JP5821946B2 - Bssr遺伝子の発現が増強した腸内細菌科の細菌を使用するl−アミノ酸の製造方法 - Google Patents
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Description
テイン、L-メチオニン、L-ロイシン、L-イソロイシン、L-バリン、L-ヒスチジン、グリシン、L-セリン、L-アラニン、L-アスパラギン、L-アスパラギン酸、L-グルタミン、L-グルタミン酸、L-プロリン、L-アルギニン、L-シトルリン、及びL-オルニチンからなる群より選択される前記細菌を提供することである。
ここに開示する主題に基づく細菌は、腸内細菌科のL-アミノ酸生産細菌であって、bssR遺伝子の発現が増強されるよう改変された細菌である。
、L-リジン、L-システイン、L-メチオニン、L-ロイシン、L-イソロイシン、L-バリン、L-ヒスチジン、グリシン、L-セリン、L-アラニン、L-アスパラギン、L-アスパラギン酸、L-グルタミン、L-グルタミン酸、L-プロリン、及びL-アルギニンを含む。具体例は、L-スレオニン、L-リジン、L-システイン、L-ロイシン、L-ヒスチジン、L-グルタミン酸、L-フェニルアラニン、L-トリプトファン、L-プロリン、及びL-アルギニンである。
び配列番号2に示す。
A Laboratory Manual, Second Edition", Cold Spring Harbor Laboratory Press (1989)に記載されている。
bssR遺伝子の発現が増強されるよう改変された、ここに開示する主題に基づく細菌としては、芳香族又は非芳香族L-アミノ酸のいずれを生産することのできる細菌でも使用することができる。
L-スレオニン生産細菌、又はL-スレオニン生産細菌を誘導するのに使用することのできる親株としては、限定されるものではないが、Escherichia属に属する株、例えば、E. coli TDH-6/pVIC40 (VKPM B-3996)(米国特許第5,175,107号、米国特許第5,705,371号)、E. coli 472T23/pYN7 (ATCC 98081)(米国特許第5,631,157号)、E. coli NRRL-21593(米国特許第5,939,307号)、E. coli FERM BP-3756(米国特許第5,474,918号)、E. coli FERM BP-3519及びFERM BP-3520(米国特許第5,376,538号)、E. coli MG442(Gusyatinerら、Genetika(ロシア語)、14, 947-956 (1978))、並びにE. coli VL643及びVL2055(EP1149911A)等が挙げられる。
of Antibiotics (Russia, 117105 Moscow, Nagatinskaya Street 3-A) に寄託された。この株は、1987年4月7日に、受託番号VKPM B-3996の下で、Russian National Collection
of Industrial Microorganisms (VKPM) (GNII genetika, 1 Dorozhny proezd, 1, Moscow 117545, Russian Federation) にも寄託された。
スレオニンによるフィードバック阻害に耐性のアスパルトキナーゼホモセリンデヒドロゲナーゼI(aspartokinase homoserine dehydrogenase I)をコードする変異型thrA遺伝子;
ホモセリンキナーゼ(homoserine kinase)をコードするthrB遺伝子;
スレオニン合成酵素(threonine synthase)をコードするthrC遺伝子;
推定上の膜貫通タンパク質(putative transmembrane protein)をコードするrhtA遺伝子;
アスパルテート−β−セミアルデヒドデヒドロゲナーゼ(aspartate-β-semialdehyde dehydrogenase)をコードするasd遺伝子;及び
アスパルテートアミノトランスフェラーゼ(aspartate aminotransferase)(アスパルテートトランスアミナーゼ(aspartate transaminase))をコードするaspC遺伝子。
C_000913.2, gi: 49175990)。thrA遺伝子は、E. coli K-12の染色体上のthrL遺伝子とthrB遺伝子との間に位置する。Escherichia coliのホモセリンキナーゼをコードするthrB遺伝子は明らかとなっている(ヌクレオチド位置2801〜3733、GenBank accession no. NC_000913.2, gi: 49175990)。thrB遺伝子は、E. coli K-12の染色体上のthrA遺伝子とthrC遺伝子との間に位置する。Escherichia coliのスレオニン合成酵素をコードするthrC遺伝子は明らかとなっている(ヌクレオチド位置3734〜5020、GenBank accession no. NC_000913.2, gi: 49175990)。thrC遺伝子は、E. coli K-12の染色体上のthrB遺伝子とyaaXオープンリーディングフレームとの間に位置する。これら3つの遺伝子は全て、単一のスレオニンオペロンとして機能する。スレオニンオペロンの発現を増強するためには、望ましくは、転写に影響を与えるアテニュエーター領域を同オペロンから除去する(WO2005/049808、WO2003/097839)。
