JP5775064B2 - プロテアソーム阻害剤による治療に対する末梢性ニューロパシー応答を評価するためのバイオマーカー - Google Patents
プロテアソーム阻害剤による治療に対する末梢性ニューロパシー応答を評価するためのバイオマーカー Download PDFInfo
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Description
本願は、2009年3月24日出願の米国特許仮出願第61/162,848号の優先権を主張する。
本発明は、概して薬理ゲノミクスの分野に関し、より具体的には、末梢性ニューロパシーの候補遺伝子の薬理ゲノミクス的解析に関する。
治療前(スクリーニング)段階、非盲検治療段階、及び治療後段階の3段階からなる無作為化、非盲検、多施設治験を実施した。未だ治療されていない多発性骨髄腫の被験体約680人を、2つの治療群のうちの1つに無作為に割り付け、ベースラインのβ2−マイクログロブリン、ベースラインのアルブミン濃度、及び地域(北米、欧州、その他)に従って層別化した。被験体に、VELCADE(商標)/メルファラン/プレドニゾン(VMP)(治療群A)又はメルファラン/プレドニゾン(MP)(治療群B)を投与した。治療群Aの被験体に、VELCADE(商標)1.3mg/m2(4回の6週間サイクル中週2回[1週目、2週目、4週目、及び5週目][1サイクル当り8投与]、続いて、5回の6週間サイクル中週1回[1週目、2週目、4週目、及び5週目][1サイクル当り4投与]に加えて、メルファラン9mg/m2及びプレドニゾン60mg/m2(各6週間サイクルの1日目〜4日目に1日1回)を投与した。治療群Bの被験体には、各6週間サイクルの1日目〜4日目に1日1回、メルファラン9mg/m2及びプレドニゾン60mg/m2を9サイクル投与した。両群とも、最大9サイクル(54週間)治療を続け、疾患が進行したり許容できないほどの治療に関連する毒性が生じた場合、又は被験体が同意を取り消した場合、治療を中断した。
新たに多発骨髄腫であると診断された65歳以下の患者において自家造血幹細胞移植(AHSCT)前の誘導処理としての、ビンクリスチン/アドリアマイシン/デキサメタゾン(VAD)とVELCADE(商標)/デキサメタゾンとを比較する無作為化、非盲検、多施設治験を実施した。約480人の患者がこの研究に含まれていた。被験体は、診断時に以下の4つの誘導処理群のうちの1つに無作為化された:
・A1VAD(4サイクル)
・A2VAD(4サイクル)、続いて、デキサメタゾン/シクロホスホミド/エトポシド/シスプラチナム(DCEP)(2サイクル)
・B1VELCADE+デキサメタゾン(4サイクル)
・B2VELCADE+デキサメタゾン(4サイクル)、続いてDCEP(2サイクル)
0.01未満のマイナー対立遺伝子頻度(MAF)のSNPは、後続の解析から除外したが、その理由は、遺伝子型解析コールを作成するために用いられるクラスタリングアルゴリズムの正確性が、非常に低いマイナー対立遺伝子頻度のSNPでは比較的低いためである。実施例1の解析全体においてコール率が90%未満であるSNPは11個存在しており、これらを除外した。残りのSNPのうち、26個のSNPは、0.01未満のMAFを有しており、これらを除外した。ハーディー−ワインベルグ平衡(HWE)試験を実施した。ハーディー−ワインベルグ平衡からの有意な偏差は、均質集団における潜在的な遺伝子型解析のエラーを示す場合がある。しかし、HWEからの軽度の偏差は、研究のエンドポイントとの正の関連を示す場合がある。実施例1の研究では、白人の被験体でHWE試験を実施したが、その理由は、彼らが、本明細書において報告される研究の最も大きな均質集団を形成しているためである。p値が0.05/2000未満であるHWEから逸脱しているSNPは、後続の解析から除外した。実施例1の研究からの5個のSNPはHWE試験に失敗したので、これらは除外した。付録1は、試験したSNP、遺伝子型の状態、コール率、MAF、HWE試験のP値、及び最終的な統計分析状態の全てのセットを列挙する。SNPレベルのQC後、1885個の非mtSNPを関連解析のために保持した。
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- rs4553808のマイナー対立遺伝子、rs1474642のマイナー対立遺伝子、rs12568757のマイナー対立遺伝子、rs11974610のマイナー対立遺伝子、rs1261134のマイナー対立遺伝子及びrs916758のマイナー対立遺伝子のうちの1つ以上からなる群より選択されるバイオマーカーを同定するためのプローブを含む、患者が癌治療に応答して有害な神経学的事象を発現する増大したリスクを有しているかどうかを同定する方法に使用するための診断キットであって、前記有害な神経学的事象が、末梢性ニューロパシー、末梢性感覚性ニューロパシー、及び神経痛からなる群より選択され、前記方法が、前記患者が前記リスク増大に関する1つ以上の前記バイオマーカーを有するかどうかを判定することを含み、前記バイオマーカーの存在が、前記有害な神経学的事象のリスク増大を示す、上記診断キット。
- 前記癌治療が、プロテオソーム阻害剤の投与を含む、請求項1に記載の診断キット。
- 前記プロテオソーム阻害剤がボルテゾミブを含む、請求項2に記載の診断キット。
- 前記判定が、前記患者から生体サンプルを得ること、及び前記サンプルに対して遺伝子型解析を実施することを含む、請求項1に記載の診断キット。
- rs4553808のマイナー対立遺伝子、rs1474642のマイナー対立遺伝子、rs12568757のマイナー対立遺伝子、rs11974610のマイナー対立遺伝子、rs1261134のマイナー対立遺伝子及びrs916758のマイナー対立遺伝子のうちの1つ以上からなる群より選択されるバイオマーカーを同定するためのプローブと、前記バイオマーカーを同定するためのプローブを使用して、癌治療に応答して末梢性ニューロパシーを発現する可能性がある患者を同定するための説明書とを含む、癌治療に応答して有害事象を発現する可能性のある患者を同定するための診断キット又は等価物。
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