JP6403809B2 - 安定化させた凍結乾燥物質を作製するための方法 - Google Patents
安定化させた凍結乾燥物質を作製するための方法 Download PDFInfo
- Publication number
- JP6403809B2 JP6403809B2 JP2016573730A JP2016573730A JP6403809B2 JP 6403809 B2 JP6403809 B2 JP 6403809B2 JP 2016573730 A JP2016573730 A JP 2016573730A JP 2016573730 A JP2016573730 A JP 2016573730A JP 6403809 B2 JP6403809 B2 JP 6403809B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- wax
- lyophilized
- reagent
- pcr
- cake
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6806—Preparing nucleic acids for analysis, e.g. for polymerase chain reaction [PCR] assay
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
- C12Q1/6848—Nucleic acid amplification reactions characterised by the means for preventing contamination or increasing the specificity or sensitivity of an amplification reaction
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Description
本発明は、一般に分子生物学、免疫学、組換えDNA技術、および核酸増幅の分野に関する。より具体的には、本発明は、ワックス成分を含む凍結乾燥させた生物学的試薬およびそのような試薬の使用に関する。
大部分の生物学的試薬は、本質的に外気温において不安定である。凍結乾燥(フリーズドライ)は、生物学的試薬を室温で長期間貯蔵できるようにこれを安定化させるために使用され得る1つのアプローチである。凍結乾燥させた生体分子を安定化させるために、糖、タンパク質、ポリマー、緩衝液、および界面活性剤などの賦形剤を添加することができる。例えば、Croweらは、糖による乾燥脂質二重層およびタンパク質の安定化を記載しており (Biochem. J. 242: 1-10 (1987)(非特許文献1))、また「The trehalose myth revisited: Introduction to a symposium on stabilization of cells in the dry state」Cryobiology 43, 89-105 (2001) (非特許文献2)において細胞のトレハロース安定化の機構の理解を概説している。生物学的試薬を凍結乾燥すると、水分含量が非常に低い (<5%) 物質が生じ、乾いた状態で貯蔵されなければ、凍結乾燥物質の機能性は損なわれる。乾燥貯蔵条件の達成は、補助的な貯蔵容器、真空密封、または低湿度の貯蔵施設もしくはチャンバーの使用を含み得る。しかしながら、これらの貯蔵機構は厄介であり得る。したがって、外界の温度および湿度において貯蔵できる、安定化させた、凍結乾燥させた生物学的組成物の必要性が存在する。
少なくとも1つの生物学的試薬を含む凍結乾燥ペレットを含む、安定化させた、凍結乾燥させた生物学的試薬の組成物であって、該ペレットがワックスで被覆されているかまたは該ペレットにワックスが含浸されている、組成物。
[本発明1002]
少なくとも1つの生物学的試薬がポリペプチドである、本発明1001の組成物。
[本発明1003]
ポリペプチドが抗体または酵素である、本発明1002の組成物。
[本発明1004]
酵素がポリメラーゼ酵素である、本発明1003の組成物。
[本発明1005]
ポリメラーゼ酵素が、DNAポリメラーゼ、Taqポリメラーゼ、逆転写酵素、RNAポリメラーゼ、またはKlenowポリメラーゼである、本発明1004の組成物。
[本発明1006]
酵素がヌクレアーゼである、本発明1003の組成物。
[本発明1007]
ヌクレアーゼがRNase HまたはRNase H2である、本発明1006の組成物。
[本発明1008]
少なくとも1つの生物学的試薬が少なくとも1つのオリゴヌクレオチドプライマーを含む、本発明1001の組成物。
[本発明1009]
凍結乾燥ペレットが緩衝液をさらに含む、本発明1002の組成物。
[本発明1010]
凍結乾燥ペレットがヌクレオシド三リン酸 (NTP) をさらに含む、本発明1001の組成物。
[本発明1011]
緩衝液が、HEPES、MES、MOPS、TRIS、またはBIS- TRISプロパンである、本発明1009の組成物。
[本発明1012]
NTPが、dATP、dGTP、dCTP、dTTP、dUTP、またはそれらの組み合わせを含む、本発明1010の組成物。
[本発明1013]
凍結乾燥ペレットが少なくとも第1の非天然NTPをさらに含む、本発明1001の組成物。
[本発明1014]
非天然NTPがイソ塩基を含む、本発明1013の組成物。
[本発明1015]
非天然NTPが標識NTPである、本発明1013の組成物。
[本発明1016]
非天然NTPがダブシクル (dabcycl) diGTPまたはビオチン-diGTPである、本発明1014の組成物。
[本発明1017]
非天然NTPがフルオロ標識ヌクレオチドまたはクエンチャー標識ヌクレオチドある、本発明1013の組成物。
[本発明1018]
凍結乾燥ペレットが糖および/または安定剤をさらに含む、本発明1001の組成物。
[本発明1019]
糖が、トレハロース、デキストラン、マンニトール、スクロース、ラフィノース、またはそれらの組み合わせである、本発明1018の組成物。
[本発明1020]
糖が、トレハロースおよびデキストラン、マンニトールおよびデキストラン、またはトレハロースおよびマンニトールである、本発明1018の組成物。
[本発明1021]