Escherichia属に属するL-リジン生産細菌としては、L-リジンアナログに対する耐性を有する変異体が挙げられる。L-リジンアナログは、Escherichia属に属する細菌の生育を阻害するが、培地中にL-リジンが存在する場合、この阻害は完全に又は部分的に脱感作される。L-リジンアナログとしては、限定されるものではないが、オキサリジン、リジンハイドロキサメート、S-(2-アミノエチル)-L-システイン(AEC)、γ‐メチルリジン、α‐クロロカプロラクタム等が挙げられる。これらのリジンアナログに対する耐性を有する変異体は、Escherichia属に属する細菌を従来の人工的な変異誘発処理に供することによって得ることができる。L-リジンを製造するのに有用な細菌株としては、特に、Escherichia coli AJ11442 (FERM BP-1543, NRRL B-12185;米国特許第4,346,170号参照)及びEscherichia coli VL611が挙げられる。これらの微生物においては、L-リジンによるアスパルト
キナーゼのフィードバック阻害が脱感作されている。
L-システイン生産細菌、又はL-システイン生産細菌を誘導するのに使用することのできる親株としては、限定されるものではないが、Escherichia属に属する株、例えば、フィードバック耐性のセリンアセチルトランスフェラーゼをコードする種々のcysEアレルを形質転換したE. coli JM15(米国特許第6,218,168号、ロシア連邦特許出願第2003121601号)、細胞に毒性の物質を分泌するのに適したタンパク質をコードする遺伝子が過剰発現したE. coli W3110(米国特許第5,972,663号)、システインデスルフヒドラーゼ活性が低下したE. coli株(JP11155571A2)、cysB遺伝子によりコードされるシステインレギュロンの正の転写制御因子(positive transcriptional regulator)の活性が増大したE. coli W3110等が挙げられる。
L-ロイシン生産細菌、又はL-ロイシン生産細菌を誘導するのに使用することのできる親株としては、限定されるものではないが、Escherichia属に属する株、例えば、ロイシンに耐性のE. coli株(例えば、57株(VKPM B-7386、米国特許第6,124,121号))又はβ-2-チエニルアラニン、3-ヒドロキシロイシン、4-アザロイシン、5,5,5-トリフルオロロイシンを含むロイシンアナログに耐性のE. coli株(JP62-34397B及びJP8-70879A)、WO96/06926に記載された遺伝子操作方法によって得られたE. coli株、E. coli H-9068(JP8-70879A)等が挙げられる。
L-ヒスチジン生産細菌、又はL-ヒスチジン生産細菌を誘導するのに使用することのできる親株としては、限定されるものではないが、Escherichia属に属する株、例えば、E. coli 24株(VKPM B-5945, RU2003677)、E. coli 80株(VKPM B-7270, RU2119536)、E. coli NRRL B-12116〜B-12121(米国特許第4,388,405号)、E. coli H-9342 (FERM BP-6675)及びH-9343 (FERM BP-6676)(米国特許第6,344,347号)、E. coli H-9341 (FERM BP-6674) (EP1085087)、E. coli AI80/pFM201(米国特許第6,258,554号)等が挙げられる。
L-グルタミン酸生産細菌、又はL-グルタミン酸生産細菌を誘導するのに使用することのできる親株としては、限定されるものではないが、Escherichia属に属する株、例えば、E. coli VL334thrC+ (EP 1172433) が挙げられる。E. coli VL334 (VKPM B-1641) は、thrC及びilvA遺伝子に変異を有するL-イソロイシン及びL-スレオニン要求性の株である(米国特許第4,278,765号)。thrC遺伝子の野生型アレルは、野生型E. coli K12 (VKPM B-7) 細胞で生育させたバクテリオファージP1を使用する一般的なトランスダクション法によって導入した。この結果、L-グルタミン酸を生産することのできるL-イソロイシン要求性株VL334thrC+ (VKPM B-8961) が得られた。
。L-グルタミン酸生合成に関与する遺伝子としては、グルタミン酸デヒドロゲナーゼ(gdhA)、グルタミン合成酵素(glnA)、グルタミン酸合成酵素(gltAB)、イソクエン酸デヒドロゲナーゼ(icdA)、アコニテートヒドラターゼ(acnA, acnB)、クエン酸合成酵素(gltA)、ホスホエノールピルビン酸カルボキシラーゼ(ppc)、ピルビン酸カルボキシラーゼ(pyc)、ピルビン酸デヒドロゲナーゼ(aceEF, lpdA)、ピルビン酸キナーゼ(pykA, pykF)、ホスホエノールピルビン酸合成酵素(ppsA)、エノラーゼ(eno)、ホスホグリセロムターゼ(pgmA, pgmI)、ホスホグリセレートキナーゼ(pgk)、グルセルアルデヒド-3-リン酸デヒドロゲナーゼ(gapA)、トリオースリン酸イソメラーゼ(tpiA)、フルクトースビスリン酸アルドラーゼ(fbp)、ホスホフルクトキナーゼ(pfkA, pfkB)、及びグルコースリン酸イソメラーゼ(pgi)をコードする遺伝子が挙げられる。
E. coli W3110sucA::KmR
E. coli AJ12624 (FERM BP-3853)
E. coli AJ12628 (FERM BP-3854)
E. coli AJ12949 (FERM BP-4881)
行政法人産業技術総合研究所特許生物寄託センター、日本国 茨城県つくば市東1丁目1番地1 中央第6 (郵便番号305-8566))に、1998年2月19日、FERM P-16645の受託番号の下で寄託された。その後、同株は1999年1月11日にブダペスト条約に基づく国際寄託に移管され、FERM BP-6615の受託番号が付与された。Pantoea ananatis AJ13356は、αKGDH-E1サブユニット遺伝子(sucA)が破壊された結果、α−ケトグルタル酸デヒドロゲナーゼ活性を欠損している。同株は、分離された当時はEnterobacter agglomeransとして同定され、Enterobacter agglomaerans AJ13356として寄託された。しかしながら、同株は、最近、16S rRNAの塩基配列解析等に基づきPantoea ananatisとして再分類された。AJ13356は、Enterobacter agglomeransとして上記寄託機関に寄託されたが、この明細書の目的のためには、Pantoea ananatisとして記載する。
L-フェニルアラニン生産細菌、又はL-フェニルアラニン生産細菌を誘導するのに使用することのできる親株としては、限定されるものではないが、Escherichia属に属する株、例えば、E. coli AJ12739 (tyrA::Tn10,tyrR) (VKPM B-8197)、変異型pheA34遺伝子を保有するE. coli HW1089 (ATCC 55371)(米国特許第5,354,672号)、E. coli MWEC101-b (KR8903681)、E. coli NRRL B-12141, NRRL B-12145, NRRL B-12146、及びNRRL B-12147(米国特許第4,407,952号)が挙げられる。また、親株としては、E. coli K-12 [W3110(tyrA)/pPHAB] (FERM BP-3566)、E. coli K-12 [W3110(tyrA)/pPHAD] (FERM BP-12659)、E. coli K-12 [W3110(tryA)/pPHATerm] (FERM BP-12662)、及びE. coli K-12 [W3110(tyrA)/pBP-aroG4, pACMAB](AJ12604 (FERM BP-3579)と命名)を使用することができる(EP 488424 B1)。更に、yedA遺伝子又はyddG遺伝子によりコードされるタンパク質の活性が増強されたEscherichia属に属するL-フェニルアラニン生産細菌を使用してもよい(米国特許出願第2003/0148473A1号及び2003/0157667A1号)。
L-トリプトファン生産細菌、又はL-トリプトファン生産細菌を誘導するのに使用することのできる親株としては、限定されるものではないが、Escherichia属に属する株、例えば、変異型trpS遺伝子によりコードされるトリプトファニルtRNA合成酵素を欠損したE. coli JP4735/pMU3028 (DSM10122)及びJP6015/pMU91 (DSM10123)(米国特許第5,756,345号)、セリンによるフィードバック阻害が解除されたホスホグリセレートデヒドロゲナーゼをコードするserAアレル及びトリプトファンによるフィードバック阻害が解除されたアントラニレート合成酵素をコードするtrpEアレルを有するE. coli SV164(pGH5)(米国特許第6,180,373号)、トリプトファナーゼ酵素を欠損したE. coli AGX17(pGX44) (NRRL B-12263)及びAGX6(pGX50)aroP (NRRL B-12264)(米国特許第4,371,614号)、ホスホエノールピルビン酸生産能が増強されたE. coli AGX17/pGX50, pACKG4-pps(WO9708333、米国特許第6,319,696号)等が挙げられる。yedA遺伝子又はyddG遺伝子によりコードされる同定済みのタンパク質の活性が増強されたEscherichia属に属するL-トリプトファン生産細菌を使用してもよい(米国特許出願第2003/0148473A1号及び2003/0157667A1号)。
L-プロリン生産細菌、又はL-プロリン生産細菌を誘導するのに使用することのできる親株としては、限定されるものではないが、Escherichia属に属する株、例えば、ilvA遺伝子を欠損し、L-プロリンを生産することのできるE. coli 702ilvA (VKPM B-8012)(EP 1172433)が挙げられる。細菌は、L-プロリン生合成に関与する1またはそれ以上の遺伝子の発現を増強することにより改良することができる。L-プロリン生産細菌に好ましい遺伝子としては、L-プロリンによるフィードバック阻害が脱感作されたグルタメートキナーゼをコードするproB遺伝子が挙げられる(DE特許3127361)。さらに、細菌は、菌体からL-アミノ酸を排出するタンパク質をコードする1またはそれ以上の遺伝子の発現を増強することにより改良されていてよい。そのような遺伝子としては、b2682及びb2683遺伝子(ygaZH遺伝子)が挙げられる(EP 1239041 A2)。
L-アルギニン生産細菌、又はL-アルギニン生産細菌を誘導するのに使用することのできる親株としては、限定されるものではないが、Escherichia属に属する株、例えば、E. coli 237株 (VKPM B-7925)(米国特許出願第2002/058315A1号)及び変異型N-アセチルグルタミン酸合成酵素を保有するその誘導体株(ロシア連邦特許出願第2001112869号)、E. coli 382株 (VKPM B-7926)(EP1170358A1)、ならびにN-アセチルグルタミン酸合成酵素をコードするargA遺伝子が導入されたアルギニン生産株(EP1170361A1)等が挙げられる。
L-シトルリン生産細菌、又はL-シトルリン生産細菌を誘導するのに使用することのできる親株としては、限定されるものではないが、Escherichia属に属する株、例えば、E. coliの変異型N-アセチルグルタミン酸合成酵素株である237/pMADS11, 237/pMADS12、及び237/pMADS13 (RU2215783, EP1170361B1, US6790647B2)、E. coli 333株 (VKPM B-8084)及び374株 (VKPM B-8086)(両者は、フィードバック耐性の変異型カルバモイルリン酸合成
酵素を保有する)(ロシア連邦特許第RU2264459 C2号)、α‐ケトグルタル酸合成酵素の活性が増加し、さらにフェレドキシンNADP+レダクターゼ、ピルビン酸合成酵素、又はα‐ケトグルタル酸デヒドロゲナーゼの活性が改変されたE. coli株(EP 2133417 A1号)、ならびに、コハク酸デヒドロゲナーゼ及びα‐ケトグルタル酸デヒドロゲナーゼの活性が減少したP. ananatis NA1sucAsdhA株(米国特許出願第2009286290号)等が挙げられる。
USA, 97, 12, p 6640-6645 (2000))。または、相同組換えを使用する遺伝子置換は、温度感受性複製開始点を有するプラスミドを用いて行うことができる(米国特許第6,303,383号又はJP 05-007491A)。更に、宿主中で複製できないプラスミドを使用する上記のような相同組換えを使用して、遺伝子置換による部位特異的変異を組み込むこともできる。
L-オルニチン生産細菌は、いずれかのアルギニン生産細菌、例えば、E. coli 382株(VKPM B-7296)から、argF及びargIの両遺伝子によりコードされるオルニチンカルバモイルトランスフェラーゼを不活化させることにより容易に取得することができる。オルニチンカルバモイルトランスフェラーゼを不活化させる方法は、上記の通りである。
L-バリン生産細菌、又はL-バリン生産細菌を誘導するのに使用することのできる親株としては、Escherichia属に属する細菌、例えば、H-81 (VKPM B-8066)、NRRL B-12287及びNRRL B-12288(米国特許第4,391,907号)、VKPM B-4411(米国特許第5,658,766号)、VKPM
B-7707(欧州特許出願第EP1016710A2号)等が挙げられる。
L-イソロイシン生産細菌、又はL-イソロイシン生産細菌を誘導するのに使用することのできる親株としては、限定されるものではないが、6-ジメチルアミノプリンに対する耐性を有する変異体(JP 5-304969A)、チアイソロイシンやイソロイシンヒドロキサメート等
のイソロイシンアナログに対する耐性を有する変異体、及びDL-エチオニン及び/又はアルギニンヒドロキサメートに対する耐性をさらに有する変異体(JP 5-130882A)が挙げられる。さらに、L-イソロイシン生合成に関与するタンパク質、例えば、スレオニンデアミナーゼやアセトヒドロキセート合成酵素、をコードする遺伝子により形質転換された組換え株を親株として使用することもできる(JP 2-458A、FR 0356739、及び米国特許第5,998,178号)。
L-メチオニン生産細菌、及びL-メチオニン生産細菌を誘導するための親株としては、限定されるものではないが、L-スレオニン要求性変異株やノルロイシン耐性変異株(JP2000-139471A)が挙げられる。また、メチオニンリプレッサー欠損株や、L-メチオニン生合成に関与するタンパク質、例えばホモセリントランススクシニラーゼやシスタチオニンγ−合成酵素、をコードする遺伝子により形質転換された組換え株(JP2000-139471A)を親株として使用することもできる。
ここに開示した主題に基づく例示的な方法には、ここに開示した主題に基づく細菌を培地中で培養して培地中にL-アミノ酸を生産および分泌させ、培地からL-アミノ酸を回収することにより、L-アミノ酸を製造することが含まれる。
E. coli MG1655::PL-tacbssR株を、MG1655株のbssR遺伝子の本来の(native)プロモーター領域をPL-tacプロモーターで置換することにより取得した。
ェニコールを含有するL-寒天上に塗布した。24時間以内に生育したコロニーについて、プライマーP3(配列番号6)及びP4(配列番号7)を使用するPCRにより、bssR遺伝子の本来のプロモーター領域に代わるCmRマーカーの存在を試験した。この目的のために、新たに単離したコロニーを20μlの水に懸濁し、次いで、1μlの得られた懸濁物をPCRに使用した。以下の温度プロファイルを使用した:95℃で10分の最初のDNA変性を行った後、95℃で30秒の変性、55℃で30秒のアニーリング、及び72℃で1分の伸長を30サイクル行い、72℃で7分の最後の伸長を行った。試験したCmRコロニーのいくつかが、所望の約2000 bpのDNA断片を有しており、bssR遺伝子の255 bpの本来のプロモーター領域に代えて、Pl-tacプロモーター及びCmRマーカーDNAの存在が確認された。これらの株の1つについて、37℃で培養することにより熱感受性プラスミドpKD46を除去し、この結果得られた株をE. coli MG1655 PL-tacbssRと命名した。
L-アルギニン生産におけるPL-tacプロモーター制御下でのbssR遺伝子の発現増強の効果を試験するために、上記E. coli MG1655 PL-tacbssRの染色体由来のDNA断片を、E. coliのアルギニン生産株382にP1トランスダクション(Miller, J.H. (1972) Experiments in Molecular Genetics, Cold Spring Harbor Lab. Press, Plainview, NY)によって導入した。382株は、Russian National Collection of Industrial Microorganisms (VKPM) (GNII genetika, 1 Dorozhny proezd, 1, Moscow 117545, Russian Federation) に2000年4月10日に受託番号VKPM B-7926の下で寄託された。
mmの試験管中の2 mlの発酵培地で37℃で48時間植菌した。
グルコース 48.0
(NH4)2SO4 35.0
KH2PO4 2.0
MgSO4・7H2O 1.0
チアミンHCl 0.0002
酵母エキス 1.0
L-イソロイシン 0.1
CaCO3 5.0
グルコース及び硫酸マグネシウムは別々に滅菌する。CaCO3は、180℃で2時間乾熱滅菌する。pHは7.0に調整する。
スレオニン生産におけるbssR遺伝子の発現増強の効果を試験するために、上記E. coli MG1655 Pl-tacbssRの染色体由来のDNA断片を、E. coliのスレオニン生産株VKPM B-3996にP1トランスダクション(Miller, J. H. Experiments in Molecular Genetics, Cold Spring Harbor Lab. Press, 1972, Plainview, NY)によって導入し、B-3996 Pl-tacbssR株を得ることができる。B-3996株は、1987年11月19日に受託番号RIA 1867の下で、All-Union Scientific Center of Antibiotics (Russia, 117105 Moscow, Nagatinskaya Street 3-A) に寄託された。同株は、受託番号VKPM B-3996の下で、Russian National Collection of Industrial Microorganisms (VKPM) (GNII genetika, 1 Dorozhny proezd, 1, Moscow 117545, Russian Federation)にも寄託された。
mlのL-ブロス(L-broth)が入った20×200 mmの試験管中で32℃で18時間、ロータリーシェーカー(250rpm)上でこれらの株を生育させることができる。その後、0.21 ml(10%)の種原料(seed material)を発酵培地に植菌することができる。発酵は、20×200 mmの試験管中の2 mlの発酵用最少培地中で行うことができる。細胞は、250 rpmで振盪しながら32℃で65時間生育させることができる。
グルコース 80.0
(NH4)2SO4 22.0
NaCl 0.8
KH2PO4 2.0
MgSO4・7H2O 0.8
FeSO4・7H2O 0.02
MnSO4・5H2O 0.02
チアミンHCl 0.0002
酵母エキス 1.0
CaCO3 30.0
グルコース及び硫酸マグネシウムは別々に滅菌する。CaCO3は、180℃で2時間乾熱滅菌する。pHは7.0に調整する。抗生物質は、滅菌後に培地に導入する。
リジン生産におけるbssR遺伝子の発現増強の効果を試験するために、上記E. coli MG1655 Pl-tacbssR株の染色体由来のDNA断片を、E. coliのリジン生産株AJ11442にP1トランスダクション(Miller, J. H. Experiments in Molecular Genetics, Cold Spring Harbor Lab. Press, 1972, Plainview, NY)によって導入し、AJ11442 Pl-tacbssR株を得ることができる。AJ11442株は、工業技術院生命工学工業技術研究所(現、産業技術総合研究所特許生物寄託センター、日本国茨城県つくば市東1丁目1番地1 中央第6 (郵便番号305-8566))に、1981年5月1日に寄託され、FERM P-5084の受託番号が付与された。その後、1987年10月29日にブダペスト条約に基づく国際寄託に移管され、FERM BP-1543の受託番号が付与された。
グルコース 40
(NH4)2SO4 24
K2HPO4 1.0
MgSO4・7H2O 1.0
FeSO4・7H2O 0.01
MnSO4・5H2O 0.01
酵母エキス 2.0
pHをKOHにより7.0に調整し、115℃で10分間培地をオートクレーブする。グルコース及びMgSO4・7H2Oは別々に滅菌する。CaCO3は、180℃で2時間乾熱滅菌し、30 g/lの終濃度で培地に添加する。
L-システイン生産におけるbssR遺伝子の発現増強の効果を試験するために、上記E. coli MG1655 Pl-tacbssRの染色体由来のDNA断片を、E. coliのL-システイン生産株JM15(ydeD)にP1トランスダクション(Miller, J. H. Experiments in Molecular Genetics, Cold Spring Harbor Lab. Press, 1972, Plainview, NY)によって導入し、JM15(ydeD) Pl-tacbssR株を得ることができる。
L-ロイシン生産におけるbssR遺伝子の発現増強の効果を試験するために、上記E. coli MG1655 Pl-tacbssR株の染色体由来のDNA断片を、E. coliのL-ロイシン生産株57(VKPM B-
7386、米国特許第6,124,121号)にP1トランスダクション(Miller, J. H. Experiments in Molecular Genetics, Cold Spring Harbor Lab. Press, 1972, Plainview, NY)によって導入し、57 Pl-tacbssR株を得ることができる。57株は、1997年5月19日に受託番号VKPM
B-7386の下で、Russian National Collection of Industrial Microorganisms (VKPM) (GNII genetika, 1 Dorozhny proezd, 1, Moscow 117545, Russian Federation) に寄託された。
グルコース 60.0
(NH4)2SO4 25.0
K2HPO4 2.0
MgSO4・7H2O 1.0
チアミン 0.01
CaCO3 25.0
グルコース及びCaCO3は別々に滅菌する。
L-ヒスチジン生産におけるbssR遺伝子の発現増強の効果を試験するために、上記E. coli MG1655 Pl-tacbssRの染色体由来のDNA断片を、E. coliのヒスチジン生産株80にP1トランスダクション(Miller, J. H. Experiments in Molecular Genetics, Cold Spring Harbor Lab. Press, 1972, Plainview, NY)によって導入し、80 Pl-tacbssR株を得ることができる。80株は、ロシア連邦特許第2119536号に記載されており、1999年10月15日に受託番号VKPM B-7270の下で、Russian National Collection of Industrial Microorganisms (GNII genetika, 1 Dorozhny proezd, 1, Moscow 117545, Russian Federation)に寄託された後、2004年7月12日にブダペスト条約に基づく寄託に移管された。
グルコース 100.0
豆濃(大豆加水分解物) 0.2(全窒素として)
L-プロリン 1.0
(NH4)2SO4 25.0
KH2PO4 2.0
MgSO4・7H2O 1.0
FeSO4・7H2O 0.01
MnSO4 0.01
チアミン 0.001
ベタイン 2.0
CaCO3 60.0
グルコース、プロリン、ベタイン、及びCaCO3は別々に滅菌する。pHは滅菌前に6.0に調整する。
L-グルタミン酸生産におけるbssR遺伝子の発現増強の効果を試験するために、上記E. coli MG1655 Pl-tacbssR株の染色体由来のDNA断片を、E. coliのL-グルタミン酸生産株VL334thrC+ (EP1172433)にP1トランスダクション(Miller, J. H. Experiments in Molecular Genetics, Cold Spring Harbor Lab. Press, 1972, Plainview, NY)によって導入し、VL334thrC+Pl-tacbssR株を得ることができる。VL334thrC+株は、2004年12月6日に受託番号VKPM B-8961の下で、Russian National Collection of Industrial Microorganisms (GNII genetika, 1 Dorozhny proezd, 1, Moscow 117545, Russian Federation)に寄託された後、2004年12月8日にブダペスト条約に基づく国際寄託に移管された。
L-フェニルアラニン生産におけるbssR遺伝子の発現増強の効果を試験するために、上記E. coli MG1655 Pl-tacbssRの染色体由来のDNA断片を、E. coliのフェニルアラニン生産株AJ12739にP1トランスダクション(Miller, J. H. Experiments in Molecular Genetics, Cold Spring Harbor Lab. Press, 1972, Plainview, NY)によって導入し、AJ12739 Pl-tacbssR株を得ることができる。AJ12739株は、2001年11月6日に受託番号VKPM B-8197の下で、Russian National Collection of Industrial Microorganisms (VKPM) (GNII genetika, 1 Dorozhny proezd, 1, Moscow 117545, Russian Federation)に寄託された後、2002年8月23日にブダペスト条約に基づく寄託に移管された。
グルコース 40.0
(NH4)2SO4 16.0
K2HPO4 0.1
MgSO4・7H2O 1.0
FeSO4・7H2O 0.01
MnSO4・5H2O 0.01
チアミンHCl 0.0002
酵母エキス 2.0
チロシン 0.125
CaCO3 20.0
グルコース及び硫酸マグネシウムは別々に滅菌する。CaCO3は、180℃で2時間乾熱滅菌する。pHは7.0に調整する。
L-トリプトファン生産におけるbssR遺伝子の発現増強の効果を試験するために、上記E.
coli MG1655 Pl-tacbssR株の染色体由来のDNA断片を、E. coliのトリプトファン生産株SV164(pGH5)にP1トランスダクション(Miller, J. H. Experiments in Molecular Genetics, Cold Spring Harbor Lab. Press, 1972, Plainview, NY)によって導入し、SV164(pGH5) Pl-tacbssR株を得ることができる。SV164株は、トリプトファンによるフィードバック阻害が解除されたアントラニレート合成酵素をコードするtrpEアレルを、trpE欠損株であるE. coli KB862 (DSM7196)(WO94/08031、特開平7-507693号)に導入することにより取得した。プラスミドpGH5は、セリンによるフィードバック阻害が解除されたホスホグリセレートデヒドロゲナーゼをコードする変異型serA遺伝子を保有する。SV164(pGH5) 株は、米国特許第6,180,373号又は欧州特許第0662143号に詳細に記載された。KB862株はAJ13828と命名され、2000年12月21日、工業技術院生命工学工業技術研究所(現、独立行政法人産業技術総合研究所特許生物寄託センター、日本国 茨城県つくば市東1丁目1番地1 中央第6
(郵便番号305-8566))に、FERM BP-7405の受託番号でブダペスト条約に基づく国際寄託として寄託された。
L-プロリン生産におけるbssR遺伝子の発現増強の効果を試験するために、上記E. coli MG1655 Pl-tacbssR株の染色体由来のDNA断片を、E. coliのプロリン生産株702ilvAにP1トランスダクション(Miller, J. H. Experiments in Molecular Genetics, Cold Spring Harbor Lab. Press, 1972, Plainview, NY)によって導入し、702ilvA Pl-tacbssR株を得ることができる。702ilvA株は、2000年7月18日に受託番号VKPM B-8012の下で、Russian National Collection of Industrial Microorganisms (VKPM) (GNII genetika, 1 Dorozhny proezd, 1, Moscow 117545, Russian Federation)に寄託された後、2001年5月18日にブダペスト条約に基づく国際寄託に移管された。
L-シトルリン生産におけるbssR遺伝子の発現増強の効果を試験するために、上記E. coli MG1655 Pl-tacbssR株の染色体由来のDNA断片を、E. coliのL-シトルリン生産株382Δar
gGにP1トランスダクション(Miller, J. H. Experiments in Molecular Genetics, Cold Spring Harbor Lab. Press, 1972, Plainview, NY)によって導入し、382ΔargG Pl-tacbssR株を得ることができる。382ΔargG株は、Datsenko, K. A.とWanner, B. L.によって最初に開発された「Redドライブンインテグレーション(Red-driven integration)」と呼ばれる方法(Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2000, 97(12), 6640-6645)により、382株(VKPM B-7926)の染色体上のagrG遺伝子を欠損させることにより取得することができる。この手順に従い、argG遺伝子に隣接する領域及びテンプレートプラスミド中の抗生物質耐性を付与する遺伝子の両方に相同なPCRプライマーを構築することができる。プラスミドpMW118-attL-Cm-attR(WO05/010175)を、PCR反応のテンプレートとして使用することができる。
グルコース 48.0
(NH4)2SO4 35.0
KH2PO4 2.0
MgSO4・7H2O 1.0
チアミンHCl 0.0002
酵母エキス 1.0
L-イソロイシン 0.1
L-アルギニン 0.1
CaCO3 5.0
グルコース及び硫酸マグネシウムは別々に滅菌する。CaCO3は、180℃で2時間乾熱滅菌する。pHは7.0に調整する。
L-オルニチン生産におけるbssR遺伝子の発現増強の効果を試験するために、上記E. coli MG1655 Pl-tacbssR株の染色体由来のDNA断片を、E. coliのL-オルニチン生産株382ΔargFΔargIにP1トランスダクション(Miller, J. H. Experiments in Molecular Genetics,
Cold Spring Harbor Lab. Press, 1972, Plainview, NY)によって導入し、382ΔargFΔargI Pl-tacbssR株を得ることができる。382ΔargFΔargI株は、Datsenko, K. A.とWanner, B. L.によって最初に開発された「Redドライブンインテグレーション(Red-driven integration)」と呼ばれる方法(Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2000, 97(12), 6640-6645)により、382株(VKPM B-7926)の染色体上のargF及びargI遺伝子を順次欠損させることにより取得することができる。この手順に従い、argF又はargI遺伝子に隣接する領域及びテンプレートプラスミド中の抗生物質耐性を付与する遺伝子の両方に相同な2対のPCRプライマーを構築することができる。プラスミドpMW118-attL-Cm-attR(WO05/010175)を、PCR反応におけるテンプレートとして使用することができる。
ュートリエントブロス中で37℃で18時間振盪しながら培養することができる。0.3 mlの得られた培養物は、20×200 mmの試験管中の2 mlの発酵培地に植菌し、ロータリーシェーカー上で32℃で48時間培養した。
グルコース 48.0
(NH4)2SO4 35.0
KH2PO4 2.0
MgSO4・7H2O 1.0
チアミンHCl 0.0002
酵母エキス 1.0
L-イソロイシン 0.1
L-アルギニン 0.1
CaCO3 5.0
グルコース及び硫酸マグネシウムは別々に滅菌する。CaCO3は、180℃で2時間乾熱滅菌する。pHは7.0に調整する。
L-バリン生産におけるbssR遺伝子の発現増強の効果を試験するために、上記E. coli MG1655 Pl-tacbssR株の染色体由来のDNA断片を、E. coliバリン生産株H-81にP1トランスダクション(Miller, J. H. Experiments in Molecular Genetics, Cold Spring Harbor Lab. Press, 1972, Plainview, NY)によって導入し、H-81 Pl-tacbssR株を得ることができる。H-81株は、2001年1月30日に受託番号VKPM B-8066の下で、Russian National Collection of Industrial Microorganisms (VKPM) (GNII genetika, 1 Dorozhny proezd, 1, Moscow 117545, Russian Federation)に寄託された後、2002年2月1日にブダペスト条約に基づく国際寄託に移管された。
グルコース 60.0
(NH4)2SO4 18.0
KH2PO4 1.8
MgSO4・7H2O 1.2
CaCO3 20.0
チアミンHCl 0.001
CaCO3は、180℃で2時間乾熱滅菌する。pHは7.0に調整する。
Claims (6)
- L-アミノ酸を生産する方法であって、
L-アミノ酸生産細菌を培地中で培養すること、および
前記L-アミノ酸を培地から回収すること、
を含み、
前記L-アミノ酸生産細菌が、bssR遺伝子の発現が野生株と比較して増強されるように改変された、エシェリヒア・コリ(Escherichia coli)であり、
前記発現が、bssR遺伝子のコピー数を増加させること、またはbssR遺伝子の発現調節配列を改変することにより増強された、方法。 - 前記L-アミノ酸が、芳香族L-アミノ酸及び非芳香族L-アミノ酸からなる群より選択される、請求項1に記載の方法。
- 前記芳香族L-アミノ酸が、L-フェニルアラニン、L-チロシン、及びL-トリプトファンからなる群より選択される、請求項2に記載の方法。
- 前記非芳香族L-アミノ酸が、L-スレオニン、L-リジン、L-システイン、L-メチオニン、L-ロイシン、L-イソロイシン、L-バリン、L-ヒスチジン、グリシン、L-セリン、L-アラニン、L-アスパラギン、L-アスパラギン酸、L-グルタミン、L-グルタミン酸、L-プロリン、L-アルギニン、L-シトルリン、及びL-オルニチンからなる群より選択される、請求項2に記載の方法。
- 前記L-アミノ酸が、L-アルギニンである、請求項1に記載の方法。
- 前記bssR遺伝子は、配列番号2に示すアミノ酸配列と90%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含むタンパク質をコードし、L-アミノ酸生産細菌で発現増強させることによりL-アミノ酸生産能を増加させる作用を有する、請求項1〜5のいずれか一項に記載の方法。
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