JP6254585B2 - Maldi−tof質量分析による侵襲性真菌感染症の体外診断法 - Google Patents
Maldi−tof質量分析による侵襲性真菌感染症の体外診断法 Download PDFInfo
- Publication number
- JP6254585B2 JP6254585B2 JP2015519273A JP2015519273A JP6254585B2 JP 6254585 B2 JP6254585 B2 JP 6254585B2 JP 2015519273 A JP2015519273 A JP 2015519273A JP 2015519273 A JP2015519273 A JP 2015519273A JP 6254585 B2 JP6254585 B2 JP 6254585B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- sample
- trehalose
- fluid
- compound
- maldi
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
- 238000001840 matrix-assisted laser desorption--ionisation time-of-flight mass spectrometry Methods 0.000 title claims description 25
- 208000037026 Invasive Fungal Infections Diseases 0.000 title description 23
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 title description 10
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 title description 6
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims description 70
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 46
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 claims description 31
- 150000002482 oligosaccharides Chemical class 0.000 claims description 30
- 229920001542 oligosaccharide Polymers 0.000 claims description 27
- 239000013060 biological fluid Substances 0.000 claims description 26
- 150000002772 monosaccharides Chemical class 0.000 claims description 26
- 150000004676 glycans Chemical class 0.000 claims description 25
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 claims description 25
- 239000005017 polysaccharide Substances 0.000 claims description 25
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 24
- 230000002538 fungal effect Effects 0.000 claims description 24
- 244000005700 microbiome Species 0.000 claims description 23
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 claims description 21
- HDTRYLNUVZCQOY-UHFFFAOYSA-N α-D-glucopyranosyl-α-D-glucopyranoside Natural products OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OC1C(O)C(O)C(O)C(CO)O1 HDTRYLNUVZCQOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 18
- HDTRYLNUVZCQOY-WSWWMNSNSA-N Trehalose Natural products O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O1 HDTRYLNUVZCQOY-WSWWMNSNSA-N 0.000 claims description 18
- HDTRYLNUVZCQOY-LIZSDCNHSA-N alpha,alpha-trehalose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 HDTRYLNUVZCQOY-LIZSDCNHSA-N 0.000 claims description 18
- 239000012530 fluid Substances 0.000 claims description 15
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 claims description 15
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 claims description 14
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 claims description 13
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 claims description 13
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 claims description 12
- 235000014680 Saccharomyces cerevisiae Nutrition 0.000 claims description 12
- 239000012071 phase Substances 0.000 claims description 12
- 239000007787 solid Substances 0.000 claims description 12
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 claims description 11
- 239000008280 blood Substances 0.000 claims description 11
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims description 11
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 11
- 238000004366 reverse phase liquid chromatography Methods 0.000 claims description 10
- 238000011282 treatment Methods 0.000 claims description 10
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 claims description 9
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N Silicium dioxide Chemical compound O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 8
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 claims description 8
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 claims description 8
- 238000000816 matrix-assisted laser desorption--ionisation Methods 0.000 claims description 8
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims description 8
- 235000000346 sugar Nutrition 0.000 claims description 8
- 239000000126 substance Substances 0.000 claims description 7
- 241000222120 Candida <Saccharomycetales> Species 0.000 claims description 6
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 claims description 6
- 239000008139 complexing agent Substances 0.000 claims description 6
- 150000002016 disaccharides Chemical class 0.000 claims description 6
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 claims description 6
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims description 5
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims description 5
- 230000009471 action Effects 0.000 claims description 5
- 150000003625 trehaloses Chemical class 0.000 claims description 5
- 241000228212 Aspergillus Species 0.000 claims description 4
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 210000000987 immune system Anatomy 0.000 claims description 4
- 238000012856 packing Methods 0.000 claims description 4
- 230000008569 process Effects 0.000 claims description 4
- 150000004043 trisaccharides Chemical class 0.000 claims description 4
- 239000005909 Kieselgur Substances 0.000 claims description 3
- 239000000696 magnetic material Substances 0.000 claims description 3
- 238000002156 mixing Methods 0.000 claims description 3
- 230000004044 response Effects 0.000 claims description 3
- 241001019659 Acremonium <Plectosphaerellaceae> Species 0.000 claims description 2
- 241000223218 Fusarium Species 0.000 claims description 2
- 241000142787 Pneumocystis jirovecii Species 0.000 claims description 2
- 206010036790 Productive cough Diseases 0.000 claims description 2
- 241001149963 Sporothrix schenckii Species 0.000 claims description 2
- 241000223230 Trichosporon Species 0.000 claims description 2
- 238000001574 biopsy Methods 0.000 claims description 2
- 238000009835 boiling Methods 0.000 claims description 2
- 210000001175 cerebrospinal fluid Anatomy 0.000 claims description 2
- 210000000416 exudates and transudate Anatomy 0.000 claims description 2
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims description 2
- 210000004877 mucosa Anatomy 0.000 claims description 2
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 claims description 2
- 230000001850 reproductive effect Effects 0.000 claims description 2
- 210000003802 sputum Anatomy 0.000 claims description 2
- 208000024794 sputum Diseases 0.000 claims description 2
- 241000228404 Histoplasma capsulatum Species 0.000 claims 1
- 230000002776 aggregation Effects 0.000 claims 1
- 238000004220 aggregation Methods 0.000 claims 1
- 238000010494 dissociation reaction Methods 0.000 claims 1
- 230000005593 dissociations Effects 0.000 claims 1
