JP6652680B2 - ｓｙｎＴａｃポリペプチド及びその使用 - Google Patents

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Description

相互参照
本出願は、参照することによってその全体が本明細書に組み込まれる、２０１４年６月１８日に出願された米国仮特許出願第６２／０１３，７１５号の恩典を主張する。
政府支援の言明
本発明は、国立衛生研究所、ＮＩＧＭＳによって与えられた認可番号３Ｕ５４ＧＭ０９４６６２−０２及び同５Ｕ０１ＧＭ０９４６６５−０２の下、政府支援を受けてなされた。政府は本発明に所定の権利を有する。
テキストファイルで提供された配列表の参照による組み込み
配列表が、２０１５年６月１０日に作成された１４２ＫＢサイズのテキストファイル「ＩＭＧＮ−Ｅ００３ＷＯ＿ＳＴ２５．ｔｘｔ」としてここに提供される。本テキストファイルの内容は、参照することによってその全体が本明細書に組み込まれる。
緒言
本出願を通して、様々な出版物が角括弧で参照される。これら参考文献の完全な引用は、本明細書の文末を参照されたい。これら出版物の開示、並びに本明細書に参照されるすべての特許、公開特許公報、及び書籍は、参照することによってその全体が本願に組み込まれ、本願発明が属する技術をさらに十分に説明する。
過去十年間にわたる臨床的に意義のあるバイオマーカーの発見に対するハイスループット技術の開発の急速な進歩は、活性成分が生物学的起源（例えば、モノクローナル抗体、治療用タンパク質、及びペプチド）によって製造されるかまたは該生物学的起源から抽出される薬物である生物製剤の段階的な展開及び適用と並行してきたとともに、免疫関連疾患の治療に革命をもたらした。しかしながら、現行の生物学的療法は、安全規制措置をそれらの合成対応物の２倍の割合で促している（生物製剤に対して１７％、合成物質は８．５％）［１］。これは、免疫を調節するこれら生物製剤の作用機序から、すなわち自己免疫の場合の包括的な免疫抑制（例えば、Ｈｕｍｉｒａ［２］）及びがんの治療に関する包括的な免疫刺激（例えば、Ｙｅｒｖｏｙ［３］）から現れると考えられている。これらの治療は、免疫調節を病原性的に関連する細胞に適切には限定せず、その結果として、患者を致死的可能性がある感染症にかかりやすくし、多くの厄介な副作用を起こしやすくする［４〜６］。さらに、これら薬物の中程度の効能と安全性プロファイル［７］は、標的治療方法へと向かう最近の傾向を誘発した。第一世代の「標的」生物製剤は、それらの影響をより限定されたＴ細胞サブセットへ向ける（例えば、抗４−１ＢＢ、抗ＣＤ２７、ＬＡＧ−３、及びＴＩＭ−３等の抗体及びタンパク質治療剤）［８〜１１］。しかしながら、以前の治療法のように、これら「第一世代」の取り組みは、病気に関連する細胞のみを標的にすることが依然としてできない。
適応免疫反応を含む分子事象の中核をなすのは、Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）と、主要組織適合複合体（ＭＨＣ）分子によって非共有結合的に提示される低分子ペプチド抗原の結合である。これは、免疫系の標的化機序を表しており、かつ、Ｔ細胞活性化とエフェクター機能に必須の分子間相互作用である。エピトープ特異的な細胞の標的化に続いて、動員されたＴ細胞は、抗原提示細胞上で見られる共刺激分子の一般的な結合によって活性化される。両方のシグナルが、Ｔ細胞の特異性及び活性化または阻害の操縦のために必要とされる。重要なことには、Ｔ細胞の発生の際、ゲノム編集過程でＴ細胞ごとに独自のＴＣＲが発現する［１２］が、該共刺激分子は、一般にすべてのＴ細胞（または大型のＴ細胞の「サブセット」）上に発現する。現行の手法は、ほとんど該共刺激分子の一般的な結合だけに依拠し、結果として「包括的な治療」になる。これら包括的な免疫療法は、非常に効力があるが、無差別にＴ細胞を標的とし、重篤な毒性につながる。共刺激分子が、病気に関連するＴＣＲを有するＴ細胞に選択的に結合できれば、それらの効力は、不利益な点から長所へと前進するであろう。
Ｔ細胞を調節するためのいくつかの方法があり、共刺激作用を阻止可能な一般にＦｃ融合体として表される可溶性共刺激分子または共刺激分子に対する抗体［１３、１４］、抗体薬物複合体（ＡＤＣ）［１５］、二重特異性抗体（ＢｓＡｂ）［１６、１７］、及び遊離ペプチド抗原［１８］が挙げられる。特に、ＡＤＣ（しばしば魔法の弾丸と呼ばれる）は、病的細胞への毒素（または他の薬物ペイロード）の直接的な標的化導入を約束する。しかしながら、ＡＤＣは、現在のところ、抗体標的化に好適なバイオマーカーを欠いており、また、内在化は多くの場合細胞の死滅に必要とされるが、投与量のわずか約１．５％の低い内在化率しか腫瘍細胞内で見いだされない。二重特異性抗体は、複数のｍＡｂの相加効果および相乗効果を組み合わせる魅力ある機会を与え、腫瘍細胞とＴ細胞の橋渡しをするために用いることができ［１７］、ゆえに反応を誘発するために内在化を必要としない。二重特異性抗体は２つの異なる抗原と二価の相互作用を有するように開発された［１９］が、これらの構築物はなおモジュール性を欠き、親ｍＡｂと比較して親和性が低い［２０］。養子Ｔ細胞（ＣＡＲ−Ｔ）療法は、これらの問題にある程度対処しており、上述の従来の治療に対して魅力的な代替手段である［２１］。ＣＡＲ−Ｔは、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）をその表面に有する遺伝子改変された一次Ｔ細胞を用いる。すなわち、患者のＴ細胞を取り出し、精製し、かつ、ＣＡＲを介して腫瘍特異的抗原を標的とするように遺伝子改変する。ＣＡＲは一般に外部一本鎖可変ドメイン（抗体フラグメント）を有し、これは病的細胞を標的とするが、従来の共刺激分子の細胞質ドメインを有する。遺伝子操作されたＴ細胞がいったん標的抗原と結合すると、内部刺激ドメインは該Ｔ細胞が完全に活性となるために必要なシグナルを与える。この完全な活性状態で、該Ｔ細胞はより効果的に増殖することができ、がん細胞を攻撃できる。サイトカイン放出症候群及びそれに伴う副作用を避けるためのこの反応の緩和、並びに拡張性の問題（例えば、相当な費用並びにＴ細胞の取り出し及び改変に伴う難しさ）のため、今のところこの技術は主流として用いられない［２２］。
生物薬剤としても知られる生物製剤は、その活性成分が生物学的起源によって製造されるかまたは該生物学的起源から抽出される薬物である（「小分子」薬物とは対照的である）。生物製剤は、治療学の世界市場にとって比較的新しい追加物であり、大部分が、遺伝子操作によって製造される組み換えタンパク質であり；これらはモノクローナル抗体、治療用タンパク質、及びペプチドを含む。現在上市されている生物製剤薬物のほとんどは、患者が慢性疾患、例えば、がん、糖尿病、循環器疾患、不妊症、及び嚢胞性線維症を患っているのを緩和するために用いられている。生物製剤の世界市場は、２０１２年には１６３０億ドルの規模を誇り、５年間の複合年間成長率９％を維持して２０１７年までに２５２０億ドルに拡大すると予想されている。この成長を推し進めるために、より費用のかかる創薬パイプライン、治りにくい病気に対する魅力的な標的の特定、及び最近の短縮されたＦＤＡ承認経路の導入がよい例となる後続の生物製剤（バイオ後続品、ジェネリック生物製剤）の追跡への支援が必要である。
本発明は、免疫腫瘍学及び自己免疫に関する精密な治療方法の必要性、すなわち、現在上市もしくは開発中の包括的かつ「疑似標的化」モジュレーターとは異なり、病気に関連するＴ細胞のみを（例えば、がんの場合における）上方調節または（例えば、自己免疫の場合における）抑制のためにクローン的に標的とするテーラード治療法の必要性に対応する。
概要
本発明は、第一のＢ２Ｍリーダー配列と同一のアミノ酸配列、これに隣接する候補エピトープペプチド、これに隣接する第一のアミノ酸リンカー配列、これに隣接する、ヒト天然Ｂ２Ｍペプチド配列と同一のアミノ酸配列、これに隣接する第二のアミノ酸リンカー配列、これに隣接するＴ細胞調節ドメインペプチド配列、これに隣接する第三のアミノ酸リンカー、これに隣接する第二のＢ２Ｍリーダー配列、これに隣接する、ＭＨＣ重鎖と同一のアミノ酸配列、これに隣接する、免疫グロブリンＦｃドメインと同一のアミノ酸配列を含む、組み換えポリペプチドを提供する。
本発明はまた、第一のＢ２Ｍリーダー配列と同一のアミノ酸配列、これに隣接する候補エピトープペプチド、これに隣接する第一のアミノ酸リンカー配列、これに隣接する、ヒト天然Ｂ２Ｍペプチド配列と同一のアミノ酸配列、これに隣接する第二のアミノ酸リンカー配列、これに隣接する第二のＢ２Ｍリーダー配列、これに隣接するＴ細胞調節ドメインペプチド配列、これに隣接する第三のアミノ酸リンカー、これに隣接するＭＨＣ重鎖と同一のアミノ酸配列、これに隣接する、免疫グロブリンＦｃドメインと同一のアミノ酸配列を含む、組み換えポリペプチドも提供する。
さらに、エピトープペプチドを認識するＴ細胞クローンを阻害する方法であって、該クローンのＴ細胞を、Ｔ細胞クローンの阻害に有効な量の本明細書に記載の組み換えペプチドと接触させる段階を含み、該組み換えペプチドが、該エピトープペプチドを含み、かつ、阻害性ドメインであるＴ細胞調節ドメインを含む、方法も提供される。
さらに、エピトープペプチドを認識する自己反応性Ｔ細胞クローンの阻害によって自己免疫疾患を治療する方法であって、該クローンのＴ細胞を、自己免疫疾患の治療に有効な量の本明細書に記載の組み換えペプチドと接触させる段階を含み、該組み換えペプチドが、該エピトープペプチドを含み、かつ、阻害性ドメインであるＴ細胞調節ドメインを含む、方法も提供される。
さらに、エピトープペプチドを認識するＴ細胞クローンを刺激する方法であって、該クローンのＴ細胞を、Ｔ細胞クローンの刺激に有効な量の本明細書に記載の組み換えペプチドと接触させる段階を含み、該組み換えペプチドが、該エピトープペプチドを含み、かつ、刺激性ドメインであるＴ細胞調節ドメインを含む、方法も提供される。
さらに、がんのエピトープペプチドを認識するＴ細胞クローンの刺激によってがんを治療する方法であって、該クローンのＴ細胞を、がんの治療に有効な量の本明細書に記載の組み換えペプチドと接触させる段階を含み、該組み換えペプチドが、該エピトープペプチドを含み、かつ、刺激性ドメインであるＴ細胞調節ドメインを含む、方法も提供される。
さらに、（ｉ）第一のアミノ酸リンカー配列によって結合された候補エピトープペプチド、これに隣接する、ヒト天然Ｂ２Ｍペプチド配列と同一の配列を含むアミノ酸配列、これに隣接する第二のアミノ酸リンカー配列、これに隣接するＴ細胞調節ドメインペプチドを含み、（ｉ）が、１つまたは２つ以上のジスルフィド結合によって、（ｉｉ）ＭＨＣ重鎖の配列を有するアミノ酸配列、これに隣接する第三のアミノ酸リンカー配列、これに隣接する、免疫グロブリンＦｃドメインと同一のアミノ酸配列に結合されている、組み換えポリペプチド構築物も提供される。
さらに、（ｉ）第一のアミノ酸リンカー配列によって結合された候補エピトープペプチド、これに隣接する、ヒト天然Ｂ２Ｍペプチド配列と同一の配列を含むアミノ酸配列を含み、（ｉ）が、１つまたは２つ以上のジスルフィド結合によって、（ｉｉ）Ｔ細胞調節ドメインペプチド、これに隣接する第二のアミノ酸リンカー、これに隣接する、ＭＨＣ重鎖の配列を有するアミノ酸配列、これに隣接する第三のアミノ酸リンカー配列、これに隣接する、免疫グロブリンＦｃドメインと同一のアミノ酸配列に結合されている、組み換えポリペプチド構築物も提供される。
さらに、それぞれの免疫グロブリンＦｃドメイン間の１つ以上のジスルフィド結合によって結合された本明細書に記載の組み換えポリペプチド構築物のうちの２つを含むタンパク質も提供される。
さらに、本それぞれの免疫グロブリンＦｃドメイン間の１つ以上のジスルフィド結合によって結合された明細書に記載の該組み換えポリペプチド構築物のうちの２つを含むタンパク質も提供される。
本発明は、本明細書に記載の組み換えポリペプチドをコードする配列を５'から３'順に含む異種核酸によって形質導入または形質転換された、単離された懸濁適応細胞を提供する。
本開示は、第一のＢ２Ｍリーダー配列と同一のアミノ酸配列、これに隣接する候補エピトープペプチド、これに隣接する第一のアミノ酸リンカー配列、これに隣接する、ヒト天然Ｂ２Ｍペプチド配列と同一のアミノ酸配列、これに隣接する第二のアミノ酸リンカー配列、これに隣接するＴ細胞調節ドメインペプチド配列、これに隣接する第三のアミノ酸リンカー、これに隣接する第二のＢ２Ｍリーダー配列、これに隣接する、ＭＨＣ重鎖と同一のアミノ酸配列、これに隣接する、免疫グロブリンＦｃドメインと同一のアミノ酸配列を含む、組み換えポリペプチドを提供する。いくつかの場合、該候補エピトープは、７〜２０アミノ酸を含む。いくつかの場合、該第三のアミノ酸リンカーは、自己開裂型である。いくつかの場合、該第二のアミノ酸リンカーは、自己開裂型である。いくつかの場合、該自己開裂型のペプチドは、ウイルス２Ａペプチドであるか、またはその配列を有する。いくつかの場合、該第一のＢ２Ｍリーダー配列及び／または該第二のＢ２Ｍリーダー配列は、ヒトＢ２Ｍリーダー配列の配列を有する。いくつかの場合、該ＭＨＣの重鎖は、ヒトＭＨＣの重鎖である。いくつかの場合、該ＭＨＣの重鎖は、ＭＨＣ Ｉ分子である。いくつかの場合、該ＭＨＣの重鎖は、ＨＬＡ−Ａ０２：０１である。いくつかの場合、該ＭＨＣの重鎖は、ＭＨＣ ＩＩ分子である。いくつかの場合、該免疫グロブリンＦｃドメインはＩｇＧのＦｃドメインである。いくつかの場合、該免疫グロブリンＦｃドメインはＩｇＡのＦｃドメインである。いくつかの場合、該免疫グロブリンＦｃドメインはＩｇＭのＦｃドメインである。いくつかの場合、該免疫グロブリンＦｃドメインはヒト免疫グロブリンＦｃドメインである。いくつかの場合、該免疫グロブリンＦｃドメインはＩｇＧ１のＦｃドメインである。いくつかの場合、該組み換えポリペプチドは、そのＣ末端に隣接するＨｉｓ−８タグを有する。いくつかの場合、該Ｔ細胞調節ドメインは、阻害性ドメインである。いくつかの場合、該Ｔ細胞調節ドメインは、刺激性ドメインである。いくつかの場合、該Ｔ細胞調節ドメインは、抗体及び抗体フラグメント、ペプチドリガンド、Ｔ細胞共刺激ペプチド、サイトカイン、または毒素である。いくつかの場合、該Ｔ細胞調節ドメインは、ＰＤ−Ｌ１ペプチド、ＰＤ−Ｌ１ペプチドのＩｇ可変ドメインを含み、該Ｔ細胞調節ドメインは、４−１ＢＢＬを含み、該Ｔ細胞調節ドメインは、Ｂ７−１Ｗ８８Ａを含むか、または、該Ｔ細胞調節ドメインは、抗ＣＤ２８一本鎖Ｆｖを含む。いくつかの場合、該組み換えポリペプチドは、そのヒト天然Ｂ２Ｍペプチド配列とその重鎖配列との間のジスルフィド結合を生じさせるように該Ｂ２Ｍペプチド配列中及び該重鎖配列中に変異を含む。
本開示は、第一のＢ２Ｍリーダー配列と同一のアミノ酸配列、これに隣接する候補エピトープペプチド、これに隣接する第一のアミノ酸リンカー配列、これに隣接する、ヒト天然Ｂ２Ｍペプチド配列と同一のアミノ酸配列、これに隣接する第二のアミノ酸リンカー配列、これに隣接する第二のＢ２Ｍリーダー配列、これに隣接するＴ細胞調節ドメインペプチド配列、これに隣接する第三のアミノ酸リンカー、これに隣接する、ＭＨＣ重鎖と同一のアミノ酸配列、これに隣接する、免疫グロブリンＦｃドメインと同一のアミノ酸配列を含む、組み換えポリペプチドを提供する。いくつかの場合、該候補エピトープは、７〜２０アミノ酸を含む。いくつかの場合、該第三のアミノ酸リンカーは、自己開裂型である。いくつかの場合、該第二のアミノ酸リンカーは、自己開裂型である。いくつかの場合、該自己開裂型のペプチドは、ウイルス２Ａペプチドであるか、またはその配列を有する。いくつかの場合、該第一のＢ２Ｍリーダー配列及び／または該第二のＢ２Ｍリーダー配列は、ヒトＢ２Ｍリーダー配列の配列を有する。いくつかの場合、該ＭＨＣ重鎖は、ヒトＭＨＣ重鎖である。いくつかの場合、該ＭＨＣ重鎖は、ＭＨＣ Ｉ分子である。いくつかの場合、該ＭＨＣ重鎖は、ＨＬＡ−Ａ０２：０１である。いくつかの場合、該ＭＨＣ重鎖は、ＭＨＣ ＩＩ分子である。いくつかの場合、該免疫グロブリンＦｃドメインはＩｇＧのＦｃドメインである。いくつかの場合、該免疫グロブリンＦｃドメインはＩｇＡのＦｃドメインである。いくつかの場合、該免疫グロブリンＦｃドメインはＩｇＭのＦｃドメインである。いくつかの場合、該免疫グロブリンＦｃドメインはヒト免疫グロブリンＦｃドメインである。いくつかの場合、該免疫グロブリンＦｃドメインはＩｇＧ１のＦｃドメインである。いくつかの場合、該組み換えポリペプチドは、そのＣ末端に隣接するＨｉｓ−８タグを有する。いくつかの場合、該Ｔ細胞調節ドメインは、阻害性ドメインである。いくつかの場合、該Ｔ細胞調節ドメインは、刺激性ドメインである。いくつかの場合、該Ｔ細胞調節ドメインは、抗体及び抗体フラグメント、ペプチドリガンド、Ｔ細胞共刺激ペプチド、サイトカイン、または毒素である。いくつかの場合、該Ｔ細胞調節ドメインは、ＰＤ−Ｌ１ペプチド、ＰＤ−Ｌ１ペプチドのＩｇ可変ドメインを含み、該Ｔ細胞調節ドメインは、４−１ＢＢＬを含み、該Ｔ細胞調節ドメインは、Ｂ７−１Ｗ８８Ａを含むか、または、該Ｔ細胞調節ドメインは、抗ＣＤ２８一本鎖Ｆｖを含む。いくつかの場合、該組み換えポリペプチドは、そのヒト天然Ｂ２Ｍペプチド配列とその重鎖配列との間のジスルフィド結合を生じさせるように該Ｂ２Ｍペプチド配列中及び該重鎖配列中に変異を含む。
いくつかの場合、該組み換えポリペプチドは、そのヒト天然Ｂ２Ｍペプチド配列とその重鎖配列との間のジスルフィド結合を生じさせるように該Ｂ２Ｍペプチド配列中及び体重鎖配列中に変異を含む。いくつかの場合、該重鎖配列はＨＬＡであり、該ジスルフィド結合は下記の残基の対のうちの１つを連結する：Ｂ２Ｍ残基１２、ＨＬＡ残基２３６；Ｂ２Ｍ残基１２、ＨＬＡ残基２３７；Ｂ２Ｍ残基８、ＨＬＡ残基２３４；Ｂ２Ｍ残基１０、ＨＬＡ残基２３５；Ｂ２Ｍ残基２４、ＨＬＡ残基２３６；Ｂ２Ｍ残基２８、ＨＬＡ残基２３２；Ｂ２Ｍ残基９８、ＨＬＡ残基１９２；Ｂ２Ｍ残基９９、ＨＬＡ残基２３４；Ｂ２Ｍ残基３、ＨＬＡ残基１２０；Ｂ２Ｍ残基３１、ＨＬＡ残基９６；Ｂ２Ｍ残基５３、ＨＬＡ残基３５；Ｂ２Ｍ残基６０、ＨＬＡ残基９６；Ｂ２Ｍ残基６０、ＨＬＡ残基１２２；Ｂ２Ｍ残基６３、ＨＬＡ残基２７；Ｂ２Ｍ残基Ａｒｇ３、ＨＬＡ残基Ｇｌｙ１２０；Ｂ２Ｍ残基Ｈｉｓ３１、ＨＬＡ残基Ｇｌｎ９６；Ｂ２Ｍ残基Ａｓｐ５３、ＨＬＡ残基Ａｒｇ３５；Ｂ２Ｍ残基Ｔｒｐ６０、ＨＬＡ残基Ｇｌｎ９６；Ｂ２Ｍ残基Ｔｒｐ６０、ＨＬＡ残基Ａｓｐ１２２；Ｂ２Ｍ残基Ｔｙｒ６３、ＨＬＡ残基Ｔｙｒ２７；Ｂ２Ｍ残基Ｌｙｓ６、ＨＬＡ残基Ｇｌｕ２３２；Ｂ２Ｍ残基Ｇｌｎ８、ＨＬＡ残基Ａｒｇ２３４；Ｂ２Ｍ残基Ｔｙｒ１０、ＨＬＡ残基Ｐｒｏ２３５；Ｂ２Ｍ残基Ｓｅｒ１１、ＨＬＡ残基Ｇｌｎ２４２；Ｂ２Ｍ残基Ａｓｎ２４、ＨＬＡ残基Ａｌａ２３６；Ｂ２Ｍ残基Ｓｅｒ２８、ＨＬＡ残基Ｇｌｕ２３２；Ｂ２Ｍ残基Ａｓｐ９８、ＨＬＡ残基Ｈｉｓ１９２；及びＢ２Ｍ残基Ｍｅｔ９９、ＨＬＡ残基Ａｒｇ２３４。
いくつかの場合、該組み換えポリペプチドは、そのヒト天然Ｂ２Ｍペプチド配列とその重鎖配列との間のジスルフィド結合を生じさせるように該Ｂ２Ｍペプチド配列中及び該重鎖配列中に変異を含む。いくつかの場合、該重鎖配列は、ＨＬＡであり、該ジスルフィド結合は下記の残基の対のうちの１つを連結する：第一のリンカー部位Ｇｌｙ２、重鎖（ＨＬＡ）部位Ｔｙｒ８４；軽鎖（Ｂ２Ｍ）部位Ａｒｇ１２、ＨＬＡ Ａｌａ２３６；及び／またはＢ２Ｍ残基Ａｒｇ１２、ＨＬＡ残基Ｇｌｙ２３７。
いくつかの場合、該Ｔ細胞調節ドメインは、阻害性ドメインである。いくつかの場合、該Ｔ細胞調節ドメインは、刺激性ドメインである。いくつかの場合、該Ｔ細胞調節ドメインは、抗体及び抗体フラグメント、ペプチドリガンド、Ｔ細胞共刺激ペプチド、サイトカイン、または毒素である。いくつかの場合、該Ｔ細胞調節ドメインは、ＰＤ−Ｌ１ペプチド、ＰＤ−Ｌ１ペプチドのＩｇ可変ドメインを含むか、該Ｔ細胞調節ドメインは、４−１ＢＢＬを含むか、該Ｔ細胞調節ドメインは、Ｂ７−１Ｗ８８Ａを含むか、または、該Ｔ細胞調節ドメインは、抗ＣＤ２８一本鎖Ｆｖを含む。
本開示は、上述または本明細書の他の場所に記載の組み換えポリペプチドのいずれかをコードする核酸を提供する。本開示は、上述または本明細書の他の場所に記載の組み換えポリペプチドのいずれかをコードする核酸で形質転換された細胞を提供する。
本開示は、エピトープペプチドを認識するＴ細胞クローンを阻害する方法であって、該クローンのＴ細胞を、Ｔ細胞クローンの阻害に有効な量の上述または本明細書の他の場所に記載の組み換えペプチドのいずれかと接触させる段階を含み、該組み換えペプチドが、該エピトープペプチドを含み、かつ、阻害性ドメインであるＴ細胞調節ドメインを含む、方法を提供する。
本開示は、エピトープペプチドを認識する自己反応性Ｔ細胞クローンの阻害によって自己免疫疾患を治療する方法であって、該クローンのＴ細胞を、自己免疫疾患の治療に有効な量の上述または本明細書の他の場所に記載の組み換えペプチドと接触させる段階を含み、該組み換えペプチドが、該エピトープペプチドを含み、かつ、阻害性ドメインであるＴ細胞調節ドメインを含む、方法を提供する。
本開示は、エピトープペプチドを認識するＴ細胞クローンを刺激する方法であって、該クローンのＴ細胞を、Ｔ細胞クローンの刺激に有効な量の上述または本明細書の他の場所に記載の組み換えペプチドと接触させる段階を含み、該組み換えペプチドが、該エピトープペプチドを含み、かつ、刺激性ドメインであるＴ細胞調節ドメインを含む、方法を提供する。
本開示は、がんのエピトープペプチドを認識するＴ細胞クローンの刺激によってがんを治療する方法であって、該クローンのＴ細胞を、がんの治療に有効な量の上述または本明細書の他の場所に記載の組み換えペプチドと接触させる段階を含み、該組み換えペプチドが、該エピトープペプチドを含み、かつ、刺激性ドメインであるＴ細胞調節ドメインを含む、方法を提供する。
本開示は、（ｉ）第一のアミノ酸リンカー配列によって結合された候補エピトープペプチド、これに隣接する、ヒト天然Ｂ２Ｍペプチド配列と同一の配列を含むアミノ酸配列、これに隣接する第二のアミノ酸リンカー配列、これに隣接するＴ細胞調節ドメインペプチドを含み、（ｉ）が、１つまたは２つ以上のジスルフィド結合によって、（ｉｉ）ＭＨＣ重鎖の配列を有するアミノ酸配列、これに隣接する第三のアミノ酸リンカー、これに隣接する、免疫グロブリンＦｃドメインと同一のアミノ酸配列に結合されている、組み換えポリペプチド構築物を提供する。本開示は、それぞれの免疫グロブリンＦｃドメイン間の１つ以上のジスルフィド結合によって結合された該組み換えポリペプチド構築物のうちの２つを含むタンパク質を提供する。
本開示は、（ｉ）第一のアミノ酸リンカー配列に結合された候補エピトープペプチド、これに隣接する、ヒト天然Ｂ２Ｍペプチド配列と同一の配列を含むアミノ酸配列を含み、（ｉ）が、１つまたは２つ以上のジスルフィド結合によって、（ｉｉ）Ｔ細胞調節ドメインペプチド、これに隣接する第二のアミノ酸リンカー配列、これに隣接する、ＭＨＣ重鎖の配列を有するアミノ酸配列、これに隣接する第三のアミノ酸リンカー配列、これに隣接する、免疫グロブリンＦｃドメインと同一のアミノ酸配列に結合されている、組み換えポリペプチド構築物を提供する。本開示は、それぞれの免疫グロブリンＦｃドメイン間の１つ以上のジスルフィド結合によって結合された該組み換えポリペプチド構築物のうちの２つを含むタンパク質を提供する。
本開示は、少なくとも第一のポリペプチド及び第二のポリペプチドを含む、多量体ポリペプチドであって、該第一のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）エピトープ；及びｉｉ）第一の主要組織適合複合体（ＭＨＣ）ポリペプチドを含み；該第二のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）第二のＭＨＣポリペプチド；及びｉｉ）免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドを含み、該第一のポリペプチドのＣ末端または該第二のポリペプチドのＮ末端に免疫調節ドメインを含む、多量体ポリペプチドを提供する。本開示は、該多量体ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸を提供する。本開示は、該核酸を含む組み換え発現ベクターを提供する。本開示は、本開示の核酸または本開示の組み換え発現ベクターによって遺伝子改変された宿主細胞を提供する。本開示は、薬学的組成物を含み、該多量体ポリペプチドを含む、組成物を提供する。本開示は、本開示の多量体ポリペプチドと該Ｔ細胞を接触させる段階を含む、Ｔ細胞活性を調節する方法を提供する。本開示は、有効量の本開示の多量体ポリペプチドを、それを必要とする個体に投与する段階を含む治療方法を提供する。本開示は、本開示の多量体ポリペプチドまたは本開示の多量体ポリペプチドを含む組成物（例えば、薬学的組成物）を含む、容器を提供する。
本開示は、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）エピトープ；及びｉｉ）第一のＭＨＣポリペプチドを含む第一のポリペプチド；並びにｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）免疫調節ドメイン；ｉｉｉ）第二のＭＨＣポリペプチド；及びｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む第二のポリペプチドを含む多量体ポリペプチドを提供する。本開示は、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）エピトープ；ｉｉ）第一のＭＨＣポリペプチド；及びｉｉｉ）免疫調節ドメインを含む第一のポリペプチド；並びにｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）第二のＭＨＣポリペプチド；及びｉｉ）免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドを含む第二のポリペプチドを含む多量体ポリペプチドを提供する。いくつかの場合、該第一のＭＨＣポリペプチドは、β２ミクログロブリンポリペプチドであり；かつ該第二のＭＨＣポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドである。いくつかの場合、該β２ミクログロブリンポリペプチドは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４に示すアミノ酸配列に対する少なくとも８５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合、該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、ＨＬＡ−Ａ、ＨＬＡ−Ｂ、またはＨＬＡ−Ｃの重鎖である。いくつかの場合、該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５に示すアミノ酸配列に対する少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合、該第一のＭＨＣポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα鎖ポリペプチドであり；かつ該第二のＭＨＣポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ鎖ポリペプチドである。いくつかの場合、該エピトープは、Ｔ細胞エピトープである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチド、ＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチド、ＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチド、ＩｇＧ４ Ｆｃポリペプチド、ＩｇＡ Ｆｃポリペプチド、またはＩｇＭ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、図２４Ａ〜２４Ｃに示すアミノ酸配列に対する少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、非共有結合的に会合している。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、共有結合的に連結されている。いくつかの場合、該共有結合はジスルフィド結合による。いくつかの場合、該第一のＭＨＣポリペプチド、または該エピトープと該第一のＭＨＣポリペプチドとの間のリンカーは第一のＣｙｓ残基を提供するためのアミノ酸置換を含みかつ該第二のＭＨＣポリペプチドは第二のＣｙｓ残基を提供するためのアミノ酸置換を含み、かつ該ジスルフィド結合は該第一Ｃｙｓ残基と該第二のＣｙｓ残基と間に存在する。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、該エピトープと該第一のＭＨＣポリペプチドとの間に挿入された第一のリンカーを含む。いくつかの場合、該免疫調節ポリペプチドは、４−１ＢＢＬポリペプチド、Ｂ７−１ポリペプチド、Ｂ７−２ポリペプチド、ＩＣＯＳ−Ｌポリペプチド、ＯＸ−４０Ｌポリペプチド、ＣＤ８０ポリペプチド、ＣＤ８６ポリペプチド、ＰＤ−Ｌ１ポリペプチド、ＦａｓＬポリペプチド、及びＰＤ−Ｌ２ポリペプチドから選択される。いくつかの場合、該第一のポリペプチドまたは該第二のポリペプチドは、２つ以上の免疫調節ポリペプチドを含む。いくつかの場合、該２つ以上の免疫調節ポリペプチドは、タンデムになっている。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、第三のポリペプチドを含み、該第三のポリペプチドは、該第一のポリペプチドの該免疫調節ポリペプチドに対する少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む免疫調節ポリペプチドを含む。いくつかの場合、該第三のポリペプチドは、該第一のポリペプチドに共有結合的に連結されている。いくつかの場合、該第二のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）該第二のＭＨＣポリペプチド；ｉｉ）該免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチド；及びｉｉｉ）親和性タグを含む。
本開示は、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）エピトープ；ｉｉ）第一のＭＨＣポリペプチドを含む第一のポリペプチド；並びにｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）第二のＭＨＣポリペプチド；及びｉｉ）任意でＩｇ Ｆｃポリペプチドまたは非Ｉｇ骨格を含む第二のポリペプチドを含む多量体ポリペプチドを提供し、該多量体ポリペプチドは任意で免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドまたは非Ｉｇ骨格を含み、該多量体ポリペプチドは１つ以上の免疫調節ドメインを含み、該１つ以上の免疫調節ドメインは、Ａ）該第一のポリペプチドのＣ末端に；Ｂ）該第二のポリペプチドのＮ末端に；Ｃ）該第二のポリペプチドのＣ末端に；またはＤ）該第一ポリペプチドのＣ末端及び該第二のポリペプチドのＮ末端に存在する。いくつかの場合、多量体ポリペプチドは、単一の免疫調節ポリペプチドを含む。いくつかの場合、多量体ポリペプチドは、２つの免疫調節ポリペプチド（例えば、同じ免疫調節ポリペプチドの２つのコピー）を含む。いくつかの場合、多量体ポリペプチドは、３つの免疫調節ポリペプチド（例えば、同じ免疫調節ポリペプチドの３つのコピー）を含む。いくつかの場合、多量体ポリペプチドは、４つの免疫調節ポリペプチド（例えば、同じ免疫調節ポリペプチドの４つのコピー）を含む。いくつかの場合、多量体ポリペプチドは、単一の免疫調節ポリペプチドを含む。いくつかの場合、多量体ポリペプチドは、２つの免疫調節ポリペプチド（例えば、同じ免疫調節ポリペプチドの２つのコピー）を含む。いくつかの場合、多量体ポリペプチドは、３つの免疫調節ポリペプチド（例えば、同じ免疫調節ポリペプチドの３つのコピー）を含む。いくつかの場合、多量体ポリペプチドは、４つの免疫調節ポリペプチド（例えば、同じ免疫調節ポリペプチドの４つのコピー）を含む。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）エピトープ；ｉｉ）第一のＭＨＣポリペプチド；及びｉｉｉ）免疫調節ドメインを含む第一のポリペプチド；並びにｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）第二のＭＨＣポリペプチド；及びｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む第二のポリペプチドを含む。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）エピトープ；及びｉｉ）第一のＭＨＣポリペプチドを含む第一のポリペプチド；並びにｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）免疫調節ドメイン；ｉｉｉ）第二のＭＨＣポリペプチド；及びｉｉ）免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドを含む第二のポリペプチドを含む。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）エピトープ；及びｉｉ）第一のＭＨＣポリペプチドを含む第一のポリペプチド；並びにｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）第二のＭＨＣポリペプチド；及びｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド；及びｉｉｉ）免疫調節ドメインを含む第二のポリペプチドを含む。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）エピトープ；及びｉｉ）第一のＭＨＣポリペプチドを含む第一のポリペプチド；並びにｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）第二のＭＨＣポリペプチド；及びｉｉ）免疫調節ドメインを含む第二のポリペプチドを含む。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）エピトープ；及びｉｉ）第一のＭＨＣポリペプチドを含む第一のポリペプチド；並びにｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）免疫調節ドメイン；及びｉｉ）第二のＭＨＣポリペプチドを含む第二のポリペプチドを含む。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）エピトープ；ｉｉ）第一のＭＨＣポリペプチド；及びｉｉｉ）免疫調節ドメインを含む第一のポリペプチド；並びにｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）第二のＭＨＣポリペプチドを含む第二のポリペプチドを含む。いくつかの場合、該非Ｉｇ骨格は、ＸＴＥＮポリペプチド、トランスフェリンポリペプチド、Ｆｃ受容体ポリペプチド、エラスチン様ポリペプチド、シルク様ポリペプチド、またはシルクエラスチン様ポリペプチドである。いくつかの場合、該第一のＭＨＣポリペプチドは、β２ミクログロブリンポリペプチドであり；かつ該第二のＭＨＣポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドである。いくつかの場合、該β２ミクログロブリンポリペプチドは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４に示すアミノ酸配列に対する少なくとも８５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合、該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、ＨＬＡ−Ａ、ＨＬＡ−Ｂ、またはＨＬＡ−Ｃの重鎖である。いくつかの場合、該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５に示すアミノ酸配列に対する少なくとも８５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合、該第一のＭＨＣポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα鎖ポリペプチドであり；かつ該第二のＭＨＣポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ鎖ポリペプチドである。いくつかの場合、該エピトープは、Ｔ細胞エピトープである。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、Ｆｃポリペプチドを含み、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチド、ＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチド、ＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチド、ＩｇＧ４ Ｆｃポリペプチド、ＩｇＡ Ｆｃポリペプチド、またはＩｇＭ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、図２４Ａ〜２４Ｃに示すアミノ酸配列に対する少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、または少なくとも１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、非共有結合的に会合している。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、共有結合的に連結されている。いくつかの場合、該共有結合はジスルフィド結合による。いくつかの場合、該第一のＭＨＣポリペプチド、または該エピトープと該第一のＭＨＣポリペプチドとの間のリンカー、第一のＣｙｓ残基を提供するためのアミノ酸置換を含みかつ該第二のＭＨＣポリペプチドは第二のＣｙｓ残基を提供するためのアミノ酸置換を含み、かつ該ジスルフィド結合は該第一のＣｙｓ残基と該第二のＣｙｓ残基との間に存在する。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、該エピトープと該第一のＭＨＣポリペプチドとの間に挿入された第一のリンカーを含む。いくつかの場合、該免疫調節ポリペプチドは、４−１ＢＢＬポリペプチド、Ｂ７−１ポリペプチド、Ｂ７−２ポリペプチド、ＩＣＯＳ−Ｌポリペプチド、ＯＸ−４０Ｌポリペプチド、ＣＤ８０ポリペプチド、ＣＤ８６ポリペプチド、ＰＤ−Ｌ１ポリペプチド、ＦａｓＬポリペプチド、及びＰＤ−Ｌ２ポリペプチドから選択される。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、２つ以上の免疫調節ポリペプチドを含む。いくつかの場合、該２つ以上の免疫調節ポリペプチドは、タンデムになっている。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、第三のポリペプチドを含み、該第三のポリペプチドは、該第一のポリペプチドまたは該第二のポリペプチドの該免疫調節ポリペプチドに対する少なくとも９０％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む免疫調節ポリペプチドを含む。いくつかの場合、該第三のポリペプチドは、該第一のポリペプチドに共有結合的に連結されている。いくつかの場合、該第二のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）該第二のＭＨＣポリペプチド：ｉｉ）該Ｉｇ Ｆｃポリペプチド；及びｉｉｉ）親和性タグを含む。
本開示は、本開示の多量体ポリペプチドのポリペプチド鎖をコードするヌクレオチド配列を含む核酸を提供し；いくつかの場合、該核酸は、組み換え発現ベクター内に存在する。本開示は、組み換えポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸を提供し、ｉ）該組み換えポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順にａ）エピトープ；ｂ）第一のＭＨＣポリペプチド；ｃ）免疫調節ポリペプチド；ｄ）タンパク質分解的に開裂可能なリンカー、もしくはリボソームスキッピングシグナル；ｅ）第二のＭＨＣポリペプチド；及びｆ）免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドもしくは非Ｉｇ系骨格を含むか；またはｉｉ）該組み換えポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順にａ）エピトープ；ｂ）第一のＭＨＣポリペプチド；ｃ）タンパク質分解的に開裂可能なリンカー、もしくはリボソームスキッピングシグナル；ｄ）免疫調節ポリペプチド；ｅ）第二のＭＨＣポリペプチド；及びｆ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドもしくは非Ｉｇ系骨格を含む。いくつかの場合、該第一のＭＨＣポリペプチドは、β２ミクログロブリンポリペプチドであり；かつ該第二のＭＨＣポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドである。いくつかの場合、該β２ミクログロブリンポリペプチドは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４に示すアミノ酸配列に対する少なくとも８５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合、該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、ＨＬＡ−Ａ、ＨＬＡ−Ｂ、またはＨＬＡ−Ｃの重鎖である。いくつかの場合、該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５に示すアミノ酸配列に対する少なくとも８５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合、該第一のＭＨＣポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα鎖ポリペプチドであり；かつ該第二のＭＨＣポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ鎖ポリペプチドである。いくつかの場合、該エピトープは、Ｔ細胞エピトープである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチド、ＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチド、ＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチド、ＩｇＧ４ Ｆｃポリペプチド、ＩｇＡ Ｆｃポリペプチド、またはＩｇＭ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、図２４Ａ〜２４Ｃに示すアミノ酸配列に対する少なくとも８５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合、該免疫調節ポリペプチドは、４−１ＢＢＬポリペプチド、Ｂ７−１ポリペプチド、Ｂ７−２ポリペプチド、ＩＣＯＳ−Ｌポリペプチド、ＯＸ−４０Ｌポリペプチド、ＣＤ８０ポリペプチド、ＣＤ８６ポリペプチド、ＰＤ−Ｌ１ポリペプチド、ＦａｓＬポリペプチド、及びＰＤ−Ｌ２ポリペプチドから選択される。いくつかの場合、該免疫調節ポリペプチドは、ＣＤ７、ＣＤ３０Ｌ、ＣＤ４０、ＣＤ７０、ＣＤ８３、ＨＬＡ−Ｇ、ＭＩＣＡ、ＭＩＣＢ、ＨＶＥＭ、リンホトキシンβ受容体、３／ＴＲ６、ＩＬＴ３、ＩＬＴ４、及びＨＶＥＭから選択される。いくつかの場合、該タンパク質分解的に開裂可能なリンカー、またはリボソームスキッピングシグナルは、
Figure 0006652680
から選択されるアミノ酸配列を含む。いくつかの場合、該組み換えポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順にａ）第一のリーダーペプチド；ｂ）該エピトープ；ｃ）該第一のＭＨＣポリペプチド；ｄ）該免疫調節ポリペプチド；ｅ）該タンパク質分解的に開裂可能なリンカー、またはリボソームスキッピングシグナル；ｆ）第二のリーダーペプチド；ｇ）該第二のＭＨＣポリペプチド；及びｈ）該免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドを含む。いくつかの場合、該第一のリーダーペプチド及び該第二のリーダーペプチドは、β２−Ｍリーダーペプチドである。いくつかの場合、該ヌクレオチド配列は、転写調節因子に作動可能に連結されている。いくつかの場合、該転写調節因子は真核細胞中で機能的であるプロモーターである。いくつかの場合、該第一のＭＨＣポリペプチド、または該エピトープと該第一のＭＨＣポリペプチドとの間のリンカーは第一のＣｙｓ残基を提供するためのアミノ酸置換を含みかつ該第二のＭＨＣポリペプチドは第二のＣｙｓ残基を提供するためのアミノ酸置換を含み、かつ該第一のＣｙｓ残基及び該第二のＣｙｓ残基は、該第一のＭＨＣポリペプチドと該第二のＭＨＣポリペプチドとの間にジスルフィド結合を提供する。本開示は、上述または本明細書の他の場所に記載の核酸のいずれか１つを含む組み換え発現ベクターを提供する。いくつかの場合、該組み換え発現ベクターは、ウイルスベクターである。いくつかの場合、該組み換え発現ベクターは、非ウイルスベクターである。本開示は、上述または本開示の他の場所に記載の組み換え発現ベクターによって遺伝子改変された宿主細胞を提供する。いくつかの場合、該宿主細胞はインビトロである。いくつかの場合、該宿主細胞は、該細胞が内因性ＭＨＣβ２ミクログロブリンポリペプチドを産生しないように遺伝子改変される。いくつかの場合、該宿主細胞はＴリンパ球である。
本開示は、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）エピトープ；ｉｉ）第一のＭＨＣポリペプチド；及びｉｉｉ）免疫調節ドメインを含む第一のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む第一の核酸；並びにｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）第二のＭＨＣポリペプチド；及びｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドまたは非Ｉｇ系骨格を含む第二のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む第一の核酸を含む、組成物を提供する。本開示は、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）エピトープ；及びｉｉ）第一のＭＨＣポリペプチドを含む第一のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む第一の核酸；並びにｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）免疫調節ドメイン；ｉｉ）第二のＭＨＣポリペプチド；及びｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む第二のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む第一の核酸を含む、組成物を提供する。いくつかの場合、該第一の核酸及び／または該第二の核酸は、組み換え発現ベクター内に存在する。本開示は、上述または本開示の他の場所に記載の核酸組成物によって遺伝子改変された宿主細胞を提供する。
本開示は、上述または本開示の他の場所に記載の多量体ポリペプチドを産生する方法であって；ａ）該宿主細胞が該多量体ポリペプチドを合成するような条件下で、上述または本開示の他の場所に記載の宿主細胞を培地中のインビトロで培養する段階；ならびにｂ）該宿主細胞から及び／または該培地から該多量体ポリペプチドを単離する段階を含む、方法を提供する。いくつかの場合、該第二のポリペプチドは親和性タグを含み、かつ、該単離する段階は、該細胞によって産生された該多量体ポリペプチドを該親和性タグの結合パートナーと接触させることを含み、ここで、該結合パートナーは固定化されており、それによって該多量体ポリペプチドを固定化する。いくつかの場合、本方法は該固定化された多量体ポリペプチドを溶出する段階を含む。
本開示は、エピトープ特異的Ｔ細胞の活性を選択的に調節する方法であって、該Ｔ細胞を、上述または本開示の他の場所に記載の多量体ポリペプチドと接触させる段階を含み、該接触させる段階が、該エピトープ特異的Ｔ細胞の活性を選択的に調節する、方法を提供する。いくつかの場合、該免疫調節ポリペプチドは活性化ポリペプチドであり、かつ該多量体ポリペプチドは該エピトープ特異的Ｔ細胞を活性化する。いくつかの場合、該免疫調節ポリペプチドは、阻害性ポリペプチドであり、かつ該多量体ポリペプチドは該エピトープ特異的Ｔ細胞を阻害する。いくつかの場合、該接触させる段階はインビトロで行われる。いくつかの場合、該接触させる段階はインビボで行われる。
本開示は、個体におけるエピトープ特異的Ｔ細胞の活性を選択的に調節する方法であって、該個体に、個体におけるエピトープ特異的Ｔ細胞の活性を選択的に調節するのに有効な上述または本開示の他の場所に記載の効果的な多量体ポリペプチドの有効量を投与する段階を含む、方法を提供する。いくつかの場合、該免疫調節ポリペプチドは、活性化ポリペプチドであり、該多量体ポリペプチドは該エピトープ特異的Ｔ細胞を活性化する。いくつかの場合、該エピトープはがん関連エピトープであり、該投与する段階は、該がん関連エピトープに特異的なＴ細胞の活性を選択的に増大させる。いくつかの場合、該免疫調節ポリペプチドは、阻害性ポリペプチドであり、該多量体ポリペプチドは該エピトープ特異的Ｔ細胞の活性を阻害する。いくつかの場合、該エピトープは自己エピトープであり、該投与する段階は、該自己エピトープに特異的なＴ細胞の活性を選択的に阻害する。
本開示は、個体における感染症を治療する方法であって、該個体に、有効量のａ）上述もしくは本開示の他の場所に記載の多量体ポリペプチド；またはｂ）該多量体ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む１つ以上の組み換え発現ベクター；もしくはｃ）該多量体ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む１つ以上のｍＲＮＡを投与する段階を含み、該エピトープが病原体関連エピトープであり、該免疫調節ポリペプチドが活性化ポリペプチドであり、該投与する段階が、個体において病原体関連エピトープ特異的Ｔ細胞の活性を選択的に調節するのに有効である、方法を提供する。いくつかの場合、該病原体は、ウイルス、細菌、または原生動物である。いくつかの場合、該投与する段階は皮下投与である（すなわち、該投与する段階は皮下投与で行われる）。いくつかの場合、該投与する段階は静脈内投与である（すなわち、該投与する段階は静脈内投与で行われる）。いくつかの場合、該投与する段階は筋肉内投与である（すなわち、該投与する段階は筋肉内投与で行われる）。いくつかの場合、該投与する段階は全身投与である。いくつかの場合、該投与する段階は、治療部位に対して遠位の投与である（すなわち、該投与する段階は皮下投与で行われる）。該投与する段階は局所投与である（すなわち、該投与する段階は皮下投与で行われる）。該投与する段階は治療部位または治療部位近傍での投与である。
本開示は、ａ）上述または本開示の他の場所に記載の多量体ポリペプチド；及びｂ）薬学的に許容される賦形剤を含む組成物を提供する。
本開示は、ａ）上述もしくは本開示の他の場所に記載の核酸、または上述もしくは本明細書の他の場所に記載の組み換え発現ベクター；及びｂ）薬学的に許容される賦形剤を含む組成物を提供する。
[本発明1001]
ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に
ｉ）エピトープ；
ｉｉ）第一の主要組織適合複合体（ＭＨＣ）ポリペプチド
を含む第一のポリペプチド、並びに
ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に
ｉ）第二のＭＨＣポリペプチド；及び
ｉｉ）任意で免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドまたは非Ｉｇ骨格
を含む第二のポリペプチド
を含み、
Ａ）前記第一のポリペプチドのＣ末端に；
Ｂ）前記第二のポリペプチドのＮ末端に；
Ｃ）前記第二のポリペプチドのＣ末端に；または
Ｄ）前記第一ポリペプチドのＣ末端及び前記第二のポリペプチドのＮ末端に
存在する1つ以上の免疫調節ドメインを含む、多量体ポリペプチド。
[本発明1002]
ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に
ｉ）エピトープ；
ｉｉ）第一のＭＨＣポリペプチド；及び
ｉｉｉ）免疫調節ドメイン
を含む第一のポリペプチド、並びに
ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に
ｉ）第二のＭＨＣポリペプチド；及び
ｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド
を含む第二のポリペプチド
を含む、本発明1001の多量体ポリペプチド。
[本発明1003]
ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に
ｉ）エピトープ；及び
ｉｉ）第一のＭＨＣポリペプチド
を含む第一のポリペプチド、並びに
ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に
ｉ）免疫調節ドメイン；
ｉｉｉ）第二のＭＨＣポリペプチド；及び
ｉｉ）免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチド
を含む第二のポリペプチド
を含む、本発明1001の多量体ポリペプチド。
[本発明1004]
ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に
ｉ）エピトープ；及び
ｉｉ）第一のＭＨＣポリペプチド
を含む第一のポリペプチド、並びに
ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に
ｉ）第二のＭＨＣポリペプチド；及び
ｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド；及び
ｉｉｉ）免疫調節ドメイン
を含む第二のポリペプチド
を含む、本発明1001の多量体ポリペプチド。
[本発明1005]
ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に
ｉ）エピトープ；及び
ｉｉ）第一のＭＨＣポリペプチド
を含む第一のポリペプチド、並びに
ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に
ｉ）第二のＭＨＣポリペプチド；及び
ｉｉ）免疫調節ドメイン
を含む第二のポリペプチド
を含む、本発明1001の多量体ポリペプチド。
[本発明1006]
ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に
ｉ）エピトープ；及び
ｉｉ）第一のＭＨＣポリペプチド
を含む第一のポリペプチド、並びに
ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に
ｉ）免疫調節ドメイン；及び
ｉｉ）第二のＭＨＣポリペプチド
を含む第二のポリペプチド
を含む、本発明1001の多量体ポリペプチド。
[本発明1007]
ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に
ｉ）エピトープ；
ｉｉ）第一のＭＨＣポリペプチド；及び
ｉｉｉ）免疫調節ドメイン
を含む第一のポリペプチド、並びに
ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に
ｉ）第二のＭＨＣポリペプチド
を含む第二のポリペプチド
を含む、本発明1001の多量体ポリペプチド。
[本発明1008]
前記非Ｉｇ骨格が、ＸＴＥＮポリペプチド、トランスフェリンポリペプチド、Ｆｃ受容体ポリペプチド、エラスチン様ポリペプチド、シルク様ポリペプチド、またはシルクエラスチン様ポリペプチドである、本発明1001の多量体ポリペプチド。
[本発明1009]
前記第一のＭＨＣポリペプチドがβ2ミクログロブリンポリペプチドであり；かつ前記第二のＭＨＣポリペプチドがＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドである、本発明1001から1008のいずれかの多量体ポリペプチド。
[本発明1010]
前記β2ミクログロブリンポリペプチドが、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：4に示すアミノ酸配列に対する少なくとも85％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、本発明1009の多量体ポリペプチド。
[本発明1011]
前記ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドが、ＨＬＡ−Ａ、ＨＬＡ−Ｂ、またはＨＬＡ−Ｃの重鎖である、本発明1008の多量体ポリペプチド。
[本発明1012]
前記ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドが、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：5に示すアミノ酸配列に対する少なくとも85％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、本発明1009の多量体ポリペプチド。
[本発明1013]
前記第一のＭＨＣポリペプチドが、ＭＨＣクラスＩＩα鎖ポリペプチドであり；かつ前記第二のＭＨＣポリペプチドが、ＭＨＣクラスＩＩβ鎖ポリペプチドである、本発明1001から1008のいずれかの多量体ポリペプチド。
[本発明1014]
前記エピトープがＴ細胞エピトープである、本発明1001から1008のいずれかの多量体ポリペプチド。
[本発明1015]
Ｆｃポリペプチドを含み、かつ、前記Ｉｇ Ｆｃポリペプチドが、ＩｇＧ1 Ｆｃポリペプチド、ＩｇＧ2 Ｆｃポリペプチド、ＩｇＧ3 Ｆｃポリペプチド、ＩｇＧ4 Ｆｃポリペプチド、ＩｇＡ Ｆｃポリペプチド、またはＩｇＭ Ｆｃポリペプチドである、本発明1001から1007のいずれかの多量体ポリペプチド。
[本発明1016]
前記Ｉｇ Ｆｃポリペプチドが、図24Ａ〜24Ｃに示すアミノ酸配列に対する少なくとも85％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、本発明1015の多量体ポリペプチド。
[本発明1017]
前記第一のポリペプチド及び前記第二のポリペプチドが非共有結合的に会合している、本発明1001から1008のいずれかの多量体ポリペプチド。
[本発明1018]
前記第一のポリペプチド及び前記第二のポリペプチドが共有結合的に連結されている、本発明1001から1008のいずれかの多量体ポリペプチド。
[本発明1019]
前記共有結合がジスルフィド結合による、本発明1013の多量体ポリペプチド。
[本発明1020]
前記第一のＭＨＣポリペプチド、または前記エピトープと前記第一のＭＨＣポリペプチドとの間のリンカーが、第一のＣｙｓ残基を提供するためのアミノ酸置換を含み、かつ前記第二のＭＨＣポリペプチドが、第二のＣｙｓ残基を提供するためのアミノ酸置換を含み、かつ、前記ジスルフィド結合が前記第一のＣｙｓ残基と前記第二のＣｙｓ残基との間に存在する、本発明1019の多量体ポリペプチド。
[本発明1021]
前記エピトープと前記第一のＭＨＣポリペプチドとの間に挿入された第一のリンカーを含む、本発明1001から1008のいずれかの多量体ポリペプチド。
[本発明1022]
前記免疫調節ポリペプチドが、4−1ＢＢＬポリペプチド、Ｂ7−1ポリペプチド、Ｂ7−2ポリペプチド、ＩＣＯＳ−Ｌポリペプチド、ＯＸ−40Ｌポリペプチド、ＣＤ80ポリペプチド、ＣＤ86ポリペプチド、ＰＤ−Ｌ1ポリペプチド、ＦａｓＬポリペプチド、及びＰＤ−Ｌ2ポリペプチドから選択される、本発明1001から1008のいずれかの多量体ポリペプチド。
[本発明1023]
2つ以上の免疫調節ポリペプチドを含む、本発明1001から1008のいずれかの多量体ポリペプチド。
[本発明1024]
前記2つ以上の免疫調節ポリペプチドがタンデムになっている、本発明1023の多量体ポリペプチド。
[本発明1025]
第三のポリペプチドを含み、前記第三のポリペプチドが、前記第一のポリペプチドまたは前記第二のポリペプチドの前記免疫調節ポリペプチドに対する少なくとも90％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む免疫調節ポリペプチドを含む、本発明1001から1008のいずれかの多量体ポリペプチド。
[本発明1026]
前記第三のポリペプチドが、前記第一のポリペプチドに共有結合的に連結されている、本発明1025の多量体ポリペプチド。
[本発明1027]
前記第二のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に
ｉ）前記第二のＭＨＣポリペプチド；
ｉｉ）前記Ｉｇ Ｆｃポリペプチド；及び
ｉｉｉ）親和性タグ
を含む、本発明1001から1007のいずれかの多量体ポリペプチド。
[本発明1028]
ｉ）組み換えポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に
ａ）エピトープ；
ｂ）第一の主要組織適合複合体（ＭＨＣ）ポリペプチド；
ｃ）免疫調節ポリペプチド；
ｄ）タンパク質分解的に開裂可能なリンカー、もしくはリボソームスキッピングシグナル；
ｅ）第二のＭＨＣポリペプチド；及び
ｆ）免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチド
を含むか、または
ｉｉ）前記組み換えポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に
ａ）エピトープ；
ｂ）第一のＭＨＣポリペプチド；
ｃ）タンパク質分解的に開裂可能なリンカー、もしくはリボソームスキッピングシグナル；
ｄ）免疫調節ポリペプチド；
ｅ）第二のＭＨＣポリペプチド；及び
ｆ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド
を含む、
前記組み換えポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸。
[本発明1029]
前記第一のＭＨＣポリペプチドがβ2ミクログロブリンポリペプチドであり；かつ前記第二のＭＨＣポリペプチドがＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドである、本発明1028の核酸。
[本発明1030]
前記β2ミクログロブリンポリペプチドが、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：4に示すアミノ酸配列に対する少なくとも85％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、本発明1029の核酸。
[本発明1031]
前記ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドが、ＨＬＡ−Ａ、ＨＬＡ−Ｂ、またはＨＬＡ−Ｃの重鎖である、本発明1028の核酸。
[本発明1032]
前記ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドが、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：5に示すアミノ酸配列に対する少なくとも85％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、本発明1031の核酸。
[本発明1033]
前記第一のＭＨＣポリペプチドがＭＨＣクラスＩＩα鎖ポリペプチドであり；かつ前記第二のＭＨＣポリペプチドがＭＨＣクラスＩＩβ鎖ポリペプチドである、本発明1028の核酸。
[本発明1034]
前記エピトープがＴ細胞エピトープである、本発明1028の核酸。
[本発明1035]
前記Ｉｇ Ｆｃポリペプチドが、ＩｇＧ1 Ｆｃポリペプチド、ＩｇＧ2 Ｆｃポリペプチド、ＩｇＧ3 Ｆｃポリペプチド、ＩｇＧ4 Ｆｃポリペプチド、ＩｇＡ Ｆｃポリペプチド、またはＩｇＭ Ｆｃポリペプチドである、本発明1028の核酸。
[本発明1036]
前記Ｉｇ Ｆｃポリペプチドが、図24Ａ〜24Ｃに示すアミノ酸配列に対する少なくとも85％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、本発明1035の核酸。
[本発明1037]
前記免疫調節ポリペプチドが、4−1ＢＢＬポリペプチド、Ｂ7−1ポリペプチド、Ｂ7−2ポリペプチド、ＩＣＯＳ−Ｌポリペプチド、ＯＸ−40Ｌポリペプチド、ＣＤ80ポリペプチド、ＣＤ86ポリペプチド、ＰＤ−Ｌ1ポリペプチド、ＦａｓＬポリペプチド、及びＰＤ−Ｌ2ポリペプチドから選択される、本発明1028の核酸。
[本発明1038]
前記免疫調節ポリペプチドが、ＣＤ7、ＣＤ30Ｌ、ＣＤ40、ＣＤ70、ＣＤ83、ＨＬＡ−Ｇ、ＭＩＣＡ、ＭＩＣＢ、ＨＶＥＭ、リンホトキシンβ受容体、3／ＴＲ6、ＩＬＴ3、ＩＬＴ4、及びＨＶＥＭから選択される、本発明1027の核酸。
[本発明1039]
前記タンパク質分解的に開裂可能なリンカーまたは前記リボソームスキッピングシグナルが、
Figure 0006652680
から選択されるアミノ酸配列を含む、本発明1028の核酸。
[本発明1040]
前記組み換えポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に
ａ）第一のリーダーペプチド；
ｂ）前記エピトープ；
ｃ）前記第一のＭＨＣポリペプチド；
ｄ）前記免疫調節ポリペプチド；
ｅ）前記タンパク質分解的に開裂可能なリンカーまたは前記リボソームスキッピングシグナル；
ｆ）第二のリーダーペプチド；
ｇ）前記第二のＭＨＣポリペプチド；及び
ｈ）前記免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチド
を含む、本発明1028の核酸。
[本発明1041]
前記第一のリーダーペプチド及び前記第二のリーダーペプチドがβ2−Ｍリーダーペプチドである、本発明1040の核酸。
[本発明1042]
前記ヌクレオチド配列が転写調節因子に作動可能に連結されている、本発明1028の核酸。
[本発明1043]
前記転写調節因子が、真核細胞中で機能的であるプロモーターである、本発明1042の核酸。
[本発明1044]
前記第一のＭＨＣポリペプチド、または前記エピトープと前記第一のＭＨＣポリペプチドとの間のリンカーが、第一のＣｙｓ残基を提供するためのアミノ酸置換を含み、かつ前記第二のＭＨＣポリペプチドが、第二のＣｙｓ残基を提供するためのアミノ酸置換を含み、かつ、前記第一のＣｙｓ残基及び前記第二のＣｙｓ残基が、前記第一のＭＨＣポリペプチドと前記第二のＭＨＣポリペプチドとの間にジスルフィド結合を提供する、本発明1028の核酸。
[本発明1045]
本発明1028から1044のいずれかの核酸を含む、組み換え発現ベクター。
[本発明1046]
ウイルスベクターまたは非ウイルスベクターである、本発明1045の組み換え発現ベクター。
[本発明1047]
本発明1045の組み換え発現ベクターによって遺伝子改変された宿主細胞。
[本発明1048]
インビトロである、本発明1047の宿主細胞。
[本発明1049]
内因性ＭＨＣβ2ミクログロブリンポリペプチドを産生しないように遺伝子改変されている、本発明1047の宿主細胞。
[本発明1050]
Ｔリンパ球である、本発明1047の宿主細胞。
[本発明1051]
ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に
ｉ）エピトープ；
ｉｉ）第一のＭＨＣポリペプチド；及び
ｉｉｉ）免疫調節ドメイン
を含む第一のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む第一の核酸；並びに
ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に
ｉ）第二のＭＨＣポリペプチド；及び
ｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド
を含む第二のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む第一の核酸
を含む、組成物。
[本発明1051]
ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に
ｉ）エピトープ；及び
ｉｉ）第一のＭＨＣポリペプチド
を含む第一のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む第一の核酸；並びに
ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に
ｉ）免疫調節ドメイン
ｉｉ）第二のＭＨＣポリペプチド；及び
ｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド
を含む第二のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む第一の核酸
を含む、組成物。
[本発明1053]
前記第一の核酸及び／または前記第二の核酸が組み換え発現ベクター内に存在する、本発明1051または1052の組成物。
[本発明1054]
本発明1051から1053のいずれかの組成物によって遺伝子改変された宿主細胞。
[本発明1055]
ａ）47または54の宿主細胞が本発明1001の多量体ポリペプチドを合成するような条件下で、前記宿主細胞を培地中のインビトロで培養する段階；ならびに
ｂ）前記宿主細胞から及び／または前記培地から前記多量体ポリペプチドを単離する段階
を含む、前記多量体ポリペプチドを産生する方法。
[本発明1056]
前記第二のポリペプチドが親和性タグを含み、かつ、前記単離する段階が、前記細胞によって産生された前記多量体ポリペプチドを前記親和性タグの結合パートナーと接触させることを含み、ここで前記結合パートナーが固定化されており、それによって前記多量体ポリペプチドを固定化する、本発明1055の方法。
[本発明1057]
固定化された前記多量体ポリペプチドを溶出する段階を含む、本発明1055の方法。
[本発明1058]
エピトープ特異的Ｔ細胞の活性を選択的に調節する方法であって、前記Ｔ細胞を、本発明1001の多量体ポリペプチドと接触させる段階を含み、前記接触させる段階が、前記エピトープ特異的Ｔ細胞の活性を選択的に調節する、方法。
[本発明1059]
前記免疫調節ポリペプチドが活性化ポリペプチドであり、かつ前記多量体ポリペプチドが前記エピトープ特異的Ｔ細胞を活性化する、本発明1058の方法。
[本発明1060]
前記免疫調節ポリペプチドが阻害ポリペプチドであり、かつ前記多量体ポリペプチドが前記エピトープ特異的Ｔ細胞を阻害する、本発明1058の方法。
[本発明1061]
前記接触させる段階がインビトロである、本発明1058の方法。
[本発明1062]
前記接触させる段階がインビボである、本発明1058の方法。
[本発明1063]
個体におけるエピトープ特異的Ｔ細胞の活性を選択的に調節する方法であって、前記個体に、個体におけるエピトープ特異的Ｔ細胞の活性を選択的に調節するのに有効な本発明1001の多量体ポリペプチドの有効量を投与する段階を含む、方法。
[本発明1064]
前記免疫調節ポリペプチドが活性化ポリペプチドであり、かつ前記多量体ポリペプチドが前記エピトープ特異的Ｔ細胞を活性化する、本発明1063の方法。
[本発明1065]
前記エピトープががん関連エピトープであり、かつ前記投与する段階が、前記がん関連エピトープに特異的なＴ細胞の活性を選択的に増大させる、本発明1064の方法。
[本発明1066]
前記免疫調節ポリペプチドが阻害性ポリペプチドであり、かつ前記多量体ポリペプチドが前記エピトープ特異的Ｔ細胞の活性を阻害する、本発明1063の方法。
[本発明1067]
前記エピトープが自己エピトープであり、かつ前記投与する段階が、前記自己エピトープに特異的なＴ細胞の活性を選択的に阻害する、本発明1066の方法。
[本発明1068]
個体における感染症を治療する方法であって、前記個体に、有効量の
ａ）本発明1001の多量体ポリペプチド；または
ｂ）本発明1001の多量体ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む1つ以上の組み換え発現ベクター；もしくは
ｃ）本発明1001の多量体ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む1つ以上のｍＲＮＡ
を投与する段階を含み、
前記エピトープが病原体関連エピトープであり、前記免疫調節ポリペプチドが活性化ポリペプチドであり、かつ前記投与する段階が、個体において病原体関連エピトープ特異的Ｔ細胞の活性を選択的に調節するのに有効である、方法。
[本発明1069]
前記病原体がウイルス、細菌、または原生動物である、本発明1068の方法。
[本発明1070]
前記投与する段階が皮下投与である、本発明1063から1068のいずれかの方法。
[本発明1071]
前記投与する段階が静脈内投与である、本発明1063から1068のいずれかの方法。
[本発明1072]
前記投与する段階が筋肉内投与である、本発明1063から1068のいずれかの方法。
[本発明1073]
前記投与する段階が全身投与である、本発明1063から1068のいずれかの方法。
[本発明1074]
前記投与する段階が治療部位に対して遠位の投与である、本発明1063から1068のいずれかの方法。
[本発明1075]
前記投与する段階が局所投与である、本発明1063から1068のいずれかの方法。
[本発明1076]
前記投与する段階が治療部位または治療部位近傍での投与である、本発明1063から1068のいずれかの方法。
[本発明1077]
ａ）本発明1001から1027のいずれかの多量体ポリペプチド；及び
ｂ）薬学的に許容される賦形剤
を含む組成物。
[本発明1078]
ａ）本発明1028から1034のいずれかの核酸、または本発明1045もしくは1046の組み換え発現ベクター；及び
ｂ）薬学的に許容される賦形剤
を含む組成物。
ｓｙｎＴａｃ：Ｔ細胞活性化用の人工免疫学的シナプスである。パネルの左側は従来のＴ細胞活性化のための２シグナル仮説を示す。すなわち、Ｔ細胞と抗原提示細胞（ＡＰＣ）間の独自のＴＣＲ：ＭＨＣ−エピトープ相互作用を介した標的Ｔ細胞の結合と、それに続く共刺激分子の結合を介した刺激または阻害である。中央のパネルは、ｓｙｎＴａｃ分子の略図であり、ｓｙｎＴａｃに対する作用機序（右）へと続く。天然の応答（左）と類似して、ｓｙｎＴａｃ融合タンパク質は、ＭＨＣ−エピトープを介した高度に特異的な細胞の標的化を可能にする。これに続くのはＴ細胞調節ドメイン（「ＭＯＤ」）であり、これは共刺激分子の結合を介して作用し、活性化または阻害のどちらかをもたらすことができる。これは、Ｔ細胞全体ではなくクローン性の応答を誘発する。特に、ＭＯＤは、任意の既知のまたは認可された抗体、抗体フラグメント、共刺激分子、もしくは文献で確認された他のペイロード（サイトカイン、毒素等）ならびに新規なものでありうる。 図２Ａ〜２Ｃは、ｓｙｎＴａｃのＦｃ融合構築物である。１つのストラテジーでは、Ｆｃ融合構築物を用いて関連生成物の結合価、安定性、及び治療域を増大させる。簡潔に言えば、Ｆｃ領域は天然の共有結合ホモ２量体であり、２つの同一の免疫グロブリンＣＨ２−ＣＨ３ドメイン（Ｆｃと呼ばれる）の相互作用によって形成され、２つの細い線で示すＣＨ２ドメイン間の２つのジスルフィド結合によって安定化される。図２Ａは、ＩｇＧのＦｃ領域にカルボキシル末端で連結された一本鎖ペプチドのＭＨＣタンパク質を示す。代替タンパク質（ＭＯＤ等）連結を導入するため、この構築物は、それぞれの重鎖及び軽鎖に分割され、ペプチド及びタンパク質の両方を別々の末端に融合させる。１つの構築物、すなわち、図２Ｂは、軽鎖（β２ミクログロブリン、Ｂ２Ｍ）への該ペプチドのアミノ末端結合と、それに続くＭＯＤエフェクター分子への該軽鎖のカルボキシル末端延長をもたらす。このシナリオでは、重鎖（ＨＬＡ分子、ＨＣ）がＦｃ領域に融合される。構築物はジスルフィド架橋（Ｓ−Ｓと表示される）を介して共有結合的にくっついている。別の配向、すなわち、図２Ｃは、該ＭＯＤをＦｃ融合重鎖のアミノ末端に付け、該ペプチドはＢ２Ｍの軽鎖に依然として連結されている。 図３Ａ〜３Ｂは、２つの基礎となるｓｙｎＴａｃ分子の全体的な構造設計である。この構築物は天然のヒトＢ２Ｍリーダー配列（ＬＥＡＤＥＲ）を用いて、効率的な分泌とＥＲプロセッシングを可能にし、直後に候補エピトープ（ＰＥＰＴＩＤＥと表示）が続く。軽鎖連結（ＬＣ、図３Ａ）については、これは、リンカーＬ１を介して天然Ｂ２Ｍ分子に、さらにリンカーＬ２を介してＭＯＤにつながれる。この全カセットは、別のＢ２Ｍリーダー配列、ＭＨＣの重鎖、及びＩｇＧ１のＦｃドメインに、ウイルスのブタテッショウウイルス‐１（Ｐ２Ａ）「自己開裂」ペプチドによって連結されて、各鎖の化学量論的発現を可能にする。重鎖（ＨＣ、図３Ｂ）連結は、同様であるが、ウイルスＰ２Ａペプチドがこの場合Ｂ２Ｍに続き、かつＭＯＤは第二のリーダーペプチドに続く。両方の構築物は、８ｘＨｉｓタグで終わる。 ＣＲＩＳＰＲ／ＣＡＳによる内因性β２ミクログロブリンのノックアウトである。ガイドＲＮＡは、内因性Ｂ２Ｍに対して設計し、ＣＲＩＳＰＲ／ＣＡＳをコードするプラスミドとともに導入し、３日間培養した。培養細胞をＢ２Ｍについて表面染色し、蛍光活性化細胞分類（ＦＡＣＳ）によって対抗選択（蛍光の損失で分類）した。分類した細胞を回復させ、さらに２回の染色、対抗分類、及び回復の巡回（全部で３回）に供し、有効なノックアウトを確実にした。最終的なプールは、上記したＦＡＣＳによるＢ２Ｍ表面発現を観察することで品質をチェックした。 図５Ａ〜５Ｂは、操作されたジスルフィド結合を有するｓｙｎＴａｃ構築物の生成及び活性試験である。高レベルの発現が１つの構築物（Ｈ２３６−Ｌ１２、ｓｙｎＴａｃ１８と表示）で、適度の発現が２番目（Ｈ２３７−Ｌ１２、ｓｙｎＴａｃ１７）で示された。ｄｔ−ＳＣＴジスルフィドスキーマを正の対照として用いる（ｓｙｎＴａｃ２と表示）。非還元ＰＡＧＥにより、高分子量、すなわちジスルフィド結合された部分が予想通り形成されたことが示唆された（図５Ａ）。すべての発現構築物を１００ｍｌ規模にスケールアップし、精製し、ＨＥＫ細胞表面で発現される同族ＴＣＲ（Ａ６と呼ばれる）の結合によって活性試験し、ＦＡＣＳ蛍光によって観察されるように、適切な折りたたみと活性が示唆された（図５Ｂ）。非同族ＴＣＲ（ＡＳ０１と呼ばれる）を発現する細胞は負の対照として用いた。 図６Ａ〜６Ｂは、各種ｓｙｎＴａｃタンパク質融合の発現である。（図６Ａ）軽鎖連結ｓｙｎＴａｃの各種標的化ペプチド及び、ＰＤ−Ｌ１のＭＯＤドメイン、特に１）ＨＴＬＶヒトＨＬＡ−Ａ０２、２）ＩＧＲＰマウスＨ２−Ｋｄ、及び３）ＴＵＭマウスＨ２−Ｋｄを有するＨＬＡアイソタイプとの融合、（図６Ｂ）各種ＭＯＤドメイン、すなわち４）ＰＤ−Ｌ１のＩｇ可変ドメイン、５）４−１ＢＢＬ、６）抗ＣＤ２８一本鎖Ｆｖ、及び７）Ｂ７−１Ｗ８８Ａを有するＩＧＲＰ系ｓｙｎＴａｃ融合、（図６Ｃ）各種ＭＯＤ、すなわち８）ＰＤ−Ｌ１及び９）抗ＣＤ２８一本鎖Ｆｖを有する重鎖連結として発現するＩＧＲＰ系ｓｙｎＴａｃ融合の発現の達成。 図７Ａ〜７Ｂは、ＴＣＲ−ｓｙｎＴａｃ−ＰＤ１架橋であり、ｓｙｎＴａｃタンパク質成分の完全性を検証する。同族ＴＣＲ（Ａ６）を発現するＨＥＫ細胞を正の対照として用い、また、非同族ＴＣＲ（ＡＳ０１）を発現する細胞を生成し、形質導入していない親細胞とともに負の対照として用いた。細胞に、非蛍光精製ＨＴＬＶ−ＰＤ−Ｌ１ｓｙｎＴａｃ変異体を負荷し、この細胞をマウスＩｇＧ２ａと融合したその同族受容体ＰＤ１とともに培養した。ＰＤ１−Ｆｃ融合は、ＦＩＴＣ標識抗マウス二次抗体を用いて検出した。反応の概略図を図７Ａに示し、ＦＡＣｓの結果を図７Ｂに示す。予想通り、共局在化蛍光は、ＰＤ−Ｌ１ＭＯＤを有するＨＴＬＶ提示ｓｙｎＴａｃが同族（Ａ６）ＨＥＫ細胞株に対して投与された場合に観察されたのみであった。注目すべきは、非同族ＴＣＲを有するＨＥＫ細胞または親細胞に対して投与した場合、すなわち、ＦＩＴＣ−ＰＤ１−Ｆｃのみに対して投与した場合、もしくはＭＯＤが存在しなかった場合に、これは観察されなかった。 図８Ａ〜８Ｄは、作用時のｓｙｎＴａｃ：インビトロＴ細胞アッセイである。８．３トランスジェニックＮＯＤマウス由来のＣＤ８＋Ｔ細胞を固定化抗ＣＤ３抗体の存在下で培養し、ポリクローナルＴ細胞活性化を刺激した。刺激された培養物は、可溶性型のｓｙｎＴａｃ ＴＵＭ−ＰＤ−Ｌ１（図８Ａ）またはｓｙｎＴａｃ ＩＧＲＰ−ＰＤ−Ｌ１（図８Ｃ）のどちらかで処理し、任意の抑制効果の抗原特異性を調べた。ＰＤ−Ｌ１のないｓｙｎＴａｃ ＩＧＲＰ型（図８Ｂ）は、ＭＯＤドメインに対するエフェクターの対照としての役割を果たした。播種の前に、Ｔ細胞活性化で誘導される細胞増殖の程度を観察するためにカルボキシフルオレセインスクシンイミジルエステル（ＣＦＳＥ）で細胞を標識化した。細胞は５日目に採取し、フローサイトメトリーを用いて生存率と増殖を調べた。上清もまた、ＣＤ８＋Ｔ細胞エフェクターサイトカインのＩＦＮγ及びＴＮＦαの発現について、多重化フローサイトメトリービーズアッセイを用いて調べた。調べたすべてのＣＤ８＋Ｔ細胞活性化パラメータは、抗原特異的かつエフェクター（すなわち、ＭＯＤ）ドメイン依存的に抑制された（図８Ｄ）。 図９ＡはｓｙｎＴａｃポリペプチドのアミノ酸配列及びドメイン構造を示す。 図９ＢはｓｙｎＴａｃポリペプチドのアミノ酸配列及びドメイン構造を示す。 図９ＣはｓｙｎＴａｃポリペプチドのアミノ酸配列及びドメイン構造を示す。 図９ＤはｓｙｎＴａｃポリペプチドのアミノ酸配列及びドメイン構造を示す。 図９ＥはｓｙｎＴａｃポリペプチドのアミノ酸配列及びドメイン構造を示す。 図９ＦはｓｙｎＴａｃポリペプチドのアミノ酸配列及びドメイン構造を示す。 図１０Ａ〜１０Ｃは、４−１ＢＢＬ３量体発現のための構築物を示す。（図１０Ａ）膜近位（Ｍｅｍｂ Ｐｒｏｘ、ＭＰ）及びＴＮＦ相同（ＴＮＦ−Ｈ）ドメインを示す天然４−１ＢＢＬ外部ドメイン（残基５０〜２５４）の単量体型、（図１０Ｂ）４−１ＢＢＬ２量体ｓｙｎＴａｃ、及び（図１０Ｃ）従来型のｓｙｎＴａｃ構築物と、親和性タグを持たない４−１ＢＢＬ外部ドメイン（残基５０〜２５４、図１０Ａ）の「遊離」型の共発現によって生成される４−１ＢＢＬｓｙｎＴａｃの完全活性二重３量体型の素描表現。すべての構築物は、哺乳類の細胞でともに発現される時に集合する。精製はＦｃ領域（プロテインＡ／Ｇ）を通過し、その後サイズ排除が続き、遊離のＢＢＬから４−１ＢＢＬ３量体ｓｙｎＴａｃの分離を可能にする。 図１１Ａ〜１１Ｂは、ｓｙｎＴａｃタンパク質を有する３量体４−１ＢＢＬの多角度光散乱（ＭＡＬＳ）分析である。（図１１Ａ）複数の独立した測定の例を示すＭＡＬＳで特定された主要な種類の分子量。（図１１Ｂ）比較的高レベルの光散乱及び低ＵＶ吸収のｓｙｎＴａｃ４０＋５１のＭＡＬＳからの代表的トレースであり、少量の高分子量タンパク質の存在を反映している。低分子量の緩衝剤成分は、ＵＶ吸光度の変化を伴わずに屈折率に大きな変化（正または負のどちらか）をもたらす。 ｓｙｎＴａｃ４−１ＢＢＬ受容体結合である。プロテインＡのマイクロビーズを飽和状態まで組み換えヒトまたはマウス４−１ＢＢ−Ｆｃ融合タンパク質で被覆して用い、共調節ドメインとして４−１ＢＢリガンド（２量体及び３量体）を有するｓｙｎＴａｃ構築物、続いて該ｓｙｎＴａｃの重鎖アイソタイプに特異的な蛍光検出抗体を結合した。ｓｙｎＴａｃ４−１ＢＢＬのビーズ付き４−１ＢＢへの特異的結合の程度をその後ハイスループットフローサイトメトリーで測定した。この系を用いて、ヒト及びマウスの４−１ＢＢの両方に対する４−１ＢＢＬの交差反応性及び相対的親和性の程度を該ｓｙｎＴａｃ骨格の中で調査した。４−１ＢＢＬを有するｓｙｎＴａｃは、同族受容体と結合し、「受容体のない」（ＭＯＤなしと呼ばれる）Ｆｃ結合マイクロビーズと結合しないことが示され、十分に折りたたまれた活性タンパク質試薬を示唆した。特に、該３量体は二重３量体結合に対して予期される親和性範囲で結合したが、元の２量体は、結合親和性における１０分の１の減少を示し、すべての構築物はマウス及びヒト受容体間で交差反応する。 ８．３トランスジェニックＮＯＤマウス由来のＣＤ８＋Ｔ細胞を固定化抗ＣＤ３抗体の存在下培養し、ポリクローナルＴ細胞活性化を刺激した。刺激された培養物は、可溶性型のｓｙｎＴａｃ ＴＵＭ−４１ＢＢＬ（Ａ）またはｓｙｎＴａｃ ＩＧＲＰ−４１ＢＢＬ（Ｂ及びＣ）のどちらかで処理し、任意の刺激効果の抗原特異性を調べた。対照の処理は培地のみ（−ＣＮＴＲＬ）または固定化抗ＣＤ３（＋ＣＮＴＲＬ）で、反応の大きさの判断基準とした。細胞は、Ｔ細胞活性化で誘導される細胞増殖の程度を観察するためにカルボキシフルオレセインスクシンイミジルエステル（ＣＦＳＥ）で標識化した。４日後、細胞を採取し、フローサイトメトリーを用いて生存率及び増殖について調べた。上清もまた、ＣＤ８＋Ｔ細胞エフェクターサイトカインのＩＦＮγ及びＴＮＦαの発現について、多重化フローサイトメトリー系ビーズアッセイを用いて調べた。調べたすべてのＣＤ８＋Ｔ細胞活性化パラメータは、抗原特異的かつエフェクター（すなわち、ＭＯＤ）ドメイン依存的に活性化された。 単回投与インビボＴ細胞刺激アッセイである。ＮＯＤマウスに、ｓｙｎＴａｃ ＩＧＲＰ−４１ＢＢＬ、ｓｙｎＴａｃ ＴＵＭ−４１ＢＢＬ、またはＰＢＳを腹腔内注射した。注射の６日後、これらマウスを殺処分し、適切なペプチド‐ＭＨＣ５量体染色を用いて、ＩＧＲＰ特異的ＣＤ８Ｔ細胞の相対頻度について、脾細胞をフローサイトメトリーで調べた。ＩＧＲＰ−４１ＢＢＬ処理は、ＩＧＲＰ特異的ＣＤ８Ｔ細胞の頻度を対照に対してはるかに高くし、単回投与がもたらすインビボでの有意な増加を裏付けた。 複数回投与インビボＴ細胞刺激アッセイである。ＮＯＤマウスに、ｓｙｎＴａｃ ＩＧＲＰ−４１ＢＢＬ、ｓｙｎＴａｃ ＴＵＭ−４１ＢＢＬ、またはＰＢＳを２週間にわたって３回腹腔内注射した。注射の７日後、これらマウスを殺処分し、適切なペプチド‐ＭＨＣ５量体染色を用いて、ＩＧＲＰ特異的ＣＤ８Ｔ細胞の相対頻度について、ＰＢＭＣ（血液由来）をフローサイトメトリーで調べた。ＩＧＲＰ−４１ＢＢＬ処理は、ＩＧＲＰ特異的ＣＤ８Ｔ細胞の頻度を対照に対して高くし、まれな腫瘍に特異的なＴ細胞（ＴＵＭ）を含めて、複数回投与がもたらすインビボでの有意な増加を裏付けた。 図１６Ａ〜１６Ｂは、４−１ＢＢＬ３量体発現に関して最適化された構築物の概略図である。ジスルフィド固定（図１６Ａ、ＤＬ）及び一本鎖３量体（図１６Ｂ、ＳＣＴ）。 ｓｙｎＴａｃ４−１ＢＢＬ受容体結合である。プロテインＡのマイクロビーズを飽和状態まで組み換えヒトまたはマウス４−１ＢＢ−Ｆｃ融合タンパク質で被覆して用い、補助調節ドメインとして４−１ＢＢリガンド（ジスルフィド固定３量体（６９、７０、及び７１）並びに一本鎖３量体（ＳＣＴ）を有するｓｙｎＴａｃ構築物、続いて該ｓｙｎＴａｃの重鎖アイソタイプに特異的な蛍光検出抗体を結合した。示した天然の３量体は結合の対照（３量体）である。ｓｙｎＴａｃ４−１ＢＢＬのビーズ付き４−１ＢＢへの特異的結合の程度をその後ハイスループットフローサイトメトリーで測定した。４−１ＢＢＬを有するｓｙｎＴａｃは、同族受容体を結合し、「受容体のない」（「ＭＯＤなし」と呼ばれる）Ｆｃ結合マイクロビーズを結合しないことが示され、十分に折りたたまれた活性タンパク質試薬を示唆した。すべての構築物はマウス及びヒト受容体間で交差反応する。 最適化４−１ＢＢＬ構築物の発現の検証である。元の４−１ＢＢＬモジュレーター（ｓｙｎＴａｃ４０／５１、ジスルフィド固定なし、「Ｏ」（元の（ｏｒｉｇｉｎａｌ））と表示）及び３量体のコンフォメーションを拘束する操作されたジスルフィド固定を含む３つの最適化構築物との共発現によるｓｙｎＴａｃ産物。各構築物の２つの天然残基をシステイン残基で置換し（Ｑ９４Ｃ：Ｐ２４５Ｃ（ゲル中、「ＤＬ１」と表示）、Ｑ９４Ｃ：Ｐ２４２Ｃ「ＤＬ２」、及びＱ８９Ｃ：Ｌ１１５Ｃ「ＤＬ３」、それぞれｓｙｎＴａｃ６９、７０、及び７１と呼ぶ）、ヒト細胞中、同じ変異を有する「遊離」非タグ型（それぞれ９８、９９、１００と呼ばれる）と共発現させ、該細胞中で共有結合的固定を可能にした。ジスルフィド結合度は、非還元ＳＤＳ−ＰＡＧＥ分析において、放出された（非共有結合的結合）「遊離」４−１ＢＢＬの量によって観察した。遊離ＢＢＬは約２０ｋＤａ（囲み）に移動するので、遺伝子操作された構築物のジスルフィド固定を確認する。４−１ＢＢＬの一本鎖３量体型（ＳＣＴ）を担持するｓｙｎＴａｃも、アフィニティー及びゲルろ過精製の後に示される（「ＳＣＴ」と表示）。正確な質量が多角度光散乱（ＭＡＬＳ）によって確認される。 図１９Ａ〜１９Ｉは、本開示のｓｙｎＴａｃ構築物の実施形態の概要図である。図１９Ａ〜１９Ｃは、それぞれ図２Ａ〜２Ｃに関して説明される構築物を示す；図１９Ｂ及び１９Ｃでは、Ｐ２Ａが未開裂のポリペプチドが示され（上部）、さらに開裂されたポリペプチド（Ｐ２Ａ介在自己開裂を通して）がジスルフィド結合（ＳＳ）とともに示され（下部）、図示されたシステイン置換（＊）によって仲介される。図１９Ｄ〜１９Ｆは、それぞれ図８Ａ〜８Ｃに関して上述の構築物を示し；図１９Ｄ〜１９Ｆの各々では、図示されたシステイン置換（＊）によって仲介される、ジスルフィド結合（ＳＳ）を有するＰ２Ａ介在自己開裂ポリペプチド（下部）の上にＰ２Ａの未開裂型（上部）が示される。図１９Ｇは、図示された未開裂（上部）及び自己開裂／ジスルフィド結合された（下部）ポリペプチドで、図９Ｂに関連してｓｙｎＴａｃ４０構築物の一般型を示す。図１９Ｈは、図９Ｃ〜９Ｅに関連してｓｙｎＴａｃ６９、ｓｙｎＴａｃ７０、及びｓｙｎＴａｃ７１の一般型を示し、未開裂（上部）及び自己開裂／ジスルフィド結合された（下部）ポリペプチドが図示され、４−１ＢＢＬドメイン内のさらなるシステイン置換も示される（＊）。図１９Ｉは、図９Ｆに関連してｓｙｎＴａｃ４−１ＢＢＬ一本鎖３量体（ＳＣＴ）の一般型を示し、未開裂（上部）及び自己開裂／ジスルフィド結合された（下部）ポリペプチドが図示される。 図１９Ａの説明を参照のこと。 図１９Ａの説明を参照のこと。 図１９Ａの説明を参照のこと。 図１９Ａの説明を参照のこと。 図１９Ａの説明を参照のこと。 図１９Ａの説明を参照のこと。 図１９Ａの説明を参照のこと。 図１９Ａの説明を参照のこと。 ホモ・サピエンス（Ｈｏｍｏ ｓａｐｉｅｎｓ）（ＮＰ＿００４０３９．１；ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７８）、チンパンジー（Ｐａｎ ｔｒｏｇｌｏｄｙｔｅｓ）（ＮＰ＿００１００９０６６．１；ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７９）、アカゲザル（Ｍａｃａｃａ ｍｕｌａｔｔａ）（ＮＰ＿００１０４０６０２．１；ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：８０）、ボス・タウラス（Ｂｏｓ Ｔａｕｒｕｓ）（ＮＰ＿７７６３１８．１；ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：８１）、及びハツカネズミ（Ｍｕｓ ｍｕｓｃｕｌｕｓ）（ＮＰ＿０３３８６５．２；ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：８２）由来のβ２ミクログロブリン（Ｂ２Ｍ）前駆体（すなわち、リーダー配列を含む）の複数のアミノ酸配列アラインメントを示す。 ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６の構築物のドメイン構造を示す。 ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７の構築物のドメイン構造を示す。 ｓｙｎＴａｃ ＩＧＲＰ−ＰＤＬ１、ｓｙｎＴａｃ ＴＵＭ−ＰＤＬ１、またはリン酸緩衝生理食塩水（ＰＢＳ）のインビボ投与のＩＧＲＰ特異的ＣＤ８＋Ｔ細胞の頻度に対する影響を示す。 図２４Ａは、免疫グロブリンＦｃポリペプチドのアミノ酸配列を示す。 図２４Ｂは、免疫グロブリンＦｃポリペプチドのアミノ酸配列を示す。 図２４Ｃは、免疫グロブリンＦｃポリペプチドのアミノ酸配列を示す。 図２５Ａ〜２５Ｃは、ヒト白血球抗原（ＨＬＡ）クラスＩ重鎖ポリペプチドのアミノ酸配列を示す。 図２６Ａ〜２６Ｂは、ＰＤ−Ｌ１ポリペプチドのアミノ酸配列を示す。 ４−１ＢＢＬポリペプチドのアミノ酸配列を示す。 ＩＣＯＳ−Ｌポリペプチドのアミノ酸配列を示す。 ＯＸ４０Ｌポリペプチドのアミノ酸配列を示す。 ＰＤ−Ｌ２ポリペプチドのアミノ酸配列を示す。 ＣＤ８０（Ｂ７−１）ポリペプチドのアミノ酸配列を示す。 ＣＤ８６（Ｂ７−２）ポリペプチドのアミノ酸配列を示す。 Ｆａｓリガンド（ＦＡＳ−Ｌ）ポリペプチドのアミノ酸配列を示す。 図３４Ａ〜３４Ｈは、本開示のｓｙｎＴａｃ構築物の実施形態の概要図を示し、システイン置換（＊）によって仲介されるジスルフィド結合（ＳＳ）が図示される。これらの実施形態では、ジスルフィド結合は別々のポリペプチドに存在するＭＨＣ（例えば、ＨＬＡ）ポリペプチド間に形成される。 図３４Ａの説明を参照のこと。 図３４Ａの説明を参照のこと。 図３４Ａの説明を参照のこと。 図３４Ａの説明を参照のこと。 図３４Ａの説明を参照のこと。 図３４Ａの説明を参照のこと。 図３４Ａの説明を参照のこと。
定義
本明細書で使用される「リーダー配列」は、ヒトＢ２Ｍリーダーを含めて、哺乳類細胞によってプロセッシングされうる任意のシグナルペプチドを含む。かかる配列は、当技術分野では周知である。
本明細書で使用される、例えば、要素Ａ及び要素Ｂに関して「隣接する」とは、要素Ａが要素Ｂに隣接し、好ましくは、別段の定めのない限り、共有結合によって要素Ｂに結合していることを意味する。例えば、第二のアミノ酸配列に隣接する第一のアミノ酸配列については、該第一のアミノ酸配列のＣ末端が、該第二のアミノ酸配列のＮ末端にペプチド結合によって結合され得る。
「ペプチド」、「ポリペプチド」、及び「タンパク質」という用語は、本明細書では区別なく用いられ、任意の長さのアミノ酸の多量体型を指し、コード及び非コードアミノ酸、化学的もしくは生化学的修飾または誘導体化アミノ酸、並びに修飾ペプチド骨格を有するポリペプチドを含みうる。これらの用語は、ポリペプチドの翻訳時修飾（例えば、シグナルペプチド開裂）及び翻訳後修飾、例えば、ジスルフィド結合形成、グリコシル化、アセチル化、リン酸化、タンパク質分解的開裂等を有するポリペプチドも含む。さらに、本明細書で使用される「ポリペプチド」は、そのタンパク質が所望の活性を維持する限り、元の配列に対して欠失、付加、及び置換（当業者に知られるように実際は概して保存的である）等の修飾を含むタンパク質に言及する。これらの修飾は、特定部位の突然変異誘発によるなどの故意、または、例えば該タンパク質を産生する宿主の変異もしくはＰＣＲ増幅もしくは他の組み換えＤＮＡ法に起因するエラーを介した偶然の場合がある。
核酸分子を説明するために本明細書で使用される「組み換え体」という用語は、ゲノム、ｃＤＮＡ、ウイルス、半合成、及び／または合成起源のポリヌクレオチドであって、その起源または操作が理由で、それが本来伴うポリヌクレオチド配列のすべてもしくは一部を伴わない、ポリヌクレオチドを意味する。タンパク質またはポリペプチドに関して用いられる「組み換え体」という用語は、組み換えポリヌクレオチド由来の発現によって産生されるポリペプチドを指す。宿主細胞またはウイルスに関して用いられる「組み換え体」という用語は、組み換えポリヌクレオチドが導入された宿主細胞またはウイルスを指す。組み換え体はまた、本明細書では、異種物質（例えば、細胞、核酸、タンパク質、またはベクター）の導入によって修飾された物質（例えば、細胞、核酸、タンパク質、またはベクター）に関連して指す。
「ポリヌクレオチド」、「オリゴヌクレオチド」、「核酸」、及び「核酸分子」という用語は、本明細書では区別なく用いられ、ヌクレオチド、すなわち、リボヌクレオチドまたはデオキシリボヌクレオチドの多量体型を含める。本用語は、該分子の一次構造のみを指す。従って、これらの用語は３本鎖、２本鎖、及び１本鎖ＤＮＡ、並びに３本鎖、２本鎖、及び１本鎖ＲＮＡを含む。これらの用語はまた、例えばメチル化及び／またはキャッピングによる修飾を有するかかる分子、並びにポリヌクレオチドの未修飾型も含む。より具体的には、「ポリヌクレオチド」、「オリゴヌクレオチド」、「核酸」、及び「核酸分子」という用語は、ポリデオキシリボヌクレオチド（２‐デオキシ‐Ｄ‐リボースを含む）、ポリリボヌクレオチド（Ｄ‐リボースを含む）、プリンもしくはピリミジン塩基のＮ‐またはＣ‐グリコシドである他の種類のポリヌクレオチド、並びに非ヌクレオチド骨格を含む他のポリマー、ポリマー、並びに、該ポリマーがＤＮＡ及びＲＮＡで見られるような塩基対合及び塩基の積み重ねを可能にする配置に核酸塩基を含む他の合成配列特異的核酸ポリマーを含む。
本明細書で使用される「ベクター」という用語は、核酸配列を標的細胞に導入できる媒体を指す。例えば、ベクターは標的細胞内で発現されうるコード配列を含んでよい。本明細書で使用される、「ベクター構築物」、「発現ベクター」、及び「遺伝子導入ベクター」とは、概して、目的の遺伝子の発現を指示することが可能で、該目的の遺伝子を標的細胞内に導入するのに有用な任意の核酸構築物を指す。ゆえに、該用語は、クローニング及び発現媒体、並びに組込みベクター及び非組込みベクターを含む。ベクターはこのように核酸配列を標的細胞に導入することが可能で、ある場合には、核酸配列の操作、例えば、核酸配列の組み換え（すなわち、組み換え核酸配列を作ること）等に用いられる。本開示のためのベクターの例としては、限定されないが、プラスミド、ファージ、トランスポゾン、コスミド、ウイルス等が挙げられる。
本明細書で使用される「発現カセット」は、目的の遺伝子／コード配列を含めた任意のＲＮＡ転写産物の発現を指示することができる任意の核酸構築物及び非翻訳ＲＮＡを含む。かかるカセットは、該発現カセットを標的細胞内に導入するために、「ベクター」、「ベクター構築物」、「発現ベクター」、または「遺伝子導入ベクター」に構築することができる。従って、本用語はクローニング及び発現媒体並びにウイルスベクターを含む。発現カセットの転写産物は、安定に、または一時的に発現されうるとともに、所望に応じて、宿主のゲノムと合体する（標的化もしくは未標的化形式で）カセットから発現されても、または合体しないままであってもよい。
「作動可能に連結されている」とは、かかる成分が、それらの対象とする方式でそれらが機能することを可能にする関係にある並置を指す。例えば、プロモーターは、該プロモーターがコード配列の転写または発現に影響を与える場合、該コード配列に作動可能に連結されている。本明細書で使用される「異種プロモーター」並びに「異種調節領域」という用語は、通常本来特定の核酸と結合しないプロモーター及び他の調節領域を指す。例えば、「コード領域に対して異種の転写調節領域」とは、通常本来該コード領域と結合しない転写調節領域である。
本明細書で使用される「免疫学的シナプス」または「免疫シナプス」という用語は、概して、２つの適応免疫反応の相互作用免疫細胞間の天然の界面を指し、例えば、抗原提示細胞（ＡＰＣ）または標的細胞とエフェクター細胞、例えば、リンパ球、エフェクターＴ細胞、ナチュラルキラー細胞等との界面を含む。ＡＰＣとＴ細胞間の免疫学的シナプスは、例えば、参照することによってその開示全体が本明細書に組み込まれる、Ｂｒｏｍｌｅｙ ｅｔ ａｌ．， Ａｎｎｕ Ｒｅｖ Ｉｍｍｕｎｏｌ． ２００１；１９：３７５−９６に記載されるように、通常、Ｔ細胞抗原受容体及び主要組織適合複合体分子の相互作用によって開始される。
本明細書で使用される、核酸配列、タンパク質、またはポリペプチドに関して用いられる「異種」という用語は、これらの分子が、該異種核酸配列、タンパク質、またはポリペプチドが得られた細胞内で天然には生じないことを意味する。例えば、ヒトの細胞ではない細胞に挿入されるヒトのポリペプチドをコードする核酸配列は、その個々の状況において異種核酸配列である。異種核酸は異なる有機体または動物種由来でありうるものの、かかる核酸は、異種であるために別の有機体種由来である必要はない。例えば、ある場合には、合成核酸配列またはそれからコードされるポリペプチドは、それが導入される細胞に対して、該細胞は該合成核酸を以前に含んでいなかったという点において、異種でありうる。このように、例えば、合成核酸配列またはそれからコードされるポリペプチドの１成分以上がもとはヒト細胞由来であったとしても、該合成核酸配列またはそれからコードされるポリペプチドは、ヒト細胞に対して異種であると見なされうる。
本明細書で使用される「宿主細胞」とは、インビボもしくはインビトロ真核細胞または単細胞の実体として培養された多細胞生物（例えば、細胞株）由来の細胞を意味し、これら真核細胞は、核酸（例えば、本開示の多量体ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む発現ベクター）に対するレシピエントとして使用可能、または使用されており、該核酸によって遺伝子改変された元の細胞の後代を含む。単一細胞の後代は自然の、偶然の、または計画的な突然変異のために、元の親と必ずしも完全に同一の形態学またはゲノムもしくは全ＤＮＡ補体であるとは限らないことが理解される。「組み換え宿主細胞」（「遺伝子改変された宿主細胞」とも呼ばれる）は、異種核酸、例えば、発現ベクターが導入された宿主細胞である。例えば、遺伝子改変された真核宿主細胞は、異種核酸、例えば、該真核宿主細胞にとって異質である外因性核酸、または該真核宿主細胞に通常は見られない組み換え核酸による適切な真核宿主細胞への導入によって遺伝子改変されている。
いくつかの場合、ポリペプチド及びポリペプチドをコードする核酸を含めて、核酸またはアミノ酸配列は、「配列類似性」または「配列同一性」を基に、例えば、１つ以上の参照配列と比較して参照される。他の例では、変異または変種配列は、１つ以上の参照配列との比較を基に参照されうる。配列の比較については、通常、１つの配列が参照配列の役割を果たし、これに対して試験配列が比較される。配列比較アルゴリズムを用いる場合、試験配列及び参照配列をコンピュータに入力し、必要に応じて部分配列座標を指定し、配列アルゴリズムのプログラムパラメータを指定する。該配列比較アルゴリズムは次に、指定されたプログラムパラメータを基にして、該試験配列について、該参照配列に対する配列同一性％を計算する。
必要または所望に応じて、比較用に最適な配列アラインメントを、例えば、Ｓｍｉｔｈ及びＷａｔｅｒｍａｎの局所的相同性アルゴリズム（Ａｄｖ． Ａｐｐｌ． Ｍａｔｈ． ２：４８２（１９８１）、参照することによって本明細書に組み込まれる）、Ｎｅｅｄｌｅｍａｎ及びＷｕｎｓｃｈの相同性アラインメントアルゴリズム（Ｊ． Ｍｏｌ． Ｂｉｏｌ． ４８：４４３−５３（１９７０）、参照することによって本明細書に組み込まれる）、Ｐｅａｒｓｏｎ及びＬｉｐｍａｎの類似性検索法（Ｐｒｏｃ． Ｎａｔｌ． Ａｃａｄ． Ｓｃｉ． ＵＳＡ ８５：２４４４−４８（１９８８）、参照することによって本明細書に組み込まれる）、これらアルゴリズムのコンピュータ実行（例えば、ＧＡＰ、ＢＥＳＴＦＩＴ、ＦＡＳＴＡ、及びＴＦＡＳＴＡ、Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ Ｓｏｆｔｗａｒｅ Ｐａｃｋａｇｅ， Ｇｅｎｅｔｉｃｓ Ｃｏｍｐｕｔｅｒ Ｇｒｏｕｐ， ５７５ Ｓｃｉｅｎｃｅ Ｄｒ．，ウィスコンシン州マジソン）または外観検査（一般的には、Ａｕｓｕｂｅｌら（編）、Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ，第４版，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ａｎｄ Ｓｏｎｓ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ（１９９９）参照）によって導くことができる。
「Ｔ細胞」は、ＣＤ３を発現するすべての種類の免疫細胞を含み、ヘルパーＴ細胞（ＣＤ４＋細胞）、細胞毒性Ｔ細胞（ＣＤ８＋細胞）、制御性Ｔ細胞（Ｔｒｅｇ）、及びＮＫ−Ｔ細胞を含む。
本明細書で使用される用語「共刺激リガンド」は、抗原提示細胞（例えば、ＡＰＣ、樹状細胞、Ｂ細胞等）上の分子であって、Ｔ細胞上の同族共刺激分子と特異的に結合し、それによって、例えば、ＴＣＲ／ＣＤ３複合体をペプチドが詰まったＭＨＣ分子に結合することによってもたらされる一次シグナルに加えて、限定されないが、増殖、活性化、分化等が挙げられるＴ細胞応答を媒介するシグナルを与える、分子を含む。共刺激リガンドとしては、限定されないが、ＣＤ７、Ｂ７−１（ＣＤ８０）、Ｂ７−２（ＣＤ８６）、ＰＤ−Ｌ１、ＰＤ−Ｌ２、４−１ＢＢＬ、ＯＸ４０Ｌ、Ｆａｓリガンド（ＦａｓＬ）、誘導共刺激リガンド（ＩＣＯＳ−Ｌ）、細胞間接着分子（ＩＣＡＭ）、ＣＤ３０Ｌ、ＣＤ４０、ＣＤ７０、ＣＤ８３、ＨＬＡ−Ｇ、ＭＩＣＡ、ＭＩＣＢ、ＨＶＥＭ、リンホトキシンβ受容体、３／ＴＲ６、ＩＬＴ３、ＩＬＴ４、ＨＶＥＭ、Ｔｏｌｌリガンド受容体と結合する作動薬または抗体、及びＢ７−Ｈ３と特異的に結合するリガンドを挙げることができる。共刺激リガンドは、とりわけ、Ｔ細胞上に存在する共刺激分子、例えば、限定されないが、ＣＤ２７、ＣＤ２８、４−１ＢＢ、ＯＸ４０、ＣＤ３０、ＣＤ４０、ＰＤ−１、ＩＣＯＳ、リンパ球機能関連抗原１（ＬＦＡ−１）、ＣＤ２、ＣＤ７、ＬＩＧＨＴ、ＮＫＧ２Ｃ、Ｂ７−Ｈ３、及びＣＤ８３と特異的に結合する抗体も網羅する。
「精製」、「単離」等の用語は、所望の物質、例えば、組み換えタンパク質を所望されない物質、例えば、混入物質を含む溶液から除去すること、または、所望の物質を含む溶液から所望されない物質を除去して基本的に所望の物質のみを残すことを指す。いくつかの場合、精製された物質は他の物質、例えば混入物質を基本的に含まない可能性がある。本明細書で使用される精製とは、多岐にわたる最終純度を指すことがあり、例えば、精製された物質は、溶液中の全物質の８０％超を構成し、８５％超、９０％超、９１％超、９２％超、９３％超、９４％超、９５％超、９６％超、９７％超、９８％超、９９％超、９９．５％超、９９．９％超等を含む。当業者には理解されるように、一般に溶液自体の成分、例えば、水もしくは緩衝液、または塩は、物質の純度の決定の際に考慮されない。
本明細書で使用される「治療（ｔｒｅａｔｍｅｎｔ）」、「治療すること（ｔｒｅａｔｉｎｇ）」等という用語は、所望の薬理作用及び／または生理作用を得ることを指す。該作用は、疾患もしくその症状を完全に、もしくは部分的に防ぐという観点から予防的である場合、並びに／または疾患及び／もしくは該疾患に起因する悪影響を部分的もしくは完全に治すという観点から治療的である場合がある。本明細書で使用される「治療」は、哺乳類、例えば、ヒトの疾患の任意の治療に及び：（ａ）疾患にかかりやすい可能性があるがまだ罹患していると診断されていない対象での発病の予防；（ｂ）該疾患の阻止、すなわち、その進行の停止；及び（ｃ）該疾患の緩和、すなわち、該疾患の退行を引き起こすことを含む。
本明細書では区別なく用いられる「個体」、「対象」、「宿主」、及び「患者」という用語は、限定されないがネズミ科の動物（例えば、ラット、マウス）、ウサギ目の動物（例えば、ウサギ）、非ヒト霊長類、ヒト、イヌ、ネコ、有蹄動物（例えば、ウマ、ウシ、ヒツジ、ブタ、ヤギ）等を含めて哺乳類を指す。
「治療有効量」または「有効量」は、哺乳類もしくは他の対象に対して疾患の治療用に投与される場合、かかる疾患の治療をもたらすのに十分な作用物質の量もしくは２つの作用物質を合わせた量を指す。この「治療有効量」は、作用物質、疾患及びその重症度、並びに治療される対象の年齢、体重等によって異なる。
本発明をさらに説明する前に、本発明は記載される特定の実施形態に限定されず、それ自体当然のことながら変化しうることを理解されたい。本発明の範囲は添付の特許請求の範囲によってのみ限定されるため、本明細書で使用される術語は、具体的な実施形態を説明する目的のみであり、限定することを目的としないこともまた理解されたい。
値域が示される場合、各介在値は、その文脈が明らかに他を示さない限り、下限値の１０分の１の単位までその範囲の上限と下限の間で、及びその規定範囲における他の規定値または介在値が本発明の範囲内に含まれることが理解される。これらのより小さい範囲の上限及び下限は、これらのより小さい範囲に独立して含まれうるとともに、該規定範囲において特に排除される任意の境界次第で、本発明の範囲内にも含まれる。該規定範囲が該境界のうちの一方または両方を含む場合、これらの含まれる境界のうちのどちらかまたは両方を排除する範囲もまた本発明に含まれる。
他に規定のない限り、本明細書で使用されるすべての専門用語及び科学用語は、本発明が属する当業者によって一般に理解されるものと同じ意味を有する。本明細書に記載のものと同様もしくは同等の任意の方法及び材料も本発明の実施または試験に用いることができるが、好適な方法及び材料をここに記載する。本明細書で言及するすべての出版物は、参照することによって本明細書に組み込まれ、該出版物の引用に関連する該方法及び／または材料を開示並びに記載する。
本明細書及び添付の特許請求の範囲で用いられる単数形の「１つの（ａ）」、「１つの（ａｎ）」、並びに「その（ｔｈｅ）」は、その文脈が明らかに他を指示しない限り、複数の指示対象を含むことに留意する必要がある。従って、例えば、「１つの多量体ポリペプチド（ａ ｍｕｌｔｉｍｅｒｉｃ ｐｏｌｙｐｅｐｔｉｄｅ）」への言及は複数のかかるポリペプチドを含み、「免疫調節ポリペプチド（ｔｈｅ ｉｍｍｕｎｏｍｏｄｕｌａｔｏｒｙ ｐｏｌｙｐｅｐｔｉｄｅ）」への言及は、１つ以上の免疫調節ポリペプチド及び当業者に周知のその同等物への言及を含む等である。さらに、特許請求の範囲は、任意の随意的な要素を排除するように起草されうるということを記載する。したがって、本文は、請求項の要素の列挙に関連して、「〜だけ（ｓｏｌｅｌｙ）」、「のみ（ｏｎｌｙ）」等の排他的な述語の使用のための、または「否定の」限定の使用のための先行詞の役割を果たすことを意図されている。
明確にするために別々の実施形態の中に記載される本発明のある特定の特徴は、単一の実施形態に合わせて示されてもよいことが理解される。反対に、簡潔にするために単一の実施形態の中に記載される本発明の様々な特徴は、別々に示されても、任意の適切な副結合に示されてもよい。本発明に関連する実施形態のすべての組合せは、まさにありとあらゆる組合せが個別にかつ明確に開示されたものとして、本発明に具体的に包含され、本明細書に開示される。さらに、これらの様々な実施形態及びそれらの要素のすべての副結合もまた、まさにありとあらゆるかかる副結合が個別にかつ明確に本明細書に開示されたものとして、本発明に具体的に包含され、本明細書に開示される。
本明細書で論じられる出版物は、本出願の出願日の前にそれらの開示のためだけを提供される。本明細書において、本発明が先行発明に基づくかかる出版物に先行する権利がないと認めることと解釈されるものはない。さらに、規定された公開日は、独立して確認が必要である場合がある実際の公開日と異なる場合がある。
発明の詳細な説明
従来の免疫反応を反復する新規なタンパク質ベースの治療プラットフォーム、すなわち、Ｔ細胞活性化用の人工免疫学的シナプス（ｓｙｎＴａｃ）を本明細書に記載する。共刺激分子をＭＨＣ−エピトープに連結して、正確なＴ細胞の結合と、ＭＯＤ分子部位に応じてクローン性Ｔ細胞活性化または阻害とを可能にする新規な融合タンパク質である。
多量体ポリペプチド
本開示は、多量体（例えば、ヘテロ２量体、ヘテロ３量体）ポリペプチドを提供する。本開示は、本開示の多量体ポリペプチドのポリタンパク質前駆体を提供する。本開示は、前駆体遺伝子産物、例えば、本開示の多量体ポリペプチドのポリタンパク質前駆体、及び本開示の多量体ポリペプチドの２つ以上のポリペプチド鎖をコードするｍＲＮＡ遺伝子産物を提供する。
さらに、（ｉ）第一のアミノ酸リンカー配列によって結合された候補エピトープペプチド、これに隣接する、ヒト天然Ｂ２Ｍペプチド配列と同一の配列を含むアミノ酸配列、これに隣接する第二のアミノ酸リンカー、これに隣接するＴ細胞調節ドメインペプチド配列を含み、（ｉ）が、１つまたは２つ以上のジスルフィド結合によって、（ｉｉ）ＭＨＣ重鎖の配列を有するアミノ酸配列、これに隣接する第三のアミノ酸リンカー配列、これに隣接する、免疫グロブリンのＦｃドメインと同一のアミノ酸配列に結合されている、組み換えポリペプチド構築物も提供される。実施形態では、該組み換えポリペプチド構築物は、
Figure 0006652680
を含む。
さらに、（ｉ）第一のアミノ酸リンカー配列によって結合された候補エピトープペプチド、これに隣接する、ヒト天然Ｂ２Ｍペプチド配列と同一の配列を含むアミノ酸配列を含み、（ｉ）が、１つまたは２つ以上のジスルフィド結合によって、（ｉｉ）Ｔ細胞調節ドメインペプチド、これに隣接する第二のアミノ酸リンカー配列、これに隣接する、ＭＨＣ重鎖の配列を有するアミノ酸配列、これに隣接する第三のアミノ酸リンカー、これに隣接する、免疫グロブリンのＦｃドメインと同一のアミノ酸配列に結合されている、組み換えポリペプチド構築物も提供される。実施形態では、該組み換えポリペプチド構築物は、
Figure 0006652680
を含む。
さらに、それぞれの免疫グロブリンのＦｃドメイン間の１つ以上のジスルフィド結合によって結合された本明細書に記載の組み換えポリペプチド構築物のうちの２つを含むタンパク質も提供される。
さらに、本それぞれの免疫グロブリンのＦｃドメイン間の１つ以上のジスルフィド結合によって結合された明細書に記載の組み換えポリペプチド構築物のうちの２つを含むタンパク質も提供される。
本発明は、ｓｙｎＴａｃプラットフォーム、すなわち、標的Ｔ細胞活性化用の人工免疫学的シナプスを提供する。
実施形態において、β２ミクログロブリンは、ヒトβ２ミクログロブリンと同じ配列を有する。実施形態において、組織適合性複合体の重鎖の配列は、ヒトＨＬＡ−Ａの配列と同じ配列を有する。実施形態において、組織適合性複合体の重鎖の膜透過ドメインは、ヒト主要組織適合複合体Ｉ（ＭＨＣ Ｉ）の重鎖の膜透過ドメインと同じ配列を有する。実施形態において、組織適合性複合体の重鎖の膜透過ドメインは、ヒト主要組織適合複合体ＩＩ（ＭＨＣ ＩＩ）の重鎖の膜透過ドメインと同じ配列を有する。
さらに、複数の該構築物を含む組成物も提供される。
実施形態において、該候補エピトープペプチドは、８、９、１０、１１、または１２アミノ酸のペプチドである。実施形態において、該候補エピトープペプチドは、１３、１４、１５、１６、または１７アミノ酸のペプチドである。実施形態において、該候補エピトープペプチドは、９量体（９アミノ酸の長さ）である。
本開示は、２つ以上（例えば、２つ、３つ、４つ、またはそれ以上）のポリペプチド鎖を含む多量体ポリペプチドを提供する。いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）エピトープ；ｉｉ）第一の主要組織適合複合体（ＭＨＣ）ポリペプチドを含む第一のポリペプチド；並びにｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）第二のＭＨＣポリペプチド；及びｉｉ）任意で免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドまたは非Ｉｇ骨格を含む第二のポリペプチドを含み、該多量体ポリペプチドは、１つ以上の免疫調節ドメインを含み、該１つ以上の免疫調節ドメインは、Ａ）該第一のポリペプチドのＣ末端に；Ｂ）該第二のポリペプチドのＮ末端に；Ｃ）該第二のポリペプチドのＣ末端に；またはＤ）該第一のポリペプチドのＣ末端及び該第二のポリペプチドのＮ末端に存在する。
いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドは、第一のポリペプチド及び第二のポリペプチドを含み、該第一のポリペプチドは、アミノ末端（Ｎ末端）からカルボキシル末端（Ｃ末端）の順にａ）エピトープ（例えば、Ｔ細胞エピトープ）；ｂ）第一の主要組織適合複合体（ＭＨＣ）ポリペプチド及びｃ）免疫調節ポリペプチドを含み；該第二のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順にａ）第二のＭＨＣポリペプチド；及びｂ）免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドを含む。他の例では、本開示の多量体ポリペプチドは、第一のポリペプチド及び第二のポリペプチドを含み、該第一のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順にａ）エピトープ（例えば、Ｔ細胞エピトープ）；及びｂ）第一のＭＨＣポリペプチドを含み；該第二のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順にａ）免疫調節ポリペプチド；ｂ）第二のＭＨＣポリペプチド；及びｃ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む。いくつかの場合、該第一のＭＨＣポリペプチド及び該第二のＭＨＣポリペプチドは、クラスＩのＭＨＣポリペプチドであって；例えば、いくつかの場合、該第一のＭＨＣポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩのβ２ミクログロブリン（Ｂ２Ｍ）ポリペプチドであり、該第二のＭＨＣポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩ重鎖（Ｈ鎖）である。他の例では、該第一のＭＨＣポリペプチド及び該第二のＭＨＣポリペプチドは、クラスＩＩのＭＨＣポリペプチドであって；例えば、いくつかの場合、該第一のＭＨＣポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα鎖ポリペプチドであり、該第二のＭＨＣポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ鎖ポリペプチドである。別の例では、該第一のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ鎖ポリペプチドであり、該第二のＭＨＣポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα鎖ポリペプチドである。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、２つ以上の免疫調節ポリペプチドを含む。本開示の多量体ポリペプチドが２つ以上の免疫調節ポリペプチドを含む場合、いくつかの場合、該２つ以上の免疫調節ポリペプチドは、同じポリペプチド鎖に存在し、タンデムになってもよい。本開示の多量体ポリペプチドが２つ以上の免疫調節ポリペプチドを含む場合、いくつかの場合、該２つ以上の免疫調節ポリペプチドは別々のポリペプチドに存在する。いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドは、ヘテロ２量体である。いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドは、３量体ポリペプチドである。
いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）エピトープ；及びｉｉ）第一のＭＨＣポリペプチドを含む第一のポリペプチド；並びにｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）第二のＭＨＣポリペプチド；及びｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド；及びｉｉｉ）免疫調節ドメインを含む第二のポリペプチドを含む。いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）エピトープ；及びｉｉ）第一のＭＨＣポリペプチドを含む第一のポリペプチド；並びにｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）第二のＭＨＣポリペプチド；及びｉｉ）免疫調節ドメインを含む第二のポリペプチドを含む。いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）エピトープ；及びｉｉ）第一のＭＨＣポリペプチドを含む第一のポリペプチド；並びにｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）免疫調節ドメイン；及びｉｉ）第二のＭＨＣポリペプチドを含む第二のポリペプチドを含む。いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）エピトープ；ｉｉ）第一のＭＨＣポリペプチド；及びｉｉｉ）免疫調節ドメインを含む第一のポリペプチド；並びにｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）第二のＭＨＣポリペプチドを含む第二のポリペプチドを含む。本開示の多量体ポリペプチドが非Ｉｇ骨格を含むいくつかの場合、該非Ｉｇ骨格は、ＸＴＥＮポリペプチド、トランスフェリンポリペプチド、Ｆｃ受容体ポリペプチド、エラスチン様ポリペプチド、シルク様ポリペプチド、またはシルクエラスチン様ポリペプチドである。
いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドは一価である。いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドは多価である。例えば、本開示の多量体ポリペプチドに存在するＦｃポリペプチド次第で、該多量体ポリペプチドは、ホモ２量体であることができ、該多量体ポリペプチドの２分子が該ホモ２量体で存在し、該多量体ポリペプチドの該２分子は、例えば、該２分子に存在するＦｃポリペプチドを介して互いにジスルフィド結合されうる。別の例として、本開示の多量体ポリペプチドは、３、４、または５分子の該多量体ポリペプチドを含むことができ、該多量体ポリペプチドのこれら分子は、例えば、これら分子に存在するＦｃポリペプチドを介して互いにジスルフィド結合されうる。
リンカー
本開示の多量体ポリペプチドは、例えばエピトープとＭＨＣポリペプチドとの間、ＭＨＣポリペプチドと免疫調節ポリペプチドとの間、またはＭＨＣポリペプチドとＩｇ Ｆｃポリペプチドとの間に挿入されたリンカーペプチドを含むことができる。
適切なリンカー（「スペーサー」とも呼ばれる）は、容易に選択可能であり、いくつかの適切な長さ、例えば、１アミノ酸（例えば、Ｇｌｙ）から２０アミノ酸、２アミノ酸から１５アミノ酸、３アミノ酸から１２アミノ酸、４アミノ酸から１０アミノ酸、５アミノ酸から９アミノ酸、６アミノ酸から８アミノ酸、または７アミノ酸から８アミノ酸であってよく、１、２、３、４、５、６、または７アミノ酸であってよい。
典型的なリンカーとしては、グリシンポリマー（Ｇ）ｎ、グリシン‐セリンポリマー（例えば、ｎは少なくとも整数１である、（ＧＳ）ｎ、（ＧＳＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：８）、及び（ＧＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：９））、グリシン‐アラニンポリマー、アラニン‐セリンポリマー、及び当技術分野で周知の他の柔軟性リンカーが挙げられる。グリシン及びグリシン‐セリンポリマーが使用可能であり；ＧｌｙとＳｅｒはともに比較的組織化されておらず、それ故成分間の中立テザーの役割を果たすことができる。グリシンポリマーが使用可能であり；グリシンは、実にアラニンよりも著しく多くのファイ‐プサイ空間を使用可能にし、より長い側鎖の残基よりはるかに規制が少ない（Ｓｃｈｅｒａｇａ， Ｒｅｖ． Ｃｏｍｐｕｔａｔｉｏｎａｌ Ｃｈｅｍ． １１１７３−１４２（１９９２）参照）。典型的なリンカーは、限定されないが、
Figure 0006652680
等を含むアミノ酸配列を含みうる。
いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドの第一のポリペプチドに存在するリンカーポリペプチドは、本開示の多量体ポリペプチドの第二のポリペプチドに存在するシステイン残基とジスルフィド結合を形成することができるシステイン残基を含む。いくつかの場合、例えば、適切なリンカーは、アミノ酸配列
Figure 0006652680
を含む。
エピトープ
本開示の多量体ポリペプチドに存在するエピトープは約４アミノ酸から約２５アミノ酸の長さを有することができ、例えば、該エピトープは４アミノ酸（ａａ）から１０ａａ、１０ａａから１５ａａ、１５ａａから２０ａａ、または２０ａａから２５ａａの長さを有することができる。例えば、本開示の多量体ポリペプチドに存在するエピトープは、４アミノ酸（ａａ）、５ａａ、６ａａ、７ａａ、８ａａ、９ａａ、１０ａａ、１１ａａ、１２ａａ、１３ａａ、１４ａａ、１５ａａ、１６ａａ、１７ａａ、１８ａａ、１９ａａ、２０ａａ、２１ａａ、２２ａａ、２３ａａ、２４ａａ、または２５ａａの長さを有することができる。いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドに存在するエピトープは、５アミノ酸から１０アミノ酸、例えば、５ａａ、６ａａ、７ａａ、８ａａ、９ａａ、または１０ａａの長さを有する。
本開示の多量体ポリペプチドに存在するエピトープは、Ｔ細胞によって特異的に結合される。すなわち、該エピトープは、エピトープ特異的Ｔ細胞によって特異的に結合される。エピトープ特異的Ｔ細胞は、参照アミノ酸配列を有するエピトープに結合するが、該参照アミノ酸配列と異なるエピトープには実質的に結合しない。例えば、エピトープ特異的Ｔ細胞は、参照アミノ酸配列を有するエピトープに結合し、該参照アミノ酸配列と異なるエピトープに結合したとしても、親和性は１０−６Ｍ未満、１０−５Ｍ未満、または１０−４Ｍ未満である。エピトープ特異的Ｔ細胞は、親和性が少なくとも１０−７Ｍ、少なくとも１０−８Ｍ、少なくとも１０−９Ｍ、または少なくとも１０−１０Ｍで特異的なエピトープに結合できる。
エピトープの限定されない例としては、例えば、ヒトＴ細胞リンパ向性ウイルス‐１エピトープＬＬＦＧＹＰＶＹＶ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１７）；腫瘍エピトープＫＹＱＡＶＴＴＴＬ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１８）、及び膵島特異的グルコース‐６‐リン酸触媒サブユニット関連タンパク質（ＩＧＲＰ）エピトープＶＹＬＫＴＮＶＦＬ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１９）またはＴＹＬＫＴＮＬＦＬ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２０）が挙げられる。Ｙａｎｇ ｅｔ ａｌ．（２００６） Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１７６：２７８１。
ＭＨＣポリペプチド
上述の通り、本開示の多量体ポリペプチドは、ＭＨＣポリペプチドを含む。本開示のために、「主要組織適合複合体（ＭＨＣ）ポリペプチド」という用語は、ヒトＭＨＣ（ヒト白血球抗原（ＨＬＡ）とも呼ばれる）ポリペプチド、げっ歯類（例えば、マウス、ラット等）ＭＨＣポリペプチド、及び他の哺乳類種（例えば、ウサギ目、非ヒト霊長類、イヌ科、ネコ科、有蹄動物（例えば、ウマ、ウシ、ヒツジ、ヤギ等）等、様々な種のＭＨＣポリペプチドを含むように意図されている。「ＭＨＣポリペプチド」という用語は、クラスＩのＭＨＣポリペプチド（例えば、β‐２ミクログロブリン及びＭＨＣクラスＩ重鎖）及びＭＨＣクラスＩＩポリペプチド（例えば、ＭＨＣクラスＩＩαポリペプチド及びＭＨＣクラスＩＩβポリペプチド）を含むように意図されている。
上述の通り、本開示の多量体ポリペプチドのいくつかの実施形態において、該第一のＭＨＣポリペプチド及び該第二のＭＨＣポリペプチドは、クラスＩのＭＨＣポリペプチドであり；例えば、いくつかの場合、該第一のＭＨＣポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩのβ２ミクログロブリン（Ｂ２Ｍ）ポリペプチドであり、該第二のＭＨＣポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩ重鎖（Ｈ鎖）である。他の例では、該第一のＭＨＣポリペプチ及び該第二のＭＨＣポリペプチドは、クラスＩＩのＭＨＣポリペプチドであり；例えば、いくつかの場合、該第一のＭＨＣポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα鎖ポリペプチドであり、該第二のＭＨＣポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ鎖ポリペプチドである。他の例では、該第一のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ鎖ポリペプチドであり、該第二のＭＨＣポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα鎖ポリペプチドである。
いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドのＭＨＣポリペプチドは、「ヒト白血球抗原」（「ＨＬＡ」）ポリペプチドとも呼ばれる、ヒトＭＨＣポリペプチドである。いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドのＭＨＣポリペプチドは、クラスＩのＨＬＡポリペプチド、例えば、β２ミクログロブリンポリペプチド、またはクラスＩのＨＬＡの重鎖ポリペプチドである。クラスＩのＨＬＡの重鎖ポリペプチドとしては、ＨＬＡ−Ａの重鎖ポリペプチド、ＨＬＡ−Ｂの重鎖ポリペプチド、ＨＬＡ−Ｃの重鎖ポリペプチド、ＨＬＡ−Ｅの重鎖ポリペプチド、ＨＬＡ−Ｆの重鎖ポリペプチド、及びＨＬＡ−Ｇの重鎖ポリペプチドが挙げられる。いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドのＭＨＣポリペプチドは、クラスＩＩのＨＬＡポリペプチド、例えば、クラスＩＩのＨＬＡα鎖またはクラスＩＩのＨＬＡのβ鎖である。ＭＨＣクラスＩＩのポリペプチドとしては、ＭＣＨクラスＩＩのＤＰα及びβポリペプチド、ＤＭα及びβポリペプチド、ＤＯＡα及びβポリペプチド、ＤＯＢα及びβポリペプチド、ＤＱα及びβポリペプチド、並びにＤＲα及びβポリペプチドが挙げられる。
例として、本開示の多量体ポリペプチドのＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、図２５Ａに示すヒトＨＬＡ−Ａ重鎖ポリペプチドのアミノ酸配列のアミノ酸２５〜３６５に対する少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含みうる。
例として、本開示の多量体ポリペプチドのＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、以下のヒトＨＬＡ−Ａ重鎖のアミノ酸配列：
Figure 0006652680
のアミノ酸２５〜３６５に対する少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含みうる。
別の例として、本開示の多量体ポリペプチドのＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、図２５Ｂに示すヒトＨＬＡ−Ｂ重鎖ポリペプチドのアミノ酸配列のアミノ酸２５〜３６２に対する少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含みうる。
別の例として、本開示の多量体ポリペプチドのＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、図２５Ｃに示すヒトＨＬＡ−Ｃ重鎖ポリペプチドのアミノ酸配列のアミノ酸２５〜３６２に対する少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含みうる。
別の例として、本開示の多量体ポリペプチドのＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、以下のアミノ酸配列：
Figure 0006652680
に対する少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含みうる。
本開示の多量体ポリペプチドのβ２ミクログロブリン（Ｂ２Ｍ）ポリペプチドは、ヒトＢ２Ｍポリペプチド、非ヒト霊長類Ｂ２Ｍポリペプチド、マウスＢ２Ｍポリペプチド等でありうる。いくつかの場合、Ｂ２Ｍポリペプチドは、図２０に示すＢ２Ｍのアミノ酸配列に対する少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
いくつかの場合、ＭＨＣポリペプチドは、参照ＭＨＣポリペプチド（参照ＭＨＣポリペプチドは野生型ＭＨＣポリペプチドでありうる）に対して単一のアミノ酸置換を含み、該単一のアミノ酸置換は、システイン（Ｃｙｓ）残基でアミノ酸を置換する。かかるシステイン残基は、本開示の多量体ポリペプチドの第一のポリペプチドのＭＨＣポリペプチドに存在する場合、本開示の多量体ポリペプチドの第二のポリペプチド鎖に存在するシステイン残基とジスルフィド結合を形成することができる。
いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドの第一のポリペプチドの第一のＭＨＣポリペプチド及び／または本開示の多量体ポリペプチドの第二のポリペプチドの第二のＭＨＣポリペプチドは、システインでアミノ酸を置換するアミノ酸置換を含み、該第一のＭＨＣポリペプチド内の該置換システインは、該第二のＭＨＣポリペプチド内のシステインとジスルフィド結合を形成するか、該第一のＭＨＣポリペプチド内のシステインは該第二のＭＨＣポリペプチド内の該置換システインとジスルフィド結合を形成するか、または、該第一のＭＨＣポリペプチド内の該置換システインは、該第二のＭＨＣポリペプチド内の該置換システインとジスルフィド結合を形成する。
例えば、いくつかの場合、ＨＬＡのβ２ミクログロブリン及びＨＬＡクラスＩ重鎖の以下の残基の対のうちの１つがシステインで置換される：１）Ｂ２Ｍ残基１２、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基２３６；２）Ｂ２Ｍ残基１２、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基２３７；３）Ｂ２Ｍ残基８、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基２３４；４）Ｂ２Ｍ残基１０、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基２３５；５）Ｂ２Ｍ残基２４、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基２３６；６）Ｂ２Ｍ残基２８、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基２３２；７）Ｂ２Ｍ残基９８、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基１９２；８）Ｂ２Ｍ残基９９、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基２３４；９）Ｂ２Ｍ残基３、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基１２０；１０）Ｂ２Ｍ残基３１、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基９６；１１）Ｂ２Ｍ残基５３、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基３５；１２）Ｂ２Ｍ残基６０、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基９６；１３）Ｂ２Ｍ残基６０、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基１２２；１４）Ｂ２Ｍ残基６３、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基２７；１５）Ｂ２Ｍ残基Ａｒｇ３、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基Ｇｌｙ１２０；１６）Ｂ２Ｍ残基Ｈｉｓ３１、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基Ｇｌｎ９６；１７）Ｂ２Ｍ残基Ａｓｐ５３、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基Ａｒｇ３５；１８）Ｂ２Ｍ残基Ｔｒｐ６０、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基Ｇｌｎ９６；１９）Ｂ２Ｍ残基Ｔｒｐ６０、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基Ａｓｐ１２２；２０）Ｂ２Ｍ残基Ｔｙｒ６３、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基Ｔｙｒ２７；２１）Ｂ２Ｍ残基Ｌｙｓ６、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基Ｇｌｕ２３２；２２）Ｂ２Ｍ残基Ｇｌｎ８、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基Ａｒｇ２３４；２３）Ｂ２Ｍ残基Ｔｙｒ１０、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基Ｐｒｏ２３５；２４）Ｂ２Ｍ残基Ｓｅｒ１１、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基Ｇｌｎ２４２；２５）Ｂ２Ｍ残基Ａｓｎ２４、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基Ａｌａ２３６；２６）Ｂ２Ｍ残基Ｓｅｒ２８、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基Ｇｌｕ２３２；２７）Ｂ２Ｍ残基Ａｓｐ９８、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基Ｈｉｓ１９２；及び２８）Ｂ２Ｍ残基Ｍｅｔ９９、ＨＬＡクラスＩ重鎖残基Ａｒｇ２３４。該ＭＨＣ／ＨＬＡクラスＩ重鎖の該アミノ酸番号は、シグナルペプチドを除いた成熟ＭＨＣ／ＨＬＡクラスＩ重鎖に準拠している。例えば、シグナルペプチドを含む、図２５Ａに示すアミノ酸配列において、Ｇｌｙ１２０はＧｌｙ１４４であり；Ｇｌｎ９６はＧｌｎ１２０である等。
免疫調節ポリペプチド
本開示の多量体ポリペプチドの免疫調節ポリペプチドは、活性化免疫調節ポリペプチドまたは阻害性免疫調節ポリペプチドでありうる。いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドは、単一の免疫調節ポリペプチドを含む。いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドは、２つの免疫調節ポリペプチドを含む。いくつかの場合、該２つの免疫調節ポリペプチドは、ポリペプチド鎖内でタンデムになっている。いくつかの場合、該２つの免疫調節ポリペプチドは、別々のポリペプチド鎖中に存在する。いくつかの場合、該２つの免疫調節ポリペプチドは、別々のポリペプチド鎖中に存在して互いにジスルフィド結合されている。
本開示の多量体ポリペプチドの免疫調節ポリペプチドは、いくつかの例ではＴ細胞調節ポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｔ細胞調節ポリペプチドは、刺激性（活性化）Ｔ細胞調節ポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｔ細胞調節ポリペプチドは、阻害性Ｔ細胞調節ポリペプチドである。Ｔ細胞調節ポリペプチドは、抗体、ペプチドリガンド、Ｔ細胞共刺激ポリペプチド、サイトカイン、または毒素でありうる。
いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドの免疫調節ポリペプチドは、エピトープ特異的Ｔ細胞の表面で発現する共刺激ポリペプチドと特異的に結合する抗体系または非抗体系認識部分である。抗体系認識部分としては、例えば、抗体；限定されないが、Ｆａｂ、Ｆｖ、一本鎖Ｆｖ（ｓｃＦｖ）、及びＦｄフラグメントが挙げられる抗原に対する特異的結合を保つ抗体のフラグメント；キメラ抗体；ヒト化抗体；一本鎖抗体（ｓｃＡｂ）、単一ドメイン抗体（ｄＡｂ）；単一ドメイン重鎖抗体；単一ドメイン軽鎖抗体等が挙げられる。適切な非抗体系認識部分としては、例えばアフィボディ（ａｆｆｉｂｏｄｙ）；遺伝子操作されたＫｕｎｉｔｚドメイン；モノボディ（アドネクチン（ａｄｎｅｃｔｉｎ））；アンチカリン（ａｎｔｉｃａｌｉｎ）；アプタマー；設計されたアンキリンリピートドメイン（ＤＡＲＰｉｎ）；システインリッチポリペプチドの結合部位（例えば、システインリッチｋｎｏｔｔｉｎペプチド）；アビマー（ａｖｉｍｅｒ）；アフリン（ａｆｆｌｉｎ）等が挙げられる。抗体系または非抗体系認識部分は、エピトープ特異的Ｔ細胞の表面で発現する共刺激ポリペプチドと特異的に結合し、かかる共刺激ポリペプチドとしては、限定されないが、ＣＴＬＡ４、ＰＤ１、ＩＣＯＳ、ＯＸ４０、ＣＤ２０、及び４−１ＢＢが挙げられる。エピトープ特異的Ｔ細胞の表面で発現する共刺激ポリペプチドは、当技術分野で周知である。
いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドの免疫調節ポリペプチドは、Ｔ細胞共刺激ポリペプチドである。いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドの免疫調節ポリペプチドは、Ｔ細胞共刺激ポリペプチドでありかつ腫瘍壊死因子（ＴＮＦ）スーパーファミリーの一員であり；例えば、ＦａｓＬポリペプチド、４１ＢＢＬポリペプチド、ＣＤ４０ポリペプチド、ＯＸ４０Ｌポリペプチド、ＣＤ３０Ｌポリペプチド、ＣＤ７０ポリペプチド等である。いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドの免疫調節ポリペプチドは、Ｔ細胞共刺激ポリペプチドでありかつ免疫グロブリン（Ｉｇ）スーパーファミリーの一員であり；例えば、ＣＤ７ポリペプチド、ＣＤ８６ポリペプチド、ＩＣＡＭポリペプチド等である。
本開示の多量体ポリペプチドの適切な免疫調節ポリペプチドとしては、限定されないが、ＣＤ８０（Ｂ７−１）、ＣＤ８６（Ｂ７−２）、４−１ＢＢＬ、ＯＸ４０Ｌ、ＩＣＯＳ−Ｌ、ＩＣＡＭ、ＰＤ−Ｌ１、ＦａｓＬ、及びＰＤ−Ｌ２が挙げられる。本開示の多量体ポリペプチドの適切な免疫調節ポリペプチドとしては、例えば、ＣＤ７、ＣＤ３０Ｌ、ＣＤ４０、ＣＤ７０、ＣＤ８３、ＨＬＡ−Ｇ、ＭＩＣＡ、ＭＩＣＢ、ＨＶＥＭ、リンホトキシンβ受容体、３／ＴＲ６、ＩＬＴ３、ＩＬＴ４、及びＨＶＥＭが挙げられる。
いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドのＴ細胞調節ポリペプチドは、ＰＤ−Ｌ１ポリペプチドである。いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドのＰＤ−Ｌ１ポリペプチドは、図２６Ａまたは２６Ｂに示すＰＤ−Ｌ１のアミノ酸配列のアミノ酸１９〜２９０に対する少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドのＴ細胞調節ポリペプチドは、４−１ＢＢＬポリペプチドである。いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドの４−１ＢＢＬポリペプチドは、図２７に示す４−１ＢＢＬのアミノ酸配列のアミノ酸５０〜２５４に対する少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドのＴ細胞調節ポリペプチドは、ＩＣＯＳ−Ｌポリペプチドである。いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドのＩＣＯＳ−Ｌポリペプチドは、図２８に示すＩＣＯＳ−Ｌのアミノ酸配列のアミノ酸１９〜３０２に対する少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドのＴ細胞調節ポリペプチドは、ＯＸ４０Ｌポリペプチドである。いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドのＯＸ４０Ｌポリペプチドは、図２９に示すＯＸ４０Ｌのアミノ酸配列のアミノ酸１〜１８３に対する少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドのＴ細胞調節ポリペプチドは、ＰＤ−Ｌ２ポリペプチドである。いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドのＰＤ−Ｌ２ポリペプチドは、図３０に示すＰＤ−Ｌ２のアミノ酸配列のアミノ酸２０〜２７３に対する少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドのＴ細胞調節ポリペプチドは、ＣＤ８０（Ｂ７−１）ポリペプチドである。いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドのＣＤ８０ポリペプチドは、図３１に示すＣＤ８０のアミノ酸配列のアミノ酸３５〜２８８に対する少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドのＴ細胞調節ポリペプチドは、ＣＤ８６ポリペプチドである。いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドのＣＤ８６ポリペプチドは、図３２に示すＣＤ８６のアミノ酸配列のアミノ酸３１〜３２９に対する少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドのＴ細胞調節ポリペプチドは、ＦａｓＬポリペプチドである。いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドのＦａｓＬポリペプチドは、図３３に示すＦａｓＬのアミノ酸配列のアミノ酸１〜２８１に対する少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
本発明で用いられうるさらなるＴ細胞調節ドメイン（ＭＯＤ）としては、天然由来または合成ヒト遺伝子産物（タンパク質）、限定されないが、古典的及び非古典的（例えば、ＦＧＦ２、ＩＬ１、Ｓ１００Ａ４）分泌機構に起因するすべての分泌タンパク質を含むヒト遺伝子産物を標的とする親和性試薬（例えば、抗体、抗体フラグメント、一本鎖Ｆｖ、アプタマー、ナノボディ）、並びに天然由来の遺伝的にコードされたタンパク質セグメント（単一膜もしくは多重膜のスパン）またはＧＰＩ連結等の翻訳後修飾によって固定されたすべての細胞表面タンパク質の外部ドメインが挙げられる。細胞表面グリカンもしくは他の翻訳後修飾（例えば、硫酸化）を標的とする任意の天然由来または合成親和性試薬（例えば、抗体、抗体フラグメント、一本鎖Ｆｖ、アプタマー、ナノボディ、レクチン等）である。例としては、限定されないが、ＴＮＦ／ＴＮＦＲファミリー員（ＯＸ４０Ｌ、ＩＣＯＳＬ、ＦＡＳＬ、ＬＴＡ、ＬＴＢ、ＴＲＡＩＬ、ＣＤ１５３、ＴＮＦＳＦ９、ＲＡＮＫＬ、ＴＷＥＡＫ、ＴＮＦＳＦ１３、ＴＮＦＳＦ１３ｂ、ＴＮＦＳＦ１４、ＴＮＦＳＦ１５、ＴＮＦＳＦ１８、ＣＤ４０ＬＧ、ＣＤ７０）または該ＴＮＦ／ＴＮＦＲファミリー員指向の親和性試薬；該免疫グロブリンスーパーファミリー員（ＶＩＳＴＡ、ＰＤ１、ＰＤ−Ｌ１、ＰＤ−Ｌ２、Ｂ７１、Ｂ７２、ＣＴＬＡ４、ＣＤ２８、ＴＩＭ３、ＣＤ４、ＣＤ８、ＣＤ１９、Ｔ細胞受容体鎖、ＩＣＯＳ、ＩＣＯＳリガンド、ＨＨＬＡ２、ブチロフィリン、ＢＴＬＡ、Ｂ７−Ｈ３、Ｂ７−Ｈ４、ＣＤ３、ＣＤ７９ａ、ＣＤ７９ｂ、ＩｇＳＦ ＣＡＭＳ（ＣＤ２、ＣＤ５８、ＣＤ４８、ＣＤ１５０、ＣＤ２２９、ＣＤ２４４、ＩＣＡＭ−１を含む）、白血球免疫グロブリン様受容体（ＬＩＬＲ）、キラー細胞免疫グロブリン様受容体（ＫＩＲ））、レクチンスーパーファミリー員、セレクチン、サイトカイン／ケモカイン及びサイトカイン／ケモカイン受容体、成長因子及び成長因子受容体）、接着分子（インテグリン、フィブロネクチン、カドヘリン）、もしくは多スパンの内在性膜タンパク質の外部ドメイン、または該免疫グロブリンスーパーファミリー及び記載された遺伝子産物指向の親和性試薬が挙げられる。さらに、限定されないが、ウイルス配列（例えば、ＣＭＶ、ＥＢＶ）、細菌配列、真菌配列、真核病原体（例えば、Ｓｃｈｉｓｔｏｓｏｍａ、Ｐｌａｓｍｏｄｉｕｍ、Ｂａｂｅｓｉａ、Ｅｉｍｅｒｉａ、Ｔｈｅｉｌｅｒｉａ、Ｔｏｘｏｐｌａｓｍａ、Ｅｎｔａｍｏｅｂａ、Ｌｅｉｓｈｍａｎｉａ、及びＴｒｙｐａｎｏｓｏｍａ）、並びに哺乳類由来コード領域を含むこれら遺伝子産物の活性ホモログ／オルソログである。さらに、ＭＯＤは、ヒト遺伝子産物を標的とする小分子薬物を含んでもよい。
Ｆｃポリペプチド
本開示の多量体ポリペプチドは、Ｆｃポリペプチドまたは別の適切な骨格ポリペプチドを含む。
適切な骨格ポリペプチドとしては、抗体系骨格ポリペプチド及び非抗体系骨格が挙げられる。非抗体系骨格としては、例えば、アルブミン、ＸＴＥＮ（延長組み換え）ポリペプチド、トランスフェリン、Ｆｃ受容体ポリペプチド、エラスチン様ポリペプチド（例えば、Ｈａｓｓｏｕｎｅｈ ｅｔ ａｌ．（２０１２）Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｅｎｚｙｍｏｌ．５０２：２１５参照；例えば、Ｘがプロリン以外のアミノ酸である、（Ｖａｌ−Ｐｒｏ−Ｇｌｙ−Ｘ−Ｇｌｙ）の５ペプチドの繰り返し単位を含むポリペプチド）、アルブミン結合ポリペプチド、シルク様ポリペプチド（例えば、Ｖａｌｌｕｚｚｉ ｅｔ ａｌ．（２００２）Ｐｈｉｌｏｓ Ｔｒａｎｓ Ｒ Ｓｏｃ Ｌｏｎｄ Ｂ Ｂｉｏｌ Ｓｃｉ．３５７：１６５参照）、シルクエラスチン様ポリペプチド（ＳＥＬＰ；例えば、Ｍｅｇｅｅｄ ｅｔ ａｌ．（２００２） Ａｄｖ Ｄｒｕｇ Ｄｅｌｉｖ Ｒｅｖ．５４：１０７５参照）等が挙げられる。適切なＸＴＥＮポリペプチドとしては、例えば、ＷＯ２００９／０２３２７０、ＷＯ２０１０／０９１１２２、ＷＯ２００７／１０３５１５、ＵＳ２０１０／０１８９６８２、及びＵＳ２００９／００９２５８２に開示のものが挙げられ；Ｓｃｈｅｌｌｅｎｂｅｒｇｅｒ ｅｔ ａｌ．（２００９）Ｎａｔ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．２７：１１８６も参照されたい。適切なアルブミンポリペプチドとしては、例えばヒト血清アルブミンが挙げられる。
適切な骨格ポリペプチドは、いくつかの場合、半減期延長ポリペプチドであろう。ゆえに、いくつかの場合、適切な骨格ポリペプチドは、該骨格ポリペプチドを欠く対照多量体ポリペプチドと比較して、該多量体ポリペプチドのインビボ半減期（例えば、血清半減期）を延ばす。例えば、いくつかの場合、骨格ポリペプチドは、該骨格ポリペプチドを欠く対照多量体ポリペプチドと比較して、該多量体ポリペプチドのインビボ半減期（例えば、血清半減期）を、少なくとも約１０％，少なくとも約１５％，少なくとも約２０％，少なくとも約２５％，少なくとも約５０％，少なくとも約２倍、少なくとも約２．５倍、少なくとも約５倍、少なくとも約１０倍、少なくとも約２５倍、少なくとも約５０倍、少なくとも約１００倍、または１００倍超延ばす。例えば、いくつかの場合、Ｆｃポリペプチドは、該Ｆｃポリペプチドを欠く対照多量体ポリペプチドと比較して、該多量体ポリペプチドのインビボ半減期（例えば、血清半減期）を、少なくとも約１０％、少なくとも約１５％、，少なくとも約２０％、少なくとも約２５％、少なくとも約５０％、少なくとも約２倍、少なくとも約２．５倍、少なくとも約５倍、少なくとも約１０倍、少なくとも約２５倍、少なくとも約５０倍、少なくとも約１００倍、または１００倍超延ばす。
本開示の多量体ポリペプチドのＦｃポリペプチドは、ヒトＩｇＧ１のＦｃ、ヒトＩｇＧ２のＦｃ、ヒトＩｇＧ３のＦｃ、ヒトＩｇＧ４のＦｃ等でありうる。いくつかの場合、該Ｆｃポリペプチドは、図２４Ａ〜Ｃに示すＦｃ領域のアミノ酸配列に対する少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合、該Ｆｃ領域は、図２４Ａに示すヒトＩｇＧ１Ｆｃポリペプチドに対する少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合、該Ｆｃポリペプチドは、図２４Ａに示すヒトＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチドに対する少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み；例えば、該Ｆｃポリペプチドは、図２４Ａに示すヒトＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチドのアミノ酸９９〜３２５に対する少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合、該Ｆｃポリペプチドは、図２４Ａに示すヒトＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチドに対する少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み；例えば、該Ｆｃポリペプチドは、図２４Ａに示すヒトＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチドのアミノ酸１９〜２４６に対する少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合、該Ｆｃポリペプチドは、図２４Ｂに示すヒトＩｇＭ Ｆｃポリペプチドに対する少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み；例えば、該Ｆｃポリペプチドは、図２４Ｂに示すヒトＩｇＭ Ｆｃポリペプチドのアミノ酸１〜２７６に対する少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合、該Ｆｃポリペプチドは、図２４Ｃに示すヒトＩｇＡ Ｆｃポリペプチドに対する少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み；例えば、該Ｆｃポリペプチドは、図２４Ｃに示すヒトＩｇＡ Ｆｃポリペプチドのアミノ酸１〜２３４に対する少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
追加ポリペプチド
本開示の多量体ポリペプチドのポリペプチド鎖は、上述したものに加えて１つ以上のポリペプチドを含むことができる。適切な追加ポリペプチドとしては、エピトープタグ及び親和性ドメインが挙げられる。該１つ以上の追加ポリペプチドは、本開示の多量体ポリペプチドのポリペプチド鎖のＮ末端に、本開示の多量体ポリペプチドのポリペプチド鎖のＣ末端に、または、本開示の多量体ポリペプチドのポリペプチド鎖の内部に含まれうる。
エピトープタグ
適切なエピトープタグとしては、限定されないが、ヘマグルチニン（ＨＡ；例えば、ＹＰＹＤＶＰＤＹＡ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２３）；ＦＬＡＧ（例えば、ＤＹＫＤＤＤＤＫ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２４）；ｃ−ｍｙｃ（例えば、ＥＱＫＬＩＳＥＥＤＬ；ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２５）等が挙げられる。
親和性ドメイン
親和性ドメインとしては、例えば、同定または精製に有用な、固体の担体に固定化されたもの等の、結合パートナーと相互作用できるペプチド配列が挙げられる。複数の連続するヒスチジン等の単一のアミノ酸をコードするＤＮＡ配列は、発現たんぱく質への融合時、ニッケルセファロース等の樹脂カラムへの高親和性結合による該組み換えタンパク質の一段階精製に用いられうる。典型的な親和性ドメインとしては、Ｈｉｓ５（ＨＨＨＨＨ）（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２６）、ＨｉｓＸ６（ＨＨＨＨＨＨ）（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２７）、Ｃ−ｍｙｃ（ＥＱＫＬＩＳＥＥＤＬ）（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２５）、Ｆｌａｇ（ＤＹＫＤＤＤＤＫ）（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２４）、ＳｔｒｅｐＴａｇ（ＷＳＨＰＱＦＥＫ）（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２８）、ヘマグルチニン、例えば、ＨＡ Ｔａｇ（ＹＰＹＤＶＰＤＹＡ）（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２３）、グルタチオン‐Ｓ‐トランスフェラーゼ（ＧＳＴ）、チオレドキシン、セルロース結合ドメイン、ＲＹＩＲＳ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３０）、Ｐｈｅ−Ｈｉｓ−Ｈｉｓ−Ｔｈｒ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１）、キチン結合ドメイン、Ｓ‐ペプチド、Ｔ７ペプチド、ＳＨ２ドメイン、Ｃ末端ＲＮＡタグ、
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、金属結合ドメイン、例えば、亜鉛結合ドメインまたはカルシウム結合ドメイン、例えば、カルシウム結合タンパク質、例えば、カルモジュリン、トロポニンＣ、カルシニューリンＢ、ミオシン軽鎖、リカバリン、Ｓ−モジュリン、ビジニン、ＶＩＬＩＰ、ニューロカルシン、ヒポカルシン、フリクエニン、カルトラクチン、カルパインラージサブユニット、Ｓ１００タンパク質、パルブアルブミン、カルビンジンＤ９Ｋ、カルビンジンＤ２８Ｋ、及びカルレチニン由来のもの、インテイン、ビオチン、ストレプトアビジン、ＭｙｏＤ、Ｉｄ、ロイシンジッパー配列、及びマルトース結合タンパク質が挙げられる。
修飾
本開示の多量体ポリペプチドは、該多量体ポリペプチドに共有結合的に連結した１つ以上の非ポリペプチド部分を含むことができる。適切な非ポリペプチド部分としては、例えば、生体適合性脂肪酸及びそれらの誘導体；ヒドロキシアルキルデンプン（ＨＡＳ）、例えば、ヒドロキシエチルデンプン（ＨＥＳ）；ポリエチレングリコール、；ヒアルロン酸（ＨＡ）；ヘパロサンポリマー（ＨＥＰ）；ホスホリルコリン系ポリマー；デキストラン；ポリシアル酸（ＰＳＡ）等が挙げられる。いくつかの場合、該非ポリペプチド部分は、該非ポリペプチド部分を含まない対照多量体ポリペプチドと比較して、該多量体ポリペプチドのインビボ半減期を延ばす。
いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドは、検出可能な標識を具備する。適切な検出可能な標識としては、放射性同位体、例えば、１２３１Ｉ（ヨウ素）、１８Ｆ（フッ素）、９９Ｔｃ（テクネチウム）、１１１Ｉｎ（インジウム）、６７Ｇａ（ガリウム）、放射性Ｇｄ同位体（１５３Ｇｄ）；造影剤、例えばガドリニウム（Ｇｄ）、ジスプロシウム、及び鉄；検出可能な産物を生成する酵素（例えば、ルシフェラーゼ、β−ガラクトシダーゼ、西洋ワサビペルオキシダーゼ、アルカリフォスファターゼ等）；蛍光タンパク質；発色タンパク質、染料（例えば、フルオレセインイソチオシアネート、ローダミン、フィコエリトリン等）；蛍光発光金属、例えば、１５２Ｅｕ、またはランタン系列のその他；化学発光化合物、例えば、ルミノール、イソルミノール、アクリジニウム塩等；生物発光化合物等が挙げられる。
活性
本開示の多量体ポリペプチドに存在する免疫調節（「ＭＯＤ」）ポリペプチドの特質に応じて、該多量体ポリペプチドは標的Ｔ細胞を活性化または阻害できる。本開示の多量体ポリペプチドは、該多量体ポリペプチドに存在するエピトープ特異的な標的Ｔ細胞を選択的に活性化または阻害する。「標的Ｔ細胞」としては、エピトープ特異的ＣＤ４＋Ｔ細胞、エピトープ特異的ＣＤ８＋Ｔ細胞が挙げられる。いくつかの場合、該標的ＣＤ４＋Ｔ細胞はヘルパーＴ細胞（例えば、Ｔｈ１、Ｔｈ２、またはＴｈ１７細胞）である。いくつかの場合、該標的ＣＤ４＋Ｔ細胞はＣＤ４＋／ＣＤ２５＋／ＦｏｘＰ３＋制御性Ｔ（Ｔｒｅｇ）細胞である。いくつかの場合、該標的Ｔ細胞は、ＣＤ８＋Ｔ細胞であり、細胞毒性Ｔ細胞である。いくつかの場合、該標的Ｔ細胞は、ＣＤ４＋Ｔ細胞またはＣＤ８＋Ｔ細胞であることができ一般にＣＤ４５ＲＯ＋である、メモリーＴ細胞である。いくつかの場合、該標的Ｔ細胞はＮＫ−Ｔ細胞である。
いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドは、Ｔ細胞のホーミング及びトラフィッキングを高める。例えば、いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドは、標的Ｔ細胞との接触時、治療部位への該標的Ｔ細胞の溢出を高める。いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドは、標的Ｔ細胞との接触時、治療部位への該標的Ｔ細胞の溢出を、該多量体ポリペプチドと接触されない該標的Ｔ細胞の溢出レベルと比較して、少なくとも１０％、少なくとも１５％、少なくとも２０％、少なくとも２５％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも７５％、少なくとも２倍、少なくとも５倍、少なくとも１０倍、少なくとも１５倍、少なくとも２０倍、少なくとも２５倍、少なくとも５０倍、少なくとも１００倍、または１００倍超高める。溢出の増大で、治療部位でのＴ細胞数を増加させることができる。いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドは、標的Ｔ細胞との接触時、治療部位でのＴ細胞数を増加させる。
いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドは、標的Ｔ細胞によるリンパ球のトラフィッキングを媒介または制御する、１つ以上のタンパク質の該標的Ｔ細胞による発現を高める。例えば、いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドは、標的Ｔ細胞との接触時、該標的Ｔ細胞における１つ以上の接着分子及び／またはケモカイン受容体分子のレベルを増加させる。例えば、いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドは、標的Ｔ細胞との接触時、該標的Ｔ細胞による１つ以上の接着分子及び／またはケモカイン受容体分子の発現を、該多量体ポリペプチドと接触されない該標的Ｔ細胞によって産生される該接着分子及び／またはケモカイン受容体分子のレベルと比較して、少なくとも２倍、少なくとも５倍、少なくとも１０倍、少なくとも１５倍、少なくとも２０倍、少なくとも２５倍、少なくとも５０倍、少なくとも１００倍、または１００倍超高める。接着分子の例としては、ＣＤ８Ｔ細胞によって産生される接着分子が挙げられ、かかる接着分子の例としては、限定されないが、ＣＤ４４、ＬＦＡ−１、及びＶＬＡ−４が挙げられる。ケモカイン受容体の例としては、ＣＤ８Ｔ細胞によって産生されるケモカイン受容体が挙げられ、かかるケモカイン受容体の例としては、限定されないが、ＣＣＲ５、ＣＣＲ７、及びＣＸＣＲ３が挙げられる。
いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドは、以前に認識したエピトープに対する迅速な細胞障害反応が可能なメモリーＴ細胞を生成する。例えば、いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドは、標的Ｔ細胞との接触時、０．５％以上の抗原特異的Ｔ細胞プールを含むメモリーＴ細胞を生成する。例えば、いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドは、標的Ｔ細胞との接触時、０．５％以上、１％以上、２％以上、３％以上、４％以上、５％以上、１０％以上、１５％以上、または２０％以上の抗原特異的Ｔ細胞プールを含むメモリーＴ細胞を生成する。Ｔメモリー細胞の細胞表面マーカーの一例はＣＤ４５ＲＯである。
いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドは、標的Ｔ細胞の増殖を高める。例えば、いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドは、標的Ｔ細胞との接触時、該標的Ｔ細胞の増殖を、該多量体ポリペプチドと接触されない該標的Ｔ細胞の増殖と比較して、少なくとも１０％、少なくとも１５％、少なくとも２０％、少なくとも２５％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも７５％、少なくとも２倍、少なくとも５倍、少なくとも１０倍、少なくとも１５倍、少なくとも２０倍、少なくとも２５倍、少なくとも５０倍、少なくとも１００倍、または１００倍超高める。
いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドは、標的細胞に対するＴ細胞の細胞毒性を高める。例えば、いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドは、標的Ｔ細胞との接触時、標的細胞に対する該Ｔ細胞の細胞毒性を、該多量体ポリペプチドと接触されない該標的細胞に対する該Ｔ細胞の細胞毒性と比較して、少なくとも１０％、少なくとも１５％、少なくとも２０％、少なくとも２５％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも７５％、少なくとも２倍、少なくとも５倍、少なくとも１０倍、少なくとも１５倍、少なくとも２０倍、少なくとも２５倍、少なくとも５０倍、少なくとも１００倍、または１００倍超高める。Ｔ細胞の標的としては、ウイルス感染細胞、がん細胞等が挙げられる。
いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドは、標的Ｔ細胞によるサイトカイン産生を高める。例えば、いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドは、標的Ｔ細胞との接触時、該Ｔ細胞によるサイトカイン産生を、該多量体ポリペプチドと接触されない該標的Ｔ細胞によって産生されるサイトカインレベルと比較して、少なくとも１０％、少なくとも１５％、少なくとも２０％、少なくとも２５％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも７５％、少なくとも２倍、少なくとも５倍、少なくとも１５倍、少なくとも２０倍、少なくとも２５倍、少なくとも５０倍、少なくとも１００倍、または１００倍超高める。サイトカインの例としては、Ｔｈ１細胞によって産生されるサイトカイン、例えば、ＩＬ−２、ＩＦＮ−γ、及びＴＮＦ−α；Ｔｈ１７細胞によって産生されるサイトカイン、例えば、ＩＬ−１７、ＩＬ−２１、及びＩＬ−２２；Ｔｒｅｇ細胞によって産生されるサイトカイン、例えば、ＴＧＦ−β、ＩＬ−３５、及びＩＬ−１０が挙げられる。
いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドは、標的Ｔ細胞によるサイトカイン産生を阻害する。例えば、いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドは、標的Ｔ細胞との接触時、標的Ｔ細胞によるサイトカイン産生を、該多量体ポリペプチドと接触されない該標的Ｔ細胞によって産生されるサイトカインレベルと比較して、少なくとも１０％、少なくとも１５％、少なくとも２０％、少なくとも２５％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、もしくは少なくとも９０％、または９０％超阻害する。サイトカインの例としては、Ｔｈ２細胞によって産生されるサイトカイン、例えば、ＩＬ−４、ＩＬ−５、ＩＬ−６、ＩＬ−１０、及びＩＬ−１３が挙げられる。
典型的な実施形態
本開示の多量体ポリペプチドの限定されない例としては以下が挙げられる。
１）ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）Ｔ細胞エピトープ；ｉｉ）ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド；及びｉｉｉ）４−ＢＢＬポリペプチドを含む第一のポリペプチド；並びにｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチド；及びｉｉ）ＩｇＦｃポリペプチドを含む第二のポリペプチドを含む多量体ポリペプチド。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチドは、該エピトープと該β２ミクログロブリンポリペプチドの間にリンカーポリペプチドを含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該リンカーポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合され；これら実施形態のいくつかでは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド及び／または該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、該ジスルフィド結合に関与するシステインを提供するためのアミノ酸置換を含む。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＡ ＦｃポリペプチドまたはＩｇＭ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、ＭＨＣクラスＩＩのポリペプチドが該ＭＨＣクラスＩのポリペプチドの代わりに用いられる。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、エピトープタグ及び／または親和性ドメインを該ＦｃポリペプチドのＣ末端に含む。
２）ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）Ｔ細胞エピトープ；ｉｉ）ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド；及びｉｉｉ）ＰＤ−Ｌ１ポリペプチドを含む第一のポリペプチド；並びにｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチド；及びｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む第二のポリペプチドを含む多量体ポリペプチド。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチドは該エピトープと該β２ミクログロブリンポリペプチドの間にリンカーポリペプチドを含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該リンカーポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合される。該エピトープと該β２ミクログロブリンポリペプチドの間にリンカーポリペプチドを含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合され；これら実施形態のいくつかでは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド及び／または該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、該ジスルフィド結合に関与するシステインを提供するためのアミノ酸置換を含む。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＡ ＦｃポリペプチドまたはＩｇＭ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、ＭＨＣクラスＩＩのポリペプチドが該ＭＨＣクラスＩのポリペプチドの代わりに用いられる。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、エピトープタグ及び／または親和性ドメインを該ＦｃポリペプチドのＣ末端に含む。
３）ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）Ｔ細胞エピトープ；ｉｉ）ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド；及びｉｉｉ）ＩＣＯＳ−Ｌポリペプチドを含む第一のポリペプチド；並びにｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチド；及びｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む第二のポリペプチドを含む多量体ポリペプチド。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチドは該エピトープと該β２ミクログロブリンポリペプチドの間にリンカーポリペプチドを含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該リンカーポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合され；これら実施形態のいくつかでは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド及び／または該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、該ジスルフィド結合に関与するシステインを提供するためのアミノ酸置換を含む。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＡ ＦｃポリペプチドまたはＩｇＭ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、ＭＨＣクラスＩＩのポリペプチドが該ＭＨＣクラスＩのポリペプチドの代わりに用いられる。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、エピトープタグ及び／または親和性ドメインを該ＦｃポリペプチドのＣ末端に含む。
４）ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）Ｔ細胞エピトープ；ｉｉ）ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド；及びｉｉｉ）ＯＸ４０Ｌポリペプチドを含む第一のポリペプチド；並びにｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチド；及びｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む第二のポリペプチドを含む多量体ポリペプチド。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチドは該エピトープと該β２ミクログロブリンポリペプチドの間にリンカーポリペプチドを含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該リンカーポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合され；これら実施形態のいくつかでは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド及び／または該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、該ジスルフィド結合に関与するシステインを提供するためのアミノ酸置換を含む。一部の例で は、該Ｉｇ のＦｃポリペプチドは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＡ ＦｃポリペプチドまたはＩｇＭ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、ＭＨＣクラスＩＩのポリペプチドが該ＭＨＣクラスＩのポリペプチドの代わりに用いられる。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、エピトープタグ及び／または親和性ドメインを該ＦｃポリペプチドのＣ末端に含む。
５）ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）Ｔ細胞エピトープ；ｉｉ）ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド；及びｉｉｉ）ＣＤ８０ポリペプチドを含む第一のポリペプチド；並びにｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチド；及びｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む第二のポリペプチドを含む多量体ポリペプチド。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチドは該エピトープと該β２ミクログロブリンポリペプチドの間にリンカーポリペプチドを含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該リンカーポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合され；これら実施形態のいくつかでは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド及び／または該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、該ジスルフィド結合に関与するシステインを提供するためのアミノ酸置換を含む。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＡ ＦｃポリペプチドまたはＩｇＭ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、ＭＨＣクラスＩＩのポリペプチドが該ＭＨＣクラスＩのポリペプチドの代わりに用いられる。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、エピトープタグ及び／または親和性ドメインを該ＦｃポリペプチドのＣ末端に含む。
６）ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）Ｔ細胞エピトープ；ｉｉ）ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド；及びｉｉｉ）ＣＤ８６ポリペプチドを含む第一のポリペプチド；並びにｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチド；及びｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む第二のポリペプチドを含む多量体ポリペプチド。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチドは該エピトープと該β２ミクログロブリンポリペプチドの間にリンカーポリペプチドを含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該リンカーポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合され；これら実施形態のいくつかでは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド及び／または該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、該ジスルフィド結合に関与するシステインを提供するためのアミノ酸置換を含む。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＡ ＦｃポリペプチドまたはＩｇＭ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、ＭＨＣクラスＩＩのポリペプチドが該ＭＨＣクラスＩのポリペプチドの代わりに用いられる。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、エピトープタグ及び／または親和性ドメインを該ＦｃポリペプチドのＣ末端に含む。
７）ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）Ｔ細胞エピトープ；ｉｉ）ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド；及びｉｉｉ）ＰＤ−Ｌ２ポリペプチドを含む第一のポリペプチド；並びにｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチド；及びｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む第二のポリペプチドを含む多量体ポリペプチドである。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチドは該エピトープと該β２ミクログロブリンポリペプチドの間にリンカーポリペプチドを含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該リンカーポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合され；これら実施形態のいくつかでは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド及び／または該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、該ジスルフィド結合に関与するシステインを提供するためのアミノ酸置換を含む。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＡ ＦｃポリペプチドまたはＩｇＭ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、ＭＨＣクラスＩＩのポリペプチドが該ＭＨＣクラスＩのポリペプチドの代わりに用いられる。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、エピトープタグ及び／または親和性ドメインを該ＦｃポリペプチドのＣ末端に含む。
８）ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）Ｔ細胞エピトープ；及びｉｉ）ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチドを含む第一のポリペプチド；並びにｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）ｉ）４−ＢＢＬポリペプチド；ｉｉ）ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチド；及びｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む第二のポリペプチドを含む多量体ポリペプチド。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチドは該エピトープと該β２ミクログロブリンポリペプチドの間にリンカーポリペプチドを含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該リンカーポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合され；これら実施形態のいくつかでは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド及び／または該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、該ジスルフィド結合に関与するシステインを提供するためのアミノ酸置換を含む。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＡ ＦｃポリペプチドまたはＩｇＭ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、ＭＨＣクラスＩＩのポリペプチドが該ＭＨＣクラスＩのポリペプチドの代わりに用いられる。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、エピトープタグ及び／または親和性ドメインを該ＦｃポリペプチドのＣ末端に含む。
９）ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）Ｔ細胞エピトープ；及びｉｉ）ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチドを含む第一のポリペプチド；並びにｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）ｉ）ＰＤ−Ｌ１ポリペプチド；ｉｉ）ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチド；及びｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む第二のポリペプチドを含む多量体ポリペプチド。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチドは該エピトープと該β２ミクログロブリンポリペプチドの間にリンカーポリペプチドを含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該リンカーポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合され；これら実施形態のいくつかでは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド及び／または該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、該ジスルフィド結合に関与するシステインを提供するためのアミノ酸置換を含む。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＡ ＦｃポリペプチドまたはＩｇＭ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、ＭＨＣクラスＩＩのポリペプチドが該ＭＨＣクラスＩのポリペプチドの代わりに用いられる。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、エピトープタグ及び／または親和性ドメインを該ＦｃポリペプチドのＣ末端に含む。
１０）ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）Ｔ細胞エピトープ；及びｉｉ）ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチドを含む第一のポリペプチド；並びにｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）ｉ）ＩＣＯＳ−Ｌポリペプチド；ｉｉ）ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチド；及びｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む第二のポリペプチドを含む多量体ポリペプチド。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチドは該エピトープと該β２ミクログロブリンポリペプチドの間にリンカーポリペプチドを含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該リンカーポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合され；これら実施形態のいくつかでは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド及び／または該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、該ジスルフィド結合に関与するシステインを提供するためのアミノ酸置換を含む。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＡ ＦｃポリペプチドまたはＩｇＭ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、ＭＨＣクラスＩＩのポリペプチドが該ＭＨＣクラスＩのポリペプチドの代わりに用いられる。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、エピトープタグ及び／または親和性ドメインを該ＦｃポリペプチドのＣ末端に含む。
１１）ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）Ｔ細胞エピトープ；及びｉｉ）ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチドを含む第一のポリペプチド；並びにｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）ｉ）ＯＸ４０Ｌポリペプチド；ｉｉ）ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチド；及びｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む第二のポリペプチドを含む多量体ポリペプチド。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチドは該エピトープと該β２ミクログロブリンポリペプチドの間にリンカーポリペプチドを含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該リンカーポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合され；これら実施形態のいくつかでは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド及び／または該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、該ジスルフィド結合に関与するシステインを提供するためのアミノ酸置換を含む。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＡ ＦｃポリペプチドまたはＩｇＭ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、ＭＨＣクラスＩＩのポリペプチドが該ＭＨＣクラスＩのポリペプチドの代わりに用いられる。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、エピトープタグ及び／または親和性ドメインを該ＦｃポリペプチドのＣ末端に含む。
１２）ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）Ｔ細胞エピトープ；及びｉｉ）ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチドを含む第一のポリペプチド；並びにｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）ｉ）ＣＤ８０ポリペプチド；ｉｉ）ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチド；及びｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む第二のポリペプチドを含む多量体ポリペプチド。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチドは該エピトープと該β２ミクログロブリンポリペプチドの間にリンカーポリペプチドを含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該リンカーポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合され；これら実施形態のいくつかでは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド及び／または該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、該ジスルフィド結合に関与するシステインを提供するためのアミノ酸置換を含む。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＡ ＦｃポリペプチドまたはＩｇＭ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、ＭＨＣクラスＩＩのポリペプチドが該ＭＨＣクラスＩのポリペプチドの代わりに用いられる。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、エピトープタグ及び／または親和性ドメインを該ＦｃポリペプチドのＣ末端に含む。
１３）ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）Ｔ細胞エピトープ；及びｉｉ）ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチドを含む第一のポリペプチド；並びにｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）ｉ）ＣＤ８６ポリペプチド；ｉｉ）ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチド；及びｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む第二のポリペプチドを含む多量体ポリペプチド。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチドは該エピトープと該β２ミクログロブリンポリペプチドの間にリンカーポリペプチドを含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該リンカーポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合され；これら実施形態のいくつかでは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド及び／または該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、該ジスルフィド結合に関与するシステインを提供するためのアミノ酸置換を含む。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＡ ＦｃポリペプチドまたはＩｇＭ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、ＭＨＣクラスＩＩのポリペプチドが該ＭＨＣクラスＩのポリペプチドの代わりに用いられる。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、エピトープタグ及び／または親和性ドメインを該ＦｃポリペプチドのＣ末端に含む。
１４）ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）Ｔ細胞エピトープ；及びｉｉ）ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチドを含む第一のポリペプチド；並びにｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）ｉ）ＰＤ−Ｌ２ポリペプチド；ｉｉ）ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチド；及びｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む第二のポリペプチドを含む多量体ポリペプチド。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチドは該エピトープと該β２ミクログロブリンポリペプチドの間にリンカーポリペプチドを含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該リンカーポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合され；これら実施形態のいくつかでは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド及び／または該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、該ジスルフィド結合に関与するシステインを提供するためのアミノ酸置換を含む。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＡ ＦｃポリペプチドまたはＩｇＭ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、ＭＨＣクラスＩＩのポリペプチドが該ＭＨＣクラスＩのポリペプチドの代わりに用いられる。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、エピトープタグ及び／または親和性ドメインを該ＦｃポリペプチドのＣ末端に含む。
１５）ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）Ｔ細胞エピトープ；及びｉｉ）ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチドを含む第一のポリペプチド；並びにｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）ｉ）ＦａｓＬポリペプチド；ｉｉ）ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチド；及びｉｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む第二のポリペプチドを含む多量体ポリペプチド。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチドは該エピトープと該β２ミクログロブリンポリペプチドの間にリンカーポリペプチドを含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該リンカーポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合され；これら実施形態のいくつかでは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド及び／または該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、該ジスルフィド結合に関与するシステインを提供するためのアミノ酸置換を含む。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＡ ＦｃポリペプチドまたはＩｇＭ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、ＭＨＣクラスＩＩのポリペプチドが該ＭＨＣクラスＩのポリペプチドの代わりに用いられる。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、エピトープタグ及び／または親和性ドメインを該ＦｃポリペプチドのＣ末端に含む。
１６）ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）Ｔ細胞エピトープ；ｉｉ）ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド；及びｉｉｉ）タンデムになっている２つの４−ＢＢＬポリペプチドを含む第一のポリペプチド；並びにｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチド；及びｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む第二のポリペプチドを含む多量体ポリペプチド。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチドは、該エピトープと該β２ミクログロブリンポリペプチドの間にリンカーポリペプチドを含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該リンカーポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合され；これら実施形態のいくつかでは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド及び／または該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、該ジスルフィド結合に関与するシステインを提供するためのアミノ酸置換を含む。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＡ ＦｃポリペプチドまたはＩｇＭ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、ＭＨＣクラスＩＩのポリペプチドが該ＭＨＣクラスＩのポリペプチドの代わりに用いられる。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、エピトープタグ及び／または親和性ドメインを該ＦｃポリペプチドのＣ末端に含む。
１７）ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）Ｔ細胞エピトープ；ｉｉ）ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド；及びｉｉｉ）タンデムになっている２つのＰＤ−Ｌ１ポリペプチドを含む第一のポリペプチド；並びにｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチド；及びｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む第二のポリペプチドを含む多量体ポリペプチド。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチドは、該エピトープと該β２ミクログロブリンポリペプチドの間にリンカーポリペプチドを含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該リンカーポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合され；これら実施形態のいくつかでは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド及び／または該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、該ジスルフィド結合に関与するシステインを提供するためのアミノ酸置換を含む。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＡ ＦｃポリペプチドまたはＩｇＭ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、ＭＨＣクラスＩＩのポリペプチドが該ＭＨＣクラスＩのポリペプチドの代わりに用いられる。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、エピトープタグ及び／または親和性ドメインを該ＦｃポリペプチドのＣ末端に含む。
１８）ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）Ｔ細胞エピトープ；ｉｉ）ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド；及びｉｉｉ）タンデムになっている２つのＩＣＯＳ−Ｌポリペプチドを含む第一のポリペプチド；並びにｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチド；及びｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む第二のポリペプチドを含む多量体ポリペプチド。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチドは、該エピトープと該β２ミクログロブリンポリペプチドの間にリンカーポリペプチドを含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該リンカーポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合され；これら実施形態のいくつかでは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド及び／または該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、該ジスルフィド結合に関与するシステインを提供するためのアミノ酸置換を含む。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＡ ＦｃポリペプチドまたはＩｇＭ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、ＭＨＣクラスＩＩのポリペプチドが該ＭＨＣクラスＩのポリペプチドの代わりに用いられる。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、エピトープタグ及び／または親和性ドメインを該ＦｃポリペプチドのＣ末端に含む。
１９）ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）Ｔ細胞エピトープ；ｉｉ）ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド；及びｉｉｉ）タンデムになっている２つのＯＸ４０Ｌポリペプチドを含む第一のポリペプチド；並びにｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチド；及びｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む第二のポリペプチドを含む多量体ポリペプチド。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチドは、該エピトープと該β２ミクログロブリンポリペプチドの間にリンカーポリペプチドを含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該リンカーポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合され；これら実施形態のいくつかでは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド及び／または該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、該ジスルフィド結合に関与するシステインを提供するためのアミノ酸置換を含む。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＡ ＦｃポリペプチドまたはＩｇＭ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、ＭＨＣクラスＩＩのポリペプチドが該ＭＨＣクラスＩのポリペプチドの代わりに用いられる。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、エピトープタグ及び／または親和性ドメインを該ＦｃポリペプチドのＣ末端に含む。
２０）ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）Ｔ細胞エピトープ；ｉｉ）ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド；及びｉｉｉ）タンデムになっている２つのＣＤ８０ポリペプチドを含む第一のポリペプチド；並びにｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチド；及びｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む第二のポリペプチドを含む多量体ポリペプチド。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチドは、該エピトープと該β２ミクログロブリンポリペプチドの間にリンカーポリペプチドを含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該リンカーポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合され；これら実施形態のいくつかでは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド及び／または該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、該ジスルフィド結合に関与するシステインを提供するためのアミノ酸置換を含む。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＡ ＦｃポリペプチドまたはＩｇＭ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、ＭＨＣクラスＩＩのポリペプチドが該ＭＨＣクラスＩのポリペプチドの代わりに用いられる。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、エピトープタグ及び／または親和性ドメインを該ＦｃポリペプチドのＣ末端に含む。
２１）ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）Ｔ細胞エピトープ；ｉｉ）ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド；及びｉｉｉ）タンデムになっている２つのＣＤ８６ポリペプチドを含む第一のポリペプチド；並びにｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチド；及びｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む第二のポリペプチドを含む多量体ポリペプチド。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチドは、該エピトープと該β２ミクログロブリンポリペプチドの間にリンカーポリペプチドを含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該リンカーポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合され；これら実施形態のいくつかでは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド及び／または該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、該ジスルフィド結合に関与するシステインを提供するためのアミノ酸置換を含む。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＡ ＦｃポリペプチドまたはＩｇＭ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、ＭＨＣクラスＩＩのポリペプチドが該ＭＨＣクラスＩのポリペプチドの代わりに用いられる。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、エピトープタグ及び／または親和性ドメインを該ＦｃポリペプチドのＣ末端に含む。
２２）ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）Ｔ細胞エピトープ；ｉｉ）ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド；及びｉｉｉ）タンデムになっている２つのＰＤ−Ｌ２ポリペプチドを含む第一のポリペプチド；並びにｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチド；及びｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む第二のポリペプチドを含む多量体ポリペプチド。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチドは、該エピトープと該β２ミクログロブリンポリペプチドの間にリンカーポリペプチドを含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該リンカーポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合され；これら実施形態のいくつかでは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド及び／または該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、該ジスルフィド結合に関与するシステインを提供するためのアミノ酸置換を含む。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ３ のＦｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＡ ＦｃポリペプチドまたはＩｇＭ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、ＭＨＣクラスＩＩ ポリペプチドが該ＭＨＣクラスＩ ポリペプチドの代わりに用いられる。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、エピトープタグ及び／または親和性ドメインを該ＦｃポリペプチドのＣ末端に含む。
２３）ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）Ｔ細胞エピトープ；ｉｉ）ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド；及びｉｉｉ）タンデムになっている２つのＦａｓＬポリペプチドを含む第一のポリペプチド；並びにｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチド；及びｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む第二のポリペプチドを含む多量体ポリペプチドである。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチドは、該エピトープと該β２ミクログロブリンポリペプチドの間にリンカーポリペプチドを含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該リンカーポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合され；これら実施形態のいくつかでは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド及び／または該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、該ジスルフィド結合に関与するシステインを提供するためのアミノ酸置換を含む。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＡ ＦｃポリペプチドまたはＩｇＭ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、ＭＨＣクラスＩＩ ポリペプチドが該ＭＨＣクラスＩ ポリペプチドの代わりに用いられる。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、エピトープタグ及び／または親和性ドメインを該ＦｃポリペプチドのＣ末端に含む。
２４）ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）Ｔ細胞エピトープ；ｉｉ）ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド；及びｉｉｉ）第一の４−１ＢＢＬポリペプチドを含む第一のポリペプチド；ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチド；及びｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む第二のポリペプチド；並びにｃ）第二の４−１ＢＢＬポリペプチドを含む第三のポリペプチドを含む多量体ポリペプチド。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは互いにジスルフィド結合され；該第一のポリペプチド及び該第三のポリペプチドは互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチドは、該エピトープと該β２ミクログロブリンポリペプチドの間にリンカーポリペプチドを含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該リンカーポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合され；これら実施形態のいくつかでは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド及び／または該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、該ジスルフィド結合に関与するシステインを提供するためのアミノ酸置換を含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第三のポリペプチドは、該第一の４−１ＢＢＬポリペプチド及び該第二の４−１ＢＢＬポリペプチドに存在する（またはその中に置換される）システイン残基を介して互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＡ ＦｃポリペプチドまたはＩｇＭ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、ＭＨＣクラスＩＩ ポリペプチドが該ＭＨＣクラスＩ ポリペプチドの代わりに用いられる。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、エピトープタグ及び／または親和性ドメインを該ＦｃポリペプチドのＣ末端に含む。
２５）ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）Ｔ細胞エピトープ；ｉｉ）ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド；及びｉｉｉ）第一のＰＤ−Ｌ１ポリペプチドを含む第一のポリペプチド；ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチド；及びｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む第二のポリペプチド；並びにｃ）第二のＰＤ−Ｌ１ポリペプチドを含む第三のポリペプチドを含む多量体ポリペプチド。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは互いにジスルフィド結合され；該第一のポリペプチド及び該第三のポリペプチドは互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチドは、該エピトープと該β２ミクログロブリンポリペプチドの間にリンカーポリペプチドを含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該リンカーポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合され；これら実施形態のいくつかでは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド及び／または該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、該ジスルフィド結合に関与するシステインを提供するためのアミノ酸置換を含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第三のポリペプチドは、該第一のＰＤ−Ｌ１ポリペプチド及び該第二のＰＤ−Ｌ１ポリペプチドに存在する（またはその中に置換される）システイン残基を介して互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＡ ＦｃポリペプチドまたはＩｇＭ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、ＭＨＣクラスＩＩ ポリペプチドが該ＭＨＣクラスＩ ポリペプチドの代わりに用いられる。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、エピトープタグ及び／または親和性ドメインを該ＦｃポリペプチドのＣ末端に含む。
２６）ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）Ｔ細胞エピトープ；ｉｉ）ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド；及びｉｉｉ）第一のＩＣＯＳ−Ｌポリペプチドを含む第一のポリペプチド；ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチド；及びｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む第二のポリペプチド；並びにｃ）第二のＩＣＯＳ−Ｌポリペプチドを含む第三のポリペプチドを含む多量体ポリペプチド。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは互いにジスルフィド結合され；該第一のポリペプチド及び該第三のポリペプチドは互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチドは、該エピトープと該β２ミクログロブリンポリペプチドの間にリンカーポリペプチドを含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該リンカーポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合され；これら実施形態のいくつかでは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド及び／または該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、該ジスルフィド結合に関与するシステインを提供するためのアミノ酸置換を含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第三のポリペプチドは、該第一のＩＣＯＳ−Ｌポリペプチド及び該第二のＩＣＯＳ−Ｌポリペプチドに存在する（またはその中に置換される）システイン残基を介して互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＡ ＦｃポリペプチドまたはＩｇＭ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、ＭＨＣクラスＩＩ ポリペプチドが該ＭＨＣクラスＩ ポリペプチドの代わりに用いられる。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、エピトープタグ及び／または親和性ドメインを該ＦｃポリペプチドのＣ末端に含む。
２７）ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）Ｔ細胞エピトープ；ｉｉ）ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド；及びｉｉｉ）第一のＯＸ４０Ｌポリペプチドを含む第一のポリペプチド；ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチド；及びｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む第二のポリペプチド；並びにｃ）第二のＯＸ４０Ｌポリペプチドを含む第三のポリペプチドを含む多量体ポリペプチド。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは互いにジスルフィド結合され；該第一のポリペプチド及び該第三のポリペプチドは互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチドは、該エピトープと該β２ミクログロブリンポリペプチドの間にリンカーポリペプチドを含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該リンカーポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合され；これら実施形態のいくつかでは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド及び／または該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、該ジスルフィド結合に関与するシステインを提供するためのアミノ酸置換を含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第三のポリペプチドは、該第一のＯＸ４０Ｌポリペプチド及び該第二のＯＸ４０Ｌポリペプチドに存在する（またはその中に置換される）システイン残基を介して互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＡ ＦｃポリペプチドまたはＩｇＭ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、ＭＨＣクラスＩＩ ポリペプチドが該ＭＨＣクラスＩ ポリペプチドの代わりに用いられる。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、エピトープタグ及び／または親和性ドメインを該ＦｃポリペプチドのＣ末端に含む。
２８）ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）Ｔ細胞エピトープ；ｉｉ）ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド；及びｉｉｉ）第一のＣＤ８０ポリペプチドを含む第一のポリペプチド；ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチド；及びｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む第二のポリペプチド；並びにｃ）第二のＣＤ８０ポリペプチドを含む第三のポリペプチドを含む多量体ポリペプチド。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは互いにジスルフィド結合され；該第一のポリペプチド及び該第三のポリペプチドは互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチドは、該エピトープと該β２ミクログロブリンポリペプチドの間にリンカーポリペプチドを含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該リンカーポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合され；これら実施形態のいくつかでは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド及び／または該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、該ジスルフィド結合に関与するシステインを提供するためのアミノ酸置換を含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第三のポリペプチドは、該第一のＣＤ８０ポリペプチド及び該第二のＣＤ８０ポリペプチドに存在する（またはその中に置換される）システイン残基を介して互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＡ ＦｃポリペプチドまたはＩｇＭ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、ＭＨＣクラスＩＩ ポリペプチドが該ＭＨＣクラスＩ ポリペプチドの代わりに用いられる。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、エピトープタグ及び／または親和性ドメインを該ＦｃポリペプチドのＣ末端に含む。
２９）ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）Ｔ細胞エピトープ；ｉｉ）ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド；及びｉｉｉ）第一のＣＤ８６ポリペプチドを含む第一のポリペプチド；ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチド；及びｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む第二のポリペプチド；並びにｃ）第二のＣＤ８６ポリペプチドを含む第三のポリペプチドを含む多量体ポリペプチド。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは互いにジスルフィド結合され；該第一のポリペプチド及び該第三のポリペプチドは互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチドは、該エピトープと該β２ミクログロブリンポリペプチドの間にリンカーポリペプチドを含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該リンカーポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合され；これら実施形態のいくつかでは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド及び／または該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、該ジスルフィド結合に関与するシステインを提供するためのアミノ酸置換を含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第三のポリペプチドは、該第一のＣＤ８６ポリペプチド及び該第二のＣＤ８６ポリペプチドに存在する（またはその中に置換される）システイン残基を介して互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＡ ＦｃポリペプチドまたはＩｇＭ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、ＭＨＣクラスＩＩ ポリペプチドが該ＭＨＣクラスＩ ポリペプチドの代わりに用いられる。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、エピトープタグ及び／または親和性ドメインを該ＦｃポリペプチドのＣ末端に含む。
３０）ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）Ｔ細胞エピトープ；ｉｉ）ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド；及びｉｉｉ）ＣＤ８０ポリペプチドを含む第一のポリペプチド；ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチド；及びｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む第二のポリペプチド；並びにｃ）ＣＤ８６ポリペプチドを含む第三のポリペプチドを含む多量体ポリペプチド。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは互いにジスルフィド結合され；該第一のポリペプチド及び該第三のポリペプチドは互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチドは、該エピトープと該β２ミクログロブリンポリペプチドの間にリンカーポリペプチドを含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該リンカーポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合され；これら実施形態のいくつかでは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド及び／または該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、該ジスルフィド結合に関与するシステインを提供するためのアミノ酸置換を含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第三のポリペプチドは、該ＣＤ８０ポリペプチド及び該ＣＤ８６ポリペプチドに存在する（またはその中に置換される）システイン残基を介して互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＡ ＦｃポリペプチドまたはＩｇＭ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、ＭＨＣクラスＩＩ ポリペプチドが該ＭＨＣクラスＩ ポリペプチドの代わりに用いられる。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、エピトープタグ及び／または親和性ドメインを該ＦｃポリペプチドのＣ末端に含む。
３１）ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）Ｔ細胞エピトープ；ｉｉ）ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド；及びｉｉｉ）第一のＰＤ−Ｌ２ポリペプチドを含む第一のポリペプチド；ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチド；及びｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む第二のポリペプチド；並びにｃ）第二のＰＤ−Ｌ２ポリペプチドを含む第三のポリペプチドを含む多量体ポリペプチド。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは互いにジスルフィド結合され；該第一のポリペプチド及び該第三のポリペプチドは互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチドは、該エピトープと該β２ミクログロブリンポリペプチドの間にリンカーポリペプチドを含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該リンカーポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合され；これら実施形態のいくつかでは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド及び／または該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、該ジスルフィド結合に関与するシステインを提供するためのアミノ酸置換を含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第三のポリペプチドは、該第一のＰＤ−Ｌ２ポリペプチド及び該第二のＰＤ−Ｌ２ポリペプチドに存在する（またはその中に置換される）システイン残基を介して互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＡ ＦｃポリペプチドまたはＩｇＭ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、ＭＨＣクラスＩＩ ポリペプチドが該ＭＨＣクラスＩ ポリペプチドの代わりに用いられる。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、エピトープタグ及び／または親和性ドメインを該ＦｃポリペプチドのＣ末端に含む。
かつ、３２）ａ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）Ｔ細胞エピトープ；ｉｉ）ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド；及びｉｉｉ）第一のＦａｓＬポリペプチドを含む第一のポリペプチド；ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順にｉ）ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチド；及びｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む第二のポリペプチド；並びにｃ）第二のＦａｓＬポリペプチドを含む第三のポリペプチドを含む多量体ポリペプチドである。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは互いにジスルフィド結合され；該第一のポリペプチド及び該第三のポリペプチドは互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチドは、該エピトープと該β２ミクログロブリンポリペプチドの間にリンカーポリペプチドを含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該リンカーポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチドに存在するシステイン残基と該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドに存在するシステイン残基を介して互いにジスルフィド結合され；これら実施形態のいくつかでは、該ＭＨＣクラスＩβ２ミクログロブリンポリペプチド及び／または該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、該ジスルフィド結合に関与するシステインを提供するためのアミノ酸置換を含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第三のポリペプチドは、該第一のＦａｓＬポリペプチド及び該第二のＦａｓＬポリペプチドに存在する（またはその中に置換される）システイン残基を介して互いにジスルフィド結合される。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＡ ＦｃポリペプチドまたはＩｇＭ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、ＭＨＣクラスＩＩ ポリペプチドが該ＭＨＣクラスＩ ポリペプチドの代わりに用いられる。いくつかの場合、該多量体ポリペプチドは、エピトープタグ及び／または親和性ドメインを該ＦｃポリペプチドのＣ末端に含む。
ポリタンパク質前駆体
本発明は、第一のＢ２Ｍリーダー配列と同一のアミノ酸配列、これに隣接する候補エピトープペプチド、これに隣接する第一のアミノ酸リンカー配列、これに隣接する、ヒト天然Ｂ２Ｍペプチド配列と同一のアミノ酸配列、これに隣接する第二のアミノ酸リンカー配列、これに隣接するＴ細胞調節ドメインペプチド配列、これに隣接する第三のアミノ酸リンカー、これに隣接する第二のＢ２Ｍリーダー配列、これに隣接する、ＭＨＣ重鎖と同一のアミノ酸配列、これに隣接する、免疫グロブリンＦｃドメインと同一のアミノ酸配列を含む、組み換えポリペプチドを提供する。
実施形態において、該第一のアミノ酸は、５０アミノ酸以下から最低５アミノ酸までの任意のアミノ酸配列でよい。実施形態において、該第二のアミノ酸リンカーは、７０アミノ酸以下から最低５アミノ酸までの任意のアミノ酸配列でよい。実施形態において、該第三のアミノ酸リンカーは、ウイルス２Ａペプチド、または既知のプロテアーゼ開裂能のペプチド（例えば、限定されない実施形態において、フューリン開裂部位、タバコエッチ病ウイルス［ＴＥＶ］配列、Ｐｒｅｃｉｓｓｉｏｎプロテアーゼ部位、またはトロンビンプロテアーゼ）でよい。実施形態において、該第一のアミノ酸は、
Figure 0006652680
を含む。実施形態において、該第二のアミノ酸リンカーは、
Figure 0006652680
を含む。実施形態において、該第三のアミノ酸リンカーは、
Figure 0006652680
を含む。
本発明はまた、第一のＢ２Ｍリーダー配列と同一のアミノ酸配列、これに隣接する候補エピトープペプチド、これに隣接する第一のアミノ酸リンカー配列、これに隣接する、ヒト天然Ｂ２Ｍペプチド配列と同一のアミノ酸配列、これに隣接する第二のアミノ酸リンカー配列、これに隣接する第二のＢ２Ｍリーダー配列、これに隣接するＴ細胞調節ドメインペプチド配列、これに隣接する第三のアミノ酸リンカー、これに隣接する、ＭＨＣ重鎖と同一のアミノ酸配列、これに隣接する、免疫グロブリンＦｃドメインと同一のアミノ酸配列を含む、組み換えポリペプチドも提供する。
リンカー
実施形態において、該第一のアミノ酸は、５０アミノ酸以下から最低５アミノ酸までの任意のアミノ酸配列でよい。実施形態において、該第二のアミノ酸リンカーは、７０アミノ酸以下から最低５アミノ酸までの任意のアミノ酸配列でよい。実施形態において、該第三のアミノ酸リンカーは、ウイルス２Ａペプチド、または既知のプロテアーゼ開裂能のペプチド（例えば、限定されない実施形態において、フューリン開裂部位、タバコエッチ病ウイルス［ＴＥＶ］配列、Ｐｒｅｃｉｓｓｉｏｎプロテアーゼ部位、またはトロンビンプロテアーゼ）でよい。実施形態において、該第一のアミノ酸は、
Figure 0006652680
を含む。実施形態において、該第二のアミノ酸リンカーは、
Figure 0006652680
を含む。実施形態において、該第三のアミノ酸リンカーは、
Figure 0006652680
を含む。
組み換えポリペプチドの実施形態において、該第三のアミノ酸リンカーは、自己開裂性である。該組み換えポリペプチドの実施形態において、該第二のアミノ酸リンカーは、自己開裂性である。該組み換えポリペプチドの実施形態において、該自己開裂性ペプチドはウイルス２Ａペプチドであるか、またはその配列を有する。実施形態において、該ウイルス２Ａペプチドは、ブタテッショウウイルス‐１（Ｐ２Ａ）、口蹄疫ウイルス（Ｆ２Ａ）、ゾーシア・アシグナ（Ｔｈｏｓｅａ ａｓｉｇｎａ）ウイルス（Ｔ２Ａ）、ウマ鼻炎Ａウイルス（Ｅ２Ａ）もしくはウイルスのブタテッショウウイルス‐１（Ｐ２Ａ）ペプチドであるか、または、これらのうちの１つの配列を有する。その代わりとして、これは、該２Ａ配列を完全に除去する２つの別個のプラスミド（またはウイルス）として与えられてもよい。
タンパク質分解的に開裂可能なリンカーは、アラニンカルボキシペプチダーゼ、ナラタケアスタシン、細菌性ロイシルアミノペプチダーゼ、がん凝血原、カテプシンＢ、クロストリパイン、細胞質アラニルアミノペプチダーゼ、エラスターゼ、エンドプロテアーゼＡｒｇ−Ｃ、エンテロキナーゼ、ガストリクシン、ゼラチナーゼ、Ｇｌｙ−Ｘカルボキシペプチダーゼ、グリシルエンドペプチダーゼ、ヒトライノウイルス３Ｃプロテアーゼ、ヒポデルミンＣ、ＩｇＡ特異的セリンエンドペプチダーゼ、ロイシルアミノペプチダーゼ、ロイシルエンドペプチダーゼ、ｌｙｓＣ、リソソームｐｒｏ−Ｘカルボキシペプチダーゼ、リシルアミノペプチダーゼ、メチオニルアミノペプチダーゼ、粘液細菌、ナーディライシン、膵内エンドペプチダーゼＥ、ピコルナイン２Ａ、ピコルナイン３Ｃ、プロエンドペプチダーゼ、プロリルアミノペプチダーゼ、プロタンパク質コンバーターゼＩ、プロタンパク質コンバーターゼＩＩ、ルスセリリシン、サッカロペプシン、セメノゲラーゼ、Ｔプラスミノーゲン活性化因子、トロンビン、組織カリクレイン、タバコエッチウイルス（ＴＥＶ）、トガビリン、トリプトファニルアミノペプチダーゼ、Ｕプラスミノーゲン活性化因子、Ｖ８、ベノンビンＡ、ベノンビンＡＢ、及びＸａａ−ｐｒｏアミノペプチダーゼからなる群から選択されるプロテアーゼによって認識されるプロテアーゼ認識配列を含みうる。いくつかの場合、該タンパク質分解的に開裂可能なリンカーは、宿主の酵素、例えば、宿主細胞によって天然に産生される酵素によって認識されるプロテアーゼ認識配列を含むことができる。
例えば、該タンパク質分解的に開裂可能なリンカーは、マトリックスメタロプロテイナーゼ開裂部位、例えば、コラゲナーゼ−１、−２、及び−３（ＭＭＰ−１、−８、及び−１３）、ゼラチナーゼＡ及びＢ（ＭＭＰ−２及び−９）、ストロメライシン１、２、及び３（ＭＭＰ−３、−１０、及び−１１）、マトリライシン（ＭＭＰ−７）、及び膜メタロプロテイナーゼ（ＭＴ１−ＭＭＰ及びＭＴ２−ＭＭＰ）から選択されるＭＭＰの開裂部位を含みうる。例えば、ＭＭＰ−９の該開裂配列は、Ｐｒｏ−Ｘ−Ｘ−Ｈｙ（Ｘは任意の残基を表す；Ｈｙは疎水性残基）、例えばＰｒｏ−Ｘ−Ｘ−Ｈｙ−（Ｓｅｒ／Ｔｈｒ）、例えば、Ｐｒｏ−Ｌｅｕ／Ｇｌｎ−Ｇｌｙ−Ｍｅｔ−Ｔｈｒ−Ｓｅｒ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３３）またはＰｒｏ−Ｌｅｕ／Ｇｌｎ−Ｇｌｙ−Ｍｅｔ−Ｔｈｒ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２１）である。プロテアーゼ開裂部位の別の例は、プラスミノーゲン活性化因子の開裂部位、例えば、ｕＰＡまたは組織プラスミノーゲン活性化因子（ｔＰＡ）開裂部位である。ｕＰＡ及びｔＰＡの開裂配列の具体例としては、Ｖａｌ−Ｇｌｙ−Ａｒｇを含む配列が挙げられる。タンパク質分解的に開裂可能なリンカーに含まれうるプロテアーゼ開裂部位の別の例は、タバコエッチウイルス（ＴＥＶ）のプロテアーゼ開裂部位、例えば、ＥＮＬＹＴＱＳ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４）であり、該プロテアーゼは該グルタミンと該セリンの間を開裂する。タンパク質分解的に開裂可能なリンカーに含まれうるプロテアーゼ開裂部位の別の例は、エンテロキナーゼの開裂部位、例えば、ＤＤＤＤＫ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５）であり、開裂は該リジン残基の後で生じる。タンパク質分解的に開裂可能なリンカーに含まれうるプロテアーゼ開裂部位の別の例は、トロンビンの開裂部位、例えば、ＬＶＰＲ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３６）である。タンパク質分解的に開裂可能なリンカーに含まれうるプロテアーゼ開裂部位の別の例は、フューリンの開裂部位、例えば、Ａｒｇ−Ｘ−（Ａｒｇ／Ｌｙｓ）−Ａｒｇであり、Ｘは任意のアミノ酸である。プロテアーゼ開裂部位を含むさらなる適切なリンカーとしては、１つ以上の、以下のアミノ酸配列を含むリンカーが挙げられる：ＰｒｅＳｃｉｓｓｉｏｎプロテアーゼ（ヒトライノウイルス３Ｃプロテアーゼ及びグルタチオン−Ｓ−トランスフェラーゼを含む融合タンパク質；Ｗａｌｋｅｒ ｅｔ ａｌ． （１９９４） Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ． １２：６０１）によって開裂されるＬＥＶＬＦＱＧＰ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７）；トロンビンの開裂部位、例えば、
Figure 0006652680
；カテプシンＢによって開裂される
Figure 0006652680
；エプスタイン‐バーウイルスプロテアーゼによって開裂される
Figure 0006652680
；ＭＭＰ−３（ストロメライシン）によって開裂される
Figure 0006652680
；ＭＭＰ−７（マトリライシン）によって開裂される
Figure 0006652680
；ＭＭＰ−９によって開裂される
Figure 0006652680
；サーモライシン様ＭＭＰによって開裂される
Figure 0006652680
；マトリックスメタロプロテイナーゼ２（ＭＭＰ−２）によって開裂される
Figure 0006652680
；カテプシンＬによって開裂される
Figure 0006652680
；カテプシンＤによって開裂される
Figure 0006652680
；マトリックスメタロプロテイナーゼ１（ＭＭＰ−１）によって開裂される
Figure 0006652680
；ウロキナーゼ型プラスミノーゲン活性化因子によって開裂される
Figure 0006652680
；膜型マトリックスメタロプロテイナーゼ１（ＭＴ−ＭＭＰ）によって開裂される
Figure 0006652680
；ストロメライシン３（またはＭＭＰ−１１）、サーモライシン、フィブロブラストコラゲナーゼ、及びストロメライシン−１によって開裂される
Figure 0006652680
；マトリックスメタロプロテイナーゼ１３（コラゲナーゼ−３）によって開裂される
Figure 0006652680
；組織型プラスミノーゲン活性化因子（ｔＰＡ）によって開裂される
Figure 0006652680
；ヒト前立腺特異的抗原によって開裂される
Figure 0006652680
；カリクレイン（ｈＫ３）によって開裂される
Figure 0006652680
；好中球エラスターゼによって開裂される
Figure 0006652680
；並びにカルパイン（カルシウム活性化中性プロテアーゼ）によって開裂される
Figure 0006652680
。適切なタンパク質分解的に開裂可能なリンカーのさらなる例として挙げられるのは、
Figure 0006652680
である。適切なタンパク質分解的に開裂可能なリンカーのさらなる例として挙げられるのは、
Figure 0006652680
である。
適切なリンカーの例としては２Ａリンカー（例えばＴ２Ａ）、２Ａ様リンカーまたは
その機能的等価物、及びこれらの組合せが挙げられる。いくつかの実施形態では、該リンカーは、ピコルナウイルス２Ａ様リンカー、ブタテッショウウイルス（Ｐ２Ａ）のＣＨＹＳＥＬ配列、ゾーシア・アシグナウイルス（Ｔ２Ａ）、並びにこれらの組合せ、変異体、及び機能的等価物を含む。他の実施形態では、該リンカー配列は、Ａｓｐ−Ｖａｌ／Ｉｌｅ−Ｇｌｕ−Ｘ−Ａｓｎ−Ｐｒｏ−Ｇｌｙ２Ａ−Ｐｒｏ２Ｂモチーフを含んでよく、これは該２Ａグリシン及び該２Ｂプロリンの間で開裂する。本開示の意図に関して、
Figure 0006652680
は、「タンパク質分解開裂部位」または「リボソームスキッピングシグナル」（ＣＨＹＳＥＬ）のどちらかと見なすことができる。例えば、Ｋｉｍ ｅｔ ａｌ． （２０１１） ＰＬｏＳ ＯＮＥ ６：ｅ１８５５６参照。該コードポリペプチドが２つのポリペプチド鎖として生成される機序は、該リンカーの自己開裂、リボソームスキッピング、または翻訳のシャントによる可能性がある。機序にかかわらず、本開示の多量体ポリペプチドの該少なくとも２つのポリペプチド鎖は、Ｐ２Ａ、Ｔ２Ａ、Ｅ２Ａ、またはＦ２Ａ配列を用いて作製されうる。適切なリンカーとしては、
Figure 0006652680
等のアミノ酸配列、またはＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６４〜６７に規定したアミノ酸配列に対して１〜５つのアミノ酸置換を有するアミノ酸配列（例えば、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６４〜６７に規定したアミノ酸配列に対して１〜５つの保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列）を含むポリペプチドが挙げられる。適切なリンカーとしては、
Figure 0006652680
等のアミノ酸配列、またはＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６４〜６７に規定したアミノ酸配列に対して１〜１０つのアミノ酸置換を有するアミノ酸配列（例えば、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６４〜６７に規定したアミノ酸配列に対して１〜１０つの保存的アミノ酸置換を有するアミノ酸配列）を含むポリペプチドが挙げられる。
エピトープ
組み換えポリペプチドの実施形態において、該候補エピトープは７〜２０アミノ酸を含む。該組み換えポリペプチドの実施形態において、該エピトープポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩについては５〜２０アミノ酸である。実施形態において、該エピトープペプチドは、ＭＨＣクラスＩにいては８〜１１アミノ酸である。実施形態において、該エピトープペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩについては５〜４０アミノ酸である。実施形態において、該エピトープペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩについては１３〜１７アミノ酸である。実施形態において、該エピトープペプチドは、任意の天然由来もしくは変異ヒト配列、または任意の病原体由来配列である。
ＭＨＣポリペプチド
組み換えポリペプチドの実施形態において、該第一のＢ２Ｍリーダー配列及び／または第二のＢ２Ｍリーダー配列は、ヒトＢ２Ｍリーダー配列の配列を有する。
いくつかの場合、リーダーペプチドは、以下のヒトＢ２Ｍリーダー配列：
Figure 0006652680
に対する少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
いくつかの場合、本明細書に記載のＢ２Ｍリーダー配列は、限定されないが、ヒトＢ２Ｍリーダー配列、霊長類Ｂ２Ｍリーダー配列、げっ歯類Ｂ２Ｍリーダー配列等が挙げられる哺乳類のＢ２Ｍリーダー配列でありうる。いくつかの場合、本明細書に記載のＢ２Ｍリーダー配列は、図２０に示すＢ２Ｍリーダー配列のうちの１つとの少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
実施形態において、該Ｂ２Ｍは、配列：
Figure 0006652680
を含む。
いくつかの場合、Ｂ２Ｍポリペプチドは、図２０に示すＢ２Ｍアミノ酸配列に対する少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
組み換えポリペプチドの実施形態において、該ＭＨＣ重鎖は、ヒトＭＨＣ重鎖である。該組み換えポリペプチドの実施形態において、該ＭＨＣ重鎖は、ＭＨＣ Ｉ分子である。典型的なＭＨＣ Ｉ重鎖としては、ＨＬＡ−Ａ、ＨＬＡ−Ｂ、ＨＬＡ−Ｃ、ＨＬＡ−Ｅ、ＨＬＡ−Ｆ、ＨＬＡ−Ｇ、ＨＬＡ−Ｋ、及びＨＬＡ−Ｌのα鎖が挙げられる。該組み換えポリペプチドの実施形態において、該ＭＨＣ重鎖は、ＨＬＡ−Ａ０２：０１である。実施形態において、該ＨＬＡはＨＬＡ−Ａ０２である。実施形態において、該ＨＬＡ−Ａ０２は配列：
Figure 0006652680
を含む。
組み換えポリペプチドの実施形態において、該ＭＨＣ重鎖は、ＭＨＣ ＩＩ分子である。典型的なＭＨＣ ＩＩ重鎖としては、ＨＬＡ−Ｄのものが挙げられる。
組み換えポリペプチドの実施形態において、該組み換えポリペプチドはさらに、そのヒト天然Ｂ２Ｍペプチド配列及びその重鎖配列との間のジスルフィド結合を生じさせるように該Ｂ２Ｍペプチド配列中及び該重鎖配列中に変異を含む。
組み換えポリペプチドの実施形態において、該組み換えポリペプチドの該重鎖配列は、ＨＬＡであり、該ジスルフィド結合は以下の残基の対の１つを連結する：
Ｂ２Ｍ残基１２、ＨＬＡ残基２３６；
Ｂ２Ｍ残基１２、ＨＬＡ残基２３７；
Ｂ２Ｍ残基８、ＨＬＡ残基２３４；
Ｂ２Ｍ残基１０、ＨＬＡ残基２３５；
Ｂ２Ｍ残基２４、ＨＬＡ残基２３６；
Ｂ２Ｍ残基２８、ＨＬＡ残基２３２；
Ｂ２Ｍ残基９８、ＨＬＡ残基１９２；
Ｂ２Ｍ残基９９、ＨＬＡ残基２３４；
Ｂ２Ｍ残基３、ＨＬＡ残基１２０；
Ｂ２Ｍ残基３１、ＨＬＡ残基９６；
Ｂ２Ｍ残基５３、ＨＬＡ残基３５；
Ｂ２Ｍ残基６０、ＨＬＡ残基９６；
Ｂ２Ｍ残基６０、ＨＬＡ残基１２２；
Ｂ２Ｍ残基６３、ＨＬＡ残基２７；
Ｂ２Ｍ残基Ａｒｇ３、ＨＬＡ残基Ｇｌｙ１２０；
Ｂ２Ｍ残基Ｈｉｓ３１、ＨＬＡ残基Ｇｌｎ９６；
Ｂ２Ｍ残基Ａｓｐ５３、ＨＬＡ残基Ａｒｇ３５；
Ｂ２Ｍ残基Ｔｒｐ６０、ＨＬＡ残基Ｇｌｎ９６；
Ｂ２Ｍ残基Ｔｒｐ６０、ＨＬＡ残基Ａｓｐ１２２；
Ｂ２Ｍ残基Ｔｙｒ６３、ＨＬＡ残基Ｔｙｒ２７；
Ｂ２Ｍ残基Ｌｙｓ６、ＨＬＡ残基Ｇｌｕ２３２；
Ｂ２Ｍ残基Ｇｌｎ８、ＨＬＡ残基Ａｒｇ２３４；
Ｂ２Ｍ残基Ｔｙｒ１０、ＨＬＡ残基Ｐｒｏ２３５；
Ｂ２Ｍ残基Ｓｅｒ１１、ＨＬＡ残基Ｇｌｎ２４２；
Ｂ２Ｍ残基Ａｓｎ２４、ＨＬＡ残基Ａｌａ２３６；
Ｂ２Ｍ残基Ｓｅｒ２８、ＨＬＡ残基Ｇｌｕ２３２；
Ｂ２Ｍ残基Ａｓｐ９８、ＨＬＡ残基Ｈｉｓ１９２；及び
Ｂ２Ｍ残基Ｍｅｔ９９、ＨＬＡ残基Ａｒｇ２３４
（Ｂ２Ｍ及びＨＬＡ配列についてはＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４及びＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５参照）。
組み換えポリペプチドの実施形態において、該重鎖配列はＨＬＡであり、該ジスルフィド結合は以下の残基の対の１つを連結する：
第一のリンカー部位Ｇｌｙ２、重鎖（ＨＬＡ）部位Ｔｙｒ８４；
軽鎖（Ｂ２Ｍ）部位Ａｒｇ１２、ＨＬＡ Ａｌａ２３６；及び／または
Ｂ２Ｍ残基Ａｒｇ１２、ＨＬＡ残基Ｇｌｙ２３７。
Ｆｃポリペプチド
組み換えポリペプチドの実施形態において、該免疫グロブリンＦｃドメインは、ＩｇＧのＦｃドメインである。該組み換えポリペプチドの実施形態において、該免疫グロブリンＦｃドメインは、ＩｇＡのＦｃドメインである。該組み換えポリペプチドの実施形態において、該免疫グロブリンＦｃドメインは、ＩｇＭのＦｃドメインである。該組み換えポリペプチドの実施形態において、該免疫グロブリンＦｃドメインは、ヒト免疫グロブリンのＦｃドメインである。該組み換えポリペプチドの実施形態において、該免疫グロブリンＦｃドメインは、ＩｇＧ１のＦｃドメインである。
免疫調節ポリペプチド
組み換えポリペプチドの実施形態において、該Ｔ細胞調節ドメインは阻害性ドメインである。
組み換えポリペプチドの実施形態において、該Ｔ細胞調節ドメインは刺激性ドメインである。
組み換えポリペプチドの実施形態において、該Ｔ細胞調節ドメインは、抗体及び抗体フラグメント、ペプチドリガンド、Ｔ細胞共刺激ペプチド、サイトカイン、または毒素である。
組み換えポリペプチドの実施形態において、該Ｔ細胞調節ドメインは、ＰＤ−Ｌ１ペプチド、ＰＤ−Ｌ１ペプチドのＩｇ可変ドメインを含むか、該Ｔ細胞調節ドメインは４−１ＢＢＬを含むか、該Ｔ細胞調節ドメインはＢ７−１Ｗ８８Ａを含むか、または、該Ｔ細胞調節ドメインは抗ＣＤ２８一本鎖Ｆｖを含む。
本発明に用いられうるさらなるＴ細胞調節ドメイン（ＭＯＤ）としては、天然由来または合成ヒト遺伝子産物（タンパク質）、限定されないが、古典的及び非古典的（例えば、ＦＧＦ２、ＩＬ１、Ｓ１００Ａ４）分泌機構に起因するすべての分泌タンパク質を含むヒト遺伝子産物を標的とする親和性試薬（例えば、抗体、抗体フラグメント、一本鎖Ｆｖ、アプタマー、ナノボディ）、並びに天然由来の遺伝的にコードされたタンパク質セグメント（単一膜もしくは多重膜のスパン）またはＧＰＩ連結等の翻訳後修飾によって固定されたすべての細胞表面タンパク質の外部ドメインが挙げられる。細胞表面グリカンもしくは他の翻訳後修飾（例えば、硫酸化）を標的とする任意の天然由来または合成親和性試薬（例えば、抗体、抗体フラグメント、一本鎖Ｆｖ、アプタマー、ナノボディ、レクチン等）である。例としては、限定されないが、ＴＮＦ／ＴＮＦＲファミリー員（ＯＸ４０Ｌ、ＩＣＯＳＬ、ＦＡＳＬ、ＬＴＡ、ＬＴＢ、ＴＲＡＩＬ、ＣＤ１５３、ＴＮＦＳＦ９、ＲＡＮＫＬ、ＴＷＥＡＫ、ＴＮＦＳＦ１３、ＴＮＦＳＦ１３ｂ、ＴＮＦＳＦ１４、ＴＮＦＳＦ１５、ＴＮＦＳＦ１８、ＣＤ４０ＬＧ、ＣＤ７０）または該ＴＮＦ／ＴＮＦＲファミリー員指向の親和性試薬；該免疫グロブリンスーパーファミリー員（ＶＩＳＴＡ、ＰＤ１、ＰＤ−Ｌ１、ＰＤ−Ｌ２、Ｂ７１、Ｂ７２、ＣＴＬＡ４、ＣＤ２８、ＴＩＭ３、ＣＤ４、ＣＤ８、ＣＤ１９、Ｔ細胞受容体鎖、ＩＣＯＳ、ＩＣＯＳリガンド、ＨＨＬＡ２、ブチロフィリン、ＢＴＬＡ、Ｂ７−Ｈ３、Ｂ７−Ｈ４、ＣＤ３、ＣＤ７９ａ、ＣＤ７９ｂ、ＩｇＳＦ ＣＡＭＳ（ＣＤ２、ＣＤ５８、ＣＤ４８、ＣＤ１５０、ＣＤ２２９、ＣＤ２４４、ＩＣＡＭ−１を含む）、白血球免疫グロブリン様受容体（ＬＩＬＲ）、キラー細胞免疫グロブリン様受容体（ＫＩＲ））、レクチンスーパーファミリー員、セレクチン、サイトカイン／ケモカイン及びサイトカイン／ケモカイン受容体、成長因子及び成長因子受容体）、接着分子（インテグリン、フィブロネクチン、カドヘリン）、もしくは多スパンの内在性膜タンパク質の外部ドメイン、または該免疫グロブリンスーパーファミリー及び記載された遺伝子産物指向の親和性試薬が挙げられる。さらに、限定されないが、ウイルス配列（例えば、ＣＭＶ、ＥＢＶ）、細菌配列、真菌配列、真核病原体（例えば、Ｓｃｈｉｓｔｏｓｏｍａ、Ｐｌａｓｍｏｄｉｕｍ、Ｂａｂｅｓｉａ、Ｅｉｍｅｒｉａ、Ｔｈｅｉｌｅｒｉａ、Ｔｏｘｏｐｌａｓｍａ、Ｅｎｔａｍｏｅｂａ、Ｌｅｉｓｈｍａｎｉａ、及びＴｒｙｐａｎｏｓｏｍａ）、並びに哺乳類由来コード領域を含むこれら遺伝子産物の活性ホモログ／オルソログである。さらに、ＭＯＤは、ヒト遺伝子産物を標的とする小分子薬物を含んでもよい。
追加ポリペプチド
組み換えポリペプチドの実施形態において、これらはさらにそのＣ末端に隣接するＨｉｓ−８タグを含む。
核酸
本明細書に記載の組み換えポリペプチドのいずれかをコードする核酸を提供する。実施形態において、該核酸はＤＮＡである。実施形態において、該核酸はｃＤＮＡである。実施形態において、該核酸はＲＮＡである。実施形態において、該核酸はｍＲＮＡである。
実施形態において、該組み換え核酸はベクターである。実施形態において、該ベクターはウイルスベクターである。実施形態において、該ウイルスベクターはレンチウイルスベクターである。
本開示は、本開示の多量体ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸を提供する。いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドの個々のポリペプチド鎖は別々の核酸でコードされる。いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドのすべてのポリペプチド鎖は単一の核酸でコードされる。いくつかの場合、第一の核酸は本開示の多量体ポリペプチドの第一のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み；第二の核酸は本開示の多量体ポリペプチドの第二のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む。いくつかの場合、単一の核酸が、本開示の多量体ポリペプチドの第一のポリペプチド及び本開示の多量体ポリペプチドの第二のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む。いくつかの場合、核酸は、上述の通り、ポリタンパク質前駆体をコードするヌクレオチド配列を含む。
多量体ポリペプチドの個々のポリペプチド鎖をコードする別々の核酸
本開示は、本開示の多量体ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸を提供する。上述の通り、いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドの個々のポリペプチド鎖は、別々の核酸でコードされる。いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドの別々のポリペプチド鎖をコードするヌクレオチド配列は、転写調節因子、例えば、真核細胞中で機能的であるプロモーター等の、構成的プロモーターまたは誘導プロモーターでありうるプロモーターに作動可能に連結されている。
本開示は、第一の核酸及び第二の核酸を提供し、該第一の核酸は本開示の多量体ポリペプチドの第一のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、該第一のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順にａ）エピトープ（例えば、Ｔ細胞エピトープ）；ｂ）第一のＭＨＣポリペプチド；及びｃ）免疫調節ポリペプチドを含み；該第二の核酸は本開示の多量体ポリペプチドの第二のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、該第二のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順にａ）第二のＭＨＣポリペプチド；及びｂ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む。適切なＴ細胞エピトープ、ＭＨＣポリペプチド、免疫調節ポリペプチド、及びＩｇ Ｆｃポリペプチドは上述の通りである。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は、転写調節因子に作動可能に連結されている。いくつかの場合、該転写調節因子は真核細胞中で機能的であるプロモーターである。いくつかの場合、該核酸は別々の発現ベクターに存在する。
本開示は、第一の核酸及び第二の核酸を提供し、該第一の核酸は本開示の多量体ポリペプチドの第一のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、該第一のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順にａ）エピトープ（例えば、Ｔ細胞エピトープ）；及びｂ）第一のＭＨＣポリペプチドを含み；該第二の核酸は本開示の多量体ポリペプチドの第二のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、該第二のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順にａ）免疫調節ポリペプチド；ｂ）第二のＭＨＣポリペプチド；及びｃ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む。適切なＴ細胞エピトープ、ＭＨＣポリペプチド、免疫調節ポリペプチド、及びＩｇ Ｆｃポリペプチドは上述の通りである。いくつかの場合、該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は、転写調節因子に作動可能に連結されている。いくつかの場合、該転写調節因子は真核細胞中で機能的であるプロモーターである。いくつかの場合、該核酸は別々の発現ベクターに存在する。
多量体ポリペプチドに存在する２つ以上のポリペプチドをコードする核酸
本開示は、本開示の多量体ポリペプチドの少なくとも該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸を提供する。本開示の多量体ポリペプチドが第一、第二、及び第三のポリペプチドを含むいくつかの場合、該核酸は、該第一、第二、及び第三のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む。いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドの該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は、該第一のポリペプチドをコードする該ヌクレオチド配列と該第二のポリペプチドをコードする該ヌクレオチド該列との間に挿入されたタンパク質分解的に開裂可能なリンカーを含む。いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドの該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は、該第一のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列と該第二のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列との間に挿入された配列内リボソーム進入部位（ＩＲＥＳ）を含む。いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドの該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は、該第一のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列と該第二のポリペプチドをコードするヌクレオチド該列との間に挿入されたリボソームスキッピングシグナル（またはシス作用性ヒドロラーゼ因子、ＣＨＹＳＥＬ）を含む。核酸の実施例は後述するが、タンパク質分解的に開裂可能なリンカーが、本開示の多量体ポリペプチドの該第一のポリペプチド及び該第二のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列の間に配置され；これら実施形態のいずれかにおいて、ＩＲＥＳまたはリボソームスキッピングシグナルを該タンパク質分解的に開裂可能なリンカーをコードするヌクレオチド配列の代わりに用いることができる。
いくつかの場合、第一の核酸（例えば、組み換え発現ベクター、ｍＲＮＡ、ウイルスＲＮＡ等）は、本開示の多量体ポリペプチドの第一のポリペプチド鎖をコードするヌクレオチド配列を含み；第二の核酸（例えば、組み換え発現ベクター、ｍＲＮＡ、ウイルスＲＮＡ等）は、本開示の多量体ポリペプチドの第二のポリペプチド鎖をコードするヌクレオチド配列を含む。いくつかの場合、該第一のポリペプチドをコードする該ヌクレオチド配列及び該第二のポリペプチドをコードする該第二のヌクレオチド配列はそれぞれ、転写調節因子、例えば、真核細胞中で機能的であるプロモーター等の、構成的プロモーターまたは誘導プロモーターでありうるプロモーターに作動可能に連結されている。
本開示は、組み換えポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸を提供し、該組み換えポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順にａ）エピトープ（例えば、Ｔ細胞エピトープ）；ｂ）第一のＭＨＣポリペプチド；ｃ）免疫調節ポリペプチド；ｄ）タンパク質分解的に開裂可能なリンカー；ｅ）第二のＭＨＣポリペプチド；及びｆ）免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドを含む。本開示は、組み換えポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸を提供し、該組み換えポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順にａ）第一のリーダーペプチド；ｂ）該エピトープ；ｃ）該第一のＭＨＣポリペプチド；ｄ）該免疫調節ポリペプチド；ｅ）該タンパク質分解的に開裂可能なリンカー；ｆ）第二のリーダーペプチド；ｇ）該第二のＭＨＣポリペプチド；及びｈ）該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む。本開示は、組み換えポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸を提供し、該組み換えポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順にａ）エピトープ；ｂ）第一のＭＨＣポリペプチド；ｃ）タンパク質分解的に開裂可能なリンカー；ｄ）免疫調節ポリペプチド；ｅ）第二のＭＨＣポリペプチド；及びｆ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチドを含む。いくつかの場合、該第一のリーダーペプチド及び該第二のリーダーペプチドは、β２−Ｍリーダーペプチドである。いくつかの場合、該ヌクレオチド配列は、転写調節因子に作動可能に連結されている。いくつかの場合、該転写調節因子は、真核細胞中で機能的であるプロモーターである。
適切なＭＨＣポリペプチドは上述の通りである。いくつかの場合、該第一のＭＨＣポリペプチドはβ２ミクログロブリンポリペプチドであって；該第二のＭＨＣポリペプチドはＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドである。いくつかの場合、該β２ミクログロブリンポリペプチドは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４に示すアミノ酸配列に対する少なくとも８５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合、該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、ＨＬＡ−Ａ、ＨＬＡ−Ｂ、ＨＬＡ−Ｃ、ＨＬＡ−Ｅ、ＨＬＡ−Ｆ、ＨＬＡ−Ｇ、ＨＬＡ−Ｋ、またはＨＬＡ−Ｌの重鎖である。いくつかの場合、該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５に示すアミノ酸配列に対する少なくとも８５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合、該第一のＭＨＣポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩα鎖ポリペプチドであって；該第二のＭＨＣポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩβ鎖ポリペプチドである。
適切なＦｃポリペプチドは上述の通りである。いくつかの場合、該Ｉｇ ＦｃポリペプチドはＩｇＧ１ Ｆｃポリペプチド、ＩｇＧ２ Ｆｃポリペプチド、ＩｇＧ３ Ｆｃポリペプチド、ＩｇＧ４ Ｆｃポリペプチド、ＩｇＡ Ｆｃポリペプチド、またはＩｇＭ Ｆｃポリペプチドである。いくつかの場合、該Ｉｇ Ｆｃポリペプチドは、図２４Ａ〜２４Ｃに示すアミノ酸配列に対する少なくとも８５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
適切な免疫調節ポリペプチドは上述の通りである。いくつかの場合、該免疫調節ポリペプチドは、４−１ＢＢＬポリペプチド、Ｂ７−１ポリペプチド、Ｂ７−２ポリペプチド、ＩＣＯＳ−Ｌポリペプチド、ＯＸ−４０Ｌポリペプチド、ＣＤ８０ポリペプチド、ＣＤ８６ポリペプチド、ＰＤ−Ｌ１ポリペプチド、ＦａｓＬポリペプチド、及びＰＤ−Ｌ２ポリペプチドから選択される。いくつかの場合、該免疫調節ポリペプチドは、ＣＤ７、ＣＤ３０Ｌ、ＣＤ４０、ＣＤ７０、ＣＤ８３、ＨＬＡ−Ｇ、ＭＩＣＡ、ＭＩＣＢ、ＨＶＥＭ、リンホトキシンβ受容体、３／ＴＲ６、ＩＬＴ３、ＩＬＴ４、及びＨＶＥＭから選択される。
適切なタンパク質分解的に開裂可能なリンカーは上述の通りである。いくつかの場合、該タンパク質分解的に開裂可能なリンカーは、
Figure 0006652680
から選択されるアミノ酸配列を含む。
いくつかの場合、該エピトープと該第一のＭＨＣポリペプチドとの間のリンカーは、第一のＣｙｓ残基を含み、該第二のＭＨＣポリペプチドは、第二のＣｙｓ残基を提供するためのアミノ酸置換を含み、該第一第二のＣｙｓ残基及び該第二のＣｙｓ残基は、該リンカーと該第二のＭＨＣポリペプチドとの間にジスルフィド結合を提供する。いくつかの場合、該第一のＣｙｓ残基及び該第二のＣｙｓ残基は、該第一のＭＨＣポリペプチドと該第二のＭＨＣポリペプチドとの間にジスルフィド結合を提供するように、第一のＭＨＣポリペプチドは第一のＣｙｓ残基を提供するためのアミノ酸置換を含みかつ該第二のＭＨＣポリペプチドは第二のＣｙｓ残基を提供するためのアミノ酸置換を含む。
組み換え発現ベクター
本開示は、本開示の核酸を含む組み換え発現ベクターを提供する。いくつかの場合、該組み換え発現ベクターは、非ウイルスベクターである。いくつかの場合、該組み換え発現ベクターは、ウイルス構築物、例えば、組み換えアデノ随伴ウイルス構築物（例えば、米国特許第７，０７８，３８７号参照）、組み換えアデノウイルス構築物、組み換えレンチウイルス構築物、組み換えレトロウイルス構築物、非組込みウイルスベクター等である。
適切な発現ベクターとしては、限定されないが、ウイルスベクター（例えば、ワクシニアウイルス；ポリオウイルス；アデノウイルス（例えば、Ｌｉ ｅｔ ａｌ．， Ｉｎｖｅｓｔ Ｏｐｔｈａｌｍｏｌ Ｖｉｓ Ｓｃｉ ３５：２５４３ ２５４９， １９９４； Ｂｏｒｒａｓ ｅｔ ａｌ．， Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒ ６：５１５ ５２４， １９９９； Ｌｉ ａｎｄ Ｄａｖｉｄｓｏｎ， ＰＮＡＳ ９２：７７００ ７７０４， １９９５； Ｓａｋａｍｏｔｏ ｅｔ ａｌ．， Ｈ Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒ ５：１０８８ １０９７， １９９９；ＷＯ９４／１２６４９，ＷＯ９３／０３７６９；ＷＯ９３／１９１９１；ＷＯ９４／２８９３８；ＷＯ９５／１１９８４及びＷＯ９５／００６５５参照）；アデノ随伴ウイルス（例えば、Ａｌｉ ｅｔ ａｌ．， Ｈｕｍ Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒ ９：８１ ８６， １９９８， Ｆｌａｎｎｅｒｙ ｅｔ ａｌ．， ＰＮＡＳ ９４：６９１６ ６９２１， １９９７； Ｂｅｎｎｅｔｔ ｅｔ ａｌ．， Ｉｎｖｅｓｔ Ｏｐｔｈａｌｍｏｌ Ｖｉｓ Ｓｃｉ ３８：２８５７ ２８６３， １９９７； Ｊｏｍａｒｙ ｅｔ ａｌ．， Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒ ４：６８３ ６９０， １９９７， Ｒｏｌｌｉｎｇ ｅｔ ａｌ．， Ｈｕｍ Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒ １０：６４１ ６４８， １９９９； Ａｌｉ ｅｔ ａｌ．， Ｈｕｍ Ｍｏｌ Ｇｅｎｅｔ ５：５９１ ５９４， １９９６； Ｓｒｉｖａｓｔａｖａ ｉｎ ＷＯ９３／０９２３９， Ｓａｍｕｌｓｋｉ ｅｔ ａｌ．， Ｊ． Ｖｉｒ． （１９８９） ６３：３８２２-３８２８； Ｍｅｎｄｅｌｓｏｎ ｅｔ ａｌ．， Ｖｉｒｏｌ． （１９８８） １６６：１５４-１６５；及びＦｌｏｔｔｅ ｅｔ ａｌ．， ＰＮＡＳ （１９９３） ９０：１０６１３-１０６１７参照）；ＳＶ４０；単純ヘルペスウイルス；ヒト免疫不全ウイルス（例えば、Ｍｉｙｏｓｈｉ ｅｔ ａｌ．， ＰＮＡＳ ９４：１０３１９ ２３， １９９７； Ｔａｋａｈａｓｈｉ ｅｔ ａｌ．， Ｊ Ｖｉｒｏｌ ７３：７８１２ ７８１６， １９９９参照）；レトロウイルスベクター（例えば、マウス白血病ウイルス、脾壊死ウイルス、及びラウス肉腫ウイルス、ハーベイ肉腫ウイルス、トリ白血病ウイルス、レンチウイルス、ヒト免疫不全ウイルス、骨髄増殖性肉腫ウイルス、及び乳がんウイルス等のレトロウイルス由来のベクター）等に基づくウイルスベクターが挙げられる。
多数の適切な発現ベクターが当業者に周知であり、多くが市販されている。例として、以下のベクターが提供される。真核宿主細胞用：ｐＸＴ１、ｐＳＧ５（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ）、ｐＳＶＫ３、ｐＢＰＶ、ｐＭＳＧ、及びｐＳＶＬＳＶ４０（Ｐｈａｒｍａｃｉａ）。しかしながら、宿主細胞と適合する限り、任意の他のベクターを用いてもよい。
使用される宿主／ベクター系に応じて、構成的及び誘導プロモーター、転写エンハンサー因子、転写ターミネーター等を含めて多数の適切な転写調節因子及び翻訳調節因子のいずれかを該発現ベクターに用いてもよい（例えば、Ｂｉｔｔｅｒ ｅｔ ａｌ． （１９８７） Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ， １５３：５１６−５４４参照）。
いくつかの実施形態において、ＤＮＡを標的とするＲＮＡ及び／または部位特異的修飾ポリペプチドをコードする核酸配列は、調節因子、例えば、プロモーター等の転写調節因子に作動可能に連結されている。該転写調節因子は、真核細胞中、例えば哺乳類細胞中；または原核細胞（例えば、細菌もしくは古細菌細胞）中のどちらかで機能的でありうる。いくつかの実施形態では、ＤＮＡを標的とするＲＮＡ及び／または部位特異的修飾ポリペプチドをコードする核酸配列は、原核細胞及び真核細胞の両方において、ＤＮＡを標的とするＲＮＡ及び／または部位特異的修飾ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を発現させる複数の調節因子に作動可能に連結されている。
適切な真核生物プロモーター（真核細胞中で機能的であるプロモーター）の限定されない例としては、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）前初期、単純ヘルペスウイルス（ＨＳＶ）チミジンキナーゼ、初期及び後期ＳＶ４０、レトロウイルス由来の末端反復配列（ＬＴＲ）、及びマウスメタロチオネイン−Ｉ由来のものが挙げられる。適切なベクター及びプロモーターの選択は、当業者のレベルの十分範囲内である。該発現ベクターはまた、翻訳開始及び転写ターミネーターに対するリボソーム結合部位を含んでもよい。該発現ベクターはまた、発現を増幅するのに適切な配列を含んでもよい。
遺伝子改変された宿主細胞
本明細書に記載の組み換えポリペプチドのいずれかをコードする核酸で形質転換された細胞を提供する。該組み換えポリペプチドのいずれかをコードする核酸で形質転換されうる細胞の例としては、限定されないが、ヒト胎児腎臓（ＨＥＫ）、チャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）、ＮＳ０（マウス骨髄腫）細胞、ヒト羊膜細胞（ＣＡＰ、ＣＡＰ−Ｔ）を含めた単離哺乳類細胞、酵母細胞（限定されないが、Ｓ． セレビシエ（Ｓ． ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）、ピキア・パストリス（Ｐｉｃｈｉａ ｐａｓｔｏｒｉｓ）等）、植物細胞（限定されないが、タバコＮＴ１、ＢＹ−２等）、昆虫細胞（限定されないが、ＳＦ９、Ｓ２、ＳＦ２１、Ｔｎｉ（例えば、Ｈｉｇｈ５）等）、または細菌細胞（限定されないが、大腸菌（Ｅ． ｃｏｌｉ）等）が挙げられる。
本開示は、宿主細胞が本開示の核酸によって遺伝子改変されている遺伝子改変された宿主細胞を提供する。
適切な宿主細胞としては、真核細胞、例えば酵母細胞、昆虫細胞、及び哺乳類細胞が挙げられる。いくつかの場合、該宿主細胞は、哺乳類細胞株の細胞である。適切な哺乳類細胞株としては、ヒト細胞株、非ヒト霊長類細胞株、げっ歯類（例えば、マウス、ラット）細胞株等が挙げられる。適切な哺乳類細胞株としては、限定されないが、ＨｅＬａ細胞（例えば、アメリカンタイプカルチャーコレクション（ＡＴＣＣ）番号ＣＣＬ−２）、ＣＨＯ細胞（例えば、ＡＴＣＣ番号ＣＲＬ９６１８、ＣＣＬ６１、ＣＲＬ９０９６）、２９３細胞（例えば、ＡＴＣＣ番号ＣＲＬ−１５７３）、ベロ細胞、ＮＩＨ ３Ｔ３細胞（例えば、ＡＴＣＣ番号ＣＲＬ−１６５８）、Ｈｕｈ−７細胞、ＢＨＫ細胞（例えば、ＡＴＣＣ番号ＣＣＬ１０）、ＰＣ１２細胞（ＡＴＣＣ番号ＣＲＬ１７２１）、ＣＯＳ細胞、ＣＯＳ−７細胞（ＡＴＣＣ番号ＣＲＬ１６５１）、ＲＡＴ１細胞、マウスＬ細胞（ＡＴＣＣ番号ＣＣＬＩ．３）、ヒト胎児腎臓（ＨＥＫ）細胞（ＡＴＣＣ番号ＣＲＬ１５７３）、ＨＬＨｅｐＧ２細胞等が挙げられる。
いくつかの場合、該宿主細胞は、内在性ＭＨＣ β２−Ｍを合成しないように遺伝子改変されている哺乳類細胞である。
多量体ポリペプチドを産生する方法
本開示は、本開示の多量体ポリペプチドを産生する方法を提供する。本方法は、概して、該多量体ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む組み換え発現ベクターによって遺伝子改変されている宿主細胞を培地中で培養する段階；ならびに遺伝子改変された該宿主細胞及び／または該培地から該多量体ポリペプチドを単離する段階を含む。該多量体ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む組み換え発現ベクターによって遺伝子改変されている宿主細胞は、「発現宿主」とも称される。上述の通り、いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドの個々のポリペプチド鎖は、別々の組み換え発現ベクターでコードされる。いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドのすべてのポリペプチドは、単一の組み換え発現ベクターでコードされる。
発現宿主細胞（例えば、該発現宿主細胞の溶解物由来）及び／または該宿主細胞が培養される培地からの該多量体ポリペプチドの単離は、標準的なタンパク質精製方法を用いて行うことができる。
例えば、溶解物は該発現宿主から調製することができ、該溶解物は高速液体クロマトグラフィー（ＨＰＬＣ）、排除クロマトグラフィー、ゲル電気泳動、アフィニティークロマトグラフィー、または他の精製技術を用いて精製されうる。別の方法として、該多量体ポリペプチドが該発現宿主細胞から該培地中へ分泌される場合、該多量体ポリペプチドは、ＨＰＬＣ、排除クロマトグラフィー、ゲル電気泳動、アフィニティークロマトグラフィー、または他の精製技術を用いて該培地から精製することができる。いくつかの場合、使用される組成物は、該生成物の調製及び精製の方法に関連する混入物質と比較して、所望の生成物を少なくとも８０重量％、少なくとも約８５重量％、少なくとも約９５重量％、または少なくとも約９９．５重量％含むであろう。これらの百分率は総タンパク質に基づきうる。
いくつかの場合、例えば、該多量体ポリペプチドが親和性タグを含む場合、該多量体ポリペプチドは該親和性タグの固定化結合パートナーを用いて精製することができる。
組成物
本開示は、薬学的組成物を含めた、本開示の多量体ポリペプチドを含む組成物を提供する。本開示は、薬学的組成物を含めた、本開示の核酸または組み換え発現ベクターを含む組成物を提供する。
多量体ポリペプチドを含む組成物
本開示の組成物は、本開示の多量体ポリペプチドに加えて、以下のうちの１つ以上を含むことができる：塩、例えば、ＮａＣｌ、ＭｇＣｌ、ＫＣｌ、ＭｇＳＯ４等；緩衝剤、例えば、トリス緩衝液、Ｎ‐（２‐ヒドロキシエチル）ピペラジン‐Ｎ'‐（２‐エタンスルホン酸）（ＨＥＰＥＳ）、２‐（Ｎ‐モルホリノ）エタンスルホン酸（ＭＥＳ）、２‐（Ｎ‐モルホリノ）エタンスルホン酸ナトリウム塩（ＭＥＳ）、３‐（Ｎ‐モルホリノ）プロパンスルホン酸（ＭＯＰＳ）、Ｎ‐トリス［ヒドロキシメチル］メチル‐３‐アミノプロパンスルホン酸（ＴＡＰＳ）等；安定剤；界面活性剤、例えば、非イオン性界面活性剤、例えばＴｗｅｅｎ−２０等；プロテアーゼインヒビター；グリセロール等。
組成物は、薬学的に許容される賦形剤を含んでよいが、これらの各種は当技術分野で周知であり、本明細書で詳述する必要はない。薬学的に許容される賦形剤は、様々な出版物に十分に記載されており、例えば、"Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ： Ｔｈｅ Ｓｃｉｅｎｃｅ ａｎｄ Ｐｒａｃｔｉｃｅ ｏｆ Ｐｈａｒｍａｃｙ"、第１９版（１９９５）、または最新版、Ｍａｃｋ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ Ｃｏ； Ａ． Ｇｅｎｎａｒｏ （２０００） "Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ： Ｔｈｅ Ｓｃｉｅｎｃｅ ａｎｄ Ｐｒａｃｔｉｃｅ ｏｆ Ｐｈａｒｍａｃｙ"第２０版、Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ， Ｗｉｌｌｉａｍｓ， ＆ Ｗｉｌｋｉｎｓ； Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｄｏｓａｇｅ Ｆｏｒｍｓ ａｎｄ Ｄｒｕｇ Ｄｅｌｉｖｅｒｙ Ｓｙｓｔｅｍｓ （１９９９） Ｈ．Ｃ． Ａｎｓｅｌら編、第７版、Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ， Ｗｉｌｌｉａｍｓ， ＆ Ｗｉｌｋｉｎｓ；及びＨａｎｄｂｏｏｋ ｏｆ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｅｘｃｉｐｉｅｎｔｓ （２０００） Ａ．Ｈ． Ｋｉｂｂｅら編、第３版、Ａｍｅｒ． Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ａｓｓｏｃ．が挙げられる。
薬学的組成物は、本開示の多量体ポリペプチド及び薬学的に許容される賦形剤を含むことができる。いくつかの場合、対象の薬学的組成物は、対象に対する投与に適しており、例えば、無菌である。例えば、いくつかの実施形態では、対象の薬学的組成物は、ヒト対象に対する投与に適しており、例えば、該組成物は無菌であり、検出可能な発熱物質及び／または他の毒素を含まない。
これらタンパク質組成物は他の成分、例えば、薬学的グレードのマンニトール、ラクトース、デンプン、ステアリン酸マグネシウム、サッカリンナトリウム、タルク粉、セルロース、グルコース、スクロース、マグネシウム、カーボネート等を含んでよい。これら組成物は、適切な生理的条件に必要な薬学的に許容される補助物質、例えば、ｐＨ調整剤及び緩衝剤、毒性調整剤等、例えば、酢酸ナトリウム、塩化ナトリウム、塩化カリウム、塩化カルシウム、乳酸ナトリウム、塩酸塩、硫酸塩、溶媒和物（例えば、混合イオン性塩、水、有機物）、水和物（例えば、水）等を含んでよい。
例えば、組成物としては、水溶液、粉体、顆粒、錠剤、丸薬、坐薬、カプセル、懸濁液、スプレー等を挙げることができる。該組成物は、後述の各種投与経路に応じて製剤化してよい。
本開示の多量体ポリペプチドが組織への直接注入物質（例えば、皮下に、腹腔内に、及び／または静脈内）として投与される場合、製剤は、すぐに使える剤形、または非水性形態（例えば、再構成可能な貯蔵安定性粉体）もしくは水性形態、例えば、薬学的に許容される担体及び賦形剤からなる液体として提供されうる。タンパク質含有製剤は、該対象タンパク質の投与後血清半減期を延ばすためにも提供されうる。例えば、該タンパク質は、血清半減期を延ばすため、コロイドとして、または他の従来技術で調製されるリポソーム製剤中に提供されうる。例えば、Ｓｚｏｋａ ｅｔ ａｌ． １９８０ Ａｎｎ． Ｒｅｖ． Ｂｉｏｐｈｙｓ． Ｂｉｏｅｎｇ． ９：４６７，米国特許第４，２３５，８７１号、同第４，５０１，７２８号、及び同第４，８３７，０２８号に記載のように、各種方法がリポソーム調製に使用可能である。これらの調製物は制御放出または持続放出の形態で提供されうる。
非経口投与に適切な製剤の他の例としては、無菌等張注入溶液、酸化防止剤、静菌薬、該製剤を目的のレシピエントの血液と等張にするための溶質、懸濁剤、可溶化剤、増粘剤、安定剤、及び防腐剤が挙げられる。例えば、対象の薬学的組成物は、容器、例えばシリンジ等の無菌容器に含まれてよい。これら製剤は、単位用量または多回投与用密閉容器、例えばアンプル及びバイアルに含まれてよく、注入用に無菌液体賦形剤、例えば、水を使用の直前に添加するだけで済むフリーズドライ（凍結乾燥）された状態で貯蔵されうる。即時注入溶液及び懸濁液は、無菌粉体、顆粒、及び錠剤から調製されうる。
本開示の多量体ポリペプチドの製剤における濃度は、変化に富み得（例えば、約０．１重量％未満、通常約２重量％または少なくとも約２重量％から、２０重量％〜５０重量％以上まで）、選択される特定の投与方式及び患者の要求に応じて、主に液量、粘度、及び患者に基づく要因を基に通常選択される。
本開示は、本開示の組成物、例えば、液体組成物を含む容器を提供する。該容器は、例えば、シリンジ、アンプル等でよい。いくつかの場合、該容器は無菌である。いくつかの場合、該容器及び該組成物はともに無菌である。
核酸または組み換え発現ベクターを含む組成物
本開示は、本開示の核酸または組み換え発現ベクターを含む組成物、例えば薬学的組成物を提供する。各種の薬学的に許容される賦形剤が当技術分野で周知であり、本明細書で詳述する必要はない。薬学的に許容される賦形剤は、様々な出版物に十分に記載されており、例えば、Ａ． Ｇｅｎｎａｒｏ （２０００） "Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ： Ｔｈｅ Ｓｃｉｅｎｃｅ ａｎｄ Ｐｒａｃｔｉｃｅ ｏｆ Ｐｈａｒｍａｃｙ"第２０版、Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ， Ｗｉｌｌｉａｍｓ， ＆ Ｗｉｌｋｉｎｓ； Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｄｏｓａｇｅ Ｆｏｒｍｓ ａｎｄ Ｄｒｕｇ Ｄｅｌｉｖｅｒｙ Ｓｙｓｔｅｍｓ （１９９９） Ｈ．Ｃ． Ａｎｓｅｌら編、第７版、Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ， Ｗｉｌｌｉａｍｓ， ＆ Ｗｉｌｋｉｎｓ；及びＨａｎｄｂｏｏｋ ｏｆ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｅｘｃｉｐｉｅｎｔｓ （２０００） Ａ．Ｈ． Ｋｉｂｂｅら編、第３版、Ａｍｅｒ． Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ａｓｓｏｃ．が挙げられる。
本開示の組成物が含みうるのは、ａ）対象の核酸または組み換え発現ベクター；及びｂ）緩衝剤、界面活性剤、酸化防止剤、親水性ポリマー、デキストリン、キレート剤、懸濁剤、可溶化剤、増粘剤、安定剤、静菌薬、湿潤剤、及び防腐剤のうちの１つ以上である。適切な緩衝剤としては、限定されないが、（例えば、Ｎ，Ｎ‐ビス（２‐ヒドロキシエチル）‐２‐アミノエタンスルホン酸（ＢＥＳ）、ビス（２‐ヒドロキシエチル）アミノトリス（ヒドロキシメチル）メタン（ＢＩＳ−Ｔｒｉｓ）、Ｎ‐（２‐ヒドロキシエチル）ピペラジン‐Ｎ'３‐プロパンスルホン酸（ＥＰＰＳまたはＨＥＰＰＳ）、グリシルグリシン、Ｎ‐２‐ヒドロキシエチルピペラジン‐Ｎ'‐２‐エタンスルホン酸（ＨＥＰＥＳ）、３‐（Ｎ‐モルホリノ）プロパンスルホン酸（ＭＯＰＳ）、ピペラジン‐Ｎ，Ｎ'‐ビス（２‐エタンスルホン酸）（ＰＩＰＥＳ）、重炭酸ナトリウム、３‐（Ｎ‐トリス（ヒドロキシメチル）メチルアミノ）‐２‐ヒドロキシプロパンスルホン酸）ＴＡＰＳＯ、（Ｎ‐トリス（ヒドロキシメチル）メチル‐２‐アミノエタンスルホン酸（ＴＥＳ）、Ｎ‐トリス（ヒドロキシメチル）メチルグリシン（Ｔｒｉｃｉｎｅ）、トリス（ヒドロキシメチル）アミノメタン（Ｔｒｉｓ）等）が挙げられる。適切な塩としては、例えば、ＮａＣｌ、ＭｇＣｌ２、ＫＣｌ、ＭｇＳＯ４等が挙げられる。
本開示の薬学的製剤は、約０．００１％〜約９０％（ｗ／ｗ）の量の本開示の核酸または組み換え発現ベクターを含むことができる。製剤の記載において、以下、「対象の核酸または組み換え発現ベクター」は、本開示の核酸または組み換え発現ベクターを含むと理解される。例えば、いくつかの実施形態では、対象の製剤は、本開示の核酸または組み換え発現ベクターを含む。
対象の核酸または組み換え発現ベクターは、他の化合物または化合物の混合物と混合され、カプセルに封入され、コンジュゲートされ、または結合される場合があり、かかる化合物としては、例えば、リポソームまたは受容体標的化分子を挙げることができる。対象の核酸または組み換え発現ベクターは、摂取、分配、及び／または吸収を助ける１つ以上の成分との製剤中で組み合わせてもよい。
対象の核酸または組み換え発現ベクター組成物は、考えられる多くの剤形、例えば、限定されないが、錠剤、カプセル、ゲルカプセル、液体シロップ、軟質ゲル、坐薬、及び注腸剤のいずれかに製剤化されうる。対象の核酸または組み換え発現ベクター組成物は、水性、非水性、または混合媒体中の懸濁液としてもまた製剤化されうる。水性懸濁液は、さらに該懸濁液の粘度を上げる物質、例えば、カルボキシメチルセルロースナトリウム、ソルビトール、及び／またはデキストラン等を含んでもよい。該懸濁液はまた、安定剤を含んでもよい。
対象の核酸または組み換え発現ベクターを含む製剤は、リポソーム製剤でありうる。本明細書で使用される「リポソーム」という用語は、球状の二重層または複数の二重層に配置された両親媒性脂質からなる小胞を意味する。リポソームは、親油性材料からなる膜及び供給されるべき組成物を含む水性内部を有する単層または多層の小胞である。カチオン性リポソームは、負の電荷を有するＤＮＡ分子と相互作用して安定な複合体を形成できる、正の電荷を有するリポソームである。ｐＨ感受性または負の電荷を有するリポソームは、ＤＮＡと複合化するのではなく、ＤＮＡを取り込むと考えられる。カチオン性リポソーム及び非カチオン性リポソームはともに、対象の核酸または組み換え発現ベクターを供給するために用いることができる。
リポソームはまた、「立体的に安定化した」リポソームも含み、本明細書で使用されるこの用語は、リポソームへ組み込まれた場合、かかる特殊化脂質を欠くリポソームと比べて循環寿命の延長をもたらす１つ以上の特殊化脂質を含むリポソームを指す。立体的に安定化したリポソームの例は、該リポソームの該小胞形成性脂質部分の一部が１つ以上の糖脂質を含むか、またはポリエチレングリコール（ＰＥＧ）部分等の親水性ポリマーの１つ以上で誘導体化されるものである。リポソーム及びそれらの使用は、さらに、参照することによってその全体が本明細書に組み込まれる米国特許第６，２８７，８６０号に記載されている。
本開示の製剤及び組成物は、界面活性剤も含みうる。薬物製造物、製剤、及び乳剤での界面活性剤の使用は、当技術分野で周知である。界面活性剤及びその使用はさらに米国特許第６，２８７，８６０号に記載されている。
１つの実施形態において、核酸の効率的な供給をもたらすために様々な浸透促進剤が含まれる。非親油性薬物の細胞膜を介した拡散を助けるのに加えて、浸透促進剤はまた、親油性薬物の透過性も高める。浸透促進剤は、５つの広い分類、すなわち、界面活性剤、脂肪酸、胆汁塩、キレート剤、及び非キレート非界面活性剤のうちの１つに属するとして分類されうる。浸透促進剤及びそれらの使用は、さらに、参照することによってその全体が本明細書に組み込まれる米国特許第６，２８７，８６０号に記載されている。
経口投与用の組成物及び製剤としては、粉体もしくは顆粒、マイクロ粒子、ナノ粒子、水もしくは非水性媒体懸濁液もしくは溶液、カプセル、ゲルカプセル、サッシェ剤、錠剤、またはミニ錠剤が挙げられる。増粘剤、香味剤、希釈剤、乳化剤、分散助剤、または結合剤が望まれる場合がある。適切な経口製剤としては、対象のアンチセンス核酸が、１つ以上の浸透促進剤、界面活性剤及びキレート剤とともに投与されるものが挙げられる。適切な界面活性剤としては、限定されないが、脂肪酸及び／またはそのエステルもしくは塩、胆汁酸及び／またはその塩が挙げられる。適切な胆汁酸／塩及び脂肪酸並びにそれらの使用は、さらに米国特許第６，２８７，８６０号に記載されている。浸透促進剤の組合せ、例えば、脂肪酸／塩と胆汁酸／塩の組合せも同様に適切である。典型的な適切な組合せは、ラウリン酸のナトリウム塩、カプリン酸、及びＵＤＣＡである。さらなる浸透促進剤としては、限定されないが、ポリオキシエチレン９‐ラウリルエーテル、及びポリオキシエチレン２０‐セチルエーテルが挙げられる。適切な浸透促進剤としては、プロピレングリコール、ジメチルスルホキシド、トリエタノールアミン、Ｎ，Ｎ‐ジメチルアセタミド、Ｎ，Ｎ‐ジメチルホルムアミド、２‐ピロリドン、及びその誘導体、テトラヒドロフルフリルアルコール、並びにＡＺＯＮＥ（商標）も挙げられる。
Ｔ細胞活性を調節する方法
エピトープペプチドを認識するＴ細胞クローンを阻害する方法であって、該クローンのＴ細胞を、Ｔ細胞クローンの阻害に有効な量の本明細書に記載の組み換えペプチドと接触させる段階を含み、該組み換えペプチドが該エピトープペプチドを含み、かつ、阻害性ドメインであるＴ細胞調節ドメインを含む、方法も提供される。
エピトープペプチドを認識するＴ細胞クローンを刺激する方法であって、該クローンのＴ細胞を、Ｔ細胞クローンの刺激に有効な量の本明細書に記載の組み換えペプチドと接触させる段階を含み、該組み換えペプチドが該エピトープペプチドを含み、かつ、刺激性ドメインであるＴ細胞調節ドメインを含む、方法も提供される。
本開示は、エピトープ特異的Ｔ細胞の活性を選択的に調節する方法であって、該Ｔ細胞を本開示の多量体ポリペプチドと接触させる段階を含み、該Ｔ細胞を本開示の多量体ポリペプチドと接触させる段階が、該エピトープ特異的Ｔ細胞の活性を選択的に調節する、方法を提供する。いくつかの場合、該接触させる段階はインビトロで行われる。いくつかの場合、該接触させる段階はインビボで行われる。いくつかの場合、該接触させる段階は、エキソビボで行われる。
例えば、該標的Ｔ細胞がＣＤ８＋Ｔ細胞であるいくつかの場合、該多量体ポリペプチドはクラスＩのＭＨＣポリペプチド（例えば、β２ミクログロブリン及びクラスＩのＭＨＣ重鎖）を含む。該標的Ｔ細胞がＣＤ４＋Ｔ細胞であるいくつかの場合、該多量体ポリペプチドはクラスＩＩのＭＨＣポリペプチド（例えば、クラスＩＩのＭＨＣのα鎖；クラスＩＩのＭＨＣのβ鎖）を含む。
本開示の多量体ポリペプチドが活性化ポリペプチドである免疫調節ポリペプチドを含む場合、該Ｔ細胞と該多量体ポリペプチドを接触させることによって該エピトープ特異的Ｔ細胞は活性化される。いくつかの場合、該エピトープ特異的Ｔ細胞はがん細胞上に存在するエピトープに特異的なＴ細胞であり、かつ該エピトープ特異的Ｔ細胞と該多量体ポリペプチドを接触させることによって該がん細胞に対する該Ｔ細胞の細胞毒性は増大する。いくつかの場合、該エピトープ特異的Ｔ細胞はがん細胞上に存在するエピトープに特異的なＴ細胞であり、かつ該エピトープ特異的Ｔ細胞と該多量体ポリペプチドを接触させることによって該エピトープ特異的Ｔ細胞の数は増加する。
いくつかの場合、該エピトープ特異的Ｔ細胞はウイルス感染細胞上に存在するエピトープに特異的なＴ細胞であり、かつ該エピトープ特異的Ｔ細胞と該多量体ポリペプチドを接触させることによって該ウイルス感染細胞に対する該Ｔ細胞の細胞毒性は増加する。いくつかの場合、該エピトープ特異的Ｔ細胞はウイルス感染細胞上に存在するエピトープに特異的なＴ細胞であり、かつ該エピトープ特異的Ｔ細胞と該多量体ポリペプチドを接触させることによって該エピトープ特異的Ｔ細胞の数は増加する。
本開示の多量体ポリペプチドが阻害ポリペプチドである免疫調節ポリペプチドを含む場合、該Ｔ細胞と該多量体ポリペプチドを接触させることで該エピトープ特異的Ｔ細胞は阻害される。いくつかの場合、該エピトープ特異的Ｔ細胞は、自己抗原に存在するエピトープに特異的な自己反応性Ｔ細胞であり、該接触により該自己反応性Ｔ細胞の数が減少する。
治療方法
エピトープペプチドを認識する自己反応性Ｔ細胞クローンの阻害による自己免疫疾患を治療する方法であって、該クローンのＴ細胞を、自己免疫疾患の治療に有効な量の本明細書に記載の組み換えペプチドと接触させる段階を含み、該組み換えペプチドが、該エピトープペプチドを含み、かつ、阻害性ドメインであるＴ細胞調節ドメインを含む、方法も提供される。
がん上のエピトープペプチドを認識するＴ細胞クローンの刺激によってがんを治療する方法であって、該クローンのＴ細胞を、がんの治療に有効な量の本明細書に記載の組み換えペプチドと接触させる段階を含み、該組み換えペプチドが、該エピトープペプチドを含み、かつ、刺激性ドメインであるＴ細胞調節ドメインを含む、方法も提供される。
実施形態において、本発明の組み換えポリペプチドを発現するように形質転換された細胞は、単離された懸濁適応細胞である。複数の該単離された懸濁適応細胞、または該組み換え核酸の実施形態において、該核酸はＤＮＡを含む。
実施形態において、該Ｔ細胞は、対象由来の末梢Ｔ細胞を含む。実施形態において、該Ｔ細胞は、対象におけるＴ細胞を含む。実施形態において、該Ｔ細胞は対象の末梢Ｔ細胞を含む。本明細書の方法の実施形態において、該対象はヒトである。
本開示は、個体におけるエピトープ特異的Ｔ細胞の活性を選択的に調節する方法であって、該個体に、個体におけるエピトープ特異的Ｔ細胞の活性を選択的に調節するのに有効な量の本開示の多量体ポリペプチド、または該多量体ポリペプチドをコードする１つ以上の核酸を投与する段階を含む、方法を提供する。いくつかの場合、本開示の治療方法は、本開示の多量体ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む１つ以上の組み換え発現ベクターを、それを必要とする個体に投与する段階を含む。いくつかの場合、本開示の治療方法は、本開示の多量体ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む１つ以上のｍＲＮＡ分子を、それを必要とする個体に投与する段階を含む。いくつかの場合、本開示の治療方法は、本開示の多量体ポリペプチドを、それを必要とする個体に投与する段階を含む。
本開示は、個体におけるエピトープ特異的Ｔ細胞の活性を選択的に調節する方法であって、該個体に、有効量の本開示の多量体ポリペプチド、または該多量体ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む１つ以上の核酸（例えば、発現ベクター；ｍＲＮＡ等）を投与する段階を含み、該多量体ポリペプチドが個体における該エピトープ特異的Ｔ細胞の活性を選択的に調節する、方法を提供する。エピトープ特異的Ｔ細胞の活性を選択的に調節することで、該個体における疾患または障害を治療することができる。従って、本開示は、有効量の本開示の多量体ポリペプチドを、それを必要とする個体に投与する段階を含む治療方法を提供する。
いくつかの場合、該免疫調節ポリペプチドは、活性化ポリペプチドであり、かつ該多量体ポリペプチドは該エピトープ特異的Ｔ細胞を活性化する。いくつかの場合、該エピトープはがん関連エピトープであり、該多量体ポリペプチドは、該がん関連エピトープに特異的なＴ細胞の活性を増大させる。
本開示は、個体におけるがんを治療する方法であって、該個体に、有効量の本開示の多量体ポリペプチド、または該多量体ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む１つ以上の核酸（例えば、発現ベクター；ｍＲＮＡ等）を投与する段階を含み、該多量体ポリペプチドが、がんのエピトープであるＴ細胞エピトープを含み、かつ、該多量体ポリペプチドが刺激性免疫調節ポリペプチドを含む、方法を提供する。いくつかの場合、多量体ポリペプチドの「有効量」とは、それを必要とする個体に１回以上投与された場合に、該個体におけるがん細胞数を減少させる量である。例えば、いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドの「有効量」とは、それを必要とする個体に１回以上投与された場合に、該個体におけるがん細胞数を、該多量体ポリペプチドの投与前の、または該多量体ポリペプチドの投与をしない該個体におけるがん細胞数と比較して、少なくとも１０％、少なくとも１５％、少なくとも２０％、少なくとも２５％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、または少なくとも９５％減少させる量である。いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドの「有効量」とは、それを必要とする個体に１回以上投与された場合に、該個体におけるがん細胞数を、検出不能なレベルまで減少させる量である。いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドの「有効量」とは、それを必要とする個体に１回以上投与された場合に、該個体における腫瘤を縮小させる量である。例えば、いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドの「有効量」とは、それを必要とする個体に１回以上投与された場合に、該個体における腫瘤を、該多量体ポリペプチドの投与前の、または該多量体ポリペプチドの投与をしない該個体における腫瘤と比較して、少なくとも１０％、少なくとも１５％、少なくとも２０％、少なくとも２５％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、または少なくとも９５％減少させる量である。いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドの「有効量」とは、それを必要とする個体に１回以上投与された場合に、該個体の生存期間を延ばす量である。例えば、いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドの「有効量」とは、それを必要とする個体に１回以上投与された場合に、該個体の生存期間を、該多量体ポリペプチドの投与をしない該個体の予想される生存期間と比較して、少なくとも１か月、少なくとも２か月、少なくとも３か月、３か月〜６か月、６か月〜１年、１年〜２年、２年〜５年、５年〜１０年、または１０年超延ばす量である。
いくつかの場合、該エピトープ特異的Ｔ細胞はウイルス感染細胞上に存在するエピトープに特異的なＴ細胞であり、かつ、該エピトープ特異的Ｔ細胞を該多量体ポリペプチドと接触させることによって該ウイルス感染細胞に対する該Ｔ細胞の細胞毒性は増大する。いくつかの場合、該エピトープ特異的Ｔ細胞はウイルス感染細胞上に存在するエピトープに特異的なＴ細胞であり、かつ該エピトープ特異的Ｔ細胞を該多量体ポリペプチドと接触させることによって該エピトープ特異的Ｔ細胞の数は増加する。
このように、本開示は、個体におけるウイルス感染症を治療する方法であって、該個体に、有効量の本開示の多量体ポリペプチド、または該多量体ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む１つ以上の核酸を投与する段階を含み、該多量体ポリペプチドがウイルスのエピトープであるＴ細胞エピトープを含み、かつ、該多量体ポリペプチドが刺激性免疫調節ポリペプチドを含む、方法を提供する。いくつかの場合、多量体ポリペプチドの「有効量」とは、それを必要とする個体に１回以上投与された場合に、該個体におけるウイルス感染細胞数を減少させる量である。例えば、いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドの「有効量」とは、それを必要とする個体に１回以上投与された場合に、該個体におけるウイルス感染細胞数を、該多量体ポリペプチドの投与前の、または該多量体ポリペプチドの投与をしない該個体におけるウイルス感染細胞数と比較して、少なくとも１０％、少なくとも１５％、少なくとも２０％、少なくとも２５％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、または少なくとも９５％減少させる量である。いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドの「有効量」とは、それを必要とする個体に１回以上投与された場合に、該個体におけるウイルス感染細胞数を、検出不能なレベルまで減少させる量である。
このように、本開示は、個体における感染症を治療する方法であって、該個体に、有効量の本開示の多量体ポリペプチド、または該多量体ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む１つ以上の核酸を投与する段階を含み、該多量体ポリペプチドが病原体関連エピトープであるＴ細胞エピトープを含み、かつ、該多量体ポリペプチドが刺激性免疫調節ポリペプチドを含む、方法を提供する。いくつかの場合、多量体ポリペプチドの「有効量」とは、それを必要とする個体に１回以上投与された場合に、該個体における病原体数を減少させる量である。例えば、いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドの「有効量」とは、それを必要とする個体に１回以上投与された場合に、該個体における病原体数を、該多量体ポリペプチドの投与前の、または該多量体ポリペプチドの投与をしない該個体における病原体数と比較して、少なくとも１０％、少なくとも１５％、少なくとも２０％、少なくとも２５％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、または少なくとも９５％減少させる量である。いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドの「有効量」とは、それを必要とする個体に１回以上投与された場合に、該個体における病原体数を、検出不能な量まで減少させる量である。病原体としては、ウイルス、細菌、原生動物等が挙げられる。
いくつかの場合、該免疫調節ポリペプチドは阻害性ポリペプチドであり、該多量体ポリペプチドは、該エピトープ特異的Ｔ細胞の活性を阻害する。いくつかの場合、該エピトープは自己エピトープであり、該多量体ポリペプチドは、該自己エピトープに特異的なＴ細胞の活性を選択的に阻害する。
本開示は、個体における自己免疫疾患を治療する方法であって、該個体に、有効量の本開示の多量体ポリペプチド、または該多量体ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む１つ以上の核酸を投与する段階を含み、該多量体ポリペプチドが自己エピトープであるＴ細胞エピトープを含み、かつ、該多量体ポリペプチドが阻害性免疫調節ポリペプチドを含む、方法を提供する。いくつかの場合、多量体ポリペプチドの「有効量」とは、それを必要とする個体に１回以上投与された場合に、自己反応性Ｔ細胞数を、該多量体ポリペプチドの投与前の該個体、または該多量体ポリペプチドの投与をしない該個体における自己反応性Ｔ細胞数と比較して、少なくとも１０％、少なくとも１５％、少なくとも２０％、少なくとも２５％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、または少なくとも９５％減少させる量である。いくつかの場合、多量体ポリペプチドの「有効量」とは、それを必要とする個体に１回以上投与された場合に、該個体におけるＴｈ２サイトカインの産生を低下させる量である。いくつかの場合、多量体ポリペプチドの「有効量」とは、それを必要とする個体に１回以上投与された場合に、該個体における自己免疫疾患に関連する１つ以上の症状を改善する量である。
上述の通り、いくつかの場合、対象の治療方法を行うにあたり、本開示の多量体ポリペプチドは、それを必要とする個体に該ポリペプチド自体として投与される。他の例では、対象の治療方法を行うにあたり、本開示の多量体ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む１つ以上の核酸が、それを必要とする個体に投与される。他の例では、１つ以上の本開示の核酸、例えば、１つ以上の本開示の組み換え発現ベクターが、それを必要とする個体に投与される。
製剤
適切な製剤は上述の通りであり、適切な製剤は薬学的に許容される賦形剤を含む。いくつかの場合、適切な製剤は、ａ）本開示の多量体ポリペプチド；及びｂ）薬学的に許容される賦形剤を含む。いくつかの場合、適切な製剤は、ａ）本開示の多量体ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸；及びｂ）薬学的に許容される賦形剤を含み；いくつかの場合、該核酸はｍＲＮＡである。いくつかの場合、適切な製剤は、ａ）本開示の多量体ポリペプチドの第一のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む第一の核酸；ｂ）本開示の多量体ポリペプチドの第二のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む第二の核酸；及びｃ）薬学的に許容される賦形剤を含む。いくつかの場合、適切な製剤は、ａ）本開示の多量体ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む組み換え発現ベクター；及びｂ）薬学的に許容される賦形剤を含む。いくつかの場合、適切な製剤は、ａ）本開示の多量体ポリペプチドの第一のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む第一の組み換え発現ベクター；ｂ）本開示の多量体ポリペプチドの第二のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む第二の組み換え発現ベクター；及びｃ）薬学的に許容される賦形剤を含む。
適切な薬学的に許容される賦形剤は上述の通りである。
用量
適切な用量は、様々な臨床学的要因を基に、主治医または他の有資格医療関係者によって決定されうる。医療分野で周知のように、いずれの患者に対する用量も、患者のサイズ、体表面積、年齢、投与される特定のポリペプチドまたは核酸、患者の性別、投与時間及び経路、全身状態、並びに同時投与される他の薬物等の多くの要因による。本開示の多量体ポリペプチドは、１回の投与当たり１ｎｇ／ｋｇ体重〜２０ｍｇ／ｋｇ体重、例えば、０．１ｍｇ／ｋｇ体重〜１０ｍｇ／ｋｇ体重、例えば、０．５ｍｇ／ｋｇ体重〜５ｍｇ／ｋｇ体重の量で投与されうるが；しかしながら、特に上記の要因を考慮して、この典型的範囲を下回るまたは上回る用量も想定される。このレジメンが持続注入の場合、体重１ｋｇ当たり１分間に１μｇ〜１０ｍｇの範囲でもよい。
いくつかの場合、本開示の多量体ポリペプチドの適切な用量は、体重１ｋｇ当たり０．０１μｇ〜１００ｇ、体重１ｋｇ当たり０．１μｇ〜１０ｇ、体重１ｋｇ当たり１μｇ〜１ｇ、体重１ｋｇ当たり１０μｇ〜１００ｍｇ、体重１ｋｇ当たり１００μｇ〜１０ｍｇ、または体重１ｋｇ当たり１００μｇ〜１ｍｇである。当業者であれば、体液または組織における該投与された薬剤の滞留時間及び濃度の測定値を基に、投薬の繰り返し数を容易に推定できる。治療の成功後、該病態の再発を予防するための維持療法を該患者に施すことが望ましい場合があり、本開示の多量体ポリペプチドが、体重１ｋｇ当たり０．０１μｇ〜１００ｇ、体重１ｋｇ当たり０．１μｇ〜１０ｇ、体重１ｋｇ当たり１μｇ〜１ｇ、体重１ｋｇ当たり１０μｇ〜１００ｍｇ、体重１ｋｇ当たり１００μｇ〜１０ｍｇ、または体重１ｋｇ当たり１００μｇ〜１ｍｇの範囲の維持量で投与される。
