JP5352460B2 - ルミネッセント大環状ランタニド錯体 - Google Patents
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Description
本発明は、National Institutes of HealthによりThe Regents of the University of California Chart Str.へ授与された認可番号F32 EB04239−01、多方面の提供者によりThe Regents of the University of Californiaへ授与された56156−10673−44−CCKNR、NIH SBIRによりLumiphore/Biostrideへ授与された認可番号 R43 AI063531−01、およびDOE(Lawrence Berkeley National Laboratory)によりThe Regents of the University of Californiaへ授与された認可番号DE−AC03−7600098のもとで政府支援により実施されたものである。政府は本発明において一定の権利を有するものである。
本出願は、2006年8月15日出願の米国仮出願番号第60/822,482号(Attorney Docket No.061818−02−5028PR)に関する優先権を請求するものである。これを参照により本明細書に組み込む。
ただし、上記化合物は少なくとも1つの官能性部分で共有結合により修飾されている。
本明細書で用いる「検体」は、そのために診断学的検査が実施される、生体高分子もしくは小分子生体活性材料などの任意の対象化合物または分子を意味する。検体は、例えばタンパク質、ペプチド、炭水化物、多糖、糖タンパク質、ホルモン、受容体、抗原、抗体、ウイルス、基質、代謝産物、遷移状態の類似体、共同因子(cofactor)、阻害物質、薬物、染料、栄養素、成長因子、脂質等であってよいが、これらに限定されない。
本発明は、金属イオンと新規な部類の大環状リガンドとの間で形成される金属キレートをベースとしたルミネッセントプローブの部類を提供する。具体的には、本発明はルミネッセントランタニド錯体を提供する。より具体的には、本発明はルミネッセントテルビウムおよびユウロピウム錯体を提供する。これらの錯体は、ミセルまたはフルオリドによるなどの二次的活性化剤を必要とせずに、水性媒体中で高い安定性、ならびにランタニドイオンルミネッセンスの高い量子収量を示す。好ましいリガンドは、その大環状構造内にヒドロキシ−フタルアミド部分を組み込んでおり、そのリガンドは驚くほど高い動力学的安定性と、予想外に少ない抗体やタンパク質などの様々な異なるポリペプチドへの非特異的結合を特徴とする。これらの特徴によって、そのリガンドは、既知の開かれた構造のリガンドと区別される。
第1の態様では、本発明は、以下のものから選択されるメンバーの構造を有する化合物を提供する。
1つの例示的な実施形態では、本発明の化合物(例えば、リガンド3)は官能性部分を用いて誘導体化される。官能性部分は、例えば、リンカー単位の1つまたはビルディングブロックの1つと結合することができる。2つ以上の官能部分を用いる場合、それぞれは、利用できる結合部位のどれとも結合することができる。
一実施形態では、官能性部分は反応性官能基Xを含み、これは、錯化剤を他の分子と共有結合により結合させるのに用いることができる。他の例示的実施形態では、他の分子は生体分子である。他の例示的実施形態では、他の分子は小分子リガンド、ペプチド、タンパク質、酵素、抗体、抗原、核酸、炭水化物、脂質および薬理学的に活性な分子である。あるいは、反応性官能基は、リガンドをいかなる種類のナノ粒子に結合させるのにも使用することができる。
一実施形態では、反応性官能基は、第一または第二アミン、ヒドラジン、ヒドラジドおよびスルホニルヒドラジドなどのアミンから選択されるメンバーである。アミンは、例えばアシル化、アルキル化または酸化されていてよい。アミノ反応基の有用な非限定的例には、N−ヒドロキシスクシンイミド(NHS)エステル、スルホ−NHSエステル、イミドエステル、イソシアネート、イソチオシアネート、アシルハライド、アリールアジド、p−ニトロフェニルエステル、アルデヒド、スルホニルクロリドおよびカルボキシル基が含まれる。
他の実施形態では、反応性官能基はスルフヒドリル基(ジスルフィドへ転換させることができる)およびスルフヒドリル反応基から選択されるメンバーである。スルフヒドリル反応基の有用な非限定的例には、マレイミド、アルキルハライド、アシルハライド(ブロモアセトアミドまたはクロロアセトアミドを含む)、ピリジルジスルフィドおよびチオフタルイミドが含まれる。
他の反応性官能基の例には、
(a)カルボキシル基、ならびに、(これらに限定されないが)N−ヒドロキシベンズトリアゾールエステル、酸ハライド、アシルイミダゾール、チオエステル、p−ニトロフェニルエステル、アルキル、アルケニル、アルキニルおよび芳香族エステルを含む様々なその誘導体、
(b)エステル、エーテル、アルデヒド等へ転換できるヒドロキシル基、
(c)ハロアルキル基(そのハライドを、例えばアミン、カルボキシレートアニオン、チオールアニオン、カルバニオンまたはアルコキシドイオンなどの求核基で置き換え、それによってハロゲン原子の部位での新規な基の共有結合をもたらすことができる)、
(d)例えばマレイミド基などのディールアルダー反応に参加することができるジエノフィル基;
(e)例えばイミン、ヒドラゾン、セミカルバゾンもしくはオキシムなどのカルボニル誘導体の生成によって、あるいはグリニャール付加もしくはアルキルリチウム付加のような機序によって後続の誘導体化が可能であるアルデヒドまたはケトン基、
(f)例えば付加環化、アシル化、マイケル付加等を施すことができるアルケン、
(g)例えばアミンやヒドロキシル基と反応できるエポキシド、
(h)核酸合成において有用なホスホルアミダイトおよび他の標準的な官能基、ならびに
(i)官能化リガンドと、分子的実体または表面との間で共有結合を形成するのに有用な任意の他の官能基
が含まれる。
部位特異的反応性部分の使用に加えて、本発明は、本明細書で記載の化合物を標的部分と結合させる非特異的反応性官能基の使用を考慮する。非特異基には、例えば光活性化可能な基が含まれる。光活性化可能な基は、暗所で不活であり、光の存在下で反応性種に転換されることが理想的である。一実施形態では、光活性化可能な基は、アジドを加熱または光分解して得られるナイトレンの前駆体から選択される。電子が不足したナイトレンは著しく反応性であり、N−H、O−H、C−HおよびC=Cを含む様々な化学結合と反応することができる。3つのタイプのアジド(アリール、アルキルおよびアシル誘導体)が使用できるが、今のところアリールアジドが好ましい。光分解の際のアリールアジドの反応性は、C−H結合とより、N−HおよびO−Hとの反応性がより良好である。電子不足アリールナイトレンは急速に開環してデヒドロアゼピンを生成する。これは、C−H挿入生成物とより、求核物質と反応する傾向がある。アリールアジドの反応性は、環中にニトロまたはヒドロキシル基などの電子吸収置換基を存在させることよって増大させることができる。そのような置換基は、アリールアジドの吸収最大をより長い波長の方へ押しやる。非置換アリールアジドは260〜280nmの範囲に吸収最大を有するが、ヒドロキシおよびニトロアリールアジドは305nmを超えたところで相当な光を吸収する。したがって、非置換アリールアジドより、親和性成分のためにより有害性の小さい光分解条件を用いることを可能にするので、ヒドロキシおよびニトロアリールアジドが最も好ましい。
例示的実施形態では、標的部分は生体分子である。例示的な標的部分には、小分子リガンド、脂質、直鎖および環状ペプチド、ポリペプチド(例えば、EPO、インスリン等)ならびに酵素および受容体などのタンパク質が含まれる。他の標的部分には、抗体および抗体断片(例えば、小分子や受容体リガンドを認識するために生成されたもの)、抗原、核酸(例えば、RNAおよびcDNA)、炭水化物部分(例えば、多糖類)ならびに毒素、調合薬および乱用薬物などの薬理学的に活性な分子(例えば、ステロイド)が含まれる。他の標的部分は、固体支持体および高分子表面(例えば、高分子ビーズおよびプラスチックウェルプレートなどのプラスチック試料リザーバー)、シート、繊維ならびに膜から選択される。標的部分は粒子(例えば、ナノ粒子)および薬物送達媒体も含む。
1つの好ましい実施形態では、官能性部分のリンカーL11は、合成の際の副反応(例えば、分子内ペプチド結合の形成などの分子内反応)を回避して本発明の化合物または錯体の標的部分への結合を可能にし、標的部分による目的とする機能の遂行を可能にするのに十分長いものである。有用なリンカーには約2〜約50個の直鎖状原子、好ましくは約4〜約20個の直鎖状原子を有するものが含まれる。
本発明の例示的化合物には以下のものが含まれる。
本発明の化合物および錯体は、一般によく知られている合成方法との適切な組合せによって合成される。本発明の化合物を合成するのに有用な技術は、容易に明らかなものと当業者が利用できるものとの両方である。本発明の化合物を構築するのに用いることができる様々な方法のいくつかを示すために、以下の考察を提供するが、本発明の化合物を調製するのに有用な反応の範囲または反応の順番を限定しようとするものではない。
官能基を含む例示的なキャップ分子の合成法の概略を以下に示す。化合物13はスキーム1に示す合成経路にしたがって調製することができる。次いで、実施例4、5、6および7に概略を示す合成アプローチを用いて、化合物13を化合物9に転換させることができる。
スキーム3は、本発明の化合物を合成するための例示的方法の概要を示す。
スキーム4は、化合物11を合成するための例示的方法の概要を示す。
スキーム10は、(dd)位置に結合する官能性部分を有する化合物を合成するための例示的方法の概要を示す。このスキームは、(cc)と(dd)の両方の位置に官能性部分を有する錯化剤の合成を示しているが、本明細書で説明する合成方法の1つ以上を用いて、(dd)位置に単一官能性部分(または別の位置に他の官能性部分)を有する錯化剤を合成することができる。
スキーム11は、(ee)位置に結合する官能性部分を有する化合物を合成するための例示的方法の概要を示す。このスキームは、(cc)と(ee)の両方の位置に官能性部分を有する錯化剤の合成を示しているが、本明細書で説明する合成方法の1つ以上を用いて、(ee)位置に単一官能性部分(または別の位置に他の官能性部分)を有する錯化剤を合成することができる。
スキーム12は、フタラミジル部分と結合したキャップ分子を合成するための例示的方法の概要を示す。
第2のキャップ部分は、スキーム13による本明細書に記載の分子と結合させることができる。
様々なリンカー部分を本発明の化合物に結合させることができる。リンカー部分の選択は、分子がそれに結合することになる部分によって分かることになる。例えば、以下のスキームはマレイミド部分を有するが、これは、システインなどのチオール部分への結合に有用である。マレイミド部分の本発明の化合物への結合の状態をスキーム18に示す。
第2の態様では、本発明は、少なくとも1つの金属イオンと本発明の化合物との間で形成される錯体を提供する。1つの例示的な実施形態では、金属はランタニドの群から選択されるメンバーである。ランタニドの例には、ネオジム(Nd)、サマリウム(Sm)、ユウロピウム(Eu)、テルビウム(Tb)、ジスプロシウム(Dy)およびイッテルビウム(Yb)が含まれる。その中でユウロピウムおよびテルビウムが好ましい。エルビウム(Er)、ランタン(La)、ガドリニウム(Gd)およびルテチウム(Lu)などの他のランタニドイオンが有用であるが、これらはそれほど好ましいものではない。他の好ましい実施形態では、本発明の錯体はルミネッセントである。
本発明のルミネッセント化合物を、広範囲のエネルギー供与体および受容体分子とともに使用して、ルミネッセンスエネルギー移動ペア、例えば、蛍光エネルギー移動(FET)プローブを構成することができる。本発明の錯体と共に用いるのに有用なフルオロフォアは当業者に周知である。例えばCardulloら、Proc.Natl Acad.Sci.USA 85:8790〜8794頁(1988年);Dexter,D.L.,J.of Chemical Physics 21:836〜850頁(1953年);Hochstrasserら、Biophysical Chemistry 45:133〜141頁(1992年);Selvin,P.,Methods in Enzymology246:300〜334頁(1995年);Steinberg,I.Ann.Rev.Biochem.,40:83〜114頁(1971年);Stryer,L.Ann.Rev.Biochem.,47:819〜846頁(1978年);Wangら、Tetrahedron Letters 31:6493〜6496頁(1990年);Wangら、Anal.Chem.67:1197〜1203頁(1995年)を参照されたい。
本発明の化合物および錯体は、様々な生物学的アッセイシステムおよび診断用途でのプローブとして有用である。競合アッセイ方式、免疫学的アッセイ、マイクロアレイ、膜結合アッセイおよび酵素活性アッセイなどのアッセイシステムの総説はRaymondらの米国特許第6,864,103号に記載されている。その全体をすべての目的のために参照により本明細書に組み込む。本発明の錯体を含み、かつ各アッセイシステムに適したプローブを選択し、それを作製することは当業者の能力の範囲内である。例示的実施形態では、ルミネッセントプローブ分子を、試料中の検体の有無を検出するために使用する。
本発明の化合物、錯体および方法は、任意の試料中の任意の検体または検体の部類を検出するのに使用することができる。試料は、例えば生体液(例えば、患者の血液)または組織を含むことができる。他の試料は、例えば、合成分子または植物もしくは微生物からの抽出物の溶液(例えば、薬物スクリーニング作業のための)を含むことができる。検体の例は、医薬品、乱用薬物、合成小分子、生物学的マーカー化合物、ホルモン、病原菌、毒素、抗体、タンパク質、脂質、有機および無機のイオン、炭水化物などである(検体の他の例については、例えば、Raymondらの米国特許第6,864,103号を参照されたい)。
メタノール(2L)と水(0.5L)の混合液中の化合物E−2(215g、1.19モル)の溶液に、冷却しながら水酸化カリウムペレット(100g、1.5モル)を加えた。混合液を終夜還流させ、次いで乾燥するまで蒸発させた。次いで残留物を水(0.5L)に溶解し、6N HClで酸性化した。2−メトキシ−3−メチル安息香酸が白色結晶として沈殿した。収量189g、95%。1H NMR(500MHz,CDCl3,25℃)δ:2.23(s,3H,CH3)、3.71(s,3H,OCH3)、7.06(t,J=7.5,1H,ArH)、7.36(d,J=7.5,1H,ArH)、7.49(d,J=7.5,1H,ArH)。
(実施例2)
化合物E−5を、報告されている手順(Bianke K.Wagnont and Susan C.Jackels,Inorg.Chem.1989年、28,1923〜1927頁)を若干修正して合成した。
(実施例3)
1H NMR(500MHz,CDCl3,25℃):δ1.34〜1.59(m,6H,Lys CH2)、1.42(s,9H,Boc CH3)、2.29(s,広幅,1H,CH2OH)、3.11(m,2H,CH2)、3.63(m,3H,CH+CH2)、4.60(s,1H,BocNH)、5.08(s,2H,CH3)、5.10(s,1H,CbzNH)、7.32(m,5H,ArH)。13C NMR(500MHz,CDCl3):δ、22.66、28.41、29.89、39.73、52.98、64.82、66.77、79.28、128.09、128.12、128.52、136.47、156.42、156.79。MS(FAB,NBA)C19H30N2O5:[M+H]+367.2。
1H NMR(500MHz,CDCl3,25℃):δ1.32〜1.86(m,6H,Lys CH2)、1.41(s,9H,Boc CH3)、3.10(s,広幅,2H,CH2)、4.27(m,1H,CH)、4.58(s,広幅,1H,BocNH)、5.10(s,2H,CH3)、5.53(d,1H,J=6Hz,CbzNH)、7.31(m,5H,ArH)、9.57(s,1H,アルデヒドH)。MS(FAB,NBA)C19H28N2O5:[M+H]+365.2。
1H NMR(500MHz,CDCl3,25℃):δ2.48(t,2H,J=5.5Hz,CH2)、2.56(s,広幅,4H,CH2)、2.67(t,2H,J=5.5Hz,CH2)、3.23(s,広幅,4H,CH2)、5.06(s,2H,CH2)、5.72(s,2H,CbzNH)、7.04(m,10H,ArH)。13C NMR(500MHz,CDCl3):δ、38.91、39.35、53.82、52.69、66.28、127.78、127.82、136.58、156.70。MS(FAB,NBA)C22H30N4O4:[M+H]+415。
(Pittelkow,ら、Synthesis,2002年、2195)
この化合物は既知のものであるが市販されてはいない。これを文献にある手順にしたがって調製した(Richら、J.Org.Chem.,1978年、43,3624)。凝縮器、メカニカルスターラーおよび添加漏斗を備えた500mLの3ッ口フラスコ中のベンジルアルコール(新規蒸留品、69.2g、0.64モル)、ピリジン(64mL)およびCH2Cl2(115mL)の混合物に、フェニルクロロホーメート(100g、0.64モル)を1時間かけて加えた。反応混合物をさらに3時間撹拌し、H2O(160mL)を加えた。有機相をH2SO4水溶液(2M;150mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥し、ろ過して真空下で濃縮した。粗生成物を真空下、127〜131℃/0.1mmHgで蒸留して所望の化合物を無色油状物として得た。収量:108g(94%)(文献収率:79%)。
1H NMR(500MHz,CDCl3,25℃):δ5.37(s,2H,CH2)、7.18〜7.48(m,10H,ArH)。MS(FAB):m/z=372.1(MH+)。
1H NMR(500MHz,CDCl3,25℃):δ1.17(s,広幅,2H,Lys CH2)、1.24〜1.89(m,4H,Lys CH2)、1.41(s,9H,Boc CH3)、2.53(s,広幅,8H,Tren CH2)、3.03(s,2H,BocNHCH2)、3.14(s,2H,CbzNHCH2)、3.20(s,2H,CbzNHCH2)、3.64(s,広幅,1H,リシンのキラルCH)、4.54(s,1H,BocNH)、5.05(m,6H,CbzCH2)、7.27(m,15H,ArH)。13C NMR(500MHz,CDCl3):δ、22.80、28.33、29.54、32.52、39.40、39.97、47.41、50.85、53.77、54.34、66.45、78.93、79.27、127.92、128.06、128.35、136.59、156.01、156.68、156.86。MS(FAB,NBA)C41H58N6O8:[M+H]+763.5。
1H NMR(500MHz,CDCl3,25℃):δ1.24〜1.87(m,6H,Lys CH2)、1.42(s,9H,Boc CH3)、2.26(s,広幅,2H,CH2)、2.47(m,広幅,,6H,CH2)、2.58(s,広幅,2H,CH2)、2.93〜3.35(m,広幅,8H,CH2)、5.05(m,8H,CbzCH2)、7.27(m,20H,ArH)。
1H NMR(300MHz,DMSO−d6,25℃):δ1.12〜1.55(m,6H,Lys CH2)、1.34(s,9H,Boc CH3)、2.60(m,2H,CH2)、2.43(s,8H,CH2)、2.85(m,2H,CH2)、3.01(s,6H,CH2)、3.43(s,1H,CH)、4.98(s,8H,CbzCH2)、6.71(t,1H,J=8Hz,アミドH)、6.92(d,1H,J=8Hz,アミドH)、7.01(t,1H,J=8Hz,アミドH)、7.07(t,2H,J=8Hz,アミドH)、7.31(s,広幅,20H,ArH)。13C NMR(500MHz,CDCl3):δ、22.78、28.37、29.65、31.15、32.96、38.54、38.67、40.09、49.36、52.09、52.31、59.35、66.47、69.10、78.94、127.94、127.97、128.02、128.11、128.36、128.38、136.57、136.64、156.01、156.68。MS(FAB,NBA)C51H69N7O10:[M+H]+940.5。
アジリジンまたはエチレンイミンはよく知られている化合物である。これは、酸化銀;水酸化ナトリウムまたは水酸化カリウムなどの強塩基の水溶液を用いて2−ハロエチルアミンヒドロハライドから調製することができる。2−アミノエチル硫酸水素塩を水酸化ナトリウムで処理することによるアジリジンの合成がOrganic Synthesis(Allen,ら、“Organic Synthesis”,V.30,John Wiley and Son,Inc.,New York,N.Y.,1950年、38〜40頁)で推奨されており、これは最も一般的な調製方法である。それが重合する傾向が高いため、この方法の調製収率は低い。37%のアジリジン収率がOrganic Synthesisで報告されているが、これでも良好な収率と思われる。
1H NMR(500MHz,CDCl3,25℃):δ0.56(s,広幅,1H,NH)、1.56(s,4H,CH2)。13C NMR(500MHz,CDCl3):δ、18.03。
1H NMR(500MHz,CDCl3,25℃):δ2.22(s,4H,CH2)、5.14(s,2H,CH2)、7.34(m,5H,ArH)。13C NMR(500MHz,CDCl3,25℃):δ、20.51、65.93、127.3、127.4、128.7、140.9、159 4。
1H NMR(500MHz,CDCl3,25℃):δ1.24〜1.87(m,6H,Lys CH2)、1.42(s,9H,Boc CH3)、2.41〜2.82(m,広幅,10H,CH2)、2.82〜3.23(m,広幅,9H,CH2)、3.29(s,広幅,1H,CH)、5.48(s,1H,BocNH)、8.52(s,3H,カルボネートのNH)。13C NMR(500MHz,CDCl3):δ、22.63、28.39、29.47、31.11、37.00、39.93、49.79、51.99、68.79、78.62、156.19、168.99。MS(FAB,NBA)C51H69N7O10:[M+H]+404.3722。
(実施例4)
1H NMR(500MHz,CDCl3,25℃):δ2.70(s,4H,CH2)、2.76(t,J=6.2Hz,8H,CH2)、3.43(t,J=7.2Hz,8H,CH2)、3.53(q,8H,J=6.0Hz,CH2)、3.85(s,12H,OCH3)、4.64(t,J=7.5,8H,CH2)、7.17(t,J=8.2Hz,4H,ArH)、7.79(t,J=5.4Hz,4H,ArH)、8.63(d,J=7.5,1H,ArH)。13C NMR(500MHz,CDCl3,25℃)δ:29.2、37.9、50.6、53.5、55.7、63.1、124.3、127.2、129.1、132.0、133.9、155.6、164.9、167.3、201.4。元素分析:(実測値):C58H64N10O12S8・H2O(1367.73)の計算値:C,50.93(51.02);H,4.86(4.98):N,10.24(10.01)。
(実施例5)
この懸垂型トリ大員環E−15を高度希釈条件下で合成した。遊離アミン(E−6)(1.2g、3ミリモル)、5mLのトリエチルアミンおよび10mLのイソプロパノールを混合して均一溶液を形成させ、1L丸底フラスコ中の950mLのクロロホルムに溶解させた。他方で、H(2,2)IAMテトラチアゾリド(E−14)(4.05g、3ミリモル)を、別の1L丸底フラスコの950mLのクロロホルムに溶解した。E−6とE−14(約3〜4mM)の溶液を、8リットルのジクロロメタンと2mLのトリエチルアミンを入れた12Lの3ッ口丸型フラスコに、手製の「テフロン(登録商標)管−ガラス毛管型スロー添加装置」を介して同時に加えた。8〜10日間にわたり、各反応物について添加速度を24時間当たり約100〜120mLに調節して、主反応フラスコ中で淡黄色のものが得られた。ポリマー系副生成物を最小限にするために、高度希釈状態に保持することが必要である。反応物がすべて消費された後、反応混合物をさらに8時間撹拌した。TLCにより、反応混合物が複雑な混合物であることが示される。この不斉分子について共存する多くの可能性のある異性体が存在するので、これらの異性体は、TLCプレートで異なったスポットで見える。次いで、反応混合物を、フラッシュシリカ充填物(200g)を通して溶媒を再循環させ、充填物上に残る生成物と副生成物を、1%トリエチルアミンを含むCH2Cl2中の20%イソプロパノールの混合液に洗い込む。精製および分離の工程を簡略化するために、大員環E−15および他の副生成物を含む洗浄用液を塩基性アルミナカラム、続いてフラッシュシリカゲルカラムで処理し、フラッシュシリカカラムの勾配溶出液(CH2Cl2中に3〜7%MeOH)の適切な画分を一緒にし、蒸発させて化合物E−15を25〜30%の収率で得た。HPLCにより粗生成物の純度が約90%であることが確認される。純粋な生成物を得るためには、さらなるカラム精製が必要である。
1H NMR(500MHz,DMSO−d6,25℃):δ1.24〜1.55(m,15H,Boc CH3+Lys CH2)、2.52〜2.95(m,広幅,24H,NCH2)、3.21〜3.62(m,広幅,16H,NHCH2)、3.65〜3.7(m,12H,CH3)、6.78(s,1H,BocNH)、7.01〜7.15(m,8H,ArH)、7.50〜7.62(m,16H,ArH)、8.15〜8.30(m,広幅,8H,アミドH)。13C NMR(500MHz,CDCl3):δ23.12、28.25、28.27、29.76、31.06、37.09、38.36、46.01、50.12、52.68、53.48、62.53、62.73、62.85、78.73、124.84、126.61、133.42、133.82、154.89、155.91、156.01、164.69、165.01、165.28。MS[(+)−FAB,NBA)]C65H89N13O14:m/Z[M+H]+1276.7。
Me4BocLysBH(2,2)IAM(E−15)(0.22g、0.17ミリモル)を、テフロン(登録商標)栓を備えたシュレンク(Schlenk)フラスコ中の20mLのCH2Cl2に溶解した。N2流雰囲気下で、溶液を−10℃に冷却し、続いて1mLのBBr3を注入した。スラリーを5日間撹拌し、続いて過剰のBBr3とCH2Cl2をポンプで抜き出した。残る淡黄色固形物を冷却しながらメタノール(100mL)に溶解した。メタノール溶液を緩やかに還流させ、栓を外して放置して、揮発性ホウ素化合物を6時間放出させた。次いで溶液を乾燥するまで蒸発させた。残留物をメタノール(10mL)中に溶解し、これを水(50mL)に希釈した。混合した溶液を、容積が約10mLに減少するまで沸騰させ、次いで冷却し、白色固体を生成物として得た。これを遠心分離して収集し、40℃で真空乾燥した。収量:150mg(53%)。
1H NMR(500MHz,D2O−NaOD,25℃):δ0.78〜1.25(m,6H,LysCH2)、2.15〜2.30(m,2H,CH2)、2.40〜2.92(m,26H,NCH2)、3.00〜3.45(m,14H,NHCH2)、3.66(s,広幅,1H,CH)、6.08〜6.52(m,4H,ArH)、7.35〜7.90(m,8H,ArH)。MS[(+)−FAB,TG/G)]C56H73N13O12:m/Z 1120.5[MH+]。元素分析:(実測値):C56H73N13O12・5HBr・8 H2O(1668.95)の計算値:C,40.30(40.29);H,5.68(5.68);N,10.91(10.65)。
(実施例6)
化合物E−15(0.25g、0.2ミリモル)をジクロロメタンとトリフルオロ酢酸(10mL)の1:1混合液にとり、この溶液を3時間撹拌させた。蒸発させた後、残留物をメタノールに溶解し、0.1N KOHのメタノール溶液で溶液のpHを11に調節した。この塩基性溶液を塩基性アルミナ充填物にロードし、ジクロロメタン中の10%メタノールで溶出させて、TFA塩と過剰の塩基を除去した。溶媒を除去した後、脱Bocした大員環E−16を次の工程の反応に直接使用した。
1H NMR(500MHz,DMSO−d6,25℃):δ1.14(t,3H,CH3)、1.20〜1.60(m,6H,CH2)、2.05(m,2H,CH2)、2.26(m,2H,CH2)、2.52〜2.80(m,広幅,23H,NCH+NCH2)、3.21〜3.62(m,広幅,16H,NHCH2)、3.65〜3.7(m,12H,CH3)、4.03(m,2H,CH2)、5.73(s,1H,アミドH)、7.01〜7.15(m,4H,ArH)、7.32(d,1H,アミドH)、7.50〜7.65(m,8H,ArH)、7.75(m,1H,アミドH)、7.95(m,1H,アミドH)、8.10〜8.20(m,4H,アミドH)、8.26(m,1H,アミドH)。13C NMR(500MHz,CDCl3):δ13.7、20.5、22.6、24.8、28.5、32.6、32.9、34.7、37.3、38.4、45.5、50.8、52.8、53.1、59.8、62.0、62.3、62.6、124.0、127.5、133.5、155.0、155.1、164.9、165.4、172.0、172.7。MS[(+)−FAB,NBA]:C67H91N13O15:m/Z 1318.8[MH+]。
化合物4について記載したように、化合物18(0.4g、0.3ミリモル)をBBr3で脱保護し、脱保護した化合物5aを遠心分離により集め、40℃で真空乾燥して生成物をベージュ色の固体として得た。収量:150mg(53%)。
1H NMR(500MHz,D2O−NaOD,25℃):δ0.78〜2.25(m,10H,CH2)、2.40〜2.92(m,26H,NCH2)、3.00〜3.85(m,17H,NHCH2)、6.08〜6.52(m,4H,ArH)、7.35〜7.90(m,8H,ArH)。元素分析:(実測値):C61H79N13O15・3HBr・5.5H2O(1576,184)の計算値:C,46.48(46.44);H,5.96(5.98);N,11.55(11.39)。MS[(+)−FAB,TG/G]]C61H↓79N13O15:m/Z 1234.5[MH+]。
無水DMF(2mL)中のグルタルLysBH(2,2)IAM(16mg、0.01ミリモル)の溶液に、過剰のNHS(3当量)と触媒量のDMAP(2mg)を加えた。溶液を30分間撹拌し、DCC(2当量)を加えた。反応混合物を4時間撹拌した後、もう1当量のDCCを加え、溶液を窒素雰囲気下で終夜撹拌した。混合物をシクロヘキサンと2−プロパノール(5mL)の1:1混合液に分割し、30分間撹拌し、次いで遠心分離にかけて沈殿物を母液から分離した。強く撹拌しながら、沈殿物を5mLの2−プロパノールに懸濁させて低分子量の不純物を洗い落とし、次いで遠心分離にかけた。この洗浄−遠心分離の処理工程を3回繰り返し、沈殿物を真空下で乾燥させた。FAB(+)質量スペクトルは、活性化されていない分子イオンピーク(1234)は示さず、MH+イオン(1331)を示した。この化合物のさらなる特性評価の試みはしなかった。これらの活性化化合物の新規な評価方法は開発中である。
以下のスキーム23により、化合物4とジグリコール無水物を結合させて、化合物5を合成した。
これまで、2などのある種のリガンドはタンパク質と非特異的相互作用を示し、Tween−20などの少量の非イオン性合成洗剤を加えると、Tween−20を含まない溶液と比較して、Tb−2のルミネッセンスを短時間安定化させるようであることが確認されていた。しかし、合成洗剤が存在することは多くの用途において望ましくない。
多く残留するルミネッセンスによって目視されることから、相当な量のリガンド2が、第2さらには第3の連続したゲルろ過スピンカラムのゲルベッドの頂部に残っていた。他方、活性化4についての残留ルミネッセンス(スルホNHSとNHSの両方)はバックグラウンドに近接していた。したがって、接合ストレプトアビジンからの非接合4の分離は効率的であり、ストレプトアビジンへのこれらのリガンドの非特異的結合は最少であることが分かった。
(実施例9)
酸またはEDTAの存在下におけるTb錯体の安定性
大環状錯体の安定性を評価するために、1%酢酸および5mMEDTA溶液などのかなり厳しい条件下に錯体を曝した。10%酢酸はゲルを固定し染色するのにしばしば用いられるが、EDTAは一般に用いられる保存剤であり、これは1mMの濃度でしばしば使用される。
検討により、Tb−3錯体(μM濃度で)は1%AcOH中で1時間以上持続する強いTb発光を示すが、他方Tb−1錯体は、1%AcOHで希釈するとその特徴的なルミネッセンスを直ちに失うことが分かった。同様に、μM濃度でのTb−3のルミネッセンスは5mM EDTA中で1時間以上安定であるが、Tb−1のルミネッセンスは5分間以内で消失する。大過剰EDTAの存在下で、リガンド3がTb3+イオンを放出しようとしない傾向により、リガンド1と比べて、中性pHで(かなり酸性の条件に加えて)非常に高い動力学的安定性を示す。錯体が様々な分子や材料に曝される錯体水溶液中において比較的薄い濃度(<1×10−8M)で、イソフタルアミド錯体の使用を必要とする用途を開発する場合、高い錯体安定性が非常に重要である。高度希釈での高い安定性がないと再現性が劣り、定量的結果に対する信頼性が低下する。
大環状リガンドの安定性をさらに検討するために、異なるTb−錯体の安定性を、1%酢酸および1mM EDTAを含む様々な媒体を用いて判定した。化合物1、3および5a(1uM)のTb錯体のストック溶液を、TBST、50mMトリス、150mM NaCl、0.05%Tween−80、pH7.6で調製した。次いで各ストック溶液を、ポリプロピレン微小遠心管中の異なる試験溶液に200×希釈して5nM Tb−錯体の最終濃度にした。各試験溶液は0.05%Tween−80も含有した。試験溶液を室温でインキュベートした。指定された時間点で試料をとり、3通りで評価し、ルミネッセンスを標準的時間分解ルミネッセンス設定、340nmおよび490励起ならびにエミッションフィルターを用いてそれぞれ記録した。結果を図1(化合物1)、図2(化合物3)および図3(化合物5a)にまとめて示す。結果は、大環状リガンド(3および5a)から誘導されたテルビウム錯体について、比較できる「非束縛型」リガンド(1)と比べて、安定性が著しく増大していることを示している。この結果はさらに、大環状リガンド(3)の置換によって、特定の媒体中における安定性をさらに増大させることができることを実証している。
実施例3で述べたタンパク質接合リガンドをSDS−PAGEにより評価した。2Xの還元性SABまたは非還元性SABと1:1で混合した後、すべての試料を95℃で5分間沸騰させた。緩衝剤を含まないPhastsystemゲル(GE Healthcare)を製造業者の使用説明書にしたがってロードした。
試料を95℃に加熱しSDSに曝露させた後、すべての標識化タンパク質試料について可視Tb3+ルミネッセンスを観測した。これらの結果は、本発明のランタニド錯体が、試験条件下で予想外に安定であることを実証している。時間分解CCDベースの画像システムは、得られた画像での信号対ノイズ差をさらに評価するのに有用のようである。励起光を取り除く遮断フィルタを使用すると画像品質はさらに向上する。
(実施例10)
Claims (28)
- 式Iの構造を有する化合物
[ただし、式中、各ZはOおよびSから独立に選択されるメンバーであり、
L1、L2、L3、L4、L5、L6、L7、L8、L9およびL10は、置換または非置換アルキル、および、置換または非置換ヘテロアルキルから独立に選択される連結基であり、
A1、A2、A3およびA4は以下の一般構造から独立に選択されるメンバーである
(式中、各R1は、Hおよび単一の負電荷から独立に選択されるメンバーであり、
各R5、R6およびR7は、H、置換または非置換アルキル、および、置換または非置換ヘテロアルキルから独立に選択されるメンバーであり、
L 1 、L 2 、L 3 、L 4 、L 5 、L 6 、L 7 、L 8 、L 9 、および、L 10 の少なくとも1つが官能性部分で置換されており、前記官能性部分が以下の構造を有し
(式中、L 11 は、置換または非置換アルキル、置換または非置換ヘテロアルキル、置換または非置換ヘテロシクロアルキル、置換または非置換アリールおよび置換または非置換ヘテロアリールから選択されるメンバーであるリンカー部分であり、
Xは、反応性官能基および標的部分から選択されるメンバーであり、
前記反応性官能基が、−OH、−SH、−NH 2 、−C(O)NHNH 2 (ヒドラジド)、マレイミド、活性化エステル、アルデヒド、ケトン、ヒドロキシルアミン、イミドエステル、イソシアネート、イソチオシアネート、スルホニルクロリド、アシルハライド、アミン部分、チアゾリジル部分、置換または非置換NHSエステル部分、スルホン化NHSエステル部分、スクシンイミジル部分、および−COOYから選択されるメンバーであり、Yが、H、負電荷および塩対イオンから選択されるメンバーであり、
前記標的部分が、小分子リガンド、ペプチド、タンパク質、酵素、抗体、抗原、核酸、炭水化物、脂質および薬理学的に活性な分子から選択されるメンバーを含む))]。 - 次式の構造を有する請求項1に記載の化合物
(式中、L 1 、L 2 、L 3 、L 4 、L 5 、L 6 、L 7 、L 8 、L 9 、および、L 10 は、置換または非置換C 1 〜C 6 アルキルから独立に選択されるメンバーであり、
R1、R2、R3およびR4は、Hおよび単一の負電荷から独立に選択されるメンバーであり、
R5、R6、R7、R8、R9、R10、R11、R12、R13、R14、R15およびR16は、Hである)。 -
から選択されるメンバーである構造を有する、請求項1に記載の化合物。 - 前記標的部分が、前記錯体が励起されたとき前記錯体と前記ルミネッセンス改変基との間のルミネッセンスエネルギー移動を可能にするようにルミネッセンス改変基で置換されている、請求項1に記載の化合物。
- XがNH2であり、L11が、置換または非置換C1〜C10アルキルおよび置換または非置換C1〜C10ヘテロアルキルから選択されるメンバーである、請求項1に記載の化合物。
- 前記官能性部分がポリエーテルを含む、請求項1に記載の化合物。
- 前記ポリエーテルが、ポリエチレングリコール(PEG)およびその誘導体から選択されるメンバーである、請求項6に記載の化合物。
- 前記ポリエーテルが約50〜約10,000ダルトンの分子量を有する、請求項7に記載の化合物。
- 前記リンカー部分のL1、L2、L3、L4、L5、L6、L7、L8、L9およびL10が、置換または非置換C1〜C6アルキルから独立に選択されるメンバーである、請求項1に記載の化合物。
- 前記リンカー部分のL1、L2、L3、L4、L5、L6、L7、L8、L9およびL10が、置換または非置換エチルから独立に選択されるメンバーである、請求項9に記載の化合物。
- 少なくとも1つの金属イオンと請求項1に記載の化合物との間で形成されたルミネッセント錯体。
- 前記金属イオンがランタニドイオンである、請求項11に記載の錯体。
- 前記ランタニドが、ネオジム(Nd)、サマリウム(Sm)、ユウロピウム(Eu)、テルビウム(Tb)、ジスプロシウム(Dy)およびイッテルビウム(Yb)から選択されるメンバーである、請求項12に記載の錯体。
- 認識分子および請求項11に記載の錯体を含むキットであって、前記認識分子が、抗体、タンパク質、ペプチドおよび核酸から選択されるメンバーであるキット。
- 試料中の検体の存在を検出する方法であって、
(a)前記試料と、請求項11に記載のルミネッセント錯体を含む組成物とを接触させることと、
(b)前記錯体を励起させることと、
(c)前記錯体からのルミネッセンスを検出することと
を含む方法。 - 試料中の検体の存在を検出する方法であって、
(a)前記試料と、請求項11に記載のルミネッセント錯体およびルミネッセンス改変基を含む組成物とを接触させること(ここで、前記錯体が励起されたとき に前記ルミネッセント錯体と前記ルミネッセンス改変基との間でエネルギーを移動させることができ、前記錯体および前記ルミネッセンス改変基は同一分子の一 部であっても異なる分子の一部であってもよい)と、
(b)前記錯体を励起させることと、
(c)前記試料のルミネッセント特性を測定することであって、前記検体の存在が前記ルミネッセント特性の変化をもたらすことと
を含む方法。 - 前記試料中に検体が存在する場合、前記検体が抗体と結合する方法であって、前記抗体がルミネッセンス改変基および請求項11に記載の錯体から選択されるメンバーと共有結合により結合する、請求項16に記載の方法。
- 前記検体が脂質である、請求項17に記載の方法。
- 式IIIの構造を有する、請求項1記載の化合物
(式中、L 1 、L 2 、L 3 、L 4 、L 5 、L 6 、L 7 、L 8 、L 9 およびL 10 は、置換または非置換エチルから独立に選択される連結基であり、
R 1 、R 2 、R 3 およびR 4 は、Hおよび単一の負電荷から独立に選択されるメンバーであり、
R 5 、R 6 、R 7 、R 8 、R 9 、R 10 、R 11 、R 12 、R 13 、R 14 、R 15 およびR 16 は、Hであり、
L 11 は、置換または非置換ヘテロアルキル、および、置換または非置換アルキルから選択される連結部分であり、
Xは、アミン、カルボン酸、マレイミジル、チアゾリジル、置換または非置換NHSエステル、スルホン化NHSエステル、スクシンイミジル、イソシアネート、イソチオシアネート部分から選択される反応性官能基である)。 - 前記式III中のL 11 −Xが、
から選択されるメンバーである構造を有する、請求項19に記載の化合物。 - 前記式III中のL 11 −Xが、
から選択されるメンバーである構造を有する、請求項19に記載の化合物。 -
から選択されるメンバーである構造を有する、請求項19に記載の化合物。 -
から選択されるメンバーである構造を有する、請求項19に記載の化合物。 - 前記式III中のL 11 が、ポリエーテルを含む、請求項19に記載の化合物。
- 前記ポリエーテルが、ポリエチレングリコール(PEG)およびその誘導体から選択されるものである、請求項24に記載の化合物。
- 前記ポリエーテルが、約50〜約10,000ダルトンの分子量を有する、請求項25に記載の化合物。
- Xが、マレイミジル、または、非置換NHSエステル部分である、請求項26に記載の化合物。
- L 11 が、置換ヘテロアルキル、または、置換アルキルであり、
Xが、イソシアネート部分である、
請求項19に記載の化合物。
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