JP6858559B2 - 蛋白質溶液の粘度測定方法 - Google Patents
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Description
一般的に、抗体等の蛋白質溶液の粘度の測定には、せん断速度とせん断応力との比例係数から粘度を算出するレオメーターや、試料溶液中の金属球の回転速度から粘度を算出するEMS粘度計、あるいは試料の通過速度や通過の際の圧力損失から粘度を算出するマイクロ流路を利用した粘度測定器を用いるのが主流である。
〔1〕以下の工程を含む、蛋白質溶液の粘度の測定方法:
1)該蛋白質の濃度が1〜100mg/mlである試料にX線を照射することによる、X線小角散乱法(SAXS)またはX線溶液散乱法を用いて、見かけの粒子サイズ(見かけの粒子の最大長(Dmax app)もしくは見かけの粒子の慣性半径(Rg app))または見かけの分子量を測定する工程;
2)予め求めた検量線に基づき、上記測定値から該蛋白質の粘度を算出する工程。
〔2〕試料中の蛋白質濃度が10〜100mg/mlである、〔1〕の測定方法。
〔3〕試料中の蛋白質濃度が10〜30mg/mlである、〔1〕または〔2〕の測定方法。
〔4〕試料中の蛋白質濃度が15〜30mg/mlである、〔1〕〜〔3〕のいずれかの測定方法。
〔5〕測定温度の条件が0〜40℃である、〔1〕〜〔4〕のいずれかの測定方法。
〔6〕測定温度の条件が0〜25℃である、〔1〕〜〔5〕のいずれかの測定方法。
〔7〕測定温度の条件が3〜10℃である、〔1〕〜〔6〕のいずれかの測定方法。
〔8〕測定する試料の量が1〜100μLである、〔1〕〜〔7〕のいずれかの測定方法。
〔9〕測定する試料の量が5〜30μLである、〔1〕〜〔8〕のいずれかの測定方法。
〔10〕前記蛋白質が抗体である、〔1〕〜〔9〕のいずれかの測定方法。
〔11〕蛋白質の粘性を予測する方法であって、該蛋白質の濃度が1〜100mg/mlである試料にX線を照射することによる、X線小角散乱法(SAXS)またはX線溶液散乱法を用いて、見かけの粒子サイズ(見かけの粒子の最大長(Dmax app)もしくは見かけの粒子の慣性半径(Rg app))または見かけの分子量を測定することを含む、前記方法。
〔12〕粘性を制御した蛋白質の選抜方法であって、該蛋白質の濃度が1〜100mg/mlである試料にX線を照射することによる、X線小角散乱法(SAXS)またはX線溶液散乱法を用いて、見かけの粒子サイズ(見かけの粒子の最大長(Dmax app)もしくは見かけの粒子の慣性半径(Rg app))または見かけの分子量を測定することを含む、前記選抜方法。
〔13〕以下の工程を含む、粘性の制御された改変蛋白質を製造する方法:
1)元の蛋白質のアミノ酸の一部を改変して、改変蛋白質を得る工程;
2)〔11〕の予測方法を用いて、当該蛋白質の粘性を予測する工程。
〔14〕以下の工程を含む、粘性の低い蛋白質を製造する方法:
1)〔11〕の予測方法を用いて、粘性の低い蛋白質を選抜する工程。
〔15〕以下の工程を含む、粘性の制御された改変蛋白質を製造する方法:
1)元の蛋白質のアミノ酸の一部を改変して、改変蛋白質を得る工程;
2)〔12〕の選抜方法を用いて、当該改変蛋白質から粘性の制御された蛋白質を選抜する工程。
〔16〕以下の工程を含む、粘性を低下させた改変蛋白質を製造する方法:
1)元の蛋白質のアミノ酸の一部を改変して、改変蛋白質を得る工程;
2)〔12〕の選抜方法を用いて、当該改変蛋白質から元の蛋白質よりも粘性が低下した改変蛋白質を選抜する工程。
〔17〕元の蛋白質が、アミノ酸残基の一部がヒスチジン(His)残基に置換された改変蛋白質である、〔13〕、〔15〕または〔16〕の方法:
〔18〕蛋白質が抗体である、〔11〕〜〔16〕のいずれかの方法。
〔19〕元の抗体のアミノ酸残基の一部がヒスチジン(His)残基に置換された改変抗体であって、Kabat numbering systemにおける97位のアミノ酸残基がHis残基でない改変抗体。