- 230000002496 gastric effect Effects 0.000 claims 1
- 241000894007 species Species 0.000 claims 1
- 210000002700 urine Anatomy 0.000 claims 1
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 28
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 19
- 229920000057 Mannan Polymers 0.000 description 15
- 206010042938 Systemic candida Diseases 0.000 description 14
- 229920001503 Glucan Polymers 0.000 description 13
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 13
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 12
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 9
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 9
- 150000002402 hexoses Chemical class 0.000 description 9
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 9
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 9
- WQZGKKKJIJFFOK-QTVWNMPRSA-N D-mannopyranose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-QTVWNMPRSA-N 0.000 description 8
- 210000003714 granulocyte Anatomy 0.000 description 8
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 8
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 208000036732 invasive candidiasis Diseases 0.000 description 7
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 6
- 208000017773 candidemia Diseases 0.000 description 6
- 239000000539 dimer Substances 0.000 description 6
- 238000004949 mass spectrometry Methods 0.000 description 6
- 241000222122 Candida albicans Species 0.000 description 5
- 230000006378 damage Effects 0.000 description 5
- 238000002405 diagnostic procedure Methods 0.000 description 5
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 5
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 5
- BPYKTIZUTYGOLE-IFADSCNNSA-N Bilirubin Chemical compound N1C(=O)C(C)=C(C=C)\C1=C\C1=C(C)C(CCC(O)=O)=C(CC2=C(C(C)=C(\C=C/3C(=C(C=C)C(=O)N\3)C)N2)CCC(O)=O)N1 BPYKTIZUTYGOLE-IFADSCNNSA-N 0.000 description 4
- CURLTUGMZLYLDI-UHFFFAOYSA-N Carbon dioxide Chemical compound O=C=O CURLTUGMZLYLDI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 241000239205 Merostomata Species 0.000 description 4
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 4
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 4
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 4
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 4
- 229920003045 dextran sodium sulfate Polymers 0.000 description 4
- -1 galactan Polymers 0.000 description 4
- 150000008163 sugars Chemical class 0.000 description 4
- TVZRAEYQIKYCPH-UHFFFAOYSA-N 3-(trimethylsilyl)propane-1-sulfonic acid Chemical compound C[Si](C)(C)CCCS(O)(=O)=O TVZRAEYQIKYCPH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N Acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 241000233866 Fungi Species 0.000 description 3
- 229920000926 Galactomannan Polymers 0.000 description 3
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 3
- 238000009640 blood culture Methods 0.000 description 3
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 3
- 210000001035 gastrointestinal tract Anatomy 0.000 description 3
- 230000000968 intestinal effect Effects 0.000 description 3
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 3
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 3
- 238000001819 mass spectrum Methods 0.000 description 3
- 244000000010 microbial pathogen Species 0.000 description 3
- 238000002414 normal-phase solid-phase extraction Methods 0.000 description 3
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 3
- 235000001674 Agaricus brunnescens Nutrition 0.000 description 2
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-K Citrate Chemical compound [O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 2
- 102000001554 Hemoglobins Human genes 0.000 description 2
- 108010054147 Hemoglobins Proteins 0.000 description 2
- DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M Ilexoside XXIX Chemical class C[C@@H]1CC[C@@]2(CC[C@@]3(C(=CC[C@H]4[C@]3(CC[C@@H]5[C@@]4(CC[C@@H](C5(C)C)OS(=O)(=O)[O-])C)C)[C@@H]2[C@]1(C)O)C)C(=O)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O6)CO)O)O)O.[Na+] DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M 0.000 description 2
- 206010061218 Inflammation Diseases 0.000 description 2
- XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N Iron Chemical compound [Fe] XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 208000031888 Mycoses Diseases 0.000 description 2
- OVRNDRQMDRJTHS-UHFFFAOYSA-N N-acelyl-D-glucosamine Natural products CC(=O)NC1C(O)OC(CO)C(O)C1O OVRNDRQMDRJTHS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- OVRNDRQMDRJTHS-FMDGEEDCSA-N N-acetyl-beta-D-glucosamine Chemical compound CC(=O)N[C@H]1[C@H](O)O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@@H]1O OVRNDRQMDRJTHS-FMDGEEDCSA-N 0.000 description 2
- MBLBDJOUHNCFQT-LXGUWJNJSA-N N-acetylglucosamine Natural products CC(=O)N[C@@H](C=O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO MBLBDJOUHNCFQT-LXGUWJNJSA-N 0.000 description 2
- 230000000843 anti-fungal effect Effects 0.000 description 2
- 229940121375 antifungal agent Drugs 0.000 description 2
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 2
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 2
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 2
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 description 2
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 description 2
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 2
- 229940095731 candida albicans Drugs 0.000 description 2
- 239000001569 carbon dioxide Substances 0.000 description 2
- 229910002092 carbon dioxide Inorganic materials 0.000 description 2
- 238000011109 contamination Methods 0.000 description 2
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 2
- LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I dipotassium trisodium dihydrogen phosphate hydrogen phosphate dichloride Chemical compound P(=O)(O)(O)[O-].[K+].P(=O)(O)([O-])[O-].[Na+].[Na+].[Cl-].[K+].[Cl-].[Na+] LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I 0.000 description 2
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 2
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 2
- 239000003651 drinking water Substances 0.000 description 2
- 235000020188 drinking water Nutrition 0.000 description 2
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 2
- 210000003743 erythrocyte Anatomy 0.000 description 2
- 230000004054 inflammatory process Effects 0.000 description 2
- 229910052500 inorganic mineral Inorganic materials 0.000 description 2
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 2
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 2
- 210000003734 kidney Anatomy 0.000 description 2
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 2
