JP7316284B2 - Tigitに対する抗体及びその多様体 - Google Patents
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Description
本出願は、2018年1月15日に出願された国際特許出願第PCT/CN2018/072607号の優先権を主張し、その内容は、全体が参照により本明細書に組み込まれる。
本出願は、ファイル名「688096.0120配列表」及び2018年1月12日の作成日を有し、61kbのサイズを有するASCIIフォーマットの配列表としてEFS-Web経由で電子的に提出される配列表を含有する。EFS-Web経由で提出される配列表は、本明細書の一部であり、本明細書に全体が参照により組み込まれる。
本出願は、TIGITタンパク質に特異的に結合することが可能な抗体またはその抗原結合フラグメント及びそのような薬剤の使用に関する。一部の実施形態では、本出願は、マウス及びヒト化モノクローナルTIGITに対する抗体及びこれらの抗体の使用に関する。抗体またはその抗原結合フラグメントは、診断薬として、TIGITの活性及び/または発現に関連する疾患の処置に有用である。
(a)
i.配列番号27~39からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む重鎖相補性決定領域1(CDR1)、
ii.配列番号40~52からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む重鎖CDR2、及び
iii.配列番号53~65からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む重鎖CDR3を含む重鎖可変ドメイン(VH)、ならびに、
(b)
i.配列番号66~78からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖CDR1、
ii.配列番号79~91からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖CDR2、及び
iii.配列番号92~104からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖CDR3を含む軽鎖可変ドメイン(VL)
を含む単離抗体またはその抗原結合フラグメントに関し、
抗体またはその抗原結合フラグメントは、TIGIT、好ましくは、ヒトTIGITに特異的に結合することが可能である。
本発明はまた、以下に関する。
[項目1]
単離抗体またはその抗原結合フラグメントであって、
(a)
i.配列番号27~39からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む重鎖相補性決定領域1(CDR1)、
ii.配列番号40~52からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む重鎖CDR2、及び
iii.それぞれ、配列番号53~65からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む重鎖CDR3、を含む重鎖可変ドメイン(VH)、ならびに
(b)
i.配列番号66~78からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖CDR1、
ii.配列番号79~91からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖CDR2、及び
iii.それぞれ、配列番号92~104からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖CDR3、
を含む軽鎖可変ドメイン(VL)を含み、
前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、TIGIT、好ましくは、ヒトTIGITに特異的に結合することが可能である、前記単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
[項目2]
(1)前記VHが、それぞれ、配列番号27、40、及び53のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3配列を含み、前記VLが、それぞれ、配列番号66、79、及び92のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含むか、
(2)前記VHが、それぞれ、配列番号28、41、及び54のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3配列を含み、前記VLが、それぞれ、配列番号67、80、及び93のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含むか、
(3)前記VHが、それぞれ、配列番号29、42、及び55のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3配列を含み、前記VLが、それぞれ、配列番号68、81、及び94のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含むか、
(4)前記VHが、それぞれ、配列番号30、43、及び56のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3配列を含み、前記VLが、それぞれ、配列番号69、82、及び95のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含むか、
(5)前記VHが、それぞれ、配列番号31、44、及び57のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3配列を含み、前記VLが、それぞれ、配列番号70、83、及び96のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含むか、
(6)前記VHが、それぞれ、配列番号32、45、及び58のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3配列を含み、前記VLが、それぞれ、配列番号71、84、及び97のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含むか、
(7)前記VHが、それぞれ、配列番号33、46、及び59のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3配列を含み、前記VLが、それぞれ、配列番号72、85、及び98のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含むか、
(8)前記VHが、それぞれ、配列番号34、47、及び60のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3配列を含み、前記VLが、それぞれ、配列番号73、86、及び99のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含むか、
(9)前記VHが、それぞれ、配列番号35、48、及び61のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3配列を含み、前記VLが、それぞれ、配列番号74、87、及び100のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含むか、
(10)前記VHが、それぞれ、配列番号36、49、及び62のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3配列を含み、前記VLが、それぞれ、配列番号75、88、及び101のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含むか、
(11)前記VHが、それぞれ、配列番号37、50、及び63のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3配列を含み、前記VLが、それぞれ、配列番号76、89、及び102のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含むか、
(12)前記VHが、それぞれ、配列番号38、51、及び64のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3配列を含み、前記VLが、それぞれ、配列番号77、90、及び103のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含むか、または