〔20〕97位のアミノ酸残基が元の抗体のアミノ酸残基である、〔19〕の改変抗体。
〔21〕元の抗体のアミノ酸残基の一部が別のアミノ酸に置換されている、抗原に対してイオン濃度依存的に結合する改変抗体であって、Kabat numbering systemにおける97位のアミノ酸残基がHis残基でない改変抗体。
〔22〕97位のアミノ酸残基が元の抗体のアミノ酸残基である、〔21〕に記載の改変抗体。
本発明は、少量の試料で実施可能な蛋白質溶液の粘度の測定方法(推定方法)、蛋白質の粘性を予測する方法、粘性を制御した蛋白質の選抜方法、粘性の制御された改変蛋白質を製造する方法、粘性を低下させた改変蛋白質を製造する方法、および粘性の低い蛋白質を製造する方法に関する。
具体的には、(1)蛋白質の濃度が1〜100mg/mlである試料にX線を照射することによる、X線小角散乱法(SAXS)またはX線溶液散乱法を用いて、見かけの粒子サイズ(見かけの粒子の最大長(Dmax app)もしくは見かけの粒子の慣性半径(Rg app))または見かけの分子量を測定し、(2)予め求めた検量線に基づき、上記測定値から該蛋白質の粘度を算出することにより、該蛋白質を含む溶液を高濃度化した際の粘度を推定することができる。
なお、ここで「元の蛋白質」や「元の抗体」とは、「人為的にアミノ酸の一部を改変する前の蛋白質」若しくは「人為的にアミノ酸の一部を改変する前の蛋白質」である。
(1)前記蛋白質の濃度が1〜100mg/mlである試料にX線を照射し、X線小角散乱法(SAXS)またはX線溶液散乱法を用いて、前記溶液中の蛋白質の見かけの粒子サイズ(見かけの粒子の最大長(Dmax app)もしくは見かけの粒子の慣性半径(Rg app))または見かけの分子量を測定する工程;および
(2)予め求めた検量線に基づき、上記測定値から該蛋白質の粘度を算出する工程。
低分子化抗体としては、抗TPO受容体アゴニストDiabody(WO02/33072参照)、抗CD47アゴニストDiabody(WO01/66737参照)などが好ましい。
(a)グルタミン酸(E)、アスパラギン酸(D)
(b)リジン(K)、アルギニン(R)、ヒスチジン(H)
すなわち、本発明における改変としては、(1)電荷を有するアミノ酸から電荷を有さないアミノ酸への置換、(2)電荷を有するアミノ酸から当該アミノ酸とは反対の電荷を有するアミノ酸への置換、(3)電荷を有さないアミノ酸から電荷を有するアミノ酸への置換が挙げられる。
なお、本明細書において引用された全ての先行技術文献は、参照として本明細書に組み入れられる。
MAb1:血液凝固第IX因子および/または活性化血液凝固第IX因子ならびに血液凝固第X因子および/または活性化血液凝固第X因子を認識する二重特異性抗体である。非特許文献(PLoS One. 2013;8(2):e57479)及び特許文献(WO 2012/067176)に記載の二重特異性抗体であるACE910 (Q499-z121/J327-z119/L404-k)(配列番号:3に記載のアミノ酸配列からなるH鎖と配列番号:5に記載のL鎖が会合し、配列番号:4に記載のアミノ酸配列からなるH鎖と配列番号:5に記載のL鎖が会合している二重特異性抗体)を、前記非特許文献又は特許文献の記載に従って作製した。尚、ACE910は前記特許文献に記載されているように凝固第VIII因子の機能を代替する活性を有している。
MAb2:WO 2009/041621に記載された抗IL-6レセプター抗体で、トシリツマブのアミノ酸を改変してpI値5.8とした抗体(SA237)である。MAb2抗体のアミノ酸配列はH鎖/配列番号:1、L鎖/配列番号:2で表される。
MAb3:抗グリピカン3ヒト化抗体(GC33、一般名:codrituzumab、WO2006/006693の実施例24に記載の方法でヒト化し、実施例25の方法でL鎖が改変された抗体)、抗体クラスはIgG1。
1) 試料及び溶媒(ブランク)の散乱パターンを2次元のイメージングプレートを用いて検出する。
2) 2次元の散乱パターンをSAXSQuantソフトウェア(アントンパール)によって散乱ベクトルqを変数とした1次元の散乱強度に変換し、散乱曲線を得る。
