JP7039470B2 - がんの治療において治療薬として使用するための、モノカルボン酸トランスポーター4(mct4)アンチセンスオリゴヌクレオチド(aso)阻害剤 - Google Patents

がんの治療において治療薬として使用するための、モノカルボン酸トランスポーター4(mct4)アンチセンスオリゴヌクレオチド(aso)阻害剤 Download PDF

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Description

本発明は、モノカルボン酸トランスポーター4(MCT4)の発現を調節する化合物、組成物および方法を提供する。詳細には、本発明は、ヒトMCT4 mRNA発現を調節することができるアンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)、ならびにそれらの使用、および各種がんを含む各種徴候の治療方法に関する。詳細には、本発明は、去勢抵抗性前立腺がん(CRPC)を含む前立腺がんなどのがんの療法および治療方法に関する。
関連出願の相互参照
本出願は、2015年11月30日出願、表題「ANTISENSE OLIGONUCLEOTIDES AS MONOCARBOXYLATE TRANSPORTER 4 THERAPEUTIC COMPOSITIONS AND METHODS FOR THEIR USE IN THE TREATMENT OF CANCER」の米国仮特許出願第62/260,837号の利益を主張するものである。
前立腺がんは最も一般的な非皮膚がんであり、西洋諸国における男性のがん関連死の原因第2位である(シーゲル R(Siegel R)、ら、2012年、62巻(1号)、p.10~29)。前立腺がんは、初期にはアンドロゲン依存性であり、アンドロゲン除去療法(ADT)により顕著な腫瘍退縮が誘導されうるが、ADTに対する抵抗性が必然的に生じ、去勢抵抗性前立腺がん(CRPC)につながる。CRPCを治療するための現行の標準的ケアは、ドセタキセルベースの全身化学療法であり、ミトキサントロンベースの療法と比較して患者の全生存率を約2ヶ月増加させる(ペトリラック DP(Petrylak DP)、ら、ニュー イングランド ジャーナル オブ メディスン(N Engl J Med.)、2004年、351巻(15号)p.1513~1520;タノック IF(Tannock IF)、ら、ニュー イングランド ジャーナル オブ メディスン(N Engl J Med.)、2004年、351巻(15号)p.1502~1512)。近年、シプロイセルT、カバジタキセル、アビラテロン、MDV3100およびラジウム223が、より長期の全生存率ベネフィットを示しており、CRPCの治療用にFDAの承認を受けている(ビシャー M(Bishr M)およびサード F(Saad F)、ネイチャー レビューズ ウロロジー(Nat Rev Urol.)、2013年、10巻(9号)p.522~528)。転移性去勢抵抗性前立腺がん(mCRPC)治療の有効性は、エンザルタミド(Ningら、2013)およびアビラテロン(デボーノ(de Bono)ら、2011年)などの、アンドロゲン受容体(AR)シグナル伝達軸を標的とするより強力な化学治療薬を使用することにより近年改善されてきてはいるものの、患者の全生存率はわずかに増加したのみである(バドレイシン(Badrising)ら、2014年;ロリオ(Loriot)ら、2013年;タノック(Tannock)ら、2004年)。さらに、このような薬物のさらなる改善型により、前立腺腺癌が、現時点では不治の疾患のサブタイプである神経内分泌前立腺がん(NEPC)に分化転換するのが促進される可能性があると考えられる(ベルトラン(Beltran)ら、2011年;ナダル(Nadal)ら、2014年;ユアン(Yuan)ら、2007年)。しかし、これらの薬物にはいずれも治癒力がなく、全生存率を徐々にしか改善しない。より有効な治療標的および薬物、特に転移性CRPCおよびmCRPCの分子ドライバーを標的とするものを確立することが、疾患管理および患者生存の改善にきわめて重要である(リン D(LinD)、ら、カレント オピニオン イン ウロロジー(Curr Opin Urol.)、2013年、23巻(3号)p.214~219)。
がんの再プログラムされたエネルギー代謝を標的とすることで、有効な治療介入のための独自の手法が与えられる、という証拠が増加している(ザング(Zhang)およびヤン(Yang)、2013年)。グルコース利用において、がん細胞は概して、正常な休止細胞とは異なり、乳酸産生につながる解糖を優先する、すなわちこれは好気的解糖またはワールブルグ効果(ワールブルグ(Warburg)、1956年)と呼ばれるプロセスである。これが、原発および転移性がんのほぼ普遍的な特性であるグルコース消費の上昇につながる。さらに、これもまた乳酸産生の上昇につながるグルタミンの異常利用が、がんに高度に共通することが観察されている(クーチェクポール(Koochekpourら)、2012年)。これらの代謝エネルギー経路により、がん細胞による微小環境への乳酸分泌が増加し、組織浸潤/転移、血管新生および低酸素への応答を含む、乳酸で刺激される複数の発癌プロセスが促進される(チョイ(Choi)ら、2013年;チョイ(Choi)ら、2014年;ドハティー(Doherty)およびクリーブランド(Cleveland)、2013年;ウッラ(Ullah)ら、2006年)。さらに、乳酸により誘導されるがん細胞微小環境の酸性化(pH6.0~6.5まで)により、局所的な宿主抗がん免疫が抑制されうる(チョイ(Choi)ら、2013年;パークス(Parks)ら、2013)。がんによりグルコース代謝が増強される現象は、18F-フルオロデオキシグルコースポジトロン断層撮影(FDG-PET)で臨床的に、最も一般的に活用されている。この画像化技術は概して、前立腺がんには使用されない(ジャバー(Jadvar)、2009年)が、ARシグナル伝達および治療抵抗性への進行により前立腺がん細胞のグルコース代謝が増大することを示唆する証拠が存在する(テナクーン(Tennakoon)ら、2014年;ヴァズ(Vaz)ら、2012年)。したがって、好気的解糖経路を標的とすることは、進行性前立腺がんを治療するのに有効となりうる。
モノカルボン酸トランスポーター(MCT)ファミリーは、乳酸および代謝に関するその他のモノカルボン酸の輸送に関与する細胞膜トランスポータータンパク質からなる。具体的には、細胞での乳酸/H+の排出は、MCT4(SLC16A3)により主に媒介されると考えられている(ダイマー(Dimmer)ら、2000年)。MCT4の発現は、高度に解糖を行う細胞に関連しており(ヘイルストラップ(Halestrap)、2013年;マンニングフォックス(Manning Fox)ら、2000年;ウッラ(Ullah)ら、2006年)、また、腫瘍におけるMCT4の発現上昇は、前立腺がんを含む(ハオ(Hao)ら、2010;ペルトガ-ゴメス(Pertega-Gomes)ら、2011年)複数のがん型における患者の予後不良に関連するため臨床的に意義がある(フィセル(Fisel)ら、2013年;リサンチ(Lisanti)ら、2013年;オオノ(Ohno)ら、2014年)。さらに、MCT4発現の上昇は、前立腺がんの進行を促進するがん-間質相互作用において重要である可能性がある(サニータ(Sanita)ら、2014年)。この情報は、がんにより生成される乳酸のがん増殖を促進する能力と併せて、MCTの発現または機能を阻害することで、多様な新生物に対する有望な治療戦略がもたらされることを示唆している(マーシン(Marchiq)ら、2015年)。しかし、MCT4により媒介される乳酸排出を特異的に標的とする治療戦略は未だ存在しない。
去勢抵抗性前立腺がん(CRPC)治療における治療選択肢は、患者生存を改善する新しい薬剤を近年FDAが承認していることによりかなり変化してきている。具体的には、第2世代アンドロゲン受容体アンタゴニストであるエンザルタミド(ENZ)が、ドセタキセル後、およびより最近ではドセタキセル前環境で転移性CRPCを治療するのに承認されている。しかし、臨床的実施から2年以内に、ENZ抵抗性が生じたことが患者の大部分で明らかとなり(クレーセンス(Claessens)ら、2014年)、現在まで既知の療法はENZ抵抗性CRPCに対し有効であることが示されていなかった。したがって、ENZ抵抗性CRPCを有効に抑制しうる新規の治療剤が有用であろう。
本発明は一部において、MCT4アンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)(配列番号1~23および配列番号46~50)によるMCT4発現の阻害が、がんの治療に有用でありうるという発見に基づいている。特定のASOによるMCT4発現の阻害が、がん細胞の増殖低下につながる。さらに、その増殖低下が去勢抵抗性前立腺がん(CRPC)に及ぶ。
第1の態様において、がん細胞の治療のための組成物、および配列番号1~23または配列番号46~50から選択される1つまたは複数のオリゴヌクレオチドを細胞に投与するステップを含む方法が提供される。
さらなる態様において、(a)配列番号1~23および配列番号46~50のうち1つまたは複数のオリゴヌクレオチドから選択されうるアンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO);ならびに(b)薬学的に許容される担体を含む医薬組成物が提供される。
さらなる態様によれば、(a)本明細書に記載されるアンチセンスオリゴヌクレオチド配列および薬学的に許容される担体、ならびに(b)MCT4活性を調節するための、その使用説明書を含む商用パッケージが提供される。
さらなる態様において、(a)配列番号1~23または配列番号46~50のオリゴヌクレオチドから選択されうるASO、および(b)がんの治療のための説明書を含む商用パッケージが提供される。
さらなる態様において、配列番号1~23および配列番号46~49のうち1つまたは複数から選択される配列を有しうるアンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)を投与するステップを含む、がんを治療する方法が提供される。
さらなる態様において、配列番号1~23および配列番号46~49のうち1つまたは複数から選択される配列を有するMCT4アンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)を投与するステップを含む、がんを治療する方法が提供される。
