JP5017653B2 - イネの第2染色体にある新規の短稈遺伝子のdnaマーカー選抜法 - Google Patents
イネの第2染色体にある新規の短稈遺伝子のdnaマーカー選抜法 Download PDFInfo
- Publication number
- JP5017653B2 JP5017653B2 JP2007084186A JP2007084186A JP5017653B2 JP 5017653 B2 JP5017653 B2 JP 5017653B2 JP 2007084186 A JP2007084186 A JP 2007084186A JP 2007084186 A JP2007084186 A JP 2007084186A JP 5017653 B2 JP5017653 B2 JP 5017653B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- gene
- seq
- marker
- chromosome
- dna
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Expired - Fee Related
Links
Images
Landscapes
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Description
Tomita, M.: The gametic lethal gene gal: activated only in the presence of the semidwarfing gene d60 in rice. In Rice Genetics III (Ed. G.S. Khush, ISBN 971-22-0087-6), International Rice Research Institute, pp. 396-403 (1996) Tomita, M., Yamagata, H. and Tanisaka, T.: Developmental cytology on gametic abortion caused by induced complementary genes gal and d60 in japonica rice. In Advances in Rice Genetics (Eds. G.S. Khush, D.S. Brar and B. Hardy, ISBN 971-22-0199-6), International Rice Research Institute, pp. 178-181 (2003)
〔DNA抽出〕
植物体(またはその一部)を液体窒素で凍結粉砕し、DNA抽出液を加え、振盪しながらインキュベートする。この溶液をから、抽出および重合沈殿によって、高分子DNAをスプールアウトする。スプールアウトしたDNAを精製し、DNA溶液を製造する。
〔PCR〕
各イネ科植物体から抽出したゲノムDNAを鋳型にして、プライマーおよびDNAポリメラーゼ等を含む反応液を調製する。サーマルサイクラー等を用いて、変性・アニーリング・伸長の一連の反応を繰り返し行う。PCR産物を電気泳動する。PCRの反応条件およびプライマーは、例えばTheor Appl Genet (2000)100:697-712を参考にすることができる(この文献を、参照により本明細書の一部とする)。
d60とGalについて、イネの全染色体を網羅するように選んだ31種類の遺伝子マーカーを持つ系統とコシヒカリd60系統(コシヒカリ/北陸100号//*6コシヒカリ)との交雑F2を展開し、d60と第2染色体のd30ならびにGalと第5染色体のd1との密接な連鎖を検出した。さらに、コシヒカリの第2染色体および第5染色体をKasalathに部分的に置換した染色体部分断片置換型系統SL204, 00KF2-11-175, 00RS-6-234)とコシヒカリd60系統との交雑F2を展開し、d60、Gal各遺伝子の近傍にあるSSRマーカーとの連鎖を明らかにした。
コシヒカリの第2染色体または第5染色体をKasalathに部分的に置換した系統(D60D60galgal)とコシヒカリd60系統(d60d60GalGal)との交雑F2 511から663個体を展開し,各個体からゲノムDNAを抽出した。植物体から採葉し、−80℃で凍結保存した。葉を液体窒素で凍結し、粉砕した。これに葉の粉末の重量と等量のDNA抽出液(2%CTAB、100mM Tris−HCl、20mM EDTA・2Na、1.4M NaCl、pH8.0)を加えて55℃で振盪しながら90分間インキュベートした。この溶液をクロロホルム・イソアミルアルコール(24:1)で抽出した。上清に1/10量の3M 酢酸ナトリウムpH5.2を加えた後、等量の−20℃の99.5%イソプロパノールを加えて重合沈殿した高分子DNAをスプールアウトした。スプールアウトしたDNAを1.5mlのHigh−Salt TE(1M NaCl、10mM Tris・HCl、1mM EDTA・2Na、pH8.0)に溶解し、エタノール沈殿後、500μlのTE(10mM Tris−HCl、1mM EDTA・2Na、pH8.0)に溶解した。これに1/100量のRNase溶液(1mg/ml)を加えて37℃で一晩インキュベートした。さらに、フェノール−クロロホルム抽出およびクロロホルム抽出を1回ずつ行った後、エタノール沈殿して500μlのTE(10mM Tris−HCl、1mM EDTA・2Na、pH8.0)に溶解した。
Claims (1)
- イネ科植物の第2染色体に存在するDNAマーカーRM452もしくは遺伝子マーカーd30を検出することによってd60遺伝子の存在を判別すること、および
イネ科植物の第5染色体に存在するDNAマーカーRM289もしくは遺伝子マーカーd1を検出することによりGal遺伝子の存在を判別することを特徴とする、短稈イネ科植物の選抜法。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2007084186A JP5017653B2 (ja) | 2007-03-28 | 2007-03-28 | イネの第2染色体にある新規の短稈遺伝子のdnaマーカー選抜法 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2007084186A JP5017653B2 (ja) | 2007-03-28 | 2007-03-28 | イネの第2染色体にある新規の短稈遺伝子のdnaマーカー選抜法 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2008237138A JP2008237138A (ja) | 2008-10-09 |
JP5017653B2 true JP5017653B2 (ja) | 2012-09-05 |
Family
ID=39909223
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2007084186A Expired - Fee Related JP5017653B2 (ja) | 2007-03-28 | 2007-03-28 | イネの第2染色体にある新規の短稈遺伝子のdnaマーカー選抜法 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
JP (1) | JP5017653B2 (ja) |
Families Citing this family (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP5828451B2 (ja) * | 2011-09-20 | 2015-12-09 | 国立大学法人鳥取大学 | イネの第3染色体にある新規の短稈晩生遺伝子のdnaマーカー選抜方法 |
JP6056042B2 (ja) * | 2012-03-29 | 2017-01-11 | 国立大学法人静岡大学 | イネ科植物を短稈化させる遺伝子および短稈イネ科植物の作出方法 |
Family Cites Families (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2550242B2 (ja) * | 1991-09-05 | 1996-11-06 | 帝人株式会社 | 芳香族ポリアミド繊維の処理方法 |
JP4504049B2 (ja) * | 2003-03-10 | 2010-07-14 | 独立行政法人農業生物資源研究所 | 植物の開花を制御する遺伝子Lhd4とその利用 |
-
2007
- 2007-03-28 JP JP2007084186A patent/JP5017653B2/ja not_active Expired - Fee Related
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
JP2008237138A (ja) | 2008-10-09 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US10595479B2 (en) | Induced mutagenesis | |
US11032986B2 (en) | Methods of creating drought tolerant corn plants using markers linked to cold shock domain-containing proteins and compositions thereof | |
CN109337998B (zh) | 与玉米株高紧密连锁的InDel6和SSR229分子标记开发方法及其应用 | |
US20240093224A1 (en) | Maize plants with improved disease resistance | |
US20220400638A1 (en) | Corn plants with improved disease resistance | |
CN110951753B (zh) | 一种水稻光温敏核雄性不育基因tms2759及其分子标记和应用 | |
JP5017653B2 (ja) | イネの第2染色体にある新規の短稈遺伝子のdnaマーカー選抜法 | |
CN109486829B (zh) | 一种水稻半矮秆基因sd1等位基因及其鉴定方法 | |
JP5828451B2 (ja) | イネの第3染色体にある新規の短稈晩生遺伝子のdnaマーカー選抜方法 | |
CN111100869B (zh) | 一种与水稻光温敏核雄性不育性状共分离的分子标记和应用 | |
CN112457385B (zh) | 一种控制水稻生育期基因ljp1的应用 | |
CN112195269B (zh) | 与水稻核雄性不育表型相关的分子标记和应用 | |
JP2018201418A (ja) | 日本型イネを大粒化させる遺伝子のdnaマーカー選抜方法 | |
CN108103236B (zh) | 玉米无叶舌基因lg1紧密连锁的SSR分子标记及其应用 | |
CN112625099A (zh) | 油菜矮杆基因bnd2及其在油菜杂交育种中的应用 | |
US10513743B2 (en) | Molecular markers associated with chloride tolerant soybeans | |
KR20070030598A (ko) | Rapd 표지인자를 이용한 양파의 웅성불임회복 유전자판별 방법 | |
CN111088258A (zh) | 一种水稻光温敏核雄性不育基因tms3650及其分子标记和应用 | |
CN109338001B (zh) | 一种鉴定水稻半矮秆基因sd1等位基因的分子标记及矮源基因鉴定方法 | |
Dhliwayo | Genetic mapping and analysis of traits related to improvement of popcorn | |
Campbell | Evaluating the utility and causative genetics of soybean mutants | |
JP2020198830A (ja) | イネの第7染色体にある極早生遺伝子のdnaマーカー選抜方法 | |
Seong et al. | Development of AFLP and STS Markers Related to Stay Green Trait in Multi-Tillered Maize | |
Arora et al. | Mapping Cold Hardiness Genes in Rhododendrons: An Assessment of Strategy | |
Arora et al. | JARS v56n4-Mapping Cold Hardiness Genes in Rhododendrons: An Assessment of Strategy |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20091015 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20120228 |
|
RD04 | Notification of resignation of power of attorney |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A7424 Effective date: 20120309 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20120423 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20120515 |
|
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 5017653 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
S111 | Request for change of ownership or part of ownership |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R313114 |
|
R350 | Written notification of registration of transfer |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R350 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
S111 | Request for change of ownership or part of ownership |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R313117 |
|
R350 | Written notification of registration of transfer |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R350 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
LAPS | Cancellation because of no payment of annual fees |