JP6605489B2 - デヒドロゲナーゼ化した変異酵素及びその用途 - Google Patents
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Description
[1]微生物由来コレステロールオキシダーゼのアミノ酸配列において、以下の(1)〜(8)からなる群より選択される一又は二以上のアミノ酸が他のアミノ酸に置換されたアミノ酸配列からなり、前記微生物由来コレステロールオキシダーゼに比較して、コレステロールオキシダーゼ活性に対するコレステロールデヒドロゲナーゼ活性(CHDH活性/CHO活性)が高い、変異酵素:
(1)配列番号1に示すアミノ酸配列の113位アミノ酸に相当するアミノ酸;
(2)配列番号1に示すアミノ酸配列の362位アミノ酸に相当するアミノ酸;
(3)配列番号1に示すアミノ酸配列の402位アミノ酸に相当するアミノ酸;
(4)配列番号1に示すアミノ酸配列の412位アミノ酸に相当するアミノ酸;
(5)配列番号1に示すアミノ酸配列の468位アミノ酸に相当するアミノ酸;
(6)配列番号1に示すアミノ酸配列の483位アミノ酸に相当するアミノ酸;
(7)配列番号1に示すアミノ酸配列の518位アミノ酸に相当するアミノ酸;
(8)配列番号1に示すアミノ酸配列の519位アミノ酸に相当するアミノ酸。
[2]前記微生物由来コレステロールオキシダーゼのアミノ酸配列が、配列番号1のアミノ酸配列と65%以上の同一性を示す配列である、[1]に記載の変異酵素。
[3]置換されるアミノ酸が(2)のアミノ酸であり、置換後のアミノ酸がプロリンである、[1]又は[2]に記載の変異酵素。
[4]置換されるアミノ酸が、(2)のアミノ酸と(4)のアミノ酸の組合せ、(2)のアミノ酸と(6)のアミノ酸の組合せ、(2)のアミノ酸と(7)のアミノ酸の組合せ、又は(2)のアミノ酸と(8)のアミノ酸の組合せである、[1]又は[2]に記載の変異酵素。
[5]置換後のアミノ酸が、(2)のアミノ酸についてはプロリンであり、(4)のアミノ酸についてはチロシンであり、(6)のアミノ酸についてはメチオニン又はトリプトファンであり、(7)のアミノ酸についてはグリシン、ロイシン、トレオニン又はアラニンであり、(8)のアミノ酸についてはシステイン、イソロイシン、セリン又はトレオニンである、[4]に記載の変異酵素。
[6]配列番号2〜18のいずれかのアミノ酸配列からなる、[1]に記載の変異酵素。
[7][1]〜[6]のいずれか一項に記載の変異酵素をコードする遺伝子。
[8]配列番号20〜36のいずれかの塩基配列を含む、[7]に記載の遺伝子。
[9][7]又は[8]に記載の遺伝子を含む組換えDNA。
[10][9]に記載の組換えDNAを保有する微生物。
[11][1]〜[6]のいずれか一項に記載の変異酵素を用いて試料中のコレステロールを測定することを特徴とする、コレステロール測定法。
[12][1]〜[6]のいずれか一項に記載の変異酵素を含むことを特徴とするコレステロール測定用試薬。
[13][12]に記載のコレステロール測定用試薬を含む、コレステロール測定用キット。
[14][1]〜[6]のいずれか一項に記載の変異酵素を含有する酵素剤。
[15]以下のステップ(I)〜(III)を含む、変異酵素の調製法:
(I)配列番号2〜18のいずれかのアミノ酸配列をコードする核酸を用意するステップ;
(II)前記核酸を発現させるステップ、及び
(III)発現産物を回収するステップ。
(用語)
用語「変異酵素」とは、本明細書が開示する手法によって、「基になる酵素」を変異ないし改変して得られる酵素である。「変異酵素」、「変異型酵素」及び「改変型酵素」は置換可能に用いられる。基になる酵素は典型的には野生型酵素である。但し、既に人為的操作が施されている酵素を「基になる酵素」として本発明に適用することを妨げるものではない。尚、「基になる酵素」のことを本明細書では「変異対象酵素」とも呼ぶ。
メチオニン:M、セリン:S、アラニン:A、トレオニン:T、バリン:V、チロシン:Y、ロイシン:L、アスパラギン:N、イソロイシン:I、グルタミン:Q、プロリン:P、アスパラギン酸:D、フェニルアラニン:F、グルタミン酸:E、トリプトファン:W、リジン:K、システイン:C、アルギニン:R、グリシン:G、ヒスチジン:H
本発明の第1の局面は微生物由来のコレステロールオキシダーゼ(CHO)を変異させた酵素(以下「変異CHO」とも呼ぶ)に関する。本発明の変異CHOは、微生物由来のCHO(変異対象酵素)のアミノ酸配列において、以下の(1)〜(8)からなる群より選択される一又は二以上のアミノ酸が他のアミノ酸に置換されたアミノ酸配列を有する。
(1)配列番号1に示すアミノ酸配列の113位アミノ酸に相当するアミノ酸
(2)配列番号1に示すアミノ酸配列の362位アミノ酸に相当するアミノ酸
(3)配列番号1に示すアミノ酸配列の402位アミノ酸に相当するアミノ酸
(4)配列番号1に示すアミノ酸配列の412位アミノ酸に相当するアミノ酸
(5)配列番号1に示すアミノ酸配列の468位アミノ酸に相当するアミノ酸
(6)配列番号1に示すアミノ酸配列の483位アミノ酸に相当するアミノ酸
(7)配列番号1に示すアミノ酸配列の518位アミノ酸に相当するアミノ酸
(8)配列番号1に示すアミノ酸配列の519位アミノ酸に相当するアミノ酸
(1)タンパク質を結晶化する。結晶化は、立体構造決定のためには欠かせないが、それ以外にも、タンパク質の高純度の精製法、高密度で安定な保存法として産業上の有用性もある。この場合、リガンドとして基質もしくはそのアナログ化合物を結合したタンパク質を結晶化すると良い。
(2)作製した結晶にX線を照射して回折データを収集する。なお、タンパク質結晶はX線照射によりダメージを受け回折能が劣化するケースが多々ある。その場合、結晶を急激に−173℃程度に冷却し、その状態で回折データを収集する低温測定技術が最近普及してきた。なお、最終的に、構造決定に利用する高分解能データを収集するために、輝度の高いシンクロトロン放射光が利用される。
(3)結晶構造解析を行うには、回折データに加えて、位相情報が必要になる。目的のタンパク質に対して、類縁のタンパク質の結晶構造が未知の場合、分子置換法で構造決定することは不可能であり、重原子同型置換法により位相問題が解決されなくてはならない。重原子同型置換法は、水銀や白金等原子番号が大きな金属原子を結晶に導入し、金属原子の大きなX線散乱能のX線回折データへの寄与を利用して位相情報を得る方法である。決定された位相は、結晶中の溶媒領域の電子密度を平滑化することにより改善することが可能である。溶媒領域の水分子は揺らぎが大きいために電子密度がほとんど観測されないので、この領域の電子密度を0に近似することにより、真の電子密度に近づくことができ、ひいては位相が改善されるのである。また、非対称単位に複数の分子が含まれている場合、これらの分子の電子密度を平均化することにより位相が更に大幅に改善される。このようにして改善された位相を用いて計算した電子密度図にタンパク質のモデルをフィットさせる。このプロセスは、コンピューターグラフィックス上で、MSI社(アメリカ)のQUANTA等のプログラムを用いて行われる。この後、MSI社のX-PLOR等のプログラムを用いて、構造精密化を行い、構造解析は完了する。目的のタンパク質に対して、類縁のタンパク質の結晶構造が既知の場合は、既知タンパク質の原子座標を用いて分子置換法により決定できる。分子置換と構造精密化はプログラム CNS_SOLVE ver.11などを用いて行うことができる。
変異酵素L113E:配列番号2:(1)の変異であり、置換後のアミノ酸はグルタミン酸。
変異酵素M362P:配列番号3:(2)の変異であり、置換後のアミノ酸はプロリン。
変異酵素M362E:配列番号4:(2)の変異であり、置換後のアミノ酸はグルタミン酸。
変異酵素M362R:配列番号5:(2)の変異であり、置換後のアミノ酸はアルギニン。
変異酵素M362A:配列番号6:(2)の変異であり、置換後のアミノ酸はアラニン。
変異酵素M362W:配列番号7:(2)の変異であり、置換後のアミノ酸はトリプトファン。
(2)と(4)の組合せ
(2)と(6)の組合せ
(2)と(7)の組合せ
