JP6839173B2 - 流体力学シャトリングチップ機器、及び、分離した単一細胞を捕捉する方法 - Google Patents

流体力学シャトリングチップ機器、及び、分離した単一細胞を捕捉する方法 Download PDF

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Description

本発明は一般に生物学的マイクロ流体チップに関し、より具体的には、複数の単一細胞を捕捉し培養するための流体力学シャトリングチップ機器に関する。
近年、単一細胞を正確に操作する技量に基づき、単一細胞の捕捉、単一細胞のペアリング及び長期間の培養のために微細加工装置が設計されてきた。それらはハイスループットであり、低コストであり、試薬の消費を減らすという理由で有利である。ヤマグチら(非特許文献1)は単一細胞の捕捉及び培養を可能にする高さ30μmで幅100μmの経路を有する簡略な機器を報告した。この機器の捕捉効率は73%である。
しかし、この機器は空間が限られているため、捕捉した細胞を24時間までしか成長させられない。リーら(非特許文献2)は細胞同士の相互作用の研究のための単一細胞共培養プラットフォームを設計する同様の概念を使用した。
Yamaguchi et al., Sens Actuators B Chem. 2009. 136(2):555-61 Lee et al., Integr Biol (Camb). 2012. 4(4):374-80
この概念の機器の単一細胞のペアリングの効率は50%であったが、まだ細胞を増殖させる十分な空間が足りていなかった。
一つの態様において、本発明は分離した単一細胞を捕捉する方法に関する。その方法は、
(a)単一細胞捕捉ユニットの配列を備える流体力学シャトリングチップ機器を提供するステップと、
(b)単一種類の分離した細胞を含む培地を一列に並んだ配列における第1の単一細胞捕捉ユニットの流入経路に装填するステップと、
(c)単一種類の分離した細胞を捕捉部位で捕捉するステップと、
(d)捕捉されていない、余分な細胞を未使用培地で洗い流すステップと、
(e)経路に培地を逆流させ、捕捉された単一種類の分離された細胞を放出し、放出された細胞を大チャンバーに逆流させるステップと、
を含む。
ステップ(a)で提供される流体力学シャトリングチップ機器における単一細胞捕捉ユニットのそれぞれは、
構成a)長さL1、幅W1、高さH1を有し、前端及び前端の反対側にある後端を有し、後端は捕捉部位を有する流入経路と、
構成b)直径M及び深さDを有し、流入経路の捕捉部位の後に位置し、捕捉部位から距離gだけ離れた受容部位を有し、1つより多くの単一細胞が付着、成長、増殖及び/又は移動するように形成された内部空間を有する大チャンバーと、
構成c)長さL2、幅W2、高さH2を有し、捕捉部位と受容部位の間に位置し、流入経路と大チャンバーと流体接続する捕捉経路と、
構成d)長さL3、幅W3、高さH3を有し、大チャンバーの後に位置し、大チャンバーと流体接続し、前端及び前端と反対の後端を有し、高さH3は大チャンバーの深さDより小さい、チャンバー経路と、
構成e)長さL4、幅W4、高さH4を有し、流入経路、大チャンバー及びチャンバー経路の横に位置し、第1の端部と第1の端部と反対の第2の端部を有し、第1の端部は捕捉部位のすぐ前の流入経路から分岐し、第2の端部はチャンバー経路の後端でチャンバー経路と合流し、幅W4及び高さH4は捕捉経路の幅W2及び高さH2より大きい、バイパス経路と、
を備える。
配列の各カラムにおいて、
(i)単一細胞捕捉ユニットは流体接続し、
(ii)各ユニットの流入経路は、第1のユニットを除き、すぐ次の上流ユニットのチャンバー経路と流体接続し、
(iii)各ユニットのバイパス経路は、最後のユニットを除き、すぐ次の下流ユニットの流入経路と流体接続する。
他の態様において、本発明は1つより多くの種類の分離した単一細胞を捕捉する方法に関する。その方法は、
(a)単一細胞捕捉ユニットの配列を備える流体力学シャトリングチップ機器を提供するステップと、
(b)特定の種類の分離した単一細胞を含む培地を一列に並んだ配列における第1の単一細胞捕捉ユニットの流入経路に装填するステップと、
(c)特定の種類の分離した単一細胞を捕捉部位で捕捉するステップと、
(d)捕捉されていない、余分な細胞を未使用培地で洗い流すステップと、
(e)チャンバー経路を逆流させ、特定の種類の捕捉された単一細胞を放出し、特定の種類の放出された細胞を大チャンバーに逆流させるステップと、
(f)それぞれの繰り返しのステップにおいて分離した単一細胞が異なる種類であることを条件として、ステップ(b)、(c)、(d)、(e)を1回以上繰り返すステップと、
を含む。
ステップ(a)で提供される流体力学シャトリングチップ機器における単一細胞捕捉ユニットのそれぞれの構成は、上述の「一つの態様」の構成と同じである。
一つの実施形態において、配列の各カラムにおいて、各ユニットのチャンバー経路は、最後のユニットを除き、すぐ隣の下流ユニットの流入経路と流体接続する。
他の実施形態において、配列の各カラムにおいて、最後のユニットのチャンバー経路は流出経路と流体接続する。
他の実施形態において、配列の各カラムにおいて、第1のユニットの流入経路は入口経路と流体接続され、最後のユニットの流出経路は出口経路と流体接続する。