凍結乾燥ペレットが、約1体積%〜10体積%のトレハロースおよび/または約1体積%〜10体積%のデキストランを含む、本発明1020の組成物。
[本発明1022]
安定剤がBSAである、本発明1018の組成物。
[本発明1023]
約0.1〜約1.0 mg/mlのBSAを含む、本発明1022の組成物。
[本発明1024]
前記ペレットに第1ワックスが含浸されている、本発明1001の組成物。
[本発明1025]
第1ワックスが含浸されたペレットが第2ワックスで被覆されている、本発明1024の組成物。
[本発明1026]
第1ワックスが室温で液体であり、第2ワックスが室温で固体である、本発明1025の組成物。
[本発明1027]
第1ワックスが第2ワックスよりも高い密度を有する、本発明1025の組成物。
[本発明1028]
ワックスが50℃未満の融点を有する、本発明1001の組成物。
[本発明1029]
ワックスが40℃未満の融点を有する、本発明1001の組成物。
[本発明1030]
ワックスが30℃〜50℃の融点を有する、本発明1001の組成物。
[本発明1031]
ワックスが石油ワックスである、本発明1001の組成物。
[本発明1032]
石油ワックスがパラフィンワックスまたはドコサンワックスである、本発明1031の組成物。
[本発明1033]
ワックスが植物ワックスである、本発明1001の組成物。
[本発明1034]
凍結乾燥ペレットがボールをさらに含む、本発明1001の組成物。
[本発明1035]
ボールがセラミックボールである、本発明1034の組成物。
[本発明1036]
ボールが磁気ボールまたは金属ボールである、本発明1034の組成物。
[本発明1037]
本発明1001〜1033のいずれかの組成物がその中に配置されている、入れ物。
[本発明1038]
チューブまたはウェルである、本発明1037の入れ物。
[本発明1039]
チューブまたはウェルがボールをさらに含む、本発明1038の組成物。
[本発明1040]
ボールが凍結乾燥ペレットの上部にある、本発明1039の組成物。
[本発明1041]
ボールが凍結乾燥ペレットの下部にある、本発明1039の組成物。
[本発明1042]
ボールがワックス中に包埋されている、本発明1039の組成物。
[本発明1043]
(a) 核酸を含む水性液体と、本発明1001のワックス被覆凍結乾燥ペレットとを容器中で混合する段階であって、該ワックス被覆凍結乾燥ペレットが1つまたは複数のPCRまたはRT-PCR試薬を含む、段階、
(b) ワックスを融解させる段階、
(c) 任意で、少なくとも1サイクルの逆転写を行う段階、および
(d) 少なくとも1サイクルのPCRを行う段階
を含む、PCRまたは逆転写 (RT)-PCRを行う方法。
[本発明1044]
段階 (c) または (d) の前に反応溶液を混合する段階をさらに含む、本発明1043の方法。
[本発明1045]
ワックスが凍結乾燥ペレットの下に配置され、水性液体よりも小さい比重を有する、本発明1043の方法。
[本発明1046]
ワックスを融解させ、それが水性液体の中を通って移動できるようにすることによって、反応物を混合する段階
をさらに含む、本発明1043の方法。
[本発明1047]
反応物の混合後に水性液体の均一性を測定する段階
をさらに含む、本発明1044の方法。
[本発明1048]
水性液体が均一でない場合に、付加的な混合を行う段階
をさらに含む、本発明1047の方法。
[本発明1049]
水性液体の均一性を測定する段階が、液体中の蛍光標識の蛍光を測定することを含む、本発明1044の方法。
[本発明1050]
ワックスを、水性液体と混合する前に、融解させる、本発明1043の方法。
[本発明1051]
水性液体が予め加熱され、予め加熱した水性液体とワックス被覆凍結乾燥ペレットとを混合することによってワックスが融解される、本発明1043の方法。
[本発明1052]
組成物がボールを含む、本発明1043の方法。
[本発明1053]
ボールの移動を誘導することによって反応溶液を混合する段階
をさらに含む、本発明1052の方法。
[本発明1054]
ボールの移動が重力によって誘導される、本発明1053の方法。
[本発明1055]
ボールが磁気ボールまたは金属ボールであり、ボールの移動が磁石によって誘導される、本発明1053の方法。
[本発明1056]
ボールが、水性液体/ワックス界面に接触することなく、容器の底から、水性液体/ワックス界面の、ボール直径の2倍以内の位置に移動させられる、本発明1055の方法。
[本発明1057]
(a) 生物学的試薬を凍結乾燥する段階、および
(b) 凍結乾燥させた生物学的試薬と接触しかつこれを取り囲むワックスバリアを形成して、安定化させた、凍結乾燥させた生物学的試薬を形成する段階
を含む、安定化させた、凍結乾燥させた生物学的試薬の組成物を作製する方法。
[本発明1058]
(a) 生物学的試薬を凍結乾燥する段階、
(b) 凍結乾燥させた生物学的試薬に第1ワックスを含浸させる段階、および
(c) 含浸させ凍結乾燥させた生物学的試薬を取り囲むワックスバリアを第2ワックスで形成して、安定化させた、凍結乾燥させた生物学的試薬を形成する段階
を含む、安定化させた、凍結乾燥させた生物学的試薬の組成物を作製する方法。
[本発明1059]
ワックスバリアを形成する段階が、生物学的試薬を凍結乾燥する前に、生物学的試薬とワックスを混合することを含む、本発明1057の方法。
[本発明1060]
ワックスが凍結乾燥機内で融解される、本発明1059の方法。
[本発明1061]
ワックスバリアを形成する段階が:
(a) 凍結乾燥させた生物学的試薬と固形ワックスを混合すること、および
(b) 固形ワックスを融解させて液体ワックスを形成すること
を含む、本発明1057の方法。
[本発明1062]
固形ワックスの融解が、ヒートブロック、オーブン、または電子レンジを用いて行われる、本発明1061の方法。
[本発明1063]
固形ワックスの融解が真空下で行われる、本発明1061の方法。
[本発明1064]
ワックスバリアを形成する段階が、凍結乾燥させた生物学的試薬と液体ワックスを混合することを含む、本発明1057の方法。
[本発明1065]
凍結乾燥させた生物学的試薬および液体ワックスを加熱する段階をさらに含む、本発明1064の方法。
[本発明1066]
凍結乾燥させた生物学的試薬および液体ワックスに真空を適用する段階をさらに含む、本発明1064または1065の方法。