3) ビームストッパーを透過したq=0における散乱強度で散乱曲線を規格化する。
4) 試料の散乱曲線からブランクの散乱曲線を差し引く(ブランク補正)。
5) デスメア補正(光学系補正)を行う。
6) 吸収補正、ブランク補正及びデスメア補正後の散乱曲線に対してギニエプロットを行い、q*Rg app<1.3を満たす条件下においてRg appを得る。
1) 試料及び溶媒(ブランク)の散乱パターンを2次元のイメージングプレートを用いて検出する。
2) 2次元の散乱パターンをSAXSQuantソフトウェア(アントンパール)によって散乱ベクトルqを変数とした1次元の散乱強度に変換し、散乱曲線を得る。
3) ビームストッパーを透過したq=0における散乱強度で散乱曲線を規格化する。
4) 試料の散乱曲線からブランクの散乱曲線を差し引く(ブランク補正)。
5) デスメア補正(光学系補正)を行う。
6) 吸収補正、ブランク補正及びデスメア補正後の散乱曲線に対して間接フーリエ変換法(J Appl Cryst. 13 :577-584 (1980))を適用し、散乱を与えている粒子の二体距離分布関数(p(r))を得る。p(r)のx軸切片からDmax appを得る。
MAb1, MAb3(いずれも実施例1に記載のものと同じ), MAb4(ヒト化抗IL-6レセプター抗体、一般名:トシリツマブ)を用い、表2の処方溶液において、抗体濃度が15 mg/mLの試料を調製した。当該試料約10 μLをマイクロキャピラリーセルに充てんし、SAXSess mc2(アントンパール)にて粒子サイズパラメータであるみかけの粒子の慣性半径Rg app (nm)とみかけの粒子の最大長Dmax app (nm)に加え,みかけの分子量に比例する値として散乱角0における散乱強度I(0) (a.u.)を算出した。これらの値が大きいほど抗体の会合性が高いことを表すと考えられる。試料間での会合性の違いをより顕著に検出するために、低温である5 ℃にて測定を実施した。測定結果を表2に記す。I(0)、Rg app、及びDmax appの算出方法を以下に記す。
1) 試料及び溶媒(ブランク)の散乱パターンを2次元のイメージングプレートを用いて検出する。
2) 2次元の散乱パターンをSAXSQuantソフトウェア(アントンパール)によって散乱ベクトルqを変数とした1次元の散乱強度に変換し、散乱曲線を得る。
3) ビームストッパーを透過したq=0における散乱強度で散乱曲線を規格化する。
4) 試料の散乱曲線からブランクの散乱曲線を差し引く(ブランク補正)。
5) デスメア補正(光学系補正)を行う。
6) 吸収補正、ブランク補正及びデスメア補正後の散乱曲線に対してギニエプロットを行い、q*Rg app<1.3を満たす条件下においてRg appを得る。同時にy切片からI(0)を得る。
1) 試料及び溶媒(ブランク)の散乱パターンを2次元のイメージングプレートを用いて検出する。
2) 2次元の散乱パターンをSAXSQuantソフトウェア(アントンパール)によって散乱ベクトルqを変数とした1次元の散乱強度に変換し、散乱曲線を得る。
3) ビームストッパーを透過したq=0における散乱強度で散乱曲線を規格化する。
4) 試料の散乱曲線からブランクの散乱曲線を差し引く(ブランク補正)。
5) デスメア補正(光学系補正)を行う。
6) 吸収補正、ブランク補正及びデスメア補正後の散乱曲線に対して間接フーリエ変換法(J Appl Cryst. 13 :577-584 (1980))を適用し、散乱を与えている粒子の二体距離分布関数(p(r))を得る。p(r)のx軸切片からDmax appを得る。
また、抗体等の蛋白質の一部アミノ酸配列を異なるアミノ酸に置換した種々の改変蛋白質を作製して、粘度が制御された改変蛋白質を選抜する場合においても、本発明の方法によって得られるパラメータと粘度の実測値について、同様に良好な相関がえられるので、所望とする粘度が制御された改変蛋白質の選抜方法としても本発明の方法は有用である。
