JP7270884B2 - バチルス科好熱細菌由来変異型グリシンオキシダーゼおよびその製造方法 - Google Patents
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Description
本開示に係る変異型グリシンオキシダーゼの由来となるバチルス科好熱細菌は、特に限定されず、分類学上、バチルス科(Bacillaceae)に分類され、かつ、好熱性を有する細菌であればよい。ここでいう好熱性とは、当該細菌の至適生育温度が45℃以上であるか、または、当該細菌の生育限界温度が55℃以上であるか、もしくはその両方を満たしていることを意味するものとする。
本開示に係る変異型グリシンオキシダーゼは、前記の通り、バチルス科好熱細菌由来の野生型グリシンオキシダーゼに変異を導入することにより得られるものであり、後述する実施例にも示すように、次の(1)~(7)に示す特徴的な酵素特性を有するものであればよい。
(1)分子量が、SDS-ポリアクリルアミドゲル電気泳動法(SDS-PAGE)において、40,000±2,000ダルトンである。
(2)至適温度が、ピロリン酸塩存在下、pH8.5の条件で45℃である。
(3)至適pHが、ピロリン酸塩存在下、37℃の条件でpH8.0である。
(4)熱安定性が、ピロリン酸塩存在下、pH8.5、1時間保持の条件で70℃まで安定である。
(5)pH安定性が、ピロリン酸塩存在下、4℃、24時間保持の条件でpH5.5~10.0の範囲内で安定である。
(6)比活性が1.2ユニット/mg以上である。
(7)速度論定数(ミカエリス定数)Kmが0.2mM以下である。
本開示には、前記構成の変異型グリシンオキシダーゼをコードするDNAも含まれる。配列表の配列番号2は、ゲオバチルス・カウストフィルスHTA426株由来のグリシンオキシダーゼをコードした塩基配列を示すが、本開示に係るDNAの代表的な一例としては、例えば、この配列番号2に示す塩基配列において変異を導入した塩基配列を有するDNAを挙げることができる。
このような組換えDNAは、公知の宿主となる細胞に導入することができる。したがって、本開示には、前記構成の変異型グリシンオキシダーゼをコードするDNAと自律複製可能なベクターとを含む、複製可能な組換えDNAを宿主細胞に導入して得られる形質転換体も含まれる。宿主細胞としては、一般的には、大腸菌、枯草菌、放線菌、酵母等の微生物を挙げることができるが、これに限定されず、植物細胞であってもよいし動物細胞であってもよい。
本実施例で野生型グリシンオキシダーゼの由来としたバチルス科細菌としては、ゲオバチルス・カウストフィルス(Geobacillus kaustophilus )HTA426株を用いた(説明の便宜上、ゲオバチルス・カウストフィルスHTA426株を、以下「HTA426」と略す)。なお、HTA426は、例えば、国立研究開発法人理化学研究所バイオリソースセンター(RIKEN BRC)微生物材料開発室(JCM)より入手可能である(JCM12893)。
HTA426からのグリシンオキシダーゼのクローニングは、非特許文献1に記載の方法にしたがって行った。ただし、ベクターとしては、pET-15bのプラスミドベクターを用いるとともに、宿主細胞(ホスト)としては、大腸菌(E. coli)BL21(DE3)を用いた。
グリシンオキシダーゼの酵素活性の測定についても、非特許文献1に記載の方法にしたがって行った。
グリシンオキシダーゼの諸性質の評価は、それぞれ次に説明する条件および/または方法にしたがって行なった。
HTA426由来の野生型グリシンオキシダーゼについて、その比活性、熱安定性、速度論定数Kmを前記の通り評価した。その結果を表1に示すとともに、比活性については図3Aに、熱安定性については図3Bにも示す。
市販のグリシンオキシダーゼである、BioVision, Inc製の商品番号H244Kについて、その比活性、熱安定性、速度論定数Kmを前記の通り評価した。その結果を表1に示すとともに、比活性については図3Aに、熱安定性については図3Bにも示す。
(実施例1)
前記実施の形態で説明した通り、比較例1のWT-GOXにおいては、配列番号1で示されるアミノ酸配列における248番目(248位)~255番目(255位)の部分アミノ酸配列が、バチルス科好熱細菌に特有の特徴的領域であることが明らかとなった。そこで、このWT-GOXの特徴的領域に対して非特許文献2に記載の方法に基づいて変異を導入し、ランダムに変異が導入されたグリシンオキシダーゼ遺伝子を含むプラスミドベクターを得た。なお、説明の便宜上、本実施例では、変異型グリシンオキシダーゼを「V-GOX」と略記する。
これらV-GOX1~V-GOX8の中でも、251番目(251位)のアミノ酸がグリシン(Gly, G)からグルタミン(Gln, Q)に置換されたアミノ酸配列を有するV-GOX1が最も高い酵素活性を示していた。そこで、このV-GOX1について、精製を行った後にその分子量(SDS-PAGE)、至適温度、至適pH、熱安定性、pH安定性、比活性、速度論定数Kmを評価した。比活性、熱安定性および速度論定数Kmの結果を前記表1に示とともに、比活性については図3Aに、熱安定性については図3Bにも示し、さらに、これらを含むV-GOX1の酵素性質の評価結果をその条件とともに表3に示す。
(実施例および比較例の対比)
表1および図3A,図3Bから明らかなように、比較例1の酵素すなわちHTA426由来のWT-GOXは、比較例2の酵素すなわち好熱細菌ではないバチルス・スブチリス由来の市販の変異型グリシンオキシダーゼであるH244Kに比べて、その熱安定性が15℃高くなっており、優れた熱安定性を示すものの、その比活性は大きく劣っている。また、速度論定数Kmについては、比較例1のWT-GOXの方が比較例2のH244Kよりも高くなっている。
Claims (11)
- ゲオバチルス属の好熱細菌に由来する野生型グリシンオキシダーゼにおけるアミノ酸配列であって、当該アミノ酸配列に含まれる、アスパラギン(N)、グリシン(G)、システイン(C)、およびチロシン(Y)の順で結合する部分アミノ酸配列におけるグリシンを他のアミノ酸に置換した変異型酵素であり、
分子量が、SDS-ポリアクリルアミドゲル電気泳動法において、40,000±2,000ダルトンであり、
至適温度が、ピロリン酸塩存在下、pH8.5の条件で45℃であり、
至適pHが、ピロリン酸塩存在下、37℃の条件でpH8.0であり、
熱安定性が、ピロリン酸塩存在下、pH8.5、1時間保持の条件で70℃まで安定であり、
pH安定性が、ピロリン酸塩存在下、4℃、24時間保持の条件でpH5.5~10.0の範囲内で安定であり、
比活性が1.2ユニット/mg以上であり、
グリシンを基質としたときの速度論定数(ミカエリス定数)Kmが0.2mM以下であることを特徴とする、
変異型グリシンオキシダーゼ。 - ゲオバチルス・カウストフィルス由来の野生型グリシンオキシダーゼと比較して、酵素反応速度の比率で2.5倍以上の酵素活性を有することを特徴とする、
請求項1に記載の変異型グリシンオキシダーゼ。 - 配列番号1で示されるアミノ酸配列と95%以上の配列同一性を示す、バチルス科好熱細菌に由来するグリシンオキシダーゼの変異型酵素であって、
配列番号1で示されるアミノ酸配列における251番目のアミノ酸が、グリシンから他のアミノ酸に置換されたアミノ酸配列を有し、
ゲオバチルス・カウストフィルス由来の野生型グリシンオキシダーゼと比較して、酵素反応速度の比率で2.5倍以上の酵素活性を有することを特徴とする、
変異型グリシンオキシダーゼ。 - 配列番号1で示されるアミノ酸配列における251番目のアミノ酸が、グリシンから塩基性アミノ酸または疎水性アミノ酸に置換されたアミノ酸配列を有することを特徴とする、
請求項3に記載の変異型グリシンオキシダーゼ。 - 前記塩基性アミノ酸が、グルタミン、アルギニン、またはヒスチジンであり、前記疎水性アミノ酸が、イソロイシンまたはスレオニンであることを特徴とする、
請求項4に記載の変異型グリシンオキシダーゼ。 - 前記他のアミノ酸が、アラニン、グルタミン酸、ヒスチジン、イソロイシン、アスパラギン、グルタミン、アルギニン、またはスレオニンであることを特徴とする、
請求項3に記載の変異型グリシンオキシダーゼ。 - 前記バチルス科好熱細菌が、バチルス(Bacillus)属、アリシクロバチルス(Alicyclobacillus)属、ブレビバチルス(Brevibacillus)属、ゲオバチルス(Geobacillus)属、スルホバチルス(Sulfobacillus)属、パエニバチルス(Paenibacillus)属、または、サリニコッカス(Salinicoccus)属に属する細菌であることを特徴とする、
請求項3から6のいずれか1項に記載の変異型グリシンオキシダーゼ。 - 請求項1から7のいずれか1項に記載の変異型グリシンオキシダーゼをコードするDNA。
- 請求項8に記載のDNAと自律複製可能なベクターとを含む、複製可能な組換えDNA。
- 請求項8に記載のDNA、または、請求項9に記載の組換えDNAを宿主細胞に導入して得られる細胞。
- 請求項10に記載の細胞を培養し、得られる培養物から前記変異型グリシンオキシダーゼを採取することを特徴とする、
変異型グリシンオキシダーゼの製造方法。
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