JP6178340B2 - 微生物の早期検出のためのデバイス - Google Patents
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Description
本発明は、主として工業微生物学の分野、例えば、製薬、バイオテクノロジーまたは農業食品工業でのその適用が見出せるであろう。
本発明は、特に、膜または固体または半固体成長培地の表面における、試料中に存在する微生物に基づくコロニー形成の早期検出を可能にするデバイスに関する。
最も一般的で最も古い方法は、微生物の一つまたは数個のタイプについてより大きくまたはより小さく選択的であり得る寒天成長培地の表面における沈着からなる。次いで、しばしば数日まで延長され得る期間の間、探索する微生物の成長のための適切な温度で培地をインキュベートする。
そのような方法は、寒天上に形成されたコロニーを肉眼で見る検出を可能にするために比較的長いインキュベーション期間を必要とするという欠点を有する。
これらの方法は、数個のDNA鎖、すなわちいくつかの汚染微生物、一般的に少なくとも数十の微生物を必要とするという欠点を有する。そのような方法は、したがって成長に基づく方法よりも感度が低い。
この原理を用いる方法は、すなわち国際特許出願WO03/022999に記載されており、この方法では、自己蛍光などのコロニーの測定光学特性が使用されている。
さらには、本発明によるデバイスにより、適任とされるオペレーターの存在を必要とする高価な設備および試薬の使用を省略することが可能となる。
− コロニーの形態で微生物を成長させるための少なくとも一つの支持体であって、膜または寒天培地のタイプの支持体が上に不動に配置された、実質的に平担で水平な検出表面、
− 検出表面の全部または一部を走査するための平担に可動に据え付けられた、少なくとも一つのCCDまたはCMOSセンサーを含み、少なくとも一つの照明とレンズなどの少なくとも一つの光学手段から構成される光学システムが連結している、リニアスキャナーのような検出システム
を含む。
さらにより好ましくは、検出システムのCCDセンサーは、4800dpiに等しいまたはそれより高い解像度を有する。
好ましくは、該表面はA5またはA5*2nフォーマットを有し、nは1に等しいまたはそれより大きい整数である。
特に有利な実施形態によれば、光学システムは、4mmに等しいまたはそれより大きい被写界深度を有する。
興味深い方法では、検出システムは、該表面の上に位置する。
さらにより好ましくは、トレイは、成長支持体を受けることができる複数の凹部を含む。
有利には、可動検出システムの光学システムは、ミラー、発光ダイオードを有する照明およびレンズを含む。
興味深い方法では、可動検出システムは、一定の時間間隔で画像を撮影しそして高解像度画像の分析を可能にする画像化システムを含み、該画像は1億画素に等しいまたはそれより大きいサイズを有する。
本発明のさらなる特徴および利点は、添付された図面を参照して、本発明の非限定的な実施形態についての以下の詳細な説明から明らかになるであろう。
試料は、例えば、飲料、飲料として取られる薬剤または液状化粧ローションなどのいかなる液体媒体で構成されている場合でも、それは適合した濾過膜2を介して濾過することができる。次いで、膜2は、例えば栄養寒天などの細菌の成長を可能とすることができる支持体3の表面上に有利に置くことができる。
膜または寒天培地などであり得る成長支持体3は、したがって、分析されるべき試料中に最終的に存在する単離された微生物の成長および増殖を可能にする。これらの微生物の増殖は、支持体3の表面におけるコロニーの形成という結果になる。
次いで、トレイ4は、支持体3の表面上に形成するコロニーの検出が可能となるように、本発明によるデバイス1に入れることができる。
しかしながら、成長支持体3は、トレイ4上に事前に位置を定めること無く、本発明による検出デバイス1の実質的に平坦な表面上に直接置かられることもできるので、そのような実施形態は本発明を限定するものと考えられるべきではない。
本発明による検出デバイス1は、一方では、好ましくは実質的に平坦で水平な検出表面5を含み、その表面上に、少なくとも一つの播種された成長支持体3が、上記した指示に従って配置されることができる。好ましくは、複数の成長支持体3は、数個の試料中に存在する最終的な汚染物の同時検出を可能にするように、表面5上に置かれる。
本発明によるデバイス1は、一方では、例えば、検出表面5の少なくとも一部そして好ましくは全部を走査でき移動可能に据え付けられたスキャナーなどの検出システム7を含む。そのような検出システムは、添付された図3に表わされている。
かくして、検出システム7は、検出を可能にするように可動であり、一つまたは複数の成長支持体3は、表面5上に不動のままである。これにより、得られた結果のエラーの原因となり得る支持体の動きを回避することが可能となる。
本発明によるデバイス1の検出システム7は、好ましくは、少なくとも一つのCCDセンサー8(電荷結合素子)または一つのCMOS型センサー(相補型金属酸化膜半導体)を含む。
本発明によるデバイス1のCCDセンサー8は、一般に、少なくとも一つの照明9、少なくとも一つのミラー11および例えばレンズ10などの少なくとも一つの光学手段で順次構成される光学システムに連結している。
実際、CCDセンサー8の解像度は、4800dpi、すなわち約5ミクロンに等しいまたはそれより高いときには、コロニーの実際のサイズとユーザーへの補間無しに復元されたその画像との間の、60に等しいまたはそれより大きい割合に対応する有用な倍率を達成することを可能にする。
CCDセンサー8についての4800dpiに等しいまたはそれより高いそのような解像度が理想的であるが、しかしながら、良好な結果はまた、2400dpi、すなわち約10ミクロンに等しいまたはそれより高い解像度を有するCCDセンサー8により得られる。
したがって、デバイス1の検出システム7は、コロニーが数マイクロメートル、例えば20μmの範囲の直径を有するときにコロニーを表示することを可能にし、他方、試料を読むのに通常の距離で約百マイクロメートルより小さいものは肉眼では何も認められず、この通常の距離は典型的には30センチメートルの範囲である。本デバイス1は、かくして、試料中の最終的な汚染物の存在の迅速な検出を可能にする。
したがって、既知の検出技術を用いて5日間で検出されるであろう汚染物は、本発明によるデバイス1によって、最大で48時間で、好ましくは24時間以下で、表示されるであろう。
換言すれば、本発明によるデバイスのCCDセンサー8の解像度は、微小コロニーとそれらの成長支持体との間のコントラストを上昇させることを目的とした技術を用いること無く、それらの光学特性とそれらの形態学にかかわらず、微小コロニーの大部分を検出することを可能にする限界値を表わす。
したがって、凹部18の高さは、使用される成長支持体3の種類に依存し、適合するトレイ4の使用により、成長支持体3の異なるサイズの使用が可能になり、その高さおよび直径は、例えば分析すべき試料に応じて、変動し得る。
検出すべきコロニーが見出される支持体3の寒天または膜が、検出システム7に対してある距離に位置しているので、例えばレンズなどの適合光学手段の使用を介して達成されるそのような被写界深度は、成長支持体3上のコロニーの検出を可能にする。加えて、微生物がその上で成長する表面は、一般に、完全に平坦ではない。
最後に、大きな被写界深度を有する光学システムの使用により、常に高倍率光学系のフォーカシングに進むことを避けることが可能であり、したがって、これにより、既存のデバイスよりもはるかに高くなり得る走査速度の上昇が可能となる。
好ましくは、可動検出システム7の光学システムは、ミラー11、発光ダイオード12を有する照明9およびレンズ10を含む。照明9は成長支持体3を照らすことを可能にし、それらが反射する光が、ミラー11によってレンズ10に戻り、それは次いで反射光をCCDセンサー8へ戻すことを可能にする。
しかしながら、本発明による検出デバイス1が、成長支持体3を検出表面5のレベルで実質的に一定の温度に維持できる加熱システムを直接組み込むことがさらに有利である。そのような特定の実施形態は、添付された図4に表わされている。
好ましくは、添付された図4から分るように、引出し13は、成長支持体3が上に配置される二つのトレイ4を有利には凹部18内に受け入れることを可能にする。
成長支持体3は、例えば、好ましくは試料中に検出したい特定の微生物の成長のための最適温度に依存して、22℃と55℃の間の温度で有利に維持される。
成長支持体3を一定温度に維持する結果として生じる利点は、結果を達成するために実施すべき操作の数の減少を可能にすることに在る。これはまた、本発明によるデバイス1による検出の自動化を容易にし、これにより、結果として、コロニーを検出するための時間の短縮を可能にする。
そのような実施形態は、一方では、検出デバイス1の比較的低コストのために、他方では、通常数十センチメートルの範囲でのデバイス1の限られた高さのために、可能である。この特定の実施形態は、例えば、標準的なカメラに基づく検出システムを使用した場合は、実行できないであろうし、このタイプのシステムは、既存のデバイスでは特別に許可されている。
