JP5960946B2 - がん幹細胞分子マーカー - Google Patents
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Description
現在のところがん幹細胞マーカーとしては、CD133、CD24、CD44などの分子マーカーが知られている(非特許文献1〜7)が、ごく一部のがん細胞でしか有効性がないといわれており、より多くの種類のがんでがん幹細胞を検出するためには、新たな分子マーカーの同定が必要である。
本発明はがん幹細胞の検出に有用な分子マーカーを提供することを目的とする。
課題を解決するための手段
本発明はまた、検出対象が、心臓、脳、胎盤、肺、肝臓、骨格筋、腎臓、膵臓、脾臓、胸腺、前立腺、精巣、卵巣、小腸、白血球、結腸、胃、骨髄、大腸および末梢血単核球からなる群から選択される1または2以上の細胞または組織由来の細胞集団である、前記の分子マーカーに関する。
本発明はさらに、全ての検出対象の、がん幹細胞でないがん細胞および正常細胞において検出されない、前記の分子マーカーに関する。
また、本発明は、判定対象において、前記の分子マーカーを指標として、がん幹細胞の有無を判定する方法に関する。
さらに、本発明は、細胞集団が正常細胞および/またはがん幹細胞でないがん細胞を含む、前記の方法に関する。
さらにまた、本発明は、細胞集団が、心臓、脳、胎盤、肺、肝臓、骨格筋、腎臓、膵臓、脾臓、胸腺、前立腺、精巣、卵巣、小腸、白血球、結腸、胃、骨髄、大腸および末梢血単核球からなる群から選択される1または2以上の細胞または組織由来である、前記の方法に関する。
また、本発明は、遺伝子の発現産物がmRNAであり、RT−PCR法により検出することを含む、前記の方法に関する。
さらに、本発明は、遺伝子の発現産物が内在性ポリペプチドであり、該内在性ポリペプチドと特異的に反応する試薬により検出することを含む、前記の方法に関する。
本発明はまた、判定が、インビトロまたはインビボで行われる、前記の方法に関する。
本発明はさらに、i)前記の分子マーカーの、候補化合物を細胞集団に投与する前の検出量Aを測定する工程、
ii)候補化合物を細胞集団に投与する工程、
iii)i)において測定した分子マーカーの、候補化合物を細胞集団に投与した後の検出量Bを測定する工程、および
iv)AとBを比較し、AがBより有意に大きい場合に、候補化合物をがん治療薬候補であると判定する工程、
を含む、がん治療薬のスクリーニング方法に関する。
また、本発明は、検出するための試薬が、Or7c1、Dnajb8、Sox2、Smcp、Ints1、Kox12、Mdf1、FLJ13464、667J232、Surf6、Pcdh19、Dchs2、Pcdh21、Gal3st1、Rasl11b、Hes6、Znf415、Nkx2−5、Pamci、PnmtおよびScgb3a1からなる群より選択される1または2以上の遺伝子の発現産物であるmRNAを検出するための前記遺伝子に相補的な塩基配列を有するプローブおよび/またはプライマーである、前記のキットに関する。
本発明はさらに、前記のキットを用いる、がんの判定方法に関する。
また本発明は、Or7c1、Dnajb8、Sox2、Smcp、Ints1、Kox12、Mdf1、FLJ13464、667J232、Surf6、Pcdh19、Dchs2、Pcdh21、Gal3st1、Rasl11b、Hes6、Znf415、Nkx2−5、Pamci、PnmtおよびScgb3a1からなる群より選択される1または2以上の遺伝子の発現産物由来のエピトープと特異的に反応する抗体に関する。
さらに、本発明は、前記のポリペプチドおよび/または前記の抗体を少なくとも1つ以上含む医薬組成物に関する。
本発明はまた、前記のポリペプチドを抗原として、がん幹細胞の機能を阻害する、またはがん幹細胞を死滅させる方法に関する。
本発明はさらに、前記の抗体を用いる、前記の方法に関する。
本発明はさらにまた、前記のポリペプチドをコードする核酸に関する。
また、本発明は、前記の核酸を含む医薬組成物に関する。
さらに、本発明は、医薬組成物が、DNAまたはRNAワクチン用である、前記の医薬組成物に関する。
本発明はさらにまた、i)目的ポリペプチドを適切な長さのペプチドに断片化したものを作製する工程、
ii)i)で得られた断片化ペプチドと、抗原提示細胞と、目的ポリペプチドおよび/またはi)で得られた断片化ペプチドで感作したT細胞とを共に培養する工程、
iii)ii)で得られたT細胞の活性化の度合いを測定する工程、
iv)iii)においてT細胞を活性化した断片化ペプチドを選別する工程、
を含む、主要組織適合抗原に抗原提示されるペプチドのスクリーニング方法であって、目的ポリペプチドが、前記のポリペプチドである、前記方法に関する。
さらに、本発明は、核酸が、DNAおよび/またはRNAである、前記の核酸に関する。
さらにまた、本発明は、前記の核酸を少なくとも1つ以上含む、医薬組成物に関する。
本発明はまた、医薬組成物が、がん治療用である、前記の医薬組成物に関する。
本発明はさらにまた、前記の核酸を用いて、がん幹細胞の機能を阻害する方法に関する。
発明の効果
また本発明の分子マーカーは、肺がん細胞、乳がん細胞、大腸がん細胞など、複数のがん幹細胞に共通して用いることができるので、汎用性のあるがん幹細胞の分子マーカーとして極めて有効である。
さらに本発明の分子マーカーは、正常細胞において全く検出されないか、ほとんど検出されないため、がん幹細胞の判別、さらにはがん幹細胞を含む腫瘍組織の判別においても有用である。
また本発明の分子マーカーは、造腫瘍性との関連性が高く、それらを標的としたがん幹細胞の免疫療法や分子標的治療法、遺伝子導入治療法、がん治療に利用可能な薬剤、ペプチドなどのスクリーニングにも有用である。
本発明の分子マーカーは、検出対象となる細胞集団においてがん幹細胞を検出するための分子マーカーであって、該検出対象に含まれるがん幹細胞において検出されるが、がん幹細胞でないがん細胞および正常細胞において検出されない。したがって、典型的には、がん細胞集団からがん幹細胞を検出するために用いる。さらに、例えば、任意の検出対象となる細胞集団を採取すると、正常細胞が混入して、がん幹細胞、がん幹細胞でないがん細胞および正常細胞が混在する細胞集団となる場合があるが、このような場合であっても、正確にがん幹細胞を検出することができる。
本発明における「がん幹細胞」とは、がん細胞のうち幹細胞の性質を有する細胞である。幹細胞とは細胞分裂を経ても分化能を維持している細胞のことをいう。がん幹細胞は、ヘキスト蛍光色素(Hoechst33342)で染色し、フローサイトメトリーを利用してUVレーザー(波長約350nm)を励起光に用いて検出すると、Side Population(SP)画分に濃縮される。SP画分とは、ヘキスト蛍光色素によって染色されるMain Population(MP)画分に対して、ABCトランスポーターなどを介して色素を細胞外に排出することで染色されない画分のことを指す。
本発明の分子マーカーは、好ましくは、複数のがん種のがん幹細胞に共通して検出されるものであり、複数のがん種において単一のマーカーとして用いることができる。例えば、心臓、脳、胎盤、肺、肝臓、骨格筋、腎臓、膵臓、脾臓、胸腺、前立腺、精巣、卵巣、小腸、白血球、結腸、胃、骨髄、大腸および末梢血単核球などの細胞または組織由来の複数のがん種のがん幹細胞に共通して発現しているので検出することができる。