[本発明1067]
ワックスを凝固させる段階をさらに含む、本発明1060〜1066のいずれかの方法。
[本発明1068]
安定化させた、凍結乾燥させた生物学的試薬の上部にボールを置く段階をさらに含む、本発明1057の方法。
[本発明1069]
安定化させた、凍結乾燥させた生物学的試薬の下部にボールを置く段階をさらに含む、本発明1057の方法。
[本発明1070]
安定化させた、凍結乾燥させた生物学的試薬を取り囲むワックス中にボールを包埋する段階をさらに含む、本発明1057の方法。
[本発明1071]
ボールが、セラミックボール、ガラスボール、磁気ボール、または金属ボールである、本発明1068〜1070のいずれかの方法。
[本発明1072]
生物学的試薬が1つまたは複数のPCR試薬を含む、本発明1057の方法。
[本発明1073]
生物学的試薬が1つまたは複数の抗体を含む、本発明1057の方法。
[本発明1074]
ワックスと生物学的試薬との体積比が1:2〜2:1である、本発明1057の方法。
[本発明1075]
(a) ボール、1つまたは複数の凍結乾燥用試薬、および1つまたは複数のPCR試薬を容器中で混合する段階、
(b) ボール、1つまたは複数の凍結乾燥用試薬、および1つまたは複数のPCR試薬を凍結乾燥して、凍結乾燥させたPCR試薬を形成する段階、
(c) 凍結乾燥させたPCR試薬にワックスを添加する段階、
(d) 凍結乾燥させたPCR試薬の周りのワックスを融解させる段階、ならびに
(e) ワックスを再凝固させて、安定化させた、凍結乾燥させたPCR試薬を形成する段階
を含む、安定化させた、凍結乾燥させたPCR試薬の組成物を作製する方法。
[本発明1076]
ボールが、セラミックボール、ガラスボール、または金属ボールである、本発明1075の方法。
[本発明1077]
金属ボールがステンレススチール球である、本発明1076の方法。
[本発明1078]
凍結乾燥用試薬が、トレハロース、デキストラン、マンニトール、スクロース、ラフィノースのうちの1つもしくは複数、またはそれらの組み合わせを含む、本発明1075の方法。
[本発明1079]
PCR試薬が、ポリメラーゼ、逆転写酵素、プライマー、またはヌクレオチド三リン酸のうちの1つまたは複数を含む、本発明1075の方法。
[本発明1080]
ワックスが、パラフィンワックス、ドコサン、またはシリコンワックスである、本発明1075の方法。
本発明のその他の目的、特色、および利点は、以下の詳細な説明から明らかになるであろう。しかしながら、本発明の精神および範囲の内の様々な変更および修正が、この詳細な説明から当業者に明らかとなると考えられるため、詳細な説明および具体例は、本発明のある特定の態様を示しながら、例示として与えられているに過ぎないことが理解されるべきである。
生物学的試薬は、本質的に外気温において不安定であり、凍結乾燥により糖を用いて安定化される場合が多い。任意の生物学的物質(核酸/タンパク質/脂質/炭水化物)を凍結乾燥すると、水分から保護される必要のある凍結乾燥ケーキまたはペレットが生じる。本発明の態様は、生物学的分子を環境水分から保護し続けるための解決方法を提供する。ワックスは、凍結乾燥物質が凍結乾燥機から取り出された時点で、凍結乾燥させた生物学的物質に水分が接近するのを防ぐかまたは阻害するためのバリアを提供する。これは、凍結乾燥機から取り出した後に、例えばヒートブロックもしくはオーブンもしくは真空オーブンを用いて凍結乾燥ケーキ上にワックスを融解させることによって、または凍結乾燥ケーキに液体形態のワックスを適用することによって達成され得る。あるいは、ワックスの存在下で生物学的試薬を凍結乾燥し、凍結乾燥サイクルの完了時に凍結乾燥機内でワックスを融解させることでもまた、大気水分から保護される凍結乾燥ケーキの生成が可能になる。凍結乾燥の工程は、昇華による真空下での、凍結された生物学的物質/試薬からの水分の除去を含む。生物学的物質の機能的活性が損なわれないように、糖および安定剤を添加して、タンパク質および他の生物学的物質の構造の保持を助けることができる。
いくつかの局面において、生物学的試薬、および低温融解ワックスなどのワックス成分(例えば、ペレットを被覆する)を含む凍結乾燥ペレットが提供される。本明細書において用いられる場合、「凍結乾燥ペレット」または「凍結乾燥ケーキ」という用語は互換的に用いられ、水分含量が例えば約5%未満の水分まで実質的に減少した物質の塊を指す。そのようなケーキまたはペレットは、任意の形状またはサイズのものであってよい。
PCRを行うための試薬を含む凍結乾燥ケーキが、頑強でかつ定量的なPCRを達成する能力をなお維持しながら、ワックス密封によって保護され得るかどうかを試験するための研究に着手した。凍結乾燥ケーキは、リアルタイムPCR増幅およびA型インフルエンザ標的配列の検出のための試薬のすべてを含んだ。これらの試薬を共に乾燥させて50μLケーキとした。次に、これらのケーキを2つの異なるワックスで処理した。1つ目の例では、60μLのドコサンワックスを凍結乾燥ケーキの上部にピペットで乗せ、室温で凝固させた。2つめの試験例では、60μLのChill-out(商標)ワックス (Bio-Rad Laboratories, Inc.) を凍結乾燥ケーキの上部にピペットで乗せ、冷所に置いて凝固させた。この様式で添加したChill-out(商標)ワックスは凍結乾燥ケーキ中に吸収され、ケーキが10℃未満で保たれる限り固体のままである。
A型インフルエンザ増幅のためのリアルタイムPCR試薬およびプライマーを含む凍結乾燥試薬ケーキ(25μL)を、スナップキャップチューブ中で調製した。詳述されない限り、本実施例に従って生成された凍結乾燥試薬ケーキは、25μLの出発湿潤試薬体積から生成され、5%トレハロース (w/v)、5%デキストラン (w/v)、および0.5 mg/ml BSAを含んだ。20μLパラフィンワックスペレットを凍結乾燥ケーキ上で融解させることにより、パラフィンワックスをチューブのサブセットに添加した。70℃のヒートブロック上で、ワックスを1.5分間融解させた。
