JP6959268B2 - 第ｘａ因子誘導体の調製 - Google Patents

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関連特許出願の相互参照
本出願は、２０１６年６月１７日に出願された米国仮特許出願連番第６２／３５１，８４１号の利益を主張し、それぞれの内容は開示内容全体が本明細書に参照により組み込まれる。

ｆＸａを標的とする抗凝固剤に対する解毒剤として有用な、第Ｘａ因子（ｆＸａ）タンパク質の修飾された誘導体が開発されている。この誘導体は、抗凝固に拮抗する必要がある、経口または注射可能な第Ｘａ因子インヒビターでの抗凝固療法を受けている患者への一般的な拮抗薬として開発されている。

本開示は、ｆＸａ解毒剤ポリペプチドを大規模で製造して、高収率の高純度タンパク質生成物を得る方法を提供する。一実施形態においては、方法は、配列番号７の核酸配列または配列番号７によりコードされるアミノ酸配列に少なくとも９０％の配列同一性を有するアミノ酸配列をコードする核酸配列を含むポリヌクレオチドコンストラクトから発現したポリペプチド生成物を調製するために提供される。この方法は、ポリヌクレオチドコンストラクトを含む試料に界面活性剤を添加し、大豆トリプシンインヒビター（ＳＴＩ）ベースのアフィニティークロマトグラフ、イオン交換及び混合モードクロマトグラフ及び／または疎水性相互作用を介してコードされた解毒剤タンパク質を精製することを含み得る。

一実施形態においては、配列番号７の核酸配列または配列番号７によりコードされるアミノ酸配列に少なくとも９０％の配列同一性を有するアミノ酸配列をコードする核酸配列を含むポリヌクレオチドコンストラクトから発現したポリペプチド生成物を調製する方法であって、ポリヌクレオチドコンストラクト及びポリヌクレオチドコンストラクトから発現したポリペプチド生成物を含む試料に界面活性剤を添加することと、試料を大豆トリプシンインヒビター（ＳＴＩ）ベースのアフィニティークロマトグラフに充填し、第１の溶出緩衝液でポリペプチドを溶出し、第１の溶出された試料を生成することであって、充填した試料は有機溶媒を含まないことと、第１の溶出された試料をイオン交換及び混合モードクロマトグラフに充填し、少なくとも１Ｍの無機塩を含む第２の溶出緩衝液でポリペプチドを溶出し、第２の溶出された試料を生成することと、第２の溶出された試料を疎水性相互作用クロマトグラフに充填し、少なくとも２ｍＭの塩化ナトリウムを含む第３の溶出緩衝液でポリペプチドを溶出することとを含み、それにより、ポリペプチド生成物を含む精製された試料を調製する方法が提供される。

いくつかの実施形態においては、界面活性剤は、トリトンＸ−１００（ポリエチレングリコールＰ−（１，１，３，３−テトラメチルブチル）−フェニルエーテル）を含む。いくつかの実施形態においては、第１の溶出緩衝液は０．５Ｍ〜２Ｍのアルギニンを含む。いくつかの実施形態においては、第１の溶出緩衝液のｐＨは約５〜５．４である。いくつかの実施形態においては、イオン交換及び混合モードクロマトグラフは、セラミックヒドロキシアパタイトタイプＩクロマトグラフを含む。

いくつかの実施形態においては、第２の溶出緩衝液は、少なくとも２Ｍの無機塩を含む。いくつかの実施形態においては、無機塩は塩化ナトリウムである。いくつかの実施形態においては、疎水性相互作用クロマトグラフはオクチルセファロースクロマトグラフを含む。

いくつかの実施形態においては、方法はアニオン交換クロマトグラフでの精製ステップを更に含む。いくつかの実施形態においては、アニオン交換クロマトグラフは、Ｓａｒｔｏｂｉｎｄ（商標）イオン交換膜を含む。

方法は、試料の１つ以上を、ナノフリースフィルタでの濾過に供することを更に含む。いくつかの実施形態においては、ナノフリースフィルタでの濾過は、試料のＳＴＩベースのアフィニティークロマトグラフへの充填に先行する。

いくつかの実施形態においては、精製された試料は、約１％未満の、ポリヌクレオチドコンストラクトから発現されたものではない汚染タンパク質を含む。いくつかの実施形態においては、ポリペプチド生成物はポリヌクレオチドコンストラクトを含む細胞において発現される。いくつかの実施形態においては、細胞は、培養液１リットルあたり少なくとも１００ｍｇのポリペプチド生成物を産生する条件下で、培養液中で増殖される。いくつかの実施形態においては、細胞は、培養液１リットルあたり少なくとも２００ｍｇのポリペプチド生成物を産生する条件下で、培養液中で増殖される。いくつかの実施形態においては、精製された試料は、約５０％を超える培養液中で産生されたポリペプチド生成物を含む。いくつかの実施形態においては、精製された試料は、培養液１リットルあたり産生量から約１００ｍｇを超えるポリペプチド生成物を含む。

いくつかの実施形態においては、ポリペプチド生成物は、軽鎖及び重鎖を含む二重鎖ポリペプチドである。いくつかの実施形態においては、精製された試料における約２０％〜５０％のポリペプチド生成物は、配列番号５のアミノ酸配列からなる重鎖を有する。いくつかの実施形態においては、配列番号５のアミノ酸配列からなる重鎖の約５％〜９５％は、２つのＯ−結合グリコシル化を有し、配列番号５のアミノ酸配列からなる重鎖の約５％〜９５％は、１つのＯ−結合グリコシル化を有する。いくつかの実施形態においては、精製された試料におけるポリペプチド生成物の約４０％〜８０％は、配列番号８のアミノ酸配列からなる重鎖を有する。いくつかの実施形態においては、配列番号８のアミノ酸配列からなる重鎖の少なくとも約９０％は、１つのＯ−結合グリコシル化を有する。いくつかの実施形態においては、精製された試料におけるポリペプチド生成物の約２％〜１２％は、配列番号９のアミノ酸配列からなる重鎖を有する。いくつかの実施形態においては、精製された試料におけるポリペプチド生成物の約０．１％〜１．５％は、配列番号１０のアミノ酸配列からなる重鎖を有する。いくつかの実施形態においては、精製された試料におけるポリペプチド生成物の約２％〜８％は、配列番号１１のアミノ酸配列からなる重鎖を有する。いくつかの実施形態においては、精製された試料におけるポリペプチド生成物の約３５％〜６０％は、配列番号４のアミノ酸配列からなる軽鎖を有する。

一実施形態においては、実施形態のいずれか１つに記載の方法により調製されたポリペプチドもまた提供される。

一実施形態においては、医薬的に許容される担体及び二重鎖ポリペプチドのポリペプチド部分を含む医薬組成物であって、約３５％〜６０％の二重鎖ポリペプチドが配列番号４のアミノ酸配列からなる軽鎖を有し、約２０％〜６０％の二重鎖ポリペプチドが配列番号５のアミノ酸配列からなる重鎖を有し、約４０％〜６０％の二重鎖ポリペプチドが配列番号８のアミノ酸配列からなる重鎖を有し、１０％未満の二重鎖ポリペプチドが配列番号９のアミノ酸配列からなる重鎖を有する、医薬組成物が提供される。

いくつかの実施形態においては、５％未満の二重鎖ポリペプチドは配列番号９のアミノ酸配列からなる重鎖を有する。いくつかの実施形態においては、３％未満の二重鎖ポリペプチドは配列番号９のアミノ酸配列からなる重鎖を有する。いくつかの実施形態においては、約０．１％〜１．５％の二重鎖ポリペプチドは、配列番号１０のアミノ酸配列からなる重鎖を有する。いくつかの実施形態においては、約２％〜８％の二重鎖ポリペプチドは配列番号１１のアミノ酸配列からなる重鎖を有する。いくつかの実施形態においては、配列番号５のアミノ酸配列からなる重鎖の約３０％〜７０％は、２つのＯ−結合グリコシル化を有する。いくつかの実施形態においては、配列番号５のアミノ酸配列からなる重鎖の約３０％〜７０％は、１つのＯ−結合グリコシル化を有する。いくつかの実施形態においては、少なくとも約９０％の配列番号８のアミノ酸配列からなる重鎖は、１つのＯ−結合グリコシル化を有する。

いくつかの実施形態においては、製剤は凍結乾燥される。いくつかの実施形態においては、組成物はＬ−アルギニンＨＣｌまたはＬ−アルギニンアセテートを更に含む。いくつかの実施形態においては、組成物はスクロースを更に含む。いくつかの実施形態においては、組成物はマンニトールを更に含む。
一実施形態においては、第Ｘａ因子インヒビターでの抗凝固療法を受けている患者において、抗凝固を拮抗または阻害するための方法であって、患者に本開示の実施形態のいずれか１つに記載の医薬組成物を投与することを含む、方法もまた提供される。
特定の実施形態では、例えば、以下が提供される：
（項目１）
配列番号７の核酸配列または配列番号７によりコードされるアミノ酸配列に少なくとも９０％の配列同一性を有するアミノ酸配列をコードする核酸配列を含むポリヌクレオチドコンストラクトから発現したポリペプチド生成物を調製する方法であって、
前記ポリヌクレオチドコンストラクト及び前記ポリヌクレオチドコンストラクトから発現したポリペプチド生成物を含む試料に界面活性剤を添加することと、
前記試料を大豆トリプシンインヒビター（ＳＴＩ）ベースのアフィニティークロマトグラフに充填し、第１の溶出緩衝液で前記ポリペプチドを溶出し、第１の溶出された試料を生成することであって、前記充填された試料は有機溶媒を含まない、前記生成することと、
前記第１の溶出された試料をイオン交換及び混合モードクロマトグラフに充填し、少なくとも１Ｍの無機塩を含む第２の溶出緩衝液で前記ポリペプチドを溶出し、第２の溶出された試料を生成することと、
前記第２の溶出された試料を疎水性相互作用クロマトグラフに充填し、少なくとも２ｍＭの塩化ナトリウムを含む第３の溶出緩衝液で前記ポリペプチドを溶出することと、を含み、
それにより、前記ポリペプチド生成物を含む精製された試料を調製する、前記方法。
（項目２）
前記界面活性剤が、トリトンＸ−１００（ポリエチレングリコールｐ−（１，１，３，３−テトラメチルブチル）−フェニルエーテル）を含む、項目１に記載の方法。
（項目３）
前記第１の溶出緩衝液が０．５Ｍ〜２Ｍのアルギニンを含む、項目１または２に記載の方法。
（項目４）
前記第１の溶出緩衝液のｐＨが約５〜５．４である、項目３に記載の方法。
（項目５）
前記イオン交換及び混合モードクロマトグラフが、セラミックヒドロキシアパタイトタイプＩクロマトグラフを含む、先行項目のいずれかに記載の方法。
（項目６）
前記第２の溶出緩衝液が、少なくとも２Ｍの無機塩を含む、先行項目のいずれかに記載の方法。
（項目７）
前記無機塩が塩化ナトリウムである、項目６に記載の方法。
（項目８）
前記疎水性相互作用クロマトグラフが、オクチルセファロースクロマトグラフを含む、先行項目のいずれかに記載の方法。
（項目９）
アニオン交換クロマトグラフでの精製ステップを更に含む、項目１に記載の方法。
（項目１０）
前記アニオン交換クロマトグラフが、Ｓａｒｔｏｂｉｎｄ（商標）イオン交換膜を含む、項目９に記載の方法。
（項目１１）
前記試料の１つ以上を、ナノフリースフィルタでの濾過に供することを更に含む、先行項目のいずれかに記載の方法。
（項目１２）
前記ナノフリースフィルタでの前記濾過が、前記試料の前記ＳＴＩベースのアフィニティークロマトグラフへの充填に先行する、項目１１に記載の方法。
（項目１３）
前記精製された試料が、約１％未満の、前記ポリヌクレオチドコンストラクトから発現
されたものではない汚染タンパク質を含む、先行項目のいずれかに記載の方法。
（項目１４）
前記ポリペプチド生成物が前記ポリヌクレオチドコンストラクトを含む細胞において発現される、先行項目のいずれかに記載の方法。
（項目１５）
前記細胞が、培養液１リットルあたり少なくとも１００ｍｇの前記ポリペプチド生成物を産生する条件下で、培養液中で増殖される、項目１４に記載の方法。
（項目１６）
前記細胞が、培養液１リットルあたり少なくとも２００ｍｇの前記ポリペプチド生成物を産生する条件下で、培養液中で増殖される、項目１５に記載の方法。
（項目１７）
前記精製された試料が、約５０％を超える前記培養液中で産生された前記ポリペプチド生成物を含む、項目１５または１６に記載の方法。
（項目１８）
前記精製された試料が、前記培養液のリットルあたりの産生量から約１００ｍｇを超える前記ポリペプチド生成物を含む、項目１５または１６に記載の方法。
（項目１９）
前記ポリペプチド生成物が、軽鎖及び重鎖を含む二重鎖ポリペプチドである、先行項目のいずれかに記載の方法。
（項目２０）
前記精製された試料における約２０％〜５０％の前記ポリペプチド生成物が、配列番号５のアミノ酸配列からなる重鎖を有する、項目１９に記載の方法。
（項目２１）
約５％〜９５％の配列番号５のアミノ酸配列からなる前記重鎖が、２つのＯ−結合グリコシル化を有し、約５％〜９５％の配列番号５のアミノ酸配列からなる前記重鎖が、１つのＯ−結合グリコシル化を有する、項目２０に記載の方法。
（項目２２）
前記精製された試料における約４０％〜８０％の前記ポリペプチド生成物が、配列番号８のアミノ酸配列からなる重鎖を有する、項目１９〜２１のいずれか１項に記載の方法。
（項目２３）
少なくとも約９０％の配列番号８のアミノ酸配列からなる前記重鎖が、１つのＯ−結合グリコシル化を有する、項目２２に記載の方法。
（項目２４）
前記精製された試料における約２％〜１２％の前記ポリペプチド生成物が、配列番号９のアミノ酸配列からなる重鎖を有する、項目１９〜２３のいずれか１項に記載の方法。
（項目２５）
前記精製された試料における約０．１％〜１．５％の前記ポリペプチド生成物が、配列番号１０のアミノ酸配列からなる重鎖を有する、項目１９〜２４のいずれか１項に記載の方法。
（項目２６）
前記精製された試料における約２％〜８％の前記ポリペプチド生成物が、配列番号１１のアミノ酸配列からなる重鎖を有する、項目１９〜２５のいずれか１項に記載の方法。
（項目２７）
前記精製された試料における約３５％〜６０％の前記ポリペプチド生成物が、配列番号４のアミノ酸配列からなる軽鎖を有する、項目１９〜２６のいずれか１項に記載の方法。
（項目２８）
項目１〜２７のいずれか１項に記載の方法により調製されたポリペプチド。
（項目２９）
医薬的に許容される担体及び二重鎖ポリペプチドのポリペプチド部分を含む医薬組成物であって、
約３５％〜６０％の前記二重鎖ポリペプチドが配列番号４のアミノ酸配列からなる軽鎖を有し、
約２０％〜６０％の前記二重鎖ポリペプチドが配列番号５のアミノ酸配列からなる重鎖を有し、
約４０％〜６０％の前記二重鎖ポリペプチドが配列番号８のアミノ酸配列からなる重鎖を有し、
１０％未満の前記二重鎖ポリペプチドが配列番号９のアミノ酸配列からなる重鎖を有する、前記医薬組成物。
（項目３０）
５％未満の前記二重鎖ポリペプチドが配列番号９のアミノ酸配列からなる重鎖を有する、項目２９に記載の医薬組成物。
（項目３１）
３％未満の前記二重鎖ポリペプチドが配列番号９のアミノ酸配列からなる重鎖を有する、項目２９に記載の医薬組成物。
（項目３２）
約０．１％〜１．５％の前記二重鎖ポリペプチドが配列番号１０のアミノ酸配列からなる重鎖を有する、項目２９〜３１のいずれか１項に記載の医薬組成物。
（項目３３）
約２％〜８％の前記二重鎖ポリペプチドが配列番号１１のアミノ酸配列からなる重鎖を有する、項目２９〜３２のいずれか１項に記載の医薬組成物。
（項目３４）
約３０％〜７０％の配列番号５のアミノ酸配列からなる前記重鎖が、２つのＯ−結合グリコシル化を有する、項目２９〜３３のいずれか１項に記載の医薬組成物。
（項目３５）
約３０％〜７０％の配列番号５のアミノ酸配列からなる前記重鎖が、１つのＯ−結合グリコシル化を有する、項目２９〜３４のいずれか１項に記載の医薬組成物。
（項目３６）
少なくとも約９０％の配列番号８のアミノ酸配列からなる前記重鎖が、１つのＯ−結合グリコシル化を有する、項目２９〜３５のいずれか１項に記載の医薬組成物。
（項目３７）
前記製剤が、凍結乾燥される、項目２９〜３６のいずれか１項に記載の医薬組成物。
（項目３８）
Ｌ−アルギニンＨＣｌまたはＬ−アルギニンアセテートを更に含む、項目２９〜３７のいずれか１項に記載の医薬組成物。
（項目３９）
スクロースを更に含む、項目２９〜３８のいずれか１項に記載の医薬組成物。
（項目４０）
マンニトールを更に含む、項目２９〜３９のいずれか１項に記載の医薬組成物。
（項目４１）
第Ｘａ因子インヒビターでの抗凝固療法を受けている患者における抗凝固を拮抗または阻害するための方法であって、前記患者に項目２９〜４０のいずれか１項に記載の医薬組成物を投与することを含む、前記方法。

記載なし 記載なし 記載なし

定義
以下の説明は本技術の例示的な実施形態を記述する。しかし、そのような説明は、本開示の範囲を限定するものではなく、例示的な実施形態の説明として提供されることが認識されるべきである。

例えば、範囲を含むｐＨ、温度、時間、濃度及び分子量などの全ての数値表示は、０．１または１０％の増分により（＋）または（−）変動する近似値である。必ずしも明記されるわけではないが、全ての数値表示の前に用語「約」が付いていることを理解されるべきである。また、必ずしも明記されるわけではないが、本明細書に記載の試薬は単なる例示であり、その等価物は当該技術分野において公知であることも理解されるべきである。

明細書及び特許請求の範囲において使用される、単数形「ａ」、「ａｎ」及び「ｔｈｅ」は、文脈上他に明確に指示されない限り、複数の参照を含む。例えば、用語「医薬的に許容される担体」としては、その混合物を含む複数の医薬的に許容される担体が挙げられる。

本明細書で用いられる、用語「含む」は、組成物及び方法が列挙された要素を含むが、他の要素を排除しないことを意味することを意図する。組成物及び方法を定義するために使用する場合、「から本質的になる」は、意図された使用のために、本質的な意味を持つ他の要素を組み合わせに含まないことを意味する。従って、本明細書で定義される要素から本質的になる組成物は、単離及び精製方法ならびにリン酸緩衝化生理食塩水、防腐剤などの医薬的に許容される担体から微量の汚染物質を排除しない。「からなる」とは、他の成分の微量を超える要素及び本開示の組成物を投与するための実質的な方法のステップを含まないことを意味する。これらの推移する用語のそれぞれにより定義される実施形態は、本開示の範囲内にある。

用語「タンパク質」及び「ポリペプチド」は、互換可能的に、これらの最も広義において、２つ以上のサブユニットアミノ酸、アミノ酸類似体またはペプチド模倣薬の化合物を指すために使用される。サブユニットはペプチド結合により結合し得る。別の実施形態においては、サブユニットは、例えばエステル、エーテルなどの他の結合により結合し得る。タンパク質またはペプチドは、少なくとも２つのアミノ酸を含まなければならず、タンパク質の配列またはペプチドの配列を含み得るアミノ酸の最大数に制限はない。本明細書で使用される用語「アミノ酸」は、グリシンならびにＤ光学異性体及びＬ光学異性体の両方、アミノ酸類似体及びペプチド模倣体を含む天然及び／または非天然もしくは合成アミノ酸のいずれかを指す。天然アミノ酸の１文字及び３文字の略語を、以下に列挙する。

「第Ｘａ因子」または「ｆＸａ」または「ｆＸａタンパク質」は、血液凝固経路におけるセリンプロテアーゼであり、これは、不活性第Ｘ因子から産生される（ｆＸ、配列番号１、表１）。ヒト第Ｘ因子（「ｆＸ」）をコードするヌクレオチド配列は、受託番号「ＮＭ＿０００５０４」でＧｅｎＢａｎｋにおいて見出すことができる。重鎖の最初の５２の残基の触媒的開裂により、ｆＸは活性化されｆＸａとなる。ＦＸａは軽鎖及び重鎖を含む。軽鎖の最初の４５のアミノ酸残基（配列番号１の残基１〜４５）は、翻訳後に修飾された１１個のγ−カルボキシグルタミン酸残基（Ｇｌａ）を含むため、Ｇｌａドメインと呼ばれる。また、短い（６のアミノ酸残基）芳香族スタック配列（配列番号１の残基４０〜４５）も含む。キモトリプシン消化は１〜４４の残基を選択的に除去し、Ｇｌａドメインを欠くｆＸａを生じる。ｆＸａのセリンプロテアーゼ触媒的ドメインは、Ｃ末端重鎖に位置する。ｆＸａの重鎖は、トロンビン、トリプシン、及び活性タンパク質Ｃなどの他のセリンプロテアーゼに対する相同性が高い。

「天然のｆＸａ」または「野生型ｆＸａ」は、血漿中に天然に存在するか、またはプロトロンビンを活性化する生物学的活性を処理し、従って、血餅の形成を促進する元の非修飾形態で単離されるｆＸａを指す。この用語には、組織試料から単離された天然に存在するポリペプチド、及び組換え産生されたｆＸａが含まれる。「活性ｆＸａ」はプロトロンビンを活性化する凝血促進活性を有するｆＸａを指す。「活性ｆＸａ」は、凝固促進活性を保持する天然ｆＸａまたは改変ｆＸａであり得る。

本明細書で用いられる「ｆＸａ解毒剤」、「解毒剤」、または「ｆＸａ誘導体」は、プロトロンビナーゼ複合体への組み込みにおいてｆＸａと競合せず、凝固促進活性または触媒活性が低下しているか、もしくはなく、更にｆＸａインヒビターなどの抗凝固剤と結合及び／またはそれを実質的に中和する改変されたｆＸａタンパク質を指す。いくつかの態様においては、ｆＸａタンパク質またはｆＸａ誘導体の「凝固促進活性」は、野生型活性ｆＸａポリペプチドが保持する酵素活性を指す。ｆＸａ誘導体の例は、米国特許第８，１５３，５９０号、及びＰＣＴ公報ＷＯ２００９／０４２９６２及びＷＯ２０１０／０５６７６５に提供され、配列番号２及び３及びそれらの生物学的等価物などが本明細書に更に提供される。

ｆＸａポリペプチドまたはその誘導体の「酵素活性」は、基質との直接的な相互作用を介して、基質との生化学反応を触媒するポリペプチドの能力を指す。

配列番号２は、野生型ｆＸａと比較して３つの突然変異を含む。第１の突然変異は、ｆＸのＧｌａドメインにおける６〜３９ａａの欠損である。第２の突然変異は、活性化ペプチド配列１４３〜１９４ａａの−ＲＫＲ−との置換である。これにより、軽鎖（配列番号４）及び重鎖（配列番号５）を結合する−ＲＫＲＲＫＲ−（配列番号６）リンカーが生成される。分泌すると、このリンカーは切断され、二重鎖ポリペプチド、配列番号３（ｒ−Ａｎｔｉｄｏｔｅ）をもたらす。第３の突然変異は、活性部位残基Ｓ３７９のＡｌａ残基への突然変異である。このアミノ酸置換は、配列番号１及び３のアミノ酸２９６及び２９０にそれぞれ対応する。

解毒剤の例は、リンカーの切断後、配列番号２のプロセシングされた二重鎖ポリペプチドプロセシング産物を指す「ｒ−Ａｎｔｉｄｏｔｅ」である。これは、配列番号３により示される。ｒ−Ａｎｔｉｄｏｔｅは、例えばＵＳ８，１５３，５９０に開示され、その内容は参考により本開示に組み込まれる。ｒ−Ａｎｔｉｄｏｔｅは、軽鎖のシステイン９８（Ｃｙｓ９８）との重鎖のシステイン１０８（Ｃｙｓ１０８）との間の単一のジスルフィド結合で結合された軽鎖（配列番号４）及び重鎖（配列番号５）を含む。野生型ｆＸａと同様に、特定の産生バッチにおいては、ｒ−Ａｎｔｉｄｏｔｅは翻訳後修飾を受けて、例えば、軽鎖のＳｅｒ５６、Ｓｅｒ７２、Ｓｅｒ７６及びＴｈｒ８２及び重鎖のＴｈｒ２４９などの特定のアミノ酸残基ならびに修飾された残基、軽鎖のＡｓｐ２９での（３Ｒ）−３−ヒドロキシＡｓｐなどの特定のアミノ酸残基でグリコシル化される。更に、鎖間のジスルフィド結合に加えて、軽鎖のシステイン１６と２７との間、２１と３６との間、３８と４７との間、５５と６６との間、６２と７５との間、７７と９０との間ならびに重鎖のシステイン７と１２との間、２７と４３との間、１５６と１７０との間、及び１８１と２０９との間に形成された鎖内のジスルフィド結合が存在することができる。