さらなる態様において、オリゴヌクレオチドが以下の、(a)TCCCATGGCCAGGAGGGTTG(配列番号1);(b)GTCCCGGAAGACGCTCAGGT(配列番号2);(c)AAGGACGCAGCCACCATGCC(配列番号3);(d)TTGGCGTAGCTCACCACGAA(配列番号4);(e)AGATGCAGAAGACCACGAGG(配列番号5);(f)CCACTCTGGAATGACACGGT(配列番号6);(g)GTAGGAGAAGCCAGTGATGAC(配列番号7);(h)AGCATGGCCAGCAGGATGGA(配列番号8);(i)GGCTGGAAGTTGAGTGCCAA(配列番号9);(j)CATGCCGTAGGAGATGCCAA(配列番号10);(k)CTCAGGCTGTGGCTCTTTGG(配列番号11);(l)TAGCGGTTCAGCATGATGA(配列番号12);(m)AGCACGGCCCAGCCCCAGCC(配列番号13);(n)GAGCTCCTTGAAGAAGACACT(配列番号14);(o)CAGGATGGAGGAGATCCAGG(配列番号15);(p)AGACCCCCCACAAGCATGAC(配列番号16);(q)GAAGTTGAGTGCCAAACCCAA(配列番号17);(r)CCCGTTGGCCATGGGGCGCC(配列番号18);(s)GCCAGCCCGTTGGCCATGGG(配列番号19);(t)AGGAAGACAGGGCTACCTGC(配列番号20);(u)GCACACAGGAAGACAGGGCT(配列番号21);(v)CAGGGCACACAGGAAGACAG(配列番号22);(w)CAGCAGTTGAGCAGCAGGCC(配列番号23);(x)ATGGCCAGGAGGGTTG(配列番号46);(y)CATGGCCAGGAGGGTT(配列番号47);(z)CCATGGCCAGGAGGGT(配列番号48);および(aa)CCCATGGCCAGGAGGG(配列番号49)から選択される配列を有しうる、アンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)が提供される。
さらなる態様において、(a)配列番号1~23および配列番号46~49のうち1つまたは複数から選択される配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)、ならびに(b)薬学的に許容される担体を含む医薬組成物が提供される。
さらなる態様において、がんを治療するための、配列番号1~23および配列番号46~49のうち1つまたは複数から選択される配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)の使用が提供される。
さらなる態様において、がんを治療するための医薬の製造における、配列番号1~23および配列番号46~49のうち1つまたは複数から選択される配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)の使用が提供される。
さらなる態様において、(a)配列番号1~23および配列番号46~49のうち1つまたは複数から選択される配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)、ならびに(b)ドセタキセルを含む組合せ療法が提供される。組合せ療法は、薬学的に許容される担体または賦形剤をさらに含んでいてよい。
さらなる態様において、配列番号1~23および配列番号46~49のうち1つまたは複数から選択される配列を有するASO、ならびにがんの治療のための説明書を含む商用パッケージが提供される。
アンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)は、配列番号1~23または配列番号46~49の配列を有しうる。アンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)は配列番号1の配列を有しうる。アンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)は配列番号2の配列を有しうる。アンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)は配列番号3の配列を有しうる。アンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)は配列番号4の配列を有しうる。アンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)は配列番号5の配列を有しうる。アンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)は配列番号6の配列を有しうる。アンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)は配列番号7の配列を有しうる。アンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)は配列番号8の配列を有しうる。アンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)は配列番号9の配列を有しうる。アンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)は配列番号10の配列を有しうる。アンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)は配列番号11の配列を有しうる。アンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)は配列番号12の配列を有しうる。アンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)は配列番号13の配列を有しうる。アンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)は配列番号14の配列を有しうる。アンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)は配列番号15の配列を有しうる。アンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)は配列番号16の配列を有しうる。アンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)は配列番号17の配列を有しうる。アンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)は配列番号18の配列を有しうる。アンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)は配列番号19の配列を有しうる。アンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)は配列番号20の配列を有しうる。アンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)は配列番号21の配列を有しうる。アンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)は配列番号22の配列を有しうる。アンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)は配列番号23の配列を有しうる。アンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)は配列番号46の配列を有しうる。アンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)は配列番号47の配列を有しうる。アンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)は配列番号48の配列を有しうる。アンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)は配列番号49の配列を有しうる。
ASOは、改変ヌクレオシド間結合をさらに含みうる。改変ヌクレオシド間結合は、ペプチド-核酸結合、モルホリノ結合、N3’~P5’ホスホロアミデート結合、メチルホスホネート結合またはホスホロチオエート結合であってよい。改変ヌクレオシド間結合は、ペプチド-核酸結合であってよい。改変ヌクレオシド間結合は、モルホリノ結合であってよい。改変ヌクレオシド間結合は、N3’~P5’ホスホロアミデート結合であってよい。改変ヌクレオシド間結合は、メチルホスホネート結合であってよい。改変ヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエート結合であってよい。ASOは、改変糖部分をさらに含みうる。改変糖部分が2’-O-アルキルオリゴリボヌクレオチドであってよい。ASOは、2’MOEギャップマー改変を有しうる。ASOは、改変核酸塩基をさらに含みうる。改変核酸塩基は、5-メチルピリミジンまたは5-プロピニルピリミジンであってよい。細胞は、ヒト細胞であってよい。がんは、MCT4の発現上昇を特徴とするものであってよい。がんは、前立腺がん、腎細胞癌、乳がん、子宮頸がん、肝がん、膀胱がん、および小細胞肺がんのうち1つまたは複数から選択されうる。がんは、前立腺がん、腎細胞癌、乳がん、子宮頸がん、肝がん、および膀胱がんのうち1つまたは複数から選択されうる。がんは、前立腺がん、腎細胞癌、乳がん、子宮頸がん、および肝がんのうち1つまたは複数から選択されうる。がんは、前立腺がん、腎細胞癌、乳がん、および子宮頸がんのうち1つまたは複数から選択されうる。がんは、前立腺がん、腎細胞癌、および乳がんのうち1つまたは複数から選択されうる。がんは、前立腺がん、および腎細胞癌のうち1つまたは複数から選択されうる。がんは、前立腺がん、および小細胞肺がんのうち1つまたは複数から選択されうる。がんは、前立腺がん、腎細胞癌、乳がん、子宮頸がん、肝がん、および小細胞肺がんのうち1つまたは複数から選択されうる。がんは、前立腺がん、腎細胞癌、乳がん、子宮頸がん、膀胱がん、および小細胞肺がんのうち1つまたは複数から選択されうる。がんは、前立腺がん、腎細胞癌、乳がん、肝がん、膀胱がん、および小細胞肺がんのうち1つまたは複数から選択されうる。がんは、前立腺がん、腎細胞癌、子宮頸がん、肝がん、膀胱がん、および小細胞肺がんのうち1つまたは複数から選択されうる。がんは、前立腺がんであってよい。前立腺がんは、去勢抵抗性前立腺がん(CRPC)であってよい。がんは、前立腺がん、腎細胞癌、乳がん、肝がん、および膀胱がんのうち1つまたは複数から選択されうる。前立腺がんは、エンザルタミド(ENZ)抵抗性CRPCであってよい。がんは、転移性前立腺がんであってよい。ASOは、MCT4のmRNAに対し実質的に相補的であってよい。ASOは、静脈内投与されうる。ASOは、組織に対し局所的に投与されうる。ASOは、投与前に脂質粒子と混合されうる。ASOは、投与前にリポソームに被包されうる。
ASOは、改変ヌクレオシド間結合をさらに含みうる。改変ヌクレオシド間結合は、ペプチド-核酸結合、モルホリノ結合、N3’~P5’ホスホロアミデート結合、メチルホスホネート結合またはホスホロチオエート結合であってよい。ASOは、改変糖部分をさらに含みうる。改変糖部分は、2’-O-アルキルオリゴリボヌクレオチドであってよい。ASOは、2’MOEギャップマー改変を有しうる。ASOは、改変核酸塩基をさらに含みうる。改変核酸塩基は、5-メチルピリミジンまたは5-プロピニルピリミジンであってよい。
細胞は、ヒト細胞であってよい。がんは、MCT4の発現上昇を特徴とするものであってよい。がんは、前立腺がん、腎細胞癌、乳がん、子宮頸がん、肝がん、膀胱がん、および小細胞肺がんのうち1つまたは複数から選択されうる。前立腺がんは、去勢抵抗性前立腺がん(CRPC)であってよい。前立腺がんは、エンザルタミド(ENZ)抵抗性CRPCまたは転移性CRPC(mCRPC)であってよい。
ASOは、MCT4のmRNAに対し実質的に相補的であってよい。ASOは、静脈内投与されうる。ASOは、組織に対し局所的に投与されうる。ASOは、投与前に脂質粒子と混合されうる。ASOは、投与前にリポソームに被包されうる。アンチセンスオリゴヌクレオチドは、外科手術、放射線(小線源療法または外照射)、またはその他の療法(例えば、HIFU)とともに、ネオアジュバント療法(術前)、補助的療法(術中)、および/またはアジュバント療法(術後)として使用可能である。例えば、本明細書に記載されるMCT4アンチセンスオリゴヌクレオチドを、ドセタキセル、MDV3100、またはグルコース代謝調節薬(ドキシサイクリンまたはその他のミトコンドリア阻害剤を含む)と組み合わせて使用することができる。
図1は、バンクーバー前立腺センター組織バンク(Vancouver Prostate Centre Tissue Bank)で入手可能な患者由来前立腺がん試料に由来し、MCT4発現について染色した組織マイクロアレイ(TMA)におけるMCT4発現について示すグラフである。図1Aは、MCT4発現の上昇がグリーソングレードの高さと関連することを確証する棒グラフを示す。 図1Bは、MCT4発現の上昇がグリーソングレードの高さと関連することを確証する棒グラフを示す。 図1Cは、血清PSAの増加により測定されたように、MCT4が高発現することが、再発までの時間がより早いことと関連する、プロットを示す。 図1Dは、長期のネオアジュバントホルモン療法(NHT)を受けている患者およびCRPC患者もMCT4発現の上昇を示すことを表す棒グラフを示す。 図1Eは、長期のネオアジュバントホルモン療法(NHT)を受けている患者およびCRPC患者もMCT4発現の上昇を示すことを表す棒グラフを示す。 図2は、MCT4発現および細胞増殖を阻害するための、インビトロでの、PC-3細胞を使用した、MCT4を標的とするASOの有効性スクリーニングについて示すグラフである。MCT4 ASO#1(配列番号1)および#14(配列番号5)が用量依存的にインビトロでの効果を発揮し、効果はトランスフェクションの96時間後も持続する。図2Aは、PC-3細胞におけるMCT4のsiRNAでのサイレンシングにより、有意な細胞増殖阻害が示されたことを示し、MCT4発現の阻害が潜在的な治療有効性を有しうることを示す。 図2Bは、MCT4を標的とする10種のASOのスクリーニングにより、細胞増殖に対する阻害効果が様々であることが明らかとなり、配列#1(配列番号1)および#14(配列番号5)が最も大きな阻害を示したことを示す。 図2Cは、qPCRおよびウェスタンブロットで測定したところ、MCT4 ASOが各種レベルのMCT4ノックダウンを誘導し、ASO#1および#14が最も有効であったことを示す。 図2Dは、MCT4 mRNA発現と生じた細胞数の間に強い相関関係(p0.001未満)が見られたことを示し、細胞増殖に対する阻害効果がMCT4発現の減少と強く関連していることを示す(点線は95%信頼区間を表す)。 図2Eは、5nM~200nMのMCT4 ASOのトランスフェクションにより、細胞増殖およびMCT4発現の阻害が同様に用量依存性である(ASO#14でIC50=32nM、ASO#1でIC50=50nM)ことが示される。 図2Fは、MCT4 ASOトランスフェクション後の細胞増殖およびMCT4発現の阻害が、トランスフェクションの少なくとも96時間後まで持続することが時間経過実験により実証されることを示す。 図3は、MCT4 ASO#1(配列番号1)および#14(配列番号5)が、PC-3以外のヒト前立腺がん細胞に対してはインビトロで有効であるが、マウス前立腺がん細胞に対しては有効でないことを示すグラフである。図3Aは、候補MCT4 ASOが、PC-3細胞で観察されたものと同等のIC50値で、用量依存的にC4-2ヒト前立腺がん細胞の増殖およびMCT4発現も阻害できることを示す。 図3Bは、候補MCT4 ASOが、その他の細胞株で得られたものと同様のIC50値で、用量依存的にDU145ヒト前立腺がん細胞の増殖も阻害し、細胞増殖の阻害にはMCT4発現の減少が伴うことを示す。 図3Cは、候補MCT4 ASOがTRAMPC2マウス前立腺がん細胞には評価可能(appreciable)な効果を有さず、試験を行った最大濃度である200nMでも細胞増殖にもマウスMCT4発現レベルにも影響を及ぼさないことを示し、試験を行ったASOがヒトMCT4に特異的であり、細胞増殖の阻害がMCT4ノックダウンに関連する現象であることを示す。 図4は、候補MCT4 ASOのトランスフェクションにより、PC-3細胞のグルコース代謝が阻害されることを示す図である。図4Aは、トランスフェクションの48時間後に、MCT4 ASOにより乳酸分泌が顕著に阻害され、それに対応する細胞内乳酸の蓄積およびグルコース消費の阻害も観察される(u.d.=検出不能)ことを示す。 図4Bは、解糖経路、ならびに解糖および乳酸変換に関与する各種遺伝子の遺伝子発現レベルをqPCR分析することで特徴付けられた、MCT4ノックダウンにより引き起こされる代謝の変化についての概略図を示し、解糖における各種遺伝子の有意な発現減少により、グルコース代謝全体の減少が示唆され、LDHAおよびPDK1の発現減少により、酸化的リン酸化のため、乳酸産生からTCAサイクルにピルビン酸が再指向化(redirection)されることが示唆される。 図5は、合計15日間で、5日間毎日、10mg/kgのMCT4 ASO#1(配列番号1)、#14(配列番号5)、対照ASO、または溶媒(PBS)の腹腔内注射により治療を行い、その後2日間治療を休んだ、皮下PC-3腫瘍を有する無胸腺ヌードマウスに基づいて、インビボでの、PC-3腫瘍細胞における、MCT4 ASOにより誘導されるMCT4発現の減少が、アポトーシスの増加および細胞増殖の阻害を特徴とするPC-3腫瘍増殖の阻害と関連していたことを示すグラフである。図5Aは、腫瘍増殖率に関してMCT4 ASOを比較した、治療日数ごとのパーセント腫瘍体積を表すプロットを示す。 図5Bは、MCT4 ASOによる治療後の、細胞アポトーシスの増加および細胞増殖の減少に起因する、パーセントカスパーゼ3陽性細胞およびパーセントKi-67陽性細胞を表す棒グラフを示す。 図5Cは、IHC染色で測定すると、MCT4 ASOでの治療により、腫瘍におけるMCT4発現が減少したことを示す。 図6は、MCT4を標的とするASOが、免疫細胞凝集を増大させ、インビボでの腫瘍関連免疫細胞の割合(すなわちNK細胞およびCD3陽性細胞)を変化させることを示すグラフである。図6Aは、MCT4 ASOによる治療の免疫調節効果が、このような免疫細胞凝集の程度の有意な増加を介して部分的に発揮される、棒グラフを示す。 図6Bは、MCT4 ASOでの治療により、腫瘍に関連するNK細胞の割合が増加した、棒グラフを示す。 図6Cは、対照と比較した、MCT4 ASO存在下での、活性化NK細胞のマーカーとしてのCD3陽性細胞(ヌードマウスはT細胞を持たないため)の割合を表す棒グラフを示す。 図7は、MCT4を標的とする候補ASOが、トランスフェクションの48時間後にLNCaPヒト前立腺がん細胞の細胞増殖およびMCT4発現を阻害できることを示すグラフである。図7Aは、MCT4 ASOが、その他のヒト前立腺がん細胞株で観察されたものと同等のレベルまでLNCaP細胞増殖を阻害できることを示す。 図7Bは、細胞増殖の減少がMCT4発現の減少と関連していることを示し、MCT4 ASOの阻害効果がアンドロゲン受容体状態よりもむしろ解糖の表現型に関連する可能性があることを示唆している。 図8は、候補MCT4 ASOがインビトロでPC-3細胞の遊走および組織浸潤を阻害できることを示すグラフである。図8Aは、観察された遊走細胞数の減少が示すように、候補MCT4 ASOでのPC3細胞処理により、トランスウェル(transwell)を通る細胞遊走の阻害がもたらされたことを示す。 図8Bは、MCT4 ASOでの処理により、PC-3細胞のマトリゲルに浸潤する能力も阻害されたことを示し、MCT4に媒介される乳酸分泌が、がん転移において重要な役割を果たしうることを示唆している。 図9は、MCT4 ASOによるヌードマウスの治療では、動物体重により測定したところ、宿主毒性が引き起こされなかったことを示すグラフである。図9Aは、インビボでの研究期間を通しての動物体重のプロットを示し、MCT4 ASOでの治療は各群の平均動物体重に有意な影響を及ぼさなかった。 図9Bは、個々の動物体重も、治療期間を通して安定なままであったことを示す。 図10は、配列番号5のASO、メトホルミン、ドキシサイクリン、ドセタキセルおよびMDV3100による処理の48時間後に評価した総生細胞数の比較について示すグラフであり、配列番号5のASOを、メトホルミン、ドキシサイクリン、ドセタキセルおよびMDV3100のそれぞれ単独、ならびに配列番号5のASOと組み合わせたものと比較して試験した。図10Aは、配列番号5のASOおよびメトホルミンについての総生PC3細胞数を示す。 図10Bは、配列番号5のASOおよびドキシサイクリンについての総生PC3細胞数を示す。 図10Cは、配列番号5のASOおよびドセタキセルについての総生PC3細胞数を示す。 図10Dは、配列番号5のASOおよびMDV3100についての総生C4-2細胞数を示す。
本明細書で直接定義されない語はいずれも、本技術分野内で理解されるように、これらの語と一般的に関連する意味を有すると理解されるものとする。実施形態の組成物、機器、方法など、およびそれらの作製または使用の仕方について記載することにおいて当業者にさらなる手引きを提供するため、特定の語について以下で、または明細書の別の箇所で論じる。1つを超える方法で同じ事物について述べる可能性があることが理解されよう。その結果、本明細書で論じる語のうちいずれか1つまたは複数について、代替の言い回しおよびシノニムを使用することがある。本明細書で語について詳しく述べるまたは論じるか否かについては重視すべきでない。いくつかのシノニムまたは代用可能な方法、物品などが提供される。明記されない限り、1つまたは数種のシノニムまたは同等物の記載によりその他のシノニムまたは同等物の使用が除外されることはない。明細書において、語の例を含む例の使用は説明のためだけのものであり、本明細書に記載される実施形態の範囲および意味を限定するものではない。
がん細胞を「治療する」方法が提供され、ここで、治療する、は細胞の増殖を防止すること、がんに関連する症状を寛解させること、およびがん細胞を根絶することを包含することを意図している。本明細書で使用される場合、「治療する」という語は、化合物の早期投与または後期投与を含む、がんの任意のステージでの投与を含むことも意図している。「寛解させる」という語が、がんを、がんに罹患した対象にとってより許容できるものにする(例えば、腫瘍量を減少させることにより)見込みを含むことを意図していることを、当業者は理解している。がんに関する「根絶」という語が、対象から全体的にまたは部分的にがん細胞が除去されることを含むことも、当業者は理解している。したがって、本明細書で使用される場合、「治療」は、対象におけるがん細胞増殖の防止、がんに関連する症状の寛解、対象からのがんの根絶、またはこれらの組合せを指しうる。
アンチセンスオリゴヌクレオチド化合物は、通常一本鎖RNA化合物であり、標的mRNA分子などの相補的RNA化合物に結合し、正常な翻訳機構を立体的に妨害することにより相補的RNA化合物からの翻訳を遮断する。このプロセスは、RNA干渉プロセスを媒介するのにさらなる酵素が必要であるわけでも関与するわけでもないという点において、通常は受動的である。望ましい遺伝子の発現を阻害するための、アンチセンスRNA化合物の特異的な標的化には概して、望ましい遺伝子に対し相同な相補的配列を有するようにアンチセンスRNA化合物を設計することが伴いうる。RNA干渉効果には完全な相同性が必要なわけではない。本発明の一実施形態で、アンチセンスRNA化合物は、MCT4タンパク質の翻訳の減少を引き起こす、MCT4 mRNA転写物に結合するのに十分な相補的相同性を有する任意のRNA化合物を含む。本発明の別の実施形態では、アンチセンスRNA化合物は、MCT4タンパク質の翻訳の減少を引き起こす、MCT4 mRNA転写物に結合するのに十分な相補的相同性を有する任意のRNA化合物を含む。アンチセンス化合物は、特にインビボで使用するため、オリゴヌクレオチドの安定性を増強するように改変されていてよい。アンチセンスRNA化合物を設計および最適化する方法についての数多くの例が文献に記載されている(すなわちパン(Pan)およびクロースン(Clawson)、2006年;パツェル(Patzel)、2007年;ピーク(Peek)およびベールケ(Behlke)、2007年)。標的遺伝子の発現を調節するのに、アンチセンス化合物には完全な配列相同性が必要なわけではない。本発明者らは、MCT4の発現を調節するアンチセンス化合物の非限定的な例を提供する。
本明細書に記載される(表AおよびBを参照のこと)、または本明細書に記載されるように使用するためのアンチセンスオリゴヌクレオチド配列は、埋込剤、移植片、プロテーゼ、ステントなどの医療機器または器具により投与可能である。また、このような化合物または組成物を含みかつ放出することを意図した埋込剤が考案されてもよい。一例は、一定期間かけて化合物を放出するのに適した高分子物質製の埋込剤であろう。
試験を行ったMCT4 ASO全てについての阻害パーセントを以下の表Aに示す。概して、MCT4 ASOでは50%阻害を、活性であるとみなした。
Figure 0007039470000001
MCT4を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)が本明細書で提供される。細胞に投与するためのMCT4 ASOの使用は、本明細書に記載される方法に包含される。実施例セクションで使用したASOの一部は、改変ヌクレオシド間結合を有していた。具体的には、ASOは全てのヌクレオシド間にホスホロチオエート結合を有していた。MCT4 ASOは、改変ホスホロチオエート結合を有する16~20merのオリゴヌクレオチドである。しかし、MCT4 ASOの変化形は、未改変のホスホジエステル結合、または改変された結合を部分的に(すなわち1~19の間の任意の整数個のホスホロチオエート結合またはその他の改変結合を)有していてもよい。代替となる改変も当技術分野で既知である。
MCT4を標的とする鎖長16~20merのアンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)が本明細書で提供される。しかし、配列番号1~23または配列番号46~49の、16、19または20個のヌクレオチドを含む生物的に活性なオリゴヌクレオチドも使用可能であることが当業者には明白であろう。
ホスホロチオエートオリゴヌクレオチド結合の改変では、非架橋酸素のうち1つを硫黄で置き換えることによりリン酸結合を変化させる。ホスホロチオエート結合の導入により、オリゴヌクレオチドの化学的特性が変化する。具体的には、ホスホロチオエート結合の追加でヌクレアーゼによるオリゴヌクレオチドの分解が減少し、それによりインサイチューでの半減期が増加する。したがって、細胞または生体マトリックスに導入すると特定の転写物の発現をサイレンシングするように標的核酸と相互作用しうるアンチセンスオリゴヌクレオチドに、この改変は特に有用である。ホスホロチオエート結合を含むオリゴヌクレオチドは、翻訳の直接遮断、または標的転写物の酵素による分解(例えば、RNaseHによる)を可能にすることいずれかを介してこの偉業を達成する。
ホスホロチオエート結合により半減期の改善がもたらされるものの、これらの結合をオリゴヌクレオチドに導入することで、アンチセンスオリゴヌクレオチドとしての機能に対する制限も導入されうる。各ホスホロチオエート結合は各結合においてキラル中心を作り出し、それにより、合成中に生成されるオリゴヌクレオチドの複数の異性体が生じる可能性があり、異性体は異なる特徴および機能特性を有しうる。しかし、異性体効果の大部分は、改変の位置取りを慎重にすることにより、またはホスホロチオエート結合と併せてさらなる改変を使用することにより軽減することができる。
オリゴヌクレオチド部分における1つまたは複数のホスホロチオジエステル結合は、結合における2つの架橋酸素原子の一方または両方を、-NH、-CH、または-Sなどのアナログで置き換えることにより改変することができる。当技術分野で既知のその他の酸素アナログも使用可能である。
本明細書で使用される場合、「改変オリゴヌクレオチド」は、置換または改変されたオリゴヌクレオチドを含むことを意図する。天然に存在する主要な塩基であるアデニン、グアニン、シトシン、およびチミン、または、イノシン、デオキシイノシン、およびヒポキサンチンなどのその他の天然の塩基に加えて、その他の数多くの改変が存在する。例えば、安定性および標的とのハイブリダイゼーションを改善するため、アイソスターであるプリン2’デオキシ-フラノシドアナログ、2’-デオキシネブラリンまたは2’デオキシキサントシン、またはその他のプリン、および5-メチルピリミジンまたは5-プロピニルピリミジンなどのピリミジンアナログも利用可能である。
本明細書で使用される場合、「改変糖」は、オリゴヌクレオチド部分について論じる場合、リボース、グルコース、スクロース、もしくはガラクトース、または任意のその他の糖となるように改変されたか置き換えられた糖である。あるいは、オリゴヌクレオチドは、その糖のうち1つまたは複数が2’位、すなわち2’アルキルまたは2’-0-アルキルにおいて置換または改変されていてもよい。2’-O-アリル糖の一例は2’-O-メチルリボヌクレオチドである。さらに、オリゴヌクレオチドは、その糖のうち1つまたは複数が、α-アノマー糖を形成するように置換または改変されていてもよい。
本明細書で使用される場合、「第2世代」オリゴヌクレオチドは、細胞ヌクレアーゼによる分解に対し抵抗性であり、第1世代ASOと等しいかこれより大きい親和性で標的mRNAと特異的にハイブリダイズすることができるオリゴヌクレオチドとして定義することができる。第2世代ASOの一例は、2’-O-(2-メトキシエチル)-RNA(2’MOEギャップマー改変)である。2’-MOEギャップマーでは、5’および3’末端は分解を防ぐように2’-MOE改変ヌクレオチドを有していてよいが、5’および3’末端間のギャップは未改変のホスホジエステル結合であってよい。ASOを改善するため、その他の数多くの化学修飾が開発されている。例えば、モルホリノ、N3’~P5’ホスホロアミデート、およびメチルホスホネート化学修飾が当技術分野で知られている(N.ディアス(N.Dias)、およびC.A.ステイン(C.A.Stein)、2002年)。さらに、ペプチド核酸(PNA)も使用可能である。
試験を行った、配列番号1の16merトランケーションのアラインメントを、それらのMCT4阻害%とともに表Bに示す。
Figure 0007039470000002
本明細書に記載される化合物は単独であってもよく、トレーサー化合物、リポソーム、糖担体、高分子担体、または当業者にとって明白であるように、その他の薬剤もしくは賦形剤と結合しているかこれらと組み合わせてもよい。代替的な実施形態では、このような化合物はさらなる医薬をさらに含んでいてよく、ここで、このような化合物は薬理学的有効量で存在していてよい。
本明細書で使用される場合、「医薬」という語は、患者または試験対象に投与してよく、患者または試験対象において効果を生じうる組成物を指す。効果は化学的でも、生物学的でも物理的でもよく、患者または試験対象はヒトであっても、げっ歯類(例えば、トランスジェニックマウス、マウスまたはラット)、イヌ、ネコ、ウシ、ヒツジ、ウマ、ハムスター、モルモット、ウサギまたはブタなどの非ヒト動物であってもよい。医薬は、有効な化学的実体単独から構成されていても、薬学的に許容される賦形剤と組み合わせてもよい。
「薬学的に許容される賦形剤」という語には、生理的に適合する任意のおよび全ての溶媒、分散媒、コーティング、抗細菌剤、抗菌剤または抗真菌剤、等張剤および吸収遅延剤などが含まれていてよい。賦形剤は、静脈内、腹腔内、筋肉内、皮下、髄腔内、局所または経口投与に適していてよい。賦形剤には、無菌の注射用溶液または分散媒を即座に調製するための、無菌の水溶液または分散媒が含まれていてよい。医薬調製のためのこのような媒質の使用については、当技術分野で既知である。
本明細書に記載される一部の実施形態による組成物または化合物は、様々な既知の経路のいずれかで投与することができる。化合物の投与に適し得る方法の例には、経口、静脈内、吸入、筋肉内、皮下、局所、腹腔内、直腸内または膣内坐剤、舌下などが含まれる。本明細書に記載される化合物は、無菌の水溶液として投与してもよく、脂溶性賦形剤中で、または適切な別の溶液、懸濁液、パッチ、錠剤もしくはペースト形式で投与してもよい。本明細書に記載される化合物を含む組成物は、吸入による投与用に製剤化されていてもよい。例えば、化合物を、エアロゾル中に分散させるように賦形剤と組み合わせることができる。吸入製剤の例は当業者に既知である。取り込みもしくは代謝を助けるため、または放出制御製剤などにおいて宿主内での分散を遅らせるため、その他の薬剤が本明細書に記載される化合物と組み合わせて含まれていてもよい。放出制御製剤の例は当業者に既知であり、マイクロカプセル化、糖またはポリマーマトリックス中の塞栓などを含んでいてよい。製剤を作製するための、当技術分野で既知のその他の方法が、例えば、「レミントンの調剤科学(Remington’s Pharmaceutical Sciences)」、(第19版)、編A.ジェンナロ(A.Gennaro)、1995年、マック出版社(Mack Publishing Company)、イーストン(Easton)、ペンシルバニア(Pa)に記載されている。
本明細書に記載される一部の実施形態の組成物または化合物の投与量は、投与経路(経口、静脈内、吸入など)、および組成物または化合物が投与される形態(溶液、放出制御など)に応じて変動しうる。適切な投与量の決定は当業者の能力の範囲内である。本明細書で使用される場合、化合物の「有効量」、「治療有効量」、または「薬理学的有効量」は、化合物が使用される期間中に送達される治療レベルの化合物をもたらす濃度に存在する、本明細書に記載されるASOの量を指す。これは、送達様式、投薬期間、化合物を投与される対象の年齢、体重、全身の健康状態、性別および食事によって決まりうる。有効量を決定する方法は当技術分野で既知である。MCT4発現の阻害が望ましい標的組織または細胞への、本明細書に記載される化合物の送達を制限することが場合によって有益でありうることが理解される。本明細書に記載される化合物を望ましい組織または細胞型に対して標的化させることが望ましい場合があることも理解される。このように、本明細書に記載される化合物は標的とする部分に結合することができる。化合物は細胞取り込み部分に結合することもできる。標的とする部分が細胞取り込み部分として機能する場合もある。
概して、本明細書に記載されるアンチセンスオリゴヌクレオチドは、実質的な毒性を引き起こすことなく使用することができる。本明細書に記載される化合物の毒性は、例えば、細胞培養物または実験動物で試験して、治療指数、すなわち、LD50(集団の50%を死に至らしめる用量)とLD100(集団の100%を死に至らしめる用量)の間の比を決定することによる、標準的な技術を使用して決定可能である。しかし、重度の疾患状態などの一部の状況では、実質的な過剰量の組成物を投与することが適切である場合がある。本明細書に記載される一部のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、ある濃度では毒性となる場合がある。毒性および非毒性濃度を決定するのに、用量設定試験を使用することができる。毒性は、細胞株全体での特定のアンチセンスオリゴヌクレオチドの特異性を試験することでも評価可能である。化合物がその他の組織に対して何らかの効果を有するかどうかについて示すため、動物研究が使用可能である。
一部の実施形態で、本明細書に記載される少なくとも1種のアンチセンスオリゴヌクレオチドが、例えば、これに限定されないが、がん細胞を治療するために使用可能である。本明細書で使用される場合、「少なくとも1つの」は、1つまたは複数、すなわち1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21,22、23、24、25、26、27などを意味することを意図している。
一部の実施形態で、本明細書に記載されるアンチセンスオリゴヌクレオチドは、例えば、これに限定されないが、MCT4の発現上昇が観察される悪性疾患から選択される少なくとも1つの徴候に対するその他の治療方法と組み合わせて使用可能である。これらには、ヒトを含む哺乳動物における、前立腺がん、腎細胞癌、乳がん、子宮頸がん、肝がん、膀胱がん、および小細胞肺がんが含まれるが、これらに限定されない。アンチセンスオリゴヌクレオチドは、外科手術、放射線(小線源療法または外照射)、またはその他の療法(例えば、HIFU)とともに、ネオアジュバント療法(術前)、補助的療法(術中)、および/またはアジュバント療法(術後)として使用可能である。例えば、本明細書に記載されるMCT4アンチセンスオリゴヌクレオチドを、ドセタキセル、MDV3100、またはグルコース代謝調節薬(ドキシサイクリンまたはその他のミトコンドリア阻害剤を含む)と組み合わせて使用することができる。
方法および材料
本明細書に記載される実施例に関して、以下の方法および材料を使用した。
細胞培養物
ヒトPC-3およびDU145CRPC細胞、ヒトLNCaP前立腺がん細胞、ならびにマウスTRAMPC2前立腺がん細胞をアメリカン タイプ カルチャー コレクション(American Type Culture Collection)(ATCC)より購入し、C4-2CRPC細胞をバンクーバー前立腺センター(Vancouver Prostate Centre)、バンクーバー(Vancouver)、ブリティッシュコロンビア(BC)、カナダ(Canada)より購入した。ヒト単層培養物は10%ウシ胎児血清(FBS)(GE Healthcare Hyclone(商標)、Logan、UT)を補充したRPMI-1640(GE Healthcare Hyclone(商標)、Logan、UT)で維持し、TRAMPC2細胞は5%FBSを補充したDMEM(GE Healthcare Hyclone(商標)、Logan、UT)で維持した。細胞計数については、単細胞懸濁液を形成するように細胞をトリプシン処理し、TC20 Automated Cell Counter(Bio-Rad、Hercules、CA)を使用して計数した。細胞生存率をトリパンブルー排除により評価した。
ヒト前立腺がん組織マイクロアレイ(TMA)構築および免疫組織化学
書面による患者のインフォームドコンセント、臨床情報および施設研究の承認を得て、バンクーバー前立腺センター組織バンク(Vancouver Prostate Centre Tissue Bank)より入手した各種グリーソングレードを示す前立腺がん検体(n=342)を使用して、以前に記載された(チャン(Chiang)ら、2014年;トーマス(Thomas)ら、2011年)ようにTMAを手作業で構築した。前立腺の経尿道的切除(TURP)によって得たCRPC試料を除いて、全ての検体を前立腺全摘除によって得た。酵素標識ビオチン-ストレプトアビジンシステムおよび溶媒抵抗性DAB Mapキット(Ventana(商標))とともに、Ventana(商標)自動染色装置(model Discover XT(商標);Ventana Medical System(商標)、Tucson、AZ)を使用して免疫組織化学的染色を実施した。染色強度を、熟練した病理学者が4ポイント段階で採点した。0は、いずれの腫瘍細胞にも染色がないことを示し、1は、かすかであるか限局性で、染色の存在が疑わしいことを示し、2は、少数の細胞で染色が確かな強度であることを示し、3は、大半の細胞で染色が確かな強度であることを示す。
抗体
以下の抗体およびコンジュゲートを使用した。ウサギ抗MCT4抗体(Santa Cruz(商標)、Santa Cruz、CA;WB 1:4000、IHC 1:100)、マウス抗ビンキュリン抗体(Sigma(商標);WB 1:1000)、ウサギ抗切断型カスパーゼ3抗体(Cell Signalling Technology(商標)、Danvers、MA;IHC 1:50)、マウス抗Ki67抗体(Dako(商標)、Burlington、ON;IHC 1:50)、ラット抗CD31抗体(Dianova(商標)、Hamburg、Germany;IHC 1:20)、マウス抗汎T細胞マーカーCD3抗体(Dako(商標);IHC 1:50)、ビオチン化マウス抗NK1.1抗体(Cedarlane(商標)、Burlington、ON;IHC 1:100)、IRDye800CWヤギ抗マウス抗体(Li-Cor Biosciences(商標)、Lincoln、NE;WB 1:10,000)、IRDye680RDヤギ抗ウサギ抗体(Li-Cor Biosciences(商標);WB 1:10,000)、ビオチン化ヤギ抗ウサギ抗体(Vector Laboratories(商標)、Burlingame、CA;IHC 1:200)、ビオチン化ヤギ抗ラット抗体(Vector Laboratories(商標);IHC 1:200)、およびビオチン化ヤギ抗マウス抗体(Vector Laboratories(商標);IHC 1:200)。
ASO設計および選択
好ましいモチーフを含む配列を選択する一方で好ましくないものを除くことにより、ヒトMCT4に対する第1世代ホスホロチオエート改変ASOを合理的に設計した(マドヴェーエワ(Matveeva)ら、2000年)。ヒトおよびマウス遺伝子(20塩基中少なくとも3塩基がミスマッチ)と比較した、MCT4を標的とする配列の特異性を、BLASTを使用して評価した。ヒトMCT4転写物バリアント全て(NM_001042422.2、NM_001042423.2、NM_001206950.1、NM_001206951.1、NM_001206952.1、およびNM_004207.3)に対し完全な相補性を有する転写物の全長にわたって分布する、配列番号1、4、5、9、11、30、36、37、40および41の10種の配列(表Aを参照のこと)が選択され、Eurofins MWG Operonにより合成された。これら10種のASOのノックダウン効率を、qPCRおよびウェスタンブロッティングを使用して、細胞トランスフェクションから48時間後の標的mRNAおよびタンパク質発現を決定することにより試験した。2種の候補ASO(#1および#14-それぞれ配列番号:1および5)をさらなる研究のために選択した。配列:ASO#1(配列番号1)、5’-TCCCATGGCCAGGAGGGTTG-3’;ASO#14(配列番号5)、5’-AGATGCAGAAGACCACGAGG-3’;公開されている非標的化対照ASO、5’-CCTTCCCTGAAGGTTCCTCC-3’(ムリック(Mullick)ら、2011年;サミュエル(Samuel)ら、2006年)。
当業者は、当技術分野の一般的な知識および本明細書で提供される情報に基づいて、本明細書に記載されるASOを合成するか、本明細書に記載されるASOを改変することができるであろう。
ASOおよびsiRNAトランスフェクション
6ウェルプレートで、製造業者の説明書に従い、Oligofectamine(商標)(Invitrogen(商標)、Carlsbad、CA)を使用して、100nMのASOを細胞に48時間トランスフェクト(別途示さない限り)するか、Lipofectamine(商標)2000(Invitrogen(商標))を使用して、MCT4を標的とする50nMのsiRNAおよび対照(Dharmacon(商標)、Chicago、IL)を細胞に48時間トランスフェクトした。
定量的PCR
RNeasy Mini Kit(商標)(Qiagen Inc.(商標)Hilden、Germany)を使用して総RNAを単離し、QuantiTect Reverse Transcription Kit(商標)(Qiagen(商標))を使用してcDNAを合成した。Primer-BLAST(商標)を使用してプライマーを設計した。KAPA SYBR Fast Universal(商標)(Kapa Biosystems(商標)、Woburn、MA)を使用して、ViiA 7 Real-Time PCR(商標)システム(Applied Biosystems(商標)、Foster City、CA)において3連でqRT-PCR反応を実施した。標的遺伝子を、3つの内部参照遺伝子の幾何平均に正規化した(バンドソンペル(Vandesompele)ら、2002年)。
ウェスタンブロッティング
細胞を採取し、completeプロテアーゼ阻害剤カクテル(Roche、Nutley、NJ)を補充したRIPA緩衝液(50mMトリス-Cl pH7.4、150mM NaCl、1%Igepal、0.5%デオキシコール酸Na、0.1%SDS)で溶解させた。Pierce BCA Protein Assay(商標)(Thermo Scientific(商標)、Waltham、MA)により溶解物のタンパク質濃度を決定した。溶解物を8%SDSポリアクリルアミドゲルで泳動し(1レーンあたりタンパク質20μg)、タンパク質をPVDF膜(Millipore(商標)、Billerica、MA)に転写した。ブロットをOdyssey(商標)ブロッキング緩衝液(Li-cor Biosciences(商標))でブロッキングし、抗MCT4抗体でプローブ付加した。ローディング対照としてビンキュリンを使用した。4℃で一晩インキュベートした後、対応する二次抗体で一次抗体にプローブ付加し、Odyssey Infrared Imaging System(商標)(Li-cor Biosciences(商標))およびImage Studio Version3.1(商標)(Li-cor Biosciences(商標))を使用して検出を行った。ImageJ(アメリカ国立衛生研究所、Bethesda、MD)を使用して濃度測定分析を行った。
改変ボイデンチャンバーアッセイ
MCT4 ASOによる処理後のPC-3細胞の遊走および浸潤可能性について、以前に記載された(チャン(Chiang)ら、2014年)ように、マトリゲルコーティングされた改変ボイデンチャンバー(BD Bioscience(商標)、San Jose、CA)を使用して研究した。簡潔に言えば、ASOで処理した細胞を、1ウェルあたり生細胞50,000個で上側チャンバーに播種した。次いで48時間後に、カルセインAMS(12.5mM;Trevigen(商標))を含む解離緩衝液(Trevigen(商標)、Gaithersburg、MD)を使用して細胞を再懸濁させた。Infinite F500 fluorometer(商標)(Tecan(商標)、Mannedorf、Switzerland)を使用した細胞懸濁液の蛍光測定(485nm励起、520nm発光)により、下側チャンバー内の遊走/浸潤細胞数を決定した。
乳酸およびグルコース決定
48時間ASOをトランスフェクトしたPC-3細胞を、乳酸およびグルコースレベルについて評価した。細胞を新しい培地とともに4時間インキュベートした。次いで、培地試料を採取して10K Spin Columns(商標)(BioVision(商標)、Milpitas、CA)によりタンパク質を除き、その後Lactate Assay Kit(BioVision)を使用して乳酸濃度を、またGlucose Assay Kit(商標)(BioVision(商標))を使用してグルコース濃度を決定した。ASOをトランスフェクトした細胞をMQHOで溶解させることにより細胞内乳酸レベルを決定した。生細胞の総数に正規化することにより最終濃度を決定した。
PC-3腫瘍を有するヌードマウスの、MCT4 ASOによる治療
オスの無胸腺ヌードマウス(Simonsen Laboratories(商標)、Gilroy、CA)24匹の両側腹に、PC-3細胞(HBSS:マトリゲル 1:1中に細胞106個)を皮下注射した。平均腫瘍体積が約100mmに達すると、マウスを4群に無作為化し、合計15日間で、5日間毎日、10mg/kgのMCT4 ASO#1(配列番号1)、#14(配列番号5)、対照ASO、または溶媒(PBS)の腹腔内注射により治療を行い、その後2日間治療を休みとした。研究を通して、体重を測定し、嗜眠、水分補給の欠如、および脱力のさらなる徴候などの異常な行動を検査することによりマウスの健康状態をモニタリングした。腫瘍サイズを週2回測定し、式:体積=長さ×幅×深さ×0.5236(mm)を使用して腫瘍体積を算出した。組織を採取するため、最終投与の1時間後にマウスを屠殺した。
腫瘍組織の免疫組織化学
免疫組織化学的分析のため、腫瘍組織をホルマリン固定してパラフィン包埋した。以前に記載された(Wangら、2005)ように、組織を切片化し、プローブ付加し、DAB(Sigma(商標))で染色した。Ki-67および切断型カスパーゼ3染色では、倍率400×で、腫瘍1つあたり5ヶ所のランダムな範囲の画像を撮り、細胞を計数して、陽性染色された細胞のパーセンテージを決定した。MCT4では、倍率200×で、腫瘍1つあたり5ヶ所のランダムな範囲の画像を撮り、パーセンテージ採点により、式:強度=(%領域スコア3)×3+(%領域スコア2)×2+(%領域スコア1)×1を使用して染色強度を評価した。CD31染色後に、倍率200×で、腫瘍1つあたり5ヶ所の、凝集物の最も際立った領域を画像化し、これらが占める範囲のパーセント面積を決定することにより、免疫細胞凝集の程度を定量化した。同じ5ヶ所の際立った領域において免疫細胞凝集物が占める面積に正規化された陽性染色面積として、免疫細胞の割合を評価した。
統計解析
プールされた結果は全て平均値±SEMとして表される。統計解析はGraphPad Prism 6(商標)(GraphPad Software、Inc.、La Jolla、CA)を使用して実施した。Studentのt検定を実施して2群間の平均値を比較した。一元配置分散分析(One-way ANOVA)、その後ダネット(Dunnett)の事後検定を使用して、2群超の平均値を比較した。二元配置分散分析(Two-way ANOVA)、その後の事後多重比較を適用して、腫瘍増殖を比較した。分割表の検定を行って、組織マイクロアレイにおける患者コホート間の染色強度を比較した。ログランク検定を行って、患者生存曲線を比較した。カイ二乗検定を行って、MCT4発現レベルを各種臨床パラメータと関連付けた。p値0.05未満の結果を統計的に有意であるとみなし、p0.05未満は*で、p0.01未満は**で、p0.001未満は***で示す。
<実施例1>
MCT4タンパク質発現の上昇はCRPCと関連する
グリーソングレード3、4および5のヒト前立腺がん由来の組織から構成される組織マイクロアレイ(TMA)を、MCT4タンパク質について染色した。図1AおよびBに示すように、グリーソングレード5の前立腺がんでは、グリーソングレード3および4の検体と比較してMCT4タンパク質発現が有意に増加した。また、血清PSAレベルの増加により測定したところ、MCT4発現の上昇は、一次治療から再発までの時間がより早いことと関連しており、MCT4高発現コホートでは、再発までの時間の中央値が、MCT4低発現コホートでの94.2ヶ月に対し63.3ヶ月であった(図1C)。さらに、MCT4が高発現することは、診断および臨床Tステージ時の血清PSAレベルがより高いことなどの予後不良と関連するその他の臨床的特徴と相関していた(表C)。さらに、MCT4タンパク質発現の上昇が、長期のネオアジュバントホルモン療法(6ヶ月超)を受けた患者、およびCRPC患者由来の腫瘍において見られ(図1DおよびE)、前立腺がんにおけるMCT4タンパク質の発現上昇がCRPC発症と関連していることが示された。
Figure 0007039470000003
<実施例2>
MCT4のノックダウンによりPC-3細胞の増殖が阻害される
MCT4発現阻害の潜在的な治療有効性について、MCT4を標的とするsiRNAおよびASOを使用して研究した。MCT4発現に関連する特性である明確な解糖代謝プロファイルを呈する(ヴァズ(Vaz)ら、2012年)ことから、ヒトPC-3 CRPC細胞を使用した。図2Aに示すように、MCT4 siRNAによるPC-3細胞の処理で細胞増殖の阻害がもたらされ、MCT4ノックダウン手法の潜在的な治療有効性が示唆された。したがって、ヒトMCT4を特異的に標的とするASOを設計した。10種のMCT4 ASOのスクリーニングにより、PC-3細胞増殖およびMCT4発現を阻害する能力が様々であることが明らかとなり、ASO#1(配列番号1)および#14(配列番号5)が最も大きい効力を示した(図2Bおよび2C)。各種ASOで処理されたPC-3細胞におけるMCT4 mRNAレベルの減少と、生じた細胞数の間に強い相関関係が見られ(図2D)、ASOによる増殖阻害がMCT4ノックダウンと直接関連していることが示された。
<実施例3>
MCT4 ASOはPC-3細胞の増殖を阻害する
MCT4 ASO#1(配列番号1)および#14(配列番号5)の増殖阻害活性の特徴をさらに明らかにした。図2Eに示すように、PC-3細胞の増殖は両ASOにより用量依存的に阻害され、ASO#1(IC50=50nM)と比較してASO#14がわずかにより有効であった(IC50=26nM)。ASOによりMCT4 mRNAレベルも用量依存的に減少し、ASOによる細胞増殖阻害を反映していた(IC50 ASO#14=32nM、IC50 ASO#1=50nM)。図2Fに示すように、両ASOはトランスフェクション後96時間時点でも細胞増殖阻害を維持していた。MCT4 mRNAレベルはトランスフェクションの48時間後からわずかに増加し始めたが、96時間時点でもMCT4タンパク質レベルは低いままであった。
<実施例4>
MCT4 ASOは様々なヒト前立腺がん細胞株で増殖の阻害およびMCT4発現の減少を発揮するが、マウスMCT4では発揮しない
MCT4 ASO#1(配列番号1)および#14(配列番号5)をヒトC4-2 CRPC細胞にトランスフェクトすると、ASOは、PC-3細胞で観察されたものと同等のIC50値でヒトC4-2 CRPC細胞の増殖を阻害した、すなわちASO#1=40nM、ASO#14=27nMであった。同様に、ASOは、ASO#1で50nMおよびASO#14で26nMのIC50値でMCT4発現を減少させた(図3A)。さらに、ASOをヒトDU145前立腺がん細胞にトランスフェクトすると、ほぼ同一のIC50値で、細胞増殖およびMCT4発現に対し同様の阻害効果が観察された(図3B)。ASOをLNCaP前立腺がん細胞にトランスフェクションすることでも、細胞増殖およびMCT4発現が同様に阻害されることが示され(図7)、阻害効果が、アンドロゲン受容体の状態よりもむしろ解糖の表現型に関連することが示唆された。重要なことには、MCT4 ASO#1および#14をマウスTRAMPC2前立腺がん細胞にトランスフェクションしても、細胞増殖またはマウスMCT4発現の有意な低下につながらなかった(図3C)。まとめると、結果より、これらのASOがヒトMCT4を特異的に標的とし、細胞増殖に対するその阻害効果はMCT4ノックダウンの結果であることが示唆される。
<実施例5>
候補MCT4 ASOは、インビトロでCRPC細胞のグルコース代謝および組織浸潤/遊走を阻害する
MCT4を標的とするASOの、前立腺がん細胞に対する効果をさらに試験するため、我々は、PC-3細胞の乳酸分泌、細胞内乳酸濃度、およびグルコース消費に対するASOの効果を測定した。MCT4 ASO#1(配列番号1)および#14(配列番号5)を細胞にトランスフェクションすると、トランスフェクションの48時間後に測定したところ、乳酸分泌の顕著な阻害、それに対応する細胞内乳酸の蓄積およびグルコース消費の大幅な減少が生じた(図4A)。さらに、図4Bに示すように、ASOでの処理により、解糖に関与する各種遺伝子、すなわちGAPDH、PGK1、PGAM1およびENO1のダウンレギュレーションが生じた。さらに、乳酸デヒドロゲナーゼA(LDHA)の発現が抑制されたことが判明し、ピルビン酸の乳酸への変換が減少したことが示された。さらに、ピルビン酸をTCAサイクルから分流させ、乳酸への変換を促進する酵素であるピルビン酸デヒドロゲナーゼキナーゼ-1(PDK1)での発現の減少が判明した。したがってMCT4 ASOでの処理により、好気的解糖が阻害された。
MCT4 ASOでの処理により、改変ボイデンチャンバーにおけるPC-3細胞の遊走および組織浸潤も阻害され(図8)、MCT4により促進される乳酸分泌が、転移プロセスでも重要な役割を果たしうることが示唆された。
<実施例6>
MCT4 ASOで治療を行ったヌードマウスにおけるPC-3異種移植片の増殖
皮下PC-3腫瘍を有するオスの無胸腺ヌードマウスを、MCT4 ASO#1(配列番号1)および#14(配列番号5)で合計15日間治療を行った。動物の体重(図9)および行動をモニタリングすることで評価したところ、両ASOは、重大な宿主毒性を誘導することなく腫瘍の増殖を著しく阻害した(図5A)。免疫組織化学的分析により、ASOにより誘導された腫瘍増殖阻害が、切断型カスパーゼ3染色で測定された細胞アポトーシスの増加、およびKi-67染色で測定された細胞増殖の減少と関連することが明らかとなった(図5B)。腫瘍増殖の減少はMCT4タンパク質発現の減少と関連しており(図5C)、MCT4ノックダウンにより生じた抗増殖効果と一致した。各群の代表的な腫瘍画像は、MCT4 ASOで治療を行った腫瘍には存在しなかった、対照腫瘍での強い膜染色の存在を示した(顕微鏡像は図示しない)。
<実施例7>
ヌードマウスにおける免疫細胞凝集物に対するMCT4 ASOの効果
乳酸により誘導される腫瘍の酸性化は、局所的な宿主抗がん免疫の抑制に関連している(チョイ(Choi)ら、2013年)ため、PC-3腫瘍を有するヌードマウスをMCT4 ASOで治療することにより、免疫反応が非常に制限されていてもこれらのマウスの局所宿主免疫応答の変化が引き起こされるか否かを決定するのは興味深いことである。その目的のため、特に腫瘍周辺において、CD31陽性血管から遊出した免疫細胞凝集物を定量化した。図6Aに示すように、2種のMCT4 ASOで処理された異種移植片は、対照腫瘍と比較して有意に大きい免疫細胞凝集物を有していた。顕微鏡像を調べたところ、顕微鏡像は、免疫凝集物が、周囲の腫瘍細胞とは異なる小型で円形の密集した核の領域を特徴とし、また、CD31の染色により、これらの免疫細胞が腫瘍周辺において血管から遊出し、血管を取り囲んでいることが明らかとなることを示した(顕微鏡像は図示しない)。ヌードマウスにおける主要な細胞毒性免疫細胞サブタイプである(シュルツ(Shultz)ら、2007年)ナチュラルキラー(NK)細胞集団の定量化により、MCT4 ASOによる治療で腫瘍関連NK細胞の割合が著しく増加したことが明らかとなった(図6B)。さらに、NK細胞の活性化は、T細胞受容体複合体と会合するためT細胞マーカーと通常みなされる分子であるCD3により促進される(コッホ(Koch)ら、2013年)。NK細胞におけるCD3の発現は免疫組織化学で検出可能であり(モリス(Morice)、2007年)、ヌードマウスにはT細胞が存在しないことを考慮すると、NK細胞活性化の指標として使用可能である(ラニア(Lanier)ら、1992年)。MCT4 ASOでの治療により、凝集物として存在する免疫細胞の組成も顕著に変化し、それにより、NK細胞マーカーNK1.1を使用する染色で、腫瘍に関連するNK細胞の割合が増加したことが明らかとなった(顕微鏡像は図示しない)。図6Cに示すように、CD3陽性細胞の割合がMCT4 ASO治療により増加した。染色により、ASOで治療を行った腫瘍に関連する活性化NK細胞の割合も増加したことが明らかとなり、抗がん免疫が刺激されたことが示唆された。
<実施例8>
配列番号5との組合せ療法
現行のがん治療薬(表Dを参照のこと)をMCT4 ASO配列番号5と組み合わせることで相乗効果が見られるか否かを決定するため、およそのIC50濃度で各種組合せ方法をスクリーニングした。図10A~Cでは、メトホルミン、ドキシサイクリンおよびドセタキセルを単独で、ならびにMCT4 ASO配列番号5と組み合わせて処理した48時間後に、総生PC3細胞数を評価した。しかし、MDV3100、配列番号5、ならびに配列番号5およびMDV3100の組合せを試験するのにはC4-2細胞を使用した(図10D)。ドセタキセルとMCT4 ASO配列番号5の組合せは、コンビネーションインデックス=0.780で相乗効果を示した。
Figure 0007039470000004
本明細書に記載される実施形態は、理解を明瞭にする目的で、説明および例示のためある程度詳細に記載されるが、添付の特許請求の範囲の趣旨または範囲から逸脱することなく変更および改変を行うことができることが、本明細書に記載される教示の観点から、当業者には容易に分かる。このような改変は、実質的に同じ方法で同じ結果を実現するために、本発明の任意の態様を既知の同等物で置換することを含む。数値範囲は、範囲を定義する数を含む。「~を含む(comprising)」という語は、「~を含むがこれに限定されない(including, but not limited to)」という成句と実質的に同等であるオープンエンドな語として本明細書で使用され、「~を含む(comprises)」という語はそれに対応する意味を有する。本明細書で使用される場合、単数形「a」、「an」および「the」は、文脈で別途明らかに定められない限り複数の指示対象を含む。したがって、例えば、「ある事物(a thing)」に言及することは、1つを超えるそのような事物を含む。本明細書で参考文献を引用することは、このような参考文献が本発明の実施形態に対する先行技術であると認めることとはならない。本発明は、本明細書で記載されるように、図を参照して、実質的に実施形態および変化形を全て含む。
なお、本発明は以下の態様を含む。
[1]配列番号1~23および配列番号46~49のうち1つまたは複数から選択される配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)を投与するステップを含む、がんを治療する方法。
[2]ASOが改変ヌクレオシド間結合をさらに含む、[1]の方法。
[3]改変ヌクレオシド間結合が、ペプチド-核酸結合、モルホリノ結合、N3’~P5’ホスホロアミデート結合、メチルホスホネート結合またはホスホロチオエート結合である、[2]の方法。
[4]ASOが改変糖部分をさらに含む、[1]の方法。
[5]改変糖部分が2’-O-アルキルオリゴリボヌクレオチドである、[4]の方法。
[6]ASOが2’MOEギャップマー改変を有する、[1]の方法。
[7]ASOが改変核酸塩基をさらに含む、[1]の方法。
[8]改変核酸塩基が5-メチルピリミジンまたは5-プロピニルピリミジンである、[7]の方法。
[9]細胞がヒト細胞である、[1]の方法。
[10]がんがMCT4の発現上昇を特徴とする、[1]の方法。
[11]がんが、前立腺がん、腎細胞癌、乳がん、子宮頸がん、肝がん、膀胱がん、および小細胞肺がんのうち1つまたは複数から選択される、[10]の方法。
[12]前立腺がんが去勢抵抗性前立腺がん(CRPC)である、[11]の方法。
[13]前立腺がんがエンザルタミド(ENZ)抵抗性CRPCである、[12]の方法。
[14]ASOが、MCT4のmRNAに対し実質的に相補的である、[1]の方法。
[15]ASOが静脈内投与される、[1]の方法。
[16]ASOが組織に対し局所的に投与される、[1]の方法。
[17]ASOが投与前に脂質粒子と混合される、[1]の方法。
[18]ASOが投与前にリポソームに被包される、[1]の方法。
[19]オリゴヌクレオチドが、
(a)TCCCATGGCCAGGAGGGTTG(配列番号1);
(b)GTCCCGGAAGACGCTCAGGT(配列番号2);
(c)AAGGACGCAGCCACCATGCC(配列番号3);
(d)TTGGCGTAGCTCACCACGAA(配列番号4);
(e)AGATGCAGAAGACCACGAGG(配列番号5);
(f)CCACTCTGGAATGACACGGT(配列番号6);
(g)GTAGGAGAAGCCAGTGATGAC(配列番号7);
(h)AGCATGGCCAGCAGGATGGA(配列番号8);
(i)GGCTGGAAGTTGAGTGCCAA(配列番号9);
(j)CATGCCGTAGGAGATGCCAA(配列番号10);
(k)CTCAGGCTGTGGCTCTTTGG(配列番号11);
(l)TAGCGGTTCAGCATGATGA(配列番号12);
(m)AGCACGGCCCAGCCCCAGCC(配列番号13);
(n)GAGCTCCTTGAAGAAGACACT(配列番号14);
(o)CAGGATGGAGGAGATCCAGG(配列番号15);
(p)AGACCCCCCACAAGCATGAC(配列番号16);
(q)GAAGTTGAGTGCCAAACCCAA(配列番号17);
(r)CCCGTTGGCCATGGGGCGCC(配列番号18);
(s)GCCAGCCCGTTGGCCATGGG(配列番号19);
(t)AGGAAGACAGGGCTACCTGC(配列番号20);
(u)GCACACAGGAAGACAGGGCT(配列番号21);
(v)CAGGGCACACAGGAAGACAG(配列番号22);
(w)CAGCAGTTGAGCAGCAGGCC(配列番号23);
(x)ATGGCCAGGAGGGTTG(配列番号46);
(y)CATGGCCAGGAGGGTT(配列番号47);
(z)CCATGGCCAGGAGGGT(配列番号48);および
(aa)CCCATGGCCAGGAGGG(配列番号49)
から選択される配列を有する、アンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)。
[20]ASOが改変ヌクレオシド間結合をさらに含む、[19]のASO。