さらに本発明の分子マーカーは、がん幹細胞でないがん細胞および正常細胞においては検出されない。好ましくは、例えば、心臓、脳、胎盤、肺、肝臓、骨格筋、腎臓、膵臓、脾臓、胸腺、前立腺、精巣、卵巣、小腸、白血球、結腸、胃、骨髄、大腸および末梢血単核球などの少なくとも1つ以上において、がん幹細胞でないがん細胞および正常細胞では検出されない。
汎用性のある分子マーカーとして用いるために、複数のがん種において単一のマーカーとして用いることができることが好ましく、典型的には、心臓、脳、胎盤、肺、肝臓、骨格筋、腎臓、膵臓、脾臓、胸腺、前立腺、精巣、卵巣、小腸、白血球、結腸、胃、骨髄、大腸および末梢血単核球などの細胞または組織の少なくとも2つ以上において正常細胞では検出されず、好ましくは、少なくとも3つ以上において検出されない。最も好ましくは全ての細胞または組織における正常細胞で検出されない。
また本明細書において「発現している」とは、例えばRT−PCR、in−situハイブリダイゼーション、免疫検定法、クロマトグラフィ法などの、当業者に知られた方法で発現産物が確認できることをいう。また、「検出されない」とは、前記の発現産物の確認方法において発現産物が確認できないことをいう。なお、例えばRT−PCRなど、極めて高感度の検出方法において検出されたようなシグナルが出ても、シグナル強度に顕著な差があったり、免疫検定法など、本発明の態様における実用性という観点から十分な感度の検出方法においては検出レベル以下であるなどの場合は、本明細書でいうところの「検出されない」に包含される。
Sox2:Gene accession No.NM_003106
Smcp:Gene accession No.NM_030663
Ints1:Gene accession No.NM_001080453
Kox12:Gene accession No.NM_152907
Mdf1:Gene accession No.NM_005586
FLJ13464:Gene accession No.AK023526
667J232:Gene accession No.AL833225
Surf6:Gene accession No.NM_006753
Pcdh19:Gene accession No.NM_001105243
Dchs2:Gene accession No.NM_017639
Pcdh21:Gene accession No.NM_033100
Gal3st1:Gene accession No.NM_004861
Rasl11b:Gene accession No.NM_023940
Hes6:Gene accession No.NM_018645
Znf415:Gene accession No.NM_018355
Nkx2−5:Gene accession No.NM_004387
Pamci:Gene accession No.NM_005447
Pnmt:Gene accession No.NM_002686
Scgb3a1:Gene accession No.NM_052863
Or7c1:Gene accession No.NM_198944
Dnajb8:Gene accession No.NM_153330
判定は、本発明の分子マーカーが検出された場合にがん幹細胞があると判定され、判定対象には正常細胞および/またはがん幹細胞でないがん細胞も含まれてよい。複数のがん種で単一のマーカーとして利用できるという観点から、好ましくはSox2、Smcp、Ints1、Kox12、Mdf1、FLJ13464、667J232、Surf6、Pcdh19、Dchs2、Pcdh21、Gal3st1、Rasl11b、Hes6、Znf415、Nkx2−5、Pamci、Pnmt、Scgb3a1、Or7c1、およびDnajb8、最も好ましくはSox2の発現産物を検出して判定する。
本発明の分子マーカーが内在性ポリペプチドである場合、その検出には、抗体やリガンドなどのペプチドに特異的に結合する試薬が用いられる。例えば、抗体は、ポリクローナル抗体および/またはモノクローナル抗体が用いられ得る。非特異的反応がより低いという観点から、モノクローナル抗体を用いることが好ましい。
判定は、インビボまたはインビトロでの判定であってもよい。本明細書において「インビトロでの判定」とは、生体から採取した組織または細胞を、例えば培養液など、生体外環境における生育を経た後に判定することをいう。それに対し「インビボでの判定」とは、生体内で直接判定すること、あるいは組織または細胞を生体から採取した後、すぐにもしくは固定化後に判定することをいう。組織または細胞の採取は、これに限定するものではないが例えば切開、細胞吸引、採血、採尿などで行う。
判定をインビボで行う場合、当業者において公知のインビボ検出法を用いて行ってよい。インビボでの判定は、例えば血液検査、in situハイブリダイゼーション、in situ PCR、免疫組織染色など、公知の検出法を用いて行ってよい。
本発明の分子マーカーは、がん幹細胞に特異的に発現しているため、その検出量はがん幹細胞の個数と相関していると推測される。したがって、対象に対する候補化合物投与の前後において、本発明の分子マーカーの検出量が減少すれば、それはがん幹細胞の個数が減少したと考えられる。つまり、投与前後の分子マーカーの検出量を比較することにより、がん幹細胞に対する治療薬の候補となる化合物をスクリーニングすることが可能である。したがって、かかるスクリーニング方法も、本発明に包含される。
複数のがん種で単一に利用できるという観点から、遺伝子配列は、好ましくは、Sox2、Smcp、Ints1、Kox12、Mdf1、FLJ13464、667J232、Surf6、Pcdh19、Dchs2、Pcdh21、Gal3st1、Rasl11b、Hes6、Znf415、Nkx2−5、Pamci、Pnmt、Scgb3a1、Or7c1、またはDnajb8、最も好ましくはSox2の遺伝子産物を検出する試薬が含まれる。
本発明における「遺伝子に相補的な塩基配列を有するプローブおよび/またはプライマー」は、遺伝子配列の一部の配列に対して特異的に結合するように相補的な配列を有するDNAまたはRNAであって、例えば蛍光標識、放射線標識などで随意に標識されていてよい。
本発明の分子マーカーとして機能するポリペプチドは、がん幹細胞の機能を阻害したり、死滅させるための抗原として利用可能である。これらのポリペプチドは、例えば抗体認識部位やタンパク質結合部位など、機能的な部位を有していればよく、例えば、9〜11アミノ酸程度の長さでもよい。また、例えばタンパク質の三次構造が抗体認識される場合、多量体として抗体認識される場合、修飾基の結合によって抗体認識部位となる場合など、機能的部位が何らかの修飾や変形などを経て現れる場合も、この機能的部位の構造を有していればよい。これらのポリペプチドは、好ましくは、Sox2、Smcp、Ints1、Kox12、Mdf1、FLJ13464、667J232、Surf6、Pcdh19、Dchs2、Pcdh21、Gal3st1、Rasl11b、Hes6、Znf415、Nkx2−5、Pamci、Pnmt、Scgb3a1、Or7c1およびDnajb8からなる群より選択される遺伝子の発現産物由来である。
これらのポリペプチドを抗原としてがん幹細胞を死滅させる方法は、これに限定するものではないが、例えば、CTL誘導による方法、ポリペプチド特異抗体を利用して免疫反応を起こす方法、ポリペプチドと結合することで機能を阻害する、あるいは拮抗する方法などが含まれる。
したがって、上記方法に用いる抗体ならびにポリペプチドおよび/または抗体を含む医薬組成物もまた、本発明に包含される。
医薬組成物としては、これに限定されるものではないが、例えばがんワクチン、抗がん剤などが挙げられる。これらの組成物は、本発明のポリペプチドおよび/または抗体の他に、必要に応じて、例えば抗腫瘍作用を有する薬剤、補助剤、医薬的に許容しうる担体などを適宜含有することができる。
さらに、上記のポリペプチドをコードする核酸、および該核酸を含む医薬組成物も、本発明に包含される。前記核酸を含む医薬組成物としては、これに限定されるものではないが、例えばDNAワクチンなどが挙げられる。これらの組成物は、本発明の核酸の他に、必要に応じて、例えば抗腫瘍作用を有する薬剤、補助剤、医薬的に許容しうる担体などを適宜含有することができる。
発明者らの研究によって、本発明の分子マーカー由来のポリペプチドのうち、一部のポリペプチドは、ヒトMHC分子の1つであるHLA−A24と高い親和性を示すことがわかっており、さらにその一部はCTLを誘導して細胞をアポトーシスに導く能力を有することがわかった。この結果は、本発明のポリペプチドによってがん幹細胞に対する免疫記憶を与えることができることを強く示唆している。このことは、本発明のポリペプチドが、がん幹細胞を特異的に治療する方法に応用可能であることを実質的に示すものである。
スクリーニングには、通常のエピトープマッピングの手法が適用できる。たとえば、目的ポリペプチドを適切な長さのペプチドに断片化したものを複数種類作製した後、目的ポリペプチドおよび/または断片化ペプチドと、抗原提示細胞とT細胞を共に培養してT細胞を感作する。その後、感作されたT細胞、抗原提示細胞および断片化ペプチドとを共に培養し、T細胞を再刺激する。その後、T細胞の活性化の度合いを測定し、活性化の度合いが高いペプチドを選別し、エピトープ配列を決定する。この際、活性化の度合いは細胞傷害活性やサイトカイン産生量の測定など、適宜当業者に周知の方法を選択することができる。また、T細胞のHLAのタイプを特定することにより、特定のHLAタイプに拘束される抗原ペプチドが選択される。
発現を抑制する方法としては、これに限定するものではないが、例えばRNAi、リプレッサーの発現などが挙げられる。よってDNAの発現を抑制するための核酸には、これに限定するものではないが、例えばsiRNA、shRNA、shDNAなどが含まれる。核酸は、DNAの発現を抑制するのに十分な塩基数があれば、いかなる長さであってもよい。
本発明の分子マーカーとして機能するDNAの発現を抑制することによって、がん幹細胞を特異的におよび/または効率よく攻撃できる可能性を示唆する。つまり、上記の核酸は遺伝子導入治療に応用できることが示唆される。よって本発明の核酸を含む医薬組成物もまた、本発明に包含される。
上記の医薬組成物は、これに限定するものではないが、例えば抗がん剤、転移抑制剤、DNAワクチンを含むがんワクチンなどのがん治療薬として用いることができる。これらの医薬組成物は、本発明の核酸の他に、必要に応じて、例えば抗腫瘍作用を有する薬剤、補助剤、医薬的に許容しうる担体などを適宜含有することができる。
また、本発明の核酸を用いて、がん幹細胞において、本発明の分子マーカーとして機能するDNAの発現を抑制する方法も、本発明に包含される。
以下の実験例は本発明について、さらに具体的に説明するものであり、本発明の範囲を何ら限定するものではない。当業者として通常の知識および技術を有するものは、本発明の精神を逸脱しない範囲で、下記実験例で示された態様に多様な改変を行うことができるが、かかる改変された態様も本発明に含まれる。
a)試薬の調整
培地は5%の抗ウシ胎児血清(FCS)入りDMEM培地を調整し、37℃に温めておいた。ベラパミルは50mMに調整し、5%FCS+DMEMで、5mMに希釈した。ヘキスト33342は5%FCS+DMEMで250μg/mlに調整した。DNAseIはDDWで1mg/mlに調整し、0.2μmのフィルターでろ過滅菌した。
b)フローサイトメトリー(FACS)用の細胞の調整
細胞を4mlの5%FCS+DMEMで懸濁し、細胞数を数えた。さらに5%FCS+DMEMを加えて細胞濃度を1×106個/mlに調整し、ベラパミル(+)用に1mlをファルコンチューブに採取した。ベラパミル(+)用および残りの細胞(ベラパミル(−)用)を37℃で10分間、ウォーターバスでインキュベートした。インキュベート後、ベラパミル(+)用にはベラパミルの最終濃度が50〜75μMになるようにベラパミル溶液を加え、その後ベラパミル(+)用およびベラパミル(−)用に、ヘキスト33342の最終濃度が2.5μM〜5.0μMとなるようにヘキスト33342溶液を加えた。
c)フローサイトメトリー(FACS)
フローサイトメーターはBD FACS Aria II special edition(登録商標)(ベクトン・ディッキントン社製)を用いた。FACSの操作は取扱説明書にしたがって行った。最初にベラパミル(−)の細胞を流してSP画分の細胞が検出できるかを確認し、確認できたらSP画分にゲートをかけてベラパミル(+)の細胞を流してSP画分の細胞が消えているかを確認した。消えていればその画分の細胞はSP画分細胞であると断定し、その画分の細胞の単離を行った。単離した細胞を4℃、1500rpmで15分間遠心分離し、上清を取り除いた後、100〜200μlの1×PBSで懸濁し、細胞数を数えた。
その結果、腺がんのA549、LHK2、および小細胞がんのLc817においてSP画分の細胞が検出された。その結果を図1に示す。
肺がんの中でも比較的転移を起こしやすい系統であるとされる腺がん、小細胞がんにおいてSP画分の細胞が検出されたことは、がん幹細胞が転移の主要な原因であるとされる見解と一致する。
実験例1と同様の方法でLHK2、MCF7およびSW480セルラインそれぞれを用いて、分画したSP細胞およびMP細胞をマウスに接種して腫瘍形成能を確認した。同数のSP細胞およびMP細胞をそれぞれ氷上で100μlの1×PBSに懸濁し、100μlのマトリゲルに混ぜた。100μlの細胞マトリゲル混合液をNOD/SCIDマウス(オリエンタル工房社から入手)の背部皮下にSPおよびMP細胞をそれぞれ、1箇所あたり1500個接種し、腫瘍を形成し始めたら長径・短径の長さを測り、回転楕円体に近似して体積を算出して比較した。結果を図2に示す。
その結果、LHK2から分画したSP細胞は、わずか15個の細胞移植で5匹中2匹に腫瘍を形成したり、150個の移植で5匹全てに腫瘍を形成するなど、150個の移植では1匹も腫瘍を形成することの無かったMP細胞と比較して、はるかに高い腫瘍形成能を有していることがわかった。これはがん幹細胞が腫瘍形成の大きな要因であり、SP画分細胞にがん幹細胞が濃縮されるという見解と一致する。(参考文献Kondo T, Setoguchi T, Taga T. Persistence of a small subpopulation of cancer stem-like cells in the C6 glioma cell line. Proc Natl Acad Sci U S A. 20:781-786, 2004.)
