JP2011191222A - 質量分析データ処理方法及び装置 - Google Patents
質量分析データ処理方法及び装置 Download PDFInfo
- Publication number
- JP2011191222A JP2011191222A JP2010058644A JP2010058644A JP2011191222A JP 2011191222 A JP2011191222 A JP 2011191222A JP 2010058644 A JP2010058644 A JP 2010058644A JP 2010058644 A JP2010058644 A JP 2010058644A JP 2011191222 A JP2011191222 A JP 2011191222A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- mass
- color
- maximum intensity
- charge ratio
- maximum
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
Classifications
-
- H—ELECTRICITY
- H01—ELECTRIC ELEMENTS
- H01J—ELECTRIC DISCHARGE TUBES OR DISCHARGE LAMPS
- H01J49/00—Particle spectrometers or separator tubes
- H01J49/0004—Imaging particle spectrometry
-
- H—ELECTRICITY
- H01—ELECTRIC ELEMENTS
- H01J—ELECTRIC DISCHARGE TUBES OR DISCHARGE LAMPS
- H01J49/00—Particle spectrometers or separator tubes
- H01J49/0027—Methods for using particle spectrometers
- H01J49/0036—Step by step routines describing the handling of the data generated during a measurement
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
- Other Investigation Or Analysis Of Materials By Electrical Means (AREA)
Abstract
【解決手段】試料8上の各ピクセルb毎にマススペクトル中の最大強度MI(i)と対応する質量電荷比m/z(i)をリストアップし、全ピクセルの最大強度MIの中で値が最大であるMIIを抽出する。0〜MIIの範囲で強度値のカラースケールを定め、ピクセル毎に最大強度MIをカラースケールに照らして色を決め、ピクセルを色付けしたイメージング画像を作成して表示する。同時に、全ピクセルのMI(i)とm/z(i)との関係を示すスペクトルを、各ピークの色がイメージング画像上のピクセルに対応した色となるように表示する。イメージング画像により試料上の組織構造の判別が可能となり、スペクトルと照らし合わせることで試料に顕著に含まれる物質のm/zが特定可能となる。
【選択図】図3
Description
即ち、MSイメージ表示ソフトウエアを用いた解析手法では、分析者が積算マススペクトル上でピークを選択すると、そのピークに対応した質量電荷比の強度空間分布が表示される。このため、空間的に特異的な分布を示す物質に対応したピークが必ずしも選択され表示されるとは限らない。また、試料上の小領域毎に特異的な強度空間分布を示すピークを探し出したい場合には、分析者が試行錯誤的に複数のピークの強度空間分布を比較したり重ね合わせ表示を行ったりする必要がある。このため、通常、分析者は積算マススペクトル上の多くのピークに対するイメージ表示を行う作業を繰り返す必要があり、多大な労力と時間とを要する。
a)前記微小領域毎に、その微小領域に対応したマススペクトルデータに基づいて最大強度とそれを与える質量電荷比とをそれぞれ抽出する第1ステップと、
b)第1ステップで得られた各微小領域の最大強度の中で最大値を抽出し、その最大値に基づいて強度表示のカラースケールを決めて、該カラースケールに従い第1ステップで得られた最大強度に対応する色をそれぞれの微小領域に与え、前記2次元領域の全体又は一部に対応したカラー2次元画像を作成して表示する第2ステップと、
c)第1ステップで得られた各微小領域の最大強度とそれを与える質量電荷比との関係について、同一質量電荷比における複数の最大強度の中で値が最大のものに対応した前記カラースケールに従った色でそのピークの少なくとも一部を表示するように、最大強度スペクトルを作成して前記カラー2次元画像と対応して表示する第3ステップと、
を有することを特徴としている。
a)前記微小領域毎に、その微小領域に対応したマススペクトルデータに基づいて最大強度とそれを与える質量電荷比とをそれぞれ抽出する情報抽出手段と、
b)該情報抽出手段により得られた各微小領域の最大強度の中で最大値を抽出し、その最大値に基づいて強度表示のカラースケールを決めて、該カラースケールに従い前記情報抽出手段により得られた最大強度に対応する色をそれぞれの微小領域に与え、前記2次元領域の全体又は一部に対応したカラー2次元画像を作成して表示画面上に表示する2次元画像表示情報形成手段と、
c)前記情報抽出手段によりで得られた各微小領域の最大強度とそれを与える質量電荷比との関係について、同一質量電荷比における複数の最大強度の中で値が最大のものに対応した前記カラースケールに従った色でそのピークの少なくとも一部を表示するように、最大強度スペクトルを作成して前記カラー2次元画像と対応して表示画面上に表示するスペクトル表示情報形成手段と、
を備えることを特徴としている。
2…データ処理部
3…データ記憶部
4…顕微画像処理部
5…制御部
6…操作部
7…表示部
8…試料
8a…2次元測定対象領域
8b…微小領域(ピクセル)
Claims (4)
- 試料上の2次元領域内に設定された複数の微小領域に対してそれぞれ質量分析を実行することにより収集されたデータを処理する質量分析データ処理方法であって、
