JP6884792B2 - がん及び新生物の治療方法及び治療用組成物 - Google Patents
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Description
以前の研究によって、3D条件下で接着性間質細胞(ASC)を培養することによって、これまでに記載されていなかった特性及び特徴を有するASCが生成されることが確立されている。がん、腫瘍及び新生物の増殖を治療、予防及び阻害するためにASCを使用する方法が、本明細書に記載される。
別段の記載がない場合、本明細書に言及される全ての範囲は境界を含む。
別段定義される場合を除いて、本明細書で使用された全ての技術用語及び科学用語は、本発明が属する技術分野の当業者によって一般に理解されるのと同じ意味を有する。発明の実施又はテストにおいて、本明細書に記載されたものと同様又は同等な方法及び材料が使用され得るが、好適な方法及び材料を以下に記載する。矛盾する場合は、定義を含む特許明細書によって調整される。更に、材料、方法及び実施例は、例示的なものにすぎず、限定することを意図するものではない。
図面は以下の通り:
本発明の少なくとも1つの実施形態を詳細に説明する前に、本発明はその適用において、以下の説明に記載された又は実施例によって例示された詳細に限定されないことが理解される。本発明は、他の実施形態であることができるか、又は多様な方法で実施若しくは実行することができる。また、本明細書で使用される語句と用語は、説明の目的のためのものであり、限定的なものとしてみなされるべきでないことが理解される。
幾つかの実施形態においては、ASCは、2次元(「2D」)培養条件、3次元(「3D」)培養条件又はそれらの組合せを使用することによって、増殖させ(propagated)得る。2D及び3D培養において、ASCを増殖させる条件は、以下の本明細書中及びそれに続く実施例の節において更に記載される。これらの工程は、それぞれが別の実施形態と考えられる、培養方法、細胞の特徴、又は治療パラメーターについて記載された他の実施形態のいずれかと自由に組合せても良い。
記載された方法及び組成物のある実施形態においては、細胞を増殖するために使用される培養プロセスの過程において、培地の組成は変化しない。換言すると、因子を添加若しくは除去することによって、又は以前の培地とは異なる組成を有する新鮮な培地を添加することによって、培地組成を意図的に変化させようとはしない。当業者によって理解されるように、培地の組成を変化させることに関する言及には、例えばそれに含まれる細胞による栄養の吸収及び代謝物の分泌のために、長期培養の結果として自動的に生じる培地組成における変化は含まれない。
ある実施形態においては、ASCの精製又は濃縮の更なる工程を、細胞調製プロセスの一部として行っても良い。そのような方法としては、ASC及び/又は、様々な実施形態において、間葉系間質細胞若しくは間葉系様ASCについてのマーカーを使用した細胞選別が挙げられるが、それらに限定されない。
当業者は、様々な等張なバッファーが、細胞を洗浄するため及び同様の用途のために使用し得ることを理解する。Hank's平衡塩溶液(HBSS;Life Technologies)は、使用し得る多くのバッファーの一つに過ぎない。
ある実施形態においては、(例、該当する場合、炎症性サイトカインを用いたインキュベーション前の)記載されたASCは、間葉系間質細胞(MSC)である。幾つかの実施形態においては、これらの細胞は、例えば胎盤、BM及び脂肪等の多くの成人組織から単離しても良い。更なる実施形態においては、細胞は、3つの基準:1.標準的な培養条件(20%ウシ胎児血清(FBS)を添加した、α最小必須培地)で維持される場合のプラスチック付着性、2.表面分子CD105、CD73及びCD90の発現、並びにCD45、CD34、CD14又はCD11b、CD79α又はCD19、及びHLA-DRの発現の欠如、3.in vitroでの骨芽細胞、脂肪細胞及び軟骨芽細胞への分化、に基づいて、The Mesenchymal and Tissue Stem Cell Committee of the International Society for Cellular Therapy (Dominiciら、2006i)によって定義される、ヒトMSCである。
