JP6372147B2 - タンパク質に対する親和性評価のための分析方法及びその装置 - Google Patents
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Description
(A)タンパク質に結合したタンパク質結合型低分子化合物及びタンパク質に結合していない遊離型低分子化合物を含む試料溶液を第1の浸透制限型カラムに導入して、遊離型低分子化合物を第1の浸透制限型カラムに保持させ、タンパク質結合型低分子化合物を第1の浸透制限型カラムから排出させる工程、
(B)工程(A)において第1の浸透制限型カラムから排出した溶液中でタンパク質結合型低分子化合物をタンパク質から切り離して遊離化低分子化合物とした状態で、該溶液を第2の浸透制限型カラムに導入して、遊離化低分子化合物を第2の浸透制限型カラムに保持させ、タンパク質を第2の浸透制限型カラムから排出させる工程、及び
(C)第1の浸透制限型カラムに保持された遊離型低分子化合物と第2の浸透制限型カラムに保持された遊離化低分子化合物を、互いに異なるタイミングで溶出させて分析カラムに導いて分析する工程。
浸透制限型カラムとは、外表面がタンパク質に対して不活性になる処理が施され孔内面に低分子化合物を捕捉する化学修飾が施された充填材が充填されたカラムであり、第1の浸透制限型カラムと第2の浸透制限型カラムは同じものであってもよく、浸透制限性を持つものであれば互いに異なるものであってもよい。
液体クロマトグラフの構成と分析条件は次の通りである。
第1の浸透制限型カラム4:
アルミニウム固定化シリカゲル粒子充填カラム(内径4.6mm、長さ10mm、充填材の粒径50μm)。アルミニウム固定化シリカゲル粒子充填カラムは、シリカゲル担体に対してアルミニウムイオンが飽和状態になるように結合した充填材を充填したカラムである。
第2の浸透制限型カラム22:
MAYI−ODS(内径4.6mm、長さ10mm、充填材の粒径50μm、株式会社島津製作所の製品)。
トラップ移動相:5mM酢酸アンモニウム溶液、流量1mL/分
希釈移動相:5mM酢酸アンモニウム‐メタノール(85:15)溶液、流量1mL/分。
試料注入量;10μL
分析カラム28:
ODS基修飾シリカゲル充填HPLCカラム(内径3.0mm、長さ75mm、充填材の粒径3μm)。
カラム温度:35℃
溶出法:
分析用移動相:20mMトリフルオロ酢酸を含む水−アセトニトリルを用いるグラジエント溶出
移動相流速:1mL/分
(A)タンパク質溶液(PDE9(9型ホスホジエステラーゼ))
(B) 化合物溶液(PDE9阻害剤)
(C)タンパク質‐化合物混合溶液
pH調整剤(pH2.0のグリシン・塩酸緩衝液)
試料をトラップ移動相により、第1の浸透制限型カラム4から第2の浸透制限型カラム22に流し、カラム4と22の間の流路8に薬剤供給流路34からpH調整剤を供給する。その後、まず、第1の浸透制限型カラム4を分析流路24へ接続し、分析用移動相により第1の浸透制限型カラム4にトラップされていた成分を検出する。次に、第2の浸透制限型カラム22を分析流路24へ接続し、分析用移動相により第2の浸透制限型カラム22にトラップされていた成分を検出する。
4、22 浸透制限型カラム
6 試料導入流路
8 流路
10、12 分析用移動相流路
14、15、18、32 送液ポンプ
17 希釈ライン
16 試料注入装置
24 分析流路
34 薬剤供給流路
Claims (4)
- タンパク質に対する低分子化合物の親和性を評価するための、以下の工程(A)から(C)を含む分析方法。
(A)タンパク質に結合したタンパク質結合型低分子化合物及びタンパク質に結合していない遊離型低分子化合物を含む試料溶液を第1の浸透制限型カラムに導入して、遊離型低分子化合物を前記第1の浸透制限型カラムに保持させ、タンパク質結合型低分子化合物を前記第1の浸透制限型カラムから排出させる工程、
(B)前記工程(A)において前記第1の浸透制限型カラムから排出した溶液にタンパク質に対する低分子化合物の結合を抑制する薬剤を添加することによって前記第1の浸透制限型カラムから排出した溶液中でタンパク質結合型低分子化合物をタンパク質から切り離して遊離化低分子化合物とした状態で、該溶液を第2の浸透制限型カラムに導入して、遊離化低分子化合物を前記第2の浸透制限型カラムに保持させ、タンパク質を前記第2の浸透制限型カラムから排出させる工程、及び
(C)前記第1の浸透制限型カラムに保持された遊離型低分子化合物と前記第2の浸透制限型カラムに保持された遊離化低分子化合物を、互いに異なるタイミングで溶出させて分析カラムに導いて分析する工程。 - 前記薬剤は前記溶液のpHを酸性化するpH調整剤又はタンパク質の高次構造を変化させるタンパク質変性剤である請求項1に記載の分析方法。
- 第1の浸透制限型カラムと、
第2の浸透制限型カラムと、
分析カラム及びその下流に接続された検出器を含む分析流路と、
前記第1、第2の浸透制限型カラムに遊離の低分子化合物を捕捉させるトラップ移動相を送液する試料導入流路と、
前記試料導入流路に配置された試料注入装置と、
前記第1、第2の浸透制限型カラムに保持された低分子化合物を溶出させる移動相を送液する分析用移動相流路と、
前記試料導入流路を前記第1の浸透制限型カラムを経て前記第2の浸透制限型カラムへ接続する第1の流路、前記分析用移動相流路を前記第1の浸透制限型カラムを経て前記分析流路へ接続する第2の流路、及び前記分析用移動相流路を前記第2の浸透制限型カラムを経て前記分析流路へ接続する第3の流路の間で切り換えるように構成された流路切換え機構と、
前記第1の浸透制限型カラムと前記第2の浸透制限型カラムを接続する流路においてタンパク質に対する低分子化合物の結合を抑制する薬剤を供給する薬剤供給流路からなり、タンパク質結合型低分子化合物をタンパク質から切り離して遊離化低分子化合物とする解離部と、を備えた分析装置。 - 前記解離部は前記第1の浸透制限型カラムからの流路と前記薬剤供給流路との合流位置又はその下流にミキサを備えている請求項3に記載の分析装置。
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