- 239000011707 mineral Substances 0.000 description 2
- 229950006780 n-acetylglucosamine Drugs 0.000 description 2
- 244000052769 pathogen Species 0.000 description 2
- 239000002953 phosphate buffered saline Substances 0.000 description 2
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 2
- 229910052708 sodium Inorganic materials 0.000 description 2
- 238000004611 spectroscopical analysis Methods 0.000 description 2
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 2
- CWERGRDVMFNCDR-UHFFFAOYSA-N thioglycolic acid Chemical compound OC(=O)CS CWERGRDVMFNCDR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- OMDQUFIYNPYJFM-XKDAHURESA-N (2r,3r,4s,5r,6s)-2-(hydroxymethyl)-6-[[(2r,3s,4r,5s,6r)-4,5,6-trihydroxy-3-[(2s,3s,4s,5s,6r)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxyoxan-2-yl]methoxy]oxane-3,4,5-triol Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1OC[C@@H]1[C@@H](O[C@H]2[C@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)O)[C@H](O)[C@H](O)[C@H](O)O1 OMDQUFIYNPYJFM-XKDAHURESA-N 0.000 description 1
- JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 2-[4-(2-hydroxyethyl)piperazin-1-yl]ethanesulfonic acid Chemical compound OCC[NH+]1CCN(CCS([O-])(=O)=O)CC1 JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SATHPVQTSSUFFW-UHFFFAOYSA-N 4-[6-[(3,5-dihydroxy-4-methoxyoxan-2-yl)oxymethyl]-3,5-dihydroxy-4-methoxyoxan-2-yl]oxy-2-(hydroxymethyl)-6-methyloxane-3,5-diol Chemical compound OC1C(OC)C(O)COC1OCC1C(O)C(OC)C(O)C(OC2C(C(CO)OC(C)C2O)O)O1 SATHPVQTSSUFFW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920000189 Arabinogalactan Polymers 0.000 description 1
- 239000001904 Arabinogalactan Substances 0.000 description 1
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 1
- 101100421200 Caenorhabditis elegans sep-1 gene Proteins 0.000 description 1
- 241000459479 Capsula Species 0.000 description 1
- 241001529572 Chaceon affinis Species 0.000 description 1
- 229920002101 Chitin Polymers 0.000 description 1
- 241000223205 Coccidioides immitis Species 0.000 description 1
- 208000035473 Communicable disease Diseases 0.000 description 1
- 229920002307 Dextran Polymers 0.000 description 1
- 208000004232 Enteritis Diseases 0.000 description 1
- 206010017533 Fungal infection Diseases 0.000 description 1
- 229930186217 Glycolipid Natural products 0.000 description 1
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 description 1
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 description 1
- 102000005744 Glycoside Hydrolases Human genes 0.000 description 1
- 108010031186 Glycoside Hydrolases Proteins 0.000 description 1
- 239000007995 HEPES buffer Substances 0.000 description 1
- 239000012981 Hank's balanced salt solution Substances 0.000 description 1
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 1
- 208000034767 Hypoproteinaemia Diseases 0.000 description 1
- 238000012404 In vitro experiment Methods 0.000 description 1
- 102000004856 Lectins Human genes 0.000 description 1
- 108090001090 Lectins Proteins 0.000 description 1
- 102000001696 Mannosidases Human genes 0.000 description 1
- 108010054377 Mannosidases Proteins 0.000 description 1
- 102000007474 Multiprotein Complexes Human genes 0.000 description 1
- 108010085220 Multiprotein Complexes Proteins 0.000 description 1
- 241001529936 Murinae Species 0.000 description 1
- 241001364096 Pachycephalidae Species 0.000 description 1
- ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N Potassium Chemical class [K] ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 210000000683 abdominal cavity Anatomy 0.000 description 1
- 238000005852 acetolysis reaction Methods 0.000 description 1
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 1
- 230000000844 anti-bacterial effect Effects 0.000 description 1
- 235000019312 arabinogalactan Nutrition 0.000 description 1
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 1
- 244000052616 bacterial pathogen Species 0.000 description 1
- 238000011325 biochemical measurement Methods 0.000 description 1
- 238000010170 biological method Methods 0.000 description 1
- 210000000601 blood cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000011088 calibration curve Methods 0.000 description 1
- 201000003984 candidiasis Diseases 0.000 description 1
- 238000012754 cardiac puncture Methods 0.000 description 1
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 1
- 150000001768 cations Chemical class 0.000 description 1
- 210000002421 cell wall Anatomy 0.000 description 1
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 1
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 1
- 238000002512 chemotherapy Methods 0.000 description 1
- 238000005345 coagulation Methods 0.000 description 1
- 230000015271 coagulation Effects 0.000 description 1
- 230000001332 colony forming effect Effects 0.000 description 1
- 230000001143 conditioned effect Effects 0.000 description 1
- 238000012790 confirmation Methods 0.000 description 1
- WISCONQAEAWCKO-UHFFFAOYSA-N cyclohexa-2,4-diene-1-carboxylic acid Chemical compound OC(=O)C1CC=CC=C1 WISCONQAEAWCKO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000009089 cytolysis Effects 0.000 description 1
- 238000013480 data collection Methods 0.000 description 1
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 1
- 230000007123 defense Effects 0.000 description 1
- 239000007857 degradation product Substances 0.000 description 1
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 1
- 229960002086 dextran Drugs 0.000 description 1
- 229960000633 dextran sulfate Drugs 0.000 description 1
- 230000008034 disappearance Effects 0.000 description 1
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 1
- 230000001747 exhibiting effect Effects 0.000 description 1
- 239000012894 fetal calf serum Substances 0.000 description 1
- 239000000945 filler Substances 0.000 description 1
- 238000013467 fragmentation Methods 0.000 description 1
- 238000006062 fragmentation reaction Methods 0.000 description 1
- 244000053095 fungal pathogen Species 0.000 description 1
- 238000000769 gas chromatography-flame ionisation detection Methods 0.000 description 1
- 230000008303 genetic mechanism Effects 0.000 description 1
- 208000036796 hyperbilirubinemia Diseases 0.000 description 1
- 208000006575 hypertriglyceridemia Diseases 0.000 description 1
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 1
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 1
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 1
- 239000007928 intraperitoneal injection Substances 0.000 description 1
- 238000010253 intravenous injection Methods 0.000 description 1
- 238000011835 investigation Methods 0.000 description 1
- 229910052742 iron Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000002523 lectin Substances 0.000 description 1
- 210000002540 macrophage Anatomy 0.000 description 1
- 230000014759 maintenance of location Effects 0.000 description 1
- LUEWUZLMQUOBSB-GFVSVBBRSA-N mannan Chemical class O[C@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)O[C@@H](O[C@@H]2[C@H](O[C@@H](O[C@H]3[C@H](O[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H]3O)CO)[C@@H](O)[C@H]2O)CO)[C@H](O)[C@H]1O LUEWUZLMQUOBSB-GFVSVBBRSA-N 0.000 description 1
- 239000000463 material Substances 0.000 description 1
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 1
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 1
- 230000006371 metabolic abnormality Effects 0.000 description 1
- 229910021645 metal ion Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000011987 methylation Effects 0.000 description 1
- 238000007069 methylation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 description 1
- 210000004400 mucous membrane Anatomy 0.000 description 1
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 description 1
- 210000000440 neutrophil Anatomy 0.000 description 1
- 238000011017 operating method Methods 0.000 description 1
- 230000001575 pathological effect Effects 0.000 description 1
- 210000005259 peripheral blood Anatomy 0.000 description 1
- 239000011886 peripheral blood Substances 0.000 description 1
- 230000002093 peripheral effect Effects 0.000 description 1
- 210000003200 peritoneal cavity Anatomy 0.000 description 1
- 229910052700 potassium Chemical class 0.000 description 1
- 239000011591 potassium Chemical class 0.000 description 1
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 1
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 1
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 1
- 238000001959 radiotherapy Methods 0.000 description 1
- 230000000717 retained effect Effects 0.000 description 1
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 1
- 239000000377 silicon dioxide Substances 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 125000004079 stearyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 1
- 230000009885 systemic effect Effects 0.000 description 1
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 1
- 150000003626 triacylglycerols Chemical class 0.000 description 1
- 210000000626 ureter Anatomy 0.000 description 1
- 210000003462 vein Anatomy 0.000 description 1
- 239000003643 water by type Substances 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/02—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving viable microorganisms
- C12Q1/04—Determining presence or kind of microorganism; Use of selective media for testing antibiotics or bacteriocides; Compositions containing a chemical indicator therefor
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/5002—Partitioning blood components
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/52—Use of compounds or compositions for colorimetric, spectrophotometric or fluorometric investigation, e.g. use of reagent paper and including single- and multilayer analytical elements
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N30/00—Investigating or analysing materials by separation into components using adsorption, absorption or similar phenomena or using ion-exchange, e.g. chromatography or field flow fractionation
- G01N30/02—Column chromatography
- G01N30/88—Integrated analysis systems specially adapted therefor, not covered by a single one of the groups G01N30/04 - G01N30/86
- G01N2030/8809—Integrated analysis systems specially adapted therefor, not covered by a single one of the groups G01N30/04 - G01N30/86 analysis specially adapted for the sample
- G01N2030/8813—Integrated analysis systems specially adapted therefor, not covered by a single one of the groups G01N30/04 - G01N30/86 analysis specially adapted for the sample biological materials
- G01N2030/8836—Integrated analysis systems specially adapted therefor, not covered by a single one of the groups G01N30/04 - G01N30/86 analysis specially adapted for the sample biological materials involving saccharides
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
- G01N2333/37—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from fungi
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
- G01N2333/37—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from fungi
- G01N2333/39—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from fungi from yeasts
- G01N2333/40—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from fungi from yeasts from Candida
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2400/00—Assays, e.g. immunoassays or enzyme assays, involving carbohydrates
- G01N2400/10—Polysaccharides, i.e. having more than five saccharide radicals attached to each other by glycosidic linkages; Derivatives thereof, e.g. ethers, esters
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2400/00—Assays, e.g. immunoassays or enzyme assays, involving carbohydrates
- G01N2400/10—Polysaccharides, i.e. having more than five saccharide radicals attached to each other by glycosidic linkages; Derivatives thereof, e.g. ethers, esters
- G01N2400/12—Homoglycans, i.e. polysaccharides having a main chain consisting of one single sugar
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2400/00—Assays, e.g. immunoassays or enzyme assays, involving carbohydrates
- G01N2400/10—Polysaccharides, i.e. having more than five saccharide radicals attached to each other by glycosidic linkages; Derivatives thereof, e.g. ethers, esters
- G01N2400/12—Homoglycans, i.e. polysaccharides having a main chain consisting of one single sugar
- G01N2400/24—Homoglycans, i.e. polysaccharides having a main chain consisting of one single sugar beta-D-Glucans, i.e. having beta 1,n (n=3,4,6) linkages between saccharide units, e.g. xanthan
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2560/00—Chemical aspects of mass spectrometric analysis of biological material
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
- G01N2800/26—Infectious diseases, e.g. generalised sepsis
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
- Y02A90/00—Technologies having an indirect contribution to adaptation to climate change
- Y02A90/40—Monitoring or fighting invasive species
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y10—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC
- Y10T—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER US CLASSIFICATION
- Y10T436/00—Chemistry: analytical and immunological testing
- Y10T436/14—Heterocyclic carbon compound [i.e., O, S, N, Se, Te, as only ring hetero atom]
- Y10T436/142222—Hetero-O [e.g., ascorbic acid, etc.]
- Y10T436/143333—Saccharide [e.g., DNA, etc.]
