JP4876258B2 - 新規ポリペプチドおよびそのポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、並びにそれらの利用 - Google Patents
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Description
本発明者らは、海藻(オオハネモ:Bryopsis maxima)から単離したポリペプチド(以下「BML−17」という)が、糖鎖、特に高マンノース型糖鎖、さらには、ニワトリ型抗体に特異的な糖鎖(すなわち非還元末端にグルコースが少なくとも1つ以上結合した高マンノース型糖鎖)と結合すること、および当該BML−17が、ニワトリ型抗体(IgY抗体等)の精製に好適に利用が可能であるということを発見し、発明を完成するに至った。また従来公知の藻類(Carpopeltis flabellata=C.prorifera)由来レクチンであるCarninについても同様の効果があることを確認した。
(a)配列番号2に示されるアミノ酸配列;または
(b)配列番号2に示されるアミノ酸配列において、1個もしくは数個のアミノ酸が置換、欠失、挿入、もしくは付加されたアミノ酸配列、
からなるポリペプチドであることが好ましい。
本発明は、糖鎖と結合するポリペプチド(以下「本発明にかかるポリペプチド」という)をコードするポリヌクレオチドを提供する。本明細書中で使用される場合、用語「ポリヌクレオチド」は「核酸」または「核酸分子」と交換可能に使用され、ヌクレオチドの重合体が意図される。本明細書中で使用される場合、用語「塩基配列」は、「核酸配列」または「ヌクレオチド配列」と交換可能に使用され、デオキシリボヌクレオチド(A、G、CおよびTと省略される)の配列として示される。
(a)配列番号2に示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド;または
(b)配列番号2に示されるアミノ酸配列において、1個もしくは数個のアミノ酸が置換、欠失、挿入、もしくは付加されたアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードするポリヌクレオチド
のいずれかであることが好ましい。
(a)配列番号1に示される塩基配列からなるポリヌクレオチド;または
(b)以下の(i)もしくは(ii)のいずれかとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチド:
(i)配列番号1に示される塩基配列からなるポリヌクレオチド;もしくは
(ii)配列番号1に示される塩基配列と相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、
のいずれかであることが好ましい。
本発明は、本発明にかかるポリペプチドと特異的に結合する抗体を提供する。本明細書中で使用される場合、用語「抗体」は、免疫グロブリン(IgA、IgD、IgE、IgY、IgG、IgMおよびこれらのFabフラグメント、F(ab’)2フラグメント、Fcフラグメント)を意味し、例としては、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体、単鎖抗体、抗イディオタイプ抗体およびヒト化抗体が挙げられるがこれらに限定されない。本発明にかかる抗体は、本発明にかかるポリペプチドを発現する生物材料を選択する際に有用であり得る。また本発明にかかるポリペプチドを含む粗溶液から、当該ペプチドを精製する際にも有用である。
(4−1)ベクター
本発明は、本発明にかかるポリペプチドを生成するために使用されるベクターを提供する。本発明にかかるベクターは、インビトロ翻訳に用いるベクターであっても組換え発現に用いるベクターであってもよい。
本発明は、上述した本発明にかかるポリペプチドをコードするポリヌクレオチドが導入された形質転換体または細胞を提供する。ここで「形質転換体」とは、組織または器官だけでなく、生物個体を含むことを意味する。
本発明は、本発明にかかるポリペプチドを生産する方法を提供する。
本発明は、種々の検出器具をも提供する。本発明にかかる検出器具は、本発明にかかるポリヌクレオチドもしくはフラグメントが基板上に固定化されたもの、または、本発明にかかるポリペプチドもしくは抗体が基板上に固定化されたものであり、種々の条件下において、本発明にかかるポリヌクレオチドおよびポリペプチドの発現パターンの検出・測定などに利用することができる。
本発明で精製される抗体としては、動物に抗原を免疫することにより得られた抗血清、動物に抗原を免疫し免疫動物の脾臓細胞より作製したハイブリドーマ細胞が分泌するモノクローナル抗体、遺伝子組換え技術により作製された抗体、すなわち抗体遺伝子を挿入した抗体発現ベクターを宿主細胞へ導入することにより取得された抗体などいかなるものでもよい。また、抗体のFc領域を融合させた融合タンパク質なども本発明では抗体として含まれる。なお精製される抗体としては、ニワトリ型抗体が好ましい。本発明にかかるポリペプチドは、ニワトリ抗体に結合する糖鎖との親和性が高いからである。なおニワトリ型抗体とは、抗原を免疫されたニワトリが生産する抗体(IgY、IgE等)、およびニワトリ以外の動物において生産されるニワトリ由来の抗体と同一構造を有する抗体をも含む。また上記抗体はモノクローナル抗体であっても、ポリクローナル抗体であってもよい。その抗体については、「(3)抗体」の記載を適宜参照できる。
(抽出液の調製および硫安沈殿)
緑藻オオハネモ(Bryopsis maxima)の凍結乾燥粉末12.2gに200mlの20mMPBSA(Phosphate−buffer saline sodium azide;0.2%アジ化ナトリウム入り20mM PBS;pH7.0)を加え、4℃で一晩撹拌した後、遠心分離を行なって抽出液を得た。この操作を3回繰り返し、抽出液1〜3を得た。
赤血球凝集活性は、マイクロタイター法を用いて測定した。生理食塩水にて調製した各精製画分溶液の2倍段階希釈液、各25μlをマイクロタイタープレート上に作製した。各希釈液に2%赤血球浮遊液25μlを加えて軽く撹拌し、室温で1.5時間静置後、凝集能を観察した。凝集能は肉眼で判定し、赤血球の50%以上が凝集している場合を陽性とした。凝集活性は凝集素価(力価)、すなわち凝集活性を示す最大希釈液のタンパク質の濃度で示した。
抽出液1の20〜60%飽和硫安塩析沈殿画分を、ゲルろ過カラム(東ソー社製、Toyopearl HW−55カラム、4.4×900cm、Vt=1368ml)に供した。具体的には、同沈殿画分16mlを、20mM PBSA(pH7.0)で平衡化したToyopearl HW−55カラムに添加し、PBSAを用いて流速60ml/hで溶出した。溶出液は15ml分取し、各フラクションのUV280nmおよび凝集活性を測定した。
ゲルろ過で得られた凝集活性を有する画分110mlを、0.86M硫安を含む20mMトリス−塩酸緩衝液(pH7.0)に対して透析を行ない、内液80mlを得た。得られた内液を、同緩衝液で平衡化したTSKgel Phenyl−5PWカラム(7.5×75mm)に注入し、20mMトリス−塩酸緩衝液,pH7.0(溶媒A)と、0.86M硫安を含む同緩衝液(溶媒B)の2液を用いる濃度勾配法により溶出した。濃度勾配[溶媒B100%(20分)、溶媒:B0%−溶媒A100%(20−60分)、溶媒A100%(60−90分)]は、グラジェントプログラマー(CCPコントローラー、東ソー社製)を用いて設定し、流速は0、5ml/分とした。溶出液は、UV280nmをモニターするとともに、各ピークを分取し、凝集活性を測定した。
上記疎水クロマトグラフィーで得られた凝集活性を有する画分(精製画分)をSDS−PAGE(10%ゲル)に供した。
BML−17、およびピリジルエチル化(PE)処理したBML−17の0.1TFA−70%アセトニトリル溶液(500μg/ml)を、エレクトロンスプレイイオン化質量分析(ESI−MS、LCQ、Finigan)に供し分子量を測定した。
BML−17のアミノ酸組成分析は、ダブシル化法を用いて行なった。なおアミノ酸組成分析には、PE処理したBML−17を用いた。
BML−17のN末端アミノ酸配列はエドマン法によるヒューレットパッカード社製の自動分析装置:プロテインシーケンサー(G1005A型)を用いて分析を行なった。なおBML−17の100pmol相当量を上記N末端アミノ酸分析に用いた。
トリプシン処理ウサギ赤血球(TRBC)に対する凝集活性を指標として、BML−17の温度安定性およびpH安定性の検討を行なった。
BML−17の凝集活性は、EDTA処理後も変化しなかった。またEDTA処理溶液の凝集活性は2価金属イオンを添加後も変化しなかったことからことから、BML−17は凝集活性の発現に2価金属イオンを必要としないということが分かった。
赤血球凝集阻害試験は以下のようにして行なった。まず生理食塩水にて調製した糖溶液の2倍段階希釈液、各25μlをマイクロタイタープレート上に作製した。なお、使用した糖類の原液の濃度は単糖および少糖の場合は100mM、糖タンパク質の場合は2mg/mlとした。これに凝集素価(力価)4に調整したBML−17溶液、各25μlを加えて軽く撹拌後、室温で1.5時間静置した。これに25μlのTRBCを加え、室温で2時間静置後、凝集阻害能を観察した。凝集阻止能の有無は肉眼で判定し、赤血球の約100%が凝集していない場合を陽性とした。凝集阻害能(凝集阻害活性)は、最小阻害濃度すなわち凝集阻害能を示す最小濃度(mMまたはmg/ml)で表示した。
供試糖鎖としてピリジルアミノ化糖鎖(以下、「PA化糖鎖」という)を44種使用した。より具体的には、N−グリコシド型糖鎖の複合型12種、高マンノース型13種、混成型3種、共通コア構造1種および共通コア関連糖鎖1種、糖脂質系糖鎖8種、オリゴマンノース5種およびPA−マンノースを用いた。上記供試糖を表3、4に示した。表3、4には各種供試糖の糖鎖構造と、その右側に各種糖鎖の番号(1〜44)を付している。これは各種供試糖このうちPA−オリゴマンノースを除き、他のPA化糖鎖は市販品(タカラバイオ社製、Ajinoki社製)を用いた。PA−オリゴマンノースは、発明者らが合成したものを用いた。
以下に示す操作を行なって、cDNAライブラリーからBML−17のcDNAのクローニングを行なった。なお特に示さない限り、標準の条件にて操作を行なった。また各種キットを用いた場合においては、当該キットのマニュアルに記載された方法に準じて操作を行なった。
(供試レクチン)
藻類(海藻)由来レクチン:Eucheuma serra由来レクチンESA−2(Kawakubo,A.,Makino,H.,Ohnishi,J.,Hirohara,H.and Hori,K.:The marine red alga Eucheuma serra J.Agardh,a high yielding source of two isolectins.J.Appl.Phycol.,9,331−338(1997)参照)、Solieria robusta由来レクチンSolnin B(Hori,K.,Ikegami,S.,Miyazawa,K.and Ito,K.:Mitogenic and antineoplastic isoagglutinins from the red alga Solieria robusta.Phytochemistry,27,2063−2067(1988)参照。)、Boodlea coacta由来レクチンBCL(Hori,K.,Miyazawa,K.,and Ito,K.:Isolation and characterization of glycoconjugate−specific isoagglutinins from a marine green alga Boodlea coacta(Dickie)Murray et De Toni.Bot.Mar.,29,323−328(1986)参照。)、Carpopeltis flabellata由来レクチンCarnin(Hori,K.,Matsuda,H.,Miyazawa,K.and Ito,K.:A mitogenic agglutinin from the red alga Carpopeltis flabellata.Phytochemistry,26,1335−1338(1987)参照。)、Hypnea japonica由来レクチンHypnin A−1(Hori,K.,Miyazawa,K.,Fusetani,N.,Hashimoto,K.and Ito,K.:Hypnins,low−molecular weight peptidic agglutinins isolated from a marine red alga,Hypnea japonica.Biochim.Biophys.Acta,873,228−236(1986);Hori,K.,Matsubara,K.and Miyazawa,K.:Primary structures of two hemagglutinins from the marine red alga,Hypnea japonica.Biochim.Biophys.Acta,28,226−236(2000)参照)、BML−17、Bryopsis plumosa由来レクチンBPL−54、Codium fragile由来レクチンCFA。
