vit
ro検出のための方法は,そのウイルス表出生成物又は
その一部を免疫学的方法の手段により検出することに特
徴を有する.この方法は、表出生成物が、特許請求の範
囲第1項記載の特徴を有するプロウイルス部分連鎖のD
NAの読み取り枠(open reading fra
me)の意味の範囲内でコード化された蛋白質、ポリペ
プチド又はその一部であり、合成法又はバイオ合成法に
より製造されることに特徴がある. この方法は更に、表出生成物又はその部分の一定量又は
組合せを前もって微量滴定板上に固定し、次いで生物学
的試料(希釈又は非希釈)を被覆した微量滴定板と接触
させ、インキュベーション及び続く洗浄工程の後で、検
出試薬又はラベル化抗一HIV抗体の手段で同定できる
ことに特徴を有する. また、濾紙片及びプラスチック片又は棒が微量滴定板の
代わりに使用され、その場合ウイルスの表出生成物は、
異なった抗原の分離された適用によりそれぞれの特定の
位置に固定される.表出生成物又はその部分は、また、
ゲル電気泳動により分離でき、次いで、プロットにより
移動され抗−HIV抗体と共にインキユベーションしそ
の検出を行なう.検出は、抗原決定基が結合ぎれており
、粒子からなる固体相キャリャ上で行なわれる. 表出生成物はin vitro−感染細胞から誘導され
たウイルス抗原であってよく、該抗原は固定された細胞
に結合した抗原として生物学的検査物質と接触され、続
く抗体結合は、例えば細胞蛍光光度計付きの装置の手段
か又は目視により、免疫学的検出試薬で決定できる. 抗原は競争ELISAで決定できる,HIV関係核酸(
DNA及びRNA)は、本発明の核酸を使用することに
より生物学的試料、細胞及び分離ざれた形態中で検出で
jる. 表出生成物は、他のHIV変異株に関連するが本発明の
分離体の物質とは生物学的性質において区別される物質
により補足される. 診断及び治療目的のために、上記DNAセグメントは、
表出コード化抗原、その部分又は異質の抗原との組合せ
のためにも使用できる.調節連鎖の狙った制御の下にD
NAセグメントを、それによりコード化yれた抗原、そ
の部分又は異質の抗原との組合せを生成するために刺激
するために原核若しくは真核標的細胞、組織又は複細胞
有機体に導入する.抗原は、特にそれぞれの患者の血清
からの抗一HIV−2抗体との反宅を介して検出できる
。より長い読み取り枠(〉50アミノ酸)を有する抗原
は、それ自身を、RNAレヘル上でスプライシング工程
を受けそしてより長い読み取り枠を形成するためにのみ
構成されるもやと同様にさせる. 本願の特許請求の範囲には、更に、同様の抗原決定基を
含有する検査物質中の抗原を検出し、それにより免疫学
的交差反応をきせるだめの、本発明によるクローン化ウ
イルス変異株から生じるポリペブチドが入る.これは、
血液から誘導ごれるそれぞれウイルスキャリャ又は無症
候ウイルスキャリャ又はウイルス生成物のエイズ及び1
′6jエイズの診断のために特に適当である.また、本
発明のウイルスの表出生成物としてこれらの抗原性ポリ
ペプチドに指向する抗体の血清学的検出が、ELISA
のような従来の系を使用することにより可能になる。免
疫抗原性のポリベプチドは、エイズ感染に対し保護を与
えるためのワクチンとしての保護ポリペプチドとして使
用できる.本発明のポリペプチドは、産出菌株中の蛋白
質分解酵素により、又はプロテアーゼの使用によるin
vitroで得られるものと同様に、長い読み取り枠
から出発する、遺伝子工学方法の手段により意図的に得
られるフラグメントを含むと理解される. 本発明のウイルス分離体及びそれから誘導される生成物
は、検査系における部分集合体HIV−2の他の分離体
、即ち、例えば、分離体HIV−2ROD(ガイヤダー
,エム他1987年)のような,上記集合体レベルでで
きるだけ遠くに離れているものと組み合わせることがで
きる.それにより、それは一つの検査で薄れた関係の集
合体を検出するための感度も可能になる。
本発明のウイルス変異株はHIV−1変異株のスペクト
ルとは非常に異なっており、玉要な範囲で区別されるけ
れども′(第1図、第2図、第3図)、ガイヤダーによ
り記述されたHIV−2ウイルスに近接した分子関係を
有する。また,生物学的性質は、上記HIV−2分離体
から明らかに区別される。そうして、本発明の変異株は
有効なin vitro複製のために、ミエロイド系統
から誘導される細胞を好む.反対に、ウイルスはリンパ
球性系統でそれ自体殆ど再生しない.この性質は特にH
IV−0194に関係している。
ルとは非常に異なっており、玉要な範囲で区別されるけ
れども′(第1図、第2図、第3図)、ガイヤダーによ
り記述されたHIV−2ウイルスに近接した分子関係を
有する。また,生物学的性質は、上記HIV−2分離体
から明らかに区別される。そうして、本発明の変異株は
有効なin vitro複製のために、ミエロイド系統
から誘導される細胞を好む.反対に、ウイルスはリンパ
球性系統でそれ自体殆ど再生しない.この性質は特にH
IV−0194に関係している。
本発明のI{IV D194は、感染した,:ト者に
漏れなく脳障害症状を起し、そのために,}ト者が非常
に短い時間の後に疾病の激しい進行の後に死亡した。本
発明のウイルスの試料は、ブダペスト条約により、Eu
ropean (:ollection of Ani
mal Cell(1:ulturesに、それぞれ指
定名HIV D194(承認番号V87122303
)及び指定名HIV D205(承認番号V8712
2304)で,それらの分離体の形で寄託している.ウ
イルス分離体HIV 0194で感染した細胞系統は
、上記と同じ寄託機関にHUT194(ECACC
V87122306)で寄託している. ffil図は、そのヌクレオチド連鎖及びアミノ酸連鎖
においてラムダD−194及びHIV−2ROD 2
7/3 5からの蛋白質p24及びgp41の偏向を示
す.(ガイヤダー,エム他、1987年”Nature
326 , 662 〜669頁):fIJ2図は
、公知のHIv連鎖と比較して本発明のウイルス分離体
の制限マー2ブを示す.第3図は、エンベローブ蛋白質
gP120のコート化範囲で本発明の変異株HIV−2
Dl94の重要な分岐を示す、HIV−2 RO
D (ガイヤダー,エム他、1987年)及びHIV−
2D194との間の連鎖の比較部分を示す.連鎖の部分
は、ヌクレオチド連鎖と比較したgp120領域の範囲
、及びHIV−2 0194とHIV−2 ROD
との間の単字表示法での対応アミノ酸連鎖を示す(ガイ
ヤダー,エム他、1987年).位置の表示はHIV−
2 ROD参照。(−)は、削除/挿入を表示する.
(・)は同じヌクレオチドを表示する. 第4図は、クローンHIV−0194を特徴付けるヌク
レオチド連鎖を示す. N又は0で示したヌクレオチド位置は、ゲルパターンか
ら明瞭に引き出すことはできなかった.該連鎖は、R/
U5領域LTRで始まり、U5領域で終っている.該連
鎖はサブクローンLIOから誘導される(制限マップ)