他の実施形態において、機器は、(a)入口経路と流体接続する入口と、(b)出口経路と流体接続する出口と、を更に備える。
他の実施形態において、配列のカラム間の単一細胞捕捉ユニットは入口経路及び出口経路を介して流体接続する。
流入経路、捕捉経路、チャンバー経路及びバイパス経路の表面は覆われているか、又は覆われていない。
一つの実施形態において、流入経路、捕捉経路、チャンバー経路及びバイパス経路の表面はアルブミン、例えばウシ血清アルブミンで覆われている。他の種類の表面コーティングは機器の適用目的に応じて使用され得る。
他の実施形態において、大チャンバーは1つの分離した単一細胞を含む。
他の実施形態において、大チャンバーは異なる種類の2つの分離した単一細胞を含む。
他の実施形態において、大チャンバーは異なる種類の複数の分離した単一細胞を含む。
他の実施形態において、大チャンバーは同じ種類の複数の分離した単一細胞を含む。
他の実施形態において、機器は大チャンバーに1つ又は1つより多くの種類の分離した単一細胞を含む。
他の実施形態において、機器は大チャンバーに2つ以上の種類の分離した単一細胞を含む。
他の実施形態において、機器は単一細胞懸濁液を更に含み、単一細胞のサイズはバイパス経路の断面より小さいが、捕捉経路の断面より大きい。
他の実施形態において、機器は透明な基板に隣接する。基板は一片のガラスでも良い。
他の実施形態において、機器はポリジメチルシロキサン、ポリメチルメタクリレート、ポリカーボネート、ガラス、プラスチック及びそれらの組合せから成る群から選択される材料から作製される。
他の実施形態において、バイパス経路はユニットの片側に沿って横方向に蛇行する。
他の実施形態において、前記捕捉するステップは1つの捕捉部位につき1つの分離した単一細胞を捕捉する。
他の実施形態において、逆流ステップにおける体積流量は洗い流しステップにおける体積流量より大きい。
他の実施形態において、逆流ステップにおける体積流量は細胞装填ステップにおける体積流量に劣らない。
これらの及び他の態様は以下の図面と併せて採用される以下の好ましい実施形態の説明から明らかになると思われるが、それらにおける変化及び修正は開示の新規な概念の精神及び範囲から逸脱しない範囲で変化させても良い。
添付の図面は本発明の1つ又は複数の実施形態を示し、記載された説明により、本発明の原理を説明する役割を果たす。出来る限り図面を通して同じ参照番号を使用し、実施形態の同様の又は類似の要素に言及する。
図1Aから1HはHSCチップのマスクデザインのパターンを示す概略図であり、縮尺は5mmである。図1Aはデザイン1における第1の層(層1)のフォトマスクの上面図を示す。 デザイン1における第2の層(層2)のフォトマスクの上面図を示す。 デザイン1における第3の層(層3)のフォトマスクの上面図を示す。 デザイン1における3つの層(層1、2、3)の重なりの上面図を示す。 デザイン2における第1の層(層1)のフォトマスクの上面図を示す。 デザイン2における第2の層(層2)のフォトマスクの上面図を示す。 デザイン2における第3の層(層3)のフォトマスクの上面図を示す。 デザイン2における3つの層(層1、2、3)の重なりの上面図を示す。 デザイン1におけるSU−8型(A−C)及び流体力学シャトリングチップ(HSC)機器のガラス上のPDMS機器(D−F)の上面図写真である。(A)3.8μmの長さ、5.0μmの幅及び4.3μmの高さの捕捉経路(層1)の写真である。(B)25.0μmの幅、23.0μmの高さのバイパス経路(層1、2、3が重なった)を示す写真である。(C)500.6μmの直径、57.8μmの高さ(深さ)を有する大チャンバーを示す写真である。(D)流体力学構造(矢印a、bは異なる流れ抵抗を示し、矢印cは細胞捕捉場所を示す)を示す顕微鏡画像である。(E)単一細胞捕捉ユニットを示す拡大図である。(F)PDMSを使用して作製されたHSC機器の外観を示す写真である。体積流量はQと規定される。経路Aの体積流量はQ1と示され、経路Bの体積流量はQ2と示される。縮尺は100μmである。 HSC機器の操作手順を示す概略図である。(A)流れ方向を示す細胞装填ステップである。(B)細胞が捕捉位置で捕捉されると、大チャンバーへの流体経路の流れ抵抗の増加を引き起こし、後に続く細胞は蛇行したバイパス経路に向かって流れる。(C)マイクロチャネルにある余分な細胞を洗うために細胞培地が使用される。(D)捕捉された細胞は捕捉位置から解放され、大チャンバーへ流れる。 大チャンバーにおけるMCF−7単一細胞捕捉の連続した画像を示す。コラム(A)の上の図は下流ユニットの流入経路に入る上流ユニットのバイパス経路からの2つの単一細胞を示す。2番目の図は下流ユニットの捕捉位置に向かって流れる2つの単一細胞を示す。3番目の図は前方の細胞(第1の細胞)が下流ユニットの流入経路の捕捉位置で捕捉されることを示す。下の図は後に続く単一細胞(第2の細胞)が捕捉位置を迂回することを示す。コラム(B)の上の図は捕捉位置で捕捉された第1の細胞を示す。2番目の図は捕捉位置から解放された第1の細胞を示す。3番目の図はチャンバーへの経路を流れる第1の細胞を示す。下の図は大チャンバーに入る第1の細胞を示す。縮尺は100μmである。 COMSOLによる流速シミュレーションを示す。広い場所及び流線形部分の流速の結果である。捕捉経路での流速はバイパス経路及び大チャンバーの流速より速い。 デザイン1のHSC機器のMCF−7細胞捕捉効率を示す。(A)捕捉位置における(実線の円で印をつけた)捕捉された単一細胞の写真である。(B)大チャンバーにおける(点線の円で印をつけた)捕捉された単一細胞の写真である。(C)捕捉位置での単一細胞捕捉と大チャンバーでの単一細胞捕捉の効率を示す。細胞は緑のカルセイン−AM蛍光染料で染色された。縮尺は100μmである。 デザイン2のHSC機器の大チャンバーのMDA−MB−231及びMCF−7の単一細胞のペアリング結果を示す写真である。MCF−7細胞は緑のカルセイン−AM蛍光染料(実線の円で印をつけた)で染色され、MDA−MB−231細胞は赤のDil蛍光染料(点線の円で印をつけた)で染色された。用語「1A+1B」は「1つの単一MDA−MB−231細胞及び1つの単一MCF−7細胞」を指す。用語「>1A+1B」は「1つより多くの単一MDA−MB−231細胞と1つの単一MCF−7細胞」を指す。縮尺は1mmである。 大チャンバーにおける単一の及び複数の単一細胞の捕捉効率を示す。用語「1A」は「1つの単一MDA−MB−231細胞」を指す。用語「1B」は「1つの単一MCF−7細胞」を指す。用語「1A+1B」は「1つの単一MDA−MB−231細胞及び1つの単一MCF−7細胞」を指す。用語「>1A+1B」は「1つより多くの単一MDA−MB−231細胞及び1つの単一MCF−7細胞」を指す。
(用語の定義)
本明細書で使用される用語は一般に本発明の文脈内、及びそれぞれの用語が使用される特定の文脈において業界の通常の意味を有する。
本発明の記載に関し熟練者に追加のガイダンスを提供するため、発明を記載するために使用される特定の用語が以下に、又は明細書の他の場所で議論される。便宜上、特定の用語は例えばイタリック体及び/又は引用符を使用して強調され得る。強調の使用は用語の範囲及び意味に影響せず、その用語が強調されているかに拘わらず、同じ文脈において用語の範囲及び意味は同じである。同じことが複数の方法で言えることが理解される。従って、本明細書で議論される1つ又は複数の用語に対し代替の言語及び類義語が使用でき、用語が詳しく述べられるか又は本明細書で議論されるかどうかに応じて特別な重要性も置かれない。特定の用語の類義語が提供される。1つ又は複数の類義語の記載は他の類義語の使用を排除しない。
本明細書で議論される用語の例を含む本明細書のどこかの例の使用は例示的のみであり、本発明又は例示された用語の範囲及び意味を少しも制限しない。同様に、発明は本明細書で与えられる様々な実施形態に制限されない。
別段の規定がない限り、本明細書で使用される全ての技術的及び科学的用語は本発明が関連する当業者により通常理解されるのと同じ意味を有する。矛盾がある場合、定義を含む本文献における用語法に準拠するものとする。
本明細書で使用されるように、「ほぼ」、「約」又は「およそ」は一般的に所与の値又は範囲の20パーセント以内、好ましくは10パーセント以内、より好ましくは5パーセント以内を意味するものとする。
本明細書で与えられる数量は概算であり、「ほぼ」、「約」又は「およそ」の用語は、明確に述べられていなければ上の記載に従って推論され得る。
本明細書で使用されるように、数又は範囲が記載される時、当業者はそれが本発明に関する特定の分野の適切で合理的な範囲を包含することを意図すると理解する。
「40μmから100μmまで」という記述により、その範囲内の全ての整数単位の量が特に本発明の一部として開示されることが意味される。よって、この場合、40、41、42・・・97、98、99及び100μmの整数単位量が本発明の実施形態として含まれる。
「300μmから4000μmまで」という記述により、その範囲内の全ての整数単位の量が特に本発明の一部として開示されることが意味される。よって、300、301、302・・・3997、3998、3999及び4000μmの整数単位量が本発明の実施形態として含まれる。
「500μmから2000μmまで」という記述により、その範囲内の全ての整数単位の量が特に本発明の一部として開示されることが意味される。よって、500、501、502・・・1997、1998、1999及び2000μmの整数単位量が本発明の実施形態として含まれる。
本明細書で使用されるように、「単一細胞捕捉ユニット」は「ユニット」と呼ばれ得る。
本明細書で使用されるように、「大チャンバー」は一般的に細胞の拡散、増殖及び/又は移動のために24時間以上細胞の培養をする広々とした空間を有する空間を意味する。
本明細書で使用されるように、「入口経路」は一般に、配列のカラムにおける第1の単一細胞捕捉ユニットの流入経路をHSC機器の入口穴に接続するマイクロチャネルを意味する。配列の各カラムはHSC機器の入口に接続された1つの入口経路を有する。入口経路はHSC機器の入口に接続される前に1つのマイクロチャネルに合流する。カラム間の入口経路は流体接続である。
本明細書で使用されるように、「出口経路」は一般に配列のカラムの最後の単一細胞捕捉ユニットの流出経路をHSC機器の出口穴に連結するマイクロチャネルを意味する。配列の各カラムはHSC機器の出口に連結された1つの出口経路を有する。出口経路はHSC機器の出口に接続される前に1つのマイクロチャネルに合流する。カラム間の出口経路は流体接続である。
「1つの単一細胞」及び「1つの分離した単一細胞」の用語は互換性がある。
「2つの単一細胞」及び「2つの分離した単一細胞」の用語は互換性がある。
「熱可塑性プラスチック材料」の用語は一般に特定の温度以上で柔軟、又は成形可能になり、冷却すると凝固するプラスチック材料又はポリマーを意味する。
(略語)「HSC」は流体力学シャトリングチップを意味する。。
(実施例)
本発明の範囲を制限する意図無しに、本発明の実施形態による例としての機器、装置、方法及びそれらに関連する結果が以下に示される。なお、読み手の便宜のため、例において題名又は副題が使用されるが、本発明の範囲を決して制限しない。さらに、特定の理論が本明細書において提案及び開示されるが、それらが正しかろうと正しくなかろうと、発明が特別な理論又は行動の計画を使用せずに本発明により実行される限り、本発明の範囲を決して制限しない。
(方法)
(機器デザイン及び製造)
マイクロ流体HSC機器は、前述の通り、ソフトリソグラフィー技術を使用してポリジメチルシロキサン(PDMS)を使って製造された。
まず、5μmのネガ型のフォトレジストの厚い層(米国、マサチューセッツ州、ニュートン、マイクロケム製のSU−8)を、シリコンウエハー上でスピンコートし、5μm幅の捕捉経路を有するフォトマスクの下で紫外線に曝した。
第2に、25μmのネガ型のフォトレジストの厚い層を、同じシリコンウエハー上でスピンコートし、25μm幅のバイパス経路を有する別のフォトマスクの下で紫外線に曝した。
第3に、デザイン1(図1から1D)に対しては50μmのネガ型のフォトレジストの厚い層を同じシリコンウエハー上でスピンコートし、500μmの直径の大チャンバーを有する他のフォトマスクの下で紫外線に曝した。デザイン2については(図1Eから1H)、50μmのネガ型のフォトレジストの厚い層を同じシリコンウエハー上でスピンコートし、2000μmの直径の大チャンバーを有する他のフォトマスクの下で紫外線に曝した。原盤は型として使用され、シルガード184(米国ダウコーニング製)PDMSプレポリマーに10対1の割合で架橋剤を混合したものが注入され、従来型オーブンを使用して65℃で一晩硬化された。硬化したPDMSの複製は型から剥がされた。
内径が0.75mmのパンチャー(ハリスユニコア(商標)、米国テッドペラ製)を使用して1つの入口穴及び1つの出口穴を穴開けし、流体をPDMS機器の流体経路へ導いた。短い酸素プラズマ処理の後、PDMSの複製とガラススライドの両方を接触し、オーブン内に65℃で24時間載置し、永久結合を実現した。
(複数の単一細胞捕捉のためのHSC機器の準備)
細胞の実験の前に、HSC機器は脱イオン水で満たされ、デシケーター内の脱イオン水で満たされた容器内に浸され、マイクロチャネル内の気泡が除去された。その後、脱ガスしたHSC機器は紫外線に曝され、30分間滅菌された。直後に細胞がPDMS表面に接着するのを防ぐため、1×PBS内の5%のBSA(ウシ血清アルブミン、ベーシングテクノロジー、台湾)がマイクロ流体経路に注入され、37℃で30分間培養された。
(細胞培養及び保持)
人間の乳がんMDA−MD−231及びMCF−7細胞株が研究において細胞モデルとして使用された。MDA−MB−231及びMCF−7細胞は10%のウシ胎仔血清(ハイクローンサーモ、米国)及び1%の抗生物質(グルタミン−ペニシリン−ストレプトミシン、バイオウエスト、フランス)を加えたDMEM培地(ギブコ、米国)内で、加湿した培養器内で37℃、5%の二酸化炭素で培養された。細胞の培養は70から80%の合流を有する製造者の標準プロトコルに従いトリプシン−EDTA(0.25%のPBS、バイオウエスト、米国)を使用して移動された。
複数の単一細胞捕捉、分離及び培養 各細胞捕捉実験の前に、細胞は、HSC機器内の細胞を認識しやすくするため、4mM膜色素DilC12(3)(BDバイオサイエンス、米国)又は4mM膜透過性生細胞標識染色カルセイン−AM(インビトロジェン、ライフテクノロジー、米国)で予め30分染色された。
デザイン1のHSC機器における各単一細胞捕捉実験に対し、1.0×106細胞/mL濃度(合計で1×103細胞)の1μLのMCF−7細胞が、注射器ポンプ(ハーバード機器、ハーバードバイオサイエンス、米国)及びテフロン(登録商標)管(内径0.51mm、外径0.82mm、エバーシャープテクノロジー社、台湾)を使用して10μL/分の流速でマイクロ流体経路に装填された。その後、5μLのDMEM培地が0.3μL/分の流速でマイクロ流体経路に装填された。その後に、10μL/分の流速の0.6μLのDMEMの逆流が、細胞を放出して大チャンバーに移動させるために使用された。
デザイン2のHSC機器に対し、1.0×106細胞/mL濃度(合計で5×102細胞)の1μLのMDA−MB−231又はMCF−7細胞が、注射器ポンプ(ハーバード機器、ハーバードバイオサイエンス、米国)及びテフロン(登録商標)管(内径0.51mm、外径0.82mm、エバーシャープテクノロジー社、台湾)を使用して0.3μL/分の流速でマイクロ流体経路に装填された。その後、5μLのDMEM培地が0.3μL/分の流速でマイクロ流体経路に装填された。その後に、200μL/分の流速の10μLのDMEMの逆流が、細胞を放出して大チャンバーに移動させるために使用された。
「複数の単一細胞捕捉」という用語は、HSC機器が大チャンバー内の1つの細胞を一度に、及び複数の分離された単一細胞が大チャンバーで捕捉される処理を繰り返すことにより捕捉可能であることを意味する。「分離する」は細胞がそれぞれ大チャンバーで捕捉される時、それらが物理的に分離されることを意味する(マイクロチャネルは大チャンバーと流体接続するが)。この特徴は1つの単一細胞が操作される間の、他の細胞への外乱を最小にする。
(細胞の撮像)
全ての細胞の画像が付属の電荷結合素子(レチガ−4000DC、Qイメージング、カナダ)及び制御ソフトウエア(NIS−エレメンツ Ar、ニコン、日本)を有する倒立顕微鏡(ニコンTi−E倒立蛍光顕微鏡、日本)を使用して得られた。
(結果)
機器デザイン及び操作 マイクロチャネル機器はPDMSから作られ、ガラス基板に隣接する。PDMS部分を作るため、3層のSU−8の原盤型がフォトリソグラフィーを使用して微細加工された。私どもは2つのHSCデザインを作成した。図1Aから1Dはデザイン1における、第1の層のフォトマスク、第2の層のフォトマスク、第3の層のフォトマスク、及び3つの層のフォトマスクの重なりのそれぞれの上面図を示す。図1Eから1Hはデザイン2における第1の層のフォトマスク、第2の層のフォトマスク、第3の層のフォトマスク、及び3つの層のフォトマスクの重なりのそれぞれの上面図を示す。
図2はデザイン1のSU−8型(A−C)及び完成したガラス上のPDMSのHSC機器(D−F)の写真の上面図である。図2AはSU−8構造の捕捉経路330(それぞれが長さ3.8μm、幅5.0μm及び高さ4.3μm)を有する第1の層を示す。第2の層は、バイパス経路360(それぞれが幅25.0μm及び高さ23.0μm)及び捕捉経路330を介してバイパス経路360に連結された大チャンバー340(それぞれが直径500μm及び高さ23.0μm)を生成する(図2B)。第3の層(高さ57.8)は第2の層の上部に建設され大チャンバーの高さ及びそれらの容積を生成及び増加させた(図2C)。よって、デザイン1の機器の大チャンバーの最終的な高さは57.8μmである。デザイン2に対し、捕捉経路のそれぞれは長さ5.1μm、幅6.5μm及び高さ4.9μmである。バイパス経路は幅25μm、高さ23.3であるが、大チャンバーのそれぞれは直径2500μmで高さ82.0μmである。
図2Dを参照する。各細胞捕捉部位が1つの単一細胞のみを確実に捕捉するようにするため、体積流量Q1及びQ2(Q1及びQ2は経路A及び経路Bのそれぞれを通過する体積流量である)が第1の流入細胞が、経路B(即ち、バイパス経路360に向かって移動する、矢印bによりマークされた方向)ではなく経路A(即ち、捕捉経路330へ向かって移動する、矢印aによりマークされた方向)を通る方法でデザインされ、その結果細胞は捕捉部位で捕捉される(矢印cでマークされる)。
細胞を捕捉部位で捕捉した後、経路Aの流れ抵抗が増加し、その結果Q1とQ2の比率が小さくなり、結果として次の流入細胞は経路Aではなく経路Bを通過する。マイクロチャネルの抵抗を計算するのにダルシー・ワイスバッハの式が使用される(数式1)。数式1で、Pは流体の駆動圧力、C(α)はマイクロチャネルのアスペクト比(0<α<1)の定数、μは流体粘度、Lは経路の長さ、Qは体積流量、Rは外周、Aはマイクロチャネルの断面積である。
設計された捕捉経路330を層流システムにおいて任意の流速で確実に機能させるため、細胞の中心は経路Aの流線の内側に位置する必要がある。細胞の中心と流入経路の壁との距離をXとし、流入経路の幅をYと規定する。Q1/Q2の比が(Y−X)/Xの値より大きい場合、細胞は層流領域において任意の流速で捕捉部位において捕捉される(数式2)。
デザイン1のHSCに対し、製造された機器はQ1/Q2の値が3.563であり、これは閾値の2.125(表1)より大きく、第1の流入細胞が経路Bではなく経路Aを通過し捕捉部位で捕捉されることを確実にする。図2EはHSC機器における捕捉部位322及び大チャンバー340の拡大図を示し、図2Fは384個の大チャンバー及び1つの入口穴及び1つの出口穴を含む全体のHSC機器200を示す。デザイン2のHSC機器のQ1/Q2の値の3.391も閾値の2.125(表1)より大きい。表1はマイクロチャネル抵抗比を示す。
HSCに適用可能な細胞のサイズは捕捉経路及びバイパス経路の直径に依存する。細胞のサイズは細胞がバイパス経路を詰まらせるのを避けるためバイパス経路の断面より小さくする必要があり、同時に細胞が捕捉部位で捕捉されずに捕捉経路を通過しないように捕捉経路の断面より大きくする必要がある。
図2Dから2Fと図3を参照する。HSC機器200は単一細胞捕捉ユニットの配列を備え、単一細胞捕捉ユニットのそれぞれは、以下の(a)〜(e)を備える。
(a)長さL1、幅W1、高さH1を有し、前端320a及び前端と反対の後端320bを有し、後端は捕捉部位322を有する流入経路320。
(b)直径Mと深さDを有し、流入経路320の捕捉部位322の後に位置し、捕捉部位322から距離gだけ離れた受容部位342を有し、1つより多くの単一細胞が付着、成長、増殖及び/又は移動に適した内部空間を有する大チャンバー340。
(c)長さL2、幅W2及び高さH2を有し、捕捉部位322と受容部位342との間に位置し、流入経路320と大チャンバー340と流体接続する捕捉経路330。
(d)長さL3、幅W3及び高さH3を有し、大チャンバー340の後に位置し大チャンバー340と流体接続し、前端350aと前端350aと反対の後端350bを有し、高さH3は大チャンバー340の深さDより小さい、チャンバー経路350。
(e)長さL4、幅W4及び高さH4を有し、流入経路320、大チャンバー340及びチャンバー経路350の横に位置し、第1の端部360aと第1の端部360aの反対にある第2の端部360bを有し、第1の端部360aは捕捉部位322のすぐ前の流入経路320から分岐し、第2の端部360bはその後端350bでチャンバー経路と結合し、幅W4及び高さH4は捕捉経路の幅W2及び高さH2より大きい、バイパス経路360。
HSC機器の操作手順は以下のステップを含む。
図3Aを参照する。細胞懸濁液がユニット300の入口経路310に装填される。個々の細胞はカラムの配列内の第1のユニット300の流入経路320に入る。第1の単一細胞370が第1のユニット300の流入経路320の捕捉部位322で捕捉される。カラムの配列内のユニット300、…306、307は流体接続される。各カラムの配列の最後のユニット307は出口経路392に連結される流出経路390を有する。
図3Bを参照する。、個々の細胞370がユニット306の流入経路320の捕捉部位322で捕捉されると、結果として大チャンバー340への流体経路の流れ抵抗が増加し、後に続く細胞380がユニット306の蛇行するバイパス経路360へ向かって流れ、すぐ隣の下流ユニット307の流入経路320に入り、その捕捉部位322で捕捉される。
図3Cを参照する。細胞培地がマイクロチャネル内の余分な細胞を洗うために使用される。
図3Dを参照する。培地がユニット307の出口経路392及び流出経路390を通ってマイクロチャネルを逆流させるのに使用される。ユニット307内の捕捉された細胞380はユニット307の流入経路320の捕捉部位322から放出され、ユニット306のチャンバー経路350を通ってすぐ隣の上流ユニット306の大チャンバー340へ流れる。
デザイン1に対し、以下のステップが実施される。
1)1μLの細胞懸濁液が注射器ポンプを使用することにより10μL/分の流速で入口経路に装填される。個々の単一細胞は単一のカラムの第1のユニットの流入経路に流入し、第1の細胞は捕捉部位で捕捉される(図3A)。細胞が捕捉部位で捕捉されると、結果として大チャンバーへの流体経路の流れ抵抗が増加し、後に続く細胞は蛇行するバイパス経路(図3B)に向かって流れ、すぐ次の下流ユニットの流入経路に入る(図3B)。
2)5マイクロリットルの未使用培地が注射器ポンプを使用することにより0.3μL/分の流速で経路に装填され(図3C)、マイクロチャネルから余分な細胞を洗い流す。
3)最後に、0.6μLの未使用培地の10μL/分での逆流がマイクロチャネルに導入され、捕捉部位から捕捉された細胞を放出し、これらの細胞を大チャンバーに移動した(図3D)。
大チャンバーへの流れ抵抗はバイパス経路を経由するより小さいため、放出された細胞はバイパス経路ではなく大チャンバーに流入する。更に、大チャンバーの拡大された断面積のため、大チャンバーの中で流速は大幅に減少し、それは大チャンバー内の装填された細胞が流れによって運び去られ、受容部位と捕捉経路の交点で捕捉されることを防止する。MCF−7細胞の実演のため、全体の手順は20分で実行される。
上記のステップを繰り返すことにより他の細胞種類の個々の細胞が大チャンバーに装填され得る。
デザイン2に対し、以下の3つの操作手順がある。
1)5マイクロリットルの細胞懸濁液が注射器ポンプを使用することにより0.3μL/分の流速で経路に装填される。このステップにおいて個々の単一細胞は捕捉部位で捕捉される。
2)5マイクロリットルの未使用培地が注射器ポンプを使用することにより0.3μL/分の流速で経路に装填され、マイクロチャネルから余分な細胞を洗う。
3)最後に、10μLの未使用培地の200μL/分の逆流がマイクロチャネルに導入され、捕捉部位から捕捉された細胞を放出し、これらの細胞を大チャンバーに移動する。全体の手順は40分で実行され得る。
図4は大チャンバーにおけるMCF−7単一細胞捕捉の連続した画像を示す。コラム(A)を参照する。上の図はバイパス経路と流入経路との交点の近くの2つの単一細胞を示し、第1の細胞は下流ユニットの流入経路にあり、第2の細胞は上流ユニットのバイパス経路にある。2番目の図は下流ユニットのチャンバーの捕捉部位に向かって流れる第1の細胞と、下流ユニットの流入経路に流入した第2の細胞を示す。3番目の図は下流ユニットの捕捉部位で捕捉された第1の細胞と、第1の細胞の後に続く第2の細胞を示す。下の図は捕捉部位を迂回し、下流ユニットのバイパス経路に流入する第2の細胞を示す。
図4のコラム(B)を参照する。上の図は下流ユニットの捕捉部位で捕捉された個々の細胞(第1の細胞)を示す。2番目の図は下流ユニットの捕捉部位から放出された第1の細胞を示す。3番目の図は上流ユニットのすぐ隣の大チャンバーへ向かって流れるチャンバー経路内の第1の細胞を示す。下の図は下流ユニットのすぐ隣の大チャンバー内の第1の細胞を示す。
COMSOLシミュレーション COMSOLの層流モジュールを使用して、操作手順の下で流速をシミュレートした。捕捉経路を通した流速はバイパス経路のものよりもずっと速く、これは注入された細胞が捕捉経路に向かって流れることを示す(図5)。シミュレーション結果は、チャンバーの大きな断面積は大チャンバーの流線形の流速を大幅に遅くすることも示す。
図6はデザイン1のHSC機器のMCF−7細胞捕捉効率を示す。細胞は観察のため緑のカルセイン−AM蛍光染料で染色された。図6Aは捕捉部位で捕捉された単一細胞を示し(実線の円で印をつけた)、図6Bは大チャンバー内の捕捉された単一細胞を示す(点線の円で印をつけた)。図6Cは捕捉部位の単一細胞捕捉と大チャンバーでの単一細胞の捕捉効率を示す。
図7はデザイン2のHSC機器のMDA−MB−231及びMCF−7単一細胞のペアリング結果を示す。大チャンバーでの対になった単一細胞の上面の写真である。MCF−7細胞(実線の円で印をつけた)は緑のカルセイン−AM蛍光染料で染色され、MDA−MB−231細胞(点線の円で印をつけた)は赤のDil蛍光染料で染色された。縮尺は1mmである。
用語「1A」は「1つの単一MDA−MB−231細胞」を指す。
用語「1B」は「1つの単一MCF−7細胞」を指す。
用語「1A+1B」は「1つの単一MDA−MB−231細胞及び1つの単一MCF−7細胞」を指す。
用語「>1A+1B」は「1つより多くの単一MDA−MB−231細胞及び1つの単一MCF−7細胞」を指す。
図8は図7に示す大チャンバー内の単一の及び複数の単一細胞の捕捉効率を示す。
本発明の例としての実施形態の上記の説明は例示及び説明の目的のみで提示され、開示された正確な形式に対して発明を消耗させる又は制限することを意図しない。多くの修正及び変化が上記の教示を考慮して実行可能である。実施形態及び実施例は本発明の原理及びそれらの実用的な応用を説明する目的で選択及び記載され、業界の他者が本発明及び様々な実施形態を、期待された特定の使用に適したものとしての様々な修正と共に利用可能とする。代替の実施形態が、本発明の精神及び範囲を逸脱せずに本発明が関連する当業者に明らかとなるであろう。従って、本発明の範囲は、上述の説明及び本明細書に記載された例としての実施形態よりも請求の範囲により規定される。
300、306、307・・ユニット
310・・・・・・・・・・入口経路
320・・・・・・・・・・流入経路
320a、350a・・・・前端
320b、350b・・・・後端
322・・・・・・・・・・捕捉部位
330・・・・・・・・・・捕捉経路
340・・・・・・・・・・大チャンバー
342・・・・・・・・・・受容部位
350・・・・・・・・・・チャンバー経路
360・・・・・・・・・・バイパス経路
360a・・・・・・・・・第1の端部
360b・・・・・・・・・第2の端部
370、380・・・・・・単一細胞
390・・・・・・・・・・流出経路
392・・・・・・・・・・出口経路
Q1、Q2・・・・・・・・体積流量

Claims (14)

  1. 分離した単一細胞を捕捉する方法であって、
    (a)単一細胞捕捉ユニットの配列を備える流体力学シャトリングチップ機器を提供するステップであって、前記単一細胞捕捉ユニットのそれぞれは、
    (構成a)長さL1、幅W1、高さH1を有し、前端及び前記前端の反対側にある後端を有し、前記後端は捕捉部位を有する流入経路と、
    (構成b)直径M及び深さDを有し、前記流入経路の前記捕捉部位の後に位置し、前記捕捉部位から距離gだけ離れた受容部位を有し、1つより多くの単一細胞が付着、成長、増殖及び/又は移動するように形成された内部空間を有する大チャンバーと、
    (構成c)長さL2、幅W2、高さH2を有し、前記捕捉部位と前記受容部位の間に位置し、前記流入経路と前記大チャンバーとを流体連結する捕捉経路と、
    (構成d)長さL3、幅W3、高さH3を有し、前記大チャンバーの後に位置し、前記大チャンバーと流体接続し、前端及び前記前端の反対側にある後端を有し、前記高さH3は前記大チャンバーの深さDより小さいチャンバー経路と、
    (構成e)長さL4、幅W4、高さH4を有し、前記流入経路、前記大チャンバー及び前記チャンバー経路の横に位置し、第1の端部と前記第1の端部の反対側にある第2の端部を有し、前記第1の端部は前記捕捉部位のすぐ前の前記流入経路から分岐し、前記第2の端部は前記チャンバー経路の前記後端で前記チャンバー経路と合流し、前記幅W4及び前記高さH4は前記捕捉経路の前記幅W2及び前記高さH2より大きいバイパス経路と、
    を備え、
    前記配列の各カラムにおいて、
    (i)前記単一細胞捕捉ユニットは流体接続し、
    (ii)各ユニットの前記流入経路は、第1のユニットを除き、すぐ次の上流ユニットの前記チャンバー経路と流体連結し、
    (iii)各ユニットの前記バイパス経路は、最後のユニットを除き、すぐ次の下流ユニットの前記流入経路と流体接続する、
    ステップと、
    (b)単一種類の分離した細胞を含む培地を、一列に並んだ前記配列における第1の単一細胞捕捉ユニットの前記流入経路に装填するステップと、
    (c)前記単一種類の分離した細胞を前記捕捉部位で捕捉するステップと、
    (d)捕捉されていない、余分な細胞を未使用培地で洗い流すステップと、
    (e)経路に培地を逆流させ、捕捉された前記単一種類の分離した細胞を放出し、放出された細胞を前記大チャンバーに逆流させるステップと、
    を含む分離した単一細胞を捕捉する方法。
  2. 1つより多くの種類の分離した単一細胞を捕捉する方法であって、
    (a)単一細胞捕捉ユニットの配列を備える流体力学シャトリングチップ機器を提供するステップであって、前記単一細胞捕捉ユニットのそれぞれは、
    (構成a)長さL1、幅W1、高さH1を有し、前端及び前記前端の反対側にある後端を有し、前記後端は捕捉部位を有する流入経路と、
    (構成b)直径M及び深さDを有し、前記流入経路の前記捕捉部位の後に位置し、前記捕捉部位から距離gだけ離れた受容部位を有し、1つより多くの単一細胞が付着、成長、増殖及び/又は移動するように形成された内部空間を有する大チャンバーと、
    (構成c)長さL2、幅W2、高さH2を有し、前記捕捉部位と前記受容部位の間に位置し、前記流入経路と前記大チャンバーとを流体連結する捕捉経路と、
    (構成d)長さL3、幅W3、高さH3を有し、前記大チャンバーの後に位置し、前記大チャンバーと流体接続し、前端及び前記前端の反対側にある後端を有し、前記高さH3は前記大チャンバーの深さDより小さいチャンバー経路と、
    (構成e)長さL4、幅W4、高さH4を有し、前記流入経路、前記大チャンバー及び前記チャンバー経路の横に位置し、第1の端部と前記第1の端部の反対側にある第2の端部を有し、前記第1の端部は前記捕捉部位のすぐ前の前記流入経路から分岐し、前記第2の端部は前記チャンバー経路の前記後端で前記チャンバー経路と合流し、前記幅W4及び前記高さH4は前記捕捉経路の前記幅W2及び前記高さH2より大きいバイパス経路と、
    を備え、
    前記配列の各カラムにおいて、
    (i)前記単一細胞捕捉ユニットは流体接続し、
    (ii)各ユニットの前記流入経路は、第1のユニットを除き、すぐ次の上流ユニットの前記チャンバー経路と流体連結し、
    (iii)各ユニットの前記バイパス経路は、最後のユニットを除き、すぐ次の下流ユニットの前記流入経路と流体接続する、
    ステップと、
    (b)特定の種類の分離した単一細胞を含む培地を一列に並んだ前記配列における第1の単一細胞捕捉ユニットの前記流入経路に装填するステップと、
    (c)前記特定の種類の分離した単一細胞を前記捕捉部位で捕捉するステップと、
    (d)捕捉されていない、余分な細胞を未使用培地で洗い流すステップと、
    (e)前記チャンバー経路を逆流させ、前記特定の種類の捕捉された単一細胞を放出し、前記特定の種類の放出された細胞を前記大チャンバーに逆流させるステップと、
    (f)それぞれの繰り返しのステップにおいて、前記分離した単一細胞が異なる種類であることを条件として、前記ステップ(b)、(c)、(d)、(e)を1回以上繰り返すステップと、
    を含む分離した単一細胞を捕捉する方法。
  3. 前記流体力学シャトリングチップ機器は、
    前記配列の各カラムにおいて、各ユニットの前記チャンバー経路は、最後のユニットを除き、すぐ隣の下流ユニットの前記流入経路と流体接続する、請求項1または2に記載の分離した単一細胞を捕捉する方法
  4. 前記流体力学シャトリングチップ機器は、
    前記配列の各カラムにおいて、前記最後のユニットの前記チャンバー経路は流出経路と流体接続する、請求項に記載の分離した単一細胞を捕捉する方法
  5. 前記流体力学シャトリングチップ機器は、
    前記配列の各カラムにおいて、前記第1のユニットの前記流入経路は入口経路と流体接続され、前記最後のユニットの前記流出経路は出口経路と流体接続する、請求項に記載の分離した単一細胞を捕捉する方法
  6. 前記流体力学シャトリングチップ機器は、
    (a)前記入口経路と流体接続する入口と、
    (b)前記出口経路と流体接続する出口と、を更に備える、請求項に記載の分離した単一細胞を捕捉する方法
  7. 前記流体力学シャトリングチップ機器は、
    前記配列のカラム間の前記単一細胞捕捉ユニットは入口経路及び出口経路を介して流体接続する、請求項1または2に記載の分離した単一細胞を捕捉する方法
  8. 前記流体力学シャトリングチップ機器は、
    前記流入経路、前記捕捉経路、前記チャンバー経路及び前記バイパス経路の表面はアルブミンで覆われている、請求項1または2に記載の分離した単一細胞を捕捉する方法
  9. 前記流体力学シャトリングチップ機器は、
    前記大チャンバー内に1つ又は複数の種類の分離した単一細胞を更に含む、請求項1または2に記載の分離した単一細胞を捕捉する方法
  10. 前記流体力学シャトリングチップ機器は、
    少なくとも2種類の分離した単一細胞を前記大チャンバー内に含む、請求項に記載の分離した単一細胞を捕捉する方法
  11. 前記流体力学シャトリングチップ機器は、
    単一細胞懸濁液を更に含み、前記単一細胞のサイズは前記バイパス経路の断面より小さいが、前記捕捉経路の断面より大きい、請求項1または2に記載の分離した単一細胞を捕捉する方法
  12. 前記流体力学シャトリングチップ機器は、
    透明な基板に隣接する、請求項1に記載の分離した単一細胞を捕捉する方法
  13. 前記流体力学シャトリングチップ機器は、
    ポリジメチルシロキサン、ポリメチルメタクリレート、ポリカーボネート、ガラス、熱可塑性プラスチック材料及びそれらの組合せから成る群から選択される材料から作製される、請求項1または2に記載の分離した単一細胞を捕捉する方法
  14. 前記流体力学シャトリングチップ機器は、
    前記バイパス経路は前記ユニットの片側に沿って横方向に蛇行する、請求項1または2に記載の分離した単一細胞を捕捉する方法
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