そのような画像化システムは、検出システム7のCCDセンサー8の、4800dpiに等しいまたはそれより高い高解像度により、特に大きな画像サイズを管理することが可能であるべきである。
実際、そのような解像度レベルで、得られる画像のサイズは1億画素の範囲であり、このサイズの画像内で、微小ロコロニーは約20画素を示す。換言すれば、分析すべき画像のサイズと検出すべき要素すなわち微小コロニーのサイズとの間の比は、一般に百万より高く、このことにより、適合画像化システムが要求される。
画像化システムは、検出表面5上に配置された成長支持体3上のコロニーの出現および/または成長を強調するように、一定の間隔で撮影された画像の比較を可能にする画像分析手段を好ましくは含む。
画像はまた、いずれかの適合手段により、スマートフォン15、携帯型コンピュータ16またはタブレット17からも成る周辺機器へ送信されることもできる。
さらにより好ましくは、画像の比較を可能にするそのような手段は、画像の比較により、コロニーの検出を可能にすることができ、この比較は、時刻tで撮像された画像と時刻t−1で予め撮影された画像との間で実行される。
連続した画像を比較する操作は、汚染物のサイズは二つの画像撮影の間で変動しないので、オペレーターが成長支持体3の汚染物(埃など)から成長しているコロニーを区別することを有利に可能にする。したがって、出発試料中の微生物の存在または非存在に関する決定の取得が容易になる。
勿論、本発明は、本発明の範囲から離れること無く変形および修飾を持ち得る、以上に示し記載した例に限定されるものではない。
Claims (9)
- 試験すべき試料中に存在する微生物の増殖の結果から生じるコロニーの蛍光を測定することなく、迅速な検出を可能にするデバイス(1)であって、デバイス(1)は、
− コロニーの形態で微生物を成長させるための少なくとも一つの支持体(3)であって、膜または寒天培地のタイプの支持体(3)が、その上に不動に配置された、平担で水平な検出表面(5)、
− 検出表面(5)の全部または一部を走査するための平担に可動に据え付けられた、少なくとも一つのCCDまたはCMOSセンサーを含み、少なくとも一つの照明(9)とレンズ(10)などの少なくとも一つの光学手段から構成される光学システムが連結している、リニアスキャナーのような検出システム(7)
を含み、デバイス(1)は、検出システム(7)のCCDまたはCMOSセンサー(8)が2400dpiに等しいまたはそれより高い解像度を有し、可動検出システム(7)が、60に等しいまたはそれより高い有用倍率を介して50μmよりも小さい直径を有するコロニーの画像化による検出を可能にし、デバイス(1)は、検出表面(5)上に配置された成長支持体(3)を22℃と55℃の間の温度に維持するための加熱システムも含むことを特徴とする、前記デバイス(1)。 - 可動検出システム(7)のCCDまたはCMOSセンサー(8)が4800dpiに等しいまたはそれより高い解像度を有することを特徴とする、請求項1に記載のデバイス(1)。
- 検出表面(5)がA5またはA5*2nフォーマットを有し、nは1に等しいまたはそれより大きい整数であるであることを特徴とする、請求項1または2に記載のデバイス(1)。
- 光学システムが4mmに等しいまたはそれより深い被写界深度を有することを特徴とする、請求項1〜3のいずれか一項に記載のデバイス(1)。
- 可動検出システム(7)が検出表面(5)の上に位置することを特徴とする、請求項1〜4のいずれか一項に記載のデバイス(1)。
- 検出表面(5)が、成長支持体(3)を受け入れるための開放位置から閉鎖位置へ通過可能な引出し(13)で構成され、それによって可動検出システム(7)による成長支持体(3)の走査が可能となり、成長支持体(3)は、引出し(13)中に置かれることを目的とした少なくとも一つのトレイ(4)上に直接配置されることを特徴とする、請求項1〜5のいずれか一項に記載のデバイス(1)。
- トレイ(4)が、成長支持体(3)を受け入れることができる複数の凹部を含むことを特徴とする、請求項1〜6のいずれか一項に記載のデバイス(1)。
- 可動検出システム(7)の光学システムが、ミラー(11)、発光ダイオード(12)を有する照明(9)およびレンズ(10)を含むことを特徴とする、請求項1〜7のいずれか一項に記載のデバイス(1)。
- 可動検出システム(7)が、一定の時間間隔で高解像度画像を得て、分析しそして比較することを可能にするように配置された画像化システムを含み、画像は100万画素に等しいまたはそれより大きいサイズを有することを特徴とする、請求項1〜8のいずれか一項に記載のデバイス(1)。
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