当業者には、投与量が、具体的な多量体ポリペプチド、症状の程度、及び該対象の副作用の受けやすさに応じて変化しうるということが容易に理解されよう。所与の化合物についての好適な用量は、種々の方法で当業者によって容易に決定される。
いくつかの実施形態では、本開示の多量体ポリペプチド、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターは複数回投与される。本開示の多量体ポリペプチド、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターの投与頻度は、様々な要因、例えば症状の程度等のいずれかに応じて変化しうる。例えば、いくつかの実施形態では、本開示の多量体ポリペプチド、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターは、月１回、月２回、月３回、隔週（ｑｏｗ）、週１回（ｑｗ）、週２回（ｂｉｗ）、週３回（ｔｉｗ）、週４回、週５回、週６回、１日おき（ｑｏｄ）、毎日（ｑｄ）、１日２回（ｑｉｄ）、または１日３回（ｔｉｄ）投与される。
本開示の多量体ポリペプチド、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターの投与期間、例えば、本開示の多量体ポリペプチド、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターが投与される期間は、様々な要因のいずれか、例えば患者の応答等に応じて変化しうる。例えば、本開示の多量体ポリペプチド、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターは、約１日〜約１週間、約２週間〜約４週間、約１か月〜約２か月、約２か月〜約４か月、約４か月〜約６か月、約６か月〜約８か月、約８か月〜約１年、約１年〜約２年、もしくは約２年〜約４年、またはそれ以上にわたる期間投与できる。
投与経路
活性物質（本開示の多量体ポリペプチド、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクター）は、インビボ及びエキソビボ法、並びに全身及び局所的投与経路を含めて、薬物送達に適した任意の可能な方法及び経路を用いて個体に投与される。
従来の薬学的に許容される投与経路としては、腫瘍内、腫瘍周辺、筋肉内、気管内、頭蓋内、皮下、皮内、局所適用、静脈内、動脈内、直腸、経鼻、経口、並びに他の腸内及び非経口投与経路が挙げられる。投与経路は必要に応じて組み合わせてもよく、該多量体ポリペプチド及び／または所望の効果に応じて調節してもよい。本開示の多量体ポリペプチド、または本開示の核酸もしくは組み換え発現ベクターは、単回または複数回投与されうる。
いくつかの実施形態において、本開示の多量体ポリペプチド、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターは、静脈内投与される。いくつかの実施形態では、本開示の多量体ポリペプチド、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターは、筋肉内投与される。いくつかの実施形態では、本開示の多量体ポリペプチド、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターは、局所投与される。いくつかの実施形態では、本開示の多量体ポリペプチド、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターは、腫瘍内投与される。いくつかの実施形態では、本開示の多量体ポリペプチド、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターは、腫瘍周辺に投与される。いくつかの実施形態では、本開示の多量体ポリペプチド、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターは、頭蓋内に投与される。いくつかの実施形態では、本開示の多量体ポリペプチド、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターは、皮下投与される。
いくつかの実施形態では、本開示の多量体ポリペプチドは静脈内投与される。いくつかの実施形態では、本開示の多量体ポリペプチドは筋肉内投与される。いくつかの実施形態では、本開示の多量体ポリペプチドは局所投与される。いくつかの実施形態では、本開示の多量体ポリペプチドは腫瘍内投与される。いくつかの実施形態では、本開示の多量体ポリペプチドは腫瘍周辺に投与される。いくつかの実施形態では、本開示の多量体ポリペプチドは頭蓋内に投与される。いくつかの実施形態では、本開示の多量体ポリペプチドは皮下投与される。
本開示の多量体ポリペプチド、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターは、全身もしくは局所的経路を含めて、従来薬物の送達に適した任意の可能な従来法及び経路を用いて宿主に投与することができる。概して、本発明によって企図される投与経路としては、必ずしも限定されないが、腸内、非経口、または吸入経路が挙げられる。
吸入投与以外の非経口投与経路としては、必ずしも限定されないが、局所、経皮、皮下、筋肉内、眼窩内、嚢内、髄腔内、胸骨内、腫瘍内、腫瘍周辺、及び静脈内経路、すなわち、消化管を通過する以外の任意の投与経路が挙げられる。非経口投与は、本開示の多量体ポリペプチド、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターの全身的もしくは局所的送達をもたらすために行われうる。全身的送達が望まれる場合、投与は通常、薬学的調製物の侵襲性投与、または全身的に吸収される局所投与もしくは粘膜投与を含む。
治療に適した対象
本開示の方法での治療に適した対象としては、がんであると診断された個体、がんの治療を受けたものの、該治療に反応しなかった個体、及びがんの治療を受け当初は応答したものの、その後該治療が効かなくなった個体を含めて、がんを有する個体が挙げられる。本開示の方法での治療に適した対象としては、感染症であると診断された個体、及び感染症に対する治療を受けたものの、該治療に応答しなかった個体を含めて、感染症（例えば、細菌、ウイルス、原生動物等の病原体による感染症）を有する個体が挙げられる。本開示の方法での治療に適した対象としては、細菌感染症であると診断された個体、及び細菌感染症に対する治療を受けたものの、該治療に応答しなかった個体を含めて、細菌感染症を有する個体が挙げられる。本開示の方法での治療に適した対象としては、ウイルス感染症であると診断された個体、及びウイルス感染症に対する治療を受けたものの、該治療に応答しなかった個体を含めて、ウイルス感染症を有する個体が挙げられる。本開示の方法での治療に適した対象としては、自己免疫疾患であると診断された個体、及び自己免疫疾患に対する治療を受けたものの、該治療に応答しなかった個体を含めて、自己免疫疾患を有する個体が挙げられる。
本明細書に記載の様々な要素のすべての組合せは、本明細書に別段の指示のない限り、または文脈から明らかに矛盾しない限り、本発明の範囲に含まれる。
本発明は、以下の実験の詳細からより良好に理解されよう。しかしながら、当業者には、記載の具体的な方法及び結果は、その後に続く特許請求の範囲でさらに十分に説明される本発明の例示に過ぎないことが容易に理解されよう。
以下の実施例は、当業者に対して、本発明の作製法及び使用法の完全な開示及び説明を提供するために提示するものであり、本発明者らが本発明であると見なすものの範囲を限定することを意図せず、以下の実験が、行われたすべての、もしくは唯一の実験であることを本発明者らが示すことも意図しない。使用される数値（例えば、量、温度等）に関する正確さの確保は図られているが、多少の実験誤差及び偏差は考慮されたい。別段の指示のない限り、部は重量部であり、分子量は重量平均分子量であり、温度はセ氏温度であり、圧力は大気圧またはその近辺である。一般的な省略形、例えば、ｂｐ、塩基対；ｋｂ、キロベース；ｐｌ、ピコリットル；ｓまたはｓｅｃ、秒；ｍｉｎ、分；ｈまたはｈｒ、時間；ａａ、アミノ酸；ｋｂ、キロベース；ｂｐ、塩基対；ｎｔ、ヌクレオチド；ｉ．ｍ．、筋肉内（に）；ｉ．ｐ．、腹腔内（に）；ｓ．ｃ．、皮下（に）等が用いられる場合がある。
実施例１：ｓｙｎＴａｃヘテロ２量体の生成
本開示の態様は、新規なタンパク質ベースの治療プラットフォーム、「ｓｙｎＴａｃ」に関し、これは、免疫学的シナプスの相互作用特異性及び調節シグナルを模倣する。ｓｙｎＴａｃは、共刺激分子をＭＨＣ−エピトープに連結して、正確なＴ細胞の結合及びクローナルＴ細胞の活性化または阻害（図１）を可能にする、すなわち身体の天然の反応の可溶性型を可能にする、融合タンパク質である。このようにして、ｓｙｎＴａｃは、エピトープ、二重特異性抗体、可溶性共刺激因子、及びＡＤＣの最良の点を組み合わせる。ｓｙｎＴａｃは、ＭＨＣ−エピトープによる高度に特異的な細胞標的化を可能にし、「一本鎖融合」設計で、遊離エピトープの交差提示を許さない（図２Ａ〜２Ｃ）。Ｔ細胞調節ドメイン（本明細書では「ＭＯＤ」としても記載される）も共有結合的に結合され、該共刺激性結合の特質に応じて、活性化または阻害のどちらかを誘発する。これは、全般的ではなく抗原特異的なＴ細胞応答を誘発する。特に、該ＭＯＤは、任意の既知の抗体、抗体フラグメント、共刺激分子、または文献で確認された他のペイロード（サイトカイン、毒素等）を含むことができ、Ｔ細胞への作用を発揮するために内在化させる必要がない。さらに、同じ細胞の表面に両方の標的が存在するため、従来の二重特異性抗体の「スペーシング問題」を解消する。
１つの実施形態において、本ストラテジーは、Ｆｃ融合構築物（限定されない例を図２Ａ〜２Ｃに示す）を用いて、関連製造物の結合価、安定性、及び治療域を増大させる。簡潔に言えば、該Ｆｃ領域は天然の共有結合ホモ２量体であり、図２Ａ〜２Ｃにおいて２つの細い線で示される２つのジスルフィド結合によって安定化されている。該Ｆｃドメインの存在は、新生児Ｆｃ受容体との相互作用及びより大型の２価分子に対する低腎クリアランスによる、血中濃度半減期の延長によって、治療活性を延長することが知られている［２３、２４］。生物物理学的見地から、該Ｆｃドメインは独立して折り重なり、インビトロ及びインビボの両方でパートナー分子の溶解性並びに安定性を改善することができ［２５］、該Ｆｃ領域は、産生の過程でプロテインＡ／Ｇアフィニティークロマトグラフィーによって、容易で費用効率の高い精製を可能にする［２６］。図２Ａは、ＩｇＧのＦｃ領域にそのカルボキシル末端で連結された一本鎖ペプチドＭＨＣタンパク質（一本鎖３量体［２７］）を示す。示されるように、これら一本鎖構築物は、代替タンパク質連結（ＭＯＤ等）によって系を延長するこれらの能力に限定される。具体的には、連結は、好ましくは、図２Ａに破線（これは本書では直接連結と称す）で示したＭＨＣのＣ末端領域に限定される。ＭＨＣ ＩまたはＭＨＣ ＩＩ分子を用いることができる。直接連結手法を用いた構築物の発現は、用いられるＭＯＤに大きく依存する。これに対する本明細書に開示の解決法は、該構築物をそれぞれの重鎖及び軽鎖に分け、ペプチド及びタンパク質の両方を別々の末端に融合させることである（図２Ｂ及び図２Ｃ）。１つの構築物は、軽鎖（β２ミクログロブリン）へのこのペプチドのアミノ末端の結合と、それに続くＭＯＤエフェクター分子に対するこの軽鎖のカルボキシル末端の延長をもたらす（図２Ｂ）。このシナリオでは、該重鎖（ＨＬＡ分子）は、Ｆｃ領域に融合される。すべての成分が、真核細胞（例えば、ＨＥＫ、ＣＨＯ）内での産生中に結合し、自己集合する。構築物はジスルフィド架橋を介して共有結合的にくっついている。別の配向(図２Ｃ)は、このＭＯＤをＦｃ融合重鎖のアミノ末端に付け、このペプチドはＢ２Ｍの軽鎖に依然として連結している。この場合もやはりすべての成分は、自己集合して、ジスルフィド結合を介して安定な共有結合性相互作用を形成する。従来の二重特異性抗体は、多くの場合、２つの細胞を、１つのアミノ末端のＦｃペイロードと１つのカルボキシル末端のＦｃペイロードの二量体化によって架橋しようとする。対照的に、本明細書に開示の構築物は、２つの異なるタンパク質ペイロード、すなわちＭＨＣ−エピトープ標的化機序及びＭＯＤエフェクターを、従来の抗体で見られるＣＨ１−軽鎖相互作用と同様、同じ細胞の表面に配向させる。さらに、Ｆｃ融合の使用は、関連するエフェクター機能の調整された結合、例えば、抗体依存性細胞媒介性細胞傷害（ＡＤＣＣ）、補体依存性細胞障害（ＣＤＣ）または貪食を、Ｆｃ受容体に対する結合親和性の変異を介した調節によって可能にする［２８］。
２つの基礎となるｓｙｎＴａｃ分子の設計を図３Ａ〜３Ｂに示す。簡潔に言えば、この構築物は天然のヒトＢ２Ｍリーダー配列を用いて、効率的な分泌とＥＲプロセッシングを可能にし、直後に候補エピトープ（ペプチドと表示）が続く。ＥＲにおいて該リーダー配列が完全に除去されると、ＭＨＣの結合ポケットでのこのペプチドの提示が可能になる。「軽鎖」連結（ＬＣ、図３Ａ）については、これは、リンカーＬ１を介して天然Ｂ２Ｍ分子に、さらにリンカーＬ２を介してＭＯＤにつながれる。この全カセットは、別のＢ２Ｍリーダー配列、ＭＨＣの重鎖（例えば、実施例ではヒトＨＬＡ−Ａ０２：０１またはマウスＨ−２Ｋｄ）、及びＦｃドメイン（ヒトＩｇＧ１またはマウスＩｇＧ２ａのどちらか）に、ウイルスのブタテッショウウイルス‐１（Ｐ２Ａ）「自己開裂」ペプチドによって連結され、各鎖の化学量論的発現を可能にする。該Ｐ２Ａペプチドは、これが哺乳類細胞で発現されるすべてのウイルス２Ａペプチドの中で最高の報告「開裂」効率を有するので選択された［２９］。「重鎖」（ＨＣ、図３Ｂ）連結は、同様であるが、ウイルスＰ２Ａペプチドがこの場合Ｂ２Ｍに続き、かつＭＯＤは第二のリーダーペプチドに続き、図２Ｃに示すタンパク質構築物に至る。両方の構築物は、精製をしやすくするために８ｘＨｉｓタグで終わることができる。
特定発現細胞：Ｐ２Ａ連結のために両方の鎖が発現され、ＥＲに共局在化するにもかかわらず、発現宿主（懸濁適応ＨＥＫ２９３細胞）由来の内因性Ｂ２Ｍは、ＨＥＫ２９３細胞が天然にＨＬＡ及びＢ２Ｍ分子を発現するため、組み換え型を打ち負かすことがあるという懸念があった。これは、安定性の低下（例えば、全体的な収率の低下を示す）または非常に望ましくない異質タンパク質試料のどちらかをもたらすことになる。この問題を避けるため、ＣＲＩＳＰＲ／ＣＡＳ系を用いて、ＨＥＫ細胞プールから天然Ｂ２Ｍをノックアウトした［３０］。簡潔に言えば、ガイドＲＮＡを内因性Ｂ２Ｍに対して設計し、ＣＲＩＳＰＲ／ＣＡＳをコードするプラスミドとともに形質移入し、３日間培養した。これら培養細胞を抗Ｂ２Ｍに対して表面染色し、蛍光活性化細胞分類（ＦＡＣＳ）によって対抗選択（蛍光の損失で分類）した。分類した細胞を回復させ、さらに２回の染色、対抗分類、及び回復の巡回（全部で３回）に供し、有効な（約１００％）ノックアウトを確実にした。図４に示すように、最終的なプールは、ＦＡＣＳによるＢ２Ｍの表面発現を観察することで品質をチェックし、内因性Ｂ２Ｍタンパク質の完全なアブレーションが示唆された。ゲノムレベルで該ノックアウトの割合を定量化する次世代シーケンシングを用いる実験が次に行われる。得られたＨＥＫ−２９３−Ｂ２Ｍ−ＫＯ株（ＨＥＫ−ＫＯと称す）を後続のすべての実験に用いた。
操作されたジスルフィド結合:タンパク質の安定性の向上並びに細胞のＭＨＣ分子への潜在的なペプチド転移（交差提示）及びＢ２Ｍ放出に伴う問題の回避のため、一本鎖構築物が一般に用いられる［２７、３１］。しかしながら、これら一本鎖構築物（図２Ａに示される）は、代替タンパク質連結（ＭＯＤ等）によって系を延長する能力に関して限定される。解決法は、過去の取り組み［３２］と同じように該構築物をそれぞれの重鎖及び軽鎖に分けるが、ここではペプチド及びタンパク質の両方を記載の通り別々の末端に融合させることである（図２Ｂ及び図２Ｃ）。しかしながら、最終構築物において、従来の一本鎖系によってもたらされる安定性を保つため、ジスルフィドで捕捉された一本鎖３量体［ｄｔ−ＳＣＴ］［３３］に見られるように、該重鎖及び軽鎖間のジスルフィド架橋を操作する選択肢を研究した（図２でＳ−Ｓで示される）。特に、該ｄｔ−ＳＣＴジスルフィドスキーマを用いた最初のｓｙｎＴａｃ産生の試みでは発現レベルが低かったため、また、これがさらに提示される該ペプチドに依存しているため、このｄｔ−ＳＣＴジスルフィド配置は、スプリットタンパク質系への使用には理想的ではないと見なされた。従って、ｓｙｎＴａｃ等のスプリットタンパク質系に適するジスルフィド架橋を操作する別の位置を特定することを求めた。各々が重鎖の２つの位置（それぞれ１１９、１２０及び２３６、２３７、ＰＤＢ ２Ｘ４Ｒの分析より）に対してジスルフィド結合の可能性を備えた２つの位置（２、１２）が軽鎖から選択された。特に、これらの位置は、高度な保存残基で、ペプチド結合溝［３４］、ＴＣＲ複合体［３５］、またはＣＤ８コレセプター［３６］と相互作用しないと考えられている。高レベルの発現が１つの構築物（Ｈ２３６−Ｌ１２、Ｈは重鎖の位置を指し、Ｌは軽鎖の位置を指し、図５Ａ〜５ＢではｓｙｎＴａｃ１８と表示）で、適度の発現が２番目（Ｈ２３７−Ｌ１２、図５Ａ〜５ＢではｓｙｎＴａｃ１７）で示された。ｄｔ−ＳＣＴジスルフィドスキーマを正の対照として用いた（ｓｙｎＴａｃ２と表示）。非還元ＰＡＧＥゲルにより見られるように、高分子量の部分が形成され、安定なジスルフィド結合の形成が示唆された（図５Ａ）。すべての発現構築物を１００ｍｌ規模にスケールアップし、精製し、ＨＥＫ細胞表面で発現される同族ＴＣＲ（ＨＥＫ−Ａ６と呼ばれる）の結合によって活性試験し、ＦＡＣＳ蛍光によって観察されたように、適切な折りたたみと活性が示唆された（図５Ｂ）。非同族ＴＣＲ（ＨＥＫ−ＡＳ０１と呼ばれる）を発現する細胞は負の対照として用いた。Ｃ末端の８×Ｈｉｓタグのみを有するさらなる構築物（１価）を生成した。
ｓｙｎＴａｃの対照：以前の研究では自己免疫性糖尿病に重点的に取り組み［３７］、疾患に関連するモデル系、特に非肥満糖尿病（ＮＯＤ）マウスの膵島から単離した自己反応性ＣＤ８＋８．３Ｔ細胞が用いられた。この研究を基に、８．３Ｔ細胞と相互作用することが知られているマウスクラスＩ Ｈ−２Ｋｄ対立遺伝子（ＩＧＲＰと呼ばれる）によって提示される膵島特異的グルコース‐６‐ホスファターゼの触媒サブユニット関連タンパク質の残基２０６〜２１４（ＩＧＲＰ２０６−２１４）からなるペプチドを有するｓｙｎＴａｃ構築物を生成した。８．３Ｔ細胞によって認識されない腫瘍由来ペプチド（ＫＹＱＡＶＴＴＴＬ、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１８）を提示する対照ｓｙｎＴａｃを、同一の方式（例えば、マウスＨ−２Ｋｄ提示）で調製し、ＴＵＭと指定した。この系が複数のＨＬＡ対立遺伝子（例えば、マウスＨ２−Ｋｄ、ヒトＨＬＡ−Ａ０２等）を容認できる程度を決定するため、以前に確認されたヒトＨＬＡ−Ａ０２拘束性エピトープ（ヒトＴリンパ球向性ウイルス、Ｔａｘ１１−１９）を有する第三のｓｙｎＴａｃ変異体を構築し、ＨＴＬＶと命名した。標的化Ｔ細胞の枯渇を可能にするため、最初のｓｙｎＴａｃ構築物は軽鎖連結形式を用い、ＰＤ−Ｌ１のＭＯＤドメイン（図２Ｂに概略的に示す）を担持した。各ｓｙｎＴａｃ変異型（ＩＧＲＰ、ＴＵＭ、及びＨＴＬＶ）は、ＨＥＫ−ＫＯ細胞において正の発現プロファイルを示した。非還元ＳＤＳ−ＰＡＧＥの結果を図６Ａに示す。発現系の普遍性を調べるため、Ｔ細胞刺激用の２つのＭＯＤ（すなわち、ヒト化抗ＣＤ２８一本鎖Ｆｖ及びＴＮＦリガンド４−１ＢＢＬの細胞外ドメイン）並びにＴ細胞阻害を可能にする別の２つのＭＯＤ（ＣＴＬＡ４にのみ結合することが知られるＢ７−１［Ｗ８８Ａ］の単一点変異体［３８］及びＰＤ−Ｌ１の切断型変異体［Ｉｇの可変ドメインのみ］）を含めて、変異型ＭＯＤドメインを備えたＩＧＲＰ系ｓｙｎＴａｃ構築物を調査した。すべての構築物は図６ＢのＨＥＫ−ＫＯ細胞で十分に発現した。重鎖連結方式を用いるｓｙｎＴａｃタンパク質発現能力をさらに調査した（図２Ｃに概略的に示す）。これらに対しては、ＩＧＲＰエピトープを標的化ペプチドとして用い、ＰＤ−Ｌ１またはヒト化抗ＣＤ２８ｓｃＦｖをＭＯＤとして用いたが、この場合もやはりＨＥＫ−ＫＯ細胞で正の発現プロファイルを示した（図６Ｃ）。これらはその後１Ｌ以上の規模で製造し、内毒素のない環境で、Ｎｉ２＋ＩＭＡＣ及びサイズ排除の両方を通して均質になるまで精製した。すべてのＩＧＲＰ及びＴＵＭ構築物をＴ細胞増殖アッセイに用い、ＨＴＬＶ構築物を以下のＴＣＲ−ｓｙｎＴａｃ−ＰＤ１架橋実験に用いた。
ＴＣＲ−ｓｙｎＴａｃ−ＰＤ１架橋：サイズ排除後の溶液プロファイルが十分に折りたたまれたタンパク質を示すものの、各ｓｙｎＴａｃ成分（ＭＨＣ−エピトープ標的化機序及びＭＯＤの両方）の完全性を、これら試薬を活性アッセイに用いる前に確認することが望ましい。前述のＨＥＫ−Ａ６細胞を正の対照として用い、非同族ＴＣＲ（ＡＳ０１、ＨＬＡ−Ａ０２０１拘束性エプスタイン‐バーウイルスエピトープに応答する）を発現する細胞を生成し、これを未形質導入親細胞とともに負の対照として用い、それぞれＨＥＫ−ＡＳ０１及びＰＡＲＥＮＴＡＬと称した。ＴＣＲ発現は、ｍＣｅｒｕｌｅａｎ蛍光（ＴＣＲ融合レポーター）及びＴＣＲシグナル伝達複合体（ＣＤ３ε発現プロキシ）に対する表面染色によって確認した。ＨＥＫ−Ａ６細胞に、無蛍光性の精製ＨＴＬＶ−ＰＤ−Ｌ１ ｓｙｎＴａｃ変異体を負荷し、マウスＩｇＧ２ａに融合させたその同族受容体ＰＤ１とともにこれを培養した。ＦＩＴＣ標識抗マウス第二抗体を用いてＰＤ−１−Ｆｃ融合を検出した。ＦＩＴＣ蛍光（すなわち、「架橋」）は、図７Ａ〜７Ｂに示すように、同族ＴＣＲ表面発現に依存していた。具体的には、ＦＩＴＣ蛍光は、非同族ＴＣＲを有するＨＥＫ細胞または親細胞（ＨＥＫ−ＡＳ０１、ＰＡＲＥＮＴＡＬ）に対して負荷した場合、すなわち、ＦＩＴＣ−ＰＤ１−Ｆｃのみに対して負荷した場合、もしくはＭＯＤが存在しなかった場合には観察されなかった。
作用時のｓｙｎＴａｃ：Ｔ細胞アッセイ。ｓｙｎＴａｃプラットフォームの標的化力の概念実証として、阻害性ｓｙｎＴａｃ構築物をＴ細胞抑制アッセイで調べた。ＰＤ−Ｌ１に融合させたｓｙｎＴａｃ ＩＧＲＰの軽鎖型は、ＩＧＲＰ２０６−２１４特異的Ｔ細胞を特異的に抑制するであろうという仮説を立てた。ＣＤ８＋脾細胞を、８．３Ｔ細胞受容体トランスジェニック非肥満糖尿病マウスから精製した。この脾細胞サブセットは、Ｈ−２Ｋｄ内のＩＧＲＰ２０６−２１４ペプチドに特異的なＣＤ８＋Ｔ細胞を主に含む。これらのＣＤ８＋Ｔ細胞を次に、固定化抗ＣＤ３抗体の存在下で培養、すなわち、ポリクローナルＴ細胞活性化を刺激し、刺激された培養物は、可溶性型のｓｙｎＴａｃ ＩＧＲＰ−ＰＤ−Ｌ１またはｓｙｎＴａｃ ＴＵＭ−ＰＤ−Ｌ１のどちらかで処理し、任意の抑制効果の抗原特異性を調べた。ＰＤ−Ｌ１のないｓｙｎＴａｃ ＩＧＲＰ型は、ＭＯＤドメインに対するエフェクターの対照としての役割を果たした。播種の前に、Ｔ細胞活性化で誘導される細胞増殖の程度を観察するために、細胞をカルボキシフルオレセインスクシンイミジルエステル（ＣＦＳＥ）、すなわち、細胞分裂ごとにその強度が半減する蛍光細胞質染料で標識化した。５日間の培養後、細胞を採取し、フローサイトメトリーを用いて生存率と増殖を調べた。上清もまた、ＣＤ８＋Ｔ細胞エフェクターサイトカインのＩＦＮγ及びＴＮＦα発現について、多重化フローサイトメトリービーズアッセイを用いて調べた。調べたすべてのＣＤ８＋Ｔ細胞活性化パラメータは、図８Ａ〜８Ｄに示すように、抗原特異的かつエフェクター（すなわち、ＭＯＤ）ドメイン依存的に抑制された。すなわち、ＩＧＲＰ−ＰＤ−Ｌ１ ｓｙｎＴａｃは、ＴＵＭ−ＰＤ−Ｌ１ ｓｙｎＴａｃまたはＩＧＲＰ−（ＰＤ−Ｌ１なし）のどちらかと比較して非常に抑制的で、ｓｙｎＴａｃの活性はペプチド−ＭＨＣ及びＭＯＤドメインの両方に依存することが示された（図８Ｄ）。ｓｙｎＴａｃは、ＩＦＮγの分泌を約１００倍抑制することができ、大部分の細胞の死をもたらし、ＭＯＤドメインとしてＰＤＬ１を有するｓｙｎＴａｃは、標的化特異性の機能的な抑制及び排除が可能であることが示唆された。
親和性の減衰：調節ドメインとしてのＰＤ−１／ＰＤＬ−１系の使用に伴って起こりうる問題は、ＰＤ−Ｌ１が、下流のシグナル伝達に相違を伴う２つ以上の受容体に結合する可能性があるということである。ＰＤ−Ｌ１はＢ７−１及びＰＤ−１の両方に結合することが示されている。標的外の結合の問題を避けるため、所望の標的、すなわちＰＤ−１にのみ結合する一方、独立したＦｃ融合として試験した場合にはそのＴ細胞阻害能を保つ、単一点変異体（例えば、特にＧ１１９Ｄ及びＧ１１９Ｒ、並びに本明細書に記載のその他）を用いてもよい。特に、この変異体ＰＤ−Ｌ１のＦｃ融合だけで、免疫調節の有用な試薬になりうる。ｓｙｎＴａｃでは、これらの変異体は様々なＰＤ−１の結合親和性をもたらす。Ｇ１１９Ｄ及びＧ１１９Ｒの変異を有するＩＧＲＰ系ｓｙｎＴａｃ融合タンパク質が製造された。
モジュール設計：可溶性の一価ＭＨＣ分子は、それらの同族Ｔ細胞受容体に対して本質的に親和性が低く、ゆえに診断または治療目的に有用な試薬ではなかった。２量体ＭＨＣ複合体は抗原特異的Ｔ細胞の可視化のために様々な系で用いられているが［３９］、より親和性の高いＭＨＣ４量体及びより高次の多量体がより通常に用いられる［４０］。本研究から、現在の２量体ｓｙｎＴａｃ構築物が十分に折りたたまれたタンパク質の高レベルの発現をもたらし、標的Ｔ細胞応答を誘発することが明らかだが、特定の場合には、結合価を増加させてＴ細胞の標的化能を高めることによって、ｓｙｎＴａｃ技術を拡張することが望ましいことがある。その目的で、ＩＧＲＰ標的化機序を有し、ＩｇＡ及びＩｇＭのＦｃ領域内に軽鎖結合としてＰＤ−Ｌ１ ＭＯＤを備えるｓｙｎＴａｃ変異体を再度設計した。Ｊ鎖とのジスルフィド架橋を介した共有結合によって、このＩｇＡ及びＩｇＭ骨格はそれぞれ４量体及び１０量体に基づく提示を可能にする。レンチウイルスを生成し、ＨＥＫ−ＫＯ細胞で形質導入し、発現検査をして、これら試薬の初期の発現能を裏付けた。必要に応じて、ＭＯＤをＪ鎖に直接、Ｎ末端として、Ｃ末端として、または二重融合として結合して、標的分子に対するＭＯＤの結合価を変更することができる。さらに、ｓｙｎＴａｃ配置は柔軟なため、二重の重鎖／軽鎖連結を用いて複数のペプチドエピトープまたはＭＯＤを同時に提示することができる（例えば、三重特異性）。さらに、他のＭＯＤとしては、限定されないが、活性化用に４−１ＢＢＬ及び抗ＣＤ２８、並びに阻害のためにＢ７Ｗが挙げられる。特定の構築物はさらなる標的化エピトープを使用できる。さらに、より高いレベルの結合価（ＩｇＡ及びＩｇＭ）を有するｓｙｎＴａｃ変異体は、記載の通り非化学量論的に連結されたＭＯＤ（例えば、Ｊ鎖連結）と同様に用いることができる。
実施例２：３量体ｓｙｎＴａｃポリペプチドの生成
刺激性ＭＯＤ（４−１ＢＢＬ）受容体３量体発現：活性４−１ＢＢＬ担持ｓｙｎＴａｃ生成のための最初の取り組みにより、軽鎖連結変異体（図３Ａ）が活用された。これは、単一の形質移入として発現され（すべての断片が単一のプラスミドにコードされた）、ウイルスＰ２Ａ配列によって分割され、かつ、高度に発現した十分に折りたたまれたタンパク質をもたらした（図６Ｂ、レーン５）。ゲルろ過プロファイルに加えて多角度光散乱（ＭＡＬＳ）データによって、この最初の型は十分に折りたたまれた２量体である（図１０Ｂ、図９Ｂに示す通り）ことが示唆された。ＴＮＦファミリーのリガンドである４−１ＢＢＬは、完全な活性のために３量体化（例えば、同じタンパク質の３つのコピー、すなわちホモ３量体）が必要である。３量体化を達成するため、この４−１ＢＢＬ担持ｓｙｎＴａｃ構築物及び「遊離」４−１ＢＢＬ（親和性タグを持たない４−１ＢＢＬ単独［残基５０〜２５４、膜近位及びＴＮＦ相同ドメイン含有、図１０Ａ；図９Ａ］）をともに同一の細胞で発現させ（例えば、共発現）、図１０Ｃに示すように天然の集合及び３量体化を可能にした（元のｓｙｎＴａｃ構築物が黒、遊離のＢＢＬがグレー）（図９Ａ及び図９Ｂ構築物の共発現）。ゲルろ過クロマトグラフィーに加えて多角度光散乱（ＭＡＬＳ）データによって、この新型が所望の３量体であることが裏付けられた（図１１Ａ〜１１Ｂ、ｓｙｎＴａｃ番号４０＋５１として表示）。後述（ＭＯＤ最適化）するように、この４−１ＢＢＬ構築物は、さらに発現及び精製プロファイルを改善して安定性及び再現性を向上させるように、さらに最適化されうる。
刺激性ＭＯＤ受容体結合及びヒト／マウス交差反応性：サイズ排除後の溶液プロファイルが十分に折りたたまれたタンパク質を示すものの、各ｓｙｎＴａｃ成分（ＭＨＣ−エピトープ標的化機序及びＭＯＤの両方）の完全性を、これら試薬を活性アッセイ法に用いる前に確認することが望ましい。この特定の標的化機序（マウスＫｄでのＩＧＲＰペプチド）は、完全に確認されているため（図７Ａ〜７Ｂ）、４−１ＢＢＬ受容体結合の程度をさらに調べた。その目的のために、プロテインＡのマイクロビーズを飽和状態まで組み換えヒトまたはマウス４−１ＢＢ−Ｆｃ融合タンパク質（市販の供給源由来）で被覆した。次に４−１ＢＢ被覆マイクロビーズを用いて、４−１ＢＢリガンド（２量体型及び３量体型）担持ｓｙｎＴａｃ構築物を共刺激ドメインとして結合し、その後ｓｙｎＴａｃ重鎖アイソタイプに特異的な蛍光検出抗体と結合した。次にビーズ付き４−１ＢＢへのｓｙｎＴａｃ４−１ＢＢＬの特異的結合度を、ハイスループットフローサイトメトリーで測定した。このシステムを用いて、ヒト及びマウス両方の４−１ＢＢに対する４−１ＢＢＬの交差反応性及び相対的親和性の程度をこのｓｙｎＴａｃ骨格の中で調査した。４−１ＢＢＬ担持ｓｙｎＴａｃ（３量体、２量体と呼ぶ）は、同族受容体に結合し、「受容体のない」（ＭＯＤなしと呼ぶ）Ｆｃ結合マイクロビーズを結合しないことが示され、十分に折りたたまれた活性タンパク質試薬が示唆された（図１２）。さらに、この３量体は、あらためて２量体の提示を裏付ける、１０分の１の結合親和性を示す元の２量体との二重３量体結合に対して期待される親和性範囲で結合した。４−１ＢＢＬ受容体に対する結合を示さないＭＯＤなしのｓｙｎＴａｃ（ＭＯＤなしと表示）を負の対照として用いた。特に、すべての構築物はマウス及びヒト受容体の両方に結合（交差反応）し、ひいてはインビボマウス試験への直接の拡張を可能にする。
インビトロＴ細胞刺激アッセイ：４−１ＢＢＬのｓｙｎＴａｃの活性を調べるため、ＣＤ８脾細胞を最初に８．３ＴＣＲトランスジェニックＮＯＤマウスから精製し、ＣＦＳＥで蛍光標識し、可溶性ＩＧＲＰ−４１ＢＢＬ ｓｙｎＴａｃ（２量体もしくは３量体）または可溶性ＴＵＭ−４１ＢＢＬ ｓｙｎＴａｃのどちらかでインビトロ処理する前に増殖を追跡した（図１３）。対照の処理は培地のみまたは固定化抗ＣＤ３とした。培養４日後、細胞はＦＡＣＳによって、生存率（ＤＡＰＩ排除）、及び増殖（ＣＦＳＥ希釈）について調べた。上清を、フローサイトメトリーＥＬＩＳＡによって、ＩＦＮγ及びＴＮＦαレベルについて調べた。ｓｙｎｔａｃ−ＰＤＬ１（図８Ａ〜８Ｄ）の場合のように、ｓｙｎｔａｃ−４１ＢＢＬのインビトロ活性は非常に抗原特異的であり、ｓｙｎｔａｃのＩＧＲＰ−４１ＢＢＬ対ＴＵＭ−４１ＢＢＬについて言えば、より多くの生存率、増殖、及びサイトカイン放出をもたらした。予想通り、３量体の４−１ＢＢＬが完全な活性（例えば、増殖、生存率、及びサイトカイン放出）にとって必要であった。さらに、ＩＧＲＰ−４１ＢＢＬに対する応答は、固定化抗ＣＤ３の判断基準と比べても遜色がなく、可溶性ｓｙｎｔａｃ−４１ＢＢＬが高レベルのＴ細胞活性化を仲介しうることが示唆された。本明細書に記載のさらなるすべての関連する実験で３量体のｓｙｎｔａｃ−４１ＢＢＬを用いた。
インビボＴ細胞刺激−単回投与：ｓｙｎＴａｃ−４１ＢＢＬがインビボでのＴ細胞活性化に同様の影響を与えるかどうかをさらに調べた。ＮＯＤマウスをｓｙｎＴａｃ ＴＵＭ−４１ＢＢＬと対比してｓｙｎＴａｃ ＩＧＲＰ−４１ＢＢＬで処置し、脾臓におけるＩＧＲＰ特異的ＣＤ８＋Ｔ細胞の頻度を測定した。ほとんどのＴ細胞が特定のクローン型であるＴＣＲトランスジェニックＮＯＤマウスと異なり、普通のＮＯＤマウスは非常に異なるＴＣＲレパートリーを有し、「天然の」免疫レパートリーのより良好な近似である。ＮＯＤマウスにｓｙｎＴａｃ ＩＧＲＰ−４１ＢＢＬ、ｓｙｎＴａｃ ＴＵＭ−４１ＢＢＬ、またはＰＢＳを腹腔内注射し、注射の６日後に殺処分した。その後、適切なペプチド−ＭＨＣ５量体染色を用いて、脾細胞のＩＧＲＰ特異的ＣＤ８Ｔ細胞の相対頻度をフローサイトメトリーで調べた。ＩＧＲＰ−４１ＢＢＬ処置により、ＩＧＲＰ特異的ＣＤ８Ｔ細胞の頻度が対照に対してはるかに高くなった。さらに、インビボで拡大されたＩＧＲＰ特異的細胞は、インビトロで再刺激した場合にＩＦＮγの産生が可能であった。これらの結果は、ｓｙｎｔａｃ−４１ＢＢＬが抗原特異的方式で機能的ＣＤ８エフェクターＴ細胞を拡大する能力を裏付ける（図１４）。
インビボＴ細胞刺激−複数回投与：確立した腫瘍抗原である「ＴＵＭ」９量体ペプチドに特に注目して、インビボでのＴ細胞活性化における変更した処理レジメンの影響を調べた。ＮＯＤマウスをｓｙｎＴａｃ ＴＵＭ−４１ＢＢＬと対比してｓｙｎＴａｃ ＩＧＲＰ−４１ＢＢＬで、３回投与（先の単回投与と比べて）を用いて２週間にわたって処置した。ＩＧＲＰまたはＴＵＭ特異的ＣＤ８Ｔ細胞の頻度を測定した。ＮＯＤマウスにｓｙｎＴａｃ ＩＧＲＰ−４１ＢＢＬ、ｓｙｎＴａｃ ＴＵＭ−４１ＢＢＬ、またはＰＢＳを腹腔内注射し、注射の７日後に殺処分した。その後、適切なペプチド−ＭＨＣ５量体染色を用いて、血液（ＰＭＢＣのもの）及び脾細胞のＩＧＲＰまたはＴＵＭ特異的ＣＤ８Ｔ細胞の相対頻度をフローサイトメトリーで調べた。この場合もやはり、不適切な抗原及びＰＢＳの対照に対して、ＩＧＲＰ−４１ＢＢＬ処置によってＩＧＲＰ特異的ＣＤ８Ｔ細胞の頻度がはるかに高くなった一方、ＴＵＭ−４１ＢＢＬ処置によってＴＵＭ特異的ＣＤ８Ｔ細胞の頻度がはるかに高くなった（図１５）。同様のパターンが脾臓で観察された。これらの結果は、ｓｙｎＴａｃ−４１ＢＢＬの複数回投与レジメンが、まれな腫瘍に特異的なＴ細胞の抗原特異的拡大を含めた、抗原特異的方式での機能的ＣＤ８エフェクターＴ細胞を拡大できることを裏付ける。
インビボＴ細胞阻害：非肥満糖尿病（ＮＯＤ）マウスにｓｙｎＴａｃ ＩＧＲＰ−ＰＤＬ１、ｓｙｎＴａｃ ＴＵＭ−ＰＤＬ１、またはＰＢＳを腹腔内注射した。注射の６日後、膵臓を分離し、適切なペプチド−ＭＨＣ５量体染色を用いて、膵細胞のＩＧＲＰ特異的ＣＤ８＋Ｔ細胞の相対頻度をフローサイトメトリーで調べた。図２３に示すように、ＩＧＲＰ−ＰＤＬ１処置によって、ＩＧＲＰ特異的ＣＤ８＋Ｔ細胞の頻度が対照のｓｙｎＴａｃ ＴＵＭ−ＰＤＬ１及びＰＢＳ処理マウスに対してはるかに低くなった。これらのデータは、ｓｙｎＴａｃ単回投与後の抗原特異的インビボ枯渇を実証する。
ＭＯＤ最適化：実験の間、ほとんどの標的タンパク質（４−１ＢＢＬ３量体ｓｙｎＴａｃ）が、より高次の多量体の特性をサイズ排除クロマトグラフィーにおいて示し、おそらく「遊離の」ＢＢＬの放出／交換によって時間とともに分解したであろうことが観察された。従って、４−１ＢＢＬの共有結合的集合に重点を置きながら、安定性が向上し、製造が容易な４−１ＢＢＬ骨格を追求した。その目的で、４−１ＢＢＬのＴＮＦ相同ドメイン内の操作されたジスルフィド結合（図１６Ａ；ジスルフィドは矢印で示す；図９Ｃ〜９Ｅ）の使用を探索した。Ｘ線構造（ＰＤＢ ２Ｘ２９）解析から、ジスルフィド結合性がありえ、受容体結合に干渉する可能性の低い、３対の可能性のある残基を選択した。各構築物の２つの天然残基をシステイン残基で置き換え（Ｑ９４Ｃ：Ｐ２４５Ｃ）、Ｑ９４Ｃ：Ｐ２４２Ｃ、及びＱ８９Ｃ：Ｌ１１５Ｃ、それぞれｓｙｎＴａｃ６９、７０、７１と呼ぶ）、ヒト細胞中、同じ変異を有する「遊離」非タグ型（それぞれ９８、９９、１００と呼ぶ）と共に発現させ、共有結合的固定を可能にし、ジスルフィド結合度を、非還元ＳＤＳ−ＰＡＧＥ分析で観察した（図１８；以下の共発現構築物をＤＬ１（ジスルフィド固定−１、ｓｙｎＴａｃ６９／９８）、ＤＬ２（７０／９９）、及びＤＬ３（７１／１００）と呼ぶ）。３つの構築物すべてが十分に発現し、ジスルフィド固定を可能にして（図１８）、受容体に結合した（図１７）。ｓｙｎＴａｃ−４−１ＢＢＬのこれら共有結合的「ジスルフィド固定」変異体は、考察された安定性の問題に対処するものの、「遊離」ＢＢＬの共発現（共発現）は、３量体化を可能にするためになお必要であり、これは、刺激性ｓｙｎＴａｃの製造及びバイオ製造を複雑にしうる。この障害に対する１つの解決法は、４−１ＢＢＬのＴＮＦ相同ドメインの、一本鎖３量体（４−１ＢＢＬ−ＳＣＴ、図１６Ｂ；図９Ｆ）と呼ばれる単一の連続的な構築物としての発現であることが分かった。具体的には、４−１ＢＢＬ残基８０〜２４６（ＴＮＦ相同ドメインのみ）の３つのコピーを２つの（Ｇ４Ｓ）５リンカー配列で共有結合的に保持された（図１６Ｂ、リンカーは曲線で示す；図９Ｆ）。発現及びゲルろ過に加えて多角度光散乱（ＭＡＬＳ）データによって、この新型が所望の共有結合的一本鎖３量体（図１８）であり、４−１ＢＢＬ受容体に良好に結合した（図１７）ことが裏付けられる。
本発明は、その具体的な実施形態を参照して記載されたが、当業者には、本発明の真の趣旨及び範囲を逸脱することなく、様々な変更がなされてもよく、等価物が置き換えられてもよいことを理解されたい。さらに、本発明の目的、趣旨及び範囲に対して、特定の状況、材料、組成物、工程、工程の１つの段階または複数の段階に適応させるために多くの変更がなされてもよい。すべてのかかる変更は、添付の特許請求の範囲内であることが意図される。
参考文献
Figure 0006652680
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Claims (20)

  1. ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に
    ｉ）ペプチドエピトープ；及び
    ｉｉ）第一の主要組織適合複合体（ＭＨＣ）クラスＩＩポリペプチド
    を含む第一のポリペプチド、
    ｂ）第二のＭＨＣクラスＩＩポリペプチドを含む第二のポリペプチド；並びに
    ｃ）少なくとも１つの免疫調節ポリペプチド
    を含む、ヘテロ二量体ポリペプチド
    を含む、多量体ポリペプチドであって、
    該第一及び／又は該第二のポリペプチドが該少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドを含み、
    該ペプチドエピトープが自己抗原のエピトープであり、かつ
    任意で、該多量体ポリペプチドが免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドまたは非Ｉｇ骨格を含む、前記多量体ポリペプチド。
  2. ａ１）Ｎ末端からＣ末端の順に
    ｉ）エピトープ；及び
    ｉｉ）第一のＭＨＣクラスＩＩポリペプチド
    を含む第一のポリペプチド、並びに
    ｂ１）Ｎ末端からＣ末端の順に
    ｉ）少なくとも１つの免疫調節ポリペプチド；
    ｉｉｉ）第二のＭＨＣクラスＩＩポリペプチド；及び
    ｉｉ）免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチド
    を含む第二のポリペプチド
    を含むか；
    ａ２）Ｎ末端からＣ末端の順に
    ｉ）エピトープ；
    ｉｉ）第一のＭＨＣクラスＩＩポリペプチド；及び
    ｉｉｉ）少なくとも一つの免疫調節ポリペプチド
    を含む第一のポリペプチド、並びに
    ｂ２）Ｎ末端からＣ末端の順に
    ｉ）第二のＭＨＣクラスＩＩポリペプチド；及び
    ｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド
    を含む第二のポリペプチド
    を含むか；
    ａ３）Ｎ末端からＣ末端の順に
    ｉ）エピトープ；及び
    ｉｉ）第一のＭＨＣクラスＩＩポリペプチド
    を含む第一のポリペプチド、並びに
    ｂ３）Ｎ末端からＣ末端の順に
    ｉ）第二のＭＨＣクラスＩＩポリペプチド；及び
    ｉｉ）Ｉｇ Ｆｃポリペプチド；及び
    ｉｉｉ）少なくとも一つの免疫調節ポリペプチド
    を含む第二のポリペプチド
    を含むか；
    ａ４）Ｎ末端からＣ末端の順に
    ｉ）エピトープ；及び
    ｉｉ）第一のＭＨＣクラスＩＩポリペプチド
    を含む第一のポリペプチド、並びに
    ｂ４）Ｎ末端からＣ末端の順に
    ｉ）第二のＭＨＣクラスＩＩポリペプチド；及び
    ｉｉ）少なくとも一つの免疫調節ポリペプチド
    を含む第二のポリペプチド
    を含むか；
    ａ５）Ｎ末端からＣ末端の順に
    ｉ）エピトープ；及び
    ｉｉ）第一のＭＨＣクラスＩＩポリペプチド
    を含む第一のポリペプチド、並びに
    ｂ５）Ｎ末端からＣ末端の順に
    ｉ）少なくとも一つの免疫調節ポリペプチド；及び
    ｉｉ）第二のＭＨＣクラスＩＩポリペプチド
    を含む第二のポリペプチド
    を含むか；または
    ａ６）Ｎ末端からＣ末端の順に
    ｉ）エピトープ；
    ｉｉ）第一のＭＨＣクラスＩＩポリペプチド；及び
    ｉｉｉ）少なくとも一つの免疫調節ポリペプチド
    を含む第一のポリペプチド、並びに
    ｂ６）Ｎ末端からＣ末端の順に
    ｉ）第二のＭＨＣクラスＩＩポリペプチド
    を含む第二のポリペプチド
    を含む、請求項１に記載の多量体ポリペプチド。
  3. 前記非Ｉｇ骨格が、ＸＴＥＮポリペプチド、トランスフェリンポリペプチド、Ｆｃ受容体ポリペプチド、エラスチン様ポリペプチド、シルク様ポリペプチド、またはシルクエラスチン様ポリペプチドである、請求項１に記載の多量体ポリペプチド。
  4. 前記第一のＭＨＣクラスＩＩポリペプチドがＭＨＣクラスＩＩβ鎖ポリペプチドであり、かつ前記第二のＭＨＣクラスＩＩポリペプチドがＭＨＣクラスＩＩα鎖ポリペプチドである、請求項１から３のいずれか一項に記載の多量体ポリペプチド。
  5. 前記第一のＭＨＣクラスＩＩポリペプチドがＭＨＣクラスＩＩα鎖ポリペプチドであり、かつ前記第二のＭＨＣクラスＩＩポリペプチドがＭＨＣクラスＩＩβ鎖ポリペプチドである、請求項１から３のいずれか一項に記載の多量体ポリペプチド。
  6. 前記少なくとも一つの免疫調節ポリペプチドが、４−１ＢＢＬポリペプチド、Ｂ７−１ポリペプチド、Ｂ７−２ポリペプチド、ＩＣＯＳ−Ｌポリペプチド、ＯＸ−４０Ｌポリペプチド、ＣＤ８０ポリペプチド、ＣＤ８６ポリペプチド、ＰＤ−Ｌ１ポリペプチド、ＦａｓＬポリペプチド、サイトカイン、及びＰＤ−Ｌ２ポリペプチドから選択される、請求項１から５のいずれか一項に記載の多量体ポリペプチド。
  7. 前記少なくとも１つの免疫調節ポリペプチドが、ＰＤ−Ｌ１ポリペプチド、ＦａｓＬポリペプチド、およびサイトカインから選択される、請求項６に記載の多量体ポリペプチド。
  8. ２つ以上の免疫調節ポリペプチドを含む、請求項１から７のいずれか一項に記載の多量体ポリペプチド。
  9. 前記２つ以上の免疫調節ポリペプチドがタンデムになっている、請求項８に記載の多量体ポリペプチド。
  10. ２つの多量体ポリペプチドのそれぞれが、免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドを含み、かつ該２つの多量体ポリペプチドが、それぞれのＩｇ Ｆｃポリペプチド間の１つまたは複数のジスルフィド結合によって結合される、請求項１から９のいずれか一項に記載の多量体ポリペプチドのうちの２つを含むタンパク質。
  11. 請求項１から９のいずれか一項に記載の第一および/または第二のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸。
  12. 請求項１１に記載の核酸を含む、発現ベクター。
  13. 請求項１２に記載の発現ベクターによって遺伝子改変された宿主細胞。
  14. 自己反応性Ｔ細胞の活性を選択的に阻害するおよび/または自己反応性Ｔ細胞の数を減少させる方法であって、前記Ｔ細胞を、請求項１から９のいずれか一項に記載の多量体ポリペプチドまたは請求項１０に記載のタンパク質とインビトロで接触させる段階を含み、前記接触させる段階が、前記自己反応性Ｔ細胞の活性を選択的に阻害する、および/または前記自己反応性Ｔ細胞の数を減少させる、前記方法。
  15. 個体における自己反応性Ｔ細胞の活性を選択的に阻害するおよび/または自己反応性Ｔ細胞の数を減少させるために投与される、個体における自己反応性Ｔ細胞の活性を選択的に阻害するおよび/または自己反応性Ｔ細胞の数を減少させる方法において使用するための、請求項１から９のいずれか一項に記載の多量体ポリペプチド、又は請求項１０に記載のタンパク質。
  16. 個体における自己免疫疾患を治療する方法において使用するための、請求項１から９のいずれか一項に記載の多量体ポリペプチド、または請求項１０に記載のタンパク質、または請求項１１記載の核酸、または請求項１２に記載の発現ベクター、または請求項１から９のいずれか一項に記載の多量体ポリペプチドもしくは請求項１０に記載のタンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む１つ以上のｍＲＮＡ。
  17. ａ）請求項１から９のいずれか一項に記載の多量体ポリペプチド、又は請求項１０に記載のタンパク質；及び
    ｂ）薬学的に許容される賦形剤
    を含む組成物。
  18. 前記多量体ポリペプチド中に存在するペプチドエピトープに特異的な標的Ｔ細胞を選択的に活性化する方法において使用するための、請求項１〜９のいずれか一項に記載の多量体ポリペプチド、または請求項１０に記載のタンパク質であって、該標的Ｔ細胞がエピトープ特異的ＣＤ４＋Ｔ細胞である、前記多量体ポリペプチドまたはタンパク質。
  19. 前記多量体ポリペプチド中に存在するペプチドエピトープに特異的な標的Ｔ細胞を選択的に阻害する方法において使用するための、請求項１〜９のいずれか一項に記載の多量体ポリペプチド、または請求項１０に記載のタンパク質であって、該標的Ｔ細胞がエピトープ特異的ＣＤ４＋Ｔ細胞である、前記多量体ポリペプチドまたはタンパク質。
  20. 前記エピトープ特異的ＣＤ４＋Ｔ細胞が、ＣＤ４＋／ＣＤ２５＋／ＦｏｘＰ３＋制御性Ｔ細胞である、請求項１８に記載の多量体ポリペプチドまたはタンパク質。
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