JP7439371B2 - Ｃａｎｄｉｄａ ａｕｒｉｓ感染症の治療方法 - Google Patents

Description

特許法第３０条第２項適用 公開者：エドワーズ， ジョン イー． ジュニア、「Ｎｏｒｔｈｅｒｎ Ｃａｌｉｆｏｒｎｉａ Ｉｎｆｅｃｔｉｏｕｓ Ｄｉｓｅａｓｅｓ Ｓｏｃｉｅｔｙにおけるプレゼンテーション」、開催日：平成３０年３月３日

Ｃａｎｄｉｄａ ａｕｒｉｓは、新たに出現している世界的衛生に脅威をもたらす病原性酵母種である。酵母は、血流に入って体全体に広がり、重篤な侵襲性感染症を引き起こし得る。さらに、Ｃ．ａｕｒｉｓは、重度の創傷、耳、呼吸器、および尿路の感染症を引き起こすことが知られている。Ｃ．ａｕｒｉｓ感染症は治療することが困難であり得るが、これは、それらが一般的に使用される抗真菌薬に対して耐性であることが多いためである。したがって、Ｃ．ａｕｒｉｓ感染症の新しい治療方法および予防方法が必要とされている。

本明細書では、Ｃ．ａｕｒｉｓ感染症に対して治療および免疫するための、組成物および方法を開示する。Ｃ．ａｕｒｉｓ感染症に対する能動的および受動的な免疫保護を提供するための、ポリペプチド、抗体、およびそれらの使用方法を特徴とする。

一態様では、Ｃ．ａｕｒｉｓ感染症に対して、対象（例えば、ヒト対象）を治療するか、または対象（例えば、ヒト対象）を免疫する方法であって、かかる対象に対し、免疫原性量の、Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログあるいは抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片を投与することによって行う方法を特徴とする。また、免疫原性量の、Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログあるいは抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片を対象に投与することによって、対象におけるＣ．ａｕｒｉｓ感染症を予防する方法も特徴とする。また、免疫原性量のＡｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログを対象に投与することによって、対象においてＣ．ａｕｒｉｓに対する免疫応答またはＣ．ａｕｒｉｓに対する抗体の産生を誘導する方法も特徴とする。方法には、投与に先立ち、対象がＣ．ａｕｒｉｓ感染症を有するとして同定することがさらに含まれ得る。方法には、投与に先立ち、対象をＣ．ａｕｒｉｓが定着しているとして同定することがさらに含まれ得る。方法には、投与に先立ち、対象をＣ．ａｕｒｉｓによる定着および／または感染のリスクがあるとして同定することがさらに含まれ得る。対象は、Ｃ．ａｕｒｉｓ感染症を有し得るか、有することが疑われるか、または有するリスクがある。対象は、Ｃ．ａｕｒｉｓに曝露されたことがあり得るか、または曝露されていることが疑われる。同定ステップには、対象から試料を得ることが含まれ得る。試料は、皮膚または粘膜（例えば、対象の口、喉、食道、直腸、または膣）の拭き取りで得られ得る。

いくつかの実施形態では、投与方法は、対象におけるＣ．ａｕｒｉｓの負荷またはバイオフィルム形成を、未治療対象におけるＣ．ａｕｒｉｓの負荷またはバイオフィルム形成と比較して阻害または低減する（例えば、約１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、８５％、９０％、または実質的に排除する）。

対象は、免疫不全である、併存疾患に罹患している、かつ／またはＣ．ａｕｒｉｓ感染症の危険因子を有する場合がある。併存疾患は、細菌感染症、真菌感染症、ウイルス感染症、免疫障害、または糖尿病であり得る。真菌感染症は、カンジダ症（例えば、口、喉、または食道などの粘膜の）、外陰膣カンジダ症（例えば、再発性外陰膣カンジダ症）、および／または侵襲性カンジダ症であり得る。例示的な危険因子は、外科手術、集中治療室入室、介護施設入居、呼吸管もしくは栄養管の使用、広域スペクトル抗生物質もしくは抗真菌剤による治療、またはカテーテルの存在（例えば、中心静脈カテーテル）である。

対象は、病院もしくは保健所で、治療されているか、治療されたことがあるか、または治療される予定の対象であり得る。対象はまた、病院もしくは保健所で、働いているか、働いたことがあるか、または働く予定である対象でもあり得る。

対象は、少なくとも５０歳、６０歳、７０歳、８０歳、または９０歳であり得る。別の方法では、対象は、新生児、乳児、または幼児（例えば、３歳未満）であり得る。

いくつかの実施形態では、Ｃ．ａｕｒｉｓは多剤耐性であり得る。

本明細書に記載の方法により、Ｃ．ａｕｒｉｓの定着が低減され得る（例えば、約１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、８５％、９０％、または定着を実質的に排除する）。方法により、対象の生存率が、Ｃ．ａｕｒｉｓの感染または定着のある未治療対象と比較して高まり得る（例えば、約１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、８５％、９０％、１００％、またはそれ以上）。方法により、それぞれ未治療対象と比較して、対象における活動性Ｃ．ａｕｒｉｓ感染の日数が減少する（例えば、１日、２日、３日、４日、５日、６日、７日、８日、９日、１０日、２０日、３０日、４０日、５０日、またはそれ以上の日数）、対象の入院日数が減少する（例えば、１日、２日、３日、４日、５日、６日、７日、８日、９日、１０日、２０日、３０日、４０日、５０日、またはそれ以上の日数）、対象の抗真菌療法を要する日数が減少する（例えば、１日、２日、３日、４日、５日、６日、７日、８日、９日、１０日、２０日、３０日、４０日、５０日、またはそれ以上の日数）、ならびに／または対象が必要とする抗真菌療法の用量および／もしくは頻度が低下する場合がある。

いくつかの実施形態では、Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログあるいは抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片は、皮下、筋肉内、皮内、経皮、鼻腔内、経口か、または注入を介して投与される。好ましくは、Ａｌｓ３ポリペプチドまたは断片は、皮内または筋肉内注射によって投与される。好ましくは、抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片は、注入（例えば、静脈内注入）によって投与される。

Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログあるいは抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片は、抗真菌薬などの追加の治療薬とともに投与され得る。抗真菌薬は、アゾール（例えば、トリアゾール（例えば、フルコナゾール、アルバコナゾール、エフィナコナゾール、エポキシコナゾール、イサブコナゾール、イトラコナゾール、ポサコナゾール、プロピコナゾール、ラブコナゾール、テルコナゾール、またはボリコナゾール）、イミダゾール（例えば、ビホナゾール、ブトコナゾール、クロトリマゾール、エベルコナゾール）、エコナゾール、フェンチコナゾール、フルトリマゾール、イソコナゾール、ケトコナゾール、ルリコナゾール、ミコナゾール、オモコナゾール、オキシコナゾール、セルタコナゾール、スルコナゾール、またはチオコナゾール）、またはチアゾール（例えば、アバファンギン））、ポリエン（例えば、アムホテリシンＢ、カンジシジン、フィリピン、ハマイシン、ナタマイシン、ナイスタチン、またはリモシジン）、アリルアミン（例えば、アモロルフィン、ブテナフィン、ナフチフィン、またはテルビナフィン）、エキノカンジン（例えば、アニデュラファンギン、ビアファンギン、カスポファンギン、またはミカファンギン）、ラノステロールデメチラーゼ阻害剤（例えば、ＶＴ－１１６１）、安息香酸、シクロピロクスオアミン、エンフマファンギン、５－フルシトシン、グリセオフルビン、ハロプロジン、トルナフタート、アミノカンジン、クロルダントイン、クロルフェネシン、ニフロキシム、ウンデシレン酸、またはクリスタルバイオレットであり得る。

追加の治療薬およびＡｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログあるいは抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片および追加の治療薬は、互いに１か月以内、２週間以内、１週間以内、１日以内、１２時間以内、６時間以内、もしくは１時間以内、または実質的に同時に（例えば、任意の順序で連続して）投与することができる。Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片は、追加の治療薬（例えば、抗真菌薬）との混合剤として投与され得る。

Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログは、配列番号１～７のうちのいずれか１つに対して少なくとも８５％（例えば、９０％、９５％、９７％、９９％、または１００％）の同一性を有し得る。抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片は、配列番号１～７のうちのいずれか１つに記載のアミノ酸配列を有するポリペプチド内部のエピトープに特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片であり得る（例えば、Ｋ_Ｄが１００ｎＭ以下、例えば、Ｋ_Ｄが約１ｐＭ～１００ｎＭであり、その端点が含まれる）。

約５マイクログラム～約５ミリグラム（例えば、１０～約６００マイクログラム、約２０～約３００マイクログラム、約３０～約９０マイクログラム、３０～３００、または約２００～約３００マイクログラム）の用量のＡｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログは、単一用量または１つ以上の分割用量に希釈して対象に投与され得る。用量は、約２ｍＬ以下（例えば、約１ｍＬ以下、約０．７５ｍＬ以下、約０．５ｍＬ以下、または約０．２５ｍＬ以下）の容量で投与され得る。好ましくは、Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片は３００マイクログラム／０．５ｍＬの用量で投与される。

Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログは、アジュバント（例えば、フロイントアジュバント、リポ多糖類、リン酸アルミニウム、水酸化アルミニウム、またはミョウバン）とともに製剤化され得る。好ましくは、アジュバントはミョウバンである。アジュバントは、溶液の約０．１～１０ｍｇ／ｍＬ（例えば、０．２ｍｇ／ｍＬ、０．３ｍｇ／ｍＬ、０．４ｍｇ／ｍＬ、０．５ｍｇ／ｍＬ、０．６ｍｇ／ｍＬ、０．７ｍｇ／ｍＬ、０．８ｍｇ／ｍＬ、０．９ｍｇ／ｍＬ、１ｍｇ／ｍＬ、２ｍｇ／ｍＬ、３ｍｇ／ｍＬ、４ｍｇ／ｍＬ、５ｍｇ／ｍＬ、６ｍｇ／ｍＬ、７ｍｇ／ｍＬ、８ｍｇ／ｍＬ、９ｍｇ／ｍＬ、または１０ｍｇ／ｍＬ）および約５％～９０％（例えば、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％）の濃度で存在し得る。好ましくは、約６００マイクログラムのＡｌｓ３ポリペプチドは、リン酸緩衝生理食塩水中に約０．５ｍｇの水酸化アルミニウムとともに製剤化される。

Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログは、対象に２回以上（例えば、２回、３回、４回、５回、６回、７回、８回、９回、１０回、もしくはそれ以上の回数、例えば、同じかまたは異なる用量で）投与され得る。２回目の用量は、初回用量投与後、約７日目～９０日目（例えば、約２１日目から６０日目の間）に投与され得る。

いくつかの実施形態では、抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片は、約０．５グラム～約５グラムの用量で投与することができる。例えば、抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片は、約１ｍｇ／ｋｇ～約２０ｍｇ／ｋｇの用量で、かつ／または約１０００ｍＬ以下の容量で投与され得る（例えば、９００ｍＬ、８００ｍＬ、７００ｍＬ、６００ｍＬ、５００ｍＬ、４００ｍＬ、３００ｍＬ、２００ｍＬ、１００ｍＬ、５０ｍＬ、もしくは１０ｍＬ以下、または約１０００ｍＬ～１０ｍＬの容量）。特に、抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片は、約０．５ｍｇ／ｍＬ（例えば、２ｍｇ／ｍＬ）～約５００ｍｇ／ｍＬ（例えば、最大２００ｍｇ／ｍＬ）の濃度で投与され得る。抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片は、持続注入またはボーラス注入などの注入として投与され得る。抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片は、投与に先立ち水和される凍結乾燥組成物として調製され得る。抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片は、対象に２回以上（例えば、２回、３回、４回、５回、６回、７回、８回、９回、１０回、またはそれ以上の回数、例えば、同じかまたは異なる用量で）投与され得る。２回目の用量は、初回用量後、または初回（または後続）用量の投与後にＣ．ａｕｒｉｓ感染症が解消されていない場合、１か月、２か月、３か月、４か月、５か月、６か月、７か月、８か月、９か月、１０か月、１１か月、もしくは１２か月、またはそれ以上の期間内に対象に投与され得る。

定義
本明細書で使用する場合、「アジュバント」は、免疫系の刺激を引き起こし、かつ／または増強する１つ以上の物質を指す。これに関連して、アジュバントは、１つ以上のワクチン抗原（例えば、本明細書に記載の１つ以上のＡｌｓ３ポリペプチド）に対する免疫応答を増強するために使用される。アジュバントは、ワクチンの投与の、前、組み合わせて、または後に、対象に投与され得る。アジュバントとして使用される化学物質の例には、アルミニウム化合物（例えば、ミョウバン、水酸化アルミニウム、リン酸アルミニウム、ＡＬＨＹＤＲＯＧＥＬ（登録商標）、ＡＤＪＵ－ＰＨＯＳ（登録商標））、油、ブロックポリマー、免疫刺激複合体、ビタミンおよびミネラル（例えば、ビタミンＥ、ビタミンＡ、セレン、およびビタミンＢ１２）、Ｑｕｉｌ Ａ（サポニン）、細菌および真菌の細胞壁成分（例えば、リポ多糖類、リポタンパク質、および糖タンパク質）、ホルモン、サイトカイン、ならびに共刺激因子が含まれるが、これらに限定されない。

本明細書で使用する場合、アミノ酸配列における「保存的置換」は、あるアミノ酸と、電荷、極性、および／またはサイズが同様のアミノ酸との置換を指す。好ましくは、保存的置換では、タンパク質またはポリペプチドの構造または機能を変化させない。

本明細書で使用する場合、「融合タンパク質」は、本発明のポリペプチド（例えば、Ａｌｓ３ポリペプチド（その断片、ホモログ、および変異型を含む）と融合パートナー（例えば、異種ポリペプチド）とが含まれるタンパク質を指す。

本明細書で使用する場合、「Ａｌｓ３ポリペプチド」は、Ｃ．ａｌｂｉｃａｎｓのＡｌｓ３と実質的な配列同一性を共有する任意のポリペプチド、その断片、または変異型を指す。これには、例えば、配列番号１～５のポリペプチドおよびそれらの断片が含まれる。Ａｌｓ３ポリペプチドの変異型は、例えば、配列番号１～５のうちのいずれか１つの配列に対し、少なくとも５０％（例えば、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、９８％、９９％、または１００％）の配列同一性を有する。

本明細書で使用する場合、「Ａｌｓ３ホモログ」は、Ａｌｓ３と共通の祖先遺伝子に由来するポリペプチドを指す。ホモログには、共通の祖先遺伝子から進化した異なる種の遺伝子であるオルソログが含まれる。Ａｌｓ３オルソログには、例えば、Ｃ．ａｕｒｉｓの仮説のタンパク質であるＱＧ３７＿０６２６５（Ｇｅｎｂａｎｋ受託番号ＸＰ＿０１８１６７５７２．１）およびＱＧ３７＿０５９７９（Ｇｅｎｂａｎｋ受託番号ＸＰ＿０１８１６７３０７．１）が含まれる。ホモログまたはオルソログは、Ａｌｓ３ポリペプチドと少なくとも１０％の配列同一性および／または配列類似性（例えば、Ａｌｓ３ポリペプチドに対する１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％の配列同一性および／または配列類似性；例えば、配列番号１～５のうちのいずれか１つの配列を有するＡｌｓ３ポリペプチドに対する少なくとも５０％以上の配列同一性）を共有し得る。

本明細書で使用する場合、「免疫原性」は、対象において免疫応答を誘導することができる任意の物質を指す（例えば、ＥＬＩＳＡ、抗体サブクラスの決定、オプソニン食作用アッセイ（例えば、Ｄｗｙｅｒ ａｎｄ Ｇａｄｊｅｖａ，Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１１００：３７３－３７９，２０１４を参照のこと）、あるいは、例えば、フローサイトメトリーもしくはＭＨＣテトラマー染色を使用する、例えば、ＣＤ４＋および／またはＣＤ８＋の細胞応答など、細胞の既往歴の存在、によって決定されるような、対象における抗体価の増加によって決定される）。

本明細書で使用する場合、免疫原性の組成物またはワクチンの場合の「免疫原性量」は、対象において免疫応答を誘導する組成物の量を指す（例えば、ＥＬＩＳＡ、抗体サブクラスの決定、オプソニン食作用アッセイ（例えば、Ｄｗｙｅｒ ａｎｄ Ｇａｄｊｅｖａ，Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１１００：３７３－３７９，２０１４を参照のこと）、あるいは、例えば、フローサイトメトリーもしくはＭＨＣテトラマー染色を使用する、例えば、ＣＤ４＋および／またはＣＤ８＋の細胞応答など、細胞の既往歴の存在、によって決定されるような、対象における抗体価の増加によって決定される）。

本明細書で使用する場合、「免疫原性組成物」は、組成物であって、それを投与される対象において免疫応答を誘発するものを指す（例えば、ＥＬＩＳＡ、抗体サブクラスの決定、オプソニン食作用アッセイ（例えば、Ｄｗｙｅｒ ａｎｄ Ｇａｄｊｅｖａ，Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１１００：３７３－３７９，２０１４を参照のこと）、あるいは例えば、フローサイトメトリーもしくはＭＨＣテトラマー染色を使用する、例えば、ＣＤ４＋および／またはＣＤ８＋の細胞応答など、細胞の既往歴の存在、によって決定されるような、対象における抗体価の増加によって決定される）。

「単離された」または「精製された」とは、天然で会合している他の成分から分離されていることを意味する。典型的には、化合物（例えば、核酸、ポリペプチド、抗体、または小分子）は、重量で少なくとも６０％（例えば、７０％、８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、９９％または１００％）が、それが天然で会合しているタンパク質および／または天然に生じる有機分子を含まない場合、実質的に単離されている。

本明細書で使用する場合、「患者」または「対象」は哺乳類を指し、ヒト、またはウシ、ウマ、イヌ、ヒツジ、もしくはネコなどの非ヒト哺乳類が含まれるが、これらに限定されない。

本明細書で交換可能に使用される「ポリペプチド」および「タンパク質」という用語は、本明細書に記載されているように、翻訳後修飾（例えば、グリコシル化またはリン酸化）に関係なく、天然に生じるかまたは天然には生じない、ポリペプチドまたはペプチドの、全部または一部を構成する、２つ以上の天然または非天然のアミノ酸の任意の鎖を指す。

本明細書で使用する場合、「医薬組成物」は、薬学的に許容される添加物または担体とともに製剤化された、本明細書に記載のポリペプチドまたは抗体を含有する組成物を指す。薬学的に許容される添加物または担体は、組成物を投与される個体に免疫応答を誘導せず、組成物の特性に悪影響を及ぼさない補助物質である。

本明細書で使用する場合、「特異的に結合する」とは、タンパク質および他の生体分子の不均一な集団内に、例えば、抗体またはその抗原結合断片などによって特別に認識される抗原（例えば、Ａｌｓ３ポリペプチド）が存在することを決定する結合反応を指す。ある抗原に特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片は、１００ｎＭ未満のＫ_Ｄでその抗原に結合する。例えば、ある抗原に特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片は、最大１００ｎＭ（例えば、１ｐＭ～１００ｎＭ）のＫ_Ｄで抗原に結合する。特定の抗原またはそのエピトープへの特異的結合を示さない抗体またはその抗原結合断片は、その特定の抗原またはそのエピトープに対し、１００ｎＭより大きい（例えば、５００ｎｍ、１μＭ、１００μＭ、５００μＭ、または１ｍＭより大きい）Ｋ_Ｄを示す。固相ＥＬＩＳＡ免疫測定法など様々な免疫測定形式が、特定のタンパク質（例えば、Ａｌｓ３ポリペプチド）と特異的に免疫反応性である抗体を選択するために使用され得る。

本明細書で使用する場合、「実質的に同一」とは、参照配列に対して少なくとも５０％の配列同一性を示すアミノ酸配列または核酸配列を指す。そのような配列は、一般に、参照するアミノ酸または核酸の配列に対しそれぞれ、アミノ酸レベルまたは核酸レベルで、少なくとも、例えば、５０％、６０％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％同一である。一般に、ポリペプチドの場合、比較配列の長さは、少なくとも５アミノ酸、例えば、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１２５、１５０、１７５、２００、２５０、３００、４００、５００、６００、７００、８００、９００、１０００、１１００、またはそれ以上のアミノ酸であり、最大でポリペプチドの全長（例えば、配列番号１、２、３、４、５、６、および７を参照のこと）であり得る。好ましくは、比較は、最大でポリペプチドの全長である。

本明細書で使用する場合、ポリペプチドまたは核酸配列が参照配列に対して「少なくともＸ％の配列同一性」を有すると言及される場合、これらの配列を最適に整列させた際に、ポリペプチドまたは核酸においてそれぞれ、アミノ酸またはヌクレオチドの少なくともＸパーセントが参照配列のものと同一であることを意味する。配列の最適なアラインメントは、当業者の技量の範囲内である様々な方法、例えば、Ｓｍｉｔｈ Ｗａｔｅｒｍａｎアラインメントアルゴリズム（Ｓｍｉｔｈ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１４７：１９５－７，１９８１）およびＢＬＡＳＴ（Ｂａｓｉｃ Ｌｏｃａｌ Ａｌｉｇｎｍｅｎｔ Ｓｅａｒｃｈ Ｔｏｏｌ；Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２１５：４０３－１０，１９９０）を使用して決定することができる。これらおよび他のアラインメントアルゴリズムは、ＧｅｎｅＭａｔｃｈｅｒ ＰｌｕｓＴＭ（Ｓｃｈｗａｒｚ ａｎｄ Ｄａｙｈｏｆ，Ａｔｌａｓ ｏｆ Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｓｅｑｕｅｎｃｅ ａｎｄ Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ，Ｄａｙｈｏｆｆ，Ｍ．Ｏ．，Ｅｄ ｐｐ ３５３－３５８，１９７９）に組み込まれている「Ｂｅｓｔ Ｆｉｔ」（Ｓｍｉｔｈ ａｎｄ Ｗａｔｅｒｍａｎ，Ａｄｖａｎｃｅｓ ｉｎ Ａｐｐｌｉｅｄ Ｍａｔｈｅｍａｔｉｃｓ，４８２－４８９，１９８１）、ＢＬＡＳＴ、ＢＬＡＳＴ－２、ＢＬＡＳＴ－Ｐ、ＢＬＡＳＴ－Ｎ、ＢＬＡＳＴ－Ｘ、ＷＵ－ＢＬＡＳＴ－２、ＡＬＩＧＮ、ＡＬＩＧＮ－２、ＣＬＵＳＴＡＬ、またはＭｅｇａｌｉｇｎ（ＤＮＡＳＴＡＲ）などの公衆に利用可能なコンピュータソフトウェアを使用してアクセスできる。さらに、当業者は、比較される配列の長さにわたって最適なアラインメントを達成するために必要な任意のアルゴリズムを含め、アラインメント測定用の適切なパラメータを決定することができる。

本明細書で使用する場合、「治療」または「治療すること」という用語は、Ｃ．ａｕｒｉｓ感染症を、低減させること、低下させること、進行を低下させること、または副作用を低下させること（例えば、１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、９７％、９９％、または約１００％）を指す。治療が有効であるかどうかを決定するために、治療された対象と、治療を受けなかった同様の状況にある対象（例えば、Ｃ．ａｕｒｉｓ感染症を有するか、またはそのリスクがある対象）との間で比較を行うことができる。比較は、治療された対象と、対照、ベースライン、または既知のレベルもしくは測定値との間で行うこともできる。Ｃ．ａｕｒｉｓ感染症を治療することには、Ｃ．ａｕｒｉｓの定着、感染量、およびバイオフィルム形成を低減すること（１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、９７％、９９％、または約１００％）、ならびに対象における活動性Ｃ．ａｕｒｉｓ感染の日数を減少させること（例えば、１日、２日、３日、４日、５日、６日、７日、８日、９日、１０日、２０日、３０日、４０日、５０日、またはそれ以上の日数）、対象の入院日数を減少させること（例えば、１日、２日、３日、４日、５日、６日、７日、８日、９日、１０日、２０日、３０日、４０日、５０日、またはそれ以上の日数）、対象の抗真菌療法を要する日数を減少させること（例えば、１日、２日、３日、４日、５日、６日、７日、８日、９日、１０日、２０日、３０日、４０日、５０日、またはそれ以上の日数）、および／または対象が必要とする抗真菌療法の用量を減量すること、のうちの１つ以上が含まれる。

本明細書で使用する場合、「予防する」という用語は、Ｃ．ａｕｒｉｓ感染症に罹患するリスクを（例えば、１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、９７％、９９％、または約１００％）低下させることを意味する。予防が有効であるかどうかを決定するために、組成物（例えば、Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログあるいは抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片）の投与を受けた対象と、組成物の投与を受けなかった同様の状況にある対象（例えば、Ｃ．ａｕｒｉｓ感染症のリスクがある対象）との間で比較を行うことができる。比較は、組成物の投与を受けた対象と、対照、ベースライン、または既知のレベルもしくは測定値との間で行うこともできる。
本発明は、例えば、以下の項目を提供する。
（項目１）
対象に対し、免疫原性量のＡｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログ、あるいは抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片を投与することによって、Ｃａｎｄｉｄａ
ａｕｒｉｓ感染症に対して、前記対象を治療するか、前記対象に免疫を与えるか、前記対象において予防するか、または抗体産生を対象において誘発する方法。
（項目２）
前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログ、あるいは抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片の投与に先立ち、前記対象がＣ．ａｕｒｉｓ感染症にかかっているとして同定することをさらに含む、項目１に記載の方法。
（項目３）
前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログ、あるいは抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片の投与に先立ち、前記対象をＣ．ａｕｒｉｓが定着しているとして同定することをさらに含む、項目１または２に記載の方法。
（項目４）
前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログ、あるいは抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片の投与に先立ち、前記対象をＣ．ａｕｒｉｓによる定着および／または感染のリスクがあるとして同定することをさらに含む、項目１または２に記載の方法。
（項目５）
前記同定することが前記対象から試料を採取することを含む、項目２～４のいずれか一項に記載の方法。
（項目６）
前記試料が皮膚または粘膜の拭き取りで得られ、任意選択で、前記粘膜が前記対象の口、喉、食道、直腸または膣である、項目５に記載の方法。
（項目７）
前記方法が、前記対象におけるＣ．ａｕｒｉｓバイオフィルム形成を、未治療対象におけるＣ．ａｕｒｉｓバイオフィルム形成と比較して阻害または低減し、任意選択で、前記方法が、Ｃ．ａｕｒｉｓバイオフィルム形成を約１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、８５％、９０％阻害もしくは低減するか、またはＣ．ａｕｒｉｓバイオフィルム形成を実質的に排除する、項目１～６のいずれか一項に記載の方法。
（項目８）
前記対象が、Ｃ．ａｕｒｉｓ感染症にかかっているか、かかっていることが疑われるか、またはかかるリスクがある、項目１～７のいずれか一項に記載の方法。
（項目９）
前記対象が、Ｃ．ａｕｒｉｓに曝露されたことがあるか、または曝露されていることが疑われる、項目１～８のいずれか一項に記載の方法。
（項目１０）
前記対象が免疫不全である、項目１～９のいずれか一項に記載の方法。
（項目１１）
前記対象がＣ．ａｕｒｉｓ感染症の併存疾患に罹患しているか、またはその危険因子を有する、項目１～１０のいずれか一項に記載の方法。
（項目１２）
前記併存疾患が、細菌感染症、真菌感染症、ウイルス感染症、免疫障害または糖尿病である、項目１１に記載の方法。
（項目１３）
前記真菌感染症がカンジダ症である、項目１２に記載の方法。
（項目１４）
前記カンジダ症が粘膜のカンジダ症感染であり、任意選択で、前記粘膜が前記対象の口、喉、または食道である、項目１３に記載の方法。
（項目１５）
前記カンジダ症が外陰膣カンジダ症である、項目１４に記載の方法。
（項目１６）
前記外陰膣カンジダ症が再発性外陰膣カンジダ症である、項目１５に記載の方法。
（項目１７）
前記カンジダ症が侵襲性カンジダ症である、項目１６に記載の方法。
（項目１８）
前記危険因子が、外科手術、集中治療室入室、介護施設での居住、呼吸管、栄養管、広域スペクトル抗生物質もしくは抗真菌剤、または中心静脈カテーテルなどのカテーテルによる治療である、項目１７に記載の方法。
（項目１９）
前記Ｃ．ａｕｒｉｓが多剤耐性である、項目１～１８のいずれか一項に記載の方法。
（項目２０）
前記対象が、病院もしくは保健所で、治療されているか、治療されたことがあるか、または治療される予定である、項目１～１９のいずれか一項に記載の方法。
（項目２１）
前記対象が、少なくとも５０歳、６０歳、７０歳、８０歳、または９０歳である、項目１～２０のいずれか一項に記載の方法。
（項目２２）
前記対象が、新生児、乳児、または幼児である、項目１～２０のいずれか一項に記載の方法。
（項目２３）
前記対象が３歳未満である、項目２２に記載の方法。
（項目２４）
前記対象が、病院もしくは保健所で、働いているか、働いたことがあるか、または働く予定である、項目１～１９のいずれか一項に記載の方法。
（項目２５）
前記方法がＣ．ａｕｒｉｓの定着を低減させ、任意選択で、前記定着が約１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、８５％、９０％低減されるか、または実質的に排除される、項目１～２４のいずれか一項に記載の方法。
（項目２６）
前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログあるいは抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片が、皮下、筋肉内、皮内、経皮、鼻腔内、経口か、または注入を介して投与される、項目１～２５のいずれか一項に記載の方法。
（項目２７）
前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログあるいは抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片が、追加の治療薬とともに投与される、項目１～２６のいずれか一項に記載の方法。
（項目２８）
前記追加の治療薬が抗真菌薬である、項目２７に記載の方法。
（項目２９）
前記抗真菌薬が、アゾール、ポリエン、アリルアミン、エキノカンジン、ラノステロールデメチラーゼ阻害剤、安息香酸、シクロピロクスオアミン、エンフマファンギン、５－フルシトシン、グリセオフルビン、ハロプロジン、トルナフタート、アミノカンジン、クロルダントイン、クロルフェネシン、ニフロキシム、ウンデシレン酸、またはクリスタルバイオレットである、項目２８に記載の方法。
（項目３０）
ａ）前記アゾールが、トリアゾール、イミダゾール、もしくはチアゾールであるか、
ｂ）前記ポリエンが、アムホテリシンＢ、カンジシジン、フィリピン、ハマイシン、ナタマイシン、ナイスタチン、もしくはリモシジンであるか、
ｃ）前記アリルアミンが、アモロルフィン、ブテナフィン、ナフチフィン、もしくはテルビナフィンであるか、
ｄ）前記エキノカンジンが、アニデュラファンギン、ビアファンギン、カスポファンギン、もしくはミカファンギンであるか、または
ｅ）前記ラノステロールデメチラーゼ阻害剤がＶＴ－１１６１である、項目２９に記載の方法。
（項目３１）
ａ）前記トリアゾールが、フルコナゾール、アルバコナゾール、エフィナコナゾール、エポキシコナゾール、イサブコナゾール、イトラコナゾール、ポサコナゾール、プロピコナゾール、ラブコナゾール、テルコナゾール、もしくはボリコナゾールであるか、
ｂ）前記イミダゾールが、ビホナゾール、ブトコナゾール、クロトリマゾール、エベルコナゾール、エコナゾール、フェンチコナゾール、フルトリマゾール、イソコナゾール、ケトコナゾール、ルリコナゾール、ミコナゾール、オモコナゾール、オキシコナゾール、セルタコナゾール、スルコナゾール、もしくはチオコナゾールであるか、または
ｃ）前記チアゾールがアバファンギンである、項目３０に記載の方法。
（項目３２）
前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログ、あるいは抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片および前記追加の治療薬が、互いに１か月以内、２週間以内、１週間以内、１日以内、１２時間以内、６時間以内、もしくは１時間以内に投与されるか、または実質的に同時に投与される、項目２７～３１のいずれか一項に記載の方法。
（項目３３）
前記方法が前記対象の生存率を高める、項目１～３２のいずれか一項に記載の方法。
（項目３４）
前記対象がヒトである、項目１～３３のいずれか一項に記載の方法。
（項目３５）
前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログが、配列番号１～７のうちのいずれか１つに対して少なくとも８５％の同一性を有する、項目１～３４のいずれか一項に記載の方法。
（項目３６）
前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログが、配列番号１～７のうちのいずれか１つに対して少なくとも９０％、９５％、９７％、９９％、または１００％の同一性を有する、項目３５に記載の方法。
（項目３７）
約５マイクログラム～約５ミリグラムの前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログが投与される、項目１～３６のいずれか一項に記載の方法。
（項目３８）
約１０～約６００マイクログラム、約２０～約３００マイクログラム、約３０～約９０マイクログラム、または約２００～約３００マイクログラムの、前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログが投与される、項目３７に記載の方法。
（項目３９）
約３０または約３００マイクログラムの前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログが投与される、項目３８に記載の方法。
（項目４０）
前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログが約２ｍＬ以下の量で投与され、任意選択で、前記量が約１ｍＬ以下、約０．７５ｍＬ以下、約０．５ｍＬ以下、または約０．２５ｍＬ以下である、項目３７～３９のいずれか一項に記載の方法。
（項目４１）
前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログが、アジュバントとともに製剤化される、項目１～４０のいずれか一項に記載の方法。
（項目４２）
前記アジュバントが、フロイントアジュバント、リポ多糖類、リン酸アルミニウム、水酸化アルミニウム、またはミョウバンである、項目４１に記載の方法。
（項目４３）
前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログが、前記対象に２回以上投与される、項目１～４２のいずれか一項に記載の方法。
（項目４４）
前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログが、２回分投与される、項目４３に記載の方法。
（項目４５）
前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログの２回目分が、前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログの初回分投与後、約７日～９０日で投与される、項目４４に記載の方法。
（項目４６）
前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログの２回目分が、前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログの初回分投与後、約２１日～６０日で投与される、項目４５に記載の方法。
（項目４７）
約０．５グラム～約５グラムの前記抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片が投与される、項目１～３４のいずれか一項に記載の方法。
（項目４８）
約１ｍｇ／ｋｇ～約２０ｍｇ／ｋｇの前記抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片が投与される、項目４７に記載の方法。
（項目４９）
前記抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片が、約１０００ｍＬ以下の量で投与され、任意選択で、前記量が約９００ｍＬ、８００ｍＬ、７００ｍＬ、６００ｍＬ、５００ｍＬ、４００ｍＬ、３００ｍＬ、２００ｍＬ、１００ｍＬ、５０ｍＬ、もしくは１０ｍＬ以下であるか、または約１０００ｍＬ～１０ｍＬの量である、項目４７または４８に記載の方法。
（項目５０）
前記抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片が注入として投与され、任意選択で、前記注入が持続注入またはボーラス注入である、項目４７～４９のいずれか一項に記載の方法。
（項目５１）
前記同定することが前記対象から試料を採取することを含む、項目２に記載の方法。
（項目５２）
前記試料が皮膚または粘膜の拭き取りで得られ、任意選択で、前記粘膜が前記対象の口、喉、食道、直腸または膣である、項目５１に記載の方法。
（項目５３）
前記方法が、前記対象におけるＣ．ａｕｒｉｓバイオフィルム形成を、未治療対象におけるＣ．ａｕｒｉｓバイオフィルム形成と比較して阻害または低減し、任意選択で、前記方法が、Ｃ．ａｕｒｉｓバイオフィルム形成を約１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、８５％、９０％阻害もしくは低減するか、またはＣ．ａｕｒｉｓバイオフィルム形成を実質的に排除する、項目１に記載の方法。
（項目５４）
前記対象が、Ｃ．ａｕｒｉｓ感染症にかかっているか、かかっていることが疑われるか、またはかかるリスクがある、項目１に記載の方法。
（項目５５）
前記対象が、Ｃ．ａｕｒｉｓに曝露されたことがあるか、または曝露されていることが疑われる、項目１に記載の方法。
（項目５６）
前記対象が免疫不全である、項目１に記載の方法。
（項目５７）
前記対象が、Ｃ．ａｕｒｉｓ感染症の併存疾患に罹患しているか、またはその危険因子を有する、項目１に記載の方法。
（項目５８）
前記併存疾患が、細菌感染症、真菌感染症、ウイルス感染症、免疫障害、または糖尿病である、項目５７に記載の方法。
（項目５９）
前記真菌感染症がカンジダ症である、項目５８に記載の方法。
（項目６０）
前記カンジダ症が、粘膜のカンジダ症感染であり、任意選択で、前記粘膜が前記対象の口、喉、または食道である、項目５９に記載の方法。
（項目６１）
前記カンジダ症が外陰膣カンジダ症である、項目６０に記載の方法。
（項目６２）
前記外陰膣カンジダ症が再発性外陰膣カンジダ症である、項目６１に記載の方法。
（項目６３）
前記カンジダ症が侵襲性カンジダ症である、項目６２に記載の方法。
（項目６４）
前記危険因子が、外科手術、集中治療室での滞在、介護施設での居住、呼吸管、栄養管、広域スペクトル抗生物質もしくは抗真菌剤による治療、または中心静脈カテーテルなどのカテーテルである、項目６３に記載の方法。
（項目６５）
前記Ｃ．ａｕｒｉｓが多剤耐性である、項目１に記載の方法。
（項目６６）
前記対象が、病院もしくは保健所で、治療されているか、治療されたことがあるか、または治療される予定である、項目１に記載の方法。
（項目６７）
前記対象が、少なくとも５０歳、６０歳、７０歳、８０歳、または９０歳である、項目１に記載の方法。
（項目６８）
前記対象が、新生児、乳児、または幼児である、項目１に記載の方法。
（項目６９）
前記対象が３歳未満である、項目６８に記載の方法。
（項目７０）
前記対象が、病院もしくは保健所で、働いているか、働いたことがあるか、または働く予定である、項目１に記載の方法。
（項目７１）
前記方法がＣ．ａｕｒｉｓの定着を低減させ、任意選択で、前記定着が約１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、８５％、９０％低減されるか、または実質的に排除される、項目１に記載の方法
（項目７２）
前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログ、あるいは抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片が、皮下、筋肉内、皮内、経皮、鼻腔内、経口か、または注入を介して投与される、項目１に記載の方法。
（項目７３）
前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログ、あるいは抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片が、追加の治療薬とともに投与される、項目１に記載の方法。
（項目７４）
前記追加の治療薬が抗真菌薬である、項目７３に記載の方法。
（項目７５）
前記抗真菌薬が、アゾール、ポリエン、アリルアミン、エキノカンジン、ラノステロールデメチラーゼ阻害剤、安息香酸、シクロピロクスオアミン、エンフマファンギン、５－フルシトシン、グリセオフルビン、ハロプロジン、トルナフタート、アミノカンジン、クロルダントイン、クロルフェネシン、ニフロキシム、ウンデシレン酸、またはクリスタルバイオレットである、項目７４に記載の方法。
（項目７６）
ａ）前記アゾールが、トリアゾール、イミダゾール、もしくはチアゾールであるか、
ｂ）前記ポリエンが、アムホテリシンＢ、カンジシジン、フィリピン、ハマイシン、ナタマイシン、ナイスタチン、もしくはリモシジンであるか、
ｃ）前記アリルアミンが、アモロルフィン、ブテナフィン、ナフチフィン、もしくはテルビナフィンであるか、
ｄ）前記エキノカンジンが、アニデュラファンギン、ビアファンギン、カスポファンギン、もしくはミカファンギンであるか、または
ｅ）前記ラノステロールデメチラーゼ阻害剤がＶＴ－１１６１である、項目７５に記載の方法。
（項目７７）
ａ）前記トリアゾールが、フルコナゾール、アルバコナゾール、エフィナコナゾール、エポキシコナゾール、イサブコナゾール、イトラコナゾール、ポサコナゾール、プロピコナゾール、ラブコナゾール、テルコナゾール、もしくはボリコナゾールであるか、
ｂ）前記イミダゾールが、ビホナゾール、ブトコナゾール、クロトリマゾール、エベルコナゾール、エコナゾール、フェンチコナゾール、フルトリマゾール、イソコナゾール、ケトコナゾール、ルリコナゾール、ミコナゾール、オモコナゾール、オキシコナゾール、セルタコナゾール、スルコナゾール、もしくはチオコナゾールであるか、または
ｃ）前記チアゾールがアバファンギンである、項目７６に記載の方法。
（項目７８）
前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログあるいは抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片および前記追加の治療薬が、互いに１か月以内、２週間以内、１週間以内、１日以内、１２時間以内、６時間以内、もしくは１時間以内に投与されるか、または実質的に同時に投与される、項目７３に記載の方法。
（項目７９）
前記方法が前記対象の生存率を高める、項目１に記載の方法。
（項目８０）
前記対象がヒトである、項目１に記載の方法。
（項目８１）
前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログが、配列番号１～７のうちのいずれか１つに対して少なくとも８５％の同一性を有する、項目１に記載の方法。
（項目８２）
前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログが、配列番号１～７のうちのいずれか１つに対して少なくとも９０％、９５％、９７％、９９％、または１００％の同一性を有する、項目８１に記載の方法。
（項目８３）
約５マイクログラム～約５ミリグラムの前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログが投与される、項目１に記載の方法。
（項目８４）
約１０～約６００マイクログラム、約２０～約３００マイクログラム、約３０～約９０マイクログラム、または約２００～約３００マイクログラムの前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログが投与される、項目８３に記載の方法。
（項目８５）
約３０または約３００マイクログラムの前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログが投与される、項目８４に記載の方法。
（項目８６）
前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログが、約２ｍＬ以下の量で投与され、任意選択で、前記量が約１ｍＬ以下、約０．７５ｍＬ以下、約０．５ｍＬ以下、または約０．２５ｍＬ以下である、項目８３に記載の方法。
（項目８７）
前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログが、アジュバントとともに製剤化される、項目１に記載の方法。
（項目８８）
前記アジュバントが、フロイントアジュバント、リポ多糖類、リン酸アルミニウム、水酸化アルミニウム、またはミョウバンである、項目８７に記載の方法。
（項目８９）
前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログが、前記対象に２回以上投与される、項目１に記載の方法。
（項目９０）
前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログが、２回分投与される、項目８９に記載の方法。
（項目９１）
前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログの２回目分が、前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログの初回分投与後、約７日～９０日で投与される、項目９０に記載の方法。
（項目９２）
前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログの２回目分が、前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログの初回分投与後、約２１日～６０日で投与される、項目９１に記載の方法。
（項目９３）
約０．５グラム～約５グラムの前記抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片が投与される、項目１に記載の方法。
（項目９４）
約１ｍｇ／ｋｇ～約２０ｍｇ／ｋｇの前記抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片が投与される、項目９３に記載の方法。
（項目９５）
前記抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片が、約１０００ｍＬ以下の量で投与され、任意選択で、前記量が約９００ｍＬ、８００ｍＬ、７００ｍＬ、６００ｍＬ、５００ｍＬ、４００ｍＬ、３００ｍＬ、２００ｍＬ、１００ｍＬ、５０ｍＬ、もしくは１０ｍＬ以下であるか、または約１０００ｍＬ～１０ｍＬの量である、項目９３に記載の方法。
（項目９６）
前記抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片が注入として投与され、任意選択で、前記注入が持続注入またはボーラス注入である、項目９３に記載の方法。
（項目９７）
Ｃａｎｄｉｄａ ａｕｒｉｓ感染症に対して、対象を治療するか、対象に免疫を与えるか、対象において予防するか、または抗体産生を対象において誘発する際に使用するための、免疫原性量の、Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログ、あるいは抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片を含む、組成物。
（項目９８）
ａ）前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログ、あるいは抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片の投与に先立ち、前記対象がＣ．ａｕｒｉｓ感染症にかかっているとして同定すること、
ｂ）前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログ、あるいは抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片の投与に先立ち、前記対象がＣ．ａｕｒｉｓが定着しているとして同定すること、かつ／あるいは
ｃ）前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログ、あるいは抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片の投与に先立ち、前記対象を、Ｃ．ａｕｒｉｓによる定着および／または感染のリスクがあるとして同定すること、をさらに含む、項目９７に記載の使用のための組成物。
（項目９９）
前記同定することが前記対象から試料を採取することを含み、任意選択で、組織試料は、皮膚または粘膜の拭き取りで得られ、任意選択で、前記粘膜は、前記対象の口、喉、食道、直腸または膣である、項目９８に記載の使用のための組成物。
（項目１００）
ａ）前記対象が免疫不全であり、かつ／あるいは
ｂ）前記対象が、Ｃ．ａｕｒｉｓ感染症の併存疾患に罹患しているか、もしくはその危険因子を有し、
ｃ）前記対象が、Ｃ．ａｕｒｉｓ感染症にかかっているか、かかっていることが疑われるか、もしくはかかるリスクがあり、
ｄ）前記対象が、Ｃ．ａｕｒｉｓに曝露されたことがあるか、もしくは曝露されていることが疑われ、
ｅ）前記Ｃ．ａｕｒｉｓが多剤耐性であり、
ｆ）前記組成物が、前記対象におけるＣ．ａｕｒｉｓバイオフィルム形成を阻害もしくは低減し、
ｇ）前記組成物が、Ｃ．ａｕｒｉｓの定着を約１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、８５％、９０％低減させるか、もしくはＣ．ａｕｒｉｓの定着を実質的に排除し、かつ／あるいは
ｈ）前記組成物が前記対象の生存率を高め、
任意選択で、前記併存疾患が、細菌感染症、カンジダ症などの真菌感染症、ウイルス感染症、免疫障害、糖尿病であり、かつ／または前記危険因子が、外科手術、集中治療室での滞在、介護施設での居住、呼吸管、栄養管、もしくは中心静脈カテーテルなどのカテーテルであり、かつ／または
任意選択で、前記カンジダ症は、
ｉ）前記対象の口、喉、もしくは食道などの粘膜の感染症であり、かつ／もしくは
ｉｉ）再発性外陰膣カンジダ症などの外陰膣カンジダ症であり、かつ／もしくは
ｉｉｉ）侵襲性カンジダ症である、項目９７～９９のいずれか一項に記載の使用のための組成物。
（項目１０１）
ａ）前記対象がヒトであるか、
ｂ）前記対象が、病院もしくは保健所で、働いているか、働いたことがあるか、もしくは働く予定であるか、
ｃ）前記対象が、病院もしくは保健所で、治療されているか、治療されたことがあるか、もしくは治療される予定であるか、
ｄ）前記対象が、少なくとも５０歳、６０歳、７０歳、８０歳、または９０歳であるか、または
ｅ）前記対象が、新生児、乳児、もしくは幼児であって、任意選択で、前記対象が３歳未満である、項目９７～１００のいずれか一項に記載の使用のための組成物。
（項目１０２）
前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログが、配列番号１～７のうちのいずれか１つに対して少なくとも８５％の同一性を有し、任意選択で、
前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログが、配列番号１～７のうちのいずれか１つに対して少なくとも９０％、９５％、９７％、９９％、または１００％の同一性を有する、項目９７～１０１のいずれか一項に記載の使用のための組成物。
（項目１０３）
前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログあるいは抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片が、アゾール、ポリエン、アリルアミン、エキノカンジン、ラノステロールデメチラーゼ阻害剤、安息香酸、シクロピロクスオアミン、エンフマファンギン、５－フルシトシン、グリセオフルビン、ハロプロジン、トルナフタート、アミノカンジン、クロルダントイン、クロルフェネシン、ニフロキシム、ウンデシレン酸、またはクリスタルバイオレットから選択される抗真菌薬などの追加の治療薬とともに投与され、任意選択で、
ａ）前記アゾールが、フルコナゾール、アルバコナゾール、エフィナコナゾール、エポキシコナゾール、イサブコナゾール、イトラコナゾール、ポサコナゾール、プロピコナゾール、ラブコナゾール、テルコナゾール、ボリコナゾールなどのトリアゾール、ビホナゾール、ブトコナゾール、クロトリマゾール、エベルコナゾール、エコナゾール、フェンチコナゾール、フルトリマゾール、イソコナゾール、ケトコナゾール、ルリコナゾール、ミコナゾール、オモコナゾール、オキシコナゾール、セルタコナゾール、スルコナゾール、チオコナゾールなどのイミダゾール、またはアバファンギンなどのチアゾールであり、
ｂ）前記ポリエンが、アムホテリシンＢ、カンジシジン、フィリピン、ハマイシン、ナタマイシン、ナイスタチン、またはリモシジンであり、
ｃ）前記アリルアミンが、アモロルフィン、ブテナフィン、ナフチフィン、またはテルビナフィンであり、
ｄ）前記エキノカンジンが、アニデュラファンギン、ビアファンギン、カスポファンギン、またはミカファンギンであり、
ｅ）前記ラノステロールデメチラーゼ阻害剤がＶＴ－１１６１である、項目９７～１０２のいずれか一項に記載の使用のための組成物。
（項目１０４）
前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログあるいは抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片および前記追加の治療薬が、互いに１か月以内、２週間以内、１週間以内、１日以内、１２時間以内、６時間以内、もしくは１時間以内に投与されるか、または実質的に同時に投与される、項目１０３に記載の使用のための組成物。
（項目１０５）
ａ）約５マイクログラム～約５ミリグラムの前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログが投与され、
任意選択で、約１０～約６００マイクログラム、約２０～約３００マイクログラム、約３０～約９０マイクログラム、もしくは約２００～約３００マイクログラムの前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログが投与され、例えば、約３０マイクログラムもしくは約３００マイクログラムなどの前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログが投与され、かつ／あるいは
ｂ）前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログが、約２ｍＬ以下の量で投与され、任意選択で、前記量が約１ｍＬ以下、約０．７５ｍＬ以下、約０．５ｍＬ以下、もしくは約０．２５ｍＬ以下である、項目９７～１０４のいずれか一項に記載の使用のための組成物。
（項目１０６）
前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログが、フロイントアジュバント、リポ多糖類、リン酸アルミニウム、水酸化アルミニウム、またはミョウバンなどのアジュバントとともに製剤化される、項目９７～１０５のいずれか一項に記載の使用のための組成物。
（項目１０７）
前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログが、前記対象に２回以上、例えば、２回分投与され、
任意選択で、前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログの２回目分が、初回分投与後、約７日～９０日で、例えば、約２１日～６０日で投与される、項目９７～１０６のいずれか一項に記載の使用のための組成物。
（項目１０８）
前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログが、皮下、筋肉内、皮内、経皮、鼻腔内、経口か、または注入を介して投与される、項目９７～１０７のいずれか一項に記載の使用のための組成物。
（項目１０９）
ａ）約０．５グラム～約５グラムの前記抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片が投与されるか、
ｂ）約１ｍｇ／ｋｇ～約２０ｍｇ／ｋｇの前記抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片が投与されるか、
ｃ）前記抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片が、約１０００ｍＬ以下の量で投与され、任意選択で、前記量が約９００ｍＬ、８００ｍＬ、７００ｍＬ、６００ｍＬ、５００ｍＬ、４００ｍＬ、３００ｍＬ、２００ｍＬ、１００ｍＬ、５０ｍＬ、もしくは１０ｍＬ以下であるか、または約１０００ｍＬ～１０ｍＬの量であり、かつ／あるいは
ｄ）前記抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片が、皮下、筋肉内、皮内、経皮、鼻腔内、経口か、もしくは注入を介して投与され、
任意選択で、前記注入が、持続注入またはボーラス注入である、項目９７～１０４のいずれか一項に記載の使用のための組成物。

Ａｌｓ３タンパク質（配列番号１）と、Ｃ．ａｕｒｉｓにおける２つのＡｌｓ３オルソログ、すなわち、仮想タンパク質のＱＧ３７＿０６２６５（Ｇｅｎｂａｎｋ受託番号ＸＰ＿０１８１６７５７２．１；配列番号６）およびＱＧ３７＿０５９７９（Ｇｅｎｂａｎｋ受託番号ＸＰ＿０１８１６７３０７．１；配列番号７）との間の配列同一性の領域を示す概略図である。 Ｃｅｎｔｅｒ ｆｏｒ Ｄｉｓｅａｓｅ Ｃｏｎｔｒｏｌ（ＣＤＣ）から入手した５つの異なるＣ．ａｕｒｉｓ株（ＣＡＵ－１、ＣＡＵ－３、ＣＡＵ－５、ＣＡＵ－７、ＣＡＵ－９）に結合する抗Ａｌｓ３ ＩｇＧ抗体を示す、一連の共焦点顕微鏡画像である。Ａｌｓ３－２（配列番号２）を接種したマウスの血清はＣ．ａｕｒｉｓの表面と結合したが（上段）、Ａｌｓ３－２を接種しなかった対照マウスの血清は結合しなかった（下段）。 Ｃ．ａｌｂｉｃａｎｓ菌株ＳＣ－５３１４に結合する抗Ａｌｓ３ ＩｇＧ抗体を示す、一連の共焦点顕微鏡画像である。図２のＣ．ａｕｒｉｓ株のＣＡＵ－１およびＣＡＵ－９に結合する抗Ａｌｓ３ ＩｇＧ抗体の共焦点顕微鏡画像は比較用に示されている。 フローサイトメトリーで決定された、抗Ａｌｓ３ ＩｇＧ抗体のＣ．ａｕｒｉｓ細胞表面への結合を示す一連のグラフである。 抗Ａｌｓ３ ＩｇＧ抗体の様々なＣ．ａｕｒｉｓ臨床株への結合を示すグラフである。 ＮＤＶ－３Ａワクチンを接種したマウスの血清が、オプソニン食作用によるＣ．ａｕｒｉｓの殺滅を増強することを示すグラフである。 ＮＤＶ－３Ａワクチンを接種したマウスの血清が、Ｃ．ａｕｒｉｓのバイオフィルム形成を阻害することを示すグラフである。 ワクチン投与スケジュールおよびワクチンを接種したマウスのＣ．ａｕｒｉｓ感染後の生存率を示す概略図およびグラフである。２００μｇのミョウバンとともに製剤化した３００μｇのＡｌｓ３－２タンパク質を各マウスに皮下投与した。２００μｇのミョウバンを対照として使用した。 様々な種類および濃度の抗真菌薬で処理した後のＣ．ａｕｒｉｓ（株ＣＡＵ－０９）のコロニー増殖を示す一連の画像である。 図８Ａに示す画像から得られた抗真菌剤の最小発育阻止濃度（ＭＩＣ）の定量化である。 ＮＤＶ－３Ａでワクチン接種され、かつ／または抗真菌薬フルコナゾール（５ｍｇ／ｋｇ体重）により治療された、Ｃ．ａｕｒｉｓ感染マウスの生存率を示すグラフである。「ＮＤＶ－３Ａワクチン」と表示されている各マウスには、２００μｇのミョウバンとともに製剤化した３００μｇのＡｌｓ３－２タンパク質が皮下投与された。２００μｇのミョウバン単独（Ａｌｕｍ）を対照として使用した。 ＮＤＶ－３Ａでワクチン接種され、抗真菌薬カスポファンギン（０．１ｍｇ／ｋｇ体重）により治療されたＣ．ａｕｒｉｓ感染マウスの生存率を示すグラフである。「ＮＤＶ－３Ａワクチン」と表示されている各マウスには、２００μｇのミョウバンとともに製剤化した３００μｇのＡｌｓ３－２タンパク質が皮下投与された。２００μｇのミョウバン単独（Ａｌｕｍ）を対照として使用した。 ＮＤＶ－３Ａでワクチン接種され、抗真菌薬ミカファンギン（０．２５ｍｇ／ｋｇ体重）により治療されたＣ．ａｕｒｉｓ感染マウスの生存率を示すグラフである。「ＮＤＶ－３Ａワクチン」と表示されている各マウスには、２００μｇのミョウバンとともに製剤化した３００μｇのＡｌｓ３－２タンパク質が皮下投与された。２００μｇのミョウバン単独（Ａｌｕｍ）を対照として使用した。 Ｃ．ａｕｒｉｓライセート上清に対するＥＬＩＳＡにより、ＮＤＶ－３Ａワクチン接種の女性と、対するプラセボの女性において同定された交差反応性抗体を示すグラフである。 ＮＤＶ－３Ａワクチン接種の女性と、対するプラセボの女性において評価した、Ｃ．ａｕｒｉｓによるバイオフィルム形成の低減を定量化したグラフである。

驚くべきことに、Ｃａｎｄｉｄａ ａｌｂｉｃａｎｓ凝集素様配列３（Ａｌｓ３）タンパク質に由来するポリペプチドおよび断片、ならびにこれらのポリペプチドおよび断片に結合する抗体またはそれらの抗原結合断片が、Ｃ．ａｕｒｉｓ感染の治療を促進し、それに対する耐性を与えることを発見した。Ａｌｓ３は、通常、Ｃ．ａｌｂｉｃａｎｓの菌糸形の細胞表面に発現するタンパク質である。Ｃ．ａｕｒｉｓは菌糸形を示さず、またＡｌｓ３タンパク質を発現することも不明である。それにもかかわらず、Ｃ．ａｕｒｉｓには、抗Ａｌｓ３抗体と交差反応するＡｌｓ３と相同性のある、これまで特徴が明らかになっていなかった２つの表面タンパク質があることを発見した。その結果、抗Ａｌｓ３抗体またはそれらの抗原結合断片を用いてＣ．ａｕｒｉｓを標的とすることにより、この酵母種の感染および／または定着に対する防御が提供される。本明細書では、Ｃ．ａｕｒｉｓの感染および定着に対して治療および免疫するための組成物および方法を開示する。Ａｌｓ３タンパク質含有組成物は、Ｃ．ａｕｒｉｓ感染を治療する、予防する、またはそのリスクを低減させるために、免疫原性組成物およびワクチンとしてヒト対象に投与され得る。同様に、抗Ａｌｓ３抗体およびそれらの抗原結合断片を含有する組成物は、Ｃ．ａｕｒｉｓ感染を治療するかまたはリスクを低減させるために、免疫療法組成物としてヒト対象に投与され得る。

患者の選択
本明細書に記載の組成物および方法を使用して、Ｃ．ａｕｒｉｓ感染のリスクがあるか、もしくはＣ．ａｕｒｉｓに感染し易い（例えば、過去の感染歴によるか、曝露されたことがあるか、または曝露されていることが疑われる）対象（例えば、ヒト）、または活動性Ｃ．ａｕｒｉｓ感染症を患っている（または有することが疑われる）対象を治療することができる。例えば、免疫系が不全であるか、併存疾患があるか、または危険因子を有する患者は、Ｃ．ａｕｒｉｓ感染症に罹患しやすいか、またはそのリスクが高い患者である。Ｃ．ａｕｒｉｓ感染症のリスクを高めるいくつかの併存疾患は、例えば、細菌感染症、真菌感染症、ウイルス感染症、および免疫障害、または糖尿病である。真菌感染症は、カンジダ症（例えば、Ｃ．ａｕｒｉｓ以外の、１種以上のカンジダ種（例えば、Ｃ．ａｌｂｉｃａｎｓ）による感染）、例えば、粘膜（例えば、口、喉、食道、直腸、または膣）のカンジダ症感染であり得る。カンジダ症は、外陰膣カンジダ症（例えば、再発性外陰膣カンジダ症（ＲＶＶＣ））または侵襲性カンジダ症であり得る。Ｃ．ａｕｒｉｓ感染の他の危険因子は、外科手術、集中治療室入室、介護施設入居、呼吸管もしくは栄養管の使用、広域スペクトル抗生物質もしくは抗真菌剤による治療、または中心静脈カテーテルなどのカテーテルである。

特定の患者は、Ｃ．ａｕｒｉｓ感染症のリスクがより高い場合もある。これらには、病院もしくは保健所で、治療されたことがあるか、治療されているか、または治療される予定の人々が含まれる。さらに、病院もしく保健所で、働いたことがあるか、働いている、または働く予定である人々は、感染に対して感受性であり得る。高齢者（例えば、５０歳、６０歳、７０歳、８０歳、または９０歳より高齢）またはかなりの年少者（例えば、新生児、乳児、または幼児（３歳未満））は、免疫系未発達または免疫不全の免疫系のためにリスクがより高い場合がある。

Ｃ．ａｕｒｉｓ感染症を診断するためのアッセイが知られており（例えば、Ｋｏｒｄａｌｅｗｓｋａ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｃｌｉｎ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．５５：２４４５－２４５２，２０１７、およびＬｅａｃｈ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｃｌｉｎ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．２０１７）、Ｃ．ａｕｒｉｓ感染症の治療について患者を同定するために使用することができる。Ｃ．ａｕｒｉｓはまた、Ｃ．ａｕｒｉｓに感染していること、もしくは含有することが疑われる組織、または血液試料の、拭き取りまたは採取の後、標準的な実験室培養増殖試験によって診断することもできる。マトリックス支援レーザー脱離／イオン化飛行時間型（ＭＡＬＤＩ－ＴＯＦ）質量分析法に基づく診断装置を使用する分子法により、Ｃ．ａｕｒｉｓを他のカンジダ種と区別することができる。別の方法には、２８ｓ ｒＤＮＡのＤ１－Ｄ２領域またはｒＤＮＡの内部転写領域（ＩＴＳ）の配列決定を行ってＣ．ａｕｒｉｓを同定することが含まれる。Ｃ．ａｕｒｉｓ株を抗真菌薬感受性についてさらに試験して、適切な治療過程を決定することもできる。

治療方法
本明細書に記載の組成物および方法は、男性および女性の両方のヒト対象に特に有用である。方法には、対象が、Ｃ．ａｕｒｉｓの感染もしくは定着の可能性を高める、本明細書に記載されるような危険因子または併存疾患を有するとして最初に同定することが含まれ得る。場合によっては、方法には、本明細書に記載の治療の投与に先立ち、対象が、Ｃ．ａｕｒｉｓ感染またはＣ．ａｕｒｉｓの定着を有するとして最初に同定することが含まれる。

対象が診断および／または治療を受けた後、対象は経時的にモニターされ、治療の進行を追跡して対象をＣ．ａｕｒｉｓの定着および／または感染についてモニターすることができる。モニタリングまたは同定のステップには、治療の投与に先立つ対象におけるＣ．ａｕｒｉｓの定着と比較した、対象におけるＣ．ａｕｒｉｓの定着の変化（例えば、増大または低下）を決定することが含まれ得る。モニタリングまたは同定のステップでは、対象の皮膚または粘膜の拭き取りなどで、対象から試料を採取することが行われ得る。粘膜は、対象の口、喉、食道、直腸、または膣からのものであり得る。次に、皮膚拭き取りの内容物を培養または分析して、感染の存在または進行を同定することができる。

組成物および方法により、Ｃ．ａｕｒｉｓの定着もしくは感染が約１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、８５％、もしくは９０％低減されるか、または定着もしくは感染が実質的に排除され得る。さらに、本明細書に記載の組成物および方法は、Ｃ．ａｕｒｉｓのバイオフィルム形成を阻害または低減させるために有用であり得る。例えば、組成物および方法により、バイオフィルム形成が約１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、８５％、もしくは９０％低減または阻害されるか、あるいはバイオフィルム形成が実質的に排除され得る。一般に、本明細書に記載の組成物および方法により、対象の生存率が、治療を受けない対象と比較して高められ得る。組成物および方法により、例えば、それぞれ未治療対象と比較して、対象における活動性Ｃ．ａｕｒｉｓ感染の日数（例えば、１日、２日、３日、４日、５日、６日、７日、８日、９日、１０日、２０日、３０日、４０日、５０日、またはそれ以上の日数）、対象の入院日数（例えば、１日、２日、３日、４日、５日、６日、７日、８日、９日、１０日、２０日、３０日、４０日、５０日、またはそれ以上の日数）、対象が抗真菌療法を要する日数（例えば、１日、２日、３日、４日、５日、６日、７日、８日、９日、１０日、２０日、３０日、４０日、５０日、またはそれ以上の日数）、および／または対象が必要とする抗真菌療法の用量が減少する場合がある。

免疫原性の組成物およびワクチンのためのポリペプチド
Ｃ．Ａｌｂｉｃａｎｓ Ａｌｓ３は、１１１９アミノ酸の前駆体タンパク質として天然に発現し、以下のアミノ酸配列を有する：
このタンパク質には、１７アミノ酸のＮ末端シグナル配列（上記下線部）が含まれており、これは、成熟タンパク質の生成中に切断される。

当業者であれば、Ａｌｓ３が表面に発現する膜結合タンパク質であり、そのため、疎水性膜貫通ドメインが含まれるということを理解するであろう。したがって、完全長タンパク質の強力な発現は、免疫原性の組成物またはワクチン組成物の作製に有用な収量を生成する大量のタンパク質を得るためには、達成が困難な場合がある。したがって、天然タンパク質よりも高収量で発現され得る、Ａｌｓ３の断片を生成することができる。Ａｌｓ３ポリペプチドには、例えば、シグナル配列を欠く４１６アミノ酸のＮ末端断片である以下のアミノ酸配列を有するＡｌｓ３－２断片が含まれる：

別のＡｌｓ３ポリペプチド断片はＡｌｓ３－１断片であり、これはＡｌｓ３－２と同様であるが、タンパク質精製を容易にするためにＮ末端に６ｘ－Ｈｉｓタグと３アミノ酸のＧＩＱリンカーを含有する４２５アミノ酸の断片である。Ａｌｓ３－１のアミノ酸配列は以下のとおりである：

別のＡｌｓ３ポリペプチド断片は、Ａｌｓ３の残基１８～３２４に対応し、Ａｌｓ３（１８－３２４）と表わされる３０７アミノ酸の断片である。Ａｌｓ３（１８－３２４）のアミノ酸配列は以下のとおりである：

残基３２５～４３２を含有する、Ａｌｓ３ Ｓｅｒ／Ｔｈｒ－ｒｉｃｈ配列として表わされる１０８アミノ酸のＡｌｓ３断片は、以下のアミノ酸配列を有する：

本明細書に記載のような組成物および方法と併せて使用され得る例示的なポリペプチドには、Ａｌｓ３ポリペプチドの任意のポリペプチド、その断片、ホモログ、またはオルソログ、例えば、上記のポリペプチド断片などが含まれる。さらに、Ａｌｓ３のホモログまたはオルソログの断片および変異型が使用され得る。

Ｃ．ａｕｒｉｓのゲノムは、Ａｌｓ３遺伝子を含有しているとは考えられていないが、Ｃ．ａｌｂｉｃａｎｓ Ａｌｓ３と相同性のある仮想タンパク質をコードする遺伝子が同定されている。１つのタンパク質はＣ．ａｕｒｉｓ仮想タンパク質ＱＧ３７＿０６２６５（Ｇｅｎｂａｎｋ受託番号ＸＰ＿０１８１６７５７２．１）として表わされ、以下の８６１アミノ酸の配列を有する：

Ｃ．ａｕｒｉｓ仮想タンパク質ＱＧ３７＿０５９７９（Ｇｅｎｂａｎｋ受託番号ＸＰ＿０１８１６７３０７．１）として表わされる第２のタンパク質は、以下の７１４アミノ酸の配列を有する：

配列番号１～７のうちのいずれか１つの任意のタンパク質、断片、または変異型もしくは修飾型を含むポリペプチドを、免疫原性の組成物またはワクチンとして調製して、対象（例えば、ヒト対象）におけるＣ．ａｕｒｉｓ感染症に対して治療または免疫するために使用することができる。本発明のポリペプチドは、例えば、配列番号１～７のうちのいずれか１つと少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％の配列同一性を有し得るか、または配列番号１～７のそれらの任意の断片と少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％の配列同一性を有し得る。

配列番号１の完全長天然Ａｌｓ３タンパク質は１１１９アミノ酸からなる。したがって、本明細書に記載の方法で使用するための組成物を調製するために使用され得るＡｌｓ３の断片には、例えば、アミノ酸長が１１１９、１１１８、１１１７、１１１６、１１１５、１１１４、１１１３、１１１２、１１１１、１１１０、１１００、１０９０、１０８０、１０７０、１０６０、１０５０、１０４０、１０３０、１０２０、１０１０、１０００、９９０、９８０、９７０、９６０、９５０、９４０、９３０、９２０、９１０、９１０、９００、８９０、８８０、８７０、８６０、８５０、８４０、８３０、８２０、８１０、８００、７９０、７８０、７７０、７６０、７５０、７４０、７３０、７２０、７１０、７００、６９０、６８０、６７０、６６０、６５０、６４０、６３０、６２０、６１０、６００、５９０、５８０、５７０、５６０、５５０、５４０、５３０、５２０、５１０、５００、４９０、４８０、４７０、４６０、４５０、４４０、４３０、４２０、４１０、４００、３９０、３８０、３７０、３６０、３５０、３４０、３３０、３２０、３１０、３００、２９０、２８０、２７０、２６０、２５０、２４０、２３０、２２０、２１０、２００、１９０、１８０、１７０、１６０、１５０、１４０、１３０、１２０、１１０、１００、９０、８０、７０、６０、５０、４０、３０、２５、２０、１５、または１０より少ない、Ａｌｓ３の断片が含まれる。

配列番号１のＡｌｓ３ポリペプチドはまた、Ｎ末端もしくはＣ末端のいずれか、または両末端で切断して、例えば、本明細書に記載の方法で使用するためなどの免疫原性断片を製造することもできると考えられる。例えば、Ｎ末端、Ｃ末端、またはＮ末端とＣ末端の両方は、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、１６０、１７０、１８０、１９０、２００、２１０、２２０、２３０、２４０、２５０、２６０、２７０、２８０、２９０、３００、３１０、３２０、３３０、３４０、３５０、３６０、３７０、３８０、３９０、４００、４１０、４２０、４３０、４４０、４５０、４６０、４７０、４８０、４９０、５００、５１０、５２０、５３０、５４０、５５０、５６０、５７０、５８０、５９０、６００、６１０、６２０、６３０、６４０、６５０、６６０、６７０、６８０、６９０、７００、７１０、７２０、７３０、７４０、７５０、７６０、７７０、７８０、７９０、８００、８１０、８２０、８３０、８４０、８５０、８６０、８７０、８８０、８９０、９００、９１０、９２０、９３０、９４０、９５０、９６０、９７０、９８０、９９０、１０００、１０１０、１０２０、１０３０、１０４０、１０５０、１０６０、１０７０、１０８０、１０９０、１１００、もしくは１１００のアミノ酸で切断され得る。

配列番号６のＣ．ａｕｒｉｓ Ａｌｓ３ホモログは８６１アミノ酸を含有する。したがって、配列番号６の断片を使用して、免疫原性の組成物またはワクチンを製造し、対象（例えば、ヒト対象）におけるＣ．ａｕｒｉｓ感染症に対して治療または免疫するために使用することができる。そのような断片には、例えば、アミノ酸長が８６１、８６０、８５９、８５８、８５７、８５６、８５５、８５４、８５３、８５２、８５１、８５０、８４０、８３０、８２０、８１０、８００、７９０、７８０、７７０、７６０、７５０、７４０、７３０、７２０、７１０、７００、６９０、６８０、６７０、６６０、６５０、６４０、６３０、６２０、６１０、６００、５９０、５８０、５７０、５６０、５５０、５４０、５３０、５２０、５１０、５００、４９０、４８０、４７０、４６０、４５０、４４０、４３０、４２０、４１０、４００、３９０、３８０、３７０、３６０、３５０、３４０、３３０、３２０、３１０、３００、２９０、２８０、２７０、２６０、２５０、２４０、２３０、２２０、２１０、２００、１９０、１８０、１７０、１６０、１５０、１４０、１３０、１２０、１１０、１００、９０、８０、７０、６０、５０、４０、３０、２５、２０、１５、または１０より少ない、配列番号６の断片が含まれる。Ｎ末端、Ｃ末端、またはＮ末端とＣ末端の両方は、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、１６０、１７０、１８０、１９０、２００、２１０、２２０、２３０、２４０、２５０、２６０、２７０、２８０、２９０、３００、３１０、３２０、３３０、３４０、３５０、３６０、３７０、３８０、３９０、４００、４１０、４２０、４３０、４４０、４５０、４６０、４７０、４８０、４９０、５００、５１０、５２０、５３０、５４０、５５０、５６０、５７０、５８０、５９０、６００、６１０、６２０、６３０、６４０、６５０、６６０、６７０、６８０、６９０、７００、７１０、７２０、７３０、７４０、７５０、７６０、７７０、７８０、７９０、８００、８１０、８２０、８３０、８４０、もしくは８５０の酸で切断され得る。

配列番号７のＣ．ａｕｒｉｓ Ａｌｓ３ホモログは７１４アミノ酸からなる。したがって、配列番号７の断片を使用して、免疫原性の組成物またはワクチンを製造し、対象（例えば、ヒト対象）におけるＣ．ａｕｒｉｓ感染症に対して治療または免疫するために使用することができる。配列番号７のそのような断片には、アミノ酸長が７１４、７１３、７１２、７１１、７１０、７００、６９０、６８０、６７０、６６０、６５０、６４０、６３０、６２０、６１０、６００、５９０、５８０、５７０、５６０、５５０、５４０、５３０、５２０、５１０、５００、４９０、４８０、４７０、４６０、４５０、４４０、４３０、４２０、４１０、４００、３９０、３８０、３７０、３６０、３５０、３４０、３３０、３２０、３１０、３００、２９０、２８０、２７０、２６０、２５０、２４０、２３０、２２０、２１０、２００、１９０、１８０、１７０、１６０、１５０、１４０、１３０、１２０、１１０、１００、９０、８０、７０、６０、５０、４０、３０、２５、２０、１５、または１０より少ない、配列番号７の断片が含まれる。Ｎ末端、Ｃ末端、またはＮ末端とＣ末端の両方は、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、１６０、１７０、１８０、１９０、２００、２１０、２２０、２３０、２４０、２５０、２６０、２７０、２８０、２９０、３００、３１０、３２０、３３０、３４０、３５０、３６０、３７０、３８０、３９０、４００、４１０、４２０、４３０、４４０、４５０、４６０、４７０、４８０、４９０、５００、５１０、５２０、５３０、５４０、５５０、５６０、５７０、５８０、５９０、６００、６１０、６２０、６３０、６４０、６５０、６６０、６７０、６８０、６９０、７００、もしくは７１０のアミノ酸で切断され得る。

場合によっては、本明細書に記載のようなポリペプチド（例えば、配列番号１～７のポリペプチドまたはそれらの断片）は、修飾（例えば、化学修飾、例えば、翻訳後修飾）を含み得る。好ましくは、修飾では、ポリペプチドの免疫原性は実質的に低下しない。修飾ポリペプチド（例えば、配列番号１～７のポリペプチド）は、インビボ安定性、生物学的利用能、毒性、免疫学的活性、免疫学的同一性、もしくは結合特性などのポリペプチドの特徴を有し得るか、または最適化し得る。

本明細書に記載のようなポリペプチド（例えば、配列番号１～７のポリペプチド）はまた、ポリペプチド配列における１つ以上のアミノ酸の挿入、欠失、または置換を含むことができる。例えば、本明細書に記載のポリペプチド（例えば、配列番号１～７のポリペプチド）のうちのいずれかのＮ末端またはＣ末端への１つ以上の残基（例えば、システイン残基）の付加により、これらのポリペプチドと、化学部分または融合パートナーとの結合を容易にすることができる。追加（例えば、１、２、３、４、５、６、および７、８、９、１０、またはそれ以上）の残基もまた、天然ペプチド配列（例えば、配列番号１～７の配列）の一部ではないＮ末端またはＣ末端に存在し得る。アミノ酸置換は、保存的（すなわち、ある残基が、同様の化学的特性を有する別の残基で置き換えられる）または非保存的（すなわち、ある残基が、異なる化学的特性を有するアミノ酸で置き換えられる）であり得る。

Ａｌｓ３ポリペプチド（例えば、配列番号１～５のポリペプチドおよびそれらの断片）およびそれらのオルソログ（例えば、配列番号６および７のポリペプチドならびにそれらの断片）は、例えば、当技術分野で知られている方法を使用して合成により作製され得、これらには、例えば、ＤＮＡによって天然ではコードされないアミノ酸（例えば、天然には生じないか、または非天然のアミノ酸）の置換などを含めることができる。天然には生じないアミノ酸の例には、Ｄ－アミノ酸、システインの硫黄原子に結合したアセチルアミノメチル基を有するアミノ酸、ペグ化アミノ酸、式ＮＨ_２（ＣＨ_２）_ｎＣＯＯＨのｎが２～６であるオメガアミノ酸、サルコシン、ｔ－ブチルアラニン、ｔ－ブチルグリシン、Ｎ－メチルイソロイシン、およびノルロイシンなどの中性非極性アミノ酸が含まれる。フェニルグリシンは、Ｔｒｐ、Ｔｙｒ、またはＰｈｅを置換し得、シトルリンおよびメチオニンスルホキシドは中性非極性であり、システイン酸は酸性であり、オルニチンは塩基性である。プロリンはヒドロキシプロリンで置換され得る。

本明細書に記載のポリペプチド（例えば、配列番号１～７のポリペプチドならびにそれらの断片、変異型、およびホモログ）は、市販の自動ペプチド合成装置を使用する化学合成によって得ることができる。合成されたタンパク質またはポリペプチドは、沈殿させ、例えば、高速液体クロマトグラフィー（ＨＰＬＣ）によってさらに精製することができる。別の方法では、タンパク質およびポリペプチドは、当技術分野で周知の組換え法（例えば、Ｓ．ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ、Ｅ．ｃｏｌｉ、ＣＨＯ細胞、または昆虫細胞での発現）によって得ることができる。

本明細書に記載のポリペプチド（例えば、配列番号１～７のポリペプチドならびにそれらの断片、変異型、およびホモログ）は、その物理的特性（例えば、安定性、免疫原性、発現、純度）を改善するために、別の部分（例えば、異種タンパク質または化学部分）と結合または融合され得る。

抗体と抗原結合断片
また、抗Ａｌｓ３抗体およびそれらの抗原結合断片も特徴とする。これらの抗体は、配列番号１～５のポリペプチドなど、Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片に存在するエピトープと特異的に結合し得る。本発明はまた、Ａｌｓ３のホモログまたはオルソログおよびかかるホモログまたはオルソログの断片、例えば、配列番号６および７のＣ．ａｕｒｉｓ Ａｌｓ３オルソログなどに配向される、抗体およびそれらの抗原結合断片を特徴とする。抗体は、Ａｌｓ３のホモログもしくはオルソログまたはその断片もしくは変異型（例えば、配列番号６および７の断片または変異型）に存在する任意のエピトープと結合し得る。

抗体は、ポリクローナル、モノクローナル、遺伝子操作されている、および他の方法で修飾された形態の抗体であり得、これには、キメラ抗体、ヒト抗体、マウス抗体、ヒト化抗体、異種複合抗体（例えば、二重、三重、および四重特異性抗体、ダイアボディ、トリアボディ、ならびにテトラボディ）、ならびにそのような抗体の抗原結合断片、例えば、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）_２、Ｆａｂ、Ｆｖ、ｒＩｇＧ、およびｓｃＦｖなどの断片を含むものが含まれるがこれらに限定されない。モノクローナル抗体（ｍＡｂ）は、インタクトな分子および標的タンパク質に特異的に結合することができる抗体断片（例えば、ＦａｂおよびＦ（ａｂ’）_２断片を含む）の両方が含まれることを意味する。ＦａｂおよびＦ（ａｂ’）_２断片は、インタクトな抗体のＦｃ断片を欠く抗体断片を指す。

抗体は、配列番号１～７のうちのいずれか１つの内部に存在するエピトープを使用して作製することができ、また抗体は、配列番号１～７のうちのいずれか１つの内部に存在するエピトープと交差反応するものでもあり得る。抗体は、エピトープ（例えば、配列番号１～７のうちのいずれか１つに存在するエピトープ）と１００ｎＭ未満のＫ_Ｄ（例えば、９０ｎＭ、８０ｎＭ、７０ｎＭ、６０ｎＭ、５０ｎＭ、４０ｎＭ、３０ｎＭ、２０ｎＭ、１０ｎＭ、９ｎＭ、８ｎＭ、７ｎＭ、６ｎＭ、５ｎＭ、４ｎＭ、３ｎＭ、２ｎＭ、１ｎＭ、９００ｐＭ、８００ｐＭ、７００ｐＭ、６００ｐＭ、５００ｐＭ、４００ｐＭ、３００ｐＭ、２００ｐＭ、１００ｐＭ、またはそれ以下）で結合し得る。

抗原結合断片とは、標的抗原（例えば、Ａｌｓ３ポリペプチドあるいは配列番号１～７のうちのいずれか１つのポリペプチドまたはその断片、変異型、もしくはホモログ）に特異的に結合する能力を保持する抗体の１つ以上の断片を指す。抗体の抗原結合機能は、完全長抗体の断片によって実行され得る。抗体断片は、例えば、Ｆａｂ、Ｆ（ａｂ’）_２、ｓｃＦｖ、ダイアボディ、トリアボディ、アフィボディ、ナノボディ、アプタマー、またはドメイン抗体であり得る。抗原結合断片の例には、Ｆａｂ断片、Ｖ_Ｌドメインと、Ｖ_Ｈドメインと、Ｃ_Ｌドメインと、Ｃ_Ｈ１ドメインとからなる一価断片、Ｆ（ａｂ’）_２断片、ヒンジ領域でジスルフィド架橋によって連結された２つのＦａｂ断片を含む二価断片、Ｖ_ＨドメインとＣ_Ｈ１ドメインとからなるＦｄ断片、抗体の一本のアームのＶ_ＬドメインとＶ_ＨドメインとからなるＦｖ断片、Ｖ_ＨドメインとＶ_Ｌドメインとが含まれるｄＡｂ、Ｖ_ＨドメインからなるｄＡｂ断片（例えば、Ｗａｒｄ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ ３４１：５４４－５４６，１９８９を参照のこと）、Ｖ_ＨドメインまたはＶ_ＬドメインからなるｄＡｂ、単離された相補性決定領域（ＣＤＲ）、および任意選択で合成リンカーにより連結され得る２つ以上（例えば、２、３、４、５、または６）の単離されたＣＤＲの組み合わせ、が含まれるが、これらに限定されない。さらに、Ｆｖ断片の２つのドメインであるＶ_ＬとＶ_Ｈは、別々の遺伝子によってコードされるが、それらは、組換え法を使用して、Ｖ_Ｌ領域とＶ_Ｈ領域とが対になって一価の分子を形成する一本のタンパク質鎖（一本鎖Ｆｖ（ｓｃＦｖ）として知られる；例えば、Ｂｉｒｄ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４２：４２３－４２６，１９８８ ａｎｄ Ｈｕｓｔｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８５：５８７９－５８８３，１９８８を参照のこと）として作製することを可能にするリンカーにより連結され得る。これらの抗体断片は、当業者に知られている従来の技術を使用して得ることができ、断片は、インタクトな抗体と同じ方法で有用性についてスクリーニングすることができる。抗原結合断片は、組換えＤＮＡ技術、インタクトな免疫グロブリンの酵素的もしくは化学的切断によって、または、特定の場合には、当技術分野で知られている化学的ペプチド合成手順によって製造することができる。

モノクローナル抗体（例えば、抗Ａｌｓ３抗体）は、例えば、Ｋｏｈｌｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ ２５６：４９５，１９７５によって最初に記載されたハイブリドーマ法を使用することによって作製され得、または組換えＤＮＡ法によって作製され得る（例えば、米国特許第４，８１６，５６７号を参照のこと）。ハイブリドーマ法では、マウスまたは他の適切な宿主動物、例えば、ハムスターまたはマカクザルなどを、例えば、本明細書に記載のポリペプチド（例えば、配列番号１～７のうちのいずれか１つのポリペプチド）を使用して免疫し、免疫に使用されるポリペプチドに特異的に結合する抗体を産生するかまたは産生することができるリンパ球を誘発する。別の方法では、リンパ球はインビトロで免疫され得る。次に、リンパ球を、ポリエチレングリコールなどの適切な融合剤を使用して骨髄腫細胞と融合させ、ハイブリドーマ細胞を形成する（Ｇｏｄｉｎｇ，Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ ａｎｄ Ｐｒａｃｔｉｃｅ，ｐｐ．５９－１０３，Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ，１９８６）。抗体はまた、ヒト抗体を産生するよう遺伝子修飾された動物モデルでも作製され得る。

製剤および担体
本明細書に記載のポリペプチドまたは断片（例えば、配列番号１～７のうちのいずれか１つのポリペプチド）および抗体もしくはそれらの抗原結合断片（例えば、配列番号１～７のうちのいずれか１つに存在するエピトープに対して配向される抗体およびそれらの抗原結合断片）は、対象（例えば、ヒト対象）への投与のための医薬組成物として製剤化され得る。

医薬組成物は、十分に熟練した当業者が容易に利用できる標準的な医薬製剤の化学および方法論を使用して調製することができる。例えば、本明細書に記載のポリペプチドおよび抗体またはそれらの抗原結合断片（例えば、配列番号１～７のうちのいずれか１つのポリペプチドまたはそれらの断片、および配列番号１～７のうちのいずれか１つの内部のエピトープに特異的に結合する、抗体またはそれらの抗原結合断片）は、１つ以上の薬学的に許容される添加物またはビヒクルと組み合わせることができる。湿潤剤または乳化剤、ｐＨ緩衝物質などの補助物質が、添加物またはビヒクル中に存在し得る。これらの添加物、ビヒクルおよび補助物質は、一般に、組成物の投与を受ける個体に免疫応答を誘導せず、過度の毒性なしに投与され得る医薬剤である。薬学的に許容される添加物には、水、生理食塩水、ポリエチレングリコール、ヒアルロン酸、グリセロール、およびエタノールなどの液体が含まれるが、これらに限定されない。その中には、薬学的に許容される塩、例えば、塩酸塩、臭化水素酸塩、リン酸塩、硫酸塩などの鉱酸塩、および酢酸塩、プロピオン酸塩、マロン酸塩、安息香酸塩などの有機酸の塩も含まれ得る。薬学的に許容される添加物、ビヒクル、および補助物質の詳細な考察は、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ（Ｍａｃｋ Ｐｕｂ．Ｃｏ．，Ｎ．Ｊ．１９９１）で入手可能である。

そのような組成物（例えば、Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログ、例えば、配列番号１～７のうちのいずれか１つのもの、または配列番号１～７のうちのいずれか１つに存在するエピトープと特異的に結合する、抗体もしくはその抗原結合断片を含む、医薬組成物）は、ボーラス投与もしくは持続投与に適した形態で、調製、包装、または販売され得る。注射用組成物は、アンプルまたは保存剤を含有する複数回用量容器などの単位剤形で、調製、包装、または販売され得る。

組成物には、懸濁液、溶液、油性もしくは水性ビヒクル中のエマルジョン、ペースト、および埋め込み型の徐放性または生分解性の製剤が含まれ得るが、これらに限定されない。そのような組成物は、懸濁剤、安定剤、または分散剤が含まれるがこれらに限定されない１つ以上の追加成分をさらに含み得る。非経口投与用組成物の一実施形態では、有効成分は、再構成された組成物の非経口投与に先立ち適切なビヒクル（例えば、滅菌パイロジェンフリー水）で再構成するための乾燥（例えば、粉末または顆粒）形態で提供される。組成物は、無菌注射用の水性もしくは油性の懸濁液もしくは溶液の形態で調製、包装、または販売され得る。この懸濁液または溶液は、既知の技術に従って製剤化され得、有効成分に加えて、本明細書に記載の分散剤、湿潤剤、または懸濁剤などの追加成分を含み得る。そのような無菌注射用製剤は、例えば、水または１，３－ブタンジオールなどの、無毒の非経口的に許容される希釈剤または溶媒を使用して調製され得る。他の許容される希釈剤および溶媒には、リンゲル液、等張塩化ナトリウム溶液、および合成のモノグリセリドまたはジグリセリドなどの固定油が含まれるが、これらに限定されない。

親的に投与可能な他の有用な組成物には、微結晶形態にあるか、リポソーム調製物になっているか、または生分解性ポリマー系の成分として有効成分を含むものが含まれる。徐放または埋め込み用の組成物は、エマルジョン、イオン交換樹脂、やや不溶性のポリマー、もしくはやや不溶性の塩など、薬学的に許容されるポリマー材料または疎水性材料を含み得る。

別の方法では、本明細書に記載のポリペプチドもしくはそれらの断片および／または抗体もしくはそれらの抗原結合断片（例えば、配列番号１～７のうちのいずれか１つのポリペプチドおよびそれらの断片、ならびに配列番号１～７のうちのいずれか１つの内部のエピトープに結合する、抗体またはそれらの抗原結合断片）は、粒子状担体と封入、吸着、または会合され得る。適切な粒子状担体には、ポリメチルメタクリレートポリマーに由来するもの、ならびにポリ（ラクチド）およびポリ（ラクチド－コ－グリコリド）に由来するＰＬＧ微粒子が含まれる。例えば、Ｊｅｆｆｅｒｙ ｅｔ ａｌ．（１９９３）Ｐｈａｒｍ．Ｒｅｓ．１０：３６２－３６８を参照のこと。他の粒子系およびポリマー、例えば、ポリリジン、ポリアルギニン、ポリオルニチン、スペルミン、スペルミジンなどのポリマー、ならびにこれらの分子の複合体も使用することができる。

抗Ａｌｓ３抗体またはそれらの断片（例えば、配列番号１～７のうちのいずれか１つの内部のエピトープに特異的に結合する抗体）は、緩衝液、塩、界面活性剤、ポリオール／二糖類／多糖類、アミノ酸、および／または抗酸化剤から選択される添加物とともに組成物として製剤化され得る。例えば、組成物は、ｐＨレベルを４．７～７．４に保つ緩衝液、例えば、酢酸塩、クエン酸塩、ヒスチジン、コハク酸塩、リン酸塩、およびヒドロキシメチルアミノメタン（Ｔｒｉｓ）などを含有し得る。存在する場合、界面活性剤は、ポリソルベート８０（Ｔｗｅｅｎ ８０）、ポリソルベート２０（Ｔｗｅｅｎ ２０）、およびポロキサマー１８８のうちの１つ以上から選択され得る。それらのうち、ポリソルベート８０が７２％使用される。凍結乾燥または液体の組成物の場合、ポリオール／二糖類／多糖類（例えば、マンニトール、ソルビトール、スクロース、トレハロース、およびデキストラン４０）のうちの１つまたは混合物が存在し得る。組成物にはまた、塩化ナトリウム（ＮａＣｌ）が含まれ得る。抗体製剤に含まれ得るアミノ酸には、例えば、グリシンおよびアルギニンが含まれる。最後に、組成物に含まれ得る抗酸化剤には、アスコルビン酸、メチオニン、およびエチレンジアミン四酢酸（ＥＤＴＡ）が含まれる。

アジュバント
免疫応答を刺激する物質、例えば、アジュバントは、ポリペプチド（例えば、Ａｌｓ３ポリペプチド）を含む組成物中に含まれ得る。アジュバントは、免疫系の刺激を引き起こし、かつ／または増大させる物質である。これに関連して、アジュバントは、１つ以上の免疫原性ペプチド（例えば、本明細書に記載のＡｌｓ３ポリペプチドのうちの１つ以上）に対する免疫応答を増強するために使用される。アジュバントは、免疫原性組成物、Ａｌｓ３ペプチド、その断片もしくはホモログ、または本明細書に記載のワクチンの投与の、前、組み合わせて、または後に、対象に投与され得る。アジュバントとして使用される化学化合物の例には、アルミニウム化合物（例えば、ミョウバン、水酸化アルミニウム、リン酸アルミニウム、ＡＬＨＹＤＲＯＧＥＬ（登録商標）、ＡＤＪＵ－ＰＨＯＳ（登録商標））、油、ブロックポリマー、免疫刺激複合体、ビタミンおよびミネラル（例えば、ビタミンＥ、ビタミンＡ、セレン、ビタミンＢ１２）、Ｑｕｉｌ Ａ（サポニン）、細菌および真菌の細胞壁成分（例えば、リポ多糖類、リポタンパク質、糖タンパク質）、ホルモン、サイトカイン、フロイントアジュバント、ならびに共刺激因子が含まれるが、これらに限定されない。

免疫原性およびワクチン製剤
本明細書に記載のポリペプチドまたは断片（例えば、配列番号１～７のうちのいずれか１つのポリペプチドまたはそれらの断片）は、免疫原性の組成物またはワクチンとして製剤化され得る。製剤化された組成物には、例えば、ＥＬＩＳＡ、抗体サブクラスの決定、オプソニン食作用アッセイ（例えば、Ｄｗｙｅｒ ａｎｄ Ｇａｄｊｅｖａ，Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１１００：３７３－３７９，２０１４を参照のこと）、あるいは、例えば、フローサイトメトリーもしくはＭＨＣテトラマー染色を使用する、例えば、ＣＤ４＋および／またはＣＤ８＋の細胞応答など、細胞の既往歴の存在、によってなど、対象の抗体価によって決定される、免疫学的応答を開始させるのに十分な量の本明細書に記載の１つ以上のポリペプチド（例えば、配列番号１～７のうちのいずれか１つのポリペプチドまたはそれらの断片）が含まれる。免疫原性量は、当業者によって容易に決定され得る。組成物は、約０．１％～約９９．９％のポリペプチド（例えば、配列番号１～７のものまたはそれらの断片）を含有し得、対象に投与することができる。

免疫原性組成物およびワクチン組成物は、本明細書に記載のような別個のポリペプチドの混合物を含むことができる。例えば、免疫原性の組成物またはワクチンには、例えば、配列番号１、２、３、４、５、６、もしくは７のアミノ酸配列、またはそれらの変異型配列であって配列番号１、２、３、４、５、６、もしくは７のうちのいずれか１つのアミノ酸配列に対して複数（例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、またはそれ以上）の置換（例えば、保存的置換）、欠失、または付加を有するものを、含有するかまたはそれらからなる、例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、またはそれ以上の別個の本明細書に記載のポリペプチドが含まれ得る。

Ａｌｓ３ポリペプチド（例えば、配列番号１～７のうちのいずれか１つのポリペプチド）は、任意選択で、アジュバント（例えば、水酸化アルミニウム；上記の例も参照のこと）と組み合わせて、例えば、緩衝液および塩を含む組成物に製剤化することができる。そのような組成物には、例えば、リン酸ナトリウム、クエン酸ナトリウム、ヒスチジン、またはコハク酸ナトリウム（２～２０ｍＭ、例えば、５～１５ｍＭまたは１０ｍＭ）、ｐＨ６．０～８．０（例えば、ｐＨ６．５～７．５またはｐＨ７．０）、および塩化ナトリウム（１００～３００ｍＭ、例えば、１００～２００ｍＭまたは１５４ｍＭが含まれ得る。

本発明で使用することができるワクチン製剤の具体例はＮＤＶ－３であり、これには、１０ｍＭのリン酸ナトリウム、ｐＨ７．０、および１５４ｍＭの塩化ナトリウムに製剤化されたＡｌｓ３－１（配列番号３）が含まれる。別の例はＮＤＶ－３Ａであり、これには、１０ｍＭのリン酸ナトリウム、ｐＨ６．５、および１５４ｍＭの塩化ナトリウムに製剤化されたＡｌｓ３－２（配列番号２）が含まれる。ＮＤＶ－３ワクチンおよびＮＤＶ－３Ａワクチンは、任意選択で、６００μｇのＡｌｓ３－１（またはＡｌｓ３－２）／ｍＬ、水酸化アルミニウムとして１．０ｍｇのＡｌ／ｍＬ、およびリン酸緩衝生理食塩水を含有する０．７ｍＬの容量で２ｍＬガラスバイアルに充填され得る。注射用の針とシリンジでバイアルから抜く場合、約０．５ｍＬを（例えば、筋肉内経路で）注射することができ、３００μｇのＡｌｓ３－１（またはＡｌｓ３－２）という送達用量がもたらされる。

投与量および投与
本明細書に記載の組成物（例えば、配列番号１～７のポリペプチドまたはそれらの断片あるいは配列番号１～７のうちのいずれか１つの内部のエピトープに特異的に結合する抗体またはそれらの断片）は、様々な方法で対象（例えば、ヒト患者）に投与することができる。組成物は、ポリペプチドもしくはその断片または抗体もしくはその断片を、唯一の活性物質として、または１つ以上の追加の活性物質と組み合わせて含有し得る。さらに、治療される感染症の重症度は、投与される投与量、投与経路、または投与頻度に影響を与え得る。投与レジメンは、対象とされている臨床適応によって、ならびに様々な患者変数（例えば、体重、年齢、性別）および臨床所見（例えば、感染の程度または重症度）によって決定され得る。組成物は、経口で、頬側で、舌下で、非経口で、静脈内に、皮下に、髄内に、鼻腔内に、坐剤として、フラッシュ製剤を使用して、局所に、皮内に、筋肉内に、経肺送達を介して、動脈内注射を介して、髄腔内に、注入（例えば、持続注入またはボーラス注入）を介して、または粘膜経路を介して、投与され得る。さらに、投与量（複数可）は、持続的に与えられるか、または経時的に与えられる複数の投与量に分割され得ることが理解される。組成物は、例えば、１時間ごと、１日ごと、１週間ごと、１か月ごと、または１年ごとに１回以上投与され得る。

一般に、本明細書に記載の医薬組成物、または本明細書に記載の医薬組成物中の活性物質（例えば、配列番号１～７のうちのいずれか１つのポリペプチドもしくはそれらの断片および配列番号１～７のうちのいずれか１つの内部のエピトープと結合する抗体）の投与量は、約１ｐｇ～約１０ｇ（例えば、１ｐｇ～１０ｐｇ、例えば、２ｐｇ、３ｐｇ、４ｐｇ、５ｐｇ、６ｐｇ、７ｐｇ、８ｐｇ、９ｐｇ、１０ｐｇ、例えば、１０ｐｇ～１００ｐｇ、例えば、２０ｐｇ、３０ｐｇ、４０ｐｇ、５０ｐｇ、６０ｐｇ、７０ｐｇ、８０ｐｇ、９０ｐｇ、１００ｐｇ、例えば、１００ｐｇ～１ｎｇ、例えば、２００ｐｇ、３００ｐｇ、４００ｐｇ、５００ｐｇ、６００ｐｇ、７００ｐｇ、８００ｐｇ、９００ｐｇ、１ｎｇ、例えば、１ｎｇ～１０ｎｇ、例えば、２ｎｇ、３ｎｇ、４ｎｇ、５ｎｇ、６ｎｇ、７ｎｇ、８ｎｇ、９ｎｇ、１０ｎｇ、例えば、１０ｎｇ～１００ｎｇ、例えば、２０ｎｇ、３０ｎｇ、４０ｎｇ、５０ｎｇ、６０ｎｇ、７０ｎｇ、８０ｎｇ、９０ｎｇ、１００ｎｇ、例えば、１００ｎｇ～１μｇ、例えば、２００ｎｇ、３００ｎｇ、４００ｎｇ、５００ｎｇ、６００ｎｇ、７００ｎｇ、８００ｎｇ、９００ｎｇ、１μｇ、例えば、１～１０μｇ、例えば、１μｇ、２μｇ、３μｇ、４μｇ、５μｇ、６μｇ、７μｇ、８μｇ、９μｇ、１０μｇ、例えば、１０μｇ～１００μｇ、例えば、２０μｇ、３０μｇ、４０μｇ、５０μｇ、６０μｇ、７０μｇ、８０μｇ、９０μｇ、１００μｇ、例えば、１００μｇ～１ｍｇ、例えば、２００μｇ、３００μｇ、４００μｇ、５００μｇ、６００μｇ、７００μｇ、８００μｇ、９００μｇ、１ｍｇ、例えば、１ｍｇ～１０ｍｇ、例えば、２ｍｇ、３ｍｇ、４ｍｇ、５ｍｇ、６ｍｇ、７ｍｇ、８ｍｇ、９ｍｇ、１０ｍｇ、例えば、１０ｍｇ～１００ｍｇ、例えば、２０ｍｇ、３０ｍｇ、４０ｍｇ、５０ｍｇ、６０ｍｇ、７０ｍｇ、８０ｍｇ、９０ｍｇ、１００ｍｇ、例えば、１００ｍｇ～１ｇ、例えば、２００ｍｇ、３００ｍｇ、４００ｍｇ、５００ｍｇ、６００ｍｇ、７００ｍｇ、８００ｍｇ、９００ｍｇ、１ｇ、例えば、１ｇ～１０ｇ、例えば、２ｇ、３ｇ、４ｇ、５ｇ、６ｇ、７ｇ、８ｇ、９ｇ、１０ｇ）の範囲であり得る。

Ａｌｓ３ポリペプチドもしくは抗Ａｌｓ３抗体、またはその断片はまた、単位用量形態で、または患者の質量もしくは体重あたりの用量として、約０．０１ｍｇ／ｋｇ～約１００ｍｇ／ｋｇ（例えば、０．０１～０．１ｍｇ／ｋｇ、例えば、０．０２ ０．０３ｍｇ／ｋｇ、０．０４ｍｇ／ｋｇ、０．０５ｍｇ／ｋｇ、０．０６ｍｇ／ｋｇ、０．０７ｍｇ／ｋｇ、０．０８ｍｇ／ｋｇ、０．０９ｍｇ／ｋｇ、０．１ｍｇ／ｋｇ、例えば、０．１～１ｍｇ／ｋｇ、例えば、０．２ｍｇ／ｋｇ、０．３ｍｇ／ｋｇ、０．４ｍｇ／ｋｇ、０．５ｍｇ／ｋｇ、０．６ｍｇ／ｋｇ、０．７ｍｇ／ｋｇ、０．８ｍｇ／ｋｇ、０．９ｍｇ／ｋｇ、１ｍｇ／ｋｇ、例えば、１～１０ｍｇ／ｋｇ、例えば、１ｍｇ／ｋｇ、２ｍｇ／ｋｇ、３ｍｇ／ｋｇ、４ｍｇ／ｋｇ、５ｍｇ／ｋｇ、６ｍｇ／ｋｇ、７ｍｇ／ｋｇ、８ｍｇ／ｋｇ、９ｍｇ／ｋｇ、１０ｍｇ／ｋｇ、例えば、１０～１００ｍｇ／ｋｇ、例えば、２０ｍｇ／ｋｇ、３０ｍｇ／ｋｇ、４０ｍｇ／ｋｇ、５０ｍｇ／ｋｇ、６０ｍｇ／ｋｇ、７０ｍｇ／ｋｇ、８０ｍｇ／ｋｇ、９０ｍｇ／ｋｇ、１００ｍｇ／ｋｇ）投与され得る。

抗体投与（例えば、配列番号１～７のうちのいずれか１つに存在するエピトープに特異的に結合する抗体またはそれらの断片）の好ましい実施形態には、持続注入またはボーラス注入などの注入が含まれる。約０．５ｇ～約５ｇの抗Ａｌｓ３抗体が投与され得る。抗Ａｌｓ３抗体は、約１ｍＬ～約１Ｌの適切な容量（例えば、１０ｍＬ～１Ｌ、例えば、９００ｍＬ、８００ｍＬ、７００ｍＬ、６００ｍＬ、５００ｍＬ、４００ｍＬ、３００ｍＬ、２００ｍＬ、１００ｍＬ、５０ｍＬ、１０ｍＬ、５ｍＬ、４ｍＬ、３ｍＬ、２ｍＬ、１ｍＬ、またはそれ以下）で投与され得る。抗Ａｌｓ３抗体は、約１ｍｇ／ｋｇ～約２０ｍｇ／ｋｇの投与量で投与され得る。用量はまた、単位日あたりの患者の質量または体重あたりの用量としても投与され得る（例えば、０．１～１０ｍｇ／ｋｇ／日）。

本明細書に記載のポリペプチド（例えば、配列番号１～７のうちのいずれか１つのポリペプチドまたはそれらの断片）を含む免疫原性組成物およびワクチンは、一次用量および１つ以上（例えば、２、３、４、５、またはそれ以上）の後続追加用量など、複数用量（例えば、２、３、４、５、またはそれ以上）で投与することができる。例えば、初回用量のポリペプチドが投与され得、２回目の用量が、１～１００日（例えば、２日、３日、４日、５日、１０日、１５日、２０日、２５日、３０日、３５日、４０日、または４５日、５０日、６０日、７０日、８０日、９０日）後に投与され得る。２回目の用量は、初回用量から約７～９０日、１～５０日、２１～６０日、または約２２日後に投与され得る。いくつかの好ましい実施形態では、約５μｇ～約５ｍｇ（例えば、約１０～６００μｇ、２０～３００μｇ、３０～３００μｇ、３０～９０μｇ、または２００～３００μｇ）のＡｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログ（例えば、配列番号１～７のうちのいずれか１つ）が投与される。これらの投与量は、０．１ｍＬ～約１Ｌの適切な容量（例えば、２ｍＬ、１ｍＬ、０．７５ｍＬ、０．５ｍＬ、または０．２５ｍＬ、またはそれ以下）で投与され得る。

併用療法
Ｃ．ａｕｒｉｓ感染症に対する治療または免疫の本明細書に記載の方法には、２つ以上の医薬剤（例えば、Ａｌｓ３ポリペプチド（例えば、配列番号１～５のうちのいずれか１つ）または抗Ａｌｓ３抗体もしくはその断片および抗真菌薬）を含む併用療法の投与が含まれ得る。２つ以上の薬剤は、順次（任意の順序であり、実質的に同時投与を含む）または混合剤として投与され得る。例えば、薬剤は、互いの間が約１か月、２週間、１週間、１日、１２時間、６時間、もしくは１時間以内、または実質的に同時に投与され得る。２つ以上の薬剤は、同一製剤にするか、または別々の製剤として投与され得る。

抗真菌薬は、アゾール、ポリエン、アリルアミン、エキノカンジン、ラノステロールデメチラーゼ阻害剤、安息香酸、シクロピロクスオアミン、エンフマファンギン、５－フルシトシン、グリセオフルビン、ハロプロジン、トルナフタート、アミノカンジン、クロルダントイン、クロルフェネシン、ニフロキシム、ウンデシレン酸、またはクリスタルバイオレットであり得る。アゾールは、トリアゾール、イミダゾール、またはチアゾールであり得る。トリアゾールは、フルコナゾール、アルバコナゾール、エフィナコナゾール、エポキシコナゾール、イサブコナゾール、イトラコナゾール、ポサコナゾール、プロピコナゾール、ラブコナゾール、テルコナゾール、またはボリコナゾールであり得る。イミダゾールは、ビホナゾール、ブトコナゾール、クロトリマゾール、エベルコナゾール、エコナゾール、フェンチコナゾール、フルトリマゾール、イソコナゾール、ケトコナゾール、ルリコナゾール、ミコナゾール、オモコナゾール、オキシコナゾール、セルタコナゾール、スルコナゾール、またはチオコナゾールであり得る。チアゾールはアバファンギンであり得る。ポリエンは、アムホテリシンＢ、カンジシジン、フィリピン、ハマイシン、ナタマイシン、ナイスタチン、またはリモシジンであり得る。アリルアミンは、アモロルフィン、ブテナフィン、ナフチフィン、またはテルビナフィンであり得る。エキノカンジンは、アニデュラファンギン、ビアファンギン、カスポファンギン、またはミカファンギンであり得る。ラノステロールデメチラーゼ阻害剤はＶＴ－１１６１であり得る。抗真菌薬のいずれも、その薬学的に許容される塩またはエステルの形態であり得る。

キット
また、本明細書に記載されるような、Ｃ．ａｕｒｉｓ感染症に対する治療または免疫の方法を実施するために使用することができるキットも特徴とする。本発明のキットは、１つ以上のＡｌｓ３ポリペプチドまたはそれらの断片もしくはホモログ（例えば、配列番号１～７のうちのいずれか１つ）を、任意選択で、アジュバント（例えば、水酸化アルミニウム）を含有する組成物など、免疫原性の組成物またはワクチン組成物の形態で含むことができる。一例では、Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログ（例えば、配列番号１～７のうちのいずれか１つ）は、容器（例えば、ガラスバイアル）内に、液体形態（例えば、水中、または緩衝塩溶液中、例えば、１０ｍＭのリン酸ナトリウム、ｐＨ６．５もしくはｐＨ７．０、および１５４ｍＭの塩化ナトリウムなど。使用できる緩衝液および塩の条件の他の例については、上記を参照のこと）で存在する。別の例では、Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログ（例えば、配列番号１～７のうちのいずれか１つ）は、容器（例えば、ガラスバイアル）内に凍結乾燥形態で存在する。この例では、キットには、任意選択で、投与に先立つ凍結乾燥ポリペプチドの液体形態への再構成用の希釈剤（例えば、水または緩衝塩溶液）も含まれ得る。ポリペプチドはまた、本明細書に記載のような、または当技術分野で知られているような、別の製剤で存在し得る。キットの組成物中に存在するポリペプチド、および、任意選択で、アジュバントの量は、例えば、上記のようなものであり得る。したがって、例えば、キットは、Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログ（例えば、配列番号１～７のうちのいずれか１つ）を、本明細書に記載のような用量の投与を容易にする量で含むことができる。

また、上記のような、抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片を含むキットも特徴とする。抗Ａｌｓ３抗体もしくはその抗原結合断片が、対象への投与のために製剤化された組成物中に存在し得るか、または組成物が凍結乾燥形態でキットに存在し得る。その場合、キットにはまた、抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片を含有する組成物を再構成するための希釈剤も含まれ得る。抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片を含有する組成物は、上記のように製剤化され得、また上記の濃度のうちの１つの濃度でキットに存在し得る。

キットにはまた、Ａｌｓ３ポリペプチドもしくはその断片または抗Ａｌｓ３抗体もしくはその抗原結合断片に加えて、１つ以上の抗真菌剤（例えば、フルコナゾール、ケトコナゾール、ブトコナゾール、ミコナゾール、テルコナゾール、チオコナゾール、クロトリマゾール、およびナイスタチン、または上記の他の抗真菌剤のいずれか）も含まれ得る。例えば、フルコナゾールの場合、キットには、本明細書に記載のような量で経口投与用の錠剤に製剤化された１つ以上の用量を含めることができる（例えば、フルコナゾールは、５０、１００、または２００ｍｇの投与量にて表形態で存在し得、また錠剤には、以下の不活性成分、すなわち、微結晶セルロース、無水リン酸水素カルシウム、ポビドン、クロスカルメロースナトリウム、およびステアリン酸マグネシウムも含まれ得る）。キットには、抗真菌剤（例えば、フルコナゾール）の単一用量、または抗真菌剤（例えば、フルコナゾール）の２、３、４、５、６、７、８、９、または１０の用量（例えば、少なくとも３用量）が含まれ得る。フルコナゾールに代えて、または加えて、他の薬剤、例えば、ブトコナゾール、ミコナゾール、テルコナゾール、チオコナゾール、およびクロトリマゾールなどがキットに存在し得る。これらの薬剤は、クリームの形態であり得る。別の方法では、クロトリマゾール、ミコナゾール、およびテルコナゾールは、当技術分野で知られているように、膣坐剤の形態で存在することができる。これらの薬剤は、単一または複数用量で存在することができる。抗真菌剤は、使用者（例えば、医師）が抗真菌剤を含有するパッケージを患者に提供できるよう、キット内に別々の容器で包装され得るか、あるいは抗真菌剤は、Ａｌｓ３ポリペプチドもしくはその断片または抗Ａｌｓ３抗体もしくはその抗原結合断片との混合剤として存在し得る。

キット構成要素は、投与を容易にする剤形で提供することができ、また任意選択で、例えば、本明細書に記載の方法と一致する、投与に必要な材料および／または患者治療のための指示を含むことができる。

例えば、キットは、Ａｌｓ３ワクチン（例えば、診療現場における、例えば、ＮＤＶ－３ワクチンまたはＮＤＶ－３Ａワクチン）の投与に関して使用者（例えば、医師）を指導する使用説明書を含むことができる。キットにはまた、医師を、抗真菌剤（例えば、フルコナゾール）の初回用量を投与するよう誘導する指示も含むことができる。キット内のこれらの指示、または別々のセットの指示は、抗真菌剤の投与に関して使用者（例えば、患者）を指導し得、これらは、抗真菌剤をその後の自宅での投与のために患者に与えることができるよう、キット内に別々に包装され得る。例えば、指示は、使用者（例えば、医師または患者）を、抗真菌剤の初回用量を直ちに投与し、抗真菌剤の２回目および後続用量を１２時間、２４時間、３６時間、４８時間、もしくは７２時間ごと、または抗真菌剤が消費されるまで投与するよう指導し得る。

キットは、室温（例えば、約７０°Ｆ（２０℃）で、または冷蔵庫内で３５°Ｆ～４６°Ｆ（２℃～８℃）の温度での保存に適した材料で包装され得る。

以下の例は、開示を限定するのではなく、むしろ例示することを意図している。

実施例１．ＮＤＶ－３Ａワクチンは好中球減少マウスを多剤耐性Ｃ．ａｕｒｉｓ感染から保護する
出現しつつある多剤耐性（ＭＤＲ）真菌Ｃ．ａｕｒｉｓをＡｌｓ３ホモログについて調べ、Ｃ．ａｕｒｉｓによる血行性播種性カンジダ症からマウスを保護することにおけるＮＤＶ－３Ａワクチン接種の有効性を試験した。この実施例で使用されるＮＤＶ－３Ａワクチンは、リン酸緩衝生理食塩水中に水酸化アルミニウムアジュバントとともに製剤化された配列番号３のＡｌｓ３ポリペプチドを含有する。

最初に、Ｃ．ａｕｒｉｓのプロテオームに対してＡｌｓ３配列をブラストすることにより、Ｃ．ａｕｒｉｓにおけるＡｌｓ３のホモログを同定した。Ｃ．ａｕｒｉｓの２つのオルソログ（仮想タンパク質ＱＧ３７＿０６２６５、Ｇｅｎｂａｎｋ受託番号ＸＰ＿０１８１６７５７２．１；配列番号６、およびＱＧ３７＿０５９７９、Ｇｅｎｂａｎｋ受託番号ＸＰ＿０１８１６７３０７．１；配列番号７）は、Ｃ．ａｌｂｉｃａｎｓ Ａｌｓ３タンパク質（配列番号１）と４７％の全体的配列同一性を有することが同定された。ただし、配列同一性がより高い領域は、Ａｌｓ３タンパク質の機能特性を有すると考えられているＮ末端領域で同定された。これらは、Ｃ．ａｕｒｉｓタンパク質とＡｌｓ３間で７２～８２％の重複する配列同一性を有していた（図１）。これらの２つのタンパク質は、それまで特徴が明らかになっていなかった。

次に、０日目に雄ＣＤ－１マウスに３００μｇのＮＤＶ－３Ａワクチンを皮下注射によりワクチン接種することにより、ＮＤＶ－３Ａワクチンのインビボでの有効性を試験した。２１日目および３５日目にマウスに追加用量を注射し、４２日目にマウス血清を採取してＥＬＩＳＡにより抗Ａｌｓ３抗体価の発現について試験した。これらのマウスにより産生された血清は、フローサイトメトリーおよび免疫蛍光染色法により決定された高親和性でＣ．ａｕｒｉｓと結合することができた（図２～図４）。

Ｃ．ａｕｒｉｓの病原性形質（プラスチックへの接着、バイオフィルム形成、および好中球による殺滅に対する感受性を予防する抗血清の能力を試験した。プラセボ血清と比較して、ＮＤＶ－３Ａワクチンを接種したマウスからの血清（５％）は、エキソビボでの好中球によるＣ．ａｕｒｉｓの殺滅を増強させ（ｐ＝０．００２）（図５）、インビトロでのＣ．ａｕｒｉｓのプラスチックへの接着およびバイオフィルム形成を低減させた（ｐ＝０．００１）（図６）。

ＮＤＶ－３Ａワクチンの有効性を試験するため、ワクチンを接種したマウスを、４７日目および５２日目にシクロホスファミド（２００ｍｇ／ｋｇ）および酢酸コルチゾンによって好中球減少にした。４９日目、マウスを静脈内によりＣ．ａｕｒｉｓの５×１０^７の芽胞子で感染させた。マウスに、３００μｇのＮＤＶ－３Ａワクチンと２００μｇのミョウバン、または２００μｇのミョウバンのみでワクチン接種した。感染１８日後、ミョウバン対照の生存０％と比較して、ワクチンを接種したマウスの４０％が生存した（図７）。非感染マウスの１００％は生存した。

次に、様々な抗真菌薬のＭＩＣを測定して、Ｃ．ａｕｒｉｓ感染症を治療する際のそれらの有効性を試験した。特に、フルコナゾール、アムホテリシンＢ、ポサコナゾール、ミカファンギン、カスポファンギン、イサブコナゾール、およびアンプリクスＡＰＸ００１を、ＤＭＳＯまたは薬物不含培地を対照として使用して試験した（図８Ａ、図８Ｂ）。また、フルコナゾール、カスポファンギン、ミカファンギンが、単独、またはＮＤＶ－３Ａワクチンとの組み合わせで、感染マウスの生存率を向上させる能力を試験した。フルコナゾールと組み合わせたＡｌｓ３ワクチン接種では、感染後２０日で５０％の生存率がもたらされた。Ａｌｓ３ワクチン単独での処置では４０％の生存率がもたらされた（図９）。カスポファンギンと組み合わせたＡｌｓ３ワクチン接種では４０％の生存率がもたらされた（図１０）。フルコナゾール処置もカスポファンギン処置も、ＮＤＶ－３Ａワクチン接種によって拮抗されることはなかった。最後に、ミカファンギンと組み合わせたＡｌｓ３ワクチン接種では７０％の生存率がもたらされた、プラセボ群の０％の生存率と比較した場合、ワクチン単独では４０％の顕著な生存率がもたらされ、ミカファンギン処置群では２０％の顕著な生存率であった（図１１）。

さらに、ＮＤＶ－３Ａワクチンを接種した女性患者から血清を採取し、Ｃ．ａｕｒｉｓへの結合に対する血清の効果を試験した。交差反応性抗体の存在を、ＮＤＶ－３Ａワクチンを接種された女性とプラセボの女性（ＮＤＶ－３Ａワクチンを受けなかった）において、Ｃ．ａｕｒｉｓのライセートの上清に対するＥＬＩＳＡによって評価した。交差反応性抗体は、ＮＤＶ－３Ａワクチン接種群で検出されたが、プラセボ群では検出されなかった（図１２Ａ）。

Ｃ．ａｕｒｉｓによるバイオフィルム形成も、ＮＤＶ－３Ａワクチン接種またはプラセボの女性からの５％血清の存在下で評価した。ワクチン接種血清およびプラセボ血清の両方について、それぞれの免疫前血清ＯＤ値を割ることによってバイオフィルム形成の低減率を計算した。図１２Ｂに示されるように、ＮＤＶ－３Ａワクチンを接種された女性からの血清は、Ｃ．ａｕｒｉｓのバイオフィルム形成を顕著に低減させる。

他の実施形態
上記明細書で言及されるすべての刊行物、特許、および特許出願は、個々の刊行物、特許、または特許出願が各々参照により組み込まれることが具体的かつ個別に示されているかの如く同程度に、参照により本明細書によってその全体が組み込まれる。

本発明をその具体的な実施形態と関連させて記載してきたが、さらなる変更が可能であり、かつ、本出願は、一般に、本発明の原則に従った本発明のいかなる変形、使用、または適応も包含されることが意図され、それらには、本開示から発展させたもの、例えば、本発明が属する技術分野の範囲内で既知または慣習的な実施に入るもの、および上述に記載される本質的な特徴に該当し得るもの、および添付の特許請求の範囲に従うものなどが含まれることを理解されるであろう。
他の実施形態は特許請求の範囲内である。

Claims (20)

1. Ｃａｎｄｉｄａ ａｕｒｉｓ感染症に対して、対象を治療するか、対象に免疫を与えるか、対象において予防するか、または抗体産生を対象において誘発する際に使用するための、免疫原性量の、Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログ、あるいは抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片を含む、組成物であって、前記Ａｌｓ３ポリペプチドが、配列番号１の配列全体に対して少なくとも９０％の配列同一性を有し、前記Ａｌｓ３ポリペプチドの断片が、配列番号２の配列全体又は配列番号３の配列全体に対して少なくとも９０％の配列同一性を有し、前記Ａｌｓ３ポリペプチドのホモログが、配列番号６の配列全体に対して少なくとも９０％の配列同一性を有する、組成物。
2. 前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログ、あるいは抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片の投与に先立ち、
   ａ）前記対象が
   （ｉ）Ｃ．ａｕｒｉｓ感染症にかかっている、および／または
   （ｉｉ）Ｃ．ａｕｒｉｓが定着している
   として同定されている；あるいは
   ｂ）Ｃ．ａｕｒｉｓによる定着および／または感染のリスクがあるとして同定されている、
   請求項１に記載の使用のための組成物。
3. 前記対象が前記対象から採取された試料を分析することにより同定され、任意選択で、前記試料は、皮膚または粘膜の拭き取りで得られ、任意選択で、前記粘膜は、前記対象の口、喉、食道、直腸または膣である、請求項２に記載の使用のための組成物。
4. ａ）前記対象が
   （ｉ）免疫不全であり、
   （ｉｉ）Ｃ．ａｕｒｉｓ感染症の併存疾患に罹患しているか、もしくはＣ．ａｕｒｉｓ感染症の危険因子を有し、
   （ｉｉｉ）Ｃ．ａｕｒｉｓ感染症にかかっていることが疑われるか、もしくはかかるリスクがあり、および／または
   （ｉｖ）Ｃ．ａｕｒｉｓに曝露されたことがあるか、もしくは曝露されていることが疑われ；
   ｂ）前記Ｃ．ａｕｒｉｓが多剤耐性であり；ならびに／あるいは
   ｃ）前記組成物が、
   （ｉ）前記対象におけるＣ．ａｕｒｉｓバイオフィルム形成を阻害もしくは低減し、
   （ｉｉ）Ｃ．ａｕｒｉｓの定着を約１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、８５％、９０％低減させるか、もしくはＣ．ａｕｒｉｓの定着を実質的に排除し、および／または
   （ｉｉｉ）前記対象の生存率を高める、
   請求項１～３のいずれか一項に記載の使用のための組成物。
5. 前記併存疾患が、細菌感染症、真菌感染症、ウイルス感染症、免疫障害、または糖尿病である、請求項１～４のいずれか一項に記載の使用のための組成物。
6. 前記真菌感染症がカンジダ症である、請求項１～５のいずれか一項に記載の使用のための組成物。
7. 前記カンジダ症は、
   （ｉ）粘膜の感染症であり、任意選択で、前記粘膜が、前記対象の口、喉、もしくは食道であり、
   （ｉｉ）外陰膣カンジダ症であり、かつ／もしくは
   （ｉｉｉ）侵襲性カンジダ症である、
   請求項１～６のいずれか一項に記載の使用のための組成物。
8. 前記危険因子が、外科手術、集中治療室での滞在、介護施設での居住、呼吸管、栄養管、もしくは中心静脈カテーテルなどのカテーテルである、請求項１～４のいずれか一項に記載の使用のための組成物。
9. 前記Ｃ．ａｕｒｉｓが多剤耐性である、請求項１～８のいずれか一項に記載の使用のための組成物。
10. ａ）前記対象がヒトであるか、
    ｂ）前記対象が、病院もしくは保健所で、働いているか、働いたことがあるか、もしくは働く予定であるか、
    ｃ）前記対象が、病院もしくは保健所で、治療されているか、治療されたことがあるか、もしくは治療される予定であるか、
    ｄ）前記対象が、少なくとも５０歳、６０歳、７０歳、８０歳、または９０歳であるか、または
    ｅ）前記対象が、新生児、乳児、もしくは幼児であって、任意選択で、前記対象が３歳未満である、請求項１～９のいずれか一項に記載の使用のための組成物。
11. 前記Ａｌｓ３ポリペプチドが、配列番号１の配列全体に対して少なくとも９５％、９７％、９９％、または１００％の配列同一性を有し、前記Ａｌｓ３ポリペプチドの断片が、配列番号２の配列全体又は配列番号３の配列全体に対して少なくとも９５％、９７％、９９％、または１００％の配列同一性を有し、前記Ａｌｓ３ポリペプチドのホモログが、配列番号６の配列全体に対して少なくとも９５％、９７％、９９％、または１００％の配列同一性を有する、請求項１～１０のいずれか一項に記載の使用のための組成物。
12. 前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログあるいは抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片が、アゾール、ポリエン、アリルアミン、エキノカンジン、ラノステロールデメチラーゼ阻害剤、安息香酸、シクロピロクスオアミン、エンフマファンギン、５－フルシトシン、グリセオフルビン、ハロプロジン、トルナフタート、アミノカンジン、クロルダントイン、クロルフェネシン、ニフロキシム、ウンデシレン酸、またはクリスタルバイオレットから選択される追加の治療薬とともに投与されることを特徴とする、請求項１～１１のいずれか一項に記載の使用のための組成物。
13. ａ）前記アゾールが、トリアゾール、イミダゾール、またはチアゾールである、
    ｂ）前記ポリエンが、アムホテリシンＢ、カンジシジン、フィリピン、ハマイシン、ナタマイシン、ナイスタチン、またはリモシジンであり、
    ｃ）前記アリルアミンが、アモロルフィン、ブテナフィン、ナフチフィン、またはテルビナフィンであり、
    ｄ）前記エキノカンジンが、アニデュラファンギン、ビアファンギン、カスポファンギン、またはミカファンギンであり、ならびに／あるいは
    ｅ）前記ラノステロールデメチラーゼ阻害剤がＶＴ－１１６１である、
    請求項１２に記載の使用のための組成物。
14. 前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログあるいは抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片および前記追加の治療薬が、互いに１か月以内、２週間以内、１週間以内、１日以内、１２時間以内、６時間以内、もしくは１時間以内に投与されるか、または実質的に同時に投与されることを特徴とする、請求項１～１３のいずれか一項に記載の使用のための組成物。
15. ａ）約５マイクログラム～約５ミリグラムの前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログが投与され、
    任意選択で、約１０～約６００マイクログラム、約２０～約３００マイクログラム、約３０～約９０マイクログラム、もしくは約２００～約３００マイクログラムの前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログが投与され、例えば、約３０マイクログラムもしくは約３００マイクログラムなどの前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログが投与されることを特徴とし、かつ／あるいは
    ｂ）前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログが、約２ｍＬ以下の量で投与されることを特徴とし、任意選択で、前記量が約１ｍＬ以下、約０．７５ｍＬ以下、約０．５ｍＬ以下、もしくは約０．２５ｍＬ以下である、請求項１～１４のいずれか一項に記載の使用のための組成物。
16. 前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログが、フロイントアジュバント、リポ多糖類、リン酸アルミニウム、水酸化アルミニウム、ミョウバン、およびその混合物からなる群から選択されるアジュバントとともに製剤化される、請求項１～１５のいずれか一項に記載の使用のための組成物。
17. 前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログが、前記対象に２回以上投与されることを特徴とする、請求項１～１６のいずれか一項に記載の使用のための組成物。
18. 前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログが、第１の用量および第２の用量で投与されることを特徴とし、任意選択で、前記第２の用量の前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログが、前記第１の用量の前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログが、前記第１の用量の投与後、約７日～約９０日で投与されることを特徴とする、請求項１７に記載の使用のための組成物。
19. 前記Ａｌｓ３ポリペプチドまたはその断片もしくはホモログが、皮下、筋肉内、皮内、経皮、鼻腔内、経口か、または注入を介して投与されることを特徴とする、請求項１～１７のいずれか一項に記載の使用のための組成物。
20. ａ）約０．５グラム～約５グラムの前記抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片が投与されるか、
    ｂ）約１ｍｇ／ｋｇ～約２０ｍｇ／ｋｇの前記抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片が投与されるか、
    ｃ）前記抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片が、約１０００ｍＬ以下の量で投与され、任意選択で、前記量が約９００ｍＬ、８００ｍＬ、７００ｍＬ、６００ｍＬ、５００ｍＬ、４００ｍＬ、３００ｍＬ、２００ｍＬ、１００ｍＬ、５０ｍＬ、もしくは１０ｍＬ以下であるか、または約１０００ｍＬ～１０ｍＬの量であり、かつ／あるいは
    ｄ）前記抗Ａｌｓ３抗体またはその抗原結合断片が、皮下、筋肉内、皮内、経皮、鼻腔内、経口か、もしくは注入を介して投与されることを特徴とし、
    任意選択で、前記注入が、持続注入またはボーラス注入である、請求項１～１９のいずれか一項に記載の使用のための組成物。