a)前記微小領域毎に、その微小領域に対応したマススペクトルデータに基づいて最大強度とそれを与える質量電荷比とをそれぞれ抽出する第1ステップと、
b)第1ステップで得られた各微小領域の最大強度の中で最大値を抽出し、その最大値に基づいて強度表示のカラースケールを決めて、該カラースケールに従い第1ステップで得られた最大強度に対応する色をそれぞれの微小領域に与え、前記2次元領域の全体又は一部に対応したカラー2次元画像を作成して表示する第2ステップと、
c)第1ステップで得られた各微小領域の最大強度とそれを与える質量電荷比との関係について、同一質量電荷比における複数の最大強度の中で値が最大のものに対応した前記カラースケールに従った色でそのピークの少なくとも一部を表示するように、最大強度スペクトルを作成して前記カラー2次元画像と対応して表示する第3ステップと、
を有することを特徴とする質量分析データ処理方法。 - 請求項1に記載の質量分析データ処理方法であって、
第1ステップで得られた最大強度を与える質量電荷比とその質量電荷比が得られた微小領域の度数との関係を示すヒストグラムを作成して前記カラー2次元画像及び前記最大強度スペクトルと対応付けて表示する第4ステップ、をさらに有することを特徴とする質量分析データ処理方法。 - 試料上の2次元領域内に設定された複数の微小領域に対してそれぞれ質量分析を実行することにより収集されたデータを処理する質量分析データ処理装置であって、
a)前記微小領域毎に、その微小領域に対応したマススペクトルデータに基づいて最大強度とそれを与える質量電荷比とをそれぞれ抽出する情報抽出手段と、
b)該情報抽出手段により得られた各微小領域の最大強度の中で最大値を抽出し、その最大値に基づいて強度表示のカラースケールを決めて、該カラースケールに従い前記情報抽出手段により得られた最大強度に対応する色をそれぞれの微小領域に与え、前記2次元領域の全体又は一部に対応したカラー2次元画像を作成して表示画面上に表示する2次元画像表示情報形成手段と、
c)前記情報抽出手段によりで得られた各微小領域の最大強度とそれを与える質量電荷比との関係について、同一質量電荷比における複数の最大強度の中で値が最大のものに対応した前記カラースケールに従った色でそのピークの少なくとも一部を表示するように、最大強度スペクトルを作成して前記カラー2次元画像と対応して表示画面上に表示するスペクトル表示情報形成手段と、
を備えることを特徴とする質量分析データ処理装置。 - 請求項3に記載の質量分析データ処理装置であって、
前記情報抽出手段により得られた最大強度を与える質量電荷比とその質量電荷比が得られた微小領域の度数との関係を示すヒストグラムを作成して前記カラー2次元画像及び前記最大強度スペクトルと対応付けて表示画面上に表示するヒストグラム表示情報形成手段、をさらに備えることを特徴とする質量分析データ処理装置。
Priority Applications (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2010058644A JP5348029B2 (ja) | 2010-03-16 | 2010-03-16 | 質量分析データ処理方法及び装置 |
US13/048,729 US8873796B2 (en) | 2010-03-16 | 2011-03-15 | Mass analysis data processing method and mass analysis data processing apparatus |
CN201110063709.2A CN102194641B (zh) | 2010-03-16 | 2011-03-16 | 质量分析数据处理方法和质量分析数据处理设备 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2010058644A JP5348029B2 (ja) | 2010-03-16 | 2010-03-16 | 質量分析データ処理方法及び装置 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2011191222A true JP2011191222A (ja) | 2011-09-29 |
JP5348029B2 JP5348029B2 (ja) | 2013-11-20 |
Family
ID=44602510
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2010058644A Active JP5348029B2 (ja) | 2010-03-16 | 2010-03-16 | 質量分析データ処理方法及び装置 |
Country Status (3)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US8873796B2 (ja) |
JP (1) | JP5348029B2 (ja) |
CN (1) | CN102194641B (ja) |
Cited By (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2014215043A (ja) * | 2013-04-22 | 2014-11-17 | 株式会社島津製作所 | イメージング質量分析データ処理方法及びイメージング質量分析装置 |
DE102016000124A1 (de) | 2015-01-16 | 2016-07-21 | Jeol Ltd. | Massenspektrometrie-Datenverarbeitungsvorrichtung und Massenspektrometrie-Datenverarbeitungsverfahren |
JP2017040520A (ja) * | 2015-08-19 | 2017-02-23 | 株式会社島津製作所 | 分析データ表示処理装置及び表示処理プログラム |
JP2017509945A (ja) * | 2014-01-10 | 2017-04-06 | イマビオテクImabiotech | 分子イメージングデータを処理する方法及び対応するデータサーバ |