解毒剤の他の例は、ｒ−Ａｎｔｉｄｏｔｅ（または配列番号２に示されるそれらの前駆体）の生物学的等価物か、あるいは配列番号３に特定の配列同一性を有するポリペプチドであり得る。一態様においては、かかる生物学的等価物は、配列番号３の構造滴特性、つまり、修飾された活性部位及び欠失または修飾されたＧｌａドメインを保持する。別の態様においては、かかる生物学的等価物は、配列番号３の機能的特性、つまり、プロトロンビナーゼ複合体への組み込みにおいてｆＸａと競合しないこと及び凝固促進（例えば、酵素的または触媒的）活性が低下しているか、またはないことを保持する。

用語「活性部位」は化学反応が起こる酵素または抗体の部分を指す。「改変された活性部位」は、化学的反応性または特異性の増加または減少した活性部位をもたらすように構造的に改変された部位である。活性部位の例としては、２３５〜４８８のアミノ酸残基を含むヒト第Ｘ因子の触媒ドメイン及び１９５〜４４８のアミノ酸残基を含むヒト第Ｘａ因子の触媒ドメインが挙げられるが、これらに限定されない。改変された活性部位の例としては、位置Ａｒｇ３０６、Ｇｌｕ３１０、Ａｒｇ３４７、Ｌｙｓ３５１、Ｌｙｓ４１４またはＡｒｇ４２４での少なくとも１つのアミノ酸置換を有する、配列番号１の１９５〜４４８のアミノ酸残基を含むヒト第Ｘａ因子の触媒ドメインが挙げられるが、これらに限定されない。

解毒剤の調製
実験例（実施例１及び２）は、ｆＸａ解毒剤を調製するための培養及び精製方法の開発を実証した。培養された細胞は、配列番号７の核酸配列または配列番号７によりコードされるアミノ酸配列に少なくとも９０％の配列同一性（もしくは少なくとも９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％または９９％の配列同一性）を有するアミノ酸配列をコードする核酸配列を含むポリヌクレオチドコンストラクトを含む。細胞は通常、チャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞である。

精製方法の１つは図１に例示される。細胞を収集（ステップ１０１）し、デプスフィルタを用いて清澄化し、高分子重量（ＨＷＭ）の不純物を除去した後、試料を濃縮した（例えば、約１０倍）（ステップ１０２）。濃縮ステップは制限なく、再生セルロースを使用することができる。ステップ１０３において、ウィルス不活性化（例えば、１％のトリトンＸ−１００、０．３％のトリブチルホスフェート（最終濃度）などの界面活性剤／溶媒を用いて）を行い、細胞培養における外被に覆われたウィルスを不活性化することができる。ウィルスの除去に続いて、ステップ１０４（混合モードカチオン交換）、１０５（混合モードアニオン交換）及び１０６（混合モードイオン交換）を行い、宿主細胞タンパク質及びＤＮＡを除去し、解毒剤を捕捉する。ステップ１０７では、疎水性相互作用樹脂を使用し、更に残存する宿主細胞タンパク質を除去することができる。場合により、これらの精製ステップの後に、最終的なウィルス除去濾過ステップを用い、全ての残存するウィルスを除去することができる。

別の実施形態においては、精製ステップは図２に例示され、実施例２において実証される。いくつかの実施形態においては、方法はポリヌクレオチドコンストラクト（例えば、配列番号７）及びポリヌクレオチドコンストラクトから発現したポリペプチド生成物（例えば、配列番号３）を含む試料に界面活性剤を添加することを含む。いくつかの実施形態においては、界面活性剤はトリトンＸ−１００を含む。いくつかの実施形態においては、試料がその後の親和性精製に供される前に、試料を処理するために溶媒は使用されない。いくつかの実施形態においては、試料がその後の親和性精製に供される前に、試料を処理するために有機溶媒は使用されない。いくつかの実施形態においては、試料がその後の親和性精製に供される前に、試料にトリブチルホスフェートは添加されない。

いくつかの実施形態においては、次いで試料を大豆トリプシンインヒビター（ＳＴＩ）ベースのアフィニティークロマトグラフに充填し、溶出緩衝液で溶出して溶出された試料を生成する。いくつかの実施形態においては、充填された試料は有機溶媒で処理されていないか、または有機溶媒を含まない。

「ＳＴＩ」または「大豆トリプシンインヒビター」は、大豆またはその生物学的等価物から単離されたトリプシンインヒビターを指す。トリプシンインヒビターは、サイズが約２０ｋＤａであり、トリプシン（タンパク質分解酵素）及び血漿カリクレイン、第Ｘａ因子及びプラスミン活性を低下させる。ＳＴＩは、Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ（Ｇｒａｎｄ Ｉｓｌａｎｄ，ＮＹ）などの供給業者から市販で入手可能である。ＳＴＩの例は、ＧｅｎＢａｎｋ受託番号ＮＰ＿００１２３８６１１を有するダイズ（大豆）由来のＫＴＩ３ Ｋｕｎｉｔｚトリプシンインヒビターである。

特定のタンパク質の精製のため、ＳＴＩを固体支持体樹脂上に固定化することができる。大豆トリプシンインヒビターに加えて、血清、ライマメ、ウシ膵臓、もしくはオボムコイドから単離されたもの、またはそれらの改変された形態などの他のトリプシンインヒビタータンパク質もまた利用することができる。また、特定のプロテアーゼインヒビター、特にセリンプロテアーゼインヒビターを使用して、解毒剤を精製する目的で親和性樹脂を調製できることも想到される。次いで、解毒剤を、アルギニンを含む緩衝液で溶出してもよい。いくつかの実施形態においては、溶出緩衝液は少なくとも０．２Ｍ、０．５Ｍ、０．６Ｍ、０．７Ｍ、０．８Ｍ、０．９Ｍ、１Ｍ、１．１Ｍ、１．２Ｍ、１．３Ｍ、１．４Ｍ、１．５Ｍ、または２Ｍのアルギニンを含む。いくつかの実施形態においては、溶出緩衝液は約０．５Ｍ〜２Ｍのアルギニン、または約０．７Ｍ〜１．５Ｍのアルギニン、または０．８Ｍ〜１．２Ｍのアルギニンを含む。いくつかの実施形態においては、溶出緩衝液は約４．５〜６、または４．６〜５．６、または４．７〜５．５、または４．８〜５．４、または５〜５．４、または５．１〜５．３または約５．２のｐＨを有する。一実施形態においては、溶出緩衝液はｐＨ５．２で２５ｍＭの酢酸ナトリウム、１．０Ｍのアルギニンを含む。

いくつかの実施形態においては、次いで、試料をイオン交換及び混合モードクロマトグラフに充填する。イオン交換及び混合モードクロマトグラフの非限定例としては、セラミックヒドロキシアパタイトタイプＩクロマトグラフが挙げられる。次いで、試料を、無機塩を含む溶出緩衝液で溶出してもよい。いくつかの実施形態においては、無機塩は塩化ナトリウムまたは塩化カリウムである。いくつかの実施形態においては、溶出緩衝液における塩の濃度は、少なくとも０．５Ｍ、１Ｍ、１．５Ｍ、２Ｍ、２．５Ｍまたは３Ｍである。

いくつかの実施形態においては、溶出は、平衡緩衝液と溶出緩衝液との間に発生した勾配の使用を伴う。均衡緩衝液は、いくつかの実施形態においては、例えば０．２Ｍ未満、０．１Ｍ未満、５０ｍＭ未満、２０ｍＭ未満、１０ｍＭ未満などのより低い濃度の塩を含む。いくつかの実施形態においては、勾配は、少なくとも５倍、または１０倍、または２０倍、または５０倍、または１００倍の塩の濃度の増加を含む。いくつかの実施形態においては、ｐＨ７．０で、平衡緩衝液は５０ｍＭのＭＥＳ（２−（Ｎ−モルホリノ）エタンスルホン酸、５ｍＭのリン酸ナトリウムを含む。いくつかの実施形態においては、ｐＨ７．０で溶出緩衝液は５０ｍＭのＭＥＳ、５ｍＭのリン酸ナトリウム、２Ｍの塩化ナトリウムを含む。いくつかの実施形態においては、勾配は約９０％の平衡緩衝液で開始し、約９０％の溶出緩衝液で終了する。

いくつかの実施形態においては、試料を更に疎水性相互作用クロマトグラフに充填する。いくつかの実施形態においては、疎水性相互作用クロマトグラフはオクチルセファロースクロマトグラフを含む。いくつかの実施形態においては、試料を、少なくとも２ｍＭの塩化ナトリウム、あるいは少なくとも１Ｍ、１．５Ｍ、２．５Ｍ、３Ｍ、４Ｍまたは５Ｍの塩化ナトリウムを含む溶出緩衝液で溶出する。

いくつかの実施形態においては、上記の中間体試料の１つを、更にアニオン交換クロマトグラフでの精製ステップに供する。いくつかの実施形態においては、アニオン交換クロマトグラフは、Ｓａｒｔｏｂｉｎｄ（商標）イオン交換膜を含む。いくつかの実施形態においては、アニオン交換クロマトグラフはアフィニティークロマトグラフの後に適用される。

いくつかの実施形態においては、上記の中間体試料の１つを、更にナノフリースフィルタでの濾過に供する。いくつかの実施形態においては、ナノフリースフィルタでの濾過は、試料をＳＴＩベースのアフィニティークロマトグラフに充填する前に適用される。

いくつかの実施形態においては、精製された試料は、宿主細胞タンパク質または親和性樹脂／カラムから放出されたＳＴＩなどのポリヌクレオチドコンストラクトにより発現されたものではない約１％未満の汚染タンパク質を含む。

上記の実施形態のいずれかの精製プロセスは、少なくとも約５０％（または少なくとも約４０％、４５％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％もしくは８５％）の、細胞培養において発現された解毒剤タンパク質を回収することができる。いくつかの実施形態においては、細胞は、培養液１リットルあたり少なくとも１００ｍｇのポリペプチド生成物を産生する条件下で、培養液中で増殖される。いくつかの実施形態においては、細胞は、培養液１リットルあたり少なくとも１２０ｍｇ（または少なくとも２１０ｍｇ、２２０ｍｇ、２３０ｍｇ、２４０ｍｇ、２５０ｍｇ、２７０ｍｇ、２８０ｍｇ、２９０ｍｇ、３００ｍｇ、３１０ｍｇ、３２０ｍｇ、３３０ｍｇ、３４０ｍｇ、もしくは３５０ｍｇ）のポリペプチド生成物を産生する条件下で培養液中で増殖する。いくつかの実施形態においては、精製された試料は、培養液１リットルあたりの産生量から、約５０ｍｇ超（または少なくとも５５ｍｇ、６０ｍｇ、７０ｍｇ、８０ｍｇ、９０ｍｇ、１００ｍｇ、１１０ｍｇ、１２０ｍｇ、１３０ｍｇ、１４０ｍｇ、１５０ｍｇ、１６０ｍｇ、１７０ｍｇ、１８０ｍｇ、１９０ｍｇもしくは２００ｍｇ）のポリペプチド生成物を含む。

精製された生成物における解毒剤異性体
本開示の実施形態のいずれかの方法からの精製された解毒剤生成物は、軽鎖及び重鎖を含むと考えられる。しかし、培養及び精製プロセスは、実際のタンパク質に変化を導入し得る。

実施例３に実証するように、精製された試料における約２０％〜５０％のポリペプチド生成物は、未変化の重鎖（配列番号５）を有する。未変化の重鎖を有するこれらの中で、約５％〜９５％の重鎖は２つのＯ−結合グリコシル化を有し、約５％〜９５％の重鎖は１つのＯ−結合グリコシル化を有する。