本明細書で他に指示がない場合、用語「胎盤」「胎盤組織」等は、胎盤の任意の部分を指す。様々な実施形態において、胎盤由来ASCは、胎児、又は他の実施形態においては、胎盤の母体領域のいずれか、又は他の実施形態においては、両方の領域から取得しても良い。母体ソースのより具体的な実施形態は、基底脱落膜及び壁側脱落膜である。胎児ソースのより具体的な実施形態は、羊膜、絨毛膜及び絨毛である。ある実施形態においては、組織試料を、生理的バッファー [例、リン酸緩衝生理食塩水(PBS)又はHank'sバッファー]中で洗浄する。他の実施形態においては、消化酵素(以下を参照)によって組織を処理すること又は/及び物理的な破砕(その非限定的な例は、ナイロンフィルターを通して組織部分を細かくし洗浄すること、又は洗浄培地を用いてやさしくピペッティングすること(Falcon、Becton、Dickinson、San Jose、CA))によって、単細胞の懸濁液を作製し得る。幾つかの実施形態においては、組織の処理には、DNAse(その非限定的な例はMerckのベンゾナーゼ(Benzonase)である)の使用を含む。他の実施形態においては、胎盤細胞は満期又は前期(pre-term)胎盤から取得しても良い。
他の実施形態においては、記載されたASCは、母体及び胎児細胞の両方を含む胎盤調製物である。ある実施形態においては、調製物は母体細胞について濃縮されている。多くの標準的な培養条件下では、数代継代後に母体細胞が2D及び3D培養を優占する傾向がある。他の実施形態においては、記載された細胞の少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、少なくとも99.5%、少なくとも99.7%、又は少なくとも99.9%は、母体由来細胞である。陰性発現を定義するための対照のアイソタイプを使用した、フローサイトメトリーによって測定されるように、CD200の発現の欠如は、胎児細胞のマーカーとして使用し得る。
本明細書において使用される場合、語句「脂肪組織」は、脂肪(fat)細胞(脂肪細胞)を含む結合組織を指す。様々な実施形態において、脂肪組織由来ASCは、当業者に公知である様々な方法によって、例えば、参照により本明細書に取り込まれる米国特許番号第6,153,432号に記載されている方法によって、抽出しても良い。他の実施形態においては、脂肪組織は大網/内臓、乳腺、性腺又は他の脂肪組織の部位に由来しても良い。幾つかの実施形態においては、脂肪は脂肪吸引によって単離し得る。
様々な実施形態において、ASCは、それらの全てがASCを含むことが知られる、例えば、胎盤;脂肪組織;BM;末梢血;臍帯血;滑液;滑膜;脾臓;胸腺;粘膜(例えば鼻粘膜);輪部間質(limbal stroma);靱帯、例えば歯周靭帯;頭皮;毛嚢、睾丸;胚性卵黄嚢;及び羊水に由来しても良い。ある実施形態においては、ASCのソースは、非胎児ソース、例えば、胎盤由来の母体細胞、又は小児若しくは成人ドナー由来の体組織、例えば、脂肪組織、BM、末梢血、臍帯血、滑液、滑膜、及び例えば歯周靭帯等の靱帯である。幾つかの実施形態においては、ASCはヒトASCである一方で、他の実施形態においては、それらは動物のASCであっても良い。特定の実施形態においては、ASCは胎盤組織由来であるか、又は脂肪組織由来である。
上述のように、幾つかの実施形態においては、記載されたASCは、「標準的な」間葉系幹細胞が骨細胞に分化する条件下で、骨細胞に分化しない。幾つかの実施形態においては、条件は、ビトロネクチン及びコラーゲンでコートしたプレート中における、0.1マイクロモーラー(mcM)デキサメタゾン、0.2 mMアスコルビン酸及び10 mM グリセロール-2-リン酸を含む溶液を用いた、17日間のインキュベーションである。更に他の実施形態においては、条件は、ビトロネクチン及びコラーゲンでコートしたプレート中における、10 mcMデキサメタゾン、0.2 mMアスコルビン酸、10 mMグリセロール-2-リン酸及び10 nMビタミンDを含む溶液を用いた、26日間のインキュベーションである。典型的には、先述の溶液は、当業者によって理解されるように、例えばDMEM+10%血清等の細胞培養培地を含む。
本明細書においては、記載された治療適応のために、細胞外小胞、例、記載されたASCによって分泌されるエキソソームの使用も提供される。エキソソーム及び他の細胞外小胞を単離する方法は、当該分野において周知であり、例えば、Clayton Aら、2001;Mathias RAら、2009;及びCrescitelli Rら、2013に記載されているように、例えば、免疫磁気単離が挙げられる。