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Immunology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Pathology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Other Investigation Or Analysis Of Materials By Electrical Means (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
Description
・哺乳動物から得られる、タンパク質および/または脂質および/または塩および/または多糖および/またはオリゴ糖および/または単糖と複合体を形成しやすい前記タンパク質および/または脂質および/または塩、および/または前記多糖および/またはオリゴ糖および/または単糖が含まれる生物学的液体のサンプルを提供し、
・前記多糖および/またはオリゴ糖および/または単糖を抽出する前記サンプルを処理し、
・前記真菌微生物由来の少なくとも1つの所与の関心対象の化合物中の多糖および/またはオリゴ糖および/または単糖の有無を確認するためにMALDI−TOF質量分光分析を使用し、
・前記サンプルに前記所与の関心対象の化合物が存在するとき、前記哺乳動物は侵襲性真菌感染症に罹っていると結論付ける。
・前記タンパク質および/または前記脂質の大部分の沈殿/凝固によって生物学的液体から前記サンプルに含まれる前記複合体を解離し、
・前記サンプルを遠心分離し、上清を固相から分離し、
・上清を回収し、
・上清に含まれる前記多糖および/またはオリゴ糖および/または単糖を特に逆相クロマトグラフィーによって残留蛋白質および残留脂質から分離し、前記多糖および/またはオリゴ糖および/または単糖を特に吸収クロマトグラフィーの実行によって前記塩から分離する。
・逆相クロマトグラフィーを実行可能にする固形疎水性相からなる少なくとも第1の支持体と、
・インプット開口部と、アウトプット開口部と、前記インプット開口部と前記アウトプット開口部との間に配置される粉末状活性炭の充填物を含む少なくとも第2容器と、を含んでいる。
本発明によれば、哺乳動物は限定されず、ヒトであっても他の任意の哺乳動物であってもよい。したがって、本発明はヒト用医薬と獣医用医薬の両方に適用される。
第1段階: グリカンを検出する生物学的サンプルが処理される段階であり、下記手順が血清に適用される。
・300pLの試験サンプルを1.5mlの滅菌マイクロチューブに入れる。
・100μLの処理溶液(EDTA酸溶液)を各試験管中に添加する。
・ボルテックス混合する。
・密封されたマイクロチューブを加熱ブロック上に置き、120℃で6分間連動ジャンプさせる。
・試験管を取り出して10,000gで10分間遠心分離する。
・上清(150μl)を無菌1.5mlマイクロチューブに移す。
質量分析によってグリカンを検出する後処理を上清に関して実施する。このプロセスでは、凝固して塊になるタンパク質複合体のマンナンおよびガラクトマンナンが放出/分離され、グルカン(Fungitell(登録商標)キット)の比色測定を全く変えず、これによって同じ未処理のサンプルから得られるものと一致した結果が得られる。反対に、この処理は過剰なタンパク質、トリグリセリド、ビリルビンおよび/またはヘモグロビンによる干渉を排除する。
100μLの上清を5容積のアセトニトリル(ANC)および水の溶液(75:25、vol/vol)で予め調整し、10容積の水で洗浄した、固相抽出(SPE)カートリッジ(ref SPE−C18:C18 Sep−Pakカートリッジ(Waters))(1容積))(1つのカラムは疎水性充填物を含む)上に入れる。集めた上清をカートリッジに入れた後、カートリッジを2容積の水ですすぎ、これを集める。C18カラム溶出液を5容積のANC/H2O(25:75、vol/vol)で予め調整し、次いで10容積の水ですすいだ、同じ重量の商業的な活性炭とセライト(登録商標)(等容積)との混合物を含むSPEカートリッジ上に載せた。上清をカートリッジに通過させた後、カートリッジを20容積の水ですすぎ、溶出液を捨てる。カラムを2容積のANC/H2O(25:75、vol/vol)ですすぐ。最初の100μLを不合格とし、次の300μLを集める。溶出液(ANC/H2O)を乾燥する。
質量分析にはMALDI−TOF Voyager Elite DES−TR分光光度計(Perspective Biosystems Framingham, MA)が使用される。乾燥抽出物を水中に溶解させ、1μL溶液をジヒドロ安息香酸溶液の1μL溶液(ACN/H2O 50/50中10mg/ml)でスパイクする。1μLの溶液をMALDI−TOFプレート(フープ状の96ウェルステンレスプレートによって適用)上に堆積させ、50℃で結晶化させる。MALDI−TOF分析は陽性リフレクトロンモード、つまり取得パラメータを使用してリフレクトロン様式が1,000未満のm/z比を有する中性オリゴ糖から最適化された取得パラメータを使用するリフレクトロンモードで実施される。データ収集後、混合物中のオリゴグルカンの存在は、生成した付加物(M+Na)+を観察することで確認される。診断のための関心対象の質量(M)は、方程式M Hexn=180+[162](n−1)+23によって算出される。分子群の相対的な定量化は、M Hexnシグナル、すなわちユビキタス内因性シグナルの比の算出、または第2段階の第1相におけるサンプルに添加された外部標準で実施される。現在まで、診断のための興味深いシグナルはM Hex2=365である。テキスト中でさらに示される分析例は365/361のシグナル比の算出に基づいている。
本発明の方法がリール地方大学病院に入院している患者の内、以下の基準に基づいて選択された患者の12の血清に適用された。
i)少なくとも1つのC.アルビカンス血液培養(C. albicans blood culture)によって証明され、入院中に全身性カンジダ症(systemic candidiasis)を発症した患者。
ii)一方または両方について陽性であり、血液培養サンプルが陽性であると判明する1週間前または判明後2週間以内に採取された血清サンプルに関して診断を導き、確定した血液グルカンまたはマンナン試験の検出が要請された患者。
iii)法律上の理由のために1年間−20℃で貯蔵された残留血清の内、最少量1mlが利用可能なもの。
m/zピーク=365によって表される侵襲性真菌感染症の診断用のマーカーとして使用される関心対象の化合物の構造を確定するために、侵襲性カンジダ症で苦しんでいる患者の上清または血清をプレメチル化(pre−methylate)した。したがって、侵襲性カンジダ症で苦しんでいる患者からの血清を、上記定義の段階1および2にしたがって処理し、第2段階で得られた溶出液中に含まれ、水中に溶解させた糖を次いでプレメチル化した。プレメチル化技術は当業者には公知であり、以下の刊行物「Ciucanu I, Kerek F. 1984. “A simple and rapid method for the pre−methylation of carbohydrates.” Carbohydr Res. 131:209−217」で特に記載されている。MALDIプレートを次いで、上記第3段階で記載されるプロトコルにしたがって調製する。プレメチル化された糖から得られる[M+Na]+シグナルはm/z値=477で現れ、それは実際、プレメチル化されたヘキソース二糖に相当する。
体外実験
Pluskotaらによって記載された方法(J Immunol. 2008 Sep 1;181(5):3609−19)にしたがってチオグリコール酸塩の腹腔内注射を受けたマウスの腹腔からマウス好中球顆粒球を集めた。この注射の6時間後に、マウスを二酸化炭素吸入によって屠殺し、腹腔を切開した。5mlの氷冷PBS(リン酸緩衝食塩水)溶液を用いて、顆粒球を腹腔洗浄によって集めた。
起こり得るマクロファージによる汚染を減らすために、5%の二酸化炭素含有雰囲気中、37℃のインキュベーター中で、ウシ胎児血清で覆われた培養組織を含むペトリ皿で細胞を培養した。非接着顆粒球を上清から集め、血球計で計数し、遠心分離(2.250gで10分間)し、次いでハンクス平衡塩類溶液(HBSS(Invitrogen Company, Franceによって販売)中に再懸濁させた。ヒト顆粒球を、酸性クエン酸ブドウ糖液(1容積の154Mのクエン酸塩および2容積の2%ブドウ糖(pH=4.6))で健常ボランティアから採取された血球から単離した。Ficoll−Hypaque装置で遠心分離することによって単離した後、デキストラン中で赤血球を沈降させ、残存赤血球の低張溶解(hypotonic lysis)をおこなった。
C.アルビカンス株SC5314由来の酵母(106単位)を、0.1MのHEPES(N−2−ヒドロキシ・エチルピペラジン−N−2’−エタンスルホン酸)pH7を含む0.25mlの溶液の中に懸濁させ、3×106のヒト顆粒球と1:3の比で1640rpmにて混合した。顆粒球(酵母)の混合物を、1〜2時間おだやかに混合しながら37℃でインキュベートした。30分毎に、混合物の300μLのアリコートを取り出し、m/z=365に対応する関心対象の化合物の有無を検出するために使用した。関心対象の化合物は、上記と同じ条件下でMALDI−TOF質量分光法によって検出された。m/z=365の関心対象の化合物に対応するシグナルが、ヒトおよびネズミ顆粒球の両方について約2時間後に現れ、関心対象の化合物が、C.アルビカンスと、真菌病原体に対する哺乳動物の防衛細胞の最前線である顆粒球との間の相互作用からおそらく生じるということを示す。
動物: 6〜8週令の雌C57BL/6マウスを本願で記述される全ての実験に使用した。全てのマウスはCharles River Laboratories(フランス)から供給され、動物実験は全てリール大学地方病院センター動物実験倫理委員会によって承認され、実験および他の科学的目的のために使用される動物の保護に関する欧州指針86/609/EECに合致したプロトコルにしたがって実施した。
Claims (14)
- 病原性真菌微生物由来のトレハロースの有無を判定する方法であって、
タンパク質および/または脂質および/または塩および/または前記タンパク質および/または脂質および/または塩と複合体を形成しやすい多糖および/またはオリゴ糖および/または単糖を含む生物学的液体のサンプルをあらかじめ用意する工程、
前記あらかじめ用意したサンプルを処理して前記複合体から、前記多糖および/またはオリゴ糖および/または単糖を分離して、前記トレハロースを抽出する工程、
MALDI−TOF質量分析を用いて前記トレハロースの有無を判定する工程、
を有する方法。 - 前記多糖および/またはオリゴ糖および/または単糖を前記サンプルから抽出するために、
前記タンパク質および/または前記脂質の大部分の沈殿/凝集によって前記サンプルに含まれる前記複合体を前記生物学的液体から分離し、
前記サンプルを遠心分離して上清を固相から分離し、
前記上清を回収し、
前記上清中に含まれる前記多糖および/またはオリゴ糖および/または単糖が特に逆相クロマトグラフィーによって任意の残留タンパク質および任意の残留脂質から分離され、前記多糖および/またはオリゴ糖および/または単糖が特に吸収クロマトグラフィーによって前記塩から分離される請求項1記載の方法。 - 前記複合体を解離させるために、錯化剤、特に前記錯化剤から選ばれた塩基であるもの、特にEDTAを添加し、結果として得られる混合物を沸点まで、特に100℃〜140℃の温度、具体的には120℃の温度まで加熱する請求項2記載の方法。
- 最初に逆相クロマトグラフィーを実施し、続いて吸収クロマトグラフィーを実施する請求項2または3に記載の方法。
- 疎水性相を含むカラムを逆相クロマトグラフィーのために使用し、活性炭を含むカラムを吸収クロマトグラフィーのために使用する請求項3または4に記載の方法。
- 前記複合体の解離から生じる前記多糖および/またはオリゴ糖の鎖を切断するために、添加される前記複合体に対して反応しやすい少なくとも1つの酵素の添加および/または化学処理を行い、結果として前記トレハロースの量が潜在的に増加する、請求項1〜5の何れか一項に記載の方法。
- 前記トレハロースが、哺乳動物の免疫系の作用後に病原性真菌微生物によって産生される、請求項1〜6の何れか一項に記載の方法。
- 前記病原性真菌微生物が、カンジダ(Candida)種、特にC.アルビカンス、アスペルギルス(Aspergillus)種、フザリウム(Fusarium)種、トリコスポロン(Trichosporon)種、サッカロミケス・セレビシエ(Saccharomyces cerevisiae)、アクレモニウム(Acremonium)種、スケドスポリウム(Scedosporium)種、コクシジオイデス・イミティス(Coccidioides immitis)、ヒストプラスマ・カプスラーツム(Histoplasma capsulatum)、スポロトリックスシェンキイ(Sporothrix schenckii)およびニューモシスチス・ジロヴェチ(Pneumocystis jirovecii)ならびに記哺乳動物の免疫系の作用に反応してトレハロースを産生する病原性真菌微生物から選択される、請求項7に記載の方法。
- 所与の前記トレハロースについて得られるシグナルの強度を標準化合物から得られるシグナルと比較することによって、前記サンプルに含まれる所与の前記トレハロースの量を確定することができるように、既知量の少なくとも1つの標準サンプルを前記サンプルに添加する、請求項1〜8の何れか一項に記載の方法。
- ユビキタス内因性シグナルの強度と対する前記所与のトレハロースに対応するシグナルの強度の比が決定され、前記内因性シグナルが前もって同定され、場合によって前記サンプルが得られた前記生物学的液体の種類に特異的であり、その結果、前記サンプルに含まれる前記所与のトレハロースを定量化できる請求項1〜9の何れか一項に記載の方法。
- 前記生物学的液体が、動脈または静脈血、血清、生殖粘膜液、気道液、特に気管支肺胞洗浄から得られる液体、気管支吸引、気管吸引、吐出物、痰、皮膚および外皮を収集するために用いられた液体、浸出液、閉鎖腔からの液体、特に脳脊髄液体、胃腸管または尿液および生検断片の摩砕から得られる液体から選択される請求項1〜10の何れか一項に記載の方法。
- 請求項1〜11の何れか一項に記載の方法を実施するために用いるキットであって、
・少なくとも、逆相クロマトグラフィーを実行可能にする疎水性固相を含む第1支持体と、
・少なくともインプット開口部、アウトプット開口部ならびに前記インプット開口部とアウトプット開口部との間に配置された固体活性炭充填物を含む第2の容器と、を含み、
前記支持体は、逆相クロマトグラフィーを実行可能にする疎水性固相を含み、
前記固体活性炭充填物を含む前記容器が互いに独立して以下の部品:プレート、ウェル、カラム、チューブおよび複数のウェルを含むプレートから選択され、前記キットは、さらにMALDIプレートも含み、
前記固体活性炭充填物は、等量の活性炭と珪藻土とを混合することによって調製され、
前記疎水性固相は、粉末状であり、かつ、磁性材料を含む、
キット。 - 場合によって放射性同位体で標識された、単糖、二糖および三糖から選択される所与の量の標準化合物、特に重水素化トレハロースを含む請求項12に記載のキット。
- 生物学的液体に含まれる多糖および/またはオリゴ糖および/または単糖により形成される複合体と反応することができる所与の量の酵素をさらに含む請求項12または13に記載のキット。
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
FR12/01796 | 2012-06-26 | ||
FR1201796 | 2012-06-26 | ||
PCT/FR2013/000158 WO2014001658A1 (fr) | 2012-06-26 | 2013-06-24 | Méthode de diagnostic in vitro d'une infection fongique invasive par spectrométrie de masse maldi-tof |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2015526711A JP2015526711A (ja) | 2015-09-10 |
JP6254585B2 true JP6254585B2 (ja) | 2017-12-27 |
Family
ID=46889116
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2015519273A Active JP6254585B2 (ja) | 2012-06-26 | 2013-06-24 | Maldi−tof質量分析による侵襲性真菌感染症の体外診断法 |
Country Status (10)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US9360470B2 (ja) |
EP (1) | EP2877590B1 (ja) |
JP (1) | JP6254585B2 (ja) |
CN (1) | CN104411833B (ja) |
DK (1) | DK2877590T3 (ja) |
ES (1) | ES2577452T3 (ja) |
HU (1) | HUE028559T2 (ja) |
PL (1) | PL2877590T3 (ja) |
PT (1) | PT2877590E (ja) |
WO (1) | WO2014001658A1 (ja) |
Families Citing this family (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN104977349B (zh) * | 2015-03-17 | 2019-04-23 | 北京毅新博创生物科技有限公司 | 全自动多肽提取飞行时间质谱检测仪 |
CN105866407A (zh) * | 2016-04-22 | 2016-08-17 | 丹娜(天津)生物科技有限公司 | 一种曲霉菌半乳甘露聚糖抗原免疫检测试剂盒及其制备方法与应用 |
JP2019207106A (ja) * | 2016-08-25 | 2019-12-05 | 日本たばこ産業株式会社 | 配糖体の分析方法 |
CN114414341A (zh) * | 2022-01-25 | 2022-04-29 | 厦门元谱生物科技有限公司 | 一种血液培养报阳的检测方法 |
Family Cites Families (11)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPH04237496A (ja) * | 1991-01-17 | 1992-08-25 | Mitsubishi Kasei Corp | 環状イヌロオリゴ糖の製造方法 |
JP2000041693A (ja) * | 1998-07-27 | 2000-02-15 | Morinaga Milk Ind Co Ltd | ガラクトオリゴ糖の製造方法 |
FR2818647B1 (fr) * | 2000-12-21 | 2006-09-29 | Pasteur Institut | Glycopeptides immunogenes, criblage, preparation et applications |
CN101104594A (zh) * | 2002-12-26 | 2008-01-16 | 盐野义制药株式会社 | 用捕捉糖链的分子纯化/浓缩糖链的方法和分析糖链结构的方法 |
US20060057638A1 (en) * | 2004-04-15 | 2006-03-16 | Massachusetts Institute Of Technology | Methods and products related to the improved analysis of carbohydrates |
JP4262289B2 (ja) | 2005-03-31 | 2009-05-13 | 財団法人野口研究所 | 生体試料の解析法及び疾患マーカーの検索法 |
US8246832B2 (en) * | 2005-05-25 | 2012-08-21 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Fluidics device |
JP2007145361A (ja) * | 2005-11-28 | 2007-06-14 | Toray Ind Inc | 納豆容器 |
EP2010679A2 (en) | 2006-04-06 | 2009-01-07 | Ibis Biosciences, Inc. | Compositions for the use in identification of fungi |
PL1920781T3 (pl) * | 2006-11-10 | 2015-06-30 | Glycotope Gmbh | Kompozycje zawierające core-1-dodatnie mikroorganizmy i ich zastosowanie w leczeniu lub profilaktyce nowotworów |
US20100003699A1 (en) * | 2008-01-18 | 2010-01-07 | Glykos Finland Ltd. | Tissue carbohydrate compositions and analysis thereof |
-
2013
- 2013-06-24 WO PCT/FR2013/000158 patent/WO2014001658A1/fr active Application Filing
- 2013-06-24 ES ES13756524.8T patent/ES2577452T3/es active Active
- 2013-06-24 CN CN201380034007.9A patent/CN104411833B/zh active Active
- 2013-06-24 US US14/410,525 patent/US9360470B2/en active Active
- 2013-06-24 EP EP13756524.8A patent/EP2877590B1/fr active Active
- 2013-06-24 PT PT137565248T patent/PT2877590E/pt unknown
- 2013-06-24 PL PL13756524.8T patent/PL2877590T3/pl unknown
- 2013-06-24 HU HUE13756524A patent/HUE028559T2/en unknown
- 2013-06-24 DK DK13756524.8T patent/DK2877590T3/en active
- 2013-06-24 JP JP2015519273A patent/JP6254585B2/ja active Active
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
WO2014001658A1 (fr) | 2014-01-03 |
DK2877590T3 (en) | 2016-07-04 |
ES2577452T3 (es) | 2016-07-15 |
PL2877590T3 (pl) | 2016-11-30 |
US9360470B2 (en) | 2016-06-07 |
PT2877590E (pt) | 2016-06-23 |
US20150338391A1 (en) | 2015-11-26 |
CN104411833A (zh) | 2015-03-11 |