いくつかの実施形態においては、精製された試料における少なくとも約２０％、２５％、３０％、３５％、４０％または４５％のポリペプチド生成物は未変化の重鎖を有する。いくつかの実施形態においては、精製された試料における約４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、または８０％以下のポリペプチド生成物は未変化の重鎖を有する。

いくつかの実施形態においては、精製された試料における約４０％〜８０％のポリペプチド生成物は、Ｃ末端リジンを欠失する重鎖（配列番号８）を有する。いくつかの実施形態においては、配列番号８は、精製された試料の少なくとも約２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％または５０％を構成する。いくつかの実施形態においては、配列番号８は、精製された試料の約４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％または９０％以下を構成する。いくつかの実施形態においては、少なくとも約９０％の配列番号８の重鎖は、１つのＯ−結合グリコシル化を有する。

いくつかの実施形態においては、精製された試料における約２％〜１２％のポリペプチド生成物は、１３のＣ末端アミノ酸残基を欠失する重鎖（配列番号９）を有する。いくつかの実施形態においては、配列番号９は、精製された試料の少なくとも約０．５％、１％、１．５％、２％、２．５％、３％または５％を構成する。いくつかの実施形態においては、配列番号９は、精製された試料の約２％、３％、４％、５％、７％、１０％、１５％、１７％、または２０％以下を構成する。

いくつかの実施形態においては、精製された試料における約０．１％〜１．５％のポリペプチド生成物は、１４のＣ末端アミノ酸残基を欠失する重鎖（配列番号１０）を有する。いくつかの実施形態においては、配列番号１０は、精製された試料の少なくとも約０．０５％、０．１％、０．１５％、０．２％、０．２５％、０．３％または０．５％を構成する。いくつかの実施形態においては、配列番号１０は、精製された試料の約０．５％、０．６％、０．７％、０．８％、０．９％、１％、１．５％、２％、２．５％または３％以下を構成する。

いくつかの実施形態においては、精製された試料における約２％〜８％のポリペプチド生成物は、１５のＣ末端アミノ酸残基を欠失する重鎖（配列番号１１）を有する。いくつかの実施形態においては、配列番号１１は、精製された試料の少なくとも約０．５％、１％、１．５％、２％、２．５％、３％または５％を構成する。いくつかの実施形態においては、配列番号１１は、精製された試料の約５％、６％、７％、８％、９％、または１０％以下を構成する。

実施例３はまた、精製された試料における約３５％〜６０％のポリペプチド生成物が未変化の軽鎖（配列番号４）を有する一方、他のいくつかは改変または切断される可能性があることを示す。いくつかの実施形態においては、軽鎖の総数における未変化の軽鎖の量は、少なくとも約２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％または５０％である。いくつかの実施形態においては、軽鎖の総数における未変化の軽鎖の量は、約４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、８０％または９０％以下である。

いくつかの実施形態においては、本開示は、医薬的に許容される担体及び二重鎖ポリペプチドのポリペプチド部分を含む医薬品であって、約３５％〜６０％の二重鎖ポリペプチドが配列番号４のアミノ酸配列からなる軽鎖を有する医薬品を提供する。いくつかの実施形態においては、約２０％〜５０％の二重鎖ポリペプチドは配列番号５のアミノ酸配列からなる重鎖を有する。いくつかの実施形態においては、約４０％〜８０％の二重鎖ポリペプチドは配列番号８のアミノ酸配列からなる重鎖を有する。いくつかの実施形態においては、約１０％、９％、８％、７％、６％、５％、４％または３％未満の二重鎖ポリペプチドは配列番号９のアミノ酸配列からなる重鎖を有する。いくつかの実施形態においては、約０．１％〜１．５％の二重鎖ポリペプチドは、配列番号１０のアミノ酸配列からなる重鎖を有する。いくつかの実施形態においては、約２％〜８％の二重鎖ポリペプチドは配列番号１１のアミノ酸配列からなる重鎖を有する。

いくつかの実施形態においては、配列番号５のアミノ酸配列からなる重鎖の約５％〜９５％は、２つのＯ−結合グリコシル化を有する。いくつかの実施形態においては、配列番号５のアミノ酸配列からなる重鎖の約５％〜９５％は、１つのＯ−結合グリコシル化を有する。いくつかの実施形態においては、配列番号８のアミノ酸配列からなる重鎖の少なくとも約９０％は、１つのＯ−結合グリコシル化を有する。

製剤、方法及び投与量
精製された解毒剤タンパク質生成物で調製された製剤もまた提供される。いくつかの実施形態においては、凍結乾燥に好適な水性製剤が提供される。一実施形態においては、製剤は、可溶化剤、安定化剤（または安定剤）、及び結晶性作用物質と共に解毒剤を含む。製剤は界面活性剤及び／または緩衝剤を更に含んでもよい。いくつかの態様においては、これらの作用剤の各々の存在により、凍結乾燥の間、例えば、凍結乾燥温度が−４０℃、−３０℃、−２０℃、−１０℃、０℃、５℃、１０℃、または１５℃より高く、２０℃または２５℃と同等の高さである場合に、解毒剤の崩壊が防止される。

「結晶質成分」は、ポリペプチドを含む製剤において、凍結乾燥プロセスの間、結晶質マトリクスを形成する分子を指す。結晶質成分の非限定例としては、マンニトール及びグリシンが挙げられる。

いくつかの態様においては、結晶質成分はマンニトール（例えば、結晶性マンニトール）である。一態様においては、水性製剤における結晶質成分の濃度は、少なくとも１％（ｗ／ｖ）である。一態様においては、水性製剤における結晶質成分の濃度は、少なくとも１．５％、２％、２．５％、３％、３．５％、または４％（ｗ／ｖ）である。一態様においては、水性製剤における結晶質成分の濃度は、８％よりも高くないか、あるいは７％、６．５％、６％、５．５％、５％、４．５％または４％（ｗ／ｖ）よりも高くない。一態様においては、水性製剤における結晶質成分の濃度は、約１％〜約８％、または約２％〜約６％、または約３％〜約５．５％、または約４．５％〜約５．５％、または約４．６％〜約５．４％、または約４．７％〜約５．３％、または約４．８％〜約５．２％、または約４．９％〜約５．１％、または約４％、４．５％、または５％（ｗ／ｖ）である。

いくつかの態様においては、可溶化剤は水性製剤中に含まれる。用語「可溶化剤」は、溶液中に存在する場合、溶液中の別の分子（例えば、活性成分）の溶解度を増加させる塩、イオン、炭水化物、複合体形成剤、ポリマー及び他の化合物を指す。可溶化剤の非限定例としては、アルギニン及びクエン酸が挙げられる。一態様においては、可溶化剤はアルギニンである。一態様においては、可溶化剤はクエン酸である。

可溶化剤の存在は、ｆＸａポリペプチドを製剤中に可溶性及び安定に保つのに有用であり得る。いくつかの態様においては、可溶化剤（例えば、アルギニン）の濃度は、少なくとも１０ｍＭ、あるいは少なくとも２０ｍＭ、２５ｍＭ、３０ｍＭ、３６ｍＭ、または４０ｍＭである。いくつかの態様においては、可溶化剤（例えば、アルギニン）の濃度は、１００ｍＭ、９６ｍＭ、９０ｍＭ、８０ｍＭ、７０ｍＭ、６０ｍＭまたは５０ｍＭよりも高くない。いくつかの態様においては、可溶化剤の濃度は約１０ｍＭまたは２０ｍＭ〜約６０ｍＭ、約１０ｍＭまたは２０ｍＭ〜約５５ｍＭ、約３５ｍＭ〜約５５ｍＭ、約４０ｍＭ〜約５０ｍＭ、約４１ｍＭ〜約４９ｍＭ、約４２ｍＭ〜約４８ｍＭ、約４３ｍＭ〜約４７ｍＭ、約４４ｍＭ〜約４６ｍＭ、または４０ｍＭ、４５ｍＭまたは５０ｍＭである。本明細書で使用されるアルギニンという用語は、アミノ酸及びその塩（例えば、アルギニンＨＣｌ）を指すことに留意されたい。アルギニンは約１７４．２ダルトンの分子量を有し、アルギニンＨＣｌ（例えば、Ｌ−アルギニンＨＣｌ、Ｌ−アルギニンアセテート）は約２１０．７ダルトンの分子量を有する。

一実施形態においては、可溶化剤はクエン酸またはその塩である。クエン酸の塩はクエン酸ナトリウムである。一態様においては、クエン酸は約１．０ｍＭ〜約２００．０ｍＭの濃度を含む。更なる態様においては、クエン酸の濃度は約２５ｍＭである。別の態様においては、クエン酸の濃度は約５０ｍＭである。更なる実施形態においては、クエン酸の濃度は約５ｍＭ、１０ｍＭ、または２０ｍＭである。別の実施形態においては、クエン酸は約０．０５ｍＭ〜約０．２ｍＭの濃度を含む。

いくつかの態様においては、安定剤は水性製剤中に含まれる。用語「安定剤」は、製造、貯蔵及び適用中の化学的及び／または物理的分解から有効成分（例えば、ｆＸａ誘導体ポリペプチド）及び／または製剤を保護する医薬的に許容される賦形剤を意味する。安定剤の例としては、スクロース、アルギニン、クエン酸、マンニトール、トレハロース、グリシン、塩化ナトリウム、デキストラン及びグルコースが挙げられる。一態様においては、安定剤はスクロースである。

一態様においては、水性製剤における安定剤（例えば、スクロース）の濃度は、少なくとも約０．５％（ｗ／ｖ）である。一態様においては、水性製剤における安定剤（例えば、スクロース）の濃度は、少なくとも約０．６％、０．７％、０．８％、０．９％、１％、１．１％、１．２％、１．３％、１．４％、１．５％、１．６％、１．７％、１．８％、１．９％または２％（ｗ／ｖ）である。一態様においては、水性製剤における安定剤（例えば、スクロース）の濃度は、約５％、４．５％、４％、３．５％、３％、２．５％または２％（ｗ／ｖ）を超えない。一態様においては、水性製剤における安定剤（例えば、スクロース）の濃度は、約１％〜約５％、または約１％〜約４％、または約１％〜約３％、または約１．５％〜約２．５％、または約１．６％〜約２．４％、または約１．７％〜約２．３％、または約１．７％〜約２．２％、または約１．９％〜約２．１％、または約１％、１．５％、２％、２．５％または３％（ｗ／ｖ）である。

いくつかの態様においては、水性製剤は、界面活性剤、緩衝剤、等張剤、抗凍結剤、界面活性剤、凍結保護剤、防腐剤またはそれらの組み合わせを更に含むことができる。

いくつかの態様においては、水性製剤は６以上、または６．５以上、または７以上、または７．５以上のｐＨを有する。いくつかの態様においては、ｐＨは９、８．５、または８よりも高くない。いくつかの態様においては、ｐＨは６〜９、６．５〜８．５、７〜８．５、７．５〜８．２、７．６〜８．１、７．７〜７．９、または約７．５、７．６、７．７、７．８、７．９、もしくは８である。

一態様においては、水性製剤は約４５ｍＭのアルギニン、約２％のスクロース（ｗ／ｖ）、約５％のマンニトール（ｗ／ｖ）及び約１０ｍｇ／ｍＬの二重鎖ｒ−Ａｎｔｉｄｏｔｅを含み、この製剤は約７．８のｐＨを有する。一態様においては、水性製剤は約４５ｍＭのアルギニン、約２％のスクロース（ｗ／ｖ）、約５％のマンニトール（ｗ／ｖ）及び約２０ｍｇ／ｍＬの二重鎖ｒ−Ａｎｔｉｄｏｔｅを含み、この製剤は約７．８のｐＨを有する。一態様においては、水性製剤は約４５ｍＭのアルギニン、約２％のスクロース（ｗ／ｖ）、約５％のマンニトール（ｗ／ｖ）及び約４０ｍｇ／ｍＬの二重鎖ｒ−Ａｎｔｉｄｏｔｅを含み、この製剤は約７．８のｐＨを有する。一態様においては、水性製剤は０．０１％〜０．０２％（ｗ／ｖ）のポリソルベート８０及び緩衝液を更に含む。

いくつかの態様においては、本開示の水性製剤を凍結乾燥することにより調製された凍結乾燥された組成物もまた提供される。水性製剤における各作用剤の濃度に基づき、凍結乾燥された組成物における作用剤の相対含有量を即座に決定できる。