MAb2、MAb4(それぞれ実施例1、2に記載のものと同じ)を用いて、アミノ酸配列を改変する前の抗体(Mab4)と一部のアミノ酸配列を別のアミノ酸に置換した抗体(Mab2)との粘度の違いを本発明の測定方法を用いて評価できるかどうか検討を行った。それぞれの抗体を用い、表3の処方溶液において,抗体濃度が15 mg/mLの試料を調製した。当該試料約10 μLをマイクロキャピラリーセルに充てんし、SAXSess mc2(アントンパール)にて,粒子サイズパラメータである散乱角0における散乱強度I(0)、みかけの粒子の慣性半径Rg app、みかけの粒子の最大長Dmax app (nm)を算出した。これらの値が大きいほど抗体の会合性が高いことを表すと考えられる。試料間での会合性の違いをより顕著に検出するために、低温である5 ℃にて測定を実施した。測定結果を表3に記す。I(0)、Rg app、及びDmax appの算出方法を以下に記す。
1) 試料及び溶媒(ブランク)の散乱パターンを2次元のイメージングプレートを用いて検出する。
2) 2次元の散乱パターンをSAXSQuantソフトウェア(アントンパール)によって散乱ベクトルqを変数とした1次元の散乱強度に変換し、散乱曲線を得る。
3) ビームストッパーを透過したq=0における散乱強度で散乱曲線を規格化する。
4) 試料の散乱曲線からブランクの散乱曲線を差し引く(ブランク補正)。
5) デスメア補正(光学系補正)を行う。
6) 吸収補正、ブランク補正及びデスメア補正後の散乱曲線に対してギニエプロットを行い、q*Rg app<1.3を満たす条件下においてRg appを得る。同時にy切片からI(0)を得る。
1) 試料及び溶媒(ブランク)の散乱パターンを2次元のイメージングプレートを用いて検出する。
2) 2次元の散乱パターンをSAXSQuantソフトウェア(アントンパール)によって散乱ベクトルqを変数とした1次元の散乱強度に変換し、散乱曲線を得る。
3) ビームストッパーを透過したq=0における散乱強度で散乱曲線を規格化する。
4) 試料の散乱曲線からブランクの散乱曲線を差し引く(ブランク補正)。
5) デスメア補正(光学系補正)を行う。
6) 吸収補正、ブランク補正及びデスメア補正後の散乱曲線に対して間接フーリエ変換法(J Appl Cryst. 13 :577-584 (1980))を適用し、散乱を与えている粒子の二体距離分布関数(p(r))を得る。p(r)のx軸切片からDmax appを得る。
SAXS測定より得られた15 mg/mL、5 ℃における粒子サイズパラメータ(I(0)、Rg app、及びDmax app)と、160 mg/mL、25 ℃における粘度は確かに相関することが確認された。よって、本発明の方法を用いた、粘度を指標とする蛋白質のアミノ酸置換体のスクリーニング法の妥当性が実証された。
MAb1、MAb2、MAb3、MAb4(いずれも実施例1〜2に記載のものと同じ)、及びBSAを用い、表4の処方溶液において、蛋白質濃度が15 mg/mLの試料を調製した。当該試料約10 μLをマイクロキャピラリーセルに充てんし、SAXSess mc2(アントンパール)にて、粒子サイズパラメータである散乱角0における散乱強度I(0)、みかけの粒子の慣性半径Rg app、みかけの粒子の最大長Dmax app (nm)を算出した。これらの値は会合状態を考慮した蛋白質の粒子サイズを表すと考えられる。試料間での会合性の違いをより顕著に検出するために、低温である5 ℃にて測定を実施した。測定結果を表3に記す。I(0)、Rg app、及びDmax appの算出方法を以下に記す。
1) 試料及び溶媒(ブランク)の散乱パターンを2次元のイメージングプレートを用いて検出する。
2) 2次元の散乱パターンをSAXSQuantソフトウェア(アントンパール)によって散乱ベクトルqを変数とした1次元の散乱強度に変換し、散乱曲線を得る。
3) ビームストッパーを透過したq=0における散乱強度で散乱曲線を規格化する。
4) 試料の散乱曲線からブランクの散乱曲線を差し引く(ブランク補正)。
5) デスメア補正(光学系補正)を行う。