。このクローンは、クローンHIV−194.5から誘
導される5kb相同体連鎖と比較して決定したとき、ヌ
クレオチド連鎖において約1%だけ同じ患名/血液試料
から誘導された他のものとは異なっている.第5図は、
HIV−0205の部分ヌクレオチド連鎖を示す(第2
図のクローンHIV−2 A7.1に対応する). 第6図は、HIV−0194とHIV−2 RODと
の間の連鎖相同体を(%)で、官能要素について別々に
示す. 第7図は、HIV/SIV群に比較したHI■2 D
205,7の連鎖相同体を示す(遺伝子レヘル;nt/
aa)。
漏れなく脳障害症状を起し、そのために,}ト者が非常
に短い時間の後に疾病の激しい進行の後に死亡した。本
発明のウイルスの試料は、ブダペスト条約により、Eu
ropean (:ollection of Ani
mal Cell(1:ulturesに、それぞれ指
定名HIV D194(承認番号V87122303
)及び指定名HIV D205(承認番号V8712
2304)で,それらの分離体の形で寄託している.ウ
イルス分離体HIV 0194で感染した細胞系統は
、上記と同じ寄託機関にHUT194(ECACC
V87122306)で寄託している. ffil図は、そのヌクレオチド連鎖及びアミノ酸連鎖
においてラムダD−194及びHIV−2ROD 2
7/3 5からの蛋白質p24及びgp41の偏向を示
す.(ガイヤダー,エム他、1987年”Nature
326 , 662 〜669頁):fIJ2図は
、公知のHIv連鎖と比較して本発明のウイルス分離体
の制限マー2ブを示す.第3図は、エンベローブ蛋白質
gP120のコート化範囲で本発明の変異株HIV−2
Dl94の重要な分岐を示す、HIV−2 RO
D (ガイヤダー,エム他、1987年)及びHIV−
2D194との間の連鎖の比較部分を示す.連鎖の部分
は、ヌクレオチド連鎖と比較したgp120領域の範囲
、及びHIV−2 0194とHIV−2 ROD
との間の単字表示法での対応アミノ酸連鎖を示す(ガイ
ヤダー,エム他、1987年).位置の表示はHIV−
2 ROD参照。(−)は、削除/挿入を表示する.
(・)は同じヌクレオチドを表示する. 第4図は、クローンHIV−0194を特徴付けるヌク
レオチド連鎖を示す. N又は0で示したヌクレオチド位置は、ゲルパターンか
ら明瞭に引き出すことはできなかった.該連鎖は、R/
U5領域LTRで始まり、U5領域で終っている.該連
鎖はサブクローンLIOから誘導される(制限マップ)
。このクローンは、クローンHIV−194.5から誘
導される5kb相同体連鎖と比較して決定したとき、ヌ
クレオチド連鎖において約1%だけ同じ患名/血液試料
から誘導された他のものとは異なっている.第5図は、
HIV−0205の部分ヌクレオチド連鎖を示す(第2
図のクローンHIV−2 A7.1に対応する). 第6図は、HIV−0194とHIV−2 RODと
の間の連鎖相同体を(%)で、官能要素について別々に
示す. 第7図は、HIV/SIV群に比較したHI■2 D
205,7の連鎖相同体を示す(遺伝子レヘル;nt/
aa)。
第8図は、HIv及びSIV菌株とのHIV−2 D
205のヌクレ才チド連鎖比較を示す.第9図は、機渣
的に公知の抗ウイルス抗原で読み取り枠の対応を示す. 第io図は、適当なベクター中に対応する制限断片とし
て挿入ごれたプライマー仲介構成を示す。
205のヌクレ才チド連鎖比較を示す.第9図は、機渣
的に公知の抗ウイルス抗原で読み取り枠の対応を示す. 第io図は、適当なベクター中に対応する制限断片とし
て挿入ごれたプライマー仲介構成を示す。
HIV−D194及びHIV−0205(7)実験結果
および#徴は、カーネル,エイチ他、1989年. P
roc. Natl. Acad. Sci. 86,
4. 2383 〜2387に記載されている. HIV−DI94(7)連鎖は、HIV−D205の断
片として多数の所謂「読み取り枠」を示す.これらの読
み取り枠の大部分は、相同体の前記HIVウイルスに対
する比較により,感染したHUT78又はU937細胞
から誘導されるHIVD194及びHIV−0205抗
原で行なわれるウエスターン法(Western Bl
ot)の比較により、そして対応する患者及び参照血清
からの血清でプローブすることにより、in vi▼0
表出蛋白質/抗原に関係付けることができる。第9図は
、機能的に公知の抗ウイルス抗原で読み取り枠の対応を
示す(数は第4図及び第5図を参照). 他の読み取り枠は、ウエスターン法での抗体染色におけ
る官能性により定義されるその表出抗原レベルと同一で
はない.しかしながら、それらはあるin vi▼0環
境下で示される.他の読み取り枠は、短いものでさえ、
スプライシング方法のために核酸連鎖データを基準にし
て単独で予測することが困難な方法でよく示すことがで
きる.表出蛋白質における抗原決定基は,それらが生物
学的機能のために重要であるとき、診断における又は免
疫法のための目的抗原のために、表出蛋白質連鎖の全て