一態様においては、凍結乾燥された組成物は少なくとも５％、あるいは少なくとも１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、または３５％（ｗ／ｗ）のｆＸａ解毒剤を含む。次いで、他の主成分内で、例えば、Ｌ−アルギニンＨＣｌ：スクロース：マンニトールの重量比は、（０．５〜１．４）：（１〜３）：（２〜６）の範囲であり得る。いくつかの態様においては、Ｌ−アルギニンＨＣｌ：スクロース：マンニトールの重量比は、（０．９〜１）：（１．５〜２．５）：（４．５〜５．５）、または（０．９１〜０．９９）：（１．６〜２．４）：（４．６〜５．４）、または（０．９２〜０．９８）：（１．７〜２．３）：（４．７〜５．３）、（０．９３〜０．９７）：（１．８〜２．２）：（４．８〜５．２）、または（０．９４〜０．９６）：（１．９〜２．１）：（４．９〜５．１）の範囲である。いくつかの態様においては、凍結乾燥された組成物は、界面活性剤及び／または緩衝液の固体部分を更に有する。

本開示はまた、ｆＸａインヒビターでの抗凝固療法を受けている対象における出血を治療、予防または軽減する治療方法であって、適切な溶媒に溶解される有効量の凍結乾燥された製剤を対象に投与することを含む治療方法に関する。本開示の解毒剤または誘導体は、待機的または緊急の状況で使用される短期間薬剤であり得、有害な血行力学的副作用または損傷に対する増殖性血管反応の増悪を引き起こさずにｆＸａインヒビターの従来の抗凝固特性を安全かつ特異的に中和することができることが想到される。

本明細書で用いられる用語「治療すること」、「治療」等は、所望の薬理的及び／または生理的効果を得ることを意味するために本明細書で使用される。その効果は、疾患またはその徴候もしくは症状を完全または部分的に予防することに関して予防的であり得、及び／または疾患及び／または疾患に起因する有害作用を部分的または完全に治癒することに関して治療的であり得る。

「治療すること」はまた、哺乳動物における疾患の任意の治療を包含し、（Ａ）罹患し得る傾向にあるが、まだ罹患していると診断されていない可能性がある対象において疾患が生じることを予防する（例えば、抗凝固剤の過剰摂取を伴う患者における出血を予防する）こと、（ｂ）疾患を阻害する（すなわちその発生を阻止すること、例えば出血を抑制する）こと、または（ｃ）疾患を軽減または改善する（例えば、出血を減少させる）ことを含む。

本明細書で用いられる「治療する」は、病状に関連する症状の全身的改善及び／または症状の発症の遅延を更に含む。「治療」の臨床的及び亜臨床的証拠は、病理学、個体及び治療によって変化する。

「投与」は、治療の過程全体にわたって、１回の投与で、連続してまたは断続的に行うことができる。投与の最も有効な手段及び投与量を決定する方法は、当業者に公知であり、治療に使用される組成物、治療の目的、治療される標的細胞、及び治療される対象によって変化する。治療する医師により選択される用量レベル及びパターンに応じて単一または複数回投与を行うことができる。投与する薬剤の好適な用量の製剤及び方法は、当該技術分野において公知である。診断または治療の「対象」は、細胞またはヒトを含む哺乳動物である。診断または治療の非ヒト動物対象としては、例えば、ラット、マウスなどのマウス、イヌなどのイヌ科動物、ウサギなどのウサギ科動物、家畜、スポーツ用の動物、及びペットが挙げられる。

本開示の薬剤及び組成物は、薬剤の製造において、ならびに医薬組成物中の有効成分などの従来の手順に従って投与することによって、ヒト及び他の動物の治療用に使用することができる。

本開示の薬剤は、任意の好適な経路により、特に非経口（皮下、筋肉内、静脈内及び皮内を含む）投与により、治療のために投与することができる。また、好ましい経路は、受容者の状態及び年齢、ならびに治療される疾患によって変化することも理解されよう。

表現「医薬的に許容されるポリマー」は、１つ以上の本明細書に記載のポリペプチドに結合することができる化合物の群を指す。ポリマーのポリペプチドへの結合は、ポリペプチドのｉｎ ｖｉｖｏ及びｉｎ ｖｉｔｒｏの半減期を延長することができることが想到される。非限定例としては、ポリエチレングリコール、ポリビニルピロリドン、ポリビニルアルコール、セルロース誘導体、ポリアクリレート、ポリメタクリレート、糖類、ポリオール及びこれらの混合物が挙げられる。

「抗凝固薬」または「抗凝固剤」は血餅形成を阻害する薬剤である。抗凝固剤の例としては、トロンビン、第ＩＸａ因子、第Ｘａ因子、第ＸＩａ因子、第ＸＩＩａ因子または第ＶＩＩａ因子に特異的なインヒビター、ヘパリン及び誘導体、ビタミンＫ拮抗剤、ならびに抗組織因子抗体が挙げられるが、これらに限定されない。トロンビンの特定のインヒビターの例としては、ヒルジン、ビバリルジン（Ａｎｇｉｏｍａｘ（商標登録））、アルガトロバン及びレピルジン（Ｒｅｆｌｕｄａｎ（商標登録））が挙げられる。ヘパリン及び誘導体の例としては、未分画ヘパリン（ＵＦＨ）、エノキサパリン（Ｌｏｖｅｎｏｘ（商標登録）、ダルテパリン（Ｆｒａｇｍｉｎ（商標登録）、及びダナパロイド（Ｏｒｇａｒａｎ（商標登録））などの低分子量ヘパリン（ＬＭＷＨ）、フォンダパリヌクス（Ａｒｉｘｔｒａ（商標登録））などの合成五糖類が挙げられる。ビタミンＫ拮抗剤の例としては、ワルファリン（Ｃｏｕｍａｄｉｎ（商標登録））、フェノクマロール、アセノクマロール（Ｓｉｎｔｒｏｍ（商標登録））、クロリンジオン、ジクマロール、ジフェナジオン、エチルビスクムアセテート、フェンプロクモン、フェニンジオン、及びチオクロマロールが挙げられる。一実施形態においては、抗凝固剤は第Ｘａ因子のインヒビターである。一実施形態においては、抗凝固剤はベトリキサバンである。

「抗凝固治療」は、望ましくない血餅または血栓症を予防するために患者に投与される治療法を指す。抗凝固治療は、患者における望ましくない血餅または血栓症を治療または予防するのに好適な用量及び計画で、１つのまたは２つ以上の抗凝固剤もしくは他の薬剤の組み合わせを投与することを含む。

用語「第Ｘａ因子インヒビター」または「第Ｘａ因子のインヒビター」は、ｉｎ ｖｉｔｒｏ及び／またはｉｎ ｖｉｖｏでのプロトロンビンのトロンビンへの変換を触媒する凝固因子Ｘａの活性を、直接的または間接的に阻害することができる化合物を指す。

「直接型第Ｘａ因子インヒビター」はｆＸａに直接結合し、非限定例としては、ＮＡＰ−５、ｒＮＡＰｃ２、組織因子経路インヒビター（ＴＦＰＩ）、ＤＸ−ＤＸ−９０６５ａ（例えば、Ｈｅｒｂｅｒｔ，Ｊ．Ｍ．，ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｐｈａｒｍａｃｏｌ Ｅｘｐ Ｔｈｅｒ．１９９６ ２７６（３）：１０３０−８に記載される）、ＹＭ−６０８２８（例えば、Ｔａｎｉｕｃｈｉ，Ｙ．，ｅｔ ａｌ，Ｔｈｒｏｍｂ Ｈａｅｍｏｓｔ．１９９８ ７９（３）：５４３−８に記載される）、ＹＭ−１５０（例えば、Ｅｒｉｋｓｓｏｎ，Ｂ．Ｉ．ｅｔ．ａｌ，Ｂｌｏｏｄ ２００５；１０６（１１），Ａｂｓｔｒａｃｔ １８６５に記載される）、アピキサバン、リバーロキサバン、ＴＡＫ−４４２、ＰＤ−３４８２９２（例えば、Ｐｉｐｅｌｉｎｅ Ｉｎｓｉｇｈｔ：Ａｎｔｉｔｈｒｏｍｂｏｔｉｃｓ−Ｒｅａｃｈｉｎｇ ｔｈｅ Ｕｎｔｒｅａｔｅｄ Ｐｒｏｐｈｙｌａｘｉｓ Ｍａｒｋｅｔ，２００７に記載される）、オタミキサバン、エドキサバン（例えば、Ｈｙｌｅｋ ＥＭ，Ｃｕｒｒ Ｏｐｉｎ Ｉｎｖｅｓｔ Ｄｒｕｇｓ ２００７ ８（９）：７７８−７８３に記載される）、ＬＹ５１７７１７（例えば、Ａｇｎｅｌｌｉ，Ｇ．，ｅｔ ａｌ，Ｊ．Ｔｈｒｏｍｂ．Ｈａｅｍｏｓｔ．２００７ ５（４）：７４６−５３に記載される）、ＧＳＫ９１３８９３、ラザキサバン、ベトリキサバンまたは薬学的に許容されるそれらの塩及びそれらの組み合わせが挙げられる。特定の態様においては、直接型第Ｘａ因子インヒビターはリバーロキサバンである。いくつかの態様においては、直接型ｆＸａインヒビターは低分子の化学化合物である。

「間接型第Ｘａ因子インヒビター」のｆＸａ活性の阻害は１つ以上の他の因子により媒介される。間接型第Ｘａ因子インヒビターの非限定例としては、フォンダパリヌクス、イドラパリナックス、ビオチン化されたイドラパリナックス、エノキサパリン、フラグミン、チンザパリン、低分子量ヘパリン（「ＬＭＷＨ］）、及びそれらの組み合わせが挙げられる。特定の態様においては、間接型第Ｘａ因子インヒビターはエノキサパリンである。

一実施形態においては、第Ｘａ因子インヒビターは、ベトリキサバン、リバーロキサバン、ＬＭＷＨ、ＤＸ−９０６５ａ、ＹＭ−６０８２８、ＹＭ−１５０、ＰＤ−３４８２９２、オタミキサバン、エドキサバン、ＬＹ５１７７１７、ＧＳＫ９１３８９３、ラザキサバン、アピキサバン、及びそれらの組み合わせから選択される。

用語「ベトリキサバン」は、化合物「［２−（｛４−［（ジメチルアミノ）イミノメチル］フェニル｝カルボニルアミノ）−５−メトキシフェニル］−Ｎ−（５−クロロ（２−ピリジル））カルボキサミド」または薬学的に許容されるその塩を指す。ベトリキサバンは、米国特許第６，３７６，５１５号、６，８３５，７３９号及び７，５９８，２７６号に記載されており、その内容は本明細書に参照により組み込まれる。ベトリキサバンは第Ｘａ因子の特異的インヒビターとして知られる。

ｆＸａのインヒビターの活性を「中和する」「拮抗する」または「相殺する」または同様の表現は、ｆＸａインヒビターの第Ｘａ因子阻害機能または抗凝固機能を阻害または防止することを指す。かかる表現は、ｉｎ ｖｉｔｒｏ及び／またはｉｎ ｖｉｖｏにおいて、機能の部分的な阻害または防止、及びｆＸａインヒビター活性の大部分または全てを阻害または防止することを指す。

「有効量」は、所望の生物学的及び／または治療的結果をもたらすのに十分な誘導体の量を指す。その結果は、疾患の徴候、症状、もしくは原因の軽減、または生物系の任意の他の所望の改変であり得る。本開示では、結果は、通常、患者に投与されたｆＸａインヒビターの中和、ｆＸａインヒビターの抗凝固活性の拮抗、血漿からのｆＸａインヒビターの除去、止血の修復、及び出血の減少または停止の１つ以上を含む。有効量は、使用される特定の解毒剤、対象に投与された特定のｆＸａインヒビター、ｆＸａインヒビターの投与レジメン、解毒剤の投与のタイミング、治療される対象及び疾患状態、対象の体重及び年齢、疾患状態の重篤度、投与様式などに依存して変化し、これらの全ては当業者によって容易に決定され得る。

特定の態様においては、溶液を投与して、約１０ミリグラム（ｍｇ）〜約２グラム（ｇ）の量のｆＸａ解毒剤を送達する。使用されるｒ−ａｎｔｉｄｏｔｅの他の量としては、約１００ｍｇ〜約１．５ｇ、約２００ｍｇ〜約１ｇ、約４００ｍｇ〜約９００ｍｇを含む。いくつかの態様においては、使用されるｒ−ａｎｔｉｄｏｔｅの量は、約４００ｍｇまたは９６０ｍｇである。いくつかの態様においては、使用されるｒ−ａｎｔｉｄｏｔｅの量は、約１０ｍｇ〜約１００ｍｇ、約１５ｍｇ〜約９５ｍｇ、約２０ｍｇ〜約８０ｍｇである。

製剤を投与すると、第Ｘａ因子インヒビターを少なくとも約２０％、または少なくとも約５０％、または少なくとも約７５％、または少なくとも約９０％、または少なくとも約９５％中和する。

トロンビン生成アッセイなどの複数のｉｎ ｖｉｔｒｏアッセイ、ならびにａＰＴＴ、ＰＴ及びＡＣＴなどの臨床的凝固アッセイによって、この方法、すなわち第Ｘａ因子インヒビターの阻害または拮抗が達成されるかどうかを決定することができる。

本開示の一態様は、有効量の凍結乾燥製剤の溶液を対象に投与することを含む、ｆＸａインヒビターでの抗凝固療法を受けている対象において、外因的に投与されたｆＸａインヒビターに選択的に結合及びそれを阻害する方法に関する。この療法に適した患者は、従来の抗凝固療法を受けており、例えば、１種以上の抗凝固剤（例えば、ｆＸａの直接型または間接型インヒビター）が投与されている。

別の態様においては、本明細書で提供される方法は、凍結乾燥製剤の溶液を対象に投与することを含む、第Ｘａ因子インヒビターでの抗凝固療法を受けている対象において、外因的に投与された第Ｘａ因子インヒビターに選択的に結合及びそれを阻害する。対象は、細胞またはヒトなどの哺乳動物であり得る。

本明細書に記載の溶解した凍結乾燥製剤の投与及び付随する方法から利益を受ける対象は、臨床的に大量出血事例または臨床的に有意な非大量出血事例を経験しているか、またはその素因があるものが含まれる。臨床的な大量出血事例の例は、出血、重要な器官への出血、再手術または新しい治療手順を必要とする出血、及び関連する顕性出血を伴う２．０以上の出血指数からなる群から選択される（Ｔｕｒｐｉｅ ＡＧＧ，ｅｔ ａｌ，ＮＥＪＭ，２００１，３４４：６１９−６２５）。更に、対象は、持続性または再発性であり、相当量であるまたは介入なしに止まらない場合がある鼻出血、治療手順を必要とするレベルまで上昇しない直腸または尿路出血、自発的であるか、または軽度の外傷を伴って起こる注射部位または他の場所における実質的な血腫、排液を必要としない通常外科手術に伴うものを超える相当の失血、予定外の輸血を必要とする出血からなる群から選択される非大量出血事例を経験しているか、またはその素因がある可能性がある。

いくつかの実施形態においては、溶解した凍結乾燥製剤は、ｆＸａインヒビターの過剰投与後または対象が出血の危険にさらされる可能性のある手術の前に投与される。

以下の実施例は、本開示の特定の実施形態を実証するために含まれる。当業者により、以下の実施例に開示される技術は、本開示の実施においてよく機能する技術を表し、従って、その実施のための特定の様式を構成すると考えることができることを理解されたい。しかし、本開示を考慮すると、当業者らは、開示された特定の実施形態において多くの変更がなされてもよく、更に、本開示の精神及び範囲から逸脱することなく、同様のまたは類似の結果を得ることができることを認識すべきである。

実施例１：細胞培養からのｒ−Ａｎｔｉｄｏｔｅの精製
この実施例は、培養条件及びｒ−Ａｎｔｉｄｏｔｅの製造のための後続の精製プロセスの開発を実証する。ＣＨＯ細胞に適合した市販の培養培地を、−ＲＫＲＲＫＲ−リンカー（配列番号６）の除去の際に二重鎖ｒ−Ａｎｔｉｄｏｔｅ（配列番号３）を生成するｒ−Ａｎｔｉｄｏｔｅ前駆体（配列番号２）をコードする核酸配列（配列番号７）を含むコンストラクトで形質移入したＣＨＯ細胞について試験した。ＰｒｏＣＨＯ（商標）培地は、好適な条件下で、７５〜９５ｍｇ／Ｌの高さの力価をもたらすことができた。

後続の精製プロセス（「後続プロセス」）を開発し、培養された細胞から解毒剤を精製した。いくつかの初期の開発実行においては、様々な膜及びカラムが試験された。

２つの試験実行においては、清澄化された収集物は、生成物が限外濾過（ＵＦ）によって濃縮されたときに膜を汚すか、またはＵＦを避けて生成物を第１のクロマトグラフィーステップによって濃縮した場合にクロマトグラフィー媒体を汚すことが判明した。実験の初期段階で、生成物の濃縮が必要であると考えられたため、ファウリングの原因を特定し、除去するステップを決定するために実験を行った。続いて、ファウリングは細胞培養中に培地中に分泌された高分子量（ＨＭＷ）タンパク質不純物により起こることが特定された。このＨＭＷタンパク質は清澄化された収集物中に部分的にしか溶解せず、濃縮すると更に不溶性になり、ＵＦ膜またはクロマトグラフィーカラムの許容できないファウリングを引き起こした。

いくつかのデプスフィルタ、イオン交換膜、及びクロマトグラフィー媒体の評価の後、１つの特定のデプスフィルタ（Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ（商標）Ｘ０ＨＣグレードフィルタ）が許容可能な生成物収率を達成しながら不純物の大部分を除去できることが見出された。次いで、生成物をＵＦにより最大１０倍まで濃縮した。このフィルタは、清澄プロセスの元のフィルタの１つを置き換え、２回の追加実行で実装された。

図１は、この開発努力からの精製プロセス１００を示す。細胞を収集（ステップ１０１）し、Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ（商標）Ｘ０ＨＣフィルタを用いて清澄化し、ＨＷＭの不純物を除去した後、試料を１０倍濃縮する（ステップ１０２）。濃縮には再生セルロースを使用できる。ステップ１０３において、ウィルス不活性化（１％のトリトンＸ−１００、最終濃度０．３％のトリブチルホスフェートなどの界面活性剤／溶媒を用いて）を行い、細胞培養における外被に覆われたウィルスを不活性化することができる。ウィルスの除去に続いて、ステップ１０４（混合モードカチオン交換）、１０５（混合モードアニオン交換）及び１０６（混合モードイオン交換）を行い、宿主細胞タンパク質及びＤＮＡを除去し、解毒剤を捕捉することができる。ステップ１０７では、疎水性相互作用樹脂を使用し、残存する宿主細胞タンパク質を更に除去することができる。場合により、これらの精製ステップの後に、最終的なウィルス除去濾過ステップを用い、全ての残存するウィルスを除去することができる。

このプロセスは、細胞培養液中に発現された解毒剤の約３０〜３５％を回収することができ、細胞培養液１リットルあたり約２２〜３３ｍｇの解毒タンパク質を産生した。

実施例２：規模拡大製造プロセス
実施例１に示されるプロセスに基づき、産生量の規模を拡大する目的のため改善されたプロセスが開発された。

実施例１の培養培地は、約７５〜９５ｍｇ／Ｌの力価を生成することができた。産生量を増加させるため、複数の他のＣＨＯ培養培地を試験した。それらの１つが、細胞増殖及びピーク細胞密度（力価＝２００〜２２５ｍｇ／Ｌ）において２〜３倍の増加を示し、１０，０００Ｌまでの規模の拡大も可能にした。

解毒剤を大量に抽出するためにアフィニティークロマトグラフを開発した。親和性配位子は、全大豆または小麦粉から抽出されたＫｕｎｉｔｚトリプシンインヒビター（２１ｋＤａ；ｐＩ＝４．５）を含んだ。大豆トリプシンインヒビター（ＳＴＩ）は、解毒剤と１：１の複合体を形成する。拡張性及び適合性に関して、非競合的インヒビターの溶出条件が同定され、ｐＨ５．２で２５ｍＭの酢酸ナトリウム、１Ｍのアルギニンを含んだ。

実施例１で開発されたプロセスにおいては、デプスフィルタでの収集物清澄化ステップを用いてＨＭＷ不純物を除去し、続いて１０倍の濃縮を行った。更に、ウィルス不活性化ステップは界面活性剤（トリトンＸ−１００）及び溶媒（トリブチルホスフェート）を使用した。これらのステップの適合性及び効率を、親和性捕捉に関して評価した。

このデータは、デプス濾過が必要ではなく、溶媒及び１０倍濃縮ステップの使用により生成物の回収が減少することを示す。従って、更なる開発においては、デプス濾過及び濃縮ステップは排除され、ウィルス不活性化では溶媒を使用せず界面活性剤のみ（トリトンＸ−１００）を使用した。ウィルス不活性化は生成物１リットルあたり５２．７ｍｌの緩衝液の比で、１０％のトリトンＸ−１００の添加により達成された（最終濃度：０．５％のトリトンＸ−１００）。この知見は、一般的にアフィニティーカラムに充填する前に試料調製のために溶媒が使用されるため、予想外であった。また、細胞培養物を採取したとき、沈殿物を除去するために通って流れる遠心分離ステップを使用したことにも留意されたい。

室温での１５分間の混合時間及び最短１時間の保持期間の後、処理した生成物を、Ｓａｒｔｏｇｒｕａｄ ＮＦフィルタ（０．８／０．２μｍ）プレフィルタからＳａｒｔｏｐｏｒｅ ２（０．４５／０．２２μｍ）プレフィルタへ、続けて０．２２μｍフィルタを備える５００Ｌの容器へのフィルタ列を通して濾過した。各カラムの充填物は使用する日に濾過した。

ＳＴＩ親和性樹脂からの生成物の溶出には、アルギニン（２５ｍＭの酢酸ナトリウム／１．０Ｍのアルギニン、ｐＨ５．２）を含む溶出緩衝液を使用した。

親和性捕捉の後、ＤＮＡ、宿主細胞タンパク質（ＨＣＰ）、及び親和性配位子の浸出液を含む残りの不純物を除去するために、いくつかの研磨ステップを用いた。カチオン交換及び混合モードイオン交換を含む２つのクロマトグラフィーの選択肢を試験した。しかし、性質決定に利用可能なプロセスに特異的な宿主細胞タンパク質アッセイはなかった。従って、代用として使用される市販のＥＬＩＳＡ、及び特異的ＨＣＰのＬＣ−ＭＳ／ＭＳ定量化を補助的な性質決定として使用した。更に、定量的性質決定のための２Ｄ銀染色評価を使用した。

図３は３つの潜在的な後続プロセス（ＤＳＰ）の評価を示す。３つのＤＳＰは親和性配位子浸出液のクリアランスに基づき同定された。生成物の性質及びプロセスに関連する不純物のクリアランスを評価するために、同じ親和性溶出プールを各ストリームにわたって順方向処理し、生成物の回収及びＣＨＯ宿主細胞タンパク質のクリアランス（ＨＣＰ；百万分率（ｐｐｍ）で表した）について比較した。各ＤＳＰプロセスからの溶出液を、生成物の性質に関して更に試験した（下記の表）。

表注：３つの評価された後続プロセスの生成物の性質評価。３つのＤＳＰ（図３）から得られた溶出液を、生成物の性質の影響について評価した。電荷に基づく不均一性（ＩＥＸ）または逆相（ＲＰ）への影響は見られなかった。しかし、カチオン交換研磨ステップにより精製されたＤＳＰ−２からの試料は、サイズ排除（ＳＥＣ）により高分子量凝集％の増加を示した。

試験に基づき、規模拡大後続プロセスを開発し、これは、図２に示される。このプロセスは図１に示したものよりも簡素である。しかし、収率は２倍高かった。実施例２に記載の方法は、２〜３倍のタンパク質産生量の増加を有する新しい細胞培養系と組み合わせて、全体の解毒剤産生量を４〜６倍増加させることができ、少なくとも１０，０００Ｌの産生規模を可能にした。

図２において、後続プロセス２００は、溶媒は使用せずに界面活性剤（トリトンＸ−１００）のみを使用する収集（２０１）後にウィルス不活性化ステップ（２０２）を使用する。親和性捕捉ステップ２０３では、ＳＴＩ配位子を有する樹脂を使用し、アルギニンを含む溶出緩衝液（ｐＨ５）で解毒剤を溶出した。親和性捕捉の後に、任意の限外濾過／ダイアフィルトレーション（ＵＦ／ＤＦ）ステップを使用することができ、これは、タンパク質を濃縮し、ｐＨを約７にすることができる。