[21]改変ヌクレオシド間結合が、ペプチド-核酸結合、モルホリノ結合、N3’~P5’ホスホロアミデート結合、メチルホスホネート結合またはホスホロチオエート結合である、[20]のASO。
[22]ASOが改変糖部分をさらに含む、[19]のASO。
[23]改変糖部分が2’-O-アルキルオリゴリボヌクレオチドである、[22]のASO。
[24]ASOが2’MOEギャップマー改変を有する、[19]のASO。
[25]ASOが改変核酸塩基をさらに含む、[19]のASO。
[26]改変核酸塩基が5-メチルピリミジンまたは5-プロピニルピリミジンである、[25]のASO。
[27]がんの治療において使用するための、[19]から[26]のいずれか1のASO。
[28](a)配列番号1~23および配列番号46~49のうち1つまたは複数から選択される配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)、ならびに(b)薬学的に許容される担体を含む医薬組成物。
[29]ASOが改変ヌクレオシド間結合をさらに含む、[28]の医薬組成物。
[30]改変ヌクレオシド間結合が、ペプチド-核酸結合、モルホリノ結合、N3’~P5’ホスホロアミデート結合、メチルホスホネート結合またはホスホロチオエート結合である、[29]の医薬組成物。
[31]ASOが改変糖部分をさらに含む、[28]の医薬組成物。
[32]ASOが改変糖部分をさらに含む、[30]の医薬組成物。
[33]改変糖部分が2’-O-アルキルオリゴリボヌクレオチドである、[32]の医薬組成物。
[34]ASOが2’MOEギャップマー改変を有する、[28]の医薬組成物。
[35]ASOが改変核酸塩基をさらに含む、[28]の医薬組成物。
[36]改変核酸塩基が5-メチルピリミジンまたは5-プロピニルピリミジンである、[32]の医薬組成物。
[37]a.配列番号1~23および配列番号46~49のうち1つまたは複数から選択される配列を有するASO、ならびに
b.がんの治療のための説明書
を含む商用パッケージ。
[38]がんが、前立腺がん、腎細胞癌、乳がん、子宮頸がん、肝がん、膀胱がん、および小細胞肺がんのうち1つまたは複数から選択される、[37]の商用パッケージ。
[39]前立腺がんが去勢抵抗性前立腺がん(CRPC)である、[37]の商用パッケージ。
[40]がんを治療するための、配列番号1~23および配列番号46~49のうち1つまたは複数から選択される配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)の使用。
[41]がんを治療するための医薬の製造における、配列番号1~23および配列番号46~49のうち1つまたは複数から選択される配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)の使用。
[42]ASOが改変ヌクレオシド間結合をさらに含む、[40]または[41]の使用。
[43]改変ヌクレオシド間結合が、ペプチド-核酸結合、モルホリノ結合、N3’~P5’ホスホロアミデート結合、メチルホスホネート結合またはホスホロチオエート結合である、[42]の使用。
[44]ASOが改変糖部分をさらに含む、[40]または[41]の使用。
[45]改変糖部分が2’-O-アルキルオリゴリボヌクレオチドである、[44]の使用。
[46]ASOが2’MOEギャップマー改変を有する、[40]または[41]の使用。
[47]ASOが改変核酸塩基をさらに含む、[40]または[41]の使用。
[48]改変核酸塩基が5-メチルピリミジンまたは5-プロピニルピリミジンである、[47]の使用。
[49]細胞がヒト細胞である、[40]または[41]の使用。
[50]がんがMCT4の発現上昇を特徴とする、[40]または[41]の使用。
[51]がんが、前立腺がん、腎細胞癌、乳がん、子宮頸がん、肝がん、膀胱がん、および小細胞肺がんのうち1つまたは複数から選択される、[50]の使用。
[52]前立腺がんが去勢抵抗性前立腺がん(CRPC)である、[51]の使用。
[53]前立腺がんがエンザルタミド(ENZ)抵抗性CRPCである、[52]の使用。
[54]ASOがMCT4のmRNAに対し実質的に相補的である、[40]または[41]の使用。
[55]ASOが静脈内投与される、[40]または[41]の使用。
[56]ASOが組織に対し局所的に投与される、[40]または[41]の使用。
[57]ASOが投与前に脂質粒子と混合される、[40]または[41]の使用。
[58]ASOが投与前にリポソームに被包される、[40]または[41]の使用。
[59](a)配列番号1~23および配列番号46~49のうち1つまたは複数から選択される配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)、ならびに(b)ドセタキセルを含む、組合せ療法。
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Claims (24)

  1. オリゴヌクレオチドが、
    (a)TCCCATGGCCAGGAGGGTTG(配列番号1);
    (b)GTCCCGGAAGACGCTCAGGT(配列番号2);
    (c)AAGGACGCAGCCACCATGCC(配列番号3);
    (d)TTGGCGTAGCTCACCACGAA(配列番号4);
    (e)AGATGCAGAAGACCACGAGG(配列番号5);
    (f)CCACTCTGGAATGACACGGT(配列番号6);
    (g)GTAGGAGAAGCCAGTGATGAC(配列番号7);
    (h)AGCATGGCCAGCAGGATGGA(配列番号8);
    (i)GGCTGGAAGTTGAGTGCCAA(配列番号9);
    (j)CATGCCGTAGGAGATGCCAA(配列番号10);
    (k)CTCAGGCTGTGGCTCTTTGG(配列番号11);
    (l)TAGCGGTTCAGCATGATGA(配列番号12);
    (m)AGCACGGCCCAGCCCCAGCC(配列番号13);
    (n)GAGCTCCTTGAAGAAGACACT(配列番号14);
    (o)CAGGATGGAGGAGATCCAGG(配列番号15);
    (p)AGACCCCCCACAAGCATGAC(配列番号16);
    (q)GAAGTTGAGTGCCAAACCCAA(配列番号17);
    (r)CCCGTTGGCCATGGGGCGCC(配列番号18);
    (s)GCCAGCCCGTTGGCCATGGG(配列番号19);
    (t)AGGAAGACAGGGCTACCTGC(配列番号20);
    (u)GCACACAGGAAGACAGGGCT(配列番号21);
    (v)CAGGGCACACAGGAAGACAG(配列番号22);
    (w)CAGCAGTTGAGCAGCAGGCC(配列番号23);
    (x)ATGGCCAGGAGGGTTG(配列番号46);
    (y)CATGGCCAGGAGGGTT(配列番号47);
    (z)CCATGGCCAGGAGGGT(配列番号48);および
    (aa)CCCATGGCCAGGAGGG(配列番号49)
    から選択される配列を有する、アンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)。
  2. 前記ASOが改変ヌクレオシド間結合をさらに含む、請求項1に記載のASO。
  3. 前記改変ヌクレオシド間結合が、ペプチド-核酸結合、モルホリノ結合、N3’~P5’ホスホロアミデート結合、メチルホスホネート結合またはホスホロチオエート結合である、請求項2に記載のASO。
  4. 前記ASOが改変糖部分をさらに含む、請求項1に記載のASO。
  5. 前記改変糖部分が2’-O-アルキルオリゴリボヌクレオチドである、請求項4に記載のASO。
  6. 前記ASOが2’MOEギャップマー改変を有する、請求項1に記載のASO。
  7. 前記ASOが改変核酸塩基をさらに含む、請求項1に記載のASO。
  8. 前記改変核酸塩基が5-メチルピリミジンまたは5-プロピニルピリミジンである、請求項7に記載のASO。
  9. がんの治療において使用するための、請求項1から8のいずれか1項に記載のASO。
  10. がんを治療するための医薬組成物であって、(a)配列番号1~23および配列番号46~49のうち1つまたは複数から選択される配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)、ならびに(b)薬学的に許容される担体を含む医薬組成物。
  11. 前記ASOが改変ヌクレオシド間結合をさらに含む、請求項10に記載の医薬組成物。
  12. 前記改変ヌクレオシド間結合が、ペプチド-核酸結合、モルホリノ結合、N3’~P5’ホスホロアミデート結合、メチルホスホネート結合またはホスホロチオエート結合である、請求項11に記載の医薬組成物。
  13. 前記ASOが改変糖部分をさらに含む、請求項10または12に記載の医薬組成物。
  14. 前記改変糖部分が2’-O-アルキルオリゴリボヌクレオチドである、請求項13に記載の医薬組成物。
  15. 前記ASOが2’MOEギャップマー改変を有する、請求項10に記載の医薬組成物。
  16. 前記ASOが改変核酸塩基をさらに含む、請求項10に記載の医薬組成物。
  17. 前記改変核酸塩基が5-メチルピリミジンまたは5-プロピニルピリミジンである、請求項16に記載の医薬組成物。
  18. a.配列番号1~23および配列番号46~49のうち1つまたは複数から選択される配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO、ならびに
    b.がんの治療のための説明書
    を含む商用パッケージ。
  19. 前記がんが、前立腺がん、腎細胞癌、乳がん、子宮頸がん、肝がん、膀胱がん、および小細胞肺がんのうち1つまたは複数から選択される、請求項18に記載の商用パッケージ。
  20. 前記前立腺がんが去勢抵抗性前立腺がん(CRPC)である、請求項19に記載の商用パッケージ。
  21. 組成物が、(a)請求項1から9のいずれか一項に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO);および(b)薬学的に許容される担体を含む医薬組成物。
  22. 前記がんが、前立腺がん、腎細胞癌、乳がん、子宮頸がん、肝がん、膀胱がん、および小細胞肺がんのうち1つまたは複数から選択される、請求項10から17のいずれか一項に記載の医薬組成物。
  23. 前記前立腺がんが去勢抵抗性前立腺がん(CRPC)である、請求項22に記載の医薬組成物。
  24. 前記医薬組成物が脂質粒子またはリポソームをさらに含む請求項10から17および21から23のいずれか一項に記載の医薬組成物。
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