a)mRNAの抽出
実験例1と同様の方法で単離したSP細胞およびMP細胞を、室温、1500rpmで5分間遠心分離し、上清を取り除いた。mRNAの抽出はRNeasy Kit(キアゲン社製)を用いて、キットのプロトコルにしたがって行った。
b)mRNAの増幅とラベリング
抽出したmRNAをSigma Genosys社から入手したRNA増幅キットを使用してmRNAを増幅し、さらにSigma Genosys社から入手したmRNAラベリングキットを用いて増幅したmRNAに、SP画分から抽出したものにCy5を、MP画分から抽出したものにCy3をそれぞれ標識、さらに色素を交換してSP画分から抽出したものにCy3を、MP画分から抽出したものにCy5をそれぞれ標識した。
異なる色素で標識したSP画分由来のmRNAとMP画分由来のmRNAとを混合し、Sigma Genosis社から入手したDNAチップ(Panorama(登録商標) Micro Array, Human)を用いて、マイクロアレイキットのプロトコルどおりにハイブリダイズさせ、mRNAの発現を解析した。その結果、Sox2遺伝子、Smcp遺伝子、Ints1遺伝子、Kox12遺伝子、Mdf1遺伝子、FLJ13464遺伝子、667J232遺伝子、Surf6遺伝子、Pcdh19遺伝子、Dchs2遺伝子、Pcdh21遺伝子、Gal3st1遺伝子、Rasl11b遺伝子、Hes6遺伝子、Znf415遺伝子、Nkx2−5遺伝子、Pamci遺伝子、Pnmt遺伝子、Scgb3a1遺伝子、Or7c1遺伝子、およびDnajb8は、SP画分において発現しているがMP画分では発現していないまたは発現していてもごくわずかであることが確認された。
a)RT−PCRに用いたプライマー
実験例でRT−PCRに用いたプライマーのリストを表1に示す。
実験例3c)で確認されたSox2について、さらに有用性を確認するため、ヒト成人正常細胞において発現を調査した。ヒト成人正常組織由来mRNAパネルをクロンテック社から入手し、これを用いてRT-PCRを行った。mRNAパネルには、心臓、脳、胎盤、肺、肝臓、骨格筋、腎臓、膵臓、脾臓、胸腺、前立腺、精巣、卵巣、小腸、大腸、末梢血単核球の各成人正常細胞および組織由来のmRNAが含まれている。
合成したcDNAを、順行プライマーおよび逆行プライマー(表1参照)を用いて、RT−PCRによりSox2のcDNAを増幅した。またコントロールとして、G3PDHのcDNAを同様の方法で増幅した。PCR条件を表2に示す。
c)Sox2のがんセルラインにおける発現
肺がんセルラインであるLHK2、大腸がんセルラインであるSW480およびKM12LMならびに乳がんセルラインであるMCF7を実験例1と同様にSP画分およびMP画分に分離した。それぞれのSP画分およびMP画分から実験例3a)と同様にmRNAを抽出し、実験例4b)と同様にcDNAを合成した。Sox2プライマー(表1参照)を用いて表2の条件でSox2のcDNAを増幅し、増幅物に対して1.5%アガロースゲルを用いて、100Vで25分間電気泳動を行った。結果を図3b)に示す。
Sox2はヒトの成人正常組織において発現が確認されなかった。これはSox2が組織中の正常細胞を認識しないマーカーであることを示し、またSox2を利用することで腫瘍細胞特異的に治療を行える可能性を示唆している。またLHK2,SW480、KM12LM、MCF7の4系統のSPおよびMP画分の細胞について調べた結果、どの系統でもSP画分の細胞において強く発現し、MP画分の細胞においてはほとんど発現が見られなかったことは、Sox2がSP画分の細胞、つまりがん幹細胞特異的なマーカーとして利用可能であることを示している。
実験例3c)で確認されたSmcpおよびFLJ13464について、さらに有用性を確認するため、ヒト成人正常組織および他のがん細胞において発現を調査した。ヒト成人正常組織はクロンテック社から入手した心臓、脳、胎盤、肺、肝臓、骨格筋、腎臓、膵臓、脾臓、胸腺、前立腺、精巣、卵巣、小腸、白血球、結腸、胃、骨髄を含むヒト成人正常組織mRNAパネルを用い、がん細胞として肺がんセルラインのLHK2,大腸がんセルラインのSW480、KM12LM、乳がんセルラインのMCF7、悪性線維性組織球腫セルラインのMFH03を用いた。
各細胞および組織のmRNAから実験例4b)と同様にcDNAを合成した。合成したcDNAを、Smcp順行プライマーおよび逆行プライマー(表1参照)、ならびにFLJ13464順行プライマーおよび逆行プライマー(表1参照)を用いて、表2に示したPCR条件によりSmcpおよびFLJ13464のcDNAを増幅した。またコントロールとして、G3PDHのcDNAを上記と同様の方法で増幅した。増幅した増幅物に対して1.5%アガロースゲルを用いて、100Vで25分間電気泳動を行った。結果を図4a)に示す。
考察
SmcpおよびFLJ13464はほとんどのヒトの成人正常組織において発現が見られなかったが、FLJ13464は膵臓と胃において、Smcpは精巣において多少の発現が見られた。これは、ほとんどの組織においてSmcpおよびFLJ13464が組織中の正常細胞を認識しないマーカーであることを示し、正常細胞で発現が見られない組織においては腫瘍細胞特異的に治療を行える可能性を示唆している。また実験例4の結果と同様、SW480,KM12、LHK2、MCF7においても、SmcpがSP画分細胞特異的に発現しており、FLJ13464もMCF7においてSP画分細胞特異的に発現していることから、SmcpおよびFLJ13464についてもがん細胞特異的なマーカーとしての利用可能性を示す結果となった。
他の遺伝子に関しても実験例5と同様に各正常細胞における発現を確認した。結果を図5に一覧表として示す。
実験例4において調査したがん細胞セルライン以外においてSox2が発現しているかを詳細に調べるため、肺がん細胞セルライン14種、腎細胞がんセルライン3種、前立腺がん細胞セルライン1種、子宮がん細胞セルラインHeLa細胞において、実験例4と同様にSox2の発現を確認した。ポジティブコントロールとして胎児脳細胞、ネガティブコントロールとして2回蒸留水を用いた。結果を図6に示す。
考察
調査した全てのがん細胞セルラインにおいてSox2の発現が確認された。このことは、現在知られている他のがん幹細胞分子マーカーよりもはるかに多種のがん細胞セルラインに対して、Sox2ががん幹細胞分子マーカーとして機能することを示している。また、多種多様なセルラインにおいて共通して発現していることは、Sox2が体内の部位にかかわらず、がん治療の標的になりうることを示唆している。
実験例5と同様に、Smcpが他のがん細胞セルラインにおいて発現しているかを詳細に調べた。がん細胞セルラインとして腎細胞がんセルライン6種、肺がん細胞セルライン7種、前立腺がん細胞セルライン1種において実験例5と同様にSmcpの発現を確認した。ポジティブコントロールとして精巣細胞、ネガティブコントロールとしてマウスの肺がん細胞を用いた。PCRのサイクル数を35サイクルおよび40サイクルとして行った結果を図7に示す。
考察
調査した全てのがん細胞セルラインにおいてSmcpの発現が確認された。このことはSox2と同様Smcpも既存のがん幹細胞分子マーカーよりもはるかに多種のがん細胞セルラインに対して分子マーカーとして機能することおよび治療の標的として利用可能性があることを示唆している。
a)正常細胞および他のがん細胞における発現
実験例3c)で確認されたInts1について、さらに有用性を確認するため、実験例5と同様に、Ints1順行プライマーおよび逆行プライマー(表1参照)を用いて、ヒト成人正常細胞および他のがん細胞において発現を調査した。その結果を図8a)に示す。
b)他のがんセルラインにおける発現
実験例8と同じセルライン用いて、他のがんセルラインにおけるInts1の発現を確認した。結果を図8b)に示す。
Ints1は正常細胞では、膵臓と脾臓にごくわずかな発現が見られた他は発現が確認できなかった。この結果は、ほぼ全ての組織においてInts1が組織中の正常細胞を認識しないマーカーであることを示し、正常細胞で発現が見られない組織において、または見られた膵臓および脾臓においても検出感度次第ではは、腫瘍細胞特異的に治療を行える可能性を示唆している。また実験例4の結果と同様、SW480,KM12、LHK2、MCF7においても、ほぼSP細胞特異的に発現しているので、がん幹細胞のマーカーとして有用であることが示唆される。
他のがんセルラインにおいては、一部を除いてほとんどのがんセルラインで発現が確認された。これはInts1が既存のがん幹細胞分子マーカーよりもはるかに多種のがん細胞セルラインに対して分子マーカーとして機能することおよび治療の標的として利用可能性があることを示唆している。
抗SOX2ポリクローナル抗体(ZYMED社製)を用いて、肺がんの組織に対して免疫組織染色を行った。20%ホルマリン固定液で固定されたヒト肺ガンのパラフィン包埋切片をエチルアルコールで脱パラフィン処理した。切片を0.01mol/Lのクエン酸緩衝液(pH6.0)に浸して、110℃で5分間オートクレーブして抗原賦活化処理した。抗SOX2ポリクローナル抗体0.5mlを切片上に滴下し、室温で1時間インキュベーションした。その後PBS−T(0.05%Tween 20/PBS、pH7.4)で3回洗浄した。2次抗体としてペルオキシダーゼで標識した抗マウスIgG抗体(シンプルステインMAX−PO、ニチレイ社製)を切片上に滴下し、室温で30分間インキュベートした。その後PBS−Tで3回洗浄した。切片を過酸化水素水とDAB基質の混合液(シンプルステインMAX−PO、ニチレイ社製)に浸し、1〜2分間発色反応させた。その後切片を流水で1分間洗浄し、ヘマトキシリンで1〜2分間核染色を行った。結果を図9に示す。
SOX2抗原タンパク質が茶色く染色されている。一部の細胞が濃く茶色に染色されているほか、腫瘍先進部に相当する部分において帯状に薄く染色された。この結果は抗SOX2抗体を用いて免疫染色することで、肺がんにおいて組織中のがん幹細胞の形態、細胞数、位置を明らかにすることが可能であることを示している。
実験例10と同様に、Basaloid typeの乳がんの組織に対して免疫組織染色を行った。比較例として、基底細胞のマーカーであるCK(サイトケラチン)5の染色も行った。結果を図10に示す。乳がん組織においてもSOX2抗原タンパク質が茶色く染色されて観察された。このことは乳がんにおいてもSOX2ががん幹細胞の形態、細胞数、位置を明らかにすることが可能であることを示している。Basaloid typeの乳癌は、一般的に予後が悪く、転移率が高いと認識されているが、このことにSOX2が関与している可能性が示唆される。
実験例10と同様に、脳、肺、胃、膵臓の正常組織に対して免疫組織染色を行った。結果を図11に示す。胃のごく一部で核の濃染像が認められたが、他の組織では発現が認められなかった。このことは、正常組織においては、SOX2がほとんど発現していないことを示している。
NOD/SCIDマウスにSox2を強制発現した細胞(LHK2−SOX2細胞)およびモックトランスフェクトした細胞(LHK2−mock細胞)をそれぞれ10000個ずつ、100μLの細胞マトリゲル混合液として左右の背部皮下に接種し、腫瘍を形成し始めたら長径・短径の長さを測り、回転楕円体に近似して体積を算出して比較した。結果を図12に示す。
考察
Sox2を強制発現した腫瘍組織において、強制発現していない腫瘍組織に比べて、顕著な造腫瘍性が観察された。この結果は、Sox2が発現すると、細胞の造腫瘍能力が高まることを示している。このメカニズムは、iPS細胞の癌化にも関係していると考えられる。
乳癌原発巣組織の免疫組織染色を行い、乳癌症例201例を、SOX2陽性乳癌40例とSOX2陰性乳癌161例とに分類した。図13は、それぞれの分類における、生存率の経時変化を表したグラフである。SOX2陽性乳癌患者は、SOX2陰性乳癌患者と比較して、有意に生存率が低いことがわかった。
shDNAオリゴヌクレオチドには、Sox2用として配列番号43、44のオリゴヌクレオチドをアニーリングしたもの、ネガティブコントロール用として配列番号45、46のオリゴヌクレオチドをアニーリングしたものをそれぞれ用いて、ベクターのプロトコルにしたがってRNAi-Ready pSIREN-RetroQベクターに導入し、sh−SOX2プラスミドおよびsh−EGFPプラスミドをそれぞれ作成した。LHK2セルラインに、sh−SOX2プラスミドおよびネガティブコントロールとしてsh−EGFPプラスミドをトランスフェクションし、シスプラチンをそれぞれ0、10、30、100μMの濃度で含有するDMEM培地で、37℃、24時間培養した。その後、MTT法によって細胞生存率を測定した。結果を図14に示す。
sh−SOX2を導入した細胞において、Sox2遺伝子の発現が顕著に抑制された。さらに、Sox2遺伝子の発現が抑制された細胞は、抑制されていない細胞と比較して、シスプラチン含有培地での培養において、生存率が優位に低下した。このことは、Sox2遺伝子の発現抑制によって、細胞のシスプラチンに対する感受性が有意に高まったことを示している。
Sox2のアミノ酸配列は、配列番号62に示されている。HLA−A24に結合するペプチドは、2番目のアミノ酸がチロシン、トリプトファン、フェニルアラニンまたはメチオニンであり、C末端のアミノ酸がロイシン、イソロイシン、トリプトファン、フェニルアラニンまたはメチオニンであることが知られている。Sox2のアミノ酸配列に含まれる配列のうち、このHLA−A24結合モチーフを有する9から11アミノ酸配列を選択し、以下のペプチドを計13種類合成した。
SOX2_1:MYNMMETEL(配列番号47)
SOX2_50:VWSRGQRRKM(配列番号48)
SOX2_58:KMAQENPKM(配列番号49)
SOX2_89:PFIDEAKRL(配列番号50)
SOX2_109:KYRPRRKTKTL(配列番号51)
SOX2_119:LMKKDKYTL(配列番号52)
SOX2_124:KYTLPGGLL(配列番号53)
SOX2_165:GWSNGSYSM(配列番号54)
SOX2_170:SYSMMQDQL(配列番号55)
SOX2_196:PMHRYDVSAL(配列番号56)
SOX2_209:SMTSSQTYM(配列番号57)
SOX2_216:YMNGSPTYSM(配列番号58)
SOX2_226:SYSQQGTPGM(配列番号59)
T2−A24細胞を、26℃で一晩培養した。その後細胞をPBSで洗浄し、SOX2由来の合成ペプチド、ポジティブコントロールとしてヒト免疫不全ウィルス由来のペプチドであるHIVペプチド(配列番号60)、エプスタイン−バーウィルス由来のペプチドであるEBVペプチド(配列番号61)、およびネガティブコントロールとして卵白アルブミン由来のペプチドであるSL8ペプチド(配列番号63)を加えて、26℃で3時間共培養した。温度を37℃にしてさらに2.5時間共培養した後、遠心分離して上清を除き、細胞を単離した。単離した細胞にHLA−A24抗体(C7709A2.6)を加え、4℃で1時間静置し、その後PBSで洗浄した。2次抗体として蛍光標識抗マウスIgG+IgM抗体を加え、4℃で30分静置した後、1%ホルマリンを加えて細胞を固定した。固定した細胞を、フローサイトメーター(BD FACS Calibur)にて、FITC蛍光強度を計測した。
インフォームドコンセントを得たHLA−A24陽性肺がん患者あるいはHLA−A24陽性健常者の末梢血50mlから、フィコール・コンレイ密度勾配中で遠心することにより、末梢血単核球(PBMC)を分離、回収した。続いてCD8 MACS beadsを用いて、PBMCよりCD8陽性リンパ球とCD8陰性リンパ球に分離した。
96ウェルプレートで200000個/ウェルのCD8陰性リンパ球と上記HLA−A24結合性SOX2ペプチドをそれぞれ混ぜ、室温で2時間静置後、100Gy分放射線処理した。処理した細胞を20U/mlのIL−2(武田薬品工業)、100000個/ウェルのCD8陽性リンパ球と共培養し、CD8陽性リンパ球刺激を週1回行い、計3回刺激してCTLを誘導した。誘導したCTLのペプチド特異的反応性を細胞傷害アッセイあるいはELISPOTアッセイにて評価した。