ステップ２０４では、アニオン性膜が使用され、試料からの特定の不純物（例えば、ＤＮＡ、ＨＣＰ）を除去する。試験されたアニオン性膜の例は、Ｓａｒｔｏｂｉｎｄ Ｑ膜であり、解毒剤に有害な効果を呈さなかった。

ステップ２０５では、混合モードイオン交換の種類の例は、ＣＨＴ（セラミックヒドロキシアパタイト）でのＩＥＸ混合モードである。溶出緩衝液の例は、リン酸塩緩衝液である。このステップはＳＴＩ浸出液を除去するのに有用である。

ステップ２０６では、オクチルセファロースクロマトグラフィーを例として疎水性分離を達成することができ、タンパク質はＮａＣｌを含む緩衝液で溶出することができる。このステップは残存するＨＣＰを除去するのに有用である。

下記の表は、いくつかの試験実行における精製及び回収収率を示す。

実施例３：製造されたタンパク質の性質決定
この実施例においては、方法は上記の開発されたプロセスから生成されたタンパク質生成物を性質決定するために開発された。試験された方法は、等電点電気泳動（ＩＥＦ）、還元逆相（Ｒｅｄ−ＲＰ）及び還元ペプチドマップ（ＰＭＡＰ）を含んだ。

等電点電気泳動は解毒剤タンパク質の電荷不均一性を決定するために使用された。等電点電気泳動は、等電点（ｐＩ）またはタンパク質が正味電荷を持たないｐＨに基づいてタンパク質を分離する電気泳動技術である。等電点電気泳動は、電気泳動（Ｎｏｖｅｘ ＩＥＦゲル）及びＣｏｌｌｏｉｄａｌ Ｂｌｕｅ Ｓｔａｉｎｉｎｇ Ｋｉｔ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）で染色するために、Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ製造業者の指示に従って、ｐＨ３〜１０のゲル及び試薬を用いて行った。結果をＳｅｒｖａ３〜１０ｐＩマーカーと比較した。

試験ロットを水中で１．６ｍｇ／ｍＬに希釈し、次いでｐＨ３〜１０の試料緩衝液のＩＥＦ中で１：１にした。各試料を１０μＬ（８．０μｇ）で充填し、１００Ｖで１時間、続いて２００Ｖで１時間、５００Ｖで３０分間電気泳動を行った。ゲルを固定液（Ｓｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈ）中で３０分間固定し、Ｃｏｌｌｏｉｄａｌ Ｂｌｕｅ染色で１時間染色し、水中で一晩脱染した。

還元逆相は、タンパク質の全長及び切断型の両方の検出のために逆相クロマトグラフィー分離を用いるＨＰＬＣ法である。試料を６ＭのグアニジンーＨＣｌ／５０ｍＭのトリスｐＨ７．５に緩衝液交換し、ＤＴＴで還元した後、５０℃で３０分間インキュベートした。次いで、室温で９０分間、暗所でビニルピリジンを用いて試料をアルキル化し、続いて１ＭのＤＴＴで消光した。この方法は、タンパク質を固定相に結合させるためにＡｇｉｌｅｎｔ Ｚｏｒｂａｘ Ｃ１８ ＨＰＬＣカラムを利用し、疎水性に基づいてタンパク質を分離するために極性が減少する移動相（アセトニトリル中０．１％のトリフルオロ酢酸）の１５〜９５％の勾配を利用する。ＵＶ波長は２１４ｎｍである。

Ｌｙｓ−Ｃ消化ペプチドマップは、Ｌｙｓ−Ｃ消化物のＵＰＬＣ−ＵＶ／ＭＳＥ分析を利用した。この方法により、９８％を超える配列包括度を提供することができ、グリコシル化、アスパラギン酸ヒドロキシル化、及びＣ末端リジン切断のような翻訳後修飾を特徴付けることができた。また、この方法は、アスパラギンの脱アミド化及びメチオニンの酸化などの安定性指示マーカーをモニターすることができた。試料ロットをそれぞれ還元し、アルキル化し、リジルエンドペプチダーゼ（Ｌｙｓ−Ｃ）で処理した。酵素消化により生成されたペプチドをＲＰ−ＵＰＬＣで分離し、質量分析により分析した。

以下の表は、精製されたタンパク質生成物及びそれらのパーセンテージ及び配列から検出されたタンパク質アイソフォームの型を示す（ロット番号１：実施例１で開発された後続プロセスを用いる、ロット番号１：実施例２で開発された後続プロセスを用いる）。興味深いことに、実施例１：のプロセスと比較して、実施例２のプロセスは、おそらく増加した精製効率に起因して、配列番号９のパーセンテージを相当に減少（９．０％から２．７％）させた。
軽鎖アイソフォーム：

重鎖アイソフォーム：

実施例４：規模拡大プロセスの検証
この実施例は、更なる検証のために、実施例１及び２に示されるプロセスに基づくプロセスを説明する。

界面活性剤によるウィルス不活性化
１０％のトリトンＸ−１００を収集したタンパク質に添加することにより、ウィルス不活性化ステップを行った。１ Ｃａｐｔｏ ＳＴＩサイクル（以下に記載）に対応する収集されたタンパク質を、収集タンクから、プレフィルタとして使用された４×３０インチのＳａｒｔｏｇｕａｒｄ ＮＦフィルタを通して１０％のトリトンＸ−１００添加タンクに濾過し、次いで３×２０インチのＳａｒｔｏｇｕａｒｄ ＮＦフィルタ０．８／０．２μｍを通して濾過した。１０％のトリトンＸ−１００の添加後、プールを混合し、次いで３×３０インチのＳａｒｔｏｇｕａｒｄ ＮＦ０．８／０．２μｍフィルタを通して保持タンクに移した。保持時間が完了した後、不活性化されたプールを、３×３０インチのＳａｒｔｏｐｏｒｅ ２ ０．４５／０．２μｍフィルタと連続する６×３０インチのＳａｒｔｏｇｕａｒｄ ＮＦフィルタ０．８／０．２μｍフィルタを通してＣａｐｔｏ ＳＴＩカラムに装填する。この順序を、Ｃａｐｔｏ ＳＴＩ操作中に実行される４つのサイクルが完了するまで繰り返した。第２のサイクルが充填された後、６×３０インチのＳａｒｔｏｇｕａｒｄ ＮＦ０．８／０．２μｍフィルタを取り換えた。

Ｃａｐｔｏ ＳＴＩクロマトグラフィー
大気温度でＣａｐｔｏ ＳＴＩ樹脂を用いてアフィニティーカラムクロマトグラフィーを行った。充填段階中、生成物は樹脂に結合し、一方、汚染物質は飛散した。溶出緩衝液中の高濃度のアルギニンとのタンパク質相互作用を破壊することによって生成物を回収した。使用の前に、カラムを注射用蒸留水（ＷＦＩ）ですすぎ、１００ｍＭのリン酸（ｐＨ３．０）で洗浄し、ＷＦＩですすいだ。このカラムを、最初に予備平衡緩衝液（２０ｍＭのトリス−ＨＣｌ、ｐＨ７．４）で予め平衡化し、次いで平衡緩衝液（２０ｍＭのトリス−ＨＣｌ、２００ｍＭのＮａＣｌ、ｐＨ７．４）で平衡化し、カラムのｐＨ及び伝導率が仕様の範囲内にある場合、トリトンＸ−１００で処理した清澄化収集物（ＨＣＣＦ）を充填した。各サイクルのＨＣＣＦ材料をウィルス不活性化保持タンクから直接カラムに移した。

充填後、カラムを平衡緩衝液で洗浄し、高アルギニン低ｐＨの溶出緩衝液（溶出緩衝液：２５ｍＭの酢酸ナトリウム、１．０Ｍのアルギニン、ｐＨ５．２）で溶出した。サイクルの終わり及び次のサイクルの前に、カラムをＷＨＩですすぎ、１００ｍＭのリン酸（ｐＨ３．０）で再度洗浄し、再度ＷＨＩですすいだ。複数のサイクルから得られる全ての溶出液を一緒に貯蔵した。最終サイクルを収集した後、溶出された生成物をカラムの後続のラインから収集容器に流すために、カラムをバイパスする緩衝液の追跡を行った。全てのサイクルが完了した後、カラムをＷＦＩですすぎ、１００ｍＭのリン酸（ｐＨ３．０）で洗浄し、ＷＦＩでリンスし、予備平衡化及び平衡化緩衝液で中和し、エタノール貯蔵溶液に保存した。

Ｃａｐｔｏ ＳＴＩ溶出液プールを１．０ＭのアルギニンＨＣｌ（ｐＨ７．０）と混合して１００ｍＭのアルギニンＨＣｌの最終濃度にし、プールを安定化させた。次いで、得られるプールを濃縮し、１０ＫＤａのウルトラセルぺリコン３メンブレン上でダイアフィルトレーションして、大部分のアルギニンを除去し、その後のクロマトグラフィーステップへの充填を可能にした。

Ｓａｒｔｏｂｉｎｄ Ｑ膜クロマトグラフィー
大気温度でＳａｒｔｏｂｉｎｄ Ｑジャンボカートリッジを用いてアニオン交換膜クロマトグラフィーを行った。充填段階中、生成物は膜を通して流れ、一方、汚染物質は結合した。使用の前にカートリッジを平衡緩衝液ですすぎ、貯蔵保湿剤を除去した。カートリッジを０．５ＭのＮａＯＨで洗浄した。次いで、カートリッジを平衡緩衝液で平衡化し、カートリッジのｐＨ及び伝導率が仕様の範囲内である場合、濃縮され、ダイアフィルトレーションされたＣａｐｔｏ ＳＴＩ溶出液で充填した。充填された材料の１つのサイクルは、ＵＦ／ＤＦ後の収集タンクから直接充填された。充填の後、カートリッジを平衡緩衝液で洗浄した。生成物を収集した後、生成物をカートリッジの後続のラインから収集容器に流すために、カートリッジをバイパスする緩衝液の追跡を行った。

セラミックヒドロキシアパタイトクロマトグラフィー（ＣＨＴ）
大気温度でＣＨＴタイプＩ ４０μｍ樹脂を用いて混合モードカラムクロマトグラフィーを行った。充填段階中、生成物は樹脂に結合し、一方、一部の汚染物質は飛散した。生成物を、直線勾配でナトリウム濃度を増加させることによって回収した。使用の前に、カラムを１．０ＭのＮａＯＨで洗浄し、少量の平衡緩衝液ですすいだ。このカラムを、最初に予備平衡緩衝液で予め平衡化し、次いで平衡緩衝液で平衡化し、カラムのｐＨ及び伝導率が仕様の範囲内にある場合、Ｓａｒｔｏｂｉｎｄ Ｑ溶出液を充填した。

各サイクルの充填物を収集タンクから直接カラムに移した。充填の後、カラムを平衡緩衝液で洗浄した。次いで、勾配を９０％平衡化緩衝液（５０ｍＭのＭＥＳ、５ｍＭのリン酸ナトリウム、ｐＨ７．０）から９０％溶出緩衝液（５０ｍＭのＭＥＳ、５ｍＭのリン酸ナトリウム、２Ｍの塩化ナトリウム、ｐＨ７．０）に実行した。

サイクルの終わり及び次のサイクルの前に、カラムを平衡緩衝液ですすぎ、その後高リン酸塩の溶出後洗浄緩衝液でストリッピングし、平衡緩衝液ですすぎ、１．０ＭのＮａＯＨで再度洗浄し、平衡緩衝液で再度すすいだ。いくつかのサイクルから得られる全ての溶出液を一緒に貯蔵した。最終サイクルを収集した後、溶出された生成物をカラムの後続のラインから収集容器に流すために、カラムをバイパスする緩衝液の追跡を行った。全てのサイクルが完了した後、カラムを平衡緩衝液ですすぎ、１．０ＭのＮａＯＨで洗浄し、腐食性／ホスフェート貯蔵溶液に保存した。