細胞、それらに由来するCM、又はそれらに由来するエキソソームは、1以上の医薬的に許容される担体を更に含む医薬組成物の一部として投与され得る。以下において、用語「医薬的に許容される担体」は、対象に重篤な刺激を引き起こさず、投与された細胞の生物学的活性及び特性を無効にしない、担体又は希釈剤を指す。担体の限定されない例は、プロピレングリコール、生理食塩水、エマルジョン及び有機溶媒と水との混合物である。幾つかの実施形態においては、医薬的な担体は生理食塩水の水溶液である。他の実施形態においては、組成物は、賦形剤、例、医薬的に許容される賦形剤を更に含む。ある実施形態においては、組成物は、がん、新生物、腫瘍及び/若しくは悪性腫瘍の治療に;又は他の実施形態においては、がん及び/若しくは新生物の転移の抑制に処方される。
ある実施形態においては、記載された方法及び組成物によって治療される対象はヒトである。他の実施形態においては、対象は動物であっても良い。代替的又は追加的に、対象は、がん、新生物及び/又は腫瘍を有する。更に他の実施形態においては、対象は転移のリスクがある原発性腫瘍を有する。より具体的な実施形態においては、原発性腫瘍は手術可能であっても良く、又は他の実施形態においては、手術不可能であっても良い。
細胞生成物を製造するプロセスは、2つの段階からなる:
段階1 中間細胞ストック(ICS)の生成は以下の工程を含む:
1.胎盤からのASCの抽出
2.最大12回まで集団を倍化するための2次元(2D)細胞増殖
3.細胞の濃縮、製剤化、充填及び凍結保存
段階2 ICSの解凍及び更なる培養は、以下の工程を含む:
1.最大8回まで解凍したICSを更に倍化する2D細胞増殖
2.最大10回まで更に倍化するバイオリアクター(複数可)中での3次元(3D)細胞増殖及びバイオリアクター(複数可)からの回収
3.下流の処理:細胞の濃縮、洗浄、製剤化、充填及び凍結保存。
該手順には、増殖培地の無菌性及び混入について定期的にテストすることが含まれる。
参照することによりその全体が本明細書に取り込まれる、Pluristem社の国際公開第2016/151476号の実施例1において更なる詳細が提供される。
方法
骨髄接着性細胞−BM接着性細胞は、参照することによりその全体が本明細書に取り込まれる、Esther Lukasiewicz Hagai及びRachel Ofirの国際公開第2016/098061号に記載されるように取得した。骨生成及び脂肪生成アッセイは、国際公開第2016/098061号に記載されるように行った。
結果
骨細胞誘導 陽性アリザリンレッド染色によって示されたように、骨形成誘導培地中でのBM由来接着性細胞のインキュベーションによって、BM細胞の50%超が分化した。反対に、いずれの胎盤由来細胞も骨形成分化の兆候を示さなかった。
次に、ビタミンD及びより高い濃度のデキサメタゾンを含む改変骨形成培地を使用した。BM細胞の50%超が骨細胞への分化を経た一方で、いずれの胎盤由来細胞も骨形成分化の兆候を示さなかった。
脂肪細胞誘導 陽性オイルレッド染色及び典型的な形態的変化(例、細胞質中の油滴の蓄積)によって示されたように、脂肪細胞誘導培地中での胎盤由来又はBM由来接着性細胞の脂肪細胞分化で、BM由来細胞の50%超が分化した。それに対して、いずれの胎盤由来細胞も脂肪細胞に分化しなかった。
次に、より高い濃度のインドメタシンを含む改変培地を使用した。BM由来細胞の50%超が脂肪細胞への分化を経た。それに対して、いずれの胎盤由来細胞も脂肪細胞への典型的な形態的変化を示さなかった。
方法(実施例3〜4)
参照することによりその全体が本明細書に取り込まれる、国際公開第2016/098061号に記載されているように、膜マーカーのFACS分析を行った。
結果
単離された細胞上での細胞マーカーの発現−モノクローナル抗体を使用して、単離された細胞によって発現される表面抗原を調べた。細胞は、CD73、CD29及びCD105を発現し、CD34、CD45、CD19、CD14及びHLA-DRのマーカーを発現しなかった。より具体的には、細胞の90%超が全ての陽性マーカーを発現し、細胞の3%未満が全ての陰性マーカーを発現した。
更に、2つの内皮マーカーであるCD31及びKDRについての陰性染色によって示されるように、細胞は内皮マーカーを発現しなかった。しかしながら、線維芽細胞に典型的なマーカーであるD7-fibの発現は明白であった。
実施例1に記載したようにASCを調製し、それらの共刺激性分子の発現を測定した。FACS分析によって、細胞膜上にCD80、CD86及びCD40を欠いていることが示された(図2A〜C)。更に、HLA A/B/Cについての染色によって検出されたように、細胞はHLAクラスI分子を低レベルで発現した(図2D)。ASCはアロ認識(allo-recognition)を免れることも示された。
プロトコール−内皮細胞増殖 (ECP)アッセイ:
実施例1に記載したように胎盤ASCを調製し、凍結保存した。1×106の解凍したASCを2 ml DMEM培地に播種した。24時間 (hr)後、培地をEBM-2培地(Lonza Group社、Basel、Switzerland)で置換し、細胞を、低酸素条件(1%O2)下で更に24時間インキュベートし、その後、馴化培地(CM)を回収した。並行して、750のヒト臍帯内皮細胞(HUVEC)を播種し、24時間インキュベートし、次いで、正常酸素条件下、37℃で4日間、CMを用いてインキュベートした。CMを除去した後、AlamarBlue(登録商標)蛍光アッセイを使用して、HUVEC細胞の増殖をアッセイした。結果は、ASC非存在下(任意に100%で設定)で観察されたパーセントECP(%ECP)で表す。
結果
サイトカイン(ヒト)抗体アレイCシリーズ4000 (RayBio)を使用して、正常酸素条件又は低酸素条件下で培養したASCをタンパク質分泌についてテストした。図3に示されるように、低酸素条件下で、幾つかの血管新生促進因子の分泌が上方制御された。
更なる実験において、ASCの様々な集団(batches)を、HUVEC細胞と共インキュベートし、ECPに対するそれらの影響をテストした。典型的には、ASC非存在下で観察されたECPの少なくとも135%のレベルまでECPの刺激が観察された。
方法
実験プロトコール全般 3D培養の最終日(典型的には、開始から5日又は6日目)は、10ナノグラム/ミリリットル (ng/ml)腫瘍壊死因子アルファ(TNF-α)、10 ng/mlインターフェロン・ガンマ(IFN-γ)及び/若しくは10%FBSを含む(又は含まない [陰性対照])DMEM中で行い(表1を参照)、バイオリアクターで更に1日インキュベートしたこと以外は、全て実施例1に記載したように、胎盤からASCを取得し、2D条件下で培養し、次いで、3D条件下で培養し、次いで、回収した。RayBio(登録商標)ヒトサイトカインアレイキットを使用して、バイオリアクター培地中の分泌されたサイトカインレベルを測定した。
低酸素インキュベーション 1×106の解凍したASCを2 ml DMEM培地に播種した。24時間 (hr)後、培地をEBM-2培地 (Lonza Group社、Basel、Switzerland)で置換し、細胞を低酸素条件(1%O2)下で更に24時間インキュベートし、その後、CMを回収した。
分泌されたタンパク質の定量的検出:それぞれのヒト免疫アッセイQuantikine(登録商標)ELISAキット (R&D Systems)を使用して、IL-6及びVEGFを定量的に測定した。
結果
様々な条件を比較(side-by-side)テストする一連の実験において、上記実施例で記載したように、ASCをバイオリアクター中でインキュベートした。バイオリアクターでのインキュベーションの最終日に、培地を、FBSの存在下又は非存在下で、添加されたTNF-α又はTNF-α+IFN-γを含むか又は含まない培地で置換した。ELISAによって、バイオリアクター培地中におけるVEGF及びIL-6の分泌を測定した。IFN-γが存在するか否かに関わらず、TNF-αを含めることによって、VEGFの分泌が有意に増加した(表2)。
本実施例の終わりまでの以下に記載される実験は全て、血清を含まない培地で増殖させた試料に対して行った。蛍光ベースのサイトカインアレイアッセイを使用して、先述の実験に由来する選択された試料のバイオリアクター培地について、一団の因子の発現を探索した。GRO(CXCL1;Uniprotアクセッション番号:P09341)、IL-6、IL-8、MCP-1、MCP-2、MCP-3、RANTES及びIP-10(Uniprotアクセッション番号:P02778)を含む、幾つかの因子の発現の増加が、サイトカインインキュベーションの後に観察された(図4A)。別の実験においては、TNF-α単独を、サイトカイン添加なしと比較した。GRO、IL-8、MCP-1、RANTESの発現の上昇、より少ない程度に、IL-6、MCP-3、アンギオゲニン、インスリン様増殖因子結合タンパク質-2(IGFBP-2)、オステオポンチン及びオステオプロテゲリンの発現の上昇が示された(図4B〜C)。
幾つかの実験において、定量的ELISAによって、バイオリアクター培地中におけるMCP-1及びGM-CSFの上昇した発現を確認した。その結果によって、MCP-1誘導のためには、TNF-α+IFN-γが、TNF-α単独よりも強力であることが示された(図5A)一方で、GM-CSF誘導のためには、TNF-α単独が僅かに優れているようであることが示された(図5B)。TNF-α+IFN-γ試験に由来する対照培地(サイトカインを含まない)と比べて、サイトカイン濃度及び変化倍数を、以下の表3に示す。
本実験では、TNF-α+IFN-γ(図6A)又はTNF-α単独(図6B)による、先述の一団の因子の誘導に対する、FBSの影響を調べた。FBSの存在下又は非存在下で、類似する一式の主要なタンパク質を誘導した。TNF-アルファ単独については、FBS非存在下よりも存在下において、IL-6が遥かに強く誘導されるようであった。
幾つかの実験で、炎症促進性サイトカインを用いて前処理しているASCのマーカー表現型を調べた。一貫して、細胞は、CD29、CD90及びCD54について90%超が陽性であり;CD73及びCD105について85%超が陽性であり;並びにCD49について65%超が陽性であった。追加的には、細胞は、CD14、CD19、CD31、CD34、CD39及びCD45について1%未満が陽性であり;CD200について3%未満が陽性であり;GlyAについて6%未満が陽性であり;並びにSSEA4について20%未満が陽性であった。
2つの点:1.サイトカインへの曝露は24時間であったこと;及び2.24時間インキュベーションの最初に濃縮されたストック溶液を使用して、サイトカインをバイオリアクター培地に添加し、目標のサイトカイン濃度にまで急速に持っていったことを除き、実施例6において記載されたのと同様の様式で、炎症性サイトカインを用いてASCを刺激した。それに続く24時間に亘って、目標のサイトカイン濃度を含む新鮮な培地をバイオリアクターに灌流した。指数増殖期に対応する、バイオリアクターに播種後5日で、24時間インキュベーションを開始した。サイトカイン処理の結果によって、細胞の増殖は倍化速度が遅くなり始める時点に到達していた。ASCを凍結した。解凍した細胞を組織培養ディッシュに播種し、播種後3日及び4日目に回収したプレート中の細胞密度を測定し比較することによって、集団倍化時間(PDT)を測定した。
24時間刺激した細胞は、PDTにおける有意な減少を示した(図7)。表5は、各試料の条件について記載する。
方法
CM生成:実施例1及び6において記載したように、バイオリアクターインキュベーション及びその後の凍結保存を行った。これらの工程に続けて、500,000細胞を、マルチウェルプレート中、2 mM L-グルタミン及び10%FBS、幾つかのケースにおいては、1ウェル当たり40 ngのIFN-γを補充した4 ml DMEM中に播種した。24時間後、培地を吸引し、細胞を洗浄し、RPMI(特に断りのない限りFBSを含まない)を添加した。24時間のインキュベーション後、培地を回収し、遠心分離し、5%FBSを培地に添加した。
抗がんアッセイ 59細胞株を、培地(RPMI+10%FBS、2 mM L-アラニル-L-グルタミン及び1 mMピルビン酸ナトリウム)中で増殖させ、ポリヒドロキシエチルメタクリレート(pHEMA)で予めコートしたマルチウェル3Dプレート(細胞を自己集合させる表面上の微空間を有するElplasiaTMプレート)中でスフェロイドを形成させるために上記の培地(但し、5%FBSを含む)に播種した。CMを2倍で連続希釈し、幾つかの濃度で、3回反復でアッセイした。希釈なしのCM、又は1:2、1:4、若しくは1:8で希釈したCMを、25 μLの体積で、播種後24時間で添加し、3日毎に交換した。全ての細胞株について対照(陽性及び陰性)を含めた。CellTiter-Glo(登録商標)細胞生存率アッセイを使用して、細胞を溶解し、分析し、細胞の生存率及び複製に対するCMの影響を決定した。ビヒクルと比較して20〜40%の阻害は、標準偏差に比較して統計的に有意であり、部分的な阻害と定義した一方で、40%以上の阻害を阻害と定義した。
母体ASC、又は母体/胎児ASCの混合のいずれかをバイオリアクター中で生成し、馴化培地(CM)を調製するために使用した。CMを、母体ASC、及び母体/胎児ASCの集団から調製し、そのうち幾らかをCM生成に先立って又はその最中に処理に供し(表6)、様々ながん細胞株の複製を阻害する能力についてテストした(表7)。
・ 12細胞株は群1によって阻害された(<60%の増殖)。
・ 14細胞株は群1によって部分的に阻害された(60〜80%の増殖)。
・ 28細胞株はCMによって阻害されなかった。
・ 4細胞株は群1によって部分的に刺激された(120〜140%の増殖)。
・ 1細胞株は群1によって刺激された(>140%の増殖)。
幾つかの種類のがん、即ち、腎細胞がん(テストした4細胞株のうち2細胞株;表8)、黒色腫(1/4株)、肝細胞がん(2/5株;表9)、結腸直腸がん(2/10)、乳がん(2/6株;表10)、肺腺がん(1/1株;表11)、大細胞肺がん(1/1)、及び横紋筋肉腫(1/1株;表12)は、少なくとも最高濃度の群1によって、阻害(増殖における少なくとも40%の低減で定義される)を示した。
ASC-TNFα/IFNγ処理に対して、応答性及び非応答性のがん細胞株間で、異なって発現されるマーカー遺伝子を特定するために、細胞株を器官によってグループ分けした。それゆえ、マーカー遺伝子選択のために選択されたがん細胞株は、5器官:乳房、大腸、腎臓、肝臓及び肺に由来する。応答性の細胞株RD(横紋筋肉腫)及びCHL-1(黒色腫)は、これらの器官に起源するがんについて、2クラスの各々について、2細胞株を確保するためのデータが不十分であったため、調査から除外した。
2つのクラスを各器官について以下の通り割り当てた(表13):
・ クラス0:応答性の細胞株(希釈していないCMを用いて、対照の%(POC)≦60%)。
・ クラス1:希釈していないCMを用いて、POC≧79%である細胞株。
60%<POC<79%であることで定義される、僅かに応答性の細胞株は、両方のクラスから除外した。
マーカー遺伝子を特定し選択するために、GenePatternにおけるComparativeMarkerSelectionモジュール(Reichら)を利用した。
プロファイルされた各遺伝子についての両側t検定の値を計算することによって、遺伝子をスコア化した。検定統計量が>5又は<−5である場合に、マーカー遺伝子を選択した。正及び負の値は、応答性の細胞株において、それぞれ上方制御された遺伝子及び下方制御された遺伝子を示す。表14は、>5及び<−5のスコアを有するマーカー遺伝子の数を示す。
各器官内のクラス0とクラス1細胞株との間で摂動された(perturbed)関連する生物学的経路を決定するために、各器官内で最も統計的に有意に上方制御及び下方制御された遺伝子を使用して、Reactome Pathway Database V53 (Croftら)を探索した。表15は、少なくとも1つのリアクトーム経路(Reactome pathway)において見出される5器官の各々に由来する、上方制御及び下方制御された遺伝子数を示す。
1.IFN-アルファ/ベータ経路のRIG-I/MDA5媒介性誘導(R-HSA-168928)
2.インターフェロンシグナル伝達(R-HSA-913531)
3.免疫系におけるサイトカインシグナル伝達(R-HSA-1280215)
4.細胞の老化(R-HSA-2559583)
5.ベータ-カテニンのトランス活性化複合体の失活(R-HSA-3769402)
1.上方制御された全遺伝子
2.下方制御された全遺伝子
3.上方制御及び下方制御された全遺伝子
(記載された統計的有意性に加えて)生物学的に最も重要な経路を探索するために、COSMICがん細胞株プロジェクト (Forbesら)に由来する完全エキソームシーケンシングによって体細胞変異を分析した。付加、欠失、置換、フレームシフト及びスプライス部位変異を考慮した一方で、CDSサイレント変異を除外した。Hep-G2、AGS、DLD1、LS-174T及びSW480からのデータは、データベース中に現れなかった。これらの細胞株に加えて、11株の応答性の細胞株において合計>10,300変異を考慮し、他の43細胞株において>53,000変異を考慮した。
・専ら11株の応答性の細胞株において変異している全ての遺伝子
・専ら他の43細胞株(僅かな応答性及び非応答性の株)において変異している全ての遺伝子
・専ら応答性の細胞株において変異している全ての遺伝子のプールした一覧;及び応答性の細胞株において下方制御された全ての遺伝子(上記の表15について記載したように)
最後のクエリ(query)は最も有益であり、その結果は以下において記載する。
表19は、専ら応答性株において変異している全ての遺伝子の数を示す。
結論として、上記のデータは、下方制御された若しくは異常調節されたMHCクラスI抗原プロセッシング及び提示経路並びに/又は下方制御された若しくは異常調節されたサイトカインシグナル伝達経路を有する、がん細胞株は、ASCを用いた処理に対して感受性であることを示す。
次に、階層的クラスタリングによって、乳がん株をLuminal、Basal A又はBasal Bとして特徴づけるために有用な305分類遺伝子(Neveら)の発現に基づいて、応答性及び非応答性の乳がん細胞株の表現型を決定した。論文のデータをダウンロードし、GenePatternソフトウェアツール(Reichら)を使用して、再現した(図10)。列及び行の両方についての距離を測定するために、ピアソン相関クラスタリングを使用し、階層的クラスタリング法はペアワイズ平均連結法であった。
図11Aは、11株の三重陰性(TN)株を含む、20株の乳がん細胞株を、TRAIL感受性についてテストした、Rahmanらのデータも取り込み;これらは、シンプルなアスタリスク(TRAIL非感受性)及び丸で囲ったアスタリスク(TRAIL感受性)によって印を付けている。TRAIL感受性であるTN細胞株の殆んどは、Basal Bのクラスターに入るが、そこから外れた2株がある。Basal Bである全8株のTRAIL感受性TN細胞株は「間葉系の表現型」を有し、Basal Aである全3株のTRAIL非感受性のものは「上皮系の表現型」を有する。
間葉系の表現型は、高レベルのビメンチン、高レベルのカベオリン、及び低レベルのE-カドヘリンを有すると定義される。上皮系の表現型は、高レベルのE-カドヘリン、豊富なケラチン、及び低レベルのビメンチンを有すると定義される。
結論として、TN乳がんは、ASCを用いた治療に対する感受性を示す。
図12Bは、図12Aの上部を示す。(丸で囲った)2株の細胞株のみが、以前の分析とは異なってクラスター化された。18,000のプローブセット(37株のCCLE細胞株のセットに由来する遺伝子発現データにおけるプローブ数)又は169のプローブセットを使用したかに関わらず、事実上、同一な階層的クラスタリングが得られ、従って、このことで、クラスタリングスキームが確認される(図12C)。
Luminal、Basal A及びBasal Bにクラスタリングするために重要であるとして、Neveらによる先述の階層的クラスタリング分析において特定された遺伝子を、Reactome Pathway Database(各セクション個別)に入力し、分類遺伝子が関与する経路を特定した(図13)。分類遺伝子の真ん中の行の区分としては、HLA及び2、3の他の抗原プロセッシング/提示遺伝子、並びにIFNシグナル伝達経路遺伝子が挙げられ、従って、このことで、先述の分析の正当性が更に確認され、以前、特定された経路が、ASC-TNFα/IFNγによって最初にテストしたよりも、広いスペクトルの乳がん細胞株に当てはまることが確認された。
方法
93匹の無胸腺Foxn1nuヌードの右脇の皮下に、0.2 ml PBS中の3×106のMDA-MB-231腺がん細胞を注射した(全群)―この日を0日目とみなした。実験群を表21に示す:
電子キャリパーを使用して、腫瘍体積を測定した。
ASCの抗腫瘍効果を、in vivo腫瘍移植モデルでテストした。1日目にASC投与を受けたマウスは、低減された腫瘍サイズを示した。各時点、即ち、5、7及び9日目で、IVを対照と比較した場合、阻害は統計的に有意であった(片側t検定で、それぞれp=0.0055、0.0067及び0.041)(図14A)。有効性の傾向は、IV注射(図14B〜C)及びIM注射(図14D〜E)したマウスの両方で見られた。12〜16日目(表22〜23);9〜28日目(表24);及び9〜16日目(表25)の腫瘍体積における変化倍数を観察した場合、阻害効果が強く見られた。
概要
ASCの抗腫瘍効果を研究するために、別の腫瘍移植モデルを使用した。このケースにおいては、腫瘍細胞を鼠径部乳腺脂肪体(inguinal mammary fat pad)に注射した。その後、0.5若しくは1.0×106のASC、又はPlasmaLyte (陰性対照;「Lyte」)を、筋肉内(IM)、静脈内(IV)、又はIM及びIV交互(「IV/IM」)に注射した。
処理をしなかった群9を除き、3×106のMDA-MB-231細胞を、第4の(鼠径部)乳腺脂肪体に注射し、0日目とした。表26は、全ての群に施した処理を記載する。研究期間中に、3匹のマウス(8週目に群5の2匹、11週目に群7の1匹)が死亡した。体重に対するASC投与による有意な影響は見られなかった。
1.異種移植腫瘍 腫瘍の真ん中を通って、標準的な5マイクロメーターの切片が調製され得るように、腫瘍試料のパラフィンブロックを調製した。一般的な組織病理学的評価のために、腫瘍切片をヘマトキシリン−エオシンを用いて染色した。
ImageJを使用して、画像を背景サブトラクション(subtraction)及びカラーデコンボリューション(color deconvolution)に供し、全ての核及びKi67で免疫染色した核をそれぞれ示す、青色及び茶色のモノクローム画像に分離した画像を得た。次いで、自動閾値処理によって、画像を二値化し、核を「分水界(watershed)」コマンドを使用して分離し、「粒子分析」コマンドを使用して自動で計数した。同じ試料に関連する全画像におけるKi67で標識した核のパーセンテージを、増殖指数として使用した。
P値は、StudentのT検定(両側分析)を使用して計算した。
ASCを用いた後期IM処理(48日目に開始)は、腫瘍増殖を有意に遅くし又は停止し、それは、平均腫瘍体積のプロット(図15A〜C)又は47日目からの腫瘍体積におけるパーセント変化(図15D〜E)であるかに関わらず、明らかであった。図15C及びEにおいては、異常値を除き、「調整した」数を生成した。群2においては0%、群1及び3においては5%であったのと比べ、群4におけるマウスの30%が84日目までに完全に寛解を示した。
更に、後期IM及びIV処理マウスにおいて、肺転移の完全な欠如が観察された一方、両方の対照群では肺転移があった(表27)。腋窩、鼠径部及び腰部リンパ節もまた、転移が観察された。後期-IM処理マウス及びIV処理マウスは、それぞれ腋窩及び腰部に対する転移が低減する傾向を示した(表28)。
実施例6又は実施例9で記載したように調製した、3集団(batches)のASCをテストした。500,000 ASCを、がん細胞増殖培地(RPMI又は高グルコースDMEM、適宜、血清なし)中で24時間インキュベートし、CMを生成した。3株のがん細胞株(TRAIL感受性であるNCI-H460及びMDA-MB-231;並びにTRAIL非感受性であるMCF7)を、1ウェル当たり1500、3000、6000又は12000細胞の初期密度で、48ウェルプレートに播種した。次の日、培地消費による非特異的な増殖阻害を回避するために、CMに5%FBS及び1%グルタミンを添加した後に、細胞を洗浄し、ASC-CMに曝露したか、又は対照として使用した標準の増殖培地+5%FBSに曝露した。ASC-CM又は培地における3日間のインキュベーション後、細胞を洗浄し、凍結した。細胞を播種した1日後に、各密度で播種したベースラインプレートを洗浄し、凍結し、次いで、他の試料と同等に以降の処理を行った。CyQUANT GRを使用して、生存細胞を定量した。ASC-CMは、NCI-H460(図21A)及びMDA-MB-231(図21B)の増殖を阻害した。
ルシフェラーゼ標識MDA-MB-231、ヒト乳房腫瘍細胞 (Yangら)を、NOD-SCID免疫不全マウスの乳腺脂肪体に注射し、先述の実施例で記載のように、IV及びIMで与えられるASCを用いてマウスを処理する。肺におけるMDA-MB-231腫瘍細胞のコロニー形成をIVIS画像化システム (PerkinElmer、American Fork、Utah)を用いてモニターする。
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Claims (12)
- 乳がんを治療する方法における使用のための接着性間質細胞(ASC)を含む医薬組成物であって、前記ASCが胎盤組織に起源するものであり、前記ASCが3次元(3D)培養から取得され、および前記ASCが、前記3D培養に先立って、2D接着性細胞培養装置中でインキュベートされている、医薬組成物。
- 前記3D培養が、前記3D培養の過程の間中、組成が変えられない培地を利用する、請求項1に記載の、医薬組成物。
- 前記3D培養のインキュベーション培地に、1以上の炎症促進性サイトカインが添加される、請求項1に記載の、医薬組成物。
- 前記3D培養が:(a)ASCを3D培養装置中、第一の増殖培地であって、炎症性サイトカインが添加されていない、前記第一の増殖培地中でインキュベートすること;及び、(b)その後、前記ASCを3D培養装置中、第二の増殖培地であって、前記1以上の炎症促進性サイトカインが添加されている、前記第二の増殖培地中でインキュベートすること、を含む、請求項3に記載の、医薬組成物。
- 前記1以上の炎症促進性サイトカインが腫瘍壊死因子アルファ(TNF−α)又はインターフェロン・ガンマ(IFN−ガンマ)を含む、請求項3に記載の、医薬組成物。
- 前記3D培養が、3Dバイオリアクターを含む装置中で行われる、請求項1〜5のいずれか一項に記載の、医薬組成物。
- 前記3D培養が、線維性ベッドマトリクスを含む装置中で行われ、前記繊維性ベッドマトリクスが合成接着性材料を含む、請求項1〜6のいずれか一項に記載の、医薬組成物。
- 前記ASCが少なくとも主に母体細胞である、請求項1〜7のいずれか一項に記載の、医薬組成物。
- 前記ASCが少なくとも主に胎児細胞である、請求項1〜7のいずれか一項に記載の、医薬組成物。
- 前記乳がんが三重陰性である、請求項1〜9のいずれか一項に記載の、医薬組成物。
- 前記ASCが全身に投与される、請求項1〜10のいずれか一項に記載の、医薬組成物。
- 前記ASCが腫瘍内に投与される、請求項1〜10のいずれか一項に記載の、医薬組成物。
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