に亙って展開する.これらの連鎖の一部は抗原サイトの
ためのべプチドスクリーニング/マップ化により示され
得るので、他のものよりも一般的な抗原特性を有する。
および#徴は、カーネル,エイチ他、1989年. P
roc. Natl. Acad. Sci. 86,
4. 2383 〜2387に記載されている. HIV−DI94(7)連鎖は、HIV−D205の断
片として多数の所謂「読み取り枠」を示す.これらの読
み取り枠の大部分は、相同体の前記HIVウイルスに対
する比較により,感染したHUT78又はU937細胞
から誘導されるHIVD194及びHIV−0205抗
原で行なわれるウエスターン法(Western Bl
ot)の比較により、そして対応する患者及び参照血清
からの血清でプローブすることにより、in vi▼0
表出蛋白質/抗原に関係付けることができる。第9図は
、機能的に公知の抗ウイルス抗原で読み取り枠の対応を
示す(数は第4図及び第5図を参照). 他の読み取り枠は、ウエスターン法での抗体染色におけ
る官能性により定義されるその表出抗原レベルと同一で
はない.しかしながら、それらはあるin vi▼0環
境下で示される.他の読み取り枠は、短いものでさえ、
スプライシング方法のために核酸連鎖データを基準にし
て単独で予測することが困難な方法でよく示すことがで
きる.表出蛋白質における抗原決定基は,それらが生物
学的機能のために重要であるとき、診断における又は免
疫法のための目的抗原のために、表出蛋白質連鎖の全て
に亙って展開する.これらの連鎖の一部は抗原サイトの
ためのべプチドスクリーニング/マップ化により示され
得るので、他のものよりも一般的な抗原特性を有する。
これらのサイトは単一エピトープとして又は連続ポリペ
プチドとして又はin vitroの変形、又は合成的
にスプライスした抗原において示すことかでJる.表出
生成物の抗原性は、ウエスターン法分析における抗原固
定化及びプロット化により示すことができる.E.co
liにおける抗原表出のための構築は、合成遺伝子、ク
ローン化ウイルスゲノムからの制限断片、そのトリミン
グ生成物を使用する従来の技術を使用することにより、
エキソヌクレアーゼ又はデオキシリボヌクレアーゼエを
使用することにより、又は適当な制限サイトと共に示さ
れる断片の所望の5′及び3′末端を定義する連鎖特定
合成ブライマー(第10図)を使用することにより行な
うことができる.これらの制限サイトは、PLc24
(レマウル他(Remault et al) 19
81年、Ger+el5、81〜83)から誘導Sれる
もののような異なった有機体の表出ベクターのパネルに
、マルチクローン化サイ} (pEX)で結ぶために容
易に使用できる. 表出抗原は,ル者の血清と特定的に反応することを示し
た,HIV−D205c7)gagからc7)p27(
24)は、典型的なHIV−1血清及び典型的なHIV
−2血清の両者と非常に感度よく反応する(キューネル
他(Kuhnel et al)参!!!!),第3図
に示す領域に対応する抗原連鎖は、このHIV一変異株
の特別の亜科のために非常に特定的である. [実施例l] HIV−D194のgag−po I領域からなるkp
n−kpn断片のようなクローン化小断片を,相同体連
鎖のために適当であるハイブリグイゼーション及び洗浄
条件で30〜40℃の条件下にハイブリドすることによ
り、HIV−2〒!及びSIV型連鎖のためのブローブ
として使用する。
プチドとして又はin vitroの変形、又は合成的
にスプライスした抗原において示すことかでJる.表出
生成物の抗原性は、ウエスターン法分析における抗原固
定化及びプロット化により示すことができる.E.co
liにおける抗原表出のための構築は、合成遺伝子、ク
ローン化ウイルスゲノムからの制限断片、そのトリミン
グ生成物を使用する従来の技術を使用することにより、
エキソヌクレアーゼ又はデオキシリボヌクレアーゼエを
使用することにより、又は適当な制限サイトと共に示さ
れる断片の所望の5′及び3′末端を定義する連鎖特定
合成ブライマー(第10図)を使用することにより行な
うことができる.これらの制限サイトは、PLc24
(レマウル他(Remault et al) 19
81年、Ger+el5、81〜83)から誘導Sれる
もののような異なった有機体の表出ベクターのパネルに
、マルチクローン化サイ} (pEX)で結ぶために容
易に使用できる. 表出抗原は,ル者の血清と特定的に反応することを示し
た,HIV−D205c7)gagからc7)p27(
24)は、典型的なHIV−1血清及び典型的なHIV
−2血清の両者と非常に感度よく反応する(キューネル
他(Kuhnel et al)参!!!!),第3図
に示す領域に対応する抗原連鎖は、このHIV一変異株
の特別の亜科のために非常に特定的である. [実施例l] HIV−D194のgag−po I領域からなるkp
n−kpn断片のようなクローン化小断片を,相同体連
鎖のために適当であるハイブリグイゼーション及び洗浄
条件で30〜40℃の条件下にハイブリドすることによ
り、HIV−2〒!及びSIV型連鎖のためのブローブ
として使用する。
HIV−1連鎖は、コノ領域は抗HIV−1血清と強く
交差反応するp24/27コード化領域を含むけれども
、in blot及びin situハイブリダイゼー
ションを明らかに示さない.しかしながら、第3図に示
されそれに対応するような核酸ブローブは、全ての他の
公知のHIV分離体に比較してHIV−0194の特定
の亜科を非常に特定的に検出する.これは、この特別の
領域のラン才フRNAを使用するin situハイブ
リダイゼーションにより示される.
交差反応するp24/27コード化領域を含むけれども
、in blot及びin situハイブリダイゼー
ションを明らかに示さない.しかしながら、第3図に示
されそれに対応するような核酸ブローブは、全ての他の
公知のHIV分離体に比較してHIV−0194の特定
の亜科を非常に特定的に検出する.これは、この特別の
領域のラン才フRNAを使用するin situハイブ
リダイゼーションにより示される.
第1図は、そのヌクレオチド連鎖及びアミノ酸連鎖にお
いてラムダD−194及びHIV−2R00 2 7/
3 5からの蛋白質p24及びgp41の偏向を示す. 第2図は、公知のHIV連鎖と比較して本発明のウイル
ス分離体の制限マップを示す.WI43図は、エンベロ
ープ蛋白質gpl20のコード化範囲で本発明の変異株
HIV−2 0194の重要な分岐を示す、HIV−
2 ROD及びHIM−2 D194との間の連鎖
の比較部分を示す. 第4図は、ク0−7HIV−Dl94を特徴付けるヌク
レオチド連鎖を示す. 第5図は、HIV−D205の部分ヌクレオチド連鎖を
示す(第1図のクローンHIV−2 A7.1に対応
する). 第6図は、HIV−D194とHIV−2 RODと
の間の連鎖相同体を(%)で、官渣要素について別々に
示す. 第7図は、HIV/SIV群に比較LタH I V−2
0205.7の連鎖相同体を示す(ill伝子レベ
ル;nt/aa). 第8図は、HIV及びSIV菌株と(7)HIV−2
D205のヌクレ才チド連鎖比較を示す。 第9図は、機能的に公知の抗ウイルス抗原で読み取り枠
の対応を示す. 第lO図は、適当なベクター中に対Lεする制限断片と
して挿入されたプライマー仲介構成を示す. 以下71ミ1′−1 ラムダD194及び旧V−2ROD27/35−力)ら
のp24及びgp41の逸脱 ヌクレオチド 連釦 アミノ酸連鎖 1987年、 662〜669頁 ri9、 F工gure 3 HXV2RODGx丁GTCTGGCkTCTATTC
GJVGxCpYTCAATAPJ4CCATGTMX
V2 Dl94 ... ... .
入GA ... ..TDVRLrn丁5′xXl
’C H工V2 ROD GTC A入A CTA
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.GC削除/挿入の記号である. (・)は、同一ヌクレオチドの記号である.4!;耀 Fig.4−2. Fig.4−3. 2コ50. 2360 23
70 2380 2コ9
0 2400人Gλ入λてλTTC
TGGCA入CCTT AGαCA?(;T(:A
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0 24:10 2440
2450 210λTλλ入入GT入
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TC;GυJ.C T G C( G λ入(l T
λCAAT’TkCCTFig Fig 4−6 . 7090 7100 7
110 7120 71
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GGT↑TC入入GGFig.4−5. 48L0 4920 4830
41140 4850
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T(;’Wr’TCTC CTCCCCCCCC
GO↑TATCTCC AACAGATCCA112
90830083108)201D’:108340τ
八TCC八CACG c入CkGGGGIC AG
CCλGCCλk C(JAC入入λck GkA
G入入G入CG CCGGAGACGAFig.4−8
、 GG(AACGCCC TCATATTCTC T
GTATAλλTG T入CCCCCTTC TT
GCATTGTA TTCFig.5 2 . CACTAGAGGA ACA(;ATACAG
−.GGATGTACk GGGCCC入AAA
TCC?GTCCCA GTGGcAAACACCC
CGATG入^ CCCAGCAG入G GGCAT
GACAC CTCCGGGGGC (;ACλc
c^TcT GCGCCCCCTGFig.5 1 . HIV−D205の部分的ヌクレオチト連鎖(Fig.
2−(7)クO−ンHIV−2 A71に対応) HIV−D205;HIV−2RODに5ける位a a
s24−92s5ニ対応,相同関係 71.6% HI.V−D205.HIV−2RODに51tる&′
I1718−2510 に対g相同関係 78.6% TTACAG入入入T 入入Tel入TC^GG入入c
c入GC入G ACTGGG^cc入 cc入ACA
CCCG ’i’UAULALt+LLFig.5〜
3. CAII;AuTATT TTAAAT^CC?
’rCccc入τcxc ’n’T人)−1mc
CCAGTGGC入λ 入(;GTAGAACC169
0 1700 1710
1720 ユ7コD
1フ<ッAGT入AA入G’r”r
GAGTT入入入入C cTcc入λλ入Gx T
CCGCC入入λC 入τCAG八C人).T (;
(;CCTCTA−.C1750 )j
60 1770 178
0 1790C^GCGλλλ入G 入
T入CTλCCCC TC入入λGλλ入T C’
rGTG入λ入λλ 入TGG入入入λGGHIV−D
205,HIV−2RODにおitる位g1 2877
−7293k−q5相同間係 75.1% 10 20 コ0
40 50
60λGGTATTAG入 TCCT
TTT入G入 λ入cccc入入C入 GC(.入TG
TC入TT入T入入TTC八CT^C入TGC入TG7
0 go 90
100 110
m20ACλTCCTTAT A(:C入AG
TGAC AG入^CTGATc rcc^CC^
CC^ CλGGGTλGTC TCCCA)CTk
A130 140
150 ユ60 1
70 180人λGAC?’τ入TT
入入λTG入CATG GC.λTTCTCTλ
cccc入C入λG^ λλλGTrCC入入 入λ^
G入CCCTC工90 200
210 2スo
2コOCG’l?C入入^TG GkTGG
GTTkT GkGCTCτGGC CAλλ入A
AGTG G入入λCTGC入A λ入AATAc
AJcTGCC入G入入入入 入G入入G?’TTGG
入C入GTG入λTGCλ^TTCλλkλ ^C
TccTAGGA GTATT))J+CTコ10
320 330
)40 コ50
:l60GGGCJGCTCX kC”rcTT’T
ccT C.GλλTτ入λCλ 0人入G(.C入
C^T 入TCC患CT^ 入Tr入(;GG(.λλ
370 380 390.
400
420λG入TG入ccc’r λλCAG入λGλ
入 GTλC入C.TCG入 C入C入入CτλGC
入G入AGCAG入G CTACACGAGA43
0 440 450
. 460 470 4
80λT入入λATC入TCTTAGA入CAGG入入
C人入C入入GG^TCCT^cT^Ck^cGAAA
GGGTACCGCTAC4905005105205
コ0540八入GCλλCAGT ACAG入入λλ
入C CT入GC入入入TC 入GTcG^CAT
入 C 入入入入TTC入TCλGGG κ入入−.A
550 560 5’+0
5110 590
600人入GTCCT入入λ ^GT^CG入入入
入 T入τGC入入入cc’r’r入入λλλCAC
GC入CλCC入AC GGCGTkM.AC61
06206コ0640650660?ACTGCCAC
A TGTA(;TTCAG 入入λATAGGC
人 )JC入AGCCCT ACTCATCT(.G
(:G4cAGATACCAGTGTrCCA
TCTCCCkGTk GAAλG入(;A(;A
CATGGG入CCA GTCCTG(:入CA
GATTACTGGO7ffO 74
0 750 760
770人AGTλ^CCTG GA?CC
CλGAG TC.GC.入CTTTG TCTC
GACCCC ACCATT入入TA 入GACT
JGCC?AC人ACCTACT CAAAGACC
CC CTACAACcGA cAG入AACC?
A CT入CACAGAT GGCTCCTGCA
Fi g.5−4. Fig.5−6. Fig.5−5. Fig.5−7 Fig. 6 HIV−DI94及びHIV−2RODの間の機能的成
分側々の連鎖相同間係(%) 外被範囲は、Fig.3 に示す内部範囲に殆ど関連
がないので含まれない. (nt ho=ヌクレオチド相同間係.AAho=ア
ミノ酸相同関係)位置 nt ho AA ho R l−173 96.0Ll
5 174−299 94.45’
−untransL 300−545 93.