(13)前記VHが、それぞれ、配列番号39、52、及び65のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3配列を含み、前記VLが、それぞれ、配列番号78、91、及び104のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含む、項目1に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
[項目3]
前記VHが、それぞれ、配列番号38、51、及び64のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3配列を含み、前記VLが、それぞれ、配列番号77、90、及び103のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含む、項目2に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
[項目4]
前記VHが、それぞれ、配列番号39、52、及び65のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3配列を含み、前記VLが、配列番号78、91、及び104のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含む、項目2に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
[項目5]
前記VHが、配列番号1~13からなる群より選択される配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を含み、前記VLが、それぞれ、配列番号14~26からなる群より選択される配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を含む、項目1~4のいずれか1項に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
[項目6]
前記VHが、配列番号1~13からなる群より選択されるアミノ酸配列、または前記VHに最大約3アミノ酸置換を含むその多様体を含み、前記VLが、配列番号14~26からなる群より選択されるアミノ酸配列、または前記VLに最大約3アミノ酸置換を含むその多様体を含む、項目5に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
[項目7]
(1)前記VHが、配列番号1のアミノ酸配列を含み、前記VLが、配列番号14のアミノ酸配列を含むか、
(2)前記VHが、配列番号2のアミノ酸配列を含み、前記VLが、配列番号15のアミノ酸配列を含むか、
(3)前記VHが、配列番号3のアミノ酸配列を含み、前記VLが、配列番号16のアミノ酸配列を含むか、
(4)前記VHが、配列番号4のアミノ酸配列を含み、前記VLが、配列番号17のアミノ酸配列を含むか、
(5)前記VHが、配列番号5のアミノ酸配列を含み、前記VLが、配列番号18のアミノ酸配列を含むか、
(6)前記VHが、配列番号6のアミノ酸配列を含み、前記VLが、配列番号19のアミノ酸配列を含むか、
(7)前記VHが、配列番号7のアミノ酸配列を含み、前記VLが、配列番号20のアミノ酸配列を含むか、
(8)前記VHが、配列番号8のアミノ酸配列を含み、前記VLが、配列番号21のアミノ酸配列を含むか、
(9)前記VHが、配列番号9のアミノ酸配列を含み、前記VLが、配列番号22のアミノ酸配列を含むか、
(10)前記VHが、配列番号10のアミノ酸配列を含み、前記VLが、配列番号23のアミノ酸配列を含むか、
(11)前記VHが、配列番号11のアミノ酸配列を含み、前記VLが、配列番号24のアミノ酸配列を含むか、
(12)前記VHが、配列番号12のアミノ酸配列を含み、前記VLが、配列番号25のアミノ酸配列を含むか、または
(13)前記VHが、配列番号13のアミノ酸配列を含み、前記VLが、配列番号26のアミノ酸配列を含む、項目5または6に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
[項目8]
前記VHが、配列番号12のアミノ酸配列を含み、前記VLが、配列番号25のアミノ酸配列を含む、項目7に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
[項目9]
前記VHが、配列番号13のアミノ酸配列を含み、前記VLが、配列番号26のアミノ酸配列を含む、項目7に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
[項目10]
前記VHが、免疫グロブリンの重鎖定常領域に融合している、項目1~9のいずれか1項に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
[項目11]
前記VLが、免疫グロブリンの軽鎖定常領域(CL)に融合している、項目1~10のいずれか1項に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
[項目12]
前記抗体またはその抗原結合フラグメント及び前記TIGIT間の結合のK D が、10 -7 M~約10 -12 M、好ましくは、約10 -8 M~約10 -12 M、より好ましくは、約10 -9 M~約10 -12 Mである、項目1~11のいずれか1項に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
[項目13]
齧歯動物、キメラ、ヒト、部分的にヒト化、または完全にヒト化である、項目1~12のいずれか1項記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
[項目14]
ヒト化である、項目13に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
[項目15]
前記VHが、配列番号105~112からなる群より選択されるアミノ酸配列を含み、前記VLが、配列番号113~118からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、項目14に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
[項目16]
さらに、第2の抗体部分を含み、前記第2の抗体部分が、第2の抗原に特異的に結合することが可能である、項目1~15のいずれか1項に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
[項目17]
前記第2の抗体部分が、Fab、Fab’、(Fab’) 2 、Fv、一本鎖Fv(scFv)、scFv-scFv、ミニボディ、ダイアボディ、sdAb、または抗体模倣物である、項目16に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
[項目18]
前記第2の抗体部分が、sdAbである、項目17に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
[項目19]
前記第2の抗体部分が、CTLA-4に特異的に結合することが可能であり、好ましくは、前記第2の抗体部分が、CTLA-4に特異的に結合することが可能なsdAbである、項目16~18のいずれか1項に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
[項目20]
前記第2の抗体部分が、PD-L1に特異的に結合することが可能であり、好ましくは、前記第2の抗体部分が、PD-L1に特異的に結合することが可能なsdAbである、項目16~18いずれか1項に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
[項目21]
前記第2の抗体部分が、TIM-3に特異的に結合することが可能であり、好ましくは、前記第2の抗体部分が、TIM-3に特異的に結合することが可能なsdAbである、項目16~18のいずれか1項に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
[項目22]
前記第2の抗体部分が、LAG-3に特異的に結合することが可能であり、好ましくは、前記第2の抗体部分が、LAG-3に特異的に結合することが可能なsdAbである、項目16~18のいずれか1項に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
[項目23]
TIGITを特異的に認識することが可能な全長IgGの前記重鎖または軽鎖の前記アミノ末端が、CTLA-4、PD-L1、TIM-3、またはLAG-3に特異的に結合することが可能な前記sdAbの前記カルボキシル末端に、任意に、ペプチドリンカーを介して融合している、項目19~22のいずれか1項に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
[項目24]
TIGITを特異的に認識することが可能な前記重鎖または軽鎖または全長IgGの前記カルボキシル末端が、CTLA-4、PD-L1、TIM-3、またはLAG-3に特異的に結合することが可能な前記sdAbの前記アミノ末端に、任意に、ペプチドリンカーを介して融合している、項目19~22のいずれか1項に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
[項目25]
TIGITを特異的に認識することが可能な前記全長IgGが、配列番号119~121の1つのアミノ酸配列を有するペプチドリンカーを介して、CTLA-4、PD-L1、TIM-3、またはLAG-3に特異的に結合することが可能な前記sdAbに融合している、項目23または24に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
[項目26]
項目1~25のいずれか1項に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメントと競合的に、TIGITに特異的に結合することが可能である、第2の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
[項目27]
項目1~25のいずれか1項に記載の単離抗体もしくはその抗原結合フラグメント、または項目26に記載の第2の単離抗体またはその抗原結合フラグメント、及び薬学的に許容される担体を含む医薬組成物。
[項目28]
それを必要とする対象のTIGIT関連疾患の処置に使用される、項目1~25のいずれか1項に記載の単離抗体もしくはその抗原結合フラグメント、項目26に記載の第2の単離抗体もしくはその抗原結合フラグメント、または項目27に記載の医薬組成物。
[項目29]
前記TIGIT関連疾患が、がんである、項目28に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメントまたは使用のための医薬組成物。
[項目30]
前記がんが、固形腫瘍である、項目29に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメントまたは使用のための医薬組成物。
[項目31]
前記がんが、結腸癌である、項目29に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメントまたは使用のための医薬組成物。
[項目32]
追加のがん治療法と組み合わせた、項目28~31のいずれか1項に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメントまたは使用のための医薬組成物。
[項目33]
前記追加のがん治療が、外科手術、放射線、化学療法、免疫療法、ホルモン療法、またはそれらの組み合わせである、項目32に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメントまたは使用のための医薬組成物。
[項目34]
前記TIGIT関連疾患が、病原性感染である、項目28に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメントまたは使用のための医薬組成物。
[項目35]
前記単離抗体またはその抗原結合フラグメントまたは医薬組成物が、全身または局所投与用である、項目28~34のいずれか1項に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメントまたは使用のための医薬組成物。
[項目36]
前記単離抗体またはその抗原結合フラグメントまたは医薬組成物が、静脈内投与用である、項目28~34のいずれか1項に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメントまたは使用のための医薬組成物。
[項目37]
前記単離抗体またはその抗原結合フラグメントまたは医薬組成物が、腫瘍内投与用である、項目28~34のいずれか1項に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメントまたは使用のための医薬組成物。
[項目38]
前記対象が、ヒトである、項目28~37のいずれか1項に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメントまたは使用のための医薬組成物。
本発明の実施は、特に反対の指示がない限り、当業者の範囲内のウイルス学、免疫学、微生物学、分子生物学、及び組み換えDNA技術の従来の方法を用いることになり、それらの多くは、例示の目的で以下に記載される。そのような技術は、文献で完全に説明される。例えば、Current Protocols in Molecular Biology or Current Protocols in Immunology,John Wiley & Sons,New York,N.Y.(2009);Ausubel et al,Short Protocols in Molecular Biology,3rd ed.,Wiley & Sons,1995;Sambrook and Russell,Molecular Cloning:A Laboratory Manual(3rd Edition,2001);Maniatis et al.Molecular Cloning:A Laboratory Manual(1982);DNA Cloning:A Practical Approach,vol.I & II(D.Glover,ed.);Oligonucleotide Synthesis(N.Gait,ed.,1984);Nucleic Acid Hybridization(B.Hames & S.Higgins,eds.,1985);Transcription and Translation(B.Hames & S.Higgins,eds.,1984);Animal Cell Culture(R.Freshney,ed.,1986);Perbal,A Practical Guide to Molecular Cloning(1984)及び他の類似の参考文献を参照のこと。
抗TIGITモノクローナル抗体
本明細書に記載の単離抗TIGIT構築物は、TIGIT(または「抗TIGIT mAb」)を特異的に認識または結合するモノクローナル抗体(mAb)部分を含む。本発明の一部の実施形態では、単離抗TIGIT構築物は、全長IgGである。
より大きなPVRネクチンファミリーの分子と構造で同様に、TIGITタンパク質は、細胞外IgVドメイン、1型膜貫通領域、ならびにITIM及び免疫グロブリンテールチロシン(ITT)様モチーフを含有する細胞質尾部を含有する。CD155を介したTIGITの関与は、Fyn及びLckを介したTIGITのリン酸化、ならびに、細胞質ゾルアダプターGrb2を介したSHIP1の動員を誘導する。SHIP1をTIGIT尾部に動員すると、PI3K及びMAPK経路を介したシグナル伝達が遮断され、NK細胞の抑制がもたらされる。さらに、リン酸化時に、TIGITのITT様モチーフが、β-アレスチン2に結合し、SHIP1を動員して、NF-κBシグナル伝達を制限する。ヒトTIGITの例示的なアミノ酸配列は、Genbankアクセッション番号NP_776160.2で開示される。
抗体または抗原結合ドメインの結合特異性は、当該技術分野で既知の方法により実験的に決定することができる。そのような方法は、ウェスタンブロット、ELISA試験、RIA試験、ECL試験、IRMA試験、EIA試験、BIAcore試験、及びペプチドスキャンを含むが、これらに限定されない。
一部の実施形態では、本明細書で提供される抗TIGIT抗体は、キメラ抗体である。特定のキメラ抗体は、例えば、米国特許第4,816,567号;及びMorrison et al.,Proc.Nat’l.Acad.Sci.USA,81:6851-6855(1984)に記載される。一例では、キメラ抗体は、非ヒト可変領域(例えば、ラマなどのラクダ科種に由来する可変領域)及びヒト定常領域を含む。さらなる例では、キメラ抗体は、クラスまたはサブクラスが親抗体のものから変化している「クラススイッチ」抗体である。キメラ抗体は、その抗原結合フラグメントを含む。
一部の実施形態では、本明細書で提供される抗TIGIT抗体、特に、mAbは、ヒト抗体である。ヒト抗体は、当該技術分野で既知の種々の技術を使用して生成することができる。ヒト抗体は一般に、van Dijk and van de Winkel,Curr.Opin.Pharmacol.5:368-74(2001)及びLonberg,Curr.Opin.Immunol.20:450-459(2008)に記載される。完全にヒト単一ドメイン抗体を産生することが可能なトランスジェニックマウスまたはラットは、当該技術分野で既知である。例えば、US20090307787A1、米国特許第8,754,287号、US20150289489A1、US20100122358A1、及びWO2004049794を参照のこと。
本出願の抗体は、所望の活性(複数可)を有する抗体についてコンビナトリアルライブラリーをスクリーニングすることにより単離することができる。例えば、ファージディスプレイライブラリーを生成し、所望の結合特性を有する抗体についてそのようなライブラリーをスクリーニングするための様々な方法が当該技術分野で既知である。そのような方法は、例えば、Hoogenboom et al.in Methods in Molecular Biology 178:1-37(O’Brien et al.,ed.,Human Press,Totowa,NJ,2001)に概説され、さらに、例えば、the McCafferty et al.,Nature 348:552-554;Clackson et al.,Nature 352:624-628(1991);Marks et al.,J.Mol.Biol.222:581-597(1992);Marks and Bradbury,in Methods in Molecular Biology 248:161-175(Lo,ed.,Human Press,Totowa,NJ,2003);Sidhu et al.,J.Mol.Biol.338(2):299-310(2004);Lee et al.,J.Mol.Biol.340(5):1073-1093(2004);Fellouse,Proc.Nat’l.Acad.Sci.USA 101(34):12467-12472(2004);及びLee et al.,J.Immunol.Methods 284(1-2):119-132(2004)に記載される。単一ドメイン抗体ライブラリーを構築するための方法が記載されており、例えば、米国特許第7371849号を参照のこと。
本明細書に記載の抗TIGIT mAbの生物活性は、その半最大阻害濃度(IC50)を測定することにより決定することができ、これは、特定の生物学的または生化学的機能の抑制(例えば、TIGIT及びそのリガンドCD155(PVRとしても知られる)間の結合の阻害))における抗体の有効性の尺度である。例えば、本明細書では、IC50は、in vitroでTIGIT生物活性の50%を中和するために必要な抗TIGIT mAbの有効濃度を示すために使用することができる。IC50は、アゴニスト薬物または他の物質(例えば、抗体)のEC50に相当する。EC50は、in vivoで最大効果の50%を得るのに必要な血漿濃度も表す。IC50またはEC50は、当該技術分野で既知のアッセイ、例えば、FACS分析(競合結合アッセイ)、細胞ベースのサイトカイン放出アッセイ、またはルシフェラーゼレポーターアッセイによるリガンド結合の阻害などのバイオアッセイ、で測定することができる。
抗TIGIT mAbを含む抗TIGIT構築物は、任意の可能なフォーマットとすることができる。
一部の実施形態では、抗TIGIT mAbは、全長IgGである。一部の実施形態では、抗TIGIT mAbは、IgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4のいずれかなどのIgGの定常領域を含む。一部の実施形態では、定常領域は、ヒト定常領域である。一部の実施形態では、定常領域は、ヒトIgG1定常領域である。
一部の実施形態では、抗TIGIT構築物は、1つ以上の他の抗体部分(例えば、別の抗原を特異的に認識する抗体部分)に融合している、本明細書に記載の抗TIGIT mAbを含む。1つ以上の他の抗体部分は、sdAb、全長抗体、Fab、Fab’、(Fab’)2、Fv、一本鎖Fv(scFv)、scFv-scFv、ミニボディ、またはダイアボディなどの任意の抗体または抗体フラグメントのフォーマットのものであり得る。特定の抗体フラグメントの概説については、Hudson et al.Nat.Med.9:129-134(2003)を参照のこと。scFvフラグメントの概説については、例えば、Pluckthun,in The Pharmacology of Monoclonal Antibodies,vol.113,Rosenburg and Moore eds.,(Springer-Verlag、ニューヨーク),pp.269-315(1994)を参照のこと;WO93/16185;ならびに米国特許第5,571,894号及び同第5,587,458号も参照のこと。サルベージ受容体結合エピトープ残基を含み、in vivo半減期の増加を有するFab及びF(ab’)2フラグメントの考察については、米国特許第5,869,046号を参照のこと。多重特異性抗体の概説については、Weidle et al.,Cancer Genomics Proteomics,10(1):1-18,2013;Geering and Fussenegger,Trends Biotechnol.,33(2):65-79,2015;Stamova et al.,Antibodies,1(2):172-198,2012を参照のこと。ダイアボディは、二価または二重特異性であり得る2つの抗原結合部位を有する抗体フラグメントである。例えば、EP404,097;WO1993/01161;Hudson et al.,Nat.Med.9:129-134(2003);及びHollinger et al.,Proc.Nat’l.Acad.Sci.USA 90:6444-6448(1993)を参照のこと。トリアボディ及びテトラボディはまた、Hudson et al.,Nat.Med.9:129-134(2003)に記載される。抗体フラグメントは、本明細書に記載されるように、限定されないが、インタクト抗体のタンパク質分解消化、及び組み換え宿主細胞(例えば、E.coliまたはファージ)による産生を含む種々の技術により作製することができる。一部の実施形態では、1つ以上の他の抗体部分は、抗体を想起させる抗原結合ドメインを含む小さな操作タンパク質である抗体模倣物である(Geering and Fussenegger,Trends Biotechnol.,33(2):65-79,2015)。これらの分子は、既存のヒト足場タンパク質に由来し、単一のポリペプチドを含む。本明細書に記載の抗TIGIT構築物内に含まれ得る例示的な抗体模倣物は、N末端及びC末端キャップドメインに隣接する設計されたアンキリン反復タンパク質(DARPin;3~5完全合成アンキリン反復を含む)、結合活性多量体(アビマー、複数のAドメインを含む高親和性タンパク質、標的に対して低い親和性を有する各ドメイン)、またはアンチカリン(4つのアクセス可能なループを有するリポカリンの足場に基づいて、それぞれの配列がランダム化することができる)であり得るが、これらに限定されない。
一部の実施形態では、抗TIGIT構築物内に2つ以上の抗体部分は、任意に、ペプチドリンカーで連結することができる。抗TIGIT構築物に使用されるペプチドリンカー(複数可)の長さ、柔軟性の程度、及び/または他の特性は、限定されないが、1つ以上の特定の抗原及びエピトープに対する親和性、特異性、または結合活性を含む特性に何らかの影響を与え得る。例えば、確実に、2つの隣接するドメインが互いに立体的に干渉させないために、より長いペプチドリンカーを選択することができる。一部の実施形態では、ペプチドリンカーは、隣接するドメインが互いに対して自由に移動できるように、柔軟な残基(例えば、グリシン及びセリン)を含む。例えば、グリシン-セリンダブレットは、好適なペプチドリンカーであり得る。
一部の実施形態では、本出願の単離抗体または抗原結合フラグメントは、第2の抗体部分に融合している本明細書に記載の抗TIGIT IgGを含む二重特異性または多重特異性抗体であり、第2の抗体部分は、別の抗原、好ましくは、別の抑制性免疫チェックポイント分子に特異的に結合する。
一部の実施形態では、本明細書で提供される抗体のアミノ酸配列多様体が企図される。例えば、抗体の結合親和性及び/または他の生物学的特性を改善することが望ましい可能性がある。抗体のアミノ酸配列多様体は、抗体をコードする核酸配列に適切な修飾を導入することにより、またはペプチド合成により調製することができる。そのような修飾としては、例えば、抗体のアミノ酸配列内の残基からの欠失及び/または残基への挿入及び/または残基の置換が挙げられる。欠失、挿入、及び置換の任意の組み合わせは、最終構築物に到達するように行うことができる。但し、最終構築物が所望の特徴、例えば、抗原結合、を有する。
一部の実施形態では、1つ以上のアミノ酸置換を有する抗体多様体が提供される。置換変異導入のための目的の部位は、HVR及びFRを含む。保存的置換は、「好ましい置換」の見出しの下の表2に示される。より実質的な変化は、「例示的置換」の見出しの下の表2に、さらにアミノ酸側鎖クラスに関しては以下に記載のように、提示される。アミノ酸置換は、目的の抗体に導入することができ、生成物を、例えば、所望の活性、結合抗原の保持/改善、免疫原性の減少、またはADCCもしくはCDCの改善、についてスクリーニングすることができる。
(1)疎水性:ノルロイシン、Met、Ala、Val、Leu、Ile、
(2)中性親水性:Cys、Ser、Thr、Asn、Gln、
(3)酸性:Asp、Glu、
(4)塩基性:His、Lys、Arg、
(5)鎖の向きに影響を与える残基:Gly、Pro、
(6)芳香族:Trp、Tyr、Phe。
一部の実施形態では、本明細書で提供される抗TIGIT構築物は、構築物がグリコシル化される程度を増加または減少させるように変更される。抗体へのグリコシル化部位の付加または欠失は、1つ以上のグリコシル化部位が作成または削除されるようにアミノ酸配列を変更することにより、都合よく達成することができる。
一部の実施形態では、1つ以上のアミノ酸修飾は、本明細書で提供される抗TIGIT構築物のFc領域に導入し、それにより、Fc領域多様体を生成することができる。Fc領域多様体は、1つ以上のアミノ酸位置においてアミノ酸修飾(例えば、置換)を含むヒトFc領域配列(例えば、ヒトIgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4のFc領域)を含み得る。
一部の実施形態では、抗体の1つ以上の残基がシステイン残基で置換されている、システイン操作された抗TIGIT構築物、例えば、「チオMAb」を作成することが望ましい可能性がある。特定の実施形態では、置換残基は、抗体の接近可能な部位に生じる。システインとそれらの残基を置換することにより、反応性チオール基は、それにより、抗体の接近部位に配置され、さらに本明細書に記載されるように、免疫複合体を作成するために、薬剤部分またはリンカー-薬物部分などの他の部分に抗体をコンジュゲートするように使用することができる。一部の実施形態では、以下の残基のうちのいずれか1つ以上は、システインで置換することができる:重鎖のA118(EUナンバリング)及び重鎖のFc領域のS400(EUナンバリング)。システイン操作された抗TIGIT構築物は、例えば、米国特許第7,521,541号に記載されるように生成することができる。
一部の実施形態では、本明細書で提供される抗TIGIT構築物はさらに、当該分野で既知であり、容易に利用可能である追加の非タンパク質性部分を含有するように修飾することができる。抗体の誘導体化に適する部分は、水溶性ポリマーを含むが、これに限定されない。水溶性ポリマーの非限定例としては、ポリエチレングリコール(PEG)、エチレングリコール/プロピレングリコールのコポリマー、カルボキシメチルセルロース、デキストラン、ポリビニルアルコール、ポリビニルピロリドン、ポリ-1,3-ジオキソラン、ポリ-1,3,6-トリオキサン、エチレン/無水マレイン酸コポリマー、ポリアミノ酸(ホモポリマーまたはランダムコポリマーのいずれか)、及びデキストランまたはポリ(n-ビニルピロリドン)ポリエチレングリコール、プロピレングリコールホモポリマー、酸化プロピレン/酸化エチレンコポリマー、ポリオキシエチル化ポリオール(例えば、グリセロール)、ポリビニルアルコール、及びそれらの混合物が挙げられるが、これらに限定されない。ポリエチレングリコールプロピオンアルデヒドは、水中での安定性に起因して、製造上有利である得る。ポリマーは、任意の分子量であり得、分枝または非分枝であり得る。抗体に結合しているポリマーの数は、変動し得、複数のポリマーが結合している場合、それらは、同じかまたは異なる分子であり得る。一般に、誘導体化に使用されるポリマーの数及び/またはタイプは、限定されないが、改善されるべき抗体の特定の特性または機能、抗体誘導体が、定義された条件下の治療に使用されるかどうかなど、を含む考慮事項に基づいて決定することができる。
さらに、本明細書に記載のTIGITを特異的に認識する全長IgG(例えば、抗TIGIT IgG、抗TIGIT/CTLA-4二重特異性抗体、TIGIT/PD-L1二重特異性抗体、抗TIGIT/TIM-3二重特異性抗体、または抗TIGIT/LAG-3二重特異性抗体)を含む抗TIGIT構築物のいずれか1つ、及び、任意に、薬学的に許容される担体を含む医薬組成物であるが、本出願により提供される。医薬組成物は、凍結乾燥製剤または水溶液の形態で、所望の純度を有する本明細書に記載の抗TIGIT構築物を任意の薬学的に許容される担体、賦形剤、または安定剤(Remington’s Pharmaceutical Sciences 16th edition,Osol,A.Ed.(1980))と混合させることにより、調製することができる。
本明細書に記載されているようにTIGITを特異的に認識するmAbを含む抗TIGITコンストラクト(例えば、抗TIGIT全長IgG、抗TIGIT/CTLA-4二重特異性抗体、抗TIGIT/PD-L1二重特異性抗体、抗TIGIT/TIM-3二重特異性抗体、または抗TIGIT/LAG-3二重特異性抗体)及びその組成物(例えば、医薬組成物)は、例えば、診断、分子アッセイ、及び治療において様々な用途に有用である。
本明細書に記載の抗TIGIT構築物(例えば、抗TIGITモノクローナル抗体)は、当該技術分野で既知の任意の方法を使用して、または本明細書に記載されるように調製することができる。
本発明は、以下の非限定的な実施形態も提供する。
(a)
i.配列番号27~39からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む重鎖相補性決定領域1(CDR1)、
ii.配列番号40~52からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む重鎖CDR2、及び
iii.配列番号53~65からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む重鎖CDR3をそれぞれ含む重鎖可変ドメイン(VH)、及び
(b)
i.配列番号66~78からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖CDR1、
ii.配列番号79~91からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖CDR2、及び
iii.配列番号92~104からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖CDR3をそれぞれ含む軽鎖可変ドメイン(VL)、
を含む単離抗体、好ましくは、mAb、またはその抗原結合フラグメントを含み、
抗体またはその抗原結合フラグメントは、TIGIT、好ましくは、ヒトTIGITに特異的に結合することができる。
(1)VHは、それぞれ、配列番号27、40、及び53のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3配列を含み、VLは、それぞれ、配列番号66、79、及び92のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含むか、
(2)VHは、それぞれ、配列番号28、41、及び54のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3配列を含み、VLは、それぞれ、配列番号67、80、及び93のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含むか、
(3)VHは、それぞれ、配列番号29、42、及び55のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3配列を含み、VLは、それぞれ、配列番号68、81、及び94のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含むか、
(4)VHは、それぞれ、配列番号30、43、及び56のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3配列を含み、VLは、それぞれ、配列番号69、82、及び95のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含むか、
(5)VHは、それぞれ、配列番号31、44、及び57のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3配列を含み、VLは、それぞれ、配列番号70、83、及び96のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含むか、
(6)VHは、それぞれ、配列番号32、45、及び58のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3配列を含み、VLは、それぞれ、配列番号71、84、及び97のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含むか、
(7)VHは、それぞれ、配列番号33、46、及び59のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3配列を含み、VLは、それぞれ、配列番号72、85、及び98のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含むか、
(8)VHは、それぞれ、配列番号34、47、及び60のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3配列を含み、VLは、それぞれ、配列番号73、86、及び99のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含むか、
(9)VHは、それぞれ、配列番号35、48、及び61のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3配列を含み、VLは、それぞれ、配列番号74、87、及び100のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含むか、
(10)VHは、それぞれ、配列番号36、49、及び62のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3配列を含み、VLは、それぞれ、配列番号75、88、及び101のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含むか、
(11)VHは、それぞれ、配列番号37、50、及び63のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3配列を含み、VLは、それぞれ、配列番号76、89、及び102のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含むか、
(12)VHは、それぞれ、配列番号38、51、及び64のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3配列を含み、VLは、それぞれ、配列番号77、90、及び103のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含むか、または
(13)VHは、それぞれ、配列番号39、52、及び65のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3配列を含み、VLは、それぞれ、配列番号78、91、及び104のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含む。
(1)VHが、配列番号1のアミノ酸配列を含み、VLが、配列番号14のアミノ酸配列を含むか、
(2)VHが、配列番号2のアミノ酸配列を含み、VLが、配列番号15のアミノ酸配列を含むか、
(3)VHが、配列番号3のアミノ酸配列を含み、VLが、配列番号16のアミノ酸配列を含むか、
(4)VHが、配列番号4のアミノ酸配列を含み、VLが、配列番号17のアミノ酸配列を含むか、
(5)VHが、配列番号5のアミノ酸配列を含み、VLが、配列番号18のアミノ酸配列を含むか、
(6)VHが、配列番号6のアミノ酸配列を含み、VLが、配列番号19のアミノ酸配列を含むか、
(7)VHが、配列番号7のアミノ酸配列を含み、VLが、配列番号20のアミノ酸配列を含むか、
(8)VHが、配列番号8のアミノ酸配列を含み、VLが、配列番号21のアミノ酸配列を含むか、
(9)VHが、配列番号9のアミノ酸配列を含み、VLが、配列番号22のアミノ酸配列を含むか、
(10)VHが、配列番号10のアミノ酸配列を含み、VLが、配列番号23のアミノ酸配列を含むか、
(11)VHが、配列番号11のアミノ酸配列を含み、VLが、配列番号24のアミノ酸配列を含むか、
(12)VHが、配列番号12のアミノ酸配列を含み、VLが、配列番号25のアミノ酸配列を含むか、または
(13)VHが、配列番号13のアミノ酸配列を含み、VLが、配列番号26のアミノ酸配列を含む、実施形態5または6の単離抗体またはその抗原結合フラグメントである。
本開示では、マウス抗ヒトTIGITモノクローナル抗体、70A11A8E6、11D8E12A4、16F10H12C11、8F2D8E7、48B5G4E12、139E2C2D2、128E3G7F5、121C2F10B5、104G12E12G2、83G6H11C12、92E9D4B4、100C4E7D11、及び64G1E9B4を以下の免疫化方法で得た。
発現マウスアイソタイプELISAキット(Clonotyping System-HRP、SouthernBiotech、アラバマ州バーミンガム)を使用して、モノクローナル抗体のアイソタイプを同定した。次に、TRIzol(Ambion)を使用して、3×106~5×106のハイブリドーマ細胞からモノクローンの総RNAを抽出した。アイソタイプ特異的プライマー及びユニバーサルプライマー(PrimeScript(商標)第1鎖cDNA合成キット、Takara;カリフォルニア州マウンテンビュー)を使用して、RNAをcDNAに逆転写し、次に、RACE PCR(GenScript)を適用して、抗体の重鎖及び軽鎖の可変領域を増幅し、PCR産物をpMD18-Tベクターシステム(Takara)にサブクローニングした。ベクター特異的プライマーを使用して、挿入されたセグメントを検証及び配列決定をした。最終的に、70A11A8E6、11D8E12A4、16F10H12C11、8F2D8E7、48B5G4E12、139E2C2D2、128E3G7F5、121C2F10B5、104G12E12G2、83G6H11C12、92E9D4B4、100C4E7D11、及び64G1E9B4の可変領域DNA/タンパク質配列を得た。
表面プラズモン共鳴(SPR)バイオセンサーBIACORE(登録商標)T200(GE Healthcare;イギリス、リトルチャルフォント)を使用して、ヒトTIGITへのマウス抗ヒトTIGITモノクローナル抗体の結合動態を決定した。異なる濃度のマウス抗ヒトTIGITモノクローナル抗体を、50nMから3倍連続希釈で調製した。Fcキャプチャー法を介して、各マウス抗ヒトTIGITモノクローナル抗体をセンサーチップ上に固定化した。HISタグ付きのヒトTIGITタンパク質を検体として使用した。BIACORE(登録商標)T200評価ソフトウェアを使用して、解離(Kd)及び会合(KA)速度定数を得た。見かけの平衡解離定数(KD)をkd対kaの比から計算した。表3に示されるように、マウス抗ヒトTIGITモノクローナル抗体は、ヒトTIGITタンパク質に相当する結合動態を有していた(表3)。
蛍光活性化細胞選別(FACS)ベースのアッセイを使用して、CHO-K1細胞で過剰発現されたヒトまたはカニクイザルTIGITへのマウス抗ヒトTIGITモノクローナル抗体の結合親和性を決定した。FACS分析のために1次抗体として(ヒトTIGITの場合111μM、カニクイザルTIGITの場合55.6μMで開始し、9つの濃度の3倍連続希釈した)、マウス抗ヒトTIGITモノクローナル抗体を調製した。ヒトTIGITを発現するCHO-K1細胞を接着培養フラスコから分離し、(両方とも96ウェルプレートで)様々な濃度のマウス抗ヒトTIGITモノクローナル抗体と混合した。混合物を室温で30分間平衡化し、FACS緩衝液(1%のBSAを含有するPBS)で3回洗浄した。2次抗体としてiFluor標識ヤギ抗マウスIgGを加え、室温で45分間インキュベートした。最終的に、細胞をPBSで3回洗浄し、シグナルをFACS BD Caliburで読み取った。非線形回帰を使用するPRISM(商標)(GraphPad Software、カリフォルニア州サンディエゴ)で、データを分析し、EC50値を計算した。図3A~3C及び表4で示されるように、FACS研究は、マウス抗ヒトTIGITモノクローナル抗体が、0.3nM~16.3nMの範囲のEC50値で、CHO-K1細胞で過剰発現されたヒトTIGITに結合したことを示した。
FACSアッセイを使用して、マウス抗ヒトTIGITモノクローナル抗体及びPVR組み換えタンパク質間のヒトTIGITに対する競合的結合を評価した。マウス抗ヒトTIGITモノクローナル抗体及びPVR間のヒトTIGITに対する競合的結合を評価するために、マウス抗ヒトTIGITモノクローナル抗体試料を調製した(500nMで開始し、10の濃度で3倍連続希釈した)。ヒトTIGITを発現するCHO細胞を接着培養フラスコから分離し、様々な濃度の各マウス抗ヒトTIGITモノクローナル抗体及びビオチン標識を有する5μg/mlのヒトTIGIT-Fc融合タンパク質と混合した。混合物を室温で30分間平衡化し、FACS緩衝液(1%のBSAを含有するPBS)で3回洗浄した。次に、PE/Cy5ストレプトアビジン2次抗体を混合物に添加し、室温で15分間インキュベートした。その後、細胞をFACS緩衝液で洗浄し、フローサイトメトリーで分析した。非線形回帰を使用するPRISM(商標)(GraphPad Software、カリフォルニア州サンディエゴ)で、データを分析し、IC50値を計算した(図4A~4B及び表6)。競合FACS研究は、16F10H12C11を除いて、0.75nM~73.5nMの範囲のIC50値で、マウス抗ヒトTIGITモノクローナル抗体がヒトTIGIT及びヒトPVR間の結合を遮断する能力を示した。
128E3G7F5、121C2F10B5、104G12E12G2、83G6H11C12、92E9D4B4、100C4E7D11、及び64G1E9B4へのエピトープ結合試験を、Octet RED96機器(ForteBio;カリフォルニア州メンロパーク)で実施した。全ての測定を30℃で実施した。アミンカップリング法を使用して、目的の1つの抗体をバイオセンサー上に固定化した。検体1として使用されるように、抗原タンパク質TIGITをPBST緩衝液(1xのPBS、pH7.4、及び0.05%のTween-20)で希釈した。抗原タンパク質TIGIT(検体1と同じ濃度)及び2次抗体の混合物を検体2として使用した。コーティングされたバイオセンサーを最初に検体1に浸し、次に、再生及び平衡化後に、検体2に浸した。検体1及び検体2のセンサーグラムを比較した。検体1の結合レベルが検体2の結合レベルよりも大幅に高い場合、第2の抗体は、標的タンパク質TIGITの結合について固定化された抗体と競合することができると考えられた。検体1の結合レベルが検体2の結合レベルよりも大幅に低い場合、第2の抗体は、標的タンパク質TIGITの結合について固定化された抗体と競合することができないと考えられた。全ての抗体が分析されるまで、実験を繰り返した。128E3G7F5、121C2F10B5、104G12E12G2、83G6H11C12、92E9D4B4、100C4E7D11、及び64G1E9B4を、3つのグループにマッピングした(表7)。各グループのマウス抗ヒトTIGITモノクローナル抗体は、ヒトTIGITにおいて密接に関連するエピトープまたは同じエピトープを有する。
T細胞受容体(TCR)アクチベーターを安定的にトランスフェクトすることにより、CHO-K1細胞を人工樹状細胞(APC)になるように設計した。次に、CHO-K1 APCをPVRで過剰発現させた。ジャーカット細胞株をNFAT誘導性ルチアレポーター構築物で安定的にトランスフェクトして、ジャーカット/NFATレポーター細胞株を生成した。次に、ジャーカット/NFATレポーター細胞株を、ヒトTIGITで過剰発現させた。CHO-K1 APC/PVR細胞をジャーカット/NFATレポーター/TIGIT細胞と共培養して、マウス抗ヒトTIGITモノクローナル抗体の中和活性を評価した。ジャーカット/NFATレポーター/TIGIT細胞を、CHO-K1 APC/PVR細胞を加える前に、各マウス抗ヒトTIGITモノクローナル抗体の連続希釈液と共に30分間プレインキュベートした。数時間の相互作用の後、20μlの上清を、IL-2測定のために各ウェルから収集し、次に、ONE-STEP(商標)ルシフェラーゼ試薬を、NFAT活性を測定するために、系に加えた。ジャーカット/NFATレポーター/TIGIT細胞の活性化を、ルシフェラーゼシグナルの強度またはIL-2の分泌により評価した。2つの細胞間のTIGITへのPVRの結合は、ジャーカット/NFATレポーター/TIGIT細胞の活性化を抑制した。マウス抗ヒトTIGITモノクローナル抗体は、PVR及びTIGIT間の相互作用を遮断し、次に、TIGITへのPVRの阻害を中和する。より多くの中和抗体を加え、より多くのジャーカット/NFATレポーター/TIGIT細胞を活性化し、より多くのルシフェラーゼシグナルまたはより多くのIL-2を分泌した(図5A~5B、表8、及び表9)。非線形回帰を使用するPRISM(商標)(GraphPad Software、カリフォルニア州サンディエゴ)で、データを分析し、EC50値を、正規化されたルシフェラーゼシグナル及びIL-2分泌の両方で計算した。
100C4E7D11または64G1E9B4の重鎖及び軽鎖の可変ドメインをヒトIgG1の定常領域と融合させることにより、キメラ抗ヒトTIGITモノクローナル抗体(100C4E7D11キメラまたは64G1E9B4キメラ)を作成した。
蛍光活性化細胞選別(FACS)ベースのアッセイを使用して、CHO-K1細胞で過剰発現されたヒトまたはカニクイザルTIGITへのキメラ抗ヒトTIGITモノクローナル抗体及びヒト化抗ヒトTIGITモノクローナル抗体の結合親和性を決定した。FACS分析のために1次抗体として、キメラ抗ヒトTIGITモノクローナル抗体及びヒト化抗ヒトTIGITモノクローナル抗体を調製した(ヒトTIGITの場合100μM、カニクイザルTIGITの場合55.6μMで開始し、10の濃度で3倍連続希釈)。ヒトTIGITを発現するCHO-K1細胞を接着培養フラスコから分離し、(両方とも96ウェルプレートで)様々な濃度のマウス抗ヒトTIGITモノクローナル抗体と混合した。混合物を室温で30分間平衡化し、FACS緩衝液(1%のBSAを含有するPBS)で3回洗浄した。2次抗体としてiFluor標識ヤギ抗マウスIgGを加え、室温で45分間インキュベートした。最終的に、細胞をPBSで3回洗浄し、シグナルをFACS BD Caliburで読み取った。非線形回帰を使用するPRISM(商標)(GraphPad Software、カリフォルニア州サンディエゴ)で、データを分析し、EC50値を計算した。図6A及び表11に示されるように、FACS研究は、キメラ抗ヒトTIGITモノクローナル抗体及びヒト化抗ヒトTIGITモノクローナル抗体が、0.4nM~1.2nMの範囲のEC50値で、CHO-K1細胞で過剰発現されたヒトTIGITに結合したことを示した。
FACSアッセイを使用して、キメラ抗ヒトTIGITモノクローナル抗体またはヒト化抗ヒトTIGITモノクローナル抗体とPVR組み換えタンパク質との間のヒトTIGITに対する競合的結合を評価した。キメラ抗ヒトTIGITモノクローナル抗体またはヒト化抗ヒトTIGITモノクローナル抗体とPVRとの間のヒトTIGITに対する競合的結合を評価するために、キメラ抗ヒトTIGITモノクローナル抗体またはヒト化抗ヒトTIGITモノクローナル抗体試料を調製した(300nMで開始し、10の濃度で3倍連続希釈)。ヒトTIGITを発現するCHO細胞を、接着培養フラスコから解離させ、様々な濃度の各キメラ抗ヒトTIGITモノクローナル抗体またはヒト化抗ヒトTIGITモノクローナル抗体及びビオチン標識を有する5μg/mlのヒトTIGIT-Fc融合タンパク質と混合した。混合物を室温で30分間平衡化し、FACS緩衝液(1%のBSAを含有するPBS)で3回洗浄した。次に、PE/Cy5ストレプトアビジン2次抗体を混合物に添加し、室温で15分間インキュベートした。その後、細胞をFACS緩衝液で洗浄し、フローサイトメトリーで分析した。非線形回帰を使用するPRISM(商標)(GraphPad Software、カリフォルニア州サンディエゴ)で、データを分析し、IC50値を計算した(図7及び表13)。競合FACS研究は、0.4nMから1.3nMの範囲のIC50値で、ヒトTIGIT及びヒトPVR間の結合へのブロッキングに対するマウス抗ヒトTIGITモノクローナル抗体の能力を示した。
T細胞受容体(TCR)アクチベーターを安定的にトランスフェクトすることにより、CHO-K1細胞を人工樹状細胞(APC)になるように設計した。次に、PVRをCHO-K1 APCで過剰発現させた。ヒトTIGITを、ジャーカット細胞株で過剰発現させた。CHO-K1 APC/PVR細胞を、ジャーカット/TIGIT細胞と共に共培養して、キメラ抗ヒトTIGITモノクローナル抗体及びヒト化抗ヒトTIGITモノクローナル抗体の中和活性を評価した。ジャーカット/TIGIT細胞を、各キメラ抗ヒトTIGITモノクローナル抗体または各ヒト化抗ヒトTIGITモノクローナル抗体の連続希釈液と共に、CHO-K1 APC/PVR細胞を加える前に30分間プレインキュベートした。数時間の相互作用の後、IL-2測定のために各ウェルから20μlの上清を収集した。ジャーカット/TIGIT細胞の活性化を、IL-2の分泌により評価した。2つの細胞間のTIGITへのPVRの結合は、ジャーカット/TIGIT細胞の活性化を抑制した。キメラ抗ヒトTIGITモノクローナル抗体またはヒト化抗ヒトTIGIT抗体は、PVR及びTIGIT間の相互作用を遮断し、次に、TIGITでのPVRの抑制を中和する。中和抗体を加えるほど、より多くのジャーカット/TIGIT細胞が活性化され、より多くのIL-2が分泌された(図8及び表14)。非線形回帰を使用するPRISM(商標)(GraphPad Software、カリフォルニア州サンディエゴ)で、データを分析し、EC50値をIL-2分泌で計算した。
マウスの結腸腺癌細胞株であるMC38腫瘍細胞をC57BL/6ヒトTIGIT Knockin(KI)マウス(Biocytogen;マサチューセッツ州ウスター)に移植することにより、マウス異種移植モデルを調製した。MC38腫瘍細胞を培養し、マグネシウム不含HBSS-/-及びカルシウム不含HBSS-/-に懸濁し、1×106の細胞を、6~8週齢の雌C57BL/6ヒトTIGIT KIマウスの脇腹に皮下注射した。ノギスを使用して、腫瘍体積を測定し、式(長さx幅x幅)/2で計算した。平均腫瘍体積が90~100mm3に達した時、マウスをランダム化して、ヒト化抗ヒトTIGITモノクローナル抗体での処置を開始した。ヒト化抗ヒトTIGITモノクローナル抗体を、i.p.で4日毎に1回投与した(5mg/kg)。研究全体を通して、体重を測定した。
Claims (15)
- 単離抗体またはその抗原結合フラグメントであって、
(a)それぞれ、
i.配列番号39のアミノ酸配列を含む重鎖相補性決定領域1(CDR1)、
ii.配列番号52、またはD7G変異を有する配列番号52のアミノ酸配列を含む重鎖CDR2、及び
iii.配列番号65のアミノ酸配列を含む重鎖CDR3、を含む重鎖可変ドメイン(VH)、ならびに
(b)それぞれ、
i.配列番号78、またはK1R変異を有する配列番号78のアミノ酸配列を含む軽鎖CDR1、
ii.配列番号91のアミノ酸配列を含む軽鎖CDR2、及び
iii.配列番号104のアミノ酸配列を含む軽鎖CDR3、
を含む軽鎖可変ドメイン(VL)を含み、
前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、TIGIT、好ましくは、ヒトTIGITに特異的に結合することが可能である、前記単離抗体またはその抗原結合フラグメント。 - 前記VHが、それぞれ、配列番号39、52、及び65のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3配列を含み、前記VLが、それぞれ、配列番号78、91、及び104のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含む、請求項1に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
- 前記VHが、配列番号13のアミノ酸配列を含み、前記VLが、配列番号26のアミノ酸配列を含む、請求項1または2に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
- 前記VHが、配列番号39、52、及び65のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3配列を含み、前記VLが、配列番号78、91、及び104のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含み、配列番号52の7D位における1つのアミノ酸がGに置換されており、配列番号78の1K位における1つのアミノ酸がRに置換されている、請求項1~3のいずれか一項に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
- 前記VHが、配列番号109~112からなる群より選択されるアミノ酸配列を含むか、または
前記VHが、配列番号39、52、及び65のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3配列を含み、配列番号52の7D位における1つのアミノ酸がGに置換されており、
前記VLが、配列番号118のアミノ酸配列を含むか、または
前記VLが、配列番号78、91、及び104のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含み、配列番号78の1K位における1つのアミノ酸がRに置換されている、請求項1~4のいずれか一項に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。 - (1)前記VHが、配列番号109のアミノ酸配列を含み、前記VLが、配列番号118のアミノ酸配列を含むか、
(2)前記VHが、配列番号110のアミノ酸配列を含み、前記VLが、配列番号118のアミノ酸配列を含むか、
(3)前記VHが、配列番号111のアミノ酸配列を含み、前記VLが、配列番号118のアミノ酸配列を含むか、
(4)前記VHが、配列番号112のアミノ酸配列を含み、前記VLが、配列番号118のアミノ酸配列を含むか、
(5)前記VHが、配列番号109のアミノ酸配列を含み、前記VLが、配列番号78、91、及び104のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含み、配列番号78の1K位における1つのアミノ酸がRに置換されているか、
(6)前記VHが、配列番号110のアミノ酸配列を含み、前記VLが、配列番号78、91、及び104のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含み、配列番号78の1K位における1つのアミノ酸がRに置換されているか、
(7)前記VHが、配列番号111のアミノ酸配列を含み、前記VLが、配列番号78、91、及び104のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含み、配列番号78の1K位における1つのアミノ酸がRに置換されているか、
(8)前記VHが、配列番号112のアミノ酸配列を含み、前記VLが、配列番号78、91、及び104のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含み、配列番号78の1K位における1つのアミノ酸がRに置換されているか、
(9)前記VHが、配列番号39、52、及び65のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3配列を含み、配列番号52の7D位における1つのアミノ酸がGに置換されており、前記VLが、配列番号118のアミノ酸配列を含むか、または
(10)前記VHが、配列番号39、52、及び65のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3配列を含み、配列番号52の7D位における1つのアミノ酸がGに置換されており、前記VLが、配列番号78、91、及び104のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含み、配列番号78の1K位における1つのアミノ酸がRに置換されている、請求項5に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。 - さらに、第2の抗体部分を含み、前記第2の抗体部分が、第2の抗原に特異的に結合することが可能である、請求項1~6のいずれか1項に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
- 前記第2の抗体部分が、CTLA-4、PD-L1、TIM-3、またはLAG-3に特異的に結合することが可能であり、好ましくは、前記第2の抗体部分が、sdAbである、請求項7に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
- TIGITを特異的に認識することが可能な全長IgGの重鎖または軽鎖のアミノ末端またはカルボキシル末端が、CTLA-4、PD-L1、TIM-3、またはLAG-3に特異的に結合することが可能なsdAbのカルボキシル末端またはアミノ末端に、任意にペプチドリンカーを介して融合している、請求項8に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
- 請求項1~9のいずれか一項に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメントをコードする単離された核酸分子。
- 請求項10に記載の単離された核酸分子を含むベクター。
- 請求項1~9のいずれか1項に記載の単離抗体もしくはその抗原結合フラグメント、及び薬学的に許容される担体を含む医薬組成物。
- 病原性感染またはがん、特に固形腫瘍または結腸癌の処置に使用される、請求項1~9のいずれか1項に記載の単離抗体もしくはその抗原結合フラグメント、または請求項12に記載の医薬組成物。
- 追加のがん治療法と組み合わせた、好ましくは追加のがん治療法が外科手術、放射線、化学療法、免疫療法、ホルモン療法、またはそれらの組み合わせである、請求項13に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメントまたは使用のための医薬組成物。
- 前記単離抗体または抗原結合フラグメントまたは医薬組成物が、全身または局所投与用であり、前記単離抗体またはその抗原結合フラグメントまたは医薬組成物が、静脈内投与用または腫瘍内投与用である、請求項13または14に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメントまたは使用のための医薬組成物。
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