JP6872034B2 - 波形解析装置 - Google Patents
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Description
a)ピークの始点及び終点が既知である複数の信号波形を用いた機械学習によって予め構築された学習済みモデルを使用して、目的試料についての信号波形に現れる一又は複数のピークの始点の位置又は終点の位置の少なくとも一方を含むピーク情報を推定するとともに、その推定の確からしさを示す指標値である確度情報を求めるピーク検出部と、
b)前記ピーク検出部により一つのピークに対して得られた一又は複数のピーク情報をそれぞれの確度情報と対応付けて、前記目的試料についての信号波形とともに表示部の画面上に表示する表示処理部と、
を備えることを特徴としている。
また本発明に係る波形解析装置では、前記表示処理部により前記表示部の画面上に表示されたピーク情報を修正するピーク情報修正部、をさらに備える構成とすることができる。
前記ピーク情報修正部は、前記最有力候補とは別の候補をユーザが選択指示する指示部を含み、該指示部により選択指示された候補を最有力候補に変更する構成とするとよい。 上記指示部としては例えば、画面上に表示されている文字や記号等をクリック操作するためのポインティングデバイスを用いればよい。
そこで、上記構成では、前記確度分布において確度情報の値が最大であるピーク情報に含まれるピーク始点及び/又は終点の位置の近傍で、且つ該確度情報の値が極大点となる位置に対応するピーク始点及び/又は終点を含むピーク情報を求め、これを最有力候補としてもよい。
図1は本発明に係る波形解析装置の一実施例を用いた液体クロマトグラフ(LC)システム及び該システムに用いられる学習済みモデルを作成するシステムの概略構成図である。
データ解析部11は、データ収集部110、ピーク検出処理部111、定性・定量解析部117などの機能ブロックを含み、ピーク検出処理部111はさらに、画像生成部112、ピーク位置推定部113、学習済みモデル記憶部114、ピーク情報修正処理部115、ピーク決定部116などの機能ブロックを含む。
ごく概略的にいうと、このピーク検出処理部111では、クロマトグラム波形(クロマトグラムカーブ)を2次元画像に変換したうえで、その画像上に存在する物体のカテゴリーと位置とを検出する機械学習の一手法であるディープラーニング(Deep Learning)の手法を用いることによって、ピークの始点及び終点の位置を検出している。
よく知られているように、機械学習法では、多数の学習データを用いて学習済みモデルを予め構築しておく必要がある。上述したように、この学習済みモデルの構築の作業は、LCシステム1の一部であるデータ解析部11において行われるのではなく、別のコンピュータシステムにより構成されるモデル作成部2で実施され、その結果が学習済みモデル記憶部114に格納される。それは、一般に学習済みモデルの構築作業は多量のデータを処理するために計算量が膨大であり、かなり高性能で且つ画像処理に対応したコンピュータが必要であるためである。図2は、モデル作成部2において行われる学習済みモデル作成時の処理の流れを示すフローチャートである。
次に、LCシステム1のデータ解析部11で実行される、目的試料に対して得られたクロマトグラム波形上のピークの検出処理を説明する。図3はピーク検出処理部111において行われるピーク検出処理の流れを示すフローチャートである。
まず、画像生成部112は処理対象であるクロマトグラム波形データをデータ収集部110から読み込む(ステップS11)。そして、読み込んだデータに対し、モデル作成部2の画像生成部21で実行されたステップS2〜S4によるクロマトグラム波形データの画像化と同様のステップS12〜S14の処理を実行することにより、クロマトグラムカーブを含む512×512画素の画像を生成する。
上述したように一般的に、一つのピークに対し始点・終点の位置がピーク検出確度と共に複数得られる。したがって、その複数のピーク始点・終点の中でピーク検出確度が最も高いものが正解であると推定し、そのピークの始点・終点の情報をピーク検出結果として出力してもよい。しかしながら、場合によっては、最大のピーク検出確度を示すピーク始点・終点の位置が必ずしも正解であるとは限らないことがある。また、一つのピークについて得られた複数のピーク始点・終点の中に正解がない場合もあり得る。そこで、本実施例の装置において、ピーク情報修正処理部115は以下のようにしてオペレータによる確認及び修正作業を支援する。
オペレータが複数の候補の中からいずれか一つを選択するうえで目安となるのはピーク検出確度であるから、ピーク検出確度が最大である候補を最有力候補として他の候補とは視覚的に識別容易であるように表示することが好ましい。そこで、各候補によるピークの始点・終点をクロマトグラム波形上に所定の色の丸印等の記号で示すものとし、最有力候補を示す記号は濃い色で、他の候補を示す記号は淡い色で示すようにするとよい。また、ピーク検出確度が高い順に記号の色の濃淡に変化をつけるようにしてもよい。また、ピークの始点と終点との区別を容易にするために、例えば始点と終点とを異なる色としたり、始点は丸印、終点は三角印等、異なる記号を用いて表示したりしてもよい。
いま、一つのピークに対してピーク始点・終点の候補が複数(実際には或る程度多数)ある場合、始点、終点毎に、時間軸上でのピーク検出確度の変化を確度分布として捉えグラフ化する。このグラフは線グラフでもよいしヒートマップ等でもよい。例えば複数の点に対して適宜のフィッティングを行って確度分布曲線を求めると、その点の中でピーク検出確度が最大である点で確度分布曲線が極大値をとるとは限らず、そのピーク検出確度が最大である点の近傍で確度分布曲線が極大値をとることがある。その場合、その極大値をとる位置(時間)のほうがピーク始点又は終点として妥当であると考えられる。そこで、確度分布曲線が極大値をとる位置をピーク始点又は終点の最有力候補とすればよい。またそのときの極大値をその最有力候補に対応するピーク検出確度とすればよい。
10…LC測定部
11…データ解析部
110…データ収集部
111…ピーク検出処理部
112…画像生成部
113…ピーク位置推定部
114…モデル記憶部
115…ピーク情報修正処理部
116…ピーク決定部
117…定性・定量解析部
12…操作部
13…表示部
2…モデル作成部
20…学習データ入力部
21…画像生成部
22…学習実行部
23…モデル構築部
Claims (10)
- 試料に対して所定の分析を行うことで得られた信号列に基づく信号波形を解析し該信号波形上のピークに関連する情報を求める波形解析装置において、
a)ピークの始点及び終点が既知である複数の信号波形を用いた機械学習によって予め構築された学習済みモデルを使用して、目的試料についての信号波形に現れる一又は複数のピークの始点の位置又は終点の位置の少なくとも一方を含むピーク情報を推定するとともに、その推定の確からしさを示す指標値である確度情報を求めるピーク検出部と、
b)前記ピーク検出部により一つのピークに対して得られた一又は複数のピーク情報をそれぞれの確度情報と対応付けて、前記目的試料についての信号波形とともに表示部の画面上に表示する表示処理部と、
を備えることを特徴とする波形解析装置。 - 請求項1に記載の波形解析装置であって、
前記表示処理部により前記表示部の画面上に表示されたピーク情報を修正するピーク情報修正部、をさらに備えることを特徴とする波形解析装置。 - 請求項2に記載の波形解析装置であって、
前記表示処理部は、信号波形上の一つのピークについて得られた複数のピーク情報のうちの一つを最有力候補として、それ以外のピーク情報である候補とは識別可能に表示し、
前記ピーク情報修正部は、前記最有力候補とは別の候補をユーザが選択指示する指示部を含み、該指示部により選択指示された候補を最有力候補に変更することを特徴とする波形解析装置。 - 請求項3に記載の波形解析装置であって、
前記表示処理部は、一つのピークについて得られた複数のピーク情報のうち確度情報の値が最も大きいものを最有力候補とし、少なくともその次に確度情報の値が大きなピーク情報である候補と共に表示することを特徴とする波形解析装置。 - 請求項3に記載の波形解析装置であって、
前記表示処理部は、一つのピークについて得られた複数のピーク情報に対応する確度情報を確率とみなし、該複数のピーク情報に含まれるピークの始点及び/又は終点の位置に対する確率の分布を示す確度分布を求め、該確度分布に基づいて前記最有力候補を決めることを特徴とする波形解析装置。 - 請求項5に記載の波形解析装置であって、
前記表示処理部は、前記確度分布において確度情報の値が最大であるピーク情報に含まれるピーク始点及び/又は終点の位置の近傍で、且つ該確度情報の値が極大点となる位置に対応するピーク始点及び/又は終点を含むピーク情報を求め、これを最有力候補とすることを特徴とする波形解析装置。 - 請求項5に記載の波形解析装置であって、
前記表示処理部は、前記確度分布に複数の凸部が存在する場合に、その凸部のそれぞれの極大点のうちの上位から所定個数の極大点に対応するピークの始点及び/又は終点をそれぞれ含むピーク情報を候補とすることを特徴とする波形解析装置。 - 請求項1に記載の波形解析装置であって、
前記表示処理部は、一つのピークについて得られた複数のピーク情報の中から、そのピーク情報に対応する確度情報の値と、同じ目的試料についての分析で得られた信号列又は信号波形に基づいて求まった同じピークについてのピーク情報に対応する確度情報の値との差異が所定以内であるピーク情報を選択して表示することを特徴とする波形解析装置。 - 請求項1に記載の波形解析装置であって、
前記表示処理部は、同じ目的試料について複数回の分析で得られた複数の信号列又は信号波形に基づいて求まった同じピークについての複数のピーク情報及び確度情報を同時に表示することを特徴とする波形解析装置。 - 請求項1に記載の波形解析装置であって、
前記表示処理部は、一つのピークに対する複数のピーク情報の候補のうち指標値が最大である候補又は最有力候補のピークの始点及び/又は終点の近傍で且つ信号強度が最も低くなる位置をピークの始点及び/又は終点の最有力候補として表示することを特徴とする波形解析装置。
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