5qaq 546−2114 88
.1 89.1p○l 1B29−49:
19 8B.7 89.6vif 4
869−5516 88.7 82..9vpx
5344−5682 .86.7 8
9.4vpr 5682−5999 8
3.0 74.5tat ax 15845−614
0 84.5 7’1.5reV eX l
6071−6140 87.1 82.6tat
ex 2 B301−8403 80.4
75.0rev ex 2 8307−853
9 78.5 70.0nef 85
57−9327 82.6 73.9U’1
8942−9496 85.4FIg.9 Fig.4.参照) 5343・5681 HIV−D205 5−3.参照) 3−1394 (5,2, part.)}11V−2
R O D ガイヤダー他参照) 546・2114 1993−2643 (5.3) 2474−2809(5.3) 2809−3128 (5.3) 6146・8701
いてラムダD−194及びHIV−2R00 2 7/
3 5からの蛋白質p24及びgp41の偏向を示す. 第2図は、公知のHIV連鎖と比較して本発明のウイル
ス分離体の制限マップを示す.WI43図は、エンベロ
ープ蛋白質gpl20のコード化範囲で本発明の変異株
HIV−2 0194の重要な分岐を示す、HIV−
2 ROD及びHIM−2 D194との間の連鎖
の比較部分を示す. 第4図は、ク0−7HIV−Dl94を特徴付けるヌク
レオチド連鎖を示す. 第5図は、HIV−D205の部分ヌクレオチド連鎖を
示す(第1図のクローンHIV−2 A7.1に対応
する). 第6図は、HIV−D194とHIV−2 RODと
の間の連鎖相同体を(%)で、官渣要素について別々に
示す. 第7図は、HIV/SIV群に比較LタH I V−2
0205.7の連鎖相同体を示す(ill伝子レベ
ル;nt/aa). 第8図は、HIV及びSIV菌株と(7)HIV−2
D205のヌクレ才チド連鎖比較を示す。 第9図は、機能的に公知の抗ウイルス抗原で読み取り枠
の対応を示す. 第lO図は、適当なベクター中に対Lεする制限断片と
して挿入されたプライマー仲介構成を示す. 以下71ミ1′−1 ラムダD194及び旧V−2ROD27/35−力)ら
のp24及びgp41の逸脱 ヌクレオチド 連釦 アミノ酸連鎖 1987年、 662〜669頁 ri9、 F工gure 3 HXV2RODGx丁GTCTGGCkTCTATTC
GJVGxCpYTCAATAPJ4CCATGTMX
V2 Dl94 ... ... .
入GA ... ..TDVRLrn丁5′xXl
’C H工V2 ROD GTC A入A CTA
ACA CC−I T?A TGT G丁
k GCA AT(i 入λA TGC X
CCMIV2 D194 ... ..G T.G
..G ..C C、. ... ..G
..G ... ..? ..T −−−!T
Σ SS τ G IJNT τ
SKMrV2 ROD XCC ACA
GAG kGC AGC 入C入 GGG AAC
入AC AC入 ACC TCX 人AGH工
V2 Dl94 −−− −−− −−− −−−
−−− −−一−−− −−− ..T .?.
..丁 ・一″−STS? 丁 TTT!’
τ DQERIV2 ROD XGC
XCλ AGC XCA λCC XCA A
CC ACA CCC 入CA GAC C
XG GAGMXV2 D194 −−− −
一− C.G ..T ...G.G ...C.
G kGT C.. CCA LC ATTOn
)Sr+DTPCAハAD 8工ν2 ハOD C入入 G入G 入τ^ 入G
T GAG G^丁 ^C丁 CCX TGC
GC^ CGC GC^ G^C)HV2 Dl
94 Ae. λTA ...Gλ. ..A
A..?.. λC τ λ丁.G.. λC
.GC削除/挿入の記号である. (・)は、同一ヌクレオチドの記号である.4!;耀 Fig.4−2. Fig.4−3. 2コ50. 2360 23
70 2380 2コ9
0 2400人Gλ入λてλTTC
TGGCA入CCTT AGαCA?(;T(:A
TT)−入ACCTAC C,lG↑CGCCλ入
GTT).GλCCC:2410 242
0 24:10 2440
2450 210λTλλ入入GT入
入 CλT’rGλλGCC ).GGG;)−IC
.gT GGλCCλλCGC TCJJ.SC入
入TG GCCCCT\ACA2470
2480 2490 2500
25xo 25)0λ入λGλ入
λ入λ入 T入G入xccxer 入λ冫一\Gλλ
kTT TGTGk).λ入L% TGGλリGGG
λ GGGCC.’..;CT)2530
2540 2550 2S60
2570 25SoGλλG八入
GC冫C CTCυUCτλλTCCM).TkkT
λCCCCC2GAT ↑TGCLLTT&λGAA)
.A).CGAC2590 2600
2610 2620 26
30 2g<0人λG入^CAAAT G
GAC入ATGCT 入ATAGATTT? λ(.
.lCυ(”Tλλ ^C^GcG丁G入C 丁C)−
”.GATTTC2g50 2660
2670 2680 26
90 2700λCAGλ入入TTCλGC
T−%GG)JTTCCλCλCCCGGCλGGAT
T入GCC入入λλλG入λυGG入TTACT271
0272027コQ27402フ502フ60G′rλ
CTAGλTG τ入CGGGλTGC c+r入
crrrrcc λ↑λCCλCTAC λTG入
λGλffiT入GGCkLT).T2フフ0
27!10 2790
2800 2810
2820xC+rcc入TTTA CCCTA
CCATC AG7人λAC入.WT (.C).G
λGCcλG λλλλ人λGλT入 ’r(:TA
TAT人λG2830 2840
21+50 2@60
2a70 2880GTCT
T).CC入C λλGGATGC入λ 入GG入T
CACCλ GC入入TCTTTC 入入TTCAT
GλT CAGGc入入ATCT?AGλλCCTT
TCAG入入入λ(;C &uCCCAGAC
GTC入TTCTCA TCo入kTkCλT
GGATGATATC??入λT入GCTA GTG
).CλC.GkC (.CGTTT入GkG Ck
τC入C入λ.lG TIGTCCT(.CA 入
C?AλλAGA)cT+rCTc入λτGGCCTA
GGGTTCTCTACCCCXGλTG入(:入1G
?TCe入入λAGG入CCC’rCCGTTT307
o コogo )o9o
3100 コ1ユ0
3120Cλ入TGGλTGG GCTλ
TGK入T”r GTGGCC)J.CT .1−u
TC;GυJ.C T G C( G λ入(l T
λCAAT’TkCCTFig Fig 4−6 . 7090 7100 7
110 7120 71
)。 7140GTTTCACTCT
CGGCuGTC? A(”−W(1−>jJじ(W
入ccTc.cGcAG GCλTGGTGTT
GGT↑TC入入GGFig.4−5. 48L0 4920 4830
41140 4850
4860GTCATAGTCA入GGTAGGGGC
(;GλCλτλλ入AGT入CTACCAAGuGG
λAGGCCλAGATTATCFrg.4−7 7450 7460 747
0 1480 7490
7SOO入GGGGkGm λcc′Tc
cλ入TTCIAAΩGT)JkC CAGCλTA
ATT GCT入kcATTG ACTCAGAT
GGフ690 フ700 77
LO 7720 7730
7740CGCλGC入CC入 GGTτ
C丁GC入入 TGGGeGGCNC GTCCTT
G入CG C’rGTCGGCTC ^GTCCC
GGACm入C?GGee GGG入TAGTGC
入GCA入CAGCA ^CkGCTCTTG C
ACGTGGTCA AGAGACAACA78lO
フm207B+107840785071!1i0^G
AAATGTrG CGATTII;ACCC 丁
CTGGj;GAAC GW一λATCTC Ck
GCC入^ckG TCACTGCTATneo
78B0 7!90
7900 7910
7920CGAG入入λT入C TThλ入
GG入CC 入GGC入CAGCT 入入入T’lr
CATGG GGATGTGCGT T’ll’A
G(;CAGGT7930 7940
7950 7960
7970 フ980Clr
GCCλCkCT kcTGTkcckT GGG
T入λ入TGk CTCCT?AACA CCTG
ACTGGA ACAATATCAC7990800
0801080208030$040^TGGCAGG
丸^ TGGG入入入入入CGλGTCC入C?A
CCTAC入GGC入 入入T八TCAGTC 入入
AGmλGA8050 B040
11070 8080
11090 8100ACAGGCXC
入入 λTTCAACk入G 入kAkGAATAT
GTATC入J.CTA CλAAAAC’r入
入 ATAGC?G(;GAa110 a
L20 81)0 1114
0 g150 8160丁G
TCTTTGGC 入^CτGGTTτG 入τ丁丁
GACCTC Cr(.G八TC入入AT入T八TT
Cλ入τ 八TGGAGT’IT入T^TAGTAGT
A GCAAT入ATAG GtTT入AG入入T
AGCCATAT入T 入T入GTGC入A?
TGT丁),%CTAC82コ0 82
40 g250 826
0 8270 8280
ACTTAC入入^G GGCrATAGGC C
T(;’Wr’TCTC CTCCCCCCCC
GO↑TATCTCC AACAGATCCA112
90830083108)201D’:108340τ
八TCC八CACG c入CkGGGGIC AG
CCλGCCλk C(JAC入入λck GkA
G入入G入CG CCGGAGACGAFig.4−8
、 GG(AACGCCC TCATATTCTC T
GTATAλλTG T入CCCCCTTC TT
GCATTGTA TTCFig.5 2 . CACTAGAGGA ACA(;ATACAG
−.GGATGTACk GGGCCC入AAA
TCC?GTCCCA GTGGcAAACACCC
CGATG入^ CCCAGCAG入G GGCAT
GACAC CTCCGGGGGC (;ACλc
c^TcT GCGCCCCCTGFig.5 1 . HIV−D205の部分的ヌクレオチト連鎖(Fig.
2−(7)クO−ンHIV−2 A71に対応) HIV−D205;HIV−2RODに5ける位a a
s24−92s5ニ対応,相同関係 71.6% HI.V−D205.HIV−2RODに51tる&′
I1718−2510 に対g相同関係 78.6% TTACAG入入入T 入入Tel入TC^GG入入c
c入GC入G ACTGGG^cc入 cc入ACA
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3. CAII;AuTATT TTAAAT^CC?
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T入CTλCCCC TC入入λGλλ入T C’
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205,HIV−2RODにおitる位g1 2877
−7293k−q5相同間係 75.1% 10 20 コ0
40 50
60λGGTATTAG入 TCCT
TTT入G入 λ入cccc入入C入 GC(.入TG
TC入TT入T入入TTC八CT^C入TGC入TG7
0 go 90
100 110
m20ACλTCCTTAT A(:C入AG
TGAC AG入^CTGATc rcc^CC^
CC^ CλGGGTλGTC TCCCA)CTk
A130 140
150 ユ60 1
70 180人λGAC?’τ入TT
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320 330
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370 380 390.
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入G入AGCAG入G CTACACGAGA43
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CATGGG入CCA GTCCTG(:入CA
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0 750 760
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CλGAG TC.GC.入CTTTG TCTC
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JGCC?AC人ACCTACT CAAAGACC
CC CTACAACcGA cAG入AACC?
A CT入CACAGAT GGCTCCTGCA
Fi g.5−4. Fig.5−6. Fig.5−5. Fig.5−7 Fig. 6 HIV−DI94及びHIV−2RODの間の機能的成
分側々の連鎖相同間係(%) 外被範囲は、Fig.3 に示す内部範囲に殆ど関連
がないので含まれない. (nt ho=ヌクレオチド相同間係.AAho=ア
ミノ酸相同関係)位置 nt ho AA ho R l−173 96.0Ll
5 174−299 94.45’
−untransL 300−545 93.
5qaq 546−2114 88
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8942−9496 85.4FIg.9 Fig.4.参照) 5343・5681 HIV−D205 5−3.参照) 3−1394 (5,2, part.)}11V−2
R O D ガイヤダー他参照) 546・2114 1993−2643 (5.3) 2474−2809(5.3) 2809−3128 (5.3) 6146・8701
Claims (1)
- 【特許請求の範囲】 1、ウィルス分離体HIVD194(ECACCV87
122303)及びウィルス分離体HIVD205(E
CACCV8712 2304)。 2、可能性のある従来の誤差の変動の範囲内で、確立し
た制限マップに形成された、下記の制限エンドヌクレア
ーゼ切断部位特徴によるプロウイルス部分連鎖のデオキ
シリボ核酸。 ▲数式、化学式、表等があります▼ 3、請求項1記載のウィルス分離体のcDNAおよび断
片。 4、請求項1記載のウィルス分離体から得られたウィル
ス性RNAおよびその断片。 5、請求項1記載のウィルス分離体から始まるDNA片
を含む組換えDNA。 6、補足的にラベル化されたDNAまたはRNA鎖によ
るハイブリドとして存在する、請求項1乃至4のいずれ
か一項記載のウィルス分離体のDNAまたはRNA。 7、ウィルス性DNAまたはその部分に対し補足的であ
ることを特徴とする、請求項1乃至5のいずれか一項記
載のDNA。 8、請求項2乃至7記載の核酸により厳しい条件下でハ
イブリド化された、変性または無変性体における核酸鎖
、及び特にエンベロープ蛋白質をコード化する領域の範
囲における、HIVゲノムの高度変異領域に対応する核
酸鎖。 9、請求項1記載のウィルス分離体の表出生成物。 10、蛋白質、ペプチドまたは断片が請求項2に記載の
DNAの読み取り枠の意味の範囲内でコード化されてい
ることを特徴とする、請求項1に記載の表出生成物。 11、ウィルスの表出生成物又はその一部を免疫学的方
法の手段により検出することを特徴とする、請求項1記
載のウィルスの表出生成物に対する抗体のinvitr
o検出方法。 12、表出生成物が、請求項2記載のDNAの読み取り
枠の意味の範囲内でコード化された蛋白質、ポリペプチ
ド又はその一部であり、合成法又はバイオ合成法により
製造されることを特徴とする請求項11記載の方法。 13、表出生成物又はその部分の一定量又は組合せを前
以って微量滴定板上に固定し、次いで生物学的試料(希
釈又は非希釈)を被覆した微量滴定板と接触させ、イン
キュベーション及び続く洗浄工程の後で、検出試薬又は
ラベル化抗−HIV抗体の手段で同定できることを特徴
とする請求項11又は12記載の方法。 14、濾紙片及びプラスチック片又は棒が微量滴定板の
代わりに使用され、その場合ウィルスの表出生成物は、
異なった抗原の分離された適用によりそれぞれの特定の
位置に固定されることを特徴とする請求項11乃至13
のいずれか一項記載の方法。 15、表出生成物又はその部分が、ゲル電気泳動により
分離され、次いで、プロットにより移動され抗−HIV
抗体と共にインキュベーションしその検出を行なうこと
を特徴とする請求項14記載の方法。 16、検出が、抗原決定基が結合されており、粒子から
なる固体相キャリヤ上で行なわれることを特徴とする請
求項11乃至15のいずれか一項記載の方法。 17、表出生成物がinvitro−感染細胞から誘導
されたウィルス抗原であり、該抗原が固定された細胞に
結合した抗原として生物学的検査物質と接触され、そし
て、続く抗体結合は、例えば細胞蛍光光度計付きの装置
の手段か又は目視により、免疫学的検出試薬で決定でき
ることを特徴とする請求項11乃至16のいずれか一項
記載の方法。 18、抗原が競争ELISAで決定されることを特徴と
する請求項11乃至17のいずれか一項記載の方法。 19、請求項2乃至7の核酸を使用することにより生物
学的試料、細胞及び分離された形態中でHIV関係核酸
(DNA及びRNA)を検出する方法。 20、表出生成物が、他のHIV変異株に関連するが本
発明の分離体の物質とは生物学的性質において区別され
る物質により補足されることを特徴とする請求項11乃
至19のいずれか一項記載の方法。 21、請求項1のウィルス分離体のウィルスによりコー
ド化された抗原のような表出生成物を含有する免疫組成
物。 22、一つの抗原が全膜抗原の一部を構成するか、又は
、全膜抗原又はその誘導体又は膜抗原の部分の混合物で
あることを特徴とする請求項21記載の免疫組成物。 23、請求項1記載のウィルス分離体の表出生成物に対
する、抗体及び特にモノクローナル抗体。 24、請求項2乃至7のいずれか一項に記載の核酸で転
換された細胞。 25、請求項1記載のウィルスで感染された細胞。 26、細胞系統HUT194(ECACC V87122306)。
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
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