T2A24にCr51を加え、RPMI培地中で、37℃で1時間培養して放射線標識した後、RPMI培地で4回洗浄した。Cr標識したT2A24にSOX2ペプチドあるいはコントロールペプチド(HIVペプチド)を混ぜ、室温で1時間静置した。SOX2ペプチドあるいはコントロールペプチドをパルスした2000個/ウェルのT2A24と、実施例2にて誘導した14000個/ウェルのCD8陽性リンパ球をRPMI培地中で、37℃で4時間共培養した。その後上清を回収し、ガンマカウンターにてガンマ線量を測定した。
またRPMI培地のみとペプチドパルスT2A24を培養した場合の線量を自然放出(SPR)、細胞溶解液(2%のNP40)とペプチドパルスT2A24を培養した場合の線量を最大放出(MXR)とし、細胞障害活性を(測定値−SPR)/(MXR−SPR)×100として算出した。
実験はHuman IFNγ ELISPOT set (BD)を使用して行った。ELISPOTプレートに抗IFNγ抗体を4℃で一晩静置してコートした。T2A24にSOX2ペプチドあるいはコントロールペプチド(HIVペプチド)をそれぞれ加え、室温1時間静置した。50000個のペプチドパルスしたT2A24と、実施例2にて誘導した10000個のCTLを抗IFNγ抗体をコートしたプレートで、37℃で一晩共培養した。1×PBSと0.05%のTween20で洗浄後、ビオチン標識抗IFNγ抗体を加え、室温で2時間静置した。1×PBSと0.05%のTween20で洗浄後、HRP標識ストレプトアビジンを加え、室温で1時間静置した。1×PBSと0.05%のTween20で洗浄後、発色試薬を加え、スポット数を測定した。
結果を図17に示す。SOX2_109ペプチドをパルスしたT2A24に対して特異的に反応するCTLを検出した。コントロールペプチドであるHIV由来ペプチドでは、T細胞からのIFNγの放出が検出されなかったが、SOX2_109ペプチドでは多くのIFNγが放出されたことが確認できる。
NOD/SCIDマウスにSmcpを強制発現した細胞(LHK2−SMCP細胞)およびLHK2−mock細胞をそれぞれ10000個および1000個ずつ100μLの細胞マトリゲル混合液として左右の背部皮下に接種し、腫瘍を形成し始めたら長径・短径の長さを測り、回転楕円体に近似して体積を算出して比較した。結果を図18に示す。
考察
SMCPを過剰発現する細胞は、モックトランスフェクトした細胞に比べ、早く大型の腫瘍を形成した。特に少数の細胞においても、顕著に高い造腫瘍性を有し、このことは、SMCPががん幹細胞の腫瘍形成能力と関連した遺伝子であることを示唆している。
si−RNAは、Stealth Select RNAi(登録商標)siRNA (Catalog# 1299003)(invitrogen)を使用した。SMCP1はOligoID HSS142897のもの、SMCP3はOligoID HSS142899のものを指す。ネガティブコントロールとしてStealth RNA(登録商標) siRNA Negative Control Hi GC (12935-400)を使用した。si−RNA 100pmolとLipofectamine RNAiMAX 4μlを混合し、DMEM培養液で37℃、2日間培養し、RT−PCRによるmRNA発現レベルを測定した。結果を図19a)に示す。また遺伝子導入1日後から4日後までのそれぞれの細胞数の増加を測定した。結果を図19b)に示す。遺伝子導入の2日後に、NOD/SCIDマウスにSMCP1を導入した細胞(LHK2−si−SMCP1細胞)またはSMCP3を導入した細胞(LHK2−si−SMCP3細胞)、およびネガティブコントロールを導入した細胞(LHK2−si−control細胞)をそれぞれ200000個ずつ100μLの細胞マトリゲル混合液として左右の背部皮下に接種し、腫瘍を形成し始めたら長径・短径の長さを測り、回転楕円体に近似して体積を算出して比較した。結果を図20に示す。
SMCP遺伝子の発現を抑制した細胞は、有意に細胞増殖能および腫瘍形成能が低下していた。配列の一部が異なるsi−SMCP1およびsi−SMCP3の間においても、増殖能および腫瘍形成能の低下に有意に差ができた。これらの結果は、SMCP遺伝子の発現を抑制することで、がんの治療が可能であることを示唆している。
DNAJB8はDNAJ/HSP40ファミリーの一員で26KDのタンパクをコードする遺伝子であるが、精巣に高発現を認める以外、その局在、機能については詳細な報告はなされていない。DNAJ/HSP40ファミリーは、その多くがN末端にJドメインを有し、そのJドメインがHSP70と結合することによりATPの加水分解を促し、HSP70の基質結合領域の構造的変化をもたらすことで、HSP70の活性を制御していると考えられている。HSP40自身もペプチド結合領域を有し、HSP70へのペプチドの受け渡しの機能を有するものも存在する。
結果を図21に示す。精巣において強く発現している以外、ヒトの正常細胞においてDNAJB8の発現はほとんど見られなかった。一方、上記培養癌細胞株においては、発現レベルの多少の違いはあるものの、全ての細胞株において発現が認められた。
ACHN、MCF7、RenCa細胞を80%の密度まで培養し、実験例1と同様にフローサイトメトリーで解析した。結果を図22に示す。
3種の細胞株いずれにおいてもSP画分が単離され、MP画分と比較して強いDNAJB8の発現が確認された。
実験例2と同様の方法で、RenCa細胞をbalb/cマウス(メス、6週)の背部下皮の左右へそれぞれ104、103、102、101づつ接種し、1週ごとに腫瘍径を測定した。腫瘍の体積は以下の近似式で計算した。
腫瘍容積(mm3)=長径(mm)×短径(mm)2×1/2。
結果を図23に示す。RenCaのSP細胞はMP細胞や細胞を分離する前の細胞と比較して強い造腫瘍能を認めた。
a)DNAプラスミドの作成
DNAJB8、Survivinを発現するプラスミドを作成するためにRenCa cDNAからクローニングを行い、pcDNA3.1(+)発現ベクター(Invitrogen)のBamHI、XhoIの制限酵素部位へ挿入した。抗原の5’側へ免疫グロブリンκ鎖のシグナル配列5’-ATGGAGACAGACACACTCCTGCTATGGGTACTGCTGCTCTGGGTTCCAGGTTCCACTGGTGAC-3’をNheI、HindIIIの制限酵素部位へ挿入し、抗原の3’側へFLAG配列5’-GATTACAAGGATGACGACGATAAG-3’をXbaI、PmeIの制限酵素部位で挿入した。DNAプラスミドはEndoFree Plasmid Giga kit (Qiagen)で増幅、精製し、DNAの濃度は260nmの吸光度により測定した。
HEK293T細胞を70%の密度まで培養した。抗原を含むプラスミドをFuGENE HD (Roche)を用いて、HEK293T細胞へ遺伝子導入した。37℃で48時間培養後、培養上清を回収し、1500rpmで5分遠心し、その上清を採取した。上清に0.1MのDTTを総量の10%加え、100℃で5分加熱した。
サンプルは12%のゲル上でSDS−PAGEにより分離され、ニトロセルロースメンブレンへ転写した。メンブレンをブロッキングし、5000倍希釈した一次抗体を加え30分、室温で反応後、5000倍希釈したペルオキシダーゼ標識2次抗体で30分、室温で反応した。ECL Western blotting detection reagents (Amersham)を用いて化学発光法により抗原を同定した。
結果を図24に示す。図24a)はプラスミド構築物のマップを表わし、該プラスミド構築物は分泌型のDNAJB8をコードする。さらに3’末端側にFLAGタグ配列を有している。図24b)はウェスタンブロッティングの結果を示す。これにより、このプラスミド構築物は、分泌型のDNAJB8およびSurvivinを発現することが分かった。
DNAプラスミドワクチンは、各群5匹づつbalb/cマウス(6週、メス)の足へ200μg/匹、1週毎に計4回接種し、最終接種日の1週後にRenCaを105/匹づつ背部皮下へ接種した。1週毎に腫瘍径を測定し、DNAワクチンの免疫原性を検討した。
結果を図25に示す。DNAJB8を免疫したマウスは、survivinを免疫したマウスよりさらに有意に腫瘍の増大抑制効果を認めた。
BIMAS(http://www-bimas.cit.nih.gov/molbio/hla_bind/)でHLA−A24拘束性のDNAJB8にコードされる抗原ペプチド配列を予測し、4つ作成した。
DNAJB8(22−30):AYRKLALRW(配列番号68)
DNAJB8(90−99):GYTFRNPEDI(配列番号69)
DNAJB8(99−107):IFREFFGGL(配列番号70)
DNAJB8(143−151):AFMEAFSSF(配列番号71)
ペプチドトランスポーターを欠損したT2細胞にHLA−A2402を遺伝子導入した細胞株T2A24をアッセイに使用し、実験例16と同様に実験を行った。本実験例では、ネガティブコントロールとしてSL−8を、ポジティブコントロールとしてsurvivin-2B(配列番号72)を用いた。
結果を図26に示す。図26a)は蛍光の遷移を表わし、図26b)は平均蛍光強度を表わす。設計した4つのペプチドのうち3つがHLA−A24との結合を認めた。
腎癌細胞株ACHNを70%まで培養し、レトロウイルスベクターにより抗原を遺伝子導入した。37℃で48時間培養後、ピューロマイシン1μg/mlを加えて細胞を選択した。
結果を図27に示す。DNAJB8を恒常的に発現する細胞株では、SP画分の細胞数が有意に増大した。
olfactory receptor family 7 subfamily C member 1(OR7C1)は、その構造からolfactory receptor familyに分類される、Gタンパク共役型タンパク質で7回膜貫通型タンパク質である。舌での発現が報告されている他は、現在までにそのリガンドについてなどの詳細な報告はない。
Human Multiple Tissue cDNA Panels I, II (Clontech) を正常組織のcDNAとして使用した。培養癌細胞株のRNAはRNeasy Mini Kit (Qiagen)を用いて抽出した。培養癌細胞株として、ヒト大腸癌細胞株Sw480、HT29、HCT15、KM12LM、ヒト肺癌細胞株LHK2を用いた。抽出したRNA2μgからSuperscript III逆転写酵素とoligo(dT) primer (Invitrogen)を用いてcDNAを精製した。PCRはcDNA 0.25μgとTaq DNA polymerase (Qiagen) 0.1μgとプライマー 12pmolを含む計20μlで行った。PCR条件は、実験例4b)の表2に記載の条件で、35サイクルで行った。PCR産物の大きさは201bpであった。
PLAT−A細胞を、1μg/mlのピューロマイシン、10μg/mlのブラストシジンを添加した10%のFBS入りDMEM培地中で、10cmディッシュにて50%程度の密度まで培養した。or7c1が挿入されたレトロウイルスベクターpMXs−Ib 10μg+Opti-MEM(Invitrogen) 1000μlと、5分間室温でインキュベートしたリポフェクタミン2000(Invitrogen) 40μl+Opti-MEM 1000μlとを混和し、さらに20分間室温でインキュベートした。その後、前述のPLAT−A細胞の培地に混和し、37℃で培養し、24時間後に10%FBS入りDMEMに培地交換を行い、さらに24時間後にウイルス液として上清を回収した。このウイルス液1.5mlと8μg/mlのポリブレンを2×105個のSw480細胞とともに6ウェルのプレートで37℃で培養し、8時間後に新鮮な10%FBS入りDMEMを1ml添加し、37℃で培養した。48時間後からピューロマイシン2μg/mlを加え、細胞を選択して恒常発現株を得た。
or7c1恒常発現株、or7c1ノックダウン株および比較対象としてモックトランスフェクションしたSw480細胞株の位相差顕微鏡画像およびRT−PCR結果を図29に示す。細胞形態においては、モックトランスフェクションしたSw480と恒常発現株の間には特徴の差は見られなかったが、ノックダウン細胞株では細胞個々の接着性が失われていた。また、RT−PCRの結果から、or7c1が恒常発現株では強く発現しており、ノックダウン株ではほとんど発現していないことが確認された。
実験例1と同様にして、or7c1ノックダウン株のSP画分の変化を検討した。結果を図30に示す。ノックダウン細胞株では、SP細胞は消失した。
実験例2と同様の方法で、腫瘍細胞(SW480細胞株のor7c1恒常発現株)およびネガティブコントロールとしてモックトランスフェクションしたSW480細胞を、NOD/SCIDマウス(メス、5週)の背部皮下の左右へそれぞれ104、103、102、101ずつ接種し、1週毎に腫瘍径を測定した。同様にor7c1ノックダウン細胞およびネガティブコントロールとしてネガティブsiRNA株を104ずつ接種し、1週毎に腫瘍径を測定した。
結果を図31に示す。モックトランスフェクションしたSw480とor7c1恒常発現株の比較では、104および103では顕著な差が見られなかったが102および101では恒常発現株で腫瘍形成能が高かった。ネガティブsiRNAとor7c1ノックダウン株では、104においてor7c1ノックダウン株は腫瘍形成能が顕著に低かった。
実験例26と同様にして、以下のペプチドを作成し、結合アッセイを行った。
or7c1_34(10):MYLVTFTGNL(配列番号73)
or7c1_59(10):MYFFlSNLSF(配列番号74)
or7c1_93(10):TYAGCLSQIF(配列番号75)
or7c1_131(10):HYTViMNPQL(配列番号76)
or7c1_217(10):SYYKiVFSIL(配列番号77)
or7c1_251(10):FYGTGFGVYL(配列番号78)
or7c1_277(9):MYTMVTPML(配列番号79)
結果を図32に示す。この結果、277(9)、34(10)、251(10)、131(10)および93(10)でHLA−A2402との結合が認められた。
被験者から採血した全血(ヘパリン加)から、Lymphoprep (Nycomed)を用いてPBMCを分離した。PBMCを37℃で24時間培養後、非付着細胞を用いて実験した。この非付着細胞からCD8陽性細胞を得るためにmagnetic cell separation system(Miltenyi Biotech)を用いてCD8陽性細胞と陰性細胞に分離した。CD8陰性細胞はAIM−V培地(Life Technologies)に100U/mlのIL−2と1μg/mlのPHA−Pを加え、PHA−blastとした。CD8陽性細胞はAIM−V培地で37℃で培養し、1週間ごと3回(0日目、7日目、14日目)に1/5量のPHA−blastで刺激した。8日目からIL−2 50U/mlを培地に添加し、以降3〜4日毎に培地交換とともにIL−2 50U/mlを加えた。この細胞はCTLとして、21日目にELISPOT、28日目に51Crリリースアッセイを施行した。
ELISPOTを施行するために、エフェクター細胞として前述の誘導したCTL5×105/mlを使用した。またターゲットとしてT2A24およびK562細胞(K562はネガティブコントロール)を使用した。T2A24細胞は、前述したペプチド結合アッセイでHLA−A24に提示されることが判明したペプチド各5μg/mlを用いて、室温で2時間インキュベートした。ターゲット細胞は5×105/mlで細胞調整した。96ウェルのmultiscreen plate(Millipore)に5μg/mlのIFN−γキャプチャー抗体(PharMingen)を100μl/ウェルで加え、PBSに浸して4℃で一晩静置した。その後、200μl/ウェルのRPMI1640(Sigma Chemical Co)で1回洗浄し、RPMI1640で2時間固定した。前述のエフェクター/ターゲット細胞をそれぞれ100μlずつウェルに加え、40時間インキュベーションし、洗浄により細胞を除去した後、検出用のサイトカイン抗体を添加した。さらに、酵素標識ストレプトアビジンを添加し、エリスポットリーダーでカウントした。
結果を図33に示す。93(10)のペプチドにおいてIFN−γの放出が確認された。
細胞障害活性を測定する為のアッセイで、放射活性を持った51Crにて細胞を標識し、CTLによる細胞障害活性を測定した。エフェクター細胞としてCTLを用い、ターゲット細胞としてT2A24、K562、Sw480、or7c1恒常発現Sw480を用いた。まず、1×106のターゲット細胞を回収し、10〜100μlの51Crを加え、37℃で1時間インキュベートし、細胞を51Crで標識した。標識終了した細胞を、RPMI1640で4回洗浄し、1×105/ml(最終的にターゲット細胞2000/ウェルで使用)になるようにRPMI1640で溶解した。T2A24は5μg/mlのペプチドでパルスし、室温で1時間インキュベートした。一方、CTLは96ウェルプレートにぞれぞれ、E/T比にあわせて100μlのAMI−Vで溶解して蒔いた。また、データの解析のため、自然放出を測定するためのウェルには100μlのAIM−Vを、最大放出を測定するためのウェルには100μlの2%NP−40をあらかじめウェルに入れておいた。ターゲット細胞をエフェクターの入った96ウェルプレートに各ウェル100μLずつ加え、37℃で4時間培養した。その後、培養上清をそれぞれ回収し、ガンマカウンターにて測定した。解析には以下の式を用いた。
殺傷%=(計測放出−自然放出)×100/(最大放出−自然放出)
結果を図34に示す。Sw480と比較し、or7c1恒常発現Sw480でより細胞障害活性が高かった。T2A24に関しては、E/T比20および6において、ペプチド93(10)でパルスした方が細胞障害活性が高かった。
Claims (24)
- (1)TYAGCLSQIF(配列番号75)からなるペプチド、および/または
(2)(1)のペプチドにおいて、N末端から2番目のアミノ酸がトリプトファン、フェニルアラニンもしくはメチオニンに置換され、および/または、C末端のアミノ酸がロイシン、イソロイシン、トリプトファンもしくはメチオニンに置換されたペプチドであって、細胞傷害性T細胞(CTL)誘導活性を有するペプチド
を有効成分として含有するCTL誘導剤。 - TYAGCLSQIF(配列番号75)からなるペプチドをコードする核酸、および/または、
前記ペプチドにおいて、N末端から2番目のアミノ酸がトリプトファン、フェニルアラニンもしくはメチオニンに置換され、および/または、C末端のアミノ酸がロイシン、イソロイシン、トリプトファンもしくはメチオニンに置換されたペプチドであって、CTL誘導活性を有するペプチドをコードする核酸
を有効成分として含有するCTL誘導剤。 - がん治療用またはがん予防用である、請求項1または2に記載の剤。
- Or7c1_93: TYAGCLSQIF (配列番号75)のアミノ酸配列からなるペプチド。
- 請求項4に記載のペプチドを有効成分として含有する、がんの治療または予防剤。
- TYAGCLSQIF(配列番号75)からなるペプチド、および/または
前記ペプチドにおいて、N末端から2番目のアミノ酸がトリプトファン、フェニルアラニンもしくはメチオニンに置換され、および/または、C末端のアミノ酸がロイシン、イソロイシン、トリプトファンもしくはメチオニンに置換されたペプチドであって、CTL誘導活性を有するペプチド
を有効成分として含有する、がん幹細胞を死滅させるための医薬組成物。 - TYAGCLSQIF(配列番号75)からなるペプチドをコードする核酸、および/または、
前記ペプチドにおいて、N末端から2番目のアミノ酸がトリプトファン、フェニルアラニンもしくはメチオニンに置換され、および/または、C末端のアミノ酸がロイシン、イソロイシン、トリプトファンもしくはメチオニンに置換されたペプチドであって、CTL誘導活性を有するペプチドをコードする核酸
を有効成分として含有する、がん幹細胞を死滅させるための医薬組成物。 - Or7c1および/またはDnajb8の発現産物由来のエピトープと特異的に反応する抗体を含む、心臓、脳、胎盤、肺、肝臓、骨格筋、腎臓、脾臓、胸腺、前立腺、精巣、卵巣、小腸、白血球、結腸、胃、骨髄、大腸および末梢血単核球からなる群から選択される1または2以上の細胞または組織由来のがん幹細胞を死滅させるための医薬組成物。
- Or7c1および/またはDnajb8の発現を抑制する核酸を含む、心臓、脳、胎盤、肺、肝臓、骨格筋、腎臓、脾臓、胸腺、前立腺、精巣、卵巣、小腸、白血球、結腸、胃、骨髄、大腸および末梢血単核球からなる群から選択される1または2以上の細胞または組織由来のがん幹細胞を死滅させるための医薬組成物。
- がんの治療用または予防用である、請求項6〜9に記載の医薬組成物。
- Or7c1またはDnajb8によりコードされるポリペプチドを含む、がんワクチン。
- Or7c1またはDnajb8をコードする核酸を含む、がんワクチン。
- Or7c1およびDnajb8からなる群から選択される遺伝子の発現産物を検出する試薬を含む、がん幹細胞を検出するための組成物。
- 遺伝子の発現産物が、mRNAおよび/または内在性ポリペプチドである、請求項13に記載の組成物。
- 判定対象の細胞集団において、Or7c1およびDnajb8からなる群から選択される遺伝子の発現産物を指標として、がん幹細胞の有無を判定する方法であって、前記遺伝子の発現産物が検出された場合、がん幹細胞が存在すると決定される前記方法。
- 細胞集団が、正常細胞および/またはがん幹細胞でないがん細胞を含む、請求項15に記載の方法。
- 遺伝子の発現産物がmRNAであり、RT−PCR法により検出することを含む、請求項15または16に記載の方法。
- 遺伝子の発現産物が内在性ポリペプチドであり、該内在性ポリペプチドと特異的に反応する試薬により検出することを含む、請求項15または16に記載の方法。
- 試薬が抗体である、請求項18に記載の方法。
- i)Or7c1およびDnajb8からなる群から選択される遺伝子の発現産物の、候補化合物を細胞集団に投与する前の検出量Aを測定する工程、
ii)候補化合物を細胞集団に投与する工程、
iii)i)において測定した遺伝子の発現産物の、候補化合物を細胞集団に投与した後の検出量Bを測定する工程、および
iv)AとBを比較し、AがBより有意に大きい場合に、候補化合物をがん幹細胞を含むがんの治療薬候補であると判定する工程、
を含む、がん幹細胞を含むがんの治療薬のスクリーニング方法。 - がん幹細胞の有無を判定するためのキットであって、Or7c1およびDnajb8からなる群から選択される遺伝子の発現産物を検出するための試薬を少なくとも含む、前記キット。
- 検出するための試薬が、Or7c1およびDnajb8からなる群から選択される遺伝子の発現産物であるmRNAを検出するための前記遺伝子に相補的な塩基配列を有するプローブおよび/またはプライマーである、請求項21に記載のキット。
- 検出するための試薬が、Or7c1およびDnajb8からなる群から選択される遺伝子の発現産物であるポリペプチドを検出するための抗体である、請求項21に記載のキット。
- i)目的ポリペプチドのアミノ酸配列に含まれる配列のうち、所定のMHCクラスI分子結合モチーフを有する配列を有する候補ペプチドを作製する工程、
ii)i)で得られた候補ペプチドを提示する抗原提示細胞で、エフェクター細胞を刺激する工程、
iii)ii)で得られたエフェクター細胞と、目的ポリペプチドを発現する、および/またはi)で得られた候補ペプチドを提示するターゲット細胞とを共に培養する工程、
iv)エフェクター細胞の活性化の度合いを測定する工程、
v)iv)においてエフェクター細胞を活性化した候補ペプチドを選別する工程、
を含む、がん幹細胞に対するCTL誘導活性を有するペプチドのスクリーニング方法であって、目的ポリペプチドが、以下の(1)または(2):
(1)Or7c1またはDnajb8によりコードされるポリペプチド、
(2)(1)のポリペプチドにおいて、1もしくは2個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたポリペプチド、
のいずれかである、前記方法。
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