JP5980580B2 - アスパラギン酸由来アミノ酸および化学物質の改善された生産のための改変グリオキシル酸シャント - Google Patents
アスパラギン酸由来アミノ酸および化学物質の改善された生産のための改変グリオキシル酸シャント Download PDFInfo
- Publication number
- JP5980580B2 JP5980580B2 JP2012131737A JP2012131737A JP5980580B2 JP 5980580 B2 JP5980580 B2 JP 5980580B2 JP 2012131737 A JP2012131737 A JP 2012131737A JP 2012131737 A JP2012131737 A JP 2012131737A JP 5980580 B2 JP5980580 B2 JP 5980580B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- promoter
- gene
- natural
- seq
- strain
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P13/00—Preparation of nitrogen-containing organic compounds
- C12P13/04—Alpha- or beta- amino acids
- C12P13/08—Lysine; Diaminopimelic acid; Threonine; Valine
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P13/00—Preparation of nitrogen-containing organic compounds
- C12P13/04—Alpha- or beta- amino acids
- C12P13/06—Alanine; Leucine; Isoleucine; Serine; Homoserine
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P13/00—Preparation of nitrogen-containing organic compounds
- C12P13/04—Alpha- or beta- amino acids
- C12P13/12—Methionine; Cysteine; Cystine
Landscapes
- Organic Chemistry (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Microbiology (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Description
本出願は、係属中の米国仮特許出願第60/692,341号(出願日2005年6月20日)への優先権を主張する。上記出願は、あたかも本明細書に完全に再記載されているかのように参考として援用される。
以下には、本発明を理解するのに有用な場合がある情報が含まれる。但し、本明細書に提供される情報の何れかが、本明細書において記載又は請求される発明の従来技術又は材料であることも、或いは具体的又は暗示的に言及される何れかの刊行物又は文書が従来技術であることも認めることはない。
そして、アスパラギン酸塩はオキサロ酢酸(OAA)に由来する。Gokarn等の特許文献1で報告されている通り、好気性発酵を使用して、オキサロ酢酸誘導アミノ酸を生成することができる。残念ながら、プロセスの収率は、炭素フローのストリンジェントな代謝調節によって制限される場合がある。一般的に、OAAに向かう炭素フラックスは、代謝システムへの摂動に関係なく、一定のままであると言われる(J. Vallinoら、Biotechnol. Bioeng., 41:633, 646 (1993))。この代謝調節を克服することが、OAA由来のアミノ酸及びその他の産物の生成を増大させるに当たって有利であると考えられる。
aceB、リンゴ酸シンターゼA:アセチル−CoA+H2O+グリコキシレート<・・・>リンゴ酸塩+CoA
glcB、リンゴ酸シンターゼG:アセチル−CoA+H2O+グリコキシレート<・・・>リンゴ酸塩+CoA
大腸菌では、グリオキシル酸シャント酵素をコードする遺伝子は、aceBAKオペロンに位置する。遺伝子は、例えば、IclR(A. Sunnarborgら、J. Bact., 172:2642−2649 (1990))、FadR(S. Maloyら、J. Bact. 148:83−90 (1981))、FruR(A. Chiaら、J. Bact., 171:2424−2434 (1989))、及びArcAB(S. Iuchiら、J. Bact., 171:868−873 (1989))を含めて、幾つかの転写調節因子によって制御されると言われる。
.F. and Wensink, P.C. Practical Methods in Molecular Biology, Springer−Verlag (1981); Singer, M. and Berg, P. Genes & Genomes, University Science Books, Mill Valley, California (1991); Kaufman, P.B.ら、Handbook of Molecular and Cellular Methods in Biology and Medicine, CRC Press, Boca Raton, Florida (1995); Plasmids: A Practical Approach, 2nd Edition, Hardy, K.D.ら、Oxford University Press, New York, N.Y. (1993); Vectors: Essential Data, Gacesa, P. and Ramji, D.P. eds., John Wiley & Sons Pub., New York, N.Y. (1994); PCR primer: A Laboratory Manual, Dieffenbach, C.W. and Dveksler, G.S. eds., Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York, NY (1995); PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications, Innis, M.A.ら、eds., Academic Press, San Diego, CA (1990); Guide to Electroporation and Electrofusions, Chang, D.ら、eds., Academic Press, San Diego, CA (1992); Promiscuous Plasmids of Gram−Negative Bacteria, Thomas, C.M., eds., Academic Press, London (1989); The Biology of Plasmids, Summers, D.K., Blackwell Science, Cambridge, MA (1996); Understanding DNA and Gene Cloning: A Guide for the Curious, Drlica, K., eds., John Wiley and Sons Pub., New York, NY (1997); Vectors: A Survey of Molecular Cloning Vectors and Their Uses, Rodriguez, R.L.ら、eds., Butterworth, Boston, MA (1988); Bacterial Conjugation, Clewell, D.B., eds., Plenum Press, New York, N.Y (1993); Del Solar, G.ら、Replication and control of circular bacterial plasmids, Microbiol. Mol. Biol. Rev. 62:434−464 (1998); Meijer, W.J.ら、Rolling−circle plasmids from Bacillus subtilis: complete nucleotide sequences and analyses of genes of pTA1015, pTA1040, pTA1050 andpTA1060, and comparisons with related plasmids from gram−positive bacteria, FEMS Microbiol. Rev. 21:337−368 (1998); Khan, S.A., Rolling−circle replication of bacterial plasmids, Microbiol. Mol. Biol. Rev. 61:442−455 (1997); Baker, R.L., Protein expression using ubiquitin fusion and cleavage, Curr. Opin. Biotechnol. 7:541−546 (1996); Makrides, S.C., Strategies for achieving high−level expression of genes in Escherichia coli, Microbiol. Rev. 60:512−538 (1996); Nicholl, D.S.T., Introduction to Genetic Engineering(2d ed.) 2002; Alonso, J.C.ら、Site−specific recombination in gram−positive theta−replicating plasmids, FEMS Microbiol. Lett. 142:1−10 (1996); Miroux, B.ら、Over−production of protein in Escherichia coli: mutant hosts that allow synthesis of some membrane protein and globular protein at high levels, J. Mol. Biol. 260:289−298 (1996); Kurland, C.G. and Dong, H., Bacterial growth inhibited by over−production of protein, Mol. Microbiol. 21:1−4 (1996); Saki, H. and Komano, T., DNA replication of IncQ broad−host−range plasmids in gram−negative bacteria, Biosci. Biotechnol. Biochem. 60:377−382 (1996); Deb, J.K. and Nath, N., Plasmids of Corynebacteria, FEMS Microbiol. Lett. 175:11−20 (1999); Smith, G.P., Filamentous pharges as cloning vectors, Biotechnol. 10:61−83 (1988); Espinosa, M.ら、Plasmid rolling circle replication and its control, FEMS Microbiol. Let
t. 130:111−120 (1995); Lanka, E. and Wilkins, B.M., DNA processing reaction in bacterial conjugation, Ann. Rev. Biochem. 64:141−169 (1995); Dreiseikelmann, B., Translocation of DNA across bacterial membranes, Microbiol. Rev. 58:293−316 (1994); Nordstrom, K. and Wagner, E.G., Kinetic aspects of control of plasmid replication by antisense RNA, Trends Biochem. Sci. 19:294−300 (1994); Frost, L.S.ら、Analysis of the sequence gene products of the transfer region of the F sex factor, Microbiol. Rev. 58:162−210 (1994); Drury, L., Transformation of bacteria by electroporation, Methods Mol. Biol. 58:249−256 (1996); Dower, W.J., Electroporation of bacteria: a general approach to genetic transformation, Genet. Eng. l2:275−295 (1990); Na, S.ら、The factors affecting transformation efficiency of coryneform bacteria by electroporation, Chin. J. Biotechnol. 11:193−198 (1995); Pansegrau, W., Covalent association of the traI gene product of plasmid RP4 with the 5’−terminal nucleotide at the relaxation nick site, J. Biol. Chem. 265:10637−10644 (1990); Bailey, J.E., Host−vector interactions in Escherichia coli, Adv. Biochem. Eng. Biotechnol. 48:29−52 (1993); Funkhouser, J.D. and Smith, W.D., Monovalent Cation Effects on Lysine−sensitive Aspartokinase Catalytic Activity and Allosteric Regulation. J. Biol. Chem. 249:7580−7583 (1974); Chassagnole, C.ら、Control of threonine−synthesis pathway in Escherichia coli: a theoretical and experimental approach. Biochem. J. 356:433−444 (2001); Rais, B.ら、Biochem. J. 356:425−432 (2001); Escherichia coli and Salmonella cellular and molecular biology, Neidhardtら、eds., American Society of Microbiology Press, Washington, D.C. (1996); de Boer, H.A.ら、The tac promoter: a functional hybrid derived from the trp and lac promoters. Proc. Natl. Acad. Sci. 80:21−25 (1983); Hawley, D.K. and McClure, W.R., Compilation and analysis of Escherichia coli promoter DNA sequences. Nucleic Acids Res. 11:2237−2255 (1983); Khlebnikov A. and Keasling, J.D., Effect of lacY expressio
n on homogeneity of induction from the Ptac and Ptrc promoters by natural and synthetic inducers. Biotechnol. Prog. l8:672−674 (2002); Mulligan, M.E.ら、Characterization in vitro of the effect of spacer length on the activity of Escherichia coli RNA polymerase at the tac promoter. J. Biol. Chem. 260:3529−3538 (1985); Chung, T.ら、Glyoxylate Bypass Operon of Escherichia coli Cloning and Determination of the Functional Map. J. Bact. 170:386−392 (1987); Jurgen Brosiusら、Spacing of the −10 and −35 regions in the tac promoter. J. Biol. Chem. 260:3539−3541 (1985); Jensen, P.R., and Hammer, K., Artificial promoter for metabolic optimization. Biotechnol. Bioeng. 58:191−195 (1998); Patek, M.ら、Promoter from Corynebacterium glutamicium: cloning, molecular analysis and search for a consensus motif. Microbiol. 142:1297−1309 (1996); Shine, J. and Dalgarno, L., Determinant of cistron specificity in bacterial ribosome. Science 254:34−38 (1975); Shine, J. and Dalgarno, L., Terminal−sequence analysis of bacterial ribosomal RNA. Correlation between the 3’−terminal−polypyrimidine sequence of 16−S RNA and translational specificity of the ribosome. Eur. J. Biochem. 57:221−230 (1975); Stormo, G.D.ら、Characterization of translational initiation sites in E. coli. Nucleic Acids Res. 10:2971−2996 (1982); de Boer, H.A.ら、A hybrid promoter and portable Shine−Dalgrano regions in Escherichia coli. Biochem. Soc. Symp. 48:233−244 (1983); Meinicke, P.ら、Oligo kernels for datamining on biological sequences: a case study on prokaryotic translation initiation sites. BMC Bioinformatics 5:169 (2004); Barrick, D.ら、Quantitative analysis of ribosome binding sites in E. coll. Nucleic Acids Res. 22:1287−1295 (1994); de Boer, H.A.ら、The tac promoter: a functional hybrid derived from the trp and lac promoters. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 80:21−25 (1983); Lithwick, G. and Margalit, H., Hierarchy of sequence−dependent features associated with prokaryotic translation. Genome Res. 13:2665−2673 (2003); Maloy, S.R.ら、Elevated levels of glyoxylate shunt enzymes in Escherichia coli strains constitutive for fatty acid degradation. J. Bact. 143:720−725 (1980); Ma, J.ら、Correlation between Shine−Dalgarno sequence and gene features such as predicted expression levels and operon structures. J. Bact. 184:5733−5745 (2002); Datsenko, K.A. and B.L. Wanner, One step inactivation of chromosomal genes in Escherichia coli K−12 using PCR products. PNAS 97:6640−6645 (2000); Ornston, L.N. and M.K. Ornston, Regulation of glyoxylate metabolism in Escherichia coli K−12. J. Bact. 98:1098−1108 (1969); Alexeyev, M.F.ら、Improved antibiotic−resistance gene cassettes and omega elements for Escherichia coli vector construction and in vitro deletion/insertion mutagenesis. Gene 160:63−67 (1995); Cremer, J.ら、Regulation of enzymes of lysine Biosynthesis in Corynebacterium glutamicum. J. Gen. Micro 134:3221−3229 (1988); Blattnerら、The Complete genome sequence of Escherichia coli K−12. Science 277:1453−1474 (1997)。
本明細書に記載及び請求される本発明は、多くの属性を有し、この概要において述べられるものを非限定的に含めて、多くの実施形態を含む。本明細書に記載及び請求される本発明は、単に例示であって、限定を目的とせずに含まれているこの概要において識別される特徴又は実施形態に限定されず、或いはそれによって限定されるものではない。
a)配列番号3、5、8からなる群から選択されるタンパク質をコードするDNA;
b)配列番号9、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号24、及び配列番号25の少なくとも1つによる核酸;
c)b)による核酸の遺伝子コードに関してのみ縮重している核酸;
d)a)又はb)による核酸の非表現突然変異を含む核酸;
e)b)の核酸と少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%同一である核酸;及び
f)b)によるDNAとストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸
の少なくとも1つを含む、組換え核酸を含む。
以下で考察する通り、本発明は、アスパラギン酸由来のアミノ酸及び化学物質を生成するための微生物菌株処理向上特性を提供する。このような菌株を作製する方法が提供される。これらの方法は、aceBAKオペロン、aceA遺伝子、aceB遺伝子、glcB遺伝子、又はその組み合わせの発現を変化させることを含む。発現の変化は、転写の増大、及び/又は天然転写制御の軽減により達成される場合がある。これらの遺伝子の天然プロモーターの置換も考慮される。例えば、その天然プロモーターが、tacプロモーター(Ptac)によって置換される場合がある。ベクターを含めて、本発明の新規の特徴を提供する遺伝子構築物も提供され、このようなベクターは、プラスミド、コスミド、ウィルス、ファージ、トランスポゾン、又は微小染色体である場合があるが、これらに限定されない。
本明細書で使用される特定の用語は、当業者によって使用され、このような者によって一般的に理解される通常の意味を有する。このような通常の意味の最も完全な範囲が、本明細書に包含されるものとして意図される。しかし、本明細書及び特許請求の範囲の用語に与えられる範囲を含め、これらの文書に対する理解を明確且つ一貫したものにするために、以下の定義が提供される。本明細書で提供される定義と競合する場合がある意味が主張された場合は、提供した定義が優先される。“a”又は“an”の冠詞を伴う実体は、その実体の1つ以上を指すことに留意されたい。例えば、“a polynucleotide”という表現は、1つ以上のポリヌクレオチドを表すものとして理解される。従って、“a”、“an”、「1つ以上(one or more)」、及び「少なくとも1つ(at least one)」は、本明細書において交換可能に使用することができる。
本発明の態様は、1つ以上のアミノ酸を過剰生成する細胞を生成する方法、並びにそれらの方法によって生成された細胞、それらの細胞の子孫、及び同様の特徴を有する細胞の両方を含む。本発明は、L−スレオニンの生成の文脈において本明細書では考察されるが、本発明の方法、菌株、及び構成は、非限定的にL−メチオニン、L−イソロイシン、L−ホモセリン、及びL−リシンを含めて、アスパラギン酸塩から誘導された他のアミノ酸又は化学物質を生成するために使用される場合がある。
別の態様において、本発明は、天然ではない少なくとも1つのプロモーターに操作可能に結合された、glcB遺伝子、aceA遺伝子、及び/又はaceB遺伝子等、大腸菌aceBAKオペロン及び/又はオペロンの少なくとも一部を含むDNA構築物(例えば、ベクター)を含む。本発明のDNA構築物は、lacリボソーム結合部位等、含まれている遺伝子の天然大腸菌遺伝子リボソーム結合部位ではないリボソーム結合部位を更に含む場合がある。本発明のDNA構築物は、当業者に既知の他の調節要素又は追加のDNA要素を含む場合がある。
本発明は又、全般的にアミノ酸を生成する発酵プロセスにおいて上述され、且つ以下において請求される菌株及び宿主細胞を使用することも対象とする。このようなアミノ酸は、アスパラギン酸塩ファミリのアミノ酸を含む場合がある。スパラギン酸塩ファミリのアミノ酸は、例えば、L−スレオニン、L−メチオニン、L−イソロイシン、L−ホモセリン、及びL−リシンを含む場合がある。アミノ酸は、例えば、少なくとも1つの炭素供給源、少なくとも1つの窒素供給源、及び適切であれば無機塩、成長因子等を含む合成媒地又は天然媒地において本発明の菌株又は宿主細胞を培養することによって得られる場合がある。
3. BTY2(1.0g/LのK2HPO4、10.0g/Lの(NH4)2SO4、40.8g/LのBis−Tris、15 g/Lの酵母エキス(Difco)、32.5g/Lのショ糖、及び1.2g/LのMgSO4−7H2O pH7.0)
3. BTC3(1.0g/LのK2HPO4、10.0g/Lの(NH4)2SO4、40.8g/LのBis−Tris、20m1/1の50%固体コーンスティープリカー(Sigma)、25.0g/Lのショ糖、及び1.2g/LのMgSO4−7H2O、pH7.0で、必要であればアミノ酸供給源(通常は0.1%カザミノ酸(w/v)又は1.5%酵母エキス(w/v))が補足されている。
以下の実施例は、本発明の幾つかの態様を単に代表するものである。当業者であれば、本明細書に記載の通り、本発明を種々の微生物及びプロモーターで実施できることを理解するであろう。本明細書で使用されるこれらの実施例及び菌株は、特許請求の範囲で明示的に言及していない何れかの方式で本発明を限定するものとして解釈してはならない。
実施例1は、aceBAKオペロンの遺伝子の発現を増大させる方式で、aceBの上流の位置にtacプロモーターを挿入することによって、リンゴ酸シンターゼ及びイソクエン酸リアーゼを過剰生成する菌株を生成することを記載する。
以下の実施例では、glcB遺伝子産物の発現を増大させるように配置された大腸菌のglcBの上流にtacプロモーターを導入することによってリンゴ酸シンターゼを過剰生成する菌株の生成を説明する。
以下の実施例では、glcB及びaceBAK遺伝子産物を構成的に過剰発現するように配置された大腸菌のglcBの上流及びaceBAKオペロンの上流にtacプロモーターを導入することによって、リンゴ酸シンターゼ及びイソクエン酸リアーゼを過剰生成する菌株の生成を説明する。
以下の実施例は、構成的に高レベルのグリオキシル酸シャント酵素を提供するために、glcB及びaceBAKオペロンの上流にtacプロモーターを配置して、発現を駆動する使用法を示す。
表2:7つの過剰発現菌株並びに親株(s4370−69−2)のリンゴ酸シンターゼ及びイソクエン酸リアーゼ特有の活性。各菌株/培地の組み合わせを最小限6回検定し、平均を示す。0.1%カザミノ酸(Difco)が補足されたデイビス最小培地(Difco)において、菌株を成長させた。炭素供給源は、0.4%ショ糖又は0.4%グリセロール+0.4%酢酸ナトリウムであった。
以下の実施例は、スレオニンの収率及びスレオニン生成菌株における力価を増大させるために、グリオキシル酸シャントの酵素を過剰発現させる有用性を示す。
Claims (16)
- 発酵によってL−アミノ酸産物を生成するためのプロセスであって、
(a)前記L−アミノ酸を生成する細菌であって、少なくとも一つの非天然プロモーターによって、glcB遺伝子を当該細菌において過剰発現するとともに、aceB遺伝子、aceA遺伝子、及びaceK遺伝子を含むaceBAKオペロンを当該細菌において過剰発現するように操作可能に構成されゲノムに組み込まれた組換え核酸構築物を含む前記細菌を、発酵培地において増殖させる工程;
(b)前記発酵培地及び前記細菌の少なくとも一方において前記L−アミノ酸を富化させる工程;並びに
(c)前記L−アミノ酸を前記発酵培地及び前記細菌の少なくとも一方から単離する工程を含む、プロセス。 - 前記細菌が大腸菌の菌株である、請求項1に記載のプロセス。
- 前記非天然プロモーターが、tacプロモーター、trcプロモーター、lacプロモーター、trpプロモーター、ラムダ−PLプロモーター、ラムダ−PRプロモーター、lacUV5プロモーター、araBADプロモーター、lppプロモーター、及びlpp−lacプロモーターからなる群から選択される、請求項1又は2に記載のプロセス。
- 前記非天然プロモーターが、前記aceBAKオペロン及び前記glcB遺伝子の天然プロモーターと置き換わり、該天然プロモーターが欠失又は中断される、請求項1乃至3のいずれか1項に記載のプロセス。
- 前記非天然プロモーターが、前記aceBAKオペロン及び前記glcB遺伝子の天然プロモーターを欠失することなく挿入される、請求項1乃至3のいずれか1項に記載のプロセス。
- 前記L−アミノ酸が、L−スレオニン、L−イソロイシン、L−ホモセリン、L−リシン、及びL−メチオニンからなる群から選択される、請求項1乃至5のいずれか1項に記載のプロセス。
- 細菌であって、
少なくとも一つの非天然プロモーターによって、glcB遺伝子を当該細菌において過剰発現するとともに、aceB遺伝子、aceA遺伝子、及びaceK遺伝子を含むaceBAKオペロンを当該細菌において過剰発現するように操作可能に構成された組換え核酸を含む
細菌。 - 前記細菌が大腸菌の菌株である、請求項7に記載の細菌。
- 前記非天然プロモーターが、tacプロモーター、trcプロモーター、lacプロモーター、trpプロモーター、ラムダ−PL−プロモーター、ラムダ−PRプロモーター、lacUV5プロモーター、araBADプロモーター、lppプロモーター、及びlpp−lacプロモーターからなる群から選択される、請求項7又は8に記載の細菌。
- 前記aceBAKオペロンの天然プロモーターが、前記非天然プロモーターによって置き換えられる、請求項7乃至9のいずれか1項に記載の細菌。
- 前記非天然プロモーターが、前記aceBAKオペロンの天然プロモーターを置換又は中断することなく、該aceBAKオペロンにおいて挿入される、請求項7乃至9のいずれか1項に記載の細菌。
- 前記glcB遺伝子の天然プロモーターが、前記非天然プロモーターによって置き換えられる、請求項7乃至9のいずれか1項に記載の細菌。
- 前記非天然プロモーターが、前記glcB遺伝子に操作可能に結合された天然プロモーターと置き換わることなく、前記glcB遺伝子に操作可能に連結される、請求項7乃至9のいずれか1項に記載の細菌。
- 寄託番号NRRLB−30847、NRRLB−30848、NRRLB−30849、NRRLB−30851を有する菌株からなる群から選択される細菌株。
- glcB遺伝子、並びにaceB遺伝子、aceA遺伝子、aceK遺伝子を含むaceBAKオペロンを細菌において過剰発現するように操作可能に構成された第1の非天然プロモーターを含む組換え核酸であって、該組換え核酸が、配列番号19の塩基配列を有する核酸、配列番号22の塩基配列を有する核酸、配列番号23の塩基配列を有する核酸、及び配列番号24の塩基配列を有する核酸の少なくとも1つの核酸を含む、組換え核酸。
- 請求項15に記載の少なくとも1つの核酸を含むベクター。
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US69234105P | 2005-06-20 | 2005-06-20 | |
US60/692,341 | 2005-06-20 |
Related Parent Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2008518279A Division JP5432524B2 (ja) | 2005-06-20 | 2006-06-20 | アスパラギン酸由来アミノ酸および化学物質の改善された生産のための改変グリオキシル酸シャント |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2012187118A JP2012187118A (ja) | 2012-10-04 |
JP5980580B2 true JP5980580B2 (ja) | 2016-08-31 |
Family
ID=37595442
Family Applications (2)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2008518279A Active JP5432524B2 (ja) | 2005-06-20 | 2006-06-20 | アスパラギン酸由来アミノ酸および化学物質の改善された生産のための改変グリオキシル酸シャント |
JP2012131737A Active JP5980580B2 (ja) | 2005-06-20 | 2012-06-11 | アスパラギン酸由来アミノ酸および化学物質の改善された生産のための改変グリオキシル酸シャント |
Family Applications Before (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2008518279A Active JP5432524B2 (ja) | 2005-06-20 | 2006-06-20 | アスパラギン酸由来アミノ酸および化学物質の改善された生産のための改変グリオキシル酸シャント |
Country Status (5)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US8187842B2 (ja) |
EP (1) | EP1899472B1 (ja) |
JP (2) | JP5432524B2 (ja) |
CN (2) | CN101365797A (ja) |
WO (1) | WO2007001982A1 (ja) |
Families Citing this family (15)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US7927859B2 (en) | 2003-08-22 | 2011-04-19 | Rice University | High molar succinate yield bacteria by increasing the intracellular NADH availability |
EP3130676A1 (en) | 2004-08-27 | 2017-02-15 | Rice University | Mutant e. coli strain with increased succinic acid production |
US7569380B2 (en) | 2004-12-22 | 2009-08-04 | Rice University | Simultaneous anaerobic production of isoamyl acetate and succinic acid |
US7803589B2 (en) | 2008-01-22 | 2010-09-28 | Genomatica, Inc. | Methods and organisms for utilizing synthesis gas or other gaseous carbon sources and methanol |
CA2717586C (en) | 2008-03-05 | 2020-08-11 | Genomatica, Inc. | Primary alcohol producing organisms |
JP2011519561A (ja) | 2008-05-01 | 2011-07-14 | ジェノマティカ, インコーポレイテッド | メタクリル酸の産生のための微生物 |
WO2010127319A2 (en) | 2009-04-30 | 2010-11-04 | Genomatica, Inc. | Organisms for the production of 1,3-butanediol |
US8993285B2 (en) | 2009-04-30 | 2015-03-31 | Genomatica, Inc. | Organisms for the production of isopropanol, n-butanol, and isobutanol |
US20110124911A1 (en) | 2009-08-05 | 2011-05-26 | Burk Mark J | Semi-synthetic terephthalic acid via microorganisms that produce muconic acid |
BR112012009332A2 (pt) | 2009-10-23 | 2015-09-15 | Genomatica Inc | micro-organismo para a produção de anilina |
WO2011063157A2 (en) | 2009-11-18 | 2011-05-26 | Myriant Technologies Llc | Organic acid production in microorganisms by combined reductive and oxidative tricarboxylic acid cycle pathways |
KR20120123742A (ko) | 2010-01-29 | 2012-11-09 | 게노마티카 인코포레이티드 | P-톨루에이트 및 테레프탈레이트 생합성 미생물 및 생합성 방법 |
US9023636B2 (en) | 2010-04-30 | 2015-05-05 | Genomatica, Inc. | Microorganisms and methods for the biosynthesis of propylene |
CN103025877A (zh) | 2010-07-26 | 2013-04-03 | 基因组股份公司 | 用于生物合成芳族化合物、2,4-戊二烯酸和1,3-丁二烯的微生物和方法 |
KR20200083435A (ko) * | 2017-08-31 | 2020-07-08 | 더 리젠츠 오브 더 유니버시티 오브 캘리포니아 | 피부 효소 활성을 제어하기 위한 분자 박테리아요법 |
Family Cites Families (48)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
GB1097908A (en) | 1964-07-01 | 1968-01-03 | Chugai Pharmaceutical Co Ltd | A fermentation process for the production of l-threonine |
US3580810A (en) | 1967-07-28 | 1971-05-25 | Ajinomoto Kk | Fermentative production of l-threonine |
SU943282A1 (ru) | 1979-07-13 | 1982-07-15 | Всесоюзный научно-исследовательский институт генетики и селекции промышленных микроорганизмов | Способ получени L-треонина |
JPS55131397A (en) | 1979-04-02 | 1980-10-13 | Ajinomoto Co Inc | Preparation of l-threonine by fermentation |
JPS55156591A (en) | 1979-05-23 | 1980-12-05 | Ajinomoto Co Inc | Method for stabilizing property of bacteria containing plasmid |
US4368266A (en) | 1979-12-27 | 1983-01-11 | Ajinomoto Company Incorporated | Method for producing L-glutamic acid by fermentation |
JPS56134993A (en) | 1980-03-21 | 1981-10-22 | Tanabe Seiyaku Co Ltd | Preparation of l-threonine by fermentation method |
US5236831A (en) | 1981-12-29 | 1993-08-17 | Kiowa Hakko Kogyo Co., Ltd. | Amino acid synthesis in corynebacteria using E. coli genes |
US4601983A (en) | 1983-06-15 | 1986-07-22 | Ajinomoto Co., Inc. | Coryneform bacteria carrying recombinant plasmids and their use in the fermentative production of L-threonine and L-isoleucine |
JPH0783714B2 (ja) | 1983-08-29 | 1995-09-13 | 味の素株式会社 | 発酵法によるl―アミノ酸の製造法 |
JPS6062982A (ja) | 1983-09-14 | 1985-04-11 | Ajinomoto Co Inc | 組換えdνa,該組換えdνaを有する細菌及び該細菌を用いるl−スレオニン又はl−イソロイシンの製造法 |
AU577301B2 (en) | 1983-09-16 | 1988-09-22 | Kato Spring Works Company, Ltd. | Tangless helical coiled insert |
US5169768A (en) | 1983-10-07 | 1992-12-08 | Biotechnica International, Inc. | Method of biosynthesis of phenylalanine |
JPH0746994B2 (ja) | 1984-10-04 | 1995-05-24 | 味の素株式会社 | 発酵法によるl−アミノ酸の製造法 |
DE3682709D1 (de) | 1985-05-13 | 1992-01-16 | Toray Industries | Verfahren zur herstellung von l-threonin durch fermentation. |
US5264353A (en) | 1985-08-23 | 1993-11-23 | Toray Industries, Inc. | Process for producing L-threonine by fermentation |
EP0219808B1 (en) | 1985-10-18 | 1993-12-22 | Toray Industries, Inc. | Plasmid with wide host range |
US5017483A (en) | 1986-02-20 | 1991-05-21 | Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd. | Process for producing L-threonine |
US5164307A (en) | 1987-01-23 | 1992-11-17 | Ajinomoto Co., Inc. | Process for producing L-amino acids by fermentation |
DE3888076T2 (de) | 1987-10-15 | 1994-07-14 | Mitsubishi Petrochemical Co | Verfahren zur Herstellung von L-Threonin. |
JP2600750B2 (ja) | 1988-01-21 | 1997-04-16 | 味の素株式会社 | 発酵法によるl―スレオニンの製造法 |
WO1990004636A1 (en) | 1988-10-25 | 1990-05-03 | Vsesojuzny Nauchno-Issledovatelsky Institut Genetiki I Selektsii Promyshlennykh Mikroorganizmov (Vniigenetika) | Strain of bacteria escherichia coli, producer of l-threonine |
JP2578492B2 (ja) | 1988-11-10 | 1997-02-05 | 協和醗酵工業株式会社 | 発酵法によるl−スレオニンの製造法 |
BR9203053A (pt) | 1991-08-07 | 1993-03-30 | Ajinomoto Kk | Processo para produzir acido l-glutamico pro fermentacao |
JP3151073B2 (ja) | 1992-02-25 | 2001-04-03 | 協和醗酵工業株式会社 | 発酵法によるアミノ酸の製造法 |
US5939307A (en) | 1996-07-30 | 1999-08-17 | The Archer-Daniels-Midland Company | Strains of Escherichia coli, methods of preparing the same and use thereof in fermentation processes for l-threonine production |
US6387694B1 (en) | 1998-04-03 | 2002-05-14 | Albert Einstein College Of Medicine Of Yeshiva University | Mycobacterial isocitrate lyase gene and uses thereof |
AU760575C (en) | 1998-04-13 | 2005-04-14 | University Of Georgia Research Foundation, Inc., The | Pyruvate carboxylase overexpression for enhanced production of oxaloacetate-derived biochemicals in microbial cells |
US6630332B2 (en) | 2000-07-18 | 2003-10-07 | Degussa Ag | Process for the fermentative preparation of L-threonine |
US6920734B2 (en) | 2000-08-31 | 2005-07-26 | Dietrich Industries, Inc. | Bridging system for off-module studs |
US7220571B2 (en) | 2000-09-28 | 2007-05-22 | Archer-Daniels-Midland Company | Escherichia coli strains which over-produce L-threonine and processes for the production of L-threonine by fermentation |
US20030054503A1 (en) | 2001-04-03 | 2003-03-20 | Degussa Ag | Process for the production of L-amino acids using strains of the family enterobacteriaceae that contain an attenuated dgsA gene |
US20030059903A1 (en) | 2001-04-03 | 2003-03-27 | Degussa Ag | Process for the production of L-amino acids using strains of the family enterobacteriaceae that contain an attenuated aceA gene |
DE10116518A1 (de) | 2001-04-03 | 2002-10-17 | Degussa | Verfahren zur fermentativen Herstellung von L-Aminosäuren unter Verwendung von Stämmen der Familie Enterobacteriaceae |
DE10132945A1 (de) | 2001-07-06 | 2003-01-16 | Degussa | Verfahren zur fermentativen Herstellung von L-Aminosäuren unter Verwendung von Stämmen der Familie Enterobacteriaceae |
DE60228961D1 (de) | 2001-07-06 | 2008-10-30 | Evonik Degussa Gmbh | Verfahren zur herstellung von l-aminosäuren durch enterobacteriaceae-stämmen mit verstärkter expression des mop-b |
ES2328229T3 (es) | 2001-07-18 | 2009-11-11 | Evonik Degussa Gmbh | Proceso para la preparacion de l-treonina utilizando cepas de la familia enterobacteriaceas que contienen genes succ y sucd intensificados. |
AU2002314203A1 (en) | 2001-07-18 | 2003-03-03 | Degussa Ag | Process for the preparation of l-amino acids using strains of the enterobacteriaceae family which contain an attenuated ugpb gene |
US20050221448A1 (en) | 2001-07-18 | 2005-10-06 | Degussa Ag | Process for the preparation of l-amino acids using strains of the enterobacteriaceae family which contain an attenuated aceb gene |
US20040241814A1 (en) | 2001-07-18 | 2004-12-02 | Mechthild Rieping | Process for the preparation of l-amino acids using strains of the enterobacteriaceae family which contain an enhanced rsea or rsec gene |
DE10154102A1 (de) | 2001-11-02 | 2003-05-15 | Degussa | Verfahren zur fermentativen Herstellung von L-Aminosäuren unter Verwendung von Stämmen der Familie Enterobacteriaceae |
DE10210527A1 (de) | 2002-03-09 | 2003-09-18 | Degussa | Allele des aceA-Gens aus coryneformen Bakterien |
US20050032178A1 (en) | 2002-07-10 | 2005-02-10 | Degussa Ag | Process for the fermentative preparation of L-amino acids using strains of the enterobacteriaceae family |
KR100505797B1 (ko) * | 2002-10-11 | 2005-08-04 | 씨제이 주식회사 | 염색체 상의 fadR 유전자가 불활성화된 L-쓰레오닌 생성 변이 미생물과 이를 이용한 L-쓰레오닌의 제조방법 |
DE10314618A1 (de) | 2003-04-01 | 2004-10-14 | Degussa Ag | Verfahren zur Herstellung von L-Aminosäuren unter Verwendung von Stämmen der Familie Enterobacteriaceae |
DE10316109A1 (de) | 2003-04-09 | 2004-10-21 | Degussa Ag | Verfahren zur fermentativen Herstellung von L-Aminosäuren unter Verwendung von Stämmen der Familie Enterobacteriaceae |
AU2004295615A1 (en) | 2003-12-05 | 2005-06-16 | Ajinomoto Co., Inc. | L-threonine producing bacterium belonging to the genus Escherichia and method for producing L-threonine |
WO2005103275A1 (ja) * | 2004-04-26 | 2005-11-03 | Ajinomoto Co., Ltd. | 発酵法によるl-トリプトファンの製造法 |
-
2006
- 2006-06-20 JP JP2008518279A patent/JP5432524B2/ja active Active
- 2006-06-20 WO PCT/US2006/023809 patent/WO2007001982A1/en active Application Filing
- 2006-06-20 US US11/471,173 patent/US8187842B2/en active Active
- 2006-06-20 CN CNA2006800302556A patent/CN101365797A/zh active Pending
- 2006-06-20 EP EP06773537.3A patent/EP1899472B1/en active Active
- 2006-06-20 CN CN201310245716.3A patent/CN103497979B/zh active Active
-
2012
- 2012-06-11 JP JP2012131737A patent/JP5980580B2/ja active Active
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
US8187842B2 (en) | 2012-05-29 |
CN103497979A (zh) | 2014-01-08 |
US20070015261A1 (en) | 2007-01-18 |
EP1899472B1 (en) | 2017-09-27 |
JP2008543330A (ja) | 2008-12-04 |
EP1899472A4 (en) | 2009-09-23 |
EP1899472A1 (en) | 2008-03-19 |
JP2012187118A (ja) | 2012-10-04 |
JP5432524B2 (ja) | 2014-03-05 |
WO2007001982A1 (en) | 2007-01-04 |
CN101365797A (zh) | 2009-02-11 |
CN103497979B (zh) | 2018-09-11 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP5980580B2 (ja) | アスパラギン酸由来アミノ酸および化学物質の改善された生産のための改変グリオキシル酸シャント | |
JP5486029B2 (ja) | 遺伝子増幅によるリジン産生の増加 | |
JP4846021B2 (ja) | L−スレオニン生成変異微生物及びそれを使用したl−スレオニンの製造方法 | |
JP5465194B2 (ja) | 改良されたプローモーターおよびそれを用いたl−リシンの生産方法 | |
EP3030649B1 (en) | Method of producing succinic acid using facilitated diffusion for sugar import | |
JP2011510625A (ja) | 改良されたプロモーターおよびこれを用いたl−リシンの生産方法 | |
DK2236610T3 (en) | Promoter and improved method for producing L-lysine using the same | |
US20100159537A1 (en) | Escherichia coli strains that over-produce l-threonine and processes for their production | |
TW201718863A (zh) | 用於製造腐胺或鳥胺酸的微生物及使用該微生物用於製造腐胺或鳥胺酸的方法 | |
BR102020000177A2 (pt) | Método para produzir l-triptofano, método para produzir um micro-organismo que produz l-triptofano por transformação, micro-organismo que produz l-triptofano e seu uso | |
EP2674499B1 (en) | Method for producing target substance by fermentation process | |
WO2022017223A1 (zh) | 丙酮酸羧化酶基因启动子的突变体及其应用 | |
JPWO2013154182A1 (ja) | アミノ酸の製造法 | |
EP4293115A1 (en) | Polynucleotide having promoter activity and use thereof in production of traget compounds | |
JP6412509B2 (ja) | ポリペプチドの組換え生産のためのアミノ酸栄養要求性除去原核生物株の使用 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20131105 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20140131 |
|
A02 | Decision of refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A02 Effective date: 20140827 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20141127 |
|
A911 | Transfer to examiner for re-examination before appeal (zenchi) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A911 Effective date: 20141204 |
|
A912 | Re-examination (zenchi) completed and case transferred to appeal board |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A912 Effective date: 20150213 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20160609 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20160727 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 5980580 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |