JP5795630B2 - 抗癌及び抗増殖活性を示すシクロプロピルジカルボキサミド及び類似体 - Google Patents
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Description
本出願は、米国特許出願第61/329,548号、2010年4月29日出願、表題「抗癌及び抗増殖活性を示すシクロプロピルジカルボキサミド及び類似体」の利益を主張し、これはその全体が参照として本明細書に組み込まれる。
並びに、その薬学的に許容される塩、水和物、溶媒和物、鏡像異性体、立体異性体及び互変異性体が記載され、
式中、
Xはハロゲンであり;
Z1及びZ2は、独立して個別に、CR2又はNであり;
Z3は、CH又はNであるが;
但し、環Bはテトラジンではなく;
各R1は、独立して個別に、ハロゲン、H、C1−C6アルキル、分岐C3−C7アルキル、C3−C7シクロアルキル又は−CNであり;
各R2は、個別に独立して、H、ハロゲン、C1−C6アルキル又はシアノであり;
R3は、−C(O)R4、−C(O)−C6−C10アリール、−C(O)−C4−C6ヘテロシクリル又は−C(O)−C5−C6ヘテロアリールであり、ここで
アリールは、フェニル、ナフチル、テトラヒドロナフチル、インデニル又はインダニルであるが、
但し、R3が−C(O)−C4−C6ヘテロシクリルである場合、ヘテロシクリルは−C(O)へのN結合手を有さず;
R4は、C1−C7アルキル、C3−C8シクロアルキル、−(CH2)P−CN、−(CH2)p−OR6、−(CH2)P−NR6(R7)、−(CH2)p−SO2−C1−C6アルキル、−(CH2)p−C6−C10アリール、−(CH2)p−C5−C6ヘテロアリール又は−(CH2)P−C4−C6ヘテロシクリルであり、ここで
各アルキル又はアルキレンは、1又は2つのC1−C6アルキルで場合により置換されており;
アリールは、フェニル、ナフチル、テトラヒドロナフチル、インデニル又はインダニルであり;
各R6及びR7は、個別に独立して、H、C1−C6アルキル又はC3−C8分岐アルキルであり;
各シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール及びヘテロシクリルは、−(R25)mで独立して置換されており;
各R25は、個別に独立して、C1−C6アルキル、分岐C3−C8アルキル、ハロゲン、−(CH2)m−CN、−(CH2)m−OR6、−(CH2)m−NR6(R7)、−(CH2)m−SO2−C1−C6アルキル、−(CH2)m−C(O)NR6(R7)、−(CH2)m−C(O)−C4−C6ヘテロシクリル又は−(CH2)m−C4−C6ヘテロシクリルであり、ここで各アルキル又はアルキレンは、1又は2つのC1−C6アルキルで場合により置換されており;
各mは、個別に独立して、0、1、2又は3であり;そして
pは、1、2又は3である。
用語「アルキル」は、本明細書で使用されるとき、直鎖アルキルを意味し、ここでアルキル鎖長さは数字の範囲で示される。例示的な実施態様において、「アルキル」は、1、2、3、4、5又は6個の炭素を含有する上記に定義されたアルキル鎖(すなわち、C1−C6アルキル)を意味する。アルキル基の例には、メチル、エチル、プロピル、ブチル、ペンチル及びヘキシルが含まれるが、これらに限定されない。
一つの態様において、式Iの化合物:
並びに、その薬学的に許容される塩、水和物、溶媒和物、鏡像異性体、立体異性体及び互変異性体が記載され、
式中、
X、B、Z1、Z2、Z3、R1、R2、R3、R4、R6、R7、R25、m、n及びpは式Iについて上記に定義されたとおりであり、そして
各ヘテロシクリル及びヘテロアリールは、個別に独立して、C又はN結合手を有する。
並びに、その薬学的に許容される塩、水和物、溶媒和物、鏡像異性体、立体異性体及び互変異性体であり、
式中、
X、R1、R2、R3、R4、R6、R7、R25、m、n及びpは、式Iについて上記に定義されたとおりであり、そして
nは、0、1又は2である。
並びに、その薬学的に許容される塩、水和物、溶媒和物、鏡像異性体、立体異性体及び互変異性体であり、
式中、
R2、R3、R4、R6、R7、R25、m、n及びpは、式Ibについて上記に定義されたとおりである。
並びに、その薬学的に許容される塩、水和物、溶媒和物、鏡像異性体、立体異性体及び互変異性体であり、
式中、
X、R1、R2、R3、R4、R6、R7、R25、m、n及びpは、式Ibについて上記に定義されたとおりである。
並びに、その薬学的に許容される塩、水和物、溶媒和物、鏡像異性体、立体異性体及び互変異性体であり、
式中、
R2、R3、R4、R6、R7、R25、m、n及びpは、式Ibについて上記に定義されたとおりである。
並びに、その薬学的に許容される塩、水和物、溶媒和物、鏡像異性体、立体異性体及び互変異性体であり、
式中、
X、R1、R2、R3、R4、R6、R7、R25、m、n及びpは、式Iについて上記に定義されたとおりである。
並びに、その薬学的に許容される塩、水和物、溶媒和物、鏡像異性体、立体異性体及び互変異性体であり、
式中、
R2、R3、R4、R6、R7、R25、m、n及びpは、式Iについて上記に定義されたとおりである。
並びに、その薬学的に許容される塩、水和物、溶媒和物、鏡像異性体、立体異性体及び互変異性体であり、
式中、
X、R1、R2、R3、R4、R6、R7、R25、m、n及びpは、式Iについて上記に定義されたとおりである。
並びに、その薬学的に許容される塩、水和物、溶媒和物、鏡像異性体、立体異性体及び互変異性体であり、
式中、
R2、R3、R4、R6、R7、R25、m、n及びpは、式Iについて上記に定義されたとおりである。
本明細書に記載される化合物は、固形腫瘍、胃癌、黒色腫、グリア芽細胞腫、卵巣癌、膵癌、前立腺癌、肺癌、非小細胞肺癌、乳癌、腎癌、子宮頸癌、原発腫瘍部位からの転移、結腸癌、骨髄増殖性疾患、病因又は進行がc−METキナーゼ活性又は腫瘍遺形成形態、異常融合タンパク質形態及びc−METキナーゼの突然変異体形態の活性に依存している疾患が含まれるが、これらに限定されない哺乳類の癌、特にヒトの癌の治療に有用性が見出される。
幾つかの実施態様において、化合物は、経口、非経口、吸入及び皮下からなる群より選択される方法により投与される。
開示される方法は、また、癌、過剰増殖性疾患、代謝性疾患、神経変性疾患又は血管形成により特徴付けられる疾患からなる群より選択される状態に罹患している個人を治療することを含む。これらの方法は、本明細書に開示される化合物、特にセクション1のものをそのような個人に投与することを含み、前記疾患には、固形腫瘍、悪性黒色腫、グリア芽細胞腫、卵巣癌、膵癌、前立腺癌、肺癌、乳癌、腎癌、肝癌、子宮頸癌、原発腫瘍部位からの転移、骨髄増殖性疾患、慢性骨髄性白血病、白血病、甲状腺乳頭癌、非小細胞肺癌、中皮腫、好酸球増加症候群、消化管間質性腫瘍、結腸癌、多様な網膜症、糖尿病性網膜症、加齢性黄斑変性及び好酸球増加症候群、リウマチ様関節炎、喘息、慢性閉塞性肺障害、肥満細胞症、肥満細胞性白血病を含む失明をもたらす過剰増殖により特徴付けられる眼疾患、c−METキナーゼ、その腫瘍形成形態、その異常融合タンパク質及びその多形により引き起こされる疾患が含まれるが、これらに限定されない。投与方法は重要ではなく、経口、非経口、吸入及び皮下からなる群のものでありうる。
本明細書に開示されている化合物は、1つ以上のそのような化合物を薬学的に許容される担体と組み合わせることによって、医薬組成物の一部を形成することができる。
加えて、組成物は、佐剤、賦形剤、希釈剤及び安定剤からなる群より選択される添加剤を含むことができる。
本発明の化合物は、下記のスキーム及び添付の実施例において例示されている一般的な合成方法により入手可能である。
N−(4−(2−アセトアミドピリジン−4−イルオキシ)−2,5−ジフルオロフェニル)−N’−(4−フルオロフェニル)シクロプロパン−1,1−ジカルボキサミド、N−(4−(2−アセトアミドピリジン−4−イルオキシ)−5−クロロ−2−フルオロフェニル)−N’−(4−フルオロフェニル)シクロプロパン−1,1−ジカルボキサミド、N−(4−(2−アセトアミドピリジン−4−イルオキシ)−2,5−ジフルオロフェニル)−N’−フェニルシクロプロパン−1,1−ジカルボキサミド、N−(4−(2−(2−(ジメチルアミノ)アセトアミド)ピリジン−4−イルオキシ)−2,5−ジフルオロフェニル)−N’−(4−フルオロフェニル)シクロプロパン−1,1−ジカルボキサミド、N−(4−(2−アセトアミドピリミジン−4−イルオキシ)−2,5−ジフルオロフェニル)−N’−(4−フルオロフェニル)シクロプロパン−1,1−ジカルボキサミド、N−(4−(2−(シクロプロパンカルボキサミド)ピリジン−4−イルオキシ)−2,5−ジフルオロフェニル)−N’−(4−フルオロフェニル)シクロプロパン−1,1−ジカルボキサミド、N−(2,5−ジフルオロ−4−(2−プロピオンアミドピリジン−4−イルオキシ)フェニル)−N’−(4−フルオロフェニル)シクロプロパン−1,1−ジカルボキサミド、N−(2,5−ジフルオロ−4−((2−(2−メトキシアセトアミド)ピリジン−4−イル)オキシ)フェニル)−N’−(4−フルオロフェニル)シクロプロパン−1,1−ジカルボキサミド、N−(2,5−ジフルオロ−4−(2−イソブチルアミドピリジン−4−イルオキシ)フェニル)−N’−(4−フルオロフェニル)シクロプロパン−1,1−ジカルボキサミド、N−(4−(2−(2−シアノアセトアミド)ピリジン−4−イルオキシ)−2,5−ジフルオロフェニル)−N’−(4−フルオロフェニル)シクロプロパン−1,1−ジカルボキサミド、N−(4−(2−(アゼチジン−3−カルボキサミド)ピリジン−4−イルオキシ)−2,5−ジフルオロフェニル)−N’−(4−フルオロフェニル)シクロプロパン−1,1−ジカルボキサミド、N−(4−(2−(シクロブタンカルボキサミド)ピリジン−4−イルオキシ)−2,5−ジフルオロフェニイ)−N’−(4−フルオロフェニル)シクロプロパン−1,1−ジカルボキサミド、(R)−N−(2,5−ジフルオロ−4−((2−(2−メトキシプロパンアミド)ピリジン−4−イル)オキシ)フェニル)−N’−(4−フルオロフェニル)シクロプロパン−1,1−ジカルボキサミド、(R)−N−(2,5−ジフルオロ−4−((2−(2−ヒドロキシプロパンアミド)ピリジン−4−イル)オキシ)フェニル)−N’−(4−フルオロフェニル)シクロプロパン−1,1−ジカルボキサミド、N−(2,5−ジフルオロ−4−((2−ピバルアミドピリジン−4−イル)オキシ)フェニル)−N’−(4−フルオロフェニル)シクロプロパン−1,1−ジカルボキサミド、(S)−N−(2,5−ジフルオロ−4−((2−(2−メトキシプロパンアミド)ピリジン−4−イル)オキシ)フェニル)−N−(4−フルオロフェニル)シクロプロパン−1,1−ジカルボキサミド、(S)−1−((4−(2,5−ジフルオロ−4−(1−((4−フルオロフェニル)カルバモイル)シクロプロパンカルボキサミド)フェノキシ)ピリジン−2−イル)アミノ)−1−オキソプロパン−2−イルアセテート及びN−(2,5−ジフルオロ−4−((2−(2−フルオロ−2−メチルプロパンアミド)ピリジン−4−イル)オキシ)フェニル)−N’−(4−フルオロフェニル)シクロプロパン−1,1−ジカルボキサミド。
c−METキナーゼアッセイ
c−METキナーゼ(配列番号2)の活性は、ピルビン酸キナーゼ/乳酸デヒドロゲナーゼ系よるカップリングを介したキナーゼ反応におけるADPの産生(例えば、Schindler et al. Science 2000, 289, pp. 1938-1942)に従って決定した。このアッセイでは、NADHの酸化(したがって、A340nmでの減少)を連続して分光光度的にモニターした。反応混合物(100μl)は、0.25mMのDTT、0.2%のオクチルグルコシド及び1%のDMSOを含有する90mM、pH7.5のTris緩衝液中に、c−MET(c−Met残基:956−1390、インビトロゲン社(Invitrogen)、カタログ番号PV3143、6nM)、ポリE4Y(1mg/mL)、MgCl2(10mM)、ピルビン酸キナーゼ(4単位)、乳酸デヒドロゲナーゼ(0.7単位)、ホスホエノールピルビン酸(1mM)及びNADH(0.28mM)を含有した。ATP(100μM)を加えて反応を開始する前に、試験化合物をc−MET(配列番号2)及び他の反応試薬と共に22℃で0.5hインキュベートした。340nmでの吸収をポーラースターオプチマ(Polarstar Optima)プレート読取機(BMG)により30℃で2時間連続してモノターした。反応速度は、1.0〜2.0hの時間枠を使用して計算した。阻害率は、対照(すなわち、試験化合物を有さない)との反応速度の比較によって得た。IC50値を、グラフパッドプリズム(GraphPad Prism)ソフトウエアパッケージにより提供されたソフトウエアルーチンを使用して一連のインヒビター濃度で決定された、一連の阻害率の値から計算した。
c−METキナーゼ(配列番号2)
MSYYHHHHHHDYDIPTTENLYFQGAMLVPRGSPWIPFTMKKRKQIKDLGSELVRYDARVHTPHLDRLVSARSVSPTTEMVSNESVDYRATFPEDQFPNSSQNGSCRQVQYPLTDMSPILTSGDSDISSPLLQNTVHIDLSALNPELVQAVQHVVIGPSSLIVHFNEVIGRGHFGCVYHGTLLDNDGKKIHCAVKSLNRITDIGEVSQFLTEGIIMKDFSHPNVLSLLGICLRSEGSPLVVLPYMKHGDLRNFIRNETHNPTVKDLIGFGLQVAKGMKYLASKKFVHRDLAARNCMLDEKFTVKVADFGLARDMYDKEYYSVHNKTGAKLPVKWMALESLQTQKFTTKSDVWSFGVLLWELMTRGAPPYPDVNTFDITVYLLQGRRLLQPEYCPDPLYEVMLKCWHPKAEMRPSFSELVSRISAIFSTFIGEHYVHVNATYVNVKCVAPYPSLLSSEDNADDEVDTRPASFWETS。
c−KITキナーゼ(配列番号1)の活性は、ピルビン酸キナーゼ/乳酸デヒドロゲナーゼ系よるカップリングを介したキナーゼ反応におけるADPの産生(例えば、Schindler et al. Science 2000, 289, pp. 1938-1942)に従って決定した。このアッセイでは、NADHの酸化(したがって、A340nmでの減少)を連続して分光光度的にモニターした。反応混合物(100μl)は、0.2%のオクチルグルコシド及び1%のDMSOを含有する90mM、pH7.5のTris緩衝液中に、c−KIT(c−KIT残基T544−V976、プロキナーゼ社(ProQinase)、5.4nM)、ポリE4Y(1mg/mL)、MgCl2(10mM)、ピルビン酸キナーゼ(4単位)、乳酸デヒドロゲナーゼ(0.7単位)、ホスホエノールピルビン酸(1mM)及びNADH(0.28mM)を含有した。ATP(200μM)を加えて反応を開始する前に、試験化合物をc−KIT(配列番号1)及び他の反応試薬と共に22℃で2min未満インキュベートした。340nmでの吸収をポーラースターオプチマ(Polarstar Optima)プレート読取機(BMG)により30℃で0.5時間連続してモノターした。反応速度は、0〜0.5hの時間枠を使用して計算した。阻害率は、対照(すなわち、試験化合物を有さない)との反応速度の比較によって得た。IC50値を、グラフパッドプリズム(GraphPad Prism)ソフトウエアパッケージにより提供されたソフトウエアルーチンを使用して一連のインヒビター濃度で決定された、一連の阻害率の値から計算した。
N末端GST融合を有するc−KIT(配列番号1)
LGYWKIKGLVQPTRLLLEYLEEKYEEHLYERDEGDKWRNKKFELGLEFPNLPYY1DGDVKLTQSMAIIRYIADKHNMLGGCPKERAEISMLEGAVDIRYGVSRIAYSKDFETL VDFLSKLPEMLKMFEDRLCHTYLNGDHVTHPDFMLYDALDVVLYMDPMCLDAFPKLVCFKKRIEAIPQIDKYLKSSKYIWPLQGWQATFGGGDHPPSDLVPRHNQTSLYKKAGSAAAVLEENLYFQGTYKYLQPMYEVQWKVVEEINGNNYVYIDPTQLPYDHWEFPRNRLSFGKTLGAGAFGKVVEATAYGLIKSDAAMTVAVMLKPSAHLTEREALMSELKVLSYLGNHMNIVNLLGACTIGGPTLVITEYCCYGDLLNFLRRKRDSFICSKQEDHAEAALYKNLLHSKESSCSDSTNEYMDMKPGVSYVVPTKADKRRSVRIGSYIERDVTPAIMEDDELALDLEDLLSFSYQVAKGMAFLASKNCIHRDLAARNILLTHGRITKICDFGLARDIKNDSNYVVKGNARLPVKWMAPESIFNCVYTFESDVWSYGIFLWELFSLGSSPYPGMPVDSKFYKMIKEGFRMLSPEHAPAEMYDIMKTCWDADPLRPTFKQIVQLIEQISESTNHIYSNLANCSPNRQKPVVDHSVRINSVGSTASSSQPLLVHDDV。
アッセイK1
KDRキナーゼの活性は、ピルビン酸キナーゼ/乳酸デヒドロゲナーゼ系よるカップリングを介したキナーゼ反応におけるADPの産生(例えば、Schindler et al. Science 2000, 289, pp. 1938-1942)に従って決定した。このアッセイでは、NADHの酸化(したがって、A340nmでの減少)を連続して分光光度的にモニターした。反応混合物(100μl)は、0.13%のオクチルグルコシド、13mMのMgCl2、6.8mMのDTT及び3.5%のDMSOを含有する60mM、pH7.5のTris緩衝液中に、KDR(配列番号3、1.5nM〜7.1nM、名目濃度)、ポリE4Y(1mg/mL)、ピルビン酸キナーゼ(3.5単位)、乳酸デヒドロゲナーゼ(5.5単位)、ホスホエノールピルビン酸(1mM)及びNADH(0.28mM)を含有した。反応を、ATP(最終濃度0.2mM)の添加により開始した。340nmでの吸収をポーラースターオプチマ(Polarstar Optima)プレート読取機(BMG)又は同様の能力の機器により30℃で3h連続してモノターした。反応速度は、1h〜2hの時間枠を使用して計算した。阻害率は、対照(すなわち、試験化合物を有さない)との反応速度の比較によって得た。IC50値を、グラフパッドプリズム(GraphPad Prism)ソフトウエアパッケージにより提供されたソフトウエアルーチンを使用して一連のインヒビター濃度で決定された、一連の阻害率の値から計算した。
KDRキナーゼアッセイK2は、(1)名目濃度2.1nMの酵素を用いたこと、(2)ATPによる開始の前に反応を30℃で2hプレインキュベートしたこと及び(3)1.0mMのATP(最終濃度)を使用して反応を開始したことを除いて、アッセイK1と同じである。
KDRキナーゼアッセイK3は、(1)名目濃度1.1nMの酵素を用いたこと、(2)反応混合物100μlあたりの緩衝液成分が、以下:0.066%のオクチルグルコシド、17mMのMgCl2及び1%のDMSOを含有する75mM、pH7.5のTris緩衝液であったこと、(3)DTTの最終濃度が0.66mMであったこと、(4)ATPによる開始の前に反応を30℃で1hプレインキュベートしたこと及び(5)1.0mMのATP(最終濃度)を使用して反応を開始したことを除いて、アッセイK1と同じである。
スクリーニングに使用したKDRタンパク質配列(配列番号3)
DPDELPLDEHCERLPYDASKWEFPRDRLKLGKPLGRGAFGQVIEADAFGIDKTATCRTVAVKMLKEGATHSEHRALMSELKILIHIGHHLNVVNLLGACTKPGGPLMVIVEFCKFGNLSTYLRSKRNEFVPYKVAPEDLYKDFLTLEHLICYSFQVAKGMEFLASRKCIHRDLAARNILLSEKNVVKICDFGLARDIYKDPDYVRKGDARLPLKWMAPETIFDRVYTIQSDVWSFGVLLWEIFSLGASPYPGVKIDEEFCRRLKEGTRMRAPDYTTPEMYQTMLDCWHGEPSQRPTFSELVEHLGNLLQANAQQD。
FMSキナーゼの活性は、ピルビン酸キナーゼ/乳酸デヒドロゲナーゼ系よるカップリングを介したキナーゼ反応におけるADPの産生(例えば、Schindler et al. Science 2000, 289, pp. 1938-1942)に従って決定した。このアッセイでは、NADHの酸化(したがって、A340nmでの減少)を連続して分光光度的にモニターした。反応混合物(100μl)は、0.2%のオクチルグルコシド及び1%のDMSOを含有する90mM、pH7.5のTris緩衝液に、FMS(インビトロゲン(Invitrogen)又はミリポア(Millipore)から購入、6nM)、ポリE4Y(1mg/mL)、MgCl2(10mM)、ピルビン酸キナーゼ(4単位)、乳酸デヒドロゲナーゼ(0.7単位)、ホスホエノールピルビン酸(1mM)、NADH(0.28mM)及びATP(500μM)を含有した。阻害反応は、連続希釈試験化合物を上記の反応混合物と混合することによって開始した。340nmでの吸収を、ポーラースターオプチマ(Polarstar Optima)又はシナジー(Synergy)2プレート読取機により30℃で4時間連続してモノターした。反応速度は、2〜3hの時間枠を使用して計算した。阻害率は、対照(すなわち、試験化合物を有さない)との反応速度の比較によって得た。IC50値を、グラフパッドプリズム(GraphPad Prism)ソフトウエアパッケージにより提供されたソフトウエアルーチンを使用して一連のインヒビター濃度で決定された、一連の阻害率の値から計算した。
EBC−1細胞(カタログ番号JCRB0820)は、ヒューマンサイエンス研究資源バンク(Japan Health Science Research Resources Bank)、大阪から得た。簡潔には、細胞を、10%の特徴決定ウシ胎児血清(インビトロゲン(Invitrogen)、カリフォルニア州カールズバッド)を補充したDMEMにより37℃、5%CO2、95%湿度で増殖させた。細胞を70〜95%のコンフルエント状態に達するまで拡大させ、この時点で、アッセイでの使用のために継代培養又は採取した。
試験化合物の連続希釈を、96ウエル黒色透明底プレート(コーニング(Corning)、ニューヨーク州コーニング)に分配した。各細胞株では、5千の細胞を各ウエルの200μLの完全増殖培地に加えた。プレートを、37℃、5%CO2、95%湿度で67時間インキュベートした。インキュベーション時間の終了時に、PBS中リザズリン(シグマ(Sigma)、ミズーリ州セントルイス)の440μM溶液の40μLを各ウエルに加え、37℃、5%CO2、95%湿度で更に5時間インキュベートした。プレートを、540nMの励起及び600nMの発光を使用するシナジー(Synergy)2読取機(バイオテック(Biotek)、バーモント州ウィヌースキ)で読み取った。データは、IC50値を計算するプリズム(Prism)ソフトウエア(グラフパッド(GraphPad)、カリフォルニア州サンディエゴ)を使用して分析した。
MKN−45細胞(カタログ番号JCRB0254)は、ヒューマンサイエンス研究資源バンク(Japan Health Science Research Resources Bank)、大阪から得た。簡潔には、細胞を、10%の特徴決定ウシ胎児血清(インビトロゲン(Invitrogen)、カリフォルニア州カールズバッド)を補充したRPMI1640培地により37℃、5%CO2、95%湿度で増殖させた。細胞を70〜95%のコンフルエント状態に達するまで拡大させ、この時点で、アッセイでの使用のために継代培養又は採取した。
試験化合物の連続希釈を、96ウエル黒色透明底プレート(コーニング(Corning)、ニューヨーク州コーニング)に分配した。5千の細胞を各ウエルの200μLの完全増殖培地に加えた。プレートを、37℃、5%CO2、95%湿度で67時間インキュベートした。インキュベーション時間の終了時に、PBS中リザズリン(シグマ(Sigma)、ミズーリ州セントルイス)の440μM溶液の40μlを各ウエルに加え、プレートを37℃、5%CO2、95%湿度で更に5hインキュベートした。プレートを、540nMの励起及び600nMの発光を使用するシナジー(Synergy)2読取機(バイオテック(Biotek)、バーモント州ウィヌースキ)で読み取った。データは、IC50値を計算するプリズム(Prism)ソフトウエア(グラフパッド(GraphPad)、カリフォルニア州サンディエゴ)を使用して分析した。
RONキナーゼの活性を、基質への、33Ρ−γ−ΑΤΡからの33Ρの組み込みを測定する放射能濾過結合アッセイにより決定した。このアッセイにおいて、33Ρの検出はRONリン酸価活性を示し、これはリン酸化ペプチド基質(KKSRGDYMTMQIG)の量に正比例していた。最初に、反応混合物は、400nMのRON、20mMmのHEPES、pH7.5、10mMのMgCl2、2mMのMnCl2、1mMのEGTA、0.02%のBrij 35、0.02mg/mLのBSA、0.1mMのNa3VO4及び2mMのDTTを含有した。反応混合物を、化合物と共に室温で30分間インキュベートした。反応の開始するために、同量の20μM ATP及び0.4mg/mLのペプチド基質を加え、次に、室温で2時間インキュベートした。最終アッセイ条件は、200nMのRON、10μΜのATP、0.2mg/mLの基質20mMのHEPES、pH7.5、10mMのMgCl2、1mMのEGTA、0.02%のBrij 35、0.02mg/mLのBSA、0.1mMのNa3VO4、2mMのDTT及び1%のDMSOであった。IC50値を、グラフパッドプリズム(GraphPad Prism)ソフトウエアパッケージにより提供されたソフトウエアルーチンを使用して一連のインヒビター濃度で決定された、一連の活性率の値から計算した。
GST標識組み換えヒトRON、アミノ酸983−1400。昆虫細胞に発現。
FLT1キナーゼの活性は、基質への、33Ρ−γ−ΑΤΡからの33Ρの組み込みを測定する放射能濾過結合アッセイにより決定した。このアッセイにおいて、33Ρの検出はFLT1リン酸価活性を示し、これはリン酸化ペプチド基質ポリ[Glu:Tyr](4:1)の量に正比例していた。最初に、反応混合物は、400nMのFLT1、20mMmのHEPES、pH7.5、10mMのMgCl2、2mMのMnCl2、1mMのEGTA、0.02%のBrij 35、0.02mg/mLのBSA、0.1mMのNa3VO4及び2mMのDTTを含有した。反応混合物を、化合物と共に室温で30分間インキュベートした。反応を開始するために、同量の20μM ATP及び0.2mg/mLのペプチド基質を加え、次に、室温で2時間インキュベートした。最終アッセイ条件は、200nMのFLT1、10μΜのATP、0.1mg/mLの基質20mMのHEPES、pH7.5、10mMのMgCl2、1mMのEGTA、0.02%のBrij 35、0.02mg/mLのBSA、0.1mMのNa3VO4、2mMのDTT及び1%のDMSOであった。IC50値を、グラフパッドプリズム(GraphPad Prism)ソフトウエアパッケージにより提供されたソフトウエアルーチンを使用して一連のインヒビター濃度で決定された、一連の活性率の値から計算した。
GST標識組み換えヒトFLT1、アミノ酸781−1338。昆虫細胞に発現。
RETキナーゼの活性は、ピルビン酸キナーゼ/乳酸デヒドロゲナーゼ系よるカップリングを介したキナーゼ反応におけるADPの産生(例えば、Schindler et al. Science 2000, 289: 1938-1942)に従って決定した。このアッセイでは、NADHの酸化(したがって、A340nmでの減少)を連続して分光光度的にモニターした。反応混合物(100μl)は、0.2%のオクチルグルコシド、1mMのDTT及び1%のDMSOを含有する90mM、pH7.5のTris緩衝液中に、RET(アミノ酸残基658−1114、インビトロゲン社(Invitrogen)、2nM)、ポリE4Y(1.5mg/mL)、MgCl2(18mM)、ピルビン酸キナーゼ(4単位)、乳酸デヒドロゲナーゼ(0.7単位)、ホスホエノールピルビン酸(1mM)及びNADH(0.28mM)を含有した。ATP(500μM)を加えて反応を開始する前に、試験化合物をRETキナーゼ及び他の反応試薬と共に22℃で<2minインキュベートした。340nmでの吸収をバイオテックシナジー(BioTek Synergy)2読取機により30℃で3時間連続してモノターした。反応速度は、1〜2hの時間枠を使用して計算した。阻害率は、対照(すなわち、試験化合物を有さない)との反応速度の比較によって得た。IC50値を、グラフパッドプリズム(GraphPad Prism)ソフトウエアパッケージにより提供されたソフトウエアルーチンを使用して一連のインヒビター濃度で決定された、一連の阻害率の値から計算した。
GST標識組み換えヒトRET、アミノ酸658−1114。昆虫細胞に発現。
当業者は、日常的なものを越えない実験を使用して、本開示に特定的に記載されている特定の実施態様に対する多数の同等物を認める又は確かめることができる。そのような同等物は、以下の請求項の範囲に包含されることが意図される。
Claims (23)
- 式Iの化合物、
式I
又はその薬学的に許容される塩、水和物、溶媒和物、鏡像異性体、立体異性体若しくは互変異性体
[式中、
Xはハロゲンであり;
Z1及びZ2はCR2であり;
Z3はCHであり;
各R1は、独立して個別に、ハロゲン、H、C1−C6アルキル、分岐C3−C7アルキル、C3−C7シクロアルキル又は−CNであり;
各R2は、個別に独立して、H、ハロゲン、C1−C6アルキル又はシアノであり;
R3は、−C(O)R4、−C(O)−C6−C10アリール、−C(O)−C4−C6ヘテロシクリル又は−C(O)−C5−C6ヘテロアリールであり、ここで
アリールは、フェニル、ナフチル、テトラヒドロナフチル、インデニル又はインダニルであるが、
但し、R3が−C(O)−C4−C6ヘテロシクリルである場合、ヘテロシクリルは−C(O)へのN結合手を有さず;
R4は、C3−C8シクロアルキル、C1−C7アルキル、−(CH2)P−CN、−(CH2)p−OR6、−(CH2)P−NR6(R7)、−(CH2)p−SO2−C1−C6アルキル、−(CH2)p−C6−C10アリール、−(CH2)p−C5−C6ヘテロアリール又は−(CH2)P−C4−C6ヘテロシクリルであり、ここで
各アルキル又はアルキレンは、1又は2つのC1−C6アルキルで場合により置換されており;
アリールは、フェニル、ナフチル、テトラヒドロナフチル、インデニル又はインダニルであり;
各R6及びR7は、個別に独立して、H、C1−C6アルキル又はC3−C8分岐アルキルであり;
各シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール及びヘテロシクリルは、−(R25)mで独立して置換されており;
各R25は、個別に独立して、C1−C6アルキル、分岐C3−C8アルキル、ハロゲン、−(CH2)m−CN、−(CH2)m−OR6、−(CH2)m−NR6(R7)、−(CH2)m−SO2−C1−C6アルキル、−(CH2)m−C(O)NR6(R7)、−(CH2)m−C(O)−C4−C6ヘテロシクリル又は−(CH2)m−C4−C6ヘテロシクリルであり、ここで各アルキル又はアルキレンは、1又は2つのC1−C6アルキルで場合により置換されており;
各mは、個別に独立して、0、1、2又は3であり;そして
pは、1、2又は3である]。 - R3が−C(O)R4である、請求項2記載の化合物。
- R4が、C3−C8シクロアルキル、C1−C7アルキル、−(CH2)P−CN、−(CH2)p−OR6、−(CH2)P−NR6(R7)、−(CH2)p−SO2−C1−C6アルキル又は−(CH2)p−C4−C6ヘテロシクリルであり、ここで各アルキル又はアルキレンが1又は2つのC1−C6アルキルで場合により置換されている、請求項3記載の化合物。
- R4が、C3−C8シクロアルキル又はC1−C7アルキルであり、ここで各アルキル又はアルキレンが1又は2つのC1−C6アルキルで場合により置換されている、請求項3記載の化合物。
- R3が、−C(O)−C6−C10アリール、−C(O)−C4−C6ヘテロシクリル又は−C(O)−C5−C6ヘテロアリールである、請求項2記載の化合物。
- N−(4−(2−アセトアミドピリジン−4−イルオキシ)−2,5−ジフルオロフェニル)−N’−(4−フルオロフェニル)シクロプロパン−1,1−ジカルボキサミド、
N−(4−(2−アセトアミドピリジン−4−イルオキシ)−5−クロロ−2−フルオロフェニル)−N’−(4−フルオロフェニル)シクロプロパン−1,1−ジカルボキサミド、
N−(4−(2−アセトアミドピリジン−4−イルオキシ)−2,5−ジフルオロフェニル)−N’−フェニルシクロプロパン−1,1−ジカルボキサミド、
N−(4−(2−(2−(ジメチルアミノ)アセトアミド)ピリジン−4−イルオキシ)−2,5−ジフルオロフェニル)−N’−(4−フルオロフェニル)シクロプロパン−1,1−ジカルボキサミド、
N−(4−(2−(シクロプロパンカルボキサミド)ピリジン−4−イルオキシ)−2,5−ジフルオロフェニル)−N’−(4−フルオロフェニル)シクロプロパン−1,1−ジカルボキサミド、
N−(2,5−ジフルオロ−4−(2−プロピオンアミドピリジン−4−イルオキシ)フェニル)−N’−(4−フルオロフェニル)シクロプロパン−1,1−ジカルボキサミド、
N−(2,5−ジフルオロ−4−((2−(2−メトキシアセトアミド)ピリジン−4−イル)オキシ)フェニル)−N’−(4−フルオロフェニル)シクロプロパン−1,1−ジカルボキサミド、
N−(2,5−ジフルオロ−4−(2−イソブチルアミドピリジン−4−イルオキシ)フェニル)−N’−(4−フルオロフェニル)シクロプロパン−1,1−ジカルボキサミド、
N−(4−(2−(2−シアノアセトアミド)ピリジン−4−イルオキシ)−2,5−ジフルオロフェニル)−N’−(4−フルオロフェニル)シクロプロパン−1,1−ジカルボキサミド、
N−(4−(2−(アゼチジン−3−カルボキサミド)ピリジン−4−イルオキシ)−2,5−ジフルオロフェニル)−N’−(4−フルオロフェニル)シクロプロパン−1,1−ジカルボキサミド、
N−(4−(2−(シクロブタンカルボキサミド)ピリジン−4−イルオキシ)−2,5−ジフルオロフェニル)−N’−(4−フルオロフェニル)シクロプロパン−1,1−ジカルボキサミド、
(R)−N−(2,5−ジフルオロ−4−((2−(2−メトキシプロパンアミド)ピリジン−4−イル)オキシ)フェニル)−N’−(4−フルオロフェニル)シクロプロパン−1,1−ジカルボキサミド、
(R)−N−(2,5−ジフルオロ−4−((2−(2−ヒドロキシプロパンアミド)ピリジン−4−イル)オキシ)フェニル)−N’−(4−フルオロフェニル)シクロプロパン−1,1−ジカルボキサミド、
N−(2,5−ジフルオロ−4−((2−ピバルアミドピリジン−4−イル)オキシ)フェニル)−N’−(4−フルオロフェニル)シクロプロパン−1,1−ジカルボキサミド、
(S)−N−(2,5−ジフルオロ−4−((2−(2−メトキシプロパンアミド)ピリジン−4−イル)オキシ)フェニル)−N−(4−フルオロフェニル)シクロプロパン−1,1−ジカルボキサミド、
(S)−1−((4−(2,5−ジフルオロ−4−(1−((4−フルオロフェニル)カルバモイル)シクロプロパンカルボキサミド)フェノキシ)ピリジン−2−イル)アミノ)−1−オキソプロパン−2−イルアセテート、
からなる群より選択される化合物、あるいはその薬学的に許容される塩、又は互変異性体。 - N−(4−(2−(シクロプロパンカルボキサミド)ピリジン−4−イルオキシ)−2,5−ジフルオロフェニル)−N’−(4−フルオロフェニル)シクロプロパン−1,1−ジカルボキサミド、
N−(2,5−ジフルオロ−4−(2−プロピオンアミドピリジン−4−イルオキシ)フェニル)−N’−(4−フルオロフェニル)シクロプロパン−1,1−ジカルボキサミド、
N−(2,5−ジフルオロ−4−(2−イソブチルアミドピリジン−4−イルオキシ)フェニル)−N’−(4−フルオロフェニル)シクロプロパン−1,1−ジカルボキサミド、
N−(4−(2−アセトアミドピリジン−4−イルオキシ)−2,5−ジフルオロフェニル)−N’−(4−フルオロフェニル)シクロプロパン−1,1−ジカルボキサミドから選択される、請求項1に記載の化合物。 - 請求項1記載の化合物と薬学的に許容される担体とを含む医薬組成物。
- 佐剤、賦形剤、希釈剤又は安定剤から選択される添加剤を更に含む、請求項9記載の組成物。
- 化合物であるN−(4−(2−(シクロプロパンカルボキサミド)ピリジン−4−イルオキシ)−2,5−ジフルオロフェニル)−N’−(4−フルオロフェニル)シクロプロパン−1,1−ジカルボキサミド、又はその薬学的に許容される塩。
- 請求項11記載の化合物と薬学的に許容される担体とを含む医薬組成物。
- 佐剤、賦形剤、希釈剤又は安定剤から選択される添加剤を更に含む、請求項12記載の組成物。
- 化合物であるN−(2,5−ジフルオロ−4−(2−プロピオンアミドピリジン−4−イルオキシ)フェニル)−N’−(4−フルオロフェニル)シクロプロパン−1,1−ジカルボキサミド、又はその薬学的に許容される塩。
- 請求項14記載の化合物と薬学的に許容される担体とを含む医薬組成物。
- 佐剤、賦形剤、希釈剤又は安定剤から選択される添加剤を更に含む、請求項15記載の組成物。
- 化合物であるN−(4−(2−アセトアミドピリジン−4−イルオキシ)−2,5−ジフルオロフェニル)−N’−(4−フルオロフェニル)シクロプロパン−1,1−ジカルボキサミド、又はその薬学的に許容される塩。
- 請求項17記載の化合物と薬学的に許容される担体とを含む医薬組成物。
- 佐剤、賦形剤、希釈剤又は安定剤から選択される添加剤を更に含む、請求項18記載の組成物。
- 癌の治療のための請求項9又は10に記載の医薬組成物。
- 前記癌が、固形腫瘍、胃癌、黒色腫、グリア芽細胞腫、卵巣癌、膵癌、前立腺癌、肺癌、乳癌、腎癌、肝癌、子宮頸癌、原発腫瘍部位からの転移、甲状腺乳頭癌、非小細胞肺癌、中皮腫、又は結腸癌である、請求項20に記載の医薬組成物。
- 前記医薬組成物が、経口、非経口、吸入又は皮下投与される、請求項21記載の医薬組成物。
- 固形腫瘍、胃癌、黒色腫、グリア芽細胞腫、卵巣癌、膵癌、前立腺癌、肺癌、乳癌、腎癌、肝癌、子宮頸癌、原発腫瘍部位からの転移、甲状腺乳頭癌、非小細胞肺癌、中皮腫、又は結腸癌を治療するための、請求項12又は13に記載の医薬組成物。
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