(2)と(8)の組合せ
変異酵素(M362P+L412Y):配列番号8:(2)と(4)の組合せであり、(2)の置換後のアミノ酸はプロリン、(4)の置換後のアミノ酸はチロシン。
変異酵素(M362P+Y483M):配列番号9:(2)と(6)の組合せであり、(2)の置換後のアミノ酸はプロリン、(6)の置換後のアミノ酸はメチオニン。
変異酵素(M362P+Y483W):配列番号10:(2)と(6)の組合せあり、(2)の置換後のアミノ酸はプロリン、(6)の置換後のアミノ酸はトリプトファン。
変異酵素(M362P+S518G):配列番号11:(2)と(7)の組合せあり、(2)の置換後のアミノ酸はプロリン、(7)の置換後のアミノ酸はグリシン。
変異酵素(M362P+S518L):配列番号12:(2)と(7)の組合せあり、(2)の置換後のアミノ酸はプロリン、(7)の置換後のアミノ酸はロイシン。
変異酵素(M362P+S518T):配列番号13:(2)と(7)の組合せあり、(2)の置換後のアミノ酸はプロリン、(7)の置換後のアミノ酸はトレオニン。
変異酵素(M362P+S518A):配列番号14:(2)と(7)の組合せあり、(2)の置換後のアミノ酸はプロリン、(7)の置換後のアミノ酸はアラニン。
変異酵素(M362P+V519C):配列番号15:(2)と(8)の組合せあり、(2)の置換後のアミノ酸はプロリン、(8)の置換後のアミノ酸はシステイン。
変異酵素(M362P+V519I):配列番号16:(2)と(8)の組合せあり、(2)の置換後のアミノ酸はプロリン、(8)の置換後のアミノ酸はイソロイシン。
変異酵素(M362P+V519S):配列番号17:(2)と(8)の組合せあり、(2)の置換後のアミノ酸はプロリン、(8)の置換後のアミノ酸はセリン。
変異酵素(M362P+V519T):配列番号18:(2)と(8)の組合せあり、(2)の置換後のアミノ酸はプロリン、(8)の置換後のアミノ酸はトレオニン。
本発明の第2の局面は本発明の変異CHOに関連する核酸を提供する。即ち、変異CHOをコードする遺伝子、変異CHOをコードする核酸を同定するためのプローブとして用いることができる核酸、変異CHOをコードする核酸を増幅又は突然変異等させるためのプライマーとして用いることができる核酸が提供される。
配列番号20:L113E
配列番号21:M362P
配列番号22:M362E
配列番号23:M362R
配列番号24:M362A
配列番号25:M362W
配列番号26:M362P及びL412Y
配列番号27:M362P及びY483M
配列番号28:M362P及びY483W
配列番号29:M362P及びS518G
配列番号30:M362P及びS518L
配列番号31:M362P及びS518T
配列番号32:M362P及びS518A
配列番号33:M362P及びV519C
配列番号34:M362P及びV519I
配列番号35:M362P及びV519S
配列番号36:M362P及びV519T
本発明の第3の局面は変異CHOの用途に関する。この局面では、変異CHOを用いたコレステロール測定法が提供される。本発明のコレステロール測定法では本酵素による酸化還元反応を利用して試料中のコレステロール量を測定する。本発明は例えば血中コレステロール量の測定、食品中コレステロール量の測定などに利用される。
本発明の更なる局面は変異酵素の調製法に関する。本発明の変異酵素調製法の一態様では、本発明者らが取得に成功した変異CHOを遺伝子工学的手法で調製する。この態様の場合、配列番号2〜18のいずれかのアミノ酸配列をコードする核酸を用意する(ステップ(I))。ここで、「特定のアミノ酸配列をコードする核酸」は、それを発現させた場合に当該アミノ酸配列を有するポリペプチドが得られる核酸であり、当該アミノ酸配列に対応する塩基配列からなる核酸は勿論のこと、そのような核酸に余分な配列(アミノ酸配列をコードする配列であっても、アミノ酸配列をコードしない配列であってもよい)が付加されていてもよい。また、コドンの縮重も考慮される。「配列番号2〜18のいずれかのアミノ酸配列をコードする核酸」は、本明細書又は添付の配列表が開示する配列情報を参考にし、標準的な遺伝子工学的手法、分子生物学的手法、生化学的手法などを用いることによって、単離された状態に調製することができる。ここで、配列番号2〜18のアミノ酸配列はいずれも、ストレプトマイセス sp.由来CHOのアミノ酸配列に変異を施したものである。従って、ストレプトマイセス sp.由来CHOをコードする遺伝子(配列番号19)に対して必要な変異を加えることによっても、配列番号2〜18のいずれかのアミノ酸配列をコードする核酸(遺伝子)を得ることができる。位置特異的塩基配列置換のための方法は当該技術分野において数多く知られており(例えば、Molecular Cloning, Third Edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press, New Yorkを参照)、その中から適切な方法を選択して用いることができる。位置特異的変異導入法として、位置特異的アミノ酸飽和変異法を採用することができる。位置特異的アミノ酸飽和変異法は、タンパクの立体構造を基に、求める機能の関与する位置を推定し、アミノ酸飽和変異を導入する「Semi-rational,semi-random」手法である(J.Mol.Biol.331,585-592(2003))。例えば、Quick change(ストラタジーン社)等のキット、Overlap extention PCR(Nucleic Acid Res. 16,7351-7367(1988))を用いて位置特異的アミノ酸飽和変異を導入することが可能である。PCRに用いるDNAポリメラーゼはTaqポリメラーゼ等を用いることができる。但し、KOD-PLUS-(東洋紡社)、Pfu turbo(ストラタジーン社)などの精度の高いDNAポリメラーゼを用いることが好ましい。
既知のコレステロールオキシダーゼ(Streptomyces sp. SA-COO)の立体構造情報(プロテインデータバンク(PDB): 1MXT)をもとに、ストレプトマイセス sp.由来コレステロールオキシダーゼ(CHO)(配列番号1)の立体構造を予測し、変異点を選択した。変異点は、基質結合部位周辺(18箇所)、及び活性中心周辺(9箇所)を選択した。
A.で特定した変異点からデヒドロゲナーゼ化に効果的な変異点を、ランダムライブラリーを用いて選抜することにした。
デヒドロゲナーゼ化に効果的な変異点を以下の方法で選抜した。
1. PCR(反応液:25μL/チューブ)により、ランダム変異を導入した。尚、テンプレートにはpC4-CHOA1 No.1(プラスミド:pColdIV、挿入遺伝子:cho遺伝子(BspHI-HindIII))を使用した。
2. PCR反応液(25μL/チューブ)に、制限酵素DpnI(1.5μL/チューブ)を添加して処理(37℃、1h)した。
3. DpnI処理液(2μL)を用いて、ライゲーション処理(16℃、2h)した。
4. ライゲーション反応液(10μL/チューブ)を用いて、E.coli DH5αに形質転換した。
5. SOC(100μL/チューブ)を添加して、復帰培養(37℃、1h)した。
6. 全量をLB+Amp(100μg/mL)プレートに塗布して、培養(37℃、O/N)した。
7. QIA Prep(Qiagen)を用いてプラスミドを抽出した。
8. 抽出したプラスミド(4μL)を用いて、E.coli BL21(pGKJE-8)を形質転換した。
9. SOC(1mL/チューブ)を添加して、復帰培養(37℃、1h)した。
10. LB+Amp(100μg/mL)+Cm(20μg/mL)プレートに塗布して、培養(37℃、O/N)した。
11. LB Broth(invitrogen)にて前培養後、Teriffic Broth(invitrogen)にて本培養した。
12. 本培養後、菌体を回収して、B-per(TaKaRa)を用いて酵素を抽出した。
13. CHO活性測定法、CHDH活性測定法を用いて、活性を確認した。
14. 活性比(CHDH/CHO)で比較した。
菌体から抽出した酵素(又は菌体から抽出し、精製した酵素)を希釈バッファー(50mM PIPES, 0.1% Triton X-100, 0.1% BSA (pH7.0))で1〜1,000倍希釈したサンプル0.02mLと反応液(0.1M りん酸緩衝液 (pH7.0) 25.5mL、基質溶液 (5.3% コレステロール溶液 (w/v)) 2 mL、1.76 g/dL 4-A.A溶液 0.5 mL、5 g/dL フェノール溶液 1 mL、250 U/mL PO-3 (PO "Amano" 3)溶液 1 mLを混合)0.2mLを混合した後、37℃で0.5時間反応させ、吸光度500nmを測定する。本測定条件下で1分間に1μmolのH2O2を生成する酵素量を1Uとして酵素活性(U)を算出する。
菌体から抽出した酵素(又は菌体から抽出し、精製した酵素)を希釈バッファー(50mM PIPES, 0.1% Triton X-100, 0.1% BSA (pH7.0))で1〜1,000倍希釈したサンプル0.02mLと反応液(0.1M りん酸緩衝液 (pH7.0) 25mL、基質溶液 (5.3% コレステロール溶液 (w/v)) 2 mL、3 mmol/L PMS溶液 2 mL、6.6 mmol/L NTB溶液 1 mLを混合)0.2mLを混合した後、37℃で0.5時間反応させ、吸光度570nmを測定する。本測定条件下で1分間に0.5μmolのジホルマザン色素を生成する酵素量を1Uとして酵素活性(U)を算出する。
結果(実験データの一部。M402及びL412のデータは省略)を図4に示す。活性比(ΔΔ570nm/Δ500nm)をもとに、基質の結合部位周辺の変異点として5箇所(L113、M362、M402、L412、D468)と、活性中心周辺の変異点として3箇所(Y483、S518、V519)を選抜した。尚、Δ570は、CHDH活性測定法における0.5時間の反応終了時のサンプルのOD値と同ブランクのOD値の差であり、Δ500はCHO活性測定法における0.5時間の反応終了時のサンプルのOD値と同ブランクのOD値の差である。
B.で選抜した変異点について、デヒドロゲナーゼ化に効果のあるアミノ酸を飽和ライブラリーを用いて検討することにした。
デヒドロゲナーゼ化に効果の高いアミノ酸を以下の方法で特定した。尚、反応条件や培養条件等はB.の方法と同様である。
1. PCR(反応液:25μL/チューブ)により、飽和変異を導入した。尚、テンプレートにはpC4-CHOA1 No.1(プラスミド:pColdIV、挿入遺伝子:cho遺伝子(BspHI-HindIII))を使用した。
2. PCR反応液(25μL/チューブ)に、制限酵素DpnI(1.5μL/チューブ)を添加して処理(37℃、1h)した。
3. DpnI処理液(2μL)を用いて、ライゲーション処理(16℃、2h)した。
4. ライゲーション反応液(10μL/チューブ)を用いて、E.coli BL21(pGKJE-8)を形質転換した。
5. LB+Amp(100μg/mL)+Cm(20μg/mL)プレートに塗布して、培養(37℃、O/N)した。
6. LB Broth(invitrogen)にて前培養後、Teriffic Broth(invitrogen)にて本培養した。
7. 本培養後、菌体を回収して、B-per(TaKaRa)を用いて酵素を抽出した。
8. CHO活性測定法、CHDH活性測定法を用いて、活性を確認した。
9. 活性比(CHDH/CHO)で比較した。
結果を図5に示す。各変異点について、以下の通り、有効な置換後のアミノ酸が特定された。尚、活性中心周辺の変異点(Y483、S518、V519)については、他の変異点と組合せた場合の効果(図7)も考慮して有効な置換後のアミノ酸を特定した。尚、図5〜7における活性比(CHDH/CHO)は、活性測定法における0.5時間の反応中、20分の時点と30分の時点(反応終了時)のサンプルのOD値の差から、CHOとCHDHの各々についてU/mLを算出し、比率で表したものである。
L113:グルタミン酸、トレオニン、バリン、メチオニン、トリプトファン
M362:プロリン、グルタミン酸、アルギニン、アラニン、トリプトファン
M402:アスパラギン酸、アスパラギン、グリシン、トリプトファン、トレオニン
L412:リジン、チロシン、プロリン、トレオニン、グリシン
D468:プロリン、グルタミン、ヒスチジン、チロシン、フェニルアラニン
Y483:メチオニン、トリプトファン
S518:グリシン、ロイシン、トレオニン、アラニン
V519:システイン、イソロイシン、セリン、トレオニン
変異点の組合せの効果について検討した。
変異点を組み合わせた場合の効果を以下の方法で検討した。尚、反応条件や培養条件等はB.の方法と同様である。
1. PCR(反応液:25μL/チューブ)により、飽和変異を導入した。尚、テンプレートにはpC4-CHOA1 No.1 - M362P(プラスミド:pColdIV、挿入遺伝子:M362P変異を含むcho遺伝子(BspHI-HindIII))を使用した。
2. PCR反応液(25μL/チューブ)に、制限酵素DpnI(1.5μL/チューブ)を添加して処理(37℃、1h)した。
3. DpnI処理液(2μL)を用いて、ライゲーション処理(16℃、2h)した。
4. ライゲーション反応液(10μL/チューブ)を用いて、E.coli BL21(pGKJE-8)を形質転換した。
5. LB+Amp(100μg/mL)+Cm(20μg/mL)プレートに塗布して、培養(37℃、O/N)した。
6. LB Broth(invitrogen)にて前培養後、Teriffic Broth(invitrogen)にて本培養した。
7. 本培養後、菌体を回収して、B-per(TaKaRa)を用いて酵素を抽出した。
8. CHO活性測定法、CHDH活性測定法を用いて、活性を確認した。
9. 活性比(CHDH/CHO)にて比較した。
結果を図6及び図7に示す。変異点の組合せにより、デヒドロゲナーゼ化の向上が確認された。M362P(単独)よりも活性比(CHDH/CHO)が高い変異の組合せを以下に示す。これらの組合せの中で、組合せ1(M362P+L412Y)は特に高い活性比を示した。尚、各組合せについて、変異酵素のアミノ酸配列を配列番号8(組合せ1)、配列番号9(組合せ2)、配列番号10(組合せ3)、配列番号11(組合せ4)、配列番号12(組合せ5)、配列番号13(組合せ6)、配列番号14(組合せ7)、配列番号15(組合せ8)、配列番号16(組合せ9)、配列番号17(組合せ10)、配列番号18(組合せ11)に示す。
組合せ1:M362P+L412Y
組合せ2:M362P+Y483M
組合せ3:M362P+Y483W
組合せ4:M362P+S518G
組合せ5:M362P+S518L
組合せ6:M362P+S518T
組合せ7:M362P+S518A
組合せ8:M362P+V519C
組合せ9:M362P+V519I
組合せ10:M362P+V519S
組合せ11:M362P+V519T
デヒドロゲナーゼ化された変異酵素を精製し、比活性の確認をした。
デヒドロゲナーゼ化された変異酵素(M362P、M362P+L412Y、M362P+Y483W、M362P+S518T、M362P+V519C)の比活性を以下の手順で求めた。尚、比較のために、野生型酵素と既報の変異酵素(V228A)の比活性も算出した。
1. 各変異酵素について、形質転換後の大腸菌を培養(前培養・本培養)した。培養条件は上記の実験に準じた。
2. 培養液から菌体を回収して、精製(集菌→菌体破砕(ビーズ破砕)→上清回収→凝集処理→カラム精製(DEAE Sepharose、Buthyl-S Sepharose)→脱塩濃縮)した。
3. 活性測定(CHO、CHDH)、タンパク濃度を測定して、比活性を算出した。
4. CHDH/CHO(比活性)を比較した。
結果を図8に示す。各変異酵素は野生型よりも優位にデヒドロゲナーゼ化していることが確認された。驚くべきことに、活性比(CHDH活性/CHO活性)は、単独の変異(M362P)であっても野生型の約1.9×106倍に向上した。デヒドロゲナーゼ化の程度は、既知の変異(Katsuhiro Kojima et al., Journal of molecular catalysis B: Enzymatic 88(2013) 41-46で報告されたV191A)に対応する変異酵素(V228A:V191に対応するアミノ酸残基V228がアラニンに置換された変異体)を遙かに凌駕する。また、変異を組み合わせることにより、単独の変異よりも活性比(CHDH活性/CHO活性)が約2〜20倍となった。尚、図8における活性値U/mLは、活性測定法における0.5時間の反応中、3分の時点と5分の時点のサンプルのOD値の差より算出している。
各変異酵素の調製に使用したストレプトマイセス sp.CHO(配列番号1)とブレビバクテリウム・ステロリカムCHO(配列番号54)の構造を、コンピュータソフトウエア(Molecule Operating Environment(Chemical Computing Group社製))を用い、FADにてスーパーポーズをかけて重ね合わせた。両者の構造は高い同一性を示し、各アミノ酸残基は概ね一致した。ストレプトマイセス sp.CHOにおいてデヒドロゲナーゼ化に関与することが判明したアミノ酸残基(L113、M362、M402、L412、D468、Y483、S518、V519)に対応する、ブレビバクテリウムCHOのアミノ酸残基を図9に示した。これらのアミノ酸残基(L113に対応するP76、M362に対応するM325、M402に対応するL365、L412に対応するL375、D468に対応するD431、Y483に対応するY446、S518に対応するN481、V519に対応するV482)を同様に変異させることにより、ブレビバクテリウム・ステロリカムCHOもデヒドロゲナーゼ化することが当然に予想される。
Claims (11)
- 配列番号1のアミノ酸配列と90%以上の同一性を示す、微生物由来コレステロールオキシダーゼのアミノ酸配列において、以下の(2)のアミノ置換、以下の(2)のアミノ酸置換と(4)のアミノ酸置換、以下の(2)のアミノ酸置換と(6)のアミノ酸置換、以下の(2)のアミノ酸置換と(7)のアミノ酸置換、又は以下の(2)のアミノ酸置換と(8)のアミノ酸置換が行われたアミノ酸配列からなり、前記微生物由来コレステロールオキシダーゼに比較して、コレステロールオキシダーゼ活性に対するコレステロールデヒドロゲナーゼ活性(CHDH活性/CHO活性)が高い、変異酵素:
(2)配列番号1に示すアミノ酸配列の362位アミノ酸に相当するアミノ酸のプロリンへの置換;
(4)配列番号1に示すアミノ酸配列の412位アミノ酸に相当するアミノ酸のチロシンへの置換;
(6)配列番号1に示すアミノ酸配列の483位アミノ酸に相当するアミノ酸のメチオニン又はトリプトファンへの置換;
(7)配列番号1に示すアミノ酸配列の518位アミノ酸に相当するアミノ酸のグリシン、ロイシン、トレオニン又はアラニンへの置換;
(8)配列番号1に示すアミノ酸配列の519位アミノ酸に相当するアミノ酸のシステイン、イソロイシン、セリン又はトレオニンへの置換。 - 配列番号3、8〜18のいずれかのアミノ酸配列からなる、請求項1に記載の変異酵素。
- 請求項1又は2に記載の変異酵素をコードする遺伝子。
- 配列番号21、26〜36のいずれかの塩基配列を含む、請求項3に記載の遺伝子。
- 請求項3又は4に記載の遺伝子を含む組換えDNA。
- 請求項5に記載の組換えDNAを保有する微生物。
- 請求項1又は2に記載の変異酵素を用いて試料中のコレステロールを測定することを特徴とする、コレステロール測定法。
- 請求項1又は2に記載の変異酵素を含むことを特徴とするコレステロール測定用試薬。
- 請求項8に記載のコレステロール測定用試薬を含む、コレステロール測定用キット。
- 請求項1又は2に記載の変異酵素を含有する酵素剤。
- 以下のステップ(I)〜(III)を含む、変異酵素の調製法:
(I)配列番号3、8〜18のいずれかのアミノ酸配列をコードする核酸を用意するステップ;
(II)前記核酸を発現させるステップ、及び
(III)発現産物を回収するステップ。
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