EP2877590B1 (fr) | 2016-05-18 |
EP2877590A1 (fr) | 2015-06-03 |
JP2015526711A (ja) | 2015-09-10 |
WO2014001658A8 (fr) | 2014-06-05 |
CN104411833B (zh) | 2017-11-14 |
HUE028559T2 (en) | 2016-12-28 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Eugene et al. | Rapid isolation method for lipopolysaccharide and lipid A from gram-negative bacteria | |
JP6254585B2 (ja) | Maldi−tof質量分析による侵襲性真菌感染症の体外診断法 | |
JP2017502307A (ja) | 唾液の糖タンパク質糖鎖に基づいて肝疾患を識別するレクチンチップ及びその使用 | |
Bordiga et al. | Identification and characterization of complex bioactive oligosaccharides in white and red wine by a combination of mass spectrometry and gas chromatography | |
Dogan et al. | Evaluation of disseminated candidiasis on an experimental animal model: a Fourier transform infrared study | |
TW200400351A (en) | Oligosaccharide biomarkers for mucopolysaccharidoses and other related disorders | |
Cooke et al. | Modification of gastric mucin oligosaccharide expression in rhesus macaques after infection with Helicobacter pylori | |
US20120208214A1 (en) | Rapid saccharide biomarker assay | |
Paul et al. | High polymeric IgA content facilitates recognition of microbial polysaccharide-natural serum antibody immune complexes by immobilized human galectin-1 | |
CN113960232A (zh) | 一种基于唾液特异性岩藻糖基化结构糖谱及其检测方法和应用 | |
Sendid et al. | Preliminary evidence for a serum disaccharide signature of invasive Candida albicans infection detected by MALDI mass spectrometry | |
UA75068C2 (en) | Lypopolysaccharides of escherichia coli | |
Dong et al. | Roles of immune dysregulation in MASLD | |
US6987002B2 (en) | Composition for detecting β-1,3-glucan | |
RU2538219C2 (ru) | Способ определения резистентности тромбоцитов к ацетилсалициловой кислоте | |
CN106802345B (zh) | 一种幽门螺旋杆菌IgG抗体酶联免疫诊断试剂盒 | |
Pither et al. | Extraction, purification, and chemical degradation of lps from gut microbiota Strains | |
CN115486439A (zh) | 粪便保存方法、乙醇在制备粪便保存液及短链脂肪酸检测试剂或试剂盒中的应用 | |
CN109323996B (zh) | 一种真菌检测试剂盒 | |
Lundström et al. | Application of capillary electrophoresis mass spectrometry and liquid chromatography multiple-step tandem electrospray mass spectrometry to profile glycoform expression during Haemophilus influenzae pathogenesis in the chinchilla model of experimental otitis media | |
Vukobrat-Bijedic et al. | Intestinal amebiasis in a group of patients with ulcerative colitis: influence on clinical course of the disease | |
KR100467165B1 (ko) | β-1,3-글루칸 검출용 조성물, 그것의 제조방법 및 그것을이용한 β-1,3-글루칸 검출 키트 | |
Uchiyama et al. | Anti-grifolan antibody reacts with the cell wall β-glucan and the extracellular mannoprotein-β-glucan complex of C. albicans | |
KR20020093612A (ko) | 펩티도글리칸 검출용 조성물, 및 이를 이용한펩티도글리칸 검출키트 | |
al-Asad et al. | Relationship of caspase-3 and calpain-2 proteins and some hematological parameters in adult acute myelogenous leukemia patients in Baghdad City |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20160608 |
|
A977 | Report on retrieval |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A971007 Effective date: 20170215 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20170228 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20170424 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20170905 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20171013 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20171107 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20171130 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 6254585 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |