JP6832970B2 - 細胞コロニー検出装置および方法並びにプログラム - Google Patents
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Description
2 細胞コロニー検出装置
3 表示装置
4 入力装置
20 細胞画像取得部
21 細胞群検出部
22 細胞群統合部
23 表示制御部
Claims (13)
- 複数の細胞を撮像した撮像画像を取得する細胞画像取得部と、
前記撮像画像内に含まれる複数の細胞の各々の細胞を表す画素毎にカーネル密度推定により計算された確率密度関数に基づいて、各細胞をクラスタリングすることにより、複数の細胞群を検出する細胞群検出部と、
前記細胞群検出部により検出された複数の細胞群の間の距離と前記複数の細胞群のそれぞれの成熟度合いを示す成熟度に基づいて、前記複数の細胞群の間の距離が予め設定された距離閾値以下で、かつ前記複数の細胞群の間の前記成熟度の差が予め設定された成熟度閾値以下である2つ以上の細胞群が同一の細胞コロニーに属するように、前記複数の細胞群を細胞コロニー毎に統合する細胞群統合部と、
を備え、
前記成熟度は、前記細胞が幹細胞の場合には、前記複数の細胞群各々の形状の変化の特徴量であることを特徴とする細胞コロニー検出装置。 - 複数の細胞を撮像した撮像画像を取得する細胞画像取得部と、
前記撮像画像内に含まれる複数の細胞の各々の細胞を表す画素毎にカーネル密度推定により計算された確率密度関数に基づいて、各細胞をクラスタリングすることにより、複数の細胞群を検出する細胞群検出部と、
前記細胞群検出部により検出された複数の細胞群の間の距離と前記複数の細胞群のそれぞれの成熟度合いを示す成熟度に基づいて、前記複数の細胞群の間の距離と前記複数の細胞群の成熟度の差の線形和もしくは非線形和が閾値以下である2つ以上の細胞群が同一の細胞コロニーに属するように、前記複数の細胞群を細胞コロニー毎に統合する細胞群統合部と、
を備え、
前記成熟度は、前記細胞が幹細胞の場合には、前記複数の細胞群各々の形状の変化の特徴量であることを特徴とする細胞コロニー検出装置。 - 前記細胞群統合部が、前記細胞の培養期間に応じて前記距離閾値および前記成熟度閾値の少なくとも1つを変更する請求項1記載の細胞コロニー検出装置。
- 前記細胞群統合部が、前記細胞の成長因子の種類または量に応じて前記距離閾値および前記成熟度閾値の少なくとも1つを変更する請求項1または3記載の細胞コロニー検出装置。
- 前記細胞群統合部が、前記細胞の培養期間に応じて前記閾値を変更する請求項2記載の細胞コロニー検出装置。
- 前記細胞群統合部が、前記細胞の成長因子の種類または量に応じて前記閾値を変更する請求項2または5記載の細胞コロニー検出装置。
- 前記細胞群統合部が、前記複数の細胞群の中に同じ種類の細胞の細胞群が含まれるか否かを判定し、前記複数の細胞群の中に複数種類の細胞群が含まれる場合、同じ種類の細胞群毎に、前記複数の細胞群の間の距離と前記複数の細胞群のそれぞれの成熟度に応じて、前記複数の細胞群が同一細胞コロニーに属するものであるか否かを判定する請求項1から6いずれか1項記載の細胞コロニー検出装置。
- 前記細胞群統合部が、前記細胞群の画像の赤色と青色の比率に基づいて、前記細胞群の種類を判定する請求項7記載の細胞コロニー検出装置。
- 前記細胞群統合部による前記細胞コロニーの検出結果を出力する出力部を備えた請求項1から8いずれか1項記載の細胞コロニー検出装置。
- 複数の細胞を撮像した撮像画像を取得し、
前記撮像画像内に含まれる複数の細胞の各々の細胞を表す画素毎にカーネル密度推定により計算された確率密度関数に基づいて、各細胞をクラスタリングすることにより、複数の細胞群を検出し、
複数の細胞群の間の距離と前記複数の細胞群のそれぞれの成熟度合いを示す成熟度であって、前記細胞が幹細胞の場合には、前記複数の細胞群各々の形状の変化の特徴量である成熟度に基づいて、前記複数の細胞群の間の距離が予め設定された距離閾値以下で、かつ前記複数の細胞群の間の前記成熟度の差が予め設定された成熟度閾値以下である2つ以上の細胞群が同一の細胞コロニーに属するように、前記複数の細胞群を細胞コロニー毎に統合することを特徴とする細胞コロニー検出方法。 - 複数の細胞を撮像した撮像画像を取得し、
前記撮像画像内に含まれる複数の細胞の各々の細胞を表す画素毎にカーネル密度推定により計算された確率密度関数に基づいて、各細胞をクラスタリングすることにより、複数の細胞群を検出し、
複数の細胞群の間の距離と前記複数の細胞群のそれぞれの成熟度合いを示す成熟度であって、前記細胞が幹細胞の場合には、前記複数の細胞群各々の形状の変化の特徴量である成熟度に基づいて、前記複数の細胞群の間の距離と前記複数の細胞群の成熟度の差の線形和もしくは非線形和が閾値以下である2つ以上の細胞群が同一の細胞コロニーに属するように、前記複数の細胞群を細胞コロニー毎に統合することを特徴とする細胞コロニー検出方法。 - 複数の細胞を撮像した撮像画像を取得する細胞画像取得部と、
前記撮像画像内に含まれる複数の細胞の各々の細胞を表す画素毎にカーネル密度推定により計算された確率密度関数に基づいて、各細胞をクラスタリングすることにより、複数の細胞群を検出する細胞群検出部と、
前記細胞群検出部により検出された複数の細胞群の間の距離と前記複数の細胞群のそれぞれの成熟度合いを示す成熟度であって、前記細胞が幹細胞の場合には、前記複数の細胞群各々の形状の変化の特徴量である成熟度に基づいて、前記複数の細胞群の間の距離が予め設定された距離閾値以下で、かつ前記複数の細胞群の間の前記成熟度の差が予め設定された成熟度閾値以下である2つ以上の複数の細胞群が同一の細胞コロニーに属するように、前記複数の細胞群を細胞コロニー毎に統合する細胞群統合部としてコンピュータを機能させることを特徴とする細胞コロニー検出プログラム。 - 複数の細胞を撮像した撮像画像を取得する細胞画像取得部と、
前記撮像画像内に含まれる複数の細胞の各々の細胞を表す画素毎にカーネル密度推定により計算された確率密度関数に基づいて、各細胞をクラスタリングすることにより、複数の細胞群を検出する細胞群検出部と、
前記細胞群検出部により検出された複数の細胞群の間の距離と前記複数の細胞群のそれぞれの成熟度合いを示す成熟度であって、前記細胞が幹細胞の場合には、前記複数の細胞群各々の形状の変化の特徴量である成熟度に基づいて、前記複数の細胞群の間の距離と前記複数の細胞群の成熟度の差の線形和もしくは非線形和が閾値以下である2つ以上の細胞群が同一の細胞コロニーに属するように、前記複数の細胞群を細胞コロニー毎に統合する細胞群統合部としてコンピュータを機能させることを特徴とする細胞コロニー検出プログラム。
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