Families Citing this family (12)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US8362931B2 (en) * | 2010-11-30 | 2013-01-29 | Microsoft Corporation | Compression and decompression of mass spectrometry data |
JP6144916B2 (ja) * | 2012-01-30 | 2017-06-07 | キヤノン株式会社 | 生体組織画像のノイズ低減処理方法及び装置 |
JP6235886B2 (ja) | 2013-01-08 | 2017-11-22 | キヤノン株式会社 | 生体組織画像の再構成方法及び装置並びに該生体組織画像を用いた画像表示装置 |
WO2014201052A2 (en) * | 2013-06-10 | 2014-12-18 | University Of Mississippi Medical Center | Medical image processing method |
EP3318866A4 (en) | 2015-07-01 | 2018-09-19 | Shimadzu Corporation | Data processing device |
CN109690307A (zh) * | 2016-08-26 | 2019-04-26 | 株式会社岛津制作所 | 成像质谱分析数据处理装置 |
EP3572805A4 (en) * | 2017-01-19 | 2020-09-16 | Shimadzu Corporation | ANALYSIS METHOD FOR ANALYSIS DATA AND ANALYSIS DEVICE FOR ANALYSIS DATA |
TW201908726A (zh) * | 2017-07-21 | 2019-03-01 | 日商日立高新技術科學股份有限公司 | 頻譜資料處理裝置以及頻譜資料處理方法 |
CN107607783B (zh) * | 2017-09-01 | 2019-09-20 | 广州辰创科技发展有限公司 | 一种高效灵活的雷达频谱显示方法 |
US11276566B2 (en) * | 2018-05-30 | 2022-03-15 | Shimadzu Corporation | Imaging data processing device |
WO2020217333A1 (ja) * | 2019-04-24 | 2020-10-29 | 株式会社島津製作所 | イメージング質量分析装置 |
WO2022108942A1 (en) * | 2020-11-17 | 2022-05-27 | MOBILion Systems, Inc. | Systems and methods for image and/or video processing of mass spectrometry data |
Citations (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2005539199A (ja) * | 2001-10-15 | 2005-12-22 | バンダービルト ユニバーシティ | 質量分析による生物学的試料の分析のための方法および装置 |
JP2007309860A (ja) * | 2006-05-22 | 2007-11-29 | Shimadzu Corp | Maldi用サンプル調製方法及び質量分析装置 |
JP2009025268A (ja) * | 2007-07-24 | 2009-02-05 | Shimadzu Corp | 質量分析装置 |
WO2010001439A1 (ja) * | 2008-07-03 | 2010-01-07 | 株式会社島津製作所 | 質量分析装置 |
JP2011203239A (ja) * | 2010-03-05 | 2011-10-13 | Shimadzu Corp | 質量分析データ処理方法及び装置 |
Family Cites Families (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2006118615A2 (en) * | 2004-12-16 | 2006-11-09 | Brandeis University | Clonable tag for purification and electron microscopy labeling |
JP4766549B2 (ja) | 2005-08-29 | 2011-09-07 | 株式会社島津製作所 | レーザー照射質量分析装置 |
JP2007157353A (ja) | 2005-11-30 | 2007-06-21 | Osaka Univ | イメージング質量分析装置 |
JP2007257851A (ja) | 2006-03-20 | 2007-10-04 | Shimadzu Corp | 質量分析装置 |
JP4602374B2 (ja) * | 2007-03-30 | 2010-12-22 | 株式会社日立ハイテクノロジーズ | クロマトグラフィー質量分析方法、及びクロマトグラフ質量分析装置 |
-
2010
- 2010-03-16 JP JP2010058644A patent/JP5348029B2/ja active Active
-
2011
- 2011-03-15 US US13/048,729 patent/US8873796B2/en active Active
- 2011-03-16 CN CN201110063709.2A patent/CN102194641B/zh active Active
Patent Citations (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2005539199A (ja) * | 2001-10-15 | 2005-12-22 | バンダービルト ユニバーシティ | 質量分析による生物学的試料の分析のための方法および装置 |
JP2007309860A (ja) * | 2006-05-22 | 2007-11-29 | Shimadzu Corp | Maldi用サンプル調製方法及び質量分析装置 |
JP2009025268A (ja) * | 2007-07-24 | 2009-02-05 | Shimadzu Corp | 質量分析装置 |
WO2010001439A1 (ja) * | 2008-07-03 | 2010-01-07 | 株式会社島津製作所 | 質量分析装置 |
JP2011203239A (ja) * | 2010-03-05 | 2011-10-13 | Shimadzu Corp | 質量分析データ処理方法及び装置 |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
EIJKEL, G B ET AL.: "Correlating MALDI and SIMS imaging mass spectrometric datasets of biological tissue surfaces", SURFACE AND INTERFACE ANALYSIS, vol. 41, no. 8, JPN6013027134, 17 July 2009 (2009-07-17), pages 675 - 685, XP055477104, ISSN: 0002584263, DOI: 10.1002/sia.3088 * |
Cited By (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2014215043A (ja) * | 2013-04-22 | 2014-11-17 | 株式会社島津製作所 | イメージング質量分析データ処理方法及びイメージング質量分析装置 |
JP2017509945A (ja) * | 2014-01-10 | 2017-04-06 | イマビオテクImabiotech | 分子イメージングデータを処理する方法及び対応するデータサーバ |
DE102016000124A1 (de) | 2015-01-16 | 2016-07-21 | Jeol Ltd. | Massenspektrometrie-Datenverarbeitungsvorrichtung und Massenspektrometrie-Datenverarbeitungsverfahren |
US10147590B2 (en) | 2015-01-16 | 2018-12-04 | Jeol Ltd. | Mass spectrometry data processing apparatus and mass spectrometry data processing method |
JP2017040520A (ja) * | 2015-08-19 | 2017-02-23 | 株式会社島津製作所 | 分析データ表示処理装置及び表示処理プログラム |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
US20110228970A1 (en) | 2011-09-22 |
JP5348029B2 (ja) | 2013-11-20 |
CN102194641B (zh) | 2014-05-14 |
US8873796B2 (en) | 2014-10-28 |
CN102194641A (zh) | 2011-09-21 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP5348029B2 (ja) | 質量分析データ処理方法及び装置 | |
JP5527232B2 (ja) | 質量分析データ処理方法及び装置 | |
US11776799B2 (en) | Data processing device | |
US11790629B2 (en) | Intensity normalization in imaging mass spectrometry | |
JP5565810B2 (ja) | 質量分析データ処理方法及び装置 | |
JP4602374B2 (ja) | クロマトグラフィー質量分析方法、及びクロマトグラフ質量分析装置 | |
JP6207036B2 (ja) | 質量分析データ処理方法及び装置 | |
JP2013040808A (ja) | 質量分析データ解析方法及び解析装置 | |
JP6569800B2 (ja) | 質量分析データ解析装置及び質量分析データ解析用プログラム | |
JP6179600B2 (ja) | 質量分析データ解析装置 | |
Thomas et al. | Visualization of high resolution spatial mass spectrometric data during acquisition | |
JP6939912B2 (ja) | イメージング質量分析用データ処理装置 | |
JP6403204B2 (ja) | 質量分析データ処理装置および質量分析データ処理方法 | |
JP5007326B2 (ja) | クロマトグラフィー質量分析方法、及びクロマトグラフ質量分析装置 | |
JP7040537B2 (ja) | イメージング質量分析装置 | |
JP2021196260A (ja) | イメージング質量分析装置、及びイメージング質量分析方法 | |
WO2019150574A1 (ja) | イメージング質量分析装置 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20120607 |
|
A977 | Report on retrieval |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A971007 Effective date: 20130527 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20130604 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20130625 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20130723 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20130805 |
|
R151 | Written notification of patent or utility model registration |
Ref document number: 5348029 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R151 |