オクチルセファロース４ＦＦクロマトグラフィー
大気温度オクチルセファロースＦＦ樹脂を用いて疎水性相互作用クロマトグラフィーを行った。充填段階中、生成物は樹脂を通して流れ、一方、汚染物質は結合した。使用の前にカラムを１．０ＭのＮａＯＨで洗浄した。このカラムを、最初にＷＦＩで予め平衡化し、次いで平衡緩衝液で平衡化し、カラムのｐＨ及び伝導率が仕様の範囲内にある場合、ＣＨＴ溶出液を充填した。各サイクルの充填物を収集タンクから直接カラムに移した。充填の後、カラムを平衡緩衝液で洗浄した。サイクルの終わり及び次のサイクルの前に、カラムをＷＦＩでストリッピングし、１．０ＭのＮａＯＨで再度洗浄した。最終サイクルを収集した後、生成物をカートリッジの後続のラインから収集容器に流すために、カラムをバイパスする緩衝液の追跡を行った。全てのサイクルが完了した後、カラムをＷＦＩでストリッピングし、１．０ＭのＮａＯＨで洗浄し、腐食性貯蔵溶液に保存した。

Ｐｌａｎｏｖａ ２０Ｎウィルス減少濾過（ＶＲＦ）
Ｐｌａｎｏｖａ ２０Ｎウィルス減少フィルタを用いてウィルス減少濾過を行った。フィルタを全量モードで操作し、生成物をフィルタを通過させ、残存するいかなるウィルス粒子も繊維に保持させた。使用前にフィルタをオクチルセファロース平衡緩衝液で洗い流した。次いで、生成物をフィルタに通し、次いで更なる平衡緩衝液で洗い流した。フィルタの完全性を試験し、使用後に処分した。

ＶＲＦ濾液を１０ＫＤａのＵｌｔｒａｃｅｌ Ｐｅｌｌｉｃｏｎ３メンブレン上で濃縮した。部分的な濃縮の後、ダイアフィルトレーションして最終製剤にした。次いで、生成物を最終目的濃度に濃縮し、回収した。

他に定義されない限り、本明細書で使用される全ての技術用語及び科学用語は、本発明が属する技術分野の当業者によって一般的に理解されるものと同じ意味を有する。

本明細書に例示的に記載された発明は、本明細書に具体的に開示されていない要素（複数可）、制限（複数可）の非存在下で好適に実施することができる。従って、例えば、「備える」、「含む」、「含有する」等の用語は、広範かつ制限なく読まれるものとする。更に、本明細書で使用される用語及び表現は、限定ではなく説明の用語として使用されており、示され説明された特徴またはその一部のいずれの等価物をも排除するような用語及び表現を使用する意図はないが、特許請求された本発明の範囲内で種々の変更が可能であることが認識される。

従って、本発明は、好ましい実施形態及び任意の特徴によって具体的に開示されているが、それに具現化され本明細書に開示されている本発明の修正、改良及び変形は、当業者が用い得るものであり、そのような改良及び変形は本発明の範囲内にあることが理解されるべきである。本明細書で提供される材料、方法、及び実施例は、好ましい実施形態の代表例であり、例示的であり、本発明の範囲を限定するものではない。

本発明は、本明細書において広く一般的に記載されている。一般的な開示の範囲内に含まれるより狭い種及び亜属のグルーピングの各々も、本発明の一部を形成する。これは、除去された物質が本明細書に具体的に列挙されているかどうかにかかわらず、属からの任意の主題を除去する条件または否定的制限を伴う本発明の一般的な説明を含む。

加えて、本発明の特徴または態様がマーカッシュ群に関して記載されているが、当業者であれば、本発明はマーカッシュ群のメンバーの任意の個々のメンバーまたはサブグループに関しても記載されることを認識するであろう。

本明細書に記載されている全ての刊行物、特許出願、特許及び他の参考文献は、それぞれが個々に同一範囲に参照により組み込まれているかのように、その全体が参照により明白に組み込まれる。矛盾する場合、定義を含む本明細書が優先する。

本開示は、上記の実施形態と共に記載されているが、前述の説明及び実施例は、例示を意図するものであり、本開示の範囲を限定するものではないことを理解されたい。本開示の範囲内の他の態様、利点及び変更は、本開示が関係する当業者には明らかであろう。

Claims (40)

1. 配列番号７の核酸配列または配列番号７によりコードされるアミノ酸配列に少なくとも９０％の配列同一性を有するアミノ酸配列をコードする核酸配列を含むポリヌクレオチドコンストラクトから発現したポリペプチド生成物を調製する方法であって、
   前記ポリヌクレオチドコンストラクト及び前記ポリヌクレオチドコンストラクトから発現したポリペプチド生成物を含む試料に界面活性剤を添加することと、
   前記試料を大豆トリプシンインヒビター（ＳＴＩ）ベースのアフィニティークロマトグラフに充填し、第１の溶出緩衝液で前記ポリペプチドを溶出し、第１の溶出された試料を生成することであって、前記充填された試料は有機溶媒を含まない、前記生成することと、
   前記第１の溶出された試料をイオン交換及び混合モードクロマトグラフに充填し、少なくとも１Ｍの無機塩を含む第２の溶出緩衝液で前記ポリペプチドを溶出し、第２の溶出された試料を生成することと、
   前記第２の溶出された試料を疎水性相互作用クロマトグラフに充填し、少なくとも２ｍＭの塩化ナトリウムを含む第３の溶出緩衝液で前記ポリペプチドを溶出することと、を含み、
   それにより、前記ポリペプチド生成物を含む精製された試料を調製する、前記方法。
2. 前記界面活性剤が、トリトンＸ−１００（ポリエチレングリコールｐ−（１，１，３，３−テトラメチルブチル）−フェニルエーテル）を含む、請求項１に記載の方法。
3. 前記第１の溶出緩衝液が０．５Ｍ〜２Ｍのアルギニンを含む、請求項１または２に記載の方法。
4. 前記第１の溶出緩衝液のｐＨが５〜５．４である、請求項３に記載の方法。
5. 前記イオン交換及び混合モードクロマトグラフが、セラミックヒドロキシアパタイトタイプＩクロマトグラフを含む、請求項１〜４のいずれかに記載の方法。
6. 前記第２の溶出緩衝液が、少なくとも２Ｍの無機塩を含む、請求項１〜５のいずれかに記載の方法。
7. 前記無機塩が塩化ナトリウムである、請求項６に記載の方法。
8. 前記疎水性相互作用クロマトグラフが、オクチルセファロースクロマトグラフを含む、請求項１〜７のいずれかに記載の方法。
9. アニオン交換クロマトグラフでの精製ステップを更に含む、請求項１に記載の方法。
10. 前記アニオン交換クロマトグラフが、Ｓａｒｔｏｂｉｎｄ（商標）イオン交換膜を含む、請求項９に記載の方法。
11. 前記試料の１つ以上を、ナノフリースフィルタでの濾過に供することを更に含む、請求項１〜１０のいずれかに記載の方法。
12. 前記ナノフリースフィルタでの前記濾過が、前記試料の前記ＳＴＩベースのアフィニティークロマトグラフへの充填に先行する、請求項１１に記載の方法。
13. 前記精製された試料が、１％未満の、前記ポリヌクレオチドコンストラクトから発現されたものではない汚染タンパク質を含む、請求項１〜１２のいずれかに記載の方法。
14. 前記ポリペプチド生成物が前記ポリヌクレオチドコンストラクトを含む細胞において発現される、請求項１〜１３のいずれかに記載の方法。
15. 前記細胞が、培養液１リットルあたり少なくとも１００ｍｇの前記ポリペプチド生成物を産生する条件下で、培養液中で増殖される、請求項１４に記載の方法。
16. 前記細胞が、培養液１リットルあたり少なくとも２００ｍｇの前記ポリペプチド生成物を産生する条件下で、培養液中で増殖される、請求項１５に記載の方法。
17. 前記精製された試料が、５０％を超える前記培養液中で産生された前記ポリペプチド生成物を含む、請求項１５または１６に記載の方法。
18. 前記精製された試料が、前記培養液のリットルあたりの産生量から１００ｍｇを超える前記ポリペプチド生成物を含む、請求項１５または１６に記載の方法。
19. 前記ポリペプチド生成物が、軽鎖及び重鎖を含む二重鎖ポリペプチドである、請求項１〜１８のいずれかに記載の方法。
20. 前記精製された試料における２０重量％〜５０重量％の前記ポリペプチド生成物が、配列番号５のアミノ酸配列からなる重鎖を有する、請求項１９に記載の方法。
21. ５％〜９５％の配列番号５のアミノ酸配列からなる前記重鎖が、２つのＯ−結合グリコシル化を有し、５％〜９５％の配列番号５のアミノ酸配列からなる前記重鎖が、１つのＯ−結合グリコシル化を有する、請求項２０に記載の方法。
22. 前記精製された試料における４０重量％〜８０重量％の前記ポリペプチド生成物が、配列番号８のアミノ酸配列からなる重鎖を有する、請求項１９〜２１のいずれか１項に記載の方法。
23. 少なくとも９０％の配列番号８のアミノ酸配列からなる前記重鎖が、１つのＯ−結合グリコシル化を有する、請求項２２に記載の方法。
24. 前記精製された試料における２重量％〜１２重量％の前記ポリペプチド生成物が、配列番号９のアミノ酸配列からなる重鎖を有する、請求項１９〜２３のいずれか１項に記載の方法。
25. 前記精製された試料における０．１重量％〜１．５重量％の前記ポリペプチド生成物が、配列番号１０のアミノ酸配列からなる重鎖を有する、請求項１９〜２４のいずれか１項に記載の方法。
26. 前記精製された試料における２重量％〜８重量％の前記ポリペプチド生成物が、配列番号１１のアミノ酸配列からなる重鎖を有する、請求項１９〜２５のいずれか１項に記載の方法。
27. 前記精製された試料における３５重量％〜６０重量％の前記ポリペプチド生成物が、配列番号４のアミノ酸配列からなる軽鎖を有する、請求項１９〜２６のいずれか１項に記載の方法。
28. 医薬的に許容される担体及び二重鎖ポリペプチドのポリペプチド部分を含む医薬組成物であって、
    ３５重量％〜６０重量％の前記二重鎖ポリペプチドが配列番号４のアミノ酸配列からなる軽鎖を有し、
    ２０重量％〜５０重量％の前記二重鎖ポリペプチドが配列番号５のアミノ酸配列からなる重鎖を有し、
    ４０重量％〜６０重量％の前記二重鎖ポリペプチドが配列番号８のアミノ酸配列からなる重鎖を有し、
    １０重量％未満の前記二重鎖ポリペプチドが配列番号９のアミノ酸配列からなる重鎖を有する、前記医薬組成物。
29. ５重量％未満の前記二重鎖ポリペプチドが配列番号９のアミノ酸配列からなる重鎖を有する、請求項２８に記載の医薬組成物。
30. ３重量％未満の前記二重鎖ポリペプチドが配列番号９のアミノ酸配列からなる重鎖を有する、請求項２８に記載の医薬組成物。
31. ０．１重量％〜１．５重量％の前記二重鎖ポリペプチドが配列番号１０のアミノ酸配列からなる重鎖を有する、請求項２８〜３０のいずれか１項に記載の医薬組成物。
32. ２重量％〜８重量％の前記二重鎖ポリペプチドが配列番号１１のアミノ酸配列からなる重鎖を有する、請求項２８〜３１のいずれか１項に記載の医薬組成物。
33. ３０％〜７０％の配列番号５のアミノ酸配列からなる前記重鎖が、２つのＯ−結合グリコシル化を有する、請求項２８〜３２のいずれか１項に記載の医薬組成物。
34. ３０％〜７０％の配列番号５のアミノ酸配列からなる前記重鎖が、１つのＯ−結合グリコシル化を有する、請求項２８〜３３のいずれか１項に記載の医薬組成物。
35. 少なくとも９０％の配列番号８のアミノ酸配列からなる前記重鎖が、１つのＯ−結合グリコシル化を有する、請求項２８〜３４のいずれか１項に記載の医薬組成物。
36. 前記医薬組成物が、凍結乾燥される、請求項２８〜３５のいずれか１項に記載の医薬組成物。
37. Ｌ−アルギニンＨＣｌまたはＬ−アルギニンアセテートを更に含む、請求項２８〜３６のいずれか１項に記載の医薬組成物。
38. スクロースを更に含む、請求項２８〜３７のいずれか１項に記載の医薬組成物。
39. マンニトールを更に含む、請求項２８〜３８のいずれか１項に記載の医薬組成物。
40. 第Ｘａ因子インヒビターでの抗凝固療法を受けている患者における抗凝固を拮抗または阻害するための、請求項２８〜３９のいずれか１項に記載の医薬組成物。
    

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