6) 吸収補正、ブランク補正及びデスメア補正後の散乱曲線に対してギニエプロットを行い、q*Rg app<1.3を満たす条件下においてRg appを得る。同時にy切片からI(0)を得る。
1) 試料及び溶媒(ブランク)の散乱パターンを2次元のイメージングプレートを用いて検出する。
2) 2次元の散乱パターンをSAXSQuantソフトウェア(アントンパール)によって散乱ベクトルqを変数とした1次元の散乱強度に変換し、散乱曲線を得る。
3) ビームストッパーを透過したq=0における散乱強度で散乱曲線を規格化する。
4) 試料の散乱曲線からブランクの散乱曲線を差し引く(ブランク補正)。
5) デスメア補正(光学系補正)を行う。
6) 吸収補正、ブランク補正及びデスメア補正後の散乱曲線に対して間接フーリエ変換法(J Appl Cryst. 13 :577-584 (1980))を適用し、散乱を与えている粒子の二体距離分布関数(p(r))を得る。p(r)のx軸切片からDmax appを得る。
MAb5(抗IgE抗体)及びMAb5の特定の位置の4つのアミノ酸残基をヒスチジンに置換した改変抗体であるMAb5-Aの粘度を測定した。改変前後の残基を表5に記載した。なお、表5における改変位置は、Kabatナンバリングに基づき表記した。表6の処方溶液において、蛋白質濃度が151、155 mg/mLの試料を調製した。当該試料90 μLを用いてEMS粘度計(京都電子)(J Artif Organs. 16:359-367 (2013))にて試料の粘度η (mPa・s)を測定した。実験温度は25 ℃とした。測定結果を表6に記す。4残基のヒスチジン置換により粘度の大幅な上昇が認められた。
1) 試料及び溶媒(ブランク)の散乱パターンを2次元のイメージングプレートを用いて検出する。
2) 2次元の散乱パターンをSAXSQuantソフトウェア(アントンパール)によって散乱ベクトルqを変数とした1次元の散乱強度に変換し、散乱曲線を得る。
3) ビームストッパーを透過したq=0における散乱強度で散乱曲線を規格化する。
4) 試料の散乱曲線からブランクの散乱曲線を差し引く(ブランク補正)。
5) デスメア補正(光学系補正)を行う。
6) 吸収補正、ブランク補正及びデスメア補正後の散乱曲線に対して間接フーリエ変換法(J Appl Cryst. 13 :577-584 (1980))を適用し、散乱を与えている粒子の二体距離分布関数(p(r))を得る。p(r)のx軸切片からDmax appを得る。
Claims (10)
- 以下の工程を含む、蛋白質溶液の粘度の測定方法:
1)該蛋白質の濃度が1〜100mg/mlである試料にX線を照射することによる、X線小角散乱法(SAXS)またはX線溶液散乱法を用いて、見かけの粒子サイズ(見かけの粒子の最大長(Dmax app)もしくは見かけの粒子の慣性半径(Rg app))または見かけの分子量を測定する工程;
2)予め求めた検量線に基づき、上記測定値から該蛋白質を160〜200mg/mlに高濃度化した際の粘度を算出する工程。 - 試料中の蛋白質濃度が10〜100mg/mlである、請求項1に記載の測定方法。
- 試料中の蛋白質濃度が10〜30mg/mlである、請求項1または2に記載の測定方法。
- 試料中の蛋白質濃度が15〜30mg/mlである、請求項1〜3のいずれか一項に記載の測定方法。
- 測定温度の条件が0〜40℃である、請求項1〜4のいずれか一項に記載の測定方法。
- 測定温度の条件が0〜25℃である、請求項1〜5のいずれか一項に記載の測定方法。
- 測定温度の条件が3〜10℃である、請求項1〜6のいずれか一項に記載の測定方法。
- 測定する試料の量が1〜100μLである、請求項1〜7のいずれか一項に記載の測定方法。
- 測定する試料の量が5〜30μLである、請求項1〜8のいずれか一項に記載の測定方法。
- 前記蛋白質が抗体である、請求項1〜9のいずれか一項に記載の測定方法。
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