上記各種レクチンとニワトリ卵黄抗体(ニワトリ型IgY抗体)との結合性を調べた。簡単には、表面プラズモン共鳴法(以下、「SPR法」という)を原理とするBiacore 2000(BIACORE社)を用いて、リガンドとしてニワトリ卵黄抗体(ニワトリ型IgY抗体)をセンサーチップ上に固定し、アナライトとして各レクチン溶液を用い、マニュアルに従って測定した。SPR法では、生体分子を標識することなく、生体分子間の特異的な相互作用を微量かつ短時間で定量的に測定できる。本法では、リガンドをセンサーチップ表面上に固定化し、これに作用する物質(アナライト)を含む溶液を添加すると、分子の結合・解離により生ずる微量の質量変化がSPRシグナルの変化として検出される。質量変化はレゾナンスウユニット(RU)で表され、1000RUは共鳴による反射角度0.1°の変化に相当し、アナライトがリガンドに1ng/mm2結合したことを意味する。センサーチップ表面の金薄膜上にはデキストランがコーティングされており、主としてこのデキストラン内に導入されたカルボキシル基を介してリガンドを固定化する。
上記検討の結果、藻類(海藻)由来レクチンであるESA−2、Solnin B、BCL、Carnin、Hypnin A−1、BML−17、および陸上植物由来レクチンであるCon A、UEA−Iがニワトリ卵黄抗体(ニワトリ型IgY抗体)と結合するということが分かった。これら結合性を示したものは、Hypnin A−1とUEA−Iを除き、すべて高マンノース型糖鎖結合性をもつレクチンであった。
(供試レクチン)
藻類(海藻)由来レクチン:ESA−2、Solnin B、Carnin、Hypnin A−1、BML−17
陸上植物由来レクチン:Con A
(方法)
高マンノース型糖鎖のみを有するタカアミラーゼA(タカジアスターゼ(コウジカビ由来、Sankyo製)からCon A固定化カラムを用いるアフニティークロマトグラフィーにより精製したもの)、複合型糖鎖のみを有するアシアロトランスフェリン(トランスフェリン(ヒト由来、SIGMA製)から希酸処理物(脱シアル化物)をODSカラムを用いる逆相系HPLCにより精製したもの)、高マンノース型糖鎖と複合型糖鎖の両方を有するウシチログロブリン(ウシ由来、SIGMA社製)、抗体(ニワトリ型IgY抗体)、およびコントロールとして牛血清アルブミン(BSA、SIGMA社製)をそれぞれ、CM5センサーチップ(BIACORE製)上に固定化した。なお固定化の方法は、マニュアルに従って行なった。より具体的にはタカアミラーゼAは表面チオールカップリン法で固定化を行ない、アシアロフェツイン、ウシチログロブリン、抗体、およびBSAはアミンカップリング法を用いて固定化を行なった。なお固定化量は、1000〜1500RUの範囲になるようマニュアルインジェクション法で調整した。なお、上記糖タンパク質の純度は、SDS−PAGEまたはMALDI−TOF−MSで確認した。
ニワトリ卵黄抗体と各種レクチンとの親和定数を表1に示した。表1には、結合速度定数Ka(M−1s−1)、解離速度定数Kd(s−1)、親和定数KA(M−1)、および解離定数KD(M)を示した。なお親和定数は、その値が大きくなればなるほど、親和性が高い(結合力が強い)ことを意味する。
(方法)
ニワトリ卵黄抗体と同様に、高マンノース型糖鎖と複合型糖鎖を有するウシチログロブリン固定化チップを用い、同チップに結合したレクチンの溶離性を検討した。なお、チログロブリンの固定化に際しては、特異的結合および溶離を確認しやすいようにCM5センサーチップ上に最大限固定化(12,095RU)した。HBS−EP(平衡化)バッファー(BIACORE社製)中、各100μg/ml濃度のアナライト(レクチン)溶液を流速5μl/minで、結合量が平衡に達するまで流した。この後、HBS−EPバッファーで洗浄し、解離が平衡に達した後、同バッファー中0.5M D−マンノースを50μl注入した。センサーグラムを基に、アナライト(レクチン)溶液を50μl(5μg)注入した時点での結合量(RU)を測定した。次に、バッファー洗浄および50μlの0.5M D−マンノース溶液での溶出後のアナライト(レクチン)の残存結合量(RU)を測定した。残存結合量を最大結合量に対する割合(%)で表示した。
図9に固定化チログロブリンと各種レクチンの相互作用のセンサーグラムを、図3に結合、洗浄および0.5M D−マンノースでの溶離後のアナライト(レクチン)の残存結合量(%)を示した。図3はウシチログロブリン固定化チップに、各種レクチンを結合させた時のチップと結合しているレクチン量を100%とした場合において、HBS−EPバッファーで解離させた後のチップと結合しているレクチン量の相対値、および0.5M D−マンノースで溶離させた後のレクチン量の相対値を示している。
(方法)
BML−17、Carnin、Con Aを、それぞれHiTrap NHS−activated HP Column(1ml容ゲル、(Amersham Bioscience Corp製)に固定化した。固定化の方法は、同HiTrapカラムに添付のマニュアルに従って行なった。なお、BML−17およびCon Aの場合は、それぞれ阻害単糖であるD−マンノースおよびメチル−α−D−マンノシドを終濃度0.2Mとなるようにリガンド溶液に加え、活性サイトをブロックした状態で固定化した。平衡化バッファー(0.15M NaClおよび0.02% NaN3を含む0.05Mトリス−塩酸バッファー(pH7.5))で十分洗浄した後の各カラムのレクチン固定化量は、400μg(BML−17)、570μg(Carnin)、270μg(Con A)であった。また、HiTrap IgY Purification HP Column(Amersham Bioscience Corp製、5ml容ゲル、以下「IgY精製用カラム」という)を比較対照として用いた。
図4に各種レクチンを固定化したカラム(BML−17カラム、Carninカラム、Con Aカラム)およびIgY精製用カラムに、ニワトリ卵黄抗体を通塔し、D−マンノースまたは溶出バッファーで溶離した場合の、タンパク質の挙動をUV280nmの吸収(図中「A280」で示す。以下同じ。)でモニターした結果を示す。図4(a)はBML−17カラムの結果を示し、図4(b)はCarninカラムの結果を示し、図4(c)はCon Aカラムの結果を示し、図4(d)はIgY精製用カラムの結果を示す。
(方法)
上記BML−17カラム、Carninカラム、Con Aカラム、IgY精製用カラムおよびCon A Sepharose 4B Lab Packsカラム(Amersham Bioscience Corp製、以下「市販Con Aカラム」という)(5ml容ゲル、固定化Con A量10〜16mg/ml)を用いて、ハイブリドーマ培養上清からニワトリモノクローナル抗体の精製を試みた。
図5に各種レクチンを固定化したカラム(BML−17カラム、Carninカラム、Con Aカラム、Con A−HiTrapカラム)およびIgY精製用カラムに、ハイブリドーマ培養上清を通塔し、500mM D−マンノースまたは溶出バッファーで溶離した場合の、タンパク質の挙動をUV280nmの吸収(図中「A280」で示す)でモニターした結果を示す。図5(a)はBML−17カラムの結果を示し、図5(b)はCarninカラムの結果を示し、図5(c)はCon Aカラムの結果を示し、図5(d)は市販Con Aカラムの結果を示し、図5(e)はIgY精製用カラムの結果を示す。
Claims (12)
- N−グリコシド型糖鎖の高マンノース型糖鎖と結合するポリペプチドであって、
(a)配列番号2に示されるアミノ酸配列;または
(b)配列番号2に示されるアミノ酸配列において、1個もしくは数個のアミノ酸が置換、欠失、挿入、もしくは付加されたアミノ酸配列、
からなることを特徴とするポリペプチド。 - 請求項1に記載のポリペプチドをコードすることを特徴とするポリヌクレオチド。
- 配列番号1に示される塩基配列からなる、請求項2に記載のポリヌクレオチド。
- 請求項2または3に記載のポリヌクレオチドを含むことを特徴とするベクター。
- 請求項4に記載のベクターを用いることを特徴とする請求項1に記載のポリペプチドの生産方法。
- 請求項2または3に記載のポリヌクレオチドが導入されていることを特徴とする形質転換体。
- 請求項6に記載の形質転換体を用いることを特徴とする請求項1に記載のポリペプチドの生産方法。
- 請求項2または3に記載のポリヌクレオチドが基板上に固定化されていることを特徴とする検出器具。
- 請求項1に記載のポリペプチドが基板上に固定化されていることを特徴とする検出器具。
- 請求項1に記載のポリペプチドを用いることを特徴とする抗体の精製方法。
- 上記抗体がニワトリ型抗体であることを特徴とする請求項10に記載の精製方法。
- 請求項1に記載のポリペプチドが固定化されていることを特徴とする担体。
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