JP5653935B2 - 抗菌薬として有用なナフチリジン―2(1h)−オン化合物 - Google Patents
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- C07D471/00—Heterocyclic compounds containing nitrogen atoms as the only ring hetero atoms in the condensed system, at least one ring being a six-membered ring with one nitrogen atom, not provided for by groups C07D451/00 - C07D463/00
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Description
本発明は、式(I)の化合物またはそれらの薬学的に許容可能な塩、溶媒和物またはN−オキシドを提供する。
R1は水素、ハロ、またはC1−3アルコキシを表し、
R2は水素またはヒドロキシを表し、
Arはフェニル、ピリジル、ピリダジニル、ピリミジニル、ピラジニル、チアゾリル、フラニル、イミダゾリルおよびチオフェニルから選択される群を表し、
Arは第1の置換基R3で置換され、R3はC1−5ヒドロキシアルキルを表し、
Arは、ハロ、CF3、C1−3アルキル、ニトロおよびC1−3アルコキシから選択される第2の置換基R4により置換されていてもよく、
R2が水素の場合、R5は水素またはC1−3アルキルであり、R2がヒドロキシルの場合、R5は水素である。
1−{2−[4−({[5−クロロ−6−(ヒドロキシメチル)−3−ピリジニル]メチル}アミノ)−1−ピペリジニル]エチル}−7−フルオロ―1、5−ナフチリジン―2(1H)−オン、
1−{2−[4−({[5−クロロ−6−(ヒドロキシメチル)−3−ピリジニル]メチル}アミノ)−1−ピペリジニル]エチル}−7−フルオロ―1、5−ナフチリジン―2(1H)−オン塩酸塩、
1−{2−[(3R,4S)−4−({[5−クロロ―6−(ヒドロキシメチル)−3−ピリジニル]メチル}アミノ)−3−ヒドロキシ―1−ピペリジニル]エチル}―7−フルオロ―1、5−ナフチリジン―2(1H)−オン、
1−{2−[(3R,4S)−4−({[5−クロロ―6−(ヒドロキシメチル)−3−ピリジニル]メチル}アミノ)−3−ヒドロキシ―1−ピペリジニル]エチル}―7−フルオロ―1、5−ナフチリジン―2(1H)−オン塩酸塩、
1−{2−[4−({[5−クロロ−6−(ヒドロキシメチル)−3−ピリジニル]メチル}アミノ)−1−ピペリジニル]エチル}−7−(メチルオキシ)−1、5−ナフチリジン―2(1H)−オン、
1−{2−[4−({[5−ブロモ−6−(ヒドロキシメチル)−3−ピリジニル]メチル}アミノ)−1−ピペリジニル]エチル}−7―フルオロ−1、5−ナフチリジン―2(1H)−オン、
1−{2−[(3R,4S)−4−({[5−クロロ―6−(ヒドロキシメチル)−3−ピリジニル]メチル}アミノ)−3−ヒドロキシ―1−ピペリジニル]エチル}―7−(メチルオキシ)−1、5−ナフチリジン―2(1H)−オン、および、
1−{2−[(3R,4S)−4−({[5−クロロ―6−(ヒドロキシメチル)−3−ピリジニル]メチル}アミノ)−3−ヒドロキシ―1−ピペリジニル]エチル}―7−(メチルオキシ)−1、5−ナフチリジン―2(1H)−オン塩酸塩である。
用語と定義
化合物の調製
組成物および製剤
略語
EtOAc 酢酸エチル
AcOH 酢酸
Ac2O 無水酢酸
BOC N−tert−ブトキシカルボニル
BOC anhydride 二炭酸ジ−tert−ブチル
Celite(登録商標) 酸洗浄した珪藻土シリカから成るろ過助剤
(Manville Corp., Denver, Coloradoの商標)
DME ジメトキシエタン
DCM ジクロロメタン
DIBAL−H 水素化ジイソブチルアルミニウム
DMF ジメチルホルムアミド
DMSO−d6 重水素化ジメチルスルホキシド
DMSO ジメチルスルホキシド
ES MS エレクロトロスプレー質量分析
EtOH エタノール
h 時間
HPLC 高速液体クロマトグラフィー
LCMS 液体クロマトグラフィー質量分析
mCPBA メタ−クロロ過安息香酸
MeOH メタノール
NaBH(OAc)3 トリアセトキシ水素化ホウ素ナトリウム
NMR 核磁気共鳴分光分析
t−BuOMe メチルt−ブチルエーテル
TFA トリフルオロ酢酸
THF テトラヒドロフラン
uv 紫外線
以下の実施例は本発明を例示する。これらの実施例は本発明の範囲を限定するものではなく、むしろ当業者に本発明の化合物、組成物、および本発明の方法を調製し使用するためのガイダンスの提供を意図する。本発明の特定の実施形態が記載されているが、種々の変更や改善を行うことができることが当業者には理解されるであろう。他の調製方法と同様の方法で実施された調製、または一般的方法における基準は、時間、温度、実験条件、試薬の量の小さな変更等のルーチン・パラメーターにおける変更を含んでもよい。
中間体1
6−(メチルオキシ)−1、5−ナフチリジン―4−オール(21.5g)(合成についてはWO2007016610 Preparation 2 (a)を参照)を、0℃にてN2下でDMF(150ml)中で撹拌し、三臭化リン(13.5ml)を徐々に添加した。混合物を室温まで温め、90分間撹拌した。H2Oを添加し、固体のNa2CO3を添加してpHをpH7に製造した。固形物を吸引濾過して単離し、2時間焼結吸引乾燥し、続いて45℃で真空下で乾燥して所望の化合物(26.0g、90%)を得た。1H−NMR (δ, ppm, DMSO−d6): 8.59 (d, 1H), 8.30 (d, 1H), 8.08 (d, 1H), 7.33 (d, 1H), 4.06 (s, 3H).
CH2Cl2(200ml)およびEtOH(200ml)中の中間体1(25.5g)の混合物に対して、NaHCO3(20g)および5%湿分パラジウム炭素(4g)を添加した。得られた懸濁液を、1.5気圧で21時間水素化した。混合物はセライトを通して吸引濾過し、固体はCH2Cl2/EtOH 1:1(200ml)で洗浄した。混合した濾液および洗浄液は減圧下で濃縮し、その後、CH2Cl2/H2O 2:1(1600ml)で処理した。有機相は分離され、MgSO4により乾燥させ、減圧下で濾過し蒸発させて所望の化合物(15.8g, 92%)を得た。[ES MS] m/z 161 (MH+).
