JP6120775B2 - ジャイレース阻害剤である(r)−1−エチル−3−[6−フルオロ−5−[2−(1−ヒドロキシ−1−メチル−エチル)ピリミジン−5−イル]−7−(テトラヒドロフラン−2−イル)−1h−ベンゾイミダゾール−2−イル]尿素の固体形態 - Google Patents

ジャイレース阻害剤である(r)−1−エチル−3−[6−フルオロ−5−[2−(1−ヒドロキシ−1−メチル−エチル)ピリミジン−5−イル]−7−(テトラヒドロフラン−2−イル)−1h−ベンゾイミダゾール−2−イル]尿素の固体形態 Download PDF

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Description

(関連出願への相互参照)
本出願は、2011年1月14日に出願された米国仮特許出願第61/433,169号の利益を米国特許法§119の下、主張する。この米国仮特許出願第61/433,169号の全内容が、参考として本明細書に援用される。
(本願の背景)
抗生物質に対する細菌耐性は、長い間認識されてきており、これは、今日では、深刻な世界的健康問題であると考えられている。耐性の結果として、いくつかの細菌感染症は、抗生物質で処置することが困難であり、または処置不能でさえある。この問題は、細菌のある特定の系統、例えば、Streptococcus pneumoniae(SP)、Mycobacterium tuberculosis、およびEnterococcusなどにおける多剤耐性の最近の展開を伴って特に深刻となっている。バンコマイシン耐性enterococcusの出現は、特に憂慮すべきことであった。その理由は、バンコマイシンは、以前は、この感染症を処置するための唯一の有効な抗生物質であり、多くの感染症にとって「最後の手段」の薬物であると考えられていたためである。enterococciなどの多くの他の薬物耐性細菌は、生命を危うくする疾患を引き起こさないが、耐性を誘発する遺伝子が、メチシリン耐性がすでに蔓延しているStaphylococcus aureusなどのより死に至る危険のある生物に蔓延し得るという恐怖がある(非特許文献1;非特許文献2)。
別の懸念は、どの程度急速に抗生物質耐性が蔓延し得るかである。例えば、1960年代まで、SPは、ペニシリンに普遍的に感受性であり、1987年では、米国において、SP系統の0.02%のみが耐性であった。しかし、1995年までに、ペニシリンに対するSPの耐性は、約7パーセントであり、米国の一部の地域では30%もの高さであることが報告された(非特許文献3)。
特に、病院は、薬物耐性生物の形成および伝播の中心として機能を果たす。病院内で発生する感染症は、院内感染として公知であり、ますます深刻な問題となっている。毎年病院内で感染する200万の米国人のうち、これらの感染症の半分超が少なくとも1つの抗生物質に耐性となる。疾病管理センターは、1992年に、13,000を超える病院患者が抗生物質処置に耐性である細菌感染症で死亡したことを報告した(非特許文献4)。
薬物耐性細菌を退治する必要性、および利用可能な薬物の機能停止の増大の結果として、新規抗生物質を発見する関心が復活している。新規抗生物質を開発するための1つの魅力的なストラテジーは、DNA複製に必要な、したがって、細菌性細胞増殖および分裂に必要な細菌酵素である、DNAジャイレースおよび/またはトポイソメラーゼIVを阻害することである。ジャイレースおよび/またはトポイソメラーゼIV活性は、DNA転写、修復、および組換えにおける事象にも関連する。
ジャイレースは、DNAのトポロジカル異性体の相互変換を触媒する酵素の群であるトポイソメラーゼの1つである(一般に、非特許文献5;非特許文献6;非特許文献7を参照)。ジャイレース自体は、DNAスーパーコイル形成を制御し、親二本鎖のDNA鎖が複製プロセスの間によりが戻される際に起こるトポロジカルストレスを軽減する。ジャイレースは、弛緩型閉環状二本鎖DNAの、組換えにとってより好都合である負高次らせんへの変換も触媒する。スーパーコイル形成反応の機構は、DNAの一領域周囲へのジャイレースのラッピング、その領域における二本鎖破壊、破壊箇所を通じたDNAの第2の領域の通過、および破壊された鎖の再結合を伴う。このような開裂機構は、II型トポイソメラーゼの特徴である。スーパーコイル形成反応は、ATPがジャイレースに結合することによって推進される。次いで、ATPは、反応の間に加水分解される。このATPの結合および後続の加水分解は、DNAに結合したジャイレースの活性に必要であるこのジャイレースのコンホメーション変化を引き起こす。DNAスーパーコイル形成(または弛緩)のレベルは、ATP/ADP比に依存することも判明している。ATPの非存在下で、ジャイレースは、スーパーコイルDNAを弛緩することができるだけである。
細菌DNAのジャイレースは、2つのA(GyrA)および2つのBサブユニット(GyrB)からなる400キロダルトンのタンパク質四量体である。DNAの結合および開裂は、GyrAに関連し、一方、ATPは、GyrBタンパク質によって結合および加水分解される。GyrBは、ATPase活性を有するアミノ末端ドメイン、ならびにGyrAおよびDNAと相互作用するカルボキシ末端ドメインからなる。対照的に、真核生物のII型トポイソメラーゼは、負のスーパーコイルおよび正のスーパーコイルを弛緩することができるが、負のスーパーコイルを導入することができないホモ二量体である。理想的には、細菌DNAのジャイレースおよび/またはトポイソメラーゼIVの阻害に基づく抗生物質は、この酵素に選択的であり、真核生物のII型トポイソメラーゼに対して相対的に不活性であるはずである。
トポイソメラーゼIVは主に、DNA複製の最後に、連結した染色体二量体を分離する。
広く使用されているキノロン抗生物質は、細菌DNAジャイレース(GyrA)および/またはトポイソメラーゼIV(ParC)を阻害する。キノロンの例として、早期の化合物、例えば、ナリジクス酸およびオキソリン酸など、ならびに後期の化合物であるより強力なフルオロキノロン、例えば、ノルフロキサシン、シプロフロキサシン、およびトロバフロキサシンなどが挙げられる。これらの化合物は、GyrAおよび/またはParCに結合し、開裂された複合体を安定化させ、したがって、全体的なジャイレースの機能を阻害し、細胞死に導く。フルオロキノロンは、ジャイレース(GyrA)および/またはトポイソメラーゼIV(ParC)の触媒サブユニットを阻害する(非特許文献7を参照)。しかし、薬剤耐性も、このクラスの化合物の問題として認識されている(非特許文献8)。キノロンでは、他のクラスの抗生物質と同様に、より早期の化合物に曝された細菌は、同じクラスのより強力な化合物に対する交差耐性を急速に発達させることが多い。
触媒ターンオーバーに必要なエネルギーの供給/ATP加水分解を介した酵素のリセットに関与する関連サブユニットは、それぞれGyrB(ジャイレース)およびParE(トポイソメラーゼIV)である(非特許文献9)。GyrBおよびParEサブユニット中のこれらの同じATP結合部位を標的にする化合物は、様々な細菌感染症を処置するのに有用であるはずである(非特許文献10)。
GyrBに結合する公知の阻害剤はより少ない。例として、クマリン、ノボビオシン、およびクメルマイシンA1、シクロチアリジン、シノジン、およびクレロシジンが挙げられる。クマリンは、非常にしっかりとGyrBに結合することが示されている。例えば、ノボビオシンは、タンパク質との水素結合のネットワーク、およびいくつかの疎水性接触を作る。ノボビオシンとATPは、ATP結合部位内で確かに結合するように思われるが、2つの化合物の結合配向(bound orientation)における重なりは最小である。重なり部分は、ノボビオシンの糖ユニットおよびATPアデニンである(非特許文献11)。
クマリン耐性細菌については、最も蔓延している点変異は、クマリン環のカルボニルに結合する表面アルギニン残基(E.coliのGyrB中のArg136)におけるものである。この変異を有する酵素は、より低いスーパーコイル形成およびATPase活性を示すが、これらはまた、クマリン薬物による阻害に対して感受性がより低い(非特許文献12)。
ジャイレーススーパーコイル形成の強力な阻害剤であるにもかかわらず、クマリンは、抗生物質として広く使用されていない。これらは、細菌において浸透性が低く、真核生物に毒性であり、水溶性が乏しいために、一般に適当でない(非特許文献11)。これらの欠点を克服し、好ましくは、活性のためにArg136への結合を利用しない新規の有効なGyrBおよびParE阻害剤を有することが望ましい。このような阻害剤は、他のクラスの抗生物質を悩ます耐性問題の履歴を伴わない魅力的な抗生物質候補であるはずである。
抗生物質に対する細菌耐性は、重要な公衆衛生問題となっているので、より新しく、より強力な抗生物質を開発する必要性が継続している。より具体的には、細菌感染症を処置するのに以前に使用されていない新しいクラスの化合物を代表する抗生物質が必要とされている。GyrB(ジャイレース)およびParE(トポイソメラーゼIV)サブユニットの両方におけるATP結合部位を標的にする化合物は、様々な細菌感染症を処置するのに有用であるはずである。このような化合物は、耐性菌の形成および伝播がますます蔓延した状態になりつつある病院における院内感染を処置するのに特に有用であるはずである。
De Clerqら、Current Opinion in Anti−infective Investigational Drugs、1999年、1巻、1号 Levy、「The Challenge of Antibiotic Resistance」、Scientific American、1998年3月 Lewis、FDA Consumer magazine (1995年9月);The Medical ReporterにおけるGershman、1997年 Lewis、「The Rise of Antibiotic−Resistant Infections」、FDA Consumer magazine、1995年9月 KornbergおよびBaker、DNA Replication、2版、12章、1992年、W. H. Freemanおよび共著者 Drlica、Molecular Microbiology、1992年、6巻、425頁 DrlicaおよびZhao、Microbiology and Molecular Biology Reviews、1997年、61巻、377〜392頁 WHO Report、「Use of Quinolones in Food Animals and Potential Impact on Human Health」、1998年 Champoux, J.J.、Annu. Rev. Biochem.、2001年、70巻、369〜413頁 Charifsonら、J. Med. Chem.、2008年、51巻、5243〜5263頁 Maxwell、Trends in Microbiology、1997年、5巻、102頁 Maxwell、Mol. Microbiol.、1993年、9巻、681頁
(本願の要旨)
本願は、(R)−1−エチル−3−[6−フルオロ−5−[2−(1−ヒドロキシ−1−メチル−エチル)ピリミジン−5−イル]−7−(テトラヒドロフラン−2−イル)−1H−ベンゾイミダゾール−2−イル]尿素(「6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物」)の固体形態に関する。一実施形態では、本願は、X線粉末回折パターン(XRPD)が約5〜約38度2シータ(2θ)から収集されるとき、9.3、11.7、12.1、12.4、14.5、15.9、16.3、16.6、18.5、19.4、21.5、22.3、22.8、23.8、24.5、25.7、28.1、28.4、30.3、および33.4からなる群から選択される、CuKα放射線を使用して測定した場合の少なくなくとも3つのおおよそのピーク位置(度2θ±0.2)を含むXRPDを特徴とする6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の固体形態Iを提供する。固体形態Iは、図1と実質的に同様の、CuKα放射線を使用して測定した場合のX線粉末回折パターン、および温度が1分当たり約10℃でスキャンされる示差走査熱量測定によって測定される場合に約318℃の開始温度を有する吸熱ピークも特徴とし得る。本願は、アルコールおよびエーテルを含む溶媒系中に遊離塩基の固体材料を懸濁させ、固体を単離することによって、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の結晶形Iを調製するための方法も提供する。
本願の別の実施形態は、X線粉末回折パターン(XRPD)が約5〜約38度2θから収集されるとき、6.7、9.2、16.7、18.6、19.5、20.5、25.6、および27.5からなる群から選択される、CuKα放射線を使用して測定した場合の少なくとも3つのおおよそのピーク位置(度2θ±0.2)を含むXRPDを特徴とする、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の塩酸塩の固体形態IIを提供する。固体形態IIは、図4と実質的に同様の、CuKα放射線を使用して測定した場合のX線粉末回折パターン、および温度が1分当たり約10℃でスキャンされる示差走査熱量測定によって測定される場合に約252℃の開始温度を有する吸熱ピークも特徴とし得る。6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の塩酸塩の固体形態IIは、1つまたは複数のエーテル溶媒および水を含む酸性溶媒混合物中に6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の遊離塩基を懸濁させることによって調製され得る。
本願のさらなる実施形態は、識別できる回折ピークをまったく含まない広いハローによって特徴付けられる、CuKα放射線を使用したX線粉末回折パターン(XRPD)を特徴とする、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物(遊離塩基)の非晶形IIIである。本願のさらなる実施形態は、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物(遊離塩基)の非晶形IIIを調製するための方法であって、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の溶液を、凍結乾燥、噴霧乾燥、ドラム乾燥、またはパルス変換乾燥(pulse conversion drying)させるステップを含む、方法である。
本願のさらに別の実施形態は、識別できる回折ピークをまったく含まない広いハローによって特徴付けられる、CuKα放射線を使用したX線粉末回折パターン(XRPD)を特徴とする、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物のメシル酸塩の非晶形IVである。
例えば、本発明は、以下の項目を提供する。
(項目1)
式(I):
Figure 0006120775

の化合物の固体形態I。
(項目2)
X線粉末回折パターン(XRPD)が約5〜約38度2θから収集されるとき、9.3、11.7、12.1、12.4、14.5、15.9、16.3、16.6、18.5、19.4、21.5、22.3、22.8、23.8、24.5、25.7、28.1、28.4、30.3、および33.4からなる群から選択される、CuK α 放射線を使用して測定した場合の少なくとも3つのおおよそのピーク位置(度2θ±0.2)を含む前記XRPDを特徴とする、項目1に記載の固体形態I。
(項目3)
X線粉末回折パターン(XRPD)が約5〜約38度2θから収集されるとき、9.3、16.6、18.5、19.4、21.5、および25.7からなる群から選択される、CuK α 放射線を使用して測定した場合の少なくとも3つのおおよそのピーク位置(度2θ±0.2)を含む前記XRPDを特徴とする、項目1に記載の固体形態I。
(項目4)
図1と実質的に同様の、CuK α 放射線を使用して測定した場合のX線粉末回折パターンを特徴とする、項目3に記載の固体形態I。
(項目5)
温度が1分当たり約10℃でスキャンされる示差走査熱量測定によって測定される場合に約318℃の開始温度を有する吸熱ピークをさらに特徴とする、項目4に記載の固体形態I。
(項目6)
項目1に記載の式(I)の化合物の結晶形Iを調製するための方法であって、アルコールおよびエーテルを含む溶媒系中に遊離塩基の固体材料を懸濁させるステップと、前記固体を単離するステップとを含む、方法。
(項目7)
式(I):
Figure 0006120775

の化合物の塩酸塩。
(項目8)
形態IIの固体形態である、項目7に記載の塩酸塩。
(項目9)
前記形態IIの固体形態が、X線粉末回折パターン(XRPD)が約5〜約38度2θから収集されるとき、6.7、9.2、16.7、18.6、19.5、20.5、25.6、および27.5からなる群から選択される、CuK α 放射線を使用して測定した場合の少なくとも3つのおおよそのピーク位置(度2θ±0.2)を含む前記XRPDを特徴とする、項目8に記載の塩酸塩。
(項目10)
前記形態IIの固体形態が、図4と実質的に同様の、CuK α 放射線を使用して測定した場合のX線粉末回折パターンを特徴とする、項目8に記載の塩酸塩。
(項目11)
前記形態IIの固体形態が、温度が1分当たり約10℃でスキャンされる示差走査熱量測定によって測定される場合に約252℃の開始温度を有する吸熱ピークをさらに特徴とする、項目9に記載の塩酸塩。
(項目12)
項目8に記載の式(I)の化合物の塩酸塩の固体形態IIを調製するための方法であって、1つまたは複数のエーテル溶媒および水を含む酸性溶媒混合物中に6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の遊離塩基を懸濁させるステップを含む、方法。
(項目13)
式I:
Figure 0006120775

の6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の非晶形III。
(項目14)
識別できる回折ピークをまったく含まない広いハローによって特徴付けられる、CuK α 放射線を使用したX線粉末回折パターン(XRPD)を特徴とする、項目13に記載のフルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の非晶形III。
(項目15)
項目13に記載の6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の非晶形IIIを調製するための方法であって、前記6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の溶液を、凍結乾燥、噴霧乾燥、ドラム乾燥、またはパルス変換乾燥させるステップを含む、方法。
(項目16)
式I:
Figure 0006120775

の6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物のメシル酸塩の非晶形IV。
(項目17)
識別できる回折ピークをまったく含まない広いハローによって特徴付けられる、CuK α 放射線を使用したX線粉末回折パターン(XRPD)を特徴とする、項目16に記載の6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物のメシル酸塩の非晶形IV。
(項目18)
前記形態IIの固体形態が、最大75%の相対湿度を伴った40℃で、少なくとも1カ月間安定である、項目8に記載の塩酸塩。
(項目19)
最大75%の相対湿度を伴った40℃で、少なくとも1カ月間安定である、項目2に記載の固体形態I。
(項目20)
項目1に記載の化合物、および薬学的に許容される担体、アジュバント、またはビヒクルを含む、医薬組成物。
(項目21)
患者における院内または非院内細菌感染症を制御、処置、またはその進行、重症度、もしくは影響を低減する方法であって、前記患者に、項目20に記載の医薬組成物を投与するステップを含む、方法。
(項目22)
前記細菌感染症が、Streptococcus pneumoniae、Staphylococcus epidermidis、Enterococcus faecalis、Staphylococcus aureus、Clostridium difficile、Moraxella catarrhalis、Neisseria gonorrhoeae、Neisseria meningitidis、Mycobacterium avium complex、Mycobacteriumabscessus、Mycobacterium kansasii、Mycobacterium ulcerans、Chlamydophila pneumoniae、Chlamydia trachomatis、Haemophilus influenzae、Streptococcus pyogenes、またはβ−溶血性streptococciのうちの1つまたは複数の存在を特徴とする、項目21に記載の方法。
(項目23)
前記細菌感染症が、以下、即ち、上気道感染症、下気道感染症、耳感染症、胸膜肺感染症および気管支感染症、複雑性尿路感染症、単純性尿路感染症、腹腔内感染症、心血管感染症、血流感染症、敗血症、菌血症、CNS感染症、皮膚感染症および軟部組織感染症、GI感染症、骨関節症および関節感染症、生殖器感染症、眼感染症、または肉芽腫性感染症、単純性皮膚および皮膚構造感染症(uncomplicated skin and skin structure infection)(uSSSI)、複雑性皮膚および皮膚構造感染症(complicated skin and skin structure infection)(cSSSI)、カテーテル感染症、咽頭炎、副鼻腔炎、外耳炎、中耳炎、気管支炎、膿胸、肺炎、市中細菌性肺炎(CABP)、院内肺炎(HAP)、院内細菌性肺炎、人工呼吸器関連肺炎(VAP)、糖尿病性足感染症、バンコマイシン耐性enterococci感染症、膀胱炎および腎盂腎炎、腎結石、前立腺炎、腹膜炎、複雑性腹腔内感染症(cIAI)、ならびに他の腹腔内(inter−abdominal)感染症、透析関連腹膜炎、内臓膿瘍、心内膜炎、心筋炎、心膜炎、輸血関連敗血症、髄膜炎、脳炎、脳膿瘍、骨髄炎、関節炎、生殖器潰瘍、尿道炎、膣炎、子宮頸管炎、歯肉炎、結膜炎、角膜炎、眼内炎(endophthalmitisa)、嚢胞性線維症患者の感染症、または発熱性好中球減少症患者の感染症のうちの1つまたは複数から選択される、項目22に記載の方法。
(項目24)
前記細菌感染症が、以下、即ち、市中細菌性肺炎(CABP)、院内肺炎(HAP)、院内細菌性肺炎、人工呼吸器関連肺炎(VAP)、菌血症、糖尿病性足感染症、カテーテル感染症、単純性皮膚および皮膚構造感染症(uSSSI)、複雑性皮膚および皮膚構造感染症(cSSSI)、バンコマイシン耐性enterococci感染症、または骨髄炎のうちの1つまたは複数から選択される、項目23に記載の方法。
図1は、約5〜約38度2θから収集される6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物(遊離塩基)の固体形態IのX線粉末回折パターンを示す図である。 図2は、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物(遊離塩基)の固体形態IのDSC(示差走査熱量測定)サーモグラムを示す図である。 図3は、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物(遊離塩基)の固体形態IのTGA(熱重量分析)サーモグラムを示す図である。 図4は、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の塩酸塩の固体形態IIのX線粉末回折パターンを示す図である。 図5は、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の塩酸塩の固体形態IIのDSCサーモグラムを示す図である。 図6は、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の固体形態IIのTGAサーモグラムを示す図である。 図7は、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物(遊離塩基)の非晶形IIIのX線粉末回折パターンである。 図8は、1つの小さい発熱、その後の3つのより大きい吸熱を呈する、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素(遊離塩基)の非晶形IIIのDSCサーモグラムを示す図である。 図9は、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物のメシル酸塩の非晶形IVのX線粉末回折パターンである。 図10は、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物のメシル酸塩のH−NMRスペクトルである。
本願は、(R)−1−エチル−3−[6−フルオロ−5−[2−(1−ヒドロキシ−1−メチル−エチル)ピリミジン−5−イル]−7−(テトラヒドロフラン−2−イル)−1H−ベンゾイミダゾール−2−イル]尿素(「6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物」)の新規の実質的に純粋な固体形態を対象とする。
本発明者らは、本化合物の遊離塩基結晶形(形態I)、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の薬学的に許容される塩の結晶形(形態II、塩酸塩に対応)、遊離塩基の非晶形(形態III)、および本化合物のメシル酸塩の非晶形(形態IV)を発見した。
したがって、本願の一態様は、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物(遊離塩基)の新規固体形態Iである。一態様では、本願は、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の固体形態Iを調製するためのプロセスを提供する。
6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の実質的に純粋な固体形態Iは、本化合物を、アルコールおよびエーテルを含む溶媒系と接触させ、固体を単離することによって、非晶質化合物または結晶化合物から調製され得る。6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物は、周囲温度で溶媒中に6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の溶液を飽和させ、この混合物を長時間(例えば、一晩)静置することによって、溶媒と接触させることができる。あるいは、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物は、高温で(例えば、還流させながら)溶媒に溶解させ、その後、室温以下にこの溶液を冷却し、固体形態Iを単離することができる。
本プロセスの一実施形態では、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の実質的に純粋な固体形態Iは、室温で適当な溶媒中の本化合物の飽和溶液を調製し、生じる形態Iを単離することによって、本化合物の非晶形または結晶形から調製され得る。実際には、これは、溶液が室温に冷却させられるとき、飽和溶液が得られ、この飽和溶液から形態Iが析出し、これを単離することができるように、高温(還流まで)で、溶媒中に十分な量の6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物を溶解させることによって達成することができる。他の実施形態では、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物は、溶媒中の化合物の溶解度を改変することによって、反応混合物から単離される場合がある。例えば、溶媒の一部もしくはすべてを除去するか、または混合物の温度を下げることにより、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の溶解度を低減することができ、固体形態Iが析出し得る。あるいは、混合物に第2の溶媒を添加することにより、本化合物の固体形態Iを析出させることができる。
一実施形態では、形態Iを調製するための溶媒は、エタノールとエチルエーテルの混合物である。得られた固体を単離すると、形態Iがもたらされる。
6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の固体形態Iは、以下の特性、即ち、1分当たり10℃のスキャン速度を使用する示差走査熱量測定によって求められる場合の、約250℃の広い吸熱、約318℃の外挿開始点を有する融解吸熱、およびXRPDパターンがCu X線管源を備えた粉末回折計を使用して測定された、本質的に表1および図1に示されるX線粉末回折パターンによって同定され得る。試料をCu Kα放射線で照射し、XRPDデータを約5〜約40°2θから収集した。当業者であれば、XRPDピークの相対強度が、試験下の試料の配向、ならびに使用される計測器の型および設定に応じて著しく変化する場合があり、その結果、本明細書に含まれるXRPDトレースの強度が、例示的な程度までのものであり、絶対比較に使用されることは意図されていないことを認識するであろう。
図1は、約5〜約40度2θから収集された6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物(遊離塩基)の固体形態IのX線粉末回折パターンである。5%以上の相対強度を有するX線粉末回折パターンに該当するピークを、表1に列挙する。
図2は、約250℃の開始転移点を有する広い吸熱、および約318℃の開始転移点を有する吸熱を呈する、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の固体形態IのDSCサーモグラムを示す。当業者であれば、吸熱のピークおよび開始温度が実験条件に応じて変化し得ることを認識するであろう。図2中のデータは、固体の試料2.5mgを、約35℃で約10分間平衡化して収集した。データ収集期間の間、1分当たり約10℃の速度で温度を上昇させた。
図3は、50〜300℃の温度範囲における約15%の初期重量損失と、300〜400℃の間の約25%の追加の重量損失を呈する、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の固体形態IのTGA(熱重量分析)サーモグラムである。
一実施形態では、本発明は、式(I):
Figure 0006120775
の化合物の固体形態Iを提供する。
別の実施形態では、固体形態Iは、X線粉末回折パターン(XRPD)が約5〜約38度2θから収集されるとき、9.3、11.7、12.1、12.4、14.5、15.9、16.3、16.6、18.5、19.4、21.5、22.3、22.8、23.8、24.5、25.7、28.1、28.4、30.3、および33.4からなる群から選択される、CuKα放射線を使用して測定した場合の少なくなくとも3つのおおよそのピーク位置(度2θ±0.2)を含むXRPDを特徴とする。
別の実施形態では、固体形態Iは、X線粉末回折パターン(XRPD)が約5〜約38度2θから収集されるとき、9.3、16.6、18.5、19.4、21.5、および25.7からなる群から選択される、CuKα放射線を使用して測定した場合の少なくとも3つのおおよそのピーク位置(度2θ±0.2)を含むXRPDを特徴とする。
別の実施形態では、固体形態Iは、図1と実質的に同様の、CuKα放射線を使用して測定した場合のX線粉末回折パターンを特徴とする。
別の実施形態では、固体形態Iは、温度が1分当たり約10℃でスキャンされる示差走査熱量測定によって測定される場合に約318℃の開始温度を有する吸熱ピークをさらに特徴とする。
別の実施形態では、本発明は、式(I)の化合物の結晶形Iを調製するための方法であって、アルコールおよびエーテルを含む溶媒系中に遊離塩基の固体材料を懸濁させるステップと、この固体を単離するステップとを含む、方法を提供する。
別の実施形態では、固体形態Iは、最大75%の相対湿度を伴った40℃で、少なくとも1カ月間安定である。
Figure 0006120775
Figure 0006120775
別の態様では、本願は、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の塩酸付加塩の結晶形IIを提供する。一実施形態では、本願は、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の固体形態IIを調製するためのプロセスを提供する。6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の薬学的に許容される塩酸付加塩は、当業者に公知の任意の方法によって調製され得る。
いくつかの実施形態では、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の塩酸付加塩は、化合物の溶液に酸を添加により形成されると析出し得る。他の実施形態では、酸付加塩は、溶媒中の塩の溶解度を改変することによって、反応混合物から単離され得る。例えば、溶媒の一部もしくはすべてを除去するか、または混合物の温度を下げることにより、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の塩酸塩の溶解度を低減することができ、塩が析出する。あるいは、混合物に第2の溶媒を添加することにより、塩を析出させることができる。
さらなる実施形態では、本化合物のモノ酸付加塩が調製されるまで、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の溶液にガス状塩酸を通してバブリングさせてもよい。ある特定の実施形態では、化学量論量の塩酸と6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物を一緒に混合することによって、本化合物のモノ酸付加塩を形成することができる。例えば、極性溶媒中の6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の溶液を、化学量論量の塩酸の水溶液と混合することができる。6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の塩酸塩の固体形態IIを調製するのに適当となり得る極性溶媒の例には、ジエチルエーテルおよびテトラヒドロフラン(THF)などのエーテルが含まれる。
特定の実施形態では、THF中の化学量論量の6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物と塩酸水溶液を徐々に混合し、この混合物を室温で一晩撹拌した。6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の固体白色塩酸塩が析出した。この固体を単離し、水で洗浄し、真空下で乾燥させた。
6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の固体形態IIは、以下の特性、即ち、1分当たり10℃のスキャン速度を使用する示差走査熱量測定によって求められる場合の、約210℃のピーク温度を有する広い吸熱、約252℃の外挿開始点を有する融解吸熱、およびXRPDパターンがCu X線管源を備えた粉末回折計を使用して測定された、本質的に表2および図4に示されるX線粉末回折パターンによって同定され得る。試料をCu Kα放射線で照射し、XRPDデータを約5〜約40°2θから収集した。当業者であれば、XRPDピークの相対強度が試料の配向に応じて著しく変化し得ることを認識するであろう。
図4は、約5〜約38度2θから収集された6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の塩酸塩の固体形態IIのX線粉末回折パターンである。5%以上の相対強度を有するX線粉末回折パターンに該当するピークを、表2に列挙する。
図5は、約210℃の吸熱および約252℃の吸熱を呈する、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の塩酸塩の固体形態IIのDSCサーモグラムを示す。吸熱のピークおよび開始温度は、実験条件に応じて変化し得ることを、当業者は認識するはずである。図5中のデータは、固体の試料1mgを、約35℃で約10分間平衡化して収集した。データ収集期間の間、1分当たり約10℃の速度で温度を上昇させた。
図6は、100〜220℃の間の約8%の初期重量損失と、その後の約240〜270℃の間の追加の約8%の第2の重量損失と、その後の270〜300℃の間の約3%の第3の重量損失を呈する、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の固体形態IIのTGAサーモグラムである。当業者であれば、重量損失の開始温度が実験条件に応じて変化し得ることを認識するであろう。出願者らは、DSCにおける吸熱およびTGAにおける重量損失の特定の説明に拘束されることを望まないが、DSCにおける大きいピークを伴った転移は、TGAにおける重量損失によって示唆される材料の分解と結びついている融解転移に起因すると思われる。
一実施形態では、本発明は、式(I):
Figure 0006120775
の化合物の塩酸塩を提供する。
別の実施形態では、塩酸塩は、形態IIの固体形態である。
別の実施形態では、形態IIの固体形態の塩酸塩は、X線粉末回折パターン(XRPD)が約5〜約38度2θから収集されるとき、6.7、9.2、16.7、18.6、19.5、20.5、25.6、および27.5からなる群から選択される、CuKα放射線を使用して測定した場合の少なくなくとも3つのおおよそのピーク位置(度2θ±0.2)を含むXRPDを特徴とする。
別の実施形態では、形態IIの固体形態の塩酸塩は、図4と実質的に同様の、CuKα放射線を使用して測定した場合のX線粉末回折パターンを特徴とする。
別の実施形態では、形態IIの固体形態の塩酸塩は、温度が1分当たり約10℃でスキャンされる示差走査熱量測定によって測定される場合に約252℃の開始温度を有する吸熱ピークをさらに特徴とする。
さらに別の実施形態では、本発明は、式(I)の化合物の塩酸塩の固体形態IIを調製するための方法であって、1つまたは複数のエーテル溶媒および水を含む酸性溶媒混合物中で、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の遊離塩基を懸濁させるステップを含む、方法を提供する。
別の実施形態では、形態IIの固体形態の塩酸塩は、最大75%の相対湿度を伴った40℃で、少なくとも1カ月間安定である。
Figure 0006120775
本願の別の態様は、非晶質6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物(遊離塩基)を含む組成物を提供することである。用語「非晶質」は、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物またはその塩に対して本明細書で適用する場合、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素分子が無秩序配置で全般的に存在し、区別可能な結晶格子または単位セルを形成しない固体状態形態を指す。X線粉末回折にかけられる場合、完全に非晶質の化合物は、結晶形の回折パターン特性を生じない。部分的に非晶質の材料のX線粉末回折は、試料の結晶性部分からの回折ピークが弱すぎてノイズに対して観察可能になり得ないために、結晶形に特徴的な特徴を依然として欠いている場合がある。図7は、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物(遊離塩基)の非晶形IIIのX線粉末回折パターンである。
図8は、小さい発熱、その後の3つのより大きい吸熱を呈する、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素(遊離塩基)の非晶形IIIのDSCサーモグラムを示す。小さい発熱の開始温度は、127℃であり、一方、3つの吸熱の開始温度は、183℃、226℃、および279℃である。当業者であれば、発熱のピークおよび開始温度ならびに吸熱のピークおよび開始温度が実験条件に応じて変化し得ることを認識するであろう。図8中のデータは、非晶質6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の試料2.9mgを、約35℃で約10分間平衡化して収集した。データ収集期間の間、1分当たり約10℃の速度で温度を上昇させた。
別の実施形態では、本発明は、式I:
Figure 0006120775
のフルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の非晶形IIIを提供する。
別の実施形態では、フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の非晶形IIIは、識別できる回折ピークをまったく含まない広いハローによって特徴付けられる、CuKα放射線を使用したX線粉末回折パターン(XRPD)を特徴とする。
さらに別の実施形態では、本発明は、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の非晶形IIIを調製するための方法であって、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の溶液を凍結乾燥、噴霧乾燥、ドラム乾燥、またはパルス変換乾燥させるステップを含む、方法を提供する。
別の態様では、本願は、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物のメシル酸塩の非晶質固相形態IVを提供する。一実施形態では、本願は、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物のメシル酸塩の固体形態IVを調製するためのプロセスを提供する。6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の薬学的に許容されるメタンスルホン酸塩は、当業者に公知の任意の方法によって調製され得る。例えば、メタンスルホン酸の溶液を、本化合物のモノ酸付加塩が調製されるまで、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の溶液に添加することができる。一実施形態では、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物のメシル酸塩は、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の溶液に酸を添加すると析出し得る。他の実施形態では、酸付加塩は、溶媒中の塩の溶解度を改変することによって、反応混合物から単離され得る。例えば、溶媒の一部もしくはすべてを除去するか、または混合物の温度を下げることにより、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物のメシル酸塩の溶解度を低減することができ、塩が析出する。したがって、いくつかの実施形態では、非晶質材料は、溶媒から、または例えば、ロータリーエバポレーターを使用して溶媒の一部を蒸発させることによって溶液を濃縮した後の溶液から析出した後収集される。あるいは、混合物に第2の溶媒を添加することにより、塩を析出させることができる。
6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物のメシル酸塩は、当業者の公知の任意の方法を使用して非晶質固体形態に変換され得る。非晶質6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物のメシル酸塩は、結晶形に特徴的な回折パターンが存在しないことを特徴とし得る。部分的に非晶質の6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物のメシル酸塩のX線粉末回折は、試料の結晶性部分からの回折ピークが弱すぎてノイズに対して観察可能になり得ないために、結晶形に特徴的な特徴を依然として欠いている場合がある。図9は、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物のメシル酸塩の非晶形IVのX線粉末回折パターンである。
一実施形態では、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の非晶質メシル酸塩は、適切な溶媒中の塩の溶液を噴霧乾燥させることによって調製され得る。噴霧乾燥は、当技術分野で周知であり、医薬品などの熱に敏感な材料を乾燥させるのに使用されることが多い。噴霧乾燥は、非常に良く再現され得る一貫した粒子分布ももたらす。粉末を乾燥させるのに任意のガスを使用することができるが、空気が一般に使用される。材料が空気に敏感である場合、不活性ガス、例えば、窒素またはアルゴンなどを使用することができる。塩の溶液、スラリー、懸濁液、またはエマルジョンを変換して固体粉末を生成する任意の方法が、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物のメシル酸塩の固体非晶形IVを調製するのに適当となり得る。例えば、フリーズドライ、ドラム乾燥、またはパルス変換乾燥を使用することによって、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の非晶質メシル酸塩を生成することができる。
一実施形態では、極性溶媒中の6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の溶液を、冷却器を備えたナノ噴霧乾燥器を使用して噴霧乾燥することができる。入口温度は、80〜120℃に保持することができる。
別の実施形態では、本発明は、式I:
Figure 0006120775
の6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物のメシル酸塩の非晶形IVを提供する。
別の実施形態では、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物のメシル酸塩の非晶形IVは、識別できる回折ピークをまったく含まない広いハローによって特徴付けられる、CuKα放射線を使用したX線粉末回折パターン(XRPD)を特徴とする。
6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の遊離塩基ならびにメシル酸塩のそれぞれの固体形態IおよびIIならびに非晶質固体形態IIIおよびIVは、本明細書に記載されるXRPD、DSC、TGA、ならびに他の特性に加えて、それだけに限らないが、水または1つもしくは複数の溶媒分子の存在などの記載されていない他の特性も有する場合があることが理解されるべきである。
X線粉末回折(XRPD):結晶形のXRPDパターンは、シールド管源およびHi−Starエリア検出器(Bruker AXS、Madison、WI)を備えたBruker D8 Discoverシステムを使用して、反射モードで、室温で記録した。X線発生器は、40kVの電圧および35mAの電流で稼働させていた。粉末試料を、Siゼロバックグラウンドウエハー上に置いた。2つのフレームを、それぞれ120秒の露光時間で合わせた。データをその後、3°〜41°2θの範囲にわたって、0.02°のステップサイズで積分し、合体させて1つの連続パターンにした。
非晶形のX線粉末回折(XRPD):非晶質固体形態のXRPDパターンは、Vantec−1位置敏感型検出器(Bruker AXS、Madison、WI)を備えたBruker D8 Advanceシステムを使用して、反射モードで、室温で記録した。X線発生器は、40kVの電圧および45mAの電流で稼働させていた。粉末試料を、Siゼロバックグラウンドホルダー上に置き、検出器の可変スリットを使用して連続モードで実験する間、15rpmで回転させた。0.0144653度の増分(0.25秒/ステップ)で、3〜40度でデータを収集した。
示差走査熱量測定(DSC):DSCは、DSC Q2000示差走査熱量計(TA Instruments、New Castle、DE)を使用して、材料の試料に対して実施した。計測器をインジウムで較正した。約1〜2mgの試料を計量してアルミニウムパンに入れ、これを、ピン−ホール無しまたはピン−ホール付きの蓋を使用してクリンプした(crimped)。50mL/分の窒素を流しながら、10℃/分の加熱速度で、30℃からプロット中に示した温度まで、DSC試料をスキャンした。変調DSC(MDSC)下で実行した試料は、2または3℃/分のランプ速度で60秒毎に+1℃および−1℃変調された。
データをThermal Advantage Q Series(商標)ソフトウェアによって収集し、Universal Analysis 2000ソフトウェア(TA Instruments、New Castle、DE)によって分析した。
熱重量分析(TGA):Model Q5000 Thermogravimetric Analyzer(TA Instruments、New Castle、DE)を、TGA測定に使用した。10℃/分の加熱速度で、30℃からプロット上に示した温度まで、約3〜5mgの重量を有する試料をスキャンした。データをThermal Advantage Q Series(商標)ソフトウェアによって収集し、Universal Analysis 2000ソフトウェア(TA Instruments、New Castle、DE)によって分析した。
本発明は、式(I)の化合物、または薬学的に許容されるその塩、および薬学的に許容される担体、アジュバント、またはビヒクルを含む医薬組成物も提供する。
本発明は、患者における院内細菌感染症または非院内細菌感染症を制御、処置、またはその進行、重症度、もしくは影響を低減する方法であって、式(I)の化合物、または薬学的に許容されるその塩を含む医薬組成物を前記患者に投与するステップを含む、方法も提供する。
別の実施形態では、本発明は、患者における院内細菌感染症または非院内細菌感染症を制御、処置、またはその進行、重症度、もしくは影響を低減する方法であって、式(I)の化合物、または薬学的に許容されるその塩を含む医薬組成物を前記患者に投与するステップを含み、細菌感染症は、Streptococcus pneumoniae、Staphylococcus epidermidis、Enterococcus faecalis、Staphylococcus aureus、Clostridium difficile、Moraxella catarrhalis、Neisseria gonorrhoeae、Neisseria meningitidis、Mycobacterium avium complex、Mycobacterium abscessus、Mycobacterium kansasii、Mycobacterium ulcerans、Chlamydophila pneumoniae、Chlamydia trachomatis、Haemophilus influenzae、Streptococcus pyogenes、またはβ−溶血性streptococciのうちの1つまたは複数の存在を特徴とする、方法を提供する。
別の実施形態では、本発明は、患者における院内細菌感染症または非院内細菌感染症を制御、処置、またはその進行、重症度、もしくは影響を低減する方法であって、式(I)の化合物、または薬学的に許容されるその塩を含む医薬組成物を前記患者に投与するステップを含み、細菌感染症は、以下、即ち、上気道感染症、下気道感染症、耳感染症、胸膜肺感染症および気管支感染症、複雑性尿路感染症、単純性尿路感染症、腹腔内感染症、心血管感染症、血流感染症、敗血症、菌血症、CNS感染症、皮膚感染症および軟部組織感染症、GI感染症、骨関節症および関節感染症、生殖器感染症、眼感染症、または肉芽腫性感染症、単純性皮膚および皮膚構造感染症(uSSSI)、複雑性皮膚および皮膚構造感染症(cSSSI)、カテーテル感染症、咽頭炎、副鼻腔炎、外耳炎、中耳炎、気管支炎、膿胸、肺炎、市中細菌性肺炎(CABP)、院内肺炎(HAP)、院内細菌性肺炎、人工呼吸器関連肺炎(VAP)、糖尿病性足感染症、バンコマイシン耐性enterococci感染症、膀胱炎および腎盂腎炎、腎結石、前立腺炎、腹膜炎、複雑性腹腔内感染症(cIAI)、ならびに他の腹腔内感染症、透析関連腹膜炎、内臓膿瘍、心内膜炎、心筋炎、心膜炎、輸血関連敗血症、髄膜炎、脳炎、脳膿瘍、骨髄炎、関節炎、生殖器潰瘍、尿道炎、膣炎、子宮頸管炎、歯肉炎、結膜炎、角膜炎、眼内炎、嚢胞性線維症患者の感染症、または発熱性好中球減少症患者の感染症のうちの1つまたは複数から選択される、方法を提供する。
別の実施形態では、細菌感染症は、以下、即ち、市中細菌性肺炎(CABP)、院内肺炎(HAP)、院内細菌性肺炎、人工呼吸器関連肺炎(VAP)、菌血症、糖尿病性足感染症、カテーテル感染症、単純性皮膚および皮膚構造感染症(uSSSI)、複雑性皮膚および皮膚構造感染症(cSSSI)、バンコマイシン耐性enterococci感染症、または骨髄炎のうちの1つまたは複数から選択される。
別の実施形態によれば、本発明は、生物学的試料中の細菌量を減少させるか、または抑制する方法を提供する。この方法は、前記生物学的試料を式(I)の化合物または薬学的に許容されるその塩と接触させるステップを含む。
用語「生物学的試料」には、本明細書において、細胞培養液またはその抽出物、哺乳動物から得られる生検物質またはその抽出物、および血液、唾液、尿、糞便、精液、涙、もしくは他の体液、またはこれらの抽出物が含まれる。用語「生物学的試料」には生体も含まれ、この場合、「本発明の化合物を生物学的試料と接触させること」は、用語「前記化合物または前記化合物を含む組成物を哺乳動物に投与すること」と同義である。
本発明のジャイレースおよび/もしくはトポイソメラーゼIV阻害剤、またはこれらの医薬用塩を製剤化して、動物またはヒトに投与するための医薬組成物にすることができる。細菌量を計れる程度に減少させるのに十分な量のジャイレースおよび/またはトポイソメラーゼIV阻害剤ならびに薬学的に許容される担体を含む、細菌感染症を処置または予防するのに有効なこれらの医薬組成物は、本発明の別の実施形態である。用語「細菌量を計れる程度に減少させる」は、本明細書において、前記阻害剤を含有する試料と、細菌のみを含有する試料との間の細菌数の測定可能な変化を意味する。
別の実施形態によれば、本発明の方法は、霊長類、げっ歯類、爬虫類、およびトリを含めた、動物園動物、実験室動物、人のコンパニオンアニマル、および家畜を含むが、これらに限定されない獣医分野における患者を処置するのに有用である。前記動物の例として、それだけに限らないが、モルモット、ハムスター、アレチネズミ、ラット、マウス、ウサギ、イヌ、ネコ、ウマ、ブタ、ヒツジ、ウシ、ヤギ、シカ、アカゲザル、サル、タマリン(tamarinds)、類人猿、ヒヒ、ゴリラ、チンパンジー、オランウータン、テナガザル、ダチョウ、ニワトリ、シチメンチョウ、アヒル、およびガチョウが挙げられる。
用語「非院内感染」は、地域感染型感染症とも呼ばれる。
別の実施形態では、細菌感染症は、Streptococcus pneumoniae、Enterococcus faecalis、またはStaphylococcus aureusのうちの1つまたは複数の存在を特徴とする。
別の実施形態では、細菌感染は、E.coli、Moraxella catarrhalis、またはHaemophilus influenzaeのうちの1つまたは複数の存在を特徴とする。
別の実施形態では、細菌感染症は、Clostridium difficile、Neisseria gonorrhoeae、Neisseria meningitidis、Mycobacterium avium complex、Mycobacterium abscessus、Mycobacterium kansasii、Mycobacterium ulcerans、Chlamydophila pneumoniae、およびChlamydia tracomatisのうちの1つまたは複数の存在を特徴とする。
別の実施形態では、細菌感染症は、Streptococcus pneumoniae、Staphylococcus epidermidis、Enterococcus faecalis、Staphylococcus aureus、Clostridium difficile、Moraxella catarrhalis、Neisseria gonorrhoeae、Neisseria meningitidis、Mycobacterium avium complex、Mycobacterium abscessus、Mycobacterium kansasii、Mycobacterium ulcerans、Chlamydophila pneumoniae、Chlamydia trachomatis、Haemophilus influenzae、Streptococcus pyogenes、またはβ−溶血性streptococciのうちの1つまたは複数の存在を特徴とする。
いくつかの実施形態では、細菌感染症は、メチシリン耐性Staphylococcus aureus、フルオロキノロン耐性Staphylococcus aureus、バンコマイシン中間体耐性Staphylococcus aureus、リネゾリド耐性Staphylococcus aureus、ペニシリン耐性Streptococcus pneumoniae、マクロライド耐性Streptococcus pneumoniae、フルオロキノロン耐性Streptococcus pneumoniae、バンコマイシン耐性Enterococcus faecalis、リネゾリド耐性Enterococcus faecalis、フルオロキノロン耐性Enterococcus faecalis、バンコマイシン耐性Enterococcus faecium、リネゾリド耐性Enterococcus faecium、フルオロキノロン耐性Enterococcus faecium、アンピシリン耐性Enterococcus faecium、マクロライド耐性Haemophilus influenzae、β−ラクタム耐性Haemophilus influenzae、フルオロキノロン耐性Haemophilus influenzae、β−ラクタム耐性Moraxella catarrhalis、メチシリン耐性Staphylococcus epidermidis、メチシリン耐性Staphylococcus epidermidis、バンコマイシン耐性Staphylococcus epidermidis、フルオロキノロン耐性Staphylococcus epidermidis、マクロライド耐性Mycoplasma pneumoniae、イソニアジド耐性Mycobacterium tuberculosis、リファンピン耐性Mycobacterium tuberculosis、メチシリン耐性コアグラーゼ陰性staphylococcus、フルオロキノロン耐性コアグラーゼ陰性staphylococcus、糖ペプチド中間体耐性Staphylococcus aureus、バンコマイシン耐性Staphylococcus aureus、ヘテロバンコマイシン中間体耐性Staphylococcus aureus、ヘテロバンコマイシン耐性Staphylococcus aureus、マクロライド−リンコサミド−ストレプトグラミン耐性Staphylococcus、β−ラクタム耐性Enterococcus faecalis、β−ラクタム耐性Enterococcus faecium、ケトライド耐性Streptococcus pneumoniae、ケトライド耐性Streptococcus pyogenes、マクロライド耐性Streptococcus pyogenes、バンコマイシン耐性staphylococcus epidermidis、フルオロキノロン耐性Neisseria gonorrhoeae、多剤耐性Pseudomonas aeruginosa、またはセファロスポリン耐性Neisseria gonorrhoeaeのうちの1つまたは複数の存在を特徴とする。
別の実施形態によれば、メチシリン耐性Staphylococciは、メチシリン耐性Staphylococcus aureus、メチシリン耐性Staphylococcus epidermidis、またはメチシリン耐性コアグラーゼ陰性staphylococcusから選択される。
いくつかの実施形態では、式(I)の化合物の一形態または薬学的に許容されるその塩が、地域感染型MRSA(即ち、cMRSA)を処置するのに使用される。
他の実施形態では、式(I)の化合物の一形態または薬学的に許容されるその塩が、それだけに限らないが、ダプトマイシン耐性Enterococcus faecium、およびダプトマイシン耐性Staphylococcus aureusを含めたダプトマイシン耐性生物を処置するのに使用される。
別の実施形態によれば、フルオロキノロン耐性Staphylococciは、フルオロキノロン耐性Staphylococcus aureus、フルオロキノロン耐性Staphylococcus epidermidis、またはフルオロキノロン耐性コアグラーゼ陰性staphylococcusから選択される。
別の実施形態によれば、糖ペプチド耐性Staphylococciは、糖ペプチド中間体耐性Staphylococcus aureus、バンコマイシン耐性Staphylococcus aureus、バンコマイシン中間体耐性Staphylococcus aureus、ヘテロバンコマイシン中間体耐性Staphylococcus aureus、またはヘテロバンコマイシン耐性Staphylococcus aureusから選択される。
別の実施形態によれば、マクロライド−リンコサミド−ストレプトグラミン耐性Staphylococciは、マクロライド−リンコサミド−ストレプトグラミン耐性Staphylococcus aureusである。
別の実施形態によれば、リネゾリド耐性Enterococciは、リネゾリド耐性Enterococcus faecalis、またはリネゾリド耐性Enterococcus faeciumから選択される。
別の実施形態によれば、糖ペプチド耐性Enterococciは、バンコマイシン耐性Enterococcus faecium、またはバンコマイシン耐性Enterococcus faecalisから選択される。
別の実施形態によれば、β−ラクタム耐性Enterococcus faecalisは、β−ラクタム耐性Enterococcus faeciumである。
別の実施形態によれば、ペニシリン耐性Streptococciは、ペニシリン耐性Streptococcus pneumoniaeである。
別の実施形態によれば、マクロライド耐性Streptococciは、マクロライド耐性Streptococcus pneumoniaである。
別の実施形態によれば、ケトライド耐性Streptococciは、マクロライド耐性Streptococcus pneumoniae、およびケトライド耐性Streptococcus pyogenesから選択される。
別の実施形態によれば、フルオロキノロン耐性Streptococciは、フルオロキノロン耐性Streptococcus pneumoniaeである。
別の実施形態によれば、β−ラクタム耐性Haemophilusは、β−ラクタム耐性Haemophilus influenzaeである。
別の実施形態によれば、フルオロキノロン耐性Haemophilusは、フルオロキノロン耐性Haemophilus influenzaeである。
別の実施形態によれば、マクロライド耐性Haemophilusは、マクロライド耐性Haemophilus influenzaeである。
別の実施形態によれば、マクロライド耐性Mycoplasmaは、マクロライド耐性Mycoplasma pneumoniaeである。
別の実施形態によれば、イソニアジド耐性Mycobacteriumは、イソニアジド耐性Mycobacterium tuberculosisである。
別の実施形態によれば、リファンピン耐性Mycobacteriumは、リファンピン耐性Mycobacterium tuberculosisである。
別の実施形態によれば、β−ラクタム耐性Moraxellaは、β−ラクタム耐性Moraxella catarrhalisである。
別の実施形態によれば、細菌感染症は、以下のうちの1つまたは複数の存在を特徴とする:メチシリン耐性Staphylococcus aureus、フルオロキノロン耐性Staphylococcus aureus、バンコマイシン中間体耐性Staphylococcus aureus、リネゾリド耐性Staphylococcus aureus、ペニシリン耐性Streptococcus pneumoniae、マクロライド耐性Streptococcus pneumoniae、フルオロキノロン耐性Streptococcus pneumoniae、バンコマイシン耐性Enterococcus faecalis、リネゾリド耐性Enterococcus faecalis、フルオロキノロン耐性Enterococcus faecalis、バンコマイシン耐性Enterococcus faecium、リネゾリド耐性Enterococcus faecium、フルオロキノロン耐性Enterococcus faecium、アンピシリン耐性Enterococcus faecium、マクロライド耐性Haemophilus influenzae、β−ラクタム耐性Haemophilus influenzae、フルオロキノロン耐性Haemophilus influenzae、β−ラクタム耐性Moraxella catarrhalis、メチシリン耐性Staphylococcus epidermidis、メチシリン耐性Staphylococcus epidermidis、バンコマイシン耐性Staphylococcus epidermidis、フルオロキノロン耐性Staphylococcus epidermidis、マクロライド耐性Mycoplasma pneumoniae、イソニアジド耐性Mycobacterium tuberculosis、リファンピン耐性Mycobacterium tuberculosis、フルオロキノロン耐性Neisseria gonorrhoeae、またはセファロスポリン耐性Neisseria gonorrhoeae。
別の実施形態によれば、細菌感染症は、以下のうちの1つまたは複数の存在を特徴とする:メチシリン耐性Staphylococcus aureus、メチシリン耐性Staphylococcus epidermidis、メチシリン耐性コアグラーゼ陰性staphylococcus、フルオロキノロン耐性Staphylococcus aureus、フルオロキノロン耐性Staphylococcus epidermidis、フルオロキノロン耐性コアグラーゼ陰性staphylococcus、バンコマイシン耐性Staphylococcus aureus、糖ペプチド中間体耐性Staphylococcus aureus、バンコマイシン耐性Staphylococcus aureus、バンコマイシン中間体耐性Staphylococcus aureus、ヘテロバンコマイシン中間体耐性Staphylococcus aureus、ヘテロバンコマイシン耐性Staphylococcus aureus、バンコマイシン耐性Enterococcus faecium、バンコマイシン耐性Enterococcus faecalis、ペニシリン耐性Streptococcus pneumoniae、マクロライド耐性Streptococcus pneumoniae、フルオロキノロン耐性Streptococcus pneumoniae、マクロライド耐性Streptococcus pyogenes、またはβ−ラクタム耐性Haemophilus influenzae。
別の実施形態によれば、細菌感染症は、以下のうちの1つまたは複数の存在を特徴とする:メチシリン耐性Staphylococcus aureus、バンコマイシン耐性Enterococcus faecium、バンコマイシン耐性Enterococcus faecalis、バンコマイシン耐性Staphylococcus aureus、バンコマイシン中間体耐性Staphylococcus aureus、ヘテロバンコマイシン中間体耐性Staphylococcus aureus、ヘテロバンコマイシン耐性Staphylococcus aureus、多剤耐性Pseudomonas aeruginosa、イソニアジド耐性Mycobacterium tuberculosis、およびリファンピン耐性Mycobacterium tuberculosis。
本発明の化合物の薬学的に許容される塩には、薬学的に許容される無機酸、有機酸、無機塩基、および有機塩基に由来するものが含まれる。適切な酸塩の例として、酢酸塩、アジピン酸塩、アルギン酸塩、アスパラギン酸塩、安息香酸塩、ベンゼンスルホン酸塩、硫酸水素塩、酪酸塩、クエン酸塩、樟脳酸塩、樟脳スルホン酸塩、シクロペンタンプロピオン酸塩、ジグルコン酸塩、ドデシル硫酸塩、エタンスルホン酸塩、ギ酸塩、フマル酸塩、グルコヘプタン酸塩、グリセロリン酸塩、グリコール酸塩、ヘミ硫酸塩、ヘプタン酸塩、ヘキサン酸塩、塩酸塩、臭化水素酸塩、ヨウ化水素酸塩、2−ヒドロキシエタンスルホン酸塩、乳酸塩、マレイン酸塩、マロン酸塩、メタンスルホン酸塩、2−ナフタレンスルホン酸塩、ニコチン酸塩、硝酸塩、パルモ酸塩、ペクチン酸塩、過硫酸塩、3−フェニルプロピオン酸塩、リン酸塩、ピクリン酸塩、ピバル酸塩、プロピオン酸塩、サリチル酸塩、コハク酸塩、硫酸塩、酒石酸塩、チオシアン酸塩、トシル酸塩、およびウンデカン酸塩が挙げられる。シュウ酸などの他の酸は、それ自体では薬学的に許容されないが、本発明の化合物およびこれらの薬学的に許容される酸付加塩を得るとき、中間体として有用な塩を調製するのに使用され得る。
適切な塩基に由来する塩には、アルカリ金属(例えば、ナトリウムおよびカリウム)、アルカリ土類金属(例えば、マグネシウム)、アンモニウム、およびN(C1〜4アルキル)の塩が含まれる。本発明は、本明細書に開示される化合物の任意の塩基性窒素含有基の四級化も想定している。水溶性もしくは油溶性、または水分散性もしくは油分散性の生成物を、このような四級化によって得ることができる。
本発明の医薬組成物は、式(I)の化合物または薬学的に許容されるその塩、および薬学的に許容される担体を含む。このような組成物は、追加の治療剤を場合により含むことができる。このような作用物質として、それだけに限らないが、抗生物質、抗炎症剤、マトリックスメタロプロテアーゼ阻害剤、リポキシゲナーゼ阻害剤、サイトカインアンタゴニスト、免疫抑制剤、抗がん剤、抗ウイルス剤、サイトカイン、成長因子、増殖因子、免疫調節剤、プロスタグランジン、または抗血管過剰増殖化合物が挙げられる。
用語「薬学的に許容される担体」は、本発明の化合物と一緒に患者に投与することができ、本発明の化合物の薬理学的活性を消失させない無毒性担体を指す。
本発明の医薬組成物に使用することができる薬学的に許容される担体として、それだけに限らないが、イオン交換体、アルミナ、ステアリン酸アルミニウム、レシチン、ヒト血清アルブミンなどの血清タンパク質、リン酸塩などのバッファー物質、グリシン、ソルビン酸、ソルビン酸カリウム、飽和植物脂肪酸の部分グリセリド混合物、水、塩、もしくは硫酸プロタミンなどの電解質、リン酸水素二ナトリウム、リン酸水素カリウム、塩化ナトリウム、亜鉛塩、コロイド状シリカ、三ケイ酸マグネシウム、ポリビニルピロリドン、セルロース系物質、ポリエチレングリコール、ナトリウムカルボキシメチルセルロース、ポリアクリレート、ワックス、ポリエチレン−ポリオキシプロピレン−ブロックポリマー、羊毛脂、およびα−トコフェロールなどの自己乳化薬物送達系(SEDDS)、ポリエチレングリコール1000スクシネート、または他の同様のポリマー送達マトリックスが挙げられる。
用語「薬学的有効量」は、患者における細菌感染症を処置するか、または寛解させるのに有効な量を指す。用語「予防有効量」は、患者における細菌感染症を予防するか、または実質的に和らげるのに有効な量を指す。
処置または予防される特定の状態または疾患状態に応じて、その状態を処置または予防するのに通常投与される追加の治療剤を、本発明の阻害剤と一緒に投与することができる。このような治療剤として、それだけに限らないが、抗生物質、抗炎症剤、マトリックスメタロプロテアーゼ阻害剤、リポキシゲナーゼ阻害剤、サイトカインアンタゴニスト、免疫抑制剤、抗がん剤、抗ウイルス剤、サイトカイン、成長因子、増殖因子、免疫調節剤、プロスタグランジン、または抗血管過剰増殖化合物が挙げられる。
本発明の化合物は、細菌感染症レベルをin vivoで制御するため、および疾患を処置するか、または細菌によって媒介される影響の進行もしくは重症度を低減するための従来の様式で使用され得る。処置のこのような方法、これらの投与量レベル、および必要条件は、利用可能な方法および技法から当業者によって選択され得る。
例えば、本発明の化合物は、細菌感染症または疾患を罹患している患者に、薬学的に許容される様式で、かつその感染症または疾患の重症度を和らげるのに有効な量で投与するために、薬学的に許容されるアジュバントと一緒に組み合わせられ得る。
あるいは、本発明の化合物を、長期間にわたって、細菌感染症または疾患に対して個体を処置または保護するための組成物および方法において使用することができる。一実施形態では、本発明の化合物を、1〜2週間の期間にわたって、細菌感染症または疾患に対して個体を処置または保護するための組成物および方法において使用することができる。別の実施形態では、本発明の化合物を、4〜8週間の期間にわたって、細菌感染症または疾患に対して個体を処置または保護するための組成物および方法において使用することができる(例えば、心内膜炎または骨髄炎を有するか、またはこれらを発症するリスクのある患者の処置において)。別の実施形態では、本発明の化合物を、8〜12週間の期間にわたって、細菌感染症または疾患に対して個体を処置または保護するための組成物および方法において使用することができる。この化合物は、医薬組成物中の酵素阻害剤の従来の利用と一致する様式で、単独で、または本発明の他の化合物と一緒に、このような組成物に使用され得る。例えば、本発明の化合物は、細菌感染症または疾患に対して長期間にわたって個体を保護するために、ワクチンに慣例的に使用される薬学的に許容されるアジュバントと組み合わされ、予防有効量で投与され得る。
いくつかの実施形態では、式(I)の化合物または薬学的に許容されるその塩は、細菌感染症を予防するために予防的に使用され得る。いくつかの実施形態では、式(I)の化合物または薬学的に許容されるその塩を、歯科的処置または外科的処置の前、最中、または後に使用することによって、細菌性心内膜炎において遭遇されるものなどの日和見感染症を予防することができる。他の実施形態では、式(I)の化合物または薬学的に許容されるその塩は、それだけに限らないが、抜歯、歯周処置、歯科インプラント配置、および歯内手術を含めた歯科処置において予防的に使用され得る。他の実施形態では、式(I)の化合物または薬学的に許容されるその塩は、それだけに限らないが、一般的な手術、呼吸器手術(扁桃摘出術/アデノイド切除)、消化管手術(上部GIおよび待期的小腸手術、食道硬化療法および拡張、大腸切除、緊急虫垂切除)、外傷手術(穿通性腹部手術)、尿生殖路手術(前立腺切除術、尿道拡張、膀胱鏡検査、膣式子宮摘出術または腹式子宮摘出術、帝王切開)、移植手術(腎臓、肝臓、膵臓、または腎臓移植)、頭頸部手術(皮膚切除、頸部廓清術、喉頭切除、頭頸部がん手術、下顎骨折)、整形外科手術(関節全置換術、外傷性開放骨折)、血管手術(末梢血管処置)、心胸郭手術、冠状動脈バイパス手術、肺切除、ならびに脳手術を含めた外科手術において予防的に使用され得る。
用語「細菌感染症を予防する」は、本明細書において、別段の指定のない限り、細菌感染症を予防するための、本発明のジャイレースおよび/またはトポイソメラーゼIV阻害剤などの抗生物質の予防的使用を意味する。ジャイレースおよび/またはトポイソメラーゼIV阻害剤を用いた処置は、ジャイレースおよび/またはトポイソメラーゼIV阻害剤に感受性である生物によって引き起こされる感染症を予防するのに予防的に行われ得る。予防的処置が考慮され得る状態の1つの一般的なセットは、個体が、例えば、弱くなった免疫、手術、外傷、体内の人工デバイスの存在(一時的もしくは永続的)、解剖学的欠損、高レベルの細菌への曝露、または疾患を引き起こす病原体への予想される曝露に起因して、感染症に対してより脆弱であるときである。免疫を弱まらせ得る要因の例には、化学療法、放射線療法、糖尿病、年齢の進行、HIV感染症、および移植が含まれる。解剖学的欠損の例は、心臓弁の欠損であり、これは、細菌性心内膜炎のリスクを増大させる。人工デバイスの例には、人工関節、手術用ピン、カテーテルなどが含まれる。ジャイレースおよび/またはトポイソメラーゼIV阻害剤の予防的使用が適切となり得る状況の別のセットは、個体同士間の病原体の蔓延(直接的または間接的)を予防することである。病原体の蔓延を予防するための予防的使用の具体例は、健康管理機関(例えば、病院または養護ホーム)の者によるジャイレースおよび/またはトポイソメラーゼIV阻害剤の使用である。
式(I)の化合物または薬学的に許容されるその塩は、様々な細菌感染症に対する療法または予防の効果を増大させるために、他の抗生物質と共投与されてもよい。本発明の化合物が他の作用物質と併用療法で投与される場合、これらは、患者に順次または同時に投与され得る。あるいは、本発明による医薬組成物または予防用組成物は、式(I)の化合物または薬学的に許容されるその塩と別の治療剤または予防剤との組合せを含む。
いくつかの実施形態では、追加の1つまたは複数の治療剤は、天然ペニシリン、ペニシリナーゼ耐性ペニシリン、抗緑膿菌性ペニシリン、アミノペニシリン、第一世代セファロスポリン、第二世代セファロスポリン、第三世代セファロスポリン、第四世代セファロスポリン、カルバペネム、セファマイシン、キノロン、フルオロキノロン、アミノグリコシド、マクロライド、ケトライド、ポリミキシン、テトラサイクリン、糖ペプチド、ストレプトグラミン、オキサゾリジノン、リファマイシン、またはスルホンアミドから選択される抗生物質である。
いくつかの実施形態では、追加の1つまたは複数の治療剤は、ペニシリン、セファロスポリン、キノロン、アミノグリコシド、またはオキサゾリジノンから選択される抗生物質である。
他の実施形態では、追加の治療剤は、ベンザチンペニシリンG、ペニシリンG、およびペニシリンVを含めた天然ペニシリンから、クロキサシリン、ジクロキサシリン、ナフシリン、およびオキサシリンを含めたペニシリナーゼ耐性ペニシリンから、カルベニシリン、メズロシリン、ピペルシリン、ピペルシリン/タゾバクタム、チカルシリン(Ticaricillin)、およびチカルシリン/クラブラネートを含めた抗緑膿菌性ペニシリンから、アモキシシリン、アンピシリン、およびアンピシリン/スルバクタムを含めたアミノペニシリンから、セファゾリン、セファドロキシル、セファレキシン、およびセファドリン(Cephadrine)を含めた第一世代セファロスポリンから、セファクロル、セファクロル−CD、セファマンドール、セフォニシド(Cefonacid)、セフプロジル、ロラカルベフ、およびセフロキシムを含めた第二世代セファロスポリンから、セフジニル、セフィキシム、セフォペラゾン、セフォタキシム、セフポドキシム、セフタジジム、セフチブテン、セフチゾキシム(Ceftizoxme)、およびセフトリアキソンを含めた第三世代セファロスポリンから、セフェピム、セフタロリン、およびセフトビプロールを含めた第四世代セファロスポリンから、セフォテタンおよびセフォキシチンを含めたセファマイシンから、ドリペネム、イミペネム、およびメロペネムを含めたカルバペネムから、アズトレオナムを含めたモノバクタムから、シノキサシン、ナリジクス酸、オキソリニック酸、およびピペミド酸を含めたキノロンから、ベシフロキサシン、シプロフロキサシン、エノキサシン、ガチフロキサシン、グレパフロキサシン、レボフロキサシン、ロメフロキサシン、モキシフロキサシン、ノルフロキサシン、オフロキサシン、およびスパルフロキサシンを含めたフルオロキノロンから、アミカシン、ゲンタマイシン、カナマイシン、ネオマイシン、ネチルマイシン、スペクチノマイシン、ストレプトマイシン、およびトブラマイシンを含めたアミノグリコシドから、アジスロマイシン、クラリスロマイシン、およびエリスロマイシンを含めたマクロライドから、テリスロマイシンを含めたケトライドから、クロルテトラサイクリン、デメクロサイクリン、ドキシサイクリン、ミノサイクリン、およびテトラサイクリンを含めたテトラサイクリンから、オリタバンシン、ダルババンシン、テラバンシン、テイコプラニン、およびバンコマイシンを含めた糖ペプチドから、ダルホプリスチン/キヌプリスチンを含めたストレプトグラミンから、リネゾリドを含めたオキサゾリドンから、リファブチンおよびリファンピンを含めたリファマイシンから、ならびにバクチトラシン(bactitracin)、コリスチン、チガシル、ダプトマイシン、クロラムフェニコール、クリンダマイシン、イソニアジド、メトロニダゾール、ムピロシン、ポリミキシンB、ピラジナミド、トリメトプリム/スルファメトキサゾール、およびスルフイソキサゾールを含めた他の抗生物質から選択される。
他の実施形態では、追加の治療剤は、ペニシリンGを含めた天然ペニシリンから、ナフシリンおよびオキサシリンを含めたペニシリナーゼ耐性ペニシリンから、ピペルシリン/タゾバクタムを含めた抗緑膿菌性ペニシリンから、アモキシシリンを含めたアミノペニシリンから、セファレキシンを含めた第一世代セファロスポリンから、セファクロル、セファクロル−CDおよびセフロキシムを含めた第二世代セファロスポリンから、セフタジジムおよびセフトリアキソンを含めた第三世代セファロスポリンから、セフェピムを含めた第四世代セファロスポリンから、イミペネム(Imepenem)、メロペネム、エルタペネム、ドリペネム、パニペネム、およびビアペネムを含めたカルバペネムから、シプロフロキサシン、ガチフロキサシン、レボフロキサシン、およびモキシフロキサシンを含めたフルオロキノロンから、トブラマイシンを含めたアミノグリコシドから、アジスロマイシンおよびクラリスロマイシンを含めたマクロライドから、ドキシサイクリンを含めたテトラサイクリンから、バンコマイシンを含めた糖ペプチドから、リファンピンを含めたリファマイシンから、ならびにイソニアジド、ピラジナミド、チガシル、ダプトマイシン、またはトリメトプリム/スルファメトキサゾールを含めた他の抗生物質から選択される。
いくつかの実施形態では、固体形態の式(I)の化合物または薬学的に許容されるその塩は、グラム陽性感染症を処置するために投与され得る。いくつかの実施形態では、組成物は、固体、液体(例えば、懸濁液)、またはiv(例えば、一形態の式(I)の化合物または薬学的に許容されるその塩を液体中に溶解させ、それがiv投与される)組成物である。いくつかの実施形態では、式(I)の化合物または薬学的に許容されるその塩を含む組成物は、追加の抗生物質剤、例えば、天然ペニシリン、ペニシリナーゼ耐性ペニシリン、抗緑膿菌性ペニシリン、アミノペニシリン、第一世代セファロスポリン、第二世代セファロスポリン、第三世代セファロスポリン、第四世代セファロスポリン、カルバペネム、セファマイシン、キノロン、フルオロキノロン、アミノグリコシド、マクロライド、ケトライド、ポリミキシン、テトラサイクリン、糖ペプチド、ストレプトグラミン、オキサゾリジノン、リファマイシン、またはスルホンアミドと併用して投与される。いくつかの実施形態では、固体形態の式(I)の化合物または薬学的に許容されるその塩を含む組成物は、経口投与され、追加の抗生物質剤、例えば、天然ペニシリン、ペニシリナーゼ耐性ペニシリン、抗緑膿菌性ペニシリン、アミノペニシリン、第一世代セファロスポリン、第二世代セファロスポリン、第三世代セファロスポリン、第四世代セファロスポリン、カルバペネム、セファマイシン、キノロン、フルオロキノロン、アミノグリコシド、マクロライド、ケトライド、ポリミキシン、テトラサイクリン、糖ペプチド、ストレプトグラミン、オキサゾリジノン、リファマイシン、またはスルホンアミドは、iv投与される。
いくつかの実施形態では、固体形態の式(I)の化合物または薬学的に許容されるその塩は、グラム陰性感染症を処置するために投与され得る。いくつかの実施形態では、組成物は、固体、液体(例えば、懸濁液)、またはiv(例えば、一形態の式(I)の化合物または薬学的に許容されるその塩を液体中に溶解させ、それがiv投与される)組成物である。いくつかの実施形態では、式(I)の化合物または薬学的に許容されるその塩を含む組成物は、天然ペニシリン、ペニシリナーゼ耐性ペニシリン、抗緑膿菌性ペニシリン、アミノペニシリン、第一世代セファロスポリン、第二世代セファロスポリン、第三世代セファロスポリン、第四世代セファロスポリン、カルバペネム、セファマイシン、モノバクタム、キノロン、フルオロキノロン、アミノグリコシド、マクロライド、ケトライド、ポリミキシン、テトラサイクリン、またはスルホンアミドから選択される追加の抗生物質剤と併用して投与される。いくつかの実施形態では、固体形態の式(I)の化合物または薬学的に許容されるその塩を含む組成物は、経口投与され、追加の抗生物質剤、例えば、天然ペニシリン、ペニシリナーゼ耐性ペニシリン、抗緑膿菌性ペニシリン、アミノペニシリン、第一世代セファロスポリン、第二世代セファロスポリン、第三世代セファロスポリン、第四世代セファロスポリン、カルバペネム、セファマイシン、モノバクタム、キノロン、フルオロキノロン、アミノグリコシド、マクロライド、ケトライド、ポリミキシン、テトラサイクリン、またはスルホンアミドは、経口投与される。いくつかの実施形態では、追加の治療剤はiv投与される。
上述した追加の治療剤は、複数回投薬レジメンの一部として、阻害剤含有組成物と別個に投与され得る。あるいは、これらの作用物質は、単一組成物中の阻害剤と一緒に混合された単一剤形の一部とすることができる。
本発明の医薬組成物は、経口的に、非経口的に、吸入スプレーによって、局所的に、経直腸的に、経鼻的に、頬側に、経膣的に、または移植されたリザーバを介して投与され得る。本発明の医薬組成物は、任意の従来の無毒性の薬学的に許容される担体、アジュバント、またはビヒクルを含有し得る。いくつかの場合では、製剤のpHを、薬学的に許容される酸、塩基、またはバッファーを用いて調整することによって、製剤化された化合物、またはその送達形態の安定性を増強することができる。用語の非経口は、本明細書において、皮下、皮内、静脈内、筋肉内、関節内、滑液包内、胸骨内、クモ膜下、病巣内、および頭蓋内の注射または注入技法を含む。
医薬組成物は、例えば、滅菌した注射可能な水性または油性の懸濁液としての、滅菌した注射可能な調製物の形態であってもよい。この懸濁液は、適切な分散剤または湿潤剤(例えば、Tween80など)、および懸濁剤を使用して、当技術分野で公知の技法によって製剤化され得る。滅菌した注射可能な調製物は、無毒性の非経口的に許容される希釈剤または溶媒中の滅菌注射用溶液または懸濁液、例えば、1,3−ブタンジオール溶液であってもよい。使用することができる、許容されるビヒクルおよび溶媒の中には、マンニトール、水、リンガー液、および等張性塩化ナトリウム溶液がある。さらに、滅菌した固定油が、溶媒または懸濁化媒質として慣用的に使用される。この目的で、合成モノグリセリドまたは合成ジグリセリドを含めた任意の無刺激性固定油を使用することができる。オレイン酸およびそのグリセリド誘導体などの脂肪酸は、天然の薬学的に許容される油、例えば、オリーブ油またはヒマシ油などと同様に、特にこれらのポリオキシエチル化型で、注入可能医薬品の調製に有用である。これらの油溶液または懸濁液は、Pharmacopeia Helveticaに記載されているものなどの長鎖アルコール希釈剤もしくは分散剤、または同様のアルコールも含有する場合がある。
本発明の医薬組成物は、それだけに限らないが、カプセル、錠剤、ならびに水性懸濁液および水溶液を含めた任意の経口的に許容される剤形で経口投与され得る。経口用途用の錠剤の場合では、一般に使用される担体には、ラクトースおよびコーンスターチが含まれる。ステアリン酸マグネシウムなどの潤滑剤も一般に添加される。カプセル形態での経口投与については、有用な希釈剤には、ラクトース、および乾燥コーンスターチが含まれる。水性懸濁液および水溶液、ならびにプロピレングリコールが経口投与される場合、活性成分は、乳化剤および懸濁剤と組み合わされる。必要に応じて、ある特定の甘味料および/または香味料および/または着色剤が添加される場合がある。
