JP7846932B2 - 改変チャネルロドプシン - Google Patents

改変チャネルロドプシン

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Description

本発明は、改変チャネルロドプシンに関する。より詳細には、イオン透過性(光反応性)が高い改変チャネルロドプシンに関する。
遺伝子導入によって光応答性タンパク(チャネルロドプシン)を発現させた神経細胞に、光を当てることで細胞応答を制御するオプトジェネティックス(Optogenetics:光遺伝学)により、視機能の再建を図る研究が世界的に行われていることは周知の通りであり、本発明者らも、ボルボックス(Volvox carteri)由来のチャネルロドプシンのN末端領域を、クラミドモナス・レインハルトチイ(Chlamydomonas reinhardtii)由来のチャネルロドプシン-1のN末端領域に置換することで、細胞膜上での発現効率が改善された改変チャネルロドプシンを特許文献1において報告している。この改変チャネルロドプシンは、光を当てることでイオンチャネルを開いて興奮を誘起することができるものであり、失明に至ったラットの網膜にその遺伝子を導入することによって視力を回復させることに本発明者らは成功している。
しかしながら、これまでに報告されている改変チャネルロドプシンよりも、イオン透過性が高い改変チャネルロドプシンが求められている。
特許第5322067号公報
そこで本発明は、イオン透過性が高い改変チャネルロドプシンを提供することを目的とする。
本発明者らは上記の点に鑑みて鋭意検討を行った結果、ボルボックス由来のチャネルロドプシンが有する3つの細胞外ドメインのN末端側から数えて3つめの細胞外ドメインを、クラミドモナス・レインハルトチイ由来のチャネルロドプシン-2の対応する細胞外ドメインに置換することで、イオン透過性が高いチャネルロドプシンが得られることを見出した。
上記の知見に基づいてなされた本発明の改変チャネルロドプシンは、請求項1記載の通り、ボルボックス由来のチャネルロドプシンが有する3つの細胞外ドメインのN末端側から数えて3つめの細胞外ドメインが、クラミドモナス・レインハルトチイ由来のチャネルロドプシン-2の対応する細胞外ドメインに置換されてなるポリペプチドであって、以下の(a)または(b)のポリペプチドで構成される。
(a)配列番号6に示すアミノ酸配列からなるポリペプチド
(b)配列番号6に示すアミノ酸配列と少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列からなり、かつチャネルロドプシン機能を有するポリペプチド
また、請求項2記載の改変チャネルロドプシンは、請求項1記載の改変チャネルロドプシンにおいて、配列番号6に示すアミノ酸配列からなるポリペプチドの172番目のHisが他のアミノ酸に置換されてなるポリペプチドで構成される。
また、請求項3記載の改変チャネルロドプシンは、請求項2記載の改変チャネルロドプシンにおいて、配列番号9~12のいずれかに示すアミノ酸配列からなるポリペプチドで構成される。
また、本発明の改変チャネルロドプシンは、請求項4記載の通り、ボルボックス由来のチャネルロドプシンが有する3つの細胞外ドメインのN末端側から数えて3つめの細胞外ドメインが、クラミドモナス・レインハルトチイ由来のチャネルロドプシン-2の対応する細胞外ドメインに置換されてなるポリペプチドであって、以下の(a)または(b)のポリペプチドで構成される。
(a)配列番号7に示すアミノ酸配列からなるポリペプチド
(b)配列番号7に示すアミノ酸配列と少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列からなり、かつチャネルロドプシン機能を有するポリペプチド
また、本発明のポリヌクレオチドは、請求項5記載の通り、請求項1~4のいずれかに記載の改変チャネルロドプシンを構成するポリペプチドをコードする。
また、本発明の発現ベクターは、請求項6記載の通り、プロモーターと機能的に連結された請求項5記載のポリヌクレオチドを含む。
また、本発明の細胞は、請求項7記載の通り、請求項1~4のいずれかに記載の改変チャネルロドプシンを構成するポリペプチドを発現する。
また、請求項8記載の細胞は、請求項7記載の細胞において、細胞が神経細胞である。
また、本発明は、請求項9記載の通り、網膜外層の障害を患う被検体を治療するための医薬の製造における、請求項1~4のいずれかに記載の改変チャネルロドプシンを構成するポリペプチド、請求項5記載のポリヌクレオチド、請求項6記載の発現ベクターのいずれかの使用である。
また、請求項10記載の使用は、請求項9記載の使用において、網膜外層の障害が、網膜色素変性症、加齢黄斑変性症、網膜はく離のいずれかである。
また、本発明の網膜外層の障害を治療するための医薬組成物は、請求項11記載の通り、請求項1~4のいずれかに記載の改変チャネルロドプシンを構成するポリペプチド又は請求項6記載の発現ベクターのいずれかを有効成分として含む。
本発明によれば、イオン透過性が高い改変チャネルロドプシンを提供することができる。
実施例1における、p525発現アデノ随伴ウイルスベクター作製用プラスミドの構成である。 試験例1において、p525、p548、p550が、mVChR1よりもイオン透過性が高いことを示すグラフである。 試験例4における、p578、p579、p580、p581のイオン透過性を示すグラフである。 試験例5において、p579がp548よりもτonが短いことを示すグラフである。 同、p579がp548よりもτoffが短いことを示すグラフである。 試験例6において、p548遺伝子を網膜に導入することで視覚誘発電位を記録することができることを示すグラフである。 同、蛍光顕微鏡下で網膜伸展標本を観察するとp548の発現を神経網膜の全体において確認することができることを示す写真である。 同、蛍光顕微鏡下で網膜切片標本を観察するとp548の発現を主として網膜神経節細胞層において確認することができることを示す写真である。
本発明の改変チャネルロドプシンは、ボルボックス由来のチャネルロドプシンが有する3つの細胞外ドメインのN末端側から数えて3つめの細胞外ドメインが、クラミドモナス・レインハルトチイ由来のチャネルロドプシン-2の対応する細胞外ドメインに置換されてなるポリペプチドである。
ボルボックス由来のチャネルロドプシンの具体例としては、配列番号1に示すアミノ酸配列の67~322番目のアミノ酸を少なくとも含んでなるポリペプチドが挙げられる。配列番号1に示すアミノ酸配列からなるポリペプチドは、本発明者らが特許文献1において報告した改変チャネルロドプシンである(特許文献1において配列番号10に示すアミノ酸配列からなるポリペプチド)。この改変チャネルロドプシンは、ボルボックス由来のチャネルロドプシンのN末端領域を、クラミドモナス・レインハルトチイ由来のチャネルロドプシン-1のN末端領域(細胞膜局在発現に関与する領域であって膜貫通ドメインを含まない)に置換することで、細胞膜上での発現効率が改善された、344個のアミノ酸からなるポリペプチドである。配列番号1に示すアミノ酸配列の1~66番目のアミノ酸は、配列番号2に示すクラミドモナス・レインハルトチイ由来のチャネルロドプシン-1のアミノ酸配列の1~66番目のアミノ酸である。本発明では、配列番号1に示すアミノ酸配列からなるポリペプチドである改変チャネルロドプシンをmVChR1と称する。また、特許文献1に記載された事項は、本明細書に記載された事項として取り扱う。
配列番号1に示すmVChR1のアミノ酸配列は下記の通りである。mVChR1が有する3つの細胞外ドメインのN末端側から数えて3つめの細胞外ドメイン(EX3)は、Gly271~Ser279である。
(mVChR1のアミノ酸配列)
MSRRPWLLALALAVALAAGSAGASTGSDATVPVATQDGPDYVFHRAHERMLFQTSYTLENNGSVICMPRGQCYCEGWLR

SRGTSIEKTIAITLQWVVFALSVACLGWYAYQAWRATCGWEEVYVALIEMMKSIIEAFHEFDSPATLWLSSGNGVVWMR
TM1 IN1 TM2 EX1 TM3
YGEWLLTCPVLLIHLSNLTGLKDDYSKRTMGLLVSDVGCIVWGATSAMCTGWTKILFFLISLSYGMYTYFHAAKVYIEA
IN2 TM4 EX2TM5
FHTVPKGICRELVRVMAWTFFVAWGMFPVLFLLGTEGFGHISPYGSAIGHSILDLIAKNMWGVLGNYLRVKIHEHILLY
IN3 TM6 EX3 TM7
GDIRKKQKITIAGQEMEVETLVAEEEDR
※ TM:膜貫通ドメイン
IN:細胞内ドメイン
EX:細胞外ドメイン
本発明の改変チャネルロドプシンは、mVChR1を例にとると、上記のEX3が、クラミドモナス・レインハルトチイ由来のチャネルロドプシン-2の対応する細胞外ドメイン、即ち、クラミドモナス・レインハルトチイ由来のチャネルロドプシン-2が有する3つの細胞外ドメインのN末端側から数えて3つめの細胞外ドメインに置換されてなるポリペプチドである。クラミドモナス・レインハルトチイ由来のチャネルロドプシン-2のアミノ酸配列は、配列番号3に示す通りであり、そのN末端側から数えて3つめの細胞外ドメインは、Gly233~Ser241である。EX3の置換に伴い、その前後の膜貫通ドメイン、即ち、EX3のN末端に隣接するTM6のC末端側のアミノ酸、及び/又は、EX3のC末端に隣接するTM7のN末端側のアミノ酸が併せて置換されてもよいが、置換されてもよいアミノ酸の個数は最大で3個であることが好ましい。3個を超えるアミノ酸の置換は、膜貫通ドメインの機能に影響を及ぼす恐れがある。
本発明の改変チャネルロドプシンは、ボルボックス由来のチャネルロドプシンが有する3つの細胞外ドメインのN末端側から数えて3つめの細胞外ドメインが、クラミドモナス・レインハルトチイ由来のチャネルロドプシン-2の対応する細胞外ドメインに置換されていることに加え、その他のドメインや領域がさらに改変されてなるポリペプチドであってもよい。例えば、mVChR1を例にとると、配列番号1に示すアミノ酸配列の142~169番目のアミノ酸が、配列番号2に示すクラミドモナス・レインハルトチイ由来のチャネルロドプシン-1のアミノ酸配列の143~170番目のアミノ酸に置換されてなるポリペプチドであってもよい。
こうした改変チャネルロドプシンの具体例としては、配列番号4に示すアミノ酸配列からなるポリペプチドが挙げられる。このポリペプチド(p525)は、mVChR1のEX3が、クラミドモナス・レインハルトチイ由来のチャネルロドプシン-2の対応する細胞外ドメインに置換され、かつ、mVChR1の142~169番目のアミノ酸が、配列番号2に示すクラミドモナス・レインハルトチイ由来のチャネルロドプシン-1の143~170番目のアミノ酸に置換されてなる(なお、EX3の置換に伴い、TM7の280番目のProがValに置換されている)。
また、本発明の改変チャネルロドプシンは、例えば、mVChR1を例にとると、そのN末端側から数えて6つめの膜貫通ドメイン(TM6)が、クロロモナス・オオガマ(Chloromonas oogama)由来のチャネルロドプシンの対応する膜貫通ドメインに置換されてなるポリペプチドであってもよい。クロロモナス・オオガマ由来のチャネルロドプシンのアミノ酸配列は、配列番号5に示す通りであり、そのN末端側から数えて6つめの膜貫通ドメインは、Arg187~Val212である。
また、本発明の改変チャネルロドプシンは、例えば、mVChR1を例にとると、配列番号1に示すアミノ酸配列の323番目以降のアミノ酸が、配列番号5に示すクロロモナス・オオガマ由来のチャネルロドプシンのアミノ酸配列の265番目以降のアミノ酸に置換されてなるポリペプチドであってもよい。
こうした改変チャネルロドプシンの具体例としては、配列番号6に示すアミノ酸配列からなるポリペプチドが挙げられる。このポリペプチド(p548)は、mVChR1のEX3が、クラミドモナス・レインハルトチイ由来のチャネルロドプシン-2の対応する細胞外ドメインに置換され、かつ、mVChR1の142~169番目のアミノ酸が、配列番号2に示すクラミドモナス・レインハルトチイ由来のチャネルロドプシン-1の143~170番目のアミノ酸に置換され、さらに、mVChR1のTM6が、クロロモナス・オオガマ由来のチャネルロドプシンの対応する膜貫通ドメインに置換され、mVChR1の323~344番目のアミノ酸が、配列番号5に示すクロロモナス・オオガマ由来のチャネルロドプシンの265~286番目のアミノ酸に置換されてなる(なお、EX3の置換に伴い、TM7の280番目のProがValに置換されている)。
別の具体例としては、配列番号7に示すアミノ酸配列からなるポリペプチドが挙げられる。このポリペプチド(p550)は、mVChR1のEX3が、クラミドモナス・レインハルトチイ由来のチャネルロドプシン-2の対応する細胞外ドメインに置換され、かつ、mVChR1の142~169番目のアミノ酸が、配列番号2に示すクラミドモナス・レインハルトチイ由来のチャネルロドプシン-1の143~170番目のアミノ酸に置換され、さらに、mVChR1のTM6が、クロロモナス・オオガマ由来のチャネルロドプシンの対応する膜貫通ドメインに置換され、mVChR1の323~344番目のアミノ酸が、配列番号5に示すクロロモナス・オオガマ由来のチャネルロドプシンの265~286番目のアミノ酸に置換されてなることは、上記の配列番号6に示すアミノ酸配列からなるポリペプチド(p548)と同じであるが、加えて、mVChR1の28~60番目のアミノ酸が欠失されてなる(なお、EX3の置換に伴い、TM7の280番目のProがValに置換されている)。
本発明の改変チャネルロドプシンは、配列番号4,6,7のそれぞれに示すアミノ酸配列において、1個若しくは複数個のアミノ酸の欠失、置換、付加又は挿入を有し、かつチャネルロドプシン機能を有するポリペプチドを含む。また、配列番号4,6,7のそれぞれに示すアミノ酸配列と少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列からなり、かつチャネルロドプシン機能を有するポリペプチドを含む。ここで、「複数個」とは、50個以下の整数、好ましくは30個以下の整数、より好ましくは10個以下の整数、例えば2~9個、2~7個、2~5個である。配列番号4,6,7のそれぞれに示すアミノ酸配列との配列同一性は、好ましくは少なくとも91%であり、より好ましくは少なくとも92%であり、より好ましくは少なくとも93%であり、より好ましくは少なくとも94%であり、より好ましくは少なくとも95%であり、より好ましくは少なくとも96%であり、より好ましくは少なくとも97%であり、より好ましくは少なくとも98%であり、最も好ましくは少なくとも99%である。なお、同一性の%は、複数(2つ)のアミノ酸配列間の同一性を演算するソフトウェア(例えば、FASTA、DANASYS、BLASTなど)をデフォルトの設定で使用して算出した値をいう。こうした改変チャネルロドプシンの具体例としては、配列番号4に示すアミノ酸配列からなるポリペプチドの210番目のTrpがTyrに置換され、211番目のThrがValに置換された、配列番号8に示すアミノ酸配列からなるポリペプチド(p528)が挙げられる。また、配列番号4,6,8のそれぞれに示すアミノ酸配列からなるポリペプチドの172番目や、配列番号7に示すアミノ酸配列からなるポリペプチドの139番目のHisが、他のアミノ酸、例えばGly,Ala,Lys,Argなどに置換されてなるポリペプチド、具体的には、配列番号6に示すアミノ酸配列からなるポリペプチドの172番目のHisが、Glyに置換された配列番号9に示すアミノ酸配列からなるポリペプチド(p578)、Alaに置換された配列番号10に示すアミノ酸配列からなるポリペプチド(p579)、Lysに置換された配列番号11に示すアミノ酸配列からなるポリペプチド(p580)、Argに置換された配列番号12に示すアミノ酸配列からなるポリペプチド(p581)などが挙げられる。配列番号4,6,8のそれぞれに示すアミノ酸配列からなるポリペプチドの172番目や、配列番号7に示すアミノ酸配列からなるポリペプチドの139番目のHisを、他のアミノ酸に置換することにより、光照射を始めてからチャネルが開くまでの時間(開速度:τon)と光照射を止めてからチャネルが閉じるまでの時間(閉速度:τoff)の少なくとも一方に変化をもたらすことができる。なお、「チャネルロドプシン機能を有する」とは、光を感受することで細胞の外側と内側の間でのイオン透過性を制御するチャネル機能を有することを意味することは当業者に周知の通りであり、光感受性の程度や光感受波長、イオン透過性の程度、τonやτoffなどによって評価される生物学的活性の少なくとも1つが、配列番号4,6,7,8のそれぞれに示すアミノ酸配列からなるポリペプチドが有する生物学的活性と少なくとも同等であることが好ましい。
本発明の改変チャネルロドプシンは、遺伝子工学的手法により製造することができる。具体的には、まず、本発明の改変チャネルロドプシンをコードするポリヌクレオチド(以下、「本発明の改変チャネルロドプシン遺伝子」という)を調製する。本発明の改変チャネルロドプシン遺伝子は、当業者に公知の手法によって調製することができる。具体的には、例えば、本発明者らが特許文献1において報告した改変チャネルロドプシンをコードするポリヌクレオチドと、クラミドモナス・レインハルトチイ由来のチャネルロドプシン-2をコードするポリヌクレオチド、さらに必要であれば、クラミドモナス・レインハルトチイ由来のチャネルロドプシン-1をコードするポリヌクレオチドや、クロロモナス・オオガマ由来のチャネルロドプシンをコードするポリヌクレオチドのそれぞれの配列情報に基づいて化学合成することで調製することができる。また、それぞれのポリヌクレオチドの配列情報に基づき、それぞれのポリヌクレオチドの所望領域を増幅するPCRプライマーを用いてそれぞれのポリヌクレオチドの所望領域を増幅し、例えばGibson Assemblyシステム(New England Biolabs社)等を用いて連結することによって調製することもできる。次に、プロモーターと機能的に連結された本発明の改変チャネルロドプシン遺伝子を、宿主菌体内で複製維持が可能であり、コードされるポリペプチドを安定に発現させることができ、この遺伝子を安定に保持できる発現ベクターに組み込み、得られた組換え発現ベクターを用いて宿主を形質転換し、宿主において本発明の改変チャネルロドプシンを生産させることができる。組換え技術については、Proc.Natl.Acad.Sci.USA.,1984 81:5662や、Molecular Cloning:A Laboratory Manual(1989)Second edition,Cold Spring Harbor Laboratory Pressなどを参照することができる。発現ベクターとしては、大腸菌(Escherichia coli)由来のプラスミド(例えばpET28、pGEX4T、pUC118、pUC119、pUC18、pUC19、及び他のプラスミドDNA)、枯草菌(Bacillus subtilis)由来のプラスミド(例えばpUB110、pTP5、及び他のプラスミドDNA)、酵母由来のプラスミド(例えばYEp13、YEp24、YCp50、及び他のプラスミドDNA)、λファージ(λgt11やλZAP)、哺乳動物用プラスミド(pCMVやpSV40)、ウイルスベクター(例えばアデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルスベクター、レトロウイルスベクター、レンチウイルスベクター、ワクシニアウイルスベクターなどの動物ウイルスベクター、バキュロウイルスベクターなどの昆虫ウイルスベクター)、植物用ベクター(例えばバイナリベクターpBI系)、コスミドベクターなどを用いることができる。ここで、「機能的に連結された」とは、プロモーター配列が目的のポリヌクレオチド配列の転写を開始することができるような、プロモーター配列と目的のポリヌクレオチド配列との間の機能的な結合をいう。プロモーターは特に制限されず、宿主に応じて適するプロモーターを選択すればよく、公知の構成的プロモーターや誘導性プロモーターを用いることができるが、構成的プロモーターを用いることが好ましい。その具体例としては、CMVプロモーター、SV40プロモーター、CAGプロモーター、シナプシンプロモーター、ロドプシンプロモーター、CaMVプロモーター、解糖系酵素プロモーター、lacプロモーター、trpプロモーター、tacプロモーター、GAPDHプロモーター、GAL1プロモーター、PH05プロモーター、PGKプロモーター、thy1プロモーター、GRKプロモーター、RPEJプロモーターなどが挙げられる。本発明の改変チャネルロドプシンを特定の細胞で特異的に発現させることを目的として、これらのプロモーターの上流にその細胞で特異的に発現しているポリペプチド遺伝子の転写調節領域(例えば視細胞で特異的に発現しているIRBP(Interphotoreceptor retinoid binding protein)の転写調節領域(Marjorie Nicoud et al.,The Journal of Gene Medicine,Volume 9,Issue12,1013-1107,December 2007))を結合したりしてもよい。本発明の改変チャネルロドプシン遺伝子の発現ベクターへの挿入は、例えば、本発明の改変チャネルロドプシン遺伝子にフランキングする制限酵素部位を作製又は連結し、適当なベクターDNAの制限酵素部位又はマルチクローニングサイトに挿入することにより行う。発現ベクターは、プロモーター及び本発明の改変チャネルロドプシン遺伝子の他、必要に応じてエンハンサー及び他のシスエレメント、スプライシングシグナル、ポリA付加シグナル、選択マーカー(アンピシリン耐性マーカー、テトラサイクリン耐性マーカーなどの薬剤耐性遺伝子マーカー、LEU1、TRP1、URA3などの栄養要求性相補遺伝子マーカー、APH、DHFR、TKなどの優性選択マーカーなど)、リボソーム結合部位(RBS)などを含んでもよい。宿主の形質転換は、プロトプラスト法、スフェロプラスト法、コンピテントセル法、ウイルス法、リン酸カルシウム法、リポフェクション法、マイクロインジェクション法、ジーンボンバートメント法、アグロバクテリウム法、エレクトロポレーションなどを用いて行うことができる。こうして得られた形質転換体は、資化しうる炭素源、窒素源、金属塩、ビタミンなどを含む培地を用いて適当な条件で培養する。形質転換体の培養は、通常、振盪培養又は通気攪拌培養などの好気的条件下、25~37℃で3~6時間行う。培養期間中、pHは中性付近に保持する。pHの調整は、無機又は有機酸、アルカリ溶液などを用いて行う。培養中は、必要に応じて、組換え発現ベクターに挿入した選択マーカーに応じて、アンピシリンやテトラサイクリンなどの抗生物質を培地に添加してもよい。また、形質転換に使用する宿主は、本発明の改変チャネルロドプシンを発現できるものであれば特に制限されるものではなく、細菌(大腸菌や枯草菌)、酵母(Saccharomyces cerevisiaeなど)、動物細胞(COS細胞、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞、3T3細胞、BHK細胞、HEK293細胞など)、昆虫細胞などが挙げられる。本発明の改変チャネルロドプシンは、形質転換体の培養により得られた培養物(培養上清、培養細胞、培養菌体、細胞や菌体のホモジェネートなど)から一般的な方法によって分取や精製を行い、限外濾過濃縮、凍結乾燥、噴霧乾燥、結晶化などによって、その活性を保持する形態で得ることができる。或いは、本発明の改変チャネルロドプシンは、単離や精製を行うことなく、本発明の改変チャネルロドプシンを発現する細胞の形態で提供してもよい。この場合、形質転換に使用する宿主細胞は、その後の用途に適した宿主細胞、例えば神経細胞(視細胞、双極細胞、神経節細胞など)、好ましくヒトの神経細胞である。また、本発明の改変チャネルロドプシンを医療用途に使用する場合には、本発明の改変チャネルロドプシンの発現ベクターの形態で提供してもよい。この場合には、細胞への導入効率、細胞内での複製維持、安定性、発現効率などに優れた発現ベクターを用いることが好ましい。このようなベクターとしては、アデノ随伴ウイルスベクター、レトロウイルスベクター、レンチウイルスベクターなどのウイルスベクター、(自立複製可能な)プラスミド、トランスポゾンなどを挙げることができる。本発明の改変チャネルロドプシンの発現ベクター作製用プラスミドは、例えばTomita H et al.,Invest Ophthalmol Vis Sci.2007 Aug;48(8):3821-6や、Sugano E et al.,Invest Ophthalmol Vis Sci.2005 Sep;46(9):3341-8に記載される方法に従って調製することができる。
ここで、本発明の改変チャネルロドプシン遺伝子としては、例えば、配列番号13に示す塩基配列からなるポリヌクレオチド(配列番号4に示すアミノ酸配列からなるポリペプチドをコード)、配列番号14に示す塩基配列からなるポリヌクレオチド(配列番号6に示すアミノ酸配列からなるポリペプチドをコード)、配列番号15に示す塩基配列からなるポリヌクレオチド(配列番号7に示すアミノ酸配列からなるポリペプチドをコード)、配列番号16に示す塩基配列からなるポリヌクレオチド(配列番号8に示すアミノ酸配列からなるポリペプチドをコード)、配列番号17に示す塩基配列からなるポリヌクレオチド(配列番号9に示すアミノ酸配列からなるポリペプチドをコード)、配列番号18に示す塩基配列からなるポリヌクレオチド(配列番号10に示すアミノ酸配列からなるポリペプチドをコード)、配列番号19に示す塩基配列からなるポリヌクレオチド(配列番号11に示すアミノ酸配列からなるポリペプチドをコード)、配列番号20に示す塩基配列からなるポリヌクレオチド(配列番号12に示すアミノ酸配列からなるポリペプチドをコード)が挙げられる。しかしながら、本発明の改変チャネルロドプシン遺伝子は、これらのポリヌクレオチドに限定されず、これらのポリヌクレオチドの相補鎖に対してストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチドであって、チャネルロドプシン機能を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。また、配列番号13~20のそれぞれに示す塩基配列と少なくとも90%、好ましくは少なくとも91%、より好ましくは少なくとも92%、より好ましくは少なくとも93%、より好ましくは少なくとも94%、より好ましくは少なくとも95%、より好ましくは少なくとも96%、より好ましくは少なくとも97%、より好ましくは少なくとも98%、最も好ましくは少なくとも99%の配列同一性を有するポリヌクレオチドであって、チャネルロドプシン機能を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。ここで、「ストリンジェントな条件でのハイブリダイゼーション」とは、例えば、30~50℃、3~4×SSC(150mM塩化ナトリウム、15mMクエン酸ナトリウム、pH7.2)、0.1~0.5%SDS中で1~24時間のハイブリダイゼーション、好ましくは40~45℃、3.4×SSC、0.3%SDS中で1~24時間のハイブリダイゼーション、そしてその後の洗浄を含む。洗浄条件としては、例えば、2×SSCと0.1%SDSを含む溶液、及び1×SSC溶液、0.2×SSC溶液による室温での連続した洗浄などの条件が挙げられる。ただし、上記条件の組み合わせは例示であり、当業者であればハイブリダイゼーションのストリンジェンシーを決定する上記の要素や他の要素(例えば、ハイブリダーゼーションプローブの濃度、長さ及びGC含量、ハイブリダイゼーションの反応時間など)を適宜組み合わせることにより、上記と同様のストリンジェンシーを実現することが可能である。
本発明の改変チャネルロドプシンは、特許文献1に従って、ボルボックス由来のチャネルロドプシンのN末端領域を、クラミドモナス・レインハルトチイ由来のチャネルロドプシン-1のN末端領域に置換されてなるポリペプチドである場合、特許文献1に記載の改変チャネルロドプシン(例えばmVChR1)が有する細胞膜上での発現効率が高いという特性を保持し、さらに、イオン透過性が高いという特性を有する。従って、本発明の改変チャネルロドプシンや、これをコードするポリヌクレオチドを含む発現ベクターは、網膜外層の障害を患う被検体の治療に有用である。ここで、「網膜外層の障害」とは、網膜外層に存在する視細胞が変性、消失するなどして視機能不全や視機能障害を生じているが、視細胞以外の細胞は依然として正常なままであったり、機能の一部が保持されていたりする任意の疾患をいう。このような疾患としては、網膜色素変性症、加齢黄斑変性症、網膜はく離などを挙げることができる。「被検体」とは、網膜外層の障害に起因して、失明している被検体や、失明のリスクを有する被検体を意味する。被検体はヒトに限らず、その他の哺乳動物であってもよい。その他の哺乳動物としては、例えばマウス、ラット、サル、ウサギ、イヌ、ネコ、ウシ、ウマなどが挙げられる。「網膜外層の障害を患う被検体の治療」とは、網膜外層の障害に起因して失明していたり、失明のリスクを有したりする被検体において、本発明の医薬の投与前と比較して、視機能を回復することを意味する。
本発明の医薬組成物は、本発明の改変チャネルロドプシンや、これをコードするポリヌクレオチドを含む発現ベクターを有効成分とし、網膜外層の障害を患う被検体を治療するための医薬として製剤化される。その有効量は、所与の症状や用法について治療効果を与え得る量であり、動物を用いた試験、臨床試験の実施により当業者によって適宜決定されるが、投与対象とする被検体の年齢、体重、性別、疾患の状態や重篤度、投与方法などが考慮される。ウイルスの場合、ウイルス量は、例えば1012~1013capsids/ml(例えば、約1013capsids/ml)である。医薬としての製剤化に際し、有効成分は1以上の薬学的に許容される担体と共に製剤化されてよい。薬学的に許容される担体としては、各種緩衝液、例えば生理食塩水、リン酸塩、酢酸塩などの緩衝液が挙げられる。医薬は、その他の治療成分を含んでよい。その他の治療成分としては、網膜色素変性症、加齢性黄斑変性症、網膜はく離などの治療剤として公知の薬剤が挙げられる。医薬は、例えば局所投与用の注射剤、点眼剤、洗眼剤などに製剤化することができる。注射用製剤は、保存剤を添加して、例えばアンプルや複数回投与容器中の単位投与剤形として提供することができる。また、医薬は、好適なビヒクル、例えば発熱物質不含の滅菌水などで使用前に再構成するための凍結乾燥剤としてもよい。医薬の投与は、被検体の患部、すなわち網膜への直接的な注射や、硝子体への直接的な接触によって行うことが好ましい。
以下、本発明を実施例によって詳細に説明するが、本発明は以下の記載に限定して解釈されるものではない。
実施例1:配列番号4に示すアミノ酸配列からなる本発明の改変チャネルロドプシン(p525を発現する細胞の取得)
特許文献1に記載のmVChR1の配列番号1に示すアミノ酸配列の1~141番目のアミノ酸をコードするポリヌクレオチドの領域と、クラミドモナス・レインハルトチイ由来のチャネルロドプシン-1の配列番号2に示すアミノ酸配列の143~170番目のアミノ酸をコードするポリヌクレオチドの領域と、配列番号1に示すアミノ酸配列の170~270番目のアミノ酸をコードするポリヌクレオチドの領域と、クラミドモナス・レインハルトチイ由来のチャネルロドプシン-2の配列番号3に示すアミノ酸配列の233~242番目のアミノ酸をコードするポリヌクレオチドの領域と、配列番号1に示すアミノ酸配列の280~342番目のアミノ酸をコードするポリヌクレオチドの領域が連結され、その5’末端と3’末端に制限酵素配列を付加したポリヌクレオチドを化学合成し、アデノ随伴ウイルスベクター作製用プラスミドのマルチクローニングサイトに挿入した。こうして調製したp525発現アデノ随伴ウイルスベクター作製用プラスミドの構成を図1に示す。このプラスミドは、マルチクローニングサイトの3’領域に蛍光タンパク質遺伝子(venus)が配置されており、目的遺伝子はC末端領域にvenusを付加した融合タンパク質として発現される。従って、このプラスミドをリン酸カルシウム法により細胞にトランスフェクトし、venusを指標にしてp525を発現する細胞を特定した。具体的には、このプラスミドの溶液(プラスミド量は15μg)を加えたチューブに、1.5mLの0.3M CaClを加えて転倒攪拌した後、内容物を別のチューブに用意した1.5mLの2X HBS(280mM NaCl、1.5mM NaHPO、50mM HEPES、pH7.1)に加え、再度転倒攪拌してから、10%FBSを含むDMEM培地で培養したヒト胎児腎由来細胞株であるHEK(Human Embryonic Kidney)293細胞に滴下添加することでプラスミドをトランスフェクトし、5%CO、37℃で培養した。6時間後、培地を新鮮な培地に交換し、2日間培養した後、蛍光顕微鏡下で細胞を観察することで、細胞内におけるp525の発現を確認した。
実施例2:配列番号6に示すアミノ酸配列からなる本発明の改変チャネルロドプシン(p548を発現する細胞の取得)
特許文献1に記載のmVChR1の配列番号1に示すアミノ酸配列の1~141番目のアミノ酸をコードするポリヌクレオチドの領域と、クラミドモナス・レインハルトチイ由来のチャネルロドプシン-1の配列番号2に示すアミノ酸配列の143~170番目のアミノ酸をコードするポリヌクレオチドの領域と、配列番号1に示すアミノ酸配列の170~244番目のアミノ酸をコードするポリヌクレオチドの領域と、クロロモナス・オオガマ由来のチャネルロドプシンの配列番号5に示すアミノ酸配列の187~212番目のアミノ酸をコードするポリヌクレオチドの領域と、クラミドモナス・レインハルトチイ由来のチャネルロドプシン-2の配列番号3に示すアミノ酸配列の233~242番目のアミノ酸をコードするポリヌクレオチドの領域と、配列番号1に示すアミノ酸配列の280~322番目のアミノ酸をコードするポリヌクレオチドの領域と、配列番号5に示すアミノ酸配列の265~286番目のアミノ酸をコードするポリヌクレオチドの領域が連結され、その5’末端と3’末端に制限酵素配列を付加したポリヌクレオチドを化学合成し、アデノ随伴ウイルスベクター作製用プラスミドのマルチクローニングサイトに挿入すること以外は実施例1と同様にして、p548を発現する細胞を作製した。
実施例3:配列番号7に示すアミノ酸配列からなる本発明の改変チャネルロドプシン(p550を発現する細胞の取得)
特許文献1に記載のmVChR1の配列番号1に示すアミノ酸配列の1~27番目のアミノ酸をコードするポリヌクレオチドの領域と、配列番号1に示すアミノ酸配列の61~141番目のアミノ酸をコードするポリヌクレオチドの領域と、クラミドモナス・レインハルトチイ由来のチャネルロドプシン-1の配列番号2に示すアミノ酸配列の143~170番目のアミノ酸をコードするポリヌクレオチドの領域と、配列番号1に示すアミノ酸配列の170~244番目のアミノ酸をコードするポリヌクレオチドの領域と、クロロモナス・オオガマ由来のチャネルロドプシンの配列番号5に示すアミノ酸配列の187~212番目のアミノ酸をコードするポリヌクレオチドの領域と、クラミドモナス・レインハルトチイ由来のチャネルロドプシン-2の配列番号3に示すアミノ酸配列の233~242番目のアミノ酸をコードするポリヌクレオチドの領域と、配列番号1に示すアミノ酸配列の280~322番目のアミノ酸をコードするポリヌクレオチドの領域と、配列番号5に示すアミノ酸配列の265~286番目のアミノ酸をコードするポリヌクレオチドの領域が連結され、その5’末端と3’末端に制限酵素配列を付加したポリヌクレオチドを化学合成し、アデノ随伴ウイルスベクター作製用プラスミドのマルチクローニングサイトに挿入すること以外は実施例1と同様にして、p550を発現する細胞を作製した。
試験例1:p525、p548、p550のそれぞれを発現する細胞のパッチクランプ法による光誘発電流の測定(その1)
p525、p548、p550のそれぞれを発現する細胞について、顕微鏡下でvenusの発現を確認した後、パッチクランプシステム(EPC-10、HEKA)を用いて測定した。細胞外液は、138mM NaCl、3mM KCl、10mM HEPES、4mM NaOH、1mM CaCl、2mM MgClからなり、1N HClでpH7.4に調整したものを用いた。電極内液は、130mM CsCl、1.1mM EGTA、2mM MgCl、0.1mM CaCl、10mM NaCl、10mM HEPES、2mM NaATPからなり、1N CsOHでpH7.2に調整したものを用いた。光照射(光源:LED)は1秒間、光強度は1μW/mm、刺激間隔は60秒、固定電位は-60mVに設定した。波長は405、455、505、560、617、656nmのそれぞれとした。結果を図2に示す。図2には、p525、p548、p550のそれぞれを発現する細胞と同様にして取得したmVChR1を発現する細胞についての測定結果をあわせて示す。図2から明らかなように、p525、p548、p550は、いずれもmVChR1よりもイオン透過性が高いことがわかった。
試験例2:p525を発現する細胞のパッチクランプ法による光誘発電流の測定(その2)
光照射を10ミリ秒で行うこと以外は試験例1と同様にして、p525の光誘発電流を測定したところ、mVChR1よりもイオン透過性が高かった。
試験例3:p528を発現する細胞のパッチクランプ法による光誘発電流の測定
試験例1と同様にして、p528の光誘発電流を測定したところ、mVChR1よりもイオン透過性が高かった。
実施例4:配列番号9に示すアミノ酸配列からなる本発明の改変チャネルロドプシン(p578(H172G)を発現する細胞の取得)
実施例2で調製したp548発現アデノ随伴ウイルスベクター作製用プラスミドに対し、KOD mutagenesis kit(Code No.SMK-101,TOYOBO)を用い、そのマニュアルに従って部位特異的変異導入を行い、172番目のHisをGlyに置換することで、p578発現アデノ随伴ウイルスベクター作製用プラスミドを調製した。具体的には、変異プライマー(配列番号21の172G Forward Primer:GGACTGAGCAACCTGACCGGCCTGAA)10pmol/μLと、Reverse Primer(配列番号22のGATCAGGATCACAGGACAGGTCAG)10pmol/μLを用い、p548発現アデノ随伴ウイルスベクター作製用プラスミド50ng/μLを鋳型にしてPCRを行った。PCRの反応サイクルは、94℃2分間→98℃10秒間→68℃7分間を5サイクルとした。PCR産物を制限酵素DpnIで処理することで、鋳型にしたp548発現アデノ随伴ウイルスベクター作製用プラスミドを消化し、その後、T4 Polynucleotide KinaseとLigaseを同時に作用させ、直鎖状プラスミドをSelf-ligationすることにより環状化し、p578発現アデノ随伴ウイルスベクター作製用プラスミドを得た。こうして得たp578発現アデノ随伴ウイルスベクター作製用プラスミドを用いること以外は実施例1と同様にして、p578を発現する細胞を作製した。
実施例5:配列番号10に示すアミノ酸配列からなる本発明の改変チャネルロドプシン(p579(H172A)を発現する細胞の取得)
変異プライマーとして配列番号23の172A Forward Primer:GCCCTGAGCAACCTGACCGGCCTGAAを用いること以外は実施例4と同様にして、p579発現アデノ随伴ウイルスベクター作製用プラスミドを調製し、p579を発現する細胞を作製した。
実施例6:配列番号11に示すアミノ酸配列からなる本発明の改変チャネルロドプシン(p580(H172K)を発現する細胞の取得)
変異プライマーとして配列番号24の172K Forward Primer:AAACTGAGCAACCTGACCGGCCTGAAを用いること以外は実施例4と同様にして、p580発現アデノ随伴ウイルスベクター作製用プラスミドを調製し、p580を発現する細胞を作製した。
実施例7:配列番号12に示すアミノ酸配列からなる本発明の改変チャネルロドプシン(p581(H172R)を発現する細胞の取得)
変異プライマーとして配列番号25の172R Forward Primer:CGCCTGAGCAACCTGACCGGCCTGAAを用いること以外は実施例4と同様にして、p581発現アデノ随伴ウイルスベクター作製用プラスミドを調製し、p581を発現する細胞を作製した。
試験例4:p578、p579、p580、p581のそれぞれを発現する細胞のパッチクランプ法による光誘発電流の測定
試験例1と同様にして、それぞれの光誘発電流を測定した。結果を図3に示す。図3には、p548を発現する細胞についての測定結果をあわせて示す。図3から明らかなように、p578、p579、p580、p581のイオン透過性は、いずれもp548よりも低かったが、mVChR1よりは高かった(mVChR1のイオン透過性は図2を参照)。
試験例5:p579を発現する細胞のパッチクランプ法によるτonとτoffの測定
試験例4における光誘発電流の測定と同じ条件でτonとτoffを測定した。結果をτonについて図4にτoffについて図5に示す。それぞれの図には、p548を発現する細胞についての測定結果をあわせて示す。図4と図5から明らかなように、p548の172番目のHisをAlaに置換したp579は、τonとτoffがいずれもp548よりも短く、高い時間分解能で細胞を制御することがわかった。
試験例6:アデノ随伴ウイルスベクターを用いたp548遺伝子の網膜への導入とその効果
(実験方法)
アデノ随伴ウイルスベクターの作製
AAVヘルパーフリーシステム(Stratagene,La Jalla,CA)を用い、そのマニュアルに従って、実施例2で調製したp548発現アデノ随伴ウイルスベクター作製用プラスミド、pAAV-RC、pHelperの3種類のプラスミドから、p548遺伝子を網膜に導入するためのアデノ随伴ウイルスベクターを作製した。具体的には、それぞれのプラスミドの溶液(プラスミド量はいずれも15μg)を加えてタッピングしたチューブに、1.5mLの0.3M CaClを加えて転倒攪拌した後、内容物を別のチューブに用意した1.5mLの2X HBS(280mM NaCl、1.5mM NaHPO、50mM HEPES、pH7.1)に加え、再度転倒攪拌してから、15cm培養皿に培養した293T細胞に滴下添加することにより、3種類のプラスミドをリン酸カルシウム法によって共トランスフェクトし、5%CO、37℃で培養した。3日間培養した後、回収した細胞から目的とするウイルス粒子を精製した。
実験動物
7ヶ月齢のRoyal College of Surgeons(RCS:rdy/rdy)ラットを用いた。RCSラットは、生後いったん正常に網膜が形成されるが、生後3週より視細胞の変性が始まり、生後3ヶ月で視細胞がほぼ消失して失明に至る。従って、7ヶ月齢のRCSラットでは視覚誘発電位は記録されない。
p548遺伝子の網膜への導入
ケタミン(66mg/kg)とキシラジン(3.3mg/kg)の混合麻酔下で、RCSラットの両眼の眼球結膜を1mm程度切開し、毛様体扁平部から32ゲージマイクロシリンジを刺入して硝子体内に5μLのウイルス溶液を注入した。
視覚誘発電位の測定
RCSラットの硝子体内にウイルス溶液を注入してから2ヶ月後、視覚誘発電位を測定し、誘発反応記録装置(メイヨー社のPuREC)を用いて記録した。視覚誘発電位を測定するための電極は、頭皮を切開して頭蓋を露出させた状態で、ブレグマからラムダへ正中線を6.8mm、その中心から3mmの左右の位置の硬膜上に設置した。基準電極は、ブレグマからラムダへ正中線を12mmの位置の硬膜上に設置した。設置した電極は歯科用セメントで固定した。視覚誘発電位の測定は、ケタミン(66mg/kg)とキシラジン(3.3mg/kg)の混合麻酔下で、1%のアトロピンと2.5%のフェニレフリン塩酸塩により散瞳した状態で行った。視覚刺激は各種LED(刺激光波長:465、525、650nm)を光源とし、照射時間10ms、刺激周波数1Hzで、200回刺激を繰り返し、加算平均により記録した。
網膜伸展標本と網膜切片標本の作製とその観察
RCSラットの硝子体内にウイルス溶液を注入してから8ヶ月後、p548の発現を確認する目的で網膜伸展標本を作製した。眼球を摘出し、4%パラフォルムアルデヒド溶液で直ちに固定した後、前眼部を取り除き、神経網膜を脈絡膜から剥離した。脈絡膜から剥離した神経網膜をスライドガラス上に伸展し、蛍光顕微鏡下で観察することでvenusを指標にしてp548の発現を確認した。続いて、作製した網膜伸展標本を凍結組織切片作製用包埋剤(サクラファインテックジャパン社のO.C.T.コンパウンド)に包埋して凍結切片(網膜切片標本)を作製し、蛍光顕微鏡下で観察することでvenusを指標にして網膜断面におけるp548の発現を確認した。
(実験結果)
視覚誘発電位の測定結果を図6に示す。図6から明らかなように、p548遺伝子を網膜に導入することにより、465、525、650nmのいずれの刺激光波長においても視覚誘発電位を記録することができた。視覚誘発電位の振幅は、光強度が強いほど大きかった。蛍光顕微鏡下で観察した網膜伸展標本の写真を図7に示す。図7から明らかなように、p548の発現を神経網膜の全体において確認することができた。蛍光顕微鏡下で観察した網膜切片標本の写真を図8に示す。図8から明らかなように、p548の発現を主として網膜神経節細胞層において確認することができた(右下の写真は染色された核である)。
本発明は、イオン透過性(光反応性)が高い改変チャネルロドプシンを提供することができる点において産業上の利用可能性を有する。

Claims (11)

  1. ボルボックス由来のチャネルロドプシンが有する3つの細胞外ドメインのN末端側から数えて3つめの細胞外ドメインが、クラミドモナス・レインハルトチイ由来のチャネルロドプシン-2の対応する細胞外ドメインに置換されてなるポリペプチドであって、以下の(a)または(b)のポリペプチドで構成される改変チャネルロドプシン。
    (a)配列番号6に示すアミノ酸配列からなるポリペプチド
    (b)配列番号6に示すアミノ酸配列と少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列からなり、かつチャネルロドプシン機能を有するポリペプチド
  2. 配列番号6に示すアミノ酸配列からなるポリペプチドの172番目のHisが他のアミノ酸に置換されてなるポリペプチドで構成される請求項1記載の改変チャネルロドプシン。
  3. 配列番号9~12のいずれかに示すアミノ酸配列からなるポリペプチドで構成される請求項2記載の改変チャネルロドプシン。
  4. ボルボックス由来のチャネルロドプシンが有する3つの細胞外ドメインのN末端側から数えて3つめの細胞外ドメインが、クラミドモナス・レインハルトチイ由来のチャネルロドプシン-2の対応する細胞外ドメインに置換されてなるポリペプチドであって、以下の(a)または(b)のポリペプチドで構成される改変チャネルロドプシン。
    (a)配列番号7に示すアミノ酸配列からなるポリペプチド
    (b)配列番号7に示すアミノ酸配列と少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列からなり、かつチャネルロドプシン機能を有するポリペプチド
  5. 請求項1~4のいずれかに記載の改変チャネルロドプシンを構成するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド。
  6. プロモーターと機能的に連結された請求項5記載のポリヌクレオチドを含む発現ベクター。
  7. 請求項1~4のいずれかに記載の改変チャネルロドプシンを構成するポリペプチドを発現する細胞。
  8. 細胞が神経細胞である請求項7記載の細胞。
  9. 網膜外層の障害を患う被検体を治療するための医薬の製造における、請求項1~4のいずれかに記載の改変チャネルロドプシンを構成するポリペプチド、請求項5記載のポリヌクレオチド、請求項6記載の発現ベクターのいずれかの使用。
  10. 網膜外層の障害が、網膜色素変性症、加齢黄斑変性症、網膜はく離のいずれかである請求項9記載の使用。
  11. 請求項1~4のいずれかに記載の改変チャネルロドプシンを構成するポリペプチド又は請求項6記載の発現ベクターのいずれかを有効成分として含む網膜外層の障害を治療するための医薬組成物。
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