中間体2(15.8g)を110℃で2時間、6N HCl(100ml)で撹拌した。混合物を0℃に冷却して、pHを固形物NaOHで6〜7に調節した。沈殿した固形物を吸引濾過で単離し、2時間焼結吸引乾燥し、45℃で真空下で乾燥させて所望のもの(14.4g, 98%)を得た。[ES MS] m/z 147 (MH+).
アルゴン雰囲気下において、0℃で乾燥DME(180ml)および乾燥DMF(45ml)中の中間体3(5.9g)の懸濁液にNaH(鉱油中の60%w:w分散液、3.2g)を少しずつ添加した。45分間の撹拌後、混合物を臭化リチウム(8.8g)で処理し、懸濁液を室温にまで温めた。45分間の撹拌後、混合物をアリルブロミド(7ml)で処理して、その後、65℃で3時間撹拌した。混合物を室温にまで冷却し、減圧下で濃縮した後、t−BuOMe(300ml)を添加し、さらにその後、混合物を1N NH4Cl(200ml)で洗浄した。
1,4−ジオキサン(100ml)とH2O(50ml)中の中間体4(5.2g)の溶液に過ヨウ素酸ナトリウム(13.8g)と四酸化オスミウム(担持OsO4が4g)を連続的に添加した。その混合物を室温で24時間撹拌した。さらなる量の過ヨウ素酸ナトリウム(1.4g)と 四酸化オスミウム(500mg)を添加し、混合物をさらに72時間撹拌した。混合物を濾過し固形物をH2O(250ml)とTHF(125ml)で洗浄した。混合した濾液および洗浄液をCH2Cl2/MeOH(525/125;375/125および375/125ml)で抽出した。有機抽出物を混合し、Na2SO4で乾燥させ、減圧下で濾過し乾燥させて所望の生成物(5.4g、90%)を得た。1H−NMR (δ, ppm, CDCl3): 9.75 (s, 1/2H), 8.59−8.55 (m, 1H), 8.03−7.85 (m, 2H), 7.50−7.30 (m, 2H), 6.98 (d, 1H), 5.15−4.25 (m, 5H), 3.70 (s, 3H), 3.49 (s, 1/2H), 3.42−3.30 (m, 1H).
CH2Cl2(350ml)およびMeOH(20ml)中の中間体5(10.2g)の混合物に1,1−ジメチルエチル―4−ピペリジニルカーバメート(10.8g、Aldrichより)を添加した。1時間撹拌した後、トリアセトキシ水素化ホウ素ナトリウム(34.4g)を添加した。H2O(200ml)を添加する前に反応物を3時間撹拌し、NaHCO3(400ml)で飽和させた。反応物はCH2Cl2/MeOH(500/75、450/50および450/50ml)で抽出した。混合した有機相はNa2SO4で乾燥させ、蒸発させ、さらにCH2Cl2およびMeOHを使って残渣をシリカゲルでのカラムクロマトグラフィーで精製し、所望の化合物(12.7g、63%)を得た。 [ES MS] m/z 373 (MH+).
CH2Cl2(90ml)中の中間体6(7.2g)の溶液にHC1(1,4−ジオキサンの4M溶液、35ml)を添加した。20時間撹拌後、得られた固形物を濾過し、CH2Cl2で洗浄し乾燥させて標題化合物6.8gを得た。1H−NMR (δ, ppm, D2O): 8.52 (d, 1H), 8.22 (d, 1H), 7.99 (d, 1H), 7.82−7.78 (m,1H), 6.99 (d, 1H), 4,66−4.60 (m), 3.79−3.72 (m, 2H), 3.48−3.42 (m, 3H), 3.14−3.03 (m, 2H), 2.23−2.15 (m, 2H), 1.87−1.76 (m, 2H).
0℃のH2O(20ml)中の中間体7(2g)の溶液にpH11になるまで水性1N NaOHを添加した。次に、反応物はCH2Cl2/MeOH 95:5(50ml)で抽出した。有機相をNa2SO4 で乾燥および蒸発させて所望の化合物(387mg)を得た。
水相を蒸発させ、残渣をCH2Cl2(25ml)で処理し、混合物を1時間撹拌した。次に、濾過して溶媒を蒸発させてさらなる量の標題化合物(1.0g)を得た。1H−NMR (δ, ppm, CDCl3): 8.55 (d, 1H), 7.90 (d, 1H), 7.77 (d, 1H), 7.48−7.44 (m, 1H), 6.91 (d, 1H), 4.38 (t, 2H), 2.99−2.94 (m, 2H), 2.73−2.62 (m, 3H), 2.18 (dt, 2H), 1.87−1.76 (m, 2H); 1.43−1.30 (m, 2H), 1.25−1.13 (m, 2H).
N2下の65℃のアセトニトリル(4200ml)中の2−クロロ−6−メトキシ―3−ニトロピリジン(600g)およびPdCL2(PPh3)2(33.5g)の懸濁液に対して、(1−エトキシビニル)−トリブチル―スタンナン(1182ml)を2時間に亘って滴加した。得られた懸濁液を65℃で4時間撹拌し、その後、室温になるまで一晩冷却させた。反応混合物を10%KF水溶液(3600ml)と共に激しく撹拌してクエンチし、1時間撹拌した。得られた固形物を真空濾過で除去し、アセトニトリル(7x1000ml)で洗浄した。相を分離し、有機相を3000mlまで蒸発させた。Whatman, GF/B ガラス繊維濾紙を通して濾過し、除去された少量の暗褐色の固形物をMeCN(1800ml)で洗浄した。EtOAc(3600ml)を添加して体積が1800mlまで減少した。シクロヘキサン(3600ml)を添加して体積が3000mlまで減少した。シクロヘキサン(2400ml)およびシリカゲル(600g、1wt)を添加し、室温で1.5時間撹拌した。固形物を真空濾過で除去し、EtOAc/シクロヘキサン、1:8(4200ml)で洗浄した。濾液は1800mlまで減少した。シクロヘキサン(2400ml)を添加して体積は1800mlまで減少した。シクロヘキサン(3600ml)とEtOAc(600ml)とシリカゲル(600g、1wt)とを添加し1.5時間撹拌した。固形物を真空濾過で除去し、EtOAc/シクロヘキサン、1:8(4200ml)で洗浄した。溶媒は蒸発乾固した。MeCN(2000ml)を添加してオレンジ色のオイルを得るまで蒸発させた。
氷水浴を使って温度<15℃を維持しながら、アセトニトリル(2060ml)およびH2O(820ml)中のSelectfluor(市販されているふっ素化試薬、1286.4g)の懸濁液にアセトニトリル(1416ml)中の中間体9を1.5時間に亘って滴加した。得られた溶液は室温で一晩撹拌した。反応混合物を飽和水性NaHCO3(2140ml)でクエンチし、30分間撹拌した。ロータリーエバポレータを用いて体積を3250mlまで減少させた。得られた黄色の懸濁液にEtOAc(4400ml)およびH2O(720ml)を添加して15分間撹拌した。相を分離し水性物をEtOAc(2x1000ml)で抽出した。有機相を混合し、H2O(1000ml)および飽和NaCl(1000ml)で洗浄した。有機相をMgSO4(400g)で乾燥させて、濾過および蒸発させた。アセトニトリル(1000ml)を添加し、蒸発させて、静置でゆっくり固化するオレンジ色オイルを得た。
N2下でトルエン(2700ml)中の中間体10の溶液(657.0g)にN、N−ジメチルホルムアミドジメチルアセタール(1550ml)を添加した。反応混合物を50℃で4時間加熱した。シクロヘキサン(2000ml)を添加し、反応混合物をゆっくりと1時間に亘って冷やし、その後、氷水浴を使って<5℃まで冷却した。沈殿した固形物を吸引濾過で集め、EtOAc/シクロヘキサン、1:1(3x1000ml)で洗浄した。黄色の固形物を40℃の真空下で一晩オーブンで乾燥させた。
DMF(10500ml)中の中間体11の混合物(1146.7g)に、DMF(1000ml)中の5%湿分パラジウム炭素(274.4g)を添加した。45℃から50℃の温度を維持しながら、得られた懸濁液を1.0気圧で3時間水素化した。反応混合物を60℃まで加熱した。DMF(1800ml)を50℃まで加熱し、加圧フィルターに装入した。触媒を除去するために、加熱した反応混合物を1.0気圧で、加圧フィルターを通して窒素転移させた。容器を加熱したDMF(2x1500ml)で洗浄した。生成物は単離せずに次のステップで直接使用した。
DMF中の中間体12の溶液に水性6N HCl(184ml)を0℃で滴加した。反応物を室温まで温め一晩撹拌した。
50℃でロータリーエバポレータを用いて反応混合物の体積を〜2000mlまで減少させ、黄色の懸濁液を氷水浴を使って10℃まで冷却した。H2O(4000ml)を30分間、ゆっくり添加した。反応混合物を激しく1時間撹拌した。沈殿した固形物を吸引濾過で採取し、まずH2O(3000ml)、そしてEtOAc/シクロヘキサン、1:1(3x2000ml)で洗浄した。真空下で50℃で4日間、薄い茶色の固形物をオーブンで乾燥させた。
中間体1で記載した手順に類似している手順を使い中間体13(15.8g)から調製して、19.6g(93%)の標題化合物を得た。1H−NMR (δ, ppm, DMSO−d6): 8.86 (s, 1H), 8.34 (d, 1H), 7.31 (d, 1H), 4.08 (s, 3H).
中間体2で記載した手順に類似している手順を使い中間体14(12.7g)から調製して、8.3g(94%)の標題化合物を得た。1H−NMR (δ, ppm, CDCl3): 8.67 (d, 1H), 8.18 (d, 1H), 7.81−7.76 (m, 1H), 7.07 (d, 1H), 4.08 (s, 3H).
中間体3で記載した手順に類似している手順を使い中間体15(6.4g)から調製して、5.7g(95%)の標題化合物を得た。 [ES MS] m/z 279 (MH+).
中間体4で記載した手順に類似している手順を使い中間体16(5.0g)から調製して、5.4g(88%)の標題化合物を得た。[ES MS] m/z 205 (MH+).
中間体5で記載した手順に類似している手順を使い中間体17(5.4g)から調製して、5.8gの標題化合物を得た。1H−NMR (δ, ppm, CDCl3): 9.77 (s, 1/2H), 8.45 (bs, 1H), 7.97 (d, 1H), 7.59 (d, 1/2H), 7.06 (d, 1H), 6.92 (d, 1H), 5.05−4.95 (m, 2H), 4.45−4.30 (m, 1H), 3.49 (s, 5/2H), 3.42 (s, 5/2H).
中間体6で記載した手順に類似している手順を使い中間体18(5.8g)から調製して、7.2g(66%)の標題化合物を得た。[ES MS] m/z 391 (MH+).
中間体7で記載した手順に類似している手順を使い中間体19(12.7g)から調製して、13.5gの標題化合物を得た。1H−NMR (δ, ppm, D2O): 8.41 (s, 1H), 7.94 (d, 1H), 7.80 (d, 1H), 6.83 (d, 1H), 4.70−4.55 (m), 3.85−3.75 (m, 2H), 3.46 (t, 2H), 3.15−3.05 (m, 2H), 2.25 (bd, 2H), 1.90−1.75 (m, 2H).
0℃でH2O(110ml)中の中間体20(13.5g)の溶液に、pH11になるまで水性2N NaOHを添加した。次に反応物をCH2Cl2/MeOH 95:5(120ml)で抽出した。有機相をNa2SO4で乾燥させ、蒸発させて所望の化合物(760mg)を得た。水相を蒸発させ、残渣をCH2Cl2/MeOH 95:5(120ml)で処理して混合物を1時間撹拌した。次に濾過させて、溶媒を蒸発させてさらなる量の標題化合物(8.0g)を得た。1H−NMR (δ, ppm, DMSO−d6): 8.54 (d, 1H), 8.01 (d, 1H), 7.92 (d, 1H), 4.29 (t, 2H), 3.65−3.15 (m, 4H), 3.35 (d, 2H), 2.80−2.70 (m, 1H), 2.53−2.48 (m), 2.01 (t, 2H), 1.72 (d, 2H), 1.35−1.20 (m, 2H).
N2下で乾燥MeOH(600ml)中の中間体14(62.5g)の溶液にNaMeO(MeOH中の25%wt溶液、525ml)を添加した。混合物を60℃で2時間撹拌し、その後、室温まで冷却した。ブライン(800ml)、H2O(800ml)およびCH2Cl2(1L)を添加した。有機相を分離し水相をさらなるCH2Cl2(2x500ml)で抽出した。混合した有機相をNa2SO4で乾燥させ、減圧下で濃縮し、所望の化合物を得た(60.1g、92%)。1H−NMR (δ, ppm, CDCl3): 8.54 (s, 1H), 8.15 (d, 1H), 7.03 (d, 1H), 4.15, 4.16 (s, 6H).
中間体2で記載した手順に類似している手順を使い中間体22(15.0g)から調製して、10.4g(98%)の標題化合物を得た。1H−NMR (δ, ppm, CDCl3): 8.52 (d, 1H), 8.14 (d, 1H), 7.46 (d, 1H), 6.96 (d, 1H), 4.07 (s, 3H), 3.96 (s, 3H).
中間体3で記載した手順に類似している手順を使い中間体23(39.7g)から調製して、36.2g(98%)の標題化合物を得た。1H−NMR (δ, ppm, DMSO−d6): 11.78 (bs, 1H), 8.19 (d, 1H), 7.84 (d, 1H), 7.12 (d, 1H), 6.52 (d, 1H), 3.86 (s, 3H).
中間体4で記載した手順に類似している手順を使い中間体24(15.0g)から調製して、14.5g(79%)の標題化合物を得た。1H−NMR (δ, ppm, CDCl3): 8.27 (d, 1H), 7.87 (dd, 1H), 7.02 (d, 1H), 6.78 (d, 1H), 6.00−5.88 (m, 1H), 5.26 (d, 1H), 5.10 (d, 1H), 4.92−4.89 (m, 2H), 3.94 (s, 3H).
1,4−ジオキサン(250ml)およびH2O(120ml)中の中間体25(15.4g)の溶液に連続して過ヨウ素酸ナトリウム(35g)と 四酸化オスミウム(担持 OsO4が11.3g)を添加した。混合物を室温で24時間撹拌した。さらなる量の過ヨウ素酸ナトリウム(3.5g)と 四酸化オスミウム(1.2g)を添加し混合物をさらに72時間撹拌する。混合物を濾過し、濾液をCH2Cl2/MeOH 9:1(300、200および100ml)で抽出した。有機相を混合し、Na2SO4で乾燥させ、減圧下で濾過および蒸発させて所望の生成物(14.9g、95%)を得た。1H−NMR (δ, ppm, CDCl3): 9.72 (s, 1H), 8.30 (d, 1H), 7.94 (d, 1H), 6.81 (d, 1H), 6.72 (bd, 1H), 5.11 (s, 2H), 3.93 (s, 3H).
中間体6で記載した手順に類似している手順を使い中間体26(12.8g)から調製して、15.3g(65%)の標題化合物を得た。1H−NMR (δ, ppm, CDCl3): 8.27 (d, 1H), 7.83 (d, 1H), 7.17 (bs, 1H), 6.73 (d, 1H), 4.44 (bs, 1H), 4.35 (t, 2H), 3.97 (s, 3H), 3.47 (bs, 1H), 2.94 (bd, 2H), 2.64 (t, 2H), 2.26 (t, 2H), 1.95 (bd, 2H), 1.70 (bs, 2H), 1.44 (s, 9H).
中間体7で記載した手順に類似している手順を使い中間体27(15.4g)から調製した。
中間体21で記載した手順に類似している手順を使い中間体28から調製して、11.5g(99%)の標題化合物を得た。1H−NMR (δ, ppm, DMSO−d6): 8.26 (d, 1H), 7.85 (d, 1H), 7.39 (d, 1H), 6.64 (d, 1H), 4.34 (d, 2H), 3.97 (s, 3H), 3.72 (bs, 2H), 2.92 (bd, 2H), 2.74−2.64 (m, 1H), 2.54−2.48 (m), 2.03 (t, 2H), 1.72 (bd, 2H), 1.35−1.24 (m, 2H).
アルゴン雰囲気下で、中間体18(200mg)および1,1−ジメチルエチル[(3R,4S)―3− ヒドロキシ−4−ピペリジニル]カーバメイト(182mg)(合成に関してはWO2004058144, Example 5(c), cis−(3−hydroxy−piperidin−4−yl)−carbamic acid tert−butyl ester Enantiomer 1を参照)をCHCl3(10ml)およびMeOH(0.5ml)中で2時間撹拌した。トリアセトキシ水素化ホウ素ナトリウム(534mg)を一度に添加し混合物を室温で一晩撹拌した後、飽和水性NaHCO3(20ml)を加えてクエンチし、CH2Cl2中の20%v:v MeOH(3x200ml)で抽出した。有機抽出物を混合し、無水MgSO4で乾燥させ、減圧下で濾過し蒸発させて粗生成物を得て、これをシリカでのカラムクロマトグラフィーで精製し、CH2Cl2中の0−20%(MeOH中の2Mアンモニア)で溶出した。減圧下で適当な留分を混合し蒸発させ、オフホワイト色の泡状物の標題化合物(247mg)を得た。[ES MS] m/z 407 (MH+).
中間体30(240mg)をCH2Cl2(10ml)中で溶解し、溶液を1,4−ジオキサン(2ml)中の4M HClで処理した。沈殿物の発泡と形成を認めた。2時間後、溶媒を減圧下で除去し残渣を減圧下で一晩乾燥させて、オフホワイト色の固形物である220mgの標題化合物を得た。[ES MS] m/z 307 (MH+).
中間体30に記載した手順と類似の手順を用いて、中間体26(200mg)および1,1−ジメチルエチル[(3R,4S)―3−ヒドロキシ−4−ピペリジニル]カーバメイト(173mg)(合成に関してはWO2004058144, Example 5(c), cis−(3−hydroxy−piperidin−4−yl)−carbamic acid tert−butyl ester Enantiomer 1を参照)から調製し、263mgの標題化合物を得た。[ES MS] m/z 419 (MH+).
中間体31で記載した手順に類似している手順を使い中間体32(258mg)から調製して、223mgの標題化合物を得た。[ES MS] m/z 319 (MH+).
中間体30に記載した手順と類似の手順を用いて、中間体5(639mg)および1,1−ジメチルエチル[(3R,4S)―3−ヒドロキシ−4−ピペリジニル]カーバメイト(250mg)(合成に関しては WO2004058144, Example 5(c), cis−(3−hydroxy−piperidin−4−yl)−carbamic acid tert−butyl ester Enantiomer 1を参照)から調製し、250mgの標題化合物を得た。
中間体31で記載した手順に類似している手順を使い中間体34(250mg)から調製して、250mgの標題化合物を得た。
H2O中の中間体35の溶液に固体のNaHCO3をpH9になるまで添加した。次に反応物をCH2Cl2/MeOH 9:1で抽出した。有機相をNa2SO4で乾燥させ、蒸発させて28mgの黄色の固形物を得たが、1H−NMRは所望の化合物とは一致しなかった。水相を蒸発させて残渣をCH2Cl2で処理し、かつ、混合物を室温で撹拌した。次に濾過して溶媒を蒸発させて標題化合物(遊離塩基)(45mg)を得た。1H−NMR (δ, ppm,CDCl3): 8.56 (d, 1H), 7.92 (d, 1H), 7.71 (d, 1H), 7.47 (dd, 1H), 6.93 (d, 1H), 4.53−4.44 (m, 1H), 4.34−4.25 (m, 1H), 3.66 (bs, 1H), 3.09−3.06 (m, 1H), 2.85−2.81 (m, 1H), 2.72−2.65 (m, 3H), 2.34 (d, 1H), 2.26−2.17 (m, 1H), 1.64−1.57 (m, 5H).
中間体30に記載した手順と類似の手順を用いて、中間体26(200mg)および1,1−ジメチルエチル[(3S,4R)―3−ヒドロキシ−4−ピペリジニル]カーバメイト(182mg)(合成に関しては WO2004058144, Example 5(c), cis−(3−hydroxy−piperidin−4−yl)−carbamic acid tert−butyl ester Enantiomer 2を参照)から調製し、226mgの標題化合物を得た。[ES MS] m/z 419 (MH+).
中間体31で記載した手順に類似している手順を使い中間体36(223mg)から調製して、209mgの標題化合物を得た。[ES MS] m/z 319 (MH+).
水素化ナトリウム(124mg)を1,4−ジオキサン(2ml)およびEtOH(2ml)の混合液に添加し室温で5分間撹拌した。中間体21(300mg)を添加して混合物を160℃で10分間マイクロオーブンで加熱した。H2Oを添加して2N HClで酸性化した。水相をCH2Cl2/MeOH 10%で洗浄してpHを水性2N NaOHで11に調節した。水相をCH2Cl2/MeOH 9:1の混合物で抽出し、Na2SO4で乾燥させて、真空下で濃縮して黄色いオイルである255mgの標題化合物を得た。1H−NMR (δ, ppm, DMSO−d6): 8.25 (d, 1H), 7.84 (d, 1H), 7.38 (d, 1H), 6.63 (d, 1H), 4.34−4.22 (m, 4H), 2.88−2.84 (m, 2H), 2.05−1.97 (m, 2H), 1.65−1.61 (m, 2H), 1.40 (t, 3H), 1.21−1.09 (m, 2H). [ES MS] m/z 317 (MH+).
(a)3−クロロ−5−(1、3−ジオキソラン―2−イル)−2−メチルピリジン
p−トルエンスルホン酸(5.53mg、0.032mmol)を5−クロロ−6−メチル−3−ピリジンカルボアルデヒド(合成についてはWO20006/137485 A1 Example 256を参照)(250mg、1.607mmol)、エチレングリコール(179μl, 3.21 mmol)、および水を共沸して除去(Dean−Stark)しながらトルエン(8ml)ならびに混合物を還流下で加熱した。進行をTLC(50%ヘキサン:EtOAc)およびHPLCでモニターした。エチレングリコール(180μl)およびTsOH(3mg)をさらに添加して46時間後にHPLCにより完全な変換を認めた。10%Na2CO3およびEtOAcを添加した。抽出、乾燥(MgSO4)、および濾過により、次のステップに使用するのに十分純粋である3−クロロ−5−(1、3−ジオキソラン―2−イル)−2−メチルピリジン(274.3mg、86%)を得た。
1H−NMR (δ, ppm, CDCl3): 8.46 (s, 1H), 7.76 (s, 1H), 5.83 (s, 1H), 4.16−4.02 (s, 4H), 2.65 (s, 3H). [ES MS] m/z 200 (MH+).
m−CPBA(626mg、2.72mmol)をDCM(3ml)中の3−クロロ−5−(1、3−ジオキソラン―2−イル)−2−メチルピリジン(271.4mg、1.359mmol)およびNaHCO3(343mg、4.08mmol)の懸濁液に添加し室温で撹拌した。21時間後HPLCが完全な変換を示した。DCMおよび1M NaOHを添加した。抽出し、乾燥(MgSO4)させ、濾過し、濃縮して、次のステップに使用するのに十分純粋である淡黄色のオイルの3−クロロ−5−(1、3−ジオキソラン―2−イル)−2−メチルピリジン1−酸化物(228mg、78%)を得た。
1H−NMR (δ, ppm, CDCl3): 8.33 (s, 1H), 7.38 (s, 1H), 5.80 (s, 1H), 4.05 (s, 4H), 2.64 (s, 3H). [ES MS] m/z 216 (MH+).
トリフルオロ酢酸無水物(231μl、1.635mmol)を、0℃で DCM(4ml)中の3−クロロ−5−(1、3−ジオキソラン―2−イル)−2−メチルピリジン1−酸化物(225mg、1.043mmol)の溶液に添加し、混合物を室温で48時間撹拌した。完全な変換をHPLCで認めた。MeOH(0.5ml、12.36mmol)を添加し、10分間撹拌した後、DCMおよび10%Na2CO3溶液を添加した。抽出、乾燥(MgSO4)、および濾過により、223.2mgの粗生成物を得た。Flashmaster II、5gシリカゲルカートリッジによる精製および溶離剤としてのヘキサンおよびEtOAcの混合物により黄色のオイルの[3−クロロ−5−(1、3−ジオキソラン―2−イル)−2−ピリジニル]メタノール(142.7mg、63%)を得た。
1H−NMR (δ, ppm, CDCl3): 8.57 (s, 1H), 7.82 (s, 1H), 5.88 (s, 1H), 4.82 (s, 2H), 4.18−4.04 (m, 4H). [ES MS] m/z 216 (MH+).
シュウ酸(415mg、3.29mmol)を[3−クロロ−5−(1、3−ジオキソラン―2−イル)−2−ピリジニル]メタノール(142mg、0.659mmol)、アセトン(7.5ml)、および水(7.5ml)の混合物に室温で添加し、還流下で加熱した。2.5時間後、HPLCが完全な変換を示した。室温まで冷却し、1M NaOHで塩基性にし、TBMEで抽出し、乾燥(MgSO4)させ濾過して濃縮して139mgの粗生成物を得た。Flashmaster II、5gシリカゲルカートリッジを用いたフラッシュクロマトグラフィーによる精製および溶離剤としてのDCMおよびMeOHの混合物により不純な生成物を得た。1gシリカゲルカートリッジを用いて手動フラッシュクロマトグラフィーおよび溶離剤としてのヘキサンおよびEtOAcの混合物による再精製により白色の固形物の5−クロロ−6−(ヒドロキシメチル)−3−ピリジンカルボアルデヒド(11.3mg、10%)を得た。
1H−NMR(δ, ppm, CDCl3): 10.12 (s, 1H), 8.95 (s, 1H), 8.17 (s, 1H), 4.90 (s, 2H),,[ES MS] m/z 172 (MH+).
(a)5−[ビス(メチルオキシ)メチル]−3−ブロモ−2−メチルピリジン
MeOH(15ml)中の5−ブロモ―6−メチル−3−ピリジンカルボアルデヒドの溶液を封入する密封した管内にオルトぎ酸トリメチル(合成についてはPB62797 Intermediate 69を参照)(1.045ml、9.55mmol)およびHCl(1,4−ジオキサン中の4M溶液、0.573ml、2.292mmol)を添加した。得られた混合物を、70℃で2時間半撹拌した。溶液を真空下で濃縮して、残渣を飽和NaHCO3およびEtOAcで希釈した。有機相を抽出し、無水Na2SO4で乾燥させて減圧下で濃縮してペールオイルを得た。粗生成物を5gMerckシリカゲルカートリッジを用いたフラッシュクロマトグラフィーおよび溶離剤としてのEtOAc/ヘキサン1/9で精製して、次のステップに使用するのに十分純粋な黄色のオイルの5−[ビス(メチルオキシ)メチル]−3−ブロモ−2−メチルピリジン(129.5mg、52%)を得た。
1H−NMR (δ, ppm, CDCl3): 8.48 (s, 1H), 7.92 (s, 1H), 5.42 (s, 1H), 3.33 (s, 6H), 2.68 (s, 3H). [ES MS] m/z 246 (MH+).
DCM(5ml)中の5−[ビス(メチルオキシ)メチル]−3−ブロモ−2−メチルピリジン(129.5mg、0.526mmol)およびNaHCO3(133mg、1.579mmol)の懸濁液にm−CPBA(242mg、1.052mmol)を添加した。混合物を室温で一晩撹拌した。得られた白色の懸濁液にDCMおよび1N NaOHを添加した。有機相を二回抽出し、飽和NaClで洗浄し、無水MgSO4で乾燥させ濃縮して、次のステップに使用するのに十分純粋な黄色のオイルの5−[ビス(メチルオキシ)メチル]―3−クロロ―2−メチルピリジン1−酸化物(118mg、81%)を得た。1H−NMR (δ, ppm, CDCl3): 8.42 (s, 1H), 7.62 (s, 1H), 5.37 (s, 1H), 3.33 (s, 6H), 2.73 (s, 3H). [ES MS] m/z 262 (MH+).
トリフルオロ酢酸無水物(0.191mL、1.353mmol)をEtOAc(3mL)中の5−[ビス(メチルオキシ)メチル]−3−ブロモ−2−メチルピリジン1−酸化物(118.2mg、0.451mmol)の溶液に0℃で添加し、混合物を密封した管内で77℃で6時間、および室温で一晩加熱した。メタノール(0.262mL,6.47mmol)を添加し、混合物を室温で撹拌して、20分間撹拌した後、DCMおよび10% Na2CO3溶液を添加した。抽出、乾燥(Na2SO4)、および濾過により、次のステップに使用するのに十分純粋な茶色のオイルの{5−[ビス(メチルオキシ)メチル]―3−ブロモ―2−ピリジニル}メタノール(98mg、83%)を得た。
1H−NMR (δ, ppm, CDCl3): 8.57 (s, 1H), 7.97 (s, 1H), 5.48 (s, 1H), 4.75 (s, 2H), 3.33 (s, 6H). [ES MS] m/z 262 (MH+).
DCM(5mL)中の{5−[ビス(メチルオキシ)メチル]―3−ブロモ―2−ピリジニル}メタノール(98mg、0.384mmol)および1N HCl(3.26mL、3.26mmol)の混合物を一晩撹拌した。DCMおよび1M NaOH溶液を添加した。抽出、乾燥(Na2SO4)、および濾過により、次のステップに使用するのに十分純粋な茶色のオイルの5−ブロモ−6−(ヒドロキシメチル)−3−ピリジンカルボアルデヒド(70mg、87%)を得た。
1H−NMR (δ, ppm, CDCl3): 8.57 (s, 1H), 7.97 (s, 1H), 5.48 (s, 1H), 4.75 (s, 2H), 3.33 (s, 6H). [ES MS] m/z 215(MH+).
実施例1
1−{2−[4−({[5−クロロ−6−(ヒドロキシメチル)−3−ピリジニル]メチル}アミノ)−1−ピペリジニル]エチル}−7―フルオロ−1、5−ナフチリジン―2(1H)−オン
1H−NMR (δ, ppm, CDCl3): 8.42 (bs, 2H); 7.89 (d, 1H); 7.74 (s,1H); 7.55 (d, 1H); 6.86 (d, 1H); 4.78 (s, 2H); 4.33 (t, 2H); 3.85 (s, 2H); 2.97 (d, 2H); 2.66 (t, 2H); 2.56−2.52 (m, 1H); 2.21 (t, 2H); 1.92 (d, 2H); 1.47−1.40 (m, 2H). [ES MS] m/z 446 (MH+).
1−{2−[4−({[5−クロロ−6−(ヒドロキシメチル)−3−ピリジニル]メチル}アミノ)−1−ピペリジニル]エチル}−7―フルオロ−1、5−ナフチリジン―2(1H)−オン塩酸塩
1H−NMR (δ, ppm, DMSO−d6): 9.06 (bs, 1H); 8.62−8.57 (m, 2H); 8.14 (s,1H); 8.06 (d, 1H); 7.96 (d, 1H); 6.84 (d, 1H); 5.31 (t, 1H); 4.64 (d, 2H); 4.36 (bs, 2H); 4.17 (bs, 2H); 3.08−2.97 (m, 3H); 2.60 (bs, 4H); 2.66 (t, 2H); 2.56−2.52 (m, 1H); 2.21 (t, 2H); 1.92 (d, 2H); 1.47−1.40 (m, 2H). [ES MS] m/z 446 (MH+).
1−{2−[(3R,4S)−4−({[5−クロロ―6−(ヒドロキシメチル)−3−ピリジニル]メチル}アミノ)−3−ヒドロキシ―1−ピペリジニル]エチル}―7−フルオロ―1、5−ナフチリジン―2(1H)−オン
1H−NMR (δ, ppm, CDCl3): 8.41−8.39 (m, 2H); 7.88 (d, 1H); 7.81 (s, 1H); 7.60 (bd,1H); 6.82 (d, 1H); 4.73 (s, 2H); 4.49−4.39 (m, 1H); 4.24−4.17 (m, 1H); 3.94−3.85 (m, 2H); 3.37−3.33 (m, 1H); 3.15 (bd, 1H); 2.86 (bd, 1H); 2.68−2.65 (m, 3H); 2.36−2.21 (m, 2H); 1.79−1.65 (m, 2H). [ES MS] m/z 462 (MH+).
1−{2−[(3R,4S)−4−({[5−クロロ―6−(ヒドロキシメチル)−3−ピリジニル]メチル}アミノ)−3−ヒドロキシ―1−ピペリジニル]エチル}―7−フルオロ―1、5−ナフチリジン―2(1H)−オン塩酸塩
1H−NMR (δ, ppm, CD3OD): 8.55−8.50 (m, 2H); 8.03−7.98 (m, 3H); 6.88 (d, 1H); 4.93−4.80 (m, 3H); 4.58−4.35 (m, 3H); 4.17−4.05 (m, 3H); 3.24−3.21 (m, 1H); 3.09−2.99 (m, 2H); 2.46−2.30 (m, 2H); 1.93−1.84 (m, 2H). [ES MS] m/z 462 (MH+).
1−{2−[4−({[5−クロロ−6−(ヒドロキシメチル)−3−ピリジニル]メチル}アミノ)−1−ピペリジニル]エチル}−7−(メチルオキシ)−1、5−ナフチリジン―2(1H)−オン
1H−NMR (δ, ppm, CDCl3): 8,41(s, 1H); 8,28(s,1H); 7,83(d,1H); 7,73(s,1H);7.22(s,1H); 6,75(d,1H);4,78(s,2H);4,47−4,29(m,2H);3,98(s,3H);3,85(s,2H);3,06−2,93(m,2H);2,72−2,61(m,2H);2,59−2,48(m,1H);2,29−2,13(m,2H);1,98−1,85(m,2H);1,59−1,37(m,2H). [ES MS] m/z 457 (MHδ).
1−{2−[4−({[5−ブロモ−6−(ヒドロキシメチル)−3−ピリジニル]メチル}アミノ)−1−ピペリジニル]エチル}−7―フルオロ−1、5−ナフチリジン―2(1H)−オン
1H−NMR (δ, ppm, CDCl3): 8.42 (d, 2H); 7.90−7.86 (m, 2H); 7.64 (d,1H); 6.83 (d, 1H); 4.70 (s, 2H); 4.34 (t, 2H); 3.81 (s, 2H); 3.00 (bd, 2H); 2.65 (t, 2H); 2.55 (bs, 1H); 2.24 (bd, 2H); 1.95−1.84 (m, 2H); 1.49−1.43 (m, 2H). [ES MS] m/z 490 (MH+).
1−{2−[(3R,4S)−4−({[5−クロロ―6−(ヒドロキシメチル)−3−ピリジニル]メチル}アミノ)−3−ヒドロキシ―1−ピペリジニル]エチル}―7−(メチルオキシ)−1、5−ナフチリジン―2(1H)−オン
1H−NMR (δ, ppm, CDCl3): 8.44 (s, 1H); 8.30 (s, 1H); 7.86 (d, 1H); 7.78 (s, 1H); 7.15 (s, 1H); 6.75 (d, 1H); 4.77 (s, 2H); 4.56−4.51 (m, 1H); 4.28 (bs, 1H); 4.00 (s, 3H); 3.96−3.82 (m, 3H); 3.22 (bd, 1H); 2.92 (bd, 1H); 2.77−2.74 (m, 2H); 2.53 (bd, 1H); 2.36 (bd, 1H); 2.27 (bs, 1H); 1.78−1.67 (m, 2H). [ES MS] m/z 474 (MH+).
1−{2−[(3R,4S)−4−({[5−クロロ―6−(ヒドロキシメチル)−3−ピリジニル]メチル}アミノ)−3−ヒドロキシ―1−ピペリジニル]エチル}―7−(メチルオキシ)−1、5−ナフチリジン―2(1H)−オン塩酸塩
1H−NMR (δ, ppm, DMSO−d6): 9.04 (bs, 1H); 8.61 (bs, 1H); 8.31 (bs, 1H); 8.13 (bs, 1H); 7.89 (d, 1H); 7.45 (bs, 1H); 6.68 (d, 1H); 5.30 (bs, 1H); 5.21 (bs, 1H); 4.64 (d, 2H); 4.42 (bs, 2H); 4.17 (bs, 2H); 4.00 (bs, 4H); 3.04 (bs, 3H); 2.66 (bs, 1H); 2.32 (bs, 2H); 1.82 (m, 2H). [ES MS] m/z 474 (MH+).
結核菌H37Rv阻害アッセイ
各検査された化合物についての最小阻止濃度(MIC)の測定を96ウエル平底ポリスチレンマイクロタイタープレートで実施した。ニートのDMSOの2倍薬物希釈を400μMから開始し10回実施した。5μlのこれらの薬剤溶液を95μlのMiddlebrook 7H9培地に添加した。(プレート・レイアウトのA−H行、1−10列)。イソニアジドを陽性コントロールとして用いて、160μgml−1から開始するイソニアジドの8つの2倍希釈を調製し、このコントロール曲線の5μlを95μlの Middlebrook 7H9培地(Difco catalogue ref. 271310)に添加した。(列11、行A−H)。ニートのDMSO5μlを列12(増殖およびブランクコントロール)に添加した。
実施例の1から6までを結核菌H37Rv阻害アッセイで試験した。全ての実施例においてMIC値は0.3μg/mlまたはこれ未満を示した。
Claims (21)
- 式(I)の化合物または薬学的に許容可能なそれらの塩:
[式(I)中、
R1は、水素、ハロ、またはC1−3アルコキシを表し、
R2は、水素またはヒドロキシを表し、
Arは、フェニル、ピリジニル、ピリダジニル、ピリミジニル、ピラジニル、チアゾリル、フラニル、イミダゾリルおよびチオフェニルから選択される群を表し、ここで、Arは、第1の置換基R3で置換され、R3は、C1−5ヒドロキシアルキルを表し、Arは、ハロ、CF3、C1−3アルキル、ニトロ、およびC1−3アルコキシから選択される第2の置換基R4により置換されていてもよく、且つ、
R2が水素の場合、R5は水素またはC1−3アルキルであり、R2がヒドロキシルの場合、R5は水素である]。 - Arが、フェニル、ピリダジニル、ピリミジニル、ピラジニル、チアゾリル、フラニルおよびチオフェニルから選択される群を表す、請求項1に記載の式(I)の化合物または薬学的に許容可能なそれらの塩。
- Arが、ピリジニルである、請求項1に記載の式(I)の化合物または薬学的に許容可能なそれらの塩。
- Arが、3−ピリジニル置換基であり、かつ、前記C1−5ヒドロキシアルキル置換基R3が、前記環の窒素に対して6位にある、請求項3に記載の式(I)の化合物または薬学的に許容可能なそれらの塩。
- 前記C1−5ヒドロキシアルキル置換基R3が、ヒドロキシメチルである、請求項1〜4のいずれか一項に記載の式(I)の化合物または薬学的に許容可能なそれらの塩。
- 前記置換基R4が存在し、かつ、ハロである、請求項1〜5のいずれか一項に記載の式(I)の化合物または薬学的に許容可能なそれらの塩。
- R4が存在し、かつ、クロロである、請求項6に記載の式(I)の化合物または薬学的に許容可能なそれらの塩。
- Arが、5−クロロ―6−(ヒドロキシメチル)−3−ピリジニルである、請求項5、6、または7に記載の式(I)の化合物または薬学的に許容可能なそれらの塩。
- 1−{2−[4−({[5−クロロ−6−(ヒドロキシメチル)−3−ピリジニル]メチル}アミノ)−1−ピペリジニル]エチル}−7―フルオロ−1、5−ナフチリジン―2(1H)−オン、
1−{2−[4−({[5−クロロ−6−(ヒドロキシメチル)−3−ピリジニル]メチル}アミノ)−1−ピペリジニル]エチル}−7―フルオロ−1、5−ナフチリジン―2(1H)−オン塩酸塩、
1−{2−[(3R,4S)−4−({[5−クロロ―6−(ヒドロキシメチル)−3−ピリジニル]メチル}アミノ)−3−ヒドロキシ―1−ピペリジニル]エチル}―7−フルオロ―1、5−ナフチリジン―2(1H)−オン、
1−{2−[(3R,4S)−4−({[5−クロロ―6−(ヒドロキシメチル)−3−ピリジニル]メチル}アミノ)−3−ヒドロキシ―1−ピペリジニル]エチル}―7−フルオロ―1、5−ナフチリジン―2(1H)−オン塩酸塩、
1−{2−[4−({[5−クロロ−6−(ヒドロキシメチル)−3−ピリジニル]メチル}アミノ)−1−ピペリジニル]エチル}−7−(メチルオキシ)−1、5−ナフチリジン―2(1H)−オン、
1−{2−[4−({[5−ブロモ−6−(ヒドロキシメチル)−3−ピリジニル]メチル}アミノ)−1−ピペリジニル]エチル}−7―フルオロ−1、5−ナフチリジン―2(1H)−オン、
1−{2−[(3R,4S)−4−({[5−クロロ―6−(ヒドロキシメチル)−3−ピリジニル]メチル}アミノ)−3−ヒドロキシ―1−ピペリジニル]エチル}―7−(メチルオキシ)−1、5−ナフチリジン―2(1H)−オン、
および、
1−{2−[(3R,4S)−4−({[5−クロロ―6−(ヒドロキシメチル)−3−ピリジニル]メチル}アミノ)−3−ヒドロキシ―1−ピペリジニル]エチル}―7−(メチルオキシ)−1、5−ナフチリジン―2(1H)−オン塩酸塩
から選択される、請求項1に記載の式(I)の化合物または薬学的に許容可能なそれらの塩。 - a)請求項1に記載の式(I)の化合物または薬学的に許容可能なそれらの塩と、b)1またはそれ以上の薬学的に許容可能な担体、賦形剤または希釈剤とを含んでなる、医薬組成物。
- 治療に使用するための、請求項1に記載の式(I)の化合物または薬学的に許容可能なそれらの塩。
- 哺乳類における結核の治療に使用するための、請求項1に記載の式(I)の化合物または薬学的に許容可能なそれらの塩。
- 哺乳類における細菌感染の治療に使用するための、請求項1に記載の式(I)の化合物または薬学的に許容可能なそれらの塩。
- 哺乳類における結核の治療のための薬剤の製造における、請求項1に記載の式(I)の化合物または薬学的に許容可能なそれらの塩の使用。
- 哺乳類における細菌感染の治療のための薬剤の製造における、請求項1に記載の式(I)の化合物または薬学的に許容可能なそれらの塩の使用。
- 哺乳類における結核の治療に使用するための、請求項1に記載の式(I)の化合物または薬学的に許容可能なそれらの塩、および、1またはそれ以上の薬学的に許容可能な担体、賦形剤または希釈剤を含んでなる、医薬組成物。
- 哺乳類における細菌感染の治療に使用するための、請求項1に記載の式(I)の化合物または薬学的に許容可能な塩、および、1またはそれ以上の薬学的に許容可能な担体、賦形剤または希釈剤を含んでなる、医薬組成物。
- a)請求項1に記載の式(I)の化合物または薬学的に許容可能なそれらの塩と、b)1またはそれ以上の追加の治療薬とを含んでなる、組み合わせ医薬。
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