本発明の医薬組成物は、直腸投与のために坐剤の形態で投与され得る。これらの組成物は、本発明の化合物を、室温で固体であるが、直腸温度で液体であり、したがって、直腸内で融解して活性成分を放出する適切な非刺激性賦形剤と混合することによって調製され得る。このような材料には、それだけに限らないが、カカオバター、蜜ろう、およびポリエチレングリコールが含まれる。
本発明の医薬組成物の局所投与は、所望の処置が、局所的な適用によって容易にアクセス可能な領域または臓器を伴う場合、特に有用である。皮膚に局所的に塗布する場合、医薬組成物は、担体中に懸濁または溶解した活性成分を含有する適切な軟膏で製剤化されるべきである。本発明の化合物の局所投与用担体として、それだけに限らないが、鉱油、流動パラフィン、白色ワセリン、プロピレングリコール、ポリオキシエチレン、ポリオキシプロピレン、乳化ろう、および水が挙げられる。あるいは、医薬組成物は、担体中に懸濁または溶解した活性化合物を含有する適切なローション剤またはクリームで製剤化されてもよい。適切な担体として、それだけに限らないが、鉱油、ソルビタンモノステアレート、ポリソルベート60、セチルエステルワックス、セテアリールアルコール、2−オクチルドデカノール、ベンジルアルコール、および水が挙げられる。本発明の医薬組成物は、直腸用坐剤製剤によって、または適切な浣腸製剤で下部腸管に局所的に適用されてもよい。局所的に投与される経皮パッチも本発明に含まれる。
本発明の医薬組成物は、鼻エアロゾルまたは吸入によって投与され得る。このような組成物は、医薬製剤の分野で周知である技法によって調製され、ベンジルアルコール、または他の適切な保存剤、生体利用率を増強するための吸収プロモーター、フルオロカーボン、および/または当技術分野で公知である他の可溶化剤もしくは分散剤を使用して、生理食塩水の溶液として調製され得る。
別の実施形態によれば、式(I)の化合物または薬学的に許容されるその塩は、埋め込み型デバイスまたは留置デバイスなどを用いて、移植によって(例えば、外科的に)送達され得る。埋め込み型デバイスまたは留置デバイスは、被験体中に永久に、または一時的にあるようにデザインされ得る。埋め込み型デバイスならびに留置デバイスの例として、それだけに限らないが、コンタクトレンズ、中心静脈カテーテル、ならびに無針コネクタ、気管内チューブ、子宮内デバイス、機械心臓弁、ペースメーカー、腹膜透析カテーテル、腰および膝の代替品などの人工関節、中耳腔換気用チューブ、導尿カテーテル、ボイスプロステーシス、ステント、吐出ポンプ、血管フィルター、ならびに移植可能な制御放出組成物が挙げられる。生物膜は、埋め込み型または留置医療用デバイスを有する患者の健康に有害となり得、その理由は、これらは、体内に人工基質を導入し、持続感染を引き起こし得るためである。したがって、埋め込み型デバイスまたは留置デバイスの中または上に式(I)の化合物または薬学的に許容されるその塩を供給することにより、生物膜の生成を予防または低減することができる。さらに、埋め込み型デバイスまたは留置デバイスは、式(I)の化合物または薬学的に許容されるその塩のデポーまたはリザーバとして使用され得る。任意の埋め込み型デバイスまたは留置デバイスを、式(I)の化合物または薬学的に許容されるその塩を送達するのに使用することができるが、ただし、a)デバイス、式(I)の化合物または薬学的に許容されるその塩、および式(I)の化合物または薬学的に許容されるその塩を含む任意の医薬組成物は生体適合性であり、b)デバイスは、有効量の式(I)の化合物または薬学的に許容されるその塩を送達または放出することによって、処置される患者に治療効果を付与され得る。
埋め込み型デバイスまたは留置デバイスを介した治療剤の送達は、当技術分野で公知である。例えば、Current Interventional Cardiology Reports、2001年、3巻:28〜36頁に公開されたHofmaらによる「Recent Developments in Coated Stents」を参照。これに引用された参考文献を含むその内容全体は、参考として本明細書に援用される。埋め込み型デバイスの他の説明は、米国特許第6,569,195号、および同第6,322,847号、ならびに米国特許出願第2004/0044405号、同第2004/0018228号、同第2003/0229390号、同第2003/0225450号、同第2003/0216699号、および同第2003/0204168号に見出すことができ、これらのそれぞれは、その全体が参考として本明細書に援用される。
いくつかの実施形態では、埋め込み型デバイスはステントである。特定の一実施形態では、ステントは、インターロックメッシュケーブル(interlocked meshed cable)を含むことができる。各ケーブルは、構造支柱用金属ワイヤ、および治療剤を送達するためのポリマーワイヤを含むことができる。ポリマーワイヤは、治療剤の溶液中にポリマーを浸漬することによって添加され得る。あるいは、ポリマー前駆体溶液からワイヤを形成する間に、ポリマーワイヤ中に治療剤を埋め込むことができる。
他の実施形態では、埋め込み型デバイスまたは留置デバイスは、治療剤を含むポリマー被膜で被覆され得る。ポリマー被膜は、治療剤の放出速度を制御するようにデザインされ得る。治療剤の制御放出は、様々な技術を利用することができる。ポリマー物質中に活性剤の不均一溶液および/または分散液を組み込んでいるモノリシック層または被膜を有するデバイスが公知であり、この場合、作用物質は、ポリマーを通じてポリマー−流体界面に拡散し、周囲流体中に放出されるので、作用物質の拡散が律速である。いくつかのデバイスでは、可溶性物質もポリマー材料中に溶解または分散させ、その結果、材料が溶解した後、追加の孔またはチャネルが残される。マトリックスデバイスは一般に、同様に拡散に制限されるが、デバイスのチャネルまたは他の内部形状も、流体への作用物質の放出に役割を果たす。チャネルは、既存のチャネル、または放出される作用物質もしくは他の可溶性物質の後に残されるチャネルであり得る。
浸食性または分解性のデバイスは一般に、ポリマー中に物理的に固定化された活性剤を有する。活性剤を、ポリマー材料全体にわたって溶解かつ/または分散させてもよい。ポリマー材料は、多くの場合、不安定な結合の加水分解を通じて経時的に、加水分解的に分解され、ポリマーが流体中へと浸食することを可能にし、流体中に活性剤を放出する。親水性ポリマーの浸食速度は一般に、疎水性ポリマーと比べてより速い。疎水性ポリマーは、表面から内側に浸食されて、活性剤をほとんど純粋に表面拡散させると考えられている。親水性ポリマーは、水がポリマーの表面を貫通することを可能にし、表面の真下の不安定な結合の加水分解を可能にし、これは、ポリマーを均質に、またはバルクで浸食させることができると考えられている。
埋め込み型デバイスまたは留置デバイスの被膜は、それぞれが、治療剤の異なる放出速度を有するポリマーのブレンドを含むことができる。例えば、被膜は、ポリ乳酸/ポリエチレンオキシド(PLA−PEO)コポリマーおよびポリ乳酸/ポリカプロラクトン(PLA−PCL)コポリマーを含み得る。ポリ乳酸/ポリエチレンオキシド(PLA−PEO)コポリマーは、ポリ乳酸/ポリカプロラクトン(PLA−PCL)コポリマーと比べて、治療剤のより高い放出速度を呈することができる。経時的に送達される治療剤の相対量および投与速度は、遅放出性ポリマーに対する速放出性ポリマーの相対量を制御することによって制御することができる。初期放出速度をより速くするために、速放出性ポリマーの比率を、遅放出性ポリマーに対して増大させることができる。投与量のほとんどが長時間にわたって放出されることが望まれる場合、ポリマーのほとんどを遅放出性ポリマーとすることができる。デバイスは、デバイスにポリマー、活性剤、および溶媒の溶液または分散液を吹き付けることによって被覆され得る。溶媒は、ポリマーおよび活性剤の被膜を残して蒸発することができる。活性剤を、ポリマー中に溶解かつ/または分散させてもよい。いくつかの実施形態では、コポリマーをデバイス上に押し出すことができる。
1日当たり、体重1kg当たり約0.01〜約100mgの間、好ましくは1日当たり、体重1kg当たり0.5〜約75mgの間、最も好ましくは、1日当たり、体重1kg当たり約1〜50mgの間の活性成分化合物の投与量レベルが、細菌感染症を予防および処置するための単剤療法において有用である。
一般に、本発明の医薬組成物は、1日当たり約1〜5回、または代わりに、持続注入として投与されることになる。あるいは、本発明の組成物は、パルス製剤で投与してもよい。このような投与は、長期療法または救急療法として使用され得る。単一剤形を生成するのに担体材料と組み合わせることができる活性成分の量は、処置されるホスト、および特定の投与方法に応じて変化する。一般的な調製物は、約5%〜約95%の活性化合物(w/w)を含有することになる。好ましくは、このような調製物は、約20%〜約80%の活性化合物を含有する。
本発明の組成物が、式(I)の化合物または薬学的に許容されるその塩と1つまたは複数の追加の治療剤または予防剤との組合せを含む場合、化合物および追加の作用物質の両方は、単剤療法投与法で通常投与される投与量の約10%〜80%の間の投与量レベルで存在するはずである。
患者の状態が改善した後、維持用量の本発明の化合物、組成物、または組合せを、必要であれば投与することができる。その後、投与量もしくは投与の頻度、または両方を、改善された状態が保持されるレベルに、症状に応じて低減することができ、症状が所望レベルに軽減したとき、処置を終えるべきである。しかし、患者は、いずれかの再発または疾患症状の後、長期間ベースの間欠的処置を必要とする場合がある。
当業者が理解するように、上記に列挙したものより低い、または高い用量を必要とする場合がある。任意の特定の患者に対する具体的な投与量および処置レジメンは、使用される特定の化合物の活性、年齢、体重、全体的な健康状態、性別、飲食物、投与の時間、排泄率、薬物の組合せ、疾患の重症度および過程、ならびに疾患に対する患者の処置、および治療医師の判断を含めた様々な要因に依存することになる。
別の実施形態によれば、本発明は、細菌感染症、または疾患状態を処置または予防するための方法であって、本明細書に記載される任意の化合物、医薬組成物、または組合せを患者に投与するステップを含む、方法を提供する。用語「患者」は、本明細書において、動物、好ましくは哺乳動物、最も好ましくはヒトを意味する。
本発明の化合物は、ジャイレースBおよび/またはトポイソメラーゼIV酵素に有効に結合する市販の試薬としても有用である。市販の試薬として、本発明の化合物およびこれらの誘導体は、細菌性ジャイレースBおよび/もしくはトポイソメラーゼIV、またはこれらの相同体についての生化学的アッセイまたは細胞アッセイにおいて、ジャイレースBおよび/またはトポイソメラーゼIV活性を遮断するのに使用され得、あるいは親和性クロマトグラフィー用途用のテザー係留された基質(tethered substrate)としての安定な樹脂に結合するように誘導体化され得る。市販のジャイレースBおよび/またはトポイソメラーゼIV阻害剤を特徴付けるこれらの使用および他の使用は、当業者に明白となるであろう。
本発明がより完全に理解されるために、以下のスキームおよび実施例を示す。これらの実施例は、例示目的だけのものであり、本発明の範囲を限定するものとして決して解釈されるべきでない。
以下の定義は、本明細書で使用される用語および略語を説明するものである:
Ac アセチル
Bu ブチル
Et エチル
Ph フェニル
Me メチル
THF テトラヒドロフラン
DCM ジクロロメタン
CHCl ジクロロメタン
EtOAc 酢酸エチル
CHCN アセトニトリル
EtOH エタノール
EtO ジエチルエーテル
MeOH メタノール
MTBE メチルtert−ブチルエーテル
DMF N,N−ジメチルホルムアミド
DMA N,N−ジメチルアセトアミド
DMSO ジメチルスルホキシド
HOAc 酢酸
TEA トリエチルアミン
TFA トリフルオロ酢酸
TFAA トリフルオロ酢酸無水物
EtN トリエチルアミン
DIPEA ジイソプロピルエチルアミン
DIEA ジイソプロピルエチルアミン
CO 炭酸カリウム
NaCO 炭酸ナトリウム
Na チオ硫酸ナトリウム
CsCO 炭酸セシウム
NaHCO 炭酸水素ナトリウム
NaOH 水酸化ナトリウム
NaSO 硫酸ナトリウム
MgSO 硫酸マグネシウム
PO リン酸カリウム
NHCl 塩化アンモニウム
LC/MS 液体クロマトグラフィー/質量スペクトル
GCMS ガスクロマトグラフィー質量スペクトル
HPLC 高速液体クロマトグラフィー
GC ガスクロマトグラフィー
LC 液体クロマトグラフィー
IC イオンクロマトグラフィー
IM 筋肉内
CFU/cfu コロニー形成単位
MIC 最小阻害濃度
Hrまたはh 時間
atm 気圧
rtまたはRT 室温
TLC 薄層クロマトグラフィー
HCl 塩酸
O 水
EtNCO イソシアン酸エチル
Pd/C 炭素上のパラジウム
NaOAc 酢酸ナトリウム
SO 硫酸
窒素ガス
水素ガス
n−BuLi n−ブチルリチウム
DI 脱イオン化された
Pd(OAc) 酢酸パラジウム(II)
PPh トリフェニルホスフィン
i−PrOH イソプロピルアルコール
NBS N−ブロモスクシンイミド
Pd[(Ph)P] テトラキス(トリフェニルホスフィン)パラジウム(0)
PTFE ポリテトラフルオロエチレン
rpm 毎分回転数
SM 出発物質
Equiv. 当量
H−NMR プロトン核磁気共鳴。
化合物の合成
(実施例)
6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物
(R)−1−エチル−3−(6−フルオロ−5−(2−(2−ヒドロキシプロパン−2−イル)ピリミジン−5−イル)−7−(テトラヒドロフラン−2−イル)−1H−ベンゾ[d]イミダゾール−2−イル)尿素の合成
スキーム3は、6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物を調製するための方法を提供する。
Figure 0006120775
(実施例1.a)
2−(2−フルオロ−6−ニトロ−フェニル)−2,3−ジヒドロフラン(15A)および2−(2−フルオロ−6−ニトロ−フェニル)−2,5−ジヒドロフラン(15B)の調製
Figure 0006120775
2−ブロモ−1−フルオロ−3−ニトロ−ベンゼン(14)(200.3g、98%、892.3mmol、Bosche F6657)、1,4−ジオキサン(981.5mL、Sigma−Aldrich 360481)および2,3−ジヒドロフラン(2)(341.1mL、99%、4.462mol、Aldrich 200018)を反応フラスコに入れ、続いてN,N−ジイソプロピルエチルアミン(155.4mL、892.3mmol、Sigma−Aldrich 550043)およびブロモ(トリ−tert−ブチルホスフィン)パラジウム(I)ダイマー(6.936g、8.923mmol、Johnson Matthey C4099)を加えた。この混合物を還流させて2時間撹拌した(HPLCは、出発アリールブロマイドの98%消費を示した)。この反応混合物を冷却し、濾過により沈殿物を除去し、EtOAcでリンスし、濾液を真空濃縮して、濃い赤褐色の半固体の油状物とした。この半固体の油状物をCHClに溶解させ、シリカのプラグを通してCHClで溶出し、真空濃縮して、15Aおよび15Bの混合物を濃い琥珀色の油状物として得た(291.3g)。この粗生成物をさらに精製することなく先に進んだ。主生成物は、2−(2−フルオロ−6−ニトロ−フェニル)−2,3−ジヒドロフラン(15A)(96%)であった:LCMS(C18カラム、ギ酸モディファイアを用いて、5分間かけて10〜90%CHCN/水勾配で溶出)M+1:210.23(3.13分間);H NMR (300 MHz, CDCl) δ 7.54 (dt, J = 8.0, 1.2 Hz, 1H), 7.43 (td, J = 8.2, 5.2 Hz, 1H), 7.32 (ddd, J = 9.7, 8.3, 1.3 Hz, 1H), 6.33 (dd, J = 4.9, 2.4 Hz, 1H), 5.80 (t, J = 10.9 Hz, 1H), 5.06 (q, J = 2.4 Hz, 1H), 3.18 − 3.07 (m, 1H), 2.94 − 2.82 (m, 1H) ppm.副生成物は、2−(2−フルオロ−6−ニトロ−フェニル)−2,5−ジヒドロフラン(15B)(4%)であった:GCMS(Agilent HP−5MS 30m×250μm×0.25μmカラム、60℃で2分間から300℃に15分間かけて加熱、流速1mL/分)M+1:210(11.95分間)。H NMR (300 MHz, CDCl) δ 7.47 (d, J = 8.0 Hz, 1H), 7.43 − 7.34 (m, 1H), 7.30 − 7.23 (m, 1H), 6.21 − 6.15 (m, 1H), 6.11 − 6.06 (m, 1H), 5.97 − 5.91 (m, 1H), 4.89 − 4.73 (m, 2H) ppm。
(実施例1.b)
3−フルオロ−2−テトラヒドロフラン−2−イル−アニリン(16)の調製
Figure 0006120775
窒素下、炭素上の5%パラジウム(37.3g、50%ウェット、8.76mmol、Aldrich 330116)をParrボトル内に入れ、続いてMeOH(70mL、JT−Baker 909333)を加えた。MeOH(117mL)中の2−(2−フルオロ−6−ニトロフェニル)−2,3−ジヒドロフランおよび2−(2−フルオロ−6−ニトロフェニル)−2,5−ジヒドロフラン(15A&15B)(186.6g、892.1mmol)の粗混合物をParrボトルに添加し、続いてNEt(124.3mL、892.1mmol、Sigma−Aldrich 471283)を加えた。Parr振盪機にボトルを置き、Hで飽和させた。45psi Hを添加した後、出発物質の消費が完了するまで反応混合物を振盪した(HPLCおよびLCMSは、完全な反応を示した)。反応混合物を窒素でパージし、セライト(商標)を通して濾過し、EtOAcでリンスした。濾液をロータリーエバポレーターにおいて濃縮して、褐色の油状物を得、これをEtOに溶解させ、水(2×)で洗浄した。エーテル相を1N HCl水溶液(5×250mL)で抽出し、これをEtO(3×)で洗浄し、続いて6N NaOH水溶液でpH12〜14となるまで塩基性化した。塩基性水相をジクロロメタン(CHCl、4×)で抽出し、合わせた有機抽出物を飽和NHCl水溶液で洗浄し、MgSOで乾燥し、CHClから25%EtOAc/ヘキサンで溶出しつつシリカのパッドを通して濾過した。所望の濾液を減圧下で濃縮して、16を淡褐色の油状物として得た(121.8g、84%GCMSプラスNMR純度)。GCMS(Agilent HP−5MS 30m×250μm×0.25μmカラム、60℃で2分間〜300℃に15分間かけて加熱、流速1mL/分)M+1:182.0(11.44分間)。LCMS(C18カラム、ギ酸モディファイアを用いて、5分間かけて10〜90%CHCN/水勾配で溶出)M+1:182.10(2.61分間)。H NMR (300 MHz, CDCl) δ 6.97 (td, J = 8.1, 6.3 Hz, 1H), 6.43 − 6.35 (m, 2H), 5.21 − 5.13 (m, 1H), 4.54 (s, 2H), 4.16 − 4.07 (m, 1H), 3.90 − 3.81 (m, 1H), 2.23 − 2.00 (m, 4H) ppm.次の通り、追加の収穫物を得た。合わせたエーテル相を飽和NaHCO水溶液、ブラインで洗浄し、NaSOで乾燥し、デカントし、減圧下で濃縮した。油状物を真空蒸留し(約15torr)、留出物を101〜108℃で収集した。EtOH(1容量)中の蒸留油状物の溶液に撹拌下2℃で、iPrOH中5MのHCl(1eq)を徐々に添加した。得られた懸濁液を室温にし、EtOAc(3容量、vol/vol)で希釈し、2時間撹拌した。白色の固体を濾過により収集し、EtOAcで洗浄し、減圧下で乾燥して、生成物の2回目の収穫物をHCl塩として得た。母液を濃縮してスラリーとし、EtOAcで希釈し、固体を濾過により収集し、EtOAcで洗浄し、真空乾燥して、生成物の3回目の収穫物としてHCl塩を得た。LCMS(C18カラム、ギ酸モディファイアを用いて、5分間かけて10〜90%CHCN/水勾配で溶出)M+1:182.10(2.58分間)。H NMR (300 MHz, CDCl) δ 10.73 (br.s, 3H), 7.66 (d, J = 8.1 Hz, 1H), 7.33 (td, J = 8.2, 5.9 Hz, 1H), 7.13 − 7.05 (m, 1H), 5.26 (dd, J = 9.0, 6.5 Hz, 1H), 4.38 − 4.28 (m, 1H), 4.00 − 3.91 (m, 1H), 2.59 − 2.46 (m, 1H), 2.30 − 1.95 (m, 3H) ppm.3回の収穫の全収率は、76%であった。
(実施例1.c)
4−ブロモ−3−フルオロ−2−テトラヒドロフラン−2−イル−アニリン(17)の調製。
Figure 0006120775
メチルtert−ブチルエーテル(1.456L)およびアセトニトリル(485mL)中の3−フルオロ−2−テトラヒドロフラン−2−イル−アニリン(16)(131.9g、92%、669.7mmol)の溶液を−20℃まで冷却し、これに撹拌下、N−ブロモスクシンイミド(120.4g、99%、669.7mmol、Aldrich B81255)を3回に分けて添加して、約−15℃を下回る反応温度を維持した。完全に添加した後、撹拌を−15〜−10℃で30分間継続した。後処理したアリコートのH NMRは、出発アニリンの96%消費を示した。さらに4.82gのNBSを反応混合物に添加し、−10℃でさらに30分間撹拌した。1N Na水溶液(670mL)を反応混合物に添加した。冷浴を除去し、混合物を20分間撹拌し、次にEtOAcで希釈した。層を分離した。有機相を飽和NaHCO水溶液(2×)、水、ブラインで洗浄し、NaSOで乾燥し、デカントし、減圧下で濃縮して、濃い琥珀色の油状物を得た。残渣をヘキサンで希釈し、25%EtOAc/ヘキサンから50%EtOAc/ヘキサンでシリカの短いプラグを通して溶出した。所望の濾液を真空濃縮して、17を濃い琥珀色の油状物として得た(182.9g、90%収率;86%NMR純度)。LCMS(C18カラム、ギ酸モディファイアを用いて、5分間かけて10〜90%AcN/水勾配で溶出)M+1:260.12(3.20分間)。H NMR (300 MHz, CDCl) δ 7.15 (dd, J = 8.6, 7.6 Hz, 1H), 6.30 (dd, J = 8.7, 1.3 Hz, 1H), 5.19 − 5.12 (m, 1H), 4.58 (s, 2H), 4.16 − 4.07 (m, 1H), 3.90 − 3.81 (m, 1H), 2.23 − 1.99 (m, 4H) ppm。
(実施例1.d)
N−(4−ブロモ−3−フルオロ−6−ニトロ−2−テトラヒドロフラン−2−イル−フェニル)−2,2,2−トリフルオロ−アセトアミド(18)の調製。
Figure 0006120775
トリフルオロ酢酸無水物(565.3mL、4.067mol、Sigma−Aldrich 106232)に撹拌下2℃で、ニートの4−ブロモ−3−フルオロ−2−テトラヒドロフラン−2−イル−アニリン(17)(123.0g、86%、406.7mmol)を濃厚油状物として、滴下漏斗により約20分間かけて徐々に添加した(反応温度は13℃まで上昇)。残りの油状物を無水THF(35mL)でリンスして反応混合物に入れた。冷浴を除去し、反応液を35℃に加熱し、続いてNHNO(4.88g×20回、1.22mol、Sigma−Aldrich A7455)を2.5時間かけて数回に分けて添加し、必要なときのみ氷水浴を用いて反応温度を30〜41℃の間に維持して、発熱を制御した。完全に添加した後、反応混合物をさらに10分間撹拌した(HPLCは、反応99%完了を示した)。これをクラッシュアイス(1.23kg)に徐々に注ぎ、1時間撹拌して、濾過可能な固体沈殿物を生成させ、これを収集し、水、控えめな量の飽和NaHCO水溶液で、再度水で(pH7となるまで)洗浄した。対流式オーブンにおいて一晩40℃、続いてオーブンにおいて減圧下で50℃一晩生成物を乾燥させて、18をベージュ色の固体として得た(152.5g、90%収率;96%HPLC純度)。LCMS(C18カラム、ギ酸モディファイアを用いて、5分間かけて10〜90%CHCN/水勾配で溶出)M+1:401.30(3.41分間)。H NMR (300 MHz, CDCl) δ 10.56 (s, 1H), 8.19 (d, J = 6.6 Hz, 1H), 5.22 (dd, J = 10.3, 6.4 Hz, 1H), 4.22 (dd, J = 15.8, 7.2 Hz, 1H), 3.99 (dd, J = 16.1, 7.5 Hz, 1H), 2.50 − 2.38 (m, 1H), 2.22 − 2.11 (m, 2H), 1.86 − 1.71 (m, 1H) ppm。
(実施例1.e)
4−ブロモ−3−フルオロ−6−ニトロ−2−テトラヒドロフラン−2−イル−アニリン(19)の調製。
Figure 0006120775
反応フラスコにN−(4−ブロモ−3−フルオロ−6−ニトロ−2−テトラヒドロフラン−2−イル−フェニル)−2,2,2−トリフルオロ−アセトアミド(18)(242.3g、604.1mmol)、1,4−ジオキサン(1.212L)、水性2M硫酸(362.4mL、724.9mmol)を入れ、還流させて5日間撹拌した(HPLCは、98%転換を示した)。この反応混合物を冷却し、EtOAcで希釈し、飽和NaHCO水溶液で中和し、層を分離し、水相をEtOAcで再度抽出した(2×)。合わせた有機相をブライン(2×)で洗浄し、MgSOで乾燥し、濾過し、真空濃縮して、19を緑褐色の固体として得た(181.7g、94%収率;95%HPLC純度)。この生成物をさらに精製することなく次のステップを行った。LCMS(C18カラム、ギ酸モディファイアを用いて、5分間かけて10〜90%CHCN/水勾配で溶出)M+1:305.20(3.63分間)。H NMR (300 MHz, CDCl) δ 8.35 (d, J = 7.3 Hz, 1H), 7.45 (s, 2H), 5.23 − 5.16 (m, 1H), 4.23 − 4.14 (m, 1H), 3.93 − 3.84 (m, 1H), 2.31 − 1.96 (m, 4H) ppm。
(実施例1.f)
2−[5−(4−アミノ−2−フルオロ−5−ニトロ−3−テトラヒドロフラン−2−イル−フェニル)ピリミジン−2−イル]プロパン−2−オール(20)の調製。
Figure 0006120775
1,4−ジオキサン(4.20L、Sigma−Aldrich 360481)中の4−ブロモ−3−フルオロ−6−ニトロ−2−テトラヒドロフラン−2−イル−アニリン(19)(525.0g、1.721mol、Bridge Organics Co.)の溶液に撹拌下、NaHCOの1.2M水溶液(4.302L、5.163mol)を添加した。撹拌下の混合物に窒素流を通して2時間泡立て、続いて2−[5−(4,4,5,5−テトラメチル−1,3,2−ジオキサボロラン−2−イル)ピリミジン−2−イル]プロパン−2−オール(7)(545.4g、2.065mol、Bridge Organics Co.)および1,1’−ビス(ジフェニルホスフィノ)フェロセンジクロロパラジウムジクロロメタン付加物(42.16g、51.63mmol、Strem 460450)を添加した。反応混合物を還流させて一晩撹拌し、冷却し、EtOAc(8.4L)で希釈し、層を分離した。有機相を飽和NHCl水溶液、続いてブラインで洗浄した。水相をEtOAc(4L)で再度抽出し、この有機抽出物をブラインで洗浄した。合わせた有機相をMgSOで乾燥し、フロリジル(登録商標)の短いプラグを通して濾過し、EtOAcで溶出し、濾液をロータリーエバポレーターにおいて濃縮して、暗褐色の湿った固体を得た。これをCHClに溶解させ、シリカゲルのパッド上にロードし、ヘキサン、続いて25%EtOAc/ヘキサン、続いて50%EtOAc/ヘキサンで溶出した。ロータリーエバポレーターにおいて所望の濾液を濃縮して濃厚懸濁液とし、固体を濾過により収集し、MTBEと摩砕し、真空乾燥して、20を鮮黄色の固体として得た(55.8%収率、90〜97%HPLC純度)。濾液を濃縮し、上述の精製を反復して、20の2回目の収穫物を鮮黄色の固体として得た(19.7%収率)。濾液を再度濃縮して、暗褐色の油状物を得、これをトルエンおよび最小CHClと共にシリカカラム上にロードした。これをEtOAc/ヘキサン(0%〜50%)により溶出した。所望の画分を濃縮してスラリーとし、MTBE/ヘキサンで希釈した。固体を濾過により収集し、最小MTBEで洗浄して、20の3回目の収穫物を鮮黄色の固体として得た(4.9%収率)ところ、3回の収穫から80%の全収率が得られた。LCMS(C18カラム、ギ酸モディファイアを用いて、5分間かけて10〜90%CHCN/水勾配で溶出)M+1:363.48(2.95分間)。H NMR (300 MHz, CDCl) δ 8.84 (d, J = 1.6 Hz, 2H), 8.27 (d, J = 8.0 Hz, 1H), 7.62 (s, 2H), 5.31 − 5.24 (m, 1H), 4.63 (s, 1H), 4.27 − 4.18 (m, 1H), 3.97 − 3.87 (m, 1H), 2.33 − 2.05 (m, 4H), 1.64 (s, 6H) ppm。
(実施例1.g)
2−[5−(4,5−ジアミノ−2−フルオロ−3−テトラヒドロフラン−2−イル−フェニル)ピリミジン−2−イル]プロパン−2−オール(21)の調製。
Figure 0006120775
窒素下、炭素上の5%パラジウム(14.21g、50%ウェット、3.339mmol、Aldrich 330116)をParrボトル内に入れ、続いて、MeOH(242mL、JT−Baker 909333)およびNEt(46.54mL、333.9mmol、Sigma−Aldrich 471283)を加えた。2−[5−(4−アミノ−2−フルオロ−5−ニトロ−3−テトラヒドロフラン−2−イル−フェニル)ピリミジン−2−イル]プロパン−2−オール(20)(121.0g 333.9mmol)を熱THF(360mL)に溶解させ、冷却し、反応混合物に添加し、20の残量をさらに1回のTHF(124mL)でリンスした。ボトルをParr振盪機に置き、Hで飽和させた。45psiでHを添加した後、20の消費が完了するまでボトルを振盪した(HPLCおよびLCMSは、完全な反応を示した)。この反応混合物を窒素でパージし、セライト(商標)を通して濾過し、EtOAcでリンスした。これを、ペーパー(ガラスマイクロファイバー)を通して再濾過し、濾液を真空濃縮した。反応を同一スケールでさらに3回反復し、バッチを合わせて、21を褐色の固体として得た(447g、99%収率;93%HPLC純度)。LCMS(C18カラム、ギ酸モディファイアを用いて、5分間かけて10〜90%CHCN/水勾配で溶出)M+1:333.46(1.79分間)。H NMR (300 MHz, CDCl) δ 8.81 (d, J = 1.4 Hz, 2H), 6.69 (d, J = 7.3 Hz, 1H), 5.27 − 5.20 (m, 1H), 4.73 (s, 1H), 4.70 (s, 2H), 4.23 − 4.14 (m, 1H), 3.94 − 3.86 (m, 1H), 3.22 (s, 2H), 2.32 − 2.22 (m, 1H), 2.18 − 1.99 (m, 3H), 1.63 (s, 6H) ppm。
(実施例1.h)
1−エチル−3−[6−フルオロ−5−[2−(1−ヒドロキシ−1−メチル−エチル)ピリミジン−5−イル]−7−テトラヒドロフラン−2−イル−1H−ベンゾイミダゾール−2−イル]尿素(22)の調製
Figure 0006120775
2−[5−(4,5−ジアミノ−2−フルオロ−3−テトラヒドロフラン−2−イル−フェニル)ピリミジン−2−イル]プロパン−2−オール(21)(111.3g、334.9mmol)および1,4−ジオキサン(556.5mL、Sigma−Aldrich 360481)の懸濁液に撹拌下、1−エチル−3−(N−(エチルカルバモイル)−C−メチルスルファニル−カルボンイミドイル)尿素(10)(93.36g、401.9mmol、CB Research and Development)を添加し、続いてNaOAc三水和物(158.1g)を1NのHSO水溶液(1.100L)に溶解させることにより調製したpH3.5バッファー(1.113L)を加えた。反応混合物を還流させて一晩撹拌し(HPLCは、完全な転換を示した)、室温に冷却し、撹拌下の飽和NaHCO(2.23L)水溶液に数回に分けて注いで(起泡を最小限にするため)、pH8〜9とした。得られた混合物を30分間撹拌し、固体を濾過により収集し、大量の水で洗浄して中性pHとし、次により控えめな量のEtOHで洗浄した。固体を減圧下で乾燥させて、22をオフホワイトの黄色がかった固体として得た(135.2g、94%収率;99%HPLC純度)。LCMS(C18カラム、ギ酸モディファイアを用いて、5分間かけて10〜90%CHCN/水勾配で溶出)M+1:429.58(2.03分間)。H NMR (300 MHz, MeOD) δ 8.95 (d, J = 1.6 Hz, 2H), 7.45 (d, J = 6.5 Hz, 1H), 5.38 (br.s, 1H), 4.27 (dd, J = 14.9, 7.1 Hz, 1H), 4.01 (dd, J = 15.1, 7.0 Hz, 1H), 3.37 − 3.29 (m, 2H), 2.55 (br.s, 1H), 2.19 − 2.07 (m, 2H), 2.02 − 1.82 (br.s, 1H), 1.63 (s, 6H), 1.21 (t, J = 7.2 Hz, 3H) ppm。
(実施例1.i)
1−エチル−3−[6−フルオロ−5−[2−(1−ヒドロキシ−1−メチル−エチル)ピリミジン−5−イル]−7−[(2R)−テトラヒドロフラン−2−イル]−1H−ベンゾイミダゾール−2−イル]尿素(23)のキラルクロマトグラフィー単離
Figure 0006120775
CHIRALPAK(登録商標)IC(登録商標)カラム(Chiral Technologies製)において、25℃でCHCl/MeOH/TEA(60/40/0.1)で溶出して、1−エチル−3−[6−フルオロ−5−[2−(1−ヒドロキシ−1−メチル−エチル)ピリミジン−5−イル]−7−テトラヒドロフラン−2−イル−1H−ベンゾイミダゾール−2−イル]尿素(22)(133.60g)のラセミ試料を分割し、所望のエナンチオマー23をオフホワイトの固体として得た(66.8g、45%収率;99.8%HPLC純度、99+%ee)。分析的キラルHPLC保持時間は、7.7分間であった(CHIRALPAK(登録商標)IC(登録商標)4.6×250mmカラム、流速1mL/分、30℃)。固体を2:1EtOH/EtO(5容量)に懸濁させ、10分間撹拌し、濾過により収集し、2:1EtOH/EtOで洗浄し、減圧下で乾燥して、白色の固体を得た(60.6g)。
単結晶X線回折解析により、23の構造および絶対立体化学を確認した。密封したチューブCu K−アルファ源(Cu Kα放射線、γ=1.54178Å)およびApex II CCD検出器を備えるBruker Apex II回折計において、単結晶回折データを取得した。0.15×0.15×0.10mmの寸法を有する結晶を選択し、鉱物油を用いてきれいにし、MicroMountにマウントし、Bruker APEXIIシステムの中央に置いた。逆格子空間において分離した40フレームの3回のバッチを得て、配向マトリックスおよび初期セルパラメータをもたらした。最終セルパラメータを得て、データ収集が完了した後に、完全データセットに基づき精緻化した。系統的非存在および強度統計に基づき構造を解明し、中心を外れたP2空間群において精緻化した。
各フレーム30秒間の曝露による0.5°ステップを用いて、0.85Åの分解能まで逆格子空間の回折データセットを得た。100(2)Kにおいてデータを収集した。APEXIIソフトウェアを用いて、強度の統合およびセルパラメータの精緻化を達成した。データ収集後の結晶の観察は、分解の兆候を示さなかった。図2に示す通り、構造において2個の対称的な独立した分子が存在し、対称的な独立した分子のどちらもR異性体である。
Apex IIソフトウェアを用いてデータを収集、精緻化および整理した。SHELXS97(Sheldrick、1990)プログラム(複数可)を用いて構造を解明し、SHELXL97(Sheldrick、1997)プログラムを用いて構造を精緻化した。結晶は、P2空間群を有する単斜セルを示す。格子パラメータは、a=9.9016(2)Å、b=10.9184(2)Å、c=19.2975(4)Å、β=102.826(1)°である。体積=2034.19(7)Å
(実施例1.j)
1−エチル−3−[6−フルオロ−5−[2−(1−ヒドロキシ−1−メチル−エチル)ピリミジン−5−イル]−7−[(2R)−テトラヒドロフラン−2−イル]−1H−ベンゾイミダゾール−2−イル]尿素のメタンスルホン酸塩(24)の調製。
Figure 0006120775
ジクロロメタン(60mL、J.T.Baker 931533)および無水エタノール(15mL、Pharmco−AAPER 111000200)中の1−エチル−3−[6−フルオロ−5−[2−(1−ヒドロキシ−1−メチル−エチル)ピリミジン−5−イル]−7−[(2R)−テトラヒドロフラン−2−イル]−1H−ベンゾイミダゾール−2−イル]尿素(23)(15.05g、35.13mmol)の懸濁液に撹拌下、メタンスルホン酸(2.392mL、36.89mmol、Sigma−Aldrich 471356)を添加した。清澄な溶液が観察されるまで室温で撹拌した。約1時間かけてヘプタン(300mL)を徐々に添加し、固体沈殿物を濾過(Whatman GF/Fガラスマイクロファイバーペーパー上に置かれたWhatman qualitative#3ペーパーを使用)により収集した。真空オーブンにおいて減圧下で一晩40℃にて乾燥して(硫酸カルシウムおよび水酸化カリウムでデシケートし)、24を白色の固体として得た(13.46g、99+%HPLC純度、99+%ee)。分析的キラルHPLCは、CHIRALPAK(登録商標)IC(登録商標)4.6×250mmカラムにおいて、流速1mL/分、30℃でCHCl/MeOH/TEA(60/40/0.1)により溶出して、8.6分間の保持時間を有する1種のエナンチオマーを示す。濾液から、白色の固体生成物24の2回目の収穫物(4.36g、98%HPLC純度、99+%ee)を得た。LCMS(C18カラム、ギ酸モディファイアを用いて、5分間かけて10〜90%CHCN/水勾配で溶出)M+1:429.58(2.03分間)。H NMR (300 MHz, MeOD) δ 9.00 (d, J = 1.6 Hz, 2H), 7.67 (d, J = 6.1 Hz, 1H), 5.39 (t, J = 7.7 Hz, 1H), 4.30 (dd, J = 14.9, 6.9 Hz, 1H), 4.03 (dd, J = 14.8, 7.7 Hz, 1H), 3.40 − 3.31 (m, 2H), 2.72 (s, 3H), 2.70 − 2.60 (m, 1H), 2.21 − 2.08 (m, 2H), 1.98 − 1.84 (m, 1H), 1.65 (s, 6H), 1.22 (t, J = 7.2 Hz, 3H) ppm。
(実施例1.k)
1−エチル−3−[6−フルオロ−5−[2−(1−ヒドロキシ−1−メチル−エチル)ピリミジン−5−イル]−7−テトラヒドロフラン−2−イル−1H−ベンゾイミダゾール−2−イル]尿素の調製
2−[5−(4,5−ジアミノ−2−フルオロ−3−テトラヒドロフラン−2−イル−フェニル)ピリミジン−2−イル]プロパン−2−オール(7.220g、21.72mmol)、および1−エチル−3−(N−(エチルカルバモイル)−C−メチルスルファニル−カルボンイミドイル)尿素(6.054g、26.06mmol、CB Research and Development)の1,4−ジオキサン(36.1mL、Sigma−Aldrich 360481)溶液に、1NのHSO水溶液(37mL)中にNaOAc三水和物(5.32g)を溶解させることによって調製したpH3.5のバッファー(72.2mL)を添加した。この反応混合物を、還流させながら一晩撹拌し(HPLCは、完全な変換を示した)、室温に冷却し、飽和NaHCO水溶液(144mL)の撹拌溶液中に少量ずつ注ぎ(起泡)、pH8〜9にした。これを20分間撹拌し、固体を濾過によって収集し、水で大量に洗浄して中性pHにし、次いでより少なめにEtOHで洗浄した。固体を減圧下で乾燥させ、ベージュ色固体を得た(7.90g、99%のHPLC純度)。LCMS(ギ酸モディファイアを用いて、5分にわたって10〜90%のCHCN/水の勾配で溶出するC18カラム)M+1:429.45(2.03分)。HPLC保持時間は、3.89分であった(0.1%のTFAモディファイアおよび1mL/分の流量を用いて、8分にわたって10〜90%のCHCN/水の勾配で溶出するYMC ODS−AQ 150×3.0mmカラム)。
形態Iの調製
(実施例1.l)
(R)−1−エチル−3−[6−フルオロ−5−[2−(1−ヒドロキシ−1−メチル−エチル)ピリミジン−5−イル]−7−(テトラヒドロフラン−2−イル]−1H−ベンゾイミダゾール−2−イル]尿素のキラルクロマトグラフィー単離
1−エチル−3−[6−フルオロ−5−[2−(1−ヒドロキシ−1−メチル−エチル)ピリミジン−5−イル]−7−テトラヒドロフラン−2−イル−1H−ベンゾイミダゾール−2−イル]尿素のラセミ試料(133.60g)を、25℃で、DCM/MeOH/TEA(60/40/0.1)で溶出するCHIRALPAK(登録商標)IC(登録商標)カラム(Chiral Technologies製)で分割して、オフホワイト色固体として所望のエナンチオマーを得た(66.8g、99.8%のHPLC純度、99+%のee)。分析的キラルHPLC保持時間は、7.7分であった(CHIRALPAK(登録商標)IC(登録商標)4.6×250mmカラム、1mL/分の流量、30℃)。固体を2:1のEtOH/EtO(5容積)中に懸濁させ、10分間撹拌し、濾過によって収集し、2:1のEtOH/EtOで洗浄し、減圧下で乾燥させて、白色固体を得た(60.6g)。H NMR (300 MHz, MeOD) δ 8.95 (d, J = 1.6 Hz, 2H), 7.45 (d, J = 6.5 Hz, 1H), 5.38 (br.s, 1H), 4.27 (dd, J = 14.9, 7.1 Hz, 1H), 4.01 (dd, J = 15.1, 7.0 Hz, 1H), 3.37 − 3.29 (m, 2H), 2.55 (br.s, 1H), 2.19 − 2.07 (m, 2H), 2.02 − 1.82 (br.s, 1H), 1.63 (s, 6H), 1.21 (t, J = 7.2 Hz, 3H) ppm。
形態IIの調製
(実施例1.m)
6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物100mgに、THF 1mlを添加した。化学量論量のHClを、12Mの水溶液として添加した。次いでMTBE 4mLを添加し、懸濁液を、室温で撹拌しながら一晩平衡化させた。次いでこれを濾過し、白色固体を真空下で数時間乾燥させた。
形態IIIの調製
(実施例1.n)
6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物100mgを量り分け、ジクロロメタン/メタノールの1:1(v:v)混合物200mL中に溶解させた。100%の噴霧率で、冷却器が取り付けられたBuchi B−90 Nano噴霧乾燥器(ポンププログラム2)でこの溶液を噴霧乾燥させた。101℃の入り口温度を使用し、窒素流量は10L/分であり、窒素の最大圧力は10psiであり、COの最大圧力は15psiであった。白色粉末55mgを回収した。
冷却器が取り付けられたBuchi B−90 Nano噴霧乾燥器で、噴霧乾燥を実施した。6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の溶液を、CHCl:メタノール(1:1)から構成される溶媒系中で調製し、以下に列挙したパラメータに従って噴霧した。
形態IVの調製
(実施例1.o)
(R)−1−エチル−3−[6−フルオロ−5−[2−(1−ヒドロキシ−1−メチル−エチル)ピリミジン−5−イル]−7−(テトラヒドロフラン−2−イル)−1H−ベンゾイミダゾール−2−イル]尿素のメタンスルホン酸塩の調製
ジクロロメタン(22.8mL、Sigma−Aldrich 270997)および無水エタノール(2.5mL)中の(R)−1−エチル−3−[6−フルオロ−5−[2−(1−ヒドロキシ−1−メチル−エチル)ピリミジン−5−イル]−7−(テトラヒドロフラン−2−イル)−1H−ベンゾイミダゾール−2−イル]尿素(2.530g、5.905mmol)の撹拌懸濁液を、氷−水浴で冷却した。メタンスルホン酸(0.402mL、6.20mmol、Sigma−Aldrich 471356)を添加し、冷浴を取り除き、室温で10分間撹拌した。30℃で、ロータリーエバポレーターでこの混合物を濃縮して、濃密油状物にし、次いで撹拌中のEtOに徐々に添加し、残留生成物をCHClですすいでエーテル中に入れた。ゴム状析出物を、これが分解してペースト状固体になるまで撹拌し、これを濾過によって収集し、EtOで洗浄し、減圧下で乾燥させて、オフホワイト色固体を得た(2.85g、99%のHPLC純度、99+%のee)。LCMS(ギ酸モディファイアを用いて、5分にわたって10〜90%のCHCN/水の勾配で溶出するC18カラム)M+1:429.51(2.49分)。HPLC保持時間は、3.86分であった(0.1%のTFAモディファイアおよび1mL/分の流量を用いて、8分にわたって10〜90%のCHCN/水の勾配で溶出するYMC ODS−AQ 150×3.0mmカラム)。分析的キラルHPLCによって1つのエナンチオマーが示され、保持時間は、30℃で1mL/分の流量を用いて、CHIRALPAK(登録商標)IC(登録商標)4.6×250mmカラムで、DCM/MeOH/TEA(60/40/0.1)で溶出して7.8分であった。H NMR (300 MHz, MeOD) δ 8.99 (d, J = 1.6 Hz, 2H), 7.67 (d, J = 6.1 Hz, 1H), 5.38 (t, J = 7.7 Hz, 1H), 4.30 (dd, J = 15.0, 6.9 Hz, 1H), 4.02 (dd, J = 14.8, 7.6 Hz, 1H), 3.38 − 3.30 (m, 2H), 2.73 (s, 3H), 2.70 − 2.60 (m, 1H), 2.20 − 2.07 (m, 2H), 1.99 − 1.84 (m, 1H), 1.64 (s, 6H), 1.22 (t, J = 7.2 Hz, 3H) ppm。
(実施例1.p)
安定性データ
6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物のメシル酸塩は、1週間の時点で、25℃/60%のRHで化学的および物理的に不安定であり、40℃/周囲で貯蔵したとき、t=2週間で化学的に不安定であることが判明した。
遊離塩基の6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物は、1カ月の時点で、すべての貯蔵条件(25℃/60%のRH、40℃/周囲、および40℃/75%のRH)下で化学的および物理的に安定であった。XRPDパターンにおいて小さな変化が観察されたが、すべては、時間ゼロ(t=0)におけるものと同じ形態であるとみなされた。
6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の塩酸塩は、1カ月の時点で、すべての貯蔵条件(25℃/60%のRH、40℃/周囲、および40℃/75%のRH)下で化学的および物理的に安定であった。
(実施例2)
酵素学研究
後述する実験において、本発明の化合物の酵素阻害活性を決定することができる。
DNAジャイレースATPaseアッセイ
ピルビン酸キナーゼ/乳酸脱水素酵素によるADP産生を、NADHの酸化に結び付けて考えることにより、S.aureus DNAジャイレースのATP加水分解活性を測定する。この方法は、以前に記載されている(TamuraおよびGellert、1990年、J. Biol. Chem.、265巻、21342頁)。
100mM TRIS pH7.6、1.5mM MgCl、150mM KClを含有する緩衝溶液において、ATPaseアッセイを30℃で行った。カップリングシステムは、2.5mMホスホエノールピルビン酸、200μMニコチンアミドアデニンジヌクレオチド(NADH)、1mM DTT、30μg/mlピルビン酸キナーゼおよび10μg/ml乳酸脱水素酵素の最終濃度を含有する。酵素(90nM最終濃度)および化合物のDMSO溶液(3%最終濃度)を添加する。反応混合物を10分間30℃でインキュベートする。最終濃度0.9mMのATPの添加により、反応を開始し、340ナノメートルで10分の経過にわたり、NADH消失率をモニターする。率対濃度プロファイルからKおよびIC50値を決定する。
Figure 0006120775
DNA Topo IV ATPaseアッセイ
S.aureus TopoIV酵素によるATPからADPへの転換を、NADHからNAD+への転換に結び付けて考え、340nmにおける吸光度の変化により反応の進行を測定する。TopoIV(64nM)を、バッファー中の選択された化合物(3%DMSO最終)と共に10分間30℃でインキュベートする。バッファーは、100mM Tris7.5、1.5mM MgCl2、200mM K・グルタメート、2.5mMホスホエノールピルビン酸、0.2mM NADH、1mM DTT、5μg/mL直鎖化DNA、50μg/mL BSA、30μg/mLピルビン酸キナーゼおよび10μg/mL乳酸脱水素酵素(lactate dehyrodgenase)(LDH)からなる。ATPにより反応を開始し、20分間30℃でMolecular Devices SpectraMAXプレートリーダーにおいて、率を継続的にモニターする。密接な結合阻害剤のためのMorrison方程式に適合させた、率対選択された化合物の濃度のプロットから、阻害定数KiおよびIC50を決定する。
Figure 0006120775
(実施例3)
液体培地における感受性試験
本発明の化合物を、液体培地における感受性試験により抗菌活性に関して試験した。このようなアッセイは、このような実施を統制する最新のCLSI文書の指針内で行われ得る。「M07−A8 Methods for Dilution Antimicrobial Susceptibility Tests for Bacteria that Grow Aerobically; Approved Standard−−Eighth Edition(2009年)」。「Antibiotics in Laboratory Medicine」(V. Lorian編集、出版社Williams and Wilkins、1996年)等、他の刊行物は、研究室の抗生物質試験における基本的な実際の技法を提供する。用いた具体的なプロトコールは、次の通りであった。
プロトコール#1:微量希釈ブロス方法を用いた化合物のジャイレースMICの決定
材料:
丸底96ウェルマイクロタイタープレート(Costar 3788)
Mueller Hinton II寒天プレート(MHII;BBLプレミックス)
Mueller Hinton II液体ブロス(MHII;BBLプレミックス)
BBL Prompt接種システム(Fisher B26306)
Test Reading Mirror(Fisher)
細菌を画線してシングルコロニーとした寒天プレート、新たに調製
無菌DMSO
ヒト血清(U.S.Biologicals S1010−51)
溶血させたウマ血液(Quad Five 270−100)
レサズリン0.01%
スプラーグドーリーラット(Sprague Dawley Rat)血清(U.S. Biologicals 1011−90BまたはValley BioMedical AS3061SD)
プールしたマウス血清(Valley BioMedical AS3054) 。
株(培地、ブロスおよび寒天):
1.Staphylococcus aureus ATCC#29213
a.MHII
b.MHII+50%ヒト血清
c.MHII+50%ラット血清
d.MHII+50%マウス血清
2.Staphylococcus aureus ATCC#29213GyrB T173I(MHII)
3.Staphylococcus aureus、JMIコレクション株;表9を参照(MHII)
4.Staphylococcus epidermidis、JMIコレクション株;表9を参照(MHII)
5.Enterococcus faecalis ATCC#29212(MHII+3% 溶血させたウマ血液)
6.Enterococcus faecium ATCC#49624(MHII+3% 溶血させたウマ血液)
7.Enterococus faecalis、JMIコレクション株;表9を参照(MHII+3% 溶血させたウマ血液)
8.Enterococus faecium、JMIコレクション株;表9を参照(MHII+3% 溶血させたウマ血液)
9.Streptococcus pneumoniae ATCC#10015(MHII+3% 溶血させたウマ血液)
10.Streptococcus pneumoniae、JMIコレクション株;表9を参照(MHII+3% 溶血させたウマ血液)
11.β−haemolytic streptococci、群A、B、C、G)JMIコレクション株;表9を参照(MHII+3% 溶血させたウマ血液)
12.Bacillus cereus ATCC10987(MHII)
13.Bacillus cereus ATCC14579(MHII)
14.Bacillus subtilis ATCC6638(MHII)
15.Bacillus subtilis(168)ATCC6051(MHII) 。
接種物プレップ(S.aureus+50%血清以外のあらゆる株に関する):
1.BBL Promptキットを使用して、上に表示する適切な寒天培地において増殖した培養物から、5個の大型または10個の小型の十分に離間したコロニーをつついて、キットに提供されている1mLの無菌食塩水に接種した。
2.約30秒間ウェルをボルテックスして、約10細胞/mLの懸濁液を生じた。実際の密度は、この懸濁液の希釈物をプレーティングする(plate out)ことにより確認することができた。
3.試験する化合物のプレート毎に0.15mLの細胞を15mL(約10細胞/mL)無菌ブロス(または後述を参照)に移すことにより、懸濁液を1/100希釈し、次に回旋して混合した。化合物23または24を含む、化合物(>8化合物)の2枚以上のプレートを試験する場合、容積はそれに応じて増加した。
a.E.faecalis、E.faeciumおよびS.pneumoniaeに関しては、14.1mL MHII+0.9mLの溶血させたウマ血液を用いた。
4.50μlの細胞(約5×10細胞)を用いて、ブロス(後述を参照)に希釈した薬物を50μl含有する各マイクロタイターウェルに接種した。
薬物希釈、接種、MICの決定:
1.全薬物/化合物ストックは通常、100%DMSOにおいて12.8mg/mL濃度で調製した。
2.薬物/化合物ストックを、50μLのDMSOにおいて200×所望の最終濃度に希釈した。MICの出発濃度が8μg/mL最終濃度である場合、6.25μLのストック+43.75μL DMSOを必要とした。各200×ストックを、新しい96ウェルマイクロタイタープレートのカラム1の別個の列に置いた。
3.25μLのDMSOを、200×化合物ストックを含有するマイクロタイタープレートの全列のカラム2〜12に添加し、カラム1の25μLをカラム11まで系列的に希釈し、カラム毎にチップを交換した。即ち、25μL化合物+25μL DMSO=2×希釈。対照のため、系列の最後に「化合物なし」DMSOウェルを残した。
4.試験した株(S.aureus+50%ヒト血清を除く)毎に、マトリックスピペッターを用いて50μLのMHIIブロスを有する2枚のマイクロタイタープレートを調製した。
5.50μlの細胞の添加前に、50μLの培地/マイクロタイターウェルに0.5μLの各希釈物を移した(w/マトリックス自動ピペッター)。化合物の通常の出発濃度は、培地+細胞に1/200希釈した後に8μg/mLであった − 化合物濃度は、マイクロタイタープレートの列にわたり2×ステップで減少した。全MICは、2連で行った。
6.全ウェルに、50μlの希釈細胞懸濁液(前述を参照)を接種して、最終容積100μlとした。
7.接種物を添加した後、手動の多チャネルピペッターにより、各ウェルを徹底的に混合した。同一マイクロタイタープレートにおける低濃度から高濃度の薬物に向かう場合、同一チップを用いた。
8.プレートを37℃で少なくとも18時間インキュベートした。
9.18時間後にtest reading mirrorによりプレートを観測して、MICを、増殖が観察されなかった(ウェルにおける光学的透明性)薬物の最低濃度として記録した。
S.aureus+50%ヒト血清、S.aureus+50%ラット血清またはS.aureus+50%マウス血清の調製。
1.15mLのMHII+15mLヒト血清を合わせることにより、50%血清培地を調製した − 合計30mL。2枚以上の化合物プレートを試験する場合、容積を30mL増分で増加させた。
2.上に記載されている通り、S.aureus ATCC#29213の同じBBL Prompt接種物を用いて、上述において調製した30mL(約5×10細胞/mL)の50%ヒト血清培地に0.15mLの細胞を移すことにより1/200希釈し、回旋して混合した。
3.所望の数のマイクロタイタープレートの全試験ウェルを、50%血清培地における100μL細胞で満たした。
4.0.5μLの各化合物希釈物を100μLの細胞/培地に移した(w/マトリックス自動ピペッター)。化合物の通常の出発濃度は、培地+細胞に1/200希釈した後に8μg/mLであった − 化合物濃度は、マイクロタイタープレートの列にわたり2×ステップで減少した。全MICは、2連で行った。
5.手動の多チャネルピペッターにより各ウェルを徹底的に混合した。同一マイクロタイタープレートにおける低濃度から高濃度の薬物に向かう場合、同一チップを用いた。
6.プレートを37℃で少なくとも18時間インキュベートした。インキュベーション後に、25μLの0.01%レサズリンを各ウェルに添加し、37℃で少なくとも追加的に1時間またはレサズリンの色が変化するまでインキュベートを継続した。
7.test reading mirrorによりプレートを観測し、MICを記録した。レサズリンを用いる場合、該色素の色は、増殖なしのウェルにおいて紺青色から明るいピンク色へと変化する。色素をピンク色にする薬物の最低濃度がMICである。
プロトコール#2:微量希釈ブロス方法を用いた、グラム陰性に対する化合物のジャイレースMICの決定
材料:
丸底96ウェルマイクロタイタープレート(Costar 3788)
Mueller Hinton II寒天プレート(MHII;BBLプレミックス)
Mueller Hinton II液体ブロス(MHII;BBLプレミックス)
BBL Prompt接種システム(Fisher b26306)
Test Reading Mirror(Fisher)
細菌を画線してシングルコロニーとした寒天プレート、新たに調製
無菌DMSO 。
株(全株のためのMHII培地;ブロスおよび寒天):
1.Escherichia coli ATCC#25922
2.Escherichia coli、JMIコレクション株、表9を参照
3.Escherichia coliAG100 WT
4.Escherichia coli AG100 tolC
5.Acinetobacter baumannii ATCC#BAA−1710
6.Acinetobacter baumannii ATCC#19606
7.Acinetobacter baumannii、JMIコレクション株、表9を参照
8.Klebsiella pneumoniae ATCC#BAA−1705
9.Klebsiella pneumoniae ATCC#700603
10.Klebsiella pneumoniae、JMIコレクション株、表9を参照
11.Moraxella catarrhalis ATCC#25238
12.Moraxella catarrhalis ATCC#49143
13.Moraxella catarrhalis、JMIコレクション株、表9を参照
14.Haemophilus influenzae ATCC49247
15.Haemophilus influenzae(Rd1 KW20)ATCC51907
16.Haemophilus influenzae Rd0894(AcrA−)
17.Haemophilus influenzae、JMIコレクション株、表9を参照
18.Pseudomonas aeruginosa PAO1
19.Pseudomonas aeruginosa、JMIコレクション株、表9を参照
20.Proteus mirabilis、JMIコレクション株、表9を参照
21.Enterobacter cloacae、JMIコレクション株、表9を参照
22.Stenotrophomonas maltophilia ATCC BAA−84
23.Stenotrophomonas maltophilia ATCC13637 。
接種物プレップ:
1.BBL Promptキットを用いて、寒天培地において増殖した培養物から5個の大型または10個の小型の十分に離間したコロニーをつついて、キットに添えられた1mL無菌食塩水に接種した。
2.約30秒間ウェルをボルテックスし、約10細胞/mLの懸濁液を得た。実際の密度は、この懸濁液の希釈物をプレーティングすることにより確認することができた。
3.試験する化合物のプレート毎に0.15mLの細胞を15mL(約10細胞/mL)無菌ブロス(後述を参照)に移すことにより、懸濁液を1/100希釈し、回旋して
混合した。化合物23または24を含む、化合物(>8化合物)の2枚以上のプレートを試験する場合、それに応じて容積を増加させた。
4.50μlの細胞(約5×10細胞)を用いて、ブロス(後述を参照)に希釈した薬物を50μl含有する各マイクロタイターウェルに接種した。
薬物希釈、接種、MICの決定:
1.全薬物/化合物ストックは通常、100%DMSOにおける12.8mg/mL濃度で調製した。
2.薬物/化合物ストックを、50μL DMSOにおいて200×所望の最終濃度に希釈した。MICの出発濃度が8μg/mL最終濃度である場合、6.25μLのストック+43.75μL DMSOを必要とした。各200×ストックを、新しい96ウェルマイクロタイタープレートのカラム1の別個の列に置いた。
3.25μLのDMSOを、200×化合物ストックを含有するマイクロタイタープレートの全列のカラム2〜12に添加し、カラム1の25μLをカラム11まで系列的に希釈し、カラム毎にチップを交換した。即ち、25μL化合物+25μL DMSO=2×希釈。対照のため、系列の最後に「化合物なし」DMSOウェルを残した。
4.試験した株毎に、マトリックスピペッターを用いて50μLのMHIIブロスを有する2枚のマイクロタイタープレートを調製した。
5.50μlの細胞の添加前に、50μLの培地/マイクロタイターウェルに0.5μLの各希釈物を移した(w/マトリックス自動ピペッター)。化合物の通常の出発濃度は、培地+細胞に1/200希釈した後、8μg/mLであった − 化合物濃度は、マイクロタイタープレートの列にわたり2×ステップで減少した。全MICは、2連で行った。
6.全ウェルに、50μlの希釈細胞懸濁液(前述を参照)を接種して、最終容積100μlとした。
7.接種物を添加した後、各ウェルを手動の多チャネルピペッターにより徹底的に混合した。同一マイクロタイタープレートにおける低濃度から高濃度の薬物に向かう場合、同一チップを用いた。
8.プレートを37℃で少なくとも18時間インキュベートした。
9.18時間後にtest reading mirrorによりプレートを観測し、MICを、増殖が観察されなかった(ウェルにおける光学的透明性)薬物の最低濃度として記録した。
プロトコール#3:寒天希釈方法を用いた化合物のジャイレースMICの決定
材料:
ペトリプレート60×15mm(Thermo Scientific Cat.#12567100)
遠心分離チューブ、15mL(Costar)
BBL Prompt接種システム(Fisher b26306)
細菌を画線してシングルコロニーとした寒天プレート、新たに調製
無菌DMSO
GasPak(商標)インキュベーションコンテナ(BD Cat.#260672)
GasPak(商標)EZ嫌気性菌コンテナシステムサシェ(BD Cat.#260678)
GasPak(商標)EZ C02コンテナシステムサシェ(BD Cat.#260679)
GasPak(商標)EZ Campyコンテナシステムサシェ(BD Cat.#260680) 。
株:
1.Clostridium difficile ATCC BAA−1382;
2.Clostridium difficile、CMIコレクション株、表8を参照
3.Clostridium perfringens、CMIコレクション株、表8を参照
4.Bacteroides fragilisおよびBacteroides spp.、CMIコレクション株、表8を参照
5.Fusobacterium spp.、CMIコレクション株、表8を参照
6.Peptostreptococcus、spp.、CMIコレクション株、表8を参照
7.Prevotella spp.、CMIコレクション株、表8を参照
8.N. gonorrhoeae ATCC 35541
9.N. gonorrhoeae ATCC 49226
10.Neisseria gonorrhoeae、JMIコレクション株、表8を参照
11.Neisseria meningitidis、JMIコレクション株、表8を参照 。
培地調製および増殖条件:
CLSI刊行物「M11−A7 Methods for Antimicrobial Susceptibility Testing of Anaerobic Bacteria; Approved Standard − 第7版(2007年)」に従って、各微生物種に推奨される増殖培地を調製したが、例外として、N.gonorrhoeaeおよびN.meningitidisの培地は、「M07−A8 Methods for Dilution Antimicrobial Susceptibility Tests for Bacteria that Grow Aerobically; Approved Standard−−第8版(2009年)」に従って調製した。
プレート注液:
1.表1に記載されている各被験化合物の100×薬物ストックを調製した。15mL遠心分離チューブを用いて、100μLの各薬物ストックを、10mLの融解した寒天(水浴において約55℃まで冷却)に添加した。チューブを2〜3回反転することにより混合し、次に、個々にラベル付けした60×15mmペトリ皿に注ぎ入れた。
2.慣用的な試験濃度:0.002μg/mL〜16μg/mL(14プレート)であった。
3.4枚の薬物不含プレートを注いだ:2枚は陽性対照、2枚は好気的対照。
4.プレートを乾かした。同日に使用、あるいはRTで一晩保存、あるいは最大3日間4℃で保存した。
5.薬物濃度および株の配置に従ってプレートにラベル付けした。
嫌気的環境の維持を必要とする細胞の増殖:
1.嫌気細菌を用いて行った全作業は、可能な限り迅速になされた。バイオセーフティーキャビネット内(即ち、好気的環境)で行う作業は、細胞を嫌気チャンバーに戻す前に30分未満で完了させた。
2.嫌気細菌のインキュベーションは、GasPak(商標)チャンバーを用いて達成した。大型のボックススタイルのチャンバー(VWR90003−636)は、2個の嫌気的サシェ(VWR90003−642)を必要としたが、背の高いシリンダースタイルのチャンバー(VWR90003−602)は、1個のサシェしか必要としなかった。
プレート接種(バイオセーフティーキャビネット内で行った):
1.上に記載されている個々の寒天プレート上に各株を画線した。要求される時間および環境条件(即ち、嫌気性、微好気性等)でインキュベートした。
2.直接的なコロニー懸濁方法を用いて、白金耳量の新たに画線した細胞を、約4mLの0.9%NaClに懸濁して、ボルテックスした。
3.懸濁液をO.D.600 0.05(5×10e7 cfu/mL)に調整した。ボルテックスして混合した。
4.約0.2mLの調整・混合済培養物を96ウェルプレートに移した。5つ以下の株を試験する場合、全株を共に一列に並べた。5つより多い株を試験する場合、5株以下が一列に収まるよう株をプレートに移した。このことは、小型のプレートに適合させるために必要であった。
5.多チャネルピペッターを用いて、調製した96ウェルプレートから、各MIC試験プレートへと0.002mLの各株をスポットした。これにより、約1×10e5 cfu/スポットとなった。C.difficileを試験する場合、株は増殖の際にスウォーミングするが、多チャネルピペッタースポット間の距離は、スウォーミングする細胞がアッセイ結果を損なわないように、十分に開いている。
a.2枚の薬物不含プレートを先ず接種し、一方、他の2枚の薬物不含プレートは、MIC試験プレート後の最後に接種した。前者および後者は、増殖および接種対照とした。薬物不含対照の各セット由来の1枚のプレートを、要求される大気条件下でMICプレートと共にインキュベートし、1セットを好気的にインキュベートして、好気細菌によるコンタミネーションを試験した。厳密な嫌気性菌または微好気性株で作業した場合、好気的培養は、増殖に対し陰性であった。N.gonorrhoeaeの場合、ある程度の増殖が目に見えた。
6.接種物を乾燥させ(必要な限り短い時間)、次に、適切な数のサシェと共にGasPakにおいてひっくり返して置き、インキュベートした。
7.Neisseria spp.を、37℃、5%CO環境で24時間インキュベートした。
MICの決定:
正確なインキュベーション時間後に試験プレートを検査し、陽性対照プレートにおける増殖の出現と比較して試験プレートにおける増殖の出現において著しい低下が生じた濃度におけるMICエンドポイントを読み取った。
Figure 0006120775
プロトコール#4.Mycobacterium属の種のためのMICの決定手順
材料
丸底96ウェルマイクロタイタープレート(Costar 3788)または類似物
フィルムプレートシール(PerkinElmer、TopSeal−A#6005250または類似物)
Middlebrook 7H10ブロス、0.2%グリセロール含有
Middlebrook 7H10寒天、0.2%グリセロール含有
Middlebrook OADC Enrichment
M.tuberculosisの接種物調製:
1.−70℃に保存した調製済凍結M.tuberculosisストックを用いた。M.tuberculosisは、7H10ブロス+10%OADCにおいて増殖させ、次に100 Klettまたは5×10cfu/mlの濃度で凍結した。
2.1mlの凍結ストックを取り出し、これを19mlの7H10ブロス+10%OADCに添加することにより、1:20希釈物を調製した(最終濃度2.5×10cfu/ml)。
3.この希釈物から、第二の1:20希釈物を調製した、即ち、1mlを取り出して、これを19mlの新鮮ブロスに添加した。これが、96ウェルプレートに添加するための最終接種物である。
M.kansasii、M.avium、M.abscessusおよびNocardia spc.の接種物調製:
1.10 Klettまたは5×10/mlの濃度の、7H10ブロスにおいて増殖した培養物の調製済凍結ストックまたは新鮮培養物を用いた。
2.1.0mlの培養ストックを取り出し、これを19mlの7H10ブロスに添加することにより、1:20希釈物を調製した(最終濃度2.5×10cfu/ml)。
3.この希釈物から、1:20希釈物を調製した、即ち、1mlを取り出し、これを19mlの新鮮ブロスに添加した(最終懸濁液)。
プレート調製:
1.プレートにラベル付けした。
2.多チャネル電子ピペッターを用いて、50μlの7H10ブロス+10%OADCを、MICの決定に利用されている全ウェルに添加した。
3.試験する薬物のストック溶液(例えば、1mg/ml濃度)を調製した。
4.凍結ストック溶液を解凍し、7H10ブロス+10%OADCを用いて希釈して、作業溶液(working solution)4×被験最大濃度を得た(例えば、最終濃度32μg/ml、被験最高濃度8μg/ml)。ストック溶液から希釈物を作製した。1μg/mlの濃度から出発するために4μg/mlの薬物を調製し、これにより出発濃度は1μg/mlとなった。1mg/mlストックの25μlを取り出し、6.2mlのブロスに添加した。薬物の全希釈は、ブロスにおいて行った。
5.50μlの4×作業溶液を、指定の列の第一のウェルに添加した。試験する全化合物に対し継続した。多チャネル電子ピペッターを用いて、4×を混合し、11番目のウェルまで化合物を系列希釈した。残った50μlを廃棄した。12番目のウェルを陽性対照として用いた。
6.M.tuberculosisは、約18日間;M.aviumおよびM.kansasiiは、約7日間;NocardiaおよびM.abcessusは、約4日間、プレートをフィルムシールして37℃でインキュベートした。
7.結果を視覚的に読み取り、記録した。増殖が観察されなかった(ウェルにおける光学的透明性)薬物の最低濃度としてMICを記録した。
プロトコール#5.Mycobacterium tuberculosis血清シフトMICアッセイのプロトコール
材料および試薬:
Costar#3904 側面が黒色の平底96ウェルマイクロタイタープレート
Middlebrook 7H9ブロス(BD271310)、0.2%グリセロール含有
Middlebrook OADC Enrichment
ウシ胎仔血清
カタラーゼ(Sigma C1345)
デキストロース
NaCl
BBL Prompt接種システム(Fisher b26306)
寒天プレート(Middlebrook 7H11、0.2%グリセロールおよびOADC enrichment含有)、細菌を画線してシングルコロニーとした
無菌DMSO 。
培地プレップ:
1.血清シフトMICのため、すべて7H9+0.2%グリセロールの基剤を有する3種の異なる培地が必要とされる。あらゆる培地およびサプリメントをMIC前に滅菌することが重要であった。
2.下の全培地を調製し、次のセクションに記載されている通りに接種した。各培地を用いて全化合物をMtbに対し試験した。
a.7H9+0.2%グリセロール+10%OADC(「標準」MIC培地)。
b.7H9+0.2%グリセロール+2g/Lデキストロース+0.85g/L NaCl+0.003g/Lカタラーゼ(0%FBS)。
c.2×7H9+0.2%グリセロール+2g/Lデキストロース+0.85g/L NaCl+0.003g/Lカタラーゼ、等容積のウシ胎仔血清(50%FBS)と合わせる。
接種物プレップ:
1.BBL Promptを用いて、5〜10個の十分に離間したコロニーをつついて、キットに添えられた1mlの無菌食塩水に接種した。この生物は培養物において増殖が遅いため、通例、プレートは、本アッセイに用いるときには培養2〜3週間経過したものである。
2.十分にボルテックスし、次に水浴において30秒間超音波処理して、約10細胞/mlの懸濁液を得た。実際の密度は、この懸濁液の希釈物のプレーティングにより確認することができた。
3.BBL Prompt懸濁液を1/200希釈することにより(例えば、0.2mlの細胞を40mlの培地に移し)、3種の培地処方物それぞれにおいて接種物を調製して、約10細胞/mlの出発細胞密度を得た。
4.100μlの細胞(約5×10細胞)を用いて、1μlのDMSOに溶解させた薬物(後述を参照)を含有する各マイクロタイターウェルに接種した。
薬物希釈、接種、MICの決定:
1.対照薬物ストック、イソニアジドおよびノボビオシンは、100%DMSOにおける10mMで調製し、一方、シプロフロキサシンおよびリファンピンは、それぞれ50%DMSOおよび100%DMSOにおいて1mMで調製した。希釈物の調製 − 100μLのストック溶液を、96ウェルプレートの第一のカラムに分注した。カラム1の50μlを、カラム2における50μlのDMSOに移すことにより、化合物毎に列にわたり、11ステップの2倍系列希釈物を調製した。混合し、カラム毎にチップを交換しつつ、引き続きカラム2の50μLをカラム11まで移した。対照としてカラム12をDMSOのみのまま残した。
2.100μlの細胞の添加前に、1μlの各希釈物を空のマイクロタイターウェルに移した。イソニアジドおよびノボビオシンの出発濃度は、培地+細胞に希釈した後に100μMであった。シプロフロキサシンおよびリファンピンの出発濃度は、培地+細胞に希釈した後に10μMであった。化合物濃度は、マイクロタイタープレートの列にわたり進む毎に2×ステップで減少した。全MICは、3種の培地条件のそれぞれにおいて2連で行った。
3.化合物の試験セットは通例、10mMおよび50μL容積であった。
4.多チャネルピペッターを用いて、マスタープレートの各カラムから全容積を取り出し、新しい96ウェルマイクロタイタープレートの第一のカラムに移した。マスタープレートにおける化合物の各カラムについて反復し、新しい96ウェルプレートのカラム1に移した。
5.対照化合物に関して上に記載されている通り、DMSOを希釈剤として用いて、各化合物の2倍、11点の希釈物を作製した。全事例において、対照のためカラム12はDMSOのみとして残した。全希釈を完了した後、100μlの細胞の添加前に、対照化合物に対してなされた通り、各希釈物の1μlを空のマイクロタイターウェルに再度移した。
6.全ウェルを100μlの希釈細胞懸濁液(前述を参照)で接種した。
7.接種物を添加した後、プレートの側面を穏やかにタッピングすることによりプレートを混合した。
8.プレートを加湿した37℃チャンバーにおいて9日間インキュベートした。
9.9日目に、25μlの0.01%無菌レサズリンを各ウェルに添加した。励起492nm、発光595nmでバックグラウンド蛍光を測定し、プレートをさらに24時間インキュベーターに戻した。
24時間後、励起492nm、発光595nmで各ウェルの蛍光を測定した。
所定の化合物によるパーセント阻害を次の通りに計算した。パーセント阻害=100−([ウェル蛍光−平均バックグラウンド蛍光]/[DMSO対照−平均バックグラウンド蛍光]×100)。全3種の培地条件に対し、所定の培地条件においてレサズリンの還元シグナルを≧70%阻害する最低化合物濃度(「%−阻害」)としてMICを点数化した。
表6は、本発明のベンゾイミダゾリル尿素化合物のメシル酸塩のためのMICアッセイの結果を示す。
表6ならびにその後の表および実施例において、「化合物24」は、「化合物23」のメシル酸塩であり、化合物24は実施例1.j(上述)に従って調製されてもよい。これは、上述の実施例において使用される番号と同じである、前記化合物を同定するために使用される番号である。
Figure 0006120775
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表7は、本発明の選択された化合物のMIC90アッセイの結果を示す。
Figure 0006120775
下の表8において、用語「CMI」は、オレゴン州ウィルソンヴィルに位置するThe Clinical Microbiology Instituteの略である。
Figure 0006120775
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下の表9において、用語「JMI」は、アイオワ州ノースリバティーに位置するThe Jones Microbiology Instituteの略である。
Figure 0006120775
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Claims (20)

  1. 式(I):
    Figure 0006120775

    の化合物の固体形態Iであって、X線粉末回折パターン(XRPD)が5〜38度2θから収集されるとき、9.3、11.7、12.1、12.4、14.5、15.9、16.3、16.6、18.5、19.4、21.5、22.3、22.8、23.8、24.5、25.7、28.1、28.4、30.3、および33.4からなる群から選択される、CuKα放射線を使用して測定した場合の少なくとも3つのピーク位置(度2θ±0.2)を含む前記XRPDを特徴とする、固体形態I。
  2. 式(I):
    Figure 0006120775

    の化合物の固体形態Iであって、X線粉末回折パターン(XRPD)が5〜38度2θから収集されるとき、9.3、16.6、18.5、19.4、21.5、および25.7からなる群から選択される、CuKα放射線を使用して測定した場合の少なくとも3つのピーク位置(度2θ±0.2)を含む前記XRPDを特徴とする、固体形態I。
  3. 温度が1分当たり10℃でスキャンされる示差走査熱量測定によって測定される場合に318℃の開始温度を有する吸熱ピークをさらに特徴とする、請求項2に記載の固体形態I。
  4. 請求項1または2に記載の式(I)の化合物の固体形態Iを調製するための方法であって、アルコールおよびエーテルを含む溶媒系中に、式(I):
    Figure 0006120775

    の化合物の遊離塩基の固体材料を懸濁させるステップと、前記固体を単離するステップとを含む、方法。
  5. 式(I):
    Figure 0006120775

    の化合物の塩酸塩。
  6. X線粉末回折パターン(XRPD)が5〜38度2θから収集されるとき、6.7、9.2、16.7、18.6、19.5、20.5、25.6、および27.5からなる群から選択される、CuKα放射線を使用して測定した場合の少なくとも3つのピーク位置(度2θ±0.2)を含む前記XRPDを特徴とする形態IIの固体形態である、請求項5に記載の塩酸塩。
  7. 前記形態IIの固体形態が、温度が1分当たり10℃でスキャンされる示差走査熱量測定によって測定される場合に252℃の開始温度を有する吸熱ピークをさらに特徴とする、請求項6に記載の塩酸塩。
  8. 請求項6に記載の式(I)の化合物の塩酸塩の固体形態IIを調製するための方法であって、1つまたは複数のエーテル溶媒および水を含む酸性溶媒混合物中に(R)−1−エチル−3−[6−フルオロ−5−[2−(1−ヒドロキシ−1−メチル−エチル)ピリミジン−5−イル]−7−(テトラヒドロフラン−2−イル)−1H−ベンゾイミダゾール−2−イル]尿素の遊離塩基を懸濁させるステップを含む、方法。
  9. 式I:
    Figure 0006120775

    の6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の非晶形III。
  10. 識別できる回折ピークをまったく含まない広いハローによって特徴付けられる、CuKα放射線を使用したX線粉末回折パターン(XRPD)を特徴とする、請求項9に記載のフルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の非晶形III。
  11. 請求項9に記載の6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の非晶形IIIを調製するための方法であって、前記6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物の溶液を、凍結乾燥、噴霧乾燥、ドラム乾燥、またはパルス変換乾燥させるステップを含む、方法。
  12. 式I:
    Figure 0006120775

    の6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物のメシル酸塩の非晶形IV。
  13. 識別できる回折ピークをまったく含まない広いハローによって特徴付けられる、CuKα放射線を使用したX線粉末回折パターン(XRPD)を特徴とする、請求項12に記載の6−フルオロベンゾイミダゾリル尿素化合物のメシル酸塩の非晶形IV。
  14. 前記形態IIの固体形態が、最大75%の相対湿度を伴った40℃で、少なくとも1カ月間安定である、請求項6に記載の塩酸塩。
  15. 最大75%の相対湿度を伴った40℃で、少なくとも1カ月間安定である、請求項1に記載の固体形態I。
  16. 請求項1または2に記載の化合物、および薬学的に許容される担体、アジュバント、またはビヒクルを含む、医薬組成物。
  17. 患者における院内または非院内細菌感染症を制御、処置、またはその進行、重症度、もしくは影響を低減するための請求項16に記載の医薬組成物。
  18. 前記細菌感染症が、Mycobacterium tuberculosis、Streptococcus pneumoniae、Staphylococcus epidermidis、Enterococcus faecalis、Staphylococcus aureus、Clostridium difficile、Moraxella catarrhalis、Neisseria gonorrhoeae、Neisseria meningitidis、Mycobacterium avium complex、Mycobacteriumabscessus、Mycobacterium kansasii、Mycobacterium ulcerans、Chlamydophila pneumoniae、Chlamydia trachomatis、Haemophilus influenzae、Streptococcus pyogenes、またはβ−溶血性streptococciのうちの1つまたは複数の存在を特徴とする、請求項17に記載の医薬組成物。
  19. 前記細菌感染症が、以下、即ち、上気道感染症、下気道感染症、耳感染症、胸膜肺感染症および気管支感染症、複雑性尿路感染症、単純性尿路感染症、腹腔内感染症、心血管感染症、血流感染症、敗血症、菌血症、CNS感染症、皮膚感染症および軟部組織感染症、GI感染症、骨関節症および関節感染症、生殖器感染症、眼感染症、または肉芽腫性感染症、単純性皮膚および皮膚構造感染症(uncomplicated skin and
    skin structure infection)(uSSSI)、複雑性皮膚および皮膚構造感染症(complicated skin and skin structure infection)(cSSSI)、カテーテル感染症、咽頭炎、副鼻腔炎、外耳炎、中耳炎、気管支炎、膿胸、肺炎、市中細菌性肺炎(CABP)、院内肺炎(HAP)、院内細菌性肺炎、人工呼吸器関連肺炎(VAP)、糖尿病性足感染症、バンコマイシン耐性enterococci感染症、膀胱炎および腎盂腎炎、腎結石、前立腺炎、腹膜炎、複雑性腹腔内感染症(cIAI)、ならびに他の腹腔内(inter−abdominal)感染症、透析関連腹膜炎、内臓膿瘍、心内膜炎、心筋炎、心膜炎、輸血関連敗血症、髄膜炎、脳炎、脳膿瘍、骨髄炎、関節炎、生殖器潰瘍、尿道炎、膣炎、子宮頸管炎、歯肉炎、結膜炎、角膜炎、眼内炎(endophthalmitisa)、嚢胞性線維症患者の感染症、または発熱性好中球減少症患者の感染症のうちの1つまたは複数から選択される、請求項18に記載の医薬組成物。
  20. 前記細菌感染症が、以下、即ち、市中細菌性肺炎(CABP)、院内肺炎(HAP)、院内細菌性肺炎、人工呼吸器関連肺炎(VAP)、菌血症、糖尿病性足感染症、カテーテル感染症、単純性皮膚および皮膚構造感染症(uSSSI)、複雑性皮膚および皮膚構造感染症(cSSSI)、バンコマイシン耐性enterococci感染症、または骨髄炎のうちの1つまたは複数から選択される、請求項19に記載の医薬組成物。
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