25μLのA型インフルエンザ凍結乾燥ケーキに、20μLのドコサンワックスペレットもまた添加した。ウェル中の温度が50℃のヒートブロック上で、ワックスを3.5分間融解させた。リアルタイムサーモサイクラー装置上で試験を行い、結果を、試験の直前に作製された湿潤対照と比較した。湿潤対照は、マスターミックスの重要な成分のすべてを含んだが、凍結乾燥に必要な糖を含まなかった。結果を表2および図3に示す(ドコサン被覆ケーキを用いた増幅による結果をA2〜A6およびA8〜A12として表示し、対照をA1およびA7として表示する)。これらの研究から、ドコサンワックスで被覆された試薬ケーキを用いて、定量的増幅がうまく達成され得ることが実証された。
A型インフルエンザ凍結乾燥ケーキ(50μLケーキ)を調製し、60μLのドコサンワックスで被覆した。ドコサンワックスを100℃まで加熱し、次いで60μLを凍結乾燥ケーキ上にピペットで乗せ、凝固させた。ワックス被覆ケーキの融解/反転混合後に、リアルタイムサーモサイクラー装置上で試験を行い、結果を、試験の直前に作製された湿潤対照と比較した。湿潤対照は、マスターミックスの重要な成分のすべてを含んだが、凍結乾燥に必要な糖を含まなかった。これらの研究の結果を図4に示す(ドコサン被覆ケーキを用いた増幅による結果をA1〜A3として表示し、対照をA4〜A6として表示する)。これらの研究から、溶融ドコサンワックスで被覆された試薬ケーキを用いて、定量的増幅がうまく達成され得ることが確認された。
25μLの凍結乾燥ケーキを、マウス肝炎ウイルスプライマーを用いて、チューブ中で凍結乾燥させて調製した。同じ凍結乾燥ケーキを用いて、RNAおよびDNA両方の内部対照標的を検出できるようにするため、モロニーマウス白血病ウイルス (MMLV) 逆転写酵素をマスターミックスに添加した。25%相対湿度 (RH) 条件において、ウェル中温度が50℃のヒートブロックを用いて、ドコサンワックス(25μL)を凍結乾燥ケーキ上で3.5分間融解させた。試験は、ワックスの機器外での反転を伴って、リアルタイムサーモサイクラー装置上で行った。機器外での反転を行うため、ウェル中温度が50℃のヒートブロック上で、ワックス被覆ケーキを30秒間加熱した。50μLの50℃標的をチューブに添加し、チューブを直ちにサーモサイクラー機器に移した。同じ試験パラメータを、DNAおよびRNAの両方に使用した。ワックスで被覆された凍結乾燥ケーキを、ワックス被覆なしの同じ凍結乾燥ケーキ(lyo対照)および湿潤対照と比較した。湿潤対照は、凍結乾燥物質と同じ成分のすべてを含んだが、試験の直前に調製された。これらの研究の結果から、Ct値(表3および図5A)およびTm値(表4および図5B)が、すべての条件にわたって同等であることが示された。
A型インフルエンザ凍結乾燥ケーキ(25μL)を、スナップキャップチューブ中で調製した。様々な量のドコサンワックスを凍結乾燥ケーキ上で融解させ(20、15、10μL)、凝固させた。次いで、ワックス被覆凍結乾燥ケーキを、高湿度環境を創出するために水の皿を含む35℃のオーブン(ワックスがなお固体であることを確実にするために、ワックスの融点よりも低い温度)に入れた。被覆されていないlyoケーキ対照が萎縮するまで(〜1時間)、物質をオーブンに入れておいた。結果として得られた物質を、サーモサイクラー装置上で試験した。
凍結乾燥ケーキ中に含まれる25μLのマウス肝炎ウイルス特異的プライマー反応混合物を調製し、55℃に設定した真空オーブン内で15分間にわたり25μLのドコサンワックスで被覆した。融解の前にセラミックボールをワックス被覆ケーキの上部に置き、その結果、融解および再凝固後にセラミックボールはワックス中に包埋された。標的としてマウス肝炎ウイルスRNAを用いて、チューブ内で試験を行った。ワックス反転がRT段階のワックス融解中に起こり、これはセラミックボールによって促進された。セラミックボールは、ワックス融解手順中に重力で底まで落下し、ひいては表面張力およびワックスと再懸濁緩衝液との間の界面を壊し、任意の「固着した」ワックスが上部まで上昇することを可能にした。セラミックボールはまた、再懸濁緩衝液中に既に閉じ込められていた任意の気泡を取り除き、かつチューブの底の表面張力を壊すことを可能にして、底の近くで気泡が形成するまたは残存するのを防いだ。
凍結乾燥のために、クロムスチール磁気ボールをPCRチューブに添加し、25μLのPCR試薬マスターミックス(ノロウイルス増幅に特異的)をボールの上部に添加した。したがって、磁気ボールはケーキの下部に配置され、ワックス添加後に付加的なボールは添加されなかった。ノロウイルスケーキのサブセットを、25μLのドコサンワックスで被覆した。ワックスはペレットとして添加し、次いで50℃に設定した真空オーブン内で5分間融解させた。試験は、逆転写酵素 (RT) 段階中に混合段階を伴って、サーモサイクラー装置上で行った。
HSV検出に特異的な凍結乾燥試薬ケーキ(25μL)を調製し、25μLのドコサンワックスで被覆した。ワックスはペレットとして添加し、次いで50℃に設定した真空オーブン内で5分間融解させた。凝固後、セラミックボールまたは金属ボールをケーキの上部に置いた。PCRは、逆転写酵素 (RT) 段階中に混合段階を伴って、サーモサイクラー装置上で行った。混合段階はRT段階の開始から90秒後に始まり、これによってワックス反転が起こることが可能になった。ワックス融解の工程中、上部に置いた金属ボールは、重力により底まで落下した。ボールが底に来た時点で、磁石をPCRチューブに向けて動かし、磁石で金属ボールを液体/ワックス界面の真下まで持ち上げ、そこで磁石を3秒間維持した。次いで磁石を離して3秒間待機し、それによってボールを底まで落下させた。これを90秒間継続した。セラミックボールもまた上部に置き、ワックス融解工程中に重力で底まで落下させたが、この物質は非磁性であるため、さらなる混合を起こさない。試験を、試験の直前に調製され、マスターミックスと同じ成分のすべてを含む「湿潤」マスターミックスと比較した;しかしながら、「湿潤」マスターミックスは、ワックス蒸気バリアの代わりにミネラルオイル蒸気バリアを使用した。
安定化させた凍結乾燥試薬ケーキを作製する際に使用するため、さらなるワックス組成物を製剤化した。第1例のプロトコールでは、30%ドコサンおよび70% PDMSオイルを含むワックスを製剤化した。最初に、サーモサイクラーを用いて、100%ドコサンワックスの1.5 mLチューブを65℃で加熱した。700μLのPDMSオイルを新たな1.5 mLチューブに添加し、同様に65℃まで加熱した。次いで、300μLの融解された100%ドコサンワックスを、1.5 mLバイアル中の700μLのPDMSに添加した。混合物を65℃で加熱し続け、P 1000ピペットでの吸引/分注によって混合した。ワックス組成物が完全に混合された時点で、ワックス混合物の25μL一定分量を、ホイルで被覆したコールドブロック上でペレット化した。ペレットは冷却され得、1分以内に固形ワックスを形成した。所望される数のペレットが作製されるまで、ペレット化を繰り返した。凍結乾燥試薬ケーキの被覆において使用するため、ペレットをさらに融解するかまたは固体として沈着させることができる。
ノロウイルスRNA増幅のためのリアルタイムPCR試薬およびプライマーを含む凍結乾燥試薬ケーキ(25μL)を、スナップキャップチューブ中で調製した。凍結乾燥させたPCR試薬ケーキを25μLドコサンワックスで覆うか、またはドコサンワックスで覆った後に15μLのChill out(商標)ワックスで覆うか、またはドコサンワックスで覆った後に15μLのミネラルオイルで覆った。ドコサンワックスケーキおよび2層ケーキを、80%相対湿度チャンバー内で、または密封された乾燥チャンバー(対照)内で3日間貯蔵した。リアルタイムサーモサイクラー装置上で試験を行い、結果を対照と比較した。結果を図9に示す。結果から、ドコサン、またはchill outワックスで覆われたドコサン、またはミネラルオイルで覆われたドコサンが、効果的な蒸気バリアを提供することが示される。
ノロウイルスRNA増幅のためのリアルタイムPCR試薬およびプライマーを含む凍結乾燥試薬ケーキ(25μL)を、スナップキャップチューブ中で調製した。凍結乾燥させたPCR試薬ケーキを30μLドコサンワックスで覆うか、もしくはドコサンワックスで覆った後に15μLのミネラルオイルで覆うか、または凍結乾燥させたPCR試薬ケーキを30μLのワックスの混合物(体積:体積:体積が30:40:30という比率のパラフィンワックス:ドコサンワックス:ミネラルオイル)で覆うか、または凍結乾燥させたPCR試薬ケーキを30μLパラフィンワックスで覆った。ドコサンワックスケーキおよびワックス層状凍結乾燥ケーキを、1ヶ月間にわたり、乾燥ボックス内で貯蔵するか(T1 対照)、または周囲環境において貯蔵するか(T1 周囲)、または80%相対湿度チャンバー内で貯蔵した(T1 80%)。リアルタイムサーモサイクラー装置上で試験を行い、結果を対照 (T1 対照) と比較した。結果を図10に示す。結果から、ワックスの組み合わせが、より効果的な蒸気バリアを提供したことが示される。
Claims (4)
- (a) 約0.5 mm〜約5 mmまたは約1 mm〜約2 mmという直径または最長寸法における長さを有し得る固体物体、1つまたは複数の凍結乾燥用試薬、および1つまたは複数のPCR試薬を容器中で混合する段階、
(b) 該固体物体、該1つまたは複数の凍結乾燥用試薬、および該1つまたは複数のPCR試薬を凍結乾燥して、凍結乾燥させたPCR試薬を形成する段階、
(c) 該凍結乾燥させたPCR試薬に固形ワックスを容器中で添加する段階、
(d) 該ワックスと該凍結乾燥させたPCR試薬を容器中で加熱して、該ワックスを融解し、該凍結乾燥させたPCR試薬に該ワックスを含浸させる段階、ならびに
(e) 該ワックスを再凝固させて、安定化させた、凍結乾燥させたPCR試薬を形成する段階
を含む、安定化させた、凍結乾燥させたPCR試薬の組成物を作製する方法。 - 前記固体物体が、セラミックボール、ガラスボール、磁気ボール、または金属ボールである、請求項1記載の方法。
- 前記凍結乾燥用試薬が、トレハロース、デキストラン、マンニトール、スクロース、ラフィノースのうちの1つもしくは複数、またはそれらの組み合わせを含む、請求項1記載の方法。
- 段階(d)が真空下で行われる、請求項1記載の方法。
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US201462013695P | 2014-06-18 | 2014-06-18 | |
US62/013,695 | 2014-06-18 | ||
PCT/US2015/035921 WO2015195597A1 (en) | 2014-06-18 | 2015-06-16 | Methods for generating stabilized lyophilized materials |
Related Child Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2018169283A Division JP6613351B2 (ja) | 2014-06-18 | 2018-09-11 | 安定化させた凍結乾燥物質を作製するための方法 |
Publications (3)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2017518062A JP2017518062A (ja) | 2017-07-06 |
JP2017518062A5 JP2017518062A5 (ja) | 2018-07-26 |
JP6403809B2 true JP6403809B2 (ja) | 2018-10-10 |
Family
ID=54869103
Family Applications (3)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2016573730A Active JP6403809B2 (ja) | 2014-06-18 | 2015-06-16 | 安定化させた凍結乾燥物質を作製するための方法 |
JP2018169283A Active JP6613351B2 (ja) | 2014-06-18 | 2018-09-11 | 安定化させた凍結乾燥物質を作製するための方法 |
JP2019199794A Active JP6955540B2 (ja) | 2014-06-18 | 2019-11-01 | 安定化させた凍結乾燥物質を作製するための方法 |
Family Applications After (2)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2018169283A Active JP6613351B2 (ja) | 2014-06-18 | 2018-09-11 | 安定化させた凍結乾燥物質を作製するための方法 |
JP2019199794A Active JP6955540B2 (ja) | 2014-06-18 | 2019-11-01 | 安定化させた凍結乾燥物質を作製するための方法 |
Country Status (8)
Country | Link |
---|---|
US (3) | US9738923B2 (ja) |
EP (1) | EP3157685A4 (ja) |
JP (3) | JP6403809B2 (ja) |
KR (1) | KR20170019458A (ja) |
CN (1) | CN106457300A (ja) |
AU (3) | AU2015277436B2 (ja) |
CA (1) | CA2951566A1 (ja) |
WO (1) | WO2015195597A1 (ja) |
Families Citing this family (13)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP3157685A4 (en) * | 2014-06-18 | 2018-03-21 | Luminex Corporation | Methods for generating stabilized lyophilized materials |
WO2016189331A1 (en) * | 2015-05-28 | 2016-12-01 | Illumina Cambridge Limited | Surface-based tagmentation |
CN106282215A (zh) * | 2016-08-26 | 2017-01-04 | 周辉 | 一种高保真dna聚合酶干粉试剂盒的制备方法 |
JP6965367B2 (ja) * | 2017-05-19 | 2021-11-10 | ジェン−プローブ・インコーポレーテッド | フラップエンドヌクレアーゼを含む乾燥組成物 |
EP3765593A4 (en) * | 2018-03-15 | 2022-03-23 | Kryptos Biotechnologies, Inc. | METHOD AND SYSTEM FOR PERFORMING HEAT ASSISTED BIOCHEMICAL REACTIONS |
US20210362154A1 (en) * | 2018-03-19 | 2021-11-25 | Sony Corporation | Particle trapping chamber, particle trapping chip, particle collecting method, and particle sorting device |
US20200328365A1 (en) * | 2019-04-10 | 2020-10-15 | Ford Global Technologies, Llc | Vehicle lamps |
KR102426788B1 (ko) * | 2019-06-30 | 2022-07-29 | 주식회사 진시스템 | Pcr 전처리 방법 및 이를 위한 멀티플렉스 pcr 칩 |
WO2021126801A1 (en) * | 2019-12-16 | 2021-06-24 | Northwestern University | Lyophilized reagents |
CN113576944B (zh) * | 2021-08-09 | 2023-07-07 | 中山中研化妆品有限公司 | 冻干球及其制备方法、护肤品 |
US20230193147A1 (en) * | 2021-12-21 | 2023-06-22 | Illumina Cambridge Limited | Wax-microsphere matrix compositions and methods of making and using the same |
CN114410755A (zh) * | 2022-02-18 | 2022-04-29 | 上海翔琼生物技术有限公司 | 一种在同一反应管中通过隔离实现多步骤反应的方法 |
WO2024047160A1 (en) * | 2022-08-31 | 2024-03-07 | Qiagen Gmbh | Freeze dried nucleic acid amplification mixture |
Family Cites Families (21)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5200236A (en) | 1989-11-15 | 1993-04-06 | Lever Brothers Company, Division Of Conopco, Inc. | Method for wax encapsulating particles |
AU2309692A (en) | 1991-07-03 | 1993-02-11 | Cryolife, Inc. | Method for stabilization of biomaterials |
US5413924A (en) | 1992-02-13 | 1995-05-09 | Kosak; Kenneth M. | Preparation of wax beads containing a reagent for release by heating |
US5565339A (en) * | 1992-10-08 | 1996-10-15 | Hoffmann-La Roche Inc. | Compositions and methods for inhibiting dimerization of primers during storage of polymerase chain reaction reagents |
AU6029694A (en) | 1993-01-19 | 1994-08-15 | Pharmacia P-L Biochemicals, Inc. | Storage and delivery of purified protein reagents with carrier wax |
US5599660A (en) | 1993-01-19 | 1997-02-04 | Pharmacia Biotech Inc. | Method and preparation for sequential delivery of wax-embedded, inactivated biological and chemical reagents |
US5556771A (en) | 1995-02-10 | 1996-09-17 | Gen-Probe Incorporated | Stabilized compositions of reverse transcriptase and RNA polymerase for nucleic acid amplification |
EP0917568B1 (de) | 1996-07-16 | 2007-03-21 | QIAGEN North American Holdings, Inc. | Verfahren zur herstellung komplexer multienzymatischer lagerstabiler reaktionsgemische und deren verwendung |
US20030180352A1 (en) * | 1999-11-23 | 2003-09-25 | Patel Mahesh V. | Solid carriers for improved delivery of active ingredients in pharmaceutical compositions |
KR100445560B1 (ko) | 2001-10-31 | 2004-08-21 | (주)바이오넥스 | 핵산 또는 생물학적 물질을 분리하기 위한 키트의 제조방법과, 그 방법에 의해 제조된 키트와, 그 키트를사용하는 장치 |
FR2855177B1 (fr) | 2003-05-23 | 2005-07-08 | Raymond Robert | Composition contenant des acides nucleiques lyophilises en presence de collagene et de disaccharides |
US20050069898A1 (en) * | 2003-09-25 | 2005-03-31 | Cepheid | Lyophilized beads containing mannitol |
GB0414815D0 (en) * | 2004-07-02 | 2004-08-04 | Secr Defence | Method for stabilising reagents which are useful for nucleic acid amplification |
EP1896610A2 (en) * | 2005-05-03 | 2008-03-12 | Handylab, Inc. | Lyophilized pellets |
DE102005054923B3 (de) | 2005-11-17 | 2007-04-12 | Siemens Ag | Vorrichtung und Verfahren zur Aufbereitung einer Probe |
DE102006056790B3 (de) | 2006-12-01 | 2008-01-17 | IfP Privates Institut für Produktqualität GmbH | Laboreinmalartikel für Analyse und Diagnosik |
GB0701253D0 (en) | 2007-01-23 | 2007-02-28 | Diagnostics For The Real World | Nucleic acid amplification and testing |
WO2013006312A2 (en) * | 2011-07-06 | 2013-01-10 | Advanced Liquid Logic Inc | Reagent storage on a droplet actuator |
GB0805296D0 (en) | 2008-03-20 | 2008-04-30 | Iti Scotland Ltd | Uses of reagents in sample collection and cartridge systems |
WO2011069528A1 (en) | 2009-12-09 | 2011-06-16 | Curevac Gmbh | Lyophilization of nucleic acids in lactate-containing solutions |
EP3157685A4 (en) * | 2014-06-18 | 2018-03-21 | Luminex Corporation | Methods for generating stabilized lyophilized materials |
-
2015
- 2015-06-16 EP EP15809313.8A patent/EP3157685A4/en not_active Withdrawn
- 2015-06-16 KR KR1020177001554A patent/KR20170019458A/ko not_active Application Discontinuation
- 2015-06-16 CA CA2951566A patent/CA2951566A1/en active Pending
- 2015-06-16 JP JP2016573730A patent/JP6403809B2/ja active Active
- 2015-06-16 US US14/740,365 patent/US9738923B2/en active Active
- 2015-06-16 CN CN201580032194.6A patent/CN106457300A/zh active Pending
- 2015-06-16 WO PCT/US2015/035921 patent/WO2015195597A1/en active Application Filing
- 2015-06-16 AU AU2015277436A patent/AU2015277436B2/en active Active
-
2017
- 2017-07-20 US US15/654,942 patent/US10144954B2/en active Active
-
2018
- 2018-09-11 JP JP2018169283A patent/JP6613351B2/ja active Active
- 2018-11-01 US US16/177,514 patent/US11098344B2/en active Active
-
2019
- 2019-03-14 AU AU2019201779A patent/AU2019201779B2/en active Active
- 2019-08-02 AU AU2019210652A patent/AU2019210652A1/en not_active Abandoned
- 2019-11-01 JP JP2019199794A patent/JP6955540B2/ja active Active
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
US9738923B2 (en) | 2017-08-22 |
EP3157685A4 (en) | 2018-03-21 |
US20150368693A1 (en) | 2015-12-24 |
KR20170019458A (ko) | 2017-02-21 |
WO2015195597A1 (en) | 2015-12-23 |
JP2017518062A (ja) | 2017-07-06 |
US20190071712A1 (en) | 2019-03-07 |
AU2019201779A1 (en) | 2019-04-04 |
US11098344B2 (en) | 2021-08-24 |
JP2019013231A (ja) | 2019-01-31 |
JP6613351B2 (ja) | 2019-11-27 |
US10144954B2 (en) | 2018-12-04 |
CA2951566A1 (en) | 2015-12-23 |
EP3157685A1 (en) | 2017-04-26 |
CN106457300A (zh) | 2017-02-22 |
JP6955540B2 (ja) | 2021-10-27 |
AU2019201779B2 (en) | 2019-05-09 |
US20170321254A1 (en) | 2017-11-09 |
AU2015277436A1 (en) | 2016-12-22 |
AU2015277436B2 (en) | 2019-01-03 |
JP2020031655A (ja) | 2020-03-05 |
AU2019210652A1 (en) | 2019-08-22 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP6613351B2 (ja) | 安定化させた凍結乾燥物質を作製するための方法 | |
US11649512B2 (en) | Freeze-dried composition | |
US20080070281A1 (en) | Method for Stabilising Reagents Which are Useful for Nucleic Acid Amplification | |
WO2017184028A1 (en) | Stabilized mixture of reagents for molecular diagnostics | |
JP6898238B2 (ja) | 安定した反応混合物 | |
JP2023184748A (ja) | 対流流体装置における核酸の表面ベースの検出方法 | |
CN102414315A (zh) | 用于分子生物学应用的包含核酸聚合酶的干燥和稳定的即用组合物 | |
RU2535995C2 (ru) | Сухая смесь для приготовления реакционной смеси для амплификации нуклеиновой кислоты и способ ее получения | |
JP2005052143A (ja) | ホットスタートリアルタイムポリメラーゼ連鎖反応のための新しい検出形式 | |
JP6413228B2 (ja) | 長期保存可能な核酸増幅試薬 | |
JP5409631B2 (ja) | 酵素反応においてサンプル中でcDNAを合成するための方法 | |
US20230193147A1 (en) | Wax-microsphere matrix compositions and methods of making and using the same | |
Chetverin et al. | Gene cloning and expression in molecular colonies |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20170125 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20180611 |
|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20180611 |
|
A871 | Explanation of circumstances concerning accelerated examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A871 Effective date: 20180611 |
|
A975 | Report on accelerated examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A971005 Effective date: 20180726 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